JP2017507328A - 室温での全血の安定化 - Google Patents
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Abstract
Description
全血は、医学において、診断分析のため、最も頻繁に収集される試料材料の1つである。しかし、全血のサンプリングおよび分析は、通常、別個の事象である。サンプリング工程後、インタクトな細胞、特にインタクトな有核細胞の長期に渡る安定化に関して、大きな技術的困難が存在する。当該技術分野には、サンプリングおよび分析の間の時間間隔を橋渡しするため、全血試料における有核細胞の生物学的状態を保存する特別な願望がある。Olson WCら(Journal of Translational Medicine 9 (2011) 26)、Tannerら(Clin. Lab. Haem. 24 (2002) 337−341)、Baechlerら(Genes and Immunity 5 (2004) 347−353)、およびElliottら(International Journal of Epidemiology 37 (2008) 234−244)を参照されたい。「生物学的状態の保存」または「安定化」は、細胞を、損なわれておらず、そして生存した状態で維持しながら、サンプリング時点で生存細胞中に存在する生体分子の組成およびレベルに関する変化が最小限である条件を提供すると理解される。これに関する関心対象の特定の生体分子は、DNA、RNAおよびタンパク質である。
本明細書において、用語「含む」は、最終結果に影響を及ぼさない他の工程および他の構成要素を利用してもよいことを意味する。用語「含む」は、表現「からなる」および「本質的にからなる」を含む。単数形の識別語、例えば「the」、「a」、または「an」の使用は、単一の構成要素の使用にのみ限定することを意図せず、多数の構成要素を含むことも可能である。例えば、別に言及しない限り、表現「化合物(a compound)」は、「1またはそれより多い化合物」の意味を有する。本明細書において、「複数」は、1より多いを意味すると理解される。例えば、複数は、少なくとも2、3、4、5、またはそれより多くを指す。特に言及しない限り、または文脈から明らかでない限り、本明細書において、用語「または」は包括的であると理解される。用語「および/または」は、列挙する要素の1またはすべて、あるいは列挙する要素の任意の2またはそれより多くの組み合わせを意味する。範囲は、本明細書において、その範囲内の各々およびすべての値を記載するための簡潔表現として用いられる(例えば1〜5には、1、1.5、2、2.75、3、3.80、4、5等が含まれる)。範囲内のいかなる値も、その範囲の末端として選択可能である。特に言及しない限り、または文脈から明らかでない限り、本明細書において、用語「約」は、当該技術分野の正常な許容範囲の範囲内と理解され、例えば平均の2標準偏差以内と理解される。異なって示されない場合、「約」は、言及する値の10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、または0.01%以内と理解される。別に文脈から明らかでない限り、本明細書に提供するすべての数値は、用語「約」によって修飾可能である。
細胞タンパク質の保存
MDA−MB−468、ヒト乳癌細胞株の懸濁細胞を、健康な個人から得た血液試料内にスパイク処理して、1ml血液あたり100,000のスパイク処理細胞を生じた。試料を直ちにまたは室温で48時間保管した後のいずれかでプロセシングした。試料1は、抗凝血剤としてEDTAのみを含有し、そして添加剤はなく、試料2〜6には、それぞれ、Sivelestat(10μg/ml)、Pefabloc(登録商標)SC(1mM)、SkQ1(100nM)、MitoQ(100nM)およびグルタチオン(3mM)を補充した。
細胞タンパク質の保存
