ES2544645T3 - Variantes de fitasa de Hafnia - Google Patents

Variantes de fitasa de Hafnia

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ES2544645T3
ES2544645T3 ES13170321.7T ES13170321T ES2544645T3 ES 2544645 T3 ES2544645 T3 ES 2544645T3 ES 13170321 T ES13170321 T ES 13170321T ES 2544645 T3 ES2544645 T3 ES 2544645T3
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ES
Spain
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phytase
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dna
eleven
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Soeren Flensted Lassen
Lars Kobberoee Skov
Leonardo De Maria
Tomoko Matsui
Allan Noergaard
Jesper Vind
Esben Peter Friis
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Novozymes AS
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
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    • A23K20/10Organic substances
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    • AHUMAN NECESSITIES
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Abstract

Método para producir una variante de fitasa de una fitasa de referencia o progenitora, con propiedades mejoradas con respecto al perfil de pH y con al menos 90 % de identidad con SEQ ID N.º:2, donde dicha variante muestra al menos una sustitución, inserción o deleción en una o varias de las posiciones: 92, 48, 26, 45, 49, 68, 100, 162, 217, 228, 304, 308 y 358, donde las posiciones corresponden a las posiciones de la fitasa con los aminoácidos 1-413 de SEQ ID N.º:2, el método comprende a) mutación del ADN o gen que codifica la fitasa progenitora de una manera por la cual el ADN o el gen codifican para dicha sustitución, inserción y/o deleción, b) conexión operativa de dicho ADN o gen a una o más secuencias de control que dirigen la producción de la fitasa en un huésped de expresión adecuado para crear un constructo de ADN o un vector de expresión recombinante, c) transferencia de dicho constructo o vector a un huésped adecuado, d) cultivo de dicho huésped para producir la variante de fitasa y e) recuperación de la fitasa.

Description

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Modificaciones, tal como sustituciones, deleciones, inserciones
[0051] Una variante de fitasa puede comprender varios tipos de modificaciones en relación a un molde (es decir, una fitasa de referencia o progenitora, o una secuencia de aminoácidos comparativa tal como la SEQ ID N.º:2): un
5 aminoácido puede ser sustituido por otro aminoácido; un aminoácido puede ser eliminado; un aminoácido puede ser insertado entre dos residuos; al igual que cualquier combinación de cualquier número de modificaciones de este tipo. En el presente contexto, el término "inserción" tiene como objetivo abarcar también las extensiones N-y/o C-terminales.
[0052] La nomenclatura general usada en este documento para una única modificación es la siguiente: XDcY, donde "X"
10 e "Y" designan independientemente un código de aminoácido de una sola letra, o un "*" (deleción de un aminoácido), "D" designa un número y "c" designa un contador alfabético (a, b, c, etcétera), que únicamente está presente en inserciones. Se hace referencia a la Tabla 1 a continuación que describe ejemplos puramente hipotéticos de la aplicación de esta nomenclatura para varios tipos de modificaciones.
15 Tabla 1 Ejemplos de nomenclatura
Tipo
Descripción Ejemplo
Sustitución
X=Aminoácido en molde D=Posición en el molde c vacío Y=Amino ácido en la variante G80A
Inserción
X="*" D=Posición en el molde antes de la inserción c="a" para primera inserción a esta posición, "b" para siguiente, etc. *80aT *80bY *85aS
Deleción
X=Aminoácido en molde D=Posición en el molde c vacío Y="*" V81*
Extensión N-terminal
Inserciones en la posición "0". *0aA *0bT *0cG
Extensión C-terminal
Inserciones después del aminoácido N-terminal *275aS *275bT
[0053] Como se explica más arriba, el número de posición ("D") se cuenta a partir del primer residuo de aminoácido de la SEQ ID N.º:2.
20 [0054] Las diferentes alteraciones en la misma secuencia se separan por "/" (barra), por ejemplo, la designación"1*/2*/3*" significa que los aminoácidos en el número de posición 1, 2 y 3 se eliminan todos y la designación
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temperatura de 20-90° C (en pasos de 10° C). Un tampón preferido es en un tampón de 0,25 M de Na-acetato pH 5,5. La actividad a cada temperatura es indicada preferiblemente como actividad relativa (en %) normalizada al valor a temperatura óptima. La temperatura óptima es la temperatura dentro de las temperaturas evaluadas (es decir, aquellas con saltos de 5-10° C) donde la actividad es máxima.
Perfil de pH
[0085] Si una fitasa de la invención tiene o no un perfil de pH alterado en comparación con una fitasa de referencia se puede determinar como se describe en los Ejemplos. Por consiguiente, una fitasa de la invención tiene un perfil de pH alterado en comparación con una fitasa de referencia, donde el perfil de pH se determina como actividad de fitasa como una función de pH en fitato de sodio a 37° C en el intervalo de pH de 2, 0 a 7,5 (en pasos de unidad de pH de 0,5). Un tampón preferido es un cóctel de 50 mM de glicina, 50 mM de ácido acético y 50 mM de Bis-Tris. La actividad en cada pH es indicada preferiblemente como actividad relativa (en %) normalizada al valor de pH óptimo.
[0086] Un ejemplo de un perfil de pH alterado es donde la curva del pH (actividad relativa como función de pH) se desplaza hacia un pH más alto, o más bajo. Las sustituciones preferidas que proporcionan un cambio de 0,5 unidades de pH a un pH más alto en comparación con la fitasa de referencia de la SEQ ID N.º:2. No obstante, para ciertos fines, puede ser preferible proporcionar un cambio de 0,5 unidades de pH hacia un pH inferior en comparación con la fitasa de referencia de SEQ ID N.º2.
[0087] Otro ejemplo de un perfil de pH alterado es donde el pH óptimo es cambiado, en dirección hacia arriba o hacia abajo.
[0088] En una forma de realización particular, la fitasa de la invención puede tener un perfil de pH alterado en comparación con una fitasa de referencia. Más en particular, el perfil de pH está modificado en el intervalo de pH de 3,55,5. Todavía más en particular, la actividad a pH 4,0; 4,5; 5,0 y/o 5,5 está a un nivel de al menos un 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, o al menos un 95% de la actividad al pH óptimo.
Actividad específica
[0089] En particular, la fitasa de la invención puede tener una actividad específica mejorada en relación a una fitasa de referencia. Más en particular, la actividad específica de una fitasa es al menos un 105%, en relación a la actividad específica de una fitasa de referencia determinada por el mismo procedimiento. En otras formas de realización particulares adicionales, la actividad específica relativa es al menos 110, 115, 120, 125, 130, 140, 145, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 220, 240, 260, 280, 300, 350 o incluso un 400%, todavía en relación a la actividad específica de la fitasa de referencia como se determina mediante el mismo procedimiento.
[0090] En la alternativa, el término actividad específica alta se refiere a una actividad específica de al menos 200 FYT/mg de proteína enzimática (PE). En particular, la actividad específica es al menos 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1500, 1600, 1700, 1800, 1900, 2000, 2100, 2200, 2300, 2400, 2500, 2600, 2700, 2800, 2900 o 3000 FYT/mg de PE.
[0091] La actividad específica se mide en muestras altamente purificadas (un gel de poliacrilamida SDS debería mostrar la presencia de un único componente). La concentración de proteína enzimática se puede determinar por análisis de aminoácido y la actividad de fitasa en las unidades de FYT se puede determinar como se describe en el Ejemplo 1. La actividad específica es una característica de la variante de fitasa específica en cuestión y se calcula como la actividad de fitasa medida en unidades FYT por mg de proteína enzimática de variante de fitasa. Véanse los Ejemplos para obtener más detalles.
[0092] Una actividad específica modificada se espera de las siguientes variantes de la fitasa de la SEQ ID N.º:2, en la que, en orden de preferencia, el bucle entre los residuos 115 y 127 (HQQNTQQADPL) que da al sitio activo es sustituido por un bucle seleccionado de, por ejemplo, HQEKMGTMDPT, HQQDIKQVDSL, HQPEIGKMDPV, TQADTSSPDPL, HQQDIKQADPL, TQTDTSSPDPL, NQADLKKTDPL.
Rendimiento en el alimento para animales
[0093] Una fitasa de la invención puede tener un rendimiento mejorado en el alimento para animales en comparación con una fitasa de referencia. El rendimiento en el alimento para animales se puede determinar por el modelo in vitro de los Ejemplos. Por consiguiente, la fitasa de la invención tiene un rendimiento mejorado en el alimento para animales, donde el rendimiento se determina en un modelo in vitro, preparando muestras de alimento para animales compuestas por un 30% de harina de soja y 70% de harina de maíz con CaCl2 añadido a una concentración de 5 g de calcio por kg
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Gly Ser, Thr
355
Val Ser, Thr
382
Pro Ser, Thr
Creación de nuevos sitios de glicosilación del tipo XXT [0110]
Número res.
Tipo res. Cambio a
33
Asp Asn
48
Tyr Asn
93
Gln Asn
96
Arg Asn
118
Gln Asn
320
Thr Asn
Creación de nuevos sitios de glicosilación del tipo XXS [0111]
Número res.
Tipo res. Cambiar a
138
Asp Asn
162
Gln Asn
175
Pro Asn
190
Asp Asn
246
Trp Asn
293
Asp Asn
383
Gly Asn
394
Pro Asn
401
Leu Asn
403
Ser Asn
Estabilidad del vapor
10 [0112] La termoestabilidad es un parámetro importante, pero asociada a esta la estabilidad del vapor también es importante. En este aspecto, se hace referencia al Ejemplo 8 más abajo.
Variantes hipoalergénicas
15 [0113] Las fitasas de la presente invención pueden ser (también) variantes hipoalergénicas, diseñadas para recurrir a una respuesta inmunológica reducida cuando es expuesta a animales, incluido el hombre. El término respuesta
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[0140] En el aspecto más preferido, la célula huésped de levadura es una célula Pichia pastoris, Pichia methanolica, Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces diastaticus, Saccharomyces douglasii, Saccharomyces kluyveri, Saccharomyces norbensis o Saccharomyces oviformis. En otro aspecto más preferido, la célula huésped de levadura es una célula de Kluyveromices lactis. En otro aspecto más preferido, la célula huésped de levadura es una célula de Yarrowia lipolytica.
[0141] En otro aspecto más preferido, la célula huésped fúngica es una célula fúngica filamentosa. Los "hongos filamentosos" incluyen todas las formas filamentosas de la subdivisión Eumycota y Oomycota (según es definido por Hawksworth et al., 1995, supra). Los hongos filamentosos están generalmente caracterizados por una pared micelial compuesta por quitina, celulosa, glucano, quitosano, manano y otros polisacáridos complejos. El crecimiento vegetativo es por elongación hifal y el catabolismo de carbono es estrictamente aeróbico. En cambio, el crecimiento vegetativo por levaduras tales como Saccharomyces cerevisiae es por injerto de un talo unicelular y el catabolismo de carbono puede ser fermentativo.
[0142] En un aspecto aún más preferido, la célula huésped fúngica filamentosa es una célula de Acremonium, Aspergillus, Aureobasidium, Bjerkandera, Ceriporiopsis, Coprinus, Coriolus, Cryptococcus, Filobasidium, Fusarium, Humicola, Magnaporthe, Mucor, Myceliophthora, Neocallimastix, Neurospora, Paecilomyces, Penicillium, Phanerochaete, Phlebia, Piromyces, Pleurotus, Schizophyllum, Talaromyces, Thermoascus, Thielavia, Tolypocladium, Trametes o Trichoderma.
[0143] En el aspecto más preferido, la célula huésped fúngica filamentosa es una célula de Aspergillus awamori, Aspergillus fumigatus, Aspergillus foetidus, Aspergillus japonicus, Aspergillus nidulans, Aspergillus niger o Aspergillus oryzae. En otro aspecto más preferido, la célula huésped fúngica filamentosa es una célula de Fusarium bactridioides, Fusarium cerealis, Fusarium crookwellense, Fusarium culmorum, Fusarium graminearum, Fusarium graminum, Fusarium heterosporum, Fusarium negundi, Fusarium oxysporum, Fusarium reticulatum, Fusarium roseum, Fusarium sambucinum, Fusarium sarcochroum, Fusarium sporotrichioides, Fusarium sulphureum, Fusarium torulosum, Fusarium trichothecioides,o Fusarium venenatum. En otro aspecto más preferido, la célula huésped fúngica filamentosa es una cepa de célula de Bjerkandera adusta, Ceriporiopsis aneirina, Ceriporiopsis aneirina, Ceriporiopsis caregiea, Ceriporiopsis gilvescens, Ceriporiopsis pannocinta, Ceriporiopsis rivulosa, Ceriporiopsis subrufa, o Ceriporiopsis subvermispora, Coprinus cinereus, Coriolus hirsutus, Humicola insolens, Humicola lanuginosa, Mucor miehei, Myceliophthora thermophila, Neurospora crassa, Penicillium purpurogenum, Phanerochaete chrysosporium, Phlebia radiata, Pleurotus eryngii, Thielavia terrestris, Trametes villosa, Trametes versicolor, Trichoderma harzianum, Trichoderma koningii, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma reesei o Trichoderma viride.
[0144] Las células fúngicas se pueden transformar mediante un proceso que implica la formación de protoplasto, la transformación de los protoplastos y la regeneración de la pared celular en un modo conocido per se. Los procedimientos adecuados para la transformación de las células huéspedes de Aspergillus y Trichoderma están descritos en EP 238 023 y Yelton et al., 1984, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 81: 1470-1474. Los métodos adecuados para la transformación de especies de Fusarium son descritos por Malardier et al., 1989, Gene
78: 147-156 y WO 96/00787. La levadura puede ser transformada usando los procedimientos descritos por Becker y Guarente, en Abelson, J.N. y Simon, M.I., editores, Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in Enzymology, volumen 194, págs. 182-187, Academic Press, Inc., Nueva York; Ito et al., 1983, Journal of Bacteriology
153: 163; y Hinnen et al., 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 1920.
Métodos de producción
[0145] La presente invención también se refiere a métodos para producir una fitasa de la presente invención que comprende (a) cultivo de una célula huésped bajo condiciones propicias para la producción de la fitasa; y (b) recuperación de la fitasa.
[0146] En los métodos de producción de la presente invención, las células se cultivan en un medio nutritivo adecuado para la producción de los polipéptidos usando métodos bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, la célula se puede cultivar por cultivo en matraz de agitación y fermentación a gran o pequeña escala (incluidas fermentaciones continuas de lote, lote alimentado o en estado sólido) en el laboratorio o fermentadores industriales realizados en un medio adecuado y bajo condiciones que permitan al polipéptido ser expresado y/o aislado. El cultivo se desarrolla en un medio nutritivo adecuado que comprende fuentes de carbono y nitrógeno y sales inorgánicas, usando procedimientos conocidos en la técnica. Hay disponibles medios adecuados de proveedores comerciales o se pueden preparar según composiciones publicadas (por ejemplo, en catálogos de la American Type Culture Collection). Si el polipéptido es secretado en el medio nutritivo, el polipéptido se puede recuperar directamente del medio. Si el polipéptido no es secretado, se puede recuperar de lisatos celulares.
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de reactivo de parada (el reactivo de parada es 0,1 M de tetraborato de sodio en agua) y la absorbancia a 405 nm se mide en un espectrofotómetro de placa de microtitulación. Una unidad de fosfatasa se define como la actividad enzimática que libera 1 micromol de fosfato/min bajo las condiciones de reacción dadas (tampón ciego sustraído). Se determina que la absorbancia de 1 micromol de p-nitrofenol es 56 AU (AU= unidades de absorbancia) bajo condiciones de ensayo.
Determinación de actividad de fitasa
[0209] 75 microlitos de solución enzimática con fitasa, diluidos apropiadamente (por ejemplo, en 0 25 M de acetato sódico, 0,005% (p/v) Tween-20. pH 5,5), se dispensan en un pocillo de placa de microtitulación, por ejemplo, NUNC 269620 y se añaden 75 microlitros de sustrato (preparados disolviendo 100 mg de fitato de sodio de arroz (Aldrich Cat.No. 274321) en 10 ml 0,25 M de tampón de acetato de sodio, pH 5,5). La placa se sella y se incuba 15 min. agitada a 750 r.p.m. a 37° C. Después de la incubación, se añaden 75 microlitros de reactivo de parada (el reactivo de parada se prepara mezclando 10 ml de solución de molibdato (10% (p/v) de hepta-molibdato de amonio en 0,25% (p/v) de solución de amoníaco); 10 ml de vanadato de amonio (0,24% producto comercial de Bie&Berntsen, Cat.No. LAB17650) y 21,7 % (p/v) de ácido nítrico) y la absorbancia a 405 nm se mide en un espectrofotómetro de placa de microtitulación. La actividad de fitasa se expresa en la unidad de FYT, siendo un FYT la cantidad de enzima que libera 1 microml de ortofosfato inorgánico por minuto bajo las condiciones anteriores. Un valor absoluto para la actividad de fitasa medida se obtiene por referencia a una curva estándar preparada a partir de diluciones apropiadas de fosfato inorgánico o por referencia a una curva estándar hecha de diluciones de una preparación de enzima de fitasa con actividad conocida (tal preparación enzimática estándar con una actividad conocida está disponible a petición de Novozymes A/S, Krogshoejvej 36; DK-2880 Bagsvaerd).
Ejemplo 2: actividad específica
[0210] La actividad específica de una variante de fitasa se determina en muestras altamente purificadas dializadas contra 250 mM de acetato sódico, pH 5,5. La pureza se controla previamente en un gel de poliacrilamida SDS que muestra la presencia de solo un componente.
[0211] La concentración de proteína se determina mediante el análisis de aminoácidos de la siguiente manera: una alícuota de la muestra es hidrolizada en 6N HCl, 0,1 % de fenol durante 16 h a 110° C en un tubo de vidrio evacuado. Los aminoácidos resultantes son cuantificados usando un sistema de análisis de aminoácidos Applied Biosystems 420A accionado según las instrucciones del fabricante. A partir de las cantidades de los aminoácidos se puede calcular la masa -y por lo tanto también la concentración-de proteína en la alícuota hidrolizada.
[0212] La actividad de fitasa se determina en las unidades de FYT como se describe en el Ejemplo 1 ("Determinación de la actividad de fitasa") y la actividad específica se calcula como la actividad de fitasa medida en unidades de FYT por mg de proteína enzimática de variante de fitasa.
Ejemplo 3: estabilidad de temperatura
Cepas y plásmidos
[0213] Se utilizó E.coli DH12S (disponible de Gibco BRL) para el rescate de plásmido de levadura.
[0214] pJHP000 es un vector transportador de S. cerevisiae y E.coli bajo el control de promotor TPI, construido a partir de pJC039 descrito en WO 01/92502, en el cual se ha insertado el gen de fitasa de Hafnia alvei.
[0215] Saccharomyces cerevisiae YNG318: MATa Dpep4[cir+] ura3-52, leu2-D2, his 4-539 se utilizó para la expresión de variantes de fitasa. Está descrito en J. Biol. Chem. 272 (15), págs 9720-9727, 1997.
Medios y sustratos
[0216] 10X Solución Basal: 66,8 g/l base nitrogenada de levadura sin aminoácidos (DIFCOI, 100 g/l succinato, 60 g/l NaOH.
[0217] Glucosa SC: 100 ml/l 20% glucosa (es decir, una concentración final de 2% = 2 g/100ml), 4 ml/l 5% treonina, 10 ml/l 1% triptófano, 25 ml/l 20% casamino ácidos, 100 ml/l 10 X solución basal. La solución es esterilizada usando un
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filtro de un tamaño de poro de 0,20 µm. Agar y H2O (aprox. 761 ml) se someten juntos a autoclave y la solución de glucosa SC separadamente esterilizada se añade a la solución de agar.
[0218] YPD: 20 g/l bacto peptona, 10 g/l extracto de levadura, 100 ml/l 20% glucosa 5 [0219] Solución de PEG/LiAc: 50ml 40% PEG4000, 1ml 5M acetato de litio
Manipulaciones de ADN
10 [0220] A menos que se declare de otra manera, las manipulaciones y transformaciones de ADN se realizaron usando métodos estándares de biología molecular como se describe en Sambrook et al. (1989) Molecular cloning: A laboratory manual, Cold Spring Harbor lab. Cold Spring Harbor, NY ; Ausubel, F. M. et al. (eds.) "Current protocols in Molecular Biology", John Wiley and Sons, 1995; Harwood, C. R. and Cutting, S. M. (eds.).
15 Transformación de levadura
[0221] La transformación de levadura se realizó por el método de acetato de litio. Mezclar 0,5 microL de vector (digerido por endonucleasas de restricción) y 1 microL de fragmentos de la PCR. Descongelar células competentes YNG318 en hielo. Mezclar 100µl de las células, la mezcla de ADN y 10µl de ADN portador (Clontech) en tubos de polipropileno de 20 12ml (Falcon 2059). Añadir 0,6 ml de solución de PEG/LiAc y mezclar suavemente. Incubar durante 30 min. a 30º C y 200 r.p.m. Incubar durante 30 min. a 42º C (choque térmico). Transferir a un tubo Eppendorf y centrifugar durante 5 seg. Eliminar el sobrenadante y redisolver en 3ml de YPD. Incubar la suspensión celular durante 45 min. a 200 r.p.m. a 30 º
C. Verter la suspensión en placas de glucosa SC e incubar a 30º C durante 3 días para formar colonias. El ADN total de
la levadura es extraído por medio del método de Robzik y Kassir descrito en Nucleic acids research vol. 20, No14 (1992) 25 3790.
Secuenciación del ADN
[0222] Una transformación de E. coli para la secuenciación de ADN fue obtenida por electroporación (BIO-RAD Gene
30 Pulser). Los plásmidos de ADN fueron preparados por medio de un método alcalino (Molecular Cloning, Cold Spring Harbor) o con el Qiagen® Plasmid Kit. Los fragmentos de ADN fueron recuperados del gel de agarosa por medio del kit de extracción en gel Qiagen. Se realizó la PCR con el PTC-200 DNA Engine. Se usó el ABI PRISMTM 310 Genetic Analyzer para determinar todas las secuencias de ADN.
35 Construcción de vector de expresión de fitasa
[0223] El gen de fitasa de Hafnia fue amplificado con los pares de cebadores (HafPhyF y HafPHyR). Los fragmentos de la PCR resultantes fueron introducidos en S. cerevisiae YNG318 con el vector pJC039 digerido con enzimas de restricción para eliminar la parte madura de gen de cutinasa de Humicola insolens.
40 HafPhyF (34mer) CTCCTGAACTTGTTGCCCGGTCGGATACAGCCCC HafPhyR (39mer) ATTACATGATGCGGCCCTCTAGATTAGGGGAGCTGACATG
45 [0224] Se recuperó el plásmido, que se denomina pJHP000 de los transformantes de levadura en las placas de glucosa SC y se determinó la secuencia interna para confirmar el gen de fitasa.
Construcción de librería de levadura y variantes dirigidas al sitio
50 [0225] Librería en levadura y variantes dirigidas se construyeron por el método SOE PCR (empalme por extensión por superposición, véase "PCR: A practical approach", p. 207-209, Oxford University Press, eds. McPherson, Quirke, Taylor), seguido de recombinación in vivo de levadura.
55 Cebadores generales para amplificación y secuenciación
[0226] Los cebadores siguientes se utilizan para hacer fragmentos de ADN que contienen cualquier fragmento mutado por el método SOE junto con cebadores degenerados (AM34 + cebador inverso y AM35 + cebador directo) o solo para amplificar un gen de asparaginasa entero (AM34 + AM35).
imagen19
imagen20
E13170321
04-08-2015 E13170321
020
D77G 46% a 72°C (WT26%)
021
D77W 40% a 72°C (WT26%)
023
T95A 44% a 72°C (WT26%)
024
E100W/H363R 42% a 72°C (WT26%)
025
D111S 69% a 72°C (WT26%)
027
D138V/Y48H 48% a 72°C (WT39%)
028-1
K234C 50% a 72°C (WT39%)
028-2
K234V 50% a 72°C (WT39%)
029
K251S 46% a 72°C (WT39%)
030
H363V 40% a 72°C (WT39%)
031
H363R 53% a 72°C (WT39%)
046-1
A132V/A217G 42% a 70°C (WT13%)
046-2
A132V/Q162R/Q181L/A217G 42% a 70°C (WT13%)
047
D293R 30% a 70°C (WT13%)
048
Q93E 22% a 70°C (WT13%)
050-1
P348R/H363R 30% a 70°C (WT13%)
050-2
P348S 30% a 70°C (WT13%)
051
Q69L 20% a 70°C (WT13%)
052
Q245E 19% a 70°C (WT13%)
053
Q9S/D92Y 42% a 70°C (WT13%)
054-2
D92Y/H115L 28% a 70°C (WT13%)
054-re1,2
D92Y/H115M 32% a 70°C (WT17%)
057
N78Q 56% a 70°C (WT28%)
058
K76V 57% a 70°C (WT28%)
061-1
G325K 47% a 70°C (WT28%)
062
E100W/A217G/H363R(reference) 63% a 72°C (WT17%)
063
A217G/K251S 40% a 72°C (WT17%)
064
E100W/A217G/K251S 38% a 72°C (WT17%)
065
E100W/K251S 26% a 72°C (WT17%)
066
A217G 29% a 72°C (WT10%)
067
E100W/I555V/A217G 45% a 72°C (WT9%)
068
Q9S/E100W/R160G/A217G/H363R 45% a 72°C (WT9%)
069
D92Y/E100W/A217G/H363R(reference) 79% a 72°C (WT9%)
070
E100W/H115M/A217G/H363R 41% a 72°C (WT9%)
071
E100W/A217G/P348R/H363R 63% a 72°C (WT9%)
072
Q9S/A89A/D92Y/H115M/A217G/H363R 67% a 72°C (WT9%)
073
A132T 21% a 72°C (WT16%)
Referencia=variante no. 62
075
N78Q/E100W/A217G/H363R 47% a 72°C (62 40%)
04-08-2015 E13170321
076
K76V/N78Q/E100W/A217G/H363R 47% a 72°C (62 40%)
077
D83G/E100W/A217G/H363R 39% a 72°C (62 40%)
078
E100W/Y179W/A217G/H363R 48% a 72°C (62 40%)
079
E100W/A217G/K234V/K251 E/I286T/H363R 60% a 72°C (62 40%)
081
E100W/A217G/K234V/P348R/H363R 50% a 72°C (62 35%)
082
Q9S/R18K/A89A/D92Y/H115M/A217G/K234V/ H363R 61% a 72°C (62 35%)
082v2-1
Q9S/D92Y/H115M/A217G/K234V/H363R 61 % a 72°C (62 35%)
083
Q9S/N78Q/D92Y/L112S/H115M/K234V/P348R/ H363R 39% a 72°C (62 35%)
084
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/Q162R/ Q181L/A217G/K234V/P348R(reference) 64% a 72°C (62 35%)
Referencia=WT y/o variante n.º 69
085
Q9S/E54C/D92Y/A101C/H143C/Q193R/I201C/ A217G/H363R 82% a 72°C (69 74% WT 14%)
086
E54C/N78S/D92Y/A101C/H143C/L199C/A217G/ H363R 74% a 72°C (wt 49% 69 80%)
088
E54C/A101C/M168V/A217G/H363R 33% a 72°C (62 36% 69 73%)
089-1
P82S/D92Y/E100W/H143C/I201C/A217G/H363R 65% a 72°C (62 36% 69 73%)
089-2
P82S/D92Y/E100W/H143C/I201C/A217G/H363R 65% a 72°C (62 36% 69 73%)
090
Q9S/N78Q//D92Y/L112S/H115M/A217G/K234V/ P348R/H363R 65% a 72°C (62 36% 69 73%)
091
D92Y/A217G/K234V/H363R 81% a 72°C (62 36% 69 73%)
092-1
Y64S/D92Y/E100W/Y179W/A217G/H363R 80% a 72°C (69 74% WT 14%)
092-2
D92Y/A217G/H363R 80% a 72°C (69 74% WT 14%)
094
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/H143C/ Q162R/Q181L/I201C/A217G/K234V/P348R 54% a 74°C (wt 9% 69 45%)
095
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/K139C/ Q162R/Q181L/I201C/A217G/K234V/P348R 75% a 74°C (wt 9% 69 45%)
097
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/Q162R/ Y179W/Q181L/A217G/K234V/P348R 76% a 74°C (wt 9% 69 45%)
100
D33C/D92Y/E100W/Y179C/A217G/H363R/ 49% a 72°C (69 79%)
103-1
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/Q162R/ Y179W/A217G/K234V/P348R/H363R 103% a 72°C (69 88%)
103-3
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/Q162R/ Y179W/A217G/K234V/S261 F/P348R/H363R 99% a 72°C (69 88%)
Referencia=variante 69 y/o variante 84
101
D92Y/E100W/A217G/H363R/+ 116-123(HQQNTQQA>TQADTSSP) 21% a 76°C (69 39%, 84 55%)
102
Q9S/E54C/D92Y/A101C/H143C/Q193R/I201C/ A217G/N298S/H363R +116-123(HQQNTQQA>TQADTSSP) 29% a 76°C (69 39%, 84 55%)
104
Q9S/N78Q/A69A/D92Y/H115M/A132V/K139C/ G151 D/Q162R/Y179W/Q181L/I201 C/A217G/ K234V/P348R(reference) 55% a 74°C (69 57% 84 65%)
105
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/H363R 77% a 74°C (69 57% 84 65%)
04-08-2015 E13170321
(reference)
Referencia=variante 104 y variante 69
106
E54C/D92Y/A101C/M168V/A217G/H363R 22% a 74°C (104 70% 69 54%)
107
Q9S/N78Q/A132V/K139C/Q162R/Y179W/I201C/ A217G/K234L/P348R/H363R 34% a 74°C (104 70% 69 54%)
Referencia=variante 105
108
D92Y/E100W/H143C/A144R/I201C/A217G/ N247D/H363R 37% a 80°C (105 36%)
109
D92Y/E100W/H116S/K139C/1201C/A217G/ N247D/H363R 43% a 78°C (105 36%)
110
D92Y/E100W/H128R/K139C/H143V/I201C/ A217G/N247D/H363R 44% a 78°C (105 36%)
111
D92Y/E100W/K139C/I201C/N206G/A217G/ N247D/H363R 45% a 78°C (105 36%)
112
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/ H363R 51% a 78°C (105 36%)
113
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/ Q256D/H363R 98% a 78°C (105 36%)
114
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/ H363R 49% a 78°C (105 36%)
115
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/ N344K/H363R 32% a 78°C (105 36%)
117
D92Y/E100W/K139C/A144S/K176E/I201C/ A217G/K234V/N247D/H363R 38% a 80C (105 34%)
118
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/H363R/E54C/H55E/A101C 32% a 80C (105 34%)
123
D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R 27% a 80C (105 15%)
124
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/ A217G/K234V/N247D/H363R 17% a 80C (105 15%)
125
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/S284C/H363R 20% a 80C (10515%)
126
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/T287W/H363R 20% a 80C (105 15%)
127
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/R289M/H363R 18% a 80C (105 15%)
128
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247D/R289W/H363R 17% a 80C (10515%)
129
N78Q/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/H363R 103% a 80C (105 34%)
130
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/Q256D/P348R/H363R 99% a 80C (105 34%)
131
D92Y/E100W/K139C/Q162R/Q181L/I201C/ A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R 76% a 80C (105 34%)
132
D92Y/E100W/A113G/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R 34% a 80C (105 34%)
133
D92Y/E100W/T120GorA*/K139C/I201C/ 41% a 80C (105 34%)
04-08-2015 E13170321
A217G/K234V/N247D/H363R/L395LorV
135
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/S284M/H363R 24% a 80C (105 34%)
137
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/H363R/A366S 31 % a 80C (105 34%)
138
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247W/Q256D/H363R 89% a 80C (10514%)
140
D92Y/E100W/H128R/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247E/Q256D/H363R 49% a 80C (10514%)
141
D92Y/E100W/K139C/Q141S/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R 24% a 80C (105 14%)
142
D92Y/E100W/K139C/A144S/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R 18% a 80C (10514%)
144
P75N/K76N/D77Q/N78T/D92Y/E100W/K139C/ 1201C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R 71 % a 80C (105 30%)
145
D92Y/E100W/K139C/D173N/P175S/I201C/ A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R 27% a 80C (105 30%)
147
D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/I294T/H363R 90% a 80C (105 26%)
Referencia=variante 113
143
D33N/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/H363R 29% a 80C (113 62%)
148
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/ A217G/K234V/N247D/Q1256D/H363R 74% a 80C (113 80%)
150
D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/H363R 67% a 82C (113 33%)
151
D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R 29% a 82C (113 33%)
152
D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/L199S/ 1201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R 38% a 80C (113 80%)
153
Y48H/D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/ I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R 38% a 80C (113 54%)
154
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/H363R 91% a 80C (113 73%)
155
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/1201C/ A217G/K234V/N247D/R289W/H363R 88% a 80C (113 80%)
156
D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247W/Q256D/R289W/H363R 41% a 82C (113 33%)
157
Y48H/D92/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/ K234V/N247W/Q1256D/R289W/H363R 79% a 80C (113 80%)
158
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247W/Q256D/H363R 95% a 80C (113 80%)
159
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247D/R289W/H363R 20% a 80C (113 57%)
160
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R 92% a 80C (113 80%)
04-08-2015
161
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/ 1201C/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R 55% a 80C (113 80%)
162
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/ K234V/N247W/R289W/H363R 56% a 80C (113 80%)
163
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247W/R289W/H363R 66% a 80C (113 80%)
Referencia=variante 138
164
Y48H/E54C/D92Y/E100W/A101C/K139C/T152A/ 1201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R 94% a 80C (138 78%)
165
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/ V208T/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R 65% a 80C (138 78%)
166
T35A/Y48H/E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/ D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R 15% a 80C (138 78%)
167
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/ K207Q/V208T/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R 61 % a 80C (138 78%)
Referencia=wt
168
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/ Q256D/H363R 69% a 80C (w 7%)
169
E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/D92Y/A101C/ K139C/I201C/A217G/H363R 33% a 80C (w 7%)
170
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/V208T/ A217G/H363R 32% a 80C (w 7%)
171
E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/D92Y/A101C/ K139C/I201C/V208T/A217G/H363R 36% a 80C (w 7%)
172
Y48H/E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/D92Y/ A101C/K139C/T152A/I201C/V208T/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R 48% a 80C (w 7%)
173
E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/D92Y/A101C/ K139C/I201C/V208T/A217G/K234V/N239S/N247D/ Q256D/H363R 50% a 80C (w 7%)
Ejemplo 4. Termoestabilidad
[0238] Una alícuota de la muestra de proteína de fitasa Hafnia alvei (purificada como se describe en el ejemplo 1) fue
5 bien desalada y cambiada de búfer en 20 mM de Na-acetato, pH 4,0 usando una columna preempaquetada PD-10 dializada contra 2 x 500 ml 20 mM de Na-acetato, pH 4,0 a 4° C en un paso de 2-3h seguido por un paso durante toda la noche. La muestra fue 0,45 µm filtrada y diluida con tampón para aprox. 2 unidades A280. El tampón de diálisis fue usado como referencia en la calorimetría diferencial de barrido (DSC). Las muestras fueron desgasificadas usando succión de vacío y agitando durante aprox. 10 minutos.
10 [0239] Se realizó una calorimetría por análisis diferencial en un calorímetro VP-DSC de MicroCal a una tasa de barrido constante de 1,5 °C/min de 20-90 °C. La manipulación de datos fue realizada usando el software Origin de MicroCal (versión 4.10) y la temperatura de desnaturalización, Td (también llamada la temperatura de fusión, Tm) se define como la temperatura en el ápice del valor máximo en el termograma.
15 [0240] Los resultados de la DSC para variantes de fitasa Hafnia alvei se resumen en la tabla 3 a continuación.
Tabla 3. Termoestabilidad comparativa de fitasas Hafnia alvei
Variante
1.º calorimetría
Td (°C)
A150C/L259C
62,4
E13170321
04-08-2015
Q162N/R96N
63,8
L16V/I1310L/I313L/M319L/M354L
64,3
V87I/L103A/L112I/A113T/I114V
67,4
E66C/L370C
67,2
H363R
68,3
Q162N/G186S
67,5
E54C/A101C
68,0
V130L/M137L/V146I/I120V/M260L/I266V
67,8
wt
69
K45P
70,9
K139C/I201C
70,8
E54C/A101C/K139C/I201C
72,6
D92Y/E100W/A217G/H363R
75,1
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132/ K139C/Q162/Q181L/I201C/A217G/K234V/P348R
75,5
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/K234V/N247D/H363R
77,7
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/H363R
78,0
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R
78,9
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/H363R
79,8
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R
80,0
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/1201C/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R
80,2
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R
81,7
Y48H/D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/N247W/Q256/H363R
82,7
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
83,1
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
84,2
S1QGPS/K26H/E54C/A101C/K139C/Q162N/G186S/I201C/K207Q/G346S
71,9
Ejemplo 5. Perfil de temperatura
[0241] El perfil de temperatura (actividad de fitasa como una función de temperatura) fue determinado para la fitasa de
5 Hafnia alvei y las variantes en el intervalo de temperatura de 20-90°C esencialmente como se describe anteriormente ("Determinación de la actividad de fitasa"). Sin embargo, las reacciones enzimáticas (100 microlitros de solución enzimática con fitasa + 100 microlitros de sustrato) fueron realizadas en tubos PCR en vez de en placas de microtitulación. Después de un periodo de reacción de 15 minutos a temperatura deseada los tubos fueron enfriados a 20° C durante 20 segundos y 150 microlitros de la mezcla reactiva fueron transferidos a una placa de microtitulación. 75
10 microlitros de reactivo de parada fueron añadidos y la absorbancia a 405 nm fue medida en un espectrofotómetro de placa de microtitulación. Los resultados se resumen en la Tabla 4 de abajo. Los números dados para cada temperatura son actividad relativa (en %) normalizados al valor en condiciones óptimas.
Tabla 4: Perfiles de temperatura relativa en estabilidad del orden de 75°C
Variante de fitasa
Temperatura (°C)
20
30 40 50 60 65 70 75 80 85 90
*wt
18 29 50 75 100 94 93 24 12 7 5
E13170321
04-08-2015 E13170321
*K131Q
21 34 53 77 94 99 100 26 16 10 6
Q162N/D138N
17 28 44 66 88 100 95 26 14 9 7
1294L
18 30 46 64 90 100 90 26 14 11 11
G72A
17 29 45 67 83 100 78 26 13 11 8
H143C/I201C
10 22 37 62 85 100 91 26 5 5 4
Q162R
18 30 49 73 91 100 95 26 15 11 9
I49L
17 29 45 65 90 100 94 26 13 9 11
*E66C/L370C
15 27 43 66 100 88 99 27 12 6 5
T369S
18 28 47 64 92 100 95 27 15 11 9
I201V
16 27 41 59 78 100 82 27 13 11 8
K148R
19 35 51 71 98 97 100 27 11 7 6
A163K
14 27 38 63 79 100 93 27 12 9 6
S1QS
15 26 40 62 87 93 100 27 9 4 2
F8M
15 27 38 67 96 100 91 27 10 5 5
F8Y
16 27 44 69 96 100 93 27 10 6 6
T242S
18 30 48 66 91 100 93 27 12 11 10
K176R
17 33 43 66 100 96 96 28 8 5 3
S403N
14 32 42 67 84 100 96 28 14 10 8
S1P
17 27 44 60 87 100 92 28 13 11 8
E41Q
16 28 44 63 87 100 99 28 13 9 9
*K131L
18 30 50 72 85 95 100 29 15 8 4
*K207R
18 30 48 70 88 93 100 29 15 8 5
*K207Q
23 37 58 81 92 97 100 29 18 10 7
G346S
16 28 47 65 95 100 92 29 10 6 4
T308A
9 17 33 56 80 99 100 29 12 9 6
S396K
19 31 44 69 86 100 87 30 14 12 10
L401N
14 33 43 68 86 100 87 30 13 10 7
I201G
16 28 43 62 81 100 87 30 14 11 8
P348R
18 30 43 62 81 100 91 31 14 11 8
E100W
18 29 40 61 79 100 85 31 13 10 7
K187E
16 28 39 66 90 100 92 31 10 -6 4
N239R
19 30 48 66 89 100 96 32 12 11 10
A304V
15 24 42 58 86 100 98 32 14 11 8
S396D
16 28 41 60 81 100 87 32 13 10 8
T152G
16 28 42 66 85 100 95 32 14 10 9
K12R
18 29 42 64 82 100 98 33 14 12 8
1303L
17 27 40 62 86 100 88 33 13 11 10
Q162N
16 27 42 62 89 90 100 34 10 7 3
04-08-2015 E13170321
S192A
17 26 43 59 88 100 94 35 13 9 9
T369D
18 29 43 66 86 100 90 35 14 12 11
V130L/M137L/V146I/I201V/ M260L/I266V
13 25 43 67 89 98 100 35 14 10 6
Q109G
17 33 44 68 94 100 94 36 11 6
N239K
19 31 47 70 92 100 94 38 14 12 11
K234V
17 29 42 63 79 100 94 39 15 11 8
K234E
17 27 43 61 86 100 92 40 15 11 7
H363R
18 28 42 66 90 100 90 41 11 6 5
S261A
13 24 39 62 83 98 100 41 14 10 7
A217G
14 32 41 65 84 100 90 43 15 11 7
E54C/A101C/K207Q
21 33 48 68 89 100 95 55 13 10 6
K45P
19 29 43 68 86 100 93 59 18 11 10
E54C/A101C
16 27 42 64 85 100 88 64 9 7 4
D33C/E54C/A101C/Y179C
16 31 45 67 94 100 82 74 9 6 3
E54C/A101C/K139C/I201C/ K207Q
18 30 41 62 85 80 100 84 36 9 10
D92Y/E100W/A217G/H363R
6 13 27 50 89 85 100 84 32 10 5
E54C/A101C/K139C/I201C
15 28 40 59 86 78 100 86 47 8 9
K139C/I201C
18 25 37 56 91 91 100 87 15 7 4
S1QGPS/K26H/E54C/A101C/ K139C/Q162N/G186S/I201C/ K207Q/ G346S
26 37 49 67 80 100 92 90 18 13 10
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/T152A/I201C/K207Q/ V208T/A217G/K234V/N247D R289W/ H363R
10 20 39 63 85 81 100 92 58 11 6
T35A/Y48H/E54C/P75N/K76N/ D77Q/N78T/D92Y/A101C/ K139C/ T152A/I201C/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R
5 9 28 50 77 80 100 93 13 5 1
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/T152A/I201C/V208T/ A217G/K234V/N247D/ R289W/ H363R
5 13 26 53 76 83 100 95 75 11 4
E54C/D92Y/A101C/K139C/ I201C/A217G/H363R
10 15 28 52 81 93 100 96 83 10 1
E54C/D92Y/A101C/K139C/ I201C/A217G/K234V/N247D/ Q256D/ H363R
9 16 33 58 81 84 100 96 79 18 6
D92Y/E100W/K139C/I201C/ A217G/ K234V/N247D/ H363R
6 13 27 49 85 84 100 98 71 13 6
P75N/K76N/D77Q/N78T/ D92Y/E100W/K139C/I201C/ A217G/K234V/N247D/Q256D/
6 15 30 51 81 82 100 98 76 20 5
04-08-2015
H363R
Y48H/D92Y/E100W/K139C/
8 11 25 44 78 88 100 99 68 10 2
1201C/A217G/K234V/N247D/ R289W/ H363R
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/ A132V/K139C/ Q162R/Q181L/I201C/A217G/ K234V/P348R
8 16 32 54 85 86 100 100 81 14 6
Y48H/D92Y/E100W/K139C/ 1201C/A217G/K234V/N247D/ Q256D/H363R
3 12 24 46 77 89 85 100 75 14 1
Y48H/D92Y/E100W/K139C/ T152I/I201C/A217G/K234V/ N247D/ H363R
4 12 24 45 76 92 87 100 66 14 4
D92Y/E100W/K139C/I201C/ A217G/K234V/N247W/Q256D/ H363R
9 16 22 47 70 81 89 100 78 24 6
D92Y/E100W/K139C/D173N/ P175S/I201C/A217G/K234V/ N247D/ Q256D/H363R
6 16 37 52 81 89 88 100 37 9 3
Y48H/D92Y/E100W/K139C/ I201C/ V208T/A217G/K234V/N247D/ Q256D/H363R
9 15 22 47 76 91 90 100 68 18 6
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R
9 16 26 57 78 89 90 100 80 21 7
Y48H/D92Y/E100W/K139C/ 1201C/A217G/K234V/N247W/ Q256D/ H363R
9 12 19 46 68 76 85 100 77 29 4
Y48H/D92Y/E100W/K139C/ T152A/I201C/A217G/K234V/ N247W/Q256D/H363R
8 12 20 46 66 78 80 100 81 33 4
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/T152A/I201C/A217G/ K234V/ N247D/R289W/ H363R
4 8 21 44 80 91 88 100 81 17 3
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/1201C/A217G/K234V/ N247W/ R289W/H363R
7 13 22 48 76 87 84 100 82 24 6
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/ T152A/I201C/A217G/K234V/ N247W/R289W/H363R
5 11 20 46 77 89 79 100 81 27 4
Tabla 5: Estabilidad térmica a 75º C, actividad relativa a la actividad máxima
Mutación
Actividad relativa
wt
24
K131Q
26
E13170321
04-08-2015 E13170321
Q162N/D138N
26
I294L
26
G72A
26
H143C/I201C
26
Q162R
26
I49L
26
E66C/L370C
27
T369S
27
I201V
27
K148R
27
A163K
27
S1QS
27
F8M
27
F8Y
27
T242S
27
K176R
28
S403N
28
S1P
28
E41Q
28
K131L
29
K207R
29
K207Q
29
G346S
29
T308A
29
S396K
30
L401N
30
I201G
30
P348R
31
E100W
31
K187E
31
N239R
32
A304V
32
S396D
32
T152G
32
K12R
33
1303L
33
Q162N
34
S192A
35
04-08-2015 E13170321
T369D
35
V130L/M137L/V146I/I201V/ M260L/I266V
35
Q109G
36
N239K
38
K234V
39
K234E
40
H363R
41
S261A
41
A217G
43
E54C/A101C/K207Q
55
K45P
59
E54C/A101C
64
D33C/E54C/A101C/Y179C
74
E54C/A101C/K139C/I201C/ K207Q
84
D92Y/E100W/A217G/H363R
84
E54C/A101C/K139C/I201C
86
K139C/I201C
87
S1QGPS/K26H/E54C/A101C/ K139C/Q162N/G186S/I201C/K207Q/G346S
90
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201 C/K207QN208T/A217G/ K234V/N247D R289W/H363R
92
T35A/Y48H/E54C/P75N/ K76N/ D77Q/N78T/D92Y/A101C/ K139C/ T152A/I201 C/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R
93
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/ T152A/I201CN208T/ A217G/ K234V/N247D/ R289W/ H363R
95
E54C/D92Y/A101C/K139C/ I201C/ A217G/H363R
96
E54C/D92Y/A101C/Kl39C/ I201C/A217G/K234V/N247D/ Q256D/ H363R
96
D92Y/E100W/K139C/I201C/ A217G/ K234V/N247D/ H363R
98
P75N/K76N/D77Q/N78T/ D92Y/ E100W/K139C/I201C/ A217G/K234V/N247D/ Q256D/H363R
98
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/ R289W/ H363R
99
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/ A132V/K139C/ Q162R/Q181 L/I201C/A217G/ K234V/ P348R
100
Y48H/D92Y/E100W/K139C/1201 C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R
100
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152VI201C/A217G/K234V/N247D/H363R
100
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/ H363R
100
D92Y/E100W/K139C/D173N/ P175S/I201C/A217G/K234V/ N247D/Q256D/ H363R
100
Y48H/D92Y/E100W/K139C/1201C/V208T/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R
100
Y48H/E54C/D92Y/A101 C/K139C/I201 C/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R
100
Y48H/D92Y/E100W/K139C/1201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
100
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
100
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/N247D/R289W/ H363R
100
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/K234V/N247W/R289W/H363R
100
04-08-2015
Y48H/E54C/D92Y/A101C/ K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/ N247W/R289W/H363R
100
Ejemplo 6. Perfil de pH
[0242] El perfil de pH se determinó a 37°C en el intervalo de pH de 2,0 a 7,5 (en pasos de 0,05 unidades de pH) como se describe eanteriormente en la sección "Determinación de la actividad de fitasa", exceptuando que se usó un cóctel de tampón (50 mM de glicina, 50 mM de ácido acético y 50 mM de bis-tris en vez del tampón de 0,25 M de acetato sódico pH 5,5. Los resultados se resumen en la Tabla 1 de abajo. Los valores dados para cada pH en el intervalo de 2, 0-7,5 son la actividad relativa en % normalizada al valor óptimo.
Tabla 6: Perfiles de pH relativos a 37º C
Mutación/pH
2 2,5 3 3,5 4 4,5 5 5,5 6 6,5 7 7,5
K26P
72 89 100 96 81 67 55 37 21 8 1 3
K26Q
40 69 91 100 98 95 84 59 35 12 -1 1
K26R
48 66 85 100 99 98 87 64 40 14 2 -1
D92Y/E100W/ A217G/H363R
63 78 94 100 95 76 46 20 7 1 -1 9
Q9S/N78Q/A89A/ D92Y/H115M/ A132V/K139C/ Q162R/Q181L/ 1201C/A217G/ K234V/P348R
50 68 90 100 99 79 42 17 3 0 0 5
T35C/L172C
39 65 87 100 99 94 73 51 30 10 1 1
D92Y/E100W/ A217G/H363R
63 78 94 100 95 76 46 20 7 1 -1 9
Q9S/N78Q/A89A/D9 2Y/H115M/A132V/ K139C/Q162R/Q181 L/ I201C/ A217G/ K234V/P348R
50 68 90 100 99 79 42 17 3 0 0 5
H143C/I201C
49 71 89 100 93 90 77 55 33 12 2 0
Y48H/E54C/D92Y/ A101C/K139C/ I201C/A217G/ K234V/N247D/ R289W/ H363R
42 65 89 100 98 85 53 21 7 1 0 -1
Y48H/E54C/D92Y/ A101C/K139C/ T152A/I201C/ A217G/K234V/N247 W/R289W/H363R
47 62 89 100 97 85 52 18 6 0 0 0
T35A/Y48H/E54C P75N/K76N/D77Q/ N78T/D92Y/A101C/ K139C/T152A I201C/A217G/ K234V/N247D/ R289W/H363R
41 74 88 100 96 78 49 17 5 0 -1 -2
Y48H/E54C/D92Y/ A101C/ K139C/
39 70 87 100 94 82 52 21 7 2 1 -1
E13170321
04-08-2015 E13170321
T152A/ I201C/ A217G/ K234V/ N247D/R289W/ H363R
E54C/D92Y/A101C/ K139C/ I201C/ A217G/H363R
40 65 87 100 99 88 57 23 7 1 0 -1
Y48H/E54C/D92Y/ A101C/ K139C/ T152A/I201C/ V208T/ A217G/ K234V/N247D/ R289W/H363R
40 70 84 100 98 90 65 29 11 3 1 -1
K131P
50 64 83 95 100 99 95 83 65 36 5 3
K131Q
51 67 82 98 100 99 95 80 69 39 7 -2
K207R
38 51 71 85 100 97 95 81 50 27 3 3
D33C/Y179C
40 53 72 86 100 92 83 65 38 18 2 5
G325C/T358C
40 54 78 93 100 100 90 68 41 16 0 -3
H228C/H363C
36 53 75 92 100 97 88 67 38 16 2 -1
A150C/L259C
36 57 78 95 100 97 89 64 42 16 3 -2
D92Y/E100W/ K139C/I201C/ A217G/N247D/ H363R
58 73 90 99 100 84 49 20 6 1 -1 3
D92Y/E100W/ K139C/I201C/ A217G/K234V/ N247D/ H363R
58 73 90 99 100 84 49 20 6 1 -1 3
T308A
39 58 79 99 100 94 85 76 55 36 4 -3
E54C/A101C
42 55 77 98 100 90 85 63 0 15 2 1
Y48H/D92Y/E100W/ K139C/T152I/ I201C/A217G K234V/ N247D/ H363R
54 68 84 98 100 93 54 20 5 0 0 -6
K131Q Q
51 67 82 98 100 99 95 80 9 39 7 -2
I49L
40 62 83 97 100 94 80 58 37 14 2 -1
Y48H/E54C/D92Y /A101C/ K139C/ I201C/A217G/ K234V/ N247W/ R289W/H363R
42 62 87 96 100 81 50 22 6 0 0 -1
Q162N
40 66 75 96 100 93 91 73 47 22 6 1
Y48H/D92Y/E100W/ K139C/201C/ A217G/K234V/ N247D/R289W/ H363R
46 69 86 95 100 79 55 23 9 2 0 0
Y48H/D92Y/E100W/ K139C/T152A/ 1201 C/A217G/ K234V/
41 59 75 94 100 95 66 24 6 1 0 -1
04-08-2015 E13170321
N247W/ Q256D/H363R
E66C/L370C
33 58 80 94 100 100 87 66 41 14 2 0
E41Q
44 62 78 93 100 97 86 68 41 17 3 0
Q109G
37 57 77 92 100 100 96 73 48 23 41 0
A163K
47 63 75 92 100 99 89 67 41 13 3 0
Y48H/D92Y/E100W/ K139C/I201C/ A217G/K234V/ N247D/Q256D/ H363R
50 55 72 91 100 91 57 19 4 -1 -1 -1
A304V
53 60 82 91 100 95 88 68 45 19 3 3
E54C/D92Y/A101C/
35 48 68 90 100 94 64 22 6 0 -1 -1
K139C/I201C/ A217G/K234V/ N247D/ Q256D/ H363R
P75N/K76N/D77Q/ N78T/ D92Y/ E100W/K139C/ I201C/A217G/ K234V/N247D/ Q256D/H363R
42 55 71 88 100 95 62 23 6 0 0 0
D92Y/E100W/ K139C/I201 C/ A217G/K234V/ N247W/Q256D/ H363R
37 51 65 89 100 97 69 20 2 -3 -5 -4
Y48H/D92Y/T98S/ E100W/ K139C/ T152A/I201C/ A217G/K234V/ N247W/Q256D/ H363R
39 50 69 89 100 99 73 28 8 0 -1 -1
K234E
44 53 75 88 100 99 95 71 47 19 3 1
D92Y/E100W/ K139C/D173N/ P175S/I201C/ A217G/ K234V/ N247D/ Q256D/ H363R
44 54 70 87 100 93 62 22 5 1 0 -1
K207R
38 51 71 85 100 97 95 81 50 27 3 3
D33C/E54C/A101C/ Y179C
37 59 74 84 100 88 82 65 41 21 5 2
Q162N/D138N
39 58 81 95 100 100 91 71 47 21 4 3
Q162R
38 58 78 88 100 100 96 72 48 22 3 0
N285D
45 61 81 96 100 100 97 71 39 18 2 7
E66C/L370C
33 58 80 94 100 100 87 66 41 14 2 0
T369S
46 56 79 92 100 100 94 72 47 22 3 2 -1
S192A
46 58 81 90 100 100 93 62 42 15 2 0
04-08-2015 E13170321
Y48H/E54C/D92Y/ A101C/K139C/ T152A/I201C/ K207Q/V208T/ A217G/K234V/ N247D/ R289W/ H363R
36 63 83 96 100 100 85 61 36 14 2 -1
Tipo salvaje
41 57 77 93 99 100 94 75 48 20 3 0
K131L
45 59 75 93 98 100 96 84 71 44 13 -1
D33C/P178C
37 61 77 90 94 100 88 66 43 15 1 1
F63C/L368C
29 55 78 92 98 100 83 65 38 14 2 -1
S1QS
45 56 80 86 99 100 83 63 45 14 3 0
1303L
40 59 75 89 98 100 91 73 45 18 2 0
F8Y
44 59 78 93 98 100 88 64 37 14 3 -4
1201V
36 53 73 91 98 100 88 68 40 13 -1 -2
Y48H/D92Y/E100W/ K139C/I201C/ V208T/A217G/ K234V/ N247D/ Q256D/H363R
46 60 76 88 98 100 74 35 10 1 0 1
K176R
38 58 76 90 97 100 94 72 45 18 0 -4
S1P
46 56 80 90 97 100 84 64 40 15 2 -2
T242S
38 58 73 85 97 100 97 73 48 22 2 -1
S396D
41 54 76 87 97 100 93 71 47 19 4 0
F8M
48 57 71 90 96 100 82 70 40 14 5 1
N239R
32 46 69 93 96 100 98 74 50 24 1 2
N239K
38 52 70 91 96 100 95 73 48 20 3 0
S396K
37 51 72 87 96 100 96 73 46 21 3 -1
K139C/I201C
34 48 69 84 96 100 94 72 45 17 1 -2
K148R
35 57 70 90 95 100 92 75 47 15 1 -1
P348R
38 54 73 91 95 100 98 72 48 25 3 1
I201G
36 52 73 93 95 100 89 68 41 14 -1 -5
V130UM137U V146I/I201V/ M260L/I266V
32 53 69 88 95 100 89 71 52 26 8 2
T152G
30 50 67 84 94 100 95 73 47 19 2 0
L401N
30 50 63 87 94 100 100 72 50 23 2 1
I294L
37 53 78 83 93 100 94 73 46 20 2 -1
G346S
34 55 71 86 93 100 90 69 43 18 2 -5
H363R
29 50 67 87 92 100 96 77 49 22 2 0
T369D G72A
35 54 68 82 92 100 90 72 51 18 3 0
35
47 67 85 90 100 80 61 37 14 -1 -2
E54C/A101C/ K139C/I201C
37 49 75 87 90 100 89 66 50 23 6 0
04-08-2015
S261A
30 46 69 83 90 100 84 67 43 19 -1 -3
K187E
34 57 72 88 89 100 92 70 44 21 1 -1
E54C/A101C/ K139C/1201C/ K207Q
28 48 65 79 89 100 98 85 71 47 18 1
A217G
39 54 73 85 88 100 85 59 39 -1 -1
K207L
41 52 69 84 92 98 100 92 69 41 11 1
K207Q
38 49 69 83 95 95 100 92 65 45 10 5
S403N
33 51 72 85 99 99 100 77 49 22 1 -1
K45P
34 60 72 90 91 98 100 75 48 23 2 0
E100W
29 44 69 78 93 98 100 84 57 28 3 0
S1QGPS/K26H/ E54C/A101C/ K139C/Q162N/ G186S/I201C/ K207Q/ G346S
38 54 69 83 92 98 100 88 64 29 2 -1
K234V
35 54 65 94 93 96 100 74 44 26 3 1
E54C/A101C/K207Q
34 52 70 85 96 96 100 92 76 47 14 1
K207Q
38 49 69 83 95 95 100 92 65 45 10 5
Ejemplo 7: Estabilidad del vapor
Método 1
5 [0243] La actividad residual de las moléculas de fitasa después del tratamiento de vapor fue evaluada usando el siguiente ensayo:
20 µL de cada muestra de enzima purificada se dispensa en un único pocillo de una placa de 96 pocillos de Corning® (1
10 x 8 Stripwell™) (Corning, Lowell, MA, EE. UU.) y posteriormente es evaporada a sequedad en un centrifugador de vacío (Genevac EZ-1 Plus, Genevac Ltd, Suffolk, Reino Unido). La incubación de vapor se realiza en un contenedor styropor cerrado con las dimensiones internas 27 x 18 x 20 cm. Las muestras, en bandas abiertas, se colocan aproximadamente 10 cm sobre el fondo del contenedor en una cremallera metálica, para no estar en contacto con el agua.
15 [0244] Un litro de agua hierviendo se vierte en el contenedor, la tapa se cierra y la temperatura del vapor producido es monitoreada usando un termómetro montado en la tapa del contenedor. La incubación procede durante 60 segundos desde el momento que el agua se vierte en el contenedor. Durante este periodo, la temperatura aumenta a aproximadamente 85° C. Inmediatamente después de la incubación, las muestras son enfriadas en hielo, resuspendidas y evaluadas respecto a la actividad de la fitasa usando ensayo de fosfato de p-nitrofenilo colorimétrico (pNPP) (Sigma,
20 Broendby, DK). Cada muestra enzimática es comparada con una muestra similar que ha sido tratada con vapor para calcular la actividad residual.
[0245] Los resultados se presentan en tablas 7 y 8 más abajo.
Tabla 7: Estabilidad al vapor determinada por el método 1
Variante
Actividad residual [%]
Experimento 1
Wt 12
E66C/L370C
23
D33C/E54C/A101C/Y179C
22
Experimento 2
Wt 14
G346S
25
E13170321
04-08-2015
Q109G
22
H143C/I201C
16
Experimento 3
Wt 10
Q162N (realizado dos veces)
31;35
Experimento 4
Wt 20
E54C/D92Y/A101C/K139C/I201C/A217G/H363R
88
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/K139C/ Q162R/Q181L/I201C/A217G/K234V/P348R
62
D92Y/E100W/K139C/1201C/A217G/N247D/H363R
51
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/ Q256D/H363R
54
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/ A217G/K234V/N247D/H363R
45
Y48H/D92Y/T98S/E100W/K139C/T152A/ I201C/A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
86
E54C/D92Y/A101C/K139C/1201C/A217G/ K234V/N247D/Q256D/H363R
91
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152A/I201C/ A217G/K234V/N247W/Q256D/H363R
88
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/ I201C/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R
90
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/ V208T/A217G/K234VM247D/R289W/H363R
95
T35A/Y48H/E54C/P75N/K76N/D77Q/N78T/ D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/A217G/K234V/ N247D/R289W/H363R
81
Y48H/E54C/D92Y/A101C/K139C/T152A/I201C/ K207Q/V208T/A217G/K234V/N247D/R289W/H363R
95
Experimento 5
Wt 25,9
D92Y/E100W/A217G/H363R
39,5
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/N247D/H363R
57,5
Q9S/N78Q/A89A/D92Y/H115M/A132V/K139C/ Q162R/Q181L/I201C/A217G/K234V/P348R
68,5
Método 2
[0246] En estos experimentos, se usó una configuración modificada por la cual el vapor es provisto desde un generador de vapor y conducido a la caja. Las muestras colocadas en una placa se insertan en la caja a través de un cajón cuando se ha alcanzado la temperatura. Tras la inserción de las muestras, la temperatura cae 4° C. La incubación se realiza durante 30 segundos mientras la temperatura permanece aproximadamente constante a 90° C. Luego la placa es rápidamente quitada de la caja y las muestras son colocadas en hielo. Las muestras se analizan como en el método 1.Tabla 8: Estabilidad al vapor determinada por el método 2
Variante
Actividad residual [%]
Experimento 1
Wt 15
V130L/M137L/V1461/I201V/M260L/I266V
27
Experimento 2
Wt 6
S1QGPS/K26H/E54C/A101C/K139C/Q162N/ G186S/I201C/K207Q/G346S
29
Experimento 3
Wt 4
S261A
12
T308A
9
E13170321
04-08-2015
Experimento 4
wt 8
L401N
14
S403N
9
T308A
11
Experimento 5
wt 4
E54C/A101C
9
Experimento 6
wt 6
T152G
10
Experimento 7
wt 5
S1P
10
F8M
14
Experimento 1
wt 15
Experimento 8
wt 3
K139C/I201C
13
Experimento 9
wt 5
S1QS
9
A217G
9
Ejemplo 8: actividad residual de glicación
[0247] Inactivación por glicación
[0248] El efecto de glicación fue investigado por incubación de variantes de fitasa purificadas con glucosa. Para esto 0,5mg/ml de enzima en 0,1 M HEPES pH 7,5 se mezcló con 1 M de glucosa y se incubó a 50° C durante 5 h. La actividad de fosfatasa fue medida antes y después de la incubación y los resultados se indicaron más abajo en la tabla 9 Tabla 9: Modifiación de glicación
mutación
Actividad residual
Wt
18%
K26Q
55%
K26R
47%
10
[0249] Los resultados mostrados arriba indican que la enzima de tipo salvaje es fuertemente inhibida por glicación (18% de actividad residual). Las variantes en la posición K26 son claramente mucho mejores en este aspecto siendo menos afectadas.
Ejemplo 9: pruebas de estabilidad de granulación
15 Mediciones de estabilidad de granulación
[0250] Aproximadamente 50 g de granulado enzimático fue premezclado con 10 kg de alimento durante 10 minutos en un mezclador horizontal pequeño. Esta premezcla fue mezclada con 90 kg de alimento durante 10 minutos en un 20 mezclador horizontal más grande. Del mezclador, el alimento fue llevado al acondicionador (un mezclador de cascada con inyección de vapor) a razón de aproximadamente 300 kg/hora. El acondicionador calentó el alimento a 95 °C (medido a la salida) por vapor de inyección. El periodo de permanencia en el acondicionador fue 30 segundos. Del acondicionador, el alimento fue llevado a una prensa Simon Heesen equipada con boquilla horizontal de 3,0x35 mm y se prensó a gránulos con una longitud de alrededor de 15 mm. Después de la prensa, los gránulos fueron colocados en
25 un refrigerador de aire y enfriados durante 15 minutos.
imagen21
imagen22
imagen23
E13170321
04-08-2015
Degradación de fitato de la variante como porcentaje de degradación de fitato por el tipo salvaje (dos números representan datos de dos ensayos diferentes)
Dosificación de fitasa (FYT/kg de alimento)
Variante de fitasa
D92Y/E100W/A217G/H363R
125 181
Como se indica arriba
250 199
D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/H363R
125 74; 101
Como se indica arriba
250 71; 137
Como se indica arriba
500 72
Como se indica arriba
1000 76
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R
125 252; 543
Como se indica arriba
250 219; 347
Como se indica arriba
500 184; 215
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/K234V/N247D/H363R
125 237; 297
Como se indica arriba
250 160; 246
Como se indica arriba
500 148;197
K207Q
250 57
E54C/A101C
250 119
G346S
250 79
Q162N
250 180
S1QS
255 68*
S1P
277 70*
F8M
246 74*
F8Y
229 71*
K139C/I201C
250 105
S1QGPS/K26H/E54C/A101C/K139C/Q162N/G186S/I201C/K207Q/G346S
250 90
* Para estos datos el peso fue evaluado a 250 FTU/kg

Ejemplo 11: rendimiento en una prueba de cerdo in vivo
[0274] Evaluación comparativa de los efectos de cantidades valoradas de dos variantes de fitasa Hafnla alveii en la 5 digestibilidad fecal y excreción de fósforo y calcio en cerdos en crecimiento.
[0275] Se utilizaron sesenta y cuatro cerdos blancos grandes Landrace con un peso corporal inicial de 43,55 ± 4,35 kg.
[0276] Los animales fueron alojados en jaulas de corral de piso en una cámara del medio ambiente controlado. Cada
10 corral tenía un suelo con cables soldados revestidos de plástico y estaba equipado con dos boquillas de agua y cuatro alimentadores individualizados de acero inoxidable. La temperatura ambiente fue 21-22° C y el porcentaje de humedad fue 50 %.
[0277] Los cerdos fueron alimentados con una dieta básica formulada para proporcionar fósforo (P) exclusivamente de 15 origen vegetal durante un periodo adaptativo de 14 días. Después de ese periodo, fueron asignados en 16 grupos iguales de 4 animales cada uno.
5
10
15
20
25
30
35
40
E13170321
04-08-2015
[0278] Fueron alimentados durante 12 días con la dieta básica o esta dieta suplementada con 1000, 2000 U/kg y 4000 U/kg de fitasa Hafnia alveii de tipo salvaje, con 500,1000 y 2000 U/kg de la variante Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R o con 500,1000 y 2000 U/kg de la variante Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/K234V / N247D/H363R.
[0279] Un marcador indigerible (óxido de cromo) se añadió a una concentración de 0,4 % a todas las dietas permitiendo el cálculo del digestibilidad de P y calcio (Ca). El alimento fue distribuido ad libitum en la forma de trituración, bajo control de consumo de alimentación de corral y los animales tenían libre acceso al agua potable. La digestibilidad de Ca no era corregida para la ingesta de Ca con el agua potable.
[0280] Las concentraciones de P Fecal, Ca y Cr fueron medidas al 12º día del segundo periodo. Las heces fueron muestreadas individualmente, en aproximadamente la misma cantidad al mismo tiempo del día, durante los últimos 3 días antes de esa fecha. De ese modo, para cada tratamiento dietético y para cada criterio, se han realizado un total de 12 determinaciones individuales. Todos los minerales fueron determinados según los métodos estándares de Association of Official Analytical Chemists (1990) usando un espectómetro Vista-MPX ICP-OES. La digestibilidad aparente (% de la toma) de los minerales fue calculada para el periodo mencionado de 3 días.
[0281] La concentración media de P fecal de los animales suplementados con enzima fue muy significativamente inferior a la observada para los animales que ingirieron la dieta de control (a).
[0282] La digestibilidad P dependió de la dosis y mejoró muy significativamente con las cinco fitasas en todos los grupos suplementados (b). La máxima digestibilidad P fue observada en la dieta suplementada con 4000 U/kg de Hafnia alvei de tipo salvaje y en el grupo JHP113 con 2000 U/kg.
[0283] La excreción fecal de P fue significativamente reducida en todos los animales suplementados con fitasa y para todos los niveles de inclusión evaluados (c).
[0284] El P aparente absorbido fue superior al 2,25 g/kg recomendado para los cerdos en crecimiento en el grupo de 4000 U/kg de Hafnia alvei de tipo salvaje y muy cerca de éste con JHP113 y "C. braakii" de tipo salvaje con 2000 U/kg y 4000 U/kg respectivamente (d).
[0285] Las equivalencias P, consideradas como P suplementario digerido comparativamente con el control no suplementado, fueron muy significantivamene superiores al control en las cinco dietas suplementadas con fitasas (e).
[0286] La digestibilidad de Ca fue mejorada y la excreción fecal de Ca fue reducida con todas las enzimas evaluadas y en todos los niveles de inclusión (f).
[0287] El máximo de eficiencia en estos parámetros fue observado con Hafnia alvei de tipo salvaje al nivel de inclusión de 4000 U/kg, mientras que la variante Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C / A217G/K234V/N247D/Q256D/H363R tuvo el mejor rendimiento al comparar la eficacia con las suplementaciones de 1000 U/kg y 2000 U/kg.
[0288] Los resultados se presentan en la siguiente tabla 12
Tabla 12: Niveles residuales de de parámetros para digestibilidad
Dosis (U/kg)
0
500 1000 2000
(a) concentración fecal de fósforo (mg/g DM)
Wt
14,3 11,5
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/Q256D/H363R
13,7 12,6 11,5
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R
14,5 13,9 11,0
Control
18,3
(b) digestibilidad fecal aparente de fósforo (%)
Wt
47,3 50,1
Y48H/D92Y/E100W/K139C/I201C/A217G/K234V/ N247D/Q256D/H363R
44,1 55,3 58,0
Y48H/D92Y/E100W/K139C/T152I/I201C/A217G/ K234V/N247D/H363R
43,1 48,6 51,4
Control
27,9
(c) excreción de fósforo (mg/g DM)

Claims (1)

  1. imagen1
    imagen2
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