DE69028370T2 - Hochempfindliche fluoreszierende einzelteilchen, gerät und verfahren zum nachweis einzelner moleküle - Google Patents
Hochempfindliche fluoreszierende einzelteilchen, gerät und verfahren zum nachweis einzelner moleküleInfo
- Publication number
- DE69028370T2 DE69028370T2 DE69028370T DE69028370T DE69028370T2 DE 69028370 T2 DE69028370 T2 DE 69028370T2 DE 69028370 T DE69028370 T DE 69028370T DE 69028370 T DE69028370 T DE 69028370T DE 69028370 T2 DE69028370 T2 DE 69028370T2
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- particles
- molecules
- volume
- detecting
- energy
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 239000002245 particle Substances 0.000 title claims abstract description 75
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 19
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims abstract description 16
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 10
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 5
- 238000005286 illumination Methods 0.000 claims 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 abstract description 15
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 6
- 238000001069 Raman spectroscopy Methods 0.000 description 4
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 4
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N chembl402140 Chemical compound Cl.C1=2C=C(C)C(NCC)=CC=2OC2=C\C(=N/CC)C(C)=CC2=C1C1=CC=CC=C1C(=O)OCC VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N 0.000 description 1
- 238000005315 distribution function Methods 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000005281 excited state Effects 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 238000001499 laser induced fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 229920000620 organic polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000010287 polarization Effects 0.000 description 1
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/10—Investigating individual particles
- G01N15/14—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
- G01N15/1468—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry with spatial resolution of the texture or inner structure of the particle
- G01N15/147—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry with spatial resolution of the texture or inner structure of the particle the analysis being performed on a sample stream
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/10—Investigating individual particles
- G01N15/14—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
- G01N15/1429—Signal processing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/10—Investigating individual particles
- G01N15/14—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
- G01N15/1429—Signal processing
- G01N15/1433—Signal processing using image recognition
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/02—Investigating particle size or size distribution
- G01N15/0205—Investigating particle size or size distribution by optical means
- G01N15/0211—Investigating a scatter or diffraction pattern
- G01N2015/0222—Investigating a scatter or diffraction pattern from dynamic light scattering, e.g. photon correlation spectroscopy
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
- G01N21/6456—Spatial resolved fluorescence measurements; Imaging
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Investigating Or Analyzing Non-Biological Materials By The Use Of Chemical Means (AREA)
Description
- Die vorliegende Erfindung wurde teilweise durch Mittel der National Science Foundation, des National Institute of Health und durch den Direktor des Office of Energy Research, Office of Health and Environmental Research, Physical and Technological Research Division, des U.S. Department of Energy gefördert.
- Die vorliegende Erfindung bezieht sich allgemein auf eine Vorrichtung und ein Verfahren zum Erfassen einzelner fluoreszierender Partikel bis auf die Ebene einzelner Moleküle und insbesondere auf eine Vorrichtung und ein Verfahren zum Messen der Konzentration fluoreszierender Partikel oder Moleküle in einer fluiden Lösung oder zum Lokalisieren und/oder Zählen fluoreszierender Partikel oder Moleküle auf Oberflächen oder in Filmen.
- Es besteht ein Bedarf nach empfindlichen Vorrichtungen und Verfahren zum Erfassen einzelner Moleküle und Partikel. In der medizinischen und biologischen Forschung ist es besonders wichtig, daß man die Konzentration, Anzahl oder Position einzelner Partikel, wie zum Beispiel von Bakterien, Viren und DNA- Fragmenten messen kann, die intrinsisch fluoreszierend sind oder mit fluoreszierenden Markierungen oder Sonden gekennzeichnet werden können.
- Bei der Suche nach erhöhter Empfindlichkeit verwendete Hirschfeld Evaneszenzwellenanregung zum Erfassen eines auf einem Objektträger adsorbierten, mit 80 Fluoreszinen markierten Antikörpermoleküls.¹ Unter Verwendung einer fließenden Probe erzielten Dovichi et al.² eine Erfassungsgrenze von 22.000 Rhodamin-6G-Molekülen in einer lntegrationszeit von 1s, und Nguyen et al.³ erweiterten diese Grenze auf 800 Moleküle bei hydrodynamisch fokussierten fließenden ¹ Hirschfeld, T. (1976) in Applled Optics 15, 2965-2966. ² Dovichi, N.J., Manin, J.C., Jett, J.H., Trkula, M. & Keller, R.A. (1984) in Anal. Chem 56, 348-354. ³ Nguyen, D., Keller, R. & Trkula, M. (1987) in J. Opt. Soc. Am. 4,138-143.
- Materialien. Mathies und Stryer&sup4; wiesen auf die durch Photozerstörung gegebenen Einschränkungen hin und erfaßten drei Moleküle B-Phycoerythrin (PE) in einem Sondenvolumen von 10&supmin;¹² pL. Kürzlich haben Nguyen et al. Fluoreszenzbursts beim Durchfluß einer 10&supmin;¹² M-Lösung von PE durch einen fokussierten Laserstrahl beobachtet, und sie interpretierten diese Bursts so, daß sie auf den Durchgang einzelner Moleküle zurückzuführen seien&sup5;. Zum Erfassen von Fluoreszenzbursts einzelner Moleküle muß sichergegangen werden, daß die Wahrscheinlichkeit des gleichzeitigen Beobachtens von zwei Molekülen im Strahl vernachlässigbar gering ist. In der Verteilungsfunktion sollte sich die Wahrscheinlichkeit der Erfassung vor Nullzählungen aus der fluoreszierenden Probe während eines vorbestimmten Zeitintervalls von derjenigen des Lösungsmittels um weniger als 10% unterscheiden. Ein einfacher Test ist, daß die mittlere Zählungsquote in der Probe sich um weniger als 10% im Vergleich zur Gegenprobe erhöhen sollte. Bei den Experimenten von Nguyen et al. ist die wahrscheinlichste Zählungsquote bei PE doppelt so groß wie diejenige der Gegenprobe, und die Wahrscheinlichkeit für ein einzelnes Vorkommen (0,34) ergibt bei ihnen eine Wahrscheinlichkeit für ein doppeltes Vorkommen von 0,11. Das deutet darauf hin, daß Nguyen et al. Fluoreszenzbursts aufgrund des gleichzeitigen Vorhandenseins von zwei oder mehr Molekülen im abgebildeten Volumen und nicht der Präsenz einzelner Moleküle beobachteten.
- Im US-Patent 4,778,593 wird die Unterscheidung winziger Partikel beschrieben, wie zum Beispiel biologischer Partikel oder organischer Polymere. Die Partikel sind in einer Flüssigkeit suspendiert, wobei einzelne Partikel im wesentlichen voneinander getrennt sind, während sie in einem Flüssigkeitsstrom fließen. Der Partikelstrom wird mit einem hochintensiven Lichtstrahl bestrahlt, und aus dem Strom bilden sich dann Tröpfchen, von denen jedes ein Partikel enthält. Die Partikel werden je nach der Veränderung der von den Partikeln über einen Zeitraum ausgestrahlten Lichtenergie unterschieden. Das heißt, jedes Partikel emittiert eine bestimmte zeitlang Licht, je nach seiner Größe und nach seinen Eigenschaften. Die Partikel werden durch Ablenken der Tröpfchen je nach der Veränderung der emittierten Energie sortiert. &sup4; Mathies, R.A. & Stiyer, L. (1986) in Fluorescence in the Bioiogicai Sciences, Taylor, D.L., Waggoner, A.S., Lanni, F. Murphy, R.F. & Birge, R. (Hrsg.) (Alan R. Liss, Inc., New York), 129-140 &sup5; Nguyen, D.C., Keller, R.A., Jett, J.H. & Martin, J.c. (1987) Anal. Chem. 59, 2158-61.
