DE19650142A1 - Neue Calpaine, ihre Herstellung und Verwendung - Google Patents
Neue Calpaine, ihre Herstellung und VerwendungInfo
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Description
Die Erfindung betrifft neue Calpaine und ihre Herstellung.
Weiterhin betrifft die Erfindung Verfahren zum Screening nach
neuen Calpaininhibitoren und deren Verwendung.
Calpaine gehören zu den intrazellulären, nicht-lysosomalen
Enzymen aus der Gruppe der Cystein-Proteasen. Sie sind an der
Ca2⁺-abhängigen Signaltransduktion in eukaryontischen Zellen betei
ligt, d. h. sie regulieren abhängig von der Ca2⁺ Konzentration
zelluläre Funktionen. Calpaine kommen ubiquitär in tierischen
Geweben bzw. Zellen von beispielsweise Mensch, Hühnern, Kaninchen
oder in der Ratte vor. Auch in niederen Tieren wie beispielsweise
in Drosophila melanogaster oder Caenorhabditis elegans wurden
Calpaine gefunden. In Hefen, Pilzen oder Bakterien konnten bisher
keine Calpaine nachgewiesen werden.
Bisher sind drei Hauptisoformen dieser ubiquitären Calpaine be
kannt, die sich in vitro durch ihre Kalzium-abhängige Aktivier
barkeit unterscheiden. Calpain I (= µCalpain) wird durch
µ-molare Kalziumion-Konzentrationen aktiviert, während Calpain II
(= mCalpain) erst durch millimolare Konzentrationen an Kalzium
ionen aktiviert wird. Beide Calpaine bestehen aus zwei Unter
einheiten, einer großen Untereinheit mit ca. 80 kDa und einer
kleinen Untereinheit von ca. 30 kDa. Beide Untereinheiten des
aktiven Heterodimers besitzen Bindungsstellen für Kalzium. Die
große Untereinheit wird aus folgenden vier Proteindomänen
(= I-IV) aufgebaut: einer Proteasedomäne (= Domäne II), einer
Kalzium-bindenden Domäne (= Domäne IV) und zwei weiterer Domänen
(= Domäne I und III), deren Funktion unklar ist. Die kleine 30
K-Untereinheit besteht aus einer Kalzium-bindenden Untereinheit
(= IV') und einer weiteren Untereinheit (= V), deren Funktion unklar
ist. Zusätzlich zu diesen beiden Calpaintypen wurde ein dritter
bezüglich der Kalziumaktivierung intermediärer Typ (= µ/m 80K)
im Huhn gefunden (Wang K. K. W. et al., TiPS, Vol. 15, 1994:
412-419, Suzuki, K. et al., Biol. Chem. Hoppe-Seyler, Vol. 376, 1995:
523-529).
Neben diesen ubiquitär vorkommenden Calpainen wurden in letzter
Zeit zwei neue gewebespezifisch exprimierte Calpaine identifi
ziert. nCL-1 (= p94) ist ein in Hühnern, Ratten und Menschen
vorkommendes, Muskel-spezifisches Calpain, das vermutlich als
Monomer aktiv sein könnte und nur aus der 80 kd Untereinheit
besteht. Neben nCL-1 gibt es ein Magen-spezifische Calpain, das
in zwei Splicing-Varianten nCL-2 und nCL-2' vorkommen kann.
nCL-2' unterscheidet sich gegenüber nCL-2 durch das Fehlen der
Kalzium-bindenden Region (Sorimachi, H. S. et al., J. Biol. Chem.
Vol. 268, No. 26, 1993 : 19476-19482, Sorimachi, H. S: et al.,
FEBS Lett. 343, 1994 : 1-5). Auch in Drosophila wurde ein
Calpain-homologes Protein (= CalpA), das mit Actin interagiert
und vermutliche eine wichtige Rolle in der Embryonalentwicklung
spielt, gefunden, daß zwei verschiedene Splicing-Varianten auf
weist (Mol. Cell. Biol. Vol. 15, No. 2, 1995 : 824-834). Auch
hier fehlt der kürzeren Variante die Kalziumbindestelle.
Man vermutet, daß Calpaine bei verschiedenen physiologischen Pro
zessen wichtige Rollen spielen. Eine Vielzahl von cytoskeletalen,
membrangebundenden oder regulatorischen Proteinen wie Protein
kinase C, Phospholipase C, Spectrin, Cytoskelett-Proteine wie
MAP2, Muskelproteine, Neurofilamente und Neuropeptide, Plättchen
proteine, -"Epidermal Growth Factor"-, NMDA-Rezeptor und
Proteine, die an der Mitose beteiligt sind, sowie weitere
Proteine sind Calpainsubstrate (Barrett M. J. et al., Life Sci.
48, 1991 : 1659-69, Wang K. K. et al., Trends in Pharmacol. Sci.,
15, 1994 : 412-419). Die normale physiologische Funktion der
Calpaine ist bis heute noch nicht klar verstanden.
Bei verschiedenen pathophysiologischen Prozessen und Krankheiten
wurden erhöhte Calpain-Spiegel gemessen, zum Beispiel bei:
Ischämien des Herzen (z. B. Herzinfarkt), der Niere oder des
Zentralnervensystems (z. B. Hirnschlag), Entzündungen, Muskel
dystrophien, Katarakten der Augen (Grauer Star), Verletzungen des
Zentralnervensystems (z. B. Trauma), Alzheimer Krankheit,
HIV-induzierte Neuropathy, Parkinsonsche- und Huntigtonsche Krankheit
usw. (siehe Wang K. K. oben). Man vermutet einen Zusammenhang
dieser Krankheiten mit einem erhöhten und anhaltenden intrazellu
lären Kalziumspiegel. Dadurch werden Kalzium-abhängige Prozesse
überaktiviert und unterliegen nicht mehr der physiologischen
Regelung. Dementsprechend kann eine Überaktivierung von Calpainen
auch pathophysiologische Prozesse auslösen.
Daher wurde postuliert, daß Inhibitoren der Calpain-Enzyme für
die Behandlung dieser Krankheiten nützlich sein können. Verschie
dene Untersuchungen bestätigten dies. So haben Seung-Chyul Hong
et al. (Stroke 1994, 25 (3), 663-669) und Bartus R. T. et al.
(Neurological Res. 1995, 17, 249-258) eine neuroprotektive
Wirkung von Calpaininhibitoren in akuten neurodegenerativen
Störungen, wie sie nach Hirnschlag auftreten, gezeigt. Ebenso
verbesserten nach experimentellen Gehirntraumata Calpaininhibi
toren die Erholung der auftretenden Gedächtnisleistungsdefizite
und neuromotorischen Störungen (Saatman K. E. et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 93, 1996 : 3428-3433). Edelstein C. L. et al.
