JP2016512848A5

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Publication number: JP2016512848A5
Application number: JP2016503420A
Authority: JP
Filing date: 2014-03-17
Publication date: 2017-04-20
Anticipated expiration: 2034-03-17

Claims

組み換えポリペプチド及び１つ以上の不純物の発現及び分泌を発酵培地にもたらす条件下で所望の細胞または微生物を培養することを含む発酵プロセスによりもたらされる１つ以上の試料から、所望の組み換えポリペプチドを精製するプロセスであって、前記精製プロセスが、前記試料中の糖化不純物の量及び／または種類を、前記糖化純物に結合するレクチンを使用して検出することを含み、前記試料を少なくとも１つのクロマトグラフィー支持体と接触させること及び所望の組み換えポリペプチドを分離することを場合により更に含み、前記糖化不純物に結合する前記レクチンを使用して、溶出液またはその画分中の糖化不純物の量及び／または種類を検出することを場合により含み、前記レクチンが、場合により支持体に結合していてもよい、ＣｏｎＡ、ＬＣＨ、ＧＮＡもしくはＧＮＬ、ＲＣＡ、ＤＣ−ＳＩＧＮ、Ｌ−ＳＩＧＮ、ＰＮＡ、ＡＩＬ、ＶＶＬ、ＷＧＡ、ＳＮＡ、ＭＡＬ、ＭＡＨ、ＵＥＡ及びＡＡＬから選択される少なくとも１つのレクチン、並びに／またはＰＮＡ、ＳＢＡ、ＰＷＭ、ＰＥＡ、ＰＴＡ、ＭＬ−Ｉ−ＩＩＩ、ＬＥＡ、ＵＤＡ、ＷＧＡ、ＰＨＡ、ＬＴＡ、ＢＳＩ−Ｂ４、ＭＰＡ、ＲＣＡ、ＬＣＡ、ＥＣＡ、ＡＡＡ、ＤＢＡ、ＧＳＬ−Ｉ、ＰＳＡ、ＳＪＡ、ＤＳＬ、ＥＣＬ、ＧＳＬ−ＩＩ、ＡＩＡ／Ｊａｃａｌｉｎ、ＬＥＬ、ＳＴＬ、ＨＨＬ、ＬＣＡ、ＮＰＬ、ＡＣＬ、ＥＣＬ、ＥＥＬ、ＭＡＬ−Ｉ、ＡＡＬ、ＬＴＬ、ＢＰＬ、ＭＰＬ、ＰＴＬ、ＳＮＡ、ＤＧＬ、ＳＪＡ、ＶＶＡ、ＬＥＡ、ＳＴＡ、ＤＳＡ、ＭＭＲ、ＤＥＣ−２０５、Ｄｅｃｔｉｎ１、Ｄｅｃｔｉｎ２、ＬａｎｇｅｒｉｎもしくはＢＤＣＡ−２から選択される少なくとも１つのレクチンを場合により含む、前記プロセス。
以下：
（ｉ）前記検出工程が、タンパク質間相互作用モニタリングプロセスが光干渉法、二重偏光干渉法、静的光散乱法、動的光散乱法、多角度光散乱法、表面プラスモン共鳴、ＥＬＩＳＡ、化学発光ＥＬＩＳＡ、ファーウエスタンまたは電気化学発光を含むがこれらに限定されないタンパク質間相互作用モニタリングプロセスを使用する；
（ｉｉ）前記不純物が、Ｏ−結合糖鎖付加の結果である及び／または前記糖化不純物が、前記所望の組み換えポリペプチドの糖鎖変異体である；
（ｉｉｉ）前記所望の組み換えポリペプチドが、ホモポリマーまたはヘテロポリマーポリペプチド、例えば、ホルモン、増殖因子、受容体、抗体、サイトカイン、受容体リガンド、転写因子または抗体、好ましくは抗体または抗体フラグメント、例えば、ヒト抗体もしくはヒト化抗体またはこれらのフラグメント、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヤギ、ヒツジまたはウシ抗体から誘導された、典型的にはウサギ由来のヒト化抗体またはそのフラグメントである；
（ｉｖ）前記組み換えポリペプチドが、抗体または抗体フラグメント、例えば、一価、二価または多価抗体、例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＦＮ−アルファ、ＩＦＮ−ガンマ、ＢＡＦＦ、ＣＸＣＬ１３、ＩＰ−１０、ＣＢＰ、アンギオテンシン（アンギオテンシンＩ及びアンギオテンシンＩＩ）、Ｎａｖ１．７、Ｎａｖ１．８、ＶＥＧＦ、ＰＤＧＦ、ＥＰＯ、ＥＧＦ、ＦＳＨ、ＴＳＨ、ｈＣＧ、ＣＧＲＰ、ＮＧＦ、ＴＮＦ、ＨＧＦ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ７、ＰＣＳＫ９またはＨＲＧに特異的に結合する抗体又は抗体フラグメントである；
