JP2002519038A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2002519038A5 JP2002519038A5 JP2000557385A JP2000557385A JP2002519038A5 JP 2002519038 A5 JP2002519038 A5 JP 2002519038A5 JP 2000557385 A JP2000557385 A JP 2000557385A JP 2000557385 A JP2000557385 A JP 2000557385A JP 2002519038 A5 JP2002519038 A5 JP 2002519038A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- stranded nucleic
- population
- library
- template
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 49
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 41
- 230000000295 complement Effects 0.000 description 11
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 description 9
- 229920001405 Coding region Polymers 0.000 description 8
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- 101700011961 DPOM Proteins 0.000 description 5
- 101710029649 MDV043 Proteins 0.000 description 5
- 101700061424 POLB Proteins 0.000 description 5
- 101700054624 RF1 Proteins 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 101710030587 ligN Proteins 0.000 description 3
- 101700077585 ligd Proteins 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 2
- 101700008821 EXO Proteins 0.000 description 2
- 101700083023 EXRN Proteins 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 description 1
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004059 degradation Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing Effects 0.000 description 1
Description
【特許請求の範囲】
【請求項１】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）一本鎖核酸鋳型の集団を提供する段階であって、各々の鋳型がコード配列及び機能的に連結したプロモーター配列を含む段階；
（b）該一本鎖核酸鋳型よりも長さが短い実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物と、該一本鎖核酸鋳型の集団とをハイブリダイズさせる段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）の各ハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）該第二の核酸鎖から転写されるRNAライブラリーを製造するため、段階（c）の産物をRNAポリメラーゼと接触させる段階。
【請求項２】 一つ又は複数の変異をライブラリーに導入するために用いられる、請求項1記載の方法。
【請求項３】 以下の段階を含む、核酸分子の集団における配列の多様性を減少させるための方法：
（a）様々な配列を有する一本鎖核酸鋳型の第一の集団を提供する段階であって、実質的に全ての鋳型の各々が、コード配列と機能的に連結したプロモーター配列とを含む段階、
（b）該核酸鋳型よりも長さが短くかつ該核酸鋳型に実質的に相補的である一本鎖核酸断片の第二の集団と、該第一の集団のメンバーとをハイブリダイズさせる段階であって、該第二の集団のサブ集団が実質的に同一の配列を有しかつさまざまな配列のある領域にハイブリダイズする段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）のハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）該第二の核酸鎖から転写され、かつ該一本鎖核酸鋳型の第一の集団と比較して配列の多様性が減少したRNA分子の第三の集団を製造するため、段階（c）の産物をRNAポリメラーゼと接触させる段階。
【請求項４】 一本鎖核酸鋳型の第一の集団から一つ又は複数の変異を取り除くために用いられる、請求項3記載の方法。
【請求項５】 実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物が、二本鎖核酸分子の切断又はランダム・オリゴヌクレオチドの合成により製造される、請求項1又は3記載の方法。
【請求項６】 実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物が、少なくとも約100個の異なる種類の核酸断片を含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項７】 第二の核酸鎖から相補鎖を製造する段階、該相補鎖を一本鎖核酸鋳型の集団又は第一の集団として提供する段階、および段階(b)および(c)を一回もしくは複数回繰り返し、続いて段階(d)を繰り返す段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項８】 一本鎖核酸鋳型とホモ二重鎖を形成する一つ又は複数の一本鎖核酸断片を提供する段階、及び該ホモ二重鎖形成断片の存在下で段階（b）を実施する段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項９】 プロモーターがT7プロモーターである、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１０】 DNAポリメラーゼがT4 DNAポリメラーゼである、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１１】 接触段階（d）の前に段階（c）の産物を増幅させる段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１２】 （e）タンパク質ライブラリーを製造するためRNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１３】 （e）RNAライブラリーの実質的に全ての各メンバーのコード配列の3’末端に、アミノ酸アクセプター分子を連結させる段階；および任意で（f）RNA−タンパク質融合体ライブラリーを製造するためRNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１４】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）一本鎖核酸鋳型の第一の集団を提供する段階であって、各々の鋳型がコード配列を含む段階；
