RU2612139C1 - Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4 - Google Patents

Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4 Download PDF

Info

Publication number
RU2612139C1
RU2612139C1 RU2015156512A RU2015156512A RU2612139C1 RU 2612139 C1 RU2612139 C1 RU 2612139C1 RU 2015156512 A RU2015156512 A RU 2015156512A RU 2015156512 A RU2015156512 A RU 2015156512A RU 2612139 C1 RU2612139 C1 RU 2612139C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
pdlim4
determination
expression
gene
pcr
Prior art date
Application number
RU2015156512A
Other languages
English (en)
Inventor
Степан Петрович Чумаков
Юлия Евгеньевна Кравченко
Елена Ивановна Фролова
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН)
Priority to RU2015156512A priority Critical patent/RU2612139C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2612139C1 publication Critical patent/RU2612139C1/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112Disease subtyping, staging or classification

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области генной инженерии, конкретно к наборам синтетических олигонуклеотидов, и может быть использовано для определения уровней экспрессии основных изоформ гена PDLIM4. Предложен набор синтетических олигонуклеотидов для определения статуса PDLIM4 методом ПЦР в реальном времени. Уровень экспрессии PDLIM4 определяют в ходе ПЦР-РВ за счет определения скорости накопления флуоресцентного продукта реакции. ПЦР проводят с использованием набора олигонуклеотидов, состоящего из концевых праймеров для проведения амплификации целевого участка кДНК PDLIM4 - области стыка экзонов 2-3 (для определения количества суммарных изоформ PDLIM4) и экзонов 6-7 (для определения полноразмерной изоформы PDLIM4). Набор олигонуклеотидов содержит разрушаемый в ходе реакции флуоресцентно-меченый зонд. Изобретение позволяет быстро, чувствительно и специфично определять уровни экспрессии полноразмерной изоформы гена PDLIM4, а также тотальной совокупности изоформ PDLIM4, в том числе в клиническом резекционном либо биопсийном материале, полученном от пациентов с опухолями молочной железы, для более точного установления фенотипических характеристик заболевания. 1 табл., 1 ил.