（ｖ）前記所望の組み換えポリペプチドの前記クロマトグラフィー精製が、
（ａ）前記試料をアフィニティークロマトグラフィー支持体と接触させ、前記所望の組み換えポリペプチドを前記支持体から分離すること；
（ｂ）工程（ａ）の溶出液またはその画分を混合モードクロマトグラフィー支持体と接触させ、前記所望の組み換えポリペプチドを前記支持体から選択的に溶出すること；及び
（ｃ）工程（ｂ）の前記溶出液またはその画分を疎水性相互作用クロマトグラフィー支持体と接触させ、前記所望の組み換えポリペプチドを前記支持体から選択的に溶出することを含み、工程（ｃ）の前記溶出液またはその画分が、実質的に精製された所望の組み換えポリペプチドを含み、場合により、工程（ａ）、工程（ｂ）及び工程（ｃ）のいずれか一つからの前記溶出液またはその画分が前記レクチンと接触して、前記溶出液またはその画分中の糖化不純物の量及び／または種類を検出する、並びに／あるいは前記所望の組み換えポリペプチドを含有する異なる試料または溶出液もしくはその画分が、糖化不純物の量及び／または種類に基づいてプールされる、並びに／あるいは前記所望の組み換えポリペプチドを含有する異なる試料または溶出液もしくはその画分が、組み換えポリペプチドの量と比べた糖化不純物の量及び／または種類に基づいてプールされる、場合により、１０％未満の糖鎖変異体を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、５％未満の糖鎖変異体を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、あるいは１％未満の糖鎖変異体を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、あるいは０．５％未満の糖鎖変異体を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、異なる試料または溶出液もしくはその画分が、前記所望の組み換えポリペプチドの純度に基づいてプールされ、例えば、９１％を超える純度を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、９７％を超える純度を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、９９％を超える純度を含む試料または溶出液もしくはその画分がプールされる、あるいは前述の任意の組み合わせである；
（ｖｉ）前記組み換えポリペプチドが、抗体又は抗体フラグメントであり、その純度が、糖化重鎖ポリペプチド及び／または糖化軽鎖ポリペプチドの質量を、重鎖ポリペプチド及び／または軽鎖ポリペプチドの合計質量の百分率として測定することによって決定される；または
（ｖｉｉ）工程（ｃ）の前記溶出液が、５０ｎｇ／ｍｇ（５％）未満の糖鎖変異体を含む、または工程（ｃ）の前記溶出液が、２５ｎｇ／ｍｇ未満の糖鎖変異体を含む、または工程（ｃ）の前記溶出液が、１０ｎｇ／ｍｇ未満の糖鎖変異体を含む、及び／または工程（ｃ）の前記溶出液が、レクチン結合動力学アッセイにより測定して約０．２〜約２ＲＵの範囲のレクチン活性を含み、工程（ｃ）の前記溶出液が、１０ｎｇ／ｍｇ（１０ｐｐｍ）未満の真菌細胞タンパク質を含む、または工程（ｃ）の前記溶出液が、５ｎｇ／ｍｇ未満の真菌細胞タンパク質を含む、または工程（ｃ）の前記溶出液が、２ｎｇ／ｍｇ未満の真菌細胞タンパク質を含む、及び／または工程（ｃ）の前記溶出液が、１０ｎｇ／ｍｇ未満の核酸を含み、工程（ｃ）の前記溶出液が、５ｎｇ／ｍｇ未満の核酸を含む、または前述の任意の組み合わせである；
