DK2857412T3 - Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer - Google Patents

Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer Download PDF

Info

Publication number
DK2857412T3
DK2857412T3 DK12877844.6T DK12877844T DK2857412T3 DK 2857412 T3 DK2857412 T3 DK 2857412T3 DK 12877844 T DK12877844 T DK 12877844T DK 2857412 T3 DK2857412 T3 DK 2857412T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
group
solution
nucleoside
compound
reaction
Prior art date
Application number
DK12877844.6T
Other languages
English (en)
Inventor
Shokaku Kim
Masanori Matsumoto
Original Assignee
Hokkaido System Science Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hokkaido System Science Co Ltd filed Critical Hokkaido System Science Co Ltd
Application granted granted Critical
Publication of DK2857412T3 publication Critical patent/DK2857412T3/da

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C07H1/02—Phosphorylation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C07H1/02—Phosphorylation
    • C07H1/04—Introducing polyphosphoric acid radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C07H19/073—Pyrimidine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (5)

1. Fremgangsmåde til syntetisering af et oligonukleotid omfattende: sekventielt at kondensere og oxidere en nukleosidphosphoramidit-forbindelse i nærvær af en syre-/azolkompleksforbindelse under anvendelse af et udgangsråmateriale, dvs. hydrofobisk gruppebundet nukleosid repræsenteret ved formel (1):
(l) hvor R1 betegner en alkylengruppe med 1 til 12 carbonatomer; R2 betegner en alkylengruppe med 1 til 22 carbonatomer; R3 og R4 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 1 til 22 carbonatomer, eller R3 og R4 betegner en divalent gruppe, i hvilken de er bundet til hinanden for at danne en hete-rocyklus sammen med tilstødende nitrogenatomer og R2, hvor heterocyklus-sen er repræsenteret ved Formel (2):
(2) hvor R7 betegner en alkylgruppe med 1 til 6 carbonatomer; m betegner et helt tal på 0 eller 1; og y betegner et helt tal på 0 til 3; R5 betegner en enkeltbinding eller en alkylengruppe med 1 til 22 carbonatomer; R6 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 6 til 30 carbonatomer; n betegner et helt tal på 2 til 6; X betegner et hydrogenatom, en hy-droxylgruppe, eller en hydroxylgruppe beskyttet af en beskyttelsesgruppe; og Z betegner en adenylgruppe, en guanylgruppe, en cytosylgruppe, en thymi-nylgruppe, en uracilgruppe eller et derivat af nukleinsyrebasen med en polargruppe eventuelt beskyttet af en beskyttelsesgruppe; hvor en kondensationsreaktion udføres ved på forhånd at opløse den hydro-fobiske gruppebundne nukleosid eller hydrofobiske gruppebundne oligonu-kleotid og nukleosidphosphoramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel, og at bringe den resulterende opløsning i kontakt med syre-/azol-kompleksforbindelsen eller en opløsning, der indeholder kompleksforbindelsen.
2. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 1, hvor en opløsning til opløsning af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid eller den hydrofobiske gruppebundne oligonukleotid og nukleosidphosphoramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel og en opløsning til opløsning af syre-/azol-kompleksforbindelsen i et ikke polært opløsningsmiddel fremstilles separat og blandes.
3. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 1 eller 2, hvor en opløsning til opløsning af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid eller den hydrofobiske gruppebundne oligonukleotid og nukleosidphospho-ramidit-forbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel og en opløsning til opløsning af syre-/azol-kompleksforbindelsen i et ikke-polært opløsningsmiddel ledes ind i en strømningsvej med henblik på kontinuerligt at føre kondensationsreaktionen ind i strømningsvejen.
4. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge et af kravene 1 til 3, hvor udgangsråmaterialet af den hydrofobiske gruppebundne nukleosid er en forbindelse repræsenteret ved Formel (3):
(3) hvor R6 hver især uafhængigt betegner en alkylgruppe med 18 til 30 carbon-atomer; og R1, X, Z og y betegner det samme som ovenfor.
5. Fremgangsmåde til syntetisering af en oligonukleotid ifølge krav 4, hvor R6 i Formel (3) er en octadecylgruppe.
DK12877844.6T 2012-05-30 2012-05-30 Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer DK2857412T3 (da)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/JP2012/063921 WO2013179412A1 (ja) 2012-05-30 2012-05-30 高分散性液相支持体を用いたオリゴヌクレオチド合成法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2857412T3 true DK2857412T3 (da) 2017-04-03