Description

Изобретение «Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена PDLIM4» относится к области молекулярной биологии и может быть использовано для быстрого определения уровней экспрессии основных изоформ гена PDLIM4.
В настоящее время многие аспекты этиологии и патогенеза рака молочной железы (РМЖ) остаются неясными. Сложность изучения этого заболевания обуславливается тем, что понятие РМЖ объединяет группу гистологически и биохимически гетерогенных опухолей, отличающихся по инвазивности, клиническому течению и чувствительности к проводимой химиотерапии. Подобная гетерогенность и разнообразие определяют потребность в более детальной классификации типов РМЖ в зависимости от характера злокачественного перерождения и проводимой терапии. В связи с этим, большой интерес представляет поиск молекулярных маркеров, ассоциированных со злокачественным перерождением клеток. Изучение генов, вовлеченных в процессы онкотрансформации, а также механизмов регуляции активности этих генов приближает нас к составлению полной картины молекулярных механизмов к РМЖ, что на практике способствует ранней диагностике, субтипированию РМЖ и, в дальнейшем, выбору оптимальной стратегии терапии.
Одним из генов, принимающих участие в малигнизации клеток, может быть ген RIL. Белок RIL (reversion-induced LIM-domain containing), впоследствии названный PDLIM4, впервые описали в 1995 году как потенциальный супрессор опухолевого роста. У человека ген PDLIM4 локализован на хромосоме 5 в области 5q31.1, часто делегируемой при ряде злокачественных заболеваний. Ген PDLIM4/RIL может подвергаться не только делециям, но и эпигенетической супрессии, часто обнаруживаемой при изучении транскриптома трансформированных клеток, в частности, клеток РМЖ.
Роль PDLIM4 в канцерогенезе РМЖ малоизучена, однако многочисленные данные о корреляции изменений экспрессии этого гена с процессами малигнизации несомненно заслуживают внимания и нуждаются в дальнейшем изучении. На начальном этапе представляется возможным проанализировать данные о взаимосвязи изменений экспрессии PDLIM4 с клиническими параметрами РМЖ, такими как статус рецепторов гормонов, тип опухоли, индекс плоидности, количество клеток в S-фазе и других.
Рецепторы эстрогена (ER) и прогестерона (PR) - важнейшие биомаркеры, на экспрессии которых основана современная классификация подтипов РМЖ.
Используя комбинацию ER и PR в сочетании с рецептором эпидермального фактора роста человека 2 (HER2), а также ряд иных молекулярно-генетических признаков, можно выделить пять подтипов РМЖ, отличающихся профилями экспрессии генов: НЕR2-положительный, базальноподобный, клаудин-дефицитный и люминальные молекулярные подтипы А и В.
Корреляцию между уровнем метилирования гена PDLIM4 и статусом PR и ER анализировали в ряде работ, посвященных молекулярным механизмам прогрессии РМЖ. В большинстве этих работ прослеживалась подобная корреляция: повышенный уровень метилирования PDLIM4 был сопряжен с утратой рецепторов и, наоборот, в рецептор-положительных опухолях уровень метилирования PDLIM4 был в среднем более низким. Эти данные позволяют предположить, что метилирование гена PDLIM4 более характерно для трижды негативных (базальноподобного и клаудин-дефицитного) и HER2-положительных подтипов РМЖ, нежели для люминальных подтипов А и В. Более точно оценить корреляцию между подтипом опухоли и уровнем экспрессии PDLIM4 сложно, так как не выявлено взаимосвязи между уровнем метилирования PDLIM4 и экспрессией третьего основного классификационного биомаркера - HER2.
Приведенные данные позволяют предположить, что опухоли с низким уровнем метилирования PDLIM4 окажутся чувствительными к гормонотерапии, проведение которой будет более целесообразным, чем химиотерапии. В то же время известны случаи устойчивости к эндокринной терапии больных с опухолями ER+/PR+, поэтому гормонально-рецепторный статус не всегда позволяет определить чувствительность к гормонотерапии при РМЖ.
Еще одна важная характеристика опухоли - количество (%) ее клеток, находящихся в S-фазе клеточного цикла (SPF, S-phasefraction). Значение SPF коррелирует со скоростью роста опухоли: чем больше таких клеток, тем быстрее они делятся и тем интенсивнее растет и развивается опухоль. Высокое значение SPF коррелирует с такими параметрами, как большой размер опухоли, вероятное поражение лимфоузлов, невысокая степень дифференцировки клеток и отсутствие рецепторов стероидов.
Величина SPF считается прогностическим фактором общей и безрецидивной выживаемости, уступающим по значимости только статусу лимфатических узлов. Высокое значение SPF оценивается как важный фактор плохого прогноза, указывающий на существенное снижение выживаемости больных. Прогностически благоприятной считают величину SPF менее 8%.
