JP2017522326A5 - - Google Patents
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Description
本明細書に開示されている組成物を含む非小細胞肺がんワクチンがさらに本明細書の記載に含まれる。ワクチンは、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与することができる。ワクチンは、対象に、追加の治療剤よりも前、それよりも後、またはそれと組み合わせて投与することができる。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離され精製されたプラスミド、ならびに賦形剤を含む組成物であって、前記ポリペプチドが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択される複数のエピトープを含む、組成物。
(項目2)
前記複数のエピトープが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記複数のエピトープが、配列番号1〜45のうちの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む、項目1に記載の組成物。
(項目4)
前記複数のエピトープが複数の隣接したエピトープである、項目1から3のいずれか一項に記載の組成物。
(項目5)
前記隣接したエピトープが、前記エピトープ配列のうちの1つまたは複数の間にリンカーをさらに含む、項目4に記載の組成物。
(項目6)
追加のポリペプチドをコードする追加のヌクレオチド配列を含む追加の単離され精製されたプラスミドをさらに含み、前記追加のポリペプチドが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む複数のエピトープを含む、項目1から5のいずれか一項に記載の組成物。
(項目7)
前記ポリペプチドと前記追加のポリペプチドとの配列が異なる、項目6に記載の組成物。
(項目8)
前記組成物が、第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミドをさらに含み、前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択されるペプチドの一部分であり、前記第1のヌクレオチド配列がプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目9)
前記組成物が、
第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミド、および
第2のヌクレオチド配列
をさらに含み、
前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、
前記第2のヌクレオチド配列が、第2の抗原の第2のエピトープをコードし、
前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択され、前記第1のヌクレオチド配列および前記第2のヌクレオチド配列が、1つまたは複数のプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目10)
前記ペプチドCDC25Bのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に
記載の組成物。
(項目11)
前記ペプチドCOX2のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目12)
前記ペプチドEGFRのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号11〜13のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目13)
前記ペプチドFASCIN1のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号14〜22のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目14)
前記ペプチドIGF1Rのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号23〜26のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目15)
前記ペプチドPRL3のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目16)
前記ペプチドRCAS1のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号32〜36のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目17)
前記ペプチドVCPのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号37〜45のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目18)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目8から17のいずれか一項に記載の組成物。
(項目19)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目8から18のいずれか一項に記載の組成物。
(項目20)
前記組成物が、第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミドをさらに含み、前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から選択されるペプチドの一部分であり、前記第1のヌクレオチド配列がプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目21)
前記組成物が、
第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミド、および
第2のヌクレオチド配列
をさらに含み、
前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、
前記第2のヌクレオチド配列が、第2の抗原の第2のエピトープをコードし、
前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択され、前記第1のヌクレオチド配列および前記第2のヌクレオチド配列が、1つまたは複数のプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目22)
前記ペプチドCDC25Bのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目23)
前記ペプチドCOX2のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目24)
前記ペプチドPRL3のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目25)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目20から24のいずれか一項に記載の組成物。
(項目26)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目20から25のいずれか一項に記載の組成物。
(項目27)
前記第1および前記第2の核酸配列が、前記第1のプラスミド上に位置する、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目28)
前記第2の核酸配列が、第2のプラスミド上に位置する、前記項目のいずれかに記載の組成物。
(項目29)
前記第1および前記第2の核酸配列が、少なくとも70%の純度に精製される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目30)
少なくとも前記第1のプラスミドが医薬組成物中に含有される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目31)
前記第1および前記第2の核酸配列が、前記第1のプラスミド上に位置し、リンカー核酸の配列によって隔てられている、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目32)
前記第1の核酸配列が、前記第1のプラスミド上で前記第2の核酸配列に隣接している、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目33)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープをさらに含み、前記第1のエピトープがCDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択されるペプチドの一部分である、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目34)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープ、および
第2の抗原の少なくとも第2のエピトープ
をさらに含み、前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目35)
前記ペプチドCDC25Bの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目36)
前記ペプチドCOX2の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目37)
前記ペプチドEGFRの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号11〜13のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目38)
前記ペプチドFASCIN1の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号14〜22のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目39)
前記ペプチドIGF1Rの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号23〜26のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目40)
前記ペプチドPRL3の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目41)
前記ペプチドRCAS1の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号32〜36のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目42)
前記ペプチドVCPの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号37〜45のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目43)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目33から42のいずれか一項に記載の組成物。
(項目44)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目33から43のいずれか一項に記載の組成物。
(項目45)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープを含み、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から選択されるペプチドの一部分である、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目46)
前記組成物が第1の抗原の、少なくとも第1のエピトープ、および
第2の抗原の少なくとも第2のエピトープ
を含み、前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目47)
前記ペプチドCDC25Bの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目48)
前記ペプチドCOX2の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目49)
前記ペプチドPRL3の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目50)
前記組成物が、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目45から49のいずれか一項に記載の組成物。
(項目51)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される、項目45から50のいずれか一項に記載の組成物。
(項目52)
前記組成物が、対象に投与される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目53)
結腸直腸がんに関連する細胞が、異型特徴を発現する結腸細胞、異型特徴を発現する直腸細胞、前新生物結腸細胞、前新生物直腸細胞、結腸がん細胞、直腸がん細胞、前浸潤結腸がん細胞、前浸潤直腸がん細胞、結腸がん幹細胞、直腸がん幹細胞、上皮細胞、間葉細胞、間質細胞、およびこれらの組合せからなる群から選択される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目54)
非小細胞肺がんに関連する細胞が、異型特徴を発現する肺細胞、前新生物肺細胞、肺がん細胞、前浸潤肺がん細胞、肺がん幹細胞、上皮細胞、間葉細胞、間質細胞、およびこれらの組合せからなる群から選択される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目55)
前記組成物が、対象において免疫応答を引き出すのに有効である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目56)
前記組成物が、対象において結腸直腸がん、非小細胞肺がん、または卵巣がんに関連するいくつかの細胞を排除するのに有効である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物
。
(項目57)
前記組成物が、対象において結腸直腸がん、非小細胞肺がん、または卵巣がんに関連する細胞の増殖を予防するために使用することができる、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目58)
前記免疫応答が1型免疫応答である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目59)
少なくとも前記第1のエピトープが医薬組成物中に含有される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目60)
医薬担体および/またはアジュバントをさらに含む、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目61)
前記第1および前記第2のエピトープのアミノ酸配列がリンカーアミノ酸の配列によって隔てられている、項目33から60のいずれか一項に記載の組成物。
(項目62)
前記第1のエピトープのアミノ酸配列が、前記第2のエピトープのアミノ酸配列に隣接している、項目33から60のいずれか一項に記載の組成物。
(項目63)
前記免疫応答が、I型サイトカイン産生のII型サイトカイン産生に対する比率が1超であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目64)
前記免疫応答が、I型サイトカイン産生のII型サイトカイン産生に対する比率が1未満であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目65)
前記免疫応答が、IFN−γ産生のIL−10産生に対する比率が1超であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目66)
前記免疫応答が、IFN−γ産生のIL−10産生に対する比率が1未満であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目67)
前記アジュバントがGM−CSFである、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目68)
結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんを処置する必要がある対象において結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんを処置する方法であって、前記対象に、前記項目のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む方法。
