JP2007508810A - スルホトランスフェラーゼの神経変性疾患に関する診断的および治療的使用 - Google Patents
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Abstract
Description
(a)(i)SULT4A1をコードする遺伝子の転写産物を選択的に検出する試薬(ii)SULT4A1をコードする遺伝子の翻訳産物を選択的に検出する試薬、から成る群から選択された少なくとも1つの試薬;および
(b)・前記被験者に由来する試料中の、SULT4A1をコードする遺伝子の前記転写産物および/または前記翻訳産物の、レベル、または活性、または前記レベルおよび前記活性の両方を検出する;および
・神経変性疾患、特にADを診断するかまたは予測診断する、および/またはそのような疾患を発症する前記被験者の傾向または素因を判定する
段階を記載することによる、神経変性疾患、特にADを診断するかまたは予測診断する、またはそのような疾患を発症する被験者の傾向または素因を判定するための指示
であって、既知の健康状態を表す参照値(対照)と比較した前記転写産物および/または前記翻訳産物の、変化したレベル、または活性、または前記レベルおよび前記活性の両方、および/または、既知の疾患状態、好ましくはADの疾患状態を表す参照値と同様であるかまたは等しい、前記転写産物および/または前記翻訳産物の、レベル、または活性、または前記レベルおよび前記活性の両方が、神経変性疾患、特にADの診断または予測診断、またはそのような疾患を発症する高い傾向または素因を示す。本発明に記載のキットは、神経変性疾患、特にADを発症するリスクがある人の特定に特に有用である可能性がある。
AD患者および対応する年齢の対照被験者由来の脳組織を死後6時間以内に採取し、直ちにドライアイス上で凍結した。診断の組織病理的確認のため、各組織からの試料切片はパラホルムアルデヒドで固定した。発現差の分析のための脳の部分を特定し、RNA抽出を実施するまで−80℃にて保存した。
総RNAは、RNeasyキット(キアゲン(Qiagen))を取扱説明書に従って使用することによって、死後脳組織から抽出した。正確なRNA濃度およびRNA品質は、DNAラブチップ(LabChip)系を用いてアジレント(Agilent)2100バイオアナライザー(アジレント・テクノロジーズ(Agilent Technologies))を使用して測定した。調製したRNAの追加の品質試験、すなわち部分分解の排除およびDNA混入に関する試験は、特に設計したイントロンGAPDHオリゴヌクレオチドおよび参照対照としてゲノムDNAを使用して、ライトサイクラー(LightCycler)技術を取扱説明書(ロシュ(Roche))に従って用いて融解曲線を作成した。
異なる組織における遺伝子発現の変化を特定するために、我々は改変および改良したディファレンシャル・ディスプレイ(DD)スクリーニング法を使用した。元のDDスクリーニング法は当業者に公知である(リャン(Liang)およびパーディー(Pardee),Science1995,267:1186−7)。この方法は、RNAの2つの集団を比較し、および一方の集団で発現されているが他方の集団では発現されていない遺伝子のクローンを提供する。いくつかの試料を同時に分析することができ、および同一の実験でアップおよびダウンレギュレートされる遺伝子の両方を特定できる。DD法でのいくつかの段階を調整および改良し、および技術的パラメーターを修正、たとえば冗長性を増大、総RNAの逆転写のための最適化された試薬および条件を評価、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)およびその産物の分離を最適化することによって、高再現性および高感度の結果を可能にする方法が開発された。その応用および改良されたDD法はフォン・デル・カマー(von der Kammer)ら(NucleicAcids Research1999,27:2211−2218)によって詳細に記載された。可能なすべてのRNA種の統計的に包括的な分析を達成するために、64種類の特に設計されたランダムプライマーの組が開発された(標準セット。さらに、蛍光標識化されたプライマーの使用に基づいて、本方法は修正されて調製用DDスラブゲル法を生じた。本発明では、AD患者および対応する年齢の対照被験者の注意深く選択された死後脳組織(前頭および側頭皮質)に由来するRNA集団を比較した。
再増幅されたcDNAをDNAラブチップ(LabChip)システム(アジレント2100バイオアナライザー、アジレント・テクノロジーズ(Agilent Technologies))で分析し、および取扱説明書に従ってPCR−ブラント(Blunt)II−TOPOベクターへライゲーションし、および大腸菌(E.coli)Top10F'細胞へ形質転換した(ゼロブラント(Zero Blunt)TOPO PCRクローニングキット、インビトロジェン(Invitrogen))。クローニングされたcDNA断片は市販の配列決定設備によって配列決定した。SULT4A1遺伝子についてのそのようなFDD実験の一つの結果を図1に示す。
側頭皮質対前頭皮質における、および海馬対前頭皮質におけるSULT4A1遺伝子発現、すなわちそれぞれSULT4A1sv1および/またはsv2およびSULT4A1sv1の差の裏付けを、ライトサイクラー(LightCycler)技術(ロシュ((Roche))を用いて実施した。この方法は、ポリメラーゼ連鎖反応についての迅速熱サイクリング、および増幅中の蛍光シグナルのリアルタイム測定を扱い、およびしたがって、終点計測値でなく動力学を用いたRT−PCR産物の高精度な定量を可能にする。AD患者のおよび対応する年齢の健常対照者の側頭皮質由来、AD患者のおよび対応する年齢の健常対照者の前頭皮質由来、AD患者および対応する年齢の健常対照者の海馬由来の、SULT4A1cDNAの比、およびAD患者のおよび対応する年齢の健常対照者の側頭皮質および前頭皮質由来のSULT4A1cDNAの比、およびAD患者のおよび対応する年齢の健常対照者の海馬および前頭皮質由来のSULT4A1cDNAの比をそれぞれ測定した(相対的定量)。
5'−CAAAGTGGTGGTCAGGAGGGT−3'(配列番号3、ヌクレオチド2064−2084;配列番号4、ヌクレオチド1725−1745)を用いて、および
5'−CCGTTTCAAATACAGCACCAAG−3'(配列番号3、ヌクレオチド2110−2131;配列番号4、ヌクレオチド1771−1792);
およびSULT4A1スプライス変異体1遺伝子だけに関する特異的プライマー:5'−CTGACCCCGATGAGATCG−3'(配列番号3、ヌクレオチド235−252)および5'−GGCAGGTGGCTCTTGATGA−3'(配列番号3、ヌクレオチド340−358);を用いて、
およびSULT4A1スプライス変異体2遺伝子だけに関する特異的プライマー:5'−TCACCTACCCCAAGTCCGT−3'(配列番号4、ヌクレオチド172−190)および5'−TTCATACTTGAGAAAAAGCACGT−3'(配列番号4、ヌクレオチド250−272)を用いて、標準曲線を作成した。
10^((Ct値−切片)/傾き) [ng総脳DNA]
SULT4A1側頭[ng]/シクロフィリンB側頭[ng]
比= −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
SULT4A1前頭[ng]/シクロフィリンB前頭[ng]
SULT4A1海馬[ng]/シクロフィリンB海馬[ng]
比= −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
SULT4A1前頭[ng]/シクロフィリンB前頭[ng]
SULT4A1(P)側頭[ng]/シクロフィリンB(P)側頭[ng]
比= −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
SULT4A1(C)側頭[ng]/シクロフィリンB(C)側頭[ng]
SULT4A1(P)前頭[ng]/シクロフィリンB(P)前頭[ng]
比= −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
SULT4A1(C)前頭[ng]/シクロフィリンB(C)前頭[ng]
この分析に関して、別の時点での別の実験間のリアルタイム定量PCR(ライトサイクラー(Lightcycler)法)の絶対値は、キャリブレーターを使用しない定量比較に用いるのに十分に一貫性があることが証明された。シクロフィリンを、100を超える組織について、qPCR実験のどれでも正規化のための標準物質として用いた。我々の正規化実験において、中でもシクロフィリンは最も一貫して発現されたハウスキーピング遺伝子であることが見出された。したがって、シクロフィリンに関して生じた値を用いることによって概念実証が行われた。
細胞中のSULT4A1タンパク質の免疫蛍光染色のために、スウェーデン変異を有するヒトAPP695アイソフォームを安定に発現する(K670N、M671L)ヒト神経膠腫細胞株(H4細胞)を使用した(H4APPsw細胞)。H4APPsw細胞に、SULT4A1のコード配列(配列番号6、855bp)およびmyc−タグを含むPFB−Neoベクター(ストラタジーン(Stratagene)、#217561、6.6kb)を用いて形質導入した(pFBNeo−SULT4A1cds−myc、SULT4A1ベクター、7483bp)。SULT4A1ベクターの作製については、SULT4A1cds−myc配列をPFB−Neoベクターのマルチクローニングサイト(MCS)のXhol−blunt/BamHI制限部位へ導入した。ForofthewiththeSULT4A1ベクターを用いたH4APPsw細胞の形質導入には、ストラタジーン(Stratagene)のレトロウイルス発現系バイラポート(ViraPort)を使用した。
SULT4A1タンパク質過剰発現細胞(実施例(v)に上述のSULT4A1細胞)に対する栄養因子欠乏の作用を分析するため、H4APPsw対照およびH4APPsw−SULT4A1−myc過剰発現細胞を、1.5x104細胞/mlの密度で96ウェルプレートに、DMEM(シグマ(Simga))、10%FCS(ギブコ(Gibco))およびペニシリン/ストレプトマイシン(ギブコ)中に播種した。37℃にてCO2条件(8.5%)下で一夜インキュベート後、培地をペニシリン/ストレプトマイシン含有DMEMに交換した。毒性について陽性対照として、0.06〜10mg/mlの範囲の12種類の濃度のクロロキン(シグマ)を、対照細胞へ、およびH4APPsw−SULT4A1−myc過剰発現細胞へ加えた(3連で)。毒性について陰性対照として、DMEM(シグマ)、10%FGS(ギブコ)およびペニシリン/ストレプトマイシン(ギブコ)を24ウェルの対照細胞およびH4APPsw−SULT4A1−myc過剰発現細胞へ加えた。栄養因子欠乏について、漸増濃度の血清(0、0.3、0.6、1.25、2.5、5%および7.5%)を含むDMEM、ペニシリン/ストレプトマイシンを対照細胞およびH4APPsw−SULT4A1−myc過剰細胞へ加えた(3連で)。37℃にてCO2条件(8.5%)下で40時間インキュベート後酸化還元指示薬アラーマーブルー(AlamarBlue)(バイオソース((BioSource))を加え、および相対蛍光(RFU)を4時間後に544nm(励起)および590nm(放出)にて、BMGフルオスター(Fluostar)検出器を用いて測定した。毒性の%はRFU平均値を用いて、下記の式を用いて計算した:
100x(RFU陰性対照−RFU毒性刺激)
%毒性= −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
(RFU陰性対照−RFU陽性対照)
グラフはグラフパッド・プリズム(GraphPad Prism)を用いて決定されている(シグモイド用量反応および可変勾配に合致する非線形回帰曲線)。
Sult4A1欠損マウスを下記の通りSult4A1構造を用いて作製した。ヒトSULT4A1遺伝子のホモログがマウスで見出されている。それはマウススルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1(Sult4A1)、別名S4A1(Unigene番号:Mm.248796;遺伝子ID:29859、遺伝子座NT_039621)である。マウスSult4A1遺伝子は第15染色体上に位置し、および284アミノ酸のタンパク質をコードする7個のエクソンから成り、および配列番号1に示すヒトSULT4A1配列と98%同一性を共有する。マウスSult4A1遺伝子についてはこれまでのところ、スプライス変異体は見出されていない。ヒトではSULT4A1遺伝子の別のスプライス変異体が発見されている。ヒトSULT4A1スプライス変異体1およびスプライス変異体2は本明細書に開示される。これらはマウス遺伝子と一部のホモロジーを共有するため、これらのスプライス変異体がマウス系にも存在することは度外視できない。マウスSult4A1タンパク質の機能ドメインは、エクソン1〜7からコードされるスルホトランスフェラーゼドメインである。そのドメイン内には、エクソン1、3および5上に位置する、スルホトランスフェラーゼの3個の保存されたアミノ酸モチーフ(ファラニー(Falany)ら,Biochem J.2000,857−864)を見出すことができる。
ヒトBACE遺伝子導入ハエおよびヒトSULT4A1遺伝子導入ハエを、グリーブら(Greeveら,J.Neurosci.2004,24:3899−3906)に従って、および本発明に記載の通り作製した。SULT4A1sv1のオープン・リーディング・フレーム全体(配列番号6)を含む918bpのNotl/BssHI−ブラント断片を、ベクターPLJASTNotl/Xbal−ブラントへGAL4結合部位UASの下流にサブクローニングした(ブランド(Brand)およびペリモン(Perrimon),Development 1993,118:401−15)。 Pエレメント媒介生殖細胞系列形質転換を、スプラドリング(Spradling)およびルビン(Rubin)によって記載された通り実施した(ルビンおよびスプラドリング,Science 1982,218:348−53;スプラドリングおよびルビン,Science 1982,218:341−7)。20の独立したヒトSULT4A1遺伝子導入ハエ系統を作製し、および3つの異なる系統を本分析に用いた。
Claims (17)
- 被験者において神経変性疾患を診断または予測診断する、または被験者が前記疾患を発症する高いリスクがあるかどうかを判定する、
前記被験者由来の試料中の
(i)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物、および/または
(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、および/または
(iii)前記転写または翻訳産物の断片、または誘導体、または変異体、
のレベルおよび/または活性を測定し、および前記レベルおよび/または前記活性を、既知の疾患または健康状態を表す参照値と比較し、それによって前記被験者において前記神経変性疾患を診断または予測診断すること、または前記被験者が前記神経変性疾患を発症する高いリスクがあるかどうかを判定すること
を含む方法。 - 前記神経変性疾患がアルツハイマー病である、請求項1に記載の方法。
- 前記細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1が細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1スプライス変異体1および/または細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1スプライス変異体2である、請求項1および2に記載の方法。
- 下記の段階(i)および(ii)によって、被験者において神経変性疾患、特にアルツハイマー病を診断または予測診断する、または被験者のそのような疾患を発症する傾向または素因を判定するためのキットであって、
(i)前記被験者に由来する試料中の、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物および/または翻訳産物の、レベル、または活性、または前記レベルおよび前記活性の両方を検出、および(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物および/または翻訳産物の前記レベルまたは活性、または前記レベルおよび前記活性の両方を、既知の健康状態を表す参照値とおよび/または既知の疾患状態を表す参照値と比較し、および前記転写産物および/または前記翻訳産物の前記レベル、または活性、または前記レベルおよび前記活性の両方が、既知の健康状態を表す参照値と比較して変化し、および/または既知の疾患状態を表す参照値と同様または等しい、
a)(i)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物を選択的に検出する試薬および(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物を選択的に検出する試薬、から成る群から選択された少なくとも一つの試薬
を含む前記キット。 - (i)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子、および/または
(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物、および/または
(iii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、および/または
(iv)(i)から(iii)の断片、または誘導体、または変異体
の活性および/またはレベルに直接的にまたは間接的に影響を及ぼす、治療的にまたは予防的に有効な量の一または複数の物質を被験者へ投与することを含む、被験者において神経変性疾患、特にアルツハイマー病を治療または予防する方法。 - 細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1、またはその断片、または誘導体、または変異体をコードする非天然遺伝子配列を含む、遺伝子操作非ヒト動物。
- 非ヒト動物が、哺乳類、好ましくはげっ歯類、より好ましくはマウス、ラットまたはモルモット、または非脊椎動物、好ましくは昆虫、より好ましくはショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)といったハエである、請求項6に記載の遺伝子操作非ヒト動物。
- 前記遺伝子操作の発現が、神経変性疾患に類似した神経病理の症状、特にADに類似した症状を発症する素因を示すおよび/または症状を示す前記非ヒト動物を結果として生じる、請求項6および7に記載の遺伝子操作非ヒト動物。
- 前記非ヒト動物を遺伝子操作するのに用いられた遺伝子の発現によって引き起こされた作用のために、前記遺伝子操作の発現が、神経変性疾患に類似した症状を発症するリスクが低い、特にADに類似した症状を発症するリスクが低い、および/またはAD症状の低減を示すおよび/またはADの症状を有しない前記非ヒト動物を結果として生じる、請求項6および7に記載の遺伝子操作非ヒト動物。
- 神経変性疾患、特にアルツハイマー病を治療するための診断薬および治療薬の開発において、化合物、物質、および調節因子を、スクリーニング、試験、および評価するための、請求項7から9に記載の遺伝子操作非ヒト動物の使用。
- 神経変性疾患、特にアルツハイマー病、または関連する疾患または障害の調節因子についての、
(i)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子、および/または
(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物、および/または
(iii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、および/または
(iv)(i)から(iii)の断片、または誘導体、または変異体
から成る群から選択された一種類以上の物質のスクリーニングのための測定法であって、
(a)細胞を被験化合物と接触させること;
(b)(i)から(iv)で列挙された一種類以上の物質の、活性および/またはレベルを測定すること;
(c)前記被験化合物と接触させていない対照細胞中の、(i)から(iv)で列挙された一種類以上の物質の、活性および/またはレベルを測定すること;および
(d)段階(b)および(c)の細胞中の物質のレベルおよび/または活性を比較すること(但し、接触させた細胞中の物質の活性および/またはレベルの変化は被験化合物が前記疾患または障害の調節因子であることを示す)
を含む前記方法。 - 神経変性疾患、特にアルツハイマー病、または関連する疾患または障害の調節因子についての、
(i)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子、および/または
(ii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の転写産物、および/または
(iii)細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、および/または
(iv)(i)から(iii)の断片、または誘導体、または変異体
から成る群から選択された一種類以上の物質のスクリーニングのための測定法であって、
(a)(i)から(iv)で列挙された一種類以上の物質に関して、神経変性疾患または関連する疾患または障害の症状を発症する素因があるかまたは既に発症している被験動物に、被験化合物を投与すること;
(b)(i)から(iv)で列挙された一種類以上の物質の、活性および/またはレベルを測定すること;
(c)(i)から(iv)で列挙された一種類以上の物質に関して、およびそのような被験化合物が投与されていない、神経変性疾患または関連する疾患または障害の症状を発症する素因があるかまたは既に発症している対応する対照動物において、(i)または(iv)で列挙された一種類以上の物質の活性および/またはレベルを測定すること;
(d)段階(b)および(c)の動物における物質の活性および/またはレベルを比較すること(但し、被験動物における物質の活性および/またはレベルの変化は被験化合物が前記疾患または障害の調節因子であることを示す)
を含む前記方法。 - 前記被験動物および/または前記対照動物が、天然の細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1遺伝子転写調節配列ではない転写調節配列の調節下にある、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子、またはその断片、または誘導体、または変異体を発現する遺伝子操作非ヒト動物である、請求項12に記載の方法。
- リガンドと、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1タンパク質、またはその断片、または誘導体、または変異体との間の結合の阻害について、化合物を試験するための、好ましくは複数の化合物をスクリーニングするための測定法であって、
(i)前記細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1タンパク質、またはその断片、または誘導体、または変異体の懸濁液を複数の容器に加える;
(ii)結合の前記阻害についてスクリーニングする一または複数の化合物を前記複数の容器に加える;
(iii)検出可能なリガンド、特に蛍光検出可能なリガンドを前記容器に加える;
(iv)前記細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1タンパク質、またはその前記断片、または誘導体、または変異体、および前記一または複数の化合物、および前記リガンドの懸濁液をインキュベートする;
(v)前記細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1タンパク質に、またはその前記断片、または誘導体、または変異体に結合した、検出可能なリガンド、好ましくは蛍光の量を測定する;および
(vi)前記リガンドの、前記細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1タンパク質、またはその前記断片、または誘導体、または変異体への結合の、一種類以上の前記化合物による阻害の程度を測定する
段階を含む前記測定法。 - 神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病を検出するための診断標的としての、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、またはその断片、または誘導体、または変異体である、配列番号1および/または配列番号2のタンパク質分子の使用。
- 神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病を予防する、または治療する、または改善する試薬または化合物についてのスクリーニング標的としての使用のための、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、またはその断片、または誘導体、または変異体である、配列番号1および/または配列番号2のタンパク質分子の使用。
- 被験者由来の試料中の細胞の病理状態を検出するための、免疫原と特異的に免疫反応性である抗体の使用であって、前記免疫原が、配列番号1および/または配列番号2の、細胞質スルホトランスフェラーゼファミリー4Aメンバー1をコードする遺伝子の翻訳産物、またはその断片、または誘導体、または変異体であり、前記抗体を用いた前記細胞の免疫細胞化学染色を含み、ここで既知の健康状態を表す細胞と比較した前記細胞における染色の程度の変化、または染色パターンの変化が、神経変性疾患、好ましくはアルツハイマー病と関係する前記細胞の病理状態を示すものである、前記使用。
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