ES2749103T3 - Benzoimidazol-1,2-ilamidas como activadores del canal Kv7 - Google Patents

Benzoimidazol-1,2-ilamidas como activadores del canal Kv7 Download PDF

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Justin K Belardi
Charles A Flentge
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David A Mareska
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Abstract

Un compuesto representado por la fórmula:**Fórmula** en donde D es ciclobutilo opcionalmente sustituido, fenilo opcionalmente sustituido, isoxazolilo opcionalmente sustituido, piridinilo opcionalmente sustituido, isopropilo o t-butilo; A es alquilo C2-8; X es H, F, CF3, fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido; Y es H, F, Cl, Br, I, CF3, OH, O-alquilo C1-5, alquil C0-6-amino o fluoroalquilo C0-6-amino; R1 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, alquilo C1-4-CO2, alquilo C1-4, -CH2CO2H, -CH2CO2CH2CH3 o -CH2CON(CH3)2 o hidroxialquilo C1-4; R2 es H, F, Cl, Br, I, -CH2OH, -CO2Me o -C(CH3)2OH; R3 es H, F, Cl, Br o I; R4 es H, F, Cl, Br, I, -CH3 o -CF3; y en donde los sustituyentes opcionales de D y X se seleccionan independientemente de F, Cl, Br, I, CN, NO2, alquilo C1-4, alquil C1-4-OH, O-alquilo C1-3, CF3, COH, CO-alquilo C1-4, CO2H, CO2-alquilo C1-4, NH2, alquil C1-4-amino, fluoroalquilo C1-6 o fluoroalcoxi C1-6.

Description

DESCRIPCIÓN
Benzoimidazol-1,2-ilamidas como activadores del canal Kv7
Referencia cruzada con casos relacionados
Esta solicitud reivindica el beneficio de la solicitud provisional de EE. UU. n.° 62/050.023, presentada el 12 de septiembre de 2014.
Antecedentes
Los canales de potasio (K+), presentes en las membranas plasmáticas de la mayoría de tipos celulares, son la clase más diversa de todos los canales iónicos y están asociados con un amplio intervalo de funciones fisiológicas incluyendo la regulación de las propiedades eléctricas de las células excitables. Las subunidades formadoras de poro primarias (a) de estos canales catiónicos altamente selectivos se dividen en tres clases estructurales primarias basadas en el número de regiones transmembrana (TM) y regiones de poro (P): actualmente son conocidos los canales de K+ 6TM/1P, 2TM/1P y 4TM/2P. Los genes Kv7 (originalmente denominados KCNQ, un nombre asignado por el Comité de nomenclatura génica HUGO (HGNC)) se asignaron a una subfamilia de canales de K+ accionados por voltaje por la International Union of Pharmacology (IUPHAR). La subfamilia de Kv7 consiste en cinco subunidades a formadoras de poro homólogas, Kv7.1- 7.5, que tienen una estructura típica de los canales de K+ accionados por voltaje con 6 regiones TM (S1-S 6 ) flanqueadas por dominios intracelulares N-terminales y C-terminales, un dominio sensor de voltaje típico localizado en S4 que comprende residuos cargados positivamente alternados y una sola región P entre S 5 y S 6 de cada subunidad. Los canales se forman como tetrámeros de las subunidades a primarias, como homotetrámeros o heterotetrámeros. Las neuronas son conocidas por expresar canales Kv7 que comprenden subunidades a Kv7.2-7.5. Algunos de estos productos génicos pueden ser exclusivamente neuronales mientras que otros, tales como Kv7.4 y Kv7.5, pueden encontrarse en otros tejidos tales como músculo liso y esquelético.
Los canales M nativos, y la correspondiente corriente M macroscópica, se caracterizaron por primera vez en neuronas simpáticas de anfibios. Los canales M eran notables porque se activaban y desactivaban lentamente, eran activos a potenciales de membrana en o cerca del potencial de membrana de reposo de neuronas y los agonistas colinérgicos muscarínicos producían una reducción de la corriente M, demostrando un enlace directo e inhibidor entre los receptores acoplados a proteína G (GPCR) y una corriente de K+ fisiológica. No fue hasta la clonación de esta subfamilia de genes que se estableció la identidad farmacológica y biofísica entre los heteromultímeros Kv7.2/7.3 (y probablemente Kv7.5/ 7.3) y el canal “M” elusivo, proporcionando nuevas evidencias significativas de su importancia en la regulación neuronal.
La distribución de estos canales, tanto por regiones como por desarrollo, así como sus características biofísicas, apoya su papel en la provisión de resistencia permanente a influencias excitatorias despolarizantes. En condiciones fisiológicas, como se demostró con canales M nativos, pueden ser muy eficaces en la regulación de la excitabilidad subumbral de ciertas poblaciones neuronales con papeles significativos en la regulación de la frecuencia y en última instancia del patrón de descarga de potencial de acción en muchos tipos de neuronas. Su importancia en la regulación neuronal estaba acompañada por el descubrimiento de que las mutaciones de Kv7 neuronal conducen a convulsiones neonatales familiares benignas (CNFB), indicando que la reducción o retirada de la influencia de los canales Kv7.2 y Kv7.3 puede alterar drásticamente la excitabilidad neuronal. Los análisis de mutaciones demostraban su implicación en las CNFB y sugerían su utilidad como dianas para fármacos antiepilépticos (FAE).
Al contrario que la terminología farmacológica establecida para GCPR, el modo de acción de los moduladores de canal de K+, en particular compuestos que activan el canal, se sigue refinando. La aplicación de técnicas de fijación de voltaje al estudio de la farmacología de canales iónicos posibilitaba estudios biofísicos detallados sobre corrientes en célula completa o canales individuales, permitiendo cierta caracterización de la naturaleza de las interacciones de compuesto-canal, pero no evitando la confusión continua sobre la terminología. El término abridor o activador se usa comúnmente en la bibliografía, pero no describe adecuadamente el modo de acción de todos estos compuestos “moduladores positivos”. En general, los abridores o activadores se espera que aumenten la probabilidad de apertura del canal o que aumenten la amplitud de corriente macroscópica, pero esta nomenclatura es ciertamente demasiado simplista. Por ejemplo, la retigabina, el primer abridor de Kv7 divulgado públicamente, tiene un perfil complejo e interesante porque tiene actividad inhibidora a potenciales de membrana mayores. Los abridores del canal Kv7 neuronal pueden funcionar concertadamente con la actividad de un canal en el intervalo de voltaje de activación “normal” y potenciar las corrientes sin afectar significativamente el umbral de activación, mientras que otros pueden alterar significativamente el umbral de activación. Además, algunos abridores parecen retirar la dependencia del voltaje de la activación enteramente. Si estos efectos representan algún continuo es actualmente dudoso, puesto que los efectos son a menudo dependientes de la concentración. Claramente, los modos de interacción de compuestos que pueden aumentar la corriente de canal son complejos y en la mayoría de casos no bien entendidos, y las implicaciones de estos perfiles sobre la sensibilidad neuronal y la fisiología de los sistemas son también dudosas. La retigabina es moderadamente potente, no altamente específica, pero es un abridor muy eficaz de los canales Kv7.2 , Kv7.5 y Kv7 heteromultiméricos. Sus efectos se caracterizan por un aumento significativo de la corriente de canal en un intervalo de voltaje estrecho. Como se menciona anteriormente, a voltajes más positivos el abridor es menos eficaz y en ciertas condiciones la corriente de canal disminuye significativamente a voltajes más positivos respecto a las corrientes de control (esta dependencia del voltaje “cruzada” de la acción del abridor es una característica de muchos abridores del canal Kv7 neuronal). Este efecto es también dependiente de la concentración y es más pronunciado a concentraciones mayores.
Compendio
Se describen en el presente documento compuestos que pueden ser potentes y/o al menos sesgados para el heteromultímero Kv7.2/7.3 frente al homomultímero Kv7.4. Estos compuestos pueden tener efectos secundarios indeseados reducidos en comparación con retigabina.
Por consiguiente, la invención proporciona un compuesto representado por la fórmula:
Figure imgf000003_0001
en donde D es ciclobutilo opcionalmente sustituido, fenilo opcionalmente sustituido, isoxazolilo opcionalmente sustituido, piridinilo opcionalmente sustituido, isopropilo o t-butilo; A es alquilo C2-8; X es H, F, CF3, fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido; Y es H, F, Cl, Br, I, CF3, OH, O-alquilo C1-5, alquil Cü-6-amino o fluoroalquil Cü-6-amino; R1 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1-4, alquilo C1-4, -CH2CO2H, -CH2CO2CH2CH3 o -CH2CON(CH3)2 o hidroxialquilo C1.4; R2 es H, F, Cl, Br, I, -CH2OH, -CO2Me o -C(CH3)2OH; R3 es H, F, Cl, Br o I; R4 es H, F, Cl, Br, I, -CH3 o -CF3; y en donde los sustituyentes opcionales de D y X se seleccionan independientemente de F, Cl, Br, I, CN, NO2, alquilo C1-4, alquil C1-4-OH, O-alquilo C1-3, CF3, COH, CO-alquilo C1-4, CO2H, CO2-alquilo C1.4, NH2, alquil C1-4-amino, fluoroalquilo C1.6 o fluoroalcoxi C1-6.
Algunas realizaciones incluyen un compuesto descrito en el presente documento para su uso en el tratamiento de epilepsia, dolor, jaqueca o acúfenos.
Descripción detallada
A menos que se indique otra cosa, cuando se hace referencia a un compuesto o rasgo estructural químico tal como benzoimidazol-1,2-ilo como “opcionalmente sustituido”, incluye un rasgo que no tiene sustituyentes (concretamente, no sustituido) o un rasgo que está “sustituido”, lo que significa que el rasgo tiene uno o más sustituyentes. El término “sustituyente” tiene el significado más amplio conocido por un especialista en la técnica e incluye un resto que reemplaza a uno o más átomos de hidrógeno enlazados con el compuesto o rasgo estructural original. En algunas realizaciones, un sustituyente puede ser un resto orgánico ordinario conocido en la técnica, que puede tener un peso molecular (p. ej., la suma de las masas atómicas de los átomos del sustituyente) de 15 Da a 50 Da, de 15 Da a 100 Da, de 15 Da a 150 Da, de 15 Da a 200 Da, de 15 Da a 300 Da o de 15 Da a 500 Da. En algunas realizaciones, un sustituyente comprende, o consiste en: 0-30, 0-20, 0-10 o 0-5 átomos de carbono y 0-30, 0-20, 0-10 o 0-5 heteroátomos, en donde cada heteroátomo puede ser independientemente: N, O, S, Si, F, Cl, Br o I; a condición de que el sustituyente incluya un átomo de C, N, O, S, Si, F, Cl, Br o I. Los ejemplos de sustituyentes incluyen, pero sin limitación, alquilo, alquenilo, alquinilo, heteroalquilo, heteroalquenilo, heteroalquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxi, alcoxi, ariloxi, acilo, aciloxi, alquilcarboxilato, tiol, alquiltio, ciano, halógeno, tiocarbonilo, O-carbamilo, N-carbamilo, O-tiocarbamilo, N-tiocarbamilo, C-amido, N-amido, S-sulfonamido, N-sulfonamido, isocianato, tiocianato, isotiocianato, nitro, sililo, sulfenilo, sulfinilo, sulfonilo, halogenoalquilo, halogenoalcoxilo, trihalogenometanosulfonilo, trihalogenometanosulfonamido, amino, etc.
Por conveniencia, la expresión “peso molecular” se usa con respecto a un resto o parte de una molécula para indicar la suma de las masas atómicas de los átomos en el resto o parte de una molécula, aunque puede no ser una molécula completa.
Las estructuras asociadas con algunos de los nombres químicos a los que se hace referencia en el presente documento se representan a continuación. Las estructuras pueden estar no sustituidas, como se muestra a continuación, o un sustituyente puede estar independientemente en cualquier posición normalmente ocupada por un átomo de hidrógeno cuando la estructura está no sustituida. A menos que se indique un punto de enlace por —I , el enlace puede aparecer en cualquier posición ocupada normalmente por un átomo de hidrógeno.
Figure imgf000004_0001
Como se usa en la presente memoria, el término “alquilo” tiene el significado más amplio entendido generalmente en la técnica y puede incluir un resto compuesto por carbono e hidrógeno que no contiene dobles o triples enlaces. Alquilo puede ser alquilo lineal, alquilo ramificado, cicloalquilo o una combinación de los mismos y, en algunas realizaciones, puede contener de 1 a 35 átomos de carbono. En algunas realizaciones, alquilo puede incluir alquilo lineal C1-10, tal como metilo (-CH3), metileno (-CH2-), etilo (-CH2CH3), etileno (-C2H4-), propileno (-C3CH6-), n-butilo (-CH2CH2CH2CH3), n-pentilo (-CH2CH2CH2CH2CH3), n-hexilo (-CH2CH2CH2CH2CH2CH3), etc.; alquilo ramificado C3-10, tal como C3H7 (p. ej., isopropilo), C4H9 (p. ej. isómeros de butilo ramificados), C5H11 (p. ej. isómeros de pentilo ramificados), C6H13 (p. ej. isómeros de hexilo ramificados), C7H15 (p. ej. isómeros de heptilo), etc.; cicloalquilo C3-10, tales como C3H5 (p. ej. ciclopropilo), C4H7 (p. ej. isómeros de ciclobutilo tales como ciclobutilo, metilciclopropilo, etc.), C5H9 (p. ej. isómeros de ciclopentilo tales como ciclopentilo, metilciclobutilo, dimetilciclopropilo, etc.), C6H11 (p. ej. isómeros de ciclohexilo), C7H13 (p. ej. isómeros de cicloheptilo), etc.; y similares.
Como se usa en el presente documento, el término "carbociclilo” tiene el significado más amplio generalmente entendido en la técnica e incluye anillos libres de heteroátomos, tales como cicloalquilo, p. ej. ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, etc.; cicloalquenilo, p. ej. ciclopropenilo, ciclobutenilo, ciclopentenilo, ciclohexenilo; cicloalquinilo, p. ej. ciclopropinilo, ciclobutinilo, ciclopentinilo, ciclohexinil; así como anillos arilo libres de heteroátomos.
Como se usa en el presente documento, el término “arilo” tiene el significado más amplio generalmente entendido en la técnica y puede incluir un anillo aromático o sistema de anillo aromático tal como fenilo, naftilo, etc.
El término “heterociclilo” incluye cualquier anillo o sistema de anillo que contenga un heteroátomo tal como N, O, S, P, etc. Heterociclilo incluye anillos o sistemas de anillo heteroarílicos (tales como los enumerados a continuación) y anillos o sistemas de anillo no aromáticos. Los ejemplos de heterociclilo no aromático incluyen azetidinilo, oxatanilo, tietanilo, pirrolidinilo, tetrahidrofuranilo, tiolanilo, imidazolidinilo, pirazolidinilo, oxazolidinilo, isoxazolidinilo, tiazolidinilo, isotiazolidinilo, dioxalanilo, ditiolanilo, tetrahidropiranilo, piperidinilo, piperazinilo, morfolino, etc.
El término “heteroarilo” tiene también el significado entendido por un especialista en la técnica e incluye un “arilo” que tiene uno o más heteroátomos en el anillo o sistema de anillo, tal como piridinilo, furilo, tienilo, oxazolilo, tiazolilo, imidazolilo, triazolilo, oxadiazolilo, isoxazolilo, indolilo, quinolinilo, benzofuranilo, benzotienilo, benzoxazolilo, benzotiazolilo, benzoimidazolilo, etc.
A menos que se indique otra cosa, cualquier referencia a un compuesto en el presente documento por estructura, nombre o cualquier otro medio incluye las sales farmacéuticamente aceptables, tales como sales de HCl, HBr, HI, H2SO4, acetato, citrato, sodio, potasio y amonio; profármacos tales como profármacos de éster; formas sólidas alternativas tales como polimorfos, solvatos, hidratos, etc.; tautómeros o cualquier otra especie química que pueda convertirse rápidamente en un compuesto descrito en el presente documento en las condiciones en que se usan los compuestos como se describen.
Si la estereoquímica no está indicada, un nombre o representación estructural incluye cualquier estereoisómero o cualquier mezcla de estereoisómeros.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es:
Figure imgf000005_0001
o alquilo C2-4 opcionalmente sustituido.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es ciclobutilo opcionalmente sustituido, fenilo opcionalmente sustituido, isoxazolilo o isopropilo opcionalmente sustituido.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es ciclobutilo opcionalmente
sustituido. En algunas realizaciones, D es ciclobutilo. En algunas realizaciones, D es
Figure imgf000005_0002
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es isopropilo.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es t-butilo o terc-butilo. Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es fenilo opcionalmente sustituido. En algunas realizaciones, D es
Figure imgf000005_0003
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es piridinilo opcionalmente sustituido, tal como piridin-2-ilo, piridin-3-ilo o piridin-4-ilo opcionalmente sustituido. En algunas realizaciones, D es
Figure imgf000005_0004
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones D es isoxazolilo
opcionalmente sustituido. En algunas realizaciones,
Figure imgf000005_0005
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones A es alquilo C2-8, tal como
Figure imgf000006_0001
lineal o ramificado, lineal o ramificado, lineal o ramificado, v
Figure imgf000006_0007
lineal o ramificado, nea o ram ca o, que contene un an o, que
Figure imgf000006_0002
contiene un anillo, y que contiene un anillo, q
contiene un sistema de anillo bicíclico. y ue contiene un anillo, o y que Con respecto a cualquier representación estructural relevante, X es H, F, CF3, fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido. En algunas realizaciones, X es H. En algunas realizaciones, X es F. En algunas realizaciones, X es CF3.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, si X es fenilo sustituido, puede tener 1, 2 , 3, 4 o 5 sustituyentes. Si X es piridinilo sustituido, puede tener 1, 2 , 3 o 4 sustituyentes.
En algunas realizaciones, Y es H. En algunas realizaciones Y es OH. En algunas realizaciones Y es F. En algunas realizaciones, Y es C F 3. En algunas realizaciones, Y es alquil C1-3-O, tal como -O C H 3, OC2H5, OC3H7. En algunas
Figure imgf000006_0003
realizaciones, Y es (o metil-(2 ,2 ,2-trifluoroetil)amino). En algunas realizaciones, Y es dimetilamino.
X
H 7 \
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones ' es alquilo C2-8
Figure imgf000006_0008
Con respecto a cual uier re resentación estructural relevante, en al unas realizaciones
Figure imgf000006_0004
es hidroxialquilo
C2-8, tal como
Figure imgf000006_0005
Figure imgf000006_0006
Figure imgf000007_0001
/
i— A \
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones es fluoroalquilo
Figure imgf000007_0002
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones Y es alcoxialquilo
Figure imgf000007_0003
C2-8, tal como
/ Ha \ Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones es
Figure imgf000007_0004
hidroxifluoroalquilo C2-8, tal como
Figure imgf000007_0005
Con respecto a cualquier representación estructural relevante,
Figure imgf000008_0001
Figure imgf000008_0002
fenilpiridilo, tal como
/ i— A \ Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones es
Figure imgf000008_0003
fluoroaminoalquilo C2-8 opcionalmente sustituido, tal como
Generalmente, R1-18 puede ser H o cualquier sustituyente, tal como un sustituyente que tiene de 0 a 12 átomos o de 0 a 6 átomos de carbono y de 0 a 5 heteroátomos, en donde cada heteroátomo es independientemente: O, N, S, F, Cl, Br o l, y/o tiene un peso molecular de 15 g/mol a 300 g/mol. Cualquiera de R1-18 puede comprender: a) 1 o más restos alquilo opcionalmente sustituidos con, u opcionalmente conectados por b) 1 o más grupos funcionales tales como C=C, C e C, CO, CO2, CON, NCO2, OH, SH, O, S, N, N=C, F, Cl, Br, I, CN, NO2, CO2H, NH2, etc.; o puede ser un sustituyente que no tiene porción alquilo, tal como F, Cl, Br, I, NO2, CN, NH2, OH, COH, CO2H, etc. En algunas realizaciones, cada uno de R1-18 es independientemente H, F, Cl, Br, l o un sustituyente que tiene un peso molecular de 15 Da a 300 Da, 15 Da a 200 Da, 15 Da a 100 Da o 15 Da a 60 Da, y que consiste en 2 a 5 elementos químicos, donde los elementos químicos son independientemente C, H, O, N, S, F, Cl o Br.
Figure imgf000008_0004
Figure imgf000008_0005
En algunas realizaciones, R1 es -OCH3, -CN, -CF3, -CH2OH, -COOCH2CH3, -C(CH3)2OH, -CHOHCH2CH3, -CHOHCH3, -CHF2, -CH (CH3)2, -C (C H 2CH3)OH, -CH2COOCH2CH3, -C H 2C(CH3)2OH, -CH2COOH o -C H 2CON(CH3)2.
En algunas realizaciones, R2 es H. En algunas realizaciones, R2 es CH2OH. En algunas realizaciones, R2 es -CO2CH3. En algunas realizaciones, R2 es -CH2OH, -CO2Me o -C(CH3)2OH.
En algunas realizaciones, R3 es H.
En algunas realizaciones, R4 es H. En algunas realizaciones, R4 es CH3. En algunas realizaciones, R4 es CF3.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R5 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1-4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1.4. En algunas realizaciones, R5 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R6 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1-4 o hidroxialquilo C1.4. En algunas realizaciones, R6 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R7 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1-4. En algunas realizaciones, R7 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R8 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1-4. En algunas realizaciones, R8 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R9 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1-4 o hidroxialquilo C1.4. En algunas realizaciones, R9 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R10 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1-4. En algunas realizaciones, R10 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R11 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1-4. En algunas realizaciones, R11 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R12 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1-4 o hidroxialquilo C1.4. En algunas realizaciones, R12 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R13 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1-4 o hidroxialquilo C1.4. En algunas realizaciones, R13 es H.
Con respecto a cualquier representación estructural relevante, en algunas realizaciones R14 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1.4, alquilo C1.4 o hidroxialquilo C1-4. En algunas realizaciones, R14 es H.
Algunas realizaciones incluyen:
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Los compuestos descritos en el presente documento (a los que se hace referencia de aquí en adelante como “compuesto en cuestión” o “compuestos en cuestión”) son adecuados para tratar un trastorno asociado con un activador del canal de potasio Kv7. El tratamiento de un trastorno incluye diagnóstico, cura, mitigación, tratamiento o prevención del trastorno en el hombre u otros animales. Realizaciones de la invención proporcionan un compuesto en cuestión para su uso en el tratamiento de epilepsia, dolor, jaqueca o acúfenos. En realizaciones de la invención, el dolor es dolor neuropático, dolor inflamatorio, dolor persistente, dolor oncológico o dolor posoperatorio.
Los excipientes apropiados para su uso en una composición farmacéutica que comprende un compuesto en cuestión (a los que se hace referencia de aquí en adelante como “composiciones en cuestión” o una “composición en cuestión”) pueden incluir, por ejemplo, uno o más portadores, aglutinantes, cargas, vehículos, disgregantes, tensioactivos, auxiliares de dispersión o suspensión, agentes espesantes o emulsionantes, agentes isotónicos, conservantes, lubricantes y similares o combinaciones de los mismos, como sea adecuado para una forma de dosificación particular deseada. Pharmaceutical Sciences de Remington, 16a edición, E. W. Martin (Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1980) divulga diversos portadores usados en la formulación de composiciones farmacéuticamente aceptables y técnicas conocidas para la preparación de los mismos.
Una composición en cuestión de esta divulgación puede formularse para cualquier vía deseable de suministro incluyendo, pero sin limitación, parenteral, intravenosa, intradérmica, subcutánea, oral, inhalativa, transdérmica, tópica, transmucosa, rectal, intracisternal, intravaginal, intraperitoneal, bucal e intraocular.
Las formulaciones parenterales, intradérmicas o subcutáneas pueden ser suspensiones o soluciones acuosas u oleaginosas inyectables estériles. Los vehículos, soluciones, suspensiones y disolventes aceptables pueden incluir, pero sin limitación, agua u otro diluyente estéril; solución salina; solución de Ringer; cloruro de sodio; aceites no volátiles tales como monoglicéridos o diglicéridos; ácidos grasos tales como ácido oleico; polietilenglicoles; glicerina; propilenglicol u otros disolventes sintéticos; agentes antibacterianos tales como alcohol bencílico o metilparabenos; antioxidantes tales como ácido ascórbico o bisulfato de sodio; agentes quelantes tales como ácido etilendiaminotetraacético; tampones tales como acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de la tonicidad tales como cloruro de sodio o dextrosa. El pH puede ajustarse con ácidos o bases, tales como ácido clorhídrico o hidróxido de sodio. Una preparación parenteral puede encerrarse en ampollas, jeringas desechables o viales multidosis hechos de vidrio o plástico.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para uso inyectable pueden incluir soluciones o dispersiones acuosas estériles y polvos estériles para la preparación extemporánea de soluciones o dispersiones inyectables estériles. Para administración intravenosa, los portadores adecuados incluyen, pero sin limitación, solución salina, agua bacteriostática, CREMOPHOR EL® (BASF, Parsippany, NJ) o solución salina tamponada con fosfato (PBS). El disolvente o medio de dispersión puede contener, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo, glicerol, propilenglicol y polietilenglicol líquido y similares) y mezclas adecuadas de los mismos. Puede mantenerse una fluidez apropiada, por ejemplo, mediante el uso de un recubrimiento tal como lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersión y mediante el uso de tensioactivos. Puede conseguirse la prevención del crecimiento de microorganismos mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal y similares. La composición puede incluir también agentes isotónicos tales como, por ejemplo, azúcares; polialcoholes tales como manitol; sorbitol; o cloruro de sodio. La absorción prolongada de composiciones inyectables puede potenciarse mediante la adición de un agente que retarde la absorción, tal como por ejemplo monoestearato de aluminio o gelatina.
Las composiciones orales pueden incluir un diluyente inerte o un portador comestible. Pueden encerrarse en cápsulas de gelatina o comprimirse en comprimidos. Los comprimidos, píldoras, cápsulas, pastillas para chupar y similares pueden contener cualquiera de los siguientes ingredientes, o compuestos de naturaleza similar: un aglutinante tal como celulosa microcristalina, goma de tragacanto o gelatina; un excipiente tal como almidón o lactosa; un agente disgregante tal como ácido algínico, Primogel o almidón de maíz; un lubricante tal como estearato de magnesio; un deslizante tal como dióxido de silicio coloidal; un agente edulcorante tal como sacarosa o sacarina o un agente aromatizante tal como menta piperita, salicilato de metilo o aroma de naranja.
Además de ser adecuadas para administración oral o inyectada, las composiciones para administración sistémica pueden ser para medios transmucosos o transdérmicos. Para administración transmucosa o transdérmica, pueden usarse penetrantes. Tales penetrantes son generalmente conocidos en la técnica e incluyen, por ejemplo, detergentes, sales biliares y derivados de ácido fusídico. La administración transdérmica puede incluir un agente bioactivo y puede formularse en pomadas, ungüentos, geles o cremas como es generalmente conocido en la técnica. Las composiciones para administración transmucosa pueden ser pulverizadores nasales o supositorios.
Un compuesto en cuestión puede ser para administración en una cantidad terapéuticamente eficaz, según un régimen de dosificación apropiado. Como se entiende por un especialista en la técnica, la cantidad exacta requerida puede variar de sujeto a sujeto, dependiendo de la especie del sujeto, la edad y la condición general, la gravedad de la infección, el agente o agentes particulares y el modo de administración. En algunas realizaciones, se administran aproximadamente 0,001 mg/kg a aproximadamente 50 mg/kg de la composición farmacéutica basándose en el peso corporal del sujeto, una o más veces al día, para obtener el efecto terapéutico deseado. En otras realizaciones, se administran aproximadamente 0,01 mg/kg a aproximadamente 25 mg/kg de la composición farmacéutica basándose en el peso corporal del sujeto, una o más veces al día, para obtener el efecto terapéutico deseado.
La dosificación diaria total de un compuesto en cuestión puede determinarse por el médico a cargo dentro del alcance del criterio médico fundado. El nivel de dosis terapéuticamente eficaz específico para cualquier paciente o sujeto particular dependerá de una variedad de factores, incluyendo el trastorno que se esté tratando y la gravedad del trastorno; la actividad del compuesto específico empleado; la composición específica empleada; la edad, peso corporal, salud general, sexo y dieta del paciente o sujeto; el momento de administración, la vía de administración y la tasa de excreción del compuesto específico empleado; la duración del tratamiento; los fármacos usados en combinación o coincidentes con el compuesto específico empleado y otros factores bien conocidos en las técnicas médicas.
Sección de realizaciones
Se contemplan las siguientes realizaciones ejemplares.
Realización 1. Un compuesto representado por la fórmula:
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en donde D es ciclobutilo opcionalmente sustituido, fenilo opcionalmente sustituido, isoxazolilo opcionalmente sustituido, piridinilo opcionalmente sustituido, isopropilo o t-butilo; A es alquilo C2-8; X es H, F, CF3, fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido; Y es H, F, Cl, Br, I, CF3, OH, O-alquilo C1-5, alquil Cü-6-amino o fluoroalquilo Cü-6-amino; R1 es H, F, Cl, Br, CN, OCH3, CHF2, CF3, CO2-alquilo C1-4, alquilo C1-4, -CH2CO2H, -CH2CO2CH2CH3 o -CH2CON(CH3)2 o hidroxialquilo C1.4; R2 es H, F, Cl, Br, I, -CH2OH, -CO2Me o -C(CH3)2OH; R3 es H, F, Cl, Br o I; R4 es H, F, Cl, Br, I, -CH3 o -CF3; y en donde los sustituyentes opcionales de D y X se seleccionan independientemente de F, Cl, Br, I, CN, NO2, alquilo C1-4, alquil C1-4-OH, O-alquilo C1-3, CF3, COH, CO-alquilo C1-4, CO2H, CO2-alquilo C1-4, NH2, alquil C1-4-amino, fluoroalquilo C1-6 o fluoroalcoxi C1-6.
Realización 2. El compuesto de la realización 1, en donde Y es H, F, CF3, OH, O-alquilo C1-5, alquil Cü.6-amino o fluoroalquil Cü-6-amino.
Realización 3. El compuesto de la realización 1 o 2, en donde R1 es Cl, Br, -OCH3, -CN, -CF3, -CH2OH, -COOCH2CH3, -C(CH3)2OH, -CHOHCH2CH3, -CHOHCH3, -CHF2, -CH(CH3)2, -C(CH2CH3)2OH, -CH2COOCH2CH3, -CH2C(CH3)2OH, -CH2COOH o -CH2CON(CH3)2.
Realización 4. El compuesto de la realización 1,2 o 3, en donde R2 es H, F, -CH2OH, -CO2Me o -C(CH3)2OH.
Realización 5. El compuesto de la realización 1,2, 3 o 4, en donde R3 es H.
Realización 6. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4 o 5, en donde R4 es H, -CH3 o -CF3.
Realización 7. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5 o 6, en donde R1 es Cl, Br, CN, OCH3, CF3, -CO2CH2CH3, alquilo C1-4 o hidroxialquilo C1-4.
Realización 8. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es ciclobutilo opcionalmente sustituido.
Realización 9. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es ciclobutilo.
Realización 10. El
Figure imgf000032_0001
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es fenilo opcionalmente sustituido.
Realización 11. El
Figure imgf000032_0002
compuesto de la realización 1, 2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es isoxazolilo opcionalmente sustituido.
Realización 12. El
Figure imgf000032_0003
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es isopropilo.
Realización 13. El
Figure imgf000032_0004
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7, en donde D es t-butilo.
Realización 14. El compuesto de la realización 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 o 12, en donde D es piridinilo opcionalmente sustituido.
Realización 15. El compuesto de la realización 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 o 14, en donde X es fenilo opcionalmente sustituido.
Realización 16. El
Figure imgf000032_0006
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
Figure imgf000032_0005
, en donde X e Realización 17. El
Figure imgf000032_0008
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
Figure imgf000032_0007
14, en donde X e Realización 18. El compuesto de la realización 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 o 14, en donde X es piridinilo opcionalmente sustituido.
Realización 19. El
Figure imgf000032_0010
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
Figure imgf000032_0009
14, en donde X e Realización 20. El
Figure imgf000032_0011
compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde Y es H.
Realización 21. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es OH.
Realización 22. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es F.
Realización 23. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es CF3.
Realización 24. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es O-alquilo C1-3.
Realización 25. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es dimetilamino.
Realización 26. El compuesto de la realización 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 o 19, en donde
Y es metil-(2,2,2-trifluoroeti|)amino.
Realización 27. Un compuesto representado por la fórmula:
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Realización 28. Una realización de esta divulgación incluye una composición que comprende un compuesto de la realización 1,2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,22 , 23, 24, 25, 26 o 27, en donde la composición es farmacéuticamente aceptable.
Realización 29. Una realización de esta divulgación incluye una forma de dosificación farmacéutica que comprende un compuesto de la realización 1,2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,22 , 23, 24, 25, 26 o 27.
Realización 30. Una realización de esta divulgación incluye un compuesto de la realización 1,2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 ,21,22 ,23 , 24, 25, 26 o 27, para su uso en tratamiento.
Realización 31. Un compuesto de la realización 1,2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26 o 27 para su uso en el tratamiento de epilepsia, dolor, jaqueca o acúfenos.
Realización 32. El compuesto para su uso según la realización 31, en donde el dolor es dolor neuropático, dolor inflamatorio, dolor persistente, dolor oncológico o dolor posoperatorio.
Sección experimental
Esquema 1
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El esquema 1 muestra una metodología general para la síntesis de 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas 1.5. Se hace reaccionar un 1-fluoro-2-nitrobenceno 1.1 apropiadamente sustituido con una amina primaria procurando 1-amino-2-nitrobenceno 1.2. Como alternativa, se hace reaccionar un 1-cloro-2-nitrobenceno con una amina primaria bajo catálisis de paladio proporcionando el 1-amino-2-nitrobenceno 1.2 deseado. El grupo nitro puede reducirse a la correspondiente amina mediante una variedad de métodos bien establecidos proporcionando 1,2-diaminobencenos 1.3. La reacción de 1.3 con bromuro de cianógeno procura 1H-benzo[d]imidazol-2-aminas 1.4. El acoplamiento de amida con un ácido carboxílico o bien cloruro de ácido apropiado puede procurar 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas tales como 1.5.
Esquema 2
Figure imgf000047_0003
Figure imgf000047_0002
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Esquema 3
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El esquema 2 y el esquema 3 describen metodologías generales que pueden usarse para crear moduladores de Kv7 novedosos después de usar la reacción de formación del enlace amida inicial para sintetizar 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas tales como 2.3. La etanólisis promovida con ácido sulfúrico del nitrilo a 2-amino-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo (2.1) da el éster etílico 2.2. Este aminoheterociclo puede usarse como amina en una reacción de formación de enlace amida estándar dando la amida de éster 2.3. El éster etílico puede servir como herramienta sintética para acceder a diversos otros grupos funcionales. El éster puede reducirse con DiBAL-H al alcohol primario 2.4. Como alternativa, puede usarse reactivo de Grignard en exceso para generar un alcohol terciario 2.7. El alcohol primario 2.4 puede oxidarse fácilmente con peryodinano de Dess-Martin o un oxidante similar generando un aldehído intermedio 2.5. El aldehído 2.5 puede servir como entrada para una reacción de difluoración, por ejemplo, usando el reactivo Xtal-FluorE, proporcionando las amidas sustituidas con difluorometilo 2.6 (véase Couturier, M, et al, J. O rg. C hem . 2010, 75, 3401-3411). Los alcoholes terciarios 2.7 pueden reducirse bajo la acción de trietilsilano y ácido trifluoroacético en diclorometano dando los grupos alquilo bencílico ramificados presentes en las amidas 2.8. Se destaca que las nuevas moléculas 2.4-2.8 son convenientes como intermedios para conversión adicional a sustituyentes de anillo bencénico adicionales, tales como amidas, éteres y heterociclos, usando metodologías conocidas.
Pueden transformarse ortogonalmente un intervalo de grupo funcionales en presencia de la funcionalidad amida de 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas. El esquema 3 muestra cómo el nitrilo 3.1 puede reaccionar selectivamente con un reactivo de Grignard produciendo una arilcetona 3.2. Esta cetona puede reducirse con reactivos de hidruro comunes, tales como borohidruro de sodio, dando el alcohol secundario 3.3. Tales reducciones de cetona pueden realizarse de manera estereoquímicamente definida, usando una variedad de reactivos reductores quirales conocidos en la bibliografía (p. ej., a través del reactivo CBS, véase Corey, EJ, Shibata, S, Bakshi, RK, J. Org. C hem . 1988, 53, 2861­ 2863).
Esquema 4
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Puede usarse la metodología general del esquema 1 para sintetizar un amplio intervalo de 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas funcionalizadas. El bromuro 4.1 del esquema 4 es un ejemplo de una 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamida halogenada que proporciona también un grupo funcional ortogonalmente reactivo. El bromuro puede reducirse por la acción de trietilsilano en cloroformo y metanol con una cantidad catalítica de paladio sobre carbón, dando el producto desbromado 4.2 (véase Mandal, PK, McMurray, JS, J. Org. C hem . 2007, 72, 6599-6601). El bromuro aromático en 4.1 puede usarse también para efectuar reacciones de acoplamiento cruzado con paladio tales como reacciones de Sonogashira, Suzuki o Stille, proporcionando alquinos, biarilo u otros productos acoplados cruzados.
Esquema 5
El esquema 5 describe un método sintético general para la síntesis de ácidos a-alquilcarboxílicos quirales que contienen ácidos protegidos con p-sililoxiéter 5.4 o ent-5.4. Estos ácidos ópticamente activos se usan como componente ácido en la reacción de formación de amida (Etapa D del esquema 1) dando amidas de alcohol pterciarias. Se usó la construcción de enlace diestereoselectivo a través de la química de enolato de titanio descrita por Evans para condensar la imida 5.1 o ent-5.1 quiral con una cetona u otro electrófilo, dando los aductos de aldol diastereoisoméricamente puros 5.2 o ent-5.2, respectivamente (véase Evans, DA, Urpi, F, Somers, TC, Clark, JS, Bilodeau, MT, J. Am . C hem . Soc. 1990, 112 , 8215-8216). La elección apropiada de la imida quiral 5.1 dará lugar a la estereoquímica absoluta deseada del a-estereocentro en los ácidos carboxílicos 5.4 o ent-5.4. La protección con sililéter de los aductos de aldol 5.2 y ent-5.2 con triflato de terc-butildimetilsililo y diisopropiletilamina da los tercbutildimetilsililéteres 5.3 y ent-5.3. Las condiciones de hidrólisis de aciloxazolidinona estándares usando hidróxido de litio y peróxido de hidrógeno en tetrahidrofurano y agua proporcionan los ácidos deseados 5.4 o ent-5.4 (véase Evans, DA, Britton, TC, Ellman, JA, T e trah ed ro n Lett. 1987, 28(49), 6141-6144). La selección apropiada de las cetonas u otros electrófilos en la química de enolato de titanio dará lugar a aductos de aldol apropiadamente sustituidos que varían en la naturaleza de los grupos R2 y R3. El cambio del grupo R1 de las imidas de partida 5.1 y ent-5.1 puede usarse para variar el tamaño y naturaleza del grupo R1 en los ácidos 5.4 o ent-5.4. Esta metodología permite sintetizar un amplio intervalo de ácidos ópticamente activos con estereocontrol absoluto del centro quiral a del carbonilo del ácido carboxílico.
Esquema 6
Se describe en el esquema 6 un método sintético general para la síntesis de ácidos carboxílicos quirales a-metil-pramificados 6.4 o ent-6.4. Ambas de las oxazolidinonas enantioméricamente puras (S)-4-benciloxazolidin-2-ona 6.1 y (R)-4-benciloxazolidin-2-ona ent-6.1 están comercialmente disponibles. Estas oxazolidononas pueden acilarse fácilmente por desprotonación con n-butil-litio seguido de reacción con los cloruros de ácido 6.5 dando las imidas quirales 6.2 y ent-6.2, respectivamente. Hay un gran número de cloruros de ácido 6.5 comercialmente disponibles con una amplia variación de los grupos R1, R2y R3 de esta entrada. Esto permite la síntesis rápida de imidas quirales 6.2 y ent-6.2 que tienen sustitución diferente en la posición p del grupo carbonilo exocíclico. Puede usarse entonces la reacción de alquilación asimétrica de enolatos de sodio de imida quiral como la desarrollada por Evans para introducir un grupo metilo de forma estereoselectiva (véase Evans, DA, Ennis, MD, Mathre, DJ, J. A m . C hem . Soc. 1982, 104, 1737-1739). El enolato de sodio de la imida 6.2 puede producirse por tratamiento de 6.2 con hexametildisilazida de sodio en tetrahidrofurano. El enolato de sodio resultante puede metilarse entonces estereoselectivamente mediante la adición de yoduro de metilo. Pueden aislarse los diastereómeros puros e individuales 6.3 y ent-6.3 por cromatografía de columna de gel de sílice. Como alternativa, pueden obtenerse los diastereómeros individuales por recristalización de los productos cristalinos 6.3 y ent-6.3. Las condiciones de hidrólisis auxiliar quiral bien conocidas descritas anteriormente para el esquema 5 dan los ácidos carboxílicos quirales a-metil-p-ramificados ópticamente activos 6.4 o ent-6.4, respectivamente.
Esquema 7
Figure imgf000051_0001
El esquema 7 muestra una metodología general para la síntesis de ácidos 3-hidroxipropanoicos tales como 7.3. Se hace reaccionar un éster 2-bromoetanoico 7.1 apropiadamente sustituido con una cetona o aldehído, procurando los ésteres 3-hidroxipropanoicos 7.2. El grupo éster puede hidrolizarse al correspondiente ácido por saponificación, proporcionando ácidos 3-hidroxipropanoicos tales como 7.3.
Esquema 8
El esquema 8 representa métodos adicionales para la preparación de ácidos 3-hidroxipropanoicos opcionalmente sustituidos. Se hace reaccionar una 3-acetiloxazolidin-2-ona 8.1 apropiadamente sustituida con una cetona o aldehido, procurando las 3-(3-hidroxipropanoil)oxazolidin-2-onas 8.2. Se funcionaliza el grupo hidroxilo con un grupo protector, proporcionando los diastereómeros 8.3, que son separables por cromatografía en gel de sílice. Se hace reaccionar entonces cada diastereómero 8.3 en una secuencia en dos etapas, en cualquier orden, de desprotección de grupo hidroxilo y escisión de oxazolidinona, proporcionando ácidos 3-hidroxipropanoicos tales como 8.6.
Esquema 9
Figure imgf000052_0001
El esquema 9 describe métodos que pueden aplicarse a las síntesis de 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas sustituidas con aminoácido tales como 9.4. Pueden acoplarse 1H-benzo[d]imidazol-2-aminas 9.1 apropiadamente sustituidas con derivados de aminoácido protegidos con carbamato tales como 9.2 procurando las correspondientes amidas 9.3. El grupo protector de carbamato puede retirarse de la amina a través de uno de una serie de reactivos fuertemente ácidos procurando aminas como 9.4. Tales aminas secundarias pueden funcionalizarse adicionalmente en condiciones de alquilación de amina estándares proporcionando 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas que contienen amina terciaria tales como 9.5.
Esquema 10
Figure imgf000052_0002
El esquema 10 describe métodos que pueden emplearse para preparar 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas sustituidas con amidas que contienen hidroxilo tales como 10.4. Pueden acoplarse 1H-benzo[d]imidazol-2-aminas 10.1 apropiadamente sustituidas con derivados de alcohol protegidos tales como 10.2 procurando las correspondientes amidas 10.3. El grupo protector de alcohol puede retirarse a través de varios métodos incluyendo fluoruro de tetrabutilamonio, proporcionando 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas que contienen alcohol tales como 10.4.
Métodos sintéticos
Sección 1. Procedimientos representativos para la preparación de intermedios de 1H-benzo[d]imidazol-2-aminas (compuestos 1.4, esquema 1).
Método 1:
Figure imgf000053_0001
Etapa A. Preparación de 3-(ciclobutilamino)-4-nitrobenzonitrilo. Se cargó un matraz de fondo redondo de 500 ml con 3-fluoro-4-nitrobenzonitrilo (5,00 g, 30,1 mmol) y tetrahidrofurano (100 ml) y se colocó en un baño a 0 °C. Después de 5 minutos, se añadió ciclobutilamina-ácido clorhídrico (3,60 g, 33,0 mmol) en una porción con agitación antes de la adición gota a gota de diisopropiletilamina (15 ml, 82 mmol). Se dejó agitar la mezcla a 0 °C durante 1 hora. Se retiró el baño de hielo y se dejó calentar el matraz a temperatura ambiente y se dejó agitar durante una noche. Se retiró el grueso del tetrahidrofurano en rotavapor antes de diluir la mezcla con EtOAc (200 ml). Se lavó la capa orgánica con cloruro de amonio acuoso saturado dos veces, bicarbonato de sodio acuoso saturado y salmuera y se secó entonces sobre sulfato de sodio anhidro. Se filtró la solución secada y se concentró dando los productos deseados en forma de un sólido naranja bruto (6,25 g). TLC Rf= trazo de 0,70-0,45 en EtOAc al 20 % en hexanos. MS (ESI) m /z 218,0 (MH+). RMN-1H (CDCla): 68,24 (d, J= 8,68 Hz, 1H), 8,11 (s a, 1H), 7,01 (d, J= 1,48 Hz, 1H), 6,86 (dd, J= 8,72, 1,64, 1H), 4,09-4,00 (m, 1H), 2,60-2,51 (m, 2H), 2 ,11-1,88 (m, 4H).
Figure imgf000053_0002
Etapa B. Preparación de 4-amino-3-(ciclobutilamino)benzonitrilo. Se añadieron hierro en polvo (8,8 g, 150 mmol) y una solución de cloruro de amonio (8,1 g, 150 mmol) en agua (30 ml) a una solución de 3-(ciclobutilamino)-4-nitrobenzonitrilo (6,50 g, 30,1 mmol) en EtOH (160 ml). Se calentó la mezcla en un baño de arena a 90 °C durante 16 horas con exposición al aire. Se dejó enfriar la mezcla, se diluyó con EtOAc (200 ml) y se filtró la mezcla resultante a través de Celite. Se aclaró la Celite con bicarbonato de sodio acuoso saturado y EtOAc. Se separaron los filtrados combinados y se extrajo la capa acuosa con EtOAc. Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio anhidro y se concentraron proporcionando el compuesto del título bruto (6,2 g). Se sometió el material a columna de gel de sílice Isco de 120 g (EtOAc al 10 a 40 % en hexanos) proporcionando el producto deseado (4,17 g) con un rendimiento de 74 % para dos etapas en forma de un sólido de color rosa. MS (ESI) m /z 188,0 (MH+). RMN-1H (CDCla): 67,01 (dd, J= 8,00, 1,76 Hz, 1H), 6,73 (d, J= 1,72 Hz, 1H), 6,68 (d, J= 8,0 Hz, 1H), 3,92-3,85 (m, 1H), 3,65-3,45 (m a, 2H), 2,53-2,44 (m, 2H), 1,88-1,83 (m, 4H).
Figure imgf000053_0003
Etapa C. Preparación de 2-amino-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo. Se añadió una solución de bromuro de cianógeno (3 M en CH 2 Ch, 14 ml, 42 mmol) a una solución de 4-amino-3-(ciclobutilamino)benzonitrilo (4,0 g, 21,3 mmol) en EtOH (100 ml). Se agitó la mezcla a temperatura ambiente durante 18 horas y se concentró entonces a vacío. Se repartió el residuo entre EtOAc (150 ml) y Na2 CO 3 acuoso (10 % , 100 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con EtOAc. Se lavaron las capas orgánicas combinadas con salmuera, se secaron (Na2 SO 4) y se concentraron dando un sólido rosa (4,5 g). Se sometió el sólido a trituración con hexanos y EtOAc proporcionando el compuesto del título en forma de un sólido rosa pálido (3,1 g, 69 % ). Rf= trazo de 0,1 en EtOAc al 100 % . MS (ESI) m /z 213 ,2 (MH+). RMN-1H (MeOH-d4): 67,78 (s, 1H), 7,38 (d, J= 8,28, 1H), 7,28 (d, J= 8,20, 1H), 4,92-4,81 (m, 1H), 2,88-2,78 (m, 2H), 2,54-2,45 (m, 2H), 2,08-1,78 (m, 2H). Se recuperó una porción adicional del producto deseado (1,0 g) del disolvente de trituración y mostró ser el producto deseado, con >90 % de pureza por RMN-1H.
Se prepararon las siguientes 1H-benzo[d]imidazol-2-aminas usando los procedimientos generales descritos en la Sección 1, Método 1, con materiales de partida apropiados. Se describen procedimientos alternativos para ciertos materiales de partida en los Métodos 2-5.
1 -ciclobutil-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000054_0001
6-bromo-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000054_0002
1 -isopropil-6-metoxi-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000054_0003
2-amino-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-7-carboxilato de metilo
Figure imgf000054_0004
2-amino-1-(terc-butil)-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo
Figure imgf000054_0005
2-amino-1-(1-metilciclobutil)-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo
Figure imgf000055_0001
6-doro-1-(4-fluorofenil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000055_0002
2-amino-1-cidobutil-5-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo
Figure imgf000055_0003
2-amino-1-(terc-butil)-5-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo
Figure imgf000055_0004
1-cidobutil-7-fluoro-5-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000055_0005
-(4-(trifluorometoxi)fenil)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000056_0001
-(3,5-diflurofenil)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000056_0002
-amino-1-(5-fluoropiridin-2-N)-1H-benzo[d]iiTiidazol-6-carbomtnlo
Figure imgf000056_0003
-(3,4-difluorofenil)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000056_0004
-(3-fluoro-4-(trifluorometoxi)fenil)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000057_0001
-(4-(trifluorometoxi)fenil)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina
Figure imgf000057_0002
-(2-amino-1-cidobutil-7-fluoro-1H-benzo[d]imidazol-6-il)acetato de etilo
Figure imgf000057_0003
-(2-amino-7-fluoro-1-(4-fluorofenil)-1H-benzo[d]imidazol-6-il)acetato de etilo Método 2: Preparación de 3-((4-fluorofenil)amino)-4-nitrobenzonitrilo para su uso en el Método 1, Etapa B.
Figure imgf000058_0001
Se calentó a 60 °C una mezcla de 3-fluoro-4-nitrobenzonitrilo (2 g, 12 mmol), trietilamina (1,7 ml, 1,5 equivalentes) y 4-fluoroanilina (1,7 ml, 1,5 equivalentes) bajo atmósfera de nitrógeno durante 60 horas. Se enfrió la masa roja-marrón sólida resultante a temperatura ambiente y se suspendió en 50 ml de ácido clorhídrico acuoso 1 N. Se extrajo la mezcla extensamente con diclorometano y se secaron los extractos orgánicos sobre sulfato de magnesio anhidro. La concentración de los extractos orgánicos a presión reducida a presión reducida procuró 2,9 g de un sólido rojo, prácticamente puro por LC/MS. MS (ESI) m /z 256 (M-H-).
Método 3: Preparación de 5-cloro-N-ciclobutil-2-nitroanilina para su uso en el Método 1, Etapa B.
Figure imgf000058_0002
Se calentó en un vial sellado a 100 °C una mezcla de clorhidrato de ciclobutilamina (2,15 g), trietilamina (2,8 ml), 2,4-dicloro-1-nitrobenceno (3,84 g, 20 mmol, reactivo limitante) y tetrahidrofurano (40 ml) durante 16 horas. Se enfrió la mezcla de reacción a temperatura ambiente, se añadieron 0 , 2 equivalentes tanto de clorhidrato de ciclobutilamina como de trietilamina y se calentó la mezcla resultante a 100 °C durante 17 horas adicionales. Se diluyó la mezcla de reacción enfriada con agua, se extrajo concienzudamente con diclorometano y acetato de etilo, se secaron los extractos orgánicos sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentraron. La purificación del producto bruto por cromatografía en sílice con diclorometano al 20 % en hexanos como eluyente procuró el producto deseado (1,65 g) en forma de un sólido naranja. RMN-1H (CDCh): 8 8,16 (NH, s a), 8,12 (1H, d), 6,70 (1H, s), 6,60 (1H, d), 4,02 (1H, m), 2,53 (2H, m), 2,03 (2H, m), 1,92 (2H, m).
Método 4: Preparación de 3-metil-N-(2-nitro-5-(trifluorometil)fenil)isoxazol-5-amina para su uso en el Método 5.
Figure imgf000058_0003
Se añadió acetato de paladio (II) (1,00 g, 0,443 mmol) a Xantphos (0,513 g, 0,887 mmol) en dioxano desgasificado (10 ml) y se agitó la suspensión durante 15 minutos bajo N2. Se añadió la solución resultante a una mezcla de 2-cloro-3-nitro-6-(trifluorometil)benceno (1 , 0 0 g, 4,43 mmol), 3-metilisoxazol-5-amina (0,522 g, 5,32 mmol) y K2 C O 3 (0,919 g, 6,65 mmol) en dioxano desgasificado (40 ml) y se calentó a reflujo la mezcla de reacción durante una noche. Se confirmó la conversión por TLC y se filtró la solución a través de un tapón de Celite. Se retiraron los productos volátiles y se purificó el residuo bruto por cromatografía en sílice (EtOAc al 0-100 %/hexanos) dando 0,811 g (63 % ) del compuesto del título. MS (ESI) m /z 288 (MH+).
Se prepararon los siguientes intermedios para su uso en el Método 1, Etapa B, usando el procedimiento general descrito en la Sección 1, Método 4, con materiales de partida apropiados.
3-((5-fluoropiridin-2-i|)amino)-4-nitrobenzonitrilo
N-(3,5-difluorofenil)-2-nitro-5-(trifluorometil)anilina
N-(3-fluoro-4-(trifluorometoxi)fenil)-2-nitro-5-(trifluorometil)anilina
2-nitro-N-(4-(trifluorometoxi)fenil)-5-(trifluorometil)anilina
N-(3,4-difluorofenil)-2-nitro-5-(trifluorometil)anilina
Método 5: Preparación de N1-(3-metilisoxazol-5-il)-5-(trifluorometil)benceno-1,2-diamina para su uso en el Método 1, Etapa C.
Figure imgf000059_0001
Se añadieron bicarbonato de sodio (0,410 g, 4,88 mmol) y entonces hidrosulfito de sodio (1,27 g, 7,31 mmol) a una solución del núcleo aromático nitro (0,700 g, 2,44 mmol) en tetrahidrofurano:H2O (2:1; 24 ml). Se dejó agitar la mezcla de reacción resultante durante 4 horas, se diluyó con H2O y se extrajo entonces con EtOAc. Se secaron los extractos orgánicos combinados (MgSO4) y se retiraron los productos volátiles, dejando un residuo bruto que se purificó por cromatografía en sílice (MeOH al 0-5 %/diclorometano) dando 380 mg (61 % ) del compuesto del título. m S (ESI) m /z 258 (MH+).
Se preparó la siguiente benceno-1,2-diamina usando los procedimientos generales descritos en la Sección 1, Métodos 4 y 5, con materiales de partida apropiados, para su uso en el Método 1, Etapa C:
4-amino-3-((3-metilisoxazol-5-il)amino)benzonitrilo
Figure imgf000059_0002
Método 6: Preparación de 2-amino-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-6-carboxilato de etilo
Figure imgf000059_0003
Se añadieron agua (3 ml) y ácido sulfúrico concentrado (3 ml) a una solución de 4-amino-3-(ciclobutilamino)benzonitrilo (1,5 g, 7,0 mmol) en EtoH (30 ml). Se colocó la solución en un baño de arena a 150 °C con agitación durante 4 días. Se dejó enfriar la reacción a temperatura ambiente y se inactivó cuidadosamente vertiendo lentamente en bicarbonato de sodio acuoso saturado. Se diluyó la mezcla con EtOAc y se separaron las capas. Se reextrajo la capa acuosa con diclorometano y se lavaron las capas orgánicas combinadas con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando el compuesto del título en forma de un sólido tostado (790 mg, 43 % de rendimiento). MS (ESI) m /z 260,0 (MH+), tiempo de retención= 2,21 min (Método B).
Sección 2. Procedimientos representativos para la preparación de 1H-benzo[d]imidazol-2-ilamidas (1,5, esquema 1). Método 7: Procedimiento general para la formación de amida usando HATU (hexafluorofosfato (V) de 3-óxido de 1 ­ ((dimetilamino)(dimetiliminio)metil)-1H-benzo[d][1,2,3]triazol) como reactivo de acoplamiento.
Figure imgf000060_0001
Se disolvió el ácido carboxílico apropiado en dimetilformamida o THF (0,20-0,7 M) y se añadió diisopropiletilamina o piridina (2 equivalentes) antes de la adición de hexafluorofosfato (V) de 3-óxido de 1 -((dimetilamino)(dimetiliminio)metil)-1H-benzo[d][1,2,3]triazol (HATU, 1,2 equivalentes) en una porción. Se dejó agitar la reacción a temperatura ambiente durante 0 a 15 minutos antes de la adición del 2-aminobencimidazol sustituido requerido (1 equivalente) y se colocó el matraz en un baño de arena calentado (40-65 °C) durante 8 a 48 horas. Se diluyó la mezcla con EtOAc y se lavó secuencialmente con NH4Cl acuoso saturado (2x), NaHCO3 acuoso saturado (2x), Na2 CO 3 acuoso al 10 % (2x) y salmuera. Se secó la capa orgánica sobre Na2 SO 4 y se concentró. La purificación por cromatografía en sílice (EtOAc al 0-100 %/hexanos o MeOH al 0-10 %/diclorometano) proporcionó las 1H -benzo[ d ]imidazol-2-ilamidas correspondientes del título.
Método 8: Procedimiento general para la formación de amida usando cloruros de acilo
Figure imgf000060_0002
Se añadieron piridina (1,5 equivalentes) y cloruro de acilo (1,2 equivalentes) a una solución del intermedio de 1H -benzo[d]imidazol-2-amina apropiado (0,22 mmol) en tetrahidrofurano (1 ml). Se agitó la mezcla de reacción durante 18 horas. Se repartió la mezcla entre EtOAc y agua. Se secó la capa orgánica (Na2 SO 4) y se concentró. Se purificó el residuo por cromatografía en sílice (EtOAc al 0-100 %/hexanos) proporcionando los compuestos del título.
Método 9: Procedimiento general para el acoplamiento de amida usando cloruro de ácido en exceso seguido de tratamiento con amoniaco.
Ejemplo 46. Preparación de 3,3-dimetil-N-(1-(3-metilisoxazol-5-il)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)butanamida
Figure imgf000061_0001
Se añadió gota a gota cloruro de 3,3-dimetilbutanoílo (0,187 ml, 1,04 mmol) a una solución a 0 °C de 1-(3-metilisoxazoI-5-il)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina (0,030 g, 0,104 mmol) y trietilamina (0,180 ml, 1,56 mmol) en CH 2 Cl2 (1 ml) y se dejó calentar la mezcla de reacción a temperatura ambiente y agitar durante 30 minutos. Se añadió amoniaco (2,0 M en MeOH, 1 ml) y se agitó la mezcla a 50 °C durante 2 horas antes de inactivar con NH4CI acuoso saturado. Se extrajo la porción acuosa con EtOAc, se secaron los extractos orgánicos combinados (MgSO4) y se retiraron los productos volátiles dando un residuo bruto que se purificó por cromatografía en sílice (MeOH al 0-5 %/D CM ) facilitando 0,017 g (43 % ) del compuesto del título. MS (ESI) m /z 381 (MH+).
Método 10: Procedimiento general para la formación de amida usando EDC (clorhidrato de 1 -etil-3-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida) y HOBt (1-hidroxibenzotriazol) como reactivos de acoplamiento.
Figure imgf000061_0002
Se calentó a 50 °C bajo nitrógeno una solución de la 1H-benzo[d]imidazol-2-amina apropiada (0,13 mmol), ácido carboxílico (0,16 mmol), EDC (0,19 mmol), HOBt (0,19 mmol) y diisopropiletilamina (0,66 mmol) en tetrahidrofurano (1 ml) durante 2-4 horas. Se enfrió la reacción a temperatura ambiente, se diluyó con EtOAc y se lavó con agua. Se concentró la solución orgánica a vacío y se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida (gel de sílice, MeOH al 0-10 %/D CM ) procurando los compuestos del título.
Método 11 : Procedimiento representativo para la formación de amida usando las condiciones de Yamaguchi.
Ejemplo 45. Preparación de (S)-2,2-dimetil-N-(1-(3-metilisoxazol-5-il)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)ciclopropanocarboxamida.
Figure imgf000061_0003
Se agitaron ácido (S)-2,2-dimetilciclopropilcarboxílico (0,018 g, 0,159 mmol), trietilamina (0,042 ml, 0,318 mmol) y cloruro de 2,4,6-triclorobenzoílo (0,025 ml, 0,159 mmol) en 1 ml de tetrahidrofurano durante 30 minutos. Se añadieron 1-(3-metilisoxazol-5-il)-6-(trifluorometil)-1H-benzo[d]imidazol-2-amina (0,030 g, 0,106 mmol) y 4-(dimetilamino)piridina (0,003 g, 0,026 mmol) a la mezcla de reacción, se calentó la solución resultante a 50 °C y se agitó durante una noche.
Se inactivó la reacción con H2O, se extrajo (EtOAc 3x), se secaron los extractos orgánicos combinados (MgSO4) y se retiraron los productos volátiles dando un producto bruto que se purificó por cromatografía en sílice (EtOAc al 0-100 %/hexanos) seguida de HPLC (MeCN al 0-100 % /H 2 O) facilitando 21 mg (71 % ) del producto deseado. MS (ESI) m /z 379 (MH+).
Método 12: Procedimiento general para la formación de amida usando acilbenzotriazoles.
Figure imgf000062_0001
Se agitó durante 5 min a temperatura ambiente una solución del intermedio 1H-benzo[d]imidazol-2-amina apropiado (0,66 mmol) y trietilamina (0,5 ml, 3,3 mmol, 5 equivalentes) en tetrahidrofurano (3 ml). Se añadió a esta solución una solución de un acilbenzotriazol apropiado (0,7 M en diclorometano, 3,0 ml, 2,0 mmol, 3 equivalentes; véase Katritzky, AR, et al, S ynle tt, 2005, 11, 1656) y se colocó la mezcla en un baño de arena a 50 °C durante 12 horas. Se dejó enfriar la mezcla a temperatura ambiente, se diluyó con EtOAc (50 ml) y se lavó secuencialmente con Na2 CO 3 acuoso saturado (tres veces) y salmuera. Se secó la capa orgánica sobre Na2 SO 4 y se concentró. La purificación por cromatografía en sílice (EtOAc al 0-100 %/hexano o MeOH al 0-10 %/diclorometano) proporcionó los compuestos del título.
Sección 3. Síntesis ejemplares para los ejemplos de la tabla 1 que implican transformación adicional de 1H -benzo[d]imidazol-2-ilamidas.
Ejemplo 51. Preparación de N-(1-ciclobutil-6-(hidroximetil)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida.
Figure imgf000062_0002
Se colocó una solución de 1-ciclobutil-2-(3,3-dimetilbutanamido)-1H-benzo[d]imidazol-6-carboxilato de etilo ( 112 mg) en CH 2 Cl2 (15 ml) en un baño a -78 °C durante 10 minutos antes de la adición gota a gota de hidruro de diisobutilaluminio (1,0 M en CH 2 Ch, 2 ml). Se dejó agitar la reacción a -78 °C durante 1 h antes de inactivar mediante la adición gota a gota de MeOH (2 ml). Se diluyó la reacción inactivada con CH 2 Ch (50 ml), se añadió tartrato de sodio/potasio (1 M, 50 ml) y se dejó agitar la mezcla vigorosamente durante una noche. En este marco temporal, se desarrollaron dos capas claras y se extrajo la porción acuosa con CH 2 Ch (2x), se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron (Na2 SO 4) y se retiraron los productos volátiles dando un residuo bruto que se purificó por cromatografía (columna de gel de sílice lsco de 12 g, MeOH al 0-10 % /C H 2 Ch) facilitando 56 mg (57 % ) del compuesto del título. MS (ESI) m /z 316,4 (MH+), tiempo de retención= 2,35 min. Se purificó adicionalmente el material sometiéndolo a otra columna de gel de sílice Isco de 12 g (EtOAc al 40 a 100 % en hexanos) dando 10 mg del compuesto del título.
Ejemplo 53. Preparación de N-(1-ciclobutil-6-(2-hidroxipropan-2-il)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida.
Se dejó enfriar a 0 °C durante 10 minutos bajo nitrógeno una solución de 1-ciclobutil-2-(3,3-dimetilbutanamido)-1H-benzo[d]imidazol-6-carboxilato de etilo (50 mg, 0,14 mmol) en tetrahidrofurano (2 ml) antes de la adición gota a gota de bromuro de metilmagnesio (2 M en éter, 0,3 ml). Se dejó agitar la reacción a 0 °C durante 1,5 horas y se inactivó entonces mediante la adición de bicarbonato de sodio saturado (25 ml) y EtOAc (25 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con EtOAc y se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando un residuo bruto. Se sometió el material bruto a cromatografía en columna (dos columnas Isco de gel de sílice de 4 g en serie, EtOAc al 5 a 50 % en hexanos) dando el compuesto del título en forma de un sólido blanco (16 mg, 33 % de rendimiento). MS (ESI) m /z 344,4 (MH+), tiempo de retención= 2,44 minutos (Método B).
Ejemplo 57. Preparación de N-(1-ciclobutil-6-(1-hidroxietil)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida.
Figure imgf000063_0001
Etapa A. Se colocó en un baño a 0 °C una solución de N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida (112 mg) en tetrahidrofurano (2 ml) durante 10 minutos antes de la adición gota a gota de bromuro de etilmagnesio (3 M en dietiléter, 0,45 ml). Se dejó agitar la reacción a 0 °C durante 1 h y se dejó calentar entonces a temperatura ambiente. Se dejó agitar la reacción a temperatura ambiente durante una noche y se colocó entonces de vuelta en un baño a 0 °C durante 10 minutos antes de inactivar con MeOH (0,5 ml). Después de 5 minutos, se repartió la reacción inactivada entre cloruro de amonio acuoso saturado (25 ml) y acetato de etilo (25 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con acetato de etilo. Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera y se secaron con sulfato de sodio. Se filtró la reacción secada, se concentró y se sometió a una columna de gel de sílice Isco de 12 g (EtOAc al 15 a 100 % en hexanos) dando el compuesto de etilcetona N-(1 -ciclobutil-6-propionil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida (75 mg, 70 % ) en forma de un sólido blanco. MS (ESI) m /z 342,4 (MH+), tiempo de retención= 3,51 minutos (Método B).
Etapa B. Se colocó N-(1-ciclobutil-6-propionil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida (41 mg) en un matraz de fondo redondo con etanol (6 ml) y se dejó enfriar el matraz en un baño a 0 °C durante 10 minutos antes de la adición por porciones de borohidruro de sodio (60 mg). Se dejó agitar la reacción durante 30 minutos y se inactivó entonces mediante la adición lenta de HCl (1,0 M, 10 ml). Se diluyó la reacción inactivada con EtOAc (30 ml) y se dejó agitar durante 1 hora. Se extrajo la capa acuosa con EtOAc (2x). Se lavaron los extractos orgánicos combinados con bicarbonato de sodio acuoso saturado (40 ml) y salmuera y se secaron con sulfato de sodio. Se filtró la solución secada y se concentró dando un material bruto que se sometió a una columna de gel de sílice Isco de 12 g (EtOAc al 20-50 % en hexanos) dando el compuesto del título (25 mg, 60 % ) en forma de un sólido blanco. MS (ESI) m /z 344,4 (MH+), tiempo de retención= 2,57 minutos (Método B).
Ejemplo 65. Preparación de (S)-N-(1-ciclobutil-6-isopropil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-2,3-dimetilbutanamida.
Figure imgf000063_0002
Se disolvió (S)-N-(1-ciclobutil-6-(2-hidroxipropan-2-il)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-2,3-dimetilbutanamida sólida (15 ml) en diclorometano (2 ml). Se añadió TFA (1,5 ml) antes de la adición gota a gota de trietilsilano puro (1 ml). Se dejó agitar la reacción durante una noche, se diluyó entonces con diclorometano (15 ml) y se lavó con bicarbonato de sodio saturado (20 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con diclorometano. Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera y se secaron con sulfato de sodio. Se filtró la solución secada y se concentró dando un producto bruto. Se sometió el material bruto a alto vacío durante 48 h antes de someter a cromatografía en columna (gel de sílice Isco de 4 g, MeOH al 0-5 % en diclorometano) dando el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (9 mg, 63 % de rendimiento). MS (ESI) m /z 328.4 (m H+), tiempo de retención= 3,36 min (Método B).
E je m p lo 66. P rep a ra c ió n de N -(1 -c id o b u til-6 -(d iflu o ro m e til) -1 H -b e n z o [d ]im id a z o l-2 -il) -3 ,3 -d im e tilb u ta n a m id a .
Figure imgf000064_0001
Etapa A . Se disolvió N-(1-ciclobutil-6-(hidroximetil)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida sólida (100 mg) en diclorometano (5 ml) y se añadió bicarbonato de sodio sólido (106 mg, 4 equivalentes) en una porción antes de la adición de peryodinano de Dess-Martin (270 mg, 2 equivalentes) en una porción. La reacción pasó de incolora a una solución de color rojo tras la adición del reactivo de Dess-Martin. Se dejó agitar la reacción a temperatura ambiente durante 1 hora antes de añadir tiosulfato de sodio (10 % , 25 ml) y EtOAc (25 ml) para inactivar la reacción. Se dejó agitar la reacción inactivada durante 1 hora y en este tiempo la solución de color rojo se decoloró a una solución incolora. Se extrajo la capa acuosa dos veces con EtOAc. Se lavaron las fases orgánicas combinadas con bicarbonato de sodio, salmuera y se secaron con sulfato de sodio. Se filtró la solución secada y se concentró dando un producto bruto que se sometió a cromatografía en columna (Isco de 12 g, EtOAc al 5 a 75 % en hexanos) facilitando 83 mg (84 % ) de N-(1-ciclobutil-6-formil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida que se usó directamente en la siguiente reacción.
Etapa B. Se disolvió el aldehído recién preparado (N-(1-ciclobutil-6-formil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida, 37 mg, 0,118 mmol) de la parte experimental anterior en diclorometano (2 ml) y se añadió TEA -3HF (58 mg, 3 equivalentes) antes de la adición por porciones de XtalFluor-E (81 mg, 3 equivalentes) a temperatura ambiente. El análisis de LC/MS a las 3 horas de tiempo de reacción mostraba una progresión lenta de la reacción. Por lo tanto, se añadieron dos equivalentes más de cada reactivo a la reacción. El análisis de LC/MS 4 horas después mostraba una conversión lenta y limpia en el producto deseado. Se dejó agitar la reacción durante una noche, se inactivó entonces mediante la adición de bicarbonato de sodio saturado (20 ml) y se diluyó con diclorometano (20 ml). Se dejó agitar la reacción inactivada durante 15 minutos, se extrajo entonces con diclorometano (3x) y se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando un material bruto. Se sometió el material bruto a cromatografía en gel de sílice (Isco de 12 g, EtOAc al 0-25 % en hexanos, el producto es de mayor Rf que el correspondiente aldehído) dando el compuesto del título (7,5 mg, 19 % de rendimiento) en forma de un sólido blanco. MS (ESI) m /z 336,4 (MH+), tiempo de retención= 3,37 min (Método B). Se recuperó el aldehído intermedio también de la cromatografía (16 mg, 43 % ). (Véase: Couturier, M. et al, J. Org. C hem . 2010, 75, 3401-3411).
Ejemplo 1. Preparación de N-(1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida.
Figure imgf000064_0002
Se disolvió N-(6-bromo-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3,3-dimetilbutanamida sólida (75 mg) en cloroformo (9 ml) y metanol (3 ml) antes de la adición de paladio sobre carbono (10 % , 30 mg). Se dejó agitar la mezcla durante 2 minutos antes de la adición gota a gota de trietilsilano (0,9 ml). Se dejó agitar la reacción durante 30 minutos y se pasó entonces a través de papel de filtro. Se concentró el filtrado y se sometió a cromatografía en gel de sílice (columna Isco de 12 g, EtOAc al 0 a 70 % en hexanos) dando el producto deseado que contenía una impureza. Se purificó adicionalmente el material sometiéndolo a otra columna de gel de sílice (gel de sílice Isco de 4 g, MeOH al 0-10 % en diclorometano) dando una muestra pura del compuesto del título (22 mg, 31 % de rendimiento) en forma de un sólido blanco espumoso. MS (ESI) m /z 286,4 (MH+), tiempo de retención= 2,71 min (Método B). (Véase Mandal, PK, McMurray, JS, J. O rg. C hem . 2007, 72, 6599-6601).
E je m p lo 22. P rep a ra c ión de (R )-N -(6 -c ¡an o -1 -c ¡c lobu t¡l-1H -b en zo [d ]¡m ¡da zo l-2 -¡l)-2 -(m e t¡l-(2 ,2 ,2 -tr if lu o ro e til)a m in o )p ro p a n a m id a .
Figure imgf000065_0001
Etapa A: Preparac¡ón de (R)-(1-((6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)am¡no)-1-oxopropan-2-¡l)(met¡l)carbamato de terc-but¡lo. Se usaron 2-am¡no-3-c¡clobut¡l-3H-¡m¡dazo[4,5-b]p¡r¡d¡n-5-carbon¡tr¡lo (100 mg, 0,47 mmol) y ác¡do (R)-2-((terc-butox¡carbon¡l)(met¡l)am¡no)propano¡co (115 mg, 0,57 mmol) s¡gu¡endo el Método 7 propordonando el producto deseado (112 mg, 59 %).
Etapa B: Preparac¡ón de clorhidrato de (R)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2-(met¡lam¡no)propanam¡da. Se añad¡ó ác¡do clorhídr¡co acuoso concentrado (3 ml) a una soluc¡ón de (R)-(1-((6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)am¡no)-1-oxopropan-2-¡l)(met¡l)carbamato de terc-butílo ( 112 mg, 0,30 mmol) de la Etapa A en MeOH (4 ml) a temperatura amb¡ente. Se ag¡tó la mezcla durante 1 hora y se concentró entonces a vacío. Se concentró el res¡duo dos veces con metanol propordonando el producto deseado (98 mg, 99 %).
Etapa C: Preparac¡ón de (R)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2-(met¡l-(2,2,2-tr¡fluoroet¡l)am¡no)propanam¡da. Se añad¡ó DIEA (130 pl, 0,76 mmol) a una soluc¡ón a temperatura amb¡ente de clorhidrato de (R)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2-(met¡lam¡no)propanam¡da de la Etapa B en d¡met¡lformam¡da (2 ml). Se ag¡tó la mezcla durante var¡os m¡nutos y se trató entonces con tr¡fluorometanosulfonato de 2,2,2-tr¡fluoroet¡lo (55 pl, 0,38 mmol). Se ag¡tó la mezcla durante ocho horas con DIEA ad¡c¡onal (130 pl, 0,76 mmol) y añad¡éndose tr¡fluorometanosulfonato de 2,2,2-tr¡fluoroet¡lo (55 pl, 0,38 mmol) a ¡ntervalos de 2 horas durante el per¡odo de reacc¡ón. Se concentró la mezcla a vacío y se pur¡f¡có por cromatografía en gel de síl¡ce (EtOAc al 10-50 %/hexanos) proporc¡onando el compuesto del título (24 mg, 21 % ). MS (ESI) m /z 380,4 (MH+).
Ejemplo 24. Preparac¡ón de N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-3-(d¡met¡lam¡no)-4,4,4-tr¡fluorobutanam¡da
Figure imgf000065_0002
Se añad¡ó C F 3CO 2 H (1 ml) a (4-((6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)am¡no)-1,1,1-tr¡fluoro-4-oxobutan-2-¡l)carbamato de terc-but¡lo (23 mg, 0,051 mmol, preparado según el proced¡m¡ento del Método 7 usando ác¡do 3-((tercbutox¡carbon¡l)am¡no)-4,4,4-tr¡fluorobutano¡co) en CH 2 Cl2 (1 ml) y se ag¡tó la mezcla a temperatura amb¡ente durante 1 hora. Se ret¡raron los d¡solventes por rotavapor, se d¡solv¡ó el res¡duo en EtOAc, se lavó secuenc¡almente con NaHCO 3 saturado y salmuera y entonces se secó (Na2 SO 4), se f¡ltró y se concentró dando 3-am¡no-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-4,4,4-tr¡fluorobutanam¡da (18 mg, 0,051 mmol) en forma de un ace¡te ¡ncoloro. Se d¡solv¡ó este mater¡al en CH 3OH/HOAc 20:1 (0,5 ml) segu¡do de Et3 N (9 pl, 0,10 mmol) y soluc¡ón de formaldehído (37 % en H2O, 12 pl, 0,23 mmol). Se añad¡ó NaCNBH3 (18 mg, 0,51 mmol) y se ag¡tó la mezcla a temperatura amb¡ente durante 4 horas. Se concentró el d¡solvente por rotavapor, se d¡str¡buyó el res¡duo entre NaHCO3 acuoso saturado y EtOAc y se separaron las capas. Se extrajo la capa acuosa con EtOAc, se comb¡naron los extractos, se secaron (Na2 SO 4), se f¡ltraron y se concentraron. Se real¡zó la pur¡f¡cac¡ón en una columna de gel de síl¡ce de 4 g eluyendo con EtOAc al 0-50 %/hexanos dando el compuesto del título (11,8 mg, 61 % ). MS (ESI) m /z 380,4 (MH+).
Secc¡ón 4. Síntes¡s ejemplares para los ejemplos en la tabla 1 que ¡mpl¡can preparac¡ón de 1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡lam¡das qu¡rales ram¡f¡cadas.
Ejemplo 18. Preparación de (2S,3R)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-3-h¡drox¡-2-met¡l-3-ifenilbutanamida.
Figure imgf000066_0001
Etapa A: Preparac¡ón de ác¡do (2S,3R)-3-h¡drox¡-2-met¡l-3-fen¡lobutano¡co. Se añad¡ó gota a gota una soluc¡ón de (R)-4-benc¡l-3-prop¡on¡loxazol¡d¡n-2-ona (1,0 g, 4,3 mmol) en tetrah¡drofurano (10 ml) a una soluc¡ón a -78 °C de L¡N(TMS)2 (1,0 M en tetrah¡drofurano, 4,5 ml, 4,5 mmol) en tetrah¡drofurano (14 ml). Se ag¡tó la mezcla durante 30 m¡nutos a -78 °C y se añad¡ó entonces acetofenona (0,53 ml, 4,5 mmol) durante 10 m¡nutos. Se agitó la mezcla a -78 °C durante dos horas y se ¡nact¡vó entonces med¡ante la ad¡c¡ón de NH4Cl acuoso saturado. Se calentó la mezcla a temperatura amb¡ente y se extrajo dos veces con EtOAc. Se secaron los extractos orgán¡cos comb¡nados sobre Na2 SO 4 anh¡dro y se concentraron. Se pur¡f¡có el res¡duo por cromatografía en gel de síl¡ce (EtOAc al 0-20 %/hexanos) proporc¡onando mezclas parc¡almente separadas del mater¡al de part¡da de oxazol¡d¡nona y cuatro pos¡bles d¡astereómeros (Rf= 0,57 en EtOAc/hexanos 1:4, 0,56 g, 37 % , fracc¡ón que cont¡ene (2S,3S); Rf= 0,50 en EtOAc/hexanos 1:4, 0,26 g, 17 % , fracc¡ón que cont¡ene (2S,3R)). Se real¡zó la as¡gnac¡ón estereoquím¡ca para los dos d¡astereómeros pr¡nc¡pales observados med¡ante extrapolac¡ón de los datos reseñados en Bartrol¡, et al; J. O rg. C hem , 1995, 60, 3000.
Etapa B: Preparac¡ón de (R)-4-benc¡l-3-((2S,3R)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-2-met¡l-3-fen¡lbutano¡l)oxazol¡d¡n-2-ona. Se añad¡ó gota a gota tr¡fluorometanosulfonato de terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡lo (200 pl, 0,88 mmol) a una soluc¡ón de la mezcla d¡astereo¡somér¡ca que contenía ác¡do (2S,3R)-3-h¡drox¡-2-met¡l-3-fen¡lbutano¡co a¡slado de la Etapa A (0,26 g, 0,74 mmol) y Et3 N (200 pl, 1,5 mmol) en CH 2 Ch (5 ml). Se ag¡tó la soluc¡ón a temperatura amb¡ente durante una hora y se repart¡ó entonces entre EtOAc y NaHCO3 acuoso saturado. Se separaron las fases y se lavaron los productos orgán¡cos con NaCl acuoso saturado. Se secaron los productos orgán¡cos sobre Na2 SO 4 anh¡dro y se concentraron. Se pur¡f¡có el res¡duo dos veces por cromatografía en gel de síl¡ce (EtOAc al 0-20 %/hexanos y entonces CH 2 Ch al 0­ 50 %/hexanos) proporc¡onando el producto esperado (0,11 g, 32 %).
Etapa C: Preparac¡ón de ác¡do (2S,3R)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-2-met¡l-3-fen¡lbutano¡co. Se añad¡eron h¡dróx¡do de l¡t¡o (29 mg, 1,2 mmol) y peróx¡do de h¡drógeno acuoso al 30 % (0,12 ml, 1,2 mmol) a una mezcla a 0 °C de (R)-4-benc¡l-3-((2S,3R)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-2-met¡l-3-fen¡lbutano¡l)oxazol¡d¡n-2-ona de la Etapa B (110 mg, 0,24 mmol) en tetrah¡drofurano/H2O 1:1 (3 ml). Se ag¡tó la mezcla de 0 ° C a temperatura amb¡ente durante una noche. Se ajustó la mezcla a pH 2 med¡ante la ad¡c¡ón de HCl acuoso 1 M y se trató entonces con NaCl sól¡do hasta que los sól¡dos dejaron de d¡solverse. Se repart¡ó entonces la mezcla entre NaCl acuoso saturado y EtOAc. Se separaron las fases y se extrajo la capa acuosa de nuevo con EtOAc. Se comb¡naron los extractos orgán¡cos, se secaron sobre Na2 SO 4 anh¡dro y se concentraron. Se pur¡f¡có el res¡duo por cromatografía en gel de síl¡ce (CH2 Ch al 0-50 %/hexanos) proporc¡onando el producto esperado (10 mg, 24 %).
Etapa D: Preparac¡ón de (2S,3R)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2-met¡l-3-fen¡lbutanam¡da. Se ag¡tó a 50 °C durante 3 días una mezcla de 2-am¡no-3-c¡clobut¡l-3H-¡m¡dazo[4,5-b]p¡r¡d¡n-5-carbon¡tr¡lo (7,0 mg, 0,032 mmol), ác¡do (2S,3R)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-2-met¡l-3-fen¡lbutano¡co de la Etapa C (10 mg, 0,032 mmol), HOBt (7,0 mg, 0,049 mmol), E d C (8,0 mg, 0,049 mmol) y d¡¡soprop¡let¡lam¡na (17 pl, 0,097 mmol) en d¡met¡lformam¡da (2 ml). Se enfr¡ó la mezcla a temperatura amb¡ente y se repart¡ó entre agua y EtOAc. Se extrajo la fase acuosa dos veces más con EtOAc. Se lavaron los extractos orgán¡cos comb¡nados con NaCl acuoso saturado, se secaron sobre Na2 SO 4 anh¡dro y se concentraron. Se usó el mater¡al bruto como tal en la s¡gu¡ente etapa.
Etapa E: Preparac¡ón de (2S,3R)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-3-h¡drox¡-2-met¡l-3-fen¡lbutanam¡da. Se añad¡ó TBAF (tetrah¡drofurano 1,0 M, 160 pl, 0,16 mmol) a una soluc¡ón del producto bruto de la Etapa D anter¡or en tetrah¡drofurano (0,32 ml). Se agitó la mezcla a 50 °C durante una noche, se enfr¡ó a temperatura amb¡ente y se concentró. Se pur¡f¡có el res¡duo por cromatografía en fase ¡nversa (CH3CN al 10 % /H 2O a CH 3CN) procurando el compuesto del título (1,7 mg, 14 % en dos etapas). MS (ESI) m /z 389,2 (MH+).
E je m p lo 29. P rep a ra c ió n de (S )-N -(6 -c ia n o -1 -c id o b u til-1 H -b e n z o [d ]im id a z o l-2 - il) -3 -h id ro x i-3 -fe n ilb u ta n a m id a .
Figure imgf000067_0001
Etapa A: Preparación de (S)-4-bencil-3-((S)-3-hidroxi-3-fenilbutanoil)oxazolidin-2-ona. Se añadió bis(trimetilsilil)amiduro de litio (tetrahidrofurano 1,0 M, 9,2 ml, 9,2 mmol) durante 15 minutos a una suspensión a -78 °C de (S)-3-acetil-4-benciloxazolidin-2-ona (2,0 g, 9,2 mmol) en tetrahidrofurano (9 ml). Se agitó la mezcla a -78 °C durante dos horas. Se añadió una solución de acetofenona (485 pl, 4,2 mmol) en tetrahidrofurano (3 ml) durante 35 minutos. Se agitó la mezcla a -78 °C durante 1 hora y se inactivó entonces mediante la adición de HCl acuoso 0,5 M. Se calentó la mezcla a temperatura ambiente y se extrajo entonces con CH 2 Ch. Se separaron las capas y se extrajo la fase acuosa dos veces más con CH 2 Ch. Se secaron los extractos orgánicos combinados sobre Na2 SO 4 anhidro y se concentraron. Se purificó el residuo por cromatografía en gel de sílice (EtOAc al 0-30 %/hexanos) proporcionando el compuesto deseado de forma parcialmente purificada (1,6 g) que se usó como tal. Se asignó la estereoquímica como se reseña en Theurer, et al; Tetrahedron , 2010, 66, 3814.
Etapa B: Preparación de (S)-4-bencil-3-((S)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-3-fenilbutanoil)oxazolidin-2-ona. Se añadió gota a gota trifluorometanosulfonato de terc-butildimetilsililo (1,3 ml, 5,7 mmol) a una solución a temperatura ambiente del residuo preparado como se describe en la Etapa A y Et3 N (1,1 ml, 7,5 mmol) en CH 2 Ch (24 ml). Se agitó la mezcla a temperatura ambiente durante una noche y se repartió entonces entre EtOAc y NaHCO3 acuoso saturado. Se separaron las fases y se lavaron los productos orgánicos con NaCl acuoso saturado. Se extrajeron entonces secuencialmente las dos fases acuosas dos veces con EtOAc. Se secaron los extractos orgánicos combinados sobre Na2 SO 4 anhidro y se concentraron. Se purificó el residuo dos veces por cromatografía en gel de sílice (EtOAc al 0-30 %/hexanos y entonces CH 2 Ch al 0-50 %/hexanos) proporcionando el producto esperado (0,57 g, 30 % en dos etapas). Etapa C: Preparación de ácido (S)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-3-fenilbutanoico. Se añadieron hidróxido de litio (150 mg, 6,3 mmol) y peróxido de hidrógeno acuoso al 30 % (0,64 ml, 6,3 mmol) a una mezcla a 0 °C de (S)-4-bencil-3-((S)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-3-fenilbutanoil)oxazolidin-2-ona de la Etapa B (570 mg, 1,3 mmol) en tetrahidrofurano/H2O 1:1 (13 ml). Se agitó la mezcla de 0 °C a temperatura ambiente durante 80 minutos. Se ajustó la mezcla a pH 2 mediante la adición de HCl acuoso 1 M y se trató entonces con NaCl sólido hasta que los sólidos dejaron de disolverse. Se repartió entonces la mezcla entre NaCl acuoso saturado y EtOAc. Se separaron las fases y se extrajo la capa acuosa de nuevo con EtOAc. Se combinaron los extractos orgánicos, se secaron sobre Na2 SO 4 anhidro y se concentraron. Se purificó el residuo por cromatografía en gel de sílice (EtOAc al 0-60 %/hexanos) proporcionando el producto esperado (0,21 g, 57 %).
Se preparó entonces el compuesto del título usando los procedimientos descritos en la Etapa D y la Etapa E del ejemplo 18. MS (ESI) m /z 375 (MH+).
Ejemplo 30: Preparación de (R)-N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3-hidroxi-3-fenilbutanamida.
Figure imgf000067_0002
Se usó el mismo procedimiento para preparar el compuesto del título que se usó para el ejemplo 29, con la excepción de partir de (R)-3-acetil-4-benciloxazolidin-2-ona en lugar del enantiómero (S). MS (ESI) m /z 375 (MH+).
E je m p lo 20. P rep a ra c ió n de (S )-N -(6 -c ia n o -1 -c id o b u til-1 H -b e n z o [d ]im id a z o l-2 - il) -3 -h id ro x i-3 -(p ir id in -2 - il)b u ta n a m id a .
Figure imgf000068_0001
Se usó el mismo procedimiento para preparar el compuesto del título que el usado para el ejemplo 29, con la excepción de partir de (R)-3-acetil-4-benciloxazolidin-2-ona en lugar del enantiómero (S) y usar 2-acetopiridina en lugar de acetofenona. MS(ESI) m /z 376 (MH+). Asignación esteroquímica basada en Peters R, et al., J. Org. C hem . 2006, 71, 7583-7595.
Ejemplo 21. Preparación de (S)-N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3-hidroxi-3-(piridin-3-il)butanamida.
Figure imgf000068_0002
Se usó el mismo procedimiento para preparar el compuesto del título que el usado para el ejemplo 29, con la excepción de partir de (R)-3-acetil-4-benciloxazolidin-2-ona en lugar del enantiómero (S) y usar 3-acetopiridina en lugar de acetofenona.
Ejemplo 23. Preparación de (S)-N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-2,3,3-trimetilbutanamida.
Figure imgf000068_0003
Etapa A: Preparación de (S)-4-bencil-3-(3,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona.
Figure imgf000069_0001
Se cargó un matraz de fondo redondo de 1,0 l con barra de agitación, tetrahidrofurano (200 ml, anhidro) y (S)-4-benciloxazolidin-2-ona (10,0 g, 56,4 mmol). Se colocó el matraz en un baño a -78 °C durante 15 minutos antes de la adición gota a gota de n-BuLi (2,5 M en hexanos, 25,0 ml, 1,1 equivalentes) bajo atmósfera de nitrógeno. Se dejó agitar la reacción durante 1 hora antes de la adición de cloruro de 3,3-dimetilbutanoílo (11,7 ml, 1.5 equivalentes). Se dejó agitar la reacción a -78 °C, se retiró entonces el baño de enfriamiento y se dejó calentar lentamente el matraz a temperatura ambiente y agitar durante una noche. Se inactivó la reacción mediante la adición de bicarbonato de sodio acuoso saturado (200 ml) y se retiró el grueso del tetrahidrofurano por rotavapor. Se disolvió el residuo restante en acetato de etilo (300 ml) y se lavó secuencialmente con bicarbonato de sodio acuoso saturado (dos veces), carbonato de sodio acuoso saturado (dos veces) y salmuera y se secó entonces sobre sulfato de sodio. Se filtró la solución secada y se concentró dando 20 g de producto bruto. Se recristalizó el material con acetato de etilo caliente (aproximadamente 30 ml) y hexanos calientes (aproximadamente 70 ml) dando la primera recogida del producto deseado (9,0 g. 58 % de rendimiento) en forma de cristales blancos. Se obtuvo una segunda recogida adicional (3,8 g, 25 % de rendimiento) de las aguas madre. RMN-1H (CDCh): 87,36-7,22 (m, 5H), 4,73-4,67 (m, 1H), 4 ,18-4,12 (m, 2H), 3,34 (dd, J= 13,28, 3,32 Hz, 1H), 2,99 (d, J= 14,9 Hz, 1H), 2,86 (d, J= 14,9 Hz, 1H), 2,71 (dd, J= 13,24, 10,00 Hz, 1H), 1,09 (s a, 9H).
Etapa B: Preparación de (S)-4-bencil-3-((S)-2,3,3-trimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona.
Figure imgf000069_0002
Figure imgf000069_0003
A, principal B. minoritario
Se mezcló azeotrópicamente (S)-4-bencil-3-(3,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona recién cristalizada (8,75 g, 31,77 mmol) con diclorometano (2x, 30 ml) y se colocó entonces a alto vacío durante 10 minutos antes de disolver en tetrahidrofurano (40 ml). En un matraz de fondo redondo de 1,0 l provisto de un balón de nitrógeno y una barra de agitación se colocó NaHMDS (1,0 M en tetrahidrofurano, 35 ml, 1,1 equivalentes) y se colocó el matraz en un baño a -78 °C. Después de enfriar durante 15 minutos, se añadió gota a gota la solución de (S)-4-bencil-3-(3,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona en 40 ml de tetrahidrofurano a NaHMDS a -78 °C. Se dejó formar la formación del enolato de sodio durante 1 hora a -78 °C y se añadió entonces yoduro de metilo (6 ml, 3 equivalentes) por jeringuilla. Se dejó agitar la reacción y calentar lentamente a temperatura ambiente durante una noche. Se inactivó la reacción mediante la adición de bicarbonato de sodio acuoso saturado (150 ml) y se retiró el grueso del tetrahidrofurano por rotavapor. Se transfirió el residuo a un embudo separador usando acetato de etilo y bicarbonato de sodio acuoso saturado. Se separaron las capas y se lavó la capa orgánica con tiosulfato de sodio acuoso al 10 % (150 ml) para retirar el color amarillo pálido. Se reextrajeron las capas orgánicas combinadas con acetato de etilo (2x). Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando un sólido blanco (8,61 g, 94 % de rendimiento). El análisis de RMN-1H indicaba la conversión completa del material de partida en los productos metilados y una relación diastereoisomérica de aproximadamente 15:1 de productos a favor del diastereómero (S)-4-bencil-3-((S)-2,3,3-trimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona A deseado. Un intento de enriquecer la relación diastereomérica por recristalización con hexanos calientes no consiguió mejorar la relación diastereoisomérica. Por lo tanto, se dividió el producto sólido inicial en tres porciones y se sometió cada una a cromatografía en columna (lsco, gel de sílice de 120 g, EtOAc al 0-10 % en hexanos). Se apartaron las fracciones de Rf de elución anterior del pico de UV de las fracciones de elución posterior dando un producto de relación diastereoisomérica mejorada (1,83 g, d.r. aproximadamente 70:1) en forma de un sólido blanco. Se repitió la cromatografía en el producto original dando dos muestras de relación diastereoisomérica mejorada (2,28 g, d.r. >20:1 y 4,59 g, d.r. 30:1) en favor del diastereómero (S)-4-bencil-3-((S)-2,3,3-trimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona. Diastereómero principal A RMN-1H (CDCla): 87,33-7,23 (m, 5H), 4,73-4,67 (m, 1H), 4 ,17-4 ,13 (m, 2H), 3,90 (c, J= 7,00 Hz, 1H), 3,28 (dd, J= 13 ,32, 3 ,20 Hz, 1H), 2,77 (dd, J= 13 ,32, 9,72 Hz, 1H), 1,20 (d, J= 7,00 Hz, 3H), 1,02 (s a, 9H). Se combinaron las fracciones de Rf de elución posterior dando el producto deseado con una relación diastereoisomérica disminuida (360 mg, d.r. 3:1) contaminado con el diastereómero B minoritario (S)-4-bencil-3-((R)-2,3,3-trimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona indeseado (Referencia: Evans, DA; Ennis, MD; Mathre, DJ J. A m . C hem . Soc.
1982, 104, 1737-1739).
Etapa C: Preparación de ácido (S)-2,3,3-trimetilbutanoico.
Figure imgf000070_0001
Se disolvió (S)-4-bencil-3-((S)-2,3,3-trimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona sólida (2,24 g, 7,73 mmol, diastereómero A de la Etapa B anterior, d.r. aprox. 30:1) en tetrahidrofurano (50 ml) y agua (10 ml) y se dejó enfriar el matraz a 0 °C durante 10 minutos antes de la adición de hidróxido de litio (326 mg, 13,6 mmol, 2 equivalentes) en una porción. Después de pocos minutos, se añadió peróxido de hidrógeno (30 % , 6 ml) por jeringuilla. Después de aproximadamente 30 min, se añadió una porción adicional de tetrahidrofurano (60 ml) y agua (10 ml) al matraz. Se dejó agitar la reacción a 0 °C durante 1 hora y se dejó calentar entonces a temperatura ambiente y agitar durante 24 horas. Se volvió a enfriar el matraz a 0 °C y se inactivó entonces mediante la adición de sulfito de sodio (19 g en 125 ml de agua) y bicarbonato de sodio acuoso saturado (75 ml). Se dejó agitar la reacción inactivada durante 1,5 horas y se retiró entonces el grueso del tetrahidrofurano por rotavapor. Se transfirió la mezcla a un embudo separador usando diclorometano y bicarbonato de sodio acuoso saturado. Se extrajo la capa acuosa con diclorometano (3 x 50 ml) retirando el grueso del auxiliar quiral. Se acidificó cuidadosamente la capa acuosa con HCI (1 M, hasta pH= 2) y se extrajo entonces con diclorometano (4 x 50 ml). Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera y se secaron con sulfato de sodio. Se filtró la solución secada y se evaporó cuidadosamente dando el ácido carboxílico deseado en forma de un aceite (925 mg, > 100 % de rendimiento, impureza diclorometano). Se diluyó el ácido (S)-2,3,3-trimetilbutanoico hasta un volumen de 9 ml con diclorometano haciendo una solución madre que se usó directamente en la reacción de acoplamiento de amida. RMN-1H (CDCla): 812,02 (s a, 1H), 2,29 (c, J= 7,08 Hz, 1H), 1 ,13 (d, J= 7,08 Hz, 3H), 0,99 (s a, 9H). (Referencia: Evans, DA, Britton, TC, Ellman, JA, T e trah ed ro n Lett. 1987, 28(49), 6141-6144).
Etapa D: Preparación de (S)-N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-2,3,3-trimetilbutanamida.
Se transfirió la solución madre de ácido (S)-2,3,3-trimetilbutanoico en diclorometano de la Etapa C a un matraz tarado y se evaporó cuidadosamente. Se disolvió este ácido en dimetilformamida y se siguió el Método 7 de acoplamiento de amida estándar dando el producto deseado.
Ejemplo 13. Preparación de (S)-N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3-hidroxi-2,3-dimetilbutanamida.
Figure imgf000070_0002
Etapa A. Preparación de (R)-4-bencil-3-((S)-3-hidroxi-2,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona.
Figure imgf000071_0001
Se disolvió (R)-4-bencil-3-propioniloxazolidin-2-ona comercialmente disponible (3,0 g, 12,85 mmol, 1,0 equivalentes) en diclorometano (40 ml) y se enfrió a 0 °C durante 10 minutos antes de la adición de TiCl4 (1,0 M en diclorometano, 14 ,15 ml, 1,1 equivalentes) por jeringuilla bajo atmósfera de nitrógeno. Después de 5 minutos, se añadió gota a gota diisopropiletilamina (2,5 ml, 1,1 equivalentes) por jeringuilla. Se dejó agitar la reacción a 0 °C durante 1 hora y se formó un enolato de titanio rojo oscuro. En ese momento, se añadió acetona (1,4 ml, 1,5 equivalentes, secada sobre carbonato de potasio anhidro durante 24 horas) por jeringuilla. Se dejó agitar la reacción a 0 °C durante 15 minutos y se dejó calentar lentamente entonces a temperatura ambiente durante una noche. Se inactivó la reacción mediante la adición de cloruro de amonio acuoso (1 M, 100 ml) y se extrajo con diclorometano (tres veces). Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando 4,0 g de un aceite bruto. Se sometió el aceite bruto a cromatografía en columna (lsco, gel de sílice de 120 g, EtOAc al 0-25 % en hexanos) dando el producto deseado (3,0 g, 80 % de rendimiento) en forma de un sólido blanco. El análisis de RMN indicaba un diastereómero individual del producto purificado. Rf= 0,75 en EtOAc al 20 % en hexanos. RMN-1H (CDCla): 87,32-7,23 (m, 5H), 4,72-4,66 (m, 1H), 4,20-4,13 (m, 2H), 3,95 (c, J= 7,00 Hz, 1H), 3,38-3,34 (m, 2H), 2,75 (dd, J= 13,36, 9,88 Hz, 1H), 1,35 (s, 3H), 1,24 -1,23 (m, 6H). (Referencia: Evans, DA, Urpi, F, Somers, TC. Clark, JS, Bilodeau, MT, J. A m . C hem . Soc. 1990, 112 , 8215-8216).
Etapa B: Preparación de (R)-4-bencil-3-((S)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-2,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona.
Figure imgf000071_0002
Se disolvió el alcohol terciario sólido (1000 mg, 3,43 mmol, 1,0 equivalentes) del procedimiento anterior, (R)-4-bencil-3-((S)-3-hidroxi-2,3-dimetilbutanoil)oxazolidin-2-ona, en diclorometano (10 ml) y se añadió diisopropiletilamina (0,9 ml, 1,5 equivalentes) por jeringuilla. Se enfrió el matraz durante 10 minutos en un baño a 0 °C antes de la adición gota a gota de triflato de terc-butildimetilsililo (0,9 ml, 1,1 equivalentes) por jeringuilla. Se dejó agitar la reacción durante una noche y se inactivó entonces mediante la adición de bicarbonato de sodio acuoso saturado (50 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con diclorometano. Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron dando un aceite bruto. Se sometió el material bruto a cromatografía en columna de gel de sílice (lsco, gel de sílice de 24 g, EtOAc al 0-20 % en hexanos) dando el éter TBS deseado (1,23 g, 95 % ) en forma de un sólido blanco. Rf= 0,75 en EtOAc al 20 % en hexanos. RMN-1H (CDCla): 87,24-7,12 (m, 5H), 4,57-4,51 (m, 1H), 4,10-3,93 (m, 3H), 3,33 (dd, J= 13,08, 3,16 Hz, 1H), 2,47 (dd, J= 13,00, 10,88 Hz, 1H), 1,25 (s, 3H), 1,24 (s, 3H), 1,07 (d, J= 7,00 Hz, 3H), 0,76 (s a, 9H), 0,00 (d, J= 5,72 Hz, 6H).
Etapa C: Preparación de ácido (S)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-2,3-dimetilbutanoico
Se disolvió (R)-4-benc¡l-3-((S)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-2,3-d¡metilbutano¡l)oxazol¡d¡n-2-ona sólida (3,8 g, 9,7 mmol, d.r. > 30:1) en tetrah¡drofurano (50 ml) y agua (10 ml) y se dejó enfr¡ar a 0 °C el matraz durante 5 m¡nutos antes de la ad¡c¡ón de h¡dróx¡do de l¡t¡o (450 mg, 18,7 mmol, 2 equ¡valentes) en una porc¡ón. Después de pocos m¡nutos, se añad¡ó peróx¡do de h¡drógeno (30 % , 12 ml) porjer¡ngu¡lla. Se dejó ag¡tar la reacc¡ón a 0 °C durante 1 hora y se dejó calentar entonces a temperatura amb¡ente y ag¡tar durante 24 horas. Se volv¡ó a enfr¡ar el matraz a 0 °C y se ¡nact¡vó entonces med¡ante la ad¡c¡ón de sulf¡to de sod¡o (12 g en 100 ml de agua). Se dejó ag¡tar la reacc¡ón ¡nact¡vada durante 1,5 horas y se retiró entonces el grueso del tetrah¡drofurano por rotavapor. Se transf¡r¡ó la mezcla a un embudo separador usando d¡clorometano y b¡carbonato de sod¡o acuoso saturado. Se extrajo la capa acuosa con d¡clorometano (2 x 50 ml). Se encontró que este extracto de d¡clorometano ¡n¡c¡al contenía tanto el auxiliar qu¡ral como el ác¡do de éter TBS deseado. Se lavaron los productos orgán¡cos comb¡nados con salmuera y se secaron con sulfato de sod¡o, se f¡ltraron y se concentraron dando el producto bruto en forma de ace¡te (3,1 g). Se somet¡ó el mater¡al bruto a cromatografía en columna de gel de síl¡ce (lsco, 40 g, EtOAc al 0-25 % en hexanos, detecc¡ón por ELSD) dando el producto deseado en forma de un ace¡te (1,2 g, 52 % de rend¡m¡ento). Rf= 0,50 en EtOAc al 20 % en hexanos, púrpura ante t¡nc¡ón con an¡saldehído y no es act¡vo para UV. RMN-1H (CDCla): 810,4-9,80 (s a, 1H), 2,32 (c, J= 7,16 Hz, 1H), 1,19 (s, 3H), 1,14 (s, 3H), 1,03 (d, J= 7,16 Hz, 3H), 0,72 (s, 9H), 0,00 (s, 6H).
Etapa D: Preparac¡ón de (S)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2,3-d¡met¡lbutanam¡da.
Figure imgf000072_0001
Se usó el método 7 para proporc¡onar el producto de am¡da deseado (38 mg, 65 % de rend¡m¡ento), a¡slado med¡ante cromatografía en columna. El mater¡al a¡slado estaba contam¡nado con el éster act¡vado del correspond¡ente copartíc¡pe de acoplam¡ento de ác¡do carboxíl¡co. Se llevó el mater¡al a la s¡gu¡ente etapa s¡n n¡nguna pur¡f¡cac¡ón ad¡c¡onal.
Etapa E: Preparac¡ón de (S)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-3-h¡drox¡-2,3-d¡met¡lbutanam¡da med¡ante desprotecc¡ón del éter TBDMS.
Figure imgf000072_0002
Se d¡solv¡ó la (S)-3-((terc-but¡ld¡met¡ls¡l¡l)ox¡)-N-(6-c¡ano-1-c¡clobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-2,3-d¡met¡lbutanam¡da bruta de la Etapa D anter¡or (38 mg) en MeOH (4 ml) y se añad¡ó HCI (3 M en d¡et¡léter, 2 ml) a la reacc¡ón por jer¡ngu¡lla. Se dejó ag¡tar la reacc¡ón a temperatura amb¡ente durante 30 m¡nutos, cuando el anál¡s¡s de LC/MS ¡nd¡caba una desprotecc¡ón lenta y l¡mp¡a del éter TBS. Se colocó el matraz en un baño de arena a 50 °C y se dejó ag¡tar tapado durante 20 horas. Se dejó enfr¡ar el matraz y se ¡nact¡vó entonces med¡ante la cu¡dadosa ad¡c¡ón de b¡carbonato de sod¡o acuoso saturado (30 ml) y acetato de etilo (30 ml). Se extrajo la capa acuosa dos veces con acetato de etilo. Se lavaron los extractos orgánicos combinados con salmuera, se secaron con sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron, dando un aceite bruto. Se sometió el material bruto a cromatografía en columna (lsco, gel de sílice de 12 g, EtOAc al 5-75 % en hexanos) dando el producto deseado (18 mg, 64 % de rendimiento). MS (ESI) m /z 327,2 (MH+).
Ejemplo 12. Preparación de N-(6-c¡ano-1-ciclobut¡l-1H-benzo[d]¡m¡dazol-2-¡l)-3-metox¡-3-met¡lbutanam¡da.
Etapa A. Preparación de ácido 3-metoxi-3-metilbutanoico.
Figure imgf000073_0001
Se añadió N-óxido de N-metilmorfolina monohidratado (6,8 g, 50 mmol, 10 equivalentes) a una solución de 3-metoxi-3-metilbutan-1-ol (0,6 g, 5 mmol) en acetonitrilo (20 ml) y se dejó agitar la mezcla a temperatura ambiente. Después de 5 min, se añadió perrutenato de tetrapropilamonio (175 mg, 0,5 mmol, 0,1 equivalentes) en una porción y se dejó agitar la reacción durante 3 h antes de retirar cuidadosamente el grueso del disolvente en un rotavapor (precaución, el producto es volátil). Se purificó el residuo por cromatografía en columna (EtOAc al 50-100 %/hexanos). Se retiraron hexanos y EtOAc tanto por rotavapor como un corto periodo de tiempo a alto vacío. El producto es volátil y no debe dejarse a vacío durante más de 30 s. Se diluyó el ácido purificado resultante con dimetilformamida (7 ml) haciendo una solución aproximadamente 0,2 M que se usó para la reacción de acoplamiento de amida como tal. Rf= trazo de 0,4 a 0,8 en EtOAc al 100 % , no activo para UV, se tiñe de púrpura con anisaldehído. M -1= 131,2. RMN-1H (CDCh): 8 12,0-9,0 (s a, 1H), 3,30 (s, 3H), 2,57 (s, 2H), 1,32 (s, 6H). (Referencia: Schmidt, A-KC, Stark, BW, O rg. Lett. 2011, 13, 4164-4167).
Etapa B. Preparación de N-(6-ciano-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3-metoxi-3-metilbutanamida.
Se preparó el compuesto del título a partir de ácido 3-metoxi-3-metilbutanoico y 4-amino-3-(ciclobutilamino)benzonitrilo según el Método 7. MS (ESI) m /z 327 (MH+).
Ejemplo 103. Preparación de (S)-N-(6-cloro-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-il)-3-(4-fluorofenil)-3-hidroxibutanamida.
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Etapa A: Preparación de (S)-4-benci|-3-((S)-3-(4-fluorofenil)-3-hidroxibutanoil)oxazolidin-2-ona. Se añadió bis(trimetilsilil)amiduro de litio (tetrahidrofurano 1,0 M, 6,6 ml, 6,6 mmol) durante 15 minutos a una suspensión a -78 °C de (S)-3-acetil-4-benciloxazolidin-2-ona (1,5 g, 6,6 mmol) en tetrahidrofurano (18 ml). Se agitó la mezcla a -78 °C durante dos horas. Se añadió gota a gota acetofenona (330 pl, 3,2 mmol) durante 5 minutos. Se agitó la mezcla a -78 °C durante 1 hora y se inactivó entonces mediante la adición de HCl acuoso 0,5 M. Se calentó la mezcla a temperatura ambiente y se extrajo entonces con CH 2 Ch. Se separaron las capas y se extrajo la fase acuosa dos veces más con CH 2 Cl2. Se secaron los extractos orgánicos combinados sobre Na2 SO 4 anhidro y se concentraron. Se purificó el residuo por cromatografía en gel de sílice (EtOAc al 0-30 %/hexanos) proporcionando el deseado (0,80 g).
Etapa B: Preparación de ácido (S)-3-(4-fluorofenil)-3-hidroxibutanoico. Se añadió hidróxido de litio (210 mg, 9,0 mmol) a una mezcla a 0 °C de (S)-4-bencil-3-((S)-3-(4-fluorofenil)-3-hidroxibutanoil)oxazolidin-2-ona (0,80 g, 2,2 mmol) y peróxido de hidrógeno acuoso al 50 % (0,51 ml, 9,0 mmol) en tetrahidrofurano/H2O 1:1 (9 ml). Se agitó la mezcla a 0 °C durante 15 minutos y entonces a temperatura ambiente durante 3 horas. Se ajustó la mezcla a pH 7 mediante la adición de HCl acuoso 1 M y se diluyó entonces con EtOAc. Se separaron las capas, se ajustó la fase acuosa a pH 2 mediante la adición de HCl acuoso 1 M y se trató entonces con NaCl sólido hasta que los sólidos dejaron de disolverse. Se repartió entonces la mezcla entre NaCl acuoso saturado y EtOAc. Se separaron las fases y se extrajo la capa acuosa de nuevo con EtOAc. Se combinaron los extractos orgánicos, se secaron sobre Na2 SO 4 anhidro y se concentraron proporcionando el producto esperado (0,35 g, 79 %).
Se preparó entonces el compuesto del título usando los procedimientos descritos en la Etapa D del ejemplo 18, sustituyendo el ácido (S)-3-(4-fluorofenil)-3-hidroxibutanoico por ácido (2S,3R)-3-((terc-butildimetilsilil)oxi)-2-metil-3-fenilbutanoico y la 6-cloro-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-2-amina por 2-amino-1-ciclobutil-1H-benzo[d]imidazol-6-carbonitrilo. MS (ESI) m /z 402 (MH+).
Preparación de ácido 2-(1-hidroxicidopentil)acético.
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Etapa A. Preparación de 2-(1-hidroxicidopentil)acetato de etilo.
Se añadió clorotrimetilsilano (181 pl, 1,4 mmol) a una suspensión de cinc en polvo (1,2 g, 19 mmol) en Et2O (30 ml). Se agitó la mezcla a temperatura ambiente durante 15 minutos y entonces se calentó a reflujo durante 15 minutos. Se retiró la fuente de calor y se añadió gota a gota bromoacetato de etilo (1,8 ml, 14 mmol) a la mezcla caliente. Se calentó a reflujo entonces la mezcla durante una hora y se agitó entonces a temperatura ambiente durante una hora. Se añadió gota a gota entonces ciclopentanona (1,0 g, 12 mmol). Se agitó la mezcla resultante durante una hora y se vertió entonces en amoniaco acuoso concentrado enfriado con hielo (80 ml). Se separaron las capas y se extrajo la fase acuosa con Et2O (3 x 40 ml). Se secaron los extractos orgánicos combinados (K2 CO 3 ) y se concentraron facilitando 1,7 g de un aceite incoloro. Se usó este material en la siguiente etapa.
Etapa B. Preparación de ácido 2-(1-hidroxiciclopentil)acético. Se añadió hidróxido de litio (1,4 g, 58 mmol) a una solución a temperatura ambiente del éster bruto preparado como se describe en la etapa anterior (1,0 g, 5,8 mmol) en EtOH:agua 1:1 (29 ml). Después de 2 horas, se repartió la reacción entre agua (100 ml) y MTBE (100 ml). Se aisló la capa acuosa y se ajustó el pH a pH= 2 con HCl acuoso 1,0 N. Se extrajo la mezcla acuosa tres veces con EtOAc. Se secaron los extractos orgánicos combinados (Na2 SO 4) y se concentraron procurando el producto deseado (500 mg, 60 % ). (ESI) m /z 143,2 (M-H).
Se prepararon los siguientes ácidos carboxílicos usando un procedimiento análogo al descrito para la preparación de ácido 2-(1 -hidroxiciclopentil)acético con materiales de partida apropiados.
ácido 3,3-diciclopropil-3-hidroxipropanoico
ácido 3-ciclopentil-3-hidroxibutanoico
ácido 3-ciclobutil-3-hidroxibutanoico
Preparación de ácido 3-hidroxi-2,2-dimetil-3-fenilpropanoico
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Se detalla la preparación de ácido 3-hidroxi-2,2-dimetil-3-fenilopropanoico en J. Org. C hem , 2012, 77 (11), 4885-4901. Sección 5. Métodos analíticos generales
Se realizó la LCMS en un instrumento Agilent 1100 MSD equipado con columna Ascentis Express C18, 10 cm x 4,6 mm x 2,7 mm, usando los siguientes métodos:
Método A de HPLC
Disolvente A: ácido fórmico al 0,1 % en agua
Disolvente B: Acetonitrilo
Caudal: 1,4 ml/min
Método:
0-6,0 min gradiente de B= 10 % a B= 95 %
6.0- 8,0 min, se mantiene B= 95 %
8.0- 8,2 min, gradiente de B= 95 % a B= 10 %
8,2-10,0 min, se mantiene B=10 %
Método B de HPLC:
Disolvente A: ácido fórmico al 0,1 % en agua
Disolvente B: Acetonitrilo
Caudal: 1,4 ml/ min
Método:
0-3,0 min gradiente de B= 10 % a B= 95 %
3.0- 4,0 min, se mantiene B= 95 %
4.0- 4,2 min, gradiente de B= 95 % a B= 10 %
4,2-6,0 min, se mantiene B= 10 %
La tabla 1 muestra las estructuras de los diversos ejemplos preparados mediante estos métodos generales, e indica el método de acoplamiento usado junto con un resumen de los datos analíticos de LCMS.
Ċ
Tabla 1. Lista de ejemplos, rutas sintéticas y datos analíticos
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Los ejemplos 83 y 106 no son parte de la invención reivindicada.
Métodos de ensayo biológicos
Ensayo de activación de Kv7.2/7.3
Se valoró la capacidad de los compuestos de potenciar las corrientes K en células HEK que contienen Kv7.2/7.3 usando fijación de membrana planar en la plataforma de cribado automatizado QPatch.
Estirpe celular: Se obtuvo la estirpe celular hKv7.2/7.3 de Chantest (Cleveland, OH 44128) n.° de cat. CT6147. Estas células HEK expresarán los canales iónicos Kv7.2/7.3 cuando se induzcan.
Cultivo celular: Se mantuvieron las células en un medio que contenía DMEM/F12; 50/50 (n.° de cat. GIBCO 11330), suero fetal bovino (FBS) al 10 % (n.° de cat. GIBCO 26140), 100 unidades/ml de penicilina-estreptomicina (n.° de cat. GIBCO 15140), blasticidina 0,005 mg/ml (n.° de cat. INVIVOGEN ant-bl-1), geneticina 0,5 mg/ml (n.° de cat. GIBCO 10131), zeocina 0,1 mg/ml (n.° de cat. GIBCO R25001). Se mantuvieron las células usadas en el ensayo de electrofisiología en medio sin blasticidina, geneticina y zeocina durante 2 días y se indujo la expresión de canal añadiendo tetraciclina (n.° de cat. BIOLINE BIO-87030) a una concentración final de 1 mg/ml. Se hicieron crecer las células en matraz T -175 a ~75 % de confluencia. Se registraron las corrientes durante 24 horas después de la inducción de canal.
Placas de compuesto: Se prepararon compuestos de prueba efectuando diluciones en serie en un Biomek NXP (BECKMAN COULTER). Se realizaron las diluciones finales en solución de registro externa con una concentración final de DMSO de DMSO al 0,1 % . Para cribados de concentración individual, cada placa tenía retigabina 10 pM como control positivo y DMSO al 0,1 % como control negativo.
Electrofisiología: El día del experimento, se lavaron las células con solución salina equilibrada de Hank (HBBS) (n.° de cat. GIBCO 14175) y se recolectaron con Tryple (n.° de cat. G IBCO 12604). Se centrifugaron entonces las células a 2000 rpm durante 5 minutos y se resuspendieron en CHO -S-SFM (n.° de cat. GIBCO 12052) a ~3x106células/ml. Se agitaron las células durante 30 minutos antes de iniciar los experimentos. La solución de registro externa contenía (en mM): NaCl (145), KCI (4), CaCh (2), MgCh (1), H EPES (10) y glucosa (10); se ajustó el pH a 7,4 con NaOH y se ajustó la osmolaridad a 300-305 mOsM con sacarosa si es necesario. La solución interna contenía (en mM): KCI (125), KF (10), EGTA (5), Na2ATP (5), MgCh (3,2), H EPES (5); se ajustó el pH a 7,2 con KOH y se ajustó la osmolaridad a 298­ 302 mOsM con sacarosa.
Se midió la actividad de canal de potasio en QPatch HTX (Sophion Bioscience) usando QPIates con 48 pocillos/placa. Cada pocillo se tomó como un experimento independiente y se probó solo un compuesto por pocillo. Se desencadenó la actividad de canal de potasio manteniendo a -80 mV y escalonando a -30 mV durante 2 s seguido de un pulso de 100 ms a -120 mV.
Cribado de concentración individual: Se obtuvieron las condiciones basales registrando 5 barridos solo en la solución externa, esto se repitió durante tres aplicaciones de la solución externa. Se valoró entonces el efecto de los compuestos de prueba sobre la corriente desencadenada registrando 5 barridos en presencia de una solución de compuesto 3 pM. Se midió la corriente en estado estacionario al final del pulso de 2 s a -30 mV para determinar el aumento en veces desde el valor basal.
Tabla 2. Resultados del cribado de concentración individual de Kv7.2/7.3
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*Aumento de la corriente de células HEK que coexpresan Kv7.2/Kv7.3, medido a una concentración de compuesto de 3 |j M, como un intervalo de aumento <1,2 veces desde el valor basal (-) hasta > 6 veces de aumento desde el valor basal (+++).
A menos que se indique otra cosa, todos los números que expresan cantidades de ingredientes, propiedades tales como peso molecular, condiciones de reacción y demás usados en la memoria descriptiva y reivindicaciones han de entenderse como modificados en todos los casos por el término “aproximadamente”. Por consiguiente, a menos que se indique lo contrario, los parámetros numéricos expuestos en la memoria descriptiva y reivindicaciones adjuntas son aproximaciones que pueden variar dependiendo de las propiedades deseadas que se busque obtener. Como mínimo, y no como un intento de limitar la aplicación de la doctrina de equivalentes al alcance de las reivindicaciones, cada parámetro numérico debería considerarse en vista del número de dígitos significativos reseñados y aplicando técnicas de redondeamiento ordinarias.
Los términos “un”, “una”, “el/la” y referentes similares usados en el contexto de la descripción de la invención (especialmente en el contexto de las siguientes reivindicaciones) ha de considerarse que cubren tanto el singular como el plural, a menos que se indique otra cosa en el presente documento o se contradiga claramente por el contexto. Todos los métodos descritos en el presente documento pueden efectuarse en cualquier orden adecuado a menos que se indique otra cosa en el presente documento o se contradiga de otro modo claramente por el contexto. El uso de todos y cada uno de los ejemplos, o vocabulario ejemplar (p. ej., “tal como”) proporcionados en el presente documento se pretende simplemente para ilustrar mejor la invención y no plantea ninguna limitación sobre el alcance de ninguna reivindicación. Ningún vocabulario de la memoria descriptiva debería considerarse como indicativo de ningún elemento no reivindicado esencial para la práctica de la invención.
Los agrupamientos de elementos o realizaciones alternativos divulgados en el presente documento no han de considerarse como limitaciones. Puede hacerse referencia a cada miembro del grupo y reivindicarse individualmente o en cualquier combinación con otros miembros del grupo u otros elementos encontrados en el presente documento. Se prevé que uno o más miembros de un grupo puedan incluirse, o eliminarse, de un grupo por razones conveniencia y/o patentabilidad. Cuando aparece tal inclusión o eliminación, se considera que la memoria descriptiva contiene el grupo así modificado, satisfaciendo por tanto la descripción escrita de todos los grupos de Markush usados en las reivindicaciones adjuntas.
Se describen ciertas realizaciones en el presente documento, incluyendo el mejor modo conocido por los inventores para llevar a cabo la invención. Por supuesto, resultarán evidentes para los especialistas en la técnica variaciones sobre estas realizaciones descritas tras la lectura de la descripción anterior. El inventor espera que los especialistas en la técnica empleen tales variaciones según sea apropiado, y los inventores pretenden que la invención se practique de otro modo que el descrito específicamente en la descripción anterior.
Para terminar, se entiende que las realizaciones divulgadas en la descripción anterior son ilustrativas de los principios de las reivindicaciones. Otras modificaciones que pueden emplearse están dentro del alcance de las reivindicaciones. Por tanto, a modo de ejemplo, pero no de limitación, pueden utilizarse realizaciones alternativas según las enseñanzas del presente documento. Por consiguiente, las reivindicaciones no están limitadas a las realizaciones precisamente como se muestran y describen.

Claims (12)

REIVINDICACIONES
1. Un compuesto representado por la fórmula:
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en donde D es ciclobutilo opcionalmente sustituido, fenilo opcionalmente sustituido, isoxazolilo opcionalmente sustituido, piridinilo opcionalmente sustituido, isopropilo o t-butilo;
A es alquilo C 2-8 ;
X es H, F, C F 3 , fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido;
Y es H, F, Cl, Br, I, C F 3 , OH, O-alquilo C 1 -5 , alquil Cü-6-amino o fluoroalquilo Cü-6-amino;
R1 es H, F, Cl, Br, CN, O CH 3 , C H F 2 , C F 3 , alquilo C 1.4 -C O 2 , alquilo C 1.4 , -C H 2 CO 2 H, -C H 2 CO 2 CH 2 CH 3 o -C H 2 CON(CH 3)2 o hidroxialquilo C 1 -4 ;
R2 es H, F, Cl, Br, I, -C H 2 OH, -C O 2 Me o -C (C H 3)2 OH;
R3 es H, F, Cl, Br o I;
R4 es H, F, Cl, Br, I, -C H 3 o -C F 3 ; y
en donde los sustituyentes opcionales de D y X se seleccionan independientemente de F, Cl, Br, I, CN, NO2 , alquilo C 1 -4 , alquil C 1-4 -OH, O-alquilo C 1 -3 , C F 3 , COH, CO-alquilo C 1 -4 , CO 2 H, C O 2-alquilo C 1.4 , NH2 , alquil C 1-4 -amino, fluoroalquilo C 1.6 o fluoroalcoxi C 1-6.
2. El compuesto de la reivindicación 1, en donde Y es H, F, C F 3 , OH, O-alquilo C 1 -5 , alquil Cü.6-amino o fluoroalquil Cü-6-amino.
3. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R1 es Cl, Br, -O C H 3 , -CN, -C F 3 , -C H 2OH, -CO O CH 2 CH 3 , -C(CH3)2OH, -CH O H CH 2 CH 3 , -CH O H CH 3 , -C H F 2 , -CH(CH3)2, -C H 2 CO O CH 2 CH 3 , -CH2C(CH3)2OH, -C H 2 COOH o -CH2CON(CH3)2.
4. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R2 es H, F, -C H 2 OH, -C O 2 Me o -C (C H 3)2OH.
5. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R3 es H y R4 es H, -C H 3 o -CF3.
6. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R1 es Cl, Br, CN, O CH 3 , C F 3 , -C O 2 CH 2 CH 3 , alquilo C 1-4 o hidroxialquilo C 1.4.
7. El compuesto de la reivindicación 1, en donde X es fenilo opcionalmente sustituido o piridinilo opcionalmente sustituido.
8. El compuesto de la reivindicación 1, en donde X es H o C F 3.
9. El compuesto de la reivindicación 1, en donde Y es H u OH.
10. El compuesto de la reivindicación 1, representado por la fórmula:
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11. Un compuesto de la reivindicación 1 para su uso en el tratamiento de epilepsia, dolor, jaqueca o acúfenos.
12. Un compuesto para su uso según la reivindicación 11, en donde el dolor es dolor neuropático, dolor inflamatorio, dolor persistente, dolor oncológico o dolor posoperatorio.
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