JP2013541323A - 貪食細胞を用いて疾患または症状のシグネチャを検出する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2010年7月23日に提出された米国特許仮出願第61/367,094号の優先権を主張するものであり、その全体が全ての目的のため、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は概して、疾患または症状の診断、予後予測、またはモニタリングにおいて、貪食細胞を使用する方法に関する。本発明はまた、貪食細胞を使用して疾患または症状のマーカーを同定する方法に関する。
多くの場合、疾患の早期診断により、その疾患の治療または治癒に成功する可能性が高くなる。しかしながら、現在の診断方法は、主として健康な個体から得られた集団由来の平均値に依存する。疾患を有することが分かっていない個体、または再発性の疾患を有する個体において、疾患または症状の存在についての診断、特に早期診断を可能にする、個別化された診断方法が必要とされる。
発明者らは、DNA量のレベルが異なる(すなわち、>2nおよび2n)貪食細胞を用いることにより、疾患または症状を検出/診断する新規で有用な方法を発明した。ある実施形態では、貪食細胞の2つの亜集団が用いられ、DNA量が2n超の貪食細胞(>2n貪食細胞)が病気の細胞の代用物として働き、DNA量が2nである貪食細胞(2n貪食細胞)がコントロール細胞として働く。
本発明は、同一個体から採取されたDNA量が異なる(>2n対2n)貪食細胞間で、疾患または症状に関連するマーカー(例えば、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物)のプロファイル(例えば、遺伝子/タンパク質/脂質/炭水化物発現プロファイル、遺伝子型、遺伝子コピー数、遺伝子量、DNAメチル化など)を比較することによって、疾患または症状を診断または診断補助する方法を提供する。
ヘキスト33342で染色し、FACSにより選別して、ヒト血液(ドナー)から白血球を単離した。図7は、このアプローチにより、2つの所望の貪食細胞集団のそれぞれについて、106個の白血球を同定、選別、および回収することができることを示す。
白血球を、1つまたは複数の貪食細胞(例えば、好中球、マクロファージ、または単球)に対して特異的な蛍光抗体で染色し、DNA結合性色素(例えば、ヨウ化プロピジウム)で染色する。
プロファイリング実験
血中貪食細胞の単離
患者から血液試料を採取する。血液(約5mL)を、50μLの0.5M EDTAを含有する50mLチューブへ移す(EDTAの最終濃度=約4.8mM)。チューブを穏やかにボルテックス攪拌し、25mLのRBC溶解バッファー(Norgen社)を添加する。チューブを再度穏やかにボルテックス攪拌し、溶液の色が明赤色に変わるまで室温にてインキュベートし(3〜5分間)、2,000rpmにて3分間遠心分離する。上清を注意深く吸引した後、40mLのCa/Mgフリー0.1M PBS(2%FBS、2mM EDTA、および20mMグルコースを含有)で白血球を洗浄し、次に、細胞(106個/mL)を、(i)生細胞透過性DNA染色液ヘキスト33342(4μg/mL、Em=483nm)、(ii)循環単球/マクロファージによって発現されるヒトF4/80抗原を認識する抗ヒト単球/マクロファージモノクローナル抗体(Alexa Fluor(登録商標)647複合体、Em=668nm)、および(iii)ヒト循環好中球を認識する抗ヒト好中球モノクローナル抗体(RPE標識複合体、Em=578nm)を含有する細胞染色溶液と共にインキュベートする(暗所で4℃、30分間)。次に、細胞を洗浄し、好中球(Nn=2)、好中球(Nn>2)、単球/マクロファージ(M/Mn=2)、および単球/マクロファージ(M/Mn>2)に選別する(BD FACSAria)。
ヒト全ゲノム遺伝子プロファイリングを実施する。ヒト腫瘍細胞、または好中球(Nn=2、Nn>2)および単球/マクロファージ(M/Mn=2、M/Mn>2)から得られたRNA試料に対して、GeneChip(登録商標)ヒトゲノムUl 33プラス2.0アレイ(Affymetrix社)を使用する。このアレイでは、38,500の十分に特徴づけられたヒト遺伝子を含む、47,000を超える転写産物およびバリアントの発現レベルが解析される。一般的には、上述のアレイを用いてヒト遺伝子の発現プロファイルを決定するために、抽出したRNAが使用される。アレイの再現性を確実にするために、各試料を3連(triplicate)でプロファイル化し、繰り返し実験を1回行う。マイクロアレイデータは、以下に記載するように、癌誘導関連遺伝子についてフィルタリングし、定量的リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)を用いて確認する。
Triazol(Invitrogen社)を用いてRNAを単離し、このキットに付属のカートリッジを用いて精製する。RNAの質および量は、Bioanalyzer 2100(Agilent Technologies社、パロアルト、カリフォルニア州)およびDegradometerソフトウェア バージョン1.41(ワールドワイドウェブ:dnaarrays.org)を用いて評価する。これらの実験結果は、腫瘍の存在により乱された分子経路を見分ける際の手助けとなる。
得られた大規模/ハイスループット分子発現データの解析は、(i)DNA量が2超である貪食細胞において異なって発現する遺伝子を同定する能力、(ii)同定された遺伝子をアノテートする能力、および(iii)アノテートされた遺伝子を特定の腫瘍によって特異的に発現される遺伝子へ割り当てる能力に大いに依存する。マイクロアレイデータの統計的解析は、例えば、「試料解析/比較」メニュー中のこの種の遺伝子リスト構築に容易に対応するdChipパッケージを用いて行うことができる。Affymetrix GeneChipsを用いる場合、1つまたは複数のGeneChipsおよび関連する方法を適用して、マイクロアレイ生データの質を確認する(Gautier et al.(2004)Bioinformatics 20:307)。さらに、種々のバックグランド補正および標準化の手順を利用して、(発現値を得るための)プローブセットの標準化および集計のために最適なプロトコルを得る(Huber et al.(2002)Bioinformatics 18(Suppl.1):S96、Wu et al.(2004)Journal of the American Statistical Association 99:909、Seo and Hoffman(2006)BioMed Central Bioinformatics 7:395)。図5に示すように、二段階フィルトレーション(two−step filtration)アプローチにおいて、発明者らは、Pn=2の遺伝子プロファイルをPn>2の遺伝子プロファイルと比較して、発現された遺伝子のリストを構築し、次にPn=2遺伝子プロファイルをフィルタリングした後に、これらの遺伝子と各腫瘍細胞株に対して同定された腫瘍特異的遺伝子とを比較する。例えば、(i)乳癌患者から血液を採取し、(ii)(>2nおよび2n)好中球を単離して、これらのプロファイルを3連(triplicate)で測定し、(iii)同定された各遺伝子の(3個の試料の)平均値および対応する標準誤差(SE)を各グループ(Nn>2、およびNn=2)に対して計算し、(iv)次に、この2つのグループの遺伝子発現プロファイルを比較し、ウェルチの改良2標本t検定に準じて、絶対値で2倍以上の対数の変化(absolute >2−fold log change)(Nn>2/Nn=2)に基づいて発現遺伝子のリスト(L−I)を同定し、(v)Nn=2の遺伝子発現プロファイルおよび(腫瘍および正常乳腺組織生検から得られる)乳癌の遺伝子発現プロファイルを比較し、発現遺伝子のリスト(L−2)を同定し、(vi)L−IおよびL−2の遺伝子を比較し(dChipの「試料解析/比較/比較の統合」)、共通の遺伝子をフィルタリングすることにより、Nn>2によって獲得/発現された乳癌特異的遺伝子シグネチャを同定する。
各種細胞からの総タンパク質50〜100マイクログラムを変性し、トリス−(2−カルボキシエチル)ホスフィントリプシン(1mM)および0.02%ドデシル硫酸ナトリウムを用いて、60℃にて1時間還元する。続いてシステインをブロックし、総タンパク質をトリプシンで37℃にて12〜16時間消化する。得られたペプチドを、1時間、(113〜119および121にタグを有する)iTRAQで標識する(比較する細胞型の数に応じて、4種類または8種類)。標識後、別々にタグ付けされた試料を1つにまとめ、強カチオンイオン交換カラム(Applied Biosystems社、4.6×100 多孔性)を備えたAgilent 1200シリーズHPLCシステムへ注入する。次に、96個の回収した画分を14個の画分へプールし、各画分を、逆相条件下にてLC Packings Ultimate HPLCシステム(LC Packings社、15cm×75μm 分析カラム)へ注入し、2回目の分画を行う。LC Packings Probotを使用して逆相画分を標的プレート上に直接スポットし、質量分析(Applied Biosystems 4800 Plus Proteomics Analyzer)によって分析する。データの取得後にProteinPilotソフトウェアパッケージ(Applied Biosystems/MDS Sciex社)を用いてスペクトルを処理し、ProteinPilot(商標)ソフトウェアを用いて各種細胞における個々のタンパク質をその相対的発現レベルと共に同定する。
Claims (123)
- (a)DNA量が2n超である貪食細胞(>2n貪食細胞)集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
(b)DNA量が2nである貪食細胞(2n貪食細胞)集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、および
(c)前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、
前記差異が対象における前記疾患または症状の存在を示す、対象における疾患または症状を診断または診断補助する方法。 - (a)>2n貪食細胞集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
(b)2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、および
(c)前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、
前記差異が対象における前記疾患または症状が発症するリスクを示す、対象における疾患または症状が発症するリスクを評価する方法。 - (a)>2n貪食細胞集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
(b)2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、および
(c)前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの差異を同定することを含み、
前記差異が対象における前記疾患または症状の予後を示す、対象における疾患または症状の予後予測または予後予測を補助する方法。 - (a)治療前の対象の>2n貪食細胞集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
前記治療前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、
(b)治療後の前記対象の>2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、
前記治療後の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、および
(c)第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、
前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状に対する治療の有効性を示す、対象における疾患または症状に対する治療の有効性を評価する方法。 - (a)第1時点における対象の>2n貪食細胞集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
第1時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、
(b)第2時点における前記対象の>2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、
第2時点における前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、および
(c)第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、
前記同定された差異が前記対象における前記疾患または症状の進行または軽減を示す、対象における疾患または症状の進行または軽減をモニターする方法。 - (a)化合物を投与する前の対象の>2n貪食細胞集団から、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーについての第1プロファイルを決定すること、
前記化合物を投与する前の対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第2プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異を同定すること、
(b)前記化合物を投与した後の前記対象の>2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーについての第3プロファイルを決定すること、
前記化合物を投与した後の前記対象の2n貪食細胞集団から、前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つについての第4プロファイルを決定すること、
前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数について、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異を同定すること、
(c)第1差異と第2差異との差異を同定することを含み、
前記同定された差異が、前記化合物が前記対象における前記疾患または症状を改善または治療することができることを示す、対象における疾患または症状を改善または治療することができる化合物を同定する方法。 - 前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記2n貪食細胞と比較して前記>2n貪食細胞において上方制御または活性化されている、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが、前記2n貪食細胞と比較して前記>2n貪食細胞において下方制御または抑制されている、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第1プロファイルまたは第2プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第3プロファイルまたは第4プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項4〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記(a)の前に前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞を溶解することをさらに含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記(a)の前に前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞から細胞内容物を抽出することをさらに含む、請求項1〜6および請求項11のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞の細胞内容物中に、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つが存在する、請求項12に記載の方法。
- 前記2n貪食細胞の細胞内容物中に、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーが存在しない、請求項12に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞の細胞内容物が、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片を含む、請求項12に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを発現する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記(c)の同定された差異と前記疾患または症状の1つまたは複数の既知のマーカーについてのリポジトリとを比較することをさらに含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記リポジトリがデータマイニングにより得られる、請求項17に記載の方法。
