DK2663633T3 - Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype - Google Patents
Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype Download PDFInfo
- Publication number
- DK2663633T3 DK2663633T3 DK12717559.4T DK12717559T DK2663633T3 DK 2663633 T3 DK2663633 T3 DK 2663633T3 DK 12717559 T DK12717559 T DK 12717559T DK 2663633 T3 DK2663633 T3 DK 2663633T3
- Authority
- DK
- Denmark
- Prior art keywords
- gene
- strain
- protein
- sebi
- variant
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/36—Adaptation or attenuation of cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1241—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
- C12Y207/07—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
- C12Y207/07013—Mannose-1-phosphate guanylyltransferase (2.7.7.13)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Virology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Botany (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Claims (19)
- FILAMENTØSE SVAMPE MED ÆNDRET VISCOSITETSFÆNOTYPE1. Stammevariant af filamentøse svampe, der er afledt af en ophavsstamme, hvilken stammevariant omfatter en genetisk ændring, der far celler af stammevarianten til at producere en reduceret mængde af funktionelt Sebl-protein sammenlignet med celler af ophavsstammen og endvidere omfatter brud på mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sfb3-genet, mpgl -genet, gas 1 -genet, crzl -genet og tps2-genet, eller homologe gener deraf, hvor cellerne af stammevarianten under en aerob fermentering i nedsænket kultur producerer en cellebouillon, der (i) kræver reduceret omrøring for at opretholde et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold sammenlignet med cellerne af ophavsstammen og/eller (ii) opretholder et øget opløst oxygenindhold ved et forhåndsvalgt omrøringsomfang sammenlignet med cellerne af ophavsstammen.
- 2. Stammevariant ifølge krav 1, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter et brud på sebi -genet, der er til stede i ophavsstammen; eller (b) et brud på sebi- genet er resultatet af deletion af hele eller en del af sebi -genet;eller (c) brud på sebi-genet er resultatet af deletion af en del af genomisk DNA omfattende sebl-genet; eller (d) brud på sebi -genet er resultatet af mutagenese af sebi -genet.
- 3. Stammevariant ifølge krav 2, hvor brud på ve/)/-genet udføres ved anvendelse af stedsspecifik rekombination eller brud på sebi -genet udføres i kombination med indsætning af en valgbar markør på det genetiske locus for sebi-genet.
- 4. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor stammevarianten ikke producerer funktionelt Sebi -protein.
- 5. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor stammevarianten ikke producerer Seb 1 -protein.
- 6. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor stammevarianten endvidere omfatter et gen, der koder for et protein af interesse.
- 7. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvilken stammevariant omfatter et brud på sfb3-genet.
- 8. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor stammevarianten producerer i alt væsentligt den samme mængde, eller mere, protein pr. enhedsmængde biomasse som ophavsstammen.
- 9. Stammevariant ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
- 10. Stammevariant ifølge krav 9, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
- 11. Stammevariant ifølge krav 1, hvor (a) brud på sebi -genet udføres i kombination med indsætning af en valgbar markør på det genetiske locus for sebi -genet og/eller (b) brud på sebi -genet udføres i kombination med brud på mpgl -genet.
- 12. Fremgangsmåde til produktion af en stammevariant af filamentøse svampeceller, hvilken fremgangsmåde omfatter: indføring af en genetisk ændring i en ophavsstamme til en filamentøs svampecelle, hvilken genetisk ændring reducerer eller forhindrer produktionen af funktionelt Sebi-protein sammenlignet med cellerne fra ophavsstammen, hvorved der produceres en filamentøs svampecellevariant, der under aerob fermentering i nedsænket kultur producerer en cellebouillon, der (i) kræver reduceret omrøring for at opretholde et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold, sammenlignet med cellerne af ophavsstammen, og/eller (ii) opretholder et øget opløst oxygenindhold ved et forhåndsvalgt omrøringsomfang, sammenlignet med cellerne af ophavsstammen, hvor brud på sebi-genet udføres i kombination med brud på mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sfl>3-genet, mpgl -genet, gasl -genet, crzl -genet og tps2-genet eller homologe gener deraf.
- 13. Fremgangsmåde ifølge krav 12, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter brud på sebi -genet i en filamentøs ophavssvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (b) den genetiske ændring omfatter de letering af sebi- genet i en filamentøs ophavssvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (c) den genetiske ændring udføres ved anvendelse af stedsspecifik genetisk rekombination.
- 14. Fremgangsmåde ifølge krav 12 eller krav 13, hvor: (a) brud på sebi-genet udføres i kombination med indsætning af en valgbar markør på det genetiske locus for ieW-genet; eller (b) brud på sebi -genet udføres i kombination med brud på s/W-genet.
- 15. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 14, hvor stammevarianten producerer i alt væsentligt den samme mængde, eller mere, protein pr. enhedsmængde biomasse som ophavsstammen.
- 16. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 15, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
- 17. Fremgangsmåde ifølge krav 16, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
- 18. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 17, hvor ophavsstammen endvidere omfatter et gen, der koder for et protein af interesse.
- 19. Fremgangsmåde ifølge krav 18, hvor genet, der koder for proteinet af interesse er til stede i ophavsstammen før indføring af den genetiske ændring, der reducerer eller forhindrer produktion af funktionelt Sebi -protein.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161478160P | 2011-04-22 | 2011-04-22 | |
| US201161478162P | 2011-04-22 | 2011-04-22 | |
| PCT/US2012/034403 WO2012145595A1 (en) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DK2663633T3 true DK2663633T3 (da) | 2016-05-23 |
Family
ID=46018123
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK12717559.4T DK2663633T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype |
| DK12718831.6T DK2699588T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype |
| DK15189224.7T DK3000870T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype |
Family Applications After (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK12718831.6T DK2699588T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype |
| DK15189224.7T DK3000870T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US9725726B2 (da) |
| EP (3) | EP3000870B1 (da) |
| JP (2) | JP6042868B2 (da) |
| KR (2) | KR101952470B1 (da) |
| CN (2) | CN103517916B (da) |
| AR (2) | AR086200A1 (da) |
| AU (3) | AU2012245322A1 (da) |
| BR (2) | BR112013025430A2 (da) |
| CA (2) | CA2833660C (da) |
| DK (3) | DK2663633T3 (da) |
| WO (2) | WO2012145595A1 (da) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US9593341B2 (en) | 2011-04-22 | 2017-03-14 | Danisco Us Inc. | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
| WO2012145595A1 (en) * | 2011-04-22 | 2012-10-26 | Danisco Us Inc. | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
| US20180215797A1 (en) * | 2015-08-13 | 2018-08-02 | Glykos Finland Oy | Regulatory Protein Deficient Trichoderma Cells and Methods of Use Thereof |
| JP7376505B2 (ja) | 2018-04-24 | 2023-11-08 | ダニスコ・ユーエス・インク | 粘性が低下した表現型を含む糸状菌株 |
| JP7459509B2 (ja) * | 2018-07-30 | 2024-04-02 | 東レ株式会社 | トリコデルマ属糸状菌の変異株およびタンパク質の製造方法 |
| KR20210038591A (ko) | 2018-07-30 | 2021-04-07 | 다니스코 유에스 인크. | 향상된 단백질 생산성 표현형을 포함하는 돌연변이체 및 유전자 변형된 사상성 진균 균주 및 이의 방법 |
| JP2022553854A (ja) | 2019-11-08 | 2022-12-26 | ダニスコ・ユーエス・インク | タンパク質生産性が増強された表現型を含む糸状菌株及びその方法 |
| FR3104169B1 (fr) * | 2019-12-04 | 2022-10-21 | Ifp Energies Now | Souche de champignon ayant une viscosite diminuee |
| CN113881586B (zh) * | 2021-09-27 | 2023-03-10 | 四川大学 | 耐高温、耐高糖、耐高盐酿酒酵母菌株及构建方法和应用 |
| CN118109437B (zh) * | 2024-04-29 | 2024-07-09 | 北京中医药大学深圳医院(龙岗) | 一种来自菌类中药的gdp-甘露糖焦磷酸化酶及其编码基因和应用 |
Family Cites Families (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FI972909A0 (fi) | 1997-07-09 | 1997-07-09 | Valtion Teknillinen | Oekad produktion av avsoendrade proteiner genom rekombinatjaestceller |
| US7189538B2 (en) | 1999-03-24 | 2007-03-13 | Genencor International, Inc. | Hyphal growth in fungi |
| CN1369016A (zh) * | 1999-07-30 | 2002-09-11 | 荷兰应用科学研究会(Tno) | 转化真菌的新方法及其用于异源蛋白质生产的用途 |
| CA2405954C (en) * | 2000-04-13 | 2015-06-30 | Mark Aaron Emalfarb | Novel expression-regulating sequences and expression products in the field of filamentous fungi |
| EP2368904A1 (en) * | 2001-03-14 | 2011-09-28 | Genencor International, Inc. | Regulatable growth of filamentous fungi |
| AU2002305903A1 (en) * | 2001-05-25 | 2002-12-09 | Incyte Genomics Inc. | Carbohydrate-associated proteins |
| US6902921B2 (en) | 2001-10-30 | 2005-06-07 | 454 Corporation | Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase |
| EP1862540B1 (en) | 2003-05-29 | 2011-09-14 | Genencor International, Inc. | Novel trichoderma genes |
| CA2699413C (en) | 2007-09-11 | 2013-09-10 | Mark Banks | Insulated pallet shipper and methods of making and using the same |
| KR101768225B1 (ko) * | 2008-03-07 | 2017-08-14 | 다니스코 유에스 인크. | 트리코데르마에서의 카탈라아제 발현 |
| JP5707494B2 (ja) | 2010-08-25 | 2015-04-30 | ダニスコ・ユーエス・インク | 粘性の表現型を変化させた糸状菌 |
| WO2012145595A1 (en) * | 2011-04-22 | 2012-10-26 | Danisco Us Inc. | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
| US9593341B2 (en) * | 2011-04-22 | 2017-03-14 | Danisco Us Inc. | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
-
2012
- 2012-04-20 WO PCT/US2012/034403 patent/WO2012145595A1/en active Application Filing
- 2012-04-20 DK DK12717559.4T patent/DK2663633T3/da active
- 2012-04-20 WO PCT/US2012/034379 patent/WO2012145584A1/en active Application Filing
- 2012-04-20 EP EP15189224.7A patent/EP3000870B1/en active Active
- 2012-04-20 US US14/111,615 patent/US9725726B2/en active Active
- 2012-04-20 KR KR1020137030769A patent/KR101952470B1/ko active IP Right Grant
- 2012-04-20 AU AU2012245322A patent/AU2012245322A1/en not_active Abandoned
- 2012-04-20 JP JP2014506565A patent/JP6042868B2/ja active Active
- 2012-04-20 BR BR112013025430A patent/BR112013025430A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 CA CA2833660A patent/CA2833660C/en active Active
- 2012-04-20 DK DK12718831.6T patent/DK2699588T3/da active
- 2012-04-20 JP JP2014506563A patent/JP6042866B2/ja active Active
- 2012-04-20 AR ARP120101366A patent/AR086200A1/es unknown
- 2012-04-20 US US14/112,879 patent/US9725727B2/en active Active
- 2012-04-20 DK DK15189224.7T patent/DK3000870T3/da active
- 2012-04-20 CN CN201280019757.4A patent/CN103517916B/zh active Active
- 2012-04-20 EP EP12717559.4A patent/EP2663633B1/en active Active
- 2012-04-20 AU AU2012245402A patent/AU2012245402B2/en active Active
- 2012-04-20 KR KR1020137030514A patent/KR101993939B1/ko active IP Right Grant
- 2012-04-20 AR ARP120101367A patent/AR086201A1/es unknown
- 2012-04-20 CN CN201280019678.3A patent/CN103502431B/zh active Active
- 2012-04-20 BR BR112013025203A patent/BR112013025203A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 EP EP12718831.6A patent/EP2699588B1/en active Active
- 2012-04-20 CA CA2833541A patent/CA2833541C/en active Active
-
2017
- 2017-04-26 AU AU2017202753A patent/AU2017202753A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK2663633T3 (da) | Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype | |
| US9868958B2 (en) | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |