JP2016075705A - 冠動脈疾患および心血管イベントのリスクの予測 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】対象からの試料中の少なくとも1種の代謝産物のレベルを検出するステップによる対象における心血管疾患のリスクを評価する方法は、本明細書に開示される。代謝産物のレベルは、対象における心血管疾患のリスクを示す。代謝産物は、アシルカルニチン、アミノ酸、ケトン、遊離脂肪酸またはヒドロキシブチラートとなり得る。心血管疾患は、心血管イベントのリスク、冠動脈疾患の存在または冠動脈疾患の発症のリスクとなり得る。
【選択図】なし
Description
本出願は、2009年3月10日出願の米国特許仮出願第61/159,077号明細書の利益を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
以下の実施例は、例示的なものであり、本発明の範囲を限定するものではないことを意味する。
方法
試験試料
CATHGENバイオレポジトリーは、Duke大学メディカルセンター(Durham、NC)の心臓カテーテル処置研究室により順次募集された対象からなる。インフォームドコンセント後、血液を、カテーテル処置のための動脈アクセス時に大腿動脈から得、直ちに血漿を分離するために処理し、−80℃で凍結した。すべての対象は、採取前に最低6時間空腹であった。臨床データは、DDCD、すなわち1969年からDuke Universityで心臓カテーテル処置を実施した患者のデータベースによって提供された。薬剤データを、慢性的に用いた薬剤、すなわち、入院時の薬剤(入院患者)について収集したまたは以前の1カ月以内の診察記録(外来患者)から収集した。心筋梗塞(MI)の発生および死亡を含めたフォローアップデータを、カテーテル処置後6カ月目に収集し、次いで、その後毎年収集した。生命状態を米国死亡指数(National Death Index)によって確認した。すべての対象についてのカテーテル処置の適応は、虚血性心疾患の臨床的な配慮であった。重症肺高血圧または臓器移植を有する患者を除外した。
空腹時血漿試料を、45種のアシルカルニチン、15種のアミノ酸、5つの従来の分析物(総コレステロール、低密度リポタンパク質[LDL]コレステロールおよび高密度リポタンパク質[HDL]コレステロール、トリグリセリド、ならびにグルコース)、ケトン、β−ヒドロキシブチラート、全遊離脂肪酸およびC反応性タンパク質[CRP]についての標的レベルの定量的な決定のために用いた(表1)。それぞれのアッセイの方法論および変動係数は報告されている。(非特許文献2および非特許文献3を参照)。研究室(Sarah WStedman Nutrition and Metabolism metabolomics/biomarker core laboratory)は、症例−対照状態に盲検化され、症例/対照は無作為に分布された。
「0」(すなわち、定量下限(LOQ)を下回る)として報告された代謝産物レベルは、LOQ/2の値を与えられた。「0」としての値の>25%を有する代謝産物を分析しなかった(5つのアシルカルニチン)。すべての代謝産物を、正規分布に近づけるために自然対数に変換させた。CAD状態の分析の場合、一般化された線形回帰モデルを、マッチング、すなわち、糖尿病、高血圧、異脂肪血症、肥満度指数(BMI)、CADの家族歴、および喫煙によって限定されない伝統的なCADリスク因子について調整されないおよび調整された、CAD症例と対照間の代謝産物レベルの差を評価するために用いた。複製群の分析を、人種、性別および年齢についてさらに調整した。対数に変換すると、すべての有意な代謝産物は、バリン、ケトン、およびC8、C8:1−OH/C6:1−DC、C10:1、C14:2、C16:1、C16:1−OH/C14:1−DC、およびC18−OH/C16−DCアシルカルニチンを除いて、正規分布(コルモゴロフ−スミルノフ検定P>0.01)を示した。分布を目視検査すると、大いに正規分布が示唆された。それにもかかわらず、本発明者らは、ノンパラメトリックウィルコクソン検定を用いて感度分析を実施し、バリンおよびC14:2アシルカルニチンを除く、セミパラメトリックな線形モデルとして類似の結果を示し、どちらも、線形回帰において有意でなかった(それぞれp=0.10およびp=0.06)が、これらのノンパラメトリック検定で有意であった(p=0.05およびp=0.008)。分析を、糖尿病および喫煙によってやはり層別化した。