- 前記貪食細胞が、専門貪食細胞、非専門貪食細胞、またはこれらの混合物である、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記専門貪食細胞が、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、好酸球、またはこれらの混合物である、請求項19に記載の方法。
- 前記非専門貪食細胞が、上皮細胞、内皮細胞、線維芽細胞、間葉細胞、またはこれらの混合物である請求項19に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が貪食細胞集団から単離される、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより貪食細胞集団から単離される、請求項23に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項23に記載の方法。
- 前記体液試料が、血液、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液である、請求項22または請求項25に記載の方法。
- 前記細胞が白血球である、請求項22または請求項25に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が抗体を用いて単離される、請求項23および請求項25〜27のいずれか1項に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより単離される、請求項23および請求項25〜27のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、前記貪食細胞により分泌される産物を用いて単離される、請求項22〜24のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、前記貪食細胞表面上の細胞表面標的を用いて単離される、請求項22〜24のいずれか1項に記載の方法。
- 前記標的が前記貪食細胞により発現される、請求項31に記載の方法。
- 前記標的が前記貪食細胞により発現されない、請求項31に記載の方法。
- 前記標的が前記疾患または症状のマーカーである、請求項31に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、白血球の細胞膜上に発現される分子受容体と結合するリガンドを用いて単離される、請求項22〜24のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの組合せである、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸が、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、DNA、RNA、またはDNA−RNAハイブリッドである、請求項36に記載の方法。
- 前記DNAが、二本鎖DNA、一本鎖DNA、多重鎖DNA、相補DNA、ゲノムDNA、または非コードDNAである、請求項37に記載の方法。
- 前記RNAが、メッセンジャーRNA(mRNA)、マイクロRNA(miRNA)、核小体低分子RNA(snoRNA)、リボソーマルRNA(rRNA)、トランスファーRNA(tRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、ヘテロ核RNA(hnRNA)、または低分子ヘアピン型RNA(shRNA)である、請求項37に記載の方法。
- 前記タンパク質が、アミノ酸、ペプチド、酵素、抗原、抗体、サイトカイン、リポタンパク質、糖タンパク質、またはホルモンである、請求項36に記載の方法。
- 前記脂質が、脂肪酸、中性脂肪、リン脂質、コレステロール、コレステロールエステル、トリグリセリド、糖脂質、グリセロ脂質、グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、ステロール脂質、プレノール脂質、サッカロ脂質、ポリケチド、コリングリセロリン脂質、エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルセリン、リゾ−コリングリセロリン脂質、リゾ−エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジン酸、リゾ−ホスファチジン酸、スフィンゴミエリン、ガラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、遊離脂肪酸、プロスタグランジン、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、モノアシルグリセロール、アシル−CoA、アシルカルニチン、オキシステロール、セラミド、カルジオリピン、スフィンゴイド塩基−1−リン酸、スフィンゴシン、リゾ−スフィンゴミエリン、ガングリオシド、プラスマローゲン、スルファチド、低密度リポタンパク質(LDL)、超低密度リポタンパク質(VLDL)、高密度リポタンパク質(HDL)、スフィンゴイド塩基−1−リン酸、またはこれらの誘導体である、請求項36に記載の方法。
- 前記炭水化物が、単糖類、二糖類、多糖類、オリゴ糖類、またはこれらの誘導体である、請求項36に記載の方法。
- 前記代謝物が、一次代謝物、二次代謝物、有機代謝物、無機代謝物、プロスタグランジン、ヒドロキシエイコサテトラエン酸、ヒドロキシオクタデカジエン酸、ステロイド類、胆汁酸、ビタミン、またはこれらの誘導体である、請求項36に記載の方法。
- 前記プロファイルが、核酸プロファイル、タンパク質プロファイル、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記プロファイルが、定性的アッセイ、定量的アッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項44に記載の方法。
- 前記定量的アッセイが、シークエンシング、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガー・ジデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシング(duplex sequencing)、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアターム(near−term)シークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシング(sequencing−by−synthesis)、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、Solexa Genome Analyzerを用いたシークエンシング、SOLiD(登録商標)を用いたシークエンシング、MS−PETシークエンシング、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)解析、定量的PCR法、リアルタイムPCR法、蛍光アッセイ、比色アッセイ、化学発光アッセイ、またはこれらの組合せを用いる、請求項45に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、遺伝子型プロファイル、一塩基多型プロファイル、遺伝子変異プロファイル、遺伝子コピー数プロファイル、DNAメチル化プロファイル、DNAアセチル化プロファイル、染色体遺伝子量プロファイル、遺伝子発現プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項44に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)解析、シークエンシング解析、電気泳動解析、制限断片長多型(RFLP)解析、ノーザンブロット解析、定量的PCR法、逆転写PCR解析(RT−PCR)、アレル特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション解析、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、ヘテロ二重鎖移動度アッセイ(HMA)、一本鎖高次構造多型(SSCP)法、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)法、RNAaseミスマッチ解析、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、表面プラズモン共鳴法、サザンブロット解析、in situハイブリダイゼーション法、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)法、発色性in situハイブリダイゼーション(CISH)法、免疫組織化学(IHC)法、マイクロアレイ法、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、核型分析、多重ライゲーション依存性プローブ増幅(MLPA)法、短蛍光フラグメントの定量的多重PCR(QMPSF)法、顕微鏡法、メチル化特異的PCR(MSP)アッセイ、ライゲーション仲介PCRによるHpaII小断片濃縮(HpaII Tiny Fragment Enrichment by Ligation−Mediated PCR)(HELP)アッセイ、放射性酢酸塩標識アッセイ、比色によるDNAアセチル化アッセイ、マイクロアレイと組み合わせたクロマチン免疫沈降(ChIP−on−chip)アッセイ、制限酵素ランドマークゲノムスキャニング法、メチル化DNA免疫沈降(MeDIP)法、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ活性の分子切断光アッセイ、クロマトグラフィーによる分離、メチル化感受性制限酵素解析、バイサルファイトによる非メチル化シトシンのウラシルへの変換、メチル結合PCR解析、またはこれらの組合せにより決定される、請求項47に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガー・ジデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシング(duplex sequencing)、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアターム(near−term)シークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシング(sequencing−by−synthesis)、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、Solexa Genome Analyzerを用いたシークエンシング、SOLiD(登録商標)を用いたシークエンシング、MS−PETシークエンシング、質量分析法、およびこれらの組合せからなる群より選択されるシークエンシング技術により決定される、請求項47に記載の方法。
- 前記タンパク質プロファイルが、タンパク質発現プロファイル、タンパク質活性化プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項44に記載の方法。
- 前記タンパク質プロファイルが、免疫組織化学アッセイ、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、in situハイブリダイゼーション法、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、顕微鏡法、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、表面プラズモン共鳴法、シークエンシング、ウェスタンブロットアッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項50に記載の方法。
- 前記タンパク質活性化プロファイルが、前記1つまたは複数のマーカーのリン酸化状態、ユビキチン化状態、ミリストイル化状態、立体構造状態、またはこれらの組合せを決定することを含む、請求項50に記載の方法。
- 前記脂質プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項44に記載の方法。
- 前記炭水化物プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、パルスドアンペロメトリー検出器を用いた高速陰イオン交換クロマトグラフィー(HPAEC−PAD)法、液体クロマトグラフィー法、ガスクロマトグラフィ法ー、蛍光アッセイ、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項44に記載の方法。
- 前記対象が少なくとも2つの疾患または症状を有する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が哺乳類動物である、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象がヒトである、請求項56に記載の方法。
- 前記差異が1倍よりも大きい、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記差異が、少なくとも1.05倍、1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の差異である、請求項58に記載の方法。
- 前記疾患または症状が、心血管系の疾患または症状、腎臓関連の疾患または症状、胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状、神経性もしくは精神神経性の疾患または症状、自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状、癌、感染性の疾患または症状、ミトコンドリア病、呼吸器胃腸管系の疾患または症状、生殖器系の疾患または症状、眼部の疾患または症状、筋骨格系の疾患または症状、あるいは皮膚の疾患または症状である、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- (a)疾患または症状を有する対象の>2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第1プロファイルを決定すること、
前記疾患または症状を有する対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第2プロファイルを決定すること、
第2プロファイルと比較して第1プロファイルに特異的である、第1プロファイルと第2プロファイルとの第1差異セットを同定すること、
(b)前記疾患または症状を有しないコントロール対象の>2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第3プロファイルを決定すること、
前記疾患または症状を有しないコントロール対象の2n貪食細胞から、複数の被分析物についての第4プロファイルを決定すること、
第4プロファイルと比較して第3プロファイルに特異的である、第3プロファイルと第4プロファイルとの第2差異セットを同定すること、
(c)第2差異セットと比較して第1差異セットに特異的である、1つまたは複数の被分析物を同定することを含み、
前記同定された被分析物が前記疾患または症状のマーカーである、疾患または症状の1つまたは複数のマーカーを同定する方法。 - (d)前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒された細胞または組織から、複数の被分析物についての第5プロファイルを得ること、
前記疾患または症状を有する対象の前記疾患または症状に冒されていない細胞または組織から、複数の被分析物についての第6プロファイルを得ること、
第6プロファイルと比較して第5プロファイルに特異的である、第5プロファイルと第6プロファイルとの第3差異セットを同定すること、および
(e)第3差異セット中に存在する、前記(c)の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つを同定することをさらに含む、請求項61に記載の方法。 - 前記(a)の前に前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞を溶解することをさらに含む、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記(a)の前に前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞から細胞内容物を抽出することをさらに含む、請求項61〜62および請求項63のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞の細胞内容物が、生存している病気の細胞、死んだ病気の細胞、アポトーシスを起こした病気の細胞、循環腫瘍細胞、感染性因子、胎生細胞、栄養芽細胞、またはこれらの断片を含む、請求項64に記載の方法。
- 前記第1プロファイルまたは第2プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第3プロファイルまたは第4プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第5プロファイルまたは第6プロファイルが、前記疾患または症状の1つまたは複数のマーカーのうちの少なくとも1つの欠如を含む、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記貪食細胞が、専門貪食細胞、非専門貪食細胞、またはこれらの混合物である、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記専門貪食細胞が、好中球、マクロファージ、単球、樹状細胞、泡沫細胞、マスト細胞、好酸球、またはこれらの混合物である、請求項69に記載の方法。
