DK2699588T3 - Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype - Google Patents

Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype Download PDF

Info

Publication number
DK2699588T3
DK2699588T3 DK12718831.6T DK12718831T DK2699588T3 DK 2699588 T3 DK2699588 T3 DK 2699588T3 DK 12718831 T DK12718831 T DK 12718831T DK 2699588 T3 DK2699588 T3 DK 2699588T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
gene
protein
strain
disruption
mpgl
Prior art date
Application number
DK12718831.6T
Other languages
English (en)
Inventor
Elizabeth A Bodie
Ii Robert James Pratt
Original Assignee
Danisco Us Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Danisco Us Inc filed Critical Danisco Us Inc
Application granted granted Critical
Publication of DK2699588T3 publication Critical patent/DK2699588T3/da

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/36Adaptation or attenuation of cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14Fungi; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1241Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y207/00Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/07Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • C12Y207/07013Mannose-1-phosphate guanylyltransferase (2.7.7.13)

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)

Claims (20)

  1. FILAMENTØSE SVAMPE MED ÆNDRET VISKOSITETSFÆNOTYPE PATENTKRAV
    1. Varian Is tamme af lilamenløs svamp, der er afledl af en moderslemme, hvilken varianlslamme omfaller en genetisk ændring, der får cellerne fra variantstammen til at producere en reduceret mængde funktionelt mannose- 1-phosphatguanyltransferase- (Mpgl) protein sammenlignet med moderstammens celler, hvor cellerne fra variantstammen under aerob fermentering i nedsænket kultur producerer en cellebouillon, der (i) kræver reduceret omrøring for at bevare et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold, sammenlignet med moderstammens celler, og/eller (ii) bevarer et øget opløst oxygenindhold ved en forhåndsvalgt mængde omrøring, sammenlignet med moderstammens celler.
  2. 2. Variantstamme ifølge krav 1, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter en disruption af det mpgl-gen, der er til stede i moderstammen; eller (b) disruption af mpgl-genet er resultatet af deletion af hele eller en del af mpgl-genet; eller (c) disruption af mpgl-genet er resultatet af deletion af en del af det genomiske DNA omfattende mpgl-genet; eller (d) disruption af mpgl-genet er resultatet af mutagenese af mpgl-genet.
  3. 3. Variantstamme ifølge krav 2, hvor disruption af mpgl-genet udføres ved anvendelse af stedsspecifik rekombination eller disruption af mpgl-genet udføres i kombination med indføring af en valgbar markør på det genetiske locus for mpgl-genet.
  4. 4. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen ikke producerer funktionelt Mpgl-protein.
  5. 5. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen ikke producerer funktionelt Mpgl-protein.
  6. 6. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen endvidere omfattet et gen, der koder for et protein af interesse.
  7. 7. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, som omfatter en disruption af sfbl-genet.
  8. 8. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen i alt væsentligt producerer den samme mængde af, eller mere, protein pr. enhed biomassemængde som moderstammen.
  9. 9. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
  10. 10. Variantstamme ifølge krav 9, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
  11. 11. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen endvidere omfatter en disruption af mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af .s/bi-genet, sehi-genet, gasl-genet, cr-J-genet og tps2-genet eller homologe gener deraf.
  12. 12. Fremgangsmåde til at producere en variantstamme af filamentøse svampeceller, hvilken fremgangsmåde omfatter: indføring af en genetisk ændring i en moderstamme af en filamentøs svampecelle, hvilken genetisk ændring reducerer eller forhindrer produktionen af funktionelt mannose-1-phosphatguanyltransferase- (Mpgl) protein sammenlignet med moderstammens celler, hvorved der produceres en filamentøs variantsvampecelle, der under aerob fermentering i nedsænket kultur producerer en cellebouillon, der (i) kræver reduceret omrøring for at bevare et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold, sammenlignet med moderstammens celler, og/eller (ii) bevarer et øget opløst oxygenindhold ved en forhåndsvalgt mængde omrøring, sammenlignet med moderstammens celler.
  13. 13. Fremgangsmåde ifølge krav 12, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter disruption af mpgl-gtnet i en filamentøs modersvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (b) den genetiske ændring omfatter deletering af mpgl-genet i en filamentøs modersvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (c) den genetiske ændring udføres ved anvendelse af stedsspecifik genetisk rekombination.
  14. 14. Fremgangsmåde ifølge krav 12 eller krav 13, hvor: (a) disruption af mpg /-genet udføres i kombination med indføring af en valgbar markør på det genetiske locus for mpgl-genet; eller (b) disruption af mpgl -genet udføres i kombination med disruption af s/hi-genet.
  15. 15. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 14, hvor variantstammen i alt væsentligt producerer den samme mængde af, eller mere, protein pr. enhed biomassemængde som moderstammen.
  16. 16. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 15, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
  17. 17. Fremgangsmåde ifølge krav 16, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
  18. 18. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 17, hvor moderstammen endvidere omfatter et gen, der koder for et protein af interesse.
  19. 19. Fremgangsmåde ifølge krav 18, hvor genet, der koder for proteinet af interesse, er til stede i moderstammen før indføring af den genetiske ændring, der reducerer eller forhindrer produktionen af funktionelt Mpgl-protein.
  20. 20. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 12 til 19, hvor disruption af mpgl-genet udføres i kombination med disruption af mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sft>3-genet, seW-genet, gasl-genet, crz/-genet og tps2-genet eller homologe gener deraf.
DK12718831.6T 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype DK2699588T3 (da)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161478162P 2011-04-22 2011-04-22
US201161478160P 2011-04-22 2011-04-22
PCT/US2012/034379 WO2012145584A1 (en) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2699588T3 true DK2699588T3 (da) 2017-03-13

