JP2007535959A - アルツハイマー病のためのｋｃｎｊ６の診断および治療使用 - Google Patents

Abstract

本発明は、アルツハイマー病患者におけるＫＣＮＪ６遺伝子およびこの蛋白質産物の異常調節を開示する。この発見を基に、本発明は、被検者においてアルツハイマー病を診断および予後判断するための、ならびに被検者がアルツハイマー病を発現するリスクが増大した状態にあるかどうか判定するための方法を提供する。さらに、本発明は、ＫＣＮＪ６遺伝子およびこの対応する遺伝子産物を使用してアルツハイマー病および関連神経変性疾患を治療および予防するための治療および予防方法を提供する。神経変性疾患の変調剤のスクリーニング方法も開示する。

Description

本発明は、被検者において神経変性疾患の進行を診断、予後判定、およびモニターする方法に関する。さらに、神経変性疾患の変調剤を治療的制御およびスクリーニングする方法を提供する。本発明は、医薬組成物、キットおよび組換え動物モデルも開示する。

神経変性疾患、特にアルツハイマー病（ＡＤ）は、患者の生命に対して強力に衰弱させる影響力を有する。さらに、これらの疾患は、非常に多くの健康的、社会的および経済的負担となる。ＡＤは、全痴呆症例の約７０％を占める最も一般的な神経変性疾患であり、おそらく、６５歳より高齢の人口の約１０％および８５歳より高齢の人口の４５％以下に影響を及ぼす最も荒廃的な加齢性神経変性状態である（最近の総説については、Ｖｉｃｋｅｒｓら、Ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｉｎ Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ２０００、６０：１３９−１６５参照）。現在、これは、米国、欧州および日本において推定１２００万例にのぼる。この状況は、先進国における老人数の人口統計学的増加（団塊の世代の高齢化）に伴って不可避的に悪化するであろう。ＡＤに罹患している個体の脳において発生する顕著な神経病理学的特徴は、アミロイド−β蛋白から成る老人斑、ならびに異常な線維状構造の出現および神経原線維変化（ｎｅｕｒｏｆｉｂｒｉｌｌａｒｙ ｔａｎｃｌｅｓ）の形成と同時に起こる重大な細胞骨格変化である。

アミロイド−β蛋白は、異なる種類のプロテアーゼによるアミロイド前駆体蛋白（ＡＰＰ）の分解から発生する。β／γ−セクレターゼによる分解は、異なる長さのＡβペプチドを形成する。それは、典型的には、短くより可溶性で、４０のアミノ酸およびより長い４２のアミノ酸からなるゆっくりと凝集するペプチドであり、細胞外では急速に凝集し、特長的なアミロイド斑を形成する。（Ｓｅｌｋｏｅ、Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖ ２００１、８１：７４１−６６；Ｇｒｅｅｎｆｉｅｌｄら、Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ ２０００、５：Ｄ７２−８３）。ＡＤ患者の脳において二つのタイプの斑、広汎性斑および神経炎性斑を検出することができ、後者のものが、古典的で最も優勢なタイプである。これらは、主として大脳皮質および海馬体において見出される。神経炎性斑は、５０μｍから２００μｍの直径を有し、不溶性線維性アミロイド、死滅ニューロンのフラグメント、小神経膠細胞および神経膠星状細胞ならびに他の成分、例えば神経伝達物質、アポリポ蛋白Ｅ、グリコサミノグリカン、α１−アンチキモトリプシンなどから成る。脳における毒性Ａβ沈着の発生は、ＡＤの経過の非常に初期に開始し、これは、ＡＤの病状を導くこの後の破壊的プロセスにとって重要な役割を果たす因子であると論じられている。ＡＤの他の顕著な病理学的特徴は、神経原線維変化（ＮＦＴ）、およびニューロピルスレッドと記載されている（Ｂｒａａｋ ａｎｄ Ｂｒａａｋ、Ａｃｔａ Ｎｅｕｒｏｐａｔｈｏｌ １９９１、８２：２３９−２５９）異常神経突起である。ＮＦＴは、ニューロン内部で発生し、ならびに互いに絡み合う対になったらせん状フィラメントを形成する化学的に改変されたタウから成る。ＮＦＴの形成に沿って、ニューロンの喪失を観察することができる（Ｊｏｈｎｓｏｎ ａｎｄ Ｊｅｎｋｉｎｓ、Ｊ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒｓ Ｄｉｓ １９９６、１：３８−５８；Ｊｏｈｎｓｏｎ ａｎｄ Ｈａｒｔｉｇａｎ、Ｊ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒｓ Ｄｉｓ １９９９、１：３２９−３５１）。神経原線維変化の出現およびこれらの増加数は、ＡＤの臨床的重症度とよく相関する（Ｓｃｈｍｉｔｔら、Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ ２０００、５５：３７０−３７６）。

ＡＤは、記憶形成の早期欠損を伴い、最終的にはより高度な認知機能の完全侵食を導く、進行性疾患である。認知障害としては、数ある中でも、記憶障害、失語症、認知不能、および実行機能の喪失が挙げられる。ＡＤの病因の独特な特徴は、変性プロセスに対する特定の脳領域および神経細胞の副次集団の選択的脆弱性である。具体的に言うと、側頭葉領域および海馬体は、この疾病の進行中、初期に、より重度に影響を受ける。一方、前頭皮質、後頭皮質および小脳内のニューロンは、主として無傷のままであり、神経変性から防護される（Ｔｅｒｒｙら、Ａｎｎａｌｓ ｏｆ Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ １９８１、１０：１８４−９２）。

ＡＤの発症年齢は、５０年の範囲内で様々であり、早発性ＡＤは、６５歳より若い年齢の人に発生し、晩発性のＡＤは、６５歳より高齢の者に発生する。全ＡＤ症例の約１０％が早発性ＡＤに罹患しており、家族性、遺伝性症例は、１から２％に過ぎない。

現在、ＡＤには治療法がなく、ＡＤの進行を停止させる有効な治療も、生前にＡＤを高い確率で診断する有効な治療さえもない。個体にＡＤ発現の素因を作る幾つかのリスク因子、中でも最も顕著なところではアポリポ蛋白Ｅ遺伝子（ＡｐｏＥ）の３つの異なる既存対立遺伝子（イプシロン２、３および４）のうちのイプシロン４対立遺伝子、は特定されている（Ｓｔｒｉｔｔｍａｔｔｅｒら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １９９３、９０：１９７７−８１；Ｒｏｓｅｓ、Ａｎｎ ＮＹ Ａｃａｄ Ｓｃｉ １９９８、８５５：７３８−４３）。染色体２１上のアミロイド前駆体蛋白（ＡＰＰ）、染色体１４上のプレセニリン−１および染色体１上のプレセニリン−２についての遺伝子の遺伝子欠損に起因する早発性ＡＤの例は稀にあるが、一般的な形態の晩発性散発性ＡＤは、これまで知られていなかった原因に起因するものである。神経変性疾患の晩発性で複合的な病因は、治療薬および診断薬の開発に厖大な難題を投げかけている。可能性のある薬物ターゲットおよび診断用マーカーのプールを拡大することが重要である。従って、本発明の目的は、神経疾患の病因への洞察をもたらすこと、ならびにとりわけこれらの疾患の治療の診断および開発に適する方法、材料、薬剤、組成物および動物モデルを提供することである。この目的は、独立クレームの特徴によって解決された。従属クレームは、本発明の好ましい実施態様を定義している。

本発明は、ヒトアルツハイマー病脳サンプルにおける、Ｇ蛋白結合内向き整流カリウムイオンチャネルサブファミリーＪメンバー６（ＫＣＮＪ６）もしくはＡＴＰ感受性カリウムチャネル（Ｋ（ＡＴＰ）２という名でもある）、またはＫｉｒ３．２、ＢＩＲ１もしくはＧＩＲＫ２をコードする遺伝子の、およびＫＣＮＪ６の蛋白質産物の、検出および異常調節された差次的発現に基づく。

機能的カリウムイオン（Ｋ^＋）チャネルは、ホモまたはヘテロメリック四量体を形成する幾つかのサブユニットから成る膜貫通型蛋白質である。カリウムチャネルの幾つかの構造クラスが今日までに判明している。ＡＴＰ感受性カリウムチャネル（Ｋ_ＡＴＰ）、内向き整流カリウムチャネル（Ｋｉｒ）およびＧ蛋白結合カリウムチャネルは、２膜貫通ドメイン（２ＴＭ）含有蛋白質に属する。各サブユニットは、ポアループ（Ｐ−ループ）により連結された２つの膜貫通ヘリックス（Ｍ１、Ｍ２）から成る（Ｋｕｂｏら、Ｎａｔｕｒｅ １９９３、３６２：１２７−１３３）。Ｎ末端およびＣ末端は、細胞質に位置している。カリウム選択性の原因であるＰ−ループ（Ｐ−領域として知られている）は、構造的に高度に保存されている。機能的内向き整流カリウムチャネルは、４つの２ＴＭサブユニットから成る。これらのチャネルは、同一のサブユニットで構成されている（Ｋｉｒ１、Ｋｉｒ２およびＫｉｒ６チャネル）か、類似したサブユニットで構成されている（Ｋｉｒ３チャネル）。ヘテロメリックチャネルの形成は、莫大な多様性を生じさせ、このため、広範な生理特性およびユニークな能力を有する多岐にわたる種々のチャネルを生じさせる（Ｍｉｎｏｒ、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２００１、１１：４０８−４１４；Ｍｉｌｌｅｒ、Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２０００、１：１−５）。

カリウムイオンチャネルの１つのファミリーは、内向き整流カリウム（Ｋｉｒ）チャネルから成り、これらは、活動電位発生の際に細胞膜を横断するカリウムイオンの流れを媒介し、細胞膜の静止電位を安定させ、これによって、例えばニューロン興奮性ならびに心臓活動電位を調節する。Ｋｉｒファミリーのカリウムチャネルは、電位が過分極してるときのほうが脱分極しているときより多くの電流を伝導することができる。内向き方向のほうが外向き方向より多くのカリウム電流を伝導する。Ｋｉｒ３ファミリーのカリウムチャネルは、Ｇ蛋白活性化され、これらは、Ｇ蛋白ベータ−ガンマ−サブユニットがこれらの細胞質ドメインに結合することにより開口される（Ｋｏｆｕｊｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉｅｎｃｅ ＵＳＡ １９９５、９５：６５４２−６５４６）。

一般に、カリウムチャネルは、多数の生理機能に関与しており、心臓、ニューロンおよび神経分泌細胞における電気活性に重要な役割を果たしている。家族性新生児痙攣、一過性運動失調症、様々な形態の癲癇などの多くのニューロン性疾患が、カリウムチャネルにおける突然変異に関連付けられている（Ｂｏｌａｎｄら、Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９９、９１：１５５７−１５６４；Ｃｈａｒｌｉｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １９９８、１８：５３−５５；Ｓｔｅｉｎｌｅｉｎら、Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １９９７、６：９４３−９４７；Ｗａｌｌａｃｅら、Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １９９８、１９：３６６−３７０）。内向き整流カリウムチャネルＫｉｒ３は、脳全体にわたっておよび心臓において発現される。これらの活性は、ニューロン興奮性、シナプス伝達を調節し、心拍数を変調する。このため、これらは、神経系において重要な種々の役割を果たす。このため、ニューロン機能は、イオンチャネル特性それ自体による、特定のニューロン区画におけるこれらの位置および密度による、ならびにニューロン集団にわたる発現勾配による影響を受ける。

Ｌｉａｏｕおよび共同研究者は、マウスからのニューロンにおいてＧ蛋白ゲート整流チャネルを形成するＫｉｒ３．２およびＫｉｒ３．１の共集合（ｃｏａｓｓｅｍｂｌｙ）について報告しており（Ｌｉａｏｕら、Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９６、１６：７１３７−７１５０；Ｋｏｆｕｊｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉｅｎｃｅ ＵＳＡ １９９５、９５：６５４２−６５４６）、さらなるデータは、両方のチャネルが小脳におけるニューロンの分化中に発現されることを示している（Ｓｌｅｓｉｎｇｅｒら、Ｎｅｕｒｏｎ １９９６、１６：３２１−３３１；Ｆｅｒｒｅｒら、Ｊ．Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ １９９５、２７０：２６０８６−２６０９１）。突然変異体Ｋｉｒ３．２チャネルは、マウスにおいてムスカリン受容体活性化（Ｍ２）への感受性低下を示し、Ｇ蛋白アルファサブユニットに応答しなかった。カリウムイオンに対する感受性低下と共にナトリウムイオン透過性増大が、膜の興奮性を変更させた（Ｎａｖａｒｒｏら、Ｓｃｉｅｎｃｅ １９９６、２７２：１９５０−１９５３；Ｒｏｓｓｉら、Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９８、１８：３５３７−３５４７）。Ｋｉｒ３．２における機能獲得型突然変異は、ｗｅａｖｅｒ表現型として知られている表現型を示すトランスジェニックマウスを導く。これらのマウスは、失調症、過敏症および震えに苦しむ。Ｋｉｒ３．２チャネルを欠くトランスジェニックマウスは、正常に小脳が発達している野生型マウスと形態学的に見分けがつかないが、発作を発現しやすい。（Ｓｉｇｎｏｒｉｎｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉｅｎｃｅ ＵＳＡ １９９７、９４：９２３−９２７）。トランスジェニックｗｅａｖｅｒマウスは、黒質における細胞喪失、およびパーキンソン病に罹患している患者で観察される黒質細胞喪失に類似した小脳の顆粒層における細胞喪失を示す（Ｐａｔｉｌら、Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １９９５、１１：１２６−１２９）ため、ｗｅａｖｅｒマウスおよびパーキンソン病に共有の遺伝子欠損が論じられた（Ｙａｍａｄａら、Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １９９０、５２６：３０３−３０７；Ｇａｓｐａｒら、Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９４、６１：２９３−３０５；Ａｂｒａｈａｍら、ＦＡＳＥＢ Ｊｏｕｒｎａｌ １９９９、１３：１９０１−１９０７）が、今までのところ、パーキンソン病に罹患している患者からのＫｉｒ３．２遺伝子の突然変異は検出できていない（Ｂａｎｄｍａｎｎら、Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９６、７２：８７７−８７９）。マウスＫｃｎｊ６（ジェンバンクアクセッション番号ＮＰ＿０３４７３６．１）は、ヒト配列（ジェンバンクアクセッション番号Ｐ４８０５１）と非常に相同であり、９８％より高い同一性を共有している。

