ES2281413T3 - Nuevas colectinas. - Google Patents
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Abstract
Una proteína que comprende una secuencia amino-acídica que consiste en 245 aminoácidos expuestos en la posición aminoacídica 1-245 de la SEQ ID NO: 4.
Description
Nuevas colectinas.
El presente invento se refiere a aislar
colectinas humanas (aquí referidas como
"hCL-L2", genes y proteínas). El presente
invento se refiere además a métodos para la producción y uso de las
mismas. Adicionalmente, el presente invento se refiere a métodos
para cribar fármacos usando CL-L2s. Por otra parte,
el presente invento también se refiere a los vectores de expresión
que comprenden genes CL-L2 y células transformadas
que fueron transformadas con el vector de expresión.
Los sistemas de complemento que juegan un papel
importante en un mecanismo de defensa corporal se conoce que
incluyen: una ruta clásica en la cual una inmunoglobulina sirve como
una molécula de reconocimiento seguida por la activación de C1 que
es el primer componente del complemento; y una ruta alternativa en
la que C3, que es el tercer componente del complemento, es
directamente acoplado a sustancias extrañas tales como bacterias.
Además de estas rutas de la activación del complemento, se ha
ilustrado en los últimos años una ruta de lectina, en la que una
proteína de unión a manosa (aquí referida como "MBP"), que es
una lectina sérica, activa el sistema de complemento a través del
reconocimiento directo de y acoplándose a una cadena hidrocarbonada
sobre la superficie de la sustancia extraña (Sato, T y otros, Int.
Immunol., 6, 665-669, 1994).
MPB es una lectina de tipo C que se une
específicamente a la manosa, N-acetilglucosamina y
similares en presencia de Ca, cuya estructura comprende un domino
de tipo colágeno que contiene al menos un
(Gly-Xaa-Yaa)n, y el dominio
de reconocimiento de cadena hidrocarbonada (CRD). De modo similar a
MBP, las lectinas que tienen un dominio de tipo colágeno y CRD son
genéricamente llamadas colectinas (Malhotora, R y otros, Eur. J.
Immunol., 22, 1437-1445, 1992), que incluye la
colectina 43 (CL-43), tensioactivo A
(SP-A), tensioactivo D (SP-D),
conglutinina bovina (BKg) y similares, además de MBP. La colectina
tiene una actividad opsonizante, que se cree que participa en una
inmunidad fundamental frente a una variedad de microorganismos tales
como bacterias y virus (Kawasaki, N. y otros, J. Biochem., 106,
483-489, 1989; Ikeda, K y otros, J. Biol. Chem.,
262, 7451-7454, 1987; Ohta, M. y otros, J. Biol.
Chem., 265, 1980-1984, 1990; Summerfield, J. A., y
otros, Lancet, 345, 886, 1995).
Estas colectinas se conoce que están
constituidas de una estructura básica que contiene dominios
característicos tales como (1) CRD y (2) dominios de tipo colágeno
y similares como se muestra en la Fig. 1(a) (Malhortra y
otros, Eur. J. Immunol., 22, 1437-1445, 1992). Esta
estructura básica forma una subunidad a través de la composición de
una triple hélice en el dominio de tipo colágeno, y así estas
subunidades forman además una estructura oligomérica tal como un
trímero, tetrámero, hexámero y similares.
Recientemente, las colectinas se ha sugerido que
participan en la respuesta inmune no específica, por ejemplo, se
documento que juegan por ejemplo, un papel importante en neutralizar
y excluir diversos microorganismos en niños que tienen anticuerpos
maternos insuficientes provenientes de la madre o que tienen un
sistema de defensa específico que se desarrolló de modo
insuficiente (Super y otros, Lancet, 2, 1236-1239,
1989). Por otro lado, se han documentado los resultados de la
investigación implicando el papel de estas colectinas en el sistema
de defensa corporal, que por ejemplo, sugiere que los hospedadores
se vuelvan más susceptibles a infecciones a través de la
concentración reducida de MPB en sangre resultantes de la mutación
genética de MBP (Sumiya y otros, Lance, 337,
1569-1570, 1991). Además, se documentó que el
contenido en MBP sérica muestra un nivel reducido tras el fallo de
la opsonización (Madsen, H.O. y otros, Immuno genetics, 40,
37-44, 1994), mientras que las infecciones
bacterianas tienen lugar fácilmente (Garred, P. y otros, Lancet,
346, 941-943, 1995). Por lo tanto, puede
considerarse que MBP juega un papel importante en el sistema
inmune.
Los presentes inventores encontraron previamente
que BKg y MPB inhiben infecciones por virus de influenza (gripe) A
de los tipos H1 y H3 así como la actividad de hemaglutinación
(Wakamiya y otros, Glycoconjugate J., 8, 235, 1991; Wakamiya y
otros, Biochem. Biophys. Res. Comm., 187, 1270-1278,
1992). A partir de ahí, se obtuvo un clon de cADN que codifica BKg,
y la relevancia entre BKg y SP-D y similares ha sido
también encontrada (Suzuki y otros, Biochem. Biophys. Res. Comm.,
191, 335-342, 1993).
Por consiguiente, las colectinas son sustancias
de las que se espera la utilidad en la elucidación de los
mecanismos de defensa corporal y su utilidad como sustancias
biológicamente activas. Así, el hallazgo de nuevas especies
moleculares pertenecientes a la familia puede contribuir en gran
medida en diversos campos médicos y campos biológicos además de a
la terapia de enfermedades infecciosas.
El objeto del presente invento es proporcionar
materiales que pueden ser utilizados en la elucidación de mecanismos
de inmunidad fundamental; en la elucidación de mecanismos del
desarrollo de una amplia variedad de enfermedades tales como
infecciones bacterianas; en el diagnóstico, métodos profilácticos y
terapéuticos de los mismos; y para el desarrollo de reactivos y
fármacos para los mismos.
Por consiguiente, los aspectos proporcionados
por el presente invento son como se describen a continuación.
(1) Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 245 aminoácidos dispuestos
en la posición aminoacídica 1-245 de la SEQ ID NO:
4.
(2) Un polinucleótido dispuesto en la SEQ
ID NO: 46 (correspondiente a la secuencia de bases dispuesta en la
posición de la base 141-875 de la SEQ ID NO: 3); un
polinucleótido que codifica una secuencia aminoacídica dispuesta en
la posición aminoacídica 1-245 de la SEQ ID NO:
4
(3) Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 197 aminoácidos dispuestos
en la posición aminoacídica 1-197 de la SEQ ID NO:
6.
(4) Un polinucleótido dispuesto en la SEQ
ID NO: 55 (correspondiente a una secuencia de bases dispuestas en
la posición de bases 141-731 de la SEQ ID NO: 5); un
polinucleótido que codifica una secuencia aminoacídica dispuesta en
la posición aminoacídica 1-197 de la SEQ ID NO:
6.
(5) Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 221 aminoácidos dispuestos
en la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
8.
(6) Un polinucleótido dispuesto en la SEQ
ID NO: 56 (correspondiente a una secuencia de bases dispuesta en la
posición de bases 141-803 de la SEQ ID NO: 7); un
polinucleótido que codifica una secuencia aminoacídica dispuesta en
la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
8.
(7) Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 221 aminoácidos dispuestos
en la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
10.
(8) Un polinucleótido dispuesto en la SEQ
ID NO: 57 (correspondiente a una secuencia de bases dispuestas en
la posición de bases 141-803 de la SEQ ID NO: 9); un
polinucleótido que codifica una secuencia aminoacídica dispuesta en
la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
10.
(9) Un vector que comprende un
polinucleótido según (2), (4), (6), u (8);
(10) Una célula transformada que lleva un
polinucleótido según (2), (4), (6), u (8) a manera de permitir la
expresión;
(11) un proceso para la producción de una
proteína que comprende las etapas de cultivar una célula según
(10);
(12) Un proceso para cribar un fármaco en
el que la proteína según (1), (3), (5) o (7) es usada.
La Fig. 1 es un dibujo esquemático que ilustra
una estructura básica (a) de las colectinas principales documentadas
hasta este momento y una visión general de la proteína (MBP,
SP-A y SP-D).
La Fig. 2 es un dibujo que ilustra una mitad
procedente de un alineamiento de secuencias aminoacídica de cuatro
tipos de colectinas documentadas hasta este momento.
La Fig. 3 es un dibujo que ilustra la otra mitad
del alineamiento a la de la Fig. 2.
La Fig. 4 describe dibujos (a) y (b) que
muestran cada cebador empleado para la determinación de la secuencia
de la nueva colectina del presente invento, y la nueva colectina
obtenida de ese modo.
La Fig. 5 es un dibujo que ilustra una mitad
precedente de un alineamiento de secuencias aminoacídicas de cuatro
tipos de colectinas documentadas hasta este momento y una colectina
adicional (hCL-L2-1).
La Fig. 6 es un dibujo que ilustra la mitad
posterior del alineamiento de la Fig. 5.
La Fig. 7 muestra los resultados de análisis de
distribución de mARN en diversos tejidos humanos que demuestran la
distribución tisular de la colectina hCL-L2.
La Fig. 8 muestra un árbol filogenético de
diversas colectinas.
La Fig. 9 muestra resultados de análisis de
distribución de mARN en diversos tejidos humanos que demuestran la
distribución tisular de la colectina
hCL-L2-1 y
hCL-L2-2 del presente invento.
La Fig. 10 es un dibujo esquemático que ilustra
unas características de unión al azúcar de la colectina
hCL-L2-1.
Los presentes inventores clonaron con éxito
genes de colectinas humanas y murinas
(hCL-L2-1 y mCL-L2).
Un CRD (posición aminoacídica 113-271 de las SEQ ID
NOs: 2 y 13, posición aminoacídica 87-245 de la SEQ
ID NO: 4), que se cree que participa en inmunidad fundamental, y un
dominio de tipo colágeno (la posición aminoacídica 41- 112 de las
SEQ ID NOs: 2 y 13, la posición aminoacídica 18-86
de la SEQ ID NO:4) que tiene la secuencia de
(Gly-Xaa-Yaa)n estuvieron
presentes en el extremo C-terminal de la nueva
CL-L2.
Por otro lado, dos tipos de proteínas
(CL-L2-1 y
CL-L2-2) que tienen diferentes
secuencias aminoacídicas N-terminales fueron
encontradas para hCL-L2 como se muestra en la Fig.
4. Específicamente, loa aminoácidos N-terminales de
CL-L2-1 (posición
1-43) expuestos en la SEQ ID NO: 2 y aminoácidos
N-terminales de
CL-L2-2 (posición
1-17) expuestos en la SEQ ID NO: 4 fueron
diferentes, mientras que el resto fueron idénticos. Además, aunque
la posición de 1-43 de aminoácidos
N-terminal de
CL-L2-1 contuvieron una secuencia
señal y una espiral de un dominio de colágeno y similar, no hubo ni
una secuencia señal ni una espiral de un dominio del tipo colágeno
en la posición 1-17 del aminoácido
N-terminal de
CL-L2-2.
Además, existieron tres tipos de proteínas
correspondientes a CL-L2-2, que
resultaron de un corte y empalme alternativo de mARN. Esos son
referidos como un CL-L2-2v1 (SEQ ID
NO: 5, 6), CL-L2-2v2 (SEQ ID NO: 7,
8) y CL-L2-2v3 (SEQ ID NO: 9, 10).
CL-L2-2v1 es una forma derivada de
CL-L2-2 expuesta en la SEQ ID NO: 4
con deleción de la posición aminoacídica desde 18 a 65 (es decir,
deleción de la posición de bases desde 192 hasta 335 de
CL-L2-2 expuesta en la SEQ ID NO:
3); CL-L2-2v2 es una forma derivada
de CL-L2-2 expuesta en la SEQ ID
NO: 4 con deleción de la posición aminoacídica desde 18 hasta 41 (es
decir, deleción de la posición de bases desde 192 hasta 263 de
CL-L2-2 expuestas en la SEQ ID NO:
3); y CL-L2-2V3 es una forma
derivada desde CL-L2-2 expuesta en
la SEQ ID NO: 4 con la deleción de la posición aminoacídica desde 42
hasta 65 (es decir, deleción de la posición de bases desde 264
hasta 335 de CL-L2-2 expuesta en la
SEQ ID NO: 3). Estos tres tipos de proteínas resultaron todos de
cortes y empalmes diferenciales de
CL-L2-2 dentro del dominio de tipo
colágeno de los mismos.
El gen hCL-12 usado aquí incluye
hCL-L2-1 expuesto en la SEQ ID NO:
1, hCL-L2-2 expuesto en la SEQ ID
NO: 3, hCL-L2-2v1 expuesto en la
SEQ ID NO: 5, hCL-L2-2v2 expuesto en
la SEQ ID NO: 7, hCL-L2-2v3 expuesto
en la SEQ ID NO: 9, hCL-L2-1v1
expuesto en la SEQ ID NO: 36,
hCL-L2-1v2 expuesto en la SEQ ID NO:
38, h hCL-L2-1v3 expuesto en la SEQ
ID NO: 40 respectivamente, a menos que se afirme de otra manera. La
proteína hCL-L2 usada aquí incluye
hCL-L2-1 expuesta en la SEQ ID NO:
2, hCL-L2-2 expuesta en la SEQ ID
NO: 4: hCL-L2-2v1 expuesta en la
SEQ ID NO: 6, hCL-L2-2v2 expuesta en
la SEQ ID NO: 8, hCL-L2-2v3 expuesta
en la SEQ ID NO: 10, hCL-L2-1v1
expuesta en la SEQ ID NO: 37,
hCL-L2-1v2 expuesta en la SEQ ID NO:
39, y hCL-L2-1v3 expuesta en la SEQ
ID NO: 41 respectivamente, a menos que se diga de otra manera.
La secuencia aminoacídica de
hCL-L2-2 expuesta en la SEQ ID NO: 4
(posición aminoacídica 1-245) representa una
proteína que consiste en 245 aminoácidos, y así la secuencia de
bases que codifica la misma (SEQ ID NO: 46) consiste en 735 bases.
Las secuencias característica aminoacídicas tales como las del
dominio de tipo colágeno, un dominio CRD y similares estuvieron
presentes en la secuencia. La secuencia de bases que codifican esta
proteína está expuesta en la SEQ ID NO: 3.
La secuencia aminoacídica de
hCL-L2-2v1 expuesta en la SEQ ID NO:
6 (posición aminoacídica 1-197) representa una
proteína que consiste en 197 aminoácidos, y así la secuencia de
bases que codifica para la misma (SEQ ID NO: 55) consiste en 591
bases. Las secuencias aminoacídicas características tales como las
del dominio tipo colágeno, un dominio CRD y similares estuvieron
presentes en la secuencia. La secuencia de bases que codifican esta
proteína está expuesta en la SEQ ID NO: 5.
La secuencia de aminoácidos de
hCL-L2-2v2 expuesta en la SEQ ID NO:
8 (posición aminoacídica 1-221) representa una
proteína que consiste en 221 aminoácidos, y así la secuencia de
bases que codifican la misma (SEQ ID NO: 56) consiste en 663 bases.
Las secuencias aminoacídicas características tales como las de un
dominio de tipo colágeno, un dominio CRD y similares estuvieron
presente en la secuencia. La secuencia de bases que codifica esta
proteína está expuesta en la SEQ ID NO: 7.
La secuencia aminoacídica de
hCL-L2-2v3 expuesta en la SEQ ID NO:
10 (aminoácidos en posición 1-221) representa una
proteína que consiste en 221 aminoácidos, y así la secuencia de
bases que codifica para la misma (SEQ ID NO: 57) consiste en 663
bases. Las secuencias aminoacídicas características tales como las
del dominio tipo colágeno, un dominio CRD y similares estuvieron
presentes en la secuencia. La secuencia de bases que codifica esta
proteína está expuesta en la SEQ ID NO: 9.
La aplicación describe fragmentos derivados de
la secuencia aminoacídica de CL-L2s descritos
anteriormente, que pueden incluir por ejemplo, un dominio
extracelular, un dominio intracelular, un dominio transmembrana, un
dominio tipo colágeno, un dominio CRD, un dominio de tipo colectina,
un dominio hidrofóbico (un dominio transmembrana y similares), un
dominio hidrofílico (dominios distintos de dominios hidrofóbicos), y
similares, así como fragmentos obtenidos mediante la fusión de
estos fragmentos.
En la secuencia aminoacídica de
hCL-L2-2 expuesto en la SEQ ID NO:
4, fragmentos ejemplares pueden incluir un fragmento que comprende
aminoácidos de aproximadamente la posición 18 a 245 que forman el
dominio CRD y un dominio de tipo colágeno, y un fragmento que
comprende aminoácidos de aproximadamente desde la posición 18 hasta
86 que forman un dominio de tipo colágeno; en la secuencia
aminoacídica de hCL-L2-2v1 expuesta
en la SEQ ID NO: 6, fragmentos ejemplares pueden incluir: un
fragmento que comprende aminoácidos de aproximadamente desde la
posición 18 hasta 197 que forman un dominio CRD y un dominio de tipo
colágeno, un fragmento que comprende aminoácidos de aproximadamente
desde la posición 18 hasta 38 que forman un dominio de tipo
colágeno; en la secuencia aminoacídica de
hCL-l2-2v2 expuesta en la SEQ ID NO:
8, fragmentos ejemplares pueden incluir: un fragmento que comprende
aminoácidos de aproximadamente desde la posición 18 hasta la 221 que
forma un dominio CRD y un dominio de tipo colágeno, un fragmento
que comprende aminoácidos de aproximadamente desde la posición 18
hasta la 62 que forma un dominio de tipo colágeno; en la secuencia
aminoacídica de hCL-L2-2v3 expuesta
en la SEQ ID NO: 10, fragmentos ejemplares pueden incluir: un
fragmento que comprende aminoácidos de aproximadamente desde la
posición 18 hasta la 221 que forma un dominio CRD y un dominio de
tipo colágeno, un fragmento que comprende aminoácidos de
aproximadamente desde la posición 18 hasta 62 que forman un dominio
de tipo colágeno.
\vskip1.000000\baselineskip
Genes CL-L2 según el presente
invento pueden ser los obtenidos a través de cualquier proceso. Por
ejemplo, la secuencia de bases que codifica CL-L2
del presente invento pueden ser obtenida preparando mARN a partir
de células que expresan la proteína, y convirtiéndola en un ADN de
doble hebra mediante una técnica convencional. Para la preparación
de mARN, el método de cloruro cálcico isotiocianato de guanidinio
(Chirwin, y otros, Biorchemistry, 18, 5294, 1979) y similares
pueden ser empleados. Para la preparación de ARN poli (A)+ de ARN
total, soportes unidos con oligo(dT), por ejemplo,
cromatografía de afinidad en la que partículas de sefarosa o latex
son usadas, pueden ser empleadas. cADN de doble hebra pueden ser
obtenido usando el ARN así obtenido descrito consecuentemente como
un molde para tratar con transcriptasa inversa, usando
oligo(dT) que es complementario a la cadena poli(A)
presente en el extremo 3'-terminal, o un cebador al
azar o un oligonucleótido correspondiente a una parte de la
secuencia aminoacídica de CL-L2 como un cebador
(Mol. Cell Biol., 2, 161, 1982; Mol. Cell Biol., 3, 280, 1983;
Gene, 25, 263, 1983); y tratando así la hebra de cADN resultante con
por ejemplo, RNasa H de E. coli, ADN polimerasa I de E.
coli, ADN ligasa de E. coli para alterar en la hebra de
ADN. Una librería de cADN puede ser producida incorporando este
cADN en un vector plasmídico, un vector fago o un vector cósmido
para transformar E. coli, o tranfectando en E. coli
siguiendo un empaquetado in vitro.
El vector plasmídico que puede ser usado aquí no
está particularmente limitado siempre y cuando pueda ser replicado
y mantenido en el hospedante. El vector fago no está particularmente
limitado siempre y cuando pueda proliferar en el hospedante. Los
vectores de clonación incluyen, por ejemplo, pBR322, pUC19,
\lambdagt10, \lambdagt11 y similares. Por otro lado, tras
someter a un cribado inmunológico, el vector tiene preferiblemente
un promotor que permite la expresión de un gen
CL-L2s en el hospedante.
Para incorporar el cADN en un plásmido, el
proceso de Maniatis y otros (Molecular Cloning, A Laboratory Manual,
segunda edición) y similares puede servir como referencia. Además,
para incorporar cADN en un vector fago, el proceso descrito en
Hyunh y otros (ADN cloning, a practical approach, 1, 49, 1985) y
similares pueden servir como referencia.
Como proceso para introducir el vector de
expresión descrito anteriormente en células hospedantes, pueden
estar implicados métodos como por ejemplo, transfección mediante el
método de la lipopoliamina, método del DEAE dextrano, método
Hanahan, método de lipofectina, método de fosfato cálcico;
microinyección, y electroporación y similares (Molecular Cloning, A
Laboratory Manual, segunda edición). El empaquetamiento in
vitro puede ser fácilmente efectuado usando kits disponibles
comercialmente (manufacturados por Stratagene, o Amersham).
El proceso para el aislamiento de cADN que
codifica una proteína CL-L2 a partir de una librería
de cADN preparada como se describe anteriormente puede implicar un
proceso general, que puede ser usado en combinación, para el
cribado de cADN. Por ejemplo, se produce una sonda marcada con
^{32}P, y un clon que contiene el cADN deseado puede ser cribado
mediante un método de hibridación de colonias (Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 72, 3961, 1975), o un método de hibridación en placa
(Molecular Cloning, A Laboratory Manual, segunda edición, Cold
Spring Harbor Laboratory, 2, 108, 1989). Además, un clon puede ser
seleccionado mediante un método de PCR. Adicionalmente, el clon
deseado puede ser seleccionado a través del uso de un anticuerpo que
reconoce CL-L2 cuando una librería de cADN es
producida usando un vector que puede expresar cADN.
Además, cuando un gen CL-L2 es
aislado de células que expresan genes CL-L2, por
ejemplo, las células que los expresan son disueltas usando SDS o
proteinasa K, seguido por un tratamiento con fenol. El ARN no
deseado es digerido con ribonucleasa. Así, el ADN resultante es
digerido con enzimas de restricción, y los fragmentos de ADN son
amplificados usando fagos o cósmidos para producir una librería. A
partir de entonces, el clon deseado es seleccionado, y entonces un
gen CL-L2 puede ser obtenido. La secuencia de bases
del ADN obtenido consecuentemente puede ser determinada por un
método Maxam-Gilbert (Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
74, 560, 1977) o por un método de Sanger (Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 74, 5463, 1977). El gen CL-L2s puede ser
obtenido por corte del clon, como se obtuvo anteriormente.
\newpage
A través del uso del cebador sintetizado sobre
la base de la secuencia de bases de CL-L2, la
clonación puede ser también afectada por un método
RT-PCR usando ARN poli (A)^{+} de las
células que expresan el CL-L2s como plantilla.
Además, el cADN deseado puede ser también obtenido por cribado
directamente de la librería de cADN después de producir/sintetizar
una sonda basada en la secuencia de bases del
CL-L2s, no por medio de PCR. El gen del presente
invento puede ser seleccionado de entre los genes obtenidos por los
métodos descritos aquí anteriormente a través de la verificación de
la secuencia de bases del gen. El gen del presente invento puede
ser también producido según el proceso convencional en el que la
síntesis química de un ácido nucleico, por ejemplo, el método
fosfoimidita (Mattencci, M.D. y otros, J. Am. Chem. Soc., 130, 3185,
1981) o similares, es empleado.
El presente invento también se refiere a un
vector que comprende una secuencia de ácidos nucleicos del invento.
El vector no está limitado particularmente siempre y cuando pueda
expresar la proteína CL-L2s, sin embargo, un vector
plasmídico, un vector ARN, un vector de ADN, un vector de virus, un
vector fago y similares pueden ser empleados. Específicamente, los
ejemplos del mismo incluyen pBAD/His, pRSETA, pcADN2.1, pTrcHis2A,
pYES2, pBlueBac4.5, pcADN3.1 o pSecTag2 fabricados por Invitrogen,
pET o pBAC fabricados por Novagen Co., pGEM fabricado por Promega,
pBluescriptII, pBs, Phagescript, pSG o pSV2CAT fabricado por
Stratagene, o pGEX, pUC18/19, pBPV, pSVK3 o pSVL fabricado por
Pharmacia Co.
La secuencia de cADN de CL-L2s
ligada al vector de expresión está operativamente unida a un
promotor. El promotor incluye, por ejemplo, un promotor fago
\lambdaPL, E. coli lac, trp, promotor tac, promotor SV40
temprano y tardío, promotor T7 y T3, promotor LTR de retrovirus.
Específicamente, el promotor para el uso en las células
eucarióticas incluye el promotor CMV, el promotor HSV, el promotor
SV40 temprano y tardío, el promotor LTR de retrovirus, el promotor
RSV, el promotor metalotioneina. Además, el vector de expresión
puede contener un marcador que permite la selección del hospedante
transformado y un potenciador. Ejemplos del marcador incluyen el
gen de la reductasa dihidrofolato, gen de resistencia a neomicina,
gen de resistencia a la ampicilina y similares. Ejemplos de
potenciador incluyen el potenciador SV40, promotor potenciador
temprano de citomegalovirus, potenciador de adenovirus y
similares.
El presente invento proporciona además células
transformadas que transportan una secuencia de bases del presente
invento para permitir la expresión del mismo por medio del vector
como se describe anteriormente que transporta la secuencia de
bases. La célula hospedante para el uso como célula transformada en
el presente invento puede preferentemente incluir células animales
y células de insectos, sin embargo, pueden estar incluidas todas
las células (los microorganismos pueden también estar incluidos), la
cual puede expresar una proteína CL-L2s en el
vector de expresión del presente invento.
Las células animales ejemplares o células de
insectos del presente invento pueden respectivamente incluir
células derivadas de humanos, o células derivadas de la mosca o del
gusano de seda (Bómbix mor). Por ejemplo, las células CHO, las
células COS, las células BHK, la células Vero, las células de
mieloma, las células HEK293, las células HeLa, las células Jurkat,
las células L de ratón, las células C127 de ratón, las células FM3A
de ratón, las células de fibroblasto de ratón, osteoblastos,
condrocitos, S2, Sf9, Sf21, High Five™ pueden ser incluidas. El
microorganismo según el presente invento incluye Escherichia
coli, Saccharomyces cerevisiae y similares. Para la
introducción de un vector en dichos hospedantes, puede ser empleado
el método como se describe anteriormente.
Las células que expresan CL-L2s
del presente invento pueden ser usadas para analizar una ruta de la
colectina implicada en enfermedades infecciosas, inmunización y
similares. Además, esas células pueden ser utilizadas en la
fabricación de una proteína CL-L2 o una proteína
CL-L2 que tiene una cadena de carbohidratos. Las
células pueden ser también utilizadas en el cribado con el
propósito de obtener un agonista o un antagonista de la proteína
CL-L2s.
El presente invento también se refiere a un
proceso para la producción de una proteína CL-L2 que
comprende el cultivo de una célula transformada con la secuencia de
bases del presente invento de acuerdo con lo anterior, y recoger
las CL-L2s así producidas. El cultivo celular, el
aislamiento de la proteína, y la purificación de la misma pueden
cumplir con los procesos conocidos convencionalmente.
La proteína según el presente invento puede ser
expresada como una proteína de fusión recombinante, que puede ser
fácilmente aislada, purificada, y reconocida por sí misma. La
proteína de fusión recombinante es una proteína expresada por
adición de una cadena peptídica apropiada al extremo N terminal y/o
al extremo C terminal de una proteína expresada de una secuencia de
ácidos nucleicos que codifica la proteína deseada. Para facilitar
la purificación de la proteína expresada, la proteína puede ser
expresada como una proteína de fusión que tiene una señal para la
secreción extracelular. Además, la proteína puede ser obtenida de
varios tipos de fuentes tales como células cultivadas, tejidos
cultivados, células transformadas y similares usando métodos
conocidos convencionalmente, por ejemplo, métodos de purificación
conocidos incluyendo: desalado tal como la técnica de precipitación
de sulfato amónico y similares; la técnica de filtración en gel
usando Sephadex y similares; la técnica cromatográfica de
intercambio de ión; la técnica cromatográfica hidrofóbica, la
técnica cromatográfica en gel de tinción; la técnica de
electroforesis; diálisis; la técnica de ultrafiltración; la técnica
de afinidad cromatográfica; la técnica de cromatografía líquida de
alto rendimiento; y similares.
Las sondas para detectar el gen
CL-L2s pueden ser especificadas en la base de la
secuencia de bases expuesta bien en la SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9,
12, 36, 38 ó 40, SEQ ID NO: 48 (que corresponde a la posición de
bases de 601-1077 de la SEQ ID NO: 1) o bien en la
posición de ácidos nucleicos de 493-969 de la SEQ ID
NO: 12. Alternativamente, los cebadores pueden ser especificados
por la amplificación del ADN o del ARN que incluyen dicha secuencia
base. Para especificar una sonda o un cebador basado en una
secuencia dada esto es llevado a cabo ordinariamente por los
profesionales especializados en esta técnica. Un oligonucleótido que
tiene una secuencia de bases específica puede ser obtenido a través
de síntesis química. Cuando una etiqueta adecuada es añadida al
oligonucleótido, puede ser utilizado para un ensayo de hibridación
en varios formatos. Alternativamente, puede ser también utilizado
en reacciones para síntesis de ácidos nucleicos tales como PCR. El
oligonucleótido que es utilizado como un cebador es al menos 10
bases de longitud, y adaptable de 15 a 50 bases en longitud. Es
deseable que el oligonucleótido que es usado como sonda sea desde
100 bases hasta su longitud máxima. Además, pueden ser también
usados para el diagnóstico de enfermedades causadas por mutación de
un gen CL-L2s porque pueden ser usados para
detectar la mutación genética que codifica una proteína
CL-L2s y para detectar SNP. Se espera que estén
disponibles para el diagnostico de una variedad de enfermedades que
incluyen por ejemplo, infecciones bacterianas y similares. Además,
son también útiles para la terapia génica a través de la cual el
gen CL-L2s es introducido en un cuerpo vivo para
permitir la expresión del mismo.
Además, también es posible obtener una región
promotora y una región potenciadora del gen CL-L2s
que está presente en un genoma, basado en una secuencia de bases de
cADN del CL-L2s proporcionado por el presente
invento. En particular, estas regiones de control pueden ser
obtenidas por métodos similares a esos descritos en la publicación
de patente japonesa sin examinar N°. 6-181767; J.
Immunol., 155, 2477, 1995; Proc. Natl. Acad. Sci, USA., 92, 3561,
1995 y similares. La región promotora referida aquí se refiere a una
región de ADN que controla la expresión de un gen que existe aguas
arriba de un sitio de inicio de la transcripción. La región
potenciadora aquí se refiere a una región de ADN que potencia la
expresión de un gen que existe en un intrón, una región 5' sin
traducir, o una región 3' sin traducir.
Las proteínas CL-L2s del
presente invento pueden ser utilizadas en la elucidación de los
mecanismos de inmunidad fundamental; en la elucidación de los
mecanismos del desarrollo de una amplia variedad de enfermedades
tales como infecciones bacterianas; en el diagnóstico, en métodos
profilácticos y terapéuticos de las mismas; y para el desarrollo de
reactivos y fármacos para las mismas. Además, pueden ser usados como
un antígeno para producir anticuerpos frente a
CL-L2s. Adicionalmente, pueden ser utilizados en los
procesos de cribado de un agonista o un antagonista.
Los polinucleótidos o las proteínas
CL-L2s son utilizados posiblemente en métodos de
diagnóstico, profilácticos y terapéuticos, y para el desarrollo de
reactivos y fármacos para diversos tipos de enfermedades que
incluyen infecciones bacterianas y los similares.
La composición farmacéutica puede comprender
polinucleótidos o proteínas CL-L2s, sustancias que
estimulan o inhiben la actividad o la activación de la proteína
CL-L2s, sustancias que incluyen anticuerpos contra
la proteína CL-L2a y similares (de aquí en
adelante, referido a "sustancia relacionada a los
CL-L2s"). Las sustancias relacionadas a los
CL-L2s pueden ser usadas solas, o después de ser
sometidas a varios tipos de tratamiento como disolución en agua y
similares, sin embargo, pueden ser usadas después de mezclarlas en
los productos farmacéuticos, cuasi fármacos y similares. En estos
casos, la cantidad de la sustancia a ser mezclada puede ser
determinada ad libitum. Cuando la sustancia es formulada para
la administración sistémica, 0,001-50% en peso, en
particular, 0,01-10% en peso es permisible. Cuando
la cantidad es menor del 0,001%, puede no ser permitida la acción
suficiente de lagrimeo. Cuando la cantidad es mayor del 50%, las
propiedades como la estabilidad, el aroma y la semejanza con la
misma composición pueden ser deterioradas.
La ruta de administración puede ser seleccionada
opcionalmente de entre la administración vía mucosa, administración
transdérmica, administración intramuscular, administración
subcutánea, administración endorectal, administración ocular
tópica, y similares, en adición a la administración oral y la
administración intravenosa descritos anteriormente.
La sustancia relacionada a los
CL-L2s puede ser incluida en la formulación como una
sal. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen por ejemplo,
sales con base tales como base inorgánica, base orgánica y
similares; sales ácidas de adición tales como las de ácido
inorgánico, ácido orgánico, ácido de aminoácidos básicos o ácidos.
Las bases inorgánicas incluyen por ejemplo, metales alcalino tal
como el sodio, potasio y similares; metales
alcalino-térreos tal como el calcio, magnesio y
similares; aluminio, amonio y similares. Las bases orgánicas
incluyen por ejemplo, aminas primarios tales como etanolamina y
similares; aminas secundarias tales como dietilamina,
dietanolamina, diciclohexilamina,
N,N'-dibenciletilen-diamina y
similares; aminas terciarias tales como trimetilamina,
trietilamina, piridina, picolina, trietanolamina y similares. Los
ácidos inorgánicos incluyen por ejemplo, ácido clorhídrico, ácido
bromhídrico, ácido nítrico, ácido sulfúrico, ácido fosfórico y
similares. Los ácidos orgánicos incluyen por ejemplo, ácido
fórmico, ácido acético, ácido láctico, ácido trifluoroacético, ácido
fumárico, ácido oxálico, ácido tartárico, ácido maleico, ácido
benzoico, ácido cítrico, ácido succínico, ácido málico, ácido
metanosulfónico, ácido etanosulfónico, ácido bencenosulfóico, ácido
p-toluenosulfónico y similares. Los aminoácidos
básicos incluyen por ejemplo, arginina, lisina, ornitina y
similares. Los aminoácidos ácidos incluyen por ejemplo ácido
aspártico, ácido glutámico y similares.
Ejemplos de formas de dosificación para el uso
en administración oral incluyen formulaciones en polvo,
formulaciones granuladas, formulaciones encapsuladas, pastillas,
tabletas, elixires, suspensiones, emulsiones, jarabes y similares,
los cuales pueden ser seleccionados ad libitum. Además, tales
formulaciones pueden ser modificadas, lo cual puede implicar la
liberación del testigo, estabilización, facilitación de la
desintegración, el bloqueo de la desintegración, revestimiento
entérico, facilidad de absorción y similares. Además, los ejemplos
de formas de dosis para la administración tópica intraoral incluyen
formulaciones masticadas, formulaciones sublinguales, formulaciones
bucales, pastillas, pomadas, tiritas, formulaciones líquidas y
similares, los cuales pueden ser seleccionados ad libitum.
Además, tales formulaciones pueden ser modificadas, lo cual puede
implicar la liberación del testigo, estabilización, facilitación de
la desintegración, el bloqueo de desintegración, revestimiento
\hbox{entérico, facilidad de absorción y similares.}
Las técnicas de sistema de suministro de
fármacos (DDS) conocidas pueden ser aplicadas a formas de
dosificación como se describe anteriormente. La formulación DDS
referida aquí implica formulaciones de liberación sostenida,
formulaciones aplicadas tópicamente (pastillas, formulaciones
bucales, formulaciones sublinguales), formulaciones de liberación
controlada de fármacos, formulaciones de revestimiento entérico,
formulaciones solubles en el estómago y similares, las cuales son
formulaciones que son preparadas de modo que la forma de
dosificación más apropiada es conseguida teniendo en cuenta la ruta
de administración, la biodisponibilidad, efectos adversos y
similares.
Los componentes para el DDS comprenden
esencialmente un fármaco, un módulo de liberación de fármaco, un
revestimiento y un programa terapéutico. En detalle, es preferido
el fármaco que tiene una vida media corta, lo cual permite una
rápida disminución de la concentración de la sangre, particularmente
tras el cese de la liberación del mismo. El revestimiento es
preferiblemente no reactivo a los tejidos corporales en la parte en
la que es administrado el fármaco. Además, el programa terapéutico
es preferiblemente configurado de modo que la concentración de
fármaco más óptima se mantiene durante el periodo predeterminado. El
módulo de liberación del fármaco tiene sustancialmente un
almacenaje del fármaco, una parte del testigo de liberación, una
fuente de energía, y una apertura de liberación o una superficie de
liberación. Todos estos componentes fundamentales no son requeridos
necesariamente, y así la adición, supresión o similares pueden ser
opcionalmente llevados a cabo para seleccionar el mejor modo.
Los ejemplos de materiales que pueden ser usados
para el DDS incluyen polímeros, derivados de ciclodextrina,
lecitina y similares. El polímero puede incluir polímeros insolubles
(silicona, copolímero de acetato de viniletileno, copolímero de
alcohol de viniletileno, etilcelulosa, acetato de celulosa y
similares), los polímeros hidrosolubles y los polímeros que forman
geles hidroxilo (poliacrilamida, forma entrecruzada de metacrilato
polihidroxietilo, forma entrecruzada de poliacrilo, alcohol
polivinilo, polietilenóxido, derivados de celulosa solubles en agua,
poloxámero reticulado, quitina, quitosan y similares), los
polímeros de disolución lenta (etilcelulosa, un copolímero de un
éster parcial de anhídrido maleico-metilviniléter y
similares), los polímeros solubles en el estómago
(hidroxilpropilmetilcelulosa, hidroxilpropilcelulosa, carmelosa
sódica, macrogol, polivinilpirrolidona, copolímero de netacrtilato
de dimetilaminoetilo-metacrilato de metilo y
similares), polímeros entéricos (ftalato de
hidroxilpropilmetilcelulosa, ftalato de acetato de celulosa,
succinato de acetato de hidroxilpropilmetilcelulosa,
carboximetiletilcelulosa, polímeros de ácidos acrílicos y similares)
polímeros biodegradables (coagulación por calor o albúmina
entrecruzada, gelatina entrecruzada, colágeno, fibrina,
policianoacrilato, ácido poliglicólico, ácido poliláctico, ácido
poli \beta-hidroxiacético, policaprolactona y
similares), que pueden ser seleccionados ad libitum en base
a la forma de dosificación.
En particular, la silicona, el copolímero
etileno-acetato de vinilo, el copolímero
etileno-alcohol de vinilo, un éster parcial del
copolímero metilviniléter-anhídrido maleico pueden
ser usados para el control de la liberación del fármaco; el acetato
de celulosa puede ser usado como material de una bomba de presión
osmótica; la etilcelulosa, la hidroxipropilmetilcelulosa, la
hidroxipropilcelulosa, la metilcelulosa pueden ser usadas como un
material de una membrana de formulaciones de disolución lenta; y la
forma entrecruzada poliacrilo puede ser usada como un agente de
unión a las mucosas.
Además, la formulación puede ser fabricada con
la adición de disolventes, excipientes, agentes de revestimiento,
bases, agentes de unión, lubricantes, desintegrantes, agentes
solubilizantes, agentes de suspensión, agentes espesantes, agentes
emulsionantes, agentes estabilizantes, agentes tamponadores, agentes
isotonizantes, agente calmantes, agentes conservantes, agentes
aromatizantes, agentes de fragancia, agentes colorantes y similares
conforme a su forma de dosis (forma de dosis conocida tal como
formas para administración oral, inyección, supositorio y
similares).
Aunque los ejemplos específicos son ilustrados
respectivamente más abajo, estos ejemplos no deberían ser
interpretados como limitación del presente invento.
[disolvente] agua purificada, agua para
inyección, salino, aceite de cacahuete, etanol, glicerol;
[excipiente] almidones, lactosa, glucosa,
sacarosa, celulosa cristalina, sulfato cálcico, carbonato cálcico,
talco, óxido de titanio, trehalosa, xilitol;
[agente de revestimiento] sacarosa, gelatina,
ftalato de acetato de celulosa y los polímeros como los descritos
anteriormente;
[base] vaselina, aceite vegetal, macrogol, base
para aceite en emulsión de agua, base para el agua en emulsión de
aceite;
[agente de unión] compuestos de polímeros
naturales tales como almidones y los derivados del mismo, celulosa
y los derivados del mismo, gelatina, alginato de sodio, goma de
tragacanto, goma arábiga, y similares; polímeros sintéticos tales
como la polivinilpirrolidona y similares; dextrina, hidroxilpropil
almidón;
[lubricante] ácido esteárico y sales del mismo,
talco, ceras, almidón de trigo, macrogol, aceite vegetal
hidrogenado, éster de ácido graso sacarosa, polietilenglicol;
[desintegrante] almidón y derivados del mismo,
agar, polvo de gelatina, bicarbonato sódico, celulosa y los
derivados del mismo, carmelosa cálcica, hidroxipropil almidón,
carboximetilcelulosa, y sales y derivados de los mismos,
hidroxipropilcelulosa poco sustituida;
[agente solubilizante] ciclodextrina, etanol,
glicol propileno, polietilén glicol;
[agente de suspensión] goma arábiga, goma de
tragacanto, alginato sódico, monoestearato de aluminio, ácido
cítrico, diversos tensioactivos;
[agente espesante] carmelosa sódica,
polivinilpirrolidona, metilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa,
polivinil alcohol, goma de tragacanto, goma arábiga, alginato
sódico;
[agente emulsionante] goma arábiga, colesterol,
goma de tragacanto, metilcelulosa, diversos tensioactivos,
lecitina;
[agente estabilizante] bisulfito sódico, ácido
ascórbico, tocoferol, agente quelante, gas inerte, agente
reductor;
[agente tamponante] hidrogenofosfato de sodio,
acetato sódico, ácido bórico;
[agente isotonizante] cloruro de sodio,
glucosa;
[agente calmante] hidrocloruro de procaína,
lidocaína, alcohol bencílico;
[agente conservante] ácido benzoico y sales del
mismo, ésteres p-hidroxibenzoicos, clorobutanol,
jabón invertido, alcohol bencílico, fenol, timerosal;
[agente aromatizante] sacarosa, sacarina,
extracto de glicirhiza, sorbitol, xilitol, glicerol;
[agente de fragancia] tintura de cáscara de
naranja, aceite de rosa;
[agente colorante] tinción comestible soluble en
agua, tinción de lago.
La nueva colectina según el presente invento es
descrita en más detalle por los siguientes Ejemplos ilustrativos no
limitados. Sin embargo, el presente invento no debería ser
interpretado como que está limitado a los Ejemplos.
Específicamente, la búsqueda en la base de datos
de EST (Ejemplo 1); el cribado de una colectina humana nueva de una
librería de cADN derivado del hígado humano por PCR y secuenciado de
la secuencia de bases (Ejemplo 2); el cribado de una nueva
colectina humana un sitio cap en una librería de cADN derivada del
riñón humano por PCR y secuenciado de la secuencia de bases
(Ejemplo 3); búsqueda de homologías de la nueva colectina (Ejemplo
4); obtención del cADN de la nueva colectina de ratón (Ejemplo 5);
análisis de distribución de la expresión de la nueva colectina
humana en los tejidos humanos (Ejemplo 6); análisis genético de la
nueva colectina humana (Ejemplo 7); análisis de distribución de la
expresión de la nueva colectina
CL-L2-1 y
CL-L2-2 en tejidos humanos (Ejemplo
8); la construcción de un vector de expresión
pcADN3,1/Myc-His(+)-CL-L2-1.2
de la nueva colectina (Ejemplo 9); la producción de una cepa
celular que expresa de modo estable la nueva colectina (Ejemplo 10);
el análisis de la especificidad del azúcar de la nueva colectina
(Ejemplo 11) son descritos a continuación.
Los Ejemplos 5 y 11 no se refieren a
realizaciones del presente invento.
Ejemplo
1
Las Figuras 2 y 3 ilustran la homología de los
residuos aminoacídicos de colecciones conocidas, es decir, MBP
humana, SP-A humano, SP-D humano y
CL-L1 colectina derivada del hígado humano, la cual
fue recientemente aislada con éxito por el presente inventor (véase
la publicación sin examinar de la Patente Japonesa N°. Hei
1l-206377), que tiene una estructura común como se
describe en la Fig. 1. En la figura, las porciones de los residuos
aminoacídicos que eran reconocidas como homologas fueron
recuadradas. Una secuencia aminoacídica de CRD (dominio de
reconocimiento de la cadena de carbohidratos) que es responsable de
una actividad lecitina (SEQ ID NO: 14) del CL-L1 en
esta figura, fue usada para buscar en la base de datos EST (marcas
de secuencia expresadas).
Como resultado, se obtuvieron varios datos que
contenían una elevada homología de secuencia de aminoácidos. Las
secuencias aminoacídicas de los datos resultantes de esta manera
fueron buscadas en la base de datos GenBank/EST, y se determinó si
eran de sustancias conocidas o desconocidas. Consecuentemente, un
dato (H30455, derivado del timo) que exhibe una alta homología pero
que contiene una secuencia de bases desconocida podría ser obtenido.
Usando la secuencia de bases del clon EST así obtenido, se llevó de
nuevo a cabo la búsqueda en la base de datos EST para dar nueve
datos (números de acceso: AA558494, derivado de células germinales;
AA582499, derivado del riñón; AI420986, derivado de la glándula
prostática; AA742449, derivado de las células germinales; AA954657,
derivado del riñón; AA908360, derivado del ovario; AI264145,
derivado del riñón; AA089855, derivado del corazón; AA456055,
derivado del melanocito, del útero embarazado, del corazón fetal)
que se demostró que incluían una secuencia de bases idéntica.
Todos estos fueron clones que demostraron una parte de una secuencia
de bases de una nueva colectina idéntica.
Ejemplo
2
Una secuencia consenso (SEQ ID NO: 15) fue
producida en vista de las secuencias bases de 10 clones descritos
anteriormente. Luego, dos cebadores hacia la dirección aguas arriba:
CAP1 (5'-agattttattgtatagcttgg-3'
(SEQ ID NO: 16)) y CAP2
(5'-ctgggtaataattacataatg-3' (SEQ ID
NO: 17) en base a una secuencia consenso obtenida en el Ejemplo 1,
y cebadores pertinente a una parte de una región de un vector de la
librería de cADN derivada del hígado humano:
\lambdaTriplEx-F1
(5'-aagctccgagatctggacgag-3' (SEQ ID
NO:18)) y \lambdaTriplEx-F2
(5'-ctcgggaagcgcgccattgtg-3' (SEQ ID
NO:19)) fueron sintetizados con el sintetizador 392 A ADN/ARN
fabricados por PE Applied Biosystems Inc., y el cribado por PCR fue
llevado a cabo como se describe a continuación para clonar una
región 5' aguas arriba de cADN de una nueva colectina humana (véase
la Fig. 4).
La primera PCR fue llevada a cabo usando una
librería de cADN derivada de humano (Clontech Co.,) como plantilla
del cribado por PCR. La mezcla de la reacción contenía un tampón LA
PCR Buffer II (libre de Mg^{2+}), 2,5 mM de MgCl_{2}, cada 1
\muL de 200 \muM de dATP, dCTP, dGTP y dTTP (cualquiera de los
cuales es fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.), una librería de
cADN derivada del hígado humano (Clontech Co.,), 0,5 \muM del
cebador \lambdaTriplEx-F1 y 0,5 \muM del
cebador CAP1 en un volumen total de 50 \muL. La PCR fue realizada
con un programa de 35 ciclos de desnaturalización por calor a 95°C
durante 20 segundos, hibridación a 60°C durante 20 segundos,
reacción de elongación a 72°C durante 90 segundos; y además, una
desnaturalización por calor a 95°C durante 5 min antes de la
reacción repetida y a la reacción final de elongación a 72°C durante
5 min. Después de completar la primera PCR, se llevó a cabo la
segunda PCR. El producto de la primera PCR fue usado como una
plantilla a 1 \muL, y los cebadores empleados fueron el cebador
\lambdaTriplEx-F2 y el cebador CAP2. La reacción
fue realizada con una reacción de constitución y programa similares
a los de la primera PCR excepto que el número de ciclos fue de 25.
La PCR aquí presente fue realizada con GeneAmp PCR System9700
fabricado por PE Applied Biosystems Inc. El producto de PCR así
resultante fue verificado mediante una electroforesis en gel de
agarosa, y cortado del gel seguido por un enfriamiento a -80°C
durante 10 min. Después de centrifugarlo a 15000 rpm durante 10
min, el producto fue purificado mediante precipitación en etanol del
sobrenadante.
El fragmento de ADN purificado fue incorporado
al vector pT7Blue fabricado por Novagen CO., y el vector fue
transformado en las células competentes, células
XL1-Blue. El transformante fue cultivado en un medio
LB (100 \mug/mL de ampicilina) seguido por la extracción del
plásmido con un método SDS alcalino para secuenciar la secuencia de
bases del mismo con el kit BigDye Terminator Cycle Sequencing FS
Ready Reaction kit y el secuenciador ABI PRISM 377 fabricado por
Applied Biosystems Inc. Los cebadores empleados fueron el cebador
universal M13
(5'-cgacgttgtaaaacgacggccagt-3' (SEQ
ID NO: 20)) y el cebador inverso M13
(5'-caggaaacagctatgac-3' (SEQ ID
NO: 21)), ambos de los cuales fueron sintetizados similarmente al
cebador CAP1. La secuencia de bases obtenida consecuentemente
reveló ser una secuencia de bases que es 575 bases más larga que el
cebador CAP2 empezando por el extremo 3' al extremo N Terminal del
mismo (una región que corresponde a: la posición aminoacídica
68-271 del ORF de
CL-L2-1 mostrado en la Fig. 4; o la
posición aminoacídica 42-245 del ORF de
CL-L2-2). Sin embargo, se encontró
una ligera diferencia en la secuencia de bases de la región del
extremo 5' de la secuencia consenso del EST obtenida en el Ejemplo
1.
Ejemplo
3
Para clonar la región del extremo 5' que
contiene un sitio de iniciación de la transcripción además de la
secuencia de bases obtenida en el Ejemplo 2, se llevó a cabo un
cribado por PCR usando un cADN de sitios cap como sigue, a través
de la sinterización de dos cebadores hacia la dirección aguas
arriba: CAP3
(5'-ggtcctatgtcaccggaatc-3' (SEQ ID
NO: 22)), CAP4
(5'-ttccatgacgacccacactgc-3' (SEQ ID
NO: 23)) con el sintetizador ADN/ARN 392A fabricado por PE Applied
Biosystems Inc., en la base de la secuencia de bases obtenida en el
Ejemplo 2 (Fig. 4).
La primera PCR fue realizada con el cADN del
sitio cap, riñón humano fabricado por NIPPON GENE Co., Ltd usando
el cebador 1RC2 adjunto
(5'-caaggtacgccacagcgtatg-3' (SEQ ID
NO: 24)) y el cebador CAP3. La mezcla de la reacción contenía un
tampón LA PCR Buffer II (libre de Mg^{2+}), 2,5 mM de MgCl_{2},
cada 1 \muL de 200 \muM de dATP, dCTP, dGTP y dTTP (cualquiera
de los cuales es fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.), un cADN de
sitios cap de riñón humano, 0,5 \muM del cebador 1RC2 (ambos de
los cuales fueron fabricados por NIPPON GENE Co., Ltd) y 0,5 \muM
del cebador CAP3 en un volumen total de 50 \muL. La PCR fue
realizada con un programa de 35 ciclos de desnaturalización por
calor a 95°C durante 20 segundos, hibridación a 60°C durante 20
segundos, reacción de elongación a 72°C durante 60 segundos; y
además, desnaturalización por calor a 95°C durante 5 min antes de
la reacción repetida y la reacción final de elongación a 72°C
durante 10 min. Después de completar la primera PCR, se llevó a
cabo la segunda PCR. El producto de la primera PCR fue usado como
una plantilla a 1 \muL, y los cebadores empleados fueron unidos
cebador 2RC2
(5'-gtacgccacagcgtatgatgc-3' (SEQ ID
NO: 25)) y cebador CAP4. La reacción fue realizada con una
reacción de constitución y un programa similares a la primera PCR
excepto que el número de ciclos fue de 25. la PCR aquí presente fue
realizada con GeneAmp PCR System9700 fabricado por PE Applied
Biosystems Inc. El producto de PCR así resultante fue verificado en
una electroforesis de gel de agarosa, y cortado del gel seguido por
un enfriamiento a -80°C durante 10 min. Después de centrifugarlo a
15000 rpm durante 10 min, el producto fue purificado por
precipitación en etanol del sobrenadante.
El fragmento de ADN purificado fue incorporado
al vector pT7Blue fabricado por Novagen CO., y el vector fue
transformado en las células competentes, células
XL1-Blue. El transformante fue cultivado en un medio
LB (100 \mug/mL de ampicilina) seguido por la extracción del
plásmido con un método SDS alcalino para secuenciar la secuencia de
bases del mismo con BigDye Terminador Cycle Sequencing FS Ready
Reaction kit y el secuenciador ABI PRISM 377 fabricado por Applied
Biosystems Inc. Los cebadores empleados fueron el cebador universal
M13 (5'-cgacgttgtaaaacgacggccagt-3'
(SEQ ID NO: 20)) y el cebador inverso M13
(5'-caggaaacagctatgac-3' (SEQ ID
NO: 21)). Dos secuencias de bases obtenidas consecuentemente
revelaron ser: una secuencia de bases que es 492 bases mayor que la
secuencia de bases obtenida en el Ejemplo 2 en la dirección a su
extremo N terminal (SEQ ID NO: 1); y una secuencia de bases que es
274 bases mayor que la secuencia de bases obtenida en el Ejemplo 2
en la dirección de su extremo N terminal (SEQ ID NO: 3).
Consecuentemente, dos cADNs en conexión con el
CL-L2 fueron obtenidos por la presente incluyendo:
un cADN que tiene un ORF (marco de lectura abierto) de 813 bases
(SEQ ID NO: 1) y que codifica 271 aminoácidos expuestos en la SEQ
ID NO: 2 (CL-L2-1); y un cADN que
tiene un ORF (marco de lectura abierto) de 735 bases (SEQ ID NO: 3)
y que codifica 245 aminoácidos expuestos en la SEQ ID NO: 4
(CL-L2-2).
Ejemplo
4
A continuación, la búsqueda de homología fue
llevada a cabo para ADN y aminoácidos en la base de datos del
GenBank. Como resultado, la secuencia aminoacídica obtenida demostró
ser un la de una proteína nueva, que es distinta de cualquier
colectina que se haya encontrado hasta el momento.
Las secuencias aminoacídicas de los tres tipos
de colectinas presentados hasta el momento (MBP,
SP-A y SP-D) y la colectina
CL-L1 derivada del hígado humano, que fue aislado
con éxito por el presente inventor recientemente (véase la
publicación sin examinar de la Patente Japonesa N°. Hei
1l-206377) fueron comparadas con la secuencia
aminoacídica de la parte estructural de la colectina de la nueva
colectina según el presente invento. Los resultados fueron
ilustrados en la Fig. 5 y la Fig. 6. Similarmente a las Figs. 2 y 3,
las porciones de los residuos de aminoácidos que son reconocidas
por ser homólogas fueron recuadradas. Según esta alineación, se
demostró que la proteína nueva resultante tiene homología con las
proteínas colectina conocidas, y que pertenece a una familia
colectina.
Además, se obtuvo un mutante (SEQ ID NO: 6)
codificado por la posición 141-731 de la secuencia
de bases establecida en la SEQ ID NO: 5 que tiene una deleción de
aminoácidos del 18-65 en la secuencia de aminoácidos
establecida en la SEQ ID NO: 4; un mutante (SEQ ID NO: 8)
codificado por la posición 141-803 de la secuencia
de bases establecida en la SEQ ID NO: 7 que tiene una deleción de
aminoácidos de 18-41 en la secuencia de aminoácidos
establecida en la SEQ ID NO: 4; y un mutante (SEQ ID NO: 10)
codificado por la posición del 141-803 de la
secuencia de bases establecida en la SEQ ID NO: 9 que tiene una
supresión de aminoácidos de 42-65 en la secuencia
de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 4.
Ejemplo
5
En una manera similar a la del
hCL-L2, el gen mCL-L2 pudo ser
obtenido a través del cribado de una librería de cADN de hígado de
ratón. El clon de cADN resultante de mCL-L2 se
confirmó que tenía un ORF (marco de lectura abierto) de 813 bases
(SEQ ID NO: 12), y codifica aminoácidos de los 271 aminoácidos
expuestos en la SEQ ID NO: 13.
Ejemplo
6
Para examinar la expresión de la nueva colectina
en varios tejidos, el análisis fue realizado mediante
RT-PCR. La RT-PCR fue realizado
usando dos cebadores que son capaces de amplificar una secuencia de
cADN que abarca desde la región del cuello al dominio de
reconocimiento de carbohidratos de la nueva colectina: RTF1
(5'-agattccggtgacataggacc-3' (SEQ
ID NO: 26)), RTR1
(5'-tggtctgggctctgtccctgc-3' (SEQ ID
NO: 27)), y dos cebadores que son capaces de amplificar una parte
del gen \beta-actina para usar en la comparación a
la cantidad de nueva colectina expresada en cada uno de los
tejidos: cebador homosentido de \beta-actina
humana (5'-caagagatggccacggctgct-3'
(SEQ ID NO: 28)), cebador antisentido de
\beta-actina humana
(5'-tccttctgcatcctgtcggca-3' (SEQ ID
NO: 29)). Todos estos cebadores fueron sintetizados de manera
similar al cebador CAP1 para llevar a cabo la
RT-PCR.
La RT-PCR fue llevada a cabo
usando el kit RNA LA PCR (AMV) Ver. 1.1 (TAKARA Syuzo, Co.) con cada
ARN derivado de varios tejidos humanos ((1) cerebro, (2) corazón,
(3) riñón, (4) hígado, (5) pulmón, (6) tráquea, (7) médula ósea,
(8) colon, (9) intestino delgado, (10) bazo, (11) estómago, (12)
timo, (13) glándula mamaria, (14) glándula prostática, (15) músculo
esquelético, (16) testículos, (17) útero, (18) cerebelo, (19)
cerebro fetal, (20) hígado fetal, (21) columna vertebral, (22)
placenta, (23) glándula adrenal, (24) páncreas, (25) glándula
salivar, y (26) tiroides) como plantilla. Primero, se llevó a cabo
una reacción de transcripción inversa en la siguiente mezcla
de
reacción.
reacción.
La mezcla de la reacción contenía 5 mM de
MgCl_{2}, un tampón 1 x RNA PCR, una mezcla de 1 mM de dNTP, un
inhibidor de 1 U/\mul RNasa y 2 \mug de ARN, y el volumen total
de la mezcla fue ajustado para dar 40 \mul con agua destilada
libre de RNasa. Al mismo tiempo, una mezcla de reacción sin
transcriptasa inversa fue preparada también como testigo negativo.
La mezcla de la reacción como se describe anteriormente fue colocada
en un tubo de 0,2 ml, y sujeta a una reacción de transcripción
inversa con GeneAmp PCR System 9700 fabricado por PE Applied
Biosystems Inc. a través de un ciclo de: 30 minutos a 42°C, 5
minutos a 99°C, y 5 minutos a 5°C. Así el producto de reacción de
transcripción inversa resultante fue usado subsecuentemente a 10
\muL para LA PCR en la siguiente mezcla de reacción con 28 ciclos
y 35 ciclos respectivamente. Se añadieron a la misma 2,5 mM de
MgCl_{2}, un tampón 1 x LA PCR (libre de Mg^{2+}), 2U TaKaRa LA
Taq, 0,2 \muM del cebador RTF1 y 0,2 \muM del cebador RTR1, y
la muestra fue ajustada para dar un volumen total de 50 \muL con
agua destilada esterilizada. La PCR fue realizada con un programa
de 28 a 35 ciclos de desnaturalización por calor a 95°C durante 20
segundos, hibridación a 60°C durante 20 segundos, reacción de
elongación a 72°C durante 60 segundos; y en adición,
desnaturalización por calor a 95°C durante 5 min antes de la
reacción repetida y la reacción final de elongación a 72°C durante
10 min. El producto de reacción fue separado en electroforesis de
gel de agarosa al 1,5%, seguido por tinción con una solución de
bromuro de etidio (0,1 \mug/mL), verificación del patrón de
electroforesis con transiluminador e identificación del tejido de
expresión. Para comparar la cantidad expresada en cada uno de los
tejidos, se realizó una RT-PCR para amplificar una
parte de la \beta-actina con cada uno de los
tejidos, y se llevó a cabo la corrección de la cantidad de ARN. La
RT-PCR fue realizada similarmente al procedimiento
anterior con la reacción de transcripción inversa, PCR, y se realizó
la estimación. Los resultados son ilustrados en la Fig. 7, la cual
demuestra la expresión de la nueva colectina según el presente
invento mediante PCR realizada con 28 ciclos en el riñón (carril 3)
intensamente, y también en el hígado (carril 4), intestino delgado
(carril 9), timo (carril 12), hígado fetal (carril 20), médula
espinal (carril 21), glándula adrenal (carril 23) y el páncreas
(carril 24). Además, con respecto a la PCR realizada con 35 ciclos,
la expresión ubicua de la nueva colectina pudo ser verificada en
todos los tejidos ensayados, aunque se observó una variación de la
intensidad en la
expresión.
expresión.
Ejemplo
7
En base a la secuencia de ADNs de las colectinas
nuevas obtenidas (hCL-L2-1 (SEQ ID
NO: 1) y mCL-L2 (SEQ ID NO: 12)) se produjo un
árbol filogenético a través de la realización del análisis con el
propósito de clarificar la posición genética entre las colectinas
conocidas.
Las colectinas seleccionadas para el análisis
fueron proteínas en diversas familias de colectina ilustradas en
la Fig. 8 (en la figura, la CL-L1 y
CL-P1 fueron aisladas con éxito por los presentes
inventores). Una alineación múltiple fue producida con el método
clustalw usando una región que contenía un dominio de lectina en la
base de datos que fueron obtenidos por la búsqueda de cada secuencia
de aminoácidos de la base de datos GenBank. Un árbol filogenético
fue producido con el programa del paquete Phylip versión 3.57c
usando un proceso N-J (proceso de unión - vecino)
basado en la alineación múltiple así resultante.
Consecuentemente, se supuso que el
SP-D, CL-43 bovino, y la
conglutinina bovina formaron un agrupamiento, mientras que el MBP y
SP-A formaron respectivamente agrupamientos
separados, sin embargo la nueva colectina del presente invento no
pertenecía a ninguno de estos agrupamientos pero pertenecía al mismo
agrupamiento que la CL-L1. Por consiguiente, se
especuló que la nueva colectina del presente invento es una homóloga
de la CL-L1.
\newpage
Ejemplo
8
El análisis con la técnica
RT-PCR fue llevado a cabo para examinar la expresión
del CL-L2-1 (SEQ ID NO: 1) y
CL-L2-2 (SEQ ID NO: 3) en diversos
tejidos. La RT PCR fue llevada a cabo usando los cebadores que son
capaces de amplificar la región traducida completa de la
CL-L2-1 obtenida como (RTF2
(5'-atgagggggaatctggccctggtg-3'
(SEQ ID NO: 30)), RTR2
(5'-catgttctccttgtcaaactcac-3' (SEQ
ID NO: 31))); los cebadores que son capaces de amplificar la región
traducida completa del CL-L2-2
obtenida como (RTF3
(5'-atgtggtgggtgcctccgagtc-3' (SEQ
ID NO: 32)), RTR2 (SEQ ID NO: 31)); y dos cebadores
\beta-actina humanos usados en el Ejemplo 6, que
son capaces de amplificar una parte del gen
\beta-actina para el uso en comparación de la
cantidad de la nueva colectina expresada en cada uno de los
tejidos. Todos estos cebadores fueron sintetizados en una manera
similar al cebador CAP1, y la RT-PCR fue realizada
similarmente al Ejemplo 6.
Los resultados son ilustrados en la Fig. 9, que
demuestra una expresión intensa del
CL-L2-1 (SEQ ID NO: 1) según el
presente invento mediante PCR realizada con 28 ciclos en el riñón
(carril 3), en el hígado (carril 4), intestino delgado (carril 9),
timo (carril 12), hígado fetal (carril 20), médula espinal (carril
21), glándula adrenal (carril 23), páncreas (carril 24). Además,
con respecto a la PCR realizada con 35 ciclos, la expresión ubicua
de CL-L2-1 (SEQ ID NO: 1) se pudo
verificar en todos los tejidos ensayados, aunque se observó
intensidad variable en la expresión. Además, se encontró que la
CL-L2-2 (SEQ ID NO: 3) se expresa
intensamente en el riñón (carril 3) para la PCR realizada con 28
ciclos, mientras que en PCR realizada con 35 ciclos e expresa en el
riñón (carril 3) así como en la glándula prostática (carril 14),
testículos (carril 16), médula espinal (carril 21), placenta
(carril 22).
Adicionalmente, varios fragmentos amplificados
fueron encontrados en los productos de RT-PCR de las
CL-L2-1 y
CL-L2-2 como se muestra en la Fig.
9. Estas bandas fueron cortadas del gel y purificadas mediante un
proceso similar al del Ejemplo 2, es decir, por congelación a -80°C
durante 10 min, centrifugación a 15000 rpm durante 10 min seguido
por precipitación en etanol del sobrenadante. El fragmento de ADN
purificado fue incorporado en el vector pT7Blue fabricado por
Novagen Co., y el vector así resultante fue transformado en las
células competentes, células CL1-Blue. El
transformante fue cultivado en un medio LB (100 \mug/mL de
ampicilina) y luego el plásmido fue extraído con un método SDS
alcalino. La secuencia de bases fue determinada por el kit BigDye
Terminador Cycle Sequencing FS Ready Reaction y el secuenciador ABI
PRISM 377 fabricado por Applied Biosystems Inc. Los cebadores
empleados fueron el cebador universal M13
(5'-cgacgttgtaaaacgacggccagt-3' (SEQ
ID NO: 20)) y el cebador inverso M13
(5'-caggaaacagctatgac-3' (SEQ ID NO:
21)).
La secuencia de bases resultante fue la misma
que CL-L2-2v1,
CL-L2-2v2 y
CL-L2-2v3 que son variantes de
CL-L2-2 (SEQ ID NO: 3) obtenidas en
el Ejemplo 2. Además, las tres proteínas estuvieron presentes como
CL-L2-1 expuestas en la SEQ ID NO:
2, que fueron derivados del corte y empalme alternativo del mARN.
Estos se refieren a CL-L2-1v1 (SEQ
ID NO: 36, 37), CL-L2-1v2 (SEQ ID
NO: 38, 39) y CL-L2-1v3 (SEQ ID NO:
40, 41). El CL-L2-1v1 tiene una
deleción de la posición aminoacídica 44-91 del
CL-L2-1 establecida en la SEQ ID NO:
2 (deleción de la posición de bases 394-537 de la
CL-L2-1 expuesta en la SEQ ID NO:
1), cuya secuencia aminoacídica es codificada por la posición del
265-933 de una secuencia de bases expuesta en la SEQ
ID NO: 36 (SEQ ID NO: 59). El
CL-L2-1v2 tiene una deleción de la
posición de aminoácidos 44-67 del
CL-L2-1 establecida en la SEQ ID NO:
2 (deleción de la posición de bases 394-465 de la
CL-L2-1 expuesta en la SEQ ID NO:
1), cuya secuencia aminoacídica está codificada por la posición del
265-1005 de una secuencia de bases expuesta en la
SEQ ID NO: 38 (SEQ ID NO: 60). La
CL-L2-1v3 tiene una deleción de la
posición de aminoácidos 68-91 de la
CL-L2-1 expuesta en la SEQ ID NO: 2
(deleción de la posición de bases 466-537 de la
CL-L2-1 expuesta en la SEQ ID NO:
1), cuya secuencia aminoacídica está codificada por la posición
265-1005 de una secuencia de bases expuesta en la
SEQ ID NO: 40 (SEQ ID NO: 61). Además, el gen
mCL-L2-2 puede ser obtenido en un
proceso similar al del Ejemplo 14.
Ejemplo
9
Una región traducida de la
CL-L2-1 (SEQ ID NO: 1) fue
amplificada usando el cebador
CL-L2-1F
(5'-gggaagcttcgatcaggatgagggggaatctggccctggtg-3'
(SEQ ID NO: 33)) y el cebador
CL-L2-1R
(5'-gggctcgagcatgttctcctt
gtcaaactcac-3' (SEQ ID NO: 34)) por PCR (Takara
termal Cycler MP fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) con una
librería de cADN derivada de riñón humano como plantilla. Además,
una región traducida de la nueva colectina (SEQ ID NO: 3) fue
amplificada usando el cebador
CL-L2-2F
(5'-gggaagcttccagcacaatgtggtgggtgcctccgagtc-3'
(SEQ ID NO: 35)) y el cebador
CL-L2-1R (SEQ ID NO: 34) por PCR
con una librería de cADN derivada del riñón humano como plantilla.
El cADN CL-L2-1 así resultante fue
ligado al vector T pT7Blue (fabricado por Novagen Co.) y fue
transformado en Escherichia coli XLI-Blue.
Un plásmido que contenía cADN
CL-L2-1 fue purificado de los clones
resultantes. Tras la confirmación de la secuencia de bases del
plásmido resultante con un secuenciador, el plásmido sin errores fue
digerido con las enzimas de restricción Hind III y
Xho I, y ligado al vector pcADN
3,1/Myc-His(+)A (fabricado por Invitrogen Co.,) que
había sido digerido con las mismas enzimas y purificado. Después de
que el plásmido ligado fue transformado en Escherichia Coli,
XLI-Blue, el clon resultante fue cultivado. El
plásmido fue luego purificado para dar un vector de expresión pcADN
3,1/Myc-His(+)A-CL-L2-1.2.
En el mismo momento, los vectores de expresión fueron producidos
similarmente por variantes de
CL-L2-1 y
CL-L2-2 (SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7,
SEQ ID NO: 9; SEQ ID NO: 36; SEQ ID NO: 38 y SEQ ID NO: 40).
Ejemplo
10
La expresión transitoria fue llevada a cabo a
través de la cotransfección del vector de expresión pcADN
3,1/Myc-His(+)A-CL-L2-1
obtenido en el Ejemplo 9 y el vector pEGFP-F
(fabricado por Clontech Co.,) a las células CHO usando el reactivo
LIPOFECTAMINA 2000 (LF2000) (fabricado por GIBCO BRL Co.). Una
disolución de 0,5 ml del reactivo LF2000 (30 \mul del reactivo
LF2000, Ham F-12 mezcla nutriente (medio
F-12 de Ham, (fabricado por Sigma Co.))) fue
preparada primero e incubado a temperatura ambiente durante 5
minutos. Después, 0,5 ml de una disolución del vector (pcADN
3,1/Myc-His(+)A-CL-L2-1.2:7,5
\mug, 2,5 \mug del vector pEGFP-F, medio
F-12 de Ham) fue mezclada con la misma, seguido por
una incubación durante 20 minutos. A partir de entonces, la
disolución fue añadida a las células CHO que habían sido cultivadas
a una elevada densidad en un frasco de 25 cm^{2} incluyendo 5 ml
del medio F-12 de Ham que contenía 5% de FCS.
Después de incubarla a 37°C durante 4 horas en presencia de 5% de
CO_{2}, el medio fue remplazado con un medio F-12
de Ham, seguido por la subsiguiente incubación a 37°C durante 20
horas en presencia de 5% de CO_{2}. A continuación, el medio fue
reemplazado con el medio F-12 de Ham que contenía
5% de FCS, 0,4 mg/ml de Geneticina, (fabricado por GIBCO BRL Co.) y
consiguientemente se dejaron transcurrir 10 días de cultivo. En
este proceso el reemplazo del medio se llevó a cabo una vez.
A través de esta selección con un fármaco
durante 10 días, sólo las células transformadas pudieron sobrevivir
y proliferar, al contrario sin embargo, las células que no fueron
transformadas murieron. Para obtener células de alta expresión a
partir de las células transformadas resultantes, la clasificación
fue realizada por un clasificador celular (fabricado por Becton
Dickinson Co.) con fluorescencia del GFP como marcador. Después de
lavar las células transformadas en un frasco de 25 cm^{2} con 5 ml
de PBS (-) dos veces, las células fueron despegadas con 0,3 ml de
una disolución de EDTA al 0,02% (fabricada por Nakarai Tesc KK). Las
células fueron suspendidas en 10 ml de PBS (-) y a partir de ese
momento centrifugadas a 200x g durante 7 minutos a 4°C para
eliminar el sobrenadante. El resto de las células fueron suspendidas
en 0,5 ml de FCS/PBS (-) al 2% de para dar una muestra de
selección. Después de que la muestra fuera hecha pasar a través de
un tubo de 5 ml equipado con una tapa de filtro celular (fabricado
por Becton Dickinson Co.) se aplicó a un aparato de selección
celular. Las células CHO sin estar sujetas a la transformación, las
cuales han sido tratadas similarmente, fueron usadas como células
testigo. Consecuentemente, una muestra fue seleccionada, la cual
exhibió una intensidad fluorescente de 10 veces o más que la
muestra testigo. Estas células fueron dispuestas en una placa de
microvaloración celular de 96 pocillos, en las que los pocillos
contenían respectivamente 100 \mul del medio F-12
de Ham (que contenía 5% de FCS, 0,4 mg/ml de Geneticina), para
cargar una célula única por pocillo. Después de que las células
fueron cultivadas a 37°C en presencia de 5% de CO_{2} durante una
semana, cada 100 \mul de medio de cultivo fue además añadido al
mismo seguido por el cultivo adicional durante una semana. Un clon
proliferado con el fármaco Geneticina de selección fue dividido en
dos partes, que fueron sujetas a pases en placas de microvaloración
de 12 pocillos y 24 pocillos. Tras el pase, los clones fueron
excluidos, los cuales fueron derivados de la proliferación en un
pocillo en el que dos o más células existían por pocillo y las
células fueron puestas en placa en una relación de número celular
de 9:1 para las placas de microvaloración de 12 pocillos y 24
pocillos. Las células fueron cultivas a 37°C en presencia de 5% de
CO_{2} hasta que las células en la placa de 12 pocillos
alcanzaron una densidad alta. Luego, 200 \mul del sobrenadante de
cultivo fueron sometidos a la transferencia dot plot sobre una
membrana Immobilon-P (fabricada por Millipore Co.,
Ltd) usando el aparato de microfiltración Bio-Dot
(fabricado por BIO-RAD Co., Ltd) y la membrana fue
incubada en una disolución de anticuerpos anti-myc
(fabricado por Invitrogen Co.,) x 5000 diluido en 0,05% de un tampón
Tween 20 al 0,05%/TBS (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) a
temperatura ambiente durante 1 hora. A partir de entonces, la
membrana fue lavada con 100 ml del tampón Tween 20 al 0,05%/TBS a
temperatura ambiente durante 20 min. x 3 seguido por la incubación
adicional en una disolución de
anti-IgG-HRP (fabricado por Chemicon
Co., Ltd) x 5000 diluido en tampón Tween 20 al 0,05%/TBS a
temperatura ambiente durante 1 hora. A partir de entonces, la
membrana fue lavada con 100 ml del tampón Tween 20 al 0,05%/TBS a
temperatura ambiente durante 20 min. x 3 seguido de la detección
usando un sistema de sustrato de peroxidasa de membrana TMB
(fabricado por Funakoshi KK). Después de confirmar los clones con
un desarrollo de color intenso, las células en los correspondientes
pocillos respectivos de la placa de 24 pocillos fueron
identificadas como una cepa celular de expresión estable
(CHO/CL-L2-1).
Ejemplo
11
Un litro del sobrenadante de cultivo de la cepa
celular de expresión estable de la nueva colectina
(CHO/CL-L2-1) producido en el
Ejemplo 10 fue concentrado a 50 ml usando el VIVAPORE10 (fabricado
por Funakoshi KK), a partir de ahí se le añadieron 200 \mul de
agarosa Ni-NTA (fabricado por Quiagen Co., Ltd) al
mismo. La nueva colectina fue vinculada a la agarosa
Ni-NTA por incubación de la mezcla con agitación a
4°C durante toda la noche. La agarosa Ni-NTA fue
embalada en columnas de cromatografía poli-prep
(fabricadas por BIO-RAD Co., Ltd.) seguido de
lavados con 5 ml de 50 mH de NaH_{2}PO_{4}, 300 mM de NaCl, 20
mM de imidazole, 0,05% de Tween20 (pH8,0) tres veces, y por elusión
con 200 \mul de 50 mM de NaH_{2}PO_{4}, 300 mM de NaCl, 250 mM
de imidazole, 0,05% de Tween20 (pH 8,0) cinco veces para purificar
la nueva colectina. La nueva colectina purificada fue determinada
cuantitativamente y usada para el análisis de la especificidad del
azúcar.
Específicamente, 1 \mug de la nueva colectina
purificada fue transferida mediante dot blot a una membrana
Immobilon-P (fabricada por Millipore Co., Ltd) para
dar manchas en un número correspondiente a los tipos de las sondas
de cadena del azúcar para ser examinadas en lo que se refiere a la
especificidad de unión, usando el aparato de Microfiltración
Bio-Dot (fabricado por BIO-RAD Co.,
Ltd.). Cada punto fue a partir de entonces cortado para rendir 1 cm
cuadrado, y fue inmerso en un Block Ace (fabricada por Dai Nippon
Pharmaceutical Co., Ltd.), y fue incubado a temperatura ambiente
durante 1 hora. Luego, la membrana fue lavada tres veces con el
tampón 0,05% de Tween 20, 5 mM de CaCl_{2}, TBS, y fue incubada
en cada disolución de sonda de cadena del azúcar (véase, Fig. 10)
diluida con 5 mM de CaCl_{2}, con el tampón TBS para dar 1
\mug/ml a temperatura ambiente durante 1 hora. A partir de
entonces, la membrana fue lavada de nuevo tres veces con el tampón
0,05% de Tween 20, 5 mM de CaCl_{2}, TBS. Luego la membrana fue
incubada en una disolución de HRP biotinilada unida a estreptavidina
(fabricado por Amersham Co.) x 1000 diluido con el tampón 0,05% de
Tween20, 5 mM de CaCl_{2}, TBS a temperatura ambiente durante 30
min. seguido por tres lavados con el tampón 0,05% de Tween 20, 5 mM
de CaCl_{2}, TBS y por detección usando el sistema de sustrato de
peroxidasa de membrana TMB (fabricado por Funakoshi KK). Como se
muestra en la Fig. 10, la nueva colectina fue activa en la unión con
manosa, fucosa, N-acetilgalactosamina, ácido
N-acetilneuramínico, manosa-6 ácido
fosfórico.
Debido a que la proteína CL-L2
del presente invento tiene una estructura de colectina, se cree que
es una sustancia que ejerce efectos característicos a esas
estructuras. Por tanto, se puede utilizar en la elucidación de
mecanismos de inmunidad fundamental; en la elucidación de mecanismos
del desarrollo de una amplia variedad de enfermedades tales como
infecciones bacterianas; en el diagnóstico, profilaxis y métodos
terapéuticos de las mismas; y en el desarrollo de reactivos y
fármacos para el mismo.
<110> FUSO PHARMACEUTICAL INDUSTRIES.
LTD.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 01P237WO
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1341
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265) .. (1077)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 271
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 1.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1139
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141).. (875)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 245
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 995
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141).. (731)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 197
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1067
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(803)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 221
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 7
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1067
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(803)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 221
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1522
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (157).. (969)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 271
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 159
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia CRD aminoacídica conocida
del CL-L1 documentado que ha sido empleado para la
búsqueda de EST en bases de datos
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 619
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia nucleotídica consenso de
la nueva colectina derivada de varias secuencias nucleotídicas
obtenidas de las bases de datos de EST
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP1 para clonar
la región 5' aguas arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagattttatt gtatagcttg g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP2 para clonar
la región 5' aguas arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgggtaata attacataat g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
\lambdaTriplEx-F1 para clonar la región 5' aguas
arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagctccgag atctggacga g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
\lambdaTriplEx-F2 para clonar la región 5' aguas
arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctcgggaagc gcgccattgt g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador universal M13 sintético para
secuenciar la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcgacgttgta aaacgacggc cagt
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador inverso M13 sintético para
secuenciar la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaggaaacag ctatgac
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP3 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtcctatgt caccggaatc
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP4 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttccatgacg acccacactg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético IRC2 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaaggtacgc cacagcgtat g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético IRC2 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtacgccaca gcgtatgatg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF1 para
RT-PCR para determinar la distribución tisular de la
nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagattccggt gacataggac c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTR1 para
RT-PCR para determinar la distribución tisular de la
nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggtctgggc tctgtccctg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador homosentido
\beta-actina sintético para RT-PCR
para determinar el nivel de control
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaagagatgg ccacggctgc t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador antisentido
\beta-actina sintético para RT-PCR
para determinar el nivel de control
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptccttctgca tcctgtcggc a
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF2 para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgaggggga atctggccct ggtg
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTR2 para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcatgttctcc ttgtcaaact cac
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF3 para
amplificación de CL-L2-2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgtggtggg tgcctccgag tc
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
CL-L2-1F sintético para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggaagcttc gatcaggatg agggggaatc tggccctggt g
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
CL-L2-IR sintético para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggctcgagc atgttctcct tgtcaaactc ac
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
CL-L2-2F sintético para
amplificación de CL-L2-2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggaagcttc cagcacaatg tggtgggtgc ctccgagtcc ctggtg
\hfill46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1197
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(933)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 223
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1269
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(1005)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1269
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(1005)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 257
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Leu Lys Gly Glu Lys Gly Asp Ser Gly Asp
Ile Gly Pro Pro Gly}
\sac{Pro Asn Gly Glu Pro Gly Leu Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 813
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 735
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 159
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 477
\vskip0.400000\baselineskip
<212>
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 72
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 69
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Glu Lys Gly Asp Ser Gly Asp Ile Gly Pro
Pro Gly Pro Asn Gly}
\sac{Glu Pro Gly Leu Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Trp Trp Val Pro Pro Ser Pro Tyr Gly Cys
Leu Pro Cys Ala Leu}
\sac{Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 591
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 663
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 663
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 813
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 669
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 741
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 741
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<110> FUSO PHARMACEUTICAL INDUSTRIES,
LTD.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 01P237WO
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\vskip0.400000\baselineskip
<160> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1341
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(1077)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
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<211> 271
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 1.
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
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<210> 3
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<211> 1139
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(875)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 245
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 995
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(731)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 197
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1067
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(803)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 221
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 7
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1067
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)..(803)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 221
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1522
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (157)..(969)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 271
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la nueva colectina de la secuencia nucleotídica expuesta en la SEQ
ID NO: 12
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 159
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia CRD aminoacídica conocida
del CL-L1 documentado que ha sido empleado para la
búsqueda de EST en bases de datos
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 619
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia nucleotídica consenso de
la nueva colectina derivada de varias secuencias nucleotídicas
obtenidas de las bases de datos de EST
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP1 para clonar
la región 5' aguas arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagattttatt gtatagcttg g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP2 para clonar
la región 5' aguas arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgggtaata attacataat g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
\lambdaTriplEx-F1 para clonar la región 5' aguas
arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagctccgag atctggacga g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
\lambdaTriplEx-F2 para clonar la región 5' aguas
arriba de la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctcgggaagc gcgccattgt g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador universal M13 sintético para
secuenciar la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcgacgttgta aaacgacggc cagt
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador inverso M13 sintético para
secuenciar la nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaggaaacag ctatgac
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP3 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtcctatgt caccggaatc
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético CAP4 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttccatgacg acccacactg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético 1RC2 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaaggtacgc cacagcgtat g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético 2RC2 para un
clonaje adicional de la región 5' aguas arriba de la nueva
colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtacgccaca gcgtatgatg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF1 para
RT-PCR para determinar la distribución tisular de la
nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagattccggt gacataggac c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTR1 para
RT-PCR para determinar la distribución tisular de la
nueva colectina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggtctgggc tctgtccctg c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador homosentido
\beta-actina sintético para RT-PCR
para determinar los niveles de control
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaagagatgg ccacggctgc t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador antisentido
\beta-actina sintético para RT-PCR
para determinar los niveles de control
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptccttctgca tcctgtcggc a
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF2 para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgaggggga atctggccct ggtg
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTR2 para
amplificación de CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcatgttctcc ttgtcaaact cac
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético RTF3 para
amplificación de CL-L2-2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgtggtggg tgcctccgag tc
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
CL-L2-1F para amplificación de
CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggaagcttc gatcaggatg agggggaatc tggccctggt g
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
CL-L2-1R para amplificación de
CL-L2-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggctcgagc atgttctcct tgtcaaactc ac
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador sintético
CL-L2-2F para amplificación de
CL-L2-2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggaagcttc cagcacaatg tggtgggtgc ctccgagtcc ctggtg
\hfill46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1197
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(933)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 223
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 36
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1269
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(1005)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1269
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (265)..(1005)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 257
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
la variante de la nueva colectina de la secuencia nucleotídica
expuesta en la SEQ ID NO: 40
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo Sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Leu Lys Gly Glu Lys Gly Asp Ser Gly Asp
Ile Gly Pro Pro Gly}
\sac{Pro Asn Gly Glu Pro Gly Leu Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoacídica deducida de
un dominio de tipo colágeno de la nueva colectina mutada
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 44
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<210> 45
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<211> 813
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<400> 45
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<210> 46
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<400> 46
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<210> 47
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<211> 159
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<400> 47
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<210> 48
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<211> 477
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<212>
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<213> Homo Sapiens
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<400> 48
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<210> 49
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<400> 49
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<213> Homo Sapiens
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\sa{Gly Glu Lys Gly Asp Ser Gly Asp Ile Gly Pro
Pro Gly Pro Asn Gly}
\sac{Glu Pro Gly Leu Pro}
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<210> 52
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<211> 45
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<400> 52
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<210> 53
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<211> 40
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<210> 54
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<211> 17
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<212> PRT
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<213> Homo Sapiens
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<400> 54
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\sa{Met Trp Trp Val Pro Pro Ser Pro Tyr Gly Cys
Leu Pro Cys Ala Leu}
\sac{Pro}
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<210> 55
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<211> 591
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<400> 55
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<210> 56
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<211> 663
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<211> 663
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<211> 813
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<212> ADN
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<213> Mus musculus
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<212> ADN
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<213> Homo Sapiens
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<400> 61
Claims (17)
1. Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 245 aminoácidos expuestos en
la posición aminoacídica 1-245 de la SEQ ID NO:
4.
2. Un polinucleótido que codifica una
secuencia aminoacídica expuesta en la posición aminoacídica
1-245 de la SEQ ID NO: 4.
3. Un polinucleótido reivindicado en la
reivindicación 2, en el que la secuencia de bases está expuesta en
la SEQ ID NO: 46.
4. Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 197 aminoácidos expuestos en
la posición aminoacídica 1-197 de la SEQ ID NO:
6.
5. Un polinucleótido que codifica una
secuencia aminoacídica expuesta en la posición aminoacídica
1-197 de la SEQ ID NO: 6.
6. Un polinucleótido como se reivindica
en la reivindicación 5, en la que la secuencia de bases está
expuesta en la SEQ ID NO: 55.
7. Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 221 aminoácidos expuestos en
la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
8.
8. Un polinucleótido que codifica una
secuencia aminoacídica expuesta en la posición aminoacídica
1-221 de la SEQ ID NO: 8.
9. Un polinucleótido como se reivindica
en la reivindicación 8, en la que la secuencia de bases está
expuesta en la SEQ ID NO: 56.
10. Una proteína que comprende una
secuencia aminoacídica que consiste en 221 aminoácidos expuestos en
la posición aminoacídica 1-221 de la SEQ ID NO:
10.
11. Un polinucleótido que codifica una
secuencia aminoacídica expuesta en la posición aminoacídica
1-221 de la SEQ ID NO: 10.
12. Un polinucleótido como se reivindica
en la reivindicación 11, en la que la secuencia de bases está
expuesta en la SEQ ID NO: 57.
13. Un vector que comprende un
polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 2, 3, 5,
6, 8, 9, 11 ó 12.
14. Una célula transformada con el vector
según la reivindicación 13, a manera de permitir la expresión ahí
del polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 2,
3, 5, 6, 8, 8, 11 ó 12.
15. Un proceso para producir una proteína,
proceso que comprende las etapas de cultivar una célula según la
reivindicación 14 y recoger las proteínas hCL-L2 así
producidas.
16. Un proceso para cribar un fármaco, en
el que la proteína según la reivindicación 1, 4, 7 ó 10 es
usada.
17. La célula según la reivindicación 14,
en la que la célula es una célula de Escherichia coli, una
célula animal o una célula de insecto.
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