JP2018083816A - Tetragalnacおよびペプチドを含む新規なコンジュゲートと、オリゴヌクレオチドの送達方法 - Google Patents

Tetragalnacおよびペプチドを含む新規なコンジュゲートと、オリゴヌクレオチドの送達方法 Download PDF

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Abstract

【課題】送達効率、細胞取り込み及び/又はエンドソーム脱出を効果的に行うことができる新たな単一の化学的コンジュゲートの提供。【解決手段】1)オリゴヌクレオチド;2)式(I)の1個又は複数個のtetraGalNAcリガンド;任意に、3)1個又は複数個のリンカー;4)特定の配列を有する1個又は複数個のペプチド;及び任意に、5)1個又は複数個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質及び/又はマスキング剤を含む、モジュール組成物。【選択図】なし

Description

治療を目的としたオリゴヌクレオチドの全身送達に着目した科学的取り組みが進行して
いる。オリゴヌクレオチド送達に注目した3つのアプローチとして、1)脂質ナノ粒子(
LNP)への封入、2)ポリマーコンジュゲーションおよび3)単一の化学的コンジュゲ
ーションが挙げられる。単一の化学的コンジュゲーションは典型的には、標的化リガンド
または脂質または可溶化基またはエンドソーム溶解ペプチドもしくは細胞膜透過ペプチド
、および/または、オリゴヌクレオチドに結合したこれらの2つまたは4つすべての組み
合わせを利用する。リンカーは、コンジュゲートのほか、他の官能基に存在してもよい。
単一の化学的コンジュゲートは公知であり、オリゴヌクレオチドの結合は、オリゴヌクレ
オチドの5’末端もしくは3’末端、両末端あるいは内部で起こる。国際公開第2005
/041859号パンフレット、国際公開第2008/036825号パンフレットおよ
び国際公開第2009/126933号パンフレットを参照されたい。
かなりの量の文献的証拠から、オリゴヌクレオチド送達の主な障害が細胞取り込みおよ
びエンドソーム脱出であることという仮説が裏付けられている。送達効率、細胞取り込み
および/またはエンドソーム脱出を効果的に行うことができる新たな単一の化学的コンジ
ュゲートが依然として求められている。
本明細書に開示されたtetraGalNAcおよびペプチドを含む単一の化学的コン
ジュゲートは、効果的な送達効率、細胞取り込みおよび/またはエンドソーム脱出という
驚くべき特性を有する。
一実施形態では、本明細書に開示されたモジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖
オリゴヌクレオチド;2)下記式(I)、(II)または(III)の、同一でもあるい
は異なっていてもよい1個または複数個のtetraGalNAcリガンド:
Figure 2018083816
(式中、Xは−O−、−S−、−CR2−または−NR1−であり、RおよびR
は各々独立に水素およびC1〜C6アルキルからなる群から選択され;nは1、2、3ま
たは4であり;かつ
Figure 2018083816
による結合は結合点を示す);任意に、3)同一でもあるいは異なっていてもよい1個ま
たは複数個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択
される1個または複数個のペプチド;および任意に、5)1個または複数個の標的化リガ
ンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。一実施形態
では、RおよびRは各々独立に水素、メチルおよびエチルからなる群から選択される
。別の実施形態では、RおよびRは各々水素である。
一実施形態では、tetraGalNAcリガンドは下記式(II)を有し、式中、X
、R、Rおよびnは、上記で定義した通りである。別の実施形態では、tetraG
alNAcリガンドは下記式(III)を有し、式中、X、R、Rおよびnは、上記
で定義した通りである。
Figure 2018083816
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド
;2)同一でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1
〜8個のtetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−また
は−NH−であり;nは1、2、3または4である);3)同一でもあるいは異なってい
てもよい1〜24個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独
立に選択される1〜8個のペプチド;および任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可
溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。tetraGalN
Acリガンドは式(II)を有し、式中、X、R、Rおよびnは、上記で定義した通
りである。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖siRNA;2)同
一でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1〜8個の
tetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−または−NH
−であり;nは1、2、3または4である);3)同一でもあるいは異なっていてもよい
1〜24個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択
される1〜8個のペプチド;および任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、
薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、リンカーは、リボース環の異なる2’位
、ならびに/または、オリゴヌクレオチドもしくはsiRNAの異なる3’位末端および
/または5’位末端でオリゴヌクレオチドもしくはsiRNAに結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
/またはペプチドは、任意にリンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結
合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
/またはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、オリゴヌクレオチ
ドもしくはsiRNAの異なる3’位末端および/または5’位末端でオリゴヌクレオチ
ドもしくはsiRNAに結合しており;tetraGalNAcリガンドおよび/または
ペプチドは、任意にリンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結合してい
る。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、式(I)、(II)または(III)の
Xは−O−、−S−または−CH−であり;nは1、2または3である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、式(I)、(II)または(III)の
Xは−O−または−CH−であり、nは1または2である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、式(I)、(II)または(III)の
Xは−O−であり、nは1または2である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、式(I)、(II)または(III)の
Xは−CH−であり、nは1または2である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、組成物は、同一でもあるいは異なってい
てもよい1〜6個のtetraGalNAcリガンド、またはより具体的には1〜4個の
tetraGalNAcリガンドを含む。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、組成物は、1〜6個のペプチド、または
より具体的には1〜4個のペプチドを含む。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつtetraGalNAcリガンドは、オリゴヌクレオチドまたはsi
RNAのガイド鎖またはパッセンジャー鎖にリボース環の異なる2’位で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつtetraGalNAcリガンドは、オリゴヌクレオチドまたはsi
RNAのガイド鎖またはパッセンジャー鎖に異なる3’位末端および/または5’位末端
で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつtetraGalNAcリガンドは、オリゴヌクレオチドまたはsi
RNAのガイド鎖およびパッセンジャー鎖の両方にリボース環の異なる2’位、ならびに
/または、異なる3’位末端および/もしくは5’位末端で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAのガイド鎖または
パッセンジャー鎖にsiRNAのリボース環の異なる2’位で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAのガイド鎖または
パッセンジャー鎖に異なる3’位末端および/または5’位末端で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAのガイド鎖および
パッセンジャー鎖の両方にリボース環の異なる2’位、ならびに/または、異なる3’位
末端および/もしくは5’位末端で結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
ペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAの同じ鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
ペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAの異なる鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
ペプチドは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAの同じ鎖または異なる鎖にリンカーを
介して結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、リンカーは各々独立に表1から選択され
る。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、リンカーは各々独立に表2から選択され
る。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり;かつ任意選択の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および
/またはマスキング剤は、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAの同じ鎖または異なる鎖
に結合している。
一実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるいは
異なっていてもよい、下記式(IV)、(V)または(VI)の1〜8個のtetraG
alNAcリガンド:
Figure 2018083816
;3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表1から独立に選択される1〜24個のリ
ンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択される1〜8個
のペプチド;および、任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善
剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるい
は異なっていてもよい、式(IV)、(V)または(VI)の1〜4個のtetraGa
lNAcリガンド;3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表1から独立に選択され
る1〜12個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選
択される1〜4個のペプチド;および、任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化
剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAc
リガンドおよび/またはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、s
iRNAの異なる3’位末端および/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;
かつtetraGalNAcリガンドおよび/またはペプチドは、任意にリンカーを介し
てsiRNAに結合している。
上記の実施形態の1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよびペプ
チドは、リンカーを介してsiRNAの同じ鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
ペプチドは、リンカーを介してsiRNAの異なる鎖に結合している。
一実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるいは
異なっていてもよい、式(IV)、(V)または(VI)の1〜4個のtetraGal
NAcリガンド;3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表2から独立に選択される
1〜12個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表4から独立に選択
される1〜4個のペプチド;および、任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤
、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAcリ
ガンドおよび/またはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、si
RNAの異なる3’位末端および/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;か
つtetraGalNAcリガンドおよび/またはペプチドは、リンカーを介してsiR
NAに結合している。
上記の実施形態の1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよびペプ
チドは、リンカーを介してsiRNAの同じ鎖に結合している。
上記の実施形態の1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよびペプ
チドは、リンカーを介してsiRNAの異なる鎖に結合している。
末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の非限定的な例を示す。 末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の非限定的な例を示す。 内部コンジュゲーションおよび/または末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の非限定的な例を示す。 内部コンジュゲーションおよび/または末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の非限定的な例を示す。 リンカー(L−Pおよび/またはL−G)を含む各々のヌクレオチド[O]または[On’]の一般的な構造を示す。 Bコンジュゲート(Ex.3)を調製するためのスキーム2を示す。 Bコンジュゲート(Ex.3)を調製するためのスキーム2を示す。 Bコンジュゲート(Ex.4)を調製するためのスキーム2を示す。 Bコンジュゲート(Ex.5)を調製するためのスキーム2を示す。 Bコンジュゲート(Ex.6)を調製するためのスキーム2を示す。 コンジュゲートB6−P32(Ex.7)を調製するためのスキーム3を示す。 コンジュゲートB8−seq32(Ex.8)を調製するためのスキーム3を示す。 B9を調製するためのスキーム4を示す。 B10−seq32を調製するためのスキーム4を示す。 B11−seq32を調製するためのスキーム4を示す。 B−13−seq13−b化合物を調製するためのスキーム5を示す。 B−13−seq13−b化合物を調製するためのスキーム5を示す。 B−13−seq13−b化合物を調製するためのスキーム5を示す。 B−13−seq13−b化合物を調製するためのスキーム5を示す。 B16−seq32化合物を調製するためスキーム6を示す。 B17−seq32−b化合物を調製するためのスキーム6を示す。 B16−seq32化合物を調製するためスキーム6を示す。 C1およびC2化合物を調製するためのスキーム7を示す。 C3化合物を調製するためのスキーム7を示す。 C4−seq32化合物を調製するためのスキーム7を示す。 C6−seq32化合物を調製するためのスキーム7を示す。 C7およびC8化合物を調製するためのスキーム8を示す。 C9化合物を調製するためのスキーム8を示す。 C10化合物を調製するためのスキーム8を示す。 C11−seq32化合物を調製するためのスキーム8を示す。 C12−seq32化合物を調製するためのスキーム8を示す。 C13化合物を調製するためのスキーム9を示す。 C13化合物を調製するためのスキーム9を示す。 C14−seq32化合物を調製するためのスキーム9を示す。 C15−seq32−a化合物を調製するためのスキーム9を示す。 D1を調製するためのスキーム10を示す。 D3を調製するためのスキーム10を示す。 D4を調製するためのスキーム10を示す。 D4を調製するためのスキーム10を示す。 D5−seq32化合物を調製するためのスキーム11を示す。 D5−seq32化合物を調製するためのスキーム11を示す。 D7−seq32化合物を調製するためのスキーム11を示す。 D7−seq32化合物を調製するためのスキーム11を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E化合物を調製するためのスキーム12を示す。 E8−seq137化合物を調製するためのスキーム13を示す。 E8−seq137化合物を調製するためのスキーム13を示す。 E10−seq137e化合物を調製するためのスキーム13を示す。 E10−seq137e化合物を調製するためのスキーム13を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F化合物を調製するためのスキーム14を示す。 F6seq463−f化合物を調製するためのスキーム15を示す。 F6seq463−f化合物を調製するためのスキーム15を示す。 F6seq463−f化合物を調製するためのスキーム15を示す。 F6seq463−f化合物を調製するためのスキーム15を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム16を示す。 G化合物を調製するためのスキーム17を示す。 G化合物を調製するためのスキーム17を示す。 G化合物を調製するためのスキーム17を示す。 G化合物を調製するためのスキーム17を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 H10−seq32−h化合物を調製するためのスキーム19を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 I10−seq1681−f化合物を調製するためのスキーム20を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 J9−seq26−i化合物を調製するためのスキーム21を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 K6 seq74−b化合物を調製するためのスキーム22を示す。 L11−seq463−j化合物を調製するためのスキーム23を示す。 L11−seq463−j化合物を調製するためのスキーム23を示す。 L11−seq463−j化合物を調製するためのスキーム23を示す。 L11−seq463−j化合物を調製するためのスキーム23を示す。 L11−seq463−j化合物を調製するためのスキーム23を示す。 M4−seq−j化合物を調製するためのスキーム24を示す。 M4−seq−j化合物を調製するためのスキーム24を示す。 M4−seq−j化合物を調製するためのスキーム24を示す。 M4−seq−j化合物を調製するためのスキーム24を示す。 N4−seq283−k化合物を調製するためのスキーム25を示す。 N4−seq283−k化合物を調製するためのスキーム25を示す。 N4−seq283−k化合物を調製するためのスキーム25を示す。 O3−seq463−k化合物を調製するためのスキーム26を示す。 O3−seq463−k化合物を調製するためのスキーム26を示す。 O3−seq463−k化合物を調製するためのスキーム26を示す。 O3−seq463−k化合物を調製するためのスキーム26を示す。 P2−seq−32−k化合物を調製するためのスキーム27を示す。 P2−seq−32−k化合物を調製するためのスキーム27を示す。 P2−seq−32−k化合物を調製するためのスキーム27を示す。 P2−seq−32−k化合物を調製するためのスキーム27を示す。 P2−seq32−m化合物を調製するためのスキーム28を示す。 P2−seq32−m化合物を調製するためのスキーム28を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 Q3−seq74−b化合物の調製に使用したスキーム29を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 R4−seq27−I化合物を調製するためのスキーム30を示す。 tetraGalNAc−siRNAコンジュゲートを調製するためのスキーム32を示す。 tetraGalNAc−siRNAコンジュゲートを調製するためのスキーム32を示す。 TetraGalNAc−siRNAコンジュゲート19−1を調製するためのスキーム33を示す。 TetraGalNAc−siRNAコンジュゲート19−1を調製するためのスキーム33を示す。 化合物26を調製するためのスキーム35を示す。 化合物26を調製するためのスキーム35を示す。 化合物27を調製するためのスキーム36を示す。 化合物28を調製するためのスキーム36を示す。 化合物28を調製するためのスキーム36を示す。 コンジュゲート35を調製するためのスキーム38を示す。 コンジュゲート36および37を調製するためのスキーム38を示す。 コンジュゲート38〜44を調製するためのスキーム39を示す。 コンジュゲート38〜44を調製するためのスキーム39を示す。 コンジュゲート38〜44を調製するためのスキーム39を示す。 スキーム40を示し、tetraGalNAcをsiRNAにコンジュゲートするための表2の様々なリンカーの例を示す。 化合物および/またはコンジュゲート46を調製するためのスキーム41を示す。 化合物および/またはコンジュゲート46を調製するためのスキーム41を示す。 化合物および/またはコンジュゲート47を調製するためのスキーム41を示す。 化合物および/またはコンジュゲート47を調製するためのスキーム41を示す。 化合物および/またはコンジュゲート48を調製するためのスキーム41を示す。 化合物および/またはコンジュゲート49を調製するためのスキーム42を示す。 化合物および/またはコンジュゲート50を調製するためのスキーム42を示す。 化合物および/またはコンジュゲート51を調製するためのスキーム42を示す。 表6に使用した表記法の説明を目的とした一般的な記載を示したスキーム43を示す。
本明細書に開示されるのは、一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド;下記式(I)、
(II)または(III)の、同一でもあるいは異なっていてもよい1個または複数個の
tetraGalNAcリガンド;
Figure 2018083816
(式中、Xは−O−、−S−、−CR2−または−NR1−であり、RおよびR
は各々独立に水素およびC1〜C6アルキルからなる群から選択され;nは1、2、3ま
たは4であり;かつ
Figure 2018083816
による結合は結合点を示す);および同一でもあるいは異なっていてもよい1個または複
数個のペプチドを含む単一の化学的コンジュゲートである。他の官能基、たとえば標的化
リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤が任意に存在す
る。一実施形態では、RおよびRは各々独立に水素、メチルおよびエチルからなる群
から選択される。別の実施形態では、RおよびRは各々水素である。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは低分子干渉RNA(siRNA)である。別の
実施形態では、siRNAは一本鎖siRNAである。別の実施形態では、siRNAは
二本鎖siRNAである。
本明細書に開示されたtetraGalNAcを使用すると、モジュール組成物を特定
の細胞に誘導することによりオリゴヌレオチドまたはsiRNAが効果的に送達される。
たとえば、標的化リガンドは、標的細胞の表面上の分子と特異的または非特異的に結合し
、リガンド−siRNAコンジュゲートのインターナリゼーションを促進することができ
る。
ペプチドは、エンドソーム溶解剤、細胞膜透過剤および/または膜融合剤として機能し
得る。さらに、ペプチドは、カチオン性、両性イオン、中性、アニオン性を有し得る。t
etraGalNAcおよびペプチドの両方をモジュール組成物に組み込むと、オリゴヌ
レオチドまたはsiRNAの送達効率をさらに改善することができる。
リンカーは、各ペプチドとオリゴヌクレオチドとの間に存在しても、あるいは各tet
raGalNAcとオリゴヌクレオチドとの間に存在してもよい。リンカーは、リボース
環の異なる2’位、ならびに/または、オリゴヌクレオチドの3’位末端および/もしく
は5’位末端でオリゴヌクレオチドに結合している。
一実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド;
2)下記式(I)、(II)または(III)の、同一でもあるいは異なっていてもよい
1個または複数個のtetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−C
−または−NH−であり;nは1、2、3または4であり;かつ
Figure 2018083816
による結合は結合点を示す);任意に、3)同一でもあるいは異なっていてもよい1個ま
たは複数個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択
される1個または複数個のペプチド;および任意に、5)1個または複数個の標的化リガ
ンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド
;2)同一でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1
〜8個のtetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−また
は−NH−であり;nは1、2、3または4である);3)同一でもあるいは異なってい
てもよい1〜24個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独
立に選択される1〜8個のペプチド;および任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可
溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖siRNA;2)同
一でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1〜8個の
tetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−または−NH
−であり;nは1、2、3または4である);3)同一でもあるいは異なっていてもよい
1〜24個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択
される1〜8個のペプチド;および任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、
薬物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含む。
上記の実施形態の1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび/ま
たはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、オリゴヌクレオチドも
しくはsiRNAの異なる3’位末端および/または5’位末端でオリゴヌクレオチドも
しくはsiRNAに結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
/またはペプチドは、任意にリンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結
合している。一実施形態では、リンカーが存在する。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
/またはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、オリゴヌクレオチ
ドもしくはsiRNAの異なる3’位末端および/または5’位末端でオリゴヌクレオチ
ドもしくはsiRNAに結合しており;tetraGalNAcリガンドおよび/または
ペプチドは、リンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドは、リ
ンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結合しており、リンカーは、リボ
ース環の異なる2’位でオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドは、リ
ンカーを介してオリゴヌクレオチドまたはsiRNAに結合しており、リンカーは、オリ
ゴヌクレオチドの異なる3’位末端および/または5’位末端でオリゴヌクレオチドまた
はsiRNAに結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、Xは−O−、−S−または−CH−で
ある。別の実施形態では、Xは−O−または−CH−である。別の実施形態では、nは
1、2または3である。別の実施形態では、Xは−O−であり、nは1または2である。
別の実施形態では、Xは−CH−であり、nは1または2である。別の実施形態では、
Xは−O−であり、nは1である。なお別の実施形態では、Xは−CH−であり、nは
1である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
一本鎖である。別の実施形態では、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは二本鎖である
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、組成物は1〜6個のtetraGalN
Acリガンドを含む。別の実施形態では、組成物は1〜4個のtetraGalNAcリ
ガンドを含む。別の実施形態では、組成物は1〜2個のtetraGalNAcリガンド
を含む。なお別の実施形態では、組成物は1個のtetraGalNAcリガンドを含む
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、組成物は1〜6個のペプチドを含む。別
の実施形態では、組成物は1〜4個のペプチドを含む。別の実施形態では、組成物は1〜
2個のペプチドを含む。なお別の実施形態では、組成物は1個のペプチドを含む。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドは、リボース環の異なる2’位でガイド
鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドは、異なる3’位末端および/または5
’位末端でガイド鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドは、リボース環の異なる2’位でパッセ
ンジャー鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドは、異なる3’位末端および/または5
’位末端でパッセンジャー鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドは、リボース環の異なる2’位、ならび
に/または、異なる3’位末端および/もしくは5’位末端でガイド鎖およびパッセンジ
ャー鎖の両方に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、ペプチドは、リボース環の異なる2’位でガイド鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、ペプチドは、異なる3’位末端および/または5’位末端でガイド鎖に結
合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、ペプチドは、リボース環の異なる2’位でパッセンジャー鎖に結合してい
る。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、ペプチドは、異なる3’位末端および/または5’位末端でパッセンジャ
ー鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、ペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、異なる3’
位末端および/もしくは5’位末端でガイド鎖およびパッセンジャー鎖の両方に結合して
いる。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドおよびペプチドは、リンカーを介して同
じ鎖または異なる鎖に結合している。一実施形態では、リンカーは各々独立選択される表
1である。別の実施形態では、リンカーは各々独立選択される表2である。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドおよびペプチドは同じ鎖に結合している
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、tetraGalNAcリガンドおよびペプチドは異なる鎖に結合してい
る。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、任意選択の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
たはマスキング剤は、同じ鎖または異なる鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAは
二本鎖であり、任意選択の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
たはマスキング剤は、リンカーを介して同じ鎖または異なる鎖に結合している。一実施形
態では、リンカーは各々独立に表1から選択される。別の実施形態では、リンカーは各々
独立に表2から選択される。
一実施形態では、モジュール組成物は、1)一本鎖または二本鎖siRNA;2)同一
でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1〜8個のt
etraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−または−NH−
であり;nは1、2、3または4である);3)同一でもあるいは異なっていてもよい1
〜24個のリンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択さ
れる1〜8個のペプチド;および任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、薬
物動態改善剤、脂質および/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAcリガン
ドおよび/またはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、siRN
Aの異なる3’位末端および/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;かつt
etraGalNAcリガンドおよび/またはペプチドは、任意にリンカーを介してsi
RNAに結合している。一実施形態では、リンカーが存在する。別の実施形態では、Xは
−O−、−S−または−CH−であり、nは1、2または3である。別の実施形態では
、Xは−O−または−CH−であり、nは1または2である。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるい
は異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1〜6個のtetraG
alNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−または−CH−であり;nは1、2ま
たは3である);3)同一でもあるいは異なっていてもよい1〜18個のリンカー;4)
同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択される1〜6個のペプチド;
および任意に、5)1〜6個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および
/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAcリガンドおよび/またはペプチド
は、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、siRNAの異なる3’位末端およ
び/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;かつtetraGalNAcリガ
ンドおよび/またはペプチドは、任意にリンカーを介してsiRNAに結合している。一
実施形態では、リンカーが存在する。別の実施形態では、Xは−O−、−S−または−C
−であり、nは1または2である。別の実施形態では、リンカーは表1から独立に選
択される。別の実施形態では、リンカーは表2から独立に選択される。別の実施形態では
、4)のペプチドは表4から独立に選択される。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるい
は異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1〜4個のtetraG
alNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−または−CH−であり;かつ、nは1
または2である);3)同一でもあるいは異なっていてもよい1〜12個のリンカー;4
)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択される1〜4個のペプチド
;および任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質およ
び/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAcリガンドおよび/またはペプチ
ドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、siRNAの異なる3’位末端お
よび/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;かつtetraGalNAcリ
ガンドおよび/またはペプチドは、リンカーを介してsiRNAに結合している。一実施
形態では、Xは−O−または−CH−であり、nは1または2である。別の実施形態で
は、リンカーは表1から独立に選択される。別の実施形態では、リンカーは表2から独立
に選択される。別の実施形態では、ペプチドは表4から独立に選択される。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)同一でもあるい
は異なっていてもよい、下記式(IV)、(V)または(VI)の1〜4個のtetra
GalNAcリガンド:
Figure 2018083816
;3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表1から独立に選択される1〜12個のリ
ンカー;4)同一でもあるいは異なっていてもよい、表3から独立に選択される1〜4個
のペプチド;および任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤
、脂質および/またはマスキング剤を含み;tetraGalNAcリガンドおよび/ま
たはペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、siRNAの異なる3
’位末端および/もしくは5’位末端でsiRNAに結合しており;かつtetraGa
lNAcリガンドおよび/またはペプチドは、リンカーを介してsiRNAに結合してい
る。
別の実施形態では、モジュール組成物は、1)二本鎖siRNA;2)式(IV)、(
V)または(VI)の1〜4個のtetraGalNAcリガンド;3)同一でもあるい
は異なっていてもよい、表2から独立に選択される1〜12個のリンカー;4)同一でも
あるいは異なっていてもよい、表4から独立に選択される1〜4個のペプチド;および任
意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/または
マスキング剤を含み;tetraGalNAcリガンドおよび/またはペプチドは、リボ
ース環の異なる2’位、ならびに/または、siRNAの異なる3’位末端および/もし
くは5’位末端でsiRNAに結合しており;かつtetraGalNAcリガンドおよ
び/またはペプチドは、リンカーを介してsiRNAに結合している。
上記の実施形態の1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび/ま
たはペプチドは、リンカーを介してsiRNAに結合しており;かつtetraGalN
Acリガンドおよび/またはペプチドは同じ鎖に結合している。
上記の実施形態のもう1つのサブセットでは、tetraGalNAcリガンドおよび
/またはペプチドは、リンカーを介してsiRNAに結合しており;かつtetraGa
lNAcリガンドおよびペプチドは異なる鎖に結合している。
カートゥーン(cartoon)により本発明を説明するには、本発明は、オリゴヌク
レオチド([O][O][O]......[O])と、1個または複数個のt
etraGalNAc(単数または複数)リガンド(G)と、1個または複数個のリンカ
ー(単数または複数)(L)と、1個または複数個のペプチド(単数または複数)(P)
と、1つまたは複数の任意選択の脂質(単数または複数)(X)、1個または複数個の標
的化リガンド(単数または複数)(X)および/または1つまたは複数の可溶化基(単数
または複数)(X)とを含むモジュール組成物を特徴とする。
一実施形態では、モジュール組成物は下記式を有し得る:
G−L−[O][O][O]......[O]−L−P。
別の実施形態では、モジュール組成物は下記式を有し得る:
P−L−[O][O][O]......[O]−L−G。
末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の
非限定的な例を図1に示す。
末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴヌクレオチドを含むモジュール組成物の
非限定的な例を図2に示す。
内部コンジュゲーションおよび/または末端コンジュゲーションを有する二本鎖オリゴ
ヌクレオチドを含むモジュール組成物の非限定的な例を図3Aおよび図3Bに示す。
これらの例は、説明としてのみ使用する。当業者であれば、所望の要素をパッセンジャ
ー鎖およびガイド鎖に配置するのに種々の並べ替えが存在することを理解するであろう。
オリゴヌクレオチドには、何個のリンカーが、したがって何個のペプチドが結合してい
てもよい。リンカー数の範囲は1〜16である。より好ましいリンカー数の範囲は1〜1
2、あるいはより具体的には1〜8、あるいはさらに詳細には1〜4である。
tetraGalNAcリガンド数の範囲は、1〜8である。より好ましいtetra
GalNAcリガンド数の範囲は1〜6、あるいはより具体的には1〜4、あるいはさら
に詳細に1〜2である。
ペプチド数の範囲は、1〜8である。より好ましいペプチド数の範囲は1〜6、あるい
はより具体的には1〜4、あるいはさらに詳細には1〜2である。
2本の鎖は、それぞれnヌクレオチドおよびn’ヌクレオチドを含む。nおよびn’の
数は、同一でもあるいは異なっていてもよい。その数は8〜50の範囲の整数である。好
ましくは、その数は12〜28の範囲の整数である。一層好ましくは、その数は19〜2
1の範囲の整数である。
一例を挙げると、リンカー(L−Pおよび/またはL−G)を含むヌクレオチド[O
]または[On’]は各々、図4に示すような一般的な構造を有する。
各ヌクレオチドでは、1)E=酸素(O)または硫黄(S);2)修飾されていてもあ
るいは修飾されていなくもよい塩基=A、U、GまたはC;3)Dはリボース環とリンカ
ーLとの間の接合点であり、D=酸素(O)、硫黄(S、S(O)またはS(O))、
窒素(N−R、式中、R=H、アルキル、L−PもしくはL−X)、炭素(CH−R、式
中、R=H、アルキル、L−PもしくはL−X)、またはリン(P(O)RまたはP(O
)(OR)、式中、R=アルキル、L−P、またはL−X)である。好ましくは、D=酸
素(O)である。
2個のヌクレオチド[On−1]および[O]または[On’−1]および[On’
]は、ホスホジエステル結合またはチオ−ホスホジエステル結合により連結されている。
オリゴヌクレオチドが二本鎖オリゴヌクレオチドである場合、「G−L」、「P−L」
ならびに脂質、標的化リガンドおよび/または可溶化基は、同じ鎖上に位置してもあるい
は異なる鎖上に位置してもよい。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」は同じ鎖上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」はパッセンジャー鎖上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」はガイド鎖上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」は異なる鎖上に位置する。
いくつかの実施形態では、「G−L」はパッセンジャー鎖上にあるのに対し、「P−L
」はガイド鎖上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」は異なる鎖上にあるが、二本鎖
オリゴヌクレオチドの同じ末端上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」および「P−L」は異なる鎖上にあり、かつ二本
鎖オリゴヌクレオチドの逆末端上にある。
いくつかの実施形態では、「G−L」はパッセンジャー鎖あるいはガイド鎖の複数の末
端に位置していてもよく、「P−L」はパッセンジャー鎖およびガイド鎖の残りの末端に
位置していてもよい。
いくつかの実施形態では、1個の「G−L」および2個以上の「P−L」がオリゴヌク
レオチドに存在する。
いくつかの実施形態では、2個以上の「G−L」および2個以上の「P−L」がオリゴ
ヌクレオチドに存在する。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドが二本鎖オリゴヌクレオチドであり、か
つ複数の「G−L」および/または「P−L」が存在する場合、そうした複数の「G−L
」成分および/または「P−L」はすべて二本鎖オリゴヌクレオチドの一方の鎖に存在し
ても、あるいは両方の鎖に存在してもよい。
複数の「G−L」成分および/または「P−L」が存在する場合、それらはすべて同一
でも、あるいは異なっていてもよい。
いくつかの実施形態では、「G−L」および/または「P−L」は内部ヌクレオチド上
のみ(すなわちオリゴヌクレオチドの3’末端および5’末端を除く)にある。
別の態様では、本発明は、オリゴヌクレオチドまたはsiRNAを細胞に送達する方法
を含む。本方法は、(a)本明細書に開示されたモジュール組成物を用意または取得する
こと;(b)細胞をモジュール組成物と接触させること;および(c)モジュール組成物
を細胞内に移行させることを含む。
本方法は、たとえばオリゴヌクレオチドまたはsiRNAを必要とすると判定された被
検体を処置するため、インビトロ、エキソビボまたはインビボで行うことができる。前記
オリゴヌクレオチドを必要とする被検体は、遺伝子(単数または複数)、たとえば、障害
に関連する遺伝子の発現をダウンレギュレートするまたはサイレンシングさせることを必
要とする被検体、たとえば、ヒトである。
一態様では、本発明は、1個または複数個の遺伝子の発現を阻害する方法を提供する。
本方法は、1つまたは複数の細胞を本発明の有効量のオリゴヌクレオチドと接触させるこ
とを含み、有効量は、1個または複数個の遺伝子の発現を抑制する量である。この方法は
、インビトロ、エキソビボまたはインビボで行うことができる。
本発明の方法および組成物、たとえば、本明細書に記載のモジュール組成物は、当該技
術分野において公知のどのようなオリゴヌクレオチドまたはsiRNAと共に使用しても
よい。さらに、本発明の方法および組成物は、当該技術分野において公知のどのような疾
患または障害の処置、どのような被検体、たとえば任意の動物、任意の哺乳動物、たとえ
ば任意のヒトの処置に使用してもよい。さらに当業者であれば、本発明の方法および組成
物は、遺伝子(単数または複数)のダウンレギュレーションまたはサイレンシングから恩
恵を受けると考えられる任意の疾患の処置に使用することができることも認識するであろ
う。
本発明の方法および組成物、たとえば、本明細書に記載のモジュール組成物は、本明細
書に記載のどのような用量および/もしくは製剤、あるいは当該技術分野において公知の
どのような用量または製剤で使用してもよい。当業者であればさらに、本明細書に記載の
投与経路に加えて他の投与経路を使用して本発明のモジュール組成物を投与してもよいこ
とも理解するであろう。
オリゴヌクレオチド
「オリゴヌクレオチド」は、本明細書で使用する場合、二本鎖または一本鎖での非修飾
または修飾RNAまたはDNAである。修飾RNAの例には、非修飾RNAよりヌクレア
ーゼ分解に対して抵抗性が高いものがある。さらなる例として、2’糖修飾、塩基修飾、
一本鎖オーバーハング、たとえば3’一本鎖オーバーハングの修飾、または、特に一本鎖
の場合、1つまたは複数のリン酸基または1つまたは複数のリン酸基のアナログを含む5
’修飾を有するものが挙げられる。オリゴヌクレオチドの例およびより詳細な説明は、本
明細書に援用する国際公開第2009/126933号パンフレットで確認することがで
きる。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドはアンチセンス、miRNA、ペプチド核酸(P
NA)、ポリ−モルホリノ(PMO)またはsiRNAである。好ましいオリゴヌクレオ
チドはsiRNAである。別の好ましいオリゴヌレオチドはsiRNAのパッセンジャー
鎖である。別の好ましいオリゴヌクレオチドはsiRNAのガイド鎖である。
siRNA
siRNAは、RNA干渉(RNAi)と呼ばれるプロセスによりmRNAの配列特異
的サイレンシングを誘導する。このプロセスは、哺乳動物および他の脊椎動物を含む多種
多様な生物で起こる。siRNAを調製および投与するための方法、ならびに遺伝子機能
を特異的に不活性化するためのその使用は、公知である。siRNAは、修飾および非修
飾siRNAを含む。siRNAの例およびより詳細な説明は、本明細書に援用する国際
公開第2009/126933号パンフレットで確認することができる。
siRNAを被検体に投与するのに使用することができる例示的送達経路は、多く知ら
れている。さらに、siRNAは、当該技術分野において公知の任意の例示的な方法によ
り製剤化することもできる。siRNAの製剤および投与の例およびより詳細な説明は、
本明細書に援用する国際公開第2009/126933号パンフレットで確認することが
できる。
「低分子干渉核酸」、「siNA」、「低分子干渉RNA」、「siRNA」、「低分
子干渉核酸分子」、「オリゴヌクレオチド」、「低分子干渉オリゴヌクレオチド分子」ま
たは「化学修飾低分子干渉核酸分子」という表現は、RNA干渉(「RNAi」)または
遺伝子サイレンシングを介して配列特異的に遺伝子発現またはウイルス複製を阻害または
ダウンレギュレートすることができる任意の核酸分子をいう。これらの用語は、個々の核
酸分子、複数のそうした核酸分子またはそうした核酸分子のプールの両方をいうことがで
きる。siNAは、アンチセンス鎖が標的核酸分子のヌクレオチド配列またはその一部と
相補的なヌクレオチド配列を含み、センス鎖が標的核酸配列に相当するヌクレオチド配列
またはその一部を含む、自己相補的なセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖核酸分
子であってもよい。siNAは、アンチセンス領域が別の標的核酸分子のヌクレオチド配
列またはその一部と相補的なヌクレオチド配列を含み、センス領域は標的核酸配列または
その一部に相当するヌクレオチド配列を含む、自己相補的なセンス領域およびアンチセン
ス領域を有する二本鎖、非対称二本鎖、ヘアピンまたは非対称ヘアピン二次構造を有する
ポリヌクレオチドであってもよい。siNAは、2つ以上のループ構造と自己相補的なセ
ンス領域およびアンチセンス領域を含むステムとを有する環状一本鎖ポリヌクレオチドで
あってもよく、この場合、アンチセンス領域は標的核酸分子ヌクレオチド配列またはその
一部と相補的なヌクレオチド配列を含み、センス領域は標的核酸配列またはその一部に相
当するヌクレオチド配列を含み、かつ環状ポリヌクレオチドはインビボあるいはインビト
ロでプロセシングを受けてRNAiを媒介する能力がある活性なsiNA分子になること
ができる。siNAは、標的核酸分子のヌクレオチド配列またはその一部と相補的なヌク
レオチド配列を有する一本鎖ポリヌクレオチドをさらに含んでもよく(たとえば、こうし
たsiNA分子には、標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列がsiN
A分子内に存在する必要がない)、一本鎖ポリヌクレオチドは、末端リン酸基、たとえば
5’−リン酸(たとえば、Martinez et al.,2002,Cell,11
0,563−574 and Schwarz et al.,2002,Molecu
lar Cell,10,537−568を参照)、または5’,3’−二リン酸をさら
に含んでもよい。
siRNAは、RNA干渉(RNAi)と呼ばれるプロセスによりmRNAの配列特異
的サイレンシングを誘導する。このプロセスは、哺乳動物および他の脊椎動物を含む多種
