ES2237954T3 - Coenzima util para la sintesis de l-carnitina. - Google Patents

Coenzima util para la sintesis de l-carnitina.

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    • C12P41/001Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by metabolizing one of the enantiomers

Abstract

Crotonobetainil-coenzima A, caracterizada por las siguientes propiedades: a) Masa molar 893, 6 b) Absorción máxima 208, 0 y 260nm c) Coeficiente de extinción molar{å260} 20, 21 mmol- 1cm-1 d) Valor de Km de la L(-)-carnitina hidratasa 8.10-6 para la crotonobetainil-coenzima A e) Estabilidad de la temperatura varias semanas a ¿20ºC una hora a 0ºC f) Estabilidad del pH buena durante una semana a pH de 2 a 10 estable durante varias semanas a pH 5 g) Solubilidad buena en agua muy pobre en disolventes orgánicos h) Otras características higroscópica

Description

Coenzima útil para la síntesis de L-carnitina.
La invención descrita en este documento se refiere a una coenzima útil para la síntesis de L-carnitina, en particular a un compuesto de coenzima A, y más en particular a la crotonobetainil-coenzima A, a procedimientos para su preparación y a su uso para la producción de L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína y D(-)-carnitina.
Hasta la fecha no tenemos conocimiento de coenzimas aisladas que sean útiles para la síntesis de L-carnitina, y en particular la crotonobetainil-coenzima A no es una sustancia aislada.
El documento WO95/10.613 postula la crotonobetainil-coenzima A y la gamma-butirobetainil-coenzima A como productos intermedios en el metabolismo de la gamma-butirobetaína o la crotonobetaína a L(-)-carnitina en la célula. Se muestra esquemáticamente una síntesis metabólica de crotonobetainil-coenzima A que parte de gamma-butirobetaína por la gamma-butirobetainil-coenzima A o directamente a partir de la crotonobetaína y una síntesis metabólica de gamma-butirobetainil-coenzima A que parte de gamma-butirobetaína. Además en el curso del metabolismo, la gamma-butirobetainil-coenzima A y la crotonobetainil-coenzima A, respectivamente, se degradan por la L(-)-carnitil-coenzima A dando como resultado L(-)-carnitina o por la L(-)-carnitil-coenzima A y deshidrocarnitil-coenzima A dando como resultado betaína. Sin embargo, este documento no enseña cómo obtener crotonobetainil-coenzima A o gamma-butirobetainil-coenzima A ya que está dirigido a la preparación de L(-)-carnitina usando microorganismos que tienen un gen que codifica una enzima que degrada de nuevo tanto la crotonobetainil-coenzima A como la gamma-butirobetainil-coenzima A, no siendo posible, por consiguiente, obtener crotonobetainil-coenzima A y gamma-butirobetainil-coenzima A como sustancia siguiendo la enseñanza de este documento.
Si se comprueban las capacidades de estos compuestos para usarse en el procedimiento de producción de la L(-)-carnitina, deberían tomarse en consideración la técnica conocida y el conocimiento relacionado con el procedimiento de producción de la L(-)-carnitina. Se conocen numerosos procedimientos químicos y bioquímicos o biotecnológicos para obtener la L(-)-carnitina. La mayoría de los procedimientos de síntesis química producen D,L-carnitina como resultado, por reacción de la mezcla racémica con ácidos de separación activos ópticamente, por ejemplo con isómeros ópticos del ácido tartárico, ácido canfórico o ácido canforsulfónico, y es posible obtener por cristalización fraccionada posterior el enantiómero L-carnitina (por ejemplo, las patentes concedidas DD23.217; DD93.347; y la solicitud publicada en el documento DE2.997.672). Hasta la fecha todos los procedimientos de síntesis presentan el inconveniente de que la D(+)-carnitina resulta como un producto de desecho y debería eliminarse y que sólo se obtiene un máximo del 50% de producto sintetizado como L(-)-carnitina. El uso terapéutico de la D, L-carnitina no es sustituible, en el sentido de que la D(+)-carnitina no es sustituible, ya que la D(+)-carnitina no sólo es inefectiva con respecto a la oxidación de ácidos grasos, sino que también es más competitiva como una sustancia que inhibe los diversos sistemas de transporte y enzimas específicas de la L(-)-carnitina (Life Sciences 28 [191] 2.931-2.938). Por esta razón, se han desarrollado procedimientos en los últimos años para la síntesis estereoespecífica de etapas aquirales iniciales (por ejemplo, Tetrahedron, [1992], Vol. 48, 319-324).
Las alternativas a la síntesis química de la L(-)-carnitina son los procedimientos microbiológicos o enzimáticos. En este sentido se demuestra que es posible aprovechar la reacción inversa de la L(-)-carnitina deshidrogenasa (documento EC1.1.1.108) para producir L(-)-carnitina a partir de la 3-dihidrocarnitina (patente de EE.UU. 4.221.869). La preparación de equivalentes de reducción, siendo una enzima NADH dependiente, debería estar garantizada. La 3-dihidrocarnitina, además, es muy inestable. Diversas cepas de Enterobacteriaceae son capaces de transformar la L(-)-carnitina en gamma-butirobetaína por la crotonobetaína en condiciones anaerobias (patentes concedidas DD221.905, JP6.167.494, JP61.234.794, JP61.234.788). La metabolización de la L(-)-carnitina a crotonobetaína es reversible y está catalizada por una enzima estereoespecífica, L(-)-carnitina deshidratasa (patentes concedidas DD281.735, DD281.919). De esta forma, la crotonobetaína puede usarse como el complemento final aquiral de la síntesis de la L(-)-carnitina. Una serie de cepas de Proteus pueden formar también L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína en condiciones aerobias (patente de EE.UU. 5.300.430). Para la síntesis enzimática de la L(-)-carnitina a partir del producto de desecho D(+)-carnitina, se ha descrito una racemasa (patente concedida DD300.181). Una tercera posibilidad consiste en obtener L(-)-carnitina a partir de gamma-butirobetaína por la gamma-butirobetaín hidroxilasa (documento EC/1.14.11.1) (solicitud publicada DE3.123.975). En las patentes EP158.194, EP195.944 y JP61.199.793 se describen los procedimientos basados en la producción de L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína o gamma-butirobetaína cultivando microorganismos seleccionados en una fuente suplementaria de C, por ejemplo glicinobetaína, en presencia de crotonobetaína o gamma-butirobetaína.
La L(-)-carnitina deshidratasa (documento EC4.2.1.89) cataliza la transformación reversible de crotonobetaína a L(-)-carnitina sólo en presencia de un factor F de bajo peso molecular aislado de Escherichia coli y todavía no identificado (patente concedida DD281.735). A partir de la inmovilización de una L(-)-carnitina deshidratasa aislada de la familia Enterobacteriaceae se ha desarrollado un procedimiento para la síntesis de L(-)-carnitina sin la formación de productos secundarios (documento DD281.910). El anteriormente citado factor F de bajo peso molecular es igualmente indispensable para la racemización de D(+)- a L(-)-carnitina. La reducción de crotonobetaína a gamma-butirobetaína también se produce sólo en presencia de este factor.
La L(-)-carnitina (3-hidroxi-4-trimetilaminobutirato) es un compuesto ubicuo que se produce naturalmente. Es de importancia fundamental como vehículo de grupos acilo para el transporte de ácidos grasos de cadena larga a través de la membrana interna mitocondrial. Como resultado de su papel central en el metabolismo de organismos superiores, se usa la L(-)-carnitina en la terapia y profilaxis de pacientes con diversas enfermedades de corazón así como en el tratamiento de pacientes en diálisis (véase: Pathology 17, [1985], 116-169). El suplemento con L(-)-carnitina es indispensable en la nutrición parenteral de neonatos en el periodo postnatal y también en adultos durante periodos más largos (Gürtler and Löster, Carnitin [1996], 21-30). La L(-)-carnitina es un suplemento dietético de cada vez mayor importancia.
Los procedimientos microbiológicos usados para la síntesis de L(-)-carnitina presentan el inconveniente de que los microorganismos, debido a su número muy limitado, pueden separarse mal de su medio de cultivo y pueden hacerse nuevos medios de nutrientes adecuados continuamente para el cultivo. El resultado es que debe hacerse un esfuerzo considerable para regenerar la L(-)-carnitina evaporada que contiene el líquido de cultivo. En la síntesis de L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína en sistemas microbiológicos hay la posibilidad de transformar crotonobetaína a gamma-butirobetaína por la crotonobetaína reductasa como una reacción que compite con la reacción de síntesis.
De no menos importancia es el problema de usar microorganismos para la producción de sustancias para uso farmacéutico. A veces, los microorganismos usados proceden de cepas patógenas, o están muy manipuladas por ingeniería genética y contienen genes extraños, que es un aspecto al que las Autoridades Reguladoras dedican mucha atención.
El procedimiento para la síntesis enzimática de L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína presenta el inconveniente de que una solución obtenida a partir de E. Coli y que carece de proteínas, por inmovilizado de la L(-)-carnitina deshidratasa, debe contener no sólo crotonobetaína, sino también un factor F no identificado, que es esencial para la activación de la enzima. No pueden excluirse las influencias que perturban el factor F producidas por componentes de la solución de proteína libre. La síntesis enzimática de la L(-)-carnitina puede optimizarse sólo hasta un punto límite, en particular en vista de que la cantidad de factor F usada no puede cuantificarse exactamente. El mismo factor F es de importancia fundamental para la racemización de D(+)- a L(-)-carnitina descrito en E. Coli. El factor F no puede reemplazarse por coenzimas conocidas o cofactores de enzimas (Jung y col., Biochim. Biophys. Acta 1.003 [1989] 270-276).
La causa de los inconvenientes mencionados consiste en nuestro escaso conocimiento de la estructura del factor F y su papel en la activación de la apoenzima de la L(-)-carnitina deshidratasa. No se conocen otros compuestos que puedieran estimular la activación de la apoenzima de la L(-)-carnitina deshidratasa de la misma manera.
El propósito de la invención descrita en este documento es hacer la síntesis estereoespecífica de la L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína en un medio acelular posible enzimáticamente así como la racemización del producto de desecho D(+)-carnitina a L(-)-carnitina. Estas reacciones catalizadas enzimáticamente representan una alternativa a la síntesis química pura de la L(-)-carnitina o al uso de los procedimientos microbiológicos para obtener la L(-)-carnitina.
