JP2003515335A - 感染性クローン - Google Patents

感染性クローン

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、(a)RNAウイルスのゲノムRNA(gRNA)の完全長コピーを含有しているDNA;または(b)RNAウイルスのgRNAの1つまたはいくつかのフラグメントを含有しているDNAであって、ここで、フラグメントはRNA依存性のRNAポリメラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク質をコードする;または(c)(a)または(b)の配列に対して少なくとも60%の相同性を有しているDNA;が、細菌の人工染色体(BAC)中にクローン化される工程を含むDNAの調製方法に関する。加えて、コロナウイルスの天然の配列に対して少なくとも60%の相同性を有し、RNA依存性RNAポリメラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク質をコードする、コロナウイルスのゲノムRNA(gRNA)に由来する配列を含むことを特徴とするDNAであって、前記DNAのフラグメントがウイルス粒子に組み立てられ得るRNAに転写され得るDNAが提供される。さらに、ウイルスRNAまたはウイルス粒子を調製するためのこれらの核酸、またはこれらのDNA、ウイルスRNA若しくはウイルス粒子を含む医薬調製物の使用が開示される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、DNAまたはRNAを調製する方法、この方法によって得ることの
できる核酸、およびワクチンとしておよび遺伝子治療のためのそれらの使用に関
する。
【0002】
【従来の技術】
組換えDNA技術の進歩によって、生物間での遺伝子導入の開発における進歩
が導かれてきた。現時点において、多数の努力が、遺伝子導入技術の使用を通じ
た経済的および商業的な目的の、化学品、医薬品、および生物学的な産物の、産
生のために行われている。
【0003】 原核生物細胞および真核生物細胞の両方の遺伝子操作における重要な因子の1
つが、ベクターおよび宿主ベクターシステムの開発である。一般的には、ベクタ
ーは、宿主細胞中で複製または発現し得る核酸分子である。ベクター−宿主シス
テムが、ベクターを保有している宿主細胞として定義され得、そしてこれによっ
てこれが含有している遺伝子情報が複製されそして発現されることを可能にする
【0004】 ベクターは、DNAおよびRNAゲノムの両方を用いて種々のウイルスから開
発されている。宿主細胞の核内で複製するDNAウイルスに由来するウイルスベ
クターは、上記の細胞のゲノム中に組み込まれ得る欠点を有し、それによってこ
れらは、一般的には非常に安全ではない。対照的に、宿主細胞の細胞質中で複製
するRNAウイルスに由来するウイルスベクターは、DNAウイルスに基づくベ
クターよりも安全である。なぜなら、複製が核の外側でRNAを通じて生じるか
らである。従って、これらのベクターは、宿主細胞のゲノム中にはほとんど組み
込まれないようである。
【0005】 cDNAクローンが、例えば、以下のような、正の極性を有する一本鎖のRN
Aウイルスから得られている:[ssRNA(+)]ピコルナウイルス(Rac
aniello & Baltimore、1981);ブロモウイルス(Ah
lquistら、1984);アルファウイルス(シンドビスウイルスを含む属
);セムリキ森林ウイルス(SFV)、およびベネズエラウマ脳炎ウイルス(V
EE)(Riceら、1987;LilkestoemおよびGaroff、1
991;Frolovら、1996;SmerdouおよびLilkestom
、1999);フラビウイルスおよびペスチウイルス(RiceおよびStra
uss、1981;Laiら、1991;Riceら、1989);ならびにA
stroviridaeファミリーのウイルス(Geigenmullerら、
1997)。同様に、異種遺伝子の発現のためのベクターが、例えば、以下のよ
うなssRNA(+)ウイルスのゲノムのDNA相補鎖のクローンから開発され
ている:アルファウイルス(シンドビスウイルスを含む属);セムリキ森林ウイ
ルス(SFV)、およびベネズエラウマ脳炎ウイルス(VEE)(Frolov
ら、1996;Lilkestoem、1994;Pushkoら、1997)
。しかし、RNAウイルスから開始して組換えウイルスを調製するための全ての
方法がなお、ウイルスのほとんどが細菌について毒性である配列を含むという事
実によって、面倒である。従って、ウイルスRNAのcDNAを調製し、そして
細菌中にcDNAをサブクローニングすることは、細菌宿主中のDNA配列の欠
失または再配置をしばしば導く。この目的のためには、ほとんどの一般的に使用
されるサブクローニングおよび発現ベクターは、組換えRNAウイルスに由来す
る大きなDNA切片の調製のためには使用され得ない。しかし、より長い外来D
NA配列を保有し得るベクターを得ることが、医薬品(特に、ワクチン)の開発
の多数の局面について必要とされる。
【0006】 コロナウイルスは、約25から31キロベース(kb)の間の長さを含む、R
NAウイルスについての、最も大きな公知のゲノムを示すssRNA(+)ウイ
ルスである(Siddell、1995;Lai & Cavanagh、19
97;Enjuanesら、1998)。コロナウイルスによる感染の間に、ゲ
ノムDNA(gDNA)は複製し、そして正および負の極性のサブゲノムRNA
(sgRNA)のセットが合成される(Sethnaら、1989;Sawic
kiおよびSawicki、1990;van der Most &Spaa
n,1995)。sgRNAの合成は、感染した細胞の細胞質中で生じるRNA
依存性のプロセスであるが、その正確な機構はなお正確にはわかっていない。
【0007】 いくつかのコロナウイルス(例えば、マウスの肝炎ウイルス(MHV)、感染
性の気管支炎ウイルス(IBV)、ウシコロナウイルス(BCV)(Chang
ら、1994)、およびブタ胃腸炎ウイルス(TGEV)(スペイン特許出願番
号第P600620号;Mendezら、1996;Izetaら、1999;
Sanchezら、1999)の欠損妨害(DI)ゲノム(それらの複製および
転写のために相補的なウイルスの存在を必要とする欠失変異体)が、記載されて
いる。しかし、コロナウイルスの完全なゲノムをコードするcDNAクローンの
構築が、コロナウイルスのゲノムの大きな大きさおよびその中の毒性の配列に起
因して、可能にはなっていない。
【0008】 まとめると、宿主細胞中で異種核酸を複製しそして発現するための多数のウイ
ルスベクターが開発されているが、異種遺伝子の発現のための公知のベクターの
大部分は、RNAウイルスのサブクローニングには十分には適さない。さらに、
そのように得られたウイルスベクターには、種特異性の欠失、標的器官または組
織の限定、ならびにクローニングについてのそれらの限定された能力に起因する
欠点が存在する。これは、基本的な研究および応用研究の両方での使用の可能性
を制限する。
【0009】
【発明が解決しようとする課題】
従って、上記の問題を克服し得る異種遺伝子の発現のための新しいベクターを
開発するための方法が、必要とされている。詳細には、高いレベルの安全性およ
びクローニング能力を有している異種遺伝子の発現のための大きなベクターを有
することが、有利である。これは、それらの種特異性および向性が制御され得る
ように、設計され得る。
【0010】
【課題を解決するための手段】
本発明によれば、上記の問題点が、複数の工程を包含するDNAの調製方法に
よって解決される。ここでは、 (a)RNAウイルスのゲノムRNA(gRNA)の完全長のコピーを含有して
いるDNA;または (b)RNAウイルスのgRNAの1つまたはいくつかのフラグメントを含有し
ているDNAであって、ここで、フラグメントは、RNA依存性のRNAポリメ
ラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク質をコードする;また
は (c)(a)または(b)の配列に対して少なくとも60%の相同性を有してい
るDNA; が、細菌の人工染色体(BAC)中にクローン化される。
【0011】 驚くべきことに、本発明者らは、ウイルスのgRNAに由来する大きなDNA
配列をサブクローン化しそして発現するための先行技術の方法によって生じる問
題が、クローニングベクターとしてBACを使用することによって克服され得る
ことを見出した。BACの使用は、これらのベクターが1個の細胞あたり1つま
たは2つのコピー数で細菌中に存在するという特定の利点を有する。これは、毒
性およびプラスミド間での組換えの可能性を相当制限する。
【0012】 本発明はさらに、複数の工程を包含する、ウイルスのRNAまたはウイルス粒
子を調製する方法を提供する。ここでは、DNAは、上記の方法の1つに従って
調製され、DNAが発現され、そしてウイルスRNAまたはウイルス粒子が単離
される。さらに、DNAを調製するために上記の方法の工程を含有している、医
薬品(特に、ワクチン)を調製する方法が、開示される。
【0013】 本発明の別の局面によれば、コロナウイルスの天然の配列に対して少なくとも
60%の相同性を有し、そしてRNA依存性ポリメラーゼおよび少なくとも1つ
の構造または非構造タンパク質をコードする、コロナウイルスのゲノムRNA(
gRNA)に由来する配列を含有しているDNAが、提供される。ここでは、上
記のDNAのフラグメントは、RNAに転写され得、そしてこのRNAは、ウイ
ルス粒子に組み立てられ得る。本発明はまた、それぞれのDNAを調製する方法
を含む。
【0014】 本発明はさらに、ベクター(より詳細には、それぞれの核酸を含有している細
菌の人工染色体(BAC))を提供する。さらなる実施態様に従うと、本発明は
、本発明のDNAまたはRNAを含有している、宿主に対して、そして感染性の
、弱毒化されたか、または不活化されたウイルスに関する。
【0015】 本発明はまた、本発明の核酸、ベクター、宿主細胞、またはウイルス粒子を含
有している、一価または多価のワクチンのような、医薬調製物を提供する。
【0016】 最後に、本発明は、複数の工程を含有している、ウイルス粒子またはウイルス
RNAを産生するための方法を提供する。ここでは、本発明のDNAが転写され
、そしてウイルス粒子またはウイルスが回収され、そしてこの方法によってウイ
ルスRNAを得ることができる。
【0017】
【発明の実施の形態】
本発明によれば、DNAの調製方法が提供される。この方法は、複数の工程を
包含する。ここでは、 (a)RNAウイルスのゲノムRNA(gRNA)の全長のコピーを含有してい
るDNA;または (b)RNAウイルスのgRNAの1つまたはいくつかのフラグメントを含有し
ているDNAであって、ここで、フラグメントは、RNA依存性のRNAポリメ
ラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク質をコードする;また
は (c)(a)または(b)の配列に対して少なくとも60%の相同性を有してい
るDNA; が、細菌の人工染色体(BAC)中にクローン化される。
【0018】 本出願によれば、「細菌の人工染色体」はF因子の配列を含むDNA配列であ
る。この配列を含有しているプラスミド(いわゆる、Fプラスミド)は、少ない
コピー数(1個の細胞あたり1個または2個のコピー)で、300kbより長い
異種配列を安定に維持し得る。それぞれのBACが、当該分野で公知である(S
hizuyaら、1992)。
【0019】 本発明によると、BAC中にクローン化されたDNAは、RNAウイルスの天
然の配列に対して、少なくとも60%、好ましくは75%、そしてより好ましく
は、85%または95%の相同性を有する。配列相同性は、好ましくは、Eur
opean Bioinformatics Institute(EBI)か
ら入手可能であるClustalコンピュータープログラムを使用して決定され
る。
【0020】 本発明の方法によると、BAC中にクローン化されたDNAはさらに、1つの
ウイルスの構造または非構造タンパク質を除いて、いくつかまたは全てをコード
する配列を含み得る。
【0021】 本発明の好ましい実施態様においては、BAC中にクローン化されたDNAは
さらに、1つまたはいくつかの異種遺伝子をコードする配列を含む。本出願によ
ると、遺伝子は、それがRNA依存性のRNAポリメラーゼおよび構造または非
構造タンパク質をコードする遺伝子についての供給源として使用されるウイルス
に由来しない場合には、「異種遺伝子」として特徴付けられる。従って、「異種
遺伝子」はまた、1つのタイプのウイルスに由来する遺伝子をいい、そして別の
タイプのウイルスに由来する配列を含有しているベクター中で発現される。目的
とするいかなる異種遺伝子も本発明の核酸に挿入することができる。哺乳動物の
免疫システムによって感染性病原体からの抗原として認識される、1つまたはい
くつかのペプチドまたはタンパク質をコードする遺伝子の挿入が、特に好ましい
。あるいは、本発明の方法は、感染性の病原体または感染性の病原体に対する防
御を提供する抗体の複製を妨害する、少なくとも1つの分子をコードする異種遺
伝子を使用して、行われ得る。異種配列は、免疫モジュレーター、サイトカイン
、免疫エンハンサー、および/または抗炎症性化合物をコードする特定の配列で
あり得る。
【0022】 本発明の方法は、任意の大きさを有するDNAを使用して、BAC中へのクロ