多様な生物で起こる。siRNAを調製および投与するための方法、ならびに遺伝子機能
を特異的に不活性化するためのその使用は、公知である。本明細書で使用する場合、si
RNAは、遺伝子発現を阻害またはダウンレギュレートすることができる化学修飾核酸分
子および非修飾核酸分子を含む。siRNA例およびより詳細な説明は、本明細書に援用
する国際公開第2009/126933号パンフレットで確認することができる。
siRNAを被検体に投与するのに使用することができる例示的送達経路は、多く知ら
れている。さらに、siRNAは、当該技術分野において公知の任意の例示的な方法によ
り製剤化することもできる。siRNAの製剤および投与の例およびより詳細な説明は、
本明細書に援用する国際公開第2009/126933号パンフレットで確認することが
できる。
リンカー
モジュール組成物のtetraGalNAcとオリゴヌクレオチドまたはsiRNAと
の間、および/または、ペプチドとオリゴヌクレオチドまたはsiRNAとの間の共有結
合は、リンカーを介してもよい。このリンカーは、用途に応じて切断型でもあるいは非切
断型でもよい。ある種の実施形態では、切断型リンカーは、エンドソームから細胞質への
輸送後にオリゴヌクレオチドを放出するのに使用してもよい。目的のコンジュゲーション
またはカップリング相互作用の性質、または所望の生物学的作用により、どのリンカー基
を選ぶかが決定される。リンカー基は、より複雑な構造を得るため組み合わせても、ある
いは分岐させてもよい。好適なリンカーとして、本明細書に援用する国際公開第2009
/126933号パンフレットに記載されているようなものが挙げられる。
一実施形態では、本発明のリンカーを表1に示す。
Figure 2018083816
別の実施形態では、好ましいリンカーを表2に示す。
Figure 2018083816
市販のリンカーは、前記リンカーの組み合わせを含め、PierceまたはQuant
a Biodesignなど様々な供給業者から入手することができる。さらに、リン酸
結合を介して結合された市販のリンカーを、リンカーとして独立に使用しても、あるいは
前記リンカーと組み合わせて使用してもよい。リンカーはさらに、1〜8個のペプチドを
適合させたより複雑な分岐構造を得るため組み合わせてもよく、そうした一例を下記に図
示する:
Figure 2018083816
ペプチド
二分子膜を用意に通過できない高分子薬剤および親水性薬剤分子の場合、それらの作用
部位への効果的な送達にとって、細胞内のエンドソームコンパートメント/リソソームコ
ンパートメントに取り込まれることが、最大の障害になると考えられる。理論に拘泥する
わけではないが、ペプチドを使用すると、そうしたエンドソームコンパートメント/リソ
ソームコンパートメントからのオリゴヌクレオチドの脱出、または細胞膜を通過するオリ
ゴヌクレオチドのトランスロケーション、および細胞質コンパートメントへの放出が促進
されると考えられる。ある種の実施形態では、本発明のペプチドは、pH依存性膜活性お
よび/または融合性を示し得るポリカチオン性または両親媒性またはポリアニオン性また
は両性イオン性または親油性または中性のペプチドもしくはペプチド模造物でもよい。ペ
プチド模倣物は、ペプチドを模倣するように設計された小さいタンパク質状の鎖であって
もよい。
いくつかの実施形態では、ペプチドは細胞膜透過性剤、好ましくはヘリックス細胞膜透
過性剤である。こうしたペプチドは一般に、細胞膜透過ペプチドと呼ばれる。たとえば、
「Handbook of Cell Penetrating Peptides」E
d.Langel,U.;2007,CRC Press,Boca Raton,Fl
oridaを参照されたい。好ましくは、この成分は両親媒性である。ヘリックス剤は、
好ましくは親油性相および疎油性相を有するα−ヘリックス剤であることが好ましい。細
胞膜透過性剤は、たとえば、細胞膜透過性ペプチド、カチオン性ペプチド、両親媒性ペプ
チド、もしくは、たとえば主にTyr、TrpおよびPheからなる疎水性ペプチド、デ
ンドリマーペプチド、規制されたペプチドあるいは架橋ペプチドであってもよい。細胞膜
透過ペプチドの例として、Tat、ペネトラチンおよびMPGが挙げられる。本発明では
、細胞膜透過ペプチドは、ペプチド、オリゴヌクレオチドおよびタンパク質などの大きな
極性分子を細胞膜を通過して運ぶことができる「送達」ペプチドであり得ると考えられる
。細胞膜透過性ペプチドは、線状でもあるいは環状でもよく、D−アミノ酸、「レトロイ
ンベルソ型」配列、非ペプチドまたは偽ペプチド結合、ペプチジル模倣体が挙げられる。
さらにペプチドおよびペプチド模倣体は、修飾されていてもよく、たとえばグリコシル化
、peg化、またはメチル化されていてもよい。ペプチドの例およびより詳細な説明は、
本明細書に援用する国際公開第2009/126933号パンフレットで確認することが
できる。ペプチドの合成は、当該技術分野において周知である。
ペプチドは、システインまたは他のチオールを含む部分をC末端またはN末端に付加す
ることによりどちらかの末端または両方の末端でコンジュゲートされていてもよい。ペプ
チドは、N末端が官能化されていない場合、アセチル基によりキャップしてもよいし、あ
るいは脂質、PEGまたは標的化部分でキャップしてもよい。ペプチドのC末端がコンジ
ュゲートされていないあるいは官能化されていない場合、ペプチドはアミドとしてキャッ
プしても、あるいは脂質、PEGまたは標的化部分でキャップしてもよい。
本明細書に開示されたコンジュゲートに使用することができる好適なペプチドを下記表
3に列記する。
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
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Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
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Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
表3に示したペプチドのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体およびシステ
インコンジュゲーション点変異体も好適である。
好ましいペプチドを下記表4に列記する。
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
表4に示したペプチドのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体およびシステ
インコンジュゲーション点変異体も好ましい。
標的化リガンド
本発明のモジュール組成物は標的化リガンドを含んでもよい。いくつかの実施形態では
、この標的化リガンドは、モジュール組成物を特定の細胞に誘導することができる。たと
えば、標的化リガンドは、標的細胞の表面上の分子と特異的または非特異的に結合するこ
とができる。標的化部分は、標的細胞に対して特異的親和性を有する分子であってもよい
。標的化部分は、標的細胞の表面に見られるタンパク質に対する抗体、あるいは標的細胞
の表面に見られる分子に対するリガンドまたはリガンドの受容体結合部を含んでもよい。
標的化リガンドの例およびより詳細な説明は、本明細書に援用する国際公開第2009/
126933号パンフレットで確認することができる。
標的化リガンドは、抗体、受容体のリガンド結合部、受容体に対するリガンド、アプタ
マー、D−ガラクトース、N−アセチル−D−ガラクトース(GalNAc)、多価N−
アシチル−D−ガラクトース、D−マンノース、コレステロール、脂肪酸、リポタンパク
質、フォレート、サイロトロピン、メラノトロピン、界面活性剤プロテインA、ムチン、
炭水化物、多価ラクトース、多価ガラクトース、N−アセチル−ガラクトサミン、N−ア
セチル−グルコサミン、多価マンノース、多価フルクトース、グリコシル化ポリアミノ酸
、トランスフェリン、ビスホスホネート、ポリグルタマート、ポリアスパルテート、血漿
タンパク質結合を増強する親油性部分、ステロイド、胆汁酸、ビタミンB12、ビオチン
、RGDペプチド、RGDペプチド模倣体、イブプロフェン、ナプロキセン、アスピリン
、フォレートならびにこれらのアナログおよび誘導体からなる群から選択される。
好ましい標的化リガンドは、D−ガラクトース、N−アセチル−D−ガラクトース(G
alNAc)、GalNAc2およびGalNAc3、コレステロール、フォレート、な
らびにこれらのアナログおよび誘導体からなる群から選択される。
脂質
親油性部分、たとえばコレステロールまたは脂肪酸は、核酸などの高度の親水性分子に
結合すると、血漿タンパク質結合を実質的に増強し、結果として循環半減期を長くするこ
とができる。さらに、親油基は細胞取り込みを促進することもできる。たとえば、脂質は
、特定の血漿タンパク質、たとえばリポタンパク質に結合でき、その結果、対応するリポ
タンパク質受容体(たとえば、LDL受容体またはスカベンジャー受容体SR−B1)を
発現する特定の組織の取り込みを促進することが示されている。親油性コンジュゲートは
、標的送達アプローチと見なすこともでき、その細胞内輸送は、エンドソーム溶解剤との
組み合わせによりさらに強力に促進され得る。
血漿タンパク質結合を増強する例示的な親油性部分には、ステロール、コレステロール
、脂肪酸、コール酸、リトコール酸、ジアルキルグリセリド、ジアシルグリセリド、リン
脂質、スフィンゴ脂質、アダマンタン酢酸、1−ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、
1,3−ビス−O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデ
シルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3−プロパンジオール、ヘプタデシ
ル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3−(オレオイル)リトコール酸、O3−(オレ
オイル)コレン酸、ジメトキシトリチル、フェノキサジン、アスピリン、ナプロキセン、
イブプロフェン、ビタミンEおよびビオチン等があるが、これに限定されるものではない
。脂質の例およびより詳細な説明は、本明細書に援用する国際公開第2009/1269
33号パンフレットで確認することができる。
好ましい脂質はコレステロールである。
可溶化剤
モジュール組成物は、水溶解度の向上、循環半減期の延長および/または細胞取り込み
の促進を行うことができる1個または複数個の他の部分/リガンドを含んでもよい。こう
したものとして、天然に存在する物質、たとえばタンパク質(たとえば、ヒト血清アルブ
ミン(HSA)、低密度リポタンパク質(LDL)、高密度リポタンパク質(HDL)ま
たはグロブリン);または炭水化物(たとえば、デキストラン、プルラン、キチン、キト
サン、イヌリン、シクロデキストリンまたはヒアルロン酸)を挙げることができる。これ
らの部分はまた、組換え分子または合成分子、たとえば合成ポリマーまたは合成ポリアミ
ノ酸であってもよい。例として、ポリリシン(PLL)、ポリL−アスパラギン酸、ポリ
L−グルタミン酸、スチレン−マレイン酸無水物コポリマー、ポリ(L−ラクチド−co
−グリコリド)コポリマー、ジビニルエーテル−無水マレイン酸コポリマー、N−(2−
ヒドロキシプロピル)メタクリルアミドコポリマー(HMPA)、ポリエチレングリコー
ル(PEG、たとえば、PEG−0.5K、PEG−2K、PEG−5K、PEG−10
K、PEG−12K、PEG−15K、PEG−20K、PEG−40K)、メチル−P
EG(mPEG)、[mPEG]2、ポリビニルアルコール(PVA)、ポリウレタン、
ポリ(2エチルアクリル酸)、N−イソプロピルアクリルアミドポリマーまたはポリホス
ファジンが挙げられる。可溶化剤の例およびより詳細な説明は、本明細書に援用する国際
公開第2009/126933号パンフレットで確認することができる。
好ましい可溶化基はPEG0.5K〜30Kである。
処置の方法
一態様では、本発明は、本発明のモジュール組成物の投与から恩恵を受け得る疾患のリ
スクがあるまたはそれに罹患した被検体を処置する方法を特徴とする。本方法は、本発明
のモジュール組成物の投与を必要とする被検体に本発明のモジュール組成物を投与するこ
とにより、被検体を処置することを含む。投与されるオリゴヌクレオチドは、処置対象の
疾患によって異なる。具体的な適応症の処置方法に関するさらなる詳細については、国際
公開第2009/126933号パンフレットを参照されたい。
処方
オリゴヌクレオチド化合物のコンジュゲートを調製するための方法は、多く存在する。
その技術は、当業者によく知られているはずである。そうした反応に関する有用な参考文
献として、Bioconjugate Techniques,Hermanson,G
.T.,Academic Press,San Diego,CA,1996がある。
他の参考文献としては、国際公開第2005/041859号パンフレット;国際公開第
2008/036825号パンフレットおよび国際公開第2009/126933号パン
フレットがある。
本発明について以下の例により詳細に説明するが、以下の例をさらに限定するものと解
釈してはならない。本出願に引用されるすべての参考文献、係属中の特許出願および公開
された特許の内容は、本明細書に明示的に援用する。本明細書に記載されるsiRNAは
、広範に発現する遺伝子SSB(シェーグレン症候群抗原B;NM_009278.4)
を標的とするように設計した。
少なくとも1個の酸素原子、少なくとも1個のリン原子および/または少なくとも1個
の窒素原子を含むいくつかの実施形態では、リンカー基は、連結結合点(LAP)でオリ
ゴヌクレオチド鎖またはsiRNA鎖(単数または複数)と連結することができ、任意の
炭素含有基を含んでもよい。いくつかの実施形態では、リン原子は、オリゴヌクレオチド
鎖の接合点としての役割を果たすことができるリンカー基上の末端リン酸基またはホスホ
ロチオエート基の一部を形成する。ある種の実施形態では、窒素原子は、目的のリンカー
、エンドソーム溶解単位、細胞膜透過ペプチド、可溶化基、脂質、標的化基または別の目
的のリンカー接合点としての役割を果たすことができるリンカー基上の末端エーテル基、
エステル基、アミノ基またはアミド(NHC(O)−)基の一部を形成する。これらの末
端リンカー基には、Cヘキシル部分、C第二級ヒドロキシ部分、Cチオール部分ま
たはCチオール部分があるが、これに限定されるものではない。下記に記載するRNA
配列の一例として、C6ヘキシル:[(CHNH]がある。
本明細書の実施例に記載したsiRNA配列を表5に示す。
Figure 2018083816
Figure 2018083816
tetraGalNAcリガンドおよびtetraGalNAc−siRNAコンジュ
ゲートの調製について、下記の例および合成スキームに記載する。下記のsiRNAの記
載は説明を目的としたものであることに留意されたい。具体的な配列情報は表5で確認す
ることができる。
セクションA
実施例1〜2
TetraGalNAcリガンド化合物A9およびA10の合成
以下のスキーム1を用いてTetraGalNAc化合物9および10を調製した。
スキーム1
Figure 2018083816
(2S)−2,6−ビス[ビス(プロプ−2−イン−1−イル)アミノ]ヘキサン酸(化
合物A1)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した2000mL 3口丸底フラスコに、(2S
)−2,6−ジアミノヘキサン酸(50g、342.03mmol、1.00当量)をア
セトニトリル(1000mL)に溶かした溶液を入れ、50℃に加熱した。これに水酸化
カリウム(22.6g、0.4025mol、1.00当量、85%)を加えた。得られ
た溶液を30分間撹拌した。次いで3−ブロモプロプ−1−イン(29.5mL、1.0
0当量)を加えた。得られた溶液を50℃で1時間撹拌した。追加の水酸化カリウム(2
2.6g、0.4025mol、1.00当量)をこの溶液に加え、50℃で30分間撹
拌した。これに3−ブロモプロプ−1−イン(29.5mL、1.00当量)を加えた。
得られた溶液を1時間撹拌した。これに水酸化カリウム(22.6g、0.4025mo
l、1.00当量)を再度加えた。得られた溶液を50℃で30分間撹拌し、続いてさら
に3−ブロモプロプ−1−イン(29.5mL、1.00当量)を加えた。得られた溶液
を1時間撹拌した。これに水酸化カリウム(22.6g、0.4025mol、1.00
当量)を加えた。得られた溶液を30分間撹拌した。これに3−ブロモプロプ−1−イン
(29.5mL、1.00当量)を加えた。得られた溶液を3時間撹拌した。反応混合物
を水/氷浴で25℃まで冷却した。固体を濾去した。濾液をHCl(6M)でpH4に調
整した。固体を濾去した。濾液を真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムに供し、ジ
クロロメタン/メタノール(100:1〜25:1)で溶出した。この結果、(2S)−
2,6−ビス[ビス(プロプ−2−イン−1−イル)アミノ]ヘキサン酸(化合物A1)
を淡黄色の油として得た。
MS(ES,m/z):297.2,[M−H] HNMR(CDCl,500M
Hz,ppm):3.62(d,J=2.0Hz,4H),3.52−3.49(m,1
H),3.50(d,J=2.4Hz,4H),2.62(t,J=7.1Hz,2H)
,2.30(t,J=2.4Hz,2H),2.27(t,J=2.4Hz,2H),1
.88−1.79(m,2H),1.60−1.53(m,2H),1.52−1.43
(m,2H)。
2−(2−ヒドロキシエトキシ)エチル4−メチルベンゼンスルホネート(化合物A3)
の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した2000mL 3口丸底フラスコに、2−(
2−ヒドロキシエトキシ)エタン−1−オール(A2、42.4g、399.55mmo
l、1.00当量)をジクロロメタン(1000mL)に溶かした溶液およびトリエチル
アミン(27.9g、275.72mmol、0.25当量)を入れた。上記にp−トル
エンスルホニルクロリド(19.1g、100.18mmol、0.50当量)を加えた
。25℃で1時間撹拌後、得られた混合物を1×500mLのカリウムヒドロスルファー
ト水溶液(1M)および1×500mLの炭酸水素ナトリウム水溶液(5%)でそれぞれ
で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残渣をシリカ
ゲルカラムに供し、ジクロロメタン/メタノール(100:1)で溶出した。この結果、
2−(2−ヒドロキシエトキシ)エチル4−メチルベンゼンスルホネート(化合物A3)
を無色油として得た。
2−(2−アジドエトキシ)エタン−1−オール(化合物A4)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した500mL 丸底フラスコに、2−(2−[
[(4−2−(2−ヒドロキシエトキシ)エチル4−メチルベンゼンスルホネート(A3
、50g、192.08mmol、1.00当量)をN,N−ジメチルホルムアミド(2
50mL)に溶かした溶液を入れた。これに続いてアジ化ナトリウム(18.79g、2
89.03mmol、1.50当量)を25℃で加えた。得られた溶液を油浴にて100
℃で5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残液を
1000mLのジクロロメタンで希釈し、1×500mLの水で洗浄した。有機層を無水
硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムに供し、ジクロ
ロメタン/メタノール(80:1)で溶出した。この結果、2−(2−アジドエトキシ)
エタン−1−オール(化合物A4)を無色油として得た。
HNMR(CDCl,400MHz,ppm):3.42−3.45(t,J=4.
8Hz,2H),3.63−3.65(t,J=4.8Hz,2H),3.71−3.7
4(t,J=4.8Hz,2H),3.71−3.79(m,2H)。
(3R,4R,5R,6R)−3−アセトアミド−6−(アセトキシメチル)テトラヒド
ロ−2H−ピラン−2,4,5−トリイルトリアセテート(化合物A6)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した2000mL 3口丸底フラスコに、(3R
,4R,5R,6R)−3−アミノ−6−(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ−2H−ピ
ラン−2,4,5−トリオールヒドロクロリド(A5、120g、556.50mmol
、1.00当量)をピリジン(1200mL)に溶かした溶液を入れた。これに続いて酢
酸無水物(341.6g、3.35mol、6.00当量)を0℃で撹拌しながら滴下し
て加えた。得られた溶液を一晩25℃で撹拌した。次いで8000mLの水/氷を加えて
反応をクエンチした。この固体を濾過により集めた。この結果、(3R,4R,5R,6
R)−3−アセトアミド−6−(アセトキシメチル)テトラヒドロ−2H−ピラン−2,
4,5−トリイルトリアセテート(化合物A6)を白色固体として得た。
(3aR,5R,6R,7R,7aR)−5−(アセトキシメチル)−2−メチル−5,
6,7,7a−テトラヒドロ−3aH−ピラノ[3,2−d]オキサゾール−6,7−ジ
イルジアセテート(化合物A7)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した2000mL 丸底フラスコに、(3R,4
R,5R,6R)−3−アセトアミド−6−(アセトキシメチル)テトラヒドロ−2H−
ピラン−2,4,5−トリイルトリアセテート(A6、30g、77.05mmol、1
.00当量)をジクロロメタン(1500mL)に溶かした溶液を入れ、次いで鉄(II
I)クロリド(30g、184.95mmol、2.40当量)を加えた。得られた混合
物を25℃で2時間撹拌した。次いで1000mLの水/氷を加えて反応をクエンチした
。有機層を1×1000mLの炭酸水素ナトリウム水溶液および1×1000mLの水で
洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。この結果、(3aR,5R
,6R,7R,7aR)−5−(アセトキシメチル)−2−メチル−5,6,7,7a−
テトラヒドロ−3aH−ピラノ[3,2−d]オキサゾール−6,7−ジイルジアセテー
ト(化合物A7)を黄色油として得た。
HNMR(CDCl,300MHz,ppm):2.03(s,9H),2.12(
s,3H),3.97−4.27(m,4H),4.90−4.93(m,J=3.3H
z,1H),5.45−5.47(t,J=3.0Hz,1H),5.98−6.00(
d,J=6.6Hz,1H)。
(2R,3R,4R,5R,6R)−5−アセトアミド−2−(アセトキシメチル)−6
−[2−(2−アジドエトキシ)エトキシ]テトラヒドロ−2H−ピラン−3,4−ジイ
ルジアセテート(化合物A8)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した500mL 丸底フラスコに、(3aR,5
R,6R,7R,7aR)−5−(アセトキシメチル)−2−メチル−5,6,7,7a
−テトラヒドロ−3aH−ピラノ[3,2−d]オキサゾール−6,7−ジイルジアセテ
ート(A7、40g、121.47mmol、1.00当量)を1,2−ジクロロエタン
(200mL)に溶かした溶液、2−(2−アジドエトキシ)エタン−1−オール(A4
、23.89g、182.18mmol、1.50当量)を入れた。上記に数個の4Aゼ
オライトを加えた。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。次いでトリメチルシリル
トリフルオロメタンスルホネート(10.8mL、0.50当量)を加えた。25℃で一
晩撹拌後、反応混合物を500mLのジクロロメタンで希釈し、1×500mLの水、1
×500mLの炭酸水素ナトリウム水溶液および1×500mLの水で洗浄した。有機層
を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムに供し、
ジクロロメタン/メタノール(100:1)で溶出した。この結果、(2R,3R,4R
,5R,6R)−5−アセトアミド−2−(アセトキシメチル)−6−[2−(2−アジ
ドエトキシ)エトキシ]テトラヒドロ−2H−ピラン−3,4−ジイルジアセテート(A
8)を無色油として得た。
MS(m/z):461.1,[M+H]
HNMR(CDCl,500MHz,ppm)5.78(d,J=8.90Hz,1
H),5.36(d,J=2.9Hz,1H),5.22(dd,J=11.2,3.6
Hz,1H),4.77(d,J=8.3Hz,1H),4.19−4.12(m,2H
),4.11−4.05(m,1H),3.98−3.92(m,2H),3.82−3
.78(m,1H),3.71−3.63(m,4H),3.49−3.38(m,2H
),2.16(s,3H),2.05(s,3H),2.01(s,3H),1.97(
s,3H)。
(S)−2,6−ビス(ビス((1−(2−(2−(((2R,3R,4R,5R,6R
)−3−アセトアミド−4,5−ジアセトキシ−6−(アセトキシメチル)テトラヒドロ
−2H−ピラン−2−イル)オキシ)エトキシ)エチル)−1H−1,2,3−トリアゾ
ール−4−イル)メチル)アミノ)ヘキサン酸(化合物A9、tetraGalNAcア
セテート)(A9)(Ex.1)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した250mL 丸底フラスコに、(2S)−2
,6−ビス[ビス(プロプ−2−イン−1−イル)アミノ]ヘキサン酸(A1、1.0g
、1.0当量)、(2R,3R,4R,5R,6R)−5−アセトアミド−2−(アセト
キシメチル)−6−[2−(2−アジドエトキシ)エトキシ]テトラヒドロ−2H−ピラ
ン−3,4−ジイルジアセテート(A8、9.26g、6.0当量)、無水THF50m
L、CuBrSMe(0.138g、0.20当量)、および無水DBU(1.5m
l、3.0当量)をそれぞれ順番に仕込んだ。得られた溶液を室温で16時間撹拌し、酢
酸(0.75mL、4.0当量)でクエンチし、MP−TMT樹脂(Part No:8
01472、Biotage製)(9g)で処理し、室温で16時間熟成させ、濾過し、
濾液を濃縮して泡状固体とした。次いでこの固体をCHCl(140mL)に溶解さ
せ、AcOH/NaCl溶液(140mL)で洗浄した。AcOH/NaCl溶液は、1
mL AcOHおよび100mL 20%NaCl溶液で調製した。下層の有機層を濃縮
し、SiOカラム(220g)で精製し、CHCl/MeOHで溶出した。この結
果、(S)−2,6−ビス(ビス((1−(2−(2−(((2R,3R,4R,5R,
6R)−3−アセトアミド−4,5−ジアセトキシ−6−(アセトキシメチル)テトラヒ
ドロ−2H−ピラン−2−イル)オキシ)エトキシ)エチル)−1H−1,2,3−トリ
アゾール−4−イル)メチル)アミノ)ヘキサン酸(化合物A9)を白色固体として得た

MS(m/z):2139.5,[M+H]
(S)−2,6−ビス(ビス((1−(2−(2−(((2R,3R,4R,5R,6R
)−3−アセトアミド−4,5−ジヒドロキシ−6−(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ
−2H−ピラン−2−イル)オキシ)エトキシ)エチル)−1H−1,2,3−トリアゾ
ール−4−イル)メチル)アミノ)ヘキサン酸(化合物A10、TetraGalNAc
)(A10)(Ex.2)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した250mL 丸底フラスコに、(S)−2,
6−ビス(ビス((1−(2−(2−(((2R,3R,4R,5R,6R)−3−アセ
トアミド−4,5−ジアセトキシ−6−(アセトキシメチル)テトラヒドロ−2H−ピラ
ン−2−イル)オキシ)エトキシ)エチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−4−イ
ル)メチル)アミノ)ヘキサン酸(A9、6.9g、1.0当量)、NaCO(6.