(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 1995, 7662-7666) fand eine
protektive Wirkung von Calpaininhibitoren auf durch Hypoxie
geschädigten Nieren. Yoshida K. I. et al. (Jap. Circ. J. 59 (1),
1995, 40-48) konnten günstige Effekte von Calpaininhibitoren
nach cardialen Schädigungen aufzeigen, die durch Ischämie oder
Reperfusion erzeugt wurden. Da Calpaininhibitoren die Freisetzung
von β-AP4-Protein hemmen, wurde eine potentielle Anwendung als
Therapeutikum der Alzheimer Krankheit vorgeschlagen (Higaki J.
et al., Neuron, 14, 1995 : 651-659). Die Freisetzung von
Interleukin-1α wird ebenfalls durch Calpaininhibitoren gehemmt
(Watanabe N. et al., Cytokine, 6 (6), 1994 : 597-601). Weiterhin
wurde gefunden, daß Calpaininhibitoren cytotoxische Effekte an
Tumorzellen zeigen (Shiba E. et al., 20th Meeting Int. Ass.
Breast Cancer Res., Sendai Jp, 1994, 25. - 28. Sept., Int. J.
Onco. 5 (Suppl.), 1994, 381). Auch bei der Restenose und bei
Arthritis spielt Calpain eine wichtige Rolle und Calpaininhibito
ren können das Krankheitsbild positiv beeinflussen (March K. L.
et al. Circ. Res. 72, 1993 : 413-423, Suzuki K. et al., Biochem.
J., 285, 1992 : 857-862).
Weitere mögliche Anwendungen von Calpaininhibitoren sind Wang K. K.
(Trends in Pharmacol. Sci., 15, 1994 : 412-419) zu entnehmen.
Der potenteste und selektivste Calpaininhibitor ist das natürlich
vorkommende intrazelluläre Protein Calpastatin. Es hemmt sowohl
Calpain I als auch Calpain II, nicht jedoch andere Cystein- bzw.
Thiolproteasen wie Cathepsin B, L oder Papain. Das aus ca.
700 Aminosäuren bestehende Calpastatin hat jedoch den Nachteil,
daß es für therapeutische Möglichkeiten aufgrund der Größe und
der Unpassierbarkeit der Zellmembran nicht in Frage kommt. Neben
niedermolekularen peptidischen Calpaininhibitoren wurden eine
Reihe nicht-peptidischer Inhibitoren identifiziert. Nachteil die
ser Inhibitoren ist, daß sie instabil sind, rasch metabolisiert
werden und zum Teil toxisch sind. Viele Calpaininhibitoren zeich
nen sich außerdem durch eine mangelnde Selektivität aus, d. h. sie
hemmen nicht nur Calpain I und II sondern auch andere Cystein
proteasen wie Papain, Chymotrypsin, Elastase oder Cathepsin B
und L.
Es besteht daher nach wie vor ein Bedarf nach selektiven, hoch
wirksamen Calpaininhibitoren. Für das Screening nach diesen
selektiven, gut wirksamen Calpaininhibitoren sind hochspezifische
Testsysteme erforderlich, die es ermöglichen selektive Inhibi
toren zu identifizieren. Üblicherweise werden die Screeningtests
mit den ubiquitär vorkommenden Calpainen Calpain I und Calpain II
durchgeführt.
Für das Auffinden selektiver Inhibitoren ist es notwendig und
wünschenswert weitere Calpaine zur Testung zur Verfügung zu
stellen, die möglichst gewebespezifisch exprimiert werden, so daß
die Inhibitoren auf ihre Selektivität zwischen den einzelnen
Calpainen geprüft werden können.
Darüber hinaus sind weitere neue Calpaine gesuchte Proteine, da
sie mit hoher Wahrscheinlichkeit bei den verschiedenen Krank
heitsbildern bzw. Krankheiten unterschiedlich exprimiert werden
und eine wichtige Rolle bei diesen Krankheiten spielen.
Aufgabe der vorliegenden Erfindung war es, Mittel zur Profilie
rung und Identifizierung von Calpaininhibitoren zur Verfügung zu
stellen, die es ermöglichen Calpaininhibitoren zu identifizieren,
die einerseits nur gegenüber einem Calpain inhibierende Wirkung
aufweisen, und anderseits gegenüber mehreren Calpainen inhibie
rende Wirkung aufweisen und diese als therapeutisches Target zur
Verfügung zu stellen.
Gegenstand der Erfindung ist ein neues Calpain sowie seine
allelischen Varianten, Analoge oder Derivate.
Gegenstand der Erfindung ist auch ein Verfahren zur Identifizie
rung von Calpaininhibitoren, wobei man das Calpain nCL-3 codiert
durch die Sequenz SEQ ID NO: 1 aus Geweben oder Zellen, in denen
das Enzym nCL-3 exprimiert wird, isoliert und die Inhibierung der
Spaltung eines Substrats des Enzyms nCL-3 und in mindestens einem
weiteren Test die Inhibierung der Spaltung eines Substrats der
Enzyme Calpain I und/oder II durch Testsubstanzen mißt und die
Testsubstanzen auswählt, die mindestens gegen eines der Calpaine
eine inhibierende Wirkung zeigen oder die Testsubstanzen aus
wählt, die das Enzym nCL-3 nicht hemmen, jedoch die Enzyme Cal
pain I und/oder II oder die das Enzym nCL-3 hemmen, nicht jedoch
die Enzyme Calpain I und/oder II oder die nCL-3 und die Enzyme
Calpain I und/oder II hemmen.
Weiterhin ist Gegenstand der Erfindung ein Verfahren zur Identi
fizierung von Calpaininhibitoren, dadurch gekennzeichnet, daß man
die Inhibierung der Spaltung eines Substrates des Enzyms nCL-3
bzw. der Calpaine I und/oder II durch Testsubstanzen in zellu
lären Systemen bestimmt und solche Testsubstanzen auswählt, die
die Zellmembran passieren und die intrazelluläre Aktivität des
Enzyms nCL-3 und/oder der Calpaine I und/oder II hemmen.
Mit Hilfe der Calpain-spezifischen Primer wurden über das
sogenannte Domain-Fingerprinting (Boehm T., Oncogene 8, 1993:
1385-1390) unter Verwendung von genomischer DNA Calpain
spezifische Sequenzsignaturen mittels PCR-Technik hergestellt,
die vorteilhafterweise auch zur besseren Differenzierung der
Calpainsequenzen Intronsequenzen enthalten.
Die in Tabelle 1 genannten redundanten PCR-Primer wurden bei
der Klonierung des Gens für nCL-3 verwendet.
Redundante PCR Primer, die zur Klonierung von nCL-3 (=2930)
verwendet wurden
Redundante PCR Primer, die zur Klonierung von nCL-3 (=2930)
verwendet wurden
Mit dem Primerpaar Ca16 und Ca19 (siehe Tab. 1) ließ sich ein
Klon mit der Bezeichnung 29/30 (=2930) darstellen. Dieser Klon
entstammt einem Gen, dessen Genprodukt als neues Calpain die Be
zeichnung nCL-3 erhielt. Die Nucleinsäuresequenz der cDNA für
nCL-3 ist Sequenz SEQ ID NO: 1 zu entnehmen. Die abgeleitete Ami
nosäuresequenz des Calpains nCL-3 ist der Sequenz SEQ ID NO: 2 zu
entnehmen. Die unter Berücksichtigung eines vorhandenen Introns
deduzierte Aminosäuresequenz der initial erhaltenen Sequenz 29/30
weist eine typische Calpainsignatur auf, wobei eine Zuordnung zu
den bekannten Calpain-Subfamilien µCalpain, mCalpain, nCL-1 oder
nCL-2 aufgrund der geringen Homologie nicht eindeutig möglich ist
(siehe Fig. 3 und Tab. 2). Fig. 2 ist die Homologie zu bekann
ten Calpain-Subfamilien zu entnehmen, wobei hier die vollständige
cDNA-Sequenz zugrunde gelegt wurde. Es handelt sich bei dem Cal
pain nCL-3 um ein neues bisher unbekanntes Calpain.
Name | |
% Homologie | |
Nematode tra-3 | 34,5 |
Drosophila CalpA | 31,5 |
Huhn p94 | 31,2 |
Mensch p94 | 30,9 |
Maus p94 | 30,5 |
Ratte p94 | 30,0 |
Huhn µ/m | 28,8 |
Huhn m | 27,8 |
Mensch m | 27,3 |
Huhn µ | 25,4 |
Schwein p94 | 25,4 |
Ratte m | 24,4 |
Ratte nCL-2 | 23,9 |
Nematode CPL1 | 23,6 |
Mensch µ | 23,1 |
Schistosoma | 21,7 |
Kaninchen m | 16,1 |
Schwein m | 15,8 |
Schwein µ | 15,6 |
Maus CAP4 | 13,7 |
Kaninchen µ | 12,9 |
Das in der Sequenz SEQ ID NO: 5 gezeigte Intron (von Nukleotid 34
bis 440) wurde durch Vergleich mit der cDNA festgelegt.
Sequenzvergleiche zwischen der nCL-3-Sequenz in verschiedensten
Datenbanken wie Genbank.nr und Genbank.dbest ergaben Homologien
zu CalpA, Tra-3 und einer humanen Sequenz mit der Bezeichnung
EST01106 Homo sapiens cDNA clone HHCPE79 (siehe Fig. 2).
Bei CalpA handelt es sich um ein gewebsspezifisches exprimiertes
Calpainhomologes von Drosophila (Theopold V. et al., Mol. Cell.
Biol., Vol. 15, No. 2, 1995: 824-834). Es wird in einigen
Neuronen des Zentralen Nervensystems, in verstreuten Zellen des
Mitteldarms und in Blutzellen von Drosophila exprimiert. Von
CalpA wurden zwei verschiedene Splicing-Varianten gefunden. Der
kürzeren Variante fehlt die Calpain-typische Kalziumbindungs
stelle.
Die Homologie auf Aminosäureebene zwischen CalpA und nCL-3
beträgt 31,5% (siehe Tab. 2).
Tra-3 ist an der Geschlechtsbestimmung von Caenorhabditis elegans
beteiligt. In einer Kaskade von mehreren Genen und deren Gen
produkten entscheidet tra-3 mit darüber, ob sich Caenorhabditis
Männchen oder Hermaphroditen entwickeln (Kuwabara P. E. et al.,
TIG, Vol. 8, No. 5, 1992 : 164-168). Tra-3 scheint an der Sperma
togenese beteiligt zu sein.
Die Homologie auf Aminosäureebene zwischen tra-3 und nCL-3 be
trägt 34,5% (s. Tab. 2). Möglicherweise ist auch nCL-3 an der
Geschlechtsbestimmung beteiligt.
Weitere Homologien zwischen nCL-3 und anderen Calpainen sind
Tabelle 2 zu entnehmen.
Zwischen nCL-3 und der humanen Teilsequenz EST01106 besteht die
größte Homologie. Die Teilsequenz EST01106 wurde aus einer Hippo
campusbibliothek gewonnen. Über die Funktion ist nichts bekannt
(Nature 355, 6361, 1992 : 632-634). Ebenfalls unbekannt ist die
vollständige Gensequenz und ob es sich bei der Sequenz um ein
Calpaingen handelt.
Die Sequenzvergleiche zwischen CalpA, Tra-3, EST01106 und nCL-3
werden in Fig. 2 wiedergegeben.
Neben dem in Sequenz SEQ ID NO: 1 dargestellten nCL-3-Gen wurde
eine verkürzte Form, die in Sequenz SEQ ID NO: 3 dargestellt
wird, identifiziert. Die abgeleitete Aminosäuresequenz des ver
kürzten nCL-3-Gens ist der Sequenz SEQ ID NO: 4 zu entnehmen.
Dieses verkürzte nCL-3-Gen, das die Bezeichnung nCL-3' trägt,
entsteht vermutlich durch alternatives Splicing.
Das erfindungsgemäße neue Calpain nCL-3 wird in vielen Geweben
mit unterschiedlicher Intensität exprimiert (Fig. 1). In den un
tersuchten mRNA-Proben wird nCL-3 klar ersichtlich in der Haut,
der Niere, dem Herz, der Lunge, dem Thymus und in der Leber
exprimiert.
Für die Identifizierung von selektiven Calpaininhibitoren sind
möglichst spezifische Verfahren zur Identifizierung der Inhibi
toren erforderlich. Wichtig dabei ist, daß die selektierten
Inhibitoren nur das gewünschte oder die gewünschten Calpaine
hemmen, nicht jedoch andere Cystein-Proteasen und damit in
physiologische Prozesse eingreifen.
Die auf ihre inhibitorische Aktivität hin zu prüfenden Test
substanzen können beispielsweise chemische Substanzen, mikro
bielle oder pflanzliche Extrakte sein. Sie werden üblicherweise
neben den Test auf ihre Inhibitoraktivität gegenüber nCL-3,
Calpain I und/oder II auf ihre Aktivität gegenüber Cathepsin B
oder andere Thiolproteasen getestet.
Idealerweise sollten gute Inhibitoren keine oder nur geringe
Aktivität gegenüber Cathepsin B, L, Elastase, Papain, Chymo
trypsin oder andere Cystein-Proteasen aufweisen, aber eine gute
Aktivität gegenüber den Calpainen I und II aufweisen.
Durch das erfindungsgemäße neue Calpain nCL-3 können mit den
erfindungsgemäßen Verfahren Inhibitoren identifiziert werden,
die zu ihrer inhibitorischen Wirkung zwischen den verschiedenen
Calpainen Calpain I, II, nCL-1 nCL-2 und/oder nCL-3 diskrimi
nieren können.
Die verschiedenen Inhibitortests wurden dabei wie folgt durch
geführt:
Die Cathepsin B-Hemmung wurde analog einer Methode von S. Hasnain
et al., J. Biol. Chem. 1993, 268, 235-240 bestimmt.
Zu 88 µl Cathepsin B (Cathepsin B aus menschlicher Leber von der
Firma Calbiochem, verdünnt auf 5 Units in 500 µM Puffer) werden
2 µl einer Inhibitorlösung, hergestellt aus der zu testenden
chemischen Substanz, einem mikrobiellen oder pflanzlichen Extrakt
und DSMO (Endkonzentration: 100 µM bis 0,01 µM) zugegeben. Dieser
Ansatz wird für 60 Minuten bei Raumtemperatur (= 25°C) vor
inkubiert und anschließend die Reaktion durch Zugabe von 10 µl
10 mM Z-Arg-Arg-pNA (in Puffer mit 10% DMSO) gestartet. Die
Reaktion wird 30 Minuten bei 405 nm im Mikrotiterplattenreader
verfolgt. Aus den maximalen Steigungen werden anschließend die
IC50's bestimmt.
