ES2256895T3 - Celulas huesped y metodos de produccion de proteinas. - Google Patents

Celulas huesped y metodos de produccion de proteinas.

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ES2256895T3 ES97939990T ES97939990T ES2256895T3 ES 2256895 T3 ES2256895 T3 ES 2256895T3 ES 97939990 T ES97939990 T ES 97939990T ES 97939990 T ES97939990 T ES 97939990T ES 2256895 T3 ES2256895 T3 ES 2256895T3
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Abstract

ESTA INVENCION SE REFIERE A NUEVAS CELULAS ANFITRIONAS Y A UNOS PROCEDIMIENTOS DE PRODUCCION DE PROTEINAS. MAS ESPECIFICAMENTE ESTA INVENCION SE REFIERE A UNA CELULA ANFITRIONA UTIL PARA LA EXPRESION DE PROTEINAS HETEROLOGAS, EN LAS CUALES LA CELULA MADRE EN CUESTION HA SIDO GENETICAMENTE MODIFICADA PARA EXPRESAR NIVELES PRACTICAMENTE REDUCIDOS DE UNA METALOPROTEASA O DE UNA PROTEASA ALCALINA. ESTA INVENCION SE REFIERE TAMBIEN A UN PROCEDIMIENTO PARA PRODUCIR UNA PROTEINA HETEROLOGA, CONSISTIENDO ESTE PROCEDIMIENTO EN CULTIVAR LA CELULA ANFITRIONA EN UN MEDIO DE CRECIMIENTO ADECUADO Y LUEGO, EN RECUPERAR LA PROTEINA DESEADA.

Description

Células huésped y métodos de producción de proteínas.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a células huésped fúngicas nuevas y a métodos para producir proteínas. Más específicamente, la invención se refiere a una célula de Aspergillus oryzae útil para la expresión de proteínas heterólogas donde la célula huésped ha sido genéticamente modificada para expresar niveles significativamente reducidos de una metaloproteinasa y una proteasa alcalina. Además, la invención se refiere a un método para producir proteínas de interés en altos rendimientos usando los hongos de la invención, donde el método comprende cultivar la célula en un medio de crecimiento adecuado, seguido de la recuperación de la proteína deseada. La invención también comprende métodos para producir tales hongos y constructos de ADN para su uso en estos métodos.
Antecedentes de la invención
El uso de células huésped recombinantes en la expresión de proteínas heterólogas ha simplificado mucho en los últimos años la producción de grandes cantidades de proteínas comercialmente valiosas que de lo contrario son obtenibles sólo mediante la purificación de sus fuentes nativas. Habitualmente, hay una selección variada de sistemas de expresión de los cuales se puede hacer una selección para la producción de cualquier proteína dada, incluyendo huéspedes eubacteriales y eucarióticos. La selección de un sistema de expresión apropiado a menudo depende no sólo de la capacidad de la célula huésped para producir rendimientos adecuados de la proteína en un estado activo, sino que también, en gran medida, puede ser determinada por el uso final al que está destinada la proteína.
Un problema frecuentemente encontrado es el alto nivel de enzimas proteolíticas producidas por una célula huésped dada o presente en el medio de cultivo. Se ha sugerido que se podrían proporcionar organismos huésped privados de la capacidad de producir compuestos proteolíticos específicos. Por ejemplo, la solicitud de patente internacional WO 90/00192 (Genencor) describe huéspedes fúngicos filamentosos incapaces de segregar proteinasa aspártica enzimáticamente activa, y EP 574 347 (Ciba Geigy AG) describe huéspedes de Aspergillus defectuosos en una serina proteasa del tipo subtilisina.
Se han aislado metaloproteasas de varias fuentes eucarióticas. Las metaloproteasas neutras, es decir metaloproteasas con actividad óptima a un pH neutro, aisladas de cepas de Aspergillus también han sido descritas. Las propiedades fisicoquímicas de dos metaloproteasas neutras de Aspergillus sojae, NpI y NpII, han sido descritas en una serie de estudios (Sekine, H. 1972. Agric. Biol. Chem. 36:198-206, 207-216; Sekine, H. 1972. Agric. Biol. Chem. 36:2143-2150). Se reveló que las características enzimáticas y fisicoquímicas de NpI, pero no de NpII, se asemejan a las de la termolisina de Bacillus thermoproteolyticus. Se ha descrito recientemente la secuencia de ADNc de una metaloproteasa neutra, NpII, de Aspergillus oryzae (Tatsumi H, et al. 1991. Mol. Gen. Genet. 228:97-103). No obstante, la secuencia de ADNc de una metaloproteasa neutra del grupo NpI de Aspergillus oryzae nunca ha sido descrita.
La proteasa alcalina es una serina proteasa con un pH alcalino óptimo (Nakagawa, Y. 1970. Methods Enzymol. 19:581-591). Es un homólogo de la subtilisina y es la endopeptidasa alcalina extracelular predominante de Aspergillus oryzae. El gen ha sido aislado y caracterizado (Murakami, et al. 1991. Agric. Biol. Chem. 55:2807-2811). Otras dos especies de Aspergillus, A. flavus y A. sojae, producen enzimas idénticas o muy relacionadas.
Un papel potencial de las metaloproteasas y proteasas alcalinas para reducir la estabilidad de productos proteínicos obtenidos a partir de Aspergillus no ha sido descrito.
Resumen de la invención
Según la presente invención se ha hallado recientemente que la actividad proteolítica de la metaloproteasa I neutra y de la proteasa alcalina, sea de forma individual o en combinación, puede reducir significativamente la estabilidad de un producto proteínico de interés producido por una célula dando como resultado un rendimiento reducido de dicha proteína.
En consecuencia, la presente invención proporciona una célula de Aspergillus orzyae en la que se ha introducido una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido heterólogo, donde la célula ha sido modificada mediante la tecnología del ADN recombinante en un modo en el que
a) una metaloproteasa endógena,
i)
codificada por la secuencia de ADN mostrada en la SEC ID NO 2, o una secuencia de ADN que tiene al menos una identidad del 70% con la SEC ID NO: 2, y
b) una actividad proteasa alcalina endógena, codificada por la secuencia de ADN mostrada en la SEC ID NO 3, o una secuencia de ADN que tiene al menos una identidad del 70% con la SEC ID NO: 3,
son funcionalmente inactivas o expresadas a niveles reducidos en comparación con una célula parental.
Según otro aspecto, la invención proporciona un método para producir un producto proteínico heterólogo en una célula de Aspergillus oryzae de la invención, donde el método comprende la introducción en la célula de una secuencia de ácidos nucleicos que codifique la proteína, el cultivo de la célula en un medio de crecimiento adecuado, y la recuperación del producto proteínico heterólogo.
Mediante el método de la invención, la actividad proteolítica resultante de una metaloproteasa I neutra y de una proteasa alcalina son significativamente reducidas, de ese modo mejorando la estabilidad y el rendimiento de la proteína obtenida por el método. Además, la proteína obtenida por el método de la invención puede ser una proteína precursora tal como un zimógeno, una proteína híbrida, una proteína obtenida como una secuencia pro o secuencia pre-pro, o cualquier otro tipo de forma inmadura.
Breve descripción de los dibujos
La presente invención se ilustra con mayor detalle haciendo referencia a los dibujos anexos, en los que:
La Fig. 1 es un diagrama de la construcción del plásmido pJaL335 que contiene el gen pyrG;
La Fig. 2 es un diagrama de la construcción del plásmido pSO5 que contiene las secuencias 5' y 3' del gen pyrG;
La Fig. 3 es un diagrama de la construcción del plásmido pJaL212 donde la secuencia de codificación de pyrG ha sido insertada entre las secuencias 5' y 3' del gen alp;
La Fig. 4 es un diagrama de la construcción del plásmido pJaL399 donde la secuencia de codificación de NpI es interrumpida;
La Fig. 5 muestra la secuencia de aminoácidos N-terminal de la lipasa B de Candida antarctica y las secuencias de dos cebadores oligonucleótidos derivados de esta secuencia;
La Fig. 6 es un diagrama de la construcción del plásmido pMT1305 que contiene la lipasa B de C. antarctica;
La Fig. 7 es un diagrama de la construcción del plásmido pMT1329 que contiene la secuencia parcial del extremo 5' del gen de la lipasa B de C. antarctica;
La Fig. 8 es un diagrama de la construcción del plásmido pMT1332 que contiene el gen de la lipasa B de C. antarctica; y
La Fig. 9 es un diagrama de la construcción del plásmido de expresión pMT1335 que contiene el gen de la lipasa B de C. antarctica.