(項目69)
結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんの寛解持続時間を延長させる必要がある対象において結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんの寛解持続時間を延長させる方法であって、前記対象に、項目1から67のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む方法。
(項目70)
少なくとも1回用量の前記組成物が投与される、項目68または69に記載の方法。
(項目71)
前記組成物が、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目68から70のいずれか一項に記載の方法。
(項目72)
前記対象に追加の治療剤を投与するステップをさらに含む、項目68から71のいずれか一項に記載の方法。
(項目73)
配列番号1〜45から選択されるエピトープ配列に対して少なくとも70%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む、単離され精製されたプラスミド。
(項目74)
前記少なくとも1つのヌクレオチド配列が、配列番号1〜45から選択されるエピトープ配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする、項目73に記載のプラスミド。
(項目75)
前記少なくとも1つのヌクレオチド配列が、配列番号1〜45のうちの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも70%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする、項目72に記載のプラスミド。
(項目76)
前記プラスミドが、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%純粋である、項目72から75のいずれか一項に記載のプラスミド。
(項目77)
項目1から67に記載の組成物を含む結腸直腸がんワクチン。
(項目78)
前記ワクチンが、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目77に記載の結腸直腸がんワクチン。
(項目79)
前記ワクチンが、対象に、追加の治療剤よりも前、それよりも後、またはそれと組み合わせて投与される、項目77または78に記載の結腸直腸がんワクチン。
(項目80)
項目1から67に記載の組成物を含む非小細胞肺がんワクチン。
(項目81)
前記ワクチンが、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目80に記載の非小細胞肺がんワクチン。
(項目82)
前記ワクチンが、対象に、追加の治療剤よりも前、それよりも後、またはそれと組み合わせて投与される、項目80または81に記載の非小細胞肺がんワクチン。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離され精製されたプラスミド、ならびに賦形剤を含む組成物であって、前記ポリペプチドが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択される複数のエピトープを含む、組成物。
(項目2)
前記複数のエピトープが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記複数のエピトープが、配列番号1〜45のうちの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む、項目1に記載の組成物。
(項目4)
前記複数のエピトープが複数の隣接したエピトープである、項目1から3のいずれか一項に記載の組成物。
(項目5)
前記隣接したエピトープが、前記エピトープ配列のうちの1つまたは複数の間にリンカーをさらに含む、項目4に記載の組成物。
(項目6)
追加のポリペプチドをコードする追加のヌクレオチド配列を含む追加の単離され精製されたプラスミドをさらに含み、前記追加のポリペプチドが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%の配列同一性を含む1つまたは複数のエピトープを含む複数のエピトープを含む、項目1から5のいずれか一項に記載の組成物。
(項目7)
前記ポリペプチドと前記追加のポリペプチドとの配列が異なる、項目6に記載の組成物。
(項目8)
前記組成物が、第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミドをさらに含み、前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択されるペプチドの一部分であり、前記第1のヌクレオチド配列がプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目9)
前記組成物が、
第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミド、および
第2のヌクレオチド配列
をさらに含み、
前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、
前記第2のヌクレオチド配列が、第2の抗原の第2のエピトープをコードし、
前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択され、前記第1のヌクレオチド配列および前記第2のヌクレオチド配列が、1つまたは複数のプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目10)
前記ペプチドCDC25Bのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に
記載の組成物。
(項目11)
前記ペプチドCOX2のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目12)
前記ペプチドEGFRのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号11〜13のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目13)
前記ペプチドFASCIN1のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号14〜22のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目14)
前記ペプチドIGF1Rのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号23〜26のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目15)
前記ペプチドPRL3のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目16)
前記ペプチドRCAS1のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号32〜36のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目17)
前記ペプチドVCPのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号37〜45のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目8または9に記載の組成物。
(項目18)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目8から17のいずれか一項に記載の組成物。
(項目19)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目8から18のいずれか一項に記載の組成物。
(項目20)
前記組成物が、第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミドをさらに含み、前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から選択されるペプチドの一部分であり、前記第1のヌクレオチド配列がプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目21)
前記組成物が、