Die Aktivität der Calpaininhibitoren wurde in einem colori
metrischen Test mit Casein nach Hammarsten (Merck, Darmstadt)
als Substrat untersucht. Der Test wurde in Mikrotiterplatten,
entsprechend der Veröffentlichung von Buroker-Kilgore und Wang
in Anal. Biochem. 208, 1993, 387-392, durchgeführt. Als Enzyme
wurde Calpain I (0,04 U/Test) aus Erythrozyten und Calpain II
(0,2 U/Test) aus Nieren, beide vom Schwein, der Firma Calbiochem,
benutzt. Die zu testenden Substanzen wurden mit dem Enzym für
60 Minuten bei Raumtemperatur inkubiert, wobei eine Konzentration
von 1% des Lösungsmittels DMSO nicht überschritten wurde. Nach
Zugabe des Bio-Rad Farbreagenz erfolgte die Messung der optischen
Dichte bei 595 nm in dem Easy Reader EAR 400 der Firma SLT. Die
50%ige Aktivität des Enzyms ergibt sich aus den optischen Dich
ten, die bei der maximalen Aktivität des Enzyms ohne Inhibitoren
und der Aktivität des Enzyms ohne Zugabe von Kalzium bestimmt
wurden.
Die Aktivität von Calpaininhibitoren kann ferner mit dem Substrat
Suc-Leu Tyr-AMC bestimmt werden. Diese fluorimetrische Methode
ist bei Zhaozhao Li et al, J. Med. Chem. 1993, 36, 3472-3480
beschrieben.
Da Calpaine intrazelluläre Cysteinproteasen sind, müssen Calpain
inhibitoren die Zellmembran passieren, um den Abbau von intra
zellulären Proteinen durch Calpain zu verhindern. Einige bekannte
Calpaininhibitoren, wie zum Beispiel E 64 und Leupeptin, über
winden die Zellmembranen nur schlecht und zeigen dementsprechend,
obwohl sie gute Calpaininhibitoren darstellen nur schlechte
Wirkung an Zellen. Es ist deshalb vorteilhaft einen zusätzlichen
Test für die Membrangängigkeit von potentiellen Calpaininhibi
toren wie den humanen Plättchentest durchzuführen.
Der Calpainvermittelte Abbau von Proteinen in Plättchen wurde,
wie von Zhaozhaoli et al., J. Med. Chem., 36, 1993, 3472-3480
beschrieben, durchgeführt. Humane Plättchen wurden aus frischem
Natrium-Citrat-Blut von Spendern isoliert und in Puffer (5 mM
Hepes, 140 mM NaCl und 1 mg/ml BSA, pH 7,3) auf 107 Zellen/ml
eingestellt.
Plättchen (0,1 ml) werden für 5 Minuten in 1 µl an verschiedenen
Konzentrationen an potentiellen Inhibitoren (gelöst in DMSO) vor
inkubiert. Danach erfolgte die Zugabe von Kalziumionophor A 23187
(1 µM im Test) und Kalzium (5 mM im Test) und eine weitere
Inkubation von 5 Minuten bei 37°C. Nach einem Zentrifugations
schritt wurden die Plättchen in SDS-Page Probenpuffer aufgenom
men, 5 Minuten bei 95°C gekocht und die Proteine in einem 8%igen
Gel aufgetrennt. Der Abbau der beiden Proteine Actin bindendes
Protein (= ABP) und Tal in wurde durch quantitative Densitometrie
verfolgt. Nach der- Zugabe von Kalzium und Ionophor verschwanden
diese Proteine und es entstanden neue Banden von kleiner 200 Kd
Molekulargewicht. Daraus wird die halb maximale Enzymaktivität
mit oder als Kontrolle ohne Inhibitor bestimmt.
Ebenfalls geeignet für die Testung der Membrangängigkeit sind
Gewebsteile wie Gehirnschnitte oder Zellkulturen.
Test auf Hemmung gegenüber nCL-3 wird in Zellen durchgeführt, die
dieses Protein exprimieren und sich dieses mit einem spezifischen
Antikörper nachweisen läßt. Werden Zellen mit z. B.: Kalzium und
dem entsprechenden Ionophor stimuliert, führt dies zu einer Akti
vierung von nCL-3. Takaomi Saido beschrieb 1992 im J. Biochem.
Vol. 11, 81-86 die autolytische Transition von µ-Calpain nach
Aktivierung und der Nachweis mit Antikörpern. Entsprechende
Antikörper werden für den Nachweis von nCL-3 erzeugt. Calpain-Inhi
bitoren verhindern die autolytische Transition und eine
entsprechende Quantifizierung ist mit Antikörpern möglich.
Neben den beschriebenen in vitro Tests so wie dem zellulären
Plättchentest eignen sich alle weiteren dem Fachmann bekannten
Calpaintests wie der Test auf Hemmung des Glutamat induzierten
Zelltods an corticalen Neuronen (Maulucci-Gedde M. A. et al.,
J. Neurosci. 7, 1987 : 357-368), der Kalzium-vermittelte Zelltod
in NT2-Zellen (Squier M. K. T. et al., J. Cell. Physiol., 159,
1994 : 229-237, Patel T. et al., Faseb Journal 590, 1996:
587-597) oder die Analyse in Gewebsproben nach Abbauprodukten von
Proteinen wie Spectrin, MAP2 oder Tau (Ami Arai et al., Brain Re
search, 1991, 555, 276-280, James Brorson et al., Stroke, 1995,
26, 1259-1267).
Für die in vitro-Tests von nCL-3 wird das Calpain nCL-3 oder
seine tierischen oder sein humanes Homologes aus Geweben oder
Zellen in denen das Enzym exprimiert wird wie beispielsweise der
Niere, dem Thymus, der Leber, der Lunge, oder aus Zellen ?der
Mikroorganismen, die mindestens eine Genkopie und/oder einen
Vektor mit mindestens einer Genkopie des nCL-3-Gens enthalten,
aufgereinigt und als Rohextrakt oder als reines Enzym verwendet.
Für die erfindungsgemäßen Verfahren werden die verschiedenen
Calpaininhibitortests vorteilhafterweise in Kombination mit dem
Test auf Hemmung der nCL-3-Enzymaktivität durch potentielle
Inhibitoren durchgeführt. Dabei werden die Inhibitoren so aus
gewählt, daß sie entweder nur das Enzym nCL-3 hemmen und nicht
die anderen Calpaine oder umgedreht nur die anderen Calpaine und
nicht das Enzym nCL-3.
Die verschiedenen Inhibitortests werden dabei so ausgeführt,
das neben dem Test auf die inhibierende Wirkung der Testsubstanz
gegenüber nCL-3, Calpain I und/oder II als Kontrolle die Tests
ohne die Testsubstanz durchgeführt wird. Durch diese Testanord
nung lassen sich einfach die inhibitorischen Wirkungen der Test
substanzen erkennen.
Ein weiteres erfindungsgemäßes Verfahren verwendet das Enzym
nCL-3 zum Screening nach neuen Calpaininhibitoren, wobei diese
Inhibitoren vorteilhafterweise generell alle Calpaine oder ein
zelne Calpaine wie Calpain I, II, nCL-1, nCl-2 oder nCL-3 hemmen
können.
Für die Inhibitortests sind generell alle Substanzen geeignet. So
stammen die Substanzen beispielsweise aus der klassischen chemi
schen Synthese, aus der Kombinatorik, aus mikrobiellen, tieri
schen oder pflanzlichen Extrakten. Unter mikrobiellen Extrakten
sind beispielsweise Fermentationsbrühen, Zellaufschlüsse von
Mikroorganismen oder Substanzen nach Biotransformation zu ver
stehen. Auch Zellfraktionen sind für die Tests geeignet.
Für die Klonierung des nCL-3 Gens oder seiner tierischen Homo
logen oder seines humanen Homologen eignen sich alle Expressions
systeme, die zur Isolierung eines enzymatisch aktiven Genprodukts
geeignet sind. Unter enzymatisch aktivem Genprodukt sind
nCL-3-Proteine zu verstehen, die direkt nach Isolierung aus dem Expres
sionsorganismus wie beispielsweise aus einer prokaryotischen oder
eukaryotischen Zelle oder nach Renaturierung ein aktives Protein
ergeben, das in der Lage ist mindestens ein bekanntes Calpain
substrat wie die oben genannten oder über Autokatalyse sich
selbst zu spalten.
Für die Bestimmung der enzymatischen Aktivität sind alle dem
Fachmann bekannten Calpaintests wie in vitro-Tests wie die oben
beschriebenen Tests für Calpain I und II oder zelluläre Tests wie
der Plättchentest geeignet. Dabei können als Detektionsmöglich
keit Tests verwendet werden, die auf Basis eines colorimetrischen
Assays (Buroker-Kilgore M. et al., Anal. Biochem. 208, 1993:
387-392) oder auf Basis eines Fluoreszenz-Assays beruhen.
Außerdem sind auch alle Teilsequenzen, die das katalytische
Zentrum des nCL-3 Gens und/oder weitere Sequenzen des nCL-3 Gens
und/oder andere Calpaingensequenzen und/oder andere Sequenzen
enthalten und enzymatische Aktivität zeigen, unter enzymatische
aktivem Genprodukt von nCL-3 zu verstehen.
Unter Wirtsorganismen sind alle prokaryotischen oder eukaryonti
schen Organismen, die als Wirtsorganismen geeignet sind, sind
beispielsweise Bakterien wie Escherichia coli, Bacillus subtilis,
Streptomyces lividans, Streptococcus carnosus, Hefen wie Saccha
romyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Pilze wie
Aspergillus niger, Insektenzellen wie Spodoptera frugiperda,
Trichoplusia-Zellen oder alle anderen Insektenzellen, die für
eine virale Expression geeignet sind, oder tierische Zellen wie
CV1, COS, C127, 3T3 oder CHO oder humane Zellen zu verstehen.
Unter Expressionssysteme sind die Kombination aus den oben
beispielhaft genannten Expressionsorganismen und den zu den
Organismen passenden Vektoren wie Plasmide, Viren oder Phagen
wie das T7 RNA Polymerase/Promoter System oder Vektoren mit
regulatorischen Sequenzen für den Phagen X zu verstehen.
Bevorzugt sind unter dem Begriff Expressionssysteme die Kombi
nation aus Escherichia coli und seinen Plasmiden und Phagen oder
das Baculovirus-System und die entsprechenden Insektenzellen wie
Spodoptera frugiperda zu verstehen.
Für die vorteilhafte erfindungsgemäße Expression des nCL-3-Gens
sind außerdem weitere 3' und/oder 5, Terminale regulatorische
Sequenzen geeignet.
Diese regulatorischen Sequenzen sollen die gezielte Expression
des nCL-3 Gens ermöglichen. Dies kann beispielsweise je nach
Wirtsorganismus bedeuten, daß das Gen erst nach Induktion
exprimiert oder überexprimiert wird, oder daß es sofort
exprimiert und/oder überexprimiert wird.
Die regulatorischen Sequenzen bzw. Faktoren können dabei vorzugs
weise die nCL-3 Genexpression positiv beeinflussen und dadurch
erhöhen. So kann eine Verstärkung der regulatorischen Elemente
vorteilhafterweise auf der Transkriptionsebene erfolgen, indem
starke Transkriptionssignale wie Promotoren und/oder "Enhancer"
verwendet werden. Daneben ist aber auch eine Verstärkung der
Translation möglich, indem beispielsweise die Stabilität der mRNA
verbessert wird.
Unter "Enhancer" sind beispielsweise DNA-Sequenzen zu verstehen,
die über eine verbesserte Wechselwirkung zwischen RNA-Polymerase
und DNA eine erhöhte nCL-3-Genexpression bewirken.
Dem nCL-3-Gen mit oder ohne vorgeschaltetem Promotor bzw. mit
oder ohne Regulatorgen können ein oder mehrere DNA-Sequenzen
vor- und/oder nachgeschaltet sein, so daß das Gen in einer Genstruktur
enthalten ist.
Die Genexpression des nCL-3-Gens läßt sich darüber hinaus auch
durch Erhöhen der nCL-3-Genkopienzahl erhöhen. Zur Erhöhung der
Genkopienzahl wird das nCL-3-Gen beispielsweise in einem
CHO-Expressionsvektor amplifiziert. Als Vektoren eignen sich auch
Vektoren der pED-Reihe - dicistronische Vektoren -, die auch
das amplifizierbare Markergen Dihydrofolat Reduktase enthalten.
Details können den Current Protocols in Molecular Biology Vol 2,
1994 entnommen werden.
Eine Steigerung der nCL-3-Enzymaktivität läßt sich zum Beispiel
gegenüber dem Ausgangsenzym durch Veränderung des nCL-3-Gens oder
seiner tierischen Homologen durch klassische Mutagenese wie
UV-Bestrahlung oder Behandlung mit chemischen Mutagentien und/oder
durch gezielte Mutagenese wie site directed mutagenesis, Dele
tion(en), Insertion(en) und/oder Substitution(en) erzielen. Eine
Erhöhung der Enzymaktivität kann beispielsweise erreicht werden,
indem das katalytische Zentrum so verändert wird, daß das zu
spaltende Substrat rascher umgesetzt wird. Auch kann eine erhöhte
Enzymaktivität neben der beschriebenen Genamplifikation durch
Ausschaltung von Faktoren, die die Enzymbiosynthese reprimieren
und/oder durch Synthese aktiver statt inaktiver nCL-3-Proteine
erreicht werden. Auf diesem Weg können erhöhte Enzymmengen für
die in vitro-Tests zur Verfügung gestellt werden.
nCL-3 oder seine tierischen Homologen lassen sich vorteilhafter
weise ausgehend von genomischer DNA oder cDNA unter Verwendung
beispielsweise der PCR-Technik (siehe Molekular Cloning, Sambrok,
Fritsch and Maniatis, Cold Spring Harbor, Laboratory Press,
Second Edition 1989, Kapitel 14, 1-35, ISBN 0-87969-309-6 und
Saiki et al., Science, 1988, Vol. 239, 487ff) klonieren, bevor
zugt läßt sich nCL-3 unter Verwendung von genomischer DNA und
besonders bevorzugt unter Verwendung von genomischer DNA aus
Mauszellen klonieren.
Als Wirtsorganismus für die Klonierung eignen sich beispielsweise
alle Escherichia coli-Stämme, bevorzugt der Escherichia coli
Stamm DH10B. Als Vektoren für die Klonierung sind alle Vektoren
geeignet, die für die Expression in Escherichia coli geeignet
sind (siehe Molecular Cloning, Sambrok, Fritsch and Maniatis,
Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Second Edition 1989, ISBN
0-87969-309-6). Besonders geeignet sind beispielsweise Vektoren,
die sich von pBR oder pUC ableiten oder shuttle-Vektoren, ganz
besonders geeignet ist pBluescript.
Nach Isolierung und Sequenzierung sind nCL-3-Gene mit Nukleotid
sequenzen erhältlich, die für die in SEQ ID NO: 2 angegebene
Aminosäuresequenz oder deren Allelvariantionen kodieren. Unter
Allelvarianten sind nCL-3-Varianten zu verstehen, die 60 bis 100%
Homologie auf Aminosäureebene, bevorzugt 70 bis 100%, ganz
besonders bevorzugt 80 bis 100% aufweisen. Alle Varianten um
fassen insbesondere funktionelle Varianten, die durch Deletion,
Insertion oder Substitution von Nukleotiden aus der in
SEQ ID NO: 1 dargestellten Sequenz erhältlich sind, wobei die
nCL-3-Aktivität aber erhalten bleibt.
Unter Analoge von nCL-3 sind beispielsweise seine tierischen
Homologen, verkürzte Sequenzen wie nCL-3' (siehe SEQ ID NO: 3),
Einzelstrang-DNA oder RNA der codierenden und nichtcodierenden
DNA-Sequenz besonders antisense RNA zu verstehen.
Derivate von nCL-3 sind beispielsweise solche Derivate, die
enzymatisch nicht oder nur schwer spaltbar sind wie die Nuclein
säurephosphonate oder -phosphothioate, bei denen die Phospat
gruppe der Nucleinsäuren gegen eine Phosphonat- bzw Thioatgruppe
ersetzt wurde.
Auch der Promotor, der der angegebenen Nukleotidsequenz vor
geschalten ist, kann durch ein oder mehrere Nukleotidaustausche,
durch Insertion(en) und/oder Deletion(en) verändert sein, ohne
daß aber die Funktionalität bzw. Wirksamkeit des Promotors
beeinträchtigt ist. Des weiteren kann der Promotor auch durch
Veränderung seiner Sequenz in seiner Wirksamkeit erhöht oder
komplett durch wirksamere Promotoren auch artfremder Organismen
ausgetauscht werden.
Die nach den erfindungsgemäßen Verfahren identifizierten Calpain
inhibitoren eignen sich zur Herstellung von Medikamenten zur
Behandlung von Krankheiten ausgewählt aus der Gruppe der kardio
vaskulären, immunologischen, entzündlichen, allergischen, neuro
logischen, neurodegenerativen, oder onkologischen Erkrankungen
wie beispielsweise Restenose, Arthritis, Ischämien des Herzen,
der Niere oder des Zentralnervensystems (z. B. Hirnschlag), Ent
zündungen, Muskeldystrophien, Katarakten der Augen (Grauer Star),
Verletzungen des Zentralnervensystems (z. B. Trauma), Alzheimer
Krankheit, HIV-induzierte Neuropathy, Parkinsonsche- und
Huntigtonsche Krankheit.
Für die Klonierung eines Teils des nCL-3-Gen wurde genomische DNA
aus Mauszellen ES E14 verwendet. Die Sequenz dieses Teils wird in
SEQ ID NO 5 (Position 102 der ermittelten Sequenz kann anstelle
des G auch ein C sein) wiedergegeben. Es wurden die 5'-3' (= Vor
wärts) und 3'-5' (= Rückwärts)-Sequenzen der Primer CAL6 und CAL9
(siehe Tabelle 1) sowie folgende PCR-Bedingungen (siehe Molekular
Cloning, Sambrok, Fritsch and Maniatis, Cold Spring Harbor,
Laboratory Press, Second Edition 1989, Kapitel 14, 1-35, ISBN
0-87969-309-6 und Saiki et al., Science, 1988, Vol. 239, 487ff)
für die Klonierung verwendet, wobei das Reaktionsvolumen des An
satzes 50µl betrug:
250 ng Vorwärts-Primer
250 ng Rückwärts-Primer
1,5 mM MgCl2
0,2 mM dNTPs
50 mM KCl
10 mM Tris pH 9,0
1 µl genomische DNA
2 Units Taq Polymerase.
250 ng Rückwärts-Primer
1,5 mM MgCl2
0,2 mM dNTPs
50 mM KCl
10 mM Tris pH 9,0
1 µl genomische DNA
2 Units Taq Polymerase.
Es wurden 35 PCR-Zyklen durchgeführt, wobei 45 Sekunden 94°C,
45 Sekunden 48°C und 2 Minuten die Temperatur auf 72°C gehalten
wurde. Das endstandene Fragment wurde in den Vektor pBluescript
(SK+), linearisiert mit dem Enzym EcoRV, einkloniert (siehe Hol
ton et al., Nucleic Acids Research, Vol. 19., No. 5, 1156ff.).
Mit dem pBluescript-Vektor mit dem einklonierten Fragment wurde
der Escherichia coli Stamm DH10B entsprechend Maniatis et al.
transformiert (siehe Molekular Cloning, Sambrok, Fritsch and Ma
niatis, Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Second Edition
1989, Band 1, Kapitel 1, 74-84, ISBN 0-87969-309-6 und Saiki et
al., Science, 1988, Vol. 239, 487ff).
Für die Klonierung und Sequenzierung der vollständigen cDNA-Se
quenzen des nCL-3 und nCL-3'-Gens (siehe SEQ ID NO 1 und SEQ ID NO
3) wurde Doppelstrang cDNA, die aus Maus Balb/c Tag 12 Embryonen
mRNA hergestellt worden war (Synthese wie unter Beispiel 3 be
schrieben) mit einem spezifischen Adapter-Molekül versehen, das
blunt-end an die cDNA legiert wurde. Dieses Adapter-Molekül
diente als Primer-Bindungsstelle. Das Adapter-Molekül hat fol
gende Sequenz 5'-CTAATACGACTCACTATAGGGCTCGAGCGGCCGCCCGGGCAGGT-3'
und enthält eine T7-Promoter-Sequenz sowie Schnittstellen für
NotI, SrfI und XmaI. Als Primer für die Adaptorsequenz wurden die
beiden Primer 5'-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3 und 5'-ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC-3'
verwendet.
Die cDNA wurde mit Hilfe des folgenden Primers
5'-TTCTAGAATTCAGCGGCCGC(T)30N1N-3' (N1=G, A oder C; N=G, A, C
oder T, degenerativer Nucleotidanker am Ende des Poly-A-Schwan
zes, Adapter enthält Schnittstellen für EcoRI und NotI) syntheti
siert.
Mit Hilfe der aus der ursprünglich erhaltenen 29/30-Sequenz
(siehe Beispiel 1) wurden genspezifische, in den Exons gelegene
Oligonukleotide abgeleitet und als weitere Primer wie in Bei
spiel 1 beschrieben zur PCR-Reaktion verwendet. Die Klonierung
der Gene erfolgte schließlich nach einem Protokoll von der Firma
Clontech (siehe Clontech, Marathon-ReadyTM cDNA, User Manual
PT1156-1, Version # PR64097, Seite 4, 5, 44 und 45).
Für die Expression wurde mRNA aus dE12 Embryonen und aus Haut-,
Niere-, Herz-, Lunge-, Gehirn-, Thymus- und Dünndarmgewebe der
Maus isoliert. Für die Extraktion der mRNA wurden die Gewebe in
flüssigem Stickstoff dispergiert und in 10 ml einer Lösung aus
4 M Guanidinium-Isothiocyanat, 25 mM NaCitrat, 0,5% Sarcosyl und
72 µl 2-Mercaptoethanol resuspendiert. Anschließend wurden 1 ml
NaAcetat (pH 4,0), 10 ml wassergesättigtes Phenol und 2 ml Chlo
roform unter Mischen zugegeben. Die Proben wurden 20 Minuten in
zentrifugiert (5000 × g, 4°C). Der Niederschlag wurde verworfen.
Aus dem Überstand wurde die RNA mit einem Volumen Isopropanol bei
-20°C (mindestens eine Stunde Fällung) ausgefällt und erneut für
30 Minuten (19000 × g, 4°C) zentrifugiert. Der Niederschlag wurde
in 300 µl resuspendiert und erneut mit NaAcetat/Ethanol in der
Kälte gefällt, mit 70% Ethanol gewaschen und in 160 µl Wasser
gelöst. Anschließend wurde die mRNA-Konzentration bei 250 nm im
Photometer und in einem Agarosegel mit einer 5 µl mRNA-Probe ge
gen eine Referenz bestimmt.
Über RT-PCR, in dem ausgehend von der isolierten mRNA zunächst
eine cDNA-Kopie mit Hilfe der Reversen Transcriptase erstellt
wurde, wurde mit Hilfe der folgenden zwei Primer
- a) Vorwärtsprimer 5'-tagctcgagtggacgtaatcgtcgatgac-3'
- b) Rückwärtsprimer 5'-tagctcgagtgctgtaggctgtgcatacg-3'
die Expression des nCL-3-Gens in den verschiedenen Mausgeweben
bestimmt (siehe
Fig.
1).
Die cDNA wurde nach einem Protokoll von der Firma GIBCO wie folgt
hergestellt:
Zu 5 µg mRNA (isoliert nach der oben beschriebenen Methode) wur den 2 µl oligo(dT) und 12 µl DEPC dH2O gegeben. Dieser Ansatz wurde 10 Minuten bei 70°C inkubiert und anschließend auf Eis ge stellt. Zur Probe wurden in der angegebenen Reihenfolge 2 µl 10 × Puffer, 2 µl 25 mM MgCl2, 1 µl 10 mM dNTPs, 2 µl 0,1 M DTT gegeben. Nach 5 Minuten Inkubation bei 23°C wurde 1 µl Super script Reverse Transcriptase hinzugegeben und das ganze 10 Min. bei 25°C, 50 Min. bei 42°C und 15 Min. bei 70°C weiter inku biert. Danach wurde 1 µl RNAse H zugegeben und 20 Min. bei 37°C inkubiert, danach wurden 79 µl H2O zugegeben. Die Reaktion wurde für weitere 15 Min. bei 70°C durchgeführt. 1 µl dieser cDNA 5 wurde für die RT-PCR-Reaktion verwendet.
Zu 5 µg mRNA (isoliert nach der oben beschriebenen Methode) wur den 2 µl oligo(dT) und 12 µl DEPC dH2O gegeben. Dieser Ansatz wurde 10 Minuten bei 70°C inkubiert und anschließend auf Eis ge stellt. Zur Probe wurden in der angegebenen Reihenfolge 2 µl 10 × Puffer, 2 µl 25 mM MgCl2, 1 µl 10 mM dNTPs, 2 µl 0,1 M DTT gegeben. Nach 5 Minuten Inkubation bei 23°C wurde 1 µl Super script Reverse Transcriptase hinzugegeben und das ganze 10 Min. bei 25°C, 50 Min. bei 42°C und 15 Min. bei 70°C weiter inku biert. Danach wurde 1 µl RNAse H zugegeben und 20 Min. bei 37°C inkubiert, danach wurden 79 µl H2O zugegeben. Die Reaktion wurde für weitere 15 Min. bei 70°C durchgeführt. 1 µl dieser cDNA 5 wurde für die RT-PCR-Reaktion verwendet.
Die PCR-Reaktion für den Nachweis der Expression von nCL-3 wurde
wie folgt durchgeführt, wobei das Reaktionsvolumen 50 µl betrug:
250 ng Vorwärts-Primer
250 ng Rückwärts-Primer
1,5 mM MgCl2
0,2 mM dNTPs
50 mM KCl
10 mM Tris pH 9,0
1 µl cDNA
2 Units Tag Polymerase.
250 ng Rückwärts-Primer
1,5 mM MgCl2
0,2 mM dNTPs
50 mM KCl
10 mM Tris pH 9,0
1 µl cDNA
2 Units Tag Polymerase.
Es wurden 35 PCR-Zyklen durchgeführt, wobei 45 Sekunden 94°C,
45 Sekunden 58°C und 1 Minute die Temperatur auf 72°C gehalten
wurde.
In den getesteten Geweben zeigte sich, daß nCL-3 in den dE12-Em
bryonen exprimiert wird. nCL-3 wird auch in der Haut, der Niere,
dem Herz, der Lunge und im Thymus exprimiert. Im Gehirn und im
Dünndarm ist die Expression schwächer als in den vorgenannten Or
ganen (in Abb. 1 nicht zu sehen). Als interner Standard
wurde hprt (= Hypoxanthin-phosphor-ribosyl-transferase)
verwendet.
Die Cathepsin B-Hemmung wurde analog einer Methode von S. Hasnain
et al., J. Biol. Chem. 1993, 268, 235-40 bestimmt.
Zu 88 µl Cathepsin B ( Cathepsin B aus menschlicher Leber (Calbio
chem), verdünnt auf 5 Units in 500 µM Puffer) werden 2µL einer
Inhibitor-Lösung, hergestellt aus Inhibitor und DM50 (Endkonzen
trationen: 100 µM bis 0,01 µM). Dieser Ansatz wird für 60 Minuten
bei Raumtemperatur (25°C) vorinkubiert und anschließend die Reak
tion durch Zugabe von 10 µL 10 mM Z-Arg-Arg-pNA (in Puffer mit
10% DMSO) gestartet. Die Reaktion wird 30 Minuten bei 405 nM im
Mikrotiterplattenreader verfolgt. Aus den maximalen Steigungen
werden anschließend die IC50 bestimmt.
Die Aktivität der Calpain Inhibitoren wurde in einem colori
metrischen Test mit Casein nach Hammarsten (Merck, Darmstadt) als
Substrat untersucht. Der Test wurde in der Mikrotiterplatte, ent
sprechend der Veröffentlichung von Buroker-Kilgore und Wang in
Anal. Biochemistry 208, 387-392 (1993), durchgeführt. Als Enzym
wurde 29/30, welches in einem der oben beschriebenen Systemen
exprimiert und anschließend gereinigt wurde, verwendet. Die Sub
stanzen wurden mit dem Enzym für 60 Minuten bei Raumtemperatur
inkubiert, wobei eine Konzentration von 1% des Lösungsmittels
DM50 nicht überschritten wurde. Nach Zugabe des Bio-Rad Farb
reagenz erfolgte die Messung der optischen Dichte bei 595 nm in
dem Easy Reader EAR 400 der Firma SLT. Die 50%ige Aktivität des
Enzyms ergibt sich aus den optischen Dichten, die bei der maxi
malen Aktivität des Enzyms ohne Inhibitoren und der Aktivität des
Enzyms ohne Zugabe von Kalzium bestimmt wurden.
Der Calpain-vermittelte Abbau von Proteinen in Plättchen wurde,
wie von Zhaozhaoli et al., J. Med. Chem., 1993, 36, 3472-3480
beschrieben, durchgeführt. Humane Plättchen wurden aus frischem
Natrium-Citrat-Blut von Spendern isoliert und in Puffer (5 mM
Hepes, 140 mM NaCl und 1 mg/ml BSA, pH 7,3) auf 107 Zellen/ ml
eingestellt.
Plättchen (0,1 ml) werden für 5 Minuten mit 1 µl an verschiedenen
Konzentrationen an Inhibitoren (gelöst in DM50) vorinkubiert.
Danach erfolgte die Zugabe von Kalziumionophor A 23187 (1 µM im
Test) und Kalzium (5 mM im Test) und eine weitere Inkubation von
5 Minuten bei 37°C. Nach einem Zentrifugationsschritt wurden die
Plättchen in SDS-Page Probenpuffer aufgenommen, 5 Minuten bei
95°C gekocht und die Proteine in einem 8%igen Gel aufgetrennt.
Der Abbau der beiden Proteine Act in bindendes Protein (ABP) und
Talin wurde durch quantitative Densitometrie verfolgt, da nach
der Zugabe von Kalzium und Ionophor diese Proteine verschwanden
und eine neue Bande im Bereich von 200 Kd Molekulargewicht ent
stand. Daraus wird die halb maximale Enzymaktivität bestimmt.
Claims (18)
1. nCL-3-Calpaingen mit der Sequenz SEQ ID NO: 1 sowie seine al
lelischen Varianten, Analoge oder Derivate.
2. nCL-3-Calpaingen nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß es sich bei dem Analogen um eine verkürzte Gensequenz
handelt.
3. Genkonstrukt nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet,
daß das Gen funktionell mit einem oder mehreren Regulations
signalen zur Erhöhung der Genexpression funktionell verknüpft
ist.
4. Aminosäuresequenz codiert durch das nCL-3-Gen gemäß
Anspruch 1.
5. Verfahren zur Identifizierung von Calpaininhibitoren, wobei
man ein Calpain codiert durch eine Sequenz gemäß Anspruch 1
aus Geweben oder Zellen, in denen das Enzym nCL-3 exprimiert
wird, isoliert und die Inhibierung der Spaltung eines Sub
strats des Enzyms nCL-3 und in mindestens einem weiteren
Test die Inhibierung der Spaltung eines Substrats der Enzyme
Calpain I und/oder II durch Testsubstanzen mißt und die Test
substanzen auswählt, die mindestens gegen eines der Calpaine
eine inhibierende Wirkung zeigen.
6. Verfahren nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, daß man
die Testsubstanzen auswählt, die das Enzym nCL-3 nicht
hemmen, jedoch die Enzyme Calpain I und/oder II.
7. Verfahren nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, daß man
die Testsubstanzen auswählt, die das Enzym nCL-3 hemmen,
nicht jedoch die Enzyme Calpain I und/oder II.
8. Verfahren nach den Ansprüchen 5 bis 7, dadurch gekennzeich
net, daß man die Testsubstanzen auswählt, die in zellulären
Systemen die Zellmembran passieren.
9. Verfahren zur Herstellung des Enzyms nCL-3, dadurch gekenn
zeichnet, daß man eine Kopie der Gensequenz für nCL-3 in
einen Vektor kloniert und in einem dem Vektor entsprechenden
Wirtsorganismus das Gen für das Enzym nCL-3 exprimiert und
anschließend das Enzym aus dem Wirtsorganismus isoliert.
10. Verfahren nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß man
einen Vektor verwendet der in Bakterienzellen, pilzlichen
und/oder tierischen Zellen die Expression des Gens für nCL-3
ermöglicht.
11. Verfahren nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß man
als Wirtsorganismus Bakterien, pilzliche oder tierische
Zellen verwendet.
12. Verfahren nach Anspruch 9 , dadurch gekennzeichnet, daß man
als Vektor Baculoviren und als Wirtsorganismus Insektenzellen
verwendet.
13. Verwendung eines Calpaininhibitors identifizierbar gemäß den
Ansprüchen 5 bis 8 zur Herstellung von Medikamenten zur Be
handlung von Krankheiten bei denen eine Calpainfehlfunktion
vorliegt.
14. Verwendung eines Calpaininhibitors nach Anspruch 13 zur Her
stellung von Medikamenten zur Behandlung von Krankheiten aus
gewählt aus der Gruppe der kardiovaskulären, immunologischen,
entzündlichen, allergischen, neurologischen, neurodegenera
tiven, oder onkologischen Erkrankungen.
15. Verwendung des Calpains nCL-3 gemäß Anspruch 4 in
Screening-Testsystemen.
16. Verwendung des Calpains nCL-3 gemäß Anspruch 4 zur Her
stellung von Antikörpern.
17. Verwendung einer Gensequenz gemäß Anspruch 1 zur Herstellung
von antisense mRNA.
18. Verwendung der antisense mRNA nach Anspruch 17 zur Her
stellung von Medikamenten zur Behandlung von Krankheiten
bei denen eine Calpainfehlfunktion vorliegt.
Priority Applications (15)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE1996150142 DE19650142A1 (de) | 1996-12-04 | 1996-12-04 | Neue Calpaine, ihre Herstellung und Verwendung |
HU0000498A HUP0000498A3 (en) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Novel calpaines, production and use thereof |
BR9713849-5A BR9713849A (pt) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Gene de calpaìna ncl-3, construção de gene, sequência de aminoácidos, processos para identificar inibidores de calpaìna e para preparar a enzina ncl3, e usos de um inibidor de calpaìna, da calpaìna ncl-3, de uma sequência de genes, do mrna anti-sentido e de um gene de calpaìna. |
US09/308,345 US6569665B1 (en) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Calpaines, production and use thereof |
EP97952002A EP0942995A1 (de) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Neue calpaine, ihre herstellung und verwendung |
CZ992005A CZ9902005A3 (cs) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Nové calpainy, jejich výroba a použití |
PCT/EP1997/006644 WO1998024916A1 (de) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | Neue calpaine, ihre herstellung und verwendung |
CN97181646A CN1245536A (zh) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | 新型钙蛋白酶,其制备和用途 |
KR1019990704896A KR20000057365A (ko) | 1996-12-04 | 1997-11-28 | 신규한 칼페인, 그들의 제조 방법 및 용도 |
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