CN112533892B - 烷氧基苯基衍生物、核苷保护体和核苷酸保护体、寡核苷酸制造方法以及取代基除去方法 - Google Patents

烷氧基苯基衍生物、核苷保护体和核苷酸保护体、寡核苷酸制造方法以及取代基除去方法 Download PDF

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Abstract

本发明提供能够利用比以往更简易迅速的液相合成法合成寡核苷酸的烷氧基苯基衍生物、键合有上述烷氧基苯基衍生物的核苷保护体和核苷酸保护体、使用它们的寡核苷酸的制造方法、以及该烷氧基苯基衍生物部分的选择性除去方法等。一种通式(1)表示的化合物或其衍生物。(式中,R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。X表示O、S、NH或者NRN。n表示1~4的整数。RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。)

Description

烷氧基苯基衍生物、核苷保护体和核苷酸保护体、寡核苷酸制 造方法以及取代基除去方法
技术领域
本发明涉及可利用液相合成法合成寡核苷酸的烷氧基苯基衍生物,结合了该烷氧基苯基衍生物的核苷保护体和核苷酸保护体,能够使用其简易构建的寡核苷酸制造方法,以及结合了烷氧基苯基衍生物的核苷保护体或者核苷酸保护体的选择性烷氧基苯基衍生物部分的除去方法等。
背景技术
近年来,寡核苷酸一般来说可以通过依次连结成为原料的核苷酸来合成,但合成20mer左右以上的寡核苷酸的情况下,还利用了预先制备2~3mer核苷酸的构件组并反复将其连结而得到所希望的链长的生成物的构件组合成法(ブロックマ一合成法),通过10个碱基左右以上的寡核苷酸间的连结而得到寡核苷酸的单元偶联(片段缩合)合成法等(例如,非专利文献1~3)。使用亚磷酰胺法的寡核苷酸的固相合成法,为了提高作为目标物质的寡核苷酸的收率,存在必须使用大大过量的核苷亚磷酰胺化合物和四唑系化合物的问题。另外,固相合成法中,设备等的规模扩大存在限制,另外,中途阶段的反应的进行状况的确认、中间体的结构解析困难。
另一方面,迄今为止的液相合成法中,需要核苷酸的脱保护、偶联、氧化等各工序中的精制操作而变得繁琐等,很难迅速且大量地合成多聚合度的寡核苷酸。因此,例如,专利文献1、2中提出了使用准固相保护基的液相合成,但例如该准固相保护基的除去需要时间,而且,从具有准固相保护基的寡核苷酸中仅选择性除去该准固相保护基是困难的,因此成为构件或片段的前体的保护了核酸碱基或磷酸基的核苷酸(以下,本说明书中,有时也称为“核苷酸保护体”)的合成也是困难的。另外,非专利文献4中,通过使用Pd催化剂的接触还原进行准固相保护基的除去,但使用具有毒性的重金属、危险的氢气,脱保护需要长达20~40小时的时间。另外,并不进行核苷酸的保护基的一般脱保护条件下的准固相保护基的除去,其通用性存在问题。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:日本专利第5548852号
专利文献2:国际公开第2012/157723号
非专利文献
非专利文献1:S.L.Beaucage,D.E.Bergstorm,G.D.Glick,R.A.Jones;CurrentProtocols in Nucleic Acid Chemistry;John Wiley&Sons(2000)
非专利文献2:关根光雄,斋藤烈编,“基因组化学-利用人工核酸的科学方法”,讲谈社科学(2003)
非专利文献3:C.-H.Chen,et al.,Aust.J.Chem.,2010,63,227-235.
非专利文献4:Y.Matsuno,et al.,Org.Lett.,2016,18,800-803.
发明内容
本发明鉴于这样的情况,目的在于提供一种不仅能够合成寡核苷酸、还能够简易迅速地合成以往很难的寡核苷酸保护体的通用性高的烷氧基苯基衍生物。
另外,本发明的目的在于提供一种不仅能够合成寡核苷酸、还能够简易迅速地合成以往很难的寡核苷酸保护体的通用性高的结合了上述烷氧基苯基衍生物(以下,本说明书中,有时也称为“Tag化”)而得的核苷保护体以及核苷酸保护体(以下,本说明书中,有时也分别称为“Tag化核苷保护体”、“Tag化核苷酸保护体”)。
进而,本发明的目的在于提供使用了上述烷氧基苯基衍生物、或者上述Tag化核苷保护体或Tag化核苷酸保护体的、与以往相比通用性高的寡核苷酸的制造方法(合成方法)。
另外,本发明的目的在于提供Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体中的Tag部分的选择性除去方法。应予说明,本发明中,“Tag部分”是上述Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体中的来自上述烷氧基苯基衍生物的部分。
本发明人等为了解决上述课题进行了深入研究,结果发现成功地生产出以下所示的新型烷氧基苯基化合物及其衍生物,可以利用上述化合物实现上述目的,从而完成了本发明。
即,本发明的化合物及其衍生物由通式(1)(以下,本说明书中,有时也称为“化合物(1)”。另外,其他通式表示的化合物也以此为准)表示。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。)
根据本发明的化合物或其衍生物,通过具有上述通式(1)表示的结构,不仅能够利用液相合成法合成寡核苷酸,还能够合成以往困难的寡核苷酸保护体。更详细而言,本发明的化合物或其衍生物(烷氧基苯基衍生物)可以经由与核苷或者核苷酸的键合反应,得到Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体。而且,得到的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体因为其Tag部分具有上述结构,所以能够通过添加极性溶剂,利用过滤操作等与酰胺单体等副原料等简便地分离,进而能够选择性且迅速地仅除去Tag部分,进而不仅能够合成寡核苷酸,还能够合成(制造)以往困难的寡核苷酸保护体。
应予说明,上述化合物的衍生物只要不损害本发明的作用效果,大范围包括将上述化合物的化学结构一部分取代而得的衍生物,例如,包括末端的羧基(-COOH)的OH基部分被取代基取代的化合物。作为上述取代基,可举出离去能力高的取代基等以便容易与核苷或者核苷酸成键,例如,可以举出F、Cl、Br、I等卤素原子、被烷氧基取代的烷基酯结构等。另外,作为上述取代基,可以适当地使用公知的离去基团。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,优选为通式(2)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。)
另外,本发明的化合物或其衍生物中,也可以为通式(3)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
具有上述构成时,成为上述Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体,但因为Tag部分具有上述结构,所以特别是在液相合成(包括准液相合成)中,能够通过添加极性溶剂,利用过滤操作等与酰胺单体等副原料等简便地分离,进而能够选择性且迅速地仅除去Tag部分,不仅能够合成寡核苷酸,还能够合成以往困难的寡核苷酸保护体。
另外,本发明的核苷一般表示嘌呤或嘧啶碱基与糖以糖苷键键合而成的物质,但只要不损害本发明的作用效果,就大范围包括其类似物、将其一般结构进行部分取代而得的物质。例如,可以举出碱基部分不一定是嘌呤或嘧啶结构的核苷(例如,修饰碱基等)、糖部分不是D-核糖或者脱氧-D-核糖的核苷(例如,通式(5)、(8)表示的吗啉代型的吗啉代核苷)等。
另外,本发明中的核苷酸一般表示嘌呤或嘧啶碱基与糖以糖苷键键合而成的上述核苷的磷酸酯,但只要不损害本发明的作用效果,就大范围包括其类似物、将该一般结构进行部分取代而得的物质。例如,可以举出碱基部分不一定是嘌呤或者嘧啶结构的核苷酸(例如,修饰碱基等)、糖部分不是D-核糖或者脱氧-D-核糖的核苷酸(例如,吗啉代型的吗啉代核苷酸),另外,可以举出磷酸酯部分的一个O原子取代为S原子的硫代磷酸酯的情况等。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,优选为通式(6)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
另外,本发明的化合物或其衍生物中,W优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。W为上述任一种时,能够更简便地进行寡核苷酸的合成。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,R4优选为在2位具有吸电子性基团的乙基。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,Q优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。Q为上述任一者时,能够更简便地进行寡核苷酸的合成。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,y1或者y2可以为1~100。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,y1或者y2也可以1~30。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,y1或者y2也可以为0。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,n优选为1或者2。
另外,本发明的化合物或其衍生物中,m优选为2~4的整数。
另一方面,本发明的制造方法包括将通式(3)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的得到通式(7)或者(8)表示的化合物的工序(1)。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。)
根据本发明的制造方法,因为使用上述Tag化核苷保护体以及Tag化核苷酸保护体,所以特别是在液相合成(包括准液相合成)中,能够通过添加极性溶剂,利用过滤操作等与酰胺单体等副原料等简便地分离,进而能够选择性且迅速地仅除去Tag部分,不仅能够合成寡核苷酸,还能够合成以往困难的寡核苷酸保护体。另外,例如,与专利文献2的方案相比,本发明的制造方法能够在更温和的条件下(例如,氨水中35℃)除去取代基(Tag部分的离去反应),另外,能够以更短时间制造。
另外,本发明的寡核苷酸保护体的制造方法中,优选包括将通式(6)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1)。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基,二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。)
另外,本发明的制造方法中,优选上述还原处理使用含硼还原剂或者使用含硼还原剂和胺。通过具有上述构成,能够更简便地合成寡核苷酸保护体。
另外,本发明的制造方法中,上述含硼还原剂优选为硼氢化锂、硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、四丁基硼氢化铵。通过具有上述构成,能够收率更高且简便地合成寡核苷酸保护体。
另外,本发明的制造方法中,W优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。W为上述任一者时,能够更简便地进行寡核苷酸保护体的合成。
另外,本发明的制造方法中,R4优选为在2位具有吸电子性基团的乙基。
另外,本发明的制造方法中,Q优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。Q为上述任一者时,能够更简便地进行寡核苷酸的合成。
另外,本发明的制造方法中,y1或者y2可以为1~100。
另外,本发明的制造方法中,y1或者y2也可以为1~30。
另外,本发明的制造方法中,y1或者y2也可以为0。
另外,本发明的制造方法中,n优选为1或者2。
另外,本发明的制造方法中,m优选为2~4的整数。
另一方面,本发明的Tag部分除去方法(取代基除去方法)包括将通式(3)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1)。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
根据本发明的Tag部分除去方法,因为使用上述Tag化核苷保护体以及Tag化核苷酸保护体,所以能够选择性且迅速地仅除去该Tag部分。另外,起到上述作用效果推测是因为通式(3)等中的与苯基直接键合的羰基(C=O基)和与该羰基键合的X原子(O、S、NH、或者NRN)与LiBH4等还原剂形成某种相互作用,还原反应更优选容易在Tag化合物部位进行,因此选择性且更迅速地进行除去反应,但该推测并不限定权利范围。
另外,本发明的Tag部分除去方法中,优选包括将通式(6)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1)。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
另外,本发明的Tag部分除去方法中,优选上述还原处理使用含硼还原剂或者使用含硼还原剂和胺。通过具有上述构成,能够简便地进行Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体中的Tag部分的选择性除去。
另外,本发明的Tag部分除去方法中,上述含硼还原剂优选为硼氢化锂、硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、四丁基硼氢化铵。通过具有上述构成,能够收率更高地进行Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体中的Tag部分的选择性除去。
本发明的化合物或其衍生物(化合物(1)、(2)等。烷氧基苯基衍生物)是新型化合物,通过使用该新型化合物,能够简便地得到上述Tag化核苷保护体以及核苷酸保护体。
另外,本发明的化合物或其衍生物(化合物(3)、(6)等。Tag化核苷保护体以及Tag化核苷酸保护体等)因为Tag部分具有上述结构,所以特别是在液相合成(包括准液相合成)中,能够通过添加极性溶剂,利用过滤操作等与酰胺单体等副原料等简便地分离,进而能够选择性且迅速地仅除去Tag部分,不仅能够利用液相合成法合成寡核苷酸,还能够合成以往困难的寡核苷酸保护体。
另外,本发明的化合物或其衍生物(化合物(7)、(8)等。寡核苷酸等)的制造方法因为使用上述Tag化核苷保护体以及Tag化核苷酸保护体,所以能够比以往更简易迅速地利用液相合成法合成寡核苷酸。
另外,本发明的化合物或其衍生物(化合物(1)、(2)、(3)、(6)等。烷氧基苯基衍生物、Tag化核苷保护体以及Tag化核苷酸保护体等)的Tag部分除去方法(取代基除去方法)因为使用上述Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体,所以能够在温和的条件下选择性且迅速地仅除去该Tag部分。
具体实施方式
以下,对本发明的实施方式进行详细说明。
〔烷氧基苯基化合物以及其衍生物〕
本发明的烷氧基苯基化合物以及其衍生物为通式(1)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。)
上述通式(1)中,R表示各自独立地可以被取代的碳原子数10~40的烷基。上述R可以为碳原子数13~30的烷基,可以为碳原子数15~20的烷基,其中作为优选的例子可以举出碳原子数18的烷基。另外,上述R多个存在的情况下各自独立地可以为直链烷基,也可以为支链烷基,但优选为直链烷基。另外,通过上述R为碳原子数10~40的烷基,本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体的合成变得容易,并且也能够得到溶解度、分离能力的提高作用。
上述通式(1)中,m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。m优选为2~4的整数,m更优选为3。另外,在将与苯基直接键合的羰基(C=O基)设为1位时,上述RO基优选键合于3位、4位或者5位,m=3的情况下,优选键合于3位、4位、还有5位。另外,通过将上述m的值调整在上述范围内,能够调整本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体相对于非极性溶剂的溶解能力。
上述通式(1)中,X表示O、S、NH、或者NRN。其中,X优选为O。
上述通式(1)中,n表示1~4的整数。其中,n优选为1或者2。
上述通式(1)中,RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。作为上述RN,例如,可以举出甲基、乙基、1-丙基、1-甲基-1-乙基、1-丁基、1-甲基-1-丙基、1,1-二甲基-1-乙基、2-甲基-1-丙基、1-戊基、2-戊基。
另外,本发明中,上述烷氧基苯基化合物以及其衍生物优选为通式(2)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。)
上述通式(2)中,R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。上述R1、R2和R3可以为碳原子数13~30的烷基,可以为碳原子数15~20的烷基,其中作为优选的例子可以举出碳原子数18的烷基。另外,上述R1、R2和R3各自独立地可以为直链烷基,也可以为支链烷基,但优选全部为直链烷基。
上述通式(2)中,X、n和RN与上述通式(1)同样。
另外,本发明的烷氧基苯基化合物以及其衍生物的合成方法例示于实施例,但另外,也可以使用市售的原料使用公知的方法合成。
〔Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体等〕
本发明中的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体为通式(3)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
上述通式(3)中,R、m、X、n、RN与上述通式(1)同样。
上述通式(3)中,Y表示下述通式(4)或者通式(5)。
上述通式(4)中,Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
作为上述Base,例如,可以举出腺嘌呤基(adenyl)、鸟嘌呤基(guanyl)、胞嘧啶基(Cytosinyl)、胸腺嘧啶基(thyminyl)、或者尿嘧啶基(uracil)和它们的衍生物、以及它们的修饰物。作为上述修饰物,例如,可以为极性基团等被公知的保护基等保护而得的修饰物。另外,寡核苷酸中多个存在的Base可以相同或者可以不同。
上述通式(4)中,B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。另外,被保护的羟基的情况下,作为保护基、保护方法,可以适当地使用公知的方法。
上述通式(4)中,W表示氢原子或者保护基。W为保护基的情况下,作为保护基、保护方法,可以适当地使用公知的方法。
另外,W优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。W为上述任一者时,能够更简便地进行寡核苷酸的合成。
上述通式(4)中,R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。另外,R4优选为在2位具有吸电子性基团的乙基。另外,作为上述吸电子性基团,例如,作为优选的例子可以举出氰基。
上述通式(4)中,Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
上述通式(4)中,y1表示0以上的任意的整数。y1可以为1~100,也可以为1~50,也可以为1~30,也可以为1~20,也可以为1~10,也可以为0。
上述通式(4)中,*表示上述通式(3)中的键合位点。
上述通式(5)中,Base与上述通式(4)同样。
上述通式(5)中,Q表示氢原子或者保护基。Q为保护基的情况下,作为保护基、保护方法,可以适当地使用公知的方法。
另外,Q优选为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。Q为上述任一者时,能够更简便地进行寡核苷酸的合成。
上述通式(5)中,V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
上述通式(5)中,y2表示0以上的任意的整数。y2可以为1~100,也可以为1~50,也可以为1~30,也可以为1~20,也可以为1~10,也可以为0。
上述通式(5)中,*表示上述通式(3)中的键合位点。
另外,本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体优选为通式(6)表示的化合物或其衍生物。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
上述通式(6)中,R1、R2、R3、X、n和RN与上述通式(2)同样。
上述通式(6)中,Y与上述通式(3)同样。
另外,本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体的合成方法例示于实施例,但另外,也可以使用市售的原料使用公知的方法合成。