Ｋｉｒチャネルは、７つのサブファミリーから成る、別のファミリーに分類される。１つのサブファミリー、Ｋｉｒ３ファミリーは、Ｋｉｒ３．１、Ｋｉｒ３．２、Ｋｉｒ３．３およびＫｉｒ３．４サブユニットから成る。約４８．５ｋＤａの分子量を有するアミノ酸数４２３のＫｉｒ３．２（別名：ＢＩＲ１、ＧＩＲＫ２、ＫＡＴＰ２、ｈｉＧＩＲＫ２、ＫＣＮＪ７、ＫＣＮＪ６）サブユニットは、ＫＣＮＪ６遺伝子によりコードされる。このＫＣＮＪ６は、当初はＴｓａｕｒら（Ｄａｂｅｔｅ １９９５、４４：５９２−５９６）によりＫＣＮＪ７と呼ばれており、１９９５年にＳａｋｕｒａおよび共同研究者によりクローニングされたものである（ヌクレオチド数２５９８のｍＲＮＡ、ジェンバンクアクセッション番号Ｌ７８４８０；蛋白質ＩＤ：Ｐ４８０５１；データベースＩＤ ＧＤＢ：１５１８５２５、Ｕ５２１５３）（Ｓａｋｕｒａら、ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔｅｒ １９９５、３６７：１９３−１９７）。ＫＣＮＪ６遺伝子（Ｋｉｒ３．２）は、染色体２１ｑ２２．１３にマッピングされた（Ｏｈｉｒａら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １９９７、７：４７−５８）。本発明者らが今日知る限り、アルツハイマー病とＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）の関係は、これまで開示されていない。

本明細書および本クレームで用いる単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈による別様の指図がない限り、複数表示を包含する。例えば、「細胞（ａ ｃｅｌｌ）」は、多数の細胞も意味するなどである。本明細書および本クレームで用いる用語「および／または」は、この用語の前後のフレーズが、二者択一と考えてもよいし、組み合わせで考えてもよいことを意味する。例えば、「レベルおよび／または活性の判定」という表現は、レベルのみ、もしくは活性のみ、またはレベルと活性の両方を判定することを意味する。ここで用いる用語「レベル」は、転写産物、例えばｍＲＮＡ、または翻訳産物、例えば蛋白質もしくはポリペプチドの、ゲージ、または量の測定値、または濃度を含む意味をもつ。ここで用いる用語「活性」は、生物学的効果を生じさせる転写産物もしくは翻訳産物の能力についての尺度、または生物活性分子のレベルについての尺度と理解するものとする。用語「活性」は、生物活性および／または薬理活性も指し、これは、カリウムチャネルまたはカリウムチャネルサブユニットの結合、拮抗、抑制、阻止、中和または離隔を指し、および配列番号１の新規カリウムチャネルポリペプチドを非限定的に含むカリウムチャネルまたはカリウムチャネルサブユニットの活性化、作動、アップレギュレーションを指す。「生物活性」は、カリウムイオンの膜貫通型輸送、および／または膜貫通型カリウムイオンフロー、および／またはこれらの調節を包含するが、これらに限定されない。「薬理活性」は、リガンド、化合物、薬剤、変調因子および／または別のカリウムチャネルサブユニットに結合するカリウムチャネルまたはカリウムチャネルサブユニットの能力を包含するが、これに限定されない。ここで用いる用語「レベル」および／または「活性」は、さらに、遺伝子発現レベルまたは遺伝子活性を指す。遺伝子発現は、遺伝子産物の生産を導くための、転写および翻訳による、遺伝子に含まれている情報の利用と定義することができる。「異常調節」は、遺伝子発現のアップレギュレーションまたはダウンレギュレーションを意味するものとする。遺伝子産物は、ＲＮＡまたは蛋白質のいずれかを含み、遺伝子発現の結果である。遺伝子産物の量を用いて、遺伝子がどのように活性であるかを測ることができる。本明細書および本特許請求の範囲において用いる用語「遺伝子」は、コード領域（エクソン）と非コード領域（例えば、非コーディング調節要素、例えばプロモータもしくはエンハンサ、イントロン、リーダーおよびトレーラー配列）の両方を含む。用語「ＯＲＦ」は、「オープンリーディングフレーム」の頭文字であり、少なくとも１つのリーディングフレームの中には停止コドンを有さず、従って、アミノ酸の配列に翻訳することができる核酸配列を指す。「調節要素」は、誘発性および非誘発性プロモータ、エンハンサ、オペレータ、および遺伝子発現を誘導し、調節する他の要素を含むものとする。ここで用いる用語「フラグメント」は、例えば、可変スプライシングされた、またはトランケートされた、または別様に切断された転写産物または翻訳産物を含む意味をもつ。ここで用いる用語「誘導体」は、突然変異もしくはＲＮＡ編集もしくは化学修飾もしくは別様に改変された転写産物、または突然変異もしくは化学修飾もしくは別様に改変された翻訳産物を指す。理解しやすいように、例えば、誘導転写産物は、核酸配列の変化、例えば単一または複数のヌクレオチドの欠失、挿入または交換、を有する転写産物を指す。例えば、誘導翻訳産物は、改変されたリン酸化もしくはグリコシル化もしくはアセチル化もしくは脂質化などのプロセスにより、または改変されたシグナルペプチド分解もしくは他のタイプの突然変異分解により生じさせることができる。これらのプロセスは、翻訳後に発生する場合もある。本発明および本特許請求の範囲で用いる用語「変調因子」は、遺伝子、または遺伝子の転写産物、または遺伝子の翻訳産物のレベルおよび／または活性を変化させるまたは変更することができる分子を指す。「変調因子」は、強化または阻害する能力、従って、カリウムチャネルサブユニットまたはカリウムチャネルの機能特性を「変調する」能力、カリウムチャネルまたはカリウムチャネルサブユニットの結合、拮抗、抑制、阻止、中和または離隔を「変調する」能力、および活性化、作動およびアップレギュレーションを「変調する」能力を有する分子を指す。「変調」は、細胞の生物活性に影響を及ぼすことができる能力を指すためにも用いられるであろう。好ましくは、「変調因子」は、遺伝子の転写産物または翻訳産物の生物活性を変化または変更することができる。例えば、前記変調は、生物活性および／もしくは薬理活性の増加もしくは減少、結合特性の変化、または遺伝子の前記翻訳産物の生物学的特性、機能的特性もしくは免疫原性特性における他の変化もしくは変更であってもよい。用語「薬剤」、「試薬」または「化合物」は、細胞、組織、体液、または文脈の中のあらゆる生物学的系、または試験されるあらゆるアッセイ系に対して正または負の生物学的効果を有する、あらゆる物質、化学物質、組成物または抽出物を指す。これらは、ターゲットの作動薬、拮抗薬、部分作動薬または逆作動薬であり得る。こうした薬剤、試薬または化合物は、核酸、天然もしくは合成ペプチドもしくは蛋白質複合体、または融合蛋白質であってもよい。これらは、抗体、有機または無機分子または組成物、小分子、薬物、およびあらゆる前記薬剤のあらゆる組み合わせであってもよい。これらは、試験のために、診断のためにまたは治療のために使用することができる。用語「オリゴヌクレオチドプライマー」または「プライマー」は、相補的塩基対のハイブリダイゼーションにより所定のターゲットポリヌクレオチドにアニールすることができる、およびポリメラーゼにより伸長することができる、短い核酸配列を指す。これらは、特定の配列に特異的であるように選択してもよく、またはランダムに選択してもよく、例えば、すべての可能な配列をミックスでプライミングするであろう。ここで使用するプライマーの長さは、１０ヌクレオチドから８０ヌクレオチドにわたって変化し得る。「プローブ」は、ここで説明および開示する核酸配列の短い核酸配列またはこれらに相補的な配列である。これらは、完全長配列、または所定の配列のフラグメント、誘導体、アイソフォームもしくは変異体を含むことができる。「プローブ」とアッセイサンプルとのハイブリダイゼーション複合体の特定により、このサンプルの中の他の類似した配列の存在を検出することができる。ここで用いる「相同体または相同性」は、あるヌクレオチドまたはペプチド配列と別のヌクレオチドまたはペプチド配列との相関性を説明するために当分野において用いられる用語であり、これは、比較される前記配列間の同一度および／または類似度によって判定される。当分野において、用語「同一性」および「類似性」は、ポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列の相関度を意味し、これは、照会配列と好ましくは同じタイプの他の配列（核酸または蛋白質配列）とを互いにマッチングさせることによって判定される。「同一性」および「類似性」を計算および判定する好ましいコンピュータプログラム法としては、ＧＣＧ ＢＬＡＳＴ（基本局所アラインメント検索ツール：Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌ）（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９９０、２１５：４０３−４１０；Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１９９７、２５：３３８９−３４０２；Ｄｅｖｅｒｅｕｘら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． １９８４、１２：３８７）、ＢＬＡＳＴＮ ２．０（Ｇｉｓｈ Ｗ．、ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｗｕｓｔｌ．ｅｄｕ、１９９６−２００２）、ＦＡＳＴＡ（Ｐｅａｒｓｏｎ ａｎｄ Ｌｉｐｍａｎ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９８８、８５：２４４４−２４４８）、および最も長いオーバーラップを有する一対のコンティーグを決定し、アライメントするＧＣＧ ＧｅｌＭｅｒｇｅ（Ｗｉｌｂｕｒ ａｎｄ Ｌｉｐｍａｎ、ＳＩＡＭ Ｊ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．１９８４、４４：５５７−５６７；Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９７０、４８：４４３−４５３）が挙げられるが、これらに限定されない。ここで用いる用語「変異体」は、本発明で開示するポリペプチドおよび蛋白質に関して、１つまたはそれ以上のアミノ酸が、本発明の天然ポリペプチドまたは蛋白質の天然アミノ酸配列のＮ末端および／もしくはＣ末端、および／または本発明の天然ポリペプチドまたは蛋白質の天然アミノ酸配列内、に追加されている、および／またはで置換されている、および／またはで欠失している、および／またはに挿入されているが、この本質的な特性を保持している、あらゆるポリペプチドまたは蛋白質を指す。さらに、用語「変異体」は、より短いまたはより長いあらゆるバージョンのポリペプチドまたは蛋白質を包含するものとする。「変異体」は、ＫＣＮＪ６蛋白質のアミノ酸配列、配列番号１（Ｋｉｒ３．２）との少なくとも約８０％の配列同一性、さらに好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、および最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する配列も含むものとする。「変異体」は、例えば、高保存性領域における保存的アミノ酸置換を有する蛋白質を包含する。本発明の「蛋白質およびポリペプチド」は、ＫＣＮＪ６蛋白質のアミノ酸配列、配列番号１（Ｋｉｒ３．２）を含む蛋白質の変異体、フラグメントおよび化学的誘導体を包含する。代替塩基配列のためあるコドンが別のコドンで置換されているが、ＤＮＡ配列により翻訳されたアミノ酸配列は変わらないままでいる配列変異を含むであろう。当分野では公知であるこの現象は、特定のアミノ酸を翻訳するコドンセットの重複性と呼ばれる。官能基に影響を及ぼさないアミノ酸の交換、例えば、アルギニンからリジンへの、バリンからロイシンへの、アスパラギンからグルタミンへの置換を含むであろう。自然から単離できる、または組換えおよび／もしくは合成手段により生産できる蛋白質およびポリペプチドを含むことができる。天然蛋白質またはポリペプチドは、自然発生トランケート形または分泌形、自然発生変異形（例えば、スプライス変異体）および自然発生対立遺伝子変異体を指す。ここで用いる用語「単離された」は、改変された分子または物質、および／またはこれらの自然環境から取り出される、すなわち、これらが通常発生する細胞もしくは生体から単離される分子または物質、ならびにこれらが元々会合していることがわかっている共存成分から分離もしくは本質的に精製される分子または物質を指すものと考える。この概念は、こうした分子をコードする配列を、これらが自然な状態では結合しないポリヌクレオチドに人間の手で連結させることができること、ならびにこうした分子を組換えおよび／または合成手段によって生産することができること（これらは「非天然」であるとも言える）をさらに意味する。前記目的のために、当業者には公知の方法によりこれらの配列を生きているまたは生きていない生物に導入することができる場合、およびこれらの配列が前記生物体内にまだ存在する場合であっても、尚、これらは単離されていると考えられる。本発明において、用語「リスク」、「罹病性」および「素因」は、同等であり、神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病を発現する確率に関して用いられる。

用語「ＡＤ」は、アルツハイマー病を意味するものとする。ここで用いる「ＡＤ型神経病理」は、本発明で説明するような、および最先端の文献（Ｉｑｂａｌ、Ｓｗａａｂ、Ｗｉｎｂｌａｄ ａｎｄ Ｗｉｓｎｉｅｗｓｋｉ、Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ ａｎｄ Ｒｅｌａｔｅｄ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ（Ｅｔｉｏｌｏｇｙ、Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓ ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ）、Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、Ｗｅｉｎｈｅｉｍ、Ｔｏｒｏｎｔｏ、１９９９；Ｓｃｉｎｔｏ ａｎｄ Ｄａｆｆｎｅｒ、Ｅａｒｌｙ Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ｏｆ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ、Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ、Ｔｏｔｏｗａ、Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ、２０００；Ｍａｙｅｕｘ ａｎｄ Ｃｈｒｉｓｔｅｎ、Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ：Ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅ ｔｏ Ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｐｒｅｓｓ、Ｂｅｒｌｉｎ、Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９９；Ｙｏｕｎｋｉｎ、Ｔａｎｚｉ ａｎｄ Ｃｈｒｉｓｔｅｎ、Ｐｒｅｓｅｎｉｌｉｎｓ ａｎｄ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｐｒｅｓｓ、Ｂｅｒｌｉｎ、Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９８参照）から一般に知られているような、神経病理学的、神経生理学的、組織病理学的および臨床的特徴を指す。用語「Ｂｒａａｋ期（Ｂｒａａｋ ｓｔａｇｅ）」または「Ｂｒａａｋ病期（Ｂｒａａｋ ｓｔａｇｉｎｇ）」は、Ｂｒａａｋ ａｎｄ Ｂｒａａｋ（Ｂｒａａｋ ａｎｄ Ｂｒａａｋ、Ａｃｔａ Ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｏｌｏｇｙ １９９１、８２：２３９−２５９）によって提案された基準による脳の分類を指す。神経原線維変化およびニューロピルスレッドの分布に基づき、ＡＤの神経病理進行は、６つの期（期０から６）に分けられる。本発明では、Ｂｒａａｋ期０から２は、対照健常者（「対照」）を表し、Ｂｒａａｋ期４から６は、アルツハイマー病に罹患している人（「ＡＤ患者」）を表す。前記「対照」から得られた値は、「健常と認められる状態」を表す「基準値」であり、前記「ＡＤ患者」から得られた値は、「疾病と認められる状態」を表す「基準値」である。Ｂｒａａｋ期３（Ｂｒａａｋ中期）は、対照健常者を表す場合もあり、ＡＤ患者を表す場合もある。高いＢｒａａｋ期ほど、ＡＤの症状を提示する可能性が高い。神経病理評価、すなわちＡＤの病理変化が痴呆の基礎原因である可能性の推定のために、推奨基準がＢｒａａｋ Ｈによって与えられている（ｗｗｗ．ａｌｚｆｏｒｕｍ．ｏｒｇ）。

