EA035909B1

EA035909B1 - Стабилизированные растворимые f-полипептиды rsv до слияния

Info

Publication number: EA035909B1
Application number: EA201890235A
Authority: EA
Inventors: Йоханнес Лангедейк; Полина Фурманова Холленстейн
Original assignee: Янссен Вэксинс Энд Превеншн Б.В.
Priority date: 2015-07-07
Filing date: 2016-07-07
Publication date: 2020-08-31
Also published as: WO2017005848A1; JP2021074020A; CA2991540A1; KR20180026734A; JP2018527897A; CN107847581B; US20200095287A1; EA201890235A1; BR112017028449A2; US20180194808A1; IL256567B; ZA201800094B; AU2016289496B2; HK1250938A1; US11034731B2; IL256567A; EP3319634B1; AU2016289496A1; JP6840718B2; US20210284698A1

Abstract

Изобретение относится к стабильным F-полипептидам респираторного синцитиального вируса (RSV) до слияния, иммуногенным композициям, содержащим указанные полипептиды, и их применениям для предупреждения и/или лечения инфекции, вызванной RSV.

Description

Настоящее изобретение относится к области медицины. Настоящее изобретение, в частности, относится к рекомбинантному F-полипептиду RSV до слияния и к его применениям, например, в иммуногенных композициях.

Предпосылки изобретения

После открытия респираторно-синцитиального вируса (RSV) в 1950-х гг. этот вирус быстро стал признанным патогеном, ассоциированным с инфекциями верхних и нижних дыхательных путей у людей. По оценкам в мире ежегодно наблюдается 64 млн инфекций RSV, которые приводят к 160000 смертей (WHO Acute Respiratory Infections Update September 2009). Наиболее тяжело заболевание протекает, в частности, у недоношенных детей, пожилых индивидуумов и индивидуумов с ослабленным иммунитетом. У детей моложе 2 лет RSV является наиболее распространенным патогеном дыхательных путей, ответственным приблизительно за 50% госпитализаций вследствие респираторных инфекций, и пик госпитализаций наблюдается в возрасте 2-4 месяца. Сообщалось, что практически все дети к двухлетнему возрасту были инфицированы RSV. Повторные инфекции в течение жизни связаны с малоэффективным врожденным иммунитетом. У пожилых людей вызванное RSV заболевание похоже на заболевания, которые вызваны инфекциями, возбудителем которых является непандемический грипп А.

RSV представляет собой парамиксовирус, принадлежащий к подсемейству pneumoviridae. Его геном кодирует различные белки, в том числе мембранные белки, известные как гликопротеин (G) RSV и белок слияния (F) RSV, которые являются главными антигенными мишенями для нейтрализующих антител. Антитела против опосредующей слияние части белка F1 могут предотвращать поглощение вируса клеткой и, таким образом, обладают нейтрализующим эффектом.

Вакцина против инфекции RSV в настоящее время недоступна, но необходима из-за высокого бремени заболевания. Гликопротеин слияния RSV (F RSV) является перспективным вакцинным антигеном, поскольку, как указано выше, он является ключевой мишенью для нейтрализующих антител в сыворотке человека. Таким образом, нейтрализующее моноклональное антитело к F RSV (паливизумаб) может предупреждать тяжелое течение заболевания, и оно было одобрено для профилактики у младенцев.

F RSV подвергает слиянию вирусные мембраны и мембраны клетки-хозяина путем необратимого рефолдинга белка из лабильной конформации до слияния в стабильную конформацию после слияния. Структуры обеих конформаций были определены для F RSV (McLellan J.S., et al., Science, 342, 592-598 (2013); McLellan J.S., et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 17, 248-250 (2010); McLellan J.S., et al., Science, 340, 1113-1117 (2013); Swanson K.A., et al., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 108, 9619-9624 (2011)), а также для белков слияния из родственных парамиксовирусов, обеспечивая возможность более глубокого изучения механизма этого сложного процесса слияния. Подобно другим слитым слияния типа I, для неактивного F₀-предшественника RSV требуется расщепление с помощью фуриноподобной протеазы в процессе внутриклеточного созревания. F RSV содержит два сайта для фурина, которые соответствуют трем полипептидам: F2, р27 и F1, причем последний на своем N-конце содержит гидрофобный пептид слияния (FP). Для рефолдинга из конформации до слияния в конформацию после слияния участок рефолдинга 1 (RR1) между остатком 137 и 216, который включает FP и гептадный повтор A (HRA), подлежит трансформации из сборки спиралей, петель и нитей в длинную непрерывную спираль. FP, расположенный на N-концевом сегменте RR1, в дальнейшем способен вытягиваться от вирусной мембраны и встраиваться в проксимальный участок мембраны целевой клетки. Затем участок рефолдинга 2 (RR2), который формирует С-концевую петлю в шиловидном отростке F до слияния и включает гептадный повтор В (HRB), перемещается на другую сторону головки F RSV и связывает суперспиральный тример HRA с доменом HRB с образованием пучка из шести спиралей. Образование суперспиральной структуры RR1 и перемещение RR2 для завершения образования пучка из шести спиралей представляют собой наиболее значительные структурные изменения, которые происходят в ходе процесса рефолдинга.

Антитела с наивысшей нейтрализующей активностью в сыворотке человека направлены против конформации до слияния, однако из-за их нестабильности конформация до слияния обладает склонностью к преждевременному рефолдингу в конформацию после слияния как в жидкой среде, так и на поверхности вирионов. F-белок RSV, который характеризуется как высокими уровнями экспрессии, так и поддержанием стабильной конформации до слияния, будет перспективным кандидатом для применения в субъединичной вакцине или векторной вакцине против RSV.

Краткое описание изобретения

Настоящее изобретение представляет стабильные, рекомбинантные полипептиды слияния (F) респираторного синцитиального вируса (RSV) до слияния, т.е. F-полипептиды RSV, которые являются стабильными в конформации до слияния. F-полипептиды RSV по настоящему изобретению содержат по меньше мере один эпитоп, который является специфичным к конформации F-белка до слияния. В определенных вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния являются растворимыми полипептидами. Настоящее изобретение также представляет молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие F-полипептиды RSV до слияния согласно настоящему изобретению и векторы, содержащие такие молекулы нуклеиновых кислот.

- 1 035909

Настоящее изобретение относится также к композициям, предпочтительно иммуногенным композициям, содержащим F-полипептид RSV, молекулу нуклеиновой кислоты и/или вектор, а также к их применению в индуцировании иммунного ответа к F-белку RSV, в частности их применению в качестве вакцины. Настоящее изобретение также относится к способам индуцирования у субъекта иммунного ответа против респираторного синцитиального вируса (RSV), включающий введение субъекту эффективного количества F-полипептида RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей упомянутый F-полипептид RSV и/или вектор, содержащий молекулу упомянутой нуклеиновой кислоты. Предпочтительно, индуцированный иммунный ответ характеризуется выработкой нейтрализующих антител к RSV и/или защитным иммунитетом против RSV. В конкретных аспектах настоящее изобретение относится к способу индуцирования у субъекта выработки антител к F-белку респираторного синцитиального вируса (RSV), включающий введение субъекту эффективного количества иммуногенной композиции, содержащей F-полипептид RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей упомянутый F-полипептид RSV и/или вектор, содержащий молекулу упомянутой нуклеиновой кислоты.

Краткое описание фигур

Фиг. 1. Очистка белка F(A2) KN66EI I76V L203I S215P. А: Хроматограмма элюирования из катионообменной колонки. Синяя кривая отображает поглощение на 280 нм, коричневая кривая отображает проводимость. Стрелка указывает на собранный пик, который элюировался на 15% этапа элюирования. В: Гель-фильтрационная хроматограмма, полученная с использованием колонки Superdex200, элюата из ионообменной колонки. Синяя кривая отображает поглощение на 280 нм, коричневая кривая отображает проводимость. Стрелки указывают на собранный пик.

Фиг. 2. А: Результаты SDS-PAGE-анализа образца белка F(A2) KN66EI I76V L203I S215P (А) и F(A2) K66E I76V L203I S215P (В), содержащего пик из SEC-хроматограммы, в восстанавливающих и невосстанавливающих условиях. Показаны фрагменты F1, F2 в образце в восстанавливающих условиях и F1+F2 в образце в невосстанавливающих условиях. С: Нативный PAGE F(A2) KN66EI I76V S215P с и без L203I и F(A2) K66E I76V L203I S215P. Нативный маркер указывает на относительную электрофоретическую подвижность белка, но его нельзя использовать для определения молекулярной массы белка. Положение бэнда между 242 и 480 кДа соответствует положению тримерного F-белка RSV (обозначен стрелкой). Гели окрашены кумасси бриллиантовым синим.

