JP2015536676A - 糞便サンプル中のヘリコバクターピロリdnaを検出するための方法 - Google Patents
糞便サンプル中のヘリコバクターピロリdnaを検出するための方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2015536676A JP2015536676A JP2015546070A JP2015546070A JP2015536676A JP 2015536676 A JP2015536676 A JP 2015536676A JP 2015546070 A JP2015546070 A JP 2015546070A JP 2015546070 A JP2015546070 A JP 2015546070A JP 2015536676 A JP2015536676 A JP 2015536676A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- seq
- helicobacter pylori
- nucleotide sequence
- oligonucleotide
- primer set
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
(1)多くの種は、比較的に密接に関連しており、各々の種に特有の配列の位置を突き止めることを困難にしている。
(2)単一の種に由来する病原体株は、遺伝子的に多様化している可能性があり、1つの種におけるすべての株を均等に効率的に増幅することを可能にする配列の位置を突き止めることを困難にしている。
(3)サンプルはPCR阻害剤を含む可能性があり、また、本発明の場合には、ヘリコバクターピロリは典型的には胃粘膜中に生息して大腸においては死滅して分解している可能性が高いので、サンプルに含まれるのは主に断片化した標的DNAである。
したがって、糞便サンプルから病原体DNAを効果的に増幅するためには、高いPCR効率(できる限り100%に近いことが最適である)を可能にするオリゴヌクレオチド設計を必要とする。
(a)糞便サンプルから単離したDNAをテンプレートとし、増幅反応においてヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子中のヘリコバクターピロリ特異的標的配列の増幅に特異的なオリゴヌクレオチド プライマー セットを用いるPCR反応を行い、ただし、該オリゴヌクレオチド プライマー セットは、配列番号1のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号2のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとを含むものであり、そして
(b)該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が増幅されると該糞便サンプル中のヘリコバクターピロリDNAを検出する。
(a)糞便サンプルから単離したDNAをテンプレートとし、増幅反応においてヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子中のヘリコバクターピロリ特異的標的配列の増幅に特異的なオリゴヌクレオチド プライマー セットを用いるPCR反応を行い、ただし、該オリゴヌクレオチド プライマー セットは、配列番号1のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号2のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとを含むものであり、そして
(b)工程(a)において該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が増幅されるときには該糞便サンプル中のヘリコバクターピロリDNAを検出する。
設計における目的は、ヘリコバクターピロリに高度に特異的なPCRであって他の密接に関連する種を増幅しないものを開発することであった。配列を確認済のヘリコバクターピロリ株(クラリスロマイシン耐性変異を有するものと、クラリスロマイシン耐性変異を有しないものとの両方)を用いて、新規なアッセイを開発し最適化した。次に、臨床的に関連のある病原性の細菌種と、非病原性の細菌種との合計50種(グラム陰性の種とグラム陽性の種とを含む)について、分析特異性を検査した。有意の交差反応は検出されなかった。陽性と判定される増幅産物についての95%信頼区間の分析感度は10fgであった。これは、ゲノムの2コピー又は1つの細菌に対応する。胃生検、組織学及びヘリコバクター培養物を用いて、至適基準の参照方法である抗菌物質感受性検査を含め、臨床上の感度及び特異性を分析した。検査した患者サンプル(全部で80)のうち、94%のサンプルにおいて正しい同定がなされ、90%のサンプルにおいて正しい抗菌物質感受性が測定された。対照として、Oryza sativa の頂生花遺伝子 Ory から得たテンプレートを用いた。
