DK2673290T3 - Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype - Google Patents
Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype Download PDFInfo
- Publication number
- DK2673290T3 DK2673290T3 DK12717558.6T DK12717558T DK2673290T3 DK 2673290 T3 DK2673290 T3 DK 2673290T3 DK 12717558 T DK12717558 T DK 12717558T DK 2673290 T3 DK2673290 T3 DK 2673290T3
- Authority
- DK
- Denmark
- Prior art keywords
- gene
- gas1
- protein
- disruption
- strain
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/36—Adaptation or attenuation of cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Botany (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Claims (21)
- FILAMENTØSE SVAMPE MED EN ÆNDRET VISKOSITETSFÆNOTYPE PATENTKRAV1. Variantstamme af filamentøs svamp, der er afledt af en ophavsstamme, hvilken variantstamme omfatter en genetisk ændring, der bevirker, at celler af variantstammen producerer en reduceret mængde funktionelt beta-1,3-glucanosyltransferase- (Gasl) protein sammenlignet med ophavsstammens celler, hvor variantstammens celler producerer under aerob fermentering i nedsænket kultur en cellebouillon, der (i) kræver en reduceret mængde omrøring for at bevare et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold sammenlignet med ophavsstammens celler, og/eller (ii) bevarer et øget opløst oxygenindhold ved en forhåndsvalgt mængde omrøring, sammenlignet med ophavsstammens celler.
- 2. Variantstamme ifølge krav 1, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter en disruption af gasl -genet til stede i ophavsstammen; eller (b) disruption af gasl -genet er resultatet af deletering af hele eller en del af gasl -genet; eller (c) disruption af gasl -genet er resultatet af deletering af en del af genomisk DNA omfattende gasl -genet; eller (d) disruption af gasl -genet er resultatet af mutagenese af gasl -genet.
- 3. Variantstamme ifølge krav 2, hvor disruption af ga,s7-genet udføres ved anvendelse af site-specifik rekombination eller disruption af gasl -genet udføres i kombination med indføring af en valgbar markør ved det genetiske locus for gasl -genet.
- 4. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen ikke producerer funktionelt Gasl-protein.
- 5. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen ikke producerer Gasl-protein.
- 6. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen endvidere omfatter et gen, der koder for et protein af interesse.
- 7. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvilken variantstamme endvidere omfatter en disruption af sfb3-genet.
- 8. Variantstamme ifølge krav 6, hvor variantstammen producerer i alt væsentligt den samme mængde, eller mere, protein af interesse pr. biomassemængdeenhed som ophavsstammen.
- 9. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
- 10. Variantstamme ifølge krav 9, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
- 11. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen omfatter et gen, der koder for et protein af interesse, hvor genet, der koder for proteinet af interesse, er til stede i variantstammen før den genetiske ændring med disruption af gasl -genet i kombination med disruption af mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sfl>3-genet, sebi-genet, mpgl-genet, crzf-genet og i/»2-genet.
- 12. Variantstamme ifølge krav 11, hvor (a) disruption af gasl-genet udføres i kombination med indføring af en valgbar markør ved det genetiske locus for gasl -genet og/eller (b) disruption af gasl -genet udføres i kombination med disruption af sebi-genet.
- 13. Variantstamme ifølge et hvilket som helst af de foregående krav, hvor variantstammen endvidere omfatter en disruption af mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sfb3-genet, sebi-genet, mpgl-genet, crzl-genet og //«/-genet eller homologe gener deraf.
- 14. Fremgangsmåde til at producere en variantstamme af filamentøse svampeceller, hvilken fremgangsmåde omfatter: indføring af en genetisk ændring i en ophavsstamme af filamentøs svampecelle, hvilken genetisk ændring reducerer eller forhindrer produktionen af funktionelt beta-1,3-glucanosyltransferase- (Gasl) protein sammenlignet med ophavsstammens celler, hvorved der produceres en filamentøs variantsvampecelle, der under aerob fermentering i nedsænket kultur producerer en cellebouillon, der (i) kræver reduceret omrøring for at bevare et forhåndsvalgt opløst oxygenindhold, sammenlignet med ophavsstammens celler, og/eller (ii) bevarer et øget opløst oxygenindhold ved en forhåndsvalgt mængde omrøring, sammenlignet med ophavsstammens celler.
- 15. Fremgangsmåde ifølge krav 14, hvor: (a) den genetiske ændring omfatter disruption af gav/-genet i en filamentøs ophavssvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (b) den genetiske ændring omfatter deletering af ga,v/-genet i en filamentøs ophavssvampecelle ved anvendelse af genmanipulation; eller (c) den genetiske ændring udføres ved anvendelse af site-specifik genetisk rekombination.
- 16. Fremgangsmåde ifølge krav 14 eller krav 15, hvor: (a) disruption af gasl-genet udføres i kombination med indføring af en valgbar markør ved det genetiske locus for gasl -genet; og/eller (b) disruption af gasl -genet udføres i kombination med disruption af sfb3-genet.
- 17. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 14 til 16, hvor den filamentøse svamp er en Pezizomycotina-art eller den filamentøse svamp er en Trichoderma spp.
