DE19816186A1 - GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten - Google Patents

GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten

Info

Publication number
DE19816186A1
DE19816186A1 DE1998116186 DE19816186A DE19816186A1 DE 19816186 A1 DE19816186 A1 DE 19816186A1 DE 1998116186 DE1998116186 DE 1998116186 DE 19816186 A DE19816186 A DE 19816186A DE 19816186 A1 DE19816186 A1 DE 19816186A1
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
dna
gdnf
sequence
exon
sequences
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
DE1998116186
Other languages
English (en)
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Helmholtz Zentrum Muenchen Deutsches Forschungszentrum fuer Gesundheit und Umwelt GmbH
Original Assignee
Ludwig Maximilians Universitaet Muenchen LMU
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ludwig Maximilians Universitaet Muenchen LMU filed Critical Ludwig Maximilians Universitaet Muenchen LMU
Priority to DE1998116186 priority Critical patent/DE19816186A1/de
Priority to EP99927658A priority patent/EP1086220A2/de
Priority to AU44964/99A priority patent/AU4496499A/en
Priority to PCT/DE1999/001111 priority patent/WO1999053091A2/de
Publication of DE19816186A1 publication Critical patent/DE19816186A1/de
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

Die vorliegende Erfindung betrifft eine GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten sowie gegen sie gerichtete Antikörper. Ferner betrifft die Erfindung die Verwendung der GDNF-kodierenden DNA, Teile davon und der GDNF-Varianten.

