ES2216926T3 - Deteccion de microorganismos. - Google Patents

Deteccion de microorganismos.

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ES2216926T3 ES00949809T ES00949809T ES2216926T3 ES 2216926 T3 ES2216926 T3 ES 2216926T3 ES 00949809 T ES00949809 T ES 00949809T ES 00949809 T ES00949809 T ES 00949809T ES 2216926 T3 ES2216926 T3 ES 2216926T3
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Abstract

Un procedimiento para recuperar microorganismos de una mezcla de muestra, que comprende las etapas de: i) hacer pasar dicha mezcla de muestra a través de la entrada de muestra de un dispositivo de filtro que comprende una pluralidad de membranas de filtro de fibra hueca que se han tratado previamente con un detergente, teniendo dichas membranas un primer y un segundo extremo, y una superficie externa y una superficie interna que definen una luz, estando el primer extremo de cada una de dichas membranas abierto y en comunicación con dicha entrada de muestra y estando el flujo desde el segundo restringido de tal modo que dicha mezcla de muestra se filtra a través de dichas membranas, dejando un retenido en dicha luz de dichas membranas; ii) resuspender dicho retenido en dichas membranas; y iii) detectar la presencia de cualquier microorganismo en dicho retenido.

Description

Detección de microorganismos.
La presente invención se refiere a procedimientos mejorados para detectar microorganismos, en particular levaduras y bacterias en mezclas (por ejemplo cerveza).
La producción de alimentos y bebidas tales como cerveza va acompañada por el ensayo de la presencia de ciertos microorganismos con el fin de garantizar la calidad del producto final. El proceso de fermentación puede, por ejemplo, requerir el ensayo en línea cada pocas horas de una muestra que tiene un volumen de al menos 25 ml, y preferiblemente, de volúmenes de muestra de por ejemplo 250 ml. El material en forma de partículas que puede incluir microorganismos, a saber, levaduras y bacterias, se debe separar de la muestra y ensayarse seguidamente para determinar la presencia o ausencia de microorganismos específicos. Los dispositivos usados para conseguir esto incluyen la unidad de filtro de vacío desechable Bibby que está dotada de un filtro plano con un diámetro medio de poro de 0,45 \mum y los soportes de filtro Nalgene con receptores, que están dotados de un filtro plano con un diámetro medio de poro de 0,45 \mum o 0,2 \mum (véase, por ejemplo, el Catálogo de suministro para laboratorios de 1998 de Merck, página 482). Dichos dispositivos permiten la filtración de volúmenes de muestra máximos de solo 100 ml, tienen un área de la superficie plana de 50 cm^{2} y pueden necesitar hasta 30 minutos para ensayar una muestra debido a su complejidad de uso. Una vez que se ha filtrado el máximo volumen, éstos se bloquean por el material en forma de partículas tales como proteínas presentes en el fluido de muestra (por ejemplo, cerveza tipo Lager) y cualquier filtración posterior requeriría presiones tan elevadas que causarían la lisis celular, evitando la detección de los microorganismos y dando lugar a resultados falseados.
Como se demuestra por los resultados de los experimentos detallados más adelante, los dispositivos de la técnica anterior necesitan sustancialmente más tiempo para separar y detectar microorganismos de una muestra que el necesario usando los dispositivos y procedimientos de la presente invención. Además, la posterior recuperación de, y por tanto ensayo de, microorganismos es relativamente simple y fácil con la presente invención puesto que los microorganismos están presentes en forma de una "torta" fácilmente extraíble (un bloque de material en partículas de baja densidad relativamente poco comprimido) sobre la superficie de las membranas, con una incursión mínima en los intersticios de la membrana. En comparación, otros dispositivos presentan material en forma de partículas en forma de una "galleta" dura (un bloque de material en forma de partículas de alta densidad relativamente muy comprimido) sobre una superficie de la membrana, microorganismos y otro material en forma de partículas que bloquea y está retenido en los intersticios de la membrana. Esta galleta es difícil de extraer y difícil de procesar para permitir su ensayo para determinar la presencia de microorganismos. Además, evitando la formación de una galleta densa, los dispositivos de la presente invención pueden operar a una menor presión. Si se opera a presiones mayores, puede producirse la lisis de bacterias, dando lugar a su vez a resultados incorrectos. Una presión elevada puede causar también distorsión de bacterias, permitiéndolas pasar a través de la membrana y dando lugar a resultados incorrectos.
Conforme a la presente invención, se proporciona un procedimiento para recuperar microorganismos de una mezcla de muestra, que comprende las etapas de:
i)
hacer pasar dicha mezcla de muestra a través de la entrada de muestra de un dispositivo de filtro que comprende una pluralidad de membranas de filtro de fibra hueca que se han tratado previamente con un detergente, teniendo dichas membranas un primer y un segundo extremo, y una superficie externa y una superficie interna que definen una luz, estando el primer extremo de cada una de dichas membranas abierto y en comunicación con dicha entrada de muestra y estando el flujo desde el segundo restringido de tal modo que dicha mezcla de muestra se filtra a través de dichas membranas, dejando un retenido en dicha luz de dichas membranas;
ii)
resuspender dicho retenido en dichas membranas; y
iii)
detectar la presencia de cualquier microorganismo en dicho retenido.
La etapa (ii) de resuspensión puede comprender hacer pasar una solución de un agente de lisado a través de la luz de dichas membranas. Esto se puede realizar por ejemplo, fijando una jeringa a un extremo del dispositivo y haciendo pasar un tampón de lisis a través de la luz de las membranas, o se pueden colocar las membranas en una solución de lisis y, usando una jeringa fijada al dispositivo, puede extraerse la solución de lisis a las luces de las membranas.
Estando el flujo desde dicho segundo extremo de dichas membranas restringido de tal modo que dicha mezcla de muestra sale de dicho dispositivo de filtro exclusivamente por filtración a través de dichas membranas.
Los dispositivos y procedimientos de la técnica anterior incluyen los de los documentos GB 2135902, EP 302949, WO 94/00222, WO 84/00015, US 5863501, US 5814179, US 4501793, JP 4-135478 (WPI Abstract 1992-205001), JP 63-104615 (WPI Abstract 1988-165566), JP 63-088007 (WPI Abstract 1988-145060) y JP 61-133105 (WPI Abstract 1986-200908). Sin embargo, ninguno de estos describe o sugiere los procedimientos de la presente invención que incluyen cada una de las etapas necesarias para obtener los resultados que éstos son capaces de proporcionar. En particular, la técnica anterior no sugiere producir un retenido en forma de una "torta" resuspendible en lugar de una "galleta" más sólida, ni sugiere resuspender el retenido de una primera etapa de filtración como parte de una posterior etapa de procesado. Por ejemplo, el documento JP 63-104615 describe un dispositivo para separar, por ejemplo, virus de fluidos, que comprende una pluralidad de fibras de celulosa huecas porosas, estando un extremo de estas inmerso en un material de relleno y abierto a la atmósfera, y estando el otro extremo sellado. No obstante, no se sugiere que las membranas se tratarán previamente con un detergente, ni se sugiere que se usarán membranas de polipropileno, ni se sugiere la forma en que microorganismos, en particular bacterias y levaduras, pueden detectarse fácilmente en el retenido o que el retenido se resuspenderá.
Otra técnica anterior relevante incluye el documento JP 07227297.
La etapa de detección de microorganismos puede comprender cualquier procedimiento de detección que detecte los microorganismos deseados. Por ejemplo, un ensayo sencillo para un microorganismo es el ensayo de ATP descrito más adelante, en el que se lisa cualquier microorganismo y se detecta el ATP liberado usando un ensayo de luciferasa. Como alternativa, se pueden usar anticuerpos específicos para microorganismos, o se puede cultivar el retenido en un medio de cultivo nutriente general y detectarse el crecimiento de cualquier colonia de microorganismo.
Mediante el tratamiento previo de las membranas con un detergente (por ejemplo, insuflando un detergente a través de las mismas y opcionalmente dejando que éstas se sequen después) se ha encontrado que el caudal de la mezcla a través de las membranas se incrementa en gran medida. Esto se cumple particularmente cuando se comparan membranas tratadas con detergente secadas con membranas no tratadas secas. Este mayor caudal asegura que los microorganismos son recogidos sin provocar su lisis o sin forzarlos a través de las membranas.
Detergentes útiles incluyen detergentes no iónicos, en particular Tween 20, más particularmente, una solución de Tween 20 al 20%.
El uso de una pluralidad de membranas de filtro de fibra hueca proporciona también un área de la superficie relativamente grande (de forma típica de al menos tres veces) a través de la cual puede tener lugar la filtración, cuando se compara con el área de la superficie proporcionada por un dispositivo sencillo de dimensiones generes similares (es decir, tamaño) que tiene una membrana plana. Esto también permite el filtrado de un volumen relativamente grande de muestra antes de que se produzca bloqueo alguno de los poros. Esto es particularmente útil con muestra turbias (por ejemplo, cerveza tipo Stout) que contienen grandes cantidades de materia en forma de partículas que pueden bloquear rápidamente las membranas de filtro plano.
La naturaleza exacta del material de la membrana de filtro también se ha encontrado que es importante - se ha descubierto que membranas de fibra hueca de polipropileno disponibles de forma comercial que tienen un diámetro medio de poros de 0,2 \mum pretratadas con detergente permiten caudales mucho mayores que, por ejemplo, membranas de polisulfona que tienen un diámetro medio de poros de 0,2 \mum, incluso cuando también se han pretratado con detergente. Así, en una realización preferida de la presente invención, la membrana de fibra hueca puede ser una membrana de polipropileno. Naturalmente, también se pueden usar otras membranas, en particular, las que tienen similares características físicas, por ejemplo, un área similar de poros por área unitaria de la superficie de membra-
na.
Las membranas de fibra hueca usadas en la presente invención pueden tener un diámetro medio de poros de 0,2 \mum.
También se proporciona conforme a la presente invención un dispositivo de filtro para separar microorganismos de una mezcla de muestra, que comprende una pluralidad de membranas de filtro de fibra hueca que se han pretratado con un detergente, teniendo cada membrana una superficie externa y una superficie interna que definen una luz, estando uno de los extremos de cada membrana abierto y en comunicación con una entrada de muestra del dispositivo de filtro y estando el otro extremo cerrado.
La facilidad para ensayar microorganismos usando los procedimientos y dispositivos se ve suplementada por la velocidad de filtración como se puede apreciar a partir de los resultados experimentales más adelante, la presente invención posibilita la recuperación de material en forma de partículas de un volumen dado de fluido de muestra en una fracción del tiempo requerido por otros dispositivos y que es frecuentemente al menos diez veces más rápido.
La presente invención también proporciona la importante ventaja de proporcionar resultados consistentes para una muestra dada, incluso cuando se está filtrando una mezcla muy turbia - puede conseguirse fácilmente al menos una consistencia del 99% entre diferentes grupos de resultados. Esto se puede comparar favorablemente con los resultados obtenidos usando membranas planas que pueden ser relativamente inconsistentes.
La invención será más evidente a partir de la siguiente descripción, con referencia a las diversas figuras de los dibujos adjuntos que muestran, únicamente a modo de ejemplo, una forma del dispositivo de filtro.
En las Figuras:
La Figura 1 muestra un primer dispositivo conforme a la presente invención y su uso en un procedimiento de detección de microorganismos;
La Figura 2 muestra una curva patrón de ATP. El eje Y es URL (unidades relativas de luz) y el eje X son los moles de ATP. Las formas de rombos sólidos indican enzima 1:625, los cuadrados sólidos indican enzima 1:9 y los triángulos sólidos indican enzima 1:1;
La Figura 3 muestra curvas de concentración retenida para P damnosus. El eje Y son las URL totales y el eje X es el número de células. Los rombos sólidos son para 137099-1 y los cuadrados sólidos son para 037099-1;
La Figura 4 muestra curvas de concentración retenida para S. carlsbergensis. El eje Y son las URL totales y el eje X es el número de células. Los cuadrados sólidos son para 266099-1, y los triángulos sólidos son para 097099-1;
La Figura 5 muestras curvas de concentración retenida para A. pasteurianus. Los rombos sólidos son para 147099-1 y los círculos sólidos son para 027099-1;
La Figura 6 muestra un segundo dispositivo conforme a la presente invención y su uso en un procedimiento de detección de microorganismos;
La Figura 7 muestra una sección a través de un tapón de extremo y una vista desde arriba de un anillo;
La Figura 8 muestra la detección de S. carlsbergensis en muestras de cerveza filtrada usando el segundo dispositivo. El eje Y son las URL y el eje X es el número de células por ensayo;
La Figura 9 muestra la detección de A. pasteurianus en muestras de cerveza filtrada usando el segundo dispositivo. El eje Y son las URL y el eje X es el número de células por ensayo;
La Figura 10 muestra la detección de P. damnosus en muestras de cerveza filtrada usando el segundo dispositivo. El eje Y son las URL y el eje X es el número de células por ensayo;
La Figura 11 muestra
Como se puede apreciar de la Figura 1, un primer dispositivo 10 de filtro comprende una entrada 20 de muestra dotada de una conexión 21 de ajuste Luer que comunica con membranas 30 de fibra hueca de polipropileno 68 que tienen un diámetro medio de poro de 0,2 \mum. Los extremos abiertos de las membranas 30 están inmersos en un adhesivo 40 curable por radiación UV que las mantiene en posición y permite que se comuniquen con la entrada 20 de muestra. Los otros extremos de las membranas 30 están inmersos en el adhesivo 41 curable por radiación UV que cierra los mismos. Las membranas 30 se han pretratado lavando con una solución formada por Tween 20 al 20% a través de las mismas y luego dejándolas secar.
En uso, la jeringa 50 que contiene la mezcla 60 de muestra está conectada a una entrada 20 de muestra y la mezcla 60 de muestra se filtra a través de las membranas 30 proporcionando el filtrado 70 y el retenido 71. Las membranas 30 se disponen seguidamente en una solución 80 de resuspensión y se tira del émbolo 90 de la jeringa 50, provocando un flujo de solución 80 de resuspensión hacia la luz de las membranas 30 para resuspender el retenido 71 que ha quedado en las membranas 30 y extrayéndolo a la jeringa 50.
Una vez se ha resuspendido el retenido 71 y recogido en la jeringa 50 puede ensayarse. Como se detalla en la Tabla 4, se han producido diversos dispositivos de filtro que tienen diferentes longitudes de membrana 30. En una realización específica, las membranas 30 tienen una longitud total de 55 mm, 40 mm de los cuales están abiertos y pueden proporcionar una superficie a través de la cual puede tener lugar la filtración. Las membranas 30 proporcionan un área de superficie total de 51,2 cm^{2} a través de los cuales puede tener lugar filtración.
El segundo dispositivo 100 de filtro comprende una entrada 20 de muestra dotada de una conexión 21 de ajuste Luer que comunica con membranas 30 de fibra hueca de polipropileno 68 que tienen un diámetro medio de poro de 0,2 \mum. En la entrada 20 de muestra, los extremos de las membranas 30 están inmersos en adhesivo curable por radiación UV que las mantiene en su posición y permite que se comuniquen con la entrada 20 de muestra. En la salida 110, los extremos de las membranas 30 están inmersos en un adhesivo curable por radiación UV que las mantiene en su posición y permite que se comuniquen con la salida 110, que está cerrada por el tapón 120. Las membranas 30 se han pretratado lavando con una solución formada por Tween 20 al 5% a través de las mismas y luego dejándolas secar.
En uso, en la Etapa I (Figura 6) se bombea un volumen de cerveza tipo Lager 60 por una bomba peristáltica 130 a un caudal de 100 ml/minuto a través del conducto flexible 140 al dispositivo 100. Cuando el dispositivo 100 se llena con la cerveza tipo Lager 60, el tapón 120 que bloquea la salida 110 hace que la única salida del dispositivo 120 sean los poros de las membranas 30 y por tanto la cerveza tipo Lager 60 se filtra a través de las membranas 30 y el filtrado se recoge en el recipiente 150 de recogida de residuos y se desecha. En la Etapa II, se bombean 400 ml de agua 160 estéril a través del conducto flexible 140 a 187 ml/minuto, se filtra a través de las membranas 30 (el tapón 120 permanece en su posición) y se recoge en el recipiente 150 de residuos y se desecha. Cuando el agua 160 ha terminado de pasar a través del dispositivo 100, la bomba 130 se deja funcionando durante otros 10 segundos con el fin de bombear aire a través del conducto flexible 140 y las membranas 30 para eliminar el exceso de fluido de las membranas 30. La bomba 140 se desconecta seguidamente y se separa el dispositivo 100 del conducto flexible 140 y la bomba 130. En la Etapa III, el tapón (es decir, el tapón de extremo) 120 se retira y, sobre un fragmento limpio de tela (no mostrado), el dispositivo 100 se drena para eliminar el fluido 160 en exceso. Se conecta entonces una jeringa 50 estéril de 1 ml que contiene 0,5 ml de tampón de lisis (NaOH 0,2 M) a la entrada 20 de muestra y un conducto flexible 165 de comunicación fijado a la salida 110. Se lleva a cabo una etapa de humectación/lisis que comprende empuja cuidadosamente el émbolo 55 de la jeringa 50 hasta que es visible líquido (tampón de lisis 160) en el conducto flexible 165 de comunicación y, seguidamente, se vuelve a tirar del émbolo 55 con el fin de extraer tampón de lisis 160 de vuelta a la jeringa 50, rehumectando de este modo las membranas 30 con tampón de lisis 160. La etapa de humectación/lisis se lleva a cabo dos veces más. Todo el líquido 160 se retira entonces del dispositivo 100 manteniendo el dispositivo 100 en un tubo 170 estéril de 1,5 ml y empujando el émbolo 55 tres veces. En la Etapa IV, se retira la comunicación 165 del dispositivo 100 y se coloca el tapón de extremo 120 en el dispositivo 100. Se vuelve a tirar del émbolo 55 para recoger todo el eluato (incluyendo el que está en las membranas). El eluato se transfiere seguidamente al tubo 170. Se añaden entonces al tubo 170 9 gotas de tampón de neutralización (tris fosfato 0,2 M). Se coloca entonces una tapa en el tubo 170 y su contenido se mezcla invirtiendo el tubo 170 de dos a tres veces. Finalmente, en la Etapa V se lleva a cabo un ensayo de ATP en la muestra usando un luminómetro Biotrace Unilite y reaccionantes de Bioluminiscencia Sigma.
Experimentos Ensayos de ATP
Todos los ensayos de ATP se llevaron a cabo siguiendo el procedimiento de desnaturalización/neutralización alcalina.
En una centrífuga estéril Eppendorf se colocan 50 \mul de hidróxido sódico 2M, se añaden 200 \mul de muestra y se mezclan pipeteando 2 a 3 veces. Se añaden 50 \mul de tampón Tris fosfato 2M y se mezcla por inversión (mezcla de muestra).
Se colocan 100 \mul de mezcla de ensayo de ATP (Sigma-Aldrich Ltd.) en la dilución apropiada en una cubeta (cubeta Uni-Lite). Se deja reposar durante 3 minutos y luego se lee la señal salida luminosa de fondo en un luminómetro (Uni-Lite) durante 35 segundos. Después de haber determinado la señal luminosa de fondo se añaden 100 \mul de la mezcla de muestra a la cubeta y se lee durante 35 segundos. La diferencia entre las lecturas de fondo y de muestra se debe a la presencia de ATP en la muestra.
Retención en la membrana
Se hicieron pasar a través de cada dispositivo mediante conexión de una jeringa de 25 ml al ajuste Luer del dispositivo de filtro 25 ml de cerveza tipo Lager que contiene aproximadamente 1 x 10^{7} células de S. carlsbergensis. El dispositivo de filtro se lavó a continuación con 10 ml de agua para eliminar cualquier exceso de cerveza (la cerveza tipo Lager tiene un ligero efecto inhibidor sobre el ensayo de ATP). La región de membrana del dispositivo de filtro se colocó entonces en agua estéril, se realizó un lavado de agua a través del dispositivo y todas las células retenidas se separaron y estaban presentes en el concentrado recogido. Se llevaron a cabo ensayos de ATP como el descrito antes para determinar la presencia de ATP microbiano en el filtrado y el concentrado.
Retención consistente
Se añadió 1 ml de un cultivo de una noche de 10 ml de S. carlsbergensis, A. pasteurianus o P. damnosus a 24 ml de cerveza tipo Lager y la muestra inoculada se hizo pasar a través de un dispositivo de filtro como el descrito antes. Se determinó la recuperación porcentual de microorganismos en el concentrado comparando los niveles de ATP microbiano en las muestras antes y después de la filtración. Se ensayaron un total de cinco dispositivos en una única cepa microbiana y el coeficiente de varianza se determinó entre los niveles recuperados.
El procedimiento más común y rápido para determinar la contaminación microbiana es la medida del ATP celular. Esto requiere la ruptura de la membrana/pared celular (lisis celular) con el fin de liberar el ATP presente en la célula. El ATP liberado se puede determinar usando una reacción enzimática que convierte un sustrato (luciferina) y ATP en una serie de productos que emiten luz. La cantidad de luz puede medirse usando un luminómetro convencional.
Están disponibles de forma comercial una serie de ensayos de ATP basados en el principio anterior. El kit de ensayo por bioluminiscencia de ATP (Sigma-Aldrich, Poole) no contiene ningún tampón que favorezca la lisis celular. se apreciará que las condiciones para la lisis de la membrana celular difieren en función del tipo de célula. El presente estudio se centra en los tipos de células que se han encontrado en cervezas durante las etapas de producción. Estas son dos cepas bacterianas, Acetobacter pasteurianus y Pedicoccus damnosus y una cepa de levadura Saccharomyces carlsbergensis. La cepa de levadura puede diferir puesto que esta es la cepa de partida para que se produzca la fermentación. La mayoría de las fábricas de cervezas usan una cepa de partida que procede de la familia de Saccharomyces y por ello se puede usar en los ensayos esta cepa.
Procedimientos de lisis celular
Desnaturalización térmica: La muestra se llevó a ebullición durante 10 minutos, se dejó enfriar y se ajustó su pH antes de llevar a cabo el ensayo de ATP. Algunas células son resistentes al calor.
Desnaturalización alcalina: Una base fuerte tal como hidróxido sódico puede lisar las células. Sin embargo, enzimas tales como la luciferasa usadas en el ensayo de ATP funcionan a pH casi neutro. Por tanto, se deberá llevar a cabo antes del ensayo de ATP un ajuste de pH de la muestra. La concentración de base puede determinar el grado de lisis celular.
Reaccionante de lisis del cultivo celular: Un procedimiento publicado para la lisis celular.
Desnaturalización alcalina/neutralización ácida: La lisis celular se consigue usando hidróxido sódico (optimizado a 2M) seguido por la neutralización inmediata del hidróxido sódico usando un tampón ácido, dejando que la muestra se use directamente en el ensayo de ATP sin pérdida funcional para la enzima.
Los resultados de los diferentes procedimientos de lisis se dan en la Tabla 1 y muestran que el procedimiento de desnaturalización alcalina/neutralización ácida desarrollado puede producir la lisis celular de todos los organismos sin que las células deban retirarse del medio de crecimiento antes del ensayo.
Curva patrón de ATP
Para determinar la sensibilidad del ensayo de ATP se determinó una curva de concentración para un patrón ATP que variaba de 10^{-7} a 10^{-16} moles de ATP. Los resultados se muestran en la Figura 2.
Las URL dadas cuando se ensayan las muestras usando los dispositivos de la presente invención se pueden comparar con la curva patrón de ATP y se puede determinar el número de células presentes en una muestra dada. Una única célula de levadura contiene aproximadamente 10^{-4} moles de ATP mientras que una célula bacteriana tiene 100 veces menos ATP presente.
Retención en la membrana
Se usaron membranas de diferente composición química y separación de tamaño molecular en la fabricación de dispositivos de la presente invención y se ensayaron en condiciones similares para determinar su capacidad para retener los microorganismos implicados en el estudio. Se ensayaron una serie de formatos de dispositivo usando membranas de polipropileno que tenían diversos diámetros de poro/separaciones de peso molecular. Los autores de la invención han identificado un formato y tipo de membrana que puede retener y funciona a baja presión, evitando de este modo daños a las células durante la aplicación de la muestra. Los dispositivos tipo Y usados en los experimentos (véase la Tabla 2) son similares a los de la presente invención, que tienen una entrada 20 de muestra, un ajuste Luer 21, membranas 30 y adhesivo 40 curable por radiación UV. Sin embargo, éstos se diferencian de los dispositivos de la presente invención porque cada membrana 30 está en una formación en bucle con cada extremo abierto, estando inmersas en adhesivo 40 curable por radiación UV y pudiéndose comunicar con la entrada 20 de muestra.
La configuración de la membrana en el dispositivo demostró que tenía una función importante en la capacidad de retener todos los organismos usados en el estudio. A menor peso molecular de la membrana, mayor presión se necesitaba para permitir el paso de la muestra a través del dispositivo. La mayor presión parecía alterar la estructura celular de modo que las células pasaban a través de la membrana (se filtraban) y no quedaban retenidas. Los resultados se dan en la Tabla 2.
Retención consistente
Se llevaron a cabo estudios para garantizar que la retención o atrapamiento de microorganismos por el dispositivo de filtro era consistente. Para cada ensayo se ensayaron cinco dispositivos para determinar su capacidad para retener cada uno de los microorganismos y el número total de células retenidas se determinó por el ensayo de ATP. Los resultados se dan en la Tabla 3.
Curva de la concentración retenida
Se analizan diluciones a una décima parte de un cultivo de una noche de cada organismo permitiendo determinar el número de células que pueden ser retenidas por el dispositivo. Cada organismo se sembró en el medio de crecimiento apropiado para determinar el número exacto de células de cada dilución. Los resultados se muestran en las Figuras 3 a 5.
Se ensayaron todos los puntos de datos usando dispositivos por triplicado y ensayos de ATP por duplicado llevados a cabo sobre cada muestra. Los datos se han corregido para eliminar los efectos del ATP libre. Se pueden detectar incrementos en la lectura de URL en muestras de menor concentración. Esto se debe a la dilución de enzima que está alterada para proporcionar un aumento en la sensibilidad.
Detección/cuantificación de contaminantes
Se llevaron a cabo ensayos para determinar si 2,5 litros de cerveza tipo Lager se pueden filtrar a través del dispositivo que tiene 68 membranas con un área de la superficie total de 51,2 cm^{2}. En dispositivos por triplicado, este volumen mostró que pasaba a través del filtro sin bloqueo alguno de la membrana.
Se llevó a cabo una reducción del área de la superficie del dispositivo para determinar el volumen de cerveza tipo Lager no contaminada que se podía filtrar. El número de membranas por dispositivo se mantuvo constante y se modificó la longitud total. Se ensayaron tres dispositivos de cada tamaño y los resultados se presentan en la Tabla 4. La aplicación de muestra de cerveza tipo Lager se terminó cuando la presión se hizo demasiado elevada para pasar a través del dispositivo.
Se llevaron a cabo los siguientes experimentos adicionales:
Se usaron los dispositivos de filtración ilustrados por el segundo dispositivo de filtración (Figura 6).
Aparato
1. Membranas de fibra hueca de polipropileno con un diámetro medio de poros de 0,2 \mum (pretratadas con Tween 20 al 5%).
2. Controlador semiautomático Loctite (RTM) 21 que incorpora un aplicador manual e interruptor de pedal con presión fijada a 2000 Pa y salida digital hasta 35,0.
3. Fuente de radiación UV Bondmatic 850, con programador fijado hasta 40 segundos.
4. Anillos (Figura 7, 200) (barra de policarbonato) con un diámetro interno de 7,0 mm y un diámetro externo de 12,4 mm.
5. Tapones de extremo en Y (Figura 7, 210) realizados en polímero de polipropileno de 2 mm con un extremo ancho (diámetro externo 12,4 mm) para recibir los anillos y un extremo externo (diámetro interno 4,1 mm) para la conexión con boquilla de jeringa Luer.
Los dispositivos de filtración se prepararon como sigue:
1. Se limpian todas las superficies de trabajo con IPA (alcohol isopropílico).
2. Se toma un haz formado por un número apropiado de longitudes de membranas de fibra hueca de polipropileno, se coloca una pluralidad de anillos alrededor del haz.
3. A una posición aproximadamente 30 mm desde el extremo del haz de membranas de fibra hueca, se coloca la boquilla del aplicador de adhesivo en el centro del haz de membranas y se aplica adhesivo de forma que penetra a través del haz de membranas y se manipula la boquilla de forma que el adhesivo se aplica a todas las membranas en el área. Se aplica además adhesivo a la cara externa del haz en la posición. Se desliza a continuación un anillo y se hace girar sobre las membranas en la posición tal que entra en contacto con el adhesivo.
4. Se coloca la sección cubierta de adhesivo del haz bajo la fuente de radiación UV para curar el adhesivo.
5. Se aplica adhesivo como se describe en la Etapa 3 (anterior) en una posición aproximadamente 30 mm a lo largo del haz desde el anillo anterior. Se deslizan y hacen girar sobre el adhesivo el primer y luego segundo anillo tal que están en contacto entre sí y luego se separan entre ellos 1-2 mm y se repite la etapa 4.
6. Se repite la etapa 5 hasta que toda la longitud de la membrana tiene anillos colocados.
7. Se cortan las fibras en el hueco de 1-2 mm entre las parejas de anillos para producir una pluralidad de dispositivos de fibra hueca, teniendo las fibras luces abiertas en cualquier extremo y estando selladas en su cara externa en el otro extremo con un anillo.
8. Se incuban los dispositivos a 55ºC durante la noche para eliminar cualquier monómero que quede de adhesivo.
9. Se toma uno de los dispositivos y una pareja de tapones de extremo, se aplica priómero Loctite 770 al borde interno de los tapones de extremo y alrededor de la cara externa de los anillos del dispositivo. Se deja aproximadamente 1 minuto y luego se aplica adhesivo 403 de endurecimiento rápido Loctite alrededor de la cara externa de cada anillo y se presionan los tapones de extremo firmemente sobre los anillos hasta que están unidos.
Experimentos
En primer lugar los resultados de los ensayos anteriores se validaron usando el segundo dispositivo de la invención (Figura 6) siguiendo las Instrucciones del Ensayo (a continuación), y el límite de detección para Saccharomyces carlsbergensis fue de 30-100 células por ensayo, para Acetobacter pasteurianus fue de 10000-20000 células por ensayo y para Pediococcus damnosus fue mayor que > 1000 células por ensayo. La capacidad del sistema para filtrar grandes volúmenes de líquidos demuestra su particular potencial para ensayar el estado de higiene de aguas de aclarado de CIP (limpieza in situ) finales.
En segundo lugar, el ensayo se modificó ligeramente para aumentar su sensibilidad a la contaminación microbiana de cervezas. Esto se consiguió mediante el cultivo en el filtro de un bajo número de microorganismos retenidos de muestras de cerveza filtradas. Después de un período de incubación de 24 horas fue posible detectar 1 célula por ml de cerveza filtrada. Este resultado es al menos tan bueno como, y el sistema es más conveniente de usar que, otros sistemas de detección basados en ATP disponibles en la actualidad. Además, el sistema de la invención tiene la ventaja de que puede filtrar mayores volúmenes de cerveza (y la capacidad de filtrar cerveza tipo Stout) comparados con la filtración de membrana en lecho plana convencional, lo cual da lugar a un límite mayor de detección. Se puede conseguir una sensibilidad similar sin la necesidad de cultivo en el filtro (o con períodos de cultivo más cortos) mediante el uso de ensayos de detección de adenilato quinasa conocidos en la técnica.
Los ensayos muestran en particular que los usos de la presente invención incluyen ensayos de limpieza in situ (CIP) para procesos de fabricación en las industrias de elaboración de cerveza, farmacéuticas, de bebidas refrescantes y lácteas. Además, la presente invención también es particularmente adecuada para ensayos de contaminación de cerveza (incluyendo cervezas Bitter, tipo Lager y tipo Stout) y sidra.
Aquí, se examinó el efecto de incubar en medio de cultivo los dispositivos de filtro que contienen un bajo número de células antes de llevar a cabo el ensayo de ATP. A los efectos de este estudio se usó un organismo diferente, Lactobacillus brevis (BSO 464). Se eligió este organismo puesto que se ha usado ampliamente con anterioridad para numerosos estudios de detección de ATP, por lo que los resultados se pueden comparar fácilmente con los obtenidos a partir de otros sistemas.
Se reprodujo BSO 464 hasta fase estacionaria en medio MRS. Después de realizar un recuento celular al microscopio, se llevaron a cabo diluciones apropiadas en agua desionizada estéril para dar aproximadamente 100 células por ml. Se usó 1 ml de este cultivo para inocular 99 ml de cerveza tipo Lager, esto se llevó a cabo por triplicado para cada muestra de cerveza tipo Lager. También se prepararon controles de cerveza tipo Lager sin inocular. Se realizaron los recuentos en placa para verificar los niveles de inoculación. Cada cerveza tipo Lager se filtró como se describe más adelante y se siguieron las instrucciones del ensayo hasta la etapa 7.
Después de esta etapa se retiró el dispositivo del conducto flexible y se usó una jeringa estéril para llenar el interior de las microfibras con medio MRS. La jeringa se retiró y se colocó en este extremo un segundo tapón de extremo estéril del dispositivo para retener los organismos retenidos en el dispositivo. Todo el dispositivo se sumergió en 20 ml de medio MRS durante diversos tiempos de incubación. Después de la incubación, se extrajo cuidadosamente el dispositivo del medio y se retiró uno de los tapones de extremo. Usando una jeringa, se hicieron pasar 10 ml de agua desionizada estéril a través del dispositivo y se recogieron en un recipiente de agua. Se inyectó a continuación aire en el dispositivo usando la jeringa para eliminar el líquido en exceso de la membrana. Las Instrucciones del ensayo (a continuación) se siguieron como protocolo desde la etapa 9.
Instrucciones del ensayo
1.
Se retira el dispositivo y el conducto flexible de la bolsa sellada.
2.
Se fija el conducto flexible a un sistema de bomba apropiado que pueda funcionar a 187 ml/minuto o 220 rpm (conducto flexible de 3,2 mm de diámetro interno y 6,4 mm de diámetro externo).
3.
Se coloca un recipiente de recogida de residuos bajo el dispositivo.
4.
Se ajusta la bomba a 100 ml/minuto o 117 rpm.
5.
Se hacen pasar 100 ml de cerveza tipo Lager (puede pasar a su través un máximo de 1 litro) y se deja filtrar para que vaya al recipiente.
6.
Se ajusta la bomba a 187 ml/minuto o 220 rpm y se elimina por lavado el exceso de cerveza tipo Lager del dispositivo filtrando 400 ml de agua estéril (destilada).
7.
Cuando el lavado con agua se completa, se deja pasar aire a través del conducto flexible durante 10 segundos para eliminar el exceso de fluido de la membrana.
8.
Se desconecta la bomba y se retira el dispositivo y conducto flexible de la bomba.
9.
Se retira el tapón de extremo del dispositivo. En un trozo limpio de tejido, se drena el dispositivo para eliminar cualquier fluido en exceso.
10.
Se une a un extremo del dispositivo un fragmento de conducto flexible de comunicación y en el otro extremo se coloca una jeringa estéril de 1 ml que contiene 0,5 ml de tampón de lisis (NaOH 0,2 M).
11.
Cuidadosamente se empuja el émbolo de la jeringa hasta que es visible líquido en el conducto flexible de comunicación. Se vuelve a tirar del émbolo con el fin de extraer el tampón de lisis de nuevo a la jeringa, rehumectando de este modo las membranas con el tampón de lisis.
12.
Se repite la etapa 11 dos veces.
13.
Se retira todo el líquido del dispositivo manteniendo el dispositivo sobre un tubo estéril de 1,5 ml y empujando el émbolo de la jeringa tres veces.
14.
Se retira la comunicación y se coloca el tapón de extremo en el dispositivo. Se tira de nuevo del émbolo de la jeringa para recoger todo el eluato (incluyendo el de las membranas) y se coloca este en el tubo de 1,5 ml.
15.
Inmediatamente se añaden 9 gotas de tampón de neutralización (Tris fosfato 0,2 M) al tubo que contiene el eluato. Se reemplaza la tapa del tubo y se mezcla suavemente invirtiendo el tubo 2 a 3 veces.
16.
Se lleva a cabo un ensayo de ATP sobre la muestra usando un luminómetro Biotrace UniLite y reaccionantes de bioluminiscencia de Sigma (ensayo de ATP), siendo el ensayo de ATP como sigue.
Ensayo de ATP
1.
En una cubeta UniLite limpia se colocan 50 \mul de mezcla de ensayo de ATP.
2.
Se incuba a temperatura ambiente durante 3 minutos.
3.
Se coloca sobre la cubeta UniLite Hold Tight y se coloca en el luminómetro, se cierra la tapa y se pulsa el botón de medida. Después de un período de 10 segundos el aparato medirá la lectura de luz durante 35 segundos.
4.
En pantalla aparecerá una relación de URL para la mezcla de ensayo y se proporciona una copia impresa. Esta es la lectura de fondo del ensayo y no será mayor que 30 URL. Una lectura mayor indica contaminación.
5.
Se retira la cubeta de la cámara de muestra y se añaden 100 \mul de la muestra de eluato a la cubeta. Se mezcla suavemente agitando y se devuelve la cubeta a la cámara de muestra.
6.
Se cierra la cámara de muestra y se pulsa el botón de medida. La lectura de luz se presenta en la pantalla y se imprime.
Resultados 1. Validación de los primeros resultados
La Tabla 5 y la Figura 8 muestran que se pueden detectar fácilmente usando el sistema aproximadamente 30 células de levadura por ensayo (o 300 células por muestra de cerveza filtrada). Es decir, que 30 células de levadura por ensayo dan una lectura de URL fácilmente distinguible de la obtenida de muestras de cerveza no inoculadas.
La Tabla 6 y la Figura 9 muestran que 3000 células de A. pasteurianus por ensayo dan una lectura media de luz mucho mayor que el nivel de fondo. El límite de detección (fiable) del ensayo parece estar en 10000-20000 células de A. pasteurianus por ensayo.
La Tabla 7 y la Figura 10 muestran que 150 células de P. damnosus por ensayo dan una lectura media de luz mayor que el nivel de fondo. El límite de detección fiable del ensayo parece ser > 1000 células de P. damnosus por ensayo.
2. Sistema mejorado
La Tabla 8 y la Figura 11 muestran el efecto del cultivo de enriquecimiento en el filtro sobre el límite de detección para números bajos de Lactobacillus brevis en cerveza filtrada usando el segundo dispositivo de la presente invención. Los resultados muestran que el enriquecimiento en el filtro 24 horas después de la filtración permite la detección de 160 células de L. brevis usando el ensayo y dispositivo de la presente invención. Con el fin de detectar números bajos de organismos bajo un estresor puede ser deseable que la etapa de enriquecimiento dure 30 a 40 horas.
Discusión
Llevando a cabo el cultivo de enriquecimiento en el filtro fue posible detectar aproximadamente 1 célula de L. brevis por ml de cerveza filtrada (que es igual a menos de 1 célula bacteriana por ensayo en la muestra original) después de una incubación de 24 horas. Sin embargo, sería recomendable en una situación "real" que el enriquecimiento durara 30 a 40 horas antes de llevar a cabo el ensayo con el fin de detectar bajos números de organismos bajo un estresor. Este resultado es al menos tan bueno y el sistema más fácil de usar que otros sistemas de detección basados en ATP disponibles en la actualidad. Además, el sistema de la presente invención tiene la ventaja de que puede filtrar mayores volúmenes de cerveza (y la capacidad de filtrar cerveza tipo Stout) comparados con la filtración en membranas en lecho plano, lo cual da como resultado un mayor límite de detección.
Por otro lado, el diseño del dispositivo significa que la muestra y etapas de extracción están contenidas en el dispositivo de filtro, haciendo que la detección basada en ATP sea más fácil de realizar.
TABLA 1
1
TABLA 2
2
TABLA 3
3
TABLA 4
4
TABLA 5 Detección de Saccharomyces carlsbergensis en muestras de cerveza filtradas
5
TABLA 6 Detección de Acetobacter pasteurianus en muestras de cerveza filtrada
6
TABLA 7 Detección de Pediococcus damnosus en muestras de cerveza filtrada
8
TABLA 8
9

Claims (12)

1. Un procedimiento para recuperar microorganismos de una mezcla de muestra, que comprende las etapas de:
i)
hacer pasar dicha mezcla de muestra a través de la entrada de muestra de un dispositivo de filtro que comprende una pluralidad de membranas de filtro de fibra hueca que se han tratado previamente con un detergente, teniendo dichas membranas un primer y un segundo extremo, y una superficie externa y una superficie interna que definen una luz, estando el primer extremo de cada una de dichas membranas abierto y en comunicación con dicha entrada de muestra y estando el flujo desde el segundo restringido de tal modo que dicha mezcla de muestra se filtra a través de dichas membranas, dejando un retenido en dicha luz de dichas membranas;
ii)
resuspender dicho retenido en dichas membranas; y
iii)
detectar la presencia de cualquier microorganismo en dicho retenido.
2. Un procedimiento según la reivindicación 1, en el que la etapa de resuspensión (ii) comprende hacer pasar una solución de un agente de lisis a través de la luz de dichas membranas.
3. Un dispositivo de filtro según la reivindicación 1, en el que el flujo a través de dicho filtro desde dicho segundo extremo de dichas membranas está restringido de tal modo que dicha mezcla de muestra sale de dicho dispositivo de filtro exclusivamente por filtración a través de dichas membranas.
4. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dichos microorganismos comprenden levadura.
5. Un procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dichos microorganismos comprenden bacterias.
6. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dichas membranas tienen un diámetro medio de poro de 0,2 \mum.
7. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicha membrana comprende polipropileno.
8. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en el que dicha membrana comprende polisulfona.
9. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicho detergente comprende un detergente no iónico.
10. Un procedimiento según la reivindicación 7, en el que dicho detergente comprende Tween 20.
11. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, que comprende además antes de dicha etapa de detección (iii) la etapa de cultivar todos los microorganismo en dicho retenido en dicho dispositivo de filtro durante un período de al menos 12 horas.
12. Un procedimiento según la reivindicación 11, en el que dichos microorganismos se cultivan durante al menos 24 a 36 horas antes de dicha etapa de detección (iii).
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