作为本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体的制造方法(合成方法),例如可以通过使上述烷氧基苯基化合物或其衍生物与核苷或者核苷酸键合的方法而得到。作为键合方法,例如可以举出使上述烷氧基苯基化合物或其衍生物与核苷或者核苷酸进行缩合反应的方法。使用上述缩合反应的情况下,例如可以适当地采用使用缩合剂使通式(1)或者(2)表示的上述烷氧基苯基化合物与核苷或者核苷酸键合的方法;使用以取代基等提高反应性的通式(1)或者(2)表示的上述烷氧基苯基化合物的衍生物(例如,酯衍生物、酰氯衍生物等)与核苷或者核苷酸使其键合的方法;使用通式(1)或者(2)表示的上述烷氧基苯基化合物与以取代基等提高反应性的核苷或者核苷酸使其键合的方法。
〔寡核苷酸保护体的制造方法和Tag部分除去方法等〕
本发明的寡核苷酸保护体的制造方法(合成方法)和本发明的Tag部分除去方法(取代基除去方法)包括将通式(3)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1)。
(式中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
m表示1~5的整数。m为2以上的情况下,多个存在的RO可以相同或者可以不同。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(3)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。)
上述寡核苷酸保护体的制造方法中,上述通式(3)、(4)、(5)与上述同样。
上述寡核苷酸保护体的制造方法中的上述通式(7)中,Base、B、W、R4、Z和y1与上述通式(4)同样。
上述寡核苷酸保护体的制造方法中的上述通式(8)中,Base、Q、V和y2与上述通式(5)同样。
本发明的寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法中优选包括将通式(6)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1)。
(式中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基。
X表示O、S、NH、或者NRN
n表示1~4的整数。
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基。
Y表示下述通式(4)或者通式(5)。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。
*表示上述通式(6)中的键合位点。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素。B存在2个以上的情况下,多个存在的B可以相同或者可以不同。
W表示氢原子或者保护基。
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基。R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4可以相同或者可以不同。
Z表示O或者S。Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z可以相同或者可以不同。
y1表示0以上的任意的整数。)
(式中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基。Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base可以相同或者可以不同。
Q表示氢原子或者保护基。
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基。V存在2个以上的情况下,多个存在的V可以相同或者可以不同。
y2表示0以上的任意的整数。)
上述寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法中,上述通式(3)、(4)、(5)与上述同样。
上述寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法中,上述通式(7)中,Base、B、W、R4、Z和y1与上述通式(4)同样。
上述寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法中,上述通式(8)中,Base、Q、V和y2与上述通式(5)同样。
上述寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法中,上述还原处理优选使用含硼还原剂、或者使用含硼还原剂和胺。通过具有上述构成,能够更简便地合成寡核苷酸保护体。
作为上述含硼还原剂,可以使用公知的含硼还原剂,其中,优选为硼氢化锂、硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、四丁基硼氢化铵等。这些化合物可以单独使用,也可以混合2种以上使用。通过具有上述构成,能够收率更高且简便地合成寡核苷酸保护体。
使用上述含硼还原剂和胺时,作为上述胺,可以使用公知的胺,其中,优选为二异丙基乙基胺、三乙胺、吡啶等。这些化合物可以单独使用,也可以混合2种以上使用。通过具有上述构成,能够收率更高且简便地合成寡核苷酸保护体。
上述工序(1)其合成方法、反应方法只要不破坏通式(6)等表示的化合物或其衍生物的化学结构,另外也可以使用市售的原料使用公知的方法。
对于上述工序(1),例如可以举出将通式(6)等表示的化合物或其衍生物与含硼还原剂或者含硼还原剂和胺溶解或者混合在有机溶剂中,在-10℃或者室温下搅拌进行反应的工序。
另外,本发明的寡核苷酸保护体的制造方法和本发明的Tag部分除去方法的合成方法、反应方法例示于实施例,但另外也可以使用市售的原料使用公知的方法。
作为本发明的Tag化寡核苷酸保护体的制造方法,例如,以二聚体为例,可以举出如下方法:使上述Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体与酰胺化的核苷或者核苷酸进行偶联反应(工序A),将得到的二聚体在氧化工序中进行磷酸酯化(工序B),进行保护基W的脱保护(工序C),进行滤出(工序D),由此得到Tag化核苷酸保护体的二聚体。另外,对于更高次的(n+1)聚体,可以举出将该方法同样地重复n次而得到的方法,或使用一定程度的长度的核苷酸衍生物使它们键合而得到的方法等。
实施例
以下,对具体显示本发明的构成和效果的实施例等进行说明。以下,实施例中的浓缩操作只要没有特别说明,就在减压下进行。应予说明,实施例等中的评价项目如下进行测定。
1H-NMR谱的测定>
1H-NMR谱的测定使用核磁共振装置(日本电子公司制,产品名AL400和日本电子公司制,产品名ECS-600)并使用四甲基硅烷作为内标来进行。
13C-NMR谱的测定>
13C-NMR谱的测定使用核磁共振装置(日本电子公司制,产品名AL400和日本电子公司制,产品名ECS-600)并使用四甲基硅烷作为内标进行。
<TOF/MS谱的测定>
TOF/MS谱的测定使用飞行时间型质量分析计(Waters公司制,产品名LCT-PremierXE和日本电子公司制,产品名JMS T-100LP)进行。
1. 2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸的合成
(A)经由叔丁酯的方法
〔实施例1-1〕
(1)3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基酯的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸(1.80g,1.94mmol)的THF(10mL)悬浮液中加入三乙胺(0.39g,3.87mmol)、2-溴乙酸叔丁酯(0.76g,3.87mmol)后,在60℃搅拌2小时。将反应液冷却到室温后,过滤通过滴加甲醇(54mL)而析出的固体。用甲醇清洗固体后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(1.95g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16-1.41(m,84H),1.41-1.57(m,6H),1.49(s,9H),1.66-1.88(m,6H),3.95-4.11(m,6H),4.70(s,2H),7.31(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.02,22.48,22.66,22.83,26.08,26.11,27.88,28.08,29.35,29.40,29.56,29.64,29.65,29.70,29.97,30.22,30.36,31.76,31.93,32.10,61.66,69.35,73.51,82.32,108.69,108.90,123.82,123.93,143.11,143.38,152.93,165.83,166.90.
TOF/MS(ESI):C67H124O7Na[M+Na]+的计算值1063.9245,实验值1063.9254.
〔实施例1-2〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基酯(5.21g,5.0mmol)的氯仿(20mL)溶液中添加三氟乙酸(11.40g,100.0mmol)后,在50℃搅拌17小时。将反应液冷却到室温后,过滤通过滴加乙腈(50mL)而析出的固体。用乙腈-氯仿混合溶剂清洗固体后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(4.89g,99%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.16-1.54(m,90H),1.69-1.88(m,6H),3.95-4.11(m,6H),4.87(s,2H),7.30(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.68,26.06,26.10,29.36,29.41,29.57,29.65,29.66,29.72,30.35,31.93,60.49,69.30,73.57,108.53,123.31,143.17,152.96,165.74.
TOF/MS(ESI):C63H116O7Na[M+Na]+的计算值1007.8619,实验值1007.8639.
(B)经由苄酯的方法
〔实施例1-3〕
(1)3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸2-苄氧基-2-氧代乙基酯的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸(0.90g,0.97mmol)的氯仿(5mL)悬浮液中加入三乙胺(0.20g,1.94mmol)、2-溴乙酸苄酯(0.45g,1.94mmol)后,在50℃搅拌14小时。将反应液冷却到室温后,过滤通过滴加甲醇(18mL)而析出的固体。用甲醇清洗固体后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(1.02g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16-1.41(m,84H),1.41-1.54(m,6H),1.66-1.91(m,6H),3.95-4.08(m,6H),4.86(s,2H),5.23(s,2H),7.24-7.41(m,7H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.71,26.13,26.16,29.40,29.43,29.46,29.62,29.69,29.71,29.76,30.00,30.43,31.98,61.24,67.07,69.40,73.59,108.76,123.69,128.32,128.50,128.65,135.35,143.28,152.96,153.01,165.84,167.77.
〔实施例1-4〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸2-苄氧基-2-氧代乙基酯(0.91g,0.85mmol)的THF(4.3mL)溶液中加入10%Pd-C(0.09g)后,在氢气球下于40℃搅拌19小时。将反应液冷却到室温后,通过硅藻土过滤除去10%Pd-C。浓缩滤液后,过滤向残渣中滴加乙腈(18mL)而析出的固体。固体用乙腈清洗后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(0.84g,100%)。
2.胸苷基-[3’→5’]脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-胸苷(20mer寡核酸)的合成
〔实施例2-1〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯的合成
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4.95g,5.02mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(3.28g,6.03mmol)、1-甲基咪唑(2.27g,27.62mmol)的THF(50mL)悬浮液中加入COMU(4.73g,11.05mmol)后,室温下搅拌3.5小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(248mL)而析出的固体。将固体用乙腈-THF混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到标题化合物(7.16g,95%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16-1.54(m,93H),1.69-1.88(m,6H),2.42-2.58(m,2H),3.42-3.55(m,2H),3.78(s,6H),3.95-4.05(m,6H),4.18(s,1H),4.82(s,2H),5.56(d,1H,J=5.6Hz),6.40-6.50(m,1H),6.80-6.90(m,4H),7.20-7.40(m,9H),7.61(s,1H),8.03(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.62,14.10,22.71,26.11,26.15,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.40,31.96,37.88,55.28,61.12,63.68,69.35,73.60,83.93,84.40,87.36,108.59,111.66,113.43,123.26,127.29,128.08,128.19,130.10,130.15,135.20,135.25,135.32,144.22,150.11,153.02,158.92,163.16,165.85,167.50.
TOF/MS(ESI):C94H146N2O13Na[M+Na]+的计算值1534.0723,实验值1534.0759.
〔实施例2-2〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸胸苷-3’-基酯的合成
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯(6.95g,4.60mmol)的二氯甲烷溶液(174mL)中加入吡咯(1.54g,22.98mmol)、三氟乙酸(0.66g,5.75mmol)后,室温下搅拌2.5小时。过滤通过向反应液中滴加丙酮(52mL)和乙腈(156mL)而析出的固体。将固体用乙腈-丙酮-二氯甲烷混合溶剂和乙腈清洗后,在50℃减压干燥,得到标题化合物(5.04g,91%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.39(m,84H),1.43-1.51(m,6H),1.66(s,1H),1.71-1.85(m,6H),1.95(s,3H),2.36-2.58(m,3H),3.89-3.97(m,2H),3.97-4.08(m,6H),4.15(dd,1H,J=2.0,2.4Hz),4.84(s,2H),5.45-5.53(m,1H),6.20(dd,1H,J=6.0,8.8Hz),7.29(s,2H),7.45(d,1H,J=1.2Hz),8.59(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.58,14.12,22.70,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.67,29.68,29.73,30.35,31.94,36.99,61.12,62.57,69.24,73.58,75.97,84.91,86.46,108.36,111.48,123.17,136.41,143.09,150.29,152.96,163.40,165.91,167.71.
TOF/MS(ESI):C73H128N2O11Na[M+Na]+的计算值1231.9416,实验值1231.9432.
〔实施例2-3〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
在氩气下向2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸胸苷-3’-基酯(1.00g,0.83mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基-亚磷酰胺(1.23g,1.65mmol)的二氯甲烷悬浮液(15mL)中加入5-苄硫基-1H-四唑(0.32g,1.65mmol)后,室温下搅拌1.5小时。接下来,加入异丙苯过氧化氢(含量82%)(0.23g,1.24mmol)后,室温下搅拌2小时。向反应液中加入吡咯(0.56g,8.27mmol)、三氟乙酸(0.28g,2.48mmol)后,室温下搅拌2小时。过滤通过向反应液中滴加丙酮(15mL)和乙腈(45mL)而析出的固体。将固体用乙腈-丙酮-二氯甲烷混合溶剂和乙腈清洗后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(1.20g,92%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.55(m,90H),1.65-2.05(m,12H),2.40-2.60(m,4H),2.75-2.90(m,2H),3.84(s,2H),3.95-4.10(m,6H),4.15-4.50(m,6H),4.85(s,2H),5.15-5.25(m,1H),5.35-5.55(m,1H),6.10-6.35(m,2H),7.29(s,2H),7.35(d,1H,J=1.2Hz),7.47(s,1H),9.60-9.95(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.42,12.46,14.10,19.72,19.79,22.71,26.12,26.19,29.38,29.43,29.49,29.63,29.70,29.75,30.43,31.96,36.47,36.56,38.46,61.14,61.91,62.00,62.63,62.68,62.75,62.80,67.53,69.42,73.64,74.66,74.77,78.94,79.12,82.33,82.40,82.48,85.60,85.66,85.79,86.02,86.21,86.35,108.61,111.27,111.33,111.73,111.82,116.58,116.66,123.15,135.87,135.94,136.53,136.62,143.41,150.49,150.59,153.07,163.94,164.02,165.96,167.79,167.83.
TOF/MS(ESI):C86H144N5O18PNa[M+Na]+的计算值1589.0142,实验值1589.0104.
〔实施例2-4〕
(4)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
重复18次与实施例2-3同样的操作,得到标题化合物(1.10g)。
TOF/MS(ESI):m/z 3114.3[M-3H]3-,2335.6[M-4H]4-,1868.9[M-5H]5-,1557.6[M-6H]6-.
〔实施例2-5〕
(5)脱保护和精制工序
在实施例2-4中合成的化合物(50mg,5.4μmol)中加入28%氨水(2.1mL)后,在80℃加热搅拌1.5小时。将反应液在减压下浓缩后,将向浓缩残渣中加入0.1mol/L-乙酸三乙胺缓冲液而析出的不溶物过滤而除去。滤液通过C-18柱进行精制,得到溶出液,干燥,得到作为目标产物的胸苷基-[3’→5’]脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-脱氧鸟苷基-[3’→5’]-脱氧胞苷基-[3’→5’]-脱氧腺苷基-[3’→5’]-胸苷基-[3’→5’]-胸苷。
HPLC(shodexODP(4.6Φ×150mm),流速:1.0mL/min,流动相:0.1mol/L三乙胺-乙酸缓冲液、乙腈梯度:0-15min(乙腈2%到98%),Rt=3.9min(98.6%)
TOF/MS(ESI):m/z 3020.9[M-2H]2-,2013.4[M-3H]3-,1509.8[M-4H]4-.
(6)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯的合成
〔实施例2-6〕
(使用EDCl-HCl作为缩合剂的情况)
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(0.87g,0.89mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(0.97g,1.77mmol)的THF(9mL)溶液中加入4-二甲氨基吡啶(0.02g,0.18mmol)和1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.34g,1.77mmol)后,室温下搅拌14小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(18mL)而析出的固体。将固体用乙腈-THF混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(1.28g)。利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:氯仿-THF)精制粗产物,由此得到作为白色固体的标题化合物(1.06g,79%)。
〔实施例2-7〕
(使用CDI作为缩合剂的情况)
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(9.86g,10.0mmol)、4-二甲氨基吡啶(0.12g,1.0mmol)的二氯甲烷(210mL)悬浮液中加入1,1’-羰基二咪唑(2.43g,15.0mmol),室温下搅拌1小时后,在30~35℃搅拌4小时。接下来,加入5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(10.89g,20.0mmol),室温下搅拌17小时。进而,向反应液中加入5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(1.09g,0.4mmol)后,室温下搅拌4.5小时。向反应液加入二氯甲烷(10mL)后,过滤通过滴加乙腈(400mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(14.44g)。利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制粗产物,由此得到作为白色固体的标题化合物(11.11g,74%)。
3. 2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯的合成
〔实施例3-1〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷(1.58g,2.40mmol)得到标题化合物(3.11g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.40(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.71-1.84(m,7H),2.73(dd,1H,J=4.4,12.8Hz),3.04-3.13(m,1H),3.46(d,2H,J=4.0Hz),3.77(s,6H),3.99-4.05(m,6H),4.34-4.37(m,1H),4.86(s,2H),5.67(d,1H,J=5.6Hz),6.51(dd,1H,J=5.6,8.4Hz),6.79(d,2H,J=9.4Hz),7.18-7.29(m,7H),7.31(s,2H),7.38(d,2H,J=7.2Hz),7.53(dd,2H,J=7.2,7.6Hz),7.59-7.63(m,1H),8.03(d,2H,J=7.2Hz),8.17(s,1H),8.74(s,1H),8.98(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,22.71,26.08,26.11,29.33,29.38,29.43,29.60,29.67,29.74,30.36,31.94,38.00,55.23,61.16,63.52,69.23,73.58,84.35,84.48,86.82,108.35,113.25,123.22,123.32,127.03,127.85,127.95,128.08,128.91,129.99,130.04,132.82,133.66,135.38,135.42,141.21,143.07,144.33,149.53,151.56,152.75,152.97,158.63,164.48,165.89,167.38.
TOF/MS(ESI):C101H149N5O12Na[M+Na]+的计算值1647.1100,实验值1647.1149.
〔实施例3-2〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯(3.00g,1.85mmol)得到标题化合物(2.25g,92%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.40(m,84H),1.44-1.50(m,6H),1.71-1.85(m,7H),2.53(dd,1H,J=5.6,14.0Hz),3.21-3.28(m,1H),3.89-3.96(m,1H),3.98-4.06(m,6H),4.36(s,1H),4.87(s,2H),5.70(d,1H,J=5.2Hz),5.91(brs,1H),6.32(dd,1H,J=5.6,10.0Hz),7.32(s,2H),7.54(dd,2H,J=7.2,8.0Hz),7.61-7.65(m,1H),8.03(d,2H,J=7.2Hz),8.07(s,1H),8.79(s,1H),9.07(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.12,22.70,26.07,26.11,29.33,29.37,29.42,29.59,29.67,29.73,30.35,31.94,37.76,61.20,63.17,69.28,73.60,87.18,87.61,108.39,123.17,124.66,127.90,128.96,133.01,133.39,142.42,143.17,150.40,150.68,152.26,153.00,164.42,165.97,167.41.
TOF/MS(ESI):C80H131N5O10Na[M+Na]+的计算值1344.9794,实验值1344.9828.
〔实施例3-3〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-3的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯(2.00g,1.51mmol)和DMTr-dT-CE-亚磷酰胺(2.25g,3.02mmol)得到标题化合物(2.50g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12-1.40(m,84H),1.43-1.50(m,6H),1.71-1.85(m,9H),1.94(s,1H),2.22-2.51(m,2H),2.70-2.78(m,3H),3.14-3.26(m,1H),3.45-3.56(m,1H),3.69-3.85(m,2H),3.95-4.07(m,6H),4.07-4.32(m,3H),4.40-4.48(m,3H),4.88(s,2H),4.99-5.11(m,1H),5.67-5.73(m,1H),6.11-6.22(m,1H),6.50-6.58(m,1H),7.30(s,2H),7.41-7.53(m,3H),7.57-7.61(m,1H),8.02-8.06(m,2H),8.38(m,1H),8.81(m,1H),9.58-9.67(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.43,14.14,19.66,19.73,19.78,22.71,26.09,26.15,29.35,29.38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.99,30.38,31.94,36.57,36.87,38.35,61.13,61.84,61.92,62.45,62.49,62.58,62.62,67.39,69.27,73.61,74.81,75.06,78.89,79.19,79.24,82.98,83.05,83.12,84.47,84.54,85.43,85.48,85.62,85.67,85.79,85.93,108.34,111.22,111.27,116.52,116.64,123.01,123.82,124.08,128.27,128.31,128.69,128.72,132.87,132.94,133.17,133.41,136.45,141.68,141.86,143.18,149.93,150.00,150.47,151.84,152.05,152.67,153.01,163.81,163.86,165.43,165.53,165.99,167.76.
TOF/MS(ESI):C93H147N8O17PNa[M+Na]+的计算值1702.0520,实验值1702.0604.
〔实施例3-4〕
(4)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯的合成
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯(7.98g,4.75mmol)、N2-异丁酰基-DMTr-dG-CE亚磷酰胺(11.97g,14.25mmol)的二氯甲烷悬浮液(90mL)中加入5-苄硫基-1H-四唑(2.74g,14.25mmol)后,室温下搅拌3小时。接下来,加入异丙苯过氧化氢(含量82%)(2.64g,14.25mmol)后,室温下搅拌1小时。过滤通过向反应液中滴加丙酮(120mL)和乙腈(359mL)而析出的固体。将固体用乙腈-丙酮-二氯甲烷混合溶剂和乙腈、甲醇清洗后,在50℃减压干燥,得到标题化合物(10.86g,94%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12-1.40(m,90H),1.43-1.50(m,6H),1.71-1.93(m,9H),1.95-2.16(m,2H),2.35-2.87(m,9H),3.16-3.37(m,3H),3.76(s,6H),3.99-4.05(m,6H),4.09-4.43(m,10H),4.86(s,2H),5.07-5.26(m,2H),5.65-5.71(m,1H),5.91-6.22(m,2H),6.49-6.54(m,1H),6.78(d,4H,J=8.4Hz),7.15-7.27(m,8H),7.30(s,2H),7.34-7.36(m,2H),7.43-7.48(m,2H),7.54-7.59(m,1H),7.69-7.71(m,1H),7.98-8.02(m,2H),8.30-8.41(m,1H),8.75-8.82(m,1H),9.43-9.58(m,1H),9.88-10.27(m,1H),12.09-12.22(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.23,12.36,14.13,18.84,19.00,19.05,19.65,19.73,22.70,26.09,26.15,29.35,29.37,29.46,29.61,29.68,29.74,29.77,30.38,31.94,35.89,36.47,36.63,55.26,61.13,62.47,62.63,62.68,63.42,67.55,69.28,73.61,74.86,75.05,79.76,81.43,83.08,83.59,84.68,86.85,108.33,111.11,111.17,113.15,113.26,116.48,116.75,116.88,121.42,121.59,123.03,124.05,127.07,127.12,127.78,127.85,127.98,128.06,128.74,129.14,130.05,132.88,133.37,135.23,139.48,141.92,142.01,143.18,144.23,147.35,148.11,148.27,148.49,149.98,150.09,151.80,152.60,153.01,155.40,155.47,158.62,158.68,164.77,165.20,165.96,167.71,167.74,179.81,180.21.
TOF/MS(ESI):C131H186N14O26P2Na[M+Na]+的计算值2456.3036,实验值2456.2988.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯的合成
〔实施例3-5〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷(1.52g,2.40mmol)得到标题化合物(3.10g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12-1.53(m,90H),1.71-1.85(m,6H),2.36-2.43(m,1H),2.83-2.95(m,1H),3.49(ddd,2H,J=3.2,10.4,18.0Hz),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.95-4.07(m,6H),4.30-4.35(m,1H),4.83(dd,2H,J=16.0,23.6Hz),5.51-5.58(m,1H),6.33(dd,1H,J=6.0,7.6Hz),6.86(dd,4H,J=2.4,8.8Hz),7.20-7.38(m,11H),7.50-7.54(m,2H),7.60-7.64(m,1H),7.88(d,2H,J=7.2Hz),8.14(d,1H,J=7.6Hz),8.40-8.60(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.09,22.70,26.10,26.15,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.40,31.95,39.47,55.26,61.10,63.17,69.33,73.59,75.77,84.68,87.32,108.54,113.46,123.32,127.22,128.10,128.13,129.10,130.04,130.10,133.20,135.13,135.30,144.07,153.01,158.84,165.81,167.43.
TOF/MS(ESI):C100H149N3O13Na[M+Na]+的计算值1623.0988,实验值1623.1069.
〔实施例3-6〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯(3.04g,1.90mmol)得到标题化合物(2.39g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.20-1.51(m,90H),1.71-1.85(m,6H),2.46-2.53(m,1H),2.69-2.80(m,1H),3.92-4.04(m,8H),4.27(d,1H,J=2.4Hz),4.84(dd,2H,J=16.4,20.4Hz),5.51-5.53(m,1H),6.26(dd,1H,J=5.6,7.6Hz),7.29(s,2H),7.48-7.62(m,4H),7.88(d,2H,J=7.6Hz),8.28(d,1H,J=7.2Hz),8.66-8.91(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,22.71,26.10,26.14,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.39,31.95,38.46,61.15,62.37,69.34,73.61,75.80,85.82,88.44,108.55,123.25,127.61,129.07,133.25,143.25,145.32,153.01,162.38,165.89,167.79.
TOF/MS(ESI):C79H131N3O11Na[M+Na]+的计算值1320.9681,实验值1320.9723.
〔实施例3-7〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-3的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯(2.27g,1.75mmol)和N2-异丁酰基DMTr-dG-CE-亚磷酰胺(2.94g,3.50mmol)得到标题化合物(3.02g,99%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.08-1.53(m,96H),1.70-1.84(m,6H),2.36-2.62(m,2H),2.75-3.30(m,7H),3.75-3.87(m,2H),3.98-4.04(m,6H),4.26-4.53(m,6H),4.78-4.89(m,2H),5.26-5.29(m,1H),5.42-5.52(m,1H),5.92-6.11(m,1H),6.24-6.38(m,1H),7.26-7.28(m,2H),7.38-7.67(m,4H),7.80-7.89(m,2H),7.95-8.00(m,1H),8.14-8.24(m,1H),10.22-10.70(m,1H),12.08-12.22(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.96,18.99,19.05,19.81,19.87,22.71,26.08,26.15,29.34,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.37,31.94,36.01,36.06,38.37,38.83,39.11,61.09,62.01,62.59,62.64,62.77,62.82,67.20,67.51,69.25,73.60,74.76,75.03,80.49,83.50,83.75,84.57,84.81,86.32,87.91,88.04,97.29,97.50,108.30,116.55,116.68,120.72,121.05,123.01,127.73,127.80,128.88,128.93,132.71,132.81,133.28,138.19,138.30,143.13,144.20,144.42,147.79,147.99,148.16,148.33,152.99,155.25,155.65,162.86,163.04,165.92,165.95,167.77,167.85,179.77,180.03.
TOF/MS(ESI):C96H152N9O18PNa[M+Na]+的计算值1773.0891,实验值1773.0914.
〔实施例3-8〕
(4)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯的合成
/>
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯(2.80g,1.60mmol)和DMTr-dT-CE亚磷酰胺(3.58g,4.80mmol)得到标题化合物(3.44g,89%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.13-1.55(m,99H),1.71-1.84(m,6H),1.95-2.14(m,2H),2.27-2.95(m,9H),3.00-3.55(m,3H),3.73-3.81(m,6H),3.99-4.04(m,6H),4.14-4.48(m,11H),4.82-4.85(m,2H),5.05-5.53(m,3H),6.00-6.46(m,3H),6.76-6.87(m,4H),7.20-7.36(m,11H),7.44-7.64(m,4H),7.72-7.88(m,3H),8.11-8.22(m,1H),9.00-9.15(m,1H),10.29-10.49(m,1H),12.14-12.17(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.67,11.71,14.13,18.86,18.90,18.94,18.98,19.00,19.59,19.67,19.81,19.88,22.70,26.08,26.15,29.35,29.37,29.46,29.61,29.67,29.74,29.77,30.37,31.94,35.88,38.67,55.29,61.13,62.66,62.73,62.87,63.33,69.25,73.59,84.20,84.28,85.31,87.29,108.31,111.69,111.73,113.15,113.35,116.64,116.79,123.01,127.31,127.71,127.77,128.08,128.99,129.14,130.09,133.33,134.93,134.97,135.01,135.17,143.14,143.96,144.04,147.84,147.93,148.16,150.40,150.48,152.99,155.48,158.83,163.52,165.96,167.86,179.65,179.76.
TOF/MS(ESI):C130H186N12O27P2Na[M+Na]+的计算值2432.2923,实验值2432.2937.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
〔实施例3-9〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷(1.54g,2.40mmol)得到标题化合物(3.14g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.86-0.89(m,12H),1.03(d,3H,J=6.8Hz),1.11-1.40(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.70-1.83(m,6H),1.95(sept,1H,J=6.8Hz),2.51(dd,1H,J=5.2,12.4Hz),3.17-3.29(m,2H),3.42(dd,1H,J=3.2,10.4Hz),3.76(s,3H),3.77(s,3H),3.98-4.05(m,6H),4.22(s,1H),4.83(s,2H),5.70(d,1H,J=6.0Hz),6.07(dd,1H,J=5.2,9.2Hz),6.76-6.82(m,4H),7.16-7.38(m,9H),7.43-7.50(m,2H),7.71(s,1H),7.73(s,1H),11.96(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,18.64,18.77,22.71,26.05,26.11,29.32,29.37,29.42,29.60,29.66,29.68,29.74,29.75,29.77,30.33,31.94,36.17,37.21,55.24,61.24,63.48,69.30,73.64,76.16,83.94,84.44,86.49,108.33,113.27,113.29,122.34,123.24,127.15,128.02,129.99,135.47,135.77,137.83,143.04,144.70,147.18,148.02,152.94,155.38,158.74,166.00,167.35,178.30.
TOF/MS(ESI):C98H151N5O13Na[M+Na]+的计算值1629.1206,实验值1629.1240.
〔实施例3-10〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(3.05g,1.90mmol)得到标题化合物(2.42g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.20-1.50(m,96H),1.71-1.85(m,6H),2.48(dd,1H,J=5.6,14.0Hz),2.72(sept,1H,J=6.8Hz),2.97-3.05(m,1H),3.49(brs,2H),3.86-4.05(m,8H),4.26(s,1H),4.86(s,2H),5.59(d,1H,J=6.0),6.13(dd,1H,J=5.6,9.2Hz),7.30(s,2H),7.86(s,2H),8.82(s,1H),12.16(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,18.94,18.97,22.71,26.09,26.15,29.38,29.45,29.61,29.69,29.75,30.39,31.96,36.50,37.85,61.26,62.92,69.43,73.67,86.27,86.34,108.59,122.49,123.26,138.42,143.34,147.09,147.73,153.04,155.01,166.02,167.52,178.69.TOF/MS(ESI):C77H133 5O11Na[M+Na]+的计算值1326.9899,实验值1326.9879.
〔实施例3-11〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-3的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(2.25g,1.72mmol)和DMTr-dT-CE-亚磷酰胺(2.57g,3.45mmol)得到标题化合物(2.68g,94%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.05-1.52(m,96H),1.71-1.89(m,9H),2.24-2.78(m,8H),3.38-3.49(m,1H),3.69-4.05(m,8H),4.17-4.89(m,7H),5.20-5.29(m,1H),5.55-5.66(m,1H),6.08-6.24(m,2H),7.30(s,2H),7.42-7.54(m,1H),7.68-7.73(m,1H),8.64-8.83(m,1H),10.20-10.32(m,1H),12.11-12.22(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.46,14.14,18.59,18.93,19.06,19.42,19.66,19.71,19.73,19.78,22.71,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.36,31.94,35.57,35.93,38.42,61.12,61.24,61.71,61.89,62.56,62.64,62.69,69.26,73.62,75.69,75.81,79.29,82.80,85.73,86.04,86.41,108.29,111.23,111.32,116.46,116.51,122.39,122.98,123.03,136.55,136.78,139.04,143.11,143.18,147.93,147.98,150.30,150.37,152.98,155.39,155.59,163.53,163.62,166.00,166.12,167.69,167.86,179.92,180.04.
TOF/MS(ESI):C90H149N8O18PNa[M+Na]+的计算值1684.0625,实验值1684.0648.
〔实施例3-12〕
(4)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(2.50g,1.50mmol)和DMTr-dT-CE亚磷酰胺(3.36g,4.51mmol)得到标题化合物(3.11g,89%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.4Hz),1.05-1.53(m,96H),1.71-1.88(m,13H),2.24-2.87(m,10H),3.25-3.53(m,3H),3.72-3.81(m,7H),3.95-4.05(m,6H),4.05-4.72(m,10H),4.81-4.91(m,2H),5.03-5.24(m,2H),5.55-5.61(m,1H),5.95-6.43(m,3H),6.82-6.85(m,4H),7.18-7.37(m,12H),7.53(s,1H),7.73(s,1H),9.10-9.31(m,2H),10.05-10.09(m,1H),12.18(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.68,11.72,12.33,12.37,14.14,18.78,18.88,19.13,19.24,19.58,19.65,19.70,19.77,22.70,26.08,26.16,29.34,29.38,29.46,29.62,29.68,29.74,29.77,30.36,31.94,35.84,35.99,37.65,38.95,55.29,61.18,62.62,62.77,62.83,63.26,67.10,67.45,69.27,73.63,75.55,79.91,82.62,82.87,84.27,87.31,108.29,111.50,111.80,113.15,113.35,116.66,116.74,116.86,122.51,122.59,123.07,127.32,128.08,128.13,129.13,130.13,134.95,135.12,136.32,138.75,143.10,143.99,147.93,147.97,148.04,150.28,150.37,150.60,150.69,152.98,155.49,155.54,158.81,163.63,163.68,163.79,166.02,167.69,167.71,179.73,179.77.
TOF/MS(ESI):C124H183N11O27P2Na[M+Na]+的计算值2343.2658,实验值2343.2742.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
〔实施例3-13〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-3的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸胸苷-3’-基酯(1.82g,1.50mmol)和N2-异丁酰基-DMTr-dG-CE亚磷酰胺(2.52g,3.00mmol)得到标题化合物(2.43g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.2Hz),1.00-1.41(m,90H),1.41-1.54(m,6H),1.71-1.85(m,6H),1.92-2.00(m,3H),2.24-2.97(m,6H),3.68-4.08(m,8H),4.14-4.54(m,6H),4.78-4.92(m,2H),5.14-5.78(m,2H),5.95-6.24(m,2H),7.27-7.43(m,3H),7.87-7.95(m,1H),10.19-10.49(m,2H),12.24-12.38(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.35,14.14,19.01,19.06,19.10,19.73,19.80,19.85,22.70,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.02,30.36,31.77,31.94,35.80,35.92,36.62,38.19,38.48,61.05,61.13,62.26,62.44,62.49,62.70,62.75,66.12,67.37,69.21,73.58,74.51,80.47,80.64,82.33,82.40,85.33,85.52,86.12,86.55,86.84,87.31,108.24,111.24,112.18,116.50,116.83,121.43,121.59,123.05,123.08,136.55,137.73,138.66,138.99,143.02,143.06,147.75,147.78,148.49,150.42,151.06,152.96,152.97,155.23,155.27,164.76,164.83,165.92,165.96,167.73,167.80,180.26,180.45.
TOF/MS(ESI):C90H149N8O18PNa[M+Na]+的计算值1684.0625,实验值1684.0643.
〔实施例3-14〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(2.20g,1.32mmol)和DMTr-dT-CE-亚磷酰胺(2.96g,3.97mmol)得到标题化合物(2.76g,90%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.13-1.47(m,96H),1.71-2.01(m,15H),2.35-2.85(m,10H),3.31-3.51(m,2H),3.78(s,6H),3.96-4.04(m,6H),4.05-4.59(m,10H),4.84(s,2H),5.13-5.55(m,3H),6.11-6.42(m,3H),6.83(d,4H,J=8.8Hz),7.16-7.37(m,12H),7.45-7.55(m,1H),7.72-7.80(m,1H),9.23-10.39(m,3H),12.15-12.21(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.70,12.39,12.45,14.14,18.82,18.86,19.04,19.08,19.58,19.65,19.74,19.80,22.70,26.08,26.15,29.34,29.38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.77,30.37,31.94,35.89,36.13,36.52,38.68,55.29,61.12,62.74,62.89,63.22,63.32,67.12,69.23,73.60,74.76,79.03,79.98,82.49,84.28,85.14,87.28,108.26,111.37,111.49,111.69,111.72,113.14,113.34,116.74,116.84,116.92,121.89,121.96,123.02,127.08,127.31,127.76,127.85,128.08,129.13,130.11,134.94,134.99,135.03,135.20,135.30,136.93,138.26,139.46,143.07,143.96,144.04,147.98,148.02,148.14,148.23,150.46,150.57,150.62,152.97,155.42,158.60,158.79,163.79,164.43,164.50,165.96,167.79,179.87,179.95.
TOF/MS(ESI):C124H183N11O27P2Na[M+Na]+的计算值2343.2658,实验值2343.2693.
〔实施例3-15〕
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-胸苷-3’-基)硫代磷酰基)-胸苷-3’-基酯的合成
/>
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸胸苷-3’-基酯(1.82g,1.50mmol)、DMTr-dT-CE亚磷酰胺(2.23g,3.00mmol)的二氯甲烷悬浮液(27mL)中加入5-苄硫基-1H-四唑(0.58g,3.00mmol)后,室温下搅拌1.5小时。接下来,加入((N,N-二甲氨基亚甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑-3-硫酮(1.13g,4.50mmol)和吡啶(0.87g,9.00mmol)后,室温下搅拌1.5小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(109mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂和乙腈、甲醇清洗后,在50℃减压干燥,得到标题化合物(2.71g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.53(m,93H),1.72-1.84(m,6H),1.92-1.95(m,3H),2.28-2.49(m,3H),2.57-2.66(m,2H),2.77(dd,1H,J=6.0,7.2Hz),3.39-3.50(m,2H),3.79(s,6H),3.97-4.04(m,6H),4.09-4.40(m,6H),4.83(d,2H,J=6.8Hz),5.31-5.43(m,2H),6.27-6.32(m,1H),6.35-6.41(m,1H),6.82-6.86(m,4H),7.22-7.32(m,10H),7.37-7.39(m,2H),7.56(s,1H),8.69-8.91(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.79,12.58,14.14,19.31,19.40,19.47,19.55,22.70,26.07,26.13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,36.78,39.00,55.29,61.06,62.65,62.69,62.90,62.94,63.21,67.63,69.19,73.56,75.01,75.09,80.18,82.27,82.36,84.40,84.53,84.91,85.39,87.31,108.25,111.74,111.90,113.37,116.15,116.39,123.06,127.28,128.05,128.11,130.09,134.97,135.03,135.06,135.30,143.01,144.04,150.22,150.27,150.35,152.94,158.78,163.36,163.46,165.86,165.88,167.71,167.76.
TOF/MS(ESI):C107H162N5O19PSNa[M+Na]+的计算值1907.1220,实验值1907.1223.
4. 2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯的合成
〔实施例4-1〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和N4-苯甲酰基-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷(1.59g,2.40mmol)得到标题化合物(2.96g,91%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.38(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.70-1.85(m,6H),3.48(d,1H,J=11.6Hz),3.62(s,3H),3.69(d,1H,J=11.2Hz),3.71(s,1H),3.83(s,5H),3.97-4.04(m,6H),4.18(d,1H,J=4.8Hz),4.36(d,1H,J=8.4Hz),4.80-4.89(m,2H),5.29(dd,1H,J=4.8Hz,8.4Hz),6.11(d,1H,J=1.6Hz),6.90(dd,4H,J=2.0,8.8Hz),7.27-7.42(m,11H),7.52(t,2H,J=7.6Hz),7.62(t,1H,J=7.6Hz),7.89(d,2H,J=7.6Hz),8.55(d,1H,J=6.4Hz),8.61-8.72(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,22.70,26.07,26.09,26.11,29.31,29.38,29.43,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,52.31,55.24,59.15,60.47,60.72,61.06,69.14,70.07,73.53,80.42,82.21,87.49,88.91,108.22,113.43,123.33,123.50,127.27,127.49,128.17,129.06,130.06,130.08,133.17,135.07,135.22,142.85,143.86,152.87,152.90,158.75,165.64,165.84,167.17,168.42.
TOF/MS(ESI):C101H151N3O14Na[M+Na]+的计算值1653.1094,实验值1653.1171.
〔实施例4-2〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯(2.80g,1.72mmol)得到标题化合物(2.26g,99%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),3.51(s,3H),3.79-3.83(m,2H),3.95-4.08(m,7H),4.34(d,1H,J=4.8Hz),4.50(t,1H,J=4.8Hz),4.83-4.90(m,2H),5.44(t,1H,J=4.8Hz),5.73(d,1H,J=4.4Hz),7.29-7.30(m,2H),7.47-7.66(m,3H),7.90(d,2H,J=7.6Hz),8.16(d,1H,J=7.6Hz),8.75-9.00(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,22.71,26.07,26.11,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,52.32,59.19,60.97,61.07,61.24,69.15,69.20,71.18,73.56,80.58,83.43,92.64,108.28,123.20,123.50,127.61,129.09,132.80,133.36,142.99,147.07,152.87,152.93,162.63,165.85,167.66,168.43.
TOF/MS(ESI):C80H133N3O12Na[M+Na]+的计算值1350.9787,实验值1350.9855.
〔实施例4-3〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯(2.10g,1.58mmol)和5’-O-DMTr-2’-O-甲基尿苷-CE亚磷酰胺(2.40g,3.16mmol)得到粗产物(2.80g)。利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制粗产物,得到标题化合物(2.21g,70%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.53(m,90H),1.71-1.83(m,6H),2.50-2.74(m,1H),2.79(t,1H,J=6.4Hz),3.46-3.76(m,8H),3.77(s,3H),3.79(s,3H),3.97-4.04(m,6H),4.11-4.58(m,7H),4.82-4.95(m,2H),5.13-5.30(m,3H),5.86-6.08(m,2H),6.82-6.88(m,4H),7.23-7.36(m,11H),7.51(t,2H,8.0Hz),7.61(t,1H,J=7.2Hz),7.82-8.05(m,4H),8.69-8.96(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,19.52,19.58,22.70,26.07,26.13,29.33,29.38,29.45,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,55.25,55.30,58.84,59.27,60.82,61.14,62.35,62.40,62.68,62.73,65.55,66.16,69.19,69.90,70.16,73.56,74.28,74.38,79.38,79.46,79.52,79.60,81.32,81.38,81.52,82.19,86.71,86.87,87.46,90.07,90.64,102.58,102.62,108.24,113.34,113.36,116.36,116.43,123.19,127.39,127.44,127.64,128.10,128.12,128.26,128.29,129.04,130.21,130.27,130.30,133.28,134.64,134.73,139.53,139.75,142.96,143.82,143.90,150.02,150.07,152.93,158.81,158.84,158.86,162.70,162.73,165.77,165.81,167.22,167.26.
TOF/MS(ESI):C114H167N6O22PNa[M+Na]+的计算值2026.1769,实验值2026.1764.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟脱氧尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
〔实施例4-4〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷(1.58g,2.40mmol)得到标题化合物(3.13g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.81(d,3H,J=6.8Hz),0.88(t,9H,J=6.8Hz),0.94(d,3H,J=7.2Hz),1.10-1.53(m,90H),1.70-1.87(m,6H),1.93(sept,1H,J=6.8Hz),3.17(d,1H,J=11.2Hz),3.59(d,1H,J=11.2Hz),3.77(s,6H),3.97-4.05(m,6H),4.32-4.34(m,1H),4.85(d,1H,J=16.0Hz),4.92(d,1H,J=16.0Hz),5.92-6.07(m,2H),6.18-6.24(m,1H),6.78(dd,4H,J=5.2,8.8Hz),7.16-7.29(m,7H),7.30(s,2H),7.36(d,2H,J=8.0Hz),7.79(s,1H),8.01(s,1H),11.92(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.39,18.47,18.88,18.91,22.70,25.61,26.06,26.11,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,36.25,36.43,55.24,55.25,60.68,60.84,61.24,67.98,69.25,70.85,71.00,73.61,79.97,81.44,83.15,86.36,86.47,86.67,90.96,108.26,113.15,113.22,122.23,123.17,127.08,127.13,127.76,127.85,127.89,127.98,129.13,129.85,129.92,135.20,135.66,138.43,138.70,139.43,143.05,144.47,147.30,147.34,147.47,147.90,152.93,152.96,155.04,155.31,158.62,158.69,165.65,165.89,167.23,167.60,178.18,178.76.
TOF/MS(ESI):C98H150N5O13F[M+H]+的计算值1623.1136,实验值1623.1160.
〔实施例4-5〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(3.00g,1.85mmol)得到标题化合物(2.40g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.55(m,96H),1.70-1.85(m,6H),2.71(sept,1H,J=6.8Hz),3.37-3.72(brs,2H),3.80(d,1H,J=11.6Hz),3.99-4.05(m,7H),4.34(d,1H,J=4.0Hz),4.94(s,2H),5.69(dt,1H,J=4.4,52.0Hz),5.78-5.84(m,1H),5.97(dd,1H,J=4.0,16.0Hz),7.31(s,2H),7.90(s,1H),9.22(s,1H),12.15(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.85,18.95,22.70,26.06,26.11,29.30,29.38,29.43,29.60,29.68,29.74,30.33,31.94,36.32,60.86,69.24,71.25,71.39,73.60,82.89,87.22,87.55,89.60,91.55,108.27,121.56,123.15,138.45,142.99,147.29,148.08,152.91,155.03,165.91,167.26,179.15.
TOF/MS(ESI):C77H132N5O11FNa[M+Na]+的计算值1344.9805,实验值1344.9834.