Family

ID=46018123

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK12718831.6T DK2699588T3 (da) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype
DK15189224.7T DK3000870T3 (da) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype
DK12717559.4T DK2663633T3 (da) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype

Family Applications After (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK15189224.7T DK3000870T3 (da) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype
DK12717559.4T DK2663633T3 (da) 2011-04-22 2012-04-20 Filamentøse svampe med ændret viscositetsfænotype

Country Status (11)

Country Link
US (2) US9725727B2 (da)
EP (3) EP2699588B1 (da)
JP (2) JP6042868B2 (da)
KR (2) KR101993939B1 (da)
CN (2) CN103517916B (da)
AR (2) AR086200A1 (da)
AU (3) AU2012245322A1 (da)
BR (2) BR112013025430A2 (da)
CA (2) CA2833541C (da)
DK (3) DK2699588T3 (da)
WO (2) WO2012145595A1 (da)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP6042868B2 (ja) * 2011-04-22 2016-12-14 ダニスコ・ユーエス・インク 粘度の表現型が変化した糸状菌
DK2673290T3 (da) 2011-04-22 2016-11-14 Danisco Us Inc Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype
US20180215797A1 (en) * 2015-08-13 2018-08-02 Glykos Finland Oy Regulatory Protein Deficient Trichoderma Cells and Methods of Use Thereof
JP7376505B2 (ja) 2018-04-24 2023-11-08 ダニスコ・ユーエス・インク 粘性が低下した表現型を含む糸状菌株
JP7459509B2 (ja) * 2018-07-30 2024-04-02 東レ株式会社 トリコデルマ属糸状菌の変異株およびタンパク質の製造方法
CN112654704A (zh) * 2018-07-30 2021-04-13 丹尼斯科美国公司 包含蛋白质生产率提高表型的突变和遗传修饰的丝状真菌菌株及其方法
KR20220097451A (ko) 2019-11-08 2022-07-07 다니스코 유에스 인크. 향상된 단백질 생산성 표현형을 포함하는 진균 균주 및 이의 방법
FR3104169B1 (fr) * 2019-12-04 2022-10-21 Ifp Energies Now Souche de champignon ayant une viscosite diminuee
CN113881586B (zh) * 2021-09-27 2023-03-10 四川大学 耐高温、耐高糖、耐高盐酿酒酵母菌株及构建方法和应用

