CZ345098A3 - Regulace metabolismu modifikací hladiny trehalosa-6-fosfátu - Google Patents
Regulace metabolismu modifikací hladiny trehalosa-6-fosfátu Download PDFInfo
- Publication number
- CZ345098A3 CZ345098A3 CZ19983450A CZ345098A CZ345098A3 CZ 345098 A3 CZ345098 A3 CZ 345098A3 CZ 19983450 A CZ19983450 A CZ 19983450A CZ 345098 A CZ345098 A CZ 345098A CZ 345098 A3 CZ345098 A3 CZ 345098A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- trehalose
- tps
- phosphate
- tpp
- gene
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8262—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield involving plant development
- C12N15/8269—Photosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8273—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1048—Glycosyltransferases (2.4)
- C12N9/1051—Hexosyltransferases (2.4.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1205—Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01028—Alpha,alpha-trehalase (3.2.1.28)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Physiology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Cereal-Derived Products (AREA)
Description
Oblast techniky
Glykolýza byla jedním z prvních biochemických metabolických procesů, popsaných detailně v literatuře. Ačkoliv obecně je tok cukrů v organizmu znám a ačkoliv jsou objasněny všechny enzymy glykolytických cest, signál, který způsobuje indukci metabolismu stimulací glykolýzy nebyl zatím rozluštěn. Bylo navrženo několik hypotéz, založených na základě znalostí kvasinek, ale žádná z nich nebyla prokázána beze vší pochybnosti.
Vliv na řízení rozdělování cukrů neovlivňuje přímo pouze glykolytické buněčné procesy a skladování cukrů, ale může být použit na ovlivnění sekundárních či odvozených procesů jako je buněčné dělení, vytváření biomasy a akumulace zásobních látek, což znamená ovlivnění růstu a produktivity.
Zvláště u rostlin jsou vlastnosti pletiv přímo ovlivněny přítomností cukrů a řízení rozdělování cukrů může přinést obrovské rozdíly.
Růst, vývoj a výnos rostlin závisí na energii, kterou mohou takovéto rostliny získat z fixace C02 během procesu fotosyntézy.
Fotosyntéza probíhá především v listech a v menší míře ve stonku. Ostatní rostlinné orgány jako jsou kořeny, semena nebo hlízy podstatě nepřispívají k fotoasimílačnímu procesu. Tato pletiva jsou ve svém růstu a výživě kompletně závislá na fotosynteticky aktivních orgánech. To poté znamená, že existuje tok produktů odvozených od fotosyntézy (nazývaných obecně fotosyntáty) do fotosynteticky inaktivních částí rostliny. Fotosynteticky aktivní části jsou nazývány zdroji (sourses) a jsou popisovány jako čisti vývozci fotosyntátů.
Předpokládá se, že jak výkonnost fotosyntézy, tak také rozdělení cukrů v rostlinách je pro rostlinu nepostradatelné. Nově se vyvíjející pletiva jako např. mladé listy nebo jiné části rostliny jako kořeny a semena jsou kompletně závislé na fotosyntetických zdrojích. Možnost ovlivnění distribuce cukrů by měla obrovský vliv na fenotyp rostliny - na například její výšku, • ·
vzdálenost internodií, velikost a tvar listů a velikost a strukturu kořenového systému.
Kromě toho má distribuce fotoasimilačních produktů velkou důležitost na výnos rostlinné biomasy a plodů. Příkladem je vývoj pšenice během posledního století. Její fotosyntetická kapacita se nezmělnila nějak výrazně, ale výnos pšeničných zrn vzrostl podstatně. Zvýšil se poměr sklídítelné biomasy ku celkové biomase (sklizňový index). Důvodem v pozadí je skutečnost, že se působením klasického šlechtění změnil poměr sink-source, to znamená poměr zdrojů a pletiv využívajících tyto zdroje. Např. část rostliny , která se dá sklidit- tedy semena, se zvýšila. Mechanismus, který řídí distribuci asimilačních produktů a následně tvorbu sinků a zdrojů je nicméně neznámý. Předpokládá se, že je tento mechanismus lokalizován někde v metabolických cestách cukrů a jejich regulaci.
Z posledních výzkumů vyplývá, že hexokinasy mohou hrát hlavní roli v metabolické signalizaci a kontrole metabolických toků. Bylo postulováno množství mechanismů regulujících aktivitu hexokinas (Graham et al. (1994), The Plant Cell 6: 761; Jang and Sheen (1994), The Plant Cell 6: 1665; Rose et al. (1991) Eur.J.Biochem. 199:511518; Blazquez et al. (1993), FEBS 329:51; Koch (1996), Annu.
Rev.Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 47:509; Jang et al. (1997) The Plant Cell 9:5).Jedna z těchto teorií hexokinasové regulace postulovaných v kvasinkách se zmiňuje o trehalose a s ní souvisejících monosacharidech (Thevelein and Hohmann (1995), TIBS 20:3). Je ovšem těžké si představit, že by toto byl univerzální mechanizmus, protože se předpokládá, že syntéza trehalosy je omezena pouze na určité druhy.
Zbývá zde tudíž stále potřeba objasnění signálu, který může řídit modifikaci vývoje a/nebo složení buněk, pletiv a orgánů in v i vo.
Dosavadní stav techniky
Vynález vychází z možnosti modifikace metabolismu in vivo hladinou T-6-P. Pokles intracelulární koncentrace T-6-P stimuluje glykolytickou aktivitu a naopak zvýšení koncentrace T-6-P inhibuje glykolytickou aktivitu a stimuluje fotosyntézu.
• · to ·· · · · · · · · · • · · · · · · · · · · • to ···· « · · · · ··· ···
Tyto modifikace způsobené změnami T-6-P jsou nejpravděpodobněji důsledkem signální funkce hexokinas, jejíchž aktivita, jak bylo ukázáno, je pomocí T-6-P regulována. Zvýšený tok prostřednictvím hexokinas, tj. zvýšeným množstvím glukosy, z které vzniká glukosa-6fosfát, inhibuje fotosyntetickou aktivitu v rostlinách. Navíc zvýšený tok přes hexokinasy nestimuluje pouze glykolýzu, ale také intenzitu dělení buněk.
Teorie regulace metabolismu uhlíku trehalosa-6-fosfátem.
V normální rostlinné buňce probíhá tvorba cukrů v průběhu fotosyntézy, při které je C02 vázán a redukován na fosforylované hexosy se sacharosou jako konečným produktem. Normálně je tato sacharosa transportována ven z buňky do buněk nebo pletiv, ve kterých díky tomuto přísunu sacharosy mohou využívat cukry jako stavební materiál pro jejich metabolismus nebo jsou schopny tyto cukry ukládat jako např.škrob. Z tohoto hlediska jsou rostlinné buňky produkující cukry považovány za zdroje, zatímco buňky, ve kterých se cukry spotřebovávají jsou nazývány sinkem.
V živočišných buňkách a ve většině buněk mikrobiálních fotosyntéza neprobíhá a cukry jsou získávány z externích zdrojů, buď přímým využitím sacharidů (např. kvasinky a další mikroorganismy) nebo štěpením cukrů (zvířata). Cukry jsou většinou transportovány ve formě glukosy, která je aktivně transportována přes buněčnou membránu.
K prvním krokům metabolické dráhy glukosy po vstupu do buňky je její fosforylace na glukosa-6-fosfát katalysovaná enzymem hexokinasou. Již dříve bylo prokázáno, že cukry fosforylované hexokinasami (HXK) v rostlinách řídí expresi genů účastnících se při fotosyntéze (Jang a Sheen (1994), The Plant Cell 6, 1665). Proto se předpokládá, že HXK mohou mít dvojí funkci a mohou působit jako klíčový senzor a přenašeč signálu regulace genové exprese řízené cukry. Tato regulace nejspíš normálně signalizuje buňce je-li dostupný počáteční produkt, tj. glukosa. Podobný účinek může být pozorován při zavedení TPS nebo TPP, které ovlivňují hladinu T-6-P. Navíc bylo ukázáno, že hladina T-6-P ovlivňuje aktivitu hexokinas in vitro. Zvyšováním hladiny T-6P buňka dostane signál, že je nedostatečný přísun cukrů. A naopak • ·
snižování hladiny T-6-P představuje signál nadbytku glukosy vedoucí ke snížení fotosyntézy: signalizuje, že substrát pro glykolýzu a následný přísun energie potřebné pro růst a dělení buněk je dostupný v dostatečné míře. Předpokládá se, že tato signalizace je spuštěna zvýšeným tokem přes hexokinasy (J.J. Van Oosten, přednáška na RijksUniversiteit Utrecht, 19.4. 1996).
Podle teorie založené na možnosti regulace hexokinasové signalizace u rostlin hladinou trehalosa-6-fosfátu, by všechny rostliny vyžadovaly přítomnost enzymatického systému schopného vytvářet a rozkládat signální molekulu trehalosa-6-fosfátu. Přestože je trehalosa běžně přítomná u mnoha druhů hub, bakterií, kvasinek, řas a některých bezobratlých, pouze u velmi omezeného okruhu cévnatých rostlin byla syntéza tohoto cukru prokázána (Elbein (1974), Adv. Carboh. Chem. Biochem. 30, 227). Stále zůstává nejasné, proč i přes zjevný nedostatek enzymů syntetizujících trehalosu obsahují všechny rostliny trehalasy, tj. enzymy schopné štěpit trehalosu na dvě molekuly glukosy.
Nepřímý důkaz přítomnosti metabolické dráhy pro trehalosu byl získán v experimentech s inhibitory trehalasy jako je Validamycin A nebe při transformaci anti-sense trehalasou prezentovaných v tomto dokumentu.
Tvorba trehalosy by mohla být bržděna, jestliže by její meziprodukt T-6-P mohl příliš ovlivnit metabolickou aktivitu. Aby se mohla trehalosa akumulovat ve vysokých koncentracích, aniž by bylo ovlivněno rozdělení a lokalizace metabolitů působením trehalosa-6fosfátu, měl by být ve velké míře exprimován dvoudílný enzym TPS/TPP. Takový enzym by byl svou genetickou stavbou podobný genu kvasinek, kde produkt genu TPS2 obsahuje TPS a TPP oblast homologní s geny otsA a otsB
E.coli (Kaasen et al. (1994), Gene 145, 9). Při použití takového enzymu nebude trehalosa-6-fosfát volně dostupný pro jiné buněčné komponenty. Jiný příklad takového bipartitního enzymu uvádí Zentella a Iturriaga (Plant Physiol. (1996), 111 abstrakt 88), kteří izolovali ze Selaginella lepidophylla cDNA o velikosti 3,2 kb kódující možnou trehalosa-6- fosfátsyntasu/fosfatasu. Lze také předpokládat, že konstrukce zkráceného produktu genu TPS-TPP, kterým by byla zajištěna aktivita pouze TPS, by byla pro syntézu T-6-P • ·
4 4 -44 4 4 4 · 4 4 • · ·' ·' 4 · · · 4 · · • 4 4444 4 4 4 4 4 444 444
4·· 4 4 4 4 4
4 44444 44 44 stejně účinná jako ostA gen z E.coli při použití v homologním systému.
Podle našich údajů na molekulární úrovni jsou geny pro syntézu trehalosy kromě Selagínella přítomny také v Arabidopsís, tabáku, rýži a slunečnici. Pomocí degenerovaných primeru založených na konzervovaných sekvencích mezi TPSE.con a TPSkvasin)cy jsme byli schopni identifikovat geny kódující možné enzymy produkující trehalosa-6fosfát u slunečnice a tabáku. Při porovnání sekvencí byla zjištěna významná homologie mezi těmito sekvencemi: TPS geny z kvasinek a E.coli a EST (expressed sequence tags) sekvencemi z Arabidopsís a rýže (viz též Tab. 6b, ve které jsou uvedena EST čísla zjištěných homologních EST).
Nedávno byl určen gen z Arabidopsís (GENBANK Acc. No. Y08568, popis v SEQ ID NO: 39), který je možné na základě jeho homologie považovat za bipartitní enzym.
Podle těchto údajů obsahuje většina rostlin, v rozporu se současnými názory, geny kódující trehalosa-fosfát syntasy, které jim umožňují syntetizovat T-6-P. Jak bylo dokázáno u rostlin exprimujících TPS a akumulujících trehalosu, rostliny obsahují specifické i nespecifické fosfatasy schopné defosforylovat T-6-P na trehalosu. Přítomnost trehalasy ve všech rostlinách by mohla zvýšit účinnost přeměny trehalosy.
Dále jsme také získali údaje o roli T-6-P při regulaci dráhy cukrů v lidských tkáních. Určili jsme lidský TPS gen (zobrazený v SEQ ID NO: 10) homologní k TPS genu z kvasinek, E. coli a rostlin. Dále jsme uvedli údaje o vlivu na aktivitu hexokinas v lidských (myších) tkáních.
Vytváření takového signálu snižováním vnitrobuněčné koncentrace trehalosa-6-fosfátu prostřednictvím exprese enzymu TPP (nebo inhibici enzymu TPS) bude signalizovat všem buněčným systémům zvýšení toku uhlíku přes glykolýzu a inhibici fotosyntézy. Toto je názorně ukázáno v experimentální části , kde např. v Příkladu 2 jsou popsány transgenní rostliny tabáku s expresí enzymu TPP, které mají větší listy, více se větví a mají snížený obsah chlorofylu. Pokud je však tento silný signál vytvářen při nedostatečném množství glukózy, je zásoba cukrů rychle spotřebována.
. ·
V případě, že tento uměle vytvořený „nadbytečný signál přetrvává, bude nakonec snížení obsahu cukrů limitující pro růst a .buněčné dělení, tj. buňky spotřebují všechny své zásobní cukry a budou hladovět. Proto se listy vytvářejí s nízkým obsahem zásobních cukrů. Naproti tomu mají rostliny exprimující konstrukt s genem pro TPS, který zvyšuje vnitrobuněčnou koncentraci T-6-P, redukovanou velikost listů, zatímco listy jsou tmavěji zelené a obsahují více chlorofylu.
U kvasinek je hlavním cílem glukosou indukované signalizace přepnutí metabolismu z neogenetického /respiračního způsobu na fermentativní způsob. Na tomto jevu se podílí několik signálních drah (Thevelein a Hohmann, (1995) TIBS 20, 3). Bylo zjištěno, že kromě možné role hexokinasové signální dráhy je glukosou aktivována také dráha RAScyklické-AMP (cAMP). Aktivace RAS-cAMP dráhy glukosou vyžaduje fosforylaci glukosy ale ne její další metabolismus. Zatím bylo prokázáno, že tato dráha aktivuje trehalasu a 6-fosfofrukto-2-kinasu (čímž stimuluje glykolýzu), zatímco je fruktosa-1,6-bísfosfatasa inhibována cAMP-dependentní fosforylaci proteinů (čímž brání glukoneogenezi). Tato dráha signální transdukce a metabolické změny, které může vyvolávat, může být považována za jednu z drah působících paralelně s hexokinasovou signální dráhou, která, jak bylo ukázáno, je ovlivněna hladinou trehalosa-6-fosfátu.
Jak je popsáno v našem vynálezu, transgenní rostliny exprimující astrehalasu se projevují podobně jako rostliny exprimující TPS gen, mají tmavozelené listy a vyšší výnos. Zdá se také, že exprese astrehalasy v dvojitých konstruktech zvyšuje účinky vyvolané expresí TPS. Aktivita trehalasy byla prokázána např. u rostlin, hmyzu, zvířat, hub a bakterií, ale pouze u omezeného počtu druhů je trehalosa akumulována.
Přestože je trehalasa přítomna u většiny rostlinných druhů, není její role v rostlinách dosud známá. Předpokládá se, že se účastní při interakci mezi patogenem a rostlinou a při obranné reakci rostliny. Z bramboru jsme izolovali gen pro trehalasu a ukázali, že inhibice aktivity trehalasy v pletivech listů a hlíz bramboru vede ke zvýšení výnosu hlíz. Exprese as-trehalasy specifické pro plody v kombinaci s expresí TPS změnila podstatně vývoj plodů rajčete.
Podle vynálezu dochází k akumulaci T-6-P v těch buňkách, kde obsah vznikajícího T-6-P byl vyvolán vnesením exprimovatelného konstruktu genu kódujícího trehalosa-fosfát-syntasu (TPS). Může být použit každý gen pro trehalosa-fosfát-syntasu řízený regulačními prvky nezbytnými pro expresi DNA v buňkách, buď specificky nebo konstitutivně, pokud je schopen produkovat trehalosa-fosfát-syntasu a tím T-6-P v uvedených buňkách. V souladu s vynálezem je příklad jednoho otevřeného čtecího rámce kódujícího TPS-enzym popsaného v SEQ ID NO:2. Dalšími příklady jsou otevřené čtecí rámce prezentované pod označením SEQ ID NO: 10, 18-23, 41 a 45-53. Je známou skutečností, jak ilustrují výše uvedené sekvence, že identický enzym může být kódován více než jednou sekvencí DNA, což je způsobeno degenerací genetického kódu. Otevřený čtecí rámec kódující trehalosa -fosfát-syntasu může být přizpůsoben použití kodonu u zvoleného hostitele, ale není to podmínkou.
Izolovaná sekvence nukleové kyseliny reprezentovaná například SEQ ID NO: 2 může být použita k identifikaci genů pro trehalosa fosfát-syntasu v jiných organismech a jejich následnou izolaci a klonování pomocí PCR technik a hybridizací DNA z jiných zdrojů s fragmentem DNA nebo
RNA získaným z genu E. coli. Přednostně je taková sekvence DNA hybridizována za více či méně přesných podmínek (ovlivněných faktory jako je teplota, iontová síla hybridizační směsí). Zda jsou přesné podmínky pro hybridizací potřebné závisí na povaze hybridizace, tj. DNA:DNA, DNA:RNA, RNA:RNA, stejně tak jako na délce nej kratšího hybridizujícího fragmentu. Odborníci pracující v tomto oboru snadno dokáží stanovit vhodné podmínky režimu hybridizace tak, aby byly izolovány TPS geny a současně se vyloučila možnost nespecifické hybridizace. Pro získání exprimovatelného genu pro trehalosa fosfát-syntasu je možné použít i další, v současnosti dostupné geny pocházející z jiných zdrojů, které se účastní syntézy trehalosy, a to podobným způsobem jak je popsáno v tomto vynálezu. Více podrobností je uvedeno v experimentální části.
Zdroje pro izolaci trehalosa -fosfát-syntasové aktivity zahrnují mikroorganismy (např. bakterie, kvasinky, houby), rostliny, zvířata a podobně. Pro produkci T-6-P mohou být podle vynálezu využity podobným způsobem i izolované sekvence DNA kódující
• · · trehalosa -fosfát-syntasovou aktivitu 2 jiných zdrojů. Jako přiklad mohou sloužit geny pro produkci T-6-P z kvasinek, které byly objeveny v WO 93/17093.
Vynález také obsahuje sekvence nukleových kyselin, které byly získány modifikací sekvence nukleové kyseliny prezentované v SEQ ID NO: 1 mutací jednoho nebo více kodonů tak, aby výsledkem byly změny aminokyselin u kódovaného proteinu. Mutace sekvence aminokyselin byla prováděna tak dlouho, až došlo k úplnému odstranění aktivity trehalosa -fosfát-syntasy.
Podle další části vynálezu může být trehalosa-6-fosfát v buňce přeměněn na trehalosu pomocí genů pro trehalosa-fosfát-fosfatasu řízenými regulačními prvky nezbytnými pro expresi DNA v buňkách. Preferovaným otevřeným čtecím rámcem je podle vynálezu rámec kódující enzym TPP prezentovaný v SEQ ID NO: 4 (Kaasen et al. (1994) Gene, 145, 9) . Je dobře známá skutečnost, že identický enzym kóduje více než jedna sekvence DNA, což je způsobeno degenerací genetického kódu. Otevřený čtecí rámec kódující trehalosa -fosfát-fosfatasu může být přizpůsoben použití kodonu u zvoleného hostitele, ale není to podmínkou.
Izolovaná sekvence nukleové kyseliny reprezentovaná v SEQ ID NO: 3 může být použita k identifikaci genů pro trehalosa -fosfátfosfatasu v jiných organizmech a jejich následnou izolaci a klonování pomocí PCR technik a hybridizací DNA z jiných zdrojů s fragmentem DNA nebo
RNA získaným z genu E. coli. Přednostně je taková sekvence DNA hybridizována za více či méně přesných podmínek (ovlivněných faktory jako je teplota, iontová síla hybridizační směsi). Zda jsou přesné podmínky pro hybridizaci potřebné závisí na povaze hybridizace, tj. DNA:DNA, DNA:RNA, RNA:RNA, stejně tak jako na délce nej kratšího hybridizujícího fragmentu. Podmínky režimu hybridizace musí být dostatečně striktní, aby byly izolovány TPS geny a současně se vyloučila možnost nespecifické hybridizace. K získání exprimovatelného genu pro trehalosa -fosfát- fosfatasu mohou být použity i další dostupné geny účastnící se při syntéze trehalosy, které pocházející z jiných zdrojů a to podobným způsobem jako v tomto vynálezu. Více podrobností je uvedeno v experimentální části.
Zdroje pro izolaci trehalosa -fosfát- fosfatasové aktivity zahrnuji mikroorganismy (např. bakterie, kvasinky, houby), rostliny, zvířata a podobně. Použít lze také izolované sekvence DNA kódující trehalosa -fosfát- fosfatasovou aktivitu z jiných zdrojů.
Vynález také obsahuje sekvence nukleových kyselin, které byly získány modifikací sekvence nukleové kyseliny prezentované v SEQ ID NO: 3 mutací jednoho nebo více kodonů tak, aby výsledkem byly změny aminokyselin u kódovaného proteinu. Mutace sekvence aminokyselin byla prováděna tak dlouho, až došlo k úplnému odstranění aktivity trehalosa -fosfát- fosfatasy.
Dalšími enzymy s TPS a TPP aktivitou jsou tzv. bipartitní enzymy.
Lze předpokládat, že část sekvence specificky kódující pouze jednu z těchto dvou aktivit, může být separována z části bipartitního enzymu kódujícího i druhou část. Jedním ze způsobů separace aktivit je vložení mutace do sekvence kódující aktivitu, která není zvolena. Touto mutací je pak zasažený exprimovaný protein poškozen nebo není aktivní a plní se zbylá funkce. Toto lze učinit u sekvencí kódujících jak TPS tak TPP aktivitu. Takto získané kódující sekvence mohou být použity pro tvorbu nového chimérického otevřeného čtecího rámce schopného exprimovat enzymy s TPS nebo TPP aktivitou.
Podle další části vynálezu mohou být rostliny geneticky pozměněné tak, aby produkovaly a akumulovaly výše zmíněné enzymy v určitých částech rostliny. Preferována je tato exprese enzymů v listech a zásobních orgánech rostlin. Za zvlášť vhodné části rostlin jsou považovány bramborové hlízy. Promotor, kterým je selektivně dosaženo exprese enzymu TPS v mikrohlízkách a hlízách bramboru, lze získat z oblasti proti směru transkripce (upstream) otevřeného čtecího rámce patatinového genu z bramboru.
Dalším vhodným promotorem pro specifickou expresi je plastocyaninový promotor, který je specifický pro fotoasimilující části rostlin. Předpokládá se také, že specifická exprese v jednotlivých částech rostlin může pozitivně působit na růst rostlin a reprodukci nebo ekonomické využití těchto rostlin.
Z tohoto hlediska jsou užitečné následující promotory: promotor E8 (EP 0 409 629) a promotor 2A11 (van Haaren a Houck (1993), Plant
Mol. Biol. 221, 625), které jsou specifické pro plody; kruciferinový promotor, napinový promotor a ACP promotor, které jsou specifické • 9 9 • 9 pro semena; PAL promotor; chalkon-izomerasový promotor specifický pro květy; SSU promotor a feredoxinový promotor, které jsou specifické pro listy; TobRb7 promotor specifický pro kořeny, RolC promotor specifický pro floém a HMG2 promotor (Enjuto et al. (1995), Plant Cell 7, 517) a PCNA promotor z rýže (Kosugi et al. (1995)
Plant J. 7, 877), které jsou specifické pro meristemová pletiva. Dalši možnosti při využiti tohoto vynálezu je aplikace indukovatelných promotorů. Jsou známy promotory indukované patogeny, stresem, chemickými nebo světelnými (světlo/tma) podněty. Lze předpokládat, že pro indukci specifických projevů, např. rašení, vybíhání, tvorba semen, ukládání do zásobních pletiv, je výhodné použít k indukci aktivity genů, které jsou předmětem vynálezu, vnější podněty. Tento přístup umožňuje normální vývoj rostlin a výhodnou řízenou indukcí požadovaného jevu. Promotory, které jsou určeny pro použití v takovém systému jsou promotory indukovatelné patogeny popsané v DE 4446342 (PRP-1 indukovaný houbami a auxinem), WO 96/28561 (PRP-1 indukovaný houbami), EP 0 586 612 (indukovaný nematody), EP 0 712 273 (indukovaný nematody), WO 96/12814 (indukovaný chladem), EP 0 494 724 (indukovaný teracyklinem), EP 0 619 844 (indukovaný etylénem), EP 0 337 532 (indukovaný kyselinou salicylovou), WO 95/24491 (indukovaný thiaminem) a WO 92/19724 (indukovaný světlem). Další chemicky indukovatelné promotory jsou popsány v EP 0 674 608, EP 637 339, EP 455 667 a v US 5, 364, 780. Podle dalšího provedení tohoto vynálezu, jsou buňky transformovány konstrukty, které inhibují funkci endogenně exprimované TPS nebo TPP. Inhibice nežádoucí endogenní enzymové aktivity může být dosazeno několika způsoby, jejichž výběr není pro vynález rozhodující. Jednou z metod inhibice genové exprese je tzv.antisense strategie. Při této metodě je exprimována sekvence DNA produkující RNA, která je alespoň částečně komplementární s RNA kódující enzymovou aktivitu, která má být inhibována. Přednostně jsou používány homologní anti-sense geny, protože jsou účinnější než geny heterologní. Další alternativní metodou blokování syntézy nežádoucí enzymové aktivity je vnesení další kopie endogenního genu přítomného v hostitelské rostlině do jejího genomu. Často je pozorováno, že takováto další kopie genu zeslabuje endogenní gen: tento efekt bývá v literatuře označován jako kosupresní efekt nebo i n • fl fl I fl · » flflfl • fl flfl flfl • · · · · a • · · · · « • ·· ··· ··« • · · « fl ·· ·· >>
kosuprese. Podrobnosti o postupu zvyšování dostupnosti substrátu jsou uvedeny v Příkladech WO 95/01446 zahrnutém zde citací. Hostitelskými buňkami mohou být jakékoli buňky, u kterých je možné modifikovat signalizaci hexokinasami prostřednictvím změn hladiny T6-P. Podle této teorie jsou tedy všechny eukaryotické buňky předmětem tohoto vynálezu. Z ekonomického hlediska jsou pro vynález nejvhodnější buňky, které jsou dobře využitelné k produkci metabolických látek. Mezi tyto organizmy mimo jiné patří rostliny, zvířata, kvasinky, houby. Možná je však také exprese ve specializovaných buňkách (pankreatické beta-buňky a tukové buňky).
K preferovaným hostitelským rostlinám ze Spermatophytae patří Angiospermae, zejména Dicotyledoneae, zahrnující kromě dalších Solanaceae jako reprezentativní čeleď, a dále Monocotyledoneae zahrnující kromě dalších reprezentativní čeleď Gramineae. Jak je definováno v tomto vynálezu, vhodné hostitelské rostliny (stejně tak jako jejich části a buňky) a jejich potomstvo, obsahují modifikovanou hladinu T-6-P, vyvolanou např. aplikací rekombinantních DNA technik vedoucích ke zvýšené produkci TPS a TPP v požadovaných rostlinách či jejich orgánech. K rostlinám dle vynálezu patří rostliny s květy jako je květák (Brassica oleracea), artyčok (Cynara scolymus), květiny k řezu jako karafiát (Dianthus caryophyllus), růže (Rosa spp), Chrysanthemum, Petunía, Alstromerla, Gerbera, Gladiolus, lilie (Lilium spp.), chmel (Humulus lupulus), brokolice; hrnkové rostliny jako Rhododendron, Azalia, Dahlia, Begonia, Fuchsia, Geranium, atd.; ovoce jako jabloň (Malus, např. domesticus), banánovník (Musa např. Acuminata), meruňka (Prunus armeniaca), oliva (Oliva sativa), ananas (Ananas comosus), kokosová palma (Cocos nucifera), mango (Mangifera indica), kiwi, avokádo (Persea americana), bobuloviny (jako např. rybíz, Ríbes, např. rubrum), třešeň (jako třešeň Prunus,např. avium), okurka (Cucumis např. sativus), vinná réva (Vitis, např. vinifera) , citrónovník (Citrus limon), meloun (Cucumis melo), hořčice (Sinapis alba a Brassica nigra), ořechy (jako ořešák vlašský, Juglans, např. regia; podzemnice olejná, Arachis hypogeae), pomerančovník (Citrus, např. maxima), broskvoň ( Prunus, např. persica) , hrušeň (Pyra,např. Communis), paprika (Solanum např. capsicum), švestka (Prunus, např. domestica), jahodník (Fragaria např. moschata), rajče (Lycopersicon, ! i • 9 99 ·· »· • 9 9. · 9 · · 9 · · ·
9·· 9 9 9 9 9 9 9 • 9 ···· 9 · 9 · 9 ··· ·9· • •9 9 9 9 9 9 • 9 9 ··· 99 99 9» např. esculentum); listové plodiny jako je vojtěška (Medicago sativa), zelí (jako Brassica oleracea), endivie (Cichoreum, např. endivia) , pór (Allium porrum) , salát (lactuca sativa), špenát (Spinacia oleracea), tabák (Nicotiana tabacum), trávy jako Festuca, Poa, luční trávy (jako Lolíum perene, Lolium multiflórům a Arrenatherum spp.), okrasné trávníky, trsnaté trávy, chaluhy, čekanka (Cichorium intybus), čajovník (Thea sinensis), celer, petržel (Petroselinum crispum) , pažitka a další koření; kořenové plodiny jako maranta (Maranta arundínacea), řepa (Beta vulgaris), mrkev (Daucus carota), kasava (Manihot esculenta), žen-šen (Panax ginseng) , tuřín (Brassica rapa), ředkvička (Raphanus sativus), jám (Dioscorea esculenta), sladké brambory (Ipomoea batatas), taro; semenné plodiny jako fazol (Phaseolus vulgaris) , hrách (Písum sativum), sója (Glycin max), pšenice (Triticum aestivum), ječmen (Hordeum vulgare) , kukuřice (Zea mays), rýže (Oryza sativa), bob (Vicia faba), bavlník (Gossypium spp.), kávovník (Coffea arabica a
C.canephora); hlíznaté rostliny jako kedluben (Brassica oleraceae), brambor (Solanum tuberosum); cibuloviny jako cibule (Allium cepa), cibule šalotka, tulipán (Tulipa spp.), narcis (Narcissus spp.), česnek (Allium sativum) ; stonkové plodiny jako korkový dub, cukrová třtina (Saccharum spp.), sisal (Sisal spp.), len (Linum vulgare), juta; stromy jako kaučukovník, dub (Quercus spp.), bříza (Betula spp.), olše (Alnus spp.), javor (Acer spp.), jilm (Ulmus spp.), palmy, kapradiny, břečtan a podobně.