83g、20当量)、水(56mL)およびMeOH(32mL)をそれぞれ順番に仕込
んだ。反応を室温で16時間熟成させ、濃縮して残渣を得、水(50mL)に再溶解させ
、Combiflash C18 gold逆相カラム(415g)で精製し、水/Me
CNで溶出した。真空下で濃縮後、生成物を最小量の水に溶解させ、凍結乾燥して(S)
−2,6−ビス(ビス((1−(2−(2−(((2R,3R,4R,5R,6R)−3
−アセトアミド−4,5−ジヒドロキシ−6−(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ−2H
−ピラン−2−イル)オキシ)エトキシ)エチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−
4−イル)メチル)アミノ)ヘキサン酸(化合物A10)を白色固体として得た。
MS(m/z):1657[M+Na]
HNMR(DO,500MHz,ppm):8.05(s,2H),7.91(s,
2H),4.62(t,J=5.0Hz,4H),4.57(t,J=5.0Hz,4H
),4.45−4.41(d,J=8.6Hz,4H),3.99−3.82(m,28
H),3.80−3.61(m,28H),3.14(t,J =7.1Hz,1H),
2.52(broad s,2H),1.99(s,6H),1.98(s,6H),1
.73(m,2H),1.60(m,2H),1.29(m,2H)。
セクションB
B2〜B5の調製
実施例3〜6
図5A−1〜図5Dに示したスキーム2を使用して、Bコンジュゲート(Ex.3〜6
)を調製した。
B2(Ex.3)の合成
A10(86mg、0.053mmol)およびDIEA(57.6μL、0.330
mmol)をDMSO(500μL)に溶解させ、次いでHATU(301μL、0.0
79mmol)の溶液に加え、15分間撹拌した。出発材料パッセンジャー鎖B1(10
1mg、0.013mmol)を水(168μL)およびDMSO(1.5mL)に溶解
させた。HATU溶液をRNA溶液に加え、15分間熟成させた。反応混合物を水(50
mL)で希釈し、3k膜を通して水に対して3回遠心透析した。濃縮物を、Dionix
ProPac SAX 22×250mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成
物を95%A(2:3 HO:2,2,2−トリフルオロエタノール、20mM TE
A)から40%溶媒B(2:3 HO:2,2,2−トリフルオロエタノール、20m
M TEA、1M CsCl)までグラジエント溶出した。画分を水で希釈して2,2,
2−トリフルオロエタノール含量を25%まで下げ、3k膜を通して水に対して3回遠心
透析した。濃縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た。Expecte
d mass:9267.5,found mass:9267.0
B3(Ex.4)の合成
B2(606mg、0.065mmol)を水(32mL)に溶かした溶液に、TEA
A(1.64mL、2M)、DTT水溶液(0.65mL、1M)およびTEA(0.6
5mL、4.69mmol)を加えた。反応混合物を10分間熟成させた。次いで反応混
合物を水で希釈し、3k膜を通して水に対して3回遠心透析した。濃縮物は、さらに単離
することなく次に使用した。Expected mass:9177.4,found
mass:9179.0
B4(Ex.5)の合成
B3(350mg、0.038mmol)を水(3mL)に溶かした溶液に、N−(2
−アミノエチル)−マレイミドトリフルオロアセテート塩(194mg、0.763mm
ol)を加えた。反応混合物を30分間熟成させ、その後反応混合物を、RP−HPLC
(95:5〜5:95% A:B直線グラジエント(A=100mM TEAA水溶液;
B=100mM TEAAのアセトニトリル溶液)Waters Phenyl xbr
idge Columnにより精製した。B4を含む画分を、3k膜を通して水に対して
3回遠心透析し、濃縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た。
B5(Ex.6)の合成
B4(286mg、0.031mmol)を炭酸水素ナトリウム水(3.0mL、20
0mM)に溶かした溶液に、NHS−dPEG12−SPDP(280mg、0.307
mmol)をアセトニトリル(0.5mL)に溶かした溶液を加えた。反応混合物を30
分間熟成させ、その後反応混合物をTEAA水溶液(1.0mL、2M)で処理し、RP
−HPLC(95:5〜5:95% A:B直線グラジエント(A=100mM TEA
A水溶液;B=100mM TEAAのアセトニトリル溶液)Waters Pheny
l xbridge Columnにより精製した。B5を含む画分を、3K膜を通して
水に対して3回遠心透析し、濃縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た
。Measured mass=10117
実施例7〜8
B6−seq32の調製
図6A〜図6Bに示すスキーム3を用いてコンジュゲートB6−P32およびB8−s
eq32(Ex.7〜8)を調製した。
コンジュゲートB6−seq32(Ex.7)の合成
B5(50mg、5umol、1当量)を、50mM AcOHを含む2,2,2−ト
リフルオロエタノール(5mL)に溶解させた。ペプチドSeq32(51mg、13u
mol、2.5当量)をグアニジン−HCl(8M、500uL)に溶解させ、50mM
AcOHを含む2,2,2−トリフルオロエタノール(5mL)で希釈した。ペプチド
溶液を撹拌RNA溶液に5分にわたり滴下して加え、反応を室温で1時間放置した。反応
をホルムアミド(10mL)で希釈し、反応混合物の1.5mLのアリコートを、Dio
nex ProPac SAX−10 22×250mmカラムを装着したHPLCに充
填した。生成物を、20mL/分で10分かけて98%溶媒A(2:3 HO:2,2
,2−トリフルオロエタノール、40mM TEA)から35%溶媒B(2:3 H
:2,2,2−トリフルオロエタノール、40mM TEA、1M グアニジン−HCl
)までグラジエント溶出した。画分を水で希釈して2,2,2−トリフルオロエタノール
含量を25%まで下げ、10k膜を通して水に対して3回遠心透析した。濃縮物を凍結乾
燥して生成物をアモルファス固体として得た。Expected mass:13961
.9,found mass:13962.0
コンジュゲートB8−seq32−b(Ex.8)の合成
ガイド鎖(B7、17.7mg)を水(5mL)に溶解させ、B6−seq42(36
.2mg)を含むバイアルに加えた。溶液を十分に混合し、室温で2時間放置した。溶液
を凍結乾燥して二本鎖をアモルファス固体として得た。
追加のB8−ペプチドコンジュゲートの合成
B8およびペプチド配列および二本鎖の追加のコンジュゲートをB8−seq32−b
に使用したのと類似の方法で調製した。
実施例9〜11
B9およびB10−seq32およびB11−seq32の調製
図7A、図7Bおよび図7Cに示したようなスキーム4を用いてB9、B10−seq
32およびB11−seq32を調製した。
B9(Ex.9)の合成
化合物B3(120mg、0.0132mmol)を含む水(5mL)を、2,2’−
ジピリジルジスルフィド(29mg、0.132mmol、10当量)をメタノール(5
mL)に溶解させた撹拌溶液に滴下して加えた。溶液を水で希釈してメタノール含量を2
0%とし、3K膜を通して水に対して3回遠心透析した。濃縮物を凍結乾燥して生成物を
白色アモルファス固体として得た。Expected mass:9166.5,fou
nd mass:9165.5
B10−seq32(Ex.10)の合成
B9(15mg、1.615umol)を水(150uL)に溶解させ、50mM A
cOHを含むTFE(1.5mL)で希釈した。別のバイアルに、P32(8.79mg
、2.155umol)を8M グアニジンHCl(60uL)に溶解させ、50mM
AcOHを含むTFE(1.5mL)で希釈し、次いでRNA溶液に加えた。反応混合物
を15分間熟成させ、次いでホルムアミドで希釈し、AEX(95:5〜55:45 A
:B直線グラジエント(A=20mM TEAを含む60%TFE水溶液;B=1M C
sClおよび20mM TEAを含む60%TFE水溶液)、Dionix Propa
cカラムにより精製した。B10−Seq32を含む画分を、10K膜を通して水に対し
て3回遠心透析し、濃縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た。
B11−seq32−b(Ex.11)の合成
B10−seq32(9.68mg、0.730umol)を、B7(5.00mg、
0.730umol)をPBS(500uL)に溶解させた溶液で処理し、30分間熟成
させた。過剰のガイド鎖をAEX精製(95:5〜55:45 A:B直線グラジエント
(A=20mM TEAを含む60%TFE水溶液;B=1M CsClおよび20mM
TEAを含む60%TFE水溶液)、Dionix Propacカラムにより除去し
た。B11−seq32を含む画分を、10K膜を通して水に対して3回遠心透析し、濃
縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た。
実施例12〜14
B11−ペプチドコンジュゲートの追加合成。
B11およびペプチド配列および対応する二本鎖の追加のコンジュゲートを、B11−
seq32−bに使用したのと類似の方法で調製した。
スキーム5を図7D、図7Eおよび図7Fに示す。
B12(Ex.12):の合成
別々のバイアルに、B3(50mg、5.4μmol)を水(3mL、約17mg/m
L)に溶解させ、化合物1,1,1’−(エタン−1,2−ジイル)ビス(1H−ピロー
ル−2,5−ジオン)、(16mg、0.073mmol)をDMF(1.2mL)に溶
解させた。B3溶液を化合物1溶液に加え、10分間撹拌した。反応を水で15mLに希
釈し、次いで3K MWCO膜で水に対して4回透析した。次いで反応を濾過し(0.2
2μmシリンジフィルター)、凍結乾燥して白色固体、B12を得た。Expected
mass:9397.535。Observed mass:9400.0。
B12−seq13(Ex.13)の合成:反応手順に関するB10−seq32の合
成を参照されたい。
B12−seq13。Expected mass:13518.215
B13−seq13−b(Ex.14)の合成:反応手順に関するB11−seq32
の合成を参照されたい。
B13−seq13−b。Expected mass:20370.215
B13−ペプチドコンジュゲートの追加合成。
B13およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをB13−seq13に使用したの
と類似の方法で調製した。
実施例15〜16
B15−seq32およびB16−seq32−bの調製
図7G−1〜図7G−2に示したスキーム6を用いてB16−seq32およびB17
−seq32−bを調製した。
B14の合成
B3(100mg、10.9μmol)を水(10mL)およびジオキサン(20mL
)に溶解させ、ジオキサン(3.8mL)に溶解させたビスマレイミドで処理して濁った
混合物を得た。反応を1.5時間撹拌し、その後反応をN−メチルマレイミド(36.3
mg、0.327mmol)でクエンチした。反応混合物を水で希釈し、3k膜を通して
水に対して1回遠心透析した。濃縮物を濾過し、RP−HPLC(95:5〜5:95%
A:B直線グラジエント(A=100mM TEAA水溶液;B=100mM TEA
Aのアセトニトリル溶液)Waters Phenyl xbridge Column
)により精製した。生成物を含む画分を透析し、凍結乾燥してB14を白色アモルファス
粉末として得た。Measured mass=9531
B15−seq32(Ex.15)の合成
B14(5mg、0.524μmol)をホルムアミド溶液(2M チオ尿素、50m
M MES緩衝液(pH6.5)、500μL)に溶解させた。別のバイアルに、ペプチ
ド配列32(4.28mg、1.048μmol)をホルムアミド溶液(2M チオ尿素
、50mM MES緩衝液(pH6.5)、500μL)に溶解させ、次いでRNA溶液
に加えた。室温で1時間熟成後、反応混合物を、Dionex ProPac SAX−
10 22×250mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、20mL/分
で10分かけて98%溶媒A(2:3 H2O:2,2,2−トリフルオロエタノール、
40mM TEA)から35%溶媒B(2:3 H2O:2,2,2−トリフルオロエタ
ノール、40mM TEA、1M グアニジン−HCl)までグラジエント溶出した。画
分を水で希釈して2,2,2−トリフルオロエタノール含量を25%まで下げ、10k膜
を通して水に対して3回遠心透析した。濃縮物を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体
として得た。
B16−seq32−b(Ex.16)の合成
B15−seq32(2.11mg、0.155μmol)を、B7(1.062mg
、0.155μmol)を水(212μL)に溶かした溶液で処理し、室温で2時間熟成
させた。溶液を凍結乾燥して生成物をアモルファス固体として得た。
セクションC
実施例17〜21
C1〜C3、C4−seq32およびC6−seq32の調製
図8A〜図8Dに示したようなスキーム7を用いてC1〜C3、C4−seq32およ
びC6−seq32を調製した。
C1(Ex.17)の合成
1,2−ジアミノドデカン(100mg、0.499mmol)をクロロホルム(3.
3mL)に溶解させ、0℃まで冷却し、次いでN−メトキシカルボニル−マレイミド(2
34mg、1.50mmol)および硫酸水素テトラブチルアンモニウム(170mg、
0.499mmol)で処理した。DIPEA(209uL、1.20mmol)をゆっ
くりと加え、反応を0℃で10分間熟成させた。氷浴を除去し、反応を飽和炭酸水素ナト
リウム水溶液(6.6mL)で処理した。室温で3.5時間熟成後、反応混合物を酢酸エ
チルで抽出した(3×15mL)。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、次いで
溶媒を真空除去した。粗生成物を、100:0〜0:100% A:B直線グラジエント
(A=ヘキサン;B=酢酸エチル)を用いたフラッシュクロマトグラフィーにより精製し
た。生成物を含む画分をプールし、濃縮してC1を白色微粉末として得た。H NMR
(CDCl):1.24−1.28(m,12H),1.55−1.61(m,4H)
,3.50(t,4H J=7.4Hz),6.68(s,4H).Measured
mass=361。
C2(Ex.18)の合成
ステップ1。3’Hamino5’C6ジスルフィドsiRNA(46.9mg、6.
16μmol)を9:1 DMSO/水(782μl)に溶解させた。TetraGal
NAc(40.0mg、0.025mmol)およびDIEA(26.9μl、0.15
4mmol)をDMSO(200μl)に溶解させ、次いでHATU(14.0mg、0
.037mmol)をDMSO(141μL)に溶かした溶液を加え、室温で15分間撹
拌した。この溶液をRNA溶液に加え、30分間熟成させた。反応をDI水で希釈し、1
回透析してDMSOを除去し、AEX(95:5〜65:35 A:B直線グラジエント
(A=20mM TEAを含む60%TFE水溶液;B=1M CsClおよび20mM
TEAを含む60%TFE水溶液)、Dionix Propacカラム)により精製
した。生成物を含む画分をプールし、透析して凍結乾燥した。Measured mas
s=9233。
ステップ2。この固体(30.8mg、3.34μmol)にTCEP(19.13m
g、0.067mmol)およびDI水(2mL)を加えた。反応を室温で1時間撹拌し
、次いで5℃で一晩熟成させた。反応をDI水で希釈し、DI水に対して2回透析してC
2の溶液を得て、さらに単離することなくその後の反応に使用した。
C3(Ex.19)の合成
DI水(37mL)に溶解させたC2(60.1mg、6.60umol、B3と類似
の方法で調製)を、DMF(7mL)に溶解させたC1(23.8mg、66.0umo
l)で処理して濁った溶液を得た。反応を一晩熟成させ、この時点でジオキサン(18m
L)を加えて反応混合物を可溶化した。さらに30分間熟成後、反応をDI水で希釈した
。次いでそれをDI水に対して1回透析して、濾過し、RP−HPLC(95:5〜5:
95% A:B直線グラジエント(A=100mM TEAA水溶液;B=100mM
TEAAのアセトニトリル溶液)Waters Phenyl xbridge Col
umn)により精製した。生成物を含む画分を透析し、凍結乾燥してC3を白色アモルフ
ァス粉末として得た。Measured mass=9458。
C4−seq32(Ex.20)の合成
C3(10mg、1.057umol)を20mM MES緩衝液および2M チオ尿
素で変性させたホルムアミド(1mL)に溶解させ、P32(8.62mg、2.11u
mol)に加えた。20分後、LC−MSにより、所望の生成物への十分な変換が確認さ
れた。反応を、AEX(95:5〜55:45 A:B直線グラジエント(A=20mM
TEAを含む60%TFE水溶液;B=1M CsClおよび20mM TEAを含む
60%TFE水溶液)、Dionix Propacカラム)により精製した。生成物を
含む画分を透析してC4−P32を得た。
C6−seq32−(Ex.21)の合成
DI水(3.40mL)に溶解させたC4(6.78mg、0.501μmol)を、
DI水(530μL)に溶解させたガイド鎖C5(3.44mg、0.501μmol)
で処理した。分析用SAXにより、過剰のガイド鎖が若干観察されたが、二本鎖の十分な
純度が確認された。溶液を凍結乾燥してC6を白色アモルファス粉末として得た。Mea
sured mass=パッセンジャー鎖:13539,ガイド鎖:6869。
C6−ペプチドコンジュゲートの追加合成。
C6およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをC6−seq32−cに使用したの
と類似の方法で調製した。
実施例22〜27
C7〜C10、C11−P32およびC12−seq32−aの調製
図9A〜図9Eに示したようなスキーム8を用いてC7〜C10、C11−seq32
およびC12−seq32を調製した。
C7(Ex.22)の合成
イコサン二酸(600mg、1.752mmol)をトルエン(11mL)に懸濁し、
DIEA(673μL、3.85mmol)およびDPPA(793uL、3.68mm
ol)で処理した。室温で30分間撹拌後、反応を80℃まで加熱し、次いで2時間穏や
かに還流させた。反応を冷却し、tBuOH(1.675mL、17.52mmol)お
よびヨウ化銅(200mg、1.051mmol)で処理し、再び加熱してさらに2時間
還流させた。反応を冷却し(沈殿が観察された)、DCMで希釈し、濾過し、真空中で濃
縮した。粗生成物を、100:0〜0:50% A:B直線グラジエント(A=ヘキサン
;B=酢酸エチル)を用いたフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。生成物を含
む画分をプールし、濃縮してC7を得た。Measured mass=486。
C8(Ex.23)の合成
C7(101mg、0.208mmol)をDCM(20mL)に溶解させ、TFA(
20mL)で処理した。反応を5分間熟成させ、その後溶媒およびTFAを真空除去して
C8を無色油状固体として得て、さらに精製することなく使用した。Measured
mass=286。
C9(Ex.24)の合成
C8(100.0mg、0.209mmol)をクロロホルム(28mL)に懸濁し、
硫酸水素テトラブチルアンモニウム(70.9mg、0.209mmol)、N−メトキ
シカルボニルマレイミド(98.0mg、0.631mmol)およびDIEA(88.
0μL、0.502mmol)で処理した。飽和炭酸水素ナトリウム(28mL)を加え
た。反応を25時間激しく撹拌し、その後反応を3×50mL DCMで抽出した。合わ
せた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、次いで蒸発乾固した。粗生成物を、100:0
〜0:50% A:B直線グラジエント(A=ヘキサン;B=酢酸エチル)を用いたフラ
ッシュクロマトグラフィーにより精製した。所望の生成物を含む画分を合わせ、蒸発させ
てC9を得た。H NMR(CDCl):1.24−1.26(m,28H),1.
55−1.59(m,4H),3.50(t,4H J=7.4Hz),6.68(s,
4H)。Measured mass =445。
C10(Ex.25)の合成
C2(12.0mg、1.31μmol)を1:3 水:ジオキサン(14.4mL)
に溶解させ、1.4mL ジオキサンに溶解させたC9(5.8mg、13.1μmol
)で処理した。一晩熟成後、反応をN−メチルマレイミド(4.38mg、39.4μm
ol)でクエンチし、DI水で希釈した。粗反応をDI水に対して1回透析し、濾過し、
RP−HPLC(95:5〜5:95% A:B直線グラジエント(A=100mM T
EAA水溶液;B=100mM TEAAのアセトニトリル溶液)Waters Phe
nyl xbridge Column)により精製した。生成物を含む画分をDI水に
対して透析し、凍結乾燥してC10を得た。Measured mass:9546。
C11−seq32およびC12−seq32−c(Ex.26およびEx.27)の合

コンジュゲートC11−seq32およびC12−seq32−cをC4−seq32
およびC6−seq32に使用したのと類似の方法で調製した。
C12−ペプチドコンジュゲートの追加合成
C12およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをC12−seq32に使用したの
と類似の方法で調製した。
セクションD
実施例28〜30
C13、C14−seq32およびC15−seq32の調製
図10A〜図10Dに示したスキーム9を用いてC13、C14−seq32およびC
15−seq32−aを調製した。
C13(Ex.28)の合成
DI水(3.5mL)に溶解させたC2(11mg、1.22μmol)を、DMF(
270μL)に溶解させたC2ビスマレイミド(2.69mg、12.20umol)で
処理した。1時間後、LC−MSにより、所望の生成物への十分な変換が確認された。反
応をDI水に対して3回透析し、凍結乾燥してC13を得た。Measured mas
s:9317。
C14−seq32(Ex.29)の合成
C13(10.53mg、1.13μmol)をDI水(50μL)に溶解させ、50
mM AcOH(2.0mL)で変性させたTFEで希釈し、次いで8M 塩酸グアニジ
ン(60μL)に溶解させたseq32(9.22mg、2.26μmol)に加えた。
反応を10分間熟成させた。反応を、AEX(95:5〜55:45 A:B直線グラジ
エント(A=20mM TEAを含む60%TFE水溶液;B=1M CsClおよび2
0mM TEAを含む60%TFE水溶液)、Dionix Propacカラム)によ
り精製した。生成物を含む画分を透析してC14−seq32を得た。
C15−seq32−c(Ex.30)の合成
DI水(2.6mL)に溶解させたC14−seq32(9.81mg、0.738μ
mol)を、DI水(751μL)に溶解させたガイド鎖C5(7.76mg、0.73
8μmol)で処理した。溶液を凍結乾燥して所望の生成物C15−seq32−cを得
た。Measured mass=パッセンジャー鎖:13396,ガイド鎖:6868
C15−ペプチドコンジュゲートの追加合成
C15およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをC15−seq32に使用したの
と類似の方法で調製した。
実施例31〜33
D1、D3およびD4の調製
図11A〜図11Dに示したようなスキーム10を用いてD1、D3およびD4を調製
した。
D1(Ex.31)の合成
NHSエステル(100.0mg、0.320mmol)を0.5mL 無水DCEに
溶かした溶液に、アジドアミン(253.0mg、0.480mmol)を含む0.5m
L 無水DCEおよび1.5当量のトリエチルアミンに加えた。得られた溶液を室温で1
時間撹拌し、反応混合物をシリカカラムに充填し、25分かけてMeOH/DCM=0/
100〜10/90で溶出した。集めた画分をLC−MS解析に供し、その結果により、
>95%純度が確認された。
D3(Ex.32)の合成
オリゴヌクレオチドD2(10mg、1.3μmol)およびアジドリンカーD1(5
.6mg、7.8μmol)を、エッペンドルフチューブ中の脱気3:1 DMA/水(
1000μL)に溶解させ、次いでこの反応混合物に、臭化銅(I)−ジメチルスルフィ
ド(0.05mg、0.26μmol)を脱気MeCN(100μL)に溶かした溶液を
加えた。40℃で60分後、D2が完全に消費されたことがLC−MSによりモニターさ
れた。反応混合物を0.4M EDTA(5mL)で希釈し、さらに15分間撹拌し、次
いでMillipore 3K膜を使用して水に対して透析し、RP HPLC(5%〜
60%Aを含むB、A:100mM TEAAを含むMeCN、B:100mM TEA
Aを含む水)により精製した。生成物画分を水に対して透析し、凍結乾燥してD3を白色
粉末として得た。
D4(Ex.33)の合成
TetraGalNAc A10(5.7mg、3.5μmol)、HATU(2.0
mg、5.2μmol)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(1.8mg、14μm
ol)をDMSO(100μL)に溶解させた。10分後、活性化エステルを、DMF(
350μL)および水(50μL)中のオリゴヌクレオチドD3(6.4mg、0.70
μmol)に加えた。得られた反応混合物を15分間撹拌し、水を加えてクエンチし、次
いでRP HPLC(5%〜60%Aを含むB、A:100mM TEAAを含むMeC
N、B:100mM TEAAを含む水)により精製した。生成物画分を水に対して透析
し、凍結乾燥してR3をより白色の粉末として得た。
実施例34〜35
D5−seq32およびD7−seq32の調製
図12A−1〜図12B−2に示したようなスキーム11を用いてD5−seq32お
よびD7−seq32を調製した。
D5−seq32(Ex.34)の合成
オリゴヌクレオチドD4(6.5mg、0.60μmol)を含む200μL ホルム
アミド/pH=6.8 トリス緩衝液=3/1を、ペプチドseq32(9.8mg、2
.4μmol)を含む200μLの同じ緩衝液で処理し、反応混合物を1時間撹拌した。
反応を、ホルムアミド2.5mLを加えて希釈し、Sepax Proteomix S
AX NP10、21.2×50mmカラム(8分かけて2%〜30%Bを含むA、A:
60:40 トリフルオロエタノール:水、40mM トリエチルアミン、B:60:4
0 トリフルオロエタノール:水、40mM トリエチルアミン、1M グアニジン−H
Cl、20mL/分)を用いた強陰イオン交換クロマトグラフィーにより精製して、D5
−seq32を白色粉末として得た。
D7−seq32(Ex.35)の合成
オリゴヌクレオチドD5−seq32(5.7mg、0.304μmol)および対応
するアンチセンス鎖D6(2.0mg、0.29μmol)を、RNaseを含まない水
中で1時間混合した。反応混合物を凍結乾燥し、生成物D7−seq32−dをインビボ
評価に供した。
追加のD7−ペプチドコンジュゲートの合成。
D7およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをD7−seq32に使用したのと類
似の方法で調製した。
セクションE。脂質およびペプチドコンジュゲートのハイブリッドの合成
実施例36〜42
スキーム12を図13A〜図13H−2に示す。
E2(Ex.36)の合成
オリゴヌクレオチドE1(300mg、39μmol)およびPEG9アジドリンカー
(58.5mg、78μmol)を、ガラスバイアル中で脱気3:1 DMA/水(10
mL)に溶解させ、次いでこの反応混合物に、臭化銅(I)−ジメチルスルフィド(20
.06mg、98μmol)を脱気DMSO(699μL)に溶かした溶液を加えた。4
5℃で40分後、E1が完全に消費されたことがLC−MSによりモニターされた。反応
混合物を0.4M EDTA(20mL)で希釈し、さらに15分間撹拌し、次いでMi
llipore 3K膜を用いて水に対して透析し、凍結乾燥してE2を白色粉末として
得た。
E3(Ex.37)の合成
TetraGalNAc A10(237mg、145μmol)、HATU(55.
2mg、145μmol)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(94mg、726μ
mol)をDMSO(700μL)に溶解させた。10分後、活性化エステルを、オリゴ
ヌクレオチドE2(306mg、36μmol)を含むDMA(7.5mL)および水(
2.5mL)に加えた。得られた反応混合物を15分間撹拌し、水を加えてクエンチし、
次いでRP HPLC(5%〜60%Aを含むB、A:100mM TEAAを含むMe
CN、B:100mM TEAAを含む水)により精製した。生成物画分を水に対して透
析し、凍結乾燥してE3をより白色の粉末として得た。
E4(Ex.38)の合成
E3(246mg、24μmol、1当量)を水(8000μL)に溶かした溶液に、
TCEP−HCl(70mg、244μmol、10当量)を加えた。反応混合物をTC
EP−HClが完全に溶解するまで混合した。この溶液を室温で2時間放置した。溶液を
、3K膜を通して水に対して2回遠心透析して粗E4を得、これを次のステップに直接使
用した。
E5(Ex.39)の合成
E4(244mg、24μmol)を水(12mL)に溶かした溶液に、MeCN(0
.5mL)に溶解させたN−(2−アミノエチル)マレイミドトリフルオロアセテート塩
(62.2mg、0.245mmol、10当量)を加えた。この溶液を室温で1時間放
置した。LCMSにより、完全な変換が確認された。溶液を、3K膜を通して水に対して
2回遠心透析し、凍結乾燥してE5を白色粉末として得た。
E6(Ex.40)の合成
E5(40mg、3.95μmol、1当量)を4:1 DMA/水(500μL)に
溶解させた。DIPEA(10.2mg、79μmol、20当量)を上記の溶液に加え
た。コレステロールクロロホルメート(18mg、40μmol、10当量)をTHF(
500μL)に溶解させた。2つの溶液を混ぜ合わせ、反応混合物を室温で1時間放置し
た。LCMSにより、反応が終わったことが確認された。反応混合物を、RP HPLC
(5%〜95%Bを含むA、A:100mM TEAAを含む水、B:100mM TE
AAを含むMeCN)により精製した。生成物画分を水に対して透析し、凍結乾燥してE
6をより白色の粉末として得た。
E7(Ex.41)の合成
E6(24.5mg、2.3μmol、1当量)を水(1000μL)に溶かした溶液
に、ピペリジンを含むDMF(200μL、20体積%、200当量)に加えた。反応混
合物を室温で1時間放置した。LCMSにより、反応が終わったことが確認された。反応
混合物を濾過し(0.2uM)、水に対して透析し、凍結乾燥してE7をより白色の粉末
として得た。
E8(Ex.42)の合成
E7(16mg、1.55μmol、1当量)を新たに調製した炭酸水素ナトリウム水
(0.1M、400μL)に溶解させた。SPDP(4.85mg、0.016mmol
、10当量)をアセトニトリル(400uL)に溶解させた。2つの溶液を混ぜ合わせ、
反応混合物を室温で1時間放置した。反応混合物を、RP HPLC(5%〜95%Bを
含むA、A:100mM TEAAを含む水、B:100mM TEAAを含むMeCN
)により精製した。生成物画分を水に対して透析し、凍結乾燥してE8をより白色の粉末
として得た。
実施例43〜44
E8−Seq137およびE9−Seq137の調製
スキーム13を図14A−1〜図14B−2に示す。
E9−Seq137(Ex.43)の合成
2M チオ尿素/20mM MESを含むホルムアミドpH6.5 100μLに溶か
したオリゴヌクレオチドE8(3.0mg、0.286μmol)を、100μLの同じ
緩衝液に溶かしたペプチドseq137(2.33mg、0.572μmol)で処理し
、反応混合物を室温で30分間放置した。反応を、ホルムアミド1mLを加えて希釈し、
Propac SAX 22×250mmカラム(15分かけて5%〜45%Bを含むA
、A:60:40 トリフルオロエタノール:水、20mM トリエチルアミン、B:6
0:40 トリフルオロエタノール:水、20mM トリエチルアミン、1M グアニジ
ン−HCl、20mL/分)を用いた強陰イオン交換クロマトグラフィーにより精製して
E9−seq−137を白色粉末として得た。
E10−Seq137−e(Ex.44)の合成
パッセンジャー鎖E9−seq137(1.30mg、0.077μmol)および対
応するガイド鎖B7(0.561mg、0.077μmol)を、RNaseを含まない
水中で混合し、1分間90℃に加熱し、次いで室温で10分間放置した。二本鎖を凍結乾
燥し、得られた生成物を白色アモルファス粉末として単離した。
追加のE10−ペプチドコンジュゲートの合成。
E10およびペプチド配列の追加のコンジュゲートをE10−Seq137−eに使用
したのと類似の方法で調製した。
セクションF。3,13,18トリペプチドコンジュゲートの調製
実施例45〜49
スキーム14を図15A〜図15E−2に示す。
化合物F2(Ex.45)の合成
化合物A10(210mg、0.129mmol)を乾燥N−メチル−2−ピロリジノ
ン(3ml)に溶解させた。HATU(48.9mg、0.129mmol)および乾燥
ジイソプロピルエチルアミン(0.046ml、0.257mmol)を加え、混合物を
、固体が完全に溶解するまで音波処理した。反応を室温で5分間放置した。別のバイアル
に、化合物F1(500mg、0.0646mmol)を水(2ml)およびN−メチル
−2−ピロリジノン(5ml)に溶解させた。A10溶液をF1溶液に加え、反応を室温
で5分間放置した。反応混合物を、60℃まで加熱したAgilent PL−SAX
8um 50×150mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、30分かけ
て100ml/分で100%溶媒A(4:1 HO:エタノール、20mM 酢酸トリ
エチルアンモニウム pH7.0)から80%溶媒B(4:1 HO:エタノール、2
0mM 酢酸トリエチルアンモニウム pH7.0、1M グアニジニウムヒドロクロリ
ド)としてグラジエント溶出した。画分を集めて、水で希釈してエタノール含量を5%ま
で下げた。この溶液を50ml/分でWaters XBridge 5um 50×5
0mmカラムにポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分間水で洗浄した。この脱
塩物を、カラムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを50ml/分でカラムに
流して溶出した。画分を凍結乾燥してF2をアモルファス固体として得た。Expect
ed mass:9363.6,found mass:9363.5。
化合物F3(Ex.46)の合成
F2(500mg、0.0534mmol)およびアジド−peg9−アミン(253
mg、0.481mmol)を2,2,2−トリフルオロエタノール(5ml)および水
(5ml)に溶解させた。この溶液に窒素を1分間バブリングした。別のバイアルに、臭
化銅(I)ジメチルスルフィド(43.9mg、0.214mmol)をアセトニトリル
(2.5ml)に溶解させた。この溶液に窒素を1分間バブリングした。2つの溶液を混
ぜ合わせ、反応混合物に窒素を1分間バブリングした。バイアルを密封し、室温で1時間
放置した。反応混合物をEDTA溶液(0.5M、pH8.0、1mL)でクエンチし、
Waters XBridge 5um 50×250mmカラムを装着したHPLCに
充填した。生成物を、100ml/分で30分かけて100%溶媒A(HO、0.1M
酢酸トリエチルアンモニウム pH7.0)から40%溶媒B(アセトニトリル)とし
てグラジエント溶出した。画分を集めて、水で希釈してアセトニトリル含量を5%まで下
げた。この溶液を50ml/分でWaters XBridge 5um 50×50m
mカラムにポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分間水で洗浄した。この脱塩物
を、カラムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを50ml/分でカラムに流し
て溶出した。画分を凍結乾燥してF3をアモルファス固体として得た。Expected
mass:10943.5,found mass:10943.2。
化合物F4(Ex.47)の合成
F3(467mg、0.0427mmol)を炭酸水素ナトリウム溶液(0.1M、4
.5mL)に溶解させた。NHS−SPDP(120mg、0.384mmol)をアセ
トニトリル(1mL)に溶解させた。これらの溶液を混ぜ合わせて、反応を室温で15分
間放置した。反応混合物を、Waters XBridge 5um 50×250mm
カラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、100ml/分で30分かけて100
%溶媒A(HO、0.1M 酢酸トリエチルアンモニウム pH7.0)から40%溶
媒B(アセトニトリル)としてグラジエント溶出した。画分を集めて、アセトニトリル含
量を水で希釈して5%まで下げた。この溶液を50ml/分でWaters XBrid
ge 5um 50×50mmカラムにポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分
間水で洗浄した。この脱塩物を、カラムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを
50ml/分でカラムに流して溶出した。画分を凍結乾燥してF4をアモルファス固体と
して得た。Expected mass:11535.3,found mass:11
535.1。
F5−Seq463(Ex.48)の合成
ペプチドSeq.612(8.75mg、0.00520mmol)を、20mM 酢
酸を含むDMSO(1mL)に溶解させた。別のバイアルに、F4(10mg、0.00
0867mmol)を、20mM 酢酸を含むDMSO(1ml)に溶解させた。2つの
溶液を混ぜ合わせ、室温で1時間放置した。反応をN−メチルマレイミド(5.78mg
、0.0520mmol)でクエンチし、Agilent PL−SAX 10um 2
5×50mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、30ml/分で20分か
けて100%溶媒A(2:3 HO:2,2,2−トリフルオロエタノール、20mM
トリエチルアミン)から70%溶媒B(2:3 HO:2,2,2−トリフルオロエ
タノール、20mM トリエチルアミン、0.5M グアニジニウムヒドロクロリド)と
してグラジエント溶出した。画分を集めて、Waters XBridge 5um 1
9×250mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、20ml/分で30分
かけて85%溶媒A(HO、0.1M 酢酸ヘキシルアンモニウム pH7.0)から
65%溶媒B(テトラヒドロフラン)としてグラジエント溶出した。画分を集めて、真空
下でテトラヒドロフラン含量を5%未満まで下げた。溶液を、10k膜を通して水に対し
て1回、0.1M 塩化ナトリウムを含む4:1 HO:エタノールに対して再び1回
、および水に対してさらに2回遠心透析した。濃縮物を凍結乾燥してF5−Seq463
をアモルファス固体として得た。Expected mass:16247.8,fou
nd mass:16247.9。
実施例49
スキーム15を図16A−1〜図16B−2に示す。
F6 Seq463−f(Ex.49)の合成
F5−Seq463(7.75mg、0.000477mmol)およびガイドB7(
3.27mg、0.000477mmol)をHO(0.5mL)に溶解させた。溶液
を室温で1時間放置し、次いで凍結乾燥してF6 Seq463−fの二本鎖をアモルフ
ァス固体(11mg、定量的)として得た。パッセンジャー鎖のExpected ma
ss:16247.8,found mass:16247.9。ガイド鎖のExpec
ted mass:6852.5,found mass:6852.7。
追加のF10−ペプチドコンジュゲートおよび二本鎖の合成。
F10およびペプチド配列の追加のコンジュゲートとその二本鎖とをF6−Seq46
3−fに使用したのと類似の方法で調製した。
セクションG。3,8,13,18テトラペプチドの調製
実施例50〜53
スキーム16を図17A−1〜図17D−2に示す。
G2(Ex.50)の合成
A10(210mg、0.129mmol)を乾燥N−メチル−2−ピロリジノン(3
ml)に溶解させた。HATU(48.9mg、0.129mmol)および乾燥ジイソ
プロピルエチルアミン(0.046ml、0.257mmol)を加え、混合物を、固体
が完全に溶解するまで音波処理した。反応を室温で5分間放置した。別のバイアルに、G
1(500mg、0.0643mmol)を水(2ml)およびN−メチル−2−ピロリ
ジノン(5ml)に溶解させた。A10溶液をG1溶液に加え、反応を室温で5分間放置
した。反応混合物を、60℃まで加熱したAgilent PL−SAX 8um 50
×150mmカラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、100ml/分で30分
かけて100%溶媒A(4:1 HO:エタノール、20mM 酢酸トリエチルアンモ
ニウム pH7.0)から80%溶媒B(4:1 HO:エタノール、20mM 酢酸
トリエチルアンモニウム pH7.0、1M グアニジニウムヒドロクロリド)としてグ
ラジエント溶出した。画分を集めて、水で希釈してエタノール含量を5%まで下げた。こ
の溶液を50ml/分でWaters XBridge 5um 50×50mmカラム
にポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分間水で洗浄した。この脱塩物を、カラ
ムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを50ml/分でカラムに流して溶出し
た。画分を凍結乾燥してG2をアモルファス固体として得た。Expected mas
s:9399.7,found mass:9399.5。
G3(Ex.51)の合成
G2(483mg、0.0514mmol)およびアジド−peg9−アミン(324
mg、0.617mmol)を2,2,2−トリフルオロエタノール(5ml)および水
(5ml)に溶解させた。この溶液に窒素を1分間バブリングした。別のバイアルに、臭
化銅(I)ジメチルスルフィド(50mg、0.244mmol)をアセトニトリル(2
.5ml)に溶解させた。この溶液に窒素を1分間バブリングした。2つの溶液を混ぜ合
わせ、反応混合物に窒素を1分間バブリングした。バイアルを密封し、室温で1時間放置
した。反応混合物をEDTA溶液(0.5M、pH8.0、1mL)でクエンチし、Wa
ters XBridge 5um 50×250mmカラムを装着したHPLCに充填
した。生成物を、100ml/分で30分かけて100%溶媒A(HO、0.1M 酢
酸トリエチルアンモニウム pH7.0)から40%溶媒B(アセトニトリル)としてグ
ラジエント溶出した。画分を集めて、アセトニトリル含量を水で希釈して5%まで下げた
。この溶液を50ml/分でWaters XBridge 5um 50×50mmカ
ラムにポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分間水で洗浄した。この脱塩物を、
カラムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを50ml/分でカラムに流して溶
出した。画分を凍結乾燥してG3をアモルファス固体として得た。Expected m
ass:11506.2,found mass:11506.0。
G4(Ex.52)の合成
G3(455mg、0.0396mmol)を炭酸水素ナトリウム溶液(0.1M、5
mL)に溶解させた。NHS−SPDP(160mg、0.512mmol)をアセトニ
トリル(1.5mL)に溶解させた。これらの溶液を混ぜ合わせて、反応を室温で15分
間放置した。反応混合物を、Waters XBridge 5um 50×250mm
カラムを装着したHPLCに充填した。生成物を、100ml/分で30分かけて100
%溶媒A(HO、0.1M 酢酸トリエチルアンモニウム pH7.0)から40%溶
媒B(アセトニトリル)としてグラジエント溶出した。画分を集めて、アセトニトリル含
量を水で希釈して5%まで下げた。この溶液を50ml/分でWaters XBrid
ge 5um 50×50mmカラムにポンプで充填し、生成物を100ml/分で5分
間水で洗浄した。この脱塩物を、カラムを反転させ、2:3 HO:アセトニトリルを
50ml/分でカラムに流して溶出した。画分を凍結乾燥してG4をアモルファス固体と
して得た。Expected mass:12295.3,found mass:12
295.1。
G5−Seq489(Ex.53)の合成
ペプチドSeq.Id489(CIFGAIAGFIKNIWEGLI すべて(D)
)(13.6mg、0.00694mmol)を、20mM 酢酸を含むDMSO(1m
L)に溶解させた。別のバイアルに、G4(10mg、0.000867mmol)を、
20mM 酢酸を含むDMSO(1ml)に溶解させた。2つの溶液を混ぜ合わせ、室温
で1時間放置した。反応をN−メチルマレイミド(7.71mg、0.0694mmol
)でクエンチし、Agilent PL−SAX 10um 25×50mmカラムを装
着したHPLCに充填した。生成物を、30ml/分で20分かけて100%溶媒A(2
:3 HO:2,2,2−トリフルオロエタノール、20mM トリエチルアミン)か
ら70%溶媒B(2:3 HO:2,2,2−トリフルオロエタノール、20mM ト
リエチルアミン、0.5M グアニジニウムヒドロクロリド)としてグラジエント溶出し
た。画分を集めて、Waters XBridge 5um 19×250mmカラムを
装着したHPLCに充填した。生成物を、20ml/分で30分かけて85%溶媒A(H
O、0.1M 酢酸ヘキシルアンモニウム pH7.0)から65%溶媒B(テトラヒ
ドロフラン)としてグラジエント溶出した。画分を集めて、真空下でテトラヒドロフラン
含量を5%未満まで下げた。溶液を、10k膜を通して水に対して1回、0.1M 塩化
ナトリウムを含む4:1 HO:エタノールに対して再び1回、および水に対してさら
に2回遠心透析した。濃縮物を凍結乾燥してG5−Seq489をアモルファス固体とし
て得た。Expected mass:19708.1,found mass:197
08.0。
実施例54
スキーム17を図18A−1〜図18B−2に示す。
G6−Seq489−g(Ex.54)の合成
G5−Seq489(8.5mg、0.000434mmol)およびB7(2.98
mg、0.000434mmol)をHO(0.5mL)に溶解させた。溶液を室温で
1時間放置し、次いで凍結乾燥して二本鎖G6−Seq489−gをアモルファス固体と
して得た。パッセンジャー鎖のExpected mass:19708.1,foun
d mass:19708.3。ガイド鎖のExpected mass:6852.5
,found mass:6852.6。
追加のG6−ペプチドコンジュゲートおよび二本鎖の合成。
G6およびペプチド配列の追加のコンジュゲートとその二本鎖とをG6−Seq489
−gに使用したのと類似の方法で調製した。
セクションH。3,8,13,18テトラペプチドの調製
実施例55〜58
下記スキーム18を用いてH1〜H5を調製した。
Figure 2018083816
H1(Ex.55)の合成
窒素の不活性雰囲気をパージして維持した500mL 丸底フラスコに、ジ−tert
−ブチル1−(tert−ブチルチオ)ヒドラジン−1,2−ジカルボキシレート(15
g、46.8mmol、2.00当量)をN,N−ジメチルホルムアミド(30mL)に
溶かした溶液を入れた。この丸底フラスコに、2−アミノエタンチオールヒドロクロリド
(2.66g、23.4mmol、1当量)をN,N−ジメチルホルムアミド(80ml
)に溶かした溶液をゆっくりと加えた。これに、続いてトリエチルアミン(2.36g、
23.4mmol、1当量)を加えた。室温で一晩撹拌後、白色固体が沈殿していた。乾
燥N,N−ジメチルホルムアミド(100ml)を加えて透明に近い溶液を得た。白色固
体が再び沈殿するまでトリエチルアミンを加えた。反応混合物を室温で8時間撹拌した。
溶液を濾過し、減圧下で蒸発させた。残渣にジエチルエーテル(200ml)を加え、濾
過した。白色固体を集めて、乾燥機で乾燥させた。その後、この白色固体をジエチルエー
テルに5回溶解させ(5×10ml)、数分間撹拌し、濾過した。所望の生成物を白色固
体として得た。HNMR(CDCl,500MHz,ppm):1.36(s,9H
),3.07(t,2H),3.4(t,2H),8.3(s,2H)。
H3(Ex.56)の合成
リトコール酸(H2)(7gm、18.59mmol、1当量)を乾燥ジコロルメタン
(200ml)に溶解させ、次いで0℃まで冷却した。この後、この溶液にN,N−ジシ
クロヘキシルカルボジイミド(4.6g、22.31mmol、1.2当量)を加えた。
0℃で30分間撹拌後、ペンタフルオロフェノール(3.76gm、20.45mmol
、1.1当量)を含むジクロロメタン(13ml)を加えた。次いでアルゴン下、室温で
さらに20時間撹拌を続けた。沈殿したN,N−ジシクロヘキシル尿素を濾別し、冷ジク
ロロメタンで洗浄した。次いで合わせた濾液を減圧下で蒸発させた。次いで得られた油状
残渣をジクロロメタン(50ml)で希釈し、飽和NaCl水溶液(60ml)および水
(80ml)で洗浄した。有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、蒸発乾固した。乾
燥させた化合物をカラムクロマトグラフィー(CHCl/CHOH、100/0〜
97/3で溶出)を用いて精製した。MS(m/z);566[M+Na]
H4(Ex.57)の合成
化合物H3(4.5gm、8.29mmol、1当量)を乾燥ジクロロメタン(15m
l)に溶解させ、次いで0℃まで冷却した。得られた溶液に、2−(tert−ブチルジ
スルファニル)エタンアミン(H1)(2.057gm、12.44mmol、1.5当
量)およびトリエチルアミン(2.56gm、2.52mmol、3当量)をジクロロメ
タン(7ml)に溶かした冷混合物を加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した。TL
Cにより生成物の形成が確認された。反応混合物を飽和NaCl水溶液(20ml×2)
および水(20ml×2)で洗浄した。有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、真空
乾燥させた。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl/CH
H、100/0〜95/5で溶出)により精製して純粋な化合物H4を得た。MS(m/
z);524.35,[M+1]
H5(Ex.58)の合成
H4(3gm、5.73mmol、1当量)を乾燥ジクロロメタン(15ml)に溶解
させ、トリエチルアミンを加えた(0.869g、8.59mmol、1.5当量)。反
応混合物を0℃まで冷却した。2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノクロロ
ホスフィット(2.71gm、11.45mmol、2当量)を含む乾燥ジクロロメタン
(10ml)を反応混合物に滴下して加えた。得られた溶液を1時間撹拌した。TLCに
より生成物の形成が確認された。反応混合物を蒸発させ、シリカゲルカラム(ヘキサン/
酢酸エチル/トリエチルアミン、100/0/1.5〜60/40/1.5で溶出)で精
製しした。MS(m/z);724.46[M+1] 31P NMR(CDCl
500MHz,ppm);146.5
実施例59〜66
図19A〜図19I−2に示したようなスキーム19を用いてEx.59〜Ex.66
を調製した。
H6(Ex.59)の合成
反応手順に関するB2の合成を参照されたい。Expected mass:9609
.071,found mass:9605。
H7(Ex.60)の合成
H6(15mg、1.56umol、1当量)を水(1400ul)に溶かした溶液に
、TCEP−HCl(26.8mg、0.094mmol、60当量)を加えた。反応混
合物をTCEP−HClが完全に溶解するまで混合した。溶液を室温で一晩放置した。溶
液を、3K膜を通して水に対して2回遠心透析した。Expected mass:95
20,found mass:9517。
H8(Ex.61)の合成
反応手順に関するB9の合成を参照されたい。Expected mass:9630
,found mass:9627。
H9−Seq32(Ex.62)の合成
反応手順に関するB10−seq32の合成を参照されたい。Expected ma
ss:13597,found mass:13598。
H7−Seq32−h(Ex.63)の合成
反応手順に関するB11−seq32の合成を参照されたい。
H8(Ex.64)の合成
反応手順に関するC13の合成を参照されたい。Expected mass:974
1。
H9−Seq32(Ex.65)の合成
反応手順に関するC14の合成を参照されたい。Expected mass:138
19,found mass:13820。
H10−Seq32−h(Ex.66)の合成
反応手順に関するC15−Seq32の合成を参照されたい。
H7およびH10ペプチドコンジュゲートの追加合成
H7およびH10とペプチド配列との追加のコンジュゲート、ならびにその二本鎖をH
7−Seq32−hおよびH10−Seq32−hに使用したのと類似の方法で調製した
セクションI。3酵素で切断可能な3,13,18リンカーペプチドコンジュゲートの調

実施例67〜73
スキーム20を図20A−1〜図20E−2に示す。
I3(Ex.67)の合成
I1(160mg、0.209mmol)およびI2(48.8mg、0.219mm
ol)をDMA(1mL)に溶解させ、N−メチルモルホリン(46μL、0.417m
mol)で処理した。反応を室温で6時間撹拌し、次いでRP−HPLC(95:5〜2
0:80% A:B直線グラジエント(A=0.1%TFA水溶液;B=0.1%TFA
を含むアセトニトリル)Waters C18 xbridge Column 19×
250mm)により精製した。I3を含む画分を2:1 DCM:MeOHで抽出し、N
SOで乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して生成物を得た。Measured m
ass=814.3
I4(Ex.68)の合成
I3(88mg、0.108mmol)をDMA(1mL)に溶解させ、ピペリジン(
200μL、2.02mmol)で処理し、10℃で10分間撹拌した。TFA(156
μL、2.02mmol)を加えて反応をクエンチした。反応混合物を、RP−HPLC
(95:5〜60:40% A:B直線グラジエント(A=0.1%TFA水溶液;B=
0.1%TFAを含むアセトニトリル)Waters C18 xbridge Col
umn 30×250mm)により精製した。I4を含む画分を凍結乾燥して生成物を得
た。Measured mass=592.3。
I5(Ex.69)の合成
I4(912mg、1.324mmol)をDMSO(7.7mL)に溶解させ、L1
(1.0g、1.40mmol)およびDIEA(463μL、2.65mmol)で処
理した。反応混合物を15分間撹拌し、RP−HPLC(100:0〜0:100% A
:B直線グラジエント(A=0.1%TFA水溶液;B=0.1%TFAを含むアセトニ
トリル)Waters C18 xbridgeカラムにより精製した。I5を含む画分
を凍結乾燥して生成物を得た。Measured mass=609.5[M+2]
I7(Ex.70)の合成
I6(500mg、0.065mmol)およびI5(236mg、0.194mmo
l)をpH5.5 MES緩衝液(51.6ml、500mM)およびアセトニトリル(
12.91ml)に溶解させた。溶液を窒素で10分間脱気し、その後、これをCuBr
.SMe(133mg、0.646mmol)で処理し、窒素でさらに5分間脱気した
。反応混合物を音波処理し、30分間撹拌し、次いでRP−HPLC(95:5〜5:9
5% A:B直線グラジエント(A=100mM TEAA水溶液;B=100mM T
EAAのアセトニトリル溶液)Waters Phenyl xbridge Colu
mn)により精製した。生成物を含む画分を、3K膜を通して0.32M EDTA p
H6.5に対して2回、次いで水に対して3回透析した。次いで濃縮物を200mM T
EAAに対して2回、次いで水に対して3回透析した。濃縮物を凍結乾燥して生成物を白
色アモルファス固体として得た。Measured mass=11400
I8(Ex.71)の合成
I7(287mg、0.025mmol)を水(100uL)に懸濁し、NMP(2.