- Im US-Patent 4,021,117 wird ein Verfahren zum Zählen und Analysieren von Impulsen beschrieben, die die Eigenschaften von Partikeln repräsentieren, die durch eine Erfassungsvorrichtung gelangen. Die Amplitude des jeweiligen Impulses wird erfaßt, der Bereich unter dem jeweiligen Impuls über einem Referenzniveau wird bestimmt, und ein Verhältnis der Amplitude zum gemessenen Bereich wird errechnet. Die Vorrichtung wird zum Vorsehen gegen den Durchgang von Vielfachpartikeln durch die Erfassungszone des Geräts verwendet.
- Im Stand der Technik ist kein Verfahren und keine Vorrichtung vorgesehen die eine schnelle ultrasensible Erfassung und Zählung fluoreszierender Partikel bis zur Grenze einzelner Moleküle durchführen könnte, noch ist beim Stand der Technik ein Verfahren zum Bestimmen der optimalen Bedingungen zum Erzielen dieser hohen Erfassungssensibilität vorgesehen.
- Es ist eine Aufgabe der Erfindung, eine Vorrichtung und ein Verfahren zur quantitativen Erfassung einzelner fluoreszierender Partikel in einer Lösung bis auf das Niveau einzelner Moleküle vorzusehen.
- Es ist eine weitere Aufgabe der Erfindung, eine Vorrichtung zum Lokalisieren und Zählen fluoreszierender Partikel oder fluoreszierender Moleküle auf Substraten vorzusehen.
- Es ist eine weitere Aufgabe der Erfindung, eine Vorrichtung und eine Verfahren zum Erfassen und Quantifizieren einzelner Partikel in einer Lösung oder auf einem Substrat in Echtzeit vorzusehen.
- Es ist eine weitere erfindungsgemäße Aufgabe, eine Vorrichtung und ein Verfahren zur quantitativen Erfassung einzelner, intrinsisch fluoreszierender Partikel oder mit fluoreszierendem Material markierter Partikel vorzusehen.
- Eine weitere Aufgabe der Erfindung ist es, eine Vorrichtung und ein Verfahren vorzusehen, bei dem einzelne Partikel in einer fluiden Lösung mit einem Lichtstrahl beleuchtet werden und das von den Partikeln und dem Fluid emittierte Licht zur Erstellung einer Parikelzählung verarbeitet wird.
- Es ist eine weitere erfindungsgemäße Aufgabe, eine Vorrichtung und ein Verfahren vorzusehen, bei dem ein fluoreszierende Partikel enthaltendes Fluid beleuchtet wird und Fluoreszenz-Photonenbursts von den Partikeln von Hintergrundphotonemission zur Erstellung einer Anzeige von Partikeln unterschieden werden.
- Die obigen und weitere erfindungsgemäße Aufgaben werden durch eine Vorrichtung und ein Verfahren zum Erfassen fluoreszenter Partikel in einem Fluid, wie sie durch die Patentansprüche definiert sind, gelöst.
- Die obigen und weitere erfindungsgemäße Aufgaben werden aus der folgenden Beschreibung anhand der Zeichnungen besser verständlich. Es zeigt:
- Fig. 1 eine schematische Darstellung der bevorzugten Ausführungsform der vorliegenden Vorrichtung, bei der die Partikel in einem Fluidstrom vorliegen,
- Fig. 2 ein Blockdiagramm der elektronischen Torschaltung von Fig. 1, wobei die Eingangs- und Ausgangssignale an verschiedenen Punkten in der Schaltung gezeigt werden,
- Fig. 3 eine weitere Ausführungsform der Torschaltung von Fig. 1,
- Fig. 4 noch eine weitere Ausführungsform der Torschaltung von Fig. 1,
- Fig. 5 eine digitale Ausführungsform der Torschaltung,
- Fig. 6 die Laserintensität und die Partikeldurchgangszeit bei optimalen Signal- zu-Rauschen-Bedingungen,
- Fig. 7 des optimale Signal-zu-Rauschen-Verhältnis bei optimalen Laserintensitäten in Abhängigkeit von der Durchgangszeit,
- Fig. 8 Ergebnisse des Betriebs der Vorrichtung von Fig. 1 in Graphform,
- Fig. 9 ein Blockdiagramm einer weiteren erfindungsgemäßen Ausführungsform zum Zählen und Lokalisieren fluoreszenter Partikel oder Moleküle auf einem Substrat,
- Fig. 10 eine schematische Darstellung noch einer weiteren erfindungsgemäßen Ausführungsform zum Zählen und Lokalisieren fluoreszierender Partikel oder Moleküle auf einem Substrat,
- Fig. 11 eine schematische Darstellung einer weiteren erfindungsgemäßen Ausfüh rungsform zum Zählen und Lokalisieren fluoreszierender Partikel oder Moleküle auf einem Substrat.
- Bei der Vorrichtung von Fig. 1 wird eine Laserstrahl 11 durch einen Laser 12 durch eine Polarisiereinrichtung 13 projiziert und durch eine Linse 14 auf den Fluidstrom fokussiert, wie durch den fokussierten Strahl 16 gezeigt. Der Strahl wird auf einen fließenden Probenfluidstrom 17, der in einer Kapillarröhre 18 fließt, fokussiert. Schematisch ist eine Flußsteuerungseinrichtung 19 gezeigt, die zum Steuern der Fließgeschwindigkeit des Stroms 17 dient. Die Laserpolarisierung ist durch die Polarisierungseinrichtung 13 zum Minimieren der Hintergrundstreuung in der Streuebene ausgerichtet. Der Laserstrahl beleuchtet den in der vergrößerten Darstellung 22 gezeigten Bereich 21. Eine Abbildung des beleuchteten Volumens wird durch die Objektivlinse 24 auf ein Raumfilter 23 abgebildet. Das Raumfilter 23 verkleinert den beleuchteten Bereich und das zu untersuchende Volumen auf das durch die Referenznummer 26 bezeichnete Volumen. Das Raumfilter definiert die Höhe und Breite des Probenvolumens. Ein Spektrumsfilter 28 filtert aus dem beleuchteten Volumen kommende gestreute Rayleigh- und Raman-Emission heraus. Die durch das Raum- und das Spektrumsfilter hindurchgelassene Energie wird durch eine Fokussierungslinse 28 auf einen Fotowandler 29, der eine Fotovervielfacherröhre oder ein anderer Fotowandler mit der erforderlichen Empfindlichkeit sein kann, fokussiert.
- Wenn ein fluoreszierendes Partikel 31 durch den Laserstrahl fließt und von diesem bestrahlt wird, wird ein Photonenburst erzeugt. Dieser Photonenburst wird zusammen mit der Hintergrundemission von der Fotovervielfacherröhre erfaßt, die ein Ausgangssignal erzeugt. Dieses Ausgangssignal wird an eine elektronische Torschaltung 33 geleitet, die so konstruiert ist, daß sie Bursts einer bestimmten Amplitude und Dauer erkennen kann. Die interessierenden Bursts haben eine Dauer, die der Durchgangszeit durch das Volumen entspricht, und mindestens eine Mindestamplitude. Wenn ein solcher Burst erfaßt wird, wird das resultierende Signal an den Zähler 34 und an einen Computer 36 weitergeleitet, der die verarbeiteten, über vorbestimmte Zeiträume vorgenommenen Zählungen verarbeiten kann und eine Konzentrationsanzeige oder andere relevante Information liefert.
