JP2020011932A - アルコキシフェニル誘導体、ヌクレオシド保護体およびヌクレオチド保護体、オリゴヌクレオチド製造方法、ならびに、置換基除去方法 - Google Patents
アルコキシフェニル誘導体、ヌクレオシド保護体およびヌクレオチド保護体、オリゴヌクレオチド製造方法、ならびに、置換基除去方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。)
(式中、
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。)
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
(式中、
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。)
(式中、
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。)
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
本発明のアルコキシフェニル化合物およびその誘導体は、一般式(1)で表される化合物またはその誘導体である。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。)
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。)
本発明におけるTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体は、一般式(3)で表される化合物またはその誘導体である。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
本発明のオリゴヌクレオチド保護体の製造方法(合成方法)、および、本発明のTag部分除去方法(置換基除去方法)は、一般式(3)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含むものである。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。)
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。)
1H−NMRスペクトルの測定は、核磁気共鳴装置(日本電子社製、製品名AL400および日本電子社製、製品名ECS−600)を用い、内部標準としてテトラメチルシランを用いて行った。
13C−NMRスペクトルの測定は、核磁気共鳴装置(日本電子社製、製品名AL400および日本電子社製、製品名ECS−600)を用い、内部標準としてテトラメチルシランを用いて行った。
TOF/MSスペクトルの測定は、飛行時間型質量分析計(Waters社製、製品名LCT−PremierXEおよび日本電子社製、製品名JMS T−100LP)を用いて行った。
(A)tert−ブチルエステルを経由する方法
〔実施例1−1〕
(1)3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸2−(tert−ブトキシ)−2−オキソエチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16−1.41(m,84H),1.41−1.57(m,6H),1.49(s,9H),1.66−1.88(m,6H),3.95−4.11(m,6H),4.70(s,2H),7.31(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.02,22.48,22.66,22.83,26.08,26.11,27.88,28.08,29.35,29.40,29.56,29.64,29.65,29.70,29.97,30.22,30.36,31.76,31.93,32.10,61.66,69.35,73.51,82.32,108.69,108.90,123.82,123.93,143.11,143.38,152.93,165.83,166.90.
TOF/MS(ESI):calcd for C67H124O7Na[M+Na]+ 1063.9245,found 1063.9254.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.16−1.54(m,90H),1.69−1.88(m,6H),3.95−4.11(m,6H),4.87(s,2H),7.30(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.68,26.06,26.10,29.36,29.41,29.57,29.65,29.66,29.72,30.35,31.93,60.49,69.30,73.57,108.53,123.31,143.17,152.96,165.74.
TOF/MS(ESI):calcd for C63H116O7Na[M+Na]+ 1007.8619,found 1007.8639.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16−1.41(m,84H),1.41−1.54(m,6H),1.66−1.91(m,6H),3.95−4.08(m,6H),4.86(s,2H),5.23(s,2H),7.24−7.41(m,7H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.71,26.13,26.16,29.40,29.43,29.46,29.62,29.69,29.71,29.76,30.00,30.43,31.98,61.24,67.07,69.40,73.59,108.76,123.69,128.32,128.50,128.65,135.35,143.28,152.96,153.01,165.84,167.77.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.16−1.54(m,93H),1.69−1.88(m,6H),2.42−2.58(m,2H),3.42−3.55(m,2H),3.78(s,6H),3.95−4.05(m,6H),4.18(s,1H),4.82(s,2H),5.56(d,1H,J=5.6Hz),6.40−6.50(m,1H),6.80−6.90(m,4H),7.20−7.40(m,9H),7.61(s,1H),8.03(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.62,14.10,22.71,26.11,26.15,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.40,31.96,37.88,55.28,61.12,63.68,69.35,73.60,83.93,84.40,87.36,108.59,111.66,113.43,123.26,127.29,128.08,128.19,130.10,130.15,135.20,135.25,135.32,144.22,150.11,153.02,158.92,163.16,165.85,167.50.
TOF/MS(ESI):calcd for C94H146N2O13Na [M+Na]+ 1534.0723, found 1534.0759.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.39(m,84H),1.43−1.51(m,6H),1.66(s,1H),1.71−1.85(m,6H),1.95(s,3H),2.36−2.58(m,3H),3.89−3.97(m,2H),3.97−4.08(m,6H),4.15(dd,1H,J=2.0,2.4Hz),4.84(s,2H),5.45−5.53(m,1H),6.20(dd,1H,J=6.0,8.8Hz),7.29(s,2H),7.45(d,1H,J=1.2Hz),8.59(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.58,14.12,22.70,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.67,29.68,29.73,30.35,31.94,36.99,61.12,62.57,69.24,73.58,75.97,84.91,86.46,108.36,111.48,123.17,136.41,143.09,150.29,152.96,163.40,165.91,167.71.
TOF/MS(ESI):calcd for C73H128N2O11Na [M+Na]+ 1231.9416, found 1231.9432.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.55(m,90H),1.65−2.05(m,12H),2.40−2.60(m,4H),2.75−2.90(m,2H),3.84(s,2H),3.95−4.10(m,6H),4.15−4.50(m,6H),4.85(s,2H),5.15−5.25(m,1H),5.35−5.55(m,1H),6.10−6.35(m,2H),7.29(s,2H),7.35(d,1H,J=1.2Hz),7.47(s,1H),9.60−9.95(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.42,12.46,14.10,19.72,19.79,22.71,26.12,26.19,29.38,29.43,29.49,29.63,29.70,29.75,30.43,31.96,36.47,36.56,38.46,61.14,61.91,62.00,62.63,62.68,62.75,62.80,67.53,69.42,73.64,74.66,74.77,78.94,79.12,82.33,82.40,82.48,85.60,85.66,85.79,86.02,86.21,86.35,108.61,111.27,111.33,111.73,111.82,116.58,116.66,123.15,135.87,135.94,136.53,136.62,143.41,150.49,150.59,153.07,163.94,164.02,165.96,167.79,167.83.
TOF/MS(ESI):calcd for C86H144N5O18PNa [M+Na]+ 1589.0142, found 1589.0104.
(4)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
TOF/MS(ESI):m/z3114.3[M−3H]3−,2335.6[M−4H]4−,1868.9[M−5H]5−,1557.6[M−6H]6−.
(5)脱保護、および、精製工程
実施例2−4で合成した化合物(50mg,5.4μmol)に28%アンモニア水(2.1mL)を加えたのち、80℃で1.5時間加熱撹拌した。反応液を減圧下で濃縮したのち、濃縮残渣に0.1mol/L−酢酸トリエチルアミン緩衝液を加えることで析出した不溶物をろ過により除去した。ろ液のC−18カートリッジ精製によって得られた溶出液を乾燥し、目的物であるチミジニル−[3’→5’]デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシグアニジル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−チミジニル−[3’→5’]−デオキシグアニジル−[3’→5’]−チミジニル−[3’→5’]−デオキシグアニジル−[3’→5’]−デオキシアデニリル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシアデニリル−[3’→5’]−チミジニル−[3’→5’]−デオキシグアニジル−[3’→5’]−デオキシシチジニル−[3’→5’]−デオキシアデニリル−[3’→5’]−チミジニル−[3’→5’]−チミジンを得た。
HPLC(shodexODP(4.6Φ×150mm),流速:1.0mL/min,移動:0.1mol/Lトリエチルアミン−酢酸緩衝液、アセトニトリル gradient:0-15min(2to98%アセトニトリル),Rt=3.9min(98.6%)
TOF/MS(ESI):m/z3020.9[M−2H]2−,2013.4[M−3H]3−,1509.8[M−4H]4−.
〔実施例2−6〕
(縮合剤としてEDCI−HClを用いる場合)
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.40(m,84H),1.42−1.50(m,6H),1.71−1.84(m,7H),2.73(dd,1H,J=4.4,12.8Hz),3.04−3.13(m,1H),3.46(d,2H,J=4.0Hz),3.77(s,6H),3.99−4.05(m,6H),4.34−4.37(m,1H),4.86(s,2H),5.67(d,1H,J=5.6Hz),6.51(dd,1H,J=5.6,8.4Hz),6.79(d,2H,J=9.4Hz),7.18−7.29(m,7H),7.31(s,2H),7.38(d,2H,J=7.2Hz),7.53(dd,2H,J=7.2,7.6Hz),7.59−7.63(m,1H),8.03(d,2H,J=7.2Hz),8.17(s,1H),8.74(s,1H),8.98(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,22.71,26.08,26.11,29.33,29.38,29.43,29.60,29.67,29.74,30.36,31.94,38.00,55.23,61.16,63.52,69.23,73.58,84.35,84.48,86.82,108.35,113.25,123.22,123.32,127.03,127.85,127.95,128.08,128.91,129.99,130.04,132.82,133.66,135.38,135.42,141.21,143.07,144.33,149.53,151.56,152.75,152.97,158.63,164.48,165.89,167.38.
TOF/MS(ESI):calcd for C101H149N5O12Na [M+Na]+ 1647.1100, found 1647.1149.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.40(m,84H),1.44−1.50(m,6H),1.71−1.85(m,7H),2.53(dd,1H,J=5.6,14.0Hz),3.21−3.28(m,1H),3.89−3.96(m,1H),3.98−4.06(m,6H),4.36(s,1H),4.87(s,2H),5.70(d,1H,J=5.2Hz),5.91(brs,1H),6.32(dd,1H,J=5.6,10.0Hz),7.32(s,2H),7.54(dd,2H,J=7.2,8.0Hz),7.61−7.65(m,1H),8.03(d,2H,J=7.2Hz),8.07(s,1H),8.79(s,1H),9.07(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.12,22.70,26.07,26.11,29.33,29.37,29.42,29.59,29.67,29.73,30.35,31.94,37.76,61.20,63.17,69.28,73.60,87.18,87.61,108.39,123.17,124.66,127.90,128.96,133.01,133.39,142.42,143.17,150.40,150.68,152.26,153.00,164.42,165.97,167.41.
TOF/MS(ESI):calcd for C80H131N5O10Na [M+Na]+ 1344.9794, found 1344.9828.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12−1.40(m,84H),1.43−1.50(m,6H),1.71−1.85(m,9H),1.94(s,1H),2.22−2.51(m,2H),2.70−2.78(m,3H),3.14−3.26(m,1H),3.45−3.56(m,1H),3.69−3.85(m,2H),3.95−4.07(m,6H),4.07−4.32(m,3H),4.40−4.48(m,3H),4.88(s,2H),4.99−5.11(m,1H),5.67−5.73(m,1H),6.11−6.22(m,1H),6.50−6.58(m,1H),7.30(s,2H),7.41−7.53(m,3H),7.57−7.61(m,1H),8.02−8.06(m,2H),8.38(m,1H),8.81(m,1H),9.58−9.67(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.43,14.14,19.66,19.73,19.78,22.71,26.09,26.15,29.35,29.38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.99,30.38,31.94,36.57,36.87,38.35,61.13,61.84,61.92,62.45,62.49,62.58,62.62,67.39,69.27,73.61,74.81,75.06,78.89,79.19,79.24,82.98,83.05,83.12,84.47,84.54,85.43,85.48,85.62,85.67,85.79,85.93,108.34,111.22,111.27,116.52,116.64,123.01,123.82,124.08,128.27,128.31,128.69,128.72,132.87,132.94,133.17,133.41,136.45,141.68,141.86,143.18,149.93,150.00,150.47,151.84,152.05,152.67,153.01,163.81,163.86,165.43,165.53,165.99,167.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C93H147N8O17PNa [M+Na]+ 1702.0520, found 1702.0604.
(4)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12−1.40(m,90H),1.43−1.50(m,6H),1.71−1.93(m,9H),1.95−2.16(m,2H),2.35−2.87(m,9H),3.16−3.37(m,3H),3.76(s,6H),3.99−4.05(m,6H),4.09−4.43(m,10H),4.86(s,2H),5.07−5.26(m,2H),5.65−5.71(m,1H),5.91−6.22(m,2H),6.49−6.54(m,1H),6.78(d,4H,J=8.4Hz),7.15−7.27(m,8H),7.30(s,2H),7.34−7.36(m,2H),7.43−7.48(m,2H),7.54−7.59(m,1H),7.69−7.71(m,1H),7.98−8.02(m,2H),8.30−8.41(m,1H),8.75−8.82(m,1H),9.43−9.58(m,1H),9.88−10.27(m,1H),12.09−12.22(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.23,12.36,14.13,18.84,19.00,19.05,19.65,19.73,22.70,26.09,26.15,29.35,29.37,29.46,29.61,29.68,29.74,29.77,30.38,31.94,35.89,36.47,36.63,55.26,61.13,62.47,62.63,62.68,63.42,67.55,69.28,73.61,74.86,75.05,79.76,81.43,83.08,83.59,84.68,86.85,108.33,111.11,111.17,113.15,113.26,116.48,116.75,116.88,121.42,121.59,123.03,124.05,127.07,127.12,127.78,127.85,127.98,128.06,128.74,129.14,130.05,132.88,133.37,135.23,139.48,141.92,142.01,143.18,144.23,147.35,148.11,148.27,148.49,149.98,150.09,151.80,152.60,153.01,155.40,155.47,158.62,158.68,164.77,165.20,165.96,167.71,167.74,179.81,180.21.
TOF/MS(ESI):calcd for C131H186N14O26P2Na [M+Na]+ 2456.3036, found 2456.2988.
〔実施例3−5〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.12−1.53(m,90H),1.71−1.85(m,6H),2.36−2.43(m,1H),2.83−2.95(m,1H),3.49(ddd,2H,J=3.2,10.4,18.0Hz),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.95−4.07(m,6H),4.30−4.35(m,1H),4.83(dd,2H,J=16.0,23.6Hz),5.51−5.58(m,1H),6.33(dd,1H,J=6.0,7.6Hz),6.86(dd,4H,J=2.4,8.8Hz),7.20−7.38(m,11H),7.50−7.54(m,2H),7.60−7.64(m,1H),7.88(d,2H,J=7.2Hz),8.14(d,1H,J=7.6Hz),8.40−8.60(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.09,22.70,26.10,26.15,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.40,31.95,39.47,55.26,61.10,63.17,69.33,73.59,75.77,84.68,87.32,108.54,113.46,123.32,127.22,128.10,128.13,129.10,130.04,130.10,133.20,135.13,135.30,144.07,153.01,158.84,165.81,167.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C100H149N3O13Na [M+Na]+ 1623.0988, found 1623.1069.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.20−1.51(m,90H),1.71−1.85(m,6H),2.46−2.53(m,1H),2.69−2.80(m,1H),3.92−4.04(m,8H),4.27(d,1H,J=2.4Hz),4.84(dd,2H,J=16.4,20.4Hz),5.51−5.53(m,1H),6.26(dd,1H,J=5.6,7.6Hz),7.29(s,2H),7.48−7.62(m,4H),7.88(d,2H,J=7.6Hz),8.28(d,1H,J=7.2Hz),8.66−8.91(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,22.71,26.10,26.14,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.39,31.95,38.46,61.15,62.37,69.34,73.61,75.80,85.82,88.44,108.55,123.25,127.61,129.07,133.25,143.25,145.32,153.01,162.38,165.89,167.79.
TOF/MS(ESI):calcd for C79H131N3O11Na [M+Na]+ 1320.9681, found 1320.9723.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.08−1.53(m,96H),1.70−1.84(m,6H),2.36−2.62(m,2H),2.75−3.30(m,7H),3.75−3.87(m,2H),3.98−4.04(m,6H),4.26−4.53(m,6H),4.78−4.89(m,2H),5.26−5.29(m,1H),5.42−5.52(m,1H),5.92−6.11(m,1H),6.24−6.38(m,1H),7.26−7.28(m,2H),7.38−7.67(m,4H),7.80−7.89(m,2H),7.95−8.00(m,1H),8.14−8.24(m,1H),10.22−10.70(m,1H),12.08−12.22(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.96,18.99,19.05,19.81,19.87,22.71,26.08,26.15,29.34,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.37,31.94,36.01,36.06,38.37,38.83,39.11,61.09,62.01,62.59,62.64,62.77,62.82,67.20,67.51,69.25,73.60,74.76,75.03,80.49,83.50,83.75,84.57,84.81,86.32,87.91,88.04,97.29,97.50,108.30,116.55,116.68,120.72,121.05,123.01,127.73,127.80,128.88,128.93,132.71,132.81,133.28,138.19,138.30,143.13,144.20,144.42,147.79,147.99,148.16,148.33,152.99,155.25,155.65,162.86,163.04,165.92,165.95,167.77,167.85,179.77,180.03.
TOF/MS(ESI):calcd for C96H152N9O18PNa [M+Na]+ 1773.0891, found 1773.0914.
(4)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.13−1.55(m,99H),1.71−1.84(m,6H),1.95−2.14(m,2H),2.27−2.95(m,9H),3.00−3.55(m,3H),3.73−3.81(m,6H),3.99−4.04(m,6H),4.14−4.48(m,11H),4.82−4.85(m,2H),5.05−5.53(m,3H),6.00−6.46(m,3H),6.76−6.87(m,4H),7.20−7.36(m,11H),7.44−7.64(m,4H),7.72−7.88(m,3H),8.11−8.22(m,1H),9.00−9.15(m,1H),10.29−10.49(m,1H),12.14−12.17(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.67,11.71,14.13,18.86,18.90,18.94,18.98,19.00,19.59,19.67,19.81,19.88,22.70,26.08,26.15,29.35,29.37,29.46,29.61,29.67,29.74,29.77,30.37,31.94,35.88,38.67,55.29,61.13,62.66,62.73,62.87,63.33,69.25,73.59,84.20,84.28,85.31,87.29,108.31,111.69,111.73,113.15,113.35,116.64,116.79,123.01,127.31,127.71,127.77,128.08,128.99,129.14,130.09,133.33,134.93,134.97,135.01,135.17,143.14,143.96,144.04,147.84,147.93,148.16,150.40,150.48,152.99,155.48,158.83,163.52,165.96,167.86,179.65,179.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C130H186N12O27P2Na [M+Na]+ 2432.2923, found 2432.2937.
〔実施例3−9〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.86−0.89(m,12H),1.03(d,3H,J=6.8Hz),1.11−1.40(m,84H),1.42−1.50(m,6H),1.70−1.83(m,6H),1.95(sept,1H,J=6.8Hz),2.51(dd,1H,J=5.2,12.4Hz),3.17−3.29(m,2H),3.42(dd,1H,J=3.2,10.4Hz),3.76(s,3H),3.77(s,3H),3.98−4.05(m,6H),4.22(s,1H),4.83(s,2H),5.70(d,1H,J=6.0Hz),6.07(dd,1H,J=5.2,9.2Hz),6.76−6.82(m,4H),7.16−7.38(m,9H),7.43−7.50(m,2H),7.71(s,1H),7.73(s,1H),11.96(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,18.64,18.77,22.71,26.05,26.11,29.32,29.37,29.42,29.60,29.66,29.68,29.74,29.75,29.77,30.33,31.94,36.17,37.21,55.24,61.24,63.48,69.30,73.64,76.16,83.94,84.44,86.49,108.33,113.27,113.29,122.34,123.24,127.15,128.02,129.99,135.47,135.77,137.83,143.04,144.70,147.18,148.02,152.94,155.38,158.74,166.00,167.35,178.30.
TOF/MS(ESI):calcd for C98H151N5O13Na [M+Na]+ 1629.1206, found 1629.1240.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.20−1.50(m,96H),1.71−1.85(m,6H),2.48(dd,1H,J=5.6,14.0Hz),2.72(sept,1H,J=6.8Hz),2.97−3.05(m,1H),3.49(brs,2H),3.86−4.05(m,8H),4.26(s,1H),4.86(s,2H),5.59(d,1H,J=6.0),6.13(dd,1H,J=5.6,9.2Hz),7.30(s,2H),7.86(s,2H),8.82(s,1H),12.16(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,18.94,18.97,22.71,26.09,26.15,29.38,29.45,29.61,29.69,29.75,30.39,31.96,36.50,37.85,61.26,62.92,69.43,73.67,86.27,86.34,108.59,122.49,123.26,138.42,143.34,147.09,147.73,153.04,155.01,166.02,167.52,178.69.