0mL)で希釈し、静置すると均一溶液が得られた。HATU(13mg、0.035m
mol)をNMP(200uL)に溶解させ、A10(62mg、0.038mmol)
に加えた。反応混合物をNMP(200uL)で希釈し、次いでDIEA(13uL、0
.076mmol)で処理した。次いでHATU反応混合物を一度にRNA溶液に加え、
10分間熟成させた。反応をDI水で希釈し、RP−HPLC(95:5〜5:95%
A:B直線グラジエント(A=100mM TEAA水溶液;B=100mM TEAA
のアセトニトリル溶液)Waters Phenyl xbridge Column)
により精製した。I8を含む画分を、3K膜を通して水に対して3回透析した。濃縮物を
凍結乾燥して生成物を白色アモルファス固体として得た。Measured mass=
13027。
I9−Seq1681(Ex.72)の合成
I8(20mg、1.537μmol)を、50mM AcOH(2mL)で変性させ
たTFEに溶解させた。別のバイアルに、Seq ID1681(8.63mg、6.1
5umol)を8M Gn.HCl(400uL)に懸濁し、50mM AcOHを含む
TFE(2mL)で希釈すると少し濁った懸濁液が形成され、次いでRNA溶液に加えた
。10分後、さらにSeq ID1681(8.63mg、1.54umol)を加え、
反応を30分熟成させ、その後AEXにより、所望の生成物にほぼ完全に変換されたこと
が確認された。反応をN−メチルマレイミド(6.83mg、61.5μmol)でクエ
ンチし、AEX(0〜40% 1M Gn.HClを含む1:1 水:TFE(40mM
TEAA pH7.5を含む)、60℃まで加熱したProteomix NP10
カラム)により精製した。材料を、200mM HAA pH7.5:ACNの70:3
0〜25:75のグラジエントおよびAgilent PLRP−Sカラムを用いて再精
製した。純粋な画分をプールし、透析し、凍結乾燥してI9−Seq1681(6.37
mg、0.302μmol、19.65%の収率)を得た。
I10−Seq1681−f(Ex.73)の合成
I9−seq1681(3.02mg、0.143μmol)を水(950μl)に溶
解させ、B7(0.980mg、0.143μmol)を水(144μl)に溶かした溶
液で処理した。反応混合物を15分間熟成させ、次いで凍結乾燥して生成物を白色アモル
ファス固体として得た。Measured mass=21107。
I10ペプチドコンジュゲートおよび二本鎖の追加合成。
I10およびペプチド配列の追加のコンジュゲートとその二本鎖とをI10−seq−
1681−fに使用したのと類似の方法で調製した。
セクションJ。アミノ修飾C2リンカーの調製
実施例74〜82
スキーム21を図21A〜図21H−2に示す。
A10B(Ex.74)の合成
撹拌子を備えた試験管内で、A10(100mg、0.061mmol)をDMSO(
611μl)に溶解させ、続いてヒューニッヒ塩基(133μl、0.764mmol)
およびHATU(76mg、0.199mmol)を加えた。20分後、400μLのD
MSOに溶解させたN−(2−アミノエチル)マレイミドトリフルオロアセテート塩(1
2.85mg、0.092mmol)を加えた。20分後、反応が終了したことを確認し
、黄色がほとんど消失するまで水(1.5mL)でクエンチした。反応を、逆相クロマト
グラフィー(Gilson 2020、溶媒A)0.1%TFAを含む水/溶媒B)0.
1%TFAを含むACN、15分間の0〜50%グラジエント、40mL/分、XBri
dge Prep C18 5μm OBD 30×250mm)により精製した。得ら
れた画分を凍結乾燥して白色固体、A10Bを得た。[M+1,expected]=1
757.807,[M+1,observed]=1759.0。
J2(Ex.75)の合成
反応手順に関するB3の合成を参照されたい。J2[M+1,expected]=7
604.750,[M+1,observed]=7600.0。
J3(Ex.76)の合成
A10B(10.26mg、5.84μmol)を水(700μL)に溶解させ、J2
(29.6mg、3.89μmol)の1.8mL溶液(水1:酢酸塩緩衝液1:ホルム
アミド2)に加えた。反応を室温で20分間振盪し、次いで終了を確認した。反応混合物
を、強陰イオン交換クロマトグラフィー(Gilson PLC 2020、Sepax
Proteomix SAX NP10 21.2×50mm、緩衝液A:3:2 ト
リフルオロエタノール:水、40mM トリエチルアミン/緩衝液B:3:2 トリフル
オロエタノール:水、40mM トリエチルアミン、1000mM グアニジン−HCl
、1%Bを3分間保持、次いで12分かけて5%B〜45%B)を用いて精製した。画分
を、3K膜を通して水に対して3回透析して白色固体、J3を得た。[M+1,expe
cted]=9362.556,[M+1,observed]=9359.0。
J4(Ex.77)の合成
エッペンドルフバイアル中で、J3(6.34mg、0.678μmol)を水(25
0μL)に溶解させた。別のエッペンドルフバイアル中で、N−スクシニミジル3−(2
−ピリジルジチオ)プロピオネート(SPDP)(0.831mg、2.035μmol
)をDMSO(50μL)に溶解させた。SPDP溶液をRNA溶液に加えた。4時間後
、反応を、50μL DMSOに溶解させた別のSPDP(2.77mg、6.78μm
ol)に再び仕込んだ。24時間後、反応を、50μL DMSOに溶解させた別のSP
DP(2.77mg、6.78μmol)に再び仕込んだ。72時間後、390μLのp
H8.1 炭酸水素ナトリウムを加えて反応を3mg/mLに希釈した。2時間後、別の
3当量のSPDPを含む50μL DMSOを加えた。反応混合物を、3K膜を通して水
に対して3回透析し、凍結乾燥して白色固体、J4を得た。[M+1,expected
]=9543.834,[M+1,observed]=9554.0。
J5−Seq26(Ex.78)の合成
反応手順に関するB10−Seq32の合成を参照されたい。J5−Seq26−Ma
ss observed:11413。
J6−Seq26−i(Ex.79)の合成
反応手順に関するB11−Seq32−bの合成を参照されたい。J6−Seq26−
i−Mass observed:18265。
J7(Ex.80)の合成
エッペンドルフバイアル中で、J3(5.8mg、0.621μmol)を水(250
μL)に溶解させた。別のエッペンドルフバイアル中で、スクシニミジル−4−(N−マ
レイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート(SMCC)(0.727mg
、1.862μmolをDMSO(50μL)に溶解させ、1滴のTFAを加えてpHを
pH5に調整した。SMCC溶液をRNA溶液に加えた。数時間後、0.1N NaOH
を徐々に加えてpHをpH7に調節した。18時間後、6当量のSMCCを50μL D
MSOに溶解させ、反応混合物に加えた。4時間後、別の3当量のSMCCを含む50μ
L DMSOを反応に加えた。数時間後、300μLのpH8.1 炭酸水素ナトリウム
溶液を反応に加えた。反応を、3K膜を通して水に対して3回透析し、凍結乾燥して白色
固体、J7を得た。[M+1,expected]=9543.834,[M+1,ob
served]=9554.0。
J8−Seq26(Ex.81)の合成
反応手順に関するB10−Seq32の合成を参照されたい。J8−Seq26−Ma
ss observed:11545。
J9−Seq26−i(Ex.82)の合成
反応手順に関するB11−Seq32の合成を参照されたい。J9−Seq26−I−
Mass expected:18397。
J6およびJ9のペプチドコンジュゲートの追加合成。
J6およびJ9とペプチド配列との追加のコンジュゲートならびにその二本鎖をJ6−
Seq26、J9−Seq26およびJ6−Seq26−i、J9−Seq26−iに使
用したのと類似の方法で調製した。
セクションK。3’ビスペプチドリンカー
実施例83〜87
スキーム22を図22A−1〜図22D−2に示す。
K2(Ex.83)の合成
20mL バイアル中で、3−(トリチルチオ)プロパン酸(158mg、0.454
mmol)をDMF(1.514mL)に溶解させ、続いてHATU(184mg、0.
484mmol)およびヒューニッヒ塩基(0.158mL、0.908mmol)を加
えた。反応液の色は淡黄色になった。5分後、K1(100mg、0.151mmol)
を固体として加えると、反応液の色は透明なオレンジ色になった。反応を室温で15分間
撹拌し、次いで終了を確認した。
反応を、逆相クロマトグラフィー(Gilson 2020、0.1%TFAモディフ
ァイヤーを含む5〜95%ACN/水、流速:20mL/分、グラジエント時間:22分
、カラム:XBridge prep OBD 5μm C18 19×250nm)に
より精製した。得られた画分を凍結乾燥して白色固体、K2を得た。[M+1,expe
cted]=877.059,[M+1,observed]=877.4
K3(Ex.84)の合成
エッペンドルフバイアル中で、K2(10.07mg、0.011mmol)をホルム
アミド(0.5mL)に溶解させた。15mL ファルコンチューブ中で、ペプチドSe
q ID74(57.92mg、0.034mmol)をホルムアミド(1mL)に溶解
させた。ペプチド/ホルムアミド溶液をリンカー/ホルムアミド溶液に加え、室温で20
分間撹拌した。
反応が終了したことを確認し、反応を、逆相クロマトグラフィー(Gilson 20
20、0.1%TFAモディファイヤーを含む5〜100%ACN/水、流速:20mL
/分、グラジエント時間:30分、カラム:XBridge prep OBD 5μm
C18 19×250nm)により精製した。得られた画分を凍結乾燥して白色固体、
K3を得た。[M+3,expected]=1416.03,[M+3,observ
ed]=1415.0
K4(Ex.85)の合成
40mL バイアル中で、TFA(1000μL)、水(96μL)およびトリイソプ
ロピルシラン(96μL)を体積で0.83:0.08:0.08に混合した溶液を組み
合わせて、20mL バイアル中のK3(47mg、0.011mmol)に加え、これ
を室温で10分間撹拌した。さらに500μLのTFAを加え、反応をさらに10分間撹
拌した。反応の終了を確認し、減圧下で濃縮し、3.5mLの2M チオ尿素 pH6.
5を含むFMDおよびMESで希釈し、逆相クロマトグラフィー(Gilson 202
0、0.1%TFAモディファイヤーを含む5〜80%ACN/水、流速:20mL/分
、グラジエント時間:20分、カラム:XBridge prep OBD 5μm C
18 19×250nm)により精製した。得られた画分を凍結乾燥して白色固体、K4
を得た。[M+3,expected]=1334.34,[M+3,observed
]=1334.4
K5−Seq74(Ex.86)の合成
反応手順に関するB10−Seq32の合成を参照されたい。K5−Seq74−Ex
pected mass:13178.103。
K6−Seq74−b(Ex.87)の合成
反応手順に関するB10−Seq32の合成を参照されたい。Observed ma
ssパッセンジャー=15907;Obsserved mass ガイド=8744;
二本鎖=24651。
K5ペプチドコンジュゲートおよび二本鎖の追加合成。
K5およびペプチド配列の追加のコンジュゲートならびに対応する二本鎖をK5−Se
q74およびK6−Seq74−bに使用したのと類似の方法で調製した。
セクションL。ガイド鎖2’位−10,15ECLペプチドコンジュゲートの調製
実施例88〜94
スキーム23を下記および図23A〜図23C−2に示す。
Figure 2018083816
L3(Ex.88)の合成
(9H−フルオレン−9−イル)メチル((S)−3−メチル−1−(((S)−1−
((4−((((4−ニトロフェノキシ)カルボニル)オキシ)メチル)フェニル)アミ
ノ)−1−オキソ−5−ウレイドペンタン−2−イル)アミノ)−1−オキソブタン−2
−イル)カルバメートL1(500mg、0.652mmol)、2−(ピリジン−2−
イルジスルファニル)エタンアミンヒドロクロリド(153mg、0.685mmol)
、およびN−メチルモルホリン(0.143mL、1.30mmol)をN,N−ジメチ
ルアセトアミド(3mL)に溶解させた。反応混合物を室温で16時間熟成させ、40m
L/分で20分かけての、0.1%TFAを含む5〜80%ACN/水のグラジエントに
よりWaters Xbridge C18 カラム(5uM、30×250mm)を用
いた逆相クロマトグラフィーによって精製した。生成物を凍結乾燥してL3を固体として
得た。MS(m/z):814(M+1)。
L4(Ex.89)の合成
(9H−フルオレン−9−イル)メチル((S)−3−メチル−1−オキソ−1−((
(S)−1−オキソ−1−((4−((((2−(ピリジン−2−イルジスルファニル)
エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)フェニル)アミノ)−5−ウレイドペンタン−
2−イル)アミノ)ブタン−2−イル)カルバメートL3(343mg、0.421mm
ol)およびピペリジン(200uL、2.02mmol)をN,N−ジメチルアセトア
ミド(3mL)に溶解させた。反応混合物を室温で10分間熟成させ、トリフルオロ酢酸
(156uL、2.02mmol)でクエンチし、40mL/分で20分かけての、0.
1%トリフルオロ酢酸を含む5〜40%アセトニトリル/水のグラジエントによりWat
ers Xbridge C18 カラム(5uM、30×250mm)を用いた逆相ク
ロマトグラフィーによって精製した。生成物を凍結乾燥してL4を固体として得た。MS
(m/z):592(M+1)。
L6(Ex.90)の合成
4−((S)−2−((S)−2−アミノ−3−メチルブタンアミド)−5−ウレイド
ペンタンアミド)ベンジル(2−(ピリジン−2−イルジスルファニル)エチル)カルバ
メートL4(238mg、0.346mmol)をジメチルスルホキシド(1.5mL)
に溶かした溶液に、ビス(2,5−ジオキソピロリジン−1−イル)オクタンジオアート
L5(509mg、1.382mmol)およびトリエチルアミン(0.096mL、0
.691mmol)の溶液を加えた。反応混合物を15分間熟成させ、60mL/分で3
0分かけての1〜10%メタノール/ジクロロメタンのグラジエントによりシリカゲルカ
ラム(80g)で精製してL6を固体として得た。MS(m/z):845(M+1)
L8(Ex.91)の合成
RNA化合物L7(163mg、0.024mmol)および2−アジドエタンアミン
ヒドロクロリド(30mg、0.245mmol)をN,N−ジメチルアセトアミド:水
(2mL)のアルゴン脱気した3:1混合物に溶解させた。臭化銅(I)ジメチルスルフ
ィド錯体(12mg、0.059mmol)のアルゴン脱気した溶液を加え、混合物を4
5℃で16時間熟成させた。混合物をEDTA(3mL)の0.5M溶液でクエンチし、
15分放置した。生成物を水に対して(3回)回転透析して単離し、続いて凍結乾燥して
固体を得た。MS(m/z):7086。
L9(Ex.92)の合成
RNA化合物L8(46mg、6.49μmol)およびN−メチルモルホリン(7.
1mL、65μmol)を10℃で水(250μL)およびDMSO(250μL)に溶
解させた。この混合物に、2,5−ジオキソピロリジン−1−イル8−(((S)−3−
メチル−1−オキソ−1−(((S)−1−オキソ−1−((4−((((2−(ピリジ
ン−2−イルジスルファニル)エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)フェニル)アミ
ノ)−5−ウレイドペンタン−2−イル)アミノ)ブタン−2−イル)アミノ)−8−オ
キソオクタノアートL6(18mg、21μmol)をDMSO(500μL)に溶解さ
せた溶液を加えた。反応混合物を16時間熟成させ、水(1.5mL)で希釈し、20m
L/分で15分かけての、100mM 酢酸トリエチルアンモニウムを含む0〜55%ア
セトニトリル/水のグラジエントによりWaters Xbridgeフェニルカラム(
5μM、19×250mm)を用いたイオン対クロマトグラフィーによって精製した。生
成物を水に対して(3回)回転透析して単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(
m/z):8547。
L10−Seq463(Ex.93)の合成
RNA化合物L9(11mg、1.29μmol)を、50mM 酢酸を含むトリフル
オロエタノール(500μL)に溶解させた。この溶液に、50mM 酢酸を含むトリフ
ルオロエタノール(1000μL)に溶解させたペプチドSeq463(8.66mg、
5.15μmol)を加えた。混合物を10分間熟成させ、N−メチルマレイミド(1.