（b）様々な配列を有する一本鎖核酸分子の第二の集団を提供する段階であって、該一本鎖核酸鋳型の第一の集団と様々な配列を有する一本鎖核酸分子の該第二の集団が実質的に相補的である段階；
（c）二重鎖を形成するために十分な条件下で、一本鎖核酸鋳型の該第一集団と、様々な配列を有する一本鎖核酸分子の該第二集団とをハイブリダイズさせる段階；並びに
（d）酵素が該二重鎖内のミスマッチ塩基対を修正することを可能にする条件下で、該二重鎖を一つ又は複数の除去／修復酵素と接触させる段階。
【請求項１５】 段階（d）の産物に由来しコード配列を含む一本鎖核酸鋳型の新しい集団を提供する段階、鋳型の第一集団を鋳型の該新しい集団で置き換える段階、並びに段階（b）、（c）及び段階（d）を一回もしくは複数回繰り返す段階を段階（d）の後にさらに含む、請求項14記載の方法。
【請求項１６】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）コード配列を各々が含む、一本鎖核酸鋳型の集団を提供する段階；
（b）該核酸鋳型よりも長さが短い実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物と、該一本鎖核酸鋳型の集団とをハイブリダイズさせる段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）の各ハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）酵素が該産物内のミスマッチ塩基対を修正することを可能にする条件下で、段階（c）の産物を一つ又は複数の除去／修復酵素と接触させる段階。
【請求項１７】 コード配列を含みかつ段階（d）の産物に由来する一本鎖核酸鋳型の新しい集団を提供する段階、該一本鎖核酸鋳型の集団を該鋳型の新しい集団に置き換える段階、および段階（b）〜（d）を一回もしくは複数回繰り返す段階をさらに含む、請求項16記載の方法。
【請求項１８】 除去／修復酵素との接触がインビボ又はインビトロで実施される、請求項14又は16記載の方法。
【請求項１９】 除去／修復酵素との接触が細菌細胞内で実施される、請求項18記載の方法。
【請求項２０】 一本鎖核酸鋳型が、該核酸鋳型を保持するM13ファージの使用、遺伝子VIエキソヌクレアーゼもしくはラムダ・エキソヌクレアーゼを用いた二本鎖核酸鋳型の一方の鎖の分解、ビオチン化された一本鎖核酸のストレプトアビジンを用いた捕捉、又はRNAの逆転写により製造される、請求項1、3、14又は16記載の方法。
【請求項２１】 段階（b）が、一本鎖核酸鋳型1個当たり1個からおよそ1000個までの、様々な配列を有する一本鎖核酸分子又は一本鎖核酸断片を用いて実施される、請求項1、3、14又は16記載の方法。
【請求項２２】 （e）段階（d）の産物を増幅させる段階をさらに含む、請求項14又は16記載の方法。
【請求項２３】 各コード配列がプロモーター配列と機能的に連結している、請求項14又は16記載の方法。
【請求項２４】 （e）RNAライブラリーを製造するために、段階（d）の産物を転写する段階をさらに含む、請求項23記載の方法。
【請求項２５】 （f）タンパク質ライブラリーを製造するために、RNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項24記載の方法。
【請求項２６】 （f）RNAライブラリーの実質的に全ての各メンバーのコード配列の3’末端に、アミノ酸アクセプター分子を連結させる段階；および任意で（g）RNA−タンパク質融合体ライブラリーを製造するために、該RNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項24記載の方法。
【請求項１】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）一本鎖核酸鋳型の集団を提供する段階であって、各々の鋳型がコード配列及び機能的に連結したプロモーター配列を含む段階；
（b）該一本鎖核酸鋳型よりも長さが短い実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物と、該一本鎖核酸鋳型の集団とをハイブリダイズさせる段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）の各ハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）該第二の核酸鎖から転写されるRNAライブラリーを製造するため、段階（c）の産物をRNAポリメラーゼと接触させる段階。
【請求項２】 一つ又は複数の変異をライブラリーに導入するために用いられる、請求項1記載の方法。
【請求項３】 以下の段階を含む、核酸分子の集団における配列の多様性を減少させるための方法：
（a）様々な配列を有する一本鎖核酸鋳型の第一の集団を提供する段階であって、実質的に全ての鋳型の各々が、コード配列と機能的に連結したプロモーター配列とを含む段階、
（b）該核酸鋳型よりも長さが短くかつ該核酸鋳型に実質的に相補的である一本鎖核酸断片の第二の集団と、該第一の集団のメンバーとをハイブリダイズさせる段階であって、該第二の集団のサブ集団が実質的に同一の配列を有しかつさまざまな配列のある領域にハイブリダイズする段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）のハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）該第二の核酸鎖から転写され、かつ該一本鎖核酸鋳型の第一の集団と比較して配列の多様性が減少したRNA分子の第三の集団を製造するため、段階（c）の産物をRNAポリメラーゼと接触させる段階。
【請求項４】 一本鎖核酸鋳型の第一の集団から一つ又は複数の変異を取り除くために用いられる、請求項3記載の方法。
【請求項５】 実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物が、二本鎖核酸分子の切断又はランダム・オリゴヌクレオチドの合成により製造される、請求項1又は3記載の方法。
【請求項６】 実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物が、少なくとも約100個の異なる種類の核酸断片を含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項７】 第二の核酸鎖から相補鎖を製造する段階、該相補鎖を一本鎖核酸鋳型の集団又は第一の集団として提供する段階、および段階(b)および(c)を一回もしくは複数回繰り返し、続いて段階(d)を繰り返す段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項８】 一本鎖核酸鋳型とホモ二重鎖を形成する一つ又は複数の一本鎖核酸断片を提供する段階、及び該ホモ二重鎖形成断片の存在下で段階（b）を実施する段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項９】 プロモーターがT7プロモーターである、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１０】 DNAポリメラーゼがT4 DNAポリメラーゼである、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１１】 接触段階（d）の前に段階（c）の産物を増幅させる段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１２】 （e）タンパク質ライブラリーを製造するためRNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１３】 （e）RNAライブラリーの実質的に全ての各メンバーのコード配列の3’末端に、アミノ酸アクセプター分子を連結させる段階；および任意で（f）RNA−タンパク質融合体ライブラリーを製造するためRNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項1又は3記載の方法。
【請求項１４】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）一本鎖核酸鋳型の第一の集団を提供する段階であって、各々の鋳型がコード配列を含む段階；
（b）様々な配列を有する一本鎖核酸分子の第二の集団を提供する段階であって、該一本鎖核酸鋳型の第一の集団と様々な配列を有する一本鎖核酸分子の該第二の集団が実質的に相補的である段階；
（c）二重鎖を形成するために十分な条件下で、一本鎖核酸鋳型の該第一集団と、様々な配列を有する一本鎖核酸分子の該第二集団とをハイブリダイズさせる段階；並びに
（d）酵素が該二重鎖内のミスマッチ塩基対を修正することを可能にする条件下で、該二重鎖を一つ又は複数の除去／修復酵素と接触させる段階。
【請求項１５】 段階（d）の産物に由来しコード配列を含む一本鎖核酸鋳型の新しい集団を提供する段階、鋳型の第一集団を鋳型の該新しい集団で置き換える段階、並びに段階（b）、（c）及び段階（d）を一回もしくは複数回繰り返す段階を段階（d）の後にさらに含む、請求項14記載の方法。
【請求項１６】 以下の段階を含む、核酸ライブラリーを製造するための方法：
（a）コード配列を各々が含む、一本鎖核酸鋳型の集団を提供する段階；
（b）該核酸鋳型よりも長さが短い実質的に相補的な一本鎖核酸断片の混合物と、該一本鎖核酸鋳型の集団とをハイブリダイズさせる段階；
（c）該断片が、該核酸鋳型と実質的に相補的な第二の核酸鎖を完成させるためのプライマーとして作用するような条件下で、段階（b）の各ハイブリダイゼーション産物を、鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼ及びDNAリガーゼの両方と接触させる段階；並びに
（d）酵素が該産物内のミスマッチ塩基対を修正することを可能にする条件下で、段階（c）の産物を一つ又は複数の除去／修復酵素と接触させる段階。
【請求項１７】 コード配列を含みかつ段階（d）の産物に由来する一本鎖核酸鋳型の新しい集団を提供する段階、該一本鎖核酸鋳型の集団を該鋳型の新しい集団に置き換える段階、および段階（b）〜（d）を一回もしくは複数回繰り返す段階をさらに含む、請求項16記載の方法。
【請求項１８】 除去／修復酵素との接触がインビボ又はインビトロで実施される、請求項14又は16記載の方法。
【請求項１９】 除去／修復酵素との接触が細菌細胞内で実施される、請求項18記載の方法。
【請求項２０】 一本鎖核酸鋳型が、該核酸鋳型を保持するM13ファージの使用、遺伝子VIエキソヌクレアーゼもしくはラムダ・エキソヌクレアーゼを用いた二本鎖核酸鋳型の一方の鎖の分解、ビオチン化された一本鎖核酸のストレプトアビジンを用いた捕捉、又はRNAの逆転写により製造される、請求項1、3、14又は16記載の方法。
【請求項２１】 段階（b）が、一本鎖核酸鋳型1個当たり1個からおよそ1000個までの、様々な配列を有する一本鎖核酸分子又は一本鎖核酸断片を用いて実施される、請求項1、3、14又は16記載の方法。
【請求項２２】 （e）段階（d）の産物を増幅させる段階をさらに含む、請求項14又は16記載の方法。
【請求項２３】 各コード配列がプロモーター配列と機能的に連結している、請求項14又は16記載の方法。
【請求項２４】 （e）RNAライブラリーを製造するために、段階（d）の産物を転写する段階をさらに含む、請求項23記載の方法。
【請求項２５】 （f）タンパク質ライブラリーを製造するために、RNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項24記載の方法。
【請求項２６】 （f）RNAライブラリーの実質的に全ての各メンバーのコード配列の3’末端に、アミノ酸アクセプター分子を連結させる段階；および任意で（g）RNA−タンパク質融合体ライブラリーを製造するために、該RNAライブラリーを翻訳する段階をさらに含む、請求項24記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US9097098P | 1998-06-29 | 1998-06-29 | |
| US60/090,970 | 1998-06-29 | ||
| PCT/US1999/014776 WO2000000632A1 (en) | 1998-06-29 | 1999-06-29 | Methods for generating highly diverse libraries |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2002519038A JP2002519038A (ja) | 2002-07-02 |
| JP2002519038A5 true JP2002519038A5 (ja) | 2006-08-31 |
| JP4700805B2 JP4700805B2 (ja) | 2011-06-15 |
Family
ID=22225171
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2000557385A Expired - Lifetime JP4700805B2 (ja) | 1998-06-29 | 1999-06-29 | 多様性の高いライブラリーを製造する方法 |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP1092039B1 (ja) |
| JP (1) | JP4700805B2 (ja) |
| KR (1) | KR20010071613A (ja) |
| CN (1) | CN1308683A (ja) |
| AT (1) | ATE547532T1 (ja) |
| AU (1) | AU761570B2 (ja) |
| CA (1) | CA2331926C (ja) |
| ES (1) | ES2381824T3 (ja) |
| IL (1) | IL140100A0 (ja) |
| NO (1) | NO20006675D0 (ja) |
| NZ (1) | NZ508287A (ja) |
| WO (1) | WO2000000632A1 (ja) |
| ZA (1) | ZA200007261B (ja) |
Families Citing this family (97)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7883872B2 (en) | 1996-10-10 | 2011-02-08 | Dyadic International (Usa), Inc. | Construction of highly efficient cellulase compositions for enzymatic hydrolysis of cellulose |
| US6902918B1 (en) | 1998-05-21 | 2005-06-07 | California Institute Of Technology | Oxygenase enzymes and screening method |
| CA2345356C (en) | 1998-10-06 | 2012-10-02 | Mark Aaron Emalfarb | Transformation system in the field of filamentous fungal hosts |
| US7488590B2 (en) | 1998-10-23 | 2009-02-10 | Amgen Inc. | Modified peptides as therapeutic agents |
| US6376246B1 (en) | 1999-02-05 | 2002-04-23 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination |
| US6368861B1 (en) | 1999-01-19 | 2002-04-09 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination |
| US8457903B1 (en) | 1999-01-19 | 2013-06-04 | Codexis Mayflower Holdings, Llc | Method and/or apparatus for determining codons |
| US7873477B1 (en) | 2001-08-21 | 2011-01-18 | Codexis Mayflower Holdings, Llc | Method and system using systematically varied data libraries |
| US7702464B1 (en) | 2001-08-21 | 2010-04-20 | Maxygen, Inc. | Method and apparatus for codon determining |
| WO2001032712A2 (en) | 1999-11-03 | 2001-05-10 | Maxygen, Inc. | Antibody diversity generation |
| US7115403B1 (en) | 2000-05-16 | 2006-10-03 | The California Institute Of Technology | Directed evolution of galactose oxidase enzymes |
| US6980674B2 (en) | 2000-09-01 | 2005-12-27 | Large Scale Proteomics Corp. | Reference database |
| US6539102B1 (en) | 2000-09-01 | 2003-03-25 | Large Scale Proteomics | Reference database |
| EP1341911A1 (en) * | 2000-12-06 | 2003-09-10 | Novozymes A/S | Method for producing a polynucleotide library |
| US6783941B2 (en) | 2000-12-06 | 2004-08-31 | Novozymes A/S | Method for producing a polynucleotide library in vitro by mismatch repair of heteroduplexes |
| US6689568B2 (en) | 2001-02-01 | 2004-02-10 | Agilent Technologies, Inc. | Capture arrays using polypeptide capture agents |
| JP4689940B2 (ja) * | 2001-02-02 | 2011-06-01 | ノビシ バイオテック，リミティド ライアビリティ カンパニー | ヘテロ二本鎖の相補性を増大させる方法 |
| WO2002083868A2 (en) | 2001-04-16 | 2002-10-24 | California Institute Of Technology | Peroxide-driven cytochrome p450 oxygenase variants |
| US20030032028A1 (en) * | 2001-06-12 | 2003-02-13 | Gayle Dace | In vitro capture of nucleic acids via modified oligonucleotides and magnetic beads |
| WO2003008563A2 (en) | 2001-07-20 | 2003-01-30 | California Institute Of Technology | Improved cytochrome p450 oxygenases |
| WO2003062417A1 (fr) * | 2002-01-22 | 2003-07-31 | Mitsubishi Chemical Corporation | Produit de ligation arn-adn, et utilisation correspondante |
| WO2003075129A2 (en) | 2002-03-01 | 2003-09-12 | Maxygen, Inc. | Methods, systems, and software for identifying functional bio-molecules |
| WO2003078583A2 (en) | 2002-03-09 | 2003-09-25 | Maxygen, Inc. | Optimization of crossover points for directed evolution |
| US7226771B2 (en) | 2002-04-19 | 2007-06-05 | Diversa Corporation | Phospholipases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| BR0309391A (pt) | 2002-04-19 | 2005-10-25 | Diversa Corp | Fosfolipases, ácidos nucléicos codificando-as e métodos para preparar e usá-las |
| US9321832B2 (en) | 2002-06-28 | 2016-04-26 | Domantis Limited | Ligand |
| EP1576151A4 (en) | 2002-08-06 | 2006-05-17 | Verdia Inc | VARIANTS OF AMINE OXIDASE AP1 |
| PL3023498T3 (pl) | 2003-03-06 | 2019-05-31 | Basf Enzymes Llc | Amylazy, kodujące je kwasy nukleinowe i sposoby ich wytwarzania i zastosowania |
| US8298799B2 (en) | 2003-03-07 | 2012-10-30 | Dsm Ip Assets B. V. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| WO2004090099A2 (en) | 2003-04-04 | 2004-10-21 | Diversa Corporation | Pectate lyases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EP2535414B1 (en) | 2003-04-29 | 2017-12-13 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Novel glyphosate-n-acetyltransferase (gat) genes |
| WO2005017105A2 (en) | 2003-06-17 | 2005-02-24 | California University Of Technology | Regio- and enantioselective alkane hydroxylation with modified cytochrome p450 |
| WO2005003319A2 (en) | 2003-07-02 | 2005-01-13 | Diversa Corporation | Glucanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| US7435570B2 (en) | 2003-08-11 | 2008-10-14 | California Institute Of Technology | Thermostable peroxide-driven cytochrome P450 oxygenase variants and methods of use |
| WO2005021714A2 (en) | 2003-08-11 | 2005-03-10 | Diversa Corporation | Laccases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| JP2005065575A (ja) * | 2003-08-22 | 2005-03-17 | Japan Science & Technology Agency | フレームシャッフリングによるタンパク質分子多様性集団の作製 |
| CN103173282A (zh) | 2004-06-16 | 2013-06-26 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 对叶绿素进行酶促脱色的组合物和方法 |
| EP2886658A1 (en) | 2005-03-10 | 2015-06-24 | BASF Enzymes LLC | Lyase enzymes, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| CA2861310A1 (en) | 2005-03-15 | 2006-09-28 | Bp Corporation North America Inc. | Cellulases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| US8715988B2 (en) | 2005-03-28 | 2014-05-06 | California Institute Of Technology | Alkane oxidation by modified hydroxylases |
| US11214817B2 (en) | 2005-03-28 | 2022-01-04 | California Institute Of Technology | Alkane oxidation by modified hydroxylases |
| EP2216403A3 (en) | 2006-02-02 | 2010-11-24 | Verenium Corporation | Esterases and related nucleic acids and methods |
| WO2007094852A2 (en) | 2006-02-10 | 2007-08-23 | Verenium Corporation | Cellulolytic enzymes, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EP2548955A1 (en) | 2006-02-14 | 2013-01-23 | Verenium Corporation | Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EP2112227B1 (en) | 2006-03-07 | 2013-05-15 | Cargill, Incorporated | Aldolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EA029538B1 (ru) | 2006-03-07 | 2018-04-30 | Басф Энзаймс Ллк | Полипептид, обладающий активностью альдолазы, полинуклеотид, кодирующий этот полипептид, и способы получения и применения полинуклеотида и полипептида |
| EP2069513A4 (en) | 2006-08-04 | 2012-03-21 | California Inst Of Techn | METHODS AND SYSTEMS FOR SELECTIVE FLUORATION OF ORGANIC MOLECULES |
| EP2444413A1 (en) | 2006-08-04 | 2012-04-25 | Verenium Corporation | Methods for oil or gas well drilling, washing and/or fracturing |
| US8252559B2 (en) | 2006-08-04 | 2012-08-28 | The California Institute Of Technology | Methods and systems for selective fluorination of organic molecules |
| DK2617814T3 (da) | 2006-09-21 | 2016-02-22 | Basf Enzymes Llc | Phytaser, nukleinsyrer, der koder for disse, og fremgangsmåder til frembringelse og anvendelse heraf |
| US8637290B2 (en) | 2006-09-21 | 2014-01-28 | Dsm Ip Assets B.V. | Phospholipases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EP2102366A4 (en) | 2006-12-10 | 2010-01-27 | Dyadic International Inc | EXPRESSION AND HIGH-DROP SCREENING OF COMPLEX EXPRESSED DNA LIBRARIES IN FADENED MUSHROOMS |
