EA032330B1 - Способ обнаружения инфекции h. pylori - Google Patents
Способ обнаружения инфекции h. pylori Download PDFInfo
- Publication number
- EA032330B1 EA032330B1 EA201690151A EA201690151A EA032330B1 EA 032330 B1 EA032330 B1 EA 032330B1 EA 201690151 A EA201690151 A EA 201690151A EA 201690151 A EA201690151 A EA 201690151A EA 032330 B1 EA032330 B1 EA 032330B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- protein
- fragment
- ru1op
- hook
- ε1ίό
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56911—Bacteria
- G01N33/56922—Campylobacter
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
- C07K16/1203—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria
- C07K16/121—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria from Helicobacter (Campylobacter) (G)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2469/00—Immunoassays for the detection of microorganisms
- G01N2469/20—Detection of antibodies in sample from host which are directed against antigens from microorganisms
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
Изобретение относится к способу обнаружения инфекции Н. pylori у субъекта, а также соответствующему набору, при этом указанный способ включает обнаружение в образце, полученном от указанного субъекта, иммунного ответа, направленного против FliD, при этом указанный иммунный ответ включает антитело против FliD. Указанный способ включает осуществление реакции указанного образца с FliD или фрагментом FliD, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы было можно идентифицировать указанный фрагмент как фрагмент FliD и исключить то, что указанный фрагмент представляет собой фрагмент белка или полипептида, отличного от FliD, и при этом указанный образец выбран из группы, состоящей из сыворотки крови, плазмы крови, цельной крови и кала.
Description
Изобретение относится к способу обнаружения инфекции Η. ρνίοπ у субъекта, а также соответствующему набору, при этом указанный способ включает обнаружение в образце, полученном от указанного субъекта, иммунного ответа, направленного против Е1Ю, при этом указанный иммунный ответ включает антитело против Εΐίϋ. Указанный способ включает осуществление реакции указанного образца с Е1Ю или фрагментом Εΐίϋ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы было можно идентифицировать указанный фрагмент как фрагмент Е1Ю и исключить то, что указанный фрагмент представляет собой фрагмент белка или полипептида, отличного от Е1Ю, и при этом указанный образец выбран из группы, состоящей из сыворотки крови, плазмы крови, цельной крови и кала.
Настоящее изобретение относится к способу обнаружения инфекции Не11соЬас!ег, в частности инфекции Н. ру1ог1, применению иммунного ответа в качестве биомаркера и набору для применения в способе обнаружения инфекции Не11соЬас!ег, в частности инфекции Н. ру1оп.
НейсоЬас!ет ру1оп (Н. ру1оп) - микроаэрофильная, грамотрицательная бактерия, имеющая форму спириллы, присутствующая приблизительно у половины населения земли и считающаяся специфичным для человека патогеном желудка (М1сйе!б, е! а1., 1999). У большинства зараженных индивидуумов развивается бессимптомный хронический гастрит. Однако у некоторых субъектов инфекция вызывает хронический гастрит, пептическую язву и атрофию и играет важную роль в развитии лимфомы лимфоидных тканей слизистых оболочек (МАЬТ-лимфомы), аденокарциномы желудка и первичной неходжкинской лимфомы желудка (8идапита, е! а1., 2001).
Всемирная организация здравоохранения отнесла Н. ру1ог1 к канцерогену группы I (Со!о, е! а1., 1999), и прямое доказательство канцерогенеза было продемонстрировано в ходе исследований на животных (Нопба, е! а1., 1998; Т. ^а!апаЬе, е! а1., 1998). Эрадикация Н. ру1ог1 может предотвратить развитие рака желудка у людей (Иетцта, е! а1., 2001). Рассматривались стратегии диагностика и лечение в популяциях с высоким риском рака желудка (Уатаока, е! а1., 1998). Однако подобный подход затруднен недостатком эффективных и доступных тест-систем, в особенности в странах с более низким социальноэкономическим положением. В таких странах применяют только серологические тесты, большинство из которых имеет такой недостаток, как низкие рабочие характеристики, или они плохо валидированы. В отношении серологических тестов на Н. ру1ог1 известны и описаны несколько специфичных единичных маркеров. Эти факторы применяют во многих диагностических подходах, но практически все из них имеют значительные ограничения, которые делают их непригодными для диагностики Н. ру1отк Например, цитотоксин-ассоциированный белок (СадА) является очень хорошо изученным белком Н. ру1ог1. Его кодирует сад-РА1 (островок патогенности цитотоксин-ассоциированного гена), и указанный белок описывают как онкогенный (Етапсо, е! а1., 2005; Мита!а-Кат1уа, е! а1., 2007). Этот белок также является высоко иммунногенным антигеном, из-за этого его часто используют как маркер для серологических тестов. Положительную пробу на СадА можно применять как индикатор вирулентности Н. ру1ог1, в связи с тем, что люди, инфицированные СадА-положительными штаммами, имеют повышенный риск развития гастродуоденальных заболеваний. Однако данный белок не походит в качестве единственного маркера, так как только подгруппа штаммов Н. ру1ог1 является СадА-положительными. Более того, положительная проба на СадА не является отличительным признаком инфекции в активной форме, так как у пациентов после избавления от Н. ру1ог1 сохраняются антитела к СадА в течение многих лет (Еиксош, е! а1., 1999). Таким образом, в серологических тестах этот белок всегда нужно комбинировать с другими подходящими антигенами, чтобы подтвердить положительный результат. Другим хорошо изученным белком Н. ру1ог1 является вакуолизирующий цитотоксин (УасА). Сообщалось, что он вызывает вакуолизацию в клетках, подвергнутых воздействию супернатантов Н. ру1ог1 или очищенного белка (Соует & В1а§ег, 1992). Ген уасА кодирует протоксин массой 140 кДа, в котором аминоконцевая сигнальная последовательность и фрагмент на карбоксильном конце протеолитически отщепляются в ходе секреции, в результате чего образуется активный белок с молекулярной массой 88 кДа, который собирается в гексамеры и образует пору (Моп!есиссо & бе Ветпатб, 2003). Данный белок состоит из двух разных областей. Сигнальная последовательность (§1а, §1Ь, §2) и средняя область (т1, т2), обе имеющие множество аллельных вариаций, которые вероятно регулируют цитотоксическую активность (АШейоп, е! а1., 1995). По причине повышенной вариабельности белка УасА он является непригодным для серологического тестирования.
Другой хорошо изученный белок Н. ру1ог1, СгоЕЬ, относится к семейству молекулярных шаперонов, которые необходимы для правильной укладки (фолдинга) многих белков в условиях стресса (Оипп, е! а1., 1992). В ходе различных исследований было показано, что этот белок является высококонсервативным среди различных штаммов Н. ру1ог1 и что его положительная серологическая реакция у инфицированных пациентов была даже выше, чем для СадА (МассЫа, е! а1., 1993; 8иегЬаит, е! а1., 1994). Кроме того, в ходе исследований, выполненных авторами настоящего изобретения, наблюдали, что положительную серологическую пробу по СгоЕЬ чаще обнаруживали у немецких пациентов с раком желудка по сравнению с аналогичными контрольными группами (неопубликованные данные). Кроме того, предполагается, что антитела против СгоЕЬ могут сохраняться дольше после связанной с болезнью потери инфекции Н. ру1ог1. Таким образом, СгоЕЬ может быть подходящим маркером для текущей или прошедшей инфекции и может помочь преодолеть занижение оценки риска развития связанного с Н. ру1ог1 рака желудка из-за клиренса инфекции (Сао е! а1., 2009).
Таким образом, проблемой, лежащей в основе настоящего изобретения, было обеспечение способа обнаружения инфекции Н. ру1ог1 с высокой чувствительностью и/или высокой специфичностью. Другой проблемой, лежащей в основе настоящего изобретения, было обеспечение анализа, который по сравнению с известными анализами, приводит к меньшему количеству ложноположительных и ложноотрицательных результатов, в частности, при подходах популяционного масштаба. Дополнительной проблемой, лежащей в основе настоящего изобретения, было обеспечение средства для осуществления указанных способов и анализов соответственно. Еще одной дополнительной проблемой, лежащей в основе настоя
- 1 032330 щего изобретения, было обеспечение биомаркера для пациентов, инфицированных Н. ργίοτί, при этом указанный биомаркер предпочтительно не проявляет никакой перекрестной реактивности с другими бактериями и любыми белками, пептидами или молекулами нуклеиновой кислоты, кодирующими, в частности, такие белки и пептиды.
Эти и другие проблемы, лежащие в основе настоящего изобретения, решены посредством сущности настоящего изобретения, изложенного в прилагаемых независимых пунктах формулы изобретения. Предпочтительные варианты реализации могут быть взяты из прилагающихся зависимых пунктов формулы изобретения.
Эти и другие проблемы, лежащие в основе настоящего изобретения, также решены посредством следующих вариантов реализации изобретения.
Вариант реализации 1.
Способ обнаружения инфекции Н. ργίοτί у субъекта, при этом указанный способ включает обнаружение в образце, полученном от указанного субъекта, иммунного ответа, направленного против ΕΙίΌ или фрагмента ΕΙίΌ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы было можно идентифицировать указанный фрагмент как фрагмент ΕΙίΌ и исключить то, что указанный фрагмент представляет собой фрагмент белка или полипептида, отличного от Είίϋ, и при этом указанный образец выбран из группы, состоящей из сыворотки крови, плазмы крови, цельной крови и кала.
Вариант реализации 2.
Способ по варианту реализации 1, в котором если в образце от указанного субъекта обнаруживают иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, то указанный субъект страдает от инфекции Н. ργίοτί, или указанный субъект перенес в прошлом инфекцию Н. ργίοτί.
Вариант реализации 3.
Способ по любому из вариантов реализации 1. 2, в котором если в образце от указанного субъекта не обнаруживают иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, то указанный субъект не страдает от инфекции Н. ργίοτί.
Вариант реализации 4.
Способ по любому из вариантов реализации 1, 2, в котором если в образце от указанного субъекта не обнаруживают иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, то указанный субъект перенес в прошлом инфекцию Н. ργίοτί.
Вариант реализации 5.
Способ по любому из вариантов реализации 1-4, в котором указанный иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, является гуморальным иммунным ответом против ΕΙίΌ, предпочтительно ответ с участием анти-ΕΙίΌ антител.
Вариант реализации 6.
Способ по варианту реализации 5, в котором указанный иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, является гуморальным иммунным ответом против ΕΙίΌ и при этом гуморальный иммунный ответ против ΕΙίΌ включает по меньшей мере одно антитело против ΕΙίΌ, выбранное из группы, включающей антитело 1дС и антитело 1дА.
Вариант реализации 7.
Способ по варианту реализации 5, в котором указанный иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, является иммунным ответом с образованием анти-ΕΙίΌ антител и при этом иммунный ответ с образованием анти-ΕΙίΌ антител включает по меньшей мере одно антитело против ΕΙίΌ, выбранное из группы, включающей антитело 1дС и антитело 1дА.
Вариант реализации 8.
Способ по любому из вариантов реализации 1-7, в котором указанный субъект инфицирован Н. ργίοτί, экспрессирующим ΕΙίΌ.
Вариант реализации 9.
Способ по любому из вариантов реализации 1-8, в котором указанный субъект отличается от субъекта, который является иммуносупрессированным, предпочтительно указанный субъект отличается от субъекта, который получает иммуносупрессивную терапию.
Вариант реализации 10.
Способ по любому из вариантов реализации 1-9, в котором указанный способ дополнительно включает обнаружение одного или более антигенов Н. ργίοτί.
Вариант реализации 11.
Способ по варианту реализации 10, в котором один или несколько антигенов Н. ργίοτί выбраны из группы, включающей СадА, УасА, СгоЕС Ηρ 0231, ΙΗρ 0940 и ΗίτΑ.
Вариант реализации 12.
Способ по любому из вариантов реализации 1-11, в котором указанный способ включает вступление в реакцию образца с ΕΙίΌ или указанным фрагментом ΕΙίΌ.
Вариант реализации 13.
Способ по варианту реализации 13, в котором указанный способ включает вступление в реакцию
- 2 032330 указанного образца с полноразмерным ΕΙίΌ или фрагментом Ε1ίΌ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного ΕΙίΌ, при этом фрагмент ΕΙίΌ все еще активен как фактор вирулентности.
Вариант реализации 14.
Способ по любому из вариантов реализации 12-13, в котором иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, содержит по меньшей мере одно из гуморальных соединений, способных взаимодействовать с ΕΙίΌ, и клеточное соединение, способное взаимодействовать с ΕΙίΌ, при этом по меньшей мере одно гуморальное соединение и/или клеточное соединение взаимодействует с ΕΙίΌ, предпочтительно по меньшей мере одно гуморальное соединение и/или клеточное соединение, взаимодействующее с ΕΙίΌ, образует продукт взаимодействия с ΕΙίΌ или указанным фрагментом ΕΙίΌ.
Вариант реализации 15.
Способ по варианту реализации 14, в котором указанный иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, является гуморальным иммунным ответом против ΕΙίΌ и при этом в результате гуморального иммунного ответа против ΕΙίΌ образуется продукт взаимодействия с ΕΙίΌ или указанным фрагментом ΕΙίΌ.
Вариант реализации 16.
Способ по варианту реализации 14, в котором иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, является иммунным ответом с образованием анти-ΕΙίΌ антител и в котором в результате иммунного ответа с образованием анти-ΕΙίΌ антител образуется продукт взаимодействия с белком ΕΙίΌ или указанным фрагментом ΕΙίΌ.
Вариант реализации 17.
Способ по варианту реализации 14, в котором иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, включает по меньшей мере образование одного антитела против ΕΙίΌ и при этом антитело против ΕΙίΌ образует продукт взаимодействия с ΕΙίΌ.
Вариант реализации 18.
Способ по любому из вариантов реализации 14-17, в котором обнаруживают продукт взаимодействия.
Вариант реализации 19.
Способ по варианту реализации 18, в котором указанный продукт взаимодействия обнаруживают напрямую.
Вариант реализации 20.
Способ по варианту реализации 18, в котором указанный продукт взаимодействия обнаруживают косвенно.
Вариант реализации 21.
Способ по любому из вариантов реализации 1-20, в котором обнаружение происходит посредством твердофазного иммуноферментного анализа (ЕЬ18Л) или линейного иммуноанализа.
Вариант реализации 22.
Способ по любому из вариантов реализации 1-20, в котором обнаружение происходит посредством анализа латерального растекания.
Вариант реализации 23.
Способ по любому из вариантов реализации 1-22, в котором образец выбран из группы, включающей сыворотку, плазму и цельную кровь.
Вариант реализации 24.
Способ по любому из вариантов реализации 1-23, в котором указанным субъектом является человек.
Вариант реализации 25.
Способ по варианту реализации 24, в котором ΕΙίΌ, вступающий в реакцию с образцом, является ΕΙίΌ Н. ру1оп.
Вариант реализации 26.
Способ по варианту реализации 25, в котором ΕΙίΌ включает аминокислотную последовательность согласно 8ЕО ΙΌ N0: 1.
Вариант реализации 27.
Способ по любому из вариантов реализации 1-23, в котором указанным субъектом является свинья. Вариант реализации 28.
Способ по варианту реализации 27, в котором Ε1ίΌ, вступающий в реакцию с образцом, является ΕΙίΌ Н. 5Ш5.
Вариант реализации 29.
Способ по варианту реализации 28, в котором ΕΙίΌ включает аминокислотную последовательность согласно 8Е0 ΙΌ N0: 3.
Вариант реализации 30.
Способ по любому из вариантов реализации 1-23, в котором указанным субъектом является кошка. Предпочтительно указанная кошка выбрана из группы, включающей домашнюю кошку, дикую кошку, малую кошку и большую кошку.
- 3 032330
Вариант реализации 31.
Способ по варианту реализации 30, в котором Ρ1ίΌ, вступающий в реакцию с образцом, является белком ΡΙίΌ бактерии Н. Гебе.
Вариант реализации 32.
Способ по варианту реализации 31, в котором ΡΙίΌ включает аминокислотную последовательность согласно 8Еф ΙΌ N0: 5.
Вариант реализации 33.
Способ по любому из вариантов реализации 1-32, в котором чувствительность способа обнаружения инфекции Н. ρνίοπ у человека составляет более 90% и/или 97% или менее.
Вариант реализации 34.
Способ по любому из вариантов реализации 1-33, в котором специфичность способа обнаружения инфекции Н. ρνίοπ у человека составляет более 90% и/или 99% или менее.
Вариант реализации 35.
Применение присутствия у субъекта иммунного ответа, направленного против ΡΙίΌ, в качестве биомаркера.
Вариант реализации 36.
Применение согласно варианту реализации 35, при котором указанный биомаркер является биомаркером инфицирования субъекта Н. ρνίοπ.
Вариант реализации 37.
Применение согласно любому из вариантов реализации 35, 36, при котором указанный биомаркер является биомаркером инфицирования субъекта Н. ρνίοπ. при этом указанным субъектом является человек.
Вариант реализации 38.
Применение любого из вариантов реализации 35-37, при котором указанный биомаркер является прогностическим биомаркером.
Вариант реализации 39.
Применение любого из вариантов реализации 35-38, при котором указанный иммунный ответ является гуморальным иммунным ответом против ΡΙίΌ.
Вариант реализации 40.
Применение любого из вариантов реализации 35-39, при котором указанный иммунный ответ является иммунным ответом против белка ΡΙίΌ с образованием анти-ΡΙίΌ антител.
Вариант реализации 41.
Набор для применения в способе согласно любому из вариантов реализации 1, 7, 13, 21-23, включающий белок ΡΙίΌ или его фрагмент и твёрдую фазу, при этом ΡΙίΌ или его фрагмент прикреплены к указанной твёрдой фазе, где указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного ΡΙίΌ, при этом фрагмент ΡΙίΌ все еще активен как фактор вирулентности.
Вариант реализации 42.
Набор по варианту реализации 41, в котором по меньшей мере один дополнительный компонент выбран из группы, включающей буфер и/или листок-вкладыш с инструкцией.
Вариант реализации 43.
Набор по любому из вариантов реализации 41, 42, в котором ΡΙίΌ является полноразмерным белком ΡΙίΌ.
Вариант реализации 44.
Набор по любому из вариантов реализации 41, 42, в котором ΡΙίΌ включает аминокислотную последовательность и в котором указанная аминокислотная последовательность выбрана из группы, включающей аминокислотную последовательность согласно 8Еф ΙΌ N0: 1, аминокислотную последовательность согласно 8Еф ΙΌ N0: 3 и аминокислотную последовательность согласно 8Еф ΙΌ N0: 5.
Вариант реализации 45.
Набор по любому из вариантов реализации 41-44, в котором указанный набор подходит для применения или служит для применения в способе обнаружения инфекции Η.ρνίοπ у субъекта.
Вариант реализации 46.
Набор по варианту реализации 45, в котором указанный набор подходит для применения или служит для применения в способе по любому из вариантов реализации 1-34.
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что ΡΙίΌ, который является белком, также называемым гомолог ассоциированного с крюком белка 2, представляет собой маркер инфицирования субъекта Не11соЬас1ег и Н. ρνίοπ в частности. Авторы настоящего изобретения также с удивлением обнаружили, что ΡΙίΌ и/или иммунный ответ, направленный против Ρ1ίΌ, можно выгодно использовать как маркер в серологическом анализе, и в связи с этим соответственно в любом способе и анализе, который основывается на или использует образец, полученный от субъекта, проверяемого на инфекцию НейсцЬаСег и инфекцию Н. ρνίοπ в частности, при этом образец предпочтительно выбирают из группы, включающей образец сыворотки, образец плазмы, образец крови и образец кала. Наконец, авторы на
- 4 032330 стоящего изобретения с удивлением обнаружили, что инфицирование субъекта Не11соЬас1ет и Н. ρνίοπ. в частности, можно обнаружить. взяв за основу Ρ1ίΌ и/или нуклеиновую кислоту. кодирующую Ρ1ίΌ, при этом Ρ1ίΌ и/или нуклеиновая кислота, кодирующая Ρ1ίΌ, используется как единственный маркер. Другими словами, согласно настоящему изобретению инфицирование субъекта НейсоЬас1ег и Н. ру1оп в частности может быть диагностировано исключительно на основе и ссылаясь соответственно на наличие белка Ρ1ίΌ и/или нуклеиновой кислоты, кодирующей таковой. То же самое справедливо для иммунного ответа, направленного против Ρ1ίΌ, который развился у субъекта, инфицированного НеНсоЬас1ет и Н. ру1оп в частности. Согласно настоящему изобретению инфицирование субъекта НейсоЬасЮг и Н. ру1оп в частности может быть диагностировано исключительно на основе и ссылаясь соответственно на наличие иммунного ответа, направленного против Ρ1ίΌ, при этом у субъекта был сформирован иммунный ответ против Ρ1ίΌ. Дополнительное преимущество настоящего изобретения состоит в том, что иммунный ответ, направленный против Ρ1ίΌ, и белок Ρ1ίΌ как таковой могут быть обнаружены в образце, который, как правило, получают неинвазивными способами в отличие от множества известных способов обнаружения, где образец необходимо отобрать посредством инвазивного способа, такого как биопсия.
Специалист в данной области техники согласится, что настоящее изобретение, в целом, может применяться для обнаружения любой инфекции НейсоЬас1ет у субъекта, при условии, что подобный НейсоЬас!ег кодирует и/или экспрессирует Ρ1ίΌ. Специалист в данной области техники также согласится, что, как правило, отдельный вид субъектов, такой как, например, человек, инфицируется определенным видом НейсоЬас1ет. В случае, когда субъектом является человек, видом НеНсоЬас1ет является Н. ру1отг В случае, когда субъектом является свинья, видом НеНсоЬас1ет является Н. 8Ш8. В случае, когда субъектом является кошка, включая больших кошек, видом НеНсоЬас1ет является Н. ГеЙ8. Данное описание изобретения, в частности, относится к обнаружению Н. ру1оп у человека. Подобная ссылка на Н. ру1оп и человека, однако, сделана единственно с целью ясности изложения, и с учетом вышеуказанного любого варианта реализации, относящийся к Н. ру1оп и человеку, равнозначно применим к любому другому НеНсоЬас!ег, экспрессирующему Ρ1ίΌ или его гомолог, и любому другому виду субъекта. Предпочтительно другим видом субъекта является любое млекопитающее, которое страдает или возможно страдает от инфицирования НеНсоЬас1ет и гомологичным Н. ру1оп видом, при этом подобный НеНсоЬас1ет и гомологичный Н. ру1оп вид экспрессирует Ρ1ίΌ или его гомолог.
Специалист в данной области техники также согласится, что для каждого вида НейсоЬас1ег, как правило, существует несколько различных штаммов. Аминокислотная последовательность и последовательность нуклеиновой кислоты для белка Ρ1ίΌ у подобных штаммов вида НейсоЬас1ег, как правило, показывают высокую степень идентичности в отношении аминокислотной последовательности. Более конкретно, биоинформатический анализ показал, что аминокислотная последовательность Ρ1ίΌ присутствует и является высококонсервативной у всех (более 200) штаммов Н. ру1отг Гомологичность Ρ1ίΌ среди приблизительно 200 штаммов Н. ру1оп, которые были проанализированы авторами настоящего изобретения, составляет 97%. Интересно, что за исключением нескольких других, не являющихся пилори, видов НейсоЬасЮг с частичной гомологией, не существует других известных организмов, обладающих значительной геномной или протеомной гомологией с Ρ1ίΌ бактерии Н. ру1отг Сравнительный анализ белка Ρ1ίΌ Н. ру1оп показывает высокую консервативность Ρ1ίΌ у видов НейсоЬас1ет, тогда как он отличается от большинства белков других бактерий, так же как эукариотических организмов. Данный анализ вместе с предположением о высокой антигенности этого белка обеспечивает рациональное основание для фактического отсутствия перекрестной реактивности.
Кроме того, Ρ1ίΌ экспрессируется фактически всеми штаммами, которые инфицируют или способны инфицировать субъект. Это объясняет, почему согласно настоящему изобретению Ρ1ίΌ является маркером для фактически каждого штамма Н. ру1оп и, соответственно, каждого штамма вида НейсоЬас1ет, инфицирующего соответствующий вид субъекта. Другими словами, практически все Н. ру1опположительные пациенты демонстрируют иммунный ответ, направленный против Ρ1ίΌ.
Белок Ρ1ίΌ Н. ру1оп является существенным элементом в сборке функционального жгутика, и мутантные по белку Ρ1ίΌ штаммы являются полностью неподвижными. Флагеллин играет центральную роль в бактериальной подвижности и необходим для колонизации и персистенции инфекции Н. ру1оп (Еа!оп, е! а1., 1996). Подвижность Н. ру1ог1 является фактором вирулентности при патогенезе повреждения слизистой желудка (8. ^а1аиаЬе, е! а1., 1997). Ген Ρ1ίΌ Н. ру1оп кодирует белок массой 76 кДа (К1т, е! а1., 1999). Оперон Ρ1ίΌ Н. ру1оп содержит гены ПаС, Ρ1ίΌ и Ρ118 в заданном порядке под контролем сигма-28-зависимого промотора. Запись о Ρ1ίΌ бактерии Н. ру1оп можно найти в банках данных ИшΡΐΌΐΚΒ/8\νί58-ΡΐΌΐ под номером Р96786.4, предоставляющей среди прочего аминокислотную последовательность белка и мутации Ρ1ίΌ, обнаруженные у различных штаммов Н. ру1отг
Способ согласно настоящему изобретению обнаружения у субъекта инфекции НейсоЬас1ет, предпочтительно инфекции Н. ру1ог1, может быть охарактеризован как способ, включающий этап определения, содержит ли образец от субъекта иммунный ответ, направленный против Ρ1ίΌ, белок Ρ1ίΌ или нуклеиновую кислоту, кодирующую Ρ1ίΌ. Если образец от тестируемого субъекта содержит гуморальный ответ, направленный против Ρ1ίΌ, белок Ρ1ίΌ или нуклеиновую кислоту, кодирующую Ρ1ίΌ, то субъект страдает от инфекции НейсоЬас1ет, предпочтительно инфекции Н. ру1ог1, или перенес в прошлом инфек
- 5 032330 цию Нс11СоЬас1сг. предпочтительно инфекцию Н. ру1оп.
Способ согласно настоящему изобретению обнаружения у субъекта инфекции НейсоЬас!ег. предпочтительно инфекции Н. ру1ог1. может быть также применим по отношению к субъекту. у которого неизвестно. страдает ли он от инфекции НейсоЬас!ег. предпочтительно инфекции Н. ру1оп. или подобный субъект перенес инфекцию НеНсоЬас1ег. предпочтительно инфекцию Н. ру1оп. В этой степени настоящее изобретение относится в дополнительном аспекте к способам определения. страдает ли субъект от инфекции НейсоЬас!ег. предпочтительно инфекции Н. ру1оп. или перенес в прошлом инфекцию НейсоЬас1ег. предпочтительно инфекцию Н. ру1оп.
Предпочтительно используемое в настоящей заявке выражение в прошлом относится к моменту времени. который предшествует моменту времени. когда образец брали или берут у субъекта. при этом подобный образец является образцом. используемым в связи с различными аспектами и/или различными вариантами реализации настоящего изобретения и. в частности. при обнаружении Н. ру1оп и/или инфекции Н. ру1оп у субъекта и при диагностике Н. ру1оп и/или инфекции Н. ру1оп у субъекта.
В связи с различными аспектами настоящего изобретения и различными способами согласно настоящему изобретению в частности специалист в данной области техники согласится. что иммунный ответ и иммунный ответ с образованием анти-ΕΊίΌ антител. формирующийся у субъекта. инфицированного Не11соЬас!ег и Н.ру1оп в частности. сохраняется в течение нескольких лет. Преобладание подобного иммунного ответа с образованием анти-ΕΊίΌ антител. как правило. составляет примерно 50% после 1-5 лет после эрадикации Н.ру1оп. примерно 50% после 6-10 лет после эрадикации Н.ру1оп. примерно 25% после 11-15 лет после эрадикации Н.ру1оп и примерно 25% после 16-20 лет после эрадикации Н. ру1оп. В свете этого. субъект. которому поставили Н.ру1оп-положительный диагноз. может быть субъектом. который действительно страдает от инфекции Н. ру1оп в момент. когда был отобран образец. или субъектом. который перенес инфекцию Н. ру1оп в прошлом с все еще преобладающим иммунным ответом. направленным против ΕΊίΌ.
В тех случаях. когда иммунный ответ. направленный против ΕΊίΌ. является гуморальным иммунным ответом против Ρ1ίΌ и иммунным ответом с образованием анти-ИЮ антител в частности. антитела против Ρ1ίΌ. как правило. представлены иммуноглобулинами классов 1дС или 1дЛ. Эта классовая специфичность может быть использована при обнаружении анти-ИЮ антител путем применения антител к 1§С и/или 1дЛ в качестве обнаруживающих антител или захватывающих антител. В варианте реализации. где субъектом является человек. обнаруживающие антитела и захватывающие антитела являются предпочтительно антителами к 1дС человека и/или 1дЛ человека.
В связи с различными аспектами настоящего изобретения и различными способами согласно настоящему изобретению в частности способы могут в одном из вариантов реализации изобретения дополнительно включать обнаружение одного или более антигенов НейсоЬас!ег или нуклеиновой кислоты. кодирующей подобные антигены Не11соЬас!ег. В одном из вариантов реализации подобные антигены Не11соЬас!ег являются антигенами Н. ру1оп. В одном из других вариантов реализации антигены выбраны из группы. включающей СадА. УасА. СгоЕЬ. Нр 0231. 1Нр 0940 и Н1гА. которые хорошо известны в данной области техники и описаны. например. в УакооЬ Ί. е! а1. (УакооЬ Ί. е! а1.. Си! апб Ыуег. Уо1. 4. Ыо. 3. 8ер!етЬег 2010. рр. 345-350). 8аЬаг1й N. е! а1. (8аЬайй N. е! а1.. 1пЕес1юп апб ΙιηιηιιηίΙν. Ыоу. 2002. р. 64996503). Сао Ь. е! а1. (Сао Ь. е! а1.. Сапсег Кез 2009; 69: (15). Аидиз! 1. 2009. р. 6164 - 6170). Уатаока У. (Уатаока У.. Ί. Меб. МюгоЬю1. 2008 Мау; 57 (Р!5): 545-553). М1ей1ке 8. е! а1. (М1ей1ке 8. е! а1.. Ιη!. Ί. Сапсег: 87. 322-327 (2000)) и АИейоп ЕС. е! а1. (АШейоп ЕС. е! а1.. Сиггеп! МюгоЬю1оду. Уо1. 39(1999). рр. 211-218). Аминокислотная последовательность СадА раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕО ΙΌ N0: 7. нуклеотидная последовательность СадА раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕО ΙΌ N0:8. аминокислотная последовательность УасА раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕО ΙΌ N0: 9. нуклеотидная последовательность УасА раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕО ΙΌ N0:10. аминокислотная последовательность СгоЕЬ раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕО ΙΌ N0: 11. нуклеотидная последовательность СгоЕЬ раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:12. аминокислотная последовательность Нр0231 раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:13. нуклеотидная последовательность Нр0231 раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:14. аминокислотная последовательность ЕНр0940 раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:15. нуклеотидная последовательность ЕНр0940 раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:16. аминокислотная последовательность Н!гА раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8Е0 ΙΌ N0:17 и нуклеотидная последовательность Н1гЛ раскрыта в настоящей заявке как последовательность 8ЕС ΙΌ N0:18.
В варианте реализации способа согласно настоящему изобретению. где инфекция НейсоЬас!ег и более предпочтительно инфекция Н. ру1оп обнаруживают у субъекта посредством обнаружения в образце от субъекта иммунного ответа. направленного против Ε1ΊΌ. и. в частности. анти-ИЮ антител в образце. образец и белок Ε1ΊΌ вступают в реакцию. В одном из вариантов реализации образец добавляют к Ε1ίΌ. Предпочтительно при подобном способе Ε1ίΌ прикреплен к твердой фазе. В рамках настоящего изобретения находится также то. что Ε1ίΌ добавляют к образцу. Предпочтительно Ε1ίΌ добавляют как раствор.
- 6 032330 более предпочтительно как водный раствор, такой как забуференный раствор. В предпочтительном варианте реализации Ε1ίΌ, вступающий в реакцию с образцом, прикреплен к твердой фазе. Специалист в данной области техники согласится, что ΕΙίΌ и образец вступают в реакцию при таких условиях, что если образец содержит иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, и антитела против ΕΙίΌ в частности, то образуется продукт взаимодействия. Предпочтительно подобный продукт взаимодействия является комплексом ΕΙίΌ и антитела против ΕΙίΌ, содержащегося в образце.
Образованный таким образом продукт взаимодействия может быть обнаружен напрямую или косвенно. В варианте реализации настоящего изобретения, где продукт взаимодействия обнаруживают напрямую, ΕΙίΌ, вступающий в реакцию с образцом, содержит метку, которая позволяет обнаруживать ΕΙίΌ, в частности, при взаимодействии с антителом против ΕΙίΌ. Метки этого типа известны специалистам в данной области техники и охватывают радиоактивные метки, флуоресцентные метки, красители, наночастицы, такие как золото, и ферменты, такие как пероксидаза хрена. Дополнительными метками являются метки, раскрытые в настоящей заявке в связи с мечением антител. В варианте реализации, где продукт взаимодействия определяют косвенно, продукт взаимодействия затем вступает в реакцию с обнаруживающим агентом, при этом обнаруживающий агент специфически связывается с продуктом взаимодействия. Подобным обнаруживающим агентом может быть антитело, предпочтительно анти-1дО или анти-1дА антитело. Обнаруживающий агент сам, как правило, содержит метку, которая позволяет обнаруживать обнаруживающий агент, предпочтительно, когда обнаруживающий агент специфически связан с продуктом взаимодействия.
В предпочтительных вариантах реализации способов согласно настоящему изобретению продукт взаимодействия определяют посредством твердофазного иммуноферментного анализа (ЕЬ18А) или радиоиммуноанализа, который известен специалистам в данной области техники (Еойкреюй Ε. апй ΖοιΕηδ Н. (ейк.), Вюапа1уйк, 8рек1гит АкайетЕсйег Уег1ад Не1йе1Ьегд, 1998). Способ ЕЬ18А может быть непрямым, сендвич-анализом, конкурентным или неконкурентным.
В альтернативных предпочтительных вариантах реализации способов согласно настоящему изобретению продукт взаимодействия обнаруживают посредством анализа латерального растекания, который также известен как иммуно-хроматографический анализ латерального растекания, который, например, описан в патенте США № 6485982. Подобный анализ латерального растекания в одном из вариантов реализации применяют при любом способе согласно настоящему изобретению, где присутствует любое антитело против Ε1ίΌ, и, соответственно, в образце, полученном от субъекта, обнаруживают антитела против Ε1ίΌ. Анализ латерального растекания описывается с целью иллюстрации варианта реализации способа согласно настоящему изобретению, где антитела против Ε1ίΌ обнаруживают в образце от субъекта, при этом субъектом является человек.
В основе технологии анализа латерального растекания лежит серия капиллярных подложек, таких как фрагменты пористой бумаги или полимера. Каждый из этих компонентов обладает способностью стремительно переносить жидкость, например сыворотку, плазму или кровь. Подушка для нанесения образца действует как губка и задерживает избыток жидкости образца. Когда подушка для нанесения образца насыщена, жидкость перемещается на подложку с конъюгатом, на которой расположены наночастицы, предпочтительно золотые наночастицы, конъюгированные с антителом к иммуноглобулину человека. Когда жидкость образца мигрирует к этому элементу, она растворяет частицы и в ходе одной общей реакции смесь образца с конъюгатом протекает через пористую структуру. Таким образом, антитело, иммобилизованное на поверхности наночастиц, связывается с 1дО человека, присутствующим в образце, в то время как мигрируя дальше через следующую капиллярную матрицу. На этом элементе, который, как правило, является гидрофобной мембраной подобной нитроцеллюлозе, антигены, также как и контроль (например, 1дО человека), иммобилизованы в качестве тестовых и контрольных линий. Как только 1дО человека, который сейчас связан с частицами конъюгата, достигнет этих линий, антиген, иммобилизованный на мембране, специфически захватит комплекс антитела. Спустя некоторое время частиц накопится все больше на месте прикрепления антигена и появится легко обнаруживаемая окрашенная полоса. В одном из вариантов реализации присутствует только один антиген, именуемый Ε1ίΌ. В другом варианте реализации кроме Ε1ίΌ присутствует один или более антигенов. Предпочтительно один или более антигенов выбирают из группы, включающей СадА, УасА, ОгоЕЬ, Нр0231, 1Нр 0940 и Н1гА.
В дополнительных альтернативных предпочтительных вариантах реализации способов согласно настоящему изобретению продукт взаимодействия обнаруживают посредством линейного иммуноанализа. Подобный линейный иммуноанализ, как правило, включает множество полосок. На упомянутых полосках фиксируют высокоочищенный рекомбинантный либо белок Ε1ίΌ, либо агент с возможностью взаимодействия, который способен взаимодействовать с Ε1ίΌ. Подобные полоски предпочтительно выполнены из нитроцеллюлозной мембраны. Эти полоски инкубируют с образцом, предпочтительно с разбавленным образцом сыворотки или плазмы, и на тестовых полосках антитела против Ε1ίΌ связываются с Ε1ίΌ в случае, когда Ε1ίΌ иммобилизован для обнаружения анти-РНО антител в образце, или Ε1ίΌ связывается с антителами против Ε1ίΌ в случае, когда антитела против Ε1ίΌ иммобилизованы для обнаружения Ε1ίΌ в образце. На втором этапе полоски инкубируют с антителами к иммуноглобулинам (1дО и 1дА), которые соединены с пероксидазой хрена. Специфически связанные антитела обнаруживают с помощью
- 7 032330 реакции окрашивания, катализируемой пероксидазой. Если произошла реакция антиген-антитело с образованием продукта взаимодействия, то появится темная полоса на полоске в соответствующей точке. В одном из вариантов реализации настоящего изобретения контрольные полосы на верхнем конце тестовых полосок представляют собой:
a) контрольную полосу прохождения реакции, находящуюся под номером полоски, которая должна показывать выполнение реакции для каждого образца;
b) контрольные полосы для конъюгата (1дС. 1дА), которые используют для проверки класса обнаруживаемых антител. Если, например, используют тестовую полоску для обнаружения антител класса 1дС. то конъюгат 1§С покажет четкую полосу;
c) контроль порогового значения. Интенсивность этой полосы позволяет оценить реактивность отдельных полос антигенов.
Анализ, имеющий такой принцип устройства, с антигенами, отличающимися от ΕΙίΌ, по существу, доступен от компании М1кгодеп ОтЬН, Нойрид, Германия, как гесотЬте Не11соЬас!ег 1дС или гесотЬте НейсоЬас!ег 1дА (ссылка: ййр://тетете.т1кгодеп.бе/ир1оаб8/!х_оет1кгодеп!аЬ1е8/ бокитеп!е/6АКГНР001ЕИ.рб£).
В одном из вариантов реализации способа согласно настоящему изобретению обнаружения у субъекта инфекции Не1юоЬас!ег и более предпочтительно инфекции Н. ру1огг где способ включает обнаружение в образце от субъекта белка Γ1ίΌ, Γ1ίΌ обнаруживают посредством масс-спектрометрии, которая, например, описана в Гойкреюй Г. апб йогЬах Н. (еб§.), В1оапа1уйк, 8рек!гит Акабетщсйег Уег1ад НеИе1Ьегд, 1998.
В этих вариантах реализации способов согласно настоящему изобретению, где Ε1ίΌ обнаруживают в образце от субъекта, агент с возможностью взаимодействия, образующий вместе с Ε1ίΌ продукт взаимодействия, предпочтительно выбран из группы, включающей антитело, аптамер и шпигельмер. Создание подобных агентов с возможностью взаимодействия находится в пределах квалификации специалиста в данной области техники.
Создание антитела, связывающегося, а конкретнее специфически связывающегося с Ε1ίΌ, хорошо известно специалисту в данной области техники и, например, описано в Наг1оте, Е., аиб Гапе, Ό., ΛπΙίЬоб1е§: А ЬаЬога!огу Мапиа1, Со1б 8рппд НагЬог ЬаЬога!огу, Со1б 8рппд НагЬог, ΝΥ, (1988). Предпочтительно применительно к настоящему изобретению можно использовать моноклональные антитела, которые можно получить согласно протоколу Сезаря Милыптейна и дополнительных разработок, основанных на нем. Используемое в настоящей заявке понятие антитела включает, но не ограничивается полными антителами, фрагментами антител или производными, такими как ГаЬ-фрагменты, Гс-фрагменты и одноцепочечные антитела, при условии, что они подходят и способны связывать белок Γ1ίΌ. Кроме моноклональных антител, можно использовать и/или создавать также поликлональные антитела. Создание поликлональных антител также хорошо известно специалисту в данной области техники и, например, описано в Наг1оте, Е., апб Ьапе, Ό., АпйЬоЛек: А ЬаЬога!огу Мапиа1, Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬога!огу, Со1б 8ргшд НагЬог, ΝΥ, (1988).
Антитела, которые можно использовать согласно настоящему изобретению, могут иметь один или несколько маркеров или меток. Подобные маркеры или метки могут быть полезны для обнаружения антитела. Предпочтительно маркеры и метки выбирают из группы, включающей авидин, стрептавидин, биотин, золото, ферменты, такие как пероксидаза хрена, и флуоресцеин, и используют, например, в способах ЕЫ8А. Эти и дополнительные маркеры, так же как способы, описаны в Наг1оте, Е., апб Ьапе, Ό., АпйЬоЛек: А ЬаЬога!огу Мапиа1, Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬога!огу, Со1б 8ргшд НагЬог, ΝΥ, (1988).
Аптамеры являются Ό-нуклеиновыми кислотами, которые являются либо одноцепочечными, либо двухцепочечными и которые специфически взаимодействуют с целевой молекулой, такой как Γ1ίΌ в настоящем изобретении. Получение или выбор аптамеров описан, например, в европейском патенте ЕР № 0533838. В основном выполняют следующие этапы. Во-первых, обеспечивают смесь нуклеиновых кислот, то есть потенциальных аптамеров, в которой каждая нуклеиновая кислота, как правило, включает сегмент из нескольких, предпочтительно по меньшей мере из восьми, последовательных рандомизированных нуклеотидов. Эта смесь затем вступает в контакт с целевой молекулой, при этом нуклеиновая кислота (кислоты) связывается с целевой молекулой, например, на основании повышенной аффинности к целевой молекуле или связывается с ней сильнее по сравнению с потенциальной смесью. После этого связывающуюся нуклеиновую кислоту (кислоты) отделяют от остатков смеси. При необходимости полученную таким образом нуклеиновую кислоту (кислоты) амплифицируют, используя, например, полимеразную цепную реакцию. Эти этапы могут быть повторены несколько раз с получением в конце смеси, имеющей повышенную долю специфически связывающихся с целевой молекулой нуклеиновых кислот, из которой при необходимости затем выбирают конечную связывающуюся нуклеиновую кислоту. Эти специфически связывающиеся нуклеиновые кислоты называются аптамерами. Очевидно, что на любом этапе способа создания или идентификации аптамеров могут быть отобраны образцы смеси отдельных нуклеиновых кислот для определения их последовательности с использованием стандартных методик. В рамках настоящего изобретения находится то, что аптамеры могут быть стабилизированы, например, путем введения определенных химических групп, которые известны специалисту в области создания
- 8 032330 аптамеров. Подобные модификации могут, например, состоять в введении аминогруппы в 2' положение остатка сахара нуклеотидов.
Создание или получение шпигельмеров, связывающихся, а конкретнее специфически связывающихся, с Ε1ίΌ в качестве целевой молекулы, основано на схожем принципе. Получение шпигельмеров описано в международной заявке на патент \УО 98/08856. Шпигельмеры являются Ь-нуклеиновыми кислотами, что означает, что они состоят из Ь-нуклеотидов, а не из Ό-нуклеотидов, как аптамеры. Шпильгельмерам свойственен тот факт, что они имеют очень высокую стабильность в биологической системе и по сравнению с аптамерами специфически взаимодействуют с целевой молекулой, против которой они направлены. С целью создания шпигельмеров создают гетерогенную популяцию Ό-нуклеиновых кислот, и эта популяция вступает в контакт с оптическим антиподом целевой молекулы, в настоящем случае, например, с Ό-энантиомером встречающегося в природе Ь-энантиомера белка Ε1ίΌ. После этого отделяют те Ό-нуклеиновые кислоты, которые не взаимодействуют с оптическим антиподом целевой молекулы. Однако те Ό-нуклеиновые кислоты, взаимодействующие с оптическим антиподом целевой молекулы, отделяют, при необходимости определяют и/или секвенируют, а затем синтезируют соответствующие Ьнуклеиновые кислоты на основе информации о последовательностях нуклеиновых кислот, полученной от Ό-нуклеиновых кислот. Эти Ь-нуклеиновые кислоты, которые в отношении последовательности идентичны вышеупомянутым Ό-нуклеиновым кислотам, взаимодействующим с оптическим антиподом целевой молекулы, будут специфически взаимодействовать с встречающейся в природе целевой молекулой, а не с оптическим антиподом таковой. Подобно способу создания аптамеров также возможно повторение по нескольку раз различных этапов создания шпигельмеров, таким образом увеличивая количество тех нуклеиновых кислот, которые специфически взаимодействуют с оптическим антиподом целевой молекулы.
В вариантах реализации способа согласно настоящему изобретению обнаружения инфекции НеНсоЬас1ет и более предпочтительно инфекции Н. ру1оп, у субъекта, где способ включает обнаружение в образце от субъекта нуклеиновой кислоты, кодирующей белок Ε1ίΌ, агент с возможностью взаимодействия выбирают из группы, включающей праймер и зонд. С учетом раскрытой в настоящей заявке нуклеотидной и аминокислотной последовательностей белка Ε1ίΌ разработка и приготовление подобных праймера и зонда находится в пределах квалификации специалиста (см., например, ЬоИзреюй Ε. апй 2отЬа§ Н. (ейк.), Вюапа1у11к, 8рек1тит Акайетксйет Уег1ад Не1йе1Ьегд, 1998). На подобный агент с возможностью взаимодействия можно поставить метку. Различные метки и способы мечения агента с возможностью взаимодействия известны специалисту в данной области техники. В одном из вариантов реализации метки являются такими же, как приведено выше в части, касающейся антител.
Продукт взаимодействия, включающий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую белок Ε1ίΌ или его фрагмент, и агент с возможностью взаимодействия, можно обнаружить с помощью средств, известных специалисту в данной области техники, и описанных, например, в ЬоЩреюй Е. апй 2отЬа§ Н. (ейк.), Вюапа1уйк, 8рек1шт Акайетксйет Уег1ад Не1йе1Ьегд, 1998.
В одном из вариантов реализации способа согласно настоящему изобретению обнаружения инфекции НеНсоЬас1ет и более предпочтительно инфекции Н. ру1оп у субъекта, где способ включает обнаружение в образце от субъекта нуклеиновой кислоты, кодирующей Ε1ίΌ, нуклеиновую кислоту, кодирующую Ε1ίΌ, обнаруживают посредством масс-спектрометрии, которая описана, например, в Ьойзреюй Е. апй 2отЬа§ Н. (ей§.), Вюапа1у11к, 8рек1тит Акайетксйет Ует1ад Не1йе1Ьегд, 1998.
В одном из вариантов реализации способа согласно настоящему изобретению обнаружения инфекции НеНсоЬас1ет и более предпочтительно инфекции Н. ру1оп у субъекта, где способ включает обнаружение в образце от субъекта, нуклеиновой кислоты, кодирующей Ε1ίΌ, нуклеиновую кислоту, кодирующую Ε1ίΌ, обнаруживают посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР) в ее различных формах, которые описаны, например, в ЬоЩреюй Ε. апй 2отЬа§ Н. (ей§.), Вюапа1у11к, 8рек1шт Акайетксйет Уег1ад Не1йе1Ьегд, 1998. Альтернативно, нуклеиновую кислоту, кодирующую Ε1ίΌ, обнаруживают посредством гибридизационного анализа, как описано, например, в ЬоИзреюй Ε. апй 2отЬа§ Н. (ей§.), Вюапа1у11к, 8рек1тит Акайетксйет Уег1ад Не1йе1Ьегд, 1998.
Касательно тех аспектов настоящего изобретения, относящихся к биомаркеру, не вызовет возражений, что иммунный ответ, направленный против Ε1ίΌ, как описано в настоящей заявке, белок Ε1ίΌ и нуклеиновая кислота, кодирующая Ε1ίΌ, каждый из них действуют как прогностический биомаркер, так как наличие упомянутого иммунного ответа против Ε1ίΌ, как описано в настоящей заявке, белка Ε1ίΌ и/или нуклеиновой кислоты, кодирующей Ε1ίΌ, коррелирует с результатами гистологических анализов и воспалением у пациентов, не подвергавшихся лечению.
Специалист в данной области техники согласится, что с учетом представленного в настоящей заявке раскрытия изобретения конкретная разработка набора согласно настоящему изобретению находится в пределах квалификации специалиста в данной области. В одном из вариантов реализации настоящего изобретения набор является готовым к применению набором.
В дополнительном аспекте настоящего изобретения настоящее изобретение относится к применению агентов с возможностью взаимодействия, как раскрыто в настоящей заявке, для обнаружения Ε1ίΌ, как раскрыто в настоящей заявке.
- 9 032330
Предпочтительно использующееся в настоящей заявке понятие образец относится к образцу, сразу полученному от субъекта, или образцу, который был подготовлен перед использованием в связи с настоящим изобретением и, в частности, со способами согласно настоящему изобретению.
В одном из вариантов реализации различных аспектов настоящего изобретения и вариантах реализации настоящего изобретения субъект является субъектом, который предположительно страдает или подозревают, что он страдает от инфекции Н. ργίοτί.
В одном из вариантов реализации инфекция ΗοΙχοΕκΙΟΓ представляет собой инфицирование НейссЬас1:ег или предполагаемое или подозреваемое инфицирование Ней^Ьа^ег.
В одном из вариантов реализации любого аспекта настоящего изобретения, где первое соединение специфически взаимодействует или специфически связывается со вторым соединением, взаимодействие или связывание между упомянутым первым соединением и упомянутым вторым соединением характеризуется константой диссоциации Кс, составляющей 1 мкМ или менее, предпочтительно Кс, составляющей 0,25 мкМ или менее, и более предпочтительно Кс, составляющей 0,1 мкМ или менее.
Специалисту в данной области будет понятно, что те варианты реализации, где обнаруживают ΕΙίΌ, белок ΕΙίΌ может быть представлен или как полноразмерный ΕΙίΌ или фрагмент ΕΙίΌ или как фрагмент полноразмерного ΕΙίΌ. Предпочтительно использующееся в настоящей заявке понятие «полноразмерный ΕΗΌ» представляет собой синтезируемый НейтоЬаЛег белок ΕΙίΌ, который является активным в качестве фактора вирулентности. В одном из вариантов реализации настоящего изобретения полноразмерный ΕΙίΌ является предпочтительно белком ΕΙίΌ, синтезируемым Ней^Ьа^ег. Фрагмент полноразмерного ΕΙίΌ является фрагментом, аминокислотная последовательность которого короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного ΕΙίΌ, при этом фрагмент ΕΙίΌ все еще активен как фактор вирулентности. Фрагмент ΕΙίΌ предпочтительно является фрагментом ΕΙίΌ, предпочтительно полноразмерного ΕΙίΌ, при этом фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы позволить специалисту в данной области техники идентифицировать фрагмент как фрагмент ΕΙίΌ и полноразмерного ΕΙίΌ в частности и исключить возможность того, что фрагмент является фрагментом белка или полипептида, отличного от ΕΙίΌ и полноразмерного ΕΙίΌ в частности. В одном из предпочтительных вариантов реализации полноразмерный ΕΙίΌ включает аминокислотную последовательность согласно 8ЕЦ ΙΌ N0: 1.
Аналогичные замечания и определения применимы в равной степени к нуклеиновой кислоте, кодирующей ΕΙίΌ. В соответствии с этим специалисту в данной области будет понятно, что в тех вариантах реализации, где обнаруживают нуклеиновую кислоту, кодирующую ΕΙίΌ, нуклеиновая кислота, кодирующая ΕΙίΌ, может быть представлена как нуклеиновая кислота, кодирующая полноразмерный ΕΙίΌ, или как нуклеиновая кислота, кодирующая фрагмент ΕΙίΌ, или как нуклеиновая кислота, кодирующая фрагмент полноразмерного ΕΙίΌ. Предпочтительно использующееся в настоящей заявке понятие полноразмерный ΕΗΌ представляет собой синтезируемый Ней^Ьа^ег белок ΕΙίΌ, который является активным в качестве фактора вирулентности. В одном из вариантов реализации полноразмерный ΕΙίΌ является предпочтительно белком ΕΙίΌ, синтезируемым Ней^^Сет. Фрагмент полноразмерного ΕΙίΌ является фрагментом, аминокислотная последовательность которого короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного ΕΙίΌ, при этом фрагмент ΕΙίΌ все еще активен как фактор вирулентности. Фрагмент ΕΙίΌ предпочтительно является фрагментом ΕΙίΌ, предпочтительно полноразмерного ΕΙίΌ, при этом фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы позволить специалисту в данной области техники идентифицировать фрагмент как фрагмент ΕΙίΌ и полноразмерного ΕΙίΌ в частности и исключить возможность того, что фрагмент является фрагментом белка или полипептида, отличного от ΕΙίΌ и полноразмерного ΕΙίΌ в частности. В одном из предпочтительных вариантов реализации нуклеиновая кислота, кодирующая полноразмерный ΕΙίΌ, включает нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ΙΌ N0: 2.
Фрагмент нуклеиновой кислоты, кодирующей ΕΙίΌ, предпочтительно является фрагментом нуклеиновой кислоты, кодирующей ΕΙίΌ, предпочтительно полноразмерный ΕΙίΌ, при этом фрагмент нуклеиновой кислоты имеет нуклеотидную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы позволить специалисту в данной области техники идентифицировать фрагмент как фрагмент нуклеиновой кислоты, кодирующей ΕΙίΌ и полноразмерный ΕΙίΌ в частности, и исключить возможность того, что фрагмент нуклеиновой кислоты является фрагментом нуклеиновой кислоты, кодирующей белок или полипептид, отличный от ΕΙίΌ и полноразмерного ΕΙίΌ в частности.
Специалисту в данной области техники также будет понятно, что в тех вариантах реализации способов согласно настоящему изобретению, где обнаруживают иммунный ответ, направленный против ΕΙίΌ, как описано в настоящей заявке, ΕΙίΌ, который вступает в реакцию с соединениями, характерными для иммунного ответа против ΕΙίΌ, как описано в настоящей заявке, может быть белком ΕΙίΌ, синтезированным видом Ней^Ьа^ег, инфицирующим субъект или предположительно инфицирующим субъект, может быть полноразмерным ΕΙίΌ, как описано в настоящей заявке, или может быть фрагментом ΕΙίΌ, как описано в настоящей заявке. Кроме того, фрагмент ΕΙίΌ является в одном из вариантов реализации настоящего изобретения фрагментом ΕΙίΌ, имеющим более короткую аминокислотную последовательность, чем ΕΙίΌ, при этом фрагмент может быть использован в упомянутых вариантах реализации спосо
- 10 032330 бов согласно настоящему изобретению, вместе с тем допуская специфическое взаимодействие с соединениями, характерными для иммунного ответа против Ε1ίΌ, или специфическое обнаружение иммунного ответа против Ε1ίΌ, как описано в настоящей заявке.
В связи с настоящим изобретением праймер, имеющий целью нуклеиновую кислоту, кодирующую Ε1ίΌ, используемый в связи с различными аспектами настоящего изобретения и/или в связи с различными вариантами реализации настоящего изобретения выбран из группы, включающей праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 21, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 22, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 23, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 24, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 25, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 26, праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 27, и праймер, включающий нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 28. Предпочтительно праймер является комбинацией по меньшей мере двух праймеров, при этом первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 21, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 22;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 21, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 24;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 21, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 26;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 21, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 28;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 23, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 22;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 23, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 24;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 23, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 26;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 23, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 28;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 25, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 22;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 25, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 24;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 25, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 26;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 25, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 28;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 27, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 22;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 27, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 24;
первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 27, и второй праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 26; или первый праймер по меньшей мере из двух праймеров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8Е0 ГО N0: 27, и второй праймер по меньшей мере из двух прай
- 11 032330 меров является праймером, включающим нуклеотидную последовательность согласно 8ЕС ГО N0: 28.
Различные последовательности, на которые ссылаются в настоящей заявке, соединения, представленные упомянутыми последовательностями, организмы, из которых были взяты упомянутые последовательности, и в некоторых случаях указания на соответствующий номер записи последовательности в общедоступных банках данных обобщены в следующей табл. 1.
Таблица 1
8Е0 ГО N0: 1 является аминокислотной последовательностью белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. ру1огг которая соответствует в Сеийапк номеру записи АС127464.1.
8Е0 ГО N0: 2 является нуклеотидной последовательностью (кодирующей ДНК) белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. ру1огг которая соответствует в Сеийапк номеру записи СР001173.1.
8ЕС ГО N0: 3 является аминокислотной последовательностью белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. 8Ш8, которая соответствует в банке данных NСΒI референтной последовательности АР_006563874.1.
8ЕС ГО N0: 4 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. 8Ш8, которая соответствует в Сеийапк номеру записи А0СУ01000008.1.
8ЕС ГО N0: 5 является аминокислотной последовательностью белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. £еЙ8, которая соответствует в банке данных NСΒI референтной последовательности УР_004073770.1.
8ЕС ГО N0: 6 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка Ε1ίΌ, экспрессируемого Н. £еЙ8, которая соответствует в СепВапк номеру записи БС670179.2.
8ЕС ГО N0: 7 является аминокислотной последовательностью белка СадА штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности УР_002266135.1.
8ЕС ГО N0: 8 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка СадА штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в СепВапк номеру записи Ю318032.1.
8ЕС ГО N0: 9 является аминокислотной последовательностью белка УасА штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности УР_002266461.1.
8ЕС ГО N0: 10 является последовательностью нуклеиновой кислоты (кДНК) белка УасА штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в банке данных NСВI референтной последовательности N^011333.1.
8ЕС ГО N0: 11 является аминокислотной последовательностью белка СгоЕЕ штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности УР_002265651.1.
8ЕС ГО N0: 12 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка СгоЕБ штамма о£ Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности N^011333.1.
8ЕС ГО N0: 13 является аминокислотной последовательностью белка Нр0231 штамма Н. ру1оп 26695, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности ИР_207029.1.
8ЕС ГО N0: 14 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка Нр0231 штамма Н. ру1оп 26695, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности N^000915.1.
8ЕС ГО N0: 15 является аминокислотной последовательностью белка Шр0940 штамма Н. ру1оп 199, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности НР_223657.1.
8ЕС ГО N0: 16 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка Шр0940 штамма Н. ру1оп 199, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности N^000921.1.
8ЕС ГО N0: 17 является аминокислотной последовательностью белка Н1гЛ штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности УР_002266040.1.
8ЕС ГО N0: 18 является нуклеотидной последовательностью (кДНК) белка Н1гА штамма Н. ру1оп С27, которая соответствует в базе данных NСВI референтной последовательности N^011333.1.
8ЕС ГО N0: 19 является праймером, используемым при клонирование гена Е1ГО, полученного от Н. ру1оп.
8ЕС ГО N0: 20 является праймером, используемым при клонирование гена Е1ГО, полученного от Н. ру1оп.
8ЕС ГО N0: 21 является прямым праймером, используемым при ПЦР1 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 22 является обратным праймером, используемым при ПЦР1 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 23 является прямым праймером, используемым при ПЦР2 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 24 является обратным праймером, используемым при ПЦР2 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 25 является прямым праймером, используемым при ПЦР3 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 26 является обратным праймером, используемым при ПЦР3 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 27 является прямым праймером, используемым при ПЦР4 в примере 9.
8ЕС ГО N0: 28 является обратным праймером, используемым при ПЦР4 в примере 9.
Специалисту в данной области будет понятно, что в случае, когда нуклеотидная последовательность является последовательностью ДНК и, в частности, последовательностью кДНК, в настоящей заявке также раскрыта последовательность РНК, отличающаяся от такой последовательности ДНК и последовательности кДНК только тем, что остаток сахара представляет собой рибонуклеотид, а не дезоксирибонуклеотид.
Настоящее изобретение далее дополнительно проиллюстрировано следующими фигурами и примерами, которые не ограничивают объем защиты настоящего изобретения. Из упомянутых фигур и примеров могут быть взяты дополнительные признаки, варианты реализации и преимущества изобретения, где
- 12 032330 на фиг. 1 показан вариант реализации линейного иммуноанализа, применяемого в способах согласно настоящему изобретению для определения анти-ΕΙίΌ антител в образцах сыворотки, полученных от 20 пациентов, которые были диагностированы как Н. ру1ой-положительные по результатам гистологического анализа;
на фиг. 2 показан один из вариантов реализации анализа латерального растекания, который можно применять в способах согласно настоящему изобретению для обнаружения анти-ΕΙίΌ антител в образце, таком как цельная кровь, полученном от субъекта-человека, при этом на фиг. 2А показано схематическое изображение анализа, а на фиг. 2В представлен результат анализа;
на фиг. 3 показана диаграмма, указывающая на преобладание иммунного ответа, направленного против Ε1ίΌ в образцах, полученных от человека, как функции от количества лет после эрадикации Н. ру1оп;
на фиг. 4 показана ВОС-кривая для белка Ε1ίΌ по сравнению с двумя хорошо известными антигенами;
на фиг. 5 показан результат вестерн-блоттинга, обнаруживающего Ε1ίΌ при различных концентрациях с применением антисыворотки мыши к Ε1ίΌ, но не обнаруживается Тф или ГГТ;
на фиг. 6 показана серия саузерн-блотов с применением полимеразной цепной реакции 1 (ПЦР1), полимеразной цепной реакции 2 (ПЦР2), полимеразной цепной реакции 3 (ПЦР3), полимеразной цепной реакции 4 (ПЦР4) для обнаружения геномной ДНК в репрезентативных образцах, полученных от пациентов, которые были диагностированы как Н. ру1ой-положительные;
на фиг. 7 показан результат репрезентативного вестерн-блоттинга, выполненного с использованием полных лизатов белков культивируемой Н. ру1оп; и на фиг. 8 показан результат двух вестерн-блоттингов для определения, экпрессировался ли Ε1ίΌ микроорганизмами, указанными внизу под каждым из вестерн-блотов.
Пример 1. Клонирование гена Ε1ίΌ бактерии Н. ру1оп.
Все операции с ДНК выполняли при стандартных условиях, как описано 8ашЬгоок е! а1. (8атЬгоок, е! а1., 1989). Вкратце, ген Ε1ίΌ амплифицировали посредством ПЦР, используя геномную ДНК из штамма Н. ру1оп 199 в качестве матрицы. Следующие олигонуклеотиды применяли в качестве праймеров: 5'-САТ АТС ОСА АТА СОТ ТСА ТТА А-3' (8ЕО ΙΌ N0: 19) и 5'-СТС ОАО АТТ СТТ ТТТ АСС ССС ТСС-3' (8ЕС ΙΌ N0: 20). Используя данный подход, вводили сайт ΝάοΙ на 5'-конце прямых праймеров и сайт Х1о1 на 5-конце обратных праймеров. После амплификации ПЦР продукт (2058 пар оснований) лигировали в клонирующий вектор рТ257В/Т (1и8ТАс1оие™ РСВ С1ошид Κίΐ, ΜΒΙ РегшеШак, Литва). После этого вставку подтверждали с помощью ПЦР и секвенирования и клонировали ее в экспрессионный вектор РЕТ-28а(+) Оа^ен. США), используя ферменты рестрикции Ше1 и Хйо1.
Пример 2. Экспрессия, очистка и распознавание рекомбинантного Ε1ίΌ.
Компетентные клетки штамма Е. сой ВЬ21 (Р1адеи, США) трансформировали вектором рЕТ-28а(+)11ίΌ и высеивали на среду ЬВ с антибиотиком (канамицин, 50 мкг/мл). Экспрессию индуцировали путем добавления 1 ммоль/л изопропил-Р-О-1-тиогалактопиранозида (ИПТГ) при оптической плотности при 600 нм, составляющей 0,6. После 4 ч клетки собирали и проводили анализ белков полного лизата посредством электрофореза в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия (ДСН-ПААГэлектрофорез). Растворимые белки с гистидиновой меткой очищали с помощью аффинной хроматографии (НщТгар сгибе, ОЕ Неаййсаге). В качестве второго этапа очистки и для замены буфера проводили гель-хроматографию (8ирегбех 75, ОЕ НеИйсаге). Необходимые фракции собирали и концентрировали с помощью центрифужного фильтрующего устройства (Мййроге) с порогом отсечения 10 кДа и хранили при -80°С. Очищенный рекомбинантный белок оценивали с помощью вестерн-блоттинга, используя антитело к гистидиновой метке, конъюгированное с пероксидазой хрена, а также антитело мыши к Н. ру1оп, конъюгированное с пероксидазой хрена (Р1егсе, Рокфорд, США), и обнаруживали с помощью системы ЕСЬ (ОЕ Неаййсаге, Уппсала, Швеция).
Амплификация гена Ε1ίΌ из ДНК штамма Н. ру1оп 199 выявила единичный продукт ПЦР массой 2,05 тысяч оснований (данные не показаны), который подтверждали секвенированием, и лигировали его в экспрессионный вектор рЕТ-28а(+). После трансформации в экспрессирующий штамм Е. сой ВЬ21 ИЕ3 и индукции ИПТГ можно было наблюдать четкую единичную полосу на вестерн-блоте, применяя коммерческую поликлональную антисыворотку к Н. ру1огг Белок очищали, как описано в материалах и способах, до чистоты более 90% (данные не показаны) и снова подтверждали с помощью вестерн-блоттинга (данные не показаны).
Пример 3. Получение и очистка специфического антитела к рекомбинантному Ε1ίΌ.
Взрослого белого новозеландского кролика иммунизировали очищенным белком в соответствии с протоколом Нау е! а1. с небольшими модификациями (Нау, е! а1., 2002). Вкратце, иммунизацию выполняли путем внутримышечных инъекций 250 мкг очищенного рекомбинантного белка (0,5 мл) с таким же объемом (0,5 мл) полного адъюванта Фрейнда. Для повторных иммунизаций кролика стимулировали 125 мкг очищенного белка, приготовленного в том же объеме (0,5 мл) неполного адъюванта Фрейнда 4, 6, 8 и 10 недель спустя. В качестве негативного контроля брали образец сыворотки перед иммунизацией. На
- 13 032330 конец, две недели спустя после последней иммунизации собирали кровь и отделяли сыворотки. Поликлональное антитело класса 1дС очищали с помощью аффинной хроматографии на сорбенте ЗерЬагоке4В с использованием колонок с конъюгированным рекомбинантным Ε1ίΌ, подготовленными в соответствии с протоколом производителя (РЬагташа, 1988). Экспрессию белка Ε1ίΌ бактерии Н. ру1оп (штамм 199) обнаруживали посредством вестерн-блоттинга, применяя супернатант после ультразвука с концентрацией белка 50 мкг/мл. Поликлональное антитело кролика класса 1дС, индуцированное против рекомбинантного белка Ε1ίΌ, использовали как первое антитело (разведение 1:5000), антитело овцы к 1дС кролика, меченное пероксидазой хрена, (Научно-исследовательский институт Авиценны, Тегеран, Иран) как второе антитело (разведение 1:3000) и для обнаружения использовали систему ЕСЬ (СЕеп, е! а1., 2001).
Кроме того, чтобы протестировать антигенные свойства рекомбинантного Ε1ίΌ и сравнить их с нативным белком, получали поликлональную антисыворотку кролика. Титры антител определяли уже после третьей иммунизации, и после четвертой иммунизации они достигали высоких уровней, подтверждая хорошую иммуногенность Ε1ίΌ. Антисыворотка кролика была способна распознавать очищенный рекомбинантный Ε1ίΌ и Е1Ю в лизате Н. ру1оп (данные не показаны).
Пример 4. Разработка ЕЫ8А.
Планшеты для ЕЫ8А покрывали 100 мкл рекомбинантного белка Е1Ю с концентрацией 1 мкг/мл в фосфатно-солевом буфере (ФСБ) и инкубировали при 4°С в течение ночи. Покрытые лунки блокировали ФСБ, содержащим 2,5% бычьего сывороточного альбумина (БСА, 81дта), в течение 2 ч при 37°С. Все Н. ру1ог1-положительные и Н. ру1оп-отрицательные серологические образцы, использованные в ходе этого исследования, тестировали на наличие антител к Е1Ю, применяя оптимальное разведение сывороток пациентов (разведение 1:100) в качестве первого антитела, антитело к 1дС человека, конъюгированное с пероксидазой хрена, (Рго те да, Мангейм, Германия) (разведение 1:100) в качестве второго антитела и 3,3',5,5'- тетраметилбензидин (ТМБ) в качестве субстрата. Кроме того, были оставлены непокрытые лунки в качестве контроля для каждой сыворотки. Результат ЕЫ8А для образца сыворотки пациента признавался положительным, если значение его оптической плотности при 450 нм было выше среднего значения плюс 3 стандартных отклонения отрицательных образцов сыворотки (СЕеп, е! а1., 2001).
Пример 5. Разработка линейного иммуноанализа Ε1ίΌ.
Подготовили линейный иммуноанализ, основанный на рекомбинантных белках Н. ру1оп, иммобилизованных на нитроцеллюлозе. По сравнению с ЕЫ8А принцип анализа позволяет идентифицировать специфические антитела к различным антигенам Н. ру1оп посредством раздельного нанесения различных единичных антигенов.
Рекомбинантный Е1Ю иммобилизовывали на полосках нитроцеллюлозной мембраны вместе с другими высокоочищенными рекомбинантными антигенами Н. ру1оп (СадА, УасА, СгоЕЬ, ИгеА (уреаза А), НсрС (цистеин-богатый белок С) (М1!!е1 е! а1., 2003) и гамма-глутамилтрансферазой (ГГТ). Подходящие условия для линейного иммуноанализа рекомбинантного Ε1ίΌ определяли эмпирически с выбором стандартных образцов сыворотки из описанной ранее исследуемой выборки, включающей 20 Н. ру1опположительных образцов по результатам гистологического анализа и 20 Н. ру1оп-отрицательных образцов по результатам гистологического анализа. Оптимальную концентрацию антигена и идеальный выбор добавок, таких как детергент, дитиотреитол и ЫаС1, подбирали для каждого антигена путем повторяющихся циклов линейного иммуноанализа и тестирования. Условия, при которых происходит наилучшее представление антигенных эпитопов и оптимальное связывание с мембраной, наблюдаемое по превосходному проявлению полосы и наилучшему разделению отрицательных и положительных образцов, выбирали для создания идеальных спецификаций первых партий продукта. Добавляли контрольные полосы на верхний конец полоски, включающий антитела кролика к 1дС/1дМ/1дА человека в качестве контроля инкубации и антитела человека класса 1дС, 1дМ или 1дА в качестве контроля конъюгата, а также контроль порогового значения, который позволяет оценить реактивность отдельных полос антигенов.
После сканирования и денситометрического анализа интенсивностей полос, контроль использовали как внутренний стандарт для оценки отношений для каждой полосы. Как правило, контрольные полосы порогового значения достигают значений между 20 и 30, тогда как яркие положительные полосы могут достигать значения до 600 единиц. Каждая полоса, достигающая значения выше значения для индивидуального контроля каждой полоски, считается положительной (отношение больше 1).
Соответствующий линейный иммуноферментный анализ представлен на фиг. 1.
Пример 6. Прототип анализа латерального растекания для диагностирования инфекции Н. ру1оп.
С использованием указанных выше материалов был разработан анализ латерального растекания, основывающийся на принципах, раскрытых в настоящей заявке, которые относятся к разработке анализа латерального растекания.
Прототип подобного латерального жидкостного анализа изображен на фиг. 2, при этом на фиг. 2А показано схематическое изображение анализа, а на фиг. 2В отражен результат анализа образца, полученного от человека, с помощью анализа латерального растекания, где обнаруживали антитела против Ε1ίΌ.
Как можно видеть из фиг. 2А, в анализе использовали наночастицы золота, покрытые антителами к 1дС человека. Рекомбинантный Ε1ίΌ, как и рекомбинантный СадА присутствовали в качестве антигенов. 1дС человека так же иммобилизовали, он служил в качестве контроля. Пористая структура была образо
- 14 032330 вана нитроцеллюлозой. Контрольная полоса указывала на надлежащую работу системы. Полоса ΡΙίΌ указывала на то, что у пациента активная инфекция или инфекция, которую недавно начали лечить. Полоса СадА в случае активной инфекции (+Ρ11Ό полоса) указывает на то, что эту инфекцию нужно лечить.
Пример 7. Анализы образцов, полученных от человека.
Всего участвовало в исследовании шестьсот восемнадцать (618) пациентов (308 мужчин, 310 женщин). Получив объяснение цели исследования, было получено информированное согласие от каждого пациента, и был взят образец крови во время эндоскопического исследования перед началом какого-либо лечения. Сыворотки отделяли и хранили при -20°С. Диагностирование инфекции основывали на результатах гистопатологии как золотого стандарта. Пациенты считались Н. ρу1ο^^-положительными, если результаты гистопатологии был положительным. Все пациенты тестировались с помощью линейного иммуноанализа на ΡΙίΌ и выборка из 246 сывороток тестировали с помощью ЕЫ8А на Ρ1ίΌ, как описано выше, и с помощью линейного иммуноанализа, как описано выше.
В табл. 2 показаны результаты применения упомянутого ЕЫ8А на Ρ1ίΌ. Конкретнее в табл. 2 показан серологический ответ в способе ЕИ18А, сравнивающий Н. ρу1ο^^-отрицательных и Н. ργΙοΓΪположительных пациентов.
Таблица 2
Результаты гистологического анализа | Итого | |||
Отрицательный | Положительный | |||
Результаты ЕЫ8А | ||||
Отрицательный | 73 | 8 | 81 | |
Положительный | 3 | 162 | 165 | |
Итого | 76 | 170 | 246 |
В табл. 3 показаны результаты применения линейного иммуноанализа для выборки из группы пациентов. Конкретнее в табл. 3 показан серологический ответ на ΡΙίΌ при линейном иммуноанализе, сравнивающий Н. ρу1ο^^-отрицательных и Н. ρу1ο^^-положительных пациентов.
_____________________________________________________________________________Таблица 3
Результаты гистологического анализа | Итого | |||
Отрицательный | Положительный | |||
Результаты линейного иммуноанализа Отрицательный | 76 | 14 | 90 | |
Положительный | 0 | 156 | 156 | |
Итого | 76 | 170 | 246 |
С помощью способа ЕЫ8А на ΡΙίΌ среди 170 заявленных положительных образцов обнаружили 165 положительных образцов, тогда как среди 76 заявленных отрицательных образцов 73 повторно подтвердили как отрицательные согласно ЕЫ8А (табл. 2). Совокупно применение ΡΙίΌ в диагностировании инфекции Н. ργΙοΓΐ, основанном на ЕЫ8А, обладает специфичностью в 96% и чувствительностью в 97%. Интересно, что пять случаев, которые согласно результатам ЕЫ8А были отрицательными, имели также низкие, но почти положительные оценки при линейном иммуноанализе, которые были немногим выше порогового значения (отношения от 1,2 к 2,2). Один из них также считали Н. ρу1ο^^-отрицательным по результатам линейного иммуноанализа, хотя другие четыре были положительными по результатам линейного иммуноанализа, вступая в реакцию с несколькими другими антигенами (данные не показаны). Важно отметить, что только один образец был отрицательным по результатам обоих тестов.
Вся группа из 618 пациентов (часть из которых была протестирована с помощью ЕЫ8А) анализировали с использованием линейного иммуноанализа, как гуморальный ответ, направленный против Ρ1ίΌ. Высокая чувствительность (97,4%) линейного иммуноанализа, при котором выявлено 310 пациентов с положительными результатами из 318 пациентов, оцененных положительно по результатам гистопатологии, тогда как специфичность линейного анализа достигает 99% (табл. 2). Результаты пациентов, у которых были получены противоречивые результаты, тщательно изучили. 8 сывороток были отрицательными по результатам линейного иммуноанализа на Ρ1ίΌ, но показали реактивность по отношению к другим антигенам, что свидетельствует о том, что в этом случае действительно ΡΙίΌ не был распознан как антиген. Среди этих 8 образцов у одного совсем не было реакции на ΡΙίΌ полосе. Семь имели слабую реактивность, которая была чуть ниже порогового значения (отношения между 0,6 и 0,95), и четыре из них имели слабую реактивность против всех других распознанных антигенов в целом (не показано). Все три образца, в которых ΡΙίΌ дал ложноположительный результат, также показали реактивность с другими полосами. Все эти полосы, включая Ρ1ίΌ, были сравнительно слабыми, но четко выше порогового значения.
- 15 032330
По результатам анализа указанных образцов определяли преобладание иммунного ответа с образованием анти-ΕΊΐΙ) антител как функцию количества лет после эрадикации. Результат показан на фиг. 3. Как можно видеть из фиг. 3, всё еще сохраняется преобладание иммунного ответа с образованием антиΕ1ΪΌ антител приблизительно на уровне 25% спустя 16-20 лет после эрадикации Н. ру1оп.
По результатам анализа указанных образцов подготовили кривые ошибок (КОС-кривые) для Ε1ΪΌ, СадА и ИгеА. Результат показан на фиг. 4. Из фиг. 4 очевидно, что Ε1ΪΌ имеет преимущество по сравнению с двумя известными антигенами, используемыми ранее при обнаружении инфекции Н. ру1оп.
Пример 8. Биоинформатический анализ последовательностей Ε1ΪΌ.
Применяя средства биоинформатики, провели крупномасштабное сравнение белка Ε1ΪΌ штамма Н. ру1ог1 027 с другими организмами, преимущественно прокариотами. Этот анализ показал более 97% гомологии между более 200 штаммами Н. ру1оп.
Результаты показаны в табл. 4.
Таблица 4
Поме .....
Р запис Название Дли Идентичн Резуль
и | записи | Названия белка | Организм | на | ость | тат |
Β5Ζ7Β | Β5Ζ7Β5ΗΕ | Предполагаемый жгутиковый | ||||
5 | БРСЗ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп (штамм 027) | 685 | 100.0% | 3412 |
юкьк | ДЖЕК. 1 НЕ | Предполагаемый жгутиковый | ||||
1 | ЬРХ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-27 | 685 | 99.0% | 3383 |
Ι9ΚΡ8 | Ι9Κ.Ρ80ΗΕ | |||||
0 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас!ег ру1оп Нр А-20 | 685 | 99.0% | 3381 |
ЮМУ | ЮМУ71Н | Предполагаемый жгутиковый | ||||
71 | ЕБРХ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп Нр А-27 | 685 | 99.0% | 3379 |
ЮЦБб | •ЮОБ62НЕ | |||||
2 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас!ег ру1оп Нр Н-11 | 685 | 99.0% | 3375 |
Ι0Α5Ρ | Ί0Α5Ρ7ΗΕ | |||||
7 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НеНсоЬас!ег ру1оп Нр А-9 | 685 | 98.0% | 3372 |
10ΐυ02_ΗΕ | ||||||
.югиог | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас(ег ру1оп Νζ)4228 | 685 | 99.0% | 3371 |
К2Б7 | К2Б7Н4Н | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
Н4 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп К0366 | 685 | 98.0% | 3370 |
ЮТрК 10Т0К4НЕ | Предполагаемый жгутиковый | |||||
4 | ЬРХ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп Нр Р-30 | 685 | 99.0% | 3369 |
М7КТ | Μ7ΚΊΊ4Η | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
14 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп ЕГМВ О1 | 685 | 98.0% | 3367 |
К2Б53 | К2Б537 НЕ | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
7 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп К055а | 685 | 99.0% | 3367 |
ТО8А | ТО8АМ4Н | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
М4 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп Нр Р-15Ь | 685 | 99.0% | 3367 |
ТОМ13 | ТОМ138НЕ | Предполагаемый жгутиковый | ||||
8 | БРХ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп Нр Н-45 | 685 | 99.0% | 3367 |
Ι9\Υν | Ι9\νν\Υ7_Η | |||||
ΧΥ7 | ЕБРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас!ег ру1оп Нр Р-15 | 685 | 99.0% | 3367 |
кгки | К2КЦЕ2Н | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
Е2 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп КОЗОЬ | 685 | 99.0% | 3365 |
Ι0ΕΗ8 | Ι0ΕΗ82ΗΕ | |||||
2 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас!ег ру1оп РеСап18 | 685 | 98.0% | 3365 |
Н8Н4 | Н8Н4Е1Н | |||||
Е1 | ЕБРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас!ег ру1оп ЕБ837 | 685 | 98.0% | 3362 |
Κ2ΕΝ | Κ2ΕΝΟ6Η | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
Об | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп К038Ь | 685 | 98.0% | 3361 |
Ό0Ι88 | Ό0Ι888 ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
8 | БР1 | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп (штамм 51) | 685 | 98.0% | 3360 |
Ν4Τ9 | Ν4Τ9Β5Η | Жгутиковый ассоциированный с крюком | ||||
В5 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас!ег ру1оп Нр А-11 | 685 | 98.0% | 3359 |
- 16 032330
Ε1ΡΖΕ 2 | Ε1ΡΖΕ2ΗΕ БРМ | Жгутиковый копирующий белок | НеНсоЬасШг ру1оп (штамм 8ΙΜ180) | 685 | 98.0% | 3358 | |
ιοινυ | ιοινυδΗΕ | ||||||
8 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп N04099 | 685 | 98.0% | 3358 | |
ТОЕПЕ | 60ΓΟΕ4ΗΕ | Предполагаемый | жгутиковый | ||||
4 | БРХ | ассоциированный с крюком белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-16 | 685 | 98.0% | 3358 | |
Ц1СТ | Ц1СТВ8Н | Предполагаемый | жгутиковый | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | |||
Β8 | ЕЬРН | ассоциированный с крюком белок 2 | НРАО1) | 685 | 98.0% | 3357 | |
Е8ЦР | Ε8()ΡΝ8_Η | НеНсоЬасШг ру1оп (штамм | |||||
N8 | ЕБРК | Жгутиковый копирующий белок | Ей1шаша75) | 685 | 98.0% | 3355 | |
кгки | Κ2ΚυΧ6_Η | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
Х6 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп К32Ь | 685 | 98.0% | 3355 | |
Κ2ΚΜ | Κ2ΚΜυ9_Η | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
υ9 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп К037с | 685 | 98.0% | 3355 | |
тонпт | ТОНПТЗНЕ | ||||||
3 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп СРУ1124 | 685 | 98.0% | 3355 | |
Ι9ΧΕ5 | Ι9ΧΕ52ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
2 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-74 | 685 | 98.0% | 3355 | |
Ι9Η4Η | Ι9Η4Η5ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
5 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-26 | 685 | 98.0% | 3355 | |
ϋ7ΕΕ | ϋ7ΕΕΑ9_Η | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
Α9 | ЕБРЗ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм В8) | 685 | 98.0% | 3354 | |
Ι9υ§7 | 19и§75_НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
5 | БРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Н-9 | 685 | 98.0% | 3354 | |
Β9ΧΖ | Β9ΧΖΚ1Η | ||||||
ΚΙ | ЕЬРХ | Предполагаемый неспецифический белок | НеНсоЬас1ег ру1оп В128 | 685 | 98.0% | 3354 | |
ТО19Ц | 1019Ц0НЕ | ||||||
0 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НеПсоЬас1ег ру1оп N04076 | 685 | 98.0% | 3353 | |
Ι9()ΖΒ | Ι9ΡΖΒ4ΗΕ | ||||||
4 | ЕРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬасШг ру1оп N04110 | 685 | 98.0% | 3353 | |
Ο2Μ3 | О2МЗРЗН | ||||||
Ρ3 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НеНсоЬас1ег ру1оп Рипо120 | 685 | 98.0% | 3352 | |
ΕΙΡΒ | Е1ЦВВ7Н | НеНсоЬасЗег ру1оп (штамм | |||||
Β7 | ЕБРС | Жгутиковый копирующий белок | Сиг20) | 685 | 98.0% | 3351 | |
ТОБК | 6ОЬКМ5_Н | ||||||
Μ5 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НеПсоЬас1ег ру1оп Нр Н-43 | 685 | 98.0% | 3351 | |
Ε6ΝΚ | Ε6ΝΚΤ1Η | ||||||
ΤΙ | ЕЕРЦ | Жгутиковый копирующий белок | НеНсоЬас1ег ру1оп (штамм Г57) | 685 | 98.0% | 3350 | |
Μ3Μ | МЗМУК5_ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
νΚ5 | НЕБРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ОАМ114ΑΪ | 685 | 98.0% | 3350 | |
Κ2ΚΚ | К2ККХ5Н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
Χ5 | ЕЬРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп КО 18с | 685 | 98.0% | 3350 | |
Κ2ΚΕ | К2КЕЦ1Н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | ||||
Ωΐ | ЕЬРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп К056а | 685 | 98.0% | 3350 |
- 17 032330
ΙΟΙΟΝ ТОКЖ4_НЕ
4 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп N(^4216 | 685 | 98.0% | 3349 |
Е681О | Ε681Ο8ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
8 | ЬРЕ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм 35А) | 685 | 98.0% | 3348 |
19УЖ | 19УЖ2НЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
2 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-13Ь | 685 | 98.0% | 3348 |
Ι9\ΥΤ5 | 19\¥Т57_НЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
7 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-13 | 685 | 98.0% | 3348 |
Ι9υΐ6 | 191Л61НЕ | |||||
1 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-14 | 685 | 98.0% | 3348 |
ВбТЬУ | ВбЛ/УбНЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
6 | ЬР2 | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм Р12) | 685 | 98.0% | 3347 |
Κ2Κ5 | К2К5Г9Н | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
Ε9 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп К046\¥а | 685 | 98.0% | 3347 |
19Х1Л | 19ХШ1-НЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
1 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп СРУ1313 | 685 | 98.0% | 3347 |
19РУ1 | 19РУ13НЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
3 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп СРУ6311 | 685 | 98.0% | 3347 |
19РШ | Ι9ΡΕΒ.1ΗΕ | |||||
1 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп СРУ6261 | 685 | 98.0% | 3347 |
Ь8У\¥ | Ь8У\У83_Н | |||||
83 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп А45 | 685 | 98.0% | 3346 |
Κ7Υ5 | Κ7Υ5Κ8Η | |||||
Κ8 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Ак1ауИ<117 | 685 | 98.0% | 3346 |
ТОТ 14 | ТОТ145НЕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
5 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М2 | 685 | 98.0% | 3346 |
Ι9Τ4Ζ | Ι9Τ4Ζ9ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
9 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-44 | 685 | 98.0% | 3346 |
Ε8(2Γ | Е8ОЕО7Н | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | ||||
Ω7 | ЕЬР7 | Жгутиковый копирующий белок | 1псйа7) | 685 | 98.0% | 3345 |
С7ВХ | С7ВХ84Н | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
84 | ЕЬРВ | белок 2 Εΐίϋ | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм В38) | 685 | 98.0% | 3345 |
Ι9ΧΥ7Ζ | Ι9\ν7Ζ2_ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
2 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-2 | 685 | 98.0% | 3345 |
ΙΟΖΒΑ | Ι0ΖΒΑ9ΗΕ | |||||
9 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Р79 | 685 | 98.0% | 3345 |
Γ4Ό5Ι | Γ4Ό5Ι7ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
7 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп 83 | 685 | 98.0% | 3345 |
Β9χυ | В9ХЦМ1Н | |||||
ΜΙ | ЕЬРХ | Предполагаемый неспецифический белок НейсоЬас1ег ру1оп 98-10 | 685 | 98.0% | 3345 | |
Жгутиковый ассоциированный с | крюком НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | |||||
Ρ9678 | ЕЬШНЕЕР | белок 2 (НАР2) (Копирующий | белок АТСС 700392 / 26695) | |||
6 | У | филамента) (Жгутиковый копирующий белок) (Сашру1оЬас1ег ру1оп) | 685 | 98.0% | 3345 | |
Μ38Ό | Μ38ΌΙ9Η | Жгутиковый ассоциированный с | крюком НейсоЬас1ег ру1оп | |||
19 | ЕЬРХ | белок 2 | ОАМсМзТОбВ | 685 | 98.0% | 3344 |
- 18 032330
Ι9ΧΑ | 19ХАиЗ_Н | |||||||
из | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-23 | 685 | 98.0% | 3344 | ||
Ι9ΡΤΝ | Ι9ΡΤΝ1ΗΕ | |||||||
1 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ρνίοπ ΟΡΥ6271 | 685 | 98.0% | 3344 | ||
О2М8 | О2М8С7Н | |||||||
С7 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Рипо135 | 685 | 98.0% | 3344 | ||
Е1()6Р | Ε1ζ)6Ρ5_ΗΕ | НеНсоЬасЩг ру1оп (штамм | ||||||
5 | ЬРР | Жгутиковый копирующий белок | РеСап4) | 685 | 98.0% | 3343 | ||
мзк | Μ3Κ\ΥΤ6_ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
\¥Т6 | НЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ119ΒΪ | 685 | 98.0% | 3343 | ||
ΙΟΖΟΥ | ΙΟΖΟΥ9ΗΕ | НейсоЬас1ег ру1оп ΝΟΤΟ 11637 | ||||||
9 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | = ССиО 17874 | 685 | 98.0% | 3343 | ||
Ι2ΌΡΤ | Ι2ΌΕΤ2ΗΕ | |||||||
2 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп ΧΖ274 | 685 | 98.0% | 3342 | ||
Ε6ΝΚ | Ε6ΝΚΟ5Η | |||||||
Ό5 | ЕЬРЕ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм Е32) | 685 | 98.0% | 3341 | ||
Ε6ΝΙ8 | Ε6ΝΙ85ΗΕ | |||||||
5 | ЬРК | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм ЕЗО) | 685 | 98.0% | 3341 | ||
Ι9ΖΡ8 | Ι9ΖΡ80ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
0 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Ν()4161 | 685 | 98.0% | 3341 | ||
Ι9ΚΚ | Ι9ΚΚΜ1Η | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
М1 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-17 | 685 | 98.0% | 3341 | ||
Σ0Α0Ν | Ι0Α0Ν9_ΗΕ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
9 | БРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-26 | 685 | 97.0% | 3340 | ||
19(^0 | 19СЮН5Н | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
Н5 | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ρνίοπ N04053 | 685 | 98.0% | 3340 | ||
Ό6ΧΡ | ϋόΧΡΖΙΗ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | |||
Ζ1 | БИРУ | белок 2 | ν225ά) | 685 | 98.0% | 3339 | ||
Μ5ΥΖ | Μ5ΥΖΕ4Η | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
Ь4 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп СгАМс1г181241 | 685 | 97.0% | 3339 | ||
Μ5Υ | Μ5ΥΜΑ1 | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
МА1 | НЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп САМсЫС! 14ΐ | 685 | 97.0% | 3339 | ||
Μ4ΖΝ | Μ4ΖΝΑ5Η | |||||||
А5 | ЕБРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп ОКЗ10 | 685 | 97.0% | 3339 | ||
Μ3ΝΝ | Μ3ΝΝ80_Η | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
80 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ246ΑΪ | 685 | 97.0% | 3339 | ||
мзмв | Μ3ΜΒΝ7_ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | ||||
N7 | НЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ105ΑΪ | 685 | 97.0% | 3339 | ||
Ι98784 ΗΕ | ||||||||
198784 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-28 | 685 | 98.0% | 3339 | ||
Ι0Ε4Κ | Ι0Ε4Κ1ΗΕ | |||||||
1 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп 8Ы417 | 685 | 98.0% | 3339 | ||
ТОР747 НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | |||||
Σ0Ρ747 | БРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-23 | 685 | 97.0% | 3338 |
- 19 032330
Ι0Ν2Η 0 | 1ΌΝ2Η0ΗΕ ЬРХ | Жгутиковый белок | ассоциированный с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-4 | 685 | 97.0% | 3338 | |
ЮЕЭ4 | Ι0ΕΌ42ΗΕ | ||||||||
2 | ЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп 8Ы112 | 685 | 98.0% | 3338 | |||
М788 | М788О1Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
ΟΙ | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΡΥ1662 | 685 | 97.0% | 3337 | |||
Μ5Υ9 | Μ5Υ955 Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп | |||
55 | ЕЬРХ | белок 2 | ОАМсШз! 17 Αΐ | 685 | 97.0% | 3337 | |||
Μ4ΖΚ | Μ4ΖΚΑ3Η | ||||||||
АЗ | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп ОК113 | 685 | 98.0% | 3337 | |||
МЗЬА | МЗЬАЗЗН | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
33 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ231 Αΐ | 685 | 97.0% | 3337 | |||
Ι9ΖΟΟ | Ι9Ζ0Ο2ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
2 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-28Ь | 685 | 97.0% | 3337 | |||
Ι983Μ | Ι983Μ7ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
7 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-24 | 685 | 98.0% | 3337 | |||
Ι0Ε\ν | 10Е\¥О9_Н | ||||||||
09 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп НЦР-В14 | 685 | 97.0% | 3337 | |||
МЗР8 | МЗР8О4Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
04 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ96ΑΪ | 685 | 97.0% | 3336 | |||
10и813_НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
ιου8ΐ3 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-ЗЬ | 685 | 97.0% | 3336 | |||
ιοκυδ | Ι0Κυ82_ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
2 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-5Ь | 685 | 97.0% | 3336 | |||
ΐοροϋ | Ι0Ρ0Ό5ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
5 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-4 | 685 | 97.0% | 3336 | |||
ТОР8В | ТОР8В5НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
5 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-3 | 685 | 97.0% | 3336 | |||
Ι9Υ93 | Ι9Υ932 ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
2 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-4с | 685 | 97.0% | 3336 | |||
Ι9Χ\ν | Ι9Χ\Υ(34_Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Ω4 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Ρ-4ά | 685 | 97.0% | 3336 | |||
Ε6ΝΟΙ | Ε6ΝΟΙ6ΗΕ | ||||||||
6 | ЬР1 | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм Р16) | 685 | 97.0% | 3334 | |||
Μ3ΡΌ | Μ3ΡΌΓ1Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
ΡΙ | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ80ΑΪ | 685 | 97.0% | 3334 | |||
Μ3<35 | МЗР5В9Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Β9 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ42ΑΪ | 685 | 97.0% | 3334 | |||
Μ3Ρ64 | МЗР646 НЕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
6 | ЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп САМ245Αΐ | 685 | 97.0% | 3334 | |||
МЗЬУ | МЗЬУ71_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
71 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ112ΑΪ | 685 | 97.0% | 3334 | |||
МЗЬб | МЗЬ655_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
55 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΘΑΜΙΟΙΒίν | 685 | 97.0% | 3334 |
- 20 032330
Е188К 1 | Е188К1НЕ БР9 | Жгутиковый белок | ассоциированный | с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм 908) | 685 | 97.0% | 3333 |
Е1РУ1 | Е1РУ14НЕ | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | |||||||
4 | БРТ | Жгутиковый копирующий белок | 8а1464) | 685 | 98.0% | 3333 | |||
ΌΟΙΖΟ | Ό01ΖΟ3_ΗΕ | ||||||||
3 | БР5 | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм 52) | 685 | 97.0% | 3333 | |||
МЗК8 | МЗК844 Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
44 | ЕЕРХ | белок 2 | НеисоЬасгег ру1оп НР116ΒΪ | 685 | 97.0% | 3333 | |||
мзко | Μ3ΒΌ05Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
05 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ264ΑΪ | 685 | 97.0% | 3333 | |||
МЗМ1 | МЗМ119Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
19 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ103ΒΪ | 685 | 97.0% | 3333 |
101156НЕБ
101156 РХ Жгутиковый копирующий белок НейсоЬас1ег ру1оп СРУ3281 685 98.0% 3333
10А18 10А185НЕ Жгутиковый ассоциированный с крюком
БРХ белок НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-16 685 97.0% 3333
Ι0Ε947 НЕ
Ι0Ε947 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп 8Ы169 | 685 | 98.0% | 3333 |
Е21ЕТ | Е21ЕТ0НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
0 | БР9 | белок | НейсоЬас1ег ру1оп 2018 | 685 | 97.0% | 3333 |
Е21АТ | Е21АТ7НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
7 | БР9 | белок | НейсоЬас1ег ру1оп 2017 | 685 | 97.0% | 3333 |
Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||||
()9ΖΕ9 | ЕЕШНЕБР | белок 2 (НАР2) (Копирующий белок НейсоЬас1ег ру1оп (штамм 199) | ||||
1 | 1 | филамента) (Жгутиковый копирующий белок) (Сашру1оЬас1ег ру1оп 199) | 685 | 97.0% | 3333 | |
Μ3ΝΙ | Μ3ΝΠ30Η | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
Ό0 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ270Α8Ϊ | 685 | 97.0% | 3332 |
тоос | тооси5_н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
и5 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-6 | 685 | 97.0% | 3332 |
19У40 | 19У408 НЕ | |||||
8 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-10 | 685 | 97.0% | 3332 |
юизо | ТОиЗО8_НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
8 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-62 | 685 | 97.0% | 3331 |
198БЗ | 198Ь37_НЕ | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
7 | БРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-29 | 685 | 97.0% | 3331 |
Е8()М | Е8()М56_Н | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | ||||
56 | ЕЙР4 | Жгутиковый копирующий белок | ОашЫа94/24) | 685 | 97.0% | 3330 |
Μ5ΥΝ | Μ5ΥΝΥ6Η | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
Уб | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜο1ι18136ΐ | 685 | 97.0% | 3330 |
МЗТ() | МЗТ()89_Н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
89 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ260ΒΪ | 685 | 97.0% | 3330 |
М3()1 | МЗ()1У4_Н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
У4 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ260ΒΪ | 685 | 97.0% | 3330 |
М3(}2 | МЗР2Б5Н | Жгутиковый ассоциированный | с крюком | |||
Б5 | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ263ΒΕΪ | 685 | 97.0% | 3330 |
- 21 032330
МЗМ5 83 | Μ3Μ583 Η ЕЙРХ | Жгутиковый белок 2 | ассоциированный | с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ115Αΐ | 685 | 97.0% | 3330 |
ТО8ЕХ | ТО8ЕХ5НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
5 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-25с | 685 | 97.0% | 3330 | |||
тоне | тонооон | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
ΩΟ | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-25Й | 685 | 97.0% | 3330 | |||
Ι9Χ9Ι1ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
19X911 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-25 | 685 | 97.0% | 3330 | |||
19УСТ | 19УСТ9_НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
9 | БРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-19 | 685 | 97.0% | 3330 | |||
М3 87 | М387О6Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Об | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ83Т | 685 | 97.0% | 3329 | |||
МЗРЕ | МЗРЕУ1Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
VI | ЕБРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΑΜ244ΑΪ | 685 | 97.0% | 3329 | |||
МЗР9 | МЗР9ГЗН | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
ЕЗ | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ83ΒΪ | 685 | 97.0% | 3329 | |||
Μ3ΝΡ | Μ3ΝΡΟ4_Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
С4 | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ118ΒΪ | 685 | 97.0% | 3329 | |||
Κ8ΟΥ | Κ8ΟΥ42Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
42 | ЕЙРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜΙΟΟΑΐ | 685 | 97.0% | 3329 | |||
тоиги | тоири9НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
9 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М9 | 685 | 97.0% | 3329 | |||
ТОТ5Р | ТОТ5РЗНЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М4 | 685 | 97.0% | 3329 | |||
ТОВЕЕ | ТОКЕЬЗНЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-24с | 685 | 97.0% | 3329 | |||
ТО1743_НЕЬ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
ТО1743 | РХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М5 | 685 | 97.0% | 3329 | |||
ТОШ2_НЕЬ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
ТОШ2 | РХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М3 | 685 | 97.0% | 3329 | |||
ТОЮК | ТОНГК5НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
5 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр М1 | 685 | 97.0% | 3329 | |||
Ι9ΖΥΡ | Ι9ΖΥΡ3ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Мб | 685 | 97.0% | 3329 | |||
19ХЛ6НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
19ХЛ6 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-24Ь | 685 | 97.0% | 3329 | |||
М31Л8 | М31Л84НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
4 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп НР260ВГЙ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
мзи8 | мзи8ро_н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Е0 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250Β8Ϊ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
МЗТ9 | МЗТ9М6Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Мб | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250Α8Ϊ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
МЗТ4 | Μ3Τ443 Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
43 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру!оп НР250А8Й | 685 | 97.0% | 3328 |
- 22 032330
М3 то ш | МЗТОШН ЕЬРХ | Жгутиковый белок 2 | ассоциированный | с | крюком | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250ΑΕϊν | 685 | 97.0% | 3328 |
Μ38\Υ | М38\¥Е6_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Е6 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250ΒΕΐν | 685 | 97.0% | 3328 | |||
М38Р | М38Р57Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
57 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250ΑΓΐΐΐ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
М3 86 | М386Е4Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Е4 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250ΒΕΐΐΐ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
МЗК7 | МЗК7Т2Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Т2 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп НР250АЕЙ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
мзру | МЗ(2У83_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
83 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ260Β8Ϊ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
М3 <38 | МЗ(2841_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
41 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп НР250ВЕЙ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
М3 (2(2 | мз(2(2б4_н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
64 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΗΡ250ΒΕΪ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
М3(261 Μ3ζ)6Ι7_ΗΕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||||
7 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ250Т | 685 | 97.0% | 3328 | |||
Μ3Νν | Μ3ΝΎ58Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
58 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ252ΒΪ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
Μ3ΝΚ | Μ3ΝΚΟ5Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
С5 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ252Т | 685 | 97.0% | 3328 | |||
мзьг | Μ3ΕΖΧ8Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Х8 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ250ΑΕΪ | 685 | 97.0% | 3328 | |||
,ЮСЕ(2 | ТОСБРЗНЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-16 | 685 | 97.0% | 3328 | |||
Ι9ΧΤΖ | Ι9ΧΤΖ6ΗΕ | ||||||||
6 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп СРУ1962 | 685 | 98.0% | 3328 | |||
вгит | В2иТ80_Н | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | |||||||
80 | ЕБР8 | Жгутиковый копирующий белок | 8Ы470) | 685 | 97.0% | 3327 | |||
Μ78\Υ | Μ78\Υ73_Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
73 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-1 | 685 | 97.0% | 3327 | |||
МЗР12 | МЗР129 НЕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
9 | БРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ254ΑΪ | 685 | 97.0% | 3327 |
Ι9Ρ985 НЕ
Ι9Ρ985 | БРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп ΕΡΥ608 Ι 685 | 97.0% | 3326 | ||
Κ7ΥΑ | Κ7ΥΑ88Η | ||||||
88 | ЕЬРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп Ак1ау1к86 685 | 97.0% | 3325 | ||
Μ3ΚΙ | МЗКПС8Н | Жгутиковый | ассоциированный с | крюком | |||
К8 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ93ΒΪ 685 | 97.0% | 3324 | ||
ТОМ8 | 10М8и8_Н | Жгутиковый | ассоциированный с | крюком | |||
и8 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-6 685 | 97.0% | 3324 | ||
Μ3ΝΟ | Μ3ΝΟΡ1Η | Жгутиковый | ассоциированный с | крюком | |||
Р1 | ЕЬРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ265В8Й 685 | 97.0% | 3323 |
- 23 032330
Μ3ΚΖ М7 | Μ3ΚΖΜ7_ НЕЕРХ | Жгутиковый белок 2 | ассоциированный | с | крюком | НеНсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ120ΑΪ | 685 | 97.0% | 3323 |
мзри | мзрирбн | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Об | ЕЬРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ρνίοπ ΘΑΜ249Τ | 685 | 97.0% | 3322 | |||
МЗРС | МЗРСБ7Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Ь7 | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ239ΒΪ | 685 | 97.0% | 3322 | |||
Μ3Ν | Μ3ΝΜ23Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
М23 | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ОАМ121 Ап | 685 | 97.0% | 3322 | |||
ιοι\νκ | Ι0ΙΧΥΚ3ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Νζ)4200 | 685 | 97.0% | 3322 | |||
ТОРЕР | ТОРЕРОНЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
0 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Р-1 | 685 | 97.0% | 3321 | |||
Ι9ΧΡ8 | Ι9ΧΡ87ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
7 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Р-1Ь | 685 | 97.0% | 3321 | |||
Ι0Ν25 | Ι0Ν254_ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
4 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Н-3 | 685 | 97.0% | 3320 | |||
мзи8 | МЗи8В7_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
В7 | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп НР260АЕЙ | 685 | 97.0% | 3319 | |||
мзиг | МЗи287_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
87 | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ΗΡ260ΑΕΪ | 685 | 97.0% | 3319 | |||
мзкь | Μ3ΚΕΙ9Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
19 | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп НР260А8Й | 685 | 97.0% | 3319 | |||
М3 (^7 | МЗ<3751_Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
51 | ЕЬРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ОАМ268Вй | 685 | 97.0% | 3319 | |||
МЗР4 | мзР4из_н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
из | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ260Α8Ϊ | 685 | 97.0% | 3319 | |||
М3 IX | МЗЕЕЕ6Н | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
Еб | ЕЬРХ | белок 2 | НеПсоЬас1ег ру1оп 6ΑΜ20 Ι Αΐ | 685 | 97.0% | 3318 | |||
ТО1Т98НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
Ι0ΙΤ98 | ЕРХ | белок 2 | НеисоЬасгег ру1оп Нр А-5 | 680 | 98.0% | 3318 | |||
Ι98ϋ(3 | Ι98ϋ(26_ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
6 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Н-30 | 677 | 97.0% | 3314 | |||
Ι0ΒΝΒ | Ι0ΒΝΒ3 ΗΕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
3 | ЕРХ | белок | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Н-42 | 680 | 97.0% | 3311 | |||
О2МЕ | Θ2ΜΕΟ6Η | ||||||||
Об | ЕЕРХ | Жгутиковый копирующий белок | НеНсоЬас1ег ру1оп 8ΝΤ49 | 685 | 97.0% | 3311 | |||
тоивр | ТОЦВРЗНЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
3 | БРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Нр Р-2Ь | 677 | 97.0% | 3308 | |||
Ι9(2ΝΒ | Ι9ζ)ΝΒ9ΗΕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
9 | ЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп Νζ)4044 | 685 | 96.0% | 3302 | |||
Ι9ΖΖΜ | Ι9ΖΖΜ5 НЕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
5 | БРХ | белок 2 | НеПсоЬас1ег ру1оп Нр А-4 | 677 | 97.0% | 3300 | |||
М78Н | М78ННЗН | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | ||||
НЗ | ЕЕРХ | белок 2 | НеНсоЬас1ег ру1оп ССН133 | 677 | 97.0% | 3297 |
- 24 032330
Ι9ΉΑ | Ι9ΊΊΑ1ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
1 | ЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр А-8 | 677 | 97.0% | 3297 | ||
Μ3Ν | Μ3ΝΜΧΥ6_ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
М\¥6 | НЕЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп ΟΑΜ210ΒΪ | 685 | 96.0% | 3296 | ||
19УЬ0 | 19УЬ06_НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
6 | ЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-11Ь | 677 | 97.0% | 3293 | ||
Ι9ΧΥ86 | Ι9ΧΥ867 ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
7 | ЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-11 | 677 | 97.0% | 3293 | ||
ТОРС8 | 10РС82НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
2 | ЕРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-34 | 677 | 97.0% | 3292 | ||
19УШ | 19УШ4НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
4 | ЕРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-21 | 677 | 97.0% | 3292 | ||
ТОРУ6 | 10РУ65НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
5 | ЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-8 | 677 | 97.0% | 3291 | ||
19 ΥΗ | Ι9ΥΗΜ9Η | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
Μ9 | ЕЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-8Ь | 677 | 97.0% | 3291 | ||
тоти | ιοτυχνοΗ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
χνο | ЕЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Р-41 | 677 | 97.0% | 3289 | ||
1ΌΝ8Κ | 1ΌΝ8Κ5ΗΕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
5 | ЕРХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-18 | 677 | 97.0% | 3289 | ||
ίΟΒΑΕ | ЮВАЕЗ-НЕ | Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||
3 | ЕРХ | белок | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-36 | 677 | 97.0% | 3289 | ||
Ι0ΕΙ78 ΗΕΕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком | |||||
10Ы78 | РХ | белок 2 | НейсоЬас1ег ру1оп Нр Н-41 | 677 | 96.0% | 3278 | ||
Ε80Κ | Е8ОКУЗН | НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | ||||||
УЗ | ЕЬРХУ | Жгутиковый копирующий белок | 8ои111А1'пса7) | 685 | 95.0% | 3264 | ||
ζ)Ι7Υ0 017Υ06 ΗΕ Жгутиковый | ассоциированный | с | крюком НейсоЬас1ег астопусЫз (штамм | |||||
6 | ЙАН | белок | ЗйееЬа) | 685 | 94.0% | 3249 | ||
НейсоЬас1ег ру1оп (штамм | ||||||||
Κ4ΝΚ | Κ4ΝΒ82Η | АТСС 700392 / 26695) | ||||||
82 | ΕΕΡΥ | Жгутиковый копирующий белок | (Сашру1оЬас1ег ру1оп) | 674 | 97.0% | 3190 | ||
Κ4ΝΕ | Κ4ΝΕ36Η | |||||||
36 | ЕЕРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп ΚΪ12 | 674 | 97.0% | 3190 |
Κ4ΝΗ Κ4ΝΗ9ΗΕ
9 | ЕРХ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ру1оп КИТ | 674 | 97.0% | 3190 |
мзру | МЗСУУ4Н | Жгутиковый ассоциированный с | крюком | |||
У4 | ЕЕРХ | белок 2 (Фрагмент) | НейсоЬас1ег ру1оп ОАМ71 Αΐ | 647 | 97.0% | 3146 |
ЮЕТ | Ι0ΕΤΧΥ0Η | НейсоЬас1ег се1огиш (штамм | ||||
ΧΥΟ | ЕЕСМ | Жгутиковый копирующий белок | АТСС ВАА-540 / ΜΙΤ 99-5656) | 685 | 88.0% | 3065 |
ГОЕМ | Ι0ΕΜΚ1Η | НейсоЬас1ег се1огиш (штамм | ||||
К1 | ЕЕС0 | Жгутиковый копирующий белок | АТСС ВАА-429 / ΜΙΤ 00-7128) | 685 | 81.0% | 2861 |
Е7АТ) | Е7АОСЗН | Жгутиковый ассоциированный с | крюком НейсоЬас1ег ЕеНз (штамм АТСС | |||
СЗ | ЕЕГС | белок | 49179/ЖТС 12436/С81) | 684 | 63.0% | 2190 |
Ε7ΓΥΙ | Ε7ΡΥΙ69Η | |||||
6 | ΕΕΙ | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег 8Ш8 Н81 | 689 | 61.0% | 2158 |
- 25 032330
Р8КТ НЗ | Р8КТНЗН ЕБВС | Жгутиковый ассоциированный белок Ρΐίϋ | с | крюком НейсоЬас1ег Ыггогегопй (штамм | 59.0% | 2091 | |
СШ-1) | 694 | ||||||
К4КН | К4КНРЗН | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | |||
РЗ | ЕЙНЕ | белок Ρΐίϋ | НейсоЬас1ег йейшаппй А8В1.4 | 691 | 58.0% | 2073 | |
НейсоЬас1ег шиз!е1ае (штамм | |||||||
АТСС 43772 / ЙМС 18044 / | |||||||
эзис | Ό3υθΜ5_Η | Предполагаемый | жгутиковый МПС 12198 / 12198) | ||||
М5 | ЕЕМ1 | ассоциированный с крюком белок 2 | (Сашру1оЬас1ег шиз!е1ае) | 674 | 52.0% | 1778 | |
О7У11 | 07У119НЕ | Жгутиковый копирующий белок филамента НейсоЬас1ег йерайсиз (штамм | |||||
9 | ЙНР | Ρΐίϋ | АТСС 51449/ЗВ 1) | 682 | 51.0% | 1698 | |
12РОС | 12РОС5НЕ | НейсоЬас1ег стаесй (штамм | |||||
5 | БСР | Жгутиковый копирующий белок | РАОибИ) | 682 | 51.0% | 1690 | |
Ι7ΟΖΙ | Ι7ΟΖΙ09Η | НейсоЬас1ег стаесй АТСС ВАА- | |||||
0 | ΕΕΙ | Жгутиковый копирующий белок | 847 | 682 | 51.0% | 1689 | |
Е4УН | Ε4ΥΗΕ69 | ||||||
Б6 | НЕЙ1 | Жгутиковый крюк-белок 2 | НейсоЬас1ег стаесй ССиО 18818 | 682 | 51.0% | 1689 | |
Ν2Β(^ | Ν2Β0Ν79 | ||||||
N7 | НЕЙ1 | Неспецифический белок | НейсоЬас1ег ЫНз \¥1\¥а | 679 | 45.0% | 1589 | |
СЗХГ) | СЗХОТ19 | ||||||
Т1 | НЕЙ1 | Жгутиковый копирующий белок | НейсоЬас1ег ЫНз АТСС 43879 | 679 | 45.0% | 1583 | |
(^7МА | О7МАМЗ_ | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком \Уо1те11а зисстодепез (штамм | |||
М3 | \ΥΟΕ8υ | белок 2 | АТСС 29543 / Ό8Μ 1740 / ЙМС | 682 | 45.0% | 1479 | |
7466 / МПС 11488 / ЕОС 602\Υ) | |||||||
(νΐΗπο зисстодепез) | |||||||
С5ЕХ | С5ЕХР09Н | НейсоЬас1ег риПошт ΜΙΤ 98- | |||||
Р0 | ΕΕΙ | Жгутиковый крюк-белок 2 | 5489 | 685 | 39.0% | 1272 | |
Жгутиковый ассоциированный | с | крюком | |||||
Ο5Ζ\Υ | Ο5Ζ\ΥΤ4_9 | белок | НейсоЬас1ег сапас1епз1з ΜΙΤ 98- | ||||
Т4 | ΗΕΕΙ | (Жгутиковый крюк-белок 2) | 5491 | 689 | 39.0% | 1262 | |
Н5УЕ | Н5УЕС0Н | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком НейсоЬас1ег Ыггогегопй ССиСг | |||
СО | ΕΕΒΙ | белок Ρΐΐϋ | 35545 | 458 | 53.0% | 1185 | |
СЗХБ | СЗХЕ84 9Н | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком НейсоЬас1ег хутдЬатепзГ | |||
84 | ΕΕΙ | белок 2 | АТСС ВАА-430 | 689 | 37.0% | 1175 | |
Н5УЕ | Н5УЕС1Н | Жгутиковый ассоциированный | с | крюком НейсоЬас1ег Ыггогегопй ССиСг | |||
С1 | ΕΕΒΙ | белок Ρΐΐϋ | 35545 | 231 | 66.0% | 807 | |
Н8С81 | Н8С811С | С атру1 оЬ ас!ег ΐ е) иш зиЬ зр.) е) иш | |||||
1 | Амти | Жгутиковый копирующий белок | ЙМС! 9872 | 645 | 27.0% | 474 | |
Сатру1оЬас1ег 1ап (штамм | |||||||
В9КО | В9КОА6С | Жгутиковый копирующий белок филамента КМ2100 / Ό67 / АТСС ВАА- | |||||
А6 | АМЙК | Ρΐΐϋ | 1060) | 766 | 26.0% | 471 | |
Эффлюксный переносчик | 8МК-типа, | ||||||
С6КО | С6КОО29 | обеспечивающий множественную | |||||
02 | ΡΚΟΤ | лекарственную устойчивость | Сатру1оЬас1ег зйохуае КМ3277 | 577 | 29.0% | 465 | |
Ό2ΜΧ | ϋ2ΜΧ77_Ο | Жгутиковый ассоциированный | с | крю ком С атру1 оЬ ас!ег ΐ е) иш зиЬ зр.) е) иш | |||
77 | Амти | белок | 414 | 642 | 28.0% | 461 |
- 26 032330
М3108 3 | Μ3Ι083 9Ρ КОТ | Жгутиковый копирующий белок | Сашру1оЬас1ег зЬосуае СС57С | 577 | 28.0% | 457 |
Н78А | Н78А14_С | |||||
14 | АМСО | Жгутиковый копирующий белок | Сашру1оЬас1ег сой 84-2 | 644 | 26.0% | 452 |
Ό2Μ8 | О2М844_С | Жгутиковый ассоциированный с | крю ком С ашру1 оЬ ас!ег ΐ е) иш зиЬ зр.) е) иш | |||
44 | АМЮ | белок Εΐίϋ | 1336 | 647 | 26.0% | 451 |
Н7ХВ | Н7ХВН0С | СатруРЬасШщещт зиЬзр. )е)ит | ||||
НО | АМЮ | Жгутиковый копирующий белок | ЙМС 23216 | 648 | 26.0% | 451 |
Η7ΥΚ | Η7ΥΚΝ9Ο | СатруРЬасШщещт зиЬзр. ΐ ерш | ||||
N9 | АМЮ | Жгутиковый копирующий белок | ЬМО 23357 | 648 | 27.0% | 449 |
ЗиИипшопаз бепйпйсапз (штамм АТСС 33889 / Ό8Μ
1251) (ТЫопмсгозрйа
ЦЗОШ цзои48_§и (Жгутиковый ассоциированный с крюком бепйпйсапз (штамм АТСС
ЫЖ белок 2)-подобный белок 33889 / Ό8Μ 1251)) 462 31.0% 441
Η8Β\Υ В9 | Н8В\¥В9_С | солирующий белок | Сашру1оЬас1ег)е)иш зиЬзр. )е)иш | ||||
АМЮ | Жгутиковый I | 1213 | 642 | 27.0% | 447 | ||
Η8Α\Υ | Н8А\¥Ш_С | СатруРЬасШщерш зиЬзр. ΐ ерш | |||||
N7 | АМЮ | Жгутиковый копирующий белок | 1997-11 | 643 | 26.0% | 447 | |
Α3ΖΌ | Α3ΖΌΚ2 С | Жгутиковый | ассоциированный с | крю ком С атру1 оЬ ас!ег ΐ е) иш зиЬ зр.) е) иш | |||
К2 | АМЮ | белок Εΐίϋ | НВ93-13 | 643 | 26.0% | 447 | |
Сатру1оЬас1ег )е)иш зиЬзр. | |||||||
Α7Η4Ι | А7Н4П СА Жгутиковый | ассоциированный с | крюком боу1е1 (зйат АТСС ВАА-1458 / | ||||
4 | мю | белок Εΐίϋ | КМ4099/269.97) | 646 | 26.0% | 447 | |
Α3ΥΚΙ | АЗУК13С | Жгутиковый | ассоциированный с | крю ком С атру1 оЬ ас!ег ΐ е) иш зиЬ зр.) е) иш | |||
3 | АМЮ | белок Εΐίϋ | 260.94 | 642 | 25.0% | 442 | |
Н7\¥Е | Н7\¥ЕН0_С | ||||||
НО | АМСО | Жгутиковый копирующий белок | Сатру1оЬас1ег сой Н8 | 637 | 26.0°/о | 441 | |
Сатру1оЬас1ег)е)иш зиЬзр. ΐ ерш | |||||||
Е1РЙ | Е1РЕЦ8С | Жгутиковый | ассоциированный с | крюком зегсбуре Н821 (штамм М1 / | |||
Ω8 | ΑΜΙΜ | белок 2 | 99/308) | 643 | 27.0% | 441 |
Пример 9. Наличие и экспрессия белка ΕΗΌ в Н. ру1оп.
Образцы.
В исследовании участвовали 81 образец Н. ру1оп. полученные от пациентов. Образцы диагностировали как Н. ру1оп-положительные посредством стандартного бактериального культивирования на селективных пластинках. В ходе такого тестирования бактерии выращивали на чашках с кровяным агаром Уилкинса-Чалгрена в микроаэробных условиях (10% СО2. 5% О2. 8.5% N2 и 37°С) в течение 36 ч и подтверждали биохимическим анализом положительный результат анализа на оксидазу. каталазу и уреазу. Часть культивированных бактерий использовали для выделения ДНК. а остаток применяли для приготовления лизата белков для вестерн-блоттинга.
Поликлональная антисыворотка мыши к ΕΗΌ.
Трёх мышей линии С57ББ6 иммунизировали 3 раза (еженедельно) 30 мкг рекомбинантного белка Ε11Ό бактерии Н. ру1оп в качестве антигена и 10 мкг холерного токсина в качестве адъюванта. повторно суспендировали в ФСБ. Через одну неделю после последней иммунной стимуляции мышей обескровили и сыворотку объединили. Антигенность и специфичность объединенной сыворотки тестировали с помощью вестерн-блоттинга.
Вестерн-блоттинг.
С целью установки оптимальных условий анализа различные концентрации рекомбинантного белка Ε11Ό. также как и других рекомбинантных контрольных белков (Т1д (Тпддег £ас!ог (ТотЬ е! а1.. 1997)) и ГТТ). созданных и очищенных при одинаковых условиях. наносили на 8% гель. содержащий ДСН. После блоттинга белков на нитроцеллюлозной мембране (Ака!тап/СЕ Неа1!ксаге. Фрайбург. Германия). мембраны блокировали в 5% обезжиренном молоке в течение 1 ч при комнатной температуре и инкубировали в течение ночи с различными разведениями антисыворотки в качестве первичных антител. После инкубации мембран с антителами мыши класса ^С. меченными пероксидазой хрена. полосы обнаруживали. добавляя реагенты системы ЕСЬ Аез!егп Б1о!!шд Бе!ес!юп.
Результаты показаны на фиг. 5. где на правой стороне показанного геля. содержащего ДСН. указаны антиген и его количество. нанесенное на отдельные дорожки. Использовали оптимальное разведение (1:2000) антисыворотки мыши.
ПЦР анализ наличия открытой рамки считывания белка Ε11Ό в геноме Н. ру1оп.
Разработали четыре варианта ПЦР на основе последовательности ДНК белка Ε1ΪΌ в качестве объек
- 27 032330 та согласно последовательности 8Е^ ΙΌ ΝΟ: 2. Специфичность каждой пары праймеров, как указано в табл. 5, была подтверждена ВйА8Т-аналнзом напротив всех бактериальных нуклеотидных последовательностей банка генов. Проводили ПЦР, используя ДНК Н. ру1ог1 в качестве положительного контроля и геномную ДНК других 10 микроорганизмов в качестве отрицательного контроля. Проводили ПЦР с использованием мастер-микса СоТад-полимеразы (Рготеда), температуры отжига в 56°С и временем элонгации 30 с.
Таблица 5
Праймеры, использованные для ПЦР анализа
Прямой праймер | Обратный праймер | Длина ампликона (пар оснований) | |
ПЦР1 | АОС ТСА ТТА ООО СТТ ООС АО (8Ε()ΙΟΝΟ: 21) | ОСТ СОС ОСТ САА СОС АТС (8Е(2 Ш ΝΟ: 22) | 246 |
ПЦР2 | АТС АСО ОАС ОСТ АСС ААТ СО (8Е() Ш ΝΟ: 23) | АОО ОАС ТТС АТС САТ ОСТ СС (8Е(2 Ш ΝΟ: 24) | 288 |
ПЦРЗ | САС АСА СОС ТАТ САТ ТСА АОС (8Е(2 Ш ΝΟ: 25) | ССС ОСТ ОАТ САС АТС АТТ ОАС (8Е(2 Ш ΝΟ: 26) | 300 |
ПЦР4 | СОС ТАА ССТ САТ АСА ТОО АОО (8Е(2 Ш ΝΟ: 27) | ТАА ОСО ОСА ААО СОС ТСС О (8Е(2 Ш ΝΟ: 28) | 150 |
Результаты.
Открытая рамка считывания белка Ρ1ΪΌ присутствует во всех изолятах Н. ру1ог1, полученных от пациентов (культивированные бактерии, выделенные из образцов биопсий пациентов). Наличие открытой рамки считывания белка Ρ1ΪΌ можно подтвердить всеми четырьмя вариантами ПЦР, использованными для этого анализа. Результаты проведенных ПЦР1, ПЦР2 и ПЦР3 для ДНК, выделенных из 81 образца Н. ру1ог1, были в целом положительными. В то время как результат ПЦР4 был положительным для 79 образцов (фиг. 6). Специфичность анализа подтверждали применением ДНК, выделенной из Р. аегидтоза (АТСС 27813), К1еЬ§1е11а оху!оса (АТСС 700324), Сапб1ба а1Ь1сап§ (АТСС 90028), Еп!гососси§ Гаесайз (АТСС 29292), 8!гер. Сгоир А (АТСС 19615), 8.!йурй1типит (АТСС 13311), 8.аигеи§ (АТСС 25923), 8.ер1бегт1б18 (АТСС 18228), Н.тйиепзае (АТСС 49247) и Е.сой (АТСС 25922).
Как можно видеть на фиг. 6, показывающей результаты репрезентативного ПЦР-анализа, проведенного с использованием геномной ДНК, которая выделена из культивируемых клеток Н. ру1ог1, выделенных из образцов биопсий пациентов, открытая рамка считывания белка Ρ1ΪΌ присутствует почти во всех изолятах Н. ру1ог1. Таким образом, результаты ПЦР подтверждают наличие Ρ1ΪΌ в геномной ДНК. На фиг. 6 числа над дорожками обозначают внутренний номер образца.
Касательно обнаружения Ρ1ΪΌ белка в образцах, полученных от пациентов, которых диагностировали как Н. ру1оп-положительных, белок Ρ1ΪΌ обнаруживают в 97,5% образцов. Применяя вестернблоттинг можно показать, что экспрессию белка Ρ1ΪΌ обнаруживают в 79 из 81 лизата белков Н. ру1ог1. Результаты показаны на фиг. 7. На фиг. 7 числа над дорожками обозначают внутренний номер образца.
Специфичность анализа подтверждали с помощью отрицательных результатов, когда лизаты белков из других микроорганизмов анализировали посредством вестерн-блоттинга. Результаты этого анализа показаны на фиг. 8. Как можно видеть на фиг. 8, кроме рекомбинантного Ρ1ΪΌ с меткой стрептавидина (дорожка 2 в обоих вестерн-блотах) и без метки стрептавидина (дорожка 3 в обоих вестерн-блотах), лизаты белков, полученные из Р. аегидтоза (АТСС 27813) (левый вестерн-блот, дорожка 4), К1еЬ§1е11а оху!оса (АТСС 700324) (левый вестерн-блот, дорожка 5), Сапб1ба а1Ысап§ (АТСС 90024) (левый вестернблот, дорожка 6), Еп!егососсиз Гаесайз (АТСС 29292) (левый вестерн-блот, дорожка 7), 8!гер!ососси§ Сгоир А (АТСС 19615) (левый вестерн-блот, дорожка 8), 8. !йурй1тигшт (АТСС 13311) (правый вестернблот, дорожка 4), 8. аигеиз (АТСС 25923) (правый вестерн-блот, дорожка 5), 8. ер1бегт1б18 (АТСС 18228) (правый вестерн-блот, дорожка 6), Н. тйиепзае (АТСС 49247) (правый вестерн-блот, дорожка 7) и Е. сой (АТСС 25922) (правый вестерн-блот, дорожка 8).
В настоящем описании изобретения присутствуют ссылки на различные документы известного уровня техники, полные ссылки которых представлены ниже и которые включены в настоящую заявку посредством ссылки.
АтоШ, I. С., ΗίΐζΙβΓ, I., & Ми11ег, А. (2012). ТНе 1тшипошос1и1а1огу Ргорегйез о£Не11соЬас1ег ру1оп СопРег Рго1ес1юп Адатз! А11егд1с апс! Сйготс 1пйатта1огу ΌΐβοπΙεΓβ. Ргоп! Се111п1ес!
М1сгоЫо1, 2, 10.
А1ИеПоп, I С., Сао, Р., Реек, К. М., 1г., Титтиги, М. К., В1азег, М. к, & Соуег, Т. Й. (1995).
Мо8а1С18т ϊη уасио1айпд су!о!охт а11е1ез о£ НеНсоЬас1ег ру1оп. АззосхаПоп оГ зресШс уасА
1урез ννΐίΗ су!о!охт ргодисйоп апс! рерйс и1сегайоп. 1 Βΐοΐ Скет, 270(30), 17771-17777.
- 28 032330
СЬеп, Υ., \¥апд, I., & 8Ы, й. (2001). [Ιη νίΐΐΌ з(иЬу о(' (Ье Ь1о1о§1са1 асйуЖез апс! 1шшипо§ешс11у о(' гесотЬтап! асШезт о£НейоЬас(ег ру1оп гНраА]. гЬопуЬиа Υΐ Хие 2а ΖΗΐ, 81(5), 276-279.
Соуег, Т. Й., & В1азег, Μ. 1. (1992). Рипйсайоп апс! сЬагас(епга(юп о(' Ле уасио! аЬпд ΐοχίη йот НеНсоЬас(ег ру1оп. ΙΒίοΙ СЬет, 267(15), 10570-10575.
ϋιιηη, В. Ε., Коор, К. Μ., 2ηά, 8ипд, С. С., 8Ьагта, 8. А., Регег-Регег, О. I., & В1азег, Μ. 1. (1992). Мепййсайоп апс! рипйсайоп о(' а српбО ИеаГ зЬоск рго(ет Ьото1од (гот НейсоЬас(ег ру1оп. 1п(ес( 1ттип, 60(5), (946-(95(.
Еа(оп, К. А., 8иегЬаит, 8., 1озепЬапз, С., & Кгакохука, 8. ((996). Со1отгайоп о('§по(оЬ1ойс ρί§1ε(8 Ьу НеНсоЬас(ег ру1оп с1ейс1еп1 ίη ΐ\νο йадеШп депез. 1п(ес( 1ттип, 64(7), 2445-2448.
Егапсо, А. Т., 1згае1, Ό. А., \УазЫпд(оп, М. К., КпзЬпа, и., Еох, 1. О., Кодегз, А. В., е( а1. (2005). Асйуайоп о£Ье(а-са(етп Ьу сагстодетс НейсоЬас(ег ру1оп. Ргос №11 Асас! 8οΐ и 8 А,(02(30), (0646-(065(.
Еизсот, М., Уайа, Ό., МепедаШ, М., ЕаппеШ, 8., Е1дига, Ν., Ηοΐίοη, 1., е( а1. ((999). Апй-СадА геасйуйу ϊη НейсоЬас(ег ру1оп-педайуе зиЬ)ес(з: а сотрапзоп о(' (Ьгее Л(Гегеп( тейюЬз. О1д ϋΐ8 8οΐ, 44(8), (69(-(695.
Оао, й., М1сЬе1, А., \¥еск, Μ. Ν., АгпсЙ, V., Ра\у1йа, М., & Вгеппег, Н. (2009). НейсоЬас(ег ру1оп тЕесйоп апс! даз(пс сапсег пзк: еуа1иайоп οί 15Н. ру1оп рго(етз άβίβπηΐηβά Ьу ηονβΐ ти1йр1ех 8его1оду. Сапсег Кез, 69((5), 6(64-6(70.
Οοίο, Т., ΝΐδΗΐζοηο, А., Еирока, Т., 1ке\уак1,1., Мйипе, К., & Иази, М. ((999). Йоса1 зесге(огу 1ттипод1оЬи1т А апс! розйттитгайоп даз(п(18 согге1а(е χνίΐΗ рго(есйоп адатз( НеНсоЬас(ег ру1оп тГесйоп айег ога1 уасстайоп о('пн се. 1п(ес( 1ттип, 67(5), 253(-2539.
Нау, Е. С., λΥεδίννοοά, О. Μ. К., Νείδοη, Р. Ν., & Нийзоп, Й. (2002). Ргасйса1 1ттипо1оду: \УИеу-В1аск\¥е11.
Нопс1а, 8., Еирока, Т., ТоИеЬа, М., 8а(оЬ, К., ΝΐδΗΐζοηο, А., & Иази, М. ((998). ϋενείορκηεηί о£НеНсоЬас(ег ру1оп-тс1исеЬ даз(пс сагстота ίη МопдоНап дегЬйз. Сапсег Кез, 58((9), 42554259.
Κίκη, 1. 8., СЬапд, 1. Н., СЬипд, 8.1., & Уит, 1. 8. ((999). Мо1еси1аг с1отпд апс! сЬагас(епгайоп о(' (Ье НеНсоЬас(ег ру1оп Είϋ депе, ап еззепйа1 (ас(ог ίη йадеПаг з(гис(иге апс! тоЫйу. 1 Вас(епо1, (8((22), 6969-6976.
Μίίίεΐ Р. К. Е., йие(Ьу й., КетЬагЛ С., 1о11ег Н. (2003). ϋείεοίίοη оЕ ЫдЬ (йегз оЕ апйЬоЬу адатз( НейсоЬас(ег суз(ете-псЬ рго(етз А, В, С, апс! Ε ίη НейсоЬас(ег ру1оп-т(ес(еЬ тЬМЬиак. С1т. О1адп. йаЬ. ТттипоЕ (0:542- 545.
- 29 032330
МассЫа, О., Маззопе, А., Виггош, Ό., Соуассц А., Сепз1ш, 8., & Карриой, К. (1993). Тйе НзрбО ρΐΌΐείη о£ НеНсоЬас!ег ру1оп: з!гис!иге ап б 1шшипе гезропзе ίη райеп!з \νίΛ даз!гобиобепа1 б18еазе8. Мо1 М1сгоЫо1, 9(3), 645-652.
М1сйеЛ, Р., Кге188, С., ΚοΐΙοίΤ, К. Б., Рог!а, Ν., В1апсо, Е Б., ВасЬшапп, Ό., е! а1. (1999). Ога1 тшишгайоп \νίΛ игеазе апб ЕзсйепсЫа соН йеа!-1аЫ1е еп!его!охт ΐδ за£е апб 1шшиподешс ίη НейсоЬас!ег ру1оп-1п£ес!еб абиЕз. Оаз!гоеп!его1оду, 116(4), 804-812.
Моп!есиссо, С., & бе Вегпагб, М. (2003). Мо1еси1аг апб се11и1аг шесйашзшз о£ асйоп о£ Ле уасио1айпд ογίοίοχίη (УасА) апб пеЛгорйб-асЙуайпд рго!ет (ΗΡ-ΝΑΡ) νίαιίεηοε £ас!огз о£ НейсоЬас!ег ру1оп. МтсгоЬез 1п£ес!, 5(8), 715-721.
Мига!а-Каш1уа, Ν., КигазЫша, Υ., Те1зЫка!а, Υ., УашайазЫ, Υ., 8айо, Υ., ЕПдазЫ, Н., е! а1. (2007). НеНсоЬас!ег ру1оп С ад А т!егас!з ν/ϊΐΐι Е-сабЬепп апб бегеди1а!ез Ле Ье!а-са!ешп 81§па1 Ла! ргошо!ез т!езйпа1 !гап8Й1йегепйайоп ίη §аз!пс ер1ЛеНа1 се11з. Опсодепе, 26(32), 46174626.
ОегЛ, М., 8ипбдшз!, Μ., ΗίίζΙεη Б, Епд1ег, Ό. В., Агпо1б, Б С., КеЛег, 8., е! а1. (2012). ОСбепуеб ΙΕ-18 бпуез Тгед бйТегепйайоп, шиппе НеНсоЬас!ег ру1оп-зрес1йс 1шшипе Л1егапсе, апб азЛша рго!есйоп. I С1ш 1пуез!, 122(3), 1082-1096.
Ораго, Р., Ми11ег, Б, КоПап, А., Уа1епгие1а, Р., ΥϋδεΙενΐΛ, А., Оагаа-бе 1а Оиагба, К., е! а1. (1999). 8его1од1са1 гезропзе !о НеНсоЬас!ег ру1оп гесошЫпап! апйдепз ίη СЛПеап Л£ес!еб райеЛз \νίΛ биобепа1 и1сег, поп-и1сег бузрерз1а апб даз!пс сапсег. ΑΡΜΙ8,107(12), 1069-1078. Р11агшас1а. (1988). АШпйу сЬгота!одгарЬу ЕКВ Вю!ес1то1оду Цррза1а, 8\уебеп.
8атЬгоок, I., Еп!зсй, Е., & Машайз, Т. (1989). Мо1еси1ег С1оптд: А БаЬога!огу Мапие1, Воок 1: Νε\ν Уогк: Со1б 8рппд НаЛог ЕаЬога!огу Ргезз.
8иегЬаит, 8., ТЫЬегде, Ε М., Капзаи, Б, Ееггего, К. Е., & БаЫдпе, А. (1994). НеНсоЬас!ег ру1оп НзрА-йзрВ йеа!-зйоск депе с1из!ег: пискойбе зедиепсе, ехргеззюп, ри!айуе йипсйоп апб ттиподешсйу. Мо1 М1сгоЫо1, 14(5), 959-974.
8идапита, М., Кигизи, М., ОкаЬе, 8., 8иеока, Ν., УозЫба, М., \Уака!зи1б, Υ., е! а1. (2001). НейсоЬас!ег ру1оп тетЬгапе рго!ет 1: а пе\у сагстодешс 1ас!ог о£НеНсоЬас!ег ру1оп. Сапсег Кез, 61(17), 6356-6359.
ТотЬ Е Г., е! а1. 1997. Тйе сотр1е!е депоте зедиепсе о£ Ле даз!пс раЛодеп НеНсоЬас!ег ру1огШа!иге, 7; 388(6642):539-47.
иетига, Ν., ОкатоЛ, 8., Уатато!о, 8., Ма!зитига, Ν., УатадисЫ, 8., УатаЮбо, М., е! а1. (2001). НеНсоЬас!ег ру1оп тйесйоп апб Ле беуе1ортеп! ой даз!пс сапсег. N Епд1 I Меб, 345(11), 784- 789.
- 30 032330
Цгйа, Υ., Ыке, К., Τοπΐ, Ν., К1кисЫ, Υ., Кигака1а, Н., Капда, Ε., εΐ а1. (2004). Сошрапзоп о£ зегит 1§А апд 1дО апйЬосНез 1ог декесдпд НеНсоЬаскег ру1оп ίηίεεΐίοη. Ιηΐειτι Мей, 43(7), 548552.
\Уа1апаЬе, 8., Така§1, А., Тада, и., КаЬи, А. М., Кода, Υ., Каппуа, 8., εΐ а1. (1997). Су1о1ох1сйу апд ιηοΐίΐίΐν о£НеНсоЬас1ег ру1оп. I СНп Оа81гоеп1его1, 25 8ирр1 1, 8169-171.
\Уа1апаЬе, Т., Тада, М., Хада1, Н., 8азак1, 8., & №као, М. (1998). НеНсоЬаскег ру1оп ίηίεεΐίοη шдисез дазШс сапсег ίη шопдоНап дегЬПз. Оаз1гоеп1его1оду, 115(3), 642-648.
Уатаока, У., Кодаша, Т., Кка, М., кпашзЫ, I., КазЫша, К., & СгаЬат, ϋ. Υ. (1998).
Ке1адопзЫр о£уасА депо!урез о£НеНсоЬас1ег ру1оп ΐο садА зШиз, ογΐοΐοχίη ргодисдоп, апд сНшса1 оЩсоте. НеНсоЬас1ег, 3(4), 241-253.
Уап, I., Ыапд, 8. Н., Мао, Υ. Г., П, Ь. XV., & П, 8. Р. (2003). Сопз1гисдоп о£ехргеззюп 8уз1етз £ог ЙаА апд 11 аВ депез о£ НеНсоЬаскег ру1оп апд де1егттадоп о£ 1ттипогеасдуйу апд апддешсйу о£ гесотЬтап! ρΐΌΐείηδ. \Уог1д I Оаз1гоеп1его1, 9(10), 2240-2250.
Уап, I., & Мао, Υ. Г. (2004). Соп81гисдоп о£ а ргокагуодс ехргеззюп зуз1ет о£уасА депе апд декесдоп о£ уасА депе, УасА ρΐΌΐείη ίη НеНсоЬаскег ру1оп ΐ8о1акез апд апЬУасА апдЬоду ίη радеШз' зега. \¥ог!д 1 Оаз1гоеп1его1, 10(7), 985-990.
Признаки настоящего изобретения, раскрытые в описании изобретения, перечне последовательностей, формуле изобретения и/или чертежах, могут по отдельности и в любой их комбинации быть материалом для воплощения изобретения в различных его формах.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> Мюнхенский технический университет <120> Способ обнаружения инфекции Н. ру1ог1 <130> О 10023 РСТ <150> ЕР 13 004 038.9 <151> 2013-08-13 <160> 28 <170> РабепЫп версия 3.3 <210> 1 <211> 685 <212> РКТ <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> М13С_ЕЕАТиКЕ <223> Н. ру1ог1 штамм 027 <400> 1
Меб А1а 1 | 11е | О1у | Зег 5 | Ьеи | Зег | Зег | Ьеи О1у Ьеи О1у Зег Ьуз Уа1 | Ьеи | |||||||
10 | 15 | ||||||||||||||
Азп | Туг | Азр | Уа1 | 11е | Азр | Ьуз | Ьеи | Ьуз | Азр | А1а | Азр | О1и | Ьуз | А1а | Ьеи |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
11е | А1а | Рго | Ьеи | Азр | Ьуз | Ьуз | Меб | О1и | О1п | Азп | Уа1 | О1и | Ьуз | О1п | Ьуз |
35 | 40 | 45 |
- 31 032330
А1а | Ьеи 50 | Уа1 | О1и | 11е | Ьуз | ТЬг 55 | Ьеи | Ьеи | 5ег | 5ег | Ьеи 60 | Ьуз | О1у | Рго | Уа1 |
Ьуз | ТЬг | Ьеи | 5ег | Азр | Туг | 5ег | ТЬг | Туг | 11е | 5ег | Агд | Ьуз | 5ег | Азп | Уа1 |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
ТЬг | О1у | Азр | А1а | Ьеи | 5ег | А1а | 5ег | Уа1 | О1у | А1а | О1у | Уа1 | Рго | 11е | О1п |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Азр | 11е | Ьуз | Уа1 | Азр | Уа1 | О1п | Азп | Ьеи | А1а | О1п | О1у | Азр | 11е | Азп | О1и |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьеи | О1у | А1а | Ьуз | Рке | 5ег | 5ег | Агд | Азр | Азр | 11е | Рке | 5ег | О1п | Уа1 | Азр |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Рке | Туг | ТЬг | О1п | Азп | Ьуз | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Азп | 11е |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | О1у | МеЬ | ТЬг | Ьеи | О1у | Азр | Уа1 | А1а | О1п | 5ег | 11е | ТЬг | Азр | А1а |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
ТЬг | Азп | О1у | О1и | Уа1 | МеЬ | О1у | 11е | Уа1 | МеЬ | Ьуз | ТЬг | О1у | О1у | Азп | Азр |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Рго | Туг | О1п | Ьеи | МеЬ | Уа1 | Азп | ТЬг | Ьуз | Азп | ТЬг | О1у | О1и | Азр | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
11е | Туг | Рке | О1у | 5ег | Н1з | Ьеи | О1п | 5ег | ТЬг | Ьеи | ТЬг | Азп | Ьуз | Азп | А1а |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | 5ег | Ьеи | О1у | Уа1 | Азр | О1у | 5ег | О1у | Ьуз | 5ег | О1и | Уа1 | 5ег | Ьеи | Азп |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | О1у | А1а | Азр | О1у | Азп | ТЬг | Н1з | О1и | Уа1 | Рго | 11е | МеЬ | Ьеи | О1и |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ьеи | Рго | О1и | 5ег | А1а | 5ег | 11е | Ьуз | О1п | Ьуз | Азп | ТЬг | А1а | 11е | О1п | Ьуз |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | 11е | О1и | О1п | А1а | Ьеи | О1и | Азп | Азр | Рго | Азп | Рке | Ьуз | Азр | Ьеи | 11е |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | Азп | О1у | Азр | 11е | 5ег | 11е | Азр | ТЬг | Ьеи | Н1з | О1у | О1у | О1и | 5ег | Ьеи |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
11е | 11е | Азп | Азр | Агд | Агд | О1у | О1у | Азп | 11е | О1и | 11е | Ьуз | О1у | 5ег | Ьуз |
- 32 032330
290
295
300
А1а 305 | Ьуз | О1и | Ьеи | О1у | Рке 310 | Ьеи | О1п | ТЬг | ТЬг | ТЬг 315 | О1п | О1и | 5ег | Азр | Ьеи 320 |
Ьеи | Ьуз | 5ег | 5ег | Агд | ТЬг | 11е | Ьуз | О1и | О1у | Ьуз | Ьеи | О1и | О1у | Уа1 | 11е |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
5ег | Ьеи | Азп | О1у | О1п | Ьуз | Ьеи | Азр | Ьеи | Ьуз | А1а | Ьеи | ТЬг | Ьуз | О1и | О1у |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Азп | ТЬг | 5ег | О1и | О1и | Азп | ТЬг | Азр | А1а | 11е | 11е | О1п | А1а | 11е | Азп | А1а |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Ьуз | О1и | О1у | Ьеи | 5ег | А1а | Рке | Ьуз | Азп | А1а | О1и | О1у | Ьуз | Ьеи | Уа1 | 11е |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Азп | 5ег | Ьуз | ТЬг | О1у | МеЕ | Ьеи | ТЬг | 11е | Ьуз | О1у | О1и | Азр | А1а | Ьеи | О1у |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Ьуз | А1а | 5ег | Ьеи | Ьуз | Азр | Ьеи | О1у | Ьеи | Азп | А1а | О1у | МеЕ | Уа1 | О1п | 5ег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Туг | О1и | А1а | 5ег | О1п | Азр | ТЬг | Ьеи | Рке | МеЕ | 5ег | Ьуз | Азп | Ьеи | О1п | Ьуз |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
А1а | 5ег | Азр | 5ег | О1п | Рке | ТЬг | Туг | Азп | О1у | Уа1 | 5ег | 11е | ТЬг | Агд | Рго |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
ТЬг | Азп | О1и | Уа1 | Азп | Азр | Уа1 | 11е | Азп | О1у | Уа1 | Азп | 11е | ТЬг | Ьеи | О1и |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
О1п | ТЬг | ТЬг | О1и | Рго | Азп | Ьуз | Рго | А1а | 11е | 11е | 5ег | Уа1 | 5ег | Агд | Азр |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Азп | О1п | А1а | 11е | 11е | Азр | 5ег | Ьеи | Ьуз | О1и | Рке | Уа1 | Ьуз | А1а | Туг | Азп |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
О1и | Ьеи | 11е | Рго | Ьуз | Ьеи | Азр | О1и | Азр | ТЬг | Агд | Туг | Азр | А1а | Азр | ТЬг |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | А1а | О1у | 11е | Рке | Азп | О1у | Уа1 | О1у | Азр | 11е | Агд | ТЬг | 11е | Агд |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
5ег | 5ег | Ьеи | Азп | Азп | Уа1 | Рке | 5ег | Туг | 5ег | Уа1 | Н1з | ТЬг | Азр | Азп | О1у |
530 | 535 | 540 |
- 33 032330
Уа1 545 | О1и | Бег | Ьеи МеЬ | Ьуз 550 | Туг | О1у | Ьеи | Бег | Ьеи 555 | Азр | Азр | Ьуз | О1у | Уа1 560 | |
МеЬ | Бег | Ьеи | Азр | О1и | А1а | Ьуз | Ьеи | Бег | Бег | ТЪг | Ьеи | Азп | Бег | Азп | Рго |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | ТЪг | О1п | Азр | РЪе | РЪе | Туг | О1у | Бег | Азр | Бег | Ьуз | Азр | МеЬ | О1у |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
О1у | Агд | О1и | 11е | Н1з | О1п | О1и | О1у | 11е | РЪе | Бег | Ьуз | РЪе | Азп | О1п | Уа1 |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
11е | А1а | Азп | Ьеи | 11е | Азр | О1у | О1у | Азп | А1а | Ьуз | Ьеи | Ьуз | 11е | Туг | О1и |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Азр | Бег | Ьеи | Азр | Агд | Азр | А1а | Ьуз | Бег | Ьеи | ТЪг | Ьуз | Азр | Ьуз | О1и | Азп |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
А1а | О1п | О1и | Ьеи | Ьеи | Ьуз | ТЪг | Агд | Туг | Азп | 11е | МеЬ | А1а | О1и | Агд | РЪе |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
А1а | А1а | Туг | Азр | Бег | О1п | 11е | Бег | Ьуз | А1а | Азп | О1п | Ьуз | РЪе | Азп | Бег |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Уа1 | О1п | МеЬ | МеЬ | 11е | Азр | О1п | А1а | А1а | А1а | Ьуз | Ьуз | Азп | |||
675 | 680 | 685 |
<210> 2 <211> 2058 <212> ДНК <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> т1зс_£еаЪиге <223> Н. ру1ог1 штамм 027 <400> 2 аЬддсааЬад аЬЬдасаадс дадсааааЬд аааддсссдд асаддсдаЬд даЬдЬдсааа дасдаЬаЁЁЬ дссдЬЬааЬа дЬЬсаЬЬаад ЬЬааддасдс ЬЬдаааадса ЁЬаааасдсЬ сдЬЬдадЬдс аЬЁЬадсдса ЁЬадссаадЬ ЬЬааадсадд сЁсаЬЬаддд сдаЬдааааа аааадсссЬЬ 55сдда55а5 дадЬдЬдддд аддсдаЬаЬЬ ддаЬассасд ааЬдасЁЁЬа сЁЬддсадЬа дсдЬЬааЬсд дЬадаааЬЬа 5ссас55а5а дсЬддсдЬдс аасдаасЬад с5сааа5555 ддсдаЬдЬдд аддЬЁЁЬдаа сссссЬЬада ааасдсЬссЬ Ьсадссдааа сЁаЬЬсаада дддсдаааЬЬ асасдсаааа сЬсааадсаЬ
ЬЬасдаЬдЬд саадааааЬд 55са5с5с5а аадсааЬдЬЬ саЬЬааадЬд 55с55саада сааддасЬас сасддасдсЬ
120
180
240
300
360
420
480
- 34 032330
ассааЕддсд | аадЕдаЕддд | саЕЕдЕдаЕд | аааасаддад | ддааЕдассс | сЕассааЕЕа | 540 |
аЕддЕдааЕа | ссааааасас | сддсдаадас | аассдсаЕсЕ | аЕЕЕЕддсЕс | асассЕссаа | 600 |
ЕссасдсЕса | сЕаасааааа | сдсссЕЕЕсЕ | ЕЕдддддЕЕд | аЕддаадсдд | ааададЕдаа | 660 |
дЕдадЕЕЕда | аЕЕЕаааддд | ддсЕдаЕддд | аасасдсаЕд | аадЕссссаЕ | саЕдсЕадад | 720 |
сЕсссЕдааа | дсдсЕЕсЕаЕ | сааасааааа | аасассдсда | Ессааааадс | даЕададсад | 780 |
дсЕЕЕадааа | асдасссЕаа | ЕЕЕЕааадас | ЕЕдаЕсдсЕа | аЕддддаЕаЕ | ЕЕссаЕадас | 840 |
асЕсЕЕсаЕд | ддддддааЕс | ЕЕЕааЕсаЕЕ | ааЕдасаддс | дЕдддддааа | саЕЕдаааЕЕ | 900 |
ааадддадса | аддсЕааада | дсЕЕдддЕЕЕ | ЕЕдсааасса | ссасссаада | аадсдаЕЕЕд | 960 |
ЕЕааааадсЕ | сЕсдсассаЕ | ЕааададддЕ | аааЕЕадаад | дддЕааЕЕад | сЕЕдааЕддс | 1020 |
сааааасЕдд | аЕЕЕаааадс | сЕЕаассааа | дадддсааса | ссадсдаада | ааасасадас | 1080 |
дсЕаЕсаЕЕс | аадсдаЕЕаа | сдсЕааадаа | ддсЕЕдадЕд | сдЕЕЕааааа | сдссдааддс | 1140 |
аадсЕЕдЕда | ЕсааЕЕсЕаа | аассддааЕд | сЕаасдаЕЕа | адддсдадда | сдсЕЕЕаддс | 1200 |
ааддссадЕЕ | ЕдааддаЕЕЕ | дддЕЕЕдаас | дсЕддсаЕдд | ЕдсааЕсЕЕа | ЕдаадсЕЕса | 1260 |
саадасасдс | ЕЕЕЕЕаЕдЕс | ЕаадааЕЕЕд | сааааадсда | дсдаЕЕсдса | аЕЕсасЕЕаЕ | 1320 |
ааЕддддЕда | дсаЕсасасд | ссссасЕааЕ | даддЕсааЕд | аЕдЕдаЕЕаа | сддддЕЕааЕ | 1380 |
аЕсасЕЕЕад | адсааассас | ададссЕааЕ | ааассЕдсда | ЕЕаЕсадсдЕ | дадсадддас | 1440 |
ааЕсаадсса | ЕЕаЕадасад | ссЕЕааадаа | ЕЕЕдЕсааад | ссЕаЕааЕда | дсЕЕаЕсссЕ | 1500 |
ааасЕадаЕд | аадасасдсд | ЕЕаЕдасдсЕ | дасасЕаааа | ЕсдсЕдддаЕ | ЕЕЕЕаасддс | 1560 |
дЕдддсдаЕа | ЕЕсдсассаЕ | ЕадаЕссЕсЕ | сЕЕааЕаасд | ЕдЕЕЕЕсЕЕа | ЕадсдЕдсаЕ | 1620 |
асддаЕаасд | дддЕадааад | сЕЕдаЕдааа | ЕасдддсЕЕа | дЕЕЕадасда | ЕаадддсдЕд | 1680 |
аЕдадЕЕЕад | аЕдаддсЕаа | аЕЕдадЕадс | ассЕЕаааЕЕ | сЕаасссЕаа | адсдасЕсаа | 1740 |
даЕЕЕЕЕЕсЕ | аЕдддадсда | ЕадсааддаЕ | аЕддддддса | дадаааЕсса | ссаададддс | 1800 |
аЕЕЕЕЕЕсЕа | ааЕЕсааЕса | адЕсаЕсдсЕ | ааЕсЕсаЕад | аЕддадддаа | сдсЕаааЕЕа | 1860 |
аадаЕЕЕаЕд | аадаЕЕсссЕ | адасададас | дсЕаааадсЕ | Едассааада | сааадаааас | 1920 |
дсЕсаададс | ЕЕЕЕааааас | ссдсЕасаас | аЕсаЕддсдд | адсдсЕЕЕдс | ддсЕЕаЕдас | 1980 |
адссаааЕсЕ | сЕааадссаа | ЕсаааааЕЕс | ааЕЕссдЕдс | аааЕдаЕдаЕ | сдаЕсаадсд | 2040 |
дсддсЕаааа | адааЕЕаа | 2058 |
<210>
<211>
<212>
<213>
<400>
689
РКТ
Н. зшз
МеЕ А1а 11е О1у Ьуз Ьеи 5ег 5ег Ьеи О1у 11е О1у 5ег Ьуз Уа1 Ьеи
- 35 032330
Азп | Туг Азр | Уа1 20 | 11е Азр | Ьуз | Ьеи | Ьуз 25 | 5ег | А1а | Азр | О1и | Ьуз 30 | ТЬг | МеЬ | ||
Уа1 | А1а | Рго | 11е | Азр | Агд | Ьуз | МеЬ | О1и | Уа1 | Азп | Ьеи | О1и | Ьуз | О1п | Ьуз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | Уа1 | О1и | 11е | Ьуз | ТЬг | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | Ьеи | Ьуз | А1а | Рго | Уа1 |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
5ег | А1а | Ьеи | ТЬг | Азр | Туг | 5ег | ТЬг | Туг | ТЬг | 5ег | Агд | 5ег | 5ег | 5ег | Уа1 |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
5ег | 5ег | О1у | А1а | Ьеи | Ьуз | А1а | 5ег | Уа1 | 5ег | Рго | О1у | 11е | Рго | Уа1 | О1п |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Азр | 11е | Ьуз | Уа1 | О1и | Уа1 | О1и | Азр | Ьеи | А1а | О1п | О1у | Азр | 11е | Азп | О1и |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | О1у | ТЬг | Н1з | Рке | Агд | Азр | Агд | Азр | Азр | А1а | Рке | 5ег | О1п | А1а | Азп |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Ьеи | Н1з | Рке | Туг | ТЬг | Азп | Азп | Ьуз | Азп | Туг | ТЬг | Уа1 | Азп | 11е |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | О1у | Ме-Ь | 5ег | Уа1 | О1у | Азр | Уа1 | А1а | О1п | А1а | 11е | ТЬг | Азр | А1а |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
ТЬг | О1у | О1у | О1и | Уа1 | МеЬ | О1у | 11е | Уа1 | МеЬ | Ьуз | ТЬг | О1у | О1у | Азр | Ьуз |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Рго | Туг | О1п | Ьеи | МеЬ | 11е | Азп | ТЬг | Ьуз | Азп | Рго | О1у | А1а | Азп | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Туг | Рке | О1у | 5ег | 5ег | Уа1 | 11е | 5ег | ТЬг | Ьеи | А1а | 5ег | Азр | А1а | Рго |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | Азп | Ьеи | А1а | 11е | О1у | О1у | ТЬг | ТЬг | А1а | Азр | О1у | Ьуз | 5ег | ТЬг | О1и |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Азр | Азр | Рке | Рке | 11е | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азр | Азр | Ьуз | О1у | О1и | Уа1 | Уа1 | Ьуз |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
11е | Рго | 11е | 5ег | Ьеи | Азп | Ьеи | Азр | Ьуз | А1а | 5ег | Уа1 | О1п | Азр | Ьуз | Азп |
245 | 250 | 255 |
- 36 032330
Ьуз | А1а | Ьеи | О1п 260 | ТЪг | А1а | 11е | Ьуз | Ьуз 265 | А1а | Ьеи | О1и Азр | Азп 270 | А1а | О1п | |
ТЪг | Ьуз | Азр | Ьеи | Уа1 | Азр | 5ег | О1у | О1п | 11е | Азп | 11е | О1у | Ьеи | 11е | Азп |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Азр | О1у | Ьуз | 5ег | Ьеи | Уа1 | Ьеи | Азп | Азр | О1п | Агд | О1у | Ьеи | О1и | Уа1 | О1и |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Уа1 | О1у | О1у | А1а | Ьуз | А1а | А1а | О1и | Ьеи | О1у | РЪе | Уа1 | Ьуз | ТЪг | Ьуз | 5ег |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Азр | О1п | О1и | Азр | Ьеи | Ьеи | Ьуз | О1у | ТЪг | А1а | О1у | 11е | А1а | 5ег | О1у | О1п |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
11е | Ьуз | О1у | ТЪг | 11е | Азп | РЪе | Азп | О1у | О1п | А1а | 11е | Азп | Ьеи | О1у | А1а |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
11е | ТЪг | А1а | ТЪг | О1у | Азп | 5ег | 5ег | Азр | А1а | Азп | А1а | О1п | А1а | 11е | Уа1 |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | 11е | Азп | О1у | 11е | О1п | О1у | Ьеи | Н1з | А1а | 5ег | Ьеи | О1у | ТЪг | Азр |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1у | Ьуз | Ьеи | 11е | Ьеи | Азп | 5ег | О1и | 5ег | О1у | О1и | Ьеи | Агд | 11е | ТЪг | О1у |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Уа1 | О1у | А1а | Азр | О1у | Ьуз | А1а | А1а | Уа1 | Азп | 5ег | Ьеи | О1у | Ьеи | 5ег | О1и |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
О1у | Ьеи | 5ег | О1п | 5ег | Туг | А1а | Ьуз | Ьеи | Н1з | Азр | Ьеи | РЪе | А1а | РЪе | Ьуз |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | Ьеи | О1п | 5ег | А1а | 5ег | Азр | А1а | Агд | РЪе | ТЪг | Туг | Азп | О1у | А1а | ТЪг |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
11е | ТЪг | Агд | Рго | ТЪг | Азп | О1и | Уа1 | Азп | Азр | Уа1 | 11е | Азп | О1у | Уа1 | 5ег |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Ьеи | 5ег | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьуз | ТЪг | О1и | Рго | О1у | Ьуз | Рго | А1а | 11е | 11е | 5ег |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
11е | ТЪг | Агд | Азр | 5ег | Ьуз | А1а | 11е | Уа1 | Азр | Н1з | Уа1 | Ьуз | О1и | РЪе | Уа1 |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | Туг | Азп | А1а | Ьеи | 11е | Рго | Ьуз | Ьеи | Азр | О1и | ТЪг | ТЪг | Агд | Туг |
500 | 505 | 510 |
- 37 032330
Азр | Рго Азр 515 | ТЬг | Ьуз | 11е | А1а | О1у Уа1 520 | Рке Азп | О1у | Уа1 525 | О1у | Азр | 11е | |||
Агд | ТЬг | 11е | Агд | 5ег | 5ег | 11е | Азп | Азп | А1а | 11е | А1а | Рке | ТЬг | 11е | ТЬг |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
ТЬг | А1а | Ьуз | О1у | Уа1 | Азр | 5ег | Ьеи | МеЬ | Ьуз | Туг | О1у | 11е | ТЬг | Ьеи | Азр |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
О1и | Н1з | О1у | Ьуз | МеЬ | 5ег | Ьеи | Азр | О1и | 5ег | Агд | Ьеи | ТЬг | Азп | А1а | Ьеи |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Азп | А1а | Азр | Рго | О1п | А1а | А1а | О1п | Азр | Рке | Рке | Туг | О1у | О1у | Азр | 11е |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ьуз | 5ег | МеЬ | О1у | О1у | Ьуз | О1и | 11е | Н1з | О1п | Азр | О1у | 11е | Рке | 11е | Ьуз |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Ьеи | Азр | Ьуз | Уа1 | Ьеи | О1п | О1у | Ьеи | Уа1 | Азр | О1у | О1у | Азп | А1а | Агд | Ьеи |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Ьуз | Ьеи | Туг | О1и | Азр | 5ег | Ьеи | Азр | О1п | Азр | А1а | Ьуз | Азп | Ьеи | Агд | Агд |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Азр | Ьуз | О1и | Азп | А1а | МеЬ | О1и | МеЬ | Ьеи | Ьуз | ТЬг | Агд | Туг | Азр | МеЬ | МеЬ |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
А1а | О1и | Агд | Рке | А1а | А1а | Туг | Азр | О1и | Агд | 11е | 5ег | Ьуз | А1а | Азп | Ьуз |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
5ег | Рке | Азр | А1а | Уа1 | О1п | МеЬ | МеЬ | 11е | Азр | О1п | А1а | А1а | А1а | Ьуз | Ьуз |
675 | 680 | 685 |
Азп <210> 4 <211> 2070 <212> ДНК <213> Н. зибз <400> 4
аЬддсдаЬЬд | дааадЬЬаад | ЬЬсЬЬЬаддд | аЬЬдддадса | аддЬЬЬЬааа | сЬасдаЬдЬд | 60 |
аЬЬдаЬааас | ЬЬаааадсдс | ЬдаЬдааааа | асЬаЬддЬдд | сЬсссаЬЬда | ЬсдаааааЬд | 120 |
даадЬсааЬс | ЬЬдаааааса | аааддсЬЬЬа | дЬЬдадаЬЬа | ааасЬЬЬдсЬ | ЬдссааЬсЬЬ | 180 |
ааадсдсссд | ЬЬадЬдсЬЬЬ | аасддаЬЬаЬ | ЬсаасЬЬаЬа | сдадссдсад | ЬадсадЬдЬд | 240 |
- 38 032330
адсадЕддад | сдсЕЕааадс | садЕдЕаадс | ссдддЕаЕсс | сЕдЕдсаада | ЕаЕЕааадЕа | 300 |
даадЕЕдадд | аЕЕЕддсЕса | аддсдаЕаЕЕ | ааЕдаадЕсд | дЕасасаЕЕЕ | ЕададаЕсдс | 360 |
даЕдаЕдссЕ | ЕЕадссаадс | Еаасассааа | ЕЕасасЕЕЕЕ | аЕассааЕаа | ЕааааасЕас | 420 |
асадЕсааЕа | ЕЕааддсЕдд | ЕаЕдадЕдЕа | ддсдаЕдЕсд | сссаадссаЕ | ЕасадаЕдсЕ | 480 |
асддддддсд | аддЕдаЕддд | даЕЕдЕдаЕд | аааассдддд | дддаЕааасс | сЕаЕсадЕЕа | 540 |
аЕдаЕЕааЕа | сЕааааассс | сддддсЕааЕ | аассдсЕЕдЕ | аЕЕЕЕддсЕс | ЕадЕдЕЕаЕЕ | 600 |
ЕсЕасЕсЕЕд | сЕадЕдаЕдс | дссЕаЕЕааЕ | ЕЕадссаЕад | ддддсасЕас | ЕдсадаЕддд | 660 |
аааадЕасад | аадаЕдаЕЕЕ | ЕЕЕЕаЕЕааа | дЕЕааадаЕд | аЕаадддсда | адЕддЕЕааа | 720 |
аЕсссЕаЕЕа | дЕсЕЕааЕсЕ | ЕдаЕааддсЕ | ЕсЕдЕдсаад | аЕаааааЕаа | адсссЕдсаа | 780 |
асадсЕаЕЕа | ааааадсссЕ | ададдаЕааЕ | дсасааасса | аадассЕадЕ | адаЕадсдда | 840 |
садаЕсааЕа | ЕсддЕЕЕдаЕ | ЕааЕдаЕддс | аааЕсЕЕЕад | ЕасЕЕаасда | Есааададдд | 900 |
ЕЕадаадЕЕд | аадЕЕддддд | адсЕааадса | дсЕдаасЕад | дЕЕЕЕдЕЕаа | аасЕаааЕса | 960 |
даЕсаадаад | аЕЕЕасЕсаа | аддсасадса | дддаЕЕдсаЕ | ссддЕсаааЕ | саадддсасЕ | 1020 |
аЕЕааЕЕЕЕа | аЕдддсаадс | саЕЕааЕЕЕа | ддддсЕаЕса | ссдсаасддд | сааЕЕсЕадс | 1080 |
даЕдсЕаасд | сЕсаадссаЕ | сдЕЕааадсс | аЕЕааЕддса | ЕЕсаадддЕЕ | дсасдсЕЕсЕ | 1140 |
ЕЕаддсасдд | асдддаааЕЕ | ааЕссЕЕааЕ | адЕдааадсд | дсдадЕЕдсд | ЕаЕаассддЕ | 1200 |
дЕдддддссд | аЕддЕааадс | ддсЕдЕаааЕ | адЕЕЕаддЕЕ | ЕдЕсЕдаддд | сЕЕаадссаа | 1260 |
ЕссЕаЕдсЕа | ааЕЕасасда | ЕсЕсЕЕЕдсс | ЕЕЕаааааас | ЕасааадЕдс | сЕсЕдаЕдсЕ | 1320 |
адаЕЕЕасЕЕ | асааЕддЕдс | дасааЕсасс | сдсссЕасаа | аЕдаддЕааа | сдаЕдЕдаЕЕ | 1380 |
аасддЕдЕаЕ | сЕЕЕдадЕЕЕ | аЕЕадссааа | асЕдадссдд | дЕааассадс | саЕЕаЕЕадс | 1440 |
аЕЕасссдсд | асадЕааддс | саЕЕдЕЕдаЕ | саЕдЕЕааад | ааЕЕЕдЕсаа | адссЕаЕааЕ | 1500 |
дсаЕЕааЕсс | сЕааасЕада | Едааасаасс | сдЕЕасдаЕс | садаЕасЕаа | ааЕЕдссддс | 1560 |
дЕдЕЕЕааЕд | дсдЕддддда | ЕаЕссдсаса | аЕЕсдсЕсЕЕ | сааЕЕааЕаа | ЕдссаЕЕдсЕ | 1620 |
ЕЕЕасааЕса | саасддсЕаа | аддЕдЕддаЕ | адЕсЕсаЕда | адЕаЕдддаЕ | ЕасасЕЕдаЕ | 1680 |
дадсаЕддаа | адаЕдадсЕЕ | адаЕдададс | адасЕсасаа | асдсдсЕЕаа | ЕдссдаЕсса | 1740 |
саадссдсЕс | аадаЕЕЕсЕЕ | сЕаЕддЕддс | даЕаЕЕаааа | дЕаЕдддддд | ЕааддадаЕЕ | 1800 |
сассаадасд | ддаЕЕЕЕЕаЕ | саадЕЕадаЕ | ааадЕЕЕЕдс | ааддЕЕЕддЕ | сдаЕддЕддЕ | 1860 |
аасдсдаддЕ | ЕдаадЕЕаЕа | сдаддаЕЕсЕ | ЕЕадаЕсаад | асдсЕааааа | ЕЕЕдадаада | 1920 |
даЕааддада | аЕдсааЕдда | даЕдсЕЕааа | асссдЕЕаЕд | асаЕдаЕддс | адаасдсЕЕЕ | 1980 |
дсадсЕЕаЕд | аЕдадсдЕаЕ | ЕЕсЕааддсд | ааЕаааЕссЕ | ЕЕдаЕдсддЕ | дсадаЕдаЕд | 2040 |
аЕсдаЕсаад | садссдссаа | ааадааЕЕаа | 2070 |
- 39 032330 <210>
<211>
<212>
<213>
684
РКТ
Н. ЬеИз <400> 5
МеЕ 1 | А1а | Уа1 | О1у | О1п 5 | Ьеи | 5ег | 5ег | Ьеи | О1у 10 | 11е | О1у | 5ег | Ьуз | Уа1 15 | Ьеи |
Азп | Туг | Азр | Уа1 | 11е | Азр | Ьуз | Ьеи | Ьуз | Ьуз | А1а | Азр | О1и | Азп | ТЬг | МеЕ |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Уа1 | Ьуз | Рго | 11е | О1и | Агд | Ьуз | МеЕ | О1и | А1а | Азп | Ьеи | О1и | Ьуз | О1п | Ьуз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | Уа1 | О1и | 11е | О1п | ТЬг | Ьеи | Ьеи | О1у | Азп | Ьеи | Агд | ТЬг | Рго | Уа1 |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Агд | А1а | Ьеи | 5ег | Азр | Туг | 5ег | ТЬг | Туг | ТЬг | А1а | Агд | Н1з | 5ег | Азп | Уа1 |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
ТЬг | О1у | Азр | А1а | Ьеи | Ьуз | Уа1 | 5ег | Уа1 | 5ег | Рго | О1у | 11е | Рго | 11е | О1п |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Азп | 11е | Ьуз | Уа1 | Азр | Уа1 | О1и | 5ег | Ьеи | А1а | О1п | О1у | Азр | 11е | Азп | О1и |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | О1у | ТЬг | Н1з | Рке | 5ег | 5ег | Агд | Азр | Азр | 5ег | Рке | А1а | О1п | Рке | Азр |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | Ьеи | Н1з | Рке | Туг | ТЬг | Азп | Н1з | О1п | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Ьуз | 11е |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | О1у | МеЕ | ТЬг | Ьеи | 5ег | Азр | Уа1 | А1а | О1п | А1а | 11е | ТЬг | Азр | А1а |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
ТЬг | Азр | О1у | Ьуз | Уа1 | МеЕ | О1у | 11е | Уа1 | МеЕ | Ьуз | ТЬг | О1у | О1у | Азп | Ьуз |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Рго | Туг | О1п | Ьеи | МеЕ | 11е | Азп | 5ег | Ьуз | О1у | ТЬг | О1у | А1а | Азр | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
11е | Рке | Рке | О1у | 5ег | 5ег | Уа1 | 11е | 5ег | Н1з | Ьеи | 5ег | Азп | Азр | А1а | ТЬг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | Азп | Ьеи | О1и | А1а | Ьуз | 5ег | О1и | ТЬг | Ьуз | Рго | О1и | Азр | Азр | Рке | Рке |
210 | 215 | 220 |
- 40 032330
11е 225 | Ьуз | Уа1 | Н1з | Азр | О1и 230 | О1п | Азп | Уа1 | 11е | О1и 235 | 11е | Рго | 11е | А1а | Ьеи 240 |
Ьуз | Ьеи | О1п | О1у | 5ег | 11е | О1и | 5ег | Ьуз | Азп | А1а | А1а | Ьеи | Агд | А1а | А1а |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | О1п | Ьуз | А1а | Ьеи | О1и | Азр | Азп | Рго | А1а | ТЬг | Ьуз | 5ег | Ьеи | А1а | Азр |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Азп | О1у | О1п | Ьеи | Азп | Уа1 | О1у | Уа1 | 11е | Азп | О1и | О1у | Ьуз | 5ег | Ьеи | Уа1 |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
11е | Азп | Азр | Ьуз | Агд | О1у | Ьеи | 5ег | Уа1 | О1и | Уа1 | О1у | О1у | А1а | Ьуз | А1а |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Агд | О1и | Ьеи | О1у | Рке | 11е | О1п | Азр | Ьуз | 5ег | О1п | А1а | О1и | О1у | Азр | Ьеи |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ьеи | Ьуз | А1а | Ьеи | ТЬг | А1а | Рго | О1п | 5ег | О1у | Ьуз | 11е | Ьуз | О1у | 11е | 11е |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
5ег | Ьеи | Азп | О1у | О1п | Азп | 11е | Азр | МеЬ | О1у | А1а | 11е | ТЬг | А1а | О1и | Н1з |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Азп | 5ег | 5ег | О1п | Азр | Азп | А1а | Азп | А1а | Ьеи | 11е | Ьуз | А1а | Уа1 | Азп | О1у |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
11е | А1а | О1у | Ьеи | 5ег | А1а | 5ег | Уа1 | О1у | А1а | Азр | О1у | Ьуз | Ьеи | Уа1 | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Азп | 5ег | А1а | 5ег | О1у | О1п | Ьеи | Агд | Ьеи | ТЬг | О1у | А1а | Азп | А1а | О1и | О1у |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Ьуз | Ьуз | А1а | Ьеи | Ьуз | Азр | Ьеи | О1у | Ьеи | 5ег | О1и | О1у | Рке | 5ег | Агд | 5ег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Туг | А1а | Азп | А1а | О1п | О1и | Ьеи | Рке | 5ег | Уа1 | Ьуз | Азп | Ьеи | О1п | 5ег | А1а |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
5ег | Азр | А1а | Ьуз | Рке | ТЬг | Туг | Азп | О1у | А1а | 5ег | 11е | ТЬг | Агд | Рго | ТЬг |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Азп | О1и | Уа1 | Азп | Азр | Уа1 | 11е | Азп | О1у | Уа1 | 5ег | Ьеи | 5ег | Ьеи | Ьеи | О1у |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | О1и | Рго | О1у | Ьуз | О1у | А1а | Уа1 | Уа1 | 5ег | 11е | ТЬг | Агд | Азр | Азр |
465 | 470 | 475 | 480 |
- 41 032330
Ьуз | А1а | 11е | 11е | Азр Азп 485 | Уа1 | Ьуз | О1и | РЪе 490 | Уа1 | Ьуз | А1а | Туг | Азп 495 | О1и | |
Ьеи | МеЬ | Рго | Ьуз | Ьеи | Азр | О1и | ТЪг | ТЪг | Агд | Туг | Азр | Рго | Азр | ТЪг | Агд |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
11е | А1а | О1у | 11е | РЪе | Азп | О1у | Уа1 | Бег | Азр | 11е | Агд | ТЪг | 11е | Агд | Бег |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Бег | Ьеи | 11е | Бег | А1а | Уа1 | ТЪг | РЪе | ТЪг | 11е | ТЪг | Азп | Бег | Ьуз | О1у | Уа1 |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
А1а | Бег | Ьеи | МеЬ | Ьуз | Туг | О1у | 11е | МеЬ | Ьеи | Азр | Азр | Н1з | О1у | Ьуз | МеЬ |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Бег | Ьеи | Азр | О1и | Бег | Агд | Ьеи | А1а | Бег | А1а | 11е | Азп | А1а | Азр | Рго | О1п |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
О1у | ТЪг | О1п | Азр | РЪе | РЪе | Туг | О1у | Бег | Азр | Уа1 | Ьуз | Бег | МеЬ | О1у | О1у |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ьуз | О1и | ТЪг | Н1з | О1п | Азр | О1у | 11е | РЪе | О1и | Агд | Уа1 | Азр | Ьуз | Уа1 | Ьеи |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
А1а | Азп | Ьеи | Уа1 | Азр | О1у | О1у | Н1з | А1а | Агд | Ьеи | Ьуз | Ьеи | Туг | О1и | Азр |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Бег | Ьеи | Азр | О1п | Азр | А1а | Ьуз | Бег | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Азр | Ьуз | О1и | Азп | А1а |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
МеЬ | О1и | Ьеи | Ьеи | Ьуз | ТЪг | Агд | Туг | Азр | 11е | МеЬ | А1а | О1и | Агд | РЪе | А1а |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
А1а | Туг | Азр | О1и | О1п | 11е | Бег | Ьуз | А1а | Азп | Агд | Бег | РЪе | Азп | А1а | Уа1 |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
О1п | МеЬ | МеЬ | 11е | Азр | О1п | А1а | А1а | А1а | Ьуз | Ьуз | Азп | ||||
675 | 680 |
<210> 6 <211> 2055 <212> ДНК <213> Н. ЕеИз
<400> 6 | ||||||
аЬддсадЬад | ддсааЬЬаад | ЖсЁЖддда | аЬЬддЬадса | аадЬЬЬЬааа | сЬасдаЬдЬд | 60 |
аЬсдаЬаадс | ЬЬаааааадс | ддасдаааас | асдаЬддЬЬа | аасссаЬсда | дадааадаЬд | 120 |
- 42 032330
даддссаабб | бадаааааса | аааадсссбб | дбадааабсс | ааасбббдсб | бдддаабббд | 180 |
сдсасассбд | бсададсбсб | аадсдаббаб | бссасббаба | садсбадаса | бадсаабдба | 240 |
ассддддабд | сдсббааадб | дадбдбдадб | ссдддбабсс | ссаббсаааа | бабсааадбд | 300 |
дабдбадада | дбббадсаса | дддддабабб | аабдаддбдд | дсасбсаббб | бадсбссада | 360 |
дасдасбсдб | ббдсдсадбб | бдабасбасб | ббдсаббббб | абассаабса | бсаддаббас | 420 |
дсддббаааа | ббааадсбдд | дабдассбба | адсдабдбсд | сбсаддсааб | сасддабдсб | 480 |
асбдабддса | аддбдабддд | даббдбдабд | аааассдддд | ддаабааасс | сбабсадсба | 540 |
абдабсааба | дбаадддсас | дддсдсддаб | аабсдбабсб | бббббддббс | бадбдбсабс | 600 |
бсссабббда | дсаабдабдс | дассаббааб | ббадаадсса | ададсдадас | ааадссбдад | 660 |
дабдаббббб | ббабсааадб | дсабдасдаа | саааабдбда | бадаааббсс | бабсдсбсбс | 720 |
аадббдсадд | дсбсбаббда | дадбааааас | дсддсбсбдс | дбдсадссаб | ссааааадсс | 780 |
ббададдаба | абсссдсбас | аааабсббба | дсадасаабд | ддсадббааа | бдбдддддбс | 840 |
абсаабдадд | дбааабсббб | ддбдабсааб | дабааасдад | дбббдадсдб | ададдбаддд | 900 |
ддддсбаадд | сдсдсдаасб | аддбббсабс | саадабаааб | сссаадсбда | дддбдаббба | 960 |
сбаааадссс | бсассдсссс | дсаабсбддс | аадабсааад | дсаббаббад | бсбдаабдда | 1020 |
саааасаббд | асабдддддс | дабсасадсб | даасабаабб | сбадбсаада | саасдсбаас | 1080 |
дсбсбдабба | аадсбдбсаа | бддсаббдса | ддбббдадсд | сдбсбдбддд | сдсддабддд | 1140 |
аадббадбдс | бсаабадбдс | садсдддсаа | ббасдсббаа | ссддадсбаа | бдсададддб | 1200 |
аааааддсбс | бсааадаббб | аддссбсбса | даддддббба | дссдсбсбба | бдсбаабдсб | 1260 |
саадаасбсб | бббсбдббаа | ааасббасад | адбдсбадсд | абдсбааабб | бассбасааб | 1320 |
ддддсбадба | бсасдсдссс | бассаабдаа | дббаабдабд | бааббаабдд | сдбдбсббба | 1380 |
адбббдсбад | дсасаасада | дссдддсаад | ддддсбдббд | бдадсабсас | асдадабдас | 1440 |
ааддсдабса | бсдабаабдб | сааададббб | дбсааадссб | абаабдадбб | дабдссаааа | 1500 |
ббадабдада | ссасссдбба | сдабссддас | асаадааббд | ссдддабсбб | баабддадбд | 1560 |
адсдабабсс | дсасбабссд | сбсббсасбб | абсадбдсад | ббасббббас | аабсасбааб | 1620 |
адсаадддсд | бддсбадсбб | дабдаадбаб | дддабсабдс | бадабдасса | бддсаадабд | 1680 |
адбббадасд | ааадссдбсб | бдсбадсдса | абсаасдссд | абссдсаадд | сасссаадас | 1740 |
ббсббббабд | даадсдабдб | даададбабд | дддддсаадд | ааасссасса | адабддаабс | 1800 |
бббдадсдсд | бддабааадб | бббддсбааб | ббддбсдабд | дбддбсабдс | дсдбббдаад | 1860 |
сбсбабдаад | асбсбсбада | бсаадабдсс | аааадссбса | ааааадабаа | ададаасдсб | 1920 |
абддадббаб | бааааасссд | сбабдасабс | абддсададс | дббббдсбдс | сбабдасдад | 1980 |
садабббсба | аддсбаассд | абсабббаас | дсбдбдсада | бдабдабсда | бсаадсбдсб | 2040 |
- 43 032330 дсЕаадаааа асЕаа
2055
<210> | 7 |
<211> | 1230 |
<212> | РЕТ |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | |
<221> | М15С_РЕАТиКЕ |
<223> | Н. ру1ог1 штамм 027 |
<400> | 7 |
МеЕ 1 | ТЪг Азп | О1и | ТЪг 5 | 11е | Азп | О1п О1п | Рго 10 | О1п | ТЪг | О1и | А1а | А1а 15 | РЪе | ||
Азп | Рго | О1п | О1п | РЪе | 11е | Азп | Азп | Ьеи | О1п | Уа1 | А1а | РЪе | Ьеи | Ьуз | Уа1 |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Азр | Азп | А1а | Уа1 | А1а | Еег | Туг | Азр | Рго | Азр | О1п | Ьуз | Рго | 11е | Уа1 | Азр |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | Азр | Агд | Азр | Азп | Агд | О1п | А1а | РЪе | Азп | О1у | 11е | Еег | О1п | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Агд | О1и | О1и | Туг | Еег | Азп | Ьуз | А1а | 11е | Ьуз | Азп | Рго | А1а | Ьуз | Ьуз | Азп |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
О1п | Туг | РЪе | Еег | Азр | РЪе | 11е | Азр | Ьуз | Еег | Азп | Азп | Ьеи | 11е | Азп | Ьуз |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Азр | А1а | Ьеи | 11е | Азр | Уа1 | О1и | Еег | Еег | ТЪг | Ьуз | Еег | РЪе | О1п | Ьуз | РЪе |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
О1у | Азр | О1п | Агд | Туг | О1п | 11е | РЪе | ТЪг | Еег | Тгр | Уа1 | Еег | Н1з | О1п | Азп |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Азр | Рго | Еег | Ьуз | 11е | Азп | ТЪг | Агд | Еег | 11е | Агд | Азп | РЪе | МеЕ | О1и | Азп |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
11е | 11е | О1п | Рго | Рго | 11е | Рго | Азр | Азр | Ьуз | О1и | Ьуз | А1а | О1и | РЪе | Ьеи |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ьуз | Еег | А1а | Ьуз | О1п | Еег | РЪе | А1а | О1у | 11е | 11е | 11е | О1у | Азп | О1п | 11е |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Агд | ТЪг | Азр | О1п | Ьуз | РЪе | МеЕ | О1у | Уа1 | РЪе | Азр | О1и | Еег | Ьеи | Ьуз | О1и |
180 | 185 | 190 |
- 44 032330
Агд | О1п | О1и 195 | А1а О1и | Ьуз | Азп | О1у О1у 200 | Рго | ТЬг | О1у | О1у 205 | Азр | Тгр | Ьеи | ||
Азр | 11е | Рке | Ьеи | 5ег | Рке | 11е | Рке | Азр | Ьуз | Ьуз | О1п | 5ег | 5ег | Азр | Уа1 |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьуз | О1и | А1а | 11е | Азп | О1п | О1и | Рго | Уа1 | Рго | Н1з | Уа1 | О1п | Рго | Азр | 11е |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
А1а | ТЬг | ТЬг | ТЬг | ТЬг | Азр | 11е | О1п | О1у | Ьеи | Рго | Рго | О1и | А1а | Агд | Азр |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | Азр | О1и | Агд | О1у | Азп | Рке | 5ег | Ьуз | Рке | ТЬг | Ьеи | О1у | Азр | МеЕ |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
О1и | МеЕ | Ьеи | Азр | Уа1 | О1и | О1у | Уа1 | А1а | Азр | 11е | Азр | Рго | Азп | Туг | Ьуз |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Рке | Азп | О1п | Ьеи | Ьеи | 11е | Н1з | Азп | Азп | А1а | Ьеи | 5ег | 5ег | Уа1 | Ьеи | МеЕ |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
О1у | 5ег | Н1з | Азп | О1у | 11е | О1и | Рго | О1и | Ьуз | Уа1 | 5ег | Ьеи | Ьеи | Туг | О1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
О1у | Азп | О1у | О1у | Рго | Ьуз | А1а | Ьуз | Н1з | Азр | Тгр | Азп | А1а | ТЬг | Уа1 | О1у |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Туг | Ьуз | Азр | О1п | О1п | О1у | Азп | Азп | Уа1 | А1а | ТЬг | 11е | 11е | Азп | Уа1 | Н1з |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
МеЕ | Ьуз | Азп | О1у | 5ег | О1у | Ьеи | Уа1 | 11е | А1а | О1у | О1у | О1и | Ьуз | О1у | 11е |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азп | Азп | Рго | 5ег | Рке | Туг | Ьеи | Туг | Ьуз | О1и | Азр | О1п | Ьеи | ТЬг | О1у | 5ег |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1п | Агд | А1а | Ьеи | 5ег | О1п | О1и | О1и | 11е | Агд | Азп | Ьуз | Уа1 | Азр | Рке | МеЕ |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
О1и | Рке | Ьеи | А1а | О1п | Азп | Азп | А1а | Ьуз | Ьеи | Азр | Азп | Ьеи | 5ег | О1и | Ьуз |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
О1и | О1и | О1и | Ьуз | Рке | Агд | Азп | О1и | 11е | Ьуз | Азр | Рке | О1п | Ьуз | Азр | 5ег |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | Туг | Ьеи | Азр | А1а | Ьеи | О1у | Азп | Азр | Агд | 11е | А1а | Рке | Уа1 | 5ег |
435 | 440 | 445 |
- 45 032330
Ьуз | Ьуз 450 | Азр | ТЬг | Ьуз | Н1з | 5ег 455 | А1а | Ьеи | 11е | ТЬг | О1и 460 | Рке | О1у | Азп | О1у |
Азр | Ьеи | 5ег | Туг | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Азр | Туг | О1у | Ьуз | Ьуз | А1а | Азр | Ьуз | А1а |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьеи | Азр | Агд | О1и | Ьуз | Азп | Уа1 | ТЬг | Ьеи | О1п | О1у | Азп | Ьеи | Ьуз | Н1з | Азр |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
О1у | Уа1 | МеЕ | Рке | Уа1 | Азр | Туг | 5ег | Азп | Рке | Ьуз | Туг | ТЬг | Азп | А1а | 5ег |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | Рго | Азп | Ьуз | О1у | Уа1 | О1у | Уа1 | ТЬг | Азп | О1у | Уа1 | 5ег | Н1з | Ьеи |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
О1и | А1а | О1у | Рке | 5ег | Ьуз | Уа1 | А1а | Уа1 | Рке | Азп | Ьеи | Рго | Азр | Ьеи | Азп |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | А1а | 11е | ТЬг | 5ег | Ьеи | Уа1 | Агд | Агд | Азр | Ьеи | О1и | Азр | Ьуз | Ьеи |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
11е | А1а | Ьуз | О1у | Ьеи | 5ег | Рго | О1п | О1и | ТЬг | Азп | Ьуз | Ьеи | Уа1 | Ьуз | Азр |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Рке | Ьеи | 5ег | 5ег | Азп | Ьуз | О1и | Ьеи | Уа1 | О1у | Ьуз | А1а | Ьеи | Азп | Рке | Азп |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | Уа1 | А1а | О1и | А1а | Ьуз | Азп | ТЬг | О1у | Азп | Туг | Азр | О1и | Уа1 | Ьуз |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
О1п | А1а | О1п | Ьуз | Азр | Ьеи | О1и | Ьуз | 5ег | Ьеи | Ьуз | Ьуз | Агд | О1и | Агд | Ьеи |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
О1и | Ьуз | О1и | Уа1 | А1а | Ьуз | Ьуз | Ьеи | О1и | 5ег | Ьуз | 5ег | О1у | Азп | Ьуз | Азп |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Ьуз | МеЕ | О1и | А1а | Ьуз | 5ег | О1п | А1а | Азп | 5ег | О1п | Ьуз | Азр | О1и | 11е | Рке |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | 11е | Азп | Ьуз | О1и | А1а | Азп | Агд | О1и | А1а | Агд | А1а | 11е | ТЬг | Туг |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
А1а | О1п | Азп | Ьеи | Ьуз | О1у | 11е | Ьуз | Агд | О1и | Ьеи | 5ег | Азр | Ьуз | Ьеи | О1и |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Азп | Уа1 | Азп | Ьуз | Азп | Ьеи | Ьуз | Азр | Рке | 5ег | Ьуз | 5ег | Рке | Азр | О1и | Рке |
- 46 032330
690
695
700
Ьуз 705 | Азп | О1у | Ьуз | Азп | Ьуз 710 | Азр | Рке | Зег | Ьуз | Зег 715 | О1и | О1и | ТЬг | Ьеи | Ьуз 720 |
А1а | Ьеи | Ьуз | О1у | Зег | Уа1 | Ьуз | Азр | Ьеи | О1у | 11е | Азп | Рго | О1и | Тгр | 11е |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Зег | Ьуз | Уа1 | О1и | Азп | Ьеи | Азп | А1а | А1а | Ьеи | Азп | О1и | Рке | Ьуз | Азп | О1у |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | Ьуз | Азр | Рке | Зег | Ьуз | Уа1 | ТЬг | О1п | А1а | Ьуз | Зег | Азр | Ьеи | О1и |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Азп | Зег | Уа1 | Ьуз | Азр | Уа1 | 11е | 11е | Азп | О1п | Ьуз | Уа1 | ТЬг | Азр | Ьуз | Уа1 |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Азр | Азп | Ьеи | Азп | О1п | А1а | Уа1 | Зег | Уа1 | А1а | Ьуз | А1а | ТЬг | О1у | Азр | Рке |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Зег | Агд | Уа1 | О1и | О1п | А1а | Ьеи | А1а | Азр | Ьеи | Ьуз | Азп | Рке | Зег | Ьуз | О1и |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
О1п | Ьеи | А1а | О1п | О1п | А1а | О1п | Ьуз | Азп | О1и | Азр | Рке | Азп | ТЬг | О1у | Ьуз |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Азп | Зег | А1а | Ьеи | Туг | О1п | Зег | Уа1 | Ьуз | Азп | О1у | Уа1 | Азп | О1у | ТЬг | Ьеи |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Уа1 | О1у | Азп | О1у | Ьеи | Зег | Ьуз | А1а | О1и | А1а | ТЬг | ТЬг | Ьеи | Зег | Ьуз | Азп |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Рке | Зег | Азр | 11е | Ьуз | Ьуз | О1и | Ьеи | Азп | А1а | Ьуз | Ьеи | О1у | Азп | Рке | Азп |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Азп | Азп | Азп | Азп | Азп | О1у | Ьеи | Ьуз | Азп | Зег | ТЬг | О1и | Рго | 11е | Туг | А1а |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Ьуз | Уа1 | Азп | Ьуз | Ьуз | Ьуз | А1а | О1у | О1п | А1а | А1а | Зег | Рго | О1и | О1и | Рго |
900 | 905 | 910 | |||||||||||||
11е | Туг | А1а | О1п | Уа1 | А1а | Ьуз | Ьуз | Уа1 | Азп | А1а | Ьуз | 11е | Азр | Агд | Ьеи |
915 | 920 | 925 | |||||||||||||
Азп | О1п | 11е | А1а | Зег | О1у | Ьеи | О1у | Уа1 | Уа1 | О1у | О1п | А1а | Уа1 | О1у | Рке |
930 | 935 | 940 |
- 47 032330
Рго | Ьеи | Ьуз | Агд | Н1з | Азр | Ьуз | Уа1 | О1у Азр | Ьеи | 5ег | Ьуз Уа1 | О1у | О1п |
945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||
5ег | Уа1 | 5ег | Рго | О1и | Рго | 11е | Туг | А1а Ткг | 11е | Азр | Азр Ьеи | О1у | О1у |
965 | 970 | 975 | |||||||||||
Рго | Рке | Рго | Ьеи | Ьуз | Агд | Н1з | Азр | Ьуз Уа1 | О1у | Азр | Ьеи 5ег | Ьуз | Уа1 |
980 | 985 | 990 | |||||||||||
О1у | Ьеи | 5ег | Уа1 | 5ег | Рго | О1и | Рго | 11е Туг А1а Ткг 11е Азр Азр Ьеи | |||||
995 | 1000 | 1005 |
О1у | О1у 1010 | Рго | Рке | Рго | Ьеи | Ьуз 1015 | Агд | Н1з | Азр | Ьуз | Уа1 1020 | О1у | Азр | Ьеи |
5ег | Ьуз | Уа1 | О1у | Ьеи | 5ег | Агд | О1и | О1п | О1п | Ьеи | Ьуз | О1п | Ьуз | 11е |
1025 | 1030 | 1035 | ||||||||||||
Азр | Азп | Ьеи | 5ег | О1п | А1а | Уа1 | 5ег | О1и | А1а | Ьуз | А1а | О1у | Рке | Рке |
1040 | 1045 | 1050 | ||||||||||||
О1у | Азп | Ьеи | О1и | О1п | ТЬг | 11е | Азр | Азп | Ьеи | Ьуз | Азр | 5ег | А1а | Ьуз |
1055 | 1060 | 1065 | ||||||||||||
Азп | Азп | Рго | Уа1 | 5ег | Ьеи | Тгр | А1а | О1и | О1у | А1а | Ьуз | Ьуз | Уа1 | Рго |
1070 | 1075 | 1080 | ||||||||||||
А1а | 5ег | Ьеи | 5ег | А1а | Ьуз | Ьеи | Азр | Азп | Туг | А1а | ТЬг | Азп | 5ег | Н1з |
1085 | 1090 | 1095 | ||||||||||||
ТЬг | Агд | 11е | Азп | 5ег | Азп | 11е | О1п | 5ег | О1у | А1а | 11е | Азп | О1и | Ьуз |
1100 | 1105 | 1110 | ||||||||||||
А1а | ТЬг | О1у | МеЬ | Ьеи | ТЬг | О1п | Ьуз | Азп | Рго | О1и | Тгр | Ьеи | Ьуз | Ьеи |
1115 | 1120 | 1125 | ||||||||||||
Уа1 | Азп | Азр | Ьуз | 11е | Уа1 | А1а | Н1з | Азп | Уа1 | О1у | 5ег | Уа1 | Рго | Ьеи |
1130 | 1135 | 1140 | ||||||||||||
Ьеи | О1и | Туг | Азр | Ьуз | 11е | О1у | Рке | Азп | О1п | Ьуз | 5ег | МеЬ | Ьуз | Азр |
1145 | 1150 | 1155 | ||||||||||||
Туг | 5ег | Азр | 5ег | Рке | Ьуз | Рке | 5ег | ТЬг | О1и | Ьеи | Азп | Азп | А1а | Уа1 |
1160 | 1165 | 1170 | ||||||||||||
Ьуз | Азр | Уа1 | Ьуз | 5ег | О1у | Рке | ТЬг | О1п | Рке | Ьеи | А1а | Азп | А1а | Рке |
1175 | 1180 | 1185 |
- 48 032330
5ег ТАг 1190 | О1у Туг | Туг | Агд | Ьеи 1195 | А1а О1у О1и | Азп | А1а 1200 | О1и | Н1з | О1у | ||||
11е | Ьуз | Азп | Уа1 | Азп | Ткг | Ьуз | О1у | О1у | 5ег | Ьуз | Азп | Ьеи | Ьуз | О1у |
1205 | 1210 | 1215 | ||||||||||||
Ьеи | Агд | Азп | Ткг | Ьуз | Азп | А1а | Ьуз | ТЬг | ТЬг | Рго | Суз | |||
1220 | 1225 | 1230 |
<210> 8 <211> 3726 <212> ДНК <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> т1зс_£еаЬиге <223> Н. ру1ог1 штамм 027 <400> 8 ааддадааас асссдсадса сЬЬсаЬЬЬда сЬЬЬЬдаЬдд ссааааадаа асааЬсЬсаЬ ассдааЬЬЬЬ сдаЬссдааа сададЬЬЬЬЬ даасддаЬса аааааааЬдд асааааааса адссадаЬаЬ ЬдсЬЬдаЬда ЬЬдадддЬдЬ асдсЬсЬдЬс ЬаЬЬдЬаЬдс аЬааадасса дЬддсЬЬадЬ аадаадасса ааЬдасЬаас аЬЬЬаЬсааЬ ЬссЬдаЬсаа ааЬсЬсдсаа ЬсадЬаЬЬЬЬ ЬдаЬдЬддаа сасаадЬЬдд ЬЬЬЬаЬддаа даааЬсЬдсс ааадЬЬсаЬд ададссЬасЬ аЬсЬЬсЬдаЬ адссасЬасЬ ааддддЬааЬ сдсЬдасаЬЬ ЬЬсЬдЬдЬЬа дддсааЬддЬ асааддЬаас саЬадсаддЬ асЬсасаддс дааасЬаЬЬд ааЬсЬЬсаад ааассааЬсд ЬЬаадддаад ЬсадасЬЬЬа ЬсЬЬссасаа дЬдЬсссаЬс ааЬаЬсаЬас ааасааЬсЬЬ ддсдЬдЬЬЬд ддЬддддаЬЬ дЬсааадаад ассассдаса ЬЬЬЬсЬаааЬ даЬссЬааЬЬ аЬддддадЬс ддЬЬЬЬддад ааЬдЬддсЬа ддЬдадааад Ьсасаасдад ассаасаасс ЬадсЬЬЬЬсЬ ЬЬдаЬаадаа ааЬасЬссаа ЬсааЬаадад ададсЬЬЬса аааасдаЬсс аасссссЬаЬ ЬЬдсаддааЬ аЬдааЬссЬЬ ддЬЬддаЬаЬ сааЬсааЬса ЬасааддсЬЬ ЬсасЬсЬЬдд асаадЬЬсаа аЬааЬддсаЬ ссаадсасда сааЬааЬЬаа ддаЬЬаасаа саЬЬдадЬса асааассдаа ЬаадсЬЬдаЬ сдаЬадддаЬ ЬааадсдаЬс сааЬдаЬЬЬа даааЬЬЬддд дЬсЬааааЬс ссаЬдаЬдас ЬаЬсаЬаддд дааадааадд ЬЬЬЬЬЬаЬса адаассадЬЬ ассдссЬдаа сдаЬаЬддаа ЬсааЬЬаЬЬд адаассЬдаа ЬЬддаасдсс ЬдЬдсаЬаЬд сссЬадЬЬЬЬ адаададаЬс дсддсЬЬЬЬа аасдсЬдЬсд аасаддсаад аааааЬссЬа аЬсаасааад даЬсадсдЬЬ аасасссдаЬ ааадааааад ааЬсаааЬсс саадаадсад ЬЬЬаЬаЬЬЬд ссЬсаЬдЬсс ЬсЬадддаЬЬ аЬдЬЬадаЬд аЬЬсасааЬа ааадЬЬЬсаЬ ассдЬЬддЬЬ ааааасддса ЬаЬсЬсЬаса сдааасаааа
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
- 49 032330
ЬадаЬЬЬсаЬ | ддааЬЬЬсЬЬ | дсасааааса | аЬдсЬаааЬЬ | адасаасЬЬд | адсдадааад | 1260 |
адааадаааа | аЬЬссдаааЬ | дадаЬЬаадд | аЬЬЬссаааа | адасЬсЬаад | дсЬЬаЬЬЬад | 1320 |
асдсссЬадд | дааЬдаЬсдЬ | аЬЬдссЬЬЬд | ЬЬЬсЬааааа | адасссаааа | саЬЬсадсЬЬ | 1380 |
ЬааЬЬасЬда | дЬЬЬддЬаад | ддддаЬЬЬда | дсЬасасЬсЬ | сааадаЬЬаЬ | дддаааааад | 1440 |
садаЬааадс | ЬЬЬадаЬадд | дадаааааЬд | ЬсасЬсЬЬса | аддЬаассЬа | ааасаЬдаЬд | 1500 |
дсдЬдаЬдЬЬ | ЬдЬЬдаЬЬаЬ | ЬсЬааЬЬЬса | ааЬасассаа | сдссЬссаад | ааЬсссааЬа | 1560 |
адддЬдЬадд | сдЬЬасдааЬ | ддсдЬЬЬссс | аЬЬЬадасдс | аддсЬЬЬадс | ааддЬадсЬд | 1620 |
ЬсЬЬЬааЬЬЬ | дссЬдаЬЬЬа | ааЬааЬсЬсд | сЬаЬсасЬад | ЬЬЬсдЬаадд | сддаасЬЬад | 1680 |
аддаЬааасЬ | ааЬЬдсЬааа | ддаЬЬдассс | сасаадаадс | ЬааЬаадсЬЬ | аЬсааадаЬЬ | 1740 |
ЬЬЬЬдадсад | саасааадаа | ЬЬддЬЬддаа | аадсЬЬЬааа | сЬЬсааЬааа | дсЬдЬадсЬд | 1800 |
асдсЬааааа | сасаддсаас | ЬаЬдасдадд | Ьдаааааадс | ЬсадааадаЬ | сЬЬдаааааЬ | 1860 |
сЬсЬааддаа | асдададсаЬ | ЬЬададааад | аадЬададаа | ааааЬЬддад | адсаааадсд | 1920 |
дсаасааааа | ЬааааЬддаа | дсаааадсЬс | аадсЬаасад | ссааааадаЬ | дадаЬЬЬЬЬд | 1980 |
сдЬЬдаЬсаа | ЬааададдсЬ | ааЬададасд | саададсааЬ | сасЬЬасдсЬ | сааааЬсЬЬа | 2040 |
ааддсаЬсаа | аадддааЬЬд | ЬсЬдаЬааас | ЬЬдааааЬаЬ | саасаадааЬ | ЬЬдааадасЬ | 2100 |
ЬЬадЬаааЬс | ЬЬЬЬдаЬдаа | ЬЬсаааааЬд | дсаааааЬаа | ддаЬЬЬсадс | ааддсадаад | 2160 |
ааасдсЬааа | адсссЬЬааа | ддсЬсддЬда | аадаЬЬЬадд | ЬаЬсааЬссд | дааЬддаЬЬЬ | 2220 |
саааадЬЬда | ааассЬЬааЬ | дсадсЬЬЬда | аЬдасЬЬсаа | аааЬддсааа | ааЬааддаЬЬ | 2280 |
ЬсадсааддЬ | аасдсаадса | аааадсдасс | ЬЬдааааЬЬс | сдЬЬааадаЬ | дЬдаЬсаЬса | 2340 |
аЬсаааадаЬ | аасддаЬааа | дЬЬдаЬдаЬс | ЬсааЬсаадс | ддЬаЬсадЬд | дсЬааадсаа | 2400 |
сдддЬдаЬЬЬ | садЬадддЬа | дддсаадсдЬ | ЬадссдаЬсЬ | саааааЬЬЬс | Ьсаааддадс | 2460 |
ааЬЬддсЬса | асааасЬсаа | аааааЬдааа | дЬЬЬсааЬдЬ | Ьддааааааа | ЬсЬдаааЬаЬ | 2520 |
аЬсааЬссдЬ | ЬаадааЬддЬ | дЬдаасддаа | сссЬадЬсдд | ЬааЬдддЬЬа | ЬсЬсаадсад | 2580 |
аадссасаас | ЬсЬЬЬсЬааа | аасЬЬЬЬсдд | асаЬсаадаа | ададЬЬдааЬ | дсаааасЬЬЬ | 2640 |
ЬЬддаааЬЬЬ | сааЬаасааЬ | аасааЬааЬд | ддсЬсааааа | садсасадаа | сссаЬЬЬаЬд | 2700 |
сЬааадЬЬаа | Ьааааадааа | асаддасаад | ЬадсЬадссс | Ьдаадаассс | аЬЬЬаЬдсЬс | 2760 |
аадЬЬдсЬаа | аааддЬаааЬ | дсаааааЬЬд | ассаасЬсаа | Ьсаадсадса | адЬддЬЬЬсд | 2820 |
дЬддЬдЬадд | дсаадсадсд | ддсЬЬсссЬЬ | Ьдааааддса | ЬдаЬааадЬЬ | даЬдаЬсЬса | 2880 |
дЬааддЬадд | дсдаЬсддЬЬ | адсссЬдаас | ссаЬЬЬаЬдс | ЬасааЬЬдаЬ | даЬсЬсддсд | 2940 |
дассЬЬЬссс | ЬЬЬдаааадд | саЬдаЬааад | ЬЬдаЬдаЬсЬ | садЬааддЬа | дддсдаЬсдд | 3000 |
ЬЬадсссЬда | асссаЬЬЬаЬ | дсЬасааЬЬд | аЬдаЬсЬсдд | сддассЬЬЬс | ссЬЬЬдаааа | 3060 |
- 50 032330
ддсаЕдаЕаа | адЕЕдаЕдаЕ | сЕсадЕаадд | ЕадддсЕЕЕс | аадддадсаа | сааЕЕдааас | 3120 |
адаадаЕЕда | саадЕЕсдаЕ | саадсддЕаЕ | садаадсЕаа | адЕаддЕЕаЕ | ЕЕЕддсааЕс | 3180 |
Еададсааас | даЕадасаад | сЕсааадаЕЕ | сЕдсааааЕа | сааЕассаЕд | ааЕсЕаЕддд | 3240 |
сЕдааадЕдс | ааааааадЕд | ссЕдсЕадЕЕ | ЕдЕсадсдаа | аЕЕддасааЕ | ЕасдсЕасЕа | 3300 |
асадссасас | асдсаЕЕааЕ | адсааЕаЕсс | ааааЕддадс | ааЕсааЕдаа | ааадсдассд | 3360 |
дЕаЕдсЕаас | дсааааааас | ссЕдадЕддс | ЕсаадсЕсдЕ | дааЕдаЕаад | аЕсдЕЕдсас | 3420 |
аЕааЕдЕддд | аадсдЕЕссЕ | ЕЕдЕсададЕ | аЕдаЕааааЕ | ЕддсЕЕсаас | садаадааЕа | 3480 |
ЕдааадаЕЕа | ЕЕсЕдаЕЕсд | ЕЕсаадЕЕЕЕ | ссассаадЕЕ | даасааЕдсЕ | дЕаааадаса | 3540 |
ЕЕаадЕсЕдд | сЕЕЕасдсаа | ЕЕЕЕЕадсса | аЕдсаЕЕЕЕс | ЕасаддаЕаЕ | ЕасЕдсЕЕдд | 3600 |
сдддддаааа | ЕдсддадсаЕ | ддааЕсаааа | аЕдЕЕааЕас | ааааддЕддЕ | ЕЕссаааааЕ | 3660 |
сЕЕаааддаЕ | ЕааддааЕас | сааааасдса | аааассдссс | сЕЕдсЕаааа | дсадддддЕЕ | 3720 |
ЕЕЕЕаа | 3726 |
<210> 9 <211> 1294 <212> РЕТ <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> М15С_ЕЕАТиЕЕ <223> Н. ру1ог1 штамм 027 <400> 9
МеЕ 1 | О1и | 11е | О1п | О1п 5 | ТЬг | Н1з | Агд | Ьуз | МеЕ 10 | Азп | Агд | Рго | Ьеи | Уа1 15 | 5ег |
Ьеи | Уа1 | Ьеи | А1а | О1у | А1а | Ьеи | 11е | 5ег | А1а | 11е | Рго | О1п | О1и | 5ег | Н1з |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | А1а | РЬе | РЬе | ТЬг | ТЬг | Уа1 | 11е | 11е | Рго | А1а | 11е | Уа1 | О1у | О1у | 11е |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | О1у | ТЬг | А1а | Уа1 | О1у | ТЬг | Уа1 | 5ег | О1у | Ьеи | Ьеи | 5ег | Тгр | О1у |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | О1п | А1а | О1и | О1и | А1а | Азп | Ьуз | Азп | Рго | Азр | Ьуз | Рго | Азр | Ьуз |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Уа1 | Тгр | Агд | 11е | О1п | А1а | О1у | Ьуз | О1у | РЬе | Азп | О1и | РЬе | Рго | Азп | Ьуз |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
О1и | Туг | Азр | Ьеи | Туг | Ьуз | 5ег | Ьеи | Ьеи | 5ег | 5ег | Ьуз | 11е | Азр | О1у | О1у |
100 | 105 | 110 |
- 51 032330
Тгр | Азр | Тгр 115 | О1у Азп | А1а | А1а Агд 120 | Н1з | Туг | Тгр | Уа1 | Ьуз 125 | О1у | О1у | О1п | ||
Тгр | Азп | Ьуз | Ьеи | О1и | Уа1 | Азр | МеЕ | Ьуз | Азр | А1а | Уа1 | О1у | ТЪг | Туг | Ьуз |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | 5ег | О1у | Ьеи | Агд | Азп | РЪе | ТЪг | О1у | О1у | Азр | Ьеи | Азр | Уа1 | Азп | МеЕ |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
О1п | Ьуз | А1а | ТЪг | Ьеи | Агд | Ьеи | О1у | О1п | РЪе | Азп | О1у | Азп | 5ег | РЪе | ТЪг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
5ег | Туг | Ьуз | Азр | А1а | А1а | Азр | Агд | ТЪг | ТЪг | Агд | Уа1 | Азп | РЪе | Азп | А1а |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | 11е | 5ег | 11е | Азр | Азп | РЪе | Уа1 | О1и | 11е | Азп | Азп | Агд | Уа1 | О1у |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
5ег | О1у | А1а | О1у | Агд | Ьуз | А1а | 5ег | 5ег | ТЪг | Уа1 | Ьеи | ТЪг | Ьеи | О1п | А1а |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
5ег | О1и | О1у | 11е | ТЪг | 5ег | Азр | Ьуз | Азп | А1а | О1и | 11е | 5ег | Ьеи | Туг | Азр |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
О1у | А1а | ТЪг | Ьеи | Азп | Ьеи | А1а | 5ег | 5ег | 5ег | Уа1 | Ьуз | Ьеи | МеЕ | О1у | Азп |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Уа1 | Тгр | МеЕ | О1у | Агд | Ьеи | О1п | Туг | Уа1 | О1у | А1а | Туг | Ьеи | А1а | Рго | 5ег |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Туг | 5ег | ТЪг | 11е | Азп | ТЪг | 5ег | Ьуз | Уа1 | ТЪг | О1у | О1и | Уа1 | Азп | РЪе | Азп |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Н1з | Ьеи | ТЪг | Уа1 | О1у | Азр | Ьуз | Азп | А1а | А1а | О1п | А1а | О1у | 11е | 11е | А1а |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
5ег | Азп | Ьуз | ТЪг | Н1з | 11е | О1у | ТЪг | Ьеи | Азр | Ьеи | Тгр | О1п | 5ег | А1а | О1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ьеи | Азп | 11е | 11е | А1а | Рго | Рго | О1и | О1у | О1у | Туг | Ьуз | Азр | Ьуз | Рго | Азп |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Азп | ТЪг | Рго | 5ег | О1п | 5ег | О1у | ТЪг | Ьуз | Азп | Азр | Ьуз | Азп | О1и | 5ег | А1а |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | Азр | Ьуз | О1п | О1и | 5ег | 5ег | О1п | Азп | Азп | 5ег | Азп | ТЪг | О1п | Уа1 |
- 52 032330
355
360
365
11е | Азп 370 | Рго | Рго Азп | 5ег | ТЬг 375 | О1п | Ьуз | ТЬг О1и | 11е 380 | О1п | Рго | ТЬг | О1п | ||
Уа1 | 11е | Азр | О1у | Рго | Рке | А1а | О1у | О1у | Ьуз | Азр | ТЬг | Уа1 | Уа1 | Азп | 11е |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Азп | Агд | 11е | Азп | ТЬг | Азп | А1а | Азр | О1у | ТЬг | 11е | Агд | Уа1 | О1у | О1у | Рке |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | 5ег | Ьеи | ТЬг | ТЬг | Азп | А1а | А1а | Н1з | Ьеи | Н1з | 11е | О1у | Ьуз | О1у |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
О1у | Уа1 | Азп | Ьеи | 5ег | Азп | О1п | А1а | 5ег | О1у | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Уа1 | О1и |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | ТЬг | О1у | Азп | 11е | ТЬг | Уа1 | Азр | О1у | Рго | Ьеи | Агд | Уа1 | Азп | Азп |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
О1п | Уа1 | О1у | О1у | Туг | А1а | Ьеи | А1а | О1у | 5ег | 5ег | А1а | Азп | Рке | О1и | Рке |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьуз | А1а | О1у | Уа1 | Азр | ТЬг | Ьуз | Азп | О1у | ТЬг | А1а | ТЬг | Рке | Азп | Азп | Азр |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
11е | 5ег | Ьеи | О1у | Агд | Рке | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Азр | А1а | Н1з | ТЬг | А1а |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Азп | Рке | Ьуз | О1у | 11е | Азр | ТЬг | О1у | Азп | О1у | О1у | Рке | Азп | ТЬг | Ьеи | Азр |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Рке | 5ег | О1у | Уа1 | ТЬг | Азр | Ьуз | Уа1 | Азп | 11е | Азп | Ьуз | Ьеи | 11е | ТЬг | А1а |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
5ег | ТЬг | Азп | Уа1 | А1а | Уа1 | Ьуз | Азп | Рке | Азп | 11е | Азп | О1и | Ьеи | 11е | Уа1 |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Ьуз | ТЬг | Азп | О1у | 11е | 5ег | Уа1 | О1у | О1и | Туг | ТЬг | Н1з | Рке | 5ег | О1и | Азр |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
11е | О1у | 5ег | О1п | 5ег | Агд | 11е | Азп | ТЬг | Уа1 | Агд | Ьеи | О1и | ТЬг | О1у | ТЬг |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Агд | 5ег | 11е | Рке | 5ег | О1у | О1у | Уа1 | Ьуз | Рке | Ьуз | 5ег | О1у | О1и | Ьуз | Ьеи |
595 | 600 | 605 |
- 53 032330
Уа1 | 11е 610 | Азр | О1и | РЪе | Туг | Туг 615 | Бег | Рго | Тгр Азп | Туг 620 | РЪе | Азр | А1а | Агд | |
Азп | Уа1 | Ьуз | Азп | Уа1 | О1и | 11е | ТЪг | Агд | Ьуз | РЪе | А1а | Бег | Бег | ТЪг | Рго |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
О1и | Азп | Рго | Тгр | О1у | ТЪг | Бег | Ьуз | Ьеи | МеЬ | РЪе | Азп | Азп | Ьеи | ТЪг | Ьеи |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
О1у | О1п | Азп | А1а | Уа1 | МеЬ | Азр | Туг | Бег | О1п | РЪе | Бег | Азп | Ьеи | ТЪг | 11е |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
О1п | О1у | Азр | РЪе | 11е | Азп | Азп | О1п | О1у | ТЪг | 11е | Азп | Туг | Ьеи | Уа1 | Агд |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
О1у | О1у | Ьуз | Уа1 | А1а | ТЪг | Ьеи | Бег | Уа1 | О1у | Азп | А1а | А1а | А1а | МеЬ | МеЬ |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
РЪе | Азп | Азп | Азр | 11е | Азр | Бег | А1а | ТЪг | О1у | РЪе | Туг | Ьуз | Рго | Ьеи | 11е |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Ьуз | 11е | Азп | Бег | А1а | О1п | Азр | Ьеи | 11е | Ьуз | Азп | ТЪг | О1и | Н1з | Уа1 | Ьеи |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | А1а | Ьуз | 11е | 11е | О1у | Туг | О1у | Азп | Уа1 | Бег | ТЪг | О1у | ТЪг | Азп |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Бег | 11е | Бег | Азп | Уа1 | Азп | Ьеи | О1и | О1и | О1п | РЪе | Ьуз | О1и | Агд | Ьеи | А1а |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Ьеи | Туг | Азп | Азп | Азп | Азп | Агд | МеЬ | Азр | ТЪг | Суз | Уа1 | Уа1 | Агд | Азп | ТЪг |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Азр | Азр | 11е | Ьуз | А1а | Суз | О1у | МеЬ | А1а | 11е | О1у | Азп | О1п | Бег | МеЬ | Уа1 |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Азп | Азп | Рго | Азр | Азп | Туг | Ьуз | Туг | Ьеи | 11е | О1у | Ьуз | А1а | Тгр | Ьуз | Азп |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
11е | О1у | 11е | Бег | Ьуз | ТЪг | А1а | Азп | О1у | Бег | Ьуз | 11е | Бег | Уа1 | Туг | Туг |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Ьеи | О1у | Азп | Бег | ТЪг | Рго | ТЪг | О1и | Азп | О1у | О1у | Азп | ТЪг | ТЪг | Азп | Ьеи |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Рго | ТЪг | Азп | ТЪг | ТЪг | Азп | Азп | А1а | Агд | Бег | А1а | Азп | Туг | А1а | Ьеи | Уа1 |
850 | 855 | 860 |
- 54 032330
Ьуз 865 | Азп | А1а | Рго | Рке | А1а 870 | Н1з | 5ег А1а | ТЬг | Рго 875 | Азп | Ьеи | Уа1 | А1а | 11е 880 | |
Азп | О1п | Н1з | Азр | Рке | О1у | ТЬг | 11е | О1и | 5ег | Уа1 | Рке | О1и | Ьеи | А1а | Азп |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Агд | 5ег | Ьуз | Азр | 11е | Азр | ТЬг | Ьеи | Туг | ТЬг | Н1з | 5ег | О1у | Уа1 | О1п | О1у |
900 | 905 | 910 | |||||||||||||
Агд | Азр | Ьеи | Ьеи | О1п | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | Азр | 5ег | Н1з | Азр | А1а | О1у | Туг |
915 | 920 | 925 | |||||||||||||
А1а | Агд | О1п | МеЕ | 11е | Азр | Азп | ТЬг | 5ег | ТЬг | О1у | О1и | 11е | ТЬг | Ьуз | О1п |
930 | 935 | 940 | |||||||||||||
Ьеи | Азп | А1а | А1а | ТЬг | Азр | А1а | Ьеи | Азп | Азп | 11е | А1а | 5ег | Ьеи | О1и | Н1з |
945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
Ьуз | ТЬг | 5ег | О1у | Ьеи | О1п | ТЬг | Ьеи | 5ег | Ьеи | 5ег | Азп | А1а | МеЕ | 11е | Ьеи |
965 | 970 | 975 | |||||||||||||
Азп | 5ег | Агд | Ьеи | Уа1 | Азп | Ьеи | 5ег | Агд | Ьуз | Н1з | ТЬг | Азп | Н1з | 11е | Азр |
980 | 985 | 990 |
5ег Рке А1а О1п Агд Ьеи О1п А1а
Ьеи Ьуз О1у О1п Агд Рке А1а 5ег
995
1000
1005
Ьеи | О1и 1010 | 5ег | А1а | А1а | О1и | Уа1 1015 | Ьеи | Туг | О1п | Рке | А1а 1020 | Рго | Ьуз | Туг |
О1и | Ьуз | Рго | ТЬг | Азп | Уа1 | Тгр | А1а | Азп | А1а | 11е | О1у | О1у | А1а | 5ег |
1025 | 1030 | 1035 | ||||||||||||
Ьеи | Азп | Азп | О1у | О1у | Азп | А1а | 5ег | Ьеи | Туг | О1у | ТЬг | 5ег | А1а | О1у |
1040 | 1045 | 1050 | ||||||||||||
Уа1 | Азр | А1а | Туг | Ьеи | Азп | О1у | О1и | Уа1 | О1и | А1а | 11е | Уа1 | О1у | О1у |
1055 | 1060 | 1065 | ||||||||||||
Рке | О1у | 5ег | Туг | О1у | Туг | 5ег | 5ег | Рке | 5ег | Азп | Агд | А1а | Азп | 5ег |
1070 | 1075 | 1080 | ||||||||||||
Ьеи | Азп | 5ег | О1у | А1а | Азп | Азп | А1а | Азп | Рке | О1у | Уа1 | Туг | 5ег | Агд |
1085 | 1090 | 1095 | ||||||||||||
11е | Рке | А1а | Азп | О1п | Н1з | О1и | Рке | Азр | Рке | О1и | А1а | О1п | О1у | А1а |
1100 1105 1110
- 55 032330
Ьеи | О1у 1115 | 5ег | Азр | О1п | 5ег | 5ег 1120 | Ьеи | Азп | Рке | Ьуз | 5ег 1125 | А1а | Ьеи | Ьеи |
О1п | Азр | Ьеи | Азп | О1п | 5ег | Туг | Н1з | Туг | Ьеи | А1а | Туг | 5ег | А1а | А1а |
1130 | 1135 | 1140 | ||||||||||||
ТЬг | Агд | А1а | 5ег | Туг | О1у | Туг | Азр | Рке | А1а | Рке | Рке | Агд | Азп | А1а |
1145 | 1150 | 1155 | ||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Ьеи | Ьуз | Рго | 5ег | Уа1 | О1у | Уа1 | 5ег | Туг | Азп | Н1з | Ьеи | О1у |
1160 | 1165 | 1170 | ||||||||||||
5ег | ТЬг | Азп | Рке | Ьуз | 5ег | 5ег | 5ег | Азп | О1п | Уа1 | А1а | Ьеи | Ьуз | Азп |
1175 | 1180 | 1185 | ||||||||||||
О1у | 5ег | 5ег | 5ег | О1п | Н1з | Ьеи | Рке | Азп | А1а | Азп | А1а | Азп | Уа1 | О1и |
1190 | 1195 | 1200 | ||||||||||||
А1а | Агд | Туг | Туг | Туг | О1у | Азр | ТЬг | 5ег | Туг | Рке | Туг | МеЕ | Азп | А1а |
1205 | 1210 | 1215 | ||||||||||||
О1у | Уа1 | Ьеи | О1п | О1и | Рке | А1а | Агд | Рке | О1у | 5ег | Азп | Азп | А1а | А1а |
1220 | 1225 | 1230 | ||||||||||||
5ег | Ьеи | Азп | ТЬг | Рке | Ьуз | Уа1 | Азп | ТЬг | А1а | Агд | Азп | Рго | Ьеи | Азп |
1235 | 1240 | 1245 | ||||||||||||
ТЬг | Н1з | А1а | Агд | Уа1 | МеЕ | МеЕ | О1у | О1у | О1и | Ьеи | О1п | Ьеи | А1а | Ьуз |
1250 | 1255 | 1260 | ||||||||||||
О1и | Уа1 | Рке | Ьеи | Азп | Ьеи | О1у | Уа1 | Уа1 | Туг | Ьеи | Н1з | Азп | Ьеи | 11е |
1265 | 1270 | 1275 | ||||||||||||
5ег | Азп | 11е | О1у | Н1з | Рке | А1а | 5ег | Азп | Ьеи | О1у | МеЕ | Агд | Туг | 5ег |
1280 | 1285 | 1290 |
Рке
<210> | 10 |
<211> | 3885 |
<212> | ДНК |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | |
<221> | т1зс_£еаЕиге |
<223> | Н. ру1ог1 штамм 027 |
- 56 032330
<400> 10 абддааабас | аасааасаса | ссдсаааабд | аабсдсссбб | бадбббсбсб | сдббббадса | 60 |
ддадсдббаа | ббадсдссаб | ассдсаадаа | адбсабдссд | ссбббббсас | дассдбдабс | 120 |
аббссадсса | ббдббддддд | бабсдссаса | ддсассдсбд | баддаасддб | сбсадддсбб | 180 |
сббадсбддд | ддсбсаааса | адссдаадаа | дсдаабаааа | асссддасаа | асссдабааа | 240 |
дбббддсдса | ббсаадсадд | ааааддсббб | аабдааббсс | сбаасаадда | абасдасбба | 300 |
басааабссс | ббббабссад | баадаббдаб | ддаддббддд | асбдддддаа | сдссдсбадд | 360 |
саббаббддд | бсаааддсдд | дсаабддаас | аадсббдаад | бддабабдаа | адасдсбдба | 420 |
дддасббаба | аасбабсадд | дсббадааас | бббасбддбд | дддабббада | бдбсаабабд | 480 |
сааааадсса | сбббасдсбб | дддссааббс | аабддсаабб | сбббсасаад | сбабааддаб | 540 |
дсддсбдабс | дсассасдад | ддбдаабббс | аасдсбаааа | абабсбсааб | бдабаабббб | 600 |
дбадааабса | абаабсдбдб | дддббсбдда | дссдддадда | аадссадсбс | басддббббд | 660 |
асбббдсаад | сббсадаадд | дабсасбадс | дабааааасд | сбдааабббс | бсбббабдаб | 720 |
ддсдссасдс | бсаабббддс | ббсаадсадс | дббаааббаа | бдддбаабдб | дбддабдддс | 780 |
сдбббдсааб | асдбдддадс | дбабббддсс | ссббсабаса | дсасдабааа | сасббсаааа | 840 |
дбаасадддд | аадбдааббб | баассассбс | асбдббддсд | абааааасдс | сдсбсаадсд | 900 |
ддсаббабсд | сбадсаасаа | дасбсабабб | ддсасасбдд | абббдбддса | аадсдссддд | 960 |
ббааасабба | бсдсбссбсс | сдааддбддс | бабааддаба | аассбаабаа | бассссббсб | 1020 |
сааадбддса | сбааааасда | сааааабдаа | адсдсбаааа | асдасаааса | адададсадб | 1080 |
саааабааба | дбаасасбса | ддбсаббаас | ссасссааба | дсасдсаааа | аасадааабб | 1140 |
саасссасдс | аадбсаббда | бдддссбббб | дсдддсддса | аадасасддб | бдбсаабабс | 1200 |
аассдсабса | асасбаасдс | бдабддсасд | аббададбдд | дадддбббаа | адсббсбсбб | 1260 |
ассассаабд | сддсбсаббб | дсабабсддс | аааддсддбд | бсаабсбдбс | саабсаадсд | 1320 |
адсдддсдса | сссббббадб | ддаааабсба | ассдддааба | бсассдббда | бдддссббба | 1380 |
ададбдааба | абсаадбддд | бддсбабдсб | ббддсаддаб | саадсдсдаа | ббббдааббб | 1440 |
ааддсбддбд | бддабасбаа | ааасддсаса | дссасбббса | абаасдабаб | бадссбддда | 1500 |
адабббдбда | абббаааддб | ддабдсбсаб | асадсбаабб | ббаааддбаб | бдабасдддб | 1560 |
аабддбддбб | бсаасассбб | адаббббадб | ддбдббасад | асааадбсаа | бабсаасаад | 1620 |
сбсабсасдд | сббссасбаа | бдбддссдбб | ааааасббса | асаббаабда | аббдаббдбб | 1680 |
аааассаабд | ддабаадбдб | дддддаабас | асбсабббба | дсдаадабаб | аддсадбсаа | 1740 |
бсдсдсабса | абассдбдсд | бббддааасб | ддсасбаддб | саабсббббс | бдддддбдбс | 1800 |
ааабббаааа | дсддсдаааа | аббддббаба | дабдадбббб | асбабадссс | ббддааббаб | 1860 |
- 57 032330
ЕЕЕдасдсЕа | ддааЕдЕЕаа | аааЕдЕЕдаа | аЕсассадаа | ааЕЕсдсЕЕс | ЕЕсаасссса | 1920 |
даааасссЕЕ | ддддсасаЕс | аааасЕЕаЕд | ЕЕЕааЕааЕс | ЕаасссЕддд | ЕсааааЕдсд | 1980 |
дЕсаЕддасЕ | аЕадЕсааЕЕ | ЕЕсаааЕЕЕа | ассаЕссаад | дддаЕЕЕЕаЕ | саасааЕсаа | 2040 |
ддсасЕаЕса | асЕаЕсЕддЕ | ссдаддсддд | ааадЕддсаа | ссЕЕаадсдЕ | аддсааЕдса | 2100 |
дсадсЕаЕда | ЕдЕЕЕааЕаа | ЕдаЕаЕадас | адсдсдассд | даЕЕЕЕасаа | ассдсЕсаЕс | 2160 |
аадаЕЕааса | дЕдсЕсаада | ЕсЕсаЕЕааа | ааЕасададс | аЕдЕЕЕЕаЕЕ | дааадсдааа | 2220 |
аЕсаЕЕддЕЕ | аЕддЕааЕдЕ | ЕЕсЕасаддЕ | ассааЕадса | ЕЕадЕааЕдЕ | ЕааЕсЕадаа | 2280 |
дадсааЕЕса | аададсдссЕ | адсссЕЕЕаЕ | аасаасааЕа | ассдсаЕдда | ЕасЕЕдЕдЕд | 2340 |
дЕдсдаааЕа | сЕдаЕдасаЕ | ЕааадсаЕдс | ддЕаЕддсЕа | ЕсддсааЕса | аадсаЕддЕд | 2400 |
ааЕаасссЕд | асааЕЕасаа | дЕаЕсЕЕаЕс | ддЕааддсаЕ | ддаааааЕаЕ | аддсаЕсадЕ | 2460 |
аааасддсЕа | асддсЕсЕаа | ааЕЕЕсддЕд | ЕаЕЕаЕЕЕад | дсааЕЕсЕас | дссЕасЕдад | 2520 |
ааЕддЕддса | аЕассассаа | сЕЕасссасс | аасассасЕа | аЕааЕдсдсд | ЕЕсЕдсЕаас | 2580 |
ЕасдсссЕсд | Едаадаасдс | ЕссЕЕЕсдсЕ | сасадЕдсса | сЕссЕааЕЕЕ | адЕсдсЕаЕс | 2640 |
ааЕсадсаЕд | аЕЕЕЕддсас | ЕаЕЕдааадс | дЕдЕЕЕдааЕ | ЕддсЕаассд | сЕсЕааадаЕ | 2700 |
аЕЕдасасдс | ЕЕЕаЕасЕса | ЕЕсаддсдЕд | сааддЕаддд | аЕсЕсЕЕаса | аассЕЕаЕЕд | 2760 |
аЕЕдаЕадсс | аЕдаЕдсддд | ЕЕаЕдссада | саааЕдаЕЕд | аЕаасасаад | сассддЕдаа | 2820 |
аЕсассааас | ааЕЕдааЕдс | ддссасЕдас | дсЕЕЕаааса | асаЕадссад | ЕЕЕададсаЕ | 2880 |
аааассадсд | дсЕЕдсааас | ЕЕЕдадсЕЕд | адЕааЕдсда | ЕдаЕЕЕЕааа | ЕЕсЕсдЕЕЕа | 2940 |
дЕсааЕсЕсЕ | ссаддаадса | сассаассаЕ | аЕЕдасЕсдЕ | ЕсдсЕсаасд | сЕЕасаадсЕ | 3000 |
ЕЕааааддсс | ааадаЕЕсдс | ЕЕсЕЕЕадад | адсдсддсад | аадЕдЕЕдЕа | ЕсааЕЕЕдсс | 3060 |
ссЕаааЕаЕд | ааааассЕас | сааЕдЕЕЕдд | дсЕаасдсЕа | ЕЕдддддадс | дадсЕЕдааЕ | 3120 |
ааЕддсддса | асдсЕЕсаЕЕ | дЕаЕддсаса | адЕдссддЕд | ЕадасдсЕЕа | ссЕЕааЕддд | 3180 |
даадЕддаад | ссаЕЕдЕддд | сдддЕЕЕдда | адсЕаЕддЕЕ | аЕадсЕсЕЕЕ | ЕадЕааЕсдЕ | 3240 |
дсдаасЕсЕс | ЕЕаасЕсЕдд | ддсЕааЕаас | дсЕааЕЕЕЕд | дсдЕдЕаЕад | ссдЕаЕЕЕЕЕ | 3300 |
дсЕаассадс | аЕдааЕЕЕда | ЕЕЕЕдаадсЕ | сааддддсдс | ЕадддадЕда | ЕсааЕсаадс | 3360 |
ЕЕдааЕЕЕса | ааадЕдсЕсЕ | асЕдсаадаЕ | ЕЕдааЕсааа | дсЕаЕсаЕЕа | ЕЕЕадссЕаЕ | 3420 |
адсдсЕдсаа | саададсдад | сЕаЕддЕЕаЕ | дасЕЕЕдсдЕ | ЕЕЕЕсаддаа | сдсЕЕЕадЕд | 3480 |
ЕЕаааассаа | дсдЕдддсдЕ | дадсЕаЕаас | саЕЕЕаддЕЕ | саассаасЕЕ | Еаааадсадс | 3540 |
адсааЕсаад | ЕддсЕЕЕдаа | аааЕддсЕсЕ | адсадЕсадс | аЕсЕаЕЕсаа | сдсЕаасдсЕ | 3600 |
ааЕдЕддаад | сдсдсЕаЕЕа | ЕЕаЕддддас | асЕЕсаЕасЕ | ЕсЕаЕаЕдаа | сдсЕддадЕЕ | 3660 |
ЕЕасаададЕ | ЕсдсЕсдсЕЕ | ЕддаЕсЕааЕ | аасдссдсдЕ | сЕЕЕааасас | сЕЕЕааадЕд | 3720 |
- 58 032330
ааЕассдсЕс | дсаасссЕЕЕ | аааЕасссаЕ | дссададЕда | ЕдаЕдддЕдд | ддааЕЕдсаа | 3780 |
ЕЕадсЕааад | аадЕдЕЕЕЕЕ | дааЕЕЕдддс | дЕЕдЕЕЕаЕЕ | ЕдсасааЕЕЕ | даЕЕЕссааЕ | 3840 |
аЕаддссаЕЕ | ЕсдсЕЕссаа | ЕЕЕаддааЕд | аддЕаЕадЕЕ | ЕсЕаа | 3885 |
<210> | 11 |
<211> | 546 |
<212> | РЕТ |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | |
<221> | М15С_РЕАТиКЕ |
<223> | Н. ру1ог1 штамм 027 |
<400> | 11 |
МеЕ 1 | А1а | Ьуз | О1и | 11е 5 | Ьуз | РЬе | Еег Азр | Еег А1а Агд 10 | Азп | Ьеи | Ьеи 15 | РЬе | |||
О1и | О1у | Уа1 | Агд | О1п | Ьеи | Н1з | Азр | А1а | Уа1 | Ьуз | Уа1 | ТЬг | МеЕ | О1у | Рго |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | О1у | Агд | Азп | Уа1 | Ьеи | 11е | О1п | Ьуз | Еег | Туг | О1у | А1а | Рго | Еег | 11е |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Азр | О1у | Уа1 | Еег | Уа1 | А1а | Ьуз | О1и | 11е | О1и | Ьеи | Еег | Суз | Рго |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | МеЕ | О1у | А1а | О1п | Ьеи | Уа1 | Ьуз | О1и | Уа1 | А1а | Еег | Ьуз | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
А1а | Азр | А1а | А1а | О1у | Азр | О1у | ТЬг | ТЬг | ТЬг | А1а | ТЬг | Уа1 | Ьеи | А1а | Туг |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Еег | 11е | РЬе | Ьуз | О1и | О1у | Ьеи | Агд | Азп | 11е | ТЬг | А1а | О1у | А1а | Азп | Рго |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
11е | О1и | Уа1 | Ьуз | Агд | О1у | МеЕ | Азр | Ьуз | А1а | А1а | О1и | А1а | 11е | 11е | Азп |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
О1и | Ьеи | Ьуз | Ьуз | А1а | Еег | Ьуз | Ьуз | Уа1 | О1у | О1у | Ьуз | О1и | О1и | 11е | ТЬг |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
О1п | Уа1 | А1а | ТЬг | 11е | Еег | А1а | Азп | Еег | Азр | Н1з | Азп | 11е | О1у | Ьуз | Ьеи |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
11е | А1а | Азр | А1а | МеЕ | О1и | Ьуз | Уа1 | О1у | Ьуз | Азр | О1у | Уа1 | 11е | ТЬг | Уа1 |
165 | 170 | 175 |
- 59 032330
О1и О1и А1а Ьуз | О1у | 11е | О1и Азр | О1и 185 | Ьеи Азр | Уа1 | Уа1 | О1и 190 | О1у | МеЬ | |||||
180 | |||||||||||||||
О1п | РАе | Азр | Агд | О1у | Туг | Ьеи | 5ег | Рго | Туг | РАе | Уа1 | ТАг | Азп | А1а | О1и |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьуз | МеЬ | ТАг | А1а | О1п | Ьеи | Азр | Азп | А1а | Туг | 11е | Ьеи | Ьеи | ТАг | Азр | Ьуз |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | 5ег | 5ег | МеЬ | Ьуз | Азр | 11е | Ьеи | Рго | Ьеи | Ьеи | О1и | Ьуз | ТАг | МеЬ |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ьуз | О1и | О1у | Ьуз | Рго | Ьеи | Ьеи | 11е | 11е | А1а | О1и | Азр | 11е | О1и | О1у | О1и |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | ТАг | ТАг | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Азп | Ьуз | Ьеи | Агд | О1у | Уа1 | Ьеи | Азп | 11е |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | А1а | Уа1 | Ьуз | А1а | Рго | О1у | РАе | О1у | Азр | Агд | Агд | Ьуз | О1и | МеЬ | Ьеи |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | Азр | 11е | А1а | Уа1 | Ьеи | ТАг | О1у | О1у | О1п | Уа1 | 11е | 5ег | О1и | О1и | Ьеи |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
О1у | Ьеи | 5ег | Ьеи | О1и | Азп | А1а | О1и | Уа1 | О1и | РАе | Ьеи | О1у | Ьуз | А1а | О1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Агд | 11е | Уа1 | 11е | Азр | Ьуз | Азр | Азп | ТАг | ТАг | 11е | Уа1 | Азр | О1у | Ьуз | О1у |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Н1з | 5ег | Азр | Азр | Уа1 | Ьуз | Азр | Агд | Уа1 | А1а | О1п | 11е | Ьуз | ТАг | О1п | 11е |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
А1а | 5ег | ТАг | ТАг | 5ег | Азр | Туг | Азр | Ьуз | О1и | Ьуз | Ьеи | О1п | О1и | Агд | Ьеи |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
А1а | Ьуз | Ьеи | 5ег | О1у | О1у | Уа1 | А1а | Уа1 | 11е | Ьуз | Уа1 | О1у | А1а | А1а | 5ег |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1и | Уа1 | О1и | МеЬ | Ьуз | О1и | Ьуз | Ьуз | Азр | Агд | Уа1 | Азр | Азр | А1а | Ьеи | 5ег |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
А1а | ТАг | Ьуз | А1а | А1а | Уа1 | О1и | О1и | О1у | 11е | Уа1 | 11е | О1у | О1у | О1у | А1а |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | 11е | Агд | А1а | А1а | О1п | Ьуз | Уа1 | Н1з | Ьеи | Азп | Ьеи | Н1з | Азр | Азр |
420 | 425 | 430 |
- 60 032330
О1и | Ьуз | Уа1 435 | О1у | Туг | О1и | 11е | 11е 440 | Меб | Агд | А1а | 11е | Ьуз 445 | А1а | Рго | Ьеи |
А1а | О1п | 11е | А1а | 11е | Азп | А1а | О1у | Туг | Азр | О1у | О1у | Уа1 | Уа1 | Уа1 | Азп |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
О1и | Уа1 | О1и | Ьуз | Н1з | О1и | О1у | Н1з | Рке | О1у | Рке | Азп | А1а | Зег | Азп | О1у |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьуз | Туг | Уа1 | Азр | Меб | Рке | Ьуз | О1и | О1у | 11е | 11е | Азр | Рго | Ьеи | Ьуз | Уа1 |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
О1и | Агд | 11е | А1а | Ьеи | О1п | Азп | А1а | Уа1 | Зег | Уа1 | Зег | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | О1и | А1а | ТЬг | Уа1 | Н1з | О1и | 11е | Ьуз | О1и | О1и | Ьуз | А1а | А1а | Рго |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
А1а | Меб | Рго | Азр | Меб | О1у | О1у | Меб | О1у | О1у | Меб | О1у | О1у | Меб | О1у | О1у |
530 | 535 | 540 |
Меб Меб
545
<210> 12 <211> 1641 <212> ДНК <213> Н. ру1ог1 | ||||||
<220> <221> т1зс_£еабиге <223> Н. ру1ог1 штамм 027 | ||||||
<400> 12 абддсаааад | ааабсааабб | ббсадабадб | дсаадааасс | ббббабббда | аддсдбдада | 60 |
саасбссабд | абдсбдбсаа | адбаассабд | дддссаадад | дсаддаабдб | дббдаббсаа | 120 |
аааадсбабд | дсдсбссаад | сабсассааа | дабддсдбда | дсдбддсбаа | ададаббдаа | 180 |
ббаадббдсс | сддбддсбаа | сабдддсдсб | саасбсдбба | аададдбадс | дадсаааасс | 240 |
дсбдабдсбд | ссддсдабдд | сасдассаса | дсдассдбдс | бддсббабад | сабббббааа | 300 |
дааддбббда | ддаабабсас | ддсбддддсб | аасссбаббд | аадбдааасд | аддсабддаб | 360 |
ааадссдсбд | аадсдабсаб | саабдадсбб | аааааадсда | дсаааааадб | аддсддбааа | 420 |
даадааабса | сссаадбадс | дассабббсб | дссаасбссд | абсасаабаб | сдддааасбс | 480 |
абсдсбдасд | сбабддаааа | адбдддбааа | дабддсдбда | бсасбдббда | ададдсбаад | 540 |
ддсаббдаад | асдааббада | бдбсдбадаа | ддсабдсааб | ббдабададд | сбабсбсбсс | 600 |
- 61 032330
ссЕЕаЕЕЕЕд | Еаасдаасдс | ЕдадааааЕд | ассдсЕсааЕ | ЕддаЕаасдс | ЕЕасаЕссЕЕ | 660 |
ЕЕаасддаЕа | ааааааЕсЕс | ЕадсаЕдааа | дасаЕссЕсс | сдсЕаЕЕдда | ааааассаЕд | 720 |
ааададддса | аассдсЕЕЕЕ | ааЕсаЕсдсЕ | даадасаЕЕд | адддсдаадс | ЕЕЕаасдасЕ | 780 |
сЕадЕддЕда | аЕаааЕЕаад | аддсдЕдЕЕд | ааЕаЕсдсад | сддЕЕааадс | ЕссаддсЕЕЕ | 840 |
ддддасадда | даааадаааЕ | дсЕсааадас | аЕсдсЕдЕЕЕ | Еаассддсдд | ЕсаадЕсаЕЕ | 900 |
адсдаадааЕ | ЕдддсЕЕдад | ЕсЕадаааас | дсЕдаадЕдд | адЕЕЕЕЕадд | сааадссдда | 960 |
аддаЕЕдЕда | ЕЕдасааада | саасассасд | аЕсдЕадаЕд | дсаааддсса | ЕадсдаЕдаЕ | 1020 |
дЕЕааадаса | дадЕсдсдса | ааЕсаааасс | саааЕЕдсаа | дсасдасаад | сдаЕЕаЕдас | 1080 |
ааадаааааЕ | Едсаадааад | дЕЕддссааа | сЕсЕсЕддсд | дЕдЕддсЕдЕ | даЕЕааадЕд | 1140 |
ддсдсЕдсда | дЕдаадЕдда | ааЕдааадад | аааааадасс | дддЕддаЕда | сдсдЕЕдадс | 1200 |
дсдасЕааад | сддсддЕЕда | адааддсаЕЕ | дЕдаЕЕддсд | дсддЕдсддс | ЕсЕЕаЕЕсдс | 1260 |
дсддсЕсааа | аадЕдсаЕЕЕ | дааЕЕЕасас | даЕдаЕдааа | аадЕдддсЕа | ЕдаааЕсаЕс | 1320 |
аЕдсдсдсса | ЕЕааадсссс | аЕЕадсЕсаа | аЕсдсЕаЕса | аЕдссддЕЕа | ЕдаЕддсддЕ | 1380 |
дЕддЕсдЕда | аЕдаадЕада | аааасасдаа | дддсаЕЕЕЕд | дЕЕЕЕаасдс | ЕадсааЕддс | 1440 |
аадЕаЕдЕдд | асаЕдЕЕЕаа | адааддсаЕЕ | аЕЕдассссЕ | ЕаааадЕада | ааддаЕсдсЕ | 1500 |
ЕЕдсааааЕд | сддЕЕЕсддЕ | ЕЕсаадссЕд | сЕЕЕЕаасса | садаадссас | сдЕдсаЕдаа | 1560 |
аЕсааадаад | ааааадсддс | сссддсааЕд | ссЕдаЕаЕдд | дЕддсаЕддд | сддЕаЕддда | 1620 |
ддсаЕдддсд | дсаЕдаЕдЕа | а | 1641 |
<210> 13 <211> 265 <212> РЕТ <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> М15С_ЕЕАТиЕЕ <223> Н. ру1ог1 26695 <400> 13
МеЕ 1 | 11е | Ьеи | Агд | А1а 5 | Еег | Уа1 | Ьеи | Еег | А1а 10 | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Уа1 | О1у Ьеи 15 | |
О1у | А1а | А1а | Рго | Ьуз | Н1з | Еег | Уа1 | Еег | А1а | Азп | Азр | Ьуз | Агд | МеЕ | О1п |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Азр | Азп | Ьеи | Уа1 | Еег | Уа1 | 11е | О1и | Ьуз | О1п | ТЪг | Азп | Ьуз | Ьуз | Уа1 | Агд |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
11е | Ьеи | О1и | 11е | Ьуз | Рго | Ьеи | Ьуз | Еег | Еег | О1п | Азр | Ьеи | Ьуз | МеЕ | Уа1 |
- 62 032330
Уа1 65 | 11е | О1и | Азр | Рго | Азр 70 | ТЬг | Ьуз | Туг | Азп | 11е 75 | Рго | Ьеи | Уа1 | Уа1 | 5ег 80 |
Ьуз | Азр | О1у | Азп | Ьеи | 11е | 11е | О1у | Ьеи | 5ег | Азп | 11е | Рке | Рке | 5ег | Азп |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Ьуз | 5ег | Азр | Азр | Уа1 | О1п | Ьеи | Уа1 | А1а | О1и | ТЬг | Азп | О1п | Ьуз | Уа1 | О1п |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | Азп | А1а | ТЬг | О1п | О1п | Азп | 5ег | А1а | Ьуз | Ьеи | Азп | А1а | 11е | Рке |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Азп | О1и | 11е | Рго | А1а | Азр | Туг | А1а | 11е | О1и | Ьеи | Рго | 5ег | ТЬг | Азп | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | Азп | Ьуз | Азр | Ьуз | 11е | Ьеи | Туг | 11е | Уа1 | 5ег | Азр | Рго | МеЕ | Суз | Рго |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Н1з | Суз | О1п | Ьуз | О1и | Ьеи | ТЬг | Ьуз | Ьеи | Агд | Азр | Н1з | Ьеи | Ьуз | О1и | Азп |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
ТЬг | Уа1 | Агд | МеЕ | Уа1 | Уа1 | Уа1 | О1у | Тгр | Ьеи | О1у | Уа1 | Азп | 5ег | А1а | Ьуз |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | А1а | Ьеи | 11е | О1п | О1и | О1и | МеЕ | А1а | Ьуз | А1а | Агд | А1а | Агд | О1у |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
А1а | 5ег | Уа1 | О1и | Азр | Ьуз | 11е | 5ег | 11е | Ьеи | О1и | Ьуз | 11е | Туг | 5ег | ТЬг |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
О1п | Туг | Азр | 11е | Азп | А1а | О1п | Ьуз | О1и | Рго | О1и | Азр | Ьеи | Агд | ТЬг | Ьуз |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Уа1 | О1и | Азп | ТЬг | ТЬг | Ьуз | Ьуз | 11е | Рке | О1и | 5ег | О1у | Уа1 | 11е | Ьуз | О1у |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Уа1 | Рго | Рке | Ьеи | Туг | Н1з | Туг | Ьуз | А1а | |||||||
260 | 265 |
<210> | 14 |
<211> | 798 |
<212> | ДНК |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | |
<221> | т1зс_£еаЕиге |
- 63 032330 <223> Н. ру1ог1 26695
<400> 14 аЁдаЬаЁЬаа | дадсдадЬдЬ | дЬЬдадсдсд | ЁЬасЁЁсЁЬд | ЬаддсЬЬадд | ддсадссссЬ | 60 |
ааасаЬЬсад | ЁЁЬсадсЬаа | Ьдасааасдд | аЬдсаддаЬа | аЁЁЬадЬдад | сдЬдаЬЬдаа | 120 |
ааасадасса | аЬаааааддЬ | дсдЁаЬЁЁЬа | даааЬсааас | сЁЁЬааааЬс | ЬадссаддаЬ | 180 |
ЬЬаааааЬдд | ЁсдЬЁаЁЬда | адаЬссддас | асЬаааЬаса | аЬаЬсссдсЬ | ЬдЬддЬдадЬ | 240 |
ааддаЬддЬа | аЁЬЁааЁсаЬ | адддсЬЬадс | аасаЁаЬЁсЬ | ЬЬадсааЬаа | аадсдаЬдаЬ | 300 |
дЬдсааЬЬад | ЬЬдсадааас | сааЬсааааа | дЁЬсаадсЬс | ЬЬаасдссас | ссаасааааЬ | 360 |
адсдсдаааЬ | ЬдаасдсЬаЬ | ЁЬЁЁааЬдаа | аЬассддсЬд | аЁЬаЁдсдаЬ | ададЬЬдссс | 420 |
ЬсЬасЬаасд | сЬдсаааЬаа | ддаЬааааЬс | сЁЬЁаЁаЁЬд | ЁсЁсЬдаЬсс | саЬдЬдссса | 480 |
саЬЬдссааа | аададсЬсас | ЬааасЬЬадд | даЁсаЬЁЬаа | аадаааасас | сдЬдадааЬд | 540 |
дЬсдЬддЬдд | ддЬддсььдд | ддЬсааЬЬса | дсЬаааааад | сддсЁЁЬааЬ | ссаадаадаа | 600 |
аЬддсдааад | сЬадддсЬад | дддадсдадс | дЬддаадаЬа | адаЁсЬсЁаЬ | ЬсЬЬдаааад | 660 |
аЬЁЁаЁЬсса | сссааЬасда | ЁаЁЬаасдсЬ | сааааададс | сЁдаадаЬЁЬ | асдсасЬааа | 720 |
дЬддааааЬа | ссасЬааааа | даЁЬЁЁЬдаа | ЬсЬддсдЬда | ЁЁаадддЬдЬ | дссЁЁЁсЁЬа | 780 |
ЁассаЁЬаЬа | аддсаЬда | 798 |
<210> 15 <211> 325 <212> РЕТ <213> Н. ру1ог1 <220>
<221> М15С_РЕАТиКЕ <223> Н. ру1ог1 Э99 <400> 15
МеЬ 1 | Рго | Ткг | 11е | Азр 5 | Рке | Ткг | Рке | Суз | О1и 10 | 11е | Азп | Рго | Ьуз | Ьуз 15 | О1у |
Рке | О1у | О1у | А1а | Азп | О1у | Азп | Ьуз | 11е | Еег | Ьеи | Рке | Туг | Азп | Азп | О1и |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ьеи | Туг | МеЬ | Уа1 | Ьуз | Рке | Рго | Рго | Ьуз | Рго | Еег | Ткг | Н1з | Ьуз | О1и | МеЬ |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Еег | Туг | Ткг | Азп | О1у | Суз | Рке | Еег | О1и | Туг | Уа1 | А1а | Суз | Н1з | 11е | Уа1 |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Азп | Еег | Ьеи | О1у | Ьеи | Ьуз | Уа1 | О1п | О1и | Ткг | Ьеи | Ьеи | О1у | Ткг | Туг | Ьуз |
65 | 70 | 75 | 80 |
- 64 032330
Азп | Ьуз | 11е | Уа1 | Уа1 85 | А1а | Суз | Ьуз | Азр | Рке 90 | ТЬг | ТЬг | Н1з | О1п | Туг 95 | О1и |
Ьеи | Уа1 | Азр | Рке | Ьеи | 5ег | Ьеи | Ьуз | Азп | ТЬг | МеЬ | 11е | О1и | Ьеи | О1и | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
5ег | О1у | Ьуз | Азр | ТЬг | Азп | Ьеи | Азп | Азр | Уа1 | Ьеи | Туг | А1а | 11е | Азр | Азп |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
О1п | Н1з | Рке | 11е | О1и | Рго | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Ьуз | Суз | Рке | Рке | Тгр | Азр | МеЬ |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Рке | Уа1 | А1а | Азр | ТЬг | Ьеи | Ьеи | О1у | Азп | Рке | Азр | Агд | Н1з | Азп | О1у | Азп |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Тгр | О1у | Рке | Ьеи | Агд | А1а | 5ег | Азп | 5ег | Ьуз | О1и | Туг | О1п | 11е | А1а | Рго |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Рке | Азр | Суз | О1у | 5ег | Суз | Ьеи | Туг | Рго | О1п | А1а | Азр | Азр | Уа1 | Уа1 |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Суз | О1п | Ьуз | Уа1 | Ьеи | 5ег | Азп | 11е | Азр | О1и | Ьеи | Азп | А1а | Агд | 11е | Туг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Азп | Рке | Рго | О1п | 5ег | 11е | Ьеи | Ьуз | Азр | Азр | Азп | Азр | Ьуз | Ьуз | 11е | Азп |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Туг | Туг | Азр | Рке | Ьеи | ТЬг | О1п | ТЬг | Азп | Азп | Ьуз | Азр | Суз | Ьеи | Азр | А1а |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ьеи | Ьеи | Агд | 11е | Туг | Рго | Агд | 11е | Азр | МеЬ | Азп | Ьуз | 11е | Н1з | 5ег | 11е |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | Азр | Азп | ТЬг | Рго | Рке | МеЬ | 5ег | О1и | 11е | Н1з | Ьуз | О1и | Рке | Ьеи | Н1з |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
ТЬг | МеЬ | Ьеи | Азр | О1и | Агд | Ьуз | 5ег | Ьуз | 11е | 11е | Азр | Уа1 | А1а | Н1з | ТЬг |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Агд | А1а | 11е | О1и | Ьеи | 5ег | Ьеи | О1п | Н1з | Ьуз | О1п | А1а | Н1з | 5ег | Азп | Рго |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Туг | Азр | Азп | А1а | Азр | Азр | Ьеи | Азр | Азп | 5ег | Азп | О1и | Туг | ТЬг | Рго | ТЬг |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Рго | Ьуз | Агд | Агд | Агд |
325
- 65 032330
<210> | 16 |
<211> | 978 |
<212> | ДНК |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | ||||||
<221> т1зс_£еаЕиге <223> Н. ру1ог1 Д99 | ||||||
<400> 16 аЕдссаасса | ЕЕдаЕЕЕЕас | ЕЕЕЕЕдЕдад | аЕЕаасссЕа | аааааддЕЕЕ | Едддддадса | 60 |
ааЕддаааЕа | аааЕЕадсЕЕ | аЕЕЕЕаЕааЕ | ааЕдаасЕсЕ | асаЕддЕсаа | аЕЕссссссЕ | 120 |
аадссЕЕсЕа | сасаЕааада | ааЕдЕссЕаЕ | ассааЕддЕЕ | дЕЕЕЕадЕда | аЕаЕдЕадса | 180 |
ЕдЕсаЕаЕад | ЕсааЕадсЕЕ | аддсЕЕааад | дЕЕсаадааа | саЕЕдсЕадд | сасЕЕаЕааа | 240 |
ааЕааааЕсд | ЕддЕЕдсЕЕд | ЕааадаЕЕЕЕ | ассасссаЕс | ааЕасдадсЕ | ЕдЕадаЕЕЕЕ | 300 |
сЕаадЕсЕаа | ааааЕасЕаЕ | даЕЕдааЕЕа | даааааЕсад | дсааадасас | ЕааЕЕЕдааЕ | 360 |
даЕдЕдсЕЕЕ | аЕдссаЕада | ЕаассадсаЕ | ЕЕЕаЕЕдадс | саааадЕЕЕЕ | ааааЕдЕЕЕс | 420 |
ЕЕЕЕдддаЕа | ЕдЕЕЕдЕадс | адаЕасаЕЕд | сЕаддЕааЕЕ | ЕЕдаЕаддса | ЕааЕддЕааЕ | 480 |
ЕдддддЕЕсЕ | ЕаададссЕс | аааЕЕсаааа | дааЕаЕсааа | ЕадсЕсссаЕ | ЕЕЕЕдаЕЕдЕ | 540 |
ддсЕсЕЕдЕс | ЕаЕассссса | адсЕдаЕдаЕ | дЕддЕаЕдсс | ааааадЕЕЕЕ | аадЕааЕаЕЕ | 600 |
даЕдаасЕса | аЕдсааддаЕ | ЕЕаЕааЕЕЕс | ссссааЕсЕа | ЕсЕЕаааада | ЕдасаасдаЕ | 660 |
аааааааЕЕа | асЕасЕаЕда | ЕЕЕсЕЕаасЕ | сааассааЕа | аЕааадаЕЕд | ссЕЕдаЕдса | 720 |
сЕасЕЕадда | ЕаЕасссасд | саЕадаЕаЕд | ааЕааааЕсс | аЕЕсааЕЕаЕ | ЕдаЕаасаса | 780 |
сссЕЕЕаЕда | дсдаааЕаса | сааадааЕЕЕ | ЕЕасаЕасаа | ЕдсЕЕдаЕда | аадааааЕса | 840 |
аадаЕЕаЕад | аЕдЕадсаса | сасЕададсЕ | аЕЕдадЕЕаЕ | ссЕЕасааса | сааасаадсЕ | 900 |
сасЕсааасс | сЕЕаЕдасаа | сдсадаЕдаЕ | ЕЕадасааЕЕ | ссааЕдааЕа | сасссссаса | 960 |
ссЕаадсдЕа дасдаЕаа 978
<210> <211> <212> <213> | 17 476 РЕТ Н. ру1ог1 |
<220> <221> <223> | М15С_РЕАТиЕЕ Н. ру1ог1 штамм 027 |
<400> | 17 |
МеЕ МеЕ Ьуз Ьуз ТЪг Ьеи Рке 11е Оег Ьеи А1а Ьеи А1а Ьеи Оег Ьеи
5 10 15
- 66 032330
Азп | А1а | О1у Азп 20 | 11е | О1п | 11е | О1п | Азп 25 | МеЬ | Рго | Ьуз | Уа1 | Ьуз 30 | О1и | Агд | |
Уа1 | Бег | Уа1 | Рго | Бег | Ьуз | Азр | Азр | ТЪг | 11е | Туг | Бег | Туг | Н1з | Азр | Бег |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Азр | Бег | 11е | Ьуз | А1а | Уа1 | Уа1 | Азп | 11е | Бег | ТЪг | О1и | Ьуз | Ьуз |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Азп | Азп | РЪе | 11е | О1у | О1у | О1у | Уа1 | РЪе | Азп | Азр | Рго | РЪе | РЪе |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
О1п | О1п | РЪе | РЪе | О1у | Азр | Ьеи | О1у | О1у | МеЬ | 11е | Рго | Ьуз | О1и | Агд | МеЬ |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
О1и | Агд | А1а | Ьеи | О1у | Бег | О1у | Уа1 | 11е | 11е | Бег | Ьуз | Азр | О1у | Туг | 11е |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | ТЪг | Азп | Азп | Н1з | Уа1 | 11е | Азр | О1у | А1а | Азр | Ьуз | 11е | Ьуз | Уа1 | ТЪг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
11е | Рго | О1у | Бег | Азп | Ьуз | О1и | Туг | Бег | А1а | ТЪг | Ьеи | Уа1 | О1у | ТЪг | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Бег | О1и | Бег | Азр | Ьеи | А1а | Уа1 | 11е | Агд | 11е | ТЪг | Ьуз | Азр | Азп | Ьеи | Рго |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
ТЪг | 11е | Ьуз | РЪе | Бег | Азр | Бег | Азп | Азр | 11е | Бег | Уа1 | О1у | Азр | Ьеи | Уа1 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
РЪе | А1а | 11е | О1у | Азп | Рго | РЪе | О1у | Уа1 | О1у | О1и | Бег | Уа1 | ТЪг | О1п | О1у |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
11е | Уа1 | Бег | А1а | Ьеи | Азп | Ьуз | Бег | О1у | 11е | О1у | 11е | Азп | Бег | Туг | О1и |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Азп | РЪе | 11е | О1п | ТЪг | Азр | А1а | Бег | 11е | Азп | Рго | О1у | Азп | Бег | О1у | О1у |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
А1а | Ьеи | 11е | Азр | Бег | Агд | О1у | О1у | Ьеи | Уа1 | О1у | 11е | Азп | ТЪг | А1а | 11е |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
11е | Бег | Ьуз | ТЪг | О1у | О1у | Азп | Н1з | О1у | 11е | О1у | РЪе | А1а | 11е | Рго | Бег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Азп | МеЬ | Уа1 | Ьуз | Азр | 11е | Уа1 | ТЪг | О1п | Ьеи | 11е | Ьуз | ТЪг | О1у | Ьуз | 11е |
260 | 265 | 270 |
- 67 032330
О1и Агд | О1у 275 | Туг | Ьеи О1у | Уа1 | О1у Ьеи 280 | О1п | Азр | Ьеи | 5ег 285 | О1у | Азр | Ьеи | |||
О1п | Азп | 5ег | Туг | Азр | Азп | Ьуз | О1и | О1у | А1а | Уа1 | Уа1 | 11е | 5ег | Уа1 | О1и |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьуз | Азр | 5ег | Рго | А1а | Ьуз | Ьуз | Уа1 | О1у | 11е | Ьеи | Уа1 | Тгр | Азр | Ьеи | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
ТЪг | О1и | Уа1 | Азп | О1у | Ьуз | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азп | ТЪг | Азп | О1и | Ьеи | Агд | Азп |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Ьеи | 11е | О1у | 5ег | МеЬ | Ьеи | Рго | Азп | О1п | Агд | Уа1 | ТЪг | Ьеи | Ьуз | Уа1 | 11е |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Агд | Азр | Ьуз | Ьуз | О1и | Агд | ТЪг | РЪе | ТЪг | Ьеи | ТЪг | Ьеи | А1а | О1и | Агд | Ьуз |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азп | Рго | Азп | Ьуз | Ьуз | О1и | ТЪг | 11е | 5ег | А1а | О1п | Азп | О1у | А1а | О1п | О1у |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1п | Ьеи | Азп | О1у | Ьеи | О1п | Уа1 | О1и | Азр | Ьеи | ТЪг | О1п | Ьуз | ТЪг | Ьуз | Агд |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
5ег | МеЬ | Агд | Ьеи | 5ег | Азр | Азр | Уа1 | О1п | О1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | 5ег | О1п | Уа1 |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Азп | О1и | Азп | 5ег | Рго | А1а | О1и | О1п | А1а | О1у | РЪе | Агд | О1п | О1у | Азп | 11е |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
11е | ТЪг | Ьуз | 11е | О1и | О1и | 11е | О1и | Уа1 | Ьуз | 5ег | Уа1 | А1а | Азр | РЪе | Азп |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Н1з | А1а | Ьеи | О1и | Ьуз | Туг | Ьуз | О1у | Ьуз | Рго | Ьуз | Агд | РЪе | Ьеи | Уа1 | Ьеи |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Азр | Ьеи | Азп | О1п | О1у | Туг | Агд | 11е | 11е | Ьеи | Уа1 | Ьуз | ||||
465 | 470 | 475 |
<210> | 18 |
<211> | 1431 |
<212> | ДНК |
<213> | Н. ру1ог1 |
<220> | |
<221> | т1зс_£еаЬиге |
<223> | Н. ру1ог1 027 |
- 68 032330
<400> 18 аЕдаЕдаааа | ааасссЕЕЕЕ | ЕаЕсЕсЕЕЕд | дсЕЕЕадсдЕ | ЕаадсЕЕдаа | ЕдсдддсааЕ | 60 |
аЕссаааЕсс | аааасаЕдсс | сааадЕЕааа | дадсдадЕда | дЕдЕссссЕс | ЕааадасдаЕ | 120 |
асдаЕсЕаЕЕ | сЕЕассасда | ЕЕсЕаЕЕаад | даЕЕсдаЕЕа | аадсддЕддЕ | дааЕаЕсЕсЕ | 180 |
асЕдаааада | адаЕЕааааа | сааЕЕЕЕаЕа | ддЕддсддЕд | ЕдЕЕЕааЕда | ссссЕЕЕЕЕс | 240 |
саасааЕЕЕЕ | ЕЕддддаЕЕЕ | дддсддсаЕд | аЕсссЕааад | ааадааЕдда | аадддсЕЕЕа | 300 |
ддсадсддсд | ЕааЕсаЕЕЕс | ЕааадаЕддс | ЕаЕаЕЕдЕаа | сЕаасаасса | ЕдЕдаЕЕдаЕ | 360 |
ддЕдсддаЕа | адаЕЕааадЕ | ЕассаЕЕсса | дддадсааЕа | аададЕаЕЕс | сдсЕасЕЕЕа | 420 |
дЕаддсассд | аЕЕсЕдааад | сдаЕЕЕадсс | дЕдаЕЕсдса | ЕсасЕааада | сааЕсЕдссс | 480 |
ассаЕсаааЕ | ЕсЕсЕдаЕЕс | ЕаасдаЕаЕЕ | ЕсадЕдддсд | аЕЕЕддЕЕЕЕ | ЕдсдаЕЕддЕ | 540 |
аасссЕЕЕЕд | дсдЕдддЕда | аадсдЕЕасЕ | сааддсаЕЕд | ЕЕЕсадсдсЕ | сааЕаааадс | 600 |
дддаЕЕддда | ЕсаасадсЕа | ЕдааааЕЕЕс | аЕЕсааасад | асдсЕЕссаЕ | сааЕссЕдда | 660 |
ааЕЕссддсд | дсдсЕЕЕааЕ | ЕдаЕадссдЕ | ддадддЕЕад | ЕддддаЕсаа | ЕассдссаЕЕ | 720 |
аЕсЕсЕаааа | ссдддддсаа | ссасддсаЕЕ | ддсЕЕЕдсса | ЕсссЕЕсЕаа | саЕддЕЕааа | 780 |
даЕаЕЕдЕаа | сссаасЕсаЕ | саааассддЕ | аадаЕЕдааа | даддЕЕасЕЕ | дддсдЕдддс | 840 |
ЕЕдсаадаЕЕ | Едадсддсда | ЕЕЕдсааааЕ | ЕсЕЕаЕдаса | аЕааадаадд | ддсддЕадЕс | 900 |
аЕЕадсдЕад | ааааадасЕс | ЕссддсЕааа | ааадЕаддда | ЕЕЕЕддЕдЕд | ддаЕЕЕдаЕс | 960 |
асЕдаадЕса | аЕдддааааа | ддЕЕааааас | асдааЕдадЕ | ЕаадаааЕсЕ | ааЕсддсЕсс | 1020 |
аЕдсЕассса | аЕсааададЕ | аассЕЕаааа | дЕсаЕЕадад | асаааааада | асдсасЕЕЕс | 1080 |
асссЕсасЕс | ЕЕдсЕдааад | дааааасссЕ | аасаааааад | ааассаЕЕЕс | ЕдсЕсаааас | 1140 |
ддсдсдсаад | дссааЕЕдаа | сдддсЕЕсаа | дЕадаадаЕЕ | Еаасссаааа | аассаааадд | 1200 |
ЕсЕаЕдсдЕЕ | ЕдадсдаЕда | ЕдЕЕсааддд | дЕЕЕЕадЕсЕ | сЕсаадЕдаа | ЕдааааЕЕсс | 1260 |
ссадсададс | аадсЕддсЕЕ | Еаддсааддс | ааЕаЕсаЕса | саааааЕЕда | ададаЕЕдаа | 1320 |
дЕдаааадсд | ЕЕдсддаЕЕЕ | ЕаассаЕдсЕ | ЕЕадаааадЕ | аЕаааддсаа | асссааасда | 1380 |
ЕЕсЕЕадЕЕЕ | ЕадаЕЕЕдаа | ЕсааддЕЕаЕ | аддаЕсаЕЕЕ | ЕддЕдаааЕд | а | 1431 |
<210> <211> <212> <213> | 19 22 ДНК Искусственная |
<220> <223> | Синтетический |
<400> | 19 |
саЕаЕддсаа ЕаддЕЕсаЕЕ аа |
- 69 032330 <210> 20 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Синтетический <400> 20 сЕсдадаЕЕс ЕЕЕЕЕадссд сЕдс <210> 21 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 21 адсЕсаЕЕад ддсЕЕддсад <210> 22 <211> 18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 22 дсЕсдсдсЕс аасдсаЕс <210> 23 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 23 аЕсасддасд сЕассааЕдд <210> 24 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 24 адддасЕЕса ЕдсаЕдсЕсс
<210> | 25 |
<211> | 21 |
<212> | ДНК |
- 70 032330 <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 25 сасадасдсЕ аЕсаЕЕсаад с
<210> | 26 |
<211> | 21 |
<212> | ДНК |
<213> | Искусственная |
<220> <223> | Праймер |
<400> | 26 |
сссдсЕдаЕс асаЕсаЕЕда с |
<210> <211> <212> <213> | 27 21 ДНК Искусственная |
<220> <223> | Праймер |
<400> | 27 |
сдсЕаассЕс аЕадаЕддад д |
<210> 28 <211> 19 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Праймер <400> 28
Еаадсддсаа адсдсЕссд
Claims (10)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Способ обнаружения инфекции Н. ру1оп у субъекта, при этом указанный способ включает обнаружение в образце, полученном от указанного субъекта, иммунного ответа, направленного против Ε1ίΌ, причём указанный иммунный ответ представляет собой присутствие антитела против Ε1ίΌ, при этом указанный способ включает осуществление реакции указанного образца с Ε1ίΌ или фрагментом Ε1ίΌ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы было можно идентифицировать указанный фрагмент как фрагмент Ε1ίΌ и исключить то, что указанный фрагмент представляет собой фрагмент белка или полипептида, отличного от Ε1ίΌ, и при этом указанный образец выбран из группы, состоящей из сыворотки крови, плазмы крови, цельной крови и кала.
- 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что указанный способ включает осуществление реакции указанного образца с полноразмерным Ε1ίΌ или фрагментом Ε1ίΌ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного Ε1ίΌ, при этом фрагмент Ε1ίΌ все еще активен как фактор вирулентности.
- 3. Способ по п.1 или 2, отличающийся тем, что указанное антитело против Ε1ίΌ представляет собой антитело ΙβΟ и/или антитело ΙβΑ.
- 4. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что указанное обнаружение осуществляют по- 71 032330 средством твердофазного иммуноферментного анализа (ЕБ18А), анализа латерального растекания или линейного иммуноанализа.
- 5. Способ по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что указанный способ дополнительно включает обнаружение одного или более антигенов Не11соЬас!ег, предпочтительно Н. ру1оп, при этом один или более антигенов выбраны из группы, состоящей из СадА, УасА, СгоЕЬ, Нр 0231, Шр 0940 и Н1гА.
- 6. Применение набора, содержащего Ε1ΪΏ или его фрагмент и твёрдую фазу, при этом Ε1ΪΏ или его фрагмент прикреплены к указанной твёрдой фазе, в способе по любому из пп.1-5, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая достаточно длинная, чтобы было можно идентифицировать указанный фрагмент как фрагмент Ε1ΪΏ и исключить то, что указанный фрагмент является фрагментом белка или полипептида, отличного от Ε1ΪΏ.
- 7. Применение по п.6, где указанный набор дополнительно содержит буфер и/или листок-вкладыш с инструкцией.
- 8. Применение по п.6 или 7, отличающееся тем, что указанный набор содержит полноразмерный Ε1ΪΏ или фрагмент Ε1ΪΏ, причём указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного Ε1ΪΏ, при этом фрагмент Ε1ΪΏ все еще активен как фактор вирулентности.
- 9. Набор для применения в способе согласно любому из пп.1-5, указанный набор содержит полноразмерный Ε1ΪΏ или его фрагмент и твёрдую фазу, при этом Ε1ΪΏ или его фрагмент прикреплены к указанной твёрдой фазе, где указанный фрагмент имеет аминокислотную последовательность, которая короче, чем аминокислотная последовательность полноразмерного Ε1ΪΏ, при этом фрагмент Ε1ΪΏ все еще активен как фактор вирулентности.
- 10. Набор по п.9, отличающийся тем, что указанный набор дополнительно содержит буфер и/или листок-вкладыш с инструкцией.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP13004038.9A EP2837939A1 (en) | 2013-08-13 | 2013-08-13 | Method for the detection of H.pylori infection |
PCT/EP2014/002230 WO2015022075A2 (en) | 2013-08-13 | 2014-08-13 | Method for the detection of h.pylori infection |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201690151A1 EA201690151A1 (ru) | 2016-07-29 |
EA032330B1 true EA032330B1 (ru) | 2019-05-31 |
Family
ID=48979516
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA201690151A EA032330B1 (ru) | 2013-08-13 | 2014-08-13 | Способ обнаружения инфекции h. pylori |
Country Status (23)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10018628B2 (ru) |
EP (2) | EP2837939A1 (ru) |
JP (1) | JP6461151B2 (ru) |
KR (1) | KR102218839B1 (ru) |
CN (1) | CN105452864B (ru) |
AU (1) | AU2014308141B2 (ru) |
BR (1) | BR112016003129B1 (ru) |
CA (1) | CA2920417C (ru) |
CY (1) | CY1121282T1 (ru) |
DK (1) | DK3033623T3 (ru) |
EA (1) | EA032330B1 (ru) |
ES (1) | ES2683628T3 (ru) |
HR (1) | HRP20181280T1 (ru) |
HU (1) | HUE039663T2 (ru) |
IL (1) | IL244077B (ru) |
LT (1) | LT3033623T (ru) |
MX (1) | MX367105B (ru) |
PL (1) | PL3033623T3 (ru) |
PT (1) | PT3033623T (ru) |
RS (1) | RS57773B1 (ru) |
SG (1) | SG11201601051SA (ru) |
SI (1) | SI3033623T1 (ru) |
WO (1) | WO2015022075A2 (ru) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SE541618C2 (en) * | 2017-02-24 | 2019-11-12 | Biotome Pty Ltd | Novel peptides and their use in diagnosis |
CN108287244B (zh) * | 2018-03-28 | 2020-03-24 | 深圳市伯劳特生物制品有限公司 | 热休克蛋白groEL在制备幽门螺杆菌检测的试剂中的应用 |
CN108956989B (zh) * | 2018-09-27 | 2021-08-13 | 重庆新赛亚生物科技有限公司 | 一种幽门螺杆菌分型检测用检测试剂卡及其制备方法 |
RU2756418C1 (ru) * | 2021-02-16 | 2021-09-30 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Смоленский государственный медицинский университет" министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ оценки степени тяжести течения язвенной болезни желудка с локализацией язвы в антральном отделе желудка, ассоциированной с Helicobacter pylori и вирусом Эпштейн-Барр |
KR20230103458A (ko) * | 2021-12-31 | 2023-07-07 | 주식회사 케이티앤지 | 에어로졸 생성장치 및 이를 포함하는 시스템 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1998027432A1 (en) * | 1996-12-19 | 1998-06-25 | Chiron Corporation | Helicobacter pylori diagnostics |
WO2004094467A2 (en) * | 2003-04-22 | 2004-11-04 | Intercell Ag | H. pylori antigens |
Family Cites Families (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2684488A (en) | 1988-06-27 | 1990-01-04 | Carter-Wallace, Inc. | Test device and method for colored particle immunoassay |
DK0786469T3 (da) | 1990-06-11 | 2006-07-10 | Gilead Sciences Inc | Nukleinsyreligander |
US5972336A (en) * | 1992-11-03 | 1999-10-26 | Oravax Merieux Co. | Urease-based vaccine against helicobacter infection |
WO1996040893A1 (en) | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Astra Aktiebolag | Nucleic acid and amino acid sequences relating to helicobacter pylori for diagnostics and therapeutics |
WO1998008856A2 (de) | 1996-08-30 | 1998-03-05 | Fuerste Jens Peter | Spiegelselektion und spiegelevolution von nucleinsäuren |
US20040052799A1 (en) | 1996-11-15 | 2004-03-18 | Astra Aktiebolag | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Helicobacter pylori for diagnostics and therapeutics |
KR100211286B1 (ko) * | 1997-06-23 | 1999-08-02 | 허영섭 | 헬리코박터 파이로리의 외막단백질 유전자 및 그를 발현하는 재조합 미생물 |
WO2002060934A2 (en) * | 2001-01-31 | 2002-08-08 | Hybrigenics | IDENTIFICATION OF THE ANTI-σ28 FACTOR IN HELICOBACTER PYLORI, IN CAMPYLOBACTER JEJUNI AND IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA AND APPLICATION THEREOF |
JP2004123737A (ja) * | 2002-09-10 | 2004-04-22 | New Industry Research Organization | 新規抗体及びその利用法 |
JP2006284567A (ja) * | 2005-03-08 | 2006-10-19 | Pharma Foods International Co Ltd | ヘリコバクター・ピロリ感染の診断方法及び診断キット |
CN101435821A (zh) * | 2008-12-19 | 2009-05-20 | 周炬华 | 一种幽门螺旋杆菌抗体的免疫检测试剂盒及其检测方法 |
CN103185793B (zh) * | 2011-12-30 | 2015-01-07 | 深圳市亚辉龙生物科技有限公司 | 一种检测幽门螺杆菌抗体的试剂装置及其方法 |
CN102967705A (zh) * | 2012-11-26 | 2013-03-13 | 深圳市伯劳特生物制品有限公司 | 一种幽门螺杆菌分型检测的试剂盒 |
-
2013
- 2013-08-13 EP EP13004038.9A patent/EP2837939A1/en not_active Withdrawn
-
2014
- 2014-08-13 JP JP2016533837A patent/JP6461151B2/ja active Active
- 2014-08-13 KR KR1020167006417A patent/KR102218839B1/ko active IP Right Grant
- 2014-08-13 HU HUE14755023A patent/HUE039663T2/hu unknown
- 2014-08-13 PT PT14755023T patent/PT3033623T/pt unknown
- 2014-08-13 ES ES14755023.0T patent/ES2683628T3/es active Active
- 2014-08-13 PL PL14755023T patent/PL3033623T3/pl unknown
- 2014-08-13 EA EA201690151A patent/EA032330B1/ru unknown
- 2014-08-13 BR BR112016003129-6A patent/BR112016003129B1/pt active IP Right Grant
- 2014-08-13 LT LTEP14755023.0T patent/LT3033623T/lt unknown
- 2014-08-13 AU AU2014308141A patent/AU2014308141B2/en active Active
- 2014-08-13 SG SG11201601051SA patent/SG11201601051SA/en unknown
- 2014-08-13 MX MX2016001828A patent/MX367105B/es active IP Right Grant
- 2014-08-13 US US14/911,426 patent/US10018628B2/en active Active
- 2014-08-13 DK DK14755023.0T patent/DK3033623T3/en active
- 2014-08-13 RS RS20180951A patent/RS57773B1/sr unknown
- 2014-08-13 EP EP14755023.0A patent/EP3033623B1/en active Active
- 2014-08-13 CA CA2920417A patent/CA2920417C/en active Active
- 2014-08-13 SI SI201430817T patent/SI3033623T1/sl unknown
- 2014-08-13 CN CN201480045125.4A patent/CN105452864B/zh active Active
- 2014-08-13 WO PCT/EP2014/002230 patent/WO2015022075A2/en active Application Filing
-
2016
- 2016-02-11 IL IL244077A patent/IL244077B/en active IP Right Grant
-
2018
- 2018-08-09 HR HRP20181280TT patent/HRP20181280T1/hr unknown
- 2018-08-10 CY CY20181100847T patent/CY1121282T1/el unknown
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1998027432A1 (en) * | 1996-12-19 | 1998-06-25 | Chiron Corporation | Helicobacter pylori diagnostics |
WO2004094467A2 (en) * | 2003-04-22 | 2004-11-04 | Intercell Ag | H. pylori antigens |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
MOHAMMAD KHALIFEH GHOLI, KALALI BEHNAM, FORMICHELLA LUCA, G�TTNER GEREON, SHAMSIPOUR FERESHTEH, ZARNANI AMIR HASSAN, HOSSEINI MOST: "Helicobacter pylori FliD protein is a highly sensitive and specific marker for serologic diagnosis of H. pylori infection", INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, URBAN & FISCHER, vol. 303, no. 8, 8 December 2013 (2013-12-08), pages 618 - 623, XP055097738, ISSN: 14384221, DOI: 10.1016/j.ijmm.2013.08.005 * |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Goettner et al. | Improvement of Lyme borreliosis serodiagnosis by a newly developed recombinant immunoglobulin G (IgG) and IgM line immunoblot assay and addition of VlsE and DbpA homologues | |
Heikkilä et al. | Species-SpecificSerodiagnosis of Lyme Arthritis and Neuroborreliosis Due to Borreliaburgdorferi Sensu Stricto, B. afzelii, and B. garinii by Using Decorin Binding ProteinA | |
Weiss et al. | Comparison of PCR and other diagnostic techniques for detection of Helicobacter pylori infection in dyspeptic patients | |
Sambri et al. | Western immunoblotting with five Treponema pallidum recombinant antigens for serologic diagnosis of syphilis | |
Friedman et al. | Infections with the chlamydia-like microorganism Simkania negevensis, a possible emerging pathogen | |
Butt et al. | Association of S treptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus with colorectal cancer: Serological evidence | |
EA032330B1 (ru) | Способ обнаружения инфекции h. pylori | |
Ching et al. | Early diagnosis of scrub typhus with a rapid flow assay using recombinant major outer membrane protein antigen (r56) of Orientia tsutsugamushi | |
Cugini et al. | Regulation of expression of the Borrelia burgdorferi β3-chain integrin ligand, P66, in ticks and in culture | |
Oliver Jr et al. | Antibody profiling of canine IgG responses to the OspC protein of the Lyme disease spirochetes supports a multivalent approach in vaccine and diagnostic assay development | |
Heikkilä et al. | Recombinant or peptide antigens in the serology of Lyme arthritis in children | |
Miller et al. | Borrelia burgdorferi B31 Erp proteins that are dominant immunoblot antigens of animals infected with isolate B31 are recognized by only a subset of human Lyme disease patient sera | |
Panelius et al. | Recombinant flagellin A proteins from Borrelia burgdorferi sensu stricto, B. afzelii, and B. garinii in serodiagnosis of Lyme borreliosis | |
Portig et al. | Characterization of the humoral immune response to Chlamydia outer membrane protein 2 in chlamydial infection | |
Liang et al. | C-terminal invariable domain of VlsE is immunodominant but its antigenicity is scarcely conserved among strains of Lyme disease spirochetes | |
Perez-Perez et al. | Detection of anti-VacA antibody responses in serum and gastric juice samples using type s1/m1 and s2/m2 Helicobacter pylori VacA antigens | |
JP2017531657A (ja) | 組換えボレリアタンパク質およびその使用のための方法 | |
Shelburne et al. | Serum antibodies to Porphyromonas gingivalis chaperone HtpG predict health in periodontitis susceptible patients | |
Gilmore Jr et al. | The Borrelia burgdorferi 37-kilodalton immunoblot band (P37) used in serodiagnosis of early Lyme disease is the flaA gene product | |
Heikkilä et al. | Recombinant BBK32 protein in serodiagnosis of early and late Lyme borreliosis | |
Bannantine et al. | Monoclonal antibodies bind a SNP-sensitive epitope that is present uniquely in Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis | |
Joyce et al. | Differential gene expression from two transcriptional units in the cag pathogenicity island of Helicobacter pylori | |
Psaroulaki et al. | In the search of potential serodiagnostic proteins to discriminate between acute and chronic Q fever in humans. Some promising outcomes | |
US10288610B2 (en) | Vitro assays for detecting Salmonella enterica serotype typhi | |
Sorenson et al. | Improved diagnosis of melioidosis using a 2-dimensional immunoarray |