〔实施例4-6〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟脱氧尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(2.20g,1.66mmol)和5’-O-DMTr-2’-氟-脱氧尿苷-CE亚磷酰胺(2.49g,3.33mmol)得到标题化合物(3.07g,93%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):0.88(t,9H,J=7.2Hz),0.97-1.53(m,96H),1.71-1.83(m,6H),2.56-2.75(m,3H),3.37-3.66(m,2H),3.74-3.79(m,6H),3.97-4.55(m,12H),4.78-5.08(m,2H),5.08-5.50(m,3H),5.70-6.01(m,4H),6.80-6.84(m,4H),7.17-7.40(m,11H),7.57-7.73(m,2H),8.94-9.07(m,1H),10.00(s,1H),12.18-12.26(m,1H).
δ13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.51,18.76,18.92,19.20,19.55,19.62,22.70,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.60,29.68,29.74,30.36,31.94,35.90,35.99,55.23,55.30,60.70,60.88,62.85,69.26,73.61,79.54,79.63,87.17,87.21,102.93,108.31,113.31,116.34,116.52,122.55,122.61,122.95,122.98,127.25,127.31,128.07,128.10,130.14,134.79,134.88,134.92,138.65,140.55,143.15,143.19,143.92,144.02,147.71,147.74,148.30,148.43,149.68,149.98,152.98,152.99,155.30,155.48,158.74,158.79,162.67,165.89,166.00,167.20,179.68.
TOF/MS(ESI):C110H163N8O20F2PNa[M+Na]+的计算值2008.1587,实验值2008.1593.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯的合成
〔实施例4-7〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯的合成
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(2.46g,2.50mmol)和5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(1.98g,3.00mmol)的二氯甲烷(25mL)悬浮液中加入4-二甲氨基吡啶(0.03g,0.25mmol)和1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.58g,3.00mmol)后,室温下搅拌5小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(148mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(2.89g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(2.76g,68%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.08(s,3H),0.11(s,3H),0.81-0.92(m,18H),1.04-1.53(m,90H),1.70-1.84(m,6H),3.49(dd,2H,J=10.8,27.6Hz),3.79(s,6H),3.79-4.04(m,6H),4.26-4.27(m,1H),4.56(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,J=16.0Hz),4.96(d,1H,16.4Hz),5.30(d,1H,J=8.0Hz),5.47(t,1H,J=4.0Hz),6.02(d,1H,J=5.6Hz),6.85(d,4H,J=8.4Hz),7.23-7.37(m,11H),7.85(d,1H,J=8.4Hz),8.37(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ-5.22,-5.09,14.14,17.87,22.71,25.51,26.07,26.11,29.30,29.38,29.43,29.59,29.67,29.74,30.34,31.94,55.25,60.75,62.47,69.14,73.36,73.54,74.40,81.20,87.58,88.03,102.56,108.25,113.40,113.43,123.33,127.33,128.03,128.14,130.03,130.17,134.71,134.83,140.00,142.87,144.10,150.14,152.89,158.78,158.83,162.59,165.67,167.10.
TOF/MS(ESI):C99H158N2O14SiNa[M+Na]+的计算值1650.1380,实验值1650.1455.
〔实施例4-8〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯(2.60g,1.60mmol)得到标题化合物(2.05g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.04(s,3H),0.07(s,3H),0.81-0.92(m,18H),1.11-1.53(m,90H),1.70-1.85(m,6H),2.95-3.10(brs,1H),3.77-3.82(m,1H),3.93-4.04(m,7H),4.25-4.28(m,1H),4.67(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,16.0Hz),4.96(d,1H,16.0Hz),5.34(dd,1H,J=3.2,4.8Hz),5.60(d,1H,J=5.6Hz),5.76(d,1H,J=8.0Hz),7.29(s,2H),7.63(d,1H,J=8.0Hz),8.71(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ-5.22,-5.19,14.14,17.88,22.71,25.52,26.07,26.10,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,60.84,61.84,69.20,72.78,73.24,73.57,82.99,92.46,102.70,108.32,123.24,141.88,142.99,150.17,152.92,162.72,165.78,167.38.
TOF/MS(ESI):C78H140N2O12SiNa[M+Na]+的计算值1348.0073,实验值1348.0115.
〔实施例4-9〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯(1.95g,1.47mmol)和5’-O-DMTr-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-CE亚磷酰胺(2.53g,2.94mmol)得到标题化合物(2.84g,92%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.03-0.13(m,12H),0.86-0.90(m,27H),1.02-1.53(m,90H),1.68-1.84(m,6H),2.45-2.69(m,1H),2.73(t,1H,J=6.0Hz),3.48(d,1H,J=10.8Hz),3.60-3.68(m,1H),3.76-3.84(m,6H),3.97-4.04(m,6H),4.10-4.58(m,8H),4.73-4.84(m,1H),4.90-5.03(m,2H),5.20-5.25(m,2H),5.67-5.78(m,2H),5.95-6.03(m,1H),6.80-6.89(m,4H),7.21-7.44(m,12H),7.84(d,1H,J=8.0Hz),8.72-8.83(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ-5.27,-5.24,-5.07,-4.94,-4.92,14.14,17.86,18.06,19.50,19.57,19.65,22.70,25.50,25.55,25.60,26.07,26.13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.74,30.35,31.94,55.27,55.30,60.69,61.96,62.37,62.42,62.58,62.63,69.19,71.39,71.60,72.86,73.00,73.57,74.47,79.43,79.51,81.75,87.65,87.68,87.99,88.18,90.56,91.22,102.54,102.64,103.05,103.13,108.28,113.39,116.31,116.40,123.21,127.43,128.13,128.21,128.25,130.25,130.27,130.32,134.56,134.65,134.70,134.73,139.84,140.05,140.15,142.97,143.01,143.92,143.97,149.95,150.19,150.40,152.92,158.83,158.87,162.53,162.58,162.69,165.64,165.68,167.05,167.12.
TOF/MS(ESI):C117H186N5O22Si2PNa[M+Na]+的计算值2123.2763,实验值2123.2769.
5. 3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸的合成
〔实施例5-1〕
(1)3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸叔丁酯的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸(2.78g,3.0mmol)、4-二甲氨基吡啶(0.04g,0.3mmol)、3-羟基丙酸叔丁酯(4.39g,30.0mmol)、三乙胺(0.46g,4.5mmol)的二氯甲烷(60mL)悬浮液中加入1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.86g,4.5mmol)后,室温下搅拌20小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(180mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(3.07g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(1.90g,60%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),2.68(t,2H,J=6.4Hz),3.95-4.05(m,6H),4.53(t,2H,J=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.68,26.08,28.09,29.35,29.40,29.57,29.65,29.71,30.35,31.93,35.42,60.72,69.25,73.51,80.97,108.19,124.57,152.84,166.14,169.93.
TOF/MS(ESI):C68H126O7Na[M+Na]+的计算值1077.9401,实验值1077.9427.
〔实施例5-2〕
(2)3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸的合成
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在3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸叔丁酯(2.75g,2.6mmol)的二氯甲烷(52mL)溶液中添加甲烷磺酸(3.75g,39.0mmol)后,室温下搅拌20小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(156mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂和乙腈清洗后,在50℃减压干燥,得到作为白色固体的标题化合物(2.54g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),2.85(t,2H,J=6.6Hz),3.95-4.10(m,6H),4.57(t,2H,J=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,22.71,26.10,26.13,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.38,31.96,33.54,59.99,69.34,73.57,108.35,124.32,142.88,152.91,166.17.
TOF/MS(ESI):C64H118O7Na[M+Na]+的计算值1021.8775,实验值1021.8817.
2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸的合成
〔实施例5-3〕
(1)2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸叔丁酯的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸(2.78g,3.0mmol)、4-二甲氨基吡啶(0.04g,0.3mmol)、肌氨酸叔丁酯盐酸盐(2.73g,15.0mmol)、三乙胺(1.52g,15.0mmol)的二氯甲烷(60mL)悬浮液中加入1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.86g,4.5mmol)后,室温下搅拌20小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(180mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(3.07g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(2.66g,84%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),3.04(s,3H),3.80-4.20(m,8H),6.63(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.01,22.66,26.13,26.15,28.16,29.35,29.42,29.48,29.65,29.71,30.39,31.93,69.51,73.52,82.02,106.19,130.61,139.93,153.25,168.33,172.01.
TOF/MS(ESI):C68H127NO6Na[M+Na]+的计算值1076.9561,实验值1076.9591.
〔实施例5-4〕
(2)2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸的合成
根据实施例5-2的方法,由2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸叔丁酯(2.53g,2.4mmol)得到作为白色固体的标题化合物(2.38g,99%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),3.11(s,3H),3.85-4.35(m,8H),6.15-6.30(brs,1H),6.66(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.05,22.67,26.12,29.36,29.43,29.61,29.66,29.72,29.98,30.36,31.93,39.20,50.02,69.49,73.56,106.47,129.16,140.27,152.97,153.24,172.11,172.92.
TOF/MS(ESI):C64H118NO6[M-H]的计算值996.8959,实验值996.8947.
3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸的合成
〔实施例5-5〕
(1)3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸叔丁酯的合成
在3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酸(2.78g,3.0mmol)、4-二甲氨基吡啶(0.04g,0.3mmol)、β-丙氨酸叔丁酯盐酸盐(2.73g,15.0mmol)、三乙胺(1.52g,15.0mmol)的二氯甲烷(60mL)悬浮液中加入1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.86g,4.5mmol)后,室温下搅拌19.5小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(180mL)而析出的固体。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(3.12g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(2.75g,87%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),2.55(t,2H,J=5.8Hz),3.66(q,2H,J=6.0Hz),3.95-4.05(m,6H),6.72(t,1H,J=6.0Hz),6.94(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.09,22.71,26.11,28.16,29.38,29.43,29.61,29.68,29.74,30.36,31.95,35.18,35.58,69.45,73.53,81.19,105.86,129.57,141.32,153.14,167.20,172.27.
TOF/MS(ESI):C68H127NO6Na[M+Na]+的计算值1076.9561,实验值1076.9579.
〔实施例5-6〕
(2)3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸的合成
根据实施例5-2的方法,由3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸叔丁基(2.64g,2.5mmol)得到作为白色固体的标题化合物(2.52g,101%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),2.74(t,2H,J=5.8Hz),3.72(t,2H,J=5.8Hz),3.90-4.05(m,6H),6.95(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.06,22.71,26.16,26.19,29.40,29.50,29.53,29.65,29.71,29.77,30.44,31.98,33.68,35.85,39.37,69.77,73.67,106.51,128.33,142.29,153.35,168.43,175.46.
TOF/MS(ESI):C64H118NO6[M-H]的计算值996.8959,实验值996.8912.
3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
〔实施例5-7〕
(1)3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸胸苷-3’-基酯的合成
在3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸(2.40g,2.40mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(1.57g,2.88mmol)、1-甲基咪唑(0.99g,12.00mmol)的THF(24mL)悬浮液中加入COMU(2.06g,4.80mmol)后,室温下搅拌6.5小时。再加入COMU(0.21g,0.48mmol)后,室温下搅拌17.5小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(120mL)而析出的固体。将固体用乙腈-THF混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(2.76g)。不对粗产物进行精制而直接用于下一反应。
向粗产物(2.60g)的二氯甲烷溶液(68mL)中加入吡咯(0.57g,8.50mmol)、三氟乙酸(0.24g,2.13mmol)后,室温下搅拌3.5小时。再加入三氟乙酸(0.05g,0.43mmol)后,室温下搅拌1.5小时。过滤通过向反应液中滴加丙酮(20mL)和乙腈(61mL)而析出的固体。将固体用乙腈-丙酮-二氯甲烷混合溶剂和乙腈清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(2.44g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(0.52g,18%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,7H),1.92(s,3H),2.30-2.40(m,1H),2.45-2.55(m,1H),2.60-2.70(m,1H),2.80-2.90(m,2H),3.85-3.95(m,2H),3.95-4.05(m,6H),4.05-4.10(m,1H),4.55-.65(m,2H),5.40-5.55(m,1H),6.10-6.20(m,1H),7.22(s,2H),7.41(s,1H),8.58-8.64(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.57,14.14,22.71,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.67,29.74,30.02,30.34,31.94,34.16,36.90,60.05,62.58,69.24,73.54,75.25,85.10,86.67,108.06,111.42,124.14,136.56,142.69,150.26,152.87,163.40,166.10,170.43.
TOF/MS(ESI):C74H130N2O11Na[M+Na]+的计算值1245.9572,实验值1245.9548.
〔实施例5-8〕
(2)3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由3-((3,4,5-三((十八烷基氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸胸苷-3’-基酯(1.50g,1.23mmol)和DMTr-dT-CE亚磷酰胺(1.83g,2.45mmol)得到作为白色固体的标题化合物(2.22g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.38(m,84H),1.41-1.50(m,9H),1.70-1.83(m,7H),1.91(s,3H),2.30-2.46(m,3H),2.62-2.68(m,2H),2.75(t,1H,J=6.0Hz),2.84(dd,2H,J=4.8,6.4Hz),3.37-3.42(m,1H),3.50-3.55(m,1H),3.79(s,6H),3.98-4.02(m,6H),4.12-4.38(m,6H),4.56(dd,2H,J=4.8,7.2Hz),5.16-5.20(m,1H),5.28-5.35(m,1H),6.21-6.26(m,1H),6.38-6.44(m,1H),6.84(d,4H,J=7.6Hz),7.21-7.32(m,10H),7.34-7.37(m,2H),7.50-7.59(m,1H),8.91-9.06(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.72,12.46,14.13,19.59,19.66,19.75,22.70,26.08,26.15,29.37,29.46,29.61,29.67,29.74,30.36,31.94,33.94,36.62,38.95,55.29,59.89,59.93,62.39,62.45,62.54,62.59,63.23,67.62,69.27,73.55,74.09,79.77,79.82,79.87,79.92,82.52,84.29,84.34,84.46,84.53,85.36,85.57,87.34,108.14,111.70,111.82,113.36,116.17,116.36,124.17,127.34,128.08,128.14,130.13,134.94,135.03,135.07,135.35,135.49,142.74,143.97,143.99,150.23,150.27,150.38,150.46,152.89,158.84,163.40,163.50,166.14,170.29,170.34.
TOF/MS(ESI):C108H164N5O20PNa[M+Na]+的计算值1905.1605,实验值1905.1636.
2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
〔实施例5-9〕
(1)2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯的合成
在2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸(2.10g,2.10mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(1.37g,2.52mmol)、1-甲基咪唑(0.86g,10.50mmol)的THF(32mL)悬浮液中加入COMU(1.80g,4.20mmol)后,室温下搅拌3.5小时。再加入COMU(0.27g,0.63mmol)后,室温下搅拌20小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(158mL)而析出的固体。将固体用乙腈-THF混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(2.96g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(2.51g,78%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15-1.55(m,93H),1.65-1.90(m,6H),2.35-2.60(m,2H),3.08(s,3H),3.45-3.55(m,2H),3.79(s,6H),3.85-4.00(m,6H),4.10-4.40(m,3H),5.50-5.60(m,1H),6.40-6.50(m,1H),6.65(s,2H),6.80-6.90(m,4H),7.20-7.40(m,9H),7.62(s,1H),8.36(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.64,14.07,22.71,26.17,29.38,29.48,29.65,29.70,29.75,30.41,31.97,38.01,55.30,63.79,69.54,73.58,76.72,84.09,84.54,87.42,106.36,111.64,113.49,127.31,128.09,128.26,129.90,130.15,135.30,135.38,140.18,144.29,150.20,153.29,159.01,163.21,168.70,172.20.