Transformace kvasinek, hub nebo živočišných buněk se provádí pomocí běžných transformačních technik s použitím obecně známých vektorových systémů jako pBluescript, pUC a virových vektorových systémů jakojsou RSV a SV40.
Způsob vnesení exprese schopných genů trehalosafosfátsyntasy, trehalosafosfátfosfatasy nebo jakýchkoliv dalších sense nebo antisense genů do buněk tranformované rostliny není rozhodující pokud jsou geny exprimovány v uvedených rostliných buňkách.
Ačkoliv některé konkrétní formy vynálezu nemohou být uskutečnitelné v současnosti, např. protože některé rostlinné druhy vzdorují genetickým transformacím, je praxe vynálezu u takových rostlinných druhů pouze otázka času a ne otázka principu, protože
Ί • · ·
poddajnost genetickým transformacím jako jsou tyto není důležitá ve vztahu k zásadním konkrétním formám vynálezu.
Transformace rostlinných druhů je dnes běžná pro velké množství rostlinných druhů zahrnujících jak jednoděložné tak i dvouděložné rostliny. V zásadě může být použito jakékohokoliv způsobu transformace k vnesení chimérické DNA dle vynálezu do vhodné buňky předka. Způsob může být vybrán z metod používající vápník a polyetylenglykol pro protoplasty (Krens et al. , 1982, Nátuře 296,
72; Negrutiu et al., 1987, Plant Mol. Biol. 8, 363), elektroporace protoplastů (Shillito et al., 1985, Bio/Technol. 3, 1099), miroinjekce do rostlinného materiálu (Crossway at al., 1986, Mol. Gen. Genet. 202), bombardování různých rostlinných pletiv částicemi potaženými DNA nebo RNA (particle bombardment) (Klein et al., 1987, Nátuře 327, 70), infekce neintegrujícími se viry, přenos genů zprostředkovaný Agrobacterium tumefaciens infiltrací dospělých rostlin nebo transformací zralého pylu či mikrospor (EP 0 301 316) apod. Upřednostňovaná metoda dle vynálezu zahrnuje přenos DNA pomocí Agrobacterium. Zvláště se preferuje použití takzvané technologie binárního vektoru (binary vector technology) jak je popsána v EP A 120 516 a U.S. Patent 4,940,838.
Ačkoliv jsou jednoděložné rostliny pokládány za nepoddanější genetickým transformacím, jsou přístupné transformacím a plodné transgenní rostliny mohou být regenerovány z transformovaných buněk nebo embryí nebo jiné rostlinné hmoty. V současnosti je v případě jednoděložných rostlin upřednostňována metoda mikroprojektilového bombardování embryí, explantátů nebo suspenzí buněk a přímé vnesení DNA (direct DNA uptake) nebo elektroporace do pletiva (Shimamoto et al., 1989, Nátuře 338, 274-276). Transgenní rostliny kukuřice byly získány vnesením Streptomyces hygroscopicus bar genu, který kóduje fosfinotricinacetyltranferasy (enzym, který inaktivuje herbicid fosfinotricin) do embryogenních buněk suspenzní kultury kukuřice mikroprojektilovým bombardováním (Gordon-Kamm, 1990, Plant Cell 2, 603). Byly popsány vnesení genetického materiálu do aleruonových protoplastů dalších jednoděložných plodin jako jsou pšenice a ječmen (Lee, 1989, Plant Mol. Biol. 13, 21). Rostliny pšenice se regenerovaly z embryogení suspenzní kultury výběrem embryogenních kalusů pro založení embryogenních suspenzních kultur (Vasíl, 1990, • » ···· »· ·· *· » · · · · ·
I · · · · · ) · · · · · ··« I · * · ·· ·· ··
Bio/Technol. 8, 429). Kombinace s transformačními systémy pro tyto plodiny umožňuje aplikaci předkládaného vynálezu na jednoděložné rostliny.
Jednoděložné rostliny včetně komerčně důležitých plodin jako jsou rýže a kukuřice jsou také přístupné přenosu DNA pomocí kmenů Agrobacterium (vide WO 94/00977; EP 0 159 418 B1+; Gould et al., 1991, Plant Physiol. 95, 426-434).
K získání transgenních rostlin schopných konstitutivní exprese více než jednoho chimérického genu je dostupných mnoho alternativ včetně:
A. Použití DNA např. T-DNA na binárním plasmídu s množstvím modifikovaných genů fyzicky spojených s druhým selektovatelným značkovacím genem (selctable markér gen). Výhodou této metody je ta skutečnost, že jsou chimérické geny fyzicky spojené a tudíž migrují jako jeden Mendelovský lokus.
B. Cizosprášení transgenních rostlin, z nichž každá byla schopna exprese jednoho nebo více chimérických genů přednostně spojených se selektovatelným merkerovým genem pylem z transgenních rostlin, které obsahovaly jeden nebo více chimérických genů spojených s jiným selektovatelným markérem. Poté je možné selektovat semena, získaná tímto křížením, na základě přítomnosti těchto dvou selektovatelných markérů nebo na základě přítomnosti samotných chimérických genů. Rostliny získané z vyselektovaných semen mohou být poté použity k dalšímu křížení. Chimérické geny nejsou zpravidla na jediném lokusu a geny se mohou z tohoto důvodu segregovat jako nezávislé jednotky.
C. Použití mnoha rozmanitých chimérických molekul DNA, např. plasmidů, z nichž každý obsahuje jeden nebo více chimérických genů a selektovatelný markér. Jestliže je kotransformace vysoká, je selekce pouze na základě jednoho z markérů dostatečná. V ostatních případech je preferována selekce na základě více než jednoho markéru.
D. Následné transformace transgenních rostlin již obsahují první,m druhý atd. chimérické geny s novou chimérickou DNA, která může obsahovat selektovatelný markerový gen. Tak jako v případě metody B nejsou chimérické geny v zásadě na jediném lokusu a mohou se tudíž segragovat jako nezávislé entity.
E. Kombinace výše uvedených strategií.
toto * 44 ·· ·· • · « ·· · · to 4» · • · « · · « · <··· • · ···· · « · · · ··· ··to ··· ··· 4 9 ·· to 944 99 44 44
Konkrétní strategie může záviset na několika předpokladech, které mohou být jednoduše stanoveny jako jsou účel rodičovských linií (přímé pěstování, použití ve šlechtitelském programu, použití k účelu produkce hybridů), nejsou však kritické z hlediska popsaného vynálezu.
Je známo, že prakticky všechny rostliny mohou být regenerovány z buněčných suspenzí nebo tkáni. Způsoby regenerace se liší od rostliny k rostlině. Obecně, nejdříve jsou připraveny suspenze transformovaných protoplastů nebo petriho misky obsahující transformované explantáty. Výhonky mohou být indukovány přímo nebo nepřímo od kalusu přes organogenezi nebo embryogenezi a následně mohou zakořenit. Vedle selektovatelného markéru budou obecně rostlinné kultury obsahovat různé aminokyseliny a rostlinné hormony jako jsou auxin a cytokininy. Je také výhodné přidat do media glutamovou kyselinu a prolin, zvláště k takovým rostlinám jako jsou kukuřice a vojtěška. Účinnost regenerace bude závislá na médiu, genotypu a na historii kultury. Jestliže jsou tyto tři proměnné pod kontrolou, je regenerace obvykle reprodukovatelná a opakovatelná. Po stabilním vnesení sekvence transformujícího genu do transgenní rostliny mohou být takto získané vlastnosti přeneseny do dalších rostlin sexuálním křížením. V závislosti na rostlinném druhu, který se bude křížit, může být použita jakákoliv metoda z množství metod používaných ve standardním šlechtitelství.
Vhodné sekvence DNA kontrolující expresi rostlinných exprimovatelných genů (včetně markerových genů), jako jsou transkrípční iniciační oblasti, enhancery (zesilovače), netranskribované vedoucí sekvence (leader) apod., mohou být získány z kteréhokoliv genu, který se exprimuje v rostlinné buňce. Je možné použít také hybridní promotory kombinující funkční části různých promotorů nebo od nich odvozené syntetické ekvivalenty. Kromě konstitutivních promotorů mohou být ke kontrole exprese expreseschopných genů dle vynálezu použity indukovatelné promotory nebo promotory jejichž exprese je jinak regulovaná (např. vývojově nebo v závislosti na typu buněk specificky).K selekci nebo hledání transformovaných buněk se dává přednost zahrnutí markerových genů spojených s rostlinným exrimovatelným genem dle vynálezu tak, aby byl přenesen do rostlinné buňky. Výběr vhodného markeřového genu při • ·· φφφ φφφ • φ φφφφ · * · · φ φ φ transformaci rostlin není problém pro běžně erudovaného pracovníka. Běžně používané markerové geny jsou například geny pro neomycin fosfotransferasu způsobující odolnost vůči kanamycinu (EP-B 131 623), geny pro glutathin-S-transferasu z krysích jater způsobující odolnost vůči herbicidům odvozených od glutathionu (EP-A 256 223), geny pro glutaminsyntasu způsobující při overexpresi odolnost vůči inhibitorům glutaminsyntasy jako je např. fosfinothricin (WO 87/05327), gen pro acetyltransferasu z Streptomyces viridochromogenes udělující odolnost k látce fosfinothricinu (EP-A 275 957), gen kódující 5-enolšíkimat-3-fosfátsyntasu (EPSPS) udělující toleranci k N-fosfonometylglycinu, gen bar způsobující odolnost vůči látce Bialaphos (např. WO 91/02071) apod.. Konkrétní výběr markéru není kritický pakliže je funkční (případně selektivní) v kombinaci s vybranými rostlinnými buňkami.
Markerový gen a sledovaný gen nemusí být spojeny, protože kotransformace nespojených genů (U.S. Patent 4,399,216) je také účinný proces v rostlinné transformací.
Upřednostňovaným materiálem pro transformaci (zvláště dvouděložných plodin) jsou listové disky, které se mohou snadno transformovat a mají dobré regenerativní schopnosti (Horsch et al., 1985, Science 227, 1229).
Specifické použití vynálezu se předpokládá v následujících oblastech: jak je možné vidět na příkladech, vliv exprese TPP (což způsobí snížení vnitrobuněčné koncentrace T-6-P) se projevuje zvýšenou velikostí listů, zvýšeným větvením vedoucím ke zvětšení počtu listů, zvýšením celkové biomasy listů, vybělením zralých listů, vznikem více malých květů a sterilitou. Tyto efekty jsou zvláště použitelné v následujících případech: zvětšení listové plochy (a zvýšení počtu listů) je ekonomicky důležité u listových rostlin jako jsou např. špenát, salát, vojtěška, pórek, silážní kukuřice, dále u trávníků a zahradních rostlin při kontrolovaném pokrytí a regulaci plevele, dále u plodin, u kterých jsou listy používány jako produkt, jako je např. tabák, čaj, konopí a růže (parfémy!), dále k zakrytí plodin podobných kapustě (např. květák).
Další výhodou skutečnosti, že jsou tyto listy stimulovány ve své metabolické aktivitě je jejich tendence použít všechny své vnitrobuněčné zdroje , což znamená, že mají nízký obsah škrobu. U • · fr · · fr · · • · · « • · « rostlin, které jsou pěstovány pro konzumaci je ve světle dnešních trendů upřednostňujících nízkokalorické potraviny, snížení obsahu škrobu výhodou. Takové snížení obsahu škrobu má také vliv na chuť a strukturu listů. Zvýšení rovnováhy mezi proteiny a cukry ve prospěch proteinů (jaké může být dosaženo expresí TPP) je zvláště důležité u listnatých plodin jako je silážní kukuřice.
Zvýšené větvení, které je doprovázeno tendencí mít stonek s větším průměrem, může být výhodné u plodin, u kterých je stonek zodpovědný za vznik ekonomicky atraktivního produktu. Příkladem v této kategorii jsou všechny stromy pro zvýšenou produkci dřeva, což je základním materiálem pro výrobu papíru, dále je to např. konopí, sisal, len, které jsou důležité pro výrobu provazů, lan a látek, dále plodiny jako jsou bambus nebo cukrová třtina, kaučukovník, korkový dub, dále pro prevenci polehávaní plodin nebo částí plodin, jako jsou obilí, kukuřice, luštěniny a jahody.
snížením fotosyntetické aktivity). Méněbarevné listy jsou preferovány u plodin jako jsou čekanka a chřest. Také u řezaných květin může být blednutí korunních plátků žádané, např. u Alstromeria.
Globálním efektem je zvýšení biomasy vyplývající ze zvýšené metabolické aktivity. To znamená, že je biomasa složena z metabolisovaných látek jako jsou proteiny a tuky. Proto je tedy zvýšena rovnováha proteinů vůči sacharidům ve zralých listech což je výhodné u plodin jako je silážní kukuřice nebo veškerá píce, která se silážuje. Podobné zvýšení rovnováhy proteinů a sacharidů může být navozeno u ovoce, hlíz a ostatních jedlích částí rostlin.
Mimo rostlinnou říši může být zvýšený metabolismus užitečný pro produkci proteinů v kulturách mikroorganismů nebo eukaryotických buněk. Produkce jak endogenních tak také heterologních proteinů se bude zvýšena, což znamená, že produkce heterologních proteinů v kulturách kvasinek nebo jiných jednobuněčných organismů může být tímto způsobem zvýšena. U kvasinek by to vedlo k účinnější fermentaci, výsledkem čehož by byl vyšší výtěžek alkoholu, což je samozřejmě preferováno v pivovarnictví, výrobě lihu apod.
U zvířat nebo lidí se předpokládá, že nemoci způsobené defektním metabolismem mohou být překonány stabilní expresí TPP nebo TPS v zasažených tkáních. U lidských buněk je zvýšená spotřeba
4 · · • ·· • 4 ···· 4 glukosy u mnoha tumorových buněk závislá do velké míry na overexpresi hexokinasy (Rempel et al., 1996, FEBS Lett. 385, 233) Předpokládá se, že tok glukosy do metabolismu nádorových buněk může být ovlivněn expresí enzymů syntetizujících trehalosu-6-fosfát. Ukázalo se také, že aktivace hexokinasy je zesilována cAMP/PKA (drahou proteinkinasy A). Proto může inaktivace této signální dráhy mít vliv na dosažitelnost glukózy a tím na proliferaci neoplazií. Enzymové aktivity v savčích buňkách schopné syntetizovat trehalosu6-fosfát a trehalosu a degradovat trehalosu byly již prokázány např. u buněk ledvinové kůry králíků (Sacktor, 1968, Proč. Nati.
Acad.Sci.USA 60, 1007).
Další příklad může být nalezen u defektů v sekreci inzulínu pankreatickými beta buňkami, v kterých je produkce glukosa-6-fosfátu katalyzována hexokinasou rozhodující reakcí, která spojuje zvýšení hladiny extracelulární glukosy se sekrecí inzulínu (Efrat et al., 1994, TIBS 19, 535). Zvýšení hexokinasové aktivity způsobené snížením vnitrobuněčné T-6-P bude stimulovat produkci inzulínu u buněk, které jsou nedostatečné v sekreci inzulínu.
Také u transgenních zvířat by zvýšená rovnováha proteinů vůči sacharidům mohla být výhodná. Obě vlastnosti - zvýšený metabolismus a zvýšená produkce proteinů - jsou velice důležité v zemědělství, v kterém u zvířat musí být přírůstek masa co nejrychlejší.
Transformace enzymu TPP do zvířat produkujících maso jako např. do kuřat, skotu, ovcí, krocanů, koz, ryb, humrů, krabů, garnátů, šneků apod. povede ke zvířatům, které porostou rychleji a budou mít maso s větším obsahem bílkovin.
Stejným způsobem povede tento zvýšený metabolismus ke zvýšenému spalování sacharidů a tudíž k prevenci obezity.
Snížení koncentrace T-6-P má za následek, pro rostliny specifičtější, zvýšení počtu květů (ačkoliv tento proces zřejmě nevede ke vzniku semen). Zvýšený počet květů je nicméně žádoucí u řezaných květin a květináčových kvetoucích rostlin a také u všech rostlin vhodných pro zahradnictví.
Dalším výsledkem tohoto fenoménu kvetení je sterilita, protože rostliny neprodukují semena. Sterilní rostliny jsou výhodné při šlechtění hybridů.
• toto · · · · · · · · • to to to » · to · · · · • to ···· to · · * · ··* ··· • · · ··· · «
Jiným ekonomicky důležitým aspektem je omezení předčasného dozrávání kulturních plodin jako je hlávkový salát, endivie a jak rekreační tak i picni tráva. Tato vlastnost je výhodná, protože dovoluje plodinám růst bez nutnosti vynakládat metabolickou práci na kvetení a produkci semen. Kromě toho u plodin jako je hlávkový salát, endivie a tráva jsou komerční produkty (či komerční použití) nezralé.
Specifická exprese TPP v určitých částech rostliny (sinku), může mít další užitečné následky. Předpokládá se, že exprese TPP pomocí promotoru , který je aktivní v raném stádiu tvorby např. semen, dovolí zvýšený růst vyvíjejících se semen. Podobný efekt by měla exprese TPP pod promotorem specifickým pro květy. Vyjádřeno zkráceně: nadměrný růst určitých částí rostlin je možné, pokud TPP je exprimována v závislosti na vhodném promotoru. Exprese specifická pro plody by mohla vést ke zvýšenému růstu slupky v poměru k dužině. To by dovolilo zlepšení loupání ovoce, což by mohlo být výhodné pro automatické průmyslové loupání.
Exprese TPP během procesu klíčení semen obsahujících oleje omezuje jeho degradaci. Při procesu klíčení je glyoxalátový cyklus velmi aktivní. Tato metabolická dráha přeměňuje acetyl-CoA přes malát na sacharosu, která může být transportována a použita jako zdroj energie během růstu klíčních rostlin. Klíčové enzymy v tomto procesu jsou malátsyntasa a isocitrátlyasa. Exprese obou enzymů je, jak se předpokládá, regulována hexokinasovou signalizací. Jednou ze známek pro tuto regulaci je, že jak 2-deoxyglukosa tak i manosa jsou fosforylovány hexokinasou a jsou schopny převést svůj signál snížení exprese malátsyntasy a isocitrátlyasy - aniž by byly dále metabolizovány. Exprese TPP v semenech, tedy snížení inhibice hexokinasy, tedy inhibice malatsyntasy a isocitrátlyasy udržuje skladování olejů do semen a zamezuje klíčení.
V porovnání s efekty TPP působí zvýšení T-6-P způsobené expresí TPS jiné efekty jak se ilustrováno v Příkladech provedení vynálezu. Z těchto příkladů vyplývá, že zvýšení T-6-P způsobuje zakrslost nebo zakrnělý růst (zvláště při vysoké expresi TPS), tvorbu více zalomených listů, tmavší barvu způsobenou zvýšeným obsahem chlorofylu a zvýšený obsah škrobu. Jak je řečeno výše, vnesení trehalasových anti-sense konstruktů také stimuluje podobné
9 efekty jako vnesení TPS. Proto budou aplikace ukázané nebo naznačené pro TPS stejnou měrou platné pro anti-sense-trehalasu. Navíc, použití dvojitého konstruktu TPS a anti-sense-trehalasy zesiluje účinky jednotlivých konstruktů.
Zakrslost je úkaz, který je vyžadován u zahradních rostlin, mezi kterými jsou japonské bonsaje příslovečným příkladem. Vytvoření minikvětin u rostlin jako jsou růže, amarylis, hortensie, bříza a palma bude mít ekonomické šance. Vedle rostlinné říše je zakrslost také žádána u zvířat.
Je také možné indukovat předčasné dozrávání u kulturních plodin jako je hlávkový salát. To je výhodné, protože dovoluje rychlou produkci semen. Ideálně by exprese TPS pro tento efekt měla být pod kontrolou indukovatelného promotoru.
Redukce růstu je dále vyžadována pro průmysl „vegetariánských občersvení, u kterých je předpokládána konzumace zeleniny ve formě malých dávek. Třešňová rajčata (cherry-tomato) jsou příkladem zeleniny zmenšené velikosti úspěšné na trhu. Lze předpokládat, že by také další zelenina jako je hlávkové zelí, květák, mrkev, řepa a sladké brambory a ovoce jako jsou jablka, broskve, hrušky, melouny a některé tropické ovoce jako je mango a banány byly úspěšné v miniaturní velikosti na trhu.
Snížení růstu je požadováno u všech buněk, které jsou škodlivé pro organismus. Příkladem jsou patogeny a nádorové buňky. Z tohoto posledního hlediska může být viděna regulace růstu změnou hladiny T6-P. Zvýšení hladiny T-6-P sníží růst a metabolismus nádorové tkáně. Jedním ze způsobů jak zvýšit vnitrobuněčnou hladinu T-6-P je vyřadit gen TPP těchto buněk vnesením specifické rekombinantní události (event), která způsobí vnesení mutace do endogenního genu pro TPP. Jedním ze způsobů jak je možné toto provést je vnesení sekvence DNA schopné vnést mutaci do endogenního genu pomocí pro nádorové buňky specifických internalizujících protilátek. Jiným způsobem je cílené bombardování mikročásticemi s řečenou DNA. Za třetí může být použito pro nádorové buňky specifických virových vektorů obsahujících řečenou DNA.
Fenomén tmavšího zeleného zabarvení pozorovaného v souvislosti se zvýšenou koncentrací T-6-P je vlastnost, která je žádaná pro • · 9 ♦ ·· ·· · · » · · » · · · · ···· · · · · · · · • · ···· · · · · · 999 999 ··· · · · · · • · · ····· » · 9 9 květináčové kvetoucí rostliny a, obecně řečeno, pro druhy v zahradnictví a pro rekreační trávy.
Zvýšení hladiny T-6-P způsobí také zvýšení zásobních sacharidů jako jsou škrob a sacharosa. To poté znamená, že pletivo, v kterém jsou sacharidy skladovány je schopno skladovat více materiálu. To může být ilustrováno na Příkladu, kde je ukázáno, že se u rostlin tvoří zvýšená biomasa zásobních orgánů jako jsou hlízy a ztluštěné kořeny (jako v případě řepy - zásoba sacharosy).
Plodiny, u kterých by toto bylo velmi užitečné jsou brambory cukrová řepa, mrkev, čekanka a cukrová třtina.
Další ekonomicky důležitý efekt u brambor je, že po transformaci s DNA kódující gen pro TPS (vytvářející zvýšení T-6-P) bylo zjištěno, že množství rozpustných cukrů se snížilo, dokonce i po sklizni a skladování hlíz za nízkých teplot (4°C) . K prevenci klíčení by běžně bylo dokonce zapotřebí skladování za ještě nižších teplot, ale to vede k extenzivnímu sládnutí brambor. Snížení množství redukujících cukrů je otázkou zásadní důležitosti pro potravinářský průmysl, protože sladké bramborové hlízy nejsou vhodné pro zpracování z důvodu vzniku Maillardovy reakce, při které reagují vzájemně redukující cukry a aminokyseliny což vede ke hnědnutí.
Stejným způsobem může být dosaženo také inhibice aktivity invertasy, transformací cukrové řepy polynukleotidy kódujícími enzym TPS. Inhibice aktivity invertasy v cukrové řepě po sklizni je ekonomicky velice důležitá.
Také v ovoci a semenech může být ukládání pozměněno. Výsledkem není pouze zvýšená kapacita ukládání, ale i změna ve složení ukládaných látek. Plodiny, u kterých je zvýšení výnosu semen zvláště důležité jsou kukuřice, rýže, obilí, hrách, řepka olejka, slunečnice, sojové boby a luštěniny. Kromě toho jsou změny ve složení a množství ukládaných sacharidů důležité pro všechny rokliny poskytující ovoce. Zvláště u ovoce se změny v ukládaných látkách projeví ve změnách bytelnosti a tuhosti, což je zvláště důležité u měkkého ovoce jako jsou rajčata, banány, jahody, broskve a hroznové víno.
Opačný k vlivu pozorovanému při expresi TPP je vliv exprese TPS, která snižuje v listech poměr proteinů k sacharidům. Tento efekt je důležitý u listových plodin jako jsou picni trávy a • · • · · ·
9994 vojtěška. Listy mají také sníženou biomasu, což může být důležité u trav pěstovaných na trávnících (není nutné je tak často sekat). Důležitější však je, že mají také relativně zvýšený obsah energie. Tato vlastnost je zvláště výhodná pro plodiny jako jsou cibule, pórek a silážní kukuřice.
Dále poté může být hladinou vnitrobuněčné T-6-P ovlivněna životaschopnost semen.
Kombinací exprese TPP v jedné části rostliny a TPS v jiné části rostliny se výše popsané vlivy mohou synergizovat a zvyšovat.Je také možné pomocí specifických promotorů exprimovat geny sekvenčně během vývoje. Nakonec je také možné indukovat expresi kteréhokoliv genu z výše uvedených genů tak, že jej umístíme pod kontrolu indukovatelného promotoru. Předpokládá se, že kombinace popsaných způsobů aplikace bude zřejmá pro osoby zběhlé v oboru.
Vynález je dále ilustrovaný na příkladech. Zdůrazňuje se, že příklady ukazují speciální provedení vynálezu, že je ovšem zřejmé, že alternativy těchto příkladů a použití jiných rostlin nebo expresních systémů je chráněno tímto vynálezem.
Podstata vynálezu
Způsob modifikace vývoje a/nebo složení buněk, tkání a orgánů in vivo jinak než udělením schopnosti syntetizovat trehalasu, indukcí změn metabolické dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
Bylo zjištěno, že změna vývoje a/nebo obsahu buněk, tkání a orgánů in vivo je možná zavedením enzymu trehalosa-6-fosfátsyntasy (TPS) a/nebo trehalosa-6-fosfátfosfatasy (TPP) a tím indukcí změn v metabolických cestách sacharidu trehalosa-6-fosfátu (T-6-P). Tyto změny vedou ve zvýšení vnitrobuněčné dostupnosti T-6-P. Vnesení TPS indukuje zvýšení vnitrobuněčné koncentrace T-6-P a to způsobuje inhibici toku uhlíku v glykolytickém směru, stimulaci fotosyntézy, inhibici růstu, stimulaci aktivit vztahujících se k sinku a zvýšení ukládání zásob. Vnesení TPP indukuje snížení vnitrobuněčné koncentrace T-6-P. Toto snížení způsobuje stimulaci toku uhlíku ve směru glykolýzy, zvýšení biomasy a snížení fotosyntetické aktivity.
• · • ·
Hladiny T-6-P mohou být ovlivněny genetickým inženýrstvím organismů genovými konstrukty schopnými ovlivnit hladinu T-6-P nebo mohou být ovlivněny exogenně dodáváním látek schopných ovlivnit tuto hladinu.
Genetické konstrukty, které mohou být použity v tomto vynálezu jsou konstrukty nesoucí gen pro trehalosufosfátsyntasu (TPS), enzym, který je schopen katalyzovat reakci při které vzniká T-6-P z glukosy-6- fosfátu a UDP-glukózy. Na druhé straně konstrukt kódující enzym trehalosafosfátfosfatasu (TPP), který katalyzuje reakci při které vzniká trehalosa z T-6-P způsobí, v závislosti na expresi, snížení množství T-6-P.
Alternativně mohou být genové konstrukty nesoucí anti-sense TPS či TPP použity k regulaci vnitrobuněčné dostupnosti T-6-P.
Dále bylo nedávno oznámeno, že vnitrobuněčná fosfoalfa-(1,1)glukosidasa, TreA, z Bacillus subtolis byla schopna hydrolyzovat T6-P na glukózu a glukosa-6-fosfát (Schock et al., Gene, 177, 77-80, 1996). Podobný enzym byl už popsán u E. coli (Rimmele and Boos (1996), J.Bact. 176 (18), 5654-). Pro overexpresi musely být použity homologní nebo heterologní genové konstrukty. Je přijímáno, že vznik endogenního T-6-P a/nebo degradujících enzymů je pod alosterickou regulací a regulací přes kovalentní modifikaci. Tato regulace může být obejita použitím heterologních genů.
Ke zrušení regulace mohou být alternativně použity mutace heterologních nebo homologních genů.
Vynález také dává schopnost měnit vztah zdrojů a sinků a také rozdělení zdrojů v rostlině. Systém využívání uhlíku v celé rostlině včetně produkce asimilátů v zdrojových tkáních a jejich zužitkování ve zdrojových tkáních může být modifikován, což může vést ke zvýšení výnosu biomasy sklízených produktů. S použitím tohoto přístupu může být realizováno jak zvýšení výnosového potenciálu tak i zlepšení sklizňového indexu a zlepšení kvality produktu. Tyto změny v zdrojových tkáních mohou vést ke změnám v sink tkáních například zvýšením exportu fotosyntetických produktů. A obráceně, změny v sink tkáních mohou vést ke změnám ve zdrojových tkáních.
Specifická exprese v buněčných organelách, tkáních nebo jiných částech organismu dovoluje výše zmíněný obecný efekt směřovat do specifických lokálních aplikací. Tato specifická exprese může být zajištěna vnesením genů kódujících TPS, TPP nebo anti-sense genů pro
TPS nebo TPP kontrolovaných specifickými promotory.
Specifická exprese také dovoluje simultánní expresi obou (TPS a
TPP) enzymů v rozdílných tkáních a proto lokální zvýšení hladiny T6-P a snížení T-6-P.
S použitím specifických promotorů je také možné vytvořit dočasné rozdíly. Pro tyto účely mohou být použity promotory, které jsou specificky aktivní během určitého období organogeneze rostlinných částí. Tímto způsobem je možné nejdříve ovlivnit množství orgánů, které se vyvinou a poté umožnit těmto orgánům, aby se naplnily zásobním materiálem jako je škrob, olej či proteiny.
Alternativně je také možné použít inducibilní promotory k selektivnímu zapínání a vypínání exprese genů vynálezu. Indukce může být dosaženo například patogeny, stresem, chemikáliemi nebo stimulací světlem/tmou. Hexokinasová aktivita je enzymatická aktivita nalézající se v buňkách, které katalyzují reakci hexozy na hexosa-6-fosfát. Hexosy zahrnují glukosu, fruktosu, galaktosu nebo jakýkoliv jiný C6 cukr. Uznává se, že existuje mnoho isozymů, které všechny mohou hrát roli ve výše zmíněných biochemických reakcích. Katalyzováním této reakce hexokinasy tvoří klíčový enzym v hexosové (glukosové) signalizaci.
Hexosová signalizace je regulační mechanizmus, kterým buňky vnímají dostupnost hexos (glukos).
Glykolýza je sekvence reakcí, které přeměňují glukózu na pyruvát s průvodním vznikem ATP.
Chladové sládnutí je akumulace rozpustných cukrů v bramborových hlízách po sklizni, jestliže jsou tyto skladovány při nízké teplotě.
