JP2012529889A5 - - Google Patents
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Claims (18)
- 一酸化炭素又は水素由来の還元当量を生成し、それにより還元的TCA回路を介してCO2を固定するのに十分な量で発現する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸を含む、非天然微生物であって、該酵素が、一酸化炭素脱水素酵素、ヒドロゲナーゼ、及びNAD(P)H:フェレドキシン酸化還元酵素から選択され、かつ該微生物が2-ブタノール経路をさらに含む、前記非天然微生物。
- 前記微生物が、スクシニル-CoAトランスフェラーゼをさらに含む、請求項1記載の非天然微生物。
- 前記微生物が、フェレドキシンをさらに含む、請求項1記載の非天然微生物。
- MEKを産生するのに十分な量で発現するMEK経路酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸を含む、MEK経路を有する非天然微生物であって、該MEK経路は、アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、3-オキソブタノールデヒドラターゼ、MEK酸化還元酵素、3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼ、AKPアミノトランスフェラーゼ、2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、AKPデアミナーゼ、アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、AKPデカルボキシラーゼ、グルタマート脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、及びAKP酸化還元酵素(アミノ化)からなる群から選択される酵素を含む、前記非天然微生物。
- MEKを産生する条件下、かつそれに十分な時間、MEKを産生するのに十分な量で発現するMEK経路酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸を含む、MEK経路を有する非天然微生物を培養することを含む、MEKの産生方法であって、該MEK経路が、アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、3-オキソブタノールデヒドラターゼ、MEK酸化還元酵素、3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼ、AKPアミノトランスフェラーゼ、2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、AKPデアミナーゼ、アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、AKPデカルボキシラーゼ、グルタマート脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、及びAKP酸化還元酵素(アミノ化)からなる群から選択される酵素を含む、前記方法。
- 前記MEK経路が、下記からなる群から選択される1セットのMEK経路酵素を含む、請求項4記載の非天然微生物、又は、請求項5記載の方法:
(a)(1)アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、(2)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、並びに(3)MEK酸化還元酵素;
(b)(1)アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、(2)3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、(3)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、並びに(4)MEK酸化還元酵素;
(c)(1)アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、(2)3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼ及び/又は3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、(3)4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、並びに(4)MEK酸化還元酵素;
(d)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPアミノトランスフェラーゼ及び/又はAKP酸化還元酵素(アミノ化)、(3)2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、(4)3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、(5)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、(6)MEK酸化還元酵素、並びに(7)グルタマート脱水素酵素;
(e)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPデアミナーゼ、(3)アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、(4)MEK酸化還元酵素、並びに(5)グルタマート脱水素酵素;及び
(f)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPデカルボキシラーゼ、(3)4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、(4)MEK酸化還元酵素、並びに(5)グルタマート脱水素酵素。 - 前記微生物が、MEK経路酵素を各々コードする2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、又は7つの外来性核酸を含む、請求項4又は6のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項5又は6のいずれか1項記載の方法。
- (a)前記アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)が、adhE、adhE2、mcr、Rcas_2929、NAP1_02720、MGP2080_00535、及びFARからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(b)前記アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素が、acr1、sucD、bphG、adhE、Msed_709、mcr、asd‐2、Saci_2370、Ald、及びeutEからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(c)前記3-オキソブチルアルデヒド還元酵素が、alrA、ADH2、yqhD、bdhI、bdhII、adhA、4hbd、adhI、P84067、mmsb、dhat、及び3hidhからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(d)前記3-オキソブタノールデヒドラターゼが、hmd、BACCAP_02294、ANACOL_02527、NtherDRAFT_2368、dmdA、dmdB、fumA、fumB、fumC、fumH、fum1、MmcB、MmcC、aroD、aroQ、及びmhpDからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(e)前記MEK酸化還元酵素が、NtRed1、YML131W、AtDBR1、P2、PulR、PtPPDBR、ALH1、enr、fadH、clcE、tfdFII、及びmacAからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(f)前記3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼが、SkyPYD4、SkUGA1、UGA1、Abat、Gta‐1、gabT、及びpuuEからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(g)前記4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼが、aspA及びansBからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(h)前記2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼが、ortA、ortB、Amet_2368、Amet_2369、Teth512_1478、Teth514_1479、TTE1235、及びthrCからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(i)前記AKPアミノトランスフェラーゼが、aspC、AAT2、ASP5、Got2、avtA、serC、及びdatからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(j)前記2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼが、pdc、pdc1、mdlC、dpgB、ilvB‐1、kgd、及びkdcAからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(k)前記AKPデアミナーゼが、aspA及びansBからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(l)前記アセチルアクリラートデカルボキシラーゼが、CAD、dmpH、dmpE、xylII、xylIII、Reut_B5691、Reut_B5692、pad1、pdc、pofK、padC、及びpadからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(m)前記AKPデカルボキシラーゼが、lysA、Odc1、及びpanDからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(n)前記グルタマート脱水素酵素が、GDH2、rocG、gdh1、gdh2、及びGDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(o)前記3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)が、gdhA、gdh、gdhA1、ldh、nadX、及びlysDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;又は
(p)前記AKP酸化還元酵素(アミノ化)が、gdhA、gdh、gdhA1、ldh、nadX、及びlysDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされる、
請求項4又は6のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項5又は6のいずれか1項記載の方法。 - 2-ブタノールを産生するのに十分な量で発現する2-ブタノール経路酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸を含む、2-ブタノール経路を有する非天然微生物であって、該2-ブタノール経路が、アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、3-オキソブタノールデヒドラターゼ、MEK酸化還元酵素、MEK還元酵素、3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼ、AKPアミノトランスフェラーゼ、2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、AKPデアミナーゼ、アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、AKPデカルボキシラーゼ、グルタマート脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、及びAKP酸化還元酵素(アミノ化)からなる群から選択される酵素を含む、前記非天然微生物。
- 2-ブタノールを産生する条件下、かつそれに十分な時間、2-ブタノールを産生するのに十分な量で発現する2-ブタノール経路酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸を含む2-ブタノール経路を有する非天然微生物を培養することを含む、2-ブタノールの産生方法であって、該2-ブタノール経路が、アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、3-オキソブタノールデヒドラターゼ、MEK酸化還元酵素、MEK還元酵素、3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼ、4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼ、AKPアミノトランスフェラーゼ、2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、AKPデアミナーゼ、アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、AKPデカルボキシラーゼ、グルタマート脱水素酵素、3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、及びAKP酸化還元酵素(アミノ化)からなる群から選択される酵素を含む、前記方法。
- 前記2-ブタノール経路が、下記からなる群から選択される1セットの2-ブタノール経路酵素を含む、請求項9記載の非天然微生物、又は、請求項10記載の方法:
(a)(1)アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)、(2)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、(3)MEK酸化還元酵素、並びに(4)MEK還元酵素;
(b)(1)アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、(2)3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、(3)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、(4)MEK酸化還元酵素、並びに(5)MEK還元酵素;
(c)(1)アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素、(2)3-オキソブチルアルデヒドトランスアミナーゼ及び/又は3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)、(3)4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、(4)MEK酸化還元酵素、並びに(5)MEK還元酵素;
(d)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPアミノトランスフェラーゼ及び/又はAKP酸化還元酵素(アミノ化)、(3)2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼ、(4)3-オキソブチルアルデヒド還元酵素、(5)3-オキソブタノールデヒドラターゼ、(6)MEK酸化還元酵素、(7)MEK還元酵素、並びに(8)グルタマート脱水素酵素;
(e)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPデアミナーゼ、(3)アセチルアクリラートデカルボキシラーゼ、(4)MEK酸化還元酵素、(5)MEK還元酵素、並びに(6)グルタマート脱水素酵素;及び
(f)(1)AKPチオラーゼ、(2)AKPデカルボキシラーゼ、(3)4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼ、(4)MEK酸化還元酵素、(5)MEK還元酵素、並びに(6)グルタマート脱水素酵素。 - 前記微生物が、2-ブタノール経路酵素を各々コードする2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、又は8つの外来性核酸を含む、請求項9又は11のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項10又は11のいずれか1項記載の方法。