第1のヌクレオチド配列を含む第1のプラスミド、および
第2のヌクレオチド配列
をさらに含み、
前記第1のヌクレオチド配列が、第1の抗原の第1のエピトープをコードし、
前記第2のヌクレオチド配列が、第2の抗原の第2のエピトープをコードし、
前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択され、前記第1のヌクレオチド配列および前記第2のヌクレオチド配列が、1つまたは複数のプラスミド内に位置する、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目22)
前記ペプチドCDC25Bのエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目23)
前記ペプチドCOX2のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目24)
前記ペプチドPRL3のエピトープをコードする核酸配列が、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目20または21に記載の組成物。
(項目25)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目20から24のいずれか一項に記載の組成物。
(項目26)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目20から25のいずれか一項に記載の組成物。
(項目27)
前記第1および前記第2の核酸配列が、前記第1のプラスミド上に位置する、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目28)
前記第2の核酸配列が、第2のプラスミド上に位置する、前記項目のいずれかに記載の組成物。
(項目29)
前記第1および前記第2の核酸配列が、少なくとも70%の純度に精製される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目30)
少なくとも前記第1のプラスミドが医薬組成物中に含有される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目31)
前記第1および前記第2の核酸配列が、前記第1のプラスミド上に位置し、リンカー核酸の配列によって隔てられている、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目32)
前記第1の核酸配列が、前記第1のプラスミド上で前記第2の核酸配列に隣接している、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目33)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープをさらに含み、前記第1のエピトープがCDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから選択されるペプチドの一部分である、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目34)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープ、および
第2の抗原の少なくとも第2のエピトープ
をさらに含み、前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目35)
前記ペプチドCDC25Bの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目36)
前記ペプチドCOX2の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目37)
前記ペプチドEGFRの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号11〜13のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目38)
前記ペプチドFASCIN1の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号14〜22のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目39)
前記ペプチドIGF1Rの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号23〜26のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目40)
前記ペプチドPRL3の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目41)
前記ペプチドRCAS1の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号32〜36のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目42)
前記ペプチドVCPの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号37〜45のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目33または34に記載の組成物。
(項目43)
前記組成物が、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目33から42のいずれか一項に記載の組成物。
(項目44)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、EGFR、FASCIN1、IGF1R、PRL3、RCAS1、およびVCPから独立に選択される、項目33から43のいずれか一項に記載の組成物。
(項目45)
前記組成物が、第1の抗原の少なくとも第1のエピトープを含み、前記第1のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から選択されるペプチドの一部分である、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目46)
前記組成物が第1の抗原の、少なくとも第1のエピトープ、および
第2の抗原の少なくとも第2のエピトープ
を含み、前記第1および前記第2のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物。
(項目47)
前記ペプチドCDC25Bの少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号1〜2のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目48)
前記ペプチドCOX2の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号3〜10のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目49)
前記ペプチドPRL3の少なくとも第1のエピトープが、アミノ酸配列から選択され、前記アミノ酸配列が、配列番号27〜31のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有する、項目45または46に記載の組成物。
(項目50)
前記組成物が、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される第1および第2のエピトープを含む、項目45から49のいずれか一項に記載の組成物。
(項目51)
前記組成物が、少なくとも追加のエピトープをさらに含み、前記第1および第2のエピトープならびに前記少なくとも追加のエピトープが、CDC25B、COX2、およびPRL3から独立に選択される、項目45から50のいずれか一項に記載の組成物。
(項目52)
前記組成物が、対象に投与される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目53)
結腸直腸がんに関連する細胞が、異型特徴を発現する結腸細胞、異型特徴を発現する直腸細胞、前新生物結腸細胞、前新生物直腸細胞、結腸がん細胞、直腸がん細胞、前浸潤結腸がん細胞、前浸潤直腸がん細胞、結腸がん幹細胞、直腸がん幹細胞、上皮細胞、間葉細胞、間質細胞、およびこれらの組合せからなる群から選択される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目54)
非小細胞肺がんに関連する細胞が、異型特徴を発現する肺細胞、前新生物肺細胞、肺がん細胞、前浸潤肺がん細胞、肺がん幹細胞、上皮細胞、間葉細胞、間質細胞、およびこれらの組合せからなる群から選択される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目55)
前記組成物が、対象において免疫応答を引き出すのに有効である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目56)
前記組成物が、対象において結腸直腸がん、非小細胞肺がん、または卵巣がんに関連するいくつかの細胞を排除するのに有効である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物
。
(項目57)
前記組成物が、対象において結腸直腸がん、非小細胞肺がん、または卵巣がんに関連する細胞の増殖を予防するために使用することができる、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目58)
前記免疫応答が1型免疫応答である、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目59)
少なくとも前記第1のエピトープが医薬組成物中に含有される、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目60)
医薬担体および/またはアジュバントをさらに含む、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目61)
前記第1および前記第2のエピトープのアミノ酸配列がリンカーアミノ酸の配列によって隔てられている、項目33から60のいずれか一項に記載の組成物。
(項目62)
前記第1のエピトープのアミノ酸配列が、前記第2のエピトープのアミノ酸配列に隣接している、項目33から60のいずれか一項に記載の組成物。
(項目63)
前記免疫応答が、I型サイトカイン産生のII型サイトカイン産生に対する比率が1超であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目64)
前記免疫応答が、I型サイトカイン産生のII型サイトカイン産生に対する比率が1未満であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目65)
前記免疫応答が、IFN−γ産生のIL−10産生に対する比率が1超であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目66)
前記免疫応答が、IFN−γ産生のIL−10産生に対する比率が1未満であることを特徴とする、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目67)
前記アジュバントがGM−CSFである、前記項目のいずれか一項に記載の組成物。
(項目68)
結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんを処置する必要がある対象において結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんを処置する方法であって、前記対象に、前記項目のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む方法。
(項目69)
結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんの寛解持続時間を延長させる必要がある対象において結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんの寛解持続時間を延長させる方法であって、前記対象に、項目1から67のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む方法。
(項目70)
少なくとも1回用量の前記組成物が投与される、項目68または69に記載の方法。
(項目71)
前記組成物が、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目68から70のいずれか一項に記載の方法。
(項目72)
前記対象に追加の治療剤を投与するステップをさらに含む、項目68から71のいずれか一項に記載の方法。
(項目73)
配列番号1〜45から選択されるエピトープ配列に対して少なくとも70%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む、単離され精製されたプラスミド。
(項目74)
前記少なくとも1つのヌクレオチド配列が、配列番号1〜45から選択されるエピトープ配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする、項目73に記載のプラスミド。
(項目75)
前記少なくとも1つのヌクレオチド配列が、配列番号1〜45のうちの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも70%、80%、85%、90%、95%、または99%の配列同一性を含むポリペプチドをコードする、項目72に記載のプラスミド。
(項目76)
前記プラスミドが、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%純粋である、項目72から75のいずれか一項に記載のプラスミド。
(項目77)
項目1から67に記載の組成物を含む結腸直腸がんワクチン。
(項目78)
前記ワクチンが、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目77に記載の結腸直腸がんワクチン。
(項目79)
前記ワクチンが、対象に、追加の治療剤よりも前、それよりも後、またはそれと組み合わせて投与される、項目77または78に記載の結腸直腸がんワクチン。
(項目80)
項目1から67に記載の組成物を含む非小細胞肺がんワクチン。
(項目81)
前記ワクチンが、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与される、項目80に記載の非小細胞肺がんワクチン。
(項目82)
前記ワクチンが、対象に、追加の治療剤よりも前、それよりも後、またはそれと組み合わせて投与される、項目80または81に記載の非小細胞肺がんワクチン。
Claims (31)
- ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離され精製されたプラスミドを含む組成物であって、前記ポリペプチドが、配列番号1〜22および27〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を各々含む複数の配列を含む、組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号23〜26から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を含む配列をさらに含む、請求項1に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜22および27〜45から選択される少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%の配列同一性を各々含む、請求項1から2のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号23〜26から選択される少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%の配列同一性を含む配列をさらに含む、請求項2から3のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、複数の隣接した配列である、請求項1から4のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の隣接した配列が、前記複数の配列のうちの1つまたは複数の配列の間にリンカーをさらに含む、請求項5に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜22または27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、および配列番号1〜22および27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列を含み、前記第1の配列と前記第2の配列とが異なる配列である、請求項1から6のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜2に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、配列番号3〜10に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列、および配列番号27〜30に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第3の配列を含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜22および27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、ならびに配列番号1〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列を含み、前記第1の配列と前記第2の配列とが異なる配列である、請求項1から6のいずれか一項に記載の組成物。