TOF/MS(ESI):C95H149N3O12Na[M+Na]+的计算值1547.1039,实验值1547.1042.
〔实施例5-10〕
(2)2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯(2.36g,1.55mmol)得到作为白色固体的标题化合物(1.86g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.05-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),1.92(s,3H),2.30-2.60(m,3H),3.09(s,3H),3.85-4.05(m,8H),4.05-4.35(m,3H),5.45(s,1H),6.05-6.30(brs,1H),6.64(s,2H),7.44(s,1H),8.28(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.50,14.08,22.71,26.17,29.38,29.47,29.51,29.65,29.70,29.75,30.41,31.97,37.20,39.06,62.67,69.59,73.60,75.74,85.09,86.62,106.33,111.45,129.86,136.38,140.23,150.26,153.33,163.22,168.96,172.29.
TOF/MS(ESI):C74H131N3O10Na[M+Na]+的计算值1244.9732,实验值1244.9786.
〔实施例5-11〕
(3)2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸胸苷-3’-基酯(1.71g,1.40mmol)和DMTr-dT-CE-亚磷酰胺(2.09g,2.80mmol)得到作为白色固体的标题化合物(2.54g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.6Hz),1.05-1.55(m,93H),1.65-1.85(m,6H),1.91(s,3H),2.30-2.55(m,3H),2.60-2.80(m,3H),3.08(s,3H),3.35-3.45(m,1H),3.50-3.60(m,1H),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90-4.05(m,6H),4.10-4.45(m,8H),5.10-5.20(m,1H),5.30-5.45(m,1H),6.10-6.30(brs,1H),6.35-6.45(m,1H),6.64(s,2H),6.75-6.90(m,4H),7.15-7.40(m,10H),7.49(d,1H,J=6.4Hz),8.50-8.75(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.76,12.41,12.46,14.07,19.63,19.70,19.78,19.85,22.70,26.20,29.37,29.50,29.52,29.70,29.75,29.79,30.43,31.96,36.86,38.50,39.03,55.30,55.34,61.99,62.10,62.50,62.55,62.63,63.33,67.69,69.61,69.64,73.60,74.61,79.78,81.51,82.43,84.41,84.52,84.57,85.65,85.88,86.36,87.47,106.43,111.40,111.78,111.83,111.89,113.31,113.50,116.07,116.42,127.09,127.38,127.86,128.11,128.27,129.21,130.20,135.07,135.18,135.45,135.54,136.37,139.66,140.30,144.12,147.51,150.16,150.21,150.26,150.38,153.30,158.81,159.03,163.33,168.90,172.25,172.43.
TOF/MS(ESI):C108H165N6O19PNa[M+Na]+的计算值1904.1765,实验值1904.1780.
3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
〔实施例5-12〕
(1)3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯的合成
在3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸(2.20g,2.20mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷(1.44g,2.64mmol)、1-甲基咪唑(0.90g,11.00mmol)的THF(44mL)悬浮液中加入COMU(1.88g,4.40mmol)后,室温下搅拌3.5小时。再加入1-甲基咪唑(0.36g,4.4mmol)、COMU(0.94g,2.20mmol)后,室温下搅拌68小时。过滤通过向反应液中滴加乙腈(220mL)而析出的固体。将固体用乙腈-THF混合溶剂和甲醇清洗后,在50℃减压干燥,得到粗产物(3.07g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-THF)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(2.01g,60%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15-1.55(m,93H),1.60-1.85(m,6H),2.40-2.55(m,2H),2.65-2.75(m,2H),3.40-3.55(m,2H),3.65-3.75(m,2H),3.78(s,6H),3.95-4.05(m,6H),4.14(d,1H,J=1.6Hz),5.47(d,1H,J=4.8Hz),6.42(t,1H,J=6.2Hz),6.59(t,1H,J=6.0Hz),6.80-6.90(m,4H),6.94(s,2H),7.20-7.45(m,9H),7.60(s,1H),8.43(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.62,14.14,22.71,26.11,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.33,31.94,34.05,35.35,37.92,55.24,63.65,69.36,73.51,75.85,83.94,84.34,87.24,105.67,111.65,113.15,113.32,127.26,127.76,127.85,128.06,128.10,129.12,130.04,130.08,135.03,135.24,135.35,141.26,144.12,150.23,153.10,158.78,163.39,167.36,172.25.
TOF/MS(ESI):C95H149N3O12Na[M+Na]+的计算值1547.1039,实验值1547.1014.
〔实施例5-13〕
(2)3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例2-2的方法,由3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯(1.91g,1.25mmol)得到作为白色固体的标题化合物(1.51g,99%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),1.91(s,3H),2.30-2.55(m,2H),2.55-2.75(m,3H),3.65-3.75(m,2H),3.85-3.95(m,2H),3.95-4.05(m,6H),4.05-4.10(m,1H),5.35-5.40(m,1H),6.16(dd,1H,J=6.0,8.4Hz),6.55-6.65(m,1H),6.95(s,2H),7.43(s,1H),8.25-8.55(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.51,14.09,22.71,26.13,26.16,29.38,29.47,29.62,29.69,29.75,29.99,30.38,31.96,34.26,35.57,37.12,62.57,69.57,73.59,75.09,85.06,86.65,106.04,111.41,129.08,136.51,141.64,150.33,153.20,163.40,167.46,172.39.
TOF/MS(ESI):C74H131N3O10Na[M+Na]+的计算值1244.9732,实验值1244.9789.
〔实施例5-14〕
(3)3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的合成
根据实施例3-4的方法,由3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸胸苷-3’-基酯(1.41g,1.15mmol)和DMTr-dT-CE-亚磷酰胺(1.71g,2.30mmol)得到作为白色固体的标题化合物(2.07g,95%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15-1.55(m,93H),1.65-1.85(m,7H),1.90(d,3H,J=1.2Hz),2.25-2.55(m,3H),2.55-2.80(m,5H),3.30-3.45(m,1H),3.50-3.60(m,1H),3.60-3.75(m,2H),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90-4.05(m,6H),4.05-4.40(m,6H),5.10-5.25(m,1H),5.30-5.40(m,1H),6.15-6.25(m,1H),6.40-6.50(m,1H),6.75-6.90(m,4H),6.99(d,2H,J=3.6Hz),7.20-7.40(m,9H),7.50-7.60(m,1H),8.95-9.05(m,1H),9.05-9.15(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.72,12.49,14.14,19.59,19.67,19.75,22.71,26.11,26.14,29.38,29.47,29.63,29.69,29.75,29.78,30.35,31.94,34.03,35.53,35.58,36.64,38.95,55.29,62.36,62.41,62.52,62.57,63.24,67.60,69.38,73.53,73.84,79.90,82.35,82.44,84.25,84.32,84.39,85.48,85.67,87.35,105.86,111.64,111.74,111.88,113.14,113.35,116.25,116.44,127.34,127.76,127.85,128.09,129.03,129.13,130.13,134.91,134.95,135.00,135.07,135.48,135.61,141.22,143.93,143.97,150.21,150.26,150.46,150.49,153.03,158.83,163.48,163.53,167.47,167.51,172.19.
TOF/MS(ESI):C108H165N6O19PNa[M+Na]+的计算值1904.1765,实验值1904.1807.
6. 2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N6-苯甲酰腺嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(胸腺嘧啶-1-基)吗啉-2-基)甲酯的合成
〔实施例6-1〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(胸腺嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和6-(羟基甲基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4-(1H,3H)-二酮(1.16g,2.40mmol)得到标题化合物(2.85g,98%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11-1.53(m,91H),1.68-1.83(m,6H),1.84(s,3H),3.13(d,1H,J=12.0Hz),3.37(d,1H,J=11.2Hz),3.98-4.04(m,6H),4.17(d,2H,J=5.2Hz),4.37-4.41(m,1H),4.78(s,2H),6.13(dd,1H,J=2.0,9.6Hz),7.00(s,1H),7.15-7.26(m,3H),7.26-7.38(m,8H),7.34-7.58(m,6H),8.34(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.45,14.13,22.70,26.07,26.11,29.32,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.35,31.94,49.01,51.85,60.89,65.08,69.19,73.55,74.58,80.50,108.31,110.68,123.33,126.64,127.97,129.13,135.33,142.95,149.63,152.91,163.23,165.75,167.64.
TOF/MS(ESI):C92H143N3O10Na[M+Na]+的计算值1473.0671,实验值1473.0629.
〔实施例6-2〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(胸腺嘧啶-1-基)吗啉-2-基)甲酯三氟乙酸盐的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(胸腺嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲酯(2.76g,1.90mmol)得到标题化合物(2.44g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.39(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.70-1.83(m,6H),1.87(s,3H),2.95-3.16(m,2H),3.42(d,1H,J=11.2Hz),3.62-3.75(m,1H),3.95-4.05(m,6H),4.31(d,1H,J=8.4Hz),4.46(d,2H,J=10.0Hz),4.86(s,2H),6.17(d,1H,J=9.6Hz),7.25(s,1H),7.30(s,2H),10.15-10.75(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.48,14.13,22.71,26.09,26.15,29.35,29.39,29.47,29.63,29.69,29.75,29.78,30.38,31.94,43.24,44.99,60.87,63.56,69.21,72.38,73.57,108.30,112.18,114.99,117.90,123.12,134.33,143.10,150.40,152.99,162.55,162.90,163.78,166.02,167.45.
TOF/MS(ESI):C73H129N3O10-CF3COOH[M-H]的计算值1320.9528,实验值1320.9517.
〔实施例6-3〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N6-苯甲酰腺嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(胸腺嘧啶-1-基)吗啉-2-基)甲酯的合成
在2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(胸腺嘧啶-1-基)吗啉-2-基)甲酯三氟乙酸盐(2.32g,1.76mmol)、N,N-二异丙基乙基胺(4.16g,32.16mmol)的1,3-二甲基-2-咪唑啉酮(16mL)-THF溶液(18mL)中加入(6-(N6-苯甲酰腺嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲基二甲基磷酰胺氯化物(3.81g,5.27mmol)后,室温下搅拌2.5小时。将通过在反应液中加入甲醇(93mL)而得到的浆液减压浓缩。将向浓缩残渣中加入甲醇而得的浆液在室温下搅拌30分钟后,过滤。用甲醇清洗固体后,在50℃减压干燥,得到粗产物(3.23g)。将粗产物利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(1.96g,59%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.53(m,90H),1.55-1.97(m,12H),2.46(d,3H,J=10.4Hz),2.63(d,3H,J=9.6Hz),2.46-2.63(m,1H),3.12-3.60(m,4H),3.75-4.07(m,10H),4.15-4.50(m,2H),4.78-4.91(m,2H),5.41-5.53(m,1H),6.42(d,1H,J=10.4Hz),7.12-7.20(m,4H),7.20-7.32(m,9H),7.40-7.58(m,8H),8.05(d,2H,J=7.6Hz),8.07-8.10(m,1H),8.68-8.80(m,1H),9.50-9.76(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.44,12.53,14.14,22.70,26.08,26.12,29.32,29.38,29.43,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,36.47,36.51,36.63,36.67,44.56,44.84,47.02,48.64,48.78,52.81,53.10,60.93,64.23,65.34,65.69,69.19,73.56,74.90,74.97,75.34,79.53,79.61,79.97,80.79,108.27,110.92,111.25,122.82,123.26,126.65,128.00,128.22,128.29,128.57,128.63,129.16,132.47,132.57,133.49,133.92,134,74,134.80,140.75,140.78,142.97,143.00,149.31,149.68,149.82,150.12,150.89,151.40,152.65,152.77,152.92,152.94,163.62,165.02,165.23,165.82,165.84,167.56,167.63.
TOF/MS(ESI):C111H165N10O14PNa[M+Na]+的计算值1916.2142,实验值1916.2216.
2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N4-苯甲酰基胞嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉-2-基)甲酯的合成
〔实施例6-4〕
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲酯的合成
根据实施例2-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(1.97g,2.00mmol)和N-(9-(6-(羟基甲基)-4-三苯甲基吗啉-2-基))-6-氧代-6,9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(1.51g,2.60mmol)得到标题化合物(3.00g,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10-1.60(m,97H),1.70-1.90(m,7H),2.64(sept,1H),3.18(d,1H,J=12.0Hz),3.45(d,1H,J=11.6Hz),3.95-4.15(m,6H),4.13-4.25(m,2H),4.37-4.46(m,1H),4.72(d,1H,J=16.0Hz),4.84(d,1H,J=16.0Hz),5.89(dd,1H,J=2.2,9.8Hz),7.06-7.37(m,12H),7.39-7.55(m,5H),7.61(s,1H),8.18(s,1H),11.92(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.93,19.03,22.71,26.07,26.12,29.33,29.37,29.42,29.60,29.67,29.74,30.35,31.94,36.64,49.04,52.24,60.90,65.03,69.25,73.58,74.22,80.36,108.38,121.30,123.27,126.69,127.96,129.18,136.12,143.08,147.32,147.42,152.95,155.36,165.98,167.61,177.85.
TOF/MS(ESI):C96H148N6O10Na[M+Na]+的计算值1568.1155,实验值1568.1176.
〔实施例6-5〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉-2-基)甲酯三氟乙酸盐的合成
根据实施例2-2的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲酯(2.78g,1.80mmol)得到标题化合物(2.45g,96%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.87(t,9H,J=6.8Hz),1.00-1.53(m,96H),1.69-1.88(m,6H),2.72-2.88(m,1H),3.19-3.38(m,1H),3.44-3.63(m,1H),3.75-4.13(m,8H),4.25-4.63(m,3H),4.69-4.94(m,2H),6.06-6.31(m,1H),7.20-7.30(m,3H),7.87-8.06(m,1H),10.19-10.63(brs,1H),12.19-12.63(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.12,18.92,22.70,26.09,26.16,29.35,29.38,29.47,29.63,29.68,29.75,29.79,30.04,30.38,31.94,36.17,42.86,60.73,63.62,69.21,71.44,73.57,108.29,115.13,118.04,123.10,143.09,148.28,152.95,156.00,165.93,167.50,180.39.
TOF/MS(ESI):C77H134N6O10-CF3COOH[M-H]的计算值1416.0012,实验值1415.9960.
〔实施例6-6〕
(3)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N4-苯甲酰基胞嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉-2-基)甲酯的合成
根据实施例6-3的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉-2-基)甲酯三氟乙酸盐(2.27g,1.60mmol)和(6-(N4-苯甲酰基胞嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲基二甲基磷酰胺氯化物(3.35g,4.80mmol)得到标题化合物(2.87g,91%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.00-1.56(m,96H),1.69-1.88(m,9H),2.38-2.97(m,8H),3.06-3.69(m,5H),3.75-4.56(m,12H),4.69-4.94(m,2H),5.34-5.63(m,1H),6.28-6.50(m,1H),7.13-8.00(m,23H),8.69-8.94(brs,1H),9.31-9.63(brs,1H),10.06-10.31(brs,1H),12.13-12.31(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,19.01,19.04,19.17,19.22,22.70,26.07,26.12,29.32,29.37,29.43,29.60,29.67,29.73,29.98,30.35,31.94,36.17,36.27,36.64,36.68,36.74,36.78,45.00,45.08,46.96,47.43,48.25,48.76,52.48,60.82,60.90,64.27,65.84,69.20,69.22,73.57,74.31,74.51,75.41,79.30,80.47,81.36,81.59,108.31,121.25,122.00,123.26,123.33,126.67,126.73,127.73,127.99,128.80,128.98,132.71,133.07,133.27,136.19,137.10,142.90,143.01,147.88,148.00,148.09,152.89,152.93,155.79,155.90,165.79,165.91,167.56,167.58,178.67,179.37.