- (a)前記アセトアセチル-CoA脱水素酵素(二機能性)が、adhE、adhE2、mcr、Rcas_2929、NAP1_02720、MGP2080_00535、及びFARからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(b)前記アセトアセチル-CoAアルデヒド脱水素酵素が、acr1、sucD、bphG、adhE、Msed_709、mcr、asd‐2、Saci_2370、Ald、及びeutEからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(c)前記3-オキソブチルアルデヒド還元酵素が、alrA、ADH2、yqhD、bdhI、bdhII、adhA、4hbd、adhI、P84067、mmsb、dhat、及び3hidhからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(d)前記3-オキソブタノールデヒドラターゼが、hmd、BACCAP_02294、ANACOL_02527、NtherDRAFT_2368、dmdA、dmdB、fumA、fumB、fumC、fumH、fum1、MmcB、MmcC、aroD、aroQ、及びmhpDからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(e)前記MEK酸化還元酵素が、NtRed1、YML131W、AtDBR1、P2、PulR、PtPPDBR、ALH1、enr、fadH、clcE、tfdFII、及びmacAからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(f)前記MEK還元酵素が、sadh、adhA、及びAdhからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(g)前記3-オキソブチルアルデヒドアミノトランスフェラーゼが、SkyPYD4、SkUGA1、UGA1、Abat、Gta‐1、gabT、及びpuuEからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(h)前記4-アミノブタン-2-オンデアミナーゼが、aspA及びansBからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(i)前記2-アミノ-4-ケトペンタノアート(AKP)チオラーゼが、ortA、ortB、Amet_2368、Amet_2369、Teth512_1478、Teth514_1479、TTE1235、及びthrCからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(j)前記AKPアミノトランスフェラーゼが、aspC、AAT2、ASP5、Got2、avtA、serC、及びdatからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(k)前記2,4-ジオキソペンタノアートデカルボキシラーゼが、pdc、pdc1、mdlC、dpgB、ilvB‐1、kgd、及びkdcAからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(l)前記AKPデアミナーゼが、aspA及びansBからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(m)前記アセチルアクリラートデカルボキシラーゼが、CAD、dmpH、dmpE、xylII、xylIII、Reut_B5691、Reut_B5692、pad1、pdc、pofK、padC、及びpadからなる群から選択される1つ以上の遺伝子によってコードされるか;
(n)前記AKPデカルボキシラーゼが、lysA、Odc1、及びpanDからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(o)前記グルタマート脱水素酵素が、GDH2、rocG、gdh1、gdh2、及びGDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;
(p)前記3-オキソブチルアルデヒド酸化還元酵素(アミノ化)が、gdhA、gdh、gdhA1、ldh、nadX、及びlysDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされるか;又は
(q)前記AKP酸化還元酵素(アミノ化)が、gdhA、gdh、gdhA1、ldh、nadX、及びlysDHからなる群から選択される遺伝子によってコードされる、
請求項9又は11のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項10又は11のいずれか1項記載の方法。 - 前記少なくとも1つの外来性核酸が異種性核酸である、請求項3、6、9、又は11のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項5、6、10、又は11のいずれか1項記載の方法。
- 前記非天然微生物が実質的に嫌気性培地中にある、請求項3、6、9、又は11のいずれか1項記載の非天然微生物、又は、請求項5、6、10、又は11のいずれか1項記載の方法。
- 2-ブタノールを産生する条件下、かつそれに十分な時間、請求項1〜3のいずれか1項記載の微生物を培養することを含む、2-ブタノールの産生方法。
- 前記MEK又は2-ブタノールを、前記培養物中の他の成分から分離する工程をさらに含む、請求項10〜16のいずれか1項記載の方法。
- 前記分離工程が、抽出、連続液体‐液体抽出、浸透気化法、膜濾過、膜分離、逆浸透、電気透析、蒸留、結晶化、遠心分離、抽出濾過、イオン交換クロマトグラフィー、分子ふるいクロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー、又は限外濾過を含む、請求項17記載の方法。
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Family Cites Families (154)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4076948A (en) * | 1968-10-10 | 1978-02-28 | El Paso Products Company | Process for treatment of adipic acid mother liquor |
US3513209A (en) * | 1968-08-19 | 1970-05-19 | Du Pont | Method of making 1,4-cyclohexadiene |
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US3965182A (en) * | 1969-10-02 | 1976-06-22 | Ethyl Corporation | Preparation of aniline from phenol and ammonia |
JPS4831084B1 (ja) | 1970-09-04 | 1973-09-26 | ||
GB1344557A (en) | 1972-06-23 | 1974-01-23 | Mitsubishi Petrochemical Co | Process for preparing 1,4-butanediol |
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DE2455617C3 (de) | 1974-11-23 | 1982-03-18 | Basf Ag, 6700 Ludwigshafen | Verfahren zur Herstellung von Butandiol und/oder Tetrahydrofuran über die Zwischenstufe des γ-Butyrolactons |
DE2501499A1 (de) | 1975-01-16 | 1976-07-22 | Hoechst Ag | Verfahren zur herstellung von butandiol-(1.4) |
US4190495A (en) * | 1976-09-27 | 1980-02-26 | Research Corporation | Modified microorganisms and method of preparing and using same |
US4301077A (en) | 1980-12-22 | 1981-11-17 | Standard Oil Company | Process for the manufacture of 1-4-butanediol and tetrahydrofuran |
JPS60114197A (ja) | 1983-11-25 | 1985-06-20 | Agency Of Ind Science & Technol | 微生物によるジカルボン酸の製造法 |
US4871667A (en) | 1984-11-26 | 1989-10-03 | Agency Of Industrial Science & Technology | Process for preparing muconic acid |