Показано, что величина SPF коррелирует с уровнем метилирования PDLIM4. Пониженный уровень метилирования PDLIM4 обнаружен в опухолях с невысоким значением SPF. Эти данные согласуются с результатами оценки связи экспрессии PDLIM4 со степенью дифференцировки клеток РМЖ - в слабо дифференцированных опухолях повышен уровень метилирования PDLIM4. Таким образом, можно предположить, что низкий уровень метилирования PDLIM4 будет соответствовать медленно растущим опухолям молочной железы и коррелировать с более благоприятным прогнозом.
Существование корреляции между уровнем метилирования PDLIM4 и степенью дифференцировки клеток представляет большой интерес для использования PDLIM4 в качестве диагностического маркера, облегчающего определение подтипа РМЖ в соответствии с моделью опухолевых стволовых клеток (ОСК). Модель ОСК подразумевает, что любое злокачественное новообразование (неоплазия) развивается из одной клетки. В результате ряда событий генетический аппарат нормальной клетки может настолько трансформироваться, что происходит ее перерождение в инициирующую раковую клетку. В основе самовоспроизведения ОСК лежит асимметричный тип деления, который заключается в том, что родительская стволовая клетка может давать начало клеткам двух типов: стволовой, аналогичной материнской, и частично дифференцированной мультипотентной клетке-предшественнику. В результате пролиферации из этих клеток формируется злокачественная опухоль, имеющая иерархическую структуру и содержащая ОСК, временно пролиферирующие клетки-предшественники и терминально дифференцированные раковые клетки. Основную массу опухоли составляют дифференцированные клетки, обладающие ограниченным пролиферативным потенциалом, однако существует компартмент, образованный ОСК, который поддерживает опухоль и обеспечивает ее устойчивость к терапии. Согласно недавним исследованиям, ОСК, входящие в состав РМЖ, можно разделить на две подгруппы: эпителиоподобные и мезенхимальноподобные. В эпителиоподобных ОСК экспрессируется альдегиддегидрогеназа (ALDH), они обладают высокой пролиферативной активностью, а мезенхимальноподобные (CD24-/CD44+) ОСК обеспечивают способность к инвазии и формированию метастазов.
Суммируя сказанное, необходимо отметить, что существование корреляции между уровнем экспрессии PDLIM4 и важнейшими клиническими параметрами РМЖ свидетельствует о непосредственном участии этого гена в процессах онкотрансформации. В большинстве случаев подавление экспрессии PDLIM4 коррелирует с прогностически неблагоприятными параметрами, такими как изменение кариотипа клеток, высокое значение SPF, крупные размеры опухолей или отсутствие рецепторов гормонов. Эти данные позволяют отнести PDLIM4 к потенциальным онкосупрессорам.
Приведенные нами свидетельства взаимосвязи эпигенетических модификаций PDLIM4 с процессами злокачественного перерождения клеток и параметрами высокоинвазивных типов РМЖ позволяют рассматривать PDLIM4 в качестве непосредственного участника процессов канцерогенеза. Один из этих механизмов может заключаться в инактивации c-Src, однако вероятно существование и иных белков, регуляторами которых может быть PDLIM4. Дальнейшее изучение механизмов участия PDLIM4 в процессе канцерогенеза, а также изучение корреляции его экспрессии с развитием отдельных субтипов РМЖ представляется перспективным для поиска новых возможностей диагностики и лечения рака.
Существует несколько различных способов определения экспрессионного статуса того или иного гена - может проводиться определение количеств присутствующей в опухолевых клетках мРНК целевого гена, либо может быть проведено бисульфитное секвенирование соответствующего участка геномной ДНК с целью определения статуса метилирования области и, как следствие, сделаны выводы об эпигенетическом статусе и уровне экспрессии целевого белка. Может быть проведена детекция продукта гена - целевого белка либо иммуноферментными методами, либо масс-спектрометрически. Из перечисленных способов лишь некоторые представляются практически применимыми в клинических условиях - это определение количества присутствующей в опухолевых клетках мРНК путем постановки совмещенной реакции обратной транскрипции - полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР), и определение уровней продукта экспрессии гена - белка иммуноферментными методами. Второй подход более трудоемок и чаще используется для определения секретирующихся из клеток белков, нежели для внутриклеточных. Метод ОТ-ПЦР может быть совмещен как с детекцией результата ПЦР по конечной точке - классической ПЦР-реакции, так и с детекцией в реальном времени - ОТ-ПЦР-РВ. Второй способ детекции позволяет не только получить качетственные данные о наличии или отсутствии экспрессии целевого гена, но и количественно оценить уровень экспрессии.