ーニングが行われ得る。しかし、大きな配列を使用する場合には、ウイルスから
サブクローニングされたDNAを調製するための公知の方法を上回る特異的な利
点が得られる。従って、BAC中にクローン化されたDNAは、少なくとも5k
bの長さを含み、ここでは、少なくとも15、25、または30kbの大きさを
有するDNAが、特に好ましい。
【0023】 本発明の特定の好ましい実施態様によれば、BACがBAC中にクローン化さ
れたDNAの転写を制御する配列を含む、方法が提供される。これによって、ウ
イルスRNAの転写を可能にし、そして従って、ウイルスの発現を可能にする。
当該分野で公知の転写を制御する任意の配列が、この目的のために使用される。
これには、DNAまたはRNAゲノムに由来する遺伝子の発現を駆動する配列が
含まれる。サイトメガロウイルスの最初期(IE)プロモーターが好ましい。
【0024】 BAC中にクローン化されたDNAもまた、ポリ(A)テイルによって3’末
端に隣接される。核酸は、終結配列および/またはウシの成長ホルモン(BGH
)のポリアデニル化配列を含み得る。さらにまたはあるいは、核酸が、リボザイ
ム(例えば、δ肝炎ウイルス(HDV)のリボザイム)をコードする配列を含み
得る。
【0025】 さらなる利点は、ウイルスの少なくとも1つが、ヌクレオチドの置換、欠失、
または付加によって改変されている場合に、達成され得る。例えば、ウイルスの
向性を制御する遺伝子が、変更された向性を有するウイルスを得るために改変さ
れ得る。あるいは、ウイルスの向性を制御する遺伝子が、別のウイルスのそれぞ
れの遺伝子で置換されている。改変は、好ましくは、ウイルスのS、M、および
/またはN遺伝子中で行われる。
【0026】 本発明の好ましい実施態様においては、BAC中にクローン化されたDNAが
、ウイルス粒子に組み立てられ得るRNAに転写され得る方法が、提供される。
ウイルス粒子は、感染性の、弱毒化された、複製欠損、または不活化されたウイ
ルスであり得る。
【0027】 任意のRNAウイルスが、本発明の方法において使用され得る。ウイルスは、
例えば、ピコルナウイルス、フラビウイルス、トガウイルス、コロナウイルス、
トロウイルス、アルテリウイルス、カルシウイルス、ラブドウイルス、パラミク
ソウイルス、フィロウイルス、ボルナウイルス、オルトミクソウルス、ブンヤウ
イルス、アレナウイルス、またはレオウイルスであり得る。正方向の鎖のゲノム
を自然に有するウイルスの使用が好ましい。
【0028】 さらに、本発明は、以下の工程を包含する、ウイルスRNAまたはウイルス粒
子の調製方法を提供する。ここでは、DNAは、上記の方法の1つに従って調製
される。DNAは、適切な宿主細胞中で発現され、そしてウイルスRNAまたは
ウイルス粒子が、宿主細胞から単離される。当該分野で公知の細胞培養物からウ
イルスを単離するための任意の方法が、使用され得る。あるいは、ウイルスRN
Aまたはウイルス粒子を調製する方法が、開示されている。ここでは、本発明の
DNAは、化学物質、生物学的試薬および/または細胞抽出物を使用して転写ま
たは翻訳され、そしてウイルスRNAまたはウイルス粒子が続いて、単離される
。特定の実施態様については、ウイルスは、実質的に不活化されるか、または死
滅させられ得る。
【0029】 本発明はまた、複数の工程を包含している医学組成物を調製するための方法を
提供する。ここでは、DNA、ウイルスのRNA、またはウイルス粒子が、上記
の方法の1つに従って調製され、そして薬学的に受容可能なアジュバントおよび
/またはキャリアと混合される。多数のアジュバントおよびキャリアおよび希釈
剤が先行技術において公知であり、そして本発明に従って使用されえる。医薬品
は、好ましくは、感染性の疾患に対してヒトまたは動物を防御するためのワクチ
ンである。医薬品は、また、遺伝子治療のために使用され得る。
【0030】 本発明はさらに、コロナウイルスの天然の配列に対して、少なくとも60%の
相同性を有し、そしてRNA依存性のRNAポリメラーゼ、および少なくとも1
つの構造または非構造タンパク質をコードする。ここでは、上記のDNAは、ウ
イルス粒子に組み立てられ得るRNAに転写され得る。
【0031】 本発明によれば、用語「コロナウイルスに由来する配列」は、少なくとも60
%、好ましくは75%、そしてより好ましくは85%または95%の相同性を、
コロナウイルスの天然の配列に対して有する核酸をいうように使用される。配列
相同性は、European Bioinformatics Institu
te(EBI)から入手可能であるClustalコンピューターを使用して決
定され得る。
【0032】 用語「コロナウイルス」は、直鎖の、正方向のセンスの、25から33kbの
ssRNAの単一の分子を有するウイルスのグループをいう。これらのウイルス
は、通常は、7個から10個の構造遺伝子(すなわち、ウイルス構造を決定する
タンパク質をコードする遺伝子)を含む。これらの遺伝子は、代表的には、5’
−レプリカーゼ−(ヘマグルチニン−エステラーゼ)−スパイクエンベロープ−
膜−核タンパク質―3’の順に、ウイルスゲノム中に並べられる。さらに、ウイ
ルスゲノムは、多数の非構造遺伝子を含み得、これらは、共通の3’末端を有す
るmRNAのネストされたセットをコードし、そしてほとんどが必須ではない。
【0033】 用語「ウイルス粒子に組み立てられ得るRNAに転写され得る」は、DNA配
列を特徴付けるために使用される。これは、適切な宿主細胞中に導入され、RN
Aに転写され、そしてウイルス粒子を作成する。ウイルス粒子は、好ましくは、
感染性のウイルスであるが、上記のRNAを含有している、不活化され得るか、
弱毒化され得るか、または複製欠損ウイルスであり得る。好ましくは、ウイルス
粒子の発現のために必要な情報の全てが、本発明のDNA配列によってコードさ
れる。
【0034】 本発明の核酸はさらに、目的の1つまたはいくつかの異種遺伝子をコードする
配列を含み得る。本発明に従うと、遺伝子は、それがコロナウイルスに由来しな
い場合には、「異種遺伝子」として特徴付けられる。これらは、RNA依存性の
RNAポリメラーゼ、および構造または非構造タンパク質をコードする遺伝子の
供給源として使用された。従って、「異種遺伝子」はまた、コロナウイルスの1
つのタイプに由来し、そして別のタイプのコロナウイルスに由来する配列を含有
しているベクター中で発現される遺伝子をいう。目的の任意の異種遺伝子が、本
発明の核酸中に挿入され得る。哺乳動物の免疫システムによって感染性の病原体
に由来する抗原として認識されるペプチドまたはタンパク質をコードする遺伝子
の挿入が、本質的に好ましい。従って、異種遺伝子は、感染性の病原体(感染性
の病原体の複製を妨害する少なくとも1つの分子、または感染性の病原体に対す
る防御を提供する抗体)に対する免疫応答を誘導するために適切な少なくとも1
つの抗原をコードする。あるいは、またはさらに、異種遺伝子は、免疫モジュレ
ーター、サイトカイン、免疫エンハンサー、および/または抗炎症性化合物をコ
ードし得る。
【0035】 RNAに転写される本発明のDNAのフラグメントは、好ましくは、少なくと
も25kbの大きさを有する。少なくとも30kbの大きさを有するフラグメン
トが、特に好ましい。
【0036】 本発明の好ましい実施態様によれば、DNAはさらに、コロナウイルスの構造
または非構造タンパク質の1つを除くいくつかまたは全てをコードするコロナウ
イルスに由来する配列を含む。あるいは、本発明のDNAは、さらにコロナウイ
ルスの構造または非構造タンパク質の全てをコードする配列を含む。
【0037】 さらなる実施態様によれば、本発明の核酸は、コロナウイルスのgRNAに由
来する配列の転写を制御する配列を含む。DNAまたはRNAゲノムに由来する
遺伝子の発現を駆動する配列を含む、当該分野で公知の転写を制御する任意の配
列は、この目的のために使用され得る。サイトメガロウイルス(CMV)の最初
期(IE)プロモーターの使用が、好ましい。
【0038】 本発明の核酸はまた、ポリ(A)テイルによって3’末端で隣接され得る。核
酸はまた、ウシの成長ホルモン(BGH)の終結および/またはポリアデニル化
配列を含む。さらに、またはあるいは、核酸は、リボザイム(例えば、デルタ肝
炎ウイルス(HDV)のリボザイム)をコードする配列を含み得る。
【0039】 本発明の核酸は、任意のコロナウイルスに由来する(例えば、ブタの伝染性の
胃腸炎ウイルス(TGEV)、マウスの肝炎ウイルス(MHV)、感染性の気管
支炎ウイルス(IBV)、ウシコロナウイルス(BCV)、イヌコロナウイルス
(CCoV)、ネココロナウイルス(FcoV)、またはヒトコロナウイルスに
由来する)配列を含み得る。好ましい実施態様によれば、核酸は、感染性の胃腸
炎ウイルスに由来する。
【0040】 本発明のさらなる実施態様によれば、本発明のDNAは、プラスミドの一部、
好ましくは、細菌の人工染色体(BAC)の一部である。
【0041】 本発明はさらに、それぞれの核酸またはワクチンを含有している宿主細胞を提
供する。宿主細胞は、真核生物または原核生物であり得る。あるいは、本発明は
、本発明の核酸を含有しているウイルス粒子を提供する。それぞれのウイルス粒
子は、例えば、本発明の核酸を用いてトランスフェクトされたかまたは感染させ
られた細胞培養物から単離され得る。
【0042】 さらなる実施態様に従うと、本発明は、複数の工程を包含している、ウイルス
粒子またはウイルスRNAを産生するための方法を提供する。ここでは、本発明
のDNAは、宿主細胞中に導入され、DNAを含有している宿主細胞が、その発
現を可能にする条件下で培養され、そしてウイルス粒子またはウイルスのRNA
が回収される。さらに、ウイルス粒子またはウイルスのRNAを産生するための
方法が、提供される。ここでは、本発明のDNAがインビトロで化学物質、生物
学的な試薬、および/または細胞抽出物と、DNAの発現を可能にする条件下で
混合され、そしてウイルス粒子またはウイルスのRNAが回収される。本発明は
また、上記の方法のいずれかによって得ることができる、ウイルス粒子およびウ
イルスのRNAを含む。異種遺伝子を含有しているRNAおよびウイルス粒子が
好ましい。そのように得られたウイルスは、感染性の、弱毒化された、複製欠損
、または不活化されたウイルスの形態を有し得る。
【0043】 ウイルスは、改変された遺伝子(例えば、改変されたS、N、またはM遺伝子
)を含み得る。本発明の特異的な実施態様においては、S、N、またはM遺伝子
の改変は、弱毒化されたウイルスまたは変更された向性を有するウイルスを生じ
る。
【0044】 さらなる実施態様によれば、本発明は、本発明の核酸、宿主細胞、またはウイ
ルスを含有している、医学調製物を提供する。好ましい実施態様に従うと、医薬
調製物は、感染性の病原体によって引き起こされる疾患に対して動物を防御し得
るワクチンである。ワクチンは、例えば、感染性の病原体に対する免疫応答を誘
導するために適切な少なくとも1つの抗原、または感染性の病原体に対する防御
を提供する抗体、または上記の感染性の病原体に対する防御を提供する抗体の配
列を含み得る。ワクチンは、感染性の病原体の複製を妨害する1つ上の分子を発
現するDNAを含み得る。あるいは、ワクチンは、全身性の免疫応答および/ま
たは呼吸器、腸粘膜、または他の組織中で増殖する種々の感染性の病原体に対し
て粘膜における免疫応答を誘導し得る少なくとも1つの抗原を発現するベクター
を含み得る。ワクチンはまた、1つ以上の感染性の病原体によって引き起こされ
る感染に対して動物を防御し得る多価ワクチンであり得る。これは、本発明の1
つ以上の核酸を含み、そしてそれぞれが、上記の感染性の病原体、または感染性
の病原体のそれぞれの1つに対する防御を提供する抗体、または任意の感染性の
病原体の複製を妨害する他の分子に対して、免疫応答を誘導し得る抗原を発現す
る。
【0045】 本発明のワクチンは、さらに、当該分野で公知の、任意の薬学的に受容可能な
キャリアまたは希釈剤を含み得る。
【0046】 本発明はさらに、複数の工程を包含する、本発明のDNAを調製するための方
法を提供する。ここでは、コロナウイルスに由来する妨害欠損ゲノムが、BAC
ベクター中でプロモーターの発現下にクローン化され、そして欠損ゲノム内での
欠失が、再挿入される。この方法はさらに、複数の工程を包含し得る。ここでは
、ウイルスゲノム中の毒性配列が、残存しているゲノムDNA中への再挿入の前
に同定される。好ましくは、ウイルスゲノム中の毒性配列は、ゲノムが完成する
前に再挿入される最後の配列である。本発明によれば、この方法は、コロナウイ
ルスの感染性のクローンを得るために適切であり、これは、少なくとも80の世代
について最近中で安定であり、そして非常に効率的なクローニングベクターを提
供する。
【0047】 本発明は、コロナウイルスに由来するcDNAの感染性のクローンの開発(A
lmazanら、2000)、ならびに上記の感染性のクローンから構築される
ベクターの開発を提供する。これはまた、上記のクローン中に挿入される異種核
酸を含む。本発明によって提供される感染性のクローンおよびベクターは、基本
的および応用研究の両方において多数の適用、ならびに高いクローニング能力を
有する。そしてこれは、それらの種特異性および向性が容易に制御され得るその
ような方法に設計され得る。
【0048】 本特許は、コロナウイルスの歴史においてはじめて、コロナウイルスのゲノム
をコードする全長の感染性のcDNAを得ることを可能にする方法の開発を記載
する。
【0049】 コロナウイルスのゲノムRNA(gRNA)をコードする感染性のcDNAか
ら作成された、コロナウイルスに基づく異種核酸を発現させるための、新しいベ
クターまたはシステムが、開発されている。本発明の1つの特定の現実化におい
ては、コロナウイルスは、ブタの感染性の胃腸炎ウイルス(TGEV)である。
【0050】 新しい発現システムが、基本的または応用研究において、例えば、目的(タン
パク質、酵素、抗体など)の産生を得るために、ワクチンのベクターとして、あ
るいは、ヒトおよび動物における遺伝子治療において、使用され得る。感染性の
cDNAクローンから得られた感染性のコロナウイルスは、従来の遺伝子操作技
術によって操作され得、その結果、新しい遺伝子がコロナウイルスのゲノム中に
挿入され得、そしてその結果、これらの遺伝子は、免疫応答を誘導するためまた
は遺伝子治療のために、組織−および種−特異的様式で発現され得る。さらに、
発現は、新しい転写調節配列(TRS)の選択によって最適化されており、これ
によって、数百倍以上に発現レベルを増大させることを可能にする。
【0051】 コロナウイルス(特に、TGEV)に由来するベクターは、それらの中では複
製しない他の発現システムに関して、粘膜において免疫の誘導のためのいくつか
の利点を示す:(i)TGEVは、胃腸および呼吸器の粘膜に感染する(Enj
uanesおよびVan der Zeijst、1955)、すなわち、分泌
性の免疫の誘導のための最適な部位;(ii)その向性が、S(スパイク)遺伝
子を改変することによって制御され得る(Ballesterosら、1997
);(iii)相補性のウイルスに依存する発現のシステムの開発のための非病
原株が存在する(Sanchezら1992);および(iv)コロナウイルス
が、中間体のDNA段階を通過することなく複製する細胞質性のRNAであり(
LaiおよびCavanagh、1997)、これによって、その細胞性の染色
体への組込みを実際に不可能にする。
【0052】 コロナウイルスのgRNAをコードするcDNAに由来する感染性のコロナウ
イルスを回収することを可能にした手順は、以下のストラテジーを含む: (i)適切なプロモーターの制御下でのコロナウイルスのRNAの発現; (ii)細菌の人工染色体(BAC)中へのコロナウイルスのRNAのクローン
ニング; (iii)細菌に対して直接または間接的に毒性であるコロナウイルスのcDN
Aの配列の同定; (iv)コロナウイルスの感染性のRNAをコードするcDNAの成分(プロモ
ーター、転写終結配列、ポリアデニル化配列、リボザイムなど)の連結の正確な
順序の同定; (v)一群の技術およびプロセスの同定(BACの増殖、BAC DNAの精製
プロセスに対する改変、形質転換技術などについての条件)、その組み合わせに
よって、cDNAの感染性のコロナウイルスの効率的なレスキューを可能にする
【0053】 プロモーターは、核内でのウイルスRNAの発現を増大させることにおいて重
要な役割を果たす。ここで、これが合成され、その後、細胞質に輸送される。
【0054】 BACの使用は、本発明の手順の重要な点の1つを構成する。公知であるよう
に、細菌プラスミド中の真核生物配列のクローニングは、細菌について外因性で
ある配列の毒性に起因して、しばしば不可能である。これらの場合においては、
細菌は通常は、導入された配列を改変することによって毒性を排除する。それに
もかかわらず、この場合に続くストラテジーにおいては、これらのウイルス配列
の可能性のある毒性を回避するために、BAC中のコロナウイルスの相補性cD
NAを得るために、必須のクローニングが行われた。これらのプラスミドは、1
個の細胞あたり1個のみまたは最大2個のコピーで存在し、それらの毒性を相当
制限し、そしてプラスミド間での組換えの可能性を減少させる。
【0055】 コロナウイルスの細菌毒性のcDNAの同定を通じて、コロナウイルスの完全
なゲノムをコードするcDNAの構築が、毒性の配列の排除を用いて完成させら
れ得る。これは、完全なゲノムの構築の最後の段階で、すなわち、それらの細菌
による改変を回避するために、真核生物中でのトランスフェクションの直前に、
付加される。
【0056】 従って、本発明の1つの目的は、コロナウイルスのgRNAをコードする感染
性の2本鎖のcDNAクローン、ならびにそれを得るための手順から構成される
【0057】 本発明のさらなる目的は、上記の感染性のクローンおよび上記の感染性のクロ
ーン中に挿入される異種核酸の配列を含む組換えウイルスベクターのセットから
構成される。
【0058】 本発明のさらなる目的は、組換えコロナウイルスを産生するための方法から構
成される。この方法は、宿主細胞中へ上記の感染性のクローンを導入する工程、
感染性のクローンの複製を可能にする条件下で形質転換された細胞を培養する工
程、および組換えコロナウイルスを産生する工程、ならびに培養物から組換えコ
ロナウイルスを回収する工程を包含する。
【0059】 本発明の別の目的は、改変された組換えコロナウイルスを産生するための方法
から構成される。この方法は、宿主細胞中に組換えウイルスベクターを導入する
工程、ウイルスベクターが複製することおよび産生された改変された組換えコロ
ナウイルスが産生されることを可能にする条件下でこれを培養する工程、ならび
に培養物から改変された組換えコロナウイルスを回収する工程を包含する。本発
明の別の目的は、異種DNAの配列の発現を可能にする条件下で、上記の組換え
ウイルスベクターを含有している宿主細胞を培養する工程を包含する、目的の産
物を産生するための方法から構成される。
【0060】 上記の感染性のクローンまたは組換えウイルスベクターを含有している細胞は
、本発明の別の目的を構成する。
【0061】 本発明の別の目的は、感染性の病原体によって引き起こされる感染に対して動
物を防御するワクチンのセットから構成される。これらのワクチンは、それぞれ
の感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するために適切な少なくとも1つの抗
原、または上記の感染性の病原体に対する防御を提供する少なくとも1つの抗体
を発現する感染性のベクターを、薬学的に受容可能な賦形剤とともに含む。ワク
チンは、ベクターが1つ以上の感染性の病原体に対する免疫応答を誘導し得る1
つ以上の抗原、あるいは、1つ以上の感染性の病原体に対する防御を提供する1
つ以上の抗体を発現するかどうかに依存して、一価または多価であり得る。
【0062】 本発明によって提供される別の目的は、上記のワクチンの投与から構成される
、動物の免疫化の方法を含む。
【0063】 本発明は、コロナウイルスの感染性のRNAをコードするcDNAクローン(
従って、以下を含有している本発明の感染性のクローン)を提供する:(1)コ
ロナウイルスまたはウイルス自体の感染性のゲノムRNA(gRNA)に対する
相補性DNAのコピー;および(2)最適化された転写促進配列を含む、さらな
る遺伝子についての発現モジュール。
【0064】 本発明の1つの特定の実施態様においては、コロナウイルスは、クローンC1
1 TGEV単離物のS遺伝子、あるいはイヌまたはヒトのコロナウイルスのS
遺伝子による、このウイルスのS遺伝子の置換によって改変された、TGEV単
離物、特に、PUR46−MAD単離物(Sanchezら1990)である。
【0065】 転写を促進する配列(すなわち、プロモーター)は、それに対してウイルスの
ポリメラーゼRNAが結合してメッセンジャーRNA(mRNA)の転写を開始
する、コロナウイルスのそれぞれのメッセンジャーRNAの5’−末端に配置さ
れたRNA配列である。特定のそして好ましい実施態様においては、ウイルスの
ゲノムは、CMVのIEプロモーターを使用してcDNAから発現される。これ
は、このプロモーターを使用して得られる発現の高いレベルに(Dubensk
yら、1996)、そしてRGEVコロナウイルスによって発現されるRNAに
由来する大きな欠損ゲノム(9.7kbおよび15kb)が、それらが合成され
る核から細胞質へのそれらの輸送の間にスプライシングを受けないことを示す本
発明者らの研究室で得られた以前の結果に起因する。
【0066】 本発明の欠損クローンはまた、BGH遺伝子から来るような、転写終結配列お
よびポリアデニル化シグナルを含む。これらの終結配列は、ポリ(A)テイルの
3’末端に配置された。1つの特定の実施態様においては、本発明の欠損クロー
ンは、24個のA残基のポリ(A)テイル、ならびにHDVリボザイムの配列に
よるポリ(A)テイルから分離されたBGHの終結およびポリアデニル化配列を
含む。
【0067】 ウイルスの感染性のcDNAがその中に挿入されているプラスミドは、複製起
点を保有しているDNA分子であり、そして従って、適切な細胞中で協力に複製
することが可能である。使用されるプラスミドは、細菌(例えば、Escher
ichia coli)のような適切な宿主細胞中で、本発明の感染性のクロー
ンを維持しそして増幅するためのレプリコンアダプターである。複製は、一般的
には、それを保有している細胞の選択を可能にする、抗生物質に対する耐性の遺
伝子を保有する(例えば、cat)。
【0068】 実施例1においては、CMVのIEプロモーターの制御下へのTGEVのクロ
ーンの構築が、記載される。cDNAの3’末端に、24ヌクレオチドのポリ(
A)配列、HDVリボザイム、およびBGHの転写終結配列が隣接させられるよ
うである。
【0069】 本発明の感染性のクローンを得るための手順は、コロナウイルスのgRNAに
由来する全長のcDNAを構築する工程、および転写調節エレメントを連結する
工程を包含する。
【0070】 コロナウイルスの感染性のgRNAをコードするcDNAは、cDNAの安定
性を増大させる目的のために、BAC中の適切なプロモーターの制御下にcDN
Aとしてクローン化されたコロナウイルスに由来するDIゲノムから得られた。
ついで、細菌毒性の配列が同定され、そしてその毒性を排除する目的のために、
上記の毒性配列が除去され、そして完全なゲノムの構築の最後に、真核生物中で
のトランスフェクションの直前に、挿入された。ウイルスの子孫は、ウイルスの
複製をサポートする真核生物細胞中のコロナウイルスのゲノムを含む、BACプ
ラスミドのトランスフェクションによって再構築され得る。
【0071】 転写調節エレメントは、従来技術の手段によって連結される(Maniati
sら、1989)。
【0072】 本発明の感染性のクローンは、決定された活性をコードする異種核酸の少なく
とも1つの配列を、感染性のクローン中に存在しそして得られる発現ベクター中
に含まれる調節配列のプロモーターの制御化に挿入するために、従来の遺伝子操
作技術によって操作され得る。
【0073】 本発明の感染性のクローンは、多数の適用を示す:例えば、これは、基礎的な
研究(例えば、コロナウイルスの複製および転写機構を研究するため)、および
応用的な研究(例えば、目的の産物(タンパク質、酵素、抗体など)の発現の効
率的なシステムの開発において)の両方において使用され得る。
【0074】 適切な細胞が、本発明の感染性のcDNAクローンによって形質転換され、そ
してコロナウイルスの完全なゲノムを含有している得られたウイルス粒子が、回
収され得る。従って、本発明はさらに、組換えコロナウイルスを産生するための
方法を提供する。この方法は、宿主細胞中への本発明の感染性のcDNAの導入
、感染性のクローンの発現および複製を可能にする条件下での上記の細胞の培養
、ならびに、組換えコロナウイルス(これは、コロナウイルスの感染性のゲノム
を含む)から得られたウイルス粒子の回収を含む。本発明の感染性のクローンは
、種々の方法で(例えば、本発明の感染性のクローンからインビトロで転写され
たRNAでの宿主細胞のトランスフェクションによって、または本発明の感染性
のcDNAクローンからインビトロで転写されたRNAでの宿主細胞のトランス
フェクションによって)宿主細胞中に導入され得る。本発明の感染性クローンを
含む上記の宿主細胞は、本発明のさらなる目的を構成する。
【0075】 本発明はまた、本発明の感染性のクローンに由来する組換えウイルスベクター
のセットを提供する。従って、本発明のウイルスベクターは、上記の異種核酸が
発現されることを可能にする条件下で、上記の感染性のクローン中に挿入された
異種核酸を含むように改変された、本発明の感染性のcDNAクローンを含む。
【0076】 用語「核酸」は、それが本明細書中で使用される場合には、遺伝子または遺伝
子フラグメントを含み、そして一般的にはDNAまたはRNAの分子である。
【0077】 本明細書中で使用される意味においては、核酸について適用される用語「異種
」は、宿主細胞中に異種核酸を導入するために使用される、ベクター中には通常
は存在しない核酸をいう。
【0078】 本発明のウイルスベクターを含み得る異種核酸は、目的のタンパク質、ペプチ
ド、エピトープ、または任意の遺伝子産物(例えば、抗体、酵素など)をコード
する遺伝子またはフラグメントであり得る。異種核酸は、cDNAの任意の適切
な領域中に(例えば、ORF 1bの後ろ、または遺伝子Nと7との間、開始コ
ドン(AUG)の後ろ)、そして遺伝子を有するリーディングフレーム中に:ま
たは、あるいは、他のORFに対応している領域中に)従来の遺伝子操作技術の
手段によって、本発明の感染性のクローン中に挿入され得る。本発明のウイルス
ベクターの構築においては、異種核酸の挿入が、任意の基本的なウイルス機能を
妨害しないことが、不可欠である。
【0079】 本発明のウイルスベクターは、1つ以上の活性を発現し得る。この後者の場合
においては、ウイルスベクターは、1つもしくは数個のプロモーターに先行して