患者母集団
初期(早期発生CAD症例174名、一致する対照174名)および複製群(CAD症例140名、対照140名)についての母集団の特徴を、表4に示し、イベント−複製群についての母集団の特徴を表5に示した。
いくつかのアミノ酸のレベルは、分枝鎖アミノ酸ロイシン/イソロイシン(P<0.0001)およびバリン(P=0.007)、グルタマート/グルタミン(P<0.0001)、プロリン(P=0.04)およびメチオニン(P=O.05)を含めて、初期群において症例と対照間で異なった(表6)。いくつかのアシルカルニチンのレベルはまた、C16アシルカルニチン(C16:1、P=0.006;C16:1−OH/C14:1−DC、P=0.004;C16:2、P=0.05;およびC18−OH/C16−DC、P=0.003)、およびC4:Ci4(P=0.009)、C8(P=0.009)、C8:1−OH/C6:1−DC(P=0.003)、およびC10:1(P=0.002)アシルカルニチンを含めて、初期群において症例と対照間で異なった(表6)。ほとんどの代謝産物の場合、これらの差は、CADリスク因子についての調整後に持続した。
PCAは、共線状の代謝産物からなる12個の因子を同定し(表9)、生物学的に妥当な因子にグループ化した。3個の因子は、調整された分析において初期群の症例と対照間で有意差があった、すなわち、因子1(中鎖アシルカルニチン)、因子4(分枝鎖アミノ酸および関連する代謝産物)、および因子9(アルギニン、ヒスチジン、シトルリン、Ci4−DC:C4DC)である。これらの因子のうち、2個の因子(4および9)は、複製群において有意なままであった。因子1は、複製群においてわずかに有意であったにすぎない(調整されないP=0.15、調整されたP=0.03)。それぞれの代謝産物についての因子負荷を表10に示す。
これらの代謝産物のより重症の表現型との関連を試験するために、本発明者らは、CADのない対照と比べた以前のMI歴を有する症例においてPCA由来の因子の関係を評価した(初期群 MI症例N=86、複製群 MI症例N=61)。CADと関連する2つの因子(4および9)はまた、両群で以前のMIと関連した(表9)。
代謝産物因子のCADとの独立した関連をさらに定量化するため、ロジスティック回帰モデルを構成した。すなわち(1)臨床モデル;(2)臨床モデルプラス因子4および9;ならびに(3)臨床モデルプラスすべての代謝産物因子である。因子4および9は、初期群(因子4:オッズ比[OR]1.42;95%CI、1.09から1.84、P=0.01;因子9:OR0.69、95%CI、0.53から0.90、P=0.006)および複製群(因子4:OR1.42;95%CI1.06から1.89、P=0.02;因子9:OR0.67;95%CI0.48から0.92、P=0.01)において、独立にCADと関連した。初期群におけるモデル適合およびROC曲線の測定値(図1)は、臨床変数のみを含むモデルを上回って(c統計量0.756;臨床モデルと臨床モデルプラス因子4および9との比較の場合、P=0.06;臨床モデルと臨床モデルプラスすべての因子との比較の場合、P=0.003)、すべての因子(c統計量0.804)の付加によるいくつかの改善と共に、因子4および9を含むモデル(c統計量0.778)について、穏やかにより優れた識別可能な能力を示した。複製群において、臨床モデル単独(c統計量0.743)の場合よりも因子4および9を臨床モデルに加えたc統計量(c統計量0.773)がわずかに高かったが、すべての因子の付加によりさらに劇的に改善した(c統計量0.874;臨床モデルと臨床モデルプラス因子4および9との比較の場合、P=0.04;および臨床モデルと臨床モデルプラスすべての因子との比較の場合、P<0.0001)。