TOF/MS(ESI):C114H170N11O15PNa[M+Na]+的计算值1987.2513,实验值1987.2521.
7.脱Tag化的确认
〔实施例7-1〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷的合成
将2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(233mg,0.10mmol)的THF(9mL)-2-丙醇(1mL)混合溶液冷却到0℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,在该温度下搅拌30分钟。向反应液中加入氯化铵水溶液后,用二氯甲烷萃取3次。将有机层用食盐水清洗后,用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过使浓缩残渣悬浮于乙腈而析出的固体利用过滤除去,浓缩滤液。将浓缩残渣的二甲基亚砜-甲醇混合溶液(1:1,5mL)的一部分(2.5mL)使用制备型色谱分5次精制,得到作为白色固体的标题化合物(64mg,95%)。
制备型色谱条件:色谱柱关东化学制MightysilRP-18GP(5μm,20Φ×250mm),流速5mL/min,流动相乙腈-水(梯度0-30分钟(乙腈的比率50→60%)。
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6):δ1.12(d,6H,J=6.0Hz),1.42(d,3H,J=7.2Hz),1.74(d,3H,J=2.8Hz),2.07(s,1H),2.30-2.41(m,3H),2.60-2.90(m,6H),3.18-3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=4.2Hz),4.00-4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.51-5.52(m,1H),6.15-6.25(m,3H),6.88(d,4H,J=9.0Hz),7.20-7.50(m,11H),8.17(q,1H,J=1.8Hz),11.33-12.07(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d6):δ10.56,10.88,17.66,33.65,35.78,52.00,53.86,56.34,61.48,61.80,65.49,66.58,68.73,76.58,77.11,81.63,82.11,82.52,82.87,84.98,90.73,108.72,112.08,116.98,119.14,125.69,126.46,126.77,128.53,133.81,134.00,134.26,134.70,136.15,143.26,147.04,147.32,149.14,153.53,156.99,162.50,168.14,178.89.
TOF/MS(ESI):C61H69N11O21P2Na[M+Na]+的计算值1376.4,实验值1376.6.
〔实施例7-2〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷的合成
根据实施例7-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基酯(244mg,0.10mmol)得到作为黄色固体的标题化合物(55mg,75%)。
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6):δ1.17-1.30(m,7H),1.74-1.79(m,3H),1.97-2.30(m,2H),2.45-2.51(m,2H),2.68-2.76(m,1H),2.79-2.83(m,1H),2.96(dt,4H,J=6.4,12.4Hz),3.03-3.12(m,1H),3.22(t,1H,J=11.3Hz),3.77(s,6H),3.93(s,1H),4.07-4.38(m,11H),5.07-5.45(m,5H),6.05-6.45(m,3H),6.85(t,4H,J=10.7Hz),7.24(d,5H,J=8.9Hz),7.29(t,2H,J=7.6Hz),7.36(d,2H,J=7.6Hz),7.49-7.56(m,3H),7.65(t,1H,J=7.2Hz),7.90(dt,1H,J=3.0,8.1Hz),8.07(d,2H,J=7.6Hz),8.13-8.16(m,1H),10.89-12.13(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d6):δ12.52,14.58,19.33,35.33,36.13,37.02,55.48,60.34,62.73,63.24,64.06,67.31,68.33,70.66,77.30,79.12,82.64,83.37,84.09,84.74,86.25,113.58,118.69,121.00,123.54,127.24,128.19,128.72,128.94,130.23,132.68,133.50,134.55,135.77,136.46,137.81,139.68,145.08,148.56,149.12,150.82,155.31,158.56,161.08,164.11,165.03,180.61.
TOF/MS(ESI):C68H72N14O20P2Na[M+Na]+的计算值1489.4,实验值1489.4.
〔实施例7-3〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷的合成
根据实施例7-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基酯(243mg,0.10mmol)得到作为白色固体的标题化合物(57mg,79%)。
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6):δ1.09-1.12(m,6H),1.42(s,3H),1.75-2.10(m,4H),2.61-2.95(m,7H),3.15-3.25(m,3H),3.70-3.77(m,7H),4.08-4.36(m,11H),5.09(d,2H,J=41.9Hz),5.32(d,2H,J=44.0Hz),6.18-6.29(m,3H),6.85-6.88(m,4H),7.20-7.22(m,5H),7.29(q,2H,J=6.9Hz),7.34(d,2H,J=7.6Hz),7.41-7.53(m,4H),7.86(d,2H,J=7.6Hz),8.19(dt,1H,J=4.4,8.2Hz),8.84(q,1H,J=6.4Hz),11.34-12.05(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d6):δ12.17,19.35,27.86,35.35,55.56,57.07,63.19,63.61,67.29,68.60,70.86,78.19,78.93,82.62,83.40,83.86,84.14,86.67,110.47,113.78,118.59,118.88,120.91,127.38,128.02,128.69,130.24,131.86,134.55,135.51,135.97,137.92,144.97,148.76,149.02,150.84,154.36,155.25,158.69,164.09,165.95,166.18,180.60.
TOF/MS(ESI):C67H72N12O21P2Li[M+Li]+的计算值1449.5,实验值1449.6.
〔实施例7-4〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷的合成
根据实施例7-1的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(232mg,0.10mmol)得到作为白色固体的标题化合物(63mg,93%)。
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6):δ1.12(d,6H,J=6.2Hz),1.42(d,3H,J=7.6Hz),1.73(d,3H,J=2.7Hz),2.07(s,1H),2.32-2.43(m,3H),2.61-2.91(m,6H),3.20-3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=3.8Hz),4.04-4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.51-5.52(m,1H),6.13-6.26(m,3H),6.88(d,4H,J=8.9Hz),7.23(d,5H,J=7.6Hz),7.30(t,2H,J=6.2Hz),7.36(d,2H,J=8.2Hz),7.43-7.47(m,2H),7.89-8.18(m,1H),11.33-12.07(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d6):δ10.46,10.84,17.69,17.83,33.61,35.32,36.22,53.86,61.50,61.98,65.53,66.44,68.89,75.88,77.15,80.92,81.78,82.16,82.47,82.92,83.51,85.00,108.75,108.90,112.08,116.92,119.11,125.71,126.48,126.77,128.55,133.80,134.02,134.33,134.53,136.24,143.27,146.96,147.20,149.17,153.63,157.01,162.41,178.92.
TOF/MS(ESI):C61H69N11O21P2Na[M+Na]+的计算值1376.4,实验值1376.6.
〔实施例7-5〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-胸苷-3’-基)硫代磷酰基)-胸苷的合成
将2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-胸苷-3’-基)硫代磷酰基)-胸苷-3’-基酯(189mg,0.10mmol)的THF(9mL)-2-丙醇(1mL)混合溶液冷却到0℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,在该温度下搅拌30分钟。向反应液加入氯化铵水溶液后,用二氯甲烷萃取3次。将有机层用食盐水清洗后,用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过使浓缩残渣悬浮于乙腈而析出的固体利用过滤除去,浓缩滤液。浓缩残渣利用柱色谱(硅胶,展开溶剂:氯仿-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(86mg,93%)。
1H-NMR(600MHz,CDCl3):δ1.46(d,3H,J=15.8Hz),1.91(d,3H,J=8.2Hz),2.21-2.79(m,6H),3.39-3.49(m,2H),3.79(d,6H,J=3.4Hz),4.08-4.52(m,8H),5.26-5.31(m,1H),6.25-6.41(m,2H),6.85(dd,4H,J=2.7,8.9Hz),7.22-7.38(m,9H),7.58(d,1H,J=24.1Hz),9.45-10.50(m,2H).
13C-NMR(151MHz,CDCl3):δ11.90,12.57,19.43,38.92,39.90,55.30,62.59,63.36,67.70,71.03,80.38,84.66,85.46,87.28,111.32,111.97,113.38,116.54,127.28,128.00,128.11,130.06,135.00,135.80,144.09,150.64,150.92,158.74,163.98.
TOF/MS(ESI):C44H48N5O13PSNa[M+Na]+的计算值940.3,实验值940.2.
〔实施例7-6〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟脱氧尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷的合成
将2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟脱氧尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-氟-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基酯(0.397g,0.200mmol)的THF(27mL)-2-丙醇(3mL)的混合溶液冷却到0~-10℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.10mL,0.400mmol)后,在该温度下搅拌20分钟。向反应液加入10%氯化铵水溶液(4mL)后进行分液,将有机层用10%食盐水清洗。将有机层用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过向浓缩残渣中添加甲醇而析出的固体利用过滤除去,将滤液浓缩,干固。将浓缩残渣利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(0.137g,67%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1.16-1.26(m,6H),2.19(s,2H),2.45-2.87(m,3H),3.44-3.66(m,2H),3.72-3.75(m,6H),3.92-4.18(m,2H),4.25-4.50(m,4H),4.89-5.55(m,6H),5.85-6.00(m,2H),6.80-6.82(m,4H),7.15-7.30(m,7H),7.33-7.37(m,2H),7.71-7.82(m,2H),10.05-10.42(brs,1H),10.55-10.87(brs,1H),12.36(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ18.75,18.85,19.01,19.07,19.38,19.45,36.01,50.81,55.26,55.28,60.65,62.85,67.86,80.26,81.13,87.13,87.19,87.53,87.88,90.59,92.53,102.62,113.33,116.74,121.28,127.26,128.05,128.19,130.22,134.80,134.91,134.96,135.07,140.41,144.01,144.11,148.00,148.06,148.50,148.55,150.44,155.70,158.76,163.72,180.33,180.39.
TOF/MS(ESI):C47H49N8O14F2PNa[M+Na]+的计算值1041.2972,实验值1041.2975.
〔实施例7-7〕
N4-苯甲酰基-5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-甲基胞苷的合成
将N,N-二异丙基乙基胺(0.065g,0.50mmol)的THF(13.5mL)和2-丙醇(1.5mL)的混合溶液冷却到0~-10℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,在该温度下搅拌10分钟。接着加入2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸N4-苯甲酰基-5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-甲基胞苷-3’-基酯(0.200g,0.10mmol)的THF(0.9mL)-2-丙醇(0.1mL)的混合溶液后,在该温度下搅拌0.5小时。向反应液加入10%氯化铵水溶液(2mL)后进行分液,将有机层用10%食盐水清洗。将有机层用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过向浓缩残渣添加甲醇而析出的固体利用过滤除去,将滤液浓缩、干固。将浓缩残渣利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制,得到作为白色固体的标题化合物(0.055g,53%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ2.00-2.27(brs,2H),2.55-2.74(m,1H),2.80(t,1H,J=6.2Hz),3.14-3.41(m,1H),3.44-3.92(m,14H),4.03-4.64(m,7H),5.12(q,1H,J=5.6Hz),5.27(t,1H,J=8.0Hz),5.87-6.05(m,2H),6.78-6.89(m,4H),7.19-7.64(m,12H),7.76-8.16(m,4H),9.05-9.42(brs,1H),9.50-9.87(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ19.54,19.56,19.61,19.64,55.28,55.32,58.80,58.82,58.93,61.30,61.34,62.38,62.43,62.68,62.73,66.03,66.08,66.41,66.46,67.85,67.95,74.30,74.34,74.42,74.47,81.32,81.41,81.49,81.58,81.64,81.72,82.17,82.99,83.08,86.58,86.79,87.46,87.48,89.42,89.51,96.78,102.69,102.71,113.39,116.35,116.48,127.37,127.42,127.80,127.85,128.12,128.25,128.29,128.57,128.90,128.93,130.22,130.27,130.30,131.01,132.94,133.02,133.14,133.17,134.72,134.75,134.82,134.84,139.51,139.66,143.90,143.97,144.26,150.43,154.73,158.81,158.85,162.82,162.86,163.22,166.72.
TOF/MS(ESI):C51H53N6O16PNa[M+Na]+的计算值1059.3153,实验值1059.3202.
〔实施例7-8〕
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷的合成
将2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基)磷酰基)-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷-3’-基酯(0.420g,0.20mmol)的THF(27mL)-2-丙醇(3mL)的混合溶液冷却到0~-10℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.25mL,1.00mmol)后,在该温度下搅拌1.5小时。向反应液加入10%氯化铵水溶液(4mL)后进行分液,将有机层用10%食盐水清洗。将有机层用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过向浓缩残渣添加甲醇而析出的固体利用过滤除去,将滤液浓缩、干固。将浓缩残渣利用柱色谱(球状中性硅胶,展开溶剂:二氯甲烷-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(0.135g,60%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.11-0.15(m,12H),0.89-0.93(m,18H),1.66-1.84(brs,2H),2.50-2.77(m,3H),3.46-3.67(m,2H),3.80(s,6H),3.98-4.55(m,9H),4.92-4.96(m,1H),5.23-5.27(m,1H),5.61-5.75(m,2H),5.97-6.00(m,1H),6.84-6.87(m,4H),7.14-7.45(m,10H),7.77-7.87(m,1H),9.00-9.50(brs,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ-5.14,-4.98,-4.96,-4.90,-4.82,-4.76,-4.74,-4.70,-4.68,17.96,18.02,18.06,19.54,19.60,19.67,25.56,25.60,25.66,25.69,55.31,62.02,62.29,62.34,62.52,62.57,62.62,67.06,67.12,67.32,69.38,69.54,70.49,70.93,73.61,74.57,74.63,74.71,74.88,81.55,81.60,81.73,81.84,81.93,82.01,87.37,87.65,87.85,87.95,88.05,91.58,91.81,93.18,93.89,102.60,102.67,102.76,102.82,102.86,113.41,116.26,116.30,127.41,127.45,128.13,128.17,128.21,130.16,130.23,130.29,130.34,134.65,134.69,134.72,134.75,139.67,139.75,140.36,140.40,141.65,141.77,143.99,144.03,149.97,150.09,150.19,150.40,150.55,150.75,158.83,158.88,162.93,163.00,163.18.
TOF/MS(ESI):C54H72N5O16Si2PNa[M+Na]+的计算值1156.4148,实验值1156.4148.
5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷的合成
〔实施例7-9〕
(1)由3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯合成
根据实施例7-8的方法,由3-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(0.377g,0.200mmol)得到作为白色固体的标题化合物(0.136g,76%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1.41(d,3H,J=5.4Hz),1.87(d,3H,J=2.0Hz),2.19-2.27(m,1H),2.34-2.48(m,2H),2.62-2.77(m,3H),3.39(t,1H,J=7.2Hz),3.47-3.52(m,1H),3.78(s,6H),4.07-4.55(m,8H),5.12-5.18(m,1H),6.18-6.24(m,1H),6.35-6.40(m,1H),6.84(d,4H,J=8.8Hz),7.21-7.31(m,8H),7.32-7.38(m,2H),7.51-7.58(m,1H),9.92-10.14(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ11.78,12.45,12.49,19.59,19.67,19.71,38.83,39.01,39.61,39.67,55.31,62.45,62.50,62.60,62.65,63.31,67.74,70.84,80.08,84.40,84.50,85.60,87.30,87.36,111.23,111.34,111.91,112.00,113.37,116.49,116.74,127.32,128.10,130.11,130.14,134.98,135.01,135.04,135.19,136.00,144.01,144.06,150.69,151.00,151.05,158.80,163.96,164.16.
TOF/MS(ESI):C44H48N5O14PNa[M+Na]+的计算值924.2833,实验值924.2836.
〔实施例7-10〕
(2)由2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯合成
将2-(N-甲基-3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(189mg,0.10mmol)的THF(9mL)-2-丙醇(1mL)混合溶液冷却到0℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,在该温度下搅拌30分钟。向反应液加入氯化铵水溶液后,用二氯甲烷萃取3次。将有机层用食盐水清洗后,用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过使浓缩残渣悬浮于乙腈而析出的固体利用过滤除去,浓缩滤液。将浓缩残渣利用柱色谱(硅胶,展开溶剂:氯仿-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(89mg,98%)。
TOF/MS(ESI):C44H48N5O14PNa[M+Na]+的计算值924.3,实验值924.2.
〔实施例7-11〕
(3)由3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯合成
将3-(3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰胺)丙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(189mg,0.10mmol)的THF(9mL)-2-丙醇(1mL)混合溶液冷却到0℃。冷却下,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,室温下搅拌1小时。向反应液加入氯化铵水溶液后,用二氯甲烷萃取3次。将有机层用食盐水清洗后,用无水硫酸钠干燥,通过过滤除去硫酸钠后,浓缩滤液。将通过使浓缩残渣悬浮于乙腈而析出的固体利用过滤除去,浓缩滤液。将浓缩残渣利用柱色谱(硅胶,展开溶剂:氯仿-甲醇)精制,由此得到作为白色固体的标题化合物(74mg,82%)。
TOF/MS(ESI):C44H48N5O14PNa[M+Na]+的计算值924.3,实验值924.2.
〔实施例7-12〕
(6-(N6-苯甲酰腺嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲基P-(2-(羟基甲基)-6-胸腺嘧啶-1-基)吗啉基)-N,N-二甲基磷酰胺的合成
根据实施例7-7的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N6-苯甲酰腺嘌呤-9-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(胸腺嘧啶-1-基)吗啉-2-基)甲酯(0.379g,0.20mmol)得到作为白色固体的标题化合物(0.114g,61%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.87-1.95(m,6H),2.01(s,1H),2.45-2.64(m,7H),3.06-4.04(m,9H),4.43-4.46(m,1H),5.52(dd,1H,J=2.4,10.4Hz),6.41(dt,1H,J=2.4,10.0Hz),7.05-7.64(m,19H),8.03(d,2H,J=8.4Hz),8.09(s,1H),8.71-8.80(m,1H),9.69-9.78(m,1H),10.28(s,1H),10.75-11.05(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ12.41,12.45,36.54,36.58,36.62,36.66,44.61,44,82,47.13,48.68,48.78,52.80,52.85,62.72,62.78,65.46,65.61,75.07,75.14,75.45,75.52,78.06,78.13,78.27,78.33,79.60,79.65,80.01,80.49,110.96,111.03,122.47,122.78,126.65,128.00,128.24,128.41,128.49,128.62,129.17,132.61,132.69,133.48,133.64,134.86,134.96,140.94,149.54,149.75,149.82,150.02,151.23,151.42,152.66,152.75,163.75,163.79,165.25.
TOF/MS(ESI):C48H51N10O8PNa[M+Na]+的计算值949.3527,实验值949.3545.
〔实施例7-13〕
(6-(N4-苯甲酰基胞嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲基P-(2-(羟基甲基)-6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉基)-N,N-二甲基磷酰胺的合成
根据实施例7-7的方法,由2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸(4-(((6-(N4-苯甲酰基胞嘧啶-1-基)-4-三苯甲基吗啉-2-基)甲氧基)(二甲氨基)磷酰基)-6-(N2-异丁酰基鸟嘌呤-9-基)吗啉-2-基)甲酯(0.197g,0.10mmol)得到作为白色固体的标题化合物(0.052g,52%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ0.78-1.55(m,9H),2.37-2.95(m,8H),3.08-3.94(m,9H),4.13-4.43(m,2H),5.42-5.54(m,1H),6.22-6.38(m,1H),7.05-7.80(m,19H),7.93(d,2H,J=7.2Hz),9.58-9.92(brs,1H),10.64-10.86(brs,1H),12.05-12.21(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ13.91,14.12,19.03,19.06,19.28,22.69,25.76,28.55,29.36,29.70,31.72,31.92,35.99,36.05,36.62,36.65,36.69,44.63,44.92,47.15,47.56,48.44,48.79,52.26,52.42,61.85,62.58,62.73,65.66,66.15,71.09,71.69,75.40,75.86,75.91,78.19,79.73,80.56,81.37,81.76,97.87,120.56,120.92,126.65,127.96,128.04,128.70,128.83,128.92,129.13,131.00,132.21,132.97,133.02,133.14,136.66,137.43,144.02,144.54,147.92,147.98,148.00,154.99,155.57,155.62,162.69,163.09,167.24,179.62,179.86.
TOF/MS(ESI):C51H56N11O9PNa[M+Na]+的计算值1020.3898,实验值1020.3942.
〔实施例7-14〕
八聚体的脱Tag化的确认
(1)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯(八聚体)的合成
氩气下,向2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸胸苷-3’-基酯(1.19g,0.98mmol)、5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基-亚磷酰胺(1.46g,1.96mmol)的二氯甲烷悬浮液(10mL)中加入5-苄硫基-1H-四唑(0.38g,1.96mmol)后,室温下搅拌1.5小时。接下来,加入吡啶(0.93g,11.77mmol)和水(0.11g,5.89mmol)、碘(1.25g,4.91mmol)后,室温下4小时搅拌。向反应液中加入1.2mol/L-抗坏血酸水溶液(3mL)后,室温下搅拌15分钟。将通过向反应液中滴加乙腈(24mL)而析出的固体过滤。将固体用乙腈-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到DMTr体(2.22g)。
接下来,向DMTr体(1.83g,0.98mmol)的二氯甲烷悬浮液(15mL)加入吡咯(0.33g,4.91mmol)、三氟乙酸(0.13g,1.18mmol)后,室温下搅拌1.5小时。将向反应液滴加乙腈(37mL)和甲醇(18mL)而析出的固体过滤。将固体用乙腈-甲醇-二氯甲烷混合溶剂清洗后,在50℃减压干燥,得到二聚体(1.48g)。
重复6次与上述同样的操作,得到八聚体(2.94g)。
TOF/MS(ESI):m/z 2106.3[M+2H]2+,1403.9[M+3H]3+.
〔实施例7-15〕
(2)2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基酯的脱Tag化
将N,N-二异丙基乙基胺(65mg,0.50mmol)加入二氯甲烷(0.4mL)和THF(0.2mL)、2-丙醇(0.04mL)的混合溶液中,冷却到0~-10℃。接下来,加入4mol/L-硼氢化锂-THF溶液(0.125mL,0.50mmol)后,在该温度下搅拌20分钟,制备还原试剂。向预先冷却到0~-10℃的八聚体(84mg,0.02mmol)的二氯甲烷(4.2mL)-THF(1.8mL)-2-丙醇(0.4mL)混合液中添加还原试剂,在该温度下搅拌40分钟。向反应液中加入10%氯化铵水溶液(5mL)后,用二氯甲烷萃取。将有机层用食盐水清洗后,将有机层浓缩、干固。将通过使浓缩残渣悬浮于二氯甲烷而析出的固体滤出。将固体用二氯甲烷清洗后,进行减压干燥,得到5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(5’-O-((2-氰乙氧基)(N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)-N2-异丁酰基脱氧鸟苷-3’-基)磷酰基)-N4-苯甲酰基脱氧胞苷-3’-基)磷酰基)-N6-苯甲酰基脱氧腺苷-3’-基)磷酰基)胸苷-3’-基)磷酰基)胸苷(25mg)。
TOF/MS(ESI):m/z 1621.9[M+2H]2+,1081.6[M+3H]3+,811.2[M+4H]4+.
8.脱Tag化进行速度的比较
〔实施例8〕
对2-((3,4,5-三(十八烷氧基)苯甲酰基)氧基)乙酸5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯(缩写为A-Tag-dT-DMTr)和琥珀酸3,4,5-三(十八烷氧基)苄基5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷-3’-基酯(缩写为S-Tag-dT-DMTr),比较在下述所示的氨性碱性条件下的脱Tag化进行速度。
<脱Tag化条件>
<dT-DMTr(脱Tag体)的生成率>
[表1]
<HPLC条件>
柱子:Inertsil WP300 Diol(5μm,4.6Φ×150mm)
流速:1.0mL/min
流动相:正己烷,CHCl3-MeOH(1/1)
梯度:0-11min;5%到30%(CHCl3-MeOH)
检测方法:UV(λ=254nm)
保留时间:A-Tag-dT-DMTr:Rt=4.23min,S-Tag-dT-DMTr:Rt=4.17min,dT-DMTr:Rt=9.40min
生成率:(dT-DMTr)/[(A-Tag-dT-DMTr或S-Tag-dT-DMTr)+(dT-DMTr)]
如上,确认了A-Tag在寡核酸合成的一般脱保护条件中,比琥珀酸酯体更迅速地脱Tag化。
9.合成例总结
以下,汇总示出上述的各实施例中的合成例。
9.1三聚体的合成
[表2]
如上述表2所示,能够以高收率得到各种的Tag结合三聚体DNA低聚物。
9.2二聚体的合成
[表3]
如上述表3所示,能够以高收率得到各种的Tag结合寡核苷酸(二聚体)。
9.3二聚体的合成
[表4]
如上述表4所示,能够以高收率得到各种的Tag结合寡核苷酸(二聚体)。
9.4二聚体的合成
[表5]
如上述表5所示,能够以高收率得到各种的Tag结合寡核苷酸(二聚体)。
9.5二十聚体的合成和完全脱保护
二十聚体的合成和完全脱保护
5′-OH-dT-3′-A-Tag→5′-OH-d(TCBzCBzCBzGiBuCBzCBzTGiBuTGiBuABzCBzABzTGiBuCBzABzTT)-3′-A-Tag
→5′OH-d(TCCCGCCTGTGACATGCATT)-3′-OH
通过使用本发明的烷氧基苯基衍生物和Tag化核苷酸保护体,能够简易地得到上述的Tag化寡核苷酸保护体(二十聚体)。并且,通过除去Tag部分和保护基,能够简便地得到寡核苷酸。
9.6三聚体的脱Tag
[表6]
三聚体脱Tag
如上述表6所示,除去各种的Tag化寡核苷酸保护体(三聚体)的Tag部分,能够以高收率得到各寡核苷酸保护体(三聚体)。
9.7二聚体的脱Tag
[表7]
二聚体脱Tag
如上述表7所示,将各种的Tag化寡核苷酸保护体(二聚体)的Tag部分除去,能够以高收率得到各寡核苷酸保护体(二聚体)。
9.8二聚体的脱Tag
[表8]
二聚体脱Tag
如上述表8所示,将各种的Tag化寡核苷酸保护体(二聚体)的Tag部分除去,能够以高收率得到各寡核苷酸保护体(二聚体)。
9.9二聚体的脱Tag
[表9]
二聚体脱Tag
如上述表9所示,将各种的Tag化寡核苷酸保护体(二聚体)的Tag部分除去,能够以高收率得到各寡核苷酸保护体(二聚体)。
产业上的可利用性
本发明的烷氧基苯基衍生物可以用于上述Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体的制造等。另外,本发明的Tag化核苷保护体和Tag化核苷酸保护体等、寡核苷酸的制造方法、以及Tag化核苷保护体或者Tag化核苷酸保护体的选择性Tag部分除去方法可以用于特别是液相合成(包括准液相合成)中的寡核苷酸保护体的合成。这些都是对核酸医药开发、解明生物体机理等非常有用的化合物和方法。

Claims (28)

1.通式(1)表示的化合物或其衍生物,
式(1)中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
m表示1~5的整数,m为2以上的情况下,多个存在的RO相同或者不同,
X表示O或者S,
n表示1~4的整数。
2.根据权利要求1所述的化合物或其衍生物,其由通式(2)表示,
式(2)中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
X表示O或者S,
n表示1~4的整数。
3.根据权利要求1所述的化合物或其衍生物,其中,n为1或者2。
4.根据权利要求1所述的化合物或其衍生物,其中,m为2~4的整数。
5.通式(3)表示的化合物或其衍生物,
式(3)中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
m表示1~5的整数,m为2以上的情况下,多个存在的RO相同或者不同,
X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C 1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点。
6.根据权利要求5所述的化合物或其衍生物,其由通式(6)表示,
式(6)中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点。
7.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,W为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基或者9-(9-苯基)噻吨基。
8.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,R4为在2位具有吸电子性基团的乙基。
9.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,Q为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基或者9-(9-苯基)噻吨基。
10.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,y1或者y2为1~100。
11.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,y1或者y2为1~30。
12.根据权利要求5或6所述的化合物或其衍生物,其中,y1或者y2为0。
13.一种通式(7)或者(8)表示的化合物或其衍生物的制造方法,包括将通式(3)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1),
式(3)中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
m表示1~5的整数,m为2以上的情况下,多个存在的RO相同或者不同,
X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点,
式(7)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
式(8)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数。
14.根据权利要求13所述的制造方法,其中,包括将通式(6)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1),
式(6)中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点,
式(7)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
式(8)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数。
15.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,所述还原处理使用含硼还原剂,或者使用含硼还原剂和胺。
16.根据权利要求15所述的制造方法,其中,所述含硼还原剂为硼氢化锂、硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、四丁基硼氢化铵。
17.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,W为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。
18.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,R4为在2位具有吸电子性基团的乙基。
19.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,Q为氢原子、三苯甲基、二(C1-6烷氧基)三苯甲基、单(C1-18烷氧基)三苯甲基、9-(9-苯基)呫吨基、或者9-(9-苯基)噻吨基。
20.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,y1或者y2为1~100。
21.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,y1或者y2为1~30。
22.根据权利要求13或14所述的制造方法,其中,y1或者y2为0。
23.根据权利要求13所述的制造方法,其中,n为1或者2。
24.根据权利要求13所述的制造方法,其中,m为2~4的整数。
25.一种取代基除去方法,包括将通式(3)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1),
式(3)中,
R各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
m表示1~5的整数,m为2以上的情况下,多个存在的RO相同或者不同,
X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(3)中的键合位点。
26.根据权利要求25所述的取代基除去方法,其中,包括将通式(6)表示的化合物或其衍生物进行还原处理的工序(1),
式(6)中,
R1、R2和R3各自独立地表示可以被取代的碳原子数10~40的烷基,
X表示O、S、NH或者NRN
n表示1~4的整数,
RN表示可以被取代的碳原子数1~6的烷基,
Y表示下述通式(4)或者通式(5),
式(4)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
B表示氢原子、可以被保护的羟基、或者卤素,B存在2个以上的情况下,多个存在的B相同或者不同,
W表示氢原子或者保护基,
R4表示具有吸电子性基团的碳原子数1~4的烷基,R4存在2个以上的情况下,多个存在的R4相同或者不同,
Z表示O或者S,Z存在2个以上的情况下,多个存在的Z相同或者不同,
y1表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点,
式(5)中,
Base表示可以被修饰的核酸碱基,Base存在2个以上的情况下,多个存在的Base相同或者不同,
Q表示氢原子或者保护基,
V表示碳原子数1~6的烷氧基、二(C1-6烷基)氨基、或者4位氮原子被保护基保护且可以进一步被取代的哌嗪基,V存在2个以上的情况下,多个存在的V相同或者不同,
y2表示0以上的任意的整数,
*表示所述通式(6)中的键合位点。
27.根据权利要求25或26所述的取代基除去方法,其中,所述还原处理使用含硼还原剂,或者使用含硼还原剂和胺。
28.根据权利要求27所述的取代基除去方法,其中,所述含硼还原剂为硼氢化锂、硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、四丁基硼氢化铵。
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