- 前記非専門貪食細胞が、上皮細胞、内皮細胞、線維芽細胞、間葉細胞、またはこれらの混合物である、請求項69に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が貪食細胞集団から単離される、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞および2n貪食細胞が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより貪食細胞集団から単離される、請求項73に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が、前記対象の体液試料、組織、または細胞から単離される、請求項72〜74のいずれか1項に記載の方法。
- 前記体液試料が、血液、尿、大便、唾液、リンパ液、脳脊髄液、滑液、嚢胞液、腹水、胸水、妊娠第1三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第2三半期の妊婦から得られた体液、妊娠第3三半期の妊婦から得られた体液、母体血、羊水、絨毛膜絨毛試料、着床前胚の体液、母体尿、母体唾液、胎盤試料、胎児血液、洗浄液および頸膣部液、間質液、または眼液である、請求項72または請求項75に記載の方法。
- 前記細胞が白血球である、請求項72または請求項75に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が抗体を用いて単離される、請求項73および請求項75〜77のいずれか1項に記載の方法。
- 前記貪食細胞集団が、フローサイトメトリー、蛍光標識細胞分取、濾過、密度勾配遠心分離法、溶出、マイクロフルイディクス、磁気分離技術、蛍光磁気分離技術、ナノ構造、量子ドット、ハイスループット顕微鏡プラットフォーム、またはこれらの組合せにより単離される、請求項73および請求項75〜77のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、前記>2n貪食細胞により分泌される産物を用いて単離される、請求項72〜74のいずれか1項に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、前記貪食細胞表面上の細胞表面標的を用いて単離される、請求項72〜74のいずれか1項に記載の方法。
- 前記標的が前記貪食細胞により発現される、請求項81に記載の方法。
- 前記標的が前記貪食細胞により発現されない、請求項81に記載の方法。
- 前記標的が前記疾患または症状のマーカーである、請求項81に記載の方法。
- 前記>2n貪食細胞が、白血球集団の細胞膜上に発現される分子受容体と結合するリガンドを用いて単離される、請求項72〜74のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの組合せである、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記被分析物が、核酸、タンパク質、脂質、炭水化物、代謝物、またはこれらの組合せである、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸が、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、DNA、RNA、またはDNA−RNAハイブリッドである、請求項86または請求項87に記載の方法。
- 前記DNAが、二本鎖DNA、一本鎖DNA、多重鎖DNA、相補DNA、ゲノムDNA、または非コードDNAである、請求項88に記載の方法。
- 前記RNAが、メッセンジャーRNA(mRNA)、マイクロRNA(miRNA)、核小体低分子RNA(snoRNA)、リボソーマルRNA(rRNA)、トランスファーRNA(tRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、ヘテロ核RNA(hnRNA)または低分子ヘアピン型RNA(shRNA)である、請求項88に記載の方法。
- 前記タンパク質が、アミノ酸、ペプチド、酵素、抗原、抗体、サイトカイン、リポタンパク質、糖タンパク質、またはホルモンである、請求項86または請求項87に記載の方法。
- 前記脂質が、脂肪酸、中性脂肪、リン脂質、コレステロール、コレステロールエステル、トリグリセリド、糖脂質、グリセロ脂質、グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、ステロール脂質、プレノール脂質、サッカロ脂質、ポリケチド、コリングリセロリン脂質、エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルセリン、リゾ−コリングリセロリン脂質、リゾ−エタノールアミングリセロリン脂質、ホスファチジン酸、リゾ−ホスファチジン酸、スフィンゴミエリン、ガラクトシルセラミド、グルコシルセラミド、遊離脂肪酸、プロスタグランジン、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、モノアシルグリセロール、アシル−CoA、アシルカルニチン、オキシステロール、セラミド、カルジオリピン、スフィンゴイド塩基−1−リン酸、スフィンゴシン、リゾ−スフィンゴミエリン、ガングリオシド、プラスマローゲン、スルファチド、低密度リポタンパク質(LDL)、超低密度リポタンパク質(VLDL)、高密度リポタンパク質(HDL)、スフィンゴイド塩基−1−リン酸、またはこれらの誘導体である、請求項86または請求項87に記載の方法。
- 前記炭水化物が、単糖類、二糖類、多糖類、オリゴ糖類、またはこれらの誘導体である、、請求項86または請求項87に記載の方法。
- 前記代謝物が、一次代謝物、二次代謝物、有機代謝物、無機代謝物、プロスタグランジン、ヒドロキシエイコサテトラエン酸、ヒドロキシオクタデカジエン酸、ステロイド類、胆汁酸、ビタミン、またはこれらの誘導体である、、請求項86または請求項87に記載の方法。
- 前記プロファイルが、核酸プロファイル、タンパク質プロファイル、脂質プロファイル、炭水化物プロファイル、代謝物プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記プロファイルが、定性的アッセイ、定量的アッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項95に記載の方法。
- 前記定量的アッセイが、シークエンシング、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガー・ジデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシング(duplex sequencing)、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアターム(near−term)シークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシング(sequencing−by−synthesis)、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、Solexa Genome Analyzerを用いたシークエンシング、SOLiD(登録商標)を用いたシークエンシング、MS−PETシークエンシング、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)アッセイ、定量的PCR法、リアルタイムPCR法、蛍光アッセイ、比色アッセイ、化学発光アッセイ、またはこれらの組合せを用いる、請求項96に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、遺伝子型プロファイル、一塩基多型プロファイル、遺伝子変異プロファイル、遺伝子コピー数プロファイル、DNAメチル化プロファイル、DNAアセチル化プロファイル、染色体遺伝子量プロファイル、遺伝子発現プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項95に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)解析、シークエンシング解析、電気泳動解析、制限断片長多型(RFLP)解析、ノーザンブロット解析、逆転写PCR解析(RT−PCR)、定量的PCR法、定量的RT−PCR法、アレル特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション解析、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、ヘテロ二重鎖移動度アッセイ(HMA)、一本鎖高次構造多型(SSCP)法、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)法、RNAaseミスマッチ解析、質量分析法、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、サザンブロット解析、in situハイブリダイゼーション法、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)法、発色性in situハイブリダイゼーション(CISH)法、免疫組織化学(IHC)法、マイクロアレイ法、比較ゲノムハイブリダイゼーション法、核型分析、多重ライゲーション依存性プローブ増幅(MLPA)法、短蛍光フラグメントの定量的多重PCR(QMPSF)法、顕微鏡法、メチル化特異的PCR(MSP)アッセイ、ライゲーション仲介PCRによるHpaII小断片濃縮(HpaII Tiny Fragment Enrichment by Ligation−Mediated PCR)(HELP)アッセイ、放射性酢酸塩標識アッセイ、比色によるDNAアセチル化アッセイ、マイクロアレイと組み合わせたクロマチン免疫沈降(ChIP−on−chip)アッセイ、制限酵素ランドマークゲノムスキャニング法、メチル化DNA免疫沈降(MeDIP)法、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ活性の分子切断光アッセイ、クロマトグラフィーによる分離、メチル化感受性制限酵素解析、表面プラズモン共鳴法、バイサルファイトによる非メチル化シトシンのウラシルへの変換、メチル結合PCR解析、またはこれらの組合せにより決定される、請求項98に記載の方法。
- 前記核酸プロファイルが、ダイレクトシークエンシング、ランダムショットガンシークエンシング、サンガー・ジデオキシターミネーションシークエンシング、全ゲノムシークエンシング、ハイブリダイゼーションによるシークエンシング、パイロシークエンシング、キャピラリー電気泳動法、ゲル電気泳動法、二重鎖シークエンシング(duplex sequencing)、サイクルシークエンシング、一塩基伸長シークエンシング、固相シークエンシング、ハイスループットシークエンシング、大規模並列処理シグネチャシークエンシング、エマルジョンPCR法、可逆的ダイターミネーターによるシークエンシング、ペアドエンドシークエンシング、ニアターム(near−term)シークエンシング、エキソヌクレアーゼシークエンシング、ライゲーションによるシークエンシング、ショートリードシークエンシング、一分子シークエンシング、合成シークエンシング(sequencing−by−synthesis)、リアルタイムシークエンシング、リバースターミネーターシークエンシング、ナノポアシークエンシング、454シークエンシング、Solexa Genome Analyzerを用いたシークエンシング、SOLiD(登録商標)を用いたシークエンシング、MS−PETシークエンシング、質量分析法、およびこれらの組合せから選択されるシークエンシング技術により決定される、請求項98に記載の方法。
- 前記タンパク質プロファイルが、タンパク質発現プロファイル、タンパク質活性化プロファイル、またはこれらの組合せである、請求項95に記載の方法。
- 前記タンパク質活性化プロファイルが、前記1つまたは複数のマーカーのリン酸化状態、ユビキチン化状態、ミリストイル化状態、または立体構造状態を決定することを含む、請求項101に記載の方法。
- 前記タンパク質プロファイルが、免疫組織化学アッセイ、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS法)、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、表面プラズモン共鳴法、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、ウェスタンブロットアッセイ、またはこれらの組合せにより決定される、請求項101に記載の方法。
- 前記脂質プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)法、ガスクロマトグラフィー法、質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)質量分析法、タンデム質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項101に記載の方法。
- 前記炭水化物プロファイルが、クロマトグラフィー法、液体クロマトグラフィー法、サイズ排除クロマトグラフィー法、パルスドアンペロメトリー検出器を用いた高速陰イオン交換クロマトグラフィー(HPAEC−PAD)法、液体クロマトグラフィー法、ガスクロマトグラフィー法、蛍光アッセイ、質量分析法、タンデム質量分析法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間(MALDI−TOF)型質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法、表面増強レーザー脱離イオン化飛行時間(SELDI−TOF)型質量分析法、四重極飛行時間(Q−TOF)型質量分析法、大気圧光イオン化質量分析(APPI−MS)法、フーリエ変換質量分析(FTMS)法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(MALDI−FT−ICR)法、二次イオン質量分析(SIMS)法、ラジオイムノアッセイ、マイクロ流体チップをベースにしたアッセイ、蛍光の検出、化学発光の検出、またはこれらの組合せにより決定される、請求項101に記載の方法。
- 前記対象が哺乳類動物である、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象がヒトである、請求項106に記載の方法。
- 前記疾患または症状が、心血管系の疾患または症状、腎臓関連の疾患または症状、胎児期もしくは妊娠関連の疾患または症状、神経性もしくは精神神経性の疾患または症状、自己免疫もしくは免疫関連の疾患または症状、癌、感染性の疾患または症状、ミトコンドリア病、呼吸器胃腸管系の疾患または症状、生殖器系の疾患または症状、眼部の疾患または症状、筋骨格系の疾患または症状、あるいは皮膚の疾患または症状である、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記差異が1倍よりも大きい、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記差異が、少なくとも1.05倍、1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の差異である、請求項108に記載の方法。
