JP2009543084A - 免疫抑制薬に関する均一系二重受容体凝集アッセイ - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書中で用いる「検出用粒子」なる語は、均一系アッセイにおいて凝集状態と非凝集状態との識別を可能にする約10nm〜約1000nmの範囲の直径の概ね球状の形状を有する任意の粒子を意味する。該検出用粒子はナノ粒子または微粒子でありうるが、便宜上の目的で、本明細書においては、すべてのそのような粒子は「微粒子」と称される。該検出用粒子の表面は官能基化されることが可能であり、例えば発蛍光団、化学発光物質、抗体、ビオチンまたはストレプトアビジンを含む種々の化合物が該表面に結合されうる。
(実施例)
該合成cDNAおよび2組のオリゴヌクレオチドプライマーを使用して、yTOR1 FRBDおよびyTOR2 FRBDに対応する約300bpのDNA断片をPCR増幅した。これらのDNA断片を発現ベクターpIVEX2.7dまたはpIVEX2.8d(Roche Diagnostics GmbH, Germany)内にクローニングした。DNA配列決定により確認された、得られたプラスミドは、AviTag化標的タンパク質を発現することが可能であり、該タンパク質は、ラパマイシン結合FKBP12に結合しうるだけでなく、唯一(ユニーク)のリシン残基においてビオチンリガーゼBirAにより特異的にビオチン標識されうる。
5’ CTTTAAGAAGGAGATATACCATGGAACTTTGGTATGAAGGACTC 3’
配列番号4(yTOR1 FRBDに対するリバースプライマー):
5’ AAGATGTCGTTCAGGCCCCCTTGACGAGTAATTTTGCGAAA 3’
配列番号5(yTOR2 FRBDに対するフォワードプライマー):
5’ CGCTTAATTAAACATATGACCGAACAATGGTATGAAGGCCTG 3’
配列番号6(yTOR2 FRBDに対するリバースプライマー):
5’ TTAGTTAGTTACCGGATCCCTTACTGTTTACCGATTTTGCGAAA 3’。
Roche Diagnostics Corporationの無細胞Rapid Translation System(RTS)を使用する選択の後、最適発現構築物をBirA発現ベクターと共にBL21-A1細胞内に形質転換し、50μM ビオチン、0.2% アラビノースおよび0.2mM イソプロピルβ-D-チオガラクトピラノシド(IPTG)の存在下、30℃で16時間誘導した。発現された組換えタンパク質を修飾アビジンビーズおよびサイズ排除クロマトグラフィーにより約90%の純度まで精製した。
2つのオリゴヌクレオチドプライマーを使用して、カルボキシル末端に複数のグリシンおよびヒスチジンアミノ酸を有するFKBP12をコードするDNA断片をPCRで得、それを発現ベクターpIVEX2.7dのNcoI/SmaI部位内にクローニングした。DNA配列決定により確認された、得られたプラスミドは、15.0kDaの推定分子量を有する融合タンパク質を発現することが可能であり、該融合タンパク質はラパマイシン、ニッケルNTAマトリックスに結合することが可能であり、AviTag特異的LysにおいてビオチンリガーゼBirAによりビオチン標識されうる。
前記発現ベクターおよびBirAを発現するベクターを含有する形質転換されたBL21-A1細胞を0.2%アラビノースおよび0.4 mMイソプロピルIPTGにより30℃で16時間誘導した。発現された組換えタンパク質を、それぞれNi-NTAアガロースおよびMono-Avidinビーズ(Pierce)を使用する連続的アフィニティ精製により約95%まで精製した。
ストレプトアビジン微粒子(127nm)(SA-Latex Universalreagenz ZLF, Mat. No 03140431001)をRoche Diagnostics GmbH, Germanyから入手した。最終濃度は50mM MOPS(3-(N-モルホリノ)プロパンスルホン酸)(pH7.9)中で0.3%(w/v)であった。
実施例3からのビオチン化yTOR FRBD(0.35mg/mLの300μL)を50mM MOPSバッファー(pH7.9)に加えた。このビオチン化タンパク質溶液を50mM MOPS(pH7.9)中の0.3%(w/v)ストレプトアビジン微粒子(127nm)の攪拌懸濁液5.2mLに室温で全て一度に加えた。該反応を室温で2時間および4℃で一晩攪拌し、ついで16,000rpmで1時間45分にわたって遠心分離した。該微粒子を50mM MOPSバッファー(pH7.9)に再懸濁させ、ついで16,000rpmで遠心分離した。再懸濁および遠心分離の過程をもう一度繰返し、yTOR1 FRBDコート化微粒子の最終濃度を0.15(w/v)に調節した。
0.5%ポリアクリル酸(PAA)を含有する175mM PIPESバッファー(pH7.4)を調製することにより、反応バッファー試薬を調製した。これを第1実施試薬とする。
配列番号11(mTOR FRBDに対するプライマー1):
5' CTTTAAGAAGGAGATATACCATGGAAATGTGGCATGAAGGACTTGAA 3'
配列番号12(mTOR FRBDに対するプライマー2):
5' AAGATGTCGTTCAGGCCCCCTTGTTTTGAGATACGGCGGAA 3'。
ビオチン標識されたAviTag化mTOR FRBDを製造するために、Rocheの無細胞Rapid Translation System(RTS)を使用した。精製されたプラスミドDNAをRTS反応試薬およびビオチン化試薬の両方と共にRTS 500 ProteoMaster反応装置内で18時間インキュベートした。生じた組換えタンパク質を修飾アビジンビーズにより約95%の純度まで精製した。
FKBP12コート化微粒子を、実施例6に記載されているのと類似の方法に従い製造した。ストレプトアビジン微粒子(SA-Latex Universalreagenz ZLF, Mat. No 03140431001)をRoche Diagnostics GmbH, Germanyから入手した(127nm)。最終濃度は50mM MOPS(3-(N-モルホリノ)プロパンスルホン酸)(pH7.9)中で0.3%(w/v)であった。
実施例11からのビオチン化m-TOR FRBD(2mg/mLの50μL)を5mLの50mM MOPSバッファー(pH7.9)に加えた。このビオチン化タンパク質溶液を50mM MOPS(pH7.9)中の0.3%ストレプトアビジン微粒子(127nm)の攪拌懸濁液5mLに全て一度に加えた。該反応を室温で2時間攪拌し、ついで16,000rpmで1時間45分にわたって遠心分離し、タンパク質-ストレプトアビジン微粒子の最終濃度を0.15(w/v)に調節した。
1:1の比(v/v)のFKBP12コート化微粒子およびmTOR FRBDコート化微粒子を混合することにより、第1実施試薬を得た。この試薬は、50mM MOPSバッファー中の0.15%の最終濃度で使用した。
ヒト血液サンプルに25ng/mLのラパマイシンを添加し、前記の方法に従い抽出を行い、図4に示す検量線を使用して該濃度を2回の反復実験において24.7ng/mLおよび24.6ng/mLと決定した。
末端切断型カルシニューリンAおよびBのcDNA
以下の最適化ヌクレオチド酸配列(配列番号14)を有する、末端切断型ヒトカルシニューリンA(アミノ酸12-394)および野生型鎖B(アミノ酸1-170)をコードするcDNAが、Blue Heron Biotechnology(Seattle, WA)により化学的に合成された。
前記合成cDNAおよび2組のオリゴヌクレオチドプライマーを使用して、それぞれCNtAB-long(長形態)およびCNtAB-short(短形態)に対応する2つのDNA断片をPCR増幅した。2つの異なる形態のHisタグ付きキメラカルシニューリンA/Bタンパク質を発現させるために、これらのDNA断片をRocheの無細胞発現ベクターpIVEX2.3d内にクローニングした。
Roche無細胞Rapid Translation System(RTS)による予備スクリーニングの後、選択された最適発現構築物をBL21-A1細胞内に形質転換し、標的タンパク質を、0.2%アラビノースおよび0.4M IPTGの存在下、37℃で15時間誘導しながら発現させた。発現された組換えタンパク質CNtAB-longまたはCNtAB-shortを、Ni-NTAアガロース上でのアフィニティ精製およびそれに続くサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200, GE)により、それぞれ約85%または約95%の純度まで精製した。
