JP2016533708A5 - - Google Patents
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Description
一実施形態において、本発明は、天然に存在するヒトＥＺＨ２遺伝子の配列と少なくとも１つのミスマッチを含むことを除いて、ＥＺＨ２＿Ｙ６４６Ｎ＿Ｒ（配列番号１）、Ｙ６４６Ｈ＿Ｒ（配列番号１２）、Ｙ６４６Ｆ＿Ｒ（配列番号２１）、Ｙ６４６Ｃ＿Ｒ（配列番号４１）、Ａ６８２Ｇ＿Ｒ（配列番号５９）及びＡ６９２Ｖ＿Ｒ（配列番号７３）に対応する配列番号から選択されるオリゴヌクレオチド配列からなる、ヒトＥＺＨ２遺伝子における変異を検出するための、単離されたオリゴヌクレオチドである。配列番号１、１２、２１、４１、５９及び７３の各々は、ＴＴデュープレット（duplet）及びＴＴＴ又はＣＴＣトリプレット（triplet）を少なくとも含む。任意の前記配列番号の長さは、２０〜３０ヌクレオチドである。これらの実施形態の変形において、ミスマッチは、各々のオリゴヌクレオチドの３’末端の最後の５つのヌクレオチドの中に位置する。これらの実施形態のさらなる変形において、当該オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの非天然オリゴヌクレオチドを更に含む。
Claims (10)
- 天然に存在するヒトＥＺＨ２遺伝子の配列と少なくとも１つのミスマッチを含むことを除いて、ＥＺＨ２＿Ｙ６４６Ｈ＿Ｒ（配列番号１１）のオリゴヌクレオチド配列を含む、ヒトＥＺＨ２遺伝子における変異を検出するための、単離されたオリゴヌクレオチドであって、
前記ミスマッチは、前記オリゴヌクレオチドの３’末端の最後の５つのヌクレオチドの中のｎ−２位又はｎ−３位に位置し、ここでｎは、前記オリゴヌクレオチドの３’末端のヌクレオチドである、
単離されたオリゴヌクレオチド。 - 配列番号１６及び１８〜２０から成る群から選択される、請求項１に記載の単離されたオリゴヌクレオチド。
- 少なくとも１つの非天然ヌクレオチドを更に含む、請求項１又は２に記載のオリゴヌクレオチド。
- 核酸試料中のヒトＥＺＨ２核酸における変異を検出する方法であって、
（ａ）前記核酸試料を請求項１〜３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドと接触させ、
（ｂ）前記オリゴヌクレオチドが前記ＥＺＨ２核酸中の標的配列へとハイブリダイゼーションすることができる条件下で前記核酸試料をインキュベートし、
（ｃ）前記ＥＺＨ２核酸中の標的配列を含む増幅産物を生成させ、そして
（ｄ）前記増幅産物の存在を検出し、それにより前記ＥＺＨ２核酸中の変異の存在を検出すること
を含む、前記方法。 - 前記核酸試料は、血液細胞、血漿、血清又はホルマリン固定パラフィン包埋組織から得られる、請求項４に記載の方法。
- 悪性腫瘍を有する患者が、ＥＺＨ２阻害剤に応答する可能性があるか否かを決定する方法であって、
（ａ）前記患者由来の核酸試料を、請求項１〜３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドと接触させ、
（ｂ）前記オリゴヌクレオチドがＥＺＨ２核酸中の標的配列へとハイブリダイゼーションすることができる条件下で前記試料をインキュベートし、前記ＥＺＨ２核酸中の標的配列を含む増幅産物を生成させ、
（ｃ）前記増幅産物の存在を検出し、それにより前記ＥＺＨ２核酸中の変異の存在を検出すること
を含み、ここで、前記変異の存在は、前記患者がＥＺＨ２阻害剤に応答する可能性があることを示す、前記方法。 - 前記悪性腫瘍は癌の兆候であり、ここで前記癌はリンパ腫である、請求項６に記載の方法。
- ヒトＥＺＨ２遺伝子における変異を検出するためのキットであって、
請求項１〜３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドと、
ＰＣＲにおける使用のための少なくとも１つの追加の試薬と
を含む、前記キット。 - 前記オリゴヌクレオチドは、配列番号１６、１８、１９及び２０から選択される、請求項１２に記載のキット。
- １又は２以上の対応する第二プライマー、標識されていてもよい１又は２以上のプローブ、ヌクレオチド三リン酸、核酸ポリメラーゼ、及び／又は緩衝液をさらに含む、請求項８又は９に記載のキット。
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