ES2569654T3 - Proteínas y ácidos nucleicos de la meningitis / sepsis asociada a la Escherichia coli - Google Patents

Proteínas y ácidos nucleicos de la meningitis / sepsis asociada a la Escherichia coli Download PDF

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Abstract

Un polipéptido que comprende: (a) una secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 7052; (b) una secuencia de aminoácido, teniendo al menos el 80% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052; (c) una secuencia de aminoácidos que es un fragmento de al menos aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052; o (d) una 5 secuencia de aminoácidos con al menos el 80% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052, incluyendo un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052, para su uso en la medicina.

Description

SUMARIO DE LA INVENCIÓN
[0011] Los inventores han identificado varios marcos de lectura abiertos de una cepa de E. coli responsable de la meningitis neonatal (MNEC) y se ha identificado un subconjunto de estos que es de particular interés para la 5 preparación de composiciones para inmunizar contra infecciones MNEC.
[0012] En un aspecto, la presente invención se refiere a un polipéptido que comprende: (a) la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052; (b) una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de identidad de secuencia con la SEC ID NO: 7052; (c) un aminoácido secuencia que es un fragmento de al menos 10 aminoácidos 10 consecutivos de SEQ ID NO: 7052; o (d) una secuencia de aminoácido que tiene al menos 80% de identidad de secuencia con la SEC ID NO: 7052 y que incluye un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052, para uso en medicina. Otras realizaciones de la invención se definen en las reclamaciones. [0013] En una realización particular, los polipéptidos de la invención comprenden un fragmento que comprende al menos un epítopo de células B (a). 15
[0014] En un segundo aspecto, la invención se refiere a un polipéptido que comprende: (a) una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO 7052; (B) una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 90% de identidad de secuencia con la SEC ID NO: 7052; o (c) una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº: 7052 y que incluye un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID 20 NO: 7052; o dicho polipéptido es un fragmento de SEQ ID NO: 7052, consistiendo de 40 o más aminoácidos consecutivos de la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052. En una realización particular, los polipéptidos de este aspecto de la invención comprenden un fragmento que comprende por lo menos un epítopo de células B (a).
[0015] La presente invención también se refiere a un ácido nucleico que comprende: (a) una secuencia de 25 nucleótidos de SEQ ID NO: 7051; (B) una secuencia de nucleótidos que tiene al menos 90% de identidad de secuencia con la SEC ID NO: 7051; o (c) una secuencia de nucleótidos que tiene al menos 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº: 7051 y que incluye un fragmento de al menos 10 nucleótidos consecutivos de SEQ ID NO: 7051 o que el ácido nucleico codifica un fragmento de la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052 que consta de 7 o más aminoácidos consecutivos de dicha secuencia de aminoácidos. 30
[0016] La presente invención también se refiere a ácidos nucleicos de la invención que codifica un polipéptido de la invención, y a anticuerpos monoclonales específicos para un polipéptido de la invención.
[0017] Los polipéptidos, ácidos nucleicos y anticuerpos de la invención se pueden usar en la medicina y en la 35 fabricación de un medicamento para elevar una respuesta inmune en un paciente.
[0018] La presente invención también se refiere a composiciones farmacéuticas que comprenden un polipéptido, ácido nucleico o anticuerpo de la invención, en mezcla con un vehículo farmacéuticamente aceptable. La invención se refiere además a una composición farmacéutica que comprende dos o más polipéptidos de la invención, en 40 mezcla con un vehículo farmacéuticamente aceptable. En una realización particular, las composiciones farmacéuticas de la invención comprenden además un adyuvante de vacuna.
[0019] Se describe en el presente documento métodos para producir una respuesta inmune en un paciente, que comprende la etapa de administrar al paciente una composición farmacéutica o composición inmunogénica de la 45 invención. En una realización particular, la respuesta inmunitaria es protectora contra la infección ExPEC, y en particular contra una infección MNEC.
[0020] Otros aspectos de la invención se describen a continuación.
50
Breve descripción de los dibujos
[0021]
La Figura 1 muestra el % de supervivencia de los ratones a lo largo del tiempo después del desafío con IHE3034, seguido de la inmunización con IHE3034 inactivado por calor o con un control (fisiol), y también niveles de 55 bacteremia (ufc / ml) después de 24 horas.
La figura 2 muestra la supervivencia% de los ratones después del desafío con IHE3034 después de la inmunización ya sea con bacterias inactivadas por calor (arriba) o con vesículas (parte inferior) de mutantes ΔTolR. Los inmunógenos se prepararon a partir de la cepa IHE3034 o de una cepa de control (DH5).
La Figura 3 muestra el % de supervivencia de los ratones después del desafío con IHE3034 después de la 60 inmunización con hierro o con un control (arriba) y el título del suero anti-IroN Ig (parte inferior).
La Figura 4 es similar a la figura 3, pero para IbeA en lugar de IroN.
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LA INVENCIÓN
65
[0022] Los inventores han identificado 4995 marcos de lectura abiertos de una cepa K1/B2 MNEC, y han identificado
un subconjunto de estos que es de particular interés para la preparación de composiciones inmunogénicas contra las cepas MNEC.
Polipéptidos
5
[0023] Los polipéptidos se describen aquí y comprende las secuencias de aminoácidos descritas en los ejemplos. Las secuencias de aminoácidos se dan en la lista de secuencias como las secuencias de pares.
[0024] La invención también proporciona polipéptidos que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen identidad de secuencia con SEQ ID NO: 7052. Dependiendo de la secuencia particular, el grado de identidad de 10 secuencia es preferiblemente mayor que 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o más. Estos polipéptidos incluyen homólogos, ortólogos, variantes alélicas y mutantes. Típicamente, 50% de identidad o más entre dos secuencias de polipéptidos se considera que es una indicación de equivalencia funcional. La identidad entre los polipéptidos se determina preferiblemente por el algoritmo de búsqueda de homología de Smith-Waterman como se aplica en el programa MPSRCH (Oxford Molecular), usando una búsqueda de huecos afines con 15 parámetros de penalización de hueco abierto = 12 y sanción por extensión de hueco = 1.
[0025] Estos polipéptidos pueden, en comparación con las secuencias de los ejemplos, incluir una o más (por ejemplo 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) sustituciones de aminoácidos conservativas, es decir, reemplazos de un aminoácido con otro que tiene una cadena lateral relacionada. Los aminoácidos codificados genéticamente se 20 dividen generalmente en cuatro familias: (1) glutamato ácidico es decir, aspartato; (2), es decir lisina base, arginina, histidina; (3) no polar es decir, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptófano; y (4) polares sin carga es decir, glicina, asparagina, glutamina, cisteína, serina, treonina, tirosina. La fenilalanina, el triptófano y la tirosina se clasifican a veces conjuntamente como aminoácidos aromáticos. En general, la sustitución de aminoácidos individuales dentro de estas familias no tiene un efecto importante sobre la actividad biológica. 25 Además, los polipéptidos pueden tener una o más (por ejemplo 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) deleciones de un solo aminoácido con respecto a una secuencia de referencia. Además, los polipéptidos pueden incluir una o más (por ejemplo 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) inserciones (por ejemplo, cada uno de 1, 2, 3, 4 o 5 aminoácidos) con respecto a una secuencia de referencia.
30
[0026] Los polipéptidos preferidos incluyen polipéptidos que están lipidados, que se encuentran en la membrana externa, que se encuentran en la membrana interna, o que se encuentren en el periplasma. Polipéptidos particularmente preferidos son los que pertenecen a más de una de estas categorías, por ejemplo, polipéptidos lipidados que se encuentran en la membrana externa. Las lipoproteínas pueden tener una cisteína N-terminal a la que los lípidos se unen de forma covalente, tras su procesamiento posterior de la traducción del péptido señal. 35
[0027] La descripción proporciona además polipéptidos que comprenden fragmentos de la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO 7052. Los fragmentos deben comprender aminoácidos al menos n consecutivos de la secuencia y, dependiendo de la secuencia particular, n es 7 o más (por ejemplo, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100 o más). El fragmento puede comprender al menos una célula T o, 40 preferiblemente, un epítopo de células B de la secuencia. Epítopos de células T y B se pueden identificar empíricamente (por ejemplo, utilizando PEPSCAN [14,15] o métodos similares), o pueden predecirse (por ejemplo, utilizando el índice antigénico de Jameson-Wolf [16], los enfoques basados en la matriz [17] TEPITOPE, [18], las redes neuronales [19], y OPTIMER epímero [20,21], ADEPT [22], Tsites [23], hidrofilicidad [24], índice antigénico [25] o los métodos descritos en la referencia 26, etc.). Otros fragmentos preferidos son (a) los péptidos N-terminales de 45 señal de los polipéptidos de la invención, (b) los polipéptidos, pero sin sus péptidos de señal N-terminales, (c) los polipéptidos, pero sin 1, 2, 3, 4 , 5, 6, 7, 8, 9 o 10 de su residuo de aminoácido N-terminal(es).
[0028] Otros fragmentos preferidos son los que comienzan con un aminoácido codificado por un potencial codón de inicio (ATG, GTG, TTG). Los fragmentos a partir de la metionina codificada por un codón de inicio corriente abajo del 50 codón de inicio indicados son polipéptidos de la invención.
[0029] Otros fragmentos preferidos son los que son comunes a un polipéptido de la invención y a un polipéptido identificado en cualquiera de las referencias 5, 6, 8, 10 y 11.
55
[0030] Los polipéptidos de la invención se pueden preparar de muchas maneras, por ejemplo, por síntesis química (en todo o en parte), por digestión de polipéptidos más largos que utilizan proteasas, por la traducción de ARN, por purificación a partir de cultivo celular (por ejemplo, de expresión recombinante), a partir del propio organismo (por ejemplo, después de un cultivo bacteriano, o directamente de los pacientes), etc. Un método preferido para la producción de péptidos <40 ácidos aminoácidos implica mucho tiempo en la síntesis química in vitro [27,28]. La 60 síntesis de péptidos en fase sólida se prefiere particularmente, tales como los métodos basados en química tBoc o Fmoc [29]. Síntesis enzimática [30] también puede ser usada en parte o en su totalidad. Como alternativa a la síntesis química, la síntesis biológica puede ser utilizada, por ejemplo, los polipéptidos pueden producirse por la traducción. Esto puede llevarse a cabo in vitro o in vivo. Los métodos biológicos son, en general limitados a la producción de polipéptidos sobre la base de L-aminoácidos, pero la manipulación de la maquinaria de traducción 65 (por ejemplo, de moléculas aminoaciles ARNt) se puede utilizar para permitir la introducción de D-aminoácidos (o de
otros aminoácidos no naturales , como yodotirosina o metilfenilalanina, azidohomoalanina, etc.) [31]. Cuando se incluyen los D-aminoácidos, sin embargo, se prefiere utilizar la síntesis química. Los polipéptidos de la invención pueden tener modificaciones covalentes en el C-terminal y / o N-terminal.
[0031] Los polipéptidos de la invención pueden adoptar diversas formas (por ejemplo, nativas, fusiones, glicosiladas, 5 no glicosiladas, lipidadas, no lipidadas, fosforiladas, no fosforiladas, miristoiladas, no miristoiladas, monoméricas, multiméricas, en partículas, desnaturalizadas, etc.).
[0032] Los polipéptidos de la invención se proporcionan preferiblemente en forma purificada o purificada sustancialmente, es decir, sustancialmente libres de otros polipéptidos (por ejemplo, polipéptidos libres de origen 10 natural), particularmente de otros polipéptidos ExPEC o de célula huésped, y son generalmente al menos aproximadamente 50% puros (en peso), y por lo general al menos aproximadamente 90% puros, es decir menos de aproximadamente 50%, y más preferiblemente menos de aproximadamente 10% (por ejemplo 5% o menos) de una composición se compone de otros polipéptidos expresados. Los polipéptidos de la invención son preferiblemente polipéptidos ExPEC y más preferiblemente MNEC. 15
[0033] Los polipéptidos de la invención pueden estar unidos a un soporte sólido. Los polipéptidos de la invención pueden comprender una etiqueta detectable (por ejemplo, un marcador radiactivo o fluorescente, o una etiqueta de biotina).
20
[0034] El término polipéptido se refiere a polímeros de aminoácidos de cualquier longitud. El polímero puede ser lineal o ramificado, puede comprender aminoácidos modificados, y puede estar interrumpido por no aminoácidos. Los términos también abarcan un amino polímero de ácido que ha sido modificado naturalmente o mediante intervención; por ejemplo, formación de enlaces de disulfuro, glicosilación, lipidación, acetilación, fosforilación, o cualquier otra manipulación o modificación, tal como conjugación con un componente de etiquetado. También 25 incluidos dentro de la definición están, por ejemplo, polipéptidos que contienen uno o más análogos de un aminoácido (incluyendo, por ejemplo, aminoácidos no naturales, etc.), así como otras modificaciones conocidas en la técnica. Polipéptidos pueden ocurrir como cadenas sencillas o cadenas asociadas. Los polipéptidos de la invención pueden estar glicosilados de forma natural o no natural (es decir, el polipéptido tiene un patrón de glicosilación que difiere del patrón de glicosilación encontrado en el correspondiente polipéptido de origen natural). 30
[0035] Los polipéptidos de la invención puede ser de al menos 40 aminoácidos de longitud (por ejemplo, al menos 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 140, 160, 180, 200, 220, 240, 260, 280 , 300, 350, 400, 450, 500 o más). Los polipéptidos de la invención pueden ser más cortos de 500 aminoácidos (por ejemplo, no más de 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 140, 160, 180, 200, 220,240, 260, 280, 300, 350, 400 o 450 aminoácidos). 35
[0036] La invención proporciona polipéptidos que comprenden una secuencia -X-Y- o -Y-X-, en el que: -X- es una secuencia de aminoácidos como se define anteriormente y -Y- no es una secuencia como se define anteriormente, es decir, la invención proporciona proteínas de fusión. Cuando el codón N-terminal de una secuencia de polipéptido de codificación no es ATG, ese codón será traducido como aminoácido estándar para ese codón en lugar de como 40 un Met, que se produce cuando el codón se traduce como un codón de inicio.
[0037] La invención proporciona un procedimiento para producir polipéptidos de la invención, que comprende la etapa de cultivo de una célula huésped de la invención en condiciones que inducen la expresión del polipéptido.
45
[0038] La invención proporciona un procedimiento para producir un polipéptido de la invención, en el que el polipéptido se sintetiza en parte o enteramente utilizando medios químicos.
[0039] La invención proporciona una composición que comprende dos o más (por ejemplo 2, 3, 4, 5, 6 o más) polipéptidos de la invención. Los diferentes polipéptidos se pueden seleccionar de tal manera que están 50 involucrados en diferentes vías de metabólica bacteriana y / o de señalización, por ejemplo, selección de 2, 3, 4, 5, 6 o más de las siguientes categorías: adhesinas; proteínas autotransportadoras; toxinas; proteínas de adquisición de hierro; y proteínas asociadas a la membrana, incluyendo, en particular, las proteínas de membrana externa integrales. Tales combinaciones de antígenos pueden orientar la respuesta inmune contra diferentes aspectos del ciclo de vida bacteriana, lo que resulta en una respuesta inmune más efectiva. 55
[0040] La invención también proporciona un polipéptido híbrido representado por la fórmula NH2-A - [- XL-]n-B-COOH, en el que X es un polipéptido de la invención como se ha definido anteriormente, L es una secuencia de ácido amino enlazador opcional, A es una secuencia de aminoácidos opcional N- terminal, B es una secuencia de aminoácidos opcional C-terminal, y n es un número entero mayor que 1. El valor de n es entre 2 y x, y el valor de x 60 es típicamente 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ó 10. Preferiblemente, n es 2, 3 o 4; es más preferiblemente 2 o 3; más preferiblemente, n = 2. Para cada instancia n, -X- pueden ser iguales o diferentes. Para cada instancia n de [-X-L-], la secuencia de aminoácidos de engarce -L- puede estar presente o ausente. Por ejemplo, cuando n = 2 el híbrido puede ser NH2-X1-L1-X2-L2-COOH, NH2-X1-X2-COOH, NH2-X1-L1-X2-COOH, NH2-X1-X2-L2-COOH, secuencia(s) etc. Secuencias de amino ácido enlazadores -L- típicamente serán cortas (por ejemplo 20 o menos 65 aminoácidos, es decir, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8 , 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1). Los ejemplos incluyen
secuencias de péptidos cortas que facilitan la clonación, enlazadores de poliglicina (es decir, Glyn donde n = 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 o más), y etiquetas de histidina (es decir, Hisn donde n = 3 , 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 o más). Otras secuencias de aminoácidos enlazadoras adecuadas serán evidentes para los expertos en la técnica. -A- y -B- son secuencias opcionales que normalmente serán cortas (por ejemplo, 40 o menos aminoácidos, es decir, 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26 , 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 5 3, 2, 1 ). Los ejemplos incluyen secuencias de líder para dirigir el tráfico de polipéptidos, o secuencias de péptidos cortas que facilitan la clonación o purificación (por ejemplo, etiquetas de histidina es decir, Hisn en la que n = 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 o más). Otras secuencias adecuadas N-terminal y C-terminal de aminoácidos serán evidentes para los expertos en la técnica.
10
[0041] Varias pruebas se pueden utilizar para evaluar la inmunogenicidad in vivo de los polipéptidos de la invención. Por ejemplo, los polipéptidos pueden expresarse de manera recombinante y usarse para seleccionar el suero del paciente por inmunoblot. Una reacción positiva entre el polipéptido y el suero del paciente indica que el paciente ha montado previamente una respuesta inmune a la proteína en cuestión es decir, la proteína es un inmunógeno. Este método también se puede utilizar para identificar las proteínas inmunodominantes. 15
Los anticuerpos
[0042] La invención proporciona anticuerpos que se unen a polipéptidos de la invención. Estos pueden ser policlonales o monoclonales y se pueden producir por cualquier medio adecuado (por ejemplo, por expresión 20 recombinante). Para aumentar la compatibilidad con el sistema inmune humano, los anticuerpos pueden ser quiméricos o humanizados [por ejemplo, refs. 32 y 33], o anticuerpos completamente humanos pueden utilizarse. Los anticuerpos pueden incluir un marcador detectable (por ejemplo para ensayos de diagnóstico). Los anticuerpos de la invención pueden estar unidos a un soporte sólido. Los anticuerpos de la invención son anticuerpos preferiblemente neutralizantes. 25
[0043] Los anticuerpos monoclonales son particularmente útiles en la identificación y purificación de los polipéptidos individuales contra los que se dirigen. Los anticuerpos monoclonales de la invención también se pueden emplear como reactivos en inmunoensayos, radioinmunoensayos (RIA) o ensayos inmunoabsorbentes ligados a enzimas (ELISA), etc. En estas aplicaciones, los anticuerpos pueden marcarse con un reactivo analíticamente detectable, tal 30 como un radioisótopo, una molécula fluorescente o una enzima. Los anticuerpos monoclonales producidos por el método anterior también se pueden usar para la identificación y caracterización molecular (mapeo de epítopos) de los polipéptidos de la invención.
[0044] Los anticuerpos de la invención son preferiblemente específicos para cepas EXPEC de E. coli, es decir, que 35 se unen preferentemente a ExPEC E. coli en relación con otras bacterias (por ejemplo, relativa a la no ExPEC E. coli y en relación con las bacterias no E. coli). Más preferiblemente, los anticuerpos son específicos para cepas MNEC es decir, que se unen preferentemente a las bacterias MNEC relativas a otras bacterias, también en relación con otros ExPEC de E.coli.
40
[0045] Los anticuerpos de la invención se proporcionan preferiblemente en forma purificada o sustancialmente purificada. Típicamente, el anticuerpo estará presente en una composición que está sustancialmente libre de otros polipéptidos por ejemplo donde menos del 90% (en peso), por lo general menos de 60% y más habitualmente menos de 50% de la composición está compuesta por otros polipéptidos.
45
[0046] Los anticuerpos de la invención pueden ser de cualquier isotipo (por ejemplo, IgA, IgG, IgM es decir, un α, γ o m de la cadena pesada), pero en general será IgG. Dentro del isotipo IgG, anticuerpos pueden ser IgG1, IgG2, IgG3 o subclase IgG4. Los anticuerpos de la invención pueden tener una κ o una cadena ligera λ.
[0047] Los anticuerpos de la invención pueden adoptar diversas formas, incluyendo anticuerpos completos, 50 fragmentos de anticuerpos, tales como F(ab')2 y fragmentos F(ab), fragmentos Fv (heterodímeros no covalentes), anticuerpos de cadena única como moléculas de cadena simple Fv (scFv), minicuerpos, oligocuerpos, etc. El término "anticuerpo" no implica ningún origen determinado, e incluye anticuerpos obtenidos a través de procesos no convencionales, como la visualización de fagos.
55
[0048] Se describe aquí un proceso para la detección de polipéptidos de la invención, que comprende las etapas de: (a) poner en contacto un anticuerpo de la invención con una muestra biológica en condiciones adecuadas para la formación de complejos de un anticuerpo-antígeno; y (b) detectar dichos complejos.
[0049] También se describe un proceso para la detección de anticuerpos de la invención, que comprende las etapas 60 de: (a) poner en contacto un polipéptido de la invención con una muestra biológica (por ejemplo, una muestra de sangre o suero) en condiciones adecuadas para la formación de complejos de antigeno-anticuerpo; y (b) detectar dichos complejos.
[0050] Los anticuerpos preferidos se unen a un polipéptido de la invención con afinidad sustancialmente mayor que 65 los anticuerpos conocidos en la técnica. Preferiblemente, la afinidad es al menos 1,5 veces, 2 veces, 5 veces 10
veces, 100 veces, 103 veces, 104 veces, 105 veces, 106 veces, etc. más fuerte que los anticuerpos conocidos en la técnica .
Ácidos nucleicos
5
[0051] La invención también proporciona ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica los polipéptidos de la invención (por ejemplo, SEQ ID NO: 7051). La invención también proporciona ácido nucleico que comprende SEQ ID NO: 7051.
[0052] La invención también proporciona ácido nucleico que comprende secuencias de nucleótidos que tienen 10 identidad de secuencia con dichas secuencias de nucleótidos. La identidad entre secuencias se determina preferiblemente por el algoritmo de búsqueda de homología de Smith-Waterman como se describe anteriormente. Dependiendo de la secuencia particular, el grado de identidad de secuencia es preferiblemente mayor que 5 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o más.
15
[0053] La invención también proporciona ácido nucleico que puede hibridar con estos ácidos nucleicos. Las reacciones de hibridación pueden llevarse a cabo en condiciones de diferente "rigurosidad". Las condiciones que aumentan la rigurosidad de una reacción de hibridación ampliamente conocida y publicada en la técnica [por ejemplo, página 7.52 de referencia 34]. Ejemplos de condiciones relevantes incluyen (en orden creciente de rigurosidad): temperaturas de incubación de 25 ° C, 37 ° C, 50 ° C, 55 ° C y 68 ° C; concentraciones de tampón de 20 10 x SSC, 6 x SSC, 1 x SSC, 0,1 x SSC (donde SSC es NaCl 0,15 M y 15 mM de tampón de citrato) y sus equivalentes usando otros sistemas de tampón; concentraciones de formamida de 0%, 25%, 50% y 75%; tiempos de incubación de 5 minutos a 24 horas; 1, 2, o más etapas de lavado; tiempos de incubación de lavado de 1, 2, o 15 minutos; y soluciones de lavado de 6 x SSC, 1 x SSC, 0,1 x SSC, o agua desionizada. Las técnicas de hibridación y su optimización se conocen bien en la técnica [por ejemplo, ver refs 34-37, etc.]. 25
[0054] En algunas realizaciones, el ácido nucleico de la invención se hibrida con una diana en condiciones de baja rigurosidad; en otras formas de realización que se hibrida en condiciones de rigurosidad intermedia; en formas de realización preferidas, se hibrida en condiciones de alta rigurosidad. Un conjunto ejemplar de las condiciones de hibridación de rigurosidad baja es de 50 ° C y 10 x SSC. Un conjunto ejemplar de las condiciones de hibridación de 30 rigurosidad intermedia es de 55 ° C y 1 x SSC. Un conjunto ejemplar de condiciones de hibridación de alta rigurosidad es de 68 ° C y 0,1 x SSC.
[0055] El ácido nucleico que comprende fragmentos de esta secuencia también se proporcionan. Estos deben comprenden al menos n nucleótidos consecutivos de las secuencias y, dependiendo de la secuencia particular, n es 35 10 o más (por ejemplo 12, 14, 15, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 o más). Los fragmentos preferidos son los que son comunes a una secuencia de ácido nucleico de la invención y para una secuencia de ácido nucleico identificado en cualquiera de las referencias 5, 6, 8, 10 y 11.
[0056] La invención proporciona ácido nucleico de fórmula 5'-X-Y-Z-3 ', en el que: -X- es una secuencia de 40 nucleótidos que consiste en x nucleótidos; -Z- es una secuencia de nucleótidos que consiste en los nucleótidos z; -Y- es una secuencia de nucleótidos que consiste de (a) un fragmento de secuencia de ácido nucleico SEQ ID NO: 7051, o (b) el complemento de (a); y dicho ácido nucleico 5'-X-Y-Z-3' no es ni (i) un fragmento de un ácido nucleico de SEQ ID NO: 7051, ni (ii) el complemento de (i). Los restos -X- y / o de -Z- pueden comprender una secuencia de promotor (o su complemento). 45
[0057] Este ácido nucleico puede ser de cadena única, al menos en parte, de modo que puede actuar como una sonda de hibridación y / o cebador de amplificación. En algunas realizaciones, el fragmento no es, o no incluye, un fragmento de una secuencia de técnica anterior ExPEC, por ejemplo, no un fragmento de una secuencia de ácido nucleico descrito específicamente en cualquiera de las refs. 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 y 13. En otras formas de realización, 50 el fragmento es también un fragmento de una secuencia de técnica anterior ExPEC, por ejemplo, es idéntica a un fragmento de una secuencia de ácido nucleico descrito específicamente en cualquiera de las refs. 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 y 13.
[0058] La invención incluye ácido nucleico que comprende secuencias complementarias a estas secuencias (por 55 ejemplo, para antisentido o sondeo, o para su uso como cebadores).
[0059] Los ácidos nucleicos de la invención pueden ser utilizados en las reacciones de hibridación (por ejemplo, Southern blot o Northern blot, o en microensayos de ácidos nucleicos o 'chips de genes') y las reacciones de amplificación (por ejemplo PCR, SDA, SSSR, LCR, TMA, NASBA, etc.) y otras técnicas de ácidos nucleicos. 60
[0060] El ácido nucleico de acuerdo con la invención puede adoptar diversas formas (por ejemplo, monocatenario, bicatenario, vectores, cebadores, sondas, etiquetado, etc.). Los ácidos nucleicos de la invención pueden ser circulares o ramificados, pero en general serán lineales. A menos que se especifique o requiera lo contrario, cualquier realización de la invención que utiliza un ácido nucleico puede utilizar tanto la forma de cadena doble y 65 cada uno de dos formas de una sola hebra complementarias que componen la forma de doble cadena. Los
cebadores y sondas son generalmente de cadena única, así como ácidos nucleicos de antisentido.
[0061] Los ácidos nucleicos de la invención se proporcionan preferiblemente en forma purificada o sustancialmente purificada, es decir, sustancialmente libre de otros ácidos nucleicos (por ejemplo, libre de ácidos nucleicos de origen natural), particularmente de otros ácidos nucleicos ExPEC o célula huésped, siendo generalmente al menos 5 aproximadamente de pureza 50% (en peso), y por lo general al menos aproximadamente de pureza 90%. Los ácidos nucleicos de la invención son preferiblemente ácidos nucleicos ExPEC.
[0062] Los ácidos nucleicos de la invención se pueden preparar de muchas maneras, por ejemplo, por síntesis química (por ejemplo, la síntesis de fosforamidita de ADN) en su totalidad o en parte, mediante la digestión de los 10 ácidos ya nucleicos usando nucleasas (enzimas, por ejemplo de restricción), por unirse a ácidos nucleicos o nucleótidos más cortos (por ejemplo, utilizando ligasas o polimerasas), a partir de bibliotecas genómicas o de ADNc, etc.
[0063] Ácido nucleico de la invención puede estar unido a un soporte sólido (por ejemplo, una perla, placa, filtro, 15 película, diapositiva, apoyo micromatriz, resina, etc.). El ácido nucleico de la invención puede marcarse, por ejemplo, con un marcador radiactivo o fluorescente, o una etiqueta de biotina. Esto es particularmente útil cuando el ácido nucleico se va a usar en técnicas de detección, por ejemplo, donde el ácido nucleico es un cebador o como una sonda.
20
[0064] El término "ácido nucleico", en general, significa una forma polimérica de nucleótidos de cualquier longitud, que contienen desoxirribonucleótidos, ribonucleótidos, y / o sus análogos. Incluye los híbridos de ADN, ARN, ADN / ARN. También incluye análogos de ADN o ARN, tales como los que contienen esqueletos modificados (por ejemplo ácidos nucleicos peptídicos (PNAs) o fosforotioatos) o bases modificadas. Así, la invención incluye ARNm , ARNt, ARNr, ribozimas, ADN, ADNc, ácidos nucleicos recombinantes, los ácidos nucleicos ramificados, plásmidos, 25 vectores, sondas, cebadores, etc., donde el ácido nucleico de la invención toma la forma de ARN, puede o puede no tener un tapón 5'.
[0065] Los ácidos nucleicos de la invención comprenden secuencias, pero que también pueden comprender secuencias no ExPEC (por ejemplo, en los ácidos nucleicos de fórmula 5'-X-Y-Z-3', como se define anteriormente). 30 Esto es particularmente útil para los cebadores, que pueden por lo tanto comprender una primera secuencia complementaria a una diana de ácido nucleico y una segunda secuencia que no es complementaria a la diana de ácido nucleico. Cualesquiera secuencias no complementarias en el cebador son preferiblemente 5' a las secuencias complementarias. Secuencias no complementarias típicas comprenden sitios de restricción o secuencias promotoras. 35
[0066] Los ácidos nucleicos de la invención se pueden preparar de muchas maneras, por ejemplo, por síntesis química (al menos en parte), por digestión de ácidos nucleicos usando ya nucleasas (por ejemplo, enzimas de restricción), por unirse a ácidos nucleicos más cortos (por ejemplo, usando ligasas o polimerasas), a partir de bibliotecas genómicas o de ADNc, etc. 40
[0067] Los ácidos nucleicos de la invención pueden ser parte de un vector, es decir, parte de una construcción de ácido nucleico diseñado para la transducción / transfección de uno o más tipos de células. Los vectores pueden ser, por ejemplo, "vectores de clonación" que están diseñadas para el aislamiento, la propagación y la replicación de los nucleótidos insertados, "vectores de expresión", que están diseñados para la expresión de una secuencia de 45 nucleótidos en una célula huésped, "vectores virales" que está diseñado para resultar en la producción de un virus recombinante o partícula similar a virus, o "vectores lanzadera", que comprenden los atributos de más de un tipo de vector. Los vectores preferidos son plásmidos. Una "célula huésped" incluye un cultivo celular o célula individual que puede ser o ha sido un receptor de ácido nucleico exógeno. Las células huésped incluyen la progenie de una única célula huésped y la progenie puede no ser necesariamente completamente idéntica (en morfología o en 50 complemento de ADN total) a la célula parental original debido a mutación natural, accidental, o deliberada y / o cambio. Las células huésped incluyen células transfectadas o infectadas in vivo o in vitro con un ácido nucleico de la invención.
[0068] Cuando un ácido nucleico es ADN, se apreciará que "U" en una secuencia de ARN se sustituye por "T" en el 55 ADN. Asimismo, cuando un ácido nucleico es ARN, se apreciará que "T" en una secuencia de ADN será reemplazado por "U" en el ARN.
[0069] El término "complemento" o "complementarios" cuando se usa en relación con ácidos nucleicos se refiere a base de sincronización de Watson-Crick. Por lo tanto el complemento de C es G, el complemento de G es C, el 60 complemento de A es T (o U), y el complemento de T (o U) es A. También es posible utilizar bases tales como I (la inosina purina) por ejemplo, para complementar las pirimidinas (C o T). Los términos también implican una dirección - el complemento de 5'-ACAGT-3 es '5'-ACTGT-3' en lugar de 5'-TGTCA-3'.
[0070] Los ácidos nucleicos de la invención se pueden utilizar, por ejemplo: para producir polipéptidos; como sondas 65 de hibridación para la detección de ácido nucleico en muestras biológicas; para generar copias adicionales de los
ácidos nucleicos; para generar ribozimas u oligonucleótidos antisentido; como cebadores o sondas de ADN de cadena única; o como la formación de oligonucleótidos de triple hebra.
[0071] La invención proporciona un procedimiento para producir ácido nucleico de la invención, en el que el ácido nucleico se sintetiza en parte o en conjunto utilizando medios químicos. 5
[0072] La invención proporciona vectores que comprenden secuencias de nucleótidos de la invención (por ejemplo, la clonación o vectores de expresión) y células huésped transformadas con tales vectores.
[0073] La invención también proporciona un kit que comprende cebadores (por ejemplo, cebadores de PCR) para 10 amplificar una secuencia de molde contenida dentro de una secuencia de ácido nucleico ExPEC, el kit comprende un primer cebador y un segundo cebador, en el que el primer cebador es sustancialmente complementario a dicha secuencia de plantilla y el segundo cebador es sustancialmente complementario a un complemento de dicha secuencia de plantilla, en el que las partes de dichos cebadores que tienen complementariedad sustancial definen los extremos de la secuencia molde a amplificar. El primer cebador y / o el segundo cebador pueden incluir un 15 marcador detectable (por ejemplo un marcador fluorescente).
[0074] La invención también proporciona un kit que comprende oligonucleótidos de cadena sencilla primeros y segundos que permiten la amplificación de una secuencia de ácido nucleico de molde ExPEC contenida en un ácido nucleico de única o de doble cadena (o mezcla de los mismos), en el que: (a) el primer oligonucleótido comprende 20 una secuencia de cebador que es sustancialmente complementario a dicha secuencia de ácido nucleico de molde; (b) el segundo oligonucleótido comprende una secuencia de cebador que es sustancialmente complementaria con el complemento de dicha secuencia de ácido nucleico de molde; (c) el primer oligonucleótido y / o el segundo oligonucleótido comprenden la secuencia que no es complementaria a dicho ácido nucleico de molde; y (d) dichas secuencias de cebadores definen los extremos de la secuencia de molde a amplificar. La secuencia no 25 complementaria de función (c) son preferiblemente aguas arriba de (es decir, 5' a) las secuencias de cebadores. Una o ambas de estas secuencias (c) pueden comprender un sitio de restricción [por ejemplo, ref. 38] o una secuencia promotora [por ejemplo, 39]. El primer oligonucleótido y / o el segundo oligonucleótido pueden incluir un marcador detectable (por ejemplo un marcador fluorescente).
30
[0075] La secuencia de la plantilla puede ser cualquier parte de una secuencia del genoma. Por ejemplo, podría ser un gen ARNr (por ejemplo, Turenne et al (2000) J. Clin Microbiol. 38: 513-520) o un gen que codifica la proteína. La secuencia del molde es preferiblemente específico para ExPEC, y más preferiblemente a MNEC.
[0076] La invención proporciona un procedimiento para la detección de ácido nucleico de la invención, que 35 comprende las etapas de: (a) poner en contacto una sonda nucleica según la invención con una muestra biológica en condiciones de hibridación para formar dúplex; y (b) detectar dicho dúplex.
[0077] La invención proporciona un procedimiento para detectar en una muestra biológica (por ejemplo, sangre), que comprende la etapa de poner en contacto el ácido nucleico de acuerdo con la invención con la muestra biológica en 40 condiciones de hibridación. El proceso puede implicar la amplificación de ácidos nucleicos (por ejemplo PCR, SDA, SSSR, LCR, TMA, NASBA, etc.) o de hibridación (por ejemplo, micromatrices, blots, hibridación con una sonda en solución, etc.). la detección por PCR de ExPEC en muestras clínicas ha informado [por ejemplo, ver ref. 40]. Los ensayos clínicos basados en ácido nucleico se describen en general en la ref. 41.
45
[0078] La invención proporciona un procedimiento para preparar un fragmento de una secuencia diana, en el que el fragmento se preparó por extensión de un cebador de ácido nucleico. La secuencia diana y / o el cebador son los ácidos nucleicos de la invención. La reacción de extensión de cebador puede implicar la amplificación de ácidos nucleicos (por ejemplo PCR, SDA, SSSR, LCR, TMA, NASBA, etc.).
50
[0079] La amplificación de ácido nucleico de acuerdo con la invención puede ser cuantitativa y / o en tiempo real.
[0080] Para ciertas realizaciones de la invención, los ácidos nucleicos son preferiblemente de al menos 7 nucleótidos de longitud (por ejemplo 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 55 180, 190, 200, 225, 250, 275, 300 nucleótidos o más).
[0081] Para ciertas realizaciones de la invención, los ácidos nucleicos son preferiblemente en la mayoría de los 500 nucleótidos de longitud (por ejemplo, 450, 400, 350, 300, 250, 200, 150, 140, 130, 120, 110, 100, 90, 80, 75, 70, 65, 60, 55, 50, 45, 40, 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15 60 nucleótidos o más cortos).
[0082] Los cebadores y sondas de la invención y otros ácidos nucleicos utilizados para la hibridación, son preferiblemente de entre 10 y 30 nucleótidos de longitud (por ejemplo 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 , 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, ó 30 nucleótidos). 65
Bacterias mutantes
[0083] Se describe en el presente documento bacteria E. coli en el que la expresión de uno o más de los genes identificados en el presente documento han sido eliminados. Las técnicas para la eliminación de genes son bien conocidas, y los mutantes objetos de eliminación de E. coli han sido objeto de informe anteriormente. 5
[0084] Tal eliminación se puede conseguir usando la supresión isogénica de la región codificante, pero cualquier otra técnica adecuada se puede utilizar, por ejemplo, deleción o mutación del promotor, deleción o mutación del codón de inicio, la inhibición de antisentido, ARN inhibidor, etc. En la bacteria resultante, sin embargo, el ARNm que codifica el producto génico estará ausente y / o su traducción será inhibida (por ejemplo, a menos del 1% de los 10 niveles de tipo silvestre).
[0085] Una bacteria puede contener un gen marcador en lugar del gen eliminado por ejemplo, un marcador de resistencia a antibiótico.
15
Vesículas
[0086] La referencia 42 describe la preparación de vesículas de una cepa MNEC por la eliminación de mltA (una transglicosilasa lítica mureína) o uno o más de los componentes del complejo de Tol-Pal de E. coli [43], tal como tolA, tolQ , tolB, pal y / o tolR. Estas vesículas se pueden mejorar al hacer uno o más cambios genéticos al 20 cromosoma de la bacteria o por medio de la inserción de elementos episomálicos "ad-hoc" (por ejemplo, vectores de expresión) a fin de aumentar la cantidad y / o inmunoaccesibilidad de "exposición" de antígenos protectores sobre la superficie de las vesículas.
[0087] Una forma de obtener estas mejoras es aumentar la expresión de los polipéptidos antígenos protectores de la 25 invención. Muchas diferentes estrategias genéticas para aumentar la expresión de una proteína diana son bien conocidas en la técnica y se pueden distinguir en dos amplias categorías: una, que depende de modificaciones del cromosoma (por ejemplo, la sustitución del promotor de tipo salvaje con un promotor más fuerte, la inactivación de genes represores naturales, etc.) para aumentar la expresión de un gen endógeno, y la otra basada en la expresión recombinante por elementos episomálicos (por ejemplo, plásmidos de número elevado de copias, los vectores que 30 alberga un gen diana de ingeniería, etc.) o la integración de un protector exógeno gen diana en el cromosoma. Ejemplos prácticos para cada uno de estos enfoques se pueden encontrar en las referencias 44 a 50.
[0088] Otra forma de aumentar la inmunogenicidad de la vesícula y la selectividad es de disminuir la expresión de antígenos no protectores inmunodominantes o disminuir proteínas que son homólogas a las proteínas que se 35 encuentran en las cepas comensales. Otras mejoras se pueden lograr buscadas por la reducción de la toxicidad potencial de la vesícula a través de la desintoxicación de la fracción de lípido A de LPS. Cambios similares se han descrito anteriormente para producir la mejora de vesículas de otros patógenos Gram-negativos (véase, por ejemplo, referencia 51 y 52).
40
[0089] Todas las estrategias anteriores se pueden utilizar solas o en combinación para obtener la mejora de vesículas para su uso en composiciones inmunogénicas. También se describe en el presente documento una bacteria patógena de Escherichia coli (particularmente un MNEC) que tiene una eliminación de MLTA y / o de un componente de su complejo Tol-Pal, y uno o más de: (i) un gen cromosómico que codifica un polipéptido de la invención bajo el control de un promotor que proporciona mayores niveles de expresión del polipéptido que el 45 promotor que se asocia naturalmente con el gen que codifica el polipéptido; (ii) un elemento extracromosómico de replicación autónoma que codifica un polipéptido de la invención; y / o (iii) una modificación genética para reducir la toxicidad de la fracción de lípido A de LPS de E. coli en relación con el de tipo salvaje LPS.
[0090] Las vesículas se pueden obtener mediante el cultivo de una bacteria, tales como las vesículas que, durante el 50 cultivo de la bacteria, se liberan en el medio de cultivo.
Composiciones farmacéuticas
[0091] La invención proporciona composiciones que comprenden: (a) polipéptido, anticuerpo, vesículas, y / o ácido 55 nucleico de la invención; y (b) un vehículo farmacéuticamente aceptable. Estas composiciones pueden ser adecuadas como composiciones inmunogénicas, por ejemplo, o como reactivos de diagnóstico, o como vacunas. Las vacunas de acuerdo con la invención pueden ser profilácticas (es decir, para prevenir la infección) o terapéuticas (es decir, para tratar la infección), pero típicamente serán profilácticas.
60
[0092] Un "vehículo farmacéuticamente aceptable" incluye cualquier vehículo que no induzca por sí mismo la producción de anticuerpos perjudiciales para el individuo que recibe la composición. Los vehículos adecuados son macromoléculas típicamente grandes, metabolizadas lentamente, tales como proteínas, polisacáridos, ácidos polilácticos, ácidos poliglicólicos, aminoácidos poliméricos, copolímeros de aminoácidos, sacarosa, trehalosa, lactosa, y agregados de lípidos (tales como gotitas de aceite o liposomas). Tales vehículos son bien conocidos por 65 los expertos normales en la técnica. Las vacunas también pueden contener diluyentes, tales como agua, solución
salina, glicerol, etc. Adicionalmente, sustancias auxiliares, tales como agentes humectantes o emulsionantes, sustancias tamponantes del pH, y similares, pueden estar presentes. Salina fisiológica tamponada con fosfato estéril libre de pirógenos es un portador típico. Una discusión completa de excipientes farmacéuticamente aceptables está disponible en la ref. 289.
5
[0093] Las composiciones de la invención pueden incluir un antimicrobiano, particularmente si se empaquetó en un formato de dosis múltiple.
[0094] Las composiciones de la invención pueden comprender detergente, por ejemplo, un TweenTM (polisorbato), tal como TweenTM 80. 10
Los detergentes están generalmente presentes a niveles bajos, por ejemplo, <0,01%.
[0095] Las composiciones de la invención pueden incluir sales de sodio (por ejemplo cloruro sódico) para dar tonicidad. Una concentración de 10+2mg/ml de NaCl es típica. 15
[0096] Las composiciones de la invención incluirán generalmente un tampón. Un tampón de fosfato es típico. Las composiciones de la invención pueden comprender un alcohol de azúcar (por ejemplo, manitol) o un disacárido (por ejemplo, sacarosa o trehalosa), por ejemplo, en alrededor de 15-30mg / ml (por ejemplo 25 mg / ml), particularmente si han de liofilizarse o si incluyen material que se ha reconstituido a partir de material liofilizado. El pH de una 20 composición para la liofilización se puede ajustar a alrededor de 6,1 antes de la liofilización.
[0097] Los polipéptidos de la invención se pueden administrar en conjunción con otros agentes inmunorreguladores. En particular, las composiciones incluirán generalmente un adyuvante de vacuna. El adyuvante puede seleccionarse de entre uno o más del grupo que consiste en un adyuvante TH1 y adyuvante TH2, analizado más adelante. Los 25 adyuvantes que pueden usarse en composiciones de la invención incluyen, pero no se limitan a:
A. Composiciones que contienen minerales
[0098] Composiciones que contienen minerales adecuadas para uso como adyuvantes en la invención incluyen 30 sales minerales, tales como sales de aluminio y sales de calcio. La invención incluye sales minerales tales como hidróxidos (por ejemplo oxihidróxidos), fosfatos (por ejemplo, hidroxifosfatos, ortofosfatos), sulfatos, etc. [por ejemplo, véanse los capítulos 8 y 9 de la ref. 53], o mezclas de diferentes compuestos minerales (por ejemplo, una mezcla de un fosfato y un adyuvante de hidróxido, opcionalmente con un exceso de fosfato), con los compuestos que toman cualquier forma adecuada (por ejemplo, gel, cristalina, amorfa, etc.), y con la adsorción a la sal, siendo 35 preferida. Composiciones que contienen minerales también pueden formularse como una partícula de sal metálica [54].
[0099] Las sales de aluminio pueden ser incluidas en las vacunas de la invención tal que la dosis de Al3+ es de entre 0,2 y 1,0 mg por dosis. 40
[0100] En otra realización, el adyuvante de la invención comprende tanto el fosfato de aluminio e hidróxido de aluminio. En una realización más particular del mismo, el adyuvante tiene una mayor cantidad de fosfato de aluminio de hidróxido de aluminio, tales como una relación de 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1 o mayor que 9:1, en peso de fosfato de aluminio a hidróxido de aluminio. Más en particular aún, sales de aluminio en la vacuna están presentes 45 en 0,4 a 1,0 mg por dosis de vacuna, o 0,4 a 0,8 mg por dosis de vacuna, o de 0,5 a 0,7 mg por dosis de vacuna, o alrededor de 0,6 mg por dosis de vacuna.
[0101] En general, el adyuvante preferido a base de aluminio, o la relación de múltiples adyuvantes basados en aluminio, tales como fosfato de aluminio a hidróxido de aluminio se selecciona por la optimización de la atracción 50 electrostática entre las moléculas de tal modo que el antígeno lleva una carga opuesta como el adyuvante al pH deseado. Por ejemplo, un adyuvante de fosfato de aluminio con pl ~ 4 adsorbe lisozima electrostáticamente, pero no de albúmina, a pH 7,4. En caso que albúmina sea el objetivo, sería seleccionado adyuvante de hidróxido de aluminio (por ejemplo, con pH 11,4). Alternativamente, el tratamiento previo de hidróxido de aluminio con fosfato disminuye su pl, lo que es un adyuvante preferido para los antígenos más básicos. 55
[0102] Un adyuvante de fosfato de aluminio típico es hidróxidofosfato de aluminio amorfo con una relación molar de PO4/Al de entre 0,84 y 0,92, incluido a 0,6 mg de Al3+/ml. La adsorción con una dosis baja de fosfato de aluminio se puede utilizar, por ejemplo, entre 50 y 100 µg Al3+ por conjugado por dosis. Cuando un fosfato de aluminio se utiliza y no se desea para adsorber un antígeno al adyuvante, esto se favorece incluyendo iones de fosfato libres en 60 solución (por ejemplo, mediante el uso de un tampón de fosfato).
B. Emulsiones de aceite
[0103] Composiciones de emulsión de aceite adecuadas para uso como adyuvantes en la invención incluyen 65 emulsiones de escualeno-agua, tales como MF59TM (5% de escualeno, 0,5% TweenTM 80, y 0,5% SpanTM 85,
formulado en partículas submicrométricas usando un microfluidizador) [Capítulo 10 de ref. 53; véase también refs. 55-57 capítulo 12 de la ref. 58.]. MF59TM se utiliza como adyuvante en la vacuna de subunidad trivalente de virus de influenza FLUADTM. La emulsión comprende ventajosamente iones de citrato, por ejemplo, 10 mM de tampón de citrato de sodio.
5
[0104] Los adyuvantes particularmente preferidos para uso en las composiciones son emulsiones de aceite en agua submicrónicas. Las emulsiones de aceite-en-agua submicrométricas preferidas para uso en esta invención son emulsiones de escualeno / agua, que contiene opcionalmente diversas cantidades de MTP-PE, tales como una emulsión submicrométrica de aceite en agua que contiene escualeno de 4-5% w / v, 0,25-1,0% w / v TweenTM 80 (monooleato de polioxieltilenesorbitán), y / o 0,25 a 1,0% SpanTM 85 (trioleato de sorbitán), y, opcionalmente, N-10 acetil- muramil-L-alanil-D-isogluatminil-L-alanina-2-(1’-2’-dipalmitoil-sn-glícero-3-hidroxifosfoforiloxi)-etilamina (MTP-PE). Emulsiones de aceite en agua submicrónicas, métodos de fabricación de agentes iguales e inmunoestimulantes, tales como péptidos de muramilo, para su uso en las composiciones, se describen en detalle en las referencias 55 y 59-60. Una emulsión de escualeno, un tocoferol, y TweenTM 80 se puede utilizar. La emulsión puede incluir solución de salina tamponada con fosfato. También puede incluir SpanTM 85 (por ejemplo, al 1%) y / o 15 lecitina. Estas emulsiones pueden tener de 2 a 10% de escualeno, de 2 a 10% de tocoferol y de 0,3 a 3% TweenTM 80, y la relación en peso de escualeno: tocoferol es preferentemente ≤1 ya que esto proporciona una emulsión más estable. Una emulsión de este tipo puede fabricarse mediante la disolución de TweenTM 80 en PBS para dar una solución de 2%, mezclando 90 ml de esta solución con una mezcla de (5g de DL de tocoferol α y escualeno de 5ml), microfluidizando la mezcla. La emulsión resultante puede tener gotas de aceite submicrométricas, por ejemplo, con 20 un diámetro medio de entre 100 y 250 nm, preferiblemente de aproximadamente 180 nm.
[0105] Una emulsión de escualeno, un tocoferol y un detergente de TritonTM (por ejemplo, TritonTM X-100) se puede utilizar.
25
[0106] Una emulsión de escualeno, polisorbato 80 y poloxámero 401 ("PluronicTM L121") se puede utilizar. La emulsión se puede formular en solución de salina tamponada con fosfato, pH 7,4. Esta emulsión es un vehículo de administración útil para dipéptidos de muramilo, y se ha utilizado con treonil MDP en el adyuvante "SAF 1" [61] (0,05 a 1% Thr MDP, 5% escualeno, 2,5% PluronicTM L121 y 0,2% de polisorbato 80). También se puede utilizar sin la Thr MDP, como en el adyuvante "AF" [62] (5% de escualano, 1,25% de Pluronic L121 y 0,2% de polisorbato 80). Se 30 prefiere microfluidización.
[0107] El adyuvante completo de Freund (CFA) y adyuvante incompleto de Freund (IFA) también se puede usar como adyuvantes en la invención.
35
C. Formulaciones de saponina [capítulo 22 de la ref. 53]
[0108] Las formulaciones de saponina también pueden utilizarse como adyuvantes en la invención. Las saponinas son un grupo heterólogo de glucósidos de esterol y glucósidos triterpenoides que se encuentran en la corteza, hojas, tallos, raíces e incluso flores de una amplia gama de especies de plantas. Las saponinas aisladas de la corteza del 40 árbol Molina de Quillaia saponaria se han estudiado ampliamente como adyuvantes. La saponina también se puede obtener comercialmente de Smilax ornata (sarsaprilla), Gypsophilla paniculata (velo de novia) y Saponaria officianalis (raís saponaria). Formulaciones de adyuvante de saponina incluyen formulaciones purificadas, tales como QS21, así como formulaciones lipídicas, tales como ISCOM.
45
[0109] Las composiciones de saponina se han purificado usando HPLC y RP-HPLC. Fracciones purificadas específicas usando estas técnicas han sido identificadas, incluyendo QS7, QS17, QS18, QS21, QH-A, QH-B y QH-C. Preferiblemente, la saponina es QS21. Un método de producción de QS21 se describe en la ref. 63. Formulaciones de saponina también pueden comprender un esterol, tal como colesterol [64].
50
[0110] Las combinaciones de saponinas y colesteroles pueden utilizarse para formar partículas únicas denominadas complejos de inmunoestimulantes (ISCOM) [capítulo 23 de ref. 53]. ISCOM también incluyen típicamente un fosfolípido tal como fosfatidiletanolamina o fosfatidilcolina. Cualquier saponina conocida puede utilizarse en los ISCOM. Preferiblemente, el ISCOM incluye uno o más de QuilA, QHA y QHC. ISCOM se describen adicionalmente en las referencias 64-66. Opcionalmente, los ISCOM pueden estar desprovistos de detergente adicional (s) [67]. 55
[0111] Una revisión del desarrollo de adyuvantes basados en saponina se pueden encontrar en las referencias. 68 y 69.
D. Virosomas y partículas similares a virus 60
[0112] Los virosomas y partículas similares a virus (VLP) también pueden utilizarse como adyuvantes en la invención. Estas estructuras contienen generalmente una o más proteínas de un virus opcionalmente combinado o formulado con un fosfolípido. Son generalmente no patógenos no replicantes y generalmente no contienen genomas virales nativos. Las proteínas virales pueden producirse de modo recombinante o aislarse de virus completos. Estas 65 proteínas virales adecuadas para el uso en virosomas o VLP incluyen proteínas derivadas de virus de influenza
(tales como HA o NA), virus de la hepatitis B (como proteínas del núcleo o de la cápsida), virus de la hepatitis E, virus del sarampión, virus de Sindbis, Rotavirus, virus de Fiebre Aftosa, Retrovirus, virus de Norwalk, virus del Papiloma humano, VIH, fagos de ARN, Qß-fago (por ejemplo, proteínas de la cubierta), la GA-fago, fr-fago, fago de AP205, y Ty (como la proteína p1 de retrotransposón Ty). VLP se analizan adicionalmente en las referencias 70-75. Los virosomas se analizan más en, por ejemplo, ref. 76 5
E. Derivados de bacteriana o microbianos
[0113] Los adyuvantes adecuados para uso en la invención incluyen derivados bacterianos o microbianos tales como derivados no tóxicos de lipopolisacárido enterobacteriano (LPS), derivados del lípido A, oligonucleótidos 10 inmunoestimuladores y toxinas de ribosilato de ADP y derivados desintoxicados de los mismos.
[0114] Derivados no tóxicos de LPS incluyen lípido A monofosforil (MPL) y MPL 3-O-desacilado (3dMPL). 3dMPL es una mezcla de lípido A monofosforil 3 de acilado O con 4, 5 ó 6 cadenas aciladas. Una forma preferida de "partícula pequeña" de lípido A monofosforil 3 de acilado O se describe en la ref. 77. Tales "partículas pequeñas" de 3dMPL 15 son lo suficientemente pequeñas para filtrarse de forma estéril a través de una membrana de 0,22 µm [77]. Otros derivados de LPS no tóxicos incluyen lípido A monofosforil, tales como derivados de fosfato de aminoalquilo de glucosaminida, por ejemplo RC-529 [78,79].
[0115] Derivados de lípido A incluyen derivados de lípido A de Escherichia coli tales como OM-174. OM-174 se 20 describe por ejemplo en las referencias. 80 y 81.
[0116] Los oligonucleótidos inmunoestimuladores adecuados para el uso como adyuvantes en la invención incluyen secuencias de nucleótidos que contienen un motivo CpG (una secuencia de dinucleótido que contiene una citosina no metilada unida por un enlace de fosfato a una guanosina). ARN y oligonucleótidos que contienen secuencias 25 palindrómicas o poli (dG) de doble cadena también se han demostrado ser inmunoestimulantes.
[0117] El CpG pueden incluir modificaciones / análogos de nucleótidos tales como modificaciones de fosforotioato y pueden ser de doble cadena o de cadena sencilla. Referencias 82, 83 y 84 describen posibles sustituciones de análogos, por ejemplo, sustitución de guanosina con 2'-desoxi-7-desazaguanosina. El efecto adyuvante de 30 oligonucleótidos CpG se analiza adicionalmente en las referencias. 85-90.
[0118] La secuencia de CpG puede dirigirse a TLR9, como el motivo GTCGTT o TTCGTT [91]. La secuencia CpG puede ser específica para inducir una respuesta inmune Th1, tal como un ODN CpG-A, o puede ser más específica para inducir una respuesta de células B, tal como ODN CpG-B. Los ODN CpG-A y CpG-B se discuten en las 35 referencias. 92-94. Preferiblemente, el CpG es un ODN CpG-A.
[0119] Preferiblemente, el oligonucleótido CpG se construye de manera que el extremo 5' es accesible para el reconocimiento del receptor. Opcionalmente, dos secuencias de oligonucleótidos CpG pueden estar unidos en sus extremos 3' para formar "inmunómeros". Véase, por ejemplo, refs. 91 y 95-97. 40
[0120] Otros oligonucleótidos inmunoestimuladores incluyen un ARN de doble cadena, o un oligonucleótido que contiene una secuencia palindrómica, o un oligonucleótido que contiene una secuencia de poli (dG).
[0121] Toxinas de ribosilación de ADP bacterianas y derivados desintoxicados de las mismas pueden usarse como 45 adyuvantes en la invención. Preferiblemente, la proteína se deriva de E. coli (enterotoxina lábil térmica de E. coli "LT"), cólera ("CT") o pertussis ("PT"). El uso de toxinas de ribosilación de ADP desintoxicadas como adyuvantes de la mucosa se describe en la ref. 98 y como adyuvantes parenterales en la ref. 99. La toxina o el toxoide está preferiblemente en la forma de una holotoxina, que comprende ambas subunidades A y B. Preferiblemente, la subunidad A contiene una mutación detoxificante; preferiblemente la subunidad B no está mutada. Preferiblemente, 50 el adyuvante es un mutante de LT destoxificada tal como LT-K63, LT-R72 y LT-G192. El uso de toxinas de ribosilación de ADP y derivados desintoxicados de las mismas, particularmente LT-K63 y LT-R72, como adyuvantes se pueden encontrar en las referencias 100-107. La referencia numérica para las subinstituciones de aminoácidos se basa preferentemente en los alineamientos de las subunidades A y B de toxinas de ribosilación de ADP establecidas en la ref. 108, que se incorpora específicamente en este documento por referencia en su totalidad. 55
[0122] Los compuestos de fórmula I, II o III, o sales de los mismos, también se pueden utilizar como adyuvantes:
como se define en la referencia 109, tales como 'ER 803058', 'ER 803732', 'ER 804053', ER 804058',' ER 804059',' ER 804442 ',' ER 804680',' ER 804764', ER 803022' o 'ER 804057', por ejemplo:
5
F. Inmunomoduladores humanos
10
[0123] Inmunomoduladores humanos adecuados para su uso como adyuvantes en la invención incluyen citocinas, tales como interleucinas (por ejemplo IL-1, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-12 [110], etc.) [111], interferones (por ejemplo interferón-γ), factor estimulante de colonias de macrófagos, factor de necrosis tumoral y la proteína inflamatoria de macrófagos-1 alfa (MIP-1 alfa) y MIP-1 beta [112].
15
G. Bioadhesivos y mucoadhesivos
[0124] Los bioadhesivos y mucoadhesivos también pueden usarse como adyuvantes en la invención. Bioadhesivos adecuados incluyen microesferas de ácido hialurónico esterificadas [113] o mucoadhesivos tales como derivados reticulados de poli(ácido acrílico), alcohol polivinílico, polivinilpirrolidona, polisacáridos y carboximetilcelulosa. Chitosan y derivados de los mismos también se pueden usar como adyuvantes en la invención [114].
5
H. Micropartículas
[0125] Las micropartículas también se pueden usar como adyuvantes en la invención. Las micropartículas (es decir, una partícula de ~100nm a ~150mm de diámetro, más preferentemente ~ 200 nm a ~ 30 mm de diámetro, y lo más preferentemente ~ 500 nm a ~10mm de diámetro) formadas a partir de materiales que son biodegradables y no 10 tóxicos (por ejemplo, un poli (ácido a-hidroxi), un ácido polihidroxibutírico, un poliortoéster, un polianhídrido, una policaprolactona, etc.), con poli(lactida-co-glicólido) son preferidos, tratados opcionalmente para tener una superficie cargada negativamente (por ejemplo con SDS) o una superficie cargada positivamente (por ejemplo, con un detergente catiónico, tal como CTAB).
15
I. Liposomas (capítulos 13 y 14 de la ref. 53)
[0126] Los ejemplos de formulaciones de liposomas adecuados para su uso como adyuvantes se describen en las referencias. 115-117.
20
J. Éter de polioxietileno y formulaciones de éster de polioxietileno
[0127] Los adyuvantes adecuados para su uso en la invención incluyen éteres de polioxietileno y ésteres de polioxietileno [118]. Dichas formulaciones incluyen además tensioactivos de éster de sorbitán de polioxietileno en combinación con un octoxinol [119], así como éteres de alquilo de polioxietileno o tensioactivos de éster en 25 combinación con al menos un agente tensioactivo no iónico adicional tal como un octoxinol [120]. Éteres de polioxietileno preferidos se seleccionan del siguiente grupo: polioxietileno-9- éter de estearoil (laureth 9), éter de polioxietileno-9-steoryl, polioxiteileno-8- éter esteoril, polioxietileno-4- éter lauril, polioxietileno-35-éter lauril, y éter de polioxietileno-23-laurilo.
30
K. fosfacenos por ejemplo, PCPP
[0128] Adyuvantes de fosfaceno incluyen poli[di(carboxilatofenoxi)fosfaceno] ("PCPP") como se describe, por ejemplo, en las referencias 121 y 122.
35
L. Péptidos de muramilo
[0129] Los ejemplos de péptidos de muramilo adecuados para uso como adyuvantes en la invención incluyen N-acetil-muramil-L-treonil-D-isoglutamina (thr-MDP), N-acetil-normuramil-L-alanil-D-isoglutamina (nor -MDP), y N-acetilmuramil-L- alanil-D-isoglutaminil-L-alanina-2-(1’-2’-dipalmitoil-sn-glicero-3-hidroxifosforiloxi)-etilamina MTP-PE). 40
M. Compuestos de imidazoquinolinaa.
[0130] Adyuvantes de imidazoquinolinaa incluyen imiquimod ("R-837") [123,124], Resiquimod ("R-848") [125], y sus registros analógicos; y sales de los mismos (por ejemplo las sales de hidrocloruro). Más detalles acerca de 45 imidazoquinolinaas inmunoestimulantes se pueden encontrar en las referencias 126 a 130.
N. Compuestos de tiosemicarbazona.
[0131] Los ejemplos de compuestos de tiosemicarbazona, así como métodos de formulación, fabricación, y la 50 detección de compuestos adecuados para uso como adyuvantes en la invención incluyen los descritos en la ref. 131. Las tiosemicarbazonas son particularmente eficaces en la estimulación de células mononucleares de sangre periférica humana para la producción de citoquinas, tales como TNF-α.
O. Compuestos de triptantrina. 55
[0132] Ejemplos de compuestos de triptantrina, así como métodos de formulación, fabricación, y la detección de compuestos adecuados para uso como adyuvantes en la invención incluyen los descritos en la ref. 132. Los compuestos de triptantrina son particularmente eficaces en la estimulación de células mononucleares de sangre periférica humana para la producción de citoquinas, tales como TNF-α. 60
P. Análogos de nucleósidos
[0133] Varios análogos de nucleósidos se pueden usar como adyuvantes, tales como (a) Isatorabina (ANA-245; sine 7-tia-8-oxoguanasina): 65
y profármacos de los mismos; (b) ANA975; (c) ANA-025-1; (d) ANA380; (e) los compuestos descritos en las referencias 133 a 135; (f) un compuesto que tiene la fórmula:
5
donde,
R1 y R2 son cada uno independientemente H, halo, -NRaRb, -OH, alcoxi C1-6, alcoxi C1-6 sustituido, heterociclilo, 10 heterociclilo sustituido, arilo C6-10, arilo C6-10 sustituido, alquilo C1-6, o alquilo C1-6 sustituido;
R3 está ausente, H, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, arilo C6-10, arilo C6-10 sustituido, heterociclilo, o heterociclilo sustituido;
15
R4 y R5 son cada uno independientemente H, halo, heterociclilo, heterociclilo sustituido, -C (O) -rd, C1-6 alquilo, alquilo C1-6 sustituido, o unidas entre sí para formar un anillo de 5 miembros como en R4-5:
el vínculo se alcanza en los enlaces indicados por 20
X1 y X2 son cada uno independientemente N, C, O, o S;
R8 es H, halo, -OH, alquilo C1-6, alquenilo C2-6, alquinilo C2-6, -OH, -NRaRb, - (CH2)n-Rc -O- (alquilo C1-6), -S(O)pRe, o -C(O)-Rd; 25
R9 es H, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, heterociclilo, heterociclilo sustituido o R9a, en el que R9a es:
30
el vínculo alcanzado en el enlace indicado por una
R10 y R11 son cada uno independientemente H, halo, alcoxi C1-6, alcoxi C1-6 sustituido, -NRaRb, o -OH;
cada Ra y Rb es independientemente H, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, -C (O) Rd, arilo C6-10; 35
cada Rc es independientemente H, fosfato, difosfato, trifosfato, alquilo C1-6, o alquilo C1-6 sustituido;
cada Rd es independientemente H, halo, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, alcoxi C1-6, alcoxi C1-6 sustituido, -NH2, -NH (C1-6 alquilo), -NH (alquilo C1-6 sustituido), -N (alquilo C1-6) 2, -N (alquilo C1-6 sustituido) 2, arilo C6-10, o heterociclilo;
cada Re es independientemente H, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, arilo C6-10, arilo C6-10 sustituido, 5 heterociclilo, o heterociclilo sustituido;
cada Rf es independientemente H, alquilo C1-6, alquilo C1-6 sustituido, -C (O) Rd, fosfato, difosfato, o trifosfato;
cada uno es independientemente 0, 1, 2, o 3; 10
cada p es independientemente 0, 1, o 2; o
o (g) una sal farmacéuticamente aceptable de cualquiera de (a) a (f), un tautómero de cualquiera de (a) a (f), o una sal farmacéuticamente aceptable del tautómero. 15
Q. Lípidos vinculados a un esqueleto acíclico que contiene fosfato
[0134] Los adyuvantes que contienen lípidos vinculados a un esqueleto acíclico que contiene fosfato incluyen el antagonista TLR4 de E5564 [136,137]: 20
R. Inmunopotenciadores de moléculas pequeñas (SMIPs)
25
[0135] SMIPs incluyen:
• N2-metil-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2, N2-dimetil-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-etil-N2-metil-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina; 30
• N2-metil-1- (2-metilpropil) -N2-propil-1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• 1- (2-metilpropil) -N2-propil-1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-butil-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-butil-N2-metil-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-metil-1- (2-metilpropil) -N2-pentil-1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina; 35
• N2-metil-1- (2-metilpropil) -N2-prop-2-enil-1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• 1- (2-metilpropil) -2 - [(fenilmetil) tio] -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-4-amina;
• 1- (2-metilpropil) -2- (propiltio) -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-4-amina;
• 2 - [[4-amino-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-2-il] (metil) amino] etanol;
• 2 - [[4-amino-1- (2-metilpropil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-2-il] (metil) amino] acetato de etilo; 40
• 4-amino-1- (2-metilpropil) -1,3-dihidro-2H-imidazo [4,5-c] quinolina-2-ona;
• N2-butil-1- (2-metilpropil) -N4, N4-bis (fenilmetil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-butil-N2-metil-1-(2-metilpropil)-N4,N4-bis(fenilmetil)-1H-imidazo[4,5-c]quinolinaa-2,4-diamina;
• N2-metil-1- (2-metilpropil) -N4, N4-bis (fenilmetil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina;
• N2, N2-dimetil-1- (2-metilpropil) -N4, N4-bis (fenilmetil) -1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina; 45
• 1- {4-amino-2- [metil (propil) amino] -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-1-il} -2-metil-2-ol;
• 1- [4-amino-2- (propilamino) -1H-imidazo [4,5-c] quinolina-1-il] -2-metil-2-ol;
• N4, N4-dibencil-1- (2-metoxi-2-metilpropil) -N2-propil-1H-imidazo [4,5-c] quinolinaa-2,4-diamina.
S. Proteosomas 50
[0136] Un adyuvante es una preparación de proteosoma de proteína de membrana externa preparadas a partir de una primera bacteria Gram-negativa en combinación con una preparación de liposacáridos derivada de una segunda
bacteria Gram negativa, en el que las preparaciones de proteosomas de proteínas de membrana y liposacáridos exteriores forman un complejo adyuvante estable no covalente. Tales complejos incluyen "IVX-908", un complejo compuesto de membrana externa de Neisseria meningitidis y lipopolisacáridos. Se han utilizado como adyuvantes para vacunas contra la influenza [138].
5
T. Otros adyuvantes
[0137] Otras sustancias que actúan como agentes inmunoestimulantes se describen en el capítulo 7 de la ref. 53. referencias 53 y 58. Otras sustancias adyuvantes útiles incluyen:
10
• Inosina de metilo 5'-monofosfato ("MIMP") [139].
• Un compuesto polihidroxlato de pirrolizidina [140], tal como uno que tiene la fórmula:
15
donde R se selecciona del grupo que comprende hidrógeno, lineal o ramificado, no sustituido o sustituido, saturado o insaturado de acilo, alquilo (por ejemplo, cicloalquilo), alquenilo, alquinilo y grupos de arilo, o una sal farmacéuticamente aceptable o derivado del mismo. Los ejemplos incluyen, pero no se limitan a: casuarina, casuarina-6-α-D-glucopiranosa, 3-epi-casuarina, 7-epi-casuarina, 3,7-diepi-casuarina, etc.
• Una inulina gamma [141] o un derivado del mismo, tal como algamulina. 20
• Los compuestos descritos en la referencia 142.
• Los compuestos descritos en la referencia 143, incluyendo: compuestos de acilpiperazina, compuestos de indolediona, compuestos de tetrahidraisoquinolina (THIQ), compuestos de benzociclodiona, compuestos de aminoazavinil, compuestos de quinolinaona de aminobencimidazol (ABIQ) [144,145], compuestos de hidraptalamida, compuestos de benzofenona, compuestos de isoxazol, compuestos de esterol, compuestos de quinazilinona, 25 compuestos de pirrol [146], compuestos de antraquinona, compuestos de quinoxalina, compuestos de triazina, compuestos de pirazalopirimidina y compuestos de benzazol [147].
• Loxoribina (7-alil-8-oxoguanosina) [148].
• Una formulación de un lípido catiónico y un co-lípido (generalmente neutral), tales como aminopropil-dimetil-miristoleiloxi-propanaminio bromuro-difitanoilfosfatidil-etanolamina ("VaxfectinTM) o aminopropil-dimetil-bis-dodeciloxi-30 propanaminio bromuro-dioleoilfosfatidil-etanolamina ("GAP-DLRIE:DOPE") Las formulaciones que contienen sales (+)-N-(3-aminopropil)-N, N-dimetil-2,3-bis(sin-9-tetradeceniloxi)-1-propanaminio se prefieren [149].
[0138] La invención también puede comprender combinaciones de uno o más de los adyuvantes identificados anteriormente. Por ejemplo, las siguientes combinaciones se pueden usar como composiciones adyuvantes en la 35 invención: (1) una saponina y una emulsión de aceite-en-agua [150]; (2) una saponina (por ejemplo QS21) + un derivado de LPS no tóxico (por ejemplo 3dMPL) [151]; (3) una saponina (por ejemplo QS21) + un derivado de LPS no tóxico (por ejemplo 3dMPL) + un colesterol; (4) una saponina (por ejemplo QS21) + 3dMPL + IL-12 (opcionalmente + un esterol) [152]; (5) combinaciones de 3dMPL con, por ejemplo, QS21 y / o emulsiones de aceite en agua [153]; (6) SAF, que contiene 10% de escualano, 0,4% de Tween 80TM, 5% de polímero Pluronic L121-40 bloque, y thr-MDP, microfluidizado en una emulsión submicrométrica o agitan con vórtex para generar una emulsión de tamaño de partícula más grande. (7) Sistema de RibiTM adyuvante (RAS), (Ribi Immunochem) que contiene 2% de escualeno, 0,2% de Tween 80, y uno o más componentes de la pared celular más bacterianas del grupo que consiste en monofosforillípido A (MPL), dimicolato de trehalosa (TDM), y esqueleto de la pared celular (CWS), preferiblemente MPL + CWS (De- toxTM); (8) una o más sales minerales (tales como una sal de aluminio) + un 45 derivado no tóxico de LPS (como 3dMPL); y (9) una o más sales minerales (tales como una sal de aluminio) + un inmunoestimulante oligonucleótido (como una secuencia de nucleótidos que incluye un motivo CpG).
[0139] Las composiciones de la invención provocarán preferiblemente tanto una respuesta inmune mediada por células, así como una respuesta inmune humoral con el fin de tratar eficazmente una infección uropatógena. Esta 50 respuesta inmune induce preferentemente (por ejemplo, anticuerpos neutralizantes) de larga duración y una inmunidad mediada por células que pueden responder rápidamente tras la exposición a antígenos asociados-MNEC.
[0140] Se cree generalmente que dos tipos de células T, las células CD4 y CD8, son necesarios para iniciar y / o mejorar la inmunidad mediada por células y la inmunidad humoral. Las células T de CD8 pueden expresar un co-55 receptor CD8 y se conoce comúnmente como linfocitos de citotóxicos T (CTL). Las células T CD8 son capaces de reconocer o interactuar con los antígenos que se muestran en las moléculas MHC de clase I. Las células T colaboradoras CD4 pueden expresar un co-receptor CD4 y se denominan comúnmente como células T colaboradoras. Las células T CD4 son capaces de reconocer péptidos antigénicos unidos a moléculas MHC de clase
II. Tras la interacción con una molécula de MHC de clase II, las células CD4 pueden secretar factores tales como citoquinas. Estas citoquinas secretadas pueden activar las células B, células T citotóxicas, macrófagos y otras células que participan en una respuesta inmune. Las células T colaboradoras o células CD4+ se pueden dividir en dos subgrupos funcionalmente distintos: fenotipo TH1 y fenotipos TH2 que difieren en su función de citocinas y efector. 5
[0141] Las células TH1 activadas mejoran la inmunidad celular (incluyendo un aumento en la producción de antígeno CTL específica) y por lo tanto son de especial valor en la respuesta a las infecciones intracelulares. células TH1 activados pueden secretar una o más de IL-2, IFN-γ, y TNF-β. Una respuesta inmune TH1 puede dar lugar a reacciones inflamatorias locales por los macrófagos de activación, NK (natural killer) las células, y las células CD8 T 10 citotóxicos (CTL). Una respuesta inmune TH1 también puede actuar para ampliar la respuesta inmune mediante la estimulación de crecimiento de células B y T con IL-12. TH1 estimula las células B pueden secretar IgG2a.
[0142] Las células TH2 activadas mejoran la producción de anticuerpos y, por tanto, son de un valor particular en la respuesta a las infecciones extracelulares. Las células TH2 activadas pueden secretar una o más de IL-4, IL-5, IL-6, 15 y IL-10. Una respuesta inmune TH2 puede resultar en la producción de IgGI, IgE, IgA y células B de memoria para la protección futura.
[0143] Una respuesta inmune mejorada puede incluir una o más de una respuesta inmune mejorada TH1 y TH2 una respuesta inmune. Una respuesta inmune TH1 mejorada puede incluir uno o más de un aumento en CTLs, un 20 aumento en una o más de las citoquinas asociadas con una respuesta inmune TH1 (tales como IL-2, IFN-γ, y TNF-β), un aumento en los macrófagos activados, un aumento de la actividad NK, o un aumento en la producción de IgG2a. Preferiblemente, la respuesta inmune TH1 mejorada incluirá un aumento en la producción de IgG2a. Una respuesta inmune TH2 mejorada puede incluir uno o más de un aumento en una o más de las citoquinas asociadas con una respuesta inmunitaria Th2 (tal como IL-4, IL-5, IL-6 y IL-10), o un aumento de la producción de células B de 25 memoria IgG1, IgE, IgA y. Preferiblemente, la mayor resonse inmune TH2 incluirá un aumento en la producción de IgG1.
[0144] Una respuesta inmune TH1 puede ser obtenido usando un adyuvante Th1. Un adyuvante TH1 generalmente provocará niveles de IgG2a producción relativa a la inmunización aumento del antígeno sin adyuvante. TH1 Los 30 adyuvantes adecuados para su uso en la invención pueden incluir, por ejemplo, saponina formulaciones, virosomas y partículas similares a virus, derivados no tóxicos de lipopolisacárido enterobacteriano (LPS), los oligonucleótidos inmunoestimulantes. oligonucleótidos inmunoestimuladores, tales como oligonucleótidos que contienen un motivo CpG, se prefieren adyuvantes TH1 para su uso en la invención.
35
[0145] Una respuesta inmune TH2 puede ser obtenida usando un adyuvante TH2. Un adyuvante TH2 generalmente provocará niveles aumentados de producción de IgG1 con respecto a la inmunización del antígeno sin adyuvante. adyuvantes TH2 adecuados para uso en la invención incluyen, por ejemplo, composiciones que contienen minerales, aceite de emulsiones, y toxinas de ribosilación de ADP y derivados ficado detoxi- de este documento. composiciones que contienen minerales, tales como sales de aluminio se prefieren adyuvantes TH2 para el uso en la invención. 40
[0146] Preferiblemente, la invención incluye una composición que comprende una combinación de un adyuvante TH1 y TH2 un adyuvante. Preferiblemente, una composición de este tipo provoca una TH1 mejorada y una respuesta TH2 mejorada es decir, un aumento en la producción tanto de la producción de IgG1 como de IgG2a con respecto a la inmunización sin adyuvante. Aún más preferiblemente, la composición que comprende una 45 combinación de un TH1 y un adyuvante TH2 provoca un aumento de TH1 y / o un aumento de TH2 de respuesta inmune en relación con la inmunización con un único adyuvante (es decir, con relación a la inmunización con un adyuvante TH1 solo o inmunización con un TH2 adyuvante solo).
[0147] La respuesta inmune puede ser una o ambas de una respuesta inmune TH1 y una respuesta TH2. 50 Preferiblemente, la respuesta inmune proporciona una o ambas de una respuesta TH1 mejorada y una respuesta TH2 mejorada.
[0148] La respuesta inmune mejorada puede ser una o ambos de una respuesta inmune sistémica y de mucosa. Preferiblemente, la respuesta inmune proporciona una o ambas de una sistémica mejorada y una respuesta inmune 55 mejorada de la mucosa. Preferiblemente, la respuesta inmune de la mucosa es una respuesta inmune Th2. Preferiblemente, la respuesta inmune de la mucosa incluye un aumento en la producción de IgA.
[0149] El uso de un hidróxido de aluminio o adyuvante de fosfato de aluminio es particularmente preferido, y los antígenos son generalmente adsorbido a estas sales. El fosfato de calcio es otro adyuvante preferido. 60
[0150] El pH de las composiciones de la invención es preferiblemente entre 6 y 8, preferiblemente aproximadamente 7. PH estable puede mantenerse mediante el uso de un tampón. Cuando una composición comprende una sal de hidróxido de aluminio, se prefiere utilizar un tampón de histidina [154]. La composición puede ser estéril y / o libre de pirógenos. Las composiciones de la invención pueden ser isotónicas con respecto a los seres humanos. 65
[0151] Las composiciones se pueden presentar en viales, o pueden presentarse en jeringas llenadas de antemano. Las jeringas pueden suministrarse con o sin agujas. Una jeringa incluirá una dosis única de la composición, mientras que un vial puede incluir una dosis única o dosis múltiples. Las composiciones inyectables normalmente serán soluciones o suspensiones líquidas. Alternativamente, pueden presentarse en forma sólida (por ejemplo liofilizada) para solución o suspensión en vehículos líquidos antes de la inyección. 5
[0152] Las composiciones de la invención pueden envasarse en forma de dosis unitaria o en forma de dosis múltiple. Para formas de dosis múltiples, se prefiere los viales a las jeringas llenadas de antemano. Volúmenes de dosificación eficaces pueden establecerse de forma rutinaria, pero una dosis humana típica de la composición para inyección tiene un volumen de 0,5 ml. 10
[0153] Cuando una composición de la invención tiene que prepararse extemporáneamente antes de su uso (por ejemplo, cuando un componente se presenta en forma liofilizada) y se presenta como un kit, el kit puede comprender dos viales, o puede comprender una jeringa llenada de antemano y un vial, con el contenido de la jeringa que se utiliza para reactivar los contenidos del vial antes de la inyección. 15
[0154] Las composiciones inmunogénicas usadas como vacunas comprenden una cantidad inmunológicamente eficaz de antígeno (s), así como cualquier otro componente, según sea necesario. Por 'cantidad inmunológicamente eficaz', se quiere decir que la administración de esa cantidad a un individuo, ya sea en una dosis única o como parte de una serie, es eficaz para el tratamiento o la prevención. Esta cantidad varía dependiendo de la salud y condición 20 física del individuo a tratar, edad, el grupo taxonómico del individuo a tratar (por ejemplo, primate no humano, primate, etc.), la capacidad del sistema inmune del individuo para sintetizar anticuerpos, el grado de protección deseado, la formulación de la vacuna, la valoración del médico que trata de la situación médica, y otros factores relevantes. Se espera que la cantidad caiga en un intervalo relativamente amplio que puede determinarse mediante ensayos de rutina, y una cantidad típica de cada antígeno sacárido meningocócico por dosis de entre 1 mg y 10 mg 25 por antígeno.
Usos farmacéuticos
[0155] La invención también proporciona un método de tratamiento de un paciente, que comprende la 30 administración al paciente de una cantidad terapeúticamente eficaz de una composición de la invención. El paciente puede estar a riesgo de la enfermedad por sí mismo o podría tratarse de una mujer embarazada ("inmunización materna '[155]).
[0156] La invención proporciona ácido nucleico, polipéptido, vesícula o anticuerpo de la invención para uso como 35 medicamentos (por ejemplo, como composiciones inmunogénicas o como vacunas) o como reactivos de diagnóstico. También proporciona el uso de ácido nucleico, polipéptido, vesícula o anticuerpo de la invención en la fabricación de: (i) un medicamento para tratar o prevenir la enfermedad y / o infección causada por una bacteria ExPEC; (ii) un reactivo de diagnóstico para detectar la presencia de anticuerpos generados contra una bacteria ExPEC; y / o (iii) un reactivo que puede generar anticuerpos contra una bacteria ExPEC. Dicha bacteria ExPEC 40 puede ser de cualquier serotipo o cepa, pero son preferentemente bacterias MNEC, por ejemplo, serotipo K1 y / o tipo B2 MLEE.
[0157] La invención es útil para la prevención y / o tratamiento de enfermedades tales como bacteremia, meningitis, una infección del tracto urinario, pielonefritis y / o cistitis. La invención es particularmente útil para el tratamiento de 45 la sepsis y / o meningitis
[0158] El paciente es preferiblemente un ser humano. El ser humano puede ser un niño (por ejemplo, con edades comprendidas entre los 0 y los 18 años, o entre 0-5 años), puede ser un adolescente (por ejemplo, edad 15-19), un adulto (por ejemplo, 19-54 años de edad) o pueden ser mayores (por ejemplo, 55 años o más). Las adolescentes y 50 adultos son un grupo preferido de los pacientes. Una vacuna destinada a niños o adolescentes también se puede administrar a adultos por ejemplo, para evaluar la seguridad, dosificación, inmunogenicidad, etc.
[0159] Otros posibles pacientes animales incluyen perros, que pueden ser portadores de ExPEC [156,157].
55
[0160] Una forma de comprobar la eficacia del tratamiento terapéutico implica el seguimiento de la infección después de la administración de la composición de la invención. Una forma de comprobar la eficacia del tratamiento profiláctico implica el monitoreo de respuestas inmunes contra un polipéptido administrado después de la administración. La inmunogenicidad de composiciones de la invención se puede determinar mediante la administración a los sujetos de prueba (por ejemplo, niños de 12-16 meses de edad, o modelos animales, por 60 ejemplo, un modelo murino) y luego la determinación de los parámetros estándar, incluyendo los títulos ELISA (GMT) de IgG. Estas respuestas inmunitarias se determinarán generalmente alrededor de 4 semanas después de la administración de la composición, y se compararon con los valores determinados antes de la administración de la composición. Si se administra más de una dosis de la composición, más de una determinación posterior a la administración puede hacerse. La eficacia también puede evaluarse utilizando modelos adultos de ratones de 65 sepsis, modelos de ratón de infección del tracto urinario, y de la protección pasiva de la meningitis en crías de rata.
[0161] La administración de antígenos polipeptídicos es un método preferido de tratamiento para inducir la inmunidad. La administración de anticuerpos de la invención es otro método preferido de tratamiento. Este método de inmunización pasiva es particularmente útil para los niños recién nacidos o para las mujeres embarazadas. Este método típicamente usa anticuerpos monoclonales, que serán humanizados o completamente humanos.
5
[0162] Las composiciones de la invención generalmente se pueden administrar directamente a un paciente. La administración directa puede conseguirse por inyección parenteral (por ejemplo subcutánea, intraperitoneal, intravenosa, intramuscular o al espacio intersticial de un tejido), o por vía rectal, oral (por ejemplo, comprimido, aerosol), vaginal, tópica, transdérmica, transcutánea, intranasal, sublingual, ocular, aural, pulmonar u otra administración en la mucosa. Se prefiere la administración intramuscular en el muslo o el brazo superior. La 10 inyección puede llevarse a cabo mediante una aguja (por ejemplo, una aguja hipodérmica), pero la inyección sin aguja puede utilizarse alternativamente. Una dosis típica es de 0,5 ml por vía intramuscular.
[0163] La invención se puede usar para provocar la inmunidad sistémica y / o mucosa. Preferiblemente, el aumento de la inmunidad sistémica y / o mucosa se refleja en un aumento de TH1 y / o respuesta inmune Th2. 15 Preferiblemente, la respuesta inmune mejorada incluye un aumento en la producción de IgG1 IgG2a y / o IgA.
[0164] El tratamiento de dosificación puede ser un programa de dosis única o un programa de dosis múltiple. Las dosis múltiples pueden utilizarse en un programa de inmunización primaria y / o en un calendario de inmunización de refuerzo. Un programa de dosis primaria puede ser seguido por un programa de dosis de refuerzo. En un programa 20 de dosis múltiple las diversas dosis pueden administrarse por la misma o diferentes rutas por ejemplo un cebado parenteral e impulso mucoso, un cebado mucoso e impulso parenteral, etc. Tiempo adecuado entre las dosis de cebado (por ejemplo, entre 4-16 semanas), y entre el cebado e impulso, se puede determinar de forma rutinaria. Por ejemplo, un curso primario de vacunación puede incluir 1-10 dosis separadas, seguidas por otras dosis administradas a intervalos de tiempo posteriores requeridos para mantener y / o reforzar una respuesta inmune, por 25 ejemplo, en 1-4 meses para una segunda dosis, y si es necesario, una dosis o dosis posteriores después de varios meses.
[0165] Las infecciones bacterianas afectan a diversas áreas del cuerpo y por lo tanto composiciones pueden prepararse en diversas formas. Por ejemplo, las composiciones pueden prepararse como inyectables, bien como 30 soluciones líquidas o suspensiones. Las formas sólidas adecuadas para solución en, o suspensión en, vehículos líquidos antes de la inyección también se pueden preparar (por ejemplo, un liofilizado o una composición de pulverización-secado por congelación). La composición puede prepararse para administración tópica, por ejemplo, como un ungüento, crema o polvo. La composición se prepara para administración oral, por ejemplo, como un comprimido o cápsula, como un aerosol, o como un jarabe (opcionalmente aromatizado). La composición puede 35 prepararse para administración pulmonar, por ejemplo, como un inhalador, usando un polvo fino o una pulverización. La composición puede prepararse como un supositorio o pesario. La composición se puede preparar para su administración nasal, aural u ocular, por ejemplo, como los sprays, gotas, gel o polvo [por ejemplo, referencias 158 y 159]. La composición puede estar en forma de kit, diseñada de tal manera que una composición combinada se reconstituye inmediatamente antes de la administración a un paciente. Tales kits pueden comprender uno o más 40 antígenos en forma líquida y uno o más antígenos liofilizados.
[0166] Las composiciones de la invención se pueden administrar a los pacientes sustancialmente al mismo tiempo que (por ejemplo, durante la misma consulta médica o visita a un profesional sanitario) otras vacunas, por ejemplo, sustancialmente al mismo tiempo como una vacuna contra el sarampión, una vacuna contra las paperas, una 45 vacuna contra la rubéola, una vacuna MMR, una vacuna contra la varicela, una vacuna MMRV, una vacuna contra la difteria, una vacuna contra el tétanos, una vacuna de pertussis, una vacuna DTP, un conjugado H. b vacuna influenzae tipo, una vacuna del virus del papiloma humano, una vacuna inactivada poliovirus, una vacuna de virus de la hepatitis B, una vacuna neumocócica conjugada, una vacuna conjugada meningocócica, etc. Similarmente se puede administrar a los pacientes sustancialmente al mismo tiempo que (por ejemplo, durante el mismo consulta 50 médica o visita a un profesional sanitario) un antibiótico, y en particular un compuesto antibiótico activo contra MNEC.
Otros componentes antigénicos de las composiciones de la invención
55
[0167] La invención también proporciona una composición que comprende un polipéptido o la invención y uno o más de los siguientes antígenos adicionales:
- Un antígeno de sacárido de N. meningitidis serogrupo A, C, W135 y / o Y (preferiblemente los cuatro), tal como el oligosacárido descrito en la ref. 160 del serogrupo C [véase también ref. 161] o los oligosacáridos de ref. 162. 60
- Un antígeno de N. meningitidis serogrupo B, tal como los descritos en las refs. 163-171, etc.
- Un antígeno de sacárido de Streptococcus pneumoniae [por ejemplo, 172, 173, 174].
- Un antígeno del virus de la hepatitis A, tal como virus inactivado [por ejemplo, 175, 176].
- Un antígeno de virus de la hepatitis B, como los antígenos de superficie y / o núcleo [por ejemplo, 176, 177].
- Un antígeno de difteria, tal como un toxoide de la difteria [por ejemplo, el capítulo 3 de la ref. 178], por ejemplo, el 65 mutante CRM197 [por ejemplo, 179].
- Un antígeno de virus de la hepatitis C [por ejemplo, 180].
- Un antígeno de VIH [181]
- Un antígeno del tétanos, tal como un toxoide tetánico [por ejemplo, el capítulo 4 de la ref. 178].
- Un antígeno de Bordetella pertussis, tal como holotoxina pertussis (PT) y hemaglutinina filamentosa (FHA) de B. pertussis, opcionalmente también en combinación con pertactina y / o aglutinógenos 2 y 3 [por ejemplo, refs. 182 y 5 183].
- Un antígeno de sacárido de Haemophilus influenza B [por ejemplo, 161].
- Antígeno (s) de la polio [por ejemplo, 184, 185] tal como IPV.
- Sarampión, las paperas y / o antígenos de rubéola [por ejemplo, capítulos 9, 10 y 11 de la ref. 178].
- Antígenos de varicela. 10
- Antígeno (s) de influenza [por ejemplo, capítulo 19 de la ref. 178], tales como la hemaglutinina y / o proteínas de la superficie de la neuraminidasa. Antígenos de la influenza se pueden derivar de cepas de la influenza interpandémicas (anuales). Antígenos de la influenza se pueden derivar de cepas con el potencial de causar un brote pandémico (es decir, las cepas de influenza con nueva hemaglutinina en comparación con la hemaglutinina en las cepas que circulan actualmente, o cepas de la influenza que son patógenos en sujetos de aves y tienen el 15 potencial de ser transmitidos horizontalmente en las cepas de la población, o la influenza humana, que son patógenos para los seres humanos). Antígenos de la influenza se pueden derivar de los virus cultivados en huevos o cultivo celular.
- Un antígeno de Moraxella catarrhalis [por ejemplo, 186].
- Un antígeno de sacárido de Streptococcus agalactiae (estreptococo del grupo B). 20
- Un antígeno proteico de Streptococcus agalactiae (estreptococo del grupo B) [por ejemplo, 187, 188].
- Un antígeno de N. gonorrhoeae [por ejemplo, 189-192].
- Un antígeno de Chlamydia pneumoniae [por ejemplo, refs. 193-199] o una combinación de antígenos de C.pneumoniae [por ejemplo. 200].
- Un antígeno de Chlamydia trachomatis, o una combinación de los antígenos de C. trachomatis [por ejemplo, 201]. 25
- Un antígeno de Porphyromonas gingivalis [por ejemplo, 202].
- Un antígeno (s) de la rabia [por ejemplo, 203], como el virus inactivado liofilizado [por ejemplo, 204, RabAvertTM].
- Antígeno (s) de un paramixovirus tales como el virus sincitial respiratorio (RSV [205, 206]) y / o virus de parainfluenza
(PIV3 [207]). 30
- Un antígeno de Bacillus anthracis [por ejemplo, 208, 209, 210].
- Un antígeno de Streptococcus pyogenes (estreptococo del grupo A) [por ejemplo, 188 211, 212].
- Un antígeno de Staphylococcus aureus [por ejemplo, 213].
- Un antígeno de un virus de la familia Flaviviridae (género flavivirus), tal como de virus de fiebre amarilla, virus de la encefalitis japonés, cuatro serotipos del virus del dengue, virus de la encefalitis por garrapatas, virus del Nilo 35 Occidental.
- Un antígeno de pestivirus, tal como virus clásico de la fiebre porcina, virus de la diarrea viral bovina, y / o virus de la enfermedad de la frontera.
- Un antígeno de parvovirus, por ejemplo, desde el parvovirus B19.
- Un virus del papiloma humano (HPV) antígeno [214] 40
[0168] La composición puede comprender uno o más de estos antígenos adicionales.
[0169] Los antígenos preferidos gonocócicos incluyen uno o más de ngs13 (OmpA), OmpH, ngs576 (cis peptidil-prolil cis/transisomerasa (PPIase) proteína), y ngs41 ngs1 17. 45
[0170] Los antígenos preferidos de HPV incluyen uno o más de HPV 16, HPV 18, HPV 6 y HPV 11.
[0171] Antígenos Chlamydia trachomatis preferidos incluyen uno o más de: CT045, CT089, CT242, CT316, CT381 CT396, CT398, CT444, CT467, CT547, CT587, CT823, CT761 y combinaciones específicas de estos antígenos 50 como se describe en el documento WO 05/002619.
[0172] Los antígenos preferidos Chlamydia pneumoniae incluyen uno o más de: CPn0324, Cpn0301, Cpn0482, Cpn0503, Cpn0525, Cpn0558, Cpn0584, Cpn0800, Cpn0979, Cpn0498, Cpn0300, Cpn0042, Cpn0013, Cpn450, Cpn0661, Cpn0557, Cpn0904, Clpn0795, Cpn0186 y Cpn0604 y combinaciones específicas de estos antígenos 55 como se describe en el documento WO 05/084306.
[0173] Los antígenos preferidos GBS incluyen uno o más de GBS80, GBS 104, GBS 59, GBS 67, GBS 322 y GBS 276.
60
[0174] En otra realización, los antígenos de la invención se combinan con uno o más antígenos adicionales, no E. coli adecuados para su uso en una vacuna diseñada para proteger a las mujeres contra genitourinario y / o enfermedades de transmisión sexual. por ejemplo, los antígenos se pueden combinar con un antígeno derivado del grupo que consiste en Streptococcus lactiae agarosa, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, el virus del papiloma y virus del herpes simple. Cuando se usan antígenos de papilomavirus humanos, que pueden ser de uno o 65 más de HPV 16, HPV 18, HPV 6 y / o HPV 11.
[0175] En otra realización, las combinaciones de antígenos de la invención se combinan con uno o más antígenos adicionaldx, no ExPEC adecuados para su uso en una vacuna diseñada para proteger a las personas de edad avanzada o inmunocomprometidos. Por ejemplo, las combinaciones de antígeno se pueden combinar con un antígeno derivado del grupo que consiste de Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermis, Pseudomonas aeruginosa, Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes, Neisseria meningitidies, la 5 influenza, y el virus de parainfluenza ('PIV').
[0176] Antígenos proteicos tóxicos pueden ser desintoxicados cuando sea necesario (por ejemplo detoxificación de toxina de pertussis por medios genéticos y / o químicos [183]).
10
[0177] Cuando un antígeno de difteria está incluido en la composición se prefiere incluir también antígeno del tétanos de antígeno pertussis. De manera similar, cuando un antígeno del tétanos está incluido también se prefiere incluir antígenos de la difteria y de pertussis. De manera similar, cuando un antígeno de pertussis se incluye se prefiere incluir también antígenos de difteria y tétanos. combinaciones de DTP se prefieren por lo tanto.
15
[0178] Antígenos de sacáridos están preferentemente en forma de conjugados. Las proteínas transportadoras de los conjugados incluyen toxinas bacterianas (tales como el toxoide diftérico o toxoide del tétanos), la proteína de N. meningitidis de la membrana externa [215], péptidos sintéticos [216,217], proteínas de choque térmico [218,219], proteínas de pertussis [220,221], proteína D de H. influenzae [222,223], citoquinas [224], linfoquinas [224], proteínas H.influenzae, hormonas [224], factores de crecimiento [224], la toxina A o B de C. difficile [225], proteínas de 20 captación de hierro [226], proteínas artificiales que comprenden múltiples epítopos de células T CD4 + humanos de diversos antígenos de patógenos derivados [227], tales como la proteína N19 [228], proteína de superficie neumocócica PspA [ 229], neumolisina [230], etc. Una proteína portadora preferida es la proteína CRM 197 [231].
[0179] Los antígenos en la composición estará presente típicamente en una concentración de al menos 1 mg / ml 25 cada una. En general, la concentración de cualquier antígeno dado será suficiente para provocar una respuesta inmune contra ese antígeno.
[0180] Los antígenos se adsorben preferiblemente en una sal de aluminio.
30
Inmunización con ácido nucleico
[0181] Las composiciones inmunogénicas descritas anteriormente incluyen antígenos de polipéptidos de MNEC. Como alternativa al uso de proteínas de antígenos en las composiciones inmunogénicas de la invención, el ácido nucleico (preferiblemente ADN por ejemplo, en la forma de un plásmido) que codifica el antígeno se puede utilizar, 35 para dar composiciones, métodos y usos basados en la inmunización con ácido nucleico. Inmunización de ácido nucleico es ahora un campo desarrollado (por ejemplo, ver las referencias 232 a 239 etc.), y se ha aplicado a muchas vacunas.
[0182] El ácido nucleico que codifica el inmunógeno se expresa in vivo después de la entrega a un paciente y el 40 inmunógeno expresado a continuación estimula el sistema inmune. El ingrediente activo típicamente tomará la forma de un vector que comprende el ácido nucleico:. (i) un promotor; (ii) una secuencia que codifica el inmunógeno, operativamente unido al promotor y, opcionalmente, (iii) un marcador de selección. Los vectores preferidos pueden comprender además (iv) un origen de replicación y (v) un terminador de la transcripción aguas abajo de y unido operativamente a (ii). En general, (i) y (v) será eucariótico y (iii) y (iv) será procariótico. 45
[0183] Los promotores preferidos son promotores virales por ejemplo, de citomegalovirus (CMV). El vector también puede incluir secuencias reguladoras transcriptionales (por ejemplo, potenciadores), además del promotor y que interaccionan funcionalmente con el promotor. Los vectores preferidos incluyen el potenciador de CMV / promotor inmediato-temprano, y los vectores más preferidos también incluyen CMV intrón A. el promotor está unido 50 operativamente a una secuencia aguas abajo que codifica un inmunógeno, de manera que la expresión de la secuencia de inmunógeno-codificación está bajo el control del promotor.
[0184] En caso de un marcador que se utilice, funciona preferiblemente en una huésped microbiana (por ejemplo, en un procariota, en una bacteria, en una levadura). El marcador es preferiblemente un marcador seleccionable 55 procariota (por ejemplo transcrito bajo el control de un promotor procariota). Para mayor comodidad, los marcadores típicos son los genes de resistencia a antibióticos.
[0185] El vector de la invención es preferiblemente un episomal o vector extracromosómico de replicación autónoma, tal como un plásmido. 60
[0186] El vector de la invención comprende preferentemente un origen de replicación. Se prefiere que el origen de replicación está activo en procariotas, pero no en los eucariotas.
[0187] Los vectores preferidos incluyen por lo tanto un marcador de procariota para la selección del vector, un origen 65 de replicación procariota, pero un promotor eucariota para dirigir la transcripción de la secuencia de inmunógeno
codificadora. Los vectores por lo tanto (a) se amplificarán y se seleccionarán en huéspedes procariotas sin la expresión del polipéptido, pero (b) se expresarán en huéspedes eucariotas sin amplificarse. Esta disposición es ideal para los vectores de vacunación de ácidos nucleicos.
[0188] El vector de la invención puede comprender una secuencia de terminación transcripcional eucariótico aguas 5 abajo de la secuencia de codificación. Esto puede mejorar los niveles de transcripción. Donde la secuencia de codificación no tenga los suyos propios, el vector de la invención comprende preferiblemente una secuencia de poliadenilación. Una secuencia de poliadenilación preferida es de la hormona de crecimiento bovino.
[0189] El vector de la invención puede comprender un sitio de clonación múltiple. 10
[0190] Además de las secuencias que codifican el inmunógeno y un marcador, el vector puede comprender una segunda secuencia codificante eucariota. El vector también puede comprender un IRES de aguas arriba de dicha segunda secuencia con el fin de permitir la traducción de un segundo polipéptido eucariota de la misma transcripción como el inmunógeno. Alternativamente, la secuencia inmunógena de codificación puede ser aguas abajo de un 15 IRES.
[0191] El vector de la invención puede comprender motivos CpG no metilados, por ejemplo, secuencias de ADN no metilados que tienen en una citosina común precedentes una guanosina, flanqueada por dos purinas 5' y dos pirimidinas 3'. En su forma no metilada estos motivos de ADN han demostrado ser potentes estimuladores de varios 20 tipos de células inmunes.
[0192] Los vectores pueden ser entregados en una forma específica. Técnicas de terapia de ADN mediada por el receptor se describen en, por ejemplo, las referencias 240 a 245. Las composiciones terapéuticas que contienen un ácido nucleico que se administran en un intervalo de aproximadamente 100 ng a aproximadamente 200 mg de ADN 25 para la administración local en un protocolo de terapia génica. Los intervalos de concentración de aproximadamente 500 ng a aproximadamente 50 mg, aproximadamente 1 mg a aproximadamente 2 mg, aproximadamente 5 µg a aproximadamente 500 µg, y aproximadamente 20 µg a aproximadamente 100 µg de ADN también se puede utilizar durante un protocolo de terapia génica. Factores tales como el método de acción (por ejemplo, para aumentar o inhibir niveles de producto génico codificado) y la eficacia de la transformación y expresión son consideraciones que 30 afectarán a la dosificación requerida para la eficacia final. Cuando se desea una mayor expresión sobre una zona más grande de tejido, grandes cantidades de vector o las mismas cantidades re-administradas en un protocolo sucesivo de administraciones, o varias administraciones a diferentes porciones de tejido adyacentes o cercanas pueden ser necesarias para efectuar un resultado terapéutico positivo. En todos los casos, la experimentación rutinaria en ensayos clínicos determinará rangos específicos para el efecto terapéutico óptimo. 35
[0193] Los vectores pueden administrarse usando vehículos de administración de genes. El vehículo de suministro de genes puede ser de origen viral o no viral (véase en general referencias 246-249).
[0194] Los vectores basados en virus para la entrega de un ácido nucleico deseado y la expresión en una célula 40 deseada son bien conocidos en la técnica. Vehículos basados en virus ejemplares incluyen, pero no se limitan a retrovirus recombinantes (por ejemplo, referencias 250-260), vectores basados en alfavirus (por ejemplo, vectores de virus Sindbis, virus del bosque Semliki (ATCC VR-67; ATCC VR-1247), virus Ross River (ATCC VR-373; ATCC VR-1246) y virus de la encefalitis equina venezolana (ATCC VR-923; ATCC VR-1250; ATCC VR 1249; ATCC VR-532); híbridos o quimeras de estos virus también se pueden usar), vectores de poxvirus (por ejemplo, vaccinia, 45 viruela aviar, viruela del canario, vaccinia Ankara modificado, etc.), vectores de adenovirus, y virus adeno-asociado (AAV) vectores (por ejemplo, ver refs. 261-266). La administración de ADN ligado a adenovirus muerto [267] también se puede emplear.
[0195] Vehículos y métodos de administración no virales se pueden emplear también, incluyendo, pero no 50 limitándose a ADN condensado policatiónico unido o no a adenovirus muerto solo [por ejemplo, 267], ligado por ligando a ADN [268], células de suministro de células eucariotas transmisoras [por ejemplo, refs. 269 a 273] y neutralización de la carga nucleica o la fusión con membranas celulares. El ADN desnudo puede también emplearse. Métodos ejemplares de introducción de ADN desnudo se describen en las refs. 274 y 275. Los liposomas (por ejemplo, inmunoliposomas) que pueden actuar como vehículos de administración de genes se describen en las 55 refs. 276 a 280. Enfoques adicionales se describen en las referencias 281 y 282.
[0196] Además de entrega no vírica adecuada para uso incluye sistemas de suministro mecánico tales como el enfoque descrito en la ref. 282. Por otra parte, la secuencia de codificación y el producto de expresión de tal se puede entregar a través de la deposición de materiales de hidrogel fotopolimerizados o el uso de la radiación [por 60 ejemplo, refs. 283 y 284] ionizante. Otros métodos convencionales para la administración de genes que pueden ser utilizados para la entrega de la secuencia codificante incluyen, por ejemplo, el uso del gen de la pistola de mano de partículas de transferencia [285] o el uso de radiación ionizante para la activación de genes transferidos [283 y 286].
[0197] ADN de entrega usando micropartículas de PLG {poli (lactida-co-glicolida)} es un método particularmente 65 preferido, por ejemplo, por adsorción a las micropartículas, que se tratan opcionalmente para tener una superficie
cargada negativamente (por ejemplo, tratada con SDS) o una superficie cargada positivamente (por ejemplo, tratada con un detergente catiónico, tal como CTAB).
General
5
[0198] El término" "que comprende" "comprende" "incluye", así como "que consiste en", por ejemplo, una composición "que comprende" X puede consistir exclusivamente en X o puede incluir algo adicional, por ejemplo X + Y.
[0199] El término" "acerca de" "en relación con un valor numérico x significa, por ejemplo, X+10%.
10
[0200] La palabra" "sustancialmente" no excluye "completamente", por ejemplo, una composición que es "sustancialmente libre" de Y puede estar completamente libre de Y. Cuando sea necesario, la palabra" "sustancialmente" "puede omitirse de la definición de la invención."
[0201] Los residuos de N-terminal en las secuencias de aminoácidos en la lista de secuencias se dan generalmente 15 como el aminoácido codificado por el primer codón en la secuencia de nucleótidos correspondiente. Cuando el primer codón no es ATG, se entenderá que se traducirá como metionina cuando el codon funciona como un codón de inicio, pero serán traducidos como el aminoácido indicado no Met cuando la secuencia está en el C-terminal de una pareja de fusión. También describe específicamente y abarca cada una de las secuencias de aminoácidos de la lista de secuencias a partir de los residuos de metionina en las secuencias internas. 20
[0202] Como se indica en el texto anterior, los ácidos nucleicos y polipéptidos de la invención pueden incluir secuencias que:
(A) son idénticas (es decir, 100% idénticas) a las secuencias descritas en el listado de secuencias; 25
(B) una identidad de secuencia de acciones con las secuencias descritas en el listado de secuencias;
(C) tener 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o 10 alteraciones individuales de nucleótidos o aminoácidos (deleciones, inserciones, sustituciones), que puede estar en lugares separados o pueden ser contiguos, en comparación con las secuencias de (a) o (b); y (d) cuando se alinea con una secuencia particular de la lista de secuencias utilizando un algoritmo de alineación por pares, una ventana móvil de monómeros X (aminoácidos o nucleótidos) que se mueve desde el 30 principio (N-terminal o 5') para poner fin a (C-terminal de 3'), tal que para una alineación que se extiende a los monómeros de p (donde p>x) hay + 1 tales ventanas, cada ventana tiene al menos x·y monómeros alineados idénticos, donde: x se selecciona de 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200; y se selecciona entre 0.50, 0.60, 0.70, 0.75, 0.80, 0.85, 0.90, 0.91, 0.92, 0.93, 0.94, 0.95, 0.96, 0.97, 0.98, 0.99, y si x·y es no es un entero, entonces se redondea al entero más cercano. El algoritmo de alineamiento de pares preferido es el algoritmo 35 de alineamiento global de Needleman-Wunsch [287], utilizando parámetros por defecto (por ejemplo, con la penalidad de apertura de Gap = 10.0, y con penalidad de extensión de Gap = 0,5, utilizando la matriz de puntuación EBLOSUM62). Este algoritmo se ejecuta convenientemente en la herramienta de la aguja en el paquete EMBOSS [288].
40
[0203] Los ácidos nucleicos y polipéptidos de la invención pueden tener, además, otras secuencias a la N-terminal / 5' y / o C-terminal / 3' de estas secuencias (a) a (d).
[0204] La práctica de la presente invención empleará, a menos que se indique lo contrario, procedimientos convencionales de química, bioquímica, biología molecular, inmunología y farmacología, dentro de la experiencia de 45 la técnica. Dichas técnicas se explican completamente en la bibliografía. Véase, por ejemplo, las referencias 289-296, etc.
EXPERIMENTAL
50
[0205] A continuación se presentan ejemplos de formas de realización o formas específicas de llevar a cabo la presente invención. Los ejemplos se ofrecen sólo a efectos ilustrativos.
[0206] Se han hecho esfuerzos para asegurar la precisión con respecto a los números utilizados (por ejemplo, cantidades, temperaturas, etc.), pero algunos errores y desviaciones experimentales deberían, por supuesto, 55 permitirse.
Modos de llevar a cabo la invención
Cepa MNEC IHE3034 60
[0207] IHE3034 es una cepa de E. coli conocida del patotipo MNEC. La Tabla 1 de referencia 297 informa de que IHE3034 está clasificado como serotipo 018:K1:H7/9 y se coloca en el grupo B2 ECOR. Genes conocidos de virulencia asociada en elementos horizontalmente transferidos de ADN son sfall, ibeA, iro, kps (grupo II), y fyuA malX. También lleva la codificación de grupo de genes cdt para la toxina de hinchamiento citoletal. 65
[0208] La secuenciación de cepa K1 de E. coli IHE3034 llevó a 283 contigs. El análisis de la secuencia del genoma de la cepa K1 de E. coli IHE3034 ha identificado 4995 marcos de lectura abiertos (ORF), que se denominan por la nomenclatura ORFnnnnn, donde nnnnn es un número entre 00001 y 04995. Las secuencias de estos ORFs se dan como SEQ ID NOs: 1 a 9990, con SEQ ID NOs impares, siendo secuencias de ADN, y los identificadores de número par que son secuencias de aminoácidos. La numeración nnnnn se puede convertir en la SEQ ID NO: numeración de 5 la lista de secuencias de la siguiente manera: para una secuencia de aminoácidos, SEQ ID NO: = nnnnn x 2; para una secuencia de nucleótidos, SEQ ID NO: = [nnnnn x 2] - 1. Por lo tanto ORF01234 se encuentra como SEQ ID NOs: 2467 y 2468, como se muestra en la Tabla 1.
[0209] Anotación funcional inicial de los ORF 4995 se da en la Tabla 1. 10
[0210] La Tabla 3 muestra los ORF que tienen baja homología con los ORF de cepas comensales (1194 en total). Estos ORFs pueden dar especificidad de cepas patológicas de E. coli frente a cepas comensales, tanto en relación con las pruebas de ácidos nucleicos y en relación a reactividad cruzada inmunológica. Las islas de patogenicidad potenciales se encuentran en los rangos de ORF00028-70, ORF000330-353, ORF00655-687, ORF00883-910, 15 ORF01031-1058, ORF1078-1119, ORF1186-1228, ORF01313-1376, ORF01479-1514, ORF01523-1543, ORF01550-1578, ORF01810-1865, ORF02295-02315, ORF02351-2375, ORF02382-2405, ORF02436-2472, ORF02788-02816, ORF02844-2891, ORF03011-3056, ORF03340-3365, ORF03499-3522, ORF04416-4439, ORF04661-4679, ORF04915-4930, y ORF04946-4966.
20
[0211] Sobre la base de diversos criterios aplicados por los inventores, un subconjunto de 142 de los 4995 ORFs (2,8%) se ha seleccionado para uso inmunogénico. Estos 142 ORF se enumeran en la Tabla 2. Los criterios para la selección del subconjunto incluyen, pero no se limitan a: baja homología con los ORF de cepas de E. coli comensales; longitud > 100aa; y localización celular apropiada (se muestra en la parte inferior de la Tabla 2).
25
[0212] Los genes que codifican estas 142 proteínas se clonan, expresados en bacterias (por ejemplo en un laboratorio no patógeno hospedante de E. coli, o en un Bacillus tales como B. subtilis o B.megaterium), purificado, y luego se utilizan para inmunizar a los animales de prueba (por ejemplo, ratones). El suero elevado en los ratones se analizó entonces en ensayos Western blot, ELISA y FACS, y se ensayaron adicionalmente tanto in vitro como in vivo. Experimentos in vitro adecuados incluyen la prueba de la capacidad de los anticuerpos para inducir la 30 destrucción bacteriana mediada por complemento y / o actividad opsonofagocitosis, para bloquear la unión de las cepas MNEC (o el antígeno purificado) a las células epiteliales humanas u otras líneas celulares, y / o para inhibir la adhesión / invasión de bacterias de E. coli (por ejemplo, cepa K1) a las células endoteliales microvasculares del cerebro (BMEC). Experimentos adecuados in vivo para probar la eficacia contra bacteriemia y meningitis incluyen inmunizaciones activas y / o pasivas sistémicas y desafío en ratas de 5 días de edad con la cepa de E. coli K1, y la 35 inmunización y la infección intraperitoneal de ratones adultos con cepas MNEC."
[0213] La importancia de las proteínas con el ciclo de vida bacteriana se puede probar mediante la creación de mutantes knockout isogénicos. Los mutantes también se pueden utilizar para asegurar que los sueros planteados por un antígeno son específicos para ese antígeno. Microensayos se utilizan para estudiar patrones de expresión. 40 Conservación y / o variabilidad se evalúan mediante la secuenciación de los genes de múltiples cepas diferentes ExPEC.
[0214] Los ensayos se realizaron con el fin de seleccionar las proteínas expuestas en la superficie predicha, que son específicos para las cepas MNEC y ausentes en las cepas no patógenas (cepas comensales y de laboratorio). Una 45 vez seleccionadas estas proteínas se expresan y se purifican y se usan para inmunizar ratones.
[0215] Se conoce de referencia 43 que una mutación en cualquiera de los genes tol-pal de resultados de E. coli resulta en la formación de vesículas que contienen proteínas de la membrana externa nativa. Mediante la comparación de las proteínas presentes en las vesículas de cepas MNEC y cepas no patógenas que es posible 50 seleccionar un pequeño grupo de proteínas que podrían utilizarse como antígenos potenciales.
Manipulación de genes mediada roja Lambda en E. coli comensales y patógenos
[0216] Este método es un método basado en PCR rápida utilizada para inactivar el gen tolR de cepas de E. coli del 55 tipo salvaje [298]. En pocas palabras, la primera etapa consiste en la amplificación de forma independiente de las regiones aguas arriba y aguas abajo del gen diana (tolR) y el cassette marcador de resistencia. Los dos productos de PCR obtenidos en la etapa 1 se mezclan con el productor de la amplificación del casete de AB en concentraciones equimolares y sometido a una segunda ronda de PCR (a tres vías PCR) para generar un cassette marcador de resistencia flanqueado por regiones aguas arriba y 500 pb corriente abajo (o más) homólogas para el 60 gen diana. En la tercera etapa, grandes cantidades (1 mg) del ADN lineal deseado están a electroporación en células competentes lambda-rojo.
Preparación de vesículas
65
1. Preparación de vesículas por precipitación con TCA
[0217] Medios de comunicación LB se inoculó con bacterias cultivadas en placas y se incubó durante la noche a 37 ° C bajo agitación suave. El cultivo se utilizó para inocular 200 ml de LB a OD600 0,1. Las bacterias se cultivaron a OD600 0,4 (o como se especifica). El cultivo se centrifugó durante 10 minutos a 4000 x g y el sobrenadante se filtró a través de un filtro de 0,22 mm para eliminar bacterias residuales.
5
[0218] Los mismos experimentos también se realizaron en condiciones de limitación de hierro mediante la adición de dipiridilo (0,25 mM) a los medios LB.
[0219] La precipitación se realiza añadiendo al sobrenadante de cultivo 10% final de una solución al 100% (w / v) TCA, 0,4% (w / v) de desoxicolato. Se dejó que la precipitación procediese durante 30 minutos a 4 ° C. El precipitado 10 se recuperó por 10 minutos de centrifugación a 20.000 x g a 4 ° C. El sedimento se lavó una vez con 10% TCA (w / v) y dos veces con etanol absoluto. El sedimento se secó con Speed Vac, y se almacenó a -20 ° C.
[0220] El tipo salvaje y cepas mutadas se sometieron a electroforesis en gel de poliacrilamida SDS a partir del cual se pudo observar que había muchas más bandas en el sobrenadante de las cepas mutadas que las cepas de tipo 15 salvaje. Bandas aleatoriamente escogidos demostraron que todas las proteínas en el sobrenadante eran proteínas de membrana.
2. Preparación de vesículas por ultracentrifugación
20
[0221] Sobrenadante de cultivo se ultracentrifugó a 200.000 x g durante 2 horas a 4 ° C. El sedimento se lavó con PBS, se resuspendieron en PBS, y se almacena a -20 ° C.
3. Desnaturalización de guanidinio de las vesículas
25
[0222] Antes de la desnaturalización de guanidinio, las vesículas se precipitaron con etanol. 10 µg de OMV en PBS fueron precipitado mediante la adición de etanol absoluto frío a 90% final. La precipitación se dejó proceder durante 20 minutos a -20°C. El precipitado se recupera por 10 minutos de centrifugación a 13.000 x g. El sedimento se resuspendió con 50 ml, 6 M de guanidina, 15M de DTT, 200 mM Tris-HCl, pH 8,0.
30
[0223] La desnaturalización se dejó proceder durante 60 minutos a 60 ° C. Antes de la digestión, la solución se diluyó 1/8 con una solución de 1,5 M Tris pH 8.0 y 5 mg de tripsina se añadieron a la solución diluida. La digestión se dejó proceder durante la noche a 37 ° C. La reacción se detuvo mediante la adición de 0,1% final de ácido fórmico. Los péptidos se extrajeron usando extracción de cartuchos Oasis. Los péptidos se analizaron por LC acoplados MS-MS. 35
4. Digestión de superficie
[0224] 5 mg de tripsina se añadieron a 10 mg de vesículas en PBS y se incubó a 37 ° C durante 3 horas. La reacción se detuvo mediante la adición de 0,1% final de ácido fórmico. Los péptidos se recuperaron por filtración a 40 través de un filtro de corte de 30 Kda y se extrajo con cartucho de extracción Oasis. Los péptidos se analizaron con LC acoplado de MSMS.
ANÁLISIS DE VESÍCULAS
45
La cuantificación de proteínas
[0225] Las proteínas se cuantificaron con el método de Bradford, utilizando BSA como estándar.
SDS-PAGE 50
[0226] Las muestras se analizaron con gel de poliacrilamida de dodecilsulfato de sodio (SDS) al 4-12%, utilizando un aparato de electroforesis Mini-Protean II. Las muestras se suspendieron en tampón de muestra SDS (0,06 M Tris-HCl pH 6,8, 10% (v / v) de glicerol, 2% (w / v) SDS, 5% (v / v) 2-mercaptoetanol, 10 mg / ml de azul de bromofenol) y se calentó a 100 ° C durante 5 min antes de SDS-electrophoreis gel de poliacrilamida. Después de la ejecución, 55 geles se tiñeron con azul de Coomassie MALDI-TOF espectrometría de masas.
[0227] Las bandas de proteínas o manchas se escindieron de los geles, se lavó con 50 mM de bicarbonato de amonio / acetonitrilo (50/50, v / v), y se secó con una centrífuga Speed-Vac (Savant). Las manchas secas se digirieron a 37 ° C durante 2 h mediante la adición de 7 a 10 ml de una solución que contiene bicarbonato de amonio 60 5 mM, 0,012 mg de tripsina de secuenciación grado. Después de la digestión 0,6 ml se cargaron en una matriz de pre-manchados objetivo y secadas al aire. Las manchas se lavaron con 0,6 ml de una solución de etanol al 70%, ácido trifluoroacético 0,1%. Los espectros de masas se adquirieron en un espectrómetro de masas ultraflex MALDI TOF. Los espectros se calibraron externamente mediante el uso de una combinación de estándares pre-manchado en el objetivo. La identificación de proteínas se llevó a cabo por ambas comparaciones automáticas y manuales de 65 picos monoisotópicos generados experimentalmente de péptidos en el intervalo de masa de 700 a 3000 Da con
huellas digitales generadas por ordenador, utilizando el programa Mascot™.
Electroforesis bidimensional
[0228] 200 mg de vesículas se resuspendieron en una solución de re-hinchazón de imobilina (urea 7M, tiourea 2M, 5 2% (w / v) CHAPS (2% w / v) de ASB 14, 2% (v / v) IPG tampón de pH 3-10 NL, 2 mM TBP, 65 mM DTT), y se adsorbió durante la noche en 7 cm de imobilina DryStrips (pH 3-10 NL). Las proteínas se separaron a continuación por electroforesis 2D. La primera dimensión se realizó utilizando una Unidad de Enfoque Isoeléctrica IPGphor, aplicando secuencialmente 150 V durante 35 minutos, 500 V durante 35 minutos, 1.000 V durante 30 minutos, 2.600 V durante 10 minutos, 3.500 V durante 15 minutos, 4.200 V durante 15 minutos, y finalmente 5.000 V para llegar a 10 10kVh. Para la segunda dimensión, las tiras se equilibraron por dos incubaciones de 10 minutos en 4 M de urea, 2 M tiourea, 30% de glicerol, 2% de SDS, 5 mM TBP, 50 mM Tris HCl pH 8,8, 2,5% de acrilamida, Bromo fenol azul 0,2%: Las proteínas se separaron en geles de poliacrilamida al 4-12% prefabricado lineales.
[0229] Los geles se tiñeron con azul de Coomassie coloidal y escaneados con un densitómetro personal SI. Las 15 imágenes se analizaron con el software Image Master™ 2D Elite.
Nano-LC / MS / MS
[0230] Los péptidos se separaron por nano-LC en un sistema de HPLC CapLC conectado a espectrómetro de masa 20 Q-ToF Micro ESI equipado con una fuente de nanopulverización. Las muestras se cargaron en una columna Atlantis C18 NanoEase (100 µm i.d. x 100 mm), a través de una columna de trampa C18 (300 µm i.d. x 5 mm). Los péptidos se eluyeron con un gradiente de 50 min desde 2% a 60% de 95% de ACN, en una solución de ácido fórmico al 0,1% a una velocidad de flujo de 400 nl / minuto. Los péptidos eluidos se sometieron a un programa automatizado dependiente de los datos de adquisición, utilizando el software MassLynx, versión 4.0, donde se utilizó una encuesta 25 de exploración MS para seleccionar automáticamente péptidos multi-cargada sobre el rango de m / z de 400-2,000 para fragmentación ulterior MS / MS. Hasta tres componentes diferentes se sometieron a fragmentación MS / MS simultáneamente. Después de datos de adquisición, los espectros individuales MS / MS se combinaron, se alisaron y se centroidaron por MassLynx. La búsqueda e identificación de péptidos se realizaron en modo batch con una versión con licencia de la MASCOT™ Los parámetros de búsqueda MASCOT™ fueron: (1) especies : ExPEC (2) 30 permitió número de divisiones perdidas (sólo para la digestión de tripsina): 6; (3) modificaciones variables posteriores a la traducción: la oxidación de metionina; (4) la tolerancia de péptidos: +500 ppm; (5) MS / MS tolerancia: +0,3 Da y (6): cargo péptido: de +1 a +4. En cuanto a la plataforma anterior, sólo éxitos significativos como se define por el análisis de probabilidad MASCOT™ se consideraron. Los umbrales de puntuación para la aceptación de la identificación de proteínas a partir de al menos un péptido se establecen en el MASCOT™ como 18 35 para la digestión de tripsina y 36 para la proteinasa de digestión K.
Resultados
[0231] Como resultado de los análisis anteriores, otros 10 antígenos se identificaron. A saber, orf03526 (SEQ ID. 40 No: 7051 + 7052), orf01339 (SEQ ID No: 2677 + 2678), orf00256 (SEQ ID No: 511 + 512), of01346 (SEQ ID No: 2691 + 2692), of04084 (SEQ ID No: 8167 + 8168), orf02374 (SEQ ID No: 4747 + 4748), orf03502 (SEQ ID No: 7003 + 7004), of02298 (SEQ ID No: 4595 + 4596), orf01228 (SEQ ID No: 2455 + 2456), orf01227 (SEQ ID No: 2453 + 2454), orf02314 (SEC ID Nº: 4627 + 4628) y orf02850 (SEQ ID NO: 5699 + 5700) Estos se enumeran en la Tabla 4, donde las identidades de estas proteínas a las proteínas en la cepa UPEC de CFT073 también se dan. 45
ANÁLISIS DE ANTÍGENOS
Modelo de ratón de infección sistémica
50
[0232] Para filtrar un gran número de antígenos seleccionados por el análisis comparativo del genoma entre cepas de E. coli patógenas y no patógenas, se ha establecido un modelo de protección basado en un ensayo de virulencia clásica.
[0233] El modelo experimental (inmunización e infección) utiliza ratones exógamas de 5 semanas de edad - CD1 55 que tienen el desafío de la inoculación intraperitoneal de la cepa virulenta de E. coli IHE3034. La dosis de exposición se ha determinado experimentalmente a medida que la cantidad de bacterias capaces de matar 80% de los ratones adultos dentro de las 72 horas y corresponde a 1x107 ufc / ratón para la cepa IHE3034.
[0234] Dos proteínas, descritas como factores de virulencia y antígenos protectores potenciales se utilizaron como 60 controles positivos. Estas proteínas son el IbeA [299] y el IroN (SEQ ID No: 2691, 2692 y refs 300,30). Las proteínas recombinantes se expresaron y se utilizaron en los ensayos de inmunización.
Protocolo de inmunización
65
[0235] Los ratones se inmunizaron tres veces por inyección subcutánea de 150 ml de solución de proteína usando
adyuvantes de freund, como se muestra en la tabla siguiente:
Ratones de control: Ratones imunizadas:
Día 0
75 µl de solución salina 75 µl de adyuvante completo de freund 75 µl de solución proteica (20 µg) 75 µl de adyuvante completo de freund
Día 21
75 µl de solución salina 75 µl de adyuvante incomoleto de freund 75 µl de solución proteica (20 µg) 75 µl de adyuvante incompleto de freund
Día 35
75 µl de solución salina 75 µl de adyuvante incompleto de freund 75 µl de solución proteica (20 µg) 75 µl de adyuvante incompleto de freund
[0236] Las muestras de sangre se recogen el día antes de la primera inmunización (suero preinmune), en el día 34 y 48 (días antes de la exposición). Los sueros de los animales inmunizados se ensayaron por Western blot y ELISA 5 para determinar el título de anticuerpos.
Reto
[0237] En el día cepa de E. coli 48 IHE3034 se sembró sobre placa de agar LB desde el almacén congelado y se 10 incubó durante la noche (ON) a 37 ° C en incubadora. En el día 49 de la placa de cultivo ON se utilizó para inocular 50 ml de medio LB para tener una O.D.600 = 0.1 y se cultivaron durante 1,5 horas a 37 ° C con agitación hasta que el cultivo bacteriano alcanza una O.D.600 = 0.6 correspondiente a 5x108 ufc / ml para la cepa IHE3034. El cultivo se diluye en solución fisiológica hasta que la concentración de las bacterias es 1x108 / ml (típicamente 2 ml de cultivo bacteriano se diluye en 8 ml de solución fisiológica) y se sembraron utilizando un método de recuento en placa 15 estándar para verificar el inóculo. 100 ml de la suspensión de células que contiene bacterias 1x107 IHE3034 se inyecta intraperitonealmente, usando una jeringa de 1 ml, para el control y ratones inmunizados. El número de muertes en cada grupo de animales a las 24, 48 y 72 horas después de la infección se registró.
[0238] La protección debida a la vacunación se evalúa por comparación de la supervivencia en el grupo vacunado y 20 la supervivencia en el grupo de control de ratones a las 72 horas desde el reto. El porcentaje de supervivencia en relación con los controles se calcula utilizando la fórmula:
Tasa de supervivencia en grupo de vacuna - Tasa de supervivencia en grupo de control
Tasa de superviviencia en grupo de control 25
Resultados
[0239] La inmunización se llevó a cabo como anteriormente con controles positivos IroN y IbeA. Como puede verse en las figuras 3 y 4, el % de supervivencia de los ratones después del reto con IHE3034 se incrementa después de 30 la inmunización ya sea con IroN o IbeA.
[0240] La inmunización se lleva a cabo entonces con inactivado por calor IHE3034. Como se puede ver en la Figura 1, el % de supervivencia de los ratones después de la provocación con IHE3034 se incrementó después de la inmunización con IHE3034 inactivado térmicamente. 35
[0241] La inmunización también se llevó a cabo con vesículas de IHE3034 ΔTol-R. Como puede verse en la Figura 2, el % de supervivencia de los ratones después del desafío con IHE3034 se incrementa después de la inmunización con IHE3034 ΔTol-R.
40
Estudios de inmunización
[0242] Los antígenos son seleccionados para combinar para dar una composición de la invención. Los ratones BALB / c se dividieron en nueve grupos y se inmunizaron como sigue:
45
Grupo
Composición inmunizante Ruta de entrega
1
Mezcla de antígenos (10-20 µg proteína/cada) + CFA (Adyuvante Completo de Freund) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
2
Mezcla de antígenos (5 µg /cada) +Al-hidróxido (200 µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
3
Mezcla de antígenos (10-20 µg proteína/cada) +CpG (10 µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
4
Mezcla de antígenos (10-20 µg proteína/cada) + Al-hidróxido Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
(200 µg) +CpG (10 µg)
5
CFA Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
6
Mezcla de antígenos (10-20 µg proteína/cada) + LTK63 (5 µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
7
Al-hidróxido (200 µg) + CpG (10 µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
8
CpG (10 µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
9
LTK63 (5µg) Intraperitoneal o intranasal o subcutáneo
[0243] Los ratones son inmunizados en intervalos de dos semanas. De dos a tres semanas después de la última inmunización, todos los ratones son desafíados con la cepa MNEC adecuada. Cuando se utiliza la inmunización de la mucosa (por ejemplo, intranasal), el modelo animal es también desafió por vía mucosa para poner a prueba el 5 efecto protector del inmunógeno mucosal. Inmediatamente antes de la exposición, los ratones se sangran para determinar el título de anticuerpos a los antígenos que se administran.
[0244] Para el reto del ratón, bacterias virulentas se cultivan en medios apropiados. Las bacterias se recogieron mediante centrifugación, volvió a suspenderse, y se diluye en serie para el inóculo de exposición. Ratones BALB / c 10 son desafiados y observados diariamente durante 30 días después de la exposición.
[0245] Subtipos IgG total e IgG1 / IgG2a se pueden medir en los sueros de ratón como resultado de los diferentes regímenes de inmunización mediante el uso de un ensayo ELISA en bacterias enteras y en proteínas recombinantes purificadas. Además, la evaluación de antígeno específico de CD4 + y CD8 + TH células en células de bazo y / o 15 PBMC aisladas de ratones inmunizados se pueden llevar a cabo mediante análisis FACS de multiparamétrico, para evaluar los perfiles de expresión de citoquinas de las células T específicas de antígeno. En particular la producción de IFN-γ y IL-5 puede medirse después de la estimulación in vitro de células T con antígenos purificados. Además, los esplenocitos y / o PBMC de ratones inmunizados con cada formulación de antígeno / vacuna puede ser recogido 10-12 días después de la última dosis de inmunización y se estimularon con las bacterias MNEC. Después de 4 20 horas de estimulación, se añade Brefeldina a las células durante las siguientes 12 horas, para bloquear la secreción de citoquinas. Después las células se fijaron y se tiñeron con anticuerpos para detectar células T específicas que expresan MNEC-IFN-γ y IL-5.
[0246] Las células T pueden ser aisladas de linfocitos de sangre periférica (PBL) por una variedad de 25 procedimientos conocidos por los expertos en la técnica. Por ejemplo, las poblaciones de células T pueden ser enriquecidas de una población de PBL a través de la eliminación de células accesorias y B. En particular, el enriquecimiento de células T se puede lograr mediante la eliminación de las células no-T, usando anticuerpos de clase II monoclonales anti-MHC. Similarmente, otros anticuerpos pueden ser usados para agotar poblaciones específicas de células no-T. Por ejemplo, las moléculas de anticuerpo anti-Ig se pueden usar para agotar las células 30 B y las moléculas de anticuerpo anti-Macl se pueden utilizar para agotar los macrófagos.
[0247] Las células T pueden fraccionarse adicionalmente en un número de diferentes subpoblaciones mediante técnicas conocidas por los expertos en la técnica. Dos subpoblaciones principales pueden ser aisladas en base a su expresión diferencial de los marcadores de superficie celular CD4 y CD8. Por ejemplo, tras el enriquecimiento de las 35 células T como se ha descrito anteriormente, las células CD4 + puede enriquecerse utilizando anticuerpos específicos para CD4. Los anticuerpos se pueden acoplar a un soporte sólido tal como perlas magnéticas. Por el contrario, las células CD8 + se pueden enriquecer mediante el uso de anticuerpos específicos para CD4 (para eliminar las células CD4 +), o puede aislarse mediante el uso de anticuerpos CD8 acoplados a un soporte sólido. Linfocitos CD4 a partir de pacientes infectados por el MNEC se puede expandir ex vivo, antes o después de la 40 transducción.
[0248] Después de la purificación de las células T, las células T purificadas se pre-estimularon con diversas citoquinas, incluyendo, pero no limitándose a rIL-2, IL-10, IL-12 e IL-15, que promueven el crecimiento y la activación de los linfocitos. 45
[0249] Las células T MNEC-específicas, pueden activarse por los polipéptidos inmunogénicos descritos anteriormente. Células T MNEC-específicas pueden ser CD8 + o CD4 +. Células T CD8+ MNEC-específicas pueden ser linfocitos citotóxicos T (CTL), los cuales pueden matar células infectadas MNEC que exhiben cualquiera de los polipéptidos descritos anteriormente o fragmentos de los mismos, complejados con una clase de molécula MAC I. 50 Células T CD8+ clamidia específicas pueden ser detectadas por, por ejemplo, ensayos de liberación de 51Cr. Ensayos de liberación de 51Cr miden la capacidad de células T CD8+ MNEC específicas para lisar células diana que presenten uno o más de estos epítopos. Células T CD8+ MNEC específicas que expresan agentes antivirales, tales como IFN γ, también se contemplan en este documento y también se pueden detectar por métodos inmunológicos,
preferentemente por tinción intracelular para IFN gamma o citoquinas por igual después de la estimulación in vitro con uno o más de los anteriores descritos polipéptidos EMN. Células T CD4+ MNEC específicas se pueden detectar mediante un ensayo de proliferación linfocitaria. Ensayos de linfoproliferación miden la capacidad de las células T CD4+ MNEC específicas de proliferar como respuesta a uno o más de los polipéptidos descritos anteriormente.
5
TABLA F Anotación de ORF00001 a ORF04995
ORFnnnnn
SEQ ID NOs Anotación
ORF00001
1 y 2 Transferasa de fosfoglicerol I
ORF00002
3 y 4 Proteína 17.5K de operón primosomal (región intergénica mdob-dnac)
ORF00003
5 y 6 Proteína de replicación de ADN dnaC
ORF00004
7 y 8 Proteína primosomal I
ORF00005
9 y 10 probable proteína integral de membrana putativa Cj1165c
ORF00006
11 y 12 probable proteína integral de membrana putativa Cj1166c
ORF00007
13 y 14 Regulador transcripcional. Proteína de dominio de familia LuxR
ORF00008
15 y 16 Proteína activadora transcripcional bglJ
ORF00009
17 y 18 Proteína reductasa de hierro férrico fhuF [1.6.99.-]
ORF00010
19 y 20 Proteína de función desconocida (DUF1435) familia
ORF00011
21 y 22 Proteína hipotética conservada
ORF00012
23 y 24 ARN ribosomal de la subunidad pequeña de metiltransferasa C (AE005668) (2.1.1.521]
ORF00013
25 y 26 ADN polimerasa III, subunidad psi (HOLD) 12.7.7.7]
ORF00014
27 y 28 ribosomal-proteína-acetiltrarisferasa de alanina (riml [2.3.1.128]
ORF00015
29 y 30 HAD superfamilia (subfamilia IA) hidrolasa T1GR02254
ORF00016
31 y 32 Familia de integrasa de fago, recombinasa específica de sitio
ORF00017
33 y 34 proteína hipotética
ORF00018
35 y 36 proteína hipotética conservada
ORF00019
37 y 38 Proteína hipotética de región nin (cysD)
ORF00020
39 y 40 proteína hipotética
ORF00021
41 y 42 proteína hipotética conservada
ORF00022
43 y 44 Sb36
ORF00023
45 y 46 Sb36
ORF00024
47 y 48 proteína hipotética
ORF00025
49 y 50 proteína hipotética
ORF00026
51 y 52 proteína hipotética conservada
ORF00027
53 y 54 represor
ORF00028
55 y 56 Sb40
ORF00029
57 y 58 región de la inmunidad
ORF00030
59 y 60 proteína hipotética conservada
ORF00031
61 y 62 proteína de replicación
ORF00032
63 y 64 proteína hipotética
ORF00033
65 y 66 fago N-6-adenina-metiltransferasa [2,1.1.721
ORF00034
67 y 68 represor LexA
ORF00035
69 y 70 cruce de unión de endodeoxinbonucleasa [3.1,22.-1
ORF00036
71 y 72 Sb46
ORF00037
73 y 74 Proteína de función desconocida (superfamilia DUF1277)
ORF00038
75 y 76 Proteína de antiterminación homólogo de Q del profago lamboidea
ORF00039
77 y 78 proteína de lisis S.b1556
ORF00040
79 y 80 endolisina (lisozima) 13.2.1.171
ORF00041
81 y 82 proteína de lisis bacteriófago
ORF00042
83 y 84 proteína hipotética
ORF00043
85 y 86 Gifsy-2 de proteínas de profago
ORF00044
87 y 88 Terminasa de fago de subunidad grande (ACP)
ORF00045
89 y 90 proteína hipotética conservada
ORF00046
91 y 92 proteína portal fase, familia lambda
ORF00047
93 y 94 profago Gifsy-2 se asemeja a proteasa Clp
ORF00048
95 y 96 proteína hipotética conservada
ORF00049
97 y 98 -proteína transportadora como el azúcar Gifsy-2 profago de unión a ATP
ORF00050
99 y 100 profago de Glfsy 1 similar a la proteína de la cola menor Z
ORF00051
101 y 102 Proteína de la cola del fago menor U
ORF00052
103 y 104 componente de la cola putativo del profago CP-933K
ORF00053
105 y 106 proteína de la cola del fago menor G
ORF00054
107 y 108 proteína de la cola del fago de ensamblaje T
ORF00055
109 y 110 proteína de profago Gifsy-1
ORF00056
111 y 112 Proteína de la cola del fago menor
ORF00057
113 y 114 proteína de la cola del fago menor L
ORF00058
115 y 116 Componente putativo de fibra de cola K del profago
ORF00059
117 y 118 Componente putativo de fibra de cola K del profago
ORF00060
119 y 120 proteína de fago prop Gifsy-1
ORF00061
121 y 122 proteína de fago Gifsy-1
ORF00062
123 y 124 proteína de especificidad de huésped (parcial)
ORF00063
125 y 126 Lom
ORF00064
127 y 128 proteína hipotética conservada
ORF00065
129 y 130 proteína hipotética
ORF00066
131 y 132 proteína hipotética conservada
ORF00067
133 y 134 proteína hipotética conservada
ORF00068
135 y 136 proteína hipotética conservada
ORF00069
137 y 138 proteína relacionada a maturasa
ORF00070
139 y 140 proteína similar a Dinl Z3916-ECs3483 (AF175466)
ORF00071
141 y 142 cadena peptídica factor de liberación 3 (PRFC)
ORF00072
143 y 144 proteína precursora osmóticamente inducible Y
ORF00073
145 y 146 Proteína de función desconocida (DUF1328) familia
ORF00074
147 y 148 producto de proteína sin nombre
ORF00075
149 y 150 DNasa Mg dependiente
ORF00076
151 y 152 enzima activadora del piruvato de formato de liasa (ACT) [1.97.1.41
ORF00077
153 y 154 Proteína
ORF00078
155 y 156 proteína hipotética conservada
ORF00079
157 y 158 aldolasa de deoxribosa-fosfato (deoC) [4.1.2.4]
ORF00080
159 y 160 fosforilasa de timidina (TDRPASE)
ORF00081
161 y 162 fosfopentomutasa (DEOB) 15,4.2.71
ORF00082
163 y 164 fosforilasa de nucleósido de purina (deoD) [2.4.2.1]
ORF00083
165 y 166 proteína hipotética conservada
ORF00084
167 y 168 ligasa de lipoato-proteína A [6.3.4.-]
ORF00085
169 y 170 precursor de la proteína pmc
ORF00086
171 y 172 fosfatasa de fosfoserina (ser8) [3.1.3.3)
ORF00087
173 y 174 proteína de reparación del ADN RadA (RADA)
ORF00088
175 y 176 adeniltransferasa de nicotinamida-nucleótido 12.7.7.1]
ORF00089
177 y 178 proteína hipotética conservada
ORF00090
179 y 180 motivo de hélice-giro-hélice
ORF00091
181 y 182 proteína transportadora ABC de unión a ATP yjjK (atp_bind)
ORF00092
183 y 184 soluble en transglicosilasa mureiri lítico [3.2.1.-]
ORF00093
185 y 186 represor de operón trp (trpR)
ORF00094
187 y 188 proteína hipotética conservada TIGROO258
ORF00095
189 y 190 proteína de la familia de mutasa de fosfoglicerato, putativo [5.4.2.1]
ORF00096
191 y 192 Proteína de unión al origen derecho
ORF00097
193 y 194 proteína CreA
ORF00098
195 y 196 Proteína reguladora transcripcional CreB
ORF00099
197 y 198 sensor de proteína creC [2.7.3.-]
ORF00100
199 y 200 proteína de membrana interna CreD (AE005671)
ORF00101
201 y 202 Proteína de control aeróbico de la respiración Arca (proteína de resistencia del tinte) (arcA)
ORF00102
203 y 204 ARN metiltransferasa, familia TrmH, grupo 1
ORF00103
205 y 206 aspartoquinasa I, deshidrogenasa de homoserina I
ORF00104
207 y 208 quinasa de homoserina (thrB) [2,7-1,39]
ORF00105
209 y 210 sintasa de treonina (thrC) [4,2.3.1)
ORF00106
211 y 212 producto de proteína sin nombre; ORF_ID:0101#5
ORF00107
213 y 214 proteína hipotética conservada
ORF00108
215 y 216 UPF0246 proteínas yaaa
ORF00109
217 y 218 producto de proteína sin nombre (ORF8)
ORF00110
219 y 220 transaldolasa (TAL) [2.2.1.21
ORF00111
221 y 222 biosíntesis de proteínas mog molybdopterin
ORF00112
223 y224 proteína de la familia gprl-fun34-yaaH
ORF00113
225 y 226 producto de proteína sin nombre; ORF4
ORF00114
227 y 228 proteína hipotética conservada
ORF00115
229 y 230 proteína hipotética
ORF00116
231 y 232 proteína chaperona DNAK <(dnaK)
ORF00117
233 y 234 proteína chaperona DnaJ (dnaJ)
ORF00118
235 y 236 proteína relacionada con la proteína-gef
ORF00119
237 y 238 Proteína conservada putativa
ORF00120
239 y 240 Sulatasa, putativo
ORF00121
241 y 242 proteína hipotética conservada
ORF00122
243 y 244 Na + -H + detoxificador NhaA (nhaA)
ORF00123
245 y 246 Proteína activadora transcripcional Nhar
ORF00124
247 y 248 proteínas de biosíntesis de riboflavina RibF (ribF) [2.7.1.26 2.7.7.21
ORF00125
249 y 250 sintetasa isoleucil-ARNt (ileS) [6.1.1.5)
ORF00126
251 y 252 peptidasa señal de la lipoproteína (ISPA) [3.4.23.361
ORF00127
253 y 254 5.2.1.8 [5.2.1.8]
ORF00128
255 y 256 4-hidroxi-3-metilbut-2-reductasa de difosfato de enil (ISPH [1.17.1.2
ORF00129
257 y 258 hidrolasa de nucleósido de preferencia de inosina-ondina [3.2.-.-]
ORF00130
259 y 260 proteína hipotética DLJF805
ORF00131
261 y 262 reductasa de dihidrodipicolinato (dapB) 11.3.1.26]
ORF00132
263 y 264 sintasa de carbamoil-fosfato, subunidad pequeña (carA) [6.3.5.5]
ORF00133
265 y 266 sintasa de carbamoil-fosfato, subunidad grande (carB) [6.3.5.5]
ORF00134
267 y 268 Transposasa
ORF00135
269 y 270 Proteína activadora transcripcional caiF
ORF00136
271 y 272 proteína carnitina de operón caiE
ORF00137
273 y 274 echAl [5.-.-.-]
ORF00138
275 y 276 caiC (fadD) [6.3.2.-]
ORF00139
277 y 278 proteína de la familia CAIB-BAIF, putativo [2.8.3.-I
ORF00140
279 y 280 Crotonobetainil-C0A deshidrogenasa (Crotonobetainyl- CoAreductasa) (ACD) [1.3.99.-
ORF00141
281 y 282 L-carnitina-gamma-butirobetaína antiporter
ORF00142
283 y 284 flavoproteına de transferencia de electrones, subunidad beta, putativa
ORF00143
285 y 286 flavoproteına de transferencia de electrones, subunidad alfa, putativa
ORF00144
287 y 288 proteína FixC [1.5.5.-]
ORF00145
289 y 290 proteína similar a ferredoxina
ORF00146
291 y 292 transportador de azúcar, putativo
ORF00147
293 y 294 proteína accesoria del sistema de potasio-flujo de salida regulada por glutatión Keff (QUINONA) [1.6.99.2]
ORF00148
295 y 296 proteína del sistema de eflujo de potasio regulada por glutatión kefC (K (+) - H (+) antiporter)
ORF00149
297 y 298 reductasa de dihidrofolato (IOTA) [1.5.1.3]
ORF00150
299 y 300 antídoto CcdB CCDA
ORF00151
301 y 302 proteína similar a CcdB
ORF00152
303 y 304 proteína similar a CcdB
ORF00153
305 y 306 bis(5’-nucleosil)-tetraphosphatasa (simétrica) [3.6.1.41]
ORF00154
307 y 308 Proteína apaG (AJ012295)
ORF00155
309 y 310 transferasa dimetiladesnosina (ksgA [2.1.1.-]
ORF00156
311 y 312 4-hidroxitreonina-4-fosfato deshidrogenasa (pDXA
[1.1.1.262
ORF00157
313 y 314 proteínas precursoras surA de supervivencia (peptidil-prolil cis-trans isomerasesurA) (PPlasa) (rotamasa C) (PPlasa [52.1.8]
ORF00158
315 y 316 Precursor de la proteína de tolerancia disolvente orgánico
ORF00159
317 y 318 Precursor de la proteína de tolerancia disolvente orgánico
ORF00160
319 y 320 proteína similar a AdnJ (AEO05182)
ORF00161
321 y 322 sintasa A de ribosomal de pseudouridina de subunidad grande
ORF00162
323 y 324 proteína asociada a la polimerasa ARN (HEPA 13.6.1-1
ORF00163
325 y 326 proteína hipotética
ORF00164
327 y 328 ADN polimerasa II
ORF00165
329 y 330 L-ribulosa-5-fosfato de 4-epimerasa (Arad [5.1.3.4]
ORF00166
331 y 332 Isomerasa L-arabinosa (araA [5.3.1.4]
ORF00167
333 y 334 L-ribuloquinasa (araB [2.7.1.16]
ORF00168
335 y 336 regulador transcripcional, AraC familia
ORF00169
337 y 338 proteína hipotética conservada
ORF00170
339 y 340 proteína de membrana integral de la familia dedA
ORF00171
341 y 342 transportador de proteína de tiamina ABC de unión a ATP
ORF00172
343 y 344 transportador ABC de tiamina-pirofosfato de tiamina, proteínas de permeasa (thiP]
ORF00173
345 y 346 Transportador ABC de tiamina-pirofosfato de tiamina, proteína de unión de thiamin-tiamina pirofosfato (thiB)
ORF00174
347 y 348 Bacteriana extracelular de unión a proteínas soluto-familia 5 familia
ORF00175
349 y 350 3-isopropilmalato deshidratasa subunidad pequeña (Leud [4.2.1.331
ORF00176
351 y 352 3-isopropilmalato deshidratasa subunidad grande (LEUC [4.2.1.331
ORF00177
353 y 354 3-isopropilmalato deshidrogenasa (leuB [1.1.1.851
ORF00178
355 y 356 2-isopropilmalato sintasa (leuA [2.3.3.13
ORF00179
357 y 358 proteína LeuO
ORF00180
359 y 360 acetolactato sintasa de tipo subunidad grande biosintética (ilvB [2.2.1.6]
ORF00181
361 y 362 acetolactato sintasa subunidad pequeña (ilvN [2.2.1.61
ORF00182
363 y 364 represor transcnptional del operón fru y otros
ORF00183
365 y 366 proteína Mraz (Mraz
ORF00184
367 y 368 S-adenosil-metiltransferasa MraW (mraW [2.1.1.-
ORF00185
369 y 370 ftsL proteína de división celular
ORF00186
371 y 372 precursor de sintetasa FTSL peptidoglicano (PBP [2.4.1.1291
ORF00187
373 y 374 UDP-N-acetilmuramiolalany-D-glutamato-2,6- ligasa diminopimelato
ORF00188
375 y 376 UDP-N-acetilmuramiolalanil-D-glutamil-2, 6- ligasa D-alanil-D-alanil (MuRF [6.3.2.10 - diaminopimelato
ORF00189
377 y 378 fosfo-N-acetilmuramoil-pentapéptido-transferasa (MRAV [2.7.8.131
ORF00190
379 y 380 IJDP-N-acetilmuramiolalanina - D-glutamato de la ligasa (Murd [6.3.2.9
ORF00191
381 y 382 proteína de división celular FTSW
ORF00192
383 y 384 undecaprenildifosfo-muramoilpentapéptido beta- Nacetilglucosaminiltransferasa (murG) [2.4.1.227]
ORF00193
385 y 386 UDP-N-acetilmuramato - ligasa alanina (MURC [6.3.2.81
ORF00194
387 y 388 D-alanina - D-alanina ligasa B (ddlB [6.3.2.4
ORF00195
389 y 390 Acetolactato sintasa isozima III subunidad grande [4.1.3.18
ORF00196
391 y 392 acetolactato sintasa, la subunidad pequeña (ilvN) (2.2.1.6]
ORF00197
393 y 394 represor de fructosa (represor-activador de catabolitos)
ORF00198
395 y 396 represor de fructosa (represor-activador de catabotitos)
ORF00199
397 y 398 Acetolactato sintasa isozima Ill subunidad grande [4.1.3.18]
ORF00200
399 y 400 Acetolactato sintasa, subunidad pequeña (ilvN) [2.2.1.6]
ORF00201
401 y 402 represor fructosa (represor-activador de catabolitos)
ORF00202
403 y 404 D-alanina-D-alanina ligasa B (ddIB) (6.3,2.4]
ORF00203
405 y 406 proteína de división celular ftsQ
ORF00204
407 y 408 proteína de división celular FtsA (FtsA)
ORF00205
409 y 410 proteína de división celular FtsZ
ORF00206
411 y 412 UDP-3-0-acil N-acetilglucosamina desacetilasa (lpxC) [3.5.1.-]
ORF00207
413 y 414 precursor del monitor de secreción
ORF00208
415 y 416 proteína secA
ORF002O9
417 y 418 translocasa preproteína, subunidad SecA (secA)
ORF00210
419 y 420 proteína mutadora mutT (mutT) [3.6.1.-)
ORF00211
421 y 422 UPF0243 proteína relacionada con la proteína yacG zinc vinculante
ORF00212
423 y 424 UPF0289 proteína hipotética yacF
ORF00213
425 y 426 defosfo-CoA quinasa (coaE) [2.7.1.24]
ORF00214
427 y 428 reductasa guanosina monofosfato (guaC) [1.7.1.7)
ORF00215
429 y 430 proteína de transporte de proteínas hofC (MTB)
ORF00216
431 y 432 proteína de transporte de proteínas hofB (MTB)
ORF00217
433 y 434 peptidasa prepilin dependiente de la proteína precursora D
ORF00218
435 y 436 pirofosforilasa nicotinato-nucleótido (NADC) [2.4.2.19]
ORF00219
437 y 438 AmpD proteína (ampD)
ORF00220
439 y 440 regula ampC
ORF00221
441 y 442 Proteína aromática de transporte de aminoácidos aroP (permeasa general aromático de aminoácidos)
ORF00222
443 y 444 proteína específica uropatógeno
ORF00223
445 y 446 producto de proteína sin nombre; 9 bp supresión en el fin 3’ OrfU2
ORF00224
447 y 448 proteína específica uropatógeno (parcial) [3.1.-.-]
ORF00225
449 y 450 producto de proteína sin nombre; OrfU3
ORF00226
451 y 452 producto de proteína sin nombre; OrfU1
ORF00227
453 y 454 Represor de complejo de piruvato deshidrogena
ORF00228
455 y 456 Componente piruvato deshidrogenasa E1 (Acee) [1.2.4.1]
ORF00229
457 y 458 piruvato deshidrogenasa dihidrolipoamida acetiltransferasa (ACEF) [2.3.1.121
ORF00230
459 y 460 deshidrogenasa dihidrolipoamida (LPDA) [1.8.1.41
ORF00231
461 y 462 proteína hipotética conservada
ORF00232
463 y 464 proteína hipotética
ORF00233
465 y 466 proteína hipotética
ORF00234
467 y 468 aconitato hidratasa 2 (ACNB) (4.2.1.3)
ORF00235
469 y 470 S-adenosilmetionina descarboxilasa proenzima
ORF00236
471 y 472 espermidina sintasa (SPEE) [2.5.1.16]
ORF00237
473 y 474 yacC
ORF00238
475 y 476 precursor de oxidasa de cobre azul cueO
ORF00239
477 y 478 glucosa deshidrogenasa
ORF00240
479 y 480 fosfonbosiltransferasa hipoxantina (HPT) [2.4.2.8]
ORF00241
481 y 482 Proteína yadF [4.2.1.1]
ORF00242
483 y 484 proteína de unión a ATP transportadora ABC
ORF00243
485 y 486 proteína de membrana transportadora integral ABC STY0195 (membrana)
ORF00244
487 y 488 sistema de fosfotransferasa-fructosa específica homólogo componente. (PTS) [2.7.1.69]
ORF00245
489 y 490 proteína de dominio de deacetilasa de polisacarida
ORF00246
491 y 492 aspartato 1-decarboxilasa (panD) [4.1.1.11]
ORF00247
493 y 494 transposasa
ORF00248
495 y 496 pantoate-beta-alanina ligasa (panC) [6.3.2.1]
ORF00249
497 y 498 hidroximetiltransferasa 3-metil-2-oxobutanoato (PAN B1f2. 1.2.111
ORF00250
499 y 500 precursor de proteína hipotética similar a fimbria yadC
ORF00251
501 y 502 yadK proteína
ORF00252
503 y 504 subfamilia de proteínas Fimbnal
ORF00253
505 y 506 proteína hipotética
ORF00254
507 y 508 precursor de proteína ujier de la membrana externa htrE
ORF00255
509 y 510 precursor de proteína chaperona ecpD
ORF00256
511 y 512 pilina chaperona ecpD2
ORF00257
513 y 514 2-amino-4-hidroxi-6-hidroximetildihidropteridina pirofosfoquinasa (popular) [2.7.6.3]
ORF00258
515 y 516 El poli (A) polimerasa (PAP) (plásmido de copia proteína número) (PAP) [2.7.7.19]
ORF00259
517 y 518 poli (A) polimerasa (PAP)
ORF00260
519 y 520 glutamato-tRNA ligasa homólogo yadB
ORF00261
521 y 522 proteína supresora de adnK
ORF00262
523 y 524 proteína de estimulación de la fermentación de azúcar (sfsA)
ORF00263
525 y 526 2-5 ARN ligasa
ORF00264
527 y 528 helicasa dependiente de ATP HrpB (hrpB)
ORF00265
529 y 530 proteína de unión de penicilina sintetasa peptidoglicano 1 B
ORF00266
531 y 532 proteína de unión a penicilina 1 B (MRCB)
ORF00267
533 y 534 precursor receptor Ferricromo-hierro (absorción férrica de hidroxamato)(receptor de hidroxamato férrico)
ORF00268
535 y 536 proteína de unión ATP de transporte de Ferricromo fhuC
ORF00269
537 y 538 precursor de la proteína de unión periplásmica de ferricromo
ORF00270
539 y 540 proteína de sistema de transporte de Ferricromo de permeasa fhuB (membrana)
ORF00271
541 y 542 glutamato-1-semialdehído-2,1-aminomutasa (hemL) [5.4.3.8]
ORF00272
543 y 544 H (+) - Cl (-) transportador de cambio clcA
ORF00273
545 y 546 proteína de la familia Hesb
ORF00274
547 y 548 proteína de membrana HesB
ORF00275
549 y 550 precursor de proteína de transporte de la vitamina B12 btuF (PBP)
ORF00276
551 y 552 nucleosidasa MTA-SAH
ORF00277
553 y 554 trifosfohidrolasa deoxiguanosinatifosfato, subfamilia putativa [3.1.5.1]
ORF00278
555 y 556 htrA producto (3.4.21.-]
ORF00279
557 y 558 regulador de diácido de carbohidratos
ORF00280
559 y 560 proteína hipotética UPF0325 yaeH
ORF00281
561 y 562 2,3,4,5-tetrahidropindina-26-dicarboxilato de N- succiniltransIerasa (dapD) (2.3.1.117]
ORF00282
563 y 564 proteína-P-11 undililtransferasa (glnD) (2.7.7.59]
ORF00283
565 y 566 metionina aminopeptidasa. tipo I (mapa) [3.4.11.18]
ORF00284
567 y 568 proteína hipotética conservada
ORF00285
569 y 570 30S proteína ribosomal S2
ORF00286
571 y 572 factor de elongación de la traducción Ts (tsf)
ORF00287
573 y 574 quinasa de uridilato (pyrH) [2.7.4.-]
ORF00288
575 y 576 factor de reciclaje de ribosoma (frr)
ORF00289
577 y 578 reductoisomerasa 5-fosfato de 1 desoxi-D-xilulosa (dx) [1.1.1.267]
ORF00290
579 y 580 undecaprenilo difosfato sintasa (uppS) (2.5.1.31]
ORF00291
581 y 582 citidililtransferasa fosfatidato (CDSA) [2.7.7.41]
ORF00292
583 y 584 metaloproteasas de zinc asociada a la membrana, putativo
ORF00293
585 y 586 precursor de proteína de membrana exterior yaeT (D15)
ORF00294
587 y 588 proteína similar a histona, ubicada en la membrana externa o
ORF00295
589 y 590 UDP-3-O- [3-hidroximinstoil] glucosamina N-aciltransferasa (IpxD) (2.3.1.-]
ORF00296
591 y 592 (3R) proteína deshidratasa portadora de acilo -hidroximinstol [4.2.1.-]
ORF00297
593 y 594 acil-[acil-portador-proteína] - UDP-N-acetilglucosamina O- aciltransferasa (IpxA) [2.3.1.129]
ORF00298
595 y 596 Lípido-A-disacárido sintasa (IpxB) [2.4.1.182]
ORF00299
597 y 598 ribonucleasa Hll (mhB) [3.1.26.4]
ORF00300
599 y 600 polimerasa ADN III subunidad alfa (dnaE) [2.7.7.7]
ORF00301
601 y 602 acetil-CoA carboxilasa, carboxilo transferasa, subunidad alfa (accA) 16.4.1.2]
ORF00302
603 y 604 Lisina descarboxilasa, constitutiva (ICIC) [4.1.1.18]
ORF00303
605 y 606 Lisina descarboxilasa, constitutiva (PMA) [4.1.1.18]
ORF00304
607 y 608 liasa lactoilglutationa
ORF00305
609 y 610 proteína del ciclo celular (lle)
ORF00306
611 y 612 proteína Rof
ORF00307
613 y 614 proteína citoplásmica putativa
ORF00308
615 y 616 proteína YaeQ
ORF00309
617 y 618 dominio hidrolasa de peptidil-ARNt, putativo
ORF0031O
619 y 620 precursor cutF proteína de homeostasis de cobre (lipoproteína)
ORF00311
621 y 622 proteína yaeF
ORF00312
623 y 624 sintetasa de prolil-ARNt (proS) [6.1.1.15]
ORF00313
625 y 626 UPF0066 proteína rcsF (orf3)
ORF00314
627 y 628 rcsF de proteínas
ORF00315
629 y 630 precursor de lipoproteína de unión metQ de D-metionina (hlpA)
ORF00316
631 y 632 metl proteína de sistema de transporte D-metionina permeasa (membrana)
ORF00317
633 y 634 D-metionina transportadora ABC, proteína de unión a ATP (metN)
ORF00318
635 y 636 producto de proteína sin nombre
ORF00319
637 y 638 proteína hipotética
ORF00420
6396640 2,5-diqueto-D-glucónico ácido reductasaB[orf267][1.1.1.274]
ORF00321
641 y 642 producto de proteína sin nombre; Muy similar a LysR regulador de la transcripcional familiar, proteína YafC de Escherichia coli (orf304)
ORF00322
643 y 644 producto de proteína sin nombre
ORF00323
645 y 646 metiltransferasa, familia UbiE-COQ5
ORF00324
647 y 648 precursor de transglicosilasa mureína lítica de unión a la membrana D (mureína hidrolasa D) (proteína reguladora dniR) [3.2.1.-]
ORF00325
649 y 650 hidrolasa de hidroxiacilglutationa [3.1.2.6]
ORF00326
651 y 652 proteína hipotética
ORF00327
653 y 654 proteína hipotética conservada
ORF00328
655 y 656 RNasa HI, se degrada el ARN de ADN-híbridos de ARN
ORF00329
657 y 658 polimerasa III ADN, subunidad de épsilon (dnaQ) (2.7.7.7]
ORF00330
659 y 660 precursor de la lipoproteína hipotética yafT
ORF00331
661 y 662 Aec32
ORF00332
663 y 664 Aec31
ORF00333
665 y 666 Aec30
ORF00334
667 y 668 Aec29
ORF00335
669 y 670 proteína hipotética
ORF00335
671 y 672 Aec28
ORF00337
673 y 674 Aec27
ORF00333
675 y 676 Aec26
ORF00339
677 y 678 Aec25
ORF00340
679 y 680 Aec24
ORF00341
681 y 682 Aec23
ORF00342
6836684 proteína hipotética
ORF00343
685 y 686 Aec22
ORF00344
687 y 688 Aec20
ORF00345
689 y 690 Aec19
ORF00346
691 y 692 Aec18
ORF00347
593 y 694 Aec17
ORF00348
695 y 696 Aec16
ORF00349
697 y 698 Aec15 (AF044503)
ORF00350
699 y 700 Aec14
ORF00351
701 y 702 Aec13
ORF00352
703 y 704 Transposasa (familia IS4)
ORF00353
705 y 706 Aec7
ORF00354
707 y 708 posible hidrolasa
ORF00355
709 y 710 proteína hipotética
ORF00356
711 y 712 precursor inhibidor de vertebrado lisozima
ORF00357
713 y 714 deshidrogenasa AciI-CoA (EC 1.3.99.-). [1.3.99.-]
ORF00358
715 y 716 isomerasa fosfoheptosa (gmhA) [5.-.-.-]
ORF00359
717 y 718 proteína bacteriana de función desconocida superfamilia (DUF949)
ORF00360
719 y 720 amidotransferasa glutamina predicha
ORF00361
721 y 722 proteína hipotética conservada
ORF00362
723 y 724 precursor de la lipoproteína hipotética yafL
ORF00363
725 y 726 Proteína de función desconocida (DUF1568) proteína de dominio
ORF00364
727 y 728 proteína FhiA
ORF00365
729 730 proteína MbhA
ORF00366
731 y 732 ADN polimerasa IV (Pol IV) [2.7.7.7]
ORF00367
733 y 734 proteína de la familia de prevención de huésped-muerte
ORF00368
735 y 736 producto de proteína sin nombre
ORF00369
737 y 738 acetiltransferasa hipotética yafP [2.3.1.-]
ORF00370
739 y 740 proteína conservada sin caracterizar, familia RtcB-UPF0027 CAC3383
ORF00371
741 y 742 cadena de péptido homólogo de factor de liberación (RF)
ORF00372
743 y 744 arninoacil-histidina de dipeptidasa pepD
ORF00373
745 y 746 xantina-guanina fosforribosiltransferasa (XGPRT) [2.4.2.22]
ORF00374
747 y 748 Hidrolasas de la superfamilia de alfa-beta
ORF00375
749 y 750 proteína activadora de la transcripción de genes curlin
ORF00376
751 y 752 Precursor proteínas de membrana externa de poro E
ORF00377
753 y 754 glutamato 5-quinasa (proB) [2.7.2.11]
ORF00378
755 y 756 reductasa gamma-glutamil fosfato (proA) [1.2.1.41]
ORF00379
757 y 758 HTH-tipo regulador transcripcional prsX
ORF00380
759 y 760 Proteasa hemoglobina
ORF00381
761 y 762 InsA
ORF00382
763 y 764 InsB
ORF00383
765 y 766 proteína hipotética conservada
ORF00384
767 y 768 YagU
ORF00385
769 y 770 familia de proteínas no caracterizada (UPF0153) superfamilia
ORF00386
771 y 772 proteína hipotética conservada
ORF00387
773 y 774 proteína hipotética conservada
ORF00388
775y776 proteína hipotética conservada
ORF00389
777 y 778 proteína hipotética conservada
ORF00390
779 y 780 precursor de MatB
ORF00391
781 y 782 regulador transcripcional. proteína de dominio de familia LuxR
ORF00392
783 y 784 proteína ribosomal L36 (rpmJ)
ORF00393
785 y 786 proteína de la cola
ORF00394
787 y 788 Sb24
ORF00395
789 y 790 proteína de ensamblaje de fibras de la cola
ORF00396
791 y 792 T4-exclusión de proteínas gplBEGd
ORF00397
793 y 794 proteína hipotética
ORF00398
795 y 796 proteína hipotética
ORF00399
797 y 798 Dependiente de NADH de flavina oxidorreductasa, familia Oye [1.-.-.-]
ORF00400
799 y 800 proteína de dominio hidrolasa dlenelactona (AE000230)
ORF00401
801 y 802 regulador de la transcripción, LysR familia Atu5241
ORF00402
803 y 804 regulador de la transcripción (familia LysR)
ORF00403
805 y 806 oxidorreductasa, la familia de reductasa aldo-ceto
ORF00404
807 y 808 2,5-diceto-D-glucónico reductasa ácido A [1.1.1-]
ORF00405
809 y 810 adhesina putativa
ORF00406
811 y 812 regulador transcripcional hipotético ykgA
ORF00407
813 y 814 2,5-diceto-D-glucónico reductasa ácido A
ORF00408
815 y 816 MC21
ORF00409
817 y 818 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1471)
ORF0041O
819 y 820 piridina oxidorreductasa nucleótido-disulfuro 11.16.1.11
1ORF00411
821 y 822 regulador transcripcional hipotético ykgO
ORF00412
823 y 824 proteína de dominio rica en cisteina
ORF00413
825 y 826 proteína de unión de hierro-azufre
ORF00414
827 y 828 Sin caracterizar ACR, la familia YkgG familia COG1556
ORF00415
829 y 830 proteína hipotética
ORF004dieciséis
831 y 832 proteína del dominio de barril de membrana externa autotransportadora
ORF00417
833 y 834 proteína hipotética conservada
ORF00418
835 y 836 proteína hipotética conservada
ORF00419
837 y 838 Tipo 1 proteína reguladora fimbriae fimB
ORF00420
839 y 840 deshidrogenasa de colina (betA) [1.1.99.1]
ORF00421
841 y 842 deshidrogenasa de betaína de aldehído (betB) [1.2.1.8]
ORF00422
843 y 844 betl proteína reguladora (U73857)
ORF00423
845 y 846 proteína de transporte de colina de alta afinidad
ORFO0424.
847 y 848 proteína de dominio EAL
ORF00425
849 y 850 allS
ORF00426
851 y 852 proteína del sistema de glutatión-regulada de potasio-eflujo
ORF00427
853 y 854 proteína de dominio de repetición anquirina
ORF00428
855 y 856 proteína hipotética conservada
ORF00429
857 y 858 YahF proteína similar de FdrA
ORF00430
859 y 860 YahG proteína similar de YIbE
ORF00431
861 y 862 Carbamato proteína de quinasa yahl [2.7.2.2]
ORF00432
863 y 864 deaminasa de citosina
ORF00433
865 y 866 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF984)
ORF00434
867 y 866 transportador ABC, la proteína de unión al sustrato [azúcar] (AE005211)
ORF00435
869 y 870 transportador de ribosa ABC (proteína de unión ATP)
ORF00436
871 y 872 transportador de ribosa ABC, proteína de permeasa, putativo
ORF00437
873 y 874 transportador de azúcar ABC, subunidad de permeasa (permeasa)
ORF00438
875 y 876 oxidorreductasa, zinc vinculante [1.1.1.2]
ORF00439
877 y 878 transportador similar a RHTC STY0397 (RHTC)
ORF00440
879 y 880 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1471)
ORF00441
881 y 882 proteína reguladora del catabolismo de propionato operón PrpR (prpR)
ORF00442
883 y 884 proteína hipotética
ORF00443
885 y 886 regulador de operón prp
ORF00444
887 y 888 proteína hipotética
ORF00445
889 y 890 liasa de metilisocitrato (prpB) [4.1.3.30]
ORF00446
891 y 892 2-metilisocitrato sintasa (metilisocitrato sintasa)(sintasa de citrato 2) [2.3.3.5]
ORF00447
893 y 894 2-deshidratasa metilcitrato (prpD) [4.2.1.79]
ORF00448
895 y 896 propionato-CoA ligasa (prpE) [6.2.1.17]
ORF00449
897 y 898 transportador de citosina, putativo
ORF00450
899 y 900 desaminasa de citosina
ORF00451
901 y 902 Galactósido 0-acetiltransferasa [2.3.1.18]
ORF00452
903 y 904 Permeasa de lactosa (simporte Lactosa-protón)
ORF00453
905 y 906 Beta-galactosidasa (lacZ) [3.2.1.23]
ORF00454
907 y 908 regulador transcripcional, proteína de dominio de familia lacl, putativa
ORF00455
909 y 910 Arac-regulador transcripcional familiar
ORF00456
911 y 912 nucleoproteína-polinucleótido asociado a enzima
ORF00457
913 y 914 carboxilesterasa [3.1.1.1]
ORF00458
915 y 916 alcohol deshidrogenasa (similitud] (adhC)[1.-.-.-]
ORF00459
917 y 918 cadena de hélice alfa putativa
ORF00460
919 y 920 proteína hipotética conservada
ORF00461
921 y 922 Transferasa de nucleotydyl fosfato de azúcar
ORF00462
923 y 924 glucosaminiltransferasa
ORF00463
925 y 926 Proteína conservada putativa
ORF00464
927 y 928 transportador taurino ABC, proteína de unión periplásmica (tauA)
ORF00465
929 y 930 transportador taurino ABC, proteína de unión a ATP (cmpC)
ORF00466
931 y 932 sistema de transporte taurino de proteína de permeasa tauC
ORF00467
933 y 934 dioxigenasa taurina dependiente de alfa-cetoglutarato
ORF00468
935 y 936 deshidratasa del ácido delta-aminolevulínico (HemB) [4.2.1.24]
ORF00469
937 y 938 factor de virulencia Autotransportadora putativo-STY0405 (parcial)
ORF00470
939 y 940 proteína hipotética conservada
ORF00471
941 y 942 beta-lactamasa
ORF00472
943 y 944 proteína SbmA
ORF00473
945 y 946 lipoproteína, putativo
ORF00474
947 y 948 proteína hipotética conservada
ORF00475
949 y 950 proteína hipotética conservada
ORF00476
951 y 952 D-alanina - D-alanina Una ligasa (sintetasaA D-alanilalanina) (D- Ala-D-Ala ligasa A) [6.3.2.4]
ORF00477
953 y 954 proteína hipotética conservada
ORF00478
955 y 956 LD01705p
ORF00479
957 y 958 precursor de fosfatasa alcalina
ORF00480
959 y 960 inducido por el falta de fosfato
ORF00481
961 y 962 AdrA proteína (GGDEF)
ORF00482
963 y 964 pirrolina-5-carboxilato reductasa (proC) [1.5.1.2]
ORF00483
965 y 966 familia de proteínas de la familia Yail-YgxD
ORF00484
967 y 968 quinasa de siquimato (aroK) [2.7.1.71]
ORF00485
969 y 970 proteína hipotética conservada
ORF00486
971 y 972 proteína AroM
ORF00487
973 y 974 proteína no caracterizada conservada en bacteria
ORF00488
975 y 976 proteína hipotética conservada
ORF00489
977 y 978 proteína hipotética conservada
ORF00490
979 y 980 Proteína asociada de recombinación rdgC
ORF00491
961 y 982 posible regulador transcripcional similar a NAGC
ORF00492
983 y 984 transportador facilitador principal de familia
ORF00493
985 y 986 Exonucleasa sbcC (P-loop) [3.1.15.-]
ORF00494
987 y 988 exonucleasa SbcD (SbcD) [3.1.-.-]
ORF00495
989 y 990 proteína hipotética conservada
ORF00496
991 y 992 proteína reguladora de regulon fosfato transcripcional PhoB (phoB)
ORF00497
993 y 994 proteína de sensor de regulón de fosfato phoR
ORF00498
995 y 996 proteína hipotética
ORF00499
997 y 998 proteína hipotética conservada
ORF00500
999 y 1000 sistema de transporte de aminoácidos de proteínas II cámar de cadena ramificada (bmQ)
ORF00501
1001 y 1002 Permeasa de prolina-específica PROY
ORF00502
1003 y 1004 maltodextrina glucosidasa [3.2.1.20]
ORF00503
1005 y 1006 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF479
ORF00504
1007 y 1008 S-adenosilmetionina: ARNt ribosiltrarisferasa-isomerasa (queA) [5.-.-.-]
ORF00505
1009 y 1010 queuina ARNt-ribosiltranferasa (tgt) [2.4.2.29]
ORF00506
1011 y 1012 preproteína translocasa, YajC subunidad, proteína putativo
ORF00507
1013 y 1014 proteína de membrana de exportación de proteína secD
ORF00508
1015 y 1016 proteína de membrana de exportación de proteína secF
ORF00509
1017 y 1018 HNH endonucleasa de proteína de dominio
ORF00S1O
1019 y 1020 precursor tsx proteína formadora de canal de nucleósidos específica
ORF00511
1021 y 1022 proteína yajl
ORF00512
1023 y 1024 proteína hipotética conservadas TIGROO244
ORF00513
1025 y 1026 riboflavina de biosíntesis de proteínas RibD (ribD) [3.5.4.26 1.1.1.193]
ORF00514
1027 y 1028 6,7-dimetil-8-, sintasa ribitilumazina
ORF00515
1029 y 1030 factor de antiterminación de transcripción NusB (nusB)
ORF00516
1031 y 1032 tiamina-monofosfato quinasa (thil) [2.7.4.16]
ORF00517
1033 y 1034 Fosfatidyiglicerofosfatasa A
ORF00518
1035 y 1036 oxidorreductasa probable yajO [1.-.-.-]
ORF00519
1037 y 1038 1-deoxi-D-xilulosa-5-fosfato sintasa (dxs) [2.2.1.7]
ORF00520
1039 y 1040 Geraniltranstransferasa (farnesil-difosfato sintasa) (FPP sintasa) (ispA) [2.5.1.10]
ORF00521
1041 y 1042 exodeoxinbonucleasa VII, la subunidad pequeña (XseB) [3.1.11.6]
ORF00522
1043 y 1044 proteína hipotética
ORF00523
1045 y 1046 Tiamina de proteína de biosíntesis thil (thil)
ORF00524
1047 y 1048 4-metil-5 (B-hidroxietil) tiazol monofosfato enzima de la biosíntesis (ThiJ)
ORF00525
1049 y 1050 2-dehidropantoato 2-reductasa (panE) [1.1.1.169]
ORF00526
1051 y 1052 Proteína yajQ
ORF00527
1053 y 1054 proteína hipotética de transporte yajR
ORF00528
1055 y 1056 protoheme IX famesiltransferasa (cyoE) [2.5.1.-]
ORF00529
1057 y 1058 citocromo o oxidasa de ubiguinol subunidad C [1.10.3.-]
ORF00530
1059 y 1060 Citocromo c oxidasa subunidad III
ORF00531
1061 y 1062 Polipéptido ubiquinol oxidasa I (citocromo o subunidad 1) (BO oxidasa (3) subunidad 1) (citocromo oxidasa o ubiguinol subunidad 1) (Ubiguinol cadena oxidasa A) [1.10.3.-]
ORF00532
1063 y 1064 Precursor de ubiquinol oxidasa polipéptido II (osubunidad citocromo 2) (BO oxidasa (3) subunidad 2) (citocromo a ubiquinol oxidasasubunidad 2) (cadena oxidasa B ubiquinol) [1.10.3.-]
ORF00533
1065 y 1066 beta-lactamasa transductora de la señal de inducción AmpG
ORF00534
1067 y 1068 AmpG-señal del transductor
ORF00535
1069 y 1070 polimerasa-proteinasa putativa
ORF00536
1071 y 1072 proteína BolA
ORF00537
1073 y 1074 proteína hipotética conservada
ORF00538
1075 y 1076 factor desencadenante (TF) (tig)
ORF00539
1077 y 1078 proteína hipotética conservada
ORF00540
1079 y 1080 factor desencadenante (tig) [5.2.1.8]
ORF00541
1081 y 1082 Proteasa dependiente de ATP Clp, subunidad proteolítica ClpP (clpP) [3.4.21.92]
ORF00542
1083 y 1084 Proteasa dependiente de ATP Clp, subunidad de unión a ATP ClpX (clpX)
ORF00543
1085 y 1086 proteasa dependiente de ATP La (Ion) (3.4.21.53]
ORF00544
1087 y 1088 ADN-proteína de unión HU-beta, NS1 (HU)
ORF00545
1089 y 1090 Peptidil-prolil cis-trans isomerasa D (PPlasa D) (rotamasa D) [5.2.1.8]
ORF00546
1091 y 1092 proteína de la captación de ADN
ORF00547
1093 y 1094 tioesterasa predicha
ORF00548
1095 y 1096 proteína exsB
ORF00549
1097 y 1098 proteína hipotética conservada
ORF00550
1099 y 1100 Proteína Cbf
ORF00551
1101 y 1102 regulador transcripcional, familia ASNC
ORF00552
1103 y 1104 proteína de unión a ATP mdlA similar a resistencia de multidroga (atp)
ORF00553
1105 y 1106 resistencia a múltiples fármacos, como la proteína de unión a ATP Mdl
ORF00554
1107 y 1108 proteína de regulación de la actividad de glutamina sintetasa
ORF00555
1109 y 1110 transportador de amonio (AMT)
ORF00556
1111 y 1112 acil-CoA tioesterasa II (TESB) (3.1.2.-]
ORF00557
1113 y 1114 proteína hipotética
ORF00558
1115 y 1116 metabolismo de glicoproteína-polisacárido
ORF00559
1117 y 1118 cisteína metiltransferasa metilada predicha de ADN-proteína
ORF00560
1119 y 1120 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1428)
ORF00561
1121 y 1122 proteína de dominio EAL
ORF00562
1123 y 1124 proteína hipotética conservada
ORF00563
1125 y 1126 La maltosa 0-acetiltransferasa [2.3.1.79]
ORF00564
1127 y 1128 proteína hipotética
ORF00565
1129 y 1130 proteína Hha
ORF00566
1131 y 1132 YmoB
ORF00567
1133 y 1134 resistencia a la proteína B de acriflavina
ORF00568
1135 y 1136 resistencia a la proteína de acriflavina A precursor
ORF00569
1137 y 1138 acrR transcripcional reguladore de tipo HTH (acrAB potencial operonrepressor) (acrEF)
ORF00570
1139 y 1140 sistema de salida de potasio kefA
ORF00571
1141 y 1142 proteína hipotética conservada
ORF00572
1143 y 1144 proteína de replicación pnmosomal N
ORF00573
1145 y 1146 Proteína de función desconocida familia (DUF454)
ORF00574
1147 y 1148 proteína hipotética
ORF00575
1149 y 1150 fosfonbosiltransferasa adenina (apt) [2.4.2.7]
ORF00576
1151 y 1152 ADN polimerasa III, subunidades gamma y tau, programada (dnaX) (2.7.7.7]
ORF00577
1153 y 1154 proteína hipotética conservada TIGRO0103
ORF00578
1155 y 1156 proteína de recombinación RecR (recR)
ORF00579
1157 y 1156 Chaperona htpG proteína (proteína de choque térmico htpG) (temperature de proteína alta G) (proteína de choque térmico C62.5) (htpG)
ORF00580
1159 y 1160 quinasa de adenilato
ORF00581
1161 y 1162 ferroquelatasa (hemH) [4.99.1.1]
ORF00582
1163 y 1164 Esterasa de acetil [3.1.1.-]
ORF00583
1165 y 1166 lnosina-guanosina-quinasa [2.7.1.73]
ORF00584
1167 y 1168 RosB
ORF00585
1169 y 1170 proteína de resistencia de fosmidomicina (CAMPs)
ORF00586
1171 y 1172 proteína precursora ushA (Incluye: hidrolasa UDP-azúcar (UDP- difosfatasa azúcar) (pirofosfatasa UDP-azúcar); 5’-nucleotidasa (EC 3.1.3.5) (5'-NT)] (5-NT) [3.6.1.45]
ORF00587
1173 y 1174 proteína hipotética
ORF00588
1175 y 1176 proteína hipotética
ORF00589
1177 y 1178 ybaK-ebsC proteína (ybaK)
ORF00590
1179 y 1180 GumN superfamilia de proteínas
ORF00591
1181 y 1182 VCAO39I probable asesino de proteínas
ORF00592
1183 y 1184 producto de proteína sin nombre; Algunas similitudes con la virulencia proteína asociada a A (Vapa)
ORF00593
1185 y 1186 Cobre-transporte-ATPasa tipo P [3.6.1.-]
ORF00594
1187 y 1188 -K-3-tipo glutaminasa [3.5.1.2]
ORF00595
1189 y 1190 permeasa de proteína de aminoácidos de familia, putativo
ORF00596
1191 y 1192 Cu (l) regulador transcripcional responsivo (cueR)
ORF00597
1193 y 1194 proteína hipotética
ORF00598
1195 y 1198 lipoproteína, putativo
ORF00599
1197 y 1198 proteína similar a adhesina-invasina
ORF00600
1199 y 1200 proteína hipotética conservada
CRF00601
1201 y 1202 proteína de membrana
ORF00602
1203 y 1204 banda 7-Mec-2 proteína de familia
ORF00603
1205 y 1206 Transportador ABC, proteína de unión ATP
ORF00604
1207 y 1208 proteína de membrana, putativo
ORF0060S
1209 y 1210 proteína ybbN
ORF00606
1211 y 1212 oxidorreductasa, de cadena corta de familia deshidrogenasa-reductasa (DEG)
ORF00607
1213 y 1214 acil.coA tioesterasa I precursor [3.1.2.-]
ORF00608
1215 y 1216 Transportador ABC, proteína de unión a ATP
ORF00609
1217 y 1218 permeasa, dominio de proteína putativa
ORFOD610
1219 y 1220 YbbB
ORF00611
1221 y 1222 aIlS
ORF00612
1223 y 1224 hidrolasa ureidoglicolato (allA) [3.5.3.19]
ORF00613
1225 y 1226 regulador negativo de alantoína y operones de utilización de glioxilato (regulador transcripcional allR)
ORF00614
1227 y 1228 carboligasa de glioxilato (gd) [4.1.1.47]
ORF00615
1229 y 1230 isomerasa de hidroxipiruvato [5.3.1.22]
ORF00616
1231 y 1232 2-hidroxi-3-oxopropionato reductasa [1.1.1.60]
ORF00617
1233 y 1234 proteínas de familia de permeasa citosina-purina-uracilo-tiamina-alantoína, putativo
ORF00618
1235 y 1236 Alantoinasa [3.5.2.5]
ORF00619
1237 y 1238 purina-permeasa putativa ybbY
ORF00620
1239 y 1240 Quinasa de glicerato 1
ORF00621
1241 y 1242 GIxB6
ORF00622
1243 y 1244 Alantoato de amidohidrolasa (parcial)
ORF00523
1245 y 1246 Ureidoglicolato deshidrogenasa [1.1.1.1541
ORF00624
1247 y 1248 proteína FDRA
ORF00625
1249 y 1250 proteína hipotética conservada
ORF00626
1251 y 1252 Proteína de función desconocida (DUF1116) superfamilia
ORF00627
1253 y 1254 proteína hipotética conservada
ORF00628
1255 y 1256 carbamato quinasa (ARCC) [2.7.2.2]
ORF00629
1257 y 1258 carboxilasa fosforibosilaminoimidazol, subunidad ATPasa (Purk) [4.1.1.21]
ORF00630
1259 y 1260 carboxilasa fosforibosilaminoimidazol, subunidad catalítica (Puro) [4.1.1.21]
ORF00631
1261 y 1262 proteína hipotética conservada
ORF00632
1263 y 1264 hidrolasa UDP-2,3-diacilglucosamina (lpxH) [3.6.1.-]
ORF00633
1265 y1266 peptidil-prolil cis-trans isomerasa B (PPIB) [5.2.1.8]
ORF00634
1267 y 1268 cisteinil sintetasa-ARNt (cysS) [6.1.1.16]
ORF00635
1269 y 1270 hidrolasa predicha dependiente de metal de membrana (DUF457) de familia
ORF00636
1271 y 1272 proteína relacionada con el ACR sin caracterizar
ORF00637
1273 y 1274 5,10-metileno-tetrahidrofolato dehidrogenasa (folD) [1.5.1.5]
ORF00638
1275 y 1276 Profago DLP12 integrasa (profago QSR’ integrasa)
ORF00639
1277 y 1278 proteína hipotética conservada
ORF00640
1279 y 1280 Gp37
ORF00641
1281 y 1282 proteína hipotética conservada
ORF00642
1283 y 1284 Sb36
ORF00643
1285 y 1286 proteína hipotética conservada
ORF00644
1287 y 1288 proteína desconocida codificada por profago CP-933N
ORF00645
1289 y 1290 proteína de antiterminación Q
ORF00646
1291 y 1292 proteína desconocida codificada por profago CP-9330
ORF00647
1293 y 1294 ADN adenina-metilasa
ORF00648
1295 y 1296 proteína de lisis
ORF00649
1297 y 1298 proteína hipotética conservada
ORF00650
1299 y 1300 Proteína de función desconocida (DUF1327) superfamilia
ORF00651
1301 y 1302 Lisozima (proteína lisis) (Muramiclasa) (endolisina) [1.2.1.17]
ORF00652
1303 y 1304 proteína relacionada con lipoproteína RZL precursor
ORF00653
1305 y 1306 proteína de lisis bacteriófago
ORF00654
1307 y 1308 Bor homólogo de proteína de DLP12 profago lamboidea
ORF00655
1309 y 1310 proteína hipotética
ORF00656
1311 y 1312 Parcial de proteína de membrana Tonb similar codificado dentro de profago
ORF00657
1313 y 1314 proteína hipotética conservada
ORF00658
1315 y 1316 Terrninase subunidad pequeña (proteína de empaquetamiento del ADN NU1) (fragmento)
ORF00659
1317 y 1318 Fago terminasa subunidad grande (ACP)
ORF00660
1319 y 1320 gpW
ORF00661
1321 y 1322 proteína portal fago, familia lambda
ORF00662
1323 y 1324 cabeza-cola proteínas GP5 preconnector
ORF00663
1325 y 1326 lambda bactenofago proteína de decoración en la cabeza D
ORFD0664
1327 y 1328 Fago cápside principal proteína E
ORF00665
1329 y 1330 proteína de empaquetamiento del ADN Fl
ORF00666
1331 y 1332 Adjunto fago cabeza-cola
ORF00667
1333 y 1334 Profago cola menor proteína Z (GPZ)
ORF00668
1335 y 1336 Proteína de la cola del fago U menor
ORF00669
1337 y 1338 Principales proteínas de la cola V
ORF00670
1339 y 1340 proteína de cola del fago G menor
ORF0O671
1341 y 1342 proteína de la cola de menor importancia
ORF00672
1343 y 1344 cinta de longitud de la cola precursora de la proteína medida
ORF00673_
1345 y 1346 cola del fago de proteína cinta métrica, familia lambda
ORF00674
1347 y 1348 proteína de fago de cola menor L
ORF00675
1349 y 1350 componente de fibra de cola K del profago putativo
ORF00676
1351 y 1352 Bacteriófago lambda cola proteína de ensamblaje I
ORF00677
1353 y 1354 sede de la proteína de especificidad (parcial)
ORF00678
1355 y 1356 sede de la proteína de especificidad (parcial)
ORF00679
1357 y 1358 Lom
ORF00680
1359 y 1360 proteína hipotética conservada
ORF00681
1361 y 1362 proteína hipotética conservada
ORF00682
1363 y 1364 proteína hipotética conservada
ORF00683
1365 y 1366 proteína hipotética conservada
ORF00684
1367 y 1368 proteína de ensamblaje de cola de homólogo de fibras de profago lamboidea
ORF00685
1369 y 1370 proteinasa, putativo
ORF00686
1371 y 1372 precursor de la proteasa VII (Omptin) (protein3B membrana externa) (Proteasa A) (SOPA) [3.4.21.87]
ORF00687
1373 y 1374 Profago DLPI2 integrasa (integrasa profago QSR')
ORF00688
1375 y 1376 fibra de la cola de proteína de ensamblaje homólogo de lamboidea
ORF00689
1377 y 1378 precursor de la proteasa VII (Omptin) (protein3B membrana externa) (Proteasa A) (SOPA) [3.4.21.87]
ORF00690
1379 y 1380 proteína hipotética conservada
ORF00691
1381 y 1382 proteína de adsorción bacteriófago N4 precursor A
ORF00692
1383 y 1384 proteína de adsorción bacteriófago N4 NfrB
ORF00693
1385 y 1386 proteína hipotética
ORF00694
1387 y 1388 quinasa de sensor CuSS [2.7.3.-]
ORF00695
1389 y 1390 proteína reguladora transcripcional cusR
ORF00696
1391 y 1392 proteína del sistema de flujo de salida de cationes precursor cusC
ORF00697
1393 y 1394 proteína del sistema de cationes de flujo de salida precursor cusF
ORF00698
1395 y 1396 proteína del sistema de flujo de salida cusB catión precursor
ORF00699
1397 y 1398 proteína del sistema de flujo de salida cusA catión (CzcA)
ORF00700
1399 y 1400 permeasa-fenitalanina específica
ORF00701
1401 y 1402 transporte putativo
ORF00702
1403 y 1404 NAD oxígeno y minúsculas (P) H nitrorreductasa
ORF00703
1405 y 1406 proteína no caracterizada conservada en las bacterias
ORF00704
1407 y 1408 Proteína de función desconocida (DUF1 158) superfamilia
ORF00705
1409 y 1410 El glutamato-cisteína ligasa familia 2, putativo
ORF00706
1411 y 1412 4-fosfopanteteinil transferasa entD
ORF00707
1413 y 1414 precursor receptor ferrienterobactina
ORF00709
1415 y 1416 proteína hipotética conservada
ORF00709
1417 y 1418 esterasa enteroquelina
ORF00710
1419 y 1420 proteínas relacionadas con la proteína mbtH
ORF00711
1421 y 1422 enterobactina componente sintetasa F [2.7.7.-]
ORF00712
1423 y 1424 proteína de transporte FEMC enterobactina fepE (enteroquelina)
ORF00713
1425 y 1426 captación exoquelina férrica (fxuB)
ORF00714
1427 y 1428 captación exoquelina férrica (fxuA)
ORF00715
1429 y 1430 captación exoquelina férrica (fxuC)
ORF00716
1431 y 1432 proteína de membrana, putativo
ORF00717
1433 y 1434 enterobactina férrica (enteroquelina) proteína de unión; componente periplásmico
ORF00718
1435 y 1436 sintasa de isocorismato [5.4.99.6]
ORF00719
1437 y 1438 2,3-dihidroxibenzoato-AMP ligasa [2.7.7.58]
ORF00720
1439 y 1440 Isocorismatasa (isocorismato liasa) (2,3 dihidro- sintasa 2,3 dihidroxibenzoato) (Enterobactina sintetasa componente B) (Eriteroquelina sintasa B) (EntB) 13.3.2.1
ORF00721
1441 y 1442 oxidorreductasa, de cadena corta de la familia deshidrogenasa-reductasa [1.3.1.28]
ORF00722
1443 y 1444 Hipotética proteína UPF0152 ybdB (p15)
ORF00723
1445 y 1446 proteína de privación de carbono
ORF00724
1447 y 1448 pequeña proteína no caracterizada
ORF00725
1449 y 1450 glicerol deshidrogenasa [1.1.-.-]
ORF00726
1451 y 1452 aminotransferasa, clase I [2.6.1.-]
ORF00727
1453 y 1454 producto de proteína sin nombre; ORF_ID:0166#4
ORF00728
1455 y 1456 proteína hipotética conservada
ORF00729
1457 y 1458 regulador transcripcional hipotético ybdO (orf2)
ORF00730
1459 y 1460 Tiol: disulfuro proteína precursora de intercambio dsbG
ORF00731
1461 y 1462 alquilo hidroperóxido reductasa proteína c22 [1.6.4.-]
ORF00732
1463 y 1464 alquilo hidroperóxido de proteína reductasa F52A [1.6.4.-]
ORF00733
1465 y 1466 proteína de estrés universal G
ORF00734
1467 y 1468 quinasa reguladora de nucleósido de difosfato
ORF00735
1469 y 1470 Ribonucleasa I del precursor [3.1.27.6]
ORF00736
1471 y 1472 Citrato de cámar-transportador (antiporte)
ORF00737
1473 y 1474 trifosfonbosil-defosfo-CoA sintasa (citG) [2.7.8.25]
ORF00738
1475 y 1476 Apo-citrato liasa fosforribosil-transferasa dephospho-C0A (CitX) [2.7.7.-]
ORF00739
1477 y 1478 citrato liasa, subunidad alfa (CITF) [2.8.3.10]
ORF00740
1479 y 1480 citrato liasa, subunidad beta (CITE) [4.1.3.6]
ORF00741
1481 y 1482 citrato liasa proteína acilo cámar (CDTI)
ORF00742
1483 y 1484 ligasa citrato liasa (CITC) [6.2.1.221
ORF00743
1485 y 1486 Sensor quinasa dpiB
ORF00744
1487 y 1488 proteína reguladora transcripcional dpiA (desestabilizador de herencia de plasmidina)
ORF00745
1489 y 1490 transporte de dicarboxitatos
ORF00746
1491 y 1492 proteína CrcA
ORF00747
1493 y 1494 proteína fría similar al choque cspE
01F00748
1495 y 1496 Proteína crcB (crcB
01F00749
1497 y 1498 nitrilasa
ORF00750
1499 y 1500 proteína de translocasa de proteína tatA Sec-independiente (YIGT)
ORF00751
1501 y 1502 sintetasa de ácido lipoico (lipA)
ORF00752
1503 y 1504 lipoato-proteína de ligasa B (lipB)
ORF00753
1505 y 1506 proteína UPF0250
ORF00754
1507 y 1508 proteína de unión a la penicilina-5 (PBP) [3.4.16.4]
ORF00755
1509 y 1510 precursor lipoproteína rara A (rlpA)
ORF00756
1511 y 1512 proteína hipotética conservada
ORF00757
1513 y 1514 barra de proteína de forma determinante de RodA (rodA)
ORF00758
1515 y 1516 proteína de unión a la penicilina-2 (PBP-2) (PBP)
ORF00759
1517 y 1518 proteína de unión a la penicilina-2 (PBP-2) (PBP)
ORF00760
1519 y 1520 proteína hipotética conservada TIGR00246
ORF00761
1521 y 1522 producto de proteína sin nombre
ORF00762
1523 y 1524 fosfoglicerato mutasa proteína de la familia. putativo [3.1.3.73]
ORF00763
1525 y 1526 nicotinato (nicotinamida) nucleótido adeniltransferasa (NadD) [2.7.7.18]
ORF00764
1527 y 1528 ADN polimerasa III, la subunidad delta (holA) [2.7.7.7]
ORF00765
1529 y 1530 lipoproteína menor
ORF00766
1531 y 1532 leucil-ARNt sintetasa (LEU) [6.1.1.4]
ORF00767
1533 y 1534 proteína de quimiotaxis de aceptación de metil
ORF00768
1535 y 1536 inosina-uridina nucleósido N-nbohidrolasa (AL355920)
ORF00769
1537 y 1538 proteína gltL transporte de glutamato-aspartato de unión a ATP
ORF00770
1539 y 1540 sistema de transporte de glutamato-aspartato permeasa gltK proteínas (membrana)
ORF00771
1541 y 1542 sistema de transporte de glutamato-aspartato permeasa gltJ proteína
ORF00772
1543 y 1544 glutamato-aspartato transportador ABC, glutamato periplásmico aspartato proteína de unión, el truncamiento
ORF00773
1545 y 1546 familia familia romboide
ORF00774
1547 y 1548 Apolipoproteína N-aciltransferasa (ALP N- aciltransferasa) (proteína de cobre de homeostasis cutE) [2.3.1.-]
ORF00775
1549 y 1550 Magnesio y el flujo de salida de cobalto proteína corC (tlyC)
ORF00776
1551 y 1552 hidrolasa dependiente de metal-predicha
ORF00777
1553 y 1554 PhoH proteína similar
ORF00778
1555 y 1556 ARNt-i(6)A37 enzima de tiotransferasa MiaB (miaB)
ORF00779
1557 y 1558 2-octaprenil-3-metil-6-metoxi-1,4-benzoguinol hidroxilasa
ORF00780
1559 y 1560 Asparagina sintetasa B [glutamina-hidrolizante]
ORF007B1
1561 y 1562 proteína nagD, degenerado
ORF00782
1563 y 1564 represor de N-acetilglucosamina
ORF00783
1565 y 1566 N-acetilglucosamina-6-fosfato deacetilasa (Naga) [3.5.1.25]
ORF00784
1567 y 1568 isomerasa glucosamina-6-fosfato (nagB) [3.5.99.6]
ORF00785
1569 y 1570 sistema PTS, componente IIABC N-acetilglucosamina-específica (Ell-Nag) [2.7.1.69]
ORF00786
1571 y 1572 proteína de membrana, putativo
ORF00787
1573 y 1574 proteína hipotética
ORF00788
1575 y 1576 proteína hipotética
ORF00789
1577 y 1578 proteína hipotética
ORF00790
1579 y 1580 proteína TerC
ORF00791
1581 y 1582 proteína TerC
ORF00792
1583 y 1584 dihidrodipicolinato sintasa (AE004999) [4.2.1.52]
ORF00793
1585 y 1586 deshidrogenasa de alcohol putativa (U59485)
ORF00794
1587 y 1588 proteína de membrana interna putativa
ORF00795
1589 y 1590 4-hidroxitreonina-4-fosfato deshidrogenasa (pdxA) [1.1.1.262]
ORF00796
1591 y 1592 regulador de la transcripción del metabolismo del azúcar, putativo
ORF00797
1593 y 1594 glutaminil-ARNt sintetasa (glnS) [6.1.1.18]
ORF00798
1595 y 1596 proteína hipotética
ORF00799
1597 y 1598 producto de proteína sin nombre; ORF_ID:0172#6
ORF00800
1599 y 1600 lipoproteína hipotética precursor ybfN
ORF00801
1601 y 1602 proteína de regulación captación férrica (regulador de captación férrico)
ORF00802
1603 y 1604 flavodoxina 1
ORF00803
1605 y 1606 proteína relacionada a urea de amidoliasa
ORF00804
1607 y 1808 proteína relacionada a urea de amidoliasa
ORF00805
1609 y 1610 proteína de Sega
ORF00806
1611 y 1612 fosfoglucomutasa, alfa-D-glucosa fosfato-específico (PGM) [5.4.2.2]
ORF00807
1613 y 1614 Putrescina-ornitina detoxificadora (proteína transportadora de putrescina) (Pote)
ORF00808
1615 y 1616 ornitina descarboxilasa, inducible (speF) [4.1.1.17]
ORF00809
1617 y 1618 proteína hipotética conservada
ORF00810
1619 y 1620 proteína hipotética
ORF00811
1621 y 1622 kdpE
ORF00812
1623 y 1624 sensor histidina quinasa KdpD, putativo
ORF00813
1625 y 1626 K + ATPasa transportadora, subunidad C (kdpC) [3.6.3.12]
ORF00814
1627 y 1628 K + ATPasa -transportadora, subunidad B (kdpB) [3.6.3.12]
ORF00815
1629 y 1630 K + ATPasa -transportadora, subunidad A (kdpA) [3.6.3.12]
ORF00816
1631 y 1632 K + ATPasa -transportadora, subunidad F (kdpF) [3.6.3.12]
ORF00817
1633 y 1634 proteína hipotética conservada
ORF008I8
1635 y 1636 proteína no caracterizada conservada (orf169)
ORF00819
1637 y 1638 fotoliasa de deoxiribodipirimidina [4.1.99.3]
ORF00820
1639 y 1640 proteína de transporte PTR2 familiar STY0750
ORF00821
1641 y 1642 proteína hipotética conservada TIGR00486
ORF00822
1643 y 1644 proteína hipotética conservada TIGR00370
ORF00823
1645 y 1646 proteína relacionada a amidoliasa de urea
ORF00824
1647 y 1648 proteína de la familia LamB YcsF (lamB)
ORF00825
1649 y 1650 glicosilasa formamidopirimidina-ADN, putativo [3.2.-.-)
ORF00826
1651 y 1652 proteína de membrana, putativo
ORF00827
1653 y 1654 proteína ybgO
ORF00828
1655 y 1656 sintasa de citrato I (gltA) [2.3.3.1]
ORF00829
1657 y 1658 succinato deshidrogenasa citocromo b-556 de la subunidad (AF007569)
ORF00830
1659 y 1660 succinato deshidrogenasa proteína de anclaje de la membrana hidrófoba (SdhD) [1.3.99.1]
ORF00331
1661 y 1662 succinato deshidrogenasa, subunidad de flavoproteínas (sdhA)
ORF00832
1663 y 1664 succinato deshidrogenasa, proteína hierro-azufre [1.3.99.1]
ORF00833
1665 y 1666 2-oxoglutarato deshidrogenasa, componente (sucA) [1.2.4.2]
ORF00834
1667 y 1668 2-oxoglutarato deshidrogenasa, componente E2, dihidrolipoamida succiniltransferasa
(sucB) [2.3.1.61]
ORF00835
1669 y 1670 componente de succiniltransferasa dihidrolipoamida de 2- oxoglutarato deshidrogenasa complejo [2.3.1.61]
ORF00836
1671 y 1672 Succinil-CoA sintetasa cadena beta (SCS-beta) (sucC) [6.2.1.5]
ORF00837
1673 y 1674 sintetasa succinil-CoA, subunidad alfa (sucD) (6.2.1.5]
ORF00838
1675 y 1676 proteína no caracterizada, probablemente de superficie situada
ORF00839
1677 y 1678 proteína hipotética
ORF00840
1679 y 1680 citocromo d cadena ubiguinol oxidasa I (similitud] [1.10.3.-]
ORF00841
1681 y 1682 citocromo d ubiguinol oxidasa, subunidad II (cydB) [1.10.3.-]
ORF00B42
1683 y 1684 cyd proteína de operón YbgT relacionada con la proteína
ORF00843
1685 y 1686 cyd proteína de operón YbgE
ORF00844
1687 y 1688 tioesterasa predicha
ORF00845
1689 y 1690 proteína TolQ
ORF00846
1691 y 1692 proteína TolR (tolR)
ORF00847
1693 y 1694 proteína TolA
ORF00648
1695 y 1696 proteína TolA
ORF00849
1697 y 1698 tolB (tolB)
ORF00850
1699 y 1700 precursor de lipoproteína asociada a peptidoglican
ORF00851
1701 y 1702 proteína YbgF
ORF00852
1703 y 1704 complejo de sintetasa de quinolinato, subunidad A (NADA)
ORF00853
1705 y 1706 proteína pnuC
ORF00854
1707 y 1708 proteína de familia de salida de catión de (flujo de salida)
ORF00855
1709 y 1710 proteína hipotética conservada
ORF00856
1711 y 1712 fosfo-2-dehidro-3-deoxiheptonato aldolasa [2.5.1.54]
ORF00857
1713 y 1714 proteína hipotética
ORF00858
1715 y 1716 Fosfoglicerato de mutasa 1
ORF00859
1717 y 1718 Aldosa 1-epimerasa
ORF00860
1719 y 1720 galactoquinasa (galK) [2.7.1.6]
ORF00861
1721 y 1722 gatactosa-1-fosfato undililtransferasa (falT) [2.7.7.10]
ORF00862
723 y 1724 UDP-glucosa 4-epimerasa (galE) [5.1.3.2]
ORF00863
1725 y 1726 componente de unión a ATP del sistema de transporte de molibdato (Atp_bind)
ORF00864
1727 y 1728 proteína hipotética
ORF00865
1729 y 1730 La función de regulador transcripcional (modo)
ORF00866
1731 y 1732 proteína hipotética conservada
ORF00867
1733 y 1734 molibdato de transportadores ABC, proteína de unión a molibdato periplásmica (modA)
ORF00868
1735 y 1736 molibdato de transportadores ABC, proteína de permeasa (modB)
ORF00869
1737 y 1738 molibdato transportadores, proteína unión a ATP(modC)[3.6.3.29]
ORF00870
1739 y 1740 fosfatasa putativa
ORF00871
1741 y 1742 proteína hipotética conservada
ORF00872
1743 y 1744 proteína ybhD
ORF00873
1745 y 1746 proteína FldA
ORF00874
1747 y 1748 2-oxogiutarate-malato translocador homólogo YFIS (SODiTI)
ORF00875
1749 y 1750 aconitato hidratasa, putativo
ORF00876
1751 y 1752 posible precursor pectinesterasa
ORF00877
1753 y 1754 conservadas hipotética proteína TIGROO481
ORF00878
1755 y 1756 adenosilmetionina-8-amino-7-oxononanoato aminotransferasa (bioA) [2.6.1.62]
ORF00879
1757 y 1758 biotina sintasa (bioB) [2.8.1.61
ORF00880
1759 y 1760 8-amino-7-oxononanoato sintasa (bioF) [2.3.1.47]
ORF00881
1761 y 1762 biosíntesis de proteínas biotina BioC (bioC)
ORF00882
1763 y 1764 Detiobiotina sintetasa (DTBS)
ORF00883
1765 y 1766 Proteína de la cola del fago menor
ORF00884
1767 y 1768 Proteína de la cola del fago menor L
ORF00885
1769 y 1770 Putativa componente de fibra de cola K del profago
ORF00886
1771 y 1772 Menor precursor de la proteína de la cola H
ORF00887
1773 y 1774 Proteína de la cola del fago menor
ORF00888
1775 y 1776 Proteína cola del fago menor L
ORF00889
1777 y 1778 componente de la cola putativo del profago
ORF00890
1779 y 1780 proteína de la cola del fago menor L
ORF00S91
1781 y 1782 componente de la cola putativo del profago
ORF00892
1783 y 1784 Fago cola menor proteína L
ORF00593
1785 y 1786 Putativo componente de fibra de cola K del profago
ORF00894
1787 y 1788 Putativo componente de fibra de cola K del profago
ORF00895
1789 y 1790 Bacteriófago lambda cola proteína de ensamblaje I
ORF00896
1791 y 1792 sede de la proteína de especificidad (parcial)
ORF00897
1793 y 1794 proteína de cola de montaje
ORF00898
1795 y 1796 Bacteriófago lambda cola proteína de ensamblaje I
ORF00899
1797 y 1798 Proteína de especificidad de huésped (parcial)
ORF00900
1799 y 1800 Putativo componente de cola del profago (parcial)
ORF00901
1801 y 1802 proteína hipotética
ORF00902
1803 y 1804 proteína hipotética conservada
ORF00903
1805 y 1806 proteína hipotética conservada
ORF00904
1807 y 1808 proteína hipotética conservada
ORF00905
1809 y 1810 SitD proteína (AF128999)
ORF00906
1811 y 1812 SitC proteína (AF128999)
ORF00907
1813 y 1814 SitB proteína (AF128999)
ORF00908
1815 y 1816 proteína de unión periplásmica (quelado)
ORF00909
1817 y 1818 transposasa putativa
ORF00910
1819 y 1820 proteína hipotética conservada
ORF00911
1821 y 1822 dehidragenasa isocitrato [1.1.1.42]
ORF00912
1823 y 1824 proteína ydfO
ORF00913
1825 y 1826 regulador transcripcional hipotético ycgE
ORF00914
1827 y 1828 proteína hipotética conservada
ORF00915
1829 y 1830 Sensores de luz azul que utilizan la familia FAD
ORF00916
1831 y 1832 proteína de membrana probable b1168 (o528)
ORF00917
1833 y 1834 proteína hipotética conservada
ORF00918
1835 y 1836 proteína hipotética conservada
ORF00919
1837 y 1838 proteína hipotética conservada
ORF0092O
1839 y 1840 proteína hipotética conservada
ORF00921
1841 y 1842 componente putativo de unión a ATP de un sistema de transporte
ORF00922
1843 y 1844 factor de división celular de especificidad topológica MinE (minE)
ORF00923
1845 y 1846 inhibidor de la división celular MinD
ORF00924
1847 y 1848 proteína de cola de montaje
ORF00925
1849 y 1850 Proteína de especificidad de huésped J (parcial)
ORF00926
1851 y 1852 Proteína de especificidad de huésped (parcial)
ORF00927
1853 y 1854 excinucleasa ABC, subunidad B (uvrB)
ORF00928
1855 y 1856 proteína asociada a la membrana conservada no caracterizada
ORF00929
1857 y 1858 cofactor molibdeno biosíntesis proteína A
ORF00930-
1859 y 1860 cofactor molibdeno biosíntesis proteína B
ORF00931
1861 y 1862 cofactor molibdeno biosíntesis proteína C (moaC)
ORF00932
1863 y 1864 subunidad del factor de molibdopterina de conversión 1 (MPT)
ORF00933
1865 y 1866 subunidad del factor de molibdopterina de conversión 2
ORF00934
1867 y 1868 proteína hipotética conservada
ORF00935
1869 y 1870 proteína de membrana (SAD)
ORF00936
1871 y 1872 proteína hipotética
ORF00937
1873 y 1874 familia de proteínas no caracterizada UPF0005, putativo
ORF00938
1875 y 1876 proteína de membrana, putativo
ORF00939
1877 y 1878 proteína de la familia de fosfolipasa [2.7.8.-]
ORF00940
1879 y 1880 proteína de la familia endonucleasa-exonucleasa-fosfatasa
ORF00941
1881 y 1882 transportador ABC, proteínas permeasa, putativo
ORF00942
1883 y 1884 proteína hipotética conservada
ORF00943
1885 y 1886 ElsD (membrana)
ORF00944
1887 y 1888 Transportador ABC, proteína de unión a ATP-permeasa
ORF00945
1889 y 1890 proteína de membrana hipotética ybhG
ORF00946
1891 y 1892 regulador de la transcripción probable ybiH
ORF00947
1893 y 1894 Superfamilia II ADN y helicasas ARN
ORF00948
1895 y 1896 GTP ciclohidrolasa II (F160)
ORF00949
1897 y 1898 helicasa probablemente dependiente de ATP
ORF00950
1899 y 1900 proteína glicosil transferasa de familia (o320) [2.4.2.18]
ORF00951
1901 y 1902 YbiC (o361) [1.1.1.-]
ORF00952
1903 y 1904 Proteína de función desconocida (DUF1471) superfamilia
ORF00953
1905 y 1906 TraR
ORF00954
1907 y 1908 proteína de membrana externa regulada por hierro
ORF00955
1909 y 1910 transporte de hierro receptor dependiente de TonB XF0599 (III)
ORF00956
1911 y 1912 proteína hipotética
ORF00957
1913 y 1914 Proteína de función desconocida familia (DUF1471)
ORF00958
1915 y 1916 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF890)
ORF00959
1917 y 1918 proteína de transporte putativo
ORF00960
1919 y 1920 sistema de transporte de componente de unión a ATP de alta afinidad de glutamina (atp_bind)
ORF00961
1921 y 1922 aminoácido transportador ABC, permeasa de proteína de aminoácido
ORF00962
1923 y 1924 aminoácido transportador ABC, el aminoácido vinculante-permeasa proteína (GlnH)
ORF00963
1925 y 1926 regulador global, las condiciones de hambre
ORF00964
1927 y 1928 transportador, familia ACEA
ORF00965
1929 y 1930 proteína de la membrana externa X
ORF00966
1931 y 1932 Dca
ORF00967
1933 y 1934 mntR regulador transcripcional (regulador de transporte de manganeso)
ORF00968
1935 y 1936 transportador, familia NadC-P-Pho87, putativo
ORF00969
1937 y 1938 Proteína precursor ybiS
ORF00970
1939 y 1940 proteína transportadora ABC de unión a ATP
ORF00971
1941 y 1942 hidrolasa, haloacid familia similar a dehalogenasa
ORF00972
1943 y 1944 piruvato formiato-liasa [2.3.1.54]
ORF00973
1945 y 1946 Enzima de piruvato formiato-liasa de activación dependiente de hierro (pflC) [1.97.1.4)
ORF00974
1947 y 1948 transaldolasa, putativo
ORF00975
1949 y 1950 molibdopterina sintasa sulturilasa MoeB (moeB)
ORF00976
1951 y 1952 biosíntesis de proteínas molibdopterina moeA (moeA)
ORF00977
1953 y 1954 asparaginasa [3.5.1.1]
ORF00978
1955 y 1956 proteína hipotética transportadora ABC de unión a ATP en bcr 5’región. (D90720)
ORF00979
1957 y 1958 proteína de unión a hemo a precursor (lipoproteína de unión a la hemina).
ORF00980
1959 y 1960 ABC transportador de proteína permeasa (perrneasa)
ORF00981
1961 y 1962 péptido transportador ABC, proteína de permeasa
ORF00982
1963 y 1964 proteína de dominio EAL
ORF00983
1965 y 1966 membrana hipotética proteína yliF
ORF00984
1967 y 1968 enzima modificadora ARNt similar a MiaB Ylig, TIGR01125
ORF00985
1969 y 1970 proteína hipotética conservada
ORF00966
1971 y 1972 lppZ
ORF00987
1973 y 1974 glutatión S-transferasa
ORF00988
1975 y 1976 proteína precursora 6 de unión a penicilina (PBP) [3.4.16.4]
ORF00989
1977 y 1978 Represor del operón de deoxiribosa (AEOO6172)
ORF00990
1979 y 1980 producto de proteína sin nombre
ORF00991
1981 y 1982 proteína hipotética
ORF00992
1983 y 1984 translocasa de fármacos múltiples mdfA
ORF00993
1985 y 1986 proteína hipotética conservada
ORF00994
1987 y 1988 hidrolasa, haloácido similar a dehalogenasa familia
ORF00995
1989 y 1990 subfamilia facilitador mayor superfamilia
ORF00996
1991 y 1992 regulador de la transcripción, familia TetR, putativo
ORF00997
1993 y 1994 proteína de canal familiar TrkA de potasio
ORF00998
1995 y 1996 proteína hipotética conservada
ORF00999
1997 y 1998 Glutaredoxina, familia GrxA (grxA)
ORF01000
1999 y 2000 Proteína de función desconocida (DUF1418) superfamilia
ORF01001
2001 y 2002 Oxígeno-insensible NADPH nitrorreductasa [1.-.-.-)
ORF01002
2003 y 2004 proteína de ribosomal proteína de modificación S6
ORF01003
2005 y 2005 regulador de la transducción sensorial putativo
ORF01004
2007 y 2008 precursor de la proteína periplásmica de unión a putrescina
ORF01005
2009 y 2010 transporte putrescina proteína de unión a ATP potG (atp_bind)
ORF01006
2011 y 2012 transportador de putrescina ABC, permeasa de proteínas (membrana)
ORF01007
2013 y 2014 proteína de permeasa sistema de transporte putrescina potl
ORF01008
2015 y 2016 proteína hipotética conservada
ORF01009
2017 y 2018 23S ARNr (uracil.5 -) - metiltransferasa RumB (rumb) [2.1.1.-]
ORF01010
2019 y 2020 Arginina-proteína de unión periplásmica 2 precursora
ORF01011
2021 y 2022 proteína de permeasa sistema de transporte de arginina artM (membrana)
ORFOI012
2023 y 2024 proteína de permeasa sistema de transporte de arginina artQ (artQ)
ORF01013
2025 y 2026 Arginina-proteína de unión periplásmica 1 precursora
ORF01014
2027 y 2028 Artp proteína transportadora de arginina de unión a ATP
ORF01015
2029 y 2030 lipoproteínas putativas de ybjP precursor
ORF01016
2031 y 2032 proteína conservada
ORF01017
2033 y 2034 N-acetilmuramiol-L-alariina proteína de dominio amidasa [3.5.1.28]
ORF01018
2035 y 2036 proteína hipotética conservada
ORF01019
2037 y 2038 COG0702: Predicción de epimerasas-difosfato-azúcar nucleósido putativo
ORF01020
2039 y 2040 Baja especificidad L-treonina aldolasa [4.1.2.5]
ORF01021
2041 y 2042 deshidrogenasa de piruvato [1.2.2.2]
ORF01022
2043 y 2044 proteínas de unión de grupo hierro-azufre
ORF01023
2045 y 2046 proteína de grupo híbrida
ORF01024
2047 y 2048 proteína de superficie putativa
ORF01025
2049 y 2050 aguaporina Z
ORF01026
2051 y 2052 homología con la proteína RecF
ORF01027
2053 y 2054 SomA (VirG)
ORF01028
2055 y 2056 Proteína de eflujo-macrólido específico macA precursor
ORF01029
2057 y 2058 portador de tipo ABC flujo específico a macrólidos (eflujo)
ORF01030
2059 y 2060 proteína similar al choque frío cspD
ORF01031
2061 y 2062 Recombinasa específica del sitio, familia integrasa del fago, truncamiento
ORF01032
2063 y 2064 proteína de unión a ADN probable proteína relacionada
ORF01033
2065 y 2066 proteína hipotética
ORF01034
2067 y 2068 proteína hipotética conservada
ORF01035
2069 y 2070 proteína hipotética conservada
ORF01036
2071 y 2072 proteína hipotética de bacteriófago
ORF01037
2073 y 2074 primasa ADN del bacteriófago P4
ORF01038
2075 y 2076 proteína desconocida codificada por profago
ORF01039
2077 y 2078 proteína de unión de un único hilo (SSB) (proteína de hélice-desestabilizador) (ssb)
ORF01040
2079 y 2080 proteína hipotética
ORF01041
2081 y 2082 proteína hipotética conservada
ORF01042
2083 y 2084 proteína de profago Gifsy-1
ORF01043
2085 y 2086 decoración de la proteína cabeza (GPSHP proteína cabeza)
ORF01044
2087 y 2088 proteína hipotética
ORF01045
2089 y 2090 proteína cabeza-cola preconnector GP5
ORF01046
2091 y 2092 gp1
ORF01047
2093 y 2094 proteína desconocida codificada por profago
ORF01048
2095 y 2096 proteína desconocida codificada por profago
ORF01049
2097 y 2098 proteínas adaptadoras de proteasa Clp dependiente de ATP clpS
ORF01050
2099 y 2100 componente de unión a ATP de serina de proteasa
ORF01051
2101 y 2102 Dependiente de ATP subunidad proteasa clp de unión a ATP clpA
ORF01052
2103 y 2104 proteína asociada CRISPR Cas1 (cas1)
ORF01053
2105 y 2106 producto de proteína sin nombre; similar a la proteína desconocida
ORF01054
2107 y 2108 proteína hipotética conservada
ORF01055
2109 y 2110 proteína hipotética conservada
ORF01056
2111 y 2112 proteína hipotética conservada
ORF01057
2113 y 2114 proteína hipotética conservada
ORF01058
2115 y 2116 proteína hipotética conservada
ORF01059
2117 y 2118 traducción factor de iniciación IF-1 (infA)
ORF01060
2119 y 2120 leucil-fenilalanil-ARNt-proteína transferasa (aat) [2.3.2.-]
ORF01061
2121 y 2122 proteína de unión a ATP de transporte cydC
ORF01062
2123 y 2124 proteína de transporte de unión a ATP cydD
ORF01063
2125 y 2126 familia de proteínas de antirestricción
ORF01064
2127 y 2128 proteína YeeS (0160)
ORF01065
2129 y 2130 proteína de transporte de unión a ATP cydD
ORF01OS6
2131 y 2132 tiorredoxina-disulfuro reductasa (trxB) [1.8.1.9]
ORF01067
2133 y 2134 proteína reguladora Leucina responsiva
ORF01068
2135 y 2136 proteína de división celular ftsK
ORF01069
2137 y 2138 proteína transportadora de lipoproteína de la membrana exterior LolA (lolA)
ORF01070
2139 y 2140 producto de proteína sin nombre
ORF01071
2141 y 2142 seril-ARNt sintetasa (serS) [6.1.1.11]
ORF01072
2143 y 2144 Anaeróbico dimetil sulfóxido cadena reductasa A precursor (dmsA) [1.8.99.-]
ORF01073
2145 y 2146 dimetilsulfóxido anaeróbico cadena reductasa B (dmsB) [1.-.-.-]
ORF01074
2147 y 2148 DMSO subunidad reductasa de anclaje (DmsC) (dmsC) [1.8.99.-]
ORF01075
2149 y 2150 proteína ycaC
ORF01076
2151 y 2152 Hipotética de tipo MFS proteína transportadora ycaD
ORF01077
2153 y 2154 enzima activadora de piruvato formiato liasa 1 [1.97.1.4]
ORF01078
2155 y 2156 integrasa del fago
ORF01079
2157 y 2158 proteína reguladora de fago
ORF01080
2159 y 2160 gpB
ORF01081
2161 y 2162 proteína relacionada con gp8O
ORF01082
2163 y 2164 proteína insAB'
ORF01083
2165 y 2166 proteína InsA
ORF01084
2167 y 2168 gp81
ORF01085
2169 y 2170 proteína TraR
ORF01086
2171 y 2172 gp83
ORF01087
2173 y 2174 Replicación del gen proteína A (GPA)
ORF01088
2175 y 2176 gp91
ORF01089
2177 y 2178 proteína hipotética conservada
ORF01090
2179 y 2180 proteína hipotética
ORF01091
2181 y 2182 proteína hipotética
ORF01092
2183 y 2184 proteína portal de fago. familia PBSX
ORF01093
2185 y 2186 Putativo ATPasa subunidad de terrninasa (similar a gpP)
ORF01094
2187 y 2186 Proteína de la cápside del fago de andamios (GPO)
ORF01095
2189 y 2190 proteínas de andamios de la cápside
ORF01096
2191 y 2192 proteína de la cápside de fago principal, familia P2
ORF01097
2193 y 2194 subunidad de teminasa de fago pequeño
ORF01098
2195 y 2196 proteína de finalización cabeza de fago (GPL)
ORF01099
2197 y 2198 proteína de cola X proteína relacionada a (GPX)
ORF01100
2199 y 2200 Fago holina familia 2
ORF01101
2201 y 2202 Lisozima (proteína de lisis) (Muramidasa) (Endolisina) (Proteína gpK) [3.2.1.17]
ORF01102
2203 y 2204 proteína hipotética
ORF01103
2205 y 2206 proteína lysA
ORF01104
2207 y 2208 Proteína lysB (AB008550)
ORF01105
2209 y 2210 LysC
ORF01106
2211 y 2212 proteína de terminación de cola R (GPR)
ORF01107
2213 y 2214 proteínas de virión del fago morfogénesis
ORF01108
2215 y 2216 gpV (gpV)
ORF01109
2217 y 2218 proteína de base de placa montaje W (GPW) (gpW)
ORF01110
2219 y 2220 proteína similar a la placa de base J
ORF01111
2221 y 2222 gpl (gpl)
ORF01112
2223 y 2224 gpH
ORF01113
2225 y 2226 gpG (gpG)
ORF01114
2227 y 2228 proteína hipotética
ORF01115
2229 y 2230 proteína de envoltura de la cola de fago
ORF01116
2231 y 2232 proteína principal de tubo de cola de fago
ORF01117
2233 y 2234 proteína de cola del fago E
ORF01118
2235 y 2236 proteína medida de cinta fago de cola, familia TP901, putativo
ORF01119
2237 y 2238 gpU (gpU)
ORF01120
2239 y 2240 proteína del gen D (GPD)
ORF01121
2241 y 2242 Ogr
ORF01122
2243 y 2244 formato acetiltransferasa (pflB) [2.3.1.54]
ORF01123
2245 y 2246 Forrnato probable transportador 1
ORF01124
22478 2248 producto de proteína sin nombre
ORF01125
2249 y 2250 Proteína de función desconocida familia (DUF421)
ORF01126
2251 y 2252 aminotransferasa fosfoserina (SERC) [2.6.1.52]
ORF01127
2253 y 2254 3-fosfoshiquimato 1-carboxiviniltransferasa (aroA) [2.5.1.19]
ORF01128
2255 y 2256 cmk precursor de proteína [3.4.24.-]
ORF01129
2257 y 2256 quinasa citidilato (cmk) [2.7.4.14]
ORF01130
2259 y 2260 proteína ribosomal S1 (rpsA)
ORF01131
2261 y 2262 factor de integración de huesped, subunidad beta (ihfB)
ORF01132
2263 y 2264 proteína de la competencia relacionada con la internalización de ADN ComEC-Rec2
ORF01133
2265 y 2266 lípido A de exportación de unión a ATP-perrneasa proteína MsbA (msbA)
ORF01134
2267 y 2268 tetraacildisacarido 4’-quinasa(IpxK) [2.7.1.130]
ORF01135
2269 y 2270 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1006)
ORF01136
2271 y 2272 Tetraacildisacarido-1-P-4’-quinasa
ORF01137
2273 y 2274 3-desoxi-D-manno-octulosonato citidililtransferasa (kdsB) [2.7.7.38]
ORF01138
2275 y 2276 ACR no caracterizado, COG1434 familia
ORF01139
2277 y 2278 proteína mukF (factor matar KicB)
ORF01140
2279 y 2280 proteína hipotética conservada
ORF01141
2281 y 2282 proteína smtA
ORF01142
2283 y 2284 proteína partición de cromosoma mukF (kicB)
ORF01143
2285 y 2286 proteína partición de cromosoma mukE
ORF01144
2287 y 2288 proteína de división celular mukB (mukB)
ORF01145
2289 y 2290 proteína hipotética conservada
ORF01146
2291 y 2292 proteína bacteriana de función desconocida superfamilia (DUF882)
ORF01147
2293 y 2294 proteína de metalo-beta-lactamasa superfamilia [3.-.-.-]
ORF01148
2295 y 2296 aspartato aminotransferasa (aspC) [2.6.1.1]
ORF01149
2297 y 2298 proteína de membrana externa F precursor (GBP)
ORF01150
2299 y 2300 asparaginil sintetasa-ARNt (asnS) [6.1.1.22]
ORF01151
2301 y 2302 nicotinato fosforibosiltransIerasa (pncB) [2.4.2.11]
ORF01152
2303 y 2304 aminopeptidasa N (pepN) [3.4.11.2]
ORF01153
2305 y 2306 sulfonato transportador ABC, subunidad de unión a ATP SsuB (AF075709)
ORF01154
2307 y 2308 sulfonato transportador ABC, permeasa de proteínas SsuC
ORF01155
2309 y 2310 monooxigenasa alcanosulfonato [1.14.14.5]
ORF01156
2311 y 2312 proteína hipotética
ORF01157
2313 y 2314 Transportador ABC, sulfonatos alifáticos proteína de unión
ORF01158
2315 y 2316 FMN reductasa [1.5.1.29]
ORF01159
2317 y 2318 dihidroorotato oxidasa (pyrD) [1.3.3.1]
ORF01160
2319 y 2320 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1379)
ORF01161
2321 y 2322 reductasa flavodoxina (ferredoxina-NADPH reductasa) de la familia 1
ORF01162
2323 y 2324 predicha metilasa de ADN N6-adenina-específica
ORF01163
2325 y 2326 uup proteína transportadora ABC de unión a ATP
ORF01164
2327 y 2328 proteína hipotética
ORF01165
2329 y 2330 proteína inducible paraguat A
ORF01166
2331 y 2332 proteína inducible paraguat B
ORF01167
2333 y 2334 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF330)
ORF01168
2335 y 2336 proteína relacionada a factor de modulación ribosoma (proteína E)
ORFOI169
2337 y 2338 beta-hidroxiacil- (acil-proteína-portadora) deshidratasa FabA (fabA) [4.2.1.-]
ORF01170
2339 y 2340 producto de proteína sin nombre
ORF01171
2341 y 2342 membrana externa de proteína A precursor
ORF01172
2343 y 2344 inhibidor de la división celular
ORF01173
2345 y 2346 proteína hipotética de membrana, TIGR01666 (yccS)
ORF01174
2347 y 2348 regulador de los genes en las competencias específicas
ORF01175
2349 y 2350 Dominio de función desconocida
ORF01176
2351 y 2352 ADN helicasa IV-I [3.6.1.-]
ORF01177
2353 y 2354 metilglioxal sintasa (mgsA) [4.2.3.3]
ORF01178
2355 y 2356 proteína hipotética UPFO319 yccT precursor
ORF01179
2357 y 2358 yccU de proteínas
ORF01180
2359 y 2360 ADN dominio de unión hipoético, putativo
ORF01181
2361 y 2362 metiltransferasa SAM-dependiente predicha
ORF01182
2363 y 2364 Acilfosfatasa
ORF01183
2365 y 2366 sulfito reductasa cadena gamma probable [1.8.-.-]
ORF01184
2367 y 2368 proteína de membrana integral
ORF01185
2369 y 2370 Hidrogenasa-1 precursor de la cadena pequeña
ORF01186
2371 y 2372 proteína hipotética conservada
ORF01187
2373 y 2374 proteína desconocida codificada dentro de profago
ORF01188
2375 y 2376 BCR no caracterizado, COG1636 familia
ORF01189
2377 y 2378 putativa proteína destrucción de las células del profago (gef)
ORFOI190
2379 y 2380 Proteína de función desconocida (DUF1277) superfamilia
ORF01191
2381 y 2382 endodeoxiribonucleasa RUS (Holliday resolvasa de cruce) [3.1.22.-]
ORFOI192
2383 y 2384 Anhitermination proteína 0 homofog del profago críptica
ORF01193
2385 y 2386 proteína hipotética
ORF01194
2387 y 2388 producto de proteína sin nombre; ORF137, longitud
ORF01195
2389 y 2390 proteína de lisis S.b1556
ORF01196
2391 y 2392 proteína hipotética de bacteriófago
ORF01197
2393 y 2394 Lisocima (proteína de lisis) (muramidasa) (endolisina) [3.2.1.17]
ORF01198
2395 y 2396 proteína relacionada con lipoproteína Rz1 precursor
ORF01199
2397 y 2398 proteína de lisis bacteriófago
ORF01200
2399 y 2400 Sb56
ORFOI201
2401 y 2402 terrninasa fago, subunidad pequeña, putativo, familia P27, putativo
ORF01202
2403 y 2404 fago terminasa, subunidad grande, putativo
ORF01203
2405 y 2406 proteína hipotética
ORF01204
2407 y 2408 proteína portal fago, familia HK97
ORF01205
2409 y 2410 Caudovirus proteasa prohead
ORF01206
2411 y 2412 fago principal proteína de la cápside, familia HK97
ORF01207
2413 y 2414 proteína del fago no caracterizada (posible empaquetamiento del ADN)
ORF01208
2415 y 2416 fago adaptador de la cabeza-cola, putativa
ORF01209
2417 y 2418 proteína del fago. HK97 familia gp10
ORF01210
2419 y 2420 Op11
ORF01211
2421 y 2422 subunidad principal de la cola
ORFOI212
2423 y 2424 Fago chaperona empenaje
ORF01213
2425 y 2426 GP14
ORF01214
2427 y 2428 proteína cinta métrica longitud de la cola
ORF01215
2429 y 2430 fago cola menor proteína L
ORF01216
2431 y 2432 Putativo componente de fibra de cola K del profago
ORF01217
2433 y 2434 Bacteriófago lambda de cola proteína de ensamblaje 1
ORF01218
2435 y 2436 Huésped J proteína especificidad (parcial)
ORF01219
2437 y 2438 Huésped J proteína especificidad (parcial)
ORF01220
2439 y 2440 sede de la proteína especificidad (parcial)
ORF01221
2441 y 2442 Lom
ORF01222
2443 y 2444 proteína hipotética conservada
ORF01223
2445 y 2446 proteína hipotética conservada
ORF01224
2447 y 2448 proteína hipotética conservada
ORF01225
2449 y 2450 proteína hipotética conservada
ORF01226
2451 y 2452 CdtA
ORF01227
2453 y 2454 CdtB
ORF01228
2455 y 2456 CdtC
ORF01229
2457 y 2458 solute periplásmico familia familia de proteínas de unión
ORF01230
2459 y 2460 proteína de membrana
ORF01231
2461 y 2462 yedY proteína hipotética UPF0190 (AE005419)
ORF01232
2463 y 2464 proteína de la familia transtiretina
ORF01233
2465 y 2466 proteína activadora transcripcional CopR.
ORF01234
2467 y 2468 quinasa de histidina [2.7.3.-]
ORF01235
2469 y 2470 proteína-H-NS-reprimida, 30K (Hsp31)
ORF01236
2471 y 2472 proteína de membrana externa N precursora (OmpF)
ORF01237
2473 y 2414 dominio de la proteína HID
ORF01238
2475 y 2476 ADN metiltransferasa-citosina (M.EcoDcm) [2.1.1.37]
ORF01239
2477 y 2478 proteína de membrana integral
ORF01240
2479 y 2480 parche de reparación de proteínas [3.1.-.-]
ORF01241
2481 y 2482 Proteína de función desconocida
ORF01242
2483 y 2484 proteína hipotética conservada
ORF01243
2485 y 2486 proteína hipotética conservada
ORF01244
2487 y 2488 ciclasa diguanilato (GGDEF) proteína de dominio
ORF01245
2489 y 2490 manosil-3-fosfoglicerato proteína relacionada con fosfatasa [3.1.3.-]
ORF01246
2491 y 2492 proteína hipotética conservada
ORF01247
2493 y 2494 proteína hipotética conservada
ORF01248
2495 y 2496 Colánico ácido biosíntesis capsular proteína de activación A
ORF01249
2497 y 2498 proteína flagelar biosíntesis FIiR (fliR)
ORF01250
2499 y 2500 proteína biosintética tlagellar FIiQ (fliQ)
ORF01251
2501 y 2502 proteína biosintética flagelar FliP (fliP)
ORF01252
2503 y 2504 terminasa subunidad grande
ORF01253
2505 y 2506 fago proteína de la familia terminasa, putativo
ORF01254
2507 y 2508 proteína hipotética
ORF01255
2509 y 2510 Gp45
ORF01256
2511 y 2512 proteína hipotética conservada
ORF01257
2513 y 2514 Proteína Cl
ORF01258
2515 y 2516 regulador de la transcripción, proteína relacionada con la familia Cro-Cl
ORF01259
2517 y 2518 represor (cll)
ORF01260
2519 y 2520 0 (replicación ADN; 299)
ORF01261
2521 y 2522 proteína P
ORF01262
2523 y 2524 Hidrogenasa
ORF01263
2525 y 2526 Hidrogenasa-1 gran cadena (hidrogenasa NiFe) (Hidrogenasa 1 de unión a membrana subunidad grande) (HYD1) (hyaB) (1.12.99.6]
ORF01264
2527 y 2528 Ni-Fe-hidrogenasa, de tipo citocromo b subunidad (CybH)
ORF01265
2529 y 2530 Hidrogenasa 1 proteasa de maduración [3.4.24.-]
ORF01266
2531 y 2532 hidrogenasa 1 proteína de operón hyaE
ORF01267
2533 y 2534 hidrogenasa 1 proteína de operón hyaF
ORF01268
2535 y 2536 citocromo d ubiguinol oxidasa, subunidad I
ORF01269
2537 y 2538 citocromo d ubiguinoloxidasa, la subunidad II (cydB) [1.10.3.-]
ORF01270
2539 y 2540 proteína hipotética conservada
ORF01271
2541 y 2542 proteína similar a choque en frío
ORF01272
2543 y 2544 precursor de la proteína periplásmica appA (agp) [3.1.3.2]
ORF01273
2545 y 2546 proteína hipotética
ORF01274
2547 y 2548 proteína similar a choque en frío
ORF01275
2549 y 2550 proteína GnsB
ORF01276
2551 y 2552 proteína de transporte de electrones yccM putativo
ORF01277
2553 y 2554 2.7.3.- [2.7.3.-]
ORF01278
2555 y 2556 TorCAD proteína reguladora de operón transcripcional torR
ORFOI279
2557 y 2558 precursor de la proteína periplásmica torT
ORF01280
2559 y 2560 trimetilamina-N-óxido reductasa de tipo c citocromo TorC (torC)
ORF01281
2561 y 2562 trimetilamina-N-óxido reductasa TorA (torA) (1.7.2.3]
ORF01282
2563 y 2564 torD proteína chaperona
ORF01283
2565 y 2566 proteína hipotética conservada
ORF01284
2567 y 2568 proteína hipotética conservada
ORF01285
2569 y 2570 proteínas dnaJ
ORF01286
2571 y 2572 periplásmico de glucosa-1-fosfatasa
ORF01287
2573 y 2574 proteína hipotética conservada
ORF01288
2575 y 2576 trp proteína de unión represora
ORF01289
2577 y 2578 proteína hipotética conservada
ORF01290
2579 y 2580 permeasa uracil-xantina
ORF01291
2581 y 2582 proteína hipotética conservada
ORF01292
2583 y 2584 permeasa uracil-xantina
ORF01293
2585 y 2586 4-hidroxifenilacetato 3-monooxigenasa (CE 1.14.13.3) pequeña cadena [1.14.13.3]
ORF01294
2587 y 2588 nitrorreductasa putativa (AE005300) [1.-.-.-]
ORF01295
2589 y 2590 3-oxoadipato enol-lactona hidrolasa 4-carboximuconolactona descarboxilasa, putativo
ORF01296
2591 y 2592 proteína hipotética
ORF01297
2593 y 2594 endorribonucleasa L-PSP, putativa
ORF01298
2595 y 2596 Isochonsmatasa hipotética proteína de la familia ycdL
ORF01299
2597 y 2598 bacteriana proteína de la familia de la luciferasa, putativo
ORF01300
2599 y 2600 regulador de la transcripción, la familia TetR.
ORF01301
2601 y 2602 prolina deshidrogenasa-delta-1-pirolina-5-carboxilato de dehidragenasa
ORF013O2
2603 y 2604 proteína hipotética conservada
ORF01303
2605 y 2606 cotransportador de sodio-prolina (putP)
ORF01304
2607 y 2608 proteína de membrana, putativo
ORF01305
26098 2610 lipoproteína putativa
ORF01306
2611 y 2612 enzima translocada-tat
ORF01307
2513 y 2614 proteína de la familia PhOH
ORF01308
2615 y 2616 proteína hipotética conservada
ORF01309
2617 y 2618 sistema de almacenamiento de hemina, proteína HmsR (lgtD)
ORF01310
2619 y 2620 HmsF (HmsF)
ORF013I1
2621 y 2622 sistema de almacenamiento de hemina, proteína HmsH
ORF01312
2623 y 2624 Dominio de la proteína E1GEF
ORF01313
2625 y 2626 integrasa
ORF01314
2627 y 2628 proteína de membrana probable
ORF01315
2629 y 26 30 INSA
ORF01316
2631 y 2632 transposasa
ORF01317
2633 y 2634 proteína hipotética
ORF01318
2635 y 2636 Profago CP4-57 Reguladora Alpa proteínas
ORF01319
2637 y 2638 proteína hipotética conservada
ORF01320
2639 y 2640 metiltransferasa predicha
ORF01321
2641 y 2642 metiltransferasa predicha
ORF01322
2643 y 2644 enterotoxina
ORF01323
2645 y 2646 aminotransferasa, clase II, putativo
ORF01324
2647 y 2648 KbaY [4.1.2.-]
ORF01325
2649 y 2650 PUTATIVOS TAGATOSA 6-FOSFATO PROTEINA QUINASA
ORF01326
2651 y 2652 DeoR familiar proteína reguladora
ORF01327
2653 y 2654 regulador del metabolismo del azúcar transcnptional
ORF01328
2655 y 2656 D-galactarato deshidratasa [4.2.1.42]
ORF01329
2657 y 2658 D-galactarato deshidratasa [4.2.1.7]
ORF01330
2659 y 2660 hidrolasa putativa
ORF01331
2661 y 2662 galactarato deshidrogenasa [4.2.1.42]
ORF01332
2663 y 2664 proteína hipotética
ORF01333
2665 y 2666 proteína hipotética conservada
ORF01334
2667 y 2668 Putativo F1C y interruptor regulador fimbrial S
ORF01335
2669 y 2670 proteína SfaB
ORF01336
2671 y 2672 proteína hipotética
ORF01337
2673 y 2674 proteína SfaD
ORF01338
2675 y 2676 proteína SfaE
ORF01339
2677 y 2678 Usher F1C fimbrial
ORF01340
2679 y 2680 S fimbrial adhesina subunidad menor SfaG
ORF01341
2681 y 2682 S adhesina fimbrial subunidad menor SfaS (pilina)
ORF01342
2683 y 2684 S adhesina fimbrial subunidad menor SfaH
ORF01343
2685 y 2686 dominio EAL, putativo
ORF01344
2687 y 2688 proteína PapX
ORF01345
2689 y 2690 proteína hipotética
ORF01346
2691 y 2692 proteína IroN
ORF01347
2693 y 2694 lroE
ORF01348
2695 y 2696 proteína IroD (Fes)
ORF01349
2697 y 2698 IroC (ABC)
ORF01350
2699 y 2700 glucosiltransferasa putativa
ORFOI351
2701 y 2702 proteína hipotética conservada
ORF01352
2703 y 2704 proteína hipotética conservada
ORF01353
2705 y 2706 producto de proteína sin nombre; ORF94, longitud (lSPlu9-p)
ORF01354
2707 y 2708 Transposasa, familia 1S4
ORF01355
2709 y 2710 dependiente de receptor de hemina membrana externa tonB, hmuR (Y08983)
ORF01356
2711 y 2712 proteína hipotética conservada
ORF01357
2713 y 2714 síntesis de proteínas cobalamina, putativa
ORF01358
2715 y 2716 ECs1339
ORF01359
2717 y 2718 proteína hipotética conservada
ORF01360
2719 y 2720 proteína hipotética
ORF01361
2721 y 2722 proteína de replicación (Rep)
ORF01362
2723 y 2724 proteína hipotética
ORF01363
2725 y 2726 proteína YeeP
ORF01364
2727 y 2728 Ortólogo de proteína de antígeno43
ORF01365
2729 y 2730 proteína hipotética conservada
ORF01366
2731 y 2732 proteína Z1215 (o273)
ORF01367
2733 y 2734 proteína hipotética conservada
ORF01368
2735 y 2736 familia de proteínas de antirestricción
ORF01369
2737 y 2738 Yees proteína (0160)
ORF01370
2739 y 2740 proteínas relacionadas con la proteína intergénica-región
ORF01371
2741 y 2742 proteína hipotética conservada
ORF01372
2743 y 2744 proteína-intergénicas región
ORF01373
2745 y 2746 proteína YeeV
ORF01374
2747 y 2748 proteína similar a L0008
ORF01375
2749 y 2750 proteína Z1225 (AF071034)
ORF01376
2751 y 2752 proteína Z1226
ORF01377
2753 y 2754 putativo deshidrogenasa (AE005314)
ORF01378
2755 y 2756 proteína de la familia de PHP
ORF01379
2757 y 2758 proteína TorD
ORF01380
2759 y 2760 Proteína de función desconocida superfamilia (DUFIO97)
ORF01381
2761 y 2762 Curli componente de ensamblaje de transporte de la producción csgG precursor
ORF01382
2763 y 2764 Curli componente de ensamblaje de transporte de la producción csgF precursor
ORF01383
2765 y 2766 Curli componente de ensamblaje de transporte de la producción csgE precursor
ORF01384
2767 y 2768 regulador de la transcripción, familia LuxR
ORF01385
2769 y 2770 curli fibra subunidad mayor CsgA, degenerado
ORF01386
2771 y 2772 curli fibra subunidad mayor CsgA, degenerado, putativo
ORF01387
2773 y 2774 proteína hipotética conservada
ORF01388
2775 y 2776 Appr-1-p proteína de procesamiento de familia de enzimas
ORF01389
2777 y 2778 sintasa de cardiolipina
ORFOI390
2779 y 2780 proteínas de biosíntesis glucanos C [2.1.-.-]
ORF01391
2781 y 2782 proteína hipotética conservada
ORF01392
2783 y 2784 proteína periplásmica de glucanos biosíntesis mdoG precursor
ORF01393
2785 y 2786 proteína petiplásmica de glucanos biosíntesis mdoH
ORF01394
2787 y 2788 proteína hipotética conservada
ORF01395
2789 y 2790 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1375)
ORF01396
2791 y 2792 proteína ácida msyB
ORF01397
2793 y 2794 facilitador principal transportador de la familia
ORF01398
2795 y 2796 Lípido A aciltransferasa biosíntesis de lauroílo
ORF01399
2797 y 2798 proteína de dominio rodanesa similar, putativo
ORF01400
2799 y 2800 proteína ycel precursor
ORF01401
2801 y 2802 Citocromo b561 homólogo 2
ORF01402
2803 y 2804 proteína hipotética conservada
ORF01403
2805 y 2806 N-metil-L-triptófano oxidasa (MTOX) (1.5.3.-]
ORF01404
2807 y 2808 producto de proteína sin nombre; ORF_JD:o233#8
ORF01405
2809 y 2810 producto de proteína sin nombre; ORF_lD:o233#9
ORF01406
2811 y 2812 dihidroorotasa, tipo homodimenc (pyrC) [3.5.2.3]
ORF01407
28138 2814 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1439)
ORF01408
2815 y 2816 Glutaredoxina, familia GrxB (grx8)
ORF01409
2817 y 2818 subfamilia importante facilitador superfamilia
ORFOI4IO
2819 y 2820 Ribosomal-proteína-alanina acetiltransferasa [2.3.1.128]
ORF01411
2821 y 2822 g20.3
ORF01412
2823 y 2824 factor de virulencia putativo
ORF01413
2825 y 2826 proteína de membrana integral MviN (mviN)
ORF01414
2827 y 2828 proteína de síntesis de flagelos FlgN
ORF01415
2829 y 2830 regulador negativo de síntesis de flagelina (factores anti-sigma-28)
ORF01416
2831 y 2832 proteína flagelar basal corporal P-anillo FlgA precursor
ORF01417
2833 y 2834 proteína de varillaflagelar basal corporal FlgB (ftgB)
ORF01418
2835 y 2836 proteínas de varilla flagelar basal corporal FlgC (flgC)
ORF01419
2837 y 2838 biosintesis flagelar, proteína de gancho
ORF01420
2339 y 2840 biosíntesis flagelar, proteína de gancho
ORF01421
2841 y 2842 proteína varilla flagelar basal corporal flgF
ORF01422
2843 y 2844 flgG proteína varilla flagelar basal corporal (proteína de varilla distal)
ORF01423
2845 y 2846 proteína de anillo L flagelar FlgH (figH)
ORF01424
2847 y 2848 P-anillo de la proteína flagelar Flgl (flgl)
ORF01425
2849 y 2850 hidrolasa peptidoglicano flgJ [3.2.1.-]
ORF01426
2851 y 2852 proteína asociada a gancho flagelar 1 (hap1)
ORF01427
2853 y 2854 proteína asociada a gancho flagelar 3 (hap3)
ORF01428
2855 y 2856 Ribonucleasa E (RNasa E) (me) [31.4.-]
ORF01429
2857 y 2858 proteína hipotética
ORF01430
2859 y 2860 ribosomal subunidad grande pseudouridina sintasa C (orfx) [4.2.1.70]
ORF01431
2861 y 2862 ribosomal subunidad grande pseudouridina sintasa C (orfx) [4.2.1.70]
ORF01432
2863 y 2864 proteína maf (maf)
ORF01433
2865 y 2866 ACR sin caracterizar, C0G1399
ORF01434
2867 y 2868 proteína ribosomal L32 (rpmF)
ORF01435
2869 y 2870 3-oxoacil-[acil-proteína-cámar] sintasa II
ORF01436
2871 y 2872 liasa aminodeoxicorismato (4-amino-4-deoxiconsmateliasa) (liasa ADC) (ADCL) (ADCL) (4.1.3.38]
ORF01437
2873 y 2874 hipotética proteína conservada T1GR00247
ORF01438
2875 y 2876 timidilato quinasa (tmk) [2.7.4.9]
ORF01439
2877 y 2878 ADN polimerasa III, subunidad delta’ [2.7.7.7)
ORF01440
2879 y 2880 Putativa deoxiribonucleasa ycfH
ORF01441
2881 y 2882 sistema PTS, componente IIBC específico de glucosa (ptsG) [2.7.1.69]
ORF01442
2883 y 2884 precursor del receptor FhuE (III)
ORF01443
2885 y 2886 proteína similar a HIT ycfF (Ap4A)
ORF01444
2887 y 2888 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1425)
ORF01445
2889 y 2890 proteína de unión a fibronectina B
ORF01446
2891 y 2892 producto de proteína sin nombre [3.2.1.21]
ORF01447
2893 y 2894 Beta-hexosaminidasa
ORF01448
2895 y 2896 proteína ycfP
ORF01449
2897 y 2898 NADH deshidrogenasa
ORF01450
2899 y 2900 proteína hipotética conservada
ORF01451
2901 y 2902 regulador transcripcional, familia TetR
ORF01452
2903 y 2904 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1471)
ORF01453
2905 y 2906 familia ErfK-YbiS-YcfS-YnhG
ORF01454
2907 y 2908 factor de acoplamiento declive frecuencia de mutación transcripción de reparación
ORF01455
2909 y 2910 familia aciltransferasa, putativo
ORF01456
2911 y 2912 proteína hipotética
ORF01457
2913 y 2914 Transportador ABC, proteína integral de membrana
ORF01458
2915 y 2916 sistema de liberación de lipoproteína, ATP-proteína de unión (lolD)
ORF01459
2917 y 2918 sistema de liberación de las lipoproteínas, proteínas transmembrana WE (lolE)
ORF01460
2919 y 2920 proteína de familia ROK
ORF01461
2921 y 2922 deacetifasa WAD-dependiente (proteína reguladora SlR2homolog) (DM8) [3.5.1.-)
ORF01462
2923 y 2924 proteína hipotética conservada
ORF01463
2925 y 2926 proteína hipotética conservada
ORF01464
2927 y 2928 precursor de la proteína periplásmica spermidina-putrescina de unión (potD)
0F01465
2929 y 2930 sistema de transporte espermidina-putrescina proteína permeasa potC (potC)
ORF01466
2931 y 2932 spemidina-putrescina sistema de transporte permeasa
ORF01467
2933 y 2934 Transportador ABC, proteína de transporte poliamina, de unión a ATP proteína (atp_bind)
ORF01468
2935 y 2936 peptidasa T (pept) [3.4.11.14]
ORF01469
2937 y 2938 proteína ycfD
ORF01470
2939 y 2940 sensor de proteína phoQ [2.7.3-]
ORF01471
2941 y 2942 proteína reguladora de la transcripción
ORF01472
2943 y 2944 liasa adenilosucdnato (purB) [4.3.2.2]
ORF01473
2945 y 2946 proteína no caracterizada implicada en el metabolismo de las purinas
ORF01474
2947 y 2948 ARNt (5-metilaminometil-2-tiouridilato) - metiltransferasa (UDAt) [2.1.1.61]
ORF01475
2949 y 2950 producto de proteína no identificada [3.6.-.-]
ORF01476
2951 y 2952 proteínas ARN pseudoundilato familia sintasa [4.2.1.70]
ORF01477
2953 y 2954 proteína hipotética conservada
ORF01478
2955 y 2956 isocitrato deshidrogenasa, NADP-dependiente (icd) [1.1.1.42]
ORF01479
2957 y 2958 Profago integrasa lambda
ORF01480
2959 y 2960 proteína hipotética conservada
ORF01481
2961 y 2962 producto de proteína sin nombre; Algunas similitudes con proteína de bacteriófago
ORF01482
2963 y 2964 exonucleasa Z0951 [similitud [3.1.11.3]
ORF01483
2965 y 2966 proteína de recombinación Bet
ORF01484
2967 y 2968 inhibidor de la proteína de acogida de nucleasa Gam
ORF01485
2969 y 2970 proteína Kil
ORF01486
2971 y 2972 proteína relacionada con proteína reguladora Lambda CIII
ORF01487
2973 y 2974 proteína del gen Ea10
ORF01488
2975 y 2976 proteína hipotética conservada
ORF01489
2977 y 2978 proteína Q antiterminación
ORF01490
2979 y 2980 tisozyma [3.2.1.17]
ORF01491
2981 y 2982 proteína de lisis bacteriófago
ORF01492
2983 y 2984 proteína hipotética
ORF01493
2985 y 2986 profago L54a, proteína HNH familia endonucleasa
ORF01494
2987 y 2988 subunidad pequeña terminasa
ORF01495
2989 y 2990 fago terminasa, subunidad grande, putativo
ORF01496
2991 y 2992 proteína hipotética conservada
ORF01497
2993 y 2994 proteína portal fago, familia HK97
ORF01498
2995 y 2996 Sb5 (AF181080)
ORF01499
2997 y 2998 fago principal proteína de la cápside, la familia HK97
ORF01500
2999 y 3000 proteína relacionada Sb7
ORF01501
3001 y 3002 Sb8
ORF01502
3003 y 3004 Sb9
ORF01503
3005 y 3006 proteína hipotética
ORF01504
3007 y 3008 Sb11
ORF01505
3009 y 3010 proteína hipotética conservada
ORF01506
3011 y 3012 Bacteriófago Mu proteína de la envoltura de la cola (GpL)
ORF01507
3013 y 3014 Sb14
ORF01508
3015 y 3016 proteína hipotética
ORF01509
3017 y 3018 Sb15
ORF01510
3019 y 3020 proteína de la cola
ORF01511
3021 y 3022 proteína de la circulación de la cola-ADN (muN)
ORF01512
3023 y 3024 Bacteriófago Mu proteína P
ORF01513
3025 y 3026 proteína gp45 Mu Bacteriófago
ORF01514
3027 y 3028 Gp46 proteína del fago
ORF01515
3029 y 3030 proteína de la cola
ORF01516
3031 y 3032 proteína de la cola
ORF01517
3033 y 3034 proteína yctE (fragmento)
ORF01518
3035 y 3036 Dominio de función desconocida DUF144 superfamilia
ORF01519
3037 y 3038 producto de proteína sin nombre; marco de lectura no identificada P-293
ORF01520
3039 y 3040 lipoproteína Rz1 precursor de la proteína relacionada
ORF01521
3041 y 3042 proteína de lisis bacteriófago
ORF01522
3043 y 3044 Bor homólogo de proteína de DLP12 profago lambdoide
ORFOI523
3045 y 3046 proteína hipotética
ORF01524
3047 y 3048 proteína hipotética conservada
ORF01525
3049 y 3050 Bacteriófago lambda cabeza decoración de la proteína D
ORF01526
3051 y 3052 Fago cápside principal proteína E
ORF01527
3053 y 3054 proteína hipotética conservada
ORF01528
3055 y 3056 Adjunto fago cabeza-cola
ORF01529
3057 y 3058 Profago cola menor proteína Z (GPZ)
ORFOI530
3059 y 3060 proteína de la cola menor U
ORF01531
3061 y 3062 proteína hipotética
ORF01532
3063 y 3064 proteína menor de la cola Z (GPZ)
ORF01533
3065 y 3066 Proteína menor de la cola del fago U
ORF01534
3067 y 3068 proteína de la cola de menor importancia
ORF01535
3069 y 3070 Proteína menor de la cola del fago U
ORF01536
3071 y 3072 principales proteínas de la cola
ORF01537
3073 y 3074 proteína menor de la cola del fago G
ORF01538
3075 y 3076 proteína de cola menor
ORF01539
3077 y 3078 proteína de cola menor
ORF01540
3079 y 3080 cinta de longitud de la cola precursor de la proteína medida
ORF01541
3081 y 3082 proteína de la cola menor
ORF01542
3083 y 3084 Menor precursor de la proteína de la cola H
ORF01543
3085 y 3086 Menor precursor de la proteína de la cola H
ORF01544
3087 y 3088 hipotética proteína de bacteriófago
ORF01545
3089 y 3090 producto de proteína sin nombre; Similar a la proteína de ensamblaje de fibras de cola
ORF01546
3091 y 3092 precursor de la proteasa VII (Omptin) (proteína3B membrana externa) (Proteasa A) (SopA) [3.4.21.87)
ORF01547
3093 y 3094 precursor de la proteasa VII (Omptina) (proteína3B membrana externa) (Proteasa A) (SopA) [3.4.21.87)
ORF01548
3095 y 3096 precursor de la proteasa VII (Omptina) (proteína3B membrana externa) (Proteasa A) (SopA) [3.4.21.87]
ORF01549
3097 y 3098 proteína ydfE (35kD)
ORF01550
3099 y 3100 Fago terminasa subunidad grande (GpA)
ORF01551
3101 y 3102 Fago temiinasa subunidad grande (GpA)
ORF01552
3103 y 3104 Fago terminasa subunidad grande (GpA)
ORF01553
3105 y 3106 Portal de la proteína (proteína cabeza GP4)
ORF01554
3107 y 3108 cabeza-cola proteína preconectora GP5
ORFOI555
3109 y 3110 Cabeza-cola de la proteína GP5 preconector [Contiene: proteína de andamios GP6(proteína de cabeza GP6)]
ORF01556
3111 y 3112 decoración de la proteína de bacteriofago cabeza lambda D
ORF01557
3113 y 3114 Fago cápside principal proteína E
ORF01558
3115 y 3116 proteína hipotética conservada
ORF01559
3117 y 3118 Adjunto fago cabeza-cola
ORF01560
3119 y 3120 Profago proteína cola menor Z (GPZ)
ORF01561
3121 y 3122 Fago proteína cola menor U
ORF01562
3123 y 3124 proteínas principal de cola
ORF01563
3125 y 3126 fago proteína cola menor G
ORF01564
3127 y 3128 proteína de cola menor
ORF01SB5
3129 y 3130 Portal de la proteína (proteína de cabeza GP4)
ORF01566
3131 y 3132 proteínas preconectora cabeza-cola GP5
ORF01567
3133 y 3134 proteína preconectora de cabeza-cola GP5 (contiene: proteínas de andamios GP6 (proteína de cabeza GP6)
ORF01568
3135 y 3136 proteínas preconectora cabeza-cola GP5 [contiene: proteínas de andamios GP6 (proteína de cabeza GP6)]
ORF01569
3137 y 3138 proteína de bacteriófago lambda decoración cabeza D
ORF01570
3139 y 3140 proteína de cola del fago de cinta métrica, familia lambda
ORF01571
3141 y 3142 Proteína de la cola del fago menor
ORF01572
3143 y 3144 proteína menor de cola
ORF01573
3145 y 3146 componente de cola putativo del profago
ORF01574
3147 y 3148 Proteína de cola del fago menor
ORF01575
3149 y 3150 Proteína de fago de cola menor L
ORF01576
3151 y 3152 componente de cola putativo del profago
ORF01577
3153 y 3154 Proteína de la cola del fago menor
ORF01578
3155 y 3156 Proteína de la cola del fago menor L
ORF01579
3157 y 3158 regulador transcripcional, familia GntR
ORF01580
3159 y 3160 oxidorreductasa probable ydfG
ORF01581
3161 y 3162 peptidil-dipeptidasa Dcp, putativo
ORF01582
3163 y 3164 peptidil-dipeptidasa Dcp
ORF01583
3165 y 3166 proteína hipotética
ORF01584
3167 y 3168 proteína de dominio GGDEF
ORF01585
3169 y 3170 proteína hipotética
ORF01586
3171 y 3172 Subfamilia facilitador mayor superfamilia
ORF01587
3173 y 3174 YdeD
ORF01588
3175 y 3176 proteína conservada putativa
ORF01589
3177 y 3176 sistema PTS, componente IIB-celobiosa específica (PTS) [2.7.1.69]
ORF01590
3179 y 3180 proteína conservada putativa
ORF01591
3181 y 3182 sistema PTS, componente IIA celobiosa-específica
ORF01592
3183 y 3184 f538
ORF01593
3185 y 3186 6-fosfo-beta-glucosidasa
ORF01594
3187 y 3188 proteína relacionada con proteínas múltiples de resistencia a antibióticos marB
ORF01595
3189 y 3190 proteína de resistencia de antibióticos múltiples MarA
ORF01596
3191 y 3192 proteína de resistencia a antibióticos multiples marR (AL359989)
ORF01597
3193 y 3194 proteína hipotética conservada T1GR00427
ORFOI598
3195 y 3196 transportador de eflujo de azúcar
ORF01599
3197 y 3198 regulador de la transcripción, familia LysR
ORF01600
3199 y 3200 Aldehído deshidrogenasa como proteína de ynel (SSDH) [1.2.1.-]
ORF01601
3201 y 3202 proteína de la familia glutaminasa, interrupción-N
ORF01602
3203 y 3204 proteína hipotética conservada
ORF01603
3205 y 3206 proteína de dominio GGDEF
ORF01604
3207 y 3208 oxidorreductasa de altronato
ORF01605
3209 y 3210 familia de proteínas no caracterizada (UPF0187) superfamilia
ORF01606
3211 y 3212 metiltransferasa trans-aconitato (2.1.1.144]
ORF01607
3213 y 3214 proteína hipB
ORF01608
3215 y 3216 proteína hipA
ORF01609
3217 y 3218 proteína hipotética conservada
ORF01610
3219 y 3220 deshidrogenasa de cadena corta
ORF01611
3221 y 3222 proteína fimbrial de tipo I, precursor de cadena
ORF01612
3223 y 3224 precursor de proteína chaperona fimC
ORF01613
3225 y 3226 precursor de proteína chaperona de membrana exterior fimC
ORF01614
3227 y 3228 morfología fimbrial
ORF01615
3229 y 3230 Hipotética proteína similar a fimbrial precursora ydeQ
ORF01616
3231 y 3232 oxidorreductasa alfa (molibdopterina) subunidad
ORF01617
3233 y 3234 regulador transcripcional de tipo HTH ydeO
ORF01618
3235 y 3236 arilsulfatasa B (GALNS)
ORF01619
3237 y 3238 proteína radical proteína de dominio SAM
ORF0162O
3239 y 3240 ABC transportador de eflujo, proteína permeasa-ATP vinculante, putativo
ORF01621
3241 y 3242 cds103
ORF01622
3243 y 3244 cds103
ORF01623
3245 y 3246 peptidasa, familia M16, putativo [3.4.99.-]
ORF01624
3247 y 3248 glutamato descarboxilasa [4.1.1.15]
ORF01625
3249 y 3250 antiporter de aminoácidos
ORF01626
3251 y 3252 proteína yngK
ORF01627
3253 y 3254 proteína relacionada con proteína conservada putativa
ORF01628
3255 y 3256 proteína de sensor FixL (EC 2.7.3.-). (nifL) [2.7.3.-]
ORF01629
3257 y 3258 proteína C, osmóticamente inducible
ORF01630
3259 y 3260 proteína hipotética
ORF01631
3261 y 3262 proteína hipotética conservada
ORF01632
3263 y 3264 proteína hipotética conservada
ORF01633
3265 y 3266 30S proteína ribosomal S22 (ribosoma- inducida por la fase estacionaria de proteína asociada) (SRA) (proteína D) proteína relacionada
ORF01634
3267 y 3268 proteína hipotética
ORF01635
3269 y 3270 deshidrogenasa de malato NAD-vinculada (enzima málica)
ORF01636
3271 y 3272 deshidrogenasa de alcohol, (adhA) de preferencia de propanol [1.-.-.-]
ORF01637
3273 y 3274 proteína de supresión asesina proteica hig A
ORF01638
3275 y 3276 proteína hipotética conservada
ORF01639
3277 y 3278 proteína activa asesina proteica hig B
ORF01640
3279 y 3280 formiato deshidrogenasa, subunidad gamma [1.2.1.2]
Cortar
3281 y 3282 formiato deshidrogenasa, subunidad beta (FdxH) [1.2.1.2]
ORF01642
3283 y 3284 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa, que contiene selenocisteína [1.2.1.2]
ORF01643
3285 y 3286 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa, que contiene selenocisteína [1.2.1.21
ORF01644
3287 y 3288 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa, que contiene selenocisteína [1.2.1.21
ORF01645
3289 y 3290 proteína hipotética
ORF01646
3291 y 3292 proteína de membrana yddG
ORFOI64T
3293 y 3294 proteína de extrusión de nitrito 2
ORF01648
3295 y 3296 reductasa de nitrato, subunidad alfa [1.7.99.4]
ORF01649
3297 y 3298 reductasa de nitrato, subunidad beta (narH) [1.7.99.4]
ORF01650
3299 y 3300 reductasa de nitrato respiratorio 2 de la cadena delta [1.7.99.4]
ORF01651
3301 y 3302 reductasa de nitrato respiratorio, subunidad gamma (narl) [1.7.99.4]
ORF01652
3303 y 3304 fenazina de biosíntesis de proteínas PhzF familia subfamilia
ORF01653
3305 y 3306 Cadena D, M. SmegmatisArylamine N-acetil transferasa [2.3.1.118]
ORF01654
3307 y 3308 reductasa flavina como la proteína de dominio
ORF01655
3309 y 3310 H repetición asociada a la proteína (ORF-H)
ORF01656
3311 y 3312 proteína hipotética conservada
ORF01657
3313 y 3314 proteína hipotética conservada
ORF01658
3315 y 3316 Aec15 (AF044503)
ORF01659
3317 y 3318 proteína conservada no caracterizada
ORF01660
3319 y 3320 transferasa probable (U59485)
ORF01661
3321 y 3322 glutatión S-transferasa gst
ORF01662
3323 y 3324 permeasa L-asparagina (516aa)
ORF01663
3325 y 3326 proteína hipotética conservada
ORF01664
3327 y 3328 proteína del receptor TonB dependiente
ORF01665
3329 y 3330 proteína conservada putativa relacionada con proteína
ORF01666
3331 y 3332 acetiltransferasa, la familia GNAT [2.3.1.-]
ORF01667
3333 y 3334 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF6O6
ORF01668
3335 y 3336 proteína hipotética conservada
ORF01669
3337 y 3338 proteína hipotética conservada
ORF01670
3339 y 3340 proteína hipotética
ORF01671
3341 y 3342 aldehído deshidrogenasa proteínas de familia (BADH [1.2.1.8]
ORF01672
3343 y 3344 poliamina transportador ABC, proteína de permeasa
ORF01673
3345 y 3346 poliamina transportador ABC, proteína de permeasa
ORF01674
3347 y 3348 poliamina transportador ABC, proteína de unión a ATP
ORF01675
3349 y 3350 poliamina transportador ABC, proteína de poliamina vinculante periplásmica
ORFOI676
3351 y 3352 producto no identificado de proteínas (TAT) [2.6.1.5]
ORF01677
3353 y 3354 producto de proteína sin nombre
ORF01678
3355 y 3356 proteína hipotética conservada
ORF01679
3357 y 3358 peptidasa, familia U32
ORF01680
3359 y 3360 regulador transcripcional de la familia de Cro-CI, putativo
ORF01681
3361 y 3362 similar a la proteína de transporte de benzoato
ORF01682
3363 y 3364 lipoproteína hipotética precursor ydcL
ORF01683
3365 y 3366 proteína de resistencia a telurito TehB (tehB)
ORF01684
3367 y 3368 proteína de resistencia a telurito tehA
ORF01685
3369 y 3370 ribosoma-proteína-serina acetiltransferasa, putativo
ORF01686
3371 y 3372 proteína hipotética conservada
ORF01687
3373 y 3374 proteína de función desconocida (DUF465) familia
ORF01688
3375 y 3376 Glucanos biosíntesis de proteína D precursor
ORF01689
3377 y 3378 Proteína de función desconocida (DUF1338) familia
ORF01690
3379 y 3380 regulador transcripcional PcaQ
ORF01691
3381 y 3382 proteína quimiotaxis de aceptación de metil II, receptor de sensor aspartato
ORF01692
3383 y 3384 proteína relacionada.- proteína Hok
ORF01693
3385 y 3386 proteína hipotética conservada
ORF01694
3387 y 3388 citocromo b561 (561)
ORF01695
3389 y 3390 gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa, tipo I (gap) [1.2.1.-]
ORF01696
3391 y 3392 deshidrogenasa de aldehído (NAD) [1.2.1.22]
ORF01697
3393 y 3394 proteína ydcF
ORF01698
3395 y 3396 helicasa dependiente de ATP HrpA (hrpA)
ORF01699
3397 y 3398 [acil-cámar-proteína] acpD fosfodiesterasa (fragmento) [3.1.4.14]
ORF01700
3399 y 3400 proteína del dominio catalítico de doble especificidad de la fosfatasa
ORF01701
3401 y 3402 lisofosfolipasa
ORF01702
3403 y 3404 citidililtransferasa de fosfatidato (cdsA) [2.7.7.41]
ORF01703
3405 y 3406 familia fosfatidiltransferasa CDP-alcohol
ORF01704
3407 y 3408 oxidorreductasa, splfamilia reductasa aldo-ceto
ORF01705
3409 y 3410 división oro
ORF01706
3411 y 3412 Proteína de función desconocida (DUF1318) familia
ORF01707
3413 y 3414 lipoproteína, putativo
ORF01708
3415 y 3416 producto de proteína sin nombre similar a la proteína de la membrana de YdbH de Escherichia coli
ORF01709
3417 y 3418 deshidrogenasa fermentativa D-lactato (D-LDH) [1.1.1.28]
ORF01710
3419 y 3420 proteína de choque térmico hslJ
ORF01711
3421 y 3422 lipoproteína, putativo
ORF01712
3423 y 3424 piruvato: ferredoxina (oxidorreductasa flavodoxina (nifJ) [1.2.7.1]
ORF01713
3425 y 3426 proteína de membrana externa N precursora (ibc)
ORF01714
3427 y 3428 proteína de filamento putativa
ORF01715
3429 y 3430 integrasa de bacteriófago BP-933W
ORF01716
3431 y 3432 proteína YdaO
ORF01717
3433 y 3434 ARN helicasa independiente de ATP dbpA
ORF01718
3435 y 3436 proteína hipotética
ORF01719
3437 y 3438 proteína transportadora similar a CorA Mg2+
ORF01720
3439 y 3440 dominio de ciclasa-fosfodiesterasa de diguanilato 1 (GGDEF)
ORF01721
3441 y 3442 proteína de dominio Smr
ORF01722
3443 y 3444 transportador de resistencia a medicamentos, familia Bcr-CflA (emrB)
ORF01723
3445 y 3446 proteína de secreción de familia HlyD
ORF01724
3447 y 3448 regulador transcripcional, familia AraC
ORF01725
3449 y 3450 proteína hipotética conservada
ORF01726
3451 y 3452 Metilado-ADN-proteína-cisteína de metiltransferasa (O-6-metiltransferasa metilguanina-ADN (MGMT) (0-6-metilguanina-ADN-alquiltransterasa [2.1.1.63]
ORF01727
3453 y 3454 Fumarato y reducción de nitrato de proteína reguladora
ORF01728
3455 y 3456 proteína de dominio de la familia de proteínas de estrés universales
ORF01729
3457 y 3458 proteína hipotética conservada
ORF01730
3459 y 3460 canal mecanosensitivo de pequeña conductancia
ORF01731
3461 y 3462 proteína penplásmica de unión al péptido de mureína precursor
ORF01732
3463 y 3464 proteína reguladora de operón xantosina.
ORF01733
3465 y 3466 proteína de dominio hidrolasa dienelactona
ORF01734
3467 y 3468 proteína hipotética conservada
ORF01735
3469 y 3470 racemasa de mandelato - enzima lactonizante de muconato, proteína de dominio C-terminal
ORF01736
3471 y 3472 Ycjl
ORF01737
3473 y 3474 peroxidasa de tiol (P20) [1.11.1.-]
ORF01738
3475 y 3476 proteína reguladora transcripcional tyrR
ORF01739
3477 y 3478 proteína hipotética conservada TIGR0162O
ORF01740
3479 y 3480 YcjX (AY008264)
ORF01741
3481 y 3482 homolog regulador transcripcional lin2974
ORF01742
3483 y 3484 proteína de membrana externa G precursor
ORF01743
3485 y 3486 dominio de la proteína transportadora ABC
ORF01744
3487 y 3488 beta-fosfoglucomutasa (pgmB) [5.4.2.6]
ORF01745
3489 y 3490 homólogo maltosa fosforilasa lin2966 (fosforilasa) [3.2.1.-]
ORF01746
3491 y 3492 oxidorreductasa, Gfo-ldh-MocA familia
ORF01747
3493 y 3494 homólogo de proteína de E. coli lin2968 (5.3.1.-]
ORF01748
3495 y 3496 deshidrogenasa de alcohol (EC 1.1.1.1). [1.1.1.-]
ORF01749
3497 y 3498 Transportador ABC, proteínas de permeasa (AF175299)
ORF01750
3499 y 3500 proteína de permeasa sistema de transporte Sn-glicerol-3-fosfato UgpA. (AF307052
ORF01751
3501 y 3502 Transportador ABC, proteína de unión al sustrato
ORF01752
3503 y 3504 dextransucrasa (EC 2.4.1.5), putativo [2.4.1.5]
ORF01753
3505 y 3506 dominio de proteína similar a rodanesa
ORF01754
3507 y 3508 proteína relacionada con proteína de choque fago
ORF01755
3509 y 3510 proteína de choque de fago C
ORF01756
3511 y 3512 proteína de choque de fago B
ORF01757
3513 y 3514 proteína de choque de fago A
ORF01758
3515 y 3516 activador transcripcional de operón psp
ORF01759
3517 y 3518 permeasa de aminoácido probable ycjJ
ORF01760
3519 y 3520 proteína hipotética conservada
ORF01761
3521 y 3522 proteína de transporte péptido periplásmico sapA precursor
ORF01762
3523 y 3524 proteína de permeasa de sistema de transporte péptido sapB
ORF01763
3525 y 3526 proteína de permeasa sistema de transporte péptido sapC (sapC
ORF01764
3527 y 3528 proteína de sistema de transporte de péptidos de unión a ATP sapD
ORF01765
3529 y 3530 proteína del sistema de transporte de péptidos de unión a ATP sapF
ORF01766
3531 y 3532 transportador de resistencia a medicamentos, proteína de familia Bcr-CflA
ORF01767
3533 y 3534 proteína de membrana externa EefC
ORF01768
3535 y 3536 resistencia a la proteína B Acriflavina
ORFOI769
3537 y 3538 resistencia a la proteína de acriflavina A precursor (MFP)
ORF01770
3539 y 3540 regulador transcnptionat, familia TetR
ORF01771
3541 y 3542 enoil-[acil-cámar-proteína] reductasa ECs1861 (NADH) [1.3.1.9]
ORF01772
3543 y 3544 proteína hipotética conservada
ORF01773
3545 y 3546 exoribonucleasa II (mb) [3.1.13.1]
ORF01774
3547 y 3548 proteína cuadro sensorial
ORF01775
3549 y 3550 proteína hipotética conservada
ORF01776
3551 y 3552 glicerol-3-fosfato regulon represor, putativo
ORF01777
3553 y 3554 Osmóticamente inducible lipoproteína B-precursor de la proteína relacionada
ORF01778
3555 y 3556 traducción factor de iniciación SUI1, putativo
ORF01779
3557 y 3558 orotidina descarboxilasa 5'-fosfato (pyrF) [4.1.1.23]
ORF01780
3559 y 3560 proteína hipotética
ORF01781
3561 y 3562 predicho N-acetilglucosaminil transferasa
ORF01782
3563 y 3564 producto de proteína sin nombre
ORF01783
3565 y 3566 fosfatidyiglicerofosfatasa B (pgpB) [3.1.3.27]
ORF01784
3567 y 3568 GTP ciclohidrolasa II (ribA) (3.5.4.25]
ORF01785
3569 y 3570 aconitato hidratasa 1 (acnA) [4.2.1.3]
ORF01786
3571 y 3572 proteína hipotética conservada
ORF01787
3573 y 3574 proteína hipotética conservada
ORF01788
3575 y 3576 regulador transcripcional de tipo HTH cysB (activador transcripcional regulón Cys)
ORF01789
3577 y 3578 ADN topoisomerasa I
ORF01790
3579 y 3580 proteína hipotética
ORF01791
3581 y 3582 proteína yciN
ORF01792
3583 y 3584 Posible proteasa sohB
ORF01793
3585 y 3586 Oxidorreductasa [1.-.-.-]
ORF01794
3587 y 3588 mazorca (l) alamina adenosiltransferasa (cobO) [2.5.1.17]
ORF01795
3589 y 3590 ARN proteína de familia sintasam de pseudouridilato [4.2.1.70]
ORF01796
3591 y 3592 proteína hipotética conservada
ORF01797
3593 y 3594 proteína de familia Sua5-YciO-YrdC-YwIC
ORF01798
3595 y 3596 trpH de proteínas
ORF01799
3597 y 3598 componente de antranilato sintasa I (trpE) [4.1.3.27]
ORF01800
3599 y 3600 componente de antranilato sintasa 11 [4.1.3.27]
ORF01801
3601 y 3602 isomerasa antranilato (PRAI) [4.1.1.48]
ORF01802
3603 y 3604 triptófano sintetasa, subunidad beta (trpB) [4.2.1.20]
ORF01803
3605 y 3606 triptophano sintetasa, subunidad alfa (trpA) [4.2.1.20]
ORF01804
3607 y 3608 proteína hipotética conservada
ORFOI805
3609 y 3610 yciF de proteína
ORF01BO6
3611 y 3612 yciE
ORF01807
3613 y 3614 proteína de membrana externa W precursor
ORF01808
3615 y 3616 homólogo de proteína de ensamblaje de fibras de cola de profago lamboidea
ORF01809
3617 y 3618 homólogo de proteína de ensamblaje de fibras de cola de profago lamboidea Qin
ORF01810
3619 y 3620 proteína de membrana probable de profago CP-933X Z1918
ORF01811
3621 y 3622 proteína de membrana probable de profago CP-933X Z1918
ORF01812
3623 y 3624 proteína desconocida codificada por profago CP-933x
ORF01813
3625 y 3626 proteína hipotética
ORF01814
3627 y 3628 Lom
ORF01815
3629 y 3630 proteína de especificidad huésped (parcial)
ORF01816
3631 y 3632 proteína de especificidad huésped J (parcial)
ORFOI817
3633 y 3634 Bacteriófago lambda cola proteína de ensamblaje I
ORF01818
3635 y 3636 componente de fibra de cola putativo K de profago
ORF01819
3637 y 3638 proteína de cola menor
ORF01820
3639 y 3640 proteína de cola menor
ORF01821
3641 y 3642 proteína de cola del fago menor
ORF01822
3643 y 3644 proteína de cola menor precursor H
ORF01823
3645 y 3646 proteína de cola menor
ORF01824
3647 y 3648 proteína de cola menor del fago G
ORF01825
3649 y 3650 dominio de bacterias similar a Ig (grupo 2) familia
ORF01826
3651 y 3652 Proteína de cola menor de fago U
ORF01827
3653 y 3654 Profago proteína de cola menor Z (GPZ)
ORF01828
3655 y 3656 Adjunto fago cabeza-cola
ORF01829
3657 y 3658 proteína hipotética conservada
ORF01830
36598 3660 Fago cápside principal proteína E
ORF01831
3661 y 3662 Bacteriófago lambda cabeza decoración de proteína D
ORF01832
3663 y 3664 cabeza-cola proteína preconectora GP5
ORF01833
3665 y 3666 proteína portal fago, familia lambda
ORF01834
3667 y 3668 gpW
ORF01835
3669 y 3670 Fago terminasa subunidad grande (GpA)
ORF01836
3671 y 3672 Terminasa subunidad pequeña (GP1) (fragmento)
ORF01837
3673 y 3674 proteína hipotética
ORF01838
3675 y 3676 proteína de lisis bacteriófago
ORF01839
3677 y 3678 proteína relacionada con lipoproteína RZL precursor
ORF01840
3679 y 3680 proteína putativa bacteriófago
ORF01841
3681 y 3682 Lisocima (proteína de lisis) (muramidasa) (endolisina) [3.2.1.17]
ORF01842
3683 y 3684 Proteína de función desconocida (DUF1327) superfamilia
ORF01843
3685 y 3686 proteína de lisis S homólogo de profago lamboidea
-0W0-1844
3687 y 3688 producto de proteína sin nombre; ORF616
ORF01845
3689 y 3690 producto de proteína sin nombre; ORF616
ORF01846
3691 y 3692 ADN adenina-metilasa
ORF01847
3693 y 3694 proteína desconocida codificada por profago CP-933O
ORF01848
3695 y 3696 Antiterminación homólogo de la proteína Q del profago críptico
ORF01849
3697 y 3698 endodeocinbonucleasa RUS (resolvasa de cruce Holliday) [3.1.22.-]
ORF01850
36998 3700 Proteína de función desconocida (DUF1277) superfamilia
ORF01851
3701 y 3702 profago proteína de mantenimiento [similitud] proteína relacionada
ORF01852
3703 y 3704 proteína hipotética
ORF01853
3705 y 3706 proteína hipotética conservada
ORF01854
3707 y 3708 proteína desconocida codificada dentro de profago
ORF01855
3709 y 3710 proteína hipotética conservada
ORF01856
3711 y 3712 proteína desconocida codificada por prófago críptico
ORF01857
3713 y 3714 dominio de peptidasa similar a S24, putativo
ORF01858
3715 y 3716 Proteína de función desconocida familia (DUF1391)
ORF01859
3717 y 3718 proteínas relacionadas con proteína ydfB
ORF01860
37198 3720 proteína hipotética conservada
ORFOI861
3721 y 3722 proteína hipotética
ORF01862
3723 y 3724 proteína de inhibición de división dicB
ORF01863
3725 y 3726 proteína desconocida codificada por la proteína relacionada de profago CP-9330
ORFOI864
3727 y 3728 Exodeoxiribonucleasa VIII (35kD) [3.1.11.-]
ORF01865
3729 y 3730 integrasa
ORF01866
3731 y 3732 proteína de membrana externa W precursor
ORF01867
3733 y 3734 yciC
ORF01868
3735 y 3736 proteína intracelular de ceptación A (ispZ)
ORF01869
37378 3738 acil-CoA hidrolasa [3.1.2.-]
ORF01870
3739 y 3740 proteína TonB
ORF01871
3741 y 3742 proteína ycil
ORF01872
3743 y 3744 proteína de canal de potasio putativo
ORF01873
3745 y 3746 Cardiolipina sintetasa (cardiolipina sintasa) (CLsintasa) [2.7.8.-]
ORF01874
3747 y 3748 Proteína de función desconocida, DUF44O superfamilia
ORF01875
3749 y 3750 transportador péptido ABC, proteína de unión a ATP (AA1)
ORF01876
3751 y 3752 transportador oligopéptido ABC, proteína de unión a ATP (AA1)
ORF01877
3753 y 3754 transportador oligopéptido ABC, permeasa de proteínas (AA1)
ORF01878
3755 y 3756 proteína de sistema de permeasa transporte oligopéptido oppB (AA1)
ORF01879
3757 y 3758 proteína de unión de oligopéptidos periplásmicos precursor
ORF01880
3759 y 3760 proteína de membrana, putativo
ORF01881
3761 y 3762 deshidrogenasa de acetaldehído (acetilación) - deshidrogenasa de alcohol (EC 1.1.1.1) (ACDH [1.2.1.10]
ORF01882
3763 y 3764 insG transposasa para el elemento de secuencia de inserción IS4
ORF01883
3765 y 3766 quinasa de timidina [2.7.1.21]
ORF01884
3767 y 3768 proteína hipotética conservada
ORF01885
3769 y 3770 homólogo ADN-proteína de unión H-NS virR
ORF01886
3771 y 3772 uridililtransferasa UTP-glucosa-1-fosfato (galU) [2.7.7.9]
ORF01887
3773 y 3774 proteína HNR
ORF01888
3775 y 3776 transportador de drogas
ORF01889
3777 y 3778 producto de proteína sin nombre
ORF01890
3779 y 3780 desformilasa formiltetrahidrofolato (purU) [3.5.1.10]
ORF01891
3781 y 3782 proteína Tpn1330
ORF01892
3783 y 3784 nitrato reductasa respiratoria, subunidad gamma (clavo) [1.7.99.4]
ORF01893
3785 y 3786 reductasa de nitrato respiratorio, cadena delta 1 [1.7.99.4]
ORF01894
3787 y 3788 reductasa de nitrato, subunidad beta (narH) [1.7.99.4]
ORF01895
3789 y 3790 nitrato reductasa, subunidad alfa [1.7.99.4]
ORF01896
3791 y 3792 proteína de extrusión nitrito 1
ORF01897
3793 y 3794 sensor de proteína de nitrato-nitrito narX [2.7.3.-]
ORF01898
3795 y 3796 narL
ORF01899
3797 y 3798 proteína hipotética conservada
ORF01900
3799 y 3800 proteína YchN
ORF01901
3801 y 3802 proteína de transporte de cationes chaC
ORF01902
3803 y 3804 regulador de transporte de cationes chaB-proteína relacionada
ORF01903
3805 y 3806 antiporter de calcio-protón
ORF01904
3807 y 3808 proteína hipotética conservada
ORF01905
3809 y 3810 3-desoxi-8-fosF00ctulonato sintasa (kdsA) [2.5.1.55]
ORF01906
3811 y 3812 proteína sirB1
ORF01907
3813 y 3814 proteína sirB1
ORF01908
3815 y 3816 proteína sirB2
ORF01909
3817 y 3818 metiltransferasa de proteína hemK (hemK) [2.1.1.-]
ORF01910
3819 y 3820 factor de liberación de cadena peptídica 1 (prfA)
ORF01911
3821 y 3822 reductasa glutarnyl-ARNt (hemA) [1.2.1.-]
ORF01912
3823 y 3824 lipoproteína de membrana externa LolB (lolB)
ORF01913
3825 y 3826 4-difosfocitidil-2C-metil-D-eritritol quinasa (ispE) [2.7.1.148]
ORF01914
3827 y 3828 pirofosfoquinasa ribosa-fosfato
ORF01915
3829 y 3830 sulfato de permeasa de proteína de familia
ORF01916
3831 y 3832 proteína hipotética conservada
ORF01917
3833 y 3834 hidrolasa de peptidil-ARNt (pth) [3.1.1.29]
ORF01918
3835 y 3836 proteína de unión a GTP YchF (ychF)
ORF01919
3837 y 3838 proteína reguladora de operón del metabolismo de glicerol
ORF01920
3839 y 3840 quinasa de dihidroxiacetona, subunidad DhaK (dhak) [2.7.1.-]
ORF01921
3841 y 3842 quinasa de dihidroxiacetona, subunidad L [2.7.1.-]
ORF01922
3843 y 3844 fosfoenolpiruvato-proteína de fosfotransferasa, componentes El-HPr-EllA
ORF01923
3845 y 3846 proteína hipotética
ORF01924
3847 y 3848 proteína hipotética conservada
ORF01925
3849 y 3850 Trehalasa [3.2.1.28]
ORF01926
3851 y 3852 proteína de unión periplásmica familiar
ORF01927
3853 y 3854 Hierro (111)
ORF01928
3855 y 3856 proteína hipotética conservada
ORF01929
3857 y 3858 posible sistema de transporte de hierro-sideróforo tipo ABC proteína de unión ATP (III)
ORF01930
3859 y 3860 proteína hipotética conservada
ORF01931
3861 y 3862 proteína modD (modD)
ORF01932
3863 y 3864 receptor de la membrana externa putativa, probablemente dependiente de tonB
ORF01933
3865 y 3866 proteína asociada de transglicosilasa
ORF01934
3867 y 3868 superfamilia de proteínas YcgR
ORF01935
3869 y 3870 transglicosilasa de mureína E
ORF01936
3871 y 3872 carboxipeptidasa de muramoiltetrapéptido (LD-carboxipeptidasa A) [3.4.17.13]
ORF01937
3873 y 3874 antiporter Na+-H+
ORF01938
3875 y 3876 racemasa de alanina (aire) [5.1.1.1]
ORF01939
3877 y 3878 subunidad pequeña de dehidrogenasa D-aminoácido
ORF01940
3879 y 3880 proteína no identificada
ORF01941
3881 y 3882 regulón regulador negativo de fad, y positivo
ORF01942
3883 y 3884 Na+-H+ antiporter NhaB (nhaB)
ORF01943
3885 y 3886 Proteína de formación de enlace de disulfuro B [1.8.4.-]
ORF01944
3887 y 3888 proteína UmuC
ORF01945
3889 y 3890 proteína UmuD (R391) [3.4.21-]
ORF01946
3891 y 3892 citolisina A
ORF01947
3893 y 3694 proteína de bacteria de función desconocida (DUF838) superfamilia
ORF01948
3895 y 3896 Proteína ycgM (FAA)
ORF01949
3897 y 3898 proteína ycgL
ORFOI950
3899 y 3900 Fels-1 Profago familia similar a proteínas
ORF01951
3901 y 3902 proteína de determinación de sitio de tabique MinC (minC)
ORF01952
3903 y 3904 Lom
ORF01953
3905 y 3906 componente de cola putativo del profago (parcial)
ORF01954
3907 y 3908 Lom
ORF01955
3909 y 3910 componente de cola de profago putativo (parcial)
ORF01956
3911 y 3912 proteína hipotética
ORF01957
3913 y 3914 regulador transcripcional familiar GntR
ORF01958
3915 y 3916 proteína hipotética conservada
ORF01959
3917 y 3918 reductasa fructuronato
ORF01960
3919 y 3920 cotransportador metabolito-protón (PPII)
ORF01S61
3921 y 3922 L-iditol 2-deshidrogenasa
ORF01962
3923 y 3924 proteína de detección de la inanición rspA
ORF01963
3925 y 3926 BCR no caracterizado, familia superfamilia YnfA-UPF0060
ORF01964
3927 y 3928 Proteína de función desconocida (DUF1283) superfamilia
ORF01965
3929 y 3930 espermidina N(1)acetiltransferasa (SAT) [2.3.1.57]
ORF01966
3931 y 3932 proteína ynfC
ORF01967
3933 y 3934 Proteína de función desconocida (DUF1161) familia
ORF01968
3935 y 3936 DmsA [1.8.99.-]
ORF01969
3937 y 3938 DmsA [1.8.99.-]
ORF01970
3939 y 3940 cadena de reductasa de dimetilsulfóxido A2 precursor, anaeróbico [1.8.-.-]
ORF01971
3941 y 3942 cadena de reductasa de sulfóxido dimetil anaeróbico B (dmsB) [1.8.-.-]
ORF01972
3943 y 3944 DMSO subunidad de anclaje de reductasa (DmsC) (dmsC) [1.8.99.-]
ORF01973
3945 y 3946 proteína TorD
ORF01974
3947 y 3948 sintetasa de detiobiotina (DTBS)
ORF01975
3949 y 3950 supuesta proteína del canal de cloruro similar a eriC
ORF01976
3951 y 3952 proteína Mlc
ORF01977
3953 y 3954 regulador de la transcripción, familia LysR
ORF01978
3955 y 3956 producto de proteína sin nombre
ORF01979
3957 y 3958 familia de repetición de proteína de choque ácido
ORF01980
3959 y 3960 endopeptidasa de glutamil [3.4.21.-]
ORF01981
3961 y 3962 chaperona posible
ORF01982
3963 y 3964 bomba de eflujo de fármaco superfamilia DMT
ORF01983
3965 y 3966 Dominio de función desconocida, putativo
ORF01984
3967 y 3968 NAD(P) transhidrogenasa, subunidad beta (pntB) [1.6.1.2]
ORF01985
3969 y 3970 NAD (P) transhidrogenasa, subunidad alfa (pntA) [1.6.1.1]
ORF01986
3971 y 3972 Proteína ydgH precursor
ORF01987
3973 y 3974 proteína hipotética
ORF01988
3975 y 3976 producto de proteína sin nombre
ORF01989
3977 y 3978 fabG5, putativo [1.-.-.-]
ORF01990
3979 y 3980 glpM proteína de membrana
ORF01991
3981 y 3982 proteína reguladora transcripcional rstA
ORF01992
3983 y 3984 proteína de sensor rstB [2.7.3.-)
ORF01993
3985 y 3986 proteína de unión a sitio terminal de replicación ADN
ORF01994
3987 y 3988 hidratasa de fumarato clase II (fumC) [4.2.1.2]
ORF01995
3989 y 3990 hidratasa de fumarato clase I, anaeróbico [4.2.1.2]
ORF01996
3991 y 3992 manosa-6-fosfato isomerasa, clase I (manA) [5.3.1.8]
ORF01997
3993 y 3994 proteína bacteriana de función desconocida (DUF945) superfamilia
ORF01998
3995 y 3996 proteína asociada a la membrana
ORFOI999
3997 y 3998 proteína transportadora de glucurónido
ORFO2000
3999 y 4000 Beta-glucuronidasa (GUS) [3.2.1.31]
ORFO2001
4001 y 4002 regulador transcripcional, proteína de dominio de familia TetR putativo
ORF02002
4003 y 4004 7-alfa-hidroxiesteroide deshidrogenasa
ORF02003
4005 y 4006 proteína reguladora de regulón maltosa mall
ORF02004
4007 y 4008 sistema de PTS, maltosa y el componente IIBC específico de glucosa (malX) [2.7.1.69]
ORF02005
4009 y 4010 aminotransferasa clase II, putativo [4.4.1.8]
ORF02006
4011 y 4012 deaminasa de adenosina (adición) [3.5.4.4]
ORF02007
4013 y 4014 deshidrogenasa predicha
ORF02008
4015 y 4016 proteína Hha
ORF02009
4017 y 4018 proteína hipotética conservada
ORFO2010
4019 y 4020 transporte de electrones proteína compleja mfA
ORFO2011
4021 y 4022 transporte de electrones proteína compleja mfB
ORFO2012
4023 y 4024 transporte de electrones proteína compleja mfC
ORF02013
4025 y 4026 transporte de electrones proteína compleja mfD
ORF02014
4027 y 4028 transporte de electrones proteína compleja mfG (mfG)
ORFO2015
4029 y 4030 transporte de electrones proteína compleja mfE
ORF02016
4031 y 4032 endonucleasa III (nth) [4.2.99.18]
ORFO2017
4033 y 4034 transportador hipotético ydgR
ORF02018
4035 y 4036 S-transferasa de glutatión [2.5.1.18]
ORF02019
4037 y 4038 quinasa de piridoxal [2.7.1.35]
ORFD2O20
4039 y 4040 sintetasa de Iirosil-ARNt (tyrS) [6.1.1.1]
ORF02021
4041 y 4042 piridoxamina 5’-fosfato oxidasa (pdxH) [1.4.3.5]
ORF02022
4043 y 4044 proteína ydhA
ORF02023
4045 y 4046 UPF0075 proteína hipotética ydhH
ORF02024
4047 y 4048 SlyA
ORF02025
4049 y 4050 proteína de resistencia de ácido fusárico FusE.
ORF02026
4051 y 4052 familia región conservada de proteína de resistencia de ácido fusárico
ORF02027
4053 y 4054 dismutasa de superóxido de cobre y zinc (sodC)
ORF02028
4055 y 4056 oxidorreductasa, familia de reductasa aldo-ceto [1.-.-.-]
ORF02029
4057 y 4058 producto de proteína sin nombre
ORF02030
4059 y 4060 proteína reguladora de la transcripción
ORF02031
4061 y 4062 reductasa de N-etilmaleimida (Y13942) [1.-.-.-]
ORF02032
4063 y 4064 liasa de lactoilglutationa (gloA) [4.4.1.5]
ORF02033
4065 y 4066 libonucleasa T (mt) [3.1.13.-]
ORF02034
4067 y 4068 proteína relacionada con glutaredoxina
ORF02035
4069 y 4070 proteína hipotética
ORF02036
4071 y 4072 lipoproteína putativa
ORF02037
4073 y 4074 dismutasa de superóxido, hierro (1.15.1.1]
ORF02038
4075 y 4076 transportador de familia facilitador principal (AL 136500)
ORF02039
4077 y 4078 proteína hipotética
ORF02040
4079 y 4080 represor de síntesis de nucleótidos de purina (purR)
ORF02041
4081 y 4082 activador transcripcional de operón cyn.
ORF02042
4083 y 4084 proteína de resistencia biciclomicina (proteína de resistencia de sulfonamida).
ORF02043
4085 y 4086 ciclopropano-graso-acil-fosfolípido sintasa [2.1.1.79]
ORF02044
4087 y 4088 sintasa de riboflavina, subunidad alfa (ribE) [2.5.1.9]
ORF02045
4089 y 4090 proteína de multirresistencia de fármacos múltiples norM
ORF02046
4091 y 4092 enzima posible
ORF02047
4093 y 4094 Proteína precursor ydhR
ORF02048
4095 y 4096 proteína hipotética conservada
ORF02049
4097 y 4098 proteína hipotética conservada
ORF02050
4099 y 4100 homólogo proteína PHSC [2.8.1.5]
ORF02051
4101 y 4102 nrfC homólogo de proteína b1671 (nrfC) [2.8.1.5]
ORF02052
4103 y 4104 proteína hipotética conservada
ORF02053
4105 y 4106 aldehído-ferredoxina oxidorreductasa PH0892 (aor) [1.-.-.-]
ORF02054
4107 y 4108 oxidorreductasa aldehído (aor) [1.-.-.-]
ORF02055
4109 y 4110 proteína de unión a grupo hierro-azufre [2.8.1.5]
ORF02056
4111 y 4112 proteína hipotética conservada
ORF02057
4113 y 4114 quinasa de piruvato (pyk) [2.7.1.40]
ORF02058
4115 y 4116 lipoproteína principal de membrana externa
ORF02059
4117 y 4118 familia ErfK-YbiS-YcfS-YnhG
ORF02060
4119 y 4120 proteína SufE (orf5)
ORF02061
4121 y 4122 aminotransferasa, clase-V [4.4.1.16]
ORF02062
4123 y 4124 proteína de ensamblaje FeS SufD (sufD)
ORF02063
4125 y 4126 FeS conjunto de ATPasa SufC (sufC)
ORF02054
4127 y 4128 FeS proteína de ensamblaje SufB (sufB)
ORF02065
4129 y 4130 FeS montaje del andamio SufA (sufA)
ORF02066
4131 y 4132 producto de proteína sin nombre
ORF02067
4133 y 4134 dominio no caracterizado 1, putativo
ORF02068
4135 y 4136 oxidorreductasa, unión de FAD, putativa
ORF02069
4137 y 4138 UPF0118 proteína hipotética ydiK
ORF02070)
4139 y 4140 proteína hipotética conservada
ORF02071
4141 y 4142 homólogo de proteína de sistema de transporte permeasa lin2340
ORF02072
4143 y 4144 proteína de transporte hipotética ydiN
ORF02073
4145 y 4146 chiquimato 5-deshidrogenasa [1.1.1.-]
ORF02074
4147 y 4148 3-dehidroguinato deshidratasa, tipo I (aroD) (4.2.1.10]
ORF02075
4149 y 4150 subunidad acetil-CoA-transferasa, putativo [2.8.3.-]
ORF02076
4151 y 4152 proteína de la familia deshidrogenasa acil-CoA, putativo [1.3.99.-]
ORF02077
4153 y 4154 Regulador transcripcional hipotética ydiP
ORF02078
4155 y 4156 proteína FixA
ORF02079
4157 y 4158 flavoproteína transferencia de electrones, subunidad alfa, putativo
ORF02080
4159 y 4160 flavoproteína, probable transporte de electrones [1.5.5.-]
ORF02081
4161 y 4162 proteína similar a Ferredoxina ydiT
ORF02082
4163 y 4164 Sustrato—CoA ligasa, putativo [6.2.1.-]
ORF02083
4165 y 4166 sintasa de fosfoenolpiruvato (ppsA) [2.7.9.2]
ORF02084
4167 y 4168 UPF0085 proteína hipotética ydiA
ORF02085
4169 y 4170 fosfo-2-dehidro-3-deoxiheptonato aldolasa [2.5.1.54]
ORF02086
4171 y 4172 proteína hipotética conservada
ORF02087
4173 y 4174 UPF006I proteína hipotética ydiU (AP001520)
ORF02088
4175 y 4176 proteína hipotética conservada
ORF02089
4177 y 4178 lipoproteína (ORF)
ORF02090
4179 y 4180 Vitamina B12 proteína de transporte de unión a ATP btuD (VitaminaB12-ATPasa transportadora) [3.6.3.33]
ORF02091
4181 y 4182 Peróxido de glutation
ORF02092
4183 y 4184 Vitamina B12 permeasa sistema de transporte de proteínas btuC (membrana)
ORF02093
4185 y 4186 factor de integración huesped, subunidad alfa (ihfA)
ORF02094
4187 y 4188 fenilalanil-ARNt sintetasa, subunidad beta (pheT) [6.1.1.20]
ORF02095
4189 y 4190 fenilalanil-ARNt sintetasa, subunidad alfa (pheS) [6.1.1.20]
ORF02096
4191 y 4192 proteína ribosomal L20 (rplT)
ORF02097
4193 y 4194 proteína ribosomal L35 (rpml) -
ORF02098
4195 y 4196 factor de inicio de traducción IF-3 (infC)
ORF02099
4197 y 4198 sintetasa treonil-ARNt / (thrS) [6.1.1.3]
ORFO2100
4199 y 4200 proteína InsAB'
ORFO2101
4201 y 4202 proteína insA
ORF02102
4203 y 4204 proteína hipotética
ORF02103
4205 y 4206 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF481
ORF02104
4207 y 4208 pfkB (pfkB) [2.7.1.11]
ORFO2105
4209 y 4210 proteína hipotética conservada
ORF02106
4211 y 4212 subfamilia quinasa fructosarnina
ORF02107
4213 y 4214 proteína hipotética conservada
ORF02108
4215 y 4216 Proteína yniC (YniC) [3.1.3.18]
ORF02109
4217 y 4218 hidrolasa predicha metal dependiente de membrana (DUF457) familia
ORFO2I10
4219 y 4220 sodio: proteína de familia cotransportadora de dicarboxilato
ORFO2111
4221 y 4222 activador de la división celular cedA
ORFO2I12
4223 y 4224 proteína hipotética conservada
ORF02113
4225 y 4226 catalasa HPII (III) [1.11.1.6]
ORFO2114
4227 y 4228 producto de proteína sin nombre; ORF 28.5
ORFO2115
4229 y 4230 6-fosfo-beta-glucosidasa [3.2.1.86]
ORF02116
4231 y 4232 represor operón Cel
ORF02117
4233 y 4234 enzima fosfotransferasa dependiente de PEP III para celobiosa, arbutina, y salicina (PTS) [2.7.1.69]
ORF02118
4235 y 4236 PTS sistema de celobiosa-específico componente de IIC (celB)
ORFO2119
4237 y 4238 sistema PTS, N, N'-diacetilquitobiosa-específica componente (EllB-Chb) (N,N'diacetilquitobiosa-permeasa componente IIB) (Fosfotransferasaenzyma II, componente B [2.7.1.69]
ORF02120
4239 y 4240 Osmóticamente inducible E lipoproteína precursor
ORF02121
4241 y 4242 NAD + sintetasa (nadE) [6.3.1.5]
ORF02122
4243 y 4244 proteína bacteriana de función desconocida superfamilia (DUF886)
ORF02123
4245 y 4246 excinucleasa ABC subunidad C homólogo
ORF02124
4247 y 4248 Esferoplastos proteína Y precursor
ORF02125
4249 y 4250 proteína hipotética conservada
ORFO2126
4251 y 4252 Succinilglutamato desuccinilasa [3.1.-.-]
ORFO2127
4253 y 4254 Succinilarginina dihidrolasa (astB)
ORFO2128
4255 y 4256 Succinato deshidrogenasa semialdehido (EC 1.2.1.24) (NAD(+)-semialdehído succínico deshidrogenasa dependiente). (retinol) [1.2.1.24]
ORF02129
4257 y 4258 La arginina N-succiniltransferasa subunidad beta (astA) [2.3.1.109]
ORFO2130
4259 y 4260 transaminasa succinilomitina (Succinilomitinaaminotransferasa) (ACOAT) [2.6.1.-]
ORF02131
4261 y 4262 exodeoxinbonucleasa III (xth) [3.1.11.2]
ORF02132
4263 y 4264 proteína de membrana, probable, putativo
ORF02133
4265 y 4266 proteína hipotética conservada
ORF02134
4267 y 4268 familia familia dedA
ORF02135
4269 y 4270 IS110 transposasa familia, truncamiento, putativo
QRFO2136
4271 y 4272 ynjB de proteínas
ORF02137
4273 y 4274 Hipotética proteína transportadora ABC permeasa ynjC
ORF02138
4275 y 4276 proteína de membrana interna Malk (P-loop)
ORF02139
4277 y 4278 2.8.1.1 [2.8.1.1]
ORF02140
4279 y 4280 sintasa de fosfatidilglicerofosfato
ORF02141
4281 y 4282 Proteína de función desconocida (DUF1496) superfamilia
ORF02142
4283 y 4284 mutT2 [3.6.1.-]
ORF02143
4285 y 4286 NADP específico de glutamato deshidrogenasa (NADP-GDH) [1.4.1.4]
ORFO2144
4287 y 4288 ADN topoisomerasa III
ORF02145
4289 y 4290 seleniuro, diquinasa de agua (selD) [2.7.9.3]
ORF02146
4291 y 4292 ydjA de proteínas
ORF02147
4293 y 4294 proteína hipotética
ORF02148
4295 y 4296 péptido señal peptidasa SppA, tipo 67K (sppA) [3.4.-.-)
ORF02149
4297 y 4298 L-asparinasa (ansA) [3.5.1.1]
ORF02150
4299 y 4300 Pirazinamidasa-nicotinamidasa (PZASE) [3.5.1.-]
ORF02151
4301 y 4302 proteína de transporte putativo
ORF02152
4303 y 4304 similar al regulador de la transcripción de la familia DeoR
ORFO2153
4305 y 4306 aldo-ceto reductasa Atu3877 (gsp69) [1.-.-.-]
ORFO2154
4307 y 4308 quinasa putativa
ORF02155
4309 84310 fructosa-tagatosa bisfosfato aldolasa [4.1.2.-]
ORF02156
4311 y 4312 Sorbitol deshidrogenasa (EC 1.1.1.14) (L-iditol 2-deshidrogenasa). (sorbitol) [1.1.1.14)
ORF02157
4313 y 4314 Dl transportador de membrana.
ORF02158
4315 y 4316 sorbitol deshidrogenasa, putativo [1.1.1.-)
ORF02159
4317 y 4318 Proteína de función desconocida (DUF1315) superfamilia
ORF02160
4319 y 4320 metionina-R-sulfóxido reductasa (msrB) [1.8.4.6]
ORF02161
4321 y 4322 gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa, tipo I (gap) [1.2.1.-]
ORF02162
4323 y 4324 transglicolasa (fragmento)
ORF02163
4325 y 4326 Morfina 6-deshidrogenasa (EC 1.1.1.218) (Natoxona reductasa). (PA0804) [1.1.1.-]
CRFO2164
4327 y 4328. MltA que interacciona con proteína precursor
ORF02165
4329 y 4330 proteína hipotética
ORF02166
4331 y 4332 quinasa proteína
ORF02167
4333 y 4334 UPF0229 proteína hipotética yeaH
ORFO2168
4335 y 4336 proteína de dominio GGDEF
ORF02169
4337 y 4338 proteína de dominio GGDEF
ORFO2170
4339 y 4340 producto de proteína sin nombre
ORF02171
4341 y 4342 regulador transcripcional araC familia
ORF02172
4343 y 4344 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF441)
ORF02173
4345 y 4346 ciariato transportador MFS (permeasa)
ORF02174
4347 y 4348 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF488
ORF02175
4349 y 4350 hemolisina VCA0594
ORF02176
4351 y 4352 proteína de dominio GGDEF
ORF02177
4353 y 4354 proteína hipotética
ORF02178
4355 y 4356 proteína asociada transglicosilasa
ORF02179
4357 y 4358 proteína hipotética conservada
ORF02180
4359 y 4360 telurito proteína de resistencia TehB, putativo
ORF02181
4361 y 4362 proteína hipotética
ORF02182
4363 y 4364 transponedor de proteínas, superfamilia familia LysE
ORF02183
4365 y 4366 proteína hipotética conservada
ORF02184
4367 y 4368 tartrato deshidrogenasa (3-IPM-DH) [1.1.1.93]
ORF02185
4369 y 4370 ribonucleasa D (md) [3.1.26.3]
ORF02186
4371 y 4372 ligasa de ácido graso-CoA de cadena larga
ORF02187
4373 y 4374 lipoproteína de membrana externa
ORF02188
4375 y 4376 Hipotética M22 peptidasa homólogo yeaZ [3.4.24.57]
ORF02189
4377 y 4378 producto de proteína sin nombre
ORF02190
4379 y 4380 Endonbonucleasa L-PSP superfamilia
ORF02191
4381 y 4382 proteína hipotética conservada
ORF02192
4383 y 4384 proteína relacionada con yoaH proteína hipotética UPF0181
ORF02193
4385 y 4386 componente sintasa para-aminobenzoato I [6.3.5.8]
ORF02194
4387 y 4388 proteína familiar MutT
ORF02195
4389 y 4390 L-Serina amonia-liasa (sdaA) [4.3.1.17]
ORF02196
4391 y 4392 proteína de dominio EAL
ORFO2197
4393 y 4394 posible CorC-HlyC familia de Mg+2-Co+2 flujo de bombas de salida de metal pesado
ORF02198
4395 y 4396 PTS enzima IIAB, manosa-específica (Ell-MAN)
ORF02199
4397 y 4398 PTS sistema, componente IIC específico de manosa
ORF02200
4399 y 4400 PTS sistema, componente IID específico de manosa
ORF02201
4401 y 4402 UPF0266 proteína hipotética yobD
ORF02202
4403 y 4404 Dominio de función desconocida familia DUF
ORF02203
4405 y 4406 23S ARNr m1G745 metiltransferasa, putativo [2.1.1.51]
ORF02204
4407 y 4408 proteína similar al choque frío cspE
ORF02205
4409 y 4410 proteína hipotética conservada
ORF02206
4411 y 4412 lipoproteína, putativo
ORF02207
4413 y 4414 proteína hipotética conservada
ORF02208
4415 y 4416 regulador transcripcional kdgR
ORF02209
4417 y 4418 proteína de resistencia a múltiples fármacos B
ORF02210
4419 y 4420 proteínas de choque térmico, proteína integral de membrana (htpX) [3.4.24.-]
ORF02211
4421 y 4422 cola-específica de la proteasa precursora [3.4.21.102]
ORF02212
4423 y 4424 carboxi-terminal de la proteasa de proteína de unión a penicilina 3
ORF02213
4425 y 4426 efector ProP
ORF02214
4427 y 4428 proteína de dominio GAF
ORF02215
4429 y 4430 proteína PqiA
ORFO2216
4431 y 4432 proteína PqiA
ORF02217
4433 y 4434 familia de proteínas relacionadas con me
ORF02218
4435 y 4436 proteína de la familia de proteínas sun-nucleolar
ORF02219
4437 y 4438 Proteína de función desconocida (DUF1480) superfamilia
ORF02220
4439 y 4440 Proteína de función desconocida (DUF1482) familia
ORF02221
4441 y 4442 Serina-treonina proteína fosfatasa 1
ORF02222
4443 y 4444 proteína hipotética conservada
ORF02223
4445 y 4446 producto de proteína sin nombre
ORF02224
4447 y 4448 familia de proteínas de resistencia de cobre D, putativo
ORF02225
4449 y 4450 Proteína precursora yobA
ORF02226
4451 y 4452 ADN polimerasa Ill, subunidad teta [2.7.7.7]
ORF02227
4453 y 4454 hidrolasa, familia familia carbono-nitrógeno
ORF02228
4455 y 4456 ADN polimerasa III, subunidad alfa, tipo Gram-positivo, putativo
ORF02229
4457 y 4458 proteasa II (AB004795) [3.4.21.83]
ORF02230
4459 y 4460 marco de lectura no identificado
ORF02231
4461 y 4462 producto proteico sin nombre: Similar al precursor YebF lipoproteína de Escherichia coli
ORF02232
4463 y 4464 proteína hipotética
ORF02233
4465 y 4466 gen daño-inducible de ADN de genes en regulon SOS, dependiente de AMP cíclico y H-NS
ORF02234
4467 y 4468 fosforibosilglicinamida formiltransferasa 2 (purT) [2.1.2.-]
ORF02235
4469 y 4470 2-deidro-3-deoxifosfogluconato aldolasa-4-hidroxi-2- oxoglutarato aldolasa (eda) [4.1.3.16]
ORF02236
4471 y 4472 fosfogluconato deshidratasa (edd) [4.2.1.12]
ORF02237
4473 y 4474 glucosa-6-fosfato 1-dehidrogenasa (zwf) [1.1.1.49]
ORF02238
4475 y 4476 proteína hipotética conservada
ORF02239
4477 y 4478 Hex represor regulon
ORF02240
4479 y 4480 quinasa de piruvato (pyk) [2.7.1.40]
ORF02241
4481 y 4482 biosíntesis del lípido A (KDO)2-(Iauroil)-lípido IVA aciltransferasa (msbB) [2.3.1.-]
ORF02242
4483 y 4484 Envoltura celular
ORF02243
4485 y 4486 Proteínas de alta afinidad sistema de absorción de zinc precursor znuA (AE005408)
ORF02244
4487 y 4488 Superfamilia ABC de alta afinidad de proteína transportadora de Zn (atp_bind)
ORF02245
4489 y 4490 sistema de absorción de zinc de alta afinidad de proteína de membrana znuB (atp.bind)
ORF02246
4491 y 4492 Holliday cruce de ADN helicasa RuvB (RuvB)
ORF02247
4493 y 4494 Holliday cruce de ADN helicasa RuvA (RuvA)
ORF02248
4495 y 4496 Proteína de función desconocida (DUF1105) superfamilia
ORF02249
4497 y 4498 cruce de intersección endodeoxiribonucleasa RuvC (ruvC) [3.1.22.4)
ORF02250
4499 y 4500 proteína hipotética conservada TIGR01O33
ORF02251
4501 y 4502 pirofosfohidrolasa dATP
ORF02252
4503 y 4504 aspartil-ARNt sintetasa (aspS) [6.1.1.12]
ORF02253
4505 y 4506 proteína de la familia isochotismatasa hipotética yecD
ORF02254
4507 y 4508 proteína de la superfamilia de función desconocida
ORF02255
4509 y 4510 proteína hipotética conservada
ORF02256
4511 y 4512 metiltransferasa, putativo
ORF02257
4513 y 4514 metiltransferasa, putativo
ORF02258
4515 y 4516 Trimetilamina-N-óxido reductasa 2 precursor
ORF02259
4517 y 4518 proteína de Cctocromo tipo c torY
ORF02260
4519 y 4520 proteína de homeostasis de cobre VC0730
ORF02261
4521 y 4522 yecM de proteína
ORF02262
4523 y 4524 arginil sintetasa-ARNt (argS) [6.1.1.19]
ORF02263
4525 y 4526 proteína flagelar flhE precursor
ORF02264
4527 y 4528 proteínas de biosíntesis flagelar FlhA (flhA)
ORF02265
4529 y 4530 proteínas de biosíntesis flagelar FlhB (FlhB)
ORF02266
4531 y 4532 proteína hipotética conservada
ORF02267
4533 y 4534 Quimiotaxis proteína cheZ
ORF02268
4535 y 4536 Quimiotaxis proteína cheY
ORF02269
4537 y 4538 Quimiotaxis regulador de respuesta de la proteína-glutamato metilesterasa (EC 3.1.1.61) [3.1.1.61]
ORF02270
4539 y 4540 quimiotaxis proteína metiltransferasa [2.1.1.80]
ORF02271.
4541 y 4542 proteína quimiotaxis de aceptación de metil IV, receptor sensor péptido
ORF02272
4543 y 4544 proteína hipotética conservada
ORF02273
4545 y 4546 proteína quimiotaxis de aceptación de metil II
ORF02274
4547 y 4548 proteínas quimiotaxis cheW
ORF02275
4549 y 4550 proteína quimiotaxis CheA
ORF02276
4551 y 4552 proteína quimiotaxis motB
ORF02277
4553 y 4554 proteína quimiotaxis motA
ORF02278
4555 y 4556 activador transcripcional flagelar flhC
ORF02279
4557 y 4558 regulador de biosíntesis flagelar, que actúa en la clase 2 operones; factor de iniciación de transcripción
ORF02280
4559 y 4560 proteína de estrés universal C (UspA)
ORF02281
4561 y 4562 alfa, alfa-trehalosa fosfato sintasa [formador UDP] (otsA) [2.4.1.15]
ORF02282
4563 y 4564 trehalosa-fosfatasa (otsB) [3.1.3.12]
ORF02283
4565 y 4566 sistema de transporte de L-arabinosa permeasa proteína araH
ORF02284
4567 y 4568 proteína de transporte de L-arabinosa de unión a ATP araG
ORF02285
4569 y 4570 precursor de la proteína periplásmica de unión a L-arabinosa (PBP)
ORF02286
4571 y 4572 proteína de unión a ferritina 2
ORF02287
4573 y 4574 proteína hipotética conservada
ORF02288
4575 y 4576 lipoproteína, putativo
ORF02289
4577 y 4578 proteína hipotética conservada
ORF02290
4579 y 4580 ferritina de citoplásmica (proteína de almacenamiento de hierro)
ORF02291
4581 y 4582 proteína hipotética conservada
ORF02292
4583 y 4584 proteína de transporte específica de tirosina
ORF02293
4585 y 4586 translocasa de preproteína, subunidad SecA
ORF02294
4587 y 4588 proteína hipotética conservada
ORF02295
4589 y 4590 Fels-2 profago: similar a retron en E
ORF02296
4591 y 4592 ParA
ORF02297
4593 y 4594 Sb32
ORF02298
4595 y 4596 proteína hipotética
ORF02299
4597 y 4598 proteína portal fago, familia PBSX
ORF02300
4599 y 4600 Putativo ATPasa subunidad de terminasa (similar a gpP)
ORF02301
4601 y 4602 Proteína de la cápside del fago de andamios (GPO)
ORF02302
4603 y 4604 fago principal proteína de la cápside, familia P2
ORF02303
4605 y 4606 pequeña subunidad terminasa de fago
ORF02304
4607 y 4608 cabeza de la finalización de estabilización de la proteína L
ORF02305
4609 y 4610 Proteína de la cola del fago X
ORF02306
4611 y 4612 Bbp2
ORF02307
4613 y 4614 proteína hipotética conservada
ORF02308
4615 y 4616 proteína de finalización cola del fago R
ORF02309
4617 y 4618 Fels-2 profago: similar al GPS para finalización
ORF02310
4619 y 4620 baseptato proteína de ensamblaje V (gpV)
ORF02311
4621 y 4622 fago placa base de proteína de ensamblaje W (gpW)
ORF02312
4623 y 4624 proteína similar a la placa de base J
ORF02313
4625 y 4626 gpl (gpl)
ORF02314
4627 y 4628 gpH (gpH)
ORF02315
4629 y 4630 primer gpU (gpG)
ORF02316
4631 y 4632 CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3- fosfatidiltransferasa (pgsA) [2.7.8.5]
ORF02317
4633 y 4634 excinucleasa ABC, subunidad C (uvrC)
ORF02318
4635 y 4636 regulador de la proteína de respuesta
ORF02319
4637 y 4638 proteína hipotética conservada
ORF02320
4639 y 4640 proteína reguladora sdiA
ORF02321
4641 y 4642 transportador de aminoácido ABC, proteína de unión a ATP
ORF02322
4643 y 4644 aminoácido transportador ABC, permeasa de proteínas (permeasa)
ORF02323
4645 y 4646 4.4.1.15 [3.5.99.7]
ORF02324
4647 y 4648 precursor de proteína periplásmica de unión a cistina
ORF02325
4649 y 4650 proteína FIiZ
ORF02326
4651 y 4652 factor de iniciación de la transcripción factor sigma alternativo 28 (Sigma)
ORF02327
4653 y 4654 FliC
ORF02328
4655 y 4656 proteínas de gancho flagelar asociado 2 (HAP2)
ORF02329
4657 y 4658 proteína flagelar FliS (fliS)
ORF02330
4659 y 4660 Flit proteína flagelar
ORF02331
4661 y 4662 alfa-amilasa citoplasmática [3.2.1.1)
ORF02332
4663 y 4664 lipoproteína hipotética yedD precursor
ORF02333
4665 y 4666 familia de proteínas de la familia YeeE-YedE
ORF02334
4667 y 4668 proteína relacionada yedF-proteína hipotética UPF0033
ORF02335
4669 y 4670 ACR no caracterizado, COG2135 superfamilia
ORF02336
4671 y 4672 proteína de membrana externa porina precursor nmpC
ORF02337
4673 y 4674 regulador transcripcional hipotético ybcM
ORF02338
4675 y 4676 proteína hipotética conservada
ORF02339
4677 y 4678 proteína EmrE
ORF02340
4679 y 4680 proteína de complejo flagelar cuerpo de gancho-basal (FliE) (fliE)
ORF02341
4681 y 4682 proteína flagellar de anillo M FIiF (fliF)
ORF02342
4683 y 4684 proteína flagelar interruptor del motor FliG (fliG)
ORF02343
4685 y 4686 proteína flagelar de ensamblaje FliH (FliH)
ORF02344
4687 y 4688 sintasa flagelo específico ATP
ORF02345
4689 y 4690 proteína flagelar de exportación FliJ (fliJ)
ORF02346
4691 y 4692 proteína flagelar de control de longitud de gancho
ORF02347
4693 y 4694 proteína flagelar basal asociada a cuerpo FliL (fliL)
ORF02348
4695 y 4696 proteína asociada a cuerpo flagelar basal FliM (fliM)
ORF02349
4697 y 4698 proteína flagelar motor conmutador fliN
ORF02350
4699 y 4700 proteína flagelar fliO
ORF02351
4701 y 4702 proteína desconocida codificada por profago críptico
ORF02352
4703 y 4704 proteína de dominio hélice-giro-hélice
ORF02353
4705 y 4706 determinante de la estabilidad
ORF02354
4707 y 4708 proteína desconocida codificada por la proteína relacionada de profago CP-933N
ORF02355
4709 y 4710 proteína de inhibición de división dicB
ORF02356
4711 y 4712 proteína hipotética conservada
ORF02357
4713 y 4714 Exodeoxinbonucleasa VIII (35 kD) [3.1.11-]
ORF02358
4715 y 4716 proteína hipotética conservada
ORF02359
4717 y 4718 Sb28 (AE005423)
ORF02360
4719 y 4720 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF980)
ORF02361
4721 y 4722 proteína hipotética
ORF02362
4723 y 4724 integrasa
ORF02363
4725 y 4726 trpE2
ORF02364
4727 y 4728 Putativa proteína citoplasmática transmembrana
ORF02365
4729 y 4730 Transportador ABC, proteína de unión a ATP-permeasa, putativo
ORF02366
4731 y 4732 EF0101
ORF02367
4733 y 4734 proteína hipotética
ORF02368
4735 y 4736 regulador de tipo AraC putativo
ORF02369
4737 y 4738 sintetasa de ácido dihidroaeruginoico
ORF02370
4739 y 4740 proteína biosintética yersiniabactina
ORF02371
4741 y 4742 proteína biosintética yersiniabactina YbtU
ORF02372
4743847 44 proteína biosintética yersiniabactina YbtT
ORF02373
47458 4746 mbtA [6.2.1.-]
ORF02374
4747 y 4748 proteína receptora de pesticina-yersiniabactina familia OMR (IRPC)
ORF02375
4749 y 4750 proteína hipotética conservada
ORF02376
4751 y 4752 factor putativo
ORF02377
4753 y 4754 factor putativo
ORF02378
4755 y 4756 proteína hipotética conservada
ORF02379
4757 y 4758 principal transportador de la familia facilitadora (PPII)
ORF02380
4759 y 4760 nucleosidasa AMP (amn) (3.2.2.4]
ORF02381
4761 y 4762 Dominio de función desconocida, putativo
ORF02382
4763 y 4764 proteína MelD
ORF02383
4765 y 4766 proteína de familia de amidasa, putativo
ORF02384
4767 y 4768 MATE familia flujo de salida de subfamilia de proteínas
ORF02385
4769 y 4770 sintetasa de péptido putativa
ORF02386
4771 y 4772 NosB (AF183408)
ORF02387
4773 y 4774 proteína similar a fmtA, putativo
ORF02388
4775 y 4776 tioesterasa
ORF023B9
4777 y 4778 integrasa profago P4
ORF02390
4779 y 4780 proteína hipotética
0RP02391
4781 y 4782 MATE familia eflujo de salida de subfamilia de proteínas
ORF02392
4783 y 4784 proteína TubD [6.3.2.-]
ORF02393
4785 y 4786 BarG
ORF02394
4787 y 4788 NosB
ORF02395
4789 y 4790 proteína del dominio de enzima similar a AMP
ORF02396
4791 y 4792 [acil-cámar-proteína] S-maloniltransferasa [2.3.1.39]
ORF02397
4793 y 4794 Putativa de acil-coA deshidrogenasa
ORF02398
4795 y 4796 proteína portadora de acilo
ORF02399
4797 y 4798 3-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa (BHBD) [1.1.1.157]
ORF02400
4799 y 4800 JarnP
ORF02401
4801 y 4802 oxidorreductasa, familia de familia de unión de zinc-deshidrogenasa
ORF02402
4803 y 4804 posible regulador de respuesta de unión al ADN
ORF02403
4805 y 4806 proteína de familia Entd-Gsp-Hetl-Sfp [2.7.8.-]
ORF02404
4807 y 4808 transposasa
ORF02405
4809 y 4810 lSSo2, transposasa OrfB, truncamiento
ORF02406
4811 y 4812 Proteína erfK-srfK precursor
ORF02407
4813 y 4814 Nicotinato-nucleótido-dimetilbencimidazol fosforribosiltransferasa (EC 2.4.2.21) (NN:DBI PRT) (N(1)-alfa-fosforribosiltransferasa) [2.4.2.21]
ORF02408
4815 y 4816 sintasa 5'-fosfato de cobalamina (cobS) [2.7.8.26]
ORF02409
4817 y 4818 biosíntesis de proteínas cobalamina cobU [2.7.1.156]
ORF02410
4819 y 4820 proteína hipotética conservada
ORF02411
4821 y 4822 proteína hipotética conservada
ORF02412
4823 y 4824 receptor dependientes TonB, putativo
ORF02413
48258 4826 proteína hipotética conservada
ORF02414
48278 4828 proteína Z1204
ORF02415
4829 y 4630 proteína hipotética conservada
ORF02416
4831 y 4832 glucosaminiltransferasa
ORF02417
4833 y 4834 transferasa de fosfato nucleotydil de azúcar
ORF02418
4835 y 4836 proteína hipotética conservada
ORF02419
4837 y 4838 proteína de especificidad huesped J, truncamiento, putativo
ORF02420
4839 y 4840 sede de la proteína especificidad (parcial)
ORF02421
4841 y 4842 sede de la proteína especificidad (parcial)
ORF02422
4843 y 4644 Terminasa subunidad pequeña (GP1) (fragmento)
ORF02423
4845 y 4846 proteína hipotética conservada
ORF02424
4847 y 4848 proteína de membrana similar a tonB parcial codificada dentro de profago.
ORF02425
4849 y 4850 proteína hipotética
ORF02426
4851 y 4852 Bor homólogo de proteína de profago lamboidea DLP12
ORF02427
4853 y 4854 proteína de bacteriofago de lisis
ORF02428
4855 y 4856 lipoproteína Rz1 proteína relacionada a precursor
ORF02429
4857 y 4858 proteína hipotética
ORF02430
4859 y 4860 lisozima (proteína lisis) (muramidasa) (endotisina) (lisozima) [3.2.1.17]
ORF02431
4861 y 4862 proteína de lisis S.b1556
ORF02432
4863 y 4864 proteína hipotética
ORF02433
4865 y 4866 proteína de porina exterior membrana nmpC precursor (lbc)
ORF02434
4867 y 4868 Antiterminación proteína Q homólogo de Iambdoide profago
ORF02435
4669 y 4870 endodeoxinbonucleasa RUS (Holliday resolvasa de cruce)
ORF02436
4871 y 4872 proteína relacionada de ninE proteína
ORF02437
4873 y 4874 fago N-6-adenina-metiltransferasa [2.1.1.72]
ORF02438
4875 y 4876 proteína ninB
ORF02439
4877 y 4878 proteína de replicación P
ORF02440
4879 y 4880 transposasa
ORF02441
4881 y 4882 ECs1339
ORF02442
4883 y 4884 riboquinasa
ORF02443
4885 y 4886 Proteína de función desconocida (DUF1355) superfamilia
ORF02444
4887 y 4888 proteína de membrana, putativo
ORF02445
4889 y 4890 fofotriesterasa putativa (PTE) [3.1.8.1]
ORF02446
4891 y 4892 gamma-glutamiltranspeptidasa
ORF02447
4893 y 4894 gamma-glutamiltranspeptidasa
ORF02448
4895 y 4896 proteína de ST55
ORF02449
4897 y 4898 proteína hipotética conservada
ORF02450
4899 y 4900 proteína hipotética conservada
ORF02451
4901 y 4902 lSBma3, transposasa, truncamiento
ORF02452
4903 y 4904 proteína reguladora profago CP4-57 (AlpA) familia
ORF02453
4905 y 4906 proteína hipotética
ORF02454
4907 y 4908 proteína hipotética conservada
ORF02455
4909 y 4910 proteína hipotética
ORF02456
4911 y 4912 proteína de inserción de secuencias de unión a ATP
ORF02457
4913 y 4914 transposasa
ORF02458
4915 y 4916 proteína hipotética conservada
ORF02459
4917 y 4918 proteína férrica-enterobactina-transporte (III)
ORF02460
4919 y 4920 ABC transportador permeasa STYO8O2 (FecCD_family)
ORF02461
4921 y 4922 proteína de unión periplásmica (III)
ORF02462
4923 y 4924 receptor dependiente TonB
ORF02463
4925 y 4926 proteína YeeP
ORF02464
4927 y 4928 proteína hipotética conservada
ORF02465
4929 y 4930 proteína hipotética conservada
ORF02466
4931 y 4932 proteína hipotética conservada
ORF02467
4933 y 4934 familia fosfolipasa patatina-como
ORF02468
4935 y 4936 proteína hipotética conservada
ORF02469
4937 y 4938. proteína hipotética conservada
ORF02470
4939 y 4940 proteína hipotética conservada
ORF02471
4941 y 4942 proteína Z1215 (o273)
ORF02472
4943 y 4944 familia de proteínas antirestricción
ORF02473
4945 y 4946 proteína YeeS (0160)
ORF02474
4947 y 4948 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF987)
ORF02475
4949 y 4950 proteína YeeU
ORF02476
4951 y 4952 proteína similar a L0007
ORF02477
4953 y 4954 proteína YeeW
ORF02478
4955 y 4956 proteína de función desconocida (DUF496) superfamilia
ORF02479
4957 y 4958 proteína hipotética conservada
ORF02480
4959 y 4960 proteína inhibidora ADN girasa
ORF02481
4961 y 4962 proteína de unión a penicilina 6B precursor (PBP)
ORF02482
4963 y 4964 proteína de unión a penicilina 6b
ORF02483
4965 y 4966 Exodeoxiribonucleasa I
ORF02484
4967 y 4968 permeasa de aminoácidos
ORF02485
4969 y 4970 regulador de transcripción, familia LysR
ORF02486
4971 y 4972 Proteína yeeZ precursor
ORF02487
4973 y 4974 toxina de módulo de adicción, familia Txe-YoeB
ORF02488
4975 y 4976 proteína yefM
ORF02489
4977 y 4978 fosforibosiltransferasa ATP (hisG) [2.4.2.17]
ORF02490
4979 y 4980 deshidrogenasa de histidinol (hisD) [1.1.1.23]
ORF02491
4981 y 4982 aminotransferasa histidinol-fosfato (hisC) [2.6.1.9]
ORF02492
4983 y 4984 proteína bifuncional de biosíntesis de histidina hisB
ORF02493
4985 y 4986 Imidazol glicerol fosfato sintasa subunidad hisH (IGPsintasa subunidad glutamina amidotransferasa) (IGP subunidadhisH sintasa) (ImGP sintetasa subunidad hisH) (IGPS subunidad hisH) [2.4.2.-]
ORF02494
4987 y 4988 imidazol glicerol fosfato sintasa, glutamina subunidad amidotransferasa (hisH) [2.4.2.-]
ORF02495
4989 y 4990 carboxamida fosforibosilformimino-5-aminoimidazol isomerasa ribótido (hisA) [5.3.1.16]
ORF02496
4991 y 4992 imidazoleglicerol sintasa fosfato, subunidad ciclasa (hisF)
ORF02497
4993 y 4994 Histidina biosíntesis de proteína bifuncional hisIE [incluye: ciclohidrolasa fosfonbosil-AMP (PRA-CH); pirofosfatasa fosfonbosil-ATP (EC 3.6.1.31) (PRA-PH)] (PRA-PH) [3.5,4.19]
ORF02498
4995 y 4996 Longitud de la cadena de proteína determinante
ORF02499
4997 y 4998 UDP-glucosa 6-deshidrogenasa (UDPGDH) [1.1.1.22]
ORF02500
4999 y 5000 6-fosfogluconato deshidrogenasa, decarboxilante (GND) [1.1.1.44)
0RP02501
5001 y 5002 WbnE [2.4.1.-]
ORF02502
5003 y 5004 glicosiltransferasa putativa [2.4.1.-]
ORF02503
5005 y 5006 glicosil transferasa CpsO
ORF02504
5007 y 5008 transferasa de ramnosilo Cps6bS
ORF02505
5009 y 5010 proteína modificación O-antígeno
ORF02506
5011 y 5012 proteína rfbX
ORF02507
5013 y 5014 dTDP-4-dehidrorhamnosa 3,5-epimerasa (rfbC) [5.1.3.13]
ORF02508
5015 y 5016 glucosa-1-fosfato timidililtransferasa (rfbA) [2.7.7.24]
ORF02509
5017 y 5018 dTDP-4-dehidrorhamnosa reductasa (rfbD) [1.1.1.133]
ORF02510
5019 y 5020 dTDP-glucosa 4,6-deshidratasa (rfbB) [4.2.1.46]
ORF02511
5021 y 5022 proteína reguladora GalF (galF)
ORF02512
5023 y 5024 ácido colánico biosíntesis de proteínas wcaM
ORF02513
5025 y 5026 Amylovoran biosíntesis de glicosiltransferasa amsK [2.-.-.-]
ORF02514
5027 y 5028 proteína de biosíntesis del ácido colánico wcaK [2.-.-.-]
ORF02515
5029 y 5030 proteína de biosíntesis de lipopolisacárido wzxC
ORF02516
5031 y 5032 glicosiltransferasa (WcaJ) [2.7.-.-]
ORF02517
5033 y 5034 Fosfomianomutasa
ORF02518
5035 y 5036 manosa-1-fosfato guanililtransferasa-manosa-6- fosfato isomerasa
ORF02519
5037 y 5038 proteína de biosíntesis de lipopolisacárido, putativo
ORF02520
5039 y 5040 hidrolasa manosil manosa GDP [3.6.1.-]
ORF02521
5041 y 5042 sintetasa GDP-fucosa cadena A (GER1) [1.1.1.271]
ORF02522
5043 y 5044 4,6-deshidratasa manosa GDP (gmd) [4.2.1.471]
ORF02523
5045 y 5046 acetiltransferasa, familia CysE-LacA-LpxA-NodL, putativo [2.3.1.-]
ORF02524
5047 y 5048 transferase glicosil proteína de familia de grupo 2, putativo
ORF02525
5049 y 5050 polimerasa de ácido colánico putativa
ORF02526
5051 y 5052 posible glicosil transferasa
ORF02527
5053 y 5054 Serina acetiltransferasa [2.3.1.-]
ORF02528
5055 y 5056 posible glicosiltransferasa
ORF02529
5057 y 5058 Tirosina-quinasa de proteínas wzc
ORF02530
5059 y 5060 Bajo peso molecular de la proteína tirosina fosfatasa wzb [3.1.3.48]
ORF02531
5061 y 5062 proteína de membrana
ORF02532
5063 y 5064 proteína de transporte putativa
ORF02533
5065 y 5066 producto de proteína sin nombre
ORF02534
5067 y 5068 PHIKZ114
ORF02535
5069 y 5070 Proteína precursora asmA
ORF02536
5071 y 5072 deaminasa trifosfato deoxiciliclina (dcd) [3.5.4.13]
ORF02537
5073 y 5074 quinasa de ondina (udk) [2.7.1.48]
ORF02538
5075 y 5076 dominio de la familia MASE1
ORF02539
5077 y 5078 proteína reguladora Ada, putativo [3.2.2.21]
ORF02540
5079 y 5080 proteína hipotética
ORF02541
5081 y 5082 chaperona molecular
ORF02542
5083 y 5084 proteína hipotética conservada
ORF02543
5085 y 5086 proteína hipotética conservada
ORF02544
5087 y 5088 factor de tipo A Willebrand de proteína de dominio
ORF02545
5089 y 5090 proteína de membrana putativa
ORF02546
5091 y 5092 AcrB-Acrd-ACRF (HAE1)
ORF02547
5093 y 5094 proteína de la membrana de la familia AcrB-AcrD-AcrF
ORF02548
5095 y 5096 bomba de eflujo de drogas superfamilia MFS
ORF02549
5097 y 5098 sensor histidina quinasa SrrB, putativo [2.7.3.-]
ORF02550
5099 y 5100 proteína reguladora transcripcional baeR (ResD)
ORF02551
5101 y 5102 Dominio de función desconocida (DUF1508) familia
ORF02552
5103 y 5104 proteína hipotética conservada
ORF02553
5105 y 5106 proteína hipotética conservada
ORF02554
5107 y 5108 proteína hipotética conservada
ORF02555
5109 y 5110 proteína hipotética conservada
ORF02556
5111 y 5112 YegQ [3.4.-.-]
ORF02557
5113 y 5114 proteína hipotética conservada TIGR00147
ORF02558
5115 y 5116 represor de utilización operón galactitol (fragmento)
ORF02559
5117 y 5118 hexitol deshidrogenasa [1.1.1.251]
ORF02560
5119 y 5120 sistema PTS, componente IIC-sorbitol específica (EIIC-GAT)
ORF02561
5121 y 5122 sistema PTS, componente IIB-galactitol específica (EIIB-Gat) (componente IIB-permeasa galacticol) (fosfotransferasa enzima II, componente B) (EC 2.7.1.69) [2.7.1.69)
ORF02562
5123 y 5124 sistema PTS, componente IIA-galactitol específica (EIIA-Gat) (componente IIA-permeasa Galacticol) (fosfotransferasa enzima II, A componente) (EC 2.7.1.69) (EllA-GAT) [2.7.1.69]
ORF02563
5125 y 5126 PUTATIVOS TAGATOSA 6-FOSFATO PROTEÍNA QUINASA [2.7.1.144]
ORF02564
5127 y 5128 clase II aldolasa, familia bisfosfato tagatosa [4.1.2.-]
ORF02565
5129 y 5130 dehIdrina [4.1.2.13]
ORF02566
5131 y 5132 nucleósido permeasa NupG, putativo
ORF02567
5133 y 5134 ADP-ribosilglicohidrolasa, putativo
ORF02568
5135 y 5136 regulador de la transcripción, familia GntR, putativo
ORF02569
5137 y 5138 Riboquinasa (EC 2.7.1.15). [2.7.1.15]
ORF02570
5139 y 5140 glicosil hidrolasa, familia 25 [3.2.1.17]
ORF02571
5141 y 5142 quinasa de fosfometilpirimidina (thiD) [2.7.4.7]
ORF02572
5143 y 5144 quinasa de hidroxietiItiazol (thiM) [2.7.1.50]
ORF02573
5145 y 5146 BCR no caracterizado, familia COG1937
ORF02574
5147 y 5148 NirC
ORF02575
5149 y 5150 proteína hipotética conservada
ORF02576
5151 y 5152 proteína hipotética conservada
ORF02577
5153 y 5154 membrana externa hipotética proteína ujier yehB precursor
ORF0257B
5155 y 5156 chaperona hipotética acompañante fimbrial yehC precursor
ORF02579
5157 y 5158 subfamilia de proteína fimbrial
ORF02580
5159 y 5160 proteína mrp (mrp)
ORF02581
5161 y 5162 Metionil-ARNt sintetasa (metG) [6.1.1.10]
ORF02582
5163 y 5164 regulador de metabolismo molibdato, segundo fragmento 2 (fragmento)
ORF02583
5165 y 5166 yehl (fragmento)
ORF02584
5167 y 5168 yehl (fragmento)
ORF02585
5169 y 5170 proteína hipotética conservada
ORF02586
5171 y 5172 proteína hipotética conservada
ORF02587
5173 y 5174 VWA dominio que contiene familia de proteínas similar a COXE
ORF02588
5175 y 5176 producto del gen yehQ
ORF02589
5177 y 5178 lipoproteína hipotética yehR precursor
ORF02590
5179 y 5180 proteína no caracterizada conservada en las bacterias
ORF02591
5181 y 5182 producto de proteína sin nombre
ORF02592
5183 y 5184 proteína sensor 2-componente putativo
ORF02593
5185 y 5186 regulador A similar a MerR
ORF02594
5187 y 5188 glicina sistema de transporte de betaína-L-prolina permeasa de proteínas prow (AE005444)
ORF02595
5189 y 5190 proteína de membrana putativa
ORF02596
5191 y 5192 transportador de aminoácidos ABC, proteína de unión a ATP (AE005444)
ORF02597
5193 y 5194 Transportador ABC, permeasa de proteínas (AEOO5444)
ORF02598
5195 y 5196 transportador ABC glicina betaína-L-prolina, proteína de unión a sustrato periplásmico, putativo
ORF02599
5197 y 5198 yohA (STI) [3.2.1.21]
ORF02600
5199 y 5200 D-lactato deshidrogenasa
ORF02601
5201 y 5202 beta-lactamasa
ORF02602
5203 y 5204 Proteína de función desconocida (DUF1282) superfamilia
ORF02603
5205 y 5206 proteína de familia DedA
ORF02604
5207 y 5208 yohF [1.-.-.-]
ORF02605
5209 y 5210 proteína de canal de filamento putativo
ORF02606
5211 y 5212 sintasa de dihidrouridina (Dus) superfamilia
ORF02607
5213 y 5214 LrgA subfamilia de familia, putativo
ORF02608
5215 y 5216 proteína de membrana, putativo
ORF02609
5217 y 5218 deaminasa de citidina (cdd) [3.5.4.5]
ORF02610
5219 y 5220 proteína SanA
ORF02611
5221 y 5222 proteína hipotética conservada
ORF02612
5223 y 5224 sintasa de glutamato, subunidad pequeña (NADPH)
ORF02613
5225 y 5226 dihidroorotasa deshidrogenasa (pyrD)
ORF02614
5227 y 5228 proteína hipotética conservada
ORFO2615
5229 y 5230 transportador de ribosa ABC, permeasa de proteínas (membrana)
ORF02616
5231 y 5232 transporte de proteínas de unión a ATP-galactósido mglA (atp_bind)
ORF02617
5233 y 5234 precursor de proteína periplásmica (GBP) D-galactosa (proteína de unión D-galactosa-D-glucosa) (GGBP)
ORF02618
5235 y 5236 represor MgI y el factor de ultrainducción galactosa
ORF02619
5237 y 5238 producto de proteína sin nombre
ORF02620
5239 y 5240 proteína hipotética conservada
ORF02621
5241 y 5242 ciclohidrolasa GTP I (folE) [3.5.4.16]
ORF02622
5243 y 5244 carboxilesterasa [3.1.1.-]
ORF02623
5245 y 5246 Precursor del receptor de colicina 1
ORF02624
5247 y 5248 permeasa específica de lisina
ORF02625
5249 y 5250 regulador de transcripción, familia LysR
ORF02626
5251 y 5252 proteína de membrana, putativo
ORF02627
5253 y 5254 Endonucleasa IV (Endodeoxinbonucleasa IV) [3.1.21.2]
ORF02628
5255 y 5256 yeil
ORF02629
5257 y 5256 hidrolasa de nucleósido de preferencia de inosina-uridina (AL355920)
ORF02630
5259 y 5260 proteína reguladora nsr
ORF02631
5261 y 5262 transportador de nucleósidos
ORF02632
5263 y 5264 enzima no caracterizada implicada en biosíntesis de pigmento
ORF02633
5265 y 5266 yeil
ORF02634
5267 y 5266 sistema PTS, componente IIBC fructosa específica [2.7.1.69]
ORF02635
5269 y 5270 1-fosfofructoquinasa (fructosa-1-fosfato quinasa) (FruK) [2.7.1.56]
ORF02636
5271 y 5272 sistema PTS, componente IlA-FPr fructosa específica (EIIA-Fru) (Componente LLA-FPr fructosa-permeasa) (Fosfotransferasa enzima II, A-FPrcomponent) (proteína FPr de Fosfotransferasa) (Pseudo-HPR) (EIIL-Fru) (proteína de Difosforil transfer fructosa) (ElII-FRU) [2.7.1.69]
ORF02637
5273 y 5274 proteína hipotética conservada
ORF02638
5275 y 5276 Azúcar proteína transportadora B (orf104)
ORF02639
5277 y 5278 factor de elongación de traducción EF-P (EF-P)
yORFO240
5279 y 5280 OXIDOREDUCTASA D-MANNONATE
ORF02641
5281 y 5282 proteína del dominio de proteína de la familia CobW-P47K
ORF02642
5283 y 5284 superfamilia de proteína de dominio PAP2
ORF02643
5285 y 5286 precursor de la lipoproteína de spr (spr)
ORF02644
5287 y 5288 proteína Rtn
ORF02645
5289 y 5290 proteína de unión a sustrato de transportador ABC
ORF02646
5291 y 5292 péptido transportador ABC, proteína de permeasa
ORF02647
5293 y 5294 Transportador ABC, proteínas de perrneasa
ORF02648
5295 y 5296 Transportador ABC, proteína de unión de nucleótidos ATPasa [péptido]
ORF02649
5297 y 5298 producto de proteína sin nombre
ORF02650
5299 y 5300 proteína de resistencia biciclomicina
ORF02651
5301 y 5302 ribosomal pequeña subunidad sintasa A pseudouridina
ORF02652
5303 y 5304 yejH
ORF02653
5305 y 5306 50S proteína de ribosomal L25
ORF02654
5307 y 5308 proteína asociada a nucleótido
ORF02655
5309 y 5310 proteína hipotética
ORF02656
5311 y 5312 Proteína de función desconocida (DUF1414) superfamilia
ORF02657
5313 y 5314 hidrolasa prevista de la superfamilia de fosfatasa alcalina
ORF02658
5315 y 5316 yejO
ORF02659
5317 y 5318 nitrato-nitrito de proteína reguladora de respuesta narP
ORF02660
5319 y 5320 precursor ccmH proteína de citocromo de tipo c biogénesis (nrfF)
ORF02661
5321 y 5322 Tiol: proteína de intercambio disulfuro dsbE (Citocromo de tipo c biogenesis proteína ccmG) (dsbE)
ORF02662
5323 y 5324 citocromo c de tipo proteína biogénesis CCMF (CCMF)
ORF02663
5325 y 5326 Citocromo c de tipo CCME proteína de la biogénesis
ORF02664
5327 y 5328 Hemo proteína exportador D (proteína de biogénesis citocromo de tipo c ccmd) relacionada a proteína
ORF02665
5329 y 5330 proteína C de hemo exportador
ORF02666
5331 y 5332 proteína exportadora hemo CcmB (ccmB)
ORF02667
5333 y 5334 proteína exportador hemo CcmA (ccmA)
ORF02668
5335 y 5336 Citocromo proteína de tipo c napC
ORF02669
5337 y 5338 reductasa de nitrato periplásmico, citocromo c dihemo subunidad (napB)
ORF02670
5339 y 5340 proteína de tipo perredoxina napH (napH)
ORF02671
5341 y 5342 proteína de tipo ferredoxina napG (napG)
ORF02672
5343 y 5344 reductasa de nitrato periplásmico, subunidad grande (napA) [1.7.99.4]
ORF02673
5345 y 5346 NapD proteína (napD)
ORF02674
5347 y 5348 proteína de tipo ferredoxina Napf (napF)
ORF02675
5349 y 5350 ecotina
ORF02676
5351 y 5352 rnalato: guinona-oxidorreductasa (mgo) [1.1.99.16]
ORF02677
5353 y 5354 proteína hipotética
ORF02678
5355 y 5356 proteína mdlB
ORF02679
5357 y 5358 proteína de reparación de ADN alquilada alkB (alkB)
ORF02680
5359 y 5360 metiltransferasa O6-metilguanina-ADN; activador-represor de transcripción [2.1.1.63]
ORF02681
5361 y 5362 lipoproteína de biosíntesis de tiamina ApbE, putativo
ORF02682
5363 y 5364 precursor proteína de membrana externa C (Porina ompC) (proteína de membrana externa 1B) (lbc)
ORF02683
5365 y 5366 YojQ [2.7.3.-]
ORF02684
5367 y 5368 regulador de respuesta positiva de biosíntesis de cápsula colánica
ORF02685
5369 y 5370 proteína sensor rcsC
ORF02686
5371 y 5372 proteína sensor atoS
ORF02687
5373 y 5374 metabolismo acetoacetato proteína reguladora atoC (atoC)
ORF02688
5375 y 5376 Acetato CoA-transferasa subunidad alfa [2.8.3.8]
ORF02689
5377 y 5378 Acetato CoA-transferasa subunidad beta (atoA) [2.8.3.8]
ORF02690
5379 y 5380 proteína de membrana, putativo
ORF02691
5381 y 5382 Acetil-CoA acetiltransferasa (atoB) [2.3.1.9]
ORF02692
5383 y 5384 proteína hipotética conservada
ORF02693
5385 y 5386 proteína hipotética conservada
ORF02694
5387 y 5388 alfa-2-macroglobulina familia región N-terminal familia
ORF02695
5389 y 5390 Proteína de función desconocida (DUF1175) superfamilia
ORF02696
5391 y 5392 proteína hipotética conservada
ORF02697
5393 y 5394 ADN girasa, una subunidad (gyrA) [5.99.1.3]
ORF02698
5395 y 5396 ubiguinone biosíntesis O-metiltransferasa (ubiG) [2.1.1.-]
ORF02699
5397 y 5398 similar a [SwissProt número de acceso P45508]
ORF02700
5399 y 5400 reductasa ribonucleósido difosfato 1, subunidad alfa, B1 (nrdA) [1.17.4.1]
ORF02701
5401 y 5402 ribonucleósido reductasa difosfago 1, subunidad beta, B2
ORF02702
5403 y 5404 ferredoxina familia adrenodoxina
ORF02703
5405 y 5406 inaA de proteína
ORF02704
5407 y 5408 glicerofosfodiester fosfodiesterasa, periplásmico
ORF02705
5409 y 5410 transportador de glicerol-3-fosfato (glpT)
ORF02706
5411 y 5412 glpD2, putativo [1.1.99.5]
ORF02707
5413 y 5414 Anaeróbico glicerol-3-fosfato deshidrogenasa subunidad B
ORF02708
5415 y 5416 Anaeróbico glicerol-3-fosfato deshidrogenasa subunidad C [1.1.99.5]
ORF02709
5417 y 5418 proteína hipotética conservada
ORF02710
5419 y 5420 transposasa
ORF02711
5421 y 5422 transposasa
ORF02712
5423 y 5424 similar a [SwissProt número de acceso P23522]
ORF02713
5425 y 5426 facilitador principal transportador de familia
ORF02714
5427 y 5428 Mandelato racemasa - enzima lactonizante de muconato, proteína de dominio C-terminal
ORF02715
5429 y 5430 regulador de transcripción, familia lclR, putativo
ORF02716
5431 y 5432 proteína similar CinA
ORF02717
5433 y 5434 superfamilia precursor YfaZ
ORF02718
5435 y 5436 hidrolasa, familia NUDIX, putativo
ORF02719
5437 y 5438 proteína inducida por aluminio
ORF02720
5439 y 5440 polisacárido proteína de biosíntesis
ORF02721
5441 y 5442 Glicosil transferasa amC (transferasa Ara4N) (proteína de polimixinresistancia pmrF) [2.-.-.-]
ORF02722
5443 y 5444 transferasa de formilo, proteína de dominio C-terminal
ORF02723
5445 y 5446 proteína PbgP4
ORF02724
5447 y 5448 proteína de resistencia a melitina PqaB
ORF02725
5449 y 5450 sacarosa-6 hidrolasa fosfato
ORF02726
5451 y 5452 proteína hipotética conservada
ORF02727
5453 y 5454 Polimixina B proteína de resistencia pmrD
ORF02728
5455 y 5456 O-sucinilbenzoato-CoA ligasa (menE) [6.21.26]
ORF02729
5457 y 5458 o-ácido sucinilbenzoico (OSB) sintetasa (menC) [4.2.1.-]
ORF02730
5459 y 5460 sintasa de naftoato (menB) [4.1.3.36]
ORF02731
5461 y 5462 hidrolasa, alfa-beta hidrolasa veces familia, putativo
ORF02732
5463 y 5464 2-succinil-6-hidroxi-2,4-ciclohexadieno-1-carboxílico descarboxilasa sintasa-2-oxoglutarato (menD) [4.1.1.71]
ORF02733
5465 y 5466 sintasa de isocorismato menaguinona específica
ORF02734
5467 y 5468 proteína ElaB
ORF02735
5469 y 5470 proteína elaA VC2565 (putativo)
ORF02736
5471 y 5472 metalo-beta-lactamasas proteína de superfamilia [3.1.26.11]
ORF02737
5473 y 5474 factor Willebrand de tipo A proteína de dominio
ORF02738
5475 y 5476 aminopeptidasa putativa
ORF02739
5477 y 5478 proteína hipotética conservada
ORF02740
5479 y 5480 NADH dehidrogenasa I cadena N (NU014) [1.6.99.5]
ORF02741
5481 y 5482 NADH dehidrogenasa I cadena N (NU013) [1.6.99.5]
ORF02742
5483 y 5484 NADH dehidrogenasa I cadena L ECs3162 (NU012) [1.6.99.5]
ORF02743
5485 y 5486 NADH dehidrogenasa I cadena L ECs3162 (NU012) [1.6.99.5]
ORF02744
5487 y 5488 NADH dehidrogenasa I subunidad K (NU011) [1.6.5.3]
ORF02745
5489 y 5490 NAD-quinona oxidoreductasa cadena J (NADH deshidrogenasa, cadena J) (NDH-1, cadena J) (NUOI0) [1.6.99.5]
ORF02746
5491 y 5492 NADH DESHIDROGENASA CADENA G (EC 1.6.5.3) (NADH- UBIQUINONA OXIDOREDUCTASA CADENA 9) (NUO9) [1.6.5.3]
ORF02747
5493 y 5494 NADH deshidrogenasa I cadena H (NUO8) [1.6.99.5]
ORF02748
5495 y 5496 NADH deshidrogenasa I cadena de G (CE 1.6.5.3) (NADH- UBIQUINONA oxidorreductasa CADENA 7) (NUO7) (fragmento) [1.6.5.3]
ORF02749
5497 y 5498 NADH-quinona oxidorreductasa, F subunidad (NuoF)
ORF02750
5499 y 5500 NADH-quinona oxidorreductasa cadena E (NADH dehidrogenasa l, cadena E) (NDH-1, cadena E) (NUO5) [1.6.99.5]
ORF02751
5501 y 5502 NADH deshidrogenasa I cadena C-D (NUO4) [1.6.99.5]
ORF02752
5503 y 0.5504 NADH-quinona oxidorreductasa cadena B (NADH deshidrogenasa I, cadena B) (NDH-1, cadena B) (NUO2) (NUO2) [1.6.99.5]
ORF02753
5505 y 5506 NADH-quinona oxidorreductasa de cadena A (NADH deshidrogenasa I, cadena A) (NDH-1 cadena A) (NU01) [1.6.99.5]
ORF02754
5507 y 5508 familia LysR NADH regulador de deshidrogenasa transcripcional (RssB)
ORF02755
5509 y 5510 proteína hipotética
ORF02756
5511 y 5512 aminotransferasa, clases I y II (ASPAT) [2.6.1.-]
ORF02757
5513 y 5514 b2291
ORF02758
5515 y 5516 producto de proteína sin nombre
ORF02759
5517 y 5518 hidrolasa, familia similar a dehalogenasa de haloácido [3.1.3.-]
ORF02760
5519 y 5520 proteína yfbU
ORF02761
5521 y 5522 UPFO2O8 proteína hipotética yfbV
ORF02762
5523 y 5524 acetato quinasa (ackA) [2.7.2.1]
ORF02763
5525 y 5526 fosfato acetiltransferasa
ORF02764
5527 y 5528 proteína de membrana teibted
ORF02765
5529 y 5530 IPP isomerasa tipo 1 proteína de familia, putativo [3,6.-.-]
ORF02766
5531 y 5532 fosfoesterasa, subfamilia putativa
ORF02767
5533 y 5534 Glutatión S-transferasa, proteína de dominio N-terminal
ORF02768
5535 y 5536 glutatión S-transferasa, putativo
ORF02769
5537 y 5538 aldotase dihydroneopterin (Folb) [4.1.2.25]
ORF02770
5539 y 5540 proteína hipotética conservada TIGR01777
ORF02771
5541 Y 5542 proteína hipotética conservada subfamilia
ORF02772
5543 y 5544 componente de transporte de histidina de unión a ATP ECs3190
ORF02773
5545 y 5546 proteína de membrana del sistema transporte histidina M (membrana)
ORF02774
5547 y 5548 aminoácido transportador ABC, proteína de permeasa
ORF02775
5549 y 5550 precursor de la proteína periplásmica de unión a histidina (HTP)
ORF02776
5551 y 5552 Lisina-arginina-omitina-proteína de unión periplásmica precursor (proteína de unión a LAO
ORF02777
5553 y 5554 3-octaprenil-4-hidroxibenzoato de carboxi-liasa (Poliprenilp- decartoxilasa hidroxibenzoato de metilo (4.1.1.-]
ORF02778
5555 y 5556 amquiofosforibosiltransferasa (purF) [2.4.2.14]
ORF02779
5557 y 5558 proteína de familia CvpA (cvpA)
ORF02780
5559 y 5560 proteína DedD
ORF02781
5561 y 5562 proteína bifuncional FolC [6.3.2.17]
ORF02782
5563 y 5564 acetil-C0A carboxilasa, carboxilo transferasa, subunidad beta (accD) [6.4.1.2]
ORF02783
5565 y 5566 proteína dedA
ORF02784
5567 y 5568 ARNt sintetasa pseudouridina A (truA) [4.2.1.70]
ORF02785
5569 y 5570 USG-1 de proteína [1.2.1.-)
ORF02786
5571 y 5572 Eritronato-4-fosfato deshidrogenasa
ORF02787
5573 y 5574 proteína hipotética
ORF02788
5575 y 5576 Int
ORF02789
5577 y 5578 proteína reguladora cox
ORF02790
5579 y 5580 proteína hipotética
ORF02791
5581 y 5582 proteína desconocida codificada por profago CP-933T
ORF02792
5583 y 5584 proteína desconocida codificada por profago CP-933T
ORF02793
5585 y 5586 proteína desconocida codificada por profago CP-933T
ORF02794
5587 y 5588 proteína hipotética
ORF02795
5589 y 5590 proteína hipotética conservada
ORF02796
5591 y 5592 proteína desconocida codificada por el profago CP-933T
ORF02797
5593 y 5594 proteína desconocida codificada por el profago CP-933T -relacionada proteína
ORF02798
5595 y 5596 proteína hipotética conservada
ORF02799
5597 y 5598 Fels-2 de proteína de profago
ORF02800
5599 y 5600 gpH
ORF02801
5601 y 5602 gpU (gpG)
ORF02802
5603 y 5604 gpU primer (gpG)
ORF02803
5605 y 5606 ADN-invertasa (pin)
ORF02804
5607 y 5608 Fels-2 proteína de profago (gpU)
ORF02805
5609 y 5610 fago cola proteína rneausure cinta, familia TP901, putativo
ORF02806
5611 85612 proteína relacionada con proteína de la cola del fago probable
ORF02807
5613 y 5614 proteína de la cola probable (gpE)
ORF02808
5615 y 5616 proteína tubo principal de la cola del fago
ORF02809
5617 y 5618 proteína de la envoltura de la cola del fago
ORF02810
5619 y 5620 proteína hipotética
ORF02811
5621 y 5622 bacteriófago proteína de control de gen final D
ORF02812
5623 y 5624 proteína hipotética
ORF02813
5625 y 5626 activador transcripcional de fago, Ogr-Delta
ORF02814
5627 y 5628 proteína hipotética conservada
ORF02815
5629 y 5630 proteína hipotética
ORF02816
5631 y 5632 proteína hipotética
ORF02817
5633 y 5634 proteína DIV (FRAGMENTO)
ORF02818
5635 y 5636 proteína hipotética UPF0226 yfcJ
ORF02819
5637 y 5638 3-oxoacil-[acil-portador-proteína] sintetasa I (Beta-cetoacil-ACP sintasa I) (KAS I) [2.3.1.41]
ORF02820
5639 y 5640 Glicina-D-oxidasas de aminoácidos (desaminante)
ORF02821
5641 y 5642 proteína hipotética conservada
ORF02822
5643 y 5644 similar a [SwissProt número de acceso P44255]
ORF02823
5645 y 5646 permeasa predicha (ORF9)
ORF02824
5647 y 5648 La penicilina y minúsculas precursor de mureína endopeptidasa [3.4.99-]
ORF02825
5649 y 5650 corismato sintasa (aroC) [4.2.3.5]
ORF02826
5651 y 5652 ARNr o ARNt metilasa predicha [2.1.1.72]
ORF02827
5653 y 5654 proteína de dominio Smr
ORF02828
5655 y 5656 proteína hipotética conservada
ORF02829
5657 y 5658 subunidad fimbrial menor StrG
ORF02830
5659 y 5660 subunidad fimbrial menor StrF
ORF02831
5661 y 5662 subunidad fimbrial
ORF02832
5663 y 5664 chaperona fimbrial periplásmica StfD
ORF02833
5665 y 5666 proteína ujier de membrana externa StfC
ORF02834
5667 y 5668 subunidad fimbrial mayor StfA
ORF02835
5669 y 5670 proteína hipotética
ORF02836
5671 y 5672 fosfohistidina fosfatasa SixA (sixA) [3.1.3.-]
ORF02837
5673 y 5674 complejo oxidación graso, la subunidad alfa FadJ (fadJ) 14.2.1.17 1.1.1.35 5.1.2.31
ORF02838
5675 y 5676 acetil-CoA C-aciltransferasa Fadi (fadl) [2.3.1.16]
ORF02839
5677 y 5678 proteína hipotética conservada superfamilia
ORF02840
5679 y 5680 precursor de cadena larga de proteína de transporte de ácidos grasos (proteína de membrana externa fadL) (proteína de membrana exterior flp)
ORF02841
5681 y 5682 VACJ LIPOPROTEÍNA PRECURSOR. (vacJ)
ORF02842
5683 y 5684 transporte probable yfdC
ORF02843
5685 y 5686 integrasa de profago putativa
ORF02844
5687 y 5688 proteína hipotética
ORF02845
5689 y 5690 endo-alfa-sialidasa [3.2.1.129]
ORF02846
5691 y 5692 proteína hipotética
ORF02847
5693 y 5694 endo-alfa-sialidasa [3.2.1.129]
ORF02848
5695 y 5696 Antirepressor hormiga proteínas
ORF02849
5697 y 5698 producto de proteína sin nombre; pot. producto mnt-gen (aa 1-83)
ORF02850
5699 y 5700 proteína de transferencia de ADN
ORF02851
5701 y 5702 proteína hipotética
ORF02852
5703 y 5704 proteína de transferencia de ADN
ORF02853
5705 y 5706 proteína de transferencia de ADN gp7
ORF02854
5707 y 5708 proteína conjunto de cabeza
ORF02855
5709 y 5710 proteína de estabilización de ADN
ORF02856
5711 y 5712 proteína de estabilización de ADN
ORF02857
5713 y 5714 proteína del gen 7
ORF02858
5715 y 5716 proteína hipotética
ORF02859
5717 y 5718 proteína de cubierta, putativo
ORF02860
5719 y 5720 P23, putativo
ORF02861
5721 y 5722 proteína de portal
ORF02862
5723 y 5724 fago terminasa, subunidad grande, familia PBSX
ORF02863
5725 y 5726 proteína hipotética conservada
ORF02864
5727 y 5728 proteína de gen 67
ORF02865
5729 y 5730 inicio alternativo en bp 59; ORF
ORF02866
5731 y 5732 proteína de lisis bacteriófago
ORF02867
5733 y 5734 lisozima [3.21.17]
ORF02868
5735 y 5736 fago holina, familia lambda
ORF02869
5737 y 5738 proteína del gen 59
ORF02870
5739 y 5740 Fago Ninh superfamilia de proteína
ORF02871
5741 y 5742 cruce holliday resolvasa [3.1.22.-]
ORF02872
5743 y 5744 Gp66
ORF02873
5745 y 5746 ADN-proteína de unión Roi (Ant1)
ORF02874
5747 y 5748 superfamilia de proteína NinF
ORF02875
5749 y 5750 Ninx
ORF02876
5751 y 5752 La proteína de nueve proteína relacionada
ORF02877
5753 y 5754 proteína ninB
ORF02878
5755 y 5756 análogo DnaB [3.6.1.-]
ORF02879
5757 y 5758 Gp54
ORF02880
5759 y 5760 proteína reguladora CII (cII)
ORF02881
5761 y 5762 proteína hipotética
ORF02882
5763 y 5764 proteína del gen 33
ORF02883
5765 y 5766 proteína del gen 33
ORF02884
5767 y 5768 proteína relacionada con la proteína kil
ORF02885
5769 y 5770 Gp42.1
ORF02886
5771 y 5772 Gp40
ORF02887
5773 y 5774 proteína del gen 25
ORF02888
5775 y 5776 proteína hipotética
ORF02889
5777 y 5778 Gp37
ORF02890
5779 y 5780 Proteína de función desconocida familia (DUF551)
ORF02891
5781 y 5782 proteína hipotética conservada
ORF02892
5783 y 5784 18 genes relacionados con la proteína-proteína
ORF02893
5785 y 5786 D-serina deaminasa activador de la transcripción (dsdC)
ORF02894
5787 y 5788 permiasa DsdX
ORF02895
5789 y 5790 D-serina amoniaco-liasa (dsdA) [4.3.1.18]
ORF02896
5791 y 5792 proteína de resistencia de fármacos múltiples Y
ORF02897
5793 y 5794 proteína de resistencia de fármacos múltiples K
ORF02898
5795 y 5796 proteína hipotética conservada
ORF02899
5797 y 5798 regulador de transcripción positiva evgA
ORF02900
5799 y 5800 precursor de proteína del sensor evgS [2.7.3.-]
ORF02901
5801 y 5802 proteína de familia CAIB-BAIF
ORF02902
5803 y 5804 similar a [SwissProt número de acceso P45869]
04F02903
5805 y 5806 oxcA [4.1.1.8]
ORF02904
5807 y 5808 proteína de familia CAIB-BAIF [2.8.3.16]
ORF02905
5809 y 5810 precursor de la proteína YfdX
ORF02906
5811 y 5812 proteína hipotética conservada
ORF02907
5813 y 5814 proteína DDG
ORF02908
5815 y 5816 tinsaminasa [similitud] (ASPAT) [2.6.1.-]
ORF02909
5817 y 5818 familia de quinasa de histidina
ORF02910
5819 y 5820 regulador de respuesta autolisina
ORF02911
5821 y 5822 regulador de transcripción VC1825
ORF02912
5823 y 5824 fosfotransferasa fosfoenolpiruvato-proteína PTSA (sistema de fosfotransferasa, enzima I) (Enzima [-Ani) [2.7.3.9]
ORF02913
5825 y 5826 proteína de operón frv
ORF02914
5827 y 5828 prolina dipeptidasa [3.4.-.-]
ORF02915
5829 y 5930 sistema PTS de componentes IIABC de fructosa específica putativa [2.7.169]
ORF02916
5831 y 5832 sistema PTS, IIB componente similar a fructosa 1 (fosfotransferasa
ORF02917
5833 y 5834 glucoquinasa (glk) [2.7.1.2]
ORF02918
5835 y 5836 proteína de iones de transporte putativo yfeO
ORF02919
5837 y 5838 proteína hipotética conservada
ORF02920
5839 y 5840 proteína de transporte, familia NRAMP
ORF02921
5841 y 5842 Nucleósido permeasa nupC
ORF02922
5843 y 5844 Nucleósido permeasa nupC
ORF02923
5845 y 5846 similar a [SwissProt Accession Number P23842] codón de inicio no identificado aún
ORF02924
5847 y 5848 similar a [SwissProt Accession Number P27239] codón de inicio no identificado aún
ORF02925
5849 y 5850 similar a [SwissProt Accession Number P27239] codón de inicio no identificado aún
ORF02926
5851 y 5852 glutamil sintetasa ARNt (gltX) [6.1.1.17]
ORF02927
5853 y 5854 regulador transcripcional, familia LysR, putativo
ORF02928
5855 y 5856 proteína hipotética conservada
ORF02929
5857 y 5856 nucleósido permeasa NupG
ORF02930
5359 y 5860 fosforilasa xantosina (xapA) [2.4.2.1]
ORF02931
5861 y 5862 proteína hipotética
ORF02932
5863 y 5864 Proteína de función desconocida (DUF1384) superfamilia
ORF02933
5865 y 5866 proteína OsmT
ORF02934
5867 y 5868 similar a [SwissProt número de acceso P39836] codón de inicio aún no está identificado
ORF02935
5869 y 5870 proteína hipotética conservada
ORF02936
5871 y 5872 ADN ligasa, dependiente de NAD (ligA) [6.5.1.2]
ORF02937
5873 y 5874 proteína de división celular ZipA (zipA)
ORF02938
5875 y 5876 proteína CysZ
ORF02939
5877 y 5878 cisteína sintasa A (cysK) [2.5.1.47]
ORF02940
5879 y 5880 proteína fosfoportadora HPr (histidina-que contiene proteína) (ptsH) [2.7.1.69]
ORF02941
5881 y 5882 fosfotransferasa fosfoenolpiruvato.proteína (ptsl) [2.7.3.9]
ORF02942
5883 y 5684 enzima de sistema fosfotransferasa II, específico de glucosa, factor III (crr) [2.7.1.69]
ORF02943
5885 y 5886 quinasa de piridoxal [2.7.1.35]
ORF02944
5887 y 5888 proteína hipotética conservada
ORF02945
5889 y 5890 cisteína sintasa B (cysM) [2.5.1.47]
ORF02946
5891 y 5892 proteína de unión al ATP de importación-sulfato de tiosulfato cysA (ATPasa de transporte de sulfato) (atp_bind) [3.6.3.25]
ORF02947
5893 y 5894 sulfato de transportadores ABC, permeasa de proteínas CysW (cysW)
ORF02948
5895 y 5896 sulfato transportador ABC, proteína de permeasa CysT (cysT)
ORF02949
5897 y 5898 proteína de unión de tiosulfato
ORF02950
5899 y 5900 3-oxoacyl- (acil-cámar-proteína) reductasa
ORF02951
5901 y 5902 proteína relacionada con regulador de glucoquinasa
ORF02952
5903 y 5904 sistema PTS, componente IIBC sacarosa específica (EIIBC-Scr) (componente IIBC sacarosa-permeasa) (fosfotransferasa enzima II, componente BC) (EC 2.7.1.69) (Ell-Scr [2.7.1.69]
ORF02953
5905 y 5906 proteína tyrA VC2145
ORF02954
5907 y 5908 Proteína de función desconocida (DUF1131) superfamilia
ORF02955
5909 y 5910 proteína hipotética conservada
ORF02956
5911 y 5912 acetiltransferasa, familia familia GNAT
ORF02957
5913 y 5914 N-acetilniuramoil-L-alanina amidasa I [3.5.1.28]
ORF02958
5915 y 5916 oxidasa coproporfirinogen Ill, aeróbico (hemF) [1.3.3.3]
ORF02959
5917 y 5918 proteína reguladora del operón etanolamina
ORF02960
5919 y 5920 Etanolamina proteína utilización eutK precursor
ORF02961.
5921 y 5922 Etanolamina proteína utilización eutL (eutL)
ORF02952
5923 y 5924 etanolamina amonio-liasa, subunidad ligera, putativo [4.3.1.7]
ORF02963
5925 y 5926 etanolamina amonio-ligasa, subunidad grande (eutB) [4.3.1.7]
ORF02964
5927 y 5928 proteína utilización etanolamina eutA
ORF02965
5929 y 5930 proteína utilización etanolamina eutH
ORF02966
5931 y 5932 proteína utilización etanolamina eutG
ORF02967
5933 y 5934 proteína utilización etanolamina eutJ (EutJ)
ORF02968
5935 y 5936 aldehído deshidrogenasa de alcohol (EutE)
ORF02969
5937 y 5938 dióxido de carbono de concentración de proteína mecanismo CcmL, putativo
ORF02970
5939 y 5940 proteínas de desintoxicación (EutM)
ORF02971
5941 y 5942 fosfato acetiltransferasa (pta) [2.3.1.8]
ORF02972
5943 y 5944 cobalamina adenosiltransferasa utilización de etanolamina. [2.5.1.17]
ORF02973
5945 y 5946 utilización de proteínas Etanotamina eutQ
ORF02974
5947 y 5948 utilización de proteínas Etanolamina eulP
ORF02975
5949 y 5950 utilización de proteínas Etanolamina outs
ORF02976
5951 y 5952 NADP dependiente de la enzima málica (NADP-ME) [1.1.1.40]
ORF02977
5953 y 5954 transaldolasa (tal) [2.2.1.2]
ORF02978
5955 y 5956 transcetolasa (tkt) [2.2.1.1]
ORF02979
5957 y 5958 Proteína de función desconocida (DUF1176) superfamilia
ORF02980
5959 y 5960 proteína hipotética conservada
ORF02981
5961 y 5962 proteína hipotética conservada TIGR00052
ORF02982
5963 y 5954 similar a [SwissProt número de acceso P37127] codón de inicio aún no está identificado (GltD) [1.4.1.13]
ORF02983
5965 y 5966 sensor de proteína de nitrato-nitrito de narQ
ORF02984
5967 y 5968 1037 aminoácidos, proteínas 113 kDa
ORF02985
5969 y 5970 Proteína yffB [1.-.-.-]
ORF02986
5971 y 5972 succinil-diaminopimelato desucinilasa (dapE) [3.5.1.18]
ORF02987
5973 y 5974 proteína hipotética conservada
ORF02988
5975 y 5976 3.1.-.-[3.1.-.-]
MINERAL02989
5977 y 5978 similar a [SwissProt número de acceso P44140]
ORF02990
5979 y 5980 metalopeptidasa, de unión a zinc [3.4.-.-]
ORF02991
5981 y 5982 fosforibosilaminoimidazol-sintasa sucinocarboxamida (purC) [6.3.2.6]
ORF02992
5983 y 5984 Lipoproteína-34 precursor
ORF02993
5985 y 5986 dihidrodipicolinato sintasa (dapA) [4.2.1.52]
ORF02994
5987 y 5988 regulación transcripcional del operón gcv
ORF02995
5989 y 5990 bcp [1.11.1.-]
ORF02996
5991 y 5992 permeasa predicha
ORF02997
5993 y 5994 familia peptidasa M48 familia [3.4.-.-]
ORF02998
5995 y 5996 reductasa arsenato (arsC) [1.20.4.1]
ORF02999
5997 y 5998 ATPasa implicada en la iniciación de replicación de ADN
ORFO3000
5999 y 6000 permeasa uracilo
ORFO3001
6001 y 6002 fosforribosiltransferasa uracilo (upp) [2.4.2.9]
ORF03002
6003 y 6004 fosforibosilformilglicinaamidina ciclo-ligasa (purM) [6.3.3.1]
ORF03003
6005 y 6006 formiltransferasa fosforibosilglicinamida (purN) [2.1.2.2]
ORF03004
6007 y 6008 quinasa polifosfato (ppk) [2.7.4.1]
ORF03005
6009 y 6010 exopolifosfatasa [3.6.1.11]
ORF03006
6011 y 6012 dominio de familia MASE1
ORF03007
6013 y 6014 proteína hipotética conservada
ORF03008
6015 y 6016 proteína hipotética
ORF03009
6017 y 6018 lipoproteína de membrana externa putativa
ORFO3010
6019 y 6020 proteína de membrana probable Z3770
ORFO3011
6021 y 6022 proteína similar a Rz putativa
ORF03012
6023 y 6024 endolisina
ORF03013
6025 y 6026 holina
ORF03014
6027 y 6028 endo-alfa-sialidasa
ORF03015
6029 y 6030 proteína hipotética
ORF03016
6031 y 6032 endo-alfa-sialidasa [3.2.1.129]
ORFO3017
6033 y 6034 proteína hipotética
ORF03018
6035 y 6036 Gp27
ORF03019
6037 y 6038 proteína hipotética
ORF03020
6039 y 6040 proteína hipotética
ORF03021
6041 y 6042 proteína hipotética
ORF03022
6043 y 6044 proteína hipotética conservada
ORF03023
6045 y 6046 proteína hipotética conservada
ORF03024
6047 y 6048 proteína hipotética
ORF03025
6049 y 6050 Bbp13
ORF03026
6051 y 6052 gp11
ORF03027
6053 y 6054 Bbp20
ORF03028
6055 y 6056 proteína hipotética conservada
ORF03029
6057 y 6058 Bbp16
ORF03030
6059 y 6060 gp08
ORF03031
6061 y 6062 Bbp18
ORF03032
6063 y 6064 proteína hipotética
ORF03033
6055 y 6066 Bbp19
ORF03034
6067 y 6068 Bbp21
ORF03035
6069 y 6070 proteína hipotética conservada
ORF03036
6071 y 6072 proteína hipotética
ORF03037
6073 y 6074 proteína hipotética
ORF03038
6075 y 6076 terminasa subunidad grande
ORF03039
6077 y 6078 proteína hipotética conservada
ORF03040
6079 y 6080 represor putativo
ORF03041
6081 y 6082 proteína hipotética conservada
ORF03042
6053 y 6054 proteína hipotética conservada
ORF03043
6055 y 6086 exonucleasa VIII RecE [3.1.11.-]
ORF03044
6087 y 6058 enterohemolisina 1
ORF03045
6089 y 6090 Profago CP4-57 proteína reguladora (AlpA) familia
ORF03046
6091 y 6092 proteína hipotética conservada
ORF03047
6093 y 6094 metilasa de adenina
ORF03048
6095 y 6096 metilasa de adenina
ORF03049
6097 y 6098 integrasa
ORF03050
6099 y 6100 GMP sintasa [glutamina hidrolizante] (Glutaminaamidotransferasa) (GMP sintetasa) (glutamina hidro) [6.3.5.2]
ORF03051
6101 y 6102 deshidrogenasa inosina-5’-monofosfato (guaB) [1.1.1.205]
ORF03052
6103 y 6104 exodeoxiribonucleasa VII, subunidad grande (xseA) [3.1.11.6]
ORF03053
6105 y 6106 precursor de Aec4
ORF03054
6107 y 6108 homólogo Sinl
ORF03055
6109 y 6110 precursor de Aec1
ORF03056
6111 y 6112 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1407)
ORF03057
6113 y 6114 predicho proteína de unión a GTP
ORF03058
6115 y 6116 PQQ proteína de dominio de repetición de la enzima [2.7.1.-]
ORF03059
6117 y 6118 producto de proteína sin nombre
ORFO3O60
6119 y 6120 histidil-ARNt sintetasa (hisS) [6.1.1.21]
ORF03061
6121 y 6122 4-hidroxi-3-metilbut-2-en-1-il difosfato sintasa (ispG) [1.17.4.3]
ORF03062
6123 y 6124 similar a [SwissProt número de acceso P27434]
ORF03063
6125 y 6126 enzima radical SAM, familia Cfr
ORF03064
6127 y 6128 nucleósido difosfato quinasa (ndk) [2.7.4.6]
ORF03065
6129 y 6130 proteína de unión a la penicilina 1C (pbpC)
ORF03066
6131 y 6132 lipoproteína hipotética yfhM precursor
ORF03067
6133 y 6134 sulfurtransferasa 3-mercaptopiruvato (AF109156) [2.8.1.1]
ORF03068
6135 y 6136 serina sensibilidad mejorada
ORF03069
6137 y 6138 Citosol familia aminopeptidasa, dominio catalítico de familia
ORF03070
6139 y 6140 Proteína de función desconocida (DUF528) superfamilia
ORF03071
6141 y 6142 ferredoxina, tipo 2Fe-2S, sistema ISC (fdx)
ORF03072
6143 y 6144 Fe-S ensamblaje proteína chaperona HscA (hscA)
ORF03073
6145 y 6146 Fe-S chaperona de ensamblaje de proteínas HscB (hscB)
ORF03074
6147 y 6148 proteína de ensamblaje de clúster hierro-azufre IscA (iscA)
ORF03075
6149 y 6150 FeS montaje de andamio clúster ISCU (UCI
ORF03076
6151 y 6152 cisteína desulfurase IscS (SICS) [4.4.1.-]
ORF03077
6153 y 6154 factor de transcripción conjunto de clúster hierro-azufre IscR (iscR)
ORF03078
6155 y 6156 RNA metiltransferasa familia TrmH, grupo 1
ORF03079
6157 y 6158 lnositol-1-monofosfatasa (IMPasa) (lnositol-1- fosfatasa) (I-1 Pasa) (I-1 Pasa [3.1.3.25]
ORF03080
6159 y 6160 proteína hipotética conservada
ORF03081
6161 y 6162 MFS (superfamilia importante facilitador) transportador
ORF03082
6163 y 6164 csiE
ORF03083
6165 y 6166 DoxX subfamilia, putativo
ORF03084
6167 y 6168 Aldosa 1-epimerasa superfamilia
ORF03085
6169 y 6170 oxidorreductasa, superfamilia familia deshidrogenasa zinc de unión [1.1.1.14]
ORF03086
6171 y 6172 transportador de ribosa ABC, proteína de permeasa
ORF03087
6173 y 6174 D-xilosa transportador ABC, proteína de unión a ATP
ORF03088
6175 y 6176 transportador de ribosa ABC, proteína periplásmica de unión a la ribosa, putativo
ORF03089
6177 y 6178 proteína de dominio TPR dominio
ORF03090
6179 y 6180 proteína del dominio de proteína de familia ROK
ORF03091
6181 y 6182 hidroximetiltransferasa serina (glyA) [2.1.2.1]
ORF03092
6183 y 6184 reductasa dihidroptendina (NOD) [1.5.1.34]
ORF03093
6185 y 6186 proteína reguladora de nitrógeno P-II
ORF03094
6187 y 6188 proteína reguladora de transcripción
ORF03095
6189 y 6190 producto de proteína sin nombre
ORF03096
6191 y 6192 quinasa de sensor de sistema de dos componentes
ORF03D97
6193 y 6194 fosforibosilformilglicinaamidina sintasa (purL) [6.3.5.3]
ORF03098
6195 y 6196 transglicosilasa, familia Slt
ORF03099
6197 y 6198 ARNt-adenosina deaminasa específica [3.5.4.-]
ORFO3100
6199 y 6200 HAD superfamilia (subfamilia IF) hidrolasa, YfhB (yfhb)
ORFO3101
6201 y 6202 regulador transcripcional (membrana)
ORF03102
6203 y 6204 proteína Napf (fdx)
ORF03103
6205 y 6206 holo-(acil-cámar-proteína) sintasa (acpS) [2.7.8.7]
ORF03104
6207 y 6208 piridoxal fosfato proteína biosintética PdxJ (pdxJ)
ORF03105
6209 y 6210 proteína de reparación del ADN RecO (recO)
ORF03106
6211 y 6212 GTP-proteína de unión Era (era)
ORF03107
6213 y 6214 ribonucleasa III (mc) [3.1.26.3]
ORF03108
6215 y 6216 peptidasa señal I [similitud] (lep) [3.4.21.89]
ORF03109
6217 y 6218 GTP-proteína de unión LepA (lepA)
ORFO3110
6219 y 6220 Sigma-E Factor RSEC proteína reguladora
ORFO3111
6221 y 6222 Sigma-E precursor de factor de proteína reguladora rseB (rseB)
ORFO3112
6223 y 6224 factor sigma-E, proteína reguladora negativa
ORF03113
6225 y 6226 ARN polimerasa sigma E (SIGMA)
ORFO3114
6227 y 6228 proteína hipotética
ORFO3115
6229 y 6230 producto de proteína sin nombre
ORFO3116
6231 y 6232 oxidasa L-aspartato (nadB) [1.4.3.16]
ORFO3117
6233 y 6234 ARN dependiente de ATP helicasa (srmB)
ORFO3118
6235 y 6236 similar a [SwissProt número de acceso P33634]
ORFO3119
6237 y 6238 proteínas de translocator, familia de LysE superfamilia
ORFO3120
6239 y 6240 yfiD de proteína
ORFO3121
6241 y 6242 glicosilasa uracilo-ADN (ung) [3.2.2.-]
ORFO3122
6243 y 6244 similar a [SwissProt número de acceso P33635] codón de inicio aún no está identificado
ORFO3123
6245 y 6246 proteína hipotética
ORFO3124
6247 y 6248 tiorredoxina (trx)
ORFO3125
6249 y 6250 proteína de dominio DTW
ORFO3126
6251 y 6252 sintetasa Acil-CoA (formando NDP)
ORFO3127
6253 y 6254 CDP-DIACILGLICEROL-SERINA O-FOSFATIDILTRANSFERASA (EC 2.7.8.8) (SINTASA FOSFATIDILSERINA). [2.7.8.8]
ORF03128
6255 y 6256 lipoproteína, putativo
ORF03129
6257 y 6258 permeasa alfa-cetoglutarato
ORF03130
6259 y 6260 transposasa
ORF03131
6261 y 6262 transposasa
ORFO3132
6263 y 6264 transposasa
ORF03133
6265 y 6266 hipotético
ORFO3134
6267 y 6268 proteína hipotética
ORF03135
6269 y 6270 proteína de choque térmico [3.4.21.-]
ORF03136
6271 _ y 6272 proteína hipotética conservada TlGR00726
ORF03137
6273 y 6274 ribosomal subunidad grande pseudoundina sintasa D (sthB) [4.2.1.70]
ORF03138
6275 y 6276 desconocido
ORFO3139
6277 y 6278 proteína interfaz subunidad ribosomal (yfiA)
ORF03140
6279 y 6280 P-proteína (PDT) [5.4.99.5]
ORF03141
6281 y 6282 T-proteína (PDH) [5.4.99.5]
ORF03142
6283 y 6284 fosfo-2-dehidro-3-deoxiheptonato aldolasa [2.5.1.54]
ORF03143
6285 y 6286 lipoproteína, putativo
ORF03144
6287 y 6288 proteína hipotética conservada
ORFO3145
6289 y 6290 similar a [SwissProt número de acceso P46139]
ORF03146
6291 y 6292 producto de proteína sin nombre; marco de lectura no identificado (16K polipéptido) (aa
1-127)
ORF03147
6293 y 6294 proteína ribosomal L19 (rplS)
ORF03148
6295 y 6296 ARNt (guanina-N1) metiltransferasa (trmD) [2.1.1.31]
ORF03149
6297 y 6298 16S ARNr procesamiento de proteína RimM (rimM)
ORF03150
6299 y 6300 30S proteína ribosómica S16 (rpS16)
ORF03151
6301 y 6302 proteína partícula de reconocimiento de señal (ffh)
ORF03152
6303 y 6304 CorE
ORF03153
6305 y 6306 producto de proteína sin nombre
ORF03154
6307 y 6308 co-chaperona GrpE (grpE)
ORF03155
6309 y 6310 NAD + quinasa [2.7.1.23]
ORF03156
6311 y 6312 proteína hipotética
ORF03157
6313 y 6314 proteína de reparación del ADN RecN (recN)
ORF03158
6315 y 6316 proteína pequeña A precursor
ORF03159
6317 y 6318 yfj de proteínas
ORF03160
6319 y 6320 Streptomices familia ciclasa-dehidrasa
ORF03161
6321 y 6322 proteína de unión SsrA (smpB)
ORFO3162_
6323 y 6324 proteína hipotética
ORFO3163
6325 y 6326 proteína hipotética conservada
ORF03164
6327 y 6328 proteína similar a Dinl Z3916-ECs3483 (AF175466)
ORFO3165
6329 y 6330 T4-proteína estimuladora de exclusión gIBEGs
ORFO3166
6331 y 6332 proteína ycfE (fragmento)
ORF03167
6333 y 6334 Producto proteico sin nombre: marco de lectura no identificado P-293
ORF03168
6335 y 6336 proteína de choque térmico [3.4.21.-]
ORF03169
6337 y 6338 proteína de choque térmico [3.4.21.-]
ORF03170
6339 y 6340 proteína hipotética conservada
ORF03171
6341 y 6342 Sb36
ORFO3172
6343 y 6344 proteína hipotética conservada
ORF03173
6345 y 6346 proteína hipotética
ORFO3174
6347 y 6348 proteína hipotética conservada
ORF03175
6349 y 6350 producto de proteína sin nombre
ORF03176
6351 y 6352 proteína hipotética
ORF03177
6353 y 6354 proteína gab
ORF03178
6355 y 6356 deshidrogenasa predicha
ORF03179
6357 y 6358 Succinato-semialdehído deshidrogenasa [NADP+] [1.2.1.16]
ORF03180
6359 y 6360 transaminasa 4-aminobutirato (gabT) [2.6.1.19]
ORF03181
6361 y 6362 GABA perrneasa (gabP)
ORFO3182
6363 y 6364 regulador transcripcional. familia GntR, putativo
ORF03183
6365 y 6366 Putativo familia dominio de unión a fosfolípidos
ORF03184
6367 y 6368 UPFO057 hipotético proteína relacionada proteína yqaE
ORFO3185
6369 y 6370 regulador transcripcional, familia ArsR (AJ001934)
ORF03186
6371 y 6372 proteína de familia rodanasa, putativo
ORF03187
6373 y 6374 proteína de unión a ADN stpA
ORF03188
6375 y 6376 Proteína de función desconocida (DUF1144) superfamilia
ORF03189
6377 y 6378 similar a [SwissProt número de acceso P36931] codón de inicio aún no está identificado
ORF03190
6379 y 6380 producto de proteína sin nombre; ORFA
ORFO3191
6381 y 6382 regulador transcripcional GntR familiar (X78503)
ORF03192
6383 y 6384 ACR no caracterizado
ORF03193
6385 y 6386 proteína relacionada con nrdH
ORF03194
6387 y 6388 proteína nrdl (nrdl)
ORF03195
6389 y 6390 cadena alfa reductasa ribonucleósido-difosfato
ORF03196
6391 y 6392 ribonucleósido-difosfato reductasa, subunidad beta [1.17.4.1]
ORF03197
6393 y 6394 componente del sistema de transporte de ATP vinculante para glicina, betaína y prolina (alp_bind)
ORF03198
6395 y 6396 sistema de transporte de betaína-L-prolina glicina permeasa de proteínas proW (membrana)
ORF03199
6397 y 6398 prolina de alta afinidad glicina betaína - sistema de transporte
ORF03200
6399 y 6400 principal transportador de la familia facilitador (pemeasa)
ORF03201
6401 y 6402 proteína de familia AzlC, putativo
ORF03202
6403 y 6404 proteína YgaH
ORF03203
6405 y 6406 represor transcripcional mprA (proteína EmrR)
ORF03204
6407 y 6408 proteína de resistencia a múltiples fármacos A
ORF03205
6409 y 6410 proteína de resistencia a múltiples fármacos B
ORF03206
6411 y 6412 proteína hipotética conservada
ORF03207
6413 y 6414 proteína hipotética conservada
ORF03208
6415 y 6416 autoinductor-2 proteína producción LuxS (luxS)
ORF03209
6417 y 6418 glutamato-cisteína ligasa (gshA) [6.3.2.2]
ORF03210
6419 y 6420 gamma-glutamato-cisteína ligasa (GCS)
ORF03211
6421 y 6422 proteína hipotética conservada
ORF03212
6423 y 6424 CbbY proteína de familia VCA0662 (pgp)
ORF03213
6425 y 6426 regulador de almacenamiento de carbono (csrA)
ORF03214
6427 y 6428 alanil-sintetasa ARNt (alaS) [6.1.1.7]
ORF03215
6429 y 6430 proteína reguladora recX (proteína oraA) (recX)
ORF03216
6431 y 6432 proteína recA (recA)
ORF03217
6433 y 6434 Proteína ygaD
ORF03218
6435 y 6436 mureína transglicosilasa lítica de unión a membrana B precursor
ORF03219
6437 y 6438 -SISTEMA PTS, GLUCITOL-COMPONENTE IIBC SORBITOL-ESPECÍFICO (EIIBC-GUT) (GLUCITOL-SORBITOL-COMPONENTE IIBC DE PERMEASA) (FOSFOTRANSFERASA ENZIMA II, COMPONENTE DE BC) (EC 2.7.1.69) (EII-GUT) [2.7.1.69]
ORF03220
6439 y 6440 SISTEMA DE PTS, GLUCITOL-SORBITOL-COMPONENTE IIBC ESPECÍFICO (EIIBC-GUT) (GLUCITOL-SORBITOL-COMPONENTE IIBC DE PERMEASA) (FOSFOTRANSFERASA ENZIMA II, COMPONENTE BC) (EC 2.7.1.69) (Ell-GUT) [2.7.1.69]
ORF03221
6441 y 6442 enzima PTS Ill glucitol [2.7.1.69]
ORF03222
6443 y 6444 3-oxoacil- (acil-proteína-portador) reductasa (sorbitol) [1.1.1.140]
ORF03223
6445 y 6446 Glucitol proteína activadora del operón (gutM)
ORF03224
6447 y 6448 Glucitol represor del operón (srl)
ORF03225
6449 y 6450 proteína GutQ
ORF03226
6451 y 6452 proteína ygaA (fhlA)
ORF03227
6453 y 6454 Anaeróbica óxido nítrico reductasa flavorubredoxin (FIRD) (FlavoRb) (fprA)
ORF03228
6455 y 6456 Nítrico reductasa óxido de FIRd-NAD(+) reductasa (Flavorubredoxina reductasa) (FIRd-reductasa) (FlavoRb reductasa) (FAD) [1.18.1.-]
ORF03229
6457 y 6458 [NiFe] proteína hidrogenasa maduración HypF (hypF)
ORF03230
6459 y 6460 Proteína de transporte de electrones hydN
ORF03231
6461 y 6462 proteína hipotética
ORF03232
6463 y 6464 ascBF operón represo
ORF03233
6465 y 6466 enzima sistema PTS II ABC (asc) [2.7.1.69]
ORF03234
6457 y 6468 6-fosfo-beta-glucosidasa [3.2.1.86]
ORF03235
6469 y 6470 producto de proteína sin nombre
ORF03236
6471 y 6472 proteína hipotética conservada
ORF03237
6473 y 6474 hidrogenasa la maduración de proteasa Hycl
ORF03238
6475 y 6476 proteína de maduración hidrogenliasa de formato hycH (HycE) [1.-.-.-]
ORF03239
6477 y 6478 subunidad de hidrogenliasa formato 7 [1.18.99.1]
ORF03240
6479 y 6480 subunidad de hidrogenliasa formato 6 [1.18.99.1]
ORF03241
6481 y 6482 hidrogenasa 3 subunidad grande [1.18.99.1]
ORF03242
6483 y 6484 subunidad de hidrogenliasa formato 4 (hycD) [1.18.99.1]
ORF03243
6485 y 6486 subunidad de hidrogenliasa formato 3 (FHL subunidad 3) (hidrogenasa-3componente C) [1.18.99.1]
ORF03244
6487 y 6488 subunidad de hidrogenliasa formato-7 componente B (FHL)
ORF03245
6489 y 6490 proteína regulatoria hidrogenliasa de formato hycA
ORF03246
6491 y 6492 hidrogenasa proteína de inserción de níquel HypA (hypA)
ORF03247
6493 y 6494 proteína accesoria de hidrogenasa HypB
tDRF03248
6495 y 6496 hidrogenasa chaperona ensamblaje HypC-HupF (hypC)
ORF03249
6497 y 6498 hidrogenasa proteína de formación-expresión HypD (hypD)
ORF03250
6499 y 6500 hidrogenasa proteína de formación-expresión HypE (hypE)
ORF03251
6501 y 6502 activador transcripcional de hidrogenliasa de formiato
ORF03252
6503 y 6504 Potencial molibdeno-pterina-proteína de unión
ORF03253
6505 y 6506 proteína hipotética conservada
ORF03254
6507 y 6508 MutS proteína de desajuste de reparación ADN (mutS)
ORF03255
6509 y 6510 Serina-treonina proteína fosfatasa 2 [3.1.3.16]
ORF03256
6511 y 6512 regulador de transcripción del metabolismo de azúcar
ORF03257
6513 y 6514 deshidrogenasa 3-hidroxiisobutirato [1.1.-.-]
ORF03258
6515 y 6516 proteína de unión a sintasa ARNt
ORF03259
6517 y 6518 L-fuculosa-1-fosfato aldolasa de proteína similar (fucA) [4.1.2.17]
ORF03260
6519 y 6520 proteína Hfi [5.3.1.22]
ORF03261
6521 y 6522 permeasa de gluconato
ORF03262
6523 y 6524 proteínas de dominio de superfamilia metalo-beta-lactamasa
ORF03263
6525 y 6526 proteína de unión al represor triptofan
ORF03264
6527 y 6528 RpoS del factor sigma (sigma38)
ORF03265
6529 y 6530 RpoS del factor sigma (sigma38)
ORF03266
6531 y 6532 precursor de lipoproteína nlpD
ORF03267
6533 y 6534 proteína-L-isoaspartato O-metiltransferasa (pcm) [2.1.1.77]
ORF03268
6535 y 6536 fosfatasa ácido SurE (surE) [3.1.3.2]
ORF03269
6537 y 6538 proteína hipotética conservada TIGR00094
ORF03270
6539 y 6540 2C-metil-D-eritritol sintasa de ciclodifosfato 2.4 (ispF) [4.6.1.12]
ORF03271
6541 y 6542 2-C-metil-D-eitritol, 4-fosfato citidililtransferasa (ispD) [2.7.7.60]
ORF03272
6543 y 6544 proteína de división celular ftsB
ORF03273
6545 y 6546 YgbE
ORF03274
6547 y 6548 quinasa de adenililsulfato (cisC) [2.7.1.25]
ORF03275
6549 y 6550 Sulfato de subunidad adeniltransferasa 1 (Sulfato adenilatotransferasa) (SAT) (ATPsulfurilasa subunidad grande) (SAT) [2.7.7.4]
ORF03276
6551 y 6552 Sulfato de subunidad adeniltransferasa 2 (Sulfato adenilatotransferasa) (SAT) (ATPsulfurilasa subunidad pequeña) (SAT) [2.7.7.4]
ORF03277
6553 y 6554 proteína hipotética
ORF03278
6555 y 6556 fosfatasa alcalina isoenzima precursor de proteína de conversión [3.4.11.-]
ORF03279
6557 y 6558 superfamilia de familia de hok-gef
ORF03280
6559 y 6560 3-fosfoadenosina 5-reductasa fosfosulfato
ORF03281
6561 y 6562 reductasa de sulfito (NADPH) hemoproteína, subunidad beta (cisl) [1.8.1.2]
ORF03282
6563 y 6564 reductasa de sulfito [NADPH] flavoproteína, cadena alfa [1.8.1.2]
ORF03283
6565 y 6566 sintasa 6-piruvoil-tetrahidropterina
ORF03284
6567 y 6568 oxidoreductasa transferencia probable de electrones fiavoproteína-quinona ygcN
ORF03285
6569 y 6570 proteína similar a ferredoxina ygcO
OF03286
6571 y 6572 operón captación de glicerol antiterminador proteína reguladora putativo
ORF03287
6573 y 6574 la transferencia de electrones flavoproteína, subunidad alfa subfamilia (etfA)
ORF03288
6575 y 6576 proteína de transporte putativo
ORF03289
6577 y 6578 transportador de azúcar, putativo
ORF03290
6579 y 6580 alquilo-dihidroxiacetona sintasa, putativo
ORF03291
6581 y 6582 1.-.-.- [1.1.1.-]
ORF03292
6583 y 6584 Subfamilia de Facilitador Mayor superfamilia
ORF03293
6585 y 6586 quinasa de azúcar, familia chapada a la antigua, putativo [2.7.1.17]
ORF03294
6587 y 6588 activación de enzima radical
ORF03295
6589 y 6590 activación de enzima radical
ORF03296
6591 y 6592 superfamilia de familia LemA
ORF03297
6593 y 6594 proteína rica de glicina
ORF03298
6595 y 6596 proteína hipotética conservada
ORF03299
6597 y 6598 función desconocida de dominio (DUF477) familia
ORF03300
6599 y 6600 proteína rica de glicina
ORF03301
6601 y 6602 enolasa (eno) [4.2.1.11]
ORF03302
6603 y 6604 sintasa CTP (pyrG) (6.3.4.2]
ORF03303
6605 y 6606 proteína mazG (mazG)
ORF03304
6607 y 6608 proteína similar a PemK 1 (proteína MazF) (AF027767)
ORF03305
6609 y 6610 proteína similar a Peml 1 (proteína MazE)
ORF03306
6611 y 6612 pirofosfoquinasa GTP (ATP:GTP 3’-pirofosfotransferasa)(ppGpp sintetasa I) ((p) ppGpp sintetasa) (relA) [2.7.6.5]
ORF03307
6613 y 6614 23S ARNr (uracilo-5-) - metiltransferasa RumA (rumA) [2.1.1.-]
ORF03308
6615 y 6616 sensor de proteína barA [2.7.3.-]
ORF03309
6617 y 6618 proteína hipotética
ORF03310
6619 y 6620 deshidratasa de glucarato [4.2.1.40]
ORF03311
6621 y 6622 deshidratasa de glucarato [4.2.1.-]
ORF03312
6623 y 6624 transportador MFS, familia permeasa ftalato
ORF03313
6625 y 6626 Exoenzima regulación regulón (mioC)
ORF03314
6627 y 6628 ARN proteína de familia sintasa pseudouridilato [4.2.1.70]
ORF03315
6629 y 6630 ARNt sintetasa pseudouridina C (sintasa pseudouridilato) (hidroliasa uracilo) [4.2.1.70]
ORF03316
6631 y 6632 interactúa con secY
ORF03317
6633 y 6634 proteína hipotética
ORF03318
6635 y 6636 GTP proteína similar a ciclohidrolasa I
ORF03319
6637 y 6638 proteína de unión de nucleótidos Rossmann predichas
ORF03320
6639 y 6640 transportador Serina
ORF03321
6641 y 6642 L-serina amoníaco liasa (sdaA) [4.3.1.17]
ORF03322
6643 y 6644 exodeoxiribonucleasa IX
ORF03323
6645 y 6646 reductasa lactaldehida [1 .1.1.77]
ORF03324
6647 y 6648 aldolasa de fosfato L-fuculosa (fucA) [4.1.2.17]
ORF03325
6649 y 6650 proteína hipotética conservada
ORF03326
6651 y 6652 permeasa-L fucosa (fucP)
ORF03327
6653 y 6654 1-fucosa isomerasa (fucl) [5.3.1.25]
ORF03328
6655 y 6656 L-fuculoquinasa (L-fuculosa quinasa) (fuck) [2.7.1.51]
ORF03329
6657 y 6658 proteína fucU fucosa operón (fucU)
ORF03330
6659 y 6660 proteína hipotética
ORF03331
6661 y 6662 activador del operón L-fucosa
ORF03332
6663 y 6664 proteína similar a metiltransferasa dependiente de SAM
ORF03333
6665 y 6666 proteína de membrana pequeña no caracterizada
ORF03334
6667 y 6668 regulador de la transcripción, familia LysR (gcvA)
ORFO3335
6669 y 6670 proteína bacteriana de función desconocida (DLJF9O3) superfamilia
ORF03336
6671 y 6672 Cisteína sulfinato desulfinasa
ORF03337
6673 y 6674 Fe-S metabolismo asociado dominio subfamilia
ORF03338
6675 y 6676 enzimas de utilización dinucleótida implicadas en molibdopterina y biosíntesis de tiamina familia 1
ORF03339
6677 y 6678 mureína lítica de unión a membrana transglicosilasa A precursor
ORF03340
6679 y 6680 Proteína de función desconocida (DUF77O) superfamilia
ORF03341
6681 y 6682 Aec18
ORF03342
6683 y 6684 proteína bacteriana de función desconocida (DUF876) superfamilia
ORF03343
6685 y 6686 proteína de membrana posiblemente conservada
ORF03344
6687 y 6688 producto de proteína sin nombre
ORF03345
6689 y 6690 proteína secretada Hcp
ORF03346
6691 y 6692 proteína ClpB
ORF03347
6693 y 6694 elemento Rhs VGR proteína subfamilia, putativo
ORF03348
6695 y 6696 producto de proteína sin nombre; Similar a la proteína desconocida
ORF03349
6697 y 6698 producto de proteína sin nombre; Muy similar a la proteína desconocida de Fotorhabdus. proteínas secretada putativa, putativo
ORF03350
6699 y 6700 producto de proteína sin nombre
ORF03351
6701 y 6702 producto de proteína sin nombre
ORF03352
6703 y 6704 familia N-terminal ImpA relacionado
ORF03353
6705 y 6706 proteína hipotética conservada
ORF03354
6707 y 6708 proteína hipotética
ORF03355
6709 y 6710 proteína bacteriana de función desconocida (DUFS79) superfamilia
ORF03356
6711 y 6712 Proteína de función desconocida (DUF1305) superfamilia
ORF03357
6713 y 6714 lipoproteína, putativo
ORF03358
6715 y 6716 Proteína de función desconocida (DUF1316) subfamilia
ORF03359
6717 y 6718 proteína hipotética conservada
ORF03360
6719 y 6720 familia N-terminal relacionada con ImpA
ORF03361
6721 y 6722 2-hidroxiácido deshidrogenasa (serA)
ORF03362
6723 y 6724 isomerasa de fosfoazúcar
ORF03363
6725 y 6726 Beta-cistationasa
ORF03364
6727 y 6728 sistema PTS, componentes IIBC, putativo [2.7.1.69]
ORF03365
6729 y 6730 antiterminador
ORF03366
6731 y 6732 N-acetilmuramiol-L-alanina amidasa precursor amiC [3.5.1.28]
ORF03367
6733 y 6734 N-acetiltransferasa aminoácidos (argA) [2.3.1.1]
ORF03368
6735 y 6736 exodeoxiribonucleasa V, subunidad alfa (recD) [3.1.11.5]
ORFO3369
6737 y 6738 exodeoxiribonucleasa V, subunidad beta (recB) [3.1.11.5]
ORF03370
6739 y 6740 precursor de proteasa Ill (Pitrilisina) (proteasa pi) (pitrilisina) [3.4.24.55]
ORF03371
6741 y 6742 exodeoxiribonucleasa V, subunidad gamma (recC) [3.1.11.5]
ORF03372
6743 y 6744 peptidasa de prepilina dependiente de proteína C precursor
ORF03373
6745 y 6746 proteína hipotética conservada
ORF03374
6747 y 6748 producto de proteína sin nombre; IJRF1 (aa 1-267)
ORF03375
6749 y 6750 peptidasa de prepilina dependiente proteína A precursor
ORF03376
6751 y 6752 timidilato sintasa (thyA) [2.1.1.45]
ORF03377
6753 y 6754 prolipoproteína diacilgliceril transferasa (lgt) [2.4.99.-]
ORF03378
6755 y 6756 fosfotransferasa fosfoenolpiruvato-proteína ptsP (Ntr) [2.7.3.9]
ORF03379
6757 y 6758 pirofosfohidrolasas NTP que incluye enzimas de reparación de daño oxidativo
ORF03380
6759 y 6760 ADN desajuste de reparación de endonucleasa mutH (mutH)
ORF03381
6761 y 6762 proteína TerC
ORF03382
6763 y 6764 lipoproteína
ORF03383
6765 y 6766 proteína Tas
ORF03384
6767 y 6768 producto de proteína sin nombre
ORF03385
6769 y 6770 proteína AAS bifunctional
ORF03386
6771 y 6772 represor del operón galactosa
ORF03387
6773 y 6774 diaminopimelato descarboxilasa (lysA) [4.1.1.20]
ORF03388
6775 y 6776 aspartato subfamilia racemasa [5.1.1.13]
ORF03389
6777 y 6778 activador de proteínas transcripcional lysR
ORF03390
6779 y 6780 cotransportador arabinosa-protón
ORF03391
6781 y 6782 2-desoxi-D-gluconato de 3-deshidrogenasa (kduD) [1.1.1.125]
ORF03392
6783 y 6784 4-desoxi-L-treo-5-hexosulose-uronato cetol-isomerasa
ORF03393
6785 y 6786 acetil-CoA probable acetiltransferasa
ORF03394
6787 y 6788 transportador serina
ORF03395
6789 y 6790 posible lipoproteína
ORF03396
6791 y 6792 oxidorreductasa aldehído, putativo [1.1.1.204]
ORF03397
6793 y 6794 xantina deshidrogenasa, subunidad de unión a FAD (cutB) [1.1.1.204]
ORF03398
6795 y 6796 pequeña cadena CO deshidrogenasa (cutC)
ORF03399
6797 y 6798 transducción de señales y de control de la transcripción de proteínas
ORF03400
6799 y 6800 proteína hipotética
ORF03401
6801 y 6802 Aspartato-ornitina carbamoiltransferasa, Asp-Om vinculante dominio de familia
ORF03402
6803 y 6804 treonina deshidratasa biosintética [4.3.1.15]
ORF03403
6805 y 6806 desacetilasa acetilomitina, putativo
ORF03404
6807 y 6808 dihidropirimidinasa (HYDA) [3.5.2.2]
ORF03405
6809 y 6810 quinasa carbamato (arcC) [2.7.2.2]
ORF03406
6811 y 6812 xantina deshidrogenasa factor accesorio, subfamilia putativa, putativo
ORF03407-
6813 y 6814 proteína hipotética conservada
ORF03408
6815 y 6816 hipotético ygfJ
ORF03409
6817 y 6818 oxidorreductasa, piridina nucleótido-disulfuro familia
ORF03410
6819 y 6820 proteína de familia clorohidrolasa, putativo
ORF03411
6821 y 6822 dominio de unión a FAD en proteínas dehidrogenasa molibdopterina
ORF03412
6823 y 6824 oxidorreductasa aldehído, putativo [1 -.-]
ORF03413
6825 y 6826 xantina-uracilo proteína de familia permeasa
ORF03414
6827 y 6828 deaminasa guanina
ORF03415
6829 y 6830 proteína de familia permeasa xantina-uracilo
ORF03416
6831 y 6832 Proteína de transporte de electrones hydN
ORF03417
6833 y 6834 oxidoreductasa anaeróbicamente expresada (GltD) [1.4.1.13]
ORF03418
6835 y 6836 permeasa xantina
ORF03419
6837 y 6838 isopentenil-difosfato delta isomerasa tipo 1 (idi) [5332]
ORF03420
6839 y 6840 sintetasa lisil-ARNt (lusS) [6.1.1.6]
ORF03421
6841 y 6842 cadena peptídica factor de liberación 2 (prfB)
ORF03422
6843 y 6844 exonucleasa RecJ monocatenario-ADN-específico.(recJ) [3.1.-.-]
ORF03423
684 8 634b Tiol proteína precursora de intercambio de disulfuro dsbC (DsbC) [5.3.4.1]
ORF03424
6847 y 6848 recombinasa de tirosina XerD (xerD)
ORF03425
6849 y 6850 flavodoxina
ORF03426
6851 y 6852 producto de proteína sin nombre
ORF03427
6853 y 6854 proteína conservada no caracterizada
ORF03428
6855 y 6856 aminometiltransferasa predicha
ORF03429
6857 y 6858 similar a hemsina Ill homólogo
ORF03430
6859 y 6860 proteína UPF0267
ORF03431
6861 y 6862 6-fosfo-beta-glucosidasa
ORF03432
6863 y 6864 glicina deshidrogenasa (gcvP) [1.4.4.2]
ORF03433
6865 y 6866 sistema de escisión de glicina proteína H (gcvH)
ORF03434
6867 y 6868 sistema de escisión de glicina proteína T (gcvT) [2.1.2.10]
ORF03435
6869 y 6870 VisC de proteínas [1.-.-.-]
ORF03436
6871 y 6872 2-poliprenilo-6-metoxifenol 4-hidroxilasa (ubiH) [1.14.13.-]
ORF03437
6873 y 6874 Xaa-Pro aminopeptidasa (APP-II) [3.4.11.9]
ORF03438
6875 y 6876 yecA subfamilia de proteína de familia
ORF03439
6877 y 6878 Familia de función desconocida (DUF71O) superfamilia
ORF03440
6879 y 6880 5-formiltetrahidrofolato proteína de la familia de ciclo-ligasa, putativo
ORF03441
6881 y 6882 D-3-fosfcglicerato deshidrogenasa [1.1.1.95]
ORF03442
6883 y 6884 ribosa 5-fosfato isomerasa A (PRAI) [5.3.1.6]
ORF03443
6885 y 6886 proteína hipotética conservada
ORF034.44
6887 y 6888 inhibidor de iniciación del cromosoma
ORF03445
6889 y 6890 producto de proteína sin nombre; smb oro (MCM)
ORF03446
6891 y 6892 regulador transcnptional putativo tipo LYSR
ORF03447
6893 y 6894 lpqG, putativo
ORF03448
6895 y 6896 posible proteína de transporte de membrana
ORF03449
6897 y 6898 pequeña conductancia del canal mecanosensitivo
ORF03450
6899 y 6900 aldolasa fructosa-bisfosfato, clase II (fbaA) [4.1.2.13]
ORF03451
6901 y 6902 fosfoglicerato quinasa (pgk) [2.7.2.3]
ORF03452
6903 y 6904 deshidrogenasa D-eritrosa-4-fosfato (epd) [1.2.1.-]
ORF03453
6905 y 6906 proteína hipotética
ORF03454
6907 y 6908 Dominio de función desconocida (DUF296) familia
ORF03455
6909 y 6910 proteína hipotética conservada
ORF03456
6911 y 6912 proteína hipotética conservada
ORF03457
6913 y 6914 Transportador ABC, proteína de unión a ATP
ORF03458
6915 y 6916 proteína relacionada con quinasa
ORF03459
6917 y 6918 cbiO proteína de transporte de cobalto de unión a ATP
ORF03460
6919 y 6920 producto de proteína sin nombre; ORF2 (AA 1-133)
ORF03461
6921 y 6922 fructosa-1, 6-bisfosfatasa, clase II
ORF03462
6923 y 6924 oxidorreductasa putativa
ORF03463
6925 y 6926 sistema PTS, manitol (Cryptic) [2.7.1.69]
ORF03464
6927 y 6928 sistema PITS, manitol (Cryptic) componente específico de IIA (EIIA-(C)mtl) (Manitol (Cryptic) -permeasa componente IIA) (Fosfotransferasa enzimaIl, componente A) (Cryptic) [2.7.1.69]
ORF03465
6929 y 6930 proteasa serina putativa
ORF03466
6931 y 6932 transquetolasa) [2.2.1.1]
ORF03467
6933 y 6934 Putativa metaloproteasa yggG
ORF03468
6935 y 6936 agmatinasa, putativo [3.5.3.11]
ORF03469
6937 y 6938 lipoproteína, putativo
ORF03470
6939 y 6940 decarboxilasa arginina (speA) [4.1.1.19]
ORF03471
6941 y 6942 proteína hipotética conservada
ORF03472
6943 y 6944 proteína hipotética conservada
ORF03473
6945 y 6946 S-sintetasa adenosilmetionina (metK) [2.5.1.6]
ORF03474
6947 y 6948 cotransportador de galactosa-protón
ORF03475
6949 y 6950 proteína sprT
ORF03476
6951 y 6952 Endonucleasa I precursor
ORF03477
6953 y 6954 hipotética proteína conservada TIGR00046
ORF03478
6955 8 6956 sintasa glutatión (gshB) [6,3.2.3]
ORF03479
6957 y 6958 ACR no caracterizado, C0G1678
ORF03480
6959 y 6960 proteína hipotética conservada TIGROO25O
ORF03481
6961 y 6962 ATPasas predicha implicada en pili biogénesis, homólogos de la píldora PilT
ORF03482
6963 y 6964 hipotética proteína conservada TIGR00044
ORF03483
6965 y 6966 proteína integral de membrana predicha
ORF03484
6967 y 6968 proteína hipotética conservada TIGR00251
ORF03485
6969 y 6970 pirofosfatasa purina no canónica NTP, familia rdgB-HAM1 (rdgB)
ORF03486
6971 y 6972 coproporfirinógeno oxidasa Ill independiente de oxígeno, putativo
ORF03487
6973 y 6974 Proteína de función desconocida (DUF12O2) superfamilia
ORF03488
6975 y 6976 L-asparaginasa II (ansB) [3.5.1.1]
ORF03489
6977 y 6978 proteína hipotética conservada
ORF03490
6979 y 6980 proteína hipotética conservada
ORF03491
6981 y 6982 Proteína
ORF03492
6983 y 6984 ARNt (guanina-N(7)-) - metiltransferasa (ARNt(m7G46)-rnetiltransferasa) [2.1.1.33]
ORF03493
6985 y 6986 A-G-glicosilasa específica adenina
ORF03494
6987 y 6988 proteína yggX
ORF03495
6989 y 6990 yggZ proteína (MLTC) [3.2.1.-]
ORF03496
6991 y 6992 permeasa de nucleósido NupG
ORF03497
6993 y 6994 omitina descarboxilasa isoenzima (speC) [4.1.1.17]
ORF03498
6995 y 6996 proteína de membrana integral
ORF03499
6997 y 6998 transposasa, truncada
ORF03500
6999 y 7000 KpsF
ORF03501
7001 y 7002 Cápsula de polisacáridos de exportación-proteína de membrana interna kpsE
ORF03502
7003 y 7004 biosíntesis de proteínas polisacárido, putativo
ORF03503
7005 y 7006 citidililtransferasa 3-desoxi-D-mano-octulosonato (kdsB) [2.7.7.38]
ORF03504
7007 y 7008 proteína cápsula de polisacáridos de exportación KPSC
ORF03505
7009 y 7010 proteína KPSS
ORF03506
7011 y 7012 ácido polisiálico biosíntesis de proteínas cápsula de ácido SiaD, truncado; interrumpido por ermC extranjero, putativo [2.4.-.-]
ORF03507
7013 y 7014 NeuE proteína
ORF03508
7015 y 7016 UDP-N-2-epimerasa acetilglucosamina [5.1.3.14]
ORF03509
7017 y 7018 citidililtransferasa acilneuraminato, putativo [2.7.7.43]
ORF03510
7019 y 7020 proteína neuB [4.1.3.-]
ORF03511
7021 y 7022 kpsT proteína de transporte de ácido polisiálico de unión a ATP [3.6.3.38]
ORF03512
7023 y 7024 proteína de transporte de ácido polisiálico kpsM
ORF03513
7025 y 7026 proteína putativa de la ruta general de secreción de tipo M yghD
ORF03514
7027 y 7028 secreción de proteína de ruta general L (gspL)
OR.F03515
7029 y 7030 secreción de proteínas de vía general K (gspK)
ORF03516
7031 y 7032 secreción de proteínas de vía general J (gspJ)
ORF03517
7033 y 7034 secreción de proteínas de vía general I (gspI)
ORF03518-
7035 y 7036 GspH, proteína de secreción de Tipo II hipotético
ORF03519
7037 y 7038 secreción de proteínas de vía general G (gspG)
ORF03520
7039 y 7040 secreción de proteínas de vía general F (gspF)
ORF03521
7041 y 7042 secreción de proteínas de vía general E (GSP)
-0R-
7043 y 7044 Tipo II, vía secretora, componente EpsD
ORF03523
7045 y 7046 secreción de proteínas de vía general C (gspC)
ORF03524
7047 y 7048 proteína YghG
ORF03525
7049 y 7050 b2972 proteínas de secreción [3.4.23.43]
ORF03526
7051 y 7052 factor de colonización accesorio ACFD precursor
ORF03527
7053 y 7054 Glicolato permeasa glcA
ORF03528
7055 y 7056 malato sintasa G (glcB) [2.3.3.9]
ORF03529
7057 y 7058 proteína glcG
ORF03530
7059 y 7060 subunidades de glicolato oxidasa GlcE y GIcF (Fe-S) [1.1.3.15]
ORF03531
7061 y 7062 subunidades de glicolato oxidasa GlcE y GIcF
ORF03532
7063 y 7064 subunidades de glicolato oxidasa GlcD (glcD)
ORF03533
7065 y 7066 GIc activador transcripcional de operón
ORF03534
7067 y 7068 proteína hipotética conservada
ORF03535
7069 y 7070 sintasa de acil-CoA
ORF03536
7071 y 7072 proteína hipotética conservada
ORF03537
7073 y 7074 sitio de unión de fosfopanteteína (ACP)
ORF03538
7075 y 7076 8-amino-7-oxononanoato sintasa
ORF03539
7077 y 7078 permeasa predicha YjgP-YjgQ familia superfamilia
ORF03540
7079 y 7080 permeasa predicha YjgP-YjgQ familia superfamilia
ORF03541
7081 y 7082 proteína hipotética conservada YlfJ-familia, TIGR01626
ORF03542
7083 y 7084 proteína hipotética conservada
ORF03543
7085 y 7086 proteína de dominio biosintesis polisacarida proteína
ORF03544
7087 y 7088 proteína de unión a ATP hipotética yghR
ORF03545
7089 y 7090 proteína de unión a ATP hipotética yghS
ORF03546
7091 y 7092 proteína hipotética
ORF03547
7093 y el 70 94 proteína de unión a ATP hipotética yghT
ORF03548
7095 y 7096 proteína de transporte de fosfato de baja afinidad
ORF03549
7097 y 7098 sintasa de glutationilsperrnidina
ORF03550
7099 y 7100 proteína hipotética similar a GST yghU
ORF03551
7101 y 7102 hidrogenasa chaperona ensamblaje HypC-HupF (hypC)
ORF03552
7103 y 7104 hidrogenasa proteína de inserción de níquel HypA (HypA)
ORF03553
7105 y 7106 proteína hidrogenasa-2 operón hybE
ORF03554
7107 y 7108 proteína hidrogenasa de expresión formación
ORF03555
7109 y 7110 hidrogenasa-2 subunidad grande HybC [1.18.99.1]
ORF03556
7111 y 7112 componente de hidrogenasa-2 de citocromo Ni-Fe
ORF03557
7113 y 7114 proteína de hidrogenasa-2 operón precursor hybA
ORF03558
7115 y 7116 Hidrogenasa-2 precursor de cadena pequeña (NiFe hidrogenasa) (hidrogenasa unida a membrana 2 de subunidad pequeña) (HYO2) (hydA) [1.12.99.6]
ORF03559
7117 y 7118 proteína hipotética conservada
ORF03560
7119 y 7120 proteína de la familia hidrolasa dienelactona
ORF03561
7121 y 7122 oxidorreductasa, familia aldo-ceto reductasa
ORF03562
7123 y 7124 proteína hipotética conservada TIGR00645
ORF03563
7125 y 7126 oxidoreductase, familia dehydrogenasa reductase de cadena corta [1.-.-.-]
ORF03564
7127 y 7128 proteína biopolímero transporte exbD
ORF03565
7129 y 7130 proteína biopolímero transporte ExbB (captación)
ORF03566
7131 y 7132 cistationina beta-tiasa (metC) [4.4.1.8]
ORF03567
7133 y 7134 producto de proteína sin nombre; Similar a DedA familia integral membrana proteína YghB de Escherichia coli
ORF03568
7135 y 7136 regulador de transcripción, familia AraC
ORF03569
7137 y 7138 oxidorreductasa no caracterizada
ORF03570
7139 y 7140 oxidorreductasa, aldo-ceto reductasa familia [1.1.1274]
ORF03571
7141 y 7142 proteína hipotética conservada
ORF03572
7143 y 7144 importante lipoproteína de membrana externa
ORF03573
7145 y 7146 radical proteína proteína de dominio SAM
ORF03574
7147 y 7148 regulador de operón Uxu
ORF03575
7149 y 7150 hipotética o, qdoreductase ydfl
ORF03576
7151 y 7152 2,3-butanodiol deshidrogenasa, putativo [1.1.1.141
ORF03577
7153 y 7154 Ureidoglicolato deshidrogenasa [1.1.1.-]
ORF03578
7155 y 7156 tipo TRAP sistema de transporte C4-dicarboxilato, componente periplásmico (AP001509)
ORF03579
7157 y 7158 producto de proteína sin nombre
ORF03580
7159 y 7160 TRAP transportador de dicarboxilato, subunidad DctM
ORF03581
7161 y 7162 supresor de ftsl
ORF03582
7163 y 7164 1-acil-sn-glicerol-3-fosfato aciltransferasa (LPAAT) [2.3.1.511
ORF03583
7165 y 7166 ADN topoisomerasa IV, subunidad A (PARC) [5.99.1.-]
ORF03584
7167 y 7168 superfamilia ABC (periplasma), proteína de transporte oligopéptido con
ORF03585
7169 y 7170 regulador de transcripción, familia AraC
ORF03586
7171 y 7172 proteína hipotética conservada TIGROD156
ORF03587
7173 y 7174 proteína reguladora transcripcional gseB
ORF03588
7175 y 7176 sensor de proteína gseC [2.7.3.-]
ORF03589
7177 y 7178 producto de proteína sin nombre; Similar a la proteína Hcp
ORF03590-
7179 y 7180 NAD(P)H guinona oxidorreductasa, putativo
ORF03591
7181 y 7182 proteína ygiN
ORF03592
7183 y 7184 proteína de dominio SIS
ORF03593
7185 y 7186 proteína putativa de hierro compuesto de unión del transportador ABC
ORF03594
7187 y 7188 compuesto de hierro transportador ABC, permeasa de proteína (III)
ORF03595
7189 y 7190 captación exoquelina férrica (fxuC)
ORF03596
7191 y 7192 captación exoquelina férrica (fxuB)
ORF03597
7193 y 7194 receptor putativo compuesto de hierro
ORF03598
7195 y 7196 ADN topoisomerasa IV, subunidad B (parE) (5.99.1.-]
ORF03599
7197 y 7198 esterasa predicha
ORF03600
7199 y 7200 proteína Icc
ORF03601
7201 y 7202 Proteína de función desconocida (DUFI 249) superfamilia
ORF03602
7203 y 7204 conservadas hipotética proteína TIGR00052
ORF03603
7205 y 7206 canal de la membrana externa de tolerancia específica para colicina
ORF03604
7207 y 7208 proteína hipotética conservada
ORF03605
7209 y 7210 glutationilsperrnidina sintasa (0386)
ORF03606
7211 y 7212 arilsulfato sulfotransferasa
ORF03607
7213 y 7214 Tiol: proteína de intercambio disultida similar a dsbA precursor [5.3.4.1]
ORF03608
7215 y 7216 formación de enlaces de disulfuro de proteína B (dsbB) [1.8.4.-]
ORF03609
7217 y 7218 Catalítica de la subunidad de LigB aromático dioxigeriasa de apertura de anillo superfamilia
ORF03610
7219 y 7220 proteína hipotética
ORF03611
7221 y 7222 zinc transportador zupT
ORFO3S12
7223 y 7224 proteína hipotética conservada
ORF03613
7225 y 7226 proteína flmbrial
ORF03614
7227 y 7228 membrana exterior porina ujier
ORF03615
7229 y 7230 MEMBRANA EXTERNA DE UJIER PROTEÍNA PMFC PRECURSOR
ORF036dieciséis
7231 y 7232 hipotética chaperona fimbrial precursor ygiH
ORF03617_
7233 y 7234 proteína ybqO
ORF03618
7235 y 7236 3,4-dihidroxi-2-butanona 4-fosfato sintasa (ribB)
ORF03619
7237 y 7238 Proteína de función desconocida (DUF526) familia
ORF03620
7239 y 7240 biosíntesis de glucógeno, proteína relacionada dependiente de rpoS
ORF03621
7241 y 7242 YgiJ
ORF03622
7243 y 7244 BCR no caracterizado, putativo
ORF03623
7245 y 7246 ADP-heptosa sintasa (2.7.-.-]
ORF03624
7247 y 7248 glutamato-amoniaco-ligasa adenililtransferasa
ORF03625
7249 y 7250 Adenil ciclasa, putativa
ORF03626
7251 y 7252 protéina hipotética conservada
ORF03627
7253 y 7254 transferasa nucleótida ARNt
ORF03628
7255 y 7256 quinasa undecaprenol, putativo [2.7.1.66]
ORF03629
7257 y 7258 dihidroneopterina aldolasa (foiB) [4.1.2.25]
ORF03630
7259 y 7260 conservadas hipotética proteína TIGROO023
ORF03631
7261 y 7262 familia proteína reguladora LysR
ORF03632
7263 y 7264 proteína hipotética
ORF03633
7265 y 7266 fumarasa (fumarasa) [4.2.1.32]
ORF03634
7267 y 7268 fumarato de clase I hdratasa putativa [4.2.1.32]
ORF03635
7269 y 7270 DASS familia, citrato: succinato de transporte (antiporte)
ORF03636
7271 y 7272 O-sialoglicoproteína endopeptidasa) [3.4.24.57]
ORF03637
7273 y 7274 30S proteína ribosomal S21 proteína relacionada
ORF03638
7275 y 7276 ADN primasa [2.7.7.-]
ORF03639
7277 y 7278 sigma factor D de RNA polimerasa
ORF03640
7279 y 7280 sigma factor D de RNA polimerasa
ORF03641
7281 y 7282 Desajuste específica glicosilasa ADN G-U (Desajuste- specificuracil ADN-glicosilasa) (UDG) [3.2.2.-]
ORF03642
7283 y 7284 proteína de utilización hierro-quelator
ORF03643
7285 y 7286 regulador de transcripción, familia PadR
ORF03644
7287 y 7288 receptor de aerotaxis
ORF03645
7289 y 7290 aminotransferasa omitina (rocD [2.6.1.13]
ORF03646
7291 y 7292 ARNt de unión a proteínas ygjH (mets) [6.1.1.10]
ORF03647
7293 y 7294 galactosa operón represor galR
ORF03648
7295 y 7296 beta-galactosidasa alfa subunidad evoluida
ORF03649
7297 y 7298 EGB enzima beta subunidad [3.2.1.23]
ORF03650
7299 y 7300 oxidoreductasa probable ygil
ORF03651
7301 y 7302 proteína hipotética conservada
ORF03652
7303 y 7304 proteína hipotética conservada
ORF03653
7305 y 7306 reductasa 2,4-dienoil-CoA [1.-.-.-]
ORF03654
7307 y 7308 2.1.1.52 [2.1.1.52]
ORF03655
7309 y 7310 proteína hipotética conservada
ORF03656
7311 y 7 312 sanA proteína
ORF03657
7313 y 7314 oxidorreductasa
ORF03658
7315 y 7316 proteína de Alx
ORF03659
7317 y 7318 odium: superfamilia familia contransportador dicarboxilato
ORF03660
7319 y 7320 proteína hipotética conservada
ORF03661
7321 y 7322 hidrolasa altronato [4.2.1.7]
ORF03662
7323 y 7324 isomerasa glucuronato (uxaC) AC [5.3.1.12]
ORF03663
7325 y 7326 facilitador principal transportador de familia, putativo
ORF03664
7327 y 7328 Exu regulón regulador transcripcional
ORF03665
7329 y 7330 producto proteico sin nombre; Similar a DedA familiar integral membrana proteína YgliB de Escherichia coli
ORF03666
7331 y 7332 proteína hipotética conservada
ORF03667
7333 y 7334 proteína precursora yqjC [3.4.24.13]
ORF03668
7335 y 7336 proteína bacteriana de función desconocida superfamilia (DUF883)
ORF03669
7337 y 7338 proteína hipotética conservada
ORF03670
7339 y 7340 proteína hipotética conservada
ORF03671
7341 y 7342 proteína de membrana predicha
ORF03672
7343 y 7344 glutatión S-transferasa terminal C (0328)
ORF03673
7345 y 7346 Proteína de función desconocida (DUF805) superfamilia
ORF03674
7347 y 7348 transcripción IysR familiar proteína reguladora YPO3545
ORF03675
7349 y 7350 BCR no caracterizado, familia YhhW familia COG1741
CR103676
7351 y 7352 proteína hipotética conservada
ORF03677
7353 y 7354 Proteína de función desconocida superfamilia (DUFI063)
ORF03678
7355 y 7356 sistema de transporte putativo proteína permeasa
CR103679
7357 y 7358 L-Serina amoniaco liasa (sdaA) [4.3.1.17]
ORF03680
7359 y 7360 endorribonucleasa L-PSP, putativa
ORF03681
7361 y 7362 formato acetiltransferasa (pflB) [2.3.1.54]
ORF03682
7363 y 7364 acetato quinasa (ackA) [2.7.2.1]
ORF03683
7365 y 7366 transportador de treonina de serina
ORF03684
7367 y 7368 Treonina deshidratasa catabólica (Treonina deaminasa) (tdcB) [4.3.1.19]
ORF03685
7369 y 7370 regulador de la transcripción, familia LysR, putativo [4.2.1.16]
ORF03686
7371 y 7372 Glicerato quinasa 2
ORF03687
7373 y 7374 reductasa 2-hidroxi-3-oxopropionato (1.1.1.60]
CR103688
7375 y 7376 aldolasa 2-dehidro-3-deoxiglucarato (PIPA) [4.1.2.20]
ORF03689
7377 y 7378 MFS transportista, ftalato permeasa familia
ORF03690
7379 y 7380 deshidratasa D-galactarato (GalcD) [4.2.1.42]
ORF03691
7381 y 7382 proteína reguladora DeoR familiar (srl)
ORF03692
7383 y 7384 PUTATIVOS TAGATOSA 6-FOSFATO PROTEINA QUINASA
ORF03693
7385 y 7386 enzima sistema PTS N-acetilgalactosamina-específica componente IIB (EIIB-AGA) [2.7.1.69]
ORF03694
7387 y 7388 N-acetylgalactosameine-componente específico Lic 2
ORF03695
7389 y 7390 sistema PTS, componente IID N-acetilgalactosamina-específica
ORF03696
7391 y 7392 AgaF [2.7.1.69]
ORF03697
7393 y 7394 N-acetilglucosamina-6-fosfato deacetilasa (nagA) [3.5.1.251
ORF03698
7395 y 7396 dominio de proteína isomerasa azúcar AgaS [5.-.-.-]
ORF03699
7397 y 7398 clase II aldolasa, familia bisfosfato tagatosa [4.1.2.-]
ORF03700
7399 y 7400 sistema PTS. N-acetilgalactosamina-IIB componente específico 1 (EIIB-Aga) (Nacetilgalactosaamino-permeasa IIB componente 1) (Fosfotransferasa enzima II, B componente 1) (EIIB-AGA) [2.7.1.69]
ORF03701
7401 y 7402 sistema PTS, N-acetilgalactosamino-específico IIC componente 1 (EIIC-Aga) (Nacetilgalactosaamino-pemieasa IIC componente 1)
ORF03702
7403 y 7404 sistema PTS, N-acetilgalactosaamino específico III) componente (EIID-AGA)
ORF03703
7405 y 7406 glucosamina-6-fosfato isomerasa, putativo [5.3.1.-]
ORF03704
7407 y 7408 proteína hipotética conservada TIGR00096
ORF03705
7409 y 7410 LppC
ORF03708
7411 y 7412 proteína hipotética conservada T1GR00252
CR103707
7413 y 7414 isomerasa fosfoheptosa (gmhA)
ORF03708
7415 y 7416 Putativo familia dominio de unión a fosfolípidos
ORF03709
7417 y 7418 permeasa predicha superfamilia
ORF03710
7419 y 7420 proteína hipotética conservada
ORF03711
7421 y 7422 producto de proteína sin nombre
ORF03712
7423 y 7424 proteasa I
ORF03713
7425 y 7426 ACETILTRANSFERASA [2.3.1.-]
ORF03714
7427 y 7428 endonucleasa predicha
ORFO3715
7429 y 7430 SCP-2 familia de transferencia de esterol familia
ORF03716
7431 y 7432 colagenasa
ORF03717
7433 y 7434 peptidasa, familia U32 de familia [3.4.-.-]
ORF03718
7435 y 7436 oxidorreductasa dependiente de flavina
ORF03719
7437 y 7438 proteína de transporte específica en triptófano
ORF03720
7439 y 7440 Dependiente de ATP ARN helicasa DeaD
ORF03721
7441 y 7442 Lipoproteína nlpl precursor
ORF03722
7443 y 7444 nucleotidiltransferasa poliribonucleótida (CAP87K)
ORF03723
7445 y 7446 proteína de ribosomal S15 (rpsO)
ORF03724
7447 y 7448 ARNt sintetasa pseudouridina B [4.2.1.70]
ORF03725
7449 y 7450 factor de unión al ribosoma-A (rbfA)
ORF03726
7451 y 7452 factor de iniciación de traducción IF-2
ORF03727
7453 y 7454 elongación de transcripción de proteínas nusA (sustancia utilización de proteína N) (factor L) (nusA)
ORF03728
7455 y 7456 YhbC proteína similar
ORF03729
7457 y 7458 sintasa argininosuccinato (ArgG) [6.3.4.5]
ORF03730
7459 y 7460 Membrana externa de proteína precursora yhbX
ORF03731
7461 y 7462 proteína de membrana de proteína-exportación secg
ORF03732
7463 y 7464 mutasa fosfoglucosamina (glmM) [5.4.2.-]
ORF03733
7465 y 7466 dihidropteroato sintasa (foIP) [2.5.1.15]
ORF03734
7467 y 7468 proteína de unión a ATP [3.4.24.-]
ORF03735
7469 y 7470 ARN ribosomal subunidad grande metiltrarisferasa J (rrmJ) [2.1.1.-]
ORF03736
7471 y 7472 proteína hipotética conservada T1GR00253
ORF03737
7473 y 7474 factor de elongación de la transcripción grey (factor de escisión de transcripción greA) (greA)
ORF03738
7475 y 7476 D-alanil-D-alanina carboxipeptidasa-D-alanil-D-alanina endopeptidasa (dacB) [3.4.16.4]
ORF03739
7477 y 7478 obg proteína (Obg)
ORF03740
7479 y 7480 Obg proteína (F390)
ORF03741
7481 y 7482 proteína RhaT
ORF03742
7483 y 7484 proteína RhaT
ORF03743
7485 y 7486 proteína ribosomal L27 (rpmA)
ORF03744
7487 y 7488 50S ribosomal L21 proteína
ORF03745
7489 y 7490 proteína hipotética conservada
ORF03746
7491 y 7492 proteína RHAT
ORF03747
7493 y 7494 proteína ribosomal 1,27 (RPMA)
ORF03748
7495 y 7496 50S proteína ribosomal L21
ORF03749
7497 y 7498 proteína ribosomal L21 (rplU)
ORF03750
7499 y 7500 proteína hipotética conservada
ORF03751
7501 y 7502 Octaprenil-difosfato sintasa (Octaprenil pirofosfatesintetasa) (sintetasa OPP) [2.5.1.-]
ORF03752
7503 y 7504 proteína estimulación de fermentación de azúcar B (proteína similar a ner)
ORF03753
7505 y 7506 UDP-N-acetilglucosamina-1 carboxiviniltransferasa (murA) [2.5.1.7]
ORF03754
7507 y 7508 proteína similar a BolA
ORF03755
7509 y 7510 proteína hipotética conservada
ORF03756
7511 y 7512 precursor de proteína yrbC (Ttg2D)
ORF03757
7513 y 7514 proteína hipotética conservada
ORF03758
7515 y 7516 VpsC
ORF03759
7517 y 7518 producto de proteína sin nombre; Muy similar a transportador ABC, YrbE proteína permeasa de Escherichia coli
ORF03760
7519 y 7520 transportador ABC, proteína de unión a ALP (atp_bind)
ORF03761
7521 y 7522 proteína relacionada con intercambiador K+ dependiente Na+-Ca+
ORF03762
7523 y 7524 proteína hipotética
ORF03763
7525 y 7526 proteína hipotética conservada
ORF03764
7527 y 7528 isomerasa putativa
ORFO3?65
7529 y 7530 3-desoxi-D-manno-octulosonato 8-fosfato fosfatasa (KDO 8-P fosfatasa) [3.1.3.45]
ORF03766
7531 y 7532 producto de proteína sin nombre; Similar a la proteína precursora YrbK de Eschenchia coli
ORF03767
7533 y 7534 familia de proteínas similares a OstA
ORF03768
7535 y 7536 ABC transportador, componente de unión a ATP
ORF03769
7537 y 7538 ARN polimerasa factor de sigma-54 (rpoN)
ORF03770
7539 y 7540 proteína interfaz subunidad ribosomal (yfiA)
ORF03771
7541 y 7542 proteína reguladora de nitrógeno similar a PTS-IIA PtsN (ptsN)
ORF03772
7543 y 7544 producto de proteína sin nombre; fragmento peptídico ORF193 (AA 1-192) (1524 es 2º base en codón
ORF03773
7545 y 7546 proteína fosfoportador (NPr)
ORF03774
7547 y 7548 proteína hipotética conservada
ORF03775
7549 y 7550 monofuncional transglicositasa peptidoglicano biosíntesis (mtgA) [2.4.2.-]
ORF03776
7551 y 7552 proteína de reacción cruzada Sigma 27A (SCRP-27A)
ORF03777
7553 y 7554 proteína de sensor aeróbica control de respiración arcB [2.7.3.-]
ORF03778
7555 y 7556 proteína radical SAM, familia TIGR01212
ORF03779
7557 y 7559 proteína hipotética
ORF03780
7559 y 7560 glutamato sintasa [gran precursor de la cadena NADPHJ [1.4.1.131
ORF03781
7561 y 7562 glutamato sintasa (NADPH) precursor de pequeña cadena (NADPH) [1.4.1.13]
ORF03782
7563 y 7564 proteína hipotética conservada subfamilia
ORF03783
7565 y 7566 ROK proteína de familia proteína del dominio, putativo
ORF03784
7567 y 7568 N-acetilmanosarnina-6-fosfato 2-epimerasa -N- quinasa acetilmanosamina
ORF03785
7569 y 7570 cis, cis-muconato transporte de proteínas MucK, putativo
ORF03786
7571 y 7572 liasa N-acetilneuraminato (nanA) [4.1.3.3]
ORF03787
7573 y 7574 regulador de transcripción, familia GntR, putativo
ORF03788
7575 y 7576 proteína estricta de inanición B (sspB)
ORF03789
7577 y 7578 proteína estricta de inanición A (Ssp)
ORF03790
7579 y 7580 proteína ribosomal S9 (rpsl)
ORF03791
7581 y 7582 proteína ribosomal L13 (rplM)
ORF03792
7583 y 7584 ATPasa predicha
ORF03793
7585 y 7586 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1043)
ORF03794
7587 y 7588 Proteasa degQ precursor
ORF03795
7589 y 7590 proteasa serina periplásmica DegS (degS) [3.4.21.-]
ORF03796
7591 y 7592 deshidrogenasa malato. NAD-dependiente (MDH) [1.1.1.37]
ORF03797
7593 y 7594 represor de arginina (argR)
ORF03798
7595 y 7596 Proteína de función desconocida (DUF1471) superfamilia
ORF03799
7597 y 7598 producto de proteína sin nombre; Similar a inhibidor ribonucleasa (barstar)
ORF03800
7599 y 7600 proteína de resistencia a los ácidos fusárica de familia de región conservada
ORF03801
7601 y 7602 proteína de resistencia-ácido fusárico
ORFO3802
7603 y 7604 proteína hipotética conservada
ORF03803
7605 y 7606 proteína hipotética conservada
ORF03804
7607 y 7608 regulador transcripcional
ORF03805
7609 y 7610 proteína TldD (CSRA)
ORF03806
7611 y 7612 proteína hipotética conservada T1GR02099
ORF03807
7613 y 7614 grupos de filamentos citoplasmáticos
ORF03808
7615 y 7616 proteína maf (maf)
ORF03809
7617 y 7618 proteína de forma de varilla determinante MreD (mreD)
ORF03810
7619 y 7620 proteína de forma de varilla determinante mreC (mreC)
ORF03811
7621 y 7622 proteína de forma de varilla determinante mreC (mreC)
ORF03812
7623 y 7624 regulador de ftsl
ORF03813
7625 y 7626 proteína de dominio EAL
ORF03814
7627 y 7628 proteína yhdH
ORF03815
7629 y 7630 acetil-CoA carboxilasa, proteína portadora de carboxilo biotina (accB)
ORF038dieciséis
7631 y 7632 acetil-CoA carboxilasa, biotina carboxilasa (accC) [6.4.1.2]
ORF03817
7633 y 7634 proteína hipotética conservada
ORF03818
7635 y 7636 proteína hipotética conservada
ORF03819
7637 y 7638 fructoquinasa (AB010074) [2.7.1.-]
ORF03820
7639 y 7640 ribosa transportador ABC, permeasa de proteínas (permeasa)
ORF03821
7641 y 7642 transporte de proteínas de unión a ATP-ribosa rbsA (aldosa)
ORF03822
7643 y 7644 proteína de unión a la ribosa periplásmica
ORF03823
7645 y 7646 aldolasa de clase II. familia bisfosfato tagatosa [4.1.2.-]
ORF03824
7647 y 7648 proteína hipotética conservada
ORF03825
7649 y 7650 represor transcripcional operón aga (familia DeoR)
ORF03826
7651 y 7652 fructoquinasa (AB010074) [2.7.1.-]
ORF03827
7653 y 7654 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF997)
ORF03828
7655 y 7656 sodio-pantotenato cotransplantador (panF)
ORF03829
7657 y 7658 ribosomai proteína L11 metiltransferasa (prmA) [2.1.1.-]
ORF03830
7659 y 7660 ARNt-sintetasa dihidrouridina B [1.-.-.-]
ORF03831
7661 y 7662 ADN-proteína de unión fis (proteína estimuladora factor para inversión) (proteínas de unión a potenciador de recombinación HIN) (fis)
ORF03832
7663 y 7664 METILTRANSFERASA ADENINA ESPECÍFICA
ORF03833
7665 y 7666 proteína hipotética conservada
ORF03834
7667 y 7668 Potencial acrEF-envCD represor operón (acrEF)
ORF03835
7669 y 7670 resistencia a la proteína E acriflavina precursor
ORF03836
7671 y 7672 resistencia a la proteína C acriflavina
ORF03837
7673 y 7674 lipoproteína, putativo
ORF03838
7675 y 7676 transportador aminoácido ABC, proteína de unión de aminoácido periplásmico
ORF03839
7677 y 7678 proteínas de permeasa L-aminoácido transportador ABC
ORF03840
7679 y 7680 proteínas de permeasa L-aminoácido transportador ABC
ORF03841
7681 y 7682 proteína de unión a ATP L-aminoácido transportador ABC
ORF03842
7683 y 7684 glutamato descarboxilasa [4.1.1.15]
ORF03843
7685 y 7686 glutamato descarboxilasa [4.1.1.15]
ORF03844
7687 y 7688 producto de proteína sin nombre
ORF03845
7689 y 7690 yrdA de proteínas
ORF03846
7691 y 7692 siquimato 5-deshidrogenasa (aroE) [1.1.1.25]
ORF03847
7693 y 7694 yrdC de proteínas
ORF03848
7695 y 7696 smg de proteínas
ORF03849
7697 y 7698 proteína de unión de nucleótidos veces Rossmann implicada en ADN
ORF03850
7699 y 7700 desformilasa péptida (def) [3.5.1.88]
.QRF03851
7701 y 7702 formiltransferasa metionil-ARNt (fmt) [2.1.2.9]
ORF03852
7703 y 7704 proteína de sol (sol) [2.1.1.-]
ORF03853
7705 y 7706 Trk proteína de captación de potasio sistema trkA (K(+)- proteína de captación trkA) (trkA)
ORF03854
7707 y 7108 gran conductancia proteína del canal mecanosensitivo (mscL)
ORF03855
7709 y 7710 proteína no caracterizada conservada en bacterias
ORF03856
7711 y 7712 Zn(II)-regulador transcripcional responsivo (zntR)
ORF03857
7713 y 7714 proteína hipotética conservada
ORF03858
7715 y 7716 proteína ribosomal L17 (rplQ)
ORF03859
7717 y 7718 polimerasa de ARN dirigida por ADN. subunidad alfa (rpoA) [2.7.7.6]
ORF03860
7719 y 7720 proteína ribosomal S4 (rpsD)
ORF03861
7721 y 7722 proteína ribosomal S11 (rpsK)
ORF03862
7723 y 7724 proteína ribosomal S13p-S18e (rpsM)
ORF03863
7725 y 7726 proteína ribosomal L36 (rpmJ)
ORF03864
7727 y 7728 translocasa de preproteína, subunidad SecY
ORF03865
7729 y 7 730 Translocasa de preproteína subunidad secY (secY)
ORF03866
7731 y 7732 proteína de ribosomal L15 (rplO)
ORF03867
7733 y 7734 proteína de ribosomal L30 (rplD)
ORF03868
7735 y 7736 proteína de ribosomal S5 (rpsE)
ORF03869
7737 y 7738 proteína de ribosomal L18 (rplR)
ORF03870
7739 y 7740 50S proteína de subunidad ribosomal L6 (rp1F)
ORF03871
7741 y 7742 proteína hipotética conservada
ORF03872
7743 y 7744 proteína ribosomal S8 (rpsH)
ORF03873
7745 y 7746 proteína ribosomal S14p-S29e (rpsN)
ORF03874
7747 y 7748 SOS proteína ribosomal subunidad L5 (rpl5)
ORF03875
7749 y 7750 ribosomal proteína L24 (rplX)
ORF03876
7751 y 7752 ribosomal proteína L14 (rplN)
ORF03877
7753 y 7 754 ribosomal proteína S17 (rpsQ)
ORF03878
7755 y 7756 ribosomal proteína L29 (rpmC)
ORF03879
7757 y 7758 ribosomal proteína L16 (rplP)
ORF03880
7759 y 7 760 ribosomal proteína S3 (rpsC)
ORF03881
7761 y 7762 ribosomal proteína L22 (rplV)
ORF03882
7763 y 7764 ribosomal proteína S19 (rpsS)
ORF03883
7765 y 7766 ribosomal proteína L2 (rplB)
ORF03884
7767 y 7768 ribosomal proteína L23 (rplW)
ORFO3885
7769 y 7770 ribosomal proteína familia L4-L1 familia (rplD)
ORF03886
7771 y 7772 ribosomal proteína L3 (rplC)
ORF03887
7773 y 7714 ribosomal proteína SLO (rpsJ)
ORF03888
7775 y 7776 PioO proteína (proteína PinO)
ORF03889
7777 y 7778 proteína de ruta probable de secreción general A (GSP)
ORF03890
7779 y 7780 proteína de ruta probable de secreción general C (gspC)
ORF03891
7781 y 7782 secreción de proteína dela ruta general D precursor (Pululanasa envoltura de secreción pulD (GSP)
ORF03892
7783 y 7784 la secreción de proteína de la ruta general E (Tipo II guardia de tráfico MPase) (Cólera secreción de la proteína toxina EPSE) (SGP)
ORF03893
7785 y 7786 proteína de ruta de secreción general F (gspF)
ORF03894
7787 y 7788 proteína de ruta de secreción general G (gspG)
ORF03895
7789 y 7790 proteína de ruta de secreción general H precursor (Pululanasa proteína de secreción pulH) (GSP)
ORF03896
7791 y 7792 exterior secreción de la proteína de membrana V LGSP)
ORF03897
7793 y 7794 proteína de la ruta de secreción en general J (gspJ)
ORF03898
7795 y 7796 proteína de la ruta de secreción en general K (gspK)
ORF03899
7797 y 7798 proteína de la ruta de secreción en general L (gspL)
ORF03900
7799 y 7800 proteína de la ruta de secreción en general putativa M (SGP)
ORF03901
7801 y 7802 enzima tipo 4 de proteínas similar a prepilina de procesamiento de líder péptido (GSP) [3.4.23.43]
ORF03902
7803 y 7804 bacterioferritina (bfr)
ORF03903
7805 y 7806 proteína asociada a bacterioferritina asociada a ferrodixina
ORF03904
7807 y 7808 Quitinasa [3.2.1.14]
ORF03905
7609 y 7810 Factor de elongación de traducción Tu (tuf)
ORF03906
7811 y 7812 Factor de elongación de traducción G (fusA)
ORF03907
7813 y 7814 proteína ribosomal S7 (rpsG)
ORF03908
7815 y 7816 proteína ribosomal S12 (rpsL)
ORF03909
7817 y 7818 proteína DsrH
ORF03910
7819 y 7820 proteína no caracterizada involucrada en la oxidación de
ORF03911
7821 y 7822 proteína no caracterizada involucrada en azufre intracelular
ORF03912
7823 y 7824 proteína hipotética conservada
ORF03913
7825 y 7826 FKBP tipo cis-transisomerasa peptidil-prolil fkpA precursor (EC 5.2. 1.8) (PPlasa) (rotamasa) (rotamasa) [5.2.1.8]
ORF03914
7827 y 7828 SIyX proteína (slyX)
ORF03915
7829 y 7830 Tipo FKBP cis-trans isomerasa peptidil-prolil slyD (PPlasa) (Rotamasa) (proteína rica en histidina) (WHP) (rotamasa) [5.2.1.8]
ORF03916
7831 y 7832 proteína hipotética conservada
ORF03917
7833 y 7834 kefB proteína del sistema de eflujo de potasio-glutatión-regulada (K (+) - H (4-) antiporter) (NEM-activatable K (+) - H (+) detoxificador)
ORF03918
7835 y 7836 sistema de glutatión-regulada de potasio-flujo de salida accesoria proteína kefG [1.6.99.2]
ORF03919
7837 y 7838 proteína transportadora ABC de unión a ATP
ORF03920
7839 y 7840 hidrolasa predicha del pliegue alfa-beta-hidrolasa
ORF03921
7841 y 7842 proteína hipotética relacionada con yheU proteína UPF0270
ORF03922
7843 y 7844 fosforibuloquinasa [2.7.1.19]
ORF03923
7845 y 7846 sin función conocida
ORF03924
7847 y 7848 activador de catabolitos de genes (proteína del receptor de cAMP) (cAMP proteína regulatoria) (crp)
ORF03925
7849 y 7850 proteína integral de membrana, subfamilia de familia YccS-YhfK
ORF03926
7851 y 7852 aminotransferasa acetilomitina (argD) [2.6.1.11]
ORF03927
7853 y 7854 Para-aminobenzoato componente de glutamina sintetasa amidotransferasa II [6.3.5.8]
ORF03928
7855 y 7856 fic, putativo
ORF03929
7857 y 7858 cis-trans peptidil-prolil isomerasa A precursor(PPlasaA) (Rotamasa A) (ciclofilina A) (utu) [5.2.1.8]
ORF03930
7859 y 7860 proteína hipotética
ORF03931
7861 y 7862 proteína TsgA
ORF03932
7863 y 7864 nitrito reductasa [NAD(P)H], subunidad grande (nirB) [1.7.1.4]
ORF03933
7865 y 7866 nitrito reductasa [NAD(P)H], subunidad pequeña (nirD) [1.7.1.4]
ORF03934
7867 y 7868 transportador de nitrito de potencial (formato)
ORF03935
7869 y 7870 sirohemo sintasa
ORF03936
7871 y 7872 lipoproteína, putativo
ORF03937
7873 y 7874 producto de proteína sin nombre
ORF03938
7875 y 7876 proteína de membrana, putativo.
ORF03939
7877 y 7878 proteína hipotética conservada
ORF03940
7879 y 7880 paratión hidrolasa, putativo
ORF03941
7881 y 7882 fosfopentomutasa
ORF03942
7883 y 7884 alanina racemasa, familia dominio N-terminal
ORF03943
7885 y 7886 producto de proteína sin nombre
ORF03944
7887 y 7888 proteína hipotética conservada
ORF03945
7889 y 7890 sintetasa triptofanoil ARNt (trpS) [6.1.1.2]
ORF03946
7891 y 7892 fosfatasa fosfoglicolato, bacteriana (gph) [3.1.3.18]
ORF03947
7893 y 7894 proteína hipotética
ORF03948
7895 y 7896 fosfatasa fosfoglicolato (PGP) [3.1.3.18]
ORFO3949
7897 y 7898 ribulosa-fosfato 3-epimerasa (rpe) [5.1.3. 1]
ORF03950
7899 y 7900 adenina metilasa de ADN (dam) [2.1.1.72]
ORF03951
7901 y 7902 proteína DamX (1989)
ORF03952
7903 y 7904 sintasa 3-dehidroguinato (aroB) [4.2.3.4]
ORF03953
7905 y 7906 siquimato quinasa I
ORF03954
7907 y 7908 proteína de transporte de proteína precursora hofQ (Tfp)
ORF03955
7909 y 7910 proteína hipotética conservada
ORF03956
7911 y 7912 proteína hipotética conservada
ORF03956
7913 y 7914 proteína de ensamblaje fimbrial (PilN) superfamilia
ORF03958
7915 y 7916 proteína hipotética conservada
ORF03959
7917 y 7918 1A-proteína de unión a la penicilina (PBP1a) [2.4.2-]
ORF03960
7919 y 7920 compuestos ADP hidrolasa nudE [3.6.1.-]
ORF03961
7921 y 7922 proteína de crecimiento atenuador intracelular igaA
ORF03962
7923 y 7924 HAD-hidrolasa superfamilia, subfamilia IA, variante 3 proteína familia
ORF03963
7925 y 7926 proteína de choque térmico 15 (HSP15) (HSP15)
ORF03964
7927 y 7928 33 kDa chaperonina (proteína de choque térmico 33) (HSP33) (HSP33)
ORF03965
7929 y 7930 proteína de membrana, putativo
ORF03966
7931 y 7932 fosfoenolpiruvato carboxyquinasa (ATP) (pckA) [4.1.1.49]
ORF03967
7933 y 7934 proteína de sensor osmolaridad envZ [2.7.3.-]
ORF03968
7935 y 7936 regulador de respuesta (sensor, EnvZ) que afecta a la transcripción de ompC y ompF: síntesis de proteínas de membrana externa
ORF03969
7937 y 7938 factor de elongación de transcripción GreB (greB)
ORF03970
7939 y 7940 proteína yhgF
ORF03971
7941 y 7942 hierro ferroso proteína de transporte B
ORF03972
7943 y 7944 hierro ferroso proteína de transporte B (feoB)
ORF03973
7945 y 7946 proteína hipotética conservada
ORF03974
7947 y 7948 transposasa
ORF03975
7949 y 7950 proteína hipotética
ORF03976
7951 y 7952 bioH proteína (bioH)
ORF03977
7953 y 7954 proteína hipotética
ORF03978
7955 y 7956 amidofosforribosiltransferasa predicha
ORF03979
7957 y 7958 yhgl de proteínas
ORF03980
7959 y 7960 -Gluconato de alta afinidad transportador (Gluconato perrnease) (GnT-Sistema-L)
ORF03981
7961 y 7962 4-alfa-glucanotransferasa (malQ) [2.4.1.25]
ORF03982
7963 y 7964 fosforilasa de maltodextrina [2.4.1.25]
ORF03983
7965 y 7966 regulador transcripcional, familia LuxR, putativo
ORF03984
7967 y 7968 ARN 3’-fosfato terminal ciclasa (rtcA) [6.5.1.4]
ORF03985
7969 y 7970 Proteína rtcB
ORF03986
7971 y 7972 represor regulón glicerol-3-fosfato
ORF03987
7973 y 7974 proteína transcripcional regulatoria rtcR
ORF03988
7975 y 7976 proteína de familia romboide, putativo
ORF03989
7977 y 7978 producto de proteína sin nombre; polipéptido glpE (AA 1-131)
ORF03990
7979 y 7980 glicerol-3-fosfato deshidrogenasa aeróbico (aeróbico)
ORF03991
7981 y 7982 proteína hipotética conservada
ORF03992
7983 y 7984 proteína hipotética conservada
ORF03993
7985 y 7986 proteína hipotética conservada
ORF03994
7987 y 7988 proteína de unión a manosa FimH precursor
ORF03995
7989 y 7990 chaperona fimbrial
ORF03996
7991 y 7992 precursor de la subunidad menor fimbrial putativo
ORF03997
7993 y 7994 precursor de la subunidad menor fimbnal putativo
ORF03998
7995 y 7996 F1C ujier fimbrial
ORF03999
7997 y 7998 precursor de proteína chaperona fimC
ORFD4000
7999 y 8000 proteína fimbria polar larga A precursor (pilin)
ORFO4001
8001 y 8002 glucógeno fosforitasa [2.4.1.1]
ORF04002
8003 y 8004 glucógeno sintasa (almidón [glicogen]sintasa bacteriana) [2.4.1.21]
ORF04003
8005 y 8006 glucosa-1-fosfato adeniltransferasa (glgC) [2.7.7.27]
ORF04004
8007 y 8008 enzima glucógeno desramaje GIgX (glgX) [3.2.1.-]
ORF04005
8009 y 8010 enzima de ramificación 1,4-alfa-glucano (GIG B) [2.4.1.18]
ORF04006
8011 y 8012 aspartato semialdehído deshidrogenasa-(asd) [1.2.1.11]
ORF04007
8013 y 8014 proteína de membrana, putativo
ORF04008
8015 y 8016 permeasa de gluconato, putativo
ORF04009
8017 y 8018 gluconoquinasa termoresistente (gluconato de quinasa 2)
ORF04010
8019 y 8020 regulador transciponal de tipo HTH gntR (sistema de utilización de gluconato GNT-l represor transcripcional (gnt)
ORF04011
8021 y 8022 Proteína yhhW
ORF04012
8023 y 8024 oxidorreductasa putativa yhhX [1.-.-.-]
ORFO4013
8025 y 8026 proteína hipotética conservada
ORF04014
8027 y 8028 acetiltransferasa, familia GNAT, putativo [2.3.1.-]
ORF04015
8029 y 8030 producto de proteína sin nombre similar a proteína Hcp
ORFO4016
8031 y 8032 proteína hipotética conservada
ORF04017
8033 y 8034 gammaglutamiltransferasa (ggt) [2.3.2.2]
ORFO4018
8035 y 8036 glicerofosfodiester fosfodieslerasa [3.1.4.46]
ORF04019
8037 y 8038 CG9973-PA
ORF04020
8039 y 8040 SN-glicerol-3-fosfato proteína de transporte de unión a ATP ugpC
ORF04021
8041 y 8042 sistema de transporte de permeasa de proteína fosfato SN-glicerol-3 ugpE (membrana)
ORF04022
8043 y 8044 glicerol-3-fosfato transportador ABC, permeasa de proteínas (membrana)
ORF04023
8045 y 8046 precursor de la proteína periplásrnica glicerol-3-fosfato vinculante
ORF04024
8047 y 8048 dominio de la proteína transportadora ABC
ORF04025
8049 y 8050 De alta afinidad de cadena ramificada ATP de transporte de aminoácidos de unión proteinlivG (LIV-l de proteína G (AJ272047)
ORF04026
8051 y 8052 sistema de transporte de aminoácidos de cadena ramificada de alta afinidad proteína permeasa livM (LIV-l de proteína M)
ORF04027
8053 y 8054 sistema de transporte de aminoácidos de cadena ramificada de alta afinidad proteína permeasa livH
ORF04028
8055 y 8056 precursor de la proteína de unión-leucina específica
ORF04029
8057 y 8058 acetiltransferasa, familia GNAT familia
ORF04030
8059 y 8060 precursor de la proteína Leu-lle-Val-vinculante
ORF04031
8061 y 8062 sistema PTS enzima II AB componente específico de manosa (EIII-MAN) [2.7.1.69]
ORF04032
8063 y 8064 sistema PTS-manosa específica IIAB componentes, putativo [2.7.1.69]
ORF04033
8065 y 8066 sistema PTS componente IIC (PTS)
ORF04034
8067 y 8068 PTS específico de manosa enzima IID
ORF04035
8069 y 8070 D-3-fosfoglicerato deshidrogenasa (serA [1.1.1.95]
ORF04036
8071 y 8072 dihidrodipicolinato sintasa (dapA) [4.2.1.52]
ORF04037
8073 y 8074 factor sigma alternativo RpoH (rpoH)
ORF04038
8075 y 8076 inserción proteína putativa permeasa FtsX (ftsX)
ORF04039
8077 y 8078 proteína de división celular de unión a ATP ftsE
ORFO4O4O
8079 y 8080 proteína de división celular ftsY
ORF04041
8081 y 8082 metiltransferasa, putativo
ORF04042
8083 y 8084 solapa anterior ORF probablemente usa aguas abajo de inicio
ORF04043
8085 y 8086 proteína hipotética conservada
ORF04044
8087 y 8088 proteína de membrana, putativo
ORF04045
8089 y 8090 Plomo-zinc cadmio y mercurio ATPasa transportadora (3.6.3.3]
ORF04046
8091 y 8092 proteína SirA
ORF04047
8093 y 8094 proteína de membrana (o221)
ORF04048
8095 y 8096 precursor de la proteína DcrB
ORF04049
8097 y 8098 yhhS proteína hipotética UPF0226
ORF04050
8099 y 8100 Dominio de función desconocida, putativo
ORF04051
8101 y 8102 4’-fosfopanteteinil transferasa acpT [2.7.8.-]
ORF04052
8103 y 8104 níquel transportador ABC periplásmica de proteínas de unión a níquel (NikA)
ORF04053
8105 y 8106 sistema trasporte níquel permeasa nikB proteína (permeasa)
ORF04054
8107 y 8108 dipéptido transportador ABC, proteína putativa perrneasa
ORF04055
8109 y 8110 proteína de transporte de níquel de unión a ATP nikD
ORF04056
8111 y 8112 transporte niquel proteína de unión a ATP nikE
ORF04057
8113 y 8114 Níquel regulador sensible
ORF04058
8115 y 8116 regulador de transcripción, familia GnLR, putativo
ORF04059
8117 y 8118 sistema PTS componente IIA, probable putativo
ORF04060
8119 y 8120 sistema PTS, enzima-galactitol II específico, componente B [2.7.1.69]
ORF04061
8121 y 8122 sistema PTS, componente IIC-sorbitol específico
ORF04062
8123 y 8124 probable xilulosa quinasa Z4878 [2.7.1.30]
ORF04063
8125 y 8126 pphotransferase sistema enzimático HPr (PTS)
ORF04064
8127 y 8128 Tagatosa-bisfosfato aldolasa GatY [4.1.2.-]
ORF04065
8129 y 8130 familia de transportadores ABC-2 Tipo
ORF04066
8131 y 8132 AlPasa ribosoma-asociado. dominio de unión a ATP (N- terminal)
ORF04067
8133 y 8134 El tipo I proteína anticongelante: secreción de proteína de familia HIyD
ORF04068
8135 y 8136 proteína de membrana, putativo
ORF04069
8137 y 8138 proteína hipotética conservada T1GR00275
ORF04070
8139 y 8140 Baja afinidad transportador de fosfato inorgánico 1
ORF04071
8141 y 8142 estrés universal proteína B
ORF04072
8143 y 8144 proteína de estrés universal (UspA)
ORF04073
8145 y 8146 proteína hipotética
ORF04074
8147 y 8148 yhiP transportador hipotética
ORF04075
8149 y 8150 inicio gtg, inicios alternativos posibles
ORF04076
8151 y 8152 Oligopeptidasa A
ORF04077
8153 y 8154 Proteína de función desconocida (DUF519) superfamilia
ORF04078
8155 y 8156 glutatión-disulfuro reductasa (gor) [1.8.1.7]
ORF04079
8157 y 8158 proteína hipotética conservada
ORF04080
8159 y 8160 reductasa arsenato [1.20.4.1]
ORFO4OB1
8161 y 8162 proteína de membrana externa inducida después de la privación de carbono
ORF04082
81638 8164 regulador transcripcional hipotética yhiF
ORF04083
8165 y 8166 proteína de transporte de hemina hmuS
ORF04084
8167 y 8168 receptor de membrana externa hemina ChuA
ORFO4OB5
8169 y 8170 proteína hipotética conservada
ORF04086
8171 88172 proteína de unión putativa periplásmica
ORF04087
8173 y 8 174 HugW
ORF04088
8175 y 8176 HuvX proteína (fragmento)
ORF04089
8177 y 8178 proteína hipotética conservada
ORF04090
8179 y 8180 proteína de hemina transportador ABC perrneasa
ORF04091
8181 y 8182 proteína del sistema de transporte hemina de unión a ATP
ORF04092
8183 y 8184 transporte de cationes ATPasa yqgG
ORF04093
8185 y 8186 proteína precursora hdeB
ORF04094
8187 y 8188 Protein HdeA precursor, putativo
ORF04095
81898 8190 proteína HdeD
ORF04096
8191 y 8192 proteína hipotética conservada
ORF04097
8193 y 8194 SdeX bomba de salida a múltiples fármacos
ORFp4O98
8195 y 8196 familia, bomba de eflujo multifármaco de acridina
ORF04099
8197 y 8198 tipo HTH regulador transcripcional appY (polipéptido M5)
ORFO4100
8199 y 8200 regulador transcripcional gadX
ORFO4101
8201 y 8202 glutamato decarboxitasa [4.1.1.15]
ORF04102
8203 y 8204 citocromo c551 peroxidasa
ORF04103
8205 y 8206 Trehalasa [3.2.1.281
ORFO4104
8207 y 8208 regulador de virulencia
ORF04105
8209 y 8210 regulador transcripcional
ORF04106
8211 y 8212 ribonucleasa, putativo
ORF04107
6213 y 8214 simportador metabolito-protón
ORF04108
8215 y 8216 proteína implicada en biogénesis de membrana externa
ORF04109
8217 y 8218 dominio EAL, putativo
ORFO411O
8219 y 8220 2-deshidro-3-deoxigluconoquinasa
ORFO4I11
8221 y 8222 Proteína yhjJ precursor [3.499.-]
ORFO4112
8223 y 8224 proteína de transporte aeróbico C4-dicarboxilato
ORF04113
8225 y 8226 yhjk de proteínas
ORFO4114
8227 y 8228 proteína de celulosa sintasa operón C
ORFO4115
8229 y 8230 precursor de endoglucanasa
ORFO4116
8231 y 8232 unión precursor de la proteína cíclica di-GMP
ORFO4I17
82338 8234 celulosa sintasa subunidad catalítica [UDP-formando)
ORF04118
8235882 36 familia de proteínas YhjQ
ORFO4I19
8237 y 8238 proteína hipotética conservada
ORF04120
8239 y 8240 proteína hipotética conservada
ORF04121
8241 y 8242 proteína hipotética conservada
ORFO4122
8243 y 8244 proteína hipotética conservada
ORFO4123
8245 y 8246 proteína hipotética conservada
ORF04124
8247 y 8248 proteína hipotética de transporte yhjV
ORF04125
8249 y 8250 péptido transportador ABC, ATP-proteína de unión (atp_bind)
ORF04126
8251 y 8252 transporte dipéptido proteína de unión al ATP dppD (atp_bind)
ORF04127
8253 y 8254 sistema de transporte de dipéptidos permeasa proteína dppC (membrana)
ORFO4I28
8255 y 8256 dipéptido de transporte de proteínas pemiease sistema dppb (permeasa)
ORFO4129
8257 y 8258 dipéptido periplásmico precursor de la proteína de transporte (DBP)
ORF04130
8259 y 8260 proteína hipotética conservada
ORF04131
8261 y 8262 Membrana-proteína yhjW
ORF04132
8263 y 8264 proteína de resistencia putativo
ORF04133
8265 y 8266 proteína hipotética conservada
ORF04134
8267 y 8268 ADN-3-metiladenina glicosilasa I [3.2.2.20]
ORF04135
8269 y 8270 reductasa sulfóxida de biotina
ORF04136
8271 y 8272 acetiltransferasa hipotética yiaC, (GNAT) [2.3.1.]
ORF04137
8273 y 8274 Proteína probable de membrana externa yiaD
ORF04138
8275 y 8276 reductasa 2-quetogluconato [1.1.1.215]
ORF04139
8277 y 8278 lipoproteína, putativo
ORF04140
8279 y 8280 HTH putativo de tipo yiaG regulador transcripcional
ORF04141
8281 y 8282 similar al choque en frío de proteínas
ORF04142
8283 y 8284 membrana probable proteína que altera la permeabilidad Z4982 - proteína relacionada
ORF04143
8285 y 8286 glicil sintetasa-ARNt, subunidad beta (glyS) [6.1.1.14]
ORF04144
8287 y 8288 sintetasa glicil-ARNt, subunidad alfa (glyQ) [6.1.1.14]
ORFO4145
8289 y 8290 proteína hipotética conservada
ORFO4I46
8291 y 8292 familia aciltransferasa, putativo
ORF04147
8293 y 8294 yiaA-B dominio de familia de dos hélices
ORF04148
82958 8296 yiaA-B dominio de familia de dos hélices
ORF04149
8297 y 8298 xiploquinasa (xylB) [2.7.1.17]
ORFO4150
8299 y 8300 xilosa isomerasa (xylA) [5.3.1.5]
ORFO41S1
8301 y 8302 D-xilosa transportador ABC, unión peripsmic D-xilosa proteína
ORF04152
8303 y 8304 proteínas de azúcar transportador ABC, de unión a ATP (xylG)
ORFO4153
8305 y 8306 azúcar transportador ABC, permeasa de proteínas
ORFO4154
8307 y 8308 proteína reguladora del operón de xilosa (xylR)
ORF04155
8309 y 8310 proteínas BAX
ORF04156
8311 y 8312 precursor de alfa-amilasa [3.2.1.1]
ORF04157
8313 y 8314 aminotransferasa valina-piruvato
ORF04158
8315 y 8316 Proteína de transporte de electrones hydN
ORF04159
8317 y 8318 IclR familia represor transcripcional
ORF04160
8319 y 8320 recluctasa 2-queto [1.1.1.-]
ORF04161
8321 y 8322 YiaL
ORF04162
8323 y 8324 YiaX1
ORF04153
8325 y 8326 transportador de TRAP, superfamilia de proteínas de membrana similar a DclQ
ORFO4164
8327 y 8328 sistema de transporte C4-dicarboxilato permeasa proteína grande (DctM)
ORF04165
8329 y 8330 proteína DctP (AP001509)
ORF04166
8331 y 8332 azúcar quinasa, familia FGGY, putativo [2.7.1.53]
ORF04167
8333 y 8334 sintasa hexulosa-6-fosfato (jorobas) [4.1.2.-]
ORF04168
8335 y 8336 hexulosa-6.phosphate isomerasa, putativo
ORF04169
8337 y 8338 4 epimerasa L-ribulosa-5-fosfato (araD) [5.1.3.4]
ORF04170
8339 y 8340 proteína aldehído familia deshidrogenasa (AF029733)
ORF04171
8341 y 8342 familia familia de proteínas Fic
ORF04172
8343 y 8344 alcohol deshidrogenasa, clase IV [1.1.1.1]
ORF04173
8345 y 8346 factor de elongación de la traducción-seleniocisteína específica (selB)
ORF04174
8347 y 8348 L-seril-tRNA transferasa selenio (selA) [2.9.1.1]
ORF04175
8349 y 8350 proteína hipotética similar a GST yibF
ORF04176
8351 y 8352 bomba de la resistencia a múltiples fármacos flujo de salida
ORF04177
8353 y 8354 GTPasa
ORF04178
8355 y 8356 sistema PTS, componentes IIABC enzima-manitol específico [2.7.1.69]
ORF04179
8357 y 8358 Manitol-1-fosfato 5-deshidrogenasa [1.1.1.17]
ORF04180
8359 y 8360 Manitol represor del operón (proteína represora manitol)
ORF04181
8361 y 8362 proteína hipotética conservada
ORF04182
8363 y 8364 proteína hipotética conservada
ORFO4183
8365 y 8366 proteína hipotética conservada
ORFO4184
8367 y 8368 proteína de superficie (parcial)
ORF04185
8369 y 8370 permeasa 1-lactato
ORF04186
8371 y 8372 regulador transcripcional
ORFO4187
8373 y 8374 L-lactato deshidrogenasa (IctD) [1.1.2.3]
ORF04188
8375 y 8376 ARN metiltransferasa, familia TrmH, grupo 2
ORF04189
8377 y 8378 Serina acetiltransferasa (SAT) (SAT) [2.3.1.30]
ORF04190
8379 y 8380 glicerol-3-fosfato deshidrogenasa [NAD(P)+] (NAD(P)H-glicerol dependiente-3-deshidrogenasa fosfato) (gpsA) [1.1.1.94]
ORF04191
8381 y 8382 proteína de proteína-exportación SecB (secB)
ORF04192
8383 y 8384 glutaredoxina 3 (grxC)
ORF04193
8385 y 8386 dominio de proteína similar a rodanesa
ORF04194
8387 y 8388 fosfoglicerato mutasa 2,3-difosfoglicerato-independiente (gpml) [5.4.2.1]
ORF04195
8389 y 8390 metalopeptidasa unida a membrana
ORF04196
8391 y 8392 glicosiltransferasa, proteína de familia grupo 2, putativo [2.-.-.-]
ORF04197
8393 y 8394 producto del gen yibQ
ORF04198
8395 y 8396 L-treonina-3 dehidrogenasa (tdh) [1.1.1.103]
ORF04199
8397 y 8398 2-amino-3-cetobutirato coenzima A ligasa (kbl) [2.3.1.29]
ORF04200
8399 y 8400 ADP-L-glicero-D-manno-heptosa-6-epimerasa (rfaD) [5.1.3.20]
ORF04201
8401 y 8402 lipopolisacarido heptosiltransterasa II (rfaF)
ORF04202
8403 y 8404 heptosiltransferasa tipopolisacarido I (RfaC) [2.-.-.-]
ORF04203
8405 y 8406 Lípido A-núcleo, ligasa polímero de superficie
ORF04204
8407 y 8408 beta-1,3-glucosiltransferasa [2.4.1.166]
ORF04205
8409 y 8410 UDP-gatactosa: (galactosil) LPS alfa-1,2-gatactosiltransferasa (glucosil) [2.4.1.58]
ORF04206
8411 y 8412 heptosyl-JI-quinasa
ORF04207
8413 y 8414 UDP-galactosa: (glucosil) [2.4.1.581
ORF04208
8415 y 8416 UDP-glucosa: (glucosil) [2.4.1.44]
ORF04209
8417 y 8418 núcleo lipopolisacarido biosíntesis de proteínas rfaP
ORF04210
8419 y 8420 UDP-glucosa (heptosil) [2.4.1.-]
ORF04211
8421 y 8422 lipopolisacárido heptosiltransterasa Ill, putativo
ORF04212
8423 y 8424 transferasa 3-desoxi-D-mano-octulosoónico-ácido (KDOtransferasa) (KDO) [2.-.-.-]
ORF04213
8425 y 8426 adeniltransferasa panteteına-fosfato (coaD) [2.7.7.3]
ORF04214
8427 y 8428 glicosilasa formamidopirimidina-ADN (mutM) [3.2.2.23]
ORF04215
8429 y 8430 la proteína ribosomal L33 (rpmG)
ORF04216
8431 y 8432 RpmB proteína (rpL28)
ORF04217
8433 y 8434 proteína de reparación del ADN
ORF04218
8435 y 8436 fosfopantotenoilcisteina decarboxitasa- fosfopantotenato - cisteína ligasa (COABC) [4.1.1.36 6.3.2.5]
ORF04219
8437 y 8438 nucleotidohidrolasa deoxiuridina 5'-trifosfato (dut) [3.6.1.23]
ORF04220
8439 y 8440 proteína Ttk
ORF04221
8441 y 8442 orotato fosforribosiltransferasa (pyrE) [2.4.2.10]
ORF04222
84438 8444 PH ribonucleasa (rph) [2.7.7.56]
ORF04223
8445 y 8446 proteína hipotética conservada TlGR00255
ORF04224
8447 y 8448 proteína hipotética
ORF04225
8449 y 8450 proteína-ADN daño inducible D
ORF04226
8451 y 8452 proteína de membrana predicha
ORF04227
8453 y 8454 Hipotética de ADN proteína similar a ligasa yicF
ORF04228
8455 y 8456 proteína hipotética conservada
ORF04229
8457 y 8458 quinasa de guanilato
ORF04230
8459 y 8460 ADN polimerasa en cadena omega dirigida por ADN (RNAP omegasubunidad) (cadena omega Transcriptasa) (ARN polimerasa subunidad omega) (rpoZ) [2.7.7.6]
ORF04231
8461 y 8462 Guanosina-35-bis (difosfato) 3-pirofosfohidrolasa (ppGpp)
ORF04232
8463 y 8464 ARNt (guanosina-2'-O-)-metiltransferasa (Gm18) [2.1.1.34]
ORF04233
8465 y 8466 ATP-dependiente de ADN helicasa RecG (recG) [3.6.1.-]
ORF04234
8467 y 8468 simportador de sodio-glutamato (gltS)
ORF04235
8469 y 8470 xantina-uracilo permeasa proteína de familia
ORF04236
8471 y 8472 posible proteína exportada
ORF04237
8473 y 8474 Proteína no conocida función (DUF1498) superfamilia
ORF04238
8475 y 8476 regulador posible de transcripciones similar a NAGC
ORF04239
8477 y 8478 aldolasa de bisfosfato de fructosa, familia clase II [4.1.2.13]
ORF04240
8479 y 8480 aldolasa de bisfosfato de fructosa, familia clase II [4.1.2.-]
ORF04241
8481 y 8482 sistema PTS, componente IIbc (PTS) [2.7.1.69]
ORF04242
8483 y 8484 sistema PTS, similar a fructosa 2 componente IIB 1
ORF04243
8485 y 8486 sistema PTS, componente Ella (PTS) [2.7.1.69]
ORF04244
8487 y 8488 antiterminador transcripción BglG proteína de familia,, putativo
ORF04245
8489 y 8490 f772 [3.2.1.20]
ORF04246
8491 y 8492 similar a proteína portadora melibiosa
ORF04247
84938 8494 RhuM (parcial)
ORF04248
8495 y 8496 proteína de membrana
ORF04249
8497 y 8498 Lipoproteína-28 precursor (hlpA)
ORF04250
8499 y 8500 proteína hipotética conservada
ORF04251
8501 y 8502 proteína de transporte putativa
ORF04252
8503 y 8504 Proteína de función desconocida (DUF1198) superfamilia
ORF04253
8505 y 8506 xantina-uracilo permeasa subfamilia de proteínas de familia
ORF04254
8507 y 8508 adenina deaminasa (ade) [3.5.4.2]
ORF04255
85098 8510 proteína transportadora de fosfato de hexosa
ORF04256
8511 y 8512 uhpC proteína reguladora
ORF04257
8513 y 8514 uhpB proteína de sensor
LORF04258
8515 y 8516 proteína hipotética
ORF04259
8517 y 8518 regulador de respuesta, activador positivo de transcripción uhpT
ORF04260
8519 y 8520 sintasa acetolactato, subunidad pequeña, putativo [2.2.1.6]
ORF04261
8521 y 8522 sintasa acetolactato, subunidad grande, tipo biosintético (ilvB) [2.2.1.6]
ORF04262
8523 y 8524 proteína de resistencia de fármacos múltiples D
ORF04263
8525 y 8526 f165 [1.-.-.-]
ORF04264
8527 y 8528 proteína hipotética conservada
ORF04265
8529 y 8530 proteína de membrana predicha
ORF04266
8531 y 8532 sulfatasa probable yidJ [3.1.6.-]
ORF04267
8533 y 8534 Putativa sulfatasa yidJ [3.1.6.-]
ORF04268
8535 y 8536 Na+-mio-inositol cotransportador
ORF04269
8537 y 8538 msm operón proteína reguladora, putativo
ORF04270
8539 y 8540 proteína de absorción de potasio TrkA, putativo
ORF04271
8541 8 8542 proteína de choque térmico
ORF04272
85438 8544 proteína de choque térmico
ORF04273
8545 y 8546 proteína hipotética
ORF04274
8547 y 8548 proteína 0135
ORF04275
8549 y 8550 f416
ORF04276
8551 y 8552 MFS transportista, ftalato perrneasa familia
ORF04277
8553 y 8554 proteína hipotética conservada
ORF04278
8555 y 8556 familia de enzima racemasa lactonizante-muconato mandelato proteína (parcial) [4.2.1.6]
ORF04279
8557 y 8558 4-hidroxi-2-oxoglutarato aldolasa-2-deshidro-3- deoxifosfogluconato [4.1.2.21]
ORF0428D
8559 y 8560 2-deshidro-3-quinasa deoxigalactonato [2.7.1.58]
ORF04281
8561 y 8562 represor transcripcional para la utilización galactonato (GntR familia) (AF096293)
ORFD4282
8563 y 8564 replicasa probable Z5187
ORF04283
8565 y 8566 proteína de familia Cof
ORF04284
8567 y 8568 proteína bacteriana de función desconocida (DUF937) familia
ORF04285
8569 y 8570 ADN girasa, B subunidad (gyrB) [5.99.1.3]
ORF04286
8571 y 8572 replicación y reparación del ADN proteína recF [similitud]
ORF04287
8573 y 8574 ADN polimerasa III, subunidad beta (adnN) [2.7.7.7]
ORF04288
8575 y 8576 cromosómica proteína iniciadora de la replicación AdnA (adnA)
ORF04289
8577 y 8578 proteína ribosomal L34 (rpmH)
ORF04290
8579 y 8580 ribonucleasa componente de proteína P (mpA) [3.1.26.5]
ORF04291
8581 y 8582 proteína hipotética conservada TIGR00278
ORF04292
8583 y 8584 oxaA proteína de membrana interna (IMP)
ORF04293
8585 y 8586 modificación ARNt GTPasa TrmE (trmE)
ORF04294
8587 y 8588 triptofanasa (TNasa) [4.1.99.1]
ORF04295
8589 y 8590 baja afinidad permeasa triptófano
ORF04296
8591 y 8592 similar a translocasa de resistencia a fármacos
ORF04297
8593 y 8594 regulador de transcripción, familia LysR
ORF04298
8595 y 8596 proteína hipotética
ORF04299
8597 y 8598 o252
ORF04300
8599 y 8600 YieF (putativo)
ORF04301
8601 y 8602 f445
ORF04302
8603 y 8604 hidrolasa similar a dehalogenasa haloácido, putativo
ORF04303
8605 y 8606 proteína hipotética conservada
ORF04304
8607 y 8608 -Pynmidine específica nucleósido hydmlase [3.5.99.6]
ORF04305
8609 y 8610 Putativo familia esterasa, putativo
ORF04306
8611 y 8612 xilanasa putativa
ORF04307
8613 y 8614 f538
ORF04308
8615 y 8616 6-fosfo-beta-glucosidasa bgIB [3.2.1.861
ORF04309
8617 y 8618 sistema PTS, componente IIABC beta-glucósido-específico
ORF04310
8619 y 8620 beta-glucósido críptico del bgl operón antiterminador
ORF04311
8621 y 8622 sistema de transporte de fosfato proteína reguladora PhoU (phoU)
ORF04312
8623 y 8624 transportador ABC de fosfato de proteínas de unión a ATP (pstB) [3.6.3.27]
ORF04313
8625 y 8626 transportador ABC de fosfato, perrneasa PstA proteína (pstA)
ORF04314
8627 y 8628 fosfato de transportadores ABC, permeasa PstC de proteínas (PstC)
ORF04315
8629 y 8630 fosfato de transportadores ABC, proteína de unión a fosfato (PstS)
ORF043dieciséis
8631 y 8632 glucosamina_fructosa-6-fosfato aminotrasferasa, isomerización (glmS) [2.6.1.16]
ORF04317
8633 y 8634 UDP-N-acetilglucosamina pirofosfarilasa (flmU) [2.7.7.23]
ORF04318
8635 y 8636 ATP sintasa F1, subunidad epsilon (atpC) [3.6.3.14]
ORF04319
8637 y 8638 ATP sintasa F1, subunidad beta (atpD) [3.6.3.14]
ORF04320
8639 y 8640 ATP sintasa F1, subunidad gamma (atpG) [3.6.3.14]
ORF04321
8641 y 8642 ATP sintasa F1, subunidad alfa (atpA) [3.6.3.14]
ORF04322
8643 y 8644 ATP sintasa F1, subunidad delta (atpH) [3.6.3.14]
ORF04323
8645 y 8646 ATP sintasa F0, subunidad B (atpF) [3.6.3.14]
ORF04324
8647 y 8648 proteína hipotética conservada
ORF04325
8649 y 8650 ATP sintasa F0, C subunidad [3.6.3.14]
ORF04326
8651 y 8652 ATP sintasa F0, A subunidad (atpB) [3.6.3.14]
ORF04327
8653 y 8654 ATP sintasa F0, Me subunidad (atpl) [3.6.3.14]
ORF04328
8655 y 8656 metiltransferasa GidB (gidB) [2.1.-.-]
ORF04329
8657 y 8658 proteína de división A inhibida por glucosa A (gidA)
ORF04330
8659 y 8660 Proteína Mioc (Mioc)
ORF04331
8661 y 8662 regulador transcripcional, familia AsnC (asnC)
ORF04332
8663 y 8664 ligasa aspartato-amoniaco (asnA) [6.3.1.1]
ORF04333
8665 y 8665 proteína hipotética conservada
ORF04334
8667 y 8668 producto de proteína sin nombre
ORFO435
6669 y 8670 proteína de absorción de potasio (kup)
ORF04336
8671 y 8672 proteína de alta afinidad de transporte ribosa rbsD
ORF04337
8673 y 8674 ribosa transportadora ABC, ATP-proteína de unión (atp_bind)
ORF04338
8675 y 8676 ribosa transportadora ABC, permeasa de proteína (rbsC)
ORF04339
8677 y 8678 ribosa transportador ABC, periplásmico D-ribosa vinculante proteína
ORF04340
8679 y 8680 nboquinasa (rbsK) [2.7.1.15]
ORF04341
8681 y 8682 resistencia transportadora de drogas, familia EmrB-QacA
ORF04342
8683 y 8684 regulador para rbs operón
ORF04343
8685 y 8686 proteína ProP
ORF04344
8687 y 8688 producto del gen yieP (AF096293)
ORF04345
8689 y 8690 proteína hipotética
ORF04346
8691 y 8692 regulador de transcripción
ORF04347
8693 y 8694 0137 (YIFE)
ORF04348
8695 y 8696 proteína relacionada quelatasa-Mg
ORF04349
8697 y 8698 proteína hipotética
ORF04350
8699 y 8700 acetotactato sintasa, subunidad grande, tipo biosintético (ilvB) [2.2.1.6]
ORF04351
8701 y 8702 acetolactato sintasa II pequeñas cadenas (ALS-11) [4.1.3.18]
ORF04352
8703 y 8704 cadena ramificada aminotransferasa de aminoácidos (ilvE)[2.6.1.42]
ORF04353
8705 y 8706 dihidroxi-ácido deshidratasa (ilvD) [4.2.9.1]
ORF04354
8707. y 8708 treonina amoniaco-liasa, biosintético (ilvA) [4.3.1.19]
ORF04355
8709 y 8710 regulador transcripcional, LysR familia, putativo
ORF04356
8711 y 8712 ácido reductoisomerasa-quetol (ILVC) [1.1.1.86]
ORF04357
8713 y 8714 isomerasa peptidilprolil (SPP39159) [5.2.1.8]
ORF04358
8715 y 8716 ATP dependiente helicasa ADN Rep (rep) [3.6.1.-]
ORF04359
8717 y 8718 Guanosina-5’-trifosfato, 3’-difosfato pirofosfatasa [3.6.1.40]
ORF04360
8719 y 8720 rhlB proteína (RHLB) [3.6.1.-]
ORF04361
8721 y 8722 tioredoxina 1
ORF04362
8723 y 8724 factor de terminación transcripción Rho (rho)
ORF04363
8725 y 8726 proteína hipotética conservada
ORF04364
8727 y 8728 undecaprenil-fosfato alfa-N-acetilglucosaminil 1-fosfatetransferasa (wecA) [2.7.8.-]
ORF04365
8729 y 8730 Lipopolisacárido biosíntesis de proteínas wzzE
ORF04366
8731 y 8732 UDP-N-acetilglucosamina 2-epimerasa [5.1.3.14]
ORF04367
8733 y 8734 UDP-N-acetil-D-manosamina deshidrogenasa (ECA) [1.1.1.-]
ORF04368
8735 y 8736 dTDP-glucosa 4.6-deshidratasa (rfbB) [4.2.1.46]
ORF04369
8737 y 8738 Glucosa-1-fosfato timidililtransferasa (rfbA) [2.7.7.24]
ORF04370
8739 y 8740 TDP-D-fucosamina acetiltransferasa (rfbA) [2.7.7.24]
ORF04371
8741 y 8742 Lipopolisacárido biosíntesis proteína rffA (WECE) [4.2.1.-]
ORF04372
8743 y 8744 proteína WzxE (WZXE)
ORF04373
8745 y 8746 TDP-Fuc4NAc: lípido II Fuc4Nac transferasa (wecF) [2.4.1.-]
ORF04374
8747 y 8748 ECA proteína de biosíntesis WzyE (wzyE)
ORF04375
8749 y 8750 posiblemente rffM (ECA) [2.4.1.-]
ORF04376
8751 y 8752 proteína hipotética
ORF04377
8753 y 8754 similar a varias proteínas de transporte de aminoácidos (o461)
ORF04378
8755 y 8756 tirosina recombinasa XerC (xerC)
ORF04379
8757 y 8758 o238 (YIGB)
ORF04380
8759 y 8760 tirosina recombinasa XerC (XerC)
ORF04381
8761 y 8762 o238 (YIGB)
ORF04382
8763 y 8764 regulador de arilsulfatasa
ORF04383
8765 y 8766 Arilsulfatasa [3.1.6.1]
ORF04384
8767 y 8768 proteína hemY (hemY)
ORF04385
8769 y 8770 uroporfirinogen Ill metilasa (HEMX) [2.1.1.107]
ORF04386
8771 y 8772 uroporfirinogen-III sintasa (HemD) [4.2.1.75]
ORF04387
8773 y 8774 porfobilinógeno desaminasa (hemC) [2.5.1.61]
ORF04388
8775 y 8776 adenilato ciclasa, clase I (cyaA) [4.6.1.1]
ORF04389
8777 y 8778 CyaY proteína (CYAY)
ORF04390
8779 y 8780 posible proteína exportada
ORF04391
8781 y 8782 lipoproteína, putativo
ORFD4392
8783 y 8784 lipoproteína hipotético yifL proteína relacionada precursor
ORF04393
8785 y 8786 diaminopimelato epimerasa (dapF) [5.1.1.7]
ORF04394
8787 y 8788 Proteína de función desconocida, DUF4B4 superfamilia
ORF04395
8789 y 8790 tirosina recombinasa XerC (XerC)
ORF04396
8791 y 8792 o238 (YIGB)
ORF04397
8793 y 8794 ADN helicasa II (uvrD) [3.6.1.-]
ORF04398
8795 y 8796 proteína de superfamilia de función desconocida
ORF04399
8797 y 8798 proteína YIGB
ORF04400
8799 y 8800 proteína hipotética
ORF04401
8801 y 8802 magnesio y transporte de cobalto proteína CorA (corA)
ORF04402
8803 y 8804 Enterobactenal proteína de membrana putativa (DUF943) superfamilia
ORF04403
8805 y 8806 proteína hipotética conservada
ORF04404
8807 y 8808 proteína hipotética
ORF04405
8809 y 8810 rarD proteína (rarD)
ORF04406
8811 y 8812 f161 (YIGI)
ORF04407
8813 y 8814 proteína de familia A1 fosfolipasa, interrupción [3.1.1.32]
ORF04408
8815 y 8816 ATP-dependiente de ADN helicasa RecQ (recQ) [3.6.1.-]
ORF04409
8817 y 8818 proteína de eflujo treonina
ORF04410
8819 y 8820 transportador, familia LysE
ORFO44tt
8821 y 8822 Lisofosfolipasa 12 (lecitinasa B) (PLDB) [3.1.1.5]
ORF04412
8823 y 8824 proteína Cof
ORF04413
8825 y 8826 tipo HTH regulador transcripcional RMet (METR)
ORF04414
8827 y 8828 proteína de membrana hipotética yigM
ORF04415
8829 y 8830 5 metiItetrahidropteroiItriglutamato-homocisteina S-metiltransferasa (metE) [2.1.1.14]
ORF04416
8831 y 8832 proteína hipotética conservada
ORF04417
8833 y 8834 proteína hipotética conservada
ORF04418
8835 y 8836 6-fosfo3-hexuloisomerasa (PHI)
ORF04419
8837 y 8838 sistema PTS, componente IIBC específico de glucosa (ptsG) [2.7.1.69]
ORF04420
8839 y 8840 transcetolasa (tkt) [2.2.1.1]
ORF04421
8841 y 8842 regulador de transcripción, proteínas de dominio de familia rpiR
ORF04422
8843 y 8844 regulador de la transcripción, familia LysR
ORF04423
8845 y 8846 citosina transportadora, putativo
ORF04424
8847 y 8848 proteína de la familia anildasa, putativo
ORF04425
8849 y 8850 Carbamato quinasa de proteínas yahl [2.7.2.2]
ORF04426
8851 y 8852 YahG proteína similar a YIbE
ORF04427
8853 y 8854 YahF proteína similar a FdrA
ORF04428
8855 y 8856 proteína hipotética conservada
ORF04429
8857 y 8858 proteína de familia isocorismatasa
ORF04430
8859 y 8860 proteína hipotética
ORF04431
8861 y 8862 carboximetilenobutenolidasa putativa
ORF04432
8863 y 8864 proteína hipotética conservada
ORF04433
8865 y 8866 fosforilasa ondina (udp) [2.4.2.3]
ORF04434
8867 y 8868 tricarboxilato proteína de transporte TctA, putativa
ORF04435
8869 y 8870 proteína hipotética conservada
ORF04436
8871 y 8872 gen captación de Bordetella (bug) superfamilia producto
ORF04437
8873 y 8874 4-hidroxi-2-oxoglutarato aldolasa-2-deshidro-3- deoxifosfogluconato
ORF04438
8875 y 8876 2-deshidro-3-quinasa deoxigalactonato
ORF04439
8877 y 8878 regulador de transcripción, familia IclR
ORF04440
8879 y 8880 ADN rmuC proteína de recombinación
ORF04441
8881 y 8882 Ubiequinona-menaquinona biosíntesis metiltransferasa ubi (EC 2.1.1.-) (UBIE) [2.1.1.-]
ORF04442
8883 y 8884 producto de proteína sin nombre
ORF04443
8885 y 8886 2-poliprenilfenol 6-hidroxilasa (ubiB) [1.14.13.-]
ORF04444
8887 y 8888 o261 (YIGT)
ORF04445
8889 y 8890 o261
ORFO4.446
8891 y 8892 translocasa Sec proteína independiente TatC (tatC)
ORF04447
8893 y 8894 de altura) producto del gen (YIGW) [3.1.21.-]
ORF04448
8895 y 8896 activador transcripcional RfaH (rfaH)
ORF04449
8897 y 8898 3-octaprenil-4-hidroxibenzoato de carboxi-liasa (Descarboxilasa Poliprenilp-hidroxibenzoato de metilo (YlGC) [4.1.1.-]
ORFO4450
8899 y 8900 NAD(P)H-reductasa flavina
ORF04451
8901 y 8902 proteína hipotética conservada
ORF04452
8903 y 8904 acetil-CoA C-aciltransferasa FadA (fadA) [2.3.1.16]
ORF04453
8905 y 8906 complejo graso oxidación, subunidad alfa fadB (fadB) [4.2.1.17 5.3.3.8 1.1.1.35 5.1.2.3]
ORF04454
8907 y 8908 producto de proteína sin nombre; pepQ producto, prolina dipeptidasa (PEPQ) [3.4.13.9]
ORF04455
8909 y 8910 proteína hipotética conservada T1GR00257
ORF04456
8911 y 8912 bis (5-nucIeosil)-tetrafosfatasa, simétrico-Trk sistema proteína de absorción de potasio TrkG, fusión
ORF04457
8913 y 8914 protoporfirina oxidasa
ORF04458
8915 y 8916 proteína hipotética
ORF04459
8917 y 8918 rnolibdopterina-guanina biosíntesis de proteínas dinucleótido B (mobB)
ORF04460
8919 y 8920 Molibdopterina-guanina biosíntesis de proteínas dinucleótido
ORF04461
8921 y 8922 yihD de proteínas
ORF04462
8923 y 8924 YihE
ORF04463
8925 y 8926 Tiol: proteína disulfuro dsbA precursor (por) [5.3.4.1]
ORF04464
8927 y 8928 proteína bacteriana de función desconocida (DUF945) superfamilia
ORF04465
8929 y 8930 proteína de dominio aciltransferasa
ORF04466
8931 y 8932 ADN polimerasa (POL I) (polA) (2.7.7.7]
ORF04467
8933 y 8934 GTPasa esencial para el ciclo celular
ORF04468
8935 y 8936 proteína de neutrófilos
ORF04469
8937 y 8938 proteína hipotética
ORF04470
8939 y 8940 coproporfirinogen independiente del oxígeno oxidasa III (hemN)
ORF04471
8941 y 8942 proteína hipotética
ORF04472
8943 y 8944 proteína de regulación de nitrógeno NR (I) (ntrC)
ORF04473
8945 y 8946 proteína de regulación de nitrógeno NR (II) [2.7.3.-)
ORF04474
8947 y 8948 glutamina sintetasa, tipo I (glnA) [6.3.1.2]
ORF04475
8949 y 8950 GTP-proteína de unión TypA (typA)
ORF04476
8951 y 8952 proteína hipotética
ORF04477
8953 y 8954 glicerol-3-fosfato regulon represor
ORF04478
8955 y 8956 quinasa hipotética azúcar yihV
ORF04479
8957 y 8958 3-hidroxiisobutirato deshidrogenasa
ORF04480
8959 y 8960 Tagatosa I, 6-difosfato aldolasa 2 (tagatosa-bisfosfato aldolasa 2) (D-tagatosa-1, 6-bifosfato aldolasa 2) [4.1.-.-]
ORF04481
8961 y 8962 2,3-butanodiol deshidrogenasa, putativo
ORF04482
8963 y 8964 facilitado principal transportador de la familia, truncamiento, putativo
ORF04483
8965 y 8966 facilitador principal transportador de la familia
ORF04484
8967 y 8968 Aldosa 1-epimerasa superfamilia
ORF04485
8969 y 8970 hidrolasa similar a haloácido dehalogenasa, putativo
ORF04486
8971 y 8972 ribonucleasa BN, putativo (3.1.-.-]
ORF04487
8973 y 8974 D-tirosil-ARNt (Tyr) desacilasa (dtd) [3.1.-.-]
ORF04488
8975 y 8976 proteína de membrana conservada [2.3.1.18]
ORF04489
8977 y 8978 lipasa, GDXG familia VCAO49O
ORF04490
8979 y 8980 regulador transcripcional, familia de Cro-CI
ORF04491
8981 y 8982 proteína cinta-hélice-hélice, proteína de dominio de familia copG
ORF04492
8983 y 8984 formiato deshidrogenasa FdhE proteína accesoria (fdhE)
ORF04493
8985 y 8986 formiato deshidrogenasa, subunidad gamma [1.2.1.2]
ORF04494
8987 y 8988 formiato deshidrogenasa, subunidad beta (FdxH) (1.2.1.2]
ORF04495
8989 y 8990 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa [1.2.1.2]
ORF04496
8991 y 8992 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa, selenocisteina- que contiene [1.2.1.2]
ORF04497
8993 y 8994 formiato deshidrogenasa proteína accesoria familia FdhD (fdhD)
ORF04498
8995 y 8996 proteína hipotética conservada
ORF04499
8997 y 8998 proteína hipotética conservada
ORF04500
8999 y 9000 glicoporina putativa
ORFO4501
9001 y 9002 B. subtilis YuID homólogo de proteína lin2978, putativo
ORF04502
9003 y 9004 Rhamnulosa-1-fosfato aldolasa
ORF04503
9005A 9006 L-ramnosa isomerasa (rhaA) [5.3.1.14]
ORF04504
9007 y 9008 quinasa de azúcar [2.7.1.5]
ORF04505
9009 y 9010 proteína hipotética
ORF04506
9011 y 9012 proteína reguladora del operón L-ramnosa rhaS
ORF04507
9013 y 9014 regulador positivo para rhaRS operón
ORF04508
9015 y 9016 simporte L-ramnosa-protón
ORF04509
9017 y 9018 dismutasa superóxida [Mn] (sodA) [1.15.1.1]
ORF04510
9019 y 9020 proteína hipotética conservada
ORF04511
9021 y 9022 2-ceto-3-deoxigluconato transportador (kdgT)
ORF04512
9023 y 9024 proteína de dominio MOSC
ORF04513
9025 y 9026 sensor de proteína cpxA [2.7.3.-]
ORF04514
9027 y 9028 proteína reguladora transcripcional cpxR
ORF04515
9029 y 9030 Proteína periplásmica cpxP precursor
ORF04516
9031 y 9032 p34 proteína
ORF04517
9033 y 9034 6-fosfofructoquinasa
ORF04518
9035 y 9036 Sulfato de unión a proteína precursora
ORF04519
9037 y 9038 CDP-diacilglicerol pirofosfatasa
ORF04520
9039 y 9040 triosefosfato isomerasa (tpiA) [5.3.1.1]
ORF04521
9041 y 9042 Proteína de función desconocida (DUF1454) superfamilia
ORF04522
9043 y 9044 proteína de membrana conservada
ORF04523
9045 y 9046 proteínas hipotética conservada superfamilia
ORF04524
9047 y 9048 proteína de estrés universal D (UspA)
ORF04525
9049 y 9050 ferredoxina-NADP (DA1) [1.18.1.2]
ORF04526
9051 y 9052 fructosa-1,6-bisfosfatasa, clase II (glpX) [3.1.3.11]
ORF04527
90538 9054 glicerol quinasa (glpK) [2.7.1.30]
ORF04528
9055 y 9056 Glicerol proteína captación facilitador (Aquagliceroporina) (glpF)
ORF04529
9057 y 9058 Proteína de función desconocida (DUF9O4) superfamilia
ORF04530
9059 y 9060 regulador de actividad ribonucteasa A (rraA)
ORF04531
9061 y 9062 1,4-dihidroxi-2-naftoato octapreniltransferasa (menA) [2,5-.-.-]
ORF04532
9063 y 9064 proteína de choque térmico HsIVU, ATPasa subunidad HsiU (hslU)
ORF04533
9065 y 9066 componente peptidasa de la proteasa HsIUV
ORF04534
9067 y 9068 proteína de división celular FtsN (ftsN)
ORF04535
9069 y 9070 regulador de operón deo, udp, cdd, tsx
ORF04536
9071 y 9072 Prirnosomal proteína N'
ORF04537
9073 y 9074 proteína ribosomal L31 (rpmE)
ORF04538
9075 y 9076 Proteína de función desconocida (DUF1105) superfamilia
ORF04539
9077 y 9078 represor Met
ORF04540
9079 y 9080 O-succinilhomoserina (tiol) liasa (metB) [2.5.1.48]
ORF04541
9081 y 9082 proteína AKII-HDII [2.7.2.4]
ORF04542
9083 y 9064 tsx proteína formadora de canal nucleósido específico precursor
ORF04543
9085 y 9086 5-nucleotidasa proteína de familia, putativo
ORF04544
9087 y 9088 5-nucleotidasa, proteína del dominio C-terminal
ORF04545
9089 y 9090 5-nucleotidasa, putativo
ORF04546
9091 y 9092 proteína hipotética conservada
ORF04547
9093 y 9094 5-nucleotidasa proteína de familia, putativo
ORF04546
9095 y 9096 5,10-metilenotetrahidrofolato reductasa (metF) [1.7.99.5]
ORF04549
9097 y 9098 catalasa-peroxidasa HPI (katG) [1.11.1.6]
ORF04550
9099 y 9100 proteína de transporte hipotética yijE
ORF04551
9101 y 9102 Proteína de función desconocida superfamilia (DUF1287)
ORF04552
9103 y 9104 proteína hipotética conservada
ORF04553
9105 y 9106 deshidrogenasa de glicerol (NAD) [1.1.1.6]
ORF04554
9107 y 9103 transaldolasa, putativo
ORF04555
9109 y 9110 Fosfoenolpiruvato-proteína fosfotransferasa ptsA [2.7.3.9]
ORF04556
9111 y 9112 sistema PTS, componentes IIABC-fructosa específica
ORF04557
9113 y 9114 sistema PTS, similar a fructosa-2 componente IIB 1 (Fosfotransferasa enzimaII, componente B [2.7.1.69]
ORF04558
9115 y 9116 piruvato formato-liasa [2.3.1.54]
ORF04559
9117 y 9118 similar a activación de enzima piruvato formiato-liasa de E. coli
ORF04560
9119 y 9120 dominio que contiene proteínas AraC de tipo de unión a ADN
ORF04561
9121 y 9122 sistema PTS componente similar a IIB 2 (fosfotransfer) [2.7.1.69]
ORF04562
9123 y 9124 proteína de membrana integral, putativo
ORF04563
9125 y 9126 carboxilasa fosfoenolpiruvato (ppc) [4.1.1.31]
ORF04564
9127 y 9128 desacetilasa acetilomitina (ArgE) (argE) [3.5.1.16]
ORF04565
9129 y 9130 N.acetil gamma glutamil-fosfato reductasa (argc) [1.2.1.38]
ORF04566
9131 y 9132 acetilglutarnato quinasa (argB) [2.7.2.8]
ORF04567
9133 y 9134 argininosuccinato liasa (argH) [4.3.2.1]
ORF04568
9135 y 9136 proteína de detección de inanición rspA
ORF04569
9137 y 9138 facilitador principal transportador de familia
ORF04570
9139 y 9140 transhidrogenasa soluble piridina nucleótido (STH) [1.6.1.1]
ORF04571
9141 y 9142 Peróxido de hidrógeno-inducible genes activadores (oxyR)
ORF04572
9143 y 9144 hipurato hidolasa
ORF04573
9145 y 9146 facilitador principal transportador de familia
ORF04574
9147 y 9148 regulador de transcripción, familia TetR
ORF04575
9149 y 9150 ATPasa de clase AAA +
ORF04576
9151 y 9152 ARNt (uracilo-5 -) - metiltranslerasa (trmA) [2.1.1.35]
ORF04577
9153 y 9154 TonB dependiente de vitamina B12 receptor (btuB)
ORF04578
9155 y 9156 racemasa glutamato (murl) [5.1.1.3]
ORF04579
9157 y 9158 proteína hipotética
ORF04580
9159 y 9160 UDP-N-acetilenolpiruvoilglucosamina reductasa (murB) [1.1.1.158]
ORF04581
9161 y 9162 proteína bifuncional BirA (BIRA) [6.3.4.15]
ORF04582
9163 y 9164 pantotenato cinasa (coaA) [2.7.1.33]
ORF04583
9165 y 9166 elongación de factor de traducción EF-Tu.B
ORF04584
9167 y 9168 elongación de factor de traducción EF-Tu.B
ORF04585
9169 y 9170 proteína del factor de elongación de cadena EF-Tu
ORF04586
9171 y 9172 preproteína translocasa SecE subunidad (SecE)
ORF04587
9173 y 9174 factor de transcripción terminación-antiterminación NusG (nusG)
ORF04588
9175 y 9176 proteína ribosomal L11 (rplK)
ORF04589
9177 y 9178 proteína ribosomal L1 (rplA)
ORF04590
9179 y 9180 50S proteína de subunidad ribosomal L10 (RPLJ)
ORF04591
9181 y 9182 proteína ribosomal L7-L12 (rplL)
ORF04592
9183 y 9164 ADN dirigida por ARN polimerasa, subunidad beta (rpoB) [2.7.7.6]
ORF04593
9185 y 9186 ADN dirigida por ARN polimerasa, subunidad beta (rpoC) [2.7.7.6]
ORF04594
9187 y 9188 proteína de biosíntesis de tiazol ThiH (thiH)
ORF04595
9189 y 9190 4-metil-5- (beta-hidroxietil)monofosfato tiazol proteína de síntesis ThiG
ORF04596
9191 y 9192 biosíntesis de proteínas tiamina ThiS (thiS)
ORF04597
9193 y 9194 tiazol biosíntesis adeniltransferasa ThiF (thiF)
ORF04598
9195 y 9196 pirofosforilasa tiamina-fosfato (thiE) [2.5.1.3
ORF04599
9197 y 9198 tiamina biosíntesis de proteína Thic
ORF04600
9199 y 9200 Regulador de sigma D
ORF04601
9201 y 9202 MutT-nudix proteína de familia [3.6.1.-]
ORF04602
9203 y 9204 descarboxilasa uroporfirinogen (hemE) [4.1.1.37]
ORF04603
9205 y 9206 endonucleasa V (desoxiinosina 3endoducleasa)
ORF04604
9207 y 9208 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF
ORF04605
9209 y 9210 ADN-proteína de unión HU-alfa (NS2) (HU-2) (HU)
ORF04606
9211 y 9212 producto de proteína sin nombre
ORF04607
9213 y 9214 precursor de la proteína asociada a resistencia de zinc
ORF04608
9215 y 9216 quinasa de sensor para HydG, hidrogenasa 3 actividad [2.7.3.-]
ORF04609
9217 y 9218 proteína reguladora transcripcional zraR (sigma54)
ORF04610
9219 y 9220 fosforibosilamina—glicina ligasa (purD) [6.3.4.13]
ORF04611
9221 y 9222 proteína bifuncional de biosíntesis de purina PurH (purH)
ORF04612
9223 y 9224 proteína hipotética conservada
ORF04613
9225 y 9226 proteína hipotética
ORF04614
9227 y 9228 proteína hipotética conservada
ORF04615
9229 y 9230 ceItransferasa, familia GNAT (putativo) [2.3.1.-]
ORF04616
9231 y 9232 homoserina 0-suciniltransterasa (Meta) [2.3.1.46]
ORF04617
9233 y 9234 sintasa malato A (aceB) [2.3.3.9]
ORF04618
9235 y 9236 isocitrato liasa (aceA) [4.1.3.1]
ORF04619
9237 y 9238 Isocitrato deshidrogenasa quinasa-fosfatasa (EC 3.1.3.-) (IDH quinasa-fosfatasa) (IDHK-P) [2.7.1.116]
ORF04620
9239 y 9240 regulador transcnptional, putativo
ORF04621
9241 y 9242 proteína hipotética
ORF04622
9243 y 9244 5-metiltetrahidrofolato - homocisteína metiltransferasa (metH) [2.1.1.13]
ORF04623
9245 y 9246 proteína hipotética conservada
ORF04624
9247 y 9248 proteína relacionada con Na-Pi-cotransportador II, putativo
ORF04625
9249 y 9250 Peptidasa E (alfa-aspartil dipeptidasa) (Asp-especificadipeptidasa) (Dipeptidasa E) (alfa) [3.4.13.2]
ORF04626
9251 y 9252 L-sorbosa 1-fosfato reductasa [1.1.1.-]
ORF04627
9253 y 9254 sistema PTS, componente IID específico de manosa
ORF04628
9255 y 9256 sistema PTS, componente llC específico de manosa [2.7.1.69]
ORF04629
9257 y 9258 sistema PTS sorbosa-permeasa es componente IIB (ElIl-MAN) [2.7.1.69]
ORF04630
9259 y 9260 sistema PTS, sorbosa-específica componente IIA (EIIA-Sor) (Sorbosa-permeasa componente IIA) (fosfotransferasa enzima II, componente A) (EC 2.7.1.69) (EIII-F-Sor (2.7.1.69]
ORF04631
9261 y 9262 D-glucitol-6-fosfato deshidrogenasa [1.1.1.140]
ORF04632
9263 y 9264 regulador transcripcional putativo de la captación de sorbosa y
ORF04633
9265 y 9266 proteínas ARN pseudouridilato familia sintasa [4.2.1.70]
ORF04634
9267 y 9268 proteína hipotética conservada
ORF04635
9269 y 9270 aspartato quinasa, clase monofuncional [2.7.2.4]
ORF04636
9271 y 9272 glucosa-6-fosfato isomerasa (pgi) [5.3.1.9]
ORF04637
9273 y 9274 proteína hipotética conservada
ORFC14638
9275 y 9276 lipoproteína, putativo
ORF04639
9277 y 9278 Proteína de función desconocida (DUF1017) superfamilia
ORF04640
9279 y 9280 proteína otnG (o698)
ORF04641
9281 y 9282 proteína hipotética conservada
ORF04642
9283 y 9284 PsiE homólogo de proteína
ORF04643
9285 y 9286 sistema de transporte de la maltosa permeasa proteína de malG (malG)
ORF04644
9287 y 9288 sistema de transporte de proteína maltosa permeasa malF (membrana)
ORF04645
9289 y 9290 proteína precursora periplásmica de unión a maltosa
ORF04646
9291 y 9292 transporte de proteínas de unión a ATP-maltosa maltodextrina malK
ORF04647
9293 y 9294 precursor de maltoporina (porina de maltosa inducible) (malL)
ORF04648
9295 y 9296 precursor de proteína periplásmica de operón maltosa (MalM) superfamilia
ORF04649
9297 y 9298 proteína hipotética conservada
ORF04650
9299 y 9300 liasa de corismato [4.-.-.-]
ORF04651
9301 y 9302 transferasa 4-hidroxibenzoato poliprenílico (ubiA) [2.5.1.-]
ORF04652
9303 y 9304 glicerol-3-fosfato O-aciltransferasa [2.3.1.15]
ORF04653
9305 y 9306 diacilglicerol quinasa (DGK) [2.7.1.107]
ORF04654
9307 y 9308 represor LexA (lexA) 3.4.21.88]
ORF04655
9309 y 9310 proteína inducible de daño de ADN F, truncamiento
ORF04656
9311 y 9312 Proteína relacionada en proteína yjbJ
ORF04657
9313 y 9314 proteína de regulación de absorción de zinc
ORF04658
9315 y 9316 ARNt-dihidroundina sintasa A [1.-.-.-]
ORF04659
9317 y 9318 proteína hipotética conservada
ORF04660
9319 y 9320_ oxidorreductasa guinona
ORF04661
9321 y 9322 oxidorreductasa putativa
ORF04662
9323 y 9324 simportador metabolito-protón
ORF04663
9325 y 9326 proteína de familia hidratasa-isomerasa enoil-CoA
ORF04664
9327 y 9328 acetil-CoA-transferasa subunidad, putativo [2.8.3.-]
ORF04665
9329 y 9330 LAD-FAMILIA DE TRANSCRIPCIÓN DEL REGULADOR
ORF04666
9331 y 9332 ADN helicasa replicativa (adnB) [3.6.1.-]
ORF04667
9333 y 9334 alanina racemasa (alr) [5.1.1.1]
ORF04668
9335 y 9336 transportador, putativo
ORF04669
9337 y 9338 homólogo NadR
ORF04670
9339 y 9340 aminoácido aromático aminotranslerasa
ORF04671
9341 y 9342 2-oxoglutarato deshidrogenasa, componente E1 (sucA) [1.2.4.2]
ORF04672
9343 y 9344 2-oxoglutarato deshidrogenasa, componente E2, dihidrolipoamida succiniltransferasa (sucB) [2.3.1.61]
ORF04673
9345 y 9346 deshidrogenasa dihidrolipoamida (ipdA) [1.8.1.4]
ORF04674
9347 y 9348 cadena de succinil-CoA sintetasa beta (AF326913) [6.2.1.5]
ORF04675
9349 y 9350 Succinil-sintetasa CoA cadena alfa [6,2.1.5]
ORF04676
9351 y 9352 proteína de familia transportadora de aniones
ORF04677
9353 y 9354 regulador de respuesta de dos componentes
ORF04678
9355 y 9356 lactato deshidrogenasa putativa
ORF04679
9357 y 9358 proteína sensora de transporte putativa
ORF04680
9359 y 9360 HAD superfamilia (subfamilia IIIS) fosfatasa, TIGR01672 (AphA) [3.1.3.-]
ORF04681
9361 y 9362 proteína hipotética conservada TIGR00149
ORF04682
9363 y 9364 yjbR de proteína
ORF04683
9365 y 9366 excinucleasa ABC, subunidad A (uvrA)
ORF04684
9367 y 9368 proteína de unión al ADNmc
ORF04685
9369 y 9370 proteína hipotética conservada
ORF04686
9371 y 9372 proteína de dominio EAL
ORF04687
9373 y 9374 soxS proteína reguladora
ORF04688
9375 y 9376 sensible a redox activador transcripcional SoxR (soxR)
ORF04689
9377 y 9378 xantina-uracilo permeasa de proteína de familia
ORF04690
9379 y 9380 antiporter Na+ -H+
ORF04691
9381 y 9382 regulador de transcripción, familia LysR, putativo
ORF04692
9383 y 9384 proteína hipotética conservada
ORF04693
9385 y 9386 mureína exportadora hidrolasa
ORF04694
9387 y 9388 superfamilia familia LrgB similar
ORF04695
9389 y 9390 Sodio, proteína soluto familia cotransportador (PutP)
ORF04696
9391 y 9392 Proteína de función desconocida, superfamilia DUF485
ORF04697
9393 y 9394 acetato-CoA ligasa (acsA) [6.2.1.1]
ORF04698
9395 y 9396 nitrito reductasa (citocromo; amoníaco formador) (nrfA) [1.7.2.2]
ORF04699
9397 y 9398 formiato dependiente de nitrito reductasa NrfB
ORF04700
9399 y 9400 NrfC proteína (NrfC) [1.-.-.-]
ORF04701
9401 y 9402 NrfD proteína (NrfD) [1.-.-.-]
ORF04702
9403 y 9404 citocromo tipo c proteína de biogénesis CcrnF (ccmF)
ORF04703
9405 y 9406 formiato dependiente de nitrito reductasa
ORF04704
9407 y 9408 Formiato dependiente de nitrito reductasa complejo nrfG subunidad (nrlF)
ORF04705
9409 y 9410 proteína hipotética conservada
ORF04706
9411 y 9412 proteína simportador glutamato-aspartato (gItP)
ORF04707
9413 y 9414 proteína hipotética conservada
ORF04708
9415 y 9416 Transportador ABC, proteína de unión a ATP
ORF04709
9417 y 9418 Transportador ABC, nucleótido de unión proteína-ATPasa [dipéptido]
ORF04710
9419 y 9420 Transportador ABC, permeasa de proteínas (AE006058)
ORF04711
9421 y 9422 ABC proteína transportadora de permeasa (AE005357)
ORF04712
9423 y 9424 transportador ABC, proteína de unión periplosmica a oligo-dipéptido-níquel (AE005357)
ORF04713
9425 y 9426 formiato dehidrogenasa, subunidad alfa [1.2.1.2]
ORF04714
9427 y 9428 formiato deshidrogenasa, subunidad alfa, putativo [1.2.1.2]
ORF04715
9429 y 9430 coincidencias PS00443: Glutamina amidotransferasas clase-lI sitio activo; similar al ácido fusárico cepacia pseudomonas resistencia a la proteína FusA
ORF04716
9431 y 9432 proteína de región conservada de resistencia a ácido fusárico familia
ORF04717
9433 y 9434 secreción de proteína de familia HIyD, putativo
ORF04718
9435 y 9436 proteína hipotética conservada
ORF04719
9437 y 9438 superfamilia de proteínas metalo-beta-lactamasa
ORF04720
9439 y 9440 glucoquinasa (EC 2.7.1.2), putativo [2.7.1.2]
ORF04721
9441 y 9442 ribulosa-fosfato de 3-epimerasa (rpe) [5.1.3.1]
ORF04722
9443 y 9444 transportador ABC ribosa, permeasa de proteína (permeasa)
ORF04723
9445 y 9446 transportador ABC ribosa, permeasa de proteína (ECOWU89)
ORF04724
9447 y 9448 transporte D-alosa proteína de unión a ATP-Alsa (aldosa)
ORF04725
9449 y 9450 proteína hipotética
ORF04726
9451 y 9452 precursor de la proteína periplásmica D-alosa vinculante (ALBP)
ORF04727
9453 y 9454 regulador transcripcional, putativo
ORF04728
9455 y 9456 proteína hipotética
ORF04729
9457 y 9458 ribosa 5-fosfato isomerasa B (rpiB) [5.3.1.6]
ORF04730
9459 y 9460 proteína hipotética conservada
ORF04731
9461 y 9462 PhnP proteína (phnp)
ORF04732
9463 y 9464 proteína PhnO
ORF04733
9465 y 9466 proteína de metabolismo fosfonato-1, 5-bisfosfoquinasa (PRPP de formación) PhnN (phnN)
ORF04734
9467 y 9468 proteína de metabolismo fosfonato PhnM (phnM)
ORF04735
9469 y 9470 fosfonato C-P proteína de sistema de liasa PhnL (phnL)
ORF04736
9471 y 9472 fosfonato C-P proteína de sistema de liasa PhnK (phnK)
ORF04737
9473 y 9474 proteína de metabolismo de fosfonato PhnJ
ORF04738
9475 y 9476 proteína de metabolismo de fosfonato bacterial (Phnl)
ORF04739
9477 y 9478 proteína de metabolismo de fosfonato bacterial (PhnH)
ORF04740
9479 y 9480 proteína PhnG
ORF04741
9481 y 9482 regulador de metabolismo transcripcional de fosfonatos PhnF (phnF)
ORF04742
9483 y 9484 componente de proteína de canal de membrana de transportador Pn
ORF04743
9485 y 9486 transportador ABC fosfonato, proteína de unión al sustrato, putativo
ORF04744
9487 y 9488 transportador ABC fosfonato, proteína de unión a ATP (phnC)
ORF04745
9489 y 9490 proteína PhnB
ORF04746
9491 y 9492 utilización de operón de proteínas alquilfosfonato PhnA
ORF04747
9493 y 9494 proteína hipotética conservada
ORF04748
9495 y 9496 proteína hipotética conservada
ORF04749
9497 y 9498 transportador MFS aminoácidos (PPII)
ORF04750
9499 y 9500 proteína de sensor basS-pmrB
ORF04751
9501 y 9502 proteínas reguladoras de transcripción basR-pmrA
ORF04752
9503 y 9504 hidrolasa dependiente de metal asociada a membrana predicha
ORF04753
9505 y 9506 detoxificador arginina-agmatina
ORF04754
9507 y 9508 HTH-transcripcional de tipo regulador adiY
ORF04755
9509 y 9510 arginina descarboxilasa [4.1.1.19]
ORF04756
9511 y 9512 adi arginina descarboxilasa, biodegradativo (ldc) [4.1.1.19]
ORF04757
9513 y 9514 proteína reguladora del operón melibiosa (AF049243)
ORF04758
9515 y 9516 glicosil hidrolasa, familia 4, putativo [3.2.1.22]
ORFD4759
9517 y 9518 proteína de membrana, putativo
ORF04760
9519 y 9520 clase de fumarato de hidrolasa I, anaeróbico [4.2.1.2]
ORF04761
9521 y 9522 anaeróbico C4-dicarboxilato de transportador de membrana
ORF04762
9523 y 9524 proteína hipotética conservada
ORF04763
9525 y 9526 regulador de respuesta VC1604 (parcial)
ORF04764
9527 y 9528 proteína de sensor dcuS [2.7.3.-]
ORF04765
9529 y 9530 proteína hipotética
ORF04766
9531 y 9532 proteína similar a Yjdl
ORF04767
9533 y 9534 aceiltsansferasa, familia GNAT (GNAT)
ORF04768
9535 y 9536 sintetasa lisil-ARNt (lysS) [6.1.1.6]
ORF04769
9537 y 9538 PTR2-familia proteína de transporte STY0750 (POT)
ORF04770
9539 y 9540 CadA (ldc) [4.1.1.18]
ORF04771
9541 y 9542 transporte de lisina-cadaverina
ORF04772
9543 y 9544 activador transcripcional
ORF04773
9545 y 9546 proteína hipotética
ORF04774
9547 y 9548 regulador de transcripción, proteína de dominio de familia TetR, putativo
ORF04775
9549 y 9550 Tiol: disulforo proteína precursora de intercambio dsbD (dsbD) [1.8.1.8]
ORF04776
9551 y 9552 divalente tolerancia catión proteína citocromo c biogénesis
ORF04777
9553 y 9554 Anaeróbica C4-dicarboxilato transportador dcuA (DcuA)
ORF04778
9555 y 9556 aspartato amonio-ligasa (aspA) [4.3.1.1]
ORF04779
9557 y 9558 supresor de F exclusión de bacteriófago T7
ORF04780
9559 y 9560 permeasa aminoácido superfamilia
ORF04781
9561 y 9562 chaperonina, 10 kDa (groES)
ORF04782
9563 y 9564 chaperonina GroEL (groL)
ORF04783
9565 y 9566 proteína hipotética conservada
ORF04784
9567 y 9568 proteína hipotética conservada
ORF04785
9569 y 9570 lisina 2; 3.aminomutasa
ORF04786
9571 y 9572 factor de elongación de traducción P (efp)
ORF04787
9573 y 9574 proteína relacionada con entericidina-B precursor
ORF04788
9575 y 9576 proteína relacionada con entericidina-B precursor
ORF04789
9577 y 9578 SugEL
ORF04790
9579 y 9580 lipoproteína de membrana externa blc precursor
ORF04791
9581 y 9582 beta-lactamasa
ORF04792
9583 y 9584 reductasa de fumarato, anaeróbica, polipéptido de anclaje a membrana
ORF04793
9585 y 9586 fumarato reductasa de subunidad C (fumarato reductasa 15 kDa hidrofobicproteína) (frdC [1.3.99.1]
ORF04794
9587 y 9588 fumarato reductasa, anaeróbica, hierro-azufre subunidad de la proteína
ORF04795
9589 y 9590 fumarato reductasa, subunidad flavoproteına (frdA) (1.3.99.1]
ORF04796
9591 y 9592 lisil-ARNt sintetasa relacionada con proteína GenX
ORF04797
9593 y 9594 permeasa de aminoácidos
ORF04798
9595 y 9596 proteína hipotética conservada
ORF04799
9597 y 9598 proteína hipotética conservada
ORF04800
9599 y 9600 producto de proteína sin nombre
ORFO4801
9601 y 9602 descarboxilasa fosfatidilserina de síntesis de fosfolípidos
ORF04802
9603 y 9604 GlPasas predichas
ORF04803
9605 y 9606 Oligonbonucleasa
ORF04804
9607 y 9608 producto de proteína sin nombre
ORF04805
9609 y 9610 quinasa predicha de azúcar
ORF04806
9611 y 9612 proteína hipotética conservada TIGR00150
ORF04807
9613 y 9614 N-acetilmuramoil-I-alanina amidasa II a hidrolasa mureína
ORF04808
9615 y 9616 ADN de desajuste de proteína de reparación mutL
ORF04809
9617 y 9618 ARNt delta(2)-isopenenilpirofosfato transferasa (miaA) [2.5.1.8]
ORF04810
9619 y 9620 factor de huesped I (HF-I)
ORF04811
9621 y 9622 proteína de unión a GTP hflX
ORF04812
9623 y 9624 proteína HflK (hflK) [3.4.-.-]
ORF04813
9625 y 9626 HflC proteína (hflC)
ORF04814
9627 y 9628 proteína hipotética
ORF04815
9629 y 9630 proteína hipotética conservada
ORF04816
9631 y 9632 proteína hipotética
ORF04817
9633 y 9634 adenilosuccinato-sintetasa (purA) [6.3.4.4]
ORF04818
9635 y 9636 regulador transcripcional predicho
ORF04819
9637 y 9638 R ribonucleasa (mr) [3.1.-.-]
ORF04820
9639 y 9640 ARN metiltransferasa, familia TrmH, grupo 3
ORF04821
9641 y 9642 proteína hipotética conservada
ORF04822
9643 y 9644 proteína de la familia PspA-IM30
ORF04823
9645 y 9646 proteína hipotética conservada
ORF04824
9647 y 9648 proteína de membrana predicha (0132)
ORF04825
9649 y 9650 Proteína de función desconocida (DUF1190) superfamilia
ORF04826
9651 y 9652 gationilspermidina sintasa (O386)
ORF04827
9653 y 9654 fadE8
ORF04828
9655 y 9656 Proteína de función desconocida (DUF1471) superfamilia
ORF04829
9657 y 9658 Proteína de función desconocida (DUF1471) familia
ORF04830
9659 y 9660 hidrolasas de superfamilia de alfa-beta (putativo)
ORF04831
9661 y 9662 regulador transcripcional, familia DeoR, putativa
ORF04832
9663 y 9664 hidrolasa Zn-dependiente predicha del pliegue de beta-lactamasa
ORF04833
9665 y 9666 permeasa azúcar específica putativa, SgaT-Ulaa superfamilia, putativo
ORF04834
9667 y 9668 lIB proteína putativa del sistema PTS
ORF04835
9669 y 9670 proteína-N fosfotransferasa pi-fosfohistidina-azúcar (Ntr-tipo) [2.7.1.69]
ORF04836
9671 y 9672 hexulosa-6-fosfato sintasa (jorobas)
ORF04837
9673 y 9674 hexulosa-6-fosfato isomerasa, putativo
ORF04838
9675 y 9676 AraD
ORF04839
9677 y 9678 Proteína de función desconocida (DUFI471) superfamilia
ORF04840
9679 y 9680 3OS proteína ribosoma (rpS6)
ORF04841
9681 y 9682 familia de proteína de cadena única
ORF04842
9683 y 9684 proteína de ribosomal S18 (rpsR)
ORF04843
9685 y 9686 proteína de ribosomal L9 (rpll)
ORF04844
9687 y 9688 proteína hipotética conservada
ORF04845
9689 y 9690 transportador MFS, familia de permeasa de ftalato, putativo
ORF04846
9691 y 9692 oxidorreductasa putativa
ORF04847
9693 y 9694 acetil-CoA-transferasa subunidad, putativo
ORF04848
9695 Y 9696, enoil-CoA hidratasa-isomerasa FadB1x putativo [4.2.1.55]
ORF04849
9697 y 9698 3-deshidrosiquimato deshidratasa
ORF04850
9699 y 9700 proteína hipotética conservada
ORF04851
9701 y 9702 3-oxoacil-(acil-portador-proteína) reductasa
ORFO4852
9703 y 9704 Opacidad asociada a la proteína A superfamilia
ORF04853
9705 y 9706 proteína conservada putativa
ORF04854
9707 y 9708 isomerasa de tipo FKBP 22 kDa peptidil-prolil cis-trans (rotamasa) [5.2.1.8]
ORF04855
9709 y 9710 D-serina-D-alanina-glicina transportador
ORF04856
9711 y 9712 proteína ScdA, putativo
ORF04857
9713 y 9714 proteína de membrana (f324)
ORF04858
9715 y 9716 proteína hipotética conservada
ORF04859
9717 y 9718 reguladores transcripcionales predichos
ORF04860
9719 y 9720 2’,3’-cíclico-nucIeotido 2’-fosfodiesteras (cpdB) [3.1.4.161]
ORF04861
9721 y 9722 proteína hipotética conservada familia YtfJ, TlGR01626
ORF04862
9723 y 9724 3’(2’),5’-nucleotidasa de bisfosfato (cysQ) [3.1.3.7]
ORF04863
9725 y 9726 proteína de función desconocida (DUF11O7) superfamilia
ORF04864
9727 y 9728 hipotética UPF0053 proteína ytfL
ORF04865
9729 y 9730 reductasa de sulfóxido de péptido de metionina
ORF04866
9731 y 9732 producto de proteína sin nombre
ORF04867
9733 y 9734 Familia de función desconocida (DUF490) familia
ORFQ4868
9735 y 9736 hipotética UPF0131 proteína ytfP
ORF04869
9737 y 9738 pirofosfatasa inorgánica (ppa) (3.6.1.1]
ORF04870
9739 y 9740 proteína periplásmica de unión a ribosa
ORF04871
9741 y 9742 proteína de unión a ATP transportador de ABC
ORF04872
9743 y 9744 transportador ABC ribosa, proteína de permeasa VCA0129
ORF04873
9745 y 9746 transportador ABC ribosa, proteína de permeasa
ORF04874
9747 y 9748 fructosa-1,6-bisfosfatasa (fbp) [3.1.3.11]
ORF04875
9749 y 9750 proteína hipotética conservada
ORF04876
9751 y 9752 UDP-N-acetiImuramato: L-alanil-gamma-D-glutamil-meso-diaminopimelato ligasa (mpl)
ORF04877
9753 y 9754 hipotética UPFO3O7 proteína yjgA (proteína x96)
ORF04878
9755 y 9756 PmbA proteína (pmbA)
ORF04879
9757 y 9758 citocromo soluble b562 precursor (562)
ORF04880
9759 y 9760 Anaeróbico ribonucleósido trifosfato reductasa de activación de proteínas (EC 1.97.1.4) (ribonucleótido anaeróbico de clase III reductasa de componente pequeño) [1.97.1.4]
ORF04881
9761 y 9762 anaeróbico ribonucleósido-trifosfato reductasa [1.17.4.2]
ORF04882
9763 y 9764 proteína hipotética
ORF04883
9765 y 9766 alfa,affa-fosfotrehalasa (treC) [3.2.1.93]
ORF04884
9767 y 9768 sistema PTS, componente IIBC-trehalosa específico (treP) [2.7.1.69]
ORF04885
9769 y 9770 trehalosa operón represor (treR)
ORFO4SB6
9771 y 9772 magnesio-translocación de tipo P ATPasa (mgtA) [3.6.3.2]
ORF04887
9773 y 9774 endorribonucleasa L-PSP, putativo
ORF04888
9775 y 9776 aspartato carbamoiltransferasa, subunidad reguladora (pyrl)
ORF04889
9777 y 9778 cartamoiltransferasa de aspartato (pyrB) [2.1.3.2]
ORF04890
9779 y 9780 represor de arginina
ORF04891
9781 y 9782 proteína de membrana, putativo
ORF04892
9783 y 9784 carbamoiltransferasa ornitina (argF) [2.1.3.3]
ORF04893
9785 y 9786 quinasa de carbamato (arcC) [2.7.2.2]
ORF04894
9787 y 9788 deiminasa de arginina (arcA) [3.5.3.6)
ORF04895
9789 y 9790 yjgK de proteínas
ORF04896
9791 y 9792 carbamoiltransferasa ornitina (argF) [2.1.3.3]
ORF04897
9793 y 9794 Proteína
ORF04898
9795 y 9796 proteína hipotética
ORF04899
9797 y 9798 acetiltransferasa, familia familia GNAT
ORF04900
9799 y 9800 proteína de membrana interna probable STY4813
ORF04901
9801 y 9802 sintetasa valil-ARNt (valS) [6.1.1.9]
ORF04902
9803 y 9804 ADN polimerasa III, chi subunidad [2.7.7.7]
ORF04903
9805 y 9806 Citosol aminopeptidasa (leucina aminopeptidasa) (LAP) (Leucil aminopeptidasa) (aminopeptidasa A-I) (LAP) [3.4.11.1]
ORF04904
9807 y 9808 proteína hipotética conservada
ORF04905
9809 y 9810 producto de proteína sin nombre
ORF04906
9811 y 9812 proteína hipotética
ORF04907
9813 y 9814 permeasa predicha
ORF04908
9815 y 9816 proteína de unión a ATP conservada
ORF04909
9817 y 9818 proteína reguladora L-idonato Gnt-II
ORF04910
9819 y 9820 sistema de Gnt-II transportador L-idonato
ORF04911
9821 y 9822 GLUCONATO PROBABLE 5-DESHIDROGENASA OXIDORREDUCTASA PROTEÍNA [1.1.1.69]
ORF04912
9823 y 9824 2.3-butanodiol dehidrogesasa [1.1.1.264]
ORF04913
9825 y 9826 gluconoquinasa termorresistente [2.7.1.12]
ORF04914
9827 y 9828 NADP dependiente de dihrogenasa de alcohol [1.1.1.-]
ORF04915
9829 y 9830 Integrasa
ORF04916
9831 y 9832 proteína CII
ORF04917
9833 y 9834 proteína beta
ORF04918
9835 y 9836 proteína de supresión de polaridad (proteína de supresión de mutación ámbar)
ORF04919
9837 y 9838 proteína de transactivación
ORF04920
9839 y 9840 Glicoproteína 3 (proteína de determinación de tamaño cápsido)
ORF04921
9841 y 9842 proteína de unión a fago ADN
ORF04922
9843 y 9844 producto proteico sin nombre: producto del gen cl (AA 1-137)
ORF04923
9845 y 9846 proteína hipotética conservada
ORF04924
9847 y 9848 proteína hipotética conservada
ORF04925
9849 y 9850 primasa ADN bacteriófago P4 [2.7.7.-]
ORF04926
9851 y 9852 proteína hipotética
ORF04927
9853 y 9854 proteína hipotética
ORF04928
9855 y 9856 proteasa dependiente de ATP La
ORF04929
9857 y 9858 proteína hipotética conservada
ORF04930
9859 y 9860 proteína hipotética conservada
ORF04931
9861 y 9862 producto de proteína sin nombre; ORF616
ORF04932
9863 y 9864 proteína de dominio motivo kelch
ORF04933
9865 y 9866 proteína porina específica a oligogalacturonato (KdgM) superfamilia
ORF04934
9867 y 9868 proteína FimB
ORF04935
9869 y 9870 recombinasa que participa en el regulador de variación de fase para
ORF04936
9871 y 9872 proteína fimbrial de tipo I fimA precursor
ORF04937
9873 y 9874 proteína fimbrial
ORF04938
9875 y 9876 precursor de proteína chaperona FimC
ORF04939
9877 y 9878 membrana externa de proteína precursora ujier fimD
ORF04940
9879 y 9880 proteína FIMF precursor
ORF04941
9881 y 9882 morfología fimbrial
ORF04942
9883 y 9884 FimH
ORF04943
9885 y 9886 deshidratasa manonato (uxuA) [4.2.1.8]
ORF04944
9887 y 9888 D-manonato oxidorreductasa [1.1.1.57]
ORF04945
9889 y 9890 regulador de operón Uxu
ORF04946
9891 y 9892 Proteína de función desconocida (DUF1316) subfamilia
ORF04947
9893 y 9894 fosfotransferasa fosfoenolpiruvato-proteína, componentes El-HPr-EIIA
ORF04948
9895 y 9896 quinasa dihidroxiacetona, L subunidad [2.7.1.-]
ORF04949
9897 y 9898 quinasa dihidroxiacetona, Dhak subunidad (dhak) [2.7.1.-]
ORF04950
9899 y 9900 proteína hipotética
ORF04951
9901 y 9902 deshidrogenasa de glicerol CgrD (NAD) [1.1.1.6]
ORF04952
9903 y 9904 CgxT transportador putativo
ORF04953
9905 y 9906 proteína invasión IbeA
ORF04954
9907 y 9908 transportador de betaína colina-glicina
ORF04955
9909 y 9910 glicerato quinasa [2.7.1.31]
ORF04956
9911 y 9912 reductasa 2-hidroxi-3-oxopropionato [1.1.1.60]
ORF04957
9913 y 9914 isomerasa de hidroxipiruvato [5.3.1.22]
ORF04958
9915 y 9916 proteína hipotética
ORF04959
9917 y 9918 glioxilato carboligasa [4.1.1.47]
ORF04960
9919 y 9920 glioxilato carboligasa [4.1.1.47]
ORF04961
9921 y 9922 familia NtrC regulador transcripcional, dominio ATPasa
ORF04962
9923 y 9924 proteína de invasión IbeA
ORF04963
9925 y 9926 proteína hipotética
ORF04964
9927 y 9928 Na+ -H+ detoxificador NhạC (nhạC)
ORF04965
9929 y 9930 regulador transcripcional hipotética yjiE
ORF04966
9931 y 9932 proteína hipotética
ORF04967
9933 y 9934 dipeptidasa isoaspartil (IadA) [3.4.19.-]
ORF04968
9935 y 9936 proteína de membrana no caracterizada
ORF04969
9937 y 9938 proteína de dominio de reconocimiento de nucleósido
ORF04970
9939 y 9940 ARN 2’-fosfotransferasa, Tpt1 proteína de dominio de familia KptA
ORF04971
9941 y 9942 proteína hipotética conservada
ORF04972
9943 y 9944 proteína de membrana, putativo
ORF04973
9945 y 9946 SrgB
ORF04974
9947 y 9948 proteína hipotética conservada
ORF04975
9949 y 9950 Activador de 2-hidroxiglutaril-CoA deshidratasa (HSP70-dominio de clase ATPasa)
ORF04976
9951 y 9952 2-hidroxiglutaril-CoA deshidratasa homólogo de subunidad beta
ORF04977
9953 y 9954 Proteína de función desconocida (DUF445) superfamilia
ORF04978
9955 y 9956 transposasa
ORF04979
9957 y 9958 proteína conservada
ORF04980
9959 y 9960 proteína hipotética conservada
ORF04981
996 y 9962 enzima de restricción de tipo EcoKI proteína de especificidad (proteína S) (S.EcoKl) [3.1.21.3]
ORF04982
9963 y 9964 enzima de restricción de tipo I proteína EcoKi M (M.EcoKl) [2.1.1.72]
ORF04983
9965 y 9966 enzima de restricción de tipo I proteína EcoKl R (R.EcoKl) [3.1.21.3]
ORF04984
9967 y 9968 Mrr proteína del sistema de restricción (EcoKMrr)
ORF04985
9969 y 9970 proteína de dominio de proteína de familia CobW-P47K
ORF04986
9971 y 9972 pequeña proteína no caracterizada
ORF04987
9973 y 9974 YjiY
ORF04988
9975 y 9976 proteína quimiotaxis de aceptación de metil I (MCP-I) (quimioreceptorproteína de serina)
ORF04989
9977 y 9978 C4-dicarboxilato de transportador de subunidad grande (DctM)
ORF04990
9979 y 9980 transportador de TRAP, superfamilia de proteínas de membrana similar a DctQ
ORF04991
9981 y 9982 proteína DctP
ORF04992
9983 y 9984 Na+ -H+ detoxificador
ORF04993
9985 y 9986 producto del gen yijM
ORF04994
9987 y 9988 deshidrogenasa de sorbitol, putativo [1.1.1.14]
ORF04995
9989 y 9990 proteína hipotética
TABLA 2 142 antígenos preferidos
imagen1
5
10
15
20
25
imagen2
30
35
40
[0250] Ubicación citoplásmica: ORF00252, ORF01056, ORF01337, ORF01341, ORF01344, ORF01348, ORF01371, ORF01477, ORF02424, ORF02833, ORF03348, ORF03504, ORF03542, ORF04162, ORF04844.
[0251] Ubicación interna de membrana: ORF00010, ORF00017, ORF00029, ORF00041, ORF00130, ORF00332, 45
ORF00333, ORF00342, ORF00353, ORF00394, ORF00405, ORF00631, ORF00773, ORF00905, ORF01034,
ORF01037, ORF01090, ORF01103, ORF01104, ORF01108, ORF01115, ORF01118, ORF01119, ORF01194,
ORF01202, ORF01207, ORF01208, ORF01214, ORF01338, ORF01339, ORF01349, ORF01350, ORF01365,
ORF01462, ORF01491, ORF01503, ORF01506, ORF01590, ORF01705, ORF01722, ORF01723, ORF01855,
ORF01932, ORF02314, ORF02392, ORF02412, ORF02470, ORF02554, ORF02735, ORF02847, ORF02868, 50
ORF02878, ORF02888, ORF03020, ORF03021, ORF03025, ORF03044, ORF03174, ORF03176, ORF03235,
ORF03300, ORF03349, ORF03364, ORF03459, ORF03501, ORF03507, ORF03512, ORF03519, ORF03520,
ORF03535, ORF03539, ORF03540, ORF03575, ORF03576, ORF03579, ORF03580, ORF04163, ORF04184,
ORF04203, ORF04204, ORF04402, ORF04477, ORF04608, ORF04693, ORF04694, ORF04845, ORF04849,
ORF04851, ORF04922, ORF04924, ORF04925. 55
[0252] Ubicación externa de membrana: ORF00250, ORF00251, ORF00469, ORF01228, ORF01236, ORF01340,
ORF01342, ORF01351, ORF01592, ORF01656, ORF02829, ORF02831, ORF02834, ORF03166, ORF03517,
ORF03613, ORF04282.
60
[0253] Ubicación periplásmica: ORF00908, ORF01589, ORF01660, ORF02307, ORF02816, ORF02828, ORF02830, ORF02832, ORF02866, ORF03011, ORF03252, ORF03262, ORF03515, ORF03516, ORF03518, ORF03522, ORF03541, ORF04390, ORF04391
65
TABLA 3 homología baja con cepas comensales
ORF00010, ORF00016, ORF00017, ORF00018, ORF00019, ORF00020, ORF00025, ORF00028, ORF00029,
ORF00030, ORF00031, ORF00032, ORF00034, ORF00035, ORF00036, ORF00037, ORF00041, ORF00042,
ORF00043, ORF00044, ORF00045, ORF00046, ORF00047, ORF00048, ORF00049, ORF00050, ORF00051, 5
ORF00052, ORF00053, ORF00054, ORF00055, ORF00056, ORF00057, ORF00058, ORF00059, ORF00060,
ORF00061, ORF00062, ORF00064, ORF00065, ORF00066, ORF00067, ORF00068, ORF00069, ORF00070,
ORF00089, ORF00090, ORF00106, ORF00107, ORF00119, ORF00120, ORF00121, ORF00130, ORF00134,
ORF00150, ORF00151, ORF00152, ORF00163, ORF00169, ORF00198, ORF00222, ORF00223, ORF00224,
ORF00225, ORF00226, ORF00231, ORF00232, ORF00233, ORF00250, ORF00251, ORF00252, ORF00253, 10
ORF00254, ORF00255, ORF00256, ORF00257, ORF00330, ORF00331, ORF00332, ORF00333, ORF00334,
ORF00335, ORF00336, ORF00337, ORF00338, ORF00339, ORF00340, ORF00341, ORF00342, ORF00343,
ORF00344, ORF00345, ORF00346, ORF00347, ORF00348, ORF00349, ORF00350, ORF00351, ORF00352,
ORF00353, ORF00361, ORF00379, ORF00380, ORF00381, ORF00382, ORF00383, ORF00394, ORF00395,
ORF00396, ORF00397, ORF00399, ORF00400, ORF00401, ORF00402, ORF00403, ORF00404, ORF00407, 15
ORF00415, ORF00416, ORF00417, ORF00418, ORF00419, ORF00433, ORF00434, ORF00435, ORF00436,
ORF00437, ORF00442, ORF00444, ORF00455, ORF00587, ORF00588, ORF00591, ORF00597, ORF00598,
ORF00599, ORF00600, ORF00631, ORF00644, ORF00646, ORF00647, ORF00648, ORF00649, ORF00650,
ORF00655, ORF00656, ORF00657, ORF00659, ORF00660, ORF00661, ORF00662, ORF00663, ORF00664,
ORF00665, ORF00666, ORF00667, ORF00668, ORF00669, ORF00670, ORF00671, ORF00672, ORF00673, 20
ORF00674, ORF00675, ORF00676, ORF00677, ORF00678, ORF00680, ORF00681, ORF00682, ORF00683,
ORF00685, ORF00687, ORF00773, ORF00786, ORF00787, ORF00788, ORF00789, ORF00790, ORF00791,
ORF00792, ORF00793, ORF00794, ORF00795, ORF00796, ORF00798, ORF00803, ORF00804, ORF00809,
ORF00810, ORF00838, ORF00839, ORF00857, ORF00864, ORF00883, ORF00884, ORF00885, ORF00886,
ORF00887, ORF00888, ORF00889, ORF00890, ORF00891, ORF00892, ORF00893, ORF00894, ORF00895, 25
ORF00896, ORF00897, ORF00898, ORF00899, ORF00900, ORF00901, ORF00902, ORF00903, ORF00904,
ORF00905, ORF00906, ORF00907, ORF00908, ORF00909, ORF00910, ORF00924, ORF00925, ORF00926,
ORF00948, ORF00956, ORF01031, ORF01032, ORF01033, ORF01034, ORF01035, ORF01036, ORF01037,
ORF01038, ORF01039, ORF01040, ORF01041, ORF01042, ORF01043, ORF01044, ORF01045, ORF01046,
ORF01047, ORF01048, ORF01052, ORF01053, ORF01054, ORF01055, ORF01056, ORF01057, ORF01058, 30
ORF01063, ORF01078, ORF01079, ORF01080, ORF01081, ORF01084, ORF01085, ORF01086, ORF01087,
ORF01088, ORF01089, ORF01090, ORF01091, ORF01092, ORF01093, ORF01094, ORF01095, ORF01096,
ORF01097, ORF01098, ORF01099, ORF01100, ORF01101, ORF01102, ORF01103, ORF01104, ORF01105,
ORF01106, ORF01107, ORF01108, ORF01109, ORF01110, ORF01111, ORF01112, ORF01113, ORF01114,
ORF01115, ORF01116, ORF01117, ORF01118, ORF01119, ORF01156, ORF01186, ORF01187, ORF01188, 35
ORF01190, ORF01191, ORF01192, ORF01193, ORF01194, ORF01195, ORF01196, ORF01199, ORF01200,
ORF01201, ORF01202, ORF01203, ORF01204, ORF01205, ORF01206, ORF01207, ORF01208, ORF01209,
ORF01210, ORF01211, ORF01212, ORF01213, ORF01214, ORF01215, ORF01216, ORF01217, ORF01218,
ORF01219, ORF01220, ORF01222, ORF01223, ORF01224, ORF01225, ORF01226, ORF01227, ORF01228,
ORF01236, ORF01252, ORF01253, ORF01254, ORF01255, ORF01256, ORF01257, ORF01258, ORF01259, 40
ORF01260, ORF01261, ORF01283, ORF01313, ORF01314, ORF01315, ORF01316, ORF01317, ORF01318,
ORF01319, ORF01320, ORF01321, ORF01322, ORF01323, ORF01325, ORF01330, ORF01331, ORF01332,
ORF01333, ORF01334, ORF01335, ORF01336, ORF01337, ORF01338, ORF01339, ORF01340, ORF01341,
ORF01342, ORF01343, ORF01344, ORF01345, ORF01346, ORF01347, ORF01348, ORF01349, ORF01350,
ORF01351, ORF01352, ORF01353, ORF01354, ORF01355, ORF01356, ORF01357, ORF01359, ORF01360, 45
ORF01361, ORF01365, ORF01366, ORF01367, ORF01368, ORF01371, ORF01373, ORF01374, ORF01375,
ORF01376, ORF01394, ORF01456, ORF01462, ORF01477, ORF01479, ORF01480, ORF01483, ORF01484,
ORF01485, ORF01486, ORF01487, ORF01488, ORF01490, ORF01491, ORF01492, ORF01493, ORF01494,
ORF01498, ORF01499, ORF01500, ORF01501, ORF01502, ORF01503, ORF01504, ORF01505, ORF01506,
ORF01507, ORF01508, ORF01509, ORF01510, ORF01511, ORF01512, ORF01513, ORF01514, ORF01518, 50
ORF01523, ORF01524, ORF01525, ORF01526, ORF01527, ORF01528, ORF01529, ORF01530, ORF01531,
ORF01532, ORF01533, ORF01534, ORF01535, ORF01536, ORF01537, ORF01538, ORF01539, ORF01540,
ORF01541, ORF01542, ORF01543, ORF01550, ORF01551, ORF01552, ORF01553, ORF01554, ORF01555,
ORF01556, ORF01557, ORF01558, ORF01559, ORF01560, ORF01561, ORF01562, ORF01563, ORF01564,
ORF01565, ORF01566, ORF01567, ORF01568, ORF01569, ORF01570, ORF01571, ORF01572, ORF01573, 55
ORF01574, ORF01575, ORF01576, ORF01577, ORF01578, ORF01583, ORF01588, ORF01589, ORF01590,
ORF01591, ORF01592, ORF01593, ORF01609, ORF01610, ORF01611, ORF01612, ORF01613, ORF01630,
ORF01631, ORF01637, ORF01651, ORF01655, ORF01656, ORF01657, ORF01658, ORF01659, ORF01660,
ORF01665, ORF01705, ORF01722, ORF01723, ORF01724, ORF01725, ORF01766, ORF01767, ORF01768,
ORF01769, ORF01770, ORF01790, ORF01810, ORF01812, ORF01813, ORF01815, ORF01816, ORF01817, 60
ORF01818, ORF01819, ORF01820, ORF01821, ORF01822, ORF01823, ORF01824, ORF01825, ORF01826,
ORF01827, ORF01828, ORF01829, ORF01830, ORF01831, ORF01832, ORF01833, ORF01834, ORF01835,
ORF01836, ORF01837, ORF01838, ORF01840, ORF01842, ORF01843, ORF01844, ORF01845, ORF01846,
ORF01847, ORF01848, ORF01849, ORF01850, ORF01852, ORF01853, ORF01854, ORF01855, ORF01856,
ORF01857, ORF01861, ORF01862, ORF01865, ORF01891, ORF01923, ORF01926, ORF01927, ORF01928, 65
ORF01929, ORF01930, ORF01931, ORF01932, ORF01946, ORF01953, ORF01955, ORF01956, ORF01987,
(continuado)
ORF02112, ORF02266, ORF02289, ORF02295, ORF02296, ORF02297, ORF02298, ORF02299, ORF02300,
ORF02301, ORF02302, ORF02303, ORF02304, ORF02305, ORF02306, ORF02307, ORF02308, ORF02309, 5
ORF02310, ORF02311, ORF02312, ORF02313, ORF02314, ORF02315, ORF02327, ORF02338, ORF02351,
ORF02352, ORF02353, ORF02354, ORF02355, ORF02356, ORF02358, ORF02359, ORF02361, ORF02362,
ORF02363, ORF02364, ORF02365, ORF02366, ORF02367, ORF02368, ORF02369, ORF02370, ORF02371,
ORF02372, ORF02373, ORF02374, ORF02375, ORF02382, ORF02383, ORF02384, ORF02385, ORF02386,
ORF02387, ORF02388, ORF02389, ORF02390, ORF02392, ORF02393, ORF02394, ORF02395, ORF02396, 10
ORF02400, ORF02401, ORF02402, ORF02403, ORF02404, ORF02405, ORF02413, ORF02414, ORF02415,
ORF02419, ORF02420, ORF02421, ORF02422, ORF02423, ORF02424, ORF02425, ORF02429, ORF02432,
ORF02436, ORF02437, ORF02438, ORF02439, ORF02440, ORF02441, ORF02442, ORF02443, ORF02444,
ORF02445, ORF02446, ORF02447, ORF02448, ORF02449, ORF02450, ORF02451, ORF02452, ORF02453,
ORF02454, ORF02455, ORF02456, ORF02457, ORF02458, ORF02459, ORF02460, ORF02461, ORF02462, 15
ORF02464, ORF02465, ORF02466, ORF02467, ORF02468, ORF02469, ORF02470, ORF02471, ORF02472,
ORF02501, ORF02502, ORF02503, ORF02504, ORF02505, ORF02506, ORF02507, ORF02533, ORF02534,
ORF02552, ORF02553, ORF02554, ORF02555, ORF02582, ORF02583. ORF02595, ORF02614, ORF02628,
ORF02633, ORF02699, ORF02735, ORF02788, ORF02789, ORF02790, ORF02791, ORF02792, ORF02793,
ORF02794, ORF02795, ORF02796, ORF02797, ORF02798, ORF02799, ORF02800, ORF02801, ORF02802, 20
ORF02803, ORF02804, ORF02805, ORF02806, ORF02807, ORF02808, ORF02809, ORF02810, ORF02811,
ORF02812, ORF02813, ORF02814, ORF02815, ORF02816, ORF02828, ORF02829, ORF02830, ORF02831,
ORF02832, ORF02833, ORF02834, ORF02835, ORF02844, ORF02845, ORF02846, ORF02847, ORF02848,
ORF02849, ORF02850, ORF02851, ORF02852, ORF02853, ORF02854, ORF02855, ORF02856, ORF02857,
ORF02858, ORF02859, ORF02860, ORF02861, ORF02862, ORF02863, ORF02864, ORF02865, ORF02866, 25
ORF02867, ORF02868, ORF02869, ORF02870, ORF02871, ORF02872, ORF02873, ORF02874, ORF02875,
ORF02876, ORF02877, ORF02878, ORF02879, ORF02880, ORF02881, ORF02882, ORF02883, ORF02884,
ORF02885, ORF02886, ORF02887, ORF02888, ORF02889, ORF02890, ORF02891, ORF02931, ORF03011,
ORF03012, ORF03013, ORF03014, ORF03015, ORF03016, ORF03017, ORF03018, ORF03019, ORF03020,
ORF03021, ORF03022, ORF03023, ORF03024, ORF03025, ORF03026, ORF03027, ORF03028, ORF03029, 30
ORF03030, ORF03031, ORF03032, ORF03033, ORF03034, ORF03035, ORF03036, ORF03037, ORF03038,
ORF03039, ORF03040, ORF03041, ORF03042, ORF03043, ORF03044, ORF03045, ORF03046, ORF03047,
ORF03048, ORF03049, ORF03053, ORF03054, ORF03055, ORF03056, ORF03114, ORF03130, ORF03131,
ORF03132, ORF03133, ORF03162, ORF03163, ORF03164, ORF03165, ORF03166, ORF03167, ORF03173,
ORF03174, ORF03175, ORF03176, ORF03191, ORF03192, ORF03206, ORF03207, ORF03235, ORF03236, 35
ORF03252, ORF03262, ORF03263, ORF03279, ORF03296, ORF03297, ORF03298, ORF03299, ORF03300,
ORF03325, ORF03340, ORF03341, ORF03342, ORF03343, ORF03344, ORF03345, ORF03346, ORF03347,
ORF03348, ORF03349, ORF03350, ORF03351, ORF03352, ORF03353, ORF03354, ORF03355, ORF03356,
ORF03357, ORF03358, ORF03359, ORF03360, ORF03361, ORF03362, ORF03363, ORF03364, ORF03365,
ORF03400, ORF03415, ORF03453, ORF03454, ORF03455, ORF03456, ORF03457, ORF03458, ORF03459, 40
ORF03465, ORF03469, ORF03499, ORF03500, ORF03501, ORF03502, ORF03503, ORF03504, ORF03505,
ORF03506, ORF03507, ORF03508, ORF03509, ORF03510, ORF03511, ORF03512, ORF03515, ORF03516,
ORF03517, ORF03518, ORF03519, ORF03520, ORF03521, ORF03522, ORF03526, ORF03535, ORF03536,
ORF03537, ORF03538, ORF03539, ORF03540, ORF03541, ORF03542, ORF03574, ORF03575, ORF03576,
ORF03577, ORF03578, ORF03579, ORF03580, ORF03589, ORF03592, ORF03593, ORF03594, ORF03595, 45
ORF03596, ORF03597, ORF03606, ORF03607, ORF03608, ORF03610,
50
55
60
65
ORF03612, ORF03613, ORF03614, ORF03615, ORF03616, ORF03617, ORF03619, ORF03695, ORF03696,
ORF03817, ORF03818, ORF03819, ORF03820, ORF03821, ORF03822, ORF03823, ORF03824, ORF03825,
ORF03826, ORF03975, ORF03991, ORF03992, ORF03993, ORF03994, ORF03995, ORF03996, ORF03997,
ORF03998, ORF03999, ORF04000, ORF04031, ORF04032, ORF04033, ORF04034, ORF04035, ORF04036,
ORF04058, ORF04059, ORF04060, ORF04061, ORF04062, ORF04063, ORF04064, ORF04073, ORF04083, 5
ORF04084, ORF04085, ORF04086, ORF04087, ORF04088, ORF04089, ORF04090, ORF04091, ORF04130,
ORF04162, ORF04163, ORF04164, ORF04171, ORF04183, ORF04184, ORF04203, ORF04204, ORF04205,
ORF04206, ORF04207, ORF04208, ORF04209, ORF04211, ORF04224, ORF04225, ORF04237, ORF04238,
ORF04239, ORF04240, ORF04241, ORF04242, ORF04243, ORF04244, ORF04247, ORF04250, ORF04282,
ORF04302, ORF04390, ORF04391, ORF04398, ORF04402, ORF04403, ORF04404, ORF04416, ORF04417, 10
ORF04418, ORF04419, ORF04420, ORF04421, ORF04422, ORF04423, ORF04424, ORF04425, ORF04426,
ORF04427, ORF04428, ORF04429, ORF04430, ORF04434, ORF04435, ORF04436, ORF04437, ORF04438,
ORF04439, ORF04451, ORF04476, ORF04477, ORF04478, ORF04479, ORF04480, ORF04481, ORF04482,
ORF04483, ORF04484, ORF04489, ORF04490, ORF04500, ORF04542, ORF04543, ORF04544, ORF04545,
ORF04546, ORF04547, ORF04552, ORF04569, ORF04572, ORF04573, ORF04608, ORF04612, ORF04623, 15
ORF04626, ORF04627, ORF04628, ORF04629, ORF04630, ORF04631, ORF04632, ORF04661, ORF04662,
ORF04663, ORF04664, ORF04665, ORF04668, ORF04669, ORF04671, ORF04672, ORF04673, ORF04674,
ORF04675, ORF04676, ORF04677, ORF04678, ORF04679, ORF04691, ORF04692, ORF04693, ORF04694,
ORF04708, ORF04709, ORF04710, ORF04711, ORF04712, ORF04728, ORF04844, ORF04845, ORF04846,
ORF04847, ORF04848, ORF04849, ORF04850, ORF04851, ORF04882, ORF04890, ORF04891, ORF04892, 20
ORF04893, ORF04894, ORF04895, ORF04898, ORF04900, ORF04915, ORF04916, ORF04917, ORF04918,
ORF04919, ORF04920, ORF04921, ORF04922, ORF04923, ORF04924, ORF04925, ORF04926, ORF04927,
ORF04928, ORF04929, ORF04930, ORF04946, ORF04947, ORF04948, ORF04949, ORF04950, ORF04951,
ORF04952, ORF04953, ORF04954, ORF04955, ORF04956, ORF04957, ORF04958, ORF04959, ORF04960,
ORF04961, ORF04962, ORF04963, ORF04964, ORF04966, ORF04974, ORF04978, ORF04979, ORF04981, 25
ORF04989, ORF04990, ORF04991, ORF04992, ORF04993, ORF04995
TABLA 4
30
Proteína
SEQ ID Anotación Psort TMD CFT073 %ID
ORF03526
7051 + 7052 Factor de colonización accesoria AcfD precursor I 0 upec-2704 45,3
ORF01339
2677 + 2678 Ujier fimbrial F1C I 1 upec-1199 99,4
ORF00256
511 + 512 Chaperona pilin ecpD2 I 1 upec-0166 100
ORF01346
2691 + 2692 proteína IroN O 0 upec-1207 99,3
ORF04084
8167 + 8168 receptor de membrana externa hermin O 0 upec-4213 99,7
ORF02374
4747 + 4748 proteína receptor de familia OMR pesticina-yersiniabactina O 0 upec-2371 100
ORF03502
7003 + 7004 proteína de polisacárido biosíntesis, putativo O 0 upec-3606 upec-3606 99.5 99,5
ORF02298
4595 + 4596 proteína hipotética C 0 upec-5009 30
ORF01228
2455 + 2456 CdtC O 0 upec-1086 30,3
ORF01227
2453 + 2454 CdtB I 1 upec-0679 31,9
ORF02314
4627 + 4628 gpH I 1 upec-0941 48,8
ORF02850
5699 + 5700 proteína de transferencia ADN C 0 upec-4881 21,2
35
Columnas:
 PSORT: Ubicación predicha por el algoritmo PSORT. I = membrana interna; O = membrana externa; P = periplasmo; C = citoplasmo
 TMD: número de dominios de transmembrana
 %ID: porcentaje de residuos idénticos a lo largo de alineación 5
REFERENCIAS (el contenido de las cuales se incorpora aquí por referencia)
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5482936, 5494916, 5525612, 6083505, 6440992, 6627640, 6656938, 6660735, 6660747, 6664260, 6664264, 10
6664265, 6667312, 6670372, 6677347, 6677348, 6677349, 6683088, 6703402, 6743920, 6800624, 6809203,
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Claims (12)

  1. Reivindicaciones
    1. Un polipéptido que comprende: (a) una secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 7052; (b) una secuencia de aminoácido, teniendo al menos el 80% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052; (c) una secuencia de aminoácidos que es un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052; o (d) una 5 secuencia de aminoácidos con al menos el 80% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052, incluyendo un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052, para su uso en la medicina.
  2. 2. Un polipéptido que comprende (a) la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052; (b) una secuencia de aminoácidos que tengan al menos el 90% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052; o (c) una secuencia de 10 aminoácidos que tengan al menos el 90% de identidad de secuencia a SEQ ID NO: 7052, incluyendo un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052, o cuyo polipéptido es un fragmento de la SEQ ID NO: 7052 que consta de 40 o más aminoácidos consecutivos a partir de la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052.
    15
  3. 3. El polipéptido de la reivindicación 1 para el uso de la reivindicación 1, o el polipéptido de la reivindicación 2, en el que dicho fragmento se compone de al menos un epítopo de células B de SEQ ID NO: 7052.
  4. 4. El polipéptido de la reivindicación 1 o 3 para el uso de la reivindicación 1 o 3, o el polipéptido de la reivindicación 2 o 3, en el que dicho fragmento se compone de (a) el péptido de señal N-terminal de dicho polipéptido, (b) dicho 20 polipéptido sin su péptido de señal N-terminal, o (c) dicho polipéptido sin 1-10 de su residuo de aminoácido(s) N-terminal.
  5. 5. Ácido nucleico que comprende: (a) la secuencia nucleotídica SEQ ID NO: 7051; (b) una secuencia de nucleótidos que tengan al menos el 90% de identidad de secuencia SEQ ID NO: 7052; o (c) una secuencia de aminoácidos que 25 tengan al menos el 90% de identidad de secuencia a SEQ ID NO: 7052, incluyendo un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de SEQ ID NO: 7052, o ácido nucleico que codifica un fragmento de la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052 que consta de 7 o más aminoácidos consecutivos de dicha secuencia de aminoácidos.
    30
  6. 6. Ácido nucleico según la reivindicación 5, que codifica el polipéptido de las reivindicaciones 2-4.
  7. 7. Un anticuerpo monoclonal específico para la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 7052.
  8. 8. Una composición farmacéutica que comprende el polipéptido de las reivindicaciones 1 a 4, el ácido nucleico de la 35 reivindicación 5 ó 6, o el anticuerpo de la reivindicación 7, en mezcla con un portador farmacéuticamente aceptable.
  9. 9. Una composición farmacéutica que comprende dos o más polipéptidos de las reivindicaciones 1 a 4, en mezcla con un portador farmacéuticamente aceptable.
    40
  10. 10. La composición de la reivindicación 8 o reivindicación 9, que consta además de un coadyuvante de la vacuna.
  11. 11. El uso del polipéptido de las reivindicaciones 1 a 4, o el ácido nucleico de la reivindicación 5 ó 6, o el anticuerpo de la reivindicación 7, o la composición
    45
    inmunogénica de las reivindicaciones 8 a 10, en la fabricación de un medicamento para la cría de una respuesta inmune en el paciente.
  12. 12. El uso de la reivindicación 11, en la que la respuesta inmune protectora contra la infección de E. coli intestinal patógena (ExPEC), y en particular contra una infección asociada a E. coli de meningitis/sepsis (MNEC). 50
    55
    60
    65
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