、またはプロモーターもしくは種々のリボザイム認識部位(IRES、内部リボ
ザイム進入部位)によって、または種々のプロモーターおよびリボザイム認識部
位によって、発現される活性のような、異種核酸の多くの配列として、含む。
【0080】 従って、本発明は、目的の産物を産生するための方法を提供する。この方法は
、異種核酸が発現されることが可能である条件下で、本発明のウイルスベクター
を含む宿主細胞を培養する工程、および目的の産物の回収を包含する。本発明の
ウイルスベクターを含有している上記の宿主細胞は、本発明のさらなる目的を構
成する。
【0081】 本発明のウイルスベクターは、その種特異性および向性が、容易に制御され得
るように設計され得る。これらの特徴に起因して、本発明のウイルスベクターの
非常に興味深い適用は、目的の遺伝子のベクターとしての、または種々の病原体
に対する免疫応答を誘導するためのワクチン用ベクターとしての、それらの使用
である。
【0082】 本発明はさらに、以下を含有する、感染性の病原体によって引き起こされる感
染に対して、動物を防御し得るワクチンを提供する:(i)上記の感染性の病原
体に対する免疫応答を誘導するために適切な少なくとも1つの抗原、または上記
の感染性の病原体に対する防御を提供する抗体を必要に応じて、以下とともに(
ii)薬学的に受容可能な賦形剤。
【0083】 本明細書中で使用される意味においては、「防御を誘導する」は、細胞性の応
答を強化する物質(インターロイキン、インターフェロンなど)、細胞性の壊死
因子、および感染性の病原体によって引き起こされる感染から動物を防御する同
様の物質によて誘導されるような適切な機構を通じて、本発明のウイルスベクタ
ーによって誘導される受容している生物体(免疫化された動物)の免疫応答とし
て、理解されるはずである。
【0084】 用語「動物」には、任意の種の全ての動物(好ましくは、ヒトを含む哺乳動物
)である。
【0085】 「感染性の病原体」は、本明細書中で使用される意味においては、任意のウイ
ルス、真菌、寄生虫、または動物に感染し得そして病気を引き起こし得る他の感
染性因子を含む。
【0086】 1つの特定の実施態様においては、本発明によって提供されるワクチンは、呼
吸器および胃腸粘膜において増殖する種々の感染性の病原体に対して、全身性の
免疫応答および/または粘膜中の免疫応答を誘導し得る、少なくとも1つの抗原
を発現する、1つ以上の本発明のウイルスベクターを含む。本発明のベクターは
、粘膜における免疫および乳腺刺激性の免疫を誘導するためにきわめて適切であ
り、これは、胃腸管の感染に対して新生児を防御することにおける特異的な目的
である。
【0087】 別の特定の実施態様においては、本発明によって提供されるワクチンは、感染
性の病原体に対して防御する、任意のイソ型抗体(例えば、IgG、IgAなど
)の軽鎖および重鎖をコードする少なくとも1つの遺伝子を発現する、本発明の
少なくとも1つのウイルスベクターを含む。
【0088】 種特異性は、ウイルスベクターが、対応している種の細胞性の応答によって認
識されるために適切である、所望される種(ヒト、イヌ、ネコ、ブタなど)に感
染するコロナウイルスのエンベロープのSタンパク質を発現し得るように、制御
され得る。
【0089】 本発明によって提供されるワクチンは、本発明のウイルスベクターが、1つ以
上の感染性の病原体に対して免疫応答を誘導し得る1つ以上の抗原、または1つ
以上の感染性の病原体に対して防御を提供する1つ以上の抗体を発現するかどう
かに依存して、一価または多価であり得る。
【0090】 本発明の特定の実施態様においては、種々の感染性のヒト、ブタ、イヌ、およ
びネコの因子に対してヒト、ブタ、イヌ、およびネコを防御し得る、そして向性
が、所望される種特異性を有するコロナウイルスのS−糖タンパク質を発現する
ことによって制御される、一価のワクチンが提供される。
【0091】 ブタの感染性の病原体に対する一価のワクチンは、以下のブタの病原体の抗原
から本質的に構成される群より選択される抗原:Actinobacillus
pleuropneumoniae、Actinobacillus sui
s、Haemophilus parasuis、ブタパルボウイルス、Lep
tospira、Escherichia coli、Erysipelotr
ix rhusiopathiae、Pasteurella multoci
da、Bordetella bronchiseptica、Clostri
dium sp.、Serpulina hydiosenteriae、My
coplasma hyopneumoiae、ブタの表皮下痢ウイルス(PE
DV)、ブタ呼吸器コロナウイルス、ロタウイルス、または、以下を引き起こす
病原体に対する抗原:ブタの呼吸器および生殖系の症候群(Porcine r
espiratory and Reproductive syndrome
)、Aujeszky’s症候群(pseudorabies)、ブタのインフ
ルエンザ、または伝染性の胃腸炎、および萎縮性の鼻炎の原因論的な因子、およ
び増殖性の回腸炎を発現するベクターを含み得る。イヌの感染性の病原体に対す
る一価のワクチンは、以下のイヌの病原体の抗原から本質的に構成される群から
選択される抗原を発現する、発現ベクターを含み得る:イヌのヘルペスウイルス
、1型および2型のイヌのアデノウイルス、1型および2型のイヌのパルボウイ
ルス、イヌのレオウイルス、イヌのロタウイルス、イヌのコロナウイルス、イヌ
のパラインフルエンザウイルス、イヌのインフルエンザウイルス、ジステンパー
ウイルス、狂犬病ウイルス、レトロウイルス、およびイヌのカルシウイルス。
【0092】 ネコの感染性の病原体に対する一価のワクチンは、以下のネコの病原体の抗原
から本質的に構成される群から選択される抗原を発現する発現ベクターを含み得
る:ネコカルシウイルス、ネコの免疫不全ウイルス、ネコのヘルペスウイルス、
ネコの全白血球減少症ウイルス、ネコのレオウイルス、ネコのロタウイルス、ネ
コのコロナウイルス、ネコの感染性の腹膜炎ウイルス、狂犬病ウイルス、ネコの
Chlamydia psittaci、およびネコ白血病ウイルス。
【0093】 ベクターは、感染性の病原体(例えば、上記に記載されているもののような、
ブタ、イヌ、またはネコの感染性の病原体)に対する防御を提供する抗体を発現
し得る。1つの特定の実施態様においては、ベクターは、6A.C3として同定
された組換えのモノクローナル抗体を発現する。これは、TGEVを中和し、I
gGまたはIgAを用いて発現され、ここでは、イムノグロブリンの定常部分
は、ブタの起源、またはヒトおよびブタのロタウイルスについての中和抗体であ
る。
【0094】 賦形剤として、生理食塩水または他の同様の生理的な溶液のような希釈剤が、
使用され得る。同様に、これらのワクチンはまた、水性のワクチン(例えば、水
酸化アルミニウム、QuilA、アルミナゲルなど)、ならびにミネラルオイル
、グリセリド、脂肪酸誘導体、およびそれらの混合物に基づく油性のワクチンの
、両方の処方物中で通常使用されるものに由来するアジュバントを含み得る。
【0095】 本発明のワクチンはまた、細胞応答を増強する(CRP)物質、すなわち、ヘ
ルパーT細胞(ThおよびTh)のサブ集団を強化する物質(例えば、イン
ターロイキン−1(IL−1)、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、I
L−12、γ−IFN(γ−インターフェロン)、細胞性の壊死因子、およびワ
クチン接種された動物において細胞性の免疫を理論的に誘発し得る同様の物質を
もまた、含み得る。これらのCRP物質は、水性または油性のアジュバントを有
するワクチン処方物中で使用され得る。細胞性の応答を調節しそして免疫刺激す
る別のタイプのアジュバントもまた、使用され得る(例えば、MDP(ムラミル
ジペプチド)、ISCOM(免疫刺激複合体)、またはリポソーム)。
【0096】 本発明は、種々の感染性の病原体によって引き起こされる感染から動物を予防
および防御し得る、多価のワクチンを提供する。これらの多価のワクチンは、対
応する抗原をコードする種々の配列が同じ組換えベクター中に挿入されている、
本発明のウイルスベクターから、あるいは、結合の接種のために後に混合される
依存性の組換えベクターを構築することによって、調製され得る。従って、これ
らの多価ワクチンは、1つ以上の抗原をコードする異種核酸、またはあるいは、
種々のウイルスベクター(それらのそれぞれが、少なくとも1つの異なる抗原を
発現する)を含むウイルスベクターを含む。
【0097】 同様に、多価のベクターを含有している多価のワクチンは、抗原をコードする
配列の代わりに感染性の病原体に対して防御する抗体をコードする配列を使用し
て調製され得る。
【0098】 本発明の1つの特定の実施態様においては、種々のブタ、イヌ、およびネコの
感染性病原体に対して、ヒト、ブタ、イヌ、およびネコを免疫化し得るワクチン
が、提供される。これについて、ワクチン中に含まれるウイルスベクターは、上
記のヒト、ブタ、イヌ、またはネコの病原体、あるいは他のものを発現しなけれ
ばならない。
【0099】 本発明のワクチンは、液体または凍結乾燥させられた形態で存在し得、そして
賦形剤中で組換えシステムを懸濁することによって調製され得る。上記のシステ
ムが、凍結乾燥させられた形態である場合には、賦形剤自体は、再構成物質であ
り得る。
【0100】 あるいは、本発明によって提供されるワクチンが、それらの形成部分、または
他の従来のもしくは組換えワクチンで希釈される希釈剤または凍結乾燥させられ
た画分としてのいずれかで、他の従来のワクチンと組み合わせて使用され得る。
【0101】 本発明によって提供されるワクチンは、動物に経口によって、鼻腔から、皮下
で、経皮的に、腹膜内で、粘膜内で、または吸入によって、投与され得る。
【0102】 本発明はまた、動物(特に、ブタ、イヌ、およびネコ)の1つ以上の感染性の
病原体に対して同時の免疫化のための方法を提供する。この方法は、本発明によ
って提供される組換えシステムの免疫学的に有効量を含むワクチンの、経口によ
る、鼻腔から、皮下での、皮内、腹膜内、筋肉内、または吸入による投与(また
はそれらの組み合わせ)を含む。
【0103】 さらに、本発明は、上記の動物を感染させる感染性の病原体に対する新生児の
動物を防御するための方法を提供する。この方法は、妊娠期間の前またはその間
での母体、あるいは、子孫に対する、本発明によって提供されるもののワクチン
の、経口による、鼻腔から、皮下での、皮内、腹膜内、筋肉内、または吸入によ
る投与(またはそれらの組み合わせ)から構成される。
【0104】
【実施例】
本発明は、以下の実施例によって説明される。これは、感染性のクローンを得
ることおよび本発明のウイルスベクターの構築を詳細に記載する。これらの実施
例は、本発明の範囲を限定するようには考えられないが、しかし、それらを説明
すると考えられる。上記の実施例においては、細菌の形質転換および増殖、DN
A複製、配列分析、ならびにプラスミドの安定性を評価するためのアッセイは、
以下に記載される方法論に従って行われた。
【0105】 細菌の形質転換 全てのプラスミドが、E.coli DH10B株(Gibco BRL)中
にエレクトロポレーションされ、これによって以前に記載されたプロトコール(
Shizuyaら、1992)に対してわずかな改変を導入する。それぞれの形
質転換のために、2μLの連結物および50μLのコンピテント細胞を、0.2
cmの皿(BioRad)中で混合され、そして200Ω、2.5kV、および
25μFでエレクトロポレーションされた。次いで、1mLのSOC培地(Ma
niatisら、1989)が、それぞれの形質転換体に添加され、細胞が37
℃で45分間インキュベートされ、そして最後に、組換えコロニーが、12.5
μg/mLのクロラムフェニコールを有するLB SOC培地(Maniati
sら、1989)上で検出された。
【0106】 細菌の増殖条件 もともともプラスミドを含有している細菌(その中のTGEVの不完全なゲノ
ムがクローン化された)が、37℃で増殖させられ、これは、正常な増殖速度論
を示す。一方、完全なcDNA含むBACは、可能な限り不安定性を最小にする
目的のために、30℃で増殖させられた。なお、コロニーの大きさは、減少させ
られ、そして24時間までのインキュベーション時間が、正常なコロニーの大き
さを達成するために必要であった。
【0107】 DNAの精製 Woo(Wooら、1994)によって記載されているプロトコールは、わず
かな改変を有して、以下の通りであった。単一のコロニーから、4LのLBが、
クロラムフェニコール(12.5μg/mL)とともに接種された。18℃で3
0時間のインキュベーション時間の後、細菌が、6,000Gでの遠心分離によ
って回収され、そしてプラスミドが、製造業者の推奨に従って、Qiagen
Plasmid Maxupreparationsキットを使用して精製され
た。この手順によって、得られたプラスミドDNAが細菌のDNAを混入してい
ることを観察した。混入している細菌のDNAを排除するために、プラスミドD
NAが、CsCl勾配上での16時間の55,000rpmでの遠心分離の手段
によって精製された。得られた収量は、プラスミドの大きさに依存して、15か
ら30μg/Lの間であった。
【0108】 配列分析 DNAは、蛍光色素マークされたジデオキシヌクレオチドと、耐熱性ポリメラ
ーゼ(Perkin Elmer)を使用して、自動配列決定装置(373 D
NA Sequencer、Applied Biosystems)中で配列
決定された。試薬は、Applied Biosystems company
によるキット(ABI PRISM Dye Terminator Cyc
le Sequencing Ready Rection Kit)の方法に
よって得られた。配列決定反応を行うために使用されたサーマルサイクラーは、
「GeneAmpPCR System 9600」(Perkin Elme
r)であった。
【0109】 配列の連結およびTGEVのコンセンサス配列とのそれらの比較が、SeqM
an II and Align(DNASTA)プログラムを使用して、それ
ぞれ行われた。コンセンサス配列中には差異は検出されなかった。
【0110】 プラスミドの安定性 もともとのグリセロレートから、組換えのpBeloBAC17プラスミドを
含有している細菌が、クロラムフェニコール(12.5μg/ml)を有する2
0mLのLB中で30℃及び37℃で16時間増殖させられた。この材料は、継
代0と考えれらた。細菌は、10倍に希釈され、そして16時間の間、30℃
および37℃で増殖させられた。連続的な継代が、連続する8日間の間に実現さ
れた(それぞれの継代が、約20世代を示す)。プラスミドDNAが、継代0お
よび8(160世代)でMiniprepによって精製され、そして制限ヌクレ
オチドを用いて分析された。TGEVのゲノムの一部を含む2つのプラスミドが
、高度に安定であり、それにもかかわらず、TGEVの完全なゲノムを含むプラ
スミドは40世代の後で、一定の不安定性を示した(この時点で、DNAの約8
0%が、正確な制限パターンを示した)。
【0111】 [実施例1] TGEVに由来する感染性のcDNAのクローンに基づく組換えベ
クターの構築 1.1 TGEVの感染性のcDNAの生成 完全なTGEVゲノムをコードするcDNAを得る目的のために、本発明者ら
は、最初に、欠損DI−CゲノムをコードするcDNAを用いて開始した(Me
ndezら、1996)。TGEVゲノムの約3分の1の長さを有するこのcD
NAを、低コピーのpACNR1180プラスミド(Ruggliら、1996
)中にクローン化し、そしてその配列を決定した。欠損ゲノムをコードするcD
NAが、相補性ウイルスの助けを用いて、効率的にレスキューされた(複製され
、そしてパッケージされた)(Mendezら、1996;Izetaら、19
99)。
【0112】 DI−Cゲノムには、約10、1、および8キロベース(kb)の3つの欠損
(Δ1、Δ2、およびΔ3)が、ORF 1a、1b、そして遺伝子Sおよび7
の間にそれぞれ存在する(図1を参照のこと)。以下の感染性のTGEVゲノム
をコードするcDNAの配列を完成させるためのストラテジーは、段階的に、D
I−Cゲノム中の欠失させられた配列を段階的に取りこむこと、新しく作成され
た構築物の細菌毒性を分析することであった。この局面は非常に重要である。な
ぜなら、RNAウイルスのcDNAを提示する組換えプラスミドが一般的にはあ
まり増殖せず、そして不安定であることが文献において広く記載されているから
である(BoyerおよびHaenni、1994;Riceら、1989;M
andlら、1997)。
【0113】 完成させられる第1の欠失は、ORF 1bの1kbの欠失Δ2であり、これ
によって安定な組換えプラスミドを生じた。ORF 1aを欠失している配列が
、cDNAフラグメントA、B、C,およびD(図1)を、レプリカーゼの遺伝
子について必要とされる全ての情報が完成させられるそのような方法によって、
クローニングすることによって導入された(Almazanら、2000)。得
られた組換えプラスミドは、細菌中では不安定であり、これによって、フラグメ
ントB中に取りこまれた付加および欠失を有する新しいプラスミドを作成した(
Almazanら、2000)。興味深いことに、ヌクレオチド4,417から
9,615の間を含むゲノムの領域を含む5,198bpのClaI−ClaI
制限酵素切断断片の排除(Penzesら、1999)によって、E.coli
DH10B株中で比較的安定なプラスミドを生じた。後者は、欠失Δ3の配列
が、TGEVゲのゲノムの3’末端の構造または非構造タンパク質についての全
ての遺伝子情報をクローニングすることによって付加した(図1)。
【0114】 TGEV cDNAの安定性を増大させる目的のためには、これがpBel−
pBAC11プラスミド(Kimら、1992)を使用してBAC中にサブクロ
ーン化されると決定した(図2を参照のこと)。pBeloBAC11プラスミ
ドを、H.ShizuyaおよびM.simon(California In
stitute of Technology)から懇意によって譲りうけた。
7,507bpの大きさのプラスミドは、parB、parC、E.coli(
oriS)に由来するF因子の複製起点、および1個の細胞あたり単一のプラス
ミドコピーを維持するために必要な遺伝子(parAおよびrepE)を含む。
プラスミドはまた、選択マーカーとしてクロラムフェニコールに対する耐性の遺
伝子(cat)を示す。cDNAを、このプロモーターを使用して得られる高い
レベルの発現(Dubenskyら、1996)、そしてRGEVコロナウイル
スによって発現されるRNAに由来する大きな欠損ゲノム(9.7kbおよび1
5kb)が、それらが合成される核から細胞質へのそれらの輸送の間にスプライ
シングを受けないことを示す本発明者らの研究室で得られた以前の結果(Ize
taら、1999;Penzesら、1999;Almazanら、2000)
に起因して、CMVのIEプロモーターの制御下にクローン化された。作成され
たTGEV cDNA(pBAC−TcDNA−ΔClaI)は、5,198b
pのClaIフラグメントを除くレプリカーゼの遺伝子についての情報、および
構造および非構造タンパク質の全ての情報を含んだ。cDNAの3’末端には、
24ヌクレオチドのポリA配列、HDVのリボザイム、およびBGHの転写終結
配列が隣接している(Izetaら、1999)。一方、TGEVの完全なゲノ
ムを作成するために必要なClaIフラグメントを、BAC中にクローン化し、
それによってプラスミドpBAC−B+C+D5’を作成した。これは、4,3
10から9,758の間のTGEVゲノムの領域を含んだ(図3を参照のこと)
。両方のプラスミドを、E.coli DH10B株中で増殖させ、そしてそれ
らの全体を配列決定した。得れらた配列は、ヌクレオチド6,752(A→G、
サイレント)および18,997(T→C、サイレント)の位置での2つの置換
、ならびに単離物C11のD遺伝子によって置換されているPRU46−MAD
のS遺伝子中での変化を除いて、本明細書の最後に提供するTGEVのPRU4
6−MAD単離物(配列番号1)のコンセント配列と同一であった(これらの変
化は、図4に示される)。
【0115】 さらに、感染性のTGEVをコードするcDNAを作成する目的のために、P
UR46−MADのS遺伝子(これは、呼吸管で高いレベル(>10PFU/
g組織)で、そして胃腸管中で低いレベル(<10PFU/mL)で複製する
)を、TGEVクローンC11(従って、C11)のS遺伝子によって完全に置
き換えた。これは、呼吸管(>10PFU/g組織)および胃腸管(<10 PFU/mL)の両方で上昇した力価で複製する(Sanchezら、1999
)。C11のS遺伝子は、PUR46−MAD単離物のSidennsiとは異
なる14個のヌクレオチドを示し、そしてS遺伝子の5’末端で6ntの挿入を
示す(図4を参照のこと)(Sanchezら、1999)。本発明者らの研究
室での以前の結果(Sanchezら、1999)は、指向された組換えによっ
て作成された変異体(TGEVのPUR46−MAD単離物のS遺伝子がC11
腸内単離物のS遺伝子で置き換えられた)が、感染したブタの胃腸管中でわずか
に複製するかまたは全く複製しないTGEVの天然のPRU46‐MAD単離物
とは異なる、腸内向性および増大した感染性を獲得したことを示した。
【0116】 cDNAを、完全なTGEVゲノムをコードするcDNAを含むpBAC−T
cDNAFLプラスミドを作成するために、pBAC−TcDNA−ΔClaI プラスミド中に、pBAC−B+C+D5’から得た5,198bpのClaI
−ClaIフラグメントのクローニングの手段によって、腸内単離物C11のS
遺伝子を用いてTGEVのPUR46‐MAD単離物から構築した(図3)。
【0117】 感染性のcDNA(pBAC−TcDNA−ΔClaIおよびpBAC−Cl
aI)、ならびに、完全なcDNAを含むプラスミド(pBAC−TcDNA FL )のクローンの構築に使用したプラスミドの細菌中での安定性を、160の
世代についてE.coli中での増殖の後で分析した。安定性を、精製したDN
Aの制限酵素での消化の手段によって分析した。欠失または挿入は検出されなか
ったが、使用した分析技術によっては検出されない主要ではない変化の存在は、
pBAC−TcDNA−ΔClaIおよびpBAC−B+C+D5’プラスミド
の場合においては除外することができなかた。pBAC‐TcDNAプラスミド
(これは、完全なTGEVのゲノムを含む)の場合においては、一定の不安定性
が、40の世代の後で検出された(この時点で、DNAの約80%が、正確な制
限パターンを示した)。しかし、このわずかな不安定性は、感染性のウイルスの
レスキューについての障害は示さない。なぜなら、20世代(4Lの培養物)の
細菌の増殖が、ウイルスレスキューがされることを可能にするプラスミドDNA
の量を作成するためには充分であるからである。
【0118】 1.2 完全なゲノムをコードするcDNAに由来する感染性のTGEVのレス
キュー ST細胞を、pBAC−TcDNAFLプラスミドを用いてトランスフェクト
した。トランスフェクションの48時間後に、培養物の上清を回収し、そして6
回、ST細胞に継代させた(図5を参照のこと)。継代2で開始して、感染の1
4時間で、細胞変性効果が現れ、これは感染後20時間まで延長され、実際にこ
れらの細胞の全てが単層を形成するまで、延長された(図6を参照のこと)。一
方、レスキューされたウイルスの力価は、継代とともに迅速に増大し、継代3で
10PFU/mLの桁の値に到達する。実験を、5回繰り返し、そしてその全
ての場合において、同様の力価を有する感染性のウイルスを回収したが、それに
もかかわらず、トランスフェクトしていないST細胞または同様のプラスミド(
ここでは、ClaI−ClaIフラグメントが反対の方向で見られた)でトラン
スフェクトしたST細胞の場合には、ウイルスは全く回収されなかった。
【0119】 得られたウイルスが混入の産物である可能性を排除する目的のために、6,7
52および18,997の位置での配列を、鋳型としてレスキューされたウイル
スのゲノムRNAを使用するRT−PCRによって増幅したcDNAフラグメン
トの配列決定の手段によって、決定した。配列に分析によって、6,752およ
び18,997の位置のヌクレオチドがcDNA中に存在するものであることを
決定した。さらに、レスキューされたウイルスは、C11のS遺伝子について予
想されるように、S遺伝子のcDNA配列中に、20,990の位置で制限部位
DraIIIを示した(図8)。これらの3個のゲノムマーカーの存在によって
、単離したウイルスがcDNAから来たことを確認した。
【0120】 作成されたウイルスのさらに深い特徴付けにおいて、比較分析を、pBAC−
TcDNAFLプラスミドでのトランスフェクションの後に回収したウイルス(
TcDNA)で感染させた細胞、またはTGEVのPRU46‐MAD単離物で
感染させた細胞の免疫蛍光によって行った。これについては、C11単離物およ
びPUR46−MAD単離物の両方を認識する特異的なポリクローナルおよびモ
ノクローナル抗体、または後者のみを(図6A.C3を参照のこと)、そしてT
cDNAおよびPUR46−MADの両方を認識するM(3B.B3)およびN
(3B.D8)タンパク質の特異的なモノクローナル抗体を、使用した。得られ
たデータは、作成したウイルスが、PUR46−MADのMおよびNタンパク質
を提示し、そしてもともとのcDNAにおいて設計されたような、C11単離物
のSタンパク質を提示したことを示した。
【0121】 1.3 インビボでの感染性および伝染性 TcDNAウイルスのインビボでの感染性を分析する目的のために、5匹の新
生児のブタのグループに、継代6に由来するウイルスのクローンを接種し、そし
て死亡率を分析した。5匹の接種したブタは、接種後3から4日で死亡した。こ
のことは、TcDNAウイルスが感染性であることを示す。対照的に、ウイルス
の希釈液のみを接種しそして同じ条件下で維持した2匹のブタは、変化を受けな
いままであった。
【0122】 1.4 転写調節配列の改変による発現のレベルの最適化 コロナウイルス中のRNA合成を、RNA依存性のプロセスの手段によって行
った。ここでは、mRNAを、負の極性を有する鋳型から転写した。TGEVに
おいては、保存されたコンセンサス配列であるCUAAACが見られる。これは
、遺伝子の大部分のすぐ前に配置される。これらの配列は、サブゲノムmRNA
の転写のためのシグナルを示す。コロナウイルスにおいては、コロナウイルスの
タイプおよび宿主のタイプに依存して変更可能な長さを有する、6から8個の間
のmRNAが存在する。最大のものは、ゲノムRNAに対応し、これは次いで、
ORF 1aおよび1bのmRNAとして機能する。mRNAの残りは、サブゲ