キット(bioMerieux NucliSens Kits)と、抽出用の半自動化 easyMAG 器具とを用いて、全核酸を抽出した。包括的Bプロトコルと特異的Bプロトコルとの両方を検査して成功した。特異的Bプロトコルは、定量PCR性能においてやや良好であり、すべての実験において選択した。製造者の説明書に従い、白金耳量の糞便(約10%の溶液)をキットの細胞溶解バッファーの2mLに入れ、5秒間強く掻き混ぜ、少なくとも15分間、室温でインキュベートした。抽出量は25μlであった。
下記のPCRプログラムとオリゴヌクレオチドのセットとを、Stratagene MxPro 3005P を用いて行うすべてのアッセイにおいて使用した。
1 95℃で13分間
2 94℃で60
3 68℃で90秒
4 工程2〜3を5サイクル
5 94℃で30秒
6 68℃で60秒
7 工程2〜3を15サイクル
8 94℃で25秒
9 64℃で25秒
10 工程8〜9を40サイクル
外部プライマー
Hpy_sel_003_ F GCTAGTCTAAGGGCGTAGATTGGAGGGAAG(配列番号1)
Hpy_sel_003_ R GCTTGTGCCATTACACTCAACTTGCGATTTC(配列番号2)
内部プライマー
F_Hpyin_06 GGTGAAAATTCCTCCTACC(配列番号3)
R_Hpyin_06 CAAGGATGGCTCCATAAG(配列番号4)
対照
F_ORY_004 CTAATCCCAGCAACCCAACC(配列番号9)
R_ORY_004 CTAATCAATGTGAGACATATGATAGAAATC(配列番号10)
P_Hpy2142wt_02_ FAM CAAGACGGAAAGACCC(配列番号5)
P_Hpyall_02_JOE CAAAGCCTCCCACCTATCCTGCG(配列番号6)
P_Hpy2143G_06_TEX CAAGACGGAGAGACCC(配列番号7)
P_Hpy2142GG_05_TEX CAAGACGGGAAGACCC(配列番号8)
P_Ory_4_Cy5 CCTGCACTGGTAAGCTATG(配列番号11)
TGCTCCTAATCCCAGCAACCCAACCTTGAGGGAATACCTGCACTGGTAAGCTATGCTCTTGCAATTGTTGTGATTTCTATCATATGTCTCACATTGATTAGTGATCTA(配列番号12)
dH2O 2.85μl
Qiagen NoRox マスターミックス 12.5μl
Hpy_sel_003_ F 0.125μM 0.15μl
Hpy_sel_003_ R 0.125μM 0.15μl
F_Hpyin_06 0.8μM 1μl
R_Hpyin_06 0.8μM 1μl
F_ORY_004 0.125μM 0.15μl
R_ORY_004 0.125μM 0.15μl
P_Hpy2142wt_02_
FAM 0.2μM 0.25μl
P_Hpyall_02_JOE 0.28μM 0.35μl
P_Hpy2143G_06_TEX 0.28μM 0.35μl
P_Hpy2142GG_05_TEX 0.28μM 0.35μl
P_Ory_4_Cy5 0.2μM 0.25μl
合成 Ory テンプレート 10exp−11 0.5μl
テンプレート 5μl
プレミックス合計量 25μl
注意: もし新規な、又は二重の変異が現れれば、JOEは内部対照(存在するクラリスロマイシン耐性遺伝子型)を別とすれば唯一の陽性プローブである。
Booka et al., 2005, Helicobacter, 10:205-213
Burucoa et al., 1999, Journal Of Clinical Microbiology, 37(12):4071-4080
Chey and Wong, 2007, Am J Gastroenterol, 102:1808-1825
Dewhirst et al., 2005, Journal Of Bacteriology, 187(17):6106-6118
Falsafi et al., 2009, World J Gastroenterol, 15(4): 484-488
Fischbach and Evans, 2007, Aliment Pharmacol Ther 2007;26:343e57
Fontana et al.,2003, Journal Of Clinical Microbiology, 41(8):3636-3640
Ford et al., 2003, The Cochrane Database of Systematic Reviews 2003, Issue 4.