Description

Die vorliegende Erfindung betrifft eine GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten sowie gegen sie gerichtete Antikörper. Ferner betrifft die Erfindung die Verwendung der GDNF-kodierenden DNA, Teile davon und der GDNF-Varianten.
Neurotrophe Faktoren sind Proteine, die im Nervensystem oder in durch das Nervensystem innervierten Geweben vorliegen. Ihre Aufgabe liegt in der Ver­ sorgung von Glia- und Nervenzellen. Ferner fördern sie die Differenzierung von Neuronen. Ein von Gliazellen stammender neurotropher Faktor ist GDNF ("glial cell line- derived neurotrophic factor"). Dieser gehört zur TGF-β ("transforming growth factor-β") Superfamilie. GDNF ist ein etwa 30 kd großer Differenzierungs-Faktor für die verschiedensten Neuronen. Dies sind z. B. dopaminerge Neuronen des Mittelhirns, spinal-motorische, kranial-sensorische und sympathische Neuronen wie auch noradrenerge Neuronen des Hinterhirns. Ferner fördert GDNF die Aufnahme von Dopamin durch das Mittelhirn. Des weiteren haben Versuche mit Parkinson aufweisenden Rhesusaffen gezeigt, daß eine intrazerebrale Verabreichung von GDNF eine funktionelle Wiederherstellung bewirken kann.
Dies läßt vermuten, daß über GDNF in neurodegenerative Erkrankungen, wie Parkinson, amyotrophische Lateralsklerose und Alzheimer, eingegriffen werden kann. Ein solches Eingreifen könnte auf mehreren Ebenen, z. B. auf der Ebene der Expression des GDNF-Gens und der Prozessierung von GDNF, erfolgen. Bisher liegen allerdings über diese Ebene keine ausreichenden Erkenntnisse vor.
Der vorliegenden Erfindung liegt somit die Aufgabe zugrunde, ein Mittel bereitzu­ stellen, mit dem die Regulation von GDNF auf molekularer Ebene untersucht und ggfs. Wege aufgezeigt werden können, mit denen in diese Regulation eingegrif­ fen werden kann.
Erfindungsgemäß wird dies durch die Gegenstände in den Patentansprüchen erreicht.
Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind somit Mittel, mit denen kodierende und regulatorische Bereiche einer genomischen GDNF-DNA und ihre gegen­ seitigen Einflüsse untersucht werden können. Ferner sind es Mittel, mit denen die Expression, insbesondere verschiedene Expressionsformen, einer solchen DNA, bestimmt werden können. Desweiteren sind es Mittel, die ein gezieltes Eingreifen in die Regulation dieser DNA ermöglichen können.
Die vorliegende Erfindung beruht auf den Erkenntnissen des Anmelders über die Struktur und die transkriptionelle Regulation einer genomischen GDNF-DNA. Der Anmelder hat eine solche DNA im humanen Genom am Genlocus 5p 12-p13.1 identifiziert. Er hat diese DNA auf dem PAC Klon 24B12 isoliert und charakterisiert (vgl. Fig. 1). Ferner hat er die Sequenz für die kodierenden und für die transkriptionelle Regulation wichtigen Bereiche der GDNF-DNA aufgeklärt (vgl. Fig. 2). Die DNA enthält drei Exons, die für eine 3.6 kb große cDNA kodieren, sowie große 5'- und 3'-untranslatierte Regionen (UTRs). Die 3'-UTR enthält ein polymorphes AGG-"repeat", das allerdings in Patienten mit neurodegenerativen Erkrankungen, wie Parkinson, idiopathisches Parkinson-Syndrom, ALS, Alzheimer, spinozerebellare Ataxie oder dopa-responsive Dystonie, nicht in klinisch relevanter Häufung vorliegt. Die Transkription der GDNF-DNA wird durch einen eine TATA-Box enthaltenden Promotor bewirkt, der vor Exon 1 liegt. Ein zweiter Promotor befindet sich vor Exon 2. Der erste Promotor kann durch verschiedene Substanzen in seiner Promotoraktivität verstärkt werden. Solche Substanzen sind z. B. der Entzündungsmediator Tetradecanoyl-12-phorbol-acetat (TPA), der Fibroblasten-Wachstumsfaktor 2 (FGF2bFGFf), cAMP wie auch das Differenzierungsmittel Retinoesäure (RA). Diese Substanzen spielen eine wichtige Rolle in Entwicklungsprozessen der Zelle wie auch in anti-apoptotischen, durch Verletzungen induzierten Signalwegen. Des weiteren hat der Anmelder DNAs gefunden, die für GDNF-Varianten kodieren. Eine dieser DNAs umfaßt die Exons 1, 2 und 3. Eine andere DNA umfaßt die Exons 1, 2 und 3, wobei Exon 2 eine 78 bp große Deletion aufweist. Eine weitere DNA umfaßt die Exons 1 und 3. Die Sequenzen dieser DNAs und der entsprechenden GDNF-Varianten sind in Fig. 3 angegeben. Der Anmelder hat erkannt, daß Exon 2 für eine sekretierbare Form von GDNF notwendig ist, während Exon 3 für eine intrazelluläre Form ausreicht. Auch hat er erkannt, daß Exon 1 nicht translatiert wird.
Erfindungsgemäß werden die Erkenntnisse des Anmelders genutzt, eine GDNF-kodierende DNA bereitzustellen, umfassend die Sequenz von Fig. 2 oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Sequenz, wobei letztere Sequenz mit der DNA von Fig. 2 hybridisiert und keine GDNF-cDNA ist. Die DNA von Fig. 2 wurde als E.coli 24B1 2 bei der DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen) am 20. März 1998 unter DSM 12063 hinterlegt.
Der Ausdruck "eine durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Se­ quenz" umfaßt jegliche für GDNF-kodierende Sequenz, die mit der DNA von Fig. 2 hybridisiert und keine GDNF-cDNA ist. Die Sequenz kann sich von der DNA von Fig. 2 durch Additionen, Deletionen, Substitutionen und/oder Inversionen von ein oder mehreren Basenpaaren unterscheiden. Der Ausdruck "Hybridisierung" weist auf eine Hybridisierung unter üblichen Bedingungen, insbesondere bei 20°C unter dem Schmelzpunkt der Sequenz hin. Der Ausdruck "keine GDNF-cDNA" weist darauf hin, daß die Sequenz Elemente umfaßt, die in einer cDNA fehlen. Solche Elemente sind z. B. Intron- oder transkriptionelle Regulations-Sequenzen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine DNA mit Pro­ motor-Aktivität, umfassend die in Fig. 2 als Promotorfragment 1 angegebene Sequenz oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Sequenz, wobei letztere Sequenz mit der ersteren hybridisiert.
Der Ausdruck "eine durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Se­ quenz" umfaßt jegliche Sequenz, die mit der in Fig. 2 als Promotorfragment angegebenen Sequenz hybridisiert und eine Promotor-Aktivität aufweist. Die Sequenz kann sich von der in Fig. 2 als Promotorfragment angegebenen Sequenz durch Additionen, Deletionen, Substitutionen und/oder Inversionen von ein oder mehreren Basenpaaren unterscheiden. Hinsichtlich des Ausdrucks "Hybridisierung" wird auf vorstehende Ausführungen entsprechend verwiesen. Der Ausdruck "Promotor-Aktivität" weist darauf hin, daß übliche Verfahren zum Nachweis einer Promotor-Aktivität verwendet werden können. Beispielsweise kann ein Reporter-Gen, z. B. ein Luciferase-Gen, an das 3'-Ende der auf ihre Promotor-Aktivität hin zu testenden Sequenz ligiert werden. Das erhaltene DNA-Molekül kann in Zellen transfiziert und die Expression des Luciferase-Gens bestimmt werden, wodurch die Promotor-Aktivität nachgewiesen wird.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine DNA, die sich zum Nachweis von GDNF-Sequenzen eignet. Insbesondere eignet sich die DNA als Primer bzw. Primer-Paar für ein PCR-Verfahren. Eine solche DNA umfaßt eine der in Fig. 4 angegebenen Sequenzen oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basen unterschiedliche Sequenz, wobei letztere mit der komplementären Sequenz der in Fig. 4 angegebenen DNA hybridisiert.
Der Ausdruck "eine durch ein oder mehrere Basen unterschiedliche Sequenz" umfaßt jegliche Sequenz, die mit der komplementären Sequenz der in Fig. 4 angegebenen DNA hybridisiert. Die Sequenz kann sich von der DNA von Fig. 4 durch Additionen, Deletionen, Substitutionen und/oder Inversionen von ein oder mehreren Basen unterscheiden. Hinsichtlich des Ausdrucks "Hybridisierung" wird auf vorstehende Ausführungen entsprechend verwiesen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine Nukleinsäure, die für eine GDNF-Variante kodiert. Die Nukleinsäure kann eine RNA oder eine DNA, z. B. eine cDNA, sein. Bevorzugt ist eine DNA, die folgendes umfaßt:
  • (a) Die DNA von Fig. 3 oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche DNA, wobei letztere DNA mit der DNA von Fig. 3 hybridisiert und Exon-1 und/oder Exon 2-Sequenzen von GDNF aufweist, oder
  • (b) eine mit der DNA von (a) über den degenerierten genetischen Code verwandte DNA.
Der Ausdruck "eine durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche DNA" umfaßt jegliche für GDNF-kodierende DNA, die mit der DNA von Fig. 3 hybridisiert und Exon-1 und/oder Exon 2-Sequenzen von GDNF aufweist. Die DNA kann sich von der DNA von Fig. 3 durch Additionen, Deletionen, Substitutionen und/oder Inversionen von ein oder mehreren Basenpaaren unterscheiden. Hinsichtlich des Ausdrucks "Hybridisierung" wird auf vorstehende Ausführungen entsprechend verwiesen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine GDNF-Variante. Eine solche umfaßt durch Exon 2 und Exon 3 kodierte Aminosäuren. Insbesondere umfaßt eine erfindungsgemäße GDNF-Variante die Aminosäuresequenz von Fig. 3(a) bzw. (b) oder eine hiervon durch ein oder mehrere Aminosäuren unterschiedliche Aminosäuresequenz, wobei die DNA-Sequenz der letzteren Aminosäuresequenz mit der DNA von Fig. 3(a) bzw. (b) hybridisiert und Exon 2- und Exon 3-Sequenzen aufweist.
Der Ausdruck "eine durch ein oder mehrere Aminosäuren unterschiedliche Aminosäuresequenz" umfaßt jegliche GDNF-Aminosäuresequenz, deren DNA-Sequenz mit der DNA von Fig. 3(a) bzw. (b) hybridisiert und Exon 2 und Exon 3-Sequenzen aufweist. Die DNA-Sequenz kann sich von der DNA von Fig. 3(a) bzw. (b) durch Additionen, Deletionen, Substitutionen und/oder Inversionen von ein oder mehreren Basenpaaren unterscheiden. Hinsichtlich des Ausdrucks "Hybridisierung" wird auf vorstehende Ausführungen entsprechend verwiesen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine Kombination aus einer GDNF-Variante und einem Rezeptor, an den die GDNF-Variante bindet. Der Ausdruck "GDNF-Variante" umfaßt eine vorstehende GDNF-Variante. Ferner umfaßt er eine GDNF-Variante, die keine durch Exon 2 kodierten Aminosäuren aufweist.
Eine erfindungsgemäße DNA kann als solche oder in Kombination mit jeglicher anderen DNA vorliegen. Beispielsweise kann eine erfindungsgemäße, eine Promotor-Aktivität aufweisende DNA in Kombination mit einer zu transkribierenden DNA, z. B. einem Reporter-Gen oder einem Struktur-Gen, vorliegen. Eine solche Kombination kann in üblichen Vektoren erfolgen. Für eine Kombination mit einem Reporter-Gen, z. B. einem Luciferase-Gen, bieten sich Vektoren, wie pXP1 und pAH1409, an. Diese können dann zur Transfektion von Zellen, wie NIH3T3 und 293-Zellen, verwendet werden. Mit der Kombination aus einer erfindungsgemäßen, eine Promotor-Aktivität aufweisenden DNA und einem Reporter-Gen ist es möglich, die Promotor-Aktivität unter den verschiedensten Bedingungen zu testen. Damit können Substanzen gefunden werden, mit denen die Promotor-Aktivität und somit die Regulation der Expression einer GDNF-DNA beeinflußt werden können. Solche Substanzen können aktivierend bzw. inhibierend sein.
Ferner kann eine erfindungsgemäße, für eine GDNF-Variante kodierende DNA in einem Expressionsvektor vorliegen. Beispiele solcher sind dem Fachmann bekannt. Im Falle eines Expressionsvektors für E. coli sind dies z. B. pGEMEX, pUC-Derivate, pGEX-2T, pET3b und pQE-8. Für die Expression in Hefe sind z. B. pY100 und Ycpad1 zu nennen, während für die Expression in tierischen Zellen z. B. pKCR, pEFBOS, cDM8, pCEV4, pBC140 und Rep 7 anzugeben sind. Für die Expression in Insektenzellen eignet sich besonders der Bacculovirus-Expressions­ vektor pAcSGHisNT-A.
Der Fachmann kennt geeignete Zellen, um die erfindungsgemäße, in einem Expressionsvektor vorliegende DNA zu exprimieren. Beispiele solcher Zellen umfassen die E.coli-Stämme HB101, DH1, x1776, JM101, JM109, BL21 und SG 13009, den Hefe-Stamm Saccharomyces cerevisiae und die tierischen Zellen L, NIH 3T3, FM3A, CHO, COS, Vero, HeLa und HEK293 sowie die Insektenzellen sf9.
Der Fachmann weiß, in welcher Weise die erfindungsgemäße DNA in einen Expressionsvektor inseriert werden muß. Ihm ist auch bekannt, daß diese DNA in Verbindung mit einer für ein anderes Protein bzw. Peptid kodierenden DNA inseriert werden kann, so daß die erfindungsgemäße DNA in Form eines Fu­ sionsproteins exprimiert werden kann.
Des weiteren kennt der Fachmann Bedingungen, transformierte bzw. trans­ fizierte Zellen zu kultivieren. Auch sind ihm Verfahren bekannt, das durch die erfindungsgemäße DNA exprimierte Protein bzw. Fusionsprotein zu isolieren und zu reinigen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein gegen ein vorstehen­ des Protein bzw. Fusionsprotein gerichteter Antikörper. Ein solcher Antikörper kann durch übliche Verfahren hergestellt werden. Er kann polyklonal bzw. monoklonal sein. Zu seiner Herstellung ist es günstig, Tiere, insbesondere Kaninchen, Hühner oder Ratten für einen polyklonalen und Mäuse oder Ratten für einen monoklonalen Antikörper, mit einem vorstehenden (Fusions)protein oder Fragmenten davon zu immunisieren. Weitere "Booster" der Tiere können mit dem gleichen (Fusions)protein oder Fragmenten davon erfolgen. Der polyklonale Antikörper kann dann aus dem Serum bzw. Eigelb der Tiere erhalten werden. Für den monoklonalen Antikörper werden Milzzellen der Tiere mit Myelomzellen fusioniert.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Kit. Ein solcher umfaßt eine oder mehrere der folgenden Komponenten:
  • (a) eine erfindungsgemäße DNA,
  • (b) eine erfindungsgemäße GDNF-Variante,
  • (c) ein erfindungsgemäßer Antikörper, sowie
  • (d) übliche Hilfsstoffe, wie Träger, Puffer, Lösungsmittel, Kontrollen, etc.
Von den einzelnen Komponenten können jeweils ein oder mehrere Vertreter vorliegen. Hinsichtlich der einzelnen Ausdrücke wird auf vorstehende Ausführungen verwiesen. Diese gelten hier entsprechend.
Die vorliegende Erfindung ermöglicht es, die Regulation von GDNF auf molekularer Ebene zu untersuchen. Mit einem erfindungsgemäßen Antikörper kann eine GDNF-Variante nachgewiesen werden. Es kann eine Beziehung der GDNF-Variante zu Geweben und/oder Funktionen hergestellt werden. Ferner kann mit einer erfindungsgemäßen GDNF-Variante ein gegen dieses Protein gerichteter Autoantikörper nachgewiesen werden. Beide Nachweise können durch übliche Verfahren, insbesondere einen Western Blot, einen ELISA, eine Immunpräzipitation oder durch Immunfluoreszenz, erfolgen. Desweiteren kann mit einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure, insbesondere einer DNA und hiervon abgeleiteten Primern, die Organisation und die Expression des für GDNF kodierenden Gens nachgewiesen werden. Dieser Nachweis kann in üblicher Weise, insbesondere in einem Southern Blot oder über "in situ" Hybridisierung, erfolgen.
Darüberhinaus eignet sich die vorliegende Erfindung, Maßnahmen für und gegen das Vorliegen von GDNF in Personen zu ergreifen. Mit einem erfindungsgemäßen Antikörper kann eine GDNF-Variante inhibiert werden. Andererseits kann mit einer erfindungsgemäßen GDNF-Variante, insbesondere nach Kopplung an ein vom Körper nicht als fremd angesehenes Protein, z. B. Transferrin oder BSA, die Menge der GDNF-Variante in Personen erhöht werden. Entsprechendes kann auch mit einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure, insbesondere einer DNA, erreicht werden, die unter die Kontrolle eines in bestimmten Geweben, z. B. Gehirn, induzierbaren Promotors gestellt wird und nach ihrer Expression zur Bereitstellung einer GDNF-Variante in diesen Geweben führt. Darüberhinaus kann eine erfindungsgemäße Nukleinsäure, insbesondere eine DNA, auch zur Inhibierung von GDNF genutzt werden. Hierzu wird die Nukleinsäure, z. B. als Basis für die Erstellung von Anti-Sinn-Oligonukleotiden zur Expressions-In­ hibierung des für GDNF kodierenden Gens verwendet. Somit stellt die vorliegende Erfindung Mittel dar, neurodegenerative Erkrankungen, wie Parkinson, amyotrophische Lateralsklerose und Alzheimer, besser zu diagnostizieren und therapeutisch eingreifen können.
Kurze Beschreibung der Zeichnungen
Fig. 1 zeigt die Organisation einer genomischen GDNF-DNA, wobei in A) eine grobe und in B) eine detaillierte Restriktionskarte angegeben ist. Exons sind als Boxen angegeben, wobei ausgefüllte Teile dieser kodierende Bereiche und nicht-ausgefüllte Teile UTRs sind. Ferner ist die Lage des AGG-"repeat" und der Poly A-Sequenzen angegeben.
Fig. 2 zeigt die Sequenzen der Exons 1, 2 und 3 einer genomischen GDNF-DNA. Ferner sind Sequenzen der Introns, des Promotorfragments 1, des AGG-"repeat" und der Poly A-Sequenzen angegeben.
Fig. 3 zeigt die DNA- und Aminosäuresequenzen für GDNF-Varianten. In Fig. 3(a) umfaßt die Variante auf der DNA-Ebene die Exons 1, 2 und 3, in Fig. 3(b) die Exons 1, 2 und 3, wobei Exon 2 eine 78 bp große Deletion aufweist, und in Fig. 3(c) die Exons 1 und 3. Auf der Proteinebene umfaßt die GDNF-Variante jeweils nicht den durch Exon 1 kodierten Bereich.
Fig. 4 zeigt Primer-Paare, die sich für eine PCR-Reaktion zum Nachweis von GDNF-Sequenzen eignen.
Fig. 5 zeigt die Expression einer GDNF-Variante, welche die durch die Exon 2 und 3 kodierten Bereiche umfaßt. Die GDNF-Variante wird in das Medium sekretiert.
Fig. 6 zeigt die Promotor-Aktivität des Promotorfragments 1 von Fig. 2 und ihre Verstärkung durch Substanzen.
Die vorliegende Erfindung wird durch die nachstehenden Beispiele erläutert.
Beispiel 1 Expression einer für eine GDNF-Variante kodierenden DNA
Es wird eine erfindungsgemäße für eine GDNF-Variante kodierende DNA exprimiert, welche die Exons 1, 2 und 3 umfaßt. Hierzu wird aus 293-Zellen Gesamt-RNA isoliert und einem RT-PCR-Verfahren unterzogen. Als Primer-Paar für das PCR-Verfahren werden die nachstehenden Primer verwendet, die eine Xhol-Restriktionsstelle aufweisen:
GDL.f: 3'-ATGGCCGCCTCGAGATGAAGTTATGGGATGTCGTGG-3'
GDX.r: 5'-GAGCTCGAGTCAGATACATCCACACC-3'.
Die erhaltene cDNA wird einer Xhol-Spaltung unterzogen und in den mit Xhol-geöffneten Expressionsvektor pBC140 bzw. Rep 7 inseriert. Es wird das Expressionsplasmid pBC140-GDNF bzw. Rep 7-GDNF erhalten.
Dieses wird zur Transfektion von tierischen Zellen verwendet, wobei 2 µg des Expressionsplasmids 1,5 × 106 Zellen zugegeben werden. Die Zellen werden in konditioniertem Medium kultiviert. 24 Stunden bzw. 48 Stunden nach Transfektion werden die Zellen geerntet und das Medium gesammelt. Die Zellen werden einer Ultraschall-Behandlung unterzogen, wodurch Zellysate gewonnen werden. Diese werden zusammen mit dem Medium und GDNF-Kontrolle einer 12%igen Polyacrylamid-Gelelektrophorese unterzogen, der anschließend ein Blot-Verfahren folgt. Nach diesem wird die Nitrocellulosemembran über Nacht bei 4°C mit einem Kaninchen-Antikörper (Sta.Cruz) inkubiert, der den durch Exon 3 kodierten Bereich von GDNF erkennt. Die Antikörperbindung wird dann durch 2stündige Inkubation bei 4°C mit einem markierten Ziege-anti-Kaninchen-Anti­ körper (Tropix) sichtbar gemacht (vgl. Fig. 5).
Es zeigt sich, daß eine erfindungsgemäße, für eine GDNF-Variante kodierende DNA exprimiert werden kann. Ferner wird deutlich, daß eine die Exons 1, 2 und 3 umfassende GDNF-DNA für eine GDNF-Variante kodiert, die von der Zelle sekretiert wird.
Beispiel 2 Nachweis von Promotor-Aktivität einer erfindungsgemäßen DNA
Es wird der Vektor pAH1409 verwendet. Dieser enthält ein Reporter-Gen, nämlich ein Luciferase-Gen. Am 5'-Ende des Luciferase-Gens befindet sich ein Polylinker, in den das 1,1 kb große EcoRI/PstI-Fragment (Promotorfragment 1 von Fig. 2) inseriert wird. Es wird das Expressionsplasmid pAH1409-GDNF erhalten.
Dieses wird zur Transfektion von tierischen Zellen verwendet, wobei 2 µg von pAH1409-GDNF 1,5 × 106 Zellen zugegeben werden. Ferner wird in einem Verhältnis von 1 : 5 ein DNA-Konstrukt cotransfiziert, das für GFP ("Green Fluorescent Protein") kodiert. Als Kontrolle wird pAH1409 in Parallelversuchen transfiziert. Die Zellen werden unbehandelt bzw. mit TPA (100 ng/ml), 8-Brom-cAMP (1 mM), Retinoesäure (RA 10 µM), bFGF (10 ng/ml) oder IFNg (1000 Enzymeinheiten) behandelt. 44-48 Stunden nach Transfektion werden die Zellen geerntet und es wird ein Luciferase-Nachweis durchgeführt (vgl. Fig. 6).
Es zeigt sich, daß eine erfindungsgemäße, das Promotorfragment 1 von Fig. 2 umfassende DNA eine Promotor-Aktivität aufweist und diese durch Substanzen verstärkt werden kann.
Beispiel 3 Herstellung und Reinigung einer erfindungsgemäßen GDNF-Variante
Die amplifizierte DNA von Beispiel 1 wird mit Xhol gespalten und in den mit Xhol gespaltenen Expressionsvektors pQE-8 (Qiagen) inseriert. Es wird das Expres­ sionsplasmid pQ/GDNF erhalten. Ein solches kodiert für ein Fusionsprotein aus 6 Histidin-Resten (N-Terminuspartner) und dem erfindungsgemäßen GDNF von Fig. 3(a) (C-Terminuspartner). pQ/GDNF wird zur Transformation von E.coli SG 13009 (vgl. Gottesman, S. et al., J. Bacteriol. 148, (1981), 265-273) verwen­ det. Die Bakterien werden in einem LB-Medium mit 100 µg/ml Ampicillin und 25 µg/ml Kanamycin kultiviert und 4 h mit 60 µM Isopropyl-β-D-Thiogalactopyra­ nosid (IPTG) induziert. Durch Zugabe von 6 M Guanidinhydrochlorid wird eine Lyse der Bakterien erreicht, anschließend wird mit dem Lysat eine Chromato­ graphie (Ni-NTA-Resin) in Gegenwart von 8 M Harnstoff entsprechend der Angaben des Herstellers (Qiagen) des Chromatographie-Materials durchgeführt. Das gebundene Fusionsprotein wird in einem Puffer mit pH 3,5 eluiert. Nach seiner Neutralisierung wird das Fusionsprotein einer 18% SDS-Polyacrylamid-Ge­ lelektrophorese unterworfen und mit Coomassie-Blau angefärbt (vgl. Thomas, J.O. und Kornberg, R.D., J. Mol. Biol. 149 (1975), 709-733).
Es zeigt sich, daß ein erfindungsgemäßes (Fusions)protein in hochreiner Form hergestellt werden kann.
Beispiel 4 Herstellung und Nachweis eines erfindungsgemäßen Antikörpers
Ein erfindungsgemäßes Fusionsprotein von Beispiel 3 wird einer 18% SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese unterzogen. Nach Anfärbung des Gels mit 4 M Natriumacetat wird eine ca. 30 kD Bande aus dem Gel herausgeschnitten und in Phosphat gepufferter Kochsalzlösung inkubiert. Gel-Stücke werden sedimentiert, bevor die Proteinkonzentration des Überstandes durch eine SDS-Polyacrylamid-Ge­ lelektrophorese, der eine Coomassie-Blau-Färbung folgt, bestimmt wird. Mit dem Gel-gereinigten Fusionsprotein werden Tiere wie folgt immunisiert:
Immunisierungsprotokoll für polyklonale Antikörper im Kaninchen
Pro Immunisierung werden 35 µg Gel-gereinigtes Fusionsprotein in 0,7 ml PBS und 0,7 ml komplettem bzw. inkomplettem Freund's Adjuvans eingesetzt.
Tag 0: 1. Immunisierung (komplettes Freund's Adjuvans)
Tag 14: 2. Immunisierung (inkomplettes Freund's Adjuvans; icFA)
Tag 28: 3. Immunisierung (icFA)
Tag 56: 4. Immunisierung (icFA)
Tag 80: Ausbluten.
Das Serum des Kaninchens wird im Immunoblot getestet. Hierzu wird ein erfindungsgemäßes Fusionsprotein von Beispiel 1 einer SDS-Polyacrylamid-Ge­ lelektrophorese unterzogen und auf ein Nitrocellulosefilter übertragen (vgl. Khyse-Andersen, J., J. Biochem. Biophys. Meth. 10, (1984), 203-209). Die Western Blot-Analyse wurde wie in Bock, C.-T. et al., Virus Genes 8, (1994), 215-229, beschrieben, durchgeführt. Hierzu wird das Nitrocellulosefilter eine Stunde bei 37°C mit einem ersten Antikörper inkubiert. Dieser Antikörper ist das Serum des Kaninchens (1 : 10000 in PBS). Nach mehreren Waschschritten mit PBS wird das Nitrocellulosefilter mit einem zweiten Antikörper inkubiert. Dieser Antikörper ist ein mit alkalischer Phosphatase gekoppelter monoklonaler Ziege Anti-Kaninchen-IgG-Antikörper (Dianova) (1 : 5000) in PBS. Nach 30-minütiger Inkubation bei 37°C folgen mehrere Waschschritte mit PBS und anschließend die alkalische Phosphatase-Nachweisreaktion mit Entwicklerlösung (36 µM 5' Bromo-4-chloro-3-indolylphosphat, 400 µM Nitroblau-tetrazolium, 100 mM Tris-HCl, pH 9.5, 100 mM NaCl, 5 mM MgCl2) bei Raumtemperatur, bis Banden sichtbar werden.
Es zeigt sich, daß erfindungsgemäße, polyklonale Antikörper hergestellt werden können.
Immunisierungsprotokoll für polyklonale Antikörper im Huhn
Pro Immunisierung werden 40 µg Gel-gereinigtes Fusionsprotein in 0,8 ml PBS und 0,8 ml komplettem bzw. inkomplettem Freund's Adjuvans eingesetzt.
Tag 0: 1. Immunisierung (komplettes Freund's Adjuvans)
Tag 28: 2. Immunisierung (inkomplettes Freund's Adjuvans; icFA)
Tag 50: 3. Immunisierung (icFA).
Aus Eigelb werden Antikörper extrahiert und im Western Blot getestet. Es werden erfindungsgemäße, polyklonale Antikörper nachgewiesen.
Immunisierungsprotokoll für monoklonale Antikörper der Maus bzw. Ratte
Pro Immunisierung werden 12 µg Gel-gereinigtes Fusionsprotein in 0,25 ml PBS und 0,25 ml komplettem bzw. inkomplettem Freund's Adjuvans eingesetzt; bei der 4. Immunisierung ist das Fusionsprotein in 0,5 ml (ohne Adjuvans) gelöst.
Tag 0: 1. Immunisierung (komplettes Freund's Adjuvans)
Tag 28: 2. Immunisierung (inkomplettes Freund's Adjuvans; icFA)
Tag 56: 3. Immunisierung (icFA)
Tag 84: 4. Immunisierung (PBS)
Tag 87: Fusion.
Überstände von Hybridomen werden im Western Blot getestet. Erfindungs­ gemäße, monoklonale Antikörper werden nachgewiesen.
Es zeigt sich, daß eine erfindungsgemäße DNA eine Promotor-Aktivität aufweist und diese durch Substanzen verstärkt werden kann.

Claims (13)

1. GDNF-kodierende DNA, umfassend die Sequenz von Fig. 2 oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Sequenz, wobei letztere Sequenz mit der DNA von Fig. 2 hybridisiert und keine GDNF-cDNA ist.
2. DNA mit Promotor-Aktivität, umfassend die in Fig. 2 als Promotorfrag­ ment 1 angegebene Sequenz oder eine hiervon durch ein oder mehrere Basenpaare unterschiedliche Sequenz, wobei letztere Sequenz mit der ersteren hybridisiert.
3. DNA nach Anspruch 2, wobei die DNA in Kombination mit einer zu trans­ kribierenden DNA vorliegt.
4. DNA nach Anspruch 3, wobei die zu transkribierende DNA ein Reporter-Gen ist.
5. DNA, geeignet zum Nachweis von GDNF-Sequenzen, umfassend eine der in Fig. 4 angegebenen Sequenzen oder eine hiervon durch ein oder mehre­ re Basen unterschiedliche Sequenz, wobei letztere mit der komplementä­ ren Sequenz der in Fig. 4 angegebenen DNA hybridisiert.
6. DNA, kodierend für eine GDNF-Variante, umfassend:
  • (a) Die DNA von Fig. 3 oder eine hiervon durch ein oder mehrere Ba­ senpaare unterschiedliche DNA, wobei letztere DNA mit der DNA von Fig. 3 hybridisiert und Exon-1 und/oder Exon 2-Sequenzen von GDNF aufweist, oder
  • (b) eine mit der DNA von (a) über den degenerierten genetischen Code verwandte DNA.
7. Expressionsplasmid, umfassend die DNA nach Anspruch 6.
8. Transformante, enthaltend das Expressionsplasmid nach Anspruch 7.
9. GDNF-Variante, umfassend die Aminosäuresequenz von Fig. 3(a) bzw. (b) oder eine hiervon durch ein oder mehrere Aminosäuren unterschiedli­ che Aminosäuresequenz, wobei die DNA-Sequenz der letzteren Aminosäu­ resequenz mit der DNA von Fig. 3(a) bzw. (b) hybridisiert und Exon 2- und Exon 3-Sequenzen aufweist.
10. Antikörper, gerichtet gegen die GDNF-Variante nach Anspruch 9.
11. Verwendung der DNA nach einem der Ansprüche 1-6 oder der GDNF-Variante nach Anspruch 9 zur Untersuchung der Regulation von GDNF.
12. Verwendung der DNA nach einem der Ansprüche 1-6 oder der GDNF-Variante nach Anspruch 9 zur Diagnose und/oder Therapie von neurode­ generativen Erkrankungen.
13. Verwendung nach Anspruch 12, wobei die neurodegenerativen Erkrankun­ gen Parkinson, amyothrophische Lateralsklerose und Alzheimer umfassen.
DE1998116186 1998-04-14 1998-04-14 GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten Ceased DE19816186A1 (de)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE1998116186 DE19816186A1 (de) 1998-04-14 1998-04-14 GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten
EP99927658A EP1086220A2 (de) 1998-04-14 1999-04-14 Gdnf-kodierende dna, teile davon und gdnf-varianten
AU44964/99A AU4496499A (en) 1998-04-14 1999-04-14 Dna coding for gdnf, parts of said dna and gdnf variants
PCT/DE1999/001111 WO1999053091A2 (de) 1998-04-14 1999-04-14 Gdnf-kodierende dna, teile davon und gdnf-varianten

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE1998116186 DE19816186A1 (de) 1998-04-14 1998-04-14 GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DE19816186A1 true DE19816186A1 (de) 1999-10-21

Family

ID=7864285

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DE1998116186 Ceased DE19816186A1 (de) 1998-04-14 1998-04-14 GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP1086220A2 (de)
AU (1) AU4496499A (de)
DE (1) DE19816186A1 (de)
WO (1) WO1999053091A2 (de)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1463530A1 (de) * 2001-12-19 2004-10-06 Lijun Wang Adeno-assoziierte virusvermittelte abgabe von gdnf an skelettmuskeln
US9579362B2 (en) 2007-10-25 2017-02-28 Liina Nevalaita Splice variants of GDNF and uses thereof

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2067858A1 (de) 2007-12-07 2009-06-10 Universidad de Sevilla Tiermodelle für neurodegenerative Erkrankungen
UA112981C2 (uk) * 2011-04-11 2016-11-25 Елі Ліллі Енд Компані Варіант людського gdnf

Citations (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1993006116A1 (en) * 1991-09-20 1993-04-01 Syntex-Synergen Neuroscience Joint Venture Glial derived neurotrophic factor
WO1995011983A1 (en) * 1993-10-25 1995-05-04 Creative Biomolecules, Inc. Methods and compositions for high protein production from recombinant dna
WO1995026408A1 (fr) * 1994-03-25 1995-10-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Adenovirus recombinants codant pour le facteur neurotrophique des cellules gliales (gdnf)
WO1997011964A1 (en) * 1995-09-28 1997-04-03 Amgen Inc. Truncated glial cell line-derived neurotrophic factor
WO1997033912A2 (en) * 1996-03-14 1997-09-18 Genentech, Inc. Uses of gdnf and gdnf receptor
WO1997033911A1 (en) * 1996-03-14 1997-09-18 Washington University Persephin and related growth factors
WO1997039629A1 (en) * 1996-04-25 1997-10-30 Genetic Therapy, Inc. Viral vectors including polynucleotides encoding neurotrophic factors and uses therefor
WO1997040152A1 (en) * 1996-04-22 1997-10-30 Amgen Inc. Glial cell line-derived neurotrophic factor receptor
WO1998052591A1 (en) * 1997-05-22 1998-11-26 Cephalon Inc. Glial cell line-derived neurotrophic factor receptors
WO1998053069A2 (en) * 1997-05-20 1998-11-26 Human Genome Sciences, Inc. Gdnf receptors
WO1998054213A2 (en) * 1997-05-30 1998-12-03 Amgen Inc. Neurotrophic factor receptors
WO1999007843A1 (en) * 1997-08-05 1999-02-18 F. Hoffman-La Roche Ag Human glial cell line-derived neurotrophic factor promoters, vectors containing same, and methods of screening compounds therewith
WO1999012560A1 (en) * 1997-09-09 1999-03-18 Creative Biomolecules, Inc. Synergistic effects of op/bmp morphogens and gdnf/ngf neurotrophic factors

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU1443095A (en) * 1993-12-22 1995-07-10 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey Novel nucleic acid sequences isolated from glial cells
WO1998046737A2 (en) * 1997-04-15 1998-10-22 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey cDNA FOR HUMAN GDNF AND PROMOTER THEREFOR WHICH ALLOWS REGULATED AND CONSTITUTIVE EXPRESSION

Patent Citations (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1993006116A1 (en) * 1991-09-20 1993-04-01 Syntex-Synergen Neuroscience Joint Venture Glial derived neurotrophic factor
WO1995011983A1 (en) * 1993-10-25 1995-05-04 Creative Biomolecules, Inc. Methods and compositions for high protein production from recombinant dna
WO1995026408A1 (fr) * 1994-03-25 1995-10-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Adenovirus recombinants codant pour le facteur neurotrophique des cellules gliales (gdnf)
WO1997011964A1 (en) * 1995-09-28 1997-04-03 Amgen Inc. Truncated glial cell line-derived neurotrophic factor
WO1997033912A2 (en) * 1996-03-14 1997-09-18 Genentech, Inc. Uses of gdnf and gdnf receptor
WO1997033911A1 (en) * 1996-03-14 1997-09-18 Washington University Persephin and related growth factors
WO1997040152A1 (en) * 1996-04-22 1997-10-30 Amgen Inc. Glial cell line-derived neurotrophic factor receptor
WO1997039629A1 (en) * 1996-04-25 1997-10-30 Genetic Therapy, Inc. Viral vectors including polynucleotides encoding neurotrophic factors and uses therefor
WO1998053069A2 (en) * 1997-05-20 1998-11-26 Human Genome Sciences, Inc. Gdnf receptors
WO1998052591A1 (en) * 1997-05-22 1998-11-26 Cephalon Inc. Glial cell line-derived neurotrophic factor receptors
WO1998054213A2 (en) * 1997-05-30 1998-12-03 Amgen Inc. Neurotrophic factor receptors
WO1999007843A1 (en) * 1997-08-05 1999-02-18 F. Hoffman-La Roche Ag Human glial cell line-derived neurotrophic factor promoters, vectors containing same, and methods of screening compounds therewith
WO1999012560A1 (en) * 1997-09-09 1999-03-18 Creative Biomolecules, Inc. Synergistic effects of op/bmp morphogens and gdnf/ngf neurotrophic factors

Non-Patent Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
EP 846764A2 (Prioritäten GB 97-9463 vom 9.5.97, GB 96-24677 vom 27.11.96), derzeit nur als Der- went-Referat verfügbar *
Medline 1998086214 (Gene 203 (2) (1997) 149-157 *
Medline 1998149678 (Eur. J. Biochem. 251 (3)(1998)622-630 *
Medline 1998150950 (Neuron 20 (2) (1998) 245-253 *
Medline 97342120 (Biotechnology and Applied Bio- chemistry 25 (pt.3) (1997) 223-233 *
Medline 97387608 (Neuroreport 8 (9-10) (1997) 2293-2298) *
Medline 97477467 (J.Neuroscience 17 (21) (1997) 8506-8519 *
Medline AN 1998181698 (J.Neurochemistry 70 (4) (1998) 1383-1393 *
WO 98/46622A1 (Prioritäten US 97-859988 vom 21.5. 97, US 97-44007 vom 17.4.97), derzeit nur als Der-went-Referat verfügbar *
WO 98/46737A2 (Priorität US 97-842675 vom 15.4.97)derzeit nur als Derwent-Referat verfügbar *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1463530A1 (de) * 2001-12-19 2004-10-06 Lijun Wang Adeno-assoziierte virusvermittelte abgabe von gdnf an skelettmuskeln
EP1463530A4 (de) * 2001-12-19 2006-09-06 Lijun Wang Adeno-assoziierte virusvermittelte abgabe von gdnf an skelettmuskeln
US9579362B2 (en) 2007-10-25 2017-02-28 Liina Nevalaita Splice variants of GDNF and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
EP1086220A2 (de) 2001-03-28
WO1999053091A9 (de) 1999-12-02
AU4496499A (en) 1999-11-01
WO1999053091A3 (de) 2000-03-30
WO1999053091A2 (de) 1999-10-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP1027440B2 (de) Inhibitor-protein des wnt-signalwegs
DE19816186A1 (de) GDNF-kodierende DNA, Teile davon und GDNF-Varianten
EP0842278B1 (de) Protein mit dnase-aktivität
EP1237910B1 (de) Mit trp-proteinen verwandtes protein mtr1 und dieses codierende dna-sequenz
EP1015583B1 (de) Srcr domäne-enthaltendes protein
WO2001062913A1 (de) Vertebraten globin
DE19845277C1 (de) Transmembran-Protein
DE19527552C2 (de) Transketolase-verwandtes-Protein
DE19818680C1 (de) DNA-Doppelstrangbruch-Reparatur-Protein
DE19856882C1 (de) Spermatogenese-Protein
DE19835910C1 (de) Gen isoliert auf dem kurzen Arm des menschlichen Chromosoms 17
DE19730997C1 (de) SRCR Domäne-enthaltendes Protein
EP0904384A2 (de) Tyrosin-phosphatase-verwandtes protein
DE19613606C1 (de) Gen für Hypertonie
DE10001377A1 (de) bHLH-Transkriptionsfaktor ASCL3 und diesen enthaltendes Arzneimittel
DE19713434C1 (de) Protein zur Inhibierung von Apoptose
DE19534763C1 (de) FMR1-verwandtes Protein
WO1998024894A2 (de) Pkd1-fragmente mit bindungsregionen für pkd1-spezifische antikörper
WO2000022117A1 (de) Tumor-protein
WO2002017947A2 (de) Verwendung von t-proteinen zur differentiellen charakterisierung und therapie von verletzungen und tumoren des nervensystems
WO1998018919A2 (de) Gabaa-rezeptoruntereinheit epsilon-verwandtes protein

Legal Events

Date Code Title Description
OP8 Request for examination as to paragraph 44 patent law
8127 New person/name/address of the applicant

Owner name: GSF-FORSCHUNGSZENTRUM FUER UMWELT UND GESUNDHEIT G

8127 New person/name/address of the applicant

Owner name: GSF - FORSCHUNGSZENTRUM FUER UMWELT UND GESUNDHEIT

8131 Rejection