El propósito de la invención según el presente documento es cómo realizar la síntesis enzimática de la L(-)-carnitina a partir de la crotonobetaína con la croronobetainil-coenzima A y la L(-)-carnitina deshidratasa sin la formación de productos secundarios. Es también posible realizar la transformación del producto de desecho inefectivo fisiológicamente D(+)-carnitina a L(-)-carnitina usando el sistema de la racemización de la carnitina junto con la crotonobetainil-coenzima A.
El objeto de la invención es un compuesto de coenzima A, denominado en lo sucesivo crotonobetainil-coenzima A, que es capaz de activar la L(-)-carnitina deshidratasa como un cofactor, de manera que tenga lugar una transformación reversible de la crotonobetaína a L(-)-carnitina. El cofactor es también estrictamente necesario para la racemización de D(+)- a L(-)-carnitina así como para la transformación de la crotonobetaína a gamma-butirobetaína. El objeto de la invención descrita en este documento es un procedimiento para la síntesis y el uso de crotonobetainil-coenzima A así como la coenzima en sí.
El uso de la L(-)-carnitina deshidratasa en combinación con crotonobetainil-coenzima A, ofrece una nueva posibilidad de síntesis de la L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína. De la inmovilización simultánea de la L(-)-carnitina deshidratasa y la crotonobetainil-coenzima A, se desarrolla una alternativa a los procedimientos industriales conocidos determinados para la producción de L(-)-carnitina. De modo similar, el sistema de racemización se usa junto con la crotonobetainil-coenzima A, como un procedimiento para la síntesis de L(-)-carnitina a partir de D(+)-carnitina.
Según la invención descrita en este documento, es posible sintetizar L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína por medio de la L(-)-carnitina deshidratasa (documento EC4.2.1.89). Para la activación de la apoenzima de la L(-)-carnitina deshidratasa son necesarias sólo cantidades catalíticas de crotonobetainil-coenzima A.
La condición para la síntesis de crotonobetainil-coenzima A es que se active la crotonobetaína.
El clorhidrato de crotonobetaína seco se usa preferentemente como el producto final. El clorhidrato de crotonobetaína reacciona con tricloruro de fósforo a 15-70ºC (preferentemente a 25ºC) en una atmósfera de oxígeno. El cloruro de crotonobetainilo formado se separa de los demás productos y sustancias finales por burbujeo con nitrógeno.
Además, el cloruro de crotonobetainilo así obtenido es adecuado para la síntesis de crotonobetainil-coenzima A. La coenzima A es primero suspendida en una mezcla helada de bicarbonato sódico 1M a pH 7,5-9,5 (preferentemente pH 8,5). A esto se le añade una cantidad definida de cloruro de crotonobetainilo (preferentemente superior) manteniendo los valores de pH bajo control. La reacción se completa tras 15-30 minutos. La formación de la crotonobetainil-coenzima A se controla por HPLC (Cromatografía líquida de alta resolución) (columna Spherisorb C_{18}) y finalmente es sometida a una etapa de purificación más (cromatografía de intercambio iónico en DOWEX 50). La pureza se comprueba de nuevo por HPLC (columna Spherisorb C_{18}). Las propiedades fisicoquímicas se determinaron en el producto lavado (véase la tabla siguiente).
1
Para la prueba de la activación de la L(-)-carnitina deshidratasa según la invención se suministra crotonobetainil-coenzima A purificada (preferentemente 1-10 nmol) en un tampón de fosfato potásico (10mM pH7,5), que se añade con L(-)-carnitina deshidratasa concentrada en parte (sin que el factor F muestre ninguna actividad) y la solución de crotonobetaína (1M) para metabolizarse e incubarse a 37ºC.
La L(-)-carnitina formada se probó posteriormente con una prueba óptica con la ayuda de carnitina acetiltransferasa (según BERGMEYER (1970)). Se adoptó un procedimiento similar en la prueba de la reacción de racemización, en la que una solución de D(+)-carnitina (1M) se añadió en el lugar de la crotonobetaína. La L(-)-carnitina formada se puede determinar exactamente por la prueba anterior del sistema con soluciones conocidas de L(-)-carnitina.
Para probar la activación del sistema enzimático según la invención descrita en este documento, que transforma crotonobetaína a gamma-butirobetaína, se suministró crotonobetainil-coenzima A purificada (preferentemente 1-10nmol) en un tampón de fosfato potásico templado (preferentemente 37ºC) y se burbujeó con nitrógeno (50mM, a pH7,8), y se añadió el sistema de reducción enzimática de crotonobetaína (sin que el factor F muestre ninguna actividad) así como ditionito (preferentemente 50 mM) y bencil-viologen (preferentemente 1mM). Tras la adición de la solución de crotonobetaína (3,75M) a metabolizar la gamma-butirobetaína formada se pudo probar usando la prueba óptica basada en el bencil-viologen oxidado.
Ejemplo 1
Formación de L(-)-carnitina a partir de crotonobetaína por medio de L(-)-carnitina deshidratasa concentrada y crotonobetainil-coenzima A (CB-CoA) tras 10 minutos de incubación a 37ºC en un tampón de fosfato potásico (10mM, pH 7,5).
2
Ejemplo 2
Formación de L(-)-carnitina a partir de D(+)-carnitina por el sistema de racemización de carnitina y crotonobetainil-coenzima A (CB-CoA) tras 10 minutos de incubación a 37ºC en un tampón de fosfato potásico (10mM, pH 7,5).
3

Claims (6)

1. Crotonobetainil-coenzima A, caracterizada por las siguientes propiedades:
a) Masa molar 893,6 b) Absorción máxima 208,0 y 260nm c) Coeficiente de extinción molar{\varepsilon_{260}} 20, 21 mmol^{-1}cm^{-1} d) \begin{minipage}[t]{65mm} Valor de K_{m}de la L(-)-carnitina hidratasa para la crotonobetainil-coenzima A \end{minipage} 8.10^{-6} e) Estabilidad de la temperatura varias semanas a -20ºC una hora a 0ºC f) Estabilidad del pH \begin{minipage}[t]{70mm} buena durante una semana a pH de 2 a 10 estable durante varias semanas a pH 5 \end{minipage} g) Solubilidad buena en agua muy pobre en disolventes orgánicos h) Otras características higroscópica
2. Procedimiento para la preparación de crotonobetainil-coenzima A según la reivindicación 1 a partir de clorhidrato de crotonobetaína y coenzima A, caracterizado porque el clorhidrato de crotonobetaína se hace reaccionar con tricloruro de fósforo para dar cloruro de crotonobetainilo, que se transforma posteriormente con coenzima A.
3. Uso de crotonobetainil-coenzima A según la reivindicación 1 para la activación de L(-)-carnitina deshidratasa, caracterizado porque los dos compuestos están en contacto uno con el otro.
4. Uso de crotonobetainil-coenzima A según la reivindicación 1 para la preparación de L(-)-carnitina, caracterizado porque la crotonobetainil-coenzima A y la L(-)-carnitina deshidratasa están en contacto una con la otra, y después se añade crotonobetaína.
5. Uso de crotonobetainil-coenzima A según la reivindicación 1 para la preparación de L(-)-carnitina, caracterizado porque la crotonobetainil-coenzima A y el sistema de racemización de la carnitina se ponen en contacto uno con el otro, y entonces se añade D(+)-carnitina.
6. Uso de crotonobetainil-coenzima A según la reivindicación 1 para la preparación de gamma-butirobetaína, caracterizado porque la crotonobetainil-coenzima A y el sistema de reducción de la crotonobetaína enzimático se ponen en contacto un con el otro, y se añade crotonobetaína.
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