- 賦形剤をさらに含む、請求項1から9のいずれか一項に記載の組成物。
- 組成物であって、
a)第1のポリペプチドをコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の単離され精製されたプラスミドであって、前記第1のポリペプチドが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を含む少なくとも1つの配列を含む、プラスミド、ならびに
b)第2のポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の単離され精製されたプラスミドであって、前記第2のポリペプチドが、配列番号1〜22および27〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を含む少なくとも1つの配列を含む、プラスミド
を含む、組成物。 - 前記第1のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列が、前記第2のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列とは異なる、請求項11に記載の組成物。
- 前記第1のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列が、配列番号1〜45から選択される配列からの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%の配列同一性を含む、請求項11から12のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第2のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列が、配列番号1〜22および27〜45から選択される配列からの少なくとも8個連続したアミノ酸に対して少なくとも90%の配列同一性を含む、請求項11から13のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のポリペプチドが、配列番号1〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を各々含む第1の複数の配列を含む、請求項11から14のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第2のポリペプチドが、配列番号1〜22および27〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を各々含む第2の複数の配列を含む、請求項11から15のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1の複数の配列が、複数の隣接した配列である、請求項15に記載の組成物。
- 前記第2の複数の配列が、複数の隣接した配列である、請求項16に記載の組成物。
- 前記隣接した配列が、前記第1の複数の配列のうちの2つまたはそれより多くの配列の間にリンカーをさらに含む、請求項17に記載の組成物。
- 前記隣接した配列が、前記第2の複数の配列のうちの2つまたはそれより多くの配列の間にリンカーをさらに含む、請求項18に記載の組成物。
- 前記第1のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列が、配列番号1〜2に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、配列番号3〜10に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列、ならびに配列番号27〜30に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第3の配列を含む、請求項11から20のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第2のポリペプチドの前記少なくとも1つの配列が、配列番号1〜2に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、配列番号3〜10に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列、ならびに配列番号27〜30に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第3の配列を含む、請求項11から21のいずれか一項に記載の組成物。
- 賦形剤をさらに含む、請求項11から22のいずれか一項に記載の組成物。
- 処置を必要とする被験体を処置する方法において使用するための組成物であって、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むプラスミドを含み、前記ポリペプチドは、配列番号1〜22および27〜45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を各々含む複数の配列を含む、組成物。
- 前記ポリペプチドが、配列番号23〜26から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を含む配列をさらに含む、請求項24に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜22または27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、および配列番号1〜22および27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列を含み、前記第1の配列と前記第2の配列とは異なる配列である、請求項24から25のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜2に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、配列番号3〜10に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列、および配列番号27〜30に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第3の配列を含む、請求項24から25のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記複数の配列が、配列番号1〜22および27〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第1の配列、ならびに配列番号1〜45に対して少なくとも90%の配列同一性からなる配列から選択される第2の配列を含み、前記第1の配列と前記第2の配列とが異なる配列である、請求項24から25のいずれか一項に記載の組成物。
- 結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんの寛解持続時間が延長される、請求項24から28のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記処置の必要がある被験体が、結腸直腸がんまたは非小細胞肺がんを有する、請求項24から29のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記組成物が、皮下注射、皮内注射、筋肉内注射、血管内注射、局所適用または吸入によって投与されることを特徴とする、請求項24から30のいずれか一項に記載の組成物。
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