ES2270424T3 - Composiciones y procedimientos relativos a genes reparadores de discordancias de adn. - Google Patents
Composiciones y procedimientos relativos a genes reparadores de discordancias de adn. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2270424T3 ES2270424T3 ES95906061T ES95906061T ES2270424T3 ES 2270424 T3 ES2270424 T3 ES 2270424T3 ES 95906061 T ES95906061 T ES 95906061T ES 95906061 T ES95906061 T ES 95906061T ES 2270424 T3 ES2270424 T3 ES 2270424T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- baselineskip
- sequence
- hmlh1
- dna
- gene
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Detergent Compositions (AREA)
Abstract
SE DESCRIBEN SECUENCIAS GENOMICAS DE GENES DE REPARACION DE DESAPAREAMIENTOS DEL ADN HUMANO, ASI COMO METODOS DE DETECCION DE MUTACIONES Y/O POLIMORFISMOS EN DICHOS GENES. ASIMISMO, SE DESCRIBEN METODOS DE DIAGNOSTICO DE LA SUSCEPTIBILIDAD AL CANCER DE UN SUJETO, Y METODOS DE CLASIFICACION E IDENTIFICACION DE TUMORES QUE PRESENTAN DEFECTOS DE REPARACION DE DESAPAREAMIENTOS DEL ADN. EN PARTICULAR, SE PROPORCIONAN METODOS RELACIONADOS CON HOMOLOGOS HUMANOS MUTL Y GENES HMLH1 Y HPMS1.
Description
Composiciones y procedimientos relativos a genes
reparadores de discordancias del ADN.
Esta invención se realizó con ayuda del gobierno
con el Contrato Nº GM 32741 y el Contrato Nº HG00395/
GM50006 concedido por el Instituto Nacional de la Salud en la División General de Ciencias. El gobierno tiene ciertos derechos sobre la invención.
GM50006 concedido por el Instituto Nacional de la Salud en la División General de Ciencias. El gobierno tiene ciertos derechos sobre la invención.
La presente invención se refiere a genes de
reparación de errores de apareamiento de ADN. En particular, la
invención se refiere a la identificación de mutaciones y
polimorfismos en genes de reparación de errores de apareamiento de
ADN, a la identificación y caracterización de tumores debidos a la
deficiencia en la reparación de errores de apareamiento de ADN y a
la detección de susceptibilidad genética al cáncer.
En los últimos años, con el desarrollo de
potentes técnicas de clonación y amplificación, tales como la
reacción en cadena de la polimerasa (PCR), en combinación con la
rápida acumulación de gran cantidad de información sobre la
estructura y localización de numerosos genes y marcadores humanos,
se ha convertido en práctico y conveniente recoger y analizar
muestras de ADN o ARN de individuos que son miembros de familias
identificadas por mostrar una alta frecuencia en ciertos trastornos
transmitidos genéticamente. Por ejemplo, se usan de forma rutinaria
procedimientos de análisis para seleccionar genes implicados en
anemia de células falciformes, fibrosis quística, síndrome del
cromosoma X frágil y esclerosis múltiple. En algunos tipos de
trastornos, un diagnóstico más temprano puede mejorar mucho el
pronóstico a largo plazo de la persona, por ejemplo, adoptando una
rutina diagnóstica agresiva y/o haciendo un cambio en el estilo de
vida si es apropiado para prevenir o prepararse para un problema
anticipado.
Una vez que se identifica una mutación en un gen
humano en particular y se asocia a una enfermedad, desarrollar
procedimientos de análisis para identificar individuos de alto
riesgo puede ser relativamente simple. Por ejemplo, una vez que se
conoce la estructura y la función fenotípica anómala del gen
mutante, es posible diseñar cebadores de uso en PCR para obtener
cantidades amplificadas del gen a partir de los individuos para su
análisis. Sin embargo, el descubrimiento inicial de un gen mutante,
es decir, su estructura, localización y ligamiento con un problema
de salud hereditario conocido, requiere un esfuerzo experimental
sustancial y estrategias de investigación creativas.
Una aproximación para descubrir el papel de un
gen mutante como causante de una enfermedad empieza con estudios
clínicos de los individuos de familias que muestran una elevada
frecuencia de la enfermedad. En estos estudios, la localización
aproximada del locus causante de la enfermedad se determina
indirectamente buscando un marcador cromosómico que tienda a
segregar con el locus. Una limitación importante de esta
aproximación es que, aunque puede determinarse la localización
genómica aproximada del gen, generalmente esto no permite el
aislamiento o secuenciación real del gen. Por ejemplo, Lindblom y
col.^{3} describen los resultados del análisis de los estudios de
ligamiento realizados con marcadores de SSLP (polimorfismo de
longitud de secuencias discretas) en individuos de una familia que
se sabe muestra una elevada incidencia de cáncer de colon
hereditario no polimórfico (CCHNP). Lindblom y col. encontraron un
"estrecho ligamiento" entre un marcador de polimorfismo en el
brazo corto del cromosoma 3 humano (3p21-23) y un
locus de la enfermedad aparentemente responsable del aumento del
riesgo del individuo al desarrollo de cáncer de colon. Aunque
3p21-23 es una localización bastante específica en
relación con el genoma completo, representa una amplia región de ADN
en relación con el tamaño probable del gen mutante. El gen mutante
podría estar separado de los marcadores que identifican el locus por
millones de bases. En el mejor de los casos, estos estudios de
ligamiento tienen sólo una utilidad limitada con fines de análisis
ya que, para predecir el riesgo personal, el análisis genético
debería realizarse en varios individuos relacionados de la familia
usando marcadores genéticos estrechamente ligados. A menudo es
imposible obtener esta información, especialmente si los miembros
afectados de la familia han muerto. Además, puede que no existan
marcadores indicativos en la familia en análisis. Sin conocer la
estructura del gen, no es posible recoger muestras, amplificar,
secuenciar y determinar directamente si un individuo es portador del
gen mutante.
Otra aproximación para descubrir un gen mutante
causante de una enfermedad se inicia con el diseño y ensayo de
cebadores de PCR, basados en la información conocida sobre la
enfermedad, por ejemplo, teorías sobre los mecanismos patológicos,
estructuras y función de proteínas relacionadas, posibles genes
análogos en humanos o en otras especies, etc. El objetivo es aislar
y secuenciar genes normales candidatos que se cree que, algunas
veces aparecen en formas mutantes, dando lugar a un individuo
propenso a la enfermedad. Esta aproximación depende en gran medida
de lo que se conoce sobre la enfermedad a nivel molecular y de la
capacidad del investigador para diseñar estrategias y procedimientos
para encontrar genes candidatos. La asociación de una mutación en un
gen candidato con una enfermedad debería demostrarse en último
extremo realizando ensayos a los miembros de una familia que muestra
una elevada incidencia de la enfermedad. La manera más directa y
definitiva de confirmar este ligamiento en estudios de familia es
usar cebadores de PCR que se diseñan para amplificar porciones del
gen candidato en muestras recogidas de los miembros de la familia. A
continuación, los productos génicos amplificados se secuencian y
comparan con la estructura génica normal con el fin de encontrar y
caracterizar mutaciones. Una mutación dada está implicada en última
instancia si se demuestra que los individuos afectados la tienen,
mientras que los individuos no afectados no la tienen, y que la
mutación causa un cambio en la función proteica que no es
simplemente un polimorfismo.
Otra manera de demostrar una probabilidad
elevada de ligamiento entre una mutación génica candidata y una
enfermedad es determinar la localización cromosómica del gen
comparando, a continuación, la localización en el mapa génico con
regiones conocidas de loci ligados a la enfermedad tal como la
identificada por Lindblom y col. La coincidencia en la localización
del mapa de un gen candidato con la región de un locus ligado a una
enfermedad identificada previamente puede implicar claramente una
asociación entre una mutación en el gen candidato y la
enfermedad.
Hay otras maneras de demostrar que las
mutaciones en un gen candidato pueden estar ligadas a la enfermedad.
Por ejemplo, pueden introducirse formas mutantes del gen producidas
artificialmente en animales. A continuación, puede compararse la
incidencia de la enfermedad en animales que llevan el gen mutante
con la de animales con el genotipo normal. La incidencia
significativamente elevada de la enfermedad en animales con el
genotipo mutante, en relación con animales con el gen de tipo
natural, puede apoyar la teoría de que las mutaciones en el gen
candidato algunas veces son responsables de la aparición de la
enfermedad.
Un tipo de enfermedad que recientemente ha
recibido mucha atención debido al descubrimiento de mutaciones
génicas ligadas a la enfermedad es el cáncer de colon hereditario no
polipósico (CCHNP)^{1,2}. Los miembros de familias con
CCHNP también muestran una susceptibilidad aumentada a otros
cánceres, incluyendo endometrial, de ovario, gástrico y de mama. Se
cree que aproximadamente el 10% de los cánceres colorrectales son
CCHNP. Los tumores de pacientes con CCHNP muestran un defecto
genético inusual en el que parece que secuencias de ADN cortas
repetidas, tales como las secuencias de dinucleótidos repetidas
encontradas en el ADN cromosómico humano ("ADN microsatélite"),
son inestables. Esta inestabilidad genómica de secuencia de ADN
cortas repetidas, denominada a veces fenotipo "RER+", también
se observa en una proporción significativa de una amplia variedad de
tumores esporádicos, lo que sugiere que muchos tumores esporádicos
pueden tener mutaciones adquiridas que son similares (o idénticas) a
mutaciones que son hereditarias en CCHNP.
Los estudios de ligamiento genético han
identificado dos loci de CCHNP que se piensa son responsables de más
del 90% de los CCHNP. Los loci mapean en los cromosomas humanos
2p15-16 (2p21) y 3p21-23. Estudios
posteriores han identificado el gen humano de reparación de errores
de apareamiento de ADN, hMSH2, como el gen del cromosoma
2p21, en el que las mutaciones son responsables de una fracción
significativa de cánceres CCHNP^{1,2,12}. hMSH2 es uno de
los diversos genes cuya función normal es identificar y corregir
desapareamientos de ADN incluyendo aquellos que siguen a cada ronda
de replicación cromosómica.
La ruta de reparación de errores de apareamiento
mejor definida es la ruta de MutHLS de E. coli que promueve
una reacción de reparación de escisión de parches largos
(aproximadamente 3 Kb) que dependen de los productos génicos
mutH, mutL, mutS y mutU (uvrD). La ruta
de MutHLS parece ser la ruta de reparación de errores de
apareamiento más activa en E. coli y se sabe que aumenta la
fidelidad de replicación del ADN y actúa en intermedios de
recombinación que contienen bases desapareadas. El sistema se ha
reconstituido in vitro y requiere de las proteínas
mutH, mutL, mutS y uvrD (helicasa II) junto con
la holoenzima ADN polimerasa III, ADN ligasa, proteína de unión a
ADN de hebra sencilla (SSB) y una de las exonucleasas de ADN de
hebra sencilla, Exo I, Exo VII o RecJ. hMSH2 es homólogo al gen
bacteriano mutS. Una ruta similar en levadura incluye el gen
MSH2 de levadura y dos genes similares a mutL
denominados como PMS1 y MLH1.
Con el conocimiento de que las mutaciones en un
gen humano de tipo mutS (hMSH2) a veces causan cáncer
y el descubrimiento de que los tumores CCHNP muestran inestabilidad
en el ADN microsatélite, se ha intensificado el interés en otros
genes de reparación de errores de apareamiento de ADN y de productos
génicos y sus posibles funciones en el CCHNP y en otros cánceres. Se
estima que 1 de cada 200 individuos llevan una mutación en el gen
hMSH2 o en otros genes relacionados que codifican otras
proteínas de la misma ruta de reparación de errores de apareamiento
de ADN.
Un objetivo importante de nuestro trabajo ha
sido identificar genes humanos que son útiles para analizar e
identificar individuos que tienen un riesgo elevado de desarrollar
cáncer. Otros objetivos son: determinar las secuencias de las
estructuras de los exones e intrones flanqueantes en estos genes;
usar la información estructural para diseñar procedimientos de
análisis con el fin de encontrar y caracterizar mutaciones que den
lugar a una ausencia o defecto de un producto génico que confiere
susceptibilidad al cáncer y distinguir estas mutaciones de
variaciones polimórficas "inofensivas". Otro objetivo es usar
la información estructural relacionada con la secuencia del exón y
del intrón flanqueante de un gen ligado al cáncer, diagnosticar
tipos de tumores y prescribir la terapia apropiada. Otro objetivo es
usar la información estructural relativa a un gen ligado al cáncer
para identificar otros genes humanos candidatos relacionados para su
estudio.
Sobre la base de nuestro conocimiento sobre los
mecanismos de reparación de errores de apareamiento de ADN en
bacterias y levaduras que incluye la conservación de genes de
reparación de errores de apareamiento, concluimos que deberían
existir homólogos de reparación de errores de apareamiento de ADN
humano y que mutaciones en estos homólogos que afecten a la función
proteica, probablemente causarían inestabilidad genética,
conduciendo posiblemente a un aumento en el riesgo de desarrollar
ciertas forma de cáncer humano.
Hemos aislado y secuenciado dos genes humanos,
hPMS1 y hMLH1 que codifican cada uno de ellos una
proteína implicada en la reparación de errores de apareamiento de
ADN. hPMS1 y hMLH1 son homólogos a los genes
mutL encontrados en E. coli. Nuestros estudios apoyan
claramente una asociación entre mutaciones en genes de reparación de
errores de apareamiento de ADN y la susceptibilidad a CCHNP. De este
modo, la información de la secuencia de genes de reparación de
errores de apareamiento de ADN, a saber, estructuras de ADNc y
genómicas relacionadas con hMLH1 y hPMS1, hace posible
varios procedimientos útiles relacionados con la determinación del
riesgo y el diagnóstico del cáncer. Para estos procedimientos son
útiles un gran número de estructuras nucleotídicas y
proteicas.
proteicas.
Hemos mapeado la localización de hMLH1 en
el cromosoma humano 3p21-23. Esta es una región del
genoma humano que, sobre la base de estudios familiares, porta un
locus que predispone a los individuos al CCHNP. Adicionalmente,
hemos descubierto una mutación en una región conservada del ADNc de
hMLH1 en individuos afectados de CCHNP de una familia sueca.
La mutación no se encuentra en individuos no afectados de la misma
familia, ni tampoco es un simple polimorfismo. También hemos
descubierto que una mutación homóloga en levadura da lugar a una
proteína reparadora de errores de apareamiento de ADN defectuosa.
También hemos descubierto una mutación en fase en hMLH1 de
individuos afectados de una familia inglesa. Nuestro descubrimiento
de mutaciones en hMLH1 ligadas al cáncer, combinado con las
posiciones en el mapa de los genes que coincide con un locus ligado
a CCHNP identificado previamente, además del probable papel del gen
hMLH1 en evitar mutaciones, hace del gen hMLH1 un
candidato principal para ser la base de una forma de cáncer humano
hereditario común y un candidato principal para analizar e
identificar individuos que tienen un riesgo elevado de desarrollar
cáncer.
hMLH1 tiene 19 exones y 18 intrones. Hemos
determinado la localización de cada uno de los 18 intrones en
relación con el ADNc de hMLH1. También hemos determinado la
estructura de todas las regiones del límite intrón/exón de
hMLH1. El conocimiento de las estructuras del límite
intrón/exón hace posible regímenes de análisis eficaces para
localizar mutaciones que afectan negativamente a la estructura y a
la función de los productos génicos. Además, hemos diseñado grupos
completos de pares de cebadores oligonucleotídicos que pueden usarse
en PCR para amplificar exones completos individuales junto con
estructuras que rodean el límite del intrón.
Hemos mapeado la localización de hPMS1 en
el cromosoma 7 humano. Otros estudios posteriores^{39} han
confirmado nuestra predicción de que las mutaciones en este gen
están ligadas al CCHNP.
El uso más inmediato de la presente invención
será en ensayos de selección en individuos humanos miembros de
familias que muestran una frecuencia inusualmente elevada de
cánceres de desarrollo temprano, por ejemplo, CCHNP. Por lo tanto,
un aspecto de la invención comprende un procedimiento de diagnóstico
de la susceptibilidad al cáncer de colon en un sujeto detectando una
mutación en un ácido nucleico de hMLH1 como se muestra en la
reivindicación 1 o un ácido nucleico de hPMS1 como se muestra en la
reivindicación 3 en un tejido del sujeto, donde la mutación es
indicativa de la susceptibilidad del sujeto al cáncer de colon.
El procedimiento de diagnóstico preferiblemente
comprende las etapas de: 1) amplificar un segmento del gen o
producto génico de reparación de errores de apareamiento de un ácido
nucleico aislado; 2) comparar el segmento amplificado con un
segmento análogo de un alelo de tipo natural del gen o producto
génico de reparación de errores de apareamiento; y 3) detectar una
diferencia entre el segmento amplificado y el segmento análogo,
siendo indicativa la diferencia de una mutación en el gen o producto
génico de reparación de errores de apareamiento que confiere
susceptibilidad al cáncer de colon.
Un procedimiento puede comprender el determinar
si la diferencia entre el segmento amplificado y el segmento análogo
de tipo natural causa un fenotipo afectado, es decir, la alteración
de la secuencia afecta a la capacidad del individuo para reparar los
errores de apareamiento de ADN.
El procedimiento de diagnóstico puede incluir
las etapas de: 1) transcribir de forma inversa toda o una porción de
una copia de ARN de un gen de reparación de errores de apareamiento
de ADN y 2) amplificar un segmento del ADN producido por
transcripción inversa. Una etapa de amplificación puede comprender:
seleccionar un par de cebadores oligonucleotídicos capaces de
hibridar con hebras opuestas del gen de reparación de errores de
apareamiento, en una orientación opuesta, y realizar una reacción en
cadena de la polimerasa utilizando los cebadores oligonucleotídicos
de modo que se amplifique el ácido nucleico de la cadena de
reparación de errores de apareamiento que queda entre los cebadores
para dar lugar al segmento amplificado.
El gen de reparación de errores de apareamiento
de ADN es hMLH1 o hPMS1. El segmento de ADN se
corresponde con una porción única de una secuencia de nucleótidos
seleccionada entre el grupo constituido por las SEC ID Nº
6-24. Los cebadores oligonucleotídicos de la
"primera etapa" seleccionados entre el grupo constituido por
las ID SEC Nº 44-82 se usan en PCR para amplificar
el segmento de ADN. Pueden usarse cebadores anidados de la
"segunda etapa" (ID SEC Nº 83-122) con los
cebadores de la primera etapa para permitir una amplificación y
conservación del ADN molde más específicas.
Un procedimiento para identificar y clasificar
un tumor debido a la deficiencia en la reparación de errores de
apareamiento de ADN puede comprender el detectar en el tumor una
mutación en un gen o producto génico de reparación de errores de
apareamiento, preferiblemente un homólogo de mutL
(hMLH1 o hPMS1), siendo la mutación indicativa de un
defecto en el sistema de reparación de errores de apareamiento del
tumor.
\newpage
Una estructura nucleotídica o proteica aislada
puede incluir un segmento que secuencialmente se corresponde con una
porción única de un gen o producto génico humano homólogo a
mutL, derivado preferiblemente de hMLH1 o
hPMS1.
Pueden usarse cebadores oligonucleotídicos
juntos en una reacción en cadena de la polimerasa para amplificar
específicamente un segmento único de un gen humano homólogo a
mutL, preferiblemente hMLH1 o hPMS1.
Una sonda puede incluir una secuencia
nucleotídica capaz de unirse específicamente mediante apareamiento
de Watson/Crick a bases complementarias en una porción de un gen
humano homólogo a mutL y un resto marcado unido a la
secuencia, en el que el resto marcado tiene una propiedad
seleccionada entre el grupo constituido por fluorescencia,
radiactividad y quimioluminiscencia.
También hemos aislado y secuenciado los genes
MLH1 (mMLH1) y PMS1 (mPMS1) de ratón.
Hemos usado nuestro conocimiento sobre genes reparadores de errores
de apareamiento del ratón para construir modelos animales para el
estudio del cáncer. Los modelos serán útiles para identificar
oncogenes adicionales y para estudiar efectos medioambientales sobre
la mutagénesis.
Hemos producidos anticuerpos policlonales
dirigidos frente a una porción de la proteína codificada por el ADNc
de mPMS1. Los anticuerpos también reaccionan con la proteína
hPMS1 y son útiles para detectar la presencia de la proteína
codificada por un gen hPMS1 normal. También hemos producido
anticuerpos monoclonales dirigidos frente a hMLH1 y
hPMS1.
Además del uso diagnóstico y terapéutico de los
genes, hemos usado nuestro conocimiento de hMLH1 y
hPMS1 para buscar otros genes de función relacionada que son
candidatos para jugar un papel en ciertas formas de cáncer
humano.
La Figura 1 es un diagrama de flujo que muestra
una visión general de la secuencia de etapas experimentales que
usamos para aislar, caracterizar y usar los genes PMS1 y
MLH1 humanos y de ratón.
La Figura 2 es un alineamiento de secuencias de
proteínas homólogas a mutL (ID SEC Nº 1-3)
mostrando dos regiones muy conservadas (subrayadas) que usamos para
crear oligonucleótidos degenerados para PCR para el aislamiento
adicional de homólogos a mutL.
La Figura 3 muestra la secuencia completa de
nucleótidos del ADNc (SEC ID Nº 4) del gen MLH1 humano, y la
correspondiente secuencia de aminoácidos predicha (ID SEC Nº 5) de
la proteína MLH1 humana. Las secuencias de ADN subrayadas son las
regiones del ADNc que se corresponden con los cebadores degenerados
para PCR que usamos originalmente para amplificar una porción del
gen MLH1 (nucleótidos 118-135 y
343-359).
La Figura 4A muestra las secuencias de
nucleótidos de los 19 exones que se corresponden en conjunto con la
estructura completa del ADNc de hMLH1. Los exones están
flanqueados por estructuras limite con los intrones. Los sitios de
los cebadores están subrayados. Los exones con sus estructuras que
flanquean a los intrones se corresponden con las ID SEC Nº
6-24. Los exones mostrados con letras minúsculas sin
subrayar se corresponden con las ID SEC Nº
25-43.
La Figura 4B muestra las secuencias
nucleotídicas de los pares de cebadores que se han usado en PCR para
amplificar los exones individuales. Los cebadores de amplificación
de la "segunda etapa" (SEC ID Nº 83-122) son
cebadores "anidados" que se usan para amplificar exones diana a
partir de productos de amplificación obtenidos con los
correspondientes cebadores de amplificación de la "primera
etapa" (ID SEC Nº 44-82). Las estructuras de la
Figura 4B se corresponden con las estructuras de las Tablas 2 y
3.
La Figura 5 es un alineamiento de las secuencias
de aminoácidos predichas de las proteínas MLH1 de humano y de
levadura (ID SEC Nº 5 y 123, respectivamente). Las identidades de
aminoácidos se indican mediante recuadros y los huecos se indican
mediante guiones.
La Figura 6 es un árbol filogenético de las
proteínas relacionadas con MutL.
La Figura 7 es una fotografía con dos paneles.
El primer panel (A) es una extensión en metafase que muestra la
hibridación del gen hMLH1 del cromosoma 3. El segundo panel
(B) es una composición del cromosoma 3 a partir de múltiples
extensiones en metafase alineadas con un ideograma del cromosoma 3
humano. La región de hibridación está indicada en el ideograma con
una barra vertical.
La Figura 8 es una comparación de los
cromatogramas de secuencia de individuos afectados y no afectados
que muestra la identificación de una mutación de transición de C a T
que produce una sustitución de aminoácido no conservadora en la
posición 44 de la proteína hMLH1.
\newpage
La Figura 9 es un alineamiento de la secuencia
de aminoácidos (ID SEC Nº 124-131) de la región muy
conservada de la familia de proteínas MLH que rodea al sitio de la
sustitución de aminoácido predicha. En negrita se indica la posición
de la sustitución del aminoácido serina por fenilalanina predicha en
los individuos afectados. También se resaltan los restos de serina o
alanina conservados en esta posición en las proteínas similares a
MutL. Los puntos negros indican las posiciones de los aminoácidos
más conservados. En la proteína MLH1, la línea punteada indica que
no se ha obtenido la secuencia. Las secuencias se han alineados como
se describe a continuación en referencia al árbol filogenético de la
Figura 6.
La Figura 10 muestra la secuencia de nucleótidos
completa de hPMS1 (ID SEC Nº 132).
La Figura 11 es un alineamiento de las
secuencias de aminoácidos predichas de las proteínas PMS1 de humano
y de levadura (ID SEC Nº 133 y 134, respectivamente). Las
identidades de aminoácidos se indican mediante recuadros y los
huecos se indican mediante guiones.
La Figura 12 es una secuencia de nucleótidos
parcial del ADNc de MLH1 de ratón (mMLH1) (ID SEC Nº
135).
La Figura 13 es una comparación de la secuencia
de aminoácidos predicha de las proteínas mMLH1 y hMLH1 (ID SEC Nº
136 y 5, respectivamente).
La Figura 14 muestra la secuencia de nucleótidos
del ADNc del PMS1 de ratón (mPMS1) (ID SEC Nº
137).
La Figura 15 es una comparación de las
secuencias de aminoácidos predichas de las proteínas mPMS1 y hPMS1
(ID SEC Nº 138 y 133, respectivamente).
Gen - "Gen" significa una secuencia
de nucleótidos que contiene una secuencia codificadora completa.
Generalmente, "genes" también incluye secuencias de nucleótidos
encontradas antes del extremo 5' (por ejemplo, secuencias
promotoras, potenciadoras, etc.) o después del extremo 3' (por
ejemplo, señales de parada de la transcripción, sitios de
poliadenilación, etc.) de la secuencia codificadora que afectan a la
expresión del polipéptido codificado.
Producto génico - Un "producto
génico" es una copia de ADN o ARN (ARNm) de una porción de un gen
o una secuencia de aminoácidos correspondiente traducida a partir
del ARNm.
Tipo natural - La expresión "tipo
natural", cuando se aplica a ácidos nucleicos y proteínas de la
presente invención, significa una versión de un ácido nucleico o
proteína que funciona de forma que no puede distinguirse de una
versión normal natural de ese ácido nucleico o proteína (es decir,
un ácido nucleico o proteína con actividad de tipo natural). Por
ejemplo, un alelo de "tipo natural" de un gen de reparación de
errores de apareamiento es capaz de reemplazar funcionalmente una
copia endógena normal del mismo gen en una célula hospedadora sin
alteración detectable de la reparación de errores de apareamiento en
esta célula. Las diferentes versiones de tipo natural del mismo
ácido nucleico o proteína pueden o no diferir estructuralmente entre
sí.
De tipo no natural - La expresión "de
tipo no natural", cuando se aplica a ácidos nucleicos y
proteínas, significa una versión de un ácido nucleico o proteína que
funciona de forma que puede distinguirse de una versión normal
natural de este ácido nucleico o proteína. Los alelos de tipo no
natural de un ácido nucleico de la invención pueden diferir
estructuralmente de los alelos de tipo natural del mismo ácido
nucleico en cualquiera de una diversidad de formas, incluyendo, pero
sin limitaciones, diferencias en la secuencia de aminoácidos de un
polipéptido codificado y/o diferencias en los niveles de expresión
de un producto polipeptídico transcrito de un nucleótido
codificador.
Por ejemplo, la secuencia de nucleótidos de un
alelo de tipo no natural de un ácido nucleico de la invención puede
diferir de la de un alelo de tipo natural en, por ejemplo, la
adición, deleción, sustitución y/o reordenamiento de nucleótidos. De
forma similar, la secuencia de aminoácidos de una proteína de
reparación de errores de apareamiento de tipo no natural puede
diferir de la de una proteína de reparación de errores de
apareamiento de tipo natural en, por ejemplo, la adición,
sustitución y/o reordenamiento de aminoácidos.
Los ácidos nucleicos o proteínas de tipo no
natural en particular que, cuando se introducen en una célula
hospedadora normal, interfieren con la ruta de reparación de errores
de apareamiento endógeno, se denominan ácidos nucleicos o proteínas
"dominantes negativos".
Homólogo - El término "homólogo" se
refiere a ácidos nucleicos o polipéptidos que están muy relacionados
a nivel de secuencia de nucleótidos o aminoácidos. Los ácidos
nucleicos o polipéptidos que son homólogos entre sí se denominan
"homólogos".
El término "homólogo" se refiere
necesariamente a una comparación entre dos secuencias. Dos
secuencias de nucleótidos se consideran homólogas si los
polipéptidos que codifican son al menos aproximadamente el
50-60% idénticos, preferiblemente aproximadamente el
70% idénticos, en al menos una extensión de 20 aminoácidos.
Preferiblemente, las secuencias homólogas de nucleótidos también se
caracterizan por la capacidad para codificar una extensión de al
menos 4-5 aminoácidos especificados exclusivamente.
Debe considerarse tanto la identidad como el espaciamiento
aproximado de estos ácidos nucleicos entre sí para que las
secuencias nucleotídicas se consideren homólogas. Para secuencias
nucleotídicas de menos de 60 nucleótidos de longitud, la homología
se determina por la capacidad para codificar una extensión de al
menos 4-5 aminoácidos exclusivamente
especificados.
Antes del extremo 5'/después del extremo
3' - Las expresiones "antes del extremo 5' " y "después
del extremo 3' " son expresiones conocidas en la técnica que se
refieren a la posición de un elemento de la secuencia de
nucleótidos. "Antes del extremo 5'" significa un elemento que
están más hacia el extremo 5' que el elemento de referencia.
"Después del extremo 3'" significa un elemento que están más
hacia el extremo 3' que un elemento de referencia.
Intrón/exón - Los términos "exón" e
"intrón" son términos conocidos en la técnica que se refieren a
diversas porciones de secuencias genómicas del gen. Los
"exones" son aquellas porciones de una secuencia genómica del
gen que codifica una proteína. Los "intrones" son secuencias de
nucleótidos que se encuentran entre los exones en las secuencias
genómicas del gen.
Afectado - El término "afectado",
según se usa en este documento, se refiere a aquellos miembros de
una familia que han desarrollado un cáncer característico (por
ejemplo, cáncer de colon en una genealogía de CCHNP) y/o se ha
predicho, sobre la base de estudios genéticos, por ejemplo, que
portan una mutación hereditaria que confiere susceptibilidad al
cáncer.
Único - Un segmento, fragmento o porción
"único" de un gen o proteína significa una porción de un gen o
proteína que es secuencialmente diferente de cualquier otro segmento
génico o proteico en el genoma de un individuo. A nivel práctico, un
segmento o fragmento único de un gen normalmente será un nucleótido
de al menos aproximadamente 13 bases de longitud y será
suficientemente diferente de otros segmentos génicos de modo que
puedan diseñarse los cebadores oligonucleotídicos y usarse para
amplificar selectiva y específicamente el segmento. Un segmento
único de una proteína, típicamente es una secuencia de aminoácidos
que puede traducirse a partir de un segmento único de un gen.
Las publicaciones siguientes se refieren en el
texto de la solicitud por su número. Cada publicación se incorpora a
este documento como referencia.
1. Fishel, R., y col. Cell 75,
1027-1038 (1993).
2. Leach, F., y col. Cell 75,
1215-1225 (1993).
3. Lindblom, A., Tannergard, Pl,
Werelius, B. y Nordenskjold, M. Nature Genetics
5, 279-282 (1993).
4. Prolla, T.A., Christie, D.M. y
Liskay, R.M. Molec. and Cell. Biol. 14,
407-415 (1994).
5. Strand, M., Prolla, T.A.,
Liskay, R.M. y Petes, T.D. Nature 365,
274-276 (1993).
6. Aaltonen, L.A., y col. Science
260, 812-816 (1993).
7. Han, H.J., Yanagisawa, A.,
Kato, Y., Park, J.G. y Nakamura, Y.
Cancer 53, 5087-5089 (1993).
8. Ionov, Y., Peinado, M.A.,
Malkhosyan, S., Shibata, D. y Perucho, M.
Nature 363, 558-561 (1993).
9. Risinger, J.I. y col. Cancer
53, 5100-5103 (1993).
10. Thibodeau, S.N., Bren, G. y
Shaid, D. Science 260, 816-819
(1993).
11. Levinson, G. y Gutman, G.A.
Nucleic Acids Res. 15, 5323-5338
(1987).
12. Parsons, R., y col. Cell 75,
1227-1236 (1993).
13. Modrich, P. Ann. Rev. of
Genet. 25, 229-53 (1991).
14. Reenan, R.A. y Kolodner, R.D.
Genetics 132, 963-73 (1992).
15. Bishop, D.K., Anderson, J. y
Kolodner, R.D. PNAS 86, 3713-3717
(1989).
16. Kramer, W., Kramer, B.,
Williamson, M.S. y Fogel, S. J. Bacteriol. 171,
5339-5346 (1989).
17. Williamson, M.S., Game, J. C.
y Fogel, S., Genetics 110, 609-646
(1985).
18. Prudhomme, M., Martin, B.,
Mejean, V. y Claverys, J. J. Bacteriol. 171,
5332-5338 (1989).
19. Mankovich, J.A., McIntyre,
C.A. y Walker, G.C. J. Bacteriol. 171,
5325-5331 (1989).
20. Lichter, P., y col. Science
247, 64-69 (1990).
21. Boyle, A., Feltquite, D.M.,
Drafiopoli, N., Housman, D. y Ward, D.C.
Genomics 12, 106-115 (1992).
22. Lyon, M.F. y Kirby, M.C.,
Mouse Genome 91, 40-80 (1993).
23. Reenan, R.A. y Kolodner, R.D.
Genetics 132, 975-85 (1992).
24. Latif, F. y col. Cancer
Research 52, 1451-1456 (1992).
25. Naylor, S.L., Johnson, B.E.,
Minna, J.D. y Sakaguchi, A.Y. Nature 329,
451-454 (1987).
26. Ali, I.U., Lidereau, R. y
Callahan, R. Journal of the National Cancer Institute
81, 1815-1820 (1989).
27. Higgins, D., Bleasby, A. y
Fuchs, R. Comput. Apple Biosci. 8,
189-191 (1992).
28. Fields, S. y Song, O.K.
Nature 340, 245-246 (1989).
29. Lynch, H.T., y col.
Gastroenterology 104, 1535-1549
(1993).
30. Elledge, S.J., Mulligan, J.T.,
Ramer, S.W., Spottswood, M. y Davis, R.W.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 1731-1735
(1991).
31. Frohman, M. Amplifications, a
forum for PCR users 1, 11-15 (1990).
32. Powell, S.M., y col. New England
Journal of Medicine 329, 1982-1987
(1993).
33. Wu, D.Y., Nozari, G.
Schold, M., Conner, B.J. y Wallace, R.B.
DNA 8, 135-142 (1989).
34. Mullis, K.E.B. y Faloona, F.A.
Methods in Enzymology 155, 335-350
(1987).
35. Bishop, T.D., Thomas, H.
Cancer Sur. 9, 585-604 (1990).
36. Capecchi, M.R. Scientific
American 52-59 (marzo 1994).
37. Erlich, H.A. PCR Technology,
Principles and Applications for DNA Amplification (1989).
38. Papadopoulos y col. Science
263, 1625-1629 (marzo 1994).
39. Nicolaides y col. Nature 371,
75-80 (septiembre 1994).
40. Tong y col. Anal. Chem. 64,
2672-2677 (1992).
41. Debuire y col. Clin. Chem. 39,
1682-5 (1993).
42. Wahlberg y col.
Electrophoresis 13, 547-551 (1992).
43. Kaneoka y col. Biotechniques
10, 30, 32, 34 (1991).
44. Huhman y col. Biotechniques
10, 84-93 (1991).
45. Hultman y col. Nuc. Acid. Res.
17, 4937-46 (1989).
46. Zu y col. Mutn. Res. 288,
232-248 (1993).
47. Espelund y col. Biotechniques
13, 74-81 (1992).
48. Prolla y col. Science 265,
1091-1093 (1994).
49. Bishop y col. Mol. Cell. Biol.
6, 3401-3409 (1986).
50. Folger y col. Mol. Cell. Biol.
5, 70-74 (1985).
51. T.C. Brown y col. Cell 54,
705-711 (1988).
52. T.C. Brown y col. Genome 31,
578-583 (1989).
53. C. Muster-Nassal y
col. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 7618-7622
(1986).
54. I. Varlet y col. Proc. Natl. Acad.
Sci. U.S.A. 87, 7883-7887 (1990).
55. D.C. Thomas y col. J. Biol.
Chem. 266, 3744-3751 (1991).
56. J.J. Holmes y col. Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A. 87, 5837-5841
(1990).
57. P. Branch y col. Nature 362,
652-654 (1993).
58. A. Kat y col. Proc. Natl. Acad.
Sci. U.S.A. 90, 6424-6428 (1993).
59. K. Wiebauer y col. Nature 339,
234-236 (1989).
60. K. Wiebauer y col. Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A. 87, 5842-5845
(1990).
61. P. Neddermann y col. J. Biol.
Chem. 268, 21218-24 (1993).
62. Kramer y col. Mol. Cell Biol.
9:4432-40 (1989).
63. Kramer y col. J. Bacteriol.
171:5339-5346 (1989).
Hemos descubierto genes de mamíferos que están
implicados en la reparación de errores de apareamiento de ADN. Uno
de los genes, hPMS1, codifica una proteína que es homologa a
la proteína de reparación de errores de apareamiento de ADN de
levadura, PMS1. Hemos mapeado las localizaciones de
hPMS1 en el cromosoma 7 humano y de PMS1 de ratón en
la banda G del cromosoma 5 de ratón. Otro gen, hMLH1 (del
ingles, MutL Homologous; homólogo de
MutL) codifica una proteína que es homóloga a la proteína de
reparación de errores de apareamiento del ADN de levadura, MLH1.
Hemos mapeado las localizaciones de hMLH1 en el cromosoma
3p21.3-23 humano y en la banda E del cromosoma 9 de
ratón.
Algunos estudios^{1,2} han demostrado la
implicación de un homólogo del gen homólogo de reparación de errores
de apareamiento de ADN humano hMSH2 en el cromosoma 2p en
CCHNP. Sobre la base de los datos de ligamiento, se ha asignado un
segundo locus de CCHNP al cromosoma 3p21-23^{3}.
El examen del ADN tumoral de familias con ligamiento al cromosoma 3
reveló una inestabilidad de dinucleótidos repetidos similar a la
observada en otros familiares con CCHNP^{6} y con varios tipos de
tumores esporádicos^{7-10}. Puesto que la
inestabilidad de dinucleótidos repetidos es característica de un
defecto en la reparación de errores de apareamiento del
ADN^{5,11,12}, dedujimos que el CCHNP ligado al cromosoma
3p21-23 podría ser el resultado de una mutación de
un segundo gen de reparación de errores de apareamiento de ADN.
La reparación de error de apareamiento de ADN en
Escherichia coli requiere varios genes que incluyen
mutS, mutL y mutH; los defectos en uno
cualquiera de estos dará lugar a tasas elevadas de mutación
espontánea^{13}. El análisis genético de la levadura
Saccharomyces cerevisiae ha identificado tres genes de
reparación de errores de apareamiento de ADN: un homólogo de
mutS, MsH2^{14} y dos homólogos de mutL,
PMS1^{16} y MLH1^{4}. Cada uno de estos tres genes
juega un papel indispensable en la fidelidad de replicación del ADN,
incluyendo la estabilización de las repeticiones de
dinucleótidos^{5}.
Creemos que hMLH1 es el gen del CCHNP
ligado previamente al cromosoma 3p sobre la base de la similitud del
producto génico de hMLH1 con la proteína de reparación de
errores de apareamiento de ADN de levaduras, MLH1^{4}, la
localización coincidente del gen hMLH1 y del locus de CCHNP
en el cromosoma 3 y las mutaciones sin sentido de hMLH1 que
hemos encontrado en individuos afectado de las familias con CCHNP
ligado al cromosoma 3.
Nuestro conocimiento sobre las estructuras de
los genes MLH1 y PMS1 humanos y de ratón tiene muchos
usos importantes. La información de la secuencia génica puede usarse
para analizar el riesgo de cáncer de los individuos. El conocimiento
de las estructuras génicas hace posible diseñar fácilmente cebadores
para PCR que pueden usarse para amplificar selectivamente porciones
de los genes hMLH1 y hPMS1 para su posterior
comparación con la secuencia normal y el análisis del riesgo de
cáncer. Este tipo de ensayo también hace posible buscar y
caracterizar mutaciones ligadas al cáncer de hMLH1 y
hPMS1 con el propósito de dirigir finalmente los esfuerzos de
análisis del cáncer hacia loci génicos específicos. La
caracterización específica de mutaciones ligadas al cáncer en
hMLH1 y hPMS1 hace posible la producción de otras
herramientas diagnósticas valiosas, tales como sondas específicas de
alelos que pueden usarse en ensayos de análisis para determinar la
presencia o ausencia de mutaciones génicas específicas.
Adicionalmente, la información de la secuencia
génica de hMLH1 y/o hPMS1 puede usarse, por ejemplo,
en un sistema de doble híbrido, para buscar otros genes de función
relacionada que son candidatos a estar implicados en el cáncer.
Las estructuras génicas de hMLH1 y
hPMS1 son útiles para hacer proteínas que se usan para
obtener anticuerpos dirigidos frente a porciones específicas o a las
proteínas hMLH1 y hPMS1 completas. A continuación, estos anticuerpos
pueden usarse para aislar la proteína correspondiente y proteínas
posiblemente relacionados con fines de investigación y
diagnóstico.
Las secuencias génicas MLH1 y PMS1
de ratón son útiles para producir ratones con mutaciones en el gen
respectivo. El ratón mutante es útil para estudiar la función del
gen, especialmente su relación con el cáncer.
Hemos aislado y caracterizado cuatros genes de
mamíferos, es decir, MLH1 humano (hMLH1), PMS1
humano (hPMS1), MLH1 de ratón (mPMS1) y
PMS1 de ratón (mPMS1). Debido a la similitud
estructural entre estos genes, los procedimientos que hemos empleado
para aislarlos y caracterizarlos son en general los mismos. La
Figura 1 muestra en términos generales, la aproximación experimental
que hemos usado para aislar y caracterizar los cuatro genes. La
siguiente descripción se refiere al procedimiento paso a paso que se
muestra en la Figura 1.
Etapa
1
Publicaciones anteriores indicaban que porciones
de las tres proteínas similares a MutL, dos de bacterias, MutL y
HexB, y una de levadura, PMS1, estaban muy conservadas^{16,18,19}.
Tras la inspección de las secuencias de aminoácidos de las proteínas
HexB, MutL y PMS1, como se muestra en la Figura 2, diseñamos grupos
de pares de oligonucleótidos degenerados que se correspondían con
dos regiones muy conservadas, KELVEN y GFRGEA, de las proteínas
similares a MutL. Las secuencias (ID SEC Nº 139 y 140,
respectivamente) de los oligonucleótidos degenerados que usamos para
aislar los cuatro genes son:
- 5'-CTTGATTCTAGAGC(T/C)TCNCCNC(T/G)(A/G)AANCC-3'
\hskip0.3cm
y
- 5'-AGGTCGGAGCTCAA(A/G)GA(A/G)(T/C)TNGTNGANAA-3'.
Las secuencias subrayadas en los cebadores son
los sitios para las endonucleasas de restricción XbaI y
SacI, respectivamente. Se introdujeron para facilitar la
clonación de los fragmentos amplificados por PCR. En el diseño de
los oligonucleótidos, tuvimos en cuenta el hecho de que un
determinado aminoácido puede estar codificado por más de un triplete
de ADN (codón). La degeneración en estas secuencias se indica
mediante múltiples nucleótidos entre paréntesis o mediante una N,
para la presencia de cualquier base en esta posición.
Etapa
2
Hemos aislado el ARN mensajero (enriquecido en
poli A+) a partir de células humanas cultivadas, sintetizado ADNc de
doble hebra a partir del ARNm y realizado una PCR con los
oligonucleótidos degenerados^{4}. Después de probar varias
condiciones diferentes de PCR, por ejemplo, ajustando la temperatura
de hibridación, logramos amplificar un ADN del tamaño predicho
(\sim 210 pb) de una proteína similar a MutL.
Etapa
3
Aislamos el material amplificado por PCR (\sim
210 pb) a partir de un gel de agarosa y clonado este material en un
plásmido (pUC19). Determinamos la secuencia de ADN de varios clones
diferentes. La secuencia de aminoácidos deducida de la secuencia de
ADN de los dos clones mostraba gran similitud con otras proteínas
similares a MutL conocidas^{4,16,18,19}. La secuencia de
aminoácidos predicha de uno de los clones era más similar a la
proteína PMS1 de levadura. Por tanto, la denominamos hPMS1,
de PMS1 humano. Se encontró que el segundo clon codificaba
un polipéptido que se parecía más a la proteína MLH1 de levadura y
se denominó, hMLH1, de MLH1 humana.
Etapa
4
Usamos los fragmentos generados por PCR de 210
pb de los ADNc de hMLH1 y hPMS1, como sondas para
analizar tanto bibliotecas de ADNc humanas como de ratón (de
Stratagene o como se describe en la referencia 30). Aislamos varios
ADNc que se correspondían con estos dos genes. Muchos de los ADNc
estaban truncados en el extremo 5'. Cuando fue necesario, usamos las
técnicas de PCR^{31} para obtener el extremo 5' del gen además de
análisis adicionales de las bibliotecas de ADNc. Se usaron
secuencias compuestas de ADNc completas para predecir la secuencia
de aminoácidos de las proteínas MLH1 y PMS1 humana o de ratón.
Etapa
5
La información de la estructura genómica y del
ADNc de los genes MLH1 y PMS1 humanos es necesaria
para analizar a fondo las mutaciones en familias propensas al
cáncer. Hemos usado secuencias del ADNc humano como sondas para
aislar las secuencias genómicas de PMS1 y MLH1
humanos. Hemos aislados cuatro cósmidos y dos clones P1 de
hPMS1, que probablemente en conjunto contienen la mayoría,
sino toda, la secuencia del ADNc (exón). Hemos aislados cuatros
clones de hMLH1 de fagos \lambda solapantes que contienen
las secuencias genómicas del extremo 5' de MLH1 y cuatro
clones P1 (dos clones de longitud completa y dos que incluyen el
extremo 5' codificador más porciones de la región promotora) del
clon P1. El análisis por PCR usando pares de oligonucleótidos
específicos para los extremos 5' y 3' del ADNc de hMLH1,
indican claramente que el clon P1 contiene la información completa
del ADNc de hMLH1. De forma similar, se han aislados los
clones genómicos de genes PMS1 y MLH1 de ratón y se
han caracterizado parcialmente (descrito en la Etapa 8).
Etapa
6
Usamos clones genómicos aislados de PMS1
y MLH1 humanos y de ratón para la localización cromosómica
mediante hibridación in situ con fluorescencia
(FISH)^{20,21}. Mapeamos el gen MLH1 humano en el
cromosoma 3p21.3-23, mostrado en la Figura 7 como se
discute con más detalle a continuación. Mapeamos el gen MLH1 de
ratón en la banda E del cromosoma 9, una región de sintenia entre
ratón y humano^{22}. Además de las técnicas de FISH, usamos PCR
con un par de oligonucleótidos específicos de hMLH1 para
analizar el ADN de un panel de mapeo de una célula somática híbrida
roedor/humano (Instituto Coriell de Investigación Médica, Camden,
N.J.). Nuestros resultados de PCR con el panel indican claramente
que hMLH1 mapea en el cromosoma 3. La posición
3p21.3-23 de hMLH1 coincide con una región
conocida porque es portadora de un segundo locus para el CCHNP
sobre la base de los datos de ligamiento.
Como se muestra en la Figura 12, mapeamos el gen
hPMS1 en el brazo largo (q) del cromosoma 7 (en 7q11 o en
7q22) y el PMS1 de ratón en la banda G del cromosoma 5, dos
regiones de sintenia entre humano y ratón^{22}. Realizamos una PCR
usando oligonucleótidos específicos para hPMS1 en el ADN de
un panel de células roedor/humano. De acuerdo con los datos de FISH,
se confirmó que la localización de hPMS1 estaba en el
cromosoma 7. Estas observaciones nos aseguraron que nuestra posición
en el mapa humano de hPMS1 en el cromosoma 7 es correcta. La
localización física de hPMS1 es útil con el objetivo de
identificar familias que potencialmente pueden tener una mutación
ligada al cáncer en hPMS1.
Etapa
7
Hemos analizado muestras recogidas de individuos
de familias con CCHNP con el fin de identificar mutaciones en el gen
hPMS1 o en hMLH1. Nuestra estrategia es diseñar
cebadores para PCR sobre la base de nuestro conocimiento de las
estructuras de los genes, para obtener segmentos exón/intrón que
podemos comparan con las secuencias normales conocidas. Nos
referimos a esta estrategia como un "análisis de exones".
Usando la información de la secuencia del ADNc
hemos diseñado y seguimos diseñando oligonucleótidos específicos de
hPMS1 y hMLH1 para trazar los limites exón/intrón
dentro de las secuencias genómicas. Los oligonucleótidos específicos
de hPMS1 y hMLH1 se usaron como sonda para identificar
los clones genómicos con exones que contienen esta secuencia. Como
cebadores para secuenciar el ADN de los clones genómicos se usaron
oligonucleótidos que hibridaban. Las uniones
exón-intrón se identificaron comparando las
secuencias genómicas con las del ADNc.
La amplificación de exones específicos a partir
de ADN genómico por PCR y la secuenciación de los productos es un
procedimiento para analizar las mutaciones en familias con
CCHNP^{1,2}. Hemos identificado clones genómicos que contenían
información del ADNc de hMLH1 y hemos determinado las
estructuras de todas las regiones límite entre intrón/exón que
flanquean los 19 exones de hMLH1.
Hemos usado la aproximación de análisis de
exones para examinar el gen MLH1 de individuos de familias
con CCHNP que mostraban ligamiento con el cromosoma 3^{3}. Como se
describirá con más detalle a continuación, hemos identificado una
mutación en el gen MLH1 de una de estas familias, que
consistía en una sustitución de C por T. Predijimos que la mutación
de C por T causa una sustitución de una serina por fenilalanina en
una región muy conservada de la proteína. Estamos identificando
continuamente familias con CCHNP a partir de las cuales podemos
obtener muestras para encontrar mutaciones adicionales en los genes
hMLH1 y hPMS1.
También hemos usado una segunda aproximación
para identificar mutaciones en hPMS1 y en hMLH1. La
aproximación es diseñar cebadores oligonucleotídicos específicos de
hPMS1 o de hMLH1 para producir una primera hebra de
ADNc mediante transcripción inversa a partir de ARN. La PCR usando
cebadores específicos del gen nos permitirá amplificar regiones
específicas de estos genes. La secuenciación del ADN de los
fragmentos amplificados nos permitirá detectar mutaciones.
Etapa
8
Construimos un vector génico dirigido sobre la
base de nuestro conocimiento de la estructura del ADN genómico de
PMS1 de ratón. Usamos el vector para interrumpir el gen
PMS1 en células madre embrionarias de ratón^{36}. Las
células se inyectaron en blastocistos de ratón que se desarrollaron
como ratones quiméricos (mezclas) para las células que llevan la
mutación en PMS1.
Los animales quiméricos se usarán para criar
ratones heterocigotos y homocigotos par la mutación en PMS1.
Estos ratones serán útiles para estudiar el papel del gen
PMS1 en el organismo completo.
La descripción siguiente es una explicación más
detallada de nuestro trabajo experimental en relación con
hMLH1. Como se mencionó anteriormente, para clonar los genes
MLH de mamífero, usamos técnicas de PCR como las usadas para
identificar los genes MSH1, MSH2 y MLH1 de
levadura y el gen MSH2 humano^{1, 2, 4, 14}. Como molde en
la PCR, usamos un ADNc de doble hebra sintetizado a partir de ARN
enriquecido en poli (A+) preparado a partir de cultivos primarios de
fibroblastos humanos. Los oligonucleótidos degenerados se dirigieron
hacia las secuencias de aminoácidos del extremo
N-terminal KELVEN y GFRGEA (véase la Figura 3), dos
de las regiones más conservadas de la familia de proteínas MutL
previamente descritas en bacterias y levaduras^{16,18,19}. Se
identificaron dos productos de PCR del tamaño predicho, se clonaron
y se demostró que codificaban una secuencia de aminoácidos predicha
con homología con las proteínas similares a MutL. Estos dos
fragmentos generados mediante PCR se usaron para aislar clones
humanos de ADNc y de ADN genómico.
Los cebadores oligonucleotídicos que usamos para
amplificar secuencias humanas relacionadas con MutL fueron
5'-CTTGATTCTAGAGC(T/C)TCNCCNC(T/G)(A/G)AANCC-3'
(ID SEC Nº 139) y
5'-AGGTCGGAGCTCAA(A/G)GA(A/G)(T/C)TNGTNGANAA-3'
(ID SEC Nº 140). La PCR se realizó en reacciones de 50 \mul que
contenían ADNc molde, 1,0 \muM de cada cebador, 5 UI de Taq
polimerasa (C), KCl 50 mM, tampón Tris 10 mM, pH 7,5 y MgCl 1,5 mM.
La PCR se realizó durante 35 ciclos de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a
43ºC y 1,5 minutos a 62ºC. Los fragmentos del tamaño esperado,
aproximadamente 212 pb, se clonaron en pUC19 y se secuenciaron. Los
productos de PCR de MLH1 clonados se marcaron con un kit de
marcaje con cebador aleatorio (RadPrime, Gibco BRL) y se usó para
incubar bibliotecas de ADNc y cósmidos genómicos humanos mediante
procedimientos convencionales. La secuenciación del ADN de los
plásmidos de ADN de doble hebra se realizó como se describe
previamente^{1}.
La secuencia de nucleótidos del ADNc de
hMLH1, como se muestra en la Figura 3, codifica una fase de
lectura abierta de 2.268 pb. También se muestra en la Figura 3 la
secuencia de la proteína predicha codificada por el ADNc de
hMLH1. Las secuencias de ADN subrayadas son las regiones del
ADNc que se corresponden con los cebadores para PCR degenerados que
originalmente se usaron para amplificar una porción del gen
MLH1 (nucleótidos 118-135 y
343-359).
La Figura 4A muestra 19 secuencias de
nucleótidos que se corresponden con porciones de hMLH1. Cada
secuencia incluye uno de los 19 exones, en su totalidad, rodeado de
secuencias intrón flanqueantes. Se subrayan los cebadores de PCR
diana citados. A continuación se explican más detalles relacionados
con la derivación y usos de las secuencias mostradas en la Figura
4.
Como se muestra en la Figura 5, la proteína
hMLH1 está compuesta de 756 aminoácidos y comparte el 41% de
identidad con el producto proteico del gen de reparación de errores
de apareamiento del ADN de levaduras, MLH1^{4}. Las
regiones de la proteína hMLH1 más similares a la MLH1 de levadura se
corresponden con los aminoácidos 11 a 317, que muestran una
identidad del 55% y los últimos 13 aminoácidos que son idénticos
entre las dos proteínas. La Figura 5 muestra un alineamiento de las
secuencias predichas de la proteína MLH1 humana y la MLH1 de S.
cerevisiae. Las identidades de aminoácidos se indican mediante
recuadros y los huecos se indican mediante guiones. El alineamiento
por pares de las secuencias de proteínas se realizó con Enastar
MedAlig usando el procedimiento clustal^{27}. Los parámetros de
alineamiento por pares fueron un tamaño de palabra de 1, una
penalización por hueco de 3, una ventana de 5 y diagonales de 5.
Además, como se muestra en la Figura 13, las secuencias de
aminoácidos predichas de las proteínas MLH1 humana y de ratón
muestran al menos una identidad del 74%.
La Figura 6 muestra un árbol filogenético de las
proteínas relacionadas con MutL. El árbol filogenético se construyó
usando las secuencias de aminoácidos predichas de 7 proteínas
relacionadas con MutL: MLH1 humana; MLH1 de ratón; MLH1 de S.
cerevisiae; PMS1 de S. cerevisiae; MutL de E.
coli; MutL de S. typhimurium y HexB de S.
pneumoniae. Las secuencias necesarias se obtuvieron del GenBank
versión 7.3. El árbol filogenético se generó con el programa PILEUP
del software del Genetics Computer Group usando una penalización por
hueco de 3 y una longitud de la penalización de 0,1. Las secuencias
registradas de ADN de hMLH1 y hPMS1 se enviaron a
GenBank.
En nuestra solicitud previa de Patente de EE.UU.
Nº 08/209.521, describíamos la secuencia de nucleótidos de un clon
de ADN complementario (ADNc) de un gen humano, hMLH1. La
secuencia de ADNc de hMLH1 (ID SEC Nº 4) se presenta en esta
solicitud en la Figura 3. Apreciamos que puede haber cierta
variabilidad entre las estructuras de los ADNc independientes de
hMLH1, resultado de polimorfismos en la población humana y de
la degeneración del código genético.
En la presente solicitud, recogemos los
resultados de nuestros estudios genómicos de secuenciación.
Específicamente, hemos clonados la región genómica humana que
incluye el gen hMLH1, con atención específica en los exones
individuales y en las estructuras que rodean al límite entre
intrón/exón. Con el objetivo final de diseñar una aproximación
exhaustiva y eficaz para identificar y caracterizar mutaciones que
confieran susceptibilidad al cáncer, creemos que es importante
conocer las secuencias de tipo natural de las estructuras de los
intrones que flanquean a los exones del gen hMLH1. Una
ventaja de conocer la secuencia de los intrones próxima a los
límites del exón es que esto hace posible diseñar pares de cebadores
para amplificar selectivamente exones individuales. Lo que es más
importante, también es posible que una mutación en una región intrón
que, por ejemplo, puede causar un error de empalme del ARNm, pueda
dar lugar a un producto génico defectuoso, es decir, susceptibilidad
al cáncer, sin mostrar ninguna anomalía en una región exón del gen.
Creemos que una aproximación de análisis exhaustivo requiere la
búsqueda de mutaciones, no sólo en el exón o en el ADNc, sino
también en las estructuras del intrón que flanquean los límites del
exón.
Hemos clonado la región genómica humana que
incluye hMLH1 usando aproximaciones conocidas en la técnica,
y podrían haberse usado otras aproximaciones conocidas. Usamos la
PCR para analizar una biblioteca genómica humana de P1 para el gen
hMLH1. Obtuvimos cuatro clones, dos que contenían el gen
completo y dos que carecían del extremo C-terminal.
Caracterizamos uno de los clones de longitud completa mediante un
ciclo de secuenciación, que dio lugar a la delimitación de todas las
secuencias de unión entre intrón/exón a ambos lados de los 19 exones
de hMLH1. A continuación diseñamos grupos múltiples de
cebadores de PCR para amplificar cada exón individual (cebadores de
la primera etapa) y verificamos la secuencia de cada exón y de la
secuencia del intrón flanqueante mediante la amplificación de varias
muestras de ADN genómico diferente y secuenciación de los fragmentos
resultante usando un secuenciador ABI 373. Además, hemos determinado
los tamaños de cada exón de hMLH1 usando procedimientos de PCR.
Finalmente, ideamos un grupo de cebadores anidados de PCR (cebadores
de la segunda etapa) para la reamplificación de exones individuales.
Hemos usados los cebadores de la segunda etapa en un procedimiento
múltiples para analizar mutaciones de hMLH1 en familias con
CCHNP y en tumores. Generalmente, en la aproximación de cebador de
PCR anidada, realizamos una primera amplificación múltiple con
cuatro a ocho grupos de cebadores de la "primera etapa",
dirigido cada uno a un exón diferente. A continuación reamplificamos
exones individuales a partir del producto de la primera etapa de
amplificación, usando un único grupo de cebadores de la segunda
etapa. A continuación, se muestran ejemplos y detalles adicionales
relacionados con nuestro uso de los cebadores de la primera y
segunda etapa.
A lo largo de nuestros estudios de secuenciación
genómica, hemos identificado los diecinueve exones del gen
hMLH1, y hemos mapeado los límites intrón/exón.
La Tabla 1 presenta las coordenadas de
nucleótidos (es decir, el punto de inserción de cada intrón en la
región codificadora del gen) de los exones de hMLH1 (ID SEC
Nº 25-43). Las coordenadas presentadas se basan en
la secuencia del ADNc de hMLH1, asignado la posición "1"
a la "A" del inicio "ATG" (donde A es el nucleótido 1 en
la ID SEC Nº 4).
Número de intrón | Coordenadas de secuencia del ADNc |
intrón 1 | 116 y 117 |
intrón 2 | 207 y 208 |
intrón 3 | 306 y 307 |
intrón 4 | 380 y 381 |
intrón 5 | 453 y 454 |
intrón 6 | 545 y 546 |
intrón 7 | 592 y 593 |
intrón 8 | 677 y 678 |
Número de intrón | Coordenadas de secuencia del ADNc |
intrón 9 | 790 y 791 |
intrón 10 | 884 y 885 |
intrón 11 | 1.038 y 1.039 |
intrón 12 | 1.409 y 1.410 |
intrón 13 | 1.558 y 1.559 |
intrón 14 | 1.667 y 1.668 |
intrón 15 | 1.731 y 1.732 |
intrón 16 | 1.896 y 1.897 |
intrón 17 | 1.989 y 1.990 |
intrón 18 | 2.103 y 2.104 |
\vskip1.000000\baselineskip
También hemos determinado la secuencia de
nucleótidos de las regiones intrón que flanquean los exones del gen
hMLH1. Las ID SEC Nº 6-24 son secuencias de
exones individuales unidas por sus respectivas secuencias intrón
antes del extremo 5' y después del extremo 3'. Las mismas
estructuras de nucleótidos se muestran en la Figura 4A, donde los
exones se numeran desde el extremo N-terminal al
C-terminal con respecto al locus cromosómico. Los
números de 5 dígitos indican los cebadores usados para amplificar el
exón. Todas las secuencias se numeran asumiendo que la A del codón
ATG es el nucleótido 1. Los números entre ( ) son las coordenadas
nucleotídicas de la secuencia codificadora encontradas en el exón
indicado. Las mayúsculas son los intrones. Las minúsculas son las
secuencias de los exones o no traducidas encontradas en los clones
de ARNm/ADNc. Las secuencias en minúsculas y subrayadas se
corresponden con cebadores. El codón de parada en
2.269-2.2271 está en cursiva y subrayado.
La tabla 2 presenta las secuencias de parejas de
cebadores (cebadores de la "primera etapa") que hemos usado
para amplificar exones individuales con estructuras de intrones
flanqueantes:
\vskip1.000000\baselineskip
Adicionalmente, hemos diseñado un grupo de
cebadores de amplificación de la "segunda etapa", cuyas
estructuras se muestran a continuación en la Tabla 3. Usamos los
cebadores de la segunda etapa junto con los cebadores de la primera
etapa en un protocolo de amplificación anidada, como se describe a
continuación.
En la tabla 3, un asterisco (*) indica que el
nucleótido 5' está biotilinado. Los exones 1-7, 10,
13 y 16-19 puede amplificarse específicamente en
reacciones de PCR que contienen MgCl_{2} 1,5 mM o 3 mM. Los exones
11 y 14 sólo pueden amplificarse específicamente en reacciones de
PCR que contiene MgCl_{2} 1,5 mM y los exones 8, 9, 12 y 15 sólo
pueden amplificarse específicamente en reacciones de PCR que
contiene MgCl_{2} 3 mM. Con respecto al exón 12, los cebadores de
la segunda etapa de amplificación se han diseñado de modo que el
exón 12 se reamplifica en dos mitades. El conjunto de cebadores
20.546 y 20.002 amplifica la mitad del extremo
N-terminal. El conjunto de cebadores 19.829 y 19.835
amplifica la mitad del extremo C terminal. Un cebador alternativo al
18.178 es el 19.070.
La información de la secuencia de hMLH1
proporcionada por nuestros estudios y descrita en esta solicitud y
en las solicitudes relacionadas anteriores, puede usarse para
diseñar un gran número de cebadores oligonucleotídicos diferentes
para su uso en la identificación de mutaciones de hMLH1 que
se correlacionan con la susceptibilidad al cáncer y/o con el
desarrollo de tumores en un individuo, incluyendo cebadores que
amplificarán más de un exón (y/o las secuencias intrón flanqueantes)
en una banda de producto.
Un experto en la materia estará familiarizado
con consideraciones importantes sobre el diseño de cebadores de PCR
usados para amplificar el fragmento o gen deseado^{37}. Estas
consideraciones pueden ser similares, si bien no necesariamente
idénticas, a aquellas implicadas en el diseño de cebadores para
secuenciación, como se discute anteriormente. Generalmente, es
importante que los cebadores hibriden de forma relativamente
específica (es decir, tienen una temperatura T_{m} mayor de
aproximadamente 55 grados ºC, y preferiblemente, de aproximadamente
60 grados ºC). En la mayoría de los casos, funcionan bien cebadores
de entre 17 y 25 nucleótidos de longitud. Pueden usarse cebadores
más largos para amplificar fragmentos más largos. En todos los
casos, es deseable evitar el uso de cebadores que sean
complementarios con más de una secuencia en el genoma humano, de
modo que cada par de cebadores para PCR amplifica sólo un fragmento
único y correcto. Sin embargo, sólo es absolutamente necesario que
la banda correcta se distinga de otras bandas de producto de la
reacción de PCR.
Las condiciones exactas de la PCR (por ejemplo,
concentración de sal, número de ciclos, tipo de ADN polimerasa,
etc.) pueden variarse, como se conoce en la técnica, para mejorar,
por ejemplo, el rendimiento o especificidad de la reacción. En
particular, hemos descubierto que es valioso usar cebadores anidados
en las reacciones de PCR para reducir la cantidad de sustrato de ADN
necesario y para mejorar la especificidad de la amplificación.
A continuación hay dos ejemplos. El primer
ejemplo ilustra el uso de un par de cebadores de la primera etapa
(ID SEC Nº 69 y 70) para amplificar un segmento intrón/exón (SECID
Nº 18). El segundo ejemplo ilustra el uso de cebadores de la segunda
etapa para amplificar un segmento intrón/exón diana a partir del
producto de una primera etapa de amplificación por PCR empleando
cebadores de la primera etapa.
Se usaron 25 ng de ADN genómico (o puede usarse
1 ng de un fago P1) en reacciones de PCR que incluían:
- dNTP 0,05 mM
- KCl 50 mM
- Mg 3 mM
- Tris-HCl 10 mM, pH 8,5
- gelatina al 0,01%
- cebadores 5 \muM
Las reacciones se realizaron en un termociclador
de Perkin-Elmer Cetus modelo 9600. Las reacciones se
incubaron a 95 grados ºC durante 5 minutos, seguido de 35 ciclos (30
ciclos para un fago P1) de:
- 94 grados ºC durante 30 segundos
- 55 grados ºC durante 30 segundos
- 72 grados ºC durante 1 minuto.
A continuación se realizó una reacción final de
extensión de 7 minutos a 72 grados ºC. Los clones P1 deseables eran
aquellos que producían una banda de producto de aproximadamente las
pb.
Realizamos una amplificación por PCR en dos
etapas de secuencias de hMLH1 a partir de ADN genómico como
sigue. Típicamente, la primera amplificación se realizó en una
reacción de 25 microlitos que incluía:
- 25 ng de ADN cromosómico
- Tampón II para PCR de Perkin-Elmer (puede usarse cualquier tampón adecuado).
- MgCl_{2} 3 mM
- 50 \muM de cada dNTP
- ADN polimerasa Taq
- cebadores 5 \muM (ID SEC Nº 69 y 70)
y se incubó a 95 grados ºC durante 5 minutos,
seguido de 20 ciclos de:
- 94 grados ºC durante 30 segundos
- 55 grados ºC durante 30 segundos
Típicamente, la banda de producto era
suficientemente pequeña (menos de aproximadamente 500 pb) como para
que no se realizaran etapas de extensión independientes como parte
de cada ciclo. Por el contrario, se realizó una única etapa de
extensión a 72 grados ºC durante 7 minutos, después se completaron
los 20 ciclos. Los productos de reacción se conservaron a 4 grados
ºC.
La segunda reacción de amplificación,
normalmente en un volumen de 25 ó 50 microlitros, incluía:
- 1 ó 2 microlitros (dependiendo del volumen de la reacción) del producto de reacción de la primera amplificación.
- Tampón II para PCR de Perkin-Elmer (podría usarse cualquier tampón adecuado)
- MgCl_{2} 3 mM
- 50 \muM de cada dNTP.
- ADN polimerasa Taq
- cebadores anidados 5 \muM (ID SEC Nº 109 y 110)
y se incubó a 95 grados ºC durante 5 minutos,
seguido de 20-25 ciclos de:
- 94 grados ºC durante 30 segundos
- 55 grados ºC durante 30 segundos
se realizó una única etapa de extensión, a 72
grados ºC durante 7 minutos, después de que se completaran los
ciclos. Los productos de reacción se conservaron a 4 grados ºC.
Puede usarse cualquier conjunto de cebadores
capaces de amplificar una secuencia diana de hMLH1 en la
primera reacción de amplificación. Hemos usado cada uno de los
conjuntos de cebadores que aparecen en la Tabla 2 para amplificar un
exón individual de hMLH1 en la primera reacción de
amplificación. También hemos usado combinaciones de esos conjuntos
de cebadores, amplificando de este modo múltiples exones
individuales de hMLH1 en la primera reacción de
amplificación.
Los cebadores anidados usados en la primera fase
de amplificación se diseñaron en relación con los cebadores usados
en la primera reacción de amplificación. Es decir, cuando se usa un
único conjunto de cebadores en la primera reacción de amplificación,
los cebadores usados en la segunda reacción de amplificación debería
ser idénticos a los cebadores usados en la primera reacción excepto
porque los cebadores usados en la segunda reacción no deberían
incluir los nucleótidos más en el extremo 5' de los cebadores de la
primera reacción de la amplificación, y deberían extenderse
suficientemente más allá del extremo 3', de modo que la T_{m} de
los cebadores de la segunda amplificación es aproximadamente la
misma que la T_{m} de los cebadores de la primera reacción de
amplificación. Típicamente, nuestros cebadores de la segunda
reacción carecían de los 3 nucleótidos más en el extremo 5' de los
cebadores de la primera reacción de amplificación y se extendían
aproximadamente 3-6 nucleótidos más allá del extremo
3'. Las ID SEC Nº 109 y 110 son ejemplos de pares de cebadores
anidados que podrían usarse en una segunda reacción de amplificación
cuando se usen las SECID Nº 69 y 70 en la primera reacción de
amplificación.
También hemos descubierto que puede valorarse la
inclusión de una secuencia convencional en el extremo 5' de uno de
los cebadores de la segunda reacción de amplificación para cebar las
reacciones de secuenciación. Adicionalmente, hemos descubierto que
es útil biotinilar esté último nucleótido de uno o de ambos
cebadores de la segunda reacción de amplificación, de modo que la
banda del producto puede purificarse fácilmente usando perlas
magnéticas^{40} y, a continuación, pueden realizarse reacciones de
secuenciación directamente sobre los productos asociados a las
perlas^{41-45}.
Para una descripción más detallada de los
procedimientos de amplificación múltiple y de secuenciación, véanse
las referencias de Zu y col. y Espelund y col^{46, 47}.
Como primera etapa para determinar si
hMLH1 era un candidato para el locus CCHNP en el cromosoma
humana 3p21-23^{3}, mapeamos hMLH1 mediante
hibridación in situ con fluorescencia
(FISH)^{20,21}. Usamos dos fragmentos genómicos
independientes (datos no mostrados) del gen hMLH1 en el
análisis por FISH. El examen de distintas extensiones de cromosomas
en metafase, localizaron hMLH1 en el cromosoma 3p21.3.23.
El panel A de la Figura 7 muestra la hibridación
de sondas de hMLH1 en una extensión en metafase. Las sondas
genómicas biotiniladas de hMLH1 se hibridaron en cromosomas
humanos en metafase bandeados como se describe
previamente^{20,21}. La detección se realizó con avidina conjugada
con isotiocianato de fluoresceína (FITC) (señal verde); los
cromosomas, que se muestra en azul, se contrastaron con
4',6-diamidino-2-fenilindol
(DAPI). Las imágenes se obtuvieron con una cámara CCD enfriada, se
potenciaron, se seudocolorearon y se integraron con los siguientes
programas: CCD Image Capture, NIH Image 1.4; Photoshop de Adobe y
Genejoin Maxpix, respectivamente. El Panel B de la Figura 7 muestra
una composición del cromosoma 3 a partir de extensiones múltiples de
metafases alineadas con el ideograma del cromosoma 3 humano. La
región de hibridación (posición distal del
3p21.3-23) se indica en el ideograma mediante una
barra vertical.
Como confirmación independiente de la
localización del hMLH1 en el cromosoma 3, usamos tanto PCR
con un par de oligonucleótidos específicos de hMLH1 como
transferencia genómica con una sonda específica de hMLH1 para
analizar el ADN del panel de células roedor/humano NIGMS2 (Coriell
Inst. for Med. Res., Camden, N.J. EE.UU.). Los resultados de ambas
técnicas indicaban un ligamiento al cromosoma 3. También mapeamos el
gen MHL1 de ratón mediante FISH en la banda E del cromosoma
9. Esta es una posición de sintenia con el cromosoma 3p
humano^{22}. Por tanto, el gen hMLH1 se localiza en
3p21.3-23, dentro de la región genómica implicada
en las familias con CCHNP^{3} ligado al cromosoma 3.
A continuación, analizamos mutaciones en el
cromosoma 3 en muestras de sangre de individuos afectados y no
afectados de dos familias candidatas con CCHNP^{3}. Una familia,
la Familia 1, mostraba un ligamiento significativo (valor de lod =
3,01 a una fracción de recombinación de 0) entre CCHNP y un marcador
en 3p. Para la segunda familia, la Familia 2, el valor de lod
indicado (1,02) estaba por debajo del nivel de significación
normalmente aceptado y, de este modo, sugería sólo ligamiento con el
mismo marcador en 3p. El análisis de ligamiento posterior de la
Familia 2 con el marcador de microsatélite D3S1298 en 3p21.3 dio un
valor de lod más significativo de 1,88 a una fracción de
recombinación de 0. Inicialmente, analizamos mutaciones en dos
exones amplificados por PCR del gen hMLH1 mediante
secuenciación directa de ADN (Figura 4). Examinamos estos dos exones
en tres individuos afectados de la Familia 1 y no detectamos ninguna
diferencia con respecto a la secuencia esperada. En la Familia 2,
observamos que cuatro individuos afectados de cáncer de colon eran
heterocigotos para la sustitución de C por T en un exón que codifica
los aminoácidos 41-69, que se corresponden con una
región muy conservada de la proteína (Figura 9). En un individuo
afectado, analizamos diferencias adicionales en la secuencia del
ADNc amplificado por PCR. La información combinada de la secuencia
obtenida de los dos exones y del ADNc de este individuo afectado
representa el 95% (es decir, todo excepto las primeras 116 pb) de la
fase de lectura abierta. No observamos cambios de nucleótidos que no
fueran la sustitución de C por T. Además, encontramos que cuatro
individuos de la Familia 2, que se predijo eran portadores sobre la
base de los datos de ligamiento y que todavía no estaban afectados
de cáncer de colon, eran heterocigotos para la misma sustitución de
C por T. Dos de estos portadores predichos están por debajo y dos
están por encima de la media de edad de inicio (50 años) en esta
familia en particular. Dos individuos no afectados examinados de
esta misma familia, ambos predichos como no portadores por los datos
de ligamiento, mostraron la secuencia normal esperada en esta
posición. Los análisis de ligamiento que incluyen la sustitución de
C por T en la Familia 2 daban un valor de lod de 2,23 a una fracción
de recombinación de 0. Usando criterios de diagnóstico de cáncer de
baja rigurosidad, calculamos un valor de lod de 2,53. Estos datos
indican que la sustitución de C por T muestra un ligamiento
significativo con el CCHNP en la Familia 2.
La Figura 8 muestra cromatogramas de secuencia
que indican una mutación de transición de C a T que produce una
sustitución de aminoácido no conservadora en la posición 44 de la
proteína hMLH1. Se presenta el análisis de secuencia de un individuo
no afectado (paneles superiores, hebras menos y más) y un individuo
afectado (paneles inferiores, hebras menos y más). La posición del
nucleótido heterocigoto se indica con una flecha. El análisis de los
cromatogramas de secuencia indica que hay suficiente señal de T en
el pico de C y suficiente señal de A en el pico de G de los
individuos afectados para ser heterocigotos en este sitio.
Para determinar si esta sustitución de C por T
era un polimorfismo, secuenciamos este mismo exón amplificado a
partir del ADN genómico de 48 individuos no relacionados y
observamos sólo la secuencia normal. Hemos examinado 26 individuos
más no relacionados usando el análisis de hibridación de
oligonucleótido específico de alelo (ASO)^{33}. Las
secuencias ASO (ID SEC Nº 141 y 142, respectivamente) que usamos
fueron:
- 5'-ACTTGTGGATTTTGC-3'
\hskip0.3cm
y
- 5'-ACTTGTGAATTTTGC-3'.
Sobre la base de la secuenciación directa del
ADN y al análisis ASO, ninguno de estos 74 individuos no
relacionados lleva la sustitución de C por T. Por tanto, la
sustitución de C por T observada en los individuos de la Familia 2
probablemente no es un polimorfismo. Como se mencionó anteriormente,
no detectamos esta misma sustitución de C por T en individuos
afectados de una segunda familia ligada al cromosoma 3, la Familia
1^{3}. Hemos seguido estudiando mutaciones en hMLH1 en
individuos de la Familia 1.
La Tabla 4, a continuación, resume nuestros
análisis experimentales de muestras de sangre de individuos
afectados y no afectados de la Familia 2 e individuos no
relacionados.
Sobre la base de varios criterios, sugerimos que
la sustitución de C por T observada en la región codificadora de
hMLH1 representa la mutación que es la base para el CCHNP en
la Familia 2^{3}. En primer lugar, la secuencia de ADN y el
análisis por ASO no detectaban la sustitución de C por T en 74
individuos no relacionados. De este modo, la sustitución de C por T
no es simplemente un polimorfismo. En segundo lugar, se espera que
la sustitución de C por T observada produzca un cambio de serina por
fenilalanina en la posición 44 (véase la Figura 9). Esta sustitución
de aminoácido es un cambio no conservador en una región conservada
de la proteína (Figura 3 y 9). Las predicciones de estructura
secundaria usando los parámetros de Chou y Fasman sugieren una
estructura hélice-giro-lámina beta
con la posición 44 localizada en el giro. La sustitución observada
de Ser por Phe, en la posición 44 reduce considerablemente la
predicción de este giro, lo que sugiere que la sustitución de
aminoácido predicha altera la conformación de la proteína hMLH1. La
sugerencia de que la sustitución de Ser por Phe es una mutación que
confiere susceptibilidad al cáncer está apoyada además por nuestros
experimentos que muestran que una sustitución análoga (alanina por
fenilanalina) en un gen MLH1 de levadura da lugar a una
proteína de reparación de errores de apareamiento no funcional. En
bacterias y levaduras, una mutación que afecta a la reparación de
errores de apareamiento de ADN causa un aumento comparable en la
frecuencia de mutación espontánea, incluyendo adiciones y deleciones
en las repeticiones de
dinucleótidos ^{4,5,11,13,14,15,16}. En humanos, la mutación de hMSH2 es la base de los CCHNP del cromosoma 2^{1,2}, tumores que muestran inestabilidad del microsatélite y un defecto aparente en la reparación de errores de apareamiento^{12}. El CCHNP ligado al cromosoma 3 también se asocia con inestabilidad en las repeticiones de dinucleótidos^{3}. En combinación con estas observaciones, el alto grado de conservación entre la proteína MLH1 humana y la proteína de reparación de errores de apareamiento de ADN de levaduras, MLH1, sugiere que hMLH1 probablemente trabaja en la reparación de errores de apareamiento de ADN. Durante el aislamiento del gen hMLH1, identificamos el gen hPMS1. Esta observación sugiere que la reparación de errores de apareamiento de ADN en mamíferos, como en levaduras^{4}, puede requerir al menos dos proteínas similares a MutL.
dinucleótidos ^{4,5,11,13,14,15,16}. En humanos, la mutación de hMSH2 es la base de los CCHNP del cromosoma 2^{1,2}, tumores que muestran inestabilidad del microsatélite y un defecto aparente en la reparación de errores de apareamiento^{12}. El CCHNP ligado al cromosoma 3 también se asocia con inestabilidad en las repeticiones de dinucleótidos^{3}. En combinación con estas observaciones, el alto grado de conservación entre la proteína MLH1 humana y la proteína de reparación de errores de apareamiento de ADN de levaduras, MLH1, sugiere que hMLH1 probablemente trabaja en la reparación de errores de apareamiento de ADN. Durante el aislamiento del gen hMLH1, identificamos el gen hPMS1. Esta observación sugiere que la reparación de errores de apareamiento de ADN en mamíferos, como en levaduras^{4}, puede requerir al menos dos proteínas similares a MutL.
Debe apreciarse que parece que las diferentes
familias con CCHNP muestran diferentes mutaciones en el gen
MLH1. Como se explica a continuación, los individuos
afectados de la Familia 1 muestran un "estrecho ligamiento"
entre el CCHNP y un locus en la región de 3p21-23.
Sin embargo, los individuos afectados de la Familia 1 no tienen la
mutación de C por T encontrada en la Familia 2. Parece que los
individuos afectados de la Familia 1 tienen una mutación diferente
en su gen MLH1. Además, usamos la información de la
estructura y procedimientos descritos en esta solicitud para
encontrar y caracterizar otra mutación de hMLH1 que
aparentemente confiere susceptibilidad al cáncer en portadores
heterocigotos del gen mutante en una gran familia inglesa con CCHNP.
La mutación de hMLH1 en la familia inglesa es un cambio de
fase +1 T que se prevé conduce a la síntesis de una proteína hMLH1
truncada. A diferencia, por ejemplo, de la anemia de células
falciformes, en la que esencialmente todos los individuos afectados
conocidos tienen la misma mutación, se han descubierto múltiples
mutaciones en hMLH1 y ligadas al cáncer. Por tanto, el
conocimiento de la secuencia completa del ADNc de hMLH1 (y
probablemente de hPMS1), así como de las secuencias
genómicas, especialmente aquellas que rodean a los exones, será útil
e importante para caracterizar las mutaciones en familias
identificadas por mostrar una elevada frecuencia de cáncer.
Posteriormente a nuestro descubrimiento de una
mutación en hMLH1 que confiere cáncer, otros estudios han
dado como resultado la caracterización de al menos 5 mutaciones
adicionales en hMLH1, cada una de las cuales parece conferir
susceptibilidad al cáncer a individuos de al menos una familia con
CCHNP. Por ejemplo, Papadopoulos y col. identificaron una mutación
como esta, caracterizada por una deleción en fase del par de bases
165 entre los codones 578 a 632. En otra familia, Papadopoulos y
col. observaron una mutación en hMLH1 caracterizada por un
cambio de fase y una sustitución de nuevos aminoácidos, en concreto,
una deleción de 4 pares de bases entre los codones 727 y 728.
Papadopoulos y col. también describen una mutación ligada al cáncer
en hMLH1, caracterizada por una extensión del extremo COOH
terminal, en concentro, una inserción de 4 pares de bases entre los
codones 755 y 756^{38}.
En resumen, hemos demostrado que el gen de
reparación de errores de apareamiento de ADN, hMLH1,
probablemente es el gen del cáncer de colon hereditario no
polipósico previamente localizado por análisis de ligamiento en el
cromosoma 3p21-23^{3}. La disponibilidad de la
secuencia del gen hMLH1 facilitará el análisis de mutaciones
ligadas al cáncer en familias con CCHNP. Además, aunque la pérdida
de heterocigosis (LOH) de marcadores ligados no es una
características de las formas 2p o 3p del CCHNP^{3,6}, se ha
observado la LOH que implica a la región 3p21.3-23
en varios cánceres humanos^{24-26}. Esto sugiere
la posibilidad de que la mutación en hMHL1 puede jugar cierto
papel en estos tumores.
La PMS1 humana se aisló usando los
procedimientos descritos con referencia a la Figura 1. La Figura 10
muestra la secuencia de nucleótidos completa del ADNc de
hPMS1. La Figura 11 muestra un alineamiento de las secuencias
predichas de las proteínas PMS1 humana y de levadura. Determinamos
mediante análisis por FISH que la PMS1 humana se localiza en el
cromosoma 7. Posteriormente a nuestro descubrimiento de
hPMS1, otros han identificado mutaciones en el gen que
parecen conferir susceptibilidad a CCHNP^{39}.
Usando el procedimiento explicado anteriormente
en referencia a la Figura 1, hemos determinado una secuencia parcial
de nucleótidos del ADNc de MLH1 de ratón, como se muestra en
la Figura 12 (ID SEC Nº 135). La Figura 13 muestra la
correspondiente secuencia de aminoácidos predicha para la proteína
mMLH1 (ID SEC Nº 136) en comparación con la secuencia predicha de la
proteína hMLH1 (ID SEC N 5). La comparación de las proteínas MLH1 de
ratón y humana así como la comparación de las proteínas hMLH1 con la
MLH1 de levadura, como se muestra en la Figura 9, indica un elevado
grado de conservación.
Usando los procedimientos descritos
anteriormente en referencia a la Figura 1, aislamos y secuenciamos
el gen PMS1 de ratón, como se muestra en la Figura 14 (ID SEC
Nº 137). Esta secuencia de ADNc codifica una proteína predicha de
864 aminoácidos (ID SEC Nº 138), como se muestra en la Figura 15,
donde se compara con la secuencia de aminoácidos predicha para hPMS1
(ID SEC Nº 133). El grado de identidad entre las proteínas PMS1
predichas de ratón y humana es alto, como podría esperarse entre dos
mamíferos. De forma similar, como se apuntó anteriormente, existe
una gran similitud entre la proteína PMS1 humana y la proteína
reparadora de errores de apareamiento de ADN de levadura, PMS1, como
se muestra en la Figura 11. El hecho de que PMS1 y MLH1 funcionen
en levaduras en la reparación de errores de apareamiento de ADN,
sugiere claramente que las PMS1 y MLH1 humanas y de ratón también
son proteínas de reparación de errores de apareamiento.
Creemos que nuestro aislamiento y
caracterización de los genes mMLH1 y mPMS1 tendrán
muchas aplicaciones en investigación. Por ejemplo, como ya se ha
descrito anteriormente, hemos aprovechado nuestro conocimiento del
gen mPMS1 para producir anticuerpos que reaccionan
específicamente con hPMS1. Ya hemos explicado que los anticuerpos
dirigidos frente a proteínas humanas, MLH1 o PMS1, se pueden usar
tanto con propósitos de investigación como con fines
diagnósticos.
También creemos que nuestro conocimiento de
mPMS1 y mMLH1 será útil para construir modelos en
ratón con el fin de estudiar las consecuencias de los defectos en la
reparación de errores de apareamiento de ADN. Esperamos que los
ratones defectivos en mPMS1 o mMLH1 sean muy propensos
al cáncer porque cada uno de los cromosomas 2p y 3p asociados con el
CCHNP son debidos a un defecto en un gen de reparación de errores de
apareamiento^{1,2}. Como se señala anteriormente, ya hemos
producido ratones quiméricos que portan un gen mPMS1
defectuoso. Actualmente estamos construyendo ratones heterocigotos
para la mutación mPMS1 o mMLH1. Estos ratones
heterocigotos deberían proporcionar modelos animales útiles para el
estudio del cáncer en humanos, en especial CCHNP. Los ratones serán
útiles para el análisis tanto de factores intrínsecos como
extrínsecos que determinan el riesgo y la progresión del cáncer.
Además, los cánceres asociados con la deficiencia en la reparación
de errores de apareamiento pueden responder de forma distinta a la
terapia convencional en comparación con otros cánceres. Estos
modelos animales serían útiles para determinar si existen
diferencias y permitir el desarrollo de regímenes para el
tratamiento eficaz de estos tipos de tumores. Estos modelos animales
pueden usarse también para estudiar la relación entre factores
hereditarios frente a factores de la dieta en la carcinogénesis.
Para estudios de susceptibilidad al cáncer y
para la identificación y caracterización de tumores, es importante
distinguir "mutaciones" de "polimorfismos". Una
"mutación" produce un "alelo de tipo no natural" de un
gen. Un alelo de tipo no natural de un gen produce una transcripción
y/o un producto proteico que no funciona de forma normal en la
célula. Las "mutaciones" pueden ser cualquier alteración en la
secuencia de nucleótidos, incluyendo inserciones, deleciones,
sustituciones y reordenamientos.
Los "polimorfismos", por otro lado, son
diferencias en la secuencia que se encuentran dentro de la población
de genes que funcionan normalmente (es decir, de "tipo
natural"). Algunos polimorfismos son el resultado de la
degeneración del código de ácidos nucleicos. Es decir, dado que la
mayoría de los aminoácidos están codificados por más de un codón
triplete, muchas secuencias nucleotídicas diferentes pueden
codificar el mismo polipéptido. Otros polimorfismos son simplemente
diferencias en la secuencia que no tienen un efecto significativo
sobre la función del gen o del polipéptido codificado. Por ejemplo,
los polipéptidos pueden tolerar a menudo pequeñas inserciones o
deleciones, o sustituciones "conservadoras" en su secuencia de
aminoácidos sin que se altere significativamente la función del
polipéptido.
Las sustituciones "conservadoras" son
aquellas en las que un aminoácido en particular se sustituye por
otro aminoácido de características químicas similares. Por ejemplo,
los aminoácidos a menudo se caracterizan como "no polares
(hidrófobos)", que incluyen alanina, leucina, isoleucina, valina,
prolina, fenilalanina, triptófano y metionina; "polares
neutros", que incluyen glicina, serina, treonina, cisteína,
tirosina, asparragina y glutamina; "cargados positivamente
(básicos)", que incluyen arginina, lisina e histidina; y
"cargados negativamente (ácidos)", que incluyen ácido
aspártico y ácido glutámico. Una sustitución de un aminoácido por
otro aminoácido del mismo grupo se considera generalmente que es
"conservadora", especialmente si los grupos laterales de los
dos aminoácidos relevantes son de tamaño similar.
La primera etapa en la identificación de una
mutación o polimorfismo en la secuencia de un gen de reparación de
errores de apareamiento implica la identificación, usando técnicas
disponibles que incluyen aquellas descritas en este documento, de
una secuencia de un gen (o fragmento génico) de reparación de
errores de apareamiento que difiera de una secuencia conocida normal
(por ejemplo, de tipo natural) del mismo gen (o fragmento génico) de
reparación de errores de apareamiento. Por ejemplo, podría
identificarse una secuencia del gen (o fragmento génico)
hMLH1 que difiera en al menos una posición nucleotídica de
una secuencia hMLH1 normal conocida (por ejemplo, de tipo
natural), como cualquiera de las ID SEC Nº 6-24.
Pueden diferenciarse las mutaciones de los
polimorfismos usando cualquiera de los diversos procedimientos, el
más directo de los cuales es quizás la recogida de datos y la
correlación con el desarrollo del tumor. Es decir, por ejemplo,
podría identificarse un sujeto cuya secuencia del gen hMLH1
difiera de las secuencias recogidas en las ID SEC Nº
6-24, pero que no tenga cáncer y que no tenga
antecedentes familiares de cáncer. Especialmente si otros miembros
de la familia de este sujeto, preferiblemente mayores, tienen
secuencias del gen hMLH1 que difieran de las ID SEC Nº
6-24 de la misma forma (o formas), es probable que
la secuencia del gen hMLH1 del sujeto pueda caracterizarse
como un "polimorfismo". Si se identifican otros individuos no
relacionados con la misma secuencia del gen hMLH1 y sin
antecedentes familiares de cáncer, puede confirmarse la
categorización.
Pueden identificarse las mutaciones que son
responsables de conferir susceptibilidad génica al cáncer porque,
entre otras cosas, estas mutaciones están presentes probablemente en
todos los tejidos de un individuo afectado y en la línea germinal de
al menos uno de los progenitores del individuo y no es probable que
se encuentre en familias no relacionadas sin antecedentes de
cáncer.
Cuando se distinguen mutaciones de
polimorfismos, a veces puede ser valioso evaluar una diferencia de
la secuencia en particular en presencia de al menos una mutación
conocida del gen de reparación de errores de apareamiento. En
algunos casos, un cambio en una secuencia en particular no tendrá un
efecto detectable (es decir, parecerá que es un polimorfismo) cuando
se analice individualmente, pero aumentará, por ejemplo, la
penetrancia de una mutación conocida, de modo que los individuos que
portan tanto la diferencia de polimorfismo aparente como una
mutación conocida tendrán mayor probabilidad de desarrollar cáncer
que los individuos que portan sólo la mutación. Las diferencias en
la secuencia que tienen tal efecto se considera que son mutaciones
propiamente, aunque débiles.
Como se describe anterior y previamente
(solicitudes de patentes de EE.UU. con Nº 08/168.877 y 08/209.521),
las mutaciones en los genes o productos génicos de reparación de
errores de apareamiento producían versiones de tipo no natural de
esos genes o productos génicos. Algunas mutaciones pueden, por
tanto, distinguirse de los polimorfismos por sus características
funcionales en ensayos de reparación de errores de apareamiento
in vivo o in vitro. Puede usarse cualquier ensayo de
reparación de errores de apareamiento disponible para analizar estas
características^{49-63}. Generalmente, es deseable
utilizar más de un ensayo de reparación de errores de apareamiento
antes de clasificar un cambio de secuencia como un polimorfismo, ya
que algunas mutaciones tendrán efectos que no se observarán en todos
los ensayos.
Por ejemplo, no es de esperar que un gen de
reparación de errores de apareamiento que contenga una mutación sea
capaz de sustituir a una copia endógena del mismo gen en una célula
hospedadora sin que se vea afectada de forma detectable la
reparación de errores de apareamiento en esa célula, mientras que
podría esperarse que un gen de reparación de errores de apareamiento
que contenga un polimorfismo de secuencia fuera capaz de sustituir a
una copia endógena del mismo gen en una célula hospedadora sin
afectar de forma detectable a la reparación de errores de
apareamiento en esa célula. Apreciamos que para estos estudios de
"sustitución" generalmente es deseable introducir el gen que se
va a analizar en una célula hospedadora de la misma especie (o al
menos muy relacionada) a la de la célula de la que deriva el gen de
ensayo, para evitar complicaciones debidas a, por ejemplo, la
incapacidad de un producto génico de una especie para interaccionar
con otros productos de genes de reparación de errores de
apareamiento de otra especie. De forma similar, no cabría esperar
que una proteína mutante de reparación de errores de apareamiento
funcionara en un sistema de reparación de errores de apareamiento
in vitro (preferiblemente de un organismo relacionado);
mientras que se esperaría que una proteína polimórfica de reparación
de errores de apareamiento funcionara normalmente.
Los procedimientos descritos en este documento y
previamente permiten la identificación de clases diferentes de
mutaciones de genes de reparación de errores de apareamiento. Los
siguientes ejemplos ilustran protocolos para distinguir mutaciones
de polimorfismos en genes de reparación de errores de apareamiento
de ADN.
Hemos desarrollado un sistema para analizar en
la levadura S. cerevisiae el significado funcional de
mutaciones encontradas en los genes hMLH1 o hPMS1. El
sistema se describe en esta solicitud usando como ejemplo la
mutación que causa el cambio de serina (SER) a fenilalanina (PHE) en
hMLH1 que se encuentra en una familia con CCHNP, como se
describe anteriormente. Hemos derivado una cepa de levadura en la
que esencialmente se ha delecionado su gen MLH1 y, por tanto,
es un potente mutador, es decir, 1.000 veces por encima de la
frecuencia normal en un simple ensayo de marcador genético que
implica la reversión del crecimiento dependiente de un aminoácido
determinado en independiente (reversión del alelo
hom3-10, Prolla, Christie y Liskay, Mol Cell Biol,
14:407-415, 1994). Cuando colocamos el gen normal
MLH1 de levadura (completo, con todas las regiones de control
conocidas) en un plasma de levadura que se mantiene estable como una
copia única en la cepa con MLH1 delecionado, el fenotipo
mutador se corrige completamente usando el ensayo de reversión a
independencia del aminoácido. Sin embargo, si introducimos una copia
delecionada del MLH1 de levadura, no se corrige. A
continuación analizamos la mutación que causa en la familia con
CCHNP la alteración de SER a PHE. Encontramos que la proteína
mutante de levadura resultante no puede corregir el fenotipo
mutador, lo que sugiere claramente que la alteración de la secuencia
génica de tipo natural probablemente confiere susceptibilidad al
cáncer y se clasifica, por tanto, como una mutación, no como un
polimorfismo. Posteriormente analizamos proteínas manipuladas
genéticamente para contener otros aminoácidos en la posición
"serina" y encontramos que la mayoría de los cambios dan lugar
a un mutante completo o al menos a un fenotipo parcialmente
mutante.
Como se han encontrado otras mutaciones
"puntuales" en los genes MLH1 y PMS1 en familias
con cáncer, el gen homólogo apropiado de levadura puede manipularse
genéticamente para contenerlas y estudiar sus consecuencias sobre la
función de la proteína. Además, hemos identificado varios
aminoácidos muy conservados en ambos genes, MLH1 y
PMS1. También tenemos evidencias de que hMLH1
interacciona con PMS1 de levadura. Este hallazgo aumenta la
posibilidad de que las mutaciones observadas en el gen hMLH1
puedan analizarse más directamente en el sistema de levadura.
Planeamos hacer sistemáticamente mutaciones que alterarán el
aminoácido de estas posiciones conservadas y determinar qué
sustituciones de aminoácidos se toleran y cuáles no. Recogiendo la
información de mutaciones relacionadas con hMLH1 y
hPMS1, determinando y documentando las mutaciones exactas
encontradas en las familias con CCHNP y sintetizando artificialmente
mutantes para analizarlos en sistemas experimentales, puede ser
posible, finalmente, practicar un protocolo de ensayo de
susceptibilidad al cáncer que, una vez determinada la estructura de
hMLH1 o hPMS1 de los individuos, sólo requiera la
comparación de esta estructura con los datos conocidos de mutaciones
frente a los de polimorfismo.
También puede usarse otro procedimiento, que
hemos empleado para estudiar las interacciones físicas entre
hMLH1 y hPMS1 para estudiar si una alteración en
particular en un producto génico tiene como resultado un cambio en
el grado de interacción proteína-proteína. La
información relacionada con cambios en la interacción
proteína-proteína puede demostrar o confirmar si una
variación genómica en particular es una mutación o un polimorfismo.
Después de nuestros hallazgos en el laboratorio sobre la interacción
entre las proteínas MLH1 y PMS1 de levadura in vitro e in
vivo (solicitud de patente de EE.UU. Nº de serie 08/168.877),
se analizaron las interacciones entre los equivalentes humanos de
estas dos proteínas de reparación de errores de apareamiento de ADN.
La interacción in vitro entre las proteínas MLH1 y PMS1
humanas se analizó usando cromatografía de afinidad con proteína de
unión a maltosa (MBP). La proteína hMLH1 se preparó como una
proteína de fusión a MBP, se inmovilizó en una columna de resina de
amilosa a través de la MBP y se analizó la unión a hPMS1 sintetizado
in vitro. La proteína hPMS1 se unía a la matriz de
MBP-hMLH1, mientras que las proteínas control no
mostraban afinidad por la matriz. Cuando la proteína hMLH1,
traducida in vitro, se pasó por una matriz con la proteína de
fusión MBP-hPMS1, la proteína hMLH1 se unía a la
matriz de MBP-hPMS1, mientras que las proteínas
control no.
Las posibles interacciones in vivo entre
hMLH1 y hPMS1 se analizaron usando el sistema de "doble
híbrido" en levadura^{28}. Nuestros resultados iniciales
indican que hMLH1 y hPMS1 interaccionan in vivo en levadura.
Puede usarse el mismo sistema para detectar cambios en la
interacción proteína-proteína como resultado de los
cambios en la estructura del gen o producto génico y que aún tienen
que ser clasificados como polimorfismo o como mutación que confiere
susceptibilidad al cáncer.
Se ha estimado que en los Estados Unidos
aproximadamente 1.000.000 de individuos portan (son heterocigotos)
un gen mutante del CCHNP^{29}. Además, las estimaciones sugieren
que el 50-60% de las familias con CCHNP segregan
mutaciones en el gen MSH2 que reside en el cromosoma
2p^{1,2}. Otra fracción significativa parece estar asociada con el
gen CCHNP que mapea en el cromosoma 3p21-22, debido,
presumiblemente, a mutaciones en hMLH1, tales como la
transición de C a T descrita anteriormente. La identificación de
familias que segregan alelos mutantes del gen hMSH2 o
hMLH1, y la determinación de qué individuos en estas familias
tienen realmente la mutación, será de gran utilidad en la
intervención temprana de la enfermedad. Esta intervención temprana
incluirá probablemente la detección temprana a través del análisis y
tratamiento complementario agresivo de los individuos afectados.
Además, la determinación de las bases genéticas, tanto para los
tumores familiares como esporádicos, podría dirigir el procedimiento
de terapia en el tumor primario o en las recurrencias.
Inicialmente, las familias candidatas con CCHNP
se diagnosticarán en parte por medio del estudio del historial
familiar, más probablemente a nivel local, por ejemplo, por
oncólogos del hospital. Un criterio para CCHNP es la observación de
la inestabilidad de microsatélites en los tumores del
individuo^{3,6}. En el paciente que lo presente, se analizarían
las mutaciones en hMSH2, hMLH1, hPMS1 y en otros genes
implicados en la reparación de errores de apareamiento de ADN cuando
se identifiquen. Esto se realiza con mayor facilidad tomando
muestras de sangre del individuo. También sería muy útil tejido
tumoral congelado en fresco. Es importante destacar para el
procedimiento de selección, que los individuos afectados son
heterocigotos para la mutación causal en sus tejidos normales.
Se consiguen los tejidos disponibles, por
ejemplo, sangre y tumor, para el análisis de mutaciones por PCR
usando uno o ambos procedimientos siguientes:
Una aproximación para identificar familias
propensas al cáncer con una mutación en hMLH1 es realizar
análisis de ligamiento con un marcador muy polimórfico localizado en
hMLH1 o estrechamente ligado a hMLH1. Los
microsatélites son muy polimórficos y, por tanto, son muy útiles
como marcadores en el análisis de ligamiento. Puesto que tenemos el
gen hMLH1 en un único fragmento genómico grande en un clon
del fago P1 (\sim 100 kpb), es muy probable que existan en el gen
hMLH1 o muy cerca de él uno o más microsatélites, por
ejemplo, extensiones de repeticiones de dinucleótidos. Se ha
descrito al menos uno de estos microsatélites^{38}. Una vez
identificados estos marcadores, se diseñarán cebadores para PCR para
amplificar los tramos de ADN que contengan los microsatélites. Se
analizará el ADN de los individuos afectados y no afectados de una
familia con elevada frecuencia de cáncer para determinar la
segregación de los marcadores de MLH1 y la presencia de
cáncer. Los datos resultantes pueden utilizarse para calcular un
valor de lod y, por tanto, determinar la probabilidad de ligamiento
entre hMLH1 y la aparición de cáncer. Una vez establecido el
ligamiento en una familia dada, se puede usar el mismo marcador
polimórfico para analizar la probabilidad de que otros miembros de
la familia porten la mutación de hMLH1.
a) El ARN de individuos afectados, no afectados
y de individuos no emparentados se somete a transcripción inversa
(RTd), seguido por una PCR para amplificar el ADNc en
4-5 porciones solapantes^{34,37}. Debe apreciarse
que para la PCR pueden usarse potencialmente muchas secuencias de
pares de cebadores oligonucleotídicos diferentes para amplificar las
porciones relevantes de un gen hMLH1 o hPMS1 del
individuo para el análisis genético. Con el conocimiento de las
estructuras de ADNc de los genes, es un ejercicio sencillo construir
los pares de cebadores que probablemente son eficaces para
amplificar específicamente porciones seleccionadas del gen. Mientras
que las secuencias de los cebadores tienen normalmente de 20 a 30
bases de longitud, puede ser posible usar cebadores más cortos,
potencialmente tan pequeños como aproximadamente 13 bases, para
amplificar específicamente segmentos génicos seleccionados. La
principal limitación sobre lo pequeño que puede ser una secuencia de
cebador es que debe ser suficientemente largo como para hibridar
específicamente con el segmento génico diana. La especificidad de la
PCR mejora generalmente con el alargamiento de los cebadores y/o el
empleo de pares de cebadores anidados.
A continuación, se secuencian los productos de
PCR que representan, en total, el ADNc completo y se comparan con
secuencias de tipo natural conocidas. En la mayoría de los casos se
observará una mutación en el individuo afectado. Idealmente, la
naturaleza de la mutación indicará que es probable inactivar el
producto génico. De otro modo, debe determinarse la posibilidad de
que la alteración no sea simplemente un polimorfismo.
b) Ciertas mutaciones, por ejemplo, aquellas que
afectan al empalme o que dan lugar a codones de parada de la
transcripción, pueden desestabilizar el ARN mensajero producido a
partir del gen mutante y, por tanto, comprometer el procedimiento
normal de detección de mutaciones basado en RT. Otra técnica
recientemente descrita puede evitar este problema analizando si el
ADNc mutante puede dirigir la síntesis de la proteína de longitud
normal en un sistema de transcripción/traducción acoplado in
vitro^{32}.
Una segunda forma de detectar mutaciones depende
del examen de exones y de los límites intrón/exón mediante
secuenciación directa por ciclos de PCR de un molde de ADN^{1,2}.
Este procedimiento requiere del uso de pares de oligonucleótidos,
tales como los descritos en las Tablas 2 y 3 anteriores, que
amplifican exones individuales para la secuenciación directa por
ciclos de PCR. El procedimiento depende de la información de la
secuencia de ADN genómico en cada límite intrón/exón (50 pb o mayor,
para cada límite). La ventaja de la técnica es doble. Primero,
porque el ADN es más estable que el ARN, el estado del material
usado para la PCR no es tan importante como lo es para los
protocolos basados en ARN. Segundo, se detectarán la mayoría de las
mutaciones en la verdadera región transcrita del gen, incluyendo
aquellas que están en un intrón afectado por el empalme.
Para cada gen candidato, la detección de
mutaciones puede requerir el conocimiento tanto de la estructura del
ADNc completo, como todos los límites intrón/exón de la estructura
genómica. Con esta información, puede determinarse el tipo de
mutación causal en una familia en particular. A su vez, puede
adaptarse un esquema de detección de mutaciones más específico y
eficaz para la familia en particular. El análisis de la enfermedad
(CCHNP) es complejo porque tiene una base genéticamente heterogénea
en el sentido de que está implicado más de un gen y para cada gen
están implicados múltiples tipos de mutaciones^{2}. Es muy
probable que cualquier familia determinada segregue una mutación en
particular. Sin embargo, cuando se determine la naturaleza de la
mutación en muchas familias, se determinará el espectro de la
mayoría de mutaciones predominantes en la población. En general, la
determinación de las mutaciones más frecuentes dirigirá y perfilará
la detección de mutaciones.
Puesto que CCHNP es tan predominante en la
población humana, la detección del portador al nacer podría llegar a
ser parte de las pruebas neonatales convencionales. Pueden
identificarse las familias de riesgo y pueden analizarse todos los
miembros que no han sido analizados previamente. Finalmente, pueden
determinarse todos los familiares afectados.
El ensayo inicial, que incluye la identificación
de las probables familias con CCHNP mediante diagnóstico
convencional y el estudio del historial familiar, se hará
probablemente en laboratorios de diagnóstico de ADN locales y más
pequeños. Sin embargo, el ensayo a gran escala de múltiples miembros
de la familia, y ciertamente el ensayo amplio de poblaciones,
finalmente requerirá grandes instalaciones comerciales centralizadas
eficaces.
Los ensayos se desarrollarán sobre la base de la
determinación de las mutaciones más frecuentes en los genes
principales subyacentes al CCHNP, que incluyen al menos el gen
hMSH2 en el cromosoma 2p y el gen MLH1 en el cromosoma
3p. Probablemente se tienen que desarrollar diversos ensayos. Por
ejemplo, una posibilidad es un grupo de ensayos que emplean
hibridaciones de oligonucleótidos que distingan entre los alelos
normales y los mutantes^{33}. Como ya se ha destacado, nuestro
conocimiento de las estructuras nucleotídicas de los genes
hMLH1, hPMS1 y hMSH2 hace posible el diseño de
numerosos pares de cebadores oligonucleotídicos que pueden
utilizarse para amplificar porciones específicas de un gen de
reparación de errores de apareamiento de un individuo para la
selección genética y el análisis del riesgo de cáncer. Nuestro
conocimiento de la estructura de los genes también hace posible el
diseño de sondas marcadas que pueden usarse para determinar
rápidamente la presencia o ausencia de todo o una porción de uno de
los genes de reparación de errores de apareamiento de ADN. Por
ejemplo, pueden diseñarse sondas de oligómeros específicas de alelos
(ASO) para diferenciar entre alelos. Los ASO son segmentos cortos de
ADN que son idénticos en secuencia, excepto por una diferencia en
una única base que refleja la diferencia entre alelos normales y
mutantes. En las condiciones apropiadas de hibridación de ADN, estas
sondas pueden reconocer una única diferencia entre dos secuencias de
ADN que de lo contrario serían idénticas. Las sondas pueden marcarse
radiactivamente o con varias moléculas indicadoras no radioactivas,
por ejemplo, restos fluorescentes o quimioluminiscentes. Las sondas
marcadas se usan entonces para analizar la presencia de alelos
causantes de enfermedades en la muestra de PCR. La presencia o
ausencia de varios genes diferentes causantes de enfermedad puede
determinarse fácilmente en una única muestra. La longitud de la
sonda debe ser suficiente como para evitar la unión inespecífica a
secuencias nucleotídicas que no sean la diana. Todos los ensayos
dependen finalmente de la información estructural completa y precisa
relacionada con hMLH1, hMSH2, hPMS1 y otros
genes de reparación de errores de apareamiento de ADN implicados en
el CCHNP.
También pueden usarse ensayos basados en la
funcionalidad del producto proteico per se. Los ensayos para
examinar la proteína utilizarán con más probabilidad anticuerpos
específicos frente a las proteínas hMLH1, hPMS1 y hMSH2 o, cuando se
identifiquen, otros productos génicos relacionados con el
"cáncer".
Por ejemplo, una muestra congelada de tumor
puede cortarse y prepararse para la tinción con anticuerpo usando
técnicas indirectas de fluorescencia. Se espera que ciertas
mutaciones génicas alteren o desestabilicen suficientemente la
estructura proteica como para dar una señal alterada o reducida
después de la tinción con anticuerpo. Probablemente estos ensayos se
realizarán en casos en los que la implicación génica en un cáncer
familiar esté aún por establecer. Estamos en el proceso de
desarrollo de anticuerpos monoclonales diagnósticos frente a las
proteínas MLH1 y PMS1 humanas. Estamos sobreexpresando las
proteínas MLH1 y PMS1 humanas en bacterias. Purificaremos las
proteínas, las inyectaremos en ratones y obtendremos anticuerpos
monoclonales específicos de las proteínas que se puedan usar con
fines de diagnóstico y de investigación.
Además de su utilidad en el diagnóstico de la
susceptibilidad al cáncer en un sujeto, las secuencias nucleotídicas
que son homólogas a un gen bacteriano de reparación de errores de
apareamiento pueden ser valiosas para, entre otras cosas, usarlas en
la identificación y caracterización de tumores defectuosos en la
reparación de errores de apareamiento. Esta identificación y
caracterización es valiosa porque los tumores defectuosos en la
reparación de errores de apareamiento pueden responder mejor a
regímenes de terapia especiales. Por ejemplo, los tumores
defectuosos para la reparación de errores de apareamiento pueden ser
sensibles a agentes que dañan el ADN, especialmente cuando se
administran en combinación con otros agentes terapéuticos.
Los defectos en los genes de reparación de
errores necesitan estar presentes en todos los tejidos del individuo
para contribuir a la formación del tumor en ese individuo. La
mutación espontánea de un gen de reparación de errores de
apareamiento en una célula o tejido en particular puede contribuir a
la formación del tumor en ese tejido. De hecho, al menos en algunos
casos, una única mutación en un gen de reparación de errores no es
suficiente para desarrollar un tumor. En estos casos, un individuo
con una única mutación en un gen de reparación de errores de
apareamiento es susceptible al cáncer, pero no desarrollará un tumor
hasta que no se produzca una segunda mutación. Adicionalmente, en
algunos casos, la misma mutación en el gen de reparación de errores
de apareamiento que está estrictamente asociada al tumor en un
individuo será responsable de conferir susceptibilidad al cáncer en
una familia con una predisposición hereditaria al desarrollo del
cáncer.
La información de secuencia que hemos
proporcionado puede usarse con procedimientos conocidos en la
técnica para analizar tumores (o líneas celulares tumorales) y para
identificar mutaciones asociadas a tumores en los genes de
reparación de errores de apareamiento. Preferiblemente, es posible
demostrar que estas mutaciones asociadas a tumores no están
presentes en tejidos no tumorales del mismo individuo. La
información descrita en esta solicitud es especialmente útil para la
identificación de mutaciones en genes de reparación de errores de
apareamiento en tumores (o líneas celulares tumorales) que muestran
inestabilidad genómica de elementos cortos de ADN repetidos.
La información de secuencia y los protocolos de
ensayo pueden usarse también para determinar si dos tumores están
relacionados, es decir, si un segundo tumor es el resultado de la
metástasis de un primer tumor encontrado anteriormente que muestra
una mutación en especial de un gen de reparación de errores de
apareamiento de ADN.
Las proteínas que interaccionan físicamente con
hMLH1 y/o hPMS1, probablemente están implicadas en la
reparación de errores de apareamiento de ADN. Por analogía con
hMLH1 y hMSH2, las mutaciones en los genes que
codifican estas proteínas serían firmes candidatos para un potencial
ligamiento al cáncer. Una poderosa aproximación de genética
molecular usando levaduras, denominada "sistema de doble
híbrido", permite la detección y aislamiento relativamente
rápidos de genes que codifican proteínas que interaccionan con un
producto génico de interés, por ejemplo, hMLH1^{28}.
El sistema de doble híbrido implica a dos
vectores plasmídicos, cada uno de ellos destinados a codificar una
proteína de fusión. Cada uno de los vectores contiene una porción, o
dominio, de un activador de la transcripción. La célula de levadura
usada en el esquema de detección contiene un gen "indicador".
El activador solo no puede activar la transcripción. Sin embargo, si
los dos dominios se colocan muy próximos, entonces puede producirse
la transcripción. El ADNc de la proteína de interés, por ejemplo, de
hMLH1 se inserta en una fase de lectura en uno de lo
vectores. Esto se denomina "cebo". Una biblioteca de ADNc
humanos, insertada en un segundo vector plasmídico para hacer
fusiones con el otro dominio del activador transcripcional, se
introduce en las células de levadura que portan el vector
"cebo". Si una célula de levadura en particular recibe un
miembro de la biblioteca que contiene un ADNc humano que codifica
una proteína que interacciona con la proteína hMLH1, esta
interacción pondrá a los dos dominios del activador transcripcional
muy próximos, activará la transcripción del gen indicador y la
célula de levadura se volverá azul. A continuación, se secuencia la
inserción para determinar si está relacionada con cualquier
secuencia de la base de datos. Puede usarse el mismo procedimiento
para identificar proteínas de levadura en la reparación de errores
de apareamiento de ADN o en un proceso relacionado. La realización
de "búsquedas" en levaduras y en humano en paralelo tiene
ciertas ventajas. La función de nuevos homólogos de levadura puede
determinarse rápidamente en levaduras mediante interrupción génica y
el posterior examen de las consecuencias génicas de ser defectuoso
en el nuevo gen descubierto. Estos estudios en levaduras ayudarán a
guiar el análisis de nuevas proteínas que "interaccionan con hMLH1
o hPMS1" humana en más o menos la misma forma que los estudios
en levaduras sobre PMS1 y MLH1 han influenciado en
nuestros estudios de los genes MLH1 y PMS1
humanos.
Usando nuestro conocimiento de las secuencias de
ADN de hMLH1 y hPMS1, podemos sintetizar las
estructuras proteicas predichas completas, o porciones de las
mismas, con el propósito de producir anticuerpos. Un uso importante
para los anticuerpos dirigidos frente a las proteínas hMLH1 y hPMS1
será la captura de otras proteínas que pueden estar implicadas en la
reparación de errores de apareamiento de ADN. Por ejemplo, empleando
técnicas de inmunoprecipitación conjunta, los anticuerpos dirigidos
frente a hMLH1 o hPMS1 pueden precipitar junto con otras proteínas
asociadas que estén funcional y/o físicamente relacionadas. Otro uso
importante para los anticuerpos será con el fin de aislar las
proteínas hMLH1 y hPMS1 a partir de tejido tumoral. A continuación,
las proteínas hMLH1 y hPMS1 de tumores pueden caracterizarse con el
fin de determinar estrategias de tratamiento apropiadas.
Estamos en el proceso de desarrollar anticuerpos
monoclonales dirigidos frente a las proteínas hMLH1 y hPMS1.
También hemos usado el siguiente procedimiento
para producir anticuerpos policlonales dirigidos frente a las
formas humana y de ratón de la proteína PMS1.
Insertamos un fragmento 3' del ADNc de
PMS1 de ratón en el vector plasmídico de expresión
bacteriano, pET (Novagen, Madison, WI). La porción expresada
esperada de la proteína PMS1 de ratón se corresponde con una región
de aproximadamente 200 aminoácidos en el extremo de la proteína
PMS1. Esta porción de la mPMS1 está conservada con respecto a la
PMS1 de levadura, pero no está conservada con respecto a las
proteínas MLH1 humana o de ratón. Una razón por la que seleccionamos
esta porción de la proteína PMS1 para producir anticuerpos es que no
queríamos que los anticuerpos resultantes tuvieran reacción cruzada
con MLH1. El fragmento de la proteína PMS1 de ratón se expresó a
niveles elevados en E. coli, se purificó de un gel de
poliacrilamida y, a continuación, se preparó la proteína eluída
para inyección en animales. Aproximadamente 2 mg del fragmento de la
proteína PMS1 se envió a la granja de conejos Pocono (PA) para
inyectársela a conejos. Los sueros de los conejos se valoraron
múltiples veces frente al antígeno PMS1 usando técnicas
convencionales de ELISA. Los anticuerpos de conejo específicos de la
proteína PMS1 de ratón se purificaron por afinidad usando columnas
que contenían la proteína PMS1 de ratón inmovilizada. La preparación
del anticuerpo policlonal purificado por afinidad se analizó
adicionalmente usando inmunotransferencia y transferencia en puntos.
Encontramos que los anticuerpos policlonales reconocían no sólo a
la proteína PMS1 de ratón, sino también a la proteína PMS1 humana
que es muy similar. Sobre la base de las inmunotransferencias, no
hay indicaciones de que otras proteínas sean reconocidas claramente
por nuestro anticuerpo, incluyendo las proteínas MLH1 humanas o de
ratón.
Con el fin de crear un sistema de modelo
experimental para estudiar defectos en la reparación de errores de
apareamiento de ADN y el cáncer resultante en un sistema animal
completo, hemos obtenido un ratón defectuoso en la reparación de
errores de apareamiento de ADN usando la tecnología de células madre
embrionarias (ES). Usando ADN genómico que contiene una porción del
gen mPMS1, construimos un vector que tras la recombinación
homóloga causa la interrupción del gen mPMS1 cromosómico. Se
confirmó que las células ES de ratón de la cepa de ratón 129
contenían un alelo mPMS1 interrumpido. Las células ES se
inyectaron en blastocitos hospedadores C57/BL6 para producir
animales que eran quiméricos o una mezcla de células 129 y C57/BL6.
La incorporación de las células ES se determinó mediante la
presencia de manchas de color agouti en el pelaje (indicativo de la
contribución de células ES). Todas las quimeras macho se cruzaron
con ratones C57/BL6 hembra.
Posteriormente, nacieron doce crías (F_{2}) en
las que se detectó el color agouti del pelaje que indicaba la
transmisión en la línea germinal del material genético de las
células ES. El análisis del ADN extraído de la punta de la cola de
las doce crías indicó que seis de los animales eran heterocigotos
(contenían un alelo de tipo salvaje y otro mutante) para la mutación
mPMS1. De los seis animales heterocigotos, tres eran hembras
(animales F_{2}-8, F_{2}-11 y
F_{2}-12) y tres eran machos (F_{2},
F_{2}-10 y F_{2}-13). Se
establecieron cuatro jaulas de cría para obtener ratones que fueran
homocigotos para la mutación mPMS1 y más ratones
heterocigotos. La jaula de cría Nº 1 que contenía los animales
F_{2}-11 y F_{2}-10, dio un
total de trece ratones en tres camadas, cuatro de los cuales se han
genotipado. La jaula Nº 2 (animales F_{2}-8 y
F_{2}-13) dio veintidós animales y tres camadas,
tres de los cuales se han genotipado. De los siete animales
genotipados, se han identificado tres animales homocigóticos hembra.
Un animal murió a las seis semanas de edad por causas desconocidas.
Las restantes hembras homocigotas están vivas y sanas a las doce
semanas de edad. Los resultados indican que los ratones homocigotos
defectuosos para mPMS1 son viables.
Las jaulas de cría Nº 3 y 4 se usaron para
retrocruzar la mutación de mPMS1 con el fondo genético de
C57/BL6. La jaula de cría Nº 3 (animal F_{2}-12
cruzado con un ratón C57/BL6) produjo veintiún animales en dos
camadas, nueve de los cuales se han genotipado. La jaula de cría Nº
4 (animal F_{2}-6 cruzado con un ratón C57/BL6)
dio ocho ratones. Además, el macho quimera original (jaula de cría
Nº 5) produjo treinta y una crías adicionales.
Para genotipar a los animales, se desarrollaron
una serie de cebadores para PCR que se usaron para identificar genes
de mPMS1 mutantes y de tipo natural. Estos son: (ID SEC Nº
143-148, respectivamente)
- Cebador 1:
- 5'TTCGGTGACAGATTTGTAAATG-3'
- Cebador 2:
- 5'TTTACGGAGCCCTGGC-3'
- Cebador 3:
- 5'TCACCATAAAAATAGTTTCCCG-3'
- Cebador 4:
- 5'TCCTGGATCATATTTTCTGAGC-3'
- Cebador 5:
- 5'TTTCAGGTATGTCCTGTTACCC-3'
- Cebador 6:
- 5'TGAGGCAGCTTTTAAGAAACTC-3'
Cebadores 1 + 2 (marcado en 5')
Cebadores 1 + 3 (no marcado en 5')
Cebadores 4 + 5 (marcado en 3')
Cebadores 4 + 6 (no marcado en 3')
Los ratones que hemos desarrollado proporcionan
un sistema de modelo animal para estudiar las consecuencias de
defectos en la reparación de errores de apareamiento y en el CCHNP
resultante. Se determinará la supervivencia a largo plazo de los
ratones homocigotos y heterocigotos para la mutación en mPMS1
y los tipos y el momento de aparición de tumores en estos ratones.
Se analizará diariamente en los ratones cualquier indicio de
aparición de cáncer que venga indicado por una apariencia abultada
en combinación con un estado de deterioro del pelaje. Estos ratones
que portan la mutación en mPMS1 se usarán para analizar los
efectos de otros factores, ambientales y genéticos, sobre la
formación de tumores. Por ejemplo, el efecto de la dieta sobre los
tumores de colon y otros tipos de tumores puede compararse entre
ratones normales y aquellos que portan la mutación en mPMS1
en el genotipo heterocigoto y homocigoto. Además, la mutación en
mPMS1 puede ponerse en diferentes fondos genéticos para
aprender sobre las interacciones entre genes de la ruta de
reparación de errores de apareamiento y otros genes implicados en el
cáncer humano, por ejemplo, p53. Los ratones que portan las
mutaciones en mPMS1 también serán útiles para analizar la
eficacia de la terapia génica somática sobre los cánceres que
aparecen en ratones, por ejemplo, los cánceres de colon esperados.
Adicionalmente, pueden establecerse líneas celulares isogénicas de
fibroblastos a partir de ratones homocigotos y heterocigotos para
mPMS1 para su uso en diversos estudios celulares, incluyendo
la determinación de frecuencias de mutación espontáneas.
Actualmente estamos construyendo un vector para
interrumpir el gen mMLH1 de ratón para obtener ratones que
porten una mutación en mMLH1. Compararemos ratones que porten
defectos en mPMS1 con ratones que porten defectos en
mMLH1. Además, obtendremos ratones que porten mutaciones en
ambos genes para ver si hay un efecto sinérgico por tener mutaciones
en dos genes asociados con CCHNP. Otros estudios sobre los ratones
mutantes para mMLH1 serán como los descritos anteriormente
para los ratones mutantes en mPMS1.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTES: Liskay, Robert M.
\hskip4.1cmBronner, C. Eric
\hskip4.1cmBaker, Sean M.
\hskip4.1cmBollag, Roni J.
\hskip4.1cmKolodner, Richard D.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: COMPOSICIONES Y PROCEDIMIENTOS RELACIONADOS CON GENES DE REPARACIÓN DE ERRORES DE APAREAMIENTO DE ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 148
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Kolisch, Hartwell, Dickinson, McCormack y Heuser
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 520 S.W. Yamhill Street, Suite 200
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Portland
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Oregón
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 97204
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM compatible con PC
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release Nº 1.0, Versión Nº 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL MANDATARIO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Van Ryseelberghe, Pierre C..
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 33.557
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: OHSU 306B
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (503) 224-6655
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (503) 295-6679
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TELEX: 360619
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 361 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 538 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 607 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2.484 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 756 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 397 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 393 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 352 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 287 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 336 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 275 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 389 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 381 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 526 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 434 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 458 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 618 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 478 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 377 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 325 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 341 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 260 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 340 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 563 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 137 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 91 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 99 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 74 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 73 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 92 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 43 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTATTCAGTA CACAATGCAG GCATTAGTTT CTCAGTTAAA AAA
\hfill43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 89 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 113 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 94 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 154 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 371 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 149 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 109 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 165 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 93 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 42:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 114 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 43:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 360 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 44:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 44:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGCACTGAG GTGATTGGC
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 45:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCGTAGCCCT TAAGTGAGC
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 46:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATATGTACA TTAGAGTAGT TG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 47:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGAGAAAGG TCCTGACTC
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 48:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAGATTTGG AAAATGAGTA AC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 49:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACAATGTCAT CACAGGAGG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 50:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 50:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACCTTTCCC TTTGGTGAGG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 51:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 51:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATTACTCTG AGACCTAGGC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 52:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 52:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATTTTCTCT TTTCCCCTTG GG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 53:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 53:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAAACAAAGC TTCAACAATT TAC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 54:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 54:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGTTTTATT TTCAAGTACT TCTATG
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 55:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 55:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCTCAGCAAC TGTTCAATGT ATGAGC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 56:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 56:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTAGTGTGTG TTTTTGGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 57:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 57:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATAACCTTA TCTCCACC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 58:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 58:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCAGCCATG AGACAATAAA TCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 59:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 59:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTTCCCAA TAATGTGATG G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 60:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 60:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAAAAGCTTC AGAATCTC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 61:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 61:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTGTGGGTGT TTCCTGTGAG TGG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 62:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 62:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGACTTTG TGTGAATGTA CACC
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 63:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 63:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGGAGAGCC TGATAGAACA TCTG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 64:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 64:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGCTTTTTC TCCCCCTCCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 65:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 65:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAATCTGGG CTCTCACG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 66:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 66:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATTATACCT CATACTAGC
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 67:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 67:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTTTATTAC AGAATAAAGG AGG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 68:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 68:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGCCAAGT TAGAAGGCA
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 69:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 69:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGCAACCCAC AAAATTTGGC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 70:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 70:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTTCTCCAT TTCCAAAACC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 71:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 71:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGTGTCTCT AGTTCTGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 72:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 72:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATTGTTGTA GTAGCTCTGC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 73:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 73:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCATTTGTC CCAACTGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 74:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 74:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGTCAGTTG AAATGTCAG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 75:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 75:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATTTGGATG CTCCGTTAAA GC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 76:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 76:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACCCFFCTG GAAATTTAT TTG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 77:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 77:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAAAGGCAC TGGAGAAATG GG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 78:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 78:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCTCCAGCA CACATGCATG TACCG
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 79:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 79:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAAGTAGTCT GTGATCTCCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 80:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 80:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGTATGAGG TCCTGTCC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 81:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 81:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGACACCAGTG TATGTTGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 82:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 82:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGAAAGAAG AACACATCCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 83:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 83:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTCA CTGAGGTGAT TGGCTGAA
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 84:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 84:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAGCCCTTAA GTGAGCCCG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 85:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 85:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTA CATTAGAGTA GTTGCAGA
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 86:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 86:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGTCCTGAC TCTTCCATG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 87:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 87:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTT GGAAAATGAG TAACATGATT
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 88:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 88:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTCATCACA GGAGGATAT
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 89:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 89:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTCT TTCCCTTTGG TGAGGTGA
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 90:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 90:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTACTCTGAGA CCTAGGCCCA
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 91:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 91:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTC TCTTTTCCCC TTGGGATTAG
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 92:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 92:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACAAAGCTTC AACAATTTAC TCT
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 93:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 46 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 93:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTGT TTTATTTTCA AGTACTTCTA TGAATT
\hfill46
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 94:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 94:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGCAACTGT TCAATGTATG AGCACT
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 95:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 95:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTGT GTGTGTTTT GGAAC
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 96:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 96:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACCTTATCT CCACCAGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 97:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 97:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTAG CCATGAGACA ATAAATCCTTG
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 98:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 98:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCCAAATAA TGTGATGGAA TG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 99:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 99:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTAA GCTTCAGAAT CTCTTTT
\hfill37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 100:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 100:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGGTGTTTC CTGTGAGTGG ATT
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 101:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 101:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CCGCCAGTAC TTTGTGTGAA TGTACACCTG TG
\hfill42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 102:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 102:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGAGCCTGA TAGAACATCT GTTG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 103:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 103:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTCT TTTTCTCCCC CTCCCACTA
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 104:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 104:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTGGGCTCT CACGTCT
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 105:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 105:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTATTCTGA GTCTCTCC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 106:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 106:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTGT TTGCTCAGAG GCTGC
\hfill35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 107:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 107:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATGSTTCGT ACAGATTCCC G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 108:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 108:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTT ATTACAGAAT AAAGGAGGTA G
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 109:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 109:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTAA CCCACAAAAT TTGGCTAAG
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 110:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 110:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTCCATTTC CAAAACCTTG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 111:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 111:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTCTCTAGT TCTGGTGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 112:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 112:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTG TTGTAGTAGC TCTGCTTG
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 113:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 113:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTTGTCCCA ACTGGTTGTA
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 114:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 114:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTC AGTTGAAATG TCAGAAGTG
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 115:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 115:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGT
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 116:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 116:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGGCTGGAA ATTTTATTTG GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 117:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 117:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTAG GCACTGGAGA AATGGGATTT G
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 118:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 118:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCAGCACAC ATGCATGTAC CGAAAT
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 119:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 119:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTAGTCTGTG ATCTCCGTTT
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 120:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 120:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTTA TGAGGTCCTG TCCTAG
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 121:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 121:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACCAGTGTAT GTTGGGATG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 122:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc_característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "cebadores dirigidos hacia un intrón de ADN genómico"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 122:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAAACGA CGGCCAGTGA AAGAAGAACA CATCCCACA
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 123:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 770 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 123:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 124:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 124:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 125:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 125:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 126:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 52 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 126:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 127:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 127:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 128:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 128:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 129:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 129:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 130:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 130:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 131:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 64 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 131:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 132:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2.687 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: 7q
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 132:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 133:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 862 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 133:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 134:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 903 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 134:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 135:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2.577 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 135:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 136:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 728 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 136:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 137:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3.065 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 137:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 138:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 864 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 138:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 139:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 139:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTGATTCTA GAGCYTCNCC NCKRAANCC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 140:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 140:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGTCGGAGC TCAARGARYT NGTNGANAA
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 141:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 141:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACTTGTGGAT TTTGC
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 142:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 142:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACTTGTGAAT TTTGC
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 143:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 143:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTCGGTGACA GATTTGTAAA TG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 144:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 144:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTACGGAGC CCTGGC
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 145:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 145:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCACCATAAA AATAGTTTCC CG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 146:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 146:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTGGATCA TATTTTCTGA GC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 147:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 147:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTCAGGTAT GTCCTGTTAC CC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 148:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 148:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGAGGCAGCT TTTAAGAAAC TC
\hfill22
Claims (17)
1. Un procedimiento para diagnosticar la
susceptibilidad al cáncer de colon de un sujeto que comprende:
detectar la presencia de una mutación en una
secuencia de ácido nucleico de hMLH1 que puede obtenerse:
- (i)
- preparando un primer cebador degenerado que se corresponde con la secuencia de aminoácidos GFRGEA y un segundo cebador degenerado que tiene la secuencia de la ID SEC Nº 140.
- (ii)
- realizando una PCR usando dichos cebadores con el ADNc obtenido a partir de un cultivo primario de fibroblastos humanos para generar un producto de PCR, y;
- (iii)
- aislando la secuencia completa de hMLh1 a partir de una biblioteca de ADNc humano usando dicho producto como sonda,
en el que dicha mutación se detecta comparando
una secuencia de hMLH1 aislada a partir de un tejido del sujeto con
una secuencia de hMLH1 de tipo natural, siendo la presencia de una
mutación indicativa de la susceptibilidad del sujeto al cáncer de
colon, y en el que la mutación se caracteriza por una
mutación de transición de C a T que produce una sustitución de
aminoácido no conservadora en la posición 44 de la proteína hMLH1
(ID SEC Nº 5).
2. Un procedimiento según la reivindicación 1 en
el que la secuencia de ácido nucleico de hMLH1 tiene la secuencia de
ID SEC Nº 4.
3. Un procedimiento para diagnosticar la
suceptibilidad al cáncer de colon de un sujeto que comprende:
detectar la presencia de una mutación en una
secuencia de ácido nucleico de hPMS1 que tiene la secuencia de ID
SEC Nº 132,
en el que dicha mutación se detecta comparando
una secuencia de ácido nucleico de hPMS1 aislado a partir de un
tejido del sujeto con una secuencia hPMS1 de tipo natural,
respectivamente, siendo la presencia de una mutación indicativa de
la susceptibilidad del sujeto al cáncer de colon.
4. Un procedimiento para diagnosticar la
susceptibilidad al cáncer de colon de un sujeto que comprende:
detectar la unión de un anticuerpo que se une
específicamente a un polipéptido de hMLH1 que tiene la secuencia de
la ID SEC Nº 5 o un polipéptido hPMS1 que tiene la secuencia de la
ID SEC Nº 133 con una muestra obtenida del sujeto,
siendo la cantidad de unión de dicho anticuerpo
indicativa de la susceptibilidad del sujeto al cáncer de colon.
5. El procedimiento de la reivindicación 1 o de
la reivindicación 2 en el que la etapa de detección comprende;
amplificar un segmento de la secuencia hMLH1
aislada;
comparar el segmento amplificado con un segmento
análogo de la secuencia hMLH1 de tipo natural; y
detectar una diferencia entre el segmento
amplificado y el segmento análogo, siendo la diferencia indicativa
de la mutación de transición de C a T en la secuencia hMLH1.
6. El procedimiento de la reivindicación 3 en el
que la etapa de detección comprende;
amplificar un segmento de la secuencia de hPMS1
aislada;
comparar el segmento amplificado con un segmento
análogo de la secuencia de hPMS1 de tipo natural; y
detectar una diferencia entre el segmento
amplificado y el segmento análogo, siendo la diferencia indicativa
de una mutación en la secuencia de hPMS1.
7. El procedimiento de la reivindicación 6 en el
que la diferencia en la secuencia de nucleotidos se selecciona entre
el grupo constituido por delecciones de al menos un nucleótido,
inserciones de al menos un nucleotido, sustituciones de al menos un
nucleótido y reordenamiento de nucleótidos.
8. El procedimiento de la reivindicación 5 y de
la reivindicación 6 en el que la etapa de amplificación
comprende:
transcribir de forma inversa un producto génico
de ARN completo, o una porción de éste, a ADN; y
amplificar un segmento del ADN producido
mediante transcripción inversa.
9. El procedimiento de la reivindicación 8 en el
que la etapa de amplificación comprende:
seleccionar un par de cebadores
oligonucleotídicos capaces de hibridar con hebras opuestas del
segmento de ADN y en orientación opuesta; y
realizar una reacción en cadena de la polimerasa
utilizando los cebadores oligonucleotídicos de modo que se amplifica
el ácido nucleico que está entre los cebadores para dar lugar al
segmento amplificado.
10. El procedimiento de una cualquiera de las
reivindicaciones precedentes en el que la etapa de detección de una
mutación comprende determinar si la diferencia entre el segmento
amplificado y el segmento análogo da lugar a un fenotipo
afectado.
11. Un polinucleótido aislado que codifica una
proteína de reparación de errores de apareamiento de ADN y comprende
la secuencia de la ID SEC Nº 132.
12. Un polipéptido de reparación de errores de
apareamiento de ADN aislado codificado por el polinucleótido aislado
de la reivindicación 11.
13. Un polipéptido de reparación de errores de
apareamiento aislado de ADN que tiene la secuencia de la ID SEC Nº
133.
14. Un anticuerpo purificado que se une
específicamente a un polipéptido según la reivindicación 12 o la
reivindicación 13.
15. Un anticuerpo según la reivindicación 14 en
el que el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal.
16. Una sonda que comprende:
una secuencia de nucleótidos de menos de 500 pb
capaz de unirse específicamente mediante apareamiento de Watson y
Crick con una Tm mayor de 55ºC a bases complementarias de la ID SEC
Nº 4; y
un resto marcado unido a la secuencia;
en la que el resto marcado tiene una propiedad
seleccionada entre el grupo constituido por fluorescencia,
radioactividad y quimioluminiscencia.
17. Una sonda que comprende:
una secuencia de nucleótidos capaz de unirse
específicamente mediante apareamiento de Watson y Crick con una Tm
mayor de 55ºC a bases complementarias de la ID SEC Nº 132; y
un resto marcado unido a la secuencia, en el que
el resto marcado tiene una propiedad seleccionada entre el grupo
constituido por fluorescencia, radiactividad y
quimioluminiscencia.
Applications Claiming Priority (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US16887793A | 1993-12-17 | 1993-12-17 | |
US168877 | 1993-12-17 | ||
US08/209,521 US5922855A (en) | 1993-12-17 | 1994-03-08 | Mammalian DNA mismatch repair genes MLH1 and PMS1 |
US08/352,902 US6191268B1 (en) | 1993-12-17 | 1994-12-09 | Compositions and methods relating to DNA mismatch repair genes |
US352902 | 1994-12-09 | ||
US209521 | 1998-12-10 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2270424T3 true ES2270424T3 (es) | 2007-04-01 |
Family
ID=27389577
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES95906061T Expired - Lifetime ES2270424T3 (es) | 1993-12-17 | 1994-12-16 | Composiciones y procedimientos relativos a genes reparadores de discordancias de adn. |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US6191268B1 (es) |
EP (1) | EP0760867B1 (es) |
JP (1) | JP4101285B2 (es) |
AT (1) | ATE330009T1 (es) |
AU (1) | AU1442495A (es) |
CA (1) | CA2179285A1 (es) |
DE (1) | DE69434765T2 (es) |
DK (1) | DK0760867T3 (es) |
ES (1) | ES2270424T3 (es) |
WO (1) | WO1995016793A1 (es) |
Families Citing this family (37)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6191268B1 (en) * | 1993-12-17 | 2001-02-20 | Dana-Farber Cancer Institute | Compositions and methods relating to DNA mismatch repair genes |
US6482606B1 (en) * | 1994-01-27 | 2002-11-19 | Human Genome Sciences, Inc. | Human DNA mismatch repair polynucleotides |
CA2182206A1 (en) * | 1994-01-27 | 1995-08-03 | William A. Haseltine | Human dna mismatch repair proteins |
US6380369B1 (en) * | 1994-01-27 | 2002-04-30 | Human Genome Sciences, Inc. | Human DNA mismatch repair proteins |
AUPM612494A0 (en) * | 1994-06-08 | 1994-06-30 | Csl Limited | Treatment or prevention of helicobacter infection |
JPH0847247A (ja) * | 1994-08-05 | 1996-02-16 | Fuji Denki Kogyo Kk | Dc/dcコンバータ回路 |
CA2223971A1 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Marilee Burrell | Antibody detection of mismatch repair proteins |
US6294325B1 (en) | 1996-07-05 | 2001-09-25 | The Mount Sinai School Of Medicine Of The City University Of New York | Cloning and expression of thermostable multi genes and proteins and uses thereof |
WO1999001550A1 (en) * | 1997-07-03 | 1999-01-14 | Dana-Farber Cancer Institute | A method for detection of alterations in msh5 |
DE19739611A1 (de) * | 1997-09-09 | 1999-03-11 | Biotecon Ges Fuer Biotechnologische Entwicklung & Consulting Mbh | Nucleinsäure-Sequenzen und Verfahren zum Nachweis von Bakterien der Gattung Pseudomonas |
DE19747748A1 (de) * | 1997-10-29 | 1999-05-06 | Manfred Dr Dr Gross | Testverfahren zur Identifizierung von Personen mit defektem Mismatch-Reparatursystem |
US6146894A (en) * | 1998-04-14 | 2000-11-14 | The Johns Hopkins University | Method for generating hypermutable organisms |
US7148016B1 (en) | 1999-01-14 | 2006-12-12 | Ca*Tx Inc. | Immunoassays to detect diseases or disease susceptibility traits |
ATE404665T1 (de) * | 2000-02-11 | 2008-08-15 | Univ Johns Hopkins | Methode zur herstellung hypermutierender bakterien |
DE60039371D1 (de) * | 2000-02-18 | 2008-08-14 | Morphotek Inc | Methode zur herstellung hypermutabler pflanzen |
WO2001062945A1 (en) * | 2000-02-23 | 2001-08-30 | The Johns Hopkins University | Methods for generating hypermutable yeast |
US6677146B1 (en) * | 2000-03-28 | 2004-01-13 | Replidyne, Inc. | Thermophilic polymerase III holoenzyme |
US6825038B2 (en) * | 2000-05-12 | 2004-11-30 | The Johns Hopkins University | Method for generating hypermutable organisms |
EP1364008A2 (en) * | 2000-07-27 | 2003-11-26 | University Of Delaware | Methods for enhancing targeted gene alteration using oligonucleotides |
US6808894B1 (en) * | 2000-11-07 | 2004-10-26 | Morphotek, Inc. | Methods for generating genetically altered antibody producing cell lines with improved antibody characteristics |
US6576468B1 (en) * | 2000-11-07 | 2003-06-10 | Morphotek, Inc. | Methods for obtaining microbe-resistant mammalian cells from hypermutable mammalian cells |
US7223598B2 (en) * | 2000-11-07 | 2007-05-29 | Morphotek, Inc. | Methods for isolating novel antimicrobial agents from hypermutable mammalian cells |
US7235643B2 (en) * | 2000-11-07 | 2007-06-26 | Morphotek, Inc. | Antibodies and methods for generating genetically altered antibodies with high affinity |
US6737268B1 (en) * | 2000-11-14 | 2004-05-18 | Morphotek, Inc. | Method for generating genetically altered antigens |
EP1351565B1 (en) * | 2001-01-15 | 2011-03-16 | Morphotek, Inc. | Chemical inhibitors of mismatch repair |
US6982169B2 (en) | 2001-01-15 | 2006-01-03 | Morphotek, Inc. | Chemical inhibitors of mismatch repair |
US20030068808A1 (en) * | 2001-07-25 | 2003-04-10 | Nicolaides Nicholas C. | Methods for generating antibiotic resistant microbes and novel antibiotics |
US20030165940A1 (en) * | 2001-12-06 | 2003-09-04 | The Johns Hopkins University | Disease detection by digital protein truncation assays |
EP1551988B1 (en) * | 2002-07-19 | 2010-11-24 | Morphotek, Inc. | Methods for generating enhanced antibody-producing cell lines with improved growth characteristics |
US7316903B2 (en) * | 2003-03-28 | 2008-01-08 | United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Detection of nucleic acid sequence variations using phase Mu transposase |
JP2007537709A (ja) * | 2003-05-23 | 2007-12-27 | モーフオテク・インコーポレーテツド | 腫瘍抗原を特異的に結合するモノクローナル抗体 |
CA2548813A1 (en) * | 2003-12-08 | 2005-06-23 | Morphotek, Inc. | Antibodies that specifically bind pms2 |
JP4805848B2 (ja) * | 2004-02-12 | 2011-11-02 | モルフォテック、インク. | 腫瘍抗原の生物活性を特異的に阻止するモノクローナル抗体 |
EP2322560B1 (en) * | 2005-03-10 | 2013-09-04 | Morphotek, Inc. | Anti-mesothelin antibodies |
EP1879922A2 (en) | 2005-04-22 | 2008-01-23 | Morphotek, Inc. | Antibodies with immune effector activity and that internalize in folate receptor alpha-positive cells |
CN102296105A (zh) * | 2010-06-25 | 2011-12-28 | 复旦大学 | 一种检测mlh1基因突变的方法及其试剂盒 |
WO2019041045A1 (en) | 2017-09-01 | 2019-03-07 | The Hospital For Sick Children | PROFILING AND TREATMENT OF HYPERMUTANT CANCER |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683195A (en) * | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US5043272A (en) * | 1989-04-27 | 1991-08-27 | Life Technologies, Incorporated | Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequence as primers |
WO1993022457A1 (en) * | 1992-04-24 | 1993-11-11 | Massachusetts Institute Of Technology | Screening for genetic variation |
US7229755B1 (en) * | 1993-11-17 | 2007-06-12 | Dana Farber Cancer Institute, Inc. | Method for detection of alterations in the DNA mismatch repair pathway |
ATE273387T1 (de) * | 1993-12-02 | 2004-08-15 | Univ Johns Hopkins | Menschliches mutator-gen nmsh2 und seine verbindung zum hereditaren, nichtpolypösen kolorrektalen karzinom |
US6191268B1 (en) * | 1993-12-17 | 2001-02-20 | Dana-Farber Cancer Institute | Compositions and methods relating to DNA mismatch repair genes |
CA2182206A1 (en) * | 1994-01-27 | 1995-08-03 | William A. Haseltine | Human dna mismatch repair proteins |
-
1994
- 1994-12-09 US US08/352,902 patent/US6191268B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-12-16 EP EP95906061A patent/EP0760867B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-12-16 AT AT95906061T patent/ATE330009T1/de active
- 1994-12-16 CA CA002179285A patent/CA2179285A1/en not_active Abandoned
- 1994-12-16 AU AU14424/95A patent/AU1442495A/en not_active Abandoned
- 1994-12-16 WO PCT/US1994/014746 patent/WO1995016793A1/en active IP Right Grant
- 1994-12-16 DE DE69434765T patent/DE69434765T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-12-16 DK DK95906061T patent/DK0760867T3/da active
- 1994-12-16 JP JP51702495A patent/JP4101285B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1994-12-16 ES ES95906061T patent/ES2270424T3/es not_active Expired - Lifetime
-
1997
- 1997-10-31 US US08/961,810 patent/US6165713A/en not_active Expired - Lifetime
-
1999
- 1999-03-10 US US09/265,503 patent/US6538108B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2003
- 2003-01-22 US US10/349,607 patent/US20030224463A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20030224463A1 (en) | 2003-12-04 |
EP0760867B1 (en) | 2006-06-14 |
AU1442495A (en) | 1995-07-03 |
CA2179285A1 (en) | 1995-06-22 |
EP0760867A1 (en) | 1997-03-12 |
US6538108B1 (en) | 2003-03-25 |
WO1995016793A1 (en) | 1995-06-22 |
ATE330009T1 (de) | 2006-07-15 |
EP0760867A4 (en) | 1998-11-25 |
US6165713A (en) | 2000-12-26 |
DE69434765T2 (de) | 2007-05-24 |
JPH09512702A (ja) | 1997-12-22 |
DE69434765D1 (de) | 2006-07-27 |
JP4101285B2 (ja) | 2008-06-18 |
DK0760867T3 (da) | 2006-10-23 |
US6191268B1 (en) | 2001-02-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2270424T3 (es) | Composiciones y procedimientos relativos a genes reparadores de discordancias de adn. | |
Cordes et al. | The mouse segmentation gene kr encodes a novel basic domain-leucine zipper transcription factor | |
US5352775A (en) | APC gene and nucleic acid probes derived therefrom | |
Duhl et al. | Pleiotropic effects of the mouse lethal yellow (A y) mutation explained by deletion of a maternally expressed gene and the simultaneous production of agouti fusion RNAs | |
JP2005224243A (ja) | ヒトのミューテーター遺伝子hMSH2及び遺伝性非ポリープ性大腸ガン | |
PT760867E (pt) | Processo para a detecção de alterações no modo de reparação de erros no emparelhamento do adn | |
WO1992013103A1 (en) | Inherited and somatic mutations of apc gene in colorectal cancer of humans | |
Scott et al. | Mutation analysis of the STK11/LKB1 gene and clinical characteristics of an Australian series of Peutz–Jeghers syndrome patients | |
US20120009648A1 (en) | DNA polymerase lambda and uses thereof | |
US5693470A (en) | Diagnostic method employing MSH2 nucleic acids | |
JPH05502789A (ja) | ムチンヌクレオチド | |
JP4290225B2 (ja) | Atp結合カセットトランスポーターの核酸配列 | |
US7700292B2 (en) | Allelic form of the HMGA2 gene predisposing women to the formation of leiomyomas | |
Witherden et al. | An integrated genetic, radiation hybrid, physical and transcription map of a region of distal mouse chromosome 12, including an imprinted locus and the ‘Legs at odd angles’(Loa) mutation | |
AU743457B2 (en) | Compositions and methods relating to DNA mismatch repair genes | |
KR102578134B1 (ko) | 수박의 여교배 세대단축 육종을 위한 단일염기 다형성 마커세트 및 이의 용도 | |
JP7388721B2 (ja) | Crebbp遺伝子に変異を導入された遺伝子改変動物 | |
EA011608B1 (ru) | Полиморфизм человеческого гена nbs1, полезный для диагностики наследственной предрасположенности к раку | |
Stormorken et al. | The inframe MSH2 codon 596 deletion is linked with HNPCC and associated with lack of MSH2 protein in tumours | |
Skarsfjord | Hereditary breast and ovarian cancer. Diversity of genetic causes of HBOC in a Norwegian breast and ovarian cancer patient cohort, BRCA2 c. 8331+ 2C> T-a Norwegian founder mutation | |
JP2005505272A (ja) | 双極性障害と関連する脳で発現されるcap−2遺伝子およびタンパク質 | |
CZ20002282A3 (cs) | Gen asociovaný s poruchou nálady, jeho použití a způsob identifikace |