フォローアップの2.72年の中央値の間、CAD症例314名のうち74名は、起こりやすい心血管イベントを有した。調整されない比較において、因子8(短鎖ジカルボキシルアシルカルニチン)は、死亡またはMIの発生に大いに関連した(図2;最高対最低三分位値のハザード比[HR]2.50;95%CI、1.47から4.17;P=0.0008;最高対中央三分位値HR2.33;95%CI、1.39から3.85;P=0.002)。この関連の強度は、CADリスク因子、CAD指数、年齢、人種、性別、駆出率、クレアチニンおよびカテーテル処置後のCABGによる治療について調整した後いくぶんか減弱した(最高対最低三分位値:HR1.67;95%CI、0.88から3.13;P=0.11;最高対中央三分位値:HR1.89;95%CI1.09から3.33;P=0.03)。因子1はまた、調整されない比較において、死亡/MIの発生に関連したが(最高対最低三分位値HR1.85;95%CI、1.06から3.23;P=0.03;最高対中央三分位値HR1.79;95%CI、1.02から3.03;P=0.04)、調整後まったく有意でなかった(それぞれP=0.14および0.05)。
材料および方法
試験母集団。GENECARD試験は、920のファミリーを登録して、(男性51歳、女性56歳以前に)早期発生のCADの遺伝子を同定するために罹患同胞対連鎖を行った(非特許文献7参照)。少なくとも2つの同胞を有し、そのそれぞれが(男性51歳、女性56歳以前に)早期発生のCADの基準を満たすファミリーを補充した。罹患していないファミリーメンバーを、CADの臨床的証拠なしおよび男性が55歳を超える(女性が60歳を超える)年齢として定義した。このコホートから、本発明者らは、本発明者らが比較的多数のファミリーメンバーの利用可能性および発端者および周囲の世代におけるCADの重い負担に基づいて特に有益であると考えた、8つの代表的なファミリーを選択した(図3)。これらのファミリーに再度連絡を取り、前もって登録していない罹患同胞対およびファミリーメンバーをCADに関係なく確認し、罹患同胞対の子孫に焦点を絞った。この確認戦略は、代謝性のプロファイルの異常がこれらのファミリーにおけるCADの発症に先行するかどうか、子孫中に顕性のCADがない場合でもファミリー内の代謝産物レベルの有意な一致が明らかであるという仮説に基づいた。所与のファミリー内の試料採取を、1人の熟練した瀉血士によりいくつかの異なる回数でおよび異なる場所で行った。血液試料を、末梢の静脈の瀉血による採取後に(数分以内に)迅速に処理し、その後可能な限り早く凍結し(試料の大部分が採取の1〜2時間以内に凍結されるなら、せいぜい12時間以内に)、EDTAによって処置した管に血漿試料として−80℃で貯蔵した。試料を、できるだけ空腹状態で採取したが、このコンシステンシーは決定できなかった。施設内審査委員会は、試験プロトコールを承認し、インフォームドコンセントを、それぞれの対象から得た。
遺伝率分析。代謝性のプロファイリングを、早期CADのGENECARD試験から得られた8つのマルチプレックスのコーカサス人ファミリー(図3)内の個体117名に行った。注目すべきことに、本試験で標本抽出したファミリーメンバーの大部分は、元の罹患同胞対の、今のところ罹患していない子孫であったが、この子孫は、これらのファミリーのメンバーとして、早期CADの発症のリスクが高かった。予想通り、有病率がファミリー間で異なったが、CADリスク因子の負担が高かった(表13)。
本発明は以下の実施の態様を含むものである。
1.対象における心血管疾患のリスクを評価するための方法であって、
a)前記対象からの試料中の少なくとも1種の代謝産物のレベルを検出するステップであって、前記代謝産物は、アシルカルニチン、アミノ酸、ケトン、遊離脂肪酸およびヒドロキシブチラートからなる群から選択される、該ステップと、