- 18. Fremgangsmåde ifølge krav 17, hvor den filamentøse svamp er Trichoderma reesei.
- 19. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 14 til 18, hvor ophavsstammen endvidere omfatter et gen, der koder for et protein af interesse.
- 20. Fremgangsmåde ifølge krav 19, hvor genet, der koder for proteinet af interesse, er til stede i ophavsstammen før indføring af den genetiske ændring, der reducerer eller forhindrer produktionen af funktionelt Gasl-protein.
- 21. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 14 til 20, hvor disruption af gasl-genet udføres i kombination med disruption af mindst ét gen, der er udvalgt fra gruppen bestående af sp3-genet, sebi-genet, mpgl-genet, crz/-genet og tps 2-genet eller homologe gener deraf.
Applications Claiming Priority (6)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161478162P | 2011-04-22 | 2011-04-22 | |
| US201161478160P | 2011-04-22 | 2011-04-22 | |
| US201161480602P | 2011-04-29 | 2011-04-29 | |
| US201161480610P | 2011-04-29 | 2011-04-29 | |
| US201161480629P | 2011-04-29 | 2011-04-29 | |
| PCT/US2012/034399 WO2012145592A1 (en) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentous fungi having an altered viscosity phenotype |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DK2673290T3 true DK2673290T3 (da) | 2016-11-14 |
Family
ID=46018122
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK12717558.6T DK2673290T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype |
| DK12717561.0T DK2699668T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype |
| DK12717560.2T DK2699667T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse fungi med en ændret viscositetsfænotype |
Family Applications After (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK12717561.0T DK2699668T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype |
| DK12717560.2T DK2699667T3 (da) | 2011-04-22 | 2012-04-20 | Filamentøse fungi med en ændret viscositetsfænotype |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US9868958B2 (da) |
| EP (3) | EP2699668B1 (da) |
| JP (3) | JP6042870B2 (da) |
| KR (3) | KR101952467B1 (da) |
| CN (3) | CN103517981B (da) |
| AU (4) | AU2012245323B2 (da) |
| BR (3) | BR112013026535A2 (da) |
| CA (3) | CA2833756C (da) |
| DK (3) | DK2673290T3 (da) |
| WO (3) | WO2012145598A1 (da) |
Families Citing this family (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DK2673290T3 (da) | 2011-04-22 | 2016-11-14 | Danisco Us Inc | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype |
| JP6042868B2 (ja) * | 2011-04-22 | 2016-12-14 | ダニスコ・ユーエス・インク | 粘度の表現型が変化した糸状菌 |
| EP2909306B1 (en) * | 2012-10-22 | 2019-12-11 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Crz1 mutant fungal cells |
| WO2018226900A2 (en) | 2017-06-06 | 2018-12-13 | Zymergen Inc. | A htp genomic engineering platform for improving fungal strains |
| JP7376505B2 (ja) * | 2018-04-24 | 2023-11-08 | ダニスコ・ユーエス・インク | 粘性が低下した表現型を含む糸状菌株 |
| WO2019236848A1 (en) | 2018-06-06 | 2019-12-12 | Zymergen Inc. | Manipulation of genes involved in signal transduction to control fungal morphology during fermentation and production |
| CN112638391A (zh) * | 2018-06-08 | 2021-04-09 | 能值股份有限公司 | 用于使真菌菌丝体生长并且从其形成可食用产品的方法 |
| JP7459509B2 (ja) * | 2018-07-30 | 2024-04-02 | 東レ株式会社 | トリコデルマ属糸状菌の変異株およびタンパク質の製造方法 |
| CN112654704A (zh) * | 2018-07-30 | 2021-04-13 | 丹尼斯科美国公司 | 包含蛋白质生产率提高表型的突变和遗传修饰的丝状真菌菌株及其方法 |
| JPWO2020075788A1 (ja) * | 2018-10-11 | 2021-09-02 | 東レ株式会社 | トリコデルマ・リーセイの変異株およびタンパク質の製造方法 |
| US20200354756A1 (en) * | 2019-04-03 | 2020-11-12 | Danisco Us Inc | Disruption of mvb12 in yeast is associated with increased alcohol production and tolerance |
| FR3104169B1 (fr) * | 2019-12-04 | 2022-10-21 | Ifp Energies Now | Souche de champignon ayant une viscosite diminuee |
| KR20220155298A (ko) * | 2020-02-14 | 2022-11-22 | 인바이오스 엔.브이. | 숙주 세포에서 글리코실화 생성물의 생산 |
| EP3926039A1 (en) | 2020-06-17 | 2021-12-22 | AB Enzymes GmbH | Use of a nuclease for reducing the viscosity and/or preventing an increase in viscosity of a fermentation broth |
| US11479779B2 (en) | 2020-07-31 | 2022-10-25 | Zymergen Inc. | Systems and methods for high-throughput automated strain generation for non-sporulating fungi |
| CN111944779B (zh) * | 2020-08-28 | 2022-06-21 | 山东省科学院生物研究所 | 一种海藻糖合成双功能酶编码基因TvTPS/TPP及其应用 |
Family Cites Families (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FI943133A0 (fi) * | 1994-06-29 | 1994-06-29 | Alko Ab Oy | Transgena vaexter |
| US7189538B2 (en) | 1999-03-24 | 2007-03-13 | Genencor International, Inc. | Hyphal growth in fungi |
| WO2001009352A2 (en) | 1999-07-30 | 2001-02-08 | Nederlandse Organisatie Voor Toegepast-Natuurwetenschappelijk Onderzoek (Tno) | Use of aspergillus sojae as host for recombinant protein production |
| DK1276876T3 (da) * | 2000-04-13 | 2007-07-16 | Mark Aaron Emalfarb | Ekspressionsregulerende sekvenser fra den filamentöse svamp Chrysosporium |
| CN102174551A (zh) * | 2000-04-13 | 2011-09-07 | 戴亚蒂克国际（美国）公司 | 丝状真菌中dna表达文库的高通量筛选 |
| US6936449B2 (en) | 2001-03-14 | 2005-08-30 | Genencor International, Inc. | Regulatable growth of filamentous fungi |
| ATE339685T1 (de) * | 2002-05-03 | 2006-10-15 | Dsm Ip Assets Bv | Prozess für die kontrolle der kontaminationsbeseitigung während des reinigungsprozesses eines durch eine wirtszelle produzierten arzneimittels |
| DK1627049T3 (da) | 2003-05-29 | 2010-05-31 | Genencor Int | Nye Trichoderma-gener |
| EP1689766B1 (en) * | 2003-11-06 | 2012-04-25 | Danisco US Inc. | Expression in filamentous fungi of protease inhibitors and variants thereof |
| US20090117227A1 (en) * | 2006-02-28 | 2009-05-07 | Suntory Limited | Gene encoding trehalose-6-phosphate phosphatase and use thereof |
| MX346558B (es) * | 2010-08-25 | 2017-03-24 | Danisco Us Inc | Hongos filamentosos que tienen un fenotipo de viscosidad alterado. |
| DK2673290T3 (da) * | 2011-04-22 | 2016-11-14 | Danisco Us Inc | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype |
| JP6042868B2 (ja) * | 2011-04-22 | 2016-12-14 | ダニスコ・ユーエス・インク | 粘度の表現型が変化した糸状菌 |
-
2012
- 2012-04-20 DK DK12717558.6T patent/DK2673290T3/da active
- 2012-04-20 US US14/113,549 patent/US9868958B2/en active Active
- 2012-04-20 CN CN201280019432.6A patent/CN103517981B/zh active Active
- 2012-04-20 US US14/113,799 patent/US9593341B2/en active Active
- 2012-04-20 WO PCT/US2012/034409 patent/WO2012145598A1/en active Application Filing
- 2012-04-20 BR BR112013026535A patent/BR112013026535A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 KR KR1020137030474A patent/KR101952467B1/ko active IP Right Grant
- 2012-04-20 WO PCT/US2012/034399 patent/WO2012145592A1/en active Application Filing
- 2012-04-20 JP JP2014506567A patent/JP6042870B2/ja active Active
- 2012-04-20 JP JP2014506566A patent/JP6042869B2/ja active Active
- 2012-04-20 DK DK12717561.0T patent/DK2699668T3/da active
- 2012-04-20 CA CA2833756A patent/CA2833756C/en active Active
- 2012-04-20 CN CN201280019710.8A patent/CN103502266B/zh active Active
- 2012-04-20 EP EP12717561.0A patent/EP2699668B1/en active Active
- 2012-04-20 EP EP12717558.6A patent/EP2673290B1/en active Active
- 2012-04-20 CN CN201280019665.6A patent/CN103502430B/zh active Active
- 2012-04-20 KR KR1020137030475A patent/KR20140033047A/ko not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 AU AU2012245323A patent/AU2012245323B2/en not_active Ceased
- 2012-04-20 AU AU2012245319A patent/AU2012245319A1/en not_active Abandoned
- 2012-04-20 CA CA2833539A patent/CA2833539C/en active Active
- 2012-04-20 JP JP2014506564A patent/JP6042867B2/ja active Active
- 2012-04-20 EP EP12717560.2A patent/EP2699667B1/en active Active
- 2012-04-20 CA CA2833765A patent/CA2833765C/en active Active
- 2012-04-20 AU AU2012245325A patent/AU2012245325B2/en not_active Ceased
- 2012-04-20 WO PCT/US2012/034405 patent/WO2012145596A1/en active Application Filing
- 2012-04-20 US US14/113,930 patent/US9587242B2/en active Active
- 2012-04-20 BR BR112013026559A patent/BR112013026559A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 KR KR1020137030515A patent/KR101952469B1/ko active IP Right Grant
- 2012-04-20 BR BR112013025434A patent/BR112013025434A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2012-04-20 DK DK12717560.2T patent/DK2699667T3/da active
-
2017
- 2017-09-28 AU AU2017235968A patent/AU2017235968B2/en not_active Ceased
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK2673290T3 (da) | Filamentøse svampe med en ændret viskositetsfænotype | |
| DK2699588T3 (da) | Filamentøse svampe med ændret viskositetsfænotype |