ノムmRNAに対応した。これらのRNAを、大きさの増大に伴ってmRNA1
から7と命名した。一方、最初に記載されたmRNAのセットが対応するmRN
Aの名称とともに命名された後で発見されたいくつかのmRNAを、ダッシュお
よび数字を用いて、例えば、mRNA2−1と命名した。mRNAは、ゲノムR
NAの構造に関係する両辺共有の(coterminal)構造を示す。最小の
mRNAを除いて、残りは構造的にポリシストロニック(polycystro
nic)であるが、一般的には、5’にもっとも近く配置されたものだけが翻訳
される。
【0123】 マーカー遺伝子(GUS)の発現の効率を、内部(IG)配列CUAAAC(
図11)、IG配列の3’末端に隣接している種々の配列(図12)、および種
々の挿入部位(図13)の5’末端に隣接している種々の配列を使用して実験し
た。得られた結果(図11から13)は、最適な発現が、以下からなるTRSを
用いて達成されたことを示した:(i)TGEVのN遺伝子のコンセント配列に
隣接している−88ヌクレオチド;(ii)IG配列;および(iii)S遺伝
子のIG配列の3’隣接配列。さらに、異種遺伝子の挿入の点との関係において
得られた結果と一致して、最大の発現レベルは、異種遺伝子がゲノムの3’末端
に配置された場合に達成された。記載されているようなTRSは、GUSが10 個の細胞あたり2から8μgのレベルで発現されることを可能にする。
【0124】 1.5 発現システムの組織特異性 多くの病原体は、粘膜を通じて宿主中に進入する。このタイプの感染を防ぐた
めには、高レベルの分泌免疫の誘導を可能にする発現システムを開発することが
重要である。これは、呼吸管および腸管に関係しているリンパ節中への抗原の投
与を通じて、基本的には達成され得る。この目的を達成するために、そして一般
的には、目的の組織で遺伝子の発現を指向するために、TGEVの向性の分子基
準を実験した。これらの実験は、TGEVの組織特異性が、所望される向性を有
するコロナウイルスのS遺伝子を含有している組換えウイルスの構築によって改
変され得る(Ballesterosら、1997;Sanchezら、199
9)。この情報によって、呼吸器または腸内向性を有するコロナウイルスのcD
NAゲノムに基づく発現システムを構築することを可能にする。
【0125】 1.6 感染性のcDNAを使用するPRRSVのORF5によってコードされ
るウイルス抗原の発現 異種遺伝子の発現のレベルを最適化する目的のために、構築物を、ベクター中
にTRSおよび異種遺伝子の交換を促進する配列をクローニングすることによっ
て隣接させられた、内部交換が可能なモジュールのベクターから作成した。ウイ
ルスのヌクレオカプシド(N)の遺伝子に隣接している−88ヌクレオチドに先
行する最小のIGSコンセンサス配列(CUAAC)およびKozak(AC)
GACCのものと同様の配列によって、5’末端で隣接されたPRRSV(ブタ
の呼吸器および生殖系の症候群ウイルス)は、最適な発現(約10μg/10 個の細胞)を生じた。原理的には、異種遺伝子のこれらの発現レベルは、免疫応
答を誘導するために充分であるものを上回る。異種遺伝子を、重要ではないウイ
ルスの遺伝子3aおよび3bによって以前に占有されていた部位に挿入した。
【0126】 1.7 cDNAに由来するウイルスベクターを用いて発現させた抗原に対する
、ブタ中での免疫応答の誘導 cDNAおよび上記のTRSに由来するウイルスベクターの同じタイプを使用
して、緑色蛍光タンパク質(GFP)をコードする遺伝子を、高いレベル(ブタ
の睾丸(ST)細胞中の100万個の細胞あたり20μgのタンパク質)で発現
させた。発現レベルは、細胞培養物中で20未満の継代について安定であった。
さらに、ブタのセットを、生存しているウイルスベクターを用いて免疫した。こ
れを、経口、鼻腔内で、および胃腸管の経路によって投与した。そして強力な体
液性の免疫応答を、ウイルスベクターおよびGFPの両方に対して検出した。興
味深いことに、副作用は、ウイルスベクターの3回の用量の投与の後には、接種
した動物中では観察されなかった。
【0127】 1.8 感染性のウイルスの作成を導く外来遺伝子を発現する安全なウイルスベ
クターの構築 ヒトについてのベクターを設計するためには、生体安全性が最優先事項である
。この目的を達成するために、3つのタイプの安全性の保護がベクター中で操作
される。これらのうちの2つは、2つのウイルス成分の欠損に基づく。これらは
、ウイルスの複製のために不可欠であるウイルスゲノムの種々の位置にマップさ
れる。これらの成分はパッケージング細胞株によってトランスで提供される。こ
の細胞(ベビーハムスター腎臓、BHK)は、ウイルスの必須の構造タンパク質
(エンベロープEおよび膜Mタンパク質)をコードする欠失TGEV遺伝子を発
現する。第3の安全性の保護は、組換えによる感染性のウイルスの回収が妨げら
れ、それによって異種遺伝子の効率的に発現するが最も近い細胞に対してもなお
増殖することを不可能にする、自殺ベクターの生成を導く方法におけるような、
ウイルスゲノムのパッケージングシグナルの再配置である。
【0128】 ヒトでの使用のための新しいベクターの設計を用いて、本発明者らは、ヒト種
内で増殖させられ得る新しいウイルスを産生することはできない。なぜなら、こ
のベクターは、ヒトにおいて細胞から細胞には伝達され得ないからである。ベク
ターは、複製欠損ウイルスに基づく。これは、ウイルスの欠損を相補するパッケ
ージング細胞を使用することによってワクチン工場でのみ増殖し得る。これらの
安全性の保護は、コロナウイルスの操作における新規の手順を示す。新しい向性
を有する組換えウイルスは、ネコの細胞中で少なくとも複製能力がある。なぜな
ら、これらの細胞は、ブタ、イヌ、およびネコのコロナウイルスを複製するから
である。
【0129】 微生物の寄託 本発明の感染性のクローンを有するプラスミドを保有しているEscheri
chia coliに由来する細菌(Escherichia colipBA
C−TcDNAFLと同定した)を、登録番号CECT 5256のもとで、1
999年11月24日に、Spanish Collection of Ty
pe Culture(CECT)、Burjassot(Valencia)
に寄託した。
【0130】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1は、TGEVの感染性のRNAをコードするcDNAクローンの構築を示
す。図1Aは、TGEVのゲノム構造を示し、そして遺伝子の名称が、文字と数
字で示される(1a、1b、S、3a、3b、E,M、N、および7)。図1B
は、cDNAクローニングストラテジーを示す。こでは、DI−Cゲノムを完成
させることからなる。欠失Δ1、Δ2、およびΔ3(これらは、cDNAの全長
を再度構築するように完成されている)が、示される。DI−cゲノムの構造の
の下い配置された数字は、上記のDI−C中のそれぞれの欠失が隣接しているヌ
クレオチドを示す。図1Cは、Δ1を完成させるために構築された4個のcDN
Aフラグメント、および結合の間に使用された重要な制限部位の位置を示す。フ
ラグメントΔ1の挿入によって、cDNAの毒性の増大を生じた。
【図2】 図2は、TGEVの感染性のcDNAのクローニングに使用される、pBel
oBACプラスミド(Wangら、1997)の構造を示す。pBeloBAC
プラスミドは、H.ShizuyaおよびM.Simon(Californi
a Institute of Technology)によって提供され、そ
してE.coliのF因子の複製起点(oriS)を含む7,507塩基対を含
む。この遺伝子は、1個の細胞あたりのプラスミドの1つの単一のコピー(pa
rA、parB、parC、およびrepE)、およびクロラムフェニコール耐
性遺伝子(CM)を維持することが不可欠である。T7およびSP6プロモー
ター、ならびに特有の制限部位の位置が示される。CosN:pBACプラスミ
ドの構築を容易にするためのラムダのcosN部位;lacZ:β−ガラクトシ
ダーゼ遺伝子。プラスミドの作成の間に使用した配列loxPもまた、示される
【図3】 図3は、TGEV cDNAの構築の間に使用された基本的なプラスミドの構
造を示す。pBAC−TcDNAΔClaIプラスミドは、5,198bpの1
つのClaI−ClaIを除く、全てのTGEVの情報を含む。cDNAを、サ
イトメガロウイルス(CMV)の発現の即時初期(IE)プロモーター下にクロ
ーン化され、そして24個のA残基、デルタ肝炎ウイルス(HDV)のリボザイ
ム、ならびにウシ成長ホルモン(BGH)の終結およびポリアデニル化配列が隣
接している。pBAC−B+CD5’プラスミドは、cDNAが全長であるまで
のpBAC−TcDNAΔClaIを完成させるために必要とされるClaI−
ClaIフラグメントを含む。pBAC−TcDNAFLプラスミドは、TGE
Vの全長のcDNAを含む。SAP:エビのアルカリホスファターゼ。
【図4】 図4は、TGEV RUR46−MAD(MAD)およびC11のクローンの
S遺伝子のヌクレオチド配列中の差異を示す。数は、それぞれの遺伝子のヌクレ
オチド1である開始コドンのAと考えられる、置換されたヌクレオチドの位置を
示す。棒の中の文字は、示される位置での対応しているヌクレオチドを示す。棒
の下の文字は、示される位置の周辺のヌクレオチドによってコードされるアミノ
酸(aa)置換を示す。Δ6ntは、6ヌクレオチドの欠失を示す。矢印は、S
遺伝子の終結コドンの位置を示す。
【図5】 図5は、全長のTGEV cDNAに由来する感染性のTGEVのレスキュに
適用されるストラテジーを示す。pBAC−TcDNAFLプラスミドがST細
胞(ブタの睾丸細胞)に対してトランスフェクトされ、そしてトランスフェクシ
ョンの48時間後に、上清が、新しいST細胞を感染させるために使用された。
ウイルスが、示される時間に継代された。それぞれの継代で、上清のアリコート
および細胞性の単層が、ウイルスの滴定およびRt−PCRアッセイのためのR
NAの単離のために、それぞれ回収された。vgRNA:全長のウイルスRNA
【図6】 図6は、トランスフェクトされたST細胞中のTGEV cDNAによって生
じる、細胞変性効果(CPE)を示す。トランスフェクトされていない(コント
ロールの)ST細胞(図6A)中にCPEが存在しないこと、およびST細胞中
でpBAC−TcDNAFLでのトランスフェクションの14および20時間後
に観察されたCPEが、示される(それぞれ、図6Bおよび6C)
【図7】 図7は、継代によるウイルス力価の展開を示す。pBAC−TcDNAFL
のトランスフェクションの後の種々の継代での、細胞性の単層(1および2)の
2つのシリーズの上清中のウイルス力価が、示される。Mock1および2は、
トランスフェクトされていないST細胞をいう。TcDNA1および2は、pB
AC−TcDNAFLでトランスフェクトされたST細胞をいう。
【図8】 図8は、pBAC−TcDNAFLでのST細胞のトランスフェクションの後
で回収されたウイルスの配列の分析結果を示す。TGEVゲノムの構造が、図の
上部に示される。同様に、pBAC−TcDNAFLプラスミドならびにTGE
VクローンC8およびC11から回収されたウイルスの間でのヌクレオチドの配
列における差異が、示される。ヌクレオチド間での差異の位置が、棒の上部に配
置された数字によって示される。TcDNAウイルスおよびクローンC11のc
DNA配列が、RT−PCR(逆転写およびポリメラーゼ連鎖反応)によって得
られたフラグメントを配列決定することによって決定された。クローンC8の配
列は、公表されており(Penzesら、1999)、そしてこれは、本特許の
最後に含まれる。制限パターンが、TcDNAおよびC8ウイルスのヌクレオチ
ド18,997および20,990を含むRT−PCRによって得られたフラグ
メントのClaIおよびDraIIIを用いて示される。制限パターンは、これ
らのウイルスのcDNA中のClaIおよびDraIII部位の存在または非損
じ亜を示す。この分析の結果は、TcDNAウイルスが、C11を単離すること
が期待されるS−遺伝子配列を有することを示す。MWM:分子量マーカー。
【図9】 図9は、回収されたウイルスのRT−PCR分析の結果を示す。ウイルスRN
Aは、細胞性のポリメラーゼpolIIによって認識されるCMVプロモーター
の制御下で発現された。原理は、このRNAが細胞質へのその輸送の間にスプラ
イシングを受け得ることである。これが事実であるかどうかを実験するために、
スプライシングの高い可能性を有するRNAの部位が、人のDNAの配列中のス
プライシング部位を推定するためのプログラムを使用して、決定された(Ver
sion 2.1.5.94、Department of Cell Bio
logy、Baylor College of Medicine)(Sol
ovyevら、1994)。切断の最大の可能性を有する可能性のあるスプライ
シング部位は、ヌクレオチド7,243にドナー部位を、そしてヌクレオチド7
,570でレシーバー部位を有した(図9A)。このドメインがスプライシング
をうけたかどうかを実験するために、nt7,078およびnt7,802によ
って隣接されるRT−PCRフラグメント(図9B)が、トランスフェクトされ
ていない培養物の継代0および2のRNA(コントロール)から、あるいは逆方
向のまたは正確な方向の(TcDNAFL)ClaIフラグメントを有するTc
DNAでトランスフェクトされたST細胞から、調製された。得られる結果が、
図9C(継代0)および9D(継代2)に示される。
【図10】 図10は、TcDNAでトランスフェクトされたST細胞の培養物中で産生さ
れるウイルスの免疫蛍光分析の結果を示す。免疫蛍光のための染色が、TGEV
PUR46−MAD単離物について特異的な抗体、pBAC−TcDNAFL プラスミドでのトランスフェクションの後で回収されたウイルスについて特異的
な抗体を用いて、行われた。このために、両方の単離物に、またはPUR46−
MADにのみ結合する、TGEV特異的モノクローナル抗体が、使用された(S
anchezら、1999)。結果によって、TcDNAウイルスが予想される
抗原性を有することを確認した。TGEVについて特異的なポリクローナル抗血
清は、両方のウイルスに結合したが、感染していない培養物には結合せず、そし
てTcDNAウイルス(Sanchezら、1999)に結合したSタンパク質
について特異的なモノクローナル抗体(ID.B12および6A.C3)、Mタ
ンパク質について特異的なモノクローナル抗体(3B.B3)、ならびにNタン
パク質について特異的なモノクローナル抗体(3B.D8)にのみ結合した。
【図11】 図11は、インタージェニック(IC)配列の5’隣接領域が変化する、種々
の転写調節配列の下でのGUSの発現を示す。ミニゲノムM39が、CMVプロ
モーターの制御下にクローン化された。複数のクローニング配列(PL1、5’
−CCTAGGATTTAAATCCTAAGG−3’;配列番号2)、および
選択された転写調節配列(TRS)によって形成される転写ユニット、別の複数
のクローニング配列(PL2、5’−GCGGCCGCGCCGGCGAGGC
CTGTCGAC−3’;配列番号3;またはPL3、5’−GTCGAC−3
’;配列番号4)、Kozak(Kz)ドメインの構造を有する配列、β−グル
クロニダーゼ(GUS)遺伝子、ならびに別の複数のクローニング部位(PL4
、5’−GCTAGCCCAGGCGCGCGGTACC−3;配列番号5)が
、このミニゲノム中に挿入された。これらの配列は、ミニゲノムM39の3’末
端、HDVリボザイム、ならびにBGHの終結配列およびポリアデニル化配列に
よって3’末端で隣接された。TRSは、異なる数(0、−3、−8、および−
88)のヌクレオチドをIG配列(CUAAAC)注1の5’末端に有し、そし
て示されるように、N、S,またはM遺伝子に由来した。ST細胞が、種々のプ
ラスミドでトランスフェクトされ、相補的なウイルス(PUR46−MAD)で
感染させられ、そして上清が、6回継代された。感染させられた細胞中でのGU
S活性が、Izeta(Izetaら、1999)によって記載されているプロ
トコールの手段によって決定された。継代された数に対するGUS活性の関係に
よって得られた結果が、図11Bにまとめられる。 注1 本特許の目的にとって、CTAAACとCUAAACは同じ意味を有する
ことに注意すべきである。前者はDNAの配列を示し、後者は対応するRNAの
配列である。
【図12】 図12は、IG配列の3’−隣接領域において変化する、種々のTRS下での
GUSの発現を示す(図11Aを参照のこと)。TGEVのN遺伝子の−88n
tに対応しているこの転写ユニットおよびIG配列(CUAAAC)を使用して
、3’−隣接配列が改変された。これらの配列は、図12Aに示されるように、
種々のTGEV遺伝子のもの(S、3a、3b、E,M、N、および7)に対応
した。2つの場合においては、3’配列は、制限部位(SalI)および最適な
Kozak配列(Kz)を含む他のものによって、またはウイルスのゲノムのリ
ーダーに続いて配置された第1のIG配列に続くものと同一の配列によって、置
き換えられた。感染させられた細胞中でのGUS活性が、上記のプロトコールの
手段によって決定された(Izetaら、1999)。cL12は、TGEVゲ
ノムの「リーダー」配列の3’末端のものと同一である12個のヌクレオチドの
配列を示す(最後に示されるウイルス配列を参照のこと)。継代された回数に対
するGUSの発現の関係によって得られた結果が、図12Bにまとめられる。
【図13】 図13は、GUSの発現のレベルを上回る、ミニ遺伝子の発現におけるモジュ
ールの挿入の部位の効果を示す。IG配列(CUAAC)の5’末端に隣接して
いるN遺伝子の−88ntを含有している、GUS転写ユニット、および3’末
端に隣接しているKz配列(図12Aを参照のこと)が、全てのこれらの部位が
異種遺伝子の発現のために等しく許容性であるかどうかを決定するために、ミニ
ゲノムM39中の4個の単一の制限部位に挿入された(図13Aを参照のこと)
。ST細胞が、これらのプラスミドでトランスフェクトされ、そして相補性ウイ
ルス(PUR46−MAD)で感染させられた。感染させられた細胞中のGUS
活性が、上記に記載されるプロトコール(Izetaら)に従って、継代0(P
0)で決定された。得られた結果が、図13Bにまとめられる。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 39/395 A61K 48/00 48/00 A61P 1/00 A61P 1/00 11/00 11/00 29/00 29/00 31/00 31/00 C12N 7/00 C12N 7/00 15/00 ZNAA (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE,TR),OA(BF ,BJ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW, ML,MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,G M,KE,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ, MD,RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM, AT,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,B Z,CA,CH,CN,CR,CU,CZ,DE,DK ,DM,DZ,EE,ES,FI,GB,GD,GE, GH,GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS,J P,KE,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR ,LS,LT,LU,LV,MA,MD,MG,MK, MN,MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,R O,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG,US,UZ, VN,YU,ZA,ZW Fターム(参考) 4B024 AA01 BA32 CA04 CA11 DA06 HA17 4B065 AA26X AA95Y AB01 BA01 CA24 CA44 4C084 AA13 ZB011 ZB012 ZB111 ZB112 ZB311 ZB312 ZC611 ZC612 4C085 AA03 AA13 AA14 BB31 CC31 DD62 EE01 EE05 4C087 AA02 BC83 ZB01 ZB11 ZB21 ZB31 ZC61 【要約の続き】 しくはウイルス粒子を含む医薬調製物の使用が開示され る。

Claims (74)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 (a)RNAウイルスのゲノムRNA(gRNA)の完全長コピーを含有して
    いるDNA;または (b)RNAウイルスのgRNAの1つまたはいくつかのフラグメントを含有
    しているDNAであって、ここで、フラグメントはRNA依存性のRNAポリメ
    ラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク質をコードする;また
    は (c)(a)または(b)の配列に対して少なくとも60%の相同性を有して
    いるDNA; が、細菌の人工染色体(BAC)中にクローン化される工程を含むことを特徴と
    するDNAの調製方法。
  2. 【請求項2】 BAC中にクロー化されたDNAが、1つのウイルスの構造または非構造タン
    パク質を除いて、いくつかまたは全てをコードする配列をさらに含む、請求項1
    に記載の方法。
  3. 【請求項3】 BAC中にクロー化されたDNAが、1つまたはいくつかの異種遺伝子をコー
    ドする配列をさらに含む、請求項1または2に記載の方法。
  4. 【請求項4】 異種遺伝子が、感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するのに適した少なく
    とも1つの抗原、感染性の病原体の複製を妨害する少なくとも1つの分子、感染
    性の病原体に対する防御を提供する抗体、免疫モジュレーター、サイトカイン、
    免疫エンハンサー、または抗炎症性化合物をコードする、請求項3に記載の方法
  5. 【請求項5】 BAC中にクローン化されたDNAが、少なくとも5kbの大きさを有する請
    求項1〜4の一項に記載の方法。
  6. 【請求項6】 BAC中にクローン化されたDNAが、少なくとも15kbの大きさを有する
    請求項1〜5の一項に記載の方法。
  7. 【請求項7】 BAC中にクローン化されたDNAが、少なくとも25kbの大きさを有する
    請求項1〜6の一項に記載の方法。
  8. 【請求項8】 BACが、BAC中にクローン化されたDNAの転写を制御する配列を含む、
    請求項1〜7の一項に記載の方法。
  9. 【請求項9】 ウイルスの1つの遺伝子がヌクレオチドの置換、欠失、または付加によって改
    変されている、請求項1〜8の一項に記載の方法。
  10. 【請求項10】 ウイルスの向性を制御する遺伝子が改変されている請求項9に記載の方法。
  11. 【請求項11】 ウイルスの向性を制御する遺伝子が、別のウイルスのそれぞれの遺伝子で置換
    されている、請求項1〜10の一項に記載の方法。
  12. 【請求項12】 BAC中にクローン化されたDNAが、ウイルス粒子に組み立てられ得るRN
    Aに転写され得る、請求項1〜11の一項に記載の方法。
  13. 【請求項13】 ウイルス粒子が、感染性の、弱毒化された、複製欠損の、または不活化された
    ウイルスである、請求項12に記載の方法。
  14. 【請求項14】 ウイルスが、自然に正方向の鎖のゲノムを有する請求項1〜13の一項に記載
    の方法。
  15. 【請求項15】 ウイルスが、ピコルナウイルス、フラビウイルス、トガウイルス、コロナウイ
    ルス、トロウイルス、アルテリウイルス、カルシウイルス、ラブドウイルス、パ
    ラミクソウイルス、フィロウイルス、ボルナウイルス、オルトミクソウイルス、
    ブンヤウイルス、アレナウイルス、またはレオウイルスである請求項1〜14の
    一項に記載の方法。
  16. 【請求項16】 DNAが請求項1〜15の一項に従って調製され、該DNAが適切な宿主細胞
    中で発現されるかまたは該DNAの転写を起こす条件下で化学物質、生物学的試
    薬および/または細胞抽出物と混合され、およびウイルスRNAが単離される工
    程を含むことを特徴とするウイルスRNAの調製方法。
  17. 【請求項17】 DNAが請求項1〜15の一項に従って調製され、該DNAが適切な宿主細胞
    中で発現されるかまたは該DNAの転写を起こす条件下で化学物質、生物学的試
    薬および/または細胞抽出物と混合され、およびウイルス粒子が単離される工程
    を含むことを特徴とするウイルス粒子の調製方法。
  18. 【請求項18】 ウイルス粒子が引き続いて不活化されるか、または死滅させられる、請求項1
    7に記載の方法。
  19. 【請求項19】 DNAが請求項1〜15の一項に従って調製され、ウイルスRNAが請求項1
    6に従って調製されるかまたはウイルス粒子が請求項17または18に従って調
    製され、および引き続いて薬学的に受容可能なアジュバントまたはキャリアと混
    合されることを特徴とする医薬組成物の調製方法。
  20. 【請求項20】 医薬品が、感染性の疾患に対してヒトまたは動物を防御するためのワクチンで
    ある請求項19に記載の方法。
  21. 【請求項21】 医薬品が、ヒトまたは動物の遺伝子治療のために使用される請求項19に記載
    の方法。
  22. 【請求項22】 コロナウイルスの天然の配列に対して少なくとも60%の相同性を有し、RN
    A依存性RNAポリメラーゼおよび少なくとも1つの構造または非構造タンパク
    質をコードする、コロナウイルスのゲノムRNA(gRNA)に由来する配列を
    含むことを特徴とするDNAであって、前記DNAのフラグメントがウイルス粒
    子に組み立てられ得るRNAに転写され得るDNA。
  23. 【請求項23】 異種遺伝子をコードする配列をさらに含む請求項22に記載のDNA。
  24. 【請求項24】 異種遺伝子が、感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するのに適した少なく
    とも1つの抗原、感染性の病原体の複製を妨害する少なくとも1つの分子、感染
    性の病原体に対する防御を提供する抗体、免疫モジュレーター、サイトカイン、
    免疫エンハンサー、または抗炎症性化合物をコードする、請求項23に記載のD
    NA。
  25. 【請求項25】 前記フラグメントが、少なくとも25kbの大きさを有する請求項22または
    24に記載のDNA。
  26. 【請求項26】 コロナウイルスの構造または非構造タンパク質の1つを除くいくつかまたは全
    てをコードするコロナウイルスに由来する配列をさらに含む、請求項22〜25
    の一項に記載のDNA。
  27. 【請求項27】 コロナウイルスの構造または非構造タンパク質の全てをコードするコロナウイ
    ルスに由来する配列をさらに含む、請求項22〜26の一項に記載のDNA。
  28. 【請求項28】 ウイルスgRNAの転写を制御する配列をさらに含む、請求項22〜27の一
    項に記載のDNA。
  29. 【請求項29】 ウイルスgRNAの転写を制御する配列がサイトメガロウイルス(CMV)の
    最初期(IE)プロモーターである請求項22〜28の一項に記載のDNA。
  30. 【請求項30】 配列が、ポリ(A)テイル、肝炎ウイルスデルタ(HDV)のリボザイム、ウ
    シ成長ホルモン(BGH)の終結およびポリアデニル化配列によって3’末端で
    隣接される、請求項22〜29の一項に記載のDNA。
  31. 【請求項31】 ウイルスの配列が、ブタ伝染性胃腸炎ウイルス(TGEV)、マウス肝炎ウイ
    ルス(MHV)、感染性の気管支炎ウイルス(IBV)、ウシコロナウイルス(
    BCV)、イヌコロナウイルス(CCoV)、ネココロナウイルス(FCoV)
    ヒトコロナウイルス(HCoV)トロウイルス、またはアルテリウイルスの分離
    物に由来する請求項22〜30の一項に記載のDNA。
  32. 【請求項32】 ウイルス粒子が、感染性の、非感染性の、または複製欠損のウイルスである、
    請求項22〜31の一項に記載のDNA。
  33. 【請求項33】 コロナウイルスに由来する構造または非構造遺伝子の配列が、天然の遺伝子配
    列の1つまたはいくつかのヌクレオチドを置換し、欠失させ、または付加するこ
    とにより改変されている、請求項22〜32の一項に記載のDNA。
  34. 【請求項34】 S、N、またはM遺伝子の配列が改変されている、請求項22〜33の一項に
    記載のDNA。
  35. 【請求項35】 コロナウイルスに由来するS遺伝子の配列が、弱毒化されたウイルス粒子を得
    るように改変されている、請求項22〜34の一項に記載のDNA。
  36. 【請求項36】 コロナウイルスに由来するS遺伝子の配列が、コロナウイルスの向性と異なる
    向性をもったウイルス粒子を得るように改変されている、請求項22〜35の一
    項に記載のDNA。
  37. 【請求項37】 請求項22〜36の一項に記載の核酸を含むベクター。
  38. 【請求項38】 ベクターが、プラスミドまたは細菌の人工染色体(BAC)である請求項37
    に記載のベクター。
  39. 【請求項39】 請求項22〜38の一項に記載の核酸を含む宿主細胞。
  40. 【請求項40】 登録番号CECT 5265のもとで、Spanish Collectio
    n of Type Cultureに寄託された大腸菌。
  41. 【請求項41】 請求項22〜38の一項に記載のDNAが宿主細胞中に導入され、該DNAを
    含有する宿主細胞が該DNAの発現を可能にする条件下で培養され、および組換
    えウイルス粒子またはウイルスRNAが回収される工程を含むことを特徴とする
    、組換えウイルス粒子またはウイルスRNAの製造方法。
  42. 【請求項42】 請求項22〜38の一項に記載のDNAが該DNAの転写を可能にする条件下
    で化学物質、生物学的試薬および/または細胞抽出物と混合され、および組換え
    ウイルス粒子またはウイルスRNAが回収される工程を含むことを特徴とする、
    組換えウイルス粒子または組換えウイルスRNAの製造方法。
  43. 【請求項43】 DNAが請求項23〜38の一項に記載のDNAである請求項41または42
    に記載の方法。
  44. 【請求項44】 請求項41〜43の一項に記載の方法により得ることができるウイルス粒子。
  45. 【請求項45】 ウイルス粒子が、感染性の、弱毒化された、複製欠損の、または不活化された
    ウイルスである、請求項44に記載のウイルス粒子。
  46. 【請求項46】 ウイルス粒子が、改変されたS、M、またはN遺伝子を含む請求項44または
    45に記載のウイルス粒子。
  47. 【請求項47】 S遺伝子の改変が弱毒化されたウイルスを生じさせる請求項46に記載のウイ
    ルス粒子。
  48. 【請求項48】 S遺伝子の改変が変更された向性をもったウイルスを生じさせる請求項46に
    記載のウイルス粒子。
  49. 【請求項49】 請求項41〜43の一項に記載の方法により得ることができるウイルスRNA
  50. 【請求項50】 請求項22〜38の一項に記載の核酸、請求項39または40に記載の宿主細
    胞、請求項41〜48の一項に記載のウイルス粒子、または請求項49に記載の
    ウイルスRNAを含むことを特徴とする医薬調製物。
  51. 【請求項51】 請求項22〜38の一項に記載の核酸、請求項39または40に記載の宿主細
    胞、請求項41〜48の一項に記載のウイルス粒子、または請求項49に記載の
    ウイルスRNAを含むことを特徴とする、感染性の病原体によって引き起こされ
    る疾患に対して動物またはヒトを防御することのできるワクチン。
  52. 【請求項52】 核酸が、感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するのに適した少なくとも1
    つの抗原、感染性の病原体の複製を妨害する少なくとも1つの遺伝子、または感
    染性の病原体に対する防御を提供する抗体をコードする配列を含む、請求項51
    に記載のワクチン。
  53. 【請求項53】 前記ウイルスベクターが、少なくとも1つの複製妨害分子、全身性の免疫応答
    および/または呼吸器、腸粘膜、または他の組織中で増殖する異なる感染性の病
    原体に対する粘膜における免疫応答を誘導し得る抗原を発現する、請求項51ま
    たは52に記載のワクチン。
  54. 【請求項54】 請求項22〜38の一項に記載の1つ以上の核酸、請求項39または40に記
    載の宿主細胞、請求項41〜48の一項に記載のウイルス粒子、または請求項4
    9に記載のウイルスRNAを含み、ここでそれぞれが、前記感染性の病原体のそ
    れぞれに対する免疫応答を誘導するのに適した抗原、妨害分子、または前記感染
    性の病原体のそれぞれに対する防御を提供する抗体を発現する、1つ以上の感染
    性の病原体によって引き起こされる感染に対して動物またはヒトを防御し得る多
    価ワクチン。
  55. 【請求項55】 薬学的に受容可能なキャリアまたは希釈剤をさらに含む、請求項51〜54の
    一項に記載のワクチン。
  56. 【請求項56】 コロナウイルスに由来する妨害欠損ゲノムがBACベクター中でプロモーター
    の発現下にクローン化され、そして欠損ゲノム内で欠失した配列が再挿入される
    、請求項22〜38の一項に記載のDNAを調製する方法。
  57. 【請求項57】 ウイルスゲノム中の毒性配列が、残存しているゲノムDNA中への再挿入の前
    に同定される、請求項56に記載のDNAの調製方法。
  58. 【請求項58】 ウイルスゲノム中の毒性配列が、ゲノムが完成する前に再挿入される最後の配
    列である、請求項56または57に記載のDNAの調製方法。
  59. 【請求項59】 転写調節配列の下にクローン化された、コロナウイルスのゲノムRNA(gR
    NA)と相補的なDNA(cDNA)の完全長のコピーを含む、コロナウイルス
    に由来する感染性クローン。
  60. 【請求項60】 前記コロナウイルスが、ブタの感染性胃腸炎ウイルス(TGEV)の単離物で
    ある請求項59に記載の感染性クローン。
  61. 【請求項61】 前記プロモーターが、サイトメガロウイルス(CMV)の発現の最初期(IE
    )プロモーターである請求項59または60に記載の感染性クローン。
  62. 【請求項62】 前記完全長cDNAが、ポリ(A)テイル、肝炎ウイルスデルタ(HDV)の
    リボザイム、ウシ成長ホルモン(BGH)の終結およびポリアデニル化配列によ
    って3’末端で隣接される、請求項59〜61の一項に記載の感染性クローン。
  63. 【請求項63】 前記感染性cDNAが細菌の人工染色体(BAC)中にクローン化されている
    請求項59〜62の一項に記載の感染性クローン。
  64. 【請求項64】 コロナウイルスのgRNAから完全長cDNAを構築し、そして転写調節因子
    をアセンブルすることを特徴とする、請求項59〜63の何れかに記載の感染性
    クローンを取得する手順。
  65. 【請求項65】 コロナウイルスgRNAの完全長cDNAの構築が、以下の工程を含む請求項
    64に記載の手順: (i)前記コロナウイルスに由来する妨害欠損ゲノムが、BAC中で発現プロ
    モーターの下でクローン化する工程、 (ii)前記妨害欠損ゲノムの欠失を完成し、感染性のgRNAについて欠失
    した配列を再生する工程、 (iii)細菌に対する毒性配列をクローン化される前に同定し、該毒性配列
    を除去し、前記毒性配列を、コロナウイルスのgRNAに対応するcDNAクロ
    ーンを得るために、真核細胞に形質転換する直前に挿入する工程。
  66. 【請求項66】 請求項59〜63の何れかに記載された感染性クローンを含むか、または請求
    項58または59の何れかの手順により得ることができる組換えウイルスベクタ
    ーであって、異種核酸が発現されることを可能にする条件下で前記感染性クロー
    ンに挿入された前記異種核酸を含むように修飾された組換えウイルスベクター。
  67. 【請求項67】 前記異種核酸が、目的の遺伝子産物をコードする遺伝子および遺伝子フラグメ
    ントから選択される請求項60に記載のベクター。
  68. 【請求項68】 異種核酸の発現を可能にする条件下で、請求項60または61の何れかに記載
    のウイルスベクターを含有する宿主細胞を培養し、目的産物を回収する工程を含
    む、目的産物の製造方法。
  69. 【請求項69】 コロナウイルスのゲノムに対応するcDNA配列中に異種核酸を含む修飾され
    た組換えコロナウイルスの製造方法であって、請求項60または61の何れかに
    記載されたウイルスベクターを宿主細胞導入する工程、前記ウイルスベクターの
    発現および複製を可能にする条件下で前記ウイルスベクターを含有する宿主細胞
    を培養する工程、および修飾された組換えコロナウイルスから得られたウイルス
    粒子を回収する工程を含む方法。
  70. 【請求項70】 (i)前記感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するために適切な少なくと
    も1つの抗原、または前記感染性の病原体に対する防御を提供する抗体を発現す
    る請求項60または61に記載の少なくとも1つのウイルスベクターと、 (ii)薬学的に受容可能な賦形剤を任意的に伴って含む、 感染性の病原体によって引き起こされる感染に対して動物を防御することがで
    きるワクチン。
  71. 【請求項71】 前記ウイルスベクターが、全身性の免疫応答および/または呼吸器、腸粘膜、
    または他の組織中で増殖する異なる感染性の病原体に対する粘膜における免疫応
    答を誘導し得る少なくとも1つの抗原を発現する、請求項64に記載のワクチン
  72. 【請求項72】 (i)前記感染性の病原体に対する免疫応答を誘導するために十分な抗原、ま
    たは前記感染性の病原体に対する防御を提供する抗体を発現する請求項60また
    は61に記載のウイルスベクターと、 (ii)薬学的に受容可能な賦形剤を任意的に伴って含む、1つ以上の感染性
    の病原体によって引き起こされる感染に対して動物を防御することができる多価
    ワクチン。
  73. 【請求項73】 (i)前記感染性の病原体のそれぞれ1つに対する免疫応答を誘導するために
    十分な抗原、または前記感染性の病原体のそれぞれ1つに対する防御を提供する
    抗体を発現する請求項60または61に記載の1つ以上のウイルスベクターと、 (ii)薬学的に受容可能な賦形剤を任意的に伴って含む、1つ以上の感染性
    の病原体によって引き起こされる感染に対して動物を防御することができる多価
    ワクチン。
  74. 【請求項74】 請求項59〜63のいずれか記載の、または請求項64または65の何れかの
    手順によって得ることのできる感染性クローンを宿主細胞に導入し、感染性クロ
    ーンを含有する前記宿主細胞を、感染性クローンが発現および複製し得る条件下
    で培養し、コロナウイルスの完全なゲノムを含有する組換えコロナウイルスから
    得られるウイルス粒子を回収することを特徴とする組換えコロナウイルスの製造
    方法。
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