- 前記疾患または症状の少なくとも1つの診断パラメーターを決定することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記診断パラメーターが、身体検査、目視検査、生検、スキャニング、組織学検査、放射線検査、画像検査、超音波検査、市販のキットの使用、遺伝検査、免疫学的検査、体液の分析、または神経活動のモニタリングにより決定される、請求項111に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法により同定された前記マーカーのうちの少なくとも1つまたは複数を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、AKT2、BAK1、EGFR、ERBB2、ETS2、FOS、JUN、MAP2K1、MMP2、PDGFB、RB1、SERPINB2、SNCG、およびSPP1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、AKT1、AKT2、BAK2、CDC25A、E2F1、EGFR、ERBB2、FOS、JUN、MAP2K1、MMP2、NFKB1、PDGFB、PIK3R1、PNN、RB1、SERPINB2、SERPINB5、SNCG、SPP1、TERT、TIMP3、およびTP53からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、CASP8、CASP9、COL18A1、ETS2、HTATIP2、MMP9、SRC、およびTWIST1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、AKT1、APAF1、ATM、CDC25A、CDKN1A、ETS2、FOS、IL8、ITGA4、ITGA6、ITGAV、JUN、MAP2K1、NFKB1A、PLAU、PLAUR、RAF1、SERPINB2、SYK、TIMP1、TNF、TNFRSF10B、およびTNFRSF1Aからなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、ACP2、AK2、AKT3、ARL5B、ATP2B3、BGN、BRAF、BTG2、CAMKK2、CAPG、CAPN12、CPLX2、DENND5A、DNA2、FAM104A、FNIP1、GFRA4、GLUD1、GNAQ、GP1BB、HNRPLL、HOXA2、HPS3、IΝΡΡ4Α、ITGAV、KLHL23、LANCL2、LYPD6、MAPKAPK3、MEF2A(EG:4205を含む)、MEF2C、NVL、PCYT1A、PGLYRP4、PLOD1、PPP1CB、PRKAB2、PROS1、PTPRE、RASA4(EG:10156を含む)、RBMS2、RBPJ、STAT5B、THBS1、TRIB1、TRIM2、TSPAN6、およびZDHHC21からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、B4GALT5、BOP1、CCL2、CCL3、CCL3L1、CCRL2、CD83、CLEC4G、CLIC4、CTSC、CTSO、CXCL10、FCGR3A、FPR3、HBA1、HBB、LRMP、MAP1LC3B2、MS4A4A、MSR1、MYADML、NID1、PF4、PION、RNF217、SAMD9L、SERPING1、およびSPARCからなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、ACOT9、AMPD2、ARHGAP15、BATF2、C3AR1、C5orf41、CCL3、CCL3L1、CD63、CHST11、CHSY1、CLEC4G、CTSZ、CXorf21、CYTH4、CYTIP、DLEU2、DNAJA1、DOCK8、DTX3L、DUSP6、EPSTI1、ERF、F2RL1、FYB、GABRB2、GBP5、GLRX、GNB4、ICAM1、IFI35、IFIH1、IFNAR2、IL1R1、IRF1、ITGA5、LAP3、LAPTM5、LCP2、MAP1LC3B、MAP1LC3B2、MICAL2、MT1DP、MT1JP、MT1M、MT2A、MYADML、NEK6、NINJ2、NNMT、NT5C3L、NUB1、PDE4B、PLOD1、PML、PRKCB、PSMB9、RCN3、RGS4、RNASE6、RTP4、SAMD9L、SEL1L、SERPING1、SETX、SIGLEC10、SKIL、SLC7A7、SNORA21、SP100、SP110、SP140、SSFA2、STAT2、STK17B、STK3、TDRD7、TMCC1、TMPRSS11E2、TNFRSF1B、TPM1、TRIM21、TXNDC4、UBE2L6、UBE2W、USP18、VAV1、WARS、WIPF1、およびWIPI1からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数のマーカーが、ADAR、ADM、ALAS1、ANKRD22、ARHGAP27、B3GNT5、BCL10、C12orf35、C15orf29、C2orf59、CD177、CEACAM1、CPEB2、DDX58、F2RL1、GDPD3、GNAI3、HIST2H3A、HIST2H3D、HIST2H4A、HMGCR、HSPA6、HSPC159、IL4R、IMPA2、KPNB1、KREMEN1、KRT23、LDLR、LOC100130904、LTB4R、MAEA、MARK2、MBOAT2、MPZL3、N4BP1、NBEAL2、NMI、NPEPPS、PARP14、PGM2、PPIF、PXN、RALBP1、ROD1、RPS6KA1、S100P、SERTAD2、SLC9A1、SLPI、SP110、SPTNT1、ST14、TBC1D3、TNFRSF9、TRIM21、UPP1、VPS24、ZBTB34、およびZNF256からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法により同定されたマーカーのうちの少なくとも1つまたは複数を検出する複数のマーカー検出薬を含むキット。
- 請求項61〜62のいずれか1項に記載の方法により同定されたマーカーのうちの少なくとも1つまたは複数の活性または発現を調節する薬剤を対象に投与することを含む、対象において疾患または症状を治療または予防する方法。
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Cited By (2)
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Families Citing this family (27)
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CN103293321B (zh) * | 2013-05-27 | 2015-05-13 | 北京大学 | 一种检测dna损伤诱导的早期核仁应激的试剂盒及其应用 |
CN103555818A (zh) * | 2013-07-16 | 2014-02-05 | 中国人民解放军海军医学研究所 | B细胞转位基因2作为低剂量电离辐射生物剂量计的应用 |
WO2015095359A1 (en) * | 2013-12-17 | 2015-06-25 | Harry Stylli | Methods of detecting diseases or conditions |
US10928404B2 (en) * | 2014-02-26 | 2021-02-23 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | System and method for cell levitation and monitoring |
EP3111220B1 (de) * | 2014-02-26 | 2019-12-25 | EarlyBio GmbH | Verfahren für die molekulardiagnostik zum anreichern einer nukleinsäure aus einer biologischen probe |
DE102014206441A1 (de) * | 2014-04-03 | 2015-10-08 | Siemens Aktiengesellschaft | Verfahren für die Molekulardiagnostik zum Anreichern einer Nukleinsäure aus einer biologischen Probe |
WO2016004221A1 (en) * | 2014-07-01 | 2016-01-07 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods and materials for identifying and treating mammals resistant to proteasome inhibitor treatments |
EP3693742B1 (en) | 2014-09-11 | 2022-04-06 | Harry Stylli | Methods of detecting prostate cancer |
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EP3256846A1 (en) * | 2015-02-09 | 2017-12-20 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Means and methods for minimizing swept and dead volumes in chromatographic applications |
WO2017031342A1 (en) * | 2015-08-20 | 2017-02-23 | Rhode Island Hospital | Circulating biomarker for brugada syndrome |
CN105132429A (zh) * | 2015-10-10 | 2015-12-09 | 华东理工大学 | 靶向人KPNB1基因的siRNA及其应用 |
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CN110885805B (zh) * | 2018-09-07 | 2021-09-07 | 广东凯安生命技术有限公司 | 具有免疫细胞靶向识别功能的多肽及其应用 |
KR20200048740A (ko) | 2018-10-30 | 2020-05-08 | (주)아모레퍼시픽 | Dnaja1 발현 촉진 물질을 포함하는 피부 장벽기능 강화용 조성물 및 dnaja1 촉진 물질의 스크리닝 방법 |
WO2020092993A1 (en) * | 2018-11-02 | 2020-05-07 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Pharmacologic treatment for right ventricular failure |
CN110117571B (zh) * | 2019-05-08 | 2023-01-31 | 南方医科大学南方医院 | 无创获取胎儿稀有细胞的试剂盒及其方法 |
KR102169901B1 (ko) * | 2019-05-17 | 2020-10-26 | 연세대학교 산학협력단 | Dna 메틸화를 이용한 면역 항암 요법의 치료 반응에 관한 정보 제공 방법 및 이를 이용한 키트 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009092068A1 (en) * | 2008-01-18 | 2009-07-23 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of detecting signatures of disease or conditions in bodily fluids |
Family Cites Families (233)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4868103A (en) | 1986-02-19 | 1989-09-19 | Enzo Biochem, Inc. | Analyte detection by means of energy transfer |
US4843155A (en) | 1987-11-19 | 1989-06-27 | Piotr Chomczynski | Product and process for isolating RNA |
DE69326967T2 (de) | 1992-01-17 | 2000-06-15 | Lakowicz Joseph R | Phasenmodulationsenergieübertragungsfluoroimmunassay |
WO1994021686A1 (en) | 1993-03-19 | 1994-09-29 | Northern Sydney Area Health Service | Papp-a, its immunodetection and uses |
US5594637A (en) | 1993-05-26 | 1997-01-14 | Base Ten Systems, Inc. | System and method for assessing medical risk |
US5514598A (en) | 1993-11-30 | 1996-05-07 | Doody; Michael | Prenatal detection of meconium |
US6025395A (en) | 1994-04-15 | 2000-02-15 | Duke University | Method of preventing or delaying the onset and progression of Alzheimer's disease and related disorders |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
US6031088A (en) | 1996-05-23 | 2000-02-29 | Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University | Polycystic kidney disease PKD2 gene and uses thereof |
US20030044859A1 (en) * | 1996-08-19 | 2003-03-06 | Henslee Jerry G. | Reagents and methods useful for detecting diseases of the breast |
US20010051341A1 (en) | 1997-03-04 | 2001-12-13 | Isis Innovation Limited | Non-invasive prenatal diagnosis |
GB9704444D0 (en) | 1997-03-04 | 1997-04-23 | Isis Innovation | Non-invasive prenatal diagnosis |
US20020119118A1 (en) | 1997-11-03 | 2002-08-29 | Genentech, Inc. | Novel polypeptides and nucleic acids encoding bolekine |
CA2702148C (en) | 1999-01-06 | 2014-03-04 | Genenews Inc. | Method of profiling gene expression in a human subject having an infectious disease |
US6762032B1 (en) | 1999-08-23 | 2004-07-13 | Biocrystal, Ltd. | Compositions, assay kits, and methods for use related to a disease condition comprising multiple sclerosis and/or a pro-MS immune response |
US20020039736A1 (en) | 2000-06-05 | 2002-04-04 | Byrne Michael C. | Compositions, kits, and methods for identification and modulation of type I diabetes |
ATE375404T1 (de) | 2000-06-27 | 2007-10-15 | Von Recklinghausen Ges E V | Verfahren zur ermittlung von daten zur präsymptomatischen oder pränatalen diagnose von typ 1 neurofibromatose |
US6631330B1 (en) | 2000-08-21 | 2003-10-07 | Assistance Publique-Hopitaux De Paris (Ap-Hp) | Diagnosis method of inflammatory, fibrotic or cancerous disease using biochemical markers |
US6664056B2 (en) | 2000-10-17 | 2003-12-16 | The Chinese University Of Hong Kong | Non-invasive prenatal monitoring |
FR2816411B1 (fr) | 2000-11-03 | 2003-07-04 | Inst Nat Sante Rech Med | Moyens de detection de la transformation pathologique de la proteine app et leurs applications |
DK1351707T3 (da) | 2001-01-09 | 2011-07-11 | Baylor Res Inst | Fremgangsmåder til behandling af autoimmunsygdomme hos et individ og in vitro-diagnostiske analyser |
US6753137B2 (en) | 2001-01-31 | 2004-06-22 | The Chinese University Of Hong Kong | Circulating epstein-barr virus DNA in the serum of patients with gastric carcinoma |
GB0104690D0 (en) | 2001-02-26 | 2001-04-11 | Cytogenetic Dna Services Ltd | Diagnostic test |
FR2824144B1 (fr) | 2001-04-30 | 2004-09-17 | Metagenex S A R L | Methode de diagnostic prenatal sur cellule foetale isolee du sang maternel |
AU2002341488A1 (en) | 2001-05-09 | 2002-11-18 | Biovision Ag | Method for detecting progredient chronic dementia, and associated peptides and detection reagents |
US7235358B2 (en) * | 2001-06-08 | 2007-06-26 | Expression Diagnostics, Inc. | Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection |
WO2003019193A1 (en) | 2001-08-30 | 2003-03-06 | Ciphergen Biosystems, Inc. | Method of diagnosing nephrotic syndrome |
US6927028B2 (en) | 2001-08-31 | 2005-08-09 | Chinese University Of Hong Kong | Non-invasive methods for detecting non-host DNA in a host using epigenetic differences between the host and non-host DNA |
US20050130245A1 (en) | 2001-09-17 | 2005-06-16 | Syn X Pharma, Inc. | Diagnosis and treatment of early pre-type-1 diabetes utilizing neuronal proteins |
US6986995B2 (en) | 2002-02-28 | 2006-01-17 | Prometheus Laboratories, Inc. | Methods of diagnosing liver fibrosis |
US7744876B2 (en) | 2002-04-09 | 2010-06-29 | The Curators Of The University Of Missouri | Methods and compositions for treatment, prevention, suppression, and/or delaying the onset of type 1 diabetes |
US7009038B2 (en) | 2002-05-02 | 2006-03-07 | Univ. Of Medicine & Dentistry Of N.J. | pDJA1, a cardiac specific gene, corresponding proteins, and uses thereof |
ES2375181T3 (es) | 2002-05-09 | 2012-02-27 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | 1l 1rl-1 como un marcador de enfermedades cardiovasculares. |
US20040009518A1 (en) | 2002-05-14 | 2004-01-15 | The Chinese University Of Hong Kong | Methods for evaluating a disease condition by nucleic acid detection and fractionation |
CA2390820A1 (en) | 2002-06-17 | 2003-12-17 | St. Vincent's Hospital Sydney Limited | Methods of diagnosis, prognosis and treatment of cardiovascular disease |
US20060094067A1 (en) * | 2002-06-26 | 2006-05-04 | Ralf Herwig | Method for the determination of characteristics and/or the classification of circulating macrophages, and analysis arrangement for carrying out said method |
AU2003246380A1 (en) | 2002-07-05 | 2004-01-23 | Evotec Neurosciences Gmbh | Diagnostic and therapeutic use of tb2 gene and protein for neurodegenerative diseases |
FR2844279A1 (fr) | 2002-09-06 | 2004-03-12 | Inst Nat Sante Rech Med | Moyens de detection des processus neurodegeneratifs et leurs applications |
US20040141969A1 (en) | 2002-09-16 | 2004-07-22 | Juergen Floege | Method for the treatment of nephritis using anti-PDGF-DD antibodies |
DK1571970T3 (da) | 2002-10-02 | 2011-11-28 | Dmi Biosciences Inc | Diagnose og monitorering af sygdomme |
US20040086864A1 (en) | 2002-10-22 | 2004-05-06 | The Chinese University Of Hong Kong | Novel classification methods for pleural effusions |
GB0225360D0 (en) | 2002-10-31 | 2002-12-11 | Univ London | Genetic markers |
AU2002952993A0 (en) | 2002-11-29 | 2002-12-12 | The Corporation Of The Trustees Of The Order Of The Sisters Of Mercy In Queensland | Therapeutic and diagnostic agents |
JP4624977B2 (ja) | 2003-01-17 | 2011-02-02 | ザ チャイニーズ ユニバーシティ オブ ホンコン | 妊娠障害診断マーカーとしての血中mRNA |
WO2004070388A1 (en) | 2003-02-04 | 2004-08-19 | Evotec Neurosciences Gmbh | Diagnostic and therapeutic use of scn2b protein for neurodegenerative diseases |
WO2004071269A2 (en) | 2003-02-13 | 2004-08-26 | Intellectual Property Consulting Inc. | Gene marker and composition for diagnosis and treatment of neurological disorders and diseases and use of the same |
US20040191818A1 (en) | 2003-02-26 | 2004-09-30 | O'toole Margot Mary | Compositions and methods for diagnosing and treating autoimmune diseases |
WO2005020784A2 (en) * | 2003-05-23 | 2005-03-10 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Surrogate cell gene expression signatures for evaluating the physical state of a subject |
JP4717810B2 (ja) | 2003-06-20 | 2011-07-06 | ユニバーシティ オブ フロリダ リサーチ ファウンデーション インコーポレイテッド | 1型糖尿病と2型糖尿病を識別するためのバイオマーカー |
DE10333406A1 (de) | 2003-07-15 | 2005-02-10 | Protagen Ag | T-regulatorische-Zellen enthaltend Galectine zur Therapie und Diagnose von Erkrankungen |
WO2005012907A1 (en) | 2003-08-01 | 2005-02-10 | Renovar, Inc. | Systems and methods for characterizing kidney diseases |
AU2004270220B2 (en) | 2003-09-05 | 2009-03-05 | The Chinese University Of Hong Kong | Method for non-invasive prenatal diagnosis |
US7445886B2 (en) | 2003-09-10 | 2008-11-04 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Macrophage migration inhibitory factor as a marker for cardiovascular risk |
CA2539535A1 (en) | 2003-10-03 | 2005-04-14 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary , Department Of Health And Human Services | Use of cripto-1 as a biomarker for neurodegenerative disease and method of inhibiting progression thereof |
CN1930303B (zh) | 2003-10-08 | 2013-11-20 | 波士顿大学信托人 | 染色体异常的产前诊断试剂盒 |
EP1524321B2 (en) | 2003-10-16 | 2014-07-23 | Sequenom, Inc. | Non-invasive detection of fetal genetic traits |
US7670764B2 (en) | 2003-10-24 | 2010-03-02 | Prometheus Laboratories Inc. | Methods of diagnosing tissue fibrosis |
US20060094064A1 (en) | 2003-11-19 | 2006-05-04 | Sandip Ray | Methods and compositions for diagnosis, stratification, and monitoring of alzheimer's disease and other neurological disorders in body fluids |
EP2211183B1 (en) | 2003-11-19 | 2013-03-06 | Satoris, Inc. | Method for diagnosis and monitoring of Alzheimer's disease |
US20070162983A1 (en) | 2003-11-19 | 2007-07-12 | Evotec Neurosciences Gmbh | Diagnostic and therapeutic use of the human sgpl1 gene and protein for neurodegenerative diseases |
WO2005072340A2 (en) | 2004-01-27 | 2005-08-11 | Compugen Ltd. | Novel polynucleotides encoding polypeptides and methods using same |
US20080269103A1 (en) | 2004-02-04 | 2008-10-30 | Heinz Von Der Kammer | Diagnostic and Therapeutic Use of the Kcne4 Gene and Protein for Alzheimer's Disease |
WO2005082110A2 (en) | 2004-02-26 | 2005-09-09 | Illumina Inc. | Haplotype markers for diagnosing susceptibility to immunological conditions |
DE602005027830D1 (de) | 2004-04-05 | 2011-06-16 | Univ Bordeaux 2 | Peptide und peptidmimetika die an cd23 binden |
US20080051334A1 (en) | 2004-04-16 | 2008-02-28 | Evotec Neurosciences Gmbh | Diagnostic and Therapeutic Use of Kcnc1 for Neurodegenerative Diseases |
US7838245B2 (en) | 2004-04-20 | 2010-11-23 | Sphingotec Gmbh | Use of precursors of tachykinins and/or their fragments in medical diagnostic |
US20090041862A1 (en) | 2004-05-07 | 2009-02-12 | Peter Robert Schofield | Detecting disease association with aberrant glycogen synthase kinase 3beta expression |
US20080038730A1 (en) | 2004-05-10 | 2008-02-14 | Heinz Von Der Kammer | Diagnostic and Therapeutic Use of Kcnj6 for Alzheimer's Disease |
DE602005026931D1 (de) | 2004-05-13 | 2011-04-28 | Brahms Gmbh | Verwendung von vorstufen von enkephalinen und/oder deren fragmenten in der medizinischen diagnostik |
WO2005113828A1 (en) * | 2004-05-14 | 2005-12-01 | King Pharmaceuticals Research & Development, Inc. | Methods of diagnosing and prognosticating solid tumors and melanoma |
EP2175277B1 (en) | 2004-05-19 | 2013-09-04 | Københavns Universitet | ADAM12 as marker for 2nd trimester Down Syndrome |
US7709194B2 (en) | 2004-06-04 | 2010-05-04 | The Chinese University Of Hong Kong | Marker for prenatal diagnosis and monitoring |
EP1797425A2 (en) | 2004-07-19 | 2007-06-20 | University of Rochester | Biomarkers of neurodegenerative disease |
US20060024757A1 (en) | 2004-07-30 | 2006-02-02 | Robert Hussa | Detection of oncofetal fibronectin for selection of concepti |
WO2006020899A2 (en) | 2004-08-13 | 2006-02-23 | Metrigenix Corporation | Markers for autoimmune disease detection |
US20070087376A1 (en) | 2004-08-30 | 2007-04-19 | Potashkin Judith A | Splice variants of pre-mRNA transcripts as biomarkers in idiopathic neurodegenerative diseases |
WO2006050475A2 (en) | 2004-11-03 | 2006-05-11 | Brigham And Women's Hospital, Inc. | Identification of dysregulated genes in patients with neurological diseases |
WO2006048778A1 (en) | 2004-11-08 | 2006-05-11 | King's College London | Markers of predisposition to addictive states |
US20060115855A1 (en) | 2004-12-01 | 2006-06-01 | Power3 Medical Products, Inc. | FK506-binding protein 7 related protein as a biomarker for neurodegenerative disease |