Ford et al., 2004, Am J Gastroenterol, 99:1833-1855
Khan et al., 2004, Antimicrobial Agents And Chemotherapy, 48(9):3567-3569
Kosunen et al., 2011, Int. J. Cancer: 128:433-439
Lottspeich, 2007, Journal Of Clinical Microbiology, 45(6):1718-1722
Maeda et al., 1998, Gut, 43:317-321
Makristathis et al., 1998, Journal Of Clinical Microbiology, 36(9):2772-2774
Malfertheiner et al., 2012, Gut 61:646e664
Mishra et al, 2008, J Infect Developing Countries. 2(3): 206-210
Monteiro et al., 2001, Journal of Microbiological Methods. 45:89-94
Noguchi et al., 2007, Journal of Medical Microbiology, 56, 1174-1180
Rimbara et al., 2005, Current Microbiology, 51:1-5
Scaletsky et al.,2011, Helicobacter, 16: 311-315
Schabereiter-Gurtner et al., 2004, Journal Of Clinical Microbiology, 42(10):4512-4518
Singh et al., 2008, Helicobacter, 13(1): 30-34
Strauss et al., 2000, Diagnostic Molecular Pathology 9(3): 151-157, 2000
Claims (19)
- 糞便サンプル中のヘリコバクターピロリDNAを検出するための方法であって、以下の工程を包含することを特徴とする方法。
(a)糞便サンプルから単離したDNAをテンプレートとし、増幅反応においてヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子中のヘリコバクターピロリ特異的標的配列の増幅に特異的なオリゴヌクレオチド プライマー セットを用いるPCR反応を行い、ただし、該オリゴヌクレオチド プライマー セットは、配列番号1のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号2のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとを含むものであり、そして
(b)該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が増幅されると該糞便サンプル中のヘリコバクターピロリDNAを検出する。 - 該PCR反応がネステッドPCR反応であることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 第2のオリゴヌクレオチド プライマー セットを該PCR反応に用い、ただし、該第2のオリゴヌクレオチド プライマー セットは、配列番号3のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号4のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとを含むものであることを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- 該オリゴヌクレオチド プライマー セットが、配列番号1のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなるオリゴヌクレオチドと、配列番号2のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなるオリゴヌクレオチドとを含むことを特徴とする、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
- 該第2のオリゴヌクレオチド プライマー セットが、配列番号3のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなるオリゴヌクレオチドと、配列番号4のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなるオリゴヌクレオチドとを含むことを特徴とする、請求項3に記載の方法。
- 該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が配列番号13の第1937番〜第2793番の位置にあるヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子のヌクレオチド領域であり、該ヌクレオチド領域の少なくとも一部が該PCR反応によって増幅されることを特徴とする、請求項1〜5のいずれかに記載の方法。
- 該第2のオリゴヌクレオチド プライマー セットの該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が配列番号13の第2482番〜第2624番の位置にあるヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子のヌクレオチド領域であり、該ヌクレオチド領域の少なくとも一部が該PCR反応によって増幅されることを特徴とする、請求項1〜6のいずれかに記載の方法。
- ヘリコバクターピロリのクラリスロマイシン耐性に関連するヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子の変異を、配列番号7のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなる第1プローブと、配列番号8のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなる第2プローブとによってさらに検出することを特徴とする、請求項1〜7のいずれかに記載の方法。
- 該第1プローブが配列番号7のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなり、該第2プローブが配列番号8のヌクレオチド配列を含み又は該配列からなることを特徴とする、請求項8に記載の方法。
- 該ヘリコバクターピロリ特異的標的配列が増幅されるときの該糞便サンプルからのヘリコバクターピロリDNAの検出を、DNAチップ、ゲル電気泳動、放射線測定、蛍光測定又は燐光測定を用いて行うことを特徴とする、請求項1〜9のいずれかに記載の方法。
- 工程(a)及び(b)を単一の容器を用いて行うことを特徴とする、請求項1〜10のいずれかに記載の方法。
- リアルタイムPCRアッセイとして行うことを特徴とする、請求項1〜11のいずれかに記載の方法。