Descripción detallada de la invención Células huésped
La presente invención proporciona una célula huésped útil para la expresión de proteínas heterólogas, donde la célula ha sido genéticamente modificada para expresar niveles significativamente reducidos de actividad metaloproteasa y proteasa alcalina en comparación con una célula parental. Dicha célula huésped está derivada de la célula parental que puede ser una célula de tipo salvaje.
Preferiblemente, la célula huésped de la invención es un hongo filamentoso capaz de producir una proteína deseada. En una forma de realización preferida, el hongo filamentoso es una cepa de Aspergillus oryzae.
Metaloproteasas
En el contexto de esta invención, una metaloproteasa es una enzima proteolítica que contiene un centro metálico de zinc catalítico que participa en la hidrólisis del esqueleto peptídico del sustrato. El centro de zinc activo diferencia estas proteasas de las calpaínas, cuyas actividades son dependientes de la presencia de calcio. Se confirma una proteasa como una metaloproteasa por la pérdida reversible de actividad proteolítica tras la eliminación del centro de zinc con 1 mM 1,10-fenantrolina, y su restauración después de la valoración con Zn^{2+} (0.1-100 mM).
En una forma de realización preferida, la metaloproteasa contemplada en el contexto de esta invención es una metaloproteasa neutra, que es una metaloproteasa que posee actividad proteolitica óptima en la región de pH neutro, es decir en la gama de pH de aproximadamente 6-8, preferiblemente en la gama de pH de aproximadamente 6.5-7.5, más específicamente, alrededor de un pH 7. Más particularmente, la metaloproteasa contemplada en el contexto de esta invención es una metaloproteasa neutra de Aspergillus del grupo NpI o NpII (Tatsumi, et al., 1991, supra).
En una forma de realización preferida, la metaloproteasa es una Metaloproteasa I neutra (NpI) de Aspergillus oryzae que comprende una secuencia de aminoácidos derivada de la secuencia de nucleótidos presentada como la SEC. ID. N°. 2, o una secuencia homóloga a ésta.
Proteasas alcalinas
En el contexto de esta invención una proteasa alcalina es una serina proteasa con una actividad que alcanza el valor máximo en la gama de pH de neutro a alcalino. Los análisis de la secuencia de aminoácidos de las proteasas alcalinas indican que existe homología con el subgrupo de las subtilasas de serina proteasas del tipo subtilisina. Como está resumido por Siezen, et al. (1991. Protein Eng. 4:719-737) más de 50 subtilasas han sido identificadas a partir de una amplia variedad de organismos, los cuales varían desde varias especies de bacterias, incluyendo especies gram positivas y gram negativas, hasta los hongos y levaduras y hasta eucariotas más grandes, incluyendo gusanos, insectos, plantas y mamíferos. La secuencia de aminoácidos ha sido determinada en más de 40 de éstas subtilasas, y revela que la región madura de la enzima varia de 268 a 1775 aminoácidos de largo y una región pre-pro de 27 a 280 aminoácidos en la proximidad del N-terminal. En los hongos y la levadura, la variación es aparentemente más pequeña, con unas gamas correspondientes de 279 a 281 y de 105 a 121 en los hongos, y de 297 a 677 y de 126 a 280 en la levadura. Un fragmento de ADNc de la zona de codificación entera de la proteasa alcalina de Aspergillus oryzae fue clonado y expresado en Saccharomyces cerevisiae (Tatsumi, H, et al. 1989. Mol. Gen. Genet. 219:33-38). La estructura primaria mostró que compartía del 29% al 44% de homología con otras subtilisinas secuenciadas, y que tres residuos en el centro activo, Asp32, His 64 y Ser221 en la subtilisina BPN', fueron conservados.
En una forma de realización preferida, la proteasa alcalina es una proteasa alcalina de Aspergillus oryzae (alp), preferiblemente codificada por una secuencia de ADNc que comprende la secuencia de nucleótidos presentada como la SEC. ID. N°. 3, o una secuencia homóloga a ésta.
Homología secuencial
Según se utiliza en este caso, la homología secuencial del ADN está determinada como el grado de identidad entre las dos secuencias indicando una derivación de la primera secuencia de la segunda. La homología puede ser determinada de manera adecuada mediante programas informáticos señalados en la técnica, tales como GAP, proporcionado en el paquete del programa GCG (Program Manual for the Wisconsin Package, versión 8, agosto 1994, Genetics Computer Group, 575 Science Drive, Madison WI, USA; Needleman, S.B. y Wunsch, C.D., 1970. J. Mol. Biol. 48:443-453). Usando los siguientes ajustes de GAP para la comparación de la secuencia de ADN, un penalidad de creación de 5.0 y una penalidad de extensión de 0.3, la zona de codificación de la secuencia de ADN análoga muestra algo de identidad preferiblemente de al menos el 70%, más preferiblemente de al menos el 80%, más preferiblemente de al menos el 90%, más preferiblemente de al menos el 95%, y más preferiblemente de al menos el 97% con la región de codificación de una secuencia de ADN indicada.
La homología de la secuencia de aminoácidos como se utiliza en este caso es determinada de forma similar como el grado de identidad entre dos secuencias indicando una derivación de la primera secuencia de la segunda. La homología puede ser determinada de manera adecuada mediante los programas informáticos señalados en la técnica, tales como GAP al que se ha hecho referencia arriba (Needleman, S.B. y Wunsch, C.D., 1970, supra). Usando GAP con los ajustes siguientes para comparar la secuencia de aminoácidos, una penalidad de creación de 3.0 y una penalidad de extensión de 0.1, el polipéptido codificado por una secuencia de ADN análoga muestra algo de identidad preferiblemente al menos del 70%, más preferiblemente al menos del 80%, más preferiblemente al menos del 90%, más preferiblemente al menos del 95%, especialmente al menos del 97% con una secuencia de ADN que comprende la región que codifica la proteína estructural.
La presente invención está también dirigida a variantes de metaloproteasas y proteasas alcalinas que tienen una secuencia de aminoácidos que difiere de no más de tres aminoácidos, preferiblemente de no más de dos aminoácidos, y más preferiblemente de no más de un aminoácido del polipéptido maduro de la secuencia de aminoácidos derivada de la SEC. ID. N°. 1, SEC. ID. N°. 2 y SEC. ID. N°. 3.
La hibridación según se utiliza en este caso se destina a indicar que una secuencia de ADN análoga se enlaza a una sonda de oligonucleótidos correspondiente a un polipéptido codificado por una secuencia de ADN indicada que comprende la región que codifica la proteína estructural bajo ciertas condiciones específicas que están descritas con más detalle más abajo.
Unas condiciones adecuadas para determinar la hibridación entre una sonda de nucleótidos y una secuencia homóloga de ADN o ARN implica prehumedecer el filtro que contiene los fragmentos de ADN o ARN que deben de ser hibridados en 5x SSC (tampón citrato salino estándar; ver, Sambrook et al., 1989. Molecular Cloninq, Cold Spring Harbor NY, USA) durante 10 min, y prehibridar el filtro en una solución de 5x SSC, 5 x solución de Denhardt, 0.5% de SDS y 100 \mug/ml de ADN de esperma de salmón desnaturalizado y sometido a ultrasonidos (Sambrook et al. 1989, supra), y a continuación hibridar en la misma solución que contiene una sonda cebada aleatoriamente (Feinberg, A. P., and Vogelstein, B. 1983. Anal. Biochem. 132:6-13), marcada con ^{32}P-DCTP (actividad específica > 1 x 10^{9} cpm/\mug) durante 12 horas a aprox. 45°C. El filtro es luego lavado dos veces durante 30 minutos en 2x SSC, 0.5% de SDS a una temperatura de al menos 55°C (baja estringencia), más preferiblemente al menos 60°C (estringencia media), más preferiblemente al menos 65°C (estringencia media/alta), más preferiblemente al menos 70°C (alta estringencia), incluso más preferiblemente al menos 75°C (estringencia muy alta). Las moléculas a las que la sonda de oligonucleótidos se hibrida bajo estas condiciones están detectadas por exposición a una película de rayos x.