US4652685A (en) * | 1985-11-15 | 1987-03-24 | General Electric Company | Hydrogenation of lactones to glycols |
EP0249773B1 (en) | 1986-06-11 | 1992-12-16 | Michigan Biotechnology Institute | A process for the production of succinic acid by anaerobic fermentation |
US5168055A (en) | 1986-06-11 | 1992-12-01 | Rathin Datta | Fermentation and purification process for succinic acid |
US5143834A (en) | 1986-06-11 | 1992-09-01 | Glassner David A | Process for the production and purification of succinic acid |
US5182199A (en) * | 1987-05-27 | 1993-01-26 | Hartley Brian S | Thermophilic ethanol production in a two-stage closed system |
US5219757A (en) * | 1988-04-27 | 1993-06-15 | Daicel Chemical Industries, Ltd. | Production of optically active 1,3-butanediol by asymmetric assimilation or reduction of 4-hydroxy-2-butanone |
WO1990012888A1 (en) * | 1989-04-27 | 1990-11-01 | Biocontrol Systems, Incorporated | Precipitate test for microorganisms |
US5192673A (en) * | 1990-04-30 | 1993-03-09 | Michigan Biotechnology Institute | Mutant strain of C. acetobutylicum and process for making butanol |
US5079143A (en) * | 1990-05-02 | 1992-01-07 | The Upjohn Company | Method of indentifying compounds useful as antiparasitic drugs |
US5173429A (en) | 1990-11-09 | 1992-12-22 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | Clostridiumm ljungdahlii, an anaerobic ethanol and acetate producing microorganism |
IL100572A (en) | 1991-01-03 | 1997-01-10 | Lepetit Spa | Amides of antibiotic ge 2270 factors their preparation and pharmaceutical compositions containing them |
US5416020A (en) * | 1992-09-29 | 1995-05-16 | Bio-Technical Resources | Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus strain and fermentation process for producing L-(+)-lactic acid |
US6136577A (en) | 1992-10-30 | 2000-10-24 | Bioengineering Resources, Inc. | Biological production of ethanol from waste gases with Clostridium ljungdahlii |
US5807722A (en) | 1992-10-30 | 1998-09-15 | Bioengineering Resources, Inc. | Biological production of acetic acid from waste gases with Clostridium ljungdahlii |
FR2702492B1 (fr) | 1993-03-12 | 1995-05-24 | Rhone Poulenc Chimie | Procédé de production par fermentation d'acide itaconique. |
US5487987A (en) * | 1993-09-16 | 1996-01-30 | Purdue Research Foundation | Synthesis of adipic acid from biomass-derived carbon sources |
US5521075A (en) * | 1994-12-19 | 1996-05-28 | Michigan Biotechnology Institute | Method for making succinic acid, anaerobiospirillum succiniciproducens variants for use in process and methods for obtaining variants |
US5504004A (en) * | 1994-12-20 | 1996-04-02 | Michigan Biotechnology Institute | Process for making succinic acid, microorganisms for use in the process and methods of obtaining the microorganisms |
US5700934A (en) | 1995-03-01 | 1997-12-23 | Dsm N.V. | Process for the preparation of epsilon-caprolactam and epsilon-caprolactam precursors |
US5478952A (en) | 1995-03-03 | 1995-12-26 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Ru,Re/carbon catalyst for hydrogenation in aqueous solution |
US5863782A (en) * | 1995-04-19 | 1999-01-26 | Women's And Children's Hospital | Synthetic mammalian sulphamidase and genetic sequences encoding same |
US5686276A (en) | 1995-05-12 | 1997-11-11 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Bioconversion of a fermentable carbon source to 1,3-propanediol by a single microorganism |
FR2736927B1 (fr) * | 1995-07-18 | 1997-10-17 | Rhone Poulenc Fibres & Polymer | Enzymes a activite amidase, outils genetiques et microorganismes hotes permettant leur obtention et procede d'hydrolyse mettant en oeuvre lesdites enzymes |
US5573931A (en) | 1995-08-28 | 1996-11-12 | Michigan Biotechnology Institute | Method for making succinic acid, bacterial variants for use in the process, and methods for obtaining variants |
US5770435A (en) * | 1995-11-02 | 1998-06-23 | University Of Chicago | Mutant E. coli strain with increased succinic acid production |
US5869301A (en) * | 1995-11-02 | 1999-02-09 | Lockhead Martin Energy Research Corporation | Method for the production of dicarboxylic acids |
IL125910A0 (en) * | 1996-02-27 | 1999-04-11 | Univ Michigan State | Cloning and expression of the gene encoding thermoanaerobacter ethanolicus 39e secondary-alcohol dehydrogenase and enzyme biochemical characterization |
US5958745A (en) | 1996-03-13 | 1999-09-28 | Monsanto Company | Methods of optimizing substrate pools and biosynthesis of poly-β-hydroxybutyrate-co-poly-β-hydroxyvalerate in bacteria and plants |
KR100387301B1 (ko) * | 1996-07-01 | 2003-06-12 | 바이오 엔지니어링 리소스 인코포레이티드 | 폐가스로부터의 생성물의 생물학적 제조방법 |
KR100459818B1 (ko) * | 1996-09-02 | 2004-12-03 | 이. 아이. 두퐁 드 느무르 앤드 컴퍼니 | ε-카프로락탐의 제조방법 |
EP0977865A1 (en) | 1997-02-13 | 2000-02-09 | James Madison University | Methods of making polyhydroxyalkanoates comprising 4-hydroxybutyrate monomer units |
KR100516986B1 (ko) * | 1997-02-19 | 2005-09-26 | 코닌클리즈케 디에스엠 엔.브이. | 6-아미노카프론산 유도체를 과열 수증기와 접촉시킴으로써 촉매 없이 카프로락탐을 제조하는 방법 |
US6274790B1 (en) * | 1997-04-14 | 2001-08-14 | The University Of British Columbia | Nucleic acids encoding a plant enzyme involved in very long chain fatty acid synthesis |
KR19990013007A (ko) | 1997-07-31 | 1999-02-25 | 박원훈 | 형질전환된 대장균 ss373(kctc 8818p)과 이를 이용한숙신산의 생산방법 |
JPH11103863A (ja) | 1997-10-08 | 1999-04-20 | Nippon Shokubai Co Ltd | マレイン酸異性化酵素遺伝子 |
US6280986B1 (en) * | 1997-12-01 | 2001-08-28 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Stabilization of pet operon plasmids and ethanol production in bacterial strains lacking lactate dehydrogenase and pyruvate formate lyase activities |
ATE458040T1 (de) | 1998-04-13 | 2010-03-15 | Univ Georgia | Pyruvate carboxylase überexpression zur verstärkten produktion von oxalacetat abgeleiteten verbindungen in mikrobiellen zellen |
US20030087381A1 (en) * | 1998-04-13 | 2003-05-08 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Metabolically engineered organisms for enhanced production of oxaloacetate-derived biochemicals |
US6159738A (en) | 1998-04-28 | 2000-12-12 | University Of Chicago | Method for construction of bacterial strains with increased succinic acid production |
US6432686B1 (en) * | 1998-05-12 | 2002-08-13 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Method for the production of 1,3-propanediol by recombinant organisms comprising genes for vitamin B12 transport |
US6444784B1 (en) * | 1998-05-29 | 2002-09-03 | Exxonmobil Research & Engineering Company | Wax crystal modifiers (LAW657) |
DE19856136C2 (de) * | 1998-12-04 | 2002-10-24 | Pasteur Institut | Verfahren und Vorrichtung zur Selektion beschleunigter Proliferation lebender Zellen in Suspension |
AU3482200A (en) * | 1999-02-02 | 2000-08-25 | Bernhard Palsson | Methods for identifying drug targets based on genomic sequence data |
US6686310B1 (en) * | 1999-02-09 | 2004-02-03 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | High surface area sol-gel route prepared hydrogenation catalysts |
US6365376B1 (en) * | 1999-02-19 | 2002-04-02 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Genes and enzymes for the production of adipic acid intermediates |
US6448473B1 (en) | 1999-03-05 | 2002-09-10 | Monsanto Technology Llc | Multigene expression vectors for the biosynthesis of products via multienzyme biological pathways |
CN100347308C (zh) | 1999-05-21 | 2007-11-07 | 卡吉尔道有限责任公司 | 合成有机产物的方法和材料 |
US6852517B1 (en) * | 1999-08-30 | 2005-02-08 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Production of 3-hydroxypropionic acid in recombinant organisms |
US6660857B2 (en) | 2000-02-03 | 2003-12-09 | Dsm N.V. | Process for the preparation of ε-caprolactam |
US6878861B2 (en) * | 2000-07-21 | 2005-04-12 | Washington State University Research Foundation | Acyl coenzyme A thioesterases |
MXPA03000711A (es) | 2000-07-25 | 2003-06-04 | Bioengineering Resources Inc | Metodos para incrementar la produccion de etanol de una fermentacion microbiana. |
AU1981802A (en) * | 2000-11-20 | 2002-06-03 | Cargill Inc | 3-hydroxypropionic acid and other organic compounds |
WO2002042471A2 (en) * | 2000-11-22 | 2002-05-30 | Cargill Dow Polymers Llc | Methods and materials for the synthesis of organic products |
CN1358841A (zh) | 2000-12-11 | 2002-07-17 | 云南省微生物研究所 | 云南链霉菌 |
CN1491282A (zh) * | 2000-12-28 | 2004-04-21 | 丰田自动车株式会社 | 异戊二烯醇的制备方法 |
JP4776146B2 (ja) | 2001-01-10 | 2011-09-21 | ザ・ペン・ステート・リサーチ・ファンデーション | 細胞代謝をモデル化する方法及びシステム |
US7127379B2 (en) | 2001-01-31 | 2006-10-24 | The Regents Of The University Of California | Method for the evolutionary design of biochemical reaction networks |
WO2002070730A2 (en) * | 2001-03-01 | 2002-09-12 | The Regents Of The University Of California | Models and methods for determining systemic properties of regulated reaction networks |
US6743610B2 (en) * | 2001-03-30 | 2004-06-01 | The University Of Chicago | Method to produce succinic acid from raw hydrolysates |
CA2356540A1 (en) * | 2001-08-30 | 2003-02-28 | Emory University | Expressed dna sequences involved in mitochondrial functions |
CA2466133A1 (en) * | 2001-11-02 | 2003-05-15 | Rice University | Recycling system for manipulation of intracellular nadh availability |
WO2003062173A2 (en) | 2002-01-18 | 2003-07-31 | Cargill, Incorporated | Alanine 2,3- aminomutase |
AU2003211492A1 (en) * | 2002-02-06 | 2003-09-02 | Showa Denko K.K. | Alpha-SUBSTITUTED-Alpha,Beta-UNSATURATED CARBONYL COMPOUND REDUCTASE GENE |
US20030224363A1 (en) | 2002-03-19 | 2003-12-04 | Park Sung M. | Compositions and methods for modeling bacillus subtilis metabolism |
WO2003082214A2 (en) * | 2002-03-29 | 2003-10-09 | Genomatica, Inc. | Human metabolic models and methods |
JPWO2003095651A1 (ja) | 2002-05-10 | 2005-09-15 | 協和醗酵工業株式会社 | メバロン酸の製造方法 |
US7856317B2 (en) | 2002-06-14 | 2010-12-21 | Genomatica, Inc. | Systems and methods for constructing genomic-based phenotypic models |
CA2491753A1 (en) * | 2002-07-10 | 2004-03-04 | The Penn State Research Foundation | Method for determining gene knockout strategies |
US7826975B2 (en) * | 2002-07-10 | 2010-11-02 | The Penn State Research Foundation | Method for redesign of microbial production systems |
AU2003253949A1 (en) * | 2002-07-15 | 2004-02-02 | Kosan Biosciences, Inc. | Metabolic pathways for starter units in polyketide biosynthesis |
KR101148255B1 (ko) * | 2002-10-04 | 2012-08-08 | 다니스코 유에스 인크. | 고수율을 갖는 1,3-프로판디올의 생물학적 제조 방법 |
WO2004035009A2 (en) * | 2002-10-15 | 2004-04-29 | The Regents Of The University Of California | Methods and systems to identify operational reaction pathways |
AU2003287625A1 (en) * | 2002-11-06 | 2004-06-03 | University Of Florida | Materials and methods for the efficient production of acetate and other products |
US7432091B2 (en) | 2003-02-24 | 2008-10-07 | Research Institute Of Innovative Technology For The Earth | Highly efficient hydrogen production method using microorganism |
RU2268300C2 (ru) * | 2003-04-07 | 2006-01-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИЙ, ОБЛАДАЮЩИХ ПОВЫШЕННОЙ ЭКСПРЕССИЕЙ ГЕНА pckA |
US7927859B2 (en) * | 2003-08-22 | 2011-04-19 | Rice University | High molar succinate yield bacteria by increasing the intracellular NADH availability |
JP4619291B2 (ja) | 2003-09-17 | 2011-01-26 | 三菱化学株式会社 | 非アミノ有機酸の製造方法 |
US7244610B2 (en) * | 2003-11-14 | 2007-07-17 | Rice University | Aerobic succinate production in bacteria |
FR2864967B1 (fr) * | 2004-01-12 | 2006-05-19 | Metabolic Explorer Sa | Microorganisme evolue pour la production de 1,2-propanediol |
BRPI0506942B1 (pt) * | 2004-01-19 | 2015-07-28 | Dsm Ip Assets Bv | Síntese bioquímica de ácido 6-amino capróico |
US7608700B2 (en) | 2004-03-08 | 2009-10-27 | North Carolina State University | Lactobacillus acidophilus nucleic acid sequences encoding stress-related proteins and uses therefor |
DE102004031177A1 (de) * | 2004-06-29 | 2006-01-19 | Henkel Kgaa | Neue Geruchsstoffe bildende Genprodukte von Bacillus licheniformis und darauf aufbauende verbesserte biotechnologische Produktionsverfahren |
US7262046B2 (en) * | 2004-08-09 | 2007-08-28 | Rice University | Aerobic succinate production in bacteria |
EP1781797B1 (en) * | 2004-08-27 | 2016-10-19 | Rice University | Mutant e. coli strain with increased succinic acid production |
US8604180B2 (en) * | 2004-09-09 | 2013-12-10 | Research Institute Of Innovative Technology For The Earth | DNA fragment having promoter function |
BRPI0515273A (pt) * | 2004-09-17 | 2008-08-05 | Rice University | bactérias modificadas, célula bacteriana geneticamente planejada, e método para produzir ácidos carbóxilicos em uma cultura bacteriana |
WO2006069174A2 (en) * | 2004-12-22 | 2006-06-29 | Rice University | Simultaneous anaerobic production of isoamyl acetate and succinic acid |
JP2006204255A (ja) | 2005-01-31 | 2006-08-10 | Canon Inc | アセチル−CoAアシルトランスフェラーゼ遺伝子破壊ポリヒドロキシアルカノエート生産菌、またこれを利用したポリヒドロキシアルカノエート生産方法 |
EP1874334A4 (en) * | 2005-04-15 | 2011-03-30 | Vascular Biogenics Ltd | COMPOSITIONS WITH BETA 2-GLYCOPROTEIN I-PEPTIDES FOR THE PREVENTION AND / OR TREATMENT OF VASCULAR DISEASES |
KR100676160B1 (ko) * | 2005-08-19 | 2007-02-01 | 한국과학기술원 | 말릭효소를 코딩하는 유전자로 형질전환된 재조합 미생물 및 이를 이용한 숙신산의 제조방법 |
KR100679638B1 (ko) * | 2005-08-19 | 2007-02-06 | 한국과학기술원 | 포메이트 디하이드로게나제 d 또는 e를 코딩하는 유전자로 형질전환된 미생물 및 이를 이용한 숙신산의 제조방법 |
CN101300356A (zh) * | 2005-09-09 | 2008-11-05 | 基因组股份公司 | 用于琥珀酸盐之生长关联性生产的方法和生物 |
US9297028B2 (en) * | 2005-09-29 | 2016-03-29 | Butamax Advanced Biofuels Llc | Fermentive production of four carbon alcohols |
JP5276986B2 (ja) * | 2005-10-26 | 2013-08-28 | ビュータマックス・アドバンスド・バイオフューエルズ・エルエルシー | 四炭素アルコールの発酵性生産 |
US8962298B2 (en) * | 2006-05-02 | 2015-02-24 | Butamax Advanced Biofuels Llc | Recombinant host cell comprising a diol dehydratase |
US8017364B2 (en) * | 2006-12-12 | 2011-09-13 | Butamax(Tm) Advanced Biofuels Llc | Solvent tolerant microorganisms |
WO2008091627A2 (en) * | 2007-01-22 | 2008-07-31 | Genomatica, Inc. | Methods and organisms for growth-coupled production of 3-hydroxypropionic acid |
AU2008229076B2 (en) * | 2007-03-16 | 2014-05-15 | Genomatica, Inc. | Compositions and methods for the biosynthesis of 1,4-butanediol and its precursors |
WO2008131286A1 (en) | 2007-04-18 | 2008-10-30 | Gevo, Inc. | Engineered microorganisms for producing isopropanol |
KR100821034B1 (ko) | 2007-04-24 | 2008-04-08 | 삼성에스디아이 주식회사 | 습도조절장치 겸용 캐소드 엔드 플레이트 및 이를 채용한공기호흡형 연료전지 스택 |
US8426174B2 (en) * | 2007-05-02 | 2013-04-23 | Butamax(Tm) Advanced Biofuels Llc | Method for the production of 2-butanol |
US20080274522A1 (en) * | 2007-05-02 | 2008-11-06 | Bramucci Michael G | Method for the production of 2-butanone |
WO2008144060A2 (en) * | 2007-05-17 | 2008-11-27 | Tetravitae Bioscience, Inc. | Methods and compositions for producing solvents |
EP2017344A1 (en) | 2007-07-20 | 2009-01-21 | Nederlandse Organisatie voor toegepast- natuurwetenschappelijk onderzoek TNO | Production of itaconic acid |
JP5243748B2 (ja) * | 2007-08-08 | 2013-07-24 | 公益財団法人地球環境産業技術研究機構 | ブタノール生産能を有する形質転換体 |
EP2348008A1 (en) | 2007-08-10 | 2011-07-27 | Genomatica, Inc. | Methods for the synthesis of acrylic acid and derivatives from fumaric acid |
US7947483B2 (en) * | 2007-08-10 | 2011-05-24 | Genomatica, Inc. | Methods and organisms for the growth-coupled production of 1,4-butanediol |
US20090139134A1 (en) * | 2007-10-04 | 2009-06-04 | Bio Architecture Lab, Inc. | Biofuel production |
BRPI0817545A2 (pt) | 2007-10-12 | 2014-11-25 | Univ California | Microorganismo recombinante, métodos para produzir um microorganismo recombinante e para produzir isopropanol, vetor recombinante, e, célula hospedeira recombinante. |
MX2010005061A (es) * | 2007-11-10 | 2010-09-09 | Joule Unltd Inc | Organismos hiperfotosinteticos. |
CN107090424A (zh) | 2008-01-22 | 2017-08-25 | 基因组股份公司 | 利用合成气或其它气态碳源和甲醇的方法和有机体 |
AU2009217293B2 (en) * | 2008-02-23 | 2014-11-20 | James Weifu Lee | Designer organisms for photobiological butanol production from carbon dioxide and water |
PL2262901T3 (pl) * | 2008-03-05 | 2019-04-30 | Genomatica Inc | Organizmy wytwarzające alkohole pierwszorzędowe |
NO2265709T3 (ja) | 2008-03-27 | 2018-04-07 | ||
CA2722680A1 (en) | 2008-05-01 | 2009-11-05 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for the production of methacrylic acid |
EP2304039B1 (en) * | 2008-06-17 | 2019-08-21 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of fumarate, malate, and acrylate |
US20100021978A1 (en) * | 2008-07-23 | 2010-01-28 | Genomatica, Inc. | Methods and organisms for production of 3-hydroxypropionic acid |
BRPI0918483A2 (pt) | 2008-09-10 | 2020-07-14 | Genomatica, Inc | organismo microbiano que não ocorre naturalmente, e, método para produzir um composto |
US8357826B2 (en) * | 2008-10-16 | 2013-01-22 | Karl Kharas | Methods and apparatus for synthesis of alcohols from syngas |
US20100184173A1 (en) * | 2008-11-14 | 2010-07-22 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for the production of methyl ethyl ketone and 2-butanol |
BRPI0922276A2 (pt) * | 2008-12-16 | 2015-08-04 | Genomatica Inc | "organismo microbiano de ocorrência não-natural, e , método para produzir isopropanol, 4-hidroxibutirato,e, 1,4-butanodiol." |
KR102302146B1 (ko) | 2009-04-30 | 2021-09-14 | 게노마티카 인코포레이티드 | 1,3-부탄다이올 생산 유기체 |
BRPI1013505A2 (pt) | 2009-04-30 | 2018-02-14 | Genomatica Inc | organismos para a produção de isopropanol, n-butanol, e isobutanol |
US8377680B2 (en) | 2009-05-07 | 2013-02-19 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of adipate, hexamethylenediamine and 6-aminocaproic acid |
EP2429587A4 (en) * | 2009-05-15 | 2014-10-08 | Genomatica Inc | ORGANISMS FOR THE PREPARATION OF CYCLOHEXANONE |
MY195387A (en) | 2009-06-04 | 2023-01-18 | Genomatica Inc | Microorganisms for the Production of 1,4-Butanediol and Related Methods |
CN105237352A (zh) * | 2009-06-04 | 2016-01-13 | 基因组股份公司 | 分离发酵液成分的方法 |
CN107586753A (zh) * | 2009-09-09 | 2018-01-16 | 基因组股份公司 | 协同产生异丙醇与伯醇,二元醇和酸的微生物和方法 |
CN105441374A (zh) * | 2009-10-13 | 2016-03-30 | 基因组股份公司 | 生产1,4-丁二醇、4-羟基丁醛、4-羟基丁酰-coa、腐胺和相关化合物的微生物及其相关方法 |
EP2491125A4 (en) * | 2009-10-23 | 2014-04-23 | Genomatica Inc | MICROORGANISMS FOR ANILINE PRODUCTION |
US8530210B2 (en) | 2009-11-25 | 2013-09-10 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the coproduction 1,4-butanediol and gamma-butyrolactone |
SG181607A1 (en) | 2009-12-10 | 2012-07-30 | Genomatica Inc | Methods and organisms for converting synthesis gas or other gaseous carbon sources and methanol to 1,3-butanediol |
EP2529011A4 (en) | 2010-01-29 | 2015-07-15 | Genomatica Inc | MICROORGANISMS AND METHODS FOR BIOSYNTHESIS OF P-TOLUATE AND TEREPHTHALATE |
US8445244B2 (en) | 2010-02-23 | 2013-05-21 | Genomatica, Inc. | Methods for increasing product yields |
US8048661B2 (en) | 2010-02-23 | 2011-11-01 | Genomatica, Inc. | Microbial organisms comprising exogenous nucleic acids encoding reductive TCA pathway enzymes |
US20110312049A1 (en) | 2010-04-13 | 2011-12-22 | Osterhout Robin E | Microorganisms and methods for the production of ethylene glycol |
US9023636B2 (en) | 2010-04-30 | 2015-05-05 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of propylene |
SG10201503501TA (en) | 2010-05-05 | 2015-06-29 | Genomatica Inc | Microorganisms and methods for the biosynthesis of butadiene |
US8715957B2 (en) * | 2010-07-26 | 2014-05-06 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of aromatics, 2,4-pentadienoate and 1,3-butadiene |
US20120156740A1 (en) * | 2010-12-17 | 2012-06-21 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the production of 1,4-cyclohexanedimethanol |
AU2012212118B2 (en) | 2011-02-02 | 2015-11-12 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of butadiene |
-
2010
- 2010-06-10 JP JP2012515163A patent/JP2012529889A/ja active Pending
- 2010-06-10 EP EP10786874.7A patent/EP2440669A4/en not_active Withdrawn
- 2010-06-10 WO PCT/US2010/038230 patent/WO2010144746A2/en active Application Filing
- 2010-06-10 US US12/813,469 patent/US8420375B2/en active Active
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