請求項１に記載のプロセス。
（ｉ）特定の試料または溶出液もしくはその画分が、検出された糖化不純物の量及び／または種類に応じて廃棄され：
（ｉｉ）特定の試料または画分が、検出された糖化不純物の量及び／または種類に応じて、糖化不純物を低減及び／または除去するように処理され；または
（ｉｉｉ）特定の試料または画分が、検出された糖化不純物の量及び／または種類に応じて、糖化不純物を低減及び／または除去するように処理され、前記処理が、（１）糖鎖付加を除去する酵素または他の化学部分を付加すること及び（２）１つ以上の結合工程を実施して、前記糖化不純物を除去することの１つ以上を含む；
請求項１または２に記載のプロセス。
（ｉ）前記アフィニティークロマトグラフィー支持体が免疫親和性リガンドを含み、例えば、前記免疫親和性リガンドがプロテインＡであるか、または前記免疫親和性リガンドがレクチンである；
（ｉｉ）混合モードクロマトグラフィー支持体が、セラミックヒドロキシアパタイト、セラミックフルオロアパタイト、結晶質ヒドロキシアパタイト、結晶質フルオロアパタイト、ＣａｐｔｏＡｄｈｅｒ、ＣａｐｔｏＭＭＣ、ＨＥＡＨｙｐｅｒｃｅｌ、ＰＰＡＨｙｐｅｒｃｅｌ及びＴｏｙｐｅａｒｌＭＸ−Ｔｒｐ−６５０Ｍから選択され、セラミックヒドロキシアパタイトであり、または例えば、ＢｕｔｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅ４ＦＦ、Ｂｕｔｙｌ−ＳＳｅｐｈａｒｏｓｅＦＦ、ＯｃｔｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅ４ＦＦ、ＰｈｅｎｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅＢＢ、ＰｈｅｎｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅＨＰ、ＰｈｅｎｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅ６ＦＦＨｉｇｈＳｕｂ、ＰｈｅｎｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅ６ＦＦＬｏｗＳｕｂ、Ｓｏｕｒｃｅ１５ＥＴＨ、Ｓｏｕｒｃｅ１５ＩＳＯ、Ｓｏｕｒｃｅ１５ＰＨＥ、ＣａｐｔｏＰｈｅｎｙｌ、ＣａｐｔｏＢｕｔｙｌ、ＳｒｅａｍｌｉｎｅＰｈｅｎｙｌ、ＴＳＫＥｔｈｅｒ５ＰＷ（２０ｕｍ及び３０ｕｍ）、ＴＳＫＰｈｅｎｙｌ５ＰＷ（２０ｕｍ及び３０ｕｍ）、Ｐｈｅｎｙｌ６５０Ｓ、Ｍ及びＣ、Ｂｕｔｙｌ６５０Ｓ、Ｍ及びＣ、Ｈｅｘｙｌ−６５０Ｍ及びＣ、Ｅｔｈｅｒ−６５０Ｓ及びＭ、Ｂｕｔｙｌ−６００Ｍ、ＳｕｐｅｒＢｕｔｙｌ−５５０Ｃ、Ｐｈｅｎｙｌ−６００Ｍ、ＰＰＧ−６００Ｍ、孔径が１２０、２００、３００ＡのＹＭＣ−ＰａｃｋＯｃｔｙｌＣｏｌｕｍｎｓ−３、５、１０Ｐ、１５及び２５ｕｍ、孔径が１２０、２００、３００ＡのＹＭＣ−ＰａｃｋＰｈｅｎｙｌＣｏｌｕｍｎｓ−３、５、１０Ｐ、１５及び２５ｕｍ、孔径が１２０、２００、３００ＡのＹＭＣ−ＰａｃｋＢｕｔｙｌＣｏｌｕｍｎｓ−３、５、１０Ｐ、１５及び２５ｕｍ、ＣｅｌｌｕｆｉｎｅＢｕｔｙｌ、ＣｅｌｌｕｆｉｎｅＯｃｔｙｌ、ＣｅｌｌｕｆｉｎｅＰｈｅｎｙｌ、ＷＰＨＩ−Ｐｒｏｐｙｌ（Ｃ３）、Ｍａｃｒｏｐｒｅｐｔ−ＢｕｔｙｌもしくはＭａｃｒｏｐｒｅｐｍｅｔｈｙｌ、並びにＨｉｇｈＤｅｎｓｉｔｙＰｈｅｎｙｌ-ＨＰ２２０ｕｍから選択される疎水性相互作用クロマトグラフィー支持体である；