Modificaciones genéticas de la célula huésped
La célula de Aspergillus oryzae de la invención, para expresar niveles significativamente reducidos de actividad metaloproteasa y proteasa alcalina, es genéticamente modificada, lo cual puede ser conseguido usando la tecnología del ADN recombinante estándar conocida por un experto en la técnica. Las secuencias de genes respectivamente responsables de producir actividad metaloproteasa y proteasa alcalina pueden ser inactivadas o parcialmente o totalmente eliminadas. Así, una célula de Aspergillus oryzae de la invención expresa niveles reducidos o no detectables de metaloproteasa y proteasa alcalina o expresa metaloproteasa y proteasa alcalina funcionalmente inactivas.
En una forma de realización particular, dicha inactivación se obtiene mediante la modificación de las respectivas regiones estructurales o reguladoras codificadas dentro de los genes de la metaloproteasa y de la proteasa alcalina de interés. Técnicas conocidas y útiles incluyen, pero no se limitan a, mutagénesis específica o aleatoria, mutagénesis generada por PCR, supresión de ADN sitio específica, inserción y/o sustitución, interrupción génica o sustitución de genes, técnicas sin sentido, o una combinación de éstas.
La mutagénesis puede ser realizada usando un agente mutagenizante físico o químico adecuado. Ejemplos de un agente mutagenizante físico o químico adecuado para este objetivo incluyen, pero no se limitan a, irradiación ultravioleta (UV), hidroxilamina, N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (MNNG), O-metil hidroxilamina, ácido nitroso, etil metano sulfonato (EMS), bisulfito sódico, ácido fórmico, y análogos de nucleótidos. Cuando se usan estos agentes, la mutagénesis es normalmente realizada incubando la célula que debe ser mutagenizada ante el agente mutagenizante de elección bajo las condiciones adecuadas, y seleccionando células que muestran una producción significativamente reducida de NpI y alp.
La modificación puede también ser realizada por la introducción, sustitución o eliminación de uno o más nucleótidos en la secuencia estructural o un elemento regulador requerido para la transcripción o traducción de la secuencia estructural. Por ejemplo, se pueden insertar o eliminar nucleótidos de tal manera que se produzca la introducción de un codón de detención, la eliminación del codón de iniciación o un cambio del marco de lectura abierto de la secuencia estructural. La modificación o inactivación de la secuencia estructural o un elemento regulador derivado puede realizarse por mutagénesis sitio dirigida o mutagénesis generada por PCR conforme a los métodos conocidos en la técnica. Aunque, en principio, la modificación puede ser realizada in vivo, es decir directamente en la célula que expresa los genes de la metaloproteasa y de la proteasa alcalina, actualmente se prefiere que la modificación sea realizada in vitro según se ejemplifica más abajo.
Un modo conveniente de inactivar o reducir la producción de metaloproteasa y de proteasa alcalina en una célula huésped de elección se basa en las técnicas de interrupción génica. En este método una secuencia de ADN correspondiente al gen endógeno o fragmento de gen de interés es mutagenizada in vitro. Dicha secuencia de ADN codifica de este modo un gen defectuoso que es luego transformado en la célula huésped. Mediante recombinación del homólogo, el gen defectuoso reemplaza al gen endógeno o al fragmento de gen. Puede ser deseable que el gen defectuoso o fragmento de gen también codifique un marcador que puede ser usado para seleccionar transformantes donde los genes respectivos que codifican la metaloproteasa y/o proteasa alcalina han sido modificados o destruidos.
Los métodos para eliminar o interrumpir un gen objetivo están específicamente descritos por Miller, et al (1985. Mol. Cell. Biol. 5:1714-1721); WO 90/00192; May, G. (1992. Applied Molecular Genetics of Filamentous Funqi. J.R. Kinghorn and G. Turner, eds., Blackie Academic and Professional, pp. 1-25); y Turner, G. (1994. Vectors for Genetic Manipulation. S.D. Martinelli and J.R. Kinghorn, eds., Elsevier, pp.641-665).
De forma alternativa, la modificación o inactivación de la secuencia de ADN puede ser realizada por técnicas antisentido establecidas usando una secuencia de nucleótidos complementaria a una secuencia de codificación para metaloproteasa, p. ej. las secuencias de nucleótidos presentadas como SEC. ID. N°. 1 y SEC. ID. N°. 2, o una secuencia de codificación de proteasa alcalina, p. ej. la secuencia de nucleótidos mostrada en la SEC. ID. N°. 4. La tecnología antisentido y su aplicación están descritas con detalle en la patente estadounidense N°. 5.190.931 (Universidad de Nueva York).
En consecuencia, debido a la modificación genética, la célula de Aspergillus oryzae de la invención expresa niveles significativamente reducidos de actividad metaloproteasa y proteasa alcalina. En una forma de realización preferida, el nivel de estas actividades proteoliticas expresado por la célula de Aspergillus oryzae es reducido individualmente más de aproximadamente el 50%, preferiblemente más de aproximadamente el 85%, más preferiblemente más de aproximadamente el 90%, y más preferiblemente más de aproximadamente el 95%. En otra forma de realización preferida, las actividades proteolíticas en la célula de Aspergillus oryzae de la invención pueden ser reducidas en cualquier combinación. En una forma de realización más preferida, el producto expresado por la célula de Aspergillus oryzae está esencialmente libre de actividad proteolítica debido a la metaloproteasa y a la proteasa
alcalina.
Métodos de producción de proteínas
Mediante el método de la invención, las actividades proteolíticas de la metaloproteasa y de la proteasa alcalina son significativamente reducidas, mejorando así la estabilidad y aumentando el rendimiento de los productos proteínicos susceptibles sintetizados por la célula de Aspergillus oryzae de la invención. Más específicamente, mediante el método de la invención, la célula de Aspergillus oryzae es genéticamente modificada dentro de las regiones estructurales y/o reguladoras codificadas dentro de los genes de la metaloproteasa y de la proteasa alcalina.
En consecuencia, otro aspecto de la invención proporciona un método para producir proteínas en una célula de Aspergillus oryzae de la invención, incluyendo polipéptidos heterólogos, donde dicho método comprende introducir en dicha célula una secuencia de ácidos nucleicos que codifica el producto proteínico de interés, cultivando la célula en un medio de crecimiento adecuado, seguido de la recuperación del producto proteínico.
Así, la célula de Aspergillus oryzae de la invención contendrá las regiones genéticas estructurales y reguladoras necesarias para la expresión del producto deseado. La naturaleza de tales regiones estructurales y reguladoras depende en gran medida del producto y de la célula de Aspergillus oryzae en cuestión. El diseño genético de la célula de Aspergillus oryzae de la invención puede ser realizado por el experto en la técnica usando la tecnología del ADN recombinante estándar para la transformación o transfección de una célula huésped (véase, p. ej., Sambrook et al., inter alia).
Preferiblemente, la célula de Aspergillus oryzae es modificada mediante los métodos conocidos en la técnica para la introducción de un vehículo de clonación apropiado, es decir un plásmido o un vector, que comprende un fragmento de ADN que codifica el producto proteínico deseado. El vehículo de clonación puede ser introducido en la célula huésped bien como un plásmido que se replica de manera autónoma o integrado en el cromosoma. Preferiblemente, el vehículo de clonación comprende una o más regiones estructurales operativamente enlazadas a una o más regiones reguladoras apropiadas.
Las regiones estructurales son regiones de las secuencias de nucleótidos que codifican el producto proteínico deseado. Las regiones reguladoras incluyen regiones del promotor que comprenden secuencias de transcripción y de control de la traducción, regiones del terminador que comprenden señales de detención, y regiones de poliadenilación. El promotor, es decir una secuencia de nucleótidos que muestra una actividad transcripcional en la célula huésped de elección, puede ser un derivado de un gen que codifica una proteína extracelular o una intracelular, preferiblemente una enzima, tal como una amilasa, una glucoamilasa, una proteasa, una lipasa, una celulasa, una xilanasa, una oxidorreductasa, una pectinasa, una cutinasa, o una enzima glicolítica. Ejemplos de promotores adecuados para la transcripción en una célula huésped fúngica son los promotores derivados del gen que codifica la TAKA amilasa de Aspergillus oryzae, \alpha-amilasa neutra de Aspergillus Niger, \alpha-amilasa ácida estable de Aspergillus Niger, glucoamilasa (GluA) de Aspergillus Niger o de Aspergillus awamsii, acetamidasa de Aspergillus nidulans, proteasa alcalina de Aspergillus oryzae, triosa fosfatasa isomerasa de Aspergillus oryzae, proteinasa aspártica de Rhizopus meihei, y lipasa de Rhizopus meihei. Los promotores preferidos son la TAKA-amilasa de Aspergillus oryzae y GluA de Aspergillus awamsii.
El vehículo de clonación puede también incluir un marcador seleccionable, tal como un producto genético que complemente una carencia en la célula huésped de Aspergillus oryzae, o uno que confiera resistencia a los antibióticos. Ejemplos de antibióticos útiles como marcadores para la selección de Aspergillus incluyen higromicina, fleomicina y Basta. Otros ejemplos de marcadores para la selección de Aspergillus incluyen amdS, que codifica una enzima implicada en la utilización de acetamida; pyrG, que codifica una enzima implicada en la biosíntesis de uridina; argB, que codifica una enzima implicada en la biosíntesis de arginina; niaD, que codifica una enzima implicada en la vía de asimilación de nitrato; y sC, que codifica una enzima implicada en la vía de asimilación de sulfato. Para el uso en una célula huésped de Aspergillus se prefieren los marcadores amdS y pyrG de Aspergillus nidulans o de Aspergillus oryzae. Además, la selección puede ser realizada por cotransformación, donde la transformación se realiza con una mezcla de dos vectores y la selección es realizada sólo para un vector.
Los procedimientos usados para ligar el constructo de ADN de la invención, el promotor, terminador y otros elementos, respectivamente, y para insertarlos en vehículos de clonación adecuados conteniendo la información necesaria para la replicación, son conocidos por los expertos en la técnica (véase p. ej., Sambrook et al., 1989; inter alia).
El caldo de cultivo o medio usado puede ser cualquier medio convencional adecuado para el cultivo de la célula huésped de la invención, y puede ser formulado según los principios de la técnica precedente. El medio preferiblemente contiene fuentes de nitrógeno y carbono al igual que otras sales inorgánicas. Los medios adecuados, p. ej. medios mínimos o complejos, están disponibles por proveedores comerciales, o pueden ser preparados según recetas publicadas, como en The Catalogue of Strains, published by The American Type Culture Collection. Rockville MD, USA. 1970.
El pH apropiado para la fermentación a menudo dependerá de factores tales como la naturaleza de la célula huésped que va a ser usada, la composición del medio de crecimiento, la estabilidad del polipéptido de interés, y similares. En consecuencia, aunque la célula de Aspergillus oryzae de la invención puede ser cultivada usando cualquier proceso de fermentación realizado a cualquier pH, es ventajoso que el pH del proceso de fermentación sea tal que las actividades de la proteasa acídica y/o netura de la célula de Aspergillus oryzae sean esencialmente eliminadas o al menos significativamente reducidas. Por lo tanto, la eliminación de la actividad de proteasa aspártica como se describe en WO 90/00192 puede también ser realizada aumentando la fermentación del pH, y no presenta ningún efecto ventajoso adicional en el rendimiento de una proteína deseada de células huésped cultivadas en la gama de pH alcalino.
Si el pH del proceso de fermentación está dentro de la gama de 5 a 11, como por ejemplo de 6 a 10.5, 7 a 10, u 8 a 9.5, la actividad de las proteasas acídicas, tales como las serina proteasas y aspárticas, y de las proteasas neutras en las gamas de pH superiores a 7, será reducida o bloqueada. Ejemplos de enzimas producidas bajo condiciones de fermentación alcalina incluyen endoglucanasas, fitasas y protein-disulfuro isomerasas.
No obstante, la gama de pH alcalino soportará la actividad proteasa alcalina en una célula huésped inmodificada, que, a su vez, puede de forma potencial suponer la degradación del producto polipeptídico de interés. Consecuentemente, en tales casos la inactivación del gen que codifica la proteasa alcalina es especialmente ventajosa.
La inactivación del gen de proteasa alcalina de la invención es también especialmente ventajosa para ciertas células huésped, puesto que los niveles de actividades proteasa acídica, neutra y alcalina varían de unas especies a otras. Por ejemplo, el nivel de actividad proteasa alcalina en Aspergillus oryzae es superior al de la de Aspergillus Niger.
Después del cultivo, la proteína deseada es recuperada por los métodos convencionales de aislamiento y purificación de proteínas de un caldo de cultivo. Los procedimientos de purificación bien establecidos incluyen separar las células del medio por centrifugado o filtración, precipitar los componentes proteínicos del medio mediante una sal tal como sulfato de amonio, y métodos cromatográficos tales como cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de filtración en gel, cromatografía de afinidad, y similares.
Productos
El producto final deseado, es decir la proteína heteróloga expresada por la célula huésped de la invención, puede ser cualquier proteína o péptido eubacterial o eucariótico.
Tal y como se define en la presente, una "proteína heteróloga" es un producto genético proteínico o polipeptídico que no es nativo de la célula huésped, o es una proteína nativa donde se han hecho modificaciones para alterar la secuencia nativa, o es una proteína nativa cuya expresión es alterada de forma cuantitativa como resultado de una manipulación de una secuencia reguladora nativa requerida para la expresión de la proteína nativa, tal como un promotor, un centro de unión al ribosoma, etc., u otra manipulación de la célula huésped por técnicas de ADN recombinante.
En una forma de realización más específica, el producto es un péptido o proteína terapéuticamente activo, tal como una hormona, en particular insulina, hormona del crecimiento, glucagón, o somatostatina; una interleuquina, en particular interferón; un factor de crecimiento hematopoyético, en particular PDGF (factor de crecimiento derivado de las plaquetas), EPO (eritropoyetina), o TPO (trombopoyetina); una proteasa, en particular el factor VII, factor VIII, uroquinasa, quimosina, o activador del t-plasminógeno; o albúmina de suero.
En otra forma de realización preferida, el producto es una enzima de origen fúngico o bacteriano.
La enzima es preferiblemente una enzima glicosidasa, p. ej. una amilasa, en particular una \alpha-amilasa (EC 3.2.1.1) o una \beta-amilasa (EC 3.2.1.2); una glucan 1,4-\alpha-glucosidasa (EC 3.2.1.3), una celulasa, en particular una endo-1,4-\beta-glucanasa (EC 3.2.1.4) o una endo-1,3(4)-\beta-glucanasa (EC 3.2.1.6); una xilanasa, en particular una endo-1,4-\beta-xilanasa (EC 3.2.1.8) o una xilan-endo-1,3-\beta-xilosidasa (EC 3.2.1.32); una poligalacturonasa (EC 3.2.1.15); una glucosidasa, en particular una \alpha-glucosidasa (EC 3.2.1.20) o una \beta-glucosidasa (EC 3.2.1.21); una galactosidasa, en particular una \alpha-galactosidasa (EC 3.2.1.22) o una \beta-galactosidasa (EC 3.2.1.23); una endoglucanasa, en particular una endo-1,3-\beta-glucanasa (EC 3.2.1.39), una endo-1,3-\alpha-glucanasa (EC 3.2.1.59), una endo-1,2-\beta-glucanasa (EC 3.2.1.71), o una endo-1,6-\beta-glucanasa (EC 3.2.1.75); y una celulosa-1,4-\beta-celobiosidasa (EC 3.2.1.91).
En otra forma de realización preferida la enzima es una enzima lipolítica, en particular una lipasa, una esterasa, una fosfolipasa, o una liso-fosfolipasa.
En otra forma de realización preferida la enzima es una fitasa, en particular una 3-fitasa (EC 3.1.3.8) o una 6-fitasa (EC 3.1.3.26).
En otra forma de realización preferida la enzima es una enzima proteolítica.
En otra forma de realización preferida la enzima es una lacasa, una pectinasa, o una cutinasa, o una oxidorreductasa, tal como una peroxidasa.
En otra forma de realización preferida el producto es un polipéptido híbrido, preferiblemente proquimosina y proteasas del tipo pro-tripsina.
Debido a la ausencia de actividades metaloproteasa y proteasa alcalina, la proteína heteróloga expresada por la célula huésped puede también ser una proteína precursora tal como un zimógeno, una proteína híbrida, una proteína obtenida como una secuencia pro o secuencia pre-pro, o cualquier otra forma inmadura.
Ejemplos
La invención está posteriormente ilustrada con referencia a los ejemplos siguientes que no deberían de ninguna manera ser construidos limitando el objetivo de la invención tal y como se define en las reivindicaciones anexas.
Materiales y métodos Cepas
IFO 4177 de Aspergillus oryzae:
disponible por el Institute for Fermention, Osaka; 17-25 Juso Hammachi 2-Chome Yodogawaku, Osaka, Japan.
DSM 2672 de Fusarium oxysporum:
depositada según el Tratado de Budapest en el Reconocimiento Internacional del Depósito de Microorganismos para fines de procedimientos en materia de patentes en Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen Gmbh (DSM), Mascheroder Weg 1b, DE-3300 Braunschweig, Alemania, el 6 Junio 1983.
HowB101:
la construcción de esta cepa está descrita en el ejemplo 1.
JaL125:
la construcción de esta cepa está descrita en el ejemplo 1.
JaL151:
la construcción de esta cepa está descrita en el ejemplo 1.
JaL228:
la construcción de esta cepa está descrita en el ejemplo 1.
Genes
alp:
Este gen codifica para la proteasa alcalina mostrada en la SEC. ID. N°. 3.
NpI:
Este gen codifica para la metaloproteasa I neutra mostrada en la SEC. ID. N°. 2.
pyrG:
Este gen codifica para orotidina-5'-fosfato-descarboxilasa, una enzima implicada en la biosíntesis de la uridina.
p45:
Este gen codifica para la metaloproteasa I neutra mostrada en la SEC. ID. N°. 1.
Plásmidos
pSO2:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
p5O5:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pSRe403:
La preparación está descrita en el ejemplo 1.
PSRe403_SacII:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pJaL173:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pJaL212:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pJaI335:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pJaL389:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pJaL399:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pToC65:
la construcción está descrita en EP 531 372 b.
pToC68:
la construcción está descrita en WO 91/17243.
pToC90:
un subclón de p3SR2 (Corrick et al., 1987. GENE 53:63- 71), conteniendo el gen amdS de Aspergillus nidulans como un fragmento XbaI de 2.7 kb , en un vector pUC19 (Yannisch-Perron et al., 1985.GENE 33:103-119), este plásmido fue preparado como se describe en WO 91/17243.
pDM115:
la preparación está descrita en el ejemplo 1.
pMT1303:
la preparación está descrita en el ejemplo 2.
pMT1305:
La preparación está descrita en el ejemplo 2.
pMT1329:
La preparación está descrita en el ejemplo 2.
pMT1330:
la preparación está descrita en el ejemplo 2.
pMT1332:
La preparación está descrita en el ejemplo 2.
pMT1335:
la preparación está descrita en el ejemplo 2.
Ensayos de enzimas proteolíticas
La actividad metaloproteasa se mide como la actividad tripsina liberada después de una pre-incubación de 30-60 min a 25°C en 0.1 M de Tris, 2 mM de CaCl_{2}, pH 7 (en la gama de pH inferior se usa un tampón de 100 mM de borato, 10 mM de DMG, 2 mM de CaCl_{2}). La actividad tríptica se mide en placas de microvaloración; 100 ml de muestras son mezcladas con 100 ml de sustrato L-BAPNA (una dilución hecha 50 veces en un tampón de la concentración stock de 87 mg/ml de DMSO, Sigma Aldrich Corp., St. Louis MO, USA) y la absorción a 405 nm es medida usando un lector de microplacas Thermomax de Molecular Devices Corp. (Sunnyvale CA, USA).
La actividad proteasa alcalina se evalúa a 25°C usando el sustrato sintético, N-succinil-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilida (Sigma Aldrich Corp.) a 1 mM en 20 mM de Tris-HCl (pH 8.0) en un volumen de reacción total de 1 ml. La liberación de p-nitroanilina se visualiza a 410 nm (Ramesh, MV, et al. 1994. Infection and Immunity 62:79-85).
Ejemplo 1 Supresión genómica del gen de la proteasa alcalina (alp) de Aspergillus oryzae y del gen de la metaloproteasa I neutra (NpI) de Aspergillus oryzae
Los genes alp y NpI fueron eliminados cada uno de ellos por el método de sustitución de genes de una única fase (Miller, B.L., et al., 1985. Mol. and Cell. Biol. 5:1714-1721, y May, G. in Applied Molecular Genetics of Filamentous Fungi, pp. 1-25. J. R. Kinghorn and G. Turner, eds.; Blackie Academic and Professional, 1992.) en dos ciclos consecutivos en una cepa de pyrG de A. oryzae, usando el gen pyrG de A. oryzae como marcador de la selección.
Clonación del gen pyrG de Aspergillus oryzae
El gen pyrG de A. oryzae fue clonado por hibridación cruzada con el gen pyrG de A. Niger (van Hartingsveldt, W., et al., 1987. Mol. Gen. Genet. 206: 71-75). Una genoteca de fago lambda de ADN de IFO 4177 de A. oryzae parcialmente digerido con Sau3A fue evaluada a baja estringencia con un fragmento de ADN de 1 kb del gen pyrG de A. Niger. El ADN de un clon positivo fue subclonado en un vector pUC118. El plásmido resultante, pSO2, demostró que contenía el gen pyrG por complementación a un mutante pyrG de A. Niger.
Construcción del plásmido de pyrG, pJaL335
Un fragmento de 431 bp localizado 479 nucleótidos hacia arriba del extremo 5' de la secuencia de codificación de pyrG de A. oryzae fue amplificada por PCR, usando los dos cebadores de oligonucleótidos siguientes:
Cebador A: 5'-GGAGGAAGATCTCTCTGGTACTCTTCGATCTC -3', SEC. ID. N°. 4; y
Cebador B: 5'-GGAGGAGAATTCAAGCTTCTTCTACATCACAGTTTGAAAGC -3'; SEC. ID. N°. 5.
Las regiones subrayadas indican secuencias presentes en la región 5' del gen pyrG de A. oryzae. Un centro de restricción fue insertado en el extremo 5' de cada cebador para facilitar la clonación; el cebador A contiene un sitio BglII y el cebador B contiene un sitio EcoRI adyacente a un sitio de restricción HindIII.
El plásmido pSO2 fue usado como molde en la reacción PCR. La reacción fue realizada en un volumen de 100 \mul que contenía 2.5 unidades de Taq polimerasa, 100 ng de pSO2, 250 nm de cada dNTP, y 10 pmol de cada uno de los dos cebadores anteriormente descritos en un tampón de reacción de 50 mM de KCl, 10 mM de Tris-HCl pH 8.0, 1.5 mM de MgCl_{2}.
La amplificación se efectuó en un Perkin-Elmer Cetus DNA Termal 480, y consistió en un ciclo de 3 minutos a 94°C, seguido de 25 ciclos de 1 minuto a 94°C, 30 segundos a 55°C, y 1 minuto a 72°C. La reacción PCR produjo un único fragmento de ADN de 430 bp de longitud. Este fragmento fue digerido con BglII y EcoRI y aislado por electroforesis en gel, purificado, clonado en el sitio correspondiente en el plásmido pSO2, dando como resultado un plásmido que fue llamado pJaL335. Por lo tanto, pJaL335 contiene el gen pyrG flanqueado por una repetición de 431 bp. La Fig. 1 resume las fases de la construcción de pJaL335.
Construcción de un plásmido de supresión de pyrG, pSO5
Un plásmido de supresión de pyrG, pSO5, fue construido a partir del plásmido pSO2 por digestión con NheI para eliminar el gen que codifica la secuencia de aproximadamente 1.1 kb, luego se volvió a ligar, con aproximadamente 1 kb cada una de las secuencias flanqueantes de pyrG 5' y 3'. La construcción está ilustrada en la Fig. 2.
Construcción de una cepa de pyrG de Aspergillus oryzae, HowB101
IFO 4177 de A. oryzae fue transformada con el fragmento HindIII de 2.2 kb de pSO5 conteniendo la secuencia flanqueante 5' y 3' del gen pyrG de A. oryzae. Los transformantes fueron seleccionados por su resistencia al ácido 5- fluoro-orótico, un fenotipo usado para seleccionar para mutantes de pyrG. Se demostró mediante el análisis Southern que un transformante, HowB101, contenía la supresión esperada en el locus de pyrG. Puesto que HowB101 es uridina dependiente, éste puede ser transformado con el gen pyrG de tipo salvaje y transformantes seleccionados por la capacidad para crecer en ausencia de uridina.
Construcción de un plásmido de supresión de alp, pJaL212
Una genoteca de ADN de IFO 4177 de A. oryzae fue obtenida por digestión parcial con Sau3A. Los fragmentos fueron ligados en pUC19 digerido con BamHI. La genoteca fue seleccionada usando sondas de oligonucleótidos degeneradas complementarias a fragmentos de secuencias proteínicas conocidas de proteasa alcalina de A. oryzae. Un plásmido conteniendo un fragmento Sau3A de 3.9 kb fue obtenido por esta selección y denominado pSRe403.
pSRe403 fue digerido con SacII, luego se volvió a ligar, para producir un plásmido en el que un fragmento del gen alp de aproximadamente 1 kb de longitud fue eliminado. El plásmido resultante fue denominado PSRe403\DeltaSacII.
pSRe403\DeltaSacII fue parcialmente digerido con HindIII, se rellenaron las extremidades usando la polimerasa Klenow, luego se volvió a ligar para eliminar el sitio HindIII en la secuencia de pUC19, dando como resultado un plásmido que fue denominado pJaL173.
Un fragmento de 3.8 kb conteniendo el gen pyrG resultante de la digestión con HindIII de pSO2 fue insertado en el sitio HindIII en pJaL173 para producir un plásmido conteniendo el fragmento HindIII del gen pyrG flanqueado por las secuencias 5' y 3' del gen alp en las posiciones hacia arriba y hacia abajo, respectivamente. La Fig. 3 resume la construcción del plásmido, que fue denominado pJaL212.
Construcción de una cepa de alp de Aspergillus oryzae, JaL125
HowB101 fue transformado con el fragmento SacI/SphI de 6.8 kb de pJaL212 usando los procedimientos estándar. Este fragmento consiste en 1.5 kb del promotor de alp, el gen pyrG y 1.5 kb del terminal 3' del gen alp. Los transformantes fueron seleccionados por su capacidad para crecer en ausencia de uridina.
Los transformantes fueron analizados por transferencia de Southern donde un fragmento PstI/SacII de 599 bp de pJaL 173 conteniendo parte del gen alp sirvió como una sonda marcada radioactivamente. Las cepas portadoras de una supresión del gen alp fueron reconocidas por un desplazamiento de la banda PstI de tipo salvaje de 1.0 kb a una banda 1.9 kb. Cuatro transformantes de este tipo fueron identificados, uno de ellos fue denominado JaL125.
Clonación del gen NpI de Aspergillus oryzae
Una genoteca de cósmidos de A. oryzae fue construida usando el kit SuperCos1 Cosmid Vector siguiente sin modificar las instrucciones proporcionadas por el proveedor (Stratagene, Inc., La Jolla, CA, USA).
ADN genómico de IFO 4177 de A. oryzae fue obtenido a partir de protoplastos aislados por procedimientos estándar (ver p. ej. Christensen, T., et. al., 1988. Biotechnology 6:1419-1422). Después del aislamiento, los protoplastos fueron granulados por centrifugado a 2500 rpm durante 5 minutos en un Labofuge T (Neto). El granulado fue luego suspendido en un tampón de 10mM de NaCl, 20 mM de Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM de EDTA, y tratado con 100 \mug/ml de proteinasa K y 0.5% de SDS. Ésta y todas las fases posteriores en la preparación de ADN fueron realizadas según el procedimiento recomendado del kit SuperCos1 Cosmid Vector.
El tamaño del ADN genómico fue analizado por electroforesis usando el aparato CHEF-gel de BioRad (Hercules, CA, USA). En resumen, un 1% de gel de agarosa fue puesto durante 20 horas a 200 voltios con un impulso de 10-50 segundos. El gel fue coloreado con bromuro de etidio y fotografiado bajo exposición UV, revelando un ADN que variaba desde 50 hasta más de 100 kb de longitud. El ADN fue luego parcialmente digerido con Sau3A. El tamaño de los fragmentos de ADN resultantes variaban de 20 a 50 kb como se ha determinado anteriormente por el análisis CHEF-gel.
El vector SuperCos1 gradiente en bandas de CsCl fue preparado, ligado y envasado según los procedimientos provistos con el kit. Después de una valoración de la genoteca todas las mezclas del empaquetamiento de una única ligadura y el empaquetamiento fueron transfectadas en las células huésped XL1-Blue MR provistas con el kit del vector y dispuestas en placas de LB conteniendo 50 \mug/ml de ampicilina. Aproximadamente 3800 colonias fueron obtenidas. El análisis de la preparación de los cósmidos de 10 colonias indicó que todas tenían insertos del tamaño esperado. Las colonias fueron seleccionadas individualmente e inoculadas en placas de microvaloración de 96 pocillos conteniendo 100 \mul de LB y 100 \mug/ml de ampicilina por pocillo, luego se incubaron a 37°C durante toda la noche. Cien microlitros de glicerol al 50% fueron añadidos a cada pocillo, y toda la genoteca fue congelada a -80°C. Un total de 3822 colonias fueron almacenadas, representando una amplificación aproximada de 4,4 veces el genoma de A. oryzae.
Preparación de una sonda de p45 de metaloproteasa de Fusarium oxysporum
El gen p45 de metaloproteasa de Fusarium oxysporum fue clonado como está descrito en la solicitud de patente WO 95/30757 (Novo Nordisk Biotech, Inc.), publicada el 16 de Noviembre 1995.
Un clon de la genoteca de ADNc anterior fue seleccionado y designado pDM115. Se obtuvo una sonda a partir de pDM115 que contenía un fragmento de 1.76 kb del ADNc de Fusarium oxysporum que codifica una parte del gen p45. Este plásmido fue digerido con SalI, y los fragmentos fueron separados en un 1% de gel de agarosa. La banda de interés fue un fragmento de 1.5 kb a partir del cual se eluyó el ADN. Este fragmento fue marcado con ^{32}P-DATP por cebado aleatorio y usado como sonda para el análisis de Southern y para visualizar una genoteca de cósmidos de A. oryzae.