9mg、44μmol)でクエンチし、20mL/分で15分かけての、100mM 酢
酸トリエチルアンモニウムを含む5〜95%アセトニトリル/水のグラジエントによりW
aters Xbridgeフェニルカラム(10μM、19×250mm)を用いたイ
オン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物を水に対して(3回)回転透析して
単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(m/z):11687。
L11−Seq463−j(Ex.94)の合成
L10−Seq463(2.46mg、0.27μmol)をDI水(300μL)に
溶解させた溶液を、B2(3.1mg、0.27μmol)に加え、90℃で1分間加熱
した。溶液を凍結乾燥して二本鎖を白色固体として得た。MS(m/z)パッセンジャー
鎖:9267,ガイド鎖:11686。
L10ペプチドコンジュゲートおよびL11二本鎖の追加合成。
ペプチド配列の追加のL10コンジュゲートおよび対応する二本鎖L11を上記に詳述
したのと類似の方法で調製した。
セクションM。ガイド鎖2’位−10,15ジスルフィドペプチドコンジュゲートの合成
実施例95〜98
スキーム24を図24A−1〜図24B−2に示す。
M1(Ex.95)の合成
3−(ピリジン−2−イルジスルファニル)プロパン酸(506mg、2.35mmo
l)、2−アジドエタンアミンヒドロクロリド(317mg、2.59mmol)、1−
エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(496mg、2.59m
mol)、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(199mg、1.46mmo
l)、およびn−メチルモルホリン(0.44mL、4.7mmol)をジクロロメタン
(25mL)に溶解させた。混合物を1時間熟成させ、飽和炭酸水素ナトリウム溶液(2
5mL)で希釈し、有機層を分離した。その後ジクロロメタンで水相を抽出し(2×25
mL)、合わせた有機物を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、固体濾別し、真空中で濃縮し
た。混合物を、30mL/分で15分かけての、0〜50%酢酸エチル/ジクロロメタン
のグラジエントによりシリカゲルカラム(80g)を用いて精製してM1の透明な油を得
た。MS(m/z):284。
M2(Ex.96)の合成
RNA化合物L7(180mg、26μmol)およびM1(59mg、208μmo
l)を100mMのpH5.5 MES緩衝液(3.6mL)およびアセトニトリル(0
.9mL)に溶解させた。この混合物をアルゴンで15分間脱気した。この溶液に、臭化
銅(I)ジメチルスルフィド錯体(13mg、65μmol)をアセトニトリル(0.4
5mL)に溶解させた脱気した溶液に加え、室温で28時間熟成させた。混合物を、ED
TA(5mL)の100mMのpH8溶液でクエンチし、15分間放置した。混合物を、
30mL/分で15分かけての、100mM 酢酸トリエチルアンモニウムを含む0〜3
0%アセトニトリル/水のグラジエントによりWaters Xbridgeフェニルカ
ラム(5μM、30×150mm)を用いたイオン対クロマトグラフィーによって精製し
た。生成物を水に対して(3回)回転透析して単離し、続いて凍結乾燥してM2の固体を
得た。MS(m/z):7481。
M3−Seq463(Ex.97)の合成
RNA化合物M2(27.3mg、3.65μmol)を、50mM 酢酸を含むトリ
フルオロエタノール(1300μL)に溶解させた。この溶液に、50mM 酢酸を含む
トリフルオロエタノール(1300μL)に溶解させたペプチドSeq463(15.4
mg、9.13μmol)を加えた。混合物を10分間熟成させ、N−メチルマレイミド
(10.1mg、91μmol)でクエンチし、20mL/分で15分かけての、100
mM 酢酸トリエチルアンモニウムを含む5〜80%アセトニトリル/水のグラジエント
によりWaters Xbridgeフェニルカラム(10μM、19×250mm)を
用いたイオン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物を水に対して(3回)回転
透析して単離し、続いて凍結乾燥してM3−Seq463の固体を得た。MS(m/z)
:10624。
M4−Seq463−j(Ex.98)の合成
B2(2.18mg、0.24μmol)をDI水(290μL)に溶解させた溶液を
M3−Seq463(2.5mg、0.24μmol)に加え、90℃で1分間加熱した
。この溶液を凍結乾燥して二本鎖M4−Seq463−jを白色固体として得た。MS(
m/z)パッセンジャー鎖:9267,ガイド鎖:10621
M3ペプチドコンジュゲートおよびM4二本鎖の追加合成。
ペプチド配列の追加のM3コンジュゲートおよび対応する二本鎖M4を上記に詳述した
のと類似の方法で調製した。
セクションN。ガイド鎖2’位−15ジスルフィドペプチドコンジュゲートの合成
実施例99〜100
スキーム25を図25A〜図25B−2に示す。
N3−Seq283(Ex.99)の合成
RNA化合物N2(11mg、1.54μmol;ジ−click基質に関するセクシ
ョンMに詳述するように調製)を、50mM 酢酸を含むトリフルオロエタノール(13
00μL)に溶解させた。この溶液に、50mM 酢酸を含むトリフルオロエタノール(
1300μL)に溶解させたペプチドseq283(3.57mg、2.31μmol)
を加えた。混合物を10分間熟成させ、20mL/分で15分かけての、100mM 酢
酸トリエチルアンモニウムを含む5〜80%アセトニトリル/水のグラジエントによりW
aters Xbridgeフェニルカラム(10μM、19×250mm)を用いたイ
オン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物を水に対して(3回)回転透析して
単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(m/z):8600。
N4−Seq283−k(Ex.100)の合成
B2(5.65mg、0.609μmol)をDI水(423μL)に溶解させた溶液
を、N3−Seq283(5.24mg、0.609μmol)に加え、90℃で1分間
加熱した。溶液を凍結乾燥して二本鎖を白色固体として得た。MS(m/z)パッセンジ
ャー鎖:9268,ガイド鎖:8601。
N3ペプチドコンジュゲートおよびN4二本鎖の追加合成。
ペプチド配列の追加のN3コンジュゲートおよび対応する二本鎖N4を上記に詳述した
のと類似の方法で調製した。
セクションO。ガイド鎖2’位−15ECLペプチドコンジュゲートの合成
実施例101〜103
スキーム26を図26A−1〜図26B−2に示す。
O2(Ex.101)の合成
RNA化合物O1(20.7mg、2.97μmol;L8と類似方法で調製)を10
0mM NaHCO(400μL)およびDMSO(300μL)に溶解させた。この
混合物に、2,5−ジオキソピロリジン−1−イル8−(((S)−3−メチル−1−オ
キソ−1−(((S)−1−オキソ−1−((4−((((2−(ピリジン−2−イルジ
スルファニル)エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)フェニル)アミノ)−5−ウレ
イドペンタン−2−イル)アミノ)ブタン−2−イル)アミノ)−8−オキソオクタノア
ートL6(6.28mg、7.43μmol)をDMSO(250μL)に溶解させた溶
液を加えた。反応混合物を1.5時間熟成させ、水(1.5mL)で希釈し、20mL/
分で15分かけての、100mM 酢酸トリエチルアンモニウムを含む0〜60%アセト
ニトリル/水のグラジエントによりWaters Xbridgeフェニルカラム(5μ
M、19×250mm)を用いたイオン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物
を水に対して(3回)回転透析して単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(m/
z):7696。
O2−Seq463(Ex.102)の合成
RNA化合物O2(10mg、1.30μmol)を、50mM 酢酸を含むトリフル
オロエタノール(1000μL)に溶解させた。この溶液に、50mM 酢酸を含むトリ
フルオロエタノール(500μL)に溶解させたペプチドSeq463(3.28mg、
1.95μmol)を加えた。混合物を1時間熟成させ、20mL/分で15分かけての
、100mM 酢酸トリエチルアンモニウムを含む5〜90%アセトニトリル/水のグラ
ジエントによりWaters Xbridgeフェニルカラム(5μM、19×250m
m)を用いたイオン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物を水に対して(3回
)回転透析して単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(m/z):9268。
O3−Seq463−k(Ex.103)の合成
O2−Seq463(3.02mg、0.326μmol)をDI水(303μL)に
溶解させた溶液をB2(3.02mg、0.326μmol)に加え、90℃で1分間加
熱した。溶液を凍結乾燥して二本鎖を白色固体として得た。MS(m/z)パッセンジャ
ー鎖:9267,ガイド鎖:9264。
O2ペプチドコンジュゲートおよびO3二本鎖の追加合成。
ペプチド配列の追加のO2コンジュゲートおよび対応する二本鎖O3を上記に詳述した
のと類似の方法で調製した。
セクションP。ガイド鎖2’位−15コレステロールおよびペプチドコンジュゲートの合

実施例104〜106
スキーム27を図27A−1〜図27B−2に示す。
P1(Ex.104)の合成
RNA化合物N2(67.2mg、9.39μmol)およびジイソプロピルエチルア
ミン(13.1μL、75μmol)を、水(750μL)、N,N−ジメチルアセトア
ミド(750μL)およびテトラヒドロフラン(1200μL)に溶解させた。この混合
物に、チオコレステロール(30.2mg、75μmol)をテトラヒドロフラン(30
0μL)に溶解させた溶液を加えた。混合物を30分間熟成させ、2M 酢酸トリエチル
アンモニウム(100μL)で希釈し、20mL/分で15分かけての、100mM 酢
酸トリエチルアンモニウムを含む5〜95%アセトニトリル/水のグラジエントによりW
aters Xbridgeフェニルカラム(10μM、19×250mm)を用いたイ
オン対クロマトグラフィーによって精製した。生成物を水に対して(3回)回転透析して
単離し、続いて凍結乾燥して固体を得た。MS(m/z):7451。
P2−Seq32−k(Ex.105)の合成
P1(1.0mg、0.134μmol)をDI水(200μL)に溶解させた溶液を
B10−Seq32(1.86mg、0.129μmol)に加え、90℃で1分間加熱
した。溶液を凍結乾燥して二本鎖を白色固体として得た。MS(m/z)パッセンジャー
鎖:13295,ガイド鎖:7450。
P2−Seq32−m(Ex.106)の合成
実施例105で上記に詳述したのと同一の方法でガイド鎖P1をさらにパッセンジャー
鎖F6−Seq32と二本鎖を形成させて二本鎖P2−Seq32−mを得た:
スキーム28を図28−1〜図28−2に示す。
セクションQ。酵素的に切断された3’リンカービスペプチド
実施例107〜109
スキーム29を図29A−1〜図29C−2に示す。
Q1(Ex.107)の合成
ファルコンチューブ中で、L6(13.82mg、0.016mmol)をDMSO(
1963μl)に溶解させ、氷浴で10℃まで冷却した。別のファルコンチューブ中で、
B4(76.2mg、8.18μmol)をpH8.3 NaHCO 200mM(1
309μl)に溶解させた。RNA溶液をDMSO溶液に加え、5分後、反応が終了した
ことを確認した。
反応を、イオン対クロマトグラフィー(GX−281、XBridge Prep P
henyl 5um、OBD、30×150mm、30mL/分、5〜45%の100m
M TEAAを含む水/100mM TEAAを含むACN、20分のグラジエント)に
より精製した。得られた画分をMillipore 3K、15mL チューブ(420
0rpm、4℃)を用いて水に対して3回透析し、次いで凍結乾燥して白色固体を得た。
Expected mass:10052.834。Found mass:10051
.0。
Q2−Seq74(Ex.108)の合成
反応手順に関するB10−Seq74の合成を参照されたい。Q2−Seq74−Fo
und mass:13940.012。
Q3−Seq74−b(Ex.109)の合成
反応手順に関するB11−Seq74の合成を参照されたい。Q3−Seq74−b−
Found mass:20792。
セクションR。5’,3’ジ−リポペプチドコンジュゲート
実施例110〜112
スキーム30を図30A〜図30E−3に示す。
R2(Ex.110)の合成
L6(23.2mg)をホルムアミド(300μl)およびDMSO(300μl)に
溶解させ、次いでpH8.3 200mM NaHCO水溶液(600μl)に溶解さ
せたR1(50mg)を加えた。5分後、沈殿が見られた。追加のDMSO(300μl
)を加えると、大部分の固体が再溶解した。15分のインキュベーション後、反応を、2
0mL/分で20分の、5〜45%CHCN(100mM TEAA)/水(100m
M TEAA)グラジエントにより、XBridge Prep Phenylカラム(
5uM、30×150mm)を用いて精製し、260nmで集めた。生成物画分を水で希
釈してCHCN含量を20%未満まで下げ、3K膜を通して水に対して4回遠心透析し
た。残留液を凍結し、白色固体に凍結乾燥した。
R3(Ex.111)の合成
R2を500ulの水に溶解させ、スキーム38の化合物35を別の500ulの水に
溶解させ、次いでGS溶液をPS溶液に加え、室温で十分にボルテックスし、次いで分析
用SAX HPLCを点検して二本鎖の形成が確認された。溶液を凍結乾燥して二本鎖を
アモルファス固体として得た。
R4−Seq27−l(Ex.112)の合成
siRNA R3を、50mM 酢酸を含む2,2,2−トリフルオロエタノール(5
00uL)に溶解させた。ペプチドを、50mM 酢酸を含む2,2,2−トリフルオロ
エタノール(500uL)に溶解させ、次いで8M グアニジニウムヒドロクロリド水溶
液(30uL)を加えた。このペプチド溶液にsiRNA溶液を加えて透明な溶液を得た
。1時間後、反応ミックスをホルムアミド(1mL)で希釈し、中性SAX系(緩衝液A
:1:1 水:TFE20mM MES pH5.5 緩衝液B:1:1 水:TFE2
0mM MES pH5.5 1M CsCl)を用いて2回精製した。生成物画分を水
で希釈してTFE含量を50%未満まで下げ、3K膜を通して水に対して3回透析した。
残留液を凍結し、白色固体に凍結乾燥にした。
R3ペプチドコンジュゲートおよびR4二本鎖の追加合成。
ペプチド配列の追加のR3コンジュゲートおよび対応するR4二本鎖を上記に詳述した
のと類似の方法で調製した。
セクションS。代替のTetraGalNAcリガンドの調製
実施例113〜115
TetraGalNAcリガンド化合物17a、17bおよび17cの合成
以下のスキーム31を用いてTetraGalNAc化合物17a、17bおよび17
cを調製した。
スキーム31
Figure 2018083816
化合物13の合成
5−クロロ−1−ペンタノール(3.0g、24.47mmol)化合物11をDMF
(20mL)に溶かした溶液にアジ化ナトリウム(1.909g、29.4mmol)化
合物12を加えた。60℃で一晩撹拌した後、反応混合物を真空中で濃縮した。残渣をシ
リカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/ヘキサン1:3)により精製して生成物化合
物13を透明な液体として得た。H NMR(500MHz,CDCl)δ3.62
(m,2H),3.25(t,J=6.9Hz,2H),1.63−1.53(m,4H
),1.45−1.40(m,2H)。
化合物15の合成
化合物13(0.796g、6.16mmol)およびD−ガラクトサミンペンタアセ
テート(2.00g、5.14mmol)化合物14を20mL DCMに懸濁し、続い
てトリフルオロメタンスルホン酸(0.154g、1.027mmol)を加えた。得ら
れた混合物を一晩還流させた。LC−MSにより、SMの変換が終了したことを確認し、
反応混合物をEtOAcで希釈し、炭酸水素ナトリウムで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥
させた。溶媒を除去し、残渣を、30分かけて100/0〜90/10のISCO DC
M/MeOHにより精製して化合物15を白色固体として得た。H NMR(500M
Hz,CDCl)δ:1.97(6H,s),2.02(6H,s),2.06(6H
,s),2.15(6H,s),3.28(6H,t,J=6.89Hz),3.50(
3H,dt,J=9.63,6.66Hz),3.68(1H,q,J=5.98Hz)
,3.94−3.92(7H,m),4.16−4.15(5H,m),4.73(2H
,d,J=8.34Hz),5.31(2H,dd,J=11.16,3.48Hz),
5.40−5.38(5H,m)。Calculated mass:[M+H]:C
1931,459.2;observed:459.4。
化合物16の合成。
Lys−アルキン化合物A1(130mg、0.436mmol)およびGalNAc
アジド6(999mg、2.178mmol)をTHF(5mL、脱気処理)に溶解させ
た。反応混合物に臭化銅(I)−ジメチルスルフィド錯体(17.91mg、0.087
mmol)を一度に加え、THF溶液を40℃で一晩撹拌した。反応の色がCu2+を示
す青/緑に変化し、反応混合物に、新鮮なアスコルビン酸ナトリウム37mgを含む0.
2mLの水を加え、一晩反応させた。反応を濃縮し、20分かけてRP HPLC 5〜
60 MeCN(0.5%TFA)/水(0.5%TFA)により精製した。集めた画分
を合わせて、凍結乾燥して化合物8を白色固体として得た。Calculated ma
ss:[M+3H]3+:C941451838,134.0,m/z=711.
3;observed:711.9。
化合物17a(Ex.113)の合成
保護されたTetraGalNAc化合物8(300mg、0.141mmol)を含
む0℃のDCM/MeOH=1/1 5mLに、ナトリウムメトキシド(91mg、1.
688mmol)を加えた。反応を1時間撹拌し、2mLの水を加えてクエンチした。揮
発性の溶媒を除去し、反応混合物を、水を用いてP4バイオゲルにより精製し、集めた画
分を合わせて、凍結乾燥して化合物9を白色固体として得た。Calculated m
ass:[M+3H]3+:C701211826,1629.9,m/z=54
3.3;observed:543.8;[M+2H]2+:C7012018
,1628.9,m/z=814.5;observed:814.9。
化合物17bおよび17c(Ex.114およびEx.115)の合成
下記構造を有する化合物17bおよび17cの合成を、適切なアジド供給源を用いて化
合物17aに使用したのと類似の方法で達成した。
Figure 2018083816
実施例116
TetraGalNAcリガンドのコンジュゲーションのスキーム
図31Aおよび図31Bに示したようなスキーム32は、tetraGalNAc−s
iRNAコンジュゲートの調製に使用することができる一般的なスキームを示す。
一般的なスキーム32を用いて、コンジュゲート10−1、10−2、10−3、10
a−1、17a−1、17b−1、17c−1を得ることができる。予め形成したsiR
NA二本鎖または一本鎖にカップリング手順を行い、続いてアニーリングを行えばよい。
あるいは、Bioconjug Chem.2011,22,pp.1723−8に概説
されたプロトコルを利用してもよい。
実施例117
TetraGalNAcアセテート化合物A9によるTetraGalNAc−siRN
Aコンジュゲート(A11−a)の合成
tetraGalNAcアセテート(A9、58.7mg、0.027mmol)をア
セトニトリル(1.5ml)に溶かした溶液に、DIPEA(2.2mg、0.055m
mol)およびHATU(10.44mg、0.027mmol)を加えた。混合物を室
温で30分間撹拌し、水(1.5ml)およびアセトニトリル(1.5ml)中の溶液s
iRNA(0.014mmol)に20分かけてシリンジポンプにより移し、30分間撹
拌してから1.5mLまで真空下で濃縮した。次いで炭酸ナトリウム(218mg、2.
059mmol)、続いてMeOH(0.50ml)を加えた。得られた溶液を室温で1
6時間撹拌し、濃縮し、透析により精製し、凍結乾燥してコンジュゲートA11−aを得
た。
A11−aに関して記載したカップリングプロトコルは、A9の代わりにA10を用い
て行ってもよい。
実施例118〜119
コンジュゲートA11−bおよびA11−c(Ex.118およびEx.119)の合成
コンジュゲートA11−bおよびA11−cについても、類似のプロトコルを使用した
。適切なアンチセンス鎖またはセンス鎖を用いた二本鎖の形成は、B11に関して記載し
たプロトコルを用いて行うことができる。
実施例120
3’5’ビスTetraGalNAc−siRNAコンジュゲート一本鎖18の合成
tetraGalNAc酸化合物10(41.2mg、0.025mmol)をDMS
O(200uL)に溶かした溶液に、HATU(9.6mg、0.025mmol)およ
びDIPEA(17.6uL、0.126mmol)を加えた。混合物を室温で15分間
撹拌し、ジアミノ−siRNA(18.8mg、2.52umol)を水(40uL)お
よびDMSO(360uL)に溶かした溶液に移し、30分間撹拌した。混合物を水(1
.5mL)で希釈し、100mM TEAAを含む0〜30%CHCN/水のグラジエ
ントによりXBridge Prep Phenylカラム(5uM、19×250mm
)を用いて精製した。画分を透析により濃縮し、凍結乾燥して化合物18を得た。
実施例121
3’5’ビスTetraGalNAc−siRNA二本鎖コンジュゲート19−1(Ex
.121)の合成
図32Aおよび図32Bに示したようなスキーム33を用いてTetraGalNAc
−siRNAコンジュゲート19−1を調製した。
3’5’ビスtetraGalNAc−siRNAコンジュゲート18(13.7mg
、1.29umol)を水(200uL)に溶かした溶液を、ガイドsiRNA(9.3
mg、1.35umol)を水(100uL)に溶解させた溶液に加え、90Cで1分間
加熱した。得られた溶液を冷却し、凍結乾燥して二本鎖19−1を得た。
実施例122
TetraGalNAcリガンド化合物24(Ex.122)の合成
以下のスキーム34を用いてtetraGalNAcリガンド化合物24を調製した。
スキーム34
Figure 2018083816
化合物22の合成
N−BOC−1,3−ジアミノプロパン(化合物20、115mg、0.660mmo
l)を1:1 CHCl/CHCN(1mL)に溶かした0℃の溶液に、3−マレ
イミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(化合物21、185mg、
0.695mmol)をアセトニトリル(4mL)およびCHCl(1mL)に溶解
させた溶液を加えた。混合物を1時間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルクロ
マトグラフィー(0〜5%MeOH/CHClにより精製して生成物化合物22を得
た。Calculated mass:[M+H]:C1524,326.
2;observed:326.3。
化合物23の合成
マレイミド化合物22(56mg、0.172mmol)をCHCl(1ml)に
溶かした溶液に、4M HCl(1ml、4.00mmol)をジオキサンに溶かした溶
液を加えた。混合物を1時間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をCHClで共沸し(
2×)、真空下で乾燥させて生成物化合物23を得た。Calculated mass
:[M+H]:C1016,226.1;observed:226.3。
tetraGalNAcマレイミド化合物24(Ex.122)の合成
tetraGalNAc酸化合物10(100mg、0.061mmol)をDMF(
500uL)に溶かした溶液に、HATU(34.9mg、0.092mmol)、Et
N(42.6uL、0.306mmol)およびN−(3−アミノプロピル)−3−(
2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)プロパンアミドヒド
ロクロリド(16.0mg、0.061mmol)を加えた。混合物を室温で1.5時間
撹拌し、TFAで酸性化し、0.1%TFAを含む逆相0〜50%CHCN/水により
精製した。画分を凍結乾燥して化合物24を得た。Calculated mass:[
M+2H]2+:C761252132,1843.8,m/z=921.9;o
bserved:922.7。
実施例123
化合物26の合成
図33Aおよび図33Bに示したようなスキーム35を用いて化合物26を調製した。
2’−3,17プロパルギルsiRNA(RNA25、33mg、4.49umol)
およびPEG9 SPDPアジド(26mg、36umol、市販のPEG−アジドおよ
びピリジルジスルフィド試薬から調製)を3:1 DMA/水(1mL)に溶かした脱気
した溶液に、臭化銅(I)−ジメチルスルフィド錯体(1.8mg、9.0umol)の
脱気した溶液を加えた。混合物を室温で72時間撹拌し、水(2mL)で希釈し、0.4
5uM シリンジフィルターを用いて濾過し、透析により濃縮した。濃縮混合物を、10
0mM TEAAを含む0〜50%CHCN/水のグラジエントを用いたXBridg
e Prep Phenylカラム(5uM、19×250mm)により精製した。画分
を透析により濃縮し、凍結乾燥して化合物26を得た。
実施例124〜125
化合物27および28(Ex.124〜125)の合成
図34A〜図34Cに示したようなスキーム36を用いて化合物27および28を調製
した。
化合物27(Ex.124)の合成
2’−3,17click PEG9 SPDPコンジュゲート26(13.2mg、
1.50μmol)を水(1mL)に溶かした溶液に、TCEPヒドロクロリド(9.1
5mg、32.2umol)を水(0.5mL)に溶解させた溶液を加えた。混合物を室
温で30分間撹拌し、次いで100mM TEAAを含む5〜40%CHCN/水のグ
ラジエントによりXBridge Prep Phenylカラム(5uM、19×25
0mm)を用いて精製した。画分を透析により濃縮し、凍結乾燥して化合物27を得た。
化合物28(Ex.125)の合成
2’−3,17−click PEG9SH27(3mg、0.35μmol)をpH
6.0酢酸塩緩衝液(100uL)に溶かした溶液に、tetraGalNAcマレイミ
ド(5.1mg、2.77μmol)をpH6.0酢酸塩緩衝液(100uL)に溶解さ
せた溶液を加えた。混合物を室温で30分撹拌し、次いで100mM TEAAを含む5
〜40%CHCN/水のグラジエントを用いてXBridge Prep Pheny
lカラム(5uM、19×250mm)により精製した。画分を透析により濃縮し、凍結
乾燥して化合物28を得た。
実施例126
2’−3,17ビスTetraGalNAc−siRNA二本鎖コンジュゲート29の合

コンジュゲート19に関連して詳述した手順を二本鎖28に使用してコンジュゲート2
9を製造した。
実施例127
TetraGalNAcチオール化合物31の合成
下記スキーム37を用いて化合物31を調製した。
スキーム37
Figure 2018083816
tetraGalNAc酸化合物10(54mg、0.033mmol)をN,N−ジ
メチルアセトアミド(500μl)に溶かした溶液に、シスタミンジヒドロクロリド30
(14.9mg、0.066mmol)、EDC(12.7mg、0.066mmol)
、HOAT(10.2mg、0.066mmol)およびDIPEA(57.7μl、0
.330mmol)を加えた。混合物を室温で18時間撹拌し、次いでDTT(50.9
mg、0.330mmol)をN,N−ジメチルアセトアミド(100μl)に溶かした
溶液を加えた。混合物を室温で0.5時間撹拌し、TFAで酸性化し、0.1%TFAを
含む逆相0〜30%CHCN/水により精製した。画分を凍結乾燥して化合物31を得
た。Calculated mass:[M+2H]2+:C681151929
S,1695.8,m/z=847.9;observed:848.0。
実施例128〜130
コンジュゲート35〜37の合成
図35Aおよび図35Bに示したようなスキーム38を用いてコンジュゲート35〜3
7を調製した。
化合物33の合成
2’−click15GS化合物32(130mg、0.019mmol)および(9
H−フルオレン−9−イル)メチル(2−アジドエチル)カルバメート(29.1mg、
0.095mmol)を3:1 DMA/水(2mL)に溶かした脱気した溶液に、臭化
銅(I)−ジメチルスルフィド錯体(9.72mg、0.042mmol)を脱気DMS
O(0.32mL)に溶解させた溶液を加えた。混合物を45℃で2時間撹拌し、室温ま
で冷却し、pH8 EDTA(0.5M、2mL)を加えて反応をクエンチした。15分
間撹拌し、100mM TEAAを含む0〜45%CHCN/水のグラジエントを用い
てXBridge Prep Phenylカラム(5uM、30×150mm)で精製
した。画分を透析により濃縮した。水(3mL)中の合わせた材料に、ピペリジン(93
6μL、1.891mmol)の溶液を加えた。混合物を4℃で18時間保管し、水(1
0mL)で希釈し、シリンジフィルターを通して固体を濾別した。pH8 EDTA(0
.5 M、2mL)を加え、透析により濃縮し、凍結乾燥して化合物33を得た。
化合物34の合成
2’−15click C2 NH2 GS化合物33(43.6mg、6.26μm
ol)を200mM NaHCO3溶液(2000μl)およびホルムアミド(1000
uL)に溶かした溶液に、N−スクシニミジル−3−[2−ピリジルジチオ]プロピオネ
ート(17.9mg、0.057mmol)をDMSO(298uL)に溶解させた溶液
を加えた。混合物を10℃で15分間撹拌し、水(10mL)およびホルムアミド(1m
L)で希釈し、透析により濃縮した。2M TEAA(200uL)を加え、100mM
TEAAを含む5〜40%CHCN/水のグラジエントを用いてXBridge P
rep Phenylカラム(5uM、19×250mm)で精製した。画分を透析によ
り濃縮し、凍結乾燥して化合物34を得た。
2’−15TetraGalNAc−siRNAコンジュゲート35(Ex.128)の
合成
2’−15click C2 NH2 NHS SPDP GS化合物34(13mg
、1.82μmol)を1:1 ホルムアミド/水(200μl)に溶かした溶液に、t
etraGalNAc SH(4.62mg、2.72μmol)をホルムアミド(20
0uL)に溶かした溶液を加えた。混合物を室温で3.5時間撹拌し、2M TEAA(
50uL)を加え、100mM TEAAを含む2〜35%CHCN/水のグラジエン
トを用いてXBridge Prep Phenylカラム(5uM、19×250mm
)で精製した。画分を透析により濃縮し、凍結乾燥した。得られた固体を、2〜30%(
溶媒A:40mM Et3Nを含む60:40 TFE/水、溶媒B:40mM Et3
N、1M グアニジンHClを含む60:40 TFE/水)のグラジエントを用いてP
roteomix SAX−NP10カラム(22.1×50mm)で精製した。画分を
透析により濃縮し、凍結乾燥してコンジュゲート35を得た。
コンジュゲート36および37(Ex.129およびEx.130)の合成
コンジュゲート19−1に関して詳述した手順を二本鎖コンジュゲート35および適切
なパッセンジャー鎖に使用して、それぞれコンジュゲート36および37を調製した。
実施例131〜139
コンジュゲート38〜45(Ex.131〜139)の合成
図36A〜図36Bに示したようなスキーム39を用いてコンジュゲート38〜44を
調製した。
スキーム40。tetraGalNAcをsiRNAにコンジュゲートするのに使用し
た、図37に示した表2の様々なリンカーの例。
ステップ1:パッセンジャー−RNAおよびリンカー、プロトコルを説明するためプロリ
ンを用いた例
FMOC−PRO−OH(11.11mg、0.033μmol)を120μL DM
SOに溶かした溶液に、DIPEA(43.2μl、0.247μmol)、続いてHA
TU(10.96mg、0.029μmol)を加えた。この淡黄色の混合物を室温で3
0分間撹拌した。次いでこの混合物を、オリゴヌクレオチドパッセンジャー鎖TEAA塩
(60mg、8.24μmol)を500μLの(10%H2O/DMSO)に溶かした
溶液に加え、混合物を引き続き室温で1時間撹拌した。反応混合物は、LC−MSにより
所望の生成物を示した。反応混合物にジエチルアミン(43.0μl、0.412μmo
l)を加え、混合物を1時間撹拌し、LC−MSにより所望の生成物を確認した。反応混
合物を、カットオフ分子量3kDaの膜を用いた遠心透析により精製した。このプロセス
を、水を用いて3回繰り返した(各回14mL)。得られた溶液を濃縮し、凍結し、一晩
凍結乾燥して生成物を白色の綿状固体として得た。LC/MSから生成物[7384.9
]が確認された。
ステップ2:TetraGalNAc−リンカー−パッセンジャーRNA
TetraGalNAc化合物10(53.2mg、0.033μmol)を532μ
L DMSOに溶かした溶液に、DIPEA(42.6μl、0.244μmol)、続
いてHATU(12.36mg、0.033μmol)を加えた。この淡黄色の混合物を
室温で30分間撹拌した。次いで混合物を、リンカー−オリゴヌクレオチドパッセンジャ
ー鎖を500μLのDMSOに溶かした溶液に加え、混合物を引き続き室温で2時間撹拌
した。LC/MSにより所望の生成物が示された。反応混合物を、カットオフ分子量3k
Daの膜を用いて遠心透析に供した。このプロセスを、水を用いて3回繰り返した(各回
14mL)。得られた溶液を、XBRIDGE PHENYL、35分間の、200μM
TEAAを含む10〜27%CHCNを用いてGilson PLC 2020によ
り精製した。回収溶液を、カットオフ分子量3kDaの膜を用いて遠心透析により濃縮し
た。得られた濃縮溶液を1.0N NaClで処理し、遠心透析した。このプロセスを、
水を用いて5回繰り返した(各回14mL)。得られた濃縮溶液(約1.5mL)を凍結
し、一晩凍結乾燥して生成物を白色の綿状固体として得た。LC/MSから生成物[90
02.5]が確認された。
ステップ3:二本鎖の形成
1.5mLの水中のTetraGalNAc−リンカー−RNA(18.5mg、2.