（ｉｉｉ）前記疎水性相互作用クロマトグラフィー支持体が、プロピレングリコール（ＰＰＧ）６００ＭまたはＰｈｅｎｙｌＳｅｐｈａｒｏｓｅＨＰである；
（ｉｖ）前記プロセスが、例えば、サイズ排除クロマトグラフィー支持体ＧＳ３０００ＳＷを使用して不純物をモニターすることに有効である、サイズ排除クロマトグラフィーを含む；
（ｖ）約１Ｍのアルギニン、ｐＨ４．０を含む緩衝液を前記クロマトグラフィー支持体に適用して、所望の組み換えポリペプチド、例えば多サブユニット複合体を溶出する；
（ｖｉ）（ｉ）約５ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ６．５及び約０Ｍ〜約１．５Ｍの塩化ナトリウム、または（ｉｉ）約５ｍＭ〜０．２５Ｍのリン酸ナトリウム、ｐＨ６．５を含む緩衝液を、前記クロマトグラフィー支持体に適用して、前記所望の組み換えポリペプチドを溶出する；
（ｖｉｉ）２０ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ７．０中に約０．７Ｍ〜約０Ｍの硫酸ナトリウムを含む緩衝液を前記クロマトグラフィー支持体に適用して、前記所望の組み換えポリペプチドを溶出する；
（ｖｉｉｉ）１００Ｍのリン酸ナトリウム、２００ｍＭの塩化ナトリウム、ｐＨ６．５を含む緩衝液を前記クロマトグラフィー支持体に適用して、前記所望の組み換えポリペプチドを溶出する；
（ｉｘ）前記宿主細胞が、酵母菌又は糸状菌である；
（ｘ）前記宿主細胞が、アルキシオジマ（Ａｒｘｉｏｚｙｍａ）、アスコボトリオジマ（Ａｓｃｏｂｏｔｒｙｏｚｙｍａ）、シテロマイセス（Ｃｉｔｅｒｏｍｙｃｅｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、デッケラ（Ｄｅｋｋｅｒａ）、エレモテシウム（Ｅｒｅｍｏｔｈｅｃｉｕｍ）、イサトケンキア（Ｉｓｓａｔｃｈｅｎｋｉａ）、カザクスタニア（Ｋａｚａｃｈｓｔａｎｉａ）、クリベロマイセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）、コダマエア（Ｋｏｄａｍａｅａ）、ロッデロマイセス（Ｌｏｄｄｅｒｏｍｙｃｅｓ）、パキソレン（Ｐａｃｈｙｓｏｌｅｎ）、ピキア（Ｐｉｃｈｉａ）、サッカロマイセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、サツルニスポラ（Ｓａｔｕｒｎｉｓｐｏｒａ）、テトラピシスポラ（Ｔｅｔｒａｐｉｓｉｓｐｏｒａ）、トルラスポラ（Ｔｏｒｕｌａｓｐｏｒａ）、ウィリオプシス（Ｗｉｌｌｉｏｐｓｉｓ）、ザイゴサッカロマイセス（Ｚｙｇｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、ハンゼヌラ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）、フィロバシウム（Ｆｉｌｏｂａｓｉｕｍ）、スポリジオボルス（Ｓｐｏｒｉｄｉｏｂｏｌｕｓ）、ブレラ（Ｂｕｌｌｅｒａ）、ロイコスポリジウム（Ｌｅｕｃｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）及びフィロバシデラ（Ｆｉｌｏｂａｓｉｄｅｌｌａ）から選択される酵母菌である；
（ｘｉ）前記宿主細胞が、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）、ピキア・アングスタ（Ｐｉｃｈｉａａｎｇｕｓｔａ）、ピキア・グイレルモルジイ（Ｐｉｃｈｉａｇｕｉｌｌｅｒｍｏｒｄｉｉ）、ピキア・メタノリカ（Ｐｉｃｈｉａｍｅｔｈａｎｏｌｉｃａ）またはピキア・イノシトベラ（Ｐｉｃｈｉａｉｎｏｓｉｔｏｖｅｒａ）から選択されるピキア（Ｐｉｃｈｉａ）酵母菌である；
