JP2004519219A5 - - Google Patents

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  1. 対象牛における牛複合脊椎奇形(CVM)を検出する方法であって、多形性マイクロサテライトマーカーBM4129およびBMS1266によって挟まれ、これらを包む領域中の牛染色体BTA3上に位置する、牛複合脊椎奇形(CVM)に関連する少なくとも1つの遺伝子マーカーの存在を同定するものであり、下記:
    a)牛遺伝子材料を準備すること、
    b)該遺伝子材料において、牛複合脊椎奇形病特性に連鎖する少なくとも1つの遺伝子マーカーの存在または不存在を検出すること、
    を含む方法。
  2. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、約59.5cM〜約67.9cMの領域に位置する、請求項1の方法。
  3. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、多形性マイクロサテライトマーカーINRAA003とBMS937に挟まれ、これらを含む領域中に位置する、請求項2の方法。
  4. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、多形性マイクロサテライトマーカーINRAA003とILSTS029に挟まれ、これらを含む領域中に位置する、請求項3の方法。
  5. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーINRAA003である、請求項1の方法。
  6. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーBMS2790である、請求項1の方法。
  7. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーILSTS029である、請求項1の方法。
  8. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーINRA123である、請求項1の方法。
  9. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーBM220である、請求項1の方法。
  10. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーHUJ246である、請求項1の方法。
  11. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーBMS862である、請求項1の方法。
  12. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、マイクロサテライトマーカーBMS937である、請求項1の方法。
  13. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、牛複合脊椎奇形病を起こす遺伝子に連鎖している、請求項1の方法。
  14. 牛複合脊椎奇形病を起こす遺伝子が、牛SLC35A3遺伝子である、請求項13の方法。
  15. 牛SLC35A3遺伝子が、配列番号17に示されるアミノ酸配列を含む牛SLC35A3タンパク質をコードする、請求項14の方法。
  16. 牛SLC35A3タンパク質が、配列番号18のヌクレオチド配列を含むcDNA配列によりコードされる、請求項15の方法
  17. 遺伝子マーカーが、配列番号18のヌクレオチド559に等価の位置での単一ヌクレオチド多形性である、請求項16の方法。
  18. 単一ヌクレオチド多形性が、G/T多形性である、請求項17の方法。
  19. G/T多形性の検出が、対立遺伝子特異的PCR、ミニシークエンス、プライマー伸長法、ピロシークエンス、PCR−RFL、遺伝子特異的ローリングサイクル増幅法およびプライマー伸長法に続くMALDI−TOF質量分析よりなる群から選ばれる技法により行われる、請求項18の方法。
  20. 少なくとも1つの遺伝子マーカーが、牛複合脊椎奇形病を起こす遺伝子または疾患特性に、少なくとも5.0、少なくとも6.0、少なくとも7.0、少なくとも8.0、少なくとも9.0、少なくとも10.0、少なくとも11.0、少なくとも12.0を含む少なくとも4.0などの少なくとも3.0のロッドスコアーで遺伝的に連鎖している、請求項1の方法。
  21. 少なくとも1つのマーカーが、遺伝子マーカーの組合せである、請求項1の方法。
  22. マイクロサテライトマーカーINRAA003を増幅するためのプライマー対が、配列番号1および配列番号2である、請求項5の方法。
  23. マイクロサテライトマーカーBMS2790を増幅するためのプライマー対が、配列番号3および配列番号4である、請求項6の方法。
  24. マイクロサテライトマーカーILSTS029を増幅するためのプライマー対が、配列番号5および配列番号6である、請求項7の方法。
  25. マイクロサテライトマーカーINRA123を増幅するためのプライマー対が、配列番号7および配列番号8である、請求項8の方法。
  26. マイクロサテライトマーカーBM220を増幅するためのプライマー対が、配列番号9および配列番号10である、請求項9の方法。
  27. マイクロサテライトマーカーHUJ246を増幅するためのプライマー対が、配列番号11および配列番号12である、請求項10の方法。
  28. マイクロサテライトマーカーBMS862を増幅するためのプライマー対が、配列番号13および配列番号14である、請求項11の方法。
  29. マイクロサテライトマーカーBMS937を増幅するためのプライマー対が、配列番号15および配列番号16である、請求項12の方法。
  30. 牛複合脊椎奇形(CVM)に関連する少なくとも1つの遺伝子マーカーの対象牛における存在を検出するために使用する診断キットであって、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38およびこれらの組合せよりなる群から選ばれる少なくとも1つのオリゴヌクレオチド配列を含むキット。
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