Ukládání zdrojových látek je proces, při kterém se primární produkt glukosa metabolizuje na molekulární formy, které jsou vhodné pro skladování v buňce nebo ve specializovaných tkáních. Tyto formy mohou být různé. V rostlinné říši mají zásoby formu polykarbonátů jako jsou škrob, fruktan nebo celulosa nebo formu jednodušších mono a disacharidů jako jsou fruktosa, sacharosa a maltosa. Dále se vyskytují ve formě olejů je arachidový nebo olejový olej a ve formě proteinů jako jsou kruciferin, napin a zásobní protein semen řepky. V živočišných buňkách také vznikají pokykarbonáty jako je glykogen.
• · • · • » · • ···*
Velké množství energeticky bohatých látek je ale také přeneseno do tuku a lipidů.
Biomasa je celková hmotnost biologického materiálu.
Přehled obrázků na výkresech
Obr.l: Schématické znázornění plasmídu pVDH275 nesoucího neomycinfosfotranferasový gen (NPTII), který je obklopený 35S promotorem viru tabákové mozaiky (p35S) a terminátorem (T35S) jako selektabilní markér. Expresní kazeta obsahuje plastocyaninový promotor z hrachu (pPCpea) a nopalinsyntasový terminátor (Tnos). Pravou (RB) a levou (LB) T-DNA hraniční sekvence a bakteriální gen pro kanamycinovou rezistenci (KanR) jako markerový gen.
Obr.2: Nothern blot analýza transgenních tabákových rostlin. Panel A znázorňuje expresi otsA mRNA v listech jednotlivých pMOG799 transgenních tabáků. Kontrolní linie C obsahuje celkovou RNA z netransformovaných rostlin N. tabacum.
Obr.3: Srovnání TPS kódující sekvence odvozené z rostliny s kvasinkovou TPS sekvencí při využití Wisconsin GCG sequence analysis package (Devereux et al. (1984) A comprehensive set of sequence analysis programs of the VAX. Nucl.Acid Res., 12, 387). TPSatal 3/56 a 142 TPSrice3 (SEQ ID NO:53) a RiceTPS kódují TPS enzymy Arabidopsís a rýže odvozené z databázových sekvencí EST. TPSsunlO, TPSsel43, (SEQ ID NO:44) and TPSsel8 (SEQ ID NO:42) kódují TPS enzymy slunečnice a Selagínella odvozené ze sekvencí izolovaných technikou PCR (viz příklad 3).
Obr.4: Vyrovnání tabákových TPS cDNA fragmentů získaných amplifikací PCR nesoucích TPS kódující kvasinkový TPS1 gen. Orámovaná políčka indikují identitu mezi aminokyselinami všech čtyř vyjmenovaných sekvencí.
Obr.5: Vyrovnání tabákových TPS cDNA fragmentů získaných amplifikací PCR nesoucích TPS kódující kvasinkový TPS2 gen. Orámovaná políčka ·* 9
9 9
9 9 9 • 9 9999 • 99 ♦ 9 0 9·· • 9 9 9 9 9 9
9 99 999 999
9 9 ·· •99 99 99 99 indikují identitu mezi aminokyselinami všech čtyř vyjmenovaných sekvencí.
Obr.6: Vyrovnání fragmentu PCR amplifikované slunečnicové TPS/TPP dvoudílné cDNA (SEQ ID NO: 24) s TPP kódujícím kvasinkovým TPS2 genem. Orámovaná políčka indikují identitu mezi aminokyselinami obou dvou sekvencí.
Obr.7: Vyrovnání fragmentu TPS1 Arabidopsis a EST klonů rýže s genem TPS1 kódujícím kvasinkovou TPS. Orámovaná políčka indikují identitu mezi aminokyselinami všech tří sekvencí.
Obr.8: Vyrovnání fragmentu lidské cDNA TPS amplifikované pomocí PCR (SEQ ID NO: 10) s genem TPS1 kódujícím kvasinkovou TPS. Orámovaná políčka indikují identitu mezi aminokyselinami obou dvou sekvencí.
Obr.9: Akumulace trehalosy v transgenních rostlinách brambor pMOG1027 (35S as-trehalase)
Obr.10: Hexokinasová aktivita extraktu z hlíz divokého typu brambor (Solanum tuberosum cv. Kardal) s přídavkem trehalosa-6-fosfátu a bez něj .
Obr.11: Hexokinasová aktivita extraktu z hlíz divokého typu brambor (Solanum tuberosum cv. Kardal) s přídavkem trehalosa-6-fosfátu a bez něj. Jako substrát pro stanovení je použita fruktosa nebo glukosa.
Obr.12: Hexokinasová aktivita extraktu z listů divokého typu tabáku (Nicotiana tabacum cv. SRÍ) s přídavkem trehalosa-6-fosfátu a bez něj. Jako substrát pro stanovení je použita fruktosa nebo glukosa.
Obr.13: Graf měření aktivity hexokinasy
Série dat 1: Extrakt z rostlin tabáku
Série dat 2: Extrakt z rostlin tabáku + 1 mM trehalosa-6- fosfát Série dat 3: Komerční hexokinasový extrakt z kvasinek (1/8 jednotky)
44 44
4 4 4 4 4
4 4 4 4 4
44 444 444
4 4 4
44 4·
4
4444 4
Obr.14: Hexokinasová aktivita extraktu z listů divokého typu rýže (Oryza sativa) s přídavkem trehalosa-6-fosfátu a bez něj. Extrakt byl prováděn dvojmo s použitím různého množství extraktu. Jako substrát pro stanovení je použita fruktosa nebo glukosa.
Obr.15: Hexokinasová aktivita extraktu z listů divokého typu kukuřice (Zea mays) s přídavkem trehalosa-6-fosfátu a bez něj. Extrakt byl prováděn dvojmo s použitím různého množství extraktu. Jako substrát pro stanovení je použita fruktosa nebo glukosa.
Obr.16: Fluorescenční charakteristiky tabákových listů divokého typu (trojúhelníky), PC-TPS (čtverečky) a 35S-TPP (kříšky). Horní dva panely ukazují efektivitu transportu elektronů (ETE) při indikovaných intenzitách světla (PAR). Rostliny byly měřeny po temné periodě (horní levý panel) a po světelné periodě (horní pravý panel). Spodní panely ukazují redukci fluorescence způsobenou akumulací asimilátů (nefotochemické zhášení) . Levý a pravý panel se liší stejně jako ve výše uvedenem popisu.
Obr.17: Relativní aktivita sinku jednotlivých částí rostlin transgenních tabáků PC-TPS (Famine) a 35S-TPP (Feast). Indikována je hrubá akumulace C vyjádřená jako procenta celkového obsahu C pro různé části rostlin po světelné periodě (D) nebo po světle + tma (D+N).
Obr.18: Aktuální distribuce uhlíku v jednotlivých částech rostlin transgenních tabáků PC-TPS (Famine) a 35SS-TPP (Feast). Indikována je hrubá akumulace C vyjádřená jako procenta celkové denní akumulace nového C pro různé části rostlin po světelné periodě (D) nebo po světle + tma (D+N).
Obr.19: Snížené a zvýšené předčasné dozrávání u transgenních linií hlávkového salátu exprimujícího PC-TPS nebo PC-TPP ve srovnání s rostlinami divokého typu. Spodní panel ukazuje morfologii a barvu listů.
0 0 00 00 00
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0000 000 0000
0 0000 0 0 0 0 0 000 000
000 000 0 0
0 00000 00 00
Obr.20: Profil rozpustných cukrů (Obr. 20/1) v extraktu transgenních linií hlávkového salátu (horní panel) a transgenních linií řepy (spodní panel). U horního panelu jsou kontroly GUS-transgenní linie, které jsou porovnávány s liniemi pro PC-TPS a PC-TPP. U spodního panelu jsou všechny transgenní rostliny PC-TPS. Profil škrobu je znázorněn na obr. 20/2.
Obr.21: Morfologie rostlin a listů transgenních linií cukrové řepy exprimující PC-TPS (TPS) nebo PC-TPP (TPP) v porovnání s divokým typům rostlin (Control). A-typ TPS má listy, které jsou srovnatelné s divokým typem zatímco D-typ TPS má jasně menší listy. Listy transgenních linií TPP mají světlejší zelenou barvu, větší řapíky a větší velikost v porovnání s kontrolou.
Obr.22: Průměr hlavního kořene trasngenních linií cukrové řepy (PCTPS). Na horním panelu indikují A,B,C, a D snižování velikosti listů v porovnání s kontrolou (A). Na spodním panelu jsou ukázány jednotlivé klony kontroly a linie PC-TPS 286-2.
Obr.23: Výnos hlíz transgenních bramborových linií pMOG799 (35S TPS) .
Obr.24: Výnos hlíz transgenních bramborových linií pMOGlOlO (35S TPP) a pMOG1124 (PC-TPP).
Obr.25: Výnos hlíz 22 nezávislých klonů divokého typu S. tuberosum.
Obr.26: Výnos hlíz transgenních bramborových linií pMOG1093 (PC-TPS) v porovnání s divokým typem. B,C,D,E,F,G indikuje snižující se velikost listů v porovnání s divokým typem (B/C).
Obr.27: Výnos hlíz transgenních bramborových linií pMOG845 (Pat-TPS) (Obr.27-1) v porovnání s divokým typem (Obr.27-2). B, C označují velikost listů.
Obr.28: Výnos hlíz transgenních bramborových linií pMOG1129 (84511/22/28).
·· toto ·· • · ···· • · · « · · • to· ··· · · * to· «· • ·· ·· ·· • to
Obr.29: Příčný řez listy TPP (spodní panel) a TPS transgenních rostlin tabáku. Další vrstva buněk a buněk jsou viditelné na příčném řezu TPS.
• · • ••to · (horní panel) zvětšená velikost
Obr. 30: Analýza HPLC-PED transgenních hlíz na TPSE.coii před a po skladování při 4°C. Kardal, C, F, B, G a H jsou netransgenní kontrolní linie.
Obr.31: Morfologie listu, barva a velikost transgenní linie tabáku. 35S TPS (horní list), divoký typ (prostřední list) a 35S TPP (spodní list).
Obr.32: Metabolické profily transgenních tabákových linií: 35S TPS (pMOG799), 35S TPP (pMOGlOlO), divokého typu (WT), PC-TPS (pMOG1177) a PC-TPP (pMOG1124) . Ukázány jsou hladiny trehalosy, rozpustných cukrů (Obr. 32-1), škrobu (starch) a chlorofylu (Chlorophyll) (Obr. 32-2).
Obr.33: Porovnání výnosu hlíz transgenních linií brambor pMOG1027 (35S as-trehalase) a pMOG1027(845-11/22/28)(35S as-trehalase pat TPS) s výnosem linií brambor divokého typu.
Obr.34: Porovnání obsahu škrobu transgenních linií brambor pMOG1027 (35S as-trehalase) a pMOG1027(845-11/22/28)(35S as-trehalase pat TPS) s liniemi brambor divokého typu. Sekvence všech znázorněných linií je identická s Obr.33.
Obr.35: Porovnání výnosu transgenních linií brambor pMOG1027 (35S as-trehalase) a pMOG1027(845-11/22/28)(35S as-trehalase pat TPS) s výnosem linií brambor divokého typu.
Obr.36: Porovnání výnosu transgenních linií brambor pMOG1092 (PC astrehalase) s výnosem linií brambor divokého typu jako v případě Obr. 35.
· • 4 • 9 4
Obr.37: Porovnání výnosu transgenních linií brambor pMOG1130 (PC as trehalase PC TPS) s výnosem linií brambor divokého typu jako v případě Obr. 35.
Příklady provedení vynálezu
DNA manipulace:
Všechny DNA postupy (izolace DNA z E. coli, restrikce, ligace, transformace, atd.) byly prováděny podle standardních protokolů (Sambrook et al. (1989) Molecular Clonning: a Laboratory manual, 2. vydání, Cold Spring Harbor Laboratory Press, CSH, New York).
Kmeny:
Pro klonování E. coli K-12 je ve všech příkladech použit kmen DH5a. Pro transformaci rostlin jsou použity kmeny EHA 105 a MOG 101 Agrobacterium tumefaciens (Hood et al. (1993) Trans Research 2,
208) .
Konstrukce kmenu MOG101 Agrobacterium tumefaciens:
Konstrukce kmenu MOG101 Agrobacterium tumefaciens je popsána v WO 96/21030.
Klonování genu otsA E.coli a konstrukce pMOG799:
V E.coli je trehalosaphosphatsyntasa (TPS) kódována genem otsA lokalizovaným na operonu otsBA. Kolonování a sekvenování genu otsA je podrobně popsáno v Příkladu I ve WO95/01446 uvedeném zde citací. Pro zvýšení exprese v rostlinných buňkách byl otevřený čtecí rámec spojen s regulačním prvkem trankripce promotoru CaMV 35S RNA, zesilovačem translace leaderu ALMV a transkripčním terminátorem nos· genu, jak bylo podrobněji popsáno v Příkladu I ve WO95/01446, jehož výsledkem byl pMOG799. Vzorek kmenu E.coli obsahující pMOG799 byl uložen na základě Budapešťské dohody v Centraal Bureau voor Schimmelcultures, Oosterstraat 1, P.O. Box 273, 3740 AG Baarn, The Netherlands, v pondělí 23. srpna, 1993: evidenční číslo přidělené International Depositary Institution je CBS 430.93.
··· · · · · · Λ
J ··· ·ζ · ·*····· · i ····· · · Ζ ζ · ·
·..· :
Izolace promotoru patatinu a konstrukce pMOG546:
Část promotoru patatinu je izolována z chromozómové DNA Solárním tuberosum cv. Bintje pomocí polymerázové řetězové reakce. Je syntetizována sada oligonukleotidů komplementárních k protisměrné oblasti patatinového genu Xpat21 skládající se z následujících sekvencí:
5' AAG CTT ATG TTG CCA TAT AGA GTA G 3' PatB33.2 (SEQ ID
NO: 5 )
5' GTA GTT GCC ATG GTG CAA ATG TCC 3' PatATG.2 (SEQ ID NO: 6)
Tyto primery jsou použity pro PCR amplifikaci fragmentu DNA o velikosti 1123 bp, jako templát slouží chromozómová DNA izolovaná z bramboru kv. Bintje. Amplifikovaný fragment vykazuje vysoký stupeň podobnosti s patatinovou sekvencí Zpat 21 a je klonován pomocí EcoRI linkerů do vektoru pUC18, výsledkem čehož je plasmid pMOG546.
Konstrukce pMOG845:
Konstrukce pMOG845 je popsána v WO 96/21030.
Konstrukce pVDH318, plastocyanin-TPS:
Plazmid pMOG798 (popsaný v WO95/01446) je štěpen pomocí HindlII a spojen s oligonukleotidovým duplexem TCV11 a TCV12 (viz konstrukce pMOG845). Výsledný vektor je štěpen pomocí Pstl a HindlII a po následné inzerci terminátoru PotPilI vzniká pTCV118. Štěpením plazmidu pTCV118 pomocí Smál a HindlII je získána část DNA obsahující TPS kódující oblast a PotPilI terminátor. Dále byly přidány BGLII linkery a takto vytvořený fragment byl vnesen do rostlinného binárního expresního vektoru pVDH275 (Obr. 1) rozštěpen BamHI za vzniku pVDH318. pVDH275 je odvozený od pMOG23 (Sijmons et al. (1990), Bio/Technol. 8. 217) obsahující selekční markér NPTII řízený promotorem 35S CaMV a expresní kazetu obsahující plastocyaninový (PC) promotor z hrachu a nos terminační sekvenci. Plastocyaninový promotor obsažený v pVDH275 byl popsán Pwee a Gray (1993) Plant J. 3, 437. Tento promotor byl přenesen do binárního vektoru PCR amplifikaci a primery obsahujícími vhodná klonovaná místa.
i ····· · • · !
«· ·
Klonování otsB genu E. colí a konstrukce pMOGlOlO (35S CaMV TPP): Sada oligonukleotidú TPP I (5' CTCAGATCTGGCCACAAA 3') (SEQ ID NO:
56) a TPP II (5' GTGCTCGTCTGCAGGTGC 3') (SEQ ID NO: 57) byla syntetizována komplementárně k sekvenci genu TPP E.coli (SEQ ID NO: 3). Tyto primery byly použity pro PCR amplifikaci fragmentu DNA o 375bp nesoucí 3'část kódující oblasti TPP genu E.coli, vneseno bylo Pstl místo 10 bp po směru od stop kodonu s použitím pMOG748 (WO 95/01446) jako templátu. Tento PCR fragment byl rozštěpen pomocí BglII a Pstl a klonován do pMOG445 (EP 0 449 376 A2 příklad 7a) a línearizován pomocí BglII a Pstl. Výsledný vektor byl štěpen Pstl a HindlII a byl vložen terminátor PotPilI (viz konstrukce pMOG845). Výše popsaný vektor byl štěpen BglII a HindlII a výsledný fragment o 1325 bp byl izolován a klonován společně s 5'TPP PCR fragmentem štěpeným Smál a BglII v pUC18 línearizován Smál a HindlII. Výsledný vektor vyl nazván pTCV124. Tento vektor byl línearizován pomocí EcoRI a Smál a použit k vložen promotoru 35S CaMV (850 bp EcoRI'Ncol' (místo pro štěpení Ncol bylo znecitlivěno nukleázou z bobů) fragment izolovaný z pMOG18 obsahující 35S CaMV dvounásobně zesilující promotor). Tento vektor byl nazván pTCV127. Z tohoto vektoru byl izolován 2.8 kb EcoRI-HindllI fragment obsahující úplnou 35S TPP expresní kazetu a klonován v binárním vektoru pMOG800 za vzniku vektoru pMOGlOlO.
Konstrukce pVDH321, plastocyanin (PC) TPP
BamHI místo plazmídu pTCV124 bylo odstraněno štěpením, zaplněním a následnou religací. Následným štěpením byl získán fragment obsahující oblast kódující TPP a PotPilI terminátor. Po přidání BamHI linkerú byl výsledný fragment vložen do rostlinného binárního expresního vektoru pVDH275 (rozštěpeného BamHI) za vzniku pVDH321.
Konstrukce patatinového TPP expresního vektoru
Podobně jako při konstrukcí patatinového TPS expresního vektoru (viz konstrukce pMOG845), byl patatinový TPP expresní vektor konstruován za vzniku binárního vektoru (pMOG1128) který, po transformaci zvyšoval specificky v hlízách účinnost exprese TPP.
Ιί. *··· • · -.
• · · • ···· • ·
Konstrukce dalších expresních vektorů:
Podobně jako při konstrukci výše uvedeného vektoru, mohou být genové konstrukty vytvořeny s použitím různých promotorů v kombinaci s TPS, TPP nebo trehalasou pomocí binárních vektorů s NTPII genem nebo genem rezistence k hydromycinu jako selekční markéry. Popis binárního vektoru pMOG22 obsahujícího selekční markér HTP je uveden v Goddijn et al. (1993) Plant J. 4, 863.
Trojnásobné vektory:
Binární vektory jsou mobilizovány v „trojrodičovském,, smísení s kmenem E.coli HB101 obsahujícím plazmid pRK2013 (Ditta et al. (1980) Proč. Nati. Acad. Sci., USA 77, 7347) do Agrobacterium tumefacíens kmen MOG101 nebo EHA105 a to je použito k transformacím.
Transformace tabáku (Nicotiana tabacum cv.SR 1 nebo cv. Sansun NN) Tabák byl transformován společnou kultivací rostlinných pletiv s Agrobacterium tumefacíens kmenem MOG101 obsahujícím příslušný binární vektor jak bylo popsáno výše. Transformace byla provedena společnou kultivací listových disků tabáku tak jak popsal Horsch et al. (1985) Science 227, 1229. Transgenní rostliny byly regenerovány z výhonů rostoucích na selekčním médiu obsahujícím kanamycin, zakořeněny a převedeny do půdy.
Transformace bramboru
Brambor (Solanum tuberosum cv. Kardal) byl transformován kmenem EHA 105 Agrobacterium obsahujícím příslušný binární vektor. Jako základní médium bylo použito MS30R3 médium obsahující MS soli (Murashige a Skoog (1962) Physiol. Plant. 14, 473), R3 vitaminy (Ooms et al. (1987) Theor. Appl. Genet. 73, 744), 30 g/1 sacharózy, 0,5 g/1 MES, pH 5,8 (upraveno KOH) a případně zpevněno 8g/l agarem Daichin. Hlízy Solanum tuberosum cv. Kardal byly oloupány a povrchově sterilizovány opálením v 96% etanolu po dobu 5 sekund. Plameny byly uhašeny ponořením hlízy do sterilní vody a z hlíz byly nakrájeny řezy o tloušťce přibližně 2 mm. Disky vykrájené korkovrtem z vaskulárních pletiv byly inkubovány po dobu 20 min v MS30R3 médiu obsahujícím 1-5 x 10® bakterií/ ml Agrobacterium EHA 105 nesoucího binární vektor. Disky z hlíz byly opláchnuty médiem MS30R3 a • to přeneseny na zpevněné kultivační médium (PM - postculture medium). PM médium se skládalo z MS30R3 média obsahujícího 3,5 mg/1 zeatin ribozidu a 0,03 mg/1 indol octové kyseliny (IAA). Po dvou dnech byly disky přeneseny na čerstvé PM médium obsahující 200 mg/1 cefotaximu a 100 mg/1 vanomycinu. Po dalších třech dnech byly disky z hlíz přeneseny na médium indukující tvorbu výhonů (SIM), které se skládalo z PM média obsahujícího 250 mg/1 carbenicilinu a 100 mg/1 kanamycinu. Po 4-8 týdnech byly výhony regenerující z disků odděleny a přeneseny na kořenící médium (MS30R3 médium se 100 mg/1 cefotaximu, 50 mg/1 vanomycinu a 50 mg/1 kanamycinu). Výhony byly množeny merístemovými řízky.
Transformace salátu
Transformace salátu, Lattuca sativa cv. Evola, byla provedena podle Curtis et al. (1994) J. Exp. Bot. 45, 1441.
Transformace cukrovky
Transformace cukrovky, Beta vulgaris (udržovací populace), byla provedena podle E'ry et al.(1991) Third International Congress of ISPMB, Tucson, USA, abstrakt č. 384, nebo podle Krens et al. (1996), Plant Sci. 116, 97.
Transformace Lycopersicon esculentum
Rajče bylo transformováno podle Van Roekel et al. (1993) Plant Cell
Rep. 12, 644.
Transformace Arabidopsis
Transformace Arabidopsis thaliana byla provedena buď podle metody popsané Clarke et al. (1992) Plant Mol. Biol. Rep. 10, 178 nebo metodou popsanou Valvekens et al. (1988) Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 85, 5536.
Indukce mikrohlízek
Stonkové řízky rostlin bramboru pěstovaných in vitro obsahující vedlejší meristem byly přeneseny na médium pro indukci mikrohlízek. Médium pro indukci mikrohlízek obsahovalo lx MS soli doplněné R3 vitaminy, 0,5 g/l MES (konečné pH 5,8 bylo upraveno KOH) a zpevněno g/l agarem Daichin a dále obsahovalo 60 g/l sacharózy a 2,5 mg/1 kinetinu. Mikrohlízky se vytvořily po 3 až 5 týdnech růstu ve tmě při 24°C.
Izolace Validamycinu A
Bylo zjištěno, že validamycin A je vysoce specifickým inhibitorem trehalas z různých zdrojů v rozsahu, (IC50) 10° M až ΙΟ'10 M (Asano et al. (1987) J. Antibiot. 40, 526; Kameda et al. (1987) J. Antibiot. 40, 563). S výjimkou trehalasy nebyly významně inhibovány aktivity žádné a- nebo β- glykohydrolasy. Validamycin A byl izolován ze Solacolu, komerčního zemědělského přípravku (Takeda Chem. Indust., Tokyo) jak podle postupu popsaného Kendall et al. (1990)
Phytochemistry 29, 2525. Postup zahrnoval iontoměničovou chromatografií (QAE-Sephadex A-25 (Pharmacia), bed vol. 10 ml, ekvilibrační pufr 0,2 mM Na-Pi, pH 7) z 3 % zemědělského přípravku Solacol. Na kolonu byl nanášen 1 ml Solacolu a eluován vodou v 7 frakcích, v podstatě veškerý Validamycin byl obsažen ve frakci 4. Na základě 100 % výtěžnosti při tomto postupu byla v testech akumulace trehalosy upravena koncentrace Validamycinu A v MS médiu na 1 . 103 M. Validamycin A a B může být také purifikován přímo ze Sreptomyces hygroscopicus var. limoneus podle metody popsané v Iwasa et al. (1971) J. Antibiot. 24, 119, jehož obsah je zde zahrnut citací.
Analýza glycidů
Obsah glycidů byl kvantitativně stanoven pomocí iontoměničové chromatografie pulsní elektrochemickou detekcí. Extrakty byly připraveny extrakcí zmraženého zhomogenizovaného materiálu 80 %
EtOH. Po 15 minutové extrakci při pokojové teplotě byla rozpustná frakce odpařena a rozpuštěna v destilované vodě. Vzorky (25 μΐ) byly analyzovány na kapalinovém chromatografu Dionex DX-300 s 4 x 250 mm Dionex 35391 carbopac PA-1 kolonou a 4 x 50 mm Dionex 43096 carbopac PA-1 předkolonou. Pro eluci byl použit 100 mM NaOH (1 ml/min) a poté NaAc gradient.
Cukry byly detekovány pulsním elektrochemickým detektorem (Dionex, PED) . Jako standard byly použity komerčně dostupné glycidy (Sigma).
Analýza škrobu
Škrob byl analyzován tak jak popsal Aman et al. (1994) Methods ín Carbohydrate Chemistry, Volume X (eds. BeMiller et al.) , pp. 111 115.
Analýza exprese
Exprese genů vnesených do různých rostlinných druhů byla hodnocena pomocí Northern blotu.
Stanovení trehalosa-6-fosfát fosfatasy
TPP byla stanovena měřením produkce [14C] trehalosy z [14C] trehalosa6-fosfátu při 37° C (Londesborough a Vuorio (1991) J. of Gen. Microbiol. 137, 323). Hrubý extrakt byl připraven v 25 mM Tris, HCl pH 7,4 obsahujícím 5,5 mM MgCl2. Vzorky byly zředěny na koncentrací proteinů 1 mg/ml extrakčním pufrem obsahujícím 1 mg/ml BSA. Standardní reakční směs (konečný objem 50 μΐ) obsahovala 27,5 mM Tris, HCl pH 7,4, 5,5 mM MgCl2, 1 mg/ml BSA a 0,55 mM T-6-P (specifická aktivita 854 cpm/nmol). Reakce byla započata přidáním 5 μΐ enzymu a zastavena zahřátím ve vroucí vodě po dobu 5 minut. Po přidání AG1-X8 (formáte) iontoměniče (Biorad) a 20 minutové ekvilibraci při pokojové teplotě byly reakční směsi centrifugovány. Radioaktivita ve vzorcích supernatantu (400 μΐ) byla měřena scintilačním počítačem.
Příprava rostlinných extraktů pro stanovení hexokinas
Zmražený rostlinný materiál byl rozdrcen v kapalném dusíku a 30s homogenizován v extrakčním pufru (EP: 100 mM HEPES pH 7,0 (KOH), 1% (hm/obj) PVP, 5 mM MgCl2, 1,5 mM EDTA, 0,1 % obj/obj β-MeOH) obsahujícím Proteinase Inhibitors Complete (Boehringer Mannheim) . Po centrifugaci byly proteiny v supernatantu precipitovány 80 % síranem amonným, rozpuštěny v Trís-HCl pH 7,4 a extrakt dialyzován přes noc proti 100 mM Tris-HCl pH 7,4. Část vzorku byla použita pro stanovení hexokinas.
Stanovení hexokinas • · ···♦ · ; ; · · · • · · .· ·· ·· ·· · ··· ·
Aktivita hexokinas byla měřena při 25°C hodnocením změny absorbance (OD) při 340 nm ve směsi obsahující 0,1 M Hepes-KOH pH 7,0, 4 mM MgCl2, 5 mM ATP, 0,2 mM NADP+, 10 U/ml kreatinfosfátkinasy (rozpuštěné v 50 % glycerolu, 0,1 % BSA, 50 mM Hepes pH 7,0), 3,5 mM kreatinfosfátu, 7 U/ml glukosa-6-fosfát dehydrogenasy a 2 mM glukózy.
Byla-li pro stanovení aktivity hexokinas místo glukosy jako substrát použita 2 mM fruktosa, byly přidány 3,8 U/ml fosfoglukosaizomerasy. Hexokinasy byly též stanoveny metodou podle Gancedo et al. (1977) J. Biol. Chemm, 252, 4443.
Příklad 1
Exprese genu otsA (TPS) z E. coli v tabáku a bramboru
Transgenní rostliny tabáku byly vytvořeny vnesením otsA genu řízeného promotorem de35SCaMV (pMOG799) nebo plastocyaninovým promotorem (pVDH318).
Transgenní rostliny bramboru byly vytvořeny vnesením otsA genu řízeného patatinovým promotorem specifickým pro hlízy (pMOG845).
Listové disky tabáku byly transformovány binárním vektorem pMOG799 s použitím Agrobacteriwn tumefacíens. Transgenní výhony byly selektovány na kanamycinu.
Listy některých rostlin pěstovaných v půdě se nevyvinuly plně v laterálním směru, což vedlo k vytvoření jejich kopinaté morfologie (Obr. 31). Dále také potlačená apikální dominance vedla k zakslému růstu rostlin a vytváření axilárních výhonů. 7 ze 32 rostlin vykazovalo silně omezený růst s výškou rostlin 4-30 cm v době kvetení (Tab. 1).
• · ··· *· ·
Tabulka 1. Akumulace trehalosy ve vzorcích listů ofcsA transgenních rostlin tabáku a jejich výška v době kvetení
rostlina - linie | trehalosa mg.g1 čerstvé váhy | výška cm |
kontrola | 0, 00 | 60-70 |
799-1 | 0,04 | ND |
799-3 | 0, 02 | 10 |
799-5 | 0,08 | 4 |
799-15 | 0, 055 | 30 |
799-24 | 0, 02 | 12 |
799-26 | 0,05 | 25 |
799-32 | 0,055 | 30 |
799-40 | 0, 11 | 25 |
ND: nebylo hodnoceno
Kontrolní rostliny dosáhly v době kvetení výšky 60-70 cm. Transgenní linie se zakrslým fenotypem vytvářely menší množství semen. Analýza pomocí Northern blotu potvrdila, že rostliny se zakrslým fenotypem exprimují gen otsA z E. coli (Obr. 2).V kontrolních rostlinách nebyly transkripty zjištěny. Funkčnost vneseného genu byla potvrzena analýzou glycidů v listovém materiálu ze 32 transgenních rostlin tabáku pěstovaných ve skleníku, při které bylo zjištěno 0,02 až 0,12 mg.g“1 čerstvé váhy trehalosy v rostlinách s omezeným růstem (Tab. 1), což naznačuje, že produkt reakce katalyzované TPS je defosforylován fosfatasami rostliny. Další důkaz akumulace trehalosy v rostlinách tabáku byl získán po ošetření surových extraktů prasečí trehalasou. Výsledkem prodloužené inkubace extraktů z listů tabáku s trehalasou byla úplná degradace trehalosy (výsledky nejsou uvedeny). Přítomnost trehalosy nebyla prokázána v kontrolních rostlinách a rostlinách tabáku, které se nevyznačovaly aberantním fenotypem.
