ES2325931T3 - Utilizacion del analisis por citometria de flujo para optimizar las estrategias de almacenamiento en bancos de celulas para celulas cho. - Google Patents

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Abstract

La utilización de anexina V en un proceso de caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO tras la descongelación.

Description

Utilización del análisis por citometría de flujo para optimizar las estrategias de almacenamiento en bancos de células para células CHO.
Campo de la invención
La presente invención está relacionada con la producción de biofármacos en células CHO. Particularmente, está relacionada con la generación de bancos de células de reserva, de trabajo y de postproducción de alta calidad mediante la criopreservación. Más particularmente, está relacionada con la propagación y caracterización de células criopreservadas en bancos de células de reserva, de trabajo y de postproducción. Además, la presente invención se refiere a nuevas estrategias que utilizan el análisis de citometría de flujo (CF) en células teñidas con anexina V para la caracterización de bancos de células criopreservadas con un alto rendimiento.
Antecedentes de la invención
El mercado de los biofármacos que se utilizan para la terapia humana ha continuado creciendo a un ritmo muy elevado en la última década. Las líneas celulares CHO son uno de los sistemas de expresión en mamíferos más atractivos debido a aspectos de su producción, seguridad y regulatorios. Para asegurar productos terapéuticos de calidad uniforme, el sistema de almacenamiento en bancos de células de estas líneas celulares es crucial. La creación de bancos de células de reserva (BCR), bancos de células de trabajo (BCT) y bancos de células de postproducción (BCPP) de células CHO son pasos esenciales en el desarrollo de los procesos de producción de biofármacos en estas líneas celulares. La calidad de estos bancos es crítica, ya que su generación no sólo es necesaria para el desarrollo clínico del producto sino que también, en último lugar, durante la fase de abastecimiento del mercado.
El parámetro principal que caracteriza la calidad de un banco de células es la supervivencia a largo plazo de las células cultivadas tras la descongelación. Además, aparte de la supervivencia a largo plazo, también son propiedades esenciales la robustez y estabilidad de un banco de células adecuado. El tiempo necesario desde la descongelación de un vial hasta que se establecen cultivos de inóculo de crecimiento robusto, estabilidad genética y elevada viabilidad del cultivo es crítico para valorar la calidad de un banco de células. Finalmente, un banco de células de elevada calidad debe garantizar que todos estos parámetros permanecen estables a lo largo de un periodo de almacenamiento prolongado del banco. Todas estas características dependen en gran parte del método de criopreservación para la producción de una línea celular determinada.
Actualmente un número creciente de biofármacos se produce a partir de células CHO debido a su capacidad de procesar y modificar correctamente las proteínas humanas. La primera generación de procesos de producción basados en células CHO requerían casi de forma exclusiva la presencia de suero en el medio de cultivo. Las mejoras de la seguridad y regulatorias dieron paso al desarrollo de nuevas líneas celulares y regímenes de cultivo que ahora permiten el cultivo de células libre de suero a lo largo del proceso (Merten, 1999). Sin embargo, la eliminación del suero de la totalidad del proceso de producción también requiere que las células se almacenen en bancos de células de reserva y de trabajo con medio de congelación libre de suero. Se han descrito una gran variedad de estrategias para el almacenamiento de células en un banco de células mediante el uso de agentes crioprotectores que son capaces, al menos parcialmente, de reemplazar los efectos protectores del suero (Groth et al., 1991). Sin embargo, el éxito de cualquiera de estas estrategia depende en gran medida de la línea celular, el medio y el protocolo de congelación y descongelación. Por lo tanto, la evaluación de diferentes estrategias de criopreservación es esencial para el éxito de un proceso de desarrollo.
Actualmente, la primera valoración de un banco de células de nueva generación se realiza mediante la descongelación de un número de viales definidos y el cultivo de las células durante 5-10 pases. El contaje celular y la viabilidad determinada mediante la exclusión de azul de tripano son los parámetros utilizados de forma rutinaria para describir la recuperación de células tras la criopreservación.
La muerte celular programada o apoptosis es un proceso crucial para un adecuado desarrollo embrionario y para la homeostasis de los tejidos en los adultos. La muerte celular programada se controla mediante un subgrupo específico de moléculas conservadas en todos los organismos multicelulares, que convierten una señal de inducción de muerte en procesos bioquímicos intracelulares, que en último término conducen a una destrucción completa de la célula (Vaux y Korsmeyer 1999). Una vez se dispara, la apoptosis procede con una cinética diferente dependiendo del tipo celular y se culmina con la disgregación celular y la formación de cuerpos apoptóticos. Una etapa crítica de la apoptosis involucra la adquisición de cambios en la superficie de las células moribundas que finalmente resulta en el reconocimiento y la ingestión de estas células por los fagocitos. Previamente, se han descrito diferentes cambios en la superficie de las células apoptóticas, como la expresión de lugares de unión a trombospondina, la pérdida de residuos de ácido siálico y la exposición de fosfolípidos como la fosfatidilserina (FS). Los fosfolípidos se distribuyen de forma asimétrica entre las caras interna y externa de la membrana plasmática, con fosfatidilcolina y esfingomielina expuestas en la cara externa de la bicapa lipídica y fosfatidilserina predominantemente observada en la superficie interna hacia el citosol. En las células sometidas a apoptosis se destruye la asimetría de los fosfolípidos de su membrana plasmática y exponen la FS, que se transloca a la capa externa de la membrana. Esto ocurre en las fases tempranas de la muerte celular apoptótica durante la cual la membrana celular permanece intacta. La exposición de FS es, por lo tanto, la principal característica temprana y extendida de las células moribundas. La anexina V, pertenece a una familia de proteínas descubiertas recientemente, las anexinas, con propiedades anticoagulantes y que se ha demostrado que son una herramienta útil para la detección de células apoptóticas, ya que se unen de forma preferente a los fosfolípidos cargados negativamente como la FS en presencia de Ca^{2+} y muestra una unión mínima a la fosfatidilcolina y la esfingomielina. Los cambios en la asimetría de la FS analizados midiendo la unión de anexina V a la membrana celular se detectan antes de que aparezcan los cambios morfológicos asociados con la apoptosis y antes de que se pierda la integridad de la membrana.