b)標準と前記試料中の前記代謝産物のレベルを比較するステップであって、前記対象における前記代謝産物のレベルは、前記対象における前記心血管疾患のリスクを示す、該ステップと
を含むことを特徴とする、該方法。
2.対象における心血管疾患のリスクを評価するための方法であって、
前記対象から試料を得るステップと、
前記試料中の代謝産物レベルの検出のために研究室に前記試料を提供するステップであって、前記代謝産物は、アシルカルニチン、アミノ酸、ケトン、脂肪酸およびヒドロキシブチラートから選択される、該ステップと、
前記研究室から前記試料中の前記代謝産物レベルを示す報告を受けるステップであって、前記代謝産物のレベルは、前記対象における前記心血管疾患のリスクを示す、該ステップと
を含むことを特徴とする、該方法。
3.前記心血管疾患は、心血管イベントであり、前記対象における前記代謝産物のレベルは、前記対象において心血管イベントのリスクを示すことを特徴とする前記1または2に記載の方法。
4.ステップ(a)において検出された代謝産物は、短鎖ジカルボキシルアシルカルニチン代謝産物であることを特徴とする前記3に記載の方法。
5.ステップ(a)において検出された代謝産物は、Gly、Ala、Ser、Pro、Met、His、Phe、Tyr、Asx、Glx、オルニチン、シトルリン、arg、C2、C3、C4:C14;C5:1、C5、C4:OH、C14−DC:C4DC、C5−DC、C6−DC、C10:3、C10、C10−OH:C8DC、C12:1、C12、C12−OH:C10DC、C14:1−OH、C14−OH:C12−DC、C16、C16−OH/C14−DC、C18:2、C18−OH/C16−DC、C20、C20:1−OH/C18:1−DC、C20−OH/C18−DC、C8:1−OH/C6:1−DC、C8:1−DC、C16:1、C16:1−OH/C14:1−DC、C20:4、FFA、HBUT、およびKetからなる群から選択されることを特徴とする前記3に記載の方法。
6.ステップ(a)において検出された代謝産物は、因子8の前記代謝産物を含むことを特徴とする前記3に記載の方法。
7.ステップ(a)において検出された代謝産物は、シトルリン、C5−DC、C6−DC、C8:1−OH/C6:1−DC、およびC8:1−DCを含むことを特徴とする前記3に記載の方法。
8.ステップ(a)において検出された代謝産物は、オルニチン、シトルリン、C5、C14−DC:C4DC、C5−DC、C6−DC、C10−OH:C8DC、C8:1−OH/C6:1−DC、C8:1−DC、C20:4およびFFAを含むことを特徴とする前記3に記載の方法。
9.前記心血管疾患は、冠動脈疾患であり、前記対象における前記代謝産物のレベルは、前記対象における前記冠動脈疾患の存在を示すことを特徴とする前記1または2に記載の方法。
10.ステップ(a)において検出される代謝産物は、中鎖アシルカルニチン、分枝鎖アミノ酸もしくは関連代謝産物、または尿素回路に関連する代謝産物であることを特徴とする前記9に記載の方法。
11.ステップ(a)において検出された代謝産物は、Pro、Leu/Ile、Met、Val、Glx、シトルリン、C2、C3、C4:Ci4;C5、C8、C8:1−OH/C6:1−DC、C10:1、C14:2、C14:1−OH、C16:2、C16:1、C16:2、C16:1、C16:1−OH/C14:1−DC、C18−OH/C16−DC、HBUT、およびKetからなる群から選択されることを特徴とする前記9に記載の方法。
12.ステップ(a)において検出された代謝産物は、因子1、因子4または因子9の少なくとも1種の前記代謝産物を含むことを特徴とする前記9に記載の方法。
13.ステップ(a)において検出された代謝産物は、Leu/Ile、Glx、C14:1−OHおよびC16:1−OH/C14:1−DCを含むことを特徴とする前記9に記載の方法。
14.170mMを超えるLeu/Ileのレベルは、冠動脈疾患を示すことを特徴とする前記13に記載の方法。
15.128mMを超えるGLxのレベルは、冠動脈疾患を示すことを特徴とする前記13に記載の方法。