Tabulka la. Primární transformanty tabáku PC-TPS (dt=divoký typ)
Rostlina - linie | List č. hm. (g) | Ploch a listu (cm2) | Počet odvětv ení | Výška rostl in (cm) | Barva listu | Axilá rní výhon y | Č.hm./ plochu (g/cm2) | Sušin a (%) | Sušina/ plochu (g/cm2) |
kontr. 1 | 8,18 | 349,3 | 1 | dt | 0,023 | 7,21 | 0,0017 | ||
kontr. 2 | 10, 5 | 418,8 | 1 | dt | 0, 025 | 9, 52 | 0,0024 | ||
kontr. 3 | 9, 99 | 373, 8 | 1 | dt | 0, 027 | 12,91 | 0,0035 | ||
kontr. 4 | 9, 91 | 362, 9 | 1 | dt | 0, 027 | 9,59 | 0,0026 | ||
kontr. 5 | 9, 82 | 393, 8 | 1 | dt | 0, 025 | 11,51 | 0,0029 | ||
průměr | 0,0254 | 10,14 | 0,0026 | ||||||
2 | 8,39 | 290 | 2 | 105 | dt | 0,029 | 12,16 | 0,0035 | |
3 | 9, 34 | 296 | 1 | 123 | dt | 0,032 | 12,21 | 0,0039 | |
4 | 8,36 | 254 | 2 | 130 | dt | četné | 0, 033 | 10, 05 | 0,0033 |
6 | 2,28 | 106 | 5 | 90 | dt | 0,022 | 11,40 | 0,0025 | |
8 | 5,21 | 133 | 4 | 100 | tmavá | četné | 0, 039 | 7,49 | 0,0029 |
10 | 8,08 | 258 | 2 | 165 | tmavá | četné | 0,031 | 12,25 | 0,0038 |
11 | 2, 61 | 64 | 12 | 95 | tmavá | četné | 0,041 | 9, 20 | 0,0038 |
13 | 2, 83 | 92 | 1 | 150 | tmavá | četné | 0, 031 | 8,48 | 0,0026 |
16 | 5,8 6+- | 7209---+ | lESSgsĚř | tmavá | četné | 0,0-28.- | |||
17 | 5,15 | 224 | 2 | 155 | dt | 0,023 | 11,65 | 0,0027 | |
18 | 17,2 | 547 | 1 | 133 | dt | 0,031 | 10,35 | 0,0033 | |
19 | 2,13 | 63 | 4 | 80 | tmavá | četné | 0, 034 | 11,74 | 0,0040 |
20 | 3, 44 | 113 | 4 | 90 | dt+tm | četné | 0, 030 | 8, 14 | 0,0025 |
21 | 9, 88 | 246 | 1 | 105 | tmavá | četné | 0, 040 | 8,50 | 0,0034 |
22 | 13, 1 | 409 | 1 | 135 | dt | 0, 032 | 10, 68 | 0,0034 | |
23 | 2,50 | 73 | 6 | 55 | tmavá | četné | 0, 034 | 8,80 | 0,0030 |
24 | 8,76 | 286 | 2 | 130 | dt | 0,031 | 15,07 | 0,0046 | |
27 | 7, 91 | 219 | 1 | 124 | dt | 0, 036 | 14,41 | 0,0052 | |
28 | 10,0 | 269 | 2 | 117 | tmavá | četné | 0, 038 | 8, 62 | 0,0032 |
29 | 4,17 | 142 | 1 | 85 | tmavá | četné | 0, 029 | 10,07 | 0,0030 |
30 | 10,2 | 343 | 1 | 160 | dt | 0, 030 | 9,56 | 0,0029 | |
32 | 1, 95 | 61 | 3 | 75 | tmavá | četné | 0, 032 | 8,21 | 0,0026 |
33 | 2,85 | 96 | 5 | 95 | dt+tm | četné | 0,030 | 11,23 | 0,0033 |
34 | 8,38 | 244 | 1 | 123 | dt | 0, 034 | 13,60 | 0,0047 | |
35 | 5,59 | 173 | 3 | 126 | dt | 0, 032 | 14,49 | 0,0047 | |
36 | 3,28 | 84 | 3 | 100 | tmavá | četné | 0,039 | 11,28 | 0,0044 |
37 | 7,80 | 222 | 1 | 125 | dt+tm | četné | 0,035 | 11,28 | 0,0040 |
39 | 3,70 | 131 | 2 | 123 | dt | 0, 028 | 17,84 | 0,0050 | |
40 | 2,40 | 68,5 | 3 | 108 | tmavá | četné | 0, 035 | 9,58 | 0,0034 |
průměr | 0, 032 | 11,00 | 0,0035 |
Rostliny transgenního tabáku pVDH318 se vyznačovaly zakrslým vzrůstem a tvorbou malých listů, které byly tmavší a poněkud silnější než listy kontroly, fenotypem se podobaly transgenním rostlinám pMOG799 (Tab. Ia). Při další analýze těchto listů byl zjištěn vyšší obsah čerstvé váhy a sušiny na listovou plochu v porovnání s kontrolou (Tab. Ia a 2). Tmavší barva listů indikuje vyšší obsah chlorofylu v listech transgenních rostlin (Tab. Ib) .
V transformantech pMOG799 (35STPS) a pMOG1177 (PCTPS) byl analyzován obsah glycidů, chlorofylu, trehalosy a škrobu (Obr. 32). pMOG1177 je funkčně identický s pVDH318.
Tabulka 1b Obsah chlorofylu v listech transgenních rostlin PC-TPS N. tabacum (To)
Vzorek | Chlorofyl (mg/g listu) |
kontrola 1 | 0,59 |
PC TPS 10-1 | 0,75 |
PC TPS 10-2 | 0, 80 |
PC TPS 11 | 0,60 |
PC TPS 13 | 0,81 |
PC TPS 16 | 0, 90 |
PC TPS 19 | 0, 64 |
PC TPS 37 | 0, 96 |
Poznámka: světelné podmínky v průběhu růstu významně ovlivňují stanovený obsah chlorofylu. Proto může být obsah chlorofylu porovnáván pouze u rostlin sklizených a analyzovaných v rámci jednoho pokusu!
Tabulka 2: Čerstvá váha a obsah sušiny (DW) listového materiálu transgenních rostlin s genem pro plastocyanin-TPSE.coli
PC-TPS transgenní N.tabacum cv. Samsun NN
Transgen | Kontrola | |
Čerstvá váha (g) | 0, 83 | 0,78 |
Sušina (g) | 0, 072 | 0,079 |
% sušiny | 8,70 % | 10,10 % |
Č.HM./plocha | 39 (139 %) | 28 (100 %) |
DW/plocha | 3,46 (121 %) | 2,87 (100 %) |
plocha (jednotek) | 208 | 275 |
Vypočtený poměr mezi délkou a šířkou vyvíjejících se listů indikuje, že listy transgenních rostlin PC-TPS jsou více kopinaté (Tab. 3).
Disky z hlíz bramboru Solanum tuberosum cv. Kardal byly transformovány Agrobacterium tumefaciens EHA105 obsahujícím binární vektor pMOG845. Transgeny byly získány s transformační frekvencí srovnatelnou s kontrolou obsahující pouze prázdný vektor. Z hlediska fenotypu byly všechny získané rostliny nerozeznatelné od divokého typu rostlin, což indikuje, že použití pletivově specifického promotoru brání vzniku fenotypů pozorovaných u rostlin, u kterých je TPS gen řízen konstitutivním promotorem. Mikrohlízky byly indukovány na stonkových řízcích transgenních a netransformovaných rostlin pěstovaných na médiu indukujícím tvorbu mikrohlízek obsahujícím 10'3M Validamycin A. Jako kontrola byla použita indukce mikrohlízek na médiu bez Validamycinu A. Mikrohlízky indukované na médiu obsahujícím Validamycin A vykazovaly zvýšenou hladinu trehalosy ve srovnání s mikrohlízkami vypěstovanými na médiu bez Validamycinu A (Tab. 4). Přítomnost malého množství trehalosy v netransformovaných rostlinách indikuje přítomnost funkční dráhy biosyntézy trehalosy.
Tabulka 3. Transgenní rostliny tabáku (cv. Samsun) s genem pro pVDH318
Transformant | Délka (cm) | Šířka (cm) | Poměr |
kontrola 1 | 12 | 8 | 1,50 |
kontrola 2 | 13 | 8, 5 | 1, 53 |
kontrola 3 | 12 | 7,5 | 1,60 |
kontrola 4 | 15 | 9 | 1,67 |
kontrola 5 | 25 | 16 | 1,56 |
kontrola 6 | 24 | 16, 5 | 1,45 |
kontrola 7 | 28 | 20 | 1,40 |
kontrola 8 | 25 | 16 | 1,56 |
kontrola 9 | 26 | 19 | 1,37 |
kontrola 10 | 21 | 15 | 1,40 |
1318-28 | 16 | 8,5 | 1, 88* |
1318-29 | 11 | 6, 5 | 1,69 |
1318-30 | 19 | 14 | 1,36 |
1318-35 | 19 | 12 | 1,58 |
1318-39 | 21 | 16, 5 | 1, 27 |
1318-40 | 14 | 7 | 2,00* |
1318-34 | 21 | 13 | 1, 62 |
1318-36' | '13^5-- ~·' | 7. | |
1318-37 | 17 | 9 | 1,89* |
1318-4 | 20, 5 | 12 | 1,71 |
1318-23 | 14 | 4,5 | 3,78* |
1318-22 | 27 | 18 | 1,50 |
1318-19 | 9 | 4 | 2,25* |
1318-2 | 27 | 19 | 1, 42 |
1318-15 | 11 | 5 | 2,20* |
1318-10 | 20 | 13 | 1,54 |
1318-3 | 25 | 18 | 1,39 |
1318-21 | 17 | 8,5 | 2,00* |
1318-16 | 20 | 10 | 2, 00* |
1318-6 | 19 | 10,5 | 1,81 |
1318-20 | 13 | 5 | 2, 60 |
1318-33 | 12 | 5 | 2,40 |
1318-27 | 23 | 20 | 1,15 |
1318-11 | 12 | 5 | 2,40* |
1318-8 | 18, 5 | 6,5 | 2,85* |
1318-24 | 27 | 17 | 1, 59 |
1318-13 | 15 | 7 | 2,14* |
1318-17 | 24 | 16 | 1,50 |
1318-18 | 23 | 16,5 | 1,39 |
* - typický TPS fenotyp
Poměr délka/šířka u kontrol je 1,50.
Tabulka 4. Trehalosa (% čerstvé váhy)
+ Validamycin Ά | - Validamycin Ά | |
845-2 | 0, 016 | |
845-4 | - | |
845-8 | 0,051 | - |
845-11 | 0, 015 | |
845-13 | 0,011 | - |
845-22 | 0, 112 | - |
845-25 | 0,002 | |
845-28 | 0,109 | - |
divoký typ Kardal | 0,001 | — |
Příklad 2
Exprese genu otsB (TPP) z E. coli v tabáku:
Byly vytvořeny transgenní rostliny v vneseným genem otsB řízeným dvojnásobným 35SCaMV promotorem (pMOGlOlO) a plastocyaninovým promotorem (pVDH321).
Rostliny tabáku (cv.Samsun) transformované pMOGlOlO vytvářely ve skleníku výrazně velké listy (plocha listu dosahovala v průměru 140 %), na kterých se v začaly v době plného rozvoje vytvářet chlorózy (Obr. 31). Tyto rostliny měly také ve srovnání s kontrolními silnější stonky, což u některých vedlo až k jejich praskání. V některých případech vyrůstaly z báze rostliny další stonky (Tab. 5) . V listových vzorcích z rostlin vytvářejících velké listy byla zjištěna 5-10x vyšší aktivita trehalosa-6-fosfátfosfarasy ve srovnání s kontrolou, což dokazuje funkčnost vneseného genu. Suchá a čerstvá váha/cm2 abnormálně velkých listů byla srovnatelná s kontrolou, takže zvýšená velikost listu je způsobena zvýšeným obsahem sušiny a ne vody. Exprese TTP ovlivnila též květenství rostlin. Rostliny se zakrslým fenotypem, pravděpodobně způsobeným konstitutivní expresí TPP genu ve všech částech rostliny, vytvářely mnoho drobných květů, které se plně nevyvinuly a opadávaly nebo nekrotizovaly. Vývoj květů a tvorba semen byla méně rostlin méně zakrslých.
narušena u
Tabulka 5. Transgenní rostliny tabáku s genem pMOGlOlO, de 35S CaMV TPP
Linie | Výška (cm) | Plocha listu (cm2) | Blednutí (5- silné) | Počet odvětvení | č.hm./ cm2(g) | Sušina/ cm2 (g) | Květy Norm. / | Průměr stonku (mm) | |
1 | 63 | 489 | 5 | + | 0,096 | 0,0031 | A | 13 | |
2 | 90 | 472 | 3 | + | 0, 076 | 0,0035 | A | 19 | |
3 | 103 | 345 | 0 | 0, 072 | 0,0023 | N | 16 | ||
4 | 90 | 612 | 4 | + | 0,096 | 0,0039 | A | 5,6,7,8,1 4 | |
5 | 104 | 618 | 1 | + | 0, 08 | 0,0035 | N | 17 | |
6 | 110 | 658 | 3 | + | 0, 078 | 0,0035 | N/A | 19 | |
7 | 120 | 427 | 0 | 0, 074 | 0,0037 | N | 18 | ||
8 | 90 | 472 | 2 | + | 0, 076 | 0,0023 | A | 6, 7,18 | |
9 | 60 | 354 | 3 | + | 0, 092 | 0,0031 | N | 9,13 | |
10 | 103 | 342 | 0 | 0, 084 | 0,0025 | N | 16 | ||
11 | 110 | 523 | 1 | + | 0, 076 | 0,0031 | A | 18 | |
12 | 90 | 533 | 1 | + | 0, 098 | 0,0023 | N | 5,16 | |
13 | 53 | 432 | 4 | + | 0,084 | 0,0043 | A | 5, 6,6,14 | |
14 | 125 | 335 | 0 | 0, 086 | 0,0023 | N | 17 | ||
15 | 85 | 251 | 0 | 0, 094 | 0,0031 | N | 14 | ||
16 | 64 | 352 . | 0 | 0_, | |||||
17 | 64 | 2 67 | 0 | 0,11 | 0,0018 | N | '···? ··.—r · | ||
18 | 71 | 370 | 2 | 0, 086 | 0,0032 | A | 5,7,8,14 | ||
19 | 92 | 672 | 4 | + | 0, 076 | 0,0034 | N | 16 | |
20 | |||||||||
21 | 94 | 517 | 4 | + | 0,07 | 0,0044 | N | 17 | |
22 | 96 | 659 | 3 | + | 0, 082 | 0,0031 | N | 17 | |
23 | 110 | 407 | 0 | 0, 082 | 0,0042 | N | 16 | ||
24 | 90 | 381 | 0 | 0,1 | 0,0034 | A | 15 | ||
25 | 120 | 535 | 0 | 0, 076 | 0,003 | N | 16 | ||
26 | 42 | 511 | 5 | 0, 08 | 0,0038 | 7 | 15 | ||
27 | 100 | 468 | 0 | 0, 086 | 0,0018 | N | 17 | ||
28 | 83 | 583 | 3 | 0, 072 | 0,0034 | N/A | 17 | ||
29 | 27 | 452 | 5 | + | 0,104 | 0,004 | 7 | 7,7,15 | |
30 | 23 | 479 | 4 | + | 0,076 | 0,0027 | 7 | 6,6,7,9,1 4 | |
31 | 103 | 308 | 1 | 0, 086 | 0,0027 | N | 14 | ||
32 | 48 | 286 | 0 | 0,108 | 0, 002 | N | 16 | ||
33 | 67 | 539 | 5 | + | 0,102 | 0,0056 | A | 18 | |
34 | 40 | 311 | 5 | + | 0,084 | 0,0051 | A | 7,7,12 |
Tabulka 6. Primární transformanty tabáku PC-TPP
Rostlina - linie | List č. hm. (g) | Plocha listu (cm2) | Počet odvětv ení | Výška rostl in (cm) | Barva listů | Blednutí | Č.hm./ plocha | Sušina S | Sušina/ plocha |
Kontr. 1 | 8,18 | 349,37 | 0, 023 | 7,213 | |||||
Kontr. 2 | 10,5 | 418,89 | 0, 025 | 9,524 | |||||
Kontr. 3 | 9,99 | 373,87 | 0,027 | 12,913 | |||||
Kontr. 4 | 9, 91 | 362,92 | 0,027 | 9,586 | |||||
Kontr. 5 | 9,82 | 393,84 | 0, 025 | 11,507 | |||||
průměr | 0,0255 | 10,149 | 0,0026 | ||||||
11 | 11,5 | 338 | 3 | 114 | dt | 0,0340 | 6, 43 | 0,0022 | |
12 | 20,1 | 742 | světí | blednutí | 0,0272 | 9,82 | 0,0027 | ||
14 | 9, 61 | 345 | 1 | 150 | dt | 0,0279 | 11,65 | 0,0032 | |
16 | 5,99 | 234 | 5 | 54 | světí | blednutí | 0,0256 | 12,85 | 0,0033 |
17 | 9,10 | 314 | 3 | 105 | dt | 0,0290 | 8,79 | 0,0025 | |
18 | 3,78 | 158 | 3 | 75 | světí | 0,0239 | 7,67 | 0,0018 | |
19 | 2,98 | 130 | 1 | 70 | světí | 0,0229 | 10,74 | 0,0025 | |
20 | 8,33 | 296 | 3 | 70 | světí | blednutí | 0,0281 | 7,56 | 0,0021 |
22 | 11,5 | 460 | 1 | 117 | světí | blednutí | 0,0251 | 3,03 | 0,0008 |
24 ··-·'·· | 9,42 | 369 | 1 · | 1-SStSt | ď&g|j&Ěi8ag | ||||
25 | 15,9 | 565 | 1 | 170 | dt | 0,0282 | 9,54 | θ', 0Ό27 | |
26 | 8,07 | 343 | 2 | 155 | dt | 0,0235 | 15,37 | 0,0036 | |
28 | 11,7 | 411 | 2 | 65 | světí | blednutí | 0,0286 | 6, 90 | 0,0020 |
29 | 11, 6 | 420 | 1 | 117 | světí | blednutí | 0,0277 | 3,53 | 0,0010 |
31 | 8,21 | 307 | 2 | 153 | dt | 0,0267 | 12,79 | 0,0034 | |
32 | 4,03 | 175 | 1 | 70 | světí | 0,0230 | 18,86 | 0,0043 | |
34 | 4,81 | 203 | 1 | 107 | světí | 0,0237 | 20,58 | 0,0049 | |
35 | 7,86 | 307 | 3 | 130 | světí | 0,0256 | 11,45 | 0,0029 | |
36 | 4,90 | 206 | 2 | 95 | světí | 0,0238 | 22,65 | 0,0054 | |
37 | 13,9 | 475 | 1 | 135 | dt | 0,0293 | 4,82 | 0,0014 | |
38 | 16,6 | 614 | 1 | 90 | světí | blednutí | 0,0271 | 3,31 | 0,0009 |
39 | 14,9 | 560 | 1 | 112 | dt | blednutí | 0,0267 | 6,08 | 0,0016 |
40 | 24,5 | 843 | 0,0292 | 9,80 | 0,0029 | ||||
41 | 8,86 | 343 | 1 | 115 | dt | 0,0258 | 2,93 | 0,0008 | |
42 | 6, 93 | 289 | 1 | dt | 0,0240 | 3,32 | 0,0008 | ||
43 | 11,3 | 433 | 136 | 135 | dt | 0,0261 | 6,73 | 0,0018 | |
44 | 10,0 | 341 | 2 | 135 | dt | 0,0294 | 6,49 | 0,0019 | |
45 | 9,40 | 327 | 2 | 135 | dt | 0,0287 | 8,51 | 0,0024 | |
46 | 9,18 | 284 | 2 | 115 | dt | 0,0323 | 15,69 | 0,0051 | |
průměr | 0,027 | 9,60 | 0,0025 |
dt- divoký typ
Vývoj pVDH321 transformantů tabáku (cv. Samsun NN) ve skleníku byl srovnatelný s transgenními rostlinami pMOGlOlO (Tab. 6).
V transgenních rostlinách pMOGlOlO (35S-TPP) a pMOG1124 (PC-TPP) byl analyzován obsah glycidů, chlorofylu, trehalosy a škrobu (Obr. 32). Obsah chlorofylu je uveden v tabulce 6a.
Tabulka 6a. Obsah chlorofylu v listech transgenních rostlin PC-TPP N. tabacum (To)
Vzorek | Chlorofyl (mg/g listu) | Fenotyp listu |
Kontrola 1 | 1,5 6 | divoký typ |
Kontrola 2 | 1, 40 | divoký typ |
Kontrola 3 | 1,46 | divoký typ |
Kontrola 4 | 1,56 | divoký typ |
Kontrola 5 | 1,96 | divoký typ |
PC TPP 12 | 0,79 | blednutí |
PC TPP 22 | 0,76 | blednutí |
PC TPP 25 | 1,30 | divoký typ |
PC TPP 37 | 0,86 | divoký typ |
PC TPP 38 | 0,74 | blednutí |
Poznámka: světelné podmínky během růstu mohou významně ovlivnit zjištěný obsah chlorofylu. Hodnoty chlorofylu mohou být proto porovnávány pouze u rostlin sklizených a analyzovaných v průběhu jednoho pokusu!
Příklad 3
Izolace částí genu kódujících trehalosa-6-fosfátsyntasy ze Selaginella lepidophylla a Helianthus annuus
Při porovnání sekvencí TPS proteinu z E. coli a S. cerevisiae byla zjištěna přítomnost několika konzervovaných oblastí. Tyto oblasti byly použity pro konstrukci degenerovaných primerů, které byly testovány pro PCR amplifikaci. Jako templát byla použita genomová
DNA z E.coli a kvasinek. K usnadnění annealingu degenerovaných primerů byl použit PCR program s postupně se měnící teplotou mezi annealingem a elongačním krokem.
Pro PCR amplifikaci byly použity sety primerů TPSdeg 1/5 a TPSdeg 2/5 a cDNA z Selaginella lepidophylla jako templát.
Použité degenerované primery (kód IUB):
TPSdegl: | GAY | ITI | ATI | TGG | RTI | CAY | GAY TAY CA | (SEQ ID NO:7) | ||||
TPSdeg2: | TIG | GIT | KIT | TYY | TIC | AYA | YIC | CIT | TYC C | (SEQ | ID | NO: 8 |
TPSdeg5: | GYI | ACI | ARR | TTC | ATI | CCR | TCI | C | (SEQ | ID | NO: 9 |
PCR fragmenty předpokládané velikosti byly klonovány a sekvenovány. Velké množství takto získaných homologních sekvencí bylo poté analyzováno pomocí Southern blotu hybridizací s genomovou DNA ze Selaginella. Byly izolovány dva klony: klon 8, jehož sekvence je uvedena v SEQ ID NO:42 (kombinace PCR primerů 1/5) a klon 43, jehož sekvence jsou uvedeny SEQ ID NO: 44 (kombinace PCR primerů 2/5), které obsahovaly oblasti s vysokým procentem podobnosti s genem TPS z E.coli a kvasinek na úrovni aminokyselin.
Jeden fragment TPS genu byl izolován PCR amplifikaci z Helianthus anuus (slunečnice) pomocí kombinace primerů TPSdeg 2/5 a genomové DNA z H. anuus jako templátu. Sekvenční analýza a Southern blot potvrdily homologii mezi TPS genem z E. coli, kvasinkami a Selaginella.Z porovnání těchto sekvencí se sekvencemi EST (expressed sequence tags) z různých organizmů, viz Tab. 6b a SEQ ID NOS 45-53 a 41, vyplývá přítomnost vysoce homologních genů v rýži a Arabidopsis, což podporuje náš objev, že většina rostlin obsahuje geny homologní k TPS (Obr. 3).
Tabulka 6b.
dbEST ID. | Genbank | Organizmus | Funkce |
35567 | D22143 | Oryza sativa | TPS |
58199 | D35348 | Caenorhabditis elegans | TPS |
60020 | D36432 | Caenorhabditis elegans | TPS |
87366 | T36750 | Saccharomyces | TPS |
35991 | D22344 | Oryza sativa | TPS |
57576 | D34725 | Caenorhabditis elegans | TPS |
298273 | H37578 | Arabidopsis thaliana | TPS |
298289 | H37594 | Arabidopsis thaliana | TPS |
315344 | T76390 | Arabidopsis thaliana | TPS |
315675 | T76758 | Arabidopsis thaliana | TPS |
317475 | R65023 | Arabidopsis thaliana | TPS |
71710 | D40048 | Oryza sativa | TPS |
401677 | D67869 | Caenorhabditis elegans | TPS |
322639 | T43451 | Arabidopsis thaliana | TPS |
76027 | D41954 | Oryza sativa | TPP |
296689 | H35994 | Arabidopsis thaliana | TPP |
297478 | H36783 | Arabidopsis thaliana | TPP |
300237 | T21695 | =&řa b i dopsW | |
372119 | U37923 | Oryza sativa | TPP |
680701 | AA054930 | Brugia malayi | trehalasa |
693476 | C12818 | Caenorhabditis elegans | trehalasa |
311652 | T21173 | Arabidopsis thaliana | TPP |
914068 | ΑΆ273090 | Brugia malayi | trehalasa |
43328 | T17578 | Saccharomyces | TPP |
267495 | H07615 | Brassica napus | trehalasa |
317331 | R64855 | Arabidopsis thaliana | TPP |
15008 | T00368 | Caenorhabditis elegans | trehalasa |
36717 | D23329 | Oryza sativa | TPP |
71650 | D39988 | Oryza sativa | TPP |
147057 | D49134 | Oryza sativa | TPP |
401537 | D67729 | Caenorhabditis elegans | trehalasa |
680728 | AA054884 | Brugia malayi | trehalasa |
694414 | C13756 | Caenorhabditis elegans | trehalasa |
871371 | AA231986 | Brugia malayi | trehalasa |
894468 | AA253544 | Brugia malayi | trehalasa |
86985 | T36369 | Saccharomyces | TPP |
Příklad 4
Izolace rostlinných genů TPS a TPP z Nicotiana tabacum:
Části cDNA kódující TPS a TPP byly izolovány pomocí PCR z cDNA odvozené z celkové RNA z listů tabáku. Sloupec označený spojení v tabulce 7 udává, jestli byl k získání odpovídajícího fragmentu DNA nutný druhý cyklus PCR amplifikace se sadou primerů 3 a 4. Primery jsou zahrnuty v seznamu sekvencí (Tab. 7). Subklonování a následná sekvenční analýza DNA fragmentů získaných pomocí uvedených sad primerů vykazovaly značnou homologii se známými TPS geny (Obr. 4 a 5) .
Tabulka 7. Arnplifikace rostlinných TPS a TPP cDNA.
TPS-CDNA | primer 1 | primer 2 | spoj e ní | primer | 3 | primer 4 |
825 bp | Tre-TPS-14 | Deg 1 | ne | |||
SEQ ID. NO | SEQ ID NO | SEQ ID NO | ||||
22 & 23 | 30 | 7 | ||||
840 bp | Tre-TPS-14 | Tre-TPS-12 | ano | Tre-TPS | -13 | Deg 5 |
SEQ ID NO | SEQ ID NO | SEQ ID NO | SEQ ID | NO | SEQ ID NO | |
18 & 19 | 30 | 31 | 32 | 9 | ||
630 bp | Tre-TPS-14 | Tre-TPS-12 | ano | Deg 2 | Deg 5 | |
SEQ ID NO | SEQ ID NO | SEQ ID NO | SEQ ID | NO 8 | SEQ ID NO | |
20 & 21 | 30 | 31 | 9 |
TPP- cDNA | primer | 1 | primer 2 | spojení |
723 bp | Tre-TPP | -5 | Tre-TPP-1.6 | ne |
SEQ ID NO 16 & | SEQ ID | NO | SEQ ID NO | |
17 | 3 5 | 38 | ||
543 bp | Tre-TPP | -7 | Tre-TPP-1.6 | ne |
SEQ ID NO 14 | SEQ ID | NO | SEQ ID NO | |
3 6 | 38 | |||
447 bp | Tre-TPI | -1.1 | Tre-TPP-16 | ne |
SEQ ID NO 12 | SEQ ID | NO | SEQ ID NO | |
37 | 38 |
Příklad 5
Izolace dvojdílného genu TPS/TPP z Helianthus annuus a Nicotiana tabacum:
Celá délka TPS klonu slunečnice (Helianthus annuus) byla získána pomocí RACE-PCR technologie na základě údajů o sekvenci fragmentu tohoto genu.
Sekvenční analýza celé délky tohoto klonu a vyrovnání s TPS2 z kvasinek (Obr. 6) a sekvence kódující TPS a TPP ukazují, že izolovaný klon kóduje bipartitní enzym TPS/TPP (SEQ ID NO 24, 26 a 28). Izolovaný bipartitní klon (pMOG1192) byl uložen 21. dubna 1997 v Central Bureau for strain collections podle pravidel Budapešťské smlouvy pod číslem CBS692.97.
Dále jsme zjišťovali, jestli i jiné rostlinné druhy obsahují bipartitní klony TPS/TPP. Dvojdílná TPS/TPP cDNA byla amplifikována z tabáku. Po PCR amplifikaci s primery TPS degl/TRE-TPP-16 a spojení s TPS deg2/TRE-TPP-15 (SEQ ID NO: 33) byl detekován DNA produkt o předpokládané velikosti (tj. 1,5 kb). Stejný band se objevil po PCR s TPS degl/TRE-TPP-6 (SEQ ID NO: 34) a spojení s TPS deg2/TRE-TPP15. Tento druhý fragment hybridizoval s bipartitní cDNA ze slunečnice v Southern blotu. Dále byl také identifikován bipartitní klon (SEQ ID NO: 39) z Arabidopsis v počítačové databázi.
Příklad 6
Exprese rostlinného genu TPS v rostlinách
Další důkaz funkce TPS genů ze slunečnice a Selaginella lepidophylla byl získán při izolaci odpovídajících klonů cDNA plné délky a následné expresi těchto klonů řízené 35S CaMV promotorem v rostlinách. Akumulace trehalosy při expresi enzymu ze Selaginella popisují Zentella a Iturriaga (1996) (Plant Physiol. 111, Abstrakt 88) .