Al conjugar FITC a la anexina V es posible identificar y cuantificar las células apoptóticas en base a una citometría de flujo de una sola célula (Steensma et al., 2003). La tinción simultánea de las células con FITC-anexina V (fluorescencia verde) y el colorante no vital yoduro de propidio (fluorescencia roja) permite (análisis bivariable) la discriminación de las células intactas (FITC -, YP -), en apoptosis temprana (FITC +, YP -) y en apoptosis tardía o células necróticas (FITC +, YP +).
Resumen de la invención
Como se menciona en la sección de antecedentes, la calidad de un banco de células criopreservadas es crítico en la utilización de un banco de células para la producción de biofármacos. En términos de esta invención, calidad significa, vitalidad tras la descongelación, robustez, estabilidad fenotípica/genética y conservación a largo plazo de la calidad de las células, propagadas y expandidas a partir de un banco de células criopreservadas. La presente invención se basa en la sorprendente observación, de que la muerte celular programada, particularmente la apoptosis, es la principal causa de muerte celular tras la descongelación de células CHO criopreservadas de un banco de células CHO congeladas. También se ha demostrado sorprendentemente que la evidencia de apoptosis temprana en las células de un cultivo propagado y expandido a partir de un banco de células criopreservadas de células CHO se correlaciona con la calidad del banco de células CHO, es decir con la vitalidad tras la descongelación, robustez, estabilidad fenotípica/ genética y conservación a largo plazo de la calidad de las células, observada cuando las células se propagan y expanden a partir de este banco de células. Además, se ha demostrado que la anexina V es un marcador adecuado para detectar la apoptosis temprana en células CHO que se han descongelado tras la criopreservación.
La presente invención por lo tanto está relacionada con la utilización de anexina V en la caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO. Particularmente, la presente invención está relacionada con la utilización de anexina V en un proceso de caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO, realizado preferiblemente poco después tras la descongelación de una porción de células de tal banco de células. De acuerdo con otra realización de la presente invención, dicho proceso incluye los pasos de: a) descongelar una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V frente a las células que no se unen a anexina V.
De acuerdo con otra realización, la presente invención también está relacionada con la utilización de anexina V en un proceso para la determinación de la calidad de un banco de células CHO, en el que dicho proceso incluye los pasos de: a) criopreservar las células en alícuotas en un medio líquido como banco de células; b) descongelar una porción de las células criopreservadas de dicho banco de células; c) cultivar dichas células en un medio de cultivo; d) establecer la tasa de vitalidad de dichas células descongeladas mediante la tinción de dichas células con anexina V. "Criopreservar las células en alícuotas" en un medio líquido significa, que alrededor de entre 0,25 y 3 x10^{7} células se congelan en entre uno y dos mL de un medio líquido en un contenedor. Por cada banco de células, se congelan alrededor de 200 contenedores o viales.
La presente invención también está relacionada con la utilización de un equipo que comprende anexina V para la caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO tras la descongelación, en el que la anexina V se utiliza para determinar la tasa de vitalidad de las células criopreservadas tras la descongelación. De acuerdo con una realización preferible de la presente invención, la tasa de vitalidad de las células criopreservadas tras la descongelación se determina mediante un proceso que incluye los pasos de a) descongelar una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V frente a las células que no se unen a anexina V. Además, la presente invención también proporciona un equipo que comprende anexina V y un prospecto que incluye la información para el uso de la anexina V en la caracterización de un banco de células de células CHO mediante el proceso de la invención aquí descrito.
La presente invención proporciona además un proceso para la caracterización de un banco de células CHO que incluye los pasos de a) descongelar una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V frente a las células que no se unen a anexina V.
De acuerdo con otra realización, la presente invención también proporciona un proceso de medición de la tasa de vitalidad de un banco de células CHO tras la descongelación, lo que incluye los pasos de a) descongelar una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V frente a las células que no se unen a anexina V.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 muestra el patrón característico de muerte celular de un cultivo de células CHO tras la criopreservación. Las células CHO DG44 se congelaron utilizando un congelador a una concentración de células de 2 x10^{7} células/mL en medio de cultivo al 90% y DMSO al 10%. Las células se analizaron mediante FACS en los puntos temporales indicados. El primer carril muestra la difracción frontal en el eje Y y la difracción lateral en el eje X. Se fijaron ventanas para distinguir las células que representan células muertas o vivas según se deriva de su morfología. El carril 2 muestra los mismos gráficos y las células CHO positivas para anexina V se muestran en gris. El carril 3 muestra la tinción con yoduro de propidio (YP) representada frente a la tinción con anexina V. Los puntos de acuerdo con la ventana de difracción frontal y lateral son grises.
La Figura 2 muestra que la tinción con anexina V a las 6 h tras la descongelación predice la calidad del banco de células. Las células CHO DG44 se congelaron utilizando un congelador a una concentración de células de 2 x10^{7} células/mL en medio de cultivo del 90% y DMSO al 10%. El tamaño del banco de células fue de 220 viales. A). Análisis de FACS de las células teñidas con anexina V a las 6 h tras la descongelación. Los datos se representan como un gráfico de difracción frontal lateral (las ventanas son las descritas en la Figura 1) y como un gráfico de intensidad de la anexina V. B). Crecimiento y viabilidad de los cultivos tras la descongelación. Las células se contaron en cada pase. Simultáneamente, se determinó la viabilidad mediante la exclusión de azul de tripano.
La Figura 3 muestra diferentes bancos de células que muestran diferentes apoptosis tras la descongelación. Las CHO DG44 se congelaron utilizando un congelador con una concentración de células de 1 x10^{7} o 2 x10^{7} células/mL en diferentes medios de congelación. El tamaño de los bancos de células fue de >200 viales. Las células se criopreservaron utilizando un congelador o una caja de espuma de poliestireno en dos medios de congelación diferentes. Los cultivos se analizaron mediante una tinción con anexina V a las 6 h tras la descongelación.
La Figura 4 muestra la utilización de las mediciones de la apoptosis temprana para comprobar la calidad del medio. Las células CHO DG44 se congelaron utilizando un congelador a una concentración de células de 2 x10^{7} células/mL en un medio de cultivo al 90% y DMSO al 10%. El tamaño del banco de células fue de 220 viales. Se utilizaron diferentes preparaciones de medios para la generación de tres bancos de células. Los cultivos se analizaron mediante FACS a las 6 h tras la descongelación, mediante distribución del ciclo celular, mediante difracción frontal-lateral y mediante tinción con anexina V.
Descripción detallada de la invención Definiciones
El término "el(los) cultivo(s) celular(es) se inició (iniciaron)" se refiere al punto temporal, en el que las células criopreservadas se descongelan y transfieren a las condiciones de cultivo adecuadas para la propagación y crecimiento de dichas células en un cultivo celular.
El término "cultivo celular" significa múltiples células cultivadas en un recipiente bajo condiciones adecuadas para el crecimiento de las células.
El término "vitalidad tras la descongelación" significa el comportamiento a lo largo del tiempo de la recuperación tras la descongelación de las células propagadas a partir de un banco de células dado, medido como el porcentaje de células viables respecto a células no viables en el momento del subcultivo. Este parámetro es esencial para el tiempo necesario para establecer cultivos de inóculo robustos y para el posterior escalaje para el cultivo a gran escala. Por lo tanto es un parámetro crítico del proceso.
El término "robustez" describe la reproducibilidad con la que dichos cultivos celulares se recuperan tras la criopreservación de acuerdo con un patrón establecido de vitalidad post descongelación. Un banco de células robusto resultará en menores diferencias entre los comportamientos post descongelación de sus diferentes viales. El término "vial/viales" se refiere al número de células congeladas en un contenedor. Normalmente, un vial contiene entre 0,25 y 3x10^{7} células en uno o dos ml de un medio líquido.
El término "estabilidad fenotípica/genética" de células se define por los cambios en los niveles de RNA y de expresión de proteína observados cuando las células de un determinado banco de células se cultivan durante un periodo de tiempo relevante al formato del proceso determinado, por ejemplo, para alrededor de 100 a 300 subpases. Un banco de células de mala calidad, lo que quiere decir unas vitalidades tras la descongelación bajas, dará lugar a una estabilidad fenotípica/genética baja debida a una alta presión de selección cuando se inician los cultivos. Una vitalidad tras la descongelación baja en el sentido dado por la presente invención indica que no más del 50%, preferiblemente no más del 30%, más preferiblemente no más del 20%, aún más preferiblemente no más del 15% de las células son anexina V positivas en las 6 h después de la descongelación. En otras palabras, un banco de células de alta calidad se caracteriza en que la tasa de vitalidad tras la descongelación es superior al 50%, preferiblemente más del 70%, más preferiblemente más del 80%, aún más preferiblemente más del 85% de las células viables, lo que indica que son anexina V negativas en las 6 h después de la descongelación.
El término "calidad de preservación a largo plazo" se define por el cambio de los tres parámetros anteriormente descritos durante un prolongado periodo de criopreservación, por ejemplo alrededor de 20 años, de un banco de células determinado.
Descripción de la invención
La necesidad de eliminar el suero de los procesos de cultivo de células de mamífero, particularmente del cultivo de células CHO, ha resultado en una mayor sensibilidad de los cultivos hacia la muerte celular en diferentes estadíos de un proceso de producción. Se proporciona un análisis detallado de la muerte celular durante la descongelación de células CHO después de la criopreservación. Un hallazgo sorprendente de la presente invención fue que la muerte celular programada o apoptosis es la forma predominante de muerte celular provocada por la criopreservación de células CHO. Se observó sorprendentemente, tan pronto como a las 3 h tras la descongelación, un aumento de nivel de fosfatidilserina en la superficie celular de las células CHO. La presentación de fosfatidilserina en la superficie celular de las células CHO como resultado de la pérdida de asimetría de fosfolípidos es una característica temprana de la muerte celular programada. En este punto, la integridad de la membrana celular está todavía intacta.
En tiempos tempranos tras la descongelación, por ejemplo, de 3 a 24 h tras la descongelación, las células CHO anexina V positivas, mostraron todavía estar morfológicamente intactas (como se puede observar en las representaciones de difracción frontal-lateral). En tiempos más tardíos (alrededor de 24-48 h tras la descongelación), la mayoría de células CHO anexina V positivas parecieron mostrar signos de reducción/desestructuración de membrana como se puede observar en los análisis de difracción frontal-lateral. De acuerdo con estos hallazgos sorprendentes, el porcentaje de células CHO que pueden ser teñidas con yoduro de propidio (YP) sólo aumenta significativamente 24 h tras la descongelación. Estos datos describen por primera vez la naturaleza y evolución de la muerte celular de las células CHO tras la criopreservación. Ciertas células CHO muestran signos de haber iniciado un programa de destrucción en las primeras horas después de haber sido desplazadas a un medio de cultivo caliente y posteriormente estas células se desestructuran durante un periodo de 48 h.
La anexina V se describió inicialmente como una proteína vascular con fuertes propiedades anticoagulantes (Reutelsberger et al., 1885). Parece que pertenece a una familia de multigenes de proteínas definidas por un motivo repetido, originalmente denominado como el lazo endonexina. En este tiempo, han sido identificadas y clonadas las secuencias génicas que codifican la proteína anexina V de varias especies. Por ejemplo véase el Nº de acceso NP 001145 de la base de datos de proteínas del NCBI.
La presente invención por lo tanto se refiere a la utilización de anexina V en la caracterización de un banco de células CHO criopreservadas. Particularmente, la presente invención se refiere a la utilización de anexina V en un proceso de caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO. De acuerdo con otra realización de la presente invención, dicho proceso incluye los pasos: a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V.
De acuerdo con otra realización de la presente invención también está relacionada con la utilización de anexina V in un proceso para determinar la calidad de un banco de células CHO, en el que dicho proceso incluye los pasos: a) criopreservar las células en partes en un medio líquido como un banco de células; b) descongelar una porción de las células criopreservadas de dicho banco de células; c) cultivar dichas células en un medio de cultivo; d) establecer la tasa de vitalidad de dichas células descongeladas mediante la tinción de dichas células con anexina V. Los criterios de calidad de un banco de células CHO son la vitalidad post-descongelación, robustez, estabilidad fenotípica/genética y calidad de preservación a largo plazo, que se observa cuando las células se propagan y se expanden a partir de este banco de células. Estos criterios se ven afectados principalmente por el número de células CHO que sobreviven al proceso de congelación/descongelación, en otras palabra, el número de "células intactas". Un gran número de células CHO intactas garantiza un rápido crecimiento del cultivo celular inicial, reduce el número de paso de subcultivo necesarios para expandir el cultivo celular hasta el nivel de fermentación a gran escala y por lo tanto para minimizar el riesgo de que las variantes genéticas puedan establecerse y/o dominar el cultivo. La tasa de vitalidad se estima preferiblemente mediante la tinción con anexina V, que indica la detección y cuantificación de células que se unen a anexina V. Por lo tanto, de acuerdo con una realización más preferible de la presente invención, el proceso de tinción con anexina V para poder estimar la tasa de vitalidad de células CHO propagadas y expandidas tras la descongelación incluye los pasos. a) incubar las células descongeladas con anexina V; b) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; c) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; d) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V. Se proporcionan ejemplos de células CHO en la Tabla 1.
TABLA 1 Líneas celulares CHO
1
Se ha descrito una serie de ensayos para la detección de cultivos de células apoptóticas, lo que incluye ensayos de encadenamiento de DNA (DNA-laddering) y TUNEL (Gavrieli et al., et al., 1992; Wijsman et al., 1993). Sin embargo, los métodos de citometría de flujo para la detección de la apoptosis ofrecen varias ventajas sobre las técnicas anteriores ya que permiten una rápida cuantificación de propiedades de miles de células. La utilización de las mediciones de citometría de flujo permite una evaluación rápida de alto procesamiento de diferentes estrategias para generar un banco de células con éxito para una línea celular determinada. Por esta razón y de acuerdo con otra realización de la presente invención, la anexina V está marcada con isotiocianato de fluoresceína (FITC). Esto permite la utilización de un ensayo de afinidad de anexina V para citometría de flujo para estimar la tasa de vitalidad de células tras la descongelación. Por lo tanto, la presente invención también está relacionada con un proceso de tinción de células criopreservadas de un banco de células CHO tras la descongelación de una porción de células de ese banco de células con anexina V marcada con FITC en un ensayo de citometría de flujo. Un ejemplo de dicho ensayo se proporciona aquí más en detalle en la sección de Ejemplos.
Los resultados proporcionados aquí dan una explicación para los resultados que se observan normalmente cuando se monitoriza la viabilidad de las células en un paso de congelación/descongelación con un análisis de exclusión con azul de tripano (el método estándar que refleja el estado de la técnica en la caracterización del banco de células). Estos experimentos clásicos de control de la descongelación generalmente muestra un gran número de células viables justo después de la descongelación y la viabilidad sólo disminuye entre las 24 h y las 48 h tras la descongelación. Un amplio análisis de datos obtenidos para los bancos de células CHO reveló de forma sorprendente el valor predictivo de los ensayos de afinidad para anexina V en la citometría de flujo. El porcentaje de células CHO apoptóticas medidas como tempranas en las 6 h tras la descongelación proporciona información en el éxito de una estrategia de criopreservación que se obtiene sólo normalmente en los experimentos clásicos de control de la descongelación en un periodo de 2-10 días. La presente invención por lo tanto también proporciona la utilización de anexina V en la caracterización de un banco de células CHO o en un proceso para determinar la calidad de un banco de células CHO, en el que el paso de incubación con anexina V se realiza en las 24 h, preferiblemente, 18 h, más preferiblemente 12 h, aún más preferiblemente 9 h, lo más preferible 6 h tras la descongelación y el inicio del cultivo de las células criopreservadas. En esta línea, el método de uso más preferible del ensayo de citometría de es flujo utilizando anexina V marcada con FITC.
De acuerdo con otra realización, la presente invención también pertenece al uso de un equipo que comprende la anexina V para la caracterización de un banco de células CHO criopreservadas tras la descongelación, en el que la anexina V se utiliza para determinar la tasa de vitalidad de las células CHO criopreservadas tras la descongelación. De acuerdo con una realización preferible de la presente invención, la tasa de vitalidad de un cultivo celular se determina mediante un proceso que incluye los pasos a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V. Además, la presente invención también proporciona un equipo que comprende anexina V y un prospecto que incluye la información para utilizar la anexina V en la caracterización de un banco de células CHO.
La presente invención proporciona además un proceso para caracterizar un banco de células CHO que incluye los pasos a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas; b) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado; c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V. De acuerdo con otra realización, la presente invención también proporciona un proceso para medir la tasa de vitalidad de un banco de células CHO tras la descongelación, que incluye los pasos a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas b) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado c) incubar dichas células con anexina V; d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; f) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V. Como se muestra en la presente invención, el porcentaje de células CHO apoptóticas medidas tan pronto como de 24 a 6 horas después de la descongelación, proporciona información sobre el éxito de la estrategia de criopreservación para las células CHO que normalmente sólo se gana en los experimentos de control de la descongelación clásicos en un periodo de 2-10 días. La presente invención también proporciona por lo tanto los procesos de caracterización de un banco de células CHO o medir la tasa de vitalidad de un banco de células tras la descongelación, en el que el paso de incubación con anexina V se realiza en un plazo de 24 h, preferiblemente, 18 h, más preferiblemente 12 h, aún más preferiblemente 9 h, aún más preferiblemente 6 h tras la descongelación e iniciar el cultivo de las células criopreservadas.
Las células CHO pueden almacenarse con éxito en nitrógeno líquido a alrededor de -196ºC durante periodos de tiempo prolongados. Sin embargo, las células pueden normalmente no congelarse y descongelarse sin la adición de crioprotectores como DMSO. Incluso así, el proceso de congelación-descongelación resultará en la pérdida de células. Un parámetro crítico para la cantidad de estas pérdidas es el protocolo utilizado para el proceso de congelación y descongelación. Generalmente es beneficioso controlar el descenso de la temperatura durante la congelación para asegurar que la temperatura disminuye a una tasa de alrededor de un grado por minuto. Para descongelar con éxito las células CHO, es necesario calentar el criovial (células descongeladas) tan rápido como sea posible hasta 37ºC, la temperatura óptima de cultivo de casi todas las líneas celulares CHO. Una ruta para asegurar unas tasas altas de recuperación de cultivos tras la descongelación es congelar las células en un medio que contenga altas cantidades de suero.
Recientemente, se ha centrado mucho trabajo en el desarrollo de estrategias de criopreservación para las células CHO sin el uso de suero en el medio de congelación. Una serie de crioprotectores pueden facilitar un almacenamiento a largo término con éxito de células sin la presencia de suero. Además, la composición del medio basal como tal, posee un impacto significativo en el éxito de cualquier criopreservación. La evaluación de la calidad por vía rápida descrita de cualquiera de estas estrategias permitirá reducir drásticamente los tiempos de desarrollo que son necesarios para generar protocolos fiables para la generación de un banco de células de reserva o de trabajo para la producción de nuevas líneas celulares CHO. De acuerdo con otra realización, la presente invención también proporciona un proceso para analizar un medio de cultivo para células CHO sin tener en cuenta el uso de dicho medio para la criopreservación de células CHO que incluye los pasos: a) criopreservar células CHO en un medio de cultivo adecuado para cultivar esas células, preferiblemente a temperaturas por debajo de los -100ºC, por ejemplo, en nitrógeno líquido, b) descongelación de una porción o todas las células criopreservadas; c) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado; d) incubar dichas células con anexina V; e) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a anexina V; f) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a anexina V; g) calcular la proporción de células que se unen a anexina V vs células que no se unen a anexina V. Los medios de cultivo adecuados son aquellos que están basados en los medios comercialmente disponibles como el medio de Ham F12 (Sigma, Deisenhofen, Alemania), RPMI-1640 (Sigma), Medio Modificado de Dulbecco (DMEM; Sigma), Medio Esencial Mínimo (MEM; Sigma), Medio Modificado de Dulbecco Iscove (IMDM; Sigma), CD-CHO (Invitrogen, Carlsbad, CA), CHO-S-Invtirogen), medio CHO libre de suero (Sigma), y medio CHO libre proteínas (Sigma). De acuerdo con un proceso preferible, dicho medio incluye crioprotectores específicos como DMSO, BSA, metilcelulosa o glicina. De acuerdo con una realización más preferible de este proceso, el paso de incubación con anexina V se realiza en un plazo de 24 h, preferiblemente 18 h, más preferiblemente 12 h, aún más preferiblemente 9 h, lo más preferible 6 h tras la descongelación e iniciar el cultivo de las células criopreservadas. El uso de anexina V marcada con FITC en un ensayo de citometría de flujo es además una realización preferible del proceso inventivo.
La invención descrita antes generalmente se entenderá más fácilmente mediante la referencia de los siguientes ejemplos, que se incluyen aquí con el único propósito de ilustrar ciertas realizaciones de la presente invención y no pretenden limitar la invención de ninguna manera.
Ejemplos Abreviaturas
BSA: albúmina sérica bovina
CHO: ovario de hámster chino
DMSO: dimetil sulfóxido
ELISA: ensayo inmunosorbente unido a enzimas
FACS: separador de células activado por fluorescencia
FITC: isotiocianato de fluoresceína
BCR: banco de células de reserva
PBS: tampón fosfato salino
PCR: reacción en cadena de la polimerasa
YP: yoduro de propidio
BCPP: banco de células post producción
FS: Fosfatidilserina
BCT: banco de células de trabajo
Métodos Cultivo celular
Se investigaron bancos de células de varias líneas celulares CHO en suspensión utilizadas para la producción y desarrollo de biofármacos. Todas las líneas celulares utilizadas están patentadas y su producto proteico no será revelado. Todas las líneas celulares utilizadas en escala de producción y desarrollo se mantuvieron en cultivos de reserva de siembra seriados en frascos T aireados en superficie (Nunc, Dinamarca) en incubadores (Thermo, Alemania) o frascos de agitación con burbujeo (Wheaton, USA) en cámaras de incubación especialmente diseñadas a una temperatura de 37ºC y una mezcla adecuada de aire y CO_{2} al 5%. Los cultivos de reserva de siembra se dividieron cada 2-3 días en una proporción de división adecuada y se sembraron en densidad. La concentración de células se determinó en todos los cultivos utilizando un hemocitómetro. Se evaluó la viabilidad mediante el método de exclusión de azul tripano. Los cultivos se originaron de los bancos de células de reserva, de trabajo o de seguridad y se analizaron exhaustivamente para la esterilidad, micoplasma y la presencia de agentes extraños. Todas las operaciones tuvieron lugar en laboratorios con filtros de aire y bajo estrictos procedimientos que cumplen con las ``Buenas Prácticas de Fabricación actuales (cGMP). Todos los medios de cultivo utilizados están patentados y su composición no será revelada.
Criopreservación
La congelación y descongelación se realizaron de acuerdo con los protocolos estándar y la ley fundamental "congelación lenta-descongelación rápida". Los cultivos se cogieron en fase exponencial a partir de cultivos en suspensión y se congelaron en viales de plástico de 1,8 mL (Nunc, Dinamarca) tanto mediante una máquina de congelación controlada por un ordenador (Consarctic, Alemania) con un programa de congelación especialmente diseñado o mediante una caja de espuma de poliestireno en un congelador a -70ºC. Tras congelar a -100ºC (máquina de congelación) o -70ºC (caja de espuma de poliestireno) las células se transfirieron a contenedores de nitrógeno líquido. Los viales se almacenaron en la fase gaseosa del nitrógeno líquido (<- 150ºC). La concentración de células en los viales de congelación fue de 1-3 E^{7} células. Se utilizó DMSO (Merck, Alemania) como crioprotector a una concentración del 10%. Los medios de congelación detallados están también patentados y su composición no será revelada. Las células CHO se descongelaron en un baño de agua a 37ºC, se diluyeron con medio apropiado y se centrifugaron (Thermo, Francia) a 180Xg. Posteriormente las células se sembraron en medio de cultivo a una concentración de células definida.
Citometría de flujo
Se midieron la fluorescencia de la anexina-V-FITC verde y del YP roja con un contador de citometría de flujo Epics XL (Coulter, Alemania) utilizando el programa Expo32. La excitación se obtuvo a 488nm con un láser de Argón y se midió utilizando los filtros de paso de banda estándar (53020nm) y de paso alto (>570nm). En cada muestra, se midieron 10000 eventos para la apoptosis y 3000 eventos para el análisis de ciclo celular. Los datos se analizaron con la herramienta de análisis Expo32. Para discriminar entre las células muertas y apoptóticas, se añadió a la suspensión celular la tinción de DNA impermeable a la membrana, yoduro de propidio (YP) en paralelo a la anexina V. Con esta doble tinción es posible discriminar entre células vivas, en apoptosis temprana, en apoptosis tardía y necróticas. El ensayo de anexina V se realizó de acuerdo con el protocolo del vendedor (Becton-Dickinson, Alemania). Se analizaron las células y se cuantificó la apoptosis mediante citometría de flujo. La tinción con yoduro de propidio se utilizó además para determinar la distribución de ciclo celular. Las muestras se tomaron de las suspensiones celulares sin fijación. Los cultivos se centrifugaron y se lavaron con PBS (Gibco, Alemania). Después, se añadió la solución de tinción con YP (BioSure, USA) y se procedió a la incubación durante 30 min. Posteriormente, se analizaron las células mediante citometría de flujo. La proporción de células en cada fase del ciclo celular se obtuvo a través del programa Multicycle (Phoenix Flow, USA).
Resultados
Análisis cuantitativo de la muerte celular durante la descongelación de las células CHO criopreservadas:
Aunque se sabe que las células CHO mueren cuando los cultivos de células se reinician tras la criopreservación, la cinética y naturaleza de esta célula muerta no se ha descrito en gran detalle. Para cuantificar el alcance de la muerte celular programada en los cultivos celulares de células CHO durante las primeras horas tras la descongelación, se determinó la cantidad de fosfatidilserina mostrada en la membrana externa de las células CHO. Las células CHO DG44 y los derivados de esta línea celular se utilizan ampliamente para la producción de biofármacos. Se analizó primero un banco de células de 220 viales generados para una línea celular de producción derivada de CHO. El banco de células se generó con un medio de congelación libre de componentes animales, como suero, y se conoce por ser particularmente sensible respecto a la viabilidad del cultivo tras la descongelación. Se analizaron las células mediante tinción doble con anexina V y yoduro de propidio en los tiempos 0 h, 3 h, 6 h, 24 h y 48 h. Se detectó un alto porcentaje de aproximadamente un 30% de células positivas para anexina V justo después de que las células se colocaran en medio de cultivo (0 h), aumentando hasta casi un 50% durante las primeras 3 h y permaneciendo alrededor del 40% para las primeras 48 h tras la descongelación. Para todos los bancos de células CHO DG44 analizados, el pico de nivel de células positivas para anexina V se alcanzó entre las 3 h y 24 h tras la descongelación. En contraste con esto, la cantidad de células positivas para YP permaneció relativamente bajo inmediatamente después de la descongelación antes de que aumentara de forma notable a las 24 h tras la descongelación. En la fase inicial de la apoptosis, se muestra FS en la superficie celular y la anexina V se une a su diana. En esta fase inicial, la membrana plasmática todavía es capaz de excluir el YP y, así, las células son anexina V+/YP-(Figura 1, cuadrante inferior derecho). Posteriormente, las células perdieron la integridad de su membrana plasmática y su capacidad de excluir el YP. Estas células apoptóticas tardías son anexina V+/YP+ (Figura 1, cuadrante superior derecho). Por lo tanto, estos experimentos demuestran que la transición desde el estadio de apoptosis temprana a tardía sólo ocurre tras las primeras 6 horas tras la descongelación. Esto también se ve en el diagrama de difracción frontal-lateral (Figura 1), mostrando un aumento en las células muy pequeñas, que representan los cuerpos celulares destruidos (Figura 1) en el punto de transición alrededor de 24 horas tras la descongelación.
El análisis tras la descongelación mediante tinción con anexina V sirve como marcador predictivo temprano para la calidad del banco de células CHO:
Como puede realizarse una cuantificación de la apoptosis mediante tinción rápida de anexina V para un gran número de muestras, ofrece un método atractivo para el análisis de alto rendimiento de diferentes métodos de criopreservación. Se analizaron dos bancos de células CHO de dos células CHO de producción diferentes mediante tinción con anexina V y se compararon estos datos con la tinción de exclusión con azul de tripano medido para seis pases de cultivo (control de descongelación estándar). Como se puede ver en la Figura 2A, la cantidad de células mostrando fosfatidilserina varía significativamente entre cultivos descongelados de los dos bancos de células diferentes (35% en la descongelación 1 versus 67% en la descongelación 2). El control clásico de descongelación (Figura 2B) mostró la misma diferencia significativa entre las viabilidades del cultivo de los diferentes bancos. La descongelación 1 demostró una caída al 83% antes de la recuperación del cultivo a una viabilidad de más del 90% cuatro días después de la descongelación. En contraste a esto, sólo el 60% de células eran viables 24 h después de la descongelación 2. Este cultivo tardó once días en alcanzar el 90% de viabilidad como se determinó mediante exclusión con azul de tripano. Un banco de células de esta calidad claramente no será adecuado para un proceso de producción comercial. Estos datos demuestran de forma sorprendente que el porcentaje de células que muestran FS en su superficie predice el resultado de controles clásicos de la descongelación tan pronto como 6 h tras la descongelación.
La calidad del banco de células puede variar de forma dramática entre las diferentes líneas celulares, protocolos de criopreservación y calidad del medio de cultivo:
Para probar el método recién descrito para la evaluación de la calidad del banco de células analizamos una serie de bancos de células. Se generaron dos bancos de células CHO DG44, uno contenía BSA al 0,8% en el medio de congelación, el otro no contenía BSA pero sí una mezcla 50:50 de medio condicionado y medio fresco. Tal como se describe en la Figura 3, las células mostraron tasas significativamente inferiores de apoptosis temprana para ambos medios de congelación. Además, fue sólo evidente un efecto beneficioso al añadir BSA al 0,8% en comparación con las células almacenadas en medio condicionado cuando se utilizaron las cajas de espuma de poliestireno.
Uso de mediciones de apoptosis tras la descongelación para el desarrollo de estrategias de vía rápida:
Como el tiempo de suministro clínico y de mercado es un parámetro crucial para el desarrollo exitoso de nuevos biofármacos, existe un interés creciente en los métodos de cribado de vía rápida para el proceso de optimización y el proceso de mejoras. Se determinó por lo tanto la viabilidad de utilizar mediciones de anexina V justo 6 h después de la descongelación para evaluar las estrategias para establecer una criopreservación exitosa en las nuevas líneas celulares de producción de CHO.
Encontramos de forma sorprendente que las mediciones tempranas de apoptosis tras la descongelación son una herramienta sensible para la evaluación de la calidad de materiales básicos. Un factor esencial para la criopreservación exitosa de células CHO es la calidad del medio utilizado. Generalmente, la GMP incluye fechas de caducidad claramente definidas para el uso de los medios para cultivar células CHO. Se investigó si las condiciones agresivas de un proceso de congelación descongelación puede resultar en tiempos de uso menores para el uso del medio en comparación con los procedimientos de cultivo estándar. Se utilizó un medio con una vida de estantería de cuatro semanas para el cultivo de células CHO para analizar esto en profundidad. La Figura 4 muestra datos de apoptosis temprana (6 h tras la descongelación) para células CHO que estaban criopreservadas en medio recién preparado (4 inferior), medio que se almacenó a 4ºC durante cuatro semanas (4 arriba) y medio que se almacenó a 4ºC durante cuatro semanas y que se suplementó con una preparación fresca de un compuesto esencial inmediatamente antes de ser usado (4 medio). Estos datos muestran un descenso en el rendimiento de descongelación para los bancos de células generados con este medio justo antes de su fecha de caducidad. Este efecto puede reducirse significativamente añadiendo una preparación fresca de un componente esencial del medio relevante. La determinación simultánea de la distribución del ciclo celular 6 h después de la descongelación mostró que un medio de cuatro semanas no presenta efecto inhibitorio sobre el crecimiento. Estos resultados demuestran de forma sorprendente cómo las mediciones de apoptosis tempranas tras la descongelación podrían utilizarse para análisis de sensibilidad de medios y sus componentes respecto al uso de preparaciones de medios para la criopreservación de células CHO.
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Claims (15)

1. La utilización de anexina V en un proceso de caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO tras la descongelación.
2. La utilización de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza por que dicho proceso incluye los pasos de:
a) la descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas;
b) el cultivo de dichas células en un medio de cultivo;
c) incubar dichas células con anexina V;
d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a la anexina V;
e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a la anexina V;
f) calcular la proporción de células unidas a anexina V frente a las no unidas a anexina V.
\vskip1.000000\baselineskip
3. La utilización de acuerdo con la reivindicación 1, en la que la anexina V se utiliza en un proceso para determinar la calidad de un banco de células de células CHO, en el que dicho proceso incluye los pasos de:
a) criopreservar las células en alícuotas en un medio líquido como un banco de células;
b) descongelar una porción de las células criopreservadas de dicho banco de células;
c) cultivar dichas células en un medio de cultivo;
d) establecer la tasa de vitalidad de dichas células descongeladas tiñendo dichas células con anexina V, en las que la tasa de vitalidad es la proporción entre células unidas a anexina V frente a las células no unidas a anexina V.
\vskip1.000000\baselineskip
4. La utilización de acuerdo con la reivindicación 3, que se caracteriza por que la tinción con anexina V se realiza:
a) incubando las células tras la descongelación con anexina V;
b) detectando las células y cuantificando el número de células que se unen a la anexina V;
c) detectando las células y cuantificando el número de células que no se unen a la anexina V;
d) calculando la proporción de células que se unen a anexina V frente a las células que no se unen a anexina V.
\vskip1.000000\baselineskip
5. La utilización de acuerdo con la reivindicación 1, en la que un equipo que comprende anexina V se utiliza para la caracterización de un banco de células criopreservadas de células CHO tras su descongelación, en el que la anexina V se utiliza para determinar la tasa de vitalidad de las células criopreservadas tras la descongelación, en el que la tasa de vitalidad es la proporción entre las células que se unen a anexina V y las células que no se unen a anexina V.
6. La utilización de acuerdo con la reivindicación 5, en la que un equipo además comprende una solución de tinción de yoduro de propidio en PBS y un tampón de unión a anexina V.
7. La utilización de acuerdo con las reivindicaciones 5 o 6, que se caracteriza por que el proceso de determinación de la tasa de vitalidad incluye los pasos de:
a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas;
b) cultivar dichas células en un medio de cultivo;
c) incubar dichas células con anexina V;
d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a la anexina V;
e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a la anexina V;
f) calcular la proporción de células que se unen a la anexina V frente a las células que no se unen a la anexina V.
8. La utilización de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 4, y 7, que se caracteriza por que el paso de incubación con anexina V se realiza durante las 24 h siguientes a la descongelación y se inicia el cultivo de las células.
9. La utilización de acuerdo con la reivindicación 8, que se caracteriza por que el paso de incubación con anexina V se realiza en las 6 h siguientes a la descongelación y se inicia el cultivo las células.
10. La utilización de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones de 1 a 9, que se caracteriza por que la anexina V está marcada con isotiocianato de fluoresceína (FITC).
11. El proceso de caracterización de un banco de células de las células CHO que incluye los pasos de:
a) descongelación de una porción de células de un banco de células criopreservadas;
b) cultivar dichas células en un medio de cultivo apropiado;
c) incubar dichas células con anexina V;
d) detectar las células y cuantificar el número de células que se unen a la anexina V;
e) detectar las células y cuantificar el número de células que no se unen a la anexina V;
f) calcular la proporción de células que se unen a la anexina V frente a las células que no se unen a la anexina V.
12. El proceso de acuerdo con la reivindicación 11 para medir la tasa de vitalidad de un banco de células de células CHO tras su descongelación, en el que la tasa de vitalidad es la proporción entre las células que se unen a la anexina V frente a las células que no se unen a la anexina V.
13. El proceso de acuerdo con las reivindicaciones 11 o 12, que se caracteriza por que el paso de incubación con anexina V se realiza en las 24 h siguientes a la descongelación y se inicia el cultivo de las células.
14. El proceso de acuerdo con la reivindicación 13, que se caracteriza por que el paso de incubación con anexina V se realiza en las 6 h siguientes a la descongelación y se inicia el cultivo de las células.
15. El proceso de acuerdo con las reivindicaciones de 11 a 14, que se caracteriza por que la tinción de las células se realiza con anexina V marcada con isotiocianato de fluoresceína (FITC).
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