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FI972909A0 (fi) * 1997-07-09 1997-07-09 Valtion Teknillinen Oekad produktion av avsoendrade proteiner genom rekombinatjaestceller
US7189538B2 (en) * 1999-03-24 2007-03-13 Genencor International, Inc. Hyphal growth in fungi
WO2001009352A2 (en) * 1999-07-30 2001-02-08 Nederlandse Organisatie Voor Toegepast-Natuurwetenschappelijk Onderzoek (Tno) Use of aspergillus sojae as host for recombinant protein production
DK1276876T3 (da) * 2000-04-13 2007-07-16 Mark Aaron Emalfarb Ekspressionsregulerende sekvenser fra den filamentöse svamp Chrysosporium
US6936449B2 (en) * 2001-03-14 2005-08-30 Genencor International, Inc. Regulatable growth of filamentous fungi
EP1461443A2 (en) * 2001-05-25 2004-09-29 Incyte Genomics, Inc. Carbohydrate-associated proteins
US6902921B2 (en) * 2001-10-30 2005-06-07 454 Corporation Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase
DK1627049T3 (da) 2003-05-29 2010-05-31 Genencor Int Nye Trichoderma-gener
US9180998B2 (en) 2007-09-11 2015-11-10 Cold Chain Technologies, Inc. Insulated pallet shipper and methods of making and using the same
CA2717799A1 (en) * 2008-03-07 2009-09-17 Timothy C. Dodge Expression of catalase in trichoderma
MX346558B (es) * 2010-08-25 2017-03-24 Danisco Us Inc Hongos filamentosos que tienen un fenotipo de viscosidad alterado.
DK2673290T3 (da) * 2011-04-22 2016-11-14 Danisco Us Inc Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype
JP6042868B2 (ja) * 2011-04-22 2016-12-14 ダニスコ・ユーエス・インク 粘度の表現型が変化した糸状菌

Also Published As

Publication number Publication date
WO2012145584A1 (en) 2012-10-26
US9725726B2 (en) 2017-08-08
KR101952470B1 (ko) 2019-02-26
AU2012245402A1 (en) 2013-08-22
JP6042866B2 (ja) 2016-12-14
EP3000870A1 (en) 2016-03-30
DK3000870T3 (da) 2018-04-30
CA2833660C (en) 2020-08-04
KR20140033053A (ko) 2014-03-17
JP2014513529A (ja) 2014-06-05
AU2012245402B2 (en) 2017-09-28
WO2012145595A1 (en) 2012-10-26
KR20140033048A (ko) 2014-03-17
AU2017202753A1 (en) 2017-05-18
EP2699588A1 (en) 2014-02-26
JP2014513531A (ja) 2014-06-05
EP3000870B1 (en) 2018-01-24
CN103502431A (zh) 2014-01-08
US20140099721A1 (en) 2014-04-10
CA2833541A1 (en) 2012-10-26
KR101993939B1 (ko) 2019-06-27
DK2663633T3 (da) 2016-05-23
AR086201A1 (es) 2013-11-27
US9725727B2 (en) 2017-08-08
AU2012245322A1 (en) 2013-08-22
JP6042868B2 (ja) 2016-12-14
EP2699588B1 (en) 2016-11-30
CN103517916A (zh) 2014-01-15
CA2833660A1 (en) 2012-10-26
CN103502431B (zh) 2016-07-06
BR112013025430A2 (pt) 2016-11-29
CA2833541C (en) 2021-04-27
EP2663633B1 (en) 2016-02-24
BR112013025203A2 (pt) 2016-11-29
US20140094587A1 (en) 2014-04-03
AR086200A1 (es) 2013-11-27
EP2663633A1 (en) 2013-11-20
CN103517916B (zh) 2017-05-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2699588T3 (da) Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype
US9868958B2 (en) Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype