ES2862923T3 - Nuevos fármacos para inhibir la agregación de proteínas implicadas en enfermedades relacionadas con enfermedades neurodegenerativas y/o agregación de proteínas - Google Patents

Nuevos fármacos para inhibir la agregación de proteínas implicadas en enfermedades relacionadas con enfermedades neurodegenerativas y/o agregación de proteínas Download PDF

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Matthias Habeck
Thomas Hirschberger
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Andrei Leonov
Sergey Ryazanov
Markus Geissen
Martin Groschup
Jens Wagner
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Abstract

Un compuesto representado por la fórmula (E): **(Ver fórmula)** en donde X, Y, M, Z y L se definen de manera que el anillo D está direccionalmente seleccionado de las siguientes estructuras: **(Ver fórmula)** en donde: R8 and R9 se selecciona de hidrógeno; alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo (C1-4) o halógeno; Hal se selecciona de F, Cl, Br e I; RE1 y RE2 están unidos a átomos de carbono adyacentes, y RE1 y RE2 juntos forman no direccionalmente una estructura - T- (CRE7RE8)nV-, en donde T se selecciona de CRE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O , así como las estructuras correspondientes en las que está presente un doble enlace; en donde al menos uno de T y V es NH u O;RE7 y RE8 son independientemente H o F; RE9 y RE10 son independientemente H o F; n es 1 a 3; RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10 m es 0 a 2; RE4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10; p es 0 o 1; aí como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable o el compuesto representado por la fórmula (E); con la condición de que los siguientes compuestos están excluidos: **(Ver fórmula)**

Description

DESCRIPCIÓN
Nuevos fármacos para inhibir la agregación de proteínas implicadas en enfermedades relacionadas con enfermedades neurodegenerativas y/o agregación de proteínas
Compendio de la invención
La presente invención se refiere a un compuesto representado por la fórmula (E). La presente invención también se refiere a un compuesto representado por la fórmula (E) para ser usado en el tratamiento o la prevención de enfermedades relacionadas con la agregación de una proteína y/o enfermedades neurodegenerativas. Además, la presente invención se refiere a composiciones farmacéuticas y diagnósticas que comprenden el compuesto de la invención, así como a un kit. Además, la presente invención se refiere a un método para tomar imágenes de los depósitos de la proteína agregada. También se describe un kit para preparar un compuesto marcado detectablemente de la presente invención.
A lo largo del texto de esta especificación se citan varios documentos. El contenido de la descripción de los documentos citados en la presente memoria (entre ellos cualquier especificación del fabricante, instrucciones, etc.) se incorpora en ella por referencia.
Antecedentes de la invención
En M. Ono et al. (Bioorganic & Medicinal Chemistry 16 (2008) 6867-6872) se describen determinadas sondas de pamiloide basadas en los 3,5-difenil-1,2,4-oxadiazoles.
En la patente de los EE. UU. 2007/0276034 se describen determinados compuestos de bis- y trisdihidroxiarilo y sus análogos de metilendioxi y ésteres farmacéuticamente aceptables, que presuntamente son idóneos para tratar sinucleinopatías.
En la solicitud de patente internacional WO 2008/131148 se describen derivados de difenilheteroarilo específicos y su uso para la fijación y la toma de imágenes de las placas amiloides.
Los compuestos heterocíclicos que son útiles como activadores de NURR-1 se describen en la solicitud de patente internacional WO 2004/072050.
El etilenglicol o el polietilenglicol radiomarcado se utiliza como un grupo de marcación en los compuestos que pueden ser útiles para tomar imágenes de tejidos en la solicitud de patente internacional WO 2007/002540.
En la solicitud de patente internacional WO 98/17652 se describen determinados derivados de oxadiazol que se afirma que son idóneos para tratar enfermedades neurodegenerativas y la isquemia cerebral.
Se conocen un gran número de enfermedades neurológicas y neurodegenerativas, muchas de las cuales no se pueden curar en la actualidad. Estas enfermedades incluyen afecciones médicas tales como enfermedad de Parkinson, corea de Huntington, enfermedad de Hallervorden-Spatz, enfermedad de Alzheimer, demencia senil, enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, demencia arteriosclerótica, tromboangitis obliterante cerebral, demencia con cuerpos de Lewy (DCL), atrofia multisistémica (AMS) y muchas otras.
Las enfermedades causadas por los priones, que incluyen enfermedades tales como la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (ECJ), la tembladera de las ovejas y la encefalopatía espongiforme bovina (EEB), se caracterizan desde el punto de vista anatomopatológico por una degeneración espongiforme del cerebro. Las enfermedades causadas por los priones están ocasionadas por un agente infeccioso no convencional que consiste principalmente en la isoforma de la glucoproteína membranaria PrPC denominada PrPSc, que es rica en láminas p por estar mal plegada, y forma agregados.
Las enfermedades causadas por los priones han provocado una preocupación importante con respecto a la salud pública debido a la aparición de la EEB. Las pruebas científicas sugieren que la EEB se ha transmitido a los humanos y ha ocasionado una nueva variante de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (vECJ) (Will et al., 1996, Bruce et al., 1997). Se desconoce cuántas personas están en la actualidad incubando la enfermedad o se verán afectadas por la vECJ en el futuro. Las pruebas disponibles no descartan una epidemia inminente que afecte a un gran número de pacientes (Andrews et al. 2000). Esto eleva la necesidad de desarrollar un tratamiento eficaz además de aplicar medidas que impidan una posterior diseminación de la enfermedad. Además, las pruebas recientes sugieren que se puede producir la transmisión secundaria por transfusión de sangre (Llewelyn et al., 2004).
El acontecimiento central en la patogenia de las enfermedades causadas por los priones es la conversión de la proteína priónica celular PrPC en la isoforma patológica PrPSc, que se agrega en grandes agregados proteicos. Esta formación de agregados de PrPSc es un distintivo de la patogenia de las enfermedades causadas por los priones. Las pruebas disponibles sugieren que la PrPSc actúa de plantilla para esta conversión y también como un agente neurotóxico que provoca disfunción neuronal y muerte celular (Prusiner 1998, Giese y Kretzschmar, 2001). Por lo tanto, el método terapéutico más prometedor contra las enfermedades causadas por los priones pasa por interferir en la amplificación de la PrPSc. Las pruebas procedentes del cultivo celular y de los estudios in vivo sugiere que una vez que se inhibe la formación de la PrPSc, puede tener lugar la eliminación de la PrPSc (Mallucci, 2003). Así pues, esta estrategia terapéutica también podría ser eficaz más tarde en el periodo de incubación, e incluso después de la manifestación de los signos clínicos de la enfermedad, lo que es esencial para encontrarle uso en el tratamiento de la enfermedad causada por los priones en los humanos.
Hay una serie de compuestos que se ha demostrado que son eficaces a la hora de interferir con la amplificación de la PrPSc in vitro, tales como los derivados de la acridina, rojo Congo, porfirinas/ftalocianinas, Cp-60, péptidos disruptores de láminas p y variantes de PrP (Caughey et al., 1998, Chabry et al., 1998, Demaimay et al., 2000, Horiuchi et al, 2000, Perrier et al. 2000, Rudyk et al. 2000, Soto et al, 2000). Sin embargo, ninguno de estos compuestos se han utilizado hasta la fecha con éxito para el tratamiento de las enfermedades o como compuestos de partida para desarrollar compuestos con un incremento de su potencial terapéutico y de sus propiedades farmacológicas.
Las sustancias identificadas hasta la fecha con potencial terapéutico se han descubierto en su mayoría por casualidad. Hasta ahora se han consolidado pocos ensayos in vitro idóneos para el cribado masivo de grandes colecciones de compuestos en busca de fármacos con potencial antipriónico. Se han propuesto dos estrategias diferentes para el cribado sistemático en los estudios publicados recientemente: uno que se basa en la levadura (Bach et al., 2003) y otro que utiliza cultivos de células ScN2a infectadas (Kocisko et al., 2004, Kocisko et al., 2003). Sin embargo, estas estrategias permitían el cribado de colecciones limitadas a 2500 y 2000 compuestos, respectivamente, y además necesitaban mucho tiempo.
Además de las sustancias de masa molecular baja, en la actualidad se han analizado tres métodos posibles más. Primero, se están utilizando anticuerpos contra PrP para suprimir la formación de PrPSc. Este método se ha utilizado con éxito en cultivos celulares, así como con ratones por inyección intraperitoneal (Enari et al., 2001; White et al., 2003). Otra estrategia es la aplicación de oligonucleótidos con CpG, que se halló que incrementaban el periodo de incubación en los ratones infectados con el prion de la tembladera de las ovejas (Sethi et al., 2002). Sin embargo, el mecanismo de acción de este método no se ha elucidado hasta ahora. Finalmente, se está debatiendo sobre los siRNA que suprimen la expresión de PrPC en las neuronas de los animales o humanos infectados. Se ha demostrado que este método inhibe la formación de PrPSc en los cultivos de células (Daude et al., 2003). Los tres métodos se enfrentan al mismo problema, a saber, que las moléculas atraviesen la barrera hematoencefálica. Debido a este inconveniente, estas estrategias son solo idóneas para la profilaxis en los órganos periféricos después de la exposición, pero no para el tratamiento de la enfermedad en el sistema nervioso central.
Otra clase de enfermedades neurodegenerativas, las denominadas sinucleinopatías, se caracterizan por la acumulación intracelular de agregados, oligómeros, protofibrillas y fibrillas de proteína, que contienen principalmente a-sinucleína. En los casos de las sinucleinopatías, se cree que los efectos patológicos sobre las células nerviosas están inducidos por la formación de agregados oligoméricos de a-sinucleína y la posterior formación de poros en la membrana. Los ejemplos de sinucleinopatías son la enfermedad de Parkinson (EP), la demencia con cuerpos de Lewy (DCL) y la atrofia multisistémica (AMS). Hasta la fecha, no hay disponible ninguna estrategia terapéutica para la inhibición de la agregación de la a-sinucleína.
Por lo tanto, existe la necesidad de identificar nuevos compuestos idóneos para el tratamiento de las enfermedades relacionadas con la agregación de una proteína, tales como las enfermedades causadas por los priones y las sinucleinopatías.
Así pues, el problema técnico que subyace en la presente invención es la provisión de compuestos para el tratamiento de las enfermedades causadas por los priones, las sinucleinopatías y otras enfermedades caracterizadas por la agregación de una proteína, en particular la enfermedad de Parkinson. Además, existe la necesidad de dar a conocer compuestos que son sondas idóneas para tomar imágenes de los depósitos de proteínas agregadas en los trastornos mencionados más arriba.
Descripción de las figuras
Figura 1: Mapa de REA generado para DIVERSet 1 y 2, cribado mediante SIFT bidimensional y en cultivo celular. El mapa muestra aglomeraciones de compuestos similares desde el punto de vista estructural (representados por estrellas o cajas) construidas a partir de 837 compuestos positivos del cribado del cultivo celular primario de DIVERSet 1 y 2. A su vez, las aglomeraciones están distribuidas de tal manera que las aglomeraciones parecidas están cercanas unas de otras. Los símbolos que representan las aglomeraciones están con la escala, con la forma y con el color que se corresponden con su tamaño y las proporciones de los activos por SIFT y los activos por cultivo celular, respectivamente, tal y como se explica en la leyenda. Así pues, las aglomeraciones más grandes, que contienen grandes proporciones de activos por SIFT y por cultivo celular, están representados por estrellas rojas grandes. Se seleccionaron cinco aglomeraciones, denominadas de DPP_1 a DPP_5 y se muestran los compuestos prototípicos que representan a estas aglomeraciones.
Figura 2: Todos los compuestos clasificados en las aglomeraciones identificadas (figura 1) se muestran en la figura 2 de A a F, junto con su actividad en los diferentes ensayos. Todos ellos pertenecen a la clase de compuestos químicos que se obtienen por modificación del 3,5-difenilpirazol (DPP) (compárese con el motivo DPP mostrado en la figura 1). En la figura 2F, se muestra otra aglomeración, DPP_6, que no está contenida en el mapa de REA de la figura 1 y que contiene un único compuesto activo, según el cultivo celular, con un átomo de N unido al anillo de pirazol. En la figura 2F, se muestran adicionalmente 4 de los 33 compuestos de DPP de DIVERSet 1 y 2, que se halló que eran inactivos en el cultivo celular y a los que el programa DM juzgó que eran diferentes a las seis clases de DPP. Hemos identificado estos compuestos mediante una búsqueda del motivo de DPP en la colección.
Figura 3: Lista de compuestos que se sintetizaron de acuerdo con los métodos descritos en el ejemplo 2 basándose en los resultados del cribado inicial y en las consideraciones químicas medicinales. Estos compuestos se analizaron con el uso de diferentes ensayos de comprobación (a saber, SIFT, ensayos con cultivos celulares de modelos de las enfermedades causadas por los priones, pruebas in vivo con animales o ensayos bioquímicos de agregación de la asinucleína).
Figura 4: Efectos del tratamiento sobre el tiempo de supervivencia de los ratones después de la infección intracerebral con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. Los compuestos se administraron diariamente durante 14 días a partir del día 80 tras la infección (50 pl del compuesto a 10 mM). (A) El tratamiento con el compuesto 10353_F11 prolonga la supervivencia de los ratones infectados por vía intracerebral (p < 0,05). En (B) se muestra la media de los tiempos de supervivencia después del tratamiento con los diferentes compuestos. Una inyección intraperitoneal al día con los compuestos anle138b y sery149 prolonga significativamente el tiempo de supervivencia después de la provocación con la cepa RML de la tembladera de las ovejas (anle138b: p < 0,01; sery149: p < 0,05). La media de los tiempos de supervivencia se expresa en días ± desviación estándar.
Figura 5: Influencia del tratamiento sobre la cantidad de PrPSc en el bazo de los ratones infectados por vía intraperitoneal con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. (A) Después de la inoculación con priones de la tembladera de las ovejas, los ratones se trataron una vez al día con el compuesto (25 pl del compuesto a 100 mM para la administración intraperitoneal y 50 mg/kg para la administración oral). (B) Análisis densitométrico de la cantidad de PrPSc esplénicos en una inmunotransferencia por puntos. El tratamiento con anle138b indujo una fuerte reducción de la cantidad de PrPSc en comparación con el control (p = 0,001). (C) Análisis inmunohistológico del bazo de los ratones infectados con el prion de la tembladera de las ovejas. Después del tratamiento con anle138b, se incrementa el porcentaje de bazos con poco depósito de PrPSc (grado ), y desaparecen los depósitos intensos de PrPSc (grado ++). En (D) se muestran dos ejemplos de depósitos de PrPSc teñidos (flechas) en el bazo. La imagen de la izquierda muestra una tinción intensa de PrPSc (grado ++), mientras que la de la derecha muestra poca tinción de PrPSc (grado ). Las barras indican la cantidad media de PrPSc ± error estándar.
Figura 6: Inmunotransferencia y análisis histológico del cerebro de los ratones. (A) El tratamiento de los ratones después de la inoculación intracerebral de ratones con la cepa RML de la tembladera de las ovejas comenzó 80 días después de la infección. Se administraron los compuestos en los momentos indicados (25 pl del compuesto a 100 mM para la aplicación i.p. y 50 mg/kg para la administración oral). (B) Cuantificación de la cantidad de PrPSc en los homogeneizados de cerebro de los ratones inoculados con priones en los diferentes momentos. El tratamiento con anle138b bloquea completamente la acumulación de PrPSc en el cerebro. La cantidad de PrPSc el día 106 está todavía en los valores del día 80. El tratamiento con anle186b conduce a una reducción de la acumulación de PrPSc en el cerebro de los ratones. (C) Cambio de la cantidad relativa de PrPSc después del tratamiento con los compuestos en comparación con el control sin tratar el día 80. (D) Evaluación histológica de células apoptósicas (flecha en (E)) en cortes de cerebro teñidos con hematoxilina y eosina (HE) en los momentos indicados. El gráfico de líneas muestra el número medio de células apoptósicas ± error estándar. En (E) se muestra un corte teñido con HE con una célula apoptósica (flecha).
Figura 7: Prolongación del tiempo de supervivencia mediante la administración diaria de los compuestos de la invención. Los ratones, que se han infectado por vía intracerebral con la cepa RML de la tembladera de las ovejas, muestra una prolongación del tiempo de supervivencia hasta alcanzar la etapa terminal de la infección de la tembladera de las ovejas.
Figura 8: Supresión de la agregación de la a-sinucleína por los compuestos de la invención. (A) El compuesto de DPP 351F11 es capaz de inhibir la formación de complejos multiméricos de a-sinucleína de un modo dependiente de la dosis. (B) (C) Detección del efecto inhibidor dependiente de la dosis sobre la agregación de la a-sinucleína que presentan otros compuestos relacionados con el DPP.
Figura 9: Cultivos celulares infectados con priones y tratados con los compuestos relacionados con DPP de la invención. Los compuestos relacionados con DPP mostraban una fuerte reducción de PrPSc en el cultivo celular a unas concentraciones micromolares bajas e incluso submicromolares.
Figura 10: Influencia del tratamiento diario con anle138b sobre la acumulación de PrPSc y la enfermedad causada por los priones en los ratones infectados con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. (A) Los cortes de cerebro teñidos para la PrPSc (fila superior: corteza e hipocampo, fila inferior: cerebelo) muestran que el tratamiento con anle138b reduce la acumulación de PrPSc en comparación con los animales tratados con DMSO. (B) La cuantificación de la cantidad de PrPSc en los homogeneizados de cerebro de los ratones inoculados con priones en los momentos indicados demuestra que se reduce mucho la acumulación de PrPSc en los ratones tratados con anle138b, incluso después del comienzo del tratamiento en una etapa tardía de la enfermedad (120 dpi). (C) La cuantificación histológica de las células apoptósicas en el cerebelo en los cortes de cerebro teñidos con h E demuestra que la inhibición de la acumulación de PrPSc da lugar a la inhibición de la muerte celular de las neuronas. (D) Los ratones de control tratados con DMSO más mantequilla de cacahuete sin el compuesto muestran un adelgazamiento progresivo. El tratamiento con anle138b desde los 80 dpi en adelante impide el adelgazamiento durante aproximadamente 100 días. El tratamiento desde los 120 dpi inhibe el adelgazamiento durante aproximadamente 70 días. Las barras de error en B y C indican el error estándar (n = 4 ratones). La leyenda que se muestra en la figura B también se aplica a las figuras C y D.
Figura 11: Comparación de diferentes protocolos de tratamiento. El tratamiento con anle138b en diferentes momentos y con diferentes pautas, tal y como se indica en la figura, prolongaron significativamente los tiempos de supervivencia después de la provocación con la cepa RML de la tembladera de las ovejas (p < 0,01). La media de los tiempos de supervivencia se expresan en días ± desviación estándar.
Figura 12: Efecto dependiente de la dosis que presenta la administración de anle138b sobre la cantidad de PrPSc en el cerebro. Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl del homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó 80 días después de la infección con la aplicación de diferentes cantidades de anle138b (tal y como se muestra en la figura) por vía oral mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete. A los 120 días de la infección, se sacrificaron los animales y se cuantificó la cantidad de PrPSc en el cerebro en comparación con los animales sacrificados 80 días después de la infección. Las barras de error indican el error estándar (n = 4 ratones).
Figura 13: Cuantificación de PrPSc por inmunotransferencia del tejido cerebral de los ratones sin infectar tratados con 1 mg al día de anle138b mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete durante 1 semana. Cada barra representa cuatro ratones en cada grupo.
Figura 14: Análisis farmacocinético de anle138b. A los ratones C57BL/6 sin infectar se les aplicó una dosis única de anle138b tal y como está indicado. En diferentes momentos después de la aplicación, se midió por LC-MS la cantidad del compuesto en el cerebro y en el suero para 2 animales por momento y el grupo experimental.
Figura 15: Inhibición de la formación de agregados de a-sinucleína debida a diferentes compuestos. Se muestra la estructura de los compuestos ensayados en la tabla 2.
Figura 16: Cuantificación de la pérdida de neuronas en los ratones tratados con MPTP en comparación con los ratones sin tratar con MPTP, según se evaluó mediante la determinación de las células de la sustancia negra compacta (SNc) que dan positivo para la tirosina hidroxilasa (TH) en cortes de 50 pm inmunoteñidos con un anticuerpo anti-TH. Se analizó un corte de cada dos a lo largo de la SNc con el programa informático Stereo Investigator (MicroBrightfield, Colchester, VT, EE. UU.). Las células inmunoteñidas se contaron mediante el método del fraccionador óptico con un objetivo de 20*. Los recuentos estereológicos los realizaron con anonimato dos investigadores independientes.
Figura 17: Efecto de anle138c en la agregación de Ap. La agregación de Ap se analizó mediante dispersión óptica dinámica. Ap40 monomérica y oligomérica en ausencia (panel superior) y presencia (panel central) de anle138. El panel inferior muestra la distribución por tamaños del estado fibrilar amiloide de Ap40, medido después de centrifugar la muestra.
Descripción detallada de la invención
La invención se resume mediante las realizaciones recogidas en las reivindicaciones. Se debe saber que las combinaciones de todas las realizaciones preferidas recogidas de aquí en adelante y en las reivindicaciones se considera que están dentro del alcance de la presente descripción.
La presente descripción se refiere a un compuesto representado por la fórmula general (E)
Figure imgf000005_0001
En el anillo, D, se seleccionan X, Y y L de manera independiente y no direccional de -C(R1)(R2)-, -C(R3)=, -N(R4)-, -N=, -N+(R5)=, -O- y -S-;
M y Z se seleccionan de manera independiente y no direccional de
Figure imgf000006_0001
------ representa un doble enlace optativo.
Es evidente por sí mismo que X, Y, Z, L y M se seleccionarán según lo permitan la valencia y la estabilidad.
R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 se seleccionan independientemente de hidrógeno; alquilo(C1-4); alquileno(C1-4)-halógeno; -alquileno(C1-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); -C(O)-alquilo(C1-4); y arilo(C6-10), en donde el anillo de arilo puede estar sustituido opcionalmente por alquilo(C1-4) o halógeno. El grupo arilo(C6-10) no está particularmente limitado y se puede, p. ej., seleccionar de fenilo y naftilo. El átomo de halógeno puede ser F, Cl, Br o I y es típicamente F o Cl.
Preferiblemente, R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 se seleccionan independientemente de hidrógeno; alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; -alquileno(C1-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); y -C(O)-alquilo(C1-4). Más preferiblemente, R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 se seleccionan de hidrógeno; alquilo(C1-4); y -alquileno(C1-4)-halógeno.
La elección del sustituyente puede depender del uso que se pretenda dar a los compuestos de la fórmula (E). En una realización preferida, al menos uno de R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 (más preferiblemente al menos uno de R4, R5 y R7) es -alquileno(C1-4)-halógeno. Esto es particularmente útil si los compuestos se han de emplear como una sonda para tomar imágenes de los depósitos de las proteínas agregadas, porque entonces es posible marcarlos con rapidez y eficacia con un marcador detectable, tal como un isótopo de halógeno detectable. Los ejemplos de isótopos de halógeno detectables incluyen 18F, 125I, 123I, 131I, 77Br y 76Br, en concreto 18F. Por supuesto, es posible utilizar un isótopo de halógeno detectable como cualquiera de los otros átomos de halógeno presentes en los compuestos de la fórmula (E), tales como los átomos de halógeno unidos al anillo de fenilo.
Como alternativa, se puede utilizar 11C para marcar detectablemente los compuestos de la fórmula (E). El 11C puede estar presente en al menos uno de R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 (más preferiblemente, al menos uno de R4, R5 y R7) o en cualquier otra parte del compuesto de la fórmula (E).
En una realización preferida alternativa, R1, R2, R3, R4, R5, R6 y R7 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-4), preferiblemente hidrógeno.
El anillo D no está particularmente limitado. Ejemplos típicos del mismo incluyen
Figure imgf000006_0002
Ejemplos particularmente preferidos de anillo D son
Figure imgf000007_0001
En las fórmulas de más arriba, R8 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(Ci-4); -alquileno(Ci-4)-halógeno; -alquileno(C-i-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); -C(O)-alquilo(C1-4); y arilo(Ca-10), en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo(C1-4) o halógeno. Preferiblemente R8 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; -alquileno(C1-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); y -C(O)-alquilo(C1-4). Más preferiblemente, R8 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno. En una realización, R8 se selecciona de hidrógeno; y alquilo(C1-4), más preferiblemente hidrógeno. En una realización alternativa, R8 es -alquileno(C1-4)-halógeno. Tal y como se explicó más arriba, R8 se puede marcar de manera detectable, si se desea.
En las fórmulas de más arriba, R9 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; -alquileno(C1-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); -C(O)-alquilo(C1-4); y arilo(Ca-1o), en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo(C1-4) o halógeno. Preferiblemente R9 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; -alquileno(C1-4)-OH; -alquileno(C1-4)-alcoxi(C1-4); y -C(O)-alquilo(C1-4). Más preferiblemente, R9 se selecciona de hidrógeno; -alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno. En una realización, R9 se selecciona de hidrógeno; y alquilo(C1-4), más preferiblemente hidrógeno. En una realización alternativa, R9 es -alquileno(C1-4)-halógeno. Tal y como se explicó más arriba, R9 se puede marcar de manera detectable, si se desea.
En una realización más, R8 y R9 son hidrógeno. Aún en otra realización, R8 es -alquileno(C1-4)-halógeno y R9 es hidrógeno.
Hal se selecciona de F, Cl, Br e I, y es preferiblemente F, Cl o Br, más preferiblemente Cl o Br, lo más preferiblemente Br.
RE1 se selecciona de hidroxi, alcoxi(C1-a) y -NRE5REa.
RE2 se selecciona de hidrógeno, halógeno, hidroxi, alcoxi(C1-a) y -NRE5REa, preferiblemente RE2 se selecciona de hidrógeno, hidroxi, alcoxi(C1-a) y -NRE5REa.
En una realización alternativa, RE1 y RE2 juntos pueden formar no direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-, así como las correspondientes estructuras en las que está presente un doble enlace, si están unidos a átomos de carbono adyacentes. En esta estructura, T se selecciona de CRE9RE10, NH y O, y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O. Preferiblemente, al menos uno de T y V es NH u O. Ejemplos de tales estructuras incluyen -O-(CH2)n-O-, -O-(CF2)n-O-, -O-(CH2)n-CH2-, -NH-(CH2)n-NH-, -NH-(CF2)n-NH-, -NH-(CH2)n-CH2- o una estructura correspondiente en la que está presente un doble enlace. Por ejemplo, si n = 1, entonces -N=CH-NH- es una estructura en la que está presente un doble enlace y que corresponde a -NH-CH2-NH-. Preferiblemente, RE1 y RE2 juntos forman una estructura -O-(CH2)n-O-. Se supone que este grupo también podría hidrolizarse in vivo a los correspondientes grupos hidroxi.
n es de 1 a 3; preferiblemente n es 1 o 2, más preferiblemente n es 1.
RE5 y REa se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-a); preferiblemente RE5 y REa se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-4).
RE7 y RE8 son independientemente H o F y son preferiblemente H.
RE9 y RE10 son independientemente H o F y son preferiblemente H.
Puede variar la posición en la que RE1 y RE2 están unidos al anillo fenilo.
En una realización, RE1 y RE2 son independientemente hidroxi o alcoxi, están unidos en meta y para por comparación con el átomo de carbono que une el anillo fenilo al anillo D.
En una segunda realización, RE1 y RE2 son una estructura -T-(CRE7RE8)n-V- o una estructura correspondiente en la que está presente un doble enlace y están unidos en meta y para por comparación con el átomo de carbono que une el anillo fenilo al anillo D. Las definiciones preferidas de más arriba para la estructura -T-(CRE7RE8)n-V- se aplican de manera análoga a esta realización.
En una tercera realización, RE1 es -NRE5REa y está unido en posición para por comparación con el átomo de carbono que une el anillo fenilo al anillo D.
Otros sustituyentes RE3 pueden estar opcionalmente presentes en el anillo fenilo además de RE1 y RE2. RE3 puede ser un grupo alquilo(Ci-6) o un grupo arilo(C5-io) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un grupo alquilo(Ci-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4). El número de sustituyentes, m, no está particularmente limitado y está típicamente en el margen de 0 a 2, preferiblemente de 0 o 1, típicamente 0.
También pueden estar presentes otros sustituyentes RE4. Son típicamente un átomo de halógeno, un grupo alquilo(C1-6) o un grupo arilo(C5-10) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un átomo de halógeno o un grupo alquilo(C1-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-6), lo más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4). El número de sustituyentes, p, no está particularmente limitado y está típicamente en el margen de 0 a 2, preferiblemente 0 o 1, típicamente 0.
En algunas realizaciones, los siguientes compuestos queda excluidos:
3(5)-(2-hidroxi-5-metilfenil)-5(3)-(4-clorofenil)-pirazol (DE 41 26 543: compuesto 26 en la tabla 1);
orfo-hidroxifenil-5-dicloro-3'-4'-fenil-3-metil-2-pirazol (FR 2.104.932: ejemplo IV);
orfo-hidroxifenil-5-dicloro-3'-4'-fenil-3-fenil-2-pirazol (FR 2.104.932: ejemplo IV);
Figure imgf000008_0002
Estos compuestos se describen como los compuestos IA-44, IA-47, IA-81, IA-106 e IA-115 en la solicitud de patente internacional WO 2004/080972.
En otras realizaciones de la descripción, estos compuestos no quedan excluidos.
Los ejemplos preferidos del compuesto representado por la fórmula (E) incluyen los compuestos representados por la fórmula (A)
Figure imgf000008_0001
Las definiciones de X, Y, Z, M, L, anillo D, m, p y Hal dadas más arriba con respecto a la fórmula (E) se aplican de manera análoga a la fórmula (A).
RA1 y RA2 se seleccionan cada uno independientemente de hidrógeno, halógeno, hidroxi, alcoxi(C1-6) y -NRA5RA6, siempre y cuando al menos uno de RA1 y RA2 sea hidroxi, alcoxi(C1-6) o -NRA5RA6. Preferiblemente, RA1 seleccionan independientemente de hidrógeno, hidroxi, alcoxi(C1-6) y -NRA5RA6.
Como alternativa, RA1 y RA2 pueden formar juntos y no direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-. Las explicaciones dadas más arriba con respecto a RE1 y RE2 forman tal estructura y en particular las definiciones de más arriba de RE7, RE8, T, n y V se aplican de manera análoga a RA1 y RA2 que forman esta estructura.
En una realización, RA1 y RA2 son de manera independiente hidroxi o alcoxi.
En una segunda realización, RA1 y RA2 son una estructura -T-(CRE7RE8)n-V- o una estructura correspondiente en la que está presente un doble enlace. Las definiciones preferidas de más arriba para la estructura -T-(CRE7RE8)n-V- se aplican de manera análoga a esta realización.
En una tercera realización, RA1 es -NRA5RA6 y RA2 es hidrógeno.
Otros sustituyentes RA3 pueden estar opcionalmente presentes sobre el anillo de fenilo además de RA1 y RA2. RA3 puede ser un grupo alquilo(C1-6) o un grupo arilo(C5-10) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un grupo alquilo(C1-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4).
También pueden estar presentes otros sustituyentes RA4. Son típicamente un átomo de halógeno, un grupo alquilo(C1-6) o un grupo arilo(C5-10) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un átomo de halógeno o un grupo alquilo(C1-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-6), lo más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4).
RA5 y RA6 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-6); preferiblemente RA5 y RA6 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-4).
Los ejemplos preferidos del compuesto representado por la fórmula (E) incluyen compuestos representados por la fórmula (B)
Figure imgf000009_0001
Las definiciones de X, Y, Z, M, L, anillo D, m, p y Hal dadas más arriba con respecto a la fórmula (E) se aplican de manera análoga a la fórmula (B).
RB1 se selecciona de hidroxi, alcoxi(C1-6) y -NRB5RB6. Preferiblemente, RB1 es hidroxi o alcoxi(C1-6).
RB2 se selecciona de hidrógeno, halógeno, hidroxi, alcoxi(C1-6) y -NRB5RB6, preferiblemente RB2 se selecciona de hidrógeno, hidroxi, alcoxi(C1-6) y -NRB5RB6. En una realización, RB1 es hidroxi o alcoxi C1-6 y RB2 es hidrógeno.
RB5 y RB6 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-6), preferiblemente RB5 y RB6 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo(C1-4).
Otros sustituyentes RB3 pueden estar opcionalmente presentes sobre el anillo de fenilo además de RB1 y RB2. RB3 puede ser un grupo alquilo(C1-6) o un grupo arilo(C5-10) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un grupo alquilo(C1-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4).
También pueden estar presentes otros sustituyentes RB4. Son típicamente un átomo de halógeno, un grupo alquilo(C1-6) o un grupo arilo(C5-10) (tal como un grupo fenilo o naftilo), preferiblemente un átomo de halógeno o un grupo alquilo(C1-6), más preferiblemente un grupo alquilo(C1-6), lo más preferiblemente un grupo alquilo(C1-4).
Los compuestos preferidos de la presente invención son:
Los compuestos preferidos de la presente descripción incluyen
Figure imgf000010_0001
Las definiciones dadas más arriba con respecto a RE7, RE8 y Hal se aplican de manera análoga a estos compuestos. R se selecciona de hidrógeno; alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; y arilo(C6-10) (tal como fenilo y naftilo), en donde el anillo de arilo puede opcionalmente estar sustituido por alquilo(C1-4) o halógeno. Preferiblemente, R se selecciona de hidrógeno; alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno. En una realización, R se selecciona de hidrógeno; y alquilo(C1-4), más preferiblemente hidrógeno. En una realización alternativa, R es -alquileno(C1-4)-halógeno. Tal y como se explicó más arriba, R se puede marcar de manera detectable, si se desea.
RA7 es H o alquilo(C1-6), preferiblemente H o alquilo(C1-4).
RA8 es H o alquilo(C1-6), preferiblemente H o alquilo(C1-4).
RA9 es H o alquilo(C1-6), preferiblemente H o alquilo(C1-4).
RA10 es H o alquilo(C1-6), preferiblemente H o alquilo(C1-4).
RB7 es H o alquilo(C1-6), preferiblemente H o alquilo(C1-4).
Los siguientes compuestos de la presente invención son particularmente preferidos porque se ha hallado que tienen una eficacia elevada a la hora de inhibir la agregación de una proteína o de tomar imágenes de las proteínas agregadas:
Figure imgf000010_0002
en donde Hal es Cl o Br, preferiblemente Hal es Br.
Los compuestos más preferidos de la presente invención son actualmente los siguientes compuestos
Figure imgf000010_0003
Los siguientes compuestos de esta descripción son particularmente preferidos porque se ha hallado que tienen una eficacia elevada a la hora de inhibir la agregación de una proteína o de tomar imágenes de proteínas agregadas:
Figure imgf000011_0001
en donde Hal es Cl o Br, preferiblemente Hal es Br.
Los compuestos más preferidos de esta descripción son en la actualidad los compuestos siguientes
Figure imgf000011_0002
Los compuestos de la fórmula (E) pueden estar también presentes en forma de profármacos, ésteres, solvatos o sales de los mismos.
Los compuestos de la fórmula (E) forman sales que están también dentro del alcance de esta invención. La referencia a un compuesto de la fórmula (E) en la presente memoria se entiende que incluye la referencia a las sales del mismo, a menos que se indique otra cosa. El término “sal” o “sales” , tal y como se emplea en la presente memoria, representa sales ácidas y/o básicas formadas con ácidos y bases inorgánicos y/u orgánicos. Además, cuando un compuesto contiene tanto un resto básico como un resto ácido, se pueden formar zwitterions (“sales internas”) y están incluidos dentro del término “sal” o “sales”, tal y como se utiliza en la presente memoria. Se prefieren sales farmacéuticamente aceptables (a saber, que no son tóxicas y son fisiológicamente aceptables), aunque son también útiles otras sales, p. ej., en las etapas de aislamiento o purificación que se pueden emplear durante la preparación. Las sales de los compuestos de la presente invención se pueden formar, por ejemplo, al hacer reaccionar un compuesto con una cantidad de ácido o base, tal como una cantidad equivalente, en un medio, tal como uno en el cual la sal se precipita, o en un medio acuoso y luego la liofilización.
Los compuestos que contienen un resto básico pueden formar sales con numerosos ácidos orgánicos e inorgánicos. Las sales por adición de ácido de ejemplo incluyen acetatos (tales como los formados con ácido acético o ácido trihaloacético, por ejemplo, ácido trifluoroacético), adipatos, alginatos, ascorbatos, aspartatos, benzoatos, bencenosulfonatos, bisulfatos, boratos, butiratos, citratos, canforatos, canforsulfonatos, ciclopentanopropionatos, digluconatos, dodecilsulfatos, etanosulfonatos, fumaratos, glucoheptanoatos, glicerofosfatos, hemisulfatos, heptanoatos, hexanoatos, hidrocloruros, hidrobromuros, hidroyoduros, hidroxietanosulfonatos (p. ej., 2-hidroxietanosulfonatos), lactatos, maleatos, metanosulfonatos, naftalenosulfonatos (p. ej., 2-naftlalenosulfonatos), nicotinatos, nitratos, oxalatos, pectinatos, persulfatos, fenilpropionatos (p. ej., 3-fenilpropionatos), fosfatos, picratos, pivalatos, propionatos, salicilatos, succinatos, sulfatos (p. ej., los formados con ácido sulfúrico), sulfonatos (p. ej., los mencionados en la presente memoria), tartratos, tiocianatos, toluenosulfonatos, tales como tosilatos, undecanoatos y similares.
Los compuestos que contienen un resto ácido pueden formar sales con numerosas bases orgánicas e inorgánicas. Las sales básicas de ejemplo incluyen sales de amonio, sales de metales alcalinos, tales como sales de sodio, litio y potasio, sales de metales alcalinotérreos, tales como sales de calcio y magnesio, sales con bases orgánicas (p. ej., aminas orgánicas) tales como benzatinas, diciclohexilaminas, hidrabaminas (formadas con N,N-bis(deshidroabietil)etilendiamina), N-metil-D-glucaminas, N-metil-D-glucamidas, t-butilaminas, y sales con aminoácidos, tales como arginina, lisina y similares. Los grupos básicos que contienen nitrógeno se pueden cuaternizar con agentes tales como haluros de alquilo inferiores (p. ej., cloruros, bromuros y yoduros de metilo, etilo, propilo y butilo), sulfatos de dialquilo (p. ej., sulfatos de dimetilo, dietilo, dibutilo y diamilo), haluros de cadena larga (p. ej., cloruros, bromuros y yoduros de decilo, laurilo, miristilo y estearilo), haluros de aralquilo (p. ej., bromuros de bencilo y fenetilo), y otros.
Los profármacos (referencia) y los solvatos de los compuestos de la fórmula (E) también están contemplados en la presente memoria. El término “profármaco”, tal y como se emplea en la presente memoria, representa un compuesto que, tras la administración a un sujeto, sufre una conversión química mediante procesos metabólicos o químicos para producir un compuesto de la fórmula (E) o una sal y/o solvato del mismo.
Los solvatos de los compuestos de la fórmula (E) incluyen, por ejemplo, hidratos.
Los ésteres de los compuestos de la fórmula (E) incluyen ésteres de alquilo(C1-6), preferiblemente de alquilo(C1-4).
Los compuestos de la fórmula (E) pueden existir en su forma tautomérica (p. ej., como un éter de amida o imino). Todas estas formas tautoméricas están contempladas en la presente memoria como parte de la presente invención o descripción, respectivamente.
Todos los estereoisómeros de los presentes compuestos (p. ej., los que pueden existir debido a carbonos asimétricos en diferentes sustituyentes), entre ellos las formas enantioméricas y las formas diastereoméricas, están contempladas dentro del alcance de esta invención o descripción, respectivamente. Cada uno de los estereoisómeros de los compuestos de la fórmula (E) pueden, por ejemplo, estar sustancialmente libres de otros isómeros (p. ej., como un isómero óptico puro o sustancialmente puro que tiene una actividad especificada) o pueden estar mezclados, por ejemplo, como racematos o con todos los otros, o solo los seleccionados, estereoisómeros. Los centros quirales de los compuestos de la fórmula (E) pueden tener la configuración S o R, tal y como se define según las recomendaciones de 1974 de la IUPAC.
Las formas racémicas se pueden resolver mediante métodos físicos, tales como cristalización fraccionada, separación o cristalización de derivados diastereoméricos, o separación por cromatografía de columna en columna quiral. Cada uno de los isómeros ópticos se puede obtener a partir de los racematos mediante cualquier método idóneo que incluye, entre otros, la formación de sales con un ácido ópticamente activo seguida de la cristalización.
Todos los isómeros configuracionales de los compuestos de la fórmula (E) están contemplados, bien en mezcla o bien en una forma pura o sustancialmente pura. La definición de los compuestos de la fórmula (E) abarca tanto los isómeros de alqueno cis (Z) y trans (E) como los isómeros cis y trans de los hidrocarburos cíclicos o anillos de heterociclo.
A lo largo de la especificación, los grupos y sustituyentes de los mismos se pueden elegir para dar a conocer restos estables y compuestos.
Los compuestos de la fórmula (E) se pueden dar a conocer en forma de una composición farmacéutica o diagnóstica que incluye opcionalmente un vehículo farmacéuticamente aceptable.
La aplicación de un sistema de ensayo bioquímico basado en la técnica de “cribado de dianas intensamente fluorescentes (SIFT)” en combinación con ensayos celulares por cultivo celular de los modelos de enfermedades causadas por priones, los presentes inventores han cribado grandes colecciones de compuestos sintéticos in vitro en busca de inhibidores de los procesos de agregación que acompañan a las enfermedades neurodegenerativas y, en particular, las enfermedades causadas por los priones y las sinucleinopatías a nivel molecular. Tales inhibidores tienen la capacidad de ser nuevos tratamientos para estas enfermedades.
Este sistema de ensayo sobrepasa con mucho los sistemas de ensayo en uso para la búsqueda de nuevos fármacos que inhiban la agregación de una proteína con respecto al grado de automatización, la velocidad de medición (75 segundos por muestra), la cantidad de compuestos químicos (solo 200 picomoles por ensayo primario), así como el agente utilizado (p. ej., solo el equivalente de 0,2 mg de cerebro de un caso de ECJ por ensayo) necesarios. Solo estos requisitos relativamente bajos de recursos y tiempo permiten el cribado de tales cantidades elevadas de compuestos (a saber, 20000). Además, el mapeo de todos los datos de cribado sobre una base de datos centralizada y su análisis automático permite la evaluación eficaz y el análisis de las relaciones entre la estructura y la actividad. La combinación con los procedimientos de cribado en cultivo celular, que se incluyen en la presente invención, permite la identificación de los compuestos que son activos tanto en los ensayos bioquímicos como en los ensayos con células. Así pues, se identifican compuestos que no son solo activos in vitro, sino también en un contexto celular, p. ej., lo que asegura la estabilidad y reactividad apropiadas de los compuestos identificados para el posterior desarrollo para aplicaciones in vivo.
Así pues, los presentes inventores identificaron una serie de compuestos activos en este cribado primario, que posteriormente se validaron con diluciones seriadas para identificar los compuestos activos incluso a concentraciones muy bajas. Los compuestos caracterizados como “activos” en el cribado primario se sometieron a un análisis de aglomeración, lo que reveló un grupo de cinco aglomeraciones cercanas (DPP_1 a DPP_5; figura 1), que comprenden compuestos muy activos, que pertenecen a la clase de compuestos químicos de los derivados del 3,5-difenilpirazol (DPP) (compárese con el motivo DPP mostrado en la figura 1).
Los presentes inventores sustituyeron además diferentes sustituyentes de la clase de compuestos identificados para identificar los compuestos relacionados idóneos como inhibidores de los procesos de agregación que acompañan a las enfermedades neurodegenerativas y, en particular, las enfermedades causadas por priones y las sinucleinopatías a nivel molecular. Mediante el uso de este método medicino-químico, se sintetizaron una serie de compuestos adicionales. Estos compuestos, junto con las sustancias seleccionadas del cribado inicial, se sometieron a más pruebas, entre ellas los ensayos de SIFT, ensayos con cultivos celulares, experimentos in vivo con ratones, así como ensayos bioquímicos dirigidos a la agregación de la a-sinucleína (véanse los ejemplos). Así pues, se verificó, la actividad de estos compuestos tanto in vitro como in vivo. El hallazgo de que estos compuestos son también capaces de inhibir con eficacia la formación de multímeros de la a-sinucleína a concentraciones micromolares bajas en los modelos in vitro para esta agregación patológica de proteínas hallada en las sinucleinopatías es una indicación clara de que los compuestos identificados no pueden funcionar solo como compuestos antipriónicos, sino que también tienen potencial terapéutico para las sinucleinopatías, como la enfermedad de Parkinson, DCL y AMS, al actuar selectivamente sobre el mecanismo patológico a nivel molecular. Además, la actividad inhibidora de estos compuestos sobre ambos, agregación de proteínas priónicas y de la a-sinucleína in vitro, puede ser reflejo de su actividad antiagregante general contra un abanico más amplio de enfermedades por agregación de una proteína, en donde el plegamiento incorrecto de las proteínas en conformaciones en las que predominan las láminas p conforma la base para la posterior agregación de la proteína en las fibrillas de amiloide. Así pues, estos compuestos y los compuestos relacionados con los miembros de la clase de sustancias de DPP es posible que resulten útiles como tratamiento para el tratamiento causativo de un panel entero de enfermedades por agregación de una proteína (neurodegenerativas), entre ellas, pero sin limitarse a ellas, enfermedad de Parkinson, enfermedad causada por priones, enfermedad de Alzheimer, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis AL), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria, amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
La presente invención se refiere además al compuesto de la presente invención, así como a un éster, solvato o sal del mismo, para ser usado en el tratamiento o la prevención de una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa. Otras realizaciones son el uso de un compuesto de la presente invención para la preparación de una composición farmacéutica para tratar o prevenir una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa.
El término “agregación”, de acuerdo con la presente invención, se refiere a la formación de complejos oligoméricos o multiméricos de típicamente uno o varios tipos de proteínas, que pueden estar acompañadas por la integración de biomoléculas adicionales, como glúcidos, ácidos nucleicos y lípidos, en los complejos.
El término “proteína implicada en una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a las enfermedades que se caracterizan por la presencia de proteínas agregadas. Tales proteínas agregadas pueden formar depósitos en determinados tejidos, más preferiblemente en el tejido nervioso o en el tejido del cerebro. La extensión de la agregación depende de la enfermedad concreta.
La presente invención se refiere además al uso de un compuesto de la presente invención tal y como está definido más arriba para preparar una composición farmacéutica para tratar o prevenir una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa.
De acuerdo con la presente invención, el término “composición farmacéutica” se refiere a una composición para la administración a un paciente, preferiblemente un paciente humano. La composición farmacéutica de la invención comprende los compuestos citados más arriba y, opcionalmente, otras moléculas capaces de alterar las características de los compuestos de la invención, con lo que, por ejemplo, se estabiliza, se modula y/o se activa su función. La composición puede estar en forma sólida, líquida o gaseosa y puede estar, entre otros, en forma de uno o varios polvos, uno o varios comprimidos, una o varias soluciones, o uno o varios aerosoles. La composición farmacéutica de la presente invención puede, opcionalmente y además, comprender un vehículo farmacéuticamente aceptable. Los ejemplos de vehículos farmacéuticos idóneos se conocen bien en la técnica e incluyen soluciones salinas tamponadas con fosfato, agua, emulsiones, tales como emulsiones de aceite/agua, diferentes tipos de humectantes, soluciones estériles, solventes orgánicos entre ellos DMSO, etc. Las composiciones que comprenden tales vehículos se pueden formular mediante los métodos convencionales bien conocidos.
La composición farmacéutica se formulará y se dosificará en consonancia con las buenas prácticas médicas, y tendrá en cuenta la afección clínica de cada paciente, el sitio de administración de la composición farmacéutica, el método de administración, la pauta de administración y otros factores conocidos por los médicos encargados del tratamiento. La “cantidad eficaz” de la composición farmacéutica para los propósitos de la presente memoria se determina, así pues, mediante tales consideraciones. El experto en la técnica sabe que la cantidad eficaz de las composiciones farmacéuticas administradas a un individuo dependerán, entre otras cosas, de la naturaleza del compuesto.
Las composiciones farmacéuticas de la invención o descripción se pueden administrar por vía oral, rectal, parenteral, intracisterna, intravaginal, intraperitoneal, tópica (tal como mediante polvos, ungüentos, gotas o parche transdérmico), bucal, o como un pulverizador oral o nasal. Con “vehículo farmacéuticamente aceptable” se quiere hacer referencia a un relleno sólido, semisólido o líquido, diluyente, material de encapsulación o formulación auxiliar de cualquier tipo que no es tóxico. El término “parenteral”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a los modos de administración que incluyen la inyección e infusión intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, intraesternal, subcutánea e intraarticular.
La composición farmacéutica también se administra idóneamente mediante sistemas de liberación prolongada. Los ejemplos idóneos de composiciones de liberación prolongada incluyen matrices de polímero semipermeable en forma de artículos conformados, p. ej., películas o microcápsulas. Las matrices de liberación prolongada incluyen polilactidas (patente de los EE. UU. n.° 3,773,919, patente europea EP 58 481), copolímeros de ácido L-glutámico y Y-etil-L-glutamato (Sidman. U et al., Biopolymers 22: 547-556 (1983)), poli(metacrilato de 2-hidroxietilo) (R. Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15: 167-277 (1981) y R. Langer, Chem. Tech. 12: 98-105 (1982)), acetato de etileno y vinilo (R. Langer et al., véase más arriba) o ácido poli-D-(-)-3-hidroxibutírico (patente europea EP 133 988). La composición farmacéutica de liberación prolongada también incluye un compuesto atrapado en liposomas. Los liposomas que contienen la composición farmacéutica se preparan mediante los métodos conocidos de por sí: patente alemana DE 32 18121; Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82: 3688-3692 (1985); Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA): 77: 4030-4034 (1980); patente europea EP 52322; patente europea EP 36676; patente europea EP 88046; patente europea EP 143949; patente europea EP 142641; solicitud de patente japonesa 83-118008; patentes de los Ee . UU. nos 4,485,045 y 4,544,545; y patente europea EP 102324. Habitualmente, los liposomas son de tipo unilaminar pequeño (aproximadamente 200 a 800 A) en los que el contenido de lípidos es superior a aproximadamente el 30% en moles de colesterol, en donde la proporción seleccionada se ajusta para el tratamiento óptimo.
Para la administración parenteral, la composición farmacéutica se formula en líneas generales mezclándola al grado deseado de pureza, en una forma inyectable de dosis unitaria (solución, suspensión o emulsión), con un vehículo farmacéuticamente aceptable, a saber, uno que no es tóxico para los destinatarios en las dosis y concentraciones empleadas, y que es compatible con otros ingredientes de la formulación.
Por lo general, las formulaciones se preparan al poner en contacto los componentes de la composición farmacéutica de manera uniforme e íntima con los vehículos líquidos o con los vehículos sólidos molidos en un polvo fino, o ambos. Entonces, si es necesario, se conforma el producto en la formulación deseada. Preferiblemente, el vehículo es un vehículo parenteral, más preferiblemente una solución que es isotónica con la sangre del destinatario. Los ejemplos de tales vehículos incluyen agua, solución salina, solución de Ringer y solución de dextrosa. Los vehículos no acuosos, tales como aceites no volátiles y oleato de etilo son también útiles en la presente memoria, así como los liposomas. El vehículo contiene idóneamente cantidades minúsculas de aditivos, tales como sustancias que refuerzan la isotonía y la estabilidad química. Tales materiales no son tóxicos para los destinatarios en las dosis y las concentraciones empleadas, e incluyen tampones tales como fosfato, citrato, succinato, ácido acético y otros ácidos orgánicos y sus sales; antioxidantes tales como ácido ascórbico; (poli)péptidos de baja masa molecular (menos de aproximadamente diez restos), p. ej., poliarginina o tripéptidos; proteínas, tales como seroalbúmina, gelatina o inmunoglobulinas; polímeros hidrófilos, tales como polivinilpirrolidona; aminoácidos, tales como glicina, ácido glutámico, ácido aspártico o arginina; monosacáridos, disacáridos y otros glúcidos que incluyen la celulosa o sus derivados, glucosa, manosa o dextrinas; quelantes, tales como EDTA; glúcidos polialcohólicos, tales como manitol o sorbitol; contraiones, tales como sodio; y/o tensioactivos no iónicos, tales como polisorbatos, poloxámeros o PEG.
Los componentes de la composición farmacéutica a ser utilizada para la administración terapéutica deben estar estériles. La esterilidad se lleva a cabo con facilidad mediante la filtración a través de membranas de filtración estériles (p. ej., membranas de 0,2 pm). Los componentes terapéuticos de la composición farmacéutica se colocan por lo general en un contenedor que tiene un puerto de acceso estéril, por ejemplo, una bolsa o vial de solución intravenosa que tiene un tapón perforable por una aguja de inyección hipodérmica.
Los componentes de la composición farmacéutica se almacenarán habitualmente en contenedores de dosis unitarias o de varias dosis, por ejemplo, ampollas o viales sellados, como una solución acuosa o como una formulación liofilizada para la reconstitución. A modo de ejemplo de una formulación liofilizada, los viales de 10 ml se llenan con 5 ml de solución acuosa al 1% (p/v) esterilizada por filtración y se liofiliza la mezcla resultante. La solución de infusión se prepara mediante la reconstitución del compuesto o compuestos liofilizados mediante el uso de agua bacteriostática para inyección.
Tal y como se utiliza en la presente memoria, el término “cantidad terapéuticamente eficaz” se refiere a una cantidad suficiente para desencadenar la respuesta biológica deseada. En la presente invención, la respuesta biológica deseada es la inhibición de la agregación de una proteína.
Se describe un método para identificar un compuesto con una mejora de la eficacia para inhibir la agregación de una proteína implicada en una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa, que comprende las etapas de (a) poner en contacto una proteína monomérica marcada y un agregado marcado de manera diferente de dicha proteína en (1) presencia y/o (2) ausencia de un candidato a inhibidor de la agregación que es un derivado de un compuesto tal y como está definido más arriba; (b) determinar la cantidad de marcaciones colocalizadas que representan la extensión de la fijación de la proteína monomérica al agregado de dicha proteína; y (c) comparar el resultado obtenido en presencia o ausencia de dicho compuesto, en donde una disminución de las marcaciones colocalizadas en presencia de dicho compuesto es indicativa de la capacidad del compuesto para inhibir la agregación de dicha proteína.
Tal y como se utiliza en la presente memoria, el término “proteína monomérica” se refiere a una unidad molecular compuesta por una sola cadena (poli)peptídica con una conformación tridimensional específica de cada proteína concreta que es preferiblemente soluble en las soluciones acuosas hasta concentraciones típicamente nanomolares, micromolares o milimolares, y pueden estar modificadas mediante la unión covalente de uno o varios glúcidos, derivados de glúcidos, lípidos, fosfato, sulfato, ácidos grasos y nucleótidos a determinados aminoácidos en la cadena. Preferiblemente, dicha modificación es una fosforilación, glucosilación, procesamiento proteolítico, glucación, oxidación y nitración. El término “(poli)péptido”, tal y como se utiliza en la presente memoria, describe un grupo de moléculas que comprende el grupo de péptidos, que consiste en 30 aminoácidos o menos, así como el grupo de polipéptidos, que consiste en más de 30 aminoácidos. Tal y como se utiliza a lo largo de la presente especificación, el término “proteína” también se refiere a (poli)péptidos.
El término “proteína agregada” significa oligómeros o multímeros unidos no covalentemente de uno o más tipos de “proteína(s) o polipéptido(s) monomérico(s)”, tal y como está definido más arriba, que se caracterizan por una alteración de la conformación tridimensional de las unidades de proteína con las que forman complejos con respecto a las unidades de las proteínas monoméricas y una solubilidad típicamente baja de los complejos en las soluciones acuosas.
El término “compuesto para inhibir la agregación de una proteína” se refiere a un compuesto que es capaz de impedir la formación de agregados de proteínas y/o que es capaz de desintegrar o degradar los agregados de proteína que ya existen, en donde dichos compuestos se derivan por modificación de los compuestos de la fórmula (E). Preferiblemente, tales compuestos están diseñador por modelado computacional, en donde el modelado computacional significa el uso de herramientas de cribado virtual para la búsqueda de compuestos que se fijan a la forma monomérica o a la forma agregada de la proteína, o a ambas. Por lo general, estos métodos se basan en la estructura tridimensional de las proteínas, preferiblemente de las proteínas cristalizadas junto con el sustrato. Más preferiblemente, el sustrato se remplaza por un candidato a modulador o inhibidor.
El término “proteína... marcada” se refiere a una proteína a la cual se une un marcador. Dicho marcador puede estar unido de manera directa o indirecta. La marcación indirecta hace referencia en particular a los (poli)péptidos marcados, más en concreto a anticuerpos marcados. La unión del marcador se puede realizar mediante una serie de técnicas que conoce el experto en la materia y que están descritas en los manuales de texto estándares (véase, por ejemplo, Harlow y Lane, “Antobodies, A Laboratory Manual”, CSH Press, Cold Spring Harbor, 1998).
El término “proteína marcada diferencialmente” significa que la isoforma agregada y la monomérica de la proteína llevan unidas diferentes marcadores. Un ejemplo típico es la unión de “FITC” a la proteína agregada y del “rojo Texas” a la proteína monomérica. Ya que estos marcadores son detectables con luz de diferente longitud de onda, se puede determinar la cantidad y/o la localización de las isoformas de la proteína. Más en particular, el uso de diferentes marcadores permite cuantificar la presencia de marcadores colocalizados, a saber, de marcadores que se encuentran muy cerca los unos de los otros.
La “determinación de la cantidad de marcadores colocalizados” se puede llevar a cabo, p. ej., con la medición por separado (a saber, específica de la longitud de onda) del número de fotones sueltos de al menos dos longitudes de onda diferentes que vienen desde el mismo elemento de volumen pequeño de típicamente menos de 1 femtolitro de una muestra en un periodo de tiempo muy breve de típicamente menos de 100 ps seguido de la comparación computarizada del número de fotones respectivo, que se pueden representar gráficamente en un histograma multidimensional con un eje para el número de fotones de una longitud de onda concreta. En el caso de dos longitudes de onda, el número de fotones de un periodo de tiempo concreto se puede representar, así pues, como puntos únicos en un histograma de intensidad de fluorescencia bidimensional.
El término “comparar el resultado obtenido en presencia o ausencia de dicho compuesto” significa valorar el efecto del compuesto sobre la formación y/o la cantidad de agregados de proteína. Tal y como se utiliza en la presente memoria, una disminución de los marcadores colocalizados de más del 10%, más preferiblemente de más del 25%, incluso más preferiblemente de más del 50% y lo más preferiblemente de más del 95%, en presencia de un compuesto candidato a inhibir la agregación, es indicativa de la capacidad que tienen los compuestos para inhibir la agregación de una proteína. El término “ausencia de dicho compuesto” significa que ningún inhibidor ni candidato a inhibidor es, o ha sido, añadido a la proteína agregante. En casos concretos, puede ser útil la adición de controles negativos, a saber, compuestos que no tienen ningún efecto sobre la agregación de una proteína. El término “ausencia de dicho compuesto” también hace referencia a estos casos. De igual modo, ninguno de los compuestos de la fórmula (E) que inhiben la agregación de una proteína se puede utilizar como control positivo en los ensayos para la identificación de nuevos compuestos inhibidores. Es evidente que el término “presencia” también se refiere a la cantidad. Por razones obvias, los compuestos a los que se hace referencia en la presente especificación tienen diferente concentración eficaz. Preferiblemente, la concentración eficaz es de menos de 100 pM, más preferiblemente por debajo de 10 pM e incluso más preferiblemente por debajo de 1 pM.
El método de la presente especificación es particularmente útil para identificar nuevos compuestos capaces de interferir con la agregación de una proteína con una mayor eficacia. Permite el cribado de grandes colecciones de compuestos derivados y permite identificar los compuestos que inhiben con una alta fidelidad. En un aspecto, el método se basa en la espectroscopia de correlación de fluorescencia. En los últimos años, la espectroscopia de correlación de fluorescencia (FCS, por su nombre en inglés) se ha reconocido como un método que permite el análisis muy sensible de la agregación de una proteína en las enfermedades neurodegenerativas, tales como las enfermedades causadas por los priones, a nivel molecular (Bieschke y Schwille, 1997, Bieschke et al. 2000, Giese et al., 2000, Post et al., 1998). Además, la FCS se presta por sí misma a la miniaturización y a la automatización, y se ha convertido en un método consolidado para el cribado masivo en la industria farmacéutica (Koltermann et al. 1998). La espectroscopia de correlación de fluorescencia (FCS) en su forma confocal actual analiza las fluctuaciones de las señales causadas por la difusión de las moléculas marcadas con una única fluorescencia a través de un elemento de volumen abierto definido por un haz de un láser de excitación enfocado a través de un objetivo de microscopio de gran abertura y que toma imágenes de manera confocal en un detector de recuento de fotones sueltos (Schwille et al. 1997). En su realización más preferida, el método se basa en esta tecnología. Este método es idóneo para el cribado masivo basándose en la inhibición de, por ejemplo, la fijación de PrPC a agregados de PrPSc o la formación de oligómeros o protofibrillas o fibrillas de a-sinucleína.
Este sistema de ensayo para la detección de inhibidores de la agregación de una proteína se puede utilizar para la búsqueda de nuevas sustancias terapéuticas para cualquier enfermedad neurodegenerativa que está relacionada con la agregación de proteínas específicas, tales como la enfermedad de Alzheimer y la enfermedad de Parkinson. Además, debe ser posible buscar sustancias con potencial terapéutico para todas las enfermedades en las que la formación de multímeros desempeña una función crucial en la patogenia, independientemente de la naturaleza química de sus componentes.
En una realización preferida de la presente descripción, dichos marcadores son marcadores fluorescentes.
Preferiblemente, el marcador se selecciona del grupo que consiste en fluorocromos, p. ej., isotiocianato de fluoresceína (FITC), rodamina, rojo Texas, Alexa 488, Alexa 647, ficoeritrina, aloficocianina, 6-carboxifluoresceína (6-FAM), 2',7'-dimetoxi-4',5'-dicloro-6-carboxifluoresceína (JOE), 6-carboxi-X-rodamina (ROX), 6-carboxi-2',4',7',4,7-hexaclorofluoresceína (HEX), 5-carboxifluoresceína (5-FAM) o W,W,W'W-tetrametil-6-carbox¡rrodam¡na (TAMRA), marcadores radiactivos, p. ej., 32P, 35S, 3H, etc. El marcador también puede ser un sistema de dos etapas, en donde, p. ej., la proteína o el (poli)péptido o el compuesto de la presente invención está conjugado a biotina, haptenos, etc., que llevan un compañero de fijación de alta afinidad, p. ej., avidina, anticuerpos específicos, etc., en donde el compañero de fijación está conjugado a un marcador detectable.
En otra realización preferida de la presente descripción, dichos marcadores están unidos a un anticuerpo o a un fragmento de un anticuerpo que se fija específicamente a dicha proteína.
El término “fijación específica” de los anticuerpos se puede describir, por ejemplo, en términos de su reactividad cruzada. Preferiblemente, “anticuerpo que se fija específicamente a...” se refiere a los anticuerpos que no se fijan a (poli)péptidos con una identidad de menos del 98%, de menos del 95%, de menos del 90%, de menos del 85%, de menos del 80%, de menos del 75%, de menos del 70% y de menos del 65% (según se calcula con los métodos conocidos en la técnica) con un (poli)péptido codificado por la proteína agregante. No obstante, los anticuerpos pueden también describirse o especificarse en términos de su afinidad de fijación. Las afinidades de fijación preferidas incluyen las que tienen una constante de disociación o Kd de menos de 5 * 10-6 M, 10-6 M, 5 * 10-7 M, 10-7 M, 5 * 10-8 M, 10-8 M, 5 * 10-9 M, 10-9 M, 5 * 10-10 M, 10-10 M, 5 * 10-11 M, 10-11 M, 5 * 10-12 M, 10-12 M, 5 * 10-13 M, 5 * 10-14 M, 10-14 M, 5 * 10-15 M y 10-15 M.
El término “anticuerpo” se refiere a anticuerpos policlonales, monoclonales, quiméricos, humanizados, de cadena única, Fv de cadena única, o a fragmentos de anticuerpos como, entre otros, los fragmentos Fab. Los fragmentos o derivados de anticuerpos comprenden además los fragmentos F(ab')2, Fv o scFv; véase, por ejemplo, Harlow y Lane (1988) y (1999), loc. cit. En la técnica se conocen diferentes procedimientos y se pueden utilizar para la producción de tales anticuerpos y/o fragmentos. Así pues, los derivados (de anticuerpo) se pueden producir mediante peptidomimética. Además, las técnicas descritas para la producción de anticuerpos de cadena única (véase, entre otras, la patente de los EE. UU. n.° 4,946,778) se pueden adaptar para producir anticuerpos de cadena única específicos contra uno o varios polipéptidos y proteínas de fusión de esta invención. De igual forma, los animales transgénicos se pueden utilizar para expresar anticuerpos humanizados específicos contra los polipéptidos y proteínas de fusión de esta invención. Lo más preferiblemente, el anticuerpo de esta invención es un anticuerpo monoclonal. Para la preparación de anticuerpos monoclonales, se puede utilizar cualquier técnica que proporciona anticuerpos producidos mediante el cultivo continuo de líneas celulares. Ejemplos de tales técnicas incluyen la técnica de hibridomas (Kohler y Milstein, Nature 256 (1975), 495-497), la técnica de triomas, la técnica de hibridomas de linfocitos B de humano (Kozbor, Immunology Today 4 (1983), 72) y la técnica de hibridomas con EBV para producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cáncer Therapy, Alan R. Liss, Inc, (1985), 77-96). La resonancia de plasmones superficiales según se emplea en el sistema de BIAcore se puede utilizar para incrementar la eficacia de los anticuerpos fágicos que se fijan a un epítopo de un polipéptido de la invención (Schier, Human Antibodies Hybridomas 7 (1996), 97-105; Malmborg, J. Immunol. Methods 183 (1995), 7-13). También se contempla en el contexto de esta invención que el término “anticuerpo” comprende construcciones de anticuerpos que se pueden expresar en las células, p. ej., construcciones de anticuerpos que se pueden transfectar y/o transducir a través de, entre otros, virus o vectores plasmídicos. El experto en la técnica sabe que, en muchos casos, los anticuerpos pueden ser remplazados por otros compuestos de fijación específica, tales como los péptidos expuestos sobre la superficie de fagos (exposición en fagos) o con (poli)péptidos aislados. El anticuerpo o los (poli)péptidos pueden estar sin marcar o marcados con cualquiera de los marcadores descritos en la presente invención. Preferiblemente, los anticuerpos se pueden obtener de humano, ratón, rata, cabra o conejo.
En una realización más preferida de la presente descripción, dicho anticuerpo es capaz de discriminar entre la proteína agregada y la proteína monomérica.
El término “capaz de discriminar” se refiere a un anticuerpo que es específico de la isoforma monomérica o de la agregada de la proteína. Preferiblemente, dicho anticuerpo tiene una Kd disminuida en 5 veces por una isoforma de la proteína, más preferiblemente la Kd está disminuida 10 veces. Como consecuencia, dicho anticuerpo es capaz de fijarse a una isoforma de la proteína, mientras que es esencialmente incapaz de unirse a la otra isoforma.
En otra realización preferida de la presente descripción, la cantidad de marcador colocalizado se determina con el uso del método de “cribado de dianas intensamente fluorescentes (SIFT)” (Bieschke et al., 2000), FRET o toma confocal de imágenes de alta resolución.
Preferiblemente, dicha toma confocal de imágenes de alta resolución se realiza con un microscopio de barrido con láser confocal o con un microscopio que utiliza la tecnología de discos giratorios.
En otra realización preferida de la presente descripción, dichas proteínas monoméricas o agregantes se seleccionan del grupo que consiste en proteína priónica, proteína precursora del amiloide (PPA), a-sinucleína, superóxido dismutasa, proteína t, inmunoglobulina, amiloide A, transtirretina, microglobulina p2, cistatina C, apolipoproteína A1, TDP-43, amilina, ANF, gelsolina, insulina, lisozima, fibrinógeno, huntingtina y ataxina, y otras proteínas con un tramo de poli-Q, y fragmentos o derivados de dichas proteínas. En una realización preferida, las proteínas monoméricas y agregantes se seleccionan del grupo que consiste en proteína precursora del amiloide (PPA) y a-sinucleína. En una realización más preferida, las proteínas monoméricas y agregantes son la a-sinucleína.
Preferiblemente, dichas proteínas con un tramo de poli-Q son proteínas que tienen al menos 36 restos de glutamina consecutivos. Más preferiblemente, dichas proteínas con el tramo de poli-Q se seleccionan del grupo que consiste en huntingtina y ataxina.
Preferiblemente, dichos fragmentos o derivados se seleccionan del grupo modificado por fosforilación, glucosilación, procesamiento proteolítico, glucación, oxidación y nitración. Los (poli)péptidos mencionados en la presente invención pueden contener uno o varios glúcidos, derivados de glúcidos, lípidos, fosfato, sulfato, ácidos grasos y nucleótidos unidos a aminoácidos independientes en la cadena. Preferiblemente, dicha modificación es una fosforilación, glucosilación, procesamiento proteolítico, glucación, oxidación y nitración.
La proteína puede ser una proteína de vertebrado o de invertebrado. Preferiblemente, la proteína es una proteína de mamífero o de ave. Más preferiblemente, la proteína de mamífero se selecciona de primate, humano, ratón, rata, ganado bovino (vacuno), cerdo y oveja. En casos concretos, puede ser preferible utilizar isoformas mezcladas, a saber, por ejemplo, la forma agregada de PrPSc derivada de humano y la forma monomérica derivada de ratón.
Las proteínas se pueden aislar de un animal o de un cultivo de tejidos, o se pueden preparar por medios recombinantes. Los inventores han contemplado que las proteínas puedan estar modificadas químicamente o que puedan estar tratadas con enzimas, tales como proteasas o glucosidasas, para mejorar la manipulación en el sistema de ensayo.
En otra realización más preferida de la presente descripción, la proteína monomérica es la proteína priónica y la proteína agregada es la PrPSc (Prusiner, 1998).
En otra realización más preferida de la presente descripción, la proteína monomérica es la a-sinucleína y dicha proteína agregada se selecciona del grupo que consiste en oligómeros o protofibrillas o fibrillas de la a-sinucleína.
La presente descripción también se refiere a un método para seleccionar compuestos que hayan mejorado su eficacia in vivo para el tratamiento de enfermedades relacionadas con la agregación de una proteína y/o enfermedades neurodegenerativas, que comprende (a) administrar un compuesto candidato, que es un derivado del compuesto de la fórmula (E), a un cultivo celular o a un animal que tiene la isoforma agregable de la proteína según se define en la presente invención; (b) cuantificar la cantidad de agregados observables; y (c) identificar y seleccionar un compuesto que es capaz de reducir los agregados o la formación de agregados de dicha proteína.
Este método de la presente descripciónpermite analizar los compuestos candidatos in vivo, a saber, en el interior de las células, o ex vivo, a saber, fuera de un organismo vivo. El análisis de los compuestos candidatos in vivo y ex vivo se muestra, por ejemplo, en los ejemplos (véase más adelante). El análisis de los compuestos candidatos in vivo y ex vivo da una información adicional importante que incluye datos en cuanto a toxicidad, estabilidad en presencia de un complejo químico en el entorno, y la capacidad para alcanzar la ubicación donde se consigue un efecto molecular deseado.
Preferiblemente, el compuesto se administra a varias concentraciones para determinar una concentración en la que se puede observar un efecto sobre la agregación de una proteína y para calcular la CE50, en donde el término CE50 se refiere a la concentración (molar) de un compuesto que produce el 50% de la respuesta máxima posible para dicho compuesto.
La presente invención o descripción también se refiere al uso de un compuesto de la fórmula (E) tal y como está definido más arriba para inhibir la agregación de una proteína en un animal (referencia), in vitro o ex vivo.
En una realización preferida, el animal es un animal no humano.
La presente invención o descripción se refiere además a una composición farmacéutica o diagnóstica que comprende el compuesto de la invención o descripción, respectivamente y, opcionalmente, un vehículo o excipiente farmacéuticamente aceptable.
De acuerdo con la presente especificación, el término “composición diagnóstica” se refiere a las composiciones para diagnosticar en cada uno de los pacientes su posible respuesta o capacidad de curación debidas a las composiciones farmacéuticas de la especificación. El término “composición diagnóstica” también se refiere a las composiciones para determinar la presencia de las proteínas agregadas que subyacen en las enfermedades citadas más arriba. La composición diagnóstica de la invencióncomprende los compuestos citados más arriba. La composición diagnóstica puede comprender además los tampones adecuados y las enzimas, tales como la transcriptasa inversa, polimerasas termoestables, etc. Las composiciones diagnósticas se pueden empaquetar en un envase o en varios envases.
En una realización preferida más, la eficacia de dicho compuesto se mejora adicionalmente por derivación.
El término “derivación”, de acuerdo con la presente especificación, se refiere a la generación de compuestos relacionados desde el punto de vista químico que tienen modificaciones en al menos una posición de la molécula.
En una realización preferida de la presente invención o descripción, dicho compuesto es detectable o está marcado de manera detectable. Se entiende que un compuesto es detectable o está marcado de manera detectable si su presencia se puede seguir mediante técnicas convencionales, tales como espectroscopia de RMN, detección óptica, tomografía de emisión de positrones (TEP), microscopia electrónica, toma de imágenes por resonancia magnética (RMN), espectrometría, cromatografía, ELISA, detección de emisión de radiactividad, preferiblemente mediante recuento de centelleo o recuento y, preferiblemente TEP.
Cuando los compuestos de la fórmula (E) se han de utilizar como sondas para la toma de imágenes de proteínas agregadas, en concreto de los depósitos de amiloide, deben estar marcadas. La naturaleza específica del marcador dependerá del método que se ha de utilizar para la toma de imágenes. Típicamente, serán útiles los marcadores radiactivos que emiten positrones (TEP) y que tienen una semivida breve, tales como 18F, 11C, 125l, 123l, 131l, 77Br y 76Br, en concreto 18F y 11C. Debido a su semivida breve, los compuestos marcados de la fórmula (E) se deben preparar poco antes de ser usados para el análisis.
En consecuencia, la composición diagnóstica también se puede dar a conocer en forma de un kit, que consiste en precursores de los compuestos de la fórmula (E), que se hacen reaccionar para formar el compuesto deseado. Tal kit es particularmente cómodo, si el compuesto de la fórmula (E) contiene al menos un resto que es X, Y o L que es -N(R4)- y R4 comprende un marcador detectable.
En una realización preferida, el compuesto que se utiliza para tomar imágenes posee un resto -N(R4)- como X, Y o L, en el que R4 es -alquileno(C1-4)-halógeno, en donde el átomo de halógeno es radiactivo. En otra realización preferida, el compuesto que se utiliza para tomar imágenes posee un resto -N(R4)- como X, Y o L, en el que R4 es -alquilo(C1-4), que contiene al menos un isótopo de 11C.
El experto en la técnica será capaz de idear métodos con los cuales el marcador detectable se puede unir a los compuestos de la fórmula (E). Los siguientes esquemas pueden servir como ejemplos ilustrativos.
El tosilato de 2-[18F]fluoroetilo 2 es un precursor útil para incorporar 18F (semivida de 109,8 min) a través de la fluoroetilación de los compuestos que contienen los nucleófilos oxígeno, azufre y nitrógeno, o mediante diferentes metilaciones mediadas por metales (R. Schirrmacher et al., J. Label. Compd. Radiopharm. 2002, 45, 763-774). El tosilato de 2-[18F]fluoroetilo se puede sintetizar en una síntesis de dos etapas, mediante la sustitución nucleófila directa del 1,2-ditosilato de etilenglicol 1 por la sustitución nucleófila directa con K[18F]/Kryptofix 2.2.2 para producir el agente 18F-fluoroetilante 2. El reactivo no radiactivo 2 se utilizó para la síntesis de sery 363A, sery 363B y sery 388B no radiactivos de acuerdo con el esquema A. Se pueden utilizar las mismas condiciones para la síntesis de los análogos radioactivos de estos compuestos.
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Esquema A
Un emisor de positrones más útil, el 11C (semivida de 20,38 min), se puede introducir mediante el yoduro de [11C]metilo (J. Eriksson et al., J. Label. Compd. Radiopharm. 2006, 49, 1177-1186) con el mismo tipo de sustitución nucleófila. Se utilizó el yoduro de metilo no radiactivo para la síntesis de sery 392A y sery 392B no radiactivos de acuerdo con el esquema B. Se pueden utilizar las mismas condiciones para la síntesis de análogos radiactivos de estos compuestos.
Figure imgf000019_0002
Aunque se prefiere unir el resto detectable al anillo D porque estos compuestos son particularmente fáciles de sintetizar, esto no es esencial. Es igualmente posible dar a conocer compuestos de la invención en los que el resto detectable está en una posición diferente en la molécula.
La presente descripción da a conocer un método para tomar imágenes de depósitos de proteínas agregadas, que comprende las etapas de:
(i) introducir una cantidad detectable de una composición que comprende un compuesto marcado de manera detectable de la presente invención en un sujeto;
(ii) dar el tiempo suficiente para que el compuesto se asocie a la proteína agregada; y
(iii) detectar el compuesto asociado a la proteína agregada.
En una realización preferida del método de toma de imágenes, la proteína agregada se selecciona del grupo que consiste en la proteína precursora del amiloide (PPA) y la a-sinucleína. En una realización más preferida, la proteína agregada es la a-sinucleína.
La composición que comprende el compuesto marcado de manera detectable se puede introducir en el sujeto mediante cualquiera de las administraciones descritas más arriba, tales como, por ejemplo, por vía oral o parenteral. El compuesto marcado se puede introducir en un paciente y después de un intervalo de tiempo suficiente para que el compuesto se termine asociando a la proteína agregada, el compuesto marcado se detecta de manera no invasiva dentro del paciente. Como alternativa, el compuesto marcado se puede introducir en un paciente, se deja un tiempo suficiente para que el compuesto se termine asociando a la proteína agregada y, a continuación, se toma una muestra de tejido del paciente y se detecta el compuesto marcado en el tejido al margen del paciente. También se puede retirar una muestra de tejido de un paciente antes de introducir el compuesto marcado en la muestra de tejido. Se puede detectar el compuesto después de dejar una cantidad de tiempo suficiente para que el compuesto se termine por fijar a la proteína agregada.
Los métodos para la detección del compuesto marcado asociado a la proteína agregada se conocen bien en la técnica e incluyen, sin limitación, resonancia magnética nuclear (RMN), tomografía de emisión de positrones (TEP) o la tomografía computarizada de emisión monofotónica (SPECT) para la detección de los compuestos radiomarcados. El marcador que se introduce en el compuesto depende del método de detección a utilizar. Así pues, por ejemplo, si se selecciona la TEP como método de detección, el compuesto debe poseer un átomo emisor de positrones, tal como 11C o 18F.
La toma de imágenes de las proteínas agregadas también se puede realizar de manera cuantitativa, de tal forma que se puede determinar la cantidad de proteína agregada.
En una realización preferida de la invención o descripción, dicha enfermedad relacionada con la agregación de una proteína se caracteriza por la presencia de formas agregadas de al menos una proteína o un fragmento o derivado de la misma, en donde esta proteína se selecciona del grupo que consiste en proteína priónica, proteína precursora del amiloide (PPA), a-sinucleína, superóxido dismutasa, proteína t, inmunoglobulina, amiloide A, transtirretina, microglobulina p2, cistatina C, apolipoproteína A1, TDP-43, amilina, ANF, gelsolina, insulina, lisozima, fibrinógeno, huntingtina y ataxina, y otras proteínas con un tramo de poli-Q. En una realización preferida, la proteína se selecciona del grupo que consiste en proteína precursora del amiloide (PPA) y a-sinucleína. En una realización más preferida, la proteína es la a-sinucleína.
Preferiblemente, dichas proteínas con un tramo de poli-Q son proteínas que tienen al menos 36 restos consecutivos de glutamina. Más preferiblemente, dichas proteínas con tramo de poli-Q se seleccionan del grupo que consiste en huntingtina y ataxina.
El experto en la técnica sabe que dichas proteínas pueden existir en diferentes isoformas, que incluyen las proteínas modificadas por fosforilación, glucosilación, procesamiento proteolítico y similares. El término “al menos un...” se refiere al hecho conocido por el experto en la técnica de que las enfermedades pueden estar relacionadas con la presencia de más de una proteína en la forma agregada. Por ejemplo, en la enfermedad de Alzheimer, los agregados de fragmentos de la proteína precursora del amiloide (PPA) y los agregados de t suelen ser detectables.
Tal y como se utiliza en la presente memoria, el término “enfermedades neurodegenerativas” comprende enfermedades tales como la enfermedad de Parkinson, enfermedad causada por los priones, enfermedad de Alzheimer, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar. Además, tal y como se utiliza en la presente memoria, el término “enfermedad por agregación de una proteína” se refiere a las enfermedades que se manifiestan predominantemente fuera del sistema nervioso e incluye enfermedades tales como la amiloidosis sistemática primaria (amiloidosis AL), la amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria y amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
En otra realización preferida de la invención o descripción, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en enfermedad de Parkinson, enfermedad causada por los priones, enfermedad de Alzheimer, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis AL), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria, amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa. En una realización más preferida, la enfermedad es la enfermedad de Parkinson.
En una realización preferida de la invención o descripción, dicha enfermedad causada por los priones se selecciona de enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, variante de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakon, enfermedad genética humana causada por priones, encefalopatía espongiforme bovina (EEB) y tembladera de las ovejas.
Finalmente, la presente invención se refiere a un kit que comprende el compuesto de la fórmula (E) y, además, se describe un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se fija específicamente a dicho compuesto; y/o proteína monomérica o agregada tal y como está definido más arriba; y/o proteína monomérica o agregada tal y como está definido más arriba, opcionalmente formando un complejo con dicho compuesto e instrucciones para el uso, en uno o más envases.
Procedimientos experimentales generales
Los compuestos de la fórmula (E) se pueden preparar mediante cualquiera de las técnicas aplicables de la síntesis orgánica. Muchas de tales técnicas aparecen elaboradas en L. F. Tietze, Th. Eicher “Reaktionen und Synthesen”, 2. Auflage (Georg Thieme Verlag, Stuttgart, NY, 1991), T. W. Greene, P. G. M. Wuts “Protective Groups in Organic Synthesis”, tercera edición (John Wiley & Sons, NY, 1999), así como J. March “Advanced Organic Chemistry”, tercera edición (John Wiley & Sons, NY, 1985).
A continuación, se dan a conocer una serie de métodos de ejemplo para preparar los compuestos de la fórmula (E).
Estos métodos están destinados a ilustrar la naturaleza de tales preparaciones y no están destinados a limitar el alcance de los métodos aplicables.
Por lo general, las condiciones de reacción, tales como temperatura, tiempo de reacción, solventes, procedimientos de aislamiento y purificación, y similares, serán los habituales en la técnica para realizar en concreto esta reacción. El material de referencia citado, junto con el material citado en él, contiene descripciones detalladas de tales condiciones. Típicamente, las temperaturas serán de -80 °C a 150 °C, los solventes serán apróticos o próticos, y los tiempos de reacción serán de 10 segundos a 10 días. El aislamiento y la purificación típicamente consisten en extinguir cualquier reactivo que no haya reaccionado seguido del reparto entre un sistema de capas de agua/orgánico (extracción), y la separación de la capa que contiene el producto.
Las técnicas sintéticas estándares, tales como el uso de las condiciones de reacción anhidras (p. ej., entornos de gas inerte) son frecuentes en la técnica y se aplicarán cuando sea aplicable.
Las modificaciones de cada uno de los esquemas que vienen a continuación conduce a diferentes análogos de los materiales de ejemplo específicos que se producen a continuación. Las citas dadas más adelante que describen métodos idóneos de síntesis orgánica son aplicables a tales modificaciones.
En cada uno de los esquemas de ejemplo que aparecen más abajo, puede ser ventajoso separar los productos de reacción los unos de los otros y/o de los materiales de partida. Los productos deseados de cada etapa se separan y/o purifican (a partir de ahora, se separan) hasta el grado deseado de homogeneidad mediante las técnicas habituales en el campo. Típicamente, tales separaciones implican extracciones multifásicas, la cristalización desde un solvente o una mezcla de solventes, destilación, sublimación o cromatografía. La cromatografía puede conllevar cualquier cantidad de métodos, entre ellos, por ejemplo, la cromatografía de exclusión por tamaños o la cromatografía de intercambio iónico, la cromatografía de alta, media o baja presión, la cromatografía preparativa y a pequeña escala en capa fina o gruesa, así como técnicas de cromatografía a pequeña escala rápida y en capa fina.
Otra clase de métodos de separación conlleva el tratamiento de una mezcla con un reactivo seleccionado por fijarse, o si no por producir en forma separable, un producto deseado, material de partida sin reaccionar, producto secundario de la reacción, o similares. Tales reactivos incluyen absorbentes, tales como carbón activado, tamices moleculares, medios de intercambio iónico o similares. Como alternativa, los reactivos pueden ser ácidos en el caso de un material básico, bases en el caso de un material ácido, reactivos de fijación tales como anticuerpos, proteínas de fijación, quelantes selectivos tales como éteres de corona, extracción de iones líquido/líquido, o similares.
La selección de métodos de separación apropiados depende de la naturaleza de los materiales implicados. Por ejemplo, el punto de ebullición y la masa molecular en la destilación y la sublimación, la presencia o ausencia de grupos funcionales polares en la cromatografía, la estabilidad de los materiales en los medios ácidos y básicos en la extracción multifásica, y similares. El experto en la técnica aplicará las técnicas que con más probabilidad consigan la separación deseada.
En concreto, los compuestos de la fórmula (E) se pueden preparar de una manera que es análoga a los procedimientos que se describen, por ejemplo, en M. Ono et al. (Bioorganic & Medicinal Chemistry 16 (2008) 6867-6872), solicitudes de patente internacional WO 2008/131148, WO 2004/080972, WO 2004/072050 y WO 98/17652. Las vías alternativas se ejemplifican también en el apartado de los ejemplos de la presente especificación.
Los siguientes ejemplos tienen el propósito de ilustrar. Sin embargo, no se han de considerar como limitantes.
Ejemplos
Ejemplo 1: Identificación de una nueva clase de compuestos para inhibir la agregación de una proteína.
Dos subconjuntos de la colección de compuestos comerciales DIVERSet (ChemBridge Corp., San Diego, CA, USA), cada uno con 10000 compuestos, y llamados DIVERSet 1 y 2 por nosotros, se han cribado en busca de los inhibidores de la propagación de los priones mediante el uso del ensayo antipriónico de SIFT bidimensional (Bertsch et al., 2005) y un modelo de cultivo celular de la enfermedad causada por los priones. En ambos ensayos, se obtuvieron positivos primarios al analizar los compuestos a una sola concentración y posteriormente se verificaron en diluciones seriadas. Además, los positivos del cultivo celular se analizaron con otra línea celular.
Cribado por SIFT bidimensional
Para analizar el efecto inhibidor de los fármacos sobre la asociación entre PrPC y PrPSc en un ensayo de cribado masivo y de alto contenido, aplicamos la técnica de “cribado de dianas intensamente fluorescentes” (SIFT, por su nombre en inglés), que utiliza una configuración del microscopio confocal de dos colores invertido con detectores de fotones únicos para dos colores de luz fluorescente. Se preparan las muestras en placas de microtitulación de 96 y 384 pocillos con fondo de portaobjetos de cristal. La mezcla del ensayo consiste en la PrP recombinante de ratón (rPrP), el anticuerpo monoclonal (Acm) L42, que no reconoce la PrP de ratón sino la PrP de humano, y agregados de PrPSc preparados a partir del cerebro de humano con ECJ. Las moléculas de rPrP y del Acm se marcan con fluoróforos verde y rojo, respectivamente. La fijación de varias moléculas de rPrP y del Acm a los agregados de PrPSc dará lugar a la formación de complejos terciarios que muestran muchos fluoróforos unidos rojos y verdes. Tales agregados se pueden identificar y analizar mediante el método de SIFT, porque dan lugar simultáneamente a intensidades elevadas en ambos canales de fluorescencia. La distribución de las intensidades de fluorescencia roja y verde se puede valorar mediante un histograma bidimensional de intensidad de la fluorescencia. Siempre y cuando se incluya en el ensayo un inhibidor de la asociación entre rPrP y PrPSc, debe disminuir la intensidad de fluorescencia verde de los agregados terciarios. La distribución del color de los agregados en el histograma bidimensional cambiará entonces hacia los sectores “rojos” de dicho histograma.
Cribado primario por SIFT de 20000 compuestos
El sistema de ensayo descrito más arriba se aplicó a dos colecciones, cada una con 10000 compuestos diferentes de tipo fármaco (ChemBridge; “DIVERSet1” y “DIVERSet2”) en placas de microtitulación de 96 pocillos para un cribado primario que incluye controles negativos sin ningún compuesto adicional y controles positivos que contienen 17 pM de DOSPA, así como controles sin cilindros de ECJ ni compuestos (que sirven para comprobar la ausencia de agregación en la mezcla de anticuerpo y de rPrP).
Las muestras que contienen DOSPA mostraron una reducción de la señal de SIFT en los sectores que vigilan las señales de los agregados predominantemente marcados con rPrP en verde. Esto indica que en estos controles se había fijado menos rPrp a los cilindros de priones de la ECJ. Ya que los cilindros de priones están marcados por los anticuerpos marcados en rojo, su fluorescencia todavía genera una señal de SIFT en los sectores “rojos”. La mayoría de los compuestos no influyen en la distribución de la señal de SIFT. Pero algunos de los compuestos de DIVERSet hicieron disminuir el número de agregados detectados en los sectores “verdes”. Las curvas de SIFT de estas muestras están desplazadas hacia los controles de DOSPA. Así pues, los compuestos correspondientes se pueden considerar que son positivos primarios de posibles fármacos antipriónicos. De vez en cuando, algunos problemas técnicos generaron artefactos, que obscurecieron toda una medición de una placa de microtitulación entera. Aparte de esto, solo aproximadamente el 7% de las mediciones sin alterar se habían de tratar como valores extremos y no eran idóneas para el análisis de SIFT automático, principalmente debido a la fluorescencia intrínseca de los compuestos analizados. No se esperaba este porcentaje más bien bajo de compuestos que no se podían tratar en el ensayo de SIFT y acentuó la versatilidad y la robustez del ensayo. La identificación de las mediciones problemáticas y de los compuestos está facilitado por la naturaleza de alto contenido de los datos del ensayo de SIFT. Para cada muestra se registran simultáneamente varios parámetros de fluorescencia, como por ejemplo la intensidad media de la fluorescencia para cada canal de color. Estos se presentan junto con la suma de los acontecimientos de alta intensidad en cada sector del histograma de distribución de colores. Por lo tanto, las muestras con una fluorescencia intrínseca alta se pueden clasificar con facilidad.
Positivos primarios por SIFT y validación mediante diluciones seriadas
Para que un compuesto se clasifique como un positivo primario, analizamos la suma de la posición esperada de los picos en los sectores “verdes” 1 a 5 y definimos un valor de corte de aproximadamente el 50% del efecto de DOSPA en comparación con los controles sin tratar como el efecto mínimo necesario. Los compuestos de DIVERSet se asignaron a valores de actividad de SIFT escalonables (tp1_sift) a partir de los datos de cribado por SIFT que caracterizan su efecto inhibidor sobre la agregación de priones tal y como describieron Bertsch et al. en 2005. Los valores de actividad menores que cero no reflejan ningún efecto inhibidor, mientras que los valores mayores que cero reflejan un efecto inhibidor. Aquí, los valores en torno a 1 indican un efecto inhibidor igualmente grande que el de las mediciones de los controles positivos en una placa dada.
En los positivos primarios se comprobó la inhibición dependiente de la dosis sobre la asociación entre PrPC y PrPSc mediante el uso de seis series de diluciones por duplicado (de 0,1 a 100 pM) de cada compuesto en el ensayo por SIFT. Las curvas de respuesta de la dosis confirmaron la actividad inhibidora dependiente de la concentración que presentaban estos compuestos. En comparación con el efecto de DOSPA a 17 pM, la inhibición semimáxima de la fijación de rPrP a los cilindrod con los priones se observó a valores de CE50 en el margen de 0,3 a 60 pM.
Positivos primarios por cultivo celular y validación mediante diluciones seriadas
Además del ensayo por SIFT, las colecciones de DIVERSet también se cribaron en modelos de cultivo celular de enfermedades causadas por los priones. En estos ensayos, la actividad antipriónica de los compuestos de DIVERSet se analizó inicialmente a una concentración de 20 pM. Los resultados del cribado primario del cultivo de células (en las células SMB a 20 pM) están codificados por una variable binaria (tp3_reduktion), donde un valor de “1,0” codifica “activo” y “0,0” codifica “inactivo”. Se validaron los compuestos activos identificados en el cribado primario, en donde el objetivo era identificar los compuestos activos incluso a concentraciones muy bajas. La verificación de los positivos primarios de los cultivos celulares se realizó en series de diluciones a cuatro concentraciones (1 pM, 4 pM, 10 pM, 40 pM) para DIVERSet 1 y solo a dos concentraciones (0,2 pM, 2 pM) para DIVERSet 2. Los resultados (tp3_reduktion_mue) se anotan mediante “1,0” para activo a 1 pM (DS1) o a 0,2 pM (DS2) y mediante “0,5” para activo a 2 pM (DS2). Los compuestos inactivos a concentraciones por encima de 20 pM se anotan mediante “0,0” (DS1 2). Además, los positivos primarios del cultivo de las células SMB se validaron a concentraciones únicas en las células ScN2a (tp3_scn2a), donde de nuevo “0,0” y “1,0” señalan los compuestos inactivos y activos, respectivamente.
Difenilpirazoles (DPP) y compuestos relacionados a modo de compuestos antipriónicos nuevos
Generación del mapa de REA
Los compuestos de DIVERSet caracterizados como “activos” en el cribado primario del cultivo de células se sometieron a un análisis de aglomeración con el uso del paquete informático Benchware HTS DataMiner (DM; Tripos Inc., St. Louis, MO, EE. UU.) que da lugar al mapa de REA que se muestra en la figura 1. Ya que la gran cantidad de compuestos contenidos en las dos colecciones (20 000) es demasiado grande como un punto de partida para el análisis de aglomeración utilizando DataMiner, el análisis se limitó inicialmente a los positivos primarios (837 compuestos) del cribado en cultivo de células de DIVERSet 1 y 2. Así pues, los aglomerados se determinaron solo para los compuestos activos. Aquí, el programa DataMiner agrupó en aglomerados los compuestos que tenían similitud estructural y eran activos, y es, por lo tanto, idóneo para identificar nuevas estructuras prototípicas potencialmente relevantes. En una segunda etapa, la clasificación así establecida se aplicó al resto de la colección que cubre los compuestos inactivos en el cultivo celular. Aquí, el programa DataMiner añadió más compuestos (inactivos) a las aglomeraciones generadas, si la medición empleada indicaba una similitud estructural elevada.
El resultado del análisis de aglomeración se muestra gráficamente mediante DataMiner en forma de un mapa de REA, en el cual las aglomeraciones de sustancias S están representadas mediante símbolos. El DataMiner ordena los símbolos de tal manera que están localizados cerca si las aglomeraciones representadas son similares desde el punto de vista estructural. El tamaño, la forma y el color de los símbolos está distribuido en función las propiedades específicas de la aglomeración, y los puede seleccionar el usuario.
Así pues, se seleccionó que el tamaño de los símbolos es proporcional al tamaño de la aglomeración |S|, a saber, al número de compuestos C contenidos en esta. La forma de los símbolos se determinó en función de la fracción
Figure imgf000023_0001
de dichas sustancias C en las correspondientes aglomeraciones S, cuya actividad primaria a(C) que se determinó según el cribado por SIFT estaba por encima de un umbral seleccionado de amin = 0,25. Así pues, las aglomeraciones cuya fracción Psift(S) está por encima del 50% se muestran como estrellas mientras que el resto, principalmente aglomeraciones inactivas, se muestran como cuadrados. De manera análoga, el color de los símbolos codifica las fracciones de las aglomeraciones
Figure imgf000023_0002
de acuerdo con los positivos primarios del cribado basado en el cultivo celular, en donde los símbolos de las aglomeraciones con más del 50% de sustancias activas son rojas y las aglomeraciones restantes son grises. En la figura 1 se muestra el mapa de REA que se obtiene del análisis de aglomeración descrito más arriba. Las estrellas rojas grandes simbolizan las aglomeraciones con una alta proporción de sustancias positivas por SIFT y en el cultivo celular. Estas aglomeraciones representan las posibles estructuras prototípicas. Con el DataMiner, las aglomeraciones de interés se analizaron adicionalmente y se identificó un grupo de cinco aglomeraciones vecinas (denominadas DPP_1 a DPP_5), que se muestran en la figura 1 en negrita. Todos los compuestos clasificados en estas aglomeraciones se muestran en la figura 2 junto con su actividad en los diferentes ensayos. El hecho de que estas aglomeraciones estén localizadas en una posición cercana las unas con las otras indica que contienen sustancias que tienen una estructura similar, a saber, todos pertenecen a la clase de compuestos químicos de derivados del 3,5-difenilpirazol (DPP) (compárese con el motivo de DPP que se muestra en la figura 1).
Ejemplo 2: Síntesis de nuevos fármacos para inhibir la agregación bajo los aspectos médico-químicos
Sobre la base del descubrimiento de la nueva estructura prototípica que se describió más arriba, se sintetizaron una serie de sustancias adicionales mediante la sustitución selectiva de diferentes sustituyentes, tal y como se esboza más abajo. En lo que viene a continuación, los compuestos que no caen dentro del alcance de las reivindicaciones se han de considerar como compuestos de referencia.
Esquema 1: Síntesis de isoxazoles
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(E)-1-(3,4-Dimetoxifenil)-3-(3-fluorofenil)-2-propeno-1-ona (1) [Nam et al., 2004]
Se agitó a temperatura ambiente durante 24 h una solución de 3,4-dimetoxiacetofenona (1,8 g, 10 mmol), 3-fluorobenzadehído (1,24 g, 10 mmol), NaOH (50 mg, 1,25 mmol) y Ba(OH)2 8^H2O (100 mg, 0,32 mmol) en metanol (10 ml). La reacción se enfrió a 4 °C, lo que dio lugar a que el precipitado se recogiese por filtración, se retrocristalizara a partir de metanol y se secara para producir 1 (1,65 g, 58%) como un polvo amarillento.
2,3-Dibromo-1-(3,4-dimetoxifenil)-3-(3-fluorofenil)-propán-1-ona (2) [Harris et al., 1977]
A una solución de 1 (715 mg, 2,5 mmol) en cloroformo (11 ml) se le añadió gota a gota una solución de bromo (400 mg, 2,5 mmol) en cloroformo (4 ml) a 0 °C. Después de agitarla durante 2 h a 0 °C, la reacción se diluyó con bencina de petróleo (20 ml) y la mezcla se refrigeró (-24 °C) durante 10 horas, tras lo cual el precipitado se recogió por filtración, se lavó con n-hexano (10 ml) y se secó para dar 2 (780 mg, 70%) como un polvo blanco.
3-(3,4-Dimetoxifenil)-5-(3-fluorofenil)isoxazol (3) [Harris et al., 1977]
A una solución de 2 (450 mg, 1 mmol) en etanol (6 ml) se la trató con hidrocloruro de hidroxilamina (306 mg, 4,4 mmol) seguido de una solución de NaOH (460 mg, 11,5 mmol) en agua (1,5 ml). La mezcla se calentó a reflujo durante 2 h, se enfrió y se trató con agua (3 ml). Después de la refrigeración (4 °C) durante una noche, el producto se recogió por filtración, se lavó con agua (5 ml) y se secó para dar 3 (180 mg, 60%) como un polvo blanco.
3-(3,4-Dihidroxifenil)-5-(3-fluorofenil)isoxazol (4) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 3 (100 mg, 0,33 mmol) en diclorometano (5 ml) se enfrió a -78 °C tratada con tibromuro de boro (0,16 ml, 1,7 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de la agitación durante 3 h a temperatura ambiente, los disolventes se evaporaron a presión reducida, y el residuo se coevaporó cuatro veces con metanol (10 ml). El precipitado resultante se sometió a reflujo en 5 ml de cloroformo, después de enfriar el producto, se recogió por filtración y se secó para dar 4 (60 mg, 67%) como un polvo blanco.
Esquema 2: Síntesis de pirazoles
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Una suspensión al 60% de hidruro de sodio en aceite mineral (0,4 g, 10 mmol) se lavó con bencina de petróleo (20 ml) dos veces, y se le añadió DMSO anhidro (10 ml). Después de la agitación durante 30 min a temperatura ambiente en argón, se le añadió THF (5 ml), se enfrió el matraz a 15 °C y se le añadió 3,4-dimetoxibenzoato (2,1 g, 10 mmol). La temperatura se dejó descender hasta 10 °C y se le añadió una solución de 3,4-dimetoxiacetofenona (1,08 g, 6 mmol) en DMSO (4 ml) a tal velocidad que la temperatura no aumentó por encima de los 15 °C. Después de completar la adición, la mezcla de reacción se agitó 72 h a temperatura ambiente, y a continuación se vertió lentamente en hielo picado (250 g) que contenía ácido fosfórico al 85% (1 ml). El precipitado resultante se recogió por filtración, se lavó con agua (50 ml) y se secó para dar 5 (2,1 g, 99%) como un polvo amarillento.
3,5-Bis(3,4-dimetoxifenil)pirazol (6) [Hauser et al., 1957]
Una solución de 5 (1,0 g, 2,9 mmol) e hidrato de hidrazina (218 mg, 4,4 mmol) en etanol (15 ml) se calentó a reflujo durante 3 h con agitación. La solución amarilla transparente se evaporó a presión reducida, se le añadió agua y el precipitado resultante se recogió por filtración, se lavó con agua y se secó para dar 6 (960 mg, 97%) como un polvo amarillento.
Hidrobromuro de 3,5-bis(3,4-dihidroxifenil)pirazol (7) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 6 (120 mg, 0,35 mmol) en diclorometano (5 ml) se enfrió a -78 °C, se trató con tribromuro de boro (0,34 ml, 3,5 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de la agitación durante 3 h a temperatura ambiente, los solventes se evaporaron a presión reducida, y el residuo se coevaporó cuatro veces con metanol (10 ml). El precipitado resultante se sometió a reflujo en 5 ml de cloroformo, después de enfriar el producto, se recogió por filtración y se secó para dar 7 (108 mg, 85%) como un polvo amarillo.
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1-(1,3-Benzodioxol-5-il)-3-(3-bromofenil)-propán-1,3-diona (21) [Anselme, 1967]
1. Procedimiento
Un matraz de tres cuellos de 500 ml seco se equipó con una barra de agitación magnética revestida con Teflon®, un tabique de goma, un termómetro y un condensador de reflujo al cual estaba unido un tubo de tipo T conectado a una fuente de nitrógeno puro. La junta restante del tubo T estaba conectada a un dispositivo de burbujeo de tal manera que la tasa de flujo del nitrógeno se puede observar a lo largo de la reacción. El aparato está organizado de tal manera que el matraz se puede enfriar intermitentemente con un baño de María. Después de que el recipiente de reacción se haya enjuagado con nitrógeno, se mantiene en el recipiente de reacción una atmósfera de nitrógeno estática durante el resto de la reacción. El matraz de carga con aproximadamente el 60% de la dispersión de hidruro de sodio (5 g, 0. 125 mol) en aceite mineral (nota 1). El aceite mineral se lava desde el hidruro con bencina de petróleo 40/60 (3 * 40 ml) (nota 2). La capa de bencina de petróleo del sobrenadante se retira mediante el uso de una jeringuilla hipodérmica con conector Luer-lock con una aguja de acero inoxidable insertada a través del tabique de goma. El hidruro de sodio residual se mezcla con 80 ml de sulfóxido de dimetilo (nota 3) y el tabique de goma se remplaza por un embudo de goteo igualador de la presión. Una solución de 16,4 g (0,1 mol) de 1-(1,3-benzodioxol-5-il)etanona (nota 4) y 26,9 g (0,125 mol) de 3-bromobenzoato de metilo (nota 5) en 60 ml de sulfóxido de dimetilo se coloca en el embudo de goteo. El embudo se tapa, se comienza la agitación y el contenido del matraz se enfría en un baño de María a 15 °C. Se le añade lentamente la solución de 1-(1,3-benzodioxol-5-il)etanona y 3-bromobenzoato de metilo de tal manera que la evolución del hidrógeno se mantiene a una velocidad controlable y la temperatura no aumenta por encima de 20 °C durante un periodo de 60 minutos (nota 6). Se retira el baño una vez completada la adición, y la mezcla de reacción se agita a temperatura ambiente (23 °C) durante 15 horas. La mezcla de reacción homogénea resultante de color rojo oscuro se vierte lentamente en 500 ml de hielo y agua que contiene 5 ml de ácido ortofosfórico al 85% (nota 7) con agitación. Al cabo de 1 hora de agitación, el producto se retira por filtración (nota 8), se lava por filtración con succión con agua (2 * 100 ml) y se seca al vacío hasta que el peso es constante a 40 °C durante 6 horas para dar 34,4 g del producto bruto (nota 9). Se retrocristaliza desde 200 ml de etanol al 99,9% y 200 ml de acetato de etilo (nota 10) y se seca al vacío hasta que el peso es constante a 40 °C durante 6 horas da 28,5 g (rendimiento del 82%) de 1-(1,3-benzodioxol-5-il)-3-(3-bromofenil)propano-1,3-diona pura (nota 11), p. f. 136-137 °C. El filtrado se concentra a presión reducida hasta un volumen de aproximadamente 30 ml, el sólido cristalino que se separa se recoge en un filtro, se lava por filtración con succión con etanol (2 * 10 ml) y se seca al vacío hasta que el peso es constante a 40 °C durante 6 horas, lo que produce una masa adicional (3,15 g) del producto bruto. El producto bruto se retrocristaliza dos veces desde 20 ml de etanol al 99,9% y 20 ml de acetato de etilo, y se seca al vacío hasta que el peso es constante a 40 °C durante 6 horas para dar 1,8 g adicionales (rendimiento del 5%) de 1-(1,3-benzodioxol-5-il)-3-(3-bromofenil)propano-1,3-diona pura (nota 12). El rendimiento total del producto es de 30,3 g (87%).
2. Notas
1. Se utilizó hidruro de sodio, dispersión de aceite al 57-63%, número de orden 13431 disponible de Alfa Aesar GmbH & Co KG, Karlsruhe.
2. Se utilizó bencina de petróleo de calidad para el análisis, el hervido oscila entre 40-60 °C, número de orden 101775 de Merk KGaA, Darmstadt.
3. Se utilizó sin más purificación sulfóxido de dimetilo de calidad para el análisis, número de orden 102952 de Merck KGaA, Darmstadt.
4. Se utilizó 1-(1,3-benzodioxol-5-il)etanona, 98%, número de orden A13597 disponible de Alfa Aesar GmbH & Co KG, Karlsruhe.
5. Se utilizó 3-bromobenzoato de metilo, 98%+, número de orden A16174 disponible de Alfa Aesar GmbH & Co KG, Karlsruhe.
6. Se observa la formación de espuma durante la adición de la solución. El uso del agitador mecánico y un antiespumante, como el éter de polietilenglicol y dimetilo, puede ser necesario cuando se escale.
7. Se utilizó ácido ortofosfórico, 85% (p/p) en solución acuosa, de calidad para el análisis, número de orden 100573 de Merck KGaA Darmstadt.
8. El valor del pH de la mezcla de reacción es pH = 7. Mediante la acidificación con 15 ml más de ácido ortofosfórico a pH = 2, se pueden obtener 1,3 g de ácido 3-bromobenzoico.
9. La pureza del producto que se determinó por HPLC es del 96,3%.
10. Se utilizó etanol al 99,9% absoluto, de calidad para análisis, número de orden 100983 y acetato de etilo de calidad para análisis, número de orden 109623 disponibles de Merck KGaA, Darmstadt.
11. La pureza del producto determinada por HPLC es del 99,3%. La HPLC analítica se realiza con un sistema de HPLC de Waters con un detector de fotodiodos ordenados Waters 996. Todas las separaciones implicaban una fase móvil de ácido trifluoroacético (TFA) al 0,1% (p/p) en agua (solvente A) y TFA al 0,1% (v/v) en acetonitrilo (solvente B) mediante el uso de una columna de fase inversa (RP) Eurospher RP 18, 100 A, 5 pm, 250 * 4,6 mm a una velocidad de flujo de 1 ml/min. El compuesto se disolvió en acetonitrilo de calidad para HPLC a una concentración de 1 mg/ml. Los picos con los tiempos de retención (TR) 20,9 y 10,3 son las formas enol y ceto, respectivamente, del ANLE 138A. La reinyección de los picos recogidos por separado de 20,9 y 10,3 min da de nuevo los mismos dos picos con los mismos TR.
12. La pureza del producto determinada por HPLC es del 98,4%.
3-(1,3-Benzodioxol-5-il)-5-(3-bromofenil)-1H-pirazol (22) [Hauser et al., 1957]
1. Procedimiento
Una mezcla de 28,4 g (81,8 mmol) de 1-(1,3-benzodioxol-5-il)-3-(3-bromofenil)propano-1,3-diona (nota 1) y 200 ml de alcohol de n-butilo (nota 2) se coloca en un matraz con fondo redondo de 500 ml equipado con una barra de agitación magnética revestida de Teflon®, un condensador de reflujo y un manto de calentamiento eléctrico. Se comienza la agitación y el calentamiento, se le añaden 6 ml (6,2 g, 123,4 mmol) de monohidrato de hidrazina (nota 3) después de la disolución del sólido y la mezcla de reacción se calienta a reflujo con agitación durante 4 horas. La mezcla de reacción se enfría a 20 °C, se almacena 1 hora 0 °C y el producto que se separa se recoge por filtración con succión. El lavado con agua (100 ml) y el secado al vacío hasta alcanzar una masa constante a 40 °C durante 36 horas da 26,8 g (rendimiento del 95%) de 3-(1,3-benzodioxol-5-il-5-(3-bromofenil)-1H-pirazol (nota 4), punto de fusión 195-197 °C.
2. Notas
1. El 1-(1,3-benzodioxol-5-il)-3-(3-bromofenil)propano-1,3-diona se prepara de acuerdo con el protocolo para ANLE 138A.
2. Se utilizó el alcohol de n-butilo, 99,4% de calidad “Baker analyzed™”, número de orden 8017 disponible de J. T. Baker B. V., Deventer, Holanda.
3. Se utilizó el monohidrato de hidrazina, de calidad pura, número de orden 53850 disponible de Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen.
4. La pureza del producto determinada por HPLC es del 99,3%. La HPLC analítica se realiza con un sistema de HPLC de Waters con un detector de fotodiodos ordenados Waters 996. Todas las separaciones implicaron una fase móvil de ácido trifluoroacético (TFA) al 0,1% (v/v) en agua (solvente A) y TFA al 0,1% (v/v) en acetonitrilo (solvente B) con el uso de una columna de fase inversa (RP) Eurospher RP 18, 100 A, 5 pm, 250 * 4,6 mm a una velocidad de flujo de 1 ml/min. El compuesto se disuelve en acetonitrilo de calidad para HPLC a una concentración de 1 mg/ml.
Esquema 3: Síntesis de imidazoles
Figure imgf000027_0001
4-(3,4-Dimetoxifenil)-2-fenilimidazol (8) [Li et al., 2000]
Se calentó a reflujo una mezcla de hidrocloruro de benzamidina (313 mg, 2 mmol) y bicarbonato de sodio (672 mg, 8 mmol) en THF (6 ml) y agua (1,5 ml). Se le añadió una solución de a-bromo-3,4-dimetoxiacetofenona (518 mg, 2 mmol) en THF (1,5 ml) durante un periodo de 30 min, mientras se mantenía la reacción a reflujo. Después de la adición, la reacción se calentó a reflujo durante 2 h, y el THF se evaporó a presión reducida. Se le añadió acetato de etilo (20 ml) a la mezcla, se separó la fase orgánica, se lavó con salmuera (5 ml), se secó con sulfato de sodio y se evaporó a presión reducida. El producto bruto resultante se purificó por cromatografía en columna de gel de sílice (cloroformo/metanol 100:1) para dar 8 (470 mg, 84%) como un sólido.
Hidrobromuro de 4-(3,4-dihidroxifenil)-2-fenilimidazol (9) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 8 (190 mg, 0,68 mmol) en diclorometano (5 ml) se enfrió a -78 °C, se trató con tribromuro de boro (0,32 ml, 3,4 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de agitar durante 3 h a temperatura ambiente, los solventes se evaporaron a presión reducida, y el residuo se coevaporó cuatro veces con metanol (10 ml). El precipitado resultante se sometió a reflujo en 5 ml de cloroformo y, después de enfriarlo, el producto se recogió por filtración y se secó para dar 9 (192 mg, 85%) como un polvo.
Esquema 4: Síntesis de pirroles
Figure imgf000027_0002
(E)-1-Fenil)-3-(3,4-dimetoxifenil)-2-propeno-1-ona (10)
El compuesto 10 se preparó de acuerdo con el procedimiento descrito para la preparación de 1. Rendimiento del 90%.
3- (3,4-Dimetoxifenil)-4-nitro-1-fenilbután-1-ona (11) [Hall et al., 2005]
Una solución de 10 (774 mg, 2,9 mmol) en MeOH (30 ml) se trató con dietilamina (1,55 ml, 15 mmol) y nitrometano (0,81 ml, 15 mmol) y se calentó a reflujo durante 24 h. La solución se enfrió, se repartió entre diclorometano (60 ml) y agua (50 ml), y se acidificó con ácido clorhídrico a 1 M. Se separó la capa orgánica, y se extrajo la capa acuosa con diclorometano (20 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (50 ml) y salmuera (50 ml), y se secaron con sulfato de sodio. El solvente se retiró a presión reducida y el aceite resultante se purificó por cromatografía en columna de un gel de sílice (n-hexano/acetato de etilo 3:2) para dar 11 (780 mg, 82%) como un sólido.
4- (3,4-Dimetoxifenil)-1 -fenilpirrol (12) [Hall et al, 2005]
Una solución agitada de 11 (400 mg, 1,22 mmol) en metanol (13 ml) y THF (26 ml) a temperatura ambiente se trató con hidróxido de potasio (343 mg, 6,1 mmol). Al cabo de 1 h, la mezcla de reacción se añadió gota a gota a una solución de ácido sulfúrico (2,44 ml) en metanol (13 ml) a 0 °C y se agitó 1 h a temperatura ambiente. Se le añadieron agua (20 ml) y hielo (20 ml), y la mezcla se neutralizó con hidróxido de sodio acuoso a 1 M y se extrajo con diclorometano (2 x 50 ml). Las fracciones orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (25 ml), se secaron sobre sulfato de sodio y se evaporaron a presión reducida. El aceite resultante se trató con ácido acético (8 ml) y cloruro de amonio (470 mg), y la solución se calentó a 100 °C durante 1 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se le añadió hielo (50 ml) y la mezcla se neutralizó con hidróxido de sodio acuoso a 1 M. La solución se extrajo con diclorometano (2 x 50 ml). Las fracciones orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (25 ml), se secaron sobre sulfato de sodio y se evaporaron a presión reducida. El producto bruto se purificó por cromatografía en columna de gel de sílice (nhexano/acetato de etilo 3:1) y a continuación se retrocristalizó a partir de una mezcla de n-hexano/acetato de etilo (2:1) para dar 12 (150 mg, 44%) como un sólido.
4-(3,4-Dihidroxifenil)-1 -fenilpirrol (13) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 12 (80 mg, 0,29 mmol) en diclorometano (5 ml) se enfrió a -78 °C, se trató con tribromuro de boro (0,13 ml, 1,4 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de la agitación durante 3 h a temperatura ambiente, los solventes se evaporaron a presión reducida, y el residuo se coevaporó cuatro veces con metanol (10 ml). El producto bruto resultante se purificó por cromatografía en columna de gel de sílice (cloroformo/metanol 95:5) y a continuación se retrocristalizó desde cloroformo con unas pocas gotas de acetonitrilo para dar 13 (36 mg, 50%) como un sólido.
Esquema 5: Síntesis de pirazolinas
Figure imgf000028_0001
3-(3,4-Dimetoxifenil)-5-(3-fluorofenil)-4,5-dihidro-1H-pirazol (14)
Una suspensión de 1 (57 mg, 0,2 mmol) e hidrato de hidrazina (0,5 ml, 10 mmol) en agua (0,14 ml) se calentó a 100 °C durante 1,5 h con agitación. Se enfrió la mezcla de reacción, se le añadió agua (0,2 ml) y el precipitado resultante se recogió por filtración, se lavó con agua y se secó para dar 14 (37 mg, 62%) como un sólido blanco.
Esquema 6: Síntesis de N-Ac-pirazolinas
Figure imgf000028_0002
(E)-1-(3,4-Met¡lend¡ox¡fen¡l)-3-fen¡l-2-propeno-1-ona (15)
El compuesto 15 se preparó de acuerdo con el procedimiento descrito para la preparación de 1. Rendimiento del 64%.
1-Acetil-3-(3,4-metilendioxifenil)-5-fenil-4,5-dihidropirazol (16) [Chimenti et al., 2004]
Una solución de 15 (504 mg, 2 mmol) e hidrato de hidrazina (250 mg, 5 mmol) en ácido acético (12 ml) se calentó a 120 °C durante 24 h con agitación. La mezcla de reacción se enfrió, se le añadió agua fría (40 ml) y el precipitado resultante se recogió por filtración, se retrocristalizó a partir de etanol y se secó para dar 16 (458 mg, 74%) como un sólido blanco.
1-Acetil-3-(3,4-dihidroxifenil)-5-fenil-4,5-dihidropirazol (17) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 17 (70 mg, 0,23 mmol) en diclorometano (3 ml) se enfrió a -78 °C, se trató con tribromuro de boro (0,11 ml, 1,16 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de la agitación durante 3 h a temperatura ambiente, los solventes se evaporaron a presión reducida, y se coevaporó el residuo cuatro veces con metanol (10 ml). El producto bruto resultante se purificó por cromatografía en columna de gel de sílice (n-hexano/acetato de etilo 1:1) para dar 17 (25 mg, 37%) como un sólido.
Esquema 7: Síntesis de 1,2,4-oxadiazoles
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3,4-Dimetoxibenzamidoxima (18) [Chalquest, 2001]
Una solución de 3,4-dimetoxibenzonitrilo (4,0 g, 24,5 mmol), hidrocloruro de hidroxilamina (2,0 g, 28,8 mmol), N,N-diisopropiletilamina (5,0 ml, 29,2 mmol) en etanol (70 ml) se agitó a temperatura ambiente durante 48 h. El etanol se evaporó a presión reducida, se le añadió agua fría (60 ml) y el precipitado resultante se recogió por filtración y se secó para dar 18 (3,4 g, 71%) como un polvo blanco.
3,5-Bis-(3,4-dimetoxifenil)-1,2,4-oxadiazol (19) [Korbonits, 1982]
A una solución de 18 (700 mg, 3,57 mmol) y 3,4-dimetoxibenzoato de etilo (834 mg, 3,97 mmol) en etanol (12 ml), se le añadió ferf-butóxido de potasio (425 mg, 3,79 mmol) y la mezcla de reacción se calentó a reflujo durante 12 h. La mezcla se enfrió y el precipitado se recogió por filtración, se lavó con etanol caliente y se secó para dar 19 (540 mg, 44%) como un polvo blanco.
Hidrobromuro de 3,5,-bis-(3,4-dihidroxifenil)-1,2,4-oxadiazol (20) [Vanelle et al., 2000]
Una solución de 19 (220 mg, 0,64 mmol) en diclorometano (6 ml) se enfrió a -78 °C, se trató con tribromuro de boro (0,59 ml, 6,1 mmol), se agitó a -78 °C durante 3 h y a continuación durante una noche a temperatura ambiente. La mezcla se enfrió a -78 °C y se paró con metanol (5 ml). Después de la agitación durante 3 h a temperatura ambiente, los solventes se evaporaron a presión reducida, y el residuo se coevaporó cuatro veces con metanol (10 ml). El precipitado resultante se sometió a reflujo en 5 ml de cloroformo, después de enfriarlo, se recogió el producto por filtración y se secó para dar 20 (190 mg, 81%) como un polvo.
Los ejemplos de más arriba representan ejemplos de cómo sintetizar o modificar los compuestos deseados. Los compuestos restantes mostrados en la figura 3 se sintetizaron de acuerdo con esto. Estas sustancias sintetizadas por medios químicos, junto con las sustancias seleccionadas del cribado inicial, se sometieron a más análisis, entre ellos ensayos de SIFT, ensayos basados en cultivo de células, experimentos in vivo con ratones, así como ensayos bioquímicos dirigidos a la agregación de la a-sinucleína (véase más abajo). En la figura 3 se da a conocer una lista de las sustancias analizadas.
Ejemplo 3: Material y métodos utilizados
Colecciones de compuestos
Las colecciones cribadas contienen 10000 compuestos cada una y las llamamos DIVERSet 1 y DIVERSet 2 porque cubren solo una parte de la colección DIVERSet más grande (ChemBridge Corp., San Diego, CA). DIVERSet es una colección de moléculas pequeñas diferentes de tipo fármaco, seleccionadas con criterios racionales. Los compuestos se suministraron en una solución de sulfóxido de dimetilo (DMSO) y en placas de microtitulación de 96 pocillos. Una base de datos que contiene estructuras moleculares y algunos datos físico-químicos para cada uno de los compuestos está disponible en www.chembridge.cam.
Producción de PrP 23-231 recombinante de ratón
Se produjo la PrP 23-231 recombinante y se purificó esencialmente como está descrito en Liemann et al., (1998), salvo que, para la expresión en bacterias, las células de E. coli BL21DE3 RIL (Novagen) se transformaron con el plásmido pET17b-MmPrP23-231WT31 para la PrP 23-231 de ratón. De igual forma, las bacterias se hicieron crecer hasta una densidad óptica de 0,5 antes de inducir la producción de la proteína con la adición de IPTG a 1 mM, y las células se recogieron dos horas después. A continuación, se lisaron las bacterias con la adición de Triton X-100 al 0,5% al tampón de lisis y la incubación durante 30 min a 37 °C en vez de utilizar una prensa francesa. Además, la filtración en gel fue remplazada por una etapa de cromatografía de afinidad con quelatos de níquel. También se omitió la etapa final de cromatografía de intercambio de cationes después del replegamiento.
En concreto, la PrP previamente purificada por cromatografía de intercambio iónico se sometió a la oxidación tal y como está descrito, y la oxidación se terminó con la adición de EDTA a 0,1 mM y el ajuste del pH a aproximadamente 6. Después de la adición de NiCh a 0,1 mM, hasta 50 mg de PrP se aplicaron a 2 ml de la Sepharose quelante (Pharmacia), cargada previamente con NiCh de acuerdo con las recomendaciones de los fabricantes, y se equilibró previamente con el tampón A (urea a 8 M, MOPS a 10 mM, pH 7,0). La fijación de la PrP a la matriz de Ni-quelato se realizó durante al menos 3 h a temperatura ambiente mediante la inversión continua de la mezcla. Se transfirió la matriz a una columna Polyprep (BioRad) y se drenó con circulación directa. La columna se lavó dos veces con 5 ml del tampón B (urea a 8 M, MOPS a 10 mM, pH 7,0, NaCl a 500 mM) y a continuación se eluyó secuencialmente con 6 x 5 ml del tampón D (urea a 7,2 M, MOPS a 10 mM, pH 7,0, NaCl a 150 mM, imidazol a 50 mM). Se agruparon las fracciones que contenían la PrP purificada, se concentraron con un dispositivo centriprep y finalmente se diluyeron a 1:50 para volverlas a plegar en MES a 10 mM, pH 6,0.
Marcación fluorescente de anticuerpos y PrP recombinante
El anticuerpo monoclonal L42 (r-biopharm, Darmstadt, Alemania) se marcó con Alexa Fluor 647 (Alexa-647; Invitrogen, Eugene) de acuerdo con el manual del fabricante. La PrP 23-231 recombinante de ratón se marcó con Alexa Fluor 488 (Alexa-488; Invitrogen, Eugene) en el tampón de fosfato de potasio a 20 mM, pH 6 , Nonidet P40 al 0,1%, tampón de bicarbonato de sodio a 40 mM, pH 8,3. Los fluoróforos sin fijar se separaron por filtración en gel con columnas PD10 (GE Healthcare, Freigburg, Alemania) equilibradas con el tampón de fosfato de potasio a 20 mM, pH 6 , Nonidet P40 al 0,1%. El control de calidad de la reacción y la razón de marcación se realizó mediante mediciones de espectroscopia de correlación de fluorescencia (FCS) en un lector Insight (Evotec Technologies, Hamburgo, Alemania). La razón de marcación fue de aproximadamente 1,3 fluoróforos por molécula de rPrP.
Ensayo para la asociación entre PrPC y PrPSc
Se preparó la PrPSc del cerebro de pacientes con ECJ de acuerdo con Safar et al., (Safar et al., (1998)) y alícuotas del sedimento final resuspendidas en la solución de PBS 1* más sarcosil al 0,1% se diluyeron cinco veces en el tampón A (tampón de fosfato de potasio a 20 mM a pH 6,0, Nonidet P40 al 0,1%) y se trataron con ultrasonidos en un homogeneizador ultrasónico de baño de María durante 60 s. Después de la centrifugación a 1000 rpm durante 1 min, el sobrenadante se diluyó 100 veces en el tampón A para el ensayo.
Una mezcla de rPrP de ratón marcada y del anticuerpo monoclonal L42 marcado se preparó en el tampón de fosfato de potasio a 20 mM, pH 6, Nonidet P40 al 0,1%, para que las moléculas marcadas fueran aproximadamente igual de abundantes a 2-6 nM. En un volumen de ensayo de 20 pl, se mezclaron 8 pl de la mezcla rPrP/anticuerpo, 2 pl del compuesto y 10 pl de la preparación de PrPSc diluida. Las muestras se cargaron en placas de 96 pocillos con un fondo de cubreobjetos de cristal (Evotec-Technologies, Hamburgo, Alemania) y se midió en un lector Insight.
Medición y análisis de partículas sueltas
Las mediciones de FIDA se realizaron a energías de excitación de 200 pW para el láser de 488 nm y de 300 pW para el láser de 633 nm. Los parámetros de barrido se establecieron en una longitud de paso del barrido de 100 pm, frecuencia del haz de barrido de 50 Hz, y movimiento del soporte de posicionamiento de 2000 pm. El tiempo de medición fue de 10 s. La fluorescencia desde los dos fluoróforos se grabó por separado con detectores de fotones sueltos, y los fotones se sumaron en intervalos de tiempo de longitud constante (compartimentos) con el uso de una longitud de compartimento de 40 ps. Se midió el número de fotones fluorescentes rojos y verdes, y se analizó en un histograma de distribución de intensidad bidimensional, tal y como se describió anteriormente (Bieschke et al., 2000).
Los datos de intensidad de la fluorescencia se evaluaron con un módulo del programa informático 2D-SIFT (Evotec-Technologies, Hamburgo, Alemania) al sumar los compartimentos de alta intensidad en los sectores. Los valores de corte para las intensidades de los compartimentos para cada serie de mediciones se ajustaron manualmente de acuerdo con las mediciones de control.
Ejemplo 4: Aplicación terapéutica de los posibles nuevos compuestos antipriónicos en los ratones infectados con la cepa de la tembladera de las ovejas transcurridos 80 días desde la infección
Para demostrar la eficacia de estos nuevos posibles compuestos antipriónicos a la hora de combatir las encefalopatías espongiformes transmisibles (EET) o las enfermedades causadas por los priones, se realizaron experimentos con animales, en los que los compuestos que tienen actividad antipriónica en el SIFT y/o en el análisis de cultivo de células con la tembladera de las ovejas se utilizaron para tratar los ratones infectados con la cepa RML de la tembladera de las ovejas en una etapa tardía del periodo de incubación. Elegimos la aplicación intraperitoneal de los compuestos en un intervalo de tiempo de 14 días 80 días después de la infección porque es típicamente el momento en el que aparecen los primeros síntomas subclínicos en los animales infectados con esta cepa de prión. Esto correspondería al tiempo más temprano en el que un humano afectado con EET que muestra los primeros síntomas de la enfermad recibiría realmente un tratamiento terapéutico. Al elegir estas condiciones muy rigurosas para el tratamiento, quisimos valorar la funcionalidad de los compuestos analizados como tratamientos contra los priones en un contexto realista. Típicamente, los tratamientos de las EET hasta la fecha solo se han analizado por la profilaxis tras la exposición en los experimentos con animales, cuando se aplican en torno al momento de infección con los priones. En la vida real, hay muy pocas ocasiones en las que tal tratamiento terapéutico es factible para los individuos afectados con EET. Para la mayoría de los pacientes con EET, se desconoce y no se pueden detectar el momento de la infección o el comienzo del tiempo de incubación para los casos familiares y esporádicos (que son la inmensa mayoría). Por lo tanto, la mayoría de los pacientes con EET solo podrán recibir el tratamiento después de la aparición de los primeros síntomas de las EET.
Procedimientos experimentales:
Las ratonas C57BI6 hembra de 6 a 7 semanas de edad se inocularon con la cepa RML de la tembladera de las ovejas mediante una inyección intracerebral con 30 pl del homogeneizado estéril de cerebro al 1% en solución salina tamponada con fosfato (PBS) de los ratones enfermos terminales con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. A los 80 días de la infección, estos ratones se trataron con una selección de los posibles compuestos antipriónicos nuevos o con el vehículo acuoso sulfóxido de dimetilo (DMSO). Cinco posibles compuestos antipriónicos se han seleccionado de acuerdo con su actividad antipriónica en un modelo de cultivo celular para este tratamiento, que se denominaron 10353F11 de acuerdo con la posición de la placa en la colección de compuestos químicos DIVERSet (Chembridge Corp., San Diego, EE. UU.) y anle138b, anle143b, sery106 y sery149. El tratamiento con estos compuestos se realizó durante 14 días consecutivos mediante inyección por vía intraperitoneal de 50 pl al día de la dilución del compuesto 10353F11 con los correspondientes 25 pl de los otros compuestos en el vehículo (DMSO). Se utilizó el compuesto 10353F11 a una concentración de 10 mM y para los compuestos anle138b, anle143b, sery106 y sery149, se inyectaron a 100 mM a lo largo de todo el periodo. Los cuidadores de animales con la formación correspondiente vigilaron en los animales todos los días los signos de la enfermedad a partir del día 80 de la infección. Se sacrificaron los animales cuando habían alcanzado la etapa terminal de la enfermedad, marcada por los síntomas clínicos, que son ataxia, temblores, dificultad para ponerse de pie desde una posición en la que yacen sobre la espalda y rigidez de la cola, y estaban moribundos. Típicamente, el progreso de la enfermedad hasta el final de la etapa terminal de la enfermedad conducirá a la muerte del animal en uno o dos días. De los animales sacrificados, se congelaron a -80 °C un hemisferio y una mitad del bazo para el análisis de inmunotransferencia, mientras que el segundo hemisferio y la segunda mitad del bazo así como todos los órganos internos se fijaron en una solución de formaldehído al 4% para la (inmuno)histología.
Resultados
Tal y como se muestra en la figura 4, el tratamiento de los ratones, que se habían infectado por vía intracerebral con la cepa RML de la tembladera de las ovejas, en una última etapa del tiempo de incubación (a los 80 días de la infección) mediante la aplicación intraperitoneal diaria de los posibles fármacos antipriónicos seleccionados dio lugar a una prolongación del tiempo de incubación, hasta alcanzar la etapa terminal de la infección de la tembladera de las ovejas, para 10353F11 (figura 4A) y anle138b y sery149 (figura 4B). El tiempo de supervivencia medio que se determinó para los compuestos anle138b y sery149 para los grupos de siete y ocho animales cada uno se prolongó hasta 14,9 y 11,5 días, respectivamente, en comparación con un grupo de 12 animales que había recibido solo el vehículo de DMSO al 100%. Para los compuestos sery106 y anle143b, la prolongación del tiempo de supervivencia en un grupo de ocho animales tratados en comparación con el mismo grupo de control con DMSO estaba por debajo del nivel de significación estadística. Para el compuesto 10353F11, el tiempo de supervivencia determinado para un grupo de ocho animales cada uno se prolongó hasta 11 días en comparación con el grupo de control. La prolongación observada del tiempo de supervivencia en los experimentos corresponde aproximadamente a la duración del tratamiento. Esto puede implicar que el tratamiento con estos fármacos ha detenido la progresión de la enfermedad, siempre y cuando se administraran los fármacos. En este caso, el tratamiento con estos fármacos conduciría a una prolongación de la vida de los individuos infectados con EET y a una estabilización de su estado de salud, lo que los protege de un deterioro adicional al detener el progreso de la enfermedad.
Ejemplo 5: Aplicación terapéutica de un posible compuesto antipriónico en los ratones infectados con la cepa de la tembladera de las ovejas después de la infección intraperitoneal
Para demostrar la eficacia de este nuevo compuesto antipriónico a la hora de combatir las encefalopatías espongiformes transmisibles (EET) o las enfermedades causadas por los priones, se realizó un experimento más con animales. Para este experimento, los ratones se infectaron por vía intraperitoneal con la cepa RML de la tembladera de las ovejas y se trataron con el compuesto anle138b, cuya actividad antipriónica estaba demostrada en un modelo animal para las últimas etapas de la enfermedad causada por los priones (ejemplo 4). Elegimos una combinación de aplicación intraperitoneal y oral del compuesto, y comenzamos el tratamiento justo después de la infección.
Procedimientos experimentales:
Infección con la cepa de la tembladera de las ovejas y tratamiento de los ratones
Las ratonas C57BL/6 hembra de 6 a 7 semanas de edad se inocularon con la cepa RML de la tembladera de las ovejas mediante la inoculación intraperitoneal con 100 pl de homogeneizado estéril de cerebro al 1% en solución salina tamponada con fosfato (PBS) de ratones enfermos en fase terminal con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. El tratamiento de estos ratones con el compuesto anle138b o con el vehículo acuoso sulfóxido de dimetilo (DMSO) comenzó justo después de la infección. El tratamiento con este compuesto se llevó a cabo durante 14 días consecutivos mediante la inyección intraperitoneal de 25 pl al día del compuesto diluido en el vehículo (DMSO) seguido de de 4 y 5 días de administración oral de 50 pl al día del compuesto en una mezcla de aceite vegetal/DMSO mediante alimentación por sonda nasogástrica oral (figura 5A). El compuesto anle138b se utilizó a una concentración de 100 nM para la aplicación intraperitoneal y a 50 mg/kg para la administración oral. Los animales se sacrificaron a los 35 días de la infección, cuando la PrPSc se detecta con claridad en el bazo de los ratones infectados por vía intraperitoneal. De los animales sacrificados, una mitad del bazo se congeló a -80 °C para el análisis de inmunotransferencia, mientras que la segunda mitad del bazo así como todos los órganos internos se fijaron en una solución de formaldehído al 4% para la inmunohistología.
Transferencia de TIP
El tejido de cerebro fijado en formol se cortó en bloques de tejido con un grosor de 2 mm, se descontaminó en ácido fórmico concentrado durante 1 hora, se fijó posteriormente en formol tamponado con solución salina tamponada con fosfato al 4% durante 48 horas siguiendo el protocolo de Browmn et al., 1990 y se incluyó en parafina. Se cortaron cortes de 5 a 7 pm en un microtomo, se colocaron en un baño de María (55 °C), se recogieron en una membrana de nitrocelulosa con poros de 0,45 pm humedecida previamente (Bio-Rad, Richmond, CA) y se secaron durante al menos 30 minutos a 55 °C. La membrana de nitrocelulosa se desparafinó con xileno. El xileno se remplazó por isopropanol, seguido de una rehidratación escalonada. Se añadió Tween 20 a una concentración final del 0,1% a la última etapa de rehidratación en H2O destilada. Se secaron las membranas y se conservaron a temperatura ambiente durante meses sin pérdida de la calidad de la posterior tinción de PrPSc.
Después de humedecer previamente con TBST (T ris-HCl a 10 mmol/l, pH 7,8; NaCl a 100 mmol/l; Tween 20 al 0,05%), se realizó la digestión con 250 pg/ml de proteinasa K (Boehringer) en el tampón de PK (Tris-HCl a 10 mmol/l; pH 7,8; NaCl a 100 mmol/l; Brij 35 al 0,1%) durante 8 horas a 55 °C. Con esta etapa, las proteínas pegadas a la membrana se fijaron a la membrana. Después de lavar tres veces con TBST, las proteínas en las membranas se desnaturalizaron con isotiocianato de guanidina a 3 mol/l en Tris-HCl a 10 mmol/l (pH 7,8) durante 10 minutos. La guanidina se eliminó con tres lavados con TBST. La inmunodetección se realizó después de la preincubación en la solución de bloqueo (caseína al 0,2% en TBST) durante 30 minutos. Como anticuerpo primario, se utilizó un anticuerpo policlonal de conejo contra la PrP recombinante de ratón, denominado CDC1, a una dilución de 1:500 en la solución de diluyente de anticuerpo (Ventana). La incubación duró al menos 1 hora. Después de tres lavados en TBST, la incubación durante al menos 1 hora se realizó con un anticuerpo antirmurino de conejo conjugado a la fosfatasa alcalina (Dako, Hamburgo) a una dilución de 1:500. Después de cinco lavados en TBST durante 10 minutos, las membranas se ajustaron a pH alcalino al incubarlas dos veces durante 5 minutos en NTM (Tris-HCl a 100 mmol/l, pH 9,5; NaCl a 100 mmol/l; MgCh a 50 mmol/l). La visualización de la reacción del anticuerpo se proporcionó mediante la reacción de formazán con el uso de NBT/BCIP. Las transferencias se evaluaron con un microscopio disector Olympus.
Resultados
El tejido de bazo extraído después de la muerte de los ratones tratados con el fármaco y tratados con el vehículo se tiñó para la detección inmunohistoquímica de la presencia de depósitos de PrPSc y se analizó la cantidad de PrPSc esplénica por inmunotransferencia. Tal y como se muestra en la figura 5B, la cantidad de PrPSc en el bazo de los animales tratados disminuye significativamente en comparación con los ratones tratados con el vehículo. El examen del tejido del bazo de los ratones infectados muestra que los depósitos de PrPSc se redujeron después del tratamiento con el compuesto anle138b. Se incrementa el porcentaje de bazos con poco depósito de PrPSc y se reduce el de los depósitos intensos de PrPSc (figura 5C). En la figura 5D se muestran ejemplos de dos transferencias de TIP, depósitos de PrPSc. Los resultados indican una clara eficacia antipriónica de este compuesto en los tejidos periféricos por la configuración experimental y la pauta terapéutica elegidas.
Ejemplo 6: Aplicación terapéutica de nuevos compuestos antipriónicos en los ratones infectados con depa de la tembladera de las ovejas a los días 80 de la infección
Para demostrar la observación del ejemplo 4 de que la prolongación del tiempo de supervivencia corresponde a la duración del tratamiento, se realizó un experimento con animales, en el que los compuestos se administraron a una dosis mayor y durante más tiempo para tratar a los ratones infectados con la cepa RML de la tembladera de las ovejas en una etapa tardía del periodo de incubación. Elegimos una combinación de la aplicación intraperitoneal y oral de los compuestos a los 80 días de la infección porque este es típicamente el momento en el que aparecen los primeros síntomas subclínicos en los animales infectados con esta cepa de priones.
Procedimientos experimentales:
Las ratonas C57BL/6 hembra de 6 a 7 semanas de edad se inocularon con la cepa RML de la tembladera de las ovejas mediante una inyección intracerebral con 30 pl de homogeneizado estéril de cerebro al 1% en la solución salina tamponada con fosfato (PBS) de ratones enfermos terminales con la cepa RML de la tembladera de las ovejas. Estos ratones se trataron a los días 80 de la infección con los nuevos compuestos antipriónicos o con el vehículo DMSO. Se utilizaron los dos compuestos antipriónicos en potencia anle138b y anle186b. El tratamiento con estos compuestos se llevó a cabo durante 14 días consecutivos mediante la inyección intraperitoneal de 25 pl al día del compuesto diluido en el vehículo DMSO seguido de dos administraciones orales durante 5 días de 50 pl al día del compuesto en una mezcla de aceite vegetal/DMSO a través de sonda nasogástrica oral (figura 6A). En 3 ratones de control y 2 ratones tratados con el anle138b, el compuesto se administró además por vía oral desde el día 109 al día 136 al darle gránulos alimenticios de mantequilla de cacahuete mezclados con soluciones de reserva de compuesto en DMSO. Los compuestos se utilizaron a una concentración de 100 mM para la aplicación intraperitoneal y de 50 mg/kg para la administración oral. Cuatro animales de cada grupo de tratamiento se sacrificaron en los puntos de tiempo indicados (figura 6A). Los cuidadores de animales con la formación necesaria vigilaron los signos de la enfermedad en ocho animales de cada grupo de tratamiento desde el día 80 después de la infección. Se sacrificaron los animales cuando habían alcanzado la fase terminal de la enfermedad, marcada por los síntomas clínicos, que son ataxia, temblores, dificultad para ponerse de pie desde una posición en la que descansan sobre la espalda y rigidez en la cola, y estaban moribundos. Típicamente, el progreso de la enfermedad hasta el final de la etapa terminal de la enfermedad conducirá a la muerte del animal en uno o dos días. De los animales sacrificados, un hemisferio y una mitad del bazo se congelaron a -80 °C recién tomados para el análisis por inmunotransferencia, mientras que el segundo hemisferio y la segunda mitad del bazo así como todos los órganos internos se fijaron en una solución de formaldehído al 4% para la histología.
Resultados
Cantidad de PrPSc en los homogeneizados de cerebro y la muerte celular por apoptosis después de la infección
En los homogeneizados de cerebro de los ratones tratados con el fármaco y de los tratados con el vehículo se analizó la cantidad de PrPSc mediante análisis de inmunotransferencia. Tal y como se muestra en la figura 6B, la cantidad de PrPSc en el cerebro de todos los animales examinados en los puntos de tiempo indicados del grupo de anle138b se puede mantener en el nivel de los ratones sin tratar el día 80, mientras que se incrementa la cantidad de PrPSc en el grupo de control. Los resultados de anle186b aparecen entre el grupo de control y anle138b. El incremento de PrPSc se podía enlentecer (figura 6B). En la figura 6C se muestra el cambio de la cantidad relativa de PrPSc después del tratamiento con los compuestos en comparación con el control sin tratar en el día 80. La cantidad de PrPSc en el cerebro disminuye ligeramente después del tratamiento con anle138b. Después de la evaluación histológica de los cortes de cerebro teñidos con HE en los puntos de tiempo indicados, los ratones tratados con anle138b y anle186b mostraban una reducción de los cambios patológicos. El número de células apoptósicas en la capa celular de los gránulos cerebelosos de los ratones infectados de los grupos tratados disminuye en comparación con el grupo de control (figura 6D). Estos resultados indican que ambos compuestos pueden atravesar la barrera hematoencefálica. Por lo tanto, el tratamiento fue capaz de prevenir más depósitos de PrPSc y la progresión de la enfermedad en el cerebro de los animales durante el tratamiento. Estos resultados implican que el tratamiento con el compuesto anle138b había detenido la progresión de la enfermedad siempre y cuando se administren los fármacos. Estos resultados indican que cabe la posibilidad de modificar el progreso de la enfermedad mediante un tratamiento que utilice este compuesto que interfiere con la formación de PrPSc. En este caso, el tratamiento conduciría a una prolongación de la vida de los individuos infectados con la EET y a la estabilización o quizás a una mejoría en su estado de salud al protegerlos de un deterioro adicional y detener el progreso de la enfermedad.
Prolongación del tiempo de incubación
Tal y como se muestra en la figura 7, el tratamiento de los ratones, que se habían infectado por vía intracerebral con la cepa RML de la tembladera de las ovejas, en una etapa tardía del tiempo de incubación (a los 80 días de la infección) mediante la administración diaria de los compuestos dio lugar a una prolongación del tiempo de supervivencia, hasta alcanzar la fase terminal de la infección de la tembladera de las ovejas (figura 7). Además, el mayor tiempo de supervivencia en los dos ratones que recibieron un tratamiento adicional desde el día 109 al día 136 por la alimentación con anle138b mezclado con mantequilla de cacahuete indica que i) la supervivencia está correlacionada con la duración de tratamiento, ii) el compuesto es eficaz cuando se administra por vía oral, y iii) el compuesto atraviesa la barrera hematoencefálica.
Ejemplo 7: Supresión de la agregación de la a-sinucleína in vitro
Las sinucleinopatías son enfermedades (neurodegenerativas) caracterizadas por la acumulación intracelular de agregados y fibrillas compuestos principalmente de la proteína a-sinucleína (para una revisión, véase: Goedert, 2001). Las sinucleinopatías neurodegenerativas más prominentes son la enfermedad de Parkinson (EP), la demencia con cuerpos de Lewy (DCL) y la atrofia multisistémica (AMS).
Se ha demostrado que la agregación de la a-sinucleína in vitro se produce en presencia de sustancias, tales como solventes orgánicos, que imitan las condiciones dieléctricas que existen de forma natural en la proximidad de las membranas biológicas (Munishkina et al., 2003). Se han desarrollado ensayos de agregación in vitro que proporcionan sistemas modelo para la investigación de los aspectos centrales del plegamiento erróneo y la agregación de la asinucleína, y para la formación de especies de agregados tóxicos durante el proceso de la enfermedad (Kostka et al., 2008).
Para analizar los compuestos seleccionados por su capacidad para suprimir la agregación de la a-sinucleína, hemos utilizado un sistema in vitro, en donde el solvente orgánico sulfóxido de dimetilo (DMSO) a concentraciones bajas (<3%) y, en algunos experimentos, el hierro férrico se utilizaron para inducir la agregación de la a-sinucleína in vitro. La formación de multímeros se vigiló con un equipo de correlación de fluorescencia de partículas sueltas mediante el análisis de correlación cruzada y el análisis de SlFT aplicados a las mezclas de monómeros de a-sinucleína marcados con los fluoróforos Alexa488 verde o Alexa647 rojo, respectivamente. Tales mezclas de a-sinucleína se agregaron en paralelo a las muestras en las que se añadió un compuesto a la reacción.
Procedimientos experimentales:
Marcación de la a-sinucleína con fluorescencia
La a-sinucleína recombinante se marcó con los colorantes fluorescentes con aminos reactivos, bien con el éster de O-succinimidilo con Alexa Flúor 488 o con el éster de O-succinimidilo con Alexa Flúor 647 (Molecular Probes, EE. UU.), respectivamente. Después de completarse la reacción, las moléculas de colorante sin fijar se separaron de las mezclas de reacción por cromatografía de exclusión por tamaños a través de dos columnas PD10 sucesivas (Amersham Bioscience, Alemania) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. La eficacia de la marcación y de la retirada del colorante sin fijar se determinó mediante mediciones de FCS con las diluciones idóneas de las fracciones que contienen los monómeros de la a-sinucleína marcados.
Mediciones de correlación de la fluorescencia de partículas sueltas
En un volumen de 20 pl en los pocillos de una placa de microtitulación especial equipada con un fondo de cubreobjetos de cristal para las mediciones de correlación de la fluorescencia (Evotec-Technologies, Alemania), se realizó la agregación de la a-sinucleína en un tampón que contenía Tris a 50 mM a pH 7,0 y una mezcla de monómeros de la a-sinucleína marcados con los fluoróforos Alexa-488 o bien Alexa-647, respectivamente, a una concentración final de aproximadamente 5 a 10 nM de cada especie de a-sinucleína. Las mediciones se realizaron en un instrumento de correlación de fluorescencia Insight (Evotec-Tecnologies, Alemania) con el uso de un objetivo de microscopio a 40* de 1,2 NA (Olympus, Japón) con ajustes ópticos de FIDA, un diámetro estenopeico de 70 pm y una excitación de 200 pW con el láser de 488 nm, así como una excitación de 300 pW con el láser de 633 nm. El tiempo de medición fue de 10 s, durante el cual el foco del láser se movió a lo largo del pocillo mediante un dispositivo de barrido de haces con el uso de una longitud de trayectoria del escáner de 100 pm a una frecuencia de barrido de 50 Hz y un movimiento de la mesa de posicionamiento de 2000 pm. Esto es equivalente a una velocidad de barrido de aproximadamente 10 mm/s. Se generaron histogramas bidimensionales de distribución de la intensidad y se analizaron con el programa informático 2D-SIFT (Evotec OAI, Alemania).
Resultados: Supresión de la agregación de la a-sinucleína debida a los compuestos
La agregación de la a-sinucleína ocasionada por DMSO y DMSO/Fe3+ queda reflejada mediante una formación de complejos multiméricos de la a-sinucleína que contienen unidades de la a-sinucleína marcadas tanto en rojo como en verde en cantidades más elevadas. Así pues, la reacción de control sin la adición de compuestos inhibidores muestra la presencia de un gran número de complejos que emiten grandes cantidades de fotones. La adición del compuesto 351F11 de tipo DPP a la solución del análisis es capaz de inhibir en gran medida la formación de complejos multiméricos de la a-sinucleína de un modo dependiente de la dosis, como se puede observar en la figura 8A. Por lo tanto, el compuesto 351F11 es capaz de inhibir de manera eficaz la formación de multímeros de la a-sinucleína a una concentración micromolar baja en este modelo in vitro para la agregación patológica de la proteína hallada en las sinucleinopatías. Esto es una clara indicación de que el compuesto 351F11 no solo puede funcionar como un compuesto antipriónico, sino que también tiene la capacidad de convertirse en un compuesto terapéutico contra las sinucleinopatías, como la enfermedad de Parkinson, DCL y AMS, ya que interfiere con el mecanismo patológico a nivel molecular. También se puede detectar un efecto inhibidor dependiente de la dosis sobre la agregación de la asinucleína en otros compuestos relacionados con DPP que se han investigado (figura 8B, C). Por lo tanto, estos compuestos representan un nuevo grupo de sustancias con una capacidad probada para inhibir la agregación in vitro de la a-sinucleína, lo que permitirá el desarrollo de un tratamiento causativo contra la enfermedad de Parkinson y otras sinucleinopatías.
Además, la actividad inhibidora de estos compuestos sobre ambas agregaciones in vitro, la de la proteína priónica y la de la a-sinucleína, puede ser el reflejo de su actividad antiagregante general contra un abanico más amplio de enfermedades por agregación de una proteína, en las que el plegamiento erróneo de la proteína en conformaciones en las que predomina la lámina p forma la base para la posterior agregación de la proteína en las fibrillas del amiloide. Por lo tanto, estos compuestos y otros miembros de la clase de sustancias de tipo DPP tienen la capacidad de ser útiles como fármacos para el tratamiento causativo de todo un conjunto completo de enfermedades por agregación de una proteína (neurodegenerativas), entre ellas por ejemplo, la enfermedad de Alzheimer, enfermedad causada por los priones, enfermedad de Parkinson, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis A l ), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria, amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
Ejemplo 8: Inhibición de PrPSc en el cultivo celular
Procedimientos experimentales:
Los cultivos de células infectados con priones se trataron con los compuestos recién sintetizados tal y como se describe para el cribado primario que está descrito más arriba. Los compuestos se añadieron a las concentraciones indicadas en la figura 9. La estructura de los compuestos se muestra a continuación y en la figura 3.
5-(3,5-Dibromofenil)-3-(3,4,5-trihidroxifenil)pirazol (anle145d)
Figure imgf000035_0001
5-(3-Bromofenil)-3-(3,4-dimetoxifenil)pirazol (sery255b)
Resultados:
Una proporción muy alta de compuestos relacionados con DPP mostraban una reducción fuerte de PrPSc en el cultivo celular a concentraciones micromolares bajas e incluso a concentraciones submicromolares. Esto indica que estos compuestos representan un grupo de sustancias químicas relacionadas con actividad antipriónica.
Ejemplo 9: Efecto inhibidor de diferentes derivados de DPP sobre la acumulación de PrPSc en el cerebro y en el bazo
Los compuestos se analizaron con respecto a su efecto inhibidor sobre la acumulación de PrPSc in vivo mediante tres protocolos experimentales:
a) Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó a los 80 días de la infección con 1 mg del compuesto al día aplicado por vía oral mezclado con DMSO más mantequilla de cacahuete. La cantidad de PrPSc en el cerebro se midió a los 120 días de la infección mediante análisis de inmunotransferencia.
b) Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó a los 80 días de la infección con 0,84 mg del compuesto (en DMSO) al día aplicado por inyección intraperitoneal durante 14 días seguido de 2 x 5 días (con 2 días sin tratamiento entre ellos) de 1 mg del compuesto (en DMSO más aceite vegetal) aplicado por vía oral mediante sonda nasogástrica. La cantidad de PrPSc en el cerebro se midió a los 106 días de la infección.
c) Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intraperitoneal (i.p.) con 100 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). La cantidad de PrPSc en el bazo se determinó a los 35 días de la infección tras 34 días de tratamiento con 1 mg del compuesto al día mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete.
La inhibición relativa de la acumulación de PrPSc en comparación con los grupos tratados con DMSO se muestra en la tabla 1 (el valor medio de los animales tratados con DMSO al final del periodo de tratamiento se definió como el 0% de inhibición, el valor medio de los animales de control al comienzo del periodo de tratamiento se definió como el 100% de inhibición).
Tabla 1: Efecto inhibidor de los diferentes derivados de DPP sobre la acumulación de PrPSc en el cerebro y en el bazo (a, b, c indican el protocolo experimental (tal y como está descrito más arriba) que se utilizó).
Figure imgf000035_0002
Figure imgf000036_0001
Los resultados de estos experimentos indican que bajo estas condiciones experimentales i) el compuesto anle138b y los compuestos químicamente relacionados proporcionan una fuerte inhibición de la amplificación priónica in vivo, ii) hay una relación entre la estructura y la actividad que indica que, para esta aplicación en estas condiciones experimentales, el anle138b represente un óptimo relativo de actividad.
Ejemplo 10: Se puede atravesar la barrera hematoencefálica y se observa una interacción con los agregados patológicos de la proteína
Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó a los 80 días de la infección con 1 mg del compuesto (sery383) o 3 mg del compuesto (sery363a) al día aplicado por vía oral mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete. Se midió la cantidad de PrPSc en el cerebro a los 120 días de la infección mediante análisis de inmunotransferencia.
Figure imgf000037_0001
En comparación con los controles tratados con DMSO, sery363a dio lugar a una reducción de la acumulación de PrPSc del 35%, y sery383 dio lugar a una reducción de la acumulación de PrPSc del 30%.
El sery363a se sintetizó y se analizó en estos experimentos porque proporciona una modificación de anle138b que está bien adaptada para la marcación con isótopos, lo que se necesita para ser usado como un trazador diagnóstico para la toma de imágenes por TEP.
El sery383 se analizó en este ensayo porque este compuesto, así como los compuestos similares desde el punto de vista estructural que contienen un grupo -NH2 y un átomo de halógeno, se halló que eran muy activos a la hora de inhibir la agregación de la a-sinucleína (véase el ejemplo 16, “ Inhibición de la formación de agregados de a-sinucleína con diferentes compuestos”).
Los resultados de estos experimentos indican que ambos compuestos pueden atravesar la barrera hematoencefálica e interaccionar con los agregados patológicos de la proteína, lo que demuestra que estos compuestos tienen propiedades que se pueden explotar mediante el uso como compuesto terapéutico, así como un compuesto diagnóstico.
Ejemplo 11: Influencia del tratamiento diario con anle138b sobre la acumulación de PrPSc y sobre la enfermedad causada por los priones en los ratones infectados con la cepa RML de la tembladera de las ovejas.
Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó a los 80 días o a los 120 días de la infección, respectivamente, con 5 mg del compuesto cada día aplicado por vía oral mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete (figura 10).
Los cortes de cerebro teñidos para PrPSc (figura 10A) muestran que el tratamiento con anle138b reduce la acumulación de PrPSc en comparación con los animales tratados con DMSO. La cuantificación de la cantidad de PrPSc en los homogeneizados de cerebro de los ratones inoculados con priones en diferentes momentos demuestra que la acumulación de PrPSc en los ratones tratados con anle138b se reduce enormemente, incluso después de comenzar el tratamiento en la fase tardía de la enfermedad (120 dpi; figura 10B). La cuantificación histológica de las células apoptósicas en el cerebelo en los cortes de cerebro teñidos con HE demuestra que la inhibición de la acumulación de PrPSc da lugar a la inhibición de la muerte celular neuronal (figura 10C). Los ratones de control tratados con DMSO y mantequilla de cacahuete sin compuesto muestran un adelgazamiento progresivo (figura 10D). El tratamiento con anle138b desde los 80 dpi hacia adelante impide el adelgazamiento durante aproximadamente 100 días. El tratamiento desde los 120 dpi impide el adelgazamiento durante aproximadamente 70 días.
Estos hallazgos experimentales indican que el tratamiento con el compuesto inhibe la acumulación de PrPSc, la muerte de las células neuronales y la progresión de los signos clínicos de la enfermedad, incluso cuando el tratamiento se comienza tarde después de que aparezcan los signos obvios de la enfermedad.
Ejemplo 12: Comparación de los diferentes protocolos de tratamiento
Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento con anle138b en diferentes momentos y pautas (tal y como se indica en la leyenda de de la figura 11) prolongó significativamente los tiempos de supervivencia después de la provocación con la cepa RML de la tembladera de las ovejas (p < 0,01). La media de los tiempos de supervivencia se expresa en días ± desviación estándar.
Tal y como se muestra en la figura 11, estos hallazgos experimentales indican que i) el tratamiento con el compuesto es eficaz también después de la aplicación oral del compuesto, ii) el tratamiento también es eficaz cuando se comienza en una fase clínica tardía de la enfermedad, y iii) que la prolongación del tratamiento da lugar a una supervivencia más duradera.
Ejemplo 13: Efecto dependiente de la dosis de la administración de anle138b sobre la cantidad de PrPSc en el cerebro
Los ratones C57BL/6 se inocularon por vía intracerebral (i.c.) con 30 pl de homogeneizado de cerebro al 1% (cepa RML de la tembladera de las ovejas). El tratamiento comenzó a los 80 días de la infección con diferentes cantidades de anle138b (tal y como se muestra en la figura 12) aplicado por vía oral y mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete. A los 120 días de la infección, se sacrificaron los animales, y la cantidad de PrPSc en el cerebro se cuantificó en comparación con los animales sacrificados a los 80 días de la infección.
Los datos dados a conocer en la figura 12 demuestran que anle138b redujo la acumulación de PrPSc en el cerebro de una manera dependiente de la dosis.
Ejemplo 14: Cuantificación de PrPC por inmunotransferencia de tejido de cerebro de los ratones sin infectar tratados con 1 mg al día de anle138b mezclado con DMSO y mantequilla de cacahuete durante 1 semana. Tal y como se muestra en la figura 13, no se observó ninguna reducción de la cantidad de PrPC en los ratones tratados con anle138b cuando se comparó con los ratones de control.
Estos hallazgos experimentales indican que el efecto terapéutico en los ratones infectados con la cepa de la tembladera de las ovejas no se debe a una reducción de la expresión de PrPC sino a una inhibición de la formación de especies patológicas agregadas de la proteína.
Ejemplo 15: Análisis farmacocinético de anle138b
Se aplicó una dosis única de anle138b a los ratones C57BL/6 sin infectar tal y como se indica en la figura 14. En diferentes momentos después de la aplicación, la cantidad del compuesto en el cerebro y en el suero se midió en 2 animales por punto temporal y grupo experimental mediante LC-MS.
Estos hallazgos experimentales indican que hay una buena biodisponibilidad oral y una buena penetración en el cerebro. El anle138c se detectó en la sangre de los ratones, por lo que se supone que es un metabolito de anle138b.
Ejemplo 16: Inhibición de la formación de agregados de la a-sinuclelína mediante diferentes compuestos
La agregación de la a-sinucleína se indujo mediante DMSO y 10 |jM de FeCb, y se analizó por espectroscopia confocal de moléculas sueltas, tal y como está descrito en Kostka et al (J. Biol. Chem. (2008) 283: 10992-11003). El efecto de diferentes compuestos añadidos a una concentración de 10 j M sobre el efecto de la formación de los oligómeros del intermedio II se estudió en comparación con los controles sin el compuesto, tal y como se muestra en la tabla 2. La estructura de los compuestos correspondientes se muestra en la figura 15.
Tabla 2. Inhibición de la formación de agregados de a-sinucleína mediante diferentes compuestos.
Compuesto Intermedio II Compuesto Intermedio II Compuesto Intermedio II
Figure imgf000038_0001
Los hallazgos experimentales indican que estos compuestos inhiben la formación de agregados tóxicos de asinucleína, lo que indica que estos compuestos con relación estructural tienen la capacidad de ser utilizados para el tratamiento de las enfermedades de la proteína con la agregación de una proteína y, en particular, también para el tratamiento de enfermedades en las que se puede observar la agregación de la a-sinucleína.
Ejemplo 16: Efecto de los compuestos en un modelo de ratón in vivo de la enfermedad de Parkinson
Las pruebas experimentales sugieren que en los modelos experimentales de la enfermedad de Parkinson que utilizan toxinas mitocondriales tales como MPTp y rotenona a las concentraciones idóneas, se puede observar la formación de agregados de a-sinucleína y contribuye a la muerte celular neuronal. Los ratones se trataron con MPTP (30 mg/kg de masa corporal al día) por inyección intraperitoneal los días 1 a 5 para inducir la degeneración de las neuronas dopaminérgicas de la sustancia negra. Los animales (de 3 a 10 por grupo experimental) se trataron con diferentes compuestos o con el vehículo (250 mg/kg de masa corporal al día, aplicación oral (alimentación por sonda del compuesto en 12,5 pl de DMSO mezclado con 487,5 pl de aceite de oliva) los días 0 a 12). El día 12 se cuantificó la pérdida de neuronas en comparación con los ratones tratados sin MPTP (control, definidos como el 0% de muerte celular) y los ratones tratados con MPTP que se trataron solo con el vehículo (DMSO, definido como el 100% de muerte celular). Para la cuantificación de las células de la sustancia negra compacta (SNc) positivas para la tirosina hidroxilasa (TH), se inmunotiñeron cortes de 50 pm con un anticuerpo anti-TH. Se analizaron los cortes alternos a lo largo de la SNc con el uso del programa Stereo Investigator (MicroBrightfield, Colchester, VT, EE. UU.). Las células inmunoteñidas se contaron con el método del fraccionador óptico y un objetivo 20*. Los recuentos estereológicos los realizaron dos investigadores independientes con anonimato.
Los hallazgos experimentales que se muestran en la figura 16 indican que los compuestos analizados reducen la muerte celular en un modelo in vivo de la enfermedad de Parkinson.
Ejemplo 17: Efecto de anle138c sobre la agregación de Ap
La Ap40 a una concentración de 50 pM se incubó en la siguiente condición durante 30 horas: fosfato de sodio a 50 mM, cloruro de sodio a 50 mM, azida de sodio al 0,01%, pH 7,4, 37 °C, agitado con barras magnéticas delgadas, con o sin anle138c a 50 pM. Se le añadió DMSO a la muestra de control a la misma concentración que la muestra problema. La concentración de DMSO era del 2% (v/v) y la solución de reserva de anle138c era de 3 mM. La solución del péptido se centrifugó a 16000g durante 15 minutos antes de los experimentos de DLD.
Mientras que el pico más grande en la Ap40 monomérica se correspondía con un radio hidrodinámico de aproximadamente 1,5 nm y un pico de oligómero a aproximadamente 30 nm (panel superior), el estado de agregación de Ap40 en presencia de anle138c (panel central) mostró un pico de oligómero en torno a 20 nm además del pico de monómero. El panel inferior muestra la distribución según el tamaño del estado de la Ap40 en fibrillas amiloides, medido después de centrifugar la muestra. La agregación de Ap40 se analizó mediante dispersión de luz dinámica. Las mediciones de DLD se realizaron por duplicado a 25 °C, en un instrumento DynaPro Titan (Wyatt Technology Corp., CA), con un láser de 827,08 nm. El ángulo de dispersión era de 90°. La medición de DLD consistió en 20 adquisiciones de 10 s de duración. El índice refractivo (IR) de la solución se estableció en 1,333 a 589 nm y 20 °C, y el iR a la longitud de onda estudiada se obtuvo mediante la ecuación de Cauchy, con un coeficiente de 3119 nm2. La viscosidad era de 1,019 cp a 20 °C y las variaciones dependientes de la temperatura se calcularon mediante un modelo acuoso. La distribución según el tamaño se determinó mediante un método de regularización constreñido.
Estos hallazgos experimentales tal y como se muestran en la figura 17 indican que anle138c inhibe la formación de grandes oligómeros de Ap40, lo que indica que el anle138c y los compuestos relacionados también pueden interferir con la agregación de Ap, lo que se puede utilizar con propósitos terapéuticos y diagnósticos en enfermedades tales como la enfermedad de Alzheimer que se caracterizan desde el punto de vista neuropatológico por depósitos de Ap agregados.
Una realización alternativa de los compuestos de la presente descripción se resume en los siguientes puntos. Estos compuestos se pueden utilizar de una manera idéntica a los compuestos de la invención mencionados más arriba.
1. Un compuesto representado por la fórmula (I)
Figure imgf000039_0001
en donde
X, Y y L se seleccionan de manera independiente y no direccional de -C(R11)(R12)-, -C(R13)=, -N(R14)-, -N=, N+(R17)=, -O- y -S-;
M y Z se seleccionan de manera independiente y no direccional de
-C (R 15)-, - O ,
I I
Figure imgf000040_0001
------ representa un doble enlace optativo;
R1 a R15 o R17 o R18 se seleccionan independientemente de hidrógeno, halo, ciano, hidroxi, nitro, amino, azido, sulfonilo, tío, fosfonilo, carboxi, carbonilamido, alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, acilo, aciloxi, acilamino, un grupo carbocíclico, carboxiclooxi, carbocicloalquilo, carbocicloalquenilo, arilo, arilalquilo, arilalquenilo, arilalquinilo, ariloxi, arilalcoxi, un grupo heterocíclico, heterociclooxi, heterocicloalquilo, un grupo heteroarilo, heteroariloxi, heteroalrilalquilo, heteroarilalquenilo y heteroarilalcoxi, o dos grupos adyacentes pueden estar unidos para formar un grupo de puente que tiene de 1 a 6 átomos de carbono, en donde uno o dos átomos de carbono pueden estar remplazado por -O-, -S­ o -N(R')-, en donde R' se selecciona de H y alquilo(C1-4); cada uno de los cuales está sustituido opcionalmente; así como un profármaco, éster, solvato o sal del mismo;
siempre y cuando el compuesto no sea uno de los siguientes compuestos (a), (b) o (c)
Figure imgf000040_0002
2. El compuesto de acuerdo con el punto 1, en donde el anillo A se selecciona de manera direccional de las siguientes estructuras:
Figure imgf000040_0003
3. El compuesto de acuerdo con el punto 1 o 2, en donde R7 es halo, ciano, hidroxi, nitro, azido, alcoxi, tío, alquiltío, amino, haloalcoxi, alquilo o haloalquilo.
4. El compuesto de acuerdo con cualquiera de los elementos 1 a 3, en donde R2 y R3 cada uno se selecciona independientemente de hidroxi y alcoxi(Ci-6); o R2 y R3 juntos forman una estructura -O-(CH2)n-O-, en donde n es de 1 a 3, preferiblemente n es 1.
5. Un compuesto representado por la fórmula (I)
Figure imgf000041_0001
en donde
X, Y y L se seleccionan de manera independiente y no direccional de -C(R11)(R12)-, -C(R13)=, -N(R14)-, -N=, -N+(R17)=, -O- y -S-;
M y Z se seleccionan de manera independiente y no direccional de
-C(R15)-, -C ;
Figure imgf000041_0002
- - - - representa un doble enlace optativo;
R1 a R15 o R17 o R18 se seleccionan independientemente de hidrógeno, halo, ciano, hidroxi, nitro, amino, azido, sulfonilo, tío, fosfonilo, carboxi, carbonilamido, alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, acilo, aciloxi, acilamino, un grupo carbocíclico, carboxiclooxi, carbocicloalquilo, carboxicloalquenilo, arilo, arilalquilo, arilalquenilo, arilalquinilo, ariloxi, arilalcoxi, un grupo heterocíclico, heterociclooxi, heterocicloalquilo, un grupo heteroarilo, heteroariloxi, heteroarilalquilo, heteroarilalquenilo y heteroarilalcoxi o dos grupos adyacentes pueden estar unidos para formar un grupo de puente que tiene de 1 a 6 átomos de carbono, en donde uno o dos átomos de carbono puede estar reemplazado por -O-, -S-, o -N(R')-,
en donde R' se selecciona de H y alquilo(C1-4); cada uno de los cuales está opcionalmente sustituido;
así como un profármaco, éster, solvato o sal del mismo;
para ser usado en el tratamiento o la prevención de una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa.
6. Uso de un compuesto representado por la fórmula (I) tal y como está definido en el punto 5 para preparar una composición farmacéutica para tratar o prevenir una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa.
7. Un método para tratar o prevenir una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa que comprende la administración de una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto representado por la fórmula (I), tal y como está definido en el punto 5, que se aplica a un paciente que lo necesita.
8. Un método de identificación de un compuesto para inhibir la agregación de una proteína implicada en una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa, que comprende las etapas de:
poner en contacto una proteína monomérica marcada y un agregado de dicha proteína marcado de manera diferente en (1) presencia y/o (2) ausencia de un candidato a inhibidor de la agregación que es un compuesto tal y como está definido en el punto 5;
determinar la cantidad de los marcadores colocalizados que representan la extensión de la fijación de la proteína monomérica al agregado de dicha proteína; y
comparar el resultado obtenido en presencia y ausencia de dicho compuesto, en donde una disminución de los marcadores colocalizados en presencia de dicho compuesto es indicativo de la capacidad del compuesto para inhibir la agregación de dicha proteína.
9. El método de acuerdo con el punto 8, en donde dichos marcadores son marcadores fluorescentes.
10. El método de acuerdo con el punto 8 o 9, en donde dichos marcadores están unidos a un anticuerpo o a un fragmento de un anticuerpo específicamente fijado a dicha proteína.
11. El método de acuerdo con el punto 10, en donde dicho anticuerpo o fragmento de un anticuerpo es capaz de discriminar entre la proteína agregada y la proteína monomérica.
12. El método acuerdo con de cualquiera de los puntos 8 a 11, en donde la cantidad de marcadores colocalizados se determina con el uso del método de “cribado de dianas intensamente fluorescentes (SIFT)” o transferencia de energía por resonancia de fluorescencia (FRET) o toma de imágenes confocales de alta resolución.
13. El método acuerdo con de cualquiera de los puntos 8 a 12, en donde dichas proteínas monoméricas y agregadas se seleccionan del grupo que consiste en proteína priónica, proteína precursora del amiloide (PPA), a-sinucleína, superóxido dismutasa, proteína t, inmunoglobulina, amiloide A, transtirretina, microglobulina p2, cistatina C, apolipoproteína A1, TDP-43, amilina, ANF, gelsolina, insulina, lisozima, fibrinógeno, huntingtina y ataxina, y otras proteínas con un tramo de poli-Q, y fragmentos o derivados de dichas proteínas.
14. El método de acuerdo con el punto 13, en donde dicha proteína monomérica es la proteína priónica y dicha proteína agregada es la PrPSc.
15. El método de acuerdo con el punto 13, en donde dicha proteína monomérica es la a-sinucleína y dicha proteína agregada se selecciona del grupo que consiste en oligómeros o protofibrillas o fibrillas de la a-sinucleína.
16. Un método para seleccionar compuestos con eficacia in vivo para el tratamiento o la prevención de una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa, que comprende:
(a) administrar un compuesto candidato tal y como está definido en el punto 5 a un cultivo celular o a un animal no humano que tiene la isoforma agregable de la proteína, tal y como está definido en cualquiera de los puntos 13 a 15; (b) cuantificar la cantidad de agregados observables; y
(c) identificar y seleccionar un compuesto que es capaz de reducir los agregados o la formación de agregados de dicha proteína o de incrementar el tiempo de supervivencia del cultivo celular o el animal no humano.
17. Uso de un compuesto tal y como está definido en el punto 5 para inhibir la agregación de una proteína in vitro, en un animal o ex vivo.
18. Una composición farmacéutica o de diagnóstico que comprende un compuesto, tal y como está definido en el punto 5, y opcionalmente un vehículo farmacéuticamente aceptable.
19. El compuesto de acuerdo con cualquiera de los puntos 1 o 5 o el uso de acuerdo con el punto 6 o el método de acuerdo con cualquiera de los puntos 7 a 16 o el uso de acuerdo con el punto 17 o la composición de acuerdo con el punto 18, en donde dicho compuesto se selecciona del grupo que consiste en:
Figure imgf000043_0001
en donde cada R16 se selecciona independientemente de H y alquilo(Ci-4); o dos grupos R16 adyacentes pueden estar unidos para forma un grupo de puente que tiene de 1 a 3 átomos de carbono; así como un profármaco, éster, solvato o sal del mismo.
20. El método de acuerdo con cualquiera de los puntos 16 o 19, o el uso de acuerdo con cualquiera de los puntos 17 o 19, la composición de diagnóstico de acuerdo con cualquiera de los puntos 18 o 19, en donde dicho compuesto está marcado de manera detectable.
21. El método de acuerdo con cualquiera de los puntos 16, 19 a 20, o el uso de acuerdo con cualquiera de los puntos 17, 19 a 20, en donde dos o más de dichos compuestos se utilizan simultáneamente.
22. El compuesto de acuerdo con cualquiera de los puntos 5 o 19, en donde dicha enfermedad relacionada con la agregación de una proteína se caracteriza por la presencia de una forma agregada de al menos una proteína o un fragmento o derivado del mismo, en donde la proteína se selecciona del grupo que consiste en proteína priónica, proteína precursora del amiloide (PPA), a-sinucleína, superóxido dismutasa, proteína t, inmunoglobulina, amiloide A, transtirretina, microglobulina p2, cistatina C, apolipoproteína A1, TDP-43, amilina, ANF, gelsolina, insulina, lisozima, fibrinógeno, huntingtina y ataxina, y otras proteínas con un tramo de poli-Q.
23. El compuesto de acuerdo con cualquiera de los puntos 5, 19 o 22, en donde dicha enfermedad se selecciona del grupo que consiste en enfermedad de Alzheimer, enfermedad causada por los priones, enfermedad de Parkinson, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis AL), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria y amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
24. El compuesto de acuerdo con el punto 23, en donde dicha enfermedad causada por los priones se selecciona de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, variante de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, enfermedad genética humana causada por los priones, encefalopatía espongiforme bovina (EEB) y tembladera de las ovejas.
25. Un kit que comprende el compuesto tal y como está definido en cualquiera de los puntos 5 y 18 a 24 y, además, un anticuerpo o fragmento de anticuerpo específicamente fijado a dicho compuesto; y/o proteína monomérica o agregada tal y como está definido en los puntos 13 a 15; y/o proteína monomérica o agregada tal y como está definido en los puntos 13 a 15 opcionalmente formando complejo con dicho compuesto; e instrucciones para el uso, en uno o varios envases.
El término “halo”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a un átomo de halógeno seleccionado de flúor, cloro, bromo y yodo, preferiblemente bromo.
El término “carboxi”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere al grupo -COOH.
El término “alquilo” y “alq” se refiere a un radical de alcano (hidrocarburo) de cadena lineal o ramificada que contiene de 1 a 12 átomos de carbono, preferiblemente de 1 a 6 átomos de carbono, más preferiblemente de 1 a 4 átomos de carbono. Tales grupos de ejemplo incluyen, pero sin limitarse a ellos, metilo, etilo, propilo, isopropilo, n-butilo, f-butilo, isobutilo, pentilo, hexilo, isohexilo, heptilo.
El término “alquenilo” se refiere a un radical de hidrocarburo de cadena lineal o ramificada que contiene de 2 a 12 átomos de carbono, preferiblemente de 2 a 6 átomos de carbono y al menos un doble enlace de carbono a carbono. Tales grupos de ejemplo incluyen etenilo o alilo.
El término “alquinilo” se refiere a un radical de hidrocarburo de cadena lineal o ramificada que contiene de 2 a 12 átomos de carbono, preferiblemente de 2 a 6 átomos de carbono, y al menos un triple enlace de carbono a carbono. Tales grupos de ejemplo incluyen etinilo.
El término “alcoxi” se refiere a un grupo alquilo tal y como está descrito más arriba unido a través de un enlace de oxígeno (-O-).
Un “grupo acilo” de acuerdo con la presente invención es un grupo funcional en el que un alquilo, arilo, heterociclo o heteroarilo está unido a un grupo carbonilo. Los ejemplos de grupos acilo son grupo formilo; grupo alquil(C1-6)-carbonilo, tal como grupo acetilo, grupo propionilo, grupo butirilo y grupo pivaloílo; grupo alquenil(C2-6)-carbonilo tal como grupo etenoílo, grupo propenoílo y grupo butenoílo; grupo aroílo, tal como grupo benzoílo, y similares, preferiblemente grupo acetilo.
El término “aciloxi”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a un grupo acilo que está unido a -O-. De igual forma, “acilamino” es un grupo acilo que está unido a -N(R'')-, en donde R'' es H o alquilo(C1-6).
El término “grupo carbocíclico” se refiere a un grupo de hidrocarburo cíclico totalmente saturado que contiene de 1 a 4 anillos, preferiblemente 1 anillo, y de 3 a 8 carbonos por anillo. Tales grupos de ejemplo incluyen ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, etc.
El término “carbociclooxi” se refiere a un grupo carbocíclico tal y como está descrito más arriba unido a través de un enlace de oxígeno (-O-).
El término “carbocicloalquilo” se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo carbocíclico, en donde el carbociclo y el alquilo son tal y como están esbozados más arriba.
El término “carbocicloalquenilo” se refiere a un grupo alquenilo sustituido con un grupo carbocíclico, en donde el grupo carbocíclico y el alquenilo están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “arilo” se refiere a grupos de hidrocarburo aromático cíclicos que tienen de 6 a 20, preferiblemente 6 a 10, átomos de carbono en el esqueleto, y tienen de 1 a 3 anillos aromáticos, sobre todo grupos monocíclicos o bicíclicos, tales como fenilo, bifenilo o naftilo. Cuando contienen dos o más anillos aromáticos (bicíclicos, etc.), los anillos aromáticos del grupo arilo pueden estar unidos por un solo punto (p. ej., bifenilo) o pueden estar fusionados (p. ej., naftilo, fenantrenilo y similares).
El término “arilalquilo” se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo arilo, en donde el arilo y el alquilo están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “arilalquenilo” se refiere a un grupo alquenilo sustituido con un grupo arilo, en donde el arilo y el alquenilo están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “arilalquinilo” se refiere a un grupo alquinilo sustituido con un grupo arilo, en donde el arilo y el alquinilo están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “ariloxi” se refiere a un grupo arilo tal y como está descrito más arriba unido a través de un enlace de oxígeno (-O-), por ejemplo, grupo fenoxi, grupo antriloxi, grupo bifeniloxi y similares, preferiblemente un grupo fenoxi.
El término “arilalcoxi” se refiere a un grupo alcoxi sustituido con un grupo arilo, en donde el arilo y el alcoxi están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “grupo heterocíclico” se refiere a los grupos cíclicos totalmente saturados, o parcial o totalmente insaturados (por ejemplo, sistemas de anillos monocíclicos con 3 a 7 miembros, bicíclicos con 7 a 11 miembros, o tricíclicos con 10 a 16 miembros) que tienen al menos un heteroátomo en al menos un anillo que contiene átomos de carbono. Cada anillo del grupo heterocíclico que contiene un heteroátomo puede tener 1, 2, 3 o 4 heteroátomos seleccionados de átomos de nitrógeno, átomos de oxígeno y/o átomos de azufre, en donde los heteroátomos de nitrógeno y azufre pueden estar opcionalmente oxidados y los heteroátomos de nitrógeno pueden estar opcionalmente cuaternizados (el término “heteroarilio” se refiere a un grupo heteroarilo que lleva un átomo de nitrógeno cuaternario y así una carga positiva). El grupo heterocíclico puede estar unido al resto de la molécula en cualquier heteroátomo o átomo de carbono del anillo o del sistema de anillos. Los grupos heterocíclicos monocíclicos de ejemplo incluyen óxido de etileno, azetidinilo, pirrolidinilo, pirrolilo, pirazolilo, oxetanilo, pirazolinilo, imidazolilo, imidazolinilo, imidazolidinilo, oxazolilo, oxazolidinilo, isoxazolinilo, isoxazolilo, tiazolilo, tiadiazolilo, tiazolidinilo, isotiazolilo, isotiazolidinilo, furilo, tetrahidrofurilo, tienilo, oxadiazolilo, piperidinilo, piperazinilo, 2-oxopiperazinilo, 2-oxopiperidinilo, 2-oxopirrolidinilo, 2­ oxoazepinilo, azepinilo, hexahidrodiazepinilo, 4-piperidonilo, piridilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, triazinilo, triazolilo, tetrazolilo, tetrahidropiranilo, morfolinilo, tiamorfolinilo, sulfóxido de tiamorfolinilo, tiamoilfolinilsulfona, 1,3-dioxolano y tetrahidro-1,1 -dioxotienilo y similares. Los grupos heterocíclicos bicíclicos de ejemplo incluyen indolilo, isoindolilo, benzotiazolilo, benzodioxolilo, benzoxazolilo, benzoxadiazolilo, benzotienilo, quinuclidinilo, quinolinilo, tetrahiroisoquinolinilo, isoquinolinilo, bencimidazolilo, benzopiranilo, indolizinilo, benzofurilo, benzofurazanilo, cromonilo, cumarinilo, benzopiranilo, cinolinilo, quinoxalinilo, indazolilo, pirrolopiridilo, furopiridinilo (tal como furo[2,3-c]piridinilo, furo[3,2-b]piridinilo o fu ro[2,3-b]piridinilo), dihidrobenzodioxinilo, dihidrodioxidobenzotiofenilo, dihidroisoindolilo, dihidroindolilo, dihidroquinolinilo, dihidroquinazolinilo (tal como 3,4-dihidro-4-oxoquinazolinilo), triazinilazepinilo, tetrahidroquinolinilo y similares. Los grupos heterocíclicos tricíclicos de ejemplo incluyen carbazolilo, benzidolilo, fenantrolinilo, dibenzofuranilo, acridinilo, fenantridinilo, xantenilo y similares.
El término “heterociclooxi” se refiere a un grupo heterocíclico tal y como está descrito más arriba unido a través de un enlace de oxígeno (-O-).
El término “heterocicloalquilo” se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo heterocíclico, en donde el heterociclo y el alquilo están definidos tal y como está esbozado más arriba.
El término “heteroarilo”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a un anillo aromático de 5 a 6 miembros que puede contener, como heteroátomos, oxígeno, azufre y/o nitrógeno, y al cual se puede fusionar un anillo aromático más. Los ejemplos no limitantes y sin limitación de grupos heteroarilo son benzofuranilo, furilo, tienilo, benzotienilo, tiazolilo, imidazolilo, oxazolilo, oxadiazolilo, tiadiazolilo, benzotiazolilo, triazolilo, tetrazolilo, isoxazolilo, isotiazolilo, pirrolilo, piranilo, tetrahidropiranilo, pirazolilo, piridilo, quinolinilo, isoquinolinilo, purinilo, carbazolilo, benzoxazolilo. benzamidazolilo, indolilo, isoindolilo, pirazinilo, diazinilo, pirazina, triaziniltriazina, tetrazinilo, tetrazolilo, benzotiofenilo, benzopiridilo y bencimidazolilo.
El término “heteroariloxi” se refiere a un grupo heteroarilo tal y como está descrito más arriba unido a través de un enlace de oxígeno (-O-).
Los términos “heteroarilalquilo”, “heteroarilalquenilo” y “heteroarilalquinilo” se refieren a grupos en los que un grupo alquilo, alquenilo o alquinilo está sustituido con un grupo heteroarilo, en donde el heteroarilo y el alquilo, alquenilo y alquinilo están definidos tal y como se esbozó más arriba.
El término “heteroarilalcoxi” se refiere a un grupo alcoxi con un grupo heteroarilo, en donde el heteroarilo y el alcoxi están definidos tal y como se esbozó más arriba.
“Sustituido”, tal y como se utiliza en la presente memoria, se refiere a un grupo sustituido con uno o más sustituyentes, preferiblemente de 1 a 4 sustituyentes, en cualquier punto de unión disponible. Los sustituyentes de ejemplo incluyen, pero sin limitarse a ellos, uno o varios de los grupos siguientes: alquilo, alcoxi, halo, hidroxi, carboxi (a saber, -COOH), alcoxicarbonilo, alquilcarboniloxi, amino (a saber, -NH2), tiol y nitro.
En una realización alternativa preferida, R1 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo, más preferiblemente hidrógeno.
En una realización alternativa preferida, R2 se selecciona del grupo que consiste en hidroxi y alcoxi.
En una realización alternativa preferida, R3 se selecciona del grupo que consiste en hidroxi y alcoxi.
En otra realización alternativa preferida, R2 y R3 están enlazados entre sí y forman una estructura -O(CH2)nO-, en donde n es de 1 a 3, preferiblemente n es 1.
En una realización alternativa preferida, R4 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno, hidroxi y alcoxi, más preferiblemente hidrógeno.
En una realización alternativa preferida, R5 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo, más preferiblemente hidrógeno.
En una realización alternativa preferida, R6 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo, más preferiblemente hidrógeno.
En una realización alternativa preferida, R7 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno, halo, ciano, nitro, hidroxi y alcoxi, más preferiblemente R7 es hidrógeno, halo, hidroxi o alcoxi, incluso más preferiblemente R7 es halo. En una realización alternativa preferida, R8 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno, hidroxi y alcoxi. En una realización alternativa preferida, R9 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno, halo, hidroxi y alcoxi. En una realización alternativa preferida, R10 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo, más preferiblemente hidrógeno.
En una realización alternativa preferida, R11 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo.
En una realización alternativa preferida, R12 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo. En una realización alternativa preferida, R13 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo. En una realización alternativa preferida, R14 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo. En una realización alternativa preferida, R15 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y alquilo.
En otra realización alternativa preferida del compuesto de la invención, R7 es halo, ciano, hidroxilo o nitro, azido, alcoxi, tío, alquiltío, amino, haloalcoxi, alquilo o haloalquilo.
En una realización alternativa preferida, R7 es halo, ciano, hidroxilo o nitro, más preferiblemente halo.
En otra realización alternativa preferida, R2 y R3 se seleccionan cada uno independientemente de hidroxi y alcoxi(C1-6); o R2 y R3 juntos forman una estructura -O-(CH2)n-O-, en donde n es de 1 a 3, preferiblemente n es 1.
En una realización alternativa preferida, el compuesto se selecciona del grupo que consiste en
Figure imgf000046_0001
y
Figure imgf000047_0001
en donde cada R16 se selecciona independientemente de H y alquilo(Ci-4); o dos grupos R16 adyacentes pueden estar enlazados para formar un grupo de puente que tiene de 1 a 3 átomos de carbono; así como profármacos, ésteres, solvatos o sales de los mismos.
En una realización alternativa más preferida, el compuesto se selecciona del grupo que consiste en:
Figure imgf000047_0002
3-(4-Hidroxifenil)-5-(3,4-dihidroxifenil)isoxazol
Figure imgf000047_0003
3,5-Bis(3,4-dimetoxifenil)pirazol
Figure imgf000047_0004
5-(3-Bromofenil)-3-(3,4-metilendioxifenil)pirazol
Figure imgf000047_0005
5-(3-Fluorofenil)-3-(3,4-metilendioxifenil)pirazol
3-(3,4-Dihidroxifenil)-5-(3-fluorofenil)pirazol
Figure imgf000048_0001
Hidrobromuro de 2,4-bis(3,4-dihidroxifenil)imidazol
Figure imgf000048_0002
3-(3,4-Dimetoxifenil)-5-(3,4,5-trimetoxifenil)pirazol
Figure imgf000048_0003
Hidrobromuro de 5-(3,5-dibromofenil)-3-(3,4,5-trihidroxifenil)pirazol
Figure imgf000048_0004
5-(3-Bromofenil)-3-(2-hidroxifenil)pirazol (10353_F11)
Los compuestos de la realización alternativa se pueden marcar de manera detectable.
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Claims (17)

REIVINDICACIONES
1. Un compuesto representado por la fórmula (E):
Figure imgf000051_0001
en donde
X, Y, M, Z y L se definen de manera que el anillo D está direccionalmente seleccionado de las siguientes estructuras:
Figure imgf000051_0002
en donde:
R8 and R9 se selecciona de hidrógeno; alquilo(C1-4); -alquileno(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo (C1-4) o halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br e I;
RE1 y RE2 están unidos a átomos de carbono adyacentes, y RE1 y RE2 juntos forman no direccionalmente una estructura - T-(CRE7RE8)nV-, en donde T se selecciona de CRE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O , así como las estructuras correspondientes en las que está presente un doble enlace; en donde al menos uno de T y V es NH u O;RE7 y RE8 son independientemente H o F;
RE9 y RE10 son independientemente H o F;
n es 1 a 3;
RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10
m es 0 a 2;
RE4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
p es 0 o 1;
aí como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable o el compuesto representado por la fórmula (E);
con la condición de que los siguientes compuestos están excluidos:
Figure imgf000051_0003
Figure imgf000052_0001
2. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el compuesto está representado por la fórmula (E) es un compuesto representado por la fórmula (A)
Figure imgf000052_0002
en donde:
m, n, p, T, V, X, Y, L, M, Z, RE7, RE8 y Hal se definen como en la reivindicación 1;
RA1 y RA2 juntos forman una estructura no direccionalmente -T-(CRE7RE8)n-V-;
RA3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10; y
RA4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
así como un hidrato o una sal farmacéuticamente aceptable del compuesto representado por la fórmula (A).
3. El compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 o 2, en donde el anillo D se selecciona direccionalmente de las siguientes estructuras:
Figure imgf000052_0003
en donde
R8 es como se define en la reivindicación 1; y
R9 es H.
4. El compuesto de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el compuesto se selecciona del grupo que consiste en:
Figure imgf000053_0001
en donde
R se selecciona de; alquilo C1-4; y alquileno-(Ci-4)-halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I; y
RE7 y RE8 son independientemente H o F;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
4. El compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 en donde el compuesto se selecciona del grupo que consiste en :
Figure imgf000053_0002
en donde
R se selecciona de hidrógeno; alquilo C1-4; y alquileno-(C1-4)-halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I; y
RE7 y RE8 son independientemente H or F;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
5. El compuesto de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el compuesto se selecciona del grupo que consiste en:
Figure imgf000053_0003
en donde Hal es Cl o Br;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
6. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 que se selecciona de
Figure imgf000053_0004
Figure imgf000054_0001
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
7. El compuesto representado por la fórmula E
Figure imgf000054_0002
en donde
X, Y, M, Z y L se definen, de manera que el anillo D se selecciona direccionalmente de la siguiente estructura:
Figure imgf000054_0003
en donde
R3 y R9 se seleccionan del hidrógeno; alquilo C1-4; alquileno-(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo arilo se puede sustituir opcionalmente por alquilo C1-4 o halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I;
RE1 y RE2 están enlzazados a átomos de carbono adyacentes, y RE1 y RE2 juntos foman no direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-, en donde T se selecciona de CRE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O, así como estructuras correspondientes en las que el doble enlace está presente, en donde al menos uno T y V es NH o O; RE7 y RE8 son independientemente H o F;
RE9 y RE10 son independientemente H o F;
n es 1 a 3;
RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
m es 0 a 2;
RE4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
p es 0 a 2;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
En donde el compuesto está marcado de manera detectable, con un marcador seleccionado de 18F, 125l, 131l, 77Br y 76Br y 11C.
8. Una composición farmacéutica o diagnóstica para usa en terapia o diagnósticos, en donde la composición farmacéutica o diagnóstica comprende un compuesto representado por la fórmula (E)
Figure imgf000055_0001
en donde
X, Y, M, Z y L se definen, de manera que el anillo D se selecciona direccionalmente de las siguientes estructuras:
Figure imgf000055_0002
en donde
R8 y R9 se seleccionan de hidrógeno; alquilo C1-4; alquileno-(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo C1-4 o halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I;
RE1 y RE2 están enlazados a átomos de carbono adyacentes, y RE1 y RE2 juntos forman uno direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-, en donde T se selecciona de CRE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O, así como estructuras correspondientes en las que un doble enlace está presente; en donde al menos uno de T y V es NH o O;
RE7 y RE8 son independientemente H o F;
RE9 y RE10 son independientemente H o F;
n es 1 a 3;
RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
m es 0 a 2;
RE4 es un átomo de halogeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
p es 0 o 1;
en donde el compuesto está opcionalmente marcado de forma detectable con un marcador seleccionado del grupo que consiste en 18F, 125I, 123I, 131I, 77Br, 76Br y 11C;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable, del compuesto representado por la fórmula (E), y opcionalmente un vehículo farmacéuticamente aceptable.
9. Un compuesto representado por la fórmula (E)
Figure imgf000056_0001
en donde
X, Y, M, Z y L se definen de manera que el anillo D se selecciona direccionalmente de las siguientes estructuras:
Figure imgf000056_0002
en donde
R3 y R9 se seleccionan de hidrógeno; alquilo C1-4; alquileno-(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo de arilo puede estar opcionalmente sustituido por alquilo C1-4 o halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I;
RE1 y RE2 están enlazadas a átomos de carbono adyacente, y RE1 y RE2 juntos forman no direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-, en donde T se selecciona de c RE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O, así como las estructuras correspondientes en las que el doble enlace está presente; en donde al menos uno de Ty V es NH o O; RE7 y RE8 son independientemente H or F;
RE9 y RE10 son independientemente H o F;
n es 1 a 3;
RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
m es 0 a 2;
RE4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
p es 0 a 2;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable de estos compuestos.
para ser usado en el tratamiento o la prevención de una enfermedad relacionada con la agregación de una proteína y/o una enfermedad neurodegenerativa.
en donde la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en enfermedad de Parkinson, enfermedad causada por los priones, enfermedad de Alzheimer, atrofia multisistémica, enfermedad difusa con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades Poly-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloide familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis AL), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis AA), diabetes tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria y amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
10. Uso de un compuesto como se define en la reivindicación 9, así como un hidrato o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para la preparación de una composición farmacéutica para tratar o prevenir una enfermedad ligada a la agregación de proteínas y/o una enfermedad neurodegenerativa, donde la enfermedad es seleccionado del grupo que consiste en enfermedad de Parkinson, enfermedad de priones, enfermedad de Alzheimer, atrofia multisistémica, enfermedad de cuerpos de Lewy difusos, demencia frontotemporal, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington, ataxias espinocerebelosas y otras enfermedades por poli-Q, angiopatía amiloide cerebral hereditaria, polineuropatía amiloidótica familiar, amiloidosis sistémica primaria (amiloidosis AL), amiloidosis sistémica reactiva (amiloidosis Aa ), diabetes de tipo II, amiloidosis localizada por inyección, amiloidosis de la microglobulina p2, amiloidosis no neuropática hereditaria y amiloidosis sistémica hereditaria finlandesa.
11. El compuesto para ser usado de acuerdo con la reivindicación 9 o el uso de acuerdo con la reivindicación 10, en donde la enfermedad relacionada con la agregación de una proteína caracterizado por que la presencia de una forma agregada de al menos una proteína o un fragmento o derivado de la misma, en donde la proteína se selecciona del grupo que consiste en proteína priónica, proteína precursora del amiloide (PPA), a-sinucleína, superóxido dismutasa, proteína t, inmunoglobulina, amiloide A, transtirretina, microglobulina p2, cistatina C, apolipoproteína A1, TDP-43, amilina, ANF, gelsolina, insulina, lisozima, fibrinógeno, huntingtina y ataxina, y otras proteínas con un tramo de poli-Q.
12. El compuesto para ser usado de acuerdo con la reivindicación 9 o el uso de acuerdo con la reivindicación 10, en donde la enfermedad causada por los priones se selecciona de enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, variante de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, enfermedad genética humana causada por priones, encefalopatía espongiforme bovina (EEB) y tembladera de las ovejas.
13. Uso de un compuesto representado por la fórmula (E)
Figure imgf000057_0001
en donde
X, Y; M, Z y L se definen de manera que el anillo D se selecciona direccionalmente de las estructuras siguientes:
Figure imgf000057_0002
en donde
R3 y R9 se selecciona de hidrógeno; alquilo C1-4; alquileno-(C1-4)-halógeno; y arilo C6-10, en donde el anillo de arilo puede ser opcionalmente sustituido por alquilo C1-4 o halógeno;
Hal se selecciona de F, Cl, Br, y I;
RE1 y RE2 están enlazados a átomos de carbono adyacentes, y RE1 y RE2 juntos forman no direccionalmente una estructura -T-(CRE7RE8)n-V-, en donde T se selecciona de CRE9RE10, NH y O y V se selecciona de CRE9RE10, NH y O, así como estructuras correspondientes en la que está presente un doble enlace; en donde al menos uno de T y V es NH o O; RE7 y RE8 son independientemente H o F;
RE9 y RE10 son independientemente H o F;
n es 1 a 3;
RE3 es un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
m es 0 a 2;
RE4 es un átomo de halógeno, un grupo alquilo C1-6 o un grupo arilo C5-10;
p es 0 a 2;
en donde el compuesto está opcionalmente marcado de forma detectable con un marcador seleccionado del grupo que consiste en 18F, 125I, 123I, 131I, 77Br, 76Br y 11C;
así como un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable del compuesto representado por la fórmula (E)
para inhibir la agregación de una proteína in vitro o ex vivo.
14. Un compuesto como se define en la reivindicación 7, un hidrato o sal farmacéuticamente aceptable del mismo para ser usado en un método de toma de imágenes de los depósitos de la proteína agregada, en donde el método comprende las etapas de:
(i) introducir una cantidad detectable de una composición que comprende un compuesto marcado de manera detectable tal y como está definido en la reivindicación 7 en un dujero;
(ii) dejar el tiempo suficiente para que el compuesto se asocie a la proteína agregada; y
(iii) detectar el compuesto asociado a la proteína agregada.
15. Un kit para preparar un compuesto marcado de manera detectable tal y como está definido en la reivindicación 7, en donde el kit comprende al menos dos compuestos precursores que, tras la reacción, forman el compuesto tal y como está definido en la reivindicación 7, un hidrato o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde al menos uno de X, Y y L es -N(R8)- y R8 comprende un marcador detectable seleccionado del grupo que consiste en 18F, 125l, 123l, 1311, 77Br, 76 y B ^C .
16. El compuesto para usarse de acuerdo con la reivindicación 14, en donde el marcador detectable se selecciona de 18F y 11C.
17. El kit de acuerdo con la reivindicación 15, en donde el marcador de manera detectable se selecciona de 18F y 11C.
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