（ｘｉｉ）前記宿主細胞が、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）である；
（ｘｉｉｉ）前記宿主細胞が、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、トリコデルマ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、ペニシリウム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、リゾプス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）、ペシロマイセス（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、フサリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、ニューロスポラ（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）及びクラビセプス（Ｃｌａｖｉｃｅｐｓ）から選択される糸状菌である；
（ｘｉｖ）前記宿主細胞が、抗体もしくは抗体フラグメントを発現するピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）であるか、または糸状菌が、抗体もしくは抗体フラグメントを発現するアスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、トリコデルマ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、ペニシリウム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、リゾプス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）、ペシロマイセス（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、フサリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、ニューロスポラ（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）及びクラビセプス（Ｃｌａｖｉｃｅｐｓ）から選択されるか、あるいは前述の（ｉ）〜（ｘｉｖ）の任意の組み合わせである；
請求項１〜３のいずれか一項に記載プロセス。
真菌細胞または酵母菌細胞に発現された所望の組み換えポリペプチドを、前記所望のポリペプチド及び少なくとも１つの糖化不純物を含む混合物から精製するプロセスであって、
（ａ）前記混合物をアフィニティークロマトグラフィー支持体と接触させ、多サブユニットタンパク質を前記支持体から分離すること；
（ｂ）工程（ａ）の前記溶出液またはその画分を混合モードクロマトグラフィー支持体と接触させ、前記多サブユニットタンパク質を前記支持体から選択的に溶出すること；及び
（ｃ）工程（ｂ）の前記溶出液またはその画分を疎水性相互作用クロマトグラフィー支持体と接触させ、前記多サブユニットタンパク質を支持体から選択的に溶出することを含み、工程（ｃ）の前記溶出液またはその画分が、実質的に精製された所望の組み換えポリペプチドを含み、
工程（ｂ）及び／または工程（ｃ）の前記溶出液またはその画分における糖化不純物の量及び／または種類が、前記糖化不純物に結合するレクチンを使用して検出され、工程（ｂ）及び／または工程（ｃ）の前記溶出液の１つ以上の画分が、検出された前記糖化不純物の量及び／または種類に基づいて、更なるプロセッシングのために選択される
前記精製プロセス。