В настоящее время из литературы известны последовательности праймеров для проведения ОТ-ПЦР на PDLIM4 с детекцией по конечной точке: RIL4ex sense 5-CTCGCTTTCCAGTCCCTCACAAT-3 и RIL5ex antisense 5-TCTAGCATGCCCTGCAAGTAGC-3 [8]. Эти праймеры могут использоваться для определения статуса PDLIM4, однако не позволяют получить информацию об уровнях экспрессии и экспрессирующихся изоформах гена.
В качестве ближайшего аналога может быть указана заявка WO 2009036922 А2. Заявка касается методов и наборов для обнаружения наличия раковых клеток или наличия геномного DNA от раковых клеток, включающих определение статуса метилирования, или уровней экспрессии или их комбинации группы генов, включающей PDLIM4. Набор праймеров включает:
PDLIM4_4_M_S (SEQ ID NO. 34): GGCGTTTAGGTTAATTTTTCGT PDLIM4_4_M_AS (SEQ ID NO. 35): CGATCCCATATCTAAAACCGA PDLIM4_4_MB (SEQ ID NO. 36): 5'-FAM-CGACATGCCTCGCGATCCGCCCGAAACGCATGTCG-3'-DABCYL
FAM и DABCYL являются флуоресцентными маркерами.
Эти праймеры могут использоваться для определения статуса PDLIM4, уровня экспрессии, однако не позволяют получить информацию об экспрессирующихся изоформах гена.
Техническая задача, на достижение которой направлено изобретение, является разработка набора праймеров для быстрого проведения анализа статуса и определения уровней экспрессии PDLIM4 методом ОТ-ПЦР-РВ. Определение уровней экспрессии PDLIM4 достигается за счет использования флуресцентно-меченого зонда, позволяющиего проводить контроль динамики накопления флуоресцентного продукта реакции и расчитывать на основании этих данных уровни экспрессии соответствующих изоформ PDLIM4.
Предложен набор синтетических олигонуклеотидов для экспрессионного анализа PDLIM4. Статус PDLIM4 определяют методом ПЦР в реальном времени. Уровень экспрессии PDLIM4 определяют в ходе ПЦР-РВ за счет определения скорости накопления флуоресцентного продукта реакции. ПЦР проводят с использованием одного из предложенных наборов олигонуклеотидов, состоящих из концевых праймеров для проведения амплификации целевого участка кДНК PDLIM4 - области стыка либо экзонов 2-3 (для определения количества суммарных изоформ PDLIM4), либо экзонов 6-7 (для определения полноразмерной изоформы PDLIM4). Набор содержит разрушаемый в ходе реакции флуоресцентно-меченый зонд.
Зонд для ПЦР в реальном времени является олигонуклеотидом, к которому присоединены молекула флуорофора (карбоксифлуоресцеин (FAM)) и молекула гасителя флуоресценции (Black Hole Quenchers (BHQ)).
Например, Black Hole Quencher-1 deoxythymidine (BHQ1-dT), см. на фиг. 1.
Технический результат: Предложенное изобретение позволяет быстро, чувствительно и специфично определять уровни экспрессии полноразмерной изоформы гена PDLIM4, а также тотальной совокупности изоформ PDLIM4, в том числе в клиническом резекционном либо биопсийном материале, полученном от пациентов с опухолями молочной железы, для более точного установления фенотипических характеристик заболевания.
Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена PDLIM4 методом ПЦР в реальном времени, включающий праймеры и зонды следующей нуклеотидной последовательности:
PDLIM4-2-3-dir ACCATCTCACGGGTCCAT (SEQ ID NO: 1),
PDLIM4-2-3-rev GGATCTCAGGATCGATGTGG (SEQ ID NO: 2),
PDLIM4-2-3-probe FAM-ACCGCATCAAGGGCTGCCAC-BHQ (SEQ ID NO: 3),
PDLIM4-6-7-dir CTCCGAGGTGTACAGGATG (SEQ ID NO: 4),
PDLIM4-6-7-rev ATGGTGCCCACGATGC ((SEQ ID NO: 5),
PDLIM4-6-7-probe FAM-GCCGCGGAGCCCAAGCAGTC-BHQ (SEQ ID NO: 6).
Заявляемый набор праймеров применяют следующим образом.
1. Получение биологического материала от пациента. В качестве образцов для проведения анализа могут быть использованы биоптаты опухолей либо резекционный материал, полученный от пациентов.
2. Выделение и очистка препаратов РНК из исходных образцов. Способы выделения РНК из биологического материала хорошо известны специалистам и, как правило, включают стадии лизиса клеток, фенол-хлороформной экстракции РНК и ее очистки. Быстрое и качественное выделение РНК можно проводить с использованием коммерчески доступных наборов реагентов.
3. Постановка реакции обратной транскрипции и получения кДНК с использованием универсальной затравки олиго-дТ-18.
4. Амплификация полученных препаратов кДНК с применением предлагаемого набора праймеров, специфичных к стыкам экзонов 2-3 и 6-7 гена PDLIM4 и соответствующих флуоресцентно-меченых зондов.
5. Анализ результатов ПЦР-РВ и определение уровней экспрессии PDLIM4 за счет измерения динамики накопления флуоресцентного продукта реакции.
Реакцию амплификации проводят с использованием специализированного оборудования - амплификатора ПЦР-РВ согласно следующему температурному режиму:
Figure 00000001
Детекция флуоресценции проводится на стадии 2 каждого цикла.