055μmol)に、1.5mLの水中のApoBガイド鎖(14.12mg、2.05
5μmol)と二本鎖を形成させた。撹拌子を用いて混合物を90℃で5分間加熱した。
二本鎖を冷却し、撹拌子を除去した。溶液を2日にわたり凍結乾燥して所望の二本鎖コン
ジュゲート38を白色の綿状固体として得た。LC/MSから生成物[16048]が確
認された。
残りのコンジュゲートもすべて、同じ一般的な手順を用いて調製した。
実施例140〜142
化合物/コンジュゲート46〜48の合成
図38A〜図38Eに示したようなスキーム41を用いて化合物および/またはコンジ
ュゲート46〜48を調製した。
RNA化合物46(Ex.140)の合成
SPDP酸(2.2mg、10.3μmol)をDMSO100μLに溶解し、N,N
−ジイソプロピルエチルアミン(14.0μl、0.08mmol)、HATU(19.
6mg、0.051mmol)を連続的に加えた。RNA(15mg、2.06μmol
)を含む200μLのDMSO:水(9:1)を加え、得られた反応混合物を1時間撹拌
し、反応を、3mL 水を加えてクエンチし、500μLになるまで透析し、ホルムアミ
ドにより3mLに希釈し、SAX(緩衝液A:60%TFE水溶液、20mM TEA、
緩衝液B:60%TFE水溶液、20mM TEA、1M CsCl、15分かけての1
00/0〜35/65のA/Bグラジエント)により精製した。集めた画分を合わせて、
水に対して透析し、凍結乾燥して化合物46を白色固体として得た。Calculate
d mass:[M−H]:C2343007215023,748
0.1;observed:7483.0。
コンジュゲート47(Ex.141)の合成
RNA化合物46(22mg、2.9μmol)およびtetraGalNAcチオー
ル化合物31(10.0mg、5.9μmol)をホルムアミド:pH=6.8トリス緩
衝液(3:1)400μLに溶解させ、1時間撹拌した。反応混合物をSAX(緩衝液A
:60%TFE水溶液、20mM TEA、緩衝液B:60%TFE水溶液、20mM
TEA、1M CsCl、15分かけての100/0〜35/65のA/Bグラジエント
)により精製した。集めた画分を合わせて、水に対して透析し、凍結乾燥してコンジュエ
ート47を白色固体として得た。Calculated mass:[M−H]:C
974109017923,9063.9;observed:906
6.2。
コンジュゲート48(Ex.142)の合成
コンジュゲート47(10.9mg、1.20μmol)およびガイド鎖(7.81m
g、1.14μmol)を、RNAseを含まない水1mL中で2時間混合した。反応混
合物を凍結乾燥して二本鎖コンジュゲート48を定量的収率で得た。
実施例143〜145
化合物/コンジュゲート49〜51の合成
図39A〜図39Cに示したようなスキーム42を用いて化合物および/またはコンジ
ュゲート49〜51を調製した。
RNA化合物49(Ex.143)の合成
33.3mgのsiRNAパッセンジャー鎖を4mL バイアルに秤量し、次いで1m
L 100mM NaHCO3を加えて溶解させた。0.86uLのプロピオン酸無水物
を加え、室温で撹拌した。約2時間熟成後、水に対して3回回転透析した。フリットで濾
過し、溶液を凍結乾燥により乾燥させてRNA化合物49を得た。
コンジュゲート50(Ex.144)の合成
ステップ1。2.8mg アジド、25.7mg siRNA、25ml N2でスパ
ージしたDMSOおよび4ml 水を40mL バイアルに仕込む。Nでスパージする
。2.98mLのCu/リガンド溶液(Nでスパージ、20/100umolを含む1
0ml DMSO)を仕込む。スパージしたN下、室温で撹拌する。
ステップ2。化合物10および1ml DMSOを仕込む。6uLのDIPEAを仕込
み、2分間撹拌する。6mg HBTUを仕込み、2分間撹拌する。ステップ1で得られ
たsiRNA混合物を仕込む。反応が終了しなかったため、前述の試薬の仕込みの半分を
繰り返した。反応混合物を蒸発させ、透析し、HPLC精製した(X−Bridge P
henyl、TEAA/ACNグラジエント)。蒸発させ、透析し、凍結乾燥してコンジ
ュゲート50を得た。
コンジュゲート51(Ex.145)の合成
GS(コンジュゲート50)10.65mgを1ml 水に溶解させ、PS(コンジュ
ゲート49)10.20mgを1.17ml 水に溶解させる。8.7mgのコンジュゲ
ート49をコンジュゲート50のすべてに加えて1:1 二本鎖を形成した。90℃に1
分間加熱し、15分にわたり室温まで冷却する。溶液を濾過し、凍結乾燥により乾燥させ
てコンジュゲート51を白色固体として得た。
ルシフェラーゼコンストラクトによる、リポフェクタミンを用いてトランスフェクトした
化合物のRNAサイレンシング活性
ウミシイタケルシフェラーゼの3’UTRにsiRNAの標的部位を含むルシフェラー
ゼベクターを安定的にトランスフェクトしたHEK293細胞を作製した。この細胞を9
6ウェル組織培養プレート(Corning:#3903)に、DMEM 10%血清培
地中1ウェル当たり7.5e3細胞の密度で播種した。次いで細胞プレートを37℃/5
%CO2で24時間インキュベートした。インキュベーション後、製造者のプロトコルに
従いOpti−MEM(Gibco:#31985)中のトランスフェクション試薬リポ
フェクタミン2000(invitrogen:#11668−019)を用いてコトラ
ンスフェクトした被検化合物でプレートを処理した。処理濃度は10nM〜0.03pM
の範囲であった。次いで処理プレートを37℃/5%CO2で24時間インキュベートし
た。インキュベーション処理後、細胞を溶解させ、Dual−GloTM Lucife
rase Assay(Promega:E2920)に従って処理し、TECAN s
afire2プレートリーダーで読み取った。
HepG2細胞における、リポフェクタミンを用いてトランスフェクトした化合物のRN
Aサイレンシング活性
HepG2細胞(ATCC:HB−8065)をコラーゲンコートプレート(BioC
oat:356649)に、DMEM 10%血清培地中1ウェル当たり7.5e3細胞
の密度で播種した。次いで細胞プレートを37℃/5%CO2で24時間インキュベート
した。インキュベーション後、プレートを、invitrogenのプロトコルに従いO
pti−MEM(Gibco:31985)中のトランスフェクション試薬リポフェクタ
ミン2000(invitrogen:11668−019)を用いてコトランスフェク
トした被検化合物で処理した。処理濃度は10nM〜0.03pMの範囲であった。次い
で処理プレートを37℃/5%CO2で24時間インキュベートした。インキュベーショ
ン処理後、提供されたプロトコルに従い細胞をPLA緩衝液(AB:4448542)で
溶解させた。得られた細胞ライセートを、High Capacity cDNA Ki
t(AB:4368813)を用いてcDNAに逆転写し、Life Technolo
gy 7900を用いてqPCRに供した。
RNAi活性のインビボ評価
CD1雌マウスに200ul量で皮下注射により投与した。動物の行動の変化または生
理学的変化を観察した。動物を投与から72時間後にCO2窒息により屠殺し、続いて心
臓穿刺により失血させた。肝臓サンプルは中葉の3mmパンチ標本とし、RNAlate
rの入ったチューブに入れて全RNAを単離した。mRNAノックダウン解析を、標準的
な手順を用いてTaqman解析により行った。
スキーム43。図40に示した表6に使用した表記法の説明を目的とした一般的な記載
。表6に使用した正確なsiRNA配列は表5で確認することができる。
選択した化合物/コンジュゲートのインビトロおよびインビボデータの概略を表6およ
び表7に示す。
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
Figure 2018083816
当業者であれば、本発明が本目的を実行し、記載した目的および利点のほか、それに内
在する目的および利点を得るように十分に適合されていることを容易に理解するであろう
。現時点で好ましい実施形態の代表例である本明細書に記載の方法および組成物は、例示
的なものであり、本発明の範囲を限定することを意図するものではない。当業者であれば
、その変更および他の使用を想到するであろうが、それらは本発明の精神に包含され、特
許請求の範囲の範囲により規定される。

Claims (35)

  1. 1)一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド;
    2)下記式(I)、(II)または(III)の、同一でもあるいは異なっていてもよ
    い1個または複数個のtetraGalNAcリガンド:
    Figure 2018083816
    (式中、Xは−O−、−S−、−CR2−または−NR1−であり、RおよびR
    は各々独立に水素およびC1〜C6アルキルからなる群から選択され;nは1、2、3ま
    たは4であり;かつ
    Figure 2018083816
    による結合は結合点を示す);
    任意に、3)同一でもあるいは異なっていてもよい1個または複数個のリンカー;
    任意に、4)配列番号1〜474から独立に選択される1個または複数個のペプチド、
    または同一でもあるいは異なっていてもよいそれらのD−アミノ酸変異体、レトロインベ
    ルソ型変異体およびシステインコンジュゲーション点変異体;および
    任意に、5)1個または複数個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質お
    よび/またはマスキング剤
    を含む、モジュール組成物。
  2. 1)一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド;
    2)同一でもあるいは異なっていてもよい、式(II)の1〜8個のtetraGal
    NAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−または−NH−であり;nは1
    、2、3または4である);
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい1〜24個のリンカー;
    4)同一でもあるいは異なっていてもよい、配列番号1〜474から独立に選択される
    1〜8個のペプチド;および
    任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含む、請求項1に記載のモジュール組成物。
  3. 1)一本鎖または二本鎖siRNA;
    2)同一でもあるいは異なっていてもよい、式(I)、(II)または(III)の1
    〜8個のtetraGalNAcリガンド(式中、Xは−O−、−S−、−CH−また
    は−NH−であり;nは1、2、3または4である);
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい1〜24個のリンカー;
    4)配列番号1〜474から独立に選択される1〜12個のペプチド、または同一でも
    あるいは異なっていてもよい、それらのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体
    およびシステインコンジュゲーション点変異体;および
    任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含む、モジュール組成物。
  4. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンドお
    よび/または前記ペプチドは、リボース環の異なる2’位、ならびに/または、前記si
    RNAの異なる3’位末端および/もしくは5’位末端で前記siRNAに結合しており
    ;かつ前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、任意にリン
    カーを介して前記siRNAに結合している、モジュール組成物。
  5. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、式(I)、(II)または(III)の
    Xは−O−、−S−または−CH−であり;nは1、2または3である、モジュール組
    成物。
  6. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、同一でもあるいは異なっていてもよい1
    〜4個のtetraGalNAcリガンドを含む、モジュール組成物。
  7. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、同一でもあるいは異なっていてもよい1
    〜8個のペプチドを含む、モジュール組成物。
  8. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドは前記siRNAのリボース環の異なる2’位で
    前記siRNAのガイド鎖またはパッセンジャー鎖に結合している
    モジュール組成物。
  9. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドは異なる3’位末端および/または5’位末端で
    前記siRNAのガイド鎖またはパッセンジャー鎖に結合している
    モジュール組成物。
  10. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドはリボース環の異なる2’位、ならびに/または
    、異なる3’位末端および/もしくは5’位末端で前記siRNAのガイド鎖およびパッ
    センジャー鎖の両方に結合している
    モジュール組成物。
  11. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記ペプチドは前記siRNAのリボース環の異なる2’位で前記siRNAのガイド
    鎖またはパッセンジャー鎖に結合している
    モジュール組成物。
  12. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記ペプチドは異なる3’位末端および/または5’位末端で前記siRNAのガイド
    鎖またはパッセンジャー鎖に結合している
    モジュール組成物。
  13. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記ペプチドはリボース環の異なる2’位、ならびに/または、異なる3’位末端およ
    び/もしくは5’位末端で前記siRNAのガイド鎖およびパッセンジャー鎖の両方に結
    合している
    モジュール組成物。
  14. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンドお
    よび前記ペプチドは前記siRNAの同じ鎖に結合している、モジュール組成物。
  15. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンドお
    よび前記ペプチドは前記siRNAの異なる鎖に結合している、モジュール組成物。
  16. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンドお
    よび前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖または異なる鎖に結合して
    いる、モジュール組成物。
  17. 請求項16に記載のモジュール組成物であって、各リンカーは独立に表1から選択され
    る、モジュール組成物。
  18. 請求項16に記載のモジュール組成物であって、各リンカーは独立に表2から選択され
    る、モジュール組成物。
  19. 請求項18に記載のモジュール組成物であって、前記リンカーは表2から独立に選択さ
    れる分岐リンカーである、モジュール組成物。
  20. 請求項3に記載のモジュール組成物であって、
    前記siRNAは二本鎖であり;かつ
    前記任意選択の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/またはマス
    キング剤はリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖または異なる鎖に結合している
    モジュール組成物。
  21. 1)二本鎖siRNA;
    2)下記式(IV)、(V)または(VI)の1〜8個のtetraGalNAcリガ
    ンド:
    Figure 2018083816
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表1から独立に選択される1〜24個のリ
    ンカー;
    4)同一でもあるいは異なっていてもよい、配列番号1〜474から独立に選択される
    1〜12個のペプチド、またはそれらのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体
    およびシステインコンジュゲーション点変異体;および、
    任意に、5)1〜8個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含むモジュール組成物。
  22. 請求項21に記載のモジュール組成物であって、
    1)二本鎖siRNA;
    2)式(V)の1〜4個のtetraGalNAcリガンド;
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表1から独立に選択される1〜12個のリ
    ンカー;
    4)同一でもあるいは異なっていてもよい、配列番号1〜474から独立に選択される
    1〜8個のペプチド、またはそれらのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体お
    よびシステインコンジュゲーション点変異体;および、
    任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含み、
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、リボース環の異
    なる2’位、ならびに/または、前記siRNAの異なる3’位末端および/もしくは5
    ’位末端で前記siRNAに結合しており;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、任意にリンカー
    を介して前記siRNAに結合している
    モジュール組成物。
  23. 請求項21に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンド
    および前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖に結合している、モジュ
    ール組成物。
  24. 請求項21に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンド
    および前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの異なる鎖に結合している、モジ
    ュール組成物。
  25. 請求項21に記載の組成物であって、
    1)二本鎖siRNA;
    2)式(V)の1〜4個のtetraGalNAcリガンド;
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表2から独立に選択される1〜12個のリ
    ンカー;
    4)同一でもあるいは異なっていてもよい、配列番号2、3、5、7、11、13、1
    9、22、27〜32、55、56、63、64、69、71〜74、86、90、94
    、95、106、137、192、200、201、228、229、266、282、
    333、337、407、423、436、437、461〜463、467、468、
    470、473および474から独立に選択される配列番号から独立に選択される1〜8
    個のペプチド、またはそれらのD−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体およびシ
    ステインコンジュゲーション点変異体;および、
    任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含み、
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、リボース環の異
    なる2’位、ならびに/または、前記siRNAの異なる3’位末端および/もしくは5
    ’位末端で前記siRNAに結合しており;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、リンカーを介し
    て前記siRNAに結合している
    モジュール組成物。
  26. 請求項25に記載のモジュール組成物であって、同一でもあるいは異なっていてもよい
    、配列番号2、3、5、7、11、13、19、22、27〜32、55、56、63、
    64、69、71〜74、86、90、94、95、106、137、192、200、
    201、228、229、266、282、333、337、407、423、436、
    437、461〜463、467、468、470、473および474から独立に選択
    される前記ペプチドのD−アミノ酸を含む、モジュール組成物。
  27. 請求項25に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンド
    および前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖または異なる鎖に結合し
    ている、モジュール組成物。
  28. 請求項25に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンド
    および前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの異なる鎖に結合している、モジ
    ュール組成物。
  29. 請求項25に記載のモジュール組成物であって、
    1)二本鎖siRNA;
    2)式(V)の1〜4個のtetraGalNAcリガンド;
    3)同一でもあるいは異なっていてもよい、表2から独立に選択される1〜12個のリ
    ンカー;
    4)同一でもあるいは異なっていてもよい、配列番号2、3、5、7、11、13、1
    9、22、27〜32、55、56、63、64、69、71〜74、86、90、94
    、95、106、137、192、200、201、228、229、266、282、
    333、337、407、423、436、437、461〜463、467、468、
    470、473および474から独立に選択される1〜8個のペプチド、またはそれらの
    D−アミノ酸変異体、レトロインベルソ型変異体およびシステインコンジュゲーション点
    変異体;および、
    任意に、5)1〜4個の標的化リガンド、可溶化剤、薬物動態改善剤、脂質および/ま
    たはマスキング剤
    を含み、
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、リボース環の異
    なる2’位、ならびに/または、前記siRNAの異なる3’位末端および/もしくは5
    ’位末端で前記siRNAに結合しており;かつ
    前記tetraGalNAcリガンドおよび/または前記ペプチドは、リンカーを介し
    て前記siRNAに結合している
    モジュール組成物。
  30. 請求項29に記載のモジュール組成物であって、前記tetraGalNAcリガンド
    および前記ペプチドはリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖または異なる鎖に結合し
    ている、モジュール組成物。
  31. 1個のtetraGalNAcリガンドを含む請求項29に記載のモジュール組成物で
    あって、前記tetraGalNAcリガンドはリンカーを介して前記siRNAに結合
    している、モジュール組成物。
  32. 1個のペプチドを含む請求項29に記載のモジュール組成物であって、前記ペプチドは
    リンカーを介して前記siRNAに結合している、モジュール組成物。
  33. 2〜4個のtetraGalNAcリガンドを含む請求項29に記載のモジュール組成
    物であって、前記tetraGalNAcリガンドはリンカーを介して前記siRNAの
    同じ鎖または異なる鎖に結合している、モジュール組成物。
  34. 2〜4個のペプチドを含む請求項29に記載のモジュール組成物であって、前記ペプチ
    ドはリンカーを介して前記siRNAの同じ鎖または異なる鎖に結合している、モジュー
    ル組成物。
  35. 請求項1に記載のモジュール組成物および薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物
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