FK506結合FKBP12への末端切断型カルシニューリンA/B融合体CNtABの結合活性を参照時間分解蛍光アッセイ(TRF)および他のアッセイにより評価した。TRFアッセイにおいては、黒色96ウェルプレート(Perkin Elmer)を、0.1M NaHCO3中、精製Hisタグ付きCNtAB-longまたはCNtAB-shortで4℃で一晩コーティングした。ついで、タンパク質でコーティングされたプレートを、0.1M Tris HCl、0.15M NaClおよび20μM ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)を含有するバッファーA中の7.5% BSAでブロッキングした。一方、実施例5からのビオチン標識FKBP12をEu標識ストレプトアビジン(Perkin Elmer)と共に氷上で30分間インキュベートすることにより、FKBP12-ユウロピウム(Eu)コンジュゲートを調製した。ブロッキング後、コート化96ウェルプレートを、0.1M Tris HCl、0.15M NaCl、0.1% TWEEN(ICI Americas, Inc.)および20μM DTPAを含有するバッファーBで洗浄した。ついで、調製されたFKBP12-EuコンジュゲートをCNtAB-longまたはCNtAB-shortコート化プレートに加えた。一連の異なる濃度のFK506を該プレートに加えてFKBP12-FK506-CNtAB複合体の形成を開始させた。室温で1時間半のインキュベーションの後、該プレートをバッファーBで数回洗浄した。最終的に、強化溶液(Perkin-Elmer)を該プレートに加え、穏やかに振とうしながら室温で5分間インキュベートした。ついで、Wallac, Inc. VICTOR2Vマイクロタイター多プレートリーダーを使用して、プレートを読み取った。示されている相対蛍光値は、三重データ点の平均から導き出されたものである。
Claims (34)
- サンプル中の免疫抑制薬の存在または量を決定するためのアッセイ方法であって、
サンプルを準備し、
該サンプルを第1受容体および第2受容体と混合して懸濁液を形成させ、ここで、第1および第2受容体は検出用粒子と結合しており、第1および第2受容体のそれぞれは該薬物上の別々の結合部位に特異的に結合するものであり、該薬物の存在は該検出用粒子の凝集を引き起こすものであり、
該懸濁液中の粒子凝集の量を直接的に検出または測定し、
粒子凝集の量を該サンプル中の免疫抑制薬の存在または量と相関させる工程を含んでなる方法。 - 該免疫抑制薬が、シクロスポリン、タクロリムス、ラパマイシンおよびエベロリムスよりなる群から選ばれ、第1受容体がイムノフィリンまたはその結合性断片である、請求項1記載の方法。
- 該検出用粒子が、微粒子およびナノシェルよりなる群から選ばれる、請求項1記載の方法。
- 該免疫抑制薬がラパマイシンまたはエベロリムスであり、
第1受容体がFK506結合性タンパク質(FKBP)を含み、
第2受容体がラパマイシン標的(TOR)タンパク質を含む、請求項1記載の方法。 - 該FKBPがFKBP12またはFKBP25の1つを含み、第2受容体が、mTOR、mTORのFKBP結合ドメイン、yTOR1、yTOR1のFKBP結合ドメイン、yTOR2、およびyTOR2のFKBP結合ドメインよりなる群から選ばれる、請求項4記載の方法。
- 該免疫抑制薬がタクロリムスであり、
第1受容体がFK506結合性タンパク質(FKBP)を含み、
第2受容体がカルシニューリンまたはその結合性断片を含む、請求項1記載の方法。 - 該カルシニューリンに、カルシウムイオンおよびカルモジュリンの両方が結合している、請求項6記載の方法。
- 該免疫抑制薬がシクロスポリンであり、
第1受容体がシクロフィリンを含み、
第2受容体がカルシニューリンを含む、請求項1記載の方法。 - 該カルシニューリンに、カルシウムイオンおよびカルモジュリンの両方が結合している、請求項8記載の方法。
- 該サンプルが、少なくとも1つの免疫抑制薬が投与されている患者から得られた血液サンプルである、請求項3記載の方法。
- 該血液サンプルを該混合工程の前に処理する、請求項10記載の方法。
- 該検出用粒子がナノシェルである、請求項3記載の方法。
- 該検出用粒子がビオチン-ストレプトアビジンまたはビオチン-アビジン連結を介して第1および第2受容体と結合している、請求項3記載の方法。
- 該検出用粒子が、リンカーを介して間接的に/又は直接的に、第1および第2受容体と共有結合している、請求項3記載の方法。
- リンカーが、第1受容体に対する抗体、および第2受容体に対する抗体を含む、請求項14記載の方法。
- 第1および第2受容体が、ビオチン分子のための付加用部位を含む組換え融合タンパク質である、請求項13記載の方法。
- 該付加用部位がビオチン化シグナル配列を含む、請求項16記載の方法。
- 該融合タンパク質が、該シグナル配列内の残基へのビオチン分子の共有結合性付加を触媒するビオチンリガーゼと共に同時発現される、または該ビオチンリガーゼの存在下で発現される、請求項17記載の方法。
- 該ビオチンリガーゼがAviTagからなり、該残基がリシンである、請求項18記載の方法。
- 該融合タンパク質の融合パートナーの1つが、C末端およびN末端を有する組換え受容体タンパク質であり、1つの融合パートナーがビオチン化シグナル配列を含み、該付加用部位が第1受容体についてはそのC末端に位置する場合、第2受容体についてはそのN末端またはC末端のいずれかに位置する、請求項17記載の方法。
- サンプル中の免疫抑制薬を決定するための試薬であって、
第1検出用粒子に結合した第1受容体を含む第1薬物結合性複合体、
検出用粒子に結合した第2受容体、第2検出用粒子に結合した免疫抑制薬特異的抗体、および第2受容体と複合体形成した第2受容体特異的抗体よりなる群から選ばれる結合性部分を含む第2薬物結合性複合体を含んでなり、
各薬物結合性複合体が該免疫抑制薬上の別々の結合部位に特異的に結合する、試薬。 - 該結合性部分が、検出用粒子と結合している第2受容体である、請求項21記載の試薬。
- 検出すべき免疫抑制薬がラパマイシンであり、第1薬物結合性複合体がFK506結合性タンパク質を含み、第2薬物結合性複合体がラパマイシン標的(TOR)タンパク質を含む、請求項22記載の試薬。
- 該検出用粒子が微粒子である、請求項21記載の試薬。
- 第2薬物結合性複合体が、第2受容体と複合体形成した第2受容体特異的抗体を含む、請求項21記載の試薬。
- サンプル中の免疫抑制薬の存在または量を決定するための方法であって、
サンプルを準備し、
該サンプルを、第1検出用粒子と結合した受容体、ならびに第2検出用粒子と結合した免疫抑制薬特異的抗体および第2受容体と複合体形成した第2受容体特異的抗体よりなる群から選ばれる結合性部分と混合して懸濁液を形成させ、ここで、該受容体は、該免疫抑制薬特異的抗体が結合する位置とは異なる位置において該免疫抑制薬に特異的に結合し、該薬物の存在が該検出用粒子の凝集を引き起こし、
吸光度測定により該懸濁液中の粒子凝集の量を測定し、
粒子凝集の量を該サンプル中の免疫抑制薬の存在または量と相関させる工程を含んでなる方法。 - 該免疫抑制薬が、シクロスポリン、タクロリムス、ラパマイシンおよびエベロリムスよりなる群から選ばれ、該結合性部分が、該免疫抑制薬に特異的な抗体であり、該抗体が検出用粒子と結合している、請求項26記載の方法。
- 該免疫抑制薬がラパマイシンまたはエベロリムスであり、
第1受容体がFK506結合性タンパク質(FKBP)を含み、
該結合性部分が、ラパマイシン標的(TOR)タンパク質、またはラパマイシン標的(TOR)タンパク質に特異的に結合する抗体を含む、請求項26記載の方法。 - 該免疫抑制薬がタクロリムスであり、
第1受容体がFK506結合性タンパク質(FKBP)を含み、
第2受容体が、カルシニューリン、またはカルシニューリンに特異的に結合する抗体を含む、請求項26記載の方法。 - 該免疫抑制薬がシクロスポリンであり、
第1受容体がシクロフィリンを含み、
第2受容体が、カルシニューリン、またはカルシニューリンに特異的に結合する抗体を含む、請求項24記載の方法。 - 免疫抑制薬を検出するためのキットであって、
該免疫抑制薬上の2つの別々の位置において標的免疫抑制薬に特異的に結合し、それぞれ更にタグを含む第1受容体および第2受容体、ならびに
該タグに結合する物質にそれぞれが結合している複数の検出用粒子を含んでなるキット。 - サンプル中の免疫抑制薬を検出するためのキットであって、
第1検出用粒子と結合しているイムノフィリンの懸濁液を含む第1試薬、
FKBP-ラパマイシン関連タンパク質、カルシニューリン、およびカルシニューリンに対する抗体よりなる群から選ばれる受容体タンパク質の懸濁液を含む第2試薬を含んでなり、ここで、第2受容体タンパク質は検出用粒子に結合されており、該検出用粒子は、微粒子およびナノシェルよりなる群から選ばれる、キット。 - 活性ラパマイシンを検出するためのキットであって、
第1検出用粒子に連結されたFK506結合性タンパク質(FKBP)を含む第1試薬、
第2検出用粒子に連結されたラパマイシン標的(TOR)タンパク質を含む第2試薬を含んでなり、ここで、第1および第2検出用粒子は、独立して、微粒子およびナノシェルよりなる群から選ばれる、キット。 - 該FKBPタンパク質がFKBP12またはFKBP25であり、FKBP-ラパマイシン関連タンパク質が、mTOR、mTORのFKBP結合ドメイン、yTOR1、yTOR1のFKBP結合ドメイン、yTOR2、およびyTOR2のFKBP結合ドメインよりなる群から選ばれる、請求項33記載のキット。
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