- 配列番号1のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号2のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとを含むオリゴヌクレオチド プライマー セットであって、ヘリコバクターピロリの23S rRNA遺伝子中の標的配列を増幅することを特徴とするオリゴヌクレオチド プライマー セット。
- 配列番号3のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドと、配列番号4のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドとをさらに含むことを特徴とする、請求項13に記載のオリゴヌクレオチド プライマー セット。
- 配列番号7のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるプローブと、配列番号8のヌクレオチド配列中の少なくとも10個の連続するヌクレオチドからなるプローブとをさらに含むことを特徴とする、請求項13に記載のオリゴヌクレオチド プライマー セット。
- 配列番号1のヌクレオチド配列と配列番号2のヌクレオチド配列とを含み又は該2つの配列からなることを特徴とする、請求項13〜15のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド プライマー セット。
- 配列番号3のヌクレオチド配列と配列番号4のヌクレオチド配列とを含み又は該2つの配列からなることを特徴とする、請求項13〜15のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド プライマー セット。
- 糞便サンプル中のヘリコバクターピロリDNAを検出するためのキットであって、請求項13〜17のいずれかのオリゴヌクレオチド プライマー セットと、PCR反応において核酸の増幅を行うための試薬とを含むことを特徴とするキット。
- 該試薬がDNAポリメラーゼ、dNTP及びバッファーからなる群より選ばれることを特徴とする、請求項18に記載のキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FI20126271 | 2012-12-05 | ||
FI20126271 | 2012-12-05 | ||
PCT/FI2013/051144 WO2014087055A1 (en) | 2012-12-05 | 2013-12-05 | Method for detecting helicobacter pylori dna in a stool sample |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2015536676A true JP2015536676A (ja) | 2015-12-24 |
JP6574703B2 JP6574703B2 (ja) | 2019-09-11 |
Family
ID=49883127
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015546070A Active JP6574703B2 (ja) | 2012-12-05 | 2013-12-05 | 糞便サンプル中のヘリコバクターピロリdnaを検出するための方法 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9868995B2 (ja) |
EP (1) | EP2929051B1 (ja) |
JP (1) | JP6574703B2 (ja) |
CN (1) | CN104919058B (ja) |
AU (1) | AU2013353904B2 (ja) |
CA (1) | CA2893941C (ja) |
DK (1) | DK2929051T3 (ja) |
ES (1) | ES2664335T3 (ja) |
PL (1) | PL2929051T3 (ja) |
PT (1) | PT2929051T (ja) |
WO (1) | WO2014087055A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN107201410A (zh) * | 2017-07-26 | 2017-09-26 | 孙晓彦 | 用于幽门螺杆菌个体化基因检测的ARMS‑qPCR方法和试剂盒 |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ITUB20160413A1 (it) * | 2016-02-05 | 2017-08-05 | Thd Spa | Metodo per determinare Helicobacter pylori |
CN106119372A (zh) * | 2016-07-05 | 2016-11-16 | 首都医科大学 | 一种检测长爪沙鼠感染幽门螺旋杆菌的方法 |
RU2651033C1 (ru) * | 2017-04-17 | 2018-04-18 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук" (ФИЦ КНЦ СО РАН) | Способ диагностики хронического гастрита, ассоциированного с Helicobacter pylori |
RU2664449C1 (ru) * | 2017-05-29 | 2018-08-17 | Наталия Васильевна Журбина | Способ прогнозирования обострения течения язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, ассоциированной с хеликобактер пилори |
CN107227374A (zh) * | 2017-08-01 | 2017-10-03 | 扬州大学 | 一种基于荧光定量pcr鉴定啮齿类螺杆菌的引物、试剂盒及鉴定方法 |
CN110669848B (zh) * | 2018-07-03 | 2022-11-15 | 北京福安华生物科技有限公司 | 一种检测幽门螺旋杆菌的人工模拟分子信标与试剂盒 |
CN111910011A (zh) * | 2019-05-10 | 2020-11-10 | 江苏康为世纪生物科技有限公司 | 一种检测幽门螺杆菌耐药突变位点的试剂盒 |
CN111944916A (zh) * | 2020-09-14 | 2020-11-17 | 壹宏(深圳)基因有限公司 | 用于粪便微生物检测的试剂及其在胃幽门螺旋杆菌检测的应用 |
CN115627297B (zh) * | 2022-12-05 | 2023-04-11 | 北京吉检医疗科技有限公司 | 一种检测人粪便幽门螺旋杆菌核酸的试剂盒 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH10286099A (ja) * | 1997-04-16 | 1998-10-27 | S R L:Kk | ピロリ菌検出用プライマー及びそれを用いたピロリ菌のクラリスロマイシン耐性の検査方法 |