| EP3540053B1 (en) | 2006-12-21 | 2021-06-02 | BASF Enzymes, LLC | Amylases and glucoamylases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| NZ578309A (en) | 2007-01-30 | 2012-06-29 | Verenium Corp | Enzymes for the treatment of lignocellulosics, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| WO2009033071A2 (en) | 2007-09-07 | 2009-03-12 | Dyadic International, Inc. | Novel fungal enzymes |
| CN101952437B (zh) | 2007-10-03 | 2014-04-09 | 维莱尼姆公司 | 木聚糖酶、编码它们的核酸以及其制备和应用方法 |
| EP2706122A3 (en) | 2008-01-03 | 2014-06-18 | Verenium Corporation | Isomerases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| EP2865750A3 (en) | 2008-01-03 | 2015-08-05 | BASF Enzymes LLC | Transferases and oxidoreductases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| CA2723427C (en) | 2008-05-23 | 2018-01-23 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Novel dgat genes for increased seed storage lipid production and altered fatty acid profiles in oilseed plants |
| US8198062B2 (en) | 2008-08-29 | 2012-06-12 | Dsm Ip Assets B.V. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
| KR102025502B1 (ko) | 2008-09-26 | 2019-09-25 | 토카겐 인크. | 유전자 요법 벡터와 시토신 디아미나아제 |
| KR101817253B1 (ko) | 2009-05-21 | 2018-01-10 | 신젠타 파티서페이션즈 아게 | 피타제, 이를 코딩하는 핵산 및 그의 제조 및 사용 방법 |
| UA111708C2 (uk) | 2009-10-16 | 2016-06-10 | Бандж Ойлз, Інк. | Спосіб рафінування олії |
| UA109884C2 (uk) | 2009-10-16 | 2015-10-26 | Поліпептид, що має активність ферменту фосфатидилінозитол-специфічної фосфоліпази с, нуклеїнова кислота, що його кодує, та спосіб його виробництва і застосування | |
| EP2603591A1 (en) | 2010-08-13 | 2013-06-19 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Compositions and methods comprising sequences having hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (hppd) activity |
| WO2013016207A2 (en) | 2011-07-22 | 2013-01-31 | California Institute Of Technology | Stable fungal cel6 enzyme variants |
| BR112014027468A2 (pt) | 2012-05-04 | 2017-06-27 | Du Pont | polinucleotídeo isolado ou recombinante, construção de dna recombinante, célula, planta, explante vegetal, semente transgênica, polipeptídeo isolado, composição, métodos de produção de meganuclease, de introdução de rompimento e de integração de um polinucleotídeo. |
| JP6004423B2 (ja) * | 2012-05-07 | 2016-10-05 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 | 遺伝子連結法およびそれを用いた単鎖抗体作製方法 |
| BR112015023272A2 (pt) | 2013-03-14 | 2017-07-18 | Pioneer Hi Bred Int | célula vegetal, planta, explante vegetal, semente transgênica, método para produzir uma célula vegetal tendo um polinucleotídeo heterólogo que codifica um polipeptídeo tendo atividade de dicamba descarboxilase, método para controlar plantas daninhas em um campo contendo uma cultura e método para controlar plantas daninhas em um campo contendo uma cultura |
| US20160040149A1 (en) | 2013-03-14 | 2016-02-11 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Compositions Having Dicamba Decarboxylase Activity and Methods of Use |
| EP2971000A4 (en) | 2013-03-15 | 2016-11-23 | Pioneer Hi Bred Int | PHI-4 POLYPEPTIDES AND METHOD FOR THEIR USE |
| WO2015023846A2 (en) | 2013-08-16 | 2015-02-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| EP4159028A1 (en) | 2013-09-13 | 2023-04-05 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| EP3087088B1 (en) | 2013-12-23 | 2022-05-25 | University Of Rochester | Methods and compositions for ribosomal synthesis of macrocyclic peptides |