US20060115854A1 (en) | 2004-12-01 | 2006-06-01 | Power3 Medical Products, Inc. | Acetyl-LDL receptor related proteins and peptides as a biomarker for neurodegenerative disease |
GB0426859D0 (en) | 2004-12-07 | 2005-01-12 | Proteome Sciences Plc | Diagnosis of neurodegenerative disorders |
WO2006061610A2 (en) | 2004-12-07 | 2006-06-15 | Electrophoretics Limited | Diagnosis of neurodegenerative diseases |
JP2008526205A (ja) | 2004-12-31 | 2008-07-24 | ジェネンテック・インコーポレーテッド | Br3に結合するポリペプチド及びその使用 |
FR2880897B1 (fr) | 2005-01-18 | 2010-12-17 | Inst Nat Sante Rech Med | Methode de detection, non invasive, prenatale, in vitro de l'etat sain normal, de l'etat de porteur sain ou de l'etat de porteur malade de la mucoviscidose |
US7432107B2 (en) | 2005-01-24 | 2008-10-07 | Roche Diagnostics Operations, Inc. | Cardiac hormones for assessing cardiovascular risk |
US7572592B2 (en) | 2005-01-31 | 2009-08-11 | Glycominds Ltd | Method for diagnosing multiple sclerosis |
US20070141625A1 (en) | 2005-02-03 | 2007-06-21 | Santos Jose H | Method for assessing risk of and predisposition to development of a pathology related to the presence of anti-epcr autoantibodies |
JP5219516B2 (ja) | 2005-03-18 | 2013-06-26 | ザ チャイニーズ ユニバーシティー オブ ホンコン | 染色体異数性の検出方法 |
JP5629051B2 (ja) | 2005-03-18 | 2014-11-19 | ザ チャイニーズ ユニバーシティー オブ ホンコンThe Chinese University Of Hongkong | 出生前診断およびモニタリングのためのマーカー |
AU2006226891A1 (en) | 2005-03-24 | 2006-09-28 | Beth Israel Deaconess Medical Center | Methods of diagnosing fetal trisomy 13 or a risk of fetal trisomy 13 during pregnancy |
ES2346467T3 (es) | 2005-04-06 | 2010-10-15 | Verstappen, Leopold | Marcadores neurodegenerativos para la depresion. |
WO2006111946A2 (en) | 2005-04-18 | 2006-10-26 | The Provost, Fellows And Scholars Of The College Of The Holy And Undivided Trinity Of Queen Elizabeth, Near Dublin | Toll-like receptor 14 (tlr14 ) and use thereof |
WO2006114661A1 (en) | 2005-04-26 | 2006-11-02 | Dwek Raymond A | High throughput glycan analysis for diagnosing and monitoring rheumatoid arthritis and other autoimmune diseases |
US7604948B2 (en) | 2005-05-05 | 2009-10-20 | The Regents Of The University Of California | Biomarkers for diagnosing an autism spectrum disorder |
EP2312315A1 (en) | 2005-05-18 | 2011-04-20 | Novartis AG | Methods for diagnosis and treatment of diseases having an autoimmune and/or inflammatory component |
GB0512401D0 (en) | 2005-06-17 | 2005-07-27 | Randox Lab Ltd | Method |
GB2428240A (en) | 2005-07-14 | 2007-01-24 | Univ Gen Ve | Diagnostic method for brain damage-related disorders |
US20070148661A1 (en) | 2005-07-19 | 2007-06-28 | Duke University | LSAMP Gene Associated With Cardiovascular Disease |
IL172297A (en) | 2005-10-03 | 2016-03-31 | Compugen Ltd | Soluble vegfr-1 variants for the diagnosis of preeclampsia |
US20070218469A1 (en) | 2005-10-03 | 2007-09-20 | Ruth Navon | Novel mutations in hexosaminidase A |
CN101326439A (zh) | 2005-10-11 | 2008-12-17 | 特提斯生物科学公司 | 糖尿病相关标记及其应用方法 |
WO2007047907A2 (en) | 2005-10-14 | 2007-04-26 | The Regents Of The University Of Michigan | Dek protein compositions and methods of using the same |
AR056786A1 (es) * | 2005-11-10 | 2007-10-24 | Smithkline Beecham Corp | Compuesto de 1h- imidazo ( 4,5-c) piridin-2-ilo, composicion farmaceutica que lo comprende, procedimiento para preparar dicha composicion, su uso para preparar unmedicamento, uso de una combinacion que omprende al compuesto y al menos un agente antineoplasico para preparar un medicamento y dicha com |
TW200726845A (en) | 2006-01-02 | 2007-07-16 | Nat Defense Medical Ct | Biomarker molecular of renal illness and detecting method for the same |
EP1808694A1 (en) | 2006-01-17 | 2007-07-18 | Universitätsklinikum Freiburg | Method for diagnosing polycystic kidney disease |
FR2896588B1 (fr) | 2006-01-20 | 2016-08-19 | Univ D'angers | Methode de diagnostic in vitro de reponse immunitaire autoimmune par detection d'anticorps diriges contre l'antigene pentraxine 3. |
EP1987361A4 (en) | 2006-01-30 | 2009-03-04 | Invitrogen Corp | COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTING AND QUANTIFYING TOXIC SUBSTANCES IN DISEASE STATES |
US7459280B2 (en) | 2006-02-27 | 2008-12-02 | Picobella, Llc | Methods for diagnosing and treating kidney cancer |
NZ570413A (en) | 2006-02-28 | 2011-07-29 | Phenomenome Discoveries Inc | Methods for the diagnosis of dementia and other neurological disorders |
US7488584B2 (en) | 2006-03-24 | 2009-02-10 | Picobella | Methods for diagnosing and treating kidney and colorectal cancer |
US20070224638A1 (en) | 2006-03-27 | 2007-09-27 | Institut Pasteur | Secreted proteins as early markers and drug targets for autoimmunity, tumorigenesis and infections |
GB0606776D0 (en) | 2006-04-03 | 2006-05-10 | Novartis Pharma Ag | Predictive biomarkers for chronic allograft nephropathy |
EP1847615A1 (en) | 2006-04-18 | 2007-10-24 | Genoscreen | Expression and polymorphism of the ornithine transcarbamylase (OTC) gene as markers for diagnosing Alzheimer's disease |
US7662578B2 (en) | 2006-04-21 | 2010-02-16 | Children's Hospital Medical Center | Method and kit for the early detection of impaired renal status |
ATE517341T1 (de) | 2006-04-27 | 2011-08-15 | Critical Care Diagnostics Inc | Interleukin-33 (il-33) zur diagnose und vorhersage von herz-gefäss-erkrankungen |
JP5377289B2 (ja) | 2006-05-01 | 2013-12-25 | クリティカル ケア ダイアグノスティクス インコーポレイテッド | 心血管疾患の診断方法 |
US7754428B2 (en) | 2006-05-03 | 2010-07-13 | The Chinese University Of Hong Kong | Fetal methylation markers |
US7901884B2 (en) | 2006-05-03 | 2011-03-08 | The Chinese University Of Hong Kong | Markers for prenatal diagnosis and monitoring |
CA2651597C (en) | 2006-05-12 | 2013-02-05 | Keio University | Detection of inflammatory disease and composition for prevention or treatment of inflammatory disease |
WO2007131345A1 (en) | 2006-05-12 | 2007-11-22 | The Hospital For Sick Children | Genetic risk factor in sod1 and sfrs15 in renal disease, diabetic cataract, cardiovascular disease and longevity |
WO2007136679A2 (en) | 2006-05-17 | 2007-11-29 | Ludwig Institute For Cancer Research | Targeting vegf-b regulation of fatty acid transporters to modulate human diseases |
EP2032983A2 (en) | 2006-05-24 | 2009-03-11 | Cellumen, Inc. | Method for modeling a disease |
US20080038269A1 (en) | 2006-05-25 | 2008-02-14 | Mount Sinai Hospital | Methods for detecting and treating kidney disease |
DE102006027818A1 (de) | 2006-06-16 | 2007-12-20 | B.R.A.H.M.S. Aktiengesellschaft | In vitro Multiparameter-Bestimmungsverfahren zur Diagnose und Frühdiagnose von neurodegenerativen Erkrankungen |
WO2008084331A2 (en) | 2006-06-21 | 2008-07-17 | Hopitaux Universitaires De Geneve | Biomarkers for renal disorders |
EP2047848A4 (en) | 2006-07-05 | 2010-06-09 | Univ Tokyo | METHOD FOR THE TREATMENT OF GENETIC DISEASES BASED ON A NONSENSE MUTATION |
WO2008003826A1 (en) | 2006-07-07 | 2008-01-10 | Oy Jurilab Ltd | Novel genes and markers in essential arterial hypertension |
KR100856375B1 (ko) | 2006-07-18 | 2008-09-04 | 김현기 | 퇴행성 신경질환 진단용 마커 |
US7851172B2 (en) | 2006-07-25 | 2010-12-14 | University Of Kentucky Research Foundation | Biomarkers of mild cognitive impairment and alzheimer's disease |
US20080026378A1 (en) | 2006-07-28 | 2008-01-31 | Gian Franco Bottazzo | Prediction and prophylactic treatment of type 1 diabetes |
WO2008014516A2 (en) | 2006-07-28 | 2008-01-31 | Living Microsystems, Inc. | Selection of cells using biomarkers |
ITTO20060614A1 (it) | 2006-08-21 | 2008-02-22 | Uni Degli Studi Del Piemonte | "diagnosi differenziale per la sclerodermia" |
US20080152589A1 (en) | 2006-09-08 | 2008-06-26 | Peter Schofield | Diagnostics and Therapeutics of Neurological Disease |
US20090318392A1 (en) | 2006-09-14 | 2009-12-24 | Zora Biosciences Oy | Biofluid metabolite profiling as a tool for early prediction of autoimmunity and type 1 diabetes risk |
EP1905841A1 (en) | 2006-09-25 | 2008-04-02 | Max Delbrück Centrum für Molekulare Medizin (MDC) Berlin-Buch; | Trex1 as a marker for lupus erythematosus |