本発明の神経変性疾患または障害は、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、ピック病、前頭側頭性痴呆、進行性核性麻痺、皮質基底核変性、脳血管性痴呆、多系統萎縮症、嗜銀顆粒性痴呆および他のタウオパシー、ならびに軽度認知障害を含む。神経変性プロセスを伴うさらなる状態は、例えば、虚血性発作、加齢性黄斑変性、睡眠発作、運動ニューロン疾患、プリオン疾患、外傷性神経傷害および修復、ならびに多発性硬化症である。

本発明は、ＡＤ患者の特定の脳領域における、互いとの比較での、および／または同年齢の対照健常者との比較での、特定のサンプルにおけるＡＴＰ感受性カリウムチャネルをコードする遺伝子、サブファミリーＪ、ＫＣＮＪ６（別名Ｋｉｒ３．２またはＧＩＲＫ２）のＧ蛋白結合内向き整流カリウムイオンチャネルをコードする遺伝子、および前記遺伝子ＫＣＮＪ６（別名Ｋｉｒ３．２またはＧＩＲＫ２）の蛋白質産物についての同定、差次的発現、特異的調節、異常調節を開示する。本発明は、ＡＤに罹患している脳ではＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）についての遺伝子発現が変更される、異常調節される、すなわち、ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）ｍＲＮＡレベルが、前頭皮質と比較して側頭皮質では減少する、ダウンレギュレートされる、または側頭皮質と比較して、前頭皮質では上昇する、またはアップレギュレートされることを開示する。さらに、本発明は、ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）の発現が、ＡＤ患者の前頭皮質と側頭皮質と比較すると、同年齢の対照健常者の前頭皮質と側頭皮質とが異なることを開示する。同年齢の健常対照から得られたサンプルを互いに比較したとき、こうした異常調節は観察されない。この異常調節は、ＡＤに罹患している脳におけるＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）の病的変化におそらく関係している。ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）遺伝子発現の異常調節と神経変性疾患、特にＡＤの病理との関係を実証する実験は、今までのところ記載されていない。同様に、ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）遺伝子の突然変異が前記疾患に関連しているということも記載されていない。ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）遺伝子をこうした疾患に結びつけることによって、中でも前記疾患の診断および治療のための新たな方法が得られる。本発明は、ＡＤ患者の特定の脳領域におけるＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）をコードする遺伝子の異常調節を開示する。下側頭葉、嗅内皮質、海馬体および扁桃内のニューロンは、ＡＤの変性プロセスに付される（Ｔｅｒｒｙら、Ａｎｎａｌｓ ｏｆ Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ １９８１、１０：１８４−１９２）。これらの脳領域は、学習および記憶機能のプロセッシングに主として関与しており、ＡＤにおけるニューロンの喪失および変性に対する選択的脆弱性を示す。対照的に、前頭皮質、後頭皮質および小脳内のニューロンは、主として無傷のままであり、神経変性プロセスから防護される。本明細書において開示する実施例には、ＡＤ患者および同年齢の対照健常者の前頭皮質（Ｆ）、側頭皮質（Ｔ）からの脳組織を使用した。従って、ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）遺伝子ならびにこの対応する転写および／または翻訳産物は、ＡＤで一般に観察される領域選択的ニューロン変性において原因的役割を果たす。または、ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）は、生き残っている神経細胞に神経保護機能を付与することができる。これらの開示を基に、本発明は、診断評価および予後判定に、ならびに神経変性疾患、特にＡＤの素因の特定に利用することができる。さらに、本発明は、こうした疾患の治療を受けている患者の診断モニター方法を提供する。

１つの側面において、本発明は、被検者において神経変性疾患を診断もしくは予後判定する、または被検者が、前記疾病を発現するリスクが増大した状態にあるかどうかを判定する方法を特徴とする。この方法は、前記被検者から得られたサンプルにおいて（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／または（ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方を判定すること；ならびに前記転写産物および／または前記翻訳産物の前記レベルおよび／または活性を、疾病と認められる状態を表す基準値および／または健常と認められる状態（健常対照）を表す基準値と比較することを含み；ならびに前記レベルおよび／または前記活性が、健常と認められる状態を表す基準値と比較して変化している、変更されている、および／または疾病と認められる状態を表す基準値と類似しているもしくは同等であることによって、前記被検者の前記神経変性疾患を診断もしくは予後判定する、または前記被検者が、前記神経変性疾病を発現するリスクが増大した状態にあるかどうかを判定することを含む。「被検者における」という表現は、方法が被検者を苦しめている疾患、言い換えると被検者の「中」に存在する疾患、に関するかぎり、開示される当該方法の結果に関連している。

本発明は、本発明において開示するような核酸配列またはこれらのフラグメントもしくは変異体に独特であるプライマーおよびプローブの構築および使用にも関する。オリゴヌクレオチドプライマーおよび／またはプローブは、蛍光、生物発光、磁性または放射性物質で特異的に標識することができる。さらに、本発明は、前記特異的オリゴヌクレオチドプライマーを適切な組み合わせで使用することによる、前記核酸配列またはこれらのフラグメントとおよび変異体の検出および生産に関する。前記プライマーの組み合わせを用いてＰＣＲ分析（当業者には周知の方法）を行って、核酸を含有するサンプルから前記遺伝子特異的核酸配列を増幅させることができる。こうしたサンプルは、健常被検者または罹病被検者、いずれに由来するものであってもよい。増幅により、特異的核酸産物が生じるか否か、および異なる長さのフラグメントを得ることができるか否かは、神経変性疾患、特に、アルツハイマー病についての指標となり得る。このため、本発明は、神経変性疾患、特にアルツハイマー病と関連があるかもしれない試験すべき核酸配列を含む所定のサンプルにおいてこの遺伝子突然変異および単一のヌクレオチド多様性を検出するために有用な、少なくとも塩基数１０で全コードおよび遺伝子配列以下の長さの核酸配列、オリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブを提供する。この特徴は、迅速なＤＮＡベースの診断試験の開発、好ましくはキットの形態での開発に利用することができる。ＫＣＮＪ６用のプライマーは、実施例（ｉｖ）において例示的に説明する。

さらなる側面において、本発明は、被検者における神経変性疾患の進行をモニターする方法を特徴とする。前記被検者から得られたサンプルにおいて（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方を判定する。前記レベルおよび／または前記活性を、疾病または健常と認められる状態を表す基準値と比較する。これによって、前記患者における前記神経変性疾患の進行をモニターする。

なお、さらなる側面において、本発明は、神経変性疾患の治療を評価する方法を特徴とし、この方法は、前記疾患の治療を受けている前記被検者から得られたサンプルにおいて（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方を判定することを含む。前記レベルもしくは前記活性または前記レベルと前記活性の両方を、疾病または健常と認められる状態を表す基準値と比較し、これによって前記神経変性疾患の治療を評価する。

ここで特許請求の範囲に記載する本発明の方法、キット、組換え動物、分子、アッセイおよび使用の好ましい実施態様において、前記ＫＣＮＪ６（Ｋｉｒ３．２）遺伝子および蛋白質［Ｇ蛋白結合内向き整流カリウムイオンチャネルサブファミリーＪメンバー６（以前はＫＣＮＪ７）、もしくはＡＴＰ感受性カリウムチャネル（Ｋ（ＡＴＰ）２という名でもある）、またはＫｉｒ３．２、ＢＩＲ１もしくはＧＩＲＫ２とも呼ばれる］は、配列番号１（Ｋｉｒ３．２）（ジェンバンクアクセッション番号Ｐ４８０５１）の蛋白質をコードするＫＣＮＪ６遺伝子によって表される。前記蛋白質のアミノ酸配列は、ジェンバンクアクセッション番号Ｕ５２１５３（Ｋｉｒ３．２）のｃＤＮＡ配列に対応する配列番号２（Ｋｉｒ３．２ ｃＤＮＡ）に対応するｍＲＮＡ配列から導き出される。本発明において、ＫＣＮＪ６は、配列番号１（ジェンバンクアクセッション番号Ｐ４８０５１）の蛋白質をコードする配列番号２の核酸配列も指し、ならびにヒトＫＣＮＪ６のコード配列（ｃｄｓ）を表す核酸配列 配列番号４も指す。本発明において、前記配列は、本明細書でこの用語が用いられるとおり「単離」されている。さらに本発明において、前記ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子は、一般にはＫＣＮＪ６遺伝子もしくはＫｉｒ３．２遺伝子、または単にＫＣＮＪ６もしくはＫｉｒ３．２とも呼ばれる。ＫＣＮＪ６またはＫｉｒ３．２の蛋白質は、一般に、ＫＣＮＪ６蛋白質またはＫｉｒ３．２蛋白質とも呼ばれる。

ここで特許請求の範囲に記載する本発明の方法、キット、組換え動物、分子、アッセイおよび使用のさらなる好ましい実施態様において、前記神経変性疾患または障害は、アルツハイマー病であり、前記被検者は、アルツハイマー病に罹患している。

好ましくは、分析および判定されるサンプルは、脳組織もしくは他の組織または体細胞を含む群から選択される。サンプルは、脳脊髄液、または唾液、尿、血液、血清血漿もしくは粘液を含有する他の体液も含むことができる。好ましくは、本発明に従って神経変性疾患を診断する、予後判定する、または神経変性疾患の進行をモニターする、または神経変性疾患の治療を評価する方法は、体外で実施することができ、こうした方法は、好ましくは、被検者または患者または対照健常者から取り出された、採取されたまたは単離されたサンプル、例えば体液または細胞に関する。

さらなる好ましい実施態様において、前記基準値は、前記神経変性疾患に罹患していない被検者から得られたサンプル（対照健常者、対照サンプル、対照）中の、または神経変性疾患、特にアルツハイマー病に罹患している被検者から得られたサンプル（患者サンプル、患者）中の（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／または（ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の、レベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方の基準値である。

好ましい実施態様において、健常と認められる状態を表す基準値（対照サンプル）を基準とした、前記被検者からのサンプル細胞または組織または体液におけるＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／またはＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／またはこれらのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルおよび／または活性の変更は、神経変性疾患、特にＡＤの診断もしくは予後判定、または神経変性疾患、特にＡＤに罹病することとなるリスク増大を示す。

さらなる好ましい実施態様において、神経変性疾患、特にアルツハイマー病について疾病と認められる状態を表す基準値（ＡＤ患者サンプル）を基準にして、被検者から得られたサンプル細胞または組織または体液におけるＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／またはＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／またはこれらのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の、同等のまたは類似したレベルおよび／または活性は、前記神経変性疾患の診断もしくは予後判定、または神経変性疾患に罹病することとなるリスク増大を示す。

好ましい実施態様では、被検者から得られたサンプルにおけるＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物のレベルの測定は、被検者のサンプルから抽出したＲＮＡの逆転写により得られたｃＤＮＡから前記遺伝子に特異的な配列を増幅するためにプライマーの組み合わせを使用する定量的ＰＣＲ分析を用いて行う。プライマーの組み合わせ（配列番号５、配列番号６）は本発明の実施例（ｉｖ）において与えるが、本発明で開示する配列から作製される他のプライマーを使用することもできる。前記遺伝子に特異的なプローブでのノーザンブロットを適用することもできる。チップ利用マイクロアレイ法による転写産物の測定は、さらに好ましいであろう。これらの技法は、当業者には公知である（Ｓａｍｂｒｏｏｋ ａｎｄ Ｒｕｓｓｅｌｌ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、２００１；Ｓｃｈｅｎａ Ｍ．、Ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ Ｂｉｏｃｈｉｐ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｅａｔｏｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｎａｔｉｃｋ、ＭＡ、２０００参照）。イムノアッセイの例は、特許出願国際公開第０２／１４５４３号パンフレットに開示および記載されているような酵素活性の検出および測定である。

さらに、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物のおよび／または前記翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルおよび／または活性、および／または前記翻訳産物のおよび／またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の活性のレベルは、イムノアッセイ、活性アッセイ、および／または結合アッセイを用いて検出することができる。これらのアッセイでは、抗蛋白質抗体または抗蛋白質抗体に結合する二次抗体のいずれかに結合する酵素標識、クロモ力学的標識、放射性標識、磁性標識または蛍光標識の使用により、前記蛋白質分子と抗蛋白質抗体との結合量を測定することができる。加えて、他の高親和性リガンドを使用してもよい。用いることができるイムノアッセイとしては、ＥＬＩＳＡ、ウエスタンブロット、および当業者には公知の他の技法が挙げられる（Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９９、およびＥｄｗａｒｄｓ Ｒ、Ｉｍｍｕｎｏｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ；Ｅｎｇｌａｎｄ、１９９９参照）。これらすべての検出技法は、マイクロアレイ、プロテインアレイ、抗体マイクロアレイ、組織マイクロアレイ、または電子バイオチップもしくはプロテインチップに基づく技法（Ｓｃｈｅｎａ Ｍ．、Ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ Ｂｉｏｃｈｉｐ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｅａｔｏｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｎａｔｉｃｋ、ＭＡ、２０００参照）の形式で利用することもできる。

好ましい実施態様では、一定の期間にわたって前記被検者から採取した一連のサンプルにおいて（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／または（ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルもしくは活性または前記レベルと活性の両方を比較して、前記疾病の進行をモニターする。さらなる好ましい実施態様では、前記被検者は、１つまたはそれ以上の前記サンプルの採取前に、治療を受ける。さらにもう１つの好ましい実施態様では、前記レベルおよび／または活性は、前記被検者の前記治療の前および後に判定する。

もう１つの側面において、本発明は、被検者において神経変性疾患、特にＡＤを診断もしくは予後判定する、または神経変性疾患、特にＡＤを発現する被検者の傾向もしくは素因を判定するためのキットを特徴とし、前記キットは、
（ａ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物を選択的に検出する試薬、（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物を選択的に検出する試薬、から成る群より選択される少なくとも１つの試薬、ならびに
（ｂ）−前記被検者から得られたサンプルにおいてＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の前記転写産物および／または前記翻訳産物のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の用量を検出すること、ならびに
−通常と認められる状態を示す基準値（対照）と比較して、前記転写産物および／または前記翻訳産物の変化または変更したレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方が、および／または前記転写産物および／または前記翻訳産物のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方が疾病と認められる状態、好ましくはＡＤの疾病状態、を表す基準値と類似しているか、同等であることが、神経変性疾患、特にＡＤの診断もしくは予後判定、またはこうした疾患を発現する傾向もしくは素因の増大を示すことから神経変性疾患、特にＡＤを診断もしくは予後判定すること、またはこうした疾患を発現する前記被検者の傾向または素因を判定すること
により、神経変性疾患、特にＡＤを診断もしくは予後判定する、またはこうした疾患を発現する被検者の傾向もしくは素因を判定するためのインストラクションを含む。本発明のキットは、神経変性疾患、特にＡＤを発現するリスクがある状態の個体の特定に特に有用であり得る。