MDA−MB−468細胞を、健康な個人から得た血液試料内にスパイク処理して、100,000スパイク処理細胞/ml血液の濃度を生じた。試料を直ちにまたは室温で48時間保管した後のいずれかでプロセシングした。試料1は、単独の抗凝血剤としてEDTAを含有し、そしてさらなる添加剤を含有せず、試料2〜4は、安定化剤として、クエン酸塩(11.7mM)/クエン酸(2.1mM)、NaH2PO4(2.1mM)、デキストロース(20.1mM;デキストロース=D−グルコース)、アデニン(0.24mM)を含有した。試料3にはさらに、ミトコンドリア標的抗酸化剤SS−31(1μM)が、試料4にはグルタチオン(0.75mM)が補充された。実施例1に記載するように、赤血球溶解によって有核細胞を濃縮し、そしてプロセシングした。
DNAの保存
EDTA、または安定化剤3とも称されるグルタチオン(325mM)、SKQ1(100μM)、およびPefabloc(登録商標)SC(100mM)と混合したEDTA中の3人の健康な個人由来の血液試料に、血液1mlあたり、200,000スパイク処理細胞の最終濃度で、Karpas 422細胞をスパイク処理した。試料を周囲温度で保管した。Karpas細胞は、t(14;18)およびt(4;11)染色体転座の両方を所持する、B細胞非ホジキンリンパ腫(NHL)細胞株である。t(14;18)転座は、正常な、すなわちt(14;18)転座不含血液細胞から生じたDNAから、Karpas細胞から生じたDNAを区別するマーカーとして選択された。
RNAの保存
循環腫瘍細胞を含有する乳癌患者由来の血液試料を、「安定化剤4」と称されるクエン酸塩(11.7mM)/クエン酸(2.1mM)、NaH2PO4(2.1mM)、デキストロース(20.1mM)、アデニン(0.24mM)およびSkQ1(100nM)中、またはCellSave(Veridex Cell Save Preservativeチューブ、カタログ番号7900005)中のいずれかで収集した。試料#59、#60、#62、#63、#58を室温で48時間保管し、試料#55、#56および#57を室温で72時間保管した。赤血球溶解によって有核細胞を濃縮した。350μl血液試料のアリコットを、1,000μlの溶解緩衝液(80mM NH4Cl、10mM Hepes、0.1mM EDTA)と混合し、室温で10分間インキュベーションし、300xgで15分間遠心分離し、1,000μlの溶解緩衝液で洗浄し、300xgで15分間遠心分離した。ペレットを200μlのPBS中に溶解し、そしてこれらの細胞から、Roche Applied Sciences、カタログ番号11828665001のHigh Pure RNA単離キットでRNAを単離した。56μlの溶出緩衝液でカラムから溶出させた。Transcriptor第一鎖cDNA合成キット(Roche Applied Sciences、カタログ番号04897030001)を用いて、反応体積20μl中で、単離RNA由来の2μlアリコットを逆転写した。LightCycler 480装置中、LightCycler 480 Probes Masterを用いて、5μl cDNAのアリコットを増幅した。用いたプライマーおよびプローブを表1に記載する。
$には5’FAM標識、および3’−TAMRA標識が含まれる。
実施例5
72時間の試料保管後に単離された細胞由来のRNAの定量化
MDA−MB−468細胞を、2人の健康な個人から得た血液試料内に、14.4x106細胞/mlでスパイク処理した。各ドナーから4つの試料を調製した。試料1および2は、抗凝血剤としてEDTAのみを含有し、そして添加剤は含有せず、試料3および4は、安定化剤として、クエン酸塩(11.7mM)、クエン酸(2.1mM)、NaH2PO4(2.1mM)、デキストロース(20.1mM)、アデニン(0.24mM),Pefabloc(登録商標)SC(0.25mM)、SS−31(1μM)およびアセチルサリチル酸(1mM)で安定化された(「安定化剤5」)。これらの試料由来のアリコットをセットアップ後、直ちにプロセシングし、他のアリコットを室温で72時間保管した後にプロセシングした。製造者によって推奨されるプロトコルにしたがって、試料材料1,000μlアリコットを用い、Adnagen、カタログ番号T1−508のBreastSelectBeadsで捕捉することによって、MDA−MB−468細胞を血液から単離した。
$には5’FAM標識、および3’−TAMRA標識が含まれる。
48時間の試料保管後の生存細胞の単離
MDA−MB−468細胞を、健康な個人から得た血液試料にスパイク処理して、300,000スパイク処理細胞/ml血液の最終濃度を生じた。試料を直ちに、または室温で48時間保管した後にプロセシングした。試料1は、抗凝血剤としてEDTAのみを含有し、そしてさらなる添加剤は含有せず、試料2は、安定化剤として、クエン酸塩(11.7mM)/クエン酸(2.1mM)、NaH2PO4(2.1mM)、デキストロース(20.1mM)、アデニン(0.24mM),Pefabloc(登録商標)SC(0.25mM)、SS−31(1μM)およびアセチルサリチル酸(1mM)を含有した(「安定化剤5」、実施例5を参照されたい)。
トリパンブルー排除法を用いて、細胞の生存能を試験した。10μlの各試料を10μlのトリパンブルー(Sigma−Aldrich T8154)と混合した。色素を排除するMDA−MB−468細胞の数をNeubauerチャンバー中で計数した。血液試料内にスパイク処理した細胞数を100%として用いて、生存細胞収率を計算した。
安定化された血液から単離された細胞は培養可能である
実施例6に記載するように処理され、そして単離されたMDA−MB−468を、リアルタイム細胞分析装置(RTCA)MP(xCELLigence系)のため、E−Plate 96ウェル・デバイス(Roche Applied Science、カタログ番号06472451001、Roche Diagnostics GmbH、ドイツ・マンハイム)のウェル内に植え付けた。細胞の50μlアリコットを、50μlのRPMI培地を含有するウェル内に植え付けた。分析のため、デュプリケートを用いた。E−Plateを37℃で一晩、インキュベーター中でインキュベーションして、E−Plateの底部へのMDA−MB−468細胞の付着を可能にした。混入した血液由来細胞を除去するため、培地を取り除き、そして培養プレートに付着した細胞をPBSで3回洗浄した。ウェルあたり150μlの新鮮なRPMI培地を添加し、そしてE−Plateをリアルタイム細胞分析装置に移した。101時間に渡って、1時間に1回、細胞インデックスを測定した。
EDTAのみで安定化した細胞と比較を行った。その結果、EDTAのみを用いて48時間保管した血液から単離した細胞は、それ以上培養可能ではない。
Claims (24)
- ex vivoの全血試料のインタクトな有核細胞において、分析物を安定化させるための液体組成物であって、該組成物が水溶液であり、該溶液が抗凝血剤、リン酸塩、細胞代謝可能糖、アデニン、および抗酸化剤を含み、ここで該抗酸化剤が、ミトコンドリア標的抗酸化剤、好ましくはSkQ1、MitoQ、SS−31、およびその混合物からなる群より選択されるミトコンドリア標的抗酸化剤を含む、前記液体組成物。
- プロテアーゼ阻害剤、好ましくはSivelestat、4−(2−アミノエチル)ベンゼンスルホニルフルオリド塩酸塩(AEBSF)、およびその混合物からなる群より選択されるプロテアーゼ阻害剤をさらに含む、請求項1記載の組成物。
- 抗酸化剤が、第一および第二の抗酸化剤の混合物であり、第一の抗酸化剤がミトコンドリア標的抗酸化剤であり、そして第二の抗酸化剤がミトコンドリア標的抗酸化剤以外の抗酸化剤である、請求項1および2のいずれか記載の組成物。
- 第二の抗酸化剤が、グルタチオン、アセチルサリチル酸、N−アセチル−5−アミノサリチル酸、N−アセチルシステイン、6−ヒドロキシ−2,5,7,8−テトラメチルクロマン−2−カルボン酸(Trolox)およびその混合物からなる群より選択される、請求項3のいずれか記載の組成物。
- 第一のミトコンドリア標的抗酸化剤が、SkQ1、MitoQ、SS−31、およびその混合物からなる群より選択される、請求項3記載の組成物。
- 細胞代謝可能糖が、グルコースおよびフルクトースからなる群より選択される、請求項1〜5のいずれか記載の組成物。
- 採血容器中に封入されている、請求項1〜6のいずれか記載の組成物。