US20090318354A1 (en) | 2006-09-26 | 2009-12-24 | Proteosys Ag | Use of at least one isoform of progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1) |
US8110365B2 (en) | 2006-10-05 | 2012-02-07 | Rhode Island Hospital | Compositions and methods for detecting and treating renal injury and inflammation |
WO2008043725A1 (en) | 2006-10-10 | 2008-04-17 | Novartis Ag | Biomarker in inflammatory disorders |
EP2081649A2 (en) | 2006-10-11 | 2009-07-29 | Novartis AG | Modulation of cd1b or cd1d expression in autoimmune disorders |
ES2443042T3 (es) | 2006-10-16 | 2014-02-17 | Bayer Intellectual Property Gmbh | LTBP2 como biomarcador, diana terapéutica y diagnóstica |
US20100081136A1 (en) | 2006-10-16 | 2010-04-01 | Stefan Golz | Crtac as a biomarker, therapeutic and diagnostic target |
US20100104501A1 (en) | 2006-10-16 | 2010-04-29 | Stefan Golz | Prss23 as a biomarker, therapeutic and diagnostic target |
WO2008046160A1 (en) | 2006-10-20 | 2008-04-24 | Newcastle Innovation Limited | Assay for the detection of biomarkers associated with pregnancy related conditions |
US20100159486A1 (en) | 2006-11-01 | 2010-06-24 | George Mason Intellectual Properties, Inc. | Biomarkers for neurological conditions |
JP2010510528A (ja) | 2006-11-22 | 2010-04-02 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | 自己免疫疾患のバイオマーカー |
EP2082237A2 (en) | 2006-12-06 | 2009-07-29 | Universität Zürich | Means and methods for isolating and determining novel targets for the treatment of neurodegenerative, neurological or neuropsychiatric disorders and compositions comprising the same |
IL180095A0 (en) | 2006-12-14 | 2007-05-15 | Ohad Birk | Method for antenatal estimation of down syndrome risk |
US8362224B2 (en) | 2006-12-19 | 2013-01-29 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Screening for CD93 (C1qRp)-associated polymorphism(S) in the diagnosis, prevention and treatment of autoimmune diseases |
US8815519B2 (en) | 2006-12-22 | 2014-08-26 | Hvidovre Hospital | Method for predicting cancer and other diseases |
EP2155228B1 (en) | 2007-01-10 | 2014-04-02 | Purdue Research Foundation | Polypeptide inhibitors of hsp27 kinase and uses therefor |
WO2008085024A1 (en) | 2007-01-12 | 2008-07-17 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Identification and detection of peptides relating to specific disorders |
WO2008089936A1 (en) | 2007-01-22 | 2008-07-31 | Medizinische Universität Innsbruck | Novel markers for chronic kidney disease |
EP2115167A1 (en) | 2007-02-08 | 2009-11-11 | Powmri Limited | Method of diagnosing a neurodegenerative disease |
WO2008100596A2 (en) | 2007-02-15 | 2008-08-21 | Burnham Institute For Medical Research | Biomarkers of neurodegenerative disease |
MX2009008878A (es) | 2007-02-21 | 2009-08-28 | Decode Genetics Ehf | Variantes de susceptibilidad genetica asociada con la enfermedad cardiovascular. |
WO2008112772A2 (en) | 2007-03-14 | 2008-09-18 | Baylor Research Institute | Gene expression in peripheral blood mononuclear cells from children with diabetes |
WO2008118813A2 (en) | 2007-03-26 | 2008-10-02 | The Government Of The U.S.A, As Represented By The Secretary, Dept. Of Health And Human Services | Schizophrenia-related isoform of kcnh2 and development of antipsychotic drugs |
EP1975252A1 (en) | 2007-03-29 | 2008-10-01 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Medicale) | Methods for the prognosis or for the diagnosis of a thyroid disease |
WO2008120684A1 (ja) | 2007-03-30 | 2008-10-09 | Yamaguchi University | 急性中枢神経障害の予後判定方法 |
EP2579038B1 (en) | 2007-04-12 | 2014-10-01 | Universiteit Hasselt | Biomarkers for multiple sclerosis |
GB0707933D0 (en) | 2007-04-24 | 2007-05-30 | Apitope Technology Bristol Ltd | Disease markers |
GB0708075D0 (en) | 2007-04-26 | 2007-06-06 | Univ Nottingham | Nethods |
AU2008247649A1 (en) | 2007-05-01 | 2008-11-13 | University Of Miami | Transcriptomic biomarkers for individual risk assessment in new onset heart failure |
EP2076590A4 (en) | 2007-05-03 | 2011-06-01 | Medimmune Llc | SELF-IMMUNE DISEASE SELF-ANTIBODY MARKERS |
WO2008147938A2 (en) | 2007-05-24 | 2008-12-04 | Centocor, Inc. | Wnt5a as an inflammatory disease marker |
WO2008154238A1 (en) | 2007-06-06 | 2008-12-18 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Predictive diagnostics for kidney disease |
EP2164983A1 (en) * | 2007-06-08 | 2010-03-24 | Vib Vzw | The novel adipocytokine visfatin/pbef1 is an apoptosis associated factor induced in monocytes during in vivo hiv-1 infection |
EP2158326B1 (en) | 2007-06-21 | 2012-06-20 | The Board of Trustees of The Leland Stanford Junior University | Biomarkers for rheumatoid arthritis |
ITRM20070351A1 (it) | 2007-06-22 | 2008-12-23 | Istituto Naz Per Le Malattie I | Gene codificante la proteina ambra 1 avente attivita' regolatoria dell autofagia e dello sviluppo del sistema nervoso centrale |
WO2009000520A1 (en) | 2007-06-25 | 2008-12-31 | Universität Duisburg-Essen | Screening-method for polymorphic markers in htra1 gene in neurodegenerative disorders |
WO2009003142A1 (en) | 2007-06-27 | 2008-12-31 | The Board Of Trustees Of The Leland, Stanford Junior University | Beta2-microglobulin and c reactive protein (crp) as biomarkers for peripheral artery disease |
FR2918329B1 (fr) | 2007-07-06 | 2009-10-02 | Renault Sas | Ecope de refroidissement pour vehicule automobile |
JP2010533866A (ja) | 2007-07-13 | 2010-10-28 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 癌、炎症性疾患及び自己免疫疾患の治療及び診断方法 |
ES2443540T3 (es) | 2007-07-17 | 2014-02-19 | Metabolon, Inc. | Biomarcadores para pre-diabetes y métodos que usan los mismos |
US20110081649A1 (en) | 2007-08-02 | 2011-04-07 | Iss Immune System Stimulation Ab | Diagnosis, staging and monitoring of inflammatory bowel disease |
US20090275046A1 (en) | 2007-08-29 | 2009-11-05 | Power3 Medical Products, Inc. | Complement factor H protein as a biomarker of Parkinson's disease |
WO2009032722A1 (en) | 2007-08-29 | 2009-03-12 | The Cleveland Clinic Foundation | Carbamylated proteins and risk of cardiovascular disease |
US8748100B2 (en) | 2007-08-30 | 2014-06-10 | The Chinese University Of Hong Kong | Methods and kits for selectively amplifying, detecting or quantifying target DNA with specific end sequences |
GB0717637D0 (en) | 2007-09-10 | 2007-10-17 | Univ Leiden | Future cardiac event biomarkers |
US8062852B2 (en) | 2007-10-01 | 2011-11-22 | The Children's Hospital And Regional Medical Center | Detection and treatment of autoimmune disorders |
ITUD20070183A1 (it) | 2007-10-01 | 2009-04-02 | Univ Degli Studi Udine | Metodo diagnostico e prognostico per la diagnosi e la prognosi della linfoproliferazione nelle malattie autoimmuni |
EP2212693B1 (en) | 2007-10-22 | 2015-04-22 | The Regents of The University of California | Biomarkers for prenatal diagnosis of congenital cytomegalovirus |
FI20070795A0 (fi) | 2007-10-24 | 2007-10-24 | Faron Pharmaceuticals Oy | Uusi biomarkkeri sairauksien kehittämisen tarkkailuun ja terapioiden tehon arviointiin |
JP2011501177A (ja) | 2007-10-26 | 2011-01-06 | ビオヒット・ユルキネン・オサケユキテュア | 自己免疫疾患および萎縮性胃炎と関連する胃癌を診断するための方法および製品 |
WO2009059259A2 (en) | 2007-10-31 | 2009-05-07 | Children's Hospital Medical Center | Detection of worsening renal disease in subjects with systemic lupus erythematosus |
WO2009058168A1 (en) | 2007-11-04 | 2009-05-07 | Prediction Sciences Llc | Cellular fibronectin as a diagnostic marker in cardiovascular disease and methods of use thereof |
US20100233716A1 (en) | 2007-11-08 | 2010-09-16 | Pierre Saint-Mezard | Transplant rejection markers |
WO2009065132A1 (en) | 2007-11-16 | 2009-05-22 | Oklahoma Medical Research Foundation | Predicting and diagnosing patients with autoimmune disease |
EP2245188A2 (en) | 2007-11-28 | 2010-11-03 | Novartis Forschungsstiftung, Zweigniederlassung Friedrich Miescher Institute For Biomedical Research | Biomarkers for the onset of neurodegenerative diseases |