さらなる側面において、本発明は、（ｉ）前記被検者から得られたサンプルにおいて、ＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の転写産物および／または翻訳産物のレベルもしくは活性もしくは前記レベルと前記活性の両方を検出する工程、ならびに（ｉｉ）ＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の転写産物および／または翻訳産物の前記レベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方を、健常と認められる状態を表す基準値および／または疾病と認められる状態を表す基準値と比較する工程、ならびに前記転写産物および／または前記翻訳産物の前記レベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方が、健常と認められる状態を表す基準値と比較して変化している、および／または疾病と認められる状態を表す基準値と類似しているか同等であることによって被検者における神経変性疾患、特にアルツハイマー病を診断または予後判定する方法およびこうした疾患を発現する被検者の傾向または素因を判定する方法における、キットの使用を特徴とする。

従って、本発明のキットは、罹患してしまった疾病の経過とともに回復不能な障害を受けないうちに、疾病発症前の早期予防措置または治療的診療をするために個体を特定することを目的とする手段として役立ち得る。さらに、好ましい実施態様において、本発明を特徴とするキットは、被検者における神経変性疾患、特にＡＤの進行のモニター、ならびに前記被検者のこうした疾患に対する治療的処置の成功または失敗のモニターに有用である。

もう１つの側面において、本発明は、被検者において神経変性疾患、特にＡＤを治療または予防する方法を特徴とし、この方法は、（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のレベルもしくは活性または前記レベルと前記活性の両方に直接または間接的に影響を及ぼす単数または複数の薬剤の治療有効量または予防有効量での前記被検者への投与を含む。前記薬剤は、小分子を含むことができ、またはペプチド、オリゴペプチドもしくはポリペプチドを含むこともできる。前記ペプチド、オリゴペプチドまたはポリペプチドは、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物であるアミノ酸配列またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を含むことができる。本発明の、神経変性疾患、特にＡＤを治療または予防するための薬剤は、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドからも成り得る。前記オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドは、センスの方向でまたはアンチセンスの方向いずれかのＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子のヌクレオチド配列を含むことができる。

好ましい実施態様において、この方法は、遺伝子療法および／またはアンチセンス核酸技術のこれ自体公知の方法を適用して、前記単数または複数の薬剤を投与することを含む。一般に、遺伝子療法は幾つかのアプローチを含む：突然変異遺伝子の分子置換、結果として治療用蛋白質を合成することとなる新たな遺伝子の付加の、および組換え発現法によるもしくは薬物による内因性細胞性遺伝子発現の調節。遺伝子導入技法は、詳細に説明されており（Ｂｅｈｒ、Ａｃｃ Ｃｈｅｍ Ｒｅｓ １９９３、２６：２７４−２７８、およびＭｕｌｌｉｇａｎ、Ｓｃｉｅｎｃｅ １９９３、２６０：９２６−９３１参照）、直接遺伝子導入技法、例えば、細胞へのＤＮＡのメカニカルマイクロインジェクション、ならびに生物ベクター（例えば、組換えウイルス、特にレトロウイルス）もしくはモデルリポソームを利用する間接的技法、またはＤＮＡでのトランスフェクション、ポリカチオンとの共沈、化学物質（溶媒、界面活性剤、ポリマー、酵素）もしくは物理的手段（機械衝的ショック、浸透圧ショック、熱ショック、電気ショック）による細胞膜通過に基づく技法を含む。中枢神経系への生後遺伝子導入は、詳細に説明されている（例えば、Ｗｏｌｆｆ、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌ １９９３、３：７４３−７４８参照）。

特に、本発明は、アンチセンス核酸療法、すなわち一定の重要な細胞へのアンチセンス核酸またはこの誘導体の導入による不適切に発現されたまたは欠損した遺伝子のダウンレギュレーション（例えば、Ｇｉｌｌｅｓｐｉｅ、ＤＮ＆Ｐ １９９２、５：３８９−３９５；Ａｇｒａｗａｌ ａｎｄ Ａｋｈｔａｒ、Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １９９５、１３：１９７−１９９；Ｃｒｏｏｋｅ、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １９９２、１０：８８２−６参照）、によって、神経変性疾患を治療または予防する方法を特徴とする。ハイブリダイゼーション戦略は別として、疾病のメッセージを運ぶＲＮＡを破壊するリボザイム、すなわち酵素として作用するＲＮＡ分子、の適用も説明されている（例えば、Ｂａｒｉｎａｇａ、Ｓｃｉｅｎｃｅ １９９３、２６２：１５１２−１５１４参照）。好ましい実施態様において、治療すべき被検者は人間であり、治療用アンチセンス核酸またはこの誘導体は、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物に対してのものである。被検者の中枢神経系、好ましくは脳の細胞をこうした方法で治療することが好ましい。細胞透過は、アンチセンス核酸およびこの誘導体と担体粒子のカップリングなどの公知の戦略、または上で説明した技法によって行うことができる。ターゲティングした治療用オリゴデオキシヌクレオチドを投与するための戦略は、当業者には公知である（例えば、Ｗｉｃｋｓｔｒｏｍ、Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １９９２、１０：２８１−２８７参照）。場合によっては、単なる局所適用により送達を行うことができる。さらなるアプローチは、アンチセンスＲＮＡの細胞内発現に関する。この戦略では、ターゲット核酸の一定の領域に相補的なＲＮＡの合成を指図する組換え遺伝子で、細胞をエクスビボで形質転換する。細胞内で発現されたアンチセンスＲＮＡの治療使用は、遺伝子療法に手順が類似している。ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）として様々に知られている２本鎖ＲＮＡの使用により遺伝子の細胞内発現を調節する最近開発された方法は、核酸療法のもう１つの有効なアプローチであり得る（Ｈａｎｎｏｎ、Ｎａｔｕｒｅ ２００２、４１８：２４４−２５１）。

さらなる好ましい実施態様において、Ｋｉｒ３．２サブユニットから成るカリウムチャネルに対する、またはＫｉｒ３．２サブユニットとＫｉｒ３．１および／もしくはＫｉｒ３．３サブユニットおよび／もしくは他のカリウムチャネルサブユニットとから成るヘテロメリックカリウムチャネルに対する化合物および／または薬剤の効果を調査する方法を提供する。これによって、適切な細胞、例えばＣＨＯ−Ｋ１細胞、ＣＯＳ−７細胞もしくＨＥＫ２９３細胞において、または他のニューロン細胞系統において、単独で発現された、またはＫｉｒ３．１および／もしくはＫｉｒ３．３および／もしくは別のカリウムチャネルと共発現されたＫｉｒ３．２によって媒介されるカリウム電流に対する化合物および／または薬剤の電気生理学的効果を試験する。前記試験を行うために、ヒト遺伝子産物Ｋｉｒ３．２をコードするｃＤＮＡを適切な発現ベクターにクローニングする。Ｋｉｒ３．１および／またはＫｉｒ３．３を、および／または別のカリウムチャネルをコードするｃＤＮＡを別の適切な発現ベクターにクローニングする。上で述べたような適切な細胞系統を、好ましくはＤＭＲＩＥ−Ｃ（カチオン性脂質 １、２−ジミリスチルオキシプロピル−３−ジメチル−ヒドロキシエチルアンモニウムブロマイド−コレステロールのリポソーム製剤）などの試薬を使用して、前記プラスミドでトランスフェクトする。電位固定モードでパッチクランプ試験を行うことができ（Ｈａｍｉｌｌら、Ｐｆｌｕｇｅｒｓ Ａｒｃｈ．１９８１、３９１：８５−１００）、全細胞電流を記録し、得られたシグナルは、適切なソフトウェア、例えば、Ｐｕｌｓｅ／Ｐｕｌｓｅｆｉｔ（ドイツ、ランブレヒト（Ｌａｍｂｒｅｃｈｔ）のＨＥＫＡ）を使用して増幅し、デジタル化し、保存し、分析することとなる。電流の「ランダウン」または「ランナップ」が（Ｖａｒｎｕｍら、Ｐｒｏ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １９９３、９０：１１５２８−１１５３２）化合物および／または薬剤効果の評価には強すぎるままである場合には、不特定の電流増幅変化を防止する穿孔パンチクランプ法（Ｄａｒｔら、Ｊ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．１９９５、４８３：２９−３９；Ｄｉｎｅｓｈ ＆ Ｈａｂｌｉｔｚ、Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ．１９９０、５３５：３１８−３２２）を用いて、前記カリウムチャネルの媒介電流の調査を行うことができる。単独のＫｉｒ３．２に対する、またはＫｉｒ３．１および／またはＫｉｒ３．３および／または別のカリウムチャネルと共発現されたＫｉｒ３．２に対する試験化合物の効果および可逆性を調査するための刺激プロトコルの例を下に示す。細胞は、例えば、−６０ｍＶの保持電位で固定することとなる。パルスサイクル速度は、１５秒であり得る。化合物および／または薬剤を試験するために、安定的にトランスフェクトされた細胞を、例えば１００ミリ秒または２５０ミリ秒または５００ミリ秒間に−５０ｍＶの保持電位から、−１０または−２０ｍｖ刻みで例えば−１６０ｍＶに過分極させ、この後、例えば＋９０ｍＶに１秒脱分極させることができる。試験パルスの最終時点での＋９０ｍＶへの電流増幅を分析に用いることとなろう。この方法は、単独のＫｉｒ３．２の、またはＫｉｒ３．１および／またはＫｉｒ３．３および／または別のカリウムチャネルと共発現されたＫｉｒ３．２の生物物理学的特性を開始させる、終了させる、活性化する、不活性化するまたは変調することができる化合物および／または薬剤の特定および試験にも適する。こうして特定および試験されたカリウムチャネル、特に内向き整流カリウムチャネルの変調因子は、学習および記憶機能に影響を及ぼす可能性があり得、例えば神経変性疾患、特にアルツハイマー病のための治療アプローチに用いることができる。

さらなる好ましい実施態様において、この方法は、前記被検者の中枢神経系、好ましくは脳に、ドナー細胞または好ましくは移植拒絶反応を最小化もしくは低減するように処理したドナー細胞を移植することを含み、前記ドナー細胞は、前記単数または複数の薬剤をコードする少なくとも１つのトランスジーンの挿入によって遺伝子修飾されている。前記トランスジーンは、ウイルスベクター、特にレトロウイルスベクターにより担持されていよう。トランスジーンは、トランスジーンをコードするＤＮＡの非ウイルス性物理的トランスフェクションによって、特にマイクロインジェクションによって、ドナー細胞に挿入することができる。トランスジーンの挿入は、エレクトロポレーション、化学媒介トランスフェクション、特にリン酸カルシウムトランスフェクションまたはリポソーム媒介トランスフェクションによって行うこともできる（Ｍｃ Ｃｅｌｌａｎｄ ａｎｄ Ｐａｒｄｅｅ、Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ：Ａｃｃｅｌｅｒａｔｅｄ ａｎｄ Ｈｉｇｈ−Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ Ｍｅｔｈｏｄｓ、Ｅａｔｏｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｎａｔｉｃｋ、ＭＡ、１９９９参照）。

好ましい実施態様において、神経変性疾患、特にＡＤを治療および予防するための前記薬剤は、前記被検者に被検者細胞を導入することを含むプロセスによって前記被検者、好ましくは人間に投与することができる治療用蛋白質であり、前記被検者細胞は、前記治療用蛋白質をコードするＤＮＡセグメントを挿入するためにインビトロで処理されており、前記被検者細胞は、前記被検者において前記治療用蛋白質の治療有効量をインビボで発現する。前記ＤＮＡセグメントは、ウイルスベクター、特にレトロウイルスベクターにより前記細胞にインビトロで挿入することができる。

本発明の治療方法は、以前に説明されている任意の細胞および遺伝子治療方法と併用での、治療的クローニング、移植、ならびに胚性幹細胞または胚性生殖細胞およびニューロン成熟幹細胞を使用する幹細胞療法を適用することを含む。幹細胞は、全能または多能性であり得る。これらは、器官特異的でもあり得る。罹病および／または損傷した脳細胞または組織を修復する戦略は、（ｉ）成熟組織からドナー細胞を採取することを含む。これらの細胞の核を、遺伝物質を除去した無精卵細胞に移植する。胚性幹細胞を、体細胞核導入を受けた細胞の胚盤胞期から単離する。この後、分化因子の使用により、この幹細胞を分化した細胞タイプ、好ましくはニューロン細胞に、直接発達させる（Ｌａｎｚａら、Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ １９９９、９：９７５−９７７）。または（ｉｉ）インビトロでの増殖（ｅｘｐａｎｓｉｏｎ）およびこの後のグラフトおよび移植のために、中枢神経系から単離された成熟幹細胞もしくは骨髄から単離された成熟幹細胞（間葉幹細胞）を精製し、または（ｉｉｉ）内在性神経幹細胞を増殖する、移行する、および機能的ニューロンに分化するように直接誘導する（Ｐｅｔｅｒｓｏｎ ＤＡ、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２００２、２：３４−４２）。成熟神経幹細胞は、成熟脳の胚中心にはニューロンの損傷または機能不全がないので、損傷または罹病した脳組織を修復するための大きな可能性を秘めている（Ｃｏｌｍａｎ Ａ、Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｗｏｒｌｄ ２００１、７：６６−７１）。

好ましい実施態様において、本発明の治療または予防のための被検者は、ヒト、または非ヒト実験動物（例えば、マウスもしくはラット）、家畜、もしくは非ヒト霊長類であり得る。実験動物は、神経変性疾患のための動物モデル、例えば、ＡＤ型神経病理を有するトランスジェニックマウスおよび／またはノックアウトマウスであり得る。

さらなる側面において、本発明は、（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体から成る群より選択される少なくとも１つの物質の活性もしくはレベルまたは前記活性と前記レベルの両方の変調因子を特徴とする。

追加の側面において、本発明は、前記変調因子および好ましくは医薬用担体を含む医薬組成物を特徴とする。前記担体は、前記変調因子と共に投与する、希釈剤、アジュバント、賦形剤またはビヒクルを指す。

もう１つの側面において、本発明は、神経変性疾患、特にＡＤを治療または予防するための医薬品を調製するための、（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体から成る群より選択される少なくとも１つの物質の活性もしくはレベルまたは前記活性と前記レベルの両方の変調因子の使用を提供する。