- ある量の全血をさらに含む、請求項1〜7のいずれか記載の組成物。
- 10nM〜200μM、好ましくは100nM〜100μM、より好ましくは200nM〜50μMの凝集体濃度で、1またはそれより多いミトコンドリア標的抗酸化剤を含む、請求項8記載の組成物。
- 50nM〜250nM、好ましくは100nMのSkQ1、250nM〜200μM、好ましくは100μMのSkQ1、50nM〜250nM、好ましくは100nMのMitoQ、および500nM〜10μM、好ましくは1μMのSS−31からなる群より選択される、測定された量のミトコンドリア標的抗酸化剤を含む、請求項9記載の組成物。
- 11.1mM〜12.3mMクエン酸三ナトリウム(約11.7mM)/2mM〜2.2mMクエン酸(約2.1mM)、2mM〜2.2mM NaH2PO4(約2.1mM)、19.1mM〜21.1mMグルコース(約20.1mM)、0.23mM〜0.25mMアデニン(約0.24mM)、0.24mM〜0.26mM AEBSF(約0.25mM)、990nM〜1.1μM SS−31(約1μM)およびアセチルサリチル酸990μM〜1.1mM(約1mM)を含む、請求項10記載の組成物。
- ex vivoの全血試料のインタクトな有核細胞において、DNA、RNAおよびタンパク質より選択される分析物を安定化させるための、請求項1〜7のいずれか記載の組成物の使用。
- パッケージング材料、ラベル、および使用説明書シートをさらに含む、請求項7記載の組成物を含む部分のキット。
- ex vivoの全血試料のインタクトな有核細胞を安定化させるための方法であって
(a)ex vivoの全血試料を提供し;
(b)請求項1〜6のいずれか記載の組成物と、工程(a)の試料を接触させ、そして混合し;
(c)工程(b)で得た混合物をインキュベーションし、
それによって、ex vivo全血試料のインタクトな有核細胞を安定化させる
工程を含む、前記方法。 - 工程(b)で得た混合物が、請求項9〜11のいずれか記載の組成物である、請求項14記載の方法。
- 0時間〜12時間、0時間〜24時間、0時間〜36時間、0時間〜48時間、0時間〜60時間、および0時間〜72時間からなる群より選択される時間間隔で、室温で工程(c)を行う、請求項14および5のいずれか記載の方法。
- (d)工程(c)で得たインキュベーションした混合物から、インタクトな有核細胞を分離し;
(e)分離した有核細胞を溶解し、そして溶解物中の有核細胞の分析物を検出する、ここで分析物は、DNA、RNA、およびタンパク質からなる群より選択される
工程をさらに含む、請求項14〜16のいずれか記載の方法。 - 工程(b)の混合物において、ミトコンドリア標的抗酸化剤が、500nM〜10μM、好ましくは約1μMの濃度のSS−31である、請求項17記載の方法。
- 工程(b)の混合物が、200nM〜10mM、好ましくは1mMの濃度のアセチルサリチル酸、および50nM〜1mM、好ましくは250nMの濃度のAEBSFをさらに含む、請求項18記載の方法。
- 工程(b)の混合物において、ミトコンドリア標的抗酸化剤が、250nM〜200μM、好ましくは100μMの濃度のSkQ1である、請求項17記載の方法。
- 工程(b)の混合物が、100mM〜600mM、好ましくは325mMの濃度のグルタチオン、および10mM〜300mM、好ましくは100mMの濃度のAEBSFをさらに含む、請求項20記載の方法。
- 工程(b)の混合物において、ミトコンドリア標的抗酸化剤が、50nM〜250nM、好ましくは100nMのSkQ1である、請求項17記載の方法。
- (d)工程(c)で得たインキュベーションした混合物から、インタクトな有核細胞を分離し;
(e)工程(d)の分離された有核細胞を培地と接触させ、そして生存細胞を培養する
工程をさらに含む、請求項14〜16のいずれか記載の方法。 - 工程(e)の生存細胞が、培地中で1またはそれより多い細胞分裂を経る、請求項23記載の方法。
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