| BR112016018103B1 (pt) | 2014-02-07 | 2024-01-16 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Polipeptídeo e seu uso, polinucleotídeo, composição, proteína de fusão, método para controlar uma população, método para inibir o crescimento, método para controlar a infestação, método para obtenção de uma planta ou célula vegetal, construto |
| MX2016010187A (es) | 2014-02-07 | 2017-07-11 | Pioneer Hi Bred Int | Proteinas insecticidas y metodos para su uso. |
| CA2963558C (en) | 2014-10-16 | 2023-04-04 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| EP3262175A4 (en) * | 2015-02-25 | 2018-10-31 | Jumpcode Genomics, Inc. | Methods and compositions for in silico long read sequencing |
| MX2017011525A (es) | 2015-03-11 | 2018-01-30 | Pioneer Hi Bred Int | Combinaciones insecticidas de pip-72 y metodos de uso. |
| RU2017144238A (ru) | 2015-05-19 | 2019-06-19 | Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. | Инсектицидные белки и способы их применения |
| RU2762832C2 (ru) | 2015-08-06 | 2021-12-23 | Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. | Инсектицидные белки растительного происхождения и способы их применения |
| EP3390431A1 (en) | 2015-12-18 | 2018-10-24 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| US11339427B2 (en) | 2016-02-12 | 2022-05-24 | Jumpcode Genomics, Inc. | Method for target specific RNA transcription of DNA sequences |
| EP3451837B1 (en) | 2016-05-04 | 2021-08-25 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| MX2018015906A (es) | 2016-07-01 | 2019-04-04 | Pioneer Hi Bred Int | Proteinas insecticidas de plantas y metodos para sus usos. |
| US11021716B2 (en) | 2016-11-01 | 2021-06-01 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| US11174295B2 (en) | 2016-12-14 | 2021-11-16 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| EP3558004A1 (en) | 2016-12-22 | 2019-10-30 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| CA3052794A1 (en) | 2017-02-08 | 2018-08-16 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal combinations of plant derived insecticidal proteins and methods for their use |
| EP3622076A1 (en) | 2017-05-11 | 2020-03-18 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
| CN110158157B (zh) * | 2018-02-13 | 2021-02-02 | 浙江大学 | 基于模板材料合成长度固定和特定末端序列dna文库的方法 |
| CA3092078A1 (en) | 2018-03-14 | 2019-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins from plants and methods for their use |
| CA3092075A1 (en) | 2018-03-14 | 2019-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins from plants and methods for their use |
| US20220169706A1 (en) | 2019-03-28 | 2022-06-02 | Danisco Us Inc | Engineered antibodies |
| BR112022013503A2 (pt) | 2020-01-10 | 2022-09-13 | Univ California | Plataforma biossintética para a produção de ácido olivetólico e análogos de ácido olivetólico |
| BR112022027035A2 (pt) | 2020-07-14 | 2023-04-11 | Pioneer Hi Bred Int | Proteínas inseticidas e métodos para uso das mesmas |
| WO2023173084A1 (en) | 2022-03-11 | 2023-09-14 | University Of Rochester | Cyclopeptibodies and uses thereof |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4994379A (en) * | 1983-03-09 | 1991-02-19 | Cetus Corporation | Modified signal peptides |
| US5447839A (en) * | 1988-09-09 | 1995-09-05 | Hoffmann-La Roche Inc. | Detection of human papillomavirus by the polymerase chain reaction |
| US6117679A (en) * | 1994-02-17 | 2000-09-12 | Maxygen, Inc. | Methods for generating polynucleotides having desired characteristics by iterative selection and recombination |
| US5580730A (en) * | 1994-08-19 | 1996-12-03 | Olympus America, Inc. | Enzyme digestion method for the detection of amplified DNA |
| DE69627189T2 (de) * | 1995-12-15 | 2004-02-05 | Duke University | Verfahren zum nachweis und zur entfernung von mutantsequenzen, die während enzymatischer amplifikation entstehen |
| IL131966A0 (en) * | 1997-03-18 | 2001-03-19 | Novo Industri As | An in vitro method for construction of a dna library |
| US6153410A (en) * | 1997-03-25 | 2000-11-28 | California Institute Of Technology | Recombination of polynucleotide sequences using random or defined primers |
-
1999
- 1999-06-29 CN CN99807977A patent/CN1308683A/zh active Pending
- 1999-06-29 IL IL14010099A patent/IL140100A0/xx unknown
- 1999-06-29 NZ NZ508287A patent/NZ508287A/en not_active IP Right Cessation
- 1999-06-29 ES ES99932081T patent/ES2381824T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-06-29 AU AU48470/99A patent/AU761570B2/en not_active Expired
- 1999-06-29 WO PCT/US1999/014776 patent/WO2000000632A1/en not_active Application Discontinuation
- 1999-06-29 JP JP2000557385A patent/JP4700805B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1999-06-29 CA CA2331926A patent/CA2331926C/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-06-29 EP EP99932081A patent/EP1092039B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-06-29 KR KR1020007014838A patent/KR20010071613A/ko not_active Application Discontinuation
- 1999-06-29 AT AT99932081T patent/ATE547532T1/de active
-
2000
- 2000-12-07 ZA ZA200007261A patent/ZA200007261B/en unknown
- 2000-12-28 NO NO20006675A patent/NO20006675D0/no not_active Application Discontinuation
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2002519038A5 (ja) | ||
| US11697843B2 (en) | Methods for creating directional bisulfite-converted nucleic acid libraries for next generation sequencing | |
| JP4700805B2 (ja) | 多様性の高いライブラリーを製造する方法 | |
| US11964997B2 (en) | Methods of library construction for polynucleotide sequencing | |
| US20200038831A1 (en) | Fabrication of patterned arrays | |
| US6387620B1 (en) | Transcription-free selex | |
| US8986958B2 (en) | Methods for generating target specific probes for solution based capture | |
| JP6894501B2 (ja) | 等温核酸自己増幅法 | |
| CN110062809B (zh) | 用于环状共有序列测序的单链环状dna文库 | |
| DE50114507D1 (de) | Nukleinsäure-Linker und deren Verwendung in der Gensynthese | |
| JPH06505872A (ja) | １本鎖直鎖状ｄｎａ鋳型から全長２本鎖ｄｎａを合成する方法 | |
| JP2016511007A (ja) | 鎖になったｒｎａまたはｄｎａのライブラリを生成するための方法、組成物およびキット | |
| EP3704248B1 (en) | Methods and kits for targeted enrichment of target dna with high gc content | |
| US20180100180A1 (en) | Methods of single dna/rna molecule counting | |
| JP2006506953A5 (ja) | ||
| CN112176422B (zh) | Rna文库的构建方法 | |
| WO2018081666A1 (en) | Methods of single dna/rna molecule counting | |
| JP7333171B2 (ja) | Ｒｎａ検出方法、ｒｎａ検出用核酸及びｒｎａ検出用キット | |
| EP4012029A1 (en) | Method for capturing nucleic acid molecule, preparation method for nucleic acid library, and a sequencing method | |
| RU2001102509A (ru) | Способы создания высокоразнообразных библиотек | |
| JP2022505788A (ja) | 核酸配列を欠乏および富化するための方法およびキット |