- Bei Fig. 2 wird in Fig. 2A das Ausgangssignal von der Fotovervielfacherröhre gezeigt, das neben mehreren Photonenbursts, wobei die niedrigfrequente Hintergrundemission 38 Rayleigh- und Raman-Streuung darstellt und die hochfrequenten Bursts 39 ein durch das Probenvolumen gehendes Partikel darstellen, elektronisches Rauschen 40 aufweist. Das von der Fotovervielfacherröhre kommende Signal wird an eine Impulshöhenunterscheidungsschaltung 41 weitergeleitet, die Impulse vorbestimmter Amplituden hindurchläßt, und dann an einen Frequenz-Spannungs-Wandler 42, der die Frequenz der Impulse in eine Spannung 43 umwandelt. Danach wird die Spannung 43 an eine Impulshöhenunterscheidungsschaltung 44 geleitet, die zwei Ausgangsimpulse 46 und 47 erzeugt und niederfrequente Hintergrundemissionen herausfiltert. Ein Impulsbreiten-Spannungs-Wandler 48 empfängt die Impulse und erzeugt das mit 51, 52 in Fig. 2E gezeigte Ausgangssignal.
- Eine Impulshöhenunterscheidungsschaltung 53 erfaßt die Impulse 51 und 52 und erzeugt einen Ausgangsimpuls 54, wenn der Impuls 52 eine vorbestimmte Amplitude übersteigt oder in einem durch die zwei punktierten Linien in Fig. 2E gezeigten Bereich liegt. Eine Fensterunterscheidungsschaltung kann zum Herausfiltern sehr langer, physikalisch nicht sinnvoller Impulse eingesetzt werden. Die Amplitude ist der Anzeiger für die Anwesenheit eines Partikels. Die Schaltung filtert hochfrequente, spitze, kurz andauernde elektronische Zacken 40, wie sie durch den Impuls 51 dargestellt sind, ebenso heraus wie niederfrequente Hintergrundemissionen 38.
- Ein alternatives Erfassungsverfahren ist in Fig. 3 gezeigt, bei dem das Signal von der Fotovervielfacherröhre 29 an einen Strom-Spannungs-Wandler 52 weitergeleitet wird, der ein im wesentlichen dem in Fig. 2C gezeigten entsprechendes Signal erzeugt. Das Signal kann dann an die Implshöhenunterscheidungsschaltung 44 und die Impulsbreitenunterscheidungsschaltungen 48 zum Erzeugen eines die Anwesenheit von Partikeln anzeigenden Signals angelegt werden.
- Fig. 4 ist eine verallgemeinertes Blockdiagramm der Verarbeitungsschaltung, die die oben beschriebene Impulshöhenunterscheidungsschaltung und Impulsbreitenunterscheidungsschaltung 48 aufweist.
- In Fig. 5 ist eine digitale Schaltung zum Durchführen der Impulshöhen- und Impulsbreitenunterscheidung zum Erfassen gültiger Photonenbursts von fluoreszierenden Partikeln dargestellt. Das aus der Fotovervielfacherröhre kommende Ausgangssignal wird verstärkt 56 und an die Impulshöhenunterscheidungsschaltung 57 zum Erzeugen eines Signal des in Fig. 2B gezeigten Typs geleitet. Das aus der Impulshöhenunterscheidungsschaltung kommende Ausgangssignal wird an eine Zählerschaltung geleitet, die durch den ersten ankommenden Impuls ausgelöst wird. Der Impuls schließt auch ein Tor und startet eine veränderbare Verzögerungsschaltung 59, die auf die Durchgangszeit des Moleküls durch den Laserstrahl eingestellt wird. Der Zähler fährt mit der Zählung fort, bis die verstellbare Verzögerungsschaltung den Zähler 61 stoppt, den Zähler zurückstellt und das Tor öffnet, damit ein neuer Verzögerungszyklus anfangen kann. Eine Größenvergleichsschaltung 62 vergleicht die Zahl der Zählungen, die der Zähler während der Verzögerungszeit erzeugt, mit einem vorbestimmten Hintergrundwert, da die Fluoreszenzbursts von den Partikeln eine höhere Zählungsquote als die Hintergrundemission aufweisen. Wenn die Zahl einen vorbestimmten Hintergrundwert übersteigt, ist das ein Anzeichen dafür, daß ein Molekül durch den Strahl gelangte, und es erfolgt eine Zählung.
- Bei der Erfassung einzelner Partikel oder Moleküle ist es wichtig, Bedingungen zu schaffen, die das Ereignis des einzelnen Partikels oder Moleküls so hell wie möglich im Vergleich zu den Fluktuationen der Hintergrundemission gestalten. In dieser Hinsicht muß der Laser eng fokussiert sein, und das Raumfilter muß ein Sondenvolumen definieren, das so klein ist, daß die Wahrscheinlichkeit mehrerer im Volumen vorhandener Moleküle oder Partikel vernachlässigbar gering ist. Die Laserenergie muß so gewählt werden, daß die hellste Fluoreszenz ohne eine übermäßige Hintergrundemission erzeugt wird.
- Zum Erhalten der zum Erfassen einzelner Moleküle durch laserinduzierte Fluoreszenz benötigten Sensibilität müssen die einfallende Laser-Erregungsintensität und die Durchgangszeit der Moleküle durch den Laserstrahl gesteuert werden. Die hier erarbeitete Theorie und die entsprechenden Experimente haben ergeben, daß die Sättigung der Absorption des erregten Zustands und der Grundwert des photochemischen Photozerstörungsorts die Laserenergie und die Belichtungszeit (Durchgangszeit) beschränken, die das beste Signal-zu-Rauschen- Verhältnis ergeben. Zum Definieren der optimalen Bedingungen ist es sinnvoll, wenn zuerst einmal die relevanten Variablen definiert werden:
- (1) Die zu beobachtende Fluoreszenzemissionszerfallsrate wird als kf (in Photon/s) definiert;
- (2) die Erregungsrate der molekularen Absorption ist durch ka (in Photon/s) gegeben. Diese Rate hängt von der einfallenden Lichtintensität und vom optischen Absorptionsquerschnitt im Molekül ab.
- ka = l a (1)
- Hier ist a der Absorptionsquerschnitt (in cm²/Molekül), der mit dem herkömmlichen Molarextinktionskoeffizienten ε (in l/(mol cm)) zusammenhängt durch:
- a= 3,824 x 10&supmin;²¹ε (2)
- (3) die Durchgangszeit des Moleküls durch den Laserstrahl oder die Überstreichzeit des Strahls über das Molekül ist durch τt = w/v (in s) gegeben, wobei w die Breite des Laserstrahls ist und v die Geschwindigkeit.
- (4) Die charakteristische Photozerstörungsrate kpd (in s&supmin;¹) definiert die Rate erster Ordnung, bei der die Moleküle durch Licht zerstört werden. Sie hängt mit dem Photozerstörungs-Quantenertrag Φpd zusammen durch
- kpd = Φpd kf (3)
- Die charakteristische Photozerstörungszeit τpd ist durch den Reziprokwert von kpd gegeben.
- Die Gleichung (4) unten gibt die Fluoreszenz pro Molekül, geteilt durch die Wurzel des mittleren Hintergrundsignals pro Durchgangszeit an. Das ist ein Signal-zu-Rauschen-Verhältnis, da ein Interesse an der Optimierung des Signals (Fluoreszenz pro Molekül) im Verhältnis zu den Fluktuationen des Hintergrunds besteht. Die Gleichung ist die folgende:
- S/ B (kτ)-1/2 [1 - exp{-k τ/(k + 1 )}] (4) In dieser Gleichung ist die Variable k als ka/kf und τ als τt/τpd definiert. Die Optimierung des Experiments hängt also von dem Verhältnis der Erregungsrate zur Emissionsrate (ka/kf) und vom Verhältnis der Durchgangszeit zur Photozerstörungszeit (τt/τpd) ab. Eine zweidimensionale Darstellung von S/ B in Abhängigkeit von k und τ ist in Fig. 6 dargestellt. Dies ist eine grundlegende Funktion, die auf alle Fluorophore zutrifft.
- Zum Optimieren der Bedingungen für ein bestimmtes Fluorophor ist es lediglich nötig, die charakteristische Fotozerstörungszeit und die beobachtete Fluoreszenzdauer zu wissen. Die Punkte in Fig. 6 geben die optimalen S/ B-Werte bei den optimalen Lichtintensitäten bei Durchgangszeiten τ von 0 bis drei an. Fig. 7 is eine Darstellung des optimalen S/ B in Abhängigkeit von der Durchgangszeit. Zum Durchführen eines Experiments wählt man lediglich die längste für das betreffende Experiment praktikable Durchgangszeit und wählt die Erregungsintensität, die bei dieser Durchgangszeit eine maximales S/ B ergibt.
- Die Vorrichtung von Fig. 1 und 2 wurde zum Erfassen von Einzelmolekülfluoreszenz in einer subpicomolaren Lösung von Monomeren und Dimeren von B- Phycoerythrin (PE) verwendet. Der Argonlaser 12 lieferte einen Erregungsstrahl, der auf einen ein paar µm messenden Punkt in der Mitte eines in einer Kapillarröhre 18 fließenden Probenstroms 17 fokussiert wurde. Die Fließgeschwindigkeit wurde so gewählt, daß eine Durchgangszeit entstand, die ungefähr gleich der Photozerstörungszeit für PE war, und die Laserintensität wurde so gewählt, daß sie ein optimales S/ B ergab, wie in Fig. 6 und 7 angegeben. Die Fluoreszenzemission wurde durch eine Mikroskopobjektiv 24 gesammelt und auf ein Raumfilter 23 abgebildet. Das Raumfilter definierte das Sondenvolumen und filterte Streulicht und Fluoreszenz von den Wänden der Kapillarröhre heraus. Ein Fluoreszenzinterferenzfilter 27 wurde zum Herausfiltern von Rayleigh- und Raman-Streuung verwendet. Die Fluoreszenz wurde mit einer Fotovervielfacherröhre und einer Verstärkungs-/Unterscheidungsschaltung erfaßt. Der Fluoreszenzburstdetektor in Fig. 2 wurde dann zum Aufzeichnen der Anzahl von Ereignissen on-line und in Echtzeit verwendet.
- Fig. 8 ist die Aufzeichnung der Anzahl von Einzelmolekülereignissen im Verhältnis zu der Aufzeichnung der Konzentration von PE-Monomeren und - Dimeren.
- Die Regressionslinien dieser zwei Funktionen haben eine Steigung, die eins ziemlich nahe kommt, nämlich 1,05 für die Monomerdaten und 1,15 für die Dimerdaten. Die lineare Konzentrationsabhängigkeit beweist, daß es sich hier um Einzelmolekülereignisse handelt. Der dynamische Bereich wird durch die Abtastzeit bei niedrigen Konzentrationen und durch vielfaches Vorkommen bei hohen Konzentrationen begrenzt. Bei Werten über 10&supmin;¹² M bewegt sich der Durchschnittswert aufgrund der Fluoreszenz um das Probenvolumen herum nach oben. Diese Experimente wurden alle mit einer ausreichend geringen Konzentration durchgeführt, so daß die Wahrscheinlichkeit für ein Einzelvorkommen geringer als ungefähr 0,02 war. Dadurch wird weiterhin sichergestellt, daß es sich um Einzelmolekülereignisse handelt.
- In Fig. 1 fließt die Fiuidlösung durch den beleuchteten Bereich, wobei Partikel einen Burst von Photonen emittieren, während sie im Volumen sind. Es ist offensichtlich, daß der beleuchtete Bereich über eine Oberfläche oder eine Folie auf einem Substrat zum Lokalisieren und Erfassen von Partikeln bewegt werden kann Der Endeffekt ist der gleiche, da die Partikel nur während der Durchgangszeit τ, während der sie beleuchtet sind, emittieren. Durch Bewegen des Lichtstrahls im Verhältnis zur Oberfläche oder durch Bewegen des Substrats zum Beispiel auf einem Objektträger oder dergleichen ist es möglich, den gesamten auf dem Substrat oder dem Objektträger liegenden Bereich zum Lokalisieren oder Zählen der Partikel zu bestreichen.
- Mit Bezug auf Fig. 9 kann die Lösung auf einem Substrat oder einem Objektträger 67 als ein dicker Film 66, in Filterpapier oder in Gel getragen werden, das durch eine geeignete X-Y-Antriebseinrichtung wie zum Beispiel durch Zahnstangenantriebe, Schrittmotoren oder dergleichen bewegt werden. Licht von einer Lichtquelle 68, die ein Laser oder dergleichen sein kann, wird auf den Objektträger durch eine Linse 69 fokussiert. Das Licht gelangt durch einen Strahlteiler 71 und trifft auf die Probenlösung. Die von der Lösung emittierten Photonen werden durch den dichroitischen Strahlteiler an die Sammlungsoptik 72, das Raumfilter 73, das Spektrumsfilter 74 und den Detektor 76 reflektiert. Wie oben beschrieben, definiert das Raumfilter den Bereich, der betrachtet wird, und das Spektrumsfilter filtert gestreute Rayleigh- und Raman-Emissionen. Das Signal wird dann durch die Torschaltung 33 verarbeitet, durch den Zähler 34 gezählt und an den Computer 36, wie zuvor beschrieben, weitergeleitet. Dadurch wird hier ein Scanner für fluoreszierende einzelne Partikel zur Verwendung in Verbindung mit einem Objektträger oder dergleichen vorgesehen. Durch Steuern des X-Y-Antriebs kann der gesamte Film analysiert werden. Die Durchgangszeit τ der Partikel im beleuchteten Volumen wird durch die Bewegungsgeschwindigkeit der Objekttische bestimmt Der Bereich kann wie gewünscht abgetastet werden. Eine der oben beschriebenen elektronischen Verarbeitungsschaltungen kann zum Verarbeiten des Ausgangssignals des Detektors verwendet werden, wodurch ein Partikelidentifikationsausgangssignal erzeugt wird.
- Fig. 10 zeigt eine weitere Vorrichtung zum Abtasten von Film 66 auf einem Substrat 67. Hier wird das Substrat nicht in einer Translationsbewegung bewegt, sondern das Substrat ist stationär, und der projizierte Strahl wird durch die Abtastbewegung eines Spiegels oder einer Baugruppe über die Probe geführt. In Fig. 10 projiziert eine Lichtquelle 78 einen Lichtstrahl 79, der durch den dichroitischen Strahlteiler 81 gelangt, durch die Abtastspiegelanordnung 82 abgelenkt und von der Abtastlinse 83 auf den Film 66 fokussiert wird. Die emittierte Photonenenergie wird von der Abtastlinse gesammelt, von der Abtastspiegel anordnung auf einen Strahlteiler gelenkt, wonach sie auf die Fokussierungs- und Sammlungsoptik 72 trifft, durch das Raumfilter 73, das Spektrumsfilter 74 gelangt und von einem Detektor 76 gesammelt wird. Das Ausgangssignal wird dann von der elektronischen Toreinrichtung 33, dem Zähler 34 analysiert und dann zum Computer 36 weitergeleitet. Der Abtastspiegel kann zwei Abtast-Galvanometerspiegel die durch an die Galvanometermotoren geleitete Signale zum Anstellen der Spiegel abgelenkt werden, verstellen. Ein Spiegel wird mit großer Geschwindigkeit in einer ersten Richtung zum Überstreichen der Probe bewegt, und ein zweiter Spiegel mit geringerer Geschwindigkeit zum Weiterbewegen der Abtastung erzeugt eine Rasterabtastung der durch die Linien 84 gezeigten Art. Alternativ kann der Strahl langsam in der x- Richtung durch einen Schrittmotor oder dergleichen bewegt werden. Wieder liefern mit dem Detektor zusammenhängende elektronische Ströme die notwendige Signalunterscheidung zum Identifizieren und Erfassen einzelner Partikel.
- In Fig. 11 ist gezeigt, wie das Substrat 67 und der Film 66 auf einem Translationstisch des im Zusammenhang mit Fig. 9 beschriebenen Typs angeordnet sind. Eine Lichtquelle 86 liefert Energie an einen dichroitischen Strahlteiler 87 und die Energie wird durch die Linse 88 auf den Film 66 fokussiert. Die emittierte Energie wird durch die Linse 88 aufgenommen und durch den dichroitischen Strahlteiler 87 durch ein Spektrumsfilter 89, Fokussierlinse 91 und Raumfilter 92 zum Detektor 93 geleitet. Das vom Detektor kommende Ausgangssignal wird durch die elektronische Schaltung verarbeitet, die die elektronische Toreinrichtung 33, den Zähler 34 und den Computer 36 aufweist.
- Es erweist sich, daß bei jedem der obigen Beispiele die Elektronik und die Ansteuerung darauf beruht, daß beim entweder durch Bewegung des Partikels oder durch Bewegen des beleuchteten Bereichs erfolgenden Durchgehen eines fluoreszenten Moleküls oder Partikels durch das beleuchtete Volumen, es über einen vorbestimmten Zeitraum beleuchtet wird und einen Photonenburst emittiert. Dieser Photonenburst kann von Hintergrundemission durch einen erfindungsgemäßen Einzelpartikelburstdetektor unterschieden werden, der nur anspricht, wenn die Photonenbursts die richtigen Amplitude und Dauer oder Breite haben.
- Die Erfindung wurde zwar anhand einer bestimmten Ausführungsform beschrieben, doch soll die Beschreibung die Erfindung nur veranschaulichen und ist nicht als die Erfindung einschränkend zu verstehen. Verschiedene Modifikationen und Anwendungsweisen mögen dem Fachmann einfallen, ohne daß dadurch vom Umfang der Erfindung, wie er in den Patentansprüchen definiert ist, abgewichen wird.
Claims (8)
1. Vorrichtung zum Erfassen einzelner fluoresziernder Partikel und/oder
Moleküle in einem Fluid mit:
einer Einrichtung zum Beleuchten eines vorbestimmten Volumens des
Fluids;
einer Einrichtung zum Durchbringen von Partikeln und/oder Molekülen
durch das beleuchtete Volumen, wobei Bursts floureszierender Energie von den
Partikeln und/oder auf die Beleuchtung ansprechenden Molekülen emittiert
werden, während sie durch das Volumen hindurchgehen; und
einer Einrichtung zum Erfassen der Bursts fluoreszierender Energie und
zum Erzeugen eines Ausgangssignals, dadurch gekennzeichnet, daß
eine Verarbeitungseinrichtung zum Empfangen des Ausgangssignals
vorgesehen ist, wobei die Verarbeitungseinrichtung eine Einrichtung zum Erfassen
der Amplitude und Dauer der Bursts und zum Unterscheiden der Bursts
fluoreszierender Energie von den Partikeln und/oder Molekülen von Hintergrundenergie
oder elektronischem Rauschen aufweist, wobei die Verarbeitungseinrichtung eine
Anzeige der Erfassung eines durch das Volumen hindurchgehenden Partikels
und/oder Moleküls erzeugt.
2. Vorrichtung nach Anspruch 1, bei der die Einrichtung zum Erfassen der
Amplitude und Dauer der Bursts einen Frequenz-Spannungs-Wandler, ein
analoges Signal, eine Impulshöhenunterscheidungseinrichtung zum Empfangen des
Signals und zum Erzeugen von Ausgangsimpulsen mit einer Impulsbreite, die der
Zeit entspricht, die das Signal einen vorbestimmten Wert überschreitet, und eine
lmpulsbreitenunterscheidungeinrichtung, die ein Ausgangssignal erzeugt, wenn
die Ausgangsimpulsbreite einen die Durchgangszeit des Partikels anzeigenden
vorbestimmten Wert überschreitet, aufweist.
3. Vorrichtung nach Anspruch 2, bei dem die
Impulsbreitenunterscheidungseinrichtung einen Impulsbreiten-Spannungs-Wandler, der die Ausgangsimpulse
empfängt und eine Ausgangsspannung erzeugt, die eine von der Impulsbreite
abhängige Amplitude hat, und eine Impulshöhenunterscheidungseinrichtung zum
Erfassen, wann die Ausgangsspannung eine vorbestimmte Amplitude
überschreitet oder in einem vorbestimmten Fenster liegt, aufweist.
4. Vorrichtung nach Anspruch 1, bei der die Einrichtung zum Erfassen der
Amplitude und Dauer der Bursts einen Strom-Spannungs-Wandler zum
Empfangen des Ausgangssignals der Erfassungeinrichtung und Erzeugen eines analogen
Ausgangssignals, eine Impulshöhenunterscheidungseinrichtung zum Empfangen
des analogen Signals und Erzeugen von Ausgangsimpulsen mit einer
Impulsbreite, die der Zeit entspricht, die das Signal ein vorbestimmtes Volumen
überschreitet, und eine Impulsbreitenunterscheidungseinrichtung, die ein Ausgangssignal
erzeugt, wenn die Ausgangsimpulsbreite einen vorbestimmten Wert überschreitet
oder in einem vorbestimmten Fenster oder Bereich liegt, der die Durchgangszeit
eines Partikels durch das Volumen anzeigt, aufweist.
5. Vorrichtung nach Anspruch 1, bei der die Einrichtung zum Erfassen der
Amplitude und Dauer der Bursts eine Einrichtung zum Zählen von über
vorbestimmte Zeiträume emittierten Photonen und zum Erzeugen eines einen Partikel
und/oder ein Molekül anzeigenden Ausgangssignals, wenn die Zählung einen
vorbestimmten Wert überschreitet, aufweist.
6. Verfahren zum Erfassen einzelner fluoresziernder Partikel und/oder
Moleküle in einem Fluid mit den folgenden Schritten:
Beleuchten eines vorbestimmten Volumens des Fluids,
Durchschicken von Partikeln und/oder Molekülen durch das beleuchtete
Volumen, wodurch Bursts zu emittierender fluoreszierender Energie erzeugt
werden, und
Erfassen der Energie und Erzeugen eines Ausgangssignals aus den
durchgehenden Partikeln und/oder Molekülen, dadurch gekennzeichnet, daß
das Signal in der folgenden Weise vearbeitet wird:
es werden Hintergrundenergie darstellende elektrische Signale gesperrt
und
es wird ein Ausgangssignal erzeugt, wenn elektrische Signale eine
Amplitude und Dauer haben, die der Durchgangszeit der Partikel und/oder Moleküle
durch das Volumen entspricht, wodurch eine Anzeige der durch das Volumen
hindurchgehenden Partikel und/oder Moleküle erstellt wird.
7. Verfahren nach Anspruch 6, mit dem folgenden Schritt:
Wählen der Beleuchtungsenergie und der Durchgangszeit der Partikel
und/oder Moleküle durch das vorbestimte Volumen zum Herstellen des optimalen
Verhältnisses von emittierter Energie von Partikeln und/oder Molekülen zur
Hintergrundenergie oder Energiefluktuation.
8. Verfahren nach Anspruch 7, bei dem die Verfahrensschritte den folgenden
Schritt enthalten: Verwenden der Fluoreszenzemissionsdauer und
Fluoreszenzlichtzerstörungszeit von Fluorophoren als bestimmende Faktoren.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US07/358,782 US4979824A (en) | 1989-05-26 | 1989-05-26 | High sensitivity fluorescent single particle and single molecule detection apparatus and method |
PCT/US1990/002702 WO1990014589A1 (en) | 1989-05-26 | 1990-05-21 | High sensitivity fluorescent single particle and single molecule detection apparatus and method |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE69028370D1 DE69028370D1 (de) | 1996-10-10 |
DE69028370T2 true DE69028370T2 (de) | 1997-03-13 |
Family
ID=23411024
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE69028370T Expired - Lifetime DE69028370T2 (de) | 1989-05-26 | 1990-05-21 | Hochempfindliche fluoreszierende einzelteilchen, gerät und verfahren zum nachweis einzelner moleküle |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US4979824A (de) |
EP (1) | EP0426829B1 (de) |
JP (1) | JPH04500274A (de) |
AT (1) | ATE142334T1 (de) |
AU (1) | AU624047B2 (de) |
DE (1) | DE69028370T2 (de) |
WO (1) | WO1990014589A1 (de) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19844931C1 (de) * | 1998-09-30 | 2000-06-15 | Stefan Seeger | Verfahren zur DNS- oder RNS-Sequenzierung |
Families Citing this family (99)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5541061A (en) * | 1992-04-29 | 1996-07-30 | Affymax Technologies N.V. | Methods for screening factorial chemical libraries |
JP2575270B2 (ja) * | 1992-11-10 | 1997-01-22 | 浜松ホトニクス株式会社 | 核酸の塩基配列決定方法、単一分子検出方法、その装置及び試料の作成方法 |
FI96638C (fi) * | 1992-11-17 | 1996-07-25 | Biohit Oy | "Inner-filter"-korjaus fluorometripohjaisella monitoimintoisella laitteella |
AU673245B2 (en) * | 1993-02-01 | 1996-10-31 | Seq, Ltd. | Methods and apparatus for DNA sequencing |
US5547849A (en) * | 1993-02-17 | 1996-08-20 | Biometric Imaging, Inc. | Apparatus and method for volumetric capillary cytometry |
US6864048B2 (en) * | 1993-04-28 | 2005-03-08 | Affymetrix, Inc. | Factorial chemical libraries |
US5439578A (en) * | 1993-06-03 | 1995-08-08 | The Governors Of The University Of Alberta | Multiple capillary biochemical analyzer |
ATE237129T1 (de) * | 1994-09-02 | 2003-04-15 | Bd Biosciences Systems And Rea | Verfahren und vorrichtung zur eichung eines optischen abtasters |
DE19649048C1 (de) * | 1996-11-27 | 1998-04-09 | Evotec Biosystems Gmbh | Verfahren zur Unterscheidung oder Erfassung von Partikeln in einer Probe durch Identifizierung von Signalabschnitten zeitaufgelöster, optischer Rohsignale aus der Probe auf Basis von Einzelphotonendetektion |
WO1998035012A2 (en) | 1997-02-12 | 1998-08-13 | Chan Eugene Y | Methods and products for analyzing polymers |
US6710871B1 (en) * | 1997-06-09 | 2004-03-23 | Guava Technologies, Inc. | Method and apparatus for detecting microparticles in fluid samples |
ES2626646T3 (es) * | 1997-06-09 | 2017-07-25 | Emd Millipore Corporation | Método y aparato para detectar micropartículas en muestras de fluidos |
US6049380A (en) * | 1997-11-12 | 2000-04-11 | Regents Of The University Of California | Single molecule identification using selected fluorescence characteristics |
SE9800360D0 (sv) | 1998-02-06 | 1998-02-06 | Goeteborg University Science I | Method, apparatus and flow cell for high sensitivity detection of fluorescent molecules |
US6780591B2 (en) | 1998-05-01 | 2004-08-24 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
US7875440B2 (en) | 1998-05-01 | 2011-01-25 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
US20100130368A1 (en) * | 1998-07-30 | 2010-05-27 | Shankar Balasubramanian | Method and system for sequencing polynucleotides |
US20040106110A1 (en) * | 1998-07-30 | 2004-06-03 | Solexa, Ltd. | Preparation of polynucleotide arrays |
JP2002521064A (ja) * | 1998-07-30 | 2002-07-16 | ソレックサ リミテッド | アレイ生体分子およびシークエンシングにおけるその使用 |
US6263286B1 (en) | 1998-08-13 | 2001-07-17 | U.S. Genomics, Inc. | Methods of analyzing polymers using a spatial network of fluorophores and fluorescence resonance energy transfer |
AU772281B2 (en) * | 1998-12-14 | 2004-04-22 | Li-Cor Inc. | A system and methods for nucleic acid sequencing of single molecules by polymerase synthesis |
US6818395B1 (en) | 1999-06-28 | 2004-11-16 | California Institute Of Technology | Methods and apparatus for analyzing polynucleotide sequences |
US6927065B2 (en) * | 1999-08-13 | 2005-08-09 | U.S. Genomics, Inc. | Methods and apparatus for characterization of single polymers |
US6696022B1 (en) | 1999-08-13 | 2004-02-24 | U.S. Genomics, Inc. | Methods and apparatuses for stretching polymers |
US6569685B1 (en) | 1999-10-05 | 2003-05-27 | The Molecular Sciences Institute, Inc. | Protein fingerprint system and related methods |
JP4278901B2 (ja) * | 2000-01-27 | 2009-06-17 | アプライド プレシジョン インコーポレイテッド | 画像パネル平坦化法 |
CA2412567A1 (en) | 2000-06-07 | 2001-12-13 | Li-Cor, Inc. | Charge-switch nucleotides |
US6936702B2 (en) * | 2000-06-07 | 2005-08-30 | Li-Cor, Inc. | Charge-switch nucleotides |
US6447995B1 (en) | 2000-10-04 | 2002-09-10 | Genvec, Inc. | Utilizing intrinsic fluorescence to detect adenovirus |
WO2002044425A2 (en) | 2000-12-01 | 2002-06-06 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
WO2002061391A2 (en) * | 2001-01-31 | 2002-08-08 | The University Of Tennessee Research Corporation | Methods for detecting interaction of molecules with surface-bound reagents |
CA2440754A1 (en) | 2001-03-12 | 2002-09-19 | Stephen Quake | Methods and apparatus for analyzing polynucleotide sequences by asynchronous base extension |
AU2002258997A1 (en) * | 2001-04-24 | 2002-11-05 | Li-Cor, Inc. | Polymerases with charge-switch activity and methods of generating such polymerases |
US7118907B2 (en) * | 2001-06-06 | 2006-10-10 | Li-Cor, Inc. | Single molecule detection systems and methods |
US7076092B2 (en) * | 2001-06-14 | 2006-07-11 | The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy | High-throughput, dual probe biological assays based on single molecule detection |
US7381535B2 (en) * | 2002-07-10 | 2008-06-03 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior | Methods and compositions for detecting receptor-ligand interactions in single cells |
US7695926B2 (en) | 2001-07-10 | 2010-04-13 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for detecting receptor-ligand interactions in single cells |
US7393656B2 (en) * | 2001-07-10 | 2008-07-01 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for risk stratification |
US7563584B2 (en) | 2001-07-10 | 2009-07-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for detecting the activation state of multiple proteins in single cells |
US20030110840A1 (en) * | 2001-07-24 | 2003-06-19 | Arriaga Edgar A. | Systems and methods for detecting a particle |
US7016087B2 (en) * | 2001-08-08 | 2006-03-21 | Becton Dickinson And Company | Photon efficient scanner |
US6750457B2 (en) * | 2001-08-29 | 2004-06-15 | Becton Dickinson And Company | System for high throughput analysis |
JP2005527220A (ja) * | 2002-05-28 | 2005-09-15 | ユー.エス. ジェノミクス, インコーポレイテッド | 単一のポリマー分析を使用する方法および装置 |
KR100473360B1 (ko) * | 2002-07-31 | 2005-03-08 | 주식회사 디지탈바이오테크놀러지 | 레이저 반사를 이용한 미세 채널 위치 및 치수의 자동측정방법, 그 측정방법을 이용한 측정장치 및 그측정방법을 이용한 미세 채널 검사장치 |
US20060003333A1 (en) * | 2002-11-19 | 2006-01-05 | Singulex, Inc. | Preparation of defined highly labeled probes |
WO2004092331A2 (en) * | 2003-04-08 | 2004-10-28 | Li-Cor, Inc. | Composition and method for nucleic acid sequencing |
US20090088982A1 (en) * | 2003-07-31 | 2009-04-02 | Fukushima Noelle H | Co-detection of single polypeptide and polynucleotide molecules |
US7317521B2 (en) * | 2003-09-18 | 2008-01-08 | Micron Technology, Inc. | Particle detection method |
US20080021674A1 (en) * | 2003-09-30 | 2008-01-24 | Robert Puskas | Methods for Enhancing the Analysis of Particle Detection |
US7169560B2 (en) | 2003-11-12 | 2007-01-30 | Helicos Biosciences Corporation | Short cycle methods for sequencing polynucleotides |
US7981604B2 (en) | 2004-02-19 | 2011-07-19 | California Institute Of Technology | Methods and kits for analyzing polynucleotide sequences |
US7476734B2 (en) | 2005-12-06 | 2009-01-13 | Helicos Biosciences Corporation | Nucleotide analogs |
US7635562B2 (en) | 2004-05-25 | 2009-12-22 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and devices for nucleic acid sequence determination |
US7340957B2 (en) | 2004-07-29 | 2008-03-11 | Los Alamos National Security, Llc | Ultrasonic analyte concentration and application in flow cytometry |
US9040305B2 (en) * | 2004-09-28 | 2015-05-26 | Singulex, Inc. | Method of analysis for determining a specific protein in blood samples using fluorescence spectrometry |
JP2008514955A (ja) * | 2004-09-28 | 2008-05-08 | シンギュレックス・インコーポレイテッド | サンプル分析システムおよび方法 |
US8685711B2 (en) * | 2004-09-28 | 2014-04-01 | Singulex, Inc. | Methods and compositions for highly sensitive detection of molecules |
US7572640B2 (en) * | 2004-09-28 | 2009-08-11 | Singulex, Inc. | Method for highly sensitive detection of single protein molecules labeled with fluorescent moieties |
US7220549B2 (en) * | 2004-12-30 | 2007-05-22 | Helicos Biosciences Corporation | Stabilizing a nucleic acid for nucleic acid sequencing |
CN101194260A (zh) * | 2005-01-24 | 2008-06-04 | 利兰·斯坦福青年大学托管委员会 | 使用贝叶斯网络建立细胞信号传导系统模型的方法 |
US7482120B2 (en) | 2005-01-28 | 2009-01-27 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and compositions for improving fidelity in a nucleic acid synthesis reaction |
US7307721B2 (en) * | 2005-04-13 | 2007-12-11 | Brightwell Technologies | Particle imaging system with a varying flow rate |
US7666593B2 (en) | 2005-08-26 | 2010-02-23 | Helicos Biosciences Corporation | Single molecule sequencing of captured nucleic acids |
US7998717B2 (en) | 2005-12-02 | 2011-08-16 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Mitigation of photodamage in analytical reactions |
AU2007313488A1 (en) | 2006-04-04 | 2008-04-24 | Singulex, Inc. | Methods and compositions for highly sensitive analysis of markers and detection of molecules |
US7838250B1 (en) * | 2006-04-04 | 2010-11-23 | Singulex, Inc. | Highly sensitive system and methods for analysis of troponin |
EP3156799B1 (de) | 2006-04-04 | 2024-01-24 | Novilux, LLC | Analysator und verfahren zur hochempfindlichen detektion von analyten |
US8124943B1 (en) * | 2006-04-06 | 2012-02-28 | Lugade Ananda G | Methods and systems for altering fluorescent intensities of a plurality of particles |
WO2008019448A1 (en) * | 2006-08-18 | 2008-02-21 | Macquarie University | Time gated fluorescent flow cytometer |
US7835000B2 (en) * | 2006-11-03 | 2010-11-16 | Los Alamos National Security, Llc | System and method for measuring particles in a sample stream of a flow cytometer or the like |
US7804594B2 (en) | 2006-12-29 | 2010-09-28 | Abbott Laboratories, Inc. | Method and apparatus for rapidly counting and identifying biological particles in a flow stream |
EP2156178B1 (de) * | 2007-04-02 | 2011-12-21 | Acoustic Cytometry Systems, Inc. | Verfahren zur verbesserten Analyse von in einem akustischen Feld fokussierten Zellen und Partikeln |
US7837040B2 (en) | 2007-04-09 | 2010-11-23 | Los Alamos National Security, Llc | Acoustic concentration of particles in fluid flow |
US8083068B2 (en) | 2007-04-09 | 2011-12-27 | Los Alamos National Security, Llc | Apparatus for separating particles utilizing engineered acoustic contrast capture particles |
FR2917842A1 (fr) * | 2007-06-19 | 2008-12-26 | Commissariat Energie Atomique | Dispositif et methode de comptage de particules elementaires emises par un fluide dans un conduit. |
US20090087860A1 (en) * | 2007-08-24 | 2009-04-02 | Todd John A | Highly sensitive system and methods for analysis of prostate specific antigen (psa) |
US8528406B2 (en) | 2007-10-24 | 2013-09-10 | Los Alamos National Security, LLP | Method for non-contact particle manipulation and control of particle spacing along an axis |
US8263407B2 (en) | 2007-10-24 | 2012-09-11 | Los Alamos National Security, Llc | Method for non-contact particle manipulation and control of particle spacing along an axis |
US8159670B2 (en) | 2007-11-05 | 2012-04-17 | Abbott Laboratories | Method and apparatus for rapidly counting and identifying biological particles in a flow stream |
EP2232271B1 (de) | 2007-12-19 | 2019-09-11 | Singulex, Inc. | Scanning-analysegerät zur einzelmolekülerkennung und verfahren zu seiner anwendung |
US8266951B2 (en) | 2007-12-19 | 2012-09-18 | Los Alamos National Security, Llc | Particle analysis in an acoustic cytometer |
US8714014B2 (en) | 2008-01-16 | 2014-05-06 | Life Technologies Corporation | System and method for acoustic focusing hardware and implementations |
US20090234202A1 (en) * | 2008-03-05 | 2009-09-17 | Goix Philippe J | Method and compositions for highly sensitive detection of molecules |
US20090291458A1 (en) * | 2008-05-22 | 2009-11-26 | Nodality, Inc. | Method for Determining the Status of an Individual |