（ｉ）前記アフィニティークロマトグラフィー支持体が、プロテインＡカラムである、もしくはレクチンカラムである、及び／または前記混合モードクロマトグラフィー支持体が、ヒドロキシアパタイトカラムである、及び／または前記疎水性相互作用クロマトグラフィー支持体が、ＰＰＧ−６００Ｍカラムである、
（ｉｉ）前記所望の組み換えポリペプチドが、多サブユニットタンパク質、例えば抗体である、
（ｉｉｉ）前記検出工程が、場合により支持体に結合していてもよい、ＣｏｎＡ、ＬＣＨ、ＧＮＡもしくはＧＮＬ、ＲＣＡ、ＤＣ−ＳＩＧＮ、Ｌ−ＳＩＧＮ、ＰＮＡ、ＡＩＬ、ＶＶＬ、ＷＧＡ、ＳＮＡ、ＭＡＬ、ＭＡＨ、ＵＥＡ及びＡＡＬから選択される少なくとも１つのレクチン、並びに／またはＰＮＡ、ＳＢＡ、ＰＷＭ、ＰＥＡ、ＰＴＡ、ＭＬ−Ｉ−ＩＩＩ、ＬＥＡ、ＵＤＡ、ＷＧＡ、ＰＨＡ、ＬＴＡ、ＢＳＩ−Ｂ４、ＭＰＡ、ＲＣＡ、ＬＣＡ、ＥＣＡ、ＡＡＡ、ＤＢＡ、ＧＳＬ−Ｉ、ＰＳＡ、ＳＪＡ、ＤＳＬ、ＥＣＬ、ＧＳＬ−ＩＩ、ＡＩＡ／Ｊａｃａｌｉｎ、ＬＥＬ、ＳＴＬ、ＨＨＬ、ＬＣＡ、ＮＰＬ、ＡＣＬ、ＥＣＬ、ＥＥＬ、ＭＡＬ−Ｉ、ＡＡＬ、ＬＴＬ、ＢＰＬ、ＭＰＬ、ＰＴＬ、ＳＮＡ、ＤＧＬ、ＳＪＡ、ＶＶＡ、ＬＥＡ、ＳＴＡ、ＤＳＡ、ＭＭＲ、ＤＥＣ−２０５、Ｄｅｃｔｉｎ１、Ｄｅｃｔｉｎ２、ＬａｎｇｅｒｉｎもしくはＢＤＣＡ−２から選択される少なくとも１つのレクチンを使用して実施される、
（ｉｖ）前記検出工程が、光干渉法、二重偏光干渉法、静的光散乱法、動的光散乱法、多角度光散乱法、表面プラスモン共鳴、ＥＬＩＳＡ、化学発光ＥＬＩＳＡ、ファーウエスタンまたは電気化学発光から選択されるタンパク質間相互作用モニタリングプロセスを使用する、
（ｖ）前記検出工程が、光干渉アッセイにおいてＧＮＡ及び／またはＤＣ−ＳＩＧＮレクチンを使用して実施される、あるいは前述の（ｉ）〜（ｖ）のいずれかの任意の組み合わせである
請求項１〜５のいずれか一項に記載のプロセス。
前記真菌細胞がピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）である、請求項１〜６のいずれか一項に記載のプロセス。
発酵培地から所望の組み換えポリペプチドを産生する及び所望の組み換えポリペプチドを精製する発酵プロセスであって、
（ｉ）前記組み換えポリペプチド及び１つ以上の不純物の発現及び分泌を前記発酵培地にもたらす条件下で宿主細胞または微生物を培養すること；
（ｉｉ）前記発酵プロセスが進行しているとき、または異なる発酵作用が実施された後に、前記発酵培地の１つ以上の試料を周期的に得ること；
（ｉｉｉ）前記試料中の糖化不純物の量及び／または種類を、前記糖化不純物に結合するレクチンを使用して検出すること；並びに
（ｉｖ）前記試料中に検出された前記糖化不純物の量に基づいて、前記発酵プロセスの１つ以上の作動パラメーターまたは条件を改変すること
を含む、前記プロセス。
（ｉ）前記不純物が、Ｏ−結合糖鎖付加よりもたらされる、
（ｉｉ）前記検出工程が、場合により支持体に結合していてもよい、ＣｏｎＡ、ＬＣＨ、ＧＮＡもしくはＧＮＬ、ＲＣＡ、ＤＣ−ＳＩＧＮ、Ｌ−ＳＩＧＮ、ＰＮＡ、ＡＩＬ、ＶＶＬ、ＷＧＡ、ＳＮＡ、ＭＡＬ、ＭＡＨ、ＵＥＡ及びＡＡＬから選択される少なくとも１つのレクチン、並びに／またはＰＮＡ、ＳＢＡ、ＰＷＭ、ＰＥＡ、ＰＴＡ、ＭＬ−Ｉ−ＩＩＩ、ＬＥＡ、ＵＤＡ、ＷＧＡ、ＰＨＡ、ＬＴＡ、ＢＳＩ−Ｂ４、ＭＰＡ、ＲＣＡ、ＬＣＡ、ＥＣＡ、ＡＡＡ、ＤＢＡ、ＧＳＬ−Ｉ、ＰＳＡ、ＳＪＡ、ＤＳＬ、ＥＣＬ、ＧＳＬ−ＩＩ、ＡＩＡ／Ｊａｃａｌｉｎ、ＬＥＬ、ＳＴＬ、ＨＨＬ、ＬＣＡ、ＮＰＬ、ＡＣＬ、ＥＣＬ、ＥＥＬ、ＭＡＬ−Ｉ、ＡＡＬ、ＬＴＬ、ＢＰＬ、ＭＰＬ、ＰＴＬ、ＳＮＡ、ＤＧＬ、ＳＪＡ、ＶＶＡ、ＬＥＡ、ＳＴＡ、ＤＳＡ、ＭＭＲ、ＤＥＣ−２０５、Ｄｅｃｔｉｎ１、Ｄｅｃｔｉｎ２、ＬａｎｇｅｒｉｎもしくはＢＤＣＡ−２から選択される少なくとも１つのレクチンを使用して実施される、
