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  1. 以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたタンパク質:
    a) 配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列、およびその生物学的に活性な断片からなる群より選択されるアミノ酸配列;
    b) 配列番号:3とまたは配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性、フィトエンシンターゼ(PS)活性、およびリコペンシクラーゼ(LC)活性、を有するアミノ酸配列;
    c) 配列番号:5と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性を有するアミノ酸配列;
    d) 配列番号:7と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンシンターゼ(PS)活性を有するアミノ酸配列;
    e) 配列番号:9と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がリコペンシクラーゼ(LC)活性を有するアミノ酸配列。
  2. 配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列、およびその生物学的に活性な断片からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の単離されたタンパク質。
  3. 以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の単離されたタンパク質:
    a) 配列番号:3とまたは配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性、フィトエンシンターゼ(PS)活性、およびリコペンシクラーゼ(LC)活性、を有するアミノ酸配列;
    b) 配列番号:5と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性を有するアミノ酸配列;
    c) 配列番号:7と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンシンターゼ(PS)活性を有するアミノ酸配列;ならびに
    d) 配列番号:9と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がリコペンシクラーゼ(LC)活性を有するアミノ酸配列。
  4. ヤブレツボカビ目の微生物に由来する、請求項1記載の単離されたタンパク質。
  5. 前記の単離されたタンパク質はシゾキトリウム属の微生物に由来する、請求項1記載の単離されたタンパク質。
  6. 以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたタンパク質:
    a) 配列番号:5および配列番号:7を含むアミノ酸配列;ならびに
    b) (a)のアミノ酸配列と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性およびフィトエンシンターゼ(PS)活性、を有するアミノ酸配列。
  7. 配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、および配列番号:9からなる群より選択されるアミノ酸配列に選択的に結合する、単離された抗体。
  8. 請求項1〜6のいずれか一項記載の単離されたタンパク質をコードする核酸配列を含む、単離核酸分子。
  9. 転写制御配列に機能的に連結された請求項8記載の単離核酸分子を含む組換え核酸分子。
  10. 転写制御配列が組織特異的転写制御配列である、請求項9記載の組換え核酸分子。
  11. 標的化配列をさらに含む、請求項9記載の組換え核酸分子。
  12. 請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された組換え細胞。
  13. 生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変微生物であって、該微生物が請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された、遺伝子改変微生物。
  14. 生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変微生物であって、該微生物がカロチンシンターゼをコードする核酸分子を含み、かつカロチンシンターゼをコードする該核酸分子が該カロチンシンターゼの発現または生物活性を増加させるために改変されている遺伝子改変微生物であり、該カロチンシンターゼが請求項1記載のタンパク質を含む遺伝子改変微生物。
  15. カロチンシンターゼをコードする核酸分子が微生物の内在性遺伝子および該カロチンシンターゼをコードする核酸分子からなる群より選択され、これにより微生物が形質転換されている、請求項14記載の遺伝子改変微生物。
  16. カロチンシンターゼをコードする内在性遺伝子を含みかつ該カロチンシンターゼをコードする組換え核酸分子で形質転換され、該遺伝子および該組換え核酸分子のうちの一方または両方が該カロチンシンターゼの発現または生物活性を増加させるために改変された、請求項15記載の遺伝子改変微生物。
  17. ヤブレツボカビ目の微生物である、請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物。
  18. シゾキトリウム属の微生物である、請求項17記載の遺伝子改変微生物。
  19. 請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物を含むバイオマス。
  20. 食品および医薬品からなる群より選択される、請求項19記載のバイオマスを含む製品。
  21. 生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変植物であって、該植物が請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された、遺伝子改変植物。
  22. 生合成過程によりカロチノイドを産生するための方法であって、請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物を発酵培地中で培養する段階を含む方法。
  23. 微生物がヤブレツボカビ目の微生物である、請求項22記載の方法。
  24. 微生物がシゾキトリウム属の微生物である、請求項23記載の方法。
  25. 生合成過程によりカロチノイドを産生するための方法であって、請求項21記載の遺伝子改変植物を増殖させる段階を含む方法。
  26. 配列番号:1、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、およびそれに完全に相補的な核酸配列からなる群より選択される核酸配列の少なくとも12個の連続ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
  27. 色素沈着がない遺伝子改変微生物であって、該微生物がカロチンシンターゼ遺伝子または機能ドメインをコードするその一部分を選択的に欠失させるかまたは不活化させるために遺伝子改変されており、該カロチンシンターゼ遺伝子が請求項9記載の核酸分子を含む遺伝子改変微生物。
  28. カロチンシンターゼ遺伝子が配列番号:3により示される核酸配列を含む、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  29. ヤブレツボカビ目の微生物である、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  30. シゾキトリウム属の微生物である、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  31. カロチンシンターゼ遺伝子が、その遺伝子の発現を阻害するために調節領域で改変されている、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  32. カロチンシンターゼ遺伝子が、微生物が機能的なカロチンシンターゼを産生しないように部分的にまたは完全に欠失されている、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  33. カロチンシンターゼ遺伝子が、該カロチンシンターゼ遺伝子にハイブリダイズして該カロチンシンターゼ遺伝子のコード領域を破壊する異種核酸配列を含む核酸配列を用いた標的相同組換えにより突然変異しているかまたは不活化している、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
  34. 同一種の野生型微生物と比べて色素沈着が減少している遺伝子改変微生物を含むバイオマスであって、該微生物が請求項27記載の微生物であるバイオマス
  35. 請求項34記載のバイオマスを含む食品。
  36. 生合成過程から色素沈着がない脂質を産生するための方法であって、該脂質を産生させるのに効果的な条件の下で遺伝子改変微生物を培養する段階を含む方法であり、該微生物が請求項27記載の微生物である方法
  37. 遺伝子改変微生物の培養物から脂質を回収する段階をさらに含む、請求項36記載の方法。
  38. 遺伝子改変微生物の培養物から回収される色素沈着がない脂質であって、該微生物が請求項27記載の微生物である脂質
  39. 食品および医薬品からなる群より選択される、請求項38記載の脂質を含む製品。
  40. カロチノイドを産生させるのに十分な条件の下で基質を単離されたカロチンシンターゼと接触させる段階を含む、カロチノイドを産生するための方法であって、該単離されたカロチンシンターゼが請求項1〜6のいずれか一項記載のタンパク質を含む方法
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Families Citing this family (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003097798A2 (en) * 2002-05-14 2003-11-27 Martek Biosciences Corporation Carotene synthase gene and uses therefor
KR101482081B1 (ko) 2005-03-18 2015-01-13 마이크로비아 인크. 유질 효모와 진균 내에서 카로티노이드의 생산
CN100562524C (zh) * 2006-07-24 2009-11-25 中国科学院植物研究所 一种植物抗逆相关蛋白及其编码基因与应用
US8161971B2 (en) 2006-08-04 2012-04-24 Ric Investments, Llc Nasal and oral patient interface
EP2078092A2 (en) 2006-09-28 2009-07-15 Microbia, Inc. Production of carotenoids in oleaginous yeast and fungi
CN101979587B (zh) * 2010-10-14 2013-05-01 浙江大学 少动鞘氨醇单胞菌的八氢番茄红素脱氢酶基因及其应用
US9113653B2 (en) 2011-08-19 2015-08-25 Steven J Maranz Methods of administering probiotic organisms that synthesize carotenoid compounds in situ to enhance human health and nutrition
CN102585007B (zh) * 2012-02-27 2013-12-04 华中农业大学 用于检测β-胡萝卜素类色素的单克隆抗体及酶联免疫方法与试剂盒
CN104419701B (zh) * 2013-08-29 2019-01-11 天津大学 多片段dna的酵母快速组装方法
JP2016010347A (ja) * 2014-06-27 2016-01-21 国立大学法人広島大学 カロテノイド合成酵素およびその利用
CN104152474B (zh) * 2014-08-18 2019-06-28 中国烟草总公司郑州烟草研究院 烟草番茄红素β环化酶基因及其应用
JP6682109B2 (ja) * 2015-01-09 2020-04-15 国立大学法人 宮崎大学 ヤブレツボカビ類を用いたリグニン分解活性を有するタンパク質の製造方法
WO2016200720A1 (en) 2015-06-06 2016-12-15 Dsm Ip Assets B.V. Production of polyunsaturated fatty acids (pufas) using a novel modular docosahexaenoic acid (dha) synthase
CA3046436A1 (en) * 2016-12-16 2018-06-21 Deinove Methods of producing phytoene
CN109536518A (zh) * 2018-10-31 2019-03-29 昆明理工大学 一种八氢番茄红素脱氢酶基因RKcrtI及其应用
CN110423765A (zh) * 2019-08-29 2019-11-08 南京大学 一种番茄红素ε-环化酶基因及其编码蛋白和应用
CN111171129B (zh) * 2020-03-09 2022-02-01 山东省农业科学院作物研究所 小麦类胡萝卜素合成途径关键基因Lcye突变体及其应用
CN111647570A (zh) * 2020-05-07 2020-09-11 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 一种橡胶树八氢番茄红素脱氢酶HbPDS及其编码基因
WO2023148187A1 (en) 2022-02-02 2023-08-10 Dsm Ip Assets B.V. Yarrowia production process
CN114703225B (zh) * 2022-04-09 2023-05-16 吉林省农业科学院 一种利用基因编辑技术提高玉米籽粒类胡萝卜素含量的方法

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NL8300698A (nl) 1983-02-24 1984-09-17 Univ Leiden Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van tweezaadlobbige planten; agrobacterium tumefaciens bacterien en werkwijze voor het produceren daarvan; planten en plantecellen met gewijzigde genetische eigenschappen; werkwijze voor het bereiden van chemische en/of farmaceutische produkten.
GB8422238D0 (en) 1984-09-03 1984-10-10 Neuberger M S Chimeric proteins
US4743546A (en) 1985-02-13 1988-05-10 Biotechnica International, Inc. Controlled gene excision
GB8607679D0 (en) 1986-03-27 1986-04-30 Winter G P Recombinant dna product
US5130242A (en) * 1988-09-07 1992-07-14 Phycotech, Inc. Process for the heterotrophic production of microbial products with high concentrations of omega-3 highly unsaturated fatty acids
US6451567B1 (en) * 1988-09-07 2002-09-17 Omegatech, Inc. Fermentation process for producing long chain omega-3 fatty acids with euryhaline microorganisms
IL162181A (en) 1988-12-28 2006-04-10 Pdl Biopharma Inc A method of producing humanized immunoglubulin, and polynucleotides encoding the same
CA2043472A1 (en) 1990-06-04 1991-12-05 Mitsutaka Miyabayashi Electrode for secondary battery
US5605793A (en) 1994-02-17 1997-02-25 Affymax Technologies N.V. Methods for in vitro recombination
EP0823475B1 (en) * 1995-04-17 2009-06-17 National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Novel microorganisms capable of producing highly unsaturated fatty acids and process for producing highly unsaturated fatty acids by using the microorganisms
US6551795B1 (en) 1998-02-18 2003-04-22 Genome Therapeutics Corporation Nucleic acid and amino acid sequences relating to pseudomonas aeruginosa for diagnostics and therapeutics
TR200607442T2 (tr) * 1999-06-25 2007-02-21 Basf Aktiengesellschaft Membran sentezi ve membran nakli dahilinde corynemacterium glutamicum kodlayan proteinler.
US6783951B2 (en) * 2000-02-24 2004-08-31 Long, Ii Thomas Veach Process for production of carotenoids, xanthophylls and apo-carotenoids utilizing eukaryotic microorganisms
EP1360313A4 (en) 2000-11-22 2004-08-04 Cargill Inc CAROTENOID BIOSYNTHESIS
WO2003097798A2 (en) * 2002-05-14 2003-11-27 Martek Biosciences Corporation Carotene synthase gene and uses therefor

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