EP2304436A1 (de) | 2008-07-10 | 2011-04-06 | Nodality, Inc. | Diagnose-, prognose- und behandlungsverfahren |
US8399206B2 (en) | 2008-07-10 | 2013-03-19 | Nodality, Inc. | Methods for diagnosis, prognosis and methods of treatment |
GB2464183A (en) * | 2008-09-19 | 2010-04-14 | Singulex Inc | Sandwich assay |
US8450069B2 (en) * | 2009-06-08 | 2013-05-28 | Singulex, Inc. | Highly sensitive biomarker panels |
CN102782479B (zh) * | 2010-03-01 | 2014-04-30 | 奥林巴斯株式会社 | 光学分析装置、光学分析方法 |
US20110301053A1 (en) | 2010-05-06 | 2011-12-08 | Singulex, Inc. | Methods for Diagnosing, Staging, Predicting Risk for Developing and Identifying Treatment Responders for Rheumatoid Arthritis |
US8834847B2 (en) | 2010-08-12 | 2014-09-16 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Photodamage mitigation compounds and systems |
JP5856983B2 (ja) | 2011-01-20 | 2016-02-10 | オリンパス株式会社 | 単一発光粒子からの光の検出を用いた光分析方法及び光分析装置 |
CN102959744B (zh) * | 2011-06-29 | 2015-08-19 | 松下电器产业株式会社 | 发光元件的制造方法及发光元件的制造装置 |
CN103765196B (zh) | 2011-08-26 | 2016-03-02 | 奥林巴斯株式会社 | 利用单个发光粒子检测的光分析装置及光分析方法 |
EP2752655A4 (de) | 2011-08-30 | 2015-06-17 | Olympus Corp | Verfahren zum nachweis von zielpartikeln |
EP2790008B1 (de) * | 2011-12-05 | 2017-11-15 | Rion Co., Ltd. | Biopartikelzähler, biopartikelzählverfahren, dialysatüberwachungssystem und wasserreinigungsüberwachungssystem |
US9028776B2 (en) | 2012-04-18 | 2015-05-12 | Toxic Report Llc | Device for stretching a polymer in a fluid sample |
JP6360481B2 (ja) | 2013-07-31 | 2018-07-18 | オリンパス株式会社 | 単一発光粒子検出技術を用いた光学顕微鏡装置、顕微鏡観察法及び顕微鏡観察のためのコンピュータプログラム |
JPWO2017098597A1 (ja) | 2015-12-09 | 2018-10-11 | オリンパス株式会社 | 単一発光粒子検出を用いた光分析方法及び光分析装置 |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB696675A (en) * | 1950-02-17 | 1953-09-09 | Ici Ltd | Improvements in and relating to methods of, and apparatus for, determining the concentration of particulate matter contained in liquid suspensions or colloidal solutionsor of solutes in true solutions |
US3536898A (en) * | 1967-12-04 | 1970-10-27 | Us Navy | Detection device |
US4021117A (en) * | 1975-08-07 | 1977-05-03 | Hildegard Gohde | Process for automatic counting and measurement of particles |
US4573798A (en) * | 1981-09-16 | 1986-03-04 | Toshiba Kikai Kabushiki Kaisha | Method and apparatus for measuring pattern area percentage for engraving films |
JPS59174742A (ja) * | 1983-03-25 | 1984-10-03 | Agency Of Ind Science & Technol | 微小粒子を区分又は選別する方法及びその装置 |
US4573796A (en) * | 1984-01-06 | 1986-03-04 | The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy | Apparatus for eliminating background interference in fluorescence measurements |
US4793705A (en) * | 1987-10-07 | 1988-12-27 | The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy | Single molecule tracking |
FR2628530B1 (fr) * | 1988-03-08 | 1994-01-28 | Chemunex Sa | Appareil et procede de detection et de numeration de particules fluorescentes, portees par un support solide |
-
1989
- 1989-05-26 US US07/358,782 patent/US4979824A/en not_active Expired - Lifetime
-
1990
- 1990-05-21 JP JP2508232A patent/JPH04500274A/ja active Pending
- 1990-05-21 EP EP90908805A patent/EP0426829B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1990-05-21 AT AT90908805T patent/ATE142334T1/de not_active IP Right Cessation
- 1990-05-21 AU AU56776/90A patent/AU624047B2/en not_active Expired
- 1990-05-21 WO PCT/US1990/002702 patent/WO1990014589A1/en active IP Right Grant
- 1990-05-21 DE DE69028370T patent/DE69028370T2/de not_active Expired - Lifetime
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19844931C1 (de) * | 1998-09-30 | 2000-06-15 | Stefan Seeger | Verfahren zur DNS- oder RNS-Sequenzierung |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE69028370D1 (de) | 1996-10-10 |
EP0426829B1 (de) | 1996-09-04 |
WO1990014589A1 (en) | 1990-11-29 |
EP0426829A1 (de) | 1991-05-15 |
AU5677690A (en) | 1990-12-18 |
EP0426829A4 (en) | 1992-05-06 |
AU624047B2 (en) | 1992-05-28 |
US4979824A (en) | 1990-12-25 |
ATE142334T1 (de) | 1996-09-15 |
JPH04500274A (ja) | 1992-01-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DE69028370T2 (de) | Hochempfindliche fluoreszierende einzelteilchen, gerät und verfahren zum nachweis einzelner moleküle | |
DE69628542T2 (de) | Verfahren und vorrichtung zur durchflusscytometrie | |
DE69417900T2 (de) | Vorrichtung und Verfahren zum schnellen und hochempfindlichen Erkennen und Zählen von Mikroorganismen mittels Fluoreszenz | |
EP0056426B1 (de) | Vorrichtung zur Darstellung von Probenparametern | |
DE3930027C2 (de) | Teilchenmeßgerät | |
DE69521558T2 (de) | Vorrichtung und Verfahren zur Zytometrie unter Verwendung einer Kapillarküvette mit definiertem Volumen | |
EP1248947B1 (de) | Verfahren und vorrichtung zur charakterisierung einer kulturflüssigkeit | |
DE69615818T2 (de) | Ein biospezifisches multiparametrisches testverfahren | |
DE69217899T2 (de) | Gerät zur Teilchenbildanalyse | |
EP0508257B1 (de) | Spektroskopiekorrelierte Licht-Rastermikroskopie | |
DE3531891C2 (de) | ||
DE69517864T2 (de) | Verfahren und Vorrichtung zur Zählung und Klassifizierung von Zellen | |
DE68924749T2 (de) | Kennzeichnung von Teilchen durch modulierte dynamische Lichtstreuung. | |
DE69115876T2 (de) | Bildgebender Durchflusszytometer | |
EP0822395B1 (de) | Verfahren und Vorrichtung zur Raman-Korrelationsspektroskopie | |
DE69221668T2 (de) | Gerät zur Zellenanalyse im Urin | |
DE69125574T2 (de) | Vorrichtung zur Auswertung fluoreszenzmarkierter Gelelektrophoresemuster | |
DE69209886T2 (de) | Gerät zur Zellenanalyse im Urin | |
DE68919165T2 (de) | In einer automatischen Anlage für chemische Analysen angewendeter Fluorophotometer zur Messung der Fluoreszenzintensität in der automatischen Anlage. | |
DE69804612T2 (de) | Verfahren zur charakterisierung von proben unter verwendung statistischer zwischendaten | |
DE1958101A1 (de) | Verfahren und Vorrichtung zum Analysieren von Mikro-Teilchen | |
DE69220598T2 (de) | Optisches Nahfeldabtastmikroskop | |
DE3026185C2 (de) | Zusammensetzung, geeignet zur Untersuchung biologischer Gewebe oder Flüssigkeiten und Verfahren zu deren Anwendung | |
DE68906443T2 (de) | Apparat und verfahren zur nachweisung und zaehlung fluoreszierender, auf einer festen unterlage getragener teilchen. | |
DE69635296T2 (de) | Automatisierte optische Ausrichtung mit Hilfe eines galvanometrischen Abtasters |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
8364 | No opposition during term of opposition |