（ｉｉｉ）前記検出工程が、支持体に結合しているレクチンを使用する、
（ｉｖ）前記検出工程が、タンパク質間相互モニタリングプロセスを使用する、
（ｖ）前記検出工程が、タンパク質間相互作用モニタリングプロセスを使用し、前記タンパク質間相互作用モニタリングプロセスが、光干渉法、二重偏光干渉法、静的光散乱法、動的光散乱法、多角度光散乱法、表面プラスモン共鳴、ＥＬＩＳＡ、化学発光ＥＬＩＳＡ、ファーウエスタンまたは電気化学発光を使用する、あるいは（ｉ）〜（ｖ）の任意の組み合わせである
請求項８に記載のプロセス
検出された前記糖化不純物の量に基づいて、前記発酵プロセスの以下の１つ以上のパラメーターまたは条件：温度、ｐＨ、ガス構成要素、供給材料構成要素、撹拌、通気、消泡及び持続時間が変更される、請求項８または９に記載のプロセス。
（ｉ）前記糖化不純物が、前記組み換えポリペプチドの糖鎖変異体である；
（ｉｉ）前記組み換えポリペプチドが、ホモポリマーもしくはヘテロポリマーポリペプチドである、または前記組み換えポリペプチドが、ホルモン、増殖因子、受容体、抗体、サイトカイン、受容体リガンド、転写因子もしくは酵素、及び／または前記組み換えポリペプチドが、抗体もしくは抗体フラグメントである；
（ｉｉｉ）前記宿主細胞が、酵母菌または糸状菌、例えば、アルキシオジマ（Ａｒｘｉｏｚｙｍａ）、アスコボトリオジマ（Ａｓｃｏｂｏｔｒｙｏｚｙｍａ）、シテロマイセス（Ｃｉｔｅｒｏｍｙｃｅｓ）、デバリオマイセス（Ｄｅｂａｒｙｏｍｙｃｅｓ）、デッケラ（Ｄｅｋｋｅｒａ）、エレモテシウム（Ｅｒｅｍｏｔｈｅｃｉｕｍ）、イサトケンキア（Ｉｓｓａｔｃｈｅｎｋｉａ）、カザクスタニア（Ｋａｚａｃｈｓｔａｎｉａ）、クリベロマイセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）、コダマエア（Ｋｏｄａｍａｅａ）、ロッデロマイセス（Ｌｏｄｄｅｒｏｍｙｃｅｓ）、パキソレン（Ｐａｃｈｙｓｏｌｅｎ）、ピキア（Ｐｉｃｈｉａ）、サッカロマイセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、サツルニスポラ（Ｓａｔｕｒｎｉｓｐｏｒａ）、テトラピシスポラ（Ｔｅｔｒａｐｉｓｉｓｐｏｒａ）、トルラスポラ（Ｔｏｒｕｌａｓｐｏｒａ）、ウィリオプシス（Ｗｉｌｌｉｏｐｓｉｓ）、ザイゴサッカロマイセス（Ｚｙｇｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、ヤロウイア（Ｙａｒｒｏｗｉａ）、ロドスポリジウム（Ｒｈｏｄｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、ハンゼヌラ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）、フィロバシウム（Ｆｉｌｏｂａｓｉｕｍ）、スポリジオボルス（Ｓｐｏｒｉｄｉｏｂｏｌｕｓ）、ブレラ（Ｂｕｌｌｅｒａ）、ロイコスポリジウム（Ｌｅｕｃｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ）及びフィロバシデラ（Ｆｉｌｏｂａｓｉｄｅｌｌａ）から選択される酵母菌細胞、またはアスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、トリコデルマ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、ペニシリウム（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、リゾプス