１つの側面において、本発明は、前記医薬組成物の治療または予防有効量が充填された１つまたはそれ以上の容器を含むキットも提供する。

さらなる側面において、本発明は、非天然ＫＣＮＪ６遺伝子配列またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を含む、組換え非ヒト動物を特徴とする。前記組換え非ヒト動物の産生は、（ｉ）前記遺伝子配列および選択可能なマーカー配列を含む遺伝子ターゲティング構築物を提供する工程、（ｉｉ）前記ターゲティング構築物を非ヒト動物の幹細胞に導入する工程、（ｉｉｉ）前記非ヒト動物幹細胞を非ヒト胚に導入する工程、（ｉｖ）前記胚を偽妊娠非ヒト動物に移植する工程、（ｖ）前記胚を満期まで発達させる工程、（ｖｉ）ゲノムが両方の対立遺伝子に前記遺伝子配列の修飾を含む遺伝子改変非ヒト動物を特定する工程、（ｖｉｉ）工程（ｖｉ）の遺伝子改変非ヒト動物を繁殖させて、ゲノムが前記内因性遺伝子の修飾を含む遺伝子改変非ヒト動物を得る工程を含み、前記遺伝子は、誤発現、または減少発現または過発現され、および前記破壊または変更が、神経変性疾患、特にＡＤの症状を発現する素因を示す前記非ヒト動物を生じさせる。こうした動物の産生および構築のための戦略および技術は、当業者には公知である（例えば、Ｃａｐｅｃｃｈｉ、Ｓｃｉｅｎｃｅ １９８９、２４４：１２８８−１２９２、およびＨｏｇａｎら、Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ ｔｈｅ Ｍｏｕｓｅ Ｅｍｂｒｙｏ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９４、およびＪａｃｋｓｏｎ ａｎｄ Ａｂｂｏｔｔ、Ｍｏｕｓｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ、Ｅｎｇｌａｎｄ、１９９９参照）。神経変性疾患、特にアルツハイマー病を調査するために動物モデルとしてこうした組換え非ヒト動物を使用することは好ましい。こうした動物は、神経変性疾患、特にアルツハイマー病を治療するための診断薬および治療薬の開発の際の化合物、薬剤および変調因子のスクリーニング、試験および評価に有用であり得る。

もう１つの側面において、本発明は、（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体から成る群より選択される１つまたはそれ以上の物質の、神経変性疾患、特にＡＤ、または関連疾患および障害の変調因子をスクリーニングするためのアッセイを特徴とする。このスクリーニング法は、（ａ）細胞を試験化合物と接触させる工程；（ｂ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性もしくはレベルまたは活性とレベルの両方を測定する工程；（ｃ）前記試験化合物と接触させていない対照細胞において、前記物質の活性もしくはレベルまたは活性とレベルの両方を測定する工程；ならびに（ｄ）工程（ｂ）および（ｃ）の細胞における前記物質のレベルおよび／または活性を比較する工程を含み、接触させた細胞における前記物質の活性および／またはレベルの変更は、この試験化合物が前記疾患または障害の変調因子であることを示す。

１つのさらなる側面において、本発明は、（ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または（ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または（ｉｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または（ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体から成る群より選択される１つまたはそれ以上の物質の、神経変性疾患、特にＡＤ、または関連疾患および障害の変調因子についてのスクリーニングアッセイを特徴とし、このアッセイは、（ａ）神経変性疾患または関連疾患もしくは障害の症状を発現する素因があるか、既に発現している非ヒト試験動物に試験化合物を投与する工程；（ｂ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性および／またはレベルを測定する工程；（ｃ）神経変性疾患の前記症状を発現する素因が同程度にあるか、又は既に発現していて、且つこうした試験化合物を投与されたことがない対応非ヒト対照動物において、前記物質の活性および／またはレベルを測定する工程；ならびに（ｄ）工程（ｂ）および（ｃ）の動物における前記物質の活性および／またはレベルを比較する工程を含み、試験動物における物質の活性および／またはレベルの変更は、この試験化合物が前記疾患または障害の変調因子であることを示す。

好ましい実施態様において、前記試験動物および／または前記対照動物は、天然ＫＣＮＪ６蛋白質遺伝子転写制御要素ではない転写制御要素の制御下で、ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくはこの誘導体を発現する組換え非ヒト動物である。

もう１つの実施態様において、本発明は、（ｉ）上述のスクリーニングアッセイの方法によって神経変性疾患の変調因子を特定する工程、および（ｉｉ）この変調因子を医薬用担体と混合する工程を含む、医薬品の製造方法を提供する。しかし、前記変調因子は、他のタイプのスクリーニングアッセイによって同定することもできる。

もう１つの側面において、本発明は、リガンドとＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体との結合を阻害する１つの化合物を試験するため、好ましくは多数の化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。前記スクリーニングアッセイは、（ｉ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の懸濁液を多数の容器に添加する工程；（ｉｉ）１つの化合物、または前記阻害についてスクリーニングされる多数の化合物を前記多数の容器に添加する工程；（ｉｉｉ）検出可能な、好ましくは蛍光標識されたリガンドを前記容器に添加する工程；（ｉｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体、および前記化合物または多数の化合物、および前記検出可能な、好ましくは蛍光標識されたリガンドをインキュベートする工程；（ｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体に結合した好ましくは蛍光の量を測定する工程；ならびに（ｖｉ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体への前記リガンドの結合に対する１つまたはそれ以上の前記化合物による阻害度を判定する工程を含む。リガンドと前記ＫＣＮＪ６翻訳産物との結合に対する阻害を判定するために、前記ＫＣＮＪ６転写産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を人工リポソームに再構成して、対応するプロテオリポソームを作製することが好ましいこともある。

界面活性剤からリポソームにＫＣＮＪ６翻訳産物を再構成する方法が詳述されている（Ｓｃｈｗａｒｚら、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ １９９９、３８：９４５６−９４６４；Ｋｒｉｖｏｓｈｅｅｖ ａｎｄ Ｕｓａｎｏｖ、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ−Ｍｏｓｃｏｗ １９９７、６２：１０６４−１０７３）。一部の側面では、蛍光標識リガンドを利用する代わりに当業者には公知の任意の他の検出可能な標識、例えば放射標識を使用し、これを然るべく検出することが好ましいことがある。前記方法は、新規化合物の特定に、ならびにＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体をコードする遺伝子の遺伝子産物へのリガンドの結合を阻害する能力が改善されたか、または別様に最適化された化合物の評価に有用であり得る。蛍光結合アッセイ（この場合、担体粒子の使用に基づくもの）の一例は、特許出願国際公開第００／５２４５１号パンフレットにおいて開示され、説明されている。さらなる例は、特許国際公開第０２／０１２２６号パンフレットに記載されているような競合アッセイ法である。本発明のスクリーニングアッセイに好ましいシグナル検出方法は、以下の特許出願に記載されている：国際公開第９６／１３７４４号パンフレット、同第９８／１６８１４号パンフレット、同第９８／２３９４２号パンフレット、同第９９／１７０８６号パンフレット、同第９９／３４１９５号パンフレット、同第００／６６９８５号パンフレット、同第０１／５９４３６号パンフレット、同第０１／５９４１６号パンフレット。

１つのさらなる実施態様において、本発明は、医薬品を製造するための方法を提供し、この方法は、（ｉ）上述の阻害性結合アッセイによって、リガンドとＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の遺伝子産物との結合の阻害剤としての化合物を特定する工程；および（ｉｉ）前記化合物と医薬用担体を混合する工程を含む。しかし、前記化合物は、他のタイプのスクリーニングアッセイによって特定することもできる。

もう１つの側面において、本発明は、ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体への化合物の結合度を判定するために、１つの化合物を試験するための、好ましくは多数の化合物をスクリーニングするためのアッセイを特徴とする。前記スクリーニングアッセイは、（ｉ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の懸濁液を多数の容器に添加する工程；（ｉｉ）検出可能な、好ましくは蛍光標識された化合物、または前記結合についてスクリーニングされる、多数の検出可能な、好ましくは蛍光標識された化合物を、前記多数の容器に添加する工程；（ｉｉｉ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体、および前記検出可能な、好ましくは蛍光標識された化合物（単数）または検出可能な好ましくは蛍光標識された化合物（複数）をインキュベートする工程；（ｉｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体に結合する好ましくは蛍光の量を測定する工程；ならびに（ｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体への１つまたはそれ以上の前記化合物による結合度を判定する工程を含む。このタイプのアッセイでは、蛍光標識の使用が好ましいだろう。しかし、任意の他のタイプの検出可能な標識を利用してもよい。また、このタイプのアッセイでは、本発明において説明するような人工リポソームへのＫＣＮＪ６翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の再構成が好ましいだろう。前記アッセイ方法は、新規化合物の特定に、ならびにＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体に結合する能力が改善されたか、または別様に最適化された化合物の評価に有用であり得る。

１つのさらなる実施態様において、本発明は、医薬品を製造するための方法を提供し、この方法は、（ｉ）上述の結合アッセイによって、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の遺伝子産物への結合剤として化合物を特定する工程；および（ｉｉ）前記化合物と医薬用担体を混合する工程を含む。しかし、前記化合物は、他のタイプのスクリーニングアッセイによって特定することもできる。

もう１つの実施態様において、本発明は、ここで特許請求の範囲に記載するスクリーニングアッセイの方法のいずれかによって得ることができる医薬品を提供する。１つのさらなる実施態様において、本発明は、ここで特許請求の範囲に記載するスクリーニングアッセイの方法のいずれかによって得られる医薬品を提供する。

さらに、もう１つの側面において、本発明は、蛋白質分子、および神経変性疾患、特にアルツハイマー病を検出するための診断ターゲットとしての配列番号１を有する前記蛋白質分子の使用を特徴とし、Ｋｉｒ３．２の前記蛋白質分子は、ＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である。

本発明は、蛋白質分子、および神経変性疾患、特にアルツハイマー病を予防または治療または改善する薬剤および化合物のためのスクリーニングターゲットとしての配列番号１を有する前記蛋白質分子の使用をさらに特徴とし、前記蛋白質分子Ｋｉｒ３．２は、ＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である。

本発明は、免疫原と特異的に免疫反応する抗体を特徴とし、前記免疫原は、配列番号１を有するＫｉｒ３．２蛋白質をコードする遺伝子ＫＣＮＪ６の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である。この免疫原は、前記遺伝子の翻訳産物の免疫原性または抗原性エピトープまたは部分を含むことができ、翻訳産物の前記免疫原性または抗原性部分はポリペプチドであり、前記ポリペプチドは動物における抗体反応を惹起し、前記ポリペプチドに前記抗体が免疫特異的に結合する。抗体を産生させるための方法は、当分野では周知である（Ｈａｒｌｏｗら、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ、Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９８８参照）。本発明で用いる用語「抗体」は、当分野において公知のすべての形態の抗体、例えばポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、組換え抗体、抗イディオタイプ抗体、ヒト化抗体または１本鎖抗体、ならびにこれらのフラグメントを包含する（Ｄｕｂｅｌ ａｎｄ Ｂｒｅｉｔｌｉｎｇ、Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９９９参照）。本発明の抗体は、例えば、エンザイムイムノアッセイ（例えば、酵素結合免疫吸着分析、ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ、化学発光イムノアッセイ、ウエスタンブロット、免疫沈降法および抗体マイクロアレイなどの最先端技術に基づく様々な診断および治療方法（Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ、Ｕｓｉｎｇ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９９ ａｎｄ Ｅｄｗａｒｄｓ Ｒ．、Ｉｍｍｕｎｏｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ、Ｅｎｇｌａｎｄ、１９９９参照）に有用である。これらの方法は、ＫＣＮＪ６遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の検出を含む。

本発明の好ましい実施態様において、前記抗体は、被検者から得られたサンプル中の細胞の病的状態の検出に使用することができ、この検出は、前記抗体での前記細胞の免疫細胞化学的染色を含み、健常と認められる状態を表す細胞と比較したときの前記細胞細胞における染色度の変更または染色パタンの変更は、前記細胞の病的状態を示す。好ましくは、前記病的状態は、神経変性疾患、特にＡＤと関係がある。細胞の免疫細胞化学的染色は、当分野では周知の多数の種々の実験法によって行うことができる。しかし、細胞の染色度の判定、または細胞もしくは細胞内染色パタンの判定、または細胞表面上の抗原の位相分布もしくは細胞内の細胞器官および他の細胞内構造中の抗原の位相分布を米国特許第６１５０１７３号に記載されている方法に従って行う、抗体結合の自動検出法を適用することが好ましいであろう。

本発明の他の特徴および利点は、後続の図および実施例の説明から明らかになろう。これらの説明は、単に実例となるものであり、いかなる点においても本開示の残りの部分を制限するためのものではない。

（ｉ）ＡＤ患者からの脳組織摘出：
平均で、死後６時間以内にＡＤ患者および同年齢の対照被検者から脳組織を採取し、ドライアイスで直ちに冷凍した。各組織からのサンプル切片を、診断の組織病理学的確認のために、パラホルムアルデヒドで固定した。差次的発現を分析するための脳領域を特定し、ＲＮＡ抽出を行うまで−８０℃で保存した。

（ｉｉ）全ｍＲＮＡの単離：
ＲＮｅａｓｙキット（Ｑｉａｇｅｎ）をこの製造業者のプロトコルに従って使用することにより、死後脳組織から全ＲＮＡを抽出した。Ａｇｉｌｅｎｔ ２１００ Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ（Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用してＤＮＡ ＬａｂＣｈｉｐシステムで正確なＲＮＡ濃度およびＲＮＡの質を決定した。調製したＲＮＡの追加の品質検査、すなわち部分的分解の排除およびＤＮＡ汚染についての検査のために、特別に設計したイントロンＧＡＰＤＨオリゴヌクレオチドおよび基準対照としてのゲノムＤＮＡを利用して、ＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙで、この製造業者（Ｒｏｃｈｅ）による提供プロトコルに記載されているとおり溶融曲線を作製した。

（ｉｉｉ）蛍光ディフェレンシャルディスプレイ（ＦＤＤ）による差次的発現遺伝子のｃＤＮＡ合成および特定：
種々の組織における遺伝子発現の変化を特定するために、修正および改良ディフェレンシャルディスプレイ（ＤＤ）スクリーニング法を利用した。元のＤＤスクリーニング法は、当業者には公知である（Ｌｉａｎｇ ａｎｄ Ｐａｒｄｅｅ、Ｓｃｉｅｎｃｅ １９９５、２６７：１１８６−７）。この技法は、ＲＮＡの２つの集団を比較し、一方の集団で発現されるが他方では発現されない遺伝子のクローンを生じさせる。幾つかのサンプルを同時に分析し、アップレギュレートされた遺伝子とダウンレギュレートされた遺伝子の両方を同じ実験で特定することができる。ＤＤ法における幾つかの工程を調整および洗練すること、ならびに技術的パラメータを修正すること、例えば重複性を増させること、全ＲＮＡの逆転写のための最適化された試薬および条件を評価すること、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を最適化しこの産物を分離することにより、非常に再現性がある高感度の結果を可能ならしめる技術が開発された。この応用改良ＤＤ法は、ｖｏｎ ｄｅｒ Ｋａｍｍｅｒら（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １９９９、２７：２２１１−２２１８）によって記載されている。６４の特別設計ランダムプライマーのセット（標準セット）を開発して、すべての可能なＲＮＡ種の統計的総合分析を達成した。さらに、この方法を修正して、蛍光標識プライマーの使用に基づく分取ＤＤスラブゲル法を作製した。本発明では、アルツハイマー病患者および同年齢の対照被検者の注意深く選択された死後脳組織（前頭および側頭皮質）からのＲＮＡ集団を比較した。

ＤＤ分析のための出発原料として、本発明者らは、上（ｉｉ）で説明したとおり抽出した全ＲＮＡを使用した。０．５ｍＭの各ｄＮＴＰ、１μＬのＳｅｎｓｉｓｃｒｉｐｔ Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅおよび１ｘ ＲＴバッファ（Ｑｉａｇｅｎ）、１０ＵのＲＮアーゼ阻害剤（Ｑｉａｇｅｎ）ならびに１μＭのいずれかの一塩基アンカー型オリゴヌクレオチド ＨＴ_１１Ａ、ＨＴ_１１ＧまたはＨＴ_１１Ｃ（Ｌｉａｎｇら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １９９４、２２：５７６３−５７６４；Ｚｈａｏら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １９９５、１８：８４２−８５０）を含有する２０μＬの反応物中のｃＤＮＡに、０．０５μｇの等量の各ＲＮＡは転写された。逆転写は、６０分間、３７℃で行い、最終変性工程は、９３℃で５分間行った。得られた各ｃＤＮＡの２μＬは、対応する一塩基アンカー型オリゴヌクレオチド（１μＭ）と共にＣｙ３標識ランダムＤＤプライマーのいずれか１つ（１μＭ）、１ｘ ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲバッファ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）、１．５ｍＭのＭｇＣｌ_２（ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）、２μＭのｄＮＴＰ−Ｍｉｘ（ｄＡＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＴＴＰ Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔｅｃｈ）、５％のＤＭＳＯ（Ｓｉｇｍａ）、１ＵのＡｍｐｌｉＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を利用する、最終体積２０μＬでのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）に付した。ＰＣＲ条件は、次のように設定した：変性のために９４℃で３０秒間、１℃／秒で４０℃に冷却、プライマーの低ストリンジェンシーアニーリングのために４０℃で４分間、１℃／秒で７２℃まで加熱、伸長のために７２℃で１分間を１ラウンド。このラウンドの後に３９の高ストリンジェンシーサイクルを行った：９４℃で３０秒間、１℃／秒で６０℃に冷却、６０℃で２分間、１℃／秒で７２℃まで加熱、７２℃で１分間。７２℃で５分間の１の最終段階を最終サイクルに加えた（ＰＣＲサイクラー：Ｍｕｌｔｉ Ｃｙｃｌｅｒ ＰＴＣ ２００、ＭＪ Ｒｅｓｅａｒｃｈ）。８μＬのＤＮＡローティングバッファを２０μＬのＰＣＲ産物試料に添加し、５分間変性し、これをゲルにローディングさせるまで氷上で保持した。２０００Ｖ、６０Ｗ、３０ｍＡで１時間４０分間、スラブゲルシステム（Ｈｉｔａｃｈｉ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｙｓｔｅｍｓ）で０．４ｍｍ厚の６％ポリアクリルアミド（Ｌｏｎｇ Ｒａｎｇｅｒ）／７Ｍ 尿素シーケンシングゲルを用いて、各３．５μＬを分離した。電気泳動完了後、適切なＦＭＢＩＯ ＩＩ Ａｎａｌｙｓｉｓ ８．０ソフトウェアを用いて、ＦＭＢＩＯ ＩＩ 蛍光スキャナー（Ｈｉｔａｃｈｉ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｙｓｔｅｍｓ）でゲルをスキャンした。原寸大の写真をプリントし、差次発現されたバンドにしるしをつけ、ゲルから切り取り、１．５ｍＬ容器に移し、２００μＬの滅菌水をかぶせ、これを抽出まで−２０℃で保存した。

ＤＤ産物の溶離および再増幅： ２００μＬのＨ_２Ｏ中で１０分間沸騰させ、氷上で冷却し、エタノール（Ｍｅｒｃｋ）およびグリコーゲン／酢酸ナトリウム（Ｍｅｒｃｋ）の使用により−２０℃で一晩、上清液から沈降させ、この後、１３．０００ｒｐｍで２５分間、４℃で遠心分離することにより、ゲルから差次的バンドを抽出した。ペレットを氷冷エタノール（８０％）で２回洗浄し、１０ｍＭのＴｒｉｓ ｐＨ８．３（Ｍｅｒｃｋ）に再び懸濁させ、０．０２５μｍのＶＳＷＰ膜（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）を用いて室温で１時間、１０％グリセロール（Ｍｅｒｃｋ）で透析した。９４℃で５分間の最初のラウンド、この後の、９４℃で４５秒間、６０℃で４５秒間、１℃／秒で７０℃にして７０℃で４５秒間という１５のサイクルおよび１回の７２℃で５分間の最終工程を除き、ＤＤ ＰＣＲ（上記参照）と同じ条件下で、ＤＤ ＰＣＲのために使用したような対応するプライマー対を含有する２５μＬのＰＣＲ混合物中において１５回の高ストリンジェンシーサイクルによる再増幅をするために、テンプレートとして得られた試料を使用した。

ＤＤ産物のクローニングおよび配列決定： 再増幅したｃＤＮＡをＤＮＡ ＬａｂＣｈｉｐシステム（Ａｇｉｌｅｎｔ ２１００ Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ、Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で分析し、製造業者のインストラクションに従って、ｐＣＲ−Ｂｌｕｎｔ ＩＩ−ＴＯＰＯベクターにライゲートし、大腸菌Ｔｏｐ１０Ｆ’細胞に形質転換した（Ｚｅｒｏ Ｂｌｕｎｔ ＴＯＰＯ ＰＣＲ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｋｉｔ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）。クローニングしたｃＤＮＡフラグメントを、市販の配列決定プログラムにより配列決定した。ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子についてのこうしたＦＤＤ実験の結果を図１に示す。

（ｉｖ）定量的ＲＴ−ＰＣＲによる差次的発現の確認：
ＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（Ｒｏｃｈｅ）を使用して、差次的ＫＣＮＪ６遺伝子発現の明確な実証を行った。この技法は、ポリメラーゼ連鎖反応の高速熱サイクリング、ならびに増幅中の蛍光シグナルの現時間測定を特徴とし、従って、終点読み出しではなく反応速度を利用することによりＲＴ−ＰＣＲ産物の非常に正確な定性を可能ならしめる。ＡＤ患者および同年齢対照健常者の側頭皮質からのＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡの比率、ＡＤ患者および同年齢の対照健常者の前頭皮質からのＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡの比率、ならびにＡＤ患者および同年齢の対照健常者の側頭皮質および前頭皮質からのＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡそれぞれの比率を決定した（相対特定）。

ＫＣＮＪ６の前頭皮質組織（Ｆ）と下側頭皮質組織（Ｔ）の間のｍＲＮＡ発現プロファイリングを、１つのＢｒａａｋ期につき４個から９個までの組織で分析した。Ｂｒａａｋ ３病理を有する１人のドナーからの高品質な組織がなかったため、Ｂｒａａｋ ２病理を有する１人の追加ドナーの組織を含め、ならびにＢｒａａｋ ６病理を有する１人のドナーからの高品質な組織がなかったため、Ｂｒａａｋ ５病理を有する１人の追加ドナーの組織サンプルを含めた。

プロファイリングの分析には、２つの一般的なアプローチを適用した。ＡＤ生理へのＫＣＮＪ６の関連性の複雑な考察の一助となる両方の比較プロファイリング研究（下側頭皮質に対して前頭皮質、ならびにＡＤ患者に対して対照）を下に詳説する。

１）対照およびＡＤ患者それぞれの前頭皮質組織と下側頭皮質との間のｍＲＮＡ発現の相対比較。

このアプローチによって、この特定された遺伝子ＫＣＮＪ６が、易損性の低い方の組織（前頭皮質）の変性からの防護に関与している、または易損性の高いほうの組織（下側頭皮質）における変性プロセスの増進に関与していることを証明することができる。

先ず、標準曲線を作製して、ＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の特異的プライマーでのＰＣＲの効率を判定する：プライマーＡ、配列番号５、５’−ＣＡＴＴＴＧＴＧＧＣＣＣＡＡＧＣＣＴ−３’（配列番号２のヌクレオチド２１４８から２１６５）およびプライマーＢ、配列番号６、３’−ＡＣＣＴＧＧＧＡＴＡＴＧＡＣＡＡＧＣＡＡＧＧ−５’（配列番号２のヌクレオチド２２７１から２２９２）。ＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ−ＦａｓｔＳｔａｒｔ ＤＮＡ Ｍａｓｔｅｒ ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ Ｉ ｍｉｘ（ＦａｓｔＳｔａｒｔ Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ、反応バッファ、ｄＴＴＰではなくｄＵＴＰを伴うｄＮＴＰミックス、ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ Ｉ色素、および１ｍＭのＭｇＣｌ_２を含有する；Ｒｏｃｈｅ）、０．５μＭのプライマー、２μＬのｃＤＮＡ稀釈系（最終濃度４０、２０、１０、５、１および０．５ｎｇのヒト全脳ｃＤＮＡ；Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）および使用するプライマーによっては追加で３ｍＭのＭｇＣｌ_２を含有する２０μＬの体積で、ＰＣＲ増幅（９５℃および１秒、５６℃および５秒、ならびに７２℃および５秒）を行った。溶融曲線分析は、約８１．５℃で単一ピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物の質およびサイズを、ＤＮＡ ＬａｂＣｈｉｐシステム（Ａｇｉｌｅｎｔ ２１００ Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ、Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で判定した。サンプルの電気泳動図では、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子についての１４５ｂｐの予測サイズで単一ピークが観察された。

類似に、ＰＣＲプロトコルを、定量のための標準試料として選択した１セットの標準遺伝子のＰＣＲ効率の判定に適用した。本発明では、５つのこうした標準遺伝子の平均値を決定した：（１）シクロフィリンＢ、ＭｇＣｌ_２を除き（３ｍＭではなく追加で１ｍＭを添加した）、特異的プライマー 配列番号７、５’−ＡＣＴＧＡＡＧＣＡＣＴＡＣＧＧＧＣＣＴＧ−３’および配列番号８、５’−ＡＧＣＣＧＴＴＧＧＴＧＴＣＴＴＴＧＣＣ−３’を使用。溶融曲線分析は、約８７℃で単一のピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物のアガロースゲル分析は、予想サイズ（６２ｂｐ）の単一バンドを１つ示した。（２）リボソーム蛋白Ｓ９（ＲＰＳ９）、特異的プライマー 配列番号９、５’−ＧＧＴＣＡＡＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＧＣＣＡ−３’および配列番号１０、５’−ＴＣＴＣＡＴＣＡＡＧＣＧＴＣＡＧＣＡＧＴＴＣ−３’（例外：３ｍＭではなく追加で１ｍＭのＭｇＣｌ_２を添加した）。溶融曲線は、約８５℃で単一ピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物のアガロースゲル分析は、予測サイズ（６２ｂｐ）を有する単一バンドを１つ示した。（３）ベータ−アクチン、特異的プライマー 配列番号１１、５’−ＴＧＧＡＡＣＧＧＴＧＡＡＧＧＴＧＡＣＡ−３’および配列番号１２、５’−ＧＧＣＡＡＧＧＧＡＣＴＴＣＣＴＧＴＡＡ−３’を使用。溶融曲線は、約８７℃で単一ピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物のアガロースゲル分析は、予測サイズ（１４２ｂｐ）を有する単一バンドを１つ示した。（４）ＧＡＰＤＨ、特異的プライマー 配列番号１３、５’−ＣＧＴＣＡＴＧＧＧＴＧＴＧＡＡＣＣＡＴＧ−３’および配列番号１４、５’−ＧＣＴＡＡＧＣＡＧＴＴＧＧＴＧＧＴＧＣＡＧ−３’を使用。溶融曲線は、約８３℃で単一ピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物のアガロースゲル分析は、予測サイズ（８１ｂｐ）を有する単一バンドを１つ示した。（５）トランスフェリン受容体 ＴＲＲ、特異的プライマー 配列番号１５、５’−ＧＴＣＧＣＴＧＧＴＣＡＧＴＴＣＧＴＧＡＴＴ−３’および配列番号１６、５’−ＡＧＣＡＧＴＴＧＧＣＴＧＴＴＧＴＡＣＣＴＣＴＣ−３’を使用。溶融曲線は、約８３℃で単一ピークを示し、プライマー二量体は見えなかった。ＰＣＲ産物のアガロースゲル分析は、予測サイズ（８０ｂｐ）を有する単一バンドを１つ示した。

値を計算するために、先ず、ｃＤＮＡ濃度の対数を、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子および５つの標準試料遺伝子についての閾値サイクル数Ｃ_ｔに対してプロットした。この標準曲線の傾きおよび切片（すなわち線形回帰）をすべての遺伝子について計算した。第二工程では、ＡＤ患者および対照健常者の前頭皮質からのｃＤＮＡ、ＡＤ患者および対照健常者の側頭皮質からのｃＤＮＡ、ならびにＡＤ患者および対照健常者の前頭皮質および側頭皮質からのｃＤＮＡ、それぞれを、並行して分析し、シクロフィリンＢに正規化した。Ｃ_ｔ値を測定し、対応する標準曲線：
１０＾（Ｃ_ｔ値−切片）／傾き ［ｎｇ全脳ｃＤＮＡ］
を用いてｎｇ全脳ｃＤＮＡに変換した。

側頭および前頭皮質ＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡについての値、ならびにＡＤ患者（Ｐ）および対照者（Ｃ）の前頭皮質ＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡについての値、ならびにＡＤ患者（Ｐ）および対照者（Ｃ）の側頭皮質ＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡについての値、それぞれを、シクロフィリンＢに正規化し、式：

に従って比を計算した。

第三工程では、標準曲線遺伝子のセットを並行して分析して、個々の脳サンプル各々についての標準試料遺伝子の発現レベルについて、ＡＤ患者対対照者側頭皮質比の平均値、ＡＤ患者対対照者前頭皮質比の平均値、ならびにＡＤ患者および対照者それぞれの側頭対前頭比の平均値を決定した。シクロフィリンＢを第二および第三工程で分析し、遺伝子間の比が異なるランで一定のままであったので、ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の値を、ある単一遺伝子のみに正規化するのではなく、標準試料遺伝子のセットの平均値に正規化することができた。計算は、上に示したそれぞれの比をすべてのハウスキーピング遺伝子の平均値からのシクロフィリンＢの偏差で割ることによって行った。ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子についてのこうした定量的ＲＴ−ＰＣＲ分析の結果を図２、３、１１に示す。

２）対照とＡＤ患者とのｍＲＮＡ発現の比較
この分析のために、異なる時点での異なる実験間の現時間定量的ＰＣＲの絶対値（Ｌｉｇｈｔｃｙｃｌｅｒ法）に、定量的比較に用いることができる十分な一貫性があり、較正の必要がないことを証明した。１００を超える組織についてのＥＮＳ ｑＰＣＲ実験のいずれにおいても、正規化のための標準物質としてシクロフィリンを使用した。中でも、これが、本発明者らの正規化実験において最も一貫して発現されるハウスキーピング遺伝子であることが判った。このため、シクロフィリンに対して生じさせた値を用いて概念の証明を行った。