Příklad 7
Geny kódující TPS a TPP z jednoděložných druhů
V počítačové databázi sekvencí Genebank bylo nalezeno několik ESTsekvencí z rýže homologních s TPS1 a TPS2 z kvasinek (Obr. 7), které jsou uvedeny v seznamu sekvencí (SEQ ID. NO: 41, 51 52 a 53). Příklad 8
Izolace lidského TPS genu
TPS gen byl izolován z lidské cDNA, na které byla provedena PCR reakce s použitím degenerovaných TPS primerů deg2 a deg5 a získán TPS fragment o předpokládané délce 0,6 kb. Sekvenční analýza a porovnání s TPS sekvencí z kvasinek naznačuje, že izolovaná sekvence kóduje homologní TPS protein (Obr.8).
Příklad 9
Inhibice endogenní exprese TPS anti-sense inhibicí:
Exprese endogenních genů TPS může být inhibována anti-sense expresí homologního TPS genu řízeného takovými sekvencemi promotoru, které spouští expresi anti-sense TPS genu v buňkách nebo pletivech, ve kterých je inhibice požadována. Pro tento účel se dává přednost sekvenci zcela identické s potlačovaným TPS genem, i když není nutné exprimovat celou kódující oblast v anti-sense expresním vektoru. Bylo zjištěno, že fragmenty této kódující oblasti jsou také funkční při anti-sense inhibici exprese genu. Další možností při anti-sense strategii je využití heterologních genů, pokud jsou dostatečně homologní s endogenním genem.
K ověření opačné orientace kódujících oblastí potlačovaných vnesených genů je možné použít podobné binární vektory jako jsou pMOG845 a pMOGlOlO. Všechny promotory použitelné pro řízení exprese genů v cílových pletivech jsou vhodné i pro anti-sense expresi genů.
Příklad 10
Inhibice endogenní exprese TPP anti-sense inhibici
Podobně jako jsou konstruovány vektory, které mohou být použity k řízení anti-sense exprese tps v buňkách a pletivech (Příklad 9), mohou být konstruovány také vektory řídící anti-sense expresi genů TPP.
Příklad 11
Akumulace trehalosy v tabácích divokého typu a rostlinách bramboru pěstovaných na Validamycinu A:
Důkaz přítomnosti dráhy biosyntézy trehalosy v tabáku byl získán při pěstování divokého typu rostlin za přítomnosti 10’3 inhibitoru trehalasy Validamycinu A. Ošetřené rostliny akumulovaly velmi malá množství (do 0,0021 % č.hm.) trehalosy. Akumulace trehalosy nebyla nikdy zjištěna v kontrolních rostlinách pěstovaných bez inhibitoru. Podobné výsledky byly získány u mikrohlízek divokého typu pěstovaných v přítomnosti Validamycinu A. Deset linií ze sedmnácti akumulovalo v průměru 0,001% (č. hm.) trehalosy (Tab. 4). V mikrohlízkách indukovaných na médiu bez Validamycinu A nebyl zjištěn žádný obsah trehalosy.
Příklad 12
Akumulace trehalosy v transgenních rostlinách bramboru s genem pro as-trehalasu:
Další důkaz přítomnosti endogenních genů pro biosyntézu trehalosy byl získán transformací bramboru divokého typu 35S CaMV antitrehalosa konstruktu (SEQ ID NO:54 a 55, pMOG1027 popsaný v WO 96/21030) . Ve výhonech transgenního bramboru pMOG1027 byla zjištěna akumulace trehalosy do 0,008 % čerstvé hmotnosti. Identita píku trehalosy byla potvrzena specifickým štěpením akumulované trehalosy enzymem trehalasou. V hlízách některých transgenních linií pMOG1027 byla shledána akumulace malých množství trehalosy (Fig. 9).
Příklad 13
Inhibice aktivity rostlinných hexokinas trehalosa-6-fosfátem: Regulační působení trehalosa-6-fosfátu na hexokinasovou aktivitu bylo studováno v rostlinných extraktech měřením hexokinasové aktivity za přítomnosti či nepřítomnosti trehalosa-6-fosfátu.
Pří analýze extraktů z hlíz bramboru sloužila fruktosa (Obr. 10, Obr. 11) a glukosa (Obr. 11) jako substrát. Analýza v hlízách byla provedena podle Gancedo et al. (1997) J. Biol. Chem. 252, 4443, s použitím lmM T-6-P a fruktózy coby substrátu. Následující postupy u tabáku, rýže a kukuřice byly provedeny podle metody popsané v experimentální části.
- Při analýze extraktů z listů tabáku byla jako substrát použita fruktosa (Obr. 12) a glukosa (Obr.12 a Obr. 13).
- Při analýze extraktů z listů rýže byla jako substrát použita fruktosa a glukosa (Obr.14).
- Při analýze extraktů z listů kukuřice byla jako substrát použita fruktosa a glukosa (Obr.15).
Příklad 14
Inhibice aktivity hexokinas v živočišných buněčných kulturách trehalosa-6-fosfátem:
Pro demonstraci regulace hexokinasové aktivity v živočišných buňkách byly připraveny extrakty z myších hybridomových buněčných kultur. Aktivita hexokinas byla stanovena s použitím glukózy nebo fruktózy jako substrátu za podmínek, které popsali Gancedo et al. (viz výše) . U myších hybridomových buněk byl vyvolán osmotický šok umístěním buněčného peletu do 20 % sacharózy s následným opláchnutím destilovanou vodou. Tento hrubý extrakt proteinů byl použit při stanovení hexokinas (50μ1 extraktu odpovídalo asi 200 pg proteinů).
Tabulka 8. Inhibice živočišné hexokinasové aktivity T-6-P
Substrát | Koncentrac e (mM) | T-6-P (mM) | Vo (ODU/min) | Vi (ODU/min) | Inhibice (%) | ||
Glukosa | 2 | 0,83 | 0, | 0204 | 0, | 0133 | 35 |
Glukosa | 20 | 0, 83 | o, | 0214 | 0, | 0141 | 35 |
Glukosa | 100 | 0, 83 | 0, | 0188 | 0, | 0125 | 34 |
Fruktosa | 20 | 0, 23 | o, | 0207 | 0, | 0205 | 1 |
Fruktosa | 20 | 0, 43 | o, | 0267 | 0, | 0197 | 26 |
Fruktosa | 20 | 0, 83 | o, | 0234 | 0, | 0151 | 35 |
Fruktosa | 20 | 1, 67 | o, | 0246 | o, | 0133 | 46 |
Uvedené výsledky jasně ukazují, že aktivita hexokinas v myších buněčných extraktech je inhibována trehalosa-6-fosfátem. Rozsah koncentrací T-6-P při kterých k inhibici dochází je srovnatelný s rozsahem zjištěným v hrubých rostlinných extraktech. Účinnost inhibice hexokinas trehalosa-6-fosfátem nezávisela na tom, zda byla použita glukosa nebo fruktosa jako substrát.
Příklad 15
Fotosyntéza a respirace u rostlin tabáku exprimujících gen pro TPS a TPP:
Účinek exprese těchto genů na fotosyntézu a respiraci byl hodnocen v listech transgennich rostlin tabáku 35S-TPP (1010-5), PC-TPS (1318-10 a 1318-37) a tabáku divokého typu Samsun NN.
Měření bylo prováděno v zařízení pro měření výměny plynů. Rychlost výměny plynů byla vypočítána na základě rozdílů koncentrací mezi vstupujícím a vystupujícím vzduchem pomocí infračerveného analyzátoru plynů. Fotosyntéza a respirace byly měřeny ve stejném listu. U každé transgenní rostliny byl pro stanovení použit jednak nejmladší plně vyvinutý list (vrchní list) a dále list o 3-4 patra níže (spodní list) .
Fotosyntéza byla měřena jako funkce fotosyntetícky aktivní světelné intenzity (PAR) od 0-975 pmol .m’2. s1 (200 Watt m'2) čtyřikrát při CO2 koncentracích 350 vpm a 950 vpm.
Respirace byla měřena pomocí dvou různých časových měřítek. Měření prováděná v průběhu krátkého období tmy v experimentech, ve kterých byla měřena fotosyntéza jsou v tabulce 9 označeny RD. Vzhledem k tomu, že se během období tmy respirace značně mění, vyjadřují tyto hodnoty okamžitou aktivitu. Z tohoto důvodu byly hodnoty za celé období tmy také sečteny, jak ukazuje tabulka 10 (měřeno pouze při 350 vpm CO2) .
Tabulka 9. Rychlost fotosyntézy a respirace, STD značí standardní odchylku.
vrchní | list | 350 ppm | 950 ppm | |||
μπιοί .m'2. s 1 | STD | pmol .m 2. s“1 | STD | |||
divoký | typ | RD | 0,0826 | 0,048 | 1, 016 | 0,142 |
EFF | 0, 060 | 0, 004 | 0, 087 | 0, 004 | ||
AMAX | 11,596 | 0,588 | 19,215 | 0, 942 | ||
1010-5 | RD | 0,873 | 0,060 | 1,014 | 0,134 | |
EFF | 0, 059 | 0, 002 | 0, 090 | 0, 007 | ||
AMAX | 12,083 | 1,546 | 18,651 | 1,941 | ||
1318-10 | RD | 0, 974 | 0,076 | 1,078 | 0,108 | |
EFF | 0,064 | 0,003 | 0, 088 | 0, 008 | ||
AMAX | 16,261 | 2,538 | 24,154 | 1, 854 | ||
1318-37 | RD | 1,067 | 0,140 | 1, 204 | 0, 116 | |
EFF | 0,061 | 0, 002 | 0, 084 | 0,011 | ||
AMAX | 16,818 | 2,368 | 25,174 | 2,093 | ||
spodní | list | |||||
divoký | typ | RD | 0, 0 438 . | Ό7ΌΤ9’ | *0“Γ5·26 · | |
EFF | 0, 068 | 0,002 | 0,085 | 0, 004 | ||
AMAX | 6, 529 | 1,271 | 11,489 | 1, 841 | ||
1010-5 | RD | 0, 455 | 0, 068 | 0,562 | 0,118 | |
EFF | 0, 064 | 0, 002 | 0, 085 | 0, 006 | ||
AMAX | 8,527 | 0,770 | 13,181 | 1,038 | ||
1318-10 | RD | 0, 690 | 0,057 | 0,828 | 0,086 | |
EFF | 0, 064 | 0, 008 | 0, 085 | 0 f 005 | ||
AMAX | 11,562 | 1,778 | 20,031 | 1,826 | ||
1318-37 | RD | 0,767 | 0,033 | 0, 918 | 0, 099 | |
EFF | 0, 073 | 0,006 | 0, 103 | 0,004 | ||
AMAX | 13,467 | 1, 818 | 19,587 | 1, 681 |
Tabulka 10. Respirace v průběhu 12 hodinového období tmy (mmol CO2),
STD značí standardní odchylku.
vrchní list | STD | spodní list | STD | |
divoký typ | 25,17 | 0,82 | 13,19 | 1, 98 |
1010-5 | 30,29 | 5,09 | 13,08 | 1,52 |
1318-10 | 28,37 | 4,50 | 20, 47 | 0,87 |
1318-37 | 32,53 | 2,01 | 17,7 | 1,03 |
Ve srovnání s divokým typem rostlin a rostlinami TPP, je u transgenních rostlin TPS respirace spodních listů významně vyšší než transpirace listů vrchních (Tab. 10), což naznačuje jejich vyšší metabolickou aktivitu. Pokles respirace během stárnutí listů je podstatně menší u transgenních rostlin TPS.
Rovněž fotosyntetické parametry se významně liší mezi transgenními rostlinami TPS na jedné straně a transgenními rostlinami TPP a divokým typem kontrolních rostlin na straně druhé. Hodnoty AMAX (maximum fotosyntézy při nasycení světlem), účinnost fotosyntézy (EFF) a rychlost respirace v průběhu krátkého období tmy následující po měření fotosyntézy (RD) jsou obsaženy v tabulce 9. V průměru jsou hodnoty AMAX v horních listech transgenních rostlin TPS o 35 % vyšší ve srovnání s transgenními rostlinami TPP nebo divokým typem rostlin. Spodní listy vykazují dokonce větší zvýšení rychlosti fotosyntézy (88%).
Aby se vyloučilo možné ovlivnění rychlosti fotosyntézy rozdíly v absorpci světla, byla absorpce měřena pomocí SPAD-502 (Minolta). Žádné významné rozdíly v absorpci nebyly zjištěny (Tab. 11).
Tabulka 11. Hodnoty absorpce u transgenních linií
1 absorpce | vrchní list | spodní list |
divoký typ Samsun NN | 84 | 83 |
1010-5 | 84 | 82 |
1318-10 | 85 | 86 |
1318-37 | 86 | 86 |
Příklad 16
Fluorescence chlorofylu v rostlinách tabáku exprimujících geny TPS a TPP:
V listovém materiálu transgenních rostlin tabáku 35S-TPP (1010-5), PC-TPS (1318-10 a 1318-37) a tabáku divokého typu Samsun NN byl hodnocen účinek exprese těchto genů na fluorescenci chlorofylu. Byly měřeny dvě charakteristiky fluorescence:
1) ETE (účinnost transportu elektronů), jako míra rychlosti transportu elektronů a tvorby redukčního ekvivalentu
2) nefotochemické zhášení jako míra disipace energie způsobené akumulací asimilátů.
Rostliny byly pěstovány ve skleníku a přisvětlovány 100 pmol .m'“. s1 (04:00 - 20:00 h). Den/noc T=21°C/18°C; R.H. ± 75 %. V průběhu noční periody předcházející měření (trvání 16 h), byly dvě rostliny od každého genotypu přeneseny do tmy a dvě rostliny na světlo ( ± 430 pmol .m'2. s'1, 20°C, R.H. 70 %). Pro měření byl použit nejmladší plně vyvinutý list na rostlině. Ukazatele fotochemické účinnosti fotosystému II (PSII) a nefotochemického zhášení byly stanoveny jako funkce zvyšující se světelné intenzity. Při každé intenzitě světla byly rostliny stabilizovány po dobu 300 s. Měření byla prováděna při 5, 38, 236, 422 a 784 pmol .m'2. s_1 za minutu, 350 ppm CO2 a 20 % O2, Při opakování experimentů byly použity tytéž rostliny a umístění rostlin ve tmě před vlastním měřením bylo zaměněno za umístění na světle a naopak. Ukazatele fluorescence znázorňuje Obr. 16.
Pokles účinnosti elektronového transportu (ETE) byl srovnatelný u rostlin TPP a divokého typu. Rostliny TPS reagovaly na zvyšující se světelnou intenzitu zřetelně méně. Tento rozdíl byl nejnápadnější při předchozím vystavení rostlin světlu. Tato pozorování jsou ve shodě s výsledky nefotochemického zhášení. Ve srovnání s transgenními rostlinami TPP a rostlinami divokého typu, reagovaly rostliny TPS jasně méně na dodatečný přísun asimilátů v důsledku ozáření. V případě rostlin TPS byla významně snížena negativní regulace fotosyntézy akumulujícími se asimiláty.
Příklad 17
Export a rozmístění asimilátů v rostlinách tabáku exprimujících geny TPS a RPP:
V transgenních rostlinách tabáku 35S-TPP (1010-5) a PC-TPS (1318-37) byl stanoven:
1) export uhlíkatých asimilátů z plně vyvinutého listu (vyjadřujícího relativní aktivitu zdroje, Koch (1996) Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 47, 509
2) čistá akumulace fotoasimilátů v pletivech sinku ( relativní aktivita sinku) v průběhu periody světla a tmy.
Vývojové stádium rostlin: květní pupeny právě viditelné. Použitá technika značení: značení produktů fotosyntézy uhlíkem 1JC za ustáleného stavu v přítomnosti přebytku uhlíku 1!C (De Visser et al. (1997) Plant Cell Environ. 20, 37). U obou genotypů byly pro značení použity plně vyvinuté listy osmi rostlin v průběhu světelné periody (10 hodin) následované periodou tmy (14 hodin). K značení bylo použito 5,1 atom% 13CO2. Po značení byly rostliny rozděleny do několika skupin: 1) vzrostný vrchol, 2) mladý rostoucí list, 3) mladý plně vyvinutý list (nad značeným listem), 4) mladý stonek (nad značeným listem), 5) značený list, 6) řapík a báze značeného listu, 7) stárnoucí list, 8) ostatní a starší listy níže položené než značený list, 9) stonek pod značeným listem, 10) kořenové špičky. Byla stanovena čerstvá váha, obsah sušiny a procentický obsah uhlíku 13C ( atom % 13C) . Kromě základních parametrů jako je biomasa a obsah sušiny, byl vypočítán: 1) export C ze značeného listu; 2) relativní přísun importovaného C do jednotlivých částí rostliny; 3) absolutní množství importovaného C do jednotlivých částí rostliny; 4) relativní distribuce importovaného C v průběhu světelné periody a celé fotoperiody.
Hmotnost nadzemní části transgenních rostlin TPP byla vyšší o 27 % ve srovnámí s transgeny TPS (P< 0,001); také kořenový systém těchto rostlin byl lépe vyvinut. U transgenních rostlin TPP byla zjištěna významně změněná distribuce sušiny v rostlině, +39% v listu a +10% v kořeni ve srovnání s rostlinami TPS. Rostliny TOS měly větší počet listů, ale menší listovou plochu. Celková plocha listu na rostlinu TPS byla srovnatelná s divokým typem rostliny (0,4 m2 rostlina“1).
Relativní aktivita zdroje u plně vyvinutých listů
Celková exportní rychlost fotoasimilátů ze značeného listu je určena relativním poklesem % nového C během noci (u TPP 39 % a u TPS 56 %) a celkovým množstvím vázaného nového C v rostlině (bez značeného listu). Po světelné periodě exportovaly listy rostlin TPP 37 % ve srovnání s 51 % u rostlin TPS (Tab. 11). V následující periodě tmy vzrostly tyto hodnoty na 52 % a 81 %. Obě metody potvrdily, že transgenní rostliny TPS mají ve srovnání s transgenními rostlinami TPP významně zvýšenou rychlost transportu produktů fotosyntézy.
Absolutní množství nového C v částech rostliny
Export u transgenů TPS byl významně vyšší ve srovnání s transgeny TPP. Mladé rostoucí listy rostlin TPS importovaly C silněji, než mladé listy rostlin TPP.
Relativní zvýšení nového C v částech rostlin: síla síňku
Relativní přísun nového C do jednotlivých částí rostlin je znázorněn v Obr. 17. Procentická hodnota vyjadřuje sílu síňku. Významně vyšší síla síňku byla shledána u transgenů TPS, a to zvláště ve vzrostných vrcholech, stonku nad a pod značeným listem a v řapíku značeného listu.
Tabulka 11: Zdrojová aktivita plně vyvinutého značeného listu:
akumulace C a jeho export. Celková denní akumulace a export uhlíkatých asimilátů ve značeném listu a celé rostlině (nadzemní část) po steady-state 13C-labeling v průběhu periody světla (den).
N=4: hodnoty LSD udávají nejmensí významný rozdíl pro P< 0,05
Čas | Transgen | Aktivita zdroje u rostoucího listu | |||
(konec) | nový C ve zdrojovém listu (% celkového C v listu) | nový C exportova ný v noci (% ve dne) | nový C ve zdrojovém listu (% nového C v rostlin ě) | celkový export C do rostliny (% celkového nového C) | |
Den | TPS | 17,8 | 48,7 | 51 | |
TPP | 22,6 | - | 63,0 | 37 | |
Den + noc | TPS | 7,8 | 56 | 16, 6 | 81 |
TPP | 13, 8 | 39 | 48,4 | 52 | |
LSD 0,05 | 2,4 | 6,1 |
Relativní distribuce nového C do jednotlivých částí rostliny: relativní síla sinku
Distribuce vázaného uhlíku mezi jednotlivými částmi rostliny potvrdila výše zmíněné závěry. U transgenů TPS byl zjištěn relativné větší export asimilátů do vzrostného vrecholu, mladých rostoucích listů (ve dne) a dokonce do nejstarších listů (bez axilárních meristémů) a také do mladého i starého stonku.
Příklad 18: salát
Projevy rostlin salátu transformovaných PC-TPS a PC-TPP:
Pro transformaci rostlin salátu byly použity konstrukty PC-TPS a PCTPP. Transgeny PC-TPS byly regenerovány na 60 g/1 sacharózy.
Fenotypy obou transgenů TPS a TPP byly snadno odlišitelné od netransformované kontroly; transgeny TPS měly silnější, tmavozelené listy a transformanty TPP světlezelené listy s hladším okrajem ve srovnání s listy kontrolních rostlin.
Exprese TPS a TPP zřetelně ovlivnila morfologii listů a nejvýrazněji okraje listů. Listy transgenních rostlin PC-TPS byly podstatně více zvrásněné, než listy transgenů PC-TPP, jejichž listy byly hladší a zaoblené (Obr. 19). V listových extraktech transgenních linií salátu byl analyzován obsah cukrů a škrobu (Obr. 20).
Příklad 19: cukrovka
Projev transgenních rostlin cukrovky PC-TPS a PC-TPP:
Pro transformaci rostlin cukrovky byly použity konstrukty PC-TPS a PC-TPP. Frekvence transformací byla u obou konstruktů TPS a TPP srovnatelná s kontrolami. Fenotyp obou transformantu TPS a TPP byl jasně odlišitelný od netransformovaných kontrol; transgeny TPS měly ve srovnání s kontrolou divokého typu tlustší tmavozelené listy a transgeny TPP světlezelené listy s delšími řapíky (Obr. 21). U všech rostlin pěstovaných ve skleníku byl ve stáří asi 8 týdnů měřen průměr kůlového kořene. Některé transgenní linie PC-TPS, jejichž velikost listů byla srovnatelná s kontrolou, vykazovaly významně větší průměr kůlového kořene (Obr. 22). Transgenní linie PC-TPP vytvářely ve srovnání s kontrolou divokého typu menší kůlový kořen.V listových extraktech transgenních linií cukrovky byl analyzován obsah cukrů a škrobu (Obr. 20).
Příklad 20: Arabidopsis
Projev transgenních rostlin Arabidopsis PC-TPS a PC-TPP:
Pro transformaci rostlin Arabidopsis byly použity konstrukty PC-TPS a PC-TPP. Fenotyp obou transformantů TPS a TPP byl jasně odlišitelný od kontrol divokého typu; transgeny TPS měly ve srovnání s kontrolou divokého typu tlustší tmavozelené listy a transgeny TPP větší bílé listy.
Rostliny s vyšší hladinou exprese TPP nevytvářely semena.
Příklad 21: brambor
Projev transgenních rostlin Solanum tuberosum nesoucích konstrukt pro TPS a TPP
Konstrukt: 35S-TPS pMOG799
Transgenní rostliny pMOG799 byly pěstovány ve skleníku a byl u nich stanoven výnos hlíz (Obr. 23). Většina transgenních rostlin měla ve srovnání s kontrolou divokého typu menší listy. Hmotnost hlíz sklizených z rostlin s menšími listy byla ve srovnání s kontrolou divokého typu nižší (Obr. 25).
Konstrukt: 35S-TPP pMOGlOlO a PC-TPP pMOG1124
Transgenní rostliny s pMOGlOlO a pMOG1124 byly pěstovány ve skleníku a byl u nich stanoven výnos hlíz. Výnos hlíz (Obr.24) byl srovnatelný nebo nižší než u kontroly divokého typu (Obr. 25).
Konstrukt: PC-TPS pMOG1093
Transgenní rostliny s pMOG1093 byly pěstovány ve skleníku a byl u nich stanoven výnos hlíz. Hmotnost hlíz byla vyšší u několika transgenních linií, jejichž velikost listů byla srovnatelná s kontrolou divokého typu (B-C) a těch, které měly poněkud tmavší listy (Obr. 26). U rostlin s menšími listy než kontrola (D-G) byl zjištěn nižší výnos hlíz.
Konstrukt: Pat-TPP pMOG1128
V explantátové kultuře transgenních rostlin pat-TPP byly v in vitro indukovány mikrohlízky. Průměrná čerstvá hmotnost vytvořených mikrohlízek byla ve srovnání s kontrolními liniemi podstatně nižší.
Konstrukt: Pat-TPS pMOG845
Transgenní rostliny pMOG845 byly pěstovány ve skleníku a byl u nich stanoven výnos hlíz. Zjištěná hmotnost hlíz byla u tří transgenních linií ve srovnání s kontrolními liniemi vyšší (Obr. 27).
Konstrukt: PC TPS Pat TPS; pMOG1129 (845-11/22/28)
Rostliny exprimující současně PC TPS a Pat-TPS byly vytvořeny retransformací Pat-TPS linií (rezistentních ke kanamycinu) konstruktem pMOG1129, který obsahoval konstrukt PC TPS a markerový gen pro rezistenci k hygromycinu, za vzniku genotypů pMOG1129 (84511), pMOG1129 (845-22) a pMOG1129 (845-28). Výnos hlíz se pohyboval od minimálního až po výnos srovnatelný nebo vyšší než výnos kontrolních rostlin.
Příklad 22: tabák
Projev transgenních rostlin N. tabacum nesoucích konstrukty TPS a TPP:
Kořenový systém
Transgenní rostliny 35S TPP (pMOGlOlO) nebo 35S TPS (pMOG799) byly pěstovány ve skleníku. Velikost kořenů byla stanovena těsně před začátkem kvetení. U transgenní linie pMOGlOlO byla zjištěna významně větší/menší velikost kořenů, než u transformantu pMOG799 a kontroly divokého typu.
Vliv exprese TPS a TPP na kveteni
Transgenní rostliny tabáku 35S-TPS, PC-TPS, 35S-TPP a PC-TPP byly pěstovány ve skleníku. Rostliny s vysokým stupněm exprese TPS genu rostly významně pomaleji ve srovnání s kontrolou divokého typu. Výsledkem zpožděného kvetení a senescence spodních listů těchto rostlin byl fenotyp „stále zelených jinak běžně stárnoucích listů. Rostliny s vysokou hladinou exprese TPP genu nevytvářely žádné květy, nebo tvořily aberantní nedokonale vyvinuté květní pupeny, v důsledku čehož byly sterilní.
Vliv exprese TPS a TPP na tvorbu semen
Transgenní rostliny tabáku 35S-TPS, PC-TPS, 35S-TPP a PC-TPP byly pěstovány ve skleníku. Rostliny s vysokou hladinou exprese TPP genu vytvářely květy málo nebo vůbec žádné a netvořily semena.
Vliv exprese TPS a TPP na klíčení semen
Transgenní rostliny tabáku 35S TPP (pMOGlOlO) nebo PC TPP byly pěstovány ve skleníku. Některé transgenní linie s nízkou hladinou exprese transgenu vytvářely květy a semena. V průběhu klíčení semen Sl generace byla významně snížena frekvence klíčení (nebo bylo klíčení inhibováno) v porovnání se semeny Sl u kontroly divokého typu (Tab. 12) .
Tabulka 12. Klíčení semen transgenních rostlin 35S-TPP
Varianta | zbělení | Rel. (TPP mRNA) | klíčení |
1010-2 | + | 15,8 | opožděné |
1010-3 | 5,3 | opožděné | |
1010-4 | + | 4,2 | opožděné |
1010-5 | + | 5,2 | opožděné |
1010-6 | + | 3, 9 | opožděné |
1010-7 | - | 2, 8 | opožděné |
1010-8 | + | 6, 5 | opožděné |
1010-9 | + | 4,6 | opožděné |
1010-10 | - | 1,9 | normální |
1010-11 | 5,7 | normální | |
1010-12 | + | 1,4 | normální |
1010-14 | 0,1 | normální | |
1010-15 | 0,3 | normální | |
1010-18 | + | 5,6 | opožděné |
1010-20 | + | 6,4 | opožděné |
1010-21 | + | 9,5 | opožděné |
1010-22 | + | 8,8 | ne |
1010-23 | 4,5 | normální | |
1010-24 | - | 10,2 | opožděné |
1010-25 | - | 4,7 | opožděné (méně) |
1010-27 | 4,8 | normální | |
1010-28 | + | 22,1 | opožděné |
1010-31 | 4 | 9,4 | opožděné (méně) |
1010-32 | 0, 3 | opožděné (méně) | |
1010-33 | + | 14,7 | opožděné |
Vliv exprese TPS resp. TPP na výnos semen
U transgenních rostlin pMOG1010-5 v generaci SI byl stanoven výnos semen. Průměrný výnos semen transgenních rostlin pMOG1010-5 byl 4,9 g na rostlinu (n=8), zatímco u kontroly divokého typu 7,8 g na • · · · • · · · • * ···· · • · · • · · · · · • · * · · · • * · ··· ··· • · · · • ·· · · ·· rostlinu (n=8). Zjištěná hmotnost tisíce semen u linie pMOG1010-5 byla 0,06g a 0,08g u kontroly Samsun NN. Příčinou těchto výsledků může být snížený export cukrů ze zdrojových listů vedoucích k slabému rozvoji pletiv sinku.
Vliv exprese TPS a TPP na morfologii listu
Segmenty transgenních rostlin tabáku PC-TPS, PC-TPP a kontroly divokého typu pěstovaných ve skleníku byly fixovány, zality do pryskyřice a na řezech byly pomocí světelné mikroskopie studovány buněčné struktury. Buněčné struktury a morfologie pozorovaná na řezech transgenních rostlin PC-TPP byly srovnatelné s kontrolou. Na řezech transgenních rostlin PC-TPS byly pozorovány změny v morfologii houbového parenchymu, který se u těchto transformantů skládal ze sedmí vrstev buněk, zatímco u transformantů TPP a kontroly divokého typu jen ze tří vrstev (Obr. 29). Tato zjištění jsou v souladu s našimi předchozími pozorováními, kde transgenní line rostlin TPS vytvářely ve srovnání s rostlinami TPP a kontrolou tlustší a tužší listy.
Příklad 23
Inhibice chladového sládnutí expresí trehalosafosfátsyntasou
Transgenní rostliny bramboru (Solanum tuberosum cv. Kardal) byly vytvořeny vnesením TPS genu řízeného patatinovým promotorem specifickým pro hlízy (pMOG845; Příklad 1). Transgenní rostliny a kontroly divokého typu byly pěstovány ve skleníku a jejich hlízy sklizeny. Vzorky hlíz pro analýzu cukrů byly odebrány jednak bezprostředně po sklizni a poté po jejich šestiměsíčním skladování při 4°C. Výsledky HPLC-PED analýzy jsou zobrazeny na Obr. 30. Výsledky jasně ukazují, že transgenní rostliny bramboru s genem TPSE.coii mají nižší celkový obsah cukrů (glukosy, fruktosy a sacharosy) v hlízách bezprostředně po sklizni. Po šesti měsících skladování při 4°C bylo zvýšení obsahu rozpustných cukrů významně nižší u transgenních linií ve srovnání s kontrolními liniemi divokého typu.
