JP2010538624A5 - - Google Patents
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Claims (15)
- サンプルにおける膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生を検出する方法であって、TWIST1、NID2、RUNX3、BMP7、CCNA1、PDLIM4、TNFRSF25、APC、RASSF1A、LOXL1、TUBB4、NTRK2、ARFGAP3、OSMR及びTJP2から選択される少なくとも1つの遺伝子におけるエピジェネティックな変化を検出することを含み、エピジェネティックな変化の検出が膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生の指標である方法。
- 前記遺伝子の少なくとも2個、3個、4個又は5個を含む遺伝子パネルにおけるエピジェネティックな変化を検出することを含み、パネルにおける遺伝子の少なくとも1つにおけるエピジェネティックな変化の検出が、膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生の指標である、請求項1に記載の方法。
- 遺伝子パネルが、TWIST1及びNID2を含む、若しくは、NID2、TWIST1及びRUNX3を含むか、それから本質的になるか、又はそれからなる、請求項2に記載の方法。
- サンプルが膀胱組織サンプル又は尿サンプルを含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 収集後の尿サンプルに安定化緩衝液を添加し、それにより、サンプルの遠心分離を必要とせずに、サンプルを最大72時間にわたり室温で保管することを可能にする、請求項4に記載の方法。
- エピジェネティックな変化がメチル化である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- 尿細胞診及び/又は突然変異分析と組み合わせて用いられる、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- サンプルにおける膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生を検出するためのキットであって、NID2、TWIST1及びRUNX3、又はTWIST1及びNID2のそれぞれのメチル化状態を決定するための少なくとも1つのプライマー対を含むキット。
- サンプルにおける膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生を検出するためのキットであって、
(a)TWIST1、NID2、RUNX3、BMP7、CCNA1、PDLIM4、TNFRSF25、APC、RASSF1A、LOXL1、TUBB4、NTRK2、ARFGAP3、OSMR及びTJP2から選択される少なくとも1つの遺伝子におけるエピジェネティックな変化を検出するための手段と、
(b)尿サンプルの収集のための密閉可能な容器及び安定化緩衝液から選択される、尿サンプルを処理するための手段とを含むキット。 - 前記遺伝子の少なくとも2個、3個、4個又は5個を含む遺伝子パネルにおけるエピジェネティックな変化を検出するための手段を含み、パネルにおける遺伝子の少なくとも1つにおけるエピジェネティックな変化の検出が、膀胱癌に対する素因又は膀胱癌の発生の指標である、請求項9に記載のキット。
- 遺伝子パネルが、TWIST1及びNID2、又は、NID2、TWIST1及びRUNX3を含む、請求項10に記載のキット。
- メチル化を検出するための手段がメチル化特異的PCR/増幅プライマーを含む、請求項9〜11のいずれか一項に記載のキット。
- FGFR3遺伝子における突然変異を検出するための1つ又は複数のプライマーをさらに含む、請求項9〜12のいずれか一項に記載のキット。
- TWIST1、NID2、RUNX3、BMP7、CCNA1、PDLIM4、TNFRSF25、APC、RASSF1A、LOXL1、TUBB4、NTRK2、ARFGAP3、OSMR及びTJP2から選択される少なくとも1つの遺伝子のメチル化状態を決定するためのプライマー又はプライマー対であって、RASSF1Aでは配列番号1及び/又は2、APCでは配列番号4及び/又は5、CCNA1では配列番号7及び/又は8、TNFRSF25では配列番号10及び/又は11、TUBB4では配列番号13及び/又は14、NTRK2では配列番号16及び/又は17、OSMRでは配列番号19及び/又は20、TWIST1では配列番号22及び/又は23、LOXL1では配列番号25及び/又は26、TJP2では配列番号28及び/又は29、RUNX3では配列番号31及び/又は32、PDLIM4では配列番号34及び/又は35、BMP7では配列番号37及び/又は38、NID2では配列番号40及び/又は41、ARFGAP3では配列番号43及び/又は44で示される1つ又は複数のヌクレオチド配列又はその機能的変異体を含むプライマー又はプライマー対。
- TWIST1、NID2、RUNX3、BMP7、CCNA1、PDLIM4、TNFRSF25、APC、RASSF1A、LOXL1、TUBB4、NTRK2、ARFGAP3、OSMR及びTJP2から選択される少なくとも1つの遺伝子のメチル化状態を決定するためのプローブであって、RASSF1Aでは配列番号3、APCでは配列番号6、CCNA1では配列番号9、TNFRSF25では配列番号12、TUBB4では配列番号15、NTRK2では配列番号18、OSMRでは配列番号21、TWIST1では配列番号24、LOXL1では配列番号27、TJP2では配列番号30、RUNX3では配列番号33、PDLIM4では配列番号36、BMP7では配列番号39、NID2では配列番号42、ARFGAP3では配列番号45で示されるヌクレオチド配列又はその機能的変異体を含むプローブ。
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JP7139248B2 (ja) | 2016-09-29 | 2022-09-20 | 有限会社ハヌマット | 孤発性大腸癌発症可能性の判定方法 |
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