Claims (7)

  1. Набор синтетических олигонуклеотидов для экспрессионного анализа гена PDLIM4 методом ПЦР в реальном времени, включающий праймеры и зонды следующей нуклеотидной последовательности:
  2. PDLIM4-2-3-dir ACCATCTCACGGGTCCAT (SEQ ID NO: 1),
  3. PDLIM4-2-3-rev GGATCTCAGGATCGATGTGG (SEQ ID NO: 2),
  4. PDLIM4-2-3-probe FAM-ACCGCATCAAGGGCTGCCAC-BHQ (SEQ ID NO: 3),
  5. PDLIM4-6-7-dir CTCCGAGGTGTACAGGATG (SEQ ID NO: 4),
  6. PDLIM4-6-7-rev ATGGTGCCCACGATGC ((SEQ ID NO: 5),
  7. PDLIM4-6-7-probe FAM-GCCGCGGAGCCCAAGCAGTC-BHQ (SEQ ID NO: 6).
RU2015156512A 2015-12-29 2015-12-29 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4 RU2612139C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015156512A RU2612139C1 (ru) 2015-12-29 2015-12-29 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015156512A RU2612139C1 (ru) 2015-12-29 2015-12-29 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2612139C1 true RU2612139C1 (ru) 2017-03-02

Family

ID=58459240

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015156512A RU2612139C1 (ru) 2015-12-29 2015-12-29 Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2612139C1 (ru)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009036922A2 (en) * 2007-09-17 2009-03-26 Oncomethylome Sciences Sa Novel markers for bladder cancer detection
WO2012172511A1 (en) * 2011-06-16 2012-12-20 Universita' Degli Studi Di Trieste Method for the prognosis of breast cancer based on the expression of the gene pin1 in combination with mutations in the gene tp53
RU2547583C2 (ru) * 2013-08-30 2015-04-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Способ диагностики рака молочной железы

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009036922A2 (en) * 2007-09-17 2009-03-26 Oncomethylome Sciences Sa Novel markers for bladder cancer detection
WO2012172511A1 (en) * 2011-06-16 2012-12-20 Universita' Degli Studi Di Trieste Method for the prognosis of breast cancer based on the expression of the gene pin1 in combination with mutations in the gene tp53
RU2547583C2 (ru) * 2013-08-30 2015-04-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Способ диагностики рака молочной железы

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11220716B2 (en) Methods for predicting the prognosis of breast cancer patient
Ntoulia et al. Detection of Mammaglobin A-mRNA-positive circulating tumor cells in peripheral blood of patients with operable breast cancer with nested RT-PCR
CN103602724B (zh) 确定肝细胞癌亚型和检测肝癌干细胞的方法
Sieuwerts et al. Which cyclin E prevails as prognostic marker for breast cancer? Results from a retrospective study involving 635 lymph node–negative breast cancer patients
CN105316341B (zh) 一种LncRNA及其在作为前列腺癌检测标记物或前列腺癌预后复发标记物中的应用
ES2608322T3 (es) Procedimiento para predecir la respuesta a la quimioterapia en un paciente que padece o está en riesgo de desarrollar cáncer de mama recurrente
WO2015071876A2 (en) Use of microrna markers for diagnosis of thyroid tumors and a diagnostic panel containing such markers.
BRPI0709397A2 (pt) propagação de células primárias
KR20180029936A (ko) 신규한 간암 진단용 바이오 마커 및 이의 용도
ES2963390T3 (es) Método para predecir la eficacia de la quimioterapia en pacientes con cáncer de mama
US8512949B2 (en) Diagnosis/treatment option for head-and-neck tumor using micro-RNA as biomarker
Magbanua et al. Approaches to isolation and molecular characterization of disseminated tumor cells
CN110229899B (zh) 用于结直肠癌早期诊断或预后预测的血浆标记物组合
Oezkan et al. Rapid and highly sensitive detection of therapeutically relevant oncogenic driver mutations in EBUS-TBNA specimens from patients with lung adenocarcinoma
CN110004229A (zh) 多基因作为egfr单克隆抗体类药物耐药标志物的应用
US20110065115A1 (en) Methods for identifying an increased likelihood of recurrence of breast cancer
JP2016086678A (ja) 腎がんの悪性度の検査マーカー及び検査方法
RU2612139C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4
WO2014057279A1 (en) Micro-rna biomarkers for prostate cancer
JP2011511635A (ja) 癌標識としての結腸癌関連転写因子1(ccat−1)
JP6612509B2 (ja) 大腸癌の予後診断を補助する方法、記録媒体および判定装置
Lebbe et al. A reliable method for the selection of exploitable melanoma archival paraffin embedded tissues for transcript biomarker profiling
Wang et al. A high-throughput method to detect RNA profiling by integration of RT-MLPA with next generation sequencing technology
US20090011423A1 (en) Genes for prognosis of cancer
US20190227023A1 (en) Biomarkers and label-free nucleic acid biomarker detection in cancer and other diseases

Legal Events

Date Code Title Description
QB4A Licence on use of patent

Free format text: LICENCE FORMERLY AGREED ON 20210623

Effective date: 20210623