最初の分析には、３人の異なるドナーからの前頭皮質および下側頭皮質組織のｑＰＣＲ実験からのシクロフィリン値を用いた。各組織からの同じｃＤＮＡ試料をすべての分析実験で用いた。デー多数が少なかったため、この分析の範囲内で値の正規分布を得ることができなかった。このため、中央値およびこの９８％信頼レベルの方法を適用した。この分析は、絶対値の比較について中央値から８．７％の中央偏差、および相対比較について中央値からの６．６％の中央偏差を示した。

第二の分析には、２人の異なるドナー各々からの前頭皮質および下側頭皮質のｑＰＣＲ実験からのシクロフィリン値を用いたが、異なる時点からの異なるｃＤＮＡ試料を用いた。この分析は、絶対値の比較について中央値からの２９．２％の中央偏差、および相対比較について中央値からの１７．６％の中央偏差を示した。この分析から、ｑＰＣＲ実験からの絶対値を用いることができるが、中央値からの中央偏差をさらに考慮に入れなければならいという結論を下した。ＫＣＮＪ６について絶対値の詳細な分析を行った。従って、ＫＣＮＪ６の絶対レベルは、シクロフィリンでの相対正規化後に用いた。対照群（Ｂｒａａｋ ０からＢｒａａｋ ３）および患者群（Ｂｒａａｋ ４からＢｒａａｋ ６）、それぞれについて、中央値ならびに９８％信頼レベルを計算した。同じ分析を行って、対照群（Ｂｒａａｋ ０からＢｒａａｋ ２）および患者群（Ｂｒａａｋ ３からＢｒａａｋ ６）を再定義し、ならびに対照群（Ｂｒａａｋ ０からＢｒａａｋ １）および患者群（Ｂｒａａｋ ２からＢｒａａｋ ６）を再定義した。後者の分析は、対照とＡＤ患者の間のｍＲＮＡ発現の差異の早期発生を特定するためのものであった。この分析のもう１つの意図として、Ｂｒａａｋ期０から１、Ｂｒａａｋ期２から３およびＢｒａａｋ期４から６それぞれを含む３つの群を互いに比較して、遺伝子発現の調節ならびに差異の早期発生の傾向を特定した。上で説明した前記分析を図３に示す。

（ｖ）免疫ブロッティング：
氷上、１ｍｌのＲＩＰＡバッファ（１５０ｍＭの塩化ナトリウム、５０ｍＭのｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４）、１ｍＭのエチレンジアミン四酢酸、１ｍＭのフッ化フェニルメチルスルホニル、１％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００、１％ デオキシコール酸ナトリウム、１％ ドデシル硫酸ナトリウム、５μｇ／ｍＬのアプロチニン、５μｇ／ｍＬのロイペプチン）中で均一化することにより、Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃを安定的に発現しているＨ４ＡＰＰｓｗ細胞から全蛋白質抽出物を得た。５分間、３０００ｒｐｍ、４℃で２回、遠心分離した後、上清をＳＤＳ−ローディングバッファで５倍稀釈した。１２μＬの稀釈サンプルのアリコートをＳＤＳ−ＰＡＧＥ（８％ ポリアクリルアミド）により分割し、ＰＶＤＦウエスタンブロッティング膜（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ）に移した。ブロットをウサギポリクローナル抗Ｋｉｒ３．２抗体（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ ｓｃ−１６１３５、１：２００）でプローブし、この後、ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合ヤギ抗ウサギＩｇＧ抗血清（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ ｓｃ−２０３０、１：５０００稀釈）でプローブし、ＥＣＬ化学発光検出キット（Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｐｈａｒｍａｃｉａ）で現像した（図１２）。

（ｖｉ）免疫蛍光分析：
細胞中のＫｉｒ３．２蛋白質の免疫蛍光染色には、スウェーデン突然変異（Ｋ６７０Ｎ、Ｍ６７１Ｌ）を有するヒトＡＰＰ６９５アイソフォームを安定的に発現するヒト神経膠腫細胞系統（Ｈ４細胞）を使用した（Ｈ４ＡＰＰｓｗ細胞）。強力なＣＭＶプロモータの制御下、Ｋｉｒ３．２のコード配列（Ｋｉｒ３．２ ｃｄｓ、１２７２ｂｐ、配列番号４）およびｍｙｃタグを含有するｐＦＢ−Ｎｅｏベクター（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ、＃２１７５６１）（ｐＦＢ−Ｎｅｏ−ＣＭＶ−Ｋｉｒ３．２ ｃｄ−ｍｙｃ、Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃベクター、８５４２ｂｐ）をＨ４ＡＰＰｓｗ細胞に形質導入した。Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃベクターの作製のために、Ｋｉｒ３．２ ｃｄｓ−ｍｙｃ配列をｐＦＢ−Ｎｅｏベクターの多重クローニング部位（ＭＣＳ）に導入した。Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃベクターでのＨ４ＡＰＰｓｗ細胞の形質導入には、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅからのレトロウイルス発現系ＶｉｒａＰｏｒｔを使用した。

ｍｙｃ標識Ｋｉｒ３．２過発現細胞（Ｈ４ＡＰＰｓｗ−Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃ）を細胞数５ｘ１０^４の密度で２４ウエルプレートのカバーガラス（デンマーク、ロスキレ（Ｒｏｓｋｉｌｄｅ）のＮｕｎｃ、＃１４３９８２）に接種し、３７℃、５％ ＣＯ_２で一晩インキュベートした。カバーガラスに細胞を固定するために、培地を除去し、冷却メタノール（−２０℃）を添加した。−２０℃で１５分のインキュベーション時間の後、メタノールを除去し、固定化した細胞を１時間、ブロッキング溶液（２００μＬのＰＢＳ／５％ ＢＳＡ／３％ヤギ血清）中、室温でブロックした。ＰＢＳ／１％ヤギ血清中の一次抗体（ポリクローナル抗ｍｙｃ抗体、ウサギ、１：５０００、ＭＢＬ）およびＤＡＰＩ（ＤＮＡ染料、０．０５μｇ／ｍＬ、１：１０００）を添加し、１時間、室温でインキュベートした。一次抗体除去後、これらの固定化細胞をＰＢＳで５分間、３回洗浄した。二次抗体（Ｃｙ３−コンジュゲート型抗ウサギ抗体、１：１０００、ドイツのＡｍｅｒｓｈａｍ Ｐｈａｒｍａｃｉａ）をブロッキング溶液に適用し、１時間、室温でインキュベートした。これらの細胞をＰＢＳ中で５分間、３回洗浄した。Ｐｅｒｍａｆｌｕｏｒ（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ）を使用してカバーガラスを顕微鏡スライドガラスに載せ、４℃で一晩保管して、封入剤を固まらせた。顕微鏡暗視野エピ蛍光および明視野位相差照明条件（１ｘ８１、オリンパス光学工業株式会社（現オリンパス株式会社）（Ｏｌｙｍｐｕｓ Ｏｐｔｉｃａｌ））を用いて細胞を視覚化した。顕微鏡画像（図１３）をＰＣＯ ＳｅｎｓｉＣａｍでデジタルコンピュータ処理し、適切なソフトウエア（ＡｎａｌｙＳｉＳ、オリンパス光学工業株式会社）分析した。

（ｖｉｉ）免疫組織化学：
ヒトの脳におけるＫＣＮＪ６、それぞれＫｉｒ３．２、の免疫蛍光染色のために、およびＡＤ罹患組織と対照組織の比較のために、様々なＢｒａａｋ期のアルツハイマー病と臨床診断され神経病理学的に確認された患者（図１４にＢｒａａｋ ５を例示する）ならびにアルツハイマー病に罹患していない同年齢対照者（図１４にＢｒａａｋ １を例示する）を含むドナーからの死後新鮮冷凍前頭および側頭前脳披検物を、クリオスタット（Ｌｅｉｃａ ＣＭ３０５０Ｓ）を使用して１４μｍ厚に切断した。これらの組織切片を空気乾燥させ、氷冷アセトン中で２０分間、または４％ ＰＦＡ中で１０分間、室温で固定化した。ＰＢＳ中で洗浄後、これらの切片をブロッキングバッファ（ＰＢＳ中、１０％ 正常ヤギ血清、０．２％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００）とともに３０分間プレインキュベートし、この後、親和精製ウサギポリクローナル抗Ｋｉｒ３．２抗体（ブロッキングバッファで１：１５稀釈；Ｕｐｓｔａｔｅ ０６−７９２；アミノ酸１８−４９）と共に一晩、４℃でインキュベートした。０．１％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００／ＰＢＳ中で３回すすいだ後、切片をＦＩＴＣ結合ヤギ抗ウサギＩｇＧ抗血清（Ｊａｃｋｓｏｎ／Ｄｉａｎｏｖａ、Ｎｏ．１１１−０９６−０４５、１％ ＢＳＡ／ＰＢＳ中で１：１５０稀釈）と共に２時間、室温でインキュベートし、この後、再びＰＢＳ中で洗浄した。核の染色は、ＰＢＳ中５μＭのＤＡＰＩと共に切片を３分間インキュベートすることによって行った。ニューロン細胞の染色は、ニューロン特異的マーカーＮｅｕＮに対するマウスモノクローナル抗体（Ｃｈｅｍｉｃｏｎ、ＭＡＢ３７７、１：４００稀釈）および二次Ｃｙ３コンジュゲート型ヤギ抗マウス抗体（Ｄｉａｎｏｖａ、１１５−１６６−０６２、１：６００希釈）を使用して行った（図１４にニューロン免疫活性を示す）。神経膠星状細胞の染色は、神経膠星状細胞特異的マーカーＧＦＡＰに対する抗体（Ａｂｃａｍ、ＡＢ７８０６、１：３００稀釈）を使用することによって行い、小神経膠細胞の染色は、小神経膠細胞特異的マーカーＣＤ６８に対する抗体（ＤＡＫＯ、Ｍ０７１８、１：２００希釈）を使用することによって行い、乏突起神経膠細胞特異的マーカーＣＮＰアーゼに対する抗体（Ｓｉｇｍａ、Ｃ５９２２、１：４００希釈）を使用することにより乏突起神経膠細胞を染色した。一般に、Ｋｉｒ３．２の免疫活性は、大脳皮質、ニューロン細胞体ならびに神経網および一部の近位樹状突起において主として観察される。Ｋｉｒ３．２免疫活性は、実際には神経膠星状細胞、ＣＤ６８陽性小神経膠細胞、ＣＮＰアーゼ陽性乏突起神経膠細胞では検出されず、ミエリンとの関連はなかった。人間の脳におけるリポフスチンの自発蛍光を阻害するために、切片を７０％エタノール中の１％スダンブラックＢで２から１０分間、室温で処理し、この後、７０％エタノール、蒸留水及びＰＢＳに順次浸漬した。「Ｖｅｃｔａｓｈｉｅｌｄ」封入剤（カリフォルニア州、ＢｕｒｌｉｎｇａｍｅのＶｅｃｔｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を用いてこれらの切片にカバーガラスを載せた。暗視野エピ蛍光および明視野位相差照明条件（１ｘ８１、オリンパス光学工業株式会社）を用いて、顕微鏡画像を得た。顕微鏡画像をＰＣＯ ＳｅｎｓｉＣａｍでデジタルコンピュータ処理し、適切なソフトウエア（ＡｎａｌｙＳＩＳ、オリンパス光学工業株式会社）を使用して分析した（図１３、１４参照）。

蛍光ディフェレンシャルディスプレイスクリーンにおけるＫｉｒ３．２蛋白質をコードするＫＣＮＪ６遺伝子の差次的発現の最初の特定を開示する図である。この図は、大量の分取蛍光ディフェレンシャルディスプレイゲルのクリッピングを示す。２人の健常対照被検者および６人のＡＤ患者の前頭皮質（Ｆ）および側頭皮質（Ｔ）からのＰＣＲ産物を二重重複で変性ポリアクリルアミドゲルに（左から右に）負荷した。ＰＣＲ産物は、個々のｃＤＮＡを対応する一塩基アンカー型オリゴヌクレオチドおよび特異的Ｃｙ３標識ランダムプライマーで増幅することによって得た。矢印は、健常対照と比較してＡＤ患者の前頭皮質および側頭皮質由来のＫＣＮＪ６遺伝子の転写産物にシグナル強度の有意な差が存在する泳動位置を示す。この差次的発現は、ＡＤ患者の前頭皮質と比較される側頭皮質におけるヒトＫＣＮＪ６遺伝子転写のダウンレギュレーション、発現減少を反映している。健常なＡＤでない対照被検者の側頭皮質および前頭皮質由来のシグナルを互いに比較したところシグナル強度に差はなく、すなわち、発現レベルの変更は検出できなかった。 定量ＲＴ−ＰＣＲ分析によるＡＤ脳組織におけるヒトＫＣＮＪ６遺伝子の差次的発現の検証を図示する図である。ＡＤ患者の前頭皮質（Ｆ）および側頭皮質（Ｔ）から採取したＲＮＡサンプル（図２ａ）ならびに健常な同年齢の対照者の前頭皮質（Ｆ）および側頭皮質からのサンプル（図２ｂ）からのＲＴ−ＰＣＲ産物の定量は、ＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ 高速熱サイクリング法によって行った。データは、遺伝子発現レベルに有意差を示さなかった標準遺伝子セットの総合平均値に正規化した。前記標準遺伝子セットは、シクロフィリンＢ、リボソーム蛋白Ｓ９、トランスフェリン受容体、ＧＡＰＤＨおよびベータ−アクチンについての遺伝子から成る。これらの図は、この蛍光によって測定されるような増幅材料の量に対してサイクル数をプロットすることにより増幅速度を図示している。反応の指数関数期中の正常な対照者の前頭および側頭皮質からのＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡの増幅速度は、並列であり（図２ｂ、矢印の先）、これに対してアルツハイマー病（図２ａ、矢印の先）では、これらに対応する曲線が有意に離れていることに注目すべきであり、これは、分析したそれぞれの脳領域におけるＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の差次的発現を示し、これは、異常調節、好ましくは、前頭皮質に対して側頭皮質でのヒトＫＣＮＪ６遺伝子の転写産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体のダウンレギュレーション、または側頭皮質に対して前頭皮質でのヒトＫＣＮＪ６遺伝子の転写産物のアップレギュレーションを示す。 ９８％信頼レベルでの中央値の統計的方法を用いる対照およびＡＤ期の比較によるＫＣＮＪ６の絶対ｍＲＮＡ発現の分析を示す図である。Ｂｒａａｋ期０から１、Ｂｒａａｋ期０から２またはＢｒａａｋ期０から３のいずれかの被検者を含む対照群を定義することによりデータを計算した。これらを、それぞれＢｒａａｋ期２から６、Ｂｒａａｋ期３から６およびＢｒａａｋ期４から６を含む被定義ＡＤ患者群について計算したデータと比較する。加えて、Ｂｒａａｋ期０から１、Ｂｒａａｋ期２から３およびＢｒａａｋ期４から６の被検者をそれぞれ含む３つの群を互いに比較した。ＡＤ患者および健常な同年齢の対照者の前頭皮質（Ｆ）および下側頭皮質（Ｔ）を互いに比較すると、有意差が検出された。前記の差は、対照者の側頭皮質に対してＡＤ患者の側頭皮質でのＫＣＮＪ６のダウンレギュレーション、およびＡＤ患者の側頭皮質における自身の前頭皮質と比較したＫＣＮＪ６のダウンレギュレーションを反映している。 配列番号１；ヒトＫＣＮＪ６蛋白質Ｋｉｒ３．２のアミノ酸配列（ジェンバンクアクセッション番号Ｐ４８０５１）を開示する図である。完全長ヒトＫｉｒ３．２蛋白質は、４３２のアミノ酸を含む。 配列番号２；２５９８個のヌクレオチドを含む、Ｋｉｒ３．２蛋白質をコードするヒトＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（ジェンバンクアクセッション番号Ｕ５２１５３）を示す図である。 配列番号２；２５９８個のヌクレオチドを含む、Ｋｉｒ３．２蛋白質をコードするヒトＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（ジェンバンクアクセッション番号Ｕ５２１５３）を示す図である。 配列番号３；ディフェレンシャルディスプレイおよびこの後のクローニングによって特定され、得られた、５７ｂｐのＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡフラグメントのヌクレオチド配列（５’から３’方向での配列）を図示する図である。 配列番号４のヌクレオチド配列；１２７２個のヌクレオチドを含み、配列番号２のヌクレオチド６５２から１９２３を含有するヒトＫＣＮＪ６遺伝子のコード配列（ｃｄｓ）を示す図である。 ＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡのヌクレオチド配列、配列番号２に対する配列番号３の配列アラインメントの略図である。 配列番号２、Ｋｉｒ３．２ ｃＤＮＡの対応するクリッピングを伴う定量的ＲＴ−ＰＣＲによるＫＣＮＪ６転写レベルのプロファイリングに使用したプライマー（プライマーＡ、配列番号５、およびプライマーＢ、配列番号６）の配列アラインメントを図示する図である。 ＫＣＮＪ６ ｃＤＮＡ 配列番号２、特定されたｃＤＮＡフラグメント 配列番号３、ＫＣＮＪ６転写レベルのプロファイリングに使用した両方のプライマー配列（プライマーＡ、配列番号５、プライマーＢ、配列番号６）およびＫＣＮＪ６のコード配列（ｃｄｓ）のアラインメントの略図である。配列位置を右側に示す。 ここでは内部参照番号Ｐ０１０、Ｐ０１１、Ｐ０１２、Ｐ０１４、Ｐ０１６、Ｐ０１７、Ｐ０１９、Ｐ０３８、Ｐ０４０、Ｐ０４１、Ｐ０４２、Ｐ０４６、Ｐ０４７、Ｐ０４８、Ｐ０４９によって識別される、１５人のＡＤ患者および２６人の同年齢対照者（ここでは、内部参照番号Ｃ００５、Ｃ００８、Ｃ０１１、Ｃ０１２、Ｃ０１４、Ｃ０２５、Ｃ０２６、Ｃ０２７、Ｃ０２８、Ｃ０２９、Ｃ０３０、Ｃ０３１、Ｃ０３２、Ｃ０３３、Ｃ０３４、Ｃ０３５、Ｃ０３６、Ｃ０３７、Ｃ０３８、Ｃ０３９、Ｃ０４１、Ｃ０４２、ＤＥ０２、ＤＥ０３、ＤＥ０５、ＤＥ０７によって識別される）における前頭皮質に対する側頭皮質におけるＫＣＮＪ６遺伝子発現レベルを列挙する図である。側頭皮質におけるアップレギュレーションについて示す値は、本明細書で説明する式（下記参照）に従って計算し、側頭皮質のアップレギュレーションの場合、逆数値をそれぞれ計算した。側頭皮質におけるダウンレギュレーション、前頭皮質におけるアップレギュレーションを反映する明らかな差を示す。棒グラフは、異なるＢｒａａｋ期（０から６）における前頭皮質に対する側頭皮質の個々の自然対数値、ｌｎ（ＩＴ／ＩＦ）、および側頭皮質調節因子に対する前頭皮質調節因子の自然対数値、ｌｎ（ＩＦ／ＩＴ）を視覚化するものである。 ポリクローナル抗Ｋｉｒ３．２抗体（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ ｓｃ１６１３５、１：２００）で標識した全細胞蛋白質抽出物のウエスタンブロット画像を図示する図である。 レーンＡおよびＢ：ｍｙｃタグで標識したＫｉｒ３．２を安定的に発現しているＨ４ＡＰＰｓｗ細胞（Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃ、Ｂ）およびｍｙｃ標識対照Ｈ４ＡＰＰｓｗ細胞（Ａ）の全細胞抽出物。矢印は、Ｋｉｒ３．２蛋白質の予測分子量に対応する約４５ｋＤａ（レーンＡ）での主バンドを示す。 Ｈ４ＡＰＰｓｗ対照細胞、およびｍｙｃ標識Ｋｉｒ３．２蛋白質を安定的に過発現しているＨ４ＡＰＰｓｗ細胞（Ｈ４ＡＰＰｓｗ−Ｋｉｒ３．２ ｃｄｓ−ｍｙｃ）の免疫蛍光分析を示す図である。Ｋｉｒ３．２−ｍｙｃ蛋白質は、抗ｍｙｃ抗体（ＭＢＬ）およびＣｙ３コンジュゲート型抗ウサギ抗体（Ａｍｅｒｓｈａｍ）で検出した（図１３Ａおよび１３Ｂ）。細胞核は、ＤＡＰＩで染色した（図１３Ｃおよび１３Ｄ）。オーバーレイ解析は、Ｋｉｒ３．２ｃｄｓ−ｍｙｃ蛋白質が、小胞体および小胞内の原型質膜に主として局在し（図１３Ｅ）、ならびにＨ４ＡＰＰｓｗ対照細胞と比較すると、Ｈ４ＡＰＰｓｗ−Ｋｉｒ３．２ ｃｄｓ−ｍｙｃ形質導入細胞の９０％より多くで過発現されること（図１３Ｆ）を示す。 対照ドナー（対照Ｂｒａａｋ １）からおよびアルツハイマー病に罹患している人（Ｂｒａａｋ ５）の患者からの下側頭回（ＩＴ、下のほうのパネル）および前頭皮質（Ｆ）の切片からデジタル撮影した電子顕微鏡写真を例示する図である。組織切片を親和精製ウサギポリクローナル抗Ｋｉｒ３．２抗体（Ｕｐｓｔａｔｅ、０６−７９２、１：１５、シグナル）で免疫標識する（倍率１０倍）。ここで例示するデータは、Ｋｉｒ３．２免疫反応性の強度および量のレベルが、対照者（Ｂｒｒａｋ １）からの下側頭皮質と比較して患者（Ｂｒａａｋ期５）からの下側頭皮質では低下していることを示している。これらの発見は、ＫＣＮＪ６翻訳産物、すなわちＫｉｒ３．２蛋白質、のレベルを表すニューロンＫｉｒ３．２免疫反応性が、対照健常者の側頭皮質と比較すると、ＡＤに罹患している患者からの側頭皮質では顕著に低下していることを示している。Ｋｉｒ３．２免疫活性のこのＡＤに関連する減少は、Ｂｒａａｋ期が進むと共に顕著になり、これは、ＡＤの経過、すなわちＡＤ病理の進行が、ＡＤ神経変性変化を随伴する、またはＡＤ神経変性変化の後に起こる、またはＡＤ神経変性変化より先にでさえ起こるＫｉｒ３．２発現の強い減少に反映されることを示している。側頭皮質（Ｔ）、前頭皮質（Ｆ）、対照健常者（対照）、アルツハイマー病患者（患者）。

Claims (12)

1. 被検者においてアルツハイマー病を診断もしくは予後判定する、または被検者が、前記疾病を発現するリスクが増大した状態にあるかどうかを判定する方法であって、
   前記被検者から得られたサンプルにおいて、
   （ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物の、および／または
   （ｉｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物の、および／または
   （ｉｉｉ）前記転写もしくは翻訳産物のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体
   のレベルおよび／または活性を判定すること；ならびに前記転写産物および／または前記翻訳産物の前記レベルおよび／または前記活性を、疾病と認められる状態を表す基準値および／または健常と認められる状態を表す基準値と比較することを含み；ならびに前記レベルおよび／または前記活性が、健常と認められる状態を表す基準値と比較して変化している、および／または疾病と認められる状態を表す基準値と類似しているもしくは同等であることによって、前記被検者のアルツハイマー病を診断もしくは予後判定する、または前記被検者が、前記疾病を発現するリスクが増大した状態にあるかどうかを判定することを含む、前記方法。
2. （ｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物および／またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を検出する試薬、および／または（ｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物および／またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を検出する試薬、から成る群より選択される少なくとも１つの試薬を含む、被検者において神経変性疾患、特にアルツハイマー病を診断もしくは予後判定する、またはこうした疾病を発現する被検者の傾向もしくは素因を判定するためのキット。
3. （ｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または
   （ｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または
   （ｉｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または
   （ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体
   から成る群より選択される少なくとも１つの物質の活性および／またはレベルの変調因子。
4. （ｉ）遺伝子配列および選択可能なマーカー配列を含む遺伝子ターゲティング構築物を提供する工程、
   （ｉｉ）前記ターゲティング構築物を非ヒト動物の幹細胞に導入する工程、
   （ｉｉｉ）前記非ヒト動物幹細胞を非ヒト胚に導入する工程、
   （ｉｖ）前記胚を偽妊娠非ヒト動物に移植する工程、
   （ｖ）前記胚を満期まで発達させる工程、
   （ｖｉ）ゲノムが両方の対立遺伝子に前記遺伝子配列の修飾を含む、遺伝子改変非ヒト動物を特定する工程、
   （ｖｉｉ）工程（ｖｉ）の遺伝子改変非ヒト動物を繁殖させて、ゲノムが前記内因性遺伝子の修飾を含む遺伝子改変非ヒト動物を得る工程（この場合、前記破壊が、神経変性疾患または関連疾患もしくは障害の症状を発現する素因を示す前記非ヒト動物を生じさせる）
   によって得られる、配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする非天然遺伝子配列またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を含む組換え非ヒト動物。
5. 神経変性疾患、特にアルツハイマー病、を治療するための診断薬および治療薬の開発の際に化合物、薬剤および変調因子をスクリーニング、試験および評価するための、請求項４に記載の組換え非ヒト動物の使用。
6. （ｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または
   （ｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または
   （ｉｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または
   （ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体
   から成る群より選択される１つまたはそれ以上の物質の神経変性疾患、特にアルツハイマー病、または関連疾患もしくは障害の変調因子をスクリーニングするためのアッセイであって、
   前記方法が、
   （ａ）細胞を試験化合物と接触させる工程、
   （ｂ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性および／またはレベルを測定する工程、
   （ｃ）前記試験化合物と接触させていない対照細胞において、（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性および／またはレベルを測定する工程；ならびに工程（ｂ）および（ｃ）の細胞における前記物質のレベルおよび／または活性を比較する工程
   を含み、接触させた細胞における物質の活性および／またはレベルの変更が、この試験化合物が前記疾患または障害の変調因子であることを示すアッセイ。
7. （ｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子、および／または
   （ｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の転写産物、および／または
   （ｉｉｉ）配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質をコードする遺伝子の翻訳産物、および／または
   （ｉｖ）（ｉ）から（ｉｉｉ）のフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体
   から成る群より選択される１つまたはそれ以上の物質の神経変性疾患、特にアルツハイマー病、または関連疾患もしくは障害の変調因子をスクリーニングする方法であって、
   （ａ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した物質に関して神経変性疾患または関連疾患もしくは障害の症状を発現する素因があるまたは既に発現している非ヒト試験動物に試験化合物を投与する工程；
   （ｂ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性および／またはレベルを測定する工程；
   （ｃ）（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した物質に関して神経変性疾患または関連疾患もしくは障害の症状を発現する素因があるまたは既に発現しおり、こうした試験化合物の投与を受けたことがない対応非ヒト対照動物において、（ｉ）から（ｉｖ）に列挙した１つまたはそれ以上の物質の活性および／またはレベルを測定する工程；
   （ｄ）工程（ｂ）および（ｃ）の動物において前記物質の活性および／またはレベルを比較する工程（この場合、非ヒト試験動物における物質の活性および／またはレベルの変更は、この試験化合物が前記疾患または障害の変調因子であることを示す）
   を含む方法。
8. 前記非ヒト試験動物および／または前記非ヒト対照動物が、天然ＫＣＮＪ６遺伝子転写制御要素でない転写制御要素の制御下で、配列番号１を有するＫＣＮＪ６またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体を発現する組換え動物である、請求項７に記載の方法。
9. （ｉ）ＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体の懸濁液を多数の容器に添加する工程；
   （ｉｉ）１つの検出可能な、特に、蛍光標識された化合物、または結合についてスクリーニングされる、多数の検出可能な、特に、蛍光標識された化合物を、前記多数の容器に添加する工程；
   （ｉｉｉ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質または前記フラグメントもしくは誘導体もしくは変異体、および前記検出可能な、特に、蛍光標識された化合物（単数）または検出可能な、特に、蛍光標識された化合物（複数）をインキュベートする工程；
   （ｉｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質に、または前記フラグメントもしくは誘導体もしくは変異体に結合する好ましくは蛍光の量を測定する工程；ならびに
   （ｖ）前記ＫＣＮＪ６蛋白質または前記フラグメントもしくは誘導体もしくは変異体への１つまたはそれ以上の前記化合物による結合度を判定する工程
   を含む、配列番号１を有するＫＣＮＪ６蛋白質またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体への化合物の結合度を判定するために化合物を試験する、好ましくは多数の化合物をスクリーングするためのアッセイ。
10. 神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病を検出するための診断ターゲットとしての、配列番号１を有するＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である、蛋白質分子の使用。
11. 神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病を予防または治療または改善する試薬または化合物についてのスクリーニングターゲットとしての、配列番号１を有するＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である、蛋白質分子の使用。
12. 抗体での細胞の免疫細胞化学的染色を含み、健常と認められる状態を表す細胞と比較して変更された前期細胞の染色度または変化した染色パタンが、アルツハイマー病に関係する前記細胞の病的状態を示す、被検者から得たサンプルにおける細胞の病的状態を検出するための、免疫原と特異的に免疫反応する抗体（この場合、前記免疫原は、配列番号１を有するＫＣＮＪ６をコードする遺伝子の翻訳産物またはこのフラグメントもしくは誘導体もしくは変異体である）の使用。

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