JP2010535500A5

JP2010535500A5 -

Info

Publication number: JP2010535500A5
Application number: JP2010519882A
Authority: JP
Filing date: 2008-08-05
Publication date: 2014-01-23
Anticipated expiration: 2028-08-05

Claims

以下の工程を含む、少なくとも2つのストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に対して免疫応答を誘引することができるストレプトコッカス・ウベリスタンパク質を同定する方法：
a）分泌タンパク質、表面結合タンパク質及び／又は配列番号１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、又は１９０のタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性を有するタンパク質を同定する工程；
b）少なくとも2つのストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型で保存されている、工程a）で同定した少なくとも1つのタンパク質を選択する工程；及び
c）工程b）で選択した少なくとも1つのタンパク質から、第一のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞並びに第二のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞と特異的に結合することができる少なくとも１つのタンパク質を選択する工程。
前記分泌タンパク質及び／又は表面結合タンパク質が、ストレプトコッカス・ウベリスのゲノム配列において、分泌及び／又は表面結合タンパク質のモチーフを含む遺伝子を同定することによって同定される、請求項１に記載の方法。
配列番号１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、又は１９０のタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性を有する前記タンパク質が、ストレプトコッカス・ウベリスのゲノム配列において、配列番号１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、又は１９０のタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性を有するタンパク質を同定することによって同定される、請求項１又は２に記載の方法。
配列番号１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、又は１９０のタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性を有する前記タンパク質が、配列番号１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、又は１８９の完全長ヌクレオチド配列と、0.5Mリン酸ナトリウム、1mM EDTA及び7％ドデシル硫酸ナトリウムを有するpH7.2の緩衝液中で65℃にてハイブリダイズする遺伝子を、ストレプトコッカス・ウベリスのゲノム配列において同定することによって同定される請求項１、２又は３に記載の方法であって、
前記核酸分子が、40mMリン酸ナトリウム（pH7.2）、1mM EDTA及び5％ドデシル硫酸ナトリウムを含む緩衝液で65℃にて30分間2回洗浄し、さらに40mMリン酸ナトリウム（pH7.2）、1mM EDTA及び1％ドデシル硫酸ナトリウムを含む緩衝液で65℃にて30分間2回洗浄した後でハイブリダイズしたままである、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
少なくとも2つのストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型で保存されている遺伝子を選択する工程をさらに含む、請求項２〜４のいずれか１項に記載の方法。
前記遺伝子によってコードされるタンパク質を入手する工程をさらに含む、請求項５に記載の方法。
前記遺伝子が原核細胞発現系で発現される、請求項２〜６のいずれか１項に記載の方法。
以下の工程を含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法：
−単離及び／又は組換えストレプトコッカス・ウベリスタンパク質を入手する工程；
−前記タンパク質を、第一のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞、並びに第二のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞とともにインキュベートする工程；及び
−タンパク質が、第一のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞、並びに第二のストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に感染した動物の抗体及び／又は免疫細胞と結合することができるか否かを決定する工程。
前記タンパク質をコードする核酸配列を用いて、前記タンパク質を発現させる工程をさらに含む、請求項８に記載の方法。
前記抗体及び／又は免疫細胞が回復期血清に由来する、請求項１〜９のいずれか１項に記載の方法。
前記ストレプトコッカス・ウベリスタンパク質がオプソニン食菌作用誘発抗体を誘引することができる、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
少なくとも2つのストレプトコッカス・ウベリス株及び／又は血清型に対して免疫応答を誘引することができる少なくとも2つのストレプトコッカス・ウベリスタンパク質が同定される、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。