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）、ペシロマイセス（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、フサリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、ニューロスポラ（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）及びクラビセプス（Ｃｌａｖｉｃｅｐｓ）から選択される糸状菌宿主細胞である、またはピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）、ピキア・アングスタ（Ｐｉｃｈｉａａｎｇｕｓｔａ）、ピキア・グイレルモルジイ（Ｐｉｃｈｉａｇｕｉｌｌｅｒｍｏｒｄｉｉ）、ピキア・メタノリカ（Ｐｉｃｈｉａｍｅｔｈａｎｏｌｉｃａ）もしくはピキア・イノシトベラ（Ｐｉｃｈｉａｉｎｏｓｉｔｏｖｅｒａ）から選択される、好ましくはピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）である、及び／または前記宿主細胞が、抗体もしくは抗体フラグメントを発現するピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａｐａｓｔｏｒｉｓ）である；
（ｉｖ）前記組み換えポリペプチドを前記発酵培地から回収または精製することを更に含む；
請求項８〜１０のいずれか一項に記載のプロセス。
前記精製プロセスが、
（ｉ）前記試料を少なくとも１つのクロマトグラフィー支持体と接触させ、前記所望の組み換えポリペプチドを選択的に溶出すること、
（ｉｉ）前記所望の組み換えポリペプチドを含有する異なる試料または溶出液もしくはその画分を、検出された糖化不純物の量及び／または種類に基づいてプールすること、
（ｉｉｉ）前記所望の組み換えポリペプチドを含有する異なる試料または溶出液もしくはその画分を、前記組み換えポリペプチドの量と比べた検出された前記糖化不純物の量及び／または種類に基づいてプールすること、あるいは前述の（ｉ）〜（ｉｉｉ）の任意の組み合わせである
請求項１１に記載のプロセス。
（ｉ）サイズ排除クロマトグラフィーを使用して前記試料中の凝集及び／または非凝集不純物の量を検出する、例えば、検出された凝集及び／または非凝集不純物の量に基づいて、前記発酵プロセスの以下の１つ以上のパラメーターまたは条件：温度、ｐＨ、ガス構成要素、供給材料構成要素、撹拌、通気、消泡及び持続時間、が変更される；
（ｉｉ）前記組み換えポリペプチドが、抗体または抗体フラグメント、例えば、ヒト抗体もしくはヒト化抗体またはそのフラグメント、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヤギ、ヒツジまたはウシ由来のヒト化抗体、好ましくはウサギ由来のヒト化抗体であり、前記抗体または抗体フラグメントが、一価、二価または多価抗体を含む；
（ｉｉｉ）前記組み換えポリペプチドが、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＦＮ−アルファ、ＩＦＮ−ガンマ、ＢＡＦＦ、ＣＸＣＬ１３、ＩＰ−１０、ＣＢＰ、アンギオテンシン（アンギオテンシンＩ及びアンギオテンシンＩＩ）、Ｎａｖ１．７、Ｎａｖ１．８、ＶＥＧＦ、ＰＤＧＦ、ＥＰＯ、ＥＧＦ、ＦＳＨ、ＴＳＨ、ｈＣＧ、ＣＧＲＰ、ＮＧＦ、ＴＮＦ、ＨＧＦ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ７、ＰＣＳＫ９またはＨＲＧに特異的に結合する抗体または抗体フラグメントである；
をさらに含む、請求項１１または１２に記載のプロセス。