US8506933B2 (en) | 2007-11-30 | 2013-08-13 | Msdx, Inc. | Methods of detecting a neurological condition via analysis of circulating phagocytes |
WO2009074331A2 (en) | 2007-12-11 | 2009-06-18 | Julius-Maximilians-Universität Würzburg | Early and differential diagnosis test for alzheimer's disease |
WO2009075566A1 (en) | 2007-12-12 | 2009-06-18 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Biomarkers for cardiovascular disease |
EP2075343A1 (en) | 2007-12-21 | 2009-07-01 | Gert Mayer | A method of diagnosing a progressive disease |
EP2240601B1 (en) | 2007-12-27 | 2016-10-12 | Compugen Ltd. | Biomarkers for the prediction of renal injury |
NZ586746A (en) | 2008-01-23 | 2012-07-27 | Righospitalet | Classification of individuals suffering from cardiovascular diseases according to survival prognoses as found by measuring the levels of biomarker ykl-40 |
US20090299155A1 (en) | 2008-01-30 | 2009-12-03 | Dexcom, Inc. | Continuous cardiac marker sensor system |
JP2011511301A (ja) | 2008-02-04 | 2011-04-07 | バンヤン・バイオマーカーズ・インコーポレイテッド | 脳損傷を診断または治療するための方法 |
CA2714410A1 (en) | 2008-02-08 | 2009-08-13 | Medimmune, Llc | Disease markers and uses thereof |
US20090239242A1 (en) | 2008-03-18 | 2009-09-24 | Biotrin Intellectual Properties Limited | Method for the early identification and prediction of kidney injury |
CA2646040A1 (en) | 2008-03-22 | 2009-09-22 | David V. Pow | Detection of a biomarker of aberrant cells of neuroectodermal origin in a body fluid |
GB0809069D0 (en) | 2008-05-19 | 2008-06-25 | Univ Leuven Kath | Gene signatures |
WO2009122387A1 (en) | 2008-04-04 | 2009-10-08 | Biotrin Group Ltd. | Method for the detection and prediction of obesity-related renal disease |
EP2107377A1 (en) | 2008-04-04 | 2009-10-07 | BRAHMS Aktiengesellschaft | Pro-endothelin-1 levels for the prediction of risk of tachyarrhytmic events |
CA2720644A1 (en) | 2008-04-15 | 2009-10-22 | Rainer Oberbauer | Markers of acute kidney failure |
US8030097B2 (en) | 2008-04-30 | 2011-10-04 | Versitech Limited and R & C Biogenius Limited | Lipocalin-2 as a prognostic and diagnostic marker for heart and stroke risks |
WO2010005750A2 (en) | 2008-06-16 | 2010-01-14 | The Regents Of The University Of California | Potential prognostic markers and therapeutic targets for neurological disorders |
US20100167937A1 (en) | 2008-07-08 | 2010-07-01 | Power3 Medical Products, Inc. | Multiple forms of Alzheimer's disease based on differences in concentrations of protein biomarkers in blood serum |
WO2010011506A2 (en) | 2008-07-23 | 2010-01-28 | The Washington University | Risk factors and a therapeutic target for neurodegenerative disorders |
US8859725B2 (en) | 2008-07-31 | 2014-10-14 | Queen Mary And Westfield College, University Of London | Healthy kidney biomarkers |
NO2324360T3 (ja) | 2008-08-11 | 2018-06-30 | ||
ES2341419B1 (es) | 2008-08-14 | 2011-05-03 | Hospital Clinic I Provincial De Barcelona | Wnt1 como biomarcador de daño renal. |
US8673574B2 (en) | 2008-08-21 | 2014-03-18 | Pxbiosciences Llc | Diagnosis and monitoring of renal failure using peptide biomarkers |
CN105021826A (zh) | 2008-08-29 | 2015-11-04 | 阿斯图特医药公司 | 用于诊断和预后肾损伤和肾衰竭的方法和组合物 |
EP2161577A1 (en) * | 2008-09-01 | 2010-03-10 | Atlas Antibodies AB | ANLN protein |
WO2010039714A1 (en) | 2008-09-30 | 2010-04-08 | Genentech, Inc. | Biological markers predictive of rheumatoid arthritis response to lymphotoxin antagonists |
GB0818650D0 (en) | 2008-10-10 | 2008-11-19 | Uni I Oslo | Methods |
US20100124756A1 (en) | 2008-10-10 | 2010-05-20 | Sandip Ray | Collection of biomarkers for diagnosis and monitoring of alzheimer's disease in body fluids |
CN106370857A (zh) | 2008-10-21 | 2017-02-01 | 阿斯图特医药公司 | 用于诊断和预后肾损伤和肾衰竭的方法和组合物 |
CN104076152B (zh) | 2008-10-21 | 2017-04-19 | 阿斯图特医药公司 | 用于诊断和预后肾损伤和肾衰竭的方法和组合物 |
EP2180322A1 (en) | 2008-10-22 | 2010-04-28 | BRAHMS Aktiengesellschaft | Prognostic biomarkers for the progression of primary chronic kidney disease |
WO2010048497A1 (en) | 2008-10-24 | 2010-04-29 | Genizon Biosciences Inc. | Genetic profile of the markers associated with alzheimer's disease |
CA2741114A1 (en) | 2008-10-24 | 2010-04-29 | Cornelis Lammert Verweij | Biomarkers for predicting the development of chronic autoimmune diseases |
WO2010054167A2 (en) | 2008-11-06 | 2010-05-14 | University Of Miami | Limited proteolysis of cd2ap and progression of renal disease |
SG195652A1 (en) | 2008-11-07 | 2013-12-30 | Sequenta Inc | Methods of monitoring conditions by sequence analysis |
NZ592488A (en) | 2008-11-10 | 2012-10-26 | Astute Medical Inc | Methods and compositions for diagnosis and prognosis of renal injury and renal failure |
US20100120050A1 (en) | 2008-11-11 | 2010-05-13 | Entelos, Inc. | Biomarkers For Assessing Altherosclerotic Potential |
WO2010059242A2 (en) | 2008-11-21 | 2010-05-27 | The Johns Hopkins University | Neurodegenerative disease diagnostic compositions and methods of use |
AU2009316387B2 (en) | 2008-11-22 | 2015-01-29 | Astute Medical, Inc. | Methods and compositions for diagnosis and prognosis of renal injury and renal failure |
IT1392551B1 (it) | 2008-11-25 | 2012-03-09 | Bioindustry Park Del Canavese S P A | Biomarcatori per la diagnosi e per rilevare la progressione di malattie neurodegenerative, in particolare della sclerosi laterale amiotrofica |
NZ628281A (en) | 2008-12-09 | 2016-05-27 | Stephanie Fryar Williams | Biomarkers for the diagnosis and/or prediction of susceptibility to mental and neurodegenerative disorders |
ES2706403T3 (es) | 2008-12-10 | 2019-03-28 | Joslin Diabetes Center Inc | Métodos para diagnosticar y predecir una enfermedad renal |
-
2011
- 2011-07-22 BR BR112013001752A patent/BR112013001752A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2011-07-22 KR KR1020137004463A patent/KR20130041962A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-07-22 WO PCT/US2011/045018 patent/WO2012012725A2/en active Application Filing
- 2011-07-22 TW TW100126110A patent/TW201209171A/zh unknown
- 2011-07-22 CA CA2806310A patent/CA2806310A1/en not_active Abandoned
- 2011-07-22 AU AU2011280944A patent/AU2011280944A1/en not_active Abandoned
- 2011-07-22 US US13/188,964 patent/US20120040846A1/en not_active Abandoned
- 2011-07-22 MX MX2013000917A patent/MX2013000917A/es unknown
- 2011-07-22 EP EP11810464.5A patent/EP2596134B1/en active Active
- 2011-07-22 EA EA201390149A patent/EA201390149A1/ru unknown
- 2011-07-22 JP JP2013521848A patent/JP2013541323A/ja not_active Withdrawn
- 2011-07-22 SG SG2013004932A patent/SG187582A1/en unknown
- 2011-07-22 CN CN2011800461746A patent/CN103124795A/zh active Pending
- 2011-07-22 SG SG10201505724SA patent/SG10201505724SA/en unknown
-
2013
- 2013-01-20 IL IL224321A patent/IL224321B/en not_active IP Right Cessation
-
2015
- 2015-07-29 US US14/812,279 patent/US20150329910A1/en not_active Abandoned
-
2016
- 2016-03-14 US US15/069,076 patent/US20160194717A1/en not_active Abandoned
- 2016-04-22 AU AU2016202563A patent/AU2016202563A1/en not_active Abandoned
- 2016-10-28 JP JP2016211869A patent/JP2017051193A/ja active Pending
- 2016-10-31 US US15/338,737 patent/US20170044614A1/en active Pending
-
2017
- 2017-06-08 US US15/617,551 patent/US20170268061A1/en not_active Abandoned
-
2018
- 2018-05-10 US US15/975,872 patent/US20180258488A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009092068A1 (en) * | 2008-01-18 | 2009-07-23 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of detecting signatures of disease or conditions in bodily fluids |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11244760B2 (en) | 2015-06-25 | 2022-02-08 | Karydo Therapeutix, Inc. | Prediction device based on inter-organ cross talk system |
US11180539B2 (en) | 2016-03-29 | 2021-11-23 | Karydo Therapeutix, Inc. | Pharmaceutical composition or food composition, and method for assessing effect of active ingredient in vivo |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2011280944A1 (en) | 2013-02-28 |
US20150329910A1 (en) | 2015-11-19 |
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