16.0.013uM未満のC14:1−OHのレベルは、冠動脈疾患を示すことを特徴とする前記13に記載の方法。
17.0.0089uM未満のC16:1−OH/C14:1−DCのレベルは、冠動脈疾患を示すことを特徴とする前記13に記載の方法。
18.ステップ(a)において検出された代謝産物は、C2、C5およびC18−OH/C16−DCをさらに含むことを特徴とする前記13に記載の方法。
19.前記心血管疾患は、冠動脈疾患であり、前記対象における前記代謝産物のレベルは、前記対象において前記冠動脈疾患を発症するリスクを示すことを特徴とする前記1または2に記載の方法。
20.測定された前記代謝産物は、短鎖および中鎖アシルカルニチン代謝産物、分枝鎖アミノ酸、ならびに尿素回路に関連する代謝産物を含むことを特徴とする前記19に記載の方法。
21.測定された前記代謝産物は、ケトン、arg、オルニチン、シトルリン、glx、ala、val、leu/ile、pro、C2、C14:1、C18:1、C5:1、C4−i4、C18、C10:1およびFFAを含むことを特徴とする前記19に記載の方法。
22.少なくとも2つの代謝産物のレベルは、ステップ(a)において検出されることを特徴とする前記1から5、9から11または19から20のいずれかに記載の方法。
23.前記試料は、血液であることを特徴とする前記1から22のいずれかに記載の方法。
24.前記代謝産物のレベルは、質量分析を用いて検出されることを特徴とする前記1から23のいずれかに記載の方法。
25.前記代謝産物のレベルは、比色定量アッセイまたは蛍光定量アッセイを用いて検出されることを特徴とする前記1から24のいずれかに記載の方法。
26.対象のための治療計画を開発する方法であって、前記対象における心血管疾患のリスクに基づいた治療計画を開発するために前記1から25のいずれかに記載のステップ(b)の比較を用いるステップを含むことを特徴とする、該方法。
Claims (7)
- 対象における冠動脈疾患のリスクを評価するための方法であって、
(a)前記対象からの試料中の
(i)Phe、Tyr、Leu/Ile、Met、Val、C5、およびAla、ならびに
(ii)Arg、His、Cit、およびCi4−DC:C4DC
から選択される少なくとも1つの群の代謝産物のレベルを検出するステップと、
(b)標準と前記試料中の前記代謝産物のレベルを比較するステップであって、前記対象における前記代謝産物のレベルは、前記対象における前記冠動脈疾患のリスクを示す、該ステップと、
を含むことを特徴とする、該方法。 - 対象における冠動脈疾患のリスクを評価するための方法であって、
(a)前記対象から得られた試料中の
(i)Phe、Tyr、Leu/Ile、Met、Val、C5、およびAla、ならびに
(ii)Arg、His、Cit、およびCi4−DC:C4DC
から選択される少なくとも1つの群の代謝産物のレベルを検出するために研究室に前記試料を提供するステップと、
(b)前記研究室から前記試料中の前記代謝産物レベルを示す報告を受けるステップであって、前記代謝産物のレベルは、前記対象における前記冠動脈疾患のリスクを示す、該ステップと、
を含むことを特徴とする、該方法。 - ステップ(a)において検出された代謝産物は、Phe、Tyr、Leu/Ile、Met、Val、C5、およびAlaを含むことを特徴とする請求項1または2に記載の方法。
- ステップ(a)において検出された代謝産物は、Arg、His、Cit、およびCi4−DC:C4DCを含むことを特徴とする請求項1または2に記載の方法。
- 前記試料は、血液であることを特徴とする請求項1から4のいずれかに記載の方法。
- 前記代謝産物のレベルは、質量分析を用いて検出されることを特徴とする請求項1から5のいずれかに記載の方法。
- 前記代謝産物のレベルは、比色定量アッセイまたは蛍光定量アッセイを用いて検出されることを特徴とする請求項1から6のいずれかに記載の方法。
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