Selección de la genoteca de A. oryzae
Para visualizar la genoteca de cósmidos de A. oryzae con la sonda de p45 de Fusarium oxysporum, las colonias congeladas individualmente en la genoteca fueron inoculadas en placas de LB conteniendo 100 \mug/ml de ampicilina usando un dispositivo multihebra en una configuración de 6 filas de 8 hebras, diseñadas para ajustarse en la mitad de una placa de microvaloración de 96 pocillos. Las placas, que contienen colonias de todos los clones en la genoteca, fueron incubadas a 37°C durante toda la noche. Unos filtros esterilizados Whatman 540 cortados para ajustar los platos petri fueron colocados sobre las colonias que fueron luego incubadas durante dos horas más a 37°C. Los filtros fueron transferidos a placas de LB conteniendo 200 \mug/ml de cloranfenicol, y las placas fueron incubadas durante toda la noche a 37°C. AI día siguiente los filtros fueron lavados dos veces en 0.5M de NaOH durante 5 minutos, luego dos veces en 0.5M de Tris-HCl (pH 7.4) durante 5 minutos y finalmente dos veces en 2x SSC durante 5 minutos. Los filtros fueron humedecidos con etanol y se dejaron secar al aire.
Los filtros fueron hibridados con el fragmento de ADN de 1.5 kb marcado con ^{32}P de pDM115. La hibridación se efectuó durante 16 horas a 65°C en un tampón de hibridación estándar de 10x solución de Denhart, 5x SSC, 0.02 M de EDTA, 1% de SDS, 0.15 mg/ml de ARN polyA y 0.05 mg/ml de ARNt de levadura. Después de la hibridación los filtros fueron lavados en 2x SSC, 0.1% de SDS a 65°C dos veces y expuestos a películas de rayos X. Tres colonias mostraron hibridación a la sonda, 3E8, 3C1 y 2A5.
Caracterización de los clones de cósmidos
El análisis de restricción reveló que dos de los tres clones de cósmidos, 3E8 y 3C1, contenían insertos derivados de la misma región del genoma de A. oryzae. Tres microgramos de cósmidos de ADN fueron digeridos con EcoRI y fraccionados por electroforesis en gel de agarosa. El ADN fue transferido a filtros de membrana Immobilan-N (Millipore) e hibridado con la sonda radiomarcada de pDM115. Los resultados revelaron que la sonda hibridó a un fragmento EcoRI de 4 kb en ambos clones de cósmidos. El fragmento EcoRI de 4.0 kb fue sometido a un análisis adicional.
Construcción del plásmido de supresión de NpI, pJaL399
El plásmido pToC65, descrito en EP 531 372, fue digerido con SacI, y tratado con fosfatasa alcalina bacteriana según las instrucciones del fabricante (Boehringer Mannheim) para eliminar los grupos fosfato en 5', luego se extrajo el fenol y se precipitó. El fragmento SacI de 5.5 kb del clon cósmido 3E8 conteniendo el gen NpI de A. oryzae fue aislado por electroforesis en gel y purificado. Los dos fragmentos fueron mezclados entre sí y ligados. Después de la transformación en E. coli, las colonias que llevaban el plásmido correcto fueron identificadas por digestión de la enzima de restricción de las preparaciones de miniplásmidos; el plásmido recuperado fue llamado pJaL389. La presencia de la región de codificación del gen NpI de A. oryzae fue confirmado por el análisis de la secuencia de ADN de algunas partes de este subclón.
El plásmido pJaL389 fue digerido con BalI para eliminar un fragmento interno de 1.1 kb del gen NpI. El fragmento restante de 7.1 kb fue tratado con la polimerasa Klenow para crear extremos romos, luego se aisló por electroforesis en gel y se purificó. Este fragmento de ADN fue tratado a continuación con fosfatasa alcalina bacteriana, se extrajo el fenol y se precipitó. El plásmido pJaL335 fue digerido con HindIII para obtener un fragmento de 3.5 kb comprendiendo el gen pyrG de A. oryzae, luego se trató de forma similar con la polimerasa Klenow, se aisló por electroforesis en gel, y se purificó. Los dos fragmentos fueron mezclados entre sí y ligados. Después de la transformación en E. coli, las colonias que llevaban el plásmido correcto fueron identificadas por digestión de la enzima de restricción de preparaciones de miniplásmidos. La construcción de este plásmido, llamado pJaL399, está resumida en la
Fig. 4.
De esta manera, el plásmido pJaL399 contiene un fragmento del vector de pToC65 conteniendo el gen NpI donde el fragmento interno BalI de 1.1 kb ha sido sustituido con un fragmento de ADN de 3.5 kb que codifica el gen pyrG de A. oryzae.
\newpage
Aislamiento de una cepa de pyrG de A. oryzae, JaL151
La cepa de alp de A. oryzae, JaL125, fue seleccionada por su resistencia al ácido 5-flouro-orótico para identificar mutantes de pyrG espontáneos. Una cepa, denominada JaL151, fue identificada como alp y pyrG. Como ocurre con HowB101, JaL151 es uridina dependiente, en consecuencia éste puede ser transformado con el gen pyrG de tipo salvaje y transformantes seleccionados por su capacidad para crecer en ausencia de uridina.
Construcción de una cepa de NpI de Aspergillus oryzae, JaL228
JaL151 fue transformado con el fragmento SacI de 7.9 kb de pJaL399 usando procedimientos estándar. Los transformantes fueron luego seleccionados por su capacidad para crecer en ausencia de uridina. Después del reaislamiento, se preparó ADN cromosómico a partir de 12 transformantes. El ADN de cada uno de los transformantes fue digerido con BalI y analizado por transferencia de Southern, usando el fragmento SacI de ADN marcado con ^{32}P de 5.5 kb de pJaL389 conteniendo el gen NpI según el modo descrito anteriormente como sonda. La cepas de interés fueron identificadas por la ausencia del fragmento de hibridación BalI de 1.1 kb, indicando una interrupción del gen NpI, así como mostrando una movilidad alterada de las secuencias 5' y 3' flanqueantes. La cepa resultante de uno de estos transformantes fue denominada JaL228.
Ejemplo 2 Clonación de lipasa B de C. antarctica
Se preparó una genoteca de Candida antarctica parcialmente digerida con Sau3A en pBR322 y los filtros de la réplica fueron seleccionados con dos sondas de oligonucleótidos designadas de la secuencia de aminoácidos N-terminal de clb, NOR929 (SEC. ID. N°. 4) y NOR930 (SEC. ID. N°. 5) (Fig. 5). Se identificaron ocho colonias. Los análisis de los plásmidos indicaron insertos superpuestos. Uno de los plásmidos, pMT1303, conteniendo un inserto de 7.8 bp, fue también analizado. Eliminando del fragmento Sal1 un plásmido, pMT1305, conteniendo un inserto de 2.1 kb fue construido (Fig. 6). Usando NOR929 como molde, se secuenció pMT1305 para confirmar que clb (lipasa B de C. antarctica) era codificado. El gen entero fue secuenciado en ambas cadenas haciendo una serie de supresiones en pMT1305 usando el sistema de Promega Erase-a-Base© (Promega Corp., Madison WI, USA. La secuencia de codificación está provista en la SEC. ID. N°. 6.
Construcción de un plásmido parcial de CLB, pMT1329
Un fragmento SalI-HindIII de 788 bp que codifica la secuencia N-terminal para CLB fue aislado de pMT1305. De este fragmento dos fragmentos más pequeños fueron aislados, un HindIII-BanI de 170 bp y un BanI de 204 bp completado con Sau3A. Estos dos fragmentos fueron clonados en el plásmido pIC19R, el cual había sido digerido con EcoRV y HindIII. Esto creó un sitio BclI en el EcoRV y el sitio de 9 bp completado con Sau3A adyacente al codón ATG para clb, dando como resultado el plásmido denominado pMT1329 (Fig. 7).
Construcción de un plásmido parcial de CLB, pMT1332
La secuencia de genes que codifica la región C-terminal de CLB fue aislada como un fragmento HindIII-Xmn1 de 670 bp de pMT1305 y se insertó en el plásmido pIC7, el cual había sido digerido con HindIII-NruI, dando como resultado pMT1330. El gen completo fue ensamblado del fragmento HindIII-NarI de 3.0 kb de pMT1329 y el fragmento HindIII-ClaI de 0.7 kb de pMT1330, dando como resultado pMT1332 (Fig. 8).
Construcción de un plásmido de expresión de CLB, pMT1335
El gen clb fue expresado en Aspergillus usando el vector de expresión de pToC68. El fragmento BclI-BglII de 1 kb de pMT1332 fue insertado en pToC68, el cual había sido digerido con BamHI, para dar pMT1335 (Fig. 9). Así, la construcción del plásmido pMT1335 resultó en un plásmido de expresión fúngico para el gen de lipasa B de C. antarctica.
Expresión de la lipasa B de C. antartica en cepas de Aspergillus oryzae
Las cepas IFO 4177 y JaL228 de A. oryzae fueron transformadas con pMT1335 por cotransformación con pToC90 (se precisa definir pToC90).
Los transformantes fueron seleccionados por su crecimiento en un medio mínimo conteniendo 10 mM de acetamida y seleccionados por la presencia de pMT1335 por la capacidad para producir CLB. Un transformante de cada cepa IFO 4177 de tipo salvaje de A. oryzae y de la cepa JaL228 de alp y NpI, fue seleccionado por su fermentación en tanques realizada durante 93 horas. Las conidiosporas fueron inoculadas en fermentadores Keiler de 2 litros a 30°C conteniendo 1.2 litros de una solución de maltosa al 20% y urea al 8%. Una mezcla de la solución de maltosa al 20% y urea al 8% fue añadida continuamente; se añadió ácido fosfórico según fuera necesario para mantener un pH
de 7.
En la tabla 1 a continuación se resume el rendimiento de la actividad de CLB de JaL228 en comparación con IFO4177, donde una unidad de lipasa (LU) está definida como la cantidad de enzima necesaria para liberar 1 \mumol de ácido butírico por minuto a partir de tributirina a un pH 7.0 y a 30°C. La tabla indica que la cantidad producida en JaL228 es 1,8 veces mayor que la producida en IFO 4177, lo cual demuestra que la supresión de los genes alp y NpI pueden mejorar significativamente la estabilidad de las proteínas sensibles a la actividad de estas proteasas.
TABLA 1
Producción de CLB por IFO 4177 y JaL228 después de la fermentación en tanques durante 93 horas
Horas IFO4177 LU/g JaL228 LU/g
93 575 1041
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Novo Nordisk NS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Novo Alle
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Bagsvaerd
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Dinamarca
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): DK-2880
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
TELÉFONO: +45 4444 8888
\vskip0.500000\baselineskip
(H)
TELEFAX: +45 4449 3256
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Células huésped nuevas y métodos de producción de Proteínas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
FORMA DE LECTURA INFORMÁTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: PC IBM Compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Version #1.30B (EPO)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2052 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Fusarium oxysporum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: DSM 2672
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
AISLADO INDIVIDUAL: p45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: mat_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 785..2049
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: sig_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 55..784
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: intrón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 364..415
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: intrón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 802..854
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: intrón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 1821..1868
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. N°. 1:
\vskip1.000000\baselineskip
1
2
\vskip1.000000\baselineskip
(3) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2968 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: único
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Aspergillus oryzae
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: IFO 4177
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
AISLADO INDIVIDUAL: NpI
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 458..817
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 868..1262
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 1320..1870
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 1930..2344
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 2404..2587
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. N°. 2:
3
4
\vskip1.000000\baselineskip
(4) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3922 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Aspergillus oryzae
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: A01560
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
AISLADO INDIVIDUAL: alp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 2310..2634
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 2684..3129
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 3188..3276
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: exón
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
UBICACIÓN: 3333..3686
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
5
6
7
\vskip1.000000\baselineskip
(5) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. N°. 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCCTCGGGCT CGGACCCCGC CTTCTCGCA GCCCAAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(6) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
descripción de la secuencia: SEC. ID. N°. 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCCTCGTTCG TCAGGCCCGC GTCCAGCACC GACTTGGGCT G
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(7) INFORMACIÓN DE LA SEC. ID. N°. 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1029 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Candida antarctica
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
AISLADO INDIVIDUAL: clb
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. N°. 6:
8

Claims (16)

1. Célula de Aspergillus orzyae en la que se ha introducido una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido heterólogo, donde la célula ha sido modificada mediante la tecnología del ADN recombinante de tal manera que
a) una metaloproteasa endógena codificada por la secuencia de ADN mostrada en la SEC ID NO 2, o una secuencia de ADN que tiene al menos el 70% de identidad con la SEC ID NO: 2, y
b) una actividad proteasa alcalina endógena, codificada por la secuencia de ADN mostrada en la SEC ID NO 3, o una secuencia de ADN que tiene al menos el 70% de identidad con la SEC ID NO: 3,
son funcionalmente inactivas o expresadas a niveles reducidos en comparación con una célula parental.
2. Célula según la reivindicación 1, donde la metaloproteasa es una metaloproteasa neutra de Aspergillus del grupo NpI o NpII.
3. Célula según la reivindicación 2, donde la metaloproteasa es una metaloproteasa I neutra de Aspergillus oryzae que comprende una secuencia de aminoácidos derivada de la secuencia de nucleótidos presentada como SEC ID NO 2, o una secuencia de ADN que tiene al menos el 70% de identidad con ésta.
4. Célula según la reivindicación 1, donde la proteasa alcalina está codificada por una secuencia de ADNc que comprende la secuencia de nucleótidos presentada como SEC ID NO 3, o una secuencia de ADN que tiene al menos el 70% de identidad con ésta.
5. Célula según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que ha sido genéticamente modificada mediante la tecnología del ADN recombinante dentro de la secuencia que codifica la metaloproteasa, o una secuencia reguladora de ésta, y dentro de la secuencia que codifica la proteasa alcalina, o una secuencia reguladora de ésta.
6. Célula según la reivindicación 5, donde la tecnología es mutagénesis específica o aleatoria, mutagénesis generada por PCR, supresión sitio específica de ADN, inserción y/o sustitución, interrupción génica o técnicas de sustitución de genes, técnicas sin sentido, o una combinación de éstas.
7. Célula según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el nivel de metaloproteasa es reducido más de aproximadamente el 50%, preferiblemente más de aproximadamente el 85%, más preferiblemente más de aproximadamente el 90%, y más preferiblemente más de aproximadamente el 95%.
8. Célula según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, donde el nivel de actividad proteasa alcalina se redujo más de aproximadamente el 50%, preferiblemente más de aproximadamente el 85%, más preferiblemente más de aproximadamente el 90%, y más preferiblemente más de aproximadamente el 95%.
9. Célula según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde la reducción de la actividad metaloproteasa y proteasa alcalina es cualquier combinación según la reivindicación 7 u 8.
10. Célula según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, donde la célula está esencialmente libre de cualquier actividad metaloproteasa y proteasa alcalina.
11. Método para producir un producto proteínico heterólogo en la célula de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10, donde el método comprende:
(a) introducir en la célula una secuencia de ácidos nucleicos que codifica el producto proteínico;
(b) cultivar en un medio de crecimiento adecuado la célula de la fase (a);
y
(c) aislar el producto proteínico.
12. El método según la reivindicación 11, donde el producto proteínico es un producto genético terapéuticamente activo, tal como insulina, hormona del crecimiento, glucagón, somatostatina, interferón, EPO, TPO, PDGF, factor VII, factor VIII, uroquinasa, quimosina, activador del t-plasminógeno, o albúmina de suero.
13. Método según la reivindicación 11, donde el producto proteínico es una proteína de origen fúngico.
14. Método según la reivindicación 13, donde el producto proteínico es una enzima fúngica, en particular una enzima amilolítica, tal como una \alpha-amilasa, una \beta-amilasa, una glucoamilasa, una \beta-galactosidasa, una enzima celulítica, una enzima lipolítica, una enzima xilanolítica, una enzima proteolítica, una oxidorreductasa, tal como una peroxidasa o una lacasa, una pectinasa, o una cutinasa.
15. Método según la reivindicación 11, donde el producto proteínico es una proteína de origen bacteriano.
16. Método según cualquiera de las reivindicaciones 11 a 15, donde el producto proteínico es una proteína precursora, es decir un zimógeno, una proteína híbrida, una proteína obtenida como una secuencia pro o secuencia pre-pro, o en forma inmadura.
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DK102496 1996-09-19

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