Фиг. 3. Дополнительная замена Leu 203 на Ile увеличивает стабильность F до слияния в метастабильном F-белке до слияния с заменой S215P. Концентрации F RSV до слияния в супернатантах клеточных культур тестировали в день сбора (72 ч после трансфекции = 1-й день) и после хранения в течение 5 и 15 дней при 4°C.

Фиг. 4. Температурная стабильность белков с L203I. Температуру плавления (Tm) определяли в очищенных образцах белков с помощью DSF.

Фиг. 5. Результаты SDS-PAGE-анализа очищенных F-белков, содержащих мутацию L203I, в восстанавливающих (R) и невосстанавливающих (NR) условиях. Показаны фрагменты F1, F2 в образце в восстанавливающих условиях и F1+F2 в образце в невосстанавливающих условиях. Гель был окрашен кумасси бриллиантовым синим.

Фиг. 6. Результаты SEC-MALS-анализа очищенных F-белков, включающих мутацию L203I: A: F(A2)-KN66EI-I76V-I2O3L-S215P-D486N; В: F(A2)-K66E-I76V-I203L-S215P-D486N.

Подробное описание изобретения

Белок слияния (F) респираторного синцитиального вируса (RSV) участвует в слиянии вирусной мембраны с мембраной клетки-хозяина, которая требуется для инфицирования вирусом. МРНК F-белка RSV транслируется в белок-предшественник из 574 аминокислот, обозначенный F0, который содержит последовательность сигнального пептида на N-конце (например, аминокислотные остатки 1-26 с SEQ ID NO: 13), которая удаляется сигнальной пептидазой в эндоплазматическом ретикулуме. F0 расщепляется по двум сайтам (между аминокислотными остатками 109/110 и 136/137) клеточной протеазой (в частности, фурином или фуриноподобной протеазой), удаляющей короткую гликозилированную вставочную последовательность (также известную как участок р27, содержащий аминокислотные остатки 110-136 и образующую два домена или две субъединицы, обозначаемые F1 и F2). Домен F1 (аминокислотные остатки 137-574) содержит гидрофобный пептид слияния на своем N-конце, и С-конец содержит трансмембранный (ТМ) (аминокислотные остатки 530-550) и цитоплазматический участок (аминокислотные остатки 551-574). Домен F2 (аминокислотные остатки 27-109) ковалентно связан с F1 двумя дисульфидными мостиками. Гетеродимеры F1-F2 подвергаются сборке в вирионе в виде гомотримеров.

Вакцина против инфекции RSV в настоящее время не существует, хотя и является очень желательной. Одним потенциальным подходом к получению вакцины является субъединичная вакцина на основе очищенного F-белка RSV. Однако для этого подхода желательно, чтобы очищенный F-белок RSV находился в конформации, которая подобна конформации F-белка RSV в состоянии до слияния, который стабилен в течение продолжительного периода и может быть получен в достаточных количествах. Кроме того, для вакцины на основе растворимой субъединицы необходимо осуществить укорочение F-белка RSV путем делеции трансмембранного (ТМ) и цитоплазматического участка с получением растворимого секретируемого F-белка (sF). Поскольку участок ТМ отвечает за заякоривание в мембране и тримериза

- 2 035909 цию, незаякоренный растворимый F-белок является в значительной степени более лабильным, чем белок полной длины, и будет с легкостью подвергаться рефолдингу в конечное состояние после слияния. Для получения растворимого F-белка в стабильной конформации до слияния, который демонстрирует высокие уровни экспрессии и высокую стабильность, необходимо, таким образом, стабилизировать конформацию до слияния. Также поскольку полноразмерный (мембраносвязанный) F-белок RSV является метастабильным, стабилизация конформации до слияния также необходима для любого подхода по созданию живых аттенуированных вакцин или векторных вакцин.

Для стабилизации растворимого F-белка RSV, который расщепляется на субъединицу F1 и F2 в конформации до слияния, производили слияние фибритинового домена тримеризации с С-концом растворимого F-белка RSV (McLellan et al., Nature Struct. Biol. 17: 2-248-250 (2010); McLellan et al., Science, 340 (6136): 1113-7 (2013)). Этот домен фибритина или Foldon получен из фибритина Т4 и описан ранее в качестве искусственного встречающегося в природе домена тримеризации (Letarov et al., Biochemistry Moscow, 64: 817-823 (1993); S-Guthe et al., J. Mol. Biol. 337: 905-915. (2004)). Однако домен тримеризации не приводит к получению стабильного белка RSV-F до слияния. Более того, эти усилия даже не привели к получению кандидатов, пригодных для испытания у людей.

Недавно заявителями были описаны комбинации из нескольких мутаций, которые способны стабилизировать конформацию F-белка RSV до слияния (WO 2014/174018 и WO 2014/202570). Таким образом, были описаны стабильные F-полипептиды RSV до слияния, содержащие мутацию аминокислотного остатка в положении 67 и/или мутацию аминокислотного остатка в положении 215, предпочтительно мутацию аминокислотного остатка N/T в положении 67 в I и/или мутацию аминокислотного остатка S в положении 215 в Р. Кроме того, были описаны растворимые F-полипептиды RSV до слияния, содержащие усеченный домен F1 и по меньшей мере одну стабилизирующую мутацию в домене F1 и/или F2 по сравнению с доменом F1 и/или F2 RSV в F-белке RSV дикого типа, где полипептид содержит гетерологичный домен тримеризации, связанный с усеченным доменом F1. Также дополнительно описаны F-полипептиды RSV до слияния, где полипептиды содержат по меньшей мере одну дополнительную мутацию, где указанная мутация выбрана из группы, состоящей из:

(a) мутации аминокислотного остатка в положении 46;

(b) мутации аминокислотного остатка в положении 77;

(c) мутации аминокислотного остатка в положении 80;

(d) мутации аминокислотного остатка в положении 92;

(e) мутации аминокислотного остатка в положении 175;

(f) мутации аминокислотного остатка в положении 184;

(g) мутации аминокислотного остатка в положении 185;

(h) мутации аминокислотного остатка в положении 201;

(i) мутации аминокислотного остатка в положении 209;

(j) мутации аминокислотного остатка в положении 421;

(k) мутации аминокислотного остатка в положении 426;

(l) мутации аминокислотного остатка в положении 465;

(m) мутации аминокислотного остатка в положении 486;

(n) мутации аминокислотного остатка в положении 487 и (o) мутации аминокислотного остатка в положении 508.

Предпочтительно по меньшей мере одна дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из:

(а) мутации аминокислотного остатка S в положении 46 в G;

(b) мутации аминокислотного остатка K в положении 77 в Е;

(c) мутации аминокислотного остатка K в положении 80 в Е;

(d) мутации аминокислотного остатка Е в положении 92 в D;

(e) мутации аминокислотного остатка N в положении 175 в Р;

(f) мутации аминокислотного остатка G в положении 184 в N;

(g) мутации аминокислотного остатка V в положении 185 в N;

(h) мутации аминокислотного остатка K в положении 201 в Q;

(i) мутации аминокислотного остатка K в положении 209 в Q;

(j) мутации аминокислотного остатка K в положении 421 в N;

(k) мутации аминокислотного остатка N в положении 426 в S;

(l) мутации аминокислотного остатка K в положении 465 в Е или Q;

(m) мутации аминокислотного остатка D в положении 486 в N;

(n) мутации аминокислотного остатка Е в положении 487 в Q, N или I и (o) мутации аминокислотного остатка K в положении 508 в Е.

Если была внесена только одна из этих мутаций (в частности, мутация S215P), то был получен метастабильный белок, который можно было применять для оценки стабилизирующего эффекта альтернативных замен.

- 3 035909

В соответствии с настоящим изобретением было обнаружено, что мутация аминокислотного остатка L в положении 203 в I дополнительно стабилизирует белок в конформации до слияния.

Таким образом, настоящее изобретение предусматривает рекомбинантные F-полипептиды до слияния, содержащие мутацию аминокислотного остатка L в положении 203 в I.

Настоящее изобретение, в частности, предусматривает рекомбинантные полипептиды слияния (F) респираторно-синцитиального вируса (RSV) до слияния, где полипептид содержит по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две стабилизирующие мутации в домене F1 и/или F2 по сравнению с доменом F1 и/или F2 RSV в F-белке RSV дикого типа, где по меньшей мере одна из стабилизирующих мутаций представляет собой мутацию аминокислотного остатка L в положении 203 в I.

Дополнительно настоящее изобретение предусматривает рекомбинантные F-полипептиды до слияния, содержащие мутацию аминокислоты S в положении 215 в Р (S215P) и мутацию аминокислотного остатка L в положении 203 в I.

Таким образом, настоящее изобретение далее предусматривает новую стабилизирующую мутацию для получения стабильных рекомбинантных F-полипептидов RSV до слияния, т.е. F-полипептидов RSV, которые являются стабилизированными в конформации до слияния. Стабильные F-полипептиды RSV до слияния по настоящему изобретению находятся в конформации до слияния, т.е. они содержат (демонстрируют) по меньшей мере один эпитоп, который является специфичным к конформации F-белка до слияния. Эпитоп, который является специфичным к конформации F-белка до слияния, представляет собой эпитоп, который не представлен в конформации после слияния. Не ограничиваясь конкретной теорией, полагают, что конформация F-белка RSV до слияния может содержать эпитопы, которые являются такими же, как эпитопы на F-белке RSV, экспрессируемые на встречающихся в природе вирионах RSV, и таким образом, может предоставлять преимущества для активизации защитных нейтрализующих антител.

В определенных вариантах осуществления полипептиды по настоящему изобретению содержат по меньшей мере один эпитоп, который распознается специфическим моноклональным антителом до слияния, содержащим CDR1-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 1, CDR2-участок тяжелой цепи SEQ ID NO: 2, CDR3-участок тяжелой цепи SEQ ID NO: 3 и CDR1-участок легкой цепи SEQ ID NO: 4, CDR2-участок легкой цепи SEQ ID NO: 5 и CDR3-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 6 (далее в этом документе упоминаемый как CR9501), и/или специфическим моноклональным антителом до слияния, содержащим CDR1-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 7, CDR2-участок тяжелой цепи SEQ ID NO: 8, CDR3-участок тяжелой цепи SEQ ID NO: 9 и CDR1-участок легкой цепи SEQ ID NO: 10, CDR2-участок легкой цепи SEQ ID NO: 11 и CDR3-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 12 (упоминаемый как CR9502). CR9501 и CR9502 содержат вариабельные участки тяжелой и легкой цепей и, таким образом, связывающие специфичности антител 58С5 и 30D8 соответственно, которые, как было показано ранее, специфично связываются с F-белком RSV в его конформации до слияния, но не в конформации после слияния (см. WO 2012/006596).

В определенных вариантах осуществления рекомбинантные F-полипептиды RSV до слияния содержат по меньшей мере один эпитоп, который распознается по меньшей мере одним специфическим моноклональным антителом до слияния, как описано выше, и полипептиды являются тримерными. В некоторых вариантах осуществления стабильные F-полипептиды RSV до слияния являются растворимыми и содержат усеченный домен F1.

Известно, что RSV существуют в виде одного серотипа, имеющего две антигенные подгруппы: А и В. Аминокислотные последовательности зрелых процессированных F-белков двух групп являются идентичными приблизительно на 93%. Как используется во всем описании, положения аминокислот приведены в отношении к последовательности F-белка RSV из штамма А2 (SEQ ID NO: 13). Как используется в настоящем изобретении, выражение аминокислота в положении x F-белка RSV, таким образом, означает аминокислоту, соответствующую аминокислоте в положении x в F-белке RSV штамма А2 RSV с SEQ ID NO: 13. Необходимо отметить, что в системе нумерации, используемой в настоящем документе, 1 относится к N-концевой аминокислоте незрелого F0-белка (SEQ ID NO: 13). При использовании штамма RSV, отличного от штамма А2, положения аминокислот F-белка следует нумеровать по отношению к нумерации F-белка штамма А2 SEQ ID NO: 1 c помощью выравнивания последовательностей другого штамма RSV с F-белком с SEQ ID NO: 13 со вставкой гэпов, при необходимости. Выравнивание последовательностей можно выполнять с помощью способов, хорошо известных в данной области, например с помощью CLUSTALW, Bioedit или CLC Workbench.

Аминокислота в соответствии с настоящим изобретением может быть любой из двадцати встречающихся в природе (или стандартных аминокислот) или их вариантов, таких как, например, D-аминокислоты (D-энантиомеры аминокислот с хиральным центром), или любым вариантом, которые не встречаются в природе в белках, таких как норлейцин. Стандартные аминокислоты можно разделить на несколько групп, исходя из их свойств. Важными факторами являются заряд, гидрофильность или гидрофобность, размер и функциональные группы. Эти свойства являются важными для структуры белков и белок-белковых взаимодействий. Некоторые аминокислоты обладают специфическими свойствами, такие как цистеин, который может образовывать ковалентные дисульфидные связи (или дисульфид- 4 035909 ные мостики) с другими цистеиновыми остатками, пролин, который индуцирует повороты полипептидного остова, и глицин, который является более гибким, чем другие аминокислоты. В табл. 1 приведены сокращения и свойства стандартных аминокислот.

Опытному специалисту следует принять во внимание, что мутации можно осуществлять с белком при помощи стандартных методик молекулярной биологии. Результатом мутаций в соответствии с настоящим изобретением предпочтительно является повышенные уровни экспрессии и/или повышенные стабилизации F-полипептидов RSV до слияния по сравнению с F-полипептидами RSV, которые не содержат данную (данные) мутацию (мутации).

В некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния являются растворимыми.

Таким образом, в некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния содержат усеченный домен F1, где полипептид содержит по меньшей мере одну стабилизирующую мутацию в домене F1 и/или F2 по сравнению с доменом F1 и/или F2 RSV в F-белке RSV дикого типа. В некоторых вариантах осуществления растворимые F-полипептиды RSV до слияния дополнительно содержат гетерологичный домен тримеризации, связанный с упомянутым усеченным доменом F1. В соответствии с настоящим изобретением было показано, что путем связывания гетерологичного домена тримеризации с С-концевым аминокислотным остатком усеченного домена F1, объединенного со стабилизирующей(стабилизирующими) мутацией(мутациями), получают F-полипептиды RSV, которые характеризуются высокой экспрессией и которые связываются с антителами, специфичными к конформации до слияния, что указывает на то, что полипептиды находятся в конформации до слияния. Кроме того, Fполипептиды RSV стабилизированы в конформации до слияния, т. е. даже после процессинга полипептидов они по-прежнему связаны со специфичными антителами CR9501 и/или CR9502 до слияния, указывая, что специфический эпитоп до слияния сохраняется.

В определенных вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния содержат по меньшей мере три мутации (по сравнению с F-белком RSV дикого типа).

В определенных вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния содержат по меньшей мере одну дополнительную мутацию, выбранную из группы, состоящей из:

(b) мутации аминокислотного остатка в положении 67;

(c) мутации аминокислотного остатка в положении 83;

(e) мутации аминокислотного остатка в положении 184;

(f) мутации аминокислотного остатка в положении 207;

(g) мутации аминокислотного остатка в положении 486 и (h) мутации аминокислотного остатка в положении 487.

В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из:

(a) мутации аминокислотного остатка S в положении 46 в G;

(b) мутации аминокислотного остатка N/T в положении 67 в I;

(c) мутации аминокислотного остатка L в положении 83 в М:

(е) мутации аминокислотного остатка G в положении 184 в N;

(f) мутации аминокислотного остатка V в положении 207 в I;

(g) мутации аминокислотного остатка D в положении 486 в N и (h) мутации аминокислотного остатка Е в положении 487 в Q, N или I.

В определенных вариантах осуществления полипептиды содержат по меньшей мере две мутации.

В определенных вариантах осуществления полипептиды содержат по меньшей мере три мутации.

В определенных вариантах осуществления полипептиды содержат по меньшей мере четыре, пять или шесть мутаций.

В некоторых вариантах осуществления гетерологичный домен тримеризации содержит аминокис„тттп wn^n^^nK^Hb GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSТFL (SEQ ID NO: 14) лотную последовательность .

Как описано выше, в некоторых вариантах осуществления полипептиды по настоящему изобретению содержат усеченный домен F1. Как используется в данном документе, усеченный домен F1 относится к домену F1, который не является доменом F1 полной длины, т. е. где на N-конце или С-конце один или несколько аминокислотных остатков были удалены. В соответствии с настоящим изобретением по меньшей мере трансмембранный домен и цитоплазматический хвост были удалены для обеспечения экспрессии продукта в виде растворимого эктодомена.

В некоторых других вариантах осуществления домен тримеризации связан с аминокислотным остатком 513 домена F1 RSV. В некоторых вариантах осуществления домен тримеризации содержит SEQ ID NO: 14 и связан с аминокислотным остатком 513 домена F1 RSV.

В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или домен F происходят из штамма A RSV. В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или F2 происходят из штамма А2 RSV с SEQ ID NO: 13.

- 5 035909

В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или домен F происходят из штамма В RSV. В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или F2 происходят из штамма В RSV SEQ ID NO: 15.

В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или домен F происходят из штамма CL57-v244

RSV. В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или F2 происходят из штамма CL57-v244 RSV

SEQ ID NO: 22.

В некоторых вариантах осуществления домен F1 и/или F2 происходят из одного штамма RSV. В некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния являются химерными полипептидами, т. е. содержат домены F1 и F2, которые происходят из разных штаммов RSV.

В некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния содержат аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 и SEQ ID NO: 24.

В некоторых вариантах осуществления уровень экспрессии F-полипептидов RSV до слияния по настоящему изобретению увеличен по сравнению с F-полипептидом RSV дикого типа. В некоторых вариантах осуществления уровень экспрессии повышен по меньшей мере в 5 раз, предпочтительно до 10 раз. В некоторых вариантах осуществления уровень экспрессии повышен более чем в 10 раз.

F-полипептиды RSV до слияния в соответствии с настоящим изобретением являются стабильными, т.е. не изменяются с легкостью в конформацию после слияния при процессинге полипептидов, таком как, например, очистка, циклы замораживания-оттаивания и/или хранение и т.д.

В некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV до слияния в соответствии с настоящим изобретением имеют повышенную стабильность при хранении при 4°C по сравнению с F-полипептидом RSV без мутации (мутаций). В некоторых вариантах осуществления полипептиды являются стабильными при хранении при 4°C в течение по меньшей мере 30 дней, предпочтительно по меньшей мере 60 дней, предпочтительно по меньшей мере 6 месяцев, даже более предпочтительно по меньшей мере 1 года. Под стабильными при хранении подразумевается, что полипептиды по-прежнему демонстрируют по меньшей мере один эпитоп, который является специфичным для специфичного антитела до слияния (например, CR9501) при хранении полипептида в растворе (например, среде для культивирования) при 4°C в течение по меньшей мере 30 дней, например, как определено с помощью способа, описанного в примере 7 или 9. В некоторых вариантах осуществления полипептиды демонстрируют по меньшей мере один специфичный эпитоп до слияния в течение по меньшей мере 6 месяцев, предпочтительно в течение по меньшей мере 1 года при хранении F-полипептидов RSV до слияния при 4°C.

В некоторых вариантах осуществления F-полипептиды RSV в соответствии с настоящим изобретением обладают повышенной стабильностью при воздействии теплом по сравнению с F-полипептидами RSV без указанной (указанных) мутации (мутаций). В некоторых вариантах осуществления Fполипептиды REV до слияния термостабильны по меньшей мере 30 мин при температуре 55°C, предпочтительно при 58°C, более предпочтительно при 60°C. Термостабильный означает, что полипептиды попрежнему демонстрируют по меньшей мере один эпитоп, специфичный для конформации до слияния, после того, как их подвергали действию по меньшей мере 30 мин повышенной температуры (например, температуры 55°C или выше), например, как определено с использованием способа, описанного в примере 6.

В определенных вариантах осуществления полипептиды демонстрируют по меньшей мере один специфичный эпитоп до слияния после воздействия от 1 до 6 циклов замораживания-размораживания в подходящей буферной смеси.

Как используется во всей настоящей заявке, нуклеотидные последовательности представлены в направлении от 5' до 3', и аминокислотные последовательности от N-конца к С-концу, как принято в данной области.

В некоторых вариантах осуществления кодируемые полипептиды в соответствии с настоящим изобретением дополнительно содержат лидерную последовательность, также называемую как сигнальная последовательность или сигнальный пептид, соответствующую аминокислотам 1-26 в SEQ ID NO: 13. Она представляет собой короткий (длиной, как правило, 5-30 аминокислот) пептид, присутствующий на N-конце большинства вновь синтезируемых белков, которые предназначены для поступления в секреторный путь. В некоторых вариантах осуществления полипептиды в соответствии с настоящим изобретением не содержат лидерную последовательность.

В определенных вариантах осуществления полипептиды содержат HIS-метку. His-метка или полигистидиновая метка представляет собой аминокислотный мотив в белках, который состоит по меньшей мере из пяти остатков гистидина (Н), зачастую на N- или С-конце белка, который обычно используют с целью очистки.

Настоящее изобретение дополнительно представляет молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей F-полипептиды RSV в соответствии с настоящим изобретением.

В предпочтительных вариантах осуществления молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептиды в соответствии с настоящим изобретением, являются оптимизированными по кодонам для экспрессии в клетках млекопитающих, предпочтительно клетках человека. Способы оптимизации по кодонам известны или были описаны ранее (например, WO 96/09378). Последовательность считается

- 6 035909 оптимизированной по кодонам, если по меньшей мере один кодон, не являющийся предпочтительным, по сравнению с последовательностью дикого типа замещен кодоном, который является более предпочтительным. В данном документе кодон, не являющийся предпочтительным, представляет собой кодон, который используется менее часто в организме, чем другой кодон, кодирующий такую же аминокислоту, и кодон, являющийся более предпочтительным, представляет собой кодон, который используется более часто в организме, чем кодон, не являющийся предпочтительным. Частоту использования кодонов для конкретного организма можно найти в таблицах частоты использования кодонов, таких как на сайте http://www.kazusa.or.jp/codon.

Предпочтительно более одного кодона, не являющегося предпочтительным, предпочтительно большинство или все кодоны, не являющиеся предпочтительными, замещают кодонами, которые являются более предпочтительными. Предпочтительно наиболее часто используемые кодоны в организме используют в кодон-оптимизированной последовательности. Как правило, замещение предпочтительными кодонами приводит к более высокой экспрессии.

Специалисту в данной области будет понятно, что несколько различных молекул полинуклеотидов и нуклеиновых кислот могут кодировать один и тот же полипептид в результате вырожденности генетического кода. Также понятно, что специалисты в данной области могут при помощи традиционных методик проводить нуклеотидные замены, которые не влияют на последовательность полипептида, кодируемую молекулами нуклеиновых кислот, для отражения частоты использования кодонов любым конкретным организмом-хозяином, в котором полипептиды будут экспрессироваться. Следовательно, если конкретно не указано иное, то нуклеотидная последовательность, кодирующая аминокислотную последовательность включает все нуклеотидные последовательности, которые являются вырожденными версиями друг друга и которые кодируют одну и ту же аминокислотную последовательность. Нуклеотидные последовательности, которые кодируют белки и РНК могут включать в себя или могут не включать в себя интроны.

Последовательности нуклеиновых кислот можно клонировать с помощью стандартных методик молекулярной биологии или получать de novo путем синтеза ДНК, который можно осуществлять с помощью стандартных процедур с участием компаний, предоставляющих услуги в области синтеза ДНК и/или молекулярного клонирования (например, GeneArt, GenScripts, Invitrogen, Eurofins).

Настоящее изобретение также представляет векторы, содержащие молекулу нуклеиновой кислоты, как описано выше. Таким образом, в определенных вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты в соответствии с настоящим изобретением является частью вектора. С такими векторами можно легко производить манипуляции с помощью способов, хорошо известных специалисту в данной области техники, и их, например, можно разработать так, чтобы они были способны к репликации в прокариотических и/или эукариотических клетках. Кроме того, многие векторы можно использовать для трансформации эукариотических клеток, и они будут интегрироваться целиком или частично в геном таких клеток, что приведет в результате к стабильным клеткам-хозяевам, содержащим в их геноме необходимую нуклеиновую кислоту. Применяемый вектор может представлять собой любой вектор, который подходит для клонирования ДНК и который можно применять для транскрипции нуклеиновой кислоты, представляющей интерес. Подходящими векторами в соответствии с настоящим изобретением являются, например, аденовекторы, альфа-вирус, парамиксовирус, вирус осповакцины, вирус герпеса, ретровирусные векторы и т.д. Специалист в данной области может выбрать подходящие векторы экспрессии и вставить последовательности нуклеиновых кислот по настоящему изобретению функциональным образом.

Клетки-хозяева, содержащие молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие F-полипептиды RSV до слияния, также образуют часть настоящего изобретения. F-полипептиды RSV до слияния можно получить с помощью технологии рекомбинантной ДНК, включающей экспрессию молекул в клеткаххозяевах, например клетках яичников китайского хомячка (СНО), линиях опухолевых клеток, клетках BHK, клеточных линиях человека, таких как клетки HEK293, клетки PER.C6 или клетках дрожжей, грибов, насекомых и т. п. или трансгенных животных, или растений. В некоторых вариантах осуществления клетки происходят из многоклеточного организма, в некоторых вариантах осуществления они происходят из позвоночных или беспозвоночных. В некоторых вариантах осуществления клетками являются клетки млекопитающих. В некоторых вариантах осуществления клетками являются клетки человека. В целом получение рекомбинантных белков, таких как F-полипептиды RSV до слияния по настоящему изобретению, в клетке-хозяине предусматривает введение гетерологичной молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид в экспрессируемом формате, в клетку-хозяина, культивирование клеток в условиях, способствующих экспрессии молекулы нуклеиновой кислоты и обеспечение экспрессии полипептида в указанной клетке. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок в экспрессируемом формате, может находиться в форме кассеты экспрессии и обычно требует последовательностей, способствующих экспрессии нуклеиновой кислоты, таких как энхансер(ы), промотор, сигнал полиаденилирования и т.п. Специалист в данной области осведомлен о том, что для достижения экспрессии гена в клетках-хозяевах можно использовать различные промоторы. Промоторы могут быть конститутивными или регулируемыми, и их можно получить из разных источников, в том числе вирусов, прокариотических или эукариотических источников, или разрабатывать искусственным путем.

- 7 035909

Среды для культивирования клеток доступны от различных поставщиков, и подходящую среду можно стандартно выбрать для клетки-хозяина для экспрессии белка, представляющего интерес, в данном случае F-полипептидов RSV до слияния. Подходящая среда может содержать или может не содержать сыворотку.

Гетерологичной молекулой нуклеиновой кислоты (также называемой в данном документе как 'трансген') является молекула нуклеиновой кислоты, которая в природе не присутствует в клеткехозяине. Ее вводят, например, в вектор с помощью стандартных методик молекулярной биологии. Трансген обычно функционально связан с последовательностями, контролирующими экспрессию. Это можно выполнить, например, путем помещения нуклеиновой кислоты, кодирующей трансген(ы), под контроль промотора. Можно добавлять дополнительные регуляторные последовательности. Многие промоторы можно использовать для экспрессии трансгена(ов), и они известны специалисту, например, такие промоторы могут включать промоторы вирусов, млекопитающих, синтетические промоторы и т.п. Неограничивающим примером подходящего промотора для получения экспрессии в эукариотических клетках является промотор CMV (патент США № 5385839), например предранний промотор CMV, например, содержащий нуклеотиды от -735 до +95 из энхансера/промотора предраннего гена CMV. Сигнал полиаденилирования, например сигнал полиА гена бычьего гормона роста (US 5122458), может располагаться позади трансгена(ов). В качестве альтернативы несколько широко используемых векторов экспрессии доступны в данной области и их получают из коммерческих источников, например серии векторов pcDNA и pEF Invitrogen, pMSCV и pTK-Hyg от BD Sciences, pCMV-Script от Stratagene и т.д., которые можно использовать для рекомбинантной экспрессии белка, представляющего интерес, или для получения подходящих промоторов и/или последовательностей терминаторов транскрипции, последовательностей polyA и т.п.

Культура клеток может представлять собой любой тип культуры клеток, в том числе адгезивную культуру клеток, например клетки, прикрепленные к поверхности культурального флакона или к микроносителям, а также суспензионную культуру. Манипуляции с суспензионными культурами наиболее крупного масштаба проводят в периодическом процессе или процессе с подпиткой, поскольку они являются наиболее простыми для управления и увеличения масштаба. В настоящее время непрерывные процессы на основе принципов перфузии становятся более распространенными, и они также являются подходящими. Подходящие питательные среды хорошо известны специалисту в данной области и могут, как правило, быть получены из коммерческих источников в больших количествах или произведены по заказу согласно стандартным протоколам. Культивирование можно проводить, например, в чашках, роллерфлаконах или в биореакторах, используя периодические, подпитываемые, непрерывные системы и т. п. Известны подходящие условия для культивирования клеток (смотри, например, Tissue Culture, Academic Press, Kruse and Paterson, editors (1973), и R.I. Freshney, Culture of animal cells: A manual of basic technique, fourth edition (Wiley-Liss Inc., 2000, ISBN 0-471-34889-9)).

Настоящее изобретение также представляет композиции, содержащие F-полипептиды RSV до слияния и/или молекулу нуклеиновой кислоты, и/или вектор, как описано выше. Настоящее изобретение также представляет композиции, содержащие F-полипептид RSV до слияния, который демонстрирует эпитоп, присутствующий в конформации F-белка RSV до слияния, но отсутствует в конформации после слияния. Настоящее изобретение также представляет композиции, содержащие молекулу нуклеиновой кислоты и/или вектор, кодирующие такой F-полипептид RSV до слияния. Настоящее изобретение также представляет иммуногенные композиции, содержащие F-полипептиды RSV до слияния, и/или молекулу нуклеиновой кислоты, и/или вектор, как описано выше. Настоящее изобретение также представляет применение стабилизированного F-полипептида RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты и/или вектор в соответствии с настоящим изобретением для индуцирования у субъекта иммунного ответа к F-белку RSV. Дополнительно представлены способы индуцирования у субъекта иммунного ответа на F-белок RSV, предусматривающие введение субъекту F-полипептида RSV до слияния, и/или молекулы нуклеиновой кислоты, и/или вектора в соответствии с настоящим изобретением. Также представлены F-полипептиды RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты и/или векторы в соответствии с настоящим изобретением для индуцирования иммунного ответа у субъекта к F-белку RSV. Также представлено применение F-полипептидов RSV до слияния, и/или молекул нуклеиновой кислоты, и/или векторов в соответствии с настоящим изобретением для получения лекарственного средства для применения в индуцировании у субъекта иммунного ответа к F-белку RSV.

F-полипептиды RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты или векторы по настоящему изобретению можно использовать для предупреждения (профилактики) и/или для лечения инфекций RSV. В определенных вариантах осуществления предупреждение и/или лечение может быть направлено на группы пациентов, которые восприимчивы к инфекции RSV. Такие группы пациентов включают, без ограничений, например, пожилых (например, в возрасте >50 лет, в возрасте >60 лет и предпочтительно в возрасте >65 лет), молодых (например, в возрасте <5 лет, в возрасте <1 года), госпитализированных пациентов и пациентов, которые получали лечение противовирусным соединением, но продемонстрировали неудовлетворительный противовирусный ответ.

- 8 035909

F-полипептиды RSV до слияния, молекулы нуклеиновых кислот и/или векторы в соответствии с настоящим изобретением можно использовать, например, в самостоятельном лечении и/или профилактике заболевания или состояния, вызванного RSV, или в комбинации с другими профилактическими и/или терапевтическими средствами лечения, такими как (существующими или будущими) вакцины, противовирусные средства и/или моноклональные антитела.

Настоящее изобретение дополнительно представляет способы предупреждения и/или лечения у субъекта инфекции RSV с использованием F-полипептидов RSV до слияния, молекул нуклеиновых кислот и/или векторов в соответствии с настоящим изобретением. В конкретном варианте осуществления способ предупреждения и/или лечения у субъекта инфекции RSV предусматривает введение субъекту, нуждающемуся в этом, эффективного количества F-полипептида RSV до слияния, молекулы нуклеиновой кислоты и/или вектора, описанных выше.

Терапевтически эффективное количество относится к количеству полипептида, молекулы нуклеиновой кислоты или вектора, которое является эффективным для предупреждения, уменьшение интенсивности и/или лечения заболевания или состояния, возникшего в результате инфекции, вызванной RSV. Предупреждение охватывает подавление или уменьшение распространения RSV, или подавление или уменьшение проявления, развития или прогрессирования одного или нескольких симптомов, связанных с инфекцией, вызванной RSV. Уменьшение интенсивности, как используется в данном документе, может относиться к уменьшению видимых или ощутимых симптомов заболевания, виремии или других поддающихся измерению проявлений инфекции гриппа.

Для введения субъектам, таким как люди, в настоящем изобретении могут использоваться фармацевтические композиции, содержащие F-полипептид RSV до слияния, молекулу нуклеиновой кислоты и/или вектор, как описано в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель или наполнитель. В настоящем контексте выражение фармацевтически приемлемый означает, что носитель или наполнитель в используемых дозировках и концентрациях не вызовет каких-либо нежелательных или вредных эффектов у субъектов, которым их вводят. Такие фармацевтически приемлемые носители и наполнители хорошо известны из уровня техники (см. Remington's Pharmaceutical Sciences, 18^th edition, A.R. Gennaro, Ed., Mack Publishing Company [1990]; Pharmaceutical Formulation Development of Peptides and Proteins, S. Frokjaer and L. Hovgaard, Eds., Taylor & Francis [2000]; и Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3^rd edition, A. Kibbe, Ed., Pharmaceutical Press [2000]). F-полипептиды RSV или молекулы нуклеиновой кислоты предпочтительно составляют и вводят в виде стерильного раствора, хотя также возможно использование лиофилизированных препаратов. Стерильные растворы получают при помощи стерилизующей фильтрации или с помощью других способов, известных per se в уровне техники. Затем растворы лиофилизируют или расфасовывают в контейнеры, предназначенные для лекарственных форм. pH раствора обычно находится в диапазоне pH от 3,0 до 9,5, например, pH от 5,0 до 7,5. F-полипептиды RSV обычно находятся в растворе, имеющем подходящий фармацевтически приемлемый буфер, и композиция может также содержать соль. Необязательно может присутствовать стабилизирующее средство, такое как альбумин. В определенных вариантах осуществления добавляют детергент. В определенных вариантах осуществления F-полипептиды RSV можно составлять в виде инъекционного препарата.

В некоторых вариантах осуществления композиция в соответствии с настоящим изобретением дополнительно содержит один или несколько адъювантов. Адъюванты, как известно в уровне техники, дополнительно повышают иммунный ответ в отношении применяемой антигенной детерминанты. Выражения адьювант и иммуностимулятор используют в данном документе взаимозаменяемо, и их определяют как одно или несколько веществ, вызывающих стимуляцию иммунной системы. В данном контексте адъювант используют для усиления иммунного ответа к F-полипептидам RSV по настоящему изобретению. Примеры подходящих адъювантов включают соли алюминия, такие как гидроксид алюминия и/или фосфат алюминия; композиции на основе масляных эмульсий (или композиции типа масло в воде), в том числе сквален-водных эмульсий, таких как MF59 (см., например, WO 90/14837); составы с сапонинами, такие как, например, QS21 и иммуностимулирующие комплексы (ISCOMS) (см., например, US 5057540; WO 90/03184, WO 96/11711, WO 2004/004762, WO 2005/002620); производные бактерий или микроорганизмов, примерами которых являются монофосфорил липид A (MPL), 3-O-деацилированный MPL (3dMPL), олигонуклеотиды, содержащие мотив CpG, ADP-рибозилирующие токсины бактерий или их мутантные формы, такие как термолабильный энтеротоксин LT из Е. coli, холерный токсин СТ и т. п.; белки эукариотов (например, антитела или их фрагменты (например, направленные против самого антигена или CD1a, CD3, Cd7, CD80) и лиганды к рецепторам (например, CD40L, GMCSF, GCSF и др.), которые стимулируют иммунный ответ при взаимодействии с клетками реципиентов. В определенных вариантах осуществления композиции по настоящему изобретению содержат в качестве адъюванта алюминий, например, в форме гидроксида алюминия, фосфата алюминия, фосфата алюминия-калия или их комбинации в концентрациях 0,05-5 мг, например 0,075-1,0 мг алюминия на дозу.

F-полипептиды RSV до слияния можно также вводить в комбинации с наночастицами или конъюгированными с наночастицами, такими как, например, полимерами, липосомами, виросомами, вирусподобными частицами. F-полипептиды до слияния можно комбинировать с наночастицами, инкапсулировать в наночастицах или конъюгировать с наночастицами с адъювантом или без него. Инкапсулирова- 9 035909 ние в липосомы описано, например, в документе US 4235877. Конъюгирование с макромолекулами раскрыто, например, в документах US 4372945 или US 4474757.

В других вариантах осуществления композиции не содержат адъюванты.

В определенных вариантах осуществления настоящее изобретение представляет способы получения вакцины против респираторного синцитиального вируса (RSV), включающие обеспечение композиции в соответствии с настоящим изобретением и помещение ее в фармацевтически приемлемую композицию. Выражение вакцина относится к средству или композиции, содержащим активный компонент, который является эффективным для индуцирования у субъекта определенной степени иммунитета к определенному патогенному микроорганизму или заболеванию, которые приведут по меньшей мере к снижению (до полного отсутствия включительно) тяжести, продолжительности или другого проявления симптомов, связанных с инфекцией патогенным микроорганизмом или заболеванием. В настоящем изобретении вакцина содержит эффективное количество F-полипептида RSV до слияния и/или молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей F-полипептид RSV до слияния, и/или вектор, содержащий указанную молекулу нуклеиновой кислоты, который приводит к образованию иммунного ответа к F-белку RSV. Это обеспечивает способ предупреждения тяжелого заболевания нижних дыхательных путей, приводящего к госпитализации, и снижает частоту осложнений, таких как пневмония и бронхиолит у субъекта вследствие инфекции и репликации RSV. Выражение вакцина согласно настоящему изобретению подразумевает, что она представляет собой фармацевтическую композицию, и, таким образом, как правило, включает фармацевтически приемлемый разбавитель, носитель или наполнитель. Она может содержать или не содержать дополнительные активные ингредиенты. В определенных вариантах осуществления она может представлять собой комбинированную вакцину, которая дополнительно содержит другие компоненты, которые индуцируют иммунный ответ, например, против других белков RSV и/или против других возбудителей инфекции. Введение дополнительных активных компонентов можно, например, осуществлять путем отдельного введения или путем введения комбинации продуктов из вакцин по настоящему изобретению и дополнительных активных компонентов.

Композиции можно вводить субъекту, например субъекту-человеку. Суммарная доза F-полипептидов RSV в композиции для однократного введения может, например, составлять от приблизительно 0,01 мкг до приблизительно 10 мг, например, 1 мкг-1 мг, например, 10-100 мкг. Определение рекомендуемой дозы будет осуществляться в процессе эксперимента и является стандартным для специалистов в данной области.

Введение композиций в соответствии с настоящим изобретением можно осуществлять с использованием стандартных путей введения. Неограничивающие варианты осуществления включают парентеральное введение, такое как внутрикожное, внутримышечное, подкожное, чрескожное введение или введение через слизистые, например, интраназальное, пероральное и т.п. В одном варианте осуществления композицию вводят путем внутримышечной инъекции. Специалисту известны различные возможности введения композиции, например вакцины, для индуцирования иммунного ответа к антигену (антигенам), присутствующему в вакцине.

Субъект, как используется в данном документе, предпочтительно представляет собой млекопитающее, например, грызуна, например, мышь, хлопкового хомяка или примата, кроме человека, или человека. Субъект, предпочтительно, является субъектом-человеком.

Полипептиды, молекулы нуклеиновых кислот, векторы и/или комбинации можно также вводить в виде прайма или в виде буста в гомологичном или гетерологичном режиме прайм-буст. При проведении бустерной вакцинации обычно такую бустерную вакцину будут вводить одному и тому же субъекту с промежутком от одной недели до одного года, предпочтительно от двух недель до четырех месяцев после введения композиции субъекту в первый раз (которое в данном случае называется первичной вакцинацией). В некоторых вариантах осуществления введение включает прайм и по меньшей мере одно бустерное введение.

В дополнение, полипептиды по настоящему изобретению можно применять в качестве диагностического средства, например, для тестирования иммунного статуса индивидуума путем установления способности антител в сыворотке крови такого индивидуума к связыванию с полипептидом по настоящему изобретению. Настоящее изобретение также относится к in vitro диагностическому способу для выявления у пациента присутствия инфекции RSV, при этом указанный способ включает стадии a) приведения в контакт биологического образца, полученного от указанного пациента, с полипептидом в соответствии с настоящим изобретением и b) выявления присутствия комплексов антитело-полипептид.

Дополнительно настоящее изобретение предусматривает способ стабилизации конформации до слияния F-полипептида RSV, предусматривающий введение по меньшей мере одной мутации в домен F1 и/или F2 RSV по сравнению с доменом F1 и/или F2 RSV дикого типа, где по меньшей мере одна мутация блокирует альфа-спираль 4 от поворота или перемещения при помощи мутации в тройной спирали в вершине RSV (альфа-спирали 1, 4 и 5). В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна мутация в альфа 4 представляет собой мутацию аминокислотного остатка Leu в Ile в положении 203.

Стабилизированные F-полипептиды RSV до слияния, получаемые и/или полученные таким способом, тоже образуют часть настоящего изобретения, а также варианты их применения, как описано выше.

- 10 035909

Примеры

Пример 1.

Для стабилизации подвижной вершины в конформации до слияния F-белка RSV вводили замену Leu203Ile в альфа4 в метастабильном варианте F-белка RSV со стабилизирующей мутацией S215P и С-концевым фибритиновым мотивом.

Экспрессия и очистка F-белка RSV.

Рекомбинантные белки экспрессировали в клетках Freestyle 293 (Life Technologies). Клетки временно трансфицировали с помощью 293Fectin (Life Technologies) в соответствии с инструкциями производителя и культивировали во встряхивателе-инкубаторе при 37°C и 10% СО₂. Супернатанты культур, содержащие F-белок, собирали на 5-й день после трансфекции.

Простерилизованные фильтрацией супернатанты хранили при 4°C до использования. Рекомбинантные полипептиды очищали согласно 2-этапному протоколу с применением катионообменной хроматографии с последующей эксклюзионной хроматографией (фиг. 1). На ионобменном этапе супернатант культуры разводили 2 объемами 50 мМ NaOAc, pH 5,0, и пропускали через 5 мл колонку HiTrap Capto S (GE Healthcare) при скорости 5 мл/мин. Затем колонки промывали 10 объемами, соответствующими объему колонки (CV), 20 мМ NaOAc, 50 мМ NaCl, 0,01% (об./об.) tween 20, pH 5, и элюировали на 15% этапа элюированием посредством 50 мМ NaOAc, 1 М NaCl, 0,01% (об./об.) tween 20, pH 5. Элюат концентрировали, а затем белок очищали на колонке Superdex200 (GE Healthcare) с использованием 40 мМ Tris, 150 мМ NaCl, 0,01% (об./об.) tween 20 и pH 7,4 в качестве подвижного буфера. Очищенный белок анализировали на SDS-PAGE и нативном PAGE (фиг. 2). Белки визуализировали на геле после окрашивания кумасси бриллиантовым голубым. Основные бэнды на SDS-PAGE соответствовали доменам F1 и F2 F-белка RSV в образцах в восстанавливающих условиях; в образцах в невосстанавливающих условиях основной бэнд соответствовал размеру доменов F1+F2, связанных вместе дисульфидными связями. На нативном PAGE электрофоретическая подвижность белка соответствовала одному из F-тримеров RSV. Конформацию до слияния очищенного белка подтверждали связыванием с антителом CR9501 (данные не показаны). Очищенный тримерный F-белок RSV до слияния хранили при 4°C до дальнейшего анализа.

Исследования стабильности.

Способность белка до слияния спонтанно превращаться в конформацию после слияния оценивали в анализе стабильности при хранении. Неочищенные образцы супернатантов клеточной культуры хранили при 4°C, а концентрацию F-белка в образцах измеряли на приборе Octet путем количественного анализа, который описан выше. Измерения проводили в день сбора супернатанта (1-й день) и после хранения супернатанта в течение указанного периода времени. CR9501 представляет собой моноклональное антитело, которое распознает только конформацию F-белка до слияния (WO2012/006596), и его применяли для измерения концентрации F-белка RSV до слияния.

Температурную стабильность очищенных белков определяли с помощью дифференциальной сканирующей флуорометрии (DSF). Очищенный F-белок до слияния смешивали с оранжевым флуоресцентным красителем SYPRO (Life Technologies S6650) в 96-луночном планшете для оптической qPCR. Оптимальную концентрацию красителя и белка определяли экспериментально (данные не показаны). Все разведения белка производили в PBS, а в качестве вычитаемого эталонного значения использовали значения отрицательного контрольного образца, содержащего только краситель. Измерение проводили в приборе для проведения qPCR (Applied Biosystems ViiA 7) с использованием следующих параметров: температурный диапазон 25-95°C со скоростью 0,015°C/c. Данные собирали непрерывно. Первую производную кривых плавления строили с использованием программного обеспечения GraphPad PRISM (версии 5.04). Температуры плавления рассчитывались в точке минимума производной кривой.

Как показано на фиг. 3, метастабильный вариант F-белка, который был стабилизирован с помощью только замены S215P, практически полностью утрачивал связывание с Mab CR9501, которое специфично к конфигурации до слияния, после хранения в течение 5 дней при 4°C. В отличие от этого, дополнительная замена L203I значительно увеличила стабильность этого метастабильного варианта F-белка RSV. Общее связывание при исследовании связывания CR9501 в день сбора было выше, и лишь незначительное падение связывания CR9501 наблюдали после хранения в течение 15 дней при 4°C. Дополнительная замена Leu 203 на Ile повышала стабильность при хранении в исследовании F-белка до слияния по сравнению с метастабильным F-белком до слияния, который содержал лишь одну замену S215P. Дополнительная замена L203I также увеличивала термостабильность (59,5°C) по сравнению с вариантом, который содержал замену N671 и S215P (57,0°C) в соответствии с результатами DSF-экспериментов (фиг. 4).

Конструкции тестировали в отношении уровней экспрессии, стабильности при хранении и связывания с антителом CR9501, специфичным к конформации до слияния у F-белка RSV. Ниже приведены аминокислотные последовательности вариабельных участков тяжелой и легкой цепей и CDR тяжелых и легких цепей данного антитела. CR9501 содержит связывающие участки антител, обозначенных как 58С5 в WO 2012/006596.

- 11 035909

Пример 2.

В соответствии с настоящим изобретением было показано, что комбинация замены Leu203Ile с другими стабилизирующими мутациями давала в результате очень стабильный белок RSV F.

Экспрессия, очистка и характеристика F-белка RSV.

Рекомбинантные белки экспрессировали и очищали, как описано выше. Очищенный белок анализировали на SDS-PAGE (фиг. 5). Белки были чистыми с единственными наблюдаемыми на гелях бэндами, которые соответствовали доменам F1 и F2 F-белка RSV в образцах в восстанавливающих условиях и доменам F1+F2, соединенным вместе, в образцах в невосстанавливающих условиях. SEC-MALS-анализ очищенных образцов (фиг. 6) показывал, что единственный вид белка, присутствовавший в образце, имел молекулярную массу ~170 кДа, что соответствовало ожидаемой молекулярной массе гликозилированного F-тримера RSV. SEC-MALS проводили на системе для HPLC Agilent с использованием колонки TSK G3000SWXL (Tosoh Bioscience). Измерения MALS проводили с использованием встроенного детектора MiniDAWN Treos (Wyatt Technology). Концентрацию белка отслеживали с помощью УФ-монитора на 280 нм и рефрактометрического детектора на 660 нм (Optilab TrEX, Wyatt Technology). Детекторы подключали в следующем порядке: UV, MALS, RI. В SEC-MALS-экспериментах использовали MALSбуфер (17,3 г №211ΡΟ4·2112Ол, 7,3 г №Н₂РО₄-Н₂О/л, 2,9 г NaCl/л, pH 7) и скорость потока 1 мл/мин. Данные анализировали с использованием программного обеспечения Astra 6.1 (Wyatt Technology) с применением рефрактометрического детектора и значением инкремента показателя преломления (dn/dc), равным 0,141 мл/г. Молекулярную массу определяли с помощью максимума пика результатов показателя преломления, общую площадь пика определяли с помощью % общей площади пика УФ-сигнала, скорректированной на коэффициент угасания.

Исследования стабильности.

Температурную стабильность очищенных белков определяли с помощью дифференциальной сканирующей флуорометрии (DSF), как описано в примере 1. Как показано на фиг. 4, при объединении замены L203I с S215P, D486N с или без N671 термостабильность белков увеличивалась соответственно до ~67 и ~70°C.

Таблица 1

Стандартные аминокислоты, аббревиатуры и свойства
Аминокислота	3буквенная	1буквенная	Полярность боковой цепи	Заряд боковой цепи (pH 7,4)
аланин	Ala	A	неполярная	Нейтральный
аргинин	Arg	R	полярная	Положительный
аспарагин	Asn	N	полярная	Нейтральный
аспарагиновая кислота	Asp	D	полярная	Отрицательный
цистеин	Cys	C	неполярная	Нейтральный
глутаминовая кислота	Glu	E	полярная	Отрицательный
глутамин	Gin	Q	полярная	Нейтральный
глицин	Gly	G	неполярная	Нейтральный
гистидин	His	H	полярная	Положительный (10%); нейтральный (90%)
изолейцин	lie	I	неполярная	Нейтральный
лейцин	Leu	L	неполярная	Нейтральный
лизин	Lys	К	полярная	Положительный
метионин	Met	M	неполярная	Нейтральный
фенилаланин	Phe	F	неполярная	Нейтральный
пролин	Pro	P	неполярная	Нейтральный
серин	Ser	S	полярная	Нейтральный
треонин	Thr	T	полярная	Нейтральный
триптофан	Trp	W	неполярная	Нейтральный
тирозин	Tyr	Y	полярная	Нейтральный
валин	Val	V	неполярная	Нейтральный

- 12 035909

Таблица 2

Аминокислотные последовательности антител CR9501 и CR9502

0 4 0 i	Домен VH	CDR1 VH	CDR2 VH	CDR3 VH
CR9501	Аминокислоты 1-125 c SEQ ID NO: 16	GASINSDNYYWT (SEQ ID NO:1)	HISYTGNTYYTPSLKS (SEQ ID NO:2)	CGAYVLISNCGWFDS (SEQ ID NO:3)
CR9502	Аминокислоты 1-121 c SEQ ID NO: 18	GFTFSGHTIA (SEQ ID NO:7)	WVSTNNGNTEYAQKIQG (SEQ ID NO:8)	EWLVMGGFAFDH (SEQ ID NO:9)
0 § В £	Домен VL	CDR1 VL	CDR2 VL	CDR3 VL
CR9501	Аминокислоты 1-107 c SEQ ID NO: 17	QASQDISTYLN (SEQ ID NO: 4)	GASNLET (SEQ ID NO:5)	QQYQYLPYT (SEQ ID NO:6)
CR9502	Аминокислоты 1-110 c SEQ ID NO: 19	GANNIGSQNVH (SEQ ID NO:10)	DDRDRPS (SEQ ID NO:11)	QVWDSSRDQAVI (SEQ ID NO:12)

Аминокислотная последовательность нескольких конструкций F RSV до слияния приведена ниже. Следует отметить, что нумерация аминокислот в различных конструкциях, описанных в данном документе, основана на последовательности дикого типа (SEQ ID NO: 13 с двумя модификациями (K66E и I76V).

Последовательности

Полноразмерная последовательность F-белка RSV A2 (SEQ ID NO: 13):

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAK KTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYIDKQLLPIVNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLHNVNAVKSTTNIMITTIIIVIIVILLSLIAVGLLLYCKARSTPVTLSKDQLSGINNIA FSN

Полноразмерная последовательность F-белка RSV B1 (SEQ ID NO: 15):

MELLIHRLSAIFLTLAINALYLTSSQNITEEFYQSTCSAVSRGYFSALRTGWYTSVITI ELSNIKETKCNGTDTKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQNTPAANNRARREAPQYMNYTINTTK NLNVSISKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGIAVSKVLHLEGEVNKIKNALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYINNQLLPIVNQQSCRISNIETVIEFQQKNSRLLEINREFSVNAGVTTPLSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSSNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPIYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNIKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQADTCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV SLCNTDIFNSKYDCKIMTSKTDISSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKLEGKNLYVKGEPIINYYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIR RSDELLHNVNTGKSTTNIMITTIIIVIIWLLSLIAIGLLLYCKAKNTPVTLSKDQLSGINNIA FSK

SEQ ID NO: 14 (фибритин):

GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLL S T FL

- 13 035909

FA2, K66E, I76V, S215P (SEQ ID NO: 20):

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAK KTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYIDKQLLPIVNKQSCSIPNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL

FA2, K66E, I76V, L203I, S215P (SEQ ID NO: 21):

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAK KTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYIDKQILPIVNKQSCSIPNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL

FA2, K66E, I76V, L203I, S215P, D486N (SEQ ID NO: 23):

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAK KTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYIDKQILPIVNKQSCSIPNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSNEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL

FA2, K66E, N671, I76V, L203I, S215P, D486N (SEQ ID NO: 24):

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKEIKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAK KTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV LTSKVLDLKNYIDKQILPIVNKQSCSIPNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYWQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSNEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL

Полноразмерная последовательность белка F RSV CL57-v224 (SEQ ID NO: 22):

MELPILKTNAITTILAAVTLCFASSQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITI ELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPAANNRARRELPRFMNYTLNNTK NNNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGIAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAWSLSNGVSV

- 14 035909

LTSKVLDLKNYIDKQLLPIVNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYM LTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWK LHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEV NLCNIDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVS NKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIR KSDELLHNVNVGKSTTNIMITTIIIVIIVILLLLIAVGLFLYCKARSTPVTLSKDQLSGINNIA FSN

CR9501, тяжелая цепь (SEQ ID NO: 16):

QVQLVQSGPGLVKPSQTLALTCNVSGASINSDNYYWTWIRQRPGGGLEWIGHISYTGNT

YYTPSLKSRLSMSLETSQSQFSLRLTSVTAADSAVYFCAACGAYVLISNCGWFDSWGQGTQVTV

SSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGL

YSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC

CR9501, легкая цепь (SEQ ID NO: 17):

EIVMTQSPSSLSASIGDRVTITCQASQDISTYLNWYQQKPGQAPRLLIYGASNLETGVP

SRFTGSGYGTDFSVTISSLQPEDIATYYCQQYQYLPYTFAPGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDE QLKSGTASWCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYE KHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

CR9502, тяжелая цепь (SEQ ID NO: 18):

EVQLLQSGAELKKPGASVKISCKTSGFTFSGHTIAWVRQAPGQGLEWMGWVSTNNGNTE

YAQKIQGRVTMTMDTSTSTVYMELRSLTSDDTAVYFCAREWLVMGGFAFDHWGQGTLLTVSSAS

TKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLS

SWTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC

CR9502, легкая цепь (SEQ ID NO: 19):

QSVLTQASSVSVAPGQTARITCGANNIGSQNVHWYQQKPGQAPVLWYDDRDRPSGIPD

RFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDSSRDQAVIFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPP SSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQ WKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTIAPTECS

Claims

ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

1. Рекомбинантный стабильный полипептид слияния (F) респираторно-синцитиального вируса (RSV) в конформации до слияния, где полипептид содержит по меньшей мере две стабилизирующие мутации в домене F1 и/или F2 по сравнению с доменом F1 и/или F2 RSV в F-белке RSV дикого типа, где по меньшей мере одна из стабилизирующих мутаций представляет собой мутацию аминокислотного остатка L в положении 203 в I, и где полипептид дополнительно содержит мутацию аминокислотного остатка S в положении 215, предпочтительно мутацию аминокислотного остатка S в положении 215 в Р, где указанные положения аминокислот приведены в отношении к последовательности F-белка RSV из штамма А2 (SEQ ID NO: 13).
2. F-полипептид RSV по п.1, где полипептид содержит по меньшей мере один эпитоп, который является специфическим к конформации F-белка до слияния, где по меньшей мере один эпитоп распознается специфическим моноклональным антителом до слияния, содержащим CDR1-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 1, CDR2-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 2, CDR3-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 3 и CDR1-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 4, CDR2-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 5 и CDR3-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 6, и/или специфическим моноклональным антителом до слияния, содержащим CDR1-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 7, CDR2-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 8, CDR3-участок тяжелой цепи с SEQ ID NO: 9 и CDR1-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 10, CDR2-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 11 и CDR3-участок легкой цепи с SEQ ID NO: 12.
3. F-полипептид RSV по п.1 или 2, где полипептид является тримерным.
4. F-полипептид RSV по любому из пп.1-3, содержащий усеченный домен F1, где полипептид содержит гетерологичный домен тримеризации, связанный с указанным усеченным доменом F1.
5. F-полипептид RSV по п.4, где гетерологичный домен тримеризации содержит аминокислотную последовательность GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL (SEQ ID NO: 14).
6. F-полипептид RSV по п.4 или 5, где домен тримеризации связан с аминокислотным остатком 513 F-белка RSV.
7. F-полипептид RSV по любому из пп.1-6, где полипептид содержит по меньшей мере одну допол

- 15 035909 нительную мутацию, где указанная мутация выбрана из группы, состоящей из:

(а) мутации аминокислотного остатка S в положении 46 в G;

(b) мутации аминокислотного остатка N/T в положении 67 в I;

(c) мутации аминокислотного остатка L в положении 83 в М;

(d) мутации аминокислотного остатка Е в положении 92 в D;

(e) мутации аминокислотного остатка G в положении 184 в N;

(f) мутации аминокислотного остатка V в положении 207 в I;

(g) мутации аминокислотного остатка D в положении 486 в N и (h) мутации аминокислотного остатка Е в положении 487 в Q, N или I.
8. F-полипептид RSV по любому из пп.1-7, где домен F1 и/или домен F2 происходят из штамма A RSV.
9. F-полипептид RSV до слияния по любому из пп.1-7, где домен F1 и/или домен F2 происходят из штамма В RSV.
10. F-полипептид RSV по любому из пп.1-9, где полипептид содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 и SEQ ID NO: 24.
11. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая F-полипептид RSV по любому из пп.1-10.
12. Молекула нуклеиновой кислоты по п.11, где молекула нуклеиновой кислоты была оптимизирована по кодонам для экспрессии в клетках млекопитающих.
13. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по п.11 или 12.
14. Композиция для индуцирования иммунного ответа к F-белку RSV, содержащая F-полипептид RSV по любому из пп.1-10, молекулу нуклеиновой кислоты по п.11 или 12 и/или вектор по п.13.
15. Применение F-полипептида RSV по любому из пп.1-10 в индуцировании иммунного ответа к F-белку RSV.
16. Применение молекулы нуклеиновой кислоты по п.11 или 12 в индуцировании иммунного ответа к F-белку RSV.
17. Применение вектора по п.13 в индуцировании иммунного ответа к F-белку RSV.