Family

ID=49672666

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK12877844.6T DK2857412T3 (da) 2012-05-30 2012-05-30 Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer

Country Status (7)

Country Link
US (1) US9284344B2 (da)
EP (1) EP2857412B1 (da)
DK (1) DK2857412T3 (da)
IL (1) IL235978B (da)
IN (1) IN2014DN10144A (da)
SG (1) SG11201407967TA (da)
WO (1) WO2013179412A1 (da)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2744987C (en) 2008-12-02 2018-01-16 Chiralgen, Ltd. Method for the synthesis of phosphorus atom modified nucleic acids
BR112012000828A8 (pt) 2009-07-06 2017-10-10 Ontorii Inc Novas pró-drogas de ácido nucleico e métodos de uso das mesmas
WO2012039448A1 (ja) 2010-09-24 2012-03-29 株式会社キラルジェン 不斉補助基
US9605019B2 (en) 2011-07-19 2017-03-28 Wave Life Sciences Ltd. Methods for the synthesis of functionalized nucleic acids
JP6237237B2 (ja) * 2012-02-17 2017-11-29 味の素株式会社 塩基部保護オリゴヌクレオチド
US8846885B2 (en) 2012-02-17 2014-09-30 Ajinomoto Co., Inc. Oligonucleotide with protected base
KR101835401B1 (ko) 2012-07-13 2018-03-08 신 니뽄 바이오메디칼 라보라토리즈, 엘티디. 키랄 핵산 어쥬번트
KR20220139425A (ko) 2012-07-13 2022-10-14 웨이브 라이프 사이언시스 리미티드 키랄 제어
AU2013288048A1 (en) 2012-07-13 2015-01-22 Wave Life Sciences Ltd. Asymmetric auxiliary group
EP3095461A4 (en) 2014-01-15 2017-08-23 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having immunity induction activity, and immunity induction activator
WO2015108048A1 (ja) 2014-01-15 2015-07-23 株式会社新日本科学 抗腫瘍作用を有するキラル核酸アジュバンド及び抗腫瘍剤
US10322173B2 (en) 2014-01-15 2019-06-18 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having anti-allergic activity, and anti-allergic agent
PT3094728T (pt) 2014-01-16 2022-05-19 Wave Life Sciences Ltd Desenho quiral
CN108350018A (zh) * 2015-11-17 2018-07-31 日产化学工业株式会社 寡核苷酸的制造方法
WO2017104836A1 (ja) * 2015-12-16 2017-06-22 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法、およびヌクレオシド、ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド
WO2017111137A1 (ja) * 2015-12-22 2017-06-29 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法
JPWO2020166705A1 (ja) 2019-02-15 2021-12-16 味の素株式会社 オリゴヌクレオチドの製造方法
JPWO2020196890A1 (da) 2019-03-28 2020-10-01
KR20220007104A (ko) * 2019-05-08 2022-01-18 바이오젠 엠에이 인코포레이티드 올리고뉴클레오타이드의 수렴형 액상 합성
JPWO2021039935A1 (da) * 2019-08-29 2021-03-04
AU2021247043A1 (en) 2020-03-31 2022-10-27 Janssen Biopharma, Inc. Synthesis of oligonucleotides and related compounds
FR3111896A1 (fr) * 2020-06-24 2021-12-31 Strainchem Procédés de synthèses en solution de macromolécules à partir d’unités de dérivés de glucides
CN113583069B (zh) * 2021-09-09 2023-06-06 北京大学 核苷磷脂类化合物及其化学合成方法和在核酸递送中的应用
WO2024083746A1 (en) 2022-10-17 2024-04-25 Bachem Holding Ag Method and composition for oligonucleotide synthesis

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7094943B2 (en) 1998-04-27 2006-08-22 Hubert Köster Solution phase biopolymer synthesis
JP2003002895A (ja) 2001-05-30 2003-01-08 Tokyo Inst Of Technol 核酸の合成法
JP4963665B2 (ja) 2007-11-27 2012-06-27 株式会社ミツバ 扁平型コミュテータ及びその製造方法
JP5548852B2 (ja) 2009-05-29 2014-07-16 国立大学法人東京農工大学 疎水性基結合ヌクレオシド、疎水性基結合ヌクレオシド溶液、及び疎水性基結合オリゴヌクレオチド合成方法
EP2711370B1 (en) 2011-05-17 2018-01-03 Ajinomoto Co., Inc. Method for producing oligonucleotides
JP6237237B2 (ja) 2012-02-17 2017-11-29 味の素株式会社 塩基部保護オリゴヌクレオチド

Also Published As

Publication number Publication date
IL235978A0 (en) 2015-02-01
EP2857412A1 (en) 2015-04-08
US9284344B2 (en) 2016-03-15
WO2013179412A1 (ja) 2013-12-05
IN2014DN10144A (da) 2015-08-21
US20150112053A1 (en) 2015-04-23
EP2857412A4 (en) 2015-10-21
IL235978B (en) 2018-02-28
EP2857412B1 (en) 2017-01-11
SG11201407967TA (en) 2015-01-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2857412T3 (da) Fremgangsmåde til oligonukleotidsyntese under anvendelse af højopløselig væskefasebærer
JP5548852B2 (ja) 疎水性基結合ヌクレオシド、疎水性基結合ヌクレオシド溶液、及び疎水性基結合オリゴヌクレオチド合成方法
JP5714490B2 (ja) Ｒｎａ合成、リバース方向での合成ｒｎａためのホスホラミダイト、及びｒｎａオリゴマーの合成のための５’から３’方向に対する結合形成によるオリゴヌクレオチドを調製する方法
US9896689B2 (en) Purification of triphosphorylated oligonucleotides using capture tags
CN112533892B (zh) 烷氧基苯基衍生物、核苷保护体和核苷酸保护体、寡核苷酸制造方法以及取代基除去方法
CN108473526A (zh) 寡核苷酸的制备方法以及核苷、核苷酸或寡核苷酸
US11400161B2 (en) Method of conjugating oligomeric compounds
CN107207555B (zh) 沉淀促进剂以及使用其的沉淀方法
CN112384520B (zh) 寡核苷酸化合物的制造方法
WO2019182037A1 (ja) 毒性が低減されたアンチセンスオリゴヌクレオチド
US20150368288A1 (en) Method of preparing oligomeric compounds using modified coupling protocols
JP5705512B2 (ja) 高分散性液相支持体を用いたオリゴヌクレオチド合成法
CA3066968C (en) Improved process for preparing imetelstat
CN114981280A (zh) 寡核苷酸化合物的制造方法
AU2013361605A1 (en) Post-synthetic orthogonal amidation plus metal catalyzed azide-alkyne cycloaddition click chemistry on siRNA
EP4130018A1 (en) Method for producing nucleic acid oligomer
WO2022064908A1 (ja) 核酸オリゴマーの製造方法
CA3207897A1 (en) Improved oligonucleotide synthesis
Ohkubo et al. Efficient synthesis of functionalized oligodeoxyribonucleotides with base-labile groups using a new silyl linker
WO2023149564A1 (ja) オリゴヌクレオチドを製造する方法
CN117980285A (zh) 纯化二氯乙酸的制造方法
JP2015093853A (ja) ボラノホスフェート化合物、及び核酸オリゴマー
EP4043473A1 (en) Method for producing nucleic acid oligomers
JP5105404B2 (ja) 水素結合性置換基を有する８−置換グアノシン誘導体及びそれを含むオリゴヌクレオチド
WO2020246443A1 (ja) 二分岐脂質結合オリゴヌクレオチドの製造方法及び中間体