TOF/MS(ESI):calcd for C77H133N5O11Na [M+Na]+ 1326.9899, found 1326.9879.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.05−1.52(m,96H),1.71−1.89(m,9H),2.24−2.78(m,8H),3.38−3.49(m,1H),3.69−4.05(m,8H),4.17−4.89(m,7H),5.20−5.29(m,1H),5.55−5.66(m,1H),6.08−6.24(m,2H),7.30(s,2H),7.42−7.54(m,1H),7.68−7.73(m,1H),8.64−8.83(m,1H),10.20−10.32(m,1H),12.11−12.22(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.46,14.14,18.59,18.93,19.06,19.42,19.66,19.71,19.73,19.78,22.71,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.36,31.94,35.57,35.93,38.42,61.12,61.24,61.71,61.89,62.56,62.64,62.69,69.26,73.62,75.69,75.81,79.29,82.80,85.73,86.04,86.41,108.29,111.23,111.32,116.46,116.51,122.39,122.98,123.03,136.55,136.78,139.04,143.11,143.18,147.93,147.98,150.30,150.37,152.98,155.39,155.59,163.53,163.62,166.00,166.12,167.69,167.86,179.92,180.04.
TOF/MS(ESI):calcd for C90H149N8O18PNa [M+Na]+ 1684.0625, found 1684.0648.
(4)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.4Hz),1.05−1.53(m,96H),1.71−1.88(m,13H),2.24−2.87(m,10H),3.25−3.53(m,3H),3.72−3.81(m,7H),3.95−4.05(m,6H),4.05−4.72(m,10H),4.81−4.91(m,2H),5.03−5.24(m,2H),5.55−5.61(m,1H),5.95−6.43(m,3H),6.82−6.85(m,4H),7.18−7.37(m,12H),7.53(s,1H),7.73(s,1H),9.10−9.31(m,2H),10.05−10.09(m,1H),12.18(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.68,11.72,12.33,12.37,14.14,18.78,18.88,19.13,19.24,19.58,19.65,19.70,19.77,22.70,26.08,26.16,29.34,29.38,29.46,29.62,29.68,29.74,29.77,30.36,31.94,35.84,35.99,37.65,38.95,55.29,61.18,62.62,62.77,62.83,63.26,67.10,67.45,69.27,73.63,75.55,79.91,82.62,82.87,84.27,87.31,108.29,111.50,111.80,113.15,113.35,116.66,116.74,116.86,122.51,122.59,123.07,127.32,128.08,128.13,129.13,130.13,134.95,135.12,136.32,138.75,143.10,143.99,147.93,147.97,148.04,150.28,150.37,150.60,150.69,152.98,155.49,155.54,158.81,163.63,163.68,163.79,166.02,167.69,167.71,179.73,179.77.
TOF/MS(ESI):calcd for C124H183N11O27P2Na [M+Na]+ 2343.2658, found 2343.2742.
〔実施例3−13〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.2Hz),1.00−1.41(m,90H),1.41−1.54(m,6H),1.71−1.85(m,6H),1.92−2.00(m,3H),2.24−2.97(m,6H),3.68−4.08(m,8H),4.14−4.54(m,6H),4.78−4.92(m,2H),5.14−5.78(m,2H),5.95−6.24(m,2H),7.27−7.43(m,3H),7.87−7.95(m,1H),10.19−10.49(m,2H),12.24−12.38(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.35,14.14,19.01,19.06,19.10,19.73,19.80,19.85,22.70,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.02,30.36,31.77,31.94,35.80,35.92,36.62,38.19,38.48,61.05,61.13,62.26,62.44,62.49,62.70,62.75,66.12,67.37,69.21,73.58,74.51,80.47,80.64,82.33,82.40,85.33,85.52,86.12,86.55,86.84,87.31,108.24,111.24,112.18,116.50,116.83,121.43,121.59,123.05,123.08,136.55,137.73,138.66,138.99,143.02,143.06,147.75,147.78,148.49,150.42,151.06,152.96,152.97,155.23,155.27,164.76,164.83,165.92,165.96,167.73,167.80,180.26,180.45.
TOF/MS(ESI):calcd for C90H149N8O18PNa [M+Na]+ 1684.0625, found 1684.0643.
(2)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.13−1.47(m,96H),1.71−2.01(m,15H),2.35−2.85(m,10H),3.31−3.51(m,2H),3.78(s,6H),3.96−4.04(m,6H),4.05−4.59(m,10H),4.84(s,2H),5.13−5.55(m,3H),6.11−6.42(m,3H),6.83(d,4H,J=8.8Hz),7.16−7.37(m,12H),7.45−7.55(m,1H),7.72−7.80(m,1H),9.23−10.39(m,3H),12.15−12.21(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.70,12.39,12.45,14.14,18.82,18.86,19.04,19.08,19.58,19.65,19.74,19.80,22.70,26.08,26.15,29.34,29.38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.77,30.37,31.94,35.89,36.13,36.52,38.68,55.29,61.12,62.74,62.89,63.22,63.32,67.12,69.23,73.60,74.76,79.03,79.98,82.49,84.28,85.14,87.28,108.26,111.37,111.49,111.69,111.72,113.14,113.34,116.74,116.84,116.92,121.89,121.96,123.02,127.08,127.31,127.76,127.85,128.08,129.13,130.11,134.94,134.99,135.03,135.20,135.30,136.93,138.26,139.46,143.07,143.96,144.04,147.98,148.02,148.14,148.23,150.46,150.57,150.62,152.97,155.42,158.60,158.79,163.79,164.43,164.50,165.96,167.79,179.87,179.95.
TOF/MS(ESI):calcd for C124H183N11O27P2Na [M+Na]+ 2343.2658, found 2343.2693.
2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−チミジン−3’−イル)ホスホロチオイル)−チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.53(m,93H),1.72−1.84(m,6H),1.92−1.95(m,3H),2.28−2.49(m,3H),2.57−2.66(m,2H),2.77(dd,1H,J=6.0,7.2Hz),3.39−3.50(m,2H),3.79(s,6H),3.97−4.04(m,6H),4.09−4.40(m,6H),4.83(d,2H,J=6.8Hz),5.31−5.43(m,2H),6.27−6.32(m,1H),6.35−6.41(m,1H),6.82−6.86(m,4H),7.22−7.32(m,10H),7.37−7.39(m,2H),7.56(s,1H),8.69−8.91(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.79,12.58,14.14,19.31,19.40,19.47,19.55,22.70,26.07,26.13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,36.78,39.00,55.29,61.06,62.65,62.69,62.90,62.94,63.21,67.63,69.19,73.56,75.01,75.09,80.18,82.27,82.36,84.40,84.53,84.91,85.39,87.31,108.25,111.74,111.90,113.37,116.15,116.39,123.06,127.28,128.05,128.11,130.09,134.97,135.03,135.06,135.30,143.01,144.04,150.22,150.27,150.35,152.94,158.78,163.36,163.46,165.86,165.88,167.71,167.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C107H162N5O19PSNa[M+Na]+ 1907.1220,found 1907.1223.
〔実施例4−1〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸N4−ベンゾイル−5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−O−メチルシチジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.38(m,84H),1.42−1.50(m,6H),1.70−1.85(m,6H),3.48(d,1H,J=11.6Hz),3.62(s,3H),3.69(d,1H,J=11.2Hz),3.71(s,1H),3.83(s,5H),3.97−4.04(m,6H),4.18(d,1H,J=4.8Hz),4.36(d,1H,J=8.4Hz),4.80−4.89(m,2H),5.29(dd,1H,J=4.8Hz,8.4Hz),6.11(d,1H,J=1.6Hz),6.90(dd,4H,J=2.0,8.8Hz),7.27−7.42(m,11H),7.52(t,2H,J=7.6Hz),7.62(t,1H,J=7.6Hz),7.89(d,2H,J=7.6Hz),8.55(d,1H,J=6.4Hz),8.61−8.72(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,22.70,26.07,26.09,26.11,29.31,29.38,29.43,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,52.31,55.24,59.15,60.47,60.72,61.06,69.14,70.07,73.53,80.42,82.21,87.49,88.91,108.22,113.43,123.33,123.50,127.27,127.49,128.17,129.06,130.06,130.08,133.17,135.07,135.22,142.85,143.86,152.87,152.90,158.75,165.64,165.84,167.17,168.42.
TOF/MS(ESI):calcd for C101H151N3O14Na[M+Na]+ 1653.1094,found 1653.1171.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.55(m,90H),1.70−1.85(m,6H),3.51(s,3H),3.79−3.83(m,2H),3.95−4.08(m,7H),4.34(d,1H,J=4.8Hz),4.50(t,1H,J=4.8Hz),4.83−4.90(m,2H),5.44(t,1H,J=4.8Hz),5.73(d,1H,J=4.4Hz),7.29−7.30(m,2H),7.47−7.66(m,3H),7.90(d,2H,J=7.6Hz),8.16(d,1H,J=7.6Hz),8.75−9.00(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,22.71,26.07,26.11,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,52.32,59.19,60.97,61.07,61.24,69.15,69.20,71.18,73.56,80.58,83.43,92.64,108.28,123.20,123.50,127.61,129.09,132.80,133.36,142.99,147.07,152.87,152.93,162.63,165.85,167.66,168.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C80H133N3O12Na[M+Na]+1350.9787,found 1350.9855.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸N4−ベンゾイル−5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−O−メチルウリジン−3’−イル)ホスホリル)−2’−O−メチルシチジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.53(m,90H),1.71−1.83(m,6H),2.50−2.74(m,1H),2.79(t,1H,J=6.4Hz),3.46−3.76(m,8H),3.77(s,3H),3.79(s,3H),3.97−4.04(m,6H),4.11−4.58(m,7H),4.82−4.95(m,2H),5.13−5.30(m,3H),5.86−6.08(m,2H),6.82−6.88(m,4H),7.23−7.36(m,11H),7.51(t,2H,8.0Hz),7.61(t,1H,J=7.2Hz),7.82−8.05(m,4H),8.69−8.96(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,19.52,19.58,22.70,26.07,26.13,29.33,29.38,29.45,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,55.25,55.30,58.84,59.27,60.82,61.14,62.35,62.40,62.68,62.73,65.55,66.16,69.19,69.90,70.16,73.56,74.28,74.38,79.38,79.46,79.52,79.60,81.32,81.38,81.52,82.19,86.71,86.87,87.46,90.07,90.64,102.58,102.62,108.24,113.34,113.36,116.36,116.43,123.19,127.39,127.44,127.64,128.10,128.12,128.26,128.29,129.04,130.21,130.27,130.30,133.28,134.64,134.73,139.53,139.75,142.96,143.82,143.90,150.02,150.07,152.93,158.81,158.84,158.86,162.70,162.73,165.77,165.81,167.22,167.26.
TOF/MS(ESI):calcd for C114H167N6O22PNa[M+Na]+2026.1769,found 2026.1764.
〔実施例4−4〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−フルオロ−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.81(d,3H,J=6.8Hz),0.88(t,9H,J=6.8Hz),0.94(d,3H,J=7.2Hz),1.10−1.53(m,90H),1.70−1.87(m,6H),1.93(sept,1H,J=6.8Hz),3.17(d,1H,J=11.2Hz),3.59(d,1H,J=11.2Hz),3.77(s,6H),3.97−4.05(m,6H),4.32−4.34(m,1H),4.85(d,1H,J=16.0Hz),4.92(d,1H,J=16.0Hz),5.92−6.07(m,2H),6.18−6.24(m,1H),6.78(dd,4H,J=5.2,8.8Hz),7.16−7.29(m,7H),7.30(s,2H),7.36(d,2H,J=8.0Hz),7.79(s,1H),8.01(s,1H),11.92(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.39,18.47,18.88,18.91,22.70,25.61,26.06,26.11,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,36.25,36.43,55.24,55.25,60.68,60.84,61.24,67.98,69.25,70.85,71.00,73.61,79.97,81.44,83.15,86.36,86.47,86.67,90.96,108.26,113.15,113.22,122.23,123.17,127.08,127.13,127.76,127.85,127.89,127.98,129.13,129.85,129.92,135.20,135.66,138.43,138.70,139.43,143.05,144.47,147.30,147.34,147.47,147.90,152.93,152.96,155.04,155.31,158.62,158.69,165.65,165.89,167.23,167.60,178.18,178.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C98H150N5O13F[M+H]+1623.1136,found 1623.1160.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.55(m,96H),1.70−1.85(m,6H),2.71(sept,1H,J=6.8Hz),3.37−3.72(brs,2H),3.80(d,1H,J=11.6Hz),3.99−4.05(m,7H),4.34(d,1H,J=4.0Hz),4.94(s,2H),5.69(dt,1H,J=4.4,52.0Hz),5.78−5.84(m,1H),5.97(dd,1H,J=4.0,16.0Hz),7.31(s,2H),7.90(s,1H),9.22(s,1H),12.15(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.85,18.95,22.70,26.06,26.11,29.30,29.38,29.43,29.60,29.68,29.74,30.33,31.94,36.32,60.86,69.24,71.25,71.39,73.60,82.89,87.22,87.55,89.60,91.55,108.27,121.56,123.15,138.45,142.99,147.29,148.08,152.91,155.03,165.91,167.26,179.15.
TOF/MS(ESI):calcd for C77H132N5O11FNa[M+Na]+1344.9805,found 1344.9834.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−フルオロデオキシウリジン−3’−イル)ホスホリル)−2’−フルオロ−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):0.88(t,9H,J=7.2Hz),0.97−1.53(m,96H),1.71−1.83(m,6H),2.56−2.75(m,3H),3.37−3.66(m,2H),3.74−3.79(m,6H),3.97−4.55(m,12H),4.78−5.08(m,2H),5.08−5.50(m,3H),5.70−6.01(m,4H),6.80−6.84(m,4H),7.17−7.40(m,11H),7.57−7.73(m,2H),8.94−9.07(m,1H),10.00(s,1H),12.18−12.26(m,1H).
δ13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.51,18.76,18.92,19.20,19.55,19.62,22.70,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.60,29.68,29.74,30.36,31.94,35.90,35.99,55.23,55.30,60.70,60.88,62.85,69.26,73.61,79.54,79.63,87.17,87.21,102.93,108.31,113.31,116.34,116.52,122.55,122.61,122.95,122.98,127.25,127.31,128.07,128.10,130.14,134.79,134.88,134.92,138.65,140.55,143.15,143.19,143.92,144.02,147.71,147.74,148.30,148.43,149.68,149.98,152.98,152.99,155.30,155.48,158.74,158.79,162.67,165.89,166.00,167.20,179.68.
TOF/MS(ESI):calcd for C110H163N8O20F2PNa[M+Na]+2008.1587,found 2008.1593.
〔実施例4−7〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.08(s,3H),0.11(s,3H),0.81−0.92(m,18H),1.04−1.53(m,90H),1.70−1.84(m,6H),3.49(dd,2H,J=10.8,27.6Hz),3.79(s,6H),3.79−4.04(m,6H),4.26−4.27(m,1H),4.56(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,J=16.0Hz),4.96(d,1H,16.4Hz),5.30(d,1H,J=8.0Hz),5.47(t,1H,J=4.0Hz),6.02(d,1H,J=5.6Hz),6.85(d,4H,J=8.4Hz),7.23−7.37(m,11H),7.85(d,1H,J=8.4Hz),8.37(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ−5.22,−5.09,14.14,17.87,22.71,25.51,26.07,26.11,29.30,29.38,29.43,29.59,29.67,29.74,30.34,31.94,55.25,60.75,62.47,69.14,73.36,73.54,74.40,81.20,87.58,88.03,102.56,108.25,113.40,113.43,123.33,127.33,128.03,128.14,130.03,130.17,134.71,134.83,140.00,142.87,144.10,150.14,152.89,158.78,158.83,162.59,165.67,167.10.
TOF/MS(ESI):calcd for C99H158N2O14SiNa[M+Na]+1650.1380,found 1650.1455.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.04(s,3H),0.07(s,3H),0.81−0.92(m,18H),1.11−1.53(m,90H),1.70−1.85(m,6H),2.95−3.10(brs,1H),3.77−3.82(m,1H),3.93−4.04(m,7H),4.25−4.28(m,1H),4.67(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,16.0Hz),4.96(d,1H,16.0Hz),5.34(dd,1H,J=3.2,4.8Hz),5.60(d,1H,J=5.6Hz),5.76(d,1H,J=8.0Hz),7.29(s,2H),7.63(d,1H,J=8.0Hz),8.71(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ−5.22,−5.19,14.14,17.88,22.71,25.52,26.07,26.10,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,31.94,60.84,61.84,69.20,72.78,73.24,73.57,82.99,92.46,102.70,108.32,123.24,141.88,142.99,150.17,152.92,162.72,165.78,167.38.
TOF/MS(ESI):calcd for C78H140N2O12SiNa[M+Na]+1348.0073,found 1348.0115.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジン−3’−イル)ホスホリル)−2’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.03−0.13(m,12H),0.86−0.90(m,27H),1.02−1.53(m,90H),1.68−1.84(m,6H),2.45−2.69(m,1H),2.73(t,1H,J=6.0Hz),3.48(d,1H,J=10.8Hz),3.60−3.68(m,1H),3.76−3.84(m,6H),3.97−4.04(m,6H),4.10−4.58(m,8H),4.73−4.84(m,1H),4.90−5.03(m,2H),5.20−5.25(m,2H),5.67−5.78(m,2H),5.95−6.03(m,1H),6.80−6.89(m,4H),7.21−7.44(m,12H),7.84(d,1H,J=8.0Hz),8.72−8.83(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ−5.27,−5.24,−5.07,−4.94,−4.92,14.14,17.86,18.06,19.50,19.57,19.65,22.70,25.50,25.55,25.60,26.07,26.13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.74,30.35,31.94,55.27,55.30,60.69,61.96,62.37,62.42,62.58,62.63,69.19,71.39,71.60,72.86,73.00,73.57,74.47,79.43,79.51,81.75,87.65,87.68,87.99,88.18,90.56,91.22,102.54,102.64,103.05,103.13,108.28,113.39,116.31,116.40,123.21,127.43,128.13,128.21,128.25,130.25,130.27,130.32,134.56,134.65,134.70,134.73,139.84,140.05,140.15,142.97,143.01,143.92,143.97,149.95,150.19,150.40,152.92,158.83,158.87,162.53,162.58,162.69,165.64,165.68,167.05,167.12.
TOF/MS(ESI):calcd for C117H186N5O22Si2PNa[M+Na]+2123.2763,found 2123.2769.
〔実施例5−1〕
(1)3−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン酸tert−ブチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,99H),1.70−1.85(m,6H),2.68(t,2H,J=6.4Hz),3.95−4.05(m,6H),4.53(t,2H,J=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.08,22.68,26.08,28.09,29.35,29.40,29.57,29.65,29.71,30.35,31.93,35.42,60.72,69.25,73.51,80.97,108.19,124.57,152.84,166.14,169.93.
TOF/MS(ESI):calcd for C68H126O7Na[M+Na]+ 1077.9401,found 1077.9427.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,90H),1.70−1.85(m,6H),2.85(t,2H,J=6.6Hz),3.95−4.10(m,6H),4.57(t,2H,J=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.10,22.71,26.10,26.13,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.38,31.96,33.54,59.99,69.34,73.57,108.35,124.32,142.88,152.91,166.17.
TOF/MS(ESI):calcd for C64H118O7Na [M+Na]+ 1021.8775,found 1021.8817.
〔実施例5−3〕
(1)2−(N−メチル−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸tert−ブチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,99H),1.70−1.85(m,6H),3.04(s,3H),3.80−4.20(m,8H),6.63(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.01,22.66,26.13,26.15,28.16,29.35,29.42,29.48,29.65,29.71,30.39,31.93,69.51,73.52,82.02,106.19,130.61,139.93,153.25,168.33,172.01.
TOF/MS(ESI):calcd for C68H127NO6Na[M+Na]+ 1076.9561,found 1076.9591.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,90H),1.70−1.85(m,6H),3.11(s,3H),3.85−4.35(m,8H),6.15−6.30(brs,1H),6.66(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.05,22.67,26.12,29.36,29.43,29.61,29.66,29.72,29.98,30.36,31.93,39.20,50.02,69.49,73.56,106.47,129.16,140.27,152.97,153.24,172.11,172.92.
TOF/MS(ESI):calcd for C64H118NO6[M−H]− 996.8959,found 996.8947.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,99H),1.70−1.85(m,6H),2.55(t,2H,J=5.8Hz),3.66(q,2H,J=6.0Hz),3.95−4.05(m,6H),6.72(t,1H,J=6.0Hz),6.94(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.09,22.71,26.11,28.16,29.38,29.43,29.61,29.68,29.74,30.36,31.95,35.18,35.58,69.45,73.53,81.19,105.86,129.57,141.32,153.14,167.20,172.27.
TOF/MS(ESI):calcd for C68H127NO6Na[M+Na]+ 1076.9561,found 1076.9579.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz),1.15−1.55(m,90H),1.65−1.85(m,6H),2.74(t,2H,J=5.8Hz),3.72(t,2H,J=5.8Hz),3.90−4.05(m,6H),6.95(s,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.06,22.71,26.16,26.19,29.40,29.50,29.53,29.65,29.71,29.77,30.44,31.98,33.68,35.85,39.37,69.77,73.67,106.51,128.33,142.29,153.35,168.43,175.46.
TOF/MS(ESI):calcd for C64H118NO6[M−H]− 996.8959,found 996.8912.
〔実施例5−7〕
(1)3−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン酸チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15−1.55(m,90H),1.65−1.85(m,7H),1.92(s,3H),2.30−2.40(m,1H),2.45−2.55(m,1H),2.60−2.70(m,1H),2.80−2.90(m,2H),3.85−3.95(m,2H),3.95−4.05(m,6H),4.05−4.10(m,1H),4.55−.65(m,2H),5.40−5.55(m,1H),6.10−6.20(m,1H),7.22(s,2H),7.41(s,1H),8.58−8.64(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.57,14.14,22.71,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.67,29.74,30.02,30.34,31.94,34.16,36.90,60.05,62.58,69.24,73.54,75.25,85.10,86.67,108.06,111.42,124.14,136.56,142.69,150.26,152.87,163.40,166.10,170.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C74H130N2O11Na[M+Na]+ 1245.9572,found 1245.9548.
(2)3−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.38(m,84H),1.41−1.50(m,9H),1.70−1.83(m,7H),1.91(s,3H),2.30−2.46(m,3H),2.62−2.68(m,2H),2.75(t,1H,J=6.0Hz),2.84(dd,2H,J=4.8,6.4Hz),3.37−3.42(m,1H),3.50−3.55(m,1H),3.79(s,6H),3.98−4.02(m,6H),4.12−4.38(m,6H),4.56(dd,2H,J=4.8,7.2Hz),5.16−5.20(m,1H),5.28−5.35(m,1H),6.21−6.26(m,1H),6.38−6.44(m,1H),6.84(d,4H,J=7.6Hz),7.21−7.32(m,10H),7.34−7.37(m,2H),7.50−7.59(m,1H),8.91−9.06(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.72,12.46,14.13,19.59,19.66,19.75,22.70,26.08,26.15,29.37,29.46,29.61,29.67,29.74,30.36,31.94,33.94,36.62,38.95,55.29,59.89,59.93,62.39,62.45,62.54,62.59,63.23,67.62,69.27,73.55,74.09,79.77,79.82,79.87,79.92,82.52,84.29,84.34,84.46,84.53,85.36,85.57,87.34,108.14,111.70,111.82,113.36,116.17,116.36,124.17,127.34,128.08,128.14,130.13,134.94,135.03,135.07,135.35,135.49,142.74,143.97,143.99,150.23,150.27,150.38,150.46,152.89,158.84,163.40,163.50,166.14,170.29,170.34.
TOF/MS(ESI):calcd for C108H164N5O20PNa[M+Na]+ 1905.1605,found 1905.1636.
〔実施例5−9〕
(1)2−(N−メチル−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15−1.55(m,93H),1.65−1.90(m,6H),2.35−2.60(m,2H),3.08(s,3H),3.45−3.55(m,2H),3.79(s,6H),3.85−4.00(m,6H),4.10−4.40(m,3H),5.50−5.60(m,1H),6.40−6.50(m,1H),6.65(s,2H),6.80−6.90(m,4H),7.20−7.40(m,9H),7.62(s,1H),8.36(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.64,14.07,22.71,26.17,29.38,29.48,29.65,29.70,29.75,30.41,31.97,38.01,55.30,63.79,69.54,73.58,76.72,84.09,84.54,87.42,106.36,111.64,113.49,127.31,128.09,128.26,129.90,130.15,135.30,135.38,140.18,144.29,150.20,153.29,159.01,163.21,168.70,172.20.
TOF/MS(ESI):calcd for C95H149N3O12Na[M+Na]+ 1547.1039,found 1547.1042.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.05−1.55(m,90H),1.65−1.85(m,6H),1.92(s,3H),2.30−2.60(m,3H),3.09(s,3H),3.85−4.05(m,8H),4.05−4.35(m,3H),5.45(s,1H),6.05−6.30(brs,1H),6.64(s,2H),7.44(s,1H),8.28(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.50,14.08,22.71,26.17,29.38,29.47,29.51,29.65,29.70,29.75,30.41,31.97,37.20,39.06,62.67,69.59,73.60,75.74,85.09,86.62,106.33,111.45,129.86,136.38,140.23,150.26,153.33,163.22,168.96,172.29.
TOF/MS(ESI):calcd for C74H131N3O10Na[M+Na]+ 1244.9732,found 1244.9786.
(3)2−(N−メチル−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.6Hz),1.05−1.55(m,93H),1.65−1.85(m,6H),1.91(s,3H),2.30−2.55(m,3H),2.60−2.80(m,3H),3.08(s,3H),3.35−3.45(m,1H),3.50−3.60(m,1H),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90−4.05(m,6H),4.10−4.45(m,8H),5.10−5.20(m,1H),5.30−5.45(m,1H),6.10−6.30(brs,1H),6.35−6.45(m,1H),6.64(s,2H),6.75−6.90(m,4H),7.15−7.40(m,10H),7.49(d,1H,J=6.4Hz),8.50−8.75(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.76,12.41,12.46,14.07,19.63,19.70,19.78,19.85,22.70,26.20,29.37,29.50,29.52,29.70,29.75,29.79,30.43,31.96,36.86,38.50,39.03,55.30,55.34,61.99,62.10,62.50,62.55,62.63,63.33,67.69,69.61,69.64,73.60,74.61,79.78,81.51,82.43,84.41,84.52,84.57,85.65,85.88,86.36,87.47,106.43,111.40,111.78,111.83,111.89,113.31,113.50,116.07,116.42,127.09,127.38,127.86,128.11,128.27,129.21,130.20,135.07,135.18,135.45,135.54,136.37,139.66,140.30,144.12,147.51,150.16,150.21,150.26,150.38,153.30,158.81,159.03,163.33,168.90,172.25,172.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C108H165N6O19PNa[M+Na]+ 1904.1765,found 1904.1780.
〔実施例5−12〕
(1)3−(3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15−1.55(m,93H),1.60−1.85(m,6H),2.40−2.55(m,2H),2.65−2.75(m,2H),3.40−3.55(m,2H),3.65−3.75(m,2H),3.78(s,6H),3.95−4.05(m,6H),4.14(d,1H,J=1.6Hz),5.47(d,1H,J=4.8Hz),6.42(t,1H,J=6.2Hz),6.59(t,1H,J=6.0Hz),6.80−6.90(m,4H),6.94(s,2H),7.20−7.45(m,9H),7.60(s,1H),8.43(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.62,14.14,22.71,26.11,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.33,31.94,34.05,35.35,37.92,55.24,63.65,69.36,73.51,75.85,83.94,84.34,87.24,105.67,111.65,113.15,113.32,127.26,127.76,127.85,128.06,128.10,129.12,130.04,130.08,135.03,135.24,135.35,141.26,144.12,150.23,153.10,158.78,163.39,167.36,172.25.
TOF/MS(ESI):calcd for C95H149N3O12Na[M+Na]+ 1547.1039,found 1547.1014.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15−1.55(m,90H),1.65−1.85(m,6H),1.91(s,3H),2.30−2.55(m,2H),2.55−2.75(m,3H),3.65−3.75(m,2H),3.85−3.95(m,2H),3.95−4.05(m,6H),4.05−4.10(m,1H),5.35−5.40(m,1H),6.16(dd,1H,J=6.0,8.4Hz),6.55−6.65(m,1H),6.95(s,2H),7.43(s,1H),8.25−8.55(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.51,14.09,22.71,26.13,26.16,29.38,29.47,29.62,29.69,29.75,29.99,30.38,31.96,34.26,35.57,37.12,62.57,69.57,73.59,75.09,85.06,86.65,106.04,111.41,129.08,136.51,141.64,150.33,153.20,163.40,167.46,172.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C74H131N3O10Na[M+Na]+ 1244.9732,found 1244.9789.
(3)3−(3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.15−1.55(m,93H),1.65−1.85(m,7H),1.90(d,3H,J=1.2Hz),2.25−2.55(m,3H),2.55−2.80(m,5H),3.30−3.45(m,1H),3.50−3.60(m,1H),3.60−3.75(m,2H),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90−4.05(m,6H),4.05−4.40(m,6H),5.10−5.25(m,1H),5.30−5.40(m,1H),6.15−6.25(m,1H),6.40−6.50(m,1H),6.75−6.90(m,4H),6.99(d,2H,J=3.6Hz),7.20−7.40(m,9H),7.50−7.60(m,1H),8.95−9.05(m,1H),9.05−9.15(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.72,12.49,14.14,19.59,19.67,19.75,22.71,26.11,26.14,29.38,29.47,29.63,29.69,29.75,29.78,30.35,31.94,34.03,35.53,35.58,36.64,38.95,55.29,62.36,62.41,62.52,62.57,63.24,67.60,69.38,73.53,73.84,79.90,82.35,82.44,84.25,84.32,84.39,85.48,85.67,87.35,105.86,111.64,111.74,111.88,113.14,113.35,116.25,116.44,127.34,127.76,127.85,128.09,129.03,129.13,130.13,134.91,134.95,135.00,135.07,135.48,135.61,141.22,143.93,143.97,150.21,150.26,150.46,150.49,153.03,158.83,163.48,163.53,167.47,167.51,172.19.
TOF/MS(ESI):calcd for C108H165N6O19PNa[M+Na]+ 1904.1765,found 1904.1807.
〔実施例6−1〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(6−(チミン−1−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.11−1.53(m,91H),1.68−1.83(m,6H),1.84(s,3H),3.13(d,1H,J=12.0Hz),3.37(d,1H,J=11.2Hz),3.98−4.04(m,6H),4.17(d,2H,J=5.2Hz),4.37−4.41(m,1H),4.78(s,2H),6.13(dd,1H,J=2.0,9.6Hz),7.00(s,1H),7.15−7.26(m,3H),7.26−7.38(m,8H),7.34−7.58(m,6H),8.34(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.45,14.13,22.70,26.07,26.11,29.32,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.35,31.94,49.01,51.85,60.89,65.08,69.19,73.55,74.58,80.50,108.31,110.68,123.33,126.64,127.97,129.13,135.33,142.95,149.63,152.91,163.23,165.75,167.64.
TOF/MS(ESI):calcd for C92H143N3O10Na[M+Na]+ 1473.0671,found 1473.0629.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.39(m,84H),1.42−1.50(m,6H),1.70−1.83(m,6H),1.87(s,3H),2.95−3.16(m,2H),3.42(d,1H,J=11.2Hz),3.62−3.75(m,1H),3.95−4.05(m,6H),4.31(d,1H,J=8.4Hz),4.46(d,2H,J=10.0Hz),4.86(s,2H),6.17(d,1H,J=9.6Hz),7.25(s,1H),7.30(s,2H),10.15−10.75(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.48,14.13,22.71,26.09,26.15,29.35,29.39,29.47,29.63,29.69,29.75,29.78,30.38,31.94,43.24,44.99,60.87,63.56,69.21,72.38,73.57,108.30,112.18,114.99,117.90,123.12,134.33,143.10,150.40,152.99,162.55,162.90,163.78,166.02,167.45.
TOF/MS(ESI):calcd for C73H129N3O10−CF3COOH[M−H]− 1320.9528,found 1320.9517.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(4−(((6−(N6−ベンゾイルアデニン−9−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)−6−(チミン−1−イル)モルホリン−2−イル)メチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.53(m,90H),1.55−1.97(m,12H),2.46(d,3H,J=10.4Hz),2.63(d,3H,J=9.6Hz),2.46−2.63(m,1H),3.12−3.60(m,4H),3.75−4.07(m,10H),4.15−4.50(m,2H),4.78−4.91(m,2H),5.41−5.53(m,1H),6.42(d,1H,J=10.4Hz),7.12−7.20(m,4H),7.20−7.32(m,9H),7.40−7.58(m,8H),8.05(d,2H,J=7.6Hz),8.07−8.10(m,1H),8.68−8.80(m,1H),9.50−9.76(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.44,12.53,14.14,22.70,26.08,26.12,29.32,29.38,29.43,29.60,29.68,29.73,30.35,31.94,36.47,36.51,36.63,36.67,44.56,44.84,47.02,48.64,48.78,52.81,53.10,60.93,64.23,65.34,65.69,69.19,73.56,74.90,74.97,75.34,79.53,79.61,79.97,80.79,108.27,110.92,111.25,122.82,123.26,126.65,128.00,128.22,128.29,128.57,128.63,129.16,132.47,132.57,133.49,133.92,134,74,134.80,140.75,140.78,142.97,143.00,149.31,149.68,149.82,150.12,150.89,151.40,152.65,152.77,152.92,152.94,163.62,165.02,165.23,165.82,165.84,167.56,167.63.
TOF/MS(ESI):calcd for C111H165N10O14PNa[M+Na]+ 1916.2142,found 1916.2216.
〔実施例6−4〕
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(6−(N2−イソブチリルグアニン−9−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.10−1.60(m,97H),1.70−1.90(m,7H),2.64(sept,1H),3.18(d,1H,J=12.0Hz),3.45(d,1H,J=11.6Hz),3.95−4.15(m,6H),4.13−4.25(m,2H),4.37−4.46(m,1H),4.72(d,1H,J=16.0Hz),4.84(d,1H,J=16.0Hz),5.89(dd,1H,J=2.2,9.8Hz),7.06−7.37(m,12H),7.39−7.55(m,5H),7.61(s,1H),8.18(s,1H),11.92(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.14,18.93,19.03,22.71,26.07,26.12,29.33,29.37,29.42,29.60,29.67,29.74,30.35,31.94,36.64,49.04,52.24,60.90,65.03,69.25,73.58,74.22,80.36,108.38,121.30,123.27,126.69,127.96,129.18,136.12,143.08,147.32,147.42,152.95,155.36,165.98,167.61,177.85.
TOF/MS(ESI):calcd for C96H148N6O10Na[M+Na]+ 1568.1155,found 1568.1176.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.87(t,9H,J=6.8Hz),1.00−1.53(m,96H),1.69−1.88(m,6H),2.72−2.88(m,1H),3.19−3.38(m,1H),3.44−3.63(m,1H),3.75−4.13(m,8H),4.25−4.63(m,3H),4.69−4.94(m,2H),6.06−6.31(m,1H),7.20−7.30(m,3H),7.87−8.06(m,1H),10.19−10.63(brs,1H),12.19−12.63(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.12,18.92,22.70,26.09,26.16,29.35,29.38,29.47,29.63,29.68,29.75,29.79,30.04,30.38,31.94,36.17,42.86,60.73,63.62,69.21,71.44,73.57,108.29,115.13,118.04,123.10,143.09,148.28,152.95,156.00,165.93,167.50,180.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C77H134N6O10−CF3COOH[M−H]− 1416.0012,found 1415.9960.
(3)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(4−(((6−(N4−ベンゾイルシトシン−1−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)−6−(N2−イソブチリルグアニン−9−イル)モルホリン−2−イル)メチルの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz),1.00−1.56(m,96H),1.69−1.88(m,9H),2.38−2.97(m,8H),3.06−3.69(m,5H),3.75−4.56(m,12H),4.69−4.94(m,2H),5.34−5.63(m,1H),6.28−6.50(m,1H),7.13−8.00(m,23H),8.69−8.94(brs,1H),9.31−9.63(brs,1H),10.06−10.31(brs,1H),12.13−12.31(m,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ14.13,19.01,19.04,19.17,19.22,22.70,26.07,26.12,29.32,29.37,29.43,29.60,29.67,29.73,29.98,30.35,31.94,36.17,36.27,36.64,36.68,36.74,36.78,45.00,45.08,46.96,47.43,48.25,48.76,52.48,60.82,60.90,64.27,65.84,69.20,69.22,73.57,74.31,74.51,75.41,79.30,80.47,81.36,81.59,108.31,121.25,122.00,123.26,123.33,126.67,126.73,127.73,127.99,128.80,128.98,132.71,133.07,133.27,136.19,137.10,142.90,143.01,147.88,148.00,148.09,152.89,152.93,155.79,155.90,165.79,165.91,167.56,167.58,178.67,179.37.
TOF/MS(ESI):calcd for C114H170N11O15PNa[M+Na]+ 1987.2513,found 1987.2521.
〔実施例7−1〕
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジンの合成
1H−NMR(600MHz,DMSO−d6):δ1.12(d,6H,J=6.0Hz),1.42(d,3H,J=7.2Hz),1.74(d,3H,J=2.8Hz),2.07(s,1H),2.30−2.41(m,3H),2.60−2.90(m,6H),3.18−3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=4.2Hz),4.00−4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.51−5.52(m,1H),6.15−6.25(m,3H),6.88(d,4H,J=9.0Hz),7.20−7.50(m,11H),8.17(q,1H,J=1.8Hz),11.33−12.07(m,3H).
13C−NMR(151MHz,DMSO−d6):δ10.56,10.88,17.66,33.65,35.78,52.00,53.86,56.34,61.48,61.80,65.49,66.58,68.73,76.58,77.11,81.63,82.11,82.52,82.87,84.98,90.73,108.72,112.08,116.98,119.14,125.69,126.46,126.77,128.53,133.81,134.00,134.26,134.70,136.15,143.26,147.04,147.32,149.14,153.53,156.99,162.50,168.14,178.89.
TOF/MS(ESI):calcd for C61H69N11O21P2Na [M+Na]+ 1376.4, found 1376.6.
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシンの合成
1H−NMR(600MHz,DMSO−d6):δ1.17−1.30(m,7H),1.74−1.79(m,3H),1.97−2.30(m,2H),2.45−2.51(m,2H),2.68−2.76(m,1H),2.79−2.83(m,1H),2.96(dt,4H,J=6.4,12.4Hz),3.03−3.12(m,1H),3.22(t,1H,J=11.3Hz),3.77(s,6H),3.93(s,1H),4.07−4.38(m,11H),5.07−5.45(m,5H),6.05−6.45(m,3H),6.85(t,4H,J=10.7Hz),7.24(d,5H,J=8.9Hz),7.29(t,2H,J=7.6Hz),7.36(d,2H,J=7.6Hz),7.49−7.56(m,3H),7.65(t,1H,J=7.2Hz),7.90(dt,1H,J=3.0,8.1Hz),8.07(d,2H,J=7.6Hz),8.13−8.16(m,1H),10.89−12.13(m,3H).
13C−NMR(151MHz,DMSO−d6):δ12.52,14.58,19.33,35.33,36.13,37.02,55.48,60.34,62.73,63.24,64.06,67.31,68.33,70.66,77.30,79.12,82.64,83.37,84.09,84.74,86.25,113.58,118.69,121.00,123.54,127.24,128.19,128.72,128.94,130.23,132.68,133.50,134.55,135.77,136.46,137.81,139.68,145.08,148.56,149.12,150.82,155.31,158.56,161.08,164.11,165.03,180.61.
TOF/MS(ESI):calcd for C68H72N14O20P2Na [M+Na]+ 1489.4, found 1489.4.
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジンの合成
1H−NMR(600MHz,DMSO−d6):δ1.09−1.12(m,6H),1.42(s,3H),1.75−2.10(m,4H),2.61−2.95(m,7H),3.15−3.25(m,3H),3.70−3.77(m,7H),4.08−4.36(m,11H),5.09(d,2H,J=41.9Hz),5.32(d,2H,J=44.0Hz),6.18−6.29(m,3H),6.85−6.88(m,4H),7.20−7.22(m,5H),7.29(q,2H,J=6.9Hz),7.34(d,2H,J=7.6Hz),7.41−7.53(m,4H),7.86(d,2H,J=7.6Hz),8.19(dt,1H,J=4.4,8.2Hz),8.84(q,1H,J=6.4Hz),11.34−12.05(m,3H).
13C−NMR(151MHz,DMSO−d6):δ12.17,19.35,27.86,35.35,55.56,57.07,63.19,63.61,67.29,68.60,70.86,78.19,78.93,82.62,83.40,83.86,84.14,86.67,110.47,113.78,118.59,118.88,120.91,127.38,128.02,128.69,130.24,131.86,134.55,135.51,135.97,137.92,144.97,148.76,149.02,150.84,154.36,155.25,158.69,164.09,165.95,166.18,180.60.
TOF/MS(ESI):calcd for C67H72N12O21P2Li [M+Li]+ 1449.5, found 1449.6.
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシンの合成
1H−NMR(600MHz,DMSO−d6):δ1.12(d,6H,J=6.2Hz),1.42(d,3H,J=7.6Hz),1.73(d,3H,J=2.7Hz),2.07(s,1H),2.32−2.43(m,3H),2.61−2.91(m,6H),3.20−3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=3.8Hz),4.04−4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.51−5.52(m,1H),6.13−6.26(m,3H),6.88(d,4H,J=8.9Hz),7.23(d,5H,J=7.6Hz),7.30(t,2H,J=6.2Hz),7.36(d,2H,J=8.2Hz),7.43−7.47(m,2H),7.89−8.18(m,1H),11.33−12.07(m,3H).
13C−NMR(151MHz,DMSO−d6):δ10.46,10.84,17.69,17.83,33.61,35.32,36.22,53.86,61.50,61.98,65.53,66.44,68.89,75.88,77.15,80.92,81.78,82.16,82.47,82.92,83.51,85.00,108.75,108.90,112.08,116.92,119.11,125.71,126.48,126.77,128.55,133.80,134.02,134.33,134.53,136.24,143.27,146.96,147.20,149.17,153.63,157.01,162.41,178.92.
TOF/MS(ESI):calcd for C61H69N11O21P2Na [M+Na]+ 1376.4, found 1376.6.
1H−NMR(600MHz,CDCl3):δ1.46(d,3H,J=15.8Hz),1.91(d,3H,J=8.2Hz),2.21−2.79(m,6H),3.39−3.49(m,2H),3.79(d,6H,J=3.4Hz),4.08−4.52(m,8H),5.26−5.31(m,1H),6.25−6.41(m,2H),6.85(dd,4H,J=2.7,8.9Hz),7.22−7.38(m,9H),7.58(d,1H,J=24.1Hz),9.45−10.50(m,2H).
13C−NMR(151MHz,CDCl3):δ11.90,12.57,19.43,38.92,39.90,55.30,62.59,63.36,67.70,71.03,80.38,84.66,85.46,87.28,111.32,111.97,113.38,116.54,127.28,128.00,128.11,130.06,135.00,135.80,144.09,150.64,150.92,158.74,163.98.
TOF/MS(ESI):calcd for C44H48N5O13PSNa [M+Na]+ 940.3, found 940.2.
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−フルオロデオキシウリジン−3’−イル)ホスホリル)−2’−フルオロ−N2−イソブチリルデオキシグアノシンの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ1.16−1.26(m,6H),2.19(s,2H),2.45−2.87(m,3H),3.44−3.66(m,2H),3.72−3.75(m,6H),3.92−4.18(m,2H),4.25−4.50(m,4H),4.89−5.55(m,6H),5.85−6.00(m,2H),
6.80−6.82(m,4H),7.15−7.30(m,7H),7.33−7.37(m,2H),7.71−7.82(m,2H),10.05−10.42(brs,1H),10.55−10.87(brs,1H),12.36(s,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ18.75,18.85,19.01,19.07,19.38,19.45,36.01,50.81,55.26,55.28,60.65,62.85,67.86,80.26,81.13,87.13,87.19,87.53,87.88,90.59,92.53,102.62,113.33,116.74,121.28,127.26,128.05,128.19,130.22,134.80,134.91,134.96,135.07,140.41,144.01,144.11,148.00,148.06,148.50,148.55,150.44,155.70,158.76,163.72,180.33,180.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C47H49N8O14F2PNa [M+Na]+ 1041.2972, found 1041.2975.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ2.00−2.27(brs,2H),2.55−2.74(m,1H),2.80(t,1H,J=6.2Hz),3.14−3.41(m,1H),3.44−3.92(m,14H),4.03−4.64(m,7H),5.12(q,1H,J=5.6Hz),5.27(t,1H,J=8.0Hz),5.87−6.05(m,2H),6.78−6.89(m,4H),7.19−7.64(m,12H),7.76−8.16(m,4H),9.05−9.42(brs,1H),9.50−9.87(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ19.54,19.56,19.61,19.64,55.28,55.32,58.80,58.82,58.93,61.30,61.34,62.38,62.43,62.68,62.73,66.03,66.08,66.41,66.46,67.85,67.95,74.30,74.34,74.42,74.47,81.32,81.41,81.49,81.58,81.64,81.72,82.17,82.99,83.08,86.58,86.79,87.46,87.48,89.42,89.51,96.78,102.69,102.71,113.39,116.35,116.48,127.37,127.42,127.80,127.85,128.12,128.25,128.29,128.57,128.90,128.93,130.22,130.27,130.30,131.01,132.94,133.02,133.14,133.17,134.72,134.75,134.82,134.84,139.51,139.66,143.90,143.97,144.26,150.43,154.73,158.81,158.85,162.82,162.86,163.22,166.72.
TOF/MS(ESI):calcd for C51H53N6O16PNa [M+Na]+ 1059.3153, found 1059.3202.
5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジン−3’−イル)ホスホリル)−2’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジンの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.11−0.15(m,12H),0.89−0.93(m,18H),1.66−1.84(brs,2H),2.50−2.77(m,3H),3.46−3.67(m,2H),3.80(s,6H),3.98−4.55(m,9H),4.92−4.96(m,1H),5.23−5.27(m,1H),5.61−5.75(m,2H),5.97−6.00(m,1H),6.84−6.87(m,4H),7.14−7.45(m,10H),7.77−7.87(m,1H),9.00−9.50(brs,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ−5.14,−4.98,−4.96,−4.90,−4.82,−4.76,−4.74,−4.70,−4.68,17.96,18.02,18.06,19.54,19.60,19.67,25.56,25.60,25.66,25.69,55.31,62.02,62.29,62.34,62.52,62.57,62.62,67.06,67.12,67.32,69.38,69.54,70.49,70.93,73.61,74.57,74.63,74.71,74.88,81.55,81.60,81.73,81.84,81.93,82.01,87.37,87.65,87.85,87.95,88.05,91.58,91.81,93.18,93.89,102.60,102.67,102.76,102.82,102.86,113.41,116.26,116.30,127.41,127.45,128.13,128.17,128.21,130.16,130.23,130.29,130.34,134.65,134.69,134.72,134.75,139.67,139.75,140.36,140.40,141.65,141.77,143.99,144.03,149.97,150.09,150.19,150.40,150.55,150.75,158.83,158.88,162.93,163.00,163.18.
TOF/MS(ESI):calcd for C54H72N5O16Si2PNa [M+Na]+ 1156.4148, found 1156.4148.
〔実施例7−9〕
(1)3−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルからの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ1.41(d,3H,J=5.4Hz),1.87(d,3H,J=2.0Hz),2.19−2.27(m,1H),2.34−2.48(m,2H),2.62−2.77(m,3H),3.39(t,1H,J=7.2Hz),3.47−3.52(m,1H),3.78(s,6H),4.07−4.55(m,8H),5.12−5.18(m,1H),6.18−6.24(m,1H),6.35−6.40(m,1H),6.84(d,4H,J=8.8Hz),7.21−7.31(m,8H),7.32−7.38(m,2H),7.51−7.58(m,1H),9.92−10.14(m,2H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ11.78,12.45,12.49,19.59,19.67,19.71,38.83,39.01,39.61,39.67,55.31,62.45,62.50,62.60,62.65,63.31,67.74,70.84,80.08,84.40,84.50,85.60,87.30,87.36,111.23,111.34,111.91,112.00,113.37,116.49,116.74,127.32,128.10,130.11,130.14,134.98,135.01,135.04,135.19,136.00,144.01,144.06,150.69,151.00,151.05,158.80,163.96,164.16.
TOF/MS(ESI):calcd for C44H48N5O14PNa [M+Na]+ 924.2833, found 924.2836.
(2)2−(N−メチル−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルからの合成
TOF/MS(ESI):calcd for C44H48N5O14PNa [M+Na]+ 924.3, found 924.2.
(3)3−(3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルのから合成
TOF/MS(ESI):calcd for C44H48N5O14PNa [M+Na]+ 924.3, found 924.2.
(6−(N6−ベンゾイルアデニン−9−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メチル P−(2−(ヒドロキシメチル)−6−チミン−1−イル)モルホリノ)−N,N−ジメチルホスホノアミダートの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.87−1.95(m,6H),2.01(s,1H),2.45−2.64(m,7H),3.06−4.04(m,9H),4.43−4.46(m,1H),5.52(dd,1H,J=2.4,10.4Hz),6.41(dt,1H,J=2.4,10.0Hz),7.05−7.64(m,19H),8.03(d,2H,J=8.4Hz),8.09(s,1H),8.71−8.80(m,1H),9.69−9.78(m,1H),10.28(s,1H),10.75−11.05(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ12.41,12.45,36.54,36.58,36.62,36.66,44.61,44,82,47.13,48.68,48.78,52.80,52.85,62.72,62.78,65.46,65.61,75.07,75.14,75.45,75.52,78.06,78.13,78.27,78.33,79.60,79.65,80.01,80.49,110.96,111.03,122.47,122.78,126.65,128.00,128.24,128.41,128.49,128.62,129.17,132.61,132.69,133.48,133.64,134.86,134.96,140.94,149.54,149.75,149.82,150.02,151.23,151.42,152.66,152.75,163.75,163.79,165.25.
TOF/MS(ESI):calcd for C48H51N10O8PNa [M+Na]+ 949.3527, found 949.3545.
(6−(N4−ベンゾイルシトシン−1−イル)−4−トリチルモルホリン−2−イル)メチルP−(2−(ヒドロキシメチル)−6−(N2−イソブチリルグアニン−9−イル)モルホリノ)−N,N−ジメチルホスホノアミダートの合成
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ0.78−1.55(m,9H),2.37−2.95(m,8H),3.08−3.94(m,9H),4.13−4.43(m,2H),5.42−5.54(m,1H),6.22−6.38(m,1H),7.05−7.80(m,19H),7.93(d,2H,J=7.2Hz),9.58−9.92(brs,1H),10.64−10.86(brs,1H),12.05−12.21(brs,1H).
13C−NMR(100MHz,CDCl3):δ13.91,14.12,19.03,19.06,19.28,22.69,25.76,28.55,29.36,29.70,31.72,31.92,35.99,36.05,36.62,36.65,36.69,44.63,44.92,47.15,47.56,48.44,48.79,52.26,52.42,61.85,62.58,62.73,65.66,66.15,71.09,71.69,75.40,75.86,75.91,78.19,79.73,80.56,81.37,81.76,97.87,120.56,120.92,126.65,127.96,128.04,128.70,128.83,128.92,129.13,131.00,132.21,132.97,133.02,133.14,136.66,137.43,144.02,144.54,147.92,147.98,148.00,154.99,155.57,155.62,162.69,163.09,167.24,179.62,179.86.
TOF/MS(ESI):calcd for C51H56N11O9PNa [M+Na]+ 1020.3898, found 1020.3942.
8mer体の脱Tag化の確認
(1)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル(8mer体)の合成
アルゴン下で、2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸チミジン−3’−イル(1.19g,0.98mmol)、5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル−ホスホロアミダイト(1.46g,1.96mmol)のジクロロメタン懸濁液(10mL)に5−ベンジルチオ−1H−テトラゾール(0.38g,1.96mmol)を加えたのち、室温で1.5時間撹拌した。次に、ピリジン(0.93g,11.77mmol)と水(0.11g,5.89mmol)、ヨウ素(1.25g,4.91mmol)を加えたのち、室温で4時間撹拌した。反応液に1.2mol/L−アスコルビン酸水溶液(3mL)を加えたのち、室温で15分間撹拌した。反応液にアセトニトリル(24mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル−ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、DMTr体(2.22g)を得た。
TOF/MS(ESI): m/z 2106.3 [M+2H]2+, 1403.9 [M+3H]3+.
(2)2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イルの脱Tag化
N,N−ジイソプロピルエチルアミン(65mg,0.50mmol)をジクロロメタン(0.4mL)とTHF(0.2mL)、2−プロパノール(0.04mL)の混合溶液に加え、0〜−10℃に冷却した。次に、4mol/L−水素化ホウ素リチウム−THF溶液(0.125mL,0.50mmol)を加えたのち、同温度で20分間撹拌し、還元試薬を調製した。あらかじめ、0〜−10℃に冷却した8mer体(84mg,0.02mmol)のジクロロメタン(4.2mL)−THF(1.8mL)−2−プロパノール(0.4mL)混合液に還元試薬を添加し、同温度で40分間撹拌した。反応液に10%塩化アンモニウム水溶液(5mL)を加えたのち、ジクロロメタンで抽出した。有機層を食塩水で洗浄したのち、有機層を濃縮、乾固した。濃縮残渣をジクロロメタンに懸濁させることで析出した固体をろ取した。固体をジクロロメタンで洗浄したのち、減圧乾燥し、5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(5’−O−((2−シアノエトキシ)(N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)−N2−イソブチリルデオキシグアノシン−3’−イル)ホスホリル)−N4−ベンゾイルデオキシシチジン−3’−イル)ホスホリル)−N6−ベンゾイルデオキシアデノシン−3’−イル)ホスホリル)チミジン−3’−イル)ホスホリル)チミジン(25mg)を得た。
TOF/MS(ESI): m/z 1621.9 [M+2H]2+, 1081.6 [M+3H]3+, 811.2 [M+4H]4+.
〔実施例8〕
2−((3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル(A−Tag−dT−DMTrと略す)とコハク酸3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−3’−イル(S−Tag−dT−DMTrと略す)について、下記に示すアンモニア性塩基性条件下での脱Tag化進行速度を比較した。
A−Tag−dT−DMTr or S−Tag−dT−DMTr 50μmol
28%アンモニア水 2.0 mL
エタノール 0.5 mL
THF 0.5 mL
反応温度 35℃
カラム :Inertsil WP300 Diol(5μm,4.6Φ×150mm)
流速 :1.0 mL/min
移動相 :n−hexane, CHCl3−MeOH (1/1)
Gradient: 0−11 min; 5 to 30%(CHCl3−MeOH)
検出方法:UV(λ=254nm)
保持時間:A−Tag−dT−DMTr:Rt=4.23min,S−Tag−dT−DMTr:Rt=4.17min,dT−DMTr:Rt=9.40min
生成率:(dT−DMTr)/[(A−Tag−dT−DMTr or S−Tag−dT−DMTr)+(dT−DMTr)]
以下、上述の各実施例における合成例をまとめたものを示す。
Claims (28)
- 一般式(3)で表される化合物またはその誘導体。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。) - 一般式(6)で表される、請求項3に記載の化合物またはその誘導体。
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。) - Wが、水素原子、トリチル基、ジ(C1−6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1−18アルコキシ)トリチル基、9−(9−フェニル)キサンテニル基、または、9−(9−フェニル)チオキサンテニル基である、請求項3、または、4に記載の化合物またはその誘導体。
- R4が、2位に電子求引性基を有するエチル基である、請求項3〜5のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- Qが、水素原子、トリチル基、ジ(C1−6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1−18アルコキシ)トリチル基、9−(9−フェニル)キサンテニル基、または、9−(9−フェニル)チオキサンテニル基である、請求項3〜6のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- y1、または、y2が、1〜100である、請求項3〜7のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- y1、または、y2が、1〜30である、請求項3〜7のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- y1、または、y2が、0である、請求項3〜7のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- nが、1、または、2である、請求項1〜10のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- mが、2〜4の整数である、請求項1〜11のいずれかに記載の化合物またはその誘導体。
- 一般式(3)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含む、一般式(7)、または、(8)で表される化合物またはその誘導体の製造方法。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) - 一般式(6)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含む、請求項13に記載の製造方法。
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) - 前記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いる、請求項13、または、14に記載の製造方法。
- 前記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テトラブチルアンモニウムである、請求項13〜15のいずれかに記載の製造方法。
- Wが、水素原子、トリチル基、ジ(C1−6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1−18アルコキシ)トリチル基、9−(9−フェニル)キサンテニル基、または、9−(9−フェニル)チオキサンテニル基である、請求項13〜16に記載の製造方法。
- R4が、2位に電子求引性基を有するエチル基である、請求項13〜17のいずれかに記載の製造方法。
- Qが、水素原子、トリチル基、ジ(C1−6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1−18アルコキシ)トリチル基、9−(9−フェニル)キサンテニル基、または、9−(9−フェニル)チオキサンテニル基である、請求項13〜18に記載の製造方法。
- y1、または、y2が、1〜100である、請求項13〜19のいずれかに記載の製造方法。
- y1、または、y2が、1〜30である、請求項13〜19のいずれかに記載の製造方法。
- y1、または、y2が、0である、請求項13〜19のいずれかに記載の製造方法。
- nが、1、または、2である、請求項13〜22のいずれかに記載の製造方法。
- mが、2〜4の整数である、請求項13〜23のいずれかに記載の製造方法。
- 一般式(3)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含む、置換基除去方法。
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
mは、1〜5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(3)における結合箇所を表す。) - 一般式(6)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含む、請求項25に記載の置換基除去方法。
R1、R2、および、R3は、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10〜40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRNを表す。
nは、1〜4の整数を表す。
RNは、置換されていてもよい、炭素数1〜6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
R4は、電子求引性基を有する、炭素数1〜4のアルキル基を表す。R4が2以上存在する場合には、複数存在するR4は同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1〜6のアルコキシ基、ジ(C1−6アルキル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、前記一般式(6)における結合箇所を表す。) - 前記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いる、請求項25、または、26に記載の置換基除去方法。
- 前記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テトラブチルアンモニウムである、請求項25〜27のいずれかに記載の置換基除去方法。
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