DK2857412T3 - Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer - Google Patents

Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer Download PDF

Info

Publication number
DK2857412T3
DK2857412T3 DK12877844.6T DK12877844T DK2857412T3 DK 2857412 T3 DK2857412 T3 DK 2857412T3 DK 12877844 T DK12877844 T DK 12877844T DK 2857412 T3 DK2857412 T3 DK 2857412T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
group
solution
nucleoside
compound
reaction
Prior art date
Application number
DK12877844.6T
Other languages
English (en)
Inventor
Shokaku Kim
Masanori Matsumoto
Original Assignee
Hokkaido System Science Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hokkaido System Science Co Ltd filed Critical Hokkaido System Science Co Ltd
Application granted granted Critical
Publication of DK2857412T3 publication Critical patent/DK2857412T3/da

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00Processes for the preparation of sugar derivatives
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C07H1/02Phosphorylation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C07H1/02Phosphorylation
    • C07H1/04Introducing polyphosphoric acid radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06Pyrimidine radicals
    • C07H19/073Pyrimidine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Claims (5)

1. Fremgangsmåde til syntetisering af et oligonukleotid omfattende: sekventielt at kondensere og oxidere en nukleosidphosphoramidit-forbindelse i nærvær af en syre-/azolkompleksforbindelse under anvendelse af et udgangsråmateriale, dvs. hydrofobisk gruppebundet nukleosid repræsenteret ved formel (1):
(l) hvor R1 betegner en alkylengruppe med 1 til 12 carbonatomer; R2 betegner en alkylengruppe med 1 til 22 carbonatomer; R3 og R4 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 1 til 22 carbonatomer, eller R3 og R4 betegner en divalent gruppe, i hvilken de er bundet til hinanden for at danne en hete-rocyklus sammen med tilstødende nitrogenatomer og R2, hvor heterocyklus-sen er repræsenteret ved Formel (2):
(2) hvor R7 betegner en alkylgruppe med 1 til 6 carbonatomer; m betegner et helt tal på 0 eller 1; og y betegner et helt tal på 0 til 3; R5 betegner en enkeltbinding eller en alkylengruppe med 1 til 22 carbonatomer; R6 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 6 til 30 carbonatomer; n betegner et helt tal på 2 til 6; X betegner et hydrogenatom, en hy-droxylgruppe, eller en hydroxylgruppe beskyttet af en beskyttelsesgruppe; og Z betegner en adenylgruppe, en guanylgruppe, en cytosylgruppe, en thymi-nylgruppe, en uracilgruppe eller et derivat af nukleinsyrebasen med en polargruppe eventuelt beskyttet af en beskyttelsesgruppe; hvor en kondensationsreaktion udføres ved på forhånd at opløse den hydro-fobiske gruppebundne nukleosid eller hydrofobiske gruppebundne oligonu-kleotid og nukleosidphosphoramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel, og at bringe den resulterende opløsning i kontakt med syre-/azol-kompleksforbindelsen eller en opløsning, der indeholder kompleksforbindelsen.
2. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 1, hvor en opløsning til opløsning af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid eller den hydrofobiske gruppebundne oligonukleotid og nukleosidphosphoramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel og en opløsning til opløsning af syre-/azol-kompleksforbindelsen i et ikke polært opløsningsmiddel fremstilles separat og blandes.
3. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 1 eller 2, hvor en opløsning til opløsning af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid eller den hydrofobiske gruppebundne oligonukleotid og nukleosidphospho-ramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel og en opløsning til opløsning af syre-/azol-kompleksforbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel ledes ind i en strømningsvej med henblik på kontinuerligt at føre kondensationsreaktionen ind i strømningsvejen.
4. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge et af kravene 1 til 3, hvor udgangsråmaterialet af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid er en forbindelse repræsenteret ved Formel (3):
(3) hvor R6 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 18 til 30 carbon-atomer; og R1, X, Z og y betegner det samme som ovenfor.
5. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 4, hvor R6 i Formel (3) er en octadecylgruppe.
DK12877844.6T 2012-05-30 2012-05-30 Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer DK2857412T3 (da)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/JP2012/063921 WO2013179412A1 (ja) 2012-05-30 2012-05-30 高分散性液相支持体を用いたオリゴヌクレオチド合成法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2857412T3 true DK2857412T3 (da) 2017-04-03

Family

ID=49672666

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK12877844.6T DK2857412T3 (da) 2012-05-30 2012-05-30 Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer

Country Status (7)

Country Link
US (1) US9284344B2 (da)
EP (1) EP2857412B1 (da)
DK (1) DK2857412T3 (da)
IL (1) IL235978B (da)
IN (1) IN2014DN10144A (da)
SG (1) SG11201407967TA (da)
WO (1) WO2013179412A1 (da)

Families Citing this family (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2015151857A (ru) 2008-12-02 2019-01-15 Уэйв Лайф Сайенсес Джапан, Инк. Способ синтеза модифицированных по атому фосфора нуклеиновых кислот
RU2612521C2 (ru) 2009-07-06 2017-03-09 Онтории, Инк. Новые пролекарства нуклеиновых кислот и способы их применения
US10428019B2 (en) 2010-09-24 2019-10-01 Wave Life Sciences Ltd. Chiral auxiliaries
MX347361B (es) 2011-07-19 2017-04-12 Wave Life Sciences Ltd Metodos para la sintesis de acidos nucleicos funcionalizados.
US8846885B2 (en) 2012-02-17 2014-09-30 Ajinomoto Co., Inc. Oligonucleotide with protected base
EP3296306B1 (en) * 2012-02-17 2022-11-09 Ajinomoto Co., Inc. Base-protected oligonucleotide
US9598458B2 (en) 2012-07-13 2017-03-21 Wave Life Sciences Japan, Inc. Asymmetric auxiliary group
US9982257B2 (en) 2012-07-13 2018-05-29 Wave Life Sciences Ltd. Chiral control
JP6246121B2 (ja) 2012-07-13 2017-12-13 株式会社新日本科学 キラル核酸アジュバント
JPWO2015108048A1 (ja) 2014-01-15 2017-03-23 株式会社新日本科学 抗腫瘍作用を有するキラル核酸アジュバンド及び抗腫瘍剤
JPWO2015108047A1 (ja) 2014-01-15 2017-03-23 株式会社新日本科学 免疫誘導活性を有するキラル核酸アジュバンド及び免疫誘導活性剤
EP3095460A4 (en) 2014-01-15 2017-08-23 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having anti-allergic activity, and anti-allergic agent
CA2936712A1 (en) 2014-01-16 2015-07-23 Meena Chiral design
WO2017086397A1 (ja) * 2015-11-17 2017-05-26 日産化学工業株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法
WO2017104836A1 (ja) * 2015-12-16 2017-06-22 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法、およびヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド
JPWO2017111137A1 (ja) * 2015-12-22 2018-10-18 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法
WO2020166705A1 (ja) 2019-02-15 2020-08-20 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法
WO2020196890A1 (ja) 2019-03-28 2020-10-01 味の素株式会社 ホスホロチオエート化部位を有するオリゴヌクレオチドの製造方法
EA202193010A1 (ru) * 2019-05-08 2022-03-18 Байоджен Ма Инк. Конвергентные жидкофазные синтезы олигонуклеотидов
JPWO2021039935A1 (da) * 2019-08-29 2021-03-04
IL296862A (en) 2020-03-31 2022-11-01 Janssen Biopharma Inc Synthesis of oligonucleotides and related compounds
FR3111896A1 (fr) 2020-06-24 2021-12-31 Strainchem Procédés de synthèses en solution de macromolécules à partir d’unités de dérivés de glucides
CN113583069B (zh) * 2021-09-09 2023-06-06 北京大学 核苷磷脂类化合物及其化学合成方法和在核酸递送中的应用

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7094943B2 (en) * 1998-04-27 2006-08-22 Hubert Köster Solution phase biopolymer synthesis
JP2003002895A (ja) * 2001-05-30 2003-01-08 Tokyo Inst Of Technol 核酸の合成法
JP4963665B2 (ja) 2007-11-27 2012-06-27 株式会社ミツバ 扁平型コミュテータ及びその製造方法
JP5548852B2 (ja) * 2009-05-29 2014-07-16 国立大学法人東京農工大学 疎水性基結合ヌクレオシド、疎水性基結合ヌクレオシド溶液、及び疎水性基結合オリゴヌクレオチド合成方法
US9029528B2 (en) 2011-05-17 2015-05-12 Ajinomoto Co., Inc. Solution-based method of making oligonucleotides via phosphoramidite coupling
EP3296306B1 (en) 2012-02-17 2022-11-09 Ajinomoto Co., Inc. Base-protected oligonucleotide

Also Published As

Publication number Publication date
EP2857412B1 (en) 2017-01-11
IL235978B (en) 2018-02-28
WO2013179412A1 (ja) 2013-12-05
US20150112053A1 (en) 2015-04-23
EP2857412A1 (en) 2015-04-08
US9284344B2 (en) 2016-03-15
IN2014DN10144A (da) 2015-08-21
SG11201407967TA (en) 2015-01-29
EP2857412A4 (en) 2015-10-21
IL235978A0 (en) 2015-02-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2857412T3 (da) Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer
JP5548852B2 (ja) 疎水性基結合ヌクレオシド、疎水性基結合ヌクレオシド溶液、及び疎水性基結合オリゴヌクレオチド合成方法
JP5714490B2 (ja) Rna合成、リバース方向での合成rnaためのホスホラミダイト、及びrnaオリゴマーの合成のための5’から3’方向に対する結合形成によるオリゴヌクレオチドを調製する方法
US9896689B2 (en) Purification of triphosphorylated oligonucleotides using capture tags
CN101861318A (zh) 合成吗啉代低聚物的方法
CN108473526A (zh) 寡核苷酸的制备方法以及核苷、核苷酸或寡核苷酸
US11400161B2 (en) Method of conjugating oligomeric compounds
CN107207555B (zh) 沉淀促进剂以及使用其的沉淀方法
WO2019182037A1 (ja) 毒性が低減されたアンチセンスオリゴヌクレオチド
US20150368288A1 (en) Method of preparing oligomeric compounds using modified coupling protocols
CN112384520A (zh) 寡核苷酸化合物的制造方法
JP5705512B2 (ja) 高分散性液相支持体を用いたオリゴヌクレオチド合成法
CN114981280A (zh) 寡核苷酸化合物的制造方法
AU2022291626A1 (en) Improved process for preparing imetelstat
EP4130018A1 (en) Method for producing nucleic acid oligomer
AU2013361605A1 (en) Post-synthetic orthogonal amidation plus metal catalyzed azide-alkyne cycloaddition click chemistry on siRNA
Ohkubo et al. Efficient synthesis of functionalized oligodeoxyribonucleotides with base-labile groups using a new silyl linker
EP4047004B1 (en) Phosphoramidite activator
WO2023149564A1 (ja) オリゴヌクレオチドを製造する方法
WO2022064908A1 (ja) 核酸オリゴマーの製造方法
EP4043473A1 (en) Method for producing nucleic acid oligomers
JP5105404B2 (ja) 水素結合性置換基を有する8−置換グアノシン誘導体及びそれを含むオリゴヌクレオチド
WO2020246443A1 (ja) 二分岐脂質結合オリゴヌクレオチドの製造方法及び中間体
CA3207897A1 (en) Improved oligonucleotide synthesis
WO2023176773A1 (ja) キメラ分子の製造方法