··· ···· · » · · • · · · · · · · · · 9 • · ···· · · · 9 9 999 999 • · · 9 9 9 « e * · · · · · · · · « · β
Příklad 24
Zlepšení projevů transgenních rostlin tabáku 35S TPS a 35S TPP (pMOG851) v podmínkách stresu vyvolaného suchem:
Transgenní rostliny byly vytvořeny vnesením obou genů TPS a TPP z E.coli ovládaných promotorem 35S CaMV. Exprese genů TPS a TPP v takto získaných liniích byla potvrzena pomocí Northern blotu a měřením aktivity enzymů. pMOG851-2 akumulovala 0,008 mg . g1 č.hm trehalosy a pMOG851-5 akumulovala 0,09 mg . g'1 č.hm. Exprese obou genů měla zjevný vliv na morfologii rostlin a růst v podmínkách stresu suchem. Když byly rostliny pěstovány ve stresových podmínkách vyvolaných nedostatkem vody, obsah sušiny byl u obou transgenních linií vyšší; u pMOG851-2 o 28 % (p< 0,01) a u pMOG851-5 o 39 % (p<0,001), než u kontrolních rostlin tabáku divokého typu. Zvýšený obsah sušiny byl způsoben především zvýšenou produkcí listů: obsah sušiny v listech u pMOG851-5 byl vyšší až o 85%. Žádné významné rozdíly nebyly zjištěny při dostatečném zásobení rostlin vodou.
Stres vyvolaný suchem - experimentální část
V experimentech byla použita Fl semena získaná samoopylením primárních transformantů pMOG851-2 a pMOG851-5 (Goddijn et al.
(1997) Plant Physiol. 113, 181). Semena byla sterilizována po dobu 10 min ve 20 % komerčním bělidle, opláchnuta pětkrát sterilní vodou a vyseta na medium o poloviční koncentraci podle Murashige -Skooga obsahující 10 g . I'1 sacharosy a 100 mg. I1 kananycinu. Semena SRÍ divokého typu byla vyseta na plotny bez kanamycinu. Po dvou týdnech byly rostliny všech linií přesazeny do půdy (písčité zeminy) a pěstovány v kultivační místnosti při 22°C, intenzitě světla přibližně 100 μΕ-m'2 a 14 h dnu. Všechny rostliny byly pěstovány ve stejném množství půdy v květináčích o objemu 3,8 1. Rostliny byly denně zalévány živným roztokem podle Hoaglanda o poloviční koncentraci. Semenáčky pMOG851-2 a pMOG851-5 rostly o něco pomaleji než semenáčky tabáku divokého typu. Vzhledem k tomu, že jsme považovali za důležité zahájit experimenty ve stejné vývojové fázi rostlin, vyvolali jsme u všech linií stres suchem při stejné výšce semenáčků (10 cm), ve stejné vývojové fázi rostlin (4 listy) a stejné sušině (stanoveno ve dvou dalších rostlinách u každé linie).
··· ·· ·· «·
To znamená, že stres suchem byl u rostlin pMOG851-2 zahájen o dva dny později a pMOG851-5 o sedm dní později než u kontroly divokého typu. U každé linie bylo suchu vystaveno šest rostlin a čtyři rostliny byly pěstovány při dostatečném zásobení vodou jako kontroly.
Tabáky divokého typu byly vystaveny suchu tak dlouho, dokud nedosáhly bodu vadnutí: když spodní poloviny listů byly zvadlé, rostliny byly zality takovým množstvím živného roztoku, až znovu získaly turgor. V praxi to znamenalo zalití rostlin 50 ml živného roztoku každé tři dny, kontroly byly zalévány denně, aby měly dostatečnou zásobu vláhy. Rostliny pMOG851-2 a pMOG851-5 byly pak zalévány přesně stejným způsobem jako rostliny divokého typu, tj. byly zalévány stejným množstvím živného roztoku a ve stejných intervalech jako rostliny divokého typu. V průběhu celého sledovaného období byla pravidelně měřena výška stonku. Všechny rostliny byly sklizeny ve stejný den (32. den po zahájení ošetření u rostlin divokého typu), protože by sklizení transgenních rostlin v pozdějším stádiu komplikovalo porovnávání jednotlivých linií rostlin. Při tomto odběru byla měřena celková listová plocha pomocí zařízení na měření listové plochy Delta-T (Santa Clara, CA). Dále byla stanovena čerstvá hmotnost a obsah sušiny v listech, stoncích a kořenech.
Pro stanovení osmotického potenciálu rostlin byl proveden druhý experiment v podstatě stejným způsobem. Po 35 dnech stresu suchem byly na počátku světelné periody odebrány vzorky z nejmladších plně vyvinutých listů (n=3).
Vysýcháni, oddělených listů na vzduchu
Ve stáří čtyř týdnů byla u rostlin pMOG851-2, pMOG851-5 a rostlin divokého typu dobře zásobených vodou měřena ztráta vody z vysychajících oddělených listů. U každé linie rostlin bylo měření provedeno na pěti rostlinách. Z každé rostliny byly odebrány dva nejmladší plně vyvinuté listy a sušeny při 25 % relativní vlhkosti vzduchu. Po 32 hodinách byla u každého listu stanovena čerstvá hmotnost. V době experimentu byly odebrány vzorky ze srovnatelných listů dobře zásobených vodou, aby mohlo být provedeno měření osmotického potenciálu a stanoven obsah rozpustných cukrů.
Měření osmotického potenciálu
Vzorky listů pro stanovení osmotického potenciálu byly ihned po odebrání zmraženy na suchém ledu v uzavřených injekčních stříkačkách o objemu 1 ml. Těsně před analýzou byla šťáva z listů vymačkána do malé zkumavky, protřepána a použita pro nasáknutí papírového terčíku. Osmotický potenciál byl pak stanoven v komůrce Wescor C52 s pomocí Wescor HR-33 mikrovoltmetru pro stanovení rosného bodu.
Fluorescence chlorofylu
Fluorescence chlorofylu u rostlin divokého typu, pMOG851-2 a pMOG851-5 byla u každé linie měřena po 20 dnech sucha pomocí pulzního modulačního fluorometru (PAM) (Walz, Effeltrich, Německo). Před vlastním měřením byly rostliny ponechány ve tmě po dobu dvou hodin, pak jednu hodinu na světle a poté byl nejmladší plně vyvinutý list adaptován ve tmě 20 minut. Na začátku každého měření byl zapnut slabý měřící světelný paprsek (0,05 pmol m2 s1 modulovaný při 1,6 KHz) a byla měřena minimální hladina fluorescence (Fo). Maximální hladina fluorescence (Fm) byla pak měřena při aplikaci saturačního světelného pulsu o 4000 μτηοΐ m2 s1 po dobu 800 ms. Po dalších 20 s, když signál poklesl téměř na Fo, krátké saturační pulsy aktinického světla (trvající 800 ms, 4000 pmol m’2 s'1) byly opakovaně aplikovány po dobu 30 s s dvousekundovými intervaly. Složky fotochemického (qQ) a nefotochemického (qE) zhášení byly odečteny z křivky vyjadřující průběh fluorescence v čase podle Bolhar-Nordenkampf a Oquist (1993). V době měření listy nebyly viditelně zvadlé. Statistické výsledky byly získány pomocí jedocestné analýzy variance a programu Number Cruncher Statistical System (Dr. J.L. Hintze, 865 East 400 North, Kaysville, UT 84037, USA).
Při analýze fluorescence chlorofylu rostlin stresovaných suchem bylo zjištěno vyšší fotochemické zhášení (qQ) a vyšší poměr proměnlivé fluorescence k maximální fluorescenci (Fv /Fm) u rostlin pMOG851-5, což svědčí o vyšší efektivitě fotosyntetického aparátu (Tab. 13).
• · ···· · • · ·
Tabulka 13. Parametry fluorescence chlorofylu v rostlinách divokého typu (dt) a transgennich rostlinách tabáku akumulujících trehalosu (pMOG851-2, pMOG851-5). Hodnoty P (pravděpodobnosti) byly získány testem ANOVA analyzujícím rozdíly mezi liniemi rostlin pěstovanými v dostatku vody (kontrola) a v podmínkách sucha, a dále rozdíly mezi jednotlivými transgenními liniemi a divokým typem rostlin pěstovanými při dostatku vody a v podmínkách sucha. F„, : maximální fluorescence, Fv proměnlivá fluorescence (F,„ - Fo) · qo : fotochemické zhášení qE: nefotochemické zhášení. Fm a Fv jsou vyjádřeny v bezrozměrné jednotce (mm záznamu).
DT | pMOG851-l | pMOG851-5 | 8-51-2/DT | 815-5 | ||
F,„ | kontrola | 174,4 | 180, 4 | 175, 6 | ns | ns |
sucho | 151,5 | 155,7 | 167,8 | ns | 0,0068 | |
P (kontr. sucho) | 0,0004 | 0,0000 | ns | |||
Fv | kontrola | 134,6 | 143, 3 | 142,8 | ns | ns |
sucho | 118,4 | 122, 1 | 135, 6 | ns | 0,0011 | |
P (kontr. sucho) | 0, 006 | 0,0000 | ns | |||
Fv /F„; | kontrola | 0,771 | 0,794 | 0,813 | 0,059 | 0,0052 |
sucho | 0,782 | 0,784 | 0,809 | ns | 0,0016 | |
P (kontr. sucho) | ns | ns | ns | |||
qs | kontrola | 15,2 | 23,8 | 29, 9 | 0,259 | 0,0085 |
sucho | 25, 4 | 21, 6 | 23,5 | ns | ns | |
P (kontr. sucho) | 0, 048 | ns | ns | |||
q<? | kontrola | 91,3 | 92,4 | 90, 4 | ns | ns |
sucho | 73,69 | 78,5 | 92,75 | ns | 0,0005 | |
P (kontr. sucho) | 0,005 | 0, 006 | ns |
Analýza cukrů
V době odběru obsahovaly rostliny pMOG851-5 0,2 mg. g'1 č. hm. trehalosy, zatímco v pMOG851-2 a rostlinách divokého typu byla hladina trehalosy pod detekčním limitem jak ve stresujících tak v nestresujících podmínkách. Obsah trehalosy v rostlinách pMOG851-5 byl ve stresovaných a nestresovaných rostlinách srovnatelný (0,19 a 0,20 mg . g1 sušiny). Při dostatku vody hladiny glukosy a fruktosy byly v rostlinách pMOG851-5 dvounásobné oproti divokému typu.
V listech stresovaných rostlin pMOG851-5 byla zjištěna trojnásobná hladina všech čtyř nestrukturálních cukrů škrobu, sacharosy, glukosy a fruktosy proti listům stresovaných rostlin divokého typu.
V listech rostlin pMOG851-2 se hladina cukrů, stejně tak jako hodnot fluorescence, významně nelišila od hodnot nalezených v divokém typu. Ve stresovaných rostlinách všech linií byl naměřen zvýšený obsah glukosy a fruktosy ve srovnání s nestresovanými rostlinami.
Osmotický potenciál rostlin stresovaných suchem a kontrolních rostlin
V průběhu druhého podobného experimentu ve skleníkových podmínkách vykazovaly transgenní rostliny stejný fenotyp, jak již bylo popsáno výše, a opět u rostlin pMOG851-5 byla redukce růstu při stresu suchem mnohem menší, než u pMOG851~2 a rostlin divokého typu. Osmotický potenciál v listech rostlin pMOG851-5 stresovaných suchem (-1,77 ±0,39 Mpa) byl významně nižší (P=0,017) než v listech rostlin divokého typu (-1,00 ±0,08 Mpa); v rostlinách pMOG851-2 dosahoval středních hodnot (-1,12 ± 0,05 Mpa). Podobně při dostatečné zásobě vody byl osmotický potenciál rostlin pMOG851~5 (-0,79 ± 0,05 Mpa) významně nižší (P=0,038) než v listech rostlin divokého typu (-0,62 ± 0,03 Mpa) a listech rostlin pMOG851-2, kde dosahoval středních hodnot (-0,70 ± 0,01 Mpa),
Usychání oddělených listů
Listy rostlin pMOG851-2, pMOG851-5 a divokého typu byly odděleny a po 32 hodinovém vysychání byla měřena jejich čerstvá hmotnost. Listy rostlin pMOG851-2 a pMOG851-5 ztrácely významně méně vody (P< 0,05) než listy rostlin divokého typu: po 32 hodinách pMOG851-5 a pMOG8512 měly 44 % a 41 % procent jejich výchozí čerstvé hmotnosti ve • 4 • 44 srovnání s 30 % u divokého typu. V době experimentu byly též odebírány vzorky ze srovnatelných listů dostatečně zásobených vodou pro stanovení osmotického potenciálu a analýzu trehalosy, sacharosy, glukosy a fruktosy.
Obě transgenní linie měly nižší osmotický potenciál než rostliny divokého typu (P<0,05); nejnižší vodní potenciál (-0,63 ± 0,03 Mpa) byl zjištěn u pMOG851-5, nejvyšší (-0,51 ± 0,02 MPa) u rostlin divokého typu a střední hodnoty (-0,57 ± 0,04 MPa) dosáhl u pMOG8512. Obsah všech sledovaných cukrů byl významně vyšší v listech pMOG851-5, kde dosahoval, ve srovnání s listy divokého typu, trojnásobných hodnot u všech čtyř cukrů (P=0,002). Rostliny pMOG8512 obsahovaly dvakrát vyšší hladinu všech čtyř cukrů (P=0,09). Obsah trehalosy v rostlinách pMOG851-5 byl 0,24±0,02 mg.g1 sušiny, v rostlinách pMOG851-2 a rostlinách divokého typu pod detekčním limitem.
Příklad 25
Projev transgenních linií salátu TPS a TPP v podmínkách stresu suchem:
Primární transformanty TPS a TPP a kontroly divokého typu byly stresovány suchem. Nejdříve dosáhly bodu vadnutí transgenní linie TPP , potom kontrolní rostliny a nakonec transgenní rostliny TPS. Ná základě tohoto výsledku lze usuzovat, že transgenní linie TPS, stejně jako bylo pozorováno u jiných rostlinných druhů, jsou v podmínkách stresu vyvolaného suchem jasně ve výhodě oproti rostlinám TPP a rostlinám divokého typu.
Příklad 26
U transgenních linií salátu PC-TPS a PC-TPP je ovlivněno vybíhání rostlin
Vybíhání salátu bylo u transgenních rostlin PC-TPP sníženo (Tab.
14). Transgenní linie PC-TPS vybíhaly ve srovnání s kontrolami divokého typu více.
Tabulka 14. Vybíhání rostlin salátu
PC-TPP | Celkový | 1. | 2. | 3. | 4. | 5. |
linie | počet | Normální | Snížené | Viditelné | Možná | Zcela |
rostlin | vybíhání | vybíhání | kvetení | fasciace | vegetativní | |
1A | 4 | 4 | ||||
2A | 3 | 1 | 2 | |||
3A | 2 | 2 | ||||
4A | 5 | 1 | 1 | 1 | 2 | |
5A | 5 | 1 | 1 | 3 | ||
7A | 1 | 1 | ||||
8A | 5 | 4 | 1 | |||
9A | 5 | 5 | ||||
10A | 3 | 1 | 2 | |||
11A | 5 | 2 | 3 | |||
12A | 4 | 4 | ||||
|kontrola | 5 | 5 |
Příklad 27
Projev transgenních rostlin rajčete TPS a TPP
K transformaci rajčete byly použity následující konstrukty: 35S TPP, PC-TPS, PC-TPS as-trehalasa, PC-TPP, E8-TPS, E8-TPP, E8 TPS E8 astrehalasa. Transgenní rostliny nesoucí TPP gen řízený plastocyaninovým promotorem a 35S promotorem měly podobný fenotyp jako byl pozorován u jiných rostlin: zbělení listů, redukovaná tvorba květů nebo jejich absence vedoucí k produkci malých plodů nebo k jejich absenci. Několik transgenních linií 35S-TPP vytvářelo extrémně velké plody. Tyto plody měly značně zvětšený perikarp. Transgenní rostliny nesoucí TPS gen řízený plastocyaninovým promotorem a promotorem 35S nevytvářely malé kopinaté listy. Některé silně zakrslé rostliny tvořily tmavozelené listy. Transgenní rostliny PC-TPS a PC - as-trehalasa tvořily menší a tmavší listy než kontrolní rostliny.
Barva a okraje listů rostlin TPS a TPP řízené promotory 35S nebo PC byly jasně rozpoznatelné stejně jako u ostatních plodin.
• · • · ·♦· *······· • · · · · · · ···· • ··*·· · · · · · ··· ··<
• · · · · a a · • · · · · · · · ·· aa
Rostliny nesoucí TPS a TPP geny řízené promotorem E8, který je specifický pro plody, nevykazovaly žádné odchylky fenotypu ve srovnání s plody rostlin divokého typu.
Transgenní rostliny E8 TPS E8 as-trehalasa tvořily aberantní plody se žlutou slupkou, které nedozrávaly.
Příklad 28
Projev transgenních rostlin bramboru s genem pro as-trehalasu nebo TPS
Konstrukty: 35S as-trehalasa (pMOGl027) a 35S as-trehalasa Pat TPS (PMOG1027 (845-11/22/28).
Rostliny exprimující současně 35S as-trehalasu a pat-TPS byly vytvořeny retransformací pat-TPS linií (rezistentních ke kanamycinu) konstruktem pMOGl027 obsahujícím konstrukt 35S as-trehalasa a markerový gen pro rezistenci k hygromycinu, za vzniku genotypů pMOG1027 (845-11), pMOG1027 (845-22) a. pMOG1027 (845-28).
Mikrohlízky byly indukovány in vitro a byla stanovena jejich čerstvá hmotnost. Průměrný výnos mikrohlízek vyjádřený jejich čerstvou hmotností byl vyšší u transgenních linií obsahujících pMOG1027 (pMOG845-ll/22/28). Čerstvá hmotnost mikrohlízek získaných z transgenních linií pMOG1027 byla oproti kontrole divokého typu pouze slabě zvýšena. Takto získané rostliny byly pěstovány ve skleníku a byl stanoven výnos hlíz (Obr. 33).Transgenní linie 35S as-trehalasa nebo v kombinaci 35S as-trehalasa a pat-TPS tvořily významně víc hmoty hlíz ve srovnání s kontrolními liniemi. Při analýze škrobu nebyl shledán žádný rozdíl v obsahu škrobu u linií s vyššími výnosy (Obr. 34). Velký počet linií 1027(845-11/22/28) tvořil hlízy z axilárních pupenů nad povrchem půdy, což svědčí o silném vlivu použitých konstruktů na vývoj rostlin. Linie transgenních rostlin pouze s 35S as-trehalasa nevytvářely hlízy nad povrchem půdy.
Konstrukty: Pat as-trehalasa (pMOGl028) a Pat as-trehalasa Pat TPS (pMOG1028(845-11/22/28))
Rostliny exprimující současně Pat as-trehalasa a Pat-TPS byly vytvořeny retransformací pat-TPS linií (rezistentních ke kanamycinu) konstruktem pMOGl028 obsahujícím konstrukt Pat as-trehalasa a
markerový gen pro rezistenci k hygromycinu, za vzniku genotypů pMOG1028 (845-11), pMOG1028 (845-22) a. pMOG1027 (845-28).
Rostliny byly pěstovány ve skleníku a byl stanoven výnos hlíz (Obr. 35). Několik transgenních linií pMOG1028 tvořilo významně víc hmoty hlíz ve srovnání s kontrolními liniemi. Výnos hlíz jednotlivých transgenních rostlin Pat TPS a Pat as-trehalasa byl různý a pohyboval se od téměř nulového výnosu až po výnos srovnatelný nebo vyšší než byl nalezen u linií kontroly divokého typu (Obr. 35).
Konstrukt: PC as-trehalasa (pMOGl092)
Transgenní rostliny pMOG1092 byly pěstovány ve skleníku a byl stanoven výnos hlíz. Několik linií tvořilo tmavěji zelené listy něž kontrola. Výnos hlíz byl ve srovnání s kontrolou divokého typu významně vyšší (Obr. 36).
Konstrukt: PC as-trehalasa PC-TPS (pMOG 1130)
Transgenní rostliny pMOG1130 byly pěstovány ve skleníku a byl stanoven výnos hlíz. Několik linií tvořilo malé tmavozelené listy a mělo silně zakrslý vzrůst, což svědčí o silnějším účinku současné exprese genů TPS a as-trehalasa na fenotyp rostlin (viz Příklad 21) . Výnos hlíz se pohyboval od téměř nulového výnosu až po výnos významně vyšší než výnos kontrolních rostlin (Obr. 37).
Příklad 29
Overexprese cDNA trehalasy z bramboru u N.tabacum:
Konstrukt: de35S CaMV trehalasa (pMOGl078)
Fenotyp primárních transformantů pMOG1078 byl odlišný od fenotypu tabáků divokého typu. Některé transgeny měly tmavozelené a tlustší listy (morfologie listů nebyla kopinatá), což ukazuje na vliv exprese genu pro trehalasu na metabolismus rostlin. Semena primárních transformantů byla vyseta a selektována na kanamycinu. Fenotyp se segregoval podle Mendelových zákonů v generaci Sl.
• · · • · · • · · « • · · · · · · • · · · · · · · ·· · ··· ·· ·· 4·
Uložení
Na základě budapešťské dohody byly klony uloženy 21. dubna 1997 v Centraal Bureau voor Schimmelcultures, Oosterstraat 1, P.O. Box 273 3740 AG Baarn, The Netherlands a byly označeny následujícím způsobem:
Escherichia coli
DH5alpha/pMOG1192 | CBS | 692.97 |
DHSalpha/pMOG1240 | CBS | 693.97 |
DHSalpha/pMOGl241 | CBS | 694.97 |
DHSalpha/pMOG1242 | CBS | 695.97 |
DHSalpha/pMOG1243 | CBS | 696.97 |
DHSalpha/pMOG1244 | CBS | 697.97 |
DH5alpha/pMOG1245 | CBS | 698.97 |
Uložené pMOG1192 pMOG1240 pMOG1241
PMOG1242 pMOG1243 pMOG1244 pMOG1245 klony:
obsahující TPS/TPP bipartitní cDNA z Helianthus annuus vloženou v multi-copy vectoru pGEM-T (Promega). obsahující TPS 825 bp cDNA fragment z tabáku vložený v pCRscript (Stratagene).
obsahující TPS 840 bp cDNA fragment z tabáku vložený v pGEM-Τ (Promega).
obsahující TPS 630 bp cDNA fragment z tabáku vložený v pGEM-T (Promega).
obsahující TPP 543 bp cDNA fragment z tabáku vložený v pGEM-T (Promega).
obsahující TPP 723 bp cDNA fragment z tabáku vložený v a pUC18 plasmid.
obsahující TPP 447 bp fragment z tabáku vložený v pGEM T (Promega).
Seznam příslušných pMOG### a pVDH### klonů
1. Binární vektory pMOG23 Binární vektor (ca.10 Kb) obsahující selekční markér. NPTII pMOG22 pVDH 275 pMOG402 pMOG800
4444 4
Derivát pMOG23, kde NPTII-gen byl nahrazen genem HPT-pro rezistenci k hygromycinu
Binární vektor odvozený z pMOG23, obsahující plastocyaninový promotor- nos terminátor v expresní kazetě
Derivát pMOG23, bodová mutace NPTII-genu byla opravena, v polylinkeru není restrikční místo KpnI
Derivát pMOG402 s opraveným místem KpnI v polylinkeru
pMOG | 799 |
pMOG | 810 |
pMOG | 845 |
pMOG | 925 |
pMOG | 851 |
pMOG | 1010 |
pMOG | 1142 |
pMOG | 1093 |
pMOG | 1129 |
pMOG | 1177 |
pVDH | 318 |
pMOG | 1124 |
pVDH | 321 |
pMOG | 1128 |
pMOG | 1140 |
pMOG | 1141 |
2. Expresní konstrukty TPS / TPP 35S-TPS-3'nos1 tentýž s Hyg markérem Pat-TPS-3'PotPilI tentýž s Hyg markérem 35S-TPS-3'nos 35S-TPP(atg)2 pMOG 1010 de35S CaMV amv leader TPP(gtg) PotPilI pMOG 1142 tentýž s Hyg markérem pMOG 1093 Plastocyanin- TPS-3'nos pMOG 1129 tentýž s Hyg markérem pMOG 1177 Plastocyanin- TPS-3'PotPilI 3'nos identický s pM0G1177 funkčně identický s pM0G1093 pMOG 1124 Plastocyanin- TPP(gtg) 3'PotPiII 3'nos identický s pM0G1124 pMOG 1128 Patatin TPP(gtg) 3'PotPilI pMOG 1140 E8-TPS-3'nos pMOG 1141 E8-TPP(gtg)-3'PotPilI
3. Trehalasa -konstrukty pMOG 1028 Patatin as-trehalase 3'PotPilI, markér rezistence k hygromycinu pMOG 1078 de35S CaMV amv leader trehalase 3'nos pMOG 1090 de35S CaMV amv leader as-trehalase 3'nos pMOG 1027 tentýž s Hyg markérem pMOG 1092 Plastocyanin- as trehalase-3'nos pMOG 1130 Plastocyanin- as trehalase-3’nos Plastocyanin-TPS-3'nos pMOG 1153 E8-TPS-3'nos E8-as trehalase-3'PotPilI
• 9 » ·· • ·· · · · « 9 · • · · · · 9 9 9 9
9999 9 9 9 99 999 999 • 9 9 9 9 9 • 999 99 99 99 1 Všechny konstrukty obsahují selekční markér NPTII, pokud není uvedeno jinak 2 Dva typy TPP konstruktů byly použity tak, jak popsali Goddijn et al. (1997) Plant Physiol.113, 181.
φ φ
• · · · ·
Seznam sekvencí (1) Obecné informace:
(i) Žadatel:
(A) Jméno: MOGEN International nv (B) Ulice: Einsteinweg 97 (C) Město: Leiden (D) Země: Holandsko (E) PSČ (ZIP): 2333 CB (F) Telefon: 071-5258282 (G) Telefax: 071-5221471 (ii) Název vynálezu: Regulace metabolismu změnou hladiny trehalosy-6 fosfátu (iii) Počet sekvenci: 57 (iv) Forma vhodná pro počítačové zpracování (A) Typ média: Floppy disk (B) Počítač: IBM PC kompatibilní (C) Operační systém: PC-DOS/MS-DOS (D) Software: Patentln Release #1.0, Version #1.25 (EPO) (vi) Předcházející údaje o žádosti (A) Číslo žádosti: EP 96.201.255.8 (B) Datum registrace: 3.5.1996 (vi) Předcházející údaje o žádosti (A) Číslo žádosti: EP 96.202.128.3 (B) Datum registrace: 26.7.1996 (vi) Předcházející údaje o žádosti (A) Číslo žádosti: EP 96.202.395.8 (B) Datum registrace:29.8.1996 (2) Informace o SEQ ID NO:1:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 1450 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetický: Ne (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 21..1450 (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO:1:
• · · 0 0 0 · · · · · • · · · 0 0 · 00·0 0 0 0·0· ♦ 0 0 0 0 ·0· 000 000 000 0 0 00 0 00000 00 00
ATÁAAACTCT CCCCGGGACC ATG ACT ATG AGT CGT TTA GTC GTA GTA TCT ' 50
Met Thr Met Ser Arg Leu Val Val Val Ser
10
AAC Asn | CGG ATT | GCA Ala | CCA Pro 15 | CCA Pro | GAC Asp | GAG Glu | CAC His | GCC GCC AGT | GCC Ala | GGT Gly | GGC Gly 25 | CTT Leu | 98 | |||
Arg | Ile | Ala 20 | Ala | Ser | ||||||||||||
GCC | GTT | GGC | ATA | CTG | GGG | GCA | CTG | AAA | GCC | GCA | GGC | GGA | CTG | TGG | TTT | 146 |
Ala | Val | Gly | Ile | Leu | Gly | Ala | Leu | Lys | Ala | Ala | Gly | Gly | Leu | Trp | Phe | |
30 | 35 | 40 | ||||||||||||||
GGC | TGG | AGT | GGT | GAA | ACA | GGG | AAT | GAG | GAT | CAG | CCG | CTA | AAA | AAG | GTG | 194 |
Gly | Trp | Ser | Gly | Glu | Thr | Gly | Asn | Glu | Asp | Gin | Pro | Leu | Lys | Lys | Val | |
45 | 50 | 55 | ||||||||||||||
AAA | AAA | GGT | AAC | ATT | ACG | TGG | GCC | TCT | TTT | AAC | CTC | AGC | GAA | CAG | GAC | 242 |
Lys | Lys | Gly | Asn | Ile | Thr | Trp | Ala | Ser | Phe | Asn | Leu | Ser | Glu | Gin | Asp | |
60 | 65 | 70 | t | |||||||||||||
CTT | GAC | GAA | TAC | TAC | AAC | CAA | TTC | TCC | AAT | GCC | GTT | CTC | TGG | CCC | GCT | 290 |
Leu | Asp | Glu | Tyr | Tyr | Asn | Gin | Phe | Ser | Asn | Ala | Val | Leu | Trp | Pro | Ala | |
75 | 80 | 85 | 90 | |||||||||||||
TTT | CAT | TAT | CGG | CTC | GAT | CTG | GTG | CAA | TTT | CAG | CGT | CCT | GCC | TGG | GAC | 338 |
Phe | His | Tyr | Arg | Leu | Asp | Leu | Val | Gin | Phe | Gin | Arg | Pro | Ala | Trp | Asp | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
GGC | TAT | CTA | CGC | GTA | AAT | GCG | TTG | CTG | GCA | GAT | AAA | TTA | CTG | CCG | CTG | 386 |
Gly | Tyr | Leu | Arg | Val | Asn | Ala | Leu | Leu | Ala | Asp | Lys | Leu | Leu | Pro | Leu | |
110 | 115 | 120 | ||||||||||||||
TTG | CAA | GAC | GAT | GAC | ATT | ATC | TGG | ATC | CAC | GAT | TAT | CAC | CTG | TTG | CCA | 434 |
Leu | Gin | Asp | Asp | Asp | Ile | Ile | Trp | Ile | His | Asp | Tyr | His | Leu | Leu | Pro | |
125 | 130 | 135 | ||||||||||||||
TTT | GCG | CAT | GAA | TTA | CGC | AAA | CGG | GGA | GTG | AAT | AAT | CGC | ATT | GGT | TTC | 482 |
Phe | Ala | His | Glu | Leu | Arg | Lys | Arg | Gly | Val | Asn | Asn | Arg | Ile | Gly | Phe | |
140 | 145 | 150 | r | |||||||||||||
TTT | CTG | CAT | ATT | CCT | TTC | CCG | ACA | CCG | GAA | ATC | TTC | AAC | GCG | CTG | CCG | ’ 530 |
Phe | Leu | His | Ile | Pro | Phe | Pro | Thr | Pro | Glu | Ile | Phe | Asn | Ala | Leu | Pro | |
155 | 160 | 165 | 170 | |||||||||||||
ACA | TAT | GAC | ACC | TTG | CTT | GAA | CAG | CTT | TGT | GAT | TAT | GAT | TTG | CTG | GGT | 578 |
Thr | Tyr | Asp | Thr | Leu | Leu | Glu | Gin | Leu | Cys | Asp | Tyr | Asp | Leu | Leu | Gly | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
TTC | CAG | ACA | GAA | AAC | GAT | CGT | CTG | GCG | 'ttc | CTG | GAT | TGT | CTT | TCT | AAC | 626 |
Phe | Gin | Thr | Glu | Asn | Asp | Arg | Leu | Ala | Phe | Leu | Asp | Cys | Leu | Ser | Asn | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
CTG | ACC | CGC | GTC | ACG | ACA | CGT | AGC | GCA | AAA | AGC | CAT | ACA | GCC | TGG | GGC | 674 |
Leu | Thr | Arg | Val | Thr | Thr | Arg | Ser | Ala | Lys | Ser | His | Thr | Ala | Trp | Gly | |
205 | 210 | 215 |
• · • · · • ···· 9 • ··
AAA GCA TTT | CGA Arg | ACA GAA | GTC Val 225 | TAC Tyr | CCG Pro | ATC GGC Ile Gly | ATT Ile 230 | GAA Glu | CCG Pro | AAA Lys | GAA '· · Glu | 722 | |||
Lys | Ala 220 | Phe | Thr | Glu | |||||||||||
ATA | GCC | AAA | CAG | GCT | GCC | GGG | CCA | CTG | CCG CCA | AAA | CTG | GCG | CAA | CTT | 770 |
Ile | Ala | Lys | Gin | Ala | Ala | Gly | Pro | Leu | Pro Pro | Lys | Leu | Ala | Gin | Leu | |
235 | 240 | 245 | 250 | • | |||||||||||
AAA | GCG | GAA | CTG | AAA | AAC | GTA | CAA | AAT | ATC TTT | TCT | GTC | GAA | CGG | CTG | 818 |
Lys | Ala | Glu | Leu | Lys | Asn | Val | Gin | Asn | Ile Phe | Ser | Val | Glu | Arg | Leu | |
255 | 260 | 265 | |||||||||||||
GAT | TAT | TCC | AAA | GGT | TTG | CCA | GAG | CGT | TTT CTC | GCC | TAT | GAA | GCG | TTG | 866 |
Asp | Tyr | Ser | Lys | Gly | Leu | Pro | Glu | Arg | Phe Leu | Ala | Tyr | Glu | Ala | Leu | |
270 | 275 | 280 | |||||||||||||
CTG | GAA | AAA | TAT | CCG | CAG | CAT | CAT | GGT | AAA ATT | CGT | TAT | ACC | CAG | ATT | 914 |
Leu | Glu | Lys | Tyr | Pro | Gin | His | His | Gly | Lys Ile | Arg | Tyr | Thr | Gin | Ile | |
285 | 290 | 295 | ! | ||||||||||||
GCA | CCA | ACG | TCG | CGT | GGT | GAT | GTG | CAA | GCC TAT | CAG | GAT | ATT | CGT | CAT | 962 |
Ala | Pro | Thr | Ser | Arg | Gly | Asp | Val | Gin | Ala Tyr | Gin | Asp | Ile | Arg | His | |
300 | 305 | 310 | |||||||||||||
CAG | CTC | GAA | AAT | GAA | GCT | GGA | CGA | ATT | AAT GGT | AAA | TAC | GGG | CAA | TTA | 1010 |
Gin | Leu | Glu | Asn | Glu | Ala | Gly | Arg | Ile | Asn Gly | Lys | Tyr | Gly | Gin | Leu | |
315 | 320 | 325 | 330 | ||||||||||||
GGC | TGG | ACG | CCG | CTT | TAT | TAT | TTG | AAT | CAG CAT | TTT | GAC | CGT | AAA | TTA | 1058 |
Gly | Trp | Thr | Pro | Leu | Tyr | Tyr | Leu | Asn | Gin His | Phe | Asp | Arg | Lys | Leu | |
335 | 340 | 345 | |||||||||||||
CTG | ATG | AAA | ATA | TTC | CGC | TAC | TCT | GAC | GTG GGC | TTA | GTG | ACG | CCA | CTG | 1106 |
Leu | Met | Lys | Ile | Phe | Arg | Tyr | Ser | Asp | Val Gly | Leu | Val | Thr | Pro | Leu | |
350 | 355 | 360 | |||||||||||||
CGT | GAC | GGG | ATG | AAC | CTG | GTA | GCA | AAA | GAG TAT | GTT | GCT | GCT | CAG | GAC | 1154 |
Arg | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | Val | Ala | Lys | Glu Tyr | Val | Ala | Ala | Gin | Asp | |
365 | 370 | 375 | - | ||||||||||||
CCA | GCC | AAT | CCG | GGC | GTT | CTT | GTT | CTT | TCG CAA | TTT | GCG | GGA | GCG | GCA | 1202 |
Pro | Ala | Asn | Pro | Gly | Val | Leu | Val | Leu | Ser Gin | Phe | Ala | Gly | Ala | Ala | |
380 | 385 | 390 | |||||||||||||
AAC | GAG | TTA | ACG | TCG | GCG | TTA | ATT | GTT | AAC CCC | TAC | GAT | CGT | GAC | GAA | 1250 |
Asn | Glu | Leu | Thr | Ser | Ala | Leu | Ile | Val | Asn Pro | Tyr | Asp | Arg | Asp | Glu | |
395 | 400 | 405 | 410 | ||||||||||||
GTT | GCA | GCT | GCG | CTG | GAT | CGT | GCA | TTG | ACT ATG | TCG | CTG | GCG | GAA | CGT | 1298 |
Val | Ala | Ala | Ala | Leu | Asp | Arg | Ala | Leu | Thr Met | Ser | Leu | Ala | Glu | Arg | |
415 | 420 | 425 | |||||||||||||
ATT | TCC | CGT | CAT | GCA | GAA | ATG | CTG | GAC | GTT ATC | GTG | AAA | AAC | GAT | ATT | 1346 |
Ile | Ser | Arg | His | Ala | Glu | Met | Leu | Asp | Val Ile | Val | Lys | Asn | Asp | Ile |
430 435 440
4444
4 4 4 4 4
4 4 4 4 4
44 444 444
4 4 4
44 44 ·· · • 4 4 • · 4 · • · 444· 4
4 ·
4
•ÁAČ | CAC | TGG | CAG | GAG | TGC TTC | ATT | AGC | GAC | CTA | AAG | CAG | ATA | GTT | ČCG | ' 1394 |
Asn | His | Trp | Gin | Glu | Cys Phe | Ile | Ser | Asp | Leu | Lys | Gin | Ile | Val | Pro | |
445 | 450 | 455 | |||||||||||||
CGA | AGC | GCG | GAA | AGC | CAG CAG | CGC | GAT | AAA | GTT | GCT | ACC | TTT | CCA | AAG | 1442 |
Arg | Ser | Ala | Glu | Ser | Gin Gin | Arg | Asp | Lys | Val | Ala | Thr | Phe | Pro | Lys | |
460 | 465 | 470 | * | ||||||||||||
CTC | TGC | AG | 1450 | ||||||||||||
Leu | Cys | ||||||||||||||
475 | |||||||||||||||
(2) Informace | o SEQ ID | NO: 2: |
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 476 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein
(xi) Popis . | sekvence: | SEQ ID | NO: 2: | ||||||||||||
Met | Thr | Met | Ser | Arg | Leu | Val | Val | Val | Ser | Asn | Arg | Ile | Ala | Pro | Pro |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Asp | Glu | His | Ala | Ala | Ser | Ala | Gly | Gly | Leu | Ala | Val | Gly | Ile | Leu | Gly |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ala | Leu | Lys | Ala | Ala | Gly | Gly | Leu | Trp | Phe | Gly | Trp | Ser | Gly | Glu | Thr |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gly | Asn | Glu | Asp | Gin | Pro | Leu | Lys | Lys | Val | Lys | Lys | Gly | Asn | Ile | Thr |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Trp | Ala | Ser | Phe | Asn | Leu | Ser | Glu | Gin | Asp | Leu | Asp | Glu | Tyr | Tyr | Asn |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Gin | Phe | Ser | Asn | Ala | Val | Leu | Trp | Pro | Ala | Phe | His | Tyr | Arg | Leu | Asp |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Leu | Val | Gin | Phe | Gin | Arg | Pro | Ala | Trp | Asp | Gly | Tyr | Leu | Arg | Val | Asn |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ala | Leu | Leu | Ala | Asp | Lys | Leu | Leu | Pro | Leu | Leu | Gin | Asp | Asp | Asp | Ile |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ile | Trp | Ile | His | Asp | Tyr | His | Leu | Leu | Pro | Phe | Ala | His | Glu | Leu | Arg |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Lys | Arg | Gly | Val | Asn | Asn | Arg | Ile | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ile | Pro | Phe |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Pro | Thr | Pro | Glu | Ile | Phe | Asn | Ala | Leu | Pro | Thr | Tyr | Asp | Thr | Leu | Leu |
165 | 170 | 175 |
• | ·· « • · | • to · | ·· « · | ·· ·· • «to · | ||||||||||
• | • · | • | • | • · | • ·· | to | ||||||||
* | • · · « to · | • | to to | • ··to to to to | ||||||||||
• | • | • | • | • · | • | • | ||||||||
·· | » | • · · | • · | ·· ·< | k | |||||||||
Glu | Gin | Leu | Cys | Asp | Tyr | Asp | Leu | Leu | Gly | Phe | Gin | Thr | Glu Asn | Ásp |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||
Arg | Leu | Ala | Phe | Leu | Asp | Cys | Leu | Ser | Asn | Leu | Thr | Arg | Val Thr | Thr |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||
Arg | Ser | Ala | Lys | Ser | His | Thr | Ala | Trp | Gly | Lys | Ala | Phe | Arg Thr | Glu |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||
Val | Tyr | Pro | Ile | Gly | Ile | Glu | Pro | Lys | Glu | Ile | Ala | Lys | Gin Ala | Ala |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||
Gly | Pro | Leu | Pro | Pro | Lys | Leu | Ala | Gin | Leu | Lys | Ala | Glu | Leu Lys | Asn |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||
Val | Gin | Asn | Ile | Phe | Ser | Val | Glu | Arg | Leu | Asp | Tyr | Ser | Lys Gly | Leu |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||
Pro | Glu | Arg | Phe | Leu | Ala | Tyr | Glu | Ala | Leu | Leu | Glu | Lys | Tyr Pro | Gin |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||
His | His | Gly | Lys | Ile | Arg | Tyr | Thr | Gin | Ile | Ala | Pro | Thr | Ser Arg | Gly |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||
Asp | Val | Gin | Ala | Tyr | Gin | Asp | Ile | Arg | His | Gin | Leu | Glu | Asn Glu | Ala |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||
Gly | Arg | Ile | Asn | Gly | Lys | Tyr | Gly | Gin | Leu | Gly | Trp | Thr | Pro Leu | Tyr |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||
Tyr | Leu | Asn | Gin | His | Phe | Asp | Arg | Lys | Leu | Leu | Met | Lys | Ile Phe | Arg |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||
Tyr | Ser | Asp | Val | Gly | Leu | Val | Thr | Pro | Leu | Arg | Asp | Gly | Met Asn | Leu |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||
Val | Ala | Lys | Glu | Tyr | Val | Ala | Ala | Gin | Asp | Pro | Ala | Asn | Pro Gly | Val |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||
Leu | Val | Leu | Ser | Gin | Phe | Ala | Gly | Ala | Ala | Asn | Glu | Leu | Thr Ser | Ala |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||
Leu | Ile | Val | Asn | Pro | Tyr | Asp | Arg | Asp | Glu | Val | Ala | Ala | Ala Leu | Asp |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||
Arg | Ala | Leu | Thr | Met | Ser | Leu | Ala | Glu | Arg | Ile | Ser | Arg | His Ala | Glu |
420 425 430
Met Leu Asp Val Ile Val Lys Asn Asp Ile Asn His Trp Gin Glu Cys 435 440 445
Phe Ile Ser Asp Leu Lys Gin Ile Val Pro Arg Ser Ala Glu Ser Gin 450 455 460
Gin Arg Asp Lys Val Ala Thr Phe Pro Lys Leu Cys
465 470 475 ·· ·· • · · · • · · · *·· ··· • · *· ·· ·· • · ·♦· ·· «
• · » * · •···· ♦ • * (2)Informace o SEQ ID NO:3:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 835 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetický: Ne (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 18..818 (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:3:
ATAAAACTCT CCCCGGG ATG ACA GAA CCG TTA ACC GAA ACC CCT GAA CTA Met Thr Glu Pro Leu Thr Glu Thr Pro Glu Leu
10
TCC GCG AAA TAT GCC TGG TTT TTT GAT CTT GAT GGA ACG CTG GCG GAA Ser Ala Lys Tyr Ala Trp Phe Phe Asp Leu Asp Gly Thr Leu Ala Glu
20 25
ATC AAA CCG CAT CCC GAT CAG GTC GTC GTG CCT GAC AAT ATT CTG CAA Ile Lys Pro His Pro Asp Gin Val Val Val Pro Asp Asn Ile Leu Gin
35 40
GGA CTA CAG CTA CTG GCA ACC GCA AGT GAT GGT GCA TTG GCA TTG ATA Gly Leu Gin Leu Leu Ala Thr Ala Ser Asp Gly Ala Leu Ala Leu Ile
50 55
TCA GGG CGC TCA ATG GTG GAG CTT GAC GCA CTG GCA AAA CCT TAT CGC Ser Gly Arg Ser Met Val Glu Leů Asp Ala Leu Ala Lys Pro Tyr Arg
65 70 75
TTC CCG TTA GCG GGC GTG CAT GGG GCG GAG CGC CGT GAC ATC AAT GGT Phe Pro Leu Ala Gly Val His Gly Ala Glu Arg Arg Asp Ile Asn Gly
85 90
AAA ACA CAT ATC GTT CAT CTG CCG GAT GCG ATT GCG CGT GAT ATT AGC Lys Thr His Ile Val His Leu Pro Asp Ala Ile Ala Arg Asp Ile Ser
100 105
GTG CAA CTG CAT ACA GTC ATC GCT CAG TAT CCC GGC GCG GAG CTG GAG Val Gin Leu His Thr Val Ile Ala Gin Tyr Pro Gly Ala Glu Leu Glu
110 115 120
GCG AAA GGG ATG GCT TTT GCG CTG CAT TAT CGT CAG GCT CCG CAG CAT
Ala Lys Gly Met Ala Phe Ala Leu His Tyr Arg Gin Ala Pro Gin His
125 130 135
146
194
242
338
386
434
• | • · 9 | • • | • 9 9 | 99 9 | 9 | 99 9 9 | 99 9 9 |
9 | 9 | • 9 | 9 | 9 | 9 | 9 · | • 9 |
• | • | • 999 9 | 9 | 9 | 9 | 9 999 | 9 9 9 |
0 | 0 | 9 | 0 | 9 | 9 | • | 9 |
*9 | 9 | 999 | 99 | 9 · | 99 |
GAA GAC | GCA Ala | TTA ATG Leu Met | ACA Thr 145 | TTA GCG | CAA Gin | CGT Arg | ATT Ile 150 | ACT Thr | CAG Gin | ATC Ile | TGG Trp | Cca · . Pro 155 | 482 | |||
Glu 140 | Asp | Leu | Ala | |||||||||||||
CAA | ATG | GCG | TTA | CAG | CAG | GGA | AAG | TGT | GTT | GTC | GAG | ATC | AAA | CCG | AGA | 530 |
Gin | Met | Ala | Leu | Gin | Gin | Gly | Lys | Cys | Val | Val | Glu | Ile | Lys | Pro | Arg | |
160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
GGT | ACC | AGT | AAA | GGT | GAG | GCA | ATT | GCA | GCT | TTT | ATG | CAG | GAA | GCT | CCC | 578 |
Gly | Thr | Ser | Lys | Gly | Glu | Ala | Ile | Ala | Ala | Phe | Met | Gin | Glu | Ala | Pro | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
TTT | ATC | GGG | CGA | ACG | CCC | GTA | TTT | CTG | GGC | GAT | GAT | TTA | ACC | GAT | GAA | 626 |
Phe | Ile | Gly | Arg | Thr | Pro | Val | Phe | Leu | Gly | Asp | Asp | Leu | Thr | Asp | Glu | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
TCT | GGC | TTC | GCA | GTC | GTT | AAC | CGA | CTG | GGC | GGA | ATG | TCA | GTA | AAA | ATT | 674 |
Ser | Gly | Phe | Ala | Val | Val | Asn | Arg | Leu | Gly | Gly | Met | Ser | Val | Lys | Ile | |
205 | 210 | 215 | ||||||||||||||
GGC | ACA | GGT | GCA | ACT | CAG | GCA | TCA | TGG | CGA | CTG | GCG | GGT | GTG | CCG | GAT | 722 |
Gly | Thr | Gly | Ala | Thr | Gin | Ala | Ser | Trp | Arg | Leu | Ala | Gly | Val | Pro | Asp | |
220 | 225 | 230 | 235 | |||||||||||||
GTC | TGG | AGC | TGG | CTT | GAA | ATG | ATA | ACC | ACC | GCA | TTA | CAA | CAA | AAA | AGA | 770 |
Val | Trp | Ser | Trp | Leu | Glu | Met | Ile | Thr | Thr | Ala | Leu | Gin | Gin | Lys | Arg | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||||
GAA | AAT | AAC | AGG | AGT | GAT | GAC | TAT | GAG | TCG | TTT | AGT | CGT | AGT | ATC | TAA | 818 |
Glu | Asn | Asn | Arg | Ser | Asp | Asp | Tyr | Glu | Ser | Phe | Ser | Arg | Ser | Ile | * |
255 260 265
CCGGATTGCA CCTGCAG 835
270 (2)Informace o SEQ ID NO:4:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 272 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii)Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:4:
Met Thr Glu Pro Leu Thr Glu Thr Pro Glu Leu Ser Ala Lys Tyr Ala 1 5 io 15
Trp Phe Phe Asp Leu Asp Gly Thr Leu Ala Glu Ile Lys Pro His Pro 20 m ·· • 4
4
44* •
4«
4 • 4
444
4· 4 • 4 4 • ·4· · »4·· ·
4 4 • · · • *4 · · • 4 · • · ·
4 4
444 4·
Ásp Gin Val | Val | Val | Pro | Asp Asn 40 | Ile | Leu Gin Gly | Leu 45 | Gin | Leu | Léů | |||||
35 | |||||||||||||||
Ala | Thr | Ala | Ser | Asp | Gly | Ala | Leu | Ala | Leu | Ile | Ser | Gly | Arg | Ser | Met |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Val | Glu | Leu | Asp | Ala | Leu | Ala | Lys | Pro | Tyr | Arg | Phe | Pro | Leu | Ala | Gly |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Val | His | Gly | Ala | Glu | Arg | Arg | Asp | Ile | Asn | Gly | Lys | Thr | His | Ile | Val |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
His | Leu | Pro | Asp | Ala | Ile | Ala | Arg | Asp | Ile | Ser | Val | Gin | Leu | His | Thr |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Val | Ile | Ala | Gin | Tyr | Pro | Gly | Ala | Glu | Leu | Glu | Ala | Lys | Gly | Met | Ala |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Phe | Ala | Leu | His | Tyr | Arg | Gin | Ala | Pro | Gin | His | Glu | Asp | Ala | Leu | Met |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Thr | Leu. | Ala | Gin | Arg | Ile | Thr | Gin | Ile | Trp | Pro | Gin | Met | Ala | Leu | Gin |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Gin | Gly | Lys | Cys | Val | Val | Glu | Ile | Lys | Pro | Arg | Gly | Thr | Ser | Lys | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Glu | Ala | Ile | Ala | Ala | Phe | Met | Gin | Glu | Ala | Pro | Phe | Ile | Gly | Arg | Thr |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Pro | Val | Phe | Leu | Gly | Asp | Asp | Leu | Thr | Asp | Glu | Ser | Gly | Phe | Ala | Val |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Val | Asn | Arg | Leu | Gly | Gly | Met | Ser | Val | Lys | Ile | Gly | Thr | Gly | Ala | Thr |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Gin | Ala | Ser | Trp | Arg | Leu | Ala | Gly | Val | Pro | Asp | Val | Trp | Ser | Trp | Leu |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Glu | Met | Ile | Thr | Thr | Ala | Leu | Gin | Gin | Lys | Arg | Glu | Asn | Asn | Arg | Ser |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Asp | Asp | Tyr | Glu | Ser | Phe | Ser | Arg | Ser | Ile | * |
260 265 (2)Informace ο SEQ ID NO:5:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 27 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA • · · · • ·· · ·99 • 9
(iii)Hypotetický: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:5:
AAGCTTATGT TGCCATATAG AGTAGAT (2)Informace o SEQ ID NO:6:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 29 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:6:
GTAGTTGCCA TGGTGCAAAT GTTCATATG (2)Informace o SEQ ID NO:7:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 26 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence; Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID N0:7:
GAYITIATIT GGRTICAYGA YTAYCA (2)Informace o SEQ ID NO:8:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 28 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO;8:
• · · ♦ ·
9 ·· · *·*
TIGGITKITT YYTICAYAYI CCITTYCC (2)Informace o SEQ ID NO:9:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 22 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:9:
GYIACIARRT TCATICCRTC IC ,22 (2)Informace o SEQ ID NO:10:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 743 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Homo sapiens (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 1..743 (D) Další informace:/částečná (xi)Popis sekvence
SEQ ID NO:10:
GAC Asp 1 | GTG Val | ATG TGG ATG | CAC His | GAC Asp | TAC Tyr | CAT His | TTG ATG | GTG Val | TTG Leu | CCT ACG | TTC Phe | 48 | ||||
Met | Trp Met 5 | Leu 10 | Met | Pro | Thr 15 | |||||||||||
TTG | AGG | AGG | CGG | TTC | AAT | CGT | TTG | AGA | ATG | GGG | TTT | TTC | CTT | CAC | AGT | 96 |
Leu | Arg | Arg | Arg | Phe | Asn | Arg | Leu | Arg | Met | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ser | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CCA | TTT | CCC | TCA | TCT | GAG | ATT | TAC | AGG | ACA | CTT | CCT | GTT | AGA | GAG | GAA | 144 |
Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | Ile | Tyr | Arg | Thr | Leu | Pro | Val | Arg | Glu | Glu | |
35 | 40 | 45 |
• 9 • · • 9
192
O · · · · · • · · · · · • 9 · ··· · · · • · · · • 9 l· 9·
ΑΤΑ CTC | AAG Lys | GCT Ala | TTG Leu | CTC Leu | TGT GCT GAC ATT GTT GGA | TTC Phe | CAC His | ACT Thr | TTT Phe | ||||||
Ile | Leu 50 | Cys 55 | Ala Asp | Ile | Val | Gly 60 | |||||||||
GAC | TAC | GCG | AGA | CAC | TTC | CTC | TCT | TGT | TGC | AGT | CGG | ATG | TTG | GGT | TTA |
Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | Leu | Ser | Cys | Cys | Ser | Arg | Met | Leu | Gly | Leu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
GAG | TAT | CAG | TCT | AAA | AGA | GGT | TAT | ATA | GGG | TTA | GAA | TAC | TAT | GGA | CGG |
Glu | Tyr | Gin | Ser | Lys | Arg | Gly | Tyr | Ile | Gly | Leu | Glu | Tyr | Tyr | Gly | Arg |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
ACA | GTA | GGC | ATC | AAG | ATT | ATG | CCC | GTC | GGG | ATA | CAT | ATG | GGT | CAT | ATT |
Thr | Val | Gly | Ile | Lys | Ile | Met | Pro | Val | Gly | Ile | His | Met | Gly | His | Ile |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
GAG | TCC | ATG | AAG | AAA | CTT | GCA | GCG | AAA | GAG | TTG | ATG | CTT | AAG | GCG | CTA |
Glu | Ser | Met | Lys | Lys | Leu | Ala | Ala | Lys | Glu | Leu | Met | Leu | Lys | Ala | Leu |
115 | 120 | 125 | 1 | ||||||||||||
AAG | CAG | CAA | TTT | GAA | GGG | AAA | ACT | GTG | TTG | CTT | GGT | GCC | GAT | GAC | CTG |
Lys | Gin | Gin | Phe | Glu | Gly | Lys | Thr | Val | Leu | Leu | Gly | Ala | Asp | Asp | Leu |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
GAT | ATT | TTC | AAA | GGT | ATA | AAC | TTA | AAG | CTT | CTA | GCT | ATG | GAA | CAG | ATG |
Asp | Ile | Phe | Lys | Gly | Ile | Asn | Leu | Lys | Leu | Leu | Ala | Met | Glu | Gin | Met |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
CTC | AAA | CAG | CAC | CCC | AAG | TGG | CAA | GGG | CAG | GCT | GTG | TTG | GTC | CAG | ATT |
Leu | Lys | Gin | His | Pro | Lys | Trp | Gin | Gly | Gin | Ala | Val | Leu | Val | Gin | Ile |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
GCA | AAT | CCT | ACG | AGG | GGT | AAA | GGA | GTA | GAT | TTT | GAG | GAA | ATA | CAG | GCT |
Ala | Asn | Pro | Thr | Arg | Gly | Lys | Gly | Val | Asp | Phe | Glu | Glu | Ile | Gin | Ala |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
GAG | ATA | TCG | GAA | AGC | TGT | AAG | AGA | ATC | AAT | AAG | CAA | TTC | GGC | AAG | CCT |
Glu | Ile | Ser | Glu | Ser | Cys | Lys | Arg | Ile | Asn | Lys | Gin | Phe | Gly | Lys | Pro |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
GGA | TAT | GAG | CCT | ATA | GTT | TAT | ATT | GAT | AGG | CCC | GTG | TCA | AGC | AGT | GAA |
Gly | Tyr | Glu | Pro | Ile | Val | Tyr | Ile | Asp | Arg | Pro | Val | Ser | Ser | Ser | Glu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
CGC | ATG | GCA | TAT | TAC | AGT | ATT | GCA | GAA | TGT | GTT | GTT | GTC | ACG | GCT | GTG |
Arg | Met | Ala | Tyr | Tyr | Ser | Ile | Ala | Glu | Cys | Val | Val | Val | Thr | Ala | Val |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
AGC | GAC | GGC | ATG | AAC | TTC | GTC | TC | ||||||||
Ser | Asp | Gly | Met | Asn | Phe | Val | |||||||||
245 |
240
288
336
384
432
480
528
576
624
672
720
743 • 9 (2)Informace o SEQ ID NO:11:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 247 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:11:
Asp 1 | Val | Met | Trp Met 5 | His Asp Tyr His | Leu 10 | Met | Val | Leu | Pro | Thr 15 | Phe | ||||
Leu | Arg | Arg | Arg | Phe | Asn | Arg | Leu | Arg | Met | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ser |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | Ile | Tyr | Arg | Thr | Leu | Pro | Val | Arg | Glu | Glu |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ile | Leu | Lys | Ala | Leu | Leu | Cys | Ala | Asp | Ile | Val | Gly | Phe | His | Thr | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | Leu | Ser | Cys | Cys | Ser | Arg | Met | Leu | Gly | Leu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Glu | Tyr | Gin | Ser | Lys | Arg | Gly | Tyr | Ile | Gly | Leu | Glu | Tyr | Tyr | Gly | Arg |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Thr | Val | Gly | Ile | Lys | Ile | Met | Pro | Val | Gly | Ile | His | Met | Gly | His | Ile |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Glu | Ser | Met | Lys | Lys | Leu | Ala | Ala | Lys | Glu | Leu | Met | Leu | Lys | Ala | Leu |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Lys | Gin | Gin | Phe | Glu | Gly | Lys | Thr | Val | Leu | Leu | Gly | Ala | Asp | Asp | Leu |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Asp | Ile | Phe | Lys | Gly | Ile | Asn | Leu | Lys | Leu | Leu | Ala | Met | Glu | Gin | Met |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Leu | Lys | Gin | His | Pro | Lys | Trp | Gin | Gly | Gin | Ala | Val | Leu | Val | Gin | Ile |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ala | Asn | Pro | Thr | Arg | Gly | Lys | Gly | Val | Asp | Phe | Glu | Glu | Ile | Gin | Ala |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Glu | Ile | Ser | Glu | Ser | Cys | Lys | Arg | Ile | Asn | Lys | Gin | Phe | Gly | Lys | Pro |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Gly | Tyr | Glu | Pro | Ile | Val | Tyr | Ile | Asp | Arg | Pro | Val | Ser | Ser | Ser | Glu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Arg | Met | Ala | Tyr | Tyr | Ser | Ile | Ala | Glu | Cys | Val | Val | Val | Thr | Ala | Val |
225 230 235 240 t i «··· · ··
Ser Asp Gly Met Asn Phe Val 245 (2)Informace o SEQ ID NO:12:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 395 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (ix) Vlastnosti:
(C) Jméno/Klíč: CDS (D) Umístění: 1..395 (D) Další informace:/částečná
(xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:12:
GCG Ala 1 | AAA Lys | CCG Pro | GTG Val | ATG AAA CTT TAC AGG | GAA GCA ACT GAC GGA TCA TAT | 48 | ||||||||||
Met 5 | Lys | Leu | Tyr Arg | Glu 10 | Ala | Thr | Asp | Gly | Ser 15 | Tyr | ||||||
ATA | GAA | ACT | AAA | GAG | AGT | GCA | TTA | GTG | TGG | CAC | CAT | CAT | GAT | GCA | GAC | 96 |
Ile | Glu | Thr | Lys | Glu | Ser | Ala | Leu | Val | Trp | His | His | His | Asp | Ala | Asp | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CCT | GAC | TTT | GGC | TCC | TGC | CAG | GCA | AAG | GAA | TTG | TTG | GAT | CAT | TTG | GAA | 144 |
Pro | Asp | Phe | Gly | Ser | Cys | Gin | Ala | Lys | Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu | <· |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
AGC | GTA | CTT | GCA | AAT | GAA | CCT | GCA | GTT | GTT | AAG | AGG | GGC | CAA | CAT | ATT | 192 |
Ser | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro | Ala | Val | Val | Lys | Arg | Gly | Gin | His | Ile | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
GTT | GAA | GTC | AAG | CCA | CAA | GGT | GTG | ACC | AAA | GGA | TTA | GTT | TCA | GAG | AAG | 240 |
Val | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Gly | Val | Thr | Lys | Gly | Leu | Val | Ser | Glu | Lys | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GTT | CTC | TCG | ATG | ATG | GTT | GAT | AGT | GGG | AAA | CCG | CCC | GAT | TTT | GTT | ATG | 288 |
Val | Leu | Ser | Met | Met | Val | Asp | Ser | Gly | Lys | Pro | Pro | Asp | Phe | Val | Met | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
TGC | ATT | GGA | GAT | GAT | AGG | TCA | GAC | GAA | GAC | ATG | TTT | GAG | AGC | ATA | TTA | 336 |
ϊ Cys | Ile | Gly | Asp | Asp | Arg | Ser | Asp | Glu | Asp | Met | Phe | Glu | Ser | Ile | Leu | |
i | 100 | 105 | 110 |
00· 0·· ·· · • 0· • 0 0· • 0 0 0 0·
AGC ACC GTA TCC AGT CTG TCA GTC ACT GCT GCC CCT GAT GTC TTT GCC Ser Thr Val Ser Ser Leu Ser Val Thr Ala Ala Pro Asp Val Phe Ala
115 120 125
TGC ACC GTC GG Cys Thr Val
130 (2)Informace o SEQ ID NO:13:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 131 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární
384
395 (ii)Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:13:
Ala 1 | Lys | Pro Val | Met 5 | Lys | Leu Tyr | Arg Glu Ala Thr Asp Gly Ser Tyr | |||||||||
10 | 15 | ||||||||||||||
Ile | Glu | Thr | Lys | Glu | Ser | Ala | Leu | Val | Trp | His | His | His | Asp | Ala | Asp |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Pro | Asp | Phe | Gly | Ser | Cys | Gin | Ala | Lys | Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ser | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro | Ala | Val | Val | Lys | Arg | Gly | Gin | His | Ile |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Val | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Gly | Val | Thr | Lys | Gly | Leu | Val | Ser | Glu | Lys |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Val | Leu | Ser | Met | Met | Val | Asp | Ser | Gly | Lys | Pro | Pro | Asp | Phe | Val | Met |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Cys | Ile | Gly | Asp | Asp | Arg | Ser | Asp | Glu | Asp | Met | Phe | Glu | Ser | Ile | Leu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ser | Thr | Val | Ser | Ser | Leu | Ser | Val | Thr | Ala | Ala | Pro | Asp | Val | Phe | Ala |
115 120 125
Cys Thr Val 130 (2)Informace o SEQ ID NO:14:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 491 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mJRNA
• • • • • • | • · • « • · 9 9 · · 9 9 · • · 9> 9 | • (· · · • 9 • 9 • · • •9 | • 4 • 9 9 • ·* | • · • · • · 9 9 9 • • * | • · • · • · 9 9 9 • 4 9 | |
(iii)Hypotetický: Ne | ||||||
(iii)Antisence: Ne | ||||||
(vi)Původní zdroj: | ||||||
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum | ||||||
(B)Druh: Samsun NN | ||||||
(F)Typ pletiva: List | ||||||
(ix) Vlastnosti: | ||||||
(A) Jméno/Klič | : CDS | |||||
(B) Umístění | : 1..491 | |||||
(D) Další informace:/částečná | ||||||
(xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:14: | ||||||
GGG CTG TCG GCG GAA CAC | GGC TAT TTC TTG | AGG ACG | AGT | CAA | GAT | GAA 48 |
Gly Leu Ser Ala Glu His | Gly Tyr Phe Leu | Arg Thr | Ser | Gin | Asp | Glu |
1 5 | 10 | 15 | i | |||
GAA TGG GAA ACA TGT GTA | CCA CCA GTG GAA | TGT TGT | TGG | AAA | GAA | ATA 96 |
Glu Trp Glu Thr Cys Val | Pro Pro Val Glu | Cys Cys | Trp | Lys | Glu | Ile |
20 | 25 | 30 | ||||
GCT GAG CCT GTT ATG CřA | CTT TAC ACT GAG | ACT ACT | GAT | GGA | TCA | GTT 144 |
Ala Glu Pro Val Met Gin | Leu Tyr Thr Glu | Thr Thr | Asp | Gly | Ser | Val |
35 | 40 | 45 | ||||
ATT GAA GAT AAG GAA ACA | TCA ATG GTC TGG | TCT TAC | GAG | GAT | GCG | GAT 192 |
Ile Glu Asp Lys Glu Thr | Ser Met Val Trp | Ser Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp |
50 | 55 | 60 | ||||
CCT GAT TTT GGA TCA TGT | CAG GCT AAG GAA | CTT CTT | GAT | CAC | CTA | GAA 240 |
Pro Asp Phe Gly Ser Cys | Gin Ala Lys Glu | Leu Leu | Asp | His | Leu | Glu |
65 70 | 75 | 80 | ||||
AGT GTA CTA GCT AAT GAA | CCG GTC ACT GTC | AGG AGT | GGA | CAG | AAT | ATA 288 |
Ser Val Leu Ala Asn Glu | Pro Val Thr Val | Arg Ser | Gly | Gin | Asn | Ile |
85 | 90 | 95 | c | |||
GTG GAA GTT AAG CCC CAG | GGT GTA TCC AAA | GGG CTT | GTT | GCC | AAG | CGC 336 |
Val Glu Val Lys Pro Gin | Gly Val Ser Lys | Gly Leu | Val | Ala | Lys | Arg |
100 | 105 | 110 | ||||
CTG CTT TCC GCA ATG CAA | GAG AAA GGA ATG | TCA CCA | GAT | TTT | GTC | CTT 384 |
Leu Leu Ser Ala Met Gin | Glu Lys Gly Met | Ser Pro | Asp | Phe | Val | Leu |
115 | 120 | 125 | ||||
TGC ATA GGA GAT GAC CGA | TCG GAT GAA GAC | ATG TTC | GAG | GTG | ATC | ATG 432 |
Cys Ile Gly Asp Asp Arg | Ser Asp Glu Asp | Met Phe | Glu | Val | Ile | Met |
130 | 135 | 140 | ||||
AGC TCG ATG TCT GGC CCG | TCC ATG GCT CCA | ACA GCT | GAA | GTC | TTT | GCC 480 |
Ser Ser Met Ser Gly Pro | Ser Met Ala Pro | Thr Ala | Glu | Val | Phe | Ala |
145 150 | 155 | 160 |
«· · · · ·· · • · <* · · · · • « «· ··· ♦ · * • · · · · « · » · · ·· ··
TGC ACC GTC GG .491
Cys Thr Val (2)Informace o SEQ ID N0:15:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 163 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:15:
Gly Leu 1 | Ser Ala Glu 5 | His | Gly Tyr | Phe | Leu Arg 10 | Thr | Ser | Gin | Asp 15 | Glu | |||||
Glu | Trp | Glu | Thr | Cys | Val | Pro | Pro | Val | Glu | Cys | Cys | Trp | Lys | Glu | Ile |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ala | Glu | Pro | Val | Met | Gin | Leu | Tyr | Thr | Glu | Thr | Thr | Asp | Gly | Ser | Val |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ile | Glu | Asp | Lys | Glu | Thr | Ser | Met | Val | Trp | Ser | Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Pro | Asp | Phe | Gly | Ser | Cys | Gin | Ala | Lys | Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Ser | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro | Val | Thr | Val | Arg | Ser | Gly | Gin | Asn | Ile |
8 5 | 90 | 95 | |||||||||||||
Val | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Gly | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Val | Ala | Lys | Arg |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Leu | Leu | Ser | Ala | Met | Gin | Glu | Lys | Gly | Met | Ser | Pro | Asp | Phe | Val | Leu |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Cys | Ile | Gly | Asp | Asp | Arg | Ser | Asp | Glu | Asp | Met | Phe | Glu | Val | Ile | Met |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ser | Ser | Met | Ser | Gly | Pro | Ser | Met | Ala | Pro | Thr | Ala | Glu | Val | Phe | Ala |
145 | 150 | 155 | 160 |
Cys Thr Val (2)Informace o SEQ ID NO:16:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 361 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární * · • · · · · ·
(ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii) Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:16:
TTTGATTATG | ATGGGACGCT | GCTGTCGGAG | GAGAGTGTGG | ACAAAACCCC | GAGTGAAGAT | 60 |
GACATCTCAA | TTCTGAATGG | TTTATGCAGT | GATCCAAAGA | ACGTAGTCTT | TATCGTGAGT | 120 |
GGCAGAGGAA | AGGATACACT | TAGCAAGTGG | TTCTCTCCGT | GTCCGAGACT | CGGCCTATCA | 180 |
GCAGAACATG | GATATTTCAC | TAGGTGGAGT | AAGGATTCCG | AGTGGGAATC | TCGTCCATAG‘ | 240 |
CTGCAGACCT | TGACTGGAAA | AAAATAGTGT | TGCCTATTAT | GGAGCGCTAC | ACAGAGCACA | 300 |
GATGGTTCGT | CGATAGAACA | GAAGGAAACC | TCGTGTTGGC | TCATCAAATG | CTGGCCCCGA | 360 |
A 361 (2)Informace o SEQ ID NO:17:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 118 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:17:
GGAAACCCAC AGGATGTAAG CAAAGTTTTA GTTTTTGAGA TCTCTTGGCA TCAAGCAAAG 60 TAGAGGGAAG TCACCCGATT CGTGCTGTGC GTAGGGATGA CAGATCGGAC GACTTAGA 118 φφ ·· (2)Informace ο SEQ ID NO:18:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 417 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA .{lid )Hypotetic.ký.: .Ne (iii) Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus·: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:18:
TTGTGGCCGA | TGTTCCACTA | CATGTTGCCG | TTCTCACCTG | ACCATGGAGG | CCGCTTTGAT | 60 |
CGCTCTATGT | GGGAAGCATA | TGTTTCTGCC | AACAAGTTGT | TTTCACAAAA | AGTAGTTGAG | 120 |
GTTCTTAATC | CTGAGGATGA | CTTTGTCTGG | ATTCATGATT | ATCATTTGAT | GGTGTTGCCA | 180 |
ACGTTCTTGA | GGAGGCGGTT | CAATCGTTTG | AGAATGGGGT | TTTTCCTTCA | CAGTCCATTC | 240 |
CTTCATCTGA | GATTTACAGG | ACACTTCCTG | TTAGAGAGGA | AATACTCAAG | GCTTTGCTCT | 300 |
GTGCTGACAT | TGTTGGATTC | CACACTTTTG | ACTACGCGAG | ACACTTCCTC | TCTTGTTGCA | 360 |
GTCGATTTTG | GGTAGAGTAC | AGTCTAAAAA | AAGTTATATT | GGGTTAAAAT | ACTATGG | 417 |
(2)Informace o SEQ ID NO:19:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 411 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List
(xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:19:
GGGTCATATT
GCAATTTGAA
GAACTTAAAG
GGCTGTGTTG
TACGGCTGAG
TGAGCCTATA
TATTGCAGGA
GATCCATGAA
GGGAAAACTG
CTTCTAGCTA
GTCCAAGATT
ACATCGGAAA
GTTTATATTG
TGTGTTGTGG
GAAATTGCAG
TGTTGTTAGG
TGGAACAGAT
GCAAATCCTA
GCTGTAAGAG
ATAGGCCCGT
TCACGCTGTG
CGAAAGAGTG
TGCCGATGAC
GCTCAAACAT
CGAGGGGTAA
AATCAATAAG
GTCAAGCAGT
AGCGATGGCA
ATGCTTTAAT
CTGGATATTT
CACCCCAAGT
AGGAGTAGAT
CAATTCGGCA
GAACGCATGG
TGAATCTGTT
GCGTAAAGCA
TCAAAGGTAT
GGCAAGGGCA
TTTGACGAAA
AGCCTGGATA
CATATTACAG
C
120
180
240
300
360
411 (2)Informace o SEQ ID NO:20:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 405 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:20:
TGGGGTGGTT
GCGAAAGATC
CAGGCACTTC
TACATAGGCC
TATGGGGCAG
GTGCAGCATT
TAAAGGCTCA
CCTGCATACG
TTACAGCTCT
CTCTCGTGTT
TCGATATTAT
CTTCAGCAAG
TAATCATCAG
TTTGAATTTA
CCGTTTCCTT
CTTGAATTCA
GCAGTCGGAT
GGCAGGACTG
TCTTGAGTCT
GGGGAGGACA
TTACCATGGA
CTTCTGAGAT
ATTTGATTGG
GTTAGGTATT
TAATATAAAA
TCCTGAAACG
TTGTTGCTGG
ACAACTCTAT
ATATAAAACT
GTTCCACACT
TCTTATGATC
ATTCTGCCAG
GAGGCAAAAT
GATTGATGAC
TGCAC
TTGCCTATTC
TTTGACTATG
AAAAAGGGGT
CGGGTATTCA
CTCGGAACTC
TGGACATATT
120
180
240
300
360
405 ,>·> * » «· ·» ·* ·· ♦ · · » » · ' « · · ♦ · · φ · · · ··« ··· • · · * * (2)Informace ο SEQ ID NO:21:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 427 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:21:
ATCATATGGG | GCAGCTTCAG | CAATCTTGAT | CTTCCTGAAA | CGGAGGCAAA | AGTCTTCGGA | 60 |
ACTCGGCAGC | AGTTTAATCA | TCAGGGGAGG | ACATTGTTGC | TGGGAGTTGA | TGACATGGAC | 120 |
ATATTTAAAG | GCATCAGTTT | GAAGTTATTA | GCAATGGAAC | AACTTCTATT | GCAGCACCCG | 180 |
GAGAAGCAGG | GGAAGGTTGT | TTTGGTGCAG | ATAGCCAATC | CTGCTAGAGG | CAAAGGAAAA | 240 |
GATGTCAAAG | AAGTGCAGGA | AGAAACTCAT | TGACGGTGAA | GCGAATTAAT | GAAGCATTTG | 300 |
GAAGACCTGG | GTACGAACCA | GTTATCTTGA | TTGATAAGCC | ACTAAAGTTT | TATGAAAGGA | 360 |
TTGCTTATTA | TGTTGTTGCA | GAGTGTTGCC | TAGTCACTGC | TGTCAGCGAT | GGCATGAACC | 420 |
TCGTCTC 427 (2)Informace o SEQ ID NO:22:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 315 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:22:
·♦ ·· ·· • 9 9 ·
9 9 9 9 · • « » · · · · · · 9 9 · ·
99 · · ·*
GATGTGGATG | CATGACTACC | AATCCAAGAG | GGGGTATATT | GGTCTTGACT | ATTATGGTAA | 60 |
ACTGTGACCA | TTAAAATCCT | TCCAGTTGGT | ATTCACATGG | GACAACTCCA | AAATGTTATG | 120 |
TCACTACAGA | CACGGGAAAG | AAAGCAAAGG | AGTTGAAAGA | AAAATATGAG | GGGAAAATTG | 180 |
TGATGTTAGG | TATTGATGAT | ATGGACATGT | TTAAAGGAAT | TGGTCTAAAG | TTTCTGGCAA | 240 |
TGGGGAGGCT | TCTAGATGAA | AACCCTGTCT | TGAGGGGTAA | AGTGGTATTG | GTTCAATCAC | 300 |
CAGGCCTGGA | AATTA | 315 |
(2)Informace o SEQ ID NO:23:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 352 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Nicotiana tabacum (B) Druh: Samsun NN (F)Typ pletiva: List (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:23:
AGAAGTAAAG | GGAGTGAGTC | CCCGAGGTTC | AAAAAGAGGT | CAACAGAATT | GCAGTGAAAT | 60 |
TAATAAAAAA | TATGGCAAAC | CGGGGTACAA | GCCGATTGTT | TGTATCAATG | GTCCAGTTTC | 120 |
GACACAAGAC | AAGATTGCAC | ATTATGCGGT | CTTGAGTGTG | TTGTTGTTAA | ť TGCTGTTAGA | 180 |
GATGGGATGA | ACTTGGTGCC | TTATGAGTAT | ACGGTCTTTA | GGCAGGGCAG | CGATAATTTG | 240 |
GATAAGGCCT | TGCAGCTAGA | TGGTCCTACT | GCTTCCAGAA | AGAGTGTGAT | TATTGTCTTG | 300 |
AATTCGTTGG | GTGCTCGCCA | TCTTTAGTGG | CGCCATCCGC | GTCAACCCCT | GG | 352 |
(2)Informace o SEQ ID NO:24:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 2640 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA
100 • · · • · * • · · · • · ·*·♦ ·
9· (iii)Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Helianthus annuus (F)Typ pletiva: List (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 171..2508 (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: nejisté (B) Umístění: nahrazeno (2141..2151, (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: nejisté (B) Umístění: nahrazeno (2237..2243, (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:24:
„ccatnnntta) „actnaaa)
GGATCCTGCG | GTTTCATCAC | ACAATATGAT | ACTGTTACAT | CTGATGCCCC | TTCAGATGTC | 60 |
CCAAATAGGT | TGATTGTCGT | ATCGAATCAG | TTACCCATAA | TCGCTAGGCT | AAGACTAACG | 120 |
ACAATGGAGG | GTCCTTTTGG | GATTTCACTT | GGGACGAGAG | TTCGATTTAC | ATG CAC Met His | 176 |
ATC Ile | AAA GAT GCA | TTA Leu | CCC Pro | GCA GCC GTT | GAG GTT TTC TAT GTT GGC GCA | 224 | ||||||||||
Lys | Asp Ala 5 | Ala | Ala 10 | Val | Glu Val | Phe | Tyr 15 | Val | Gly | Ala | ||||||
CTA | AGG | GCT | GAC | GTT | GGC | CCT | ACC | GAA | CAA | GAT | GAC | GTG | TCA | AAG | ACA | 272 |
Leu | Arg | Ala | Asp | Val | Gly | Pro | Thr | Glu | Gin | Asp | Asp | Val | Ser | Lys | Thr | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
TTG | CTC | GAT | AGG | TTT | AAT | TGC | GTT | GCG | GTT | TTT | GTC | CCT | ACT | TCA | AAA <· | 320 |
Leu | Leu | Asp | Arg | Phe | Asn | Cys | Val | Ala | Val | Phe | Val | Pro | Thr | Ser | Lys | |
35 | 40 | 45 | 50 | |||||||||||||
TGG | GAC | CAA | TAT | TAT | CAC | TGC | TTT | TGT | AAG | CAG | TAT | TTG | TGG | CCG | ATA | 368 |
Trp | Asp | Gin | Tyr | Tyr | His | Cys | Phe | Cys | Lys | Gin | Tyr | Leu | Trp | Pro | Ile | |
55 | 60 | 65 | ||||||||||||||
TTT | CAT | TAC | AAG | GTT | CCC | GCT | TCT | GAC | GTC | AAG | AGT | GTC | CCG | AAT | AGT | 416 |
Phe | His | Tyr | Lys | Val | Pro | Ala | Ser | Asp | Val | Lys | Ser | Val | Pro | Asn | Ser | |
70 | 75 | 80 | ||||||||||||||
CGG | GAT | TCA | TGG | AAC | GCT | TAT | GTT | CAC | GTG | AAC | AAA | GAG | TTT | TCC | CAG | 464 |
Arg | Asp | Ser | Trp | Asn | Ala | Tyr | Val | His | Val | Asn | Lys | Glu | Phe | Ser | Gin | |
85 | 90 | 95 |
101
4 • 4
444·
AAG Lys | GTG Val 100 | ATG Met | GAG GCA GTA | ACC AAT GCT Thr Asn Ala 105 | AGC Ser | AAT Asn | TAT Tyr 110 | GTA Val | TGG Trp | ATA Ile | CAT His | ' 512 | ||||
Glu | Ala | Val | ||||||||||||||
GAC | TAC | CAT | TTA | ATG | ACG | CTA | CCG | ACT | TTC | TTG | AGG | CGG | GAT | TTT | TGT | 560 |
Asp | Tyr | His | Leu | Met | Thr | Leu | Pro | Thr | Phe | Leu | Arg | Arg | Asp | Phe | Cys | |
115 | 120 | 125 | 130 | |||||||||||||
CGT | TTT | AAA | ATC | GGT | TTT | TTT | CTG | CAT | AGC | CCG | TTT | CCT | TCC | TCG | GAG | 608 |
Arg | Phe | Lys | Ile | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ser | Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | |
135 | 140 | 145 | ||||||||||||||
GTT | TAC | AAG | ACC | CTA | CCA | ATG | AGA | AAC | GAG | CTC | TTG | AAG | GGT | CTG | TTA | 656 |
Val | Tyr | Lys | Thr | Leu | Pro | Met | Arg | Asn | Glu | Leu | Leu | Lys | Gly | Leu | Leu | |
150 | 155 | 160 | ||||||||||||||
AAT | GCT | GAT | CTT | ATC | GGG | TTC | CAT | ACA | TAC | GAT | TAT | GCC | CGT | CAT | TTT | 704 |
Asn | Ala | Asp | Leu | Ile | Gly | Phe | His | Thr | Tyr | Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
CTA | ACG | TGT | TGT | AGT | CGA | ATG | TTT | GGT | TTG | GAT | CAT | CAG | TTG | AAA | AGG | 752 |
Leu | Thr | Cys | Cys | Ser | Arg | Met | Phe | Gly | Leu | Asp | His | Gin | Leu | Lys | Arg | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GGG | TAC | ATT | TTC | TTG | GAA | TAT | AAT | GGA | AGG | AGC | ATT | GAG | ATC | AAG | ATA | 800 |
Gly | Tyr | Ile | Phe | Leu | Glu | Tyr | Asn | Gly | Arg | Ser | Ile | Glu | Ile | Lys | Ile | |
195 | 200 | 205 | 210 | |||||||||||||
AAG | GCG | AGC | GGG | ATT | CAT | GTT | GGT | CGA | ATG | GAG | TCG | TAC | TTG | AGT | CAG | 848 |
Lys | Ala | Ser | Gly | Ile | His | Val | Gly | Arg | Met | Glu | Ser | Tyr | Leu | Ser | Gin | |
215 | 220 | 225 | ||||||||||||||
CCC | GAT | ACA | AGA | TTA | CAA | GTT | CAA | GAA | CTA | AAA | AAA | CGT | TTC | GAA | GGG | 896 |
Pro | Asp | Thr | Arg | Leu | Gin | Val | Gin | Glu | Leu | Lys | Lys | Arg | Phe | Glu | Gly | |
230 | 235 | 240 | ||||||||||||||
AAA | ATC | GTG | CTA | CTT | GGA | GTT | GAT | GAT | TTG | GAT | ATA | TTC | AAA | GGT | GTG | 944 |
Lys | Xle | Val | Leu | Leu | Gly | Val | Asp | Asp | Leu | Asp | Ile | Phe | Lys | Gly | Val | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
AAC | TTC | AAG | GTT | TTA | GCG | TTG | GAG | AAG | TTA | CTT | AAA | TCA | CAC | CCG | AGT | 992 |
Asn | Phe | Lys | Val | Leu | Ala | Leu | Glu | Lys | Leu | Leu | Lys | Ser | His | Pro | Ser | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
TGG | CAA | GGG | CGT | GTG | GTT | TTG | GTG | CAA | ATC | TTG | AAT | CCC | GCT | CGC | GCG | 1040 |
Trp | Gin | Gly | Arg | Val | Val | Leu | Val | Gin | Ile | Leu | Asn | Pro | Ala | Arg | Ala | |
275 | 280 | 285 | 290 | |||||||||||||
CGT | TGC | CAA | GAC | GTC | GAT | GAG | ATC | AAT | GCC | GAG | ATA | AGA | ACA | GTC | TGT | 1088 |
Arg | Cys | Gin | Asp | Val | Asp | Glu | Ile | Asn | Ala | Glu | Ile | Arg | Thr | Val | Cys | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
GAA | AGA | ATC | AAT | AAC | GAA | CTG | GGA | AGC | CCG | GGA | TAC | CAG | CCC | GTT | GTG | 1136 |
Glu | Arg | Ile | Asn | Asn | Glu | Leu | Gly | Ser | Pro | Gly | Tyr | Gin | Pro | Val | Val |
310 315 320
102 * · ·♦
• · • · | • • | • ·· · | • * ·· | • · | 9 9 | |||||||||||
TTA | ATT | GAT | GGG | CCC | GTT | TCG | TTA | AGT | GAA | AAA | GCT | GCT | TAT | TAT | f GCT | 1184 |
Leu | Ile | Asp | Gly | Pro | Val | Ser | Leu | Ser | Glu | Lys | Ala | Ala | Tyr | Tyr | Ala | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
ATC | GCC | GAT | ATG | GCA | ATT | GTT | ACA | CCG | TTA | CGT | GAC | GGC | ATG | AAT | CTT | 1232 |
Ile | Ala | Asp | Met | Ala | Ile | Val | Thr | Pro | Leu | Arg | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
ATC | CCG | TAC | GAG | TAC | GTC | GTT | TCC | CGA | CAA | AGT | GTT | AAT | GAC | CCA | AAT | 1280 |
Ile | Pro | Tyr | Glu | Tyr | Val | Val | Ser | Arg | Gin | Ser | Val | Asn | Asp | Pro | Asn | |
355 | 360 | 365 | 370 | |||||||||||||
CCC | AAT | ACT | CCA | AAA | AAG | AGC | ATG | CTA | GTG | GTC | TCC | GAG | TTC | ATC | GGG | 1328 |
Pro | Asn | Thr | Pro | Lys | Lys | Ser | Met | Leu | Val | Val | Ser | Glu | Phe | Ile | Gly | |
375 | 380 | 385 | ||||||||||||||
TGT | TCA | CTA | TCT | TTA | ACC | GGG | GCC | ATA | CGG | GTC | AAC | CCA | TGG | GAT | GAG | 1376 |
Cys | Ser | Leu | Ser | Leu | Thr | Gly | Ala | Ile | Arg | Val | Asn | Pro | Trp | Asp | Glu | |
390 | 395 | 400 | - | |||||||||||||
TTG | GAG | ACA | GCA | GAA | GCA | TTA | TAC | GAC | GCA | CTC | ATG | GCT | CCT | GAT | GAC | 1424 |
Leu | Glu | Thr | Ala | Glu | Ala | Leu | Tyr | Asp | Ala | Leu | Met | Ala | Pro | Asp | Asp | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
CAT | AAA | GAA | ACC | GCC | CAC | ATG | AAA | CAG | TAT | CAA | TAC | ATT | ATC | TCC | CAT | 1472 |
His | Lys | Glu | Thr | Ala | His | Met | Lys | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Ile | Ser | His | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GAT | GTA | GCT | AAC | TGG | GCT | CGT | AGC | TTC | TTT | CAA | GAT | TTA | GAG | CAA | GCG | 1520 |
Asp | Val | Ala | Asn | Trp | Ala | Arg | Ser | Phe | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu | Gin | Ala | |
435 | 440 | 445 | 450 | |||||||||||||
TGC | ATC | GAT | CAT | TCT | CGT | AAA | CGA | TGC | ATG | AAT | TTA | GGA | TTT | GGG | TTA | 1568 |
Cys | Ile | Asp | His | Ser | Arg | Lys | Arg | Cys | Met | Asn | Leu | Gly | Phe | Gly | Leu | |
455 | 460 | 465 | ||||||||||||||
GAT | ACT | AGA | GTC | GTT | CTT | TTT | GAT | GAG | AAG | TTT | AGC | AAG | TTG | GAT | ATA | 1616 |
Asp | Thr | Arg | Val | Val | Leu | Phe | Asp | Glu | Lys | Phe | Ser | Lys | Leu | Asp | Ile | |
470 | 475 | 480 | ||||||||||||||
GAT | GTC | TTG | GAG | AAT | GCT | TAT | TCC | ATG | GCT | CAA | AAT | CGG | GCC | ATA | CTT | 1664 |
Asp | Val | Leu | Glu | Asn | Ala | Tyr | Ser | Met | Ala | Gin | Asn | Arg | Ala | Ile | Leu | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
TTG | GAC | TAT | GAC | GGC | ACT | GTT | ACT | CCA | TCT | ATC | AGT | AAA | TCT | CCA | ACT | 1712 |
Leu | Asp | Tyr | Asp | Gly | Thr | Val | Thr | Pro | Ser | Ile | Ser | Lys | Ser | Pro | Thr | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
GAA | GCT | GTT | ATC | TCC | ATG | ATC | AAC | AAA | CTG | TGC | AAT | GAT | CCA | AAG | AAC | 1760 |
Glu | Ala | Val | Ile | Ser | Met | Ile | Asn | Lys | Leu | Cys | Asn | Asp | Pro | Lys | Asn | |
515 | 520 | 525 | 530 | |||||||||||||
ATG | GTG | TTC | ATC | GTT | AGT | GGA | CGC | AGT | AGA | GAA | AAT | CTT | GGC | AGT | TGG | 1808 |
Met | Val | Phe | Ile | Val | Ser | Gly | Arg | Ser | Arg | Glu | Asn | Leu | Gly | Ser | Trp | |
535 | 540 | 545 |
103 ·* ·· * · <
1856 • · • · · •···· ·
TTC Phe | GGC Gly | GCG TGT GAG AAA CCC | GCC Ala | ATT Ile 555 | GCA GCT GAG CAC GGA TAC | TTT Phe | |||||||||
Ala | Cys 550 | Glu | Lys | Pro | Ala | Ala | Glu | His | Gly 560 | Tyr | |||||
ΑΤΑ | AGG | TGG | GCG | GGT | GAT | CAA | GAA | TGG | GAA | ACG | TGC | GCA | CGT | GAG | AAT |
Ile | Arg | Trp | Ala | Gly | Asp | Gin | Glu | Trp | Glu | Thr | Cys | Ala | Arg | Glu | Asn |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
AAT | GTC | GGG | TGG | ATG | GAA | ATG | GCT | GAG | CCG | GTT | ATG | AAT | CTT | TAT | ACA |
Asn | Val | Gly | Trp | Met | Glu | Met | Ala | Glu | Pro | Val | Met | Asn | Leu | Tyr | Thr |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
GAA | ACT | ACT | GAC | GGT | TCG | TAT | ATT | GAA | AAG | AAA | GAA | ACT | GCA | ATG | GTT |
Glu | Thr | Thr | Asp | Gly | Ser | Tyr | Ile | Glu | Lys | Lys | Glu | Thr | Ala | Met | Val |
595 | 600 | 605 | 610 | ||||||||||||
TGG | CAC | TAT | GAA | GAT | GCT | GAT | AAA | GAT | CTT | GGG | TTG | GAG | CAG | GCT | AAG |
Trp | His | Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp | Lys | Asp | Leu | Gly | Leu | Glu | Gin | Ala | Lys |
615 | 620 | 625 | |||||||||||||
GAA | CTG | TTG | GAC | CAT | CTT | GAA | AAC | GTG | CTC | GCT | AAT | GAG | CCC | GTT | GAA |
Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu | Asn | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro | Val | Glu |
630 | 635 | 640 | |||||||||||||
GTG | AAA | CGA | GGT | CAA | TAC | ATT | GTA | GAA | GTT | AAA | CCA | CAG | GTA | CCC | CAT |
Val | Lys | Arg | Gly | Gin | Tyr | Ile | Val | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Val | Pro | His |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
GGG | TTA | CCT | TCT | TGT | TAT | GAC | ATT | CAT | AGG | CAC | AGA | TTT | GTA | GAA | TCT |
Gly | Leu | Pro | Ser | Cys | Tyr | Asp | Ile | His | Arg | His | Arg | Phe | Val | Glu | Ser |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
TTT | AAC | TTA | AAT | TTC | TTT | AAA | TAT | GAA | TGC | AAT | TAT | AGG | GGG | TCA | CTG |
Phe | Asn | Leu | Asn | Phe | Phe | Lys | Tyr | Glu | Cys | Asn | Tyr | Arg | Gly | Ser | Leu |
675 | 680 | 685 | 690 | ||||||||||||
AAA | GGT | ATA | GTT | GCA | GAG | AAG | ATT | TTT | GCG | TTC | ATG | GCT | GAA | AAG | GGA |
Lys | Gly | Ile | