EA028228B1 - Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение - Google Patents

Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение Download PDF

Info

Publication number
EA028228B1
EA028228B1 EA201491117A EA201491117A EA028228B1 EA 028228 B1 EA028228 B1 EA 028228B1 EA 201491117 A EA201491117 A EA 201491117A EA 201491117 A EA201491117 A EA 201491117A EA 028228 B1 EA028228 B1 EA 028228B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
endopeptidase
sequence
enzyme composition
endopep
tht
Prior art date
Application number
EA201491117A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201491117A1 (ru
Inventor
Линда Кавалетти
Лючия Каррано
Моника Аббонди
Мара Брунати
Анна Таравелла
Original Assignee
Фондацьоне Иституто Инсубрико Ди Ричерка Пер Ла Вита
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Фондацьоне Иституто Инсубрико Ди Ричерка Пер Ла Вита filed Critical Фондацьоне Иституто Инсубрико Ди Ричерка Пер Ла Вита
Publication of EA201491117A1 publication Critical patent/EA201491117A1/ru
Publication of EA028228B1 publication Critical patent/EA028228B1/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46Hydrolases (3)
    • A61K38/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • A61K38/482Serine endopeptidases (3.4.21)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23JPROTEIN COMPOSITIONS FOR FOODSTUFFS; WORKING-UP PROTEINS FOR FOODSTUFFS; PHOSPHATIDE COMPOSITIONS FOR FOODSTUFFS
    • A23J3/00Working-up of proteins for foodstuffs
    • A23J3/30Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis
    • A23J3/32Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents
    • A23J3/34Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents using enzymes
    • A23J3/346Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents using enzymes of vegetable proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L2/00Non-alcoholic beverages; Dry compositions or concentrates therefor; Their preparation
    • A23L2/52Adding ingredients
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L33/00Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
    • A23L33/10Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46Hydrolases (3)
    • A61K38/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/52Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2002/00Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21026Prolyl oligopeptidase (3.4.21.26), i.e. proline-specific endopeptidase

Abstract

Изобретение относится к эндопептидазной композиции, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, выделенной эндопептидазе из семейства S8/S53, их применению для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, их применению для получения пищевых белковых гидролизатов при производстве пищевых добавок и для обработки жидких пищевых добавок; также изобретение относится к пищевой добавке, содержащей заявленную эндопептидазную композицию или эндопептидазу; выделенной нуклеиновой кислоте, кодирующей заявленную эндопептидазу; способам получения заявленной эндопептидазной композиции; способу разрушения глютеновых олигопептидов.

Description

Настоящее изобретение относится к новому семейству эндопептидаз, имеющих уникальные каталитические свойства, которые придают им способность разрушать крупные полипептиды, включая полипептиды, обогащенные пролином. Настоящее изобретение дополнительно относится к способам получения ферментной композиции, а также фармацевтической композиции и пищевой добавки, содержащей ферментную композицию, и ее применению при разрушении полипептидов.
Предшествующий уровень техники
Целиакия (СГО) представляет собой хроническое расстройство желудочно-кишечного тракта, при котором прием глютена, присутствующего в пищевых продуктах, изготовленных из пшеницы, ржи, ячменя и их разновидностей, полученных скрещиванием, приводит к повреждению слизистой оболочки тонкого кишечника посредством аутоиммунного механизма у генетически восприимчивых индивидуумов (Сгееи Р.Н.К., СеШег С. Секас Ойзеазе, N. Еид1. 1. Мей., 2007, 357, 1731-1743; Кадиойй М.Р. Секас ййзеазе: райкодеиезйз ой а тойе1 йттииодеиекс ййзеазе, й. Ски. 1иуез1.. 2007, 117, 41-9). Механизмы, посредством которых глютен индуцирует свои патогенные эффекты, были объяснены за последние годы. Вовлеченными являются как врожденные, так и адаптивные механизмы иммунности, и они отвечают за критическое повреждение слизистых.
Глютен состоит из глиадинов и глютенинов, нерастворимых в воде/солях фракций запасных белков, присутствующих в зерновых культурах. Глютеновый каркас создается при взаимодействии между двумя белками, когда муку и воду смешивают при получении теста.
При приеме внутрь глютен направляется на частичное расщепление посредством желудочнопанкреатических протеолитических ферментов и ферментов щеточной каймы, что приводит в результате к множеству пептидов различной длины (от нескольких до более чем 30 аминокислот), которые являются устойчивыми к дальнейшему расщеплению вследствие высокого содержания остатков пролина, поскольку многие протеазы неспособны расщеплять пептидные связи, расположенные по Ν- или С-концам пролина (Наизск Р., 8каи Ь., 8аикадо Ν.Α., Сгау С.М., Ккоз1а С. 1п1езкпа1 ййдезкуе гезйзйаисе ой йттииойотйиаий дкайш реркйез. Ат. 1. Ркузю1. СазкоиНезЕ Ьйуег Ркузю1., 2002, 283, 996-1003; 8каи Ь., Мо1Ьегд О., Раггой I., Наизск Р., Εί1ίζ Р., Сгау С.М., 8о11тй Ь.М., Ккоз1а С. 8йгисйига1 Ьазйз йог д1ийеи шйо1егаисе ш секас зргие, 8сйеисе, 2002, 297, 2275-2279). Недостаток пролин-специфических расщепляющих ферментов не представляет собой особенную ферментную недостаточность у субъектов с целиакией, как предполагали в прошлом, но является характерным свойством пищеварительного аппарата млекопитающих, который неразвит настолько, чтобы потреблять белки с таким высоким содержанием пролина в диете.
Непереваренные глютеновые пептиды могут проходить через эпителиальный барьер посредством механизмов, еще ясно не объясненных, хотя недавно предположили зонулин-опосредованное параклеточное прохождение и трансклеточный путь, через трансцитоз и ретротрансцитоз (Эгадо 8., Е1 Азтаг К., Όί Рйегго М., Сита С1етеШе М., Тпрайи А., 8ароие А., Ткакаг М., 1асоио С., Саггоссю А., Э'АдаЮ С, Νθ1 Т., 2атрйий Ь., Са1азз1 С, Разаио А. Скайш, ζоии1^и аий дий регтеаЬйку: ЕГГес1з ои секас аий иои-секас шйезкиа1 тисоза аий ш!езкиа1 се11 киез, 8саий. й. Сазйгоеийего1., 2006, 41, 408-19; 8скитаии М., Кйскйег Й.Р., Аейе11 I., Мооз V., 2йттегтаии-Когйтаии М., 8скиеййег Т., Оаит 8., 2е1к М., Рготт М., §скикке Й.Э. Мескашзтз ой ерккекай йгаиз1осакои ой 1ке а1рка(2)-дкайш-33тег ш соекас зргие Сий, 2008, 57, 747754; Майузйак-Вийийк Т., Моига 1.С., Агсоз-Ра.)агйо М., ЬеЬгейои С, Меиагй 8., Саийа1к С., Веи-Ккакйа К., Эндауе С., Тато^а Н., уаи №е1 С., Воикийк Υ., Ьатащие Ό., Скаиззайе 8., Майатий С., СеШег С., СейВеизиззаи Ν., Моийейго К.С., Неутаи М. 8есгейогу 1дА теййайез гейгокаизсуйозйз ой иНас! дкайш реркйез уйа йке йгаизйети гесерйог ш секас ййзеазе й. Ехр. Мей., 2008, 205, 143-154).
При поступлении в 1атйиа ргоргйа (ЬМ), деамидирование глутамина до остатков глутамата посредством тканевой трансглутаминазы (ЙТС, аутоантиген при СО) усиливает их предоставление в ΌΟ2 или ΌΟ8 СГО4+ Т-клетки (Мо1Ьегд О., МсАйат 8., Ьиийш К.Е., Кгйзкаизеи С., Агепк-Напзеп РЬ, Кек К., 8о1кй Ь.М. Т се11з йгот секас ййзеазе 1езйоиз гесодгШе дкайш еркорез йеатййайей ш зки Ьу еийодеиоиз кззие каиздШйатйиазе, Еиг. й. 1ттиио1., 2001, 31, 1317-23), продуцируя провоспалительный ответ с интерфероном-гамма (ΙΡΝ-γ) в качестве основного цитокинового рецептора. Было также показано, что некоторые глютеновые пептиды вызывают повреждение слизистой независимо от специфического распознавания С.ГО4+ Т-лимфоцитами, но индуцируя врожденный иммунный ответ посредством восходящей регуляции экспрессии 1Ь-15, цикло-оксигеназы-2 и активационных маркеров С.ГО25 и С.ГО83 в ЬМ моноядерных клетках: среди них, наилучшим образом охарактеризованы пептиды р31-43/49 а1-глиадинов (РС^^^РРРР^^РΥ/Р^Р^РР) (Сйссосюрро К., Όί 8аЬайшо А., Сон^а С.К. Тке йттиие гесодшкои ой д1ийеи ш соекас ййзеазе, Ски. Ехр. 1ттиио1., 2005, 140, 408-16).
СО оценивают как поражающую приблизительно 1% населения как Европы, так и Северной Америки, причем исследования в Финляндии показывает возрастающую заболеваюмость (1:47) у пожилых людей (УПрри1а А., Каикшеи К., Ьиозйагйиеи Ь., Кгеке1а I., Райпкашеи РЬ, Vа1νе К., Макй М., Со11ш Р. 1исгеазшд ргеуа1еисе аий кйдк шсййеисе ой секас ййзеазе ш е1йег1у реор1е: а рори1акои-Ьазей зйийу ВМС Сазкоеийегок, 2009, 29, 9-49). Однако многие исследования указывают на то, что СО распространена по все- 1 028228 му миру с подобными значениями преобладания (Вагаба К., ВИаг А., Мокабет М.А., На8На8Н !С.. Огееп Р. СеНас б18еа8е ίη М1бб1е Еа81егп апб ΝοΠίι АГпсап еоиШпез: а пей Ъигбеп? \Уог1б ί. Оа81гоеп1его1., 2010, 16. 1449-57; ЭаЩс В., §ап δ., Ва81игк В., Еп8ап А., Едтйа8 О., Вики1те/ А., Вап8 Ζ., Тигк18Й СеНас 81ибу Огоир Ргеуа1епее оГ сеНас б18еа8е ш НеаННу Тигк18Й 8сНоо1 сНббгеп, Ат. 1. Оа8йоеп1ето1., 2011,106, 15127; МакНапа О.К., Уегта А.К., АтагсНапб К., ВНаШадаг δ., Эа8 Р., Оо8\уапи А., ВНайа V., А1ш)а V., ЭаНа Оир1а δ., Апапб К. Ргеуа1епсе оГ сеНас б18еа8е ш Не пойНегп рай оГ 1пб1а: а соттипйу Ъа8еб 81ибу, 1. Оа81гоеп1его1. Нерайок, 2011, 26, 894-900; Уапу ХЦ., Ьщ №., Хи СГО., Ме1 Н., Оао Υ., Репд Н.М., Уиап Ь., Хи 1.1. СеНас б18еа8е ш сйббгеп \\ЙН б1аггНеа ш 4 с111е8 ш СЫпа, 1. Реб1а1г. Оа8йоеЫего1. ΝυΐΓ., 2011, 53, 368-70).
В настоящее время недоступны никакие терапии, и только определено восстановление после заболевания, длительная безглютеновая диета является необходимой для предотвращения не только специфичного для СО повреждения слизистой и последующих ассоциированных с мальабсорбцией растройств (таких как железо-дефицитная анемия или остеопороз), но также других аутоиммунных заболеваний, которые были ассоциированы с СО, таких как диабет типа I и аутоиммунный тиреоидит, или более тяжелых осложнений, таких как ассоциированные с энтеропатией Т-клеточные лимфомы.
Полное исключение глютена (обычно указывают пороговое значение безопасного приема глютена, равное 50 мг/день, хотя 10 мг/день считается более безопасным) поддерживает СО в состоянии ремиссии у всех, кроме небольшого процента пациентов (2-5%), которые страдают от ареактивной формы. Такая диета является, однако, значительно ограничивающей для пациентов, которые являются ограниченными в их общей деятельности и страдают от социальной изоляции. Применение глютена в качестве добавки в производстве пищи является широко распространенным и является основной причиной неумышленного приема глютена, что делает эту диету в действительности трудной для поддержания.
По этим причинам пациенты с СО активно поддержали бы любую альтернативу, позволяющую им принимать в составе их ежедневной диеты, по меньшей мере, минимальные количества глютена.
Применение экзогенных протеолитических ферментов для глютеновой детоксификации является одной из наиболее перспективных стратегий лечения СО. При различных путях применения может использоваться потенциал этих ферментов: обработка глютенсодержащей муки, перед или во время ферментации теста, таким образом, двигаясь по направлению получения новой пищи, а также сопутствующее потребление глютена и подходящих протеолитических ферментов, таким образом, используемых как пищевая добавка, аналогично применению лактазы при непереносимости лактозы. Обязательно, чтобы различные свойства ферментов отвечали различным требованиям.
Ферментативный подход для лечения СО основан на демонстрации §Нап е1 а1. (8с1епсе, 2002) способности микробиальных ферментов расщеплять глютеновые пептиды по специфичным остаткам и удалять токсичные/иммунотоксичные конкретные пептидные последовательности. В частности, они показали, что экзогенная пролил-специфичная эндопротеаза, полученная из НауоЪасЮпит тептдо8ерйсит (РМ-РЕР), оказалась в результате способствующей расщеплению глиадиновых пептидов. Добавление РЕР либо ш уйго в присутствии экстрактов мембраны щеточной каймы (ВВМ) или во время перфузии ш νί\Ό тонкого кишечника крысы вызывало быстрое разрушение иммунодоминантного 33-мерного пептида (33-мера) и потерю его способности стимулировать глиадин-специфичные Т-клетки (Наи8сН е1 а1, 2002).
Другие ферменты того же самого семейства (ЕС. 3.4.21.26) из других бактериальных штаммов (т.е. 8рйшдотопа8 сар8и1а1а и Мухососси8 хап1Ни8) были подвергнуты оценке с этой целью теми же авторами (8Нап Ь., Матй Т., 8оШб Ь.М., Огау О.М., КНо81а С. Сотрагайуе ЫосНетюа1 апа1у818 оГ 1Нгее Ьас1епа1 рго1у1 епборерйба8е8: НпрПсайогь Гог соеНас 8ргие ВюсНет. 1., 2004, 383, 311-318). В целом, эти исследования показали существенные различия между тремя ферментами по отношению к длине цепи и субстратной специфичности и подтвердили потенциал пероральной ферментной терапии, несмотря на возникшие соображения, касающиеся их возможной эффективности действия ш-уКо, вследствие ограничений по специфичности к субстратам, рН активности (оптимальная активность при почти нейтральном рН вместо кислотного рН, что необходимо для действия в желудке), длительного времени, необходимого для полного расщепления токсических пептидов и устойчивости к разрушению под действием пепсина. Затем была предложена комбинация из двух ферментов с желудочной активностью и комплементарной субстратной специфичностью (Оа88 1., Вебшпе М.Т., §1еде1 М., δ репсе г А., КНо81а С. СотЪшайоп еп/уте Легару Гог да81пс б1де811оп оГ б1е1ату дНПеп ш раПеп18 \\ЙН сеНас 8ргие Оа8йоеЫето1оду, 2007, 133, 472480): РЕР из δ. сар8и1а1а, ассоциированной с ЕР-В2, изоформы 2 глутамин-специфичной эндопротеазы В из Ногбеит уи1дате, цистеин-протеазы, полученной из пророщенных семян ячменя, которая активируется при кислотном рН и посредством пепсина (Вебшпе М.Т., δΐ^οр Р., Тапд Υ., δο11^б Ь.М., КНо81а С. Не1его1одои8 ехрте88юп, рипйсайоп, геГо1бшд, апб 8йисЫга1-Гипсйопа1 сНагасЮп/айоп оГ ЕР-В2, 8е1Г-асНуайпд Ъаг1еу су81еше епборго1еа8е СНеш. Вю1., 2006, 13, 637-47), было показано, что она являются потенциально более активным терапевтическим инструментом. В еще одном исследовании сообщается, что РЕР, полученная из А8ретдй1и8 шдет, проявляющая свою основную активность при кислотных условиях в желудке, может начинать разрушать глиадин перед достижением кишечного просвета (ЛерЫак Ό., δраеη^^Эеккшд Ь., Мйеа С., Мое81ег М., бе Ки А., Ваак-РаЪ1о К. уап Vее1еη Р., Ебеп8 Ь., Кошпд Р. ШдН1у еГй- 2 028228
С1сп1 д1и!еп бедтабайоп \νί11ι пс\у1у ШепШтеб рго1у1 еп4орто1еаве: ипрПсаОопв Гог сеПас Швеаве Ат. I. РЬувю1. Оав1гош1ев1. Ыуег РЬувю1., 2006, 291, 0621-9).
Эти открытия были представлены в нескольких патентных документах. В XVО 2003/068170 (ЕР 572127) авторы изобретения заявляют, что введение эффективной дозы глютеназы пациенту с целиакией или герпетиформным дерматитом снижает уровни токсичных глютеновых олигопептидов, посредством чего уменьшаются или снижаются повреждающие эффекты глютена. Дополнительное подтверждение этого подхода дается в νθ 2005/107786 (ЕР 1740197), где раскрыты фармацевтические готовые формы глютеназных ферментов для применения при лечении пациентов с целиакией или герпетиформным дерматитом.
νθ 2005/027953 (ЕР 16663298) описывает лечение новой пролил-специфичной эндопротеазы из АврегдШив шдет (ΑΝ-ΡΕΡ), которая в результате способствовала расщеплению токсичных глютеновых пептидов. νθ 2005/019251 предоставляет лейцинаминопептидазу (БАР) из двух различных видов грибков, ТпсНорНуЮп гиЬгит и АврегдШив Гит1да1ив в комбинации с дипептидилпептидазой IV (Брр1У). Эти ферменты оценивали на предмет расщепления 33-мера при нейтральных условиях рН, поскольку оптимальная активность ЬАР была оценена около 7,0 с интервалом активности между рН 6 и 8, таким образом предотвращая или ограничивая возможное разрушение глиадина в желудочном соке.
Также было показано, что трипептидилпептидазы из А. ГипидаШв могут разрушать белки при кислотном рН (КеюНатб и., Ьесйеппе В., АвГ А.К., 8(тей Р., Огои/тапп Е., 1оиввоп О., Мопоб М. 8е4о1|в1пв. пеи с1авв оГ весге1е4 ргоЮавев Ггот АврегдШив ГипидаШв νίΐΗ епборгоЮаве ог 1прерО4у1-рер1Шаве асйуйу а! атШс рНв Арр1. Епуиоп. М1сгоЬ., 2006, 72, 1739-48). В νθ 2011/077359 предоставлен набор, составленный из пролил-протеазы (АГи828) и по меньшей мере одной трипептидилпротеазы, принадлежащей к семейству седолизина для применения в качестве пищевой добавки, применимой также для лечения СБ.
Понятно, что терапевтическое значение фермента или ферментной композиции для лечения СБ имеет отношение к ферментам а) являющимся устойчивыми к разрушению под действием других желудочно-кишечных ферментов, Ь) являющимся эффективными в окружении, где продуцируются 33-мер и другие токсичные пептиды и с) проявляющим быструю и высокую протеолитическую активность по отношению к глютеновым пептидам. Эти ферменты должны быть активными при кислотном рН и должны обладать способностью принимать сложный состав глютена, затрудненный другими компонентами обычных пищевых продуктов в виде выпечки или обжаренных изделий.
Краткое содержание сущности изобретения
Заявители в настоящем изобретении идентифицировали новое семейство ферментов и предоставили фермент или композицию этого семейства ферментов, имеющие уникальные каталитические свойства.
Заявители идентифицировали АсйпоаНотитив вр. в качестве продуцента данного семейства ферментов. Эндопептидазы изобретения продуцируют посредством культивирования АсйпоаНотитив в соответствующей культуральной среде, например, содержащей сою. Штамм, исходно идентифицированный под кодом А8 заявителя, был выделен из почвы Италии и депонирован 24 июня 2011 г., в коллекции Б8М2,-Беи1всЬе 8атт1цпд уоп МШгоогдатвтеп ипб 2е11ки1(игеп ОтЬН, (пои Бе|Ьп1/-1пв111и1 βδΜΖБеШвсНе 8атт1ипд уоп МШгоогдатвтеп ипб Ζе11ки1ΐи^еη ОтЬН), 1пНоГГепв1агвве 7Ь, Б-38124 Вгаипвсйие1д, Оегтапу, по условиям Будапештского Договора. Штамму был присвоен учетный номер Б8М 24988.
Эндопептидазы настоящего изобретения обладают способностью гидролизовать некоторые глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и чье присутствие в просвете кишечника приводит в результате к токсическим эффектам. Ферментативная обработка может удалять такие пептиды и их токсические эффекты; она может разрушать глиадин и, таким образом, детоксифицировать глютен без какого-либо добавления РЕР. Пептидазы изобретения имеют активности в широком диапазоне рН и способны проявлять протеолитическую активность от рН 3 до 8. Такая активность будет определяться как глютеназная активность.
Эти глютеназные ферменты предоставляют способы для предотвращения симптомов глютенчувствительной целиакии и/или герпетиформного дерматита посредством снижения уровней токсичных глютеновых олигопептидов в пищевых продуктах, либо перед приемом или после приема пищи пациентом. Эти ферменты могут применяться вместе с другими протеолитическими ферментами, такими как протеазы и амнопротеазы, чтобы эффективно продуцировать белковые гидролизаты, применяемые для пищи, питья и медицинских препаратов.
Эти ферменты секретируются различными штаммами АсйпоПотитив посредством их культивирования в подходящих средах, и их активность может быть оценена с использованием как хромогенных субстратов, так и зимографического анализа.
Кроме того, ферменты изобретения могут продуцироваться в клетках-хозяевах посредством введения нуклеиновой кислоты, кодирующей эти ферменты, культивирования клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования и извлечения ферментов.
Настоящее изобретение касается ферментной композиции, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и пан- 3 028228 креатических ферментов, и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам, где ферментная композиция содержит по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 5.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая эндопептидазу, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичной ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, полученную из штамма Лсйпоа11отиги8.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, полученную из Лсйпоа11отиги8 8р. Ό8Μ24988.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая один или несколько других протеолитических ферментов, выбранных из пролил-эндопротеаз, х-пролилдипептидиламинопептидаз и пролил-аминопептидаз.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, функционально слитую с полипептидом с образованием химерного меченого белка.
Настоящее изобретение касается выделенной эндопептидазы из семейства 88/853, активной при рН 3-8, которая применяема ввышеуказанной композиции и выбранна из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная эндопептидаза из семейства 88/853, выбранная из:
а) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
- 4 028228
Ь) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции для получения пищевых белковых гидролизатов.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для получения пищевых белковых гидролизатов.
Настоящее изобретение касается фармацевтической композиции для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента вышеуказанной ферментную композицию или по меньшей мере одну вышеуказанной выделенную эндопептидазу из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является фармацевтическая композиция, выполненная в форме, подходящей для перорального введения.
Настоящее изобретение касается пищевой добавки, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента вышеуказанную ферментную композицию или по меньшей мере одну вышеуказанную выделенную эндопептидазу из семейства 88/853.
Настоящее изобретение касается выделенной нуклеиновой кислоты, кодирующая по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% любой из последовательностей 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8Еф ГО N0: 7 и 8.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает культивирование природного штамма Лс1тоа11отиги8, способного продуцировать по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу из семейства 88/853, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает: культивирование штамма ЛсйпоаНотигик, полученного с помощью стандартных способов введения мутаций и/или селекции из природного штамма ЛсйпоаПотигик, где культивируемый штамм ЛсйпоаПотишк сохраняет способность к продуцированию по меньшей мере одной вышеуказанной эндопептидазы из семейства 88/853, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает: введение в клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из группы:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически ак- 5 028228 тивный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕО ГО N0: 5, культивирование клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования по меньшей мере одной эндопептидазы, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где вместо штамма Асйпоа11отиги8 используют штамм, принадлежащий к роду Са1епиЙ8рога, 1<1сбопоЬас1сг или §1гер1отусе8, способный продуцировать по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где штамм ЛсйпоаПотигик представляет собой Лс1шоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из вышеуказанных полинуклеотидных последовательностей.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей 8Еф ГО N0: 7 и 8 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8Е0 ГО N0: 7 и 8.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где клетка-хозяин представляет собой микроорганизм, выбранный из родов ВасШи8, 81гер1отусе8, Ьас1оЪасй1и8, Ругососси8, Р8еиботопа8, Л8регдШи8 и вида Е8сйепсЫа сой.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где клетка-хозяин представляет собой Е8сйепсЫа сой ВЬ21(ОЕ3) 81аг.
Настоящее изобретение касается способа разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и присутствие которых во внутреннем просвете приводит к токсическим эффектам, где способ включает контактирование указанных глютеновых олигопептидов с вышеуказанной ферментной композицией или по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853.
Настоящее изобретение касается способа лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, где способ включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества вышеуказанной ферментной композиции или по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где ферментную композицию или выделенную эндопептидазу вводят в составе фармацевтической композиции, пищевой добавки, питья или напитка.
Настоящее изобретение касается применения при производстве пищевых добавок вышеуказанной ферментной композиции для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
Настоящее изобретение касается применения при производстве пищевых добавок по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
Вариантом настоящего изобретения является применение, где ферментная композиция или выделенная эндопептидаза находятся в иммобилизованной форме.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции для обработки жидких пищевых продуктов.
Настоящее изобретение касается применения по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для обработки жидких пищевых продуктов.
Описание чертежей
Фиг. 1: филогенетическое дерево, выведенное на основании последовательностей глютеназ изобретения и протеаз седолизина или кумамолизина.
Белковые последовательности были получены путем выравнивания с помощью программы СЬИ8ТАЬА, и максимальное дерево подобия с бутстреп-значениями было вычислено с использованием программного обеспечения МЕОЛ5. Эндопептидазы Лсйпоа11отиги8 8р. выделены жирным шрифтом. 8ебЕ использовали как внешнюю группу. Затем дерево визуализировали с помощью программного обеспечения МЕОЛ5. Бутстреп-значения, равные или большие чем 50%, указаны в точках ветвления. Масштабная метка указывает на число аминокислотных замен на сайт.
8ебЕ = седолизин Е из А. Гитща1и8 АГ293 (ЕАЬ86850); 8ебВ = седолизин В из А8регдй1и8 Гитща1и8 Αί293 (САЕ17674); ТРРа = трипептидилпептидаза А из А. огу/ае К1В40 (ВАС56232); 8ейЭ = седолизин Ό из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ17675); 8ебС = седолизин С из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ46473); 8ебА = седолизин А из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ51075); КитаА = Кумамолизин-А8 из Айсус1оЪасШи8 8еп±йеп818 (О8СВ88); КитаВ = Кумамолизин из ВасШи8 8р. ΜΝ-32 (О8РР56); седолизинА = седолизин из Р8еиботопа8 8р. 101 (Р42790); седолизин В = седолизин-В из Хаййотопа8 8р. Т-22 (060106); Эндопеп- являют- 6 028228 ся глютеназами изобретения. Учетные номера белковых последовательностей приведены в скобках.
Фиг. 2: профиль активности эндопеп-140 (>100 кДа) и эндопеп-40 (<100 кДа), измеренный на флуоресцентном субстрате Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РПе-АМС при разнообразных условиях рН.
Флуоресценцию измеряли через 2 ч при 37°С. Конкретные значения рН приведены на Х-оси, процентная доля относительной активности приведена на Υ-оси.
Фиг. 3: эндопептидазная активность эндопеп-140 (>100 кДа) и эндопеп-40 (<100 кДа), измеренная на флуоресцентном субстрате Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РПе-АМС при рН 3 и 5. Флуоресценцию измеряли при различных интервалах времени при 37°С. Значения времени инкубации приведены на Х-оси, условные единицы флуоресценции (гГи) приведены на Υ-оси.
Фиг. 4: 8% §Э§-РАСЕ с краской Кумасси голубым рекомбинантных глютеназ.
Экспрессию белка индуцировали 1РТС 0,2 мкМ при 22°С в течение ночи. §1 указывает на штамм Е.соП, трансформированный рЕТ28Ь-эндопеп-140; §3 указывает на штамм Е.соП, трансформированный рЕТ28Ь-эндопеп-40. Молекулярные массы используемого маркера указаны слева.
Слева: полоса 1 = маркер молеклярной массы; полоса 2 = §1 не индуцирован; полоса 3 = §1 индуцирован, 3 ч сбор; полоса 4 = §1 индуцирован, сбор в течение ночи (в.н.); полоса 5 = пробел; полоса 6 = §3 не индуцирован; полоса 7 = §3 индуцирован, 3 ч сбор; полоса 8 = §3 индуцирован, в.н. сбор.
Фиг. 5: разрушение 33-мерного глиадинового пептида под действием эндопеп-140.
Продукты реакции с течением времени разделяли посредством ВЭЖХ на обращенной фазе.
Фиг. 5А: МС профили, ионный счет ιη/ζ=300-2000; фиг. 5В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0, 30 мин, 2 ч. Только один сигнал, соответствующий интактному 33-мерному пептиду ([М-2Н]=1957) присутствовал при времени 0. Этот сигнал отчетливо снижался с течением времени. Несколько пиков появлялось через 30 мин инкубации, и их количество увеличивалось при времени 2 ч. Все наблюдаемые молекулярные ионы приведены в табл. 2. Размер наиболее характеристического пика выделен цифрой.
Фиг. 6: разрушение 33-мерного глиадинового пептида под действием эндопеп-140 в присутствии пепсина (1 мг/мл). Продукты реакции с течением времени разделяли посредством ВЭЖХ на обращенной фазе.
Фиг. 6А: МС профили, ионный счет т//=300-2000; фиг. 6В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0, 3 0 мин, 2ч. В то время как только один сигнал, соответствующий интактному 33-мерному пептиду ([М2Н]=1957) присутствовал при времени 0, несколько пиков появлялось чере 30 мин инкубации, и их количество возрастало при времени 2 ч. Все наблюдаемые молекулярные ионы приведены в табл. 3. Размер наиболее характеристических пиков выделен цифрой. Сигнал при ([М-Н]=1068) соответствует пептиду из девяти аминокислот, присутствующему в последовательности 33-мера. Сигнал 689,7 обусловлен пепсином.
Фиг. 7: ВЭЖХ-МС анализ. 33-мерный глиадиновый пептид инкубировали с пепсином.
Фиг. 7А: МС профили; фиг. 7В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0 и 2 ч. Почти никакого разрушения 33-мера не наблюдают.
Фиг. 8: протеолиз глиадина на §Э§-РАСЕ. окрашенного Кумасси голубым.
Расщепление глиадина под действием двух различных глютеназ в присутствии или в отсутствие пепсина. Глиадин инкубировали 2 ч при 37°С.
Слева: полоса 1 = маркер молекулярной массы; полоса 2 = глиадин; полоса 3 = глиадин + эндопеп40 (<100 кДа); полоса 4 = глиадин + эндопеп-40 (<100 кДа) + пепсин; полоса 5 = реакция 3, остановленная через 10 мин инкубации; полоса 6 = глиадин + эндопеп-140 (>100 кДа); полоса 7 = глиадин + эндопеп-140 (>100 кДа) + пепсин.
Краткое описание таблиц
Таблица 1. Предполагаемые белки, очищенные из секретома АсПпоа11отигив.
Таблица 2. Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера под действием эндопеп-140.
Таблица 3. Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера под действием эндопеп-40.
Подробное описание изобретения
Актиномицеты представляют собой нитевидные грам-положительные бактерии, в основном известные по их способности продуцировать вторичные биоактивные метаболиты. Актиномицеты использовались как источник гидролаз, хотя только несколько, конкретно, алкалифильные актиномицеты, были до сих пор исследованы на предмет их ферментативного потенциала (ЕиПо А., Мигака^а §., §1ιίιηίζιι Н., §ЫгаЫи Υ. РипйсаПоп аиП ргорегЛев оГ со11адепаве Ггот §)гер!отусев врешев 1. ВюсПет., 1987, 102, 163-70; §акига1 Υ., 1поие Н., ΝίβΠίί ^., ТакаПавЫ Т., Пио Υ., Υататоΐо М., ТакаПавЫ К. РипйсаПои аиП СПагас1етаНоп оГ Мфог Со11адепаве Ггот §йер1отусев рагуиЫв Вювск Вю1есПпо1. ВюсПет., 2009, 73, 21-28; МеП)а V.!, ТПитаг ЕТ., §шдП §.Р., РгоПисПоп оГ а1каЛпе рго!еаве Ггот ап а1каНрЫПс асПпотусе1е Вюгевоигсе ТесПпо1оду, 2006, 97, 1650-1654).
Более того, полная последовательность генома §1гер1отусев соеНсо1ог А3(2) позволила предсказать
- 7 028228 наличие 60 секретируемых предполагаемых протеаз и пептидаз среди 819 потенциальных секретируемых белков (Веибеу 8.И., СЕа1ет К.Р., Сегбеио-Таггада А.М., СЕа1бк О.Ь., ТЕоткои Ν.Κ., 1атек К.И., Натк И.Е., Циаб М.А., К1екег Н., Нагрег И., Ва1етаи А., Вго\уп 8., СЕаибга О., СЕеи С.\У.. СоШик М., Стоит А., Ргакег А., ОоЫе А., Н1ба1до 1., НогикЬу Т., НоуабЕ 8., Ниаид С.Н., К1екет Т., Ьатке Ь., МигрЕу Ь., Обует К., О'№П 8., КаЬЬшоубксЕ Е., Кфаибгеат М.А., КиШетГотб К., Кибет 8., 8еедег К., 8аиибегк И., 8Еатр 8., 8циагек К., 8циагек 8., Тау1ог К., ^атгеи Т., \У1е1/оггек А., \Уооб\уагб 1., Вагге11 В.О., РаткЫ11 1., Нор\уооб Э.Л. Сотр1е1е деиоте кециеисе оГ тобе1 асбиотусе1е 81гер1отусек соеПсо1ог А3(2) №1иге, 2002, 417, 141-7), придавая актиномицетам дополнительную ценность в качестве потенциального источника для новых гидролитических ферментов. Среди актиномицетов, ацидофильные штаммы предлагают более высокие шансы для продуцирования ферментов со свойствами, наиболее удовлетворяющими требованиям быть эффективными в СИ, а именно, активности при кислотных рН. Несколько новых родов ацидофильных актиномицетов (т.е. Са1еии11крота, Асбиокрюа, Кидоктоиокрота, 81гер1ас1б1рШ1ик) а также нитевидные бактерии с ацидофильными свойствами, принадлежащие к ранее неизвестной бактериальной линии (т.е. К1ебоиоЬас1ет) были описаны впервые за последние годы (Викб Е., Сауа1еШ Ь., МоишатбШ Р., 5>с1шташ1 Р., КоЕбе М., 8окю М., Иоиабю 8. Са1еиц11крота ас1б1рЫ1а деи. иоу., кр. иоу., иоуе1, тусебитГоттшд асбиотусе1е, аиб ргорока1 оГ Са1еиц11крогасеае Гат. иоу. 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1егю1., 2006, 56, 1741-1746; Сауа1еШ Ь., МоиаатбШ Р., Ватои1е К., ЗсЕцтаии Р., КоЕбе М., 8окю М., Иоиабю 8. №у 1теаде оГ Й1атеи1оик, кроге-Гогтшд, дгат-рокШуе Ьас1епа Ггот коб Арр1. Еиу. МгегоЬюк, 2006, 72, 43604369; Сауа1е1б Ь., МоиаатбШ Р., 8сЕитаии Р., КоЕбе М., Ватои1е К., Викб Е., 8окю М., Иоиабю 8. Асбиокрюа ас1б1рЕЛа деи. иоу., кр. иоу. аиб Асбиокрюа гоЬииае деи. иоу., кр. иоу.; ргорока1 Гог Асбиокрюасеае Гат. иоу. аиб Са1еиибкрогшае киЬогбо. иоу. ш огбег Асбиотусе1а1ек 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1егю1., 2006, 56, 1747-1753; Моис1атб1т Р., Сауа1еШ Ь., КаидЕеШ А., 8сЕитаии Р., КоЕбе М., Ватои1е К., 8окю М., Ме//е1аш А., Иоиабю 8. №уе1 тетЬегк оГ Гатбу Мютотоиокрогасеае, Кидоытоиокрота ас1б1рЫ1а деи. иоу., кр. иоу. аиб Кидоытоиокрота айтсаиа кр. иоу 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1етю1., 2009, 59, 2752-2758; К1т 8.В., Ьоикба1е 1., 8еоид С.М., ОообГе11оу М. 8бер1ас1б1рЫ1ик деи. иоу., асборЫПс асбиотусе1ек убб уа11 сЕето1уре I аиб етеибабои оГ Гатбу 8бер1отусе1асеае (ЛУаккиит и Нетти (1943)АЪ) етеиб. Кашеу е1 а1. 1997) Аи1оте уаи Ееетееибоек, 2003, 83, 107-116).
Асбиоаботитк, подобно многим другим актиномицетам, может расти в среде, содержащей белок в качестве единственного источника азота и углерода. Эта способность расти в белковой среде зависит от синергичного действия секретируемых эндо- и экзопротеаз, поскольку только аминокислоты и короткие пептиды могут ассимилироваться через мембранные переносчики. Штаммы Асбиоаботитик обладают оптимальным ростом при незначительно кислотных рН, таким образом, позволяя предположить, что протеолитические ферменты могут экспрессироваться при этом рН и могут иметь способность расщеплять сложные белки в кислотных условиях. Насколько известно заявителям ни в одном другом сообщении не описано продуцирование протеаз, действующих при кислотных рН, из актиномицетов.
Асбиоаботитик кр. И8М 24988 был выделен заявителями из итальянской почвы, хранился в коллекции штаммов заявителей, и депонирован 24 Июня, 2011 с И8М2, Иеи1ксЕе 8атт1иид уои М1кгоогдаи1ктеи ииб 2е11кибигеи ОтЬН, ^оГГеикбЭЬ, И-38124 ВгаииксЕуе1д, Оегтаиу (теперь Ее1Ьш7-1икб1и1 И8М2-Иеи1ксЕе 8атт1иид уои МШгоотдатктеи ииб 2е11кибигеи ОтЬН), по условиям Будапештского Договора. Штамму был присвоен инвентарный номер И8М 24988. Асбиоаботитик кр. И8М 24988 растет на разнообразных стандартных твердых средах (8Ыт1шд Е.В., ОоббеЬ И. МеШобк оГ сЕатайеб/абои оГ 8бер1отусек крешек 1и1. 1. 8ук1. Вас1етю1., 1966, 16, 313-340), подкисленных до рН 5,5 с помощью НС1. Через 15 дней инкубации при 28°С, субстратный мицелий является скрученным, имеет кремовый цвет, становящийся фиолетовым при старении, и на агаре 18Р2 не образуется воздушный мицелий. Цвет воздушного мицелия является белым при формировании на Н8А5 (Викб е1 а1., 2006). Обширный рост и продуцирование скрученного кремового/коричневого вегетативного мицелия наблюдали на агаре 18Р3 через 15 дней инкубации. Небольшое продуцирование коричневатых растворимых пигментов присутствовало через 20 дней инкубации. Штамм может расти при температуре между 21°С и 35°С, оптимальной температурой является 28°С на 18Р2 и Н8А5. Асбиоаботитик кр. И8М 24988 способен расти в присутствии №С1 до 2,5 % (мас./об.); при концентрации 1% (мас./об.) и выше, штамм не дифферецирует фиолетовый вегетативный мицелий, но только скрученный кремовый субстратный мицелий. Штамм, в чашках с агаром 18Р2, доведенный до желательных значений рН с помощью НС1 или №ОН, хорошо растет при рН между 4,0 и 7,0, с оптимальным рН 5,5. Обширный скрученный кремовый вегетативный мицелий наблюдают при росте на кислотном 18Р9 с добавлением глютена. Не продуцируются воздушный мицелий и растворимые пигменты.
Протеомное исследование секретируемых белков Асбиоаботитик подтверждает, что секретируются различные наборы протеаз, активных при нейтральных, основных или кислотных рН, и в частности, некоторые члены семейства пептидаз 88/853.
Глютеназы изобретения принадлежат к пептидазе МЕКОР8 88 [подсемейства 88 А (субтилизин) и семейству 88В (кексин)] и 853 (седолизин) (Каубидк Ν.Ό., Ваттеб А.1., Ва1етаи А. МЕКОР8: рерббаке ба1аЬаке №.ю1ею Ас1бк Кек., 2010, 38, И227-И233).
Глютен представляет собой белковый компонент пшеницы, ячменя, ржи и родственных видов, уни- 8 028228 кальный по своей способности обеспечивать эластичность и другие желательные характеристики тесту и многим другим пищевым продуктам. Глютеновые белки являются обогащенными остатками глутамина (35%) и пролина (15%), признак, который является особенно примечательным среди глютеновых эпитопов, которые распознаются специфическими для заболеваний Т-клетками. Главными токсическими компонентами глютена пшеницы являются глиадины, семейство пролин- и глутамин-обогащенных белков, которые содержат некоторые стимуляторные эпитопы для Т-клеток. Их частичное разрушение в желудочно-кишечном тракте под действием пепсина, трипсина, химотрипсина приводит к образованию нескольких токсических пептидов, из которых пептиды р31-49 и его производное р31-43 из фракции а1глиадина, и р56-88 (33-мер) из а2-фракции охарактеризованы лучше всего. 33-мер представляет собой пептидный фрагмент из 33 остатков, получаемый также посредством ίπ-νίίτο с имитацией физиологического желудочно-кишечного ферментативного расщепления (8Ьап с1 а1., 2002), аминокислотная последовательность которого представляет собой ТРТРРРРРРРТРУРРРРТРУРРРРЬРУРРРРРР (8ЕЦ ГО N0: 6). Он является сильнейшим иммуностимуляторным пептидом, поскольку он несет множество копий трех эпитопов, которые являются иммуногенными у пациентов с глютенчувствительной целиакией; он, таким образом, является ответственным за сильный иммунотоксический ответ (Οίαο 8.^., Вегдзепд Е., Мо1Ьегд О., Х1а 1., Р1ескеп81еш В., КЬоз1а С, 8ο11ίά М.Ь. АпЧдеп РгезейаЧоп ίο СеПас ЬевюпГОегщей Т Се11з оР 33-тег ОПайш Рерййе №1ига11у Рогтей Ьу Оа81го1п1е8Йпа1 ОщезПоп 1. 1ттипо1., 2004, 173, 17571762), и, следовательно, его применяют как модель для глютеновой детоксификации. 33-мерный пептид является превосходным субстратом для фермента трансглутаминазы 2 (ТО2), которая деамидирует глиадиновые пептиды в собственной пластинке слизистой оболочки, увеличивая его сродство к молекулам Ό02 или Ό08 антигена лейкоцитов человека (ИЬА), и, таким образом, усиливая опосредованный Тклетками слизистый иммунный ответ, приводящий к клиническим последствиям. Транспорт в кишечнике интактного 33-мера через слой энтероцитов может быть обусловлен сверхэкспрессией трансферринового рецептора в СИ и/или усиленной проницаемостью слизистой. В любом случае, пептиды могут избежать разрушения посредством кислотного эндосомально-лизосомального пути и могут достигать серозной границы неизмененными. Разрушение 33-мерного глиадиного пептида до пептидов, содержащих менее чем девять остатков, не приводит в результате к глютеновой токсичности.
Поскольку желудочно-кишечный тракт не обладает ферментативным оборудованием для эффективного расщепления глютен-производных пролин-обогащенных пептидов, вызывая у пациентов с глютенчувствительной целиакией аномальный иммунный кишечный ответ, применение перорально активных протеаз для разрушения токсичных глиадиновых пептидов перед тем, как они достигают слизистой оболочки, может рассматриваться в качестве альтернативного лечения по отношению к диете.
Заявители идентифицировали новое подсемейство белков, которое проявляет протеолитическую активность по отношению к пептидам, таким как пролин-обогащенные пептиды, при кислотном рН, который соответствует рН желудочного сока, и обнаружили, что эта ферментная композиция также обладает способностью разрушать 33-мерный глиадиновый пептид. На основе структурных свойств, полученных посредством биоинформатического анализа, заявители показали, что это новое подсемейство принадлежит к пептидазам 88/853 (субтилизин-кексин-седолизин) и может быть сгруппировано в новую подгруппу, отличную от уже известных седолизина или кумамолизина, которые принадлежат семейству 853 (фиг. 1).
Заявители разработали конкретную композицию из этих эндопептидаз. Данная композиция содержит по меньшей мере одну из эндопротеаз из семейства пептидаз 88/853 (субтилизин-кексин-седолизин), продуцируемую АсЧпоа11отигл8, которая расщепляет непроцессированные полипептиды и разрушает фрагмент глиадина, известный как устойчивый к действию протеазы. Итак, по меньшей мере одна эндопротеаза может применяться для лечения целиакии или любого заболевания процесса пищеварения, такого как мальабсорбция. Более того, поскольку фермент является устойчивым к пепсину, комбинация этих двух протеолитических активностей могла бы приводить в результате к более экстенсивному разрушению полипептидов и белков, таких как глиадин. Заявители обнаружили, что 33-мер разрушается до пептидов из шести аминокислот (табл. 2 и 3). Хотя ферменты изобретения являются активными по отдельности, добавление к ним одной или нескольких пептидаз, которые действуют на пролинобогащенные пептиды, таких как пролил-эндопротеазы и/или х-пролил-дипептидиламинопептидазы и/или пролил-аминопептидазы, может приводить в результате к более быстрому действию.
Белковое семейство 88/853 данного изобретения по отдельности или необязательно в комбинации с другими протеазами может быть применимым в пищевой промышленности, как, но не ограничиваясь лишь приведенными, для разрушения субстратов для горечи, обработки мяса, в мыловаренной промышленности или для разрушения прионов, вирусов и токсичных или контаминантных белков до коротких пептидов и/или свободных аминокислот.
Таким образом, настоящее изобретение предоставляет ферментную композицию, содержащую по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, активную при рН 3-8 (включительно), выбранную из группы, состоящей из:
а) эндопеп-140, содержащей 8Е0 ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный ал- 9 028228 лельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
b) эндопеп-40, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
c) эндопеп-120, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
й) эндопеп-60, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
е) эндопеп-41, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности.
Термин пептидаза(ы) изобретения, протеаза(ы) изобретения или эндопептидаза(ы) изобретения, как используют здесь, идентифицирует одну или несколько из эндопептидаз, определенных выше.
Настоящее изобретение также включает эндопептидазу, являющуюся производной любой одной из последовательностей, указанных выше, где любые из аминокислот могут отличаться от соответствующих остатков, показанных в 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, все еще поддерживающих ее биологическую активность и физиологические функции, или ее биологически активный фрагмент. Цель данного изобретения включает также любой вариант пептидазы, содержащий замены, делеции, модификации боковых цепей и/или включения по определенным положениям в пределах аминокислотной последовательности нативной аминокислотной последовательности, которая сохраняет биологическую активность и физиологическую функцию указанной нативной аминокислотной последовательности. Примеры замен являются хорошо известными квалифицированным специалистам в области техники и указаны, например, в \\'0 2011/077359.
В еще одном другом аспекте настоящее изобретение направлено на выделенные протеазы изобретения, и их биологически активные фрагменты (или их производные, части, аналоги или гомологи). Биологически активный фрагмент относится к областям протеаз изобретения, которые являются необходимыми для конкретных протеазных активностей.
В дополнительном варианте осуществления протеаза изобретения представляет собой протеазу, которая содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 50%, предпочтительно по меньшей мере 60%, более предпочтительно по меньшей мере 70%, даже более предпочтительно 80%, еще более предпочтительно 90% и наиболее предпочтительно 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, и сохраняет активность протеаз, содержащих 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
Термины идентичность и гомология, когда относятся к нуклеотидной или аминокислотной последовательности, применяются здесь взаимозаменяемо и относятся к степени, в которой две полинуклеотидные или полипептидные последовательности являются идентичными или гомологичными на основании принципа остаток-за-остатком на протяжении конкретной области сравнения. Выравнивание и процент идентичности или гомологии могут быть определены с использованием любого подходящего программного обеспечения, известного в области техники, например, программ, описанных в Сиггеи! РгоЮсоЕ ίη Мо1еси1аг Вю1о§у (Ли8иЬе1 Р.М. е! а1., Соттегаа11у АуайаЫе 8оП\уаге. Сштеп! РгоЮсоЕ ίη Мо1еси1аг Вю1о§у, 1987, 8ирр1етеп! 30, 8есйоп 7.7.18, ТаЬ1е 7.7.1). Предпочтительные программы включают программу ССС Рйеир, РА8ТА (Реагеоп К. апй Ыртап Ό. ί. Бпргоуей Тоо1§ £ог Вю1ощса1 8ециепсе Лпа1у515 Ргос. №Й., Асай. 8οΐ. И8А, 1988, 85, 2444-2448), и ВЬА8Т (А1Щс1ш1 8.Р., САП \., МШег \., Муегк Е.\., Ыртап Ό.Ι. Валс 1оса1 аПдптеШ кеагсй !оо1 1. Мо1. Вю1., 1990, 215, 403-410).
Изобретение также предоставляет протеазы изобретения, функционально слитые с еще одним другим полипептидом, которые специалисты в данной области называют химерными или мечеными белками. Полипептид может быть гибридизирован по №концу и/или С-концу протеазы изобретения. Различные меченые слитые белки могут быть получены специалистами в области техники и продуцированы стандартными методами рекомбинантных ДНК или общепринятыми методами, включая автоматизированные синтезаторы ДНК. Такие слитые белки могут облегчить очистку рекомбинантных протеаз изобретения или их экспрессию и секрецию в клетках-хозяевах. Эти методы являются хорошо известными квалифицированным специалистам в области техники.
Заявители показали, что крупные пептиды, такие как 33-мерный глиадиновый пептид могут разрушаться при кислотном рН эндопептидазами. Секретируемая эндопеп-140 действует посредством расщепления полипептидной цепи в нескольких местах, с генерированием различных малых пептидов из шести аминокислот (табл. 2, фиг. 5). Эта эндопептидаза демонстрирует предпочтения для участков, имеющих тирозин или лейцин или фенилаланин в положении Р1 и пролин в положении Р2 и Р1'. Увеличение количества эндопептидазы и/или времени инкубации приводит к полной деградации 33-мерного полипептида. В соответствии с обнаруживаемыми молекулярными массами, по-видимому, остатки глутамина
- 10 028228 превращаются в остатки глутаминовой кислоты, таким образом, позволяя предположить вовлечение амидотрансферазной активности. Эндопептидазы ферментной композиции изобретения могут функционировать в присутствии пепсина млекопитающих (табл. 2, фиг. 6).
Такие же анализы осуществляли с эндопеп-40, и полученные результаты, показанные в табл. 3, указывают, что эта глютеназа ведет себя аналогично.
Эндопеп-140 содержит структурный домен с высокой гомологией к другим эндопептидазам изобретения. Например, выравнивание ВЬА8Т дает идентичности = 223/370 (60%), положительные = 261/370 (71%) между эндопеп-140 и эндопеп-40 или идентичности = 227/431 (53%), положительные = 273/431 (63%) между эндопеп-140 и эндопеп-41. Подобные результаты получают посредством выравнивания ВЬА8Т между эндопеп-40 и эндопеп-41, с идентичностями = 230/419 (55%), положительные = 278/419 (66%). Положительными являются аминокислотные остатки, которые являются идентичными или очень похожими друг с другом по их физико-химическим признакам, как определяют с помощью матрицы ВЬ08ИМ62.
Эндопептидазы ферментной композиции изобретения могут продуцироваться посредством культивирования природного штамма Лс11поа11отиги5 или его мутанта, который способен продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, или клеток-хозяев, полученных методами рекомбинантных ДНК.
Термин рекомбинантная, когда его используют по отношению к клетке, указывает на то, что клетка реплицирует гетерологичную нуклеиновую кислоту или экспрессирует пептид или белок, кодируемый гетерологичной нуклеиновой кислотой. Гены, не обнаруженные в нативной (нерекомбинантной) форме клетки или обнаруженные в нативной форме клетки, где гены модифицируют и повторно внедряют в клетку искусственными средствами, могут содержаться в рекомбинантных клетках.
Квалифицированный специалист в области техники поймет, что эти клетки могут представлять собой одноклеточные или многоклеточные трансгенные организмы.
Изобретение также включает способы, основанные на культивировании клеток, которые содержат нуклеиновую кислоту, эндогенную для клетки, которая была модифицирована без удаления нуклеиновой кислоты из клетки; такие модификации включают модификации, полученные посредством замены гена, сайт-специфической мутации и родственных методов, например, посредством обработки мутагенными средствами или с помощью ионизирующих излучений.
Термин аллельный вариант обозначает любую из двух или нескольких альтернативных форм гена, занимающего тот же хромосомный локус. Аллельная вариация возникает естественным образом через мутацию, и может приводить в результате к фенотипическому полиморфизму внутри популяций. Генные мутации могут быть молчащими (без изменений в кодируемом полипептиде) или могут кодировать полипептиды, имеющие измененную аминокислотную последовательность. Термин аллельный вариант относится также к белку, кодируемому аллельным вариантом гена.
Таким образом, настоящее изобретение предоставляет способ получения ферментной композиции изобретения, который включает в себя:
A) культивирование природного штамма АсйпоаНотигик, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, и извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования; или
B) культивирование штамма АсйпоаНотигик, производного от природного штамма АсйпоаНотигик, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, посредством методов общепринятой мутации и/или селекции, который поддерживает способность к продуцированию по меньшей мере одной из определенных выше эндопептидазы(аз), и извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования; или
C) технологию рекомбинантных ДНК, включающую стадии:
1) введения в клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу класса 88/853 субтилизина-кексина-седолизина, выбранную из группы, состоящей из:
a) эндопеп-140, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
b) эндопеп-40, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
c) эндопеп-120, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
4) эндопеп-60, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
е) эндопеп-41, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% иден- 11 028228 тичности;
2) культивирование клеток стадии 1) в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования эндопептидазы(аз);
3) извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования.
Одна или несколько эндопептидаз изобретения могут продуцироваться при осуществлении одного способа, как определено выше. Когда единичные эндопептидазы продуцируются раздельно при осуществлении способа, определенного выше, данное изобретение включает необязательно стадию объединения двух или нескольких из полученных эндопептидаз для обеспечения ферментной композиции, содержащей смесь указанных эндопептидаз. Указанные эндопептидазы могут быть получены как выделенные эндопептидазы. Под термином выделенная эндопептидаза, как используют здесь, подразумевают очищенную форму эндопептидазы, которая не содержит, по существу, других белков или клеточного материала из клетки, из которой производят эндопептидазу.
Все термины, касающиеся ДНК/РНК нуклеиновой кислоты, также относящиеся к родственным технологиям манипуляции, применяемым здесь, являются хорошо известными экспертам в области техники молекулярной биологии, и пока эти термины используют во всем их широком и обычном значении, как изложено в МашаДк Т., РгНкск Е.Р., ЗатЬгоок 1. Мо1еси1аг с1ошпд: 1аЬога!огу тапиа1 Со1Д Зрппд НагЬог, ΝΥ, 1982 или АикиЬе1 Р.М. Сиггеп! РгоЮсок ίη Мо1еси1аг Вю1оду 1о1т \УПеу & Зопк, Ые№ Уогк, ΝΥ, 1993 или ЗатЬгоок е1 а1., Мо1еси1аг С1ошпд: а ЬаЬогаФгу Мапиа1 2'1 ЕД., Со1Д Зрппд НагЬог ЬаЬогаФгу Ргекк, Со1Д Зрппд НагЬог, ΝΥ, 1989.
Нуклеиновые кислоты, кодирующие эндопептидазы ферментной композиции изобретения, представляют собой дополнительную цель изобретения, которые включают нуклеиновые кислоты, чьи последовательности предоставлены здесь и определены как ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11 или их фрагменты. Изобретение также включает мутантные или вариантные нуклеиновые кислоты или часть этих нуклеиновых кислот. Соответственно, нуклеиновые кислоты данного изобретения включают полинуклеотидную последовательность, показанную в ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, или последовательность, имеющую по меньшей мере 50%, предпочтительно 60%, более предпочтительно по меньшей мере 70%, даже более предпочтительно 80%, еще более предпочтительно 90% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 95% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, и кодирующую аминокислотную последовательность, которая все еще поддерживает биологическую активность и физиологическую функцию указанной аминокислотной последовательности.
Последовательности, характеризуемые идентичностями на нуклеотидном уровне, обозначены в настоящем описании также как гомологичные последовательности нуклеиновой кислоты или их вариации. Гомологичные нуклеотидные последовательности кодируют эти последовательности, кодирующие изоформы протеаз изобретения. Изоформы могут экспрессироваться в том же самом организме в результате, например, альтернативного сплайсинга РНК. Альтернативно, изоформы могут кодироваться различными генами.
Гомологичные нуклеотидные последовательности также включают, но не ограничиваясь ими, природные аллельные вариации и мутации нуклеотидных последовательностей, представленных здесь выше. Гомологичные последовательности нуклеиновых кислот включают последовательности нуклеиновых кислот, которые кодируют консервативные аминокислотные замены в ЗЕО ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
В изобретении, гомологичные нуклеотидные последовательности могут включать нуклеотидные последовательности, кодирующие протеазу изобретения из других видов, принадлежащих АсДпоаНотигик, а также родов, отличных от АсДпоаНотигик, таких как, например Са1епи11крога, АсДпокрюа, КДеДопоЬас1ег. ЗйерФтусек, З1гер1ас1Д1рЫ1ик, Мюготопокрога, Кидоктопокрога.
Заявители определили посредством ВЬАЗТ-анализа, что геномы Са1епиПкрога, К1еДопоЬас1ег, З1герЮтусек содержат гены, которые кодируют белки, имеющие более чем 50% гомологию с соответствующей протеазой изобретения; например, предполагаемые белки с учетными номерами АСИ72534 и АСИ72320 из С’аЮпиПкрога ас|Д|рНДа имеют идентичности = 261/400 (65%), положительные = 295/400 (74%) с эндопеп-40 ЗЕО ГО N0: 2 и идентичности = 705/1342 (53%), положительные = 878/1342 (65%) с эндопеп-140 ЗЕО ГО N0: 1, соответственно, или предполагаемый белок с учетным номером ЕРН81837 из 1<1еДопоЬас1ег гасепиГег имеет идентичности = 244/402 (61%), положительные = 299/402 (74%) с эндопеп40 ЗЕО ГО N0: 2 или белковой последовательностью З1гер1отусек кр. Е14 с учетным номером ЕРР91270 также имеет идентичности = 230/371 (62%), положительные = 274/371 (74%) с эндопеп-40 ЗЕО ГО N0: 2. Гены, кодирующие гомологичные эндопептидазы, могут присутствовать в штаммах, принадлежащих родам филогенетически родственным, указанным выше, чьи геномные последовательности не являются доступными из общедоступных баз данных.
Биологически активный фрагмент эндопротеазы изобретения может быть получен посредством выделения фрагмента нуклеиновой кислоты с ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, который кодирует эндопротеазу с такой же биологической активностью, что и у эндопротеаз изобретения, экспрессируя кодируемую часть эндопротеазы (например, посредством рекомбинантной экспрессии ш уйго) и с оценкой активности кодируемого фрагмента эндопротеазы. Изобретение дополнительно охватывает молекулы нуклеиновой кислоты, которые отличаются от последовательностей нуклеиновой кислоты, показанных в
- 12 028228
8ЕЦ ΙΌ N0: 7, 8, 9, 10 или 11 вследствие вырождения генетического кода, и, таким образом, кодируют такие же протеазы, которые кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, показанными в 8ЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11.
Технологии манипуляции с генами и белковой экспрессии являются известными квалифицированным специалистам в области техники и могут быть также найдены в КпеДег Μ. Оепе ТтапкГет ηηά Ехртеккюп: А ЬаЬогаФгу Мапиа1 81оск1оп Рте88, ΚΥ, 1990.
Заявители указывают, используя термин биологическая активность или функциональная активность на природную или нормальную функцию протеаз изобретения, например, способность к разрушению других белков. Предсказывают, что аминокислотные остатки, которые являются консервативными среди протеаз изобретения, конкретно являются не подверженными изменению. Аминокислоты, для которых могут быть проведены консервативные замены, являются хорошо известными в области техники. Как признают все квалифицированные специалисты в области техники, каждый кодон в нуклеиновой кислоте (за исключением АИС, который обычно является только кодоном для метионина) может быть модифицирован с получением функционально идентичной молекулы посредством стандартных методов. Кроме того, индивидуальные замены, делеции или дополнения, которые изменяют, дополняют или проводят делецию единичной аминокислоты или небольшого процентного содержания аминокислот (обычно менее чем 5%, более типично менее чем 1%) в кодируемой последовательности, представляют собой консервативные мутации, где изменения приводят к замене аминокислоты на химически сходную аминокислоту.
Еще один другой аспект изобретения имеет отношение к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим протеазы изобретения, которые содержат изменения в аминокислотных остатках, которые не являются существенными для активности. Такие протеазы изобретения отличаются по аминокислотной последовательности от 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, все еще сохраняют биологическую активность. В одном варианте осуществления молекула выделенной нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую протеазу, где протеаза содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере приблизительно 50% идентичностью с аминокислотными последовательностями из 8ЕО ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
Термин выделенная нуклеиновая кислота или выделенная полинуклеотидная последовательность, как используют здесь, идентифицирует молекулу нуклеиновой кислоты, которая отделена от других молекул нуклеиновой кислоты, которые присутствуют в клетке, из которой происходит нуклеиновая кислота, и не содержит, по существу, другой клеточный материал или материал культуральной среды, когда указанную молекулу нуклеиновой кислоты получают из природных микроорганизмов, микроорганизма, производного от них, или микроорганизмов, полученных посредством рекомбинантных технологий.
Молекула выделенной нуклеиновой кислоты, кодирующая эндопротеазу изобретения, гомологичную белку с 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, может быть создана посредством введения одной или нескольких нуклеотидных замен, добавлений или делеций в последовательности нуклеиновой кислоты 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, таким образом, что одна или несколько аминокислотных замен, добавлений или делеций вводят в кодируемую протеазу. Мутации могут быть введены в 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, посредством стандартных методов, таких как сайт-направленный мутагенез, ПЦР-опосредованный мутагенез и перестановка в ДНК. Альтернативно, мутации могут вводиться статистически вдоль всей кодирующей последовательности протеазы изобретения или ее части, таким образом, как посредством насыщающего мутагенеза, и полученные в результате мутанты могут быть подвергнуты скринингу на биологическую активность протеазы изобретения для идентификации мутантов, которые сохраняют активность.
Ферментная композиция глютеназ в соответствии с настоящим изобретением может также применяться в иммобилизованной форме и использоваться, например, для обработки жидких пищевых продуктов. Ферментная композиция изобретения может также применяться в плодоперерабатывющей и пивоваренной промышленности для очистки и обеспечения функционирования оборудования. Например, обеспечивают протекание глютенсодержащего жидкого пищевого продукта вдоль матрицы, проницаемой для глютена, в которую погружена ферментная композиция изобретения. Глютен экстрагируют из пищевого продукта и расщепляют под действием ферментов. Ферментная композиция изобретения может также вносить вклад в доступную энергию пищи. Например, частично или полность непереваримаемый пролинсодержащий белок полностью или частично разрушается ферментной композицией изобретения, что приводит к доступности более переваримаемой пищи для человека или животного. Таким образом, скорость роста и/или отношение пищевой конверсии (т.е. масса перевариваемой пищи относительно прироста массы) человека или животного улучшаются.
Способы продуцирования эндопептидаз и их характеризация
Настоящее изобретение также относится к способам продуцирования ферментов настоящего изобретения, включающих культивирование (а) штамма, который находится в его форме дикого типа, или (Ь) форме, производимой из него посредством обычных технологий мутации, например, посредством обработки мутагенными средствами или с помощью ионизирующих излучений, или (с) клеток-хозяев,
- 13 028228 которые способны продуцировать полипептид изобретения, и извлечение указанного полипептид из конечной среды культивирования. В способах получения настоящего изобретения, среды для клеточного культивирования различным образом выбирают из сред, известных в области техники для получения белков в соответствии с культивированием штаммов дикого типа, штаммов, производимых из них, или рекомбинантных клеток-хозяев. Культивирование происходит в подходящей питательной среде, содержащей источники углерода и азота и неорганические соли, с использованием методик, известных в области техники. Подходящие среды являются доступными от промышленных поставщиков или могут быть получены в соответствии с опуликованными композициями (например, в каталогах Американской Коллекции Типовых Культур). Например, среды, содержащие сою, являются более адаптированными для обеспечения продуцирования ферментов изобретения микроорганизмами дикого типа.
Клетки могут культивироваться посредством культивирования во встряхиваемых колбах, мелкомасштабной или крупномасштабной ферментации (включая непрерывные, периодические, подпитываемые или твердофазные ферментации) в лабораторных или промышленных ферментаторах, осуществляемые в подходящей среде и при условиях, обеспечивающих экспрессию и/или выделение полипептида. Если полипептид секретируется в питательную среду, полипептид может быть извлечен непосредственно из среды. Если полипептид не секретируется, он может быть извлечен из клеточных лизатов. Продуцируются несколько протеолитических активностей, и культивирование прекращают, когда продуцирование эндопептидаз достигает максимума. После завершения культивирования, культуральную среду отфильтровывают для отделения микробных тел, и фильтрат обрабатывают обычным образом для сбора эндопептидаз посредством нескольких методик в комбинации, таких как ультрафильтрация, концентрирование при пониженном давлении, высаливание, осаждение органическим растворителем, диализ, гельфильтрация, адсорбционная хроматография, ионообменная хроматография, электрофокусирование и лиофилизация. Соответствующие методики должны выбираться с учетом желательных физических и химических свойств эндопептидаз.
Представительный пример продуцирования эндопептидаз данного изобретения посредством культивирования штамма Лс11поа11отиги5 дикого типа представлен в примере 1 здесь далее. Эндопептидаза(ы) изобретения могут быть очищены до желательной степени чистоты, которая может зависеть от предназначенного применения и от специфической активности эндопептидаз(ы).
Гетерологичная экспрессия в клетках-хозяевах
Для продуцирования эндопептидаз настоящего изобретения могут использоваться рекомбинантные клетки и микроорганизмы. Клетка-хозяин может представлять собой любую из клеток-хозяев, известных квалифицированным специалистам в области техники, включающих прокариотные клетки, эукариотные клетки, клетки млекопитающих, клетки насекомых, клетки грибков, дрожжевые клетки и/или растительные клетки. Выбор соответствующего хозяина находится в пределах квалификации специалистов в области техники.
Применимые микроорганизмы представляют собой бактериальные клетки, такие как грамположительные бактерии, включающие, но не ограничиваясь ими, клетки ВасШик (например, ВасШик киЬББк, ВасШик сегеик) или клетки 81гер1отусек или клетки молочнокислых бактерий или грамотрицательных бактерий, таких как Е.соП и РкеиБотопак. Предпочтительные продуцирующие клетки включают клетки из организмов, известных как в целом рассматриваемых как безопасные, таких как прокариоты Ьас&ЬасШик, Ругососсик, ВасШик, 81герЮтусек. и эукариоты АкретдШик. Более предпочтительные клетки включают клетки, которые уже применяют при получении пищевых продуктов, такие как Ьас&ЬасШик крр. и/или АкретдШик огу/ае.
Внеклеточное продуцирование ферментов может быть получено из микроорганизмов, таких как АкретдШик оту/ае, БасЮЬасШик саке1, К1цууетотусек 1асПк или 81герЮтусек БуШапк.
Введение вектора в бактериальную клетку-хозяина может, например, быть проведено посредством трансформации протопластов (например, СНапд 8., СоНеп 8.№ НщН Ггесщепсу 1тапк£оттаБоп оГ ВасШик киЬББк рго1ор1ак1к Ьу р1актШ ОНА Мо1. Сеп. Сепе!., 1979, 168, 111-115), с использованием компетентных клеток (например, ОиЬпаи Ό., ОауШоГГ-АЬе1коп К. Ра!е оГ (гапкГогпипд ΏΚΛ Го11о\уи1д ир!аке Ьу сотре1еп1 ВасШик киЫШк. I. РоттаБоп апБ рторетБек оГ Бопог-геар1еп1 сотр1ех Т Мо1. Вю1., 1971, 56, 209-221), электропорации (например, 8Б1дека№а, К., Оо\уег V. Т Е1есБоротаБои оГ еикатуо1ек апБ ргокагуо!ек: а депега1 арртоасБ Ю шБоБисБоп оГ тасгото1еси1ек иНо се11к Вю1есБшдиек, 1988, 6, 742-751) или конъюгации (например, КоеН1ег Т.М., ТБоте С. В. ВасШик киЬББк (пайо) р1акппБ рЬ820 теБ1а1ек БиегкреШек р1акпПБ йапкГег Т ВасГегю1., 1987, 169, 5771-5278).
Применимые многоклеточные организмы для применения в качестве клеток-хозяев представляют собой, например, растения, части растений, семена или растительные клетки.
Предпочтительные продуцирующие многоклеточные организмы представляют собой, например, трансгенные сельскохозяйственные культуры, такие как зерновые или овощи, такие как томат, которые содержат нуклеиновые кислоты, кодирующие протеазы изобретения.
Представительный пример продуцирования эндопептидаз данного изобретения в рекомбинантных клетках-хозяевах дан в примере 2 здесь далее.
- 14 028228
Фармацевтические композиции
Эндопептидазные средства настоящего изобретения могут вводиться по отдельности или включены в разнообразные готовые формы. Фармацевтическую композицию изобретения составляют так, чтобы она была совместимой со своим предназначенным путем введения, которым является предпочтительно пероральное введение. Например, поскольку секретируются несколько эндопептидаз ферментной композиции изобретения, неочищенный препарат, полученный из среды клеточной культуры АсйпоаНотитив или других применимых одноклеточных рекомбинантных микроорганизмов, таких как грамположительные бактерии включающие, но не ограничиваясь ими, клетки ВасШив, клетки §1тер1отусев, клетки молочнокислых бактерий, грамотрицательные бактерии, такие как Е.сой, может вводиться перорально. Молочнокислые бактерии включают, но не ограничиваясь ими, виды родов Ьас1ососсив, ЬасФЬасШив, ЬеисоповЮс, §1тер1ососсив, Ребюсоссив и ЕЩегососсив. Альтернативно, ферментная композиция изобретения может вводиться перорально после очистки.
Такие препаративные формы могут быть получены с соответствующими ингредиентами для генерации прпарата в жидкой форме, например, в форме раствора, эмульсии или в твердой форме, такой как таблетки, капсулы или полутвердой форме. Препаративная форма ферментной композиции может вводиться разнообразными путями, включающими пути, особенно подходящими для замешивания с продуктом питания. Ферментные компоненты могут быть активными перед приемом пищи или во время приема пищи, и могут обрабатываться, например, посредством подходящего инкапсулирования, для контроля временного режима активности.
Для получения соответствующей фармацевтической композиции эндопептидаз настоящего изобретения может применяться любой способ для стабилизации химического или биологического материала, известный в области техники, включая способы, основанные на облучении или температурной модуляции или их комбинаций.
Для лечения заболевания целиакии используемые фармацевтические композиции предпочтительно составляют так, чтобы высвобождать их активность в желудочный сок. Этот тип препаративных форм будет обеспечивать оптимальную активность в правильном месте, например, высвобождать эндопротеазы изобретения в желудке.
Альтернативно микроорганизм, такой как бактериальная или дрожжевая культура, способная продуцировать активные средства, может вводиться пациенту. Такая культура может быть примешана к пищевым препаратам или составлена, например, как энтеросолюбильная капсула.
Настоящее изобретение дополнительно предоставляет пищевую добавку, содержащую ферментную композицию настоящего изобретения. Термин пищевая добавка в контексте настоящего изобретения является взаимозаменимым с терминами добавка к пище, биологически активная добавка и питательная добавка.
Пищевая добавка изобретения может быть составлена, получена, поставлена и распределена, как описано в других документах предшествующего уровня, относящихся к области данного изобретения (\νϋ 2011/077359, XVО 2003/068170, XVО 2005107786), которые предоставляют способы лечения и/или предотвращения синдрома, ассоциированного с человеческим заболеванием, указанное заболевание является выбранным из группы, включающей целиакию, герпетиформный дерматит, плохое всасывание пищеварительного тракта, аллергическую реакцию, ферментную недостаточность, грибковую инфекцию, болезнь Крона, микозы и синдром мальабсорбции.
В качестве примера, пищевая добавка изобретения может представлять собой гранулированный ферментный продукт с оболочкой или без оболочки, который может легко быть смешан с пищевыми компонентами, альтернативно, пищевые добавки изобретения могут образовывать компонент премикса.
Альтернативно, пищевые добавки изобретения могут представлять собой жидкость, водную взвесь или взвесь на масляной основе. Ферментная композиция изобретения может доставляться посредством экспрессирования ферментов непосредственно в трансгенных продовольственных культурах (как, например, трансгенных растениях, семенах и т.п.), таких как зерновые культуры, хлебных злаках, кукурузе, сое, рапсовых семенах, люпине.
Фармацевтическая композиция или пищевая добавка изобретения могут быть предоставлены перед питанием, непосредственно перед питанием, вместе с питанием или непосредственно после питания, таким образом, чтобы эндопротеазы ферментной композиции данного изобретения высвобождались или активировались в верхнем желудочно-кишечном просвете, где эндопротеазы могли бы служить дополнением к желудочным и панкреатическим ферментам для детоксификации усваиваемого глютена и предотвращать прохождение вредных пептидов через слой энтероцитов.
Ферментная композиция данного изобретения имеет многочисленные применения в пищевой промышленности, в особенности, они могут применяться при производстве пищевых добавок, как описано в приведенных выше документах предшествующего уровня техники.
Исходя из данного описания, в результате становится очевидным, что дополнительная цель данного изобретения состоит в предоставлении способа для разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и чье присутствие во внутреннем просвете приводит в результате к токсическим эффектам, который включает
- 15 028228 контактирование указанных глютеновых олигопептидов с ферментной композицией или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазой данного изобретения.
Конкретно, один аспект указанного способа состоит в лечении или предотвращении глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, который включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества ферментной композиции или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы данного изобретения, предпочтительно, включенной в фармацевтическую композицию, пищевую добавку, питье или напиток.
Примеры
Пример 1. Идентификация и характеризация эндопептидаз Асйиоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988.
1.1. Культивирование штамма и получение белка.
Штамм Асйиоа11отиги8, используемый в соответствии с данным изобретением, происходит из коллекции штаммов заявителей.
Асйиоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988 поддерживали на среде 18Р2 с агаром (ЗЫгйпд апб СоййеЪ, 1966), подкисленной до рН 5,5 с помощью НС1. Микробное содержимое одной чашки соскребали и засевали в одну колбу Эрленмейера объемом 50 мл, содержащую 15 мл среды АР5, которая состояла из: (г/л) декстрозы 20, дрожжевого экстракта 2, соевой муки 8, ЫаС1 1 и ΜΕ8 10. Среду готовили в дистиллированной воде и рН доводили до 5,5 перед стерилизацией при 121°С в течение 20 мин. Инокулированную колбу оставляли для выращивания при 28°С, на ротационном встряхивателе, работающим при 200 об/мин. Через 5-6 дней инкубации, 5% культуры засевали во вторую серию колб Эрленмейера с объемом 500 мл, содержащих 100 мл такой же среды для ферментации. Продуцирование белка осуществляли в колбах, инкубируемых в течение 15 дней при 28°С на ротационном встряхивателе, работающем при 200 об/мин. Продуцирование белка подвергали мониторингу посредством биоанализа, как описано ниже.
Продуцировались несколько протеолитических активностей и культивирование останавливали, когда продуцирование эндопептидаз, с последующими анализами, описанными ниже, достигало максимума. Ферментацию собирали через 15 дней и жидкую среду центрифугировали при 4000 об/мин в течение 15 мин. Культуральную среду отфильтровывали для отделения микробных тел и фильтрат обрабатывали. Соответствующие методики выбирали, принимая во внимание желательные физические и химические свойства эндопептидаз.
1.2. Определение протеолитических активностей.
Ферментные активности измеряли при различных рН в ацетатном буфере (ацетат аммония - АМАС, конечная концентрация 50 мМ, рН 4,0-8,0; уксусная кислота 20 мМ, рН 3,0) при 37°С в общем объеме 0,2 мл.
Ферментативную активность эндопептидазы определяли посредством измерения степени гидролиза Сукцинил-А1а-А1а-Рго-Рйе-АМС (Амино-Метил-Кумарин) в качестве субстрата (Васйет АС, Наир181га88е 144, 4416 ВиЪепбогГ, 8\\й/ег1апб).
Исходные растворы субстрата получали при концентрации 10 мМ и хранили при -20°С. Субстрат готовили из 10-20 мкл 60% раствора метанола, содержащего 2 мМ Сукцинил-А1а-А1а-Рго-Рйе-АМС и 50150 мкл раствора ацетатного буфера. Реакционная смесь содержала концентрацию 0,2 мМ субстрата, и ферментный препарат (между 10-40 мкл или 1,0 мкг на анализ) в 200 мкл ацетатного буфера при различных значениях рН.
К субстрату, который предварительно нагревали до 37°С в течение 10 мин, добавляли 10-40 мкл ферментного раствора, и реакцию осуществляли при 37°С в течение до 2 часов. Высвобождаемый АМС измеряли с помощью считывающего устройства для микропланшетов Ри8юи (Регкш Е1тег ПаПа 8рА, Моп/а, Пайа) при длине волны возбуждения, равной 360 нм, и длине волны эмиссии, равной 460 нм. В качестве контроля, субстрат инкубировали без фермента.
Ферментативную активность для высвобождения 1 ммоль АМС за 1 мин определяли как 1 единицу.
1.3. Очистка эндопептидаз.
Мицелий отделяли от культуральной среды посредством фильтрации на бумаге (Мпас1об1 от Са1Ъюсйет, И8А). Затем, 200 мл супернатанта центрифугировали в течение 10 мин при 5000 об/мин для удаления остатков клеток, далее супернатант дополнительно центрифугировали при 10000 об/мин в течение 20 мин при 4°С для удаления нерастворимой фракции. Белки осаждали из супернатанта этанолом (1:4 об./об.) или насыщением 20-75% сульфата аммония. Сгусток ресуспендировали и диализовали, при необходимости концентрировали с использованием Сепйгсоп Р1и8-70 с пределом пропускания 5 кДа (Мбйроге, ВебГогб, Ма88., И8А). Присутствие протеаз, способных гидролизовать Сукцинил-А1а-А1а-РгоРйе-АМС, проявлялось, когда тестирование проводили при рН 5. Аликвоты суспензии белка после диализа кипятили, чтобы подвергнуть анализу методом остронаправленной МС (шотган). Процедура кипячения является необходимой, чтобы избежать аутолиза. По меньшей мере, было обнаружено 5 белков, принадлежащих семейству протеаз 88/853.
Ресуспендированные белки хроматографировали на ионообменной смоле АтЪег1йе 1КА900 (А1Га Ае8аг СтЪН, КагПгийе, 76185 Сегтапу) или ΌΕ-52-целлюлозе (\УНа1тап 1и1ег. Ыб, Ма1б81опе Епд1апб) или другом матриксе; полученные фракции тестировали на предмет гидролиза Сукцинил-А1а-А1а-Рго- 16 028228
Рйе-ЛМС и выделенные активные фракции подвергали ГО-δΌδ-ΡΑΟΕ и зимографическому анализу.
Белки далее фракционировали посредством гель-фильтрации с пределами пропускания по молекулярной массе, равными 300, 100, 50, 30, 10 кДа (Ыаиокер Ра11, М1сЫ§аи. υδΑ, Υίναδρίη δαΠοπιΐδ ОтЬН 37070 Ооейтдеи, Оегтапу). Их активность тестировали, как описано. Получали активные фракции с различными молекулярными массами. Аликвоты этих фракций кипятили и анализировали посредством анализа остронаправленной МС.
Белки разделяли посредством электрофореза на гомогенном 10% или диск-геле 4-15% или полиакриламидном геле любого типа (Βίο-Раб. Негси1е8, 9640, СА, υδΑ) с последующим окрашиванием Кумасси Бриллиантовым голубым Р-250 (Βίο-Раб) или серебром (δΙΟΜΑ-ΑΜήΛ, υδΑ) или посредством окрашивания ферментной активностью (зимографии), проводимых посредством инкубации геля при 37°С 50-100 мкМ флуоресцентного субстрата Сукцинил-Л1а-Л1а-Рго-РНе-ЛМС при требуемых рН.
Две эндопептидазы, принадлежащие семейству δ8/δ53, очищали до тех пор, пока электрофоретический анализ не показывал присутствие одиночной полосы, обнаруживаемой как посредством окрашивания серебром, так и зимографией.
Первая эндопептидаза была получена после фильтрации по молекулярным массам: она удерживалась при пределе пропускания >100 кДа. Анализ методом остронаправленной МС соответствующей кипяченой аликвоты показал присутствие эндопеп-140, δΕΟ ΙΌ N0: 1 (табл. 1А), с молекулярной массой 142449,4 и теоретическим р1, равным 5,18; были обнаружены следы двух других белков. Эта белковая фракция проявляла активность в интервале рН от 4 до 8 с рН оптимумом, равным 5 (фиг. 2). При тестировании при рН 3 фермент проявлял 95% своей активности при рН 5 через 30 мин инкубации при 37°С (фиг. 3). Эта белковая фракция была в результате более эффективной при расщеплении 33-мера, чем при гидролизе Сукцинил-Α1а-Α1а-Ρ^ο-ΡЬе-ΑМС, как показано в примере 3.
Вторая глютеназа, указанная как эндопеп-40, δΕΟ ΙΌ N0: 2, содержалась в белковой фракции <100 кДа предела пропускания (табл. 1В) с молекулярной массой, равной 39908,4, и теоретическим р1 5,94. Этот белк проявлял активность в интервале рН от 4 до 6 с оптимальным рН, равным 5. При тестировании при рН 3 фермент проявлял 85% своей активности при рН 5 через 30 мин инкубации при 37°С (фиг. 3). Флуоресцентная полоса, высвечиваемая посредством зимографии, показала молекулярную массу, равную приблизительно 40 кДа. Либо активный белок, элюируемый из полосы геля, или концентрат с соответствующим пределом пропускания по молекулярной массе характеризовали на предмет ферментативной активности. Анализ методом остронаправленной МС показал присутствие других белков; сигналы, указывающие на присутствие последовательностей эндопеп-140, могут быть обусловлены присутствием более мелких полипептидов (<100 кДа), образованных при ее разрушении.
Другие три эндопептидазы (указанные как эндопеп-120, δΕΟ ΙΌ N0: 3, эндопеп-60, δΕΟ ΙΌ N0: 4, эндопеп-41, δΕΟ ΙΌ N0: 5) не были очищены до гомогенности. Их присутствие было обнаружено посредством остронаправленной МС в секретоме и в активных фракциях первых стадий очистки. Анализ методом остронаправленной МС, обеспечивший идентификацию их аминокислотной последовательности, изложен здесь. Заявители именовали белки в соответствии с их предполагаемой молекулярной массой. Итак, эндопеп-120 имеет молекулярную массу, равную 112012,8, и теоретический рI 6,75, эндопеп60 имеет молекулярную массу, равную 59646,0, и теоретический рI 6,02, эндопеп-41 имеет молекулярную массу, равную 41646,1, и теоретический рI 5,22.
1.4. МС анализ белка: эксперименты с остронаправленной МС.
В настоящее время протеомные методологии имеют первостепенную важность для исследований, направляемых обнаружением по биомаркерам или исследований по характеризации белка.
Классический протеомный подход основан на двухмерном гель-электрофорезе (2ΌΟ), при котором пятна белка, представляющие интерес, изолируют и идентифицируют посредством масс-спектрометрии (МС). 2И Ο-подход имеет относительно высокое разрешение, которое однако ограничено трудностью обнаружения некоторых классов белков. Эти ограничения включают мембранные белки вследствие их низкой растворимости в буфере для гель-электрофореза, белки либо с низкой (<10 кДа), либо высокой (>200 кДа) молекулярной массой, а также белки с крайней изоэлектрической точкой φΙ <4 или >9). Дополнительное ограничение этого подхода состоит в трудности анализа менее представленных белков и в том, что фактически он является трудоемким и времязатратным.
Эти проблемы решаются с использованием новой протеомной методологии, основанной на двухмерной капиллярной хроматографии, в сочетании с тандемной масс-спектрометрией (2ДХ-МС/МС), также называемой МибРН (Технология идентификации многомерного белка) (^акйЬигп, М.Р., ^о11ег8 И., Уа1е8 ЕР. 3гб Ьагде-8са1е апаРУ о£ уеа§1 рго!еоте Ьу тиШб1теп8юпа1 рго!ет 1беп0ПсаОоп 1есйпо1о§у №ιί. Вю1есЬпоЬ, 2001, 19, 242-7). Она включает генерацию пептидов в результате ферментативного расщепления сложной белковой смеси, их разделение посредством двух микро-ВЭЖХ колонок и непосредственный анализ элюируемых пиков посредством МС/МС. 2ДХ-МС/МС сочетает ионный обмен с обращенно-фазовым разделением пептидных смесей, получаемых в результате прямого расщепления общего (или префракционированного) белка. В частности, пептидные смеси первоначально разделяют посредством ионообменной хроматографии (колонка δСX, 5 мкм, 0,3 ВД х 150 мм) с использованием семи стадий увеличения концентрации хлорида аммония (от 0 до 1000 мМ). Результат каждой солевой
- 17 028228 стадии непосредственно загружают на колонку с обращенной фазой (С18, 0,180 ВД х 100 мм) и разделяют с использованием градиента ацетонитрила: элюент А, 0,1% муравьиной кислоты в воде; элюент В, 0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле. Пептиды, элюируемые из колонки С18, анализируют непосредственно на масс-спектрометре с ионной ловушкой; предел обнаружения составляет около 10 фмоль или менее. Спектры регистрируют в положительном режиме (обычно в интервале 400-1600 т/ζ), используя динамическую эксклюзию для МС/МС-анализа. Различные протеазы используют для обработки белкового экстракта из образцов (трипсин, пепсин или протеаза К).
Затем получают идентификацию соответствующих белков посредством автоматизированного поиска в базе данных с использованием соответствующего программного обепечения, такого как алгоритм 8ЕфИЕ8Т (Епд, ГК., МсКогтаск, А.Ь., Уа1е8, ГК. Ап Арргоасй 1о Согге1а1е Тапкет Ма88 8рес1га Эа1а оГ Рерйке8 тейй Аттоаак 8е4иепсе8 ш а Рго1еш Оа1аЪа8е, к Ат. 8ос. Ма88 8рес1гот., 1994, 5, 976-984) для обработки масс-спектров. Полученные экспериментальные масс-спектры коррелируют с пептидными последовательностями, полученными при сравнении с теоретическими масс-спектрами в базе данных белков, загруженной из NСВI (\у\у\у.псЫ.п1т.шй.доу) или других вебсайтов.
1.5. Критерии для идентификации белков.
Идентификации пептидов принимались, если они могли быть установлены с большей чем 90,0% вероятностью, как установлено алгоритмом Рерйке Ргорйе! (Ке11ег А., Nе8ν^ζй8кй А.Ь, Ко1кег Е., АеЪег8о1к К. Ешрйгса1 81аЙ8Йса1 токе1 Ю е8Йта1е ассигасу оГ рерйке 1кепййсайоп8 таке Ъу М8/М8 апк ка1аЬа8е 8еагсй Апа1. Сйет., 2002, 15, 5383-92). Идентификации белков принимались, если они могли быть установлены с большей чем 95,0% вероятностью и содержали по меньшей мере один идентифицированный пептид. Поскольку было обнаружено не более чем 50% идентичности с общедоступными базами данных белков, геном Асйпоа11отиги8 секвенировали и транслировали в 6 возможных рамок считывания. Последовательное выравнивание посредством ВЬА8Т обнаруженных пептидов против предполагаемых белков Асйпоа11отиги8 позволило идентифицировать известные гомологичные белки.
Всего 94 белка были предположительно идентифицированы в секретоме Асйпоа11отиги8. Ферменты составляли из них значительную фракцию, было обнаружено 17 протеолитических ферментов, и были также обнаружены гликозидазы, липазы, кислые фосфатазы и диэстеразы. Никакой функции не могло быть присвоено посредством ВЬА8Т-анализа для 25 последовательностей.
Среди протеаз смогли обнаружить пять белков, принадлежащих семейству пептидаз 88/853, два из которых находились среди наиболее представленных белков.
Такие же анализы осуществляли на всех последующих стадиях очистки, пока не обнаруживались только несколько последовательностей.
Данные, полученные посредством МС-анализа подвергнутых кипячению активных фракций, показали несколько белковых последовательностей, несмотря на то, что на окрашенном серебром геле 8Ό8РАОЕ присутствовала одиночная полоса. Как показано в табл. 1, эндопеп-140 (8Еф ГО N0: 1) и эндопеп40 (8ЕО ГО N0: 2) были обнаружены как белки, ответственные за две описанных активности. Присутствие эндопеп-140 в образце, идентифицированном как <100 кДа, возможно обусловлено частичным разрушением белка на более мелкие полипептиды.
Анализ щ 81Йсо указывал на то, что как эндопеп-140, так и эндопеп-40 представляют собой гликозилированные белки, содержащие сигнальный пептид, приводящий к секреции, позволяя предположить, что они могут продуцироваться как препроферменты.
Анализ ш 81Йсо позволил сгруппировать все пять эндопептидаз в семейство 88/853 и указывал на то, что все они представляют собой гликозилированные белки. Высокая гомология была обнаружена среди эндопеп-140, эндопеп-40 и эндопеп-41 (8Еф ГО N0: 5), позволяя осуществлять их кластерирование в подгруппу, как показано посредством филогенетического дерева фиг. 1. Последовательность сигнального пептида была обнаружена также для эндопеп-60 (8Еф ГО N0: 4), в то время как она отсутствовала в эндопеп-120 (8Еф ГО N0: 3) и эндопеп-41. Филогенетическое дерево, показанное на фиг. 1, выделяет новизну этих глютеназ 88/853, которые не образуют кластера ни с кумамолизином, ни с седолизином, ни с ферментами трипептидил-пептидазы (от 8екА до 8екО), раскрытыми в А0 2011/077359, которые принадлежат к семейству 853.
Новизна этих ферментов была дополнительно подтверждена субстратной специфичностью, как показано в примере 3. Схема разрушения 33-мера, полученная при обработке посредством эндопеп-140 или эндопеп-40, показала эндо-протеолитическую активность.
Пример 2. Продуцирование эндопептидаз в рекомбинантных клетках-хозяевах.
2.1. Штаммы и плазмиды.
В этом исследовании применяли Асйпоа11отиги8 8р. Э8М 24988. Все эксперименты с субклонированием плазмид осуществляли на Е.сой ЭН10В (1пуйгодеп, Саг18Ъак, СА), используя плазмиду рТ257К/Т (Регшейа8, ИАВ, Ьййиаша).
Е8сйепсЫа сой ВЬ21(ОЕ3) 81аг(№уадеп Пайа, Роке^апо, РС) использовали для продуцирования гетерологичных (рекомбинантных) пептидаз.
2.2. Продуцирование рекомбинантных протеаз.
Рекомбинантные протеазы Асйпоа11отиги8 продуцировали и очищали из Е8сйепс1йа сой ВЬ21
- 18 028228 (ЭЕ3) 81аг, используемой в качестве экспрессионной системы.
Для построения штаммов Е.соН, продуцирующих эндопеп-140 и эндопеп-40, нуклеотидные последовательности генов амплифицировали, используя следующие наборы праймеров:
Фэндопеп-140 5 ' '-АААААССГГСАОСТАСАООТОТООТСОО-З’ ЗЕО Ιϋ ΝΟ: 12
Рэндопеп-140 5 ' '-АААААААСАГАГ6ССССАТСТТСССАССС-3’ ЗЕО Ιϋ ΝΟ: 13
Фэндопеп-4 0 5 ' '-АААААССГГСАСААСССТССССТССС-З’ ЗЕО Ιϋ ΝΟ: 14
Рэндопеп-4 0 5 ' '-АААААААСАГАГСТСАССАССССТСАССС-З’ ЗЕО Ιϋ ΝΟ: 15
Продукты ПЦР клонировали в вектор ρΤΖ57Κ/Τ и секвенировали перед клонированием в экспрессионный вектор для подтверждения того, что во время амплификации ПЦР не было введено никакой мутации.
Затем эндопеп-гены клонировали в сайты №е1-НткШ плазмиды рЕТ28Ь (Хохадеп) и трансформировали в экспрессионного хозяина ВЬ21(рЕ3) 81аг.
Трансформированные клетки выращивали в культурах объемом 50 мл со средой ЬВ, содержащей 30 мкг/мл канамицина, при 37°С до достижения 0Ό600, равной 0,6-1. Экспрессию глютеназ индуцировали добавлением 0,2 мкМ изопропил β-ϋ-тиогалактозида (81дта), и культуры далее инкубировали при 22°С в течение ночи. Как показано на фиг. 4, получали белковые полосы, соответствующие требуемой молекулярной массе эндопеп-140 и эндопеп-40.
2.3. Очистка гетерологически продуцированных эндопептидазы(аз).
Клетки, экспрессирующие рекомбинантные эндопептидазы, центрифугировали при 5000 д в течение 20 мин. Сгусток ресуспендировали в 8 мл буферного раствора (20 мМ фосфата натрия, 500 мМ №С1, рН 7,8), затем добавляли 1 мг/мл лизоцима для полного лизиса клеток. Ηίδ-меченные белки очищали из неочищенных клеточных экстрактов посредством аффинной хроматографии с иммобилизованным №2+, используя систему для очистки №-ХТА Рипйсайоп 8уз1ет (1пуйгодеп) в соответствии с инструкциями производителя. Аликвоты по пять микролитров элюированных фракций мигрировали через 8О8-РАОЕ и окрашивались кумасси голубым или серебром для подтверждения присутствия и степени чистоты экспрессированных эндопептидаз. Фиг. 4 показывает уровни экспрессии, полученные для эндопеп-140 и эндопеп-40 после индукции в сравнении с неиндуцированным контрольным штаммом.
Ферментативную активность общих экстрактов, полученных из штаммов Е.соН, трансформированных пустым рЕТ28Ь и рЕТ28Ь-эндопеп-140 или рЕТ28Ь-эндопеп-40, соответственно, тестировали с Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РНе-АМС в качестве субстрата.
Ферментативная активность была обнаружена в экстрактах из штаммов рЕТ28Ь-эндопеп, в то время как отрицательный контроль не проявил никакой активности.
Пример 3. Биологическая активность эндопептидаз.
3.1. Разрушение 33-мерного токсичного пептида глиадина при кислотном рН.
Раствор 33-мерного иммунотоксичного пептида глиадина (50 мкМ) инкубировали при 37°С в течение времени до 2 часов в присутствии 4 мкЕд эндопеп-140 или 2 мкЕд эндопеп-40 в присутствии или отсутствии пепсина 1 мг/мл. Реакцию осуществляли в уксусной кислоте 20 мМ рН 3, при общем объеме 300 мкл. Мониторинг реакции проводили в различные моменты времени от 0 до 120 мин (10, 13, 115, 130, 160 и 1120 мин) при 37°С. Исчезновение 33-мерного пептида и появление продуктов разрушения регистрировали посредством ВЭЖХ-МС-анализа. Отбирали аликвоты по 50 мкл, и активность ферментов останавливали с помощью смеси 50 мкл Н20: СΗзСN 50:50 (+0,1% муравьиная кислота). Образцы подвергали ВЭЖХ-МС, анализировали на масс-спектрометре 1,Т()-Х1, (ТНегто ПзНег 8шепййс, 8ап 1озе, Сай&гша, И8А). Профили ВЭЖХ-МС, полученные для эндопеп-140, эндопеп-140 и пепсина, пепсина по отдельности, приведены на Фигурах 5, 6, 7, соответственно. Исчезновение 33-мерного пептида было очевидным после 2 ч инкубации. Все пептиды, обнаруженные после инкубации 33-мерного пептида с 4 мкл эндопеп140, или 2 мкл эндопеп-40, приведены в табл. 2 и 3, соответственно.
После 2 ч инкубации наблюдаемый наиболее интенсивный пик имеет статус заряда, равный 1, и соответствует [МН]+ 748,4, указывая на присутствие малых пептидов. Этот сигнал также появляется первым. На основании 33-мерной последовательности, четыре (1-6, 8-13, 15-20, 22-27) пептида соответствуют этой молекулярной массе, причем все составлены из 6 остатков. В соответствии с МС анализом расщепленного 33-мера, остатки глутаминовой кислоты вместо остатков глутамина присутствуют в гидролизованной пептидной последовательности, таким образом, позволяя предположить деамидирование субстрата. Анализ показал, что после 2 часов инкубации 33-мера с пепсином гидролиз почти не наблюдался (фиг. 7 и табл. 2 и 3) в соответствии с литературными данными.
Увеличение количества эндопеп-140 вплоть до 8 мкЕд или эндопеп-40 до 9 мкЕд приводило в результате к полному исчезновению 33-мера через 2 ч при рН 3 (не показано).
Даже в присутствии пепсина наблюдается такая же схема разрушения, несмотря на то, что количество интактного пептида через 2 ч является более высоким, чем в его отсутствие, позволяя предположить, что эндопептидазы не разрушаются под действием пепсина.
- 19 028228
3.2. Анализ ВЭЖХ/МС.
Анализ ВЭЖХ осуществляли, используя масс-спектрометр с ионной ловушкой. ЬТЦ-ХЬ или АПуаШаде, присоединенный к насосу Ассе1а или §игуеуог (ТПегтойвПег §с1епййс, §ап 1ове, СА, и§А) применяли при характеризации гидролизатов ферментного белка, полученных под действием ферментной смеси. Пептиды разделяли, используя колонку ТПегтойвПег §с1епййс НурегвП до1П или колонку симметрии С18 (Ща1егв, МйГогП, Мавв., и§А) в сочетании с градиентом 0,1% муравьиной кислоты в воде М1Ш О (МПИроге, ВеПГогП, Мавв., и§А) (Раствор А) и 0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле (раствор В) для элюирования. Градиент начинался при 95% раствора А и возрастал до 60% раствора В. Подробную информацию по индивидуальным пептидам, получали используя скан-зависимый МС/МС алгоритм, который является характеристическим алгоритмом для масс-спектрометра с ионной ловушкой. Анализ полного сканирования сопровождался анализом в увеличенном масштабе для определения состояния заряда наиболее интенсивного иона в диапазоне масс при полном сканировании. 33-мер (М=3910) применяли для настройки на оптимальную чувствительности в МС-режиме и на оптимальную фрагментацию в режиме МС/МС, осуществляя постоянную инфузию 60 мкг/мл, что приводило в основном к двухзарядным и трехзарядным типам ионов в режиме МС, и оптимальной энергии столкновения около 35% в режиме МС/МС.
Пример 4. Биологическая активность эндопептидаз.
4.1. Разрушение гидролизованной смеси глиадина и глютена.
Благодаря специфичному структурному признаку пролилолигопептидазы не могут расщеплять крупные пептиды, обычно длинее 30 аминокислот. Также, трипептидил-протеаза седолизин не может гидролизовать глиадин без добавления пролилпротеазы. Это ограничение является очевидным недостатком для фермента, значение которого состоит в том, чтобы гидролизовать настолько быстро и настолько эффективно, насколько возможно все потенциальные токсичные пролин-обогащенные пептиды.
Эндопеп-140 и эндопеп-40 из АсйпоаПотигив инкубировали с глиадинами, чтобы увидеть, способны ли эндопротеазы АсйпоаПотигив расщеплять цельные белки. Образованные продукты гидролиза анализировали посредством §0§-РЛСЕ.
Раствор глиадина получали растворением глиадинового порошка (§1дта С3375) в 70% этаноле при 70°С при концентрации 10 мг/мл (20 мкМ). Интактные молекулы глиадина состоят из смеси белков с 4055 кДа. Глиадин инкубировали при 37°С с 10 мкл (5 мкЕд) эндопротеаз АсйпоПотигив в уксусной кислоте 20 мМ рН 3 в конечном объеме 0,3 мл. Реакции осуществляли в ТПегтот1хег (ЕррепПогГ АС, НатЬигд, Сеггтапу) как в отсутствие, так и в присутствии пепсина при 1 мг/мл (фиг. 8). Мониторинг реакций проводили при различных интервалах времени, 30 мкл образцов отбирали из инкубационной смеси при значениях времени 0, 30 мин, 1 и 2 ч и выдерживали при 4°С до §И§-РАОЕ. Все материалы, используемые для §И§-РАСЕ и окрашивания, были приобретены от Вю-РаП (Вю-РаП ЬаЬогаФйев, 1пс., Негси1ев, СА, и§А). Образцы готовили, используя буфер для образцов, в соответствии с инструкциями изготовителя и разделяли на любом типе гелей В1в-Тйв, применяя буферную систему §Ό§ в соответствии с инструкциями изготовителя. Окрашивание осуществляли, используя Кумасси Р250 или серебро.
Как можно видеть на фиг. 8, глиадин расщепляется под действием эндопептидаз, производимых Асйпо11отигив, на небольшие пептиды до почти полного расщепления за 2 ч. Распад продукта можно видеть по снижению интенсивности полосы на §И§-геле. Этот эксперимент также показывает, что пепсин не оказывает воздействия на эффективность расщепления.
- 20 028228
Таблица 1
Предполагаемые белки, очищенные из секретома Асйпоа11отиги§
А
БелокЫ ВЬА8Т учетный номер ВЬА8Т аннотация ГСредняя примечания
8ец 48773 ΥΡ_003835151.1 Пептидаза 88/853 101,9 Эндопеп-140
5ец_100531 0Ь]1ВА132040.1 предполагаемая липаза 20,2
8ед_293141 н.р. н.р. 10,14
В
БелокЫ ВЬА8Т учетный номер ВЬА8Т аннотация ГСредняя примечания
8ец_44766 ΖΡ_06921971.1 секретируемый белок 40,14
8еч_72108 ¥Р_003114375.1 Пептидаза 88/853 30,25 Эндопеп-40
8ед_48773 ΥΡ_003835151.1 Пептидаза 88/853 20,15 Эндопеп-140
3ец_293141 н.р. н.р. 10,15
Очищенные фракции из Ас1тоа11отиги§ отфильтровывали с пределом пропускания молекулярной массы, равным 100 кДа, и подвергали анализу методом остронаправленной МС. Идентифицированные пептиды выравнивали против белков, полученных вследствие трансляции генома Ас1тоа11отига§ (Белок _1й: внутренний код для последовательности предполагаемого белка), и последовательный анализ ш §Шсо посредством ВЬА8Т свидетельствовал о гомологе известного белка (учетный номер ВЬА8Т: код последовательности; аннотация ВЬА8Т: название белка; н.р.: нет результата). Число совпадающих спектров давало полуколичественную меру оценки количеств белка, указанную как частота (Р_средняя). А: данные, полученные по фракции >100 кДа; В: данные, полученные по фракции <100 кДа.
- 21 028228
Таблица 2
Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера эндопеп-140
1 5 10 15 20 25 30
ь (Η ОР Р р ОР ОЬ Р Υ Р () Р () Ь Ρ Υ Р ()Ρ(ΗΡΥΡ()Ρ(3ΡΡ
Время инкубации Массовый сигнал Зарядный статус Выведенная пептидная последовательность Примечания
То 1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 100% остаточные
Т30 1088,73 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 50% остаточные
Тзо + пепсин 1088,73 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 70% остаточные
Т 1088,73 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 Наиболее интенсивный пик
1068,24 1 [МН]+ 16-24
845,27 1 [МН]+ 1-7 следы
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 20% остаточные
Т + пепсин 1088,8 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1068,24 1 [МН]+ 16-24
845,27 1 [МН]+ 1-7
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 45% остаточные
Контроль т 1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ 1-33 95% остаточные
Все молекулярные массы, обнаруживаемые посредством ВЭЖХ-МС после расщепления 33-мерного глиадинового пептида (50 мкМ) 4 мкЕд эндопеп-140 в присутствии и в отсутствие пепсина (1 мг/мл). Контроль получают посредством инкубации 33-мера с пепсином по отдельности. Инкубация при 37°С, уксусная кислота 20 мМ, рН 3.
- 22 028228
Таблица 3
Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера эндопеп-40
1 5 10 15 20 25 30
ь 0 ь Э р Р Р э Р О Ь Р γ р Э р Э ь р γ р Э р 0 ь р γ р Э р Э р р
Время инкубации Массовый сигнал Зарядный статус Выведенная пептидная последовательность примечания
То 1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 100% остаточные
Тзо 1197,45 1 [МН]+ 1-10
1088,73 1 [МН]+ 25-33
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 50% остаточные
Тзо + пепсин 1088,73 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 70% остаточные
Т 1088,73 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 20% остаточные
т + пепсин 1088,8 1 [МН]+ 25-33
1197,45 1 [МН]+ 1-10
748,45 1 [МН]+ 1-6; 8-13; 15-20; 22-27
1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 30% остаточные
Контроль Т 1306,27; 1956,64 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ 1-33 95% остаточные
Все молекулярные массы, обнаруживаемые посредством ВЭЖХ-МС после расщепления 33-мерного глиадинового пептида (50 мкМ) 2 мкЕд эндопеп-40 в присутствии и в отсутствие пепсина (1 мг/мл) при различных интервалах времени. Контроль получают посредством инкубации 33-мера с пепсином по отдельности. Инкубация при 37°С, уксусная кислота 20 мМ, рН 3.
- 23 028228
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> Ροπόαζίοηθ 1зЕ1ЕиЕо 1пзиЬг1со Ы КЪсегса рег 1а 71;а (Ρΐΐκν) <120> НОВЫЕ ПРОТЕАЗЫ ИЗ АКТИНОМИЦЕТА АсттыоАььомикиз, СПОСОБНЫЕ ГИДРОЛИЗО-
ВАТЬ ГЛЮТЕНОВЫЕ ПЕПТИДЫ И БЕЛКИ ПРИ КИСЛОТНОМ РН
<130> 072110
<160> 15
<170> РаЕепЕ1п иегз1оп 3.5
<210> <211> <212> <213> 1 1390 БЕЛОК АсЕ1поа11отигиз
<220> <221> <222> РКОРЕР (1)..(1390)
<400> 1
МеЕ 1 Рго Азр Ьеи Рго 5 ТЬг О1п Агд Агд Бег 10 Рго Агд Агд Бег Агд 15 Агд
Рго А1а Уа1 Ьеи А1а Агд Ьеи А1а О1у Ьеи Агд Уа1 О1у А1а Ьеи Уа1
20 25 30
Ьеи А1а Ьеи А1а Уа1 ТЬг ТЬг Ьеи ТЬг Ьеи 11е Бег МеЕ Рго Бег А1а
35 40 45
Азп А1а А1а Рго А1а Ьуз Рго Уа1 Уа1 Рго Н1з А1а Ьуз А1а Бег Бег
50 55 60
Рго ТЬг А1а О1п О1у О1п Н1з Рго ТЬг Бег Агд Уа1 Суз Агд ТЬг Рго
65 70 75 80
О1у Агд А1а Азп О1и МеЕ ТЬг Суз Ьеи А1а МеЕ Уа1 Агд Азр Азр Уа1
85 90 95
11е О1у Рго Ьуз О1у Уа1 О1п А1а Азп Азр А1а Рго А1а О1у РЬе О1у
100 105 110
Рго А1а Азр Ьеи Ьеи Азп А1а Туг Азп Ьеи Рго Бег А1а О1у Бег ТЬг
115 120 125
О1и ТЬг Уа1 А1а 11е Уа1 Азр А1а РЬе Азр Азп Рго Азп А1а О1и А1а
130 135 140
Азр Ьеи О1у Уа1 Туг Агд О1п О1п Туг О1у Ьеи Рго А1а Суз ТЬг ТЬг
145 150 155 160
- 24 028228
А1а Азп О1у Суз РЬе 165 Ьуз Ьуз 11е Азр О1п Агд 170 О1у О1у ТЬг Зег 175 Туг
Рго Рго Рго Азр А1а О1у Тгр А1а О1у О1и 11е А1а Ьеи Азр 11е Азр
180 185 190
МеЕ Уа1 Зег А1а 11е Суз Рго ТЬг Суз Ьуз 11е Ьеи Ьеи Уа1 О1и А1а
195 200 205
Азр Азр Азп Туг МеЕ Азр Азп Ьеи О1у ТЬг А1а Уа1 Азп О1п А1а Уа1
210 215 220
Зег С1п С1у А1а Ьуз РЬе Уа1 Зег Азп Зег Туг О1у О1у Зег О1и О1у
225 230 235 240
Зег Азр О1и О1у О1п А1а Азр Азр А1а Туг РЬе Н1з Н1з Азр О1у Уа1
245 250 255
А1а 11е ТЬг А1а Зег Зег О1у Азр Зег О1у Туг О1у А1а Зег Туг Рго
260 265 270
А1а А1а Зег Рго Туг Уа1 ТЬг Зег Уа1 О1у О1у ТЬг Зег Ьеи А1а Ьуз
275 280 285
Азр ТЬг Зег Зег Зег Агд О1у Тгр ТЬг О1и Зег ТЬг Тгр Азп О1у А1а
290 295 300
О1у Зег О1у Суз Зег А1а Туг О1и ТЬг Ьуз Рго Зег РЬе О1п Ьуз Азр
305 310 315 320
ТЬг С1у Суз А1а Агд Агд ТЬг 11е А1а Азр Уа1 Зег А1а Уа1 А1а Азр
325 330 335
Рго Азп ТЬг О1у Уа1 А1а Уа1 Туг Азп О1у О1у Тгр Н1з Уа1 Туг О1у
340 345 350
О1у ТЬг Зег Уа1 Зег А1а Рго 11е 11е А1а Зег Уа1 Туг А1а Ьеи О1у
355 360 365
О1у А1а Рго А1а А1а О1у Зег А1а Рго Азп Зег РЬе Рго Туг Азр Н1з
370 375 380
Рго А1а Азр Ьеи Азп Азр Уа1 ТЬг Зег О1у Зег Азп О1у Зег Суз Зег
385 390 395 400
Рго А1а Туг Ьеи Суз ТЬг А1а О1у ТЬг О1у Туг Азр О1у Рго ТЬг О1у
- 25 028228
405 410 415
Ьеи О1у ТЬг Рго 420 Азп О1у 11е А1а А1а 425 РЬе Агд Зег О1у Рго 430 Н1з А1а
Уа1 Уа1 ТЬг О1у ТЬг Уа1 ТЬг Азр О1у ТЬг А1а Рго Ьеи А1а Зег А1а
435 440 445
О1п Уа1 Ьуз А1а О1у Азр Уа1 ТЬг А1а ТЬг ТЬг Азр О1у О1п О1у Н1з
450 455 460
Туг ТЬг Ьеи Зег Уа1 Рго Рго О1у ТЬг Туг Азр Уа1 Зег А1а Зег Ьуз
465 470 475 480
РЬе О1у Туг ТЬг О1у Ьуз ТЬг 11е Зег О1у Уа1 О1п Уа1 А1а Азр О1у
485 490 495
О1п ТЬг Уа1 ТЬг О1и Азр РЬе А1а Ьеи ТЬг А1а Ьуз А1а Агд Уа1 Азр
500 505 510
ναι Зег О1у Ьеи Уа1 Агд Азр О1у Зег О1у Н1з О1у Тгр Рго Уа1 Туг
515 520 525
А1а ТЬг Уа1 Агд Уа1 Ьуз Азр О1п Рго ТЬг А1а Уа1 А1а Туг ТЬг Азр
530 535 540
Рго Ьуз ТЬг О1у Агд Туг ТЬг Ьеи Зег Ьеи Рго ТЬг Азр Азр ТЬг Туг
545 550 555 560
ТЬг Ьеи О1п Уа1 Азр Рго Ьеи Туг Рго О1у Туг ТЬг О1п Азр Зег Н1з
565 570 575
Азр Уа1 ТЬг Уа1 ТЬг Зег А1а Азр Уа1 Уа1 Н1з Азр Уа1 Азп Уа1 А1а
580 585 590
ναι Азр О1п ТЬг ТЬг Суз Зег А1а Рго О1у Туг Зег Туг Н1з Туг А1а
595 600 605
О1у А1а ТЬг О1п Рго РЬе Азр О1у ТЬг ТЬг А1а Рго А1а О1у Тгр ТЬг
610 615 620
ναι Азр Азр Ьуз Уа1 О1у Азп О1у О1п ТЬг Тгр Уа1 РЬе Азп Азр Рго
625 630 635 640
О1у Зег Агд О1у Азп Ьуз ТЬг О1у О1у ТЬг О1у О1у РЬе А1а Уа1 11е
645 650 655
- 26 028228
Азр Зег Азр Н1з 660 Туг О1у Зег О1у Азп ТЬг О1п Азр 665 Зег ТЬг 670 Ьеи РЬе
Зег Рго Уа1 ТЬг Азр РЬе Зег А1а Агд ТЬг Н1з Рго 11е Ьеи Зег РЬе
675 680 685
Агд Зег Азр Тгр Туг О1у Туг ТЬг О1у О1п А1а О1у Азр Ьеи Азр Ьеи
690 695 700
Зег Уа1 Азр О1у О1у ТЬг ТЬг Тгр ТЬг Азп Ьеи Ьуз Н1з Туг ТЬг А1а
705 710 715 720
Зег О1и Агд О1у Рго Агд ТЬг О1и ТЬг МеБ Азр Ьеи Зег А1а А1а А1а
725 730 735
О1у Ьуз Зег А1а Уа1 О1п Уа1 Агд РЬе Н1з РЬе ТЬг О1у Ьуз РЬе О1у
740 745 750
Туг Туг Тгр О1п Уа1 Азр Азр Уа1 РЬе Ьеи О1у Азр Агд ТЬг Суз Азр
755 760 765
Рго ТЬг Зег О1у О1у Ьеи Уа1 Уа1 О1у О1п Уа1 ТЬг Азр А1а Азп ТЬг
770 775 780
О1у А1а О1у Уа1 А1а О1у А1а ТЬг Уа1 ТЬг Зег Уа1 Азр Агд Рго А1а
785 790 795 800
О1и Ηΐ3 А1а ТЬг Зег А1а А1а ТЬг Рго Азр Азр Рго Азп Ьеи О1у Азр
805 810 815
О1у Ьеи РЬе Тгр МеБ РЬе Зег Зег Уа1 ТЬг О1у Зег Н1з Ьуз РЬе ТЬг
820 825 830
А1а ТЬг А1а О1у Азп Туг Азр Зег Н1з Азр Уа1 ТЬг Уа1 Азп Уа1 А1а
835 840 845
А1а Азп Тгр А1а ТЬг А1а А1а Азр 11е А1а Ьеи Зег А1а Рго Агд Ьеи
850 855 860
ТЬг Уа1 ТЬг Рго О1у А1а 11е Зег Ьуз ТЬг Уа1 О1у Тгр О1п Ьуз А1а
865 870 875 880
А1а ТЬг А1а А1а Ьеи ТЬг Ьеи Ьуз Азп ТЬг О1у ТЬг Зег Рго Уа1 ТЬг
885 890 895
А1а Ьуз 11е О1у О1и О1п Рго О1у О1у Зег ТЬг ТЬг А1а ТЬг А1а О1у
900 905 910
- 27 028228
А1а Рго Ьеи 915 О1п Агд Уа1 Ьуз О1у Азр 920 РЬе А1а Зег О1у Агд 925 Ьеи О1п
О1п О1у Ьуз А1а Зег О1у А1а Ьуз А1а О1у Уа1 ТЬг Рго Туг А1а Рго
930 935 940
Рго Тгр ТЬг А1а 11е А1а Азр Туг А1а Зег Рго 11е МеЬ Азр Азп О1у
945 950 955 960
А1а Уа1 А1а Ьеи Азп О1у Ьуз 11е Туг Зег Уа1 А1а О1у Уа1 Азр О1у
965 970 975
А1а Азп Уа1 Ьеи Азп Ьуз А1а Туг А1а Туг Азр Рго О1у ТЬг О1п А1а
980 985 990
Тгр ТЬг А1а 11е А1а Рго Ьеи А1а ТЬг О1у Агд О1и А1а Рго О1п А1а 995 1000 1005
ТЬг ТЬг ТЬг О1у О1у Ьуз Ьеи 1015 Туг Уа1 ТЬг О1у О1у 1020 Тгр О1у Зег
1010
ТЬг О1у А1а А1а Уа1 А1а Ьуз ТЬг О1и 11е РЬе Азр Рго Зег Зег
1025 1030 1035
О1у А1а Тгр Зег А1а О1у А1а Азр Азп Рго Ьуз Рго Туг А1а О1у
1040 1045 1050
Зег О1у А1а А1а Уа1 Ьеи Азр О1у Ьуз 11е Туг Уа1 Уа1 О1у О1у
1055 1060 1065
Суз Ьеи А1а ТЬг Суз О1у ТЬг Ьуз Азр Уа1 О1п Уа1 Туг Азр Рго
1070 1075 1080
А1а А1а Азп Зег Тгр Зег Зег О1у Рго А1а Туг Рго О1и Азп ТЬг
1085 1090 1095
А1а Тгр Ьеи О1у Суз А1а О1у 11е Азр О1у Ьуз Ьеи Туг Суз А1а
1100 1105 1110
О1у О1у Зег А1а А1а А1а Зег ТЬг Ьуз Н1з О1у Туг Уа1 Ьеи Азр
1115 1120 1125
Рго А1а Зег О1у ТЬг Тгр Зег Рго 11е А1а Азр Ьеи Рго 11е Азр
1130 1135 1140
Ьеи Тгр А1а МеЁ О1у Туг Зег А1а А1а Азп О1у Ьуз Ьеи 11е Уа1
1145 1150 1155
- 28 028228
Зег О1у 1160 О1у Уа1 ТЬг Азп О1у 1165 А1а Зег ТЬг Ьеи ТЬг 1170 Азп О1п О1у
РЬе А1а Туг Азр Рго Зег А1а Азп Зег Тгр ТЬг А1а Ьеи Рго Азп
1175 1180 1185
Зег Азп Азп А1а Ьеи Туг Агд О1у А1а Зег А1а Суз О1у РЬе Туг
1190 1195 1200
Ьуз 11е О1у О1у Зег Ьеи О1у О1п РЬе Азп А1а Уа1 Ьуз Зег О1у
1205 1210 1215
О1и Уа1 Ьеи Рго О1у Туг Азр О1п Суз А1а Зег ТЬг А1а Азр Уа1
1220 1225 1230
Рго Тгр Ьеи Зег О1и Азр Ьуз ТЬг О1и Уа1 ТЬг 11е О1п Рго О1у
1235 1240 1245
О1п Зег Уа1 Ьуз Уа1 Азп Уа1 ТЬг Ьеи Азр А1а Азп Уа1 Рго А1а
1250 1255 1260
11е ТЬг О1п Рго О1у ТЬг Туг ТЬг А1а О1п Ьеи ТЬг Уа1 О1у А1а
1265 1270 1275
Ьуз ТЬг Рго Туг А1а 11е Рго Рго Уа1 А1а Уа1 ТЬг МеЬ ТЬг Уа1
1280 1285 1290
Азп Рго Рго О1у ТЬг Тгр О1у Ьуз 11е ТЬг О1у ТЬг Ьеи ТЬг О1у
1295 1300 1305
А1а О1у Суз ТЬг О1у Зег Рго А1а Рго Ьеи ТЬг О1у А1а ТЬг Ьеи
1310 1315 1320
О1п 11е Азр Зег Тгр А1а А1а Зег Туг ТЬг Ьеи Ьуз ТЬг Азр Ьуз
1325 1330 1335
Азп О1у О1п Туг А1а Ьеи Тгр Ьеи Азр Уа1 Агд Азп Азп Рго Ьеи
1340 1345 1350
ТЬг Ьеи 11е А1а А1а Ьуз Азр О1у Тгр А1а Рго О1п ТЬг Агд Азп
1355 1360 1365
Уа1 Ьуз 11е ТЬг Ьуз Ьеи ТЬг Зег ТЬг ТЬг А1а Азр РЬе ТЬг Ьеи
1370 1375 1380
Ьуз Рго Азр Нгз ТЬг Суз Зег
- 29 028228
1385 1390
<210> 2
<211> 398
<212> БЕЛОК
<213> АсЁ1поа11отигиз зр.
<220>
<221> РКОРЕР <222> (1)..(398) <400> 2
МеЁ 1 Зег Агд Агд Уа1 5 ТЬг О1у ТЬг 11е Ьеи О1у О1у Ьеи 10 11е Ьеи 15 А1а
МеЁ Уа1 Рго РЬе Ьеи Зег ТЬг А1а А1а Азп А1а А1а Рго О1п А1а А1а
20 25 30
Рго А1а Зег Уа1 Зег Ηΐ3 Рго РЬе Н1з Н1з Зег Суз А1а ТЬг Уа1 Ьуз
35 40 45
Рго О1у Агд А1а Зег Суз Азп А1а Ьеи Уа1 Агд Зег Азр 11е А1а О1п
50 55 60
Зег А1а А1а ТЬг Ьеи А1а Ηΐ3 О1п А1а А1а А1а Рго Зег О1у Ьеи Зег
65 70 75 80
Рго А1а Азп Ьеи О1п Зег А1а Туг Ьуз Ьеи Рго Зег Зег ТЬг А1а О1у
85 90 95
Зег О1у О1п ТЬг Уа1 А1а 11е Уа1 Азр А1а Туг Азр А1а Рго ТЬг А1а
100 105 110
О1и А1а Азр Ьеи Азп Уа1 Туг Агд Зег О1п РЬе О1у Ьеи О1у А1а Суз
115 120 125
ТЬг ТЬг А1а Азп О1у Суз РЬе Ьуз Ьуз Уа1 Азр О1п Азп О1у О1у ТЬг
130 135 140
Зег Туг Рго Агд Ьуз Азр О1у О1у Тгр А1а О1п О1и 11е Зег Ьеи Азр
145 150 155 160
Ьеи Азр МеЁ Уа1 Зег А1а Уа1 Суз Рго Азп Суз Ьуз 11е Уа1 Ьеи Уа1
165 170 175
О1и А1а Ьуз ТЬг Азп Зег РЬе А1а Азп Ьеи О1у ТЬг А1а О1и Азп ТЬг
180 185 190
- 30 028228
А1а А1а Зег Ьеи А1а 195 Азп Уа1 11е 200 Зег Азп Зег Туг О1у 205 О1у Зег Азр
А1а Зег Азр А1а Зег Туг О1у Зег Туг Туг Азп Н1з Рго О1у Ьуз А1а
210 215 220
11е ТЬг Уа1 Зег Зег О1у Азр А1а О1у Туг О1у Уа1 О1и Туг Рго А1а
225 230 235 240
Зег Зег Ηΐ3 Туг Уа1 ТЬг А1а Уа1 О1у О1у ТЬг Зег Ьеи Агд ТЬг А1а
245 250 255
Зег ТЬг Зег Агд О1у Тгр Зег О1и ТЬг А1а Тгр Зег О1у А1а О1у Зег
260 265 270
О1у Суз Зег А1а Туг Азп ТЬг А1а Ьеи Зег О1у О1п Зег О1у Ьеи ТЬг
275 280 285
О1у Суз Зег Агд Агд А1а Уа1 А1а Азр Уа1 Зег А1а Уа1 А1а Азр Рго
290 295 300
А1а ТЬг О1у Уа1 А1а Уа1 Туг Азр Зег ТЬг А1а Туг О1п О1у О1п Зег
305 310 315 320
О1у Тгр МеЬ Уа1 РЬе О1у О1у ТЬг Зег Уа1 А1а А1а Рго 11е 11е О1у
325 330 335
О1у Уа1 Туг О1у Ьеи А1а А1а Азп А1а А1а Зег 11е Азр Азп Азп Туг
340 345 350
Рго Туг А1а Ηΐ3 ТЬг Зег Зег Ьеи РЬе Азр Уа1 ТЬг Зег О1у Зег Азп
355 360 365
О1у ТЬг Суз ТЬг ТЬг ТЬг Ьуз Тгр Суз ТЬг А1а О1у ТЬг О1у Тгр Азр
370 375 380
О1у Рго ТЬг О1у Ьеи О1у ТЬг Рго Азп О1у ТЬг О1у А1а РЬе
385 390 395 <210> 3 <211> 1094 <212> БЕЛОК <213> АсЬ1поа11отигиз <220>
<221> РКОРЕР
<222> (1). .(1094
<400> 3
- 31 028228
МеЁ 1 Зег А1а А1а Уа1 5 Уа1 11е РЬе А1а О1у А1а 10 Рго А1а ТЬг А1а 15 А1а
Рго ТЬг Рго О1и О1у Зег О1у Агд ΗΪ8 Тгр ТЬг А1а ТЬг Рго Ьеи Зег
20 25 30
О1у ТЬг Уа1 Уа1 О1п О1у РЬе Ьуз Зег ТЬг ТЬг О1у Агд Ьеи А1а Ьуз
35 40 45
Зег Азр А1а О1у Ьеи Ьеи Агд Ьеи Ьуз Зег Зег Ьуз Рго Уа1 Н1з Уа1
50 55 60
МеЁ Уа1 Ьуз Ьеи Азр Туг Азр Зег Ьеи А1а А1а Туг Агд О1у О1у 11е
65 70 75 80
Рго О1у Туг А1а А1а ТЬг Зег Рго А1а Уа1 ТЬг О1у Н1з ТЬг Ьеи Азр
85 90 95
Рго А1а Зег А1а О1у А1а Агд Агд Туг О1п О1у Туг 11е О1у О1у Уа1
100 105 110
О1и Азп Агд РЬе Агд А1а А1а Ьеи О1у Ьуз Агд Ьеи Рго О1у А1а Ьуз
115 120 125
А1а О1у О1у О1у Ьеи Агд ТЬг Уа1 Туг О1у О1у Ьеи А1а Уа1 ТЬг Ьеи
130 135 140
Рго О1у Азр Ьуз Уа1 А1а Азр Ьеи Ьеи Ьуз Ьеи Рго О1у Уа1 А1а А1а
145 150 155 160
Уа1 О1п О1и Азр А1а Уа1 А1а Ьуз Рго Ьеи ТЬг Азр Зег Зег Рго О1у
165 170 175
РЬе 11е О1у А1а Рго ТЬг 11е Туг Ьуз О1п Ьеи О1у О1у Зег Азр Зег
180 185 190
Зег О1у Ьуз О1у Уа1 11е Уа1 О1у Азр Ьеи Азр Зег О1у А1а Тгр Рго
195 200 205
О1и Ηΐ3 Рго Зег Туг Ьуз Азр Зег О1у Ьуз Ьеи Рго А1а Рго Рго Рго
210 215 220
ТЬг ТЬг Азр О1у А1а Рго Агд Рго Суз Азр РЬе О1у Азр Азп Рго Ьеи
225 230 235 240
ТЬг Рго А1а Азп Азр Рго Туг Уа1 Суз Азр Нтз Ьуз Ьеи 11е Зег О1у
245 250 255
- 32 028228
О1п Рго РЪе Ьеи Азр 260 ТЪг Туг Азп А1а 265 Уа1 Уа1 О1у О1у О1и 270 Агд РЪе
Рго Азр Зег А1а Агд Азр Зег Азр О1у Н1з О1у ТЪг Н1з ТЪг Зег ТЪг
275 280 285
ТЪг А1а А1а О1у Зег А1а Уа1 Зег Н1з А1а Азп Рго Ьеи О1у 11е Азр
290 295 300
Агд О1у А1а 11е Н1з О1у 11е А1а Рго А1а А1а Н1з 11е А1а Уа1 Туг
305 310 315 320
Ьуз Уа1 Суз О1у А1а О1п О1у Суз РЪе О1п Зег Азр Зег Уа1 А1а А1а
325 330 335
Уа1 О1п Агд А1а 11е Ьеи Азр Ьуз Уа1 Агд Уа1 11е Азп Туг Зег 11е
340 345 350
Зег О1у О1у Уа1 Азр Рго Туг Зег Азр Рго Уа1 О1и Ьеи А1а РЪе Ьеи
355 360 365
Азр А1а Туг А1а А1а О1у Уа1 Ьеи Уа1 Зег А1а Зег А1а О1у Азп Азр
370 375 380
О1у Рго ТЪг А1а О1у ТЪг Уа1 Азп Н1з Азп О1у Рго Тгр Уа1 ТЪг ТЪг
385 390 395 400
Уа1 А1а А1а Зег ТЪг О1п О1п Агд ТЪг РЪе О1п Зег ТЪг Уа1 ТЪг Ьеи
405 410 415
О1п А1а О1у О1у А1а Зег Ьеи Ьуз Ьеи А1а О1у Зег Зег 11е ТЪг Зег
420 425 430
О1у 11е ТЪг Зег Рго Ьеи Рго Уа1 Уа1 Ьеи А1а Зег А1а А1а Рго Туг
435 440 445
О1у Азр Рго Азр Суз Азр ТЪг О1п А1а А1а Рго О1у ТЪг РЪе ТЪг О1у
450 455 460
Ьуз 11е Уа1 А1а Суз Агд Ьеи Ьеи Азп Агд О1у Агд 11е МеЪ Ьуз О1у
465 470 475 480
Туг Азп Уа1 РЪе Ьуз О1у О1у А1а А1а О1у МеЪ Ьеи Ьеи Туг Азп Азр
485 490 495
ТЪг Ьеи Зег О1п ТЪг МеЪ ТЪг Азр Азп Нтз Тгр Ьеи Рго ТЪг Уа1 Нтз
- 33 028228
500 505 510
Ьеи О1и Ьуз Рго О1п А1а Азр А1а Ьеи Ьеи А1а РЬе Ьеи Бег О1у Н1з
515 520 525
ТЬг О1у ТЬг ТЬг А1а ТЬг РЬе Рго О1п О1у А1а Ьуз А1а Азп О1у О1п
530 535 540
О1у Азр Уа1 МеЕ ТЬг А1а РЬе Бег Бег Агд О1у Рго О1у О1у Азр РЬе
545 550 555 560
Ьеи Ьуз Рго Азр Уа1 ТЬг А1а Рго О1у Ьеи О1п 11е МеЕ О1у О1у О1п
565 570 575
ТЬг Рго Уа1 Рго Азр Азр Рго Бег Ьеи О1у Рго Рго О1у ТЬг Ьеи Туг
580 585 590
О1п Уа1 11е А1а О1у ТЬг Бег МеЕ Бег А1а Рго Н1з Уа1 ТЬг О1у А1а
595 600 605
А1а А1а Ьеи Ьеи РЬе А1а Ьеи Н1з Рго Бег Тгр ТЬг Рго О1у О1п Уа1
610 615 620
Ьуз Бег А1а Ьеи О1и ТЬг ТЬг О1у Ьуз ТЬг Бег Уа1 Уа1 Ьуз Н1з Азр
625 630 635 640
Агд Ьуз ТЬг Рго А1а Азр Рго РЬе Азр Ьеи О1у О1у О1у Агд 11е Азр
645 650 655
Ьеи ТЬг Ьуз А1а О1у Азр Рго О1у Ьеи ТЬг 11е Азр О1и ТЬг А1а А1а
660 665 670
Азп Туг А1а А1а Бег А1а ТЬг Азр Рго Ьеи Н1з Агд 11е Азр Ьеи Азп
675 680 685
να1 Рго Бег Уа1 Азп А1а Рго Уа1 МеЕ Рго О1у А1а 11е МеЕ ТЬг ТЬг
690 695 700
Агд ТЬг Уа1 Ьуз Азп Уа1 Бег О1у Ьуз ТЬг МеЕ ТЬг Туг О1у ТЬг Бег
705 710 715 720
О1у ТЬг ТЬг Уа1 Ьуз О1у А1а Бег 11е Бег Уа1 Бег Рго О1у ТЬг РЬе
725 730 735
ТЬг Уа1 Ьуз Рго О1у Ьуз ТЬг А1а Агд Ьеи Агд 11е ТЬг 11е А1а А1а
740 745 750
- 34 028228
Рго А1а Ьеи 755 А1а Азп О1у О1п Туг 760
Агд Азп 770 О1у О1у Ηΐ3 Азр Ьеи 775 Ηΐ3
О1п 785 О1у Уа1 Уа1 Зег Ьеи 790 Азп О1п
Ьеи Азп Зег О1у Агд 805 Зег ТЬг Суз
Ьеи А1а Азр ТЬг 820 Ьуз Уа1 11е А1а
Агд Ьеи ТЬг 835 А1а Уа1 ТЬг О1у А1а 840
Ьеи А1а 850 О1п А1а Азр Ьеи А1а 855 Агд
А1а 865 Рго О1у А1а ТЬг Рго 870 А1а О1у
11е Рго Рго ТЬг Рго 885 11е О1у Азр
Рго А1а РЬе ТЬг 900 РЬе А1а О1у Агд
Зег Азр О1у 915 Туг ТЬг Уа1 А1а О1у 920
А1а ТЬг 930 Рго О1п ТЬг Ьеи Рго 935 Азп
А1а 945 Рго РЬе Тгр ТЬг Азр 950 Ьеи Азр
А1а А1а Агд Ьеи ТЬг 965 Азр О1у ТЬг
Агд Ьеи Азп Уа1 980 РЬе О1у ТЬг Азп
11е О1у Уа1 995 Азп О1у А1а О1и Азр 1000
РЬе О1у Агд Уа1 Азр 765 Ьеи Агд О1п
Ьеи Рго Уа1 А1а 780 РЬе Уа1 Агд Ьуз
ТЬг Суз ТЬг 795 Рго Зег Уа1 11е А1а 800
Азр Уа1 810 Азр Уа1 О1и Азп ТЬг 815 Зег
А1а 825 Зег ΗΪ8 Ьеи Азр ТЬг 830 Агд Ьеи
ТЬг Ьуз Уа1 О1у А1а 845 ΗΪ8 Азр Уа1
Агд О1п Рго Азр 860 Ьуз Рго О1п 11е
Туг Ьеи Рго 875 Ьеи Азр А1а РЬе О1у 880
О1и О1п 890 Зег Ьеи Азп Ьеи ТЬг 895 ТЬг
ТЬг 905 Туг ТЬг Зег Ьеи О1у 910 Уа1 Уа1
О1у А1а ТЬг Рго Азр 925 Азр Уа1 А1а
Рго А1а Агд Рго 940 Азп О1у О1и Ьеи
О1у А1а О1у 955 А1а Рго О1у Уа1 Туг 960
Зег ТЬг 970 Тгр 11е Уа1 Уа1 О1и 975 Тгр
Зег 985 Ьеи Агд Уа1 РЬе О1п 990 О1п Тгр
11е Зег Туг ТЬг Туг Азр Рго Азп
1005
- 35 028228
Азп Беи 1010 Рго А1а А1а Рго Рго 1015 А1а О1у Туг О1у Беи 1020 ТЬг Уа1 О1у
А1а О1и Азп Азр О1и О1у ТЬг А1а О1у Бег С1п 11е Бег О1у ТЬг
1025 1030 1035
Рго ТЬг О1и Азр Беи Агд Уа1 ТЬг Бег ТЬг Рго О1у А1а А1а О1у
1040 1045 1050
О1у Бег Беи Буз Туг Бег РЬе ТЬг Беи Буз О1у ТЬг О1у Агд О1у
1055 1060 1065
Азп А1а Рго Уа1 ТЬг ТЬг Беи Уа1 Бег ТЬг Рго Беи Уа1 Агд О1у
1070 1075 1080
Уа1 ТЬг А1а О1и Уа1 Азр Азп 11е ТЬг Уа1 Азп
1085 1090
<210> 4 <211> 570 <212> БЕЛОК <213> АсБ1поа11отигиз <220>
<221> РКОРЕР <222> (1)..(570) <400> 4
МеБ Агд Агд 1 А1а Беи Уа1 5 Беи А1а А1а Суз 10 А1а Уа1 Уа1 ТЬг А1а 15 А1а
Беи А1а А1а Рго А1а С1п А1а О1у Бег Бег Бег Буз ТЬг С1п О1у Буз
20 25 30
ТЬг ТЬг О1и Туг Уа1 Уа1 Беи Туг Буз Азр О1у Уа1 Бег Беи О1и Буз
35 40 45
А1а НБз Бег А1а Уа1 Буз А1а А1а О1у О1у ТЬг 11е Уа1 Буз О1и Азп
50 55 60
Буз А1а 11е О1у Уа1 А1а ТЬг Уа1 Агд Бег А1а Бег ТЬг А1а РЬе Беи
65 70 75 80
ТЬг Азр А1а Агд Буз О1п Бег А1а Уа1 Азр О1у Уа1 А1а ТЬг Азп Агд
85 90 95
А1а Уа1 О1у О1и А1а Рго Буз Уа1 А1а Агд А1а А1а Уа1 Азп Буз Бег
100 105 110
- 36 028228
О1п А1а Уа1 115 О1и Ьуз О1и О1у Агд 120 Уа1 О1у О1у Н1з А1а 125 О1у Зег Зег
Зег Н1з Ьуз Рго Зег А1а О1и Рго Ьеи А1а Азр Агд О1п Тгр Азр МеЕ
130 135 140
Ьуз О1п 11е Н1з А1а ТЬг ТЬг Азр О1у Зег Туг Ьуз Ьуз О1и Рго О1у
145 150 155 160
Азр Агд Агд Уа1 Ьеи Уа1 О1у Уа1 11е Азр ТЬг О1у 11е Азр О1у ТЬг
165 170 175
Н1з Рго Азр 11е А1а Рго Азп РЬе Азр Ьуз Зег Ьеи Зег Агд Азп РЬе
180 185 190
ТЬг ТЬг Азр 11е Рго Уа1 Азр А1а Азп О1у ТЬг О1и Уа1 Азр О1у Рго
195 200 205
Суз О1и Н1з Рго Зег Суз Уа1 Азр Рго Уа1 Азр О1и Азр Азр Азп О1и
210 215 220
Н1з О1у ТЬг Н1з Уа1 А1а Зег ТЬг 11е А1а Зег Рго Ьеи Азп О1у Ьеи
225 230 235 240
О1у 11е А1а О1у Уа1 А1а Рго Азп Уа1 ТЬг Ьеи Уа1 Азп Уа1 Агд А1а
245 250 255
О1у О1п Азр Зег О1у Туг РЬе РЬе Ьеи О1п Рго Уа1 Уа1 Азр А1а Ьеи
260 265 270
ТЬг Туг Зег А1а Азр Н1з О1у 11е Азр Уа1 Уа1 Азп МеЕ Зег РЬе Туг
275 280 285
ТЬг Азр Рго Тгр Ьеи РЬе Азп Суз ТЬг Азп Азп Рго А1а Азр Зег Рго
290 295 300
О1и Азп О1п А1а О1и О1п Агд ТЬг Уа1 11е О1п А1а Зег О1и Агд А1а
305 310 315 320
Ьеи А1а Туг А1а Н1з Агд Н1з О1у Уа1 ТЬг Ьеи Уа1 А1а А1а А1а О1у
325 330 335
Азп О1у А1а ТЬг Азр Туг ТЬг Ьуз ТЬг 11е ТЬг Азр А1а Зег Зег Рго
340 345 350
Азр Туг Рго Зег Уа1 Рго О1у О1и А1а Рго Туг Зег Агд ТЬг 11е Рго
- 37 028228
355 360 365
Рго Зег Суз 11е Зег О1и Рго Зег О1и О1у О1п Азп Уа1 Ьеи А1а Уа1
370 375 380
Зег А1а Ьеи О1у 11е Зег ТЬг Агд Ьуз Зег Туг Туг Зег Азр Туг О1у
385 390 395 400
Азп О1у Туг Уа1 А1а Уа1 Зег А1а Рго О1у О1у Азр Зег Туг Азр ТЬг
405 410 415
А1а Азр С1п Ьуз А1а Азр Уа1 ТЬг Нпз А1а 11е Ьеи А1а А1а Туг Рго
420 425 430
Ьуз Зег Ьеи А1а Уа1 А1а Агд О1у О1и Ьеи Азп А1а Азр О1у ТЬг Рго
435 440 445
Азп Уа1 Рго Туг Уа1 Уа1 Агд Зег Суз Ьуз О1у Зег ТЬг Суз А1а Туг
450 455 460
Туг О1п Туг Ьеи О1п О1у ТЬг Зег МеЕ А1а Зег Рго Нпз А1а ТЬг О1у
465 470 475 480
ναι Уа1 А1а Ьеи 11е Уа1 Зег Агд Туг О1у Ьуз Рго Азр Агд Уа1 Нпз
485 490 495
О1у О1у Ьеи ТЬг Ьеи Зег Рго Азр Агд Уа1 Ьуз Зег 11е Ьеи О1и О1у
500 505 510
ТЬг А1а ТЬг О1и Нпз А1а Суз Рго Азр Рго Агд А1а РЬе ТЬг Туг ТЬг
515 520 525
Агд О1п Уа1 Ьуз О1п Зег Азр О1у ТЬг Туг Агд ТЬг Уа1 ТЬг А1а ТЬг
530 535 540
Нпз ТЬг Суз О1и О1у Зег Ьуз Зег Нпз Азп О1у РЬе Туг О1у Нпз О1у
545 550 555 560
11е 11е Азр А1а Ьеи О1у А1а Уа1 ТЬг Нпз
565 570
<210> 5 <211> 416 <212> БЕЛОК <213> АсЕппоаНотигиз <220>
<221> РКОРЕР
- 38 028228 <222> (1)..(416) <400> 5
МеЕ 1 Азп Рго Агд О1п Агд 5 РЬе А1а 11е Уа1 10 ^еυ А1а А1а ^еυ 11е 15 ТЬг
МеЕ 11е РЬе Бег ^еυ Уа1 Бег Уа1 Рго Бег А1а О1у А1а А1а Уа1 Бег
20 25 30
А1а Бег ^уз ^еυ Бег Уа1 О1у РЬе О1у Суз А1а Бег А1а А1а Ηΐ3 А1а
35 40 45
О1у О1п ^еυ Ηΐ3 Суз РЬе О1у Агд 11е Агд А1а Ηΐ3 Агд А1а Бег А3п
50 55 60
О1у ^уз 11е А1а Рго ^еυ ТЬг Уа1 ТЬг Бег Рго ТЬг О1у ^еυ ^еυ Рго
65 70 75 80
А1а Азр ^еυ О1п Бег А1а Туг ^уз Уа1 А1а О1у ^еυ А3п О1у О1у О1у
85 90 95
Агд ТЬг Уа1 А1а 11е Уа1 Азр А1а О1п Азр Азп Рго ^уз А1а О1и А1а
100 105 110
Азр ^еυ А1а Ηΐ3 Туг Агд Бег О1п ^еυ О1у ^еυ Рго А1а Су3 ТЬг ТЬг
115 120 125
А1а Азп О1у Суз РЬе ^уз ^уз Уа1 Азп О1п Азп О1у О1п А1а Бег Рго
130 135 140
^еυ Рго А1а А1а Азр Туг О1у Тгр А1а О1и О1и 11е Бег ^еυ А3р ^еυ
145 150 155 160
Азр МеЕ Уа1 Бег А1а 11е Суз Рго Бег Суз Ηΐ3 11е ^еυ ^еυ Уа1 О1и
165 170 175
А1а Азп А1а Рго Азр Азр ТЬг Бег ^еυ О1у ТЬг А1а Уа1 А3р ТЬг А1а
180 185 190
А1а А1а ТЬг Бег О1у Уа1 Уа1 А1а 11е Бег Азп Бег Туг О1у О1у А1а
195 200 205
О1и Азр Бег ТЬг 11е ^еυ А1а А1а Азр А1а Ηΐ3 РЬе А3п Ηΐ3 Рго О1у
210 215 220
11е А1а Уа1 ТЬг А1а Бег Бег О1у Азр Бег О1у Туг О1у Уа1 Бег Тгр
225 230 235 240
- 39 028228
Рго А1а Зег Зег О1п Туг Уа1 245 ТЬг А1а Уа1 250 О1у О1у ТЬг ТЬг Ьеи 255 Азп
Ьуз А1а Зег Азп А1а Агд О1у Тгр ТЬг О1и ТЬг А1а Тгр Зег О1у А1а
260 265 270
О1у Зег О1у Суз Зег А1а Туг О1и Рго Ьуз Рго Зег Тгр О1п Няз Азр
275 280 285
ТЬг А1а Суз А1а Ьуз Агд ТЬг Уа1 А1а Азр Уа1 Зег А1а Уа1 А1а Азр
290 295 300
Рго А1а ТЬг О1у Уа1 О1у Уа1 Туг Азр ТЬг Туг Азп Зег Суз О1у ТЬг
305 310 315 320
Зег Зег РЬе Суз Азр РЬе Ьеи 11е Зег Ьеи О1у Ьеи Уа1 О1п О1у Ьеи
325 330 335
Азр О1у Тгр А1а А1а Уа1 О1у О1у ТЬг Зег А1а Зег Зег Рго 11е 11е
340 345 350
А1а Зег Уа1 Туг А1а Ьеи А1а О1у Азп ТЬг О1у Зег ТЬг ТЬг Туг О1у
355 360 365
Зег Туг Рго Туг А1а Няз ТЬг Зег А1а Ьеи РЬе Азр Уа1 ТЬг Зег О1у
370 375 380
Зег Азп О1у Зег Суз О1у О1у ТЬг Туг Ьеи Суз ТЬг А1а О1у ТЬг О1у
385 390 395 400
Туг Азр О1у Рго ТЬг О1у Ьеи О1у ТЬг Рго Азп О1у ТЬг О1у О1у РЬе
405 410 415 <210> 6 <211> 33 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Глиадиновый 33-мерный пептид <400> 6
Ьеи 1 О1п Ьеи О1п Рго 5 РЬе Рго О1п Рго О1п 10 Ьеи Рго Туг Рго О1п 15 Рго
О1п Ьеи Рго Туг Рго О1п Рго О1п Ьеи Рго Туг Рго О1п Рго О1п Рго
20 25 30
- 40 028228
РЬе
<210> 7 <211> 4173 <212> ДНК <213> АсЕгпоа11отигиз
<220> <221> ген <222> (1). .(4173)
<400> 7 аЕдсссдаЕс ЕЕсссассса асддсдЕЕсс ссасдсаддЕ сасдссддсс сдсддЕссЕЕ 60
дсдаддсЕсд сдддссЕдсд сдЕсддсдсд сЕддЕссЕсд сдсЕсдссдЕ сассасдсЕс 120
асссЕсаЕсЕ ссаЕдсссЕс ддссаасдсс дссссддсса адсссдЕддЕ сссдсасдсс 180
ааддсдадса дЕсссассдс асадддссад сасссдасса дссдсдЕдЕд ссддассссс 240
ддссдсдсса аЕдадаЕдас сЕдссЕсдсс аЕддЕссдЕд асдасдЕсаЕ сдддссдаад 300
ддсдЕссадд сдаасдасдс дссддссддд ЕЕсддсссдд ссдассЕдсЕ даасдссЕас 360
аассЕдсссЕ сддссддаЕс дасддадасд дЕсдсдаЕсд ЕсдасдсдЕЕ сдасаасссд 420
аасдссдадд сддассЕддд сдЕсЕассдс садсадЕасд ддсЕдссддс сЕдсасдасд 480
дссаасддсЕ дсЕЕсаадаа даЕсдассаа сдсддсддса ссадсЕаЕсс дссдссддас 540
дссддсЕддд ссддададаЕ сдсдсЕддас аЕсдасаЕдд ЕсадсдссаЕ сЕдсссдасс 600
ЕдсаадаЕсс ЕссЕддЕсда ддссдасдас аасЕасаЕдд асаассЕддд сасддссдЕс 660
аассаддсдд Есадссаддд сдссаадЕЕс дЕсЕссааса дсЕасддсдд садЕдадддс 720
Ессдасдадд ддсаддссда сдасдсдЕас ЕЕссассасд асддсдЕсдс саЕсассдсд 780
адсадсддсд асадсддсЕа сддддсдадс Еасссддссд ссЕссссдЕа сдЕсассЕсд 840
дЕсддсддса сдЕсдсЕддс сааддасасд ЕссЕссЕсдс дсддсЕддас сдададсасс 900
Еддаасддсд сдддсадсдд сЕдсЕссдсд Еасдадасса адсссЕсдЕЕ ссадааддас 960
ассддсЕдсд сдсдссдЕас даЕсдссдас дЕсЕссдсдд Еддссдассс даасассддс 1020
дЕсдсддЕсЕ асаасддсдд сЕддсасдЕс Еасддсддса сдадсдЕдЕс сдссссдаЕс 1080
аЕсдсдЕсдд ЕдЕасдсссЕ сддсддсдсд ссддсддсдд дсЕсддсдсс саасЕссЕЕс 1140
ссдЕасдасс асссддссда ссЕсаасдас дЕдассадсд дсадсаасдд дадсЕдЕадЕ 1200
сссдссЕасс ЕсЕдсасддс дддЕассддс Еасдасдддс сдассдддсЕ сддсассссд 1260
аасддсаЕсд ссдсдЕЕссд сЕссдддссд сасдссдЕсд ЕсассддЕас ддЕсассдас 1320
ддсассдсдс сдсЕддсдЕс сдсссаддЕд ааддсдддсд асдЕсасддс дасдасддас 1380
ддссаддддс асЕасасссЕ дадсдЕЕссд ссддддассЕ асдасдЕдЕс сдсдадсаад 1440
- 41 028228
ЁЁсдддЁаса ссддЁаадас даЁсЁсдддд дЁдсаддЁсд ссдасддсса дассдЁсасс 1500
даддасЁЁсд сдсЁдассдс сааддсасдс дЁсдасдЁсЁ ссддасЁсдЁ асдддасддс 1560
ЁсдддЁсасд дсЁддссддЁ сЁасдсдасс дЁасдддЁса аддассадсс сассдсддЁс 1620
дссЁасассд асссдаадас сдддсддЁас асссЁсадсс Ёдсссасдда сдасасдЁас 1680
асдсЁдсадд ЁддаЁссдсЁ дЁаЁссдддЁ Ёасасдсадд асЁсдсасда сдЁдассдЁд 1740
ассЁсддсдд асдЁддЁсса сдасдЁсаас дЁсдсддЁдд ассадасдас дЁдсадсдса 1800
ссдддсЁаса дсЁассасЁа сдссддадсс асссадссдЁ Ёсдасддсас дассдсдссд 1860
дсдддсЁдда ссдЁсдаЁда сааддЁсддс аасддссада ссЁдддЁдЁЁ саасдасссд 1920
ддсЁсссдЁд дсаасаадас дддсдддасс ддсддсЁЁсд ссдЁсаЁсда садЁдассас 1980
ЁасддсЁсдд дсаасасдса ддасадсасд сЁдЁЁсадсс сддЁсассда сЁЁсадсдсд 2040
сдЁасссасс сдаЁссЁдад сЁЁссдсадс дасЁддЁасд дсЁасассдд ссаддссддс 2100
дассЁсдасс ЁдадсдЁсда сддсддсасд асдЁддасса ассЁдаадса сЁасасддсс 2160
адсдадсдсд ддссдсдЁас ддадасдаЁд дассЁдЁссд сддсддссдд даададсдсс 2220
дЁдсаддЁда ддЁЁссасЁЁ сассддсаад ЁЁсддсЁасЁ асЁддсаддЁ сдасдасдЁс 2280
ЁЁссЁсддсд ассдЁассЁд Ёдасссдасс Ёсдддсддсс ЁддЁсдЁсдд ссаддЁдасс 2340
дасдсдааса ссддсдсддд сдЁддссддд дссасддЁса ссЁсддЁдда ссддссддсс 2400
дадсасдсса ссЁсддсддс дасдссддас дассссаасс Ёсддсдасдд ЁсЁсЁЁсЁдд 2460
аЁдЁЁсЁссЁ ссдЁсассдд садссасаад ЁЁсассдсса сддсддддаа сЁасдасЁсс 2520
саЁдасдЁса сддЁдаасдЁ сдссдссаас Ёдддсдассд сддссдасаЁ сдсдсЁдЁсс 2580
дсдссасддс ЁсасддЁсас Ёссдддсдсд аЁсадсаада сддЁсддсЁд дсадааддсд 2640
дссассдсдд сдсЁдасссЁ даадаасасс ддсасдЁсдс сддЁдассдс саадаЁсддЁ 2700
даасадссдд дЁддсадсас дассдссасс дсдддЁдсас сдсЁдсадсд ддЁдаадддс 2760
дасЁЁсдсса дЁддасдасЁ дсадсадддс ааддсдЁсдд дЁдссааддс сддсдЁдаса 2820
ссдЁасдсдс сдссдЁддас ддссаЁсдсс дасЁасдссЁ сдссдаЁсаЁ ддасаасддс 2880
дсддЁддсас Ёдаасддсаа даЁсЁасЁсд дЁддсдддсд Ёсдасддсдс даасдЁдсЁд 2940
аасааддсдЁ асдссЁасда Ёсссддсасс саддссЁдда ссдссаЁсдс сссдсЁсдсс 3000
асдддасдЁд аддсЁсссса ддсдасдасс ассддсддаа адсЁдЁасдЁ сассддсддс 3060
ЁддддсЁсда сдддсдссдс ддЁддссаад асддадаЁсЁ ЁсдаЁссдЁс сЁсдддсдсс 3120
ЁддЁсддссд дсдсддасаа сссдаадссд ЁасдссддсЁ ссддсдсддс сдЁдсЁсдас 3180
ддсаадаЁсЁ асдЁсдЁсдд сдддЁдссЁс дссассЁдсд дЁасдаадда сдЁдсаддЁс 3240
Ёасдасссдд сддссаасЁс сЁддадсЁсд ддассддссЁ аЁссддадаа сассдсдЁдд 3300
сЁсддсЁдсд ссддсаЁсда сддсаадсЁд ЁасЁдсдсдд дсддсЁссдс ддссдсдадс 3360
- 42 028228
ассаадсасд дсБасдБдсБ сдасссддсс БсдддсассБ ддБсдссдаБ сдссдассБд 3420
ссдаБсдасс БдБдддсдаБ дддсБасБсд дсддсдаасд ддаадсБдаБ сдБсБссддБ 3480
ддсдБсасса асддддссад сасдсБсасс ааБсадддсБ БсдссБасда сссдБсддсд 3540
аасБссБдда сддсссБдсс саасБссаас аасдсссБдБ ассдсддсдс дБсддссБдс 3600
дддББсБаса адаБсддадд аБсдсБдддд садББсаасд сддБсаадад сддБдаддБд 3660
сБдсссддсБ аБдассадБд сдссБсдасс дссдасдББс сдБддсБдБс ддаддасаад 3720
ассдаддБда сдаБссадсс сддссададс дБсааддБса асдБдасссБ сдасдсдаас 3780
дБсссддсда БсасБсадсс сддсасдБас ассдсдсадс БсассдБсдд ддсдаадасд 3840
ссдБасдсда БсссдссддБ сдссдБсасд аБдасддБда асссдссддд сассБдддда 3900
аадаБсассд даасдсБсас сддадссддс БдБасдддББ сБсссдсасс дсБдассддд 3960
дсдасссБас адаБсдасБс сБдддсБдсд БсдБасасдс Бсаадассда саадаасддБ 4020
садБасдсдс БсБддсБсда сдБссдсаас аасссдсБда сдсБдаБсдс ддсдааддас 4080
ддаБдддсдс сдсадассад ааасдБсаад аБсассааас БдассБсдас сасддссдаБ 4140
ББсасБсБда аасссдасса сассБдБадс Бда 4173
<210> 8 <211> 1197 <212> ДНК <213> АсБгпоа11отигиз
<220>
<221> ген
<222> (1). ..(1197)
<400> 8
аБдБсасдас дсдБдассдд дассаБасБд ддсдддББда БссБсдссаБ ддБссссББс 60
сБББссассд сддссаасдс сдсассссад дссдсдссдд сББссдБсБс ссасссдББс 120
сассасБссБ дсдссасддБ даадссдддБ сдддсдадсБ дсааБдсссБ сдБасдсадс 180
дасаБсдссс ададсдсддс дасссБсдсд сассаадсдд ссдссссаБс сдддсБсБсд 240
ссддссаасс Бдсададсдс сБасаадсБд ссдБссБсса сддссддаБс сддссадасс 300
дБсдсдаБсд БсдасдссБа Бдасдссссд ассдссдаад сддасББдаа сдБдБассда 360
адссадББсд дасБсддсдс дБдсасдасс дссаасддсБ дБББсаадаа ддБсдассад 420
аасддсддса сдБссБаБсс даддааддас ддсддсБддд сдсаддадаБ сБсссБддас 480
сБсдасаБдд БсБссдсддБ сБдссссаас БдсаадаБсд ББсБсдБсда ддсдаадасс 540
аасБсдББсд ссаассБддд Бассдссдад аасассдсдд сдадБсБсдс даасдБсаБс 600
адсаасадсБ асддсддсБс ддасдссБсБ дасдсдадсБ аБддсБсдБа сБасаассас 660
- 43 028228
ссдддсаадд ссаЁсасддЁ садсЁссддс дасдссддсЁ асддсдЁдда дЁасссддсс 720
ЁсдЁсссасЁ асдЁдассдс сдЁсддсддс ассЁсдсЁдс дсассдсдад сассадссдс 780
ддсЁддадсд адассдсдЁд дадсддсдсд ддсадЁддсЁ дсЁсддссЁа саасассдсд 840
сЁдЁссддсс адЁссддссЁ сассддсЁдс Ёсссддсдсд ссдЁсдссда сдЁсЁссдсс 900
дЁддссдасс сддссассдд сдЁсдссдЁс Ёасдасадса сддссЁасса дддссададс 960
ддсЁддаЁдд ЁсЁЁсддсдд сассадсдЁс дссдсассда ЁсаЁсддЁдд сдЁдЁасддс 1020
сЁсдссдсса асдссдсдад саЁсдасаас аасЁассссЁ асдсссасас садсЁсдсЁс 1080
ЁЁсдасдЁса сдЁсдддсад саасддсасс Ёдсассасса ссаадЁддЁд сассдссддс 1140
ассддсЁддд асддссссас сддссЁсдда асдссдаасд дсассддадс сЁЁсЁда 1197
<210> 9 <211> 3285
<212> ДНК <213> АсЁгпоа11отигиз
<220> <221> ген <222> (1). ..(3285)
<400> 9 аЁдадЁдссд ссдЁЁдЁдаЁ сЁЁсдссддс дсассддсда сддсддсдсс дасдссддаа 60
ддсЁссддса дасасЁддас ддссасдссд сЁсадсддса ссдЁсдЁсса дддсЁЁсаад 120
Ёсдасдассд дасддсЁсдс саададсдаЁ дссдддсЁдс ЁЁсдссЁдаа дЁсдадсаад 180
сссдЁдсасд ЁсаЁддЁсаа дсЁсдасЁас дасЁсасЁсд ссдссЁассд дддсдддаЁЁ 240
сссдддЁасд ссдссасдад сссддсддЁд ассдддсаса сдсЁсдассс ддсдадсдсс 300
ддсдсдсддс дсЁассаддд сЁасаЁсддд ддсдЁсдада ассдсЁЁссд сдссдсссЁд 360
ддсаадсдсс Ёдссдддсдс дааддссддс ддсдддсЁдс дсасддЁдЁа сддсддЁсЁд 420
дсддЁдасдс ЁдсссддЁда сааддЁддсс дассЁдсЁса адсЁдсссдд сдЁддссдсд 480
дЁссаддадд асдсддЁддс саадссасЁд ассдасЁсса дссссддсЁЁ саЁсддсдсс 540
ссдассаЁсЁ асаадсаасЁ сддсддсадс дасадсЁссд дааадддсдЁ саЁсдЁсддс 600
дассЁддаса дсддсдссЁд дсссдадсас сссЁсдЁаса аддасадсдд саадсЁдссс 660
дсдссдссдс ссассасдда сддЁдсдсса сддссдЁдсд асЁЁсддсда сааЁссдсЁд 720
асдссддсда асдасссдЁа сдЁсЁдсдас сасаадсЁда ЁсЁсдддсса дссдЁЁссЁд 780
дасассЁаса асдсддЁсдЁ сддсддддад аддЁЁссссд асадсдсссд сдасЁссдас 840
дддсасддса сдсасассЁс дассассдсд дссддЁЁсдд сддЁдадсса сдсдаасссд 900
сЁсддсаЁсд ассдсддсдс саЁссасддс аЁсдсдсссд ссдсссасаЁ сдссдЁсЁас 960
ааддЁдЁдсд дсдсссаддд сЁдсЁЁссад ЁссдасЁсдд ЁддссдссдЁ дсадсдддсд 1020
- 44 028228
а5сс5сдаса адд5ссддд5 да5саас5ас 5сда5с5ссд дсддсдЬсда сссаЬасадс 1080
да5ссдд5сд аас5ддсс55 ссЬсдасдсд Ьасдсддссд дсдЬдсЬсдЬ сЬсддссЬсд 1140
дссддсаасд асдддсссас сдсдддсасс дЬсаассаса асдддссдЬд ддЬдассасд 1200
д5ддссдсд5 ссасдсадса дсддасс55с садЬсдассд 5сасдс5дса ддсдддсддс 1260
дсдадссЬда адсЬддссдд с5сд5сда5с ассадсддда 5сасс5сдсс дсЬЬсссдЬс 1320
д5дс5сдсд5 ссдсддсдсс дЬасддсдас ссддасЬдЬд асасдсаддс сдсЬсссддс 1380
асд55сассд дсаада5сд5 сдссЬдссдд с5дс5саасс дсддссддаЬ саЬдаадддс 1440
5асаасд5с5 Ьсаадддсдд сдсддссддд аЬдсЬдсЬсЬ асаасдасас дсЬдЬсссад 1500
асдаЬдассд асаассасЬд дсЬдссдасс дЬдсассЬдд адаадссдса ддссдасдсд 1560
с5дс5ддсс5 5сс555ссдд ссасассддс ассассдсса сдЬЬссссса дддсдсдаад 1620
дсдаасддсс адддсдасдЬ саЬдассдсд 55с5сс5сдс дсддсссддд сддсдасЬЬс 1680
сЬсаадсссд асдЬсассдс дсссддссЬд садаЬсаЬдд дсддссадас дссддЬЬссд 1740
дасдассссЬ сдсЬдддссс дсссддсасс сЬсЬассадд ЬдаЬсдссдд ЬассЬсдаЬд 1800
Ьсддсдссдс асдЬсассдд ддсддсддсд с5дс5д55сд сссЬдсаЬсс дадсЬддасд 1860
ссддддсадд 5саад5сддс дсЬддадасд ассддсаада сдЬсЬдЬддЬ саадсасдас 1920
сдсаадасдс ссдссдассс д55сдасс5с ддсддЬдддс дсаЬсдассЬ сассааддсс 1980
ддЬдассссд ддс5дасса5 сдасдадасс дсддсдаасЬ асдсддссЬс ддсдассдас 2040
ссдсЬдсасс дда5сдасс5 даасдЬдссд 5с5д5даасд сассддЬдаЬ дсссддсдсд 2100
а5са5дасса сссд5асдд5 саадаасдЬс Ьсдддааада сдаЬдасдЬа сддсассЬсд 2160
ддЬасдасдд Ьдаадддсдс с5сса5с5сс д5с5сссссд дсасдЬЬсас сдЬсаадссд 2220
ддсаадассд сссддсЬдсд да5сасда5с дссдсдссдд сдсЬсдссаа ЬдддсадЬас 2280
55сддссддд 5сдасс5дсд Ьсадсдааас ддсддссасд ассЬдсассЬ дссддЬсдсд 2340
55сд5ссдса адсадддсдЬ дд5дадсс5д аассадассЬ дсасдсссЬс ддЬдаЬсдсд 2400
сЬдаасадсд дссдаЬсдас д5дсдасд5с дасдЬсдада асассЬсЬсЬ сдссдасасс 2460
аадд5са5сд ссдсдадсса ссЬддасасд сддсЬдсдас ЬдассдсддЬ дассддсдсд 2520
асдааддЬдд дсдсдсасда сд5сс5ддсс саддссдасс Ьддсссдссд ссадсссдас 2580
аадссдсада Ьсдсссссдд ддссасдссд дссддсЬасс ЬдссдсЬсда сдссЬЬсддс 2640
аЬссссссда сдссдаЬсдд сдасдадсад 5сдс5саасс Ьсассасдсс ддсдЬЬсасс 2700
55сдссддса ддассЬасас садссЬдддс дЬддЬсЬссд асддсЬасас ддЬсдссддс 2760
ддадсдассс ссда5дасд5 ддссдсдасд ссдсадассс Ьдссдаассс ддсасддссд 2820
аасддсдаас 5ддссссд55 сЬддассдас сЬддасддсд ссддЬдсссс дддсдЬдЬас 2880
- 45 028228
дсддсссдсс Ьсассдасдд сасдадсасс ЬддаЬсдЬсд ЬддадЬддсд дсЬсаасдЬс 2940
ЬЬсддсасда асадссЬссд ддЬдЬЬссад садЬддаЬсд дддЬдаасдд сдссдаддас 3000
аЬсЬссЬаса ссЬасдассс даасаассЬд ссддсддсдс сдсссдсддд сЬасддссЬд 3060
асддЬсддсд сддадаасда сдадддЬасс дссддЬЬсдс адаЬсЬссдд сассссдасс 3120
даддаЬсЬсс дсдЬсасдад сасдссдддд дссдсдддЬд дЬЬсдсЬдаа дЬасЬссЬЬс 3180
асасЬдаадд даасдддссд дддсаасдсс ссддЬдасда сссЬддЬсЬс сасдссдсЬс 3240
дЬасдаддсд Ьдасддссда ддЬсдасаас аЬсасддЬда асЬда 3285
<210> 10 <211> 1713
<212> ДНК <213> АсЬ1поа11отигиз
<220> <221> ген <222> (1). ..(1713)
<400> 10 дЬдсддсдсд сссЬадЬссЬ сдссдссЬдс дссдЬсдЬса сддсддсдсЬ сдсддсассс 60
дсдсаддсдд даЬсдадсад саадасдсад ддааадасда сЬдадЬасдЬ сдЬссЬдЬас 120
ааддасддад ЬсЬсссЬдда дааддсдсас ЬсддссдЬда аддсддссдд ЬддсассаЬс 180
дЬсааддада асааддсдаЬ сддсдЬддсс ассдЬасдсЬ сддссадсас ддсдЬЬссЬс 240
ассдасдсдс дсаадсадЬс ддсддЬсдас ддсдЬсдсда ссаассдсдс ддЬсддсдад 300
дсдсссаадд Ьсдсасдддс ддсддЬдаас аададссадд ссдЬддадаа ддадддссдс 360
дЬсдддддсс аЬдсддддЬс сЬссЬсдсас аадссдЬсдд сддадссдсЬ ддсддассдь 420
садЬдддаса ЬдаадсадаЬ ссасдсдасс асддасддсЬ сдЬасаадаа ддадссдддс 480
дассддсдсд ЬдсЬсдЬсдд сдЬсаЬсдас ассддсаЬсд асддсасдса сссддасаЬс 540
дсдссдаасЬ ЬсдасаадЬс дсЬдадссдд аасЬЬсасса сддасаЬссс ддЬсдасдсс 600
аасддсассд аддЬсдасдд сссдЬдЬдад сасссдЬссЬ дсдЬддассс ддЬддасдад 660
дасдасаасд адсасддсас дсасдЬсдсс ЬсдасдаЬсд ссЬсдссдсЬ даасддссЬд 720
ддсаЬсдсдд дсдЬддсдсс даасдЬдасд сЬддЬсаасд Ьасдддссдд дсаддасЬсд 780
ддсЬасЬЬсЬ ЬссЬдсадсс сдЬддЬсдас дсдсЬдасдЬ асЬсддссда ссасддсаЬс 840
дасдЬддЬда асаЬдЬсдЬЬ сЬасассдас ссдЬддсЬдЬ ЬсаасЬдсас саасаасссд 900
дссдасЬсдс сддадаасса ддссдадсад сдЬасддЬса ЬссаддсдЬс адаасдсдсс 960
сЬддсдЬасд сдсассддса сддЬдЬсасс сЬддЬддсдд ссдссддсаа сддсдссасс 1020
дасЬасасса адасдаЬсас сдасдсдЬсд адсссддасЬ асссдЬссдЬ дсссддсдад 1080
дсдссдЬасЬ сдсдЬасдаЬ сссдссдЬсс ЬдсаЬсЬссд адссдадсда дддссадаас 1140
- 46 028228
дЁссЁсдсдд ЁдЁсддсссЁ дддсаЁсадс асдсдсаадЁ сдЁасЁасЁс сдасЁасддс 1200
аасддсЁасд ЁсдсддЁдЁс ддссссдддс ддсдасЁссЁ асдасасддс сдассадаад 1260
дсддасдЁда сссасдсдаЁ ссЁддссдсд ЁасссдаадЁ сссЁддссдЁ ддсссдсддс 1320
даасЁдаасд сддасддсас сссдаасдЁд ссдЁасдЁдд ЁссдсЁсдЁд саадддсЁсд 1380
ассЁдсдсдЁ асЁассадЁа ссЁдсадддс асдЁсдаЁдд ссЁсЁссдса сдсдассддс 1440
дЁддЁддсдс ЁдаЁсдЁсад ссдсЁасддс аадсссдасс дсдЁасасдд сддссЁдасс 1500
сЁдЁссссдд ассдддЁсаа дЁссаЁссЁд дадддаассд ссассдааса сдссЁдсссд 1560
дасссасдсд ссЁЁсасдЁа сасдсдссад дЁсаадсадЁ ссдасддЁас дЁасаддасс 1620
дЁдассдсда сссасассЁд ЁдадддЁЁсд аададссаса асддсЁЁсЁа сддссасддс 1680
аЁсаЁсдаЁд сссЁдддсдс сдЁдасдсаЁ Ёаа 1713
<210> 11 <211> 1251
<212> ДНК <213> АсЁ1поа11отигиз
<220> <221> ген <222> (1). ..(1251)
<400> 11 ЁЁдаассссс дссааадаЁЁ сдсдаЁсдЁс сЁсдсддссс ЁсаЁсасааЁ даЁсЁЁсЁсс 60
сЁддЁЁЁссд ЁссссЁссдс сддсдссдсд дЁсадсдсдЁ ссаадсЁсад сдЁсддсЁЁс 120
ддсЁдсдссЁ сддсддсдса сдссддЁсад сЁдсасЁдсЁ ЁсдддсддаЁ ссдсдсссас 180
сдддсдадса асддсаадаЁ сдссссдсЁс асддЁсасса дсссдассдд асЁдсЁсссд 240
дсддассЁдс адЁсддсдЁа сааддЁддсс дддсЁдаасд дсддсддссд ЁасддЁсдсд 300
аЁсдЁсдасд сдсаддасаа сссдааддсс даддссдасс ЁсдсссасЁа ссдсЁсссад 360
сЁсддссЁдс ссдсдЁдсас дассдсдаас ддсЁдсЁЁса адааддЁсаа ссадаасддс 420
саддсдЁсдс сдсЁдсссдс ддссдасЁас ддсЁдддссд аддадаЁсад ссЁсдассЁд 480
дасаЁддЁсЁ сддсдаЁсЁд сссдадсЁдс сасаЁссЁдс ЁсдЁсдаддс даасдссссЁ 540
дасдасассЁ сдсЁсддсас сдсддЁсдас ассдссдссд сдассадсдд сдЁсдЁддсс 600
аЁсЁссааса дсЁасддадд сдссдаддас ЁсдассаЁсс Ёсдссдссда сдсссасЁЁс 660
аассасссдд дсаЁсдсддЁ сасддсдадс ЁссддсдасЁ ссддсЁасдд сдЁсадсЁдд 720
ссддссЁсдЁ сссадЁасдЁ сассдсддЁд ддсддсасда сдсЁдаасаа ддсдадсаас 780
дсдсдсддсЁ ддассдадас сдссЁддЁсс ддсдссддсЁ сдддсЁдсЁс ддсдЁасдад 840
ссдаадссдЁ ссЁддсадса сдасассдсс Ёдсдссаадс дсассдЁсдс ддасдЁсЁсд 900
- 47 028228
дсддЕсдссд асссддссас сддсдЕсддс дЕсЕасдаса ссЕасаасад сЕдсдддасс 960
адсЕсдЕЕсЕ дсдасЕЕссЕ саЕсЕсдсЕс дддсЕсдЕдс адддссЕдда сддсЕдддсс 1020
дсддЕсддсд ддасдадсдс дЕссЕсдссд аЕсаЕсдсда дсдЕдЕасдс ссЕддссддс 1080
аасассддса дсасдасдЕа сддсЕсдЕас ссдЕасдсдс асасдЕссдс дсЕсЕЕсдас 1140
дЕсасдЕссд дсЕсдаасдд аадсЕдЕддс ддсассЕасс ЕдЕдсасддс сддаассддс 1200
ЕасдасддЕс ссассддЕсЕ дддсасдссс аасддаассд дсддсЕЕсЕд а 1251
<210> 12 <211> 28 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, прямой для Эндопеп140 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(28) <400> 12 ааааадсЕЕс адсЕасаддЕ дЕддЕсдд 28 <210> 13 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, обратный для Эндопеп140 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(29) <400> 13 ааааааасаЕ аЕдсссдаЕс ЕЕсссассс 29 <210> 14 <211> 26 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> праймер, прямой для Эндопеп40 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(26) <400> 14 ааааадсЕЕс адааддсЕсс ддЕдсс 26
- 48 028228 <210> 15 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, обратный для Эндопеп40 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(29) <400> 15 ааааааасаЪ аЪдЪсасдас дсдЪдассд 29

Claims (36)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Ферментная композиция, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам, где ферментная композиция содержит по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;
    c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;
    Б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;
    е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 5.
  2. 2. Ферментная композиция по п.1, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, выбранную из:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    Б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
  3. 3. Ферментная композиция по любому из пп.1 и 2, содержащая эндопептидазу, выбранную из:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
  4. 4. Ферментная композиция по любому из пп.1-3, где по меньшей мере одна указанная эндопептидаза получена из штамма АсйпоаНотигик.
  5. 5. Ферментная композиция по п.4, где по меньшей мере одна эндопептидаза получена из Ас1шоа11отигик кр. Ό8Μ24988.
  6. 6. Ферментная композиция по любому из пп.1-5, содержащая один или несколько других протеоли- 49 028228 тических ферментов, выбранных из пролил-эндопротеаз, х-пролил-дипептидиламинопептидаз и пролиламинопептидаз.
  7. 7. Ферментная композиция по любому из пп.1-6, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, функционально слитую с полипептидом с образованием химерного меченого белка.
  8. 8. Выделенная эндопептидаза из семейства 88/853, активная при рН 3-8, используемая в композиции по пп.1-7, выбранная из:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
  9. 9. Выделенная эндопептидаза из семейства 88/853 по п.8, выбранная из:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
  10. 10. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
  11. 11. Применение выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
  12. 12. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 для получения пищевых белковых гидролизатов.
  13. 13. Применение выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для получения пищевых белковых гидролизатов.
  14. 14. Фармацевтическая композиция для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента ферментную композицию по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одну выделенную эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
  15. 15. Фармацевтическая композиция по п.14, выполненная в форме, подходящей для перорального введения.
  16. 16. Пищевая добавка, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента ферментную композицию по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одну выделенную эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
  17. 17. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11, или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% любой из последовательностей 8ЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
  18. 18. Выделенная нуклеиновая кислота по п.17, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
  19. 19. Выделенная нуклеиновая кислота по п.17, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8.
  20. 20. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает культивирование природного штамма АсбпоаНотигив, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
  21. 21. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает культивирование штамма АсбпоаПотигив, полученного с помощью стандартных способов введения мутаций и/или селекции из природного штамма АсПпоаПотигив, где культивируемый штамм АсПпоаПотигив сохраняет способность к продуцированию по меньшей мере одной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извле- 50 028228 чение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
  22. 22. Способ по п.20 или 21, где штамм Ас(тоа11отигив представляет собой АсйпоаПотигив вр. Б8М 24988.
  23. 23. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает введение в клеткухозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из группы:
    a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 1;
    b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 2;
    c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 3;
    ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 4;
    е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 5, культивирование клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования по меньшей мере одной эндопептидазы, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
  24. 24. Способ по п.20 или 21, где вместо штамма АсйпоаПотигив используют штамм, принадлежащий к роду Са(епи11врога, К(ейопоЬас(ег или 8(гер(отусев, способный продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9.
  25. 25. Способ по п.22, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей, указанных в любом из пп.17 и 18.
  26. 26. Способ по п.25, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8.
  27. 27. Способ по любому из пп.22, 25 и 26, где клетка-хозяин представляет собой микроорганизм, выбранный из родов ВасШив, 8(гер(отусев, Ьас(оЬасШив, Ругососсив, Рвеийотопав, АврегдШив и вида ЕвсНепсЫа соП.
  28. 28. Способ по п.27, где клетка-хозяин представляет собой ЕвсНепсЫа соП ВЬ21(БЕ3) 8(аг.
  29. 29. Способ разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых во внутреннем просвете приводит к токсическим эффектам, где способ включает контактирование указанных глютеновых олигопептидов с ферментной композицией по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
  30. 30. Способ лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, где способ включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества ферментной композиции по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
  31. 31. Способ по п.30, где ферментную композицию или выделенную эндопептидазу вводят в составе фармацевтической композиции, пищевой добавки, питья или напитка.
  32. 32. Применение при производстве пищевых добавок ферментной композиции по любому из пп.1-7 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
  33. 33. Применение при производстве пищевых добавок по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
  34. 34. Применение по п.32 или 33, где ферментная композиция или выделенная эндопептидаза находятся в иммобилизованной форме.
  35. 35. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 для обработки жидких пищевых продуктов.
  36. 36. Применение по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для обработки жидких пищевых продуктов.
EA201491117A 2011-12-06 2012-11-05 Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение EA028228B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP11425291 2011-12-06
PCT/EP2012/071816 WO2013083338A1 (en) 2011-12-06 2012-11-05 New proteases able to hydrolyze gluten peptides and proteins at acidic ph, from the actinomycete actinoallomurus

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201491117A1 EA201491117A1 (ru) 2014-09-30
EA028228B1 true EA028228B1 (ru) 2017-10-31

Family

ID=47137719

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201491117A EA028228B1 (ru) 2011-12-06 2012-11-05 Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение

Country Status (12)

Country Link
US (2) US20140356345A1 (ru)
EP (1) EP2788018B1 (ru)
JP (1) JP6203743B2 (ru)
CN (1) CN104039345B (ru)
AU (1) AU2012348782B2 (ru)
BR (1) BR112014012100B1 (ru)
CA (1) CA2852365C (ru)
EA (1) EA028228B1 (ru)
ES (1) ES2595500T3 (ru)
HK (1) HK1198244A1 (ru)
IN (1) IN2014CN04131A (ru)
WO (1) WO2013083338A1 (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL2718434T3 (pl) 2011-08-10 2018-08-31 University Of Washington Through Its Center For Commercialization Kompozycje i sposoby leczenia choroby trzewnej
AU2014306716B2 (en) 2013-08-14 2020-01-30 University Of Washington Through Its Center For Commercialization Compositions and methods for treating celiac sprue disease
US9867872B2 (en) 2013-09-05 2018-01-16 Dsm Ip Assets B.V. Use of an acidic soft drink to enhance the efficacy of a gluten-digesting enzyme
CN105899543A (zh) * 2013-11-26 2016-08-24 诺维信公司 研磨方法
EP3209774B1 (en) * 2014-10-24 2020-02-26 DuPont Nutrition Biosciences ApS Use of proline tolerant tripeptidyl peptidases in feed additive compositions
EP3302518A1 (en) 2015-06-08 2018-04-11 University of Washington Compositions and methods for treating celiac sprue disease
US11124785B2 (en) 2016-02-11 2021-09-21 Trustees Of Boston University Rothia subtilisins, S8A family proteases, as therapeutic enzymes for application in gluten intolerance disorders
WO2021013553A1 (en) 2019-07-25 2021-01-28 Nemysis Limited Method for the production of an enzymatic composition comprising a recombinant endopeptidase
IT201900012942A1 (it) 2019-07-25 2021-01-25 Nemysis Ltd Metodo per la produzione di una composizione enzimatica comprendente una endopeptidasi ricombinante
CN111172138B (zh) * 2020-02-14 2022-03-25 江南大学 一种蛋白水解酶及其在蛋白肽生产中的应用
IT202100018254A1 (it) 2021-07-12 2023-01-12 Nemysis Ltd New systems for producing recombinant proteins/ nuovi sistemi di produzione di proteine ricombinanti
CN114438044B (zh) * 2022-01-14 2024-03-29 南昌大学 一种高效降解麸质蛋白的多酶复合体及其应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003068170A2 (en) * 2002-02-14 2003-08-21 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Enzyme treatment of foodstuffs for celiac sprue
WO2005107786A1 (en) * 2004-04-26 2005-11-17 Celiac Sprue Research Foundation Therapeutic enzyme formulations and uses thereof
WO2011077359A2 (en) * 2009-12-21 2011-06-30 Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (Chuv) Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP3104935B2 (ja) 1992-05-28 2000-10-30 株式会社ブリヂストン 空気入りタイヤ
US7265093B2 (en) * 2002-05-14 2007-09-04 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Drug therapy for Celiac Sprue
US7354734B2 (en) 2003-08-25 2008-04-08 Funzyme Biotechnologies Sa Fungal proteins and nucleic acids encoding same
JP5328100B2 (ja) 2003-09-23 2013-10-30 ディーエスエム アイピー アセッツ ビー.ブイ. ペプチドおよびタンパク質を加水分解するためのプロリン特異的エンドプロテアーゼの使用
NL1027650C1 (nl) 2004-12-03 2006-06-07 Leonardus Antonius Luttikhold Transporthulpmiddel voor deuren en panelen.
EP1985698A1 (en) * 2007-04-25 2008-10-29 Nestec S.A. Peptidases from basidiomycetes
CN102858795A (zh) * 2010-02-02 2013-01-02 天野酶制品美国有限公司 蛋白酶针对谷蛋白不耐受的用途
WO2011126873A2 (en) * 2010-03-30 2011-10-13 Alvine Pharmaceuticals, Inc. Proteases for degrading gluten
JP2011211997A (ja) * 2010-04-02 2011-10-27 Astellas Pharma Inc アントラサイクリン化合物を生産する微生物

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003068170A2 (en) * 2002-02-14 2003-08-21 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Enzyme treatment of foodstuffs for celiac sprue
WO2005107786A1 (en) * 2004-04-26 2005-11-17 Celiac Sprue Research Foundation Therapeutic enzyme formulations and uses thereof
WO2011077359A2 (en) * 2009-12-21 2011-06-30 Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (Chuv) Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ROBERTA POZZI, MATTEO SIMONE, CARLO MAZZETTI, SONIA MAFFIOLI, PAOLO MONCIARDINI, LINDA CAVALETTI, RUGGIERO BAMONTE, MARGHERITA SOS: "The genus Actinoallomurus and some of its metabolites", THE JOURNAL OF ANTIBIOTICS, NATURE PUBLISHING GROUP, GB, vol. 64, no. 1, 1 January 2011 (2011-01-01), GB, pages 133 - 139, XP002673610, ISSN: 0021-8820, DOI: 10.1038/ja.2010.149 *

Also Published As

Publication number Publication date
US20160114009A1 (en) 2016-04-28
JP6203743B2 (ja) 2017-09-27
EP2788018B1 (en) 2016-06-29
US10201593B2 (en) 2019-02-12
AU2012348782B2 (en) 2017-10-26
JP2015500641A (ja) 2015-01-08
BR112014012100A2 (pt) 2020-10-27
HK1198244A1 (en) 2015-03-20
BR112014012100B1 (pt) 2023-04-18
US20140356345A1 (en) 2014-12-04
WO2013083338A1 (en) 2013-06-13
CA2852365C (en) 2021-01-26
ES2595500T3 (es) 2016-12-30
CN104039345B (zh) 2016-11-09
EP2788018A1 (en) 2014-10-15
CN104039345A (zh) 2014-09-10
AU2012348782A1 (en) 2014-05-15
EA201491117A1 (ru) 2014-09-30
CA2852365A1 (en) 2013-06-13
IN2014CN04131A (ru) 2015-07-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EA028228B1 (ru) Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение
CN1871351B (zh) 一种新的真菌蛋白及其编码核酸
AU2010334383B2 (en) Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases
CN105324483B (zh) 工程化苯丙氨酸解氨酶多肽
EP3162894B1 (en) Methods for the manufacture of proteolytically processed polypeptides
EA006825B1 (ru) Способы получения биологически активных молекул
KR20080017039A (ko) 약학적 용도의 프로테아제
Alvarez-Sieiro et al. Generation of food-grade recombinant Lactobacillus casei delivering Myxococcus xanthus prolyl endopeptidase
Shetty et al. Discovery, cloning and characterisation of proline specific prolyl endopeptidase, a gluten degrading thermo-stable enzyme from Sphaerobacter thermophiles
Dvoryakova et al. Primary digestive cathepsins L of Tribolium castaneum larvae: Proteomic identification, properties, comparison with human lysosomal cathepsin L
US20220162619A1 (en) Preparation of wheat cysteine protease triticain-alpha produced in soluble form and method of producing same
US20220364069A1 (en) Method for the production of an enzymatic composition comprising a recombinant endopeptidase
WO2022198019A1 (en) Synthetic pre-protein signal peptides for directing secretion of heterologous proteins in bacillus bacteria
KR20110086711A (ko) 봉입체 형성 단백질의 제조방법
WO2016120764A1 (en) Aspergillus oryzae prolyl endopeptidases and use thereof in degradation of polypeptides
KR102113588B1 (ko) 히스티딘-프롤린 반복서열을 갖는 올리고펩타이드의 대량생산 시스템
IT201900012942A1 (it) Metodo per la produzione di una composizione enzimatica comprendente una endopeptidasi ricombinante

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ BY KZ KG TJ TM