JP2006271290A (ja) * | 2005-03-30 | 2006-10-12 | Toyobo Co Ltd | 新規オリゴヌクレオチドプライマー及びそれを用いた点突然変異の検出方法 |
JP2008306935A (ja) * | 2007-06-12 | 2008-12-25 | Toyobo Co Ltd | 核酸の迅速な検出方法 |
CN101665824A (zh) * | 2009-09-24 | 2010-03-10 | 周玉贵 | 一种检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因的生物芯片及其制备方法和应用 |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5538848A (en) | 1994-11-16 | 1996-07-23 | Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. | Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe |
JP2005168474A (ja) | 2003-12-15 | 2005-06-30 | Morinaga Milk Ind Co Ltd | ヘリコバクター・ピロリ菌のクラリスロマイシン耐性検査方法 |
JP2006020511A (ja) | 2004-07-06 | 2006-01-26 | Toyobo Co Ltd | 核酸の検出方法 |
WO2007106407A2 (en) * | 2006-03-10 | 2007-09-20 | Wyeth | Microarray for monitoring gene expression in multiple strains of streptococcus pneumoniae |
JP5608998B2 (ja) | 2009-03-31 | 2014-10-22 | 東洋紡株式会社 | 保存安定性に優れた核酸増幅検出試薬キット |
JP2011062143A (ja) | 2009-09-17 | 2011-03-31 | Arkray Inc | ピロリ菌の23SrRNA遺伝子増幅用プライマー試薬およびその用途 |
-
2013
- 2013-12-05 WO PCT/FI2013/051144 patent/WO2014087055A1/en active Application Filing
- 2013-12-05 ES ES13814189.0T patent/ES2664335T3/es active Active
- 2013-12-05 AU AU2013353904A patent/AU2013353904B2/en active Active
- 2013-12-05 EP EP13814189.0A patent/EP2929051B1/en active Active
- 2013-12-05 PL PL13814189T patent/PL2929051T3/pl unknown
- 2013-12-05 PT PT138141890T patent/PT2929051T/pt unknown
- 2013-12-05 DK DK13814189.0T patent/DK2929051T3/en active
- 2013-12-05 CA CA2893941A patent/CA2893941C/en active Active
- 2013-12-05 CN CN201380069820.XA patent/CN104919058B/zh active Active
- 2013-12-05 US US14/649,674 patent/US9868995B2/en active Active
- 2013-12-05 JP JP2015546070A patent/JP6574703B2/ja active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH10286099A (ja) * | 1997-04-16 | 1998-10-27 | S R L:Kk | ピロリ菌検出用プライマー及びそれを用いたピロリ菌のクラリスロマイシン耐性の検査方法 |
JP2006271290A (ja) * | 2005-03-30 | 2006-10-12 | Toyobo Co Ltd | 新規オリゴヌクレオチドプライマー及びそれを用いた点突然変異の検出方法 |
JP2008306935A (ja) * | 2007-06-12 | 2008-12-25 | Toyobo Co Ltd | 核酸の迅速な検出方法 |
CN101665824A (zh) * | 2009-09-24 | 2010-03-10 | 周玉贵 | 一种检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因的生物芯片及其制备方法和应用 |
Non-Patent Citations (7)
Title |
---|
CURRENT MICROBIOLOGY, vol. 51, JPN6017037812, 2005, pages 1 - 5, ISSN: 0003872804 * |
JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY, vol. 60, JPN6017037819, 2012, pages 8103 - 8110, ISSN: 0003872808 * |
JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 41, no. 8, JPN6017037817, 2003, pages 3636 - 3640, ISSN: 0003872810 * |
JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY, vol. 27, JPN6017037816, 2012, pages 888 - 892, ISSN: 0003872806 * |
JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, vol. 56, JPN6017037814, 2007, pages 1174 - 1180, ISSN: 0003872805 * |
JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, vol. 183, JPN6017037821, 2012, pages 215 - 218, ISSN: 0003872809 * |
LETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGY, vol. 49, JPN6017037823, 2009, pages 568 - 572, ISSN: 0003872807 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN107201410A (zh) * | 2017-07-26 | 2017-09-26 | 孙晓彦 | 用于幽门螺杆菌个体化基因检测的ARMS‑qPCR方法和试剂盒 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20160017406A1 (en) | 2016-01-21 |
EP2929051B1 (en) | 2018-01-10 |
US9868995B2 (en) | 2018-01-16 |
DK2929051T3 (en) | 2018-04-16 |
CN104919058B (zh) | 2017-11-21 |
CA2893941A1 (en) | 2014-06-12 |
ES2664335T3 (es) | 2018-04-19 |
WO2014087055A1 (en) | 2014-06-12 |
JP6574703B2 (ja) | 2019-09-11 |
AU2013353904B2 (en) | 2017-07-13 |
EP2929051A1 (en) | 2015-10-14 |
PL2929051T3 (pl) | 2018-07-31 |
PT2929051T (pt) | 2018-04-10 |
AU2013353904A1 (en) | 2015-07-09 |
CA2893941C (en) | 2021-05-18 |
CN104919058A (zh) | 2015-09-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6574703B2 (ja) | 糞便サンプル中のヘリコバクターピロリdnaを検出するための方法 | |
US20220064715A1 (en) | Polymerase Chain Reaction Primers and Probes for Mycobacterium Tuberculosis | |
US20110287965A1 (en) | Methods and compositions to detect clostridium difficile | |
Debruyne et al. | Comparative performance of different PCR assays for the identification of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli | |
KR20190037027A (ko) | 중증 열성 혈소판 감소 증후군 바이러스 검출용 프라이머 세트 및 검출방법 | |
US9593384B2 (en) | Metronidazole resistance in trichomonas vaginalis and single nucleotide polymorphisms | |
CN111712583B (zh) | 使用多拷贝基因诊断恙虫病的方法 | |
ES2839874T3 (es) | Método para detectar la presencia de una cepa de Clostridium difficile hipervirulenta | |
US10190176B2 (en) | Primers, probes, and methods for mycobacterium tuberculosis specific diagnosis | |
JP2006075139A (ja) | 試料中に存在するヘリコバクター・ピロリ菌のcagA遺伝子の検出及び型判別の為のプライマー、方法及びキット | |
JP2007075018A (ja) | Campylobactercoliの検出法 | |
Prabhraj et al. | OIE recommended nucleic acid based techniques for poultry diseases diagnosis | |
EA032489B1 (ru) | Олигонуклеотидные праймеры, флуоресцентные днк-зонды и способ выявления mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2-w148 генотипа beijing в клинических образцах |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150828 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20161122 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20170913 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20171003 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20171226 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20180302 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180330 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20180330 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20180904 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20181129 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190130 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190227 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20190724 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20190819 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6574703 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313111 |
|
R371 | Transfer withdrawn |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R371 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313111 |
|
S631 | Written request for registration of reclamation of domicile |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313631 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
RD02 | Notification of acceptance of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R3D02 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |