EA028228B1 - Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение - Google Patents
Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение Download PDFInfo
- Publication number
- EA028228B1 EA028228B1 EA201491117A EA201491117A EA028228B1 EA 028228 B1 EA028228 B1 EA 028228B1 EA 201491117 A EA201491117 A EA 201491117A EA 201491117 A EA201491117 A EA 201491117A EA 028228 B1 EA028228 B1 EA 028228B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- endopeptidase
- sequence
- enzyme composition
- endopep
- tht
- Prior art date
Links
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 title claims abstract description 169
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 title claims abstract description 169
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 101
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 title claims abstract description 59
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 title claims abstract description 58
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 57
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 title claims abstract description 17
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 title claims abstract description 17
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 title claims description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 title abstract description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 43
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 35
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 35
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 33
- 208000015943 Coeliac disease Diseases 0.000 claims abstract description 32
- 235000015872 dietary supplement Nutrition 0.000 claims abstract description 19
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 16
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 claims abstract description 11
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 claims abstract description 9
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 claims abstract description 9
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 claims abstract description 7
- 235000021056 liquid food Nutrition 0.000 claims abstract description 7
- 239000003531 protein hydrolysate Substances 0.000 claims abstract description 7
- 235000021245 dietary protein Nutrition 0.000 claims abstract description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims abstract description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 138
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 138
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 claims description 138
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 103
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 96
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 86
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 83
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 66
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 claims description 65
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims description 65
- 229940066758 endopeptidases Drugs 0.000 claims description 53
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 37
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 claims description 24
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 claims description 24
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 22
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 22
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 claims description 20
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 18
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 18
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 17
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 17
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 17
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 claims description 15
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 claims description 15
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 claims description 13
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 13
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 11
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 11
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 11
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 claims description 11
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 claims description 9
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 claims description 9
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 claims description 9
- 239000000047 product Substances 0.000 claims description 8
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims description 8
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 claims description 8
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 7
- 235000013373 food additive Nutrition 0.000 claims description 6
- 239000002778 food additive Substances 0.000 claims description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 5
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 claims description 5
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 5
- 230000029087 digestion Effects 0.000 claims description 4
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 claims description 4
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 claims description 3
- 101710135670 Putative Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase Proteins 0.000 claims description 3
- 101710143531 Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase Proteins 0.000 claims description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 2
- 241000282985 Cervus Species 0.000 claims 1
- 206010012468 Dermatitis herpetiformis Diseases 0.000 abstract 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 55
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 43
- 108010061711 Gliadin Proteins 0.000 description 38
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 32
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 30
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 28
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 28
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 27
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 22
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 22
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 20
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 20
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 19
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 19
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 17
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 15
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 12
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 11
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 11
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 11
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 11
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 10
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 10
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 9
- 241000186361 Actinobacteria <class> Species 0.000 description 8
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 8
- 230000009471 action Effects 0.000 description 8
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 8
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 8
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 7
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 6
- 238000000589 high-performance liquid chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 5
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 5
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 5
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 5
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 5
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 5
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 5
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 4
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 4
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 239000000306 component Substances 0.000 description 4
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 4
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 4
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 4
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 4
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HZWWPUTXBJEENE-UHFFFAOYSA-N 5-amino-2-[[1-[5-amino-2-[[1-[2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound C1CCC(C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)N2C(CCC2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O)N1C(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 HZWWPUTXBJEENE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100034560 Cytosol aminopeptidase Human genes 0.000 description 3
- 108090000194 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Proteins 0.000 description 3
- 102000003779 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Human genes 0.000 description 3
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 3
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 3
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 3
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 3
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 101150114014 cagA gene Proteins 0.000 description 3
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 3
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 3
- 210000004051 gastric juice Anatomy 0.000 description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 231100000110 immunotoxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000002625 immunotoxic effect Effects 0.000 description 3
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 description 3
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 3
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 3
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 3
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 3
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 238000007805 zymography Methods 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 2
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 2
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 2
- 206010025476 Malabsorption Diseases 0.000 description 2
- 208000004155 Malabsorption Syndromes Diseases 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 108700039882 Protein Glutamine gamma Glutamyltransferase 2 Proteins 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- 102100038095 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000555745 Sciuridae Species 0.000 description 2
- 241000209056 Secale Species 0.000 description 2
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 2
- 235000013361 beverage Nutrition 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 150000001793 charged compounds Chemical class 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 230000006240 deamidation Effects 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000001784 detoxification Methods 0.000 description 2
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 2
- 230000001079 digestive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 2
- 210000001842 enterocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 description 2
- 230000009931 harmful effect Effects 0.000 description 2
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000005865 ionizing radiation Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 2
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 210000000110 microvilli Anatomy 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 2
- 108010017378 prolyl aminopeptidase Proteins 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 108090000797 sedolisin Proteins 0.000 description 2
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 229960001322 trypsin Drugs 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 1,2-bis(ethenyl)benzene;1-ethenyl-2-ethylbenzene;styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1.CCC1=CC=CC=C1C=C.C=CC1=CC=CC=C1C=C NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AUUIARVPJHGTSA-UHFFFAOYSA-N 3-(aminomethyl)chromen-2-one Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C(CN)=CC2=C1 AUUIARVPJHGTSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100038776 ADP-ribosylation factor-related protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 208000035404 Autolysis Diseases 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 1
- 101100324465 Caenorhabditis elegans arr-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010057248 Cell death Diseases 0.000 description 1
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 1
- 108010037462 Cyclooxygenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 108010005843 Cysteine Proteases Proteins 0.000 description 1
- 102000005927 Cysteine Proteases Human genes 0.000 description 1
- 102000016622 Dipeptidyl Peptidase 4 Human genes 0.000 description 1
- 241001362576 Eana Species 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 102000018389 Exopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010091443 Exopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 208000001613 Gambling Diseases 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 101000930822 Giardia intestinalis Dipeptidyl-peptidase 4 Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 102100025255 Haptoglobin Human genes 0.000 description 1
- 208000030836 Hashimoto thyroiditis Diseases 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000809413 Homo sapiens ADP-ribosylation factor-related protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000637792 Homo sapiens Solute carrier family 35 member G5 Proteins 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 101000668058 Infectious salmon anemia virus (isolate Atlantic salmon/Norway/810/9/99) RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit Proteins 0.000 description 1
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 208000015710 Iron-Deficiency Anemia Diseases 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical group CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 108010059881 Lactase Proteins 0.000 description 1
- 201000010538 Lactose Intolerance Diseases 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Chemical group CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010004098 Leucyl aminopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 102000002704 Leucyl aminopeptidase Human genes 0.000 description 1
- 241000219745 Lupinus Species 0.000 description 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 208000001132 Osteoporosis Diseases 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 241001442654 Percnon planissimum Species 0.000 description 1
- 102100030887 Pleckstrin homology-like domain family A member 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710134452 Pleckstrin homology-like domain family A member 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000029797 Prion Human genes 0.000 description 1
- 108091000054 Prion Proteins 0.000 description 1
- 241000316914 Prococcus Species 0.000 description 1
- 101710088675 Proline-rich peptide Proteins 0.000 description 1
- 108700015930 Prolyl Oligopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000056251 Prolyl Oligopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 102100038280 Prostaglandin G/H synthase 2 Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 241000801924 Sena Species 0.000 description 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 1
- 102100032019 Solute carrier family 35 member G5 Human genes 0.000 description 1
- 108090000787 Subtilisin Proteins 0.000 description 1
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000007238 Transferrin Receptors Human genes 0.000 description 1
- 206010067584 Type 1 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- 206010000059 abdominal discomfort Diseases 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- 208000030961 allergic reaction Diseases 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- -1 aqueous Substances 0.000 description 1
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 1
- 235000015173 baked goods and baking mixes Nutrition 0.000 description 1
- 210000004082 barrier epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000000975 bioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 235000019658 bitter taste Nutrition 0.000 description 1
- 239000001045 blue dye Substances 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 1
- 102000003675 cytokine receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010057085 cytokine receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 229910003460 diamond Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010432 diamond Substances 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 1
- 230000003241 endoproteolytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 208000037902 enteropathy Diseases 0.000 description 1
- 230000006862 enzymatic digestion Effects 0.000 description 1
- 230000004890 epithelial barrier function Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 235000012041 food component Nutrition 0.000 description 1
- 239000005428 food component Substances 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 238000010413 gardening Methods 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L glutamate group Chemical group N[C@@H](CCC(=O)[O-])C(=O)[O-] WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L 0.000 description 1
- 235000006171 gluten free diet Nutrition 0.000 description 1
- 235000020884 gluten-free diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000008076 immune mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 230000015788 innate immune response Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 1
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 239000003456 ion exchange resin Substances 0.000 description 1
- 229920003303 ion-exchange polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 238000004898 kneading Methods 0.000 description 1
- 229940116108 lactase Drugs 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000002132 lysosomal effect Effects 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004677 mucosal permeability Effects 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000031787 nutrient reservoir activity Effects 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 231100000255 pathogenic effect Toxicity 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000010412 perfusion Effects 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 238000005191 phase separation Methods 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Chemical group OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N phenylalanine group Chemical group N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000007112 pro inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012514 protein characterization Methods 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000000575 proteomic method Methods 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 238000012797 qualification Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 1
- 230000028043 self proteolysis Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012882 sequential analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000000344 soap Substances 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004885 tandem mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 230000031998 transcytosis Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 238000002834 transmittance Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000000539 two dimensional gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 230000004584 weight gain Effects 0.000 description 1
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- 108010027843 zonulin Proteins 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- A61K38/482—Serine endopeptidases (3.4.21)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23J—PROTEIN COMPOSITIONS FOR FOODSTUFFS; WORKING-UP PROTEINS FOR FOODSTUFFS; PHOSPHATIDE COMPOSITIONS FOR FOODSTUFFS
- A23J3/00—Working-up of proteins for foodstuffs
- A23J3/30—Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis
- A23J3/32—Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents
- A23J3/34—Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents using enzymes
- A23J3/346—Working-up of proteins for foodstuffs by hydrolysis using chemical agents using enzymes of vegetable proteins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
- A23L2/00—Non-alcoholic beverages; Dry compositions or concentrates therefor; Their preparation
- A23L2/52—Adding ingredients
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
- A23L33/00—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
- A23L33/10—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/52—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23V—INDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
- A23V2002/00—Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
- C12Y304/21026—Prolyl oligopeptidase (3.4.21.26), i.e. proline-specific endopeptidase
Abstract
Изобретение относится к эндопептидазной композиции, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, выделенной эндопептидазе из семейства S8/S53, их применению для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, их применению для получения пищевых белковых гидролизатов при производстве пищевых добавок и для обработки жидких пищевых добавок; также изобретение относится к пищевой добавке, содержащей заявленную эндопептидазную композицию или эндопептидазу; выделенной нуклеиновой кислоте, кодирующей заявленную эндопептидазу; способам получения заявленной эндопептидазной композиции; способу разрушения глютеновых олигопептидов.
Description
Настоящее изобретение относится к новому семейству эндопептидаз, имеющих уникальные каталитические свойства, которые придают им способность разрушать крупные полипептиды, включая полипептиды, обогащенные пролином. Настоящее изобретение дополнительно относится к способам получения ферментной композиции, а также фармацевтической композиции и пищевой добавки, содержащей ферментную композицию, и ее применению при разрушении полипептидов.
Предшествующий уровень техники
Целиакия (СГО) представляет собой хроническое расстройство желудочно-кишечного тракта, при котором прием глютена, присутствующего в пищевых продуктах, изготовленных из пшеницы, ржи, ячменя и их разновидностей, полученных скрещиванием, приводит к повреждению слизистой оболочки тонкого кишечника посредством аутоиммунного механизма у генетически восприимчивых индивидуумов (Сгееи Р.Н.К., СеШег С. Секас Ойзеазе, N. Еид1. 1. Мей., 2007, 357, 1731-1743; Кадиойй М.Р. Секас ййзеазе: райкодеиезйз ой а тойе1 йттииодеиекс ййзеазе, й. Ски. 1иуез1.. 2007, 117, 41-9). Механизмы, посредством которых глютен индуцирует свои патогенные эффекты, были объяснены за последние годы. Вовлеченными являются как врожденные, так и адаптивные механизмы иммунности, и они отвечают за критическое повреждение слизистых.
Глютен состоит из глиадинов и глютенинов, нерастворимых в воде/солях фракций запасных белков, присутствующих в зерновых культурах. Глютеновый каркас создается при взаимодействии между двумя белками, когда муку и воду смешивают при получении теста.
При приеме внутрь глютен направляется на частичное расщепление посредством желудочнопанкреатических протеолитических ферментов и ферментов щеточной каймы, что приводит в результате к множеству пептидов различной длины (от нескольких до более чем 30 аминокислот), которые являются устойчивыми к дальнейшему расщеплению вследствие высокого содержания остатков пролина, поскольку многие протеазы неспособны расщеплять пептидные связи, расположенные по Ν- или С-концам пролина (Наизск Р., 8каи Ь., 8аикадо Ν.Α., Сгау С.М., Ккоз1а С. 1п1езкпа1 ййдезкуе гезйзйаисе ой йттииойотйиаий дкайш реркйез. Ат. 1. Ркузю1. СазкоиНезЕ Ьйуег Ркузю1., 2002, 283, 996-1003; 8каи Ь., Мо1Ьегд О., Раггой I., Наизск Р., Εί1ίζ Р., Сгау С.М., 8о11тй Ь.М., Ккоз1а С. 8йгисйига1 Ьазйз йог д1ийеи шйо1егаисе ш секас зргие, 8сйеисе, 2002, 297, 2275-2279). Недостаток пролин-специфических расщепляющих ферментов не представляет собой особенную ферментную недостаточность у субъектов с целиакией, как предполагали в прошлом, но является характерным свойством пищеварительного аппарата млекопитающих, который неразвит настолько, чтобы потреблять белки с таким высоким содержанием пролина в диете.
Непереваренные глютеновые пептиды могут проходить через эпителиальный барьер посредством механизмов, еще ясно не объясненных, хотя недавно предположили зонулин-опосредованное параклеточное прохождение и трансклеточный путь, через трансцитоз и ретротрансцитоз (Эгадо 8., Е1 Азтаг К., Όί Рйегго М., Сита С1етеШе М., Тпрайи А., 8ароие А., Ткакаг М., 1асоио С., Саггоссю А., Э'АдаЮ С, Νθ1 Т., 2атрйий Ь., Са1азз1 С, Разаио А. Скайш, ζоии1^и аий дий регтеаЬйку: ЕГГес1з ои секас аий иои-секас шйезкиа1 тисоза аий ш!езкиа1 се11 киез, 8саий. й. Сазйгоеийего1., 2006, 41, 408-19; 8скитаии М., Кйскйег Й.Р., Аейе11 I., Мооз V., 2йттегтаии-Когйтаии М., 8скиеййег Т., Оаит 8., 2е1к М., Рготт М., §скикке Й.Э. Мескашзтз ой ерккекай йгаиз1осакои ой 1ке а1рка(2)-дкайш-33тег ш соекас зргие Сий, 2008, 57, 747754; Майузйак-Вийийк Т., Моига 1.С., Агсоз-Ра.)агйо М., ЬеЬгейои С, Меиагй 8., Саийа1к С., Веи-Ккакйа К., Эндауе С., Тато^а Н., уаи №е1 С., Воикийк Υ., Ьатащие Ό., Скаиззайе 8., Майатий С., СеШег С., СейВеизиззаи Ν., Моийейго К.С., Неутаи М. 8есгейогу 1дА теййайез гейгокаизсуйозйз ой иНас! дкайш реркйез уйа йке йгаизйети гесерйог ш секас ййзеазе й. Ехр. Мей., 2008, 205, 143-154).
При поступлении в 1атйиа ргоргйа (ЬМ), деамидирование глутамина до остатков глутамата посредством тканевой трансглутаминазы (ЙТС, аутоантиген при СО) усиливает их предоставление в ΌΟ2 или ΌΟ8 СГО4+ Т-клетки (Мо1Ьегд О., МсАйат 8., Ьиийш К.Е., Кгйзкаизеи С., Агепк-Напзеп РЬ, Кек К., 8о1кй Ь.М. Т се11з йгот секас ййзеазе 1езйоиз гесодгШе дкайш еркорез йеатййайей ш зки Ьу еийодеиоиз кззие каиздШйатйиазе, Еиг. й. 1ттиио1., 2001, 31, 1317-23), продуцируя провоспалительный ответ с интерфероном-гамма (ΙΡΝ-γ) в качестве основного цитокинового рецептора. Было также показано, что некоторые глютеновые пептиды вызывают повреждение слизистой независимо от специфического распознавания С.ГО4+ Т-лимфоцитами, но индуцируя врожденный иммунный ответ посредством восходящей регуляции экспрессии 1Ь-15, цикло-оксигеназы-2 и активационных маркеров С.ГО25 и С.ГО83 в ЬМ моноядерных клетках: среди них, наилучшим образом охарактеризованы пептиды р31-43/49 а1-глиадинов (РС^^^РРРР^^РΥ/Р^Р^РР) (Сйссосюрро К., Όί 8аЬайшо А., Сон^а С.К. Тке йттиие гесодшкои ой д1ийеи ш соекас ййзеазе, Ски. Ехр. 1ттиио1., 2005, 140, 408-16).
СО оценивают как поражающую приблизительно 1% населения как Европы, так и Северной Америки, причем исследования в Финляндии показывает возрастающую заболеваюмость (1:47) у пожилых людей (УПрри1а А., Каикшеи К., Ьиозйагйиеи Ь., Кгеке1а I., Райпкашеи РЬ, Vа1νе К., Макй М., Со11ш Р. 1исгеазшд ргеуа1еисе аий кйдк шсййеисе ой секас ййзеазе ш е1йег1у реор1е: а рори1акои-Ьазей зйийу ВМС Сазкоеийегок, 2009, 29, 9-49). Однако многие исследования указывают на то, что СО распространена по все- 1 028228 му миру с подобными значениями преобладания (Вагаба К., ВИаг А., Мокабет М.А., На8На8Н !С.. Огееп Р. СеНас б18еа8е ίη М1бб1е Еа81егп апб ΝοΠίι АГпсап еоиШпез: а пей Ъигбеп? \Уог1б ί. Оа81гоеп1его1., 2010, 16. 1449-57; ЭаЩс В., §ап δ., Ва81игк В., Еп8ап А., Едтйа8 О., Вики1те/ А., Вап8 Ζ., Тигк18Й СеНас 81ибу Огоир Ргеуа1епее оГ сеНас б18еа8е ш НеаННу Тигк18Й 8сНоо1 сНббгеп, Ат. 1. Оа8йоеп1ето1., 2011,106, 15127; МакНапа О.К., Уегта А.К., АтагсНапб К., ВНаШадаг δ., Эа8 Р., Оо8\уапи А., ВНайа V., А1ш)а V., ЭаНа Оир1а δ., Апапб К. Ргеуа1епсе оГ сеНас б18еа8е ш Не пойНегп рай оГ 1пб1а: а соттипйу Ъа8еб 81ибу, 1. Оа81гоеп1его1. Нерайок, 2011, 26, 894-900; Уапу ХЦ., Ьщ №., Хи СГО., Ме1 Н., Оао Υ., Репд Н.М., Уиап Ь., Хи 1.1. СеНас б18еа8е ш сйббгеп \\ЙН б1аггНеа ш 4 с111е8 ш СЫпа, 1. Реб1а1г. Оа8йоеЫего1. ΝυΐΓ., 2011, 53, 368-70).
В настоящее время недоступны никакие терапии, и только определено восстановление после заболевания, длительная безглютеновая диета является необходимой для предотвращения не только специфичного для СО повреждения слизистой и последующих ассоциированных с мальабсорбцией растройств (таких как железо-дефицитная анемия или остеопороз), но также других аутоиммунных заболеваний, которые были ассоциированы с СО, таких как диабет типа I и аутоиммунный тиреоидит, или более тяжелых осложнений, таких как ассоциированные с энтеропатией Т-клеточные лимфомы.
Полное исключение глютена (обычно указывают пороговое значение безопасного приема глютена, равное 50 мг/день, хотя 10 мг/день считается более безопасным) поддерживает СО в состоянии ремиссии у всех, кроме небольшого процента пациентов (2-5%), которые страдают от ареактивной формы. Такая диета является, однако, значительно ограничивающей для пациентов, которые являются ограниченными в их общей деятельности и страдают от социальной изоляции. Применение глютена в качестве добавки в производстве пищи является широко распространенным и является основной причиной неумышленного приема глютена, что делает эту диету в действительности трудной для поддержания.
По этим причинам пациенты с СО активно поддержали бы любую альтернативу, позволяющую им принимать в составе их ежедневной диеты, по меньшей мере, минимальные количества глютена.
Применение экзогенных протеолитических ферментов для глютеновой детоксификации является одной из наиболее перспективных стратегий лечения СО. При различных путях применения может использоваться потенциал этих ферментов: обработка глютенсодержащей муки, перед или во время ферментации теста, таким образом, двигаясь по направлению получения новой пищи, а также сопутствующее потребление глютена и подходящих протеолитических ферментов, таким образом, используемых как пищевая добавка, аналогично применению лактазы при непереносимости лактозы. Обязательно, чтобы различные свойства ферментов отвечали различным требованиям.
Ферментативный подход для лечения СО основан на демонстрации §Нап е1 а1. (8с1епсе, 2002) способности микробиальных ферментов расщеплять глютеновые пептиды по специфичным остаткам и удалять токсичные/иммунотоксичные конкретные пептидные последовательности. В частности, они показали, что экзогенная пролил-специфичная эндопротеаза, полученная из НауоЪасЮпит тептдо8ерйсит (РМ-РЕР), оказалась в результате способствующей расщеплению глиадиновых пептидов. Добавление РЕР либо ш уйго в присутствии экстрактов мембраны щеточной каймы (ВВМ) или во время перфузии ш νί\Ό тонкого кишечника крысы вызывало быстрое разрушение иммунодоминантного 33-мерного пептида (33-мера) и потерю его способности стимулировать глиадин-специфичные Т-клетки (Наи8сН е1 а1, 2002).
Другие ферменты того же самого семейства (ЕС. 3.4.21.26) из других бактериальных штаммов (т.е. 8рйшдотопа8 сар8и1а1а и Мухососси8 хап1Ни8) были подвергнуты оценке с этой целью теми же авторами (8Нап Ь., Матй Т., 8оШб Ь.М., Огау О.М., КНо81а С. Сотрагайуе ЫосНетюа1 апа1у818 оГ 1Нгее Ьас1епа1 рго1у1 епборерйба8е8: НпрПсайогь Гог соеНас 8ргие ВюсНет. 1., 2004, 383, 311-318). В целом, эти исследования показали существенные различия между тремя ферментами по отношению к длине цепи и субстратной специфичности и подтвердили потенциал пероральной ферментной терапии, несмотря на возникшие соображения, касающиеся их возможной эффективности действия ш-уКо, вследствие ограничений по специфичности к субстратам, рН активности (оптимальная активность при почти нейтральном рН вместо кислотного рН, что необходимо для действия в желудке), длительного времени, необходимого для полного расщепления токсических пептидов и устойчивости к разрушению под действием пепсина. Затем была предложена комбинация из двух ферментов с желудочной активностью и комплементарной субстратной специфичностью (Оа88 1., Вебшпе М.Т., §1еде1 М., δ репсе г А., КНо81а С. СотЪшайоп еп/уте Легару Гог да81пс б1де811оп оГ б1е1ату дНПеп ш раПеп18 \\ЙН сеНас 8ргие Оа8йоеЫето1оду, 2007, 133, 472480): РЕР из δ. сар8и1а1а, ассоциированной с ЕР-В2, изоформы 2 глутамин-специфичной эндопротеазы В из Ногбеит уи1дате, цистеин-протеазы, полученной из пророщенных семян ячменя, которая активируется при кислотном рН и посредством пепсина (Вебшпе М.Т., δΐ^οр Р., Тапд Υ., δο11^б Ь.М., КНо81а С. Не1его1одои8 ехрте88юп, рипйсайоп, геГо1бшд, апб 8йисЫга1-Гипсйопа1 сНагасЮп/айоп оГ ЕР-В2, 8е1Г-асНуайпд Ъаг1еу су81еше епборго1еа8е СНеш. Вю1., 2006, 13, 637-47), было показано, что она являются потенциально более активным терапевтическим инструментом. В еще одном исследовании сообщается, что РЕР, полученная из А8ретдй1и8 шдет, проявляющая свою основную активность при кислотных условиях в желудке, может начинать разрушать глиадин перед достижением кишечного просвета (ЛерЫак Ό., δраеη^^Эеккшд Ь., Мйеа С., Мое81ег М., бе Ки А., Ваак-РаЪ1о К. уап Vее1еη Р., Ебеп8 Ь., Кошпд Р. ШдН1у еГй- 2 028228
С1сп1 д1и!еп бедтабайоп \νί11ι пс\у1у ШепШтеб рго1у1 еп4орто1еаве: ипрПсаОопв Гог сеПас Швеаве Ат. I. РЬувю1. Оав1гош1ев1. Ыуег РЬувю1., 2006, 291, 0621-9).
Эти открытия были представлены в нескольких патентных документах. В XVО 2003/068170 (ЕР 572127) авторы изобретения заявляют, что введение эффективной дозы глютеназы пациенту с целиакией или герпетиформным дерматитом снижает уровни токсичных глютеновых олигопептидов, посредством чего уменьшаются или снижаются повреждающие эффекты глютена. Дополнительное подтверждение этого подхода дается в νθ 2005/107786 (ЕР 1740197), где раскрыты фармацевтические готовые формы глютеназных ферментов для применения при лечении пациентов с целиакией или герпетиформным дерматитом.
νθ 2005/027953 (ЕР 16663298) описывает лечение новой пролил-специфичной эндопротеазы из АврегдШив шдет (ΑΝ-ΡΕΡ), которая в результате способствовала расщеплению токсичных глютеновых пептидов. νθ 2005/019251 предоставляет лейцинаминопептидазу (БАР) из двух различных видов грибков, ТпсНорНуЮп гиЬгит и АврегдШив Гит1да1ив в комбинации с дипептидилпептидазой IV (Брр1У). Эти ферменты оценивали на предмет расщепления 33-мера при нейтральных условиях рН, поскольку оптимальная активность ЬАР была оценена около 7,0 с интервалом активности между рН 6 и 8, таким образом предотвращая или ограничивая возможное разрушение глиадина в желудочном соке.
Также было показано, что трипептидилпептидазы из А. ГипидаШв могут разрушать белки при кислотном рН (КеюНатб и., Ьесйеппе В., АвГ А.К., 8(тей Р., Огои/тапп Е., 1оиввоп О., Мопоб М. 8е4о1|в1пв. пеи с1авв оГ весге1е4 ргоЮавев Ггот АврегдШив ГипидаШв νίΐΗ епборгоЮаве ог 1прерО4у1-рер1Шаве асйуйу а! атШс рНв Арр1. Епуиоп. М1сгоЬ., 2006, 72, 1739-48). В νθ 2011/077359 предоставлен набор, составленный из пролил-протеазы (АГи828) и по меньшей мере одной трипептидилпротеазы, принадлежащей к семейству седолизина для применения в качестве пищевой добавки, применимой также для лечения СБ.
Понятно, что терапевтическое значение фермента или ферментной композиции для лечения СБ имеет отношение к ферментам а) являющимся устойчивыми к разрушению под действием других желудочно-кишечных ферментов, Ь) являющимся эффективными в окружении, где продуцируются 33-мер и другие токсичные пептиды и с) проявляющим быструю и высокую протеолитическую активность по отношению к глютеновым пептидам. Эти ферменты должны быть активными при кислотном рН и должны обладать способностью принимать сложный состав глютена, затрудненный другими компонентами обычных пищевых продуктов в виде выпечки или обжаренных изделий.
Краткое содержание сущности изобретения
Заявители в настоящем изобретении идентифицировали новое семейство ферментов и предоставили фермент или композицию этого семейства ферментов, имеющие уникальные каталитические свойства.
Заявители идентифицировали АсйпоаНотитив вр. в качестве продуцента данного семейства ферментов. Эндопептидазы изобретения продуцируют посредством культивирования АсйпоаНотитив в соответствующей культуральной среде, например, содержащей сою. Штамм, исходно идентифицированный под кодом А8 заявителя, был выделен из почвы Италии и депонирован 24 июня 2011 г., в коллекции Б8М2,-Беи1всЬе 8атт1цпд уоп МШгоогдатвтеп ипб 2е11ки1(игеп ОтЬН, (пои Бе|Ьп1/-1пв111и1 βδΜΖБеШвсНе 8атт1ипд уоп МШгоогдатвтеп ипб Ζе11ки1ΐи^еη ОтЬН), 1пНоГГепв1агвве 7Ь, Б-38124 Вгаипвсйие1д, Оегтапу, по условиям Будапештского Договора. Штамму был присвоен учетный номер Б8М 24988.
Эндопептидазы настоящего изобретения обладают способностью гидролизовать некоторые глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и чье присутствие в просвете кишечника приводит в результате к токсическим эффектам. Ферментативная обработка может удалять такие пептиды и их токсические эффекты; она может разрушать глиадин и, таким образом, детоксифицировать глютен без какого-либо добавления РЕР. Пептидазы изобретения имеют активности в широком диапазоне рН и способны проявлять протеолитическую активность от рН 3 до 8. Такая активность будет определяться как глютеназная активность.
Эти глютеназные ферменты предоставляют способы для предотвращения симптомов глютенчувствительной целиакии и/или герпетиформного дерматита посредством снижения уровней токсичных глютеновых олигопептидов в пищевых продуктах, либо перед приемом или после приема пищи пациентом. Эти ферменты могут применяться вместе с другими протеолитическими ферментами, такими как протеазы и амнопротеазы, чтобы эффективно продуцировать белковые гидролизаты, применяемые для пищи, питья и медицинских препаратов.
Эти ферменты секретируются различными штаммами АсйпоПотитив посредством их культивирования в подходящих средах, и их активность может быть оценена с использованием как хромогенных субстратов, так и зимографического анализа.
Кроме того, ферменты изобретения могут продуцироваться в клетках-хозяевах посредством введения нуклеиновой кислоты, кодирующей эти ферменты, культивирования клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования и извлечения ферментов.
Настоящее изобретение касается ферментной композиции, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и пан- 3 028228 креатических ферментов, и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам, где ферментная композиция содержит по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 5.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая эндопептидазу, выбранную из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичной ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, полученную из штамма Лсйпоа11отиги8.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, полученную из Лсйпоа11отиги8 8р. Ό8Μ24988.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая один или несколько других протеолитических ферментов, выбранных из пролил-эндопротеаз, х-пролилдипептидиламинопептидаз и пролил-аминопептидаз.
Вариантом настоящего изобретения является ферментная композиция, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, функционально слитую с полипептидом с образованием химерного меченого белка.
Настоящее изобретение касается выделенной эндопептидазы из семейства 88/853, активной при рН 3-8, которая применяема ввышеуказанной композиции и выбранна из:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная эндопептидаза из семейства 88/853, выбранная из:
а) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;
- 4 028228
Ь) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции для получения пищевых белковых гидролизатов.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для получения пищевых белковых гидролизатов.
Настоящее изобретение касается фармацевтической композиции для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента вышеуказанной ферментную композицию или по меньшей мере одну вышеуказанной выделенную эндопептидазу из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является фармацевтическая композиция, выполненная в форме, подходящей для перорального введения.
Настоящее изобретение касается пищевой добавки, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента вышеуказанную ферментную композицию или по меньшей мере одну вышеуказанную выделенную эндопептидазу из семейства 88/853.
Настоящее изобретение касается выделенной нуклеиновой кислоты, кодирующая по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% любой из последовательностей 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8Еф ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
Вариантом настоящего изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8Еф ГО N0: 7 и 8.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает культивирование природного штамма Лс1тоа11отиги8, способного продуцировать по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу из семейства 88/853, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает: культивирование штамма ЛсйпоаНотигик, полученного с помощью стандартных способов введения мутаций и/или селекции из природного штамма ЛсйпоаПотигик, где культивируемый штамм ЛсйпоаПотишк сохраняет способность к продуцированию по меньшей мере одной вышеуказанной эндопептидазы из семейства 88/853, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Настоящее изобретение касается способа получения вышеуказанной ферментной композиции, который включает: введение в клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из группы:
a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;
b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;
c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;
ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;
е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически ак- 5 028228 тивный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕО ГО N0: 5, культивирование клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования по меньшей мере одной эндопептидазы, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где вместо штамма Асйпоа11отиги8 используют штамм, принадлежащий к роду Са1епиЙ8рога, 1<1сбопоЬас1сг или §1гер1отусе8, способный продуцировать по меньшей мере одну вышеуказанную эндопептидазу из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где штамм ЛсйпоаПотигик представляет собой Лс1шоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из вышеуказанных полинуклеотидных последовательностей.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей 8Еф ГО N0: 7 и 8 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8Е0 ГО N0: 7 и 8.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где клетка-хозяин представляет собой микроорганизм, выбранный из родов ВасШи8, 81гер1отусе8, Ьас1оЪасй1и8, Ругососси8, Р8еиботопа8, Л8регдШи8 и вида Е8сйепсЫа сой.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где клетка-хозяин представляет собой Е8сйепсЫа сой ВЬ21(ОЕ3) 81аг.
Настоящее изобретение касается способа разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и присутствие которых во внутреннем просвете приводит к токсическим эффектам, где способ включает контактирование указанных глютеновых олигопептидов с вышеуказанной ферментной композицией или по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853.
Настоящее изобретение касается способа лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, где способ включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества вышеуказанной ферментной композиции или по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853.
Вариантом настоящего изобретения является способ, где ферментную композицию или выделенную эндопептидазу вводят в составе фармацевтической композиции, пищевой добавки, питья или напитка.
Настоящее изобретение касается применения при производстве пищевых добавок вышеуказанной ферментной композиции для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
Настоящее изобретение касается применения при производстве пищевых добавок по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
Вариантом настоящего изобретения является применение, где ферментная композиция или выделенная эндопептидаза находятся в иммобилизованной форме.
Настоящее изобретение касается применения вышеуказанной ферментной композиции для обработки жидких пищевых продуктов.
Настоящее изобретение касается применения по меньшей мере одной вышеуказанной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 для обработки жидких пищевых продуктов.
Описание чертежей
Фиг. 1: филогенетическое дерево, выведенное на основании последовательностей глютеназ изобретения и протеаз седолизина или кумамолизина.
Белковые последовательности были получены путем выравнивания с помощью программы СЬИ8ТАЬА, и максимальное дерево подобия с бутстреп-значениями было вычислено с использованием программного обеспечения МЕОЛ5. Эндопептидазы Лсйпоа11отиги8 8р. выделены жирным шрифтом. 8ебЕ использовали как внешнюю группу. Затем дерево визуализировали с помощью программного обеспечения МЕОЛ5. Бутстреп-значения, равные или большие чем 50%, указаны в точках ветвления. Масштабная метка указывает на число аминокислотных замен на сайт.
8ебЕ = седолизин Е из А. Гитща1и8 АГ293 (ЕАЬ86850); 8ебВ = седолизин В из А8регдй1и8 Гитща1и8 Αί293 (САЕ17674); ТРРа = трипептидилпептидаза А из А. огу/ае К1В40 (ВАС56232); 8ейЭ = седолизин Ό из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ17675); 8ебС = седолизин С из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ46473); 8ебА = седолизин А из А. Гитща1и8 АГ293 (САЕ51075); КитаА = Кумамолизин-А8 из Айсус1оЪасШи8 8еп±йеп818 (О8СВ88); КитаВ = Кумамолизин из ВасШи8 8р. ΜΝ-32 (О8РР56); седолизинА = седолизин из Р8еиботопа8 8р. 101 (Р42790); седолизин В = седолизин-В из Хаййотопа8 8р. Т-22 (060106); Эндопеп- являют- 6 028228 ся глютеназами изобретения. Учетные номера белковых последовательностей приведены в скобках.
Фиг. 2: профиль активности эндопеп-140 (>100 кДа) и эндопеп-40 (<100 кДа), измеренный на флуоресцентном субстрате Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РПе-АМС при разнообразных условиях рН.
Флуоресценцию измеряли через 2 ч при 37°С. Конкретные значения рН приведены на Х-оси, процентная доля относительной активности приведена на Υ-оси.
Фиг. 3: эндопептидазная активность эндопеп-140 (>100 кДа) и эндопеп-40 (<100 кДа), измеренная на флуоресцентном субстрате Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РПе-АМС при рН 3 и 5. Флуоресценцию измеряли при различных интервалах времени при 37°С. Значения времени инкубации приведены на Х-оси, условные единицы флуоресценции (гГи) приведены на Υ-оси.
Фиг. 4: 8% §Э§-РАСЕ с краской Кумасси голубым рекомбинантных глютеназ.
Экспрессию белка индуцировали 1РТС 0,2 мкМ при 22°С в течение ночи. §1 указывает на штамм Е.соП, трансформированный рЕТ28Ь-эндопеп-140; §3 указывает на штамм Е.соП, трансформированный рЕТ28Ь-эндопеп-40. Молекулярные массы используемого маркера указаны слева.
Слева: полоса 1 = маркер молеклярной массы; полоса 2 = §1 не индуцирован; полоса 3 = §1 индуцирован, 3 ч сбор; полоса 4 = §1 индуцирован, сбор в течение ночи (в.н.); полоса 5 = пробел; полоса 6 = §3 не индуцирован; полоса 7 = §3 индуцирован, 3 ч сбор; полоса 8 = §3 индуцирован, в.н. сбор.
Фиг. 5: разрушение 33-мерного глиадинового пептида под действием эндопеп-140.
Продукты реакции с течением времени разделяли посредством ВЭЖХ на обращенной фазе.
Фиг. 5А: МС профили, ионный счет ιη/ζ=300-2000; фиг. 5В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0, 30 мин, 2 ч. Только один сигнал, соответствующий интактному 33-мерному пептиду ([М-2Н]=1957) присутствовал при времени 0. Этот сигнал отчетливо снижался с течением времени. Несколько пиков появлялось через 30 мин инкубации, и их количество увеличивалось при времени 2 ч. Все наблюдаемые молекулярные ионы приведены в табл. 2. Размер наиболее характеристического пика выделен цифрой.
Фиг. 6: разрушение 33-мерного глиадинового пептида под действием эндопеп-140 в присутствии пепсина (1 мг/мл). Продукты реакции с течением времени разделяли посредством ВЭЖХ на обращенной фазе.
Фиг. 6А: МС профили, ионный счет т//=300-2000; фиг. 6В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0, 3 0 мин, 2ч. В то время как только один сигнал, соответствующий интактному 33-мерному пептиду ([М2Н]=1957) присутствовал при времени 0, несколько пиков появлялось чере 30 мин инкубации, и их количество возрастало при времени 2 ч. Все наблюдаемые молекулярные ионы приведены в табл. 3. Размер наиболее характеристических пиков выделен цифрой. Сигнал при ([М-Н]=1068) соответствует пептиду из девяти аминокислот, присутствующему в последовательности 33-мера. Сигнал 689,7 обусловлен пепсином.
Фиг. 7: ВЭЖХ-МС анализ. 33-мерный глиадиновый пептид инкубировали с пепсином.
Фиг. 7А: МС профили; фиг. 7В: УФ-профиль 230 нм, цАИ представляют микроединицы поглощения. Сравнивают профили, полученные при временных значениях 0 и 2 ч. Почти никакого разрушения 33-мера не наблюдают.
Фиг. 8: протеолиз глиадина на §Э§-РАСЕ. окрашенного Кумасси голубым.
Расщепление глиадина под действием двух различных глютеназ в присутствии или в отсутствие пепсина. Глиадин инкубировали 2 ч при 37°С.
Слева: полоса 1 = маркер молекулярной массы; полоса 2 = глиадин; полоса 3 = глиадин + эндопеп40 (<100 кДа); полоса 4 = глиадин + эндопеп-40 (<100 кДа) + пепсин; полоса 5 = реакция 3, остановленная через 10 мин инкубации; полоса 6 = глиадин + эндопеп-140 (>100 кДа); полоса 7 = глиадин + эндопеп-140 (>100 кДа) + пепсин.
Краткое описание таблиц
Таблица 1. Предполагаемые белки, очищенные из секретома АсПпоа11отигив.
Таблица 2. Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера под действием эндопеп-140.
Таблица 3. Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера под действием эндопеп-40.
Подробное описание изобретения
Актиномицеты представляют собой нитевидные грам-положительные бактерии, в основном известные по их способности продуцировать вторичные биоактивные метаболиты. Актиномицеты использовались как источник гидролаз, хотя только несколько, конкретно, алкалифильные актиномицеты, были до сих пор исследованы на предмет их ферментативного потенциала (ЕиПо А., Мигака^а §., §1ιίιηίζιι Н., §ЫгаЫи Υ. РипйсаПоп аиП ргорегЛев оГ со11адепаве Ггот §)гер!отусев врешев 1. ВюсПет., 1987, 102, 163-70; §акига1 Υ., 1поие Н., ΝίβΠίί ^., ТакаПавЫ Т., Пио Υ., Υататоΐо М., ТакаПавЫ К. РипйсаПои аиП СПагас1етаНоп оГ Мфог Со11адепаве Ггот §йер1отусев рагуиЫв Вювск Вю1есПпо1. ВюсПет., 2009, 73, 21-28; МеП)а V.!, ТПитаг ЕТ., §шдП §.Р., РгоПисПоп оГ а1каЛпе рго!еаве Ггот ап а1каНрЫПс асПпотусе1е Вюгевоигсе ТесПпо1оду, 2006, 97, 1650-1654).
Более того, полная последовательность генома §1гер1отусев соеНсо1ог А3(2) позволила предсказать
- 7 028228 наличие 60 секретируемых предполагаемых протеаз и пептидаз среди 819 потенциальных секретируемых белков (Веибеу 8.И., СЕа1ет К.Р., Сегбеио-Таггада А.М., СЕа1бк О.Ь., ТЕоткои Ν.Κ., 1атек К.И., Натк И.Е., Циаб М.А., К1екег Н., Нагрег И., Ва1етаи А., Вго\уп 8., СЕаибга О., СЕеи С.\У.. СоШик М., Стоит А., Ргакег А., ОоЫе А., Н1ба1до 1., НогикЬу Т., НоуабЕ 8., Ниаид С.Н., К1екет Т., Ьатке Ь., МигрЕу Ь., Обует К., О'№П 8., КаЬЬшоубксЕ Е., Кфаибгеат М.А., КиШетГотб К., Кибет 8., 8еедег К., 8аиибегк И., 8Еатр 8., 8циагек К., 8циагек 8., Тау1ог К., ^атгеи Т., \У1е1/оггек А., \Уооб\уагб 1., Вагге11 В.О., РаткЫ11 1., Нор\уооб Э.Л. Сотр1е1е деиоте кециеисе оГ тобе1 асбиотусе1е 81гер1отусек соеПсо1ог А3(2) №1иге, 2002, 417, 141-7), придавая актиномицетам дополнительную ценность в качестве потенциального источника для новых гидролитических ферментов. Среди актиномицетов, ацидофильные штаммы предлагают более высокие шансы для продуцирования ферментов со свойствами, наиболее удовлетворяющими требованиям быть эффективными в СИ, а именно, активности при кислотных рН. Несколько новых родов ацидофильных актиномицетов (т.е. Са1еии11крота, Асбиокрюа, Кидоктоиокрота, 81гер1ас1б1рШ1ик) а также нитевидные бактерии с ацидофильными свойствами, принадлежащие к ранее неизвестной бактериальной линии (т.е. К1ебоиоЬас1ет) были описаны впервые за последние годы (Викб Е., Сауа1еШ Ь., МоишатбШ Р., 5>с1шташ1 Р., КоЕбе М., 8окю М., Иоиабю 8. Са1еиц11крота ас1б1рЫ1а деи. иоу., кр. иоу., иоуе1, тусебитГоттшд асбиотусе1е, аиб ргорока1 оГ Са1еиц11крогасеае Гат. иоу. 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1егю1., 2006, 56, 1741-1746; Сауа1еШ Ь., МоиаатбШ Р., Ватои1е К., ЗсЕцтаии Р., КоЕбе М., 8окю М., Иоиабю 8. №у 1теаде оГ Й1атеи1оик, кроге-Гогтшд, дгат-рокШуе Ьас1епа Ггот коб Арр1. Еиу. МгегоЬюк, 2006, 72, 43604369; Сауа1е1б Ь., МоиаатбШ Р., 8сЕитаии Р., КоЕбе М., Ватои1е К., Викб Е., 8окю М., Иоиабю 8. Асбиокрюа ас1б1рЕЛа деи. иоу., кр. иоу. аиб Асбиокрюа гоЬииае деи. иоу., кр. иоу.; ргорока1 Гог Асбиокрюасеае Гат. иоу. аиб Са1еиибкрогшае киЬогбо. иоу. ш огбег Асбиотусе1а1ек 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1егю1., 2006, 56, 1747-1753; Моис1атб1т Р., Сауа1еШ Ь., КаидЕеШ А., 8сЕитаии Р., КоЕбе М., Ватои1е К., 8окю М., Ме//е1аш А., Иоиабю 8. №уе1 тетЬегк оГ Гатбу Мютотоиокрогасеае, Кидоытоиокрота ас1б1рЫ1а деи. иоу., кр. иоу. аиб Кидоытоиокрота айтсаиа кр. иоу 1и1. 1. 8ук1. Еуо1. Вас1етю1., 2009, 59, 2752-2758; К1т 8.В., Ьоикба1е 1., 8еоид С.М., ОообГе11оу М. 8бер1ас1б1рЫ1ик деи. иоу., асборЫПс асбиотусе1ек убб уа11 сЕето1уре I аиб етеибабои оГ Гатбу 8бер1отусе1асеае (ЛУаккиит и Нетти (1943)АЪ) етеиб. Кашеу е1 а1. 1997) Аи1оте уаи Ееетееибоек, 2003, 83, 107-116).
Асбиоаботитк, подобно многим другим актиномицетам, может расти в среде, содержащей белок в качестве единственного источника азота и углерода. Эта способность расти в белковой среде зависит от синергичного действия секретируемых эндо- и экзопротеаз, поскольку только аминокислоты и короткие пептиды могут ассимилироваться через мембранные переносчики. Штаммы Асбиоаботитик обладают оптимальным ростом при незначительно кислотных рН, таким образом, позволяя предположить, что протеолитические ферменты могут экспрессироваться при этом рН и могут иметь способность расщеплять сложные белки в кислотных условиях. Насколько известно заявителям ни в одном другом сообщении не описано продуцирование протеаз, действующих при кислотных рН, из актиномицетов.
Асбиоаботитик кр. И8М 24988 был выделен заявителями из итальянской почвы, хранился в коллекции штаммов заявителей, и депонирован 24 Июня, 2011 с И8М2, Иеи1ксЕе 8атт1иид уои М1кгоогдаи1ктеи ииб 2е11кибигеи ОтЬН, ^оГГеикбЭЬ, И-38124 ВгаииксЕуе1д, Оегтаиу (теперь Ее1Ьш7-1икб1и1 И8М2-Иеи1ксЕе 8атт1иид уои МШгоотдатктеи ииб 2е11кибигеи ОтЬН), по условиям Будапештского Договора. Штамму был присвоен инвентарный номер И8М 24988. Асбиоаботитик кр. И8М 24988 растет на разнообразных стандартных твердых средах (8Ыт1шд Е.В., ОоббеЬ И. МеШобк оГ сЕатайеб/абои оГ 8бер1отусек крешек 1и1. 1. 8ук1. Вас1етю1., 1966, 16, 313-340), подкисленных до рН 5,5 с помощью НС1. Через 15 дней инкубации при 28°С, субстратный мицелий является скрученным, имеет кремовый цвет, становящийся фиолетовым при старении, и на агаре 18Р2 не образуется воздушный мицелий. Цвет воздушного мицелия является белым при формировании на Н8А5 (Викб е1 а1., 2006). Обширный рост и продуцирование скрученного кремового/коричневого вегетативного мицелия наблюдали на агаре 18Р3 через 15 дней инкубации. Небольшое продуцирование коричневатых растворимых пигментов присутствовало через 20 дней инкубации. Штамм может расти при температуре между 21°С и 35°С, оптимальной температурой является 28°С на 18Р2 и Н8А5. Асбиоаботитик кр. И8М 24988 способен расти в присутствии №С1 до 2,5 % (мас./об.); при концентрации 1% (мас./об.) и выше, штамм не дифферецирует фиолетовый вегетативный мицелий, но только скрученный кремовый субстратный мицелий. Штамм, в чашках с агаром 18Р2, доведенный до желательных значений рН с помощью НС1 или №ОН, хорошо растет при рН между 4,0 и 7,0, с оптимальным рН 5,5. Обширный скрученный кремовый вегетативный мицелий наблюдают при росте на кислотном 18Р9 с добавлением глютена. Не продуцируются воздушный мицелий и растворимые пигменты.
Протеомное исследование секретируемых белков Асбиоаботитик подтверждает, что секретируются различные наборы протеаз, активных при нейтральных, основных или кислотных рН, и в частности, некоторые члены семейства пептидаз 88/853.
Глютеназы изобретения принадлежат к пептидазе МЕКОР8 88 [подсемейства 88 А (субтилизин) и семейству 88В (кексин)] и 853 (седолизин) (Каубидк Ν.Ό., Ваттеб А.1., Ва1етаи А. МЕКОР8: рерббаке ба1аЬаке №.ю1ею Ас1бк Кек., 2010, 38, И227-И233).
Глютен представляет собой белковый компонент пшеницы, ячменя, ржи и родственных видов, уни- 8 028228 кальный по своей способности обеспечивать эластичность и другие желательные характеристики тесту и многим другим пищевым продуктам. Глютеновые белки являются обогащенными остатками глутамина (35%) и пролина (15%), признак, который является особенно примечательным среди глютеновых эпитопов, которые распознаются специфическими для заболеваний Т-клетками. Главными токсическими компонентами глютена пшеницы являются глиадины, семейство пролин- и глутамин-обогащенных белков, которые содержат некоторые стимуляторные эпитопы для Т-клеток. Их частичное разрушение в желудочно-кишечном тракте под действием пепсина, трипсина, химотрипсина приводит к образованию нескольких токсических пептидов, из которых пептиды р31-49 и его производное р31-43 из фракции а1глиадина, и р56-88 (33-мер) из а2-фракции охарактеризованы лучше всего. 33-мер представляет собой пептидный фрагмент из 33 остатков, получаемый также посредством ίπ-νίίτο с имитацией физиологического желудочно-кишечного ферментативного расщепления (8Ьап с1 а1., 2002), аминокислотная последовательность которого представляет собой ТРТРРРРРРРТРУРРРРТРУРРРРЬРУРРРРРР (8ЕЦ ГО N0: 6). Он является сильнейшим иммуностимуляторным пептидом, поскольку он несет множество копий трех эпитопов, которые являются иммуногенными у пациентов с глютенчувствительной целиакией; он, таким образом, является ответственным за сильный иммунотоксический ответ (Οίαο 8.^., Вегдзепд Е., Мо1Ьегд О., Х1а 1., Р1ескеп81еш В., КЬоз1а С, 8ο11ίά М.Ь. АпЧдеп РгезейаЧоп ίο СеПас ЬевюпГОегщей Т Се11з оР 33-тег ОПайш Рерййе №1ига11у Рогтей Ьу Оа81го1п1е8Йпа1 ОщезПоп 1. 1ттипо1., 2004, 173, 17571762), и, следовательно, его применяют как модель для глютеновой детоксификации. 33-мерный пептид является превосходным субстратом для фермента трансглутаминазы 2 (ТО2), которая деамидирует глиадиновые пептиды в собственной пластинке слизистой оболочки, увеличивая его сродство к молекулам Ό02 или Ό08 антигена лейкоцитов человека (ИЬА), и, таким образом, усиливая опосредованный Тклетками слизистый иммунный ответ, приводящий к клиническим последствиям. Транспорт в кишечнике интактного 33-мера через слой энтероцитов может быть обусловлен сверхэкспрессией трансферринового рецептора в СИ и/или усиленной проницаемостью слизистой. В любом случае, пептиды могут избежать разрушения посредством кислотного эндосомально-лизосомального пути и могут достигать серозной границы неизмененными. Разрушение 33-мерного глиадиного пептида до пептидов, содержащих менее чем девять остатков, не приводит в результате к глютеновой токсичности.
Поскольку желудочно-кишечный тракт не обладает ферментативным оборудованием для эффективного расщепления глютен-производных пролин-обогащенных пептидов, вызывая у пациентов с глютенчувствительной целиакией аномальный иммунный кишечный ответ, применение перорально активных протеаз для разрушения токсичных глиадиновых пептидов перед тем, как они достигают слизистой оболочки, может рассматриваться в качестве альтернативного лечения по отношению к диете.
Заявители идентифицировали новое подсемейство белков, которое проявляет протеолитическую активность по отношению к пептидам, таким как пролин-обогащенные пептиды, при кислотном рН, который соответствует рН желудочного сока, и обнаружили, что эта ферментная композиция также обладает способностью разрушать 33-мерный глиадиновый пептид. На основе структурных свойств, полученных посредством биоинформатического анализа, заявители показали, что это новое подсемейство принадлежит к пептидазам 88/853 (субтилизин-кексин-седолизин) и может быть сгруппировано в новую подгруппу, отличную от уже известных седолизина или кумамолизина, которые принадлежат семейству 853 (фиг. 1).
Заявители разработали конкретную композицию из этих эндопептидаз. Данная композиция содержит по меньшей мере одну из эндопротеаз из семейства пептидаз 88/853 (субтилизин-кексин-седолизин), продуцируемую АсЧпоа11отигл8, которая расщепляет непроцессированные полипептиды и разрушает фрагмент глиадина, известный как устойчивый к действию протеазы. Итак, по меньшей мере одна эндопротеаза может применяться для лечения целиакии или любого заболевания процесса пищеварения, такого как мальабсорбция. Более того, поскольку фермент является устойчивым к пепсину, комбинация этих двух протеолитических активностей могла бы приводить в результате к более экстенсивному разрушению полипептидов и белков, таких как глиадин. Заявители обнаружили, что 33-мер разрушается до пептидов из шести аминокислот (табл. 2 и 3). Хотя ферменты изобретения являются активными по отдельности, добавление к ним одной или нескольких пептидаз, которые действуют на пролинобогащенные пептиды, таких как пролил-эндопротеазы и/или х-пролил-дипептидиламинопептидазы и/или пролил-аминопептидазы, может приводить в результате к более быстрому действию.
Белковое семейство 88/853 данного изобретения по отдельности или необязательно в комбинации с другими протеазами может быть применимым в пищевой промышленности, как, но не ограничиваясь лишь приведенными, для разрушения субстратов для горечи, обработки мяса, в мыловаренной промышленности или для разрушения прионов, вирусов и токсичных или контаминантных белков до коротких пептидов и/или свободных аминокислот.
Таким образом, настоящее изобретение предоставляет ферментную композицию, содержащую по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, активную при рН 3-8 (включительно), выбранную из группы, состоящей из:
а) эндопеп-140, содержащей 8Е0 ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный ал- 9 028228 лельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
b) эндопеп-40, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
c) эндопеп-120, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
й) эндопеп-60, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
е) эндопеп-41, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности.
Термин пептидаза(ы) изобретения, протеаза(ы) изобретения или эндопептидаза(ы) изобретения, как используют здесь, идентифицирует одну или несколько из эндопептидаз, определенных выше.
Настоящее изобретение также включает эндопептидазу, являющуюся производной любой одной из последовательностей, указанных выше, где любые из аминокислот могут отличаться от соответствующих остатков, показанных в 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, все еще поддерживающих ее биологическую активность и физиологические функции, или ее биологически активный фрагмент. Цель данного изобретения включает также любой вариант пептидазы, содержащий замены, делеции, модификации боковых цепей и/или включения по определенным положениям в пределах аминокислотной последовательности нативной аминокислотной последовательности, которая сохраняет биологическую активность и физиологическую функцию указанной нативной аминокислотной последовательности. Примеры замен являются хорошо известными квалифицированным специалистам в области техники и указаны, например, в \\'0 2011/077359.
В еще одном другом аспекте настоящее изобретение направлено на выделенные протеазы изобретения, и их биологически активные фрагменты (или их производные, части, аналоги или гомологи). Биологически активный фрагмент относится к областям протеаз изобретения, которые являются необходимыми для конкретных протеазных активностей.
В дополнительном варианте осуществления протеаза изобретения представляет собой протеазу, которая содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 50%, предпочтительно по меньшей мере 60%, более предпочтительно по меньшей мере 70%, даже более предпочтительно 80%, еще более предпочтительно 90% и наиболее предпочтительно 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, и сохраняет активность протеаз, содержащих 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
Термины идентичность и гомология, когда относятся к нуклеотидной или аминокислотной последовательности, применяются здесь взаимозаменяемо и относятся к степени, в которой две полинуклеотидные или полипептидные последовательности являются идентичными или гомологичными на основании принципа остаток-за-остатком на протяжении конкретной области сравнения. Выравнивание и процент идентичности или гомологии могут быть определены с использованием любого подходящего программного обеспечения, известного в области техники, например, программ, описанных в Сиггеи! РгоЮсоЕ ίη Мо1еси1аг Вю1о§у (Ли8иЬе1 Р.М. е! а1., Соттегаа11у АуайаЫе 8оП\уаге. Сштеп! РгоЮсоЕ ίη Мо1еси1аг Вю1о§у, 1987, 8ирр1етеп! 30, 8есйоп 7.7.18, ТаЬ1е 7.7.1). Предпочтительные программы включают программу ССС Рйеир, РА8ТА (Реагеоп К. апй Ыртап Ό. ί. Бпргоуей Тоо1§ £ог Вю1ощса1 8ециепсе Лпа1у515 Ргос. №Й., Асай. 8οΐ. И8А, 1988, 85, 2444-2448), и ВЬА8Т (А1Щс1ш1 8.Р., САП \., МШег \., Муегк Е.\., Ыртап Ό.Ι. Валс 1оса1 аПдптеШ кеагсй !оо1 1. Мо1. Вю1., 1990, 215, 403-410).
Изобретение также предоставляет протеазы изобретения, функционально слитые с еще одним другим полипептидом, которые специалисты в данной области называют химерными или мечеными белками. Полипептид может быть гибридизирован по №концу и/или С-концу протеазы изобретения. Различные меченые слитые белки могут быть получены специалистами в области техники и продуцированы стандартными методами рекомбинантных ДНК или общепринятыми методами, включая автоматизированные синтезаторы ДНК. Такие слитые белки могут облегчить очистку рекомбинантных протеаз изобретения или их экспрессию и секрецию в клетках-хозяевах. Эти методы являются хорошо известными квалифицированным специалистам в области техники.
Заявители показали, что крупные пептиды, такие как 33-мерный глиадиновый пептид могут разрушаться при кислотном рН эндопептидазами. Секретируемая эндопеп-140 действует посредством расщепления полипептидной цепи в нескольких местах, с генерированием различных малых пептидов из шести аминокислот (табл. 2, фиг. 5). Эта эндопептидаза демонстрирует предпочтения для участков, имеющих тирозин или лейцин или фенилаланин в положении Р1 и пролин в положении Р2 и Р1'. Увеличение количества эндопептидазы и/или времени инкубации приводит к полной деградации 33-мерного полипептида. В соответствии с обнаруживаемыми молекулярными массами, по-видимому, остатки глутамина
- 10 028228 превращаются в остатки глутаминовой кислоты, таким образом, позволяя предположить вовлечение амидотрансферазной активности. Эндопептидазы ферментной композиции изобретения могут функционировать в присутствии пепсина млекопитающих (табл. 2, фиг. 6).
Такие же анализы осуществляли с эндопеп-40, и полученные результаты, показанные в табл. 3, указывают, что эта глютеназа ведет себя аналогично.
Эндопеп-140 содержит структурный домен с высокой гомологией к другим эндопептидазам изобретения. Например, выравнивание ВЬА8Т дает идентичности = 223/370 (60%), положительные = 261/370 (71%) между эндопеп-140 и эндопеп-40 или идентичности = 227/431 (53%), положительные = 273/431 (63%) между эндопеп-140 и эндопеп-41. Подобные результаты получают посредством выравнивания ВЬА8Т между эндопеп-40 и эндопеп-41, с идентичностями = 230/419 (55%), положительные = 278/419 (66%). Положительными являются аминокислотные остатки, которые являются идентичными или очень похожими друг с другом по их физико-химическим признакам, как определяют с помощью матрицы ВЬ08ИМ62.
Эндопептидазы ферментной композиции изобретения могут продуцироваться посредством культивирования природного штамма Лс11поа11отиги5 или его мутанта, который способен продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, или клеток-хозяев, полученных методами рекомбинантных ДНК.
Термин рекомбинантная, когда его используют по отношению к клетке, указывает на то, что клетка реплицирует гетерологичную нуклеиновую кислоту или экспрессирует пептид или белок, кодируемый гетерологичной нуклеиновой кислотой. Гены, не обнаруженные в нативной (нерекомбинантной) форме клетки или обнаруженные в нативной форме клетки, где гены модифицируют и повторно внедряют в клетку искусственными средствами, могут содержаться в рекомбинантных клетках.
Квалифицированный специалист в области техники поймет, что эти клетки могут представлять собой одноклеточные или многоклеточные трансгенные организмы.
Изобретение также включает способы, основанные на культивировании клеток, которые содержат нуклеиновую кислоту, эндогенную для клетки, которая была модифицирована без удаления нуклеиновой кислоты из клетки; такие модификации включают модификации, полученные посредством замены гена, сайт-специфической мутации и родственных методов, например, посредством обработки мутагенными средствами или с помощью ионизирующих излучений.
Термин аллельный вариант обозначает любую из двух или нескольких альтернативных форм гена, занимающего тот же хромосомный локус. Аллельная вариация возникает естественным образом через мутацию, и может приводить в результате к фенотипическому полиморфизму внутри популяций. Генные мутации могут быть молчащими (без изменений в кодируемом полипептиде) или могут кодировать полипептиды, имеющие измененную аминокислотную последовательность. Термин аллельный вариант относится также к белку, кодируемому аллельным вариантом гена.
Таким образом, настоящее изобретение предоставляет способ получения ферментной композиции изобретения, который включает в себя:
A) культивирование природного штамма АсйпоаНотигик, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, и извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования; или
B) культивирование штамма АсйпоаНотигик, производного от природного штамма АсйпоаНотигик, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу 88/853, определенную выше, посредством методов общепринятой мутации и/или селекции, который поддерживает способность к продуцированию по меньшей мере одной из определенных выше эндопептидазы(аз), и извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования; или
C) технологию рекомбинантных ДНК, включающую стадии:
1) введения в клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу класса 88/853 субтилизина-кексина-седолизина, выбранную из группы, состоящей из:
a) эндопеп-140, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
b) эндопеп-40, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
c) эндопеп-120, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
4) эндопеп-60, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% идентичности;
е) эндопеп-41, содержащей 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, имеющую по меньшей мере 50, 60, 70, 80, 90 или 95% иден- 11 028228 тичности;
2) культивирование клеток стадии 1) в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования эндопептидазы(аз);
3) извлечение эндопептидазы(аз) из конечной среды культивирования.
Одна или несколько эндопептидаз изобретения могут продуцироваться при осуществлении одного способа, как определено выше. Когда единичные эндопептидазы продуцируются раздельно при осуществлении способа, определенного выше, данное изобретение включает необязательно стадию объединения двух или нескольких из полученных эндопептидаз для обеспечения ферментной композиции, содержащей смесь указанных эндопептидаз. Указанные эндопептидазы могут быть получены как выделенные эндопептидазы. Под термином выделенная эндопептидаза, как используют здесь, подразумевают очищенную форму эндопептидазы, которая не содержит, по существу, других белков или клеточного материала из клетки, из которой производят эндопептидазу.
Все термины, касающиеся ДНК/РНК нуклеиновой кислоты, также относящиеся к родственным технологиям манипуляции, применяемым здесь, являются хорошо известными экспертам в области техники молекулярной биологии, и пока эти термины используют во всем их широком и обычном значении, как изложено в МашаДк Т., РгНкск Е.Р., ЗатЬгоок 1. Мо1еси1аг с1ошпд: 1аЬога!огу тапиа1 Со1Д Зрппд НагЬог, ΝΥ, 1982 или АикиЬе1 Р.М. Сиггеп! РгоЮсок ίη Мо1еси1аг Вю1оду 1о1т \УПеу & Зопк, Ые№ Уогк, ΝΥ, 1993 или ЗатЬгоок е1 а1., Мо1еси1аг С1ошпд: а ЬаЬогаФгу Мапиа1 2'1 ЕД., Со1Д Зрппд НагЬог ЬаЬогаФгу Ргекк, Со1Д Зрппд НагЬог, ΝΥ, 1989.
Нуклеиновые кислоты, кодирующие эндопептидазы ферментной композиции изобретения, представляют собой дополнительную цель изобретения, которые включают нуклеиновые кислоты, чьи последовательности предоставлены здесь и определены как ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11 или их фрагменты. Изобретение также включает мутантные или вариантные нуклеиновые кислоты или часть этих нуклеиновых кислот. Соответственно, нуклеиновые кислоты данного изобретения включают полинуклеотидную последовательность, показанную в ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, или последовательность, имеющую по меньшей мере 50%, предпочтительно 60%, более предпочтительно по меньшей мере 70%, даже более предпочтительно 80%, еще более предпочтительно 90% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 95% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, и кодирующую аминокислотную последовательность, которая все еще поддерживает биологическую активность и физиологическую функцию указанной аминокислотной последовательности.
Последовательности, характеризуемые идентичностями на нуклеотидном уровне, обозначены в настоящем описании также как гомологичные последовательности нуклеиновой кислоты или их вариации. Гомологичные нуклеотидные последовательности кодируют эти последовательности, кодирующие изоформы протеаз изобретения. Изоформы могут экспрессироваться в том же самом организме в результате, например, альтернативного сплайсинга РНК. Альтернативно, изоформы могут кодироваться различными генами.
Гомологичные нуклеотидные последовательности также включают, но не ограничиваясь ими, природные аллельные вариации и мутации нуклеотидных последовательностей, представленных здесь выше. Гомологичные последовательности нуклеиновых кислот включают последовательности нуклеиновых кислот, которые кодируют консервативные аминокислотные замены в ЗЕО ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
В изобретении, гомологичные нуклеотидные последовательности могут включать нуклеотидные последовательности, кодирующие протеазу изобретения из других видов, принадлежащих АсДпоаНотигик, а также родов, отличных от АсДпоаНотигик, таких как, например Са1епи11крога, АсДпокрюа, КДеДопоЬас1ег. ЗйерФтусек, З1гер1ас1Д1рЫ1ик, Мюготопокрога, Кидоктопокрога.
Заявители определили посредством ВЬАЗТ-анализа, что геномы Са1епиПкрога, К1еДопоЬас1ег, З1герЮтусек содержат гены, которые кодируют белки, имеющие более чем 50% гомологию с соответствующей протеазой изобретения; например, предполагаемые белки с учетными номерами АСИ72534 и АСИ72320 из С’аЮпиПкрога ас|Д|рНДа имеют идентичности = 261/400 (65%), положительные = 295/400 (74%) с эндопеп-40 ЗЕО ГО N0: 2 и идентичности = 705/1342 (53%), положительные = 878/1342 (65%) с эндопеп-140 ЗЕО ГО N0: 1, соответственно, или предполагаемый белок с учетным номером ЕРН81837 из 1<1еДопоЬас1ег гасепиГег имеет идентичности = 244/402 (61%), положительные = 299/402 (74%) с эндопеп40 ЗЕО ГО N0: 2 или белковой последовательностью З1гер1отусек кр. Е14 с учетным номером ЕРР91270 также имеет идентичности = 230/371 (62%), положительные = 274/371 (74%) с эндопеп-40 ЗЕО ГО N0: 2. Гены, кодирующие гомологичные эндопептидазы, могут присутствовать в штаммах, принадлежащих родам филогенетически родственным, указанным выше, чьи геномные последовательности не являются доступными из общедоступных баз данных.
Биологически активный фрагмент эндопротеазы изобретения может быть получен посредством выделения фрагмента нуклеиновой кислоты с ЗЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, который кодирует эндопротеазу с такой же биологической активностью, что и у эндопротеаз изобретения, экспрессируя кодируемую часть эндопротеазы (например, посредством рекомбинантной экспрессии ш уйго) и с оценкой активности кодируемого фрагмента эндопротеазы. Изобретение дополнительно охватывает молекулы нуклеиновой кислоты, которые отличаются от последовательностей нуклеиновой кислоты, показанных в
- 12 028228
8ЕЦ ΙΌ N0: 7, 8, 9, 10 или 11 вследствие вырождения генетического кода, и, таким образом, кодируют такие же протеазы, которые кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, показанными в 8ЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11.
Технологии манипуляции с генами и белковой экспрессии являются известными квалифицированным специалистам в области техники и могут быть также найдены в КпеДег Μ. Оепе ТтапкГет ηηά Ехртеккюп: А ЬаЬогаФгу Мапиа1 81оск1оп Рте88, ΚΥ, 1990.
Заявители указывают, используя термин биологическая активность или функциональная активность на природную или нормальную функцию протеаз изобретения, например, способность к разрушению других белков. Предсказывают, что аминокислотные остатки, которые являются консервативными среди протеаз изобретения, конкретно являются не подверженными изменению. Аминокислоты, для которых могут быть проведены консервативные замены, являются хорошо известными в области техники. Как признают все квалифицированные специалисты в области техники, каждый кодон в нуклеиновой кислоте (за исключением АИС, который обычно является только кодоном для метионина) может быть модифицирован с получением функционально идентичной молекулы посредством стандартных методов. Кроме того, индивидуальные замены, делеции или дополнения, которые изменяют, дополняют или проводят делецию единичной аминокислоты или небольшого процентного содержания аминокислот (обычно менее чем 5%, более типично менее чем 1%) в кодируемой последовательности, представляют собой консервативные мутации, где изменения приводят к замене аминокислоты на химически сходную аминокислоту.
Еще один другой аспект изобретения имеет отношение к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим протеазы изобретения, которые содержат изменения в аминокислотных остатках, которые не являются существенными для активности. Такие протеазы изобретения отличаются по аминокислотной последовательности от 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, все еще сохраняют биологическую активность. В одном варианте осуществления молекула выделенной нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую протеазу, где протеаза содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере приблизительно 50% идентичностью с аминокислотными последовательностями из 8ЕО ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5.
Термин выделенная нуклеиновая кислота или выделенная полинуклеотидная последовательность, как используют здесь, идентифицирует молекулу нуклеиновой кислоты, которая отделена от других молекул нуклеиновой кислоты, которые присутствуют в клетке, из которой происходит нуклеиновая кислота, и не содержит, по существу, другой клеточный материал или материал культуральной среды, когда указанную молекулу нуклеиновой кислоты получают из природных микроорганизмов, микроорганизма, производного от них, или микроорганизмов, полученных посредством рекомбинантных технологий.
Молекула выделенной нуклеиновой кислоты, кодирующая эндопротеазу изобретения, гомологичную белку с 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 3, 4 или 5, может быть создана посредством введения одной или нескольких нуклеотидных замен, добавлений или делеций в последовательности нуклеиновой кислоты 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, таким образом, что одна или несколько аминокислотных замен, добавлений или делеций вводят в кодируемую протеазу. Мутации могут быть введены в 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 или 11, посредством стандартных методов, таких как сайт-направленный мутагенез, ПЦР-опосредованный мутагенез и перестановка в ДНК. Альтернативно, мутации могут вводиться статистически вдоль всей кодирующей последовательности протеазы изобретения или ее части, таким образом, как посредством насыщающего мутагенеза, и полученные в результате мутанты могут быть подвергнуты скринингу на биологическую активность протеазы изобретения для идентификации мутантов, которые сохраняют активность.
Ферментная композиция глютеназ в соответствии с настоящим изобретением может также применяться в иммобилизованной форме и использоваться, например, для обработки жидких пищевых продуктов. Ферментная композиция изобретения может также применяться в плодоперерабатывющей и пивоваренной промышленности для очистки и обеспечения функционирования оборудования. Например, обеспечивают протекание глютенсодержащего жидкого пищевого продукта вдоль матрицы, проницаемой для глютена, в которую погружена ферментная композиция изобретения. Глютен экстрагируют из пищевого продукта и расщепляют под действием ферментов. Ферментная композиция изобретения может также вносить вклад в доступную энергию пищи. Например, частично или полность непереваримаемый пролинсодержащий белок полностью или частично разрушается ферментной композицией изобретения, что приводит к доступности более переваримаемой пищи для человека или животного. Таким образом, скорость роста и/или отношение пищевой конверсии (т.е. масса перевариваемой пищи относительно прироста массы) человека или животного улучшаются.
Способы продуцирования эндопептидаз и их характеризация
Настоящее изобретение также относится к способам продуцирования ферментов настоящего изобретения, включающих культивирование (а) штамма, который находится в его форме дикого типа, или (Ь) форме, производимой из него посредством обычных технологий мутации, например, посредством обработки мутагенными средствами или с помощью ионизирующих излучений, или (с) клеток-хозяев,
- 13 028228 которые способны продуцировать полипептид изобретения, и извлечение указанного полипептид из конечной среды культивирования. В способах получения настоящего изобретения, среды для клеточного культивирования различным образом выбирают из сред, известных в области техники для получения белков в соответствии с культивированием штаммов дикого типа, штаммов, производимых из них, или рекомбинантных клеток-хозяев. Культивирование происходит в подходящей питательной среде, содержащей источники углерода и азота и неорганические соли, с использованием методик, известных в области техники. Подходящие среды являются доступными от промышленных поставщиков или могут быть получены в соответствии с опуликованными композициями (например, в каталогах Американской Коллекции Типовых Культур). Например, среды, содержащие сою, являются более адаптированными для обеспечения продуцирования ферментов изобретения микроорганизмами дикого типа.
Клетки могут культивироваться посредством культивирования во встряхиваемых колбах, мелкомасштабной или крупномасштабной ферментации (включая непрерывные, периодические, подпитываемые или твердофазные ферментации) в лабораторных или промышленных ферментаторах, осуществляемые в подходящей среде и при условиях, обеспечивающих экспрессию и/или выделение полипептида. Если полипептид секретируется в питательную среду, полипептид может быть извлечен непосредственно из среды. Если полипептид не секретируется, он может быть извлечен из клеточных лизатов. Продуцируются несколько протеолитических активностей, и культивирование прекращают, когда продуцирование эндопептидаз достигает максимума. После завершения культивирования, культуральную среду отфильтровывают для отделения микробных тел, и фильтрат обрабатывают обычным образом для сбора эндопептидаз посредством нескольких методик в комбинации, таких как ультрафильтрация, концентрирование при пониженном давлении, высаливание, осаждение органическим растворителем, диализ, гельфильтрация, адсорбционная хроматография, ионообменная хроматография, электрофокусирование и лиофилизация. Соответствующие методики должны выбираться с учетом желательных физических и химических свойств эндопептидаз.
Представительный пример продуцирования эндопептидаз данного изобретения посредством культивирования штамма Лс11поа11отиги5 дикого типа представлен в примере 1 здесь далее. Эндопептидаза(ы) изобретения могут быть очищены до желательной степени чистоты, которая может зависеть от предназначенного применения и от специфической активности эндопептидаз(ы).
Гетерологичная экспрессия в клетках-хозяевах
Для продуцирования эндопептидаз настоящего изобретения могут использоваться рекомбинантные клетки и микроорганизмы. Клетка-хозяин может представлять собой любую из клеток-хозяев, известных квалифицированным специалистам в области техники, включающих прокариотные клетки, эукариотные клетки, клетки млекопитающих, клетки насекомых, клетки грибков, дрожжевые клетки и/или растительные клетки. Выбор соответствующего хозяина находится в пределах квалификации специалистов в области техники.
Применимые микроорганизмы представляют собой бактериальные клетки, такие как грамположительные бактерии, включающие, но не ограничиваясь ими, клетки ВасШик (например, ВасШик киЬББк, ВасШик сегеик) или клетки 81гер1отусек или клетки молочнокислых бактерий или грамотрицательных бактерий, таких как Е.соП и РкеиБотопак. Предпочтительные продуцирующие клетки включают клетки из организмов, известных как в целом рассматриваемых как безопасные, таких как прокариоты Ьас&ЬасШик, Ругососсик, ВасШик, 81герЮтусек. и эукариоты АкретдШик. Более предпочтительные клетки включают клетки, которые уже применяют при получении пищевых продуктов, такие как Ьас&ЬасШик крр. и/или АкретдШик огу/ае.
Внеклеточное продуцирование ферментов может быть получено из микроорганизмов, таких как АкретдШик оту/ае, БасЮЬасШик саке1, К1цууетотусек 1асПк или 81герЮтусек БуШапк.
Введение вектора в бактериальную клетку-хозяина может, например, быть проведено посредством трансформации протопластов (например, СНапд 8., СоНеп 8.№ НщН Ггесщепсу 1тапк£оттаБоп оГ ВасШик киЬББк рго1ор1ак1к Ьу р1актШ ОНА Мо1. Сеп. Сепе!., 1979, 168, 111-115), с использованием компетентных клеток (например, ОиЬпаи Ό., ОауШоГГ-АЬе1коп К. Ра!е оГ (гапкГогпипд ΏΚΛ Го11о\уи1д ир!аке Ьу сотре1еп1 ВасШик киЫШк. I. РоттаБоп апБ рторетБек оГ Бопог-геар1еп1 сотр1ех Т Мо1. Вю1., 1971, 56, 209-221), электропорации (например, 8Б1дека№а, К., Оо\уег V. Т Е1есБоротаБои оГ еикатуо1ек апБ ргокагуо!ек: а депега1 арртоасБ Ю шБоБисБоп оГ тасгото1еси1ек иНо се11к Вю1есБшдиек, 1988, 6, 742-751) или конъюгации (например, КоеН1ег Т.М., ТБоте С. В. ВасШик киЬББк (пайо) р1акппБ рЬ820 теБ1а1ек БиегкреШек р1акпПБ йапкГег Т ВасГегю1., 1987, 169, 5771-5278).
Применимые многоклеточные организмы для применения в качестве клеток-хозяев представляют собой, например, растения, части растений, семена или растительные клетки.
Предпочтительные продуцирующие многоклеточные организмы представляют собой, например, трансгенные сельскохозяйственные культуры, такие как зерновые или овощи, такие как томат, которые содержат нуклеиновые кислоты, кодирующие протеазы изобретения.
Представительный пример продуцирования эндопептидаз данного изобретения в рекомбинантных клетках-хозяевах дан в примере 2 здесь далее.
- 14 028228
Фармацевтические композиции
Эндопептидазные средства настоящего изобретения могут вводиться по отдельности или включены в разнообразные готовые формы. Фармацевтическую композицию изобретения составляют так, чтобы она была совместимой со своим предназначенным путем введения, которым является предпочтительно пероральное введение. Например, поскольку секретируются несколько эндопептидаз ферментной композиции изобретения, неочищенный препарат, полученный из среды клеточной культуры АсйпоаНотитив или других применимых одноклеточных рекомбинантных микроорганизмов, таких как грамположительные бактерии включающие, но не ограничиваясь ими, клетки ВасШив, клетки §1тер1отусев, клетки молочнокислых бактерий, грамотрицательные бактерии, такие как Е.сой, может вводиться перорально. Молочнокислые бактерии включают, но не ограничиваясь ими, виды родов Ьас1ососсив, ЬасФЬасШив, ЬеисоповЮс, §1тер1ососсив, Ребюсоссив и ЕЩегососсив. Альтернативно, ферментная композиция изобретения может вводиться перорально после очистки.
Такие препаративные формы могут быть получены с соответствующими ингредиентами для генерации прпарата в жидкой форме, например, в форме раствора, эмульсии или в твердой форме, такой как таблетки, капсулы или полутвердой форме. Препаративная форма ферментной композиции может вводиться разнообразными путями, включающими пути, особенно подходящими для замешивания с продуктом питания. Ферментные компоненты могут быть активными перед приемом пищи или во время приема пищи, и могут обрабатываться, например, посредством подходящего инкапсулирования, для контроля временного режима активности.
Для получения соответствующей фармацевтической композиции эндопептидаз настоящего изобретения может применяться любой способ для стабилизации химического или биологического материала, известный в области техники, включая способы, основанные на облучении или температурной модуляции или их комбинаций.
Для лечения заболевания целиакии используемые фармацевтические композиции предпочтительно составляют так, чтобы высвобождать их активность в желудочный сок. Этот тип препаративных форм будет обеспечивать оптимальную активность в правильном месте, например, высвобождать эндопротеазы изобретения в желудке.
Альтернативно микроорганизм, такой как бактериальная или дрожжевая культура, способная продуцировать активные средства, может вводиться пациенту. Такая культура может быть примешана к пищевым препаратам или составлена, например, как энтеросолюбильная капсула.
Настоящее изобретение дополнительно предоставляет пищевую добавку, содержащую ферментную композицию настоящего изобретения. Термин пищевая добавка в контексте настоящего изобретения является взаимозаменимым с терминами добавка к пище, биологически активная добавка и питательная добавка.
Пищевая добавка изобретения может быть составлена, получена, поставлена и распределена, как описано в других документах предшествующего уровня, относящихся к области данного изобретения (\νϋ 2011/077359, XVО 2003/068170, XVО 2005107786), которые предоставляют способы лечения и/или предотвращения синдрома, ассоциированного с человеческим заболеванием, указанное заболевание является выбранным из группы, включающей целиакию, герпетиформный дерматит, плохое всасывание пищеварительного тракта, аллергическую реакцию, ферментную недостаточность, грибковую инфекцию, болезнь Крона, микозы и синдром мальабсорбции.
В качестве примера, пищевая добавка изобретения может представлять собой гранулированный ферментный продукт с оболочкой или без оболочки, который может легко быть смешан с пищевыми компонентами, альтернативно, пищевые добавки изобретения могут образовывать компонент премикса.
Альтернативно, пищевые добавки изобретения могут представлять собой жидкость, водную взвесь или взвесь на масляной основе. Ферментная композиция изобретения может доставляться посредством экспрессирования ферментов непосредственно в трансгенных продовольственных культурах (как, например, трансгенных растениях, семенах и т.п.), таких как зерновые культуры, хлебных злаках, кукурузе, сое, рапсовых семенах, люпине.
Фармацевтическая композиция или пищевая добавка изобретения могут быть предоставлены перед питанием, непосредственно перед питанием, вместе с питанием или непосредственно после питания, таким образом, чтобы эндопротеазы ферментной композиции данного изобретения высвобождались или активировались в верхнем желудочно-кишечном просвете, где эндопротеазы могли бы служить дополнением к желудочным и панкреатическим ферментам для детоксификации усваиваемого глютена и предотвращать прохождение вредных пептидов через слой энтероцитов.
Ферментная композиция данного изобретения имеет многочисленные применения в пищевой промышленности, в особенности, они могут применяться при производстве пищевых добавок, как описано в приведенных выше документах предшествующего уровня техники.
Исходя из данного описания, в результате становится очевидным, что дополнительная цель данного изобретения состоит в предоставлении способа для разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов, и чье присутствие во внутреннем просвете приводит в результате к токсическим эффектам, который включает
- 15 028228 контактирование указанных глютеновых олигопептидов с ферментной композицией или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазой данного изобретения.
Конкретно, один аспект указанного способа состоит в лечении или предотвращении глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, который включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества ферментной композиции или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы данного изобретения, предпочтительно, включенной в фармацевтическую композицию, пищевую добавку, питье или напиток.
Примеры
Пример 1. Идентификация и характеризация эндопептидаз Асйиоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988.
1.1. Культивирование штамма и получение белка.
Штамм Асйиоа11отиги8, используемый в соответствии с данным изобретением, происходит из коллекции штаммов заявителей.
Асйиоа11отиги8 8р. Ό8Μ 24988 поддерживали на среде 18Р2 с агаром (ЗЫгйпд апб СоййеЪ, 1966), подкисленной до рН 5,5 с помощью НС1. Микробное содержимое одной чашки соскребали и засевали в одну колбу Эрленмейера объемом 50 мл, содержащую 15 мл среды АР5, которая состояла из: (г/л) декстрозы 20, дрожжевого экстракта 2, соевой муки 8, ЫаС1 1 и ΜΕ8 10. Среду готовили в дистиллированной воде и рН доводили до 5,5 перед стерилизацией при 121°С в течение 20 мин. Инокулированную колбу оставляли для выращивания при 28°С, на ротационном встряхивателе, работающим при 200 об/мин. Через 5-6 дней инкубации, 5% культуры засевали во вторую серию колб Эрленмейера с объемом 500 мл, содержащих 100 мл такой же среды для ферментации. Продуцирование белка осуществляли в колбах, инкубируемых в течение 15 дней при 28°С на ротационном встряхивателе, работающем при 200 об/мин. Продуцирование белка подвергали мониторингу посредством биоанализа, как описано ниже.
Продуцировались несколько протеолитических активностей и культивирование останавливали, когда продуцирование эндопептидаз, с последующими анализами, описанными ниже, достигало максимума. Ферментацию собирали через 15 дней и жидкую среду центрифугировали при 4000 об/мин в течение 15 мин. Культуральную среду отфильтровывали для отделения микробных тел и фильтрат обрабатывали. Соответствующие методики выбирали, принимая во внимание желательные физические и химические свойства эндопептидаз.
1.2. Определение протеолитических активностей.
Ферментные активности измеряли при различных рН в ацетатном буфере (ацетат аммония - АМАС, конечная концентрация 50 мМ, рН 4,0-8,0; уксусная кислота 20 мМ, рН 3,0) при 37°С в общем объеме 0,2 мл.
Ферментативную активность эндопептидазы определяли посредством измерения степени гидролиза Сукцинил-А1а-А1а-Рго-Рйе-АМС (Амино-Метил-Кумарин) в качестве субстрата (Васйет АС, Наир181га88е 144, 4416 ВиЪепбогГ, 8\\й/ег1апб).
Исходные растворы субстрата получали при концентрации 10 мМ и хранили при -20°С. Субстрат готовили из 10-20 мкл 60% раствора метанола, содержащего 2 мМ Сукцинил-А1а-А1а-Рго-Рйе-АМС и 50150 мкл раствора ацетатного буфера. Реакционная смесь содержала концентрацию 0,2 мМ субстрата, и ферментный препарат (между 10-40 мкл или 1,0 мкг на анализ) в 200 мкл ацетатного буфера при различных значениях рН.
К субстрату, который предварительно нагревали до 37°С в течение 10 мин, добавляли 10-40 мкл ферментного раствора, и реакцию осуществляли при 37°С в течение до 2 часов. Высвобождаемый АМС измеряли с помощью считывающего устройства для микропланшетов Ри8юи (Регкш Е1тег ПаПа 8рА, Моп/а, Пайа) при длине волны возбуждения, равной 360 нм, и длине волны эмиссии, равной 460 нм. В качестве контроля, субстрат инкубировали без фермента.
Ферментативную активность для высвобождения 1 ммоль АМС за 1 мин определяли как 1 единицу.
1.3. Очистка эндопептидаз.
Мицелий отделяли от культуральной среды посредством фильтрации на бумаге (Мпас1об1 от Са1Ъюсйет, И8А). Затем, 200 мл супернатанта центрифугировали в течение 10 мин при 5000 об/мин для удаления остатков клеток, далее супернатант дополнительно центрифугировали при 10000 об/мин в течение 20 мин при 4°С для удаления нерастворимой фракции. Белки осаждали из супернатанта этанолом (1:4 об./об.) или насыщением 20-75% сульфата аммония. Сгусток ресуспендировали и диализовали, при необходимости концентрировали с использованием Сепйгсоп Р1и8-70 с пределом пропускания 5 кДа (Мбйроге, ВебГогб, Ма88., И8А). Присутствие протеаз, способных гидролизовать Сукцинил-А1а-А1а-РгоРйе-АМС, проявлялось, когда тестирование проводили при рН 5. Аликвоты суспензии белка после диализа кипятили, чтобы подвергнуть анализу методом остронаправленной МС (шотган). Процедура кипячения является необходимой, чтобы избежать аутолиза. По меньшей мере, было обнаружено 5 белков, принадлежащих семейству протеаз 88/853.
Ресуспендированные белки хроматографировали на ионообменной смоле АтЪег1йе 1КА900 (А1Га Ае8аг СтЪН, КагПгийе, 76185 Сегтапу) или ΌΕ-52-целлюлозе (\УНа1тап 1и1ег. Ыб, Ма1б81опе Епд1апб) или другом матриксе; полученные фракции тестировали на предмет гидролиза Сукцинил-А1а-А1а-Рго- 16 028228
Рйе-ЛМС и выделенные активные фракции подвергали ГО-δΌδ-ΡΑΟΕ и зимографическому анализу.
Белки далее фракционировали посредством гель-фильтрации с пределами пропускания по молекулярной массе, равными 300, 100, 50, 30, 10 кДа (Ыаиокер Ра11, М1сЫ§аи. υδΑ, Υίναδρίη δαΠοπιΐδ ОтЬН 37070 Ооейтдеи, Оегтапу). Их активность тестировали, как описано. Получали активные фракции с различными молекулярными массами. Аликвоты этих фракций кипятили и анализировали посредством анализа остронаправленной МС.
Белки разделяли посредством электрофореза на гомогенном 10% или диск-геле 4-15% или полиакриламидном геле любого типа (Βίο-Раб. Негси1е8, 9640, СА, υδΑ) с последующим окрашиванием Кумасси Бриллиантовым голубым Р-250 (Βίο-Раб) или серебром (δΙΟΜΑ-ΑΜήΛ, υδΑ) или посредством окрашивания ферментной активностью (зимографии), проводимых посредством инкубации геля при 37°С 50-100 мкМ флуоресцентного субстрата Сукцинил-Л1а-Л1а-Рго-РНе-ЛМС при требуемых рН.
Две эндопептидазы, принадлежащие семейству δ8/δ53, очищали до тех пор, пока электрофоретический анализ не показывал присутствие одиночной полосы, обнаруживаемой как посредством окрашивания серебром, так и зимографией.
Первая эндопептидаза была получена после фильтрации по молекулярным массам: она удерживалась при пределе пропускания >100 кДа. Анализ методом остронаправленной МС соответствующей кипяченой аликвоты показал присутствие эндопеп-140, δΕΟ ΙΌ N0: 1 (табл. 1А), с молекулярной массой 142449,4 и теоретическим р1, равным 5,18; были обнаружены следы двух других белков. Эта белковая фракция проявляла активность в интервале рН от 4 до 8 с рН оптимумом, равным 5 (фиг. 2). При тестировании при рН 3 фермент проявлял 95% своей активности при рН 5 через 30 мин инкубации при 37°С (фиг. 3). Эта белковая фракция была в результате более эффективной при расщеплении 33-мера, чем при гидролизе Сукцинил-Α1а-Α1а-Ρ^ο-ΡЬе-ΑМС, как показано в примере 3.
Вторая глютеназа, указанная как эндопеп-40, δΕΟ ΙΌ N0: 2, содержалась в белковой фракции <100 кДа предела пропускания (табл. 1В) с молекулярной массой, равной 39908,4, и теоретическим р1 5,94. Этот белк проявлял активность в интервале рН от 4 до 6 с оптимальным рН, равным 5. При тестировании при рН 3 фермент проявлял 85% своей активности при рН 5 через 30 мин инкубации при 37°С (фиг. 3). Флуоресцентная полоса, высвечиваемая посредством зимографии, показала молекулярную массу, равную приблизительно 40 кДа. Либо активный белок, элюируемый из полосы геля, или концентрат с соответствующим пределом пропускания по молекулярной массе характеризовали на предмет ферментативной активности. Анализ методом остронаправленной МС показал присутствие других белков; сигналы, указывающие на присутствие последовательностей эндопеп-140, могут быть обусловлены присутствием более мелких полипептидов (<100 кДа), образованных при ее разрушении.
Другие три эндопептидазы (указанные как эндопеп-120, δΕΟ ΙΌ N0: 3, эндопеп-60, δΕΟ ΙΌ N0: 4, эндопеп-41, δΕΟ ΙΌ N0: 5) не были очищены до гомогенности. Их присутствие было обнаружено посредством остронаправленной МС в секретоме и в активных фракциях первых стадий очистки. Анализ методом остронаправленной МС, обеспечивший идентификацию их аминокислотной последовательности, изложен здесь. Заявители именовали белки в соответствии с их предполагаемой молекулярной массой. Итак, эндопеп-120 имеет молекулярную массу, равную 112012,8, и теоретический рI 6,75, эндопеп60 имеет молекулярную массу, равную 59646,0, и теоретический рI 6,02, эндопеп-41 имеет молекулярную массу, равную 41646,1, и теоретический рI 5,22.
1.4. МС анализ белка: эксперименты с остронаправленной МС.
В настоящее время протеомные методологии имеют первостепенную важность для исследований, направляемых обнаружением по биомаркерам или исследований по характеризации белка.
Классический протеомный подход основан на двухмерном гель-электрофорезе (2ΌΟ), при котором пятна белка, представляющие интерес, изолируют и идентифицируют посредством масс-спектрометрии (МС). 2И Ο-подход имеет относительно высокое разрешение, которое однако ограничено трудностью обнаружения некоторых классов белков. Эти ограничения включают мембранные белки вследствие их низкой растворимости в буфере для гель-электрофореза, белки либо с низкой (<10 кДа), либо высокой (>200 кДа) молекулярной массой, а также белки с крайней изоэлектрической точкой φΙ <4 или >9). Дополнительное ограничение этого подхода состоит в трудности анализа менее представленных белков и в том, что фактически он является трудоемким и времязатратным.
Эти проблемы решаются с использованием новой протеомной методологии, основанной на двухмерной капиллярной хроматографии, в сочетании с тандемной масс-спектрометрией (2ДХ-МС/МС), также называемой МибРН (Технология идентификации многомерного белка) (^акйЬигп, М.Р., ^о11ег8 И., Уа1е8 ЕР. 3гб Ьагде-8са1е апаРУ о£ уеа§1 рго!еоте Ьу тиШб1теп8юпа1 рго!ет 1беп0ПсаОоп 1есйпо1о§у №ιί. Вю1есЬпоЬ, 2001, 19, 242-7). Она включает генерацию пептидов в результате ферментативного расщепления сложной белковой смеси, их разделение посредством двух микро-ВЭЖХ колонок и непосредственный анализ элюируемых пиков посредством МС/МС. 2ДХ-МС/МС сочетает ионный обмен с обращенно-фазовым разделением пептидных смесей, получаемых в результате прямого расщепления общего (или префракционированного) белка. В частности, пептидные смеси первоначально разделяют посредством ионообменной хроматографии (колонка δСX, 5 мкм, 0,3 ВД х 150 мм) с использованием семи стадий увеличения концентрации хлорида аммония (от 0 до 1000 мМ). Результат каждой солевой
- 17 028228 стадии непосредственно загружают на колонку с обращенной фазой (С18, 0,180 ВД х 100 мм) и разделяют с использованием градиента ацетонитрила: элюент А, 0,1% муравьиной кислоты в воде; элюент В, 0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле. Пептиды, элюируемые из колонки С18, анализируют непосредственно на масс-спектрометре с ионной ловушкой; предел обнаружения составляет около 10 фмоль или менее. Спектры регистрируют в положительном режиме (обычно в интервале 400-1600 т/ζ), используя динамическую эксклюзию для МС/МС-анализа. Различные протеазы используют для обработки белкового экстракта из образцов (трипсин, пепсин или протеаза К).
Затем получают идентификацию соответствующих белков посредством автоматизированного поиска в базе данных с использованием соответствующего программного обепечения, такого как алгоритм 8ЕфИЕ8Т (Епд, ГК., МсКогтаск, А.Ь., Уа1е8, ГК. Ап Арргоасй 1о Согге1а1е Тапкет Ма88 8рес1га Эа1а оГ Рерйке8 тейй Аттоаак 8е4иепсе8 ш а Рго1еш Оа1аЪа8е, к Ат. 8ос. Ма88 8рес1гот., 1994, 5, 976-984) для обработки масс-спектров. Полученные экспериментальные масс-спектры коррелируют с пептидными последовательностями, полученными при сравнении с теоретическими масс-спектрами в базе данных белков, загруженной из NСВI (\у\у\у.псЫ.п1т.шй.доу) или других вебсайтов.
1.5. Критерии для идентификации белков.
Идентификации пептидов принимались, если они могли быть установлены с большей чем 90,0% вероятностью, как установлено алгоритмом Рерйке Ргорйе! (Ке11ег А., Nе8ν^ζй8кй А.Ь, Ко1кег Е., АеЪег8о1к К. Ешрйгса1 81аЙ8Йса1 токе1 Ю е8Йта1е ассигасу оГ рерйке 1кепййсайоп8 таке Ъу М8/М8 апк ка1аЬа8е 8еагсй Апа1. Сйет., 2002, 15, 5383-92). Идентификации белков принимались, если они могли быть установлены с большей чем 95,0% вероятностью и содержали по меньшей мере один идентифицированный пептид. Поскольку было обнаружено не более чем 50% идентичности с общедоступными базами данных белков, геном Асйпоа11отиги8 секвенировали и транслировали в 6 возможных рамок считывания. Последовательное выравнивание посредством ВЬА8Т обнаруженных пептидов против предполагаемых белков Асйпоа11отиги8 позволило идентифицировать известные гомологичные белки.
Всего 94 белка были предположительно идентифицированы в секретоме Асйпоа11отиги8. Ферменты составляли из них значительную фракцию, было обнаружено 17 протеолитических ферментов, и были также обнаружены гликозидазы, липазы, кислые фосфатазы и диэстеразы. Никакой функции не могло быть присвоено посредством ВЬА8Т-анализа для 25 последовательностей.
Среди протеаз смогли обнаружить пять белков, принадлежащих семейству пептидаз 88/853, два из которых находились среди наиболее представленных белков.
Такие же анализы осуществляли на всех последующих стадиях очистки, пока не обнаруживались только несколько последовательностей.
Данные, полученные посредством МС-анализа подвергнутых кипячению активных фракций, показали несколько белковых последовательностей, несмотря на то, что на окрашенном серебром геле 8Ό8РАОЕ присутствовала одиночная полоса. Как показано в табл. 1, эндопеп-140 (8Еф ГО N0: 1) и эндопеп40 (8ЕО ГО N0: 2) были обнаружены как белки, ответственные за две описанных активности. Присутствие эндопеп-140 в образце, идентифицированном как <100 кДа, возможно обусловлено частичным разрушением белка на более мелкие полипептиды.
Анализ щ 81Йсо указывал на то, что как эндопеп-140, так и эндопеп-40 представляют собой гликозилированные белки, содержащие сигнальный пептид, приводящий к секреции, позволяя предположить, что они могут продуцироваться как препроферменты.
Анализ ш 81Йсо позволил сгруппировать все пять эндопептидаз в семейство 88/853 и указывал на то, что все они представляют собой гликозилированные белки. Высокая гомология была обнаружена среди эндопеп-140, эндопеп-40 и эндопеп-41 (8Еф ГО N0: 5), позволяя осуществлять их кластерирование в подгруппу, как показано посредством филогенетического дерева фиг. 1. Последовательность сигнального пептида была обнаружена также для эндопеп-60 (8Еф ГО N0: 4), в то время как она отсутствовала в эндопеп-120 (8Еф ГО N0: 3) и эндопеп-41. Филогенетическое дерево, показанное на фиг. 1, выделяет новизну этих глютеназ 88/853, которые не образуют кластера ни с кумамолизином, ни с седолизином, ни с ферментами трипептидил-пептидазы (от 8екА до 8екО), раскрытыми в А0 2011/077359, которые принадлежат к семейству 853.
Новизна этих ферментов была дополнительно подтверждена субстратной специфичностью, как показано в примере 3. Схема разрушения 33-мера, полученная при обработке посредством эндопеп-140 или эндопеп-40, показала эндо-протеолитическую активность.
Пример 2. Продуцирование эндопептидаз в рекомбинантных клетках-хозяевах.
2.1. Штаммы и плазмиды.
В этом исследовании применяли Асйпоа11отиги8 8р. Э8М 24988. Все эксперименты с субклонированием плазмид осуществляли на Е.сой ЭН10В (1пуйгодеп, Саг18Ъак, СА), используя плазмиду рТ257К/Т (Регшейа8, ИАВ, Ьййиаша).
Е8сйепсЫа сой ВЬ21(ОЕ3) 81аг(№уадеп Пайа, Роке^апо, РС) использовали для продуцирования гетерологичных (рекомбинантных) пептидаз.
2.2. Продуцирование рекомбинантных протеаз.
Рекомбинантные протеазы Асйпоа11отиги8 продуцировали и очищали из Е8сйепс1йа сой ВЬ21
- 18 028228 (ЭЕ3) 81аг, используемой в качестве экспрессионной системы.
Для построения штаммов Е.соН, продуцирующих эндопеп-140 и эндопеп-40, нуклеотидные последовательности генов амплифицировали, используя следующие наборы праймеров:
Фэндопеп-140 | 5 ' | '-АААААССГГСАОСТАСАООТОТООТСОО-З’ | ЗЕО | Ιϋ | ΝΟ: | 12 |
Рэндопеп-140 | 5 ' | '-АААААААСАГАГ6ССССАТСТТСССАССС-3’ | ЗЕО | Ιϋ | ΝΟ: | 13 |
Фэндопеп-4 0 | 5 ' | '-АААААССГГСАСААСССТССССТССС-З’ | ЗЕО | Ιϋ | ΝΟ: | 14 |
Рэндопеп-4 0 | 5 ' | '-АААААААСАГАГСТСАССАССССТСАССС-З’ | ЗЕО | Ιϋ | ΝΟ: | 15 |
Продукты ПЦР клонировали в вектор ρΤΖ57Κ/Τ и секвенировали перед клонированием в экспрессионный вектор для подтверждения того, что во время амплификации ПЦР не было введено никакой мутации.
Затем эндопеп-гены клонировали в сайты №е1-НткШ плазмиды рЕТ28Ь (Хохадеп) и трансформировали в экспрессионного хозяина ВЬ21(рЕ3) 81аг.
Трансформированные клетки выращивали в культурах объемом 50 мл со средой ЬВ, содержащей 30 мкг/мл канамицина, при 37°С до достижения 0Ό600, равной 0,6-1. Экспрессию глютеназ индуцировали добавлением 0,2 мкМ изопропил β-ϋ-тиогалактозида (81дта), и культуры далее инкубировали при 22°С в течение ночи. Как показано на фиг. 4, получали белковые полосы, соответствующие требуемой молекулярной массе эндопеп-140 и эндопеп-40.
2.3. Очистка гетерологически продуцированных эндопептидазы(аз).
Клетки, экспрессирующие рекомбинантные эндопептидазы, центрифугировали при 5000 д в течение 20 мин. Сгусток ресуспендировали в 8 мл буферного раствора (20 мМ фосфата натрия, 500 мМ №С1, рН 7,8), затем добавляли 1 мг/мл лизоцима для полного лизиса клеток. Ηίδ-меченные белки очищали из неочищенных клеточных экстрактов посредством аффинной хроматографии с иммобилизованным №2+, используя систему для очистки №-ХТА Рипйсайоп 8уз1ет (1пуйгодеп) в соответствии с инструкциями производителя. Аликвоты по пять микролитров элюированных фракций мигрировали через 8О8-РАОЕ и окрашивались кумасси голубым или серебром для подтверждения присутствия и степени чистоты экспрессированных эндопептидаз. Фиг. 4 показывает уровни экспрессии, полученные для эндопеп-140 и эндопеп-40 после индукции в сравнении с неиндуцированным контрольным штаммом.
Ферментативную активность общих экстрактов, полученных из штаммов Е.соН, трансформированных пустым рЕТ28Ь и рЕТ28Ь-эндопеп-140 или рЕТ28Ь-эндопеп-40, соответственно, тестировали с Сукцинил-А1а-А1а-Рго-РНе-АМС в качестве субстрата.
Ферментативная активность была обнаружена в экстрактах из штаммов рЕТ28Ь-эндопеп, в то время как отрицательный контроль не проявил никакой активности.
Пример 3. Биологическая активность эндопептидаз.
3.1. Разрушение 33-мерного токсичного пептида глиадина при кислотном рН.
Раствор 33-мерного иммунотоксичного пептида глиадина (50 мкМ) инкубировали при 37°С в течение времени до 2 часов в присутствии 4 мкЕд эндопеп-140 или 2 мкЕд эндопеп-40 в присутствии или отсутствии пепсина 1 мг/мл. Реакцию осуществляли в уксусной кислоте 20 мМ рН 3, при общем объеме 300 мкл. Мониторинг реакции проводили в различные моменты времени от 0 до 120 мин (10, 13, 115, 130, 160 и 1120 мин) при 37°С. Исчезновение 33-мерного пептида и появление продуктов разрушения регистрировали посредством ВЭЖХ-МС-анализа. Отбирали аликвоты по 50 мкл, и активность ферментов останавливали с помощью смеси 50 мкл Н20: СΗзСN 50:50 (+0,1% муравьиная кислота). Образцы подвергали ВЭЖХ-МС, анализировали на масс-спектрометре 1,Т()-Х1, (ТНегто ПзНег 8шепййс, 8ап 1озе, Сай&гша, И8А). Профили ВЭЖХ-МС, полученные для эндопеп-140, эндопеп-140 и пепсина, пепсина по отдельности, приведены на Фигурах 5, 6, 7, соответственно. Исчезновение 33-мерного пептида было очевидным после 2 ч инкубации. Все пептиды, обнаруженные после инкубации 33-мерного пептида с 4 мкл эндопеп140, или 2 мкл эндопеп-40, приведены в табл. 2 и 3, соответственно.
После 2 ч инкубации наблюдаемый наиболее интенсивный пик имеет статус заряда, равный 1, и соответствует [МН]+ 748,4, указывая на присутствие малых пептидов. Этот сигнал также появляется первым. На основании 33-мерной последовательности, четыре (1-6, 8-13, 15-20, 22-27) пептида соответствуют этой молекулярной массе, причем все составлены из 6 остатков. В соответствии с МС анализом расщепленного 33-мера, остатки глутаминовой кислоты вместо остатков глутамина присутствуют в гидролизованной пептидной последовательности, таким образом, позволяя предположить деамидирование субстрата. Анализ показал, что после 2 часов инкубации 33-мера с пепсином гидролиз почти не наблюдался (фиг. 7 и табл. 2 и 3) в соответствии с литературными данными.
Увеличение количества эндопеп-140 вплоть до 8 мкЕд или эндопеп-40 до 9 мкЕд приводило в результате к полному исчезновению 33-мера через 2 ч при рН 3 (не показано).
Даже в присутствии пепсина наблюдается такая же схема разрушения, несмотря на то, что количество интактного пептида через 2 ч является более высоким, чем в его отсутствие, позволяя предположить, что эндопептидазы не разрушаются под действием пепсина.
- 19 028228
3.2. Анализ ВЭЖХ/МС.
Анализ ВЭЖХ осуществляли, используя масс-спектрометр с ионной ловушкой. ЬТЦ-ХЬ или АПуаШаде, присоединенный к насосу Ассе1а или §игуеуог (ТПегтойвПег §с1епййс, §ап 1ове, СА, и§А) применяли при характеризации гидролизатов ферментного белка, полученных под действием ферментной смеси. Пептиды разделяли, используя колонку ТПегтойвПег §с1епййс НурегвП до1П или колонку симметрии С18 (Ща1егв, МйГогП, Мавв., и§А) в сочетании с градиентом 0,1% муравьиной кислоты в воде М1Ш О (МПИроге, ВеПГогП, Мавв., и§А) (Раствор А) и 0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле (раствор В) для элюирования. Градиент начинался при 95% раствора А и возрастал до 60% раствора В. Подробную информацию по индивидуальным пептидам, получали используя скан-зависимый МС/МС алгоритм, который является характеристическим алгоритмом для масс-спектрометра с ионной ловушкой. Анализ полного сканирования сопровождался анализом в увеличенном масштабе для определения состояния заряда наиболее интенсивного иона в диапазоне масс при полном сканировании. 33-мер (М=3910) применяли для настройки на оптимальную чувствительности в МС-режиме и на оптимальную фрагментацию в режиме МС/МС, осуществляя постоянную инфузию 60 мкг/мл, что приводило в основном к двухзарядным и трехзарядным типам ионов в режиме МС, и оптимальной энергии столкновения около 35% в режиме МС/МС.
Пример 4. Биологическая активность эндопептидаз.
4.1. Разрушение гидролизованной смеси глиадина и глютена.
Благодаря специфичному структурному признаку пролилолигопептидазы не могут расщеплять крупные пептиды, обычно длинее 30 аминокислот. Также, трипептидил-протеаза седолизин не может гидролизовать глиадин без добавления пролилпротеазы. Это ограничение является очевидным недостатком для фермента, значение которого состоит в том, чтобы гидролизовать настолько быстро и настолько эффективно, насколько возможно все потенциальные токсичные пролин-обогащенные пептиды.
Эндопеп-140 и эндопеп-40 из АсйпоаПотигив инкубировали с глиадинами, чтобы увидеть, способны ли эндопротеазы АсйпоаПотигив расщеплять цельные белки. Образованные продукты гидролиза анализировали посредством §0§-РЛСЕ.
Раствор глиадина получали растворением глиадинового порошка (§1дта С3375) в 70% этаноле при 70°С при концентрации 10 мг/мл (20 мкМ). Интактные молекулы глиадина состоят из смеси белков с 4055 кДа. Глиадин инкубировали при 37°С с 10 мкл (5 мкЕд) эндопротеаз АсйпоПотигив в уксусной кислоте 20 мМ рН 3 в конечном объеме 0,3 мл. Реакции осуществляли в ТПегтот1хег (ЕррепПогГ АС, НатЬигд, Сеггтапу) как в отсутствие, так и в присутствии пепсина при 1 мг/мл (фиг. 8). Мониторинг реакций проводили при различных интервалах времени, 30 мкл образцов отбирали из инкубационной смеси при значениях времени 0, 30 мин, 1 и 2 ч и выдерживали при 4°С до §И§-РАОЕ. Все материалы, используемые для §И§-РАСЕ и окрашивания, были приобретены от Вю-РаП (Вю-РаП ЬаЬогаФйев, 1пс., Негси1ев, СА, и§А). Образцы готовили, используя буфер для образцов, в соответствии с инструкциями изготовителя и разделяли на любом типе гелей В1в-Тйв, применяя буферную систему §Ό§ в соответствии с инструкциями изготовителя. Окрашивание осуществляли, используя Кумасси Р250 или серебро.
Как можно видеть на фиг. 8, глиадин расщепляется под действием эндопептидаз, производимых Асйпо11отигив, на небольшие пептиды до почти полного расщепления за 2 ч. Распад продукта можно видеть по снижению интенсивности полосы на §И§-геле. Этот эксперимент также показывает, что пепсин не оказывает воздействия на эффективность расщепления.
- 20 028228
Таблица 1
Предполагаемые белки, очищенные из секретома Асйпоа11отиги§
А
БелокЫ | ВЬА8Т учетный номер | ВЬА8Т аннотация | ГСредняя | примечания |
8ец 48773 | ΥΡ_003835151.1 | Пептидаза 88/853 | 101,9 | Эндопеп-140 |
5ец_100531 | 0Ь]1ВА132040.1 | предполагаемая липаза | 20,2 | |
8ед_293141 | н.р. | н.р. | 10,14 |
В
БелокЫ | ВЬА8Т учетный номер | ВЬА8Т аннотация | ГСредняя | примечания |
8ец_44766 | ΖΡ_06921971.1 | секретируемый белок | 40,14 | |
8еч_72108 | ¥Р_003114375.1 | Пептидаза 88/853 | 30,25 | Эндопеп-40 |
8ед_48773 | ΥΡ_003835151.1 | Пептидаза 88/853 | 20,15 | Эндопеп-140 |
3ец_293141 | н.р. | н.р. | 10,15 |
Очищенные фракции из Ас1тоа11отиги§ отфильтровывали с пределом пропускания молекулярной массы, равным 100 кДа, и подвергали анализу методом остронаправленной МС. Идентифицированные пептиды выравнивали против белков, полученных вследствие трансляции генома Ас1тоа11отига§ (Белок _1й: внутренний код для последовательности предполагаемого белка), и последовательный анализ ш §Шсо посредством ВЬА8Т свидетельствовал о гомологе известного белка (учетный номер ВЬА8Т: код последовательности; аннотация ВЬА8Т: название белка; н.р.: нет результата). Число совпадающих спектров давало полуколичественную меру оценки количеств белка, указанную как частота (Р_средняя). А: данные, полученные по фракции >100 кДа; В: данные, полученные по фракции <100 кДа.
- 21 028228
Таблица 2
Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера эндопеп-140
1 5 | 10 | 15 | 20 | 25 30 |
ь (Η ОР | Р р ОР ОЬ Р | Υ Р () Р | () Ь Ρ Υ Р | ()Ρ(ΗΡΥΡ()Ρ(3ΡΡ |
Время инкубации | Массовый сигнал | Зарядный статус | Выведенная пептидная последовательность | Примечания |
То | 1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 100% остаточные |
Т30 | 1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 50% остаточные | |
Тзо + пепсин | 1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 70% остаточные | |
Т2ч | 1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | Наиболее интенсивный пик | |
1068,24 | 1 [МН]+ | 16-24 | ||
845,27 | 1 [МН]+ | 1-7 | следы | |
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 20% остаточные | |
Т2ч + пепсин | 1088,8 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1068,24 | 1 [МН]+ | 16-24 | ||
845,27 | 1 [МН]+ | 1-7 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 45% остаточные | |
Контроль т2ч | 1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч.]+ | 1-33 | 95% остаточные |
Все молекулярные массы, обнаруживаемые посредством ВЭЖХ-МС после расщепления 33-мерного глиадинового пептида (50 мкМ) 4 мкЕд эндопеп-140 в присутствии и в отсутствие пепсина (1 мг/мл). Контроль получают посредством инкубации 33-мера с пепсином по отдельности. Инкубация при 37°С, уксусная кислота 20 мМ, рН 3.
- 22 028228
Таблица 3
Пептиды, высвобождаемые при расщеплении 33-мера эндопеп-40
1 5 | 10 | 15 | 20 | 25 | 30 |
ь 0 ь Э р | Р Р э Р О Ь Р | γ р Э р | Э ь р γ р | Э р 0 ь р γ р | Э р Э р р |
Время инкубации | Массовый сигнал | Зарядный статус | Выведенная пептидная последовательность | примечания |
То | 1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 100% остаточные |
Тзо | 1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | |
1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 50% остаточные | |
Тзо + пепсин | 1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 70% остаточные | |
Т2ч | 1088,73 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 20% остаточные | |
т2ч + пепсин | 1088,8 | 1 [МН]+ | 25-33 | |
1197,45 | 1 [МН]+ | 1-10 | ||
748,45 | 1 [МН]+ | 1-6; 8-13; 15-20; 22-27 | ||
1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 30% остаточные | |
Контроль Т2ч | 1306,27; 1956,64 | 3 [М-ЗН]+; 2 [М-2ч,]+ | 1-33 | 95% остаточные |
Все молекулярные массы, обнаруживаемые посредством ВЭЖХ-МС после расщепления 33-мерного глиадинового пептида (50 мкМ) 2 мкЕд эндопеп-40 в присутствии и в отсутствие пепсина (1 мг/мл) при различных интервалах времени. Контроль получают посредством инкубации 33-мера с пепсином по отдельности. Инкубация при 37°С, уксусная кислота 20 мМ, рН 3.
- 23 028228
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> Ροπόαζίοηθ 1зЕ1ЕиЕо 1пзиЬг1со Ы КЪсегса рег 1а 71;а (Ρΐΐκν) <120> НОВЫЕ ПРОТЕАЗЫ ИЗ АКТИНОМИЦЕТА АсттыоАььомикиз, СПОСОБНЫЕ ГИДРОЛИЗО-
ВАТЬ ГЛЮТЕНОВЫЕ ПЕПТИДЫ | И БЕЛКИ ПРИ КИСЛОТНОМ РН | |
<130> | 072110 | |
<160> | 15 | |
<170> | РаЕепЕ1п иегз1оп | 3.5 |
<210> <211> <212> <213> | 1 1390 БЕЛОК АсЕ1поа11отигиз | |
<220> <221> <222> | РКОРЕР (1)..(1390) | |
<400> | 1 |
МеЕ 1 | Рго | Азр | Ьеи | Рго 5 | ТЬг | О1п Агд | Агд | Бег 10 | Рго | Агд | Агд | Бег | Агд 15 | Агд | |
Рго | А1а | Уа1 | Ьеи | А1а | Агд | Ьеи | А1а | О1у | Ьеи | Агд | Уа1 | О1у | А1а | Ьеи | Уа1 |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ьеи | А1а | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | ТЬг | Ьеи | ТЬг | Ьеи | 11е | Бег | МеЕ | Рго | Бег | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Азп | А1а | А1а | Рго | А1а | Ьуз | Рго | Уа1 | Уа1 | Рго | Н1з | А1а | Ьуз | А1а | Бег | Бег |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Рго | ТЬг | А1а | О1п | О1у | О1п | Н1з | Рго | ТЬг | Бег | Агд | Уа1 | Суз | Агд | ТЬг | Рго |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
О1у | Агд | А1а | Азп | О1и | МеЕ | ТЬг | Суз | Ьеи | А1а | МеЕ | Уа1 | Агд | Азр | Азр | Уа1 |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | О1у | Рго | Ьуз | О1у | Уа1 | О1п | А1а | Азп | Азр | А1а | Рго | А1а | О1у | РЬе | О1у |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | А1а | Азр | Ьеи | Ьеи | Азп | А1а | Туг | Азп | Ьеи | Рго | Бег | А1а | О1у | Бег | ТЬг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
О1и | ТЬг | Уа1 | А1а | 11е | Уа1 | Азр | А1а | РЬе | Азр | Азп | Рго | Азп | А1а | О1и | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Азр | Ьеи | О1у | Уа1 | Туг | Агд | О1п | О1п | Туг | О1у | Ьеи | Рго | А1а | Суз | ТЬг | ТЬг |
145 | 150 | 155 | 160 |
- 24 028228
А1а | Азп О1у Суз | РЬе 165 | Ьуз | Ьуз | 11е | Азр | О1п Агд 170 | О1у | О1у | ТЬг | Зег 175 | Туг | |||
Рго | Рго | Рго | Азр | А1а | О1у | Тгр | А1а | О1у | О1и | 11е | А1а | Ьеи | Азр | 11е | Азр |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
МеЕ | Уа1 | Зег | А1а | 11е | Суз | Рго | ТЬг | Суз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьеи | Уа1 | О1и | А1а |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Азр | Азр | Азп | Туг | МеЕ | Азр | Азп | Ьеи | О1у | ТЬг | А1а | Уа1 | Азп | О1п | А1а | Уа1 |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Зег | С1п | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | Зег | Азп | Зег | Туг | О1у | О1у | Зег | О1и | О1у |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Азр | О1и | О1у | О1п | А1а | Азр | Азр | А1а | Туг | РЬе | Н1з | Н1з | Азр | О1у | Уа1 |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | 11е | ТЬг | А1а | Зег | Зег | О1у | Азр | Зег | О1у | Туг | О1у | А1а | Зег | Туг | Рго |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | А1а | Зег | Рго | Туг | Уа1 | ТЬг | Зег | Уа1 | О1у | О1у | ТЬг | Зег | Ьеи | А1а | Ьуз |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Азр | ТЬг | Зег | Зег | Зег | Агд | О1у | Тгр | ТЬг | О1и | Зег | ТЬг | Тгр | Азп | О1у | А1а |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
О1у | Зег | О1у | Суз | Зег | А1а | Туг | О1и | ТЬг | Ьуз | Рго | Зег | РЬе | О1п | Ьуз | Азр |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
ТЬг | С1у | Суз | А1а | Агд | Агд | ТЬг | 11е | А1а | Азр | Уа1 | Зег | А1а | Уа1 | А1а | Азр |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Рго | Азп | ТЬг | О1у | Уа1 | А1а | Уа1 | Туг | Азп | О1у | О1у | Тгр | Н1з | Уа1 | Туг | О1у |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
О1у | ТЬг | Зег | Уа1 | Зег | А1а | Рго | 11е | 11е | А1а | Зег | Уа1 | Туг | А1а | Ьеи | О1у |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
О1у | А1а | Рго | А1а | А1а | О1у | Зег | А1а | Рго | Азп | Зег | РЬе | Рго | Туг | Азр | Н1з |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Рго | А1а | Азр | Ьеи | Азп | Азр | Уа1 | ТЬг | Зег | О1у | Зег | Азп | О1у | Зег | Суз | Зег |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Рго | А1а | Туг | Ьеи | Суз | ТЬг | А1а | О1у | ТЬг | О1у | Туг | Азр | О1у | Рго | ТЬг | О1у |
- 25 028228
405 410 415
Ьеи | О1у | ТЬг | Рго 420 | Азп О1у | 11е | А1а А1а 425 | РЬе | Агд | Зег | О1у | Рго 430 | Н1з | А1а | ||
Уа1 | Уа1 | ТЬг | О1у | ТЬг | Уа1 | ТЬг | Азр | О1у | ТЬг | А1а | Рго | Ьеи | А1а | Зег | А1а |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
О1п | Уа1 | Ьуз | А1а | О1у | Азр | Уа1 | ТЬг | А1а | ТЬг | ТЬг | Азр | О1у | О1п | О1у | Н1з |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Туг | ТЬг | Ьеи | Зег | Уа1 | Рго | Рго | О1у | ТЬг | Туг | Азр | Уа1 | Зег | А1а | Зег | Ьуз |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
РЬе | О1у | Туг | ТЬг | О1у | Ьуз | ТЬг | 11е | Зег | О1у | Уа1 | О1п | Уа1 | А1а | Азр | О1у |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
О1п | ТЬг | Уа1 | ТЬг | О1и | Азр | РЬе | А1а | Ьеи | ТЬг | А1а | Ьуз | А1а | Агд | Уа1 | Азр |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
ναι | Зег | О1у | Ьеи | Уа1 | Агд | Азр | О1у | Зег | О1у | Н1з | О1у | Тгр | Рго | Уа1 | Туг |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | Уа1 | Агд | Уа1 | Ьуз | Азр | О1п | Рго | ТЬг | А1а | Уа1 | А1а | Туг | ТЬг | Азр |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Рго | Ьуз | ТЬг | О1у | Агд | Туг | ТЬг | Ьеи | Зег | Ьеи | Рго | ТЬг | Азр | Азр | ТЬг | Туг |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
ТЬг | Ьеи | О1п | Уа1 | Азр | Рго | Ьеи | Туг | Рго | О1у | Туг | ТЬг | О1п | Азр | Зег | Н1з |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Азр | Уа1 | ТЬг | Уа1 | ТЬг | Зег | А1а | Азр | Уа1 | Уа1 | Н1з | Азр | Уа1 | Азп | Уа1 | А1а |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
ναι | Азр | О1п | ТЬг | ТЬг | Суз | Зег | А1а | Рго | О1у | Туг | Зег | Туг | Н1з | Туг | А1а |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
О1у | А1а | ТЬг | О1п | Рго | РЬе | Азр | О1у | ТЬг | ТЬг | А1а | Рго | А1а | О1у | Тгр | ТЬг |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
ναι | Азр | Азр | Ьуз | Уа1 | О1у | Азп | О1у | О1п | ТЬг | Тгр | Уа1 | РЬе | Азп | Азр | Рго |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
О1у | Зег | Агд | О1у | Азп | Ьуз | ТЬг | О1у | О1у | ТЬг | О1у | О1у | РЬе | А1а | Уа1 | 11е |
645 650 655
- 26 028228
Азр | Зег | Азр | Н1з 660 | Туг | О1у Зег | О1у | Азп ТЬг О1п Азр 665 | Зег | ТЬг 670 | Ьеи | РЬе | ||||
Зег | Рго | Уа1 | ТЬг | Азр | РЬе | Зег | А1а | Агд | ТЬг | Н1з | Рго | 11е | Ьеи | Зег | РЬе |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Агд | Зег | Азр | Тгр | Туг | О1у | Туг | ТЬг | О1у | О1п | А1а | О1у | Азр | Ьеи | Азр | Ьеи |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Зег | Уа1 | Азр | О1у | О1у | ТЬг | ТЬг | Тгр | ТЬг | Азп | Ьеи | Ьуз | Н1з | Туг | ТЬг | А1а |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Зег | О1и | Агд | О1у | Рго | Агд | ТЬг | О1и | ТЬг | МеБ | Азр | Ьеи | Зег | А1а | А1а | А1а |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
О1у | Ьуз | Зег | А1а | Уа1 | О1п | Уа1 | Агд | РЬе | Н1з | РЬе | ТЬг | О1у | Ьуз | РЬе | О1у |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Туг | Туг | Тгр | О1п | Уа1 | Азр | Азр | Уа1 | РЬе | Ьеи | О1у | Азр | Агд | ТЬг | Суз | Азр |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Рго | ТЬг | Зег | О1у | О1у | Ьеи | Уа1 | Уа1 | О1у | О1п | Уа1 | ТЬг | Азр | А1а | Азп | ТЬг |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
О1у | А1а | О1у | Уа1 | А1а | О1у | А1а | ТЬг | Уа1 | ТЬг | Зег | Уа1 | Азр | Агд | Рго | А1а |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
О1и | Ηΐ3 | А1а | ТЬг | Зег | А1а | А1а | ТЬг | Рго | Азр | Азр | Рго | Азп | Ьеи | О1у | Азр |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
О1у | Ьеи | РЬе | Тгр | МеБ | РЬе | Зег | Зег | Уа1 | ТЬг | О1у | Зег | Н1з | Ьуз | РЬе | ТЬг |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | А1а | О1у | Азп | Туг | Азр | Зег | Н1з | Азр | Уа1 | ТЬг | Уа1 | Азп | Уа1 | А1а |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
А1а | Азп | Тгр | А1а | ТЬг | А1а | А1а | Азр | 11е | А1а | Ьеи | Зег | А1а | Рго | Агд | Ьеи |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
ТЬг | Уа1 | ТЬг | Рго | О1у | А1а | 11е | Зег | Ьуз | ТЬг | Уа1 | О1у | Тгр | О1п | Ьуз | А1а |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
А1а | ТЬг | А1а | А1а | Ьеи | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Азп | ТЬг | О1у | ТЬг | Зег | Рго | Уа1 | ТЬг |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
А1а | Ьуз | 11е | О1у | О1и | О1п | Рго | О1у | О1у | Зег | ТЬг | ТЬг | А1а | ТЬг | А1а | О1у |
900 | 905 | 910 |
- 27 028228
А1а | Рго | Ьеи 915 | О1п Агд | Уа1 | Ьуз | О1у Азр 920 | РЬе | А1а | Зег О1у Агд 925 | Ьеи | О1п | ||||
О1п | О1у | Ьуз | А1а | Зег | О1у | А1а | Ьуз | А1а | О1у | Уа1 | ТЬг | Рго | Туг | А1а | Рго |
930 | 935 | 940 | |||||||||||||
Рго | Тгр | ТЬг | А1а | 11е | А1а | Азр | Туг | А1а | Зег | Рго | 11е | МеЬ | Азр | Азп | О1у |
945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
А1а | Уа1 | А1а | Ьеи | Азп | О1у | Ьуз | 11е | Туг | Зег | Уа1 | А1а | О1у | Уа1 | Азр | О1у |
965 | 970 | 975 | |||||||||||||
А1а | Азп | Уа1 | Ьеи | Азп | Ьуз | А1а | Туг | А1а | Туг | Азр | Рго | О1у | ТЬг | О1п | А1а |
980 | 985 | 990 |
Тгр ТЬг А1а 11е А1а Рго Ьеи А1а ТЬг О1у Агд О1и А1а Рго О1п А1а 995 1000 1005
ТЬг ТЬг | ТЬг | О1у О1у | Ьуз | Ьеи 1015 | Туг Уа1 | ТЬг | О1у | О1у 1020 | Тгр | О1у | Зег | |||
1010 | ||||||||||||||
ТЬг | О1у | А1а | А1а | Уа1 | А1а | Ьуз | ТЬг | О1и | 11е | РЬе | Азр | Рго | Зег | Зег |
1025 | 1030 | 1035 | ||||||||||||
О1у | А1а | Тгр | Зег | А1а | О1у | А1а | Азр | Азп | Рго | Ьуз | Рго | Туг | А1а | О1у |
1040 | 1045 | 1050 | ||||||||||||
Зег | О1у | А1а | А1а | Уа1 | Ьеи | Азр | О1у | Ьуз | 11е | Туг | Уа1 | Уа1 | О1у | О1у |
1055 | 1060 | 1065 | ||||||||||||
Суз | Ьеи | А1а | ТЬг | Суз | О1у | ТЬг | Ьуз | Азр | Уа1 | О1п | Уа1 | Туг | Азр | Рго |
1070 | 1075 | 1080 | ||||||||||||
А1а | А1а | Азп | Зег | Тгр | Зег | Зег | О1у | Рго | А1а | Туг | Рго | О1и | Азп | ТЬг |
1085 | 1090 | 1095 | ||||||||||||
А1а | Тгр | Ьеи | О1у | Суз | А1а | О1у | 11е | Азр | О1у | Ьуз | Ьеи | Туг | Суз | А1а |
1100 | 1105 | 1110 | ||||||||||||
О1у | О1у | Зег | А1а | А1а | А1а | Зег | ТЬг | Ьуз | Н1з | О1у | Туг | Уа1 | Ьеи | Азр |
1115 | 1120 | 1125 | ||||||||||||
Рго | А1а | Зег | О1у | ТЬг | Тгр | Зег | Рго | 11е | А1а | Азр | Ьеи | Рго | 11е | Азр |
1130 | 1135 | 1140 | ||||||||||||
Ьеи | Тгр | А1а | МеЁ | О1у | Туг | Зег | А1а | А1а | Азп | О1у | Ьуз | Ьеи | 11е | Уа1 |
1145 1150 1155
- 28 028228
Зег | О1у 1160 | О1у Уа1 | ТЬг | Азп | О1у 1165 | А1а | Зег | ТЬг | Ьеи | ТЬг 1170 | Азп | О1п | О1у | |
РЬе | А1а | Туг | Азр | Рго | Зег | А1а | Азп | Зег | Тгр | ТЬг | А1а | Ьеи | Рго | Азп |
1175 | 1180 | 1185 | ||||||||||||
Зег | Азп | Азп | А1а | Ьеи | Туг | Агд | О1у | А1а | Зег | А1а | Суз | О1у | РЬе | Туг |
1190 | 1195 | 1200 | ||||||||||||
Ьуз | 11е | О1у | О1у | Зег | Ьеи | О1у | О1п | РЬе | Азп | А1а | Уа1 | Ьуз | Зег | О1у |
1205 | 1210 | 1215 | ||||||||||||
О1и | Уа1 | Ьеи | Рго | О1у | Туг | Азр | О1п | Суз | А1а | Зег | ТЬг | А1а | Азр | Уа1 |
1220 | 1225 | 1230 | ||||||||||||
Рго | Тгр | Ьеи | Зег | О1и | Азр | Ьуз | ТЬг | О1и | Уа1 | ТЬг | 11е | О1п | Рго | О1у |
1235 | 1240 | 1245 | ||||||||||||
О1п | Зег | Уа1 | Ьуз | Уа1 | Азп | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Азр | А1а | Азп | Уа1 | Рго | А1а |
1250 | 1255 | 1260 | ||||||||||||
11е | ТЬг | О1п | Рго | О1у | ТЬг | Туг | ТЬг | А1а | О1п | Ьеи | ТЬг | Уа1 | О1у | А1а |
1265 | 1270 | 1275 | ||||||||||||
Ьуз | ТЬг | Рго | Туг | А1а | 11е | Рго | Рго | Уа1 | А1а | Уа1 | ТЬг | МеЬ | ТЬг | Уа1 |
1280 | 1285 | 1290 | ||||||||||||
Азп | Рго | Рго | О1у | ТЬг | Тгр | О1у | Ьуз | 11е | ТЬг | О1у | ТЬг | Ьеи | ТЬг | О1у |
1295 | 1300 | 1305 | ||||||||||||
А1а | О1у | Суз | ТЬг | О1у | Зег | Рго | А1а | Рго | Ьеи | ТЬг | О1у | А1а | ТЬг | Ьеи |
1310 | 1315 | 1320 | ||||||||||||
О1п | 11е | Азр | Зег | Тгр | А1а | А1а | Зег | Туг | ТЬг | Ьеи | Ьуз | ТЬг | Азр | Ьуз |
1325 | 1330 | 1335 | ||||||||||||
Азп | О1у | О1п | Туг | А1а | Ьеи | Тгр | Ьеи | Азр | Уа1 | Агд | Азп | Азп | Рго | Ьеи |
1340 | 1345 | 1350 | ||||||||||||
ТЬг | Ьеи | 11е | А1а | А1а | Ьуз | Азр | О1у | Тгр | А1а | Рго | О1п | ТЬг | Агд | Азп |
1355 | 1360 | 1365 | ||||||||||||
Уа1 | Ьуз | 11е | ТЬг | Ьуз | Ьеи | ТЬг | Зег | ТЬг | ТЬг | А1а | Азр | РЬе | ТЬг | Ьеи |
1370 | 1375 | 1380 | ||||||||||||
Ьуз | Рго | Азр | Нгз | ТЬг | Суз | Зег |
- 29 028228
1385 1390 | |
<210> | 2 |
<211> | 398 |
<212> | БЕЛОК |
<213> | АсЁ1поа11отигиз зр. |
<220>
<221> РКОРЕР <222> (1)..(398) <400> 2
МеЁ 1 | Зег Агд Агд | Уа1 5 | ТЬг | О1у | ТЬг | 11е | Ьеи О1у О1у Ьеи 10 | 11е | Ьеи 15 | А1а | |||||
МеЁ | Уа1 | Рго | РЬе | Ьеи | Зег | ТЬг | А1а | А1а | Азп | А1а | А1а | Рго | О1п | А1а | А1а |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Рго | А1а | Зег | Уа1 | Зег | Ηΐ3 | Рго | РЬе | Н1з | Н1з | Зег | Суз | А1а | ТЬг | Уа1 | Ьуз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Рго | О1у | Агд | А1а | Зег | Суз | Азп | А1а | Ьеи | Уа1 | Агд | Зег | Азр | 11е | А1а | О1п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Зег | А1а | А1а | ТЬг | Ьеи | А1а | Ηΐ3 | О1п | А1а | А1а | А1а | Рго | Зег | О1у | Ьеи | Зег |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Рго | А1а | Азп | Ьеи | О1п | Зег | А1а | Туг | Ьуз | Ьеи | Рго | Зег | Зег | ТЬг | А1а | О1у |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Зег | О1у | О1п | ТЬг | Уа1 | А1а | 11е | Уа1 | Азр | А1а | Туг | Азр | А1а | Рго | ТЬг | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
О1и | А1а | Азр | Ьеи | Азп | Уа1 | Туг | Агд | Зег | О1п | РЬе | О1у | Ьеи | О1у | А1а | Суз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | А1а | Азп | О1у | Суз | РЬе | Ьуз | Ьуз | Уа1 | Азр | О1п | Азп | О1у | О1у | ТЬг |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Зег | Туг | Рго | Агд | Ьуз | Азр | О1у | О1у | Тгр | А1а | О1п | О1и | 11е | Зег | Ьеи | Азр |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ьеи | Азр | МеЁ | Уа1 | Зег | А1а | Уа1 | Суз | Рго | Азп | Суз | Ьуз | 11е | Уа1 | Ьеи | Уа1 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
О1и | А1а | Ьуз | ТЬг | Азп | Зег | РЬе | А1а | Азп | Ьеи | О1у | ТЬг | А1а | О1и | Азп | ТЬг |
180 | 185 | 190 |
- 30 028228
А1а А1а | Зег Ьеи А1а 195 | Азп Уа1 | 11е 200 | Зег Азп Зег Туг О1у 205 | О1у | Зег | Азр | ||||||||
А1а | Зег | Азр | А1а | Зег | Туг | О1у | Зег | Туг | Туг | Азп | Н1з | Рго | О1у | Ьуз | А1а |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
11е | ТЬг | Уа1 | Зег | Зег | О1у | Азр | А1а | О1у | Туг | О1у | Уа1 | О1и | Туг | Рго | А1а |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Зег | Ηΐ3 | Туг | Уа1 | ТЬг | А1а | Уа1 | О1у | О1у | ТЬг | Зег | Ьеи | Агд | ТЬг | А1а |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Зег | ТЬг | Зег | Агд | О1у | Тгр | Зег | О1и | ТЬг | А1а | Тгр | Зег | О1у | А1а | О1у | Зег |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
О1у | Суз | Зег | А1а | Туг | Азп | ТЬг | А1а | Ьеи | Зег | О1у | О1п | Зег | О1у | Ьеи | ТЬг |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
О1у | Суз | Зег | Агд | Агд | А1а | Уа1 | А1а | Азр | Уа1 | Зег | А1а | Уа1 | А1а | Азр | Рго |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | О1у | Уа1 | А1а | Уа1 | Туг | Азр | Зег | ТЬг | А1а | Туг | О1п | О1у | О1п | Зег |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
О1у | Тгр | МеЬ | Уа1 | РЬе | О1у | О1у | ТЬг | Зег | Уа1 | А1а | А1а | Рго | 11е | 11е | О1у |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
О1у | Уа1 | Туг | О1у | Ьеи | А1а | А1а | Азп | А1а | А1а | Зег | 11е | Азр | Азп | Азп | Туг |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Рго | Туг | А1а | Ηΐ3 | ТЬг | Зег | Зег | Ьеи | РЬе | Азр | Уа1 | ТЬг | Зег | О1у | Зег | Азп |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
О1у | ТЬг | Суз | ТЬг | ТЬг | ТЬг | Ьуз | Тгр | Суз | ТЬг | А1а | О1у | ТЬг | О1у | Тгр | Азр |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1у | Рго | ТЬг | О1у | Ьеи | О1у | ТЬг | Рго | Азп | О1у | ТЬг | О1у | А1а | РЬе |
385 390 395 <210> 3 <211> 1094 <212> БЕЛОК <213> АсЬ1поа11отигиз <220>
<221> РКОРЕР
<222> | (1). | .(1094 |
<400> | 3 |
- 31 028228
МеЁ 1 | Зег | А1а | А1а Уа1 5 | Уа1 | 11е | РЬе | А1а | О1у А1а 10 | Рго | А1а ТЬг | А1а 15 | А1а | |||
Рго | ТЬг | Рго | О1и | О1у | Зег | О1у | Агд | ΗΪ8 | Тгр | ТЬг | А1а | ТЬг | Рго | Ьеи | Зег |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
О1у | ТЬг | Уа1 | Уа1 | О1п | О1у | РЬе | Ьуз | Зег | ТЬг | ТЬг | О1у | Агд | Ьеи | А1а | Ьуз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Зег | Азр | А1а | О1у | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Ьуз | Зег | Зег | Ьуз | Рго | Уа1 | Н1з | Уа1 |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
МеЁ | Уа1 | Ьуз | Ьеи | Азр | Туг | Азр | Зег | Ьеи | А1а | А1а | Туг | Агд | О1у | О1у | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Рго | О1у | Туг | А1а | А1а | ТЬг | Зег | Рго | А1а | Уа1 | ТЬг | О1у | Н1з | ТЬг | Ьеи | Азр |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | А1а | Зег | А1а | О1у | А1а | Агд | Агд | Туг | О1п | О1у | Туг | 11е | О1у | О1у | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
О1и | Азп | Агд | РЬе | Агд | А1а | А1а | Ьеи | О1у | Ьуз | Агд | Ьеи | Рго | О1у | А1а | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
А1а | О1у | О1у | О1у | Ьеи | Агд | ТЬг | Уа1 | Туг | О1у | О1у | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | Ьеи |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Рго | О1у | Азр | Ьуз | Уа1 | А1а | Азр | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Ьеи | Рго | О1у | Уа1 | А1а | А1а |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Уа1 | О1п | О1и | Азр | А1а | Уа1 | А1а | Ьуз | Рго | Ьеи | ТЬг | Азр | Зег | Зег | Рго | О1у |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
РЬе | 11е | О1у | А1а | Рго | ТЬг | 11е | Туг | Ьуз | О1п | Ьеи | О1у | О1у | Зег | Азр | Зег |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Зег | О1у | Ьуз | О1у | Уа1 | 11е | Уа1 | О1у | Азр | Ьеи | Азр | Зег | О1у | А1а | Тгр | Рго |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
О1и | Ηΐ3 | Рго | Зег | Туг | Ьуз | Азр | Зег | О1у | Ьуз | Ьеи | Рго | А1а | Рго | Рго | Рго |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | Азр | О1у | А1а | Рго | Агд | Рго | Суз | Азр | РЬе | О1у | Азр | Азп | Рго | Ьеи |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
ТЬг | Рго | А1а | Азп | Азр | Рго | Туг | Уа1 | Суз | Азр | Нтз | Ьуз | Ьеи | 11е | Зег | О1у |
245 250 255
- 32 028228
О1п | Рго | РЪе | Ьеи Азр 260 | ТЪг Туг | Азп А1а 265 | Уа1 | Уа1 | О1у О1у | О1и 270 | Агд | РЪе | ||||
Рго | Азр | Зег | А1а | Агд | Азр | Зег | Азр | О1у | Н1з | О1у | ТЪг | Н1з | ТЪг | Зег | ТЪг |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
ТЪг | А1а | А1а | О1у | Зег | А1а | Уа1 | Зег | Н1з | А1а | Азп | Рго | Ьеи | О1у | 11е | Азр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Агд | О1у | А1а | 11е | Н1з | О1у | 11е | А1а | Рго | А1а | А1а | Н1з | 11е | А1а | Уа1 | Туг |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ьуз | Уа1 | Суз | О1у | А1а | О1п | О1у | Суз | РЪе | О1п | Зег | Азр | Зег | Уа1 | А1а | А1а |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | О1п | Агд | А1а | 11е | Ьеи | Азр | Ьуз | Уа1 | Агд | Уа1 | 11е | Азп | Туг | Зег | 11е |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Зег | О1у | О1у | Уа1 | Азр | Рго | Туг | Зег | Азр | Рго | Уа1 | О1и | Ьеи | А1а | РЪе | Ьеи |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азр | А1а | Туг | А1а | А1а | О1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Зег | А1а | Зег | А1а | О1у | Азп | Азр |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
О1у | Рго | ТЪг | А1а | О1у | ТЪг | Уа1 | Азп | Н1з | Азп | О1у | Рго | Тгр | Уа1 | ТЪг | ТЪг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | А1а | Зег | ТЪг | О1п | О1п | Агд | ТЪг | РЪе | О1п | Зег | ТЪг | Уа1 | ТЪг | Ьеи |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
О1п | А1а | О1у | О1у | А1а | Зег | Ьеи | Ьуз | Ьеи | А1а | О1у | Зег | Зег | 11е | ТЪг | Зег |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
О1у | 11е | ТЪг | Зег | Рго | Ьеи | Рго | Уа1 | Уа1 | Ьеи | А1а | Зег | А1а | А1а | Рго | Туг |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
О1у | Азр | Рго | Азр | Суз | Азр | ТЪг | О1п | А1а | А1а | Рго | О1у | ТЪг | РЪе | ТЪг | О1у |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | Уа1 | А1а | Суз | Агд | Ьеи | Ьеи | Азп | Агд | О1у | Агд | 11е | МеЪ | Ьуз | О1у |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Туг | Азп | Уа1 | РЪе | Ьуз | О1у | О1у | А1а | А1а | О1у | МеЪ | Ьеи | Ьеи | Туг | Азп | Азр |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
ТЪг | Ьеи | Зег | О1п | ТЪг | МеЪ | ТЪг | Азр | Азп | Нтз | Тгр | Ьеи | Рго | ТЪг | Уа1 | Нтз |
- 33 028228
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ьеи | О1и | Ьуз | Рго | О1п | А1а | Азр | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | РЬе | Ьеи | Бег | О1у | Н1з |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
ТЬг | О1у | ТЬг | ТЬг | А1а | ТЬг | РЬе | Рго | О1п | О1у | А1а | Ьуз | А1а | Азп | О1у | О1п |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
О1у | Азр | Уа1 | МеЕ | ТЬг | А1а | РЬе | Бег | Бег | Агд | О1у | Рго | О1у | О1у | Азр | РЬе |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Ьеи | Ьуз | Рго | Азр | Уа1 | ТЬг | А1а | Рго | О1у | Ьеи | О1п | 11е | МеЕ | О1у | О1у | О1п |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
ТЬг | Рго | Уа1 | Рго | Азр | Азр | Рго | Бег | Ьеи | О1у | Рго | Рго | О1у | ТЬг | Ьеи | Туг |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
О1п | Уа1 | 11е | А1а | О1у | ТЬг | Бег | МеЕ | Бег | А1а | Рго | Н1з | Уа1 | ТЬг | О1у | А1а |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
А1а | А1а | Ьеи | Ьеи | РЬе | А1а | Ьеи | Н1з | Рго | Бег | Тгр | ТЬг | Рго | О1у | О1п | Уа1 |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Ьуз | Бег | А1а | Ьеи | О1и | ТЬг | ТЬг | О1у | Ьуз | ТЬг | Бег | Уа1 | Уа1 | Ьуз | Н1з | Азр |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | ТЬг | Рго | А1а | Азр | Рго | РЬе | Азр | Ьеи | О1у | О1у | О1у | Агд | 11е | Азр |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Ьеи | ТЬг | Ьуз | А1а | О1у | Азр | Рго | О1у | Ьеи | ТЬг | 11е | Азр | О1и | ТЬг | А1а | А1а |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Азп | Туг | А1а | А1а | Бег | А1а | ТЬг | Азр | Рго | Ьеи | Н1з | Агд | 11е | Азр | Ьеи | Азп |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
να1 | Рго | Бег | Уа1 | Азп | А1а | Рго | Уа1 | МеЕ | Рго | О1у | А1а | 11е | МеЕ | ТЬг | ТЬг |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Агд | ТЬг | Уа1 | Ьуз | Азп | Уа1 | Бег | О1у | Ьуз | ТЬг | МеЕ | ТЬг | Туг | О1у | ТЬг | Бег |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
О1у | ТЬг | ТЬг | Уа1 | Ьуз | О1у | А1а | Бег | 11е | Бег | Уа1 | Бег | Рго | О1у | ТЬг | РЬе |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
ТЬг | Уа1 | Ьуз | Рго | О1у | Ьуз | ТЬг | А1а | Агд | Ьеи | Агд | 11е | ТЬг | 11е | А1а | А1а |
740 | 745 | 750 |
- 34 028228
Рго | А1а | Ьеи 755 | А1а | Азп | О1у | О1п | Туг 760 |
Агд | Азп 770 | О1у | О1у | Ηΐ3 | Азр | Ьеи 775 | Ηΐ3 |
О1п 785 | О1у | Уа1 | Уа1 | Зег | Ьеи 790 | Азп | О1п |
Ьеи | Азп | Зег | О1у | Агд 805 | Зег | ТЬг | Суз |
Ьеи | А1а | Азр | ТЬг 820 | Ьуз | Уа1 | 11е | А1а |
Агд | Ьеи | ТЬг 835 | А1а | Уа1 | ТЬг | О1у | А1а 840 |
Ьеи | А1а 850 | О1п | А1а | Азр | Ьеи | А1а 855 | Агд |
А1а 865 | Рго | О1у | А1а | ТЬг | Рго 870 | А1а | О1у |
11е | Рго | Рго | ТЬг | Рго 885 | 11е | О1у | Азр |
Рго | А1а | РЬе | ТЬг 900 | РЬе | А1а | О1у | Агд |
Зег | Азр | О1у 915 | Туг | ТЬг | Уа1 | А1а | О1у 920 |
А1а | ТЬг 930 | Рго | О1п | ТЬг | Ьеи | Рго 935 | Азп |
А1а 945 | Рго | РЬе | Тгр | ТЬг | Азр 950 | Ьеи | Азр |
А1а | А1а | Агд | Ьеи | ТЬг 965 | Азр | О1у | ТЬг |
Агд | Ьеи | Азп | Уа1 980 | РЬе | О1у | ТЬг | Азп |
11е | О1у | Уа1 995 | Азп | О1у | А1а | О1и | Азр 1000 |
РЬе | О1у | Агд | Уа1 | Азр 765 | Ьеи | Агд | О1п |
Ьеи | Рго | Уа1 | А1а 780 | РЬе | Уа1 | Агд | Ьуз |
ТЬг | Суз | ТЬг 795 | Рго | Зег | Уа1 | 11е | А1а 800 |
Азр | Уа1 810 | Азр | Уа1 | О1и | Азп | ТЬг 815 | Зег |
А1а 825 | Зег | ΗΪ8 | Ьеи | Азр | ТЬг 830 | Агд | Ьеи |
ТЬг | Ьуз | Уа1 | О1у | А1а 845 | ΗΪ8 | Азр | Уа1 |
Агд | О1п | Рго | Азр 860 | Ьуз | Рго | О1п | 11е |
Туг | Ьеи | Рго 875 | Ьеи | Азр | А1а | РЬе | О1у 880 |
О1и | О1п 890 | Зег | Ьеи | Азп | Ьеи | ТЬг 895 | ТЬг |
ТЬг 905 | Туг | ТЬг | Зег | Ьеи | О1у 910 | Уа1 | Уа1 |
О1у | А1а | ТЬг | Рго | Азр 925 | Азр | Уа1 | А1а |
Рго | А1а | Агд | Рго 940 | Азп | О1у | О1и | Ьеи |
О1у | А1а | О1у 955 | А1а | Рго | О1у | Уа1 | Туг 960 |
Зег | ТЬг 970 | Тгр | 11е | Уа1 | Уа1 | О1и 975 | Тгр |
Зег 985 | Ьеи | Агд | Уа1 | РЬе | О1п 990 | О1п | Тгр |
11е Зег Туг ТЬг Туг Азр Рго Азп
1005
- 35 028228
Азп | Беи 1010 | Рго | А1а | А1а | Рго | Рго 1015 | А1а | О1у Туг О1у | Беи 1020 | ТЬг | Уа1 | О1у | ||
А1а | О1и | Азп | Азр | О1и | О1у | ТЬг | А1а | О1у | Бег | С1п | 11е | Бег | О1у | ТЬг |
1025 | 1030 | 1035 | ||||||||||||
Рго | ТЬг | О1и | Азр | Беи | Агд | Уа1 | ТЬг | Бег | ТЬг | Рго | О1у | А1а | А1а | О1у |
1040 | 1045 | 1050 | ||||||||||||
О1у | Бег | Беи | Буз | Туг | Бег | РЬе | ТЬг | Беи | Буз | О1у | ТЬг | О1у | Агд | О1у |
1055 | 1060 | 1065 | ||||||||||||
Азп | А1а | Рго | Уа1 | ТЬг | ТЬг | Беи | Уа1 | Бег | ТЬг | Рго | Беи | Уа1 | Агд | О1у |
1070 | 1075 | 1080 | ||||||||||||
Уа1 | ТЬг | А1а | О1и | Уа1 | Азр | Азп | 11е | ТЬг | Уа1 | Азп | ||||
1085 | 1090 |
<210> 4 <211> 570 <212> БЕЛОК <213> АсБ1поа11отигиз <220>
<221> РКОРЕР <222> (1)..(570) <400> 4
МеБ Агд Агд 1 | А1а | Беи Уа1 5 | Беи А1а А1а | Суз 10 | А1а | Уа1 | Уа1 | ТЬг | А1а 15 | А1а | |||||
Беи | А1а | А1а | Рго | А1а | С1п | А1а | О1у | Бег | Бег | Бег | Буз | ТЬг | С1п | О1у | Буз |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | О1и | Туг | Уа1 | Уа1 | Беи | Туг | Буз | Азр | О1у | Уа1 | Бег | Беи | О1и | Буз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
А1а | НБз | Бег | А1а | Уа1 | Буз | А1а | А1а | О1у | О1у | ТЬг | 11е | Уа1 | Буз | О1и | Азп |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Буз | А1а | 11е | О1у | Уа1 | А1а | ТЬг | Уа1 | Агд | Бег | А1а | Бег | ТЬг | А1а | РЬе | Беи |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
ТЬг | Азр | А1а | Агд | Буз | О1п | Бег | А1а | Уа1 | Азр | О1у | Уа1 | А1а | ТЬг | Азп | Агд |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | Уа1 | О1у | О1и | А1а | Рго | Буз | Уа1 | А1а | Агд | А1а | А1а | Уа1 | Азп | Буз | Бег |
100 | 105 | 110 |
- 36 028228
О1п А1а | Уа1 115 | О1и | Ьуз | О1и | О1у Агд 120 | Уа1 | О1у | О1у | Н1з | А1а 125 | О1у | Зег | Зег | ||
Зег | Н1з | Ьуз | Рго | Зег | А1а | О1и | Рго | Ьеи | А1а | Азр | Агд | О1п | Тгр | Азр | МеЕ |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | О1п | 11е | Н1з | А1а | ТЬг | ТЬг | Азр | О1у | Зег | Туг | Ьуз | Ьуз | О1и | Рго | О1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Азр | Агд | Агд | Уа1 | Ьеи | Уа1 | О1у | Уа1 | 11е | Азр | ТЬг | О1у | 11е | Азр | О1у | ТЬг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Н1з | Рго | Азр | 11е | А1а | Рго | Азп | РЬе | Азр | Ьуз | Зег | Ьеи | Зег | Агд | Азп | РЬе |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
ТЬг | ТЬг | Азр | 11е | Рго | Уа1 | Азр | А1а | Азп | О1у | ТЬг | О1и | Уа1 | Азр | О1у | Рго |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Суз | О1и | Н1з | Рго | Зег | Суз | Уа1 | Азр | Рго | Уа1 | Азр | О1и | Азр | Азр | Азп | О1и |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Н1з | О1у | ТЬг | Н1з | Уа1 | А1а | Зег | ТЬг | 11е | А1а | Зег | Рго | Ьеи | Азп | О1у | Ьеи |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
О1у | 11е | А1а | О1у | Уа1 | А1а | Рго | Азп | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Уа1 | Азп | Уа1 | Агд | А1а |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
О1у | О1п | Азр | Зег | О1у | Туг | РЬе | РЬе | Ьеи | О1п | Рго | Уа1 | Уа1 | Азр | А1а | Ьеи |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
ТЬг | Туг | Зег | А1а | Азр | Н1з | О1у | 11е | Азр | Уа1 | Уа1 | Азп | МеЕ | Зег | РЬе | Туг |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
ТЬг | Азр | Рго | Тгр | Ьеи | РЬе | Азп | Суз | ТЬг | Азп | Азп | Рго | А1а | Азр | Зег | Рго |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
О1и | Азп | О1п | А1а | О1и | О1п | Агд | ТЬг | Уа1 | 11е | О1п | А1а | Зег | О1и | Агд | А1а |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ьеи | А1а | Туг | А1а | Н1з | Агд | Н1з | О1у | Уа1 | ТЬг | Ьеи | Уа1 | А1а | А1а | А1а | О1у |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Азп | О1у | А1а | ТЬг | Азр | Туг | ТЬг | Ьуз | ТЬг | 11е | ТЬг | Азр | А1а | Зег | Зег | Рго |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Азр | Туг | Рго | Зег | Уа1 | Рго | О1у | О1и | А1а | Рго | Туг | Зег | Агд | ТЬг | 11е | Рго |
- 37 028228
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Рго | Зег | Суз | 11е | Зег | О1и | Рго | Зег | О1и | О1у | О1п | Азп | Уа1 | Ьеи | А1а | Уа1 |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Зег | А1а | Ьеи | О1у | 11е | Зег | ТЬг | Агд | Ьуз | Зег | Туг | Туг | Зег | Азр | Туг | О1у |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Азп | О1у | Туг | Уа1 | А1а | Уа1 | Зег | А1а | Рго | О1у | О1у | Азр | Зег | Туг | Азр | ТЬг |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
А1а | Азр | С1п | Ьуз | А1а | Азр | Уа1 | ТЬг | Нпз | А1а | 11е | Ьеи | А1а | А1а | Туг | Рго |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | Ьеи | А1а | Уа1 | А1а | Агд | О1у | О1и | Ьеи | Азп | А1а | Азр | О1у | ТЬг | Рго |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Азп | Уа1 | Рго | Туг | Уа1 | Уа1 | Агд | Зег | Суз | Ьуз | О1у | Зег | ТЬг | Суз | А1а | Туг |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Туг | О1п | Туг | Ьеи | О1п | О1у | ТЬг | Зег | МеЕ | А1а | Зег | Рго | Нпз | А1а | ТЬг | О1у |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
ναι | Уа1 | А1а | Ьеи | 11е | Уа1 | Зег | Агд | Туг | О1у | Ьуз | Рго | Азр | Агд | Уа1 | Нпз |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
О1у | О1у | Ьеи | ТЬг | Ьеи | Зег | Рго | Азр | Агд | Уа1 | Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | О1и | О1у |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
ТЬг | А1а | ТЬг | О1и | Нпз | А1а | Суз | Рго | Азр | Рго | Агд | А1а | РЬе | ТЬг | Туг | ТЬг |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Агд | О1п | Уа1 | Ьуз | О1п | Зег | Азр | О1у | ТЬг | Туг | Агд | ТЬг | Уа1 | ТЬг | А1а | ТЬг |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Нпз | ТЬг | Суз | О1и | О1у | Зег | Ьуз | Зег | Нпз | Азп | О1у | РЬе | Туг | О1у | Нпз | О1у |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
11е | 11е | Азр | А1а | Ьеи | О1у | А1а | Уа1 | ТЬг | Нпз | ||||||
565 | 570 |
<210> 5 <211> 416 <212> БЕЛОК <213> АсЕппоаНотигиз <220>
<221> РКОРЕР
- 38 028228 <222> (1)..(416) <400> 5
МеЕ 1 | Азп | Рго | Агд | О1п Агд 5 | РЬе | А1а | 11е | Уа1 10 | ^еυ А1а А1а | ^еυ | 11е 15 | ТЬг | |||
МеЕ | 11е | РЬе | Бег | ^еυ | Уа1 | Бег | Уа1 | Рго | Бег | А1а | О1у | А1а | А1а | Уа1 | Бег |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Бег | ^уз | ^еυ | Бег | Уа1 | О1у | РЬе | О1у | Суз | А1а | Бег | А1а | А1а | Ηΐ3 | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
О1у | О1п | ^еυ | Ηΐ3 | Суз | РЬе | О1у | Агд | 11е | Агд | А1а | Ηΐ3 | Агд | А1а | Бег | А3п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
О1у | ^уз | 11е | А1а | Рго | ^еυ | ТЬг | Уа1 | ТЬг | Бег | Рго | ТЬг | О1у | ^еυ | ^еυ | Рго |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
А1а | Азр | ^еυ | О1п | Бег | А1а | Туг | ^уз | Уа1 | А1а | О1у | ^еυ | А3п | О1у | О1у | О1у |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Агд | ТЬг | Уа1 | А1а | 11е | Уа1 | Азр | А1а | О1п | Азр | Азп | Рго | ^уз | А1а | О1и | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Азр | ^еυ | А1а | Ηΐ3 | Туг | Агд | Бег | О1п | ^еυ | О1у | ^еυ | Рго | А1а | Су3 | ТЬг | ТЬг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
А1а | Азп | О1у | Суз | РЬе | ^уз | ^уз | Уа1 | Азп | О1п | Азп | О1у | О1п | А1а | Бег | Рго |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
^еυ | Рго | А1а | А1а | Азр | Туг | О1у | Тгр | А1а | О1и | О1и | 11е | Бег | ^еυ | А3р | ^еυ |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Азр | МеЕ | Уа1 | Бег | А1а | 11е | Суз | Рго | Бег | Суз | Ηΐ3 | 11е | ^еυ | ^еυ | Уа1 | О1и |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Рго | Азр | Азр | ТЬг | Бег | ^еυ | О1у | ТЬг | А1а | Уа1 | А3р | ТЬг | А1а |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
А1а | А1а | ТЬг | Бег | О1у | Уа1 | Уа1 | А1а | 11е | Бег | Азп | Бег | Туг | О1у | О1у | А1а |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
О1и | Азр | Бег | ТЬг | 11е | ^еυ | А1а | А1а | Азр | А1а | Ηΐ3 | РЬе | А3п | Ηΐ3 | Рго | О1у |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
11е | А1а | Уа1 | ТЬг | А1а | Бег | Бег | О1у | Азр | Бег | О1у | Туг | О1у | Уа1 | Бег | Тгр |
225 | 230 | 235 | 240 |
- 39 028228
Рго | А1а | Зег | Зег | О1п Туг Уа1 245 | ТЬг А1а Уа1 250 | О1у | О1у ТЬг | ТЬг | Ьеи 255 | Азп | |||||
Ьуз | А1а | Зег | Азп | А1а | Агд | О1у | Тгр | ТЬг | О1и | ТЬг | А1а | Тгр | Зег | О1у | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
О1у | Зег | О1у | Суз | Зег | А1а | Туг | О1и | Рго | Ьуз | Рго | Зег | Тгр | О1п | Няз | Азр |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
ТЬг | А1а | Суз | А1а | Ьуз | Агд | ТЬг | Уа1 | А1а | Азр | Уа1 | Зег | А1а | Уа1 | А1а | Азр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Рго | А1а | ТЬг | О1у | Уа1 | О1у | Уа1 | Туг | Азр | ТЬг | Туг | Азп | Зег | Суз | О1у | ТЬг |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Зег | Зег | РЬе | Суз | Азр | РЬе | Ьеи | 11е | Зег | Ьеи | О1у | Ьеи | Уа1 | О1п | О1у | Ьеи |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Азр | О1у | Тгр | А1а | А1а | Уа1 | О1у | О1у | ТЬг | Зег | А1а | Зег | Зег | Рго | 11е | 11е |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
А1а | Зег | Уа1 | Туг | А1а | Ьеи | А1а | О1у | Азп | ТЬг | О1у | Зег | ТЬг | ТЬг | Туг | О1у |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Зег | Туг | Рго | Туг | А1а | Няз | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | РЬе | Азр | Уа1 | ТЬг | Зег | О1у |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Зег | Азп | О1у | Зег | Суз | О1у | О1у | ТЬг | Туг | Ьеи | Суз | ТЬг | А1а | О1у | ТЬг | О1у |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Туг | Азр | О1у | Рго | ТЬг | О1у | Ьеи | О1у | ТЬг | Рго | Азп | О1у | ТЬг | О1у | О1у | РЬе |
405 410 415 <210> 6 <211> 33 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Глиадиновый 33-мерный пептид <400> 6
Ьеи 1 | О1п | Ьеи | О1п | Рго 5 | РЬе | Рго | О1п | Рго | О1п 10 | Ьеи | Рго | Туг | Рго | О1п 15 | Рго |
О1п | Ьеи | Рго | Туг | Рго | О1п | Рго | О1п | Ьеи | Рго | Туг | Рго | О1п | Рго | О1п | Рго |
20 | 25 | 30 |
- 40 028228
РЬе
<210> 7 <211> 4173 <212> ДНК <213> АсЕгпоа11отигиз | ||||||
<220> <221> ген <222> (1). | .(4173) | |||||
<400> 7 аЕдсссдаЕс | ЕЕсссассса | асддсдЕЕсс | ссасдсаддЕ | сасдссддсс | сдсддЕссЕЕ | 60 |
дсдаддсЕсд | сдддссЕдсд | сдЕсддсдсд | сЕддЕссЕсд | сдсЕсдссдЕ | сассасдсЕс | 120 |
асссЕсаЕсЕ | ссаЕдсссЕс | ддссаасдсс | дссссддсса | адсссдЕддЕ | сссдсасдсс | 180 |
ааддсдадса | дЕсссассдс | асадддссад | сасссдасса | дссдсдЕдЕд | ссддассссс | 240 |
ддссдсдсса | аЕдадаЕдас | сЕдссЕсдсс | аЕддЕссдЕд | асдасдЕсаЕ | сдддссдаад | 300 |
ддсдЕссадд | сдаасдасдс | дссддссддд | ЕЕсддсссдд | ссдассЕдсЕ | даасдссЕас | 360 |
аассЕдсссЕ | сддссддаЕс | дасддадасд | дЕсдсдаЕсд | ЕсдасдсдЕЕ | сдасаасссд | 420 |
аасдссдадд | сддассЕддд | сдЕсЕассдс | садсадЕасд | ддсЕдссддс | сЕдсасдасд | 480 |
дссаасддсЕ | дсЕЕсаадаа | даЕсдассаа | сдсддсддса | ссадсЕаЕсс | дссдссддас | 540 |
дссддсЕддд | ссддададаЕ | сдсдсЕддас | аЕсдасаЕдд | ЕсадсдссаЕ | сЕдсссдасс | 600 |
ЕдсаадаЕсс | ЕссЕддЕсда | ддссдасдас | аасЕасаЕдд | асаассЕддд | сасддссдЕс | 660 |
аассаддсдд | Есадссаддд | сдссаадЕЕс | дЕсЕссааса | дсЕасддсдд | садЕдадддс | 720 |
Ессдасдадд | ддсаддссда | сдасдсдЕас | ЕЕссассасд | асддсдЕсдс | саЕсассдсд | 780 |
адсадсддсд | асадсддсЕа | сддддсдадс | Еасссддссд | ссЕссссдЕа | сдЕсассЕсд | 840 |
дЕсддсддса | сдЕсдсЕддс | сааддасасд | ЕссЕссЕсдс | дсддсЕддас | сдададсасс | 900 |
Еддаасддсд | сдддсадсдд | сЕдсЕссдсд | Еасдадасса | адсссЕсдЕЕ | ссадааддас | 960 |
ассддсЕдсд | сдсдссдЕас | даЕсдссдас | дЕсЕссдсдд | Еддссдассс | даасассддс | 1020 |
дЕсдсддЕсЕ | асаасддсдд | сЕддсасдЕс | Еасддсддса | сдадсдЕдЕс | сдссссдаЕс | 1080 |
аЕсдсдЕсдд | ЕдЕасдсссЕ | сддсддсдсд | ссддсддсдд | дсЕсддсдсс | саасЕссЕЕс | 1140 |
ссдЕасдасс | асссддссда | ссЕсаасдас | дЕдассадсд | дсадсаасдд | дадсЕдЕадЕ | 1200 |
сссдссЕасс | ЕсЕдсасддс | дддЕассддс | Еасдасдддс | сдассдддсЕ | сддсассссд | 1260 |
аасддсаЕсд | ссдсдЕЕссд | сЕссдддссд | сасдссдЕсд | ЕсассддЕас | ддЕсассдас | 1320 |
ддсассдсдс | сдсЕддсдЕс | сдсссаддЕд | ааддсдддсд | асдЕсасддс | дасдасддас | 1380 |
ддссаддддс | асЕасасссЕ | дадсдЕЕссд | ссддддассЕ | асдасдЕдЕс | сдсдадсаад | 1440 |
- 41 028228
ЁЁсдддЁаса | ссддЁаадас | даЁсЁсдддд | дЁдсаддЁсд | ссдасддсса | дассдЁсасс | 1500 |
даддасЁЁсд | сдсЁдассдс | сааддсасдс | дЁсдасдЁсЁ | ссддасЁсдЁ | асдддасддс | 1560 |
ЁсдддЁсасд | дсЁддссддЁ | сЁасдсдасс | дЁасдддЁса | аддассадсс | сассдсддЁс | 1620 |
дссЁасассд | асссдаадас | сдддсддЁас | асссЁсадсс | Ёдсссасдда | сдасасдЁас | 1680 |
асдсЁдсадд | ЁддаЁссдсЁ | дЁаЁссдддЁ | Ёасасдсадд | асЁсдсасда | сдЁдассдЁд | 1740 |
ассЁсддсдд | асдЁддЁсса | сдасдЁсаас | дЁсдсддЁдд | ассадасдас | дЁдсадсдса | 1800 |
ссдддсЁаса | дсЁассасЁа | сдссддадсс | асссадссдЁ | Ёсдасддсас | дассдсдссд | 1860 |
дсдддсЁдда | ссдЁсдаЁда | сааддЁсддс | аасддссада | ссЁдддЁдЁЁ | саасдасссд | 1920 |
ддсЁсссдЁд | дсаасаадас | дддсдддасс | ддсддсЁЁсд | ссдЁсаЁсда | садЁдассас | 1980 |
ЁасддсЁсдд | дсаасасдса | ддасадсасд | сЁдЁЁсадсс | сддЁсассда | сЁЁсадсдсд | 2040 |
сдЁасссасс | сдаЁссЁдад | сЁЁссдсадс | дасЁддЁасд | дсЁасассдд | ссаддссддс | 2100 |
дассЁсдасс | ЁдадсдЁсда | сддсддсасд | асдЁддасса | ассЁдаадса | сЁасасддсс | 2160 |
адсдадсдсд | ддссдсдЁас | ддадасдаЁд | дассЁдЁссд | сддсддссдд | даададсдсс | 2220 |
дЁдсаддЁда | ддЁЁссасЁЁ | сассддсаад | ЁЁсддсЁасЁ | асЁддсаддЁ | сдасдасдЁс | 2280 |
ЁЁссЁсддсд | ассдЁассЁд | Ёдасссдасс | Ёсдддсддсс | ЁддЁсдЁсдд | ссаддЁдасс | 2340 |
дасдсдааса | ссддсдсддд | сдЁддссддд | дссасддЁса | ссЁсддЁдда | ссддссддсс | 2400 |
дадсасдсса | ссЁсддсддс | дасдссддас | дассссаасс | Ёсддсдасдд | ЁсЁсЁЁсЁдд | 2460 |
аЁдЁЁсЁссЁ | ссдЁсассдд | садссасаад | ЁЁсассдсса | сддсддддаа | сЁасдасЁсс | 2520 |
саЁдасдЁса | сддЁдаасдЁ | сдссдссаас | Ёдддсдассд | сддссдасаЁ | сдсдсЁдЁсс | 2580 |
дсдссасддс | ЁсасддЁсас | Ёссдддсдсд | аЁсадсаада | сддЁсддсЁд | дсадааддсд | 2640 |
дссассдсдд | сдсЁдасссЁ | даадаасасс | ддсасдЁсдс | сддЁдассдс | саадаЁсддЁ | 2700 |
даасадссдд | дЁддсадсас | дассдссасс | дсдддЁдсас | сдсЁдсадсд | ддЁдаадддс | 2760 |
дасЁЁсдсса | дЁддасдасЁ | дсадсадддс | ааддсдЁсдд | дЁдссааддс | сддсдЁдаса | 2820 |
ссдЁасдсдс | сдссдЁддас | ддссаЁсдсс | дасЁасдссЁ | сдссдаЁсаЁ | ддасаасддс | 2880 |
дсддЁддсас | Ёдаасддсаа | даЁсЁасЁсд | дЁддсдддсд | Ёсдасддсдс | даасдЁдсЁд | 2940 |
аасааддсдЁ | асдссЁасда | Ёсссддсасс | саддссЁдда | ссдссаЁсдс | сссдсЁсдсс | 3000 |
асдддасдЁд | аддсЁсссса | ддсдасдасс | ассддсддаа | адсЁдЁасдЁ | сассддсддс | 3060 |
ЁддддсЁсда | сдддсдссдс | ддЁддссаад | асддадаЁсЁ | ЁсдаЁссдЁс | сЁсдддсдсс | 3120 |
ЁддЁсддссд | дсдсддасаа | сссдаадссд | ЁасдссддсЁ | ссддсдсддс | сдЁдсЁсдас | 3180 |
ддсаадаЁсЁ | асдЁсдЁсдд | сдддЁдссЁс | дссассЁдсд | дЁасдаадда | сдЁдсаддЁс | 3240 |
Ёасдасссдд | сддссаасЁс | сЁддадсЁсд | ддассддссЁ | аЁссддадаа | сассдсдЁдд | 3300 |
сЁсддсЁдсд | ссддсаЁсда | сддсаадсЁд | ЁасЁдсдсдд | дсддсЁссдс | ддссдсдадс | 3360 |
- 42 028228
ассаадсасд | дсБасдБдсБ | сдасссддсс | БсдддсассБ | ддБсдссдаБ | сдссдассБд | 3420 |
ссдаБсдасс | БдБдддсдаБ | дддсБасБсд | дсддсдаасд | ддаадсБдаБ | сдБсБссддБ | 3480 |
ддсдБсасса | асддддссад | сасдсБсасс | ааБсадддсБ | БсдссБасда | сссдБсддсд | 3540 |
аасБссБдда | сддсссБдсс | саасБссаас | аасдсссБдБ | ассдсддсдс | дБсддссБдс | 3600 |
дддББсБаса | адаБсддадд | аБсдсБдддд | садББсаасд | сддБсаадад | сддБдаддБд | 3660 |
сБдсссддсБ | аБдассадБд | сдссБсдасс | дссдасдББс | сдБддсБдБс | ддаддасаад | 3720 |
ассдаддБда | сдаБссадсс | сддссададс | дБсааддБса | асдБдасссБ | сдасдсдаас | 3780 |
дБсссддсда | БсасБсадсс | сддсасдБас | ассдсдсадс | БсассдБсдд | ддсдаадасд | 3840 |
ссдБасдсда | БсссдссддБ | сдссдБсасд | аБдасддБда | асссдссддд | сассБдддда | 3900 |
аадаБсассд | даасдсБсас | сддадссддс | БдБасдддББ | сБсссдсасс | дсБдассддд | 3960 |
дсдасссБас | адаБсдасБс | сБдддсБдсд | БсдБасасдс | Бсаадассда | саадаасддБ | 4020 |
садБасдсдс | БсБддсБсда | сдБссдсаас | аасссдсБда | сдсБдаБсдс | ддсдааддас | 4080 |
ддаБдддсдс | сдсадассад | ааасдБсаад | аБсассааас | БдассБсдас | сасддссдаБ | 4140 |
ББсасБсБда | аасссдасса | сассБдБадс | Бда | 4173 |
<210> 8 <211> 1197 <212> ДНК <213> АсБгпоа11отигиз
<220> | ||||||
<221> ген | ||||||
<222> (1). | ..(1197) | |||||
<400> 8 | ||||||
аБдБсасдас | дсдБдассдд | дассаБасБд | ддсдддББда | БссБсдссаБ | ддБссссББс | 60 |
сБББссассд | сддссаасдс | сдсассссад | дссдсдссдд | сББссдБсБс | ссасссдББс | 120 |
сассасБссБ | дсдссасддБ | даадссдддБ | сдддсдадсБ | дсааБдсссБ | сдБасдсадс | 180 |
дасаБсдссс | ададсдсддс | дасссБсдсд | сассаадсдд | ссдссссаБс | сдддсБсБсд | 240 |
ссддссаасс | Бдсададсдс | сБасаадсБд | ссдБссБсса | сддссддаБс | сддссадасс | 300 |
дБсдсдаБсд | БсдасдссБа | Бдасдссссд | ассдссдаад | сддасББдаа | сдБдБассда | 360 |
адссадББсд | дасБсддсдс | дБдсасдасс | дссаасддсБ | дБББсаадаа | ддБсдассад | 420 |
аасддсддса | сдБссБаБсс | даддааддас | ддсддсБддд | сдсаддадаБ | сБсссБддас | 480 |
сБсдасаБдд | БсБссдсддБ | сБдссссаас | БдсаадаБсд | ББсБсдБсда | ддсдаадасс | 540 |
аасБсдББсд | ссаассБддд | Бассдссдад | аасассдсдд | сдадБсБсдс | даасдБсаБс | 600 |
адсаасадсБ | асддсддсБс | ддасдссБсБ | дасдсдадсБ | аБддсБсдБа | сБасаассас | 660 |
- 43 028228
ссдддсаадд | ссаЁсасддЁ | садсЁссддс | дасдссддсЁ | асддсдЁдда | дЁасссддсс | 720 |
ЁсдЁсссасЁ | асдЁдассдс | сдЁсддсддс | ассЁсдсЁдс | дсассдсдад | сассадссдс | 780 |
ддсЁддадсд | адассдсдЁд | дадсддсдсд | ддсадЁддсЁ | дсЁсддссЁа | саасассдсд | 840 |
сЁдЁссддсс | адЁссддссЁ | сассддсЁдс | Ёсссддсдсд | ссдЁсдссда | сдЁсЁссдсс | 900 |
дЁддссдасс | сддссассдд | сдЁсдссдЁс | Ёасдасадса | сддссЁасса | дддссададс | 960 |
ддсЁддаЁдд | ЁсЁЁсддсдд | сассадсдЁс | дссдсассда | ЁсаЁсддЁдд | сдЁдЁасддс | 1020 |
сЁсдссдсса | асдссдсдад | саЁсдасаас | аасЁассссЁ | асдсссасас | садсЁсдсЁс | 1080 |
ЁЁсдасдЁса | сдЁсдддсад | саасддсасс | Ёдсассасса | ссаадЁддЁд | сассдссддс | 1140 |
ассддсЁддд | асддссссас | сддссЁсдда | асдссдаасд | дсассддадс | сЁЁсЁда | 1197 |
<210> 9 <211> 3285
<212> ДНК <213> АсЁгпоа11отигиз | ||||||
<220> <221> ген <222> (1). | ..(3285) | |||||
<400> 9 аЁдадЁдссд | ссдЁЁдЁдаЁ | сЁЁсдссддс | дсассддсда | сддсддсдсс | дасдссддаа | 60 |
ддсЁссддса | дасасЁддас | ддссасдссд | сЁсадсддса | ссдЁсдЁсса | дддсЁЁсаад | 120 |
Ёсдасдассд | дасддсЁсдс | саададсдаЁ | дссдддсЁдс | ЁЁсдссЁдаа | дЁсдадсаад | 180 |
сссдЁдсасд | ЁсаЁддЁсаа | дсЁсдасЁас | дасЁсасЁсд | ссдссЁассд | дддсдддаЁЁ | 240 |
сссдддЁасд | ссдссасдад | сссддсддЁд | ассдддсаса | сдсЁсдассс | ддсдадсдсс | 300 |
ддсдсдсддс | дсЁассаддд | сЁасаЁсддд | ддсдЁсдада | ассдсЁЁссд | сдссдсссЁд | 360 |
ддсаадсдсс | Ёдссдддсдс | дааддссддс | ддсдддсЁдс | дсасддЁдЁа | сддсддЁсЁд | 420 |
дсддЁдасдс | ЁдсссддЁда | сааддЁддсс | дассЁдсЁса | адсЁдсссдд | сдЁддссдсд | 480 |
дЁссаддадд | асдсддЁддс | саадссасЁд | ассдасЁсса | дссссддсЁЁ | саЁсддсдсс | 540 |
ссдассаЁсЁ | асаадсаасЁ | сддсддсадс | дасадсЁссд | дааадддсдЁ | саЁсдЁсддс | 600 |
дассЁддаса | дсддсдссЁд | дсссдадсас | сссЁсдЁаса | аддасадсдд | саадсЁдссс | 660 |
дсдссдссдс | ссассасдда | сддЁдсдсса | сддссдЁдсд | асЁЁсддсда | сааЁссдсЁд | 720 |
асдссддсда | асдасссдЁа | сдЁсЁдсдас | сасаадсЁда | ЁсЁсдддсса | дссдЁЁссЁд | 780 |
дасассЁаса | асдсддЁсдЁ | сддсддддад | аддЁЁссссд | асадсдсссд | сдасЁссдас | 840 |
дддсасддса | сдсасассЁс | дассассдсд | дссддЁЁсдд | сддЁдадсса | сдсдаасссд | 900 |
сЁсддсаЁсд | ассдсддсдс | саЁссасддс | аЁсдсдсссд | ссдсссасаЁ | сдссдЁсЁас | 960 |
ааддЁдЁдсд | дсдсссаддд | сЁдсЁЁссад | ЁссдасЁсдд | ЁддссдссдЁ | дсадсдддсд | 1020 |
- 44 028228
а5сс5сдаса | адд5ссддд5 | да5саас5ас | 5сда5с5ссд | дсддсдЬсда | сссаЬасадс | 1080 |
да5ссдд5сд | аас5ддсс55 | ссЬсдасдсд | Ьасдсддссд | дсдЬдсЬсдЬ | сЬсддссЬсд | 1140 |
дссддсаасд | асдддсссас | сдсдддсасс | дЬсаассаса | асдддссдЬд | ддЬдассасд | 1200 |
д5ддссдсд5 | ссасдсадса | дсддасс55с | садЬсдассд | 5сасдс5дса | ддсдддсддс | 1260 |
дсдадссЬда | адсЬддссдд | с5сд5сда5с | ассадсддда | 5сасс5сдсс | дсЬЬсссдЬс | 1320 |
д5дс5сдсд5 | ссдсддсдсс | дЬасддсдас | ссддасЬдЬд | асасдсаддс | сдсЬсссддс | 1380 |
асд55сассд | дсаада5сд5 | сдссЬдссдд | с5дс5саасс | дсддссддаЬ | саЬдаадддс | 1440 |
5асаасд5с5 | Ьсаадддсдд | сдсддссддд | аЬдсЬдсЬсЬ | асаасдасас | дсЬдЬсссад | 1500 |
асдаЬдассд | асаассасЬд | дсЬдссдасс | дЬдсассЬдд | адаадссдса | ддссдасдсд | 1560 |
с5дс5ддсс5 | 5сс555ссдд | ссасассддс | ассассдсса | сдЬЬссссса | дддсдсдаад | 1620 |
дсдаасддсс | адддсдасдЬ | саЬдассдсд | 55с5сс5сдс | дсддсссддд | сддсдасЬЬс | 1680 |
сЬсаадсссд | асдЬсассдс | дсссддссЬд | садаЬсаЬдд | дсддссадас | дссддЬЬссд | 1740 |
дасдассссЬ | сдсЬдддссс | дсссддсасс | сЬсЬассадд | ЬдаЬсдссдд | ЬассЬсдаЬд | 1800 |
Ьсддсдссдс | асдЬсассдд | ддсддсддсд | с5дс5д55сд | сссЬдсаЬсс | дадсЬддасд | 1860 |
ссддддсадд | 5саад5сддс | дсЬддадасд | ассддсаада | сдЬсЬдЬддЬ | саадсасдас | 1920 |
сдсаадасдс | ссдссдассс | д55сдасс5с | ддсддЬдддс | дсаЬсдассЬ | сассааддсс | 1980 |
ддЬдассссд | ддс5дасса5 | сдасдадасс | дсддсдаасЬ | асдсддссЬс | ддсдассдас | 2040 |
ссдсЬдсасс | дда5сдасс5 | даасдЬдссд | 5с5д5даасд | сассддЬдаЬ | дсссддсдсд | 2100 |
а5са5дасса | сссд5асдд5 | саадаасдЬс | Ьсдддааада | сдаЬдасдЬа | сддсассЬсд | 2160 |
ддЬасдасдд | Ьдаадддсдс | с5сса5с5сс | д5с5сссссд | дсасдЬЬсас | сдЬсаадссд | 2220 |
ддсаадассд | сссддсЬдсд | да5сасда5с | дссдсдссдд | сдсЬсдссаа | ЬдддсадЬас | 2280 |
55сддссддд | 5сдасс5дсд | Ьсадсдааас | ддсддссасд | ассЬдсассЬ | дссддЬсдсд | 2340 |
55сд5ссдса | адсадддсдЬ | дд5дадсс5д | аассадассЬ | дсасдсссЬс | ддЬдаЬсдсд | 2400 |
сЬдаасадсд | дссдаЬсдас | д5дсдасд5с | дасдЬсдада | асассЬсЬсЬ | сдссдасасс | 2460 |
аадд5са5сд | ссдсдадсса | ссЬддасасд | сддсЬдсдас | ЬдассдсддЬ | дассддсдсд | 2520 |
асдааддЬдд | дсдсдсасда | сд5сс5ддсс | саддссдасс | Ьддсссдссд | ссадсссдас | 2580 |
аадссдсада | Ьсдсссссдд | ддссасдссд | дссддсЬасс | ЬдссдсЬсда | сдссЬЬсддс | 2640 |
аЬссссссда | сдссдаЬсдд | сдасдадсад | 5сдс5саасс | Ьсассасдсс | ддсдЬЬсасс | 2700 |
55сдссддса | ддассЬасас | садссЬдддс | дЬддЬсЬссд | асддсЬасас | ддЬсдссддс | 2760 |
ддадсдассс | ссда5дасд5 | ддссдсдасд | ссдсадассс | Ьдссдаассс | ддсасддссд | 2820 |
аасддсдаас | 5ддссссд55 | сЬддассдас | сЬддасддсд | ссддЬдсссс | дддсдЬдЬас | 2880 |
- 45 028228
дсддсссдсс | Ьсассдасдд | сасдадсасс | ЬддаЬсдЬсд | ЬддадЬддсд | дсЬсаасдЬс | 2940 |
ЬЬсддсасда | асадссЬссд | ддЬдЬЬссад | садЬддаЬсд | дддЬдаасдд | сдссдаддас | 3000 |
аЬсЬссЬаса | ссЬасдассс | даасаассЬд | ссддсддсдс | сдсссдсддд | сЬасддссЬд | 3060 |
асддЬсддсд | сддадаасда | сдадддЬасс | дссддЬЬсдс | адаЬсЬссдд | сассссдасс | 3120 |
даддаЬсЬсс | дсдЬсасдад | сасдссдддд | дссдсдддЬд | дЬЬсдсЬдаа | дЬасЬссЬЬс | 3180 |
асасЬдаадд | даасдддссд | дддсаасдсс | ссддЬдасда | сссЬддЬсЬс | сасдссдсЬс | 3240 |
дЬасдаддсд | Ьдасддссда | ддЬсдасаас | аЬсасддЬда | асЬда | 3285 |
<210> 10 <211> 1713
<212> ДНК <213> АсЬ1поа11отигиз | ||||||
<220> <221> ген <222> (1). | ..(1713) | |||||
<400> 10 дЬдсддсдсд | сссЬадЬссЬ | сдссдссЬдс | дссдЬсдЬса | сддсддсдсЬ | сдсддсассс | 60 |
дсдсаддсдд | даЬсдадсад | саадасдсад | ддааадасда | сЬдадЬасдЬ | сдЬссЬдЬас | 120 |
ааддасддад | ЬсЬсссЬдда | дааддсдсас | ЬсддссдЬда | аддсддссдд | ЬддсассаЬс | 180 |
дЬсааддада | асааддсдаЬ | сддсдЬддсс | ассдЬасдсЬ | сддссадсас | ддсдЬЬссЬс | 240 |
ассдасдсдс | дсаадсадЬс | ддсддЬсдас | ддсдЬсдсда | ссаассдсдс | ддЬсддсдад | 300 |
дсдсссаадд | Ьсдсасдддс | ддсддЬдаас | аададссадд | ссдЬддадаа | ддадддссдс | 360 |
дЬсдддддсс | аЬдсддддЬс | сЬссЬсдсас | аадссдЬсдд | сддадссдсЬ | ддсддассдь | 420 |
садЬдддаса | ЬдаадсадаЬ | ссасдсдасс | асддасддсЬ | сдЬасаадаа | ддадссдддс | 480 |
дассддсдсд | ЬдсЬсдЬсдд | сдЬсаЬсдас | ассддсаЬсд | асддсасдса | сссддасаЬс | 540 |
дсдссдаасЬ | ЬсдасаадЬс | дсЬдадссдд | аасЬЬсасса | сддасаЬссс | ддЬсдасдсс | 600 |
аасддсассд | аддЬсдасдд | сссдЬдЬдад | сасссдЬссЬ | дсдЬддассс | ддЬддасдад | 660 |
дасдасаасд | адсасддсас | дсасдЬсдсс | ЬсдасдаЬсд | ссЬсдссдсЬ | даасддссЬд | 720 |
ддсаЬсдсдд | дсдЬддсдсс | даасдЬдасд | сЬддЬсаасд | Ьасдддссдд | дсаддасЬсд | 780 |
ддсЬасЬЬсЬ | ЬссЬдсадсс | сдЬддЬсдас | дсдсЬдасдЬ | асЬсддссда | ссасддсаЬс | 840 |
дасдЬддЬда | асаЬдЬсдЬЬ | сЬасассдас | ссдЬддсЬдЬ | ЬсаасЬдсас | саасаасссд | 900 |
дссдасЬсдс | сддадаасса | ддссдадсад | сдЬасддЬса | ЬссаддсдЬс | адаасдсдсс | 960 |
сЬддсдЬасд | сдсассддса | сддЬдЬсасс | сЬддЬддсдд | ссдссддсаа | сддсдссасс | 1020 |
дасЬасасса | адасдаЬсас | сдасдсдЬсд | адсссддасЬ | асссдЬссдЬ | дсссддсдад | 1080 |
дсдссдЬасЬ | сдсдЬасдаЬ | сссдссдЬсс | ЬдсаЬсЬссд | адссдадсда | дддссадаас | 1140 |
- 46 028228
дЁссЁсдсдд | ЁдЁсддсссЁ | дддсаЁсадс | асдсдсаадЁ | сдЁасЁасЁс | сдасЁасддс | 1200 |
аасддсЁасд | ЁсдсддЁдЁс | ддссссдддс | ддсдасЁссЁ | асдасасддс | сдассадаад | 1260 |
дсддасдЁда | сссасдсдаЁ | ссЁддссдсд | ЁасссдаадЁ | сссЁддссдЁ | ддсссдсддс | 1320 |
даасЁдаасд | сддасддсас | сссдаасдЁд | ссдЁасдЁдд | ЁссдсЁсдЁд | саадддсЁсд | 1380 |
ассЁдсдсдЁ | асЁассадЁа | ссЁдсадддс | асдЁсдаЁдд | ссЁсЁссдса | сдсдассддс | 1440 |
дЁддЁддсдс | ЁдаЁсдЁсад | ссдсЁасддс | аадсссдасс | дсдЁасасдд | сддссЁдасс | 1500 |
сЁдЁссссдд | ассдддЁсаа | дЁссаЁссЁд | дадддаассд | ссассдааса | сдссЁдсссд | 1560 |
дасссасдсд | ссЁЁсасдЁа | сасдсдссад | дЁсаадсадЁ | ссдасддЁас | дЁасаддасс | 1620 |
дЁдассдсда | сссасассЁд | ЁдадддЁЁсд | аададссаса | асддсЁЁсЁа | сддссасддс | 1680 |
аЁсаЁсдаЁд | сссЁдддсдс | сдЁдасдсаЁ | Ёаа | 1713 |
<210> 11 <211> 1251
<212> ДНК <213> АсЁ1поа11отигиз | ||||||
<220> <221> ген <222> (1). | ..(1251) | |||||
<400> 11 ЁЁдаассссс | дссааадаЁЁ | сдсдаЁсдЁс | сЁсдсддссс | ЁсаЁсасааЁ | даЁсЁЁсЁсс | 60 |
сЁддЁЁЁссд | ЁссссЁссдс | сддсдссдсд | дЁсадсдсдЁ | ссаадсЁсад | сдЁсддсЁЁс | 120 |
ддсЁдсдссЁ | сддсддсдса | сдссддЁсад | сЁдсасЁдсЁ | ЁсдддсддаЁ | ссдсдсссас | 180 |
сдддсдадса | асддсаадаЁ | сдссссдсЁс | асддЁсасса | дсссдассдд | асЁдсЁсссд | 240 |
дсддассЁдс | адЁсддсдЁа | сааддЁддсс | дддсЁдаасд | дсддсддссд | ЁасддЁсдсд | 300 |
аЁсдЁсдасд | сдсаддасаа | сссдааддсс | даддссдасс | ЁсдсссасЁа | ссдсЁсссад | 360 |
сЁсддссЁдс | ссдсдЁдсас | дассдсдаас | ддсЁдсЁЁса | адааддЁсаа | ссадаасддс | 420 |
саддсдЁсдс | сдсЁдсссдс | ддссдасЁас | ддсЁдддссд | аддадаЁсад | ссЁсдассЁд | 480 |
дасаЁддЁсЁ | сддсдаЁсЁд | сссдадсЁдс | сасаЁссЁдс | ЁсдЁсдаддс | даасдссссЁ | 540 |
дасдасассЁ | сдсЁсддсас | сдсддЁсдас | ассдссдссд | сдассадсдд | сдЁсдЁддсс | 600 |
аЁсЁссааса | дсЁасддадд | сдссдаддас | ЁсдассаЁсс | Ёсдссдссда | сдсссасЁЁс | 660 |
аассасссдд | дсаЁсдсддЁ | сасддсдадс | ЁссддсдасЁ | ссддсЁасдд | сдЁсадсЁдд | 720 |
ссддссЁсдЁ | сссадЁасдЁ | сассдсддЁд | ддсддсасда | сдсЁдаасаа | ддсдадсаас | 780 |
дсдсдсддсЁ | ддассдадас | сдссЁддЁсс | ддсдссддсЁ | сдддсЁдсЁс | ддсдЁасдад | 840 |
ссдаадссдЁ | ссЁддсадса | сдасассдсс | Ёдсдссаадс | дсассдЁсдс | ддасдЁсЁсд | 900 |
- 47 028228
дсддЕсдссд | асссддссас | сддсдЕсддс | дЕсЕасдаса | ссЕасаасад | сЕдсдддасс | 960 |
адсЕсдЕЕсЕ | дсдасЕЕссЕ | саЕсЕсдсЕс | дддсЕсдЕдс | адддссЕдда | сддсЕдддсс | 1020 |
дсддЕсддсд | ддасдадсдс | дЕссЕсдссд | аЕсаЕсдсда | дсдЕдЕасдс | ссЕддссддс | 1080 |
аасассддса | дсасдасдЕа | сддсЕсдЕас | ссдЕасдсдс | асасдЕссдс | дсЕсЕЕсдас | 1140 |
дЕсасдЕссд | дсЕсдаасдд | аадсЕдЕддс | ддсассЕасс | ЕдЕдсасддс | сддаассддс | 1200 |
ЕасдасддЕс | ссассддЕсЕ | дддсасдссс | аасддаассд | дсддсЕЕсЕд | а | 1251 |
<210> 12 <211> 28 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, прямой для Эндопеп140 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(28) <400> 12 ааааадсЕЕс адсЕасаддЕ дЕддЕсдд 28 <210> 13 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, обратный для Эндопеп140 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(29) <400> 13 ааааааасаЕ аЕдсссдаЕс ЕЕсссассс 29 <210> 14 <211> 26 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> праймер, прямой для Эндопеп40 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(26) <400> 14 ааааадсЕЕс адааддсЕсс ддЕдсс 26
- 48 028228 <210> 15 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ПЦР праймер, обратный для Эндопеп40 <220>
<221> праймер_связь <222> (1)..(29) <400> 15 ааааааасаЪ аЪдЪсасдас дсдЪдассд 29
Claims (36)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Ферментная композиция, которая способна гидролизовать глютеновые олигопептиды, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам, где ферментная композиция содержит по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 1;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 2;c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 3;Б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 4;е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8Еф ГО N0: 5.
- 2. Ферментная композиция по п.1, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, выбранную из:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;Б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
- 3. Ферментная композиция по любому из пп.1 и 2, содержащая эндопептидазу, выбранную из:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8Еф ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
- 4. Ферментная композиция по любому из пп.1-3, где по меньшей мере одна указанная эндопептидаза получена из штамма АсйпоаНотигик.
- 5. Ферментная композиция по п.4, где по меньшей мере одна эндопептидаза получена из Ас1шоа11отигик кр. Ό8Μ24988.
- 6. Ферментная композиция по любому из пп.1-5, содержащая один или несколько других протеоли- 49 028228 тических ферментов, выбранных из пролил-эндопротеаз, х-пролил-дипептидиламинопептидаз и пролиламинопептидаз.
- 7. Ферментная композиция по любому из пп.1-6, содержащая по меньшей мере одну эндопептидазу, функционально слитую с полипептидом с образованием химерного меченого белка.
- 8. Выделенная эндопептидаза из семейства 88/853, активная при рН 3-8, используемая в композиции по пп.1-7, выбранная из:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 3 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;б) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 4 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 5 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
- 9. Выделенная эндопептидаза из семейства 88/853 по п.8, выбранная из:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1 или идентичную ей по меньшей мере на 95%;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2 или идентичную ей по меньшей мере на 95%.
- 10. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
- 11. Применение выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 в качестве лекарственного средства для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины.
- 12. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 для получения пищевых белковых гидролизатов.
- 13. Применение выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для получения пищевых белковых гидролизатов.
- 14. Фармацевтическая композиция для лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента ферментную композицию по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одну выделенную эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
- 15. Фармацевтическая композиция по п.14, выполненная в форме, подходящей для перорального введения.
- 16. Пищевая добавка, которая содержит в качестве активного протеолитического ингредиента ферментную композицию по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одну выделенную эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
- 17. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11, или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% любой из последовательностей 8ЕО ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
- 18. Выделенная нуклеиновая кислота по п.17, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7, 8, 9, 10 и 11.
- 19. Выделенная нуклеиновая кислота по п.17, которая содержит по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, выбранную из 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8.
- 20. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает культивирование природного штамма АсбпоаНотигив, способного продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
- 21. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает культивирование штамма АсбпоаПотигив, полученного с помощью стандартных способов введения мутаций и/или селекции из природного штамма АсПпоаПотигив, где культивируемый штамм АсПпоаПотигив сохраняет способность к продуцированию по меньшей мере одной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9, в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования ферментной композиции, и извле- 50 028228 чение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
- 22. Способ по п.20 или 21, где штамм Ас(тоа11отигив представляет собой АсйпоаПотигив вр. Б8М 24988.
- 23. Способ получения ферментной композиции по п.1, который включает введение в клеткухозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853, активную при рН 3-8, выбранную из группы:a) эндопептидазы эндопеп-140, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 1, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 1;b) эндопептидазы эндопеп-40, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 2, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 2;c) эндопептидазы эндопеп-120, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 3, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 3;ά) эндопептидазы эндопеп-60, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 4, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 4;е) эндопептидазы эндопеп-41, содержащей последовательность 8ЕЦ ГО N0: 5, ее биологически активный фрагмент, ее природный аллельный вариант или последовательность, идентичную по меньшей мере на 70, 80, 90 или 95% последовательности 8ЕЦ ГО N0: 5, культивирование клеток в культуральной среде при условиях, подходящих для продуцирования по меньшей мере одной эндопептидазы, и извлечение ферментной композиции из конечной среды культивирования.
- 24. Способ по п.20 или 21, где вместо штамма АсйпоаПотигив используют штамм, принадлежащий к роду Са(епи11врога, К(ейопоЬас(ег или 8(гер(отусев, способный продуцировать по меньшей мере одну эндопептидазу из семейства 88/853 по любому из пп.8, 9.
- 25. Способ по п.22, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей, указанных в любом из пп.17 и 18.
- 26. Способ по п.25, где нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере одну из полинуклеотидных последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8 или по меньшей мере одну полинуклеотидную последовательность, идентичную по меньшей мере на 95% любой из последовательностей 8ЕЦ ГО N0: 7 и 8.
- 27. Способ по любому из пп.22, 25 и 26, где клетка-хозяин представляет собой микроорганизм, выбранный из родов ВасШив, 8(гер(отусев, Ьас(оЬасШив, Ругососсив, Рвеийотопав, АврегдШив и вида ЕвсНепсЫа соП.
- 28. Способ по п.27, где клетка-хозяин представляет собой ЕвсНепсЫа соП ВЬ21(БЕ3) 8(аг.
- 29. Способ разрушения глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых во внутреннем просвете приводит к токсическим эффектам, где способ включает контактирование указанных глютеновых олигопептидов с ферментной композицией по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазой из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
- 30. Способ лечения или предотвращения глютенчувствительной целиакии, герпетиформного дерматита и/или любого другого расстройства, ассоциированного с непереносимостью клейковины, где способ включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества ферментной композиции по любому из пп.1-7 или по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9.
- 31. Способ по п.30, где ферментную композицию или выделенную эндопептидазу вводят в составе фармацевтической композиции, пищевой добавки, питья или напитка.
- 32. Применение при производстве пищевых добавок ферментной композиции по любому из пп.1-7 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
- 33. Применение при производстве пищевых добавок по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для гидролиза глютеновых олигопептидов, которые являются устойчивыми к расщеплению посредством желудочных и панкреатических ферментов и присутствие которых в просвете кишечника приводит к токсическим эффектам.
- 34. Применение по п.32 или 33, где ферментная композиция или выделенная эндопептидаза находятся в иммобилизованной форме.
- 35. Применение ферментной композиции по любому из пп.1-7 для обработки жидких пищевых продуктов.
- 36. Применение по меньшей мере одной выделенной эндопептидазы из семейства 88/853 по любому из пп.8 и 9 для обработки жидких пищевых продуктов.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP11425291 | 2011-12-06 | ||
PCT/EP2012/071816 WO2013083338A1 (en) | 2011-12-06 | 2012-11-05 | New proteases able to hydrolyze gluten peptides and proteins at acidic ph, from the actinomycete actinoallomurus |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201491117A1 EA201491117A1 (ru) | 2014-09-30 |
EA028228B1 true EA028228B1 (ru) | 2017-10-31 |
Family
ID=47137719
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA201491117A EA028228B1 (ru) | 2011-12-06 | 2012-11-05 | Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20140356345A1 (ru) |
EP (1) | EP2788018B1 (ru) |
JP (1) | JP6203743B2 (ru) |
CN (1) | CN104039345B (ru) |
AU (1) | AU2012348782B2 (ru) |
BR (1) | BR112014012100B1 (ru) |
CA (1) | CA2852365C (ru) |
EA (1) | EA028228B1 (ru) |
ES (1) | ES2595500T3 (ru) |
HK (1) | HK1198244A1 (ru) |
IN (1) | IN2014CN04131A (ru) |
WO (1) | WO2013083338A1 (ru) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
PL2718434T3 (pl) | 2011-08-10 | 2018-08-31 | University Of Washington Through Its Center For Commercialization | Kompozycje i sposoby leczenia choroby trzewnej |
AU2014306716B2 (en) | 2013-08-14 | 2020-01-30 | University Of Washington Through Its Center For Commercialization | Compositions and methods for treating celiac sprue disease |
US9867872B2 (en) | 2013-09-05 | 2018-01-16 | Dsm Ip Assets B.V. | Use of an acidic soft drink to enhance the efficacy of a gluten-digesting enzyme |
CN105899543A (zh) * | 2013-11-26 | 2016-08-24 | 诺维信公司 | 研磨方法 |
EP3209774B1 (en) * | 2014-10-24 | 2020-02-26 | DuPont Nutrition Biosciences ApS | Use of proline tolerant tripeptidyl peptidases in feed additive compositions |
EP3302518A1 (en) | 2015-06-08 | 2018-04-11 | University of Washington | Compositions and methods for treating celiac sprue disease |
US11124785B2 (en) | 2016-02-11 | 2021-09-21 | Trustees Of Boston University | Rothia subtilisins, S8A family proteases, as therapeutic enzymes for application in gluten intolerance disorders |
WO2021013553A1 (en) | 2019-07-25 | 2021-01-28 | Nemysis Limited | Method for the production of an enzymatic composition comprising a recombinant endopeptidase |
IT201900012942A1 (it) | 2019-07-25 | 2021-01-25 | Nemysis Ltd | Metodo per la produzione di una composizione enzimatica comprendente una endopeptidasi ricombinante |
CN111172138B (zh) * | 2020-02-14 | 2022-03-25 | 江南大学 | 一种蛋白水解酶及其在蛋白肽生产中的应用 |
IT202100018254A1 (it) | 2021-07-12 | 2023-01-12 | Nemysis Ltd | New systems for producing recombinant proteins/ nuovi sistemi di produzione di proteine ricombinanti |
CN114438044B (zh) * | 2022-01-14 | 2024-03-29 | 南昌大学 | 一种高效降解麸质蛋白的多酶复合体及其应用 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2003068170A2 (en) * | 2002-02-14 | 2003-08-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Enzyme treatment of foodstuffs for celiac sprue |
WO2005107786A1 (en) * | 2004-04-26 | 2005-11-17 | Celiac Sprue Research Foundation | Therapeutic enzyme formulations and uses thereof |
WO2011077359A2 (en) * | 2009-12-21 | 2011-06-30 | Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (Chuv) | Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP3104935B2 (ja) | 1992-05-28 | 2000-10-30 | 株式会社ブリヂストン | 空気入りタイヤ |
US7265093B2 (en) * | 2002-05-14 | 2007-09-04 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Drug therapy for Celiac Sprue |
US7354734B2 (en) | 2003-08-25 | 2008-04-08 | Funzyme Biotechnologies Sa | Fungal proteins and nucleic acids encoding same |
JP5328100B2 (ja) | 2003-09-23 | 2013-10-30 | ディーエスエム アイピー アセッツ ビー.ブイ. | ペプチドおよびタンパク質を加水分解するためのプロリン特異的エンドプロテアーゼの使用 |
NL1027650C1 (nl) | 2004-12-03 | 2006-06-07 | Leonardus Antonius Luttikhold | Transporthulpmiddel voor deuren en panelen. |
EP1985698A1 (en) * | 2007-04-25 | 2008-10-29 | Nestec S.A. | Peptidases from basidiomycetes |
CN102858795A (zh) * | 2010-02-02 | 2013-01-02 | 天野酶制品美国有限公司 | 蛋白酶针对谷蛋白不耐受的用途 |
WO2011126873A2 (en) * | 2010-03-30 | 2011-10-13 | Alvine Pharmaceuticals, Inc. | Proteases for degrading gluten |
JP2011211997A (ja) * | 2010-04-02 | 2011-10-27 | Astellas Pharma Inc | アントラサイクリン化合物を生産する微生物 |
-
2012
- 2012-11-05 CA CA2852365A patent/CA2852365C/en active Active
- 2012-11-05 EP EP12781098.4A patent/EP2788018B1/en active Active
- 2012-11-05 AU AU2012348782A patent/AU2012348782B2/en active Active
- 2012-11-05 ES ES12781098.4T patent/ES2595500T3/es active Active
- 2012-11-05 JP JP2014545146A patent/JP6203743B2/ja active Active
- 2012-11-05 BR BR112014012100-1A patent/BR112014012100B1/pt active IP Right Grant
- 2012-11-05 EA EA201491117A patent/EA028228B1/ru not_active IP Right Cessation
- 2012-11-05 WO PCT/EP2012/071816 patent/WO2013083338A1/en active Application Filing
- 2012-11-05 US US14/356,122 patent/US20140356345A1/en not_active Abandoned
- 2012-11-05 CN CN201280060514.5A patent/CN104039345B/zh active Active
- 2012-11-05 IN IN4131CHN2014 patent/IN2014CN04131A/en unknown
-
2014
- 2014-11-21 HK HK14111801.0A patent/HK1198244A1/xx unknown
-
2015
- 2015-11-23 US US14/949,503 patent/US10201593B2/en active Active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2003068170A2 (en) * | 2002-02-14 | 2003-08-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Enzyme treatment of foodstuffs for celiac sprue |
WO2005107786A1 (en) * | 2004-04-26 | 2005-11-17 | Celiac Sprue Research Foundation | Therapeutic enzyme formulations and uses thereof |
WO2011077359A2 (en) * | 2009-12-21 | 2011-06-30 | Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (Chuv) | Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
ROBERTA POZZI, MATTEO SIMONE, CARLO MAZZETTI, SONIA MAFFIOLI, PAOLO MONCIARDINI, LINDA CAVALETTI, RUGGIERO BAMONTE, MARGHERITA SOS: "The genus Actinoallomurus and some of its metabolites", THE JOURNAL OF ANTIBIOTICS, NATURE PUBLISHING GROUP, GB, vol. 64, no. 1, 1 January 2011 (2011-01-01), GB, pages 133 - 139, XP002673610, ISSN: 0021-8820, DOI: 10.1038/ja.2010.149 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20160114009A1 (en) | 2016-04-28 |
JP6203743B2 (ja) | 2017-09-27 |
EP2788018B1 (en) | 2016-06-29 |
US10201593B2 (en) | 2019-02-12 |
AU2012348782B2 (en) | 2017-10-26 |
JP2015500641A (ja) | 2015-01-08 |
BR112014012100A2 (pt) | 2020-10-27 |
HK1198244A1 (en) | 2015-03-20 |
BR112014012100B1 (pt) | 2023-04-18 |
US20140356345A1 (en) | 2014-12-04 |
WO2013083338A1 (en) | 2013-06-13 |
CA2852365C (en) | 2021-01-26 |
ES2595500T3 (es) | 2016-12-30 |
CN104039345B (zh) | 2016-11-09 |
EP2788018A1 (en) | 2014-10-15 |
CN104039345A (zh) | 2014-09-10 |
AU2012348782A1 (en) | 2014-05-15 |
EA201491117A1 (ru) | 2014-09-30 |
CA2852365A1 (en) | 2013-06-13 |
IN2014CN04131A (ru) | 2015-07-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EA028228B1 (ru) | Гидролизующая глютеновые олигопептиды эндопептидазная композиция, способ ее получения и применение | |
CN1871351B (zh) | 一种新的真菌蛋白及其编码核酸 | |
AU2010334383B2 (en) | Synergic action of a prolyl protease and tripeptidyl proteases | |
CN105324483B (zh) | 工程化苯丙氨酸解氨酶多肽 | |
EP3162894B1 (en) | Methods for the manufacture of proteolytically processed polypeptides | |
EA006825B1 (ru) | Способы получения биологически активных молекул | |
KR20080017039A (ko) | 약학적 용도의 프로테아제 | |
Alvarez-Sieiro et al. | Generation of food-grade recombinant Lactobacillus casei delivering Myxococcus xanthus prolyl endopeptidase | |
Shetty et al. | Discovery, cloning and characterisation of proline specific prolyl endopeptidase, a gluten degrading thermo-stable enzyme from Sphaerobacter thermophiles | |
Dvoryakova et al. | Primary digestive cathepsins L of Tribolium castaneum larvae: Proteomic identification, properties, comparison with human lysosomal cathepsin L | |
US20220162619A1 (en) | Preparation of wheat cysteine protease triticain-alpha produced in soluble form and method of producing same | |
US20220364069A1 (en) | Method for the production of an enzymatic composition comprising a recombinant endopeptidase | |
WO2022198019A1 (en) | Synthetic pre-protein signal peptides for directing secretion of heterologous proteins in bacillus bacteria | |
KR20110086711A (ko) | 봉입체 형성 단백질의 제조방법 | |
WO2016120764A1 (en) | Aspergillus oryzae prolyl endopeptidases and use thereof in degradation of polypeptides | |
KR102113588B1 (ko) | 히스티딘-프롤린 반복서열을 갖는 올리고펩타이드의 대량생산 시스템 | |
IT201900012942A1 (it) | Metodo per la produzione di una composizione enzimatica comprendente una endopeptidasi ricombinante |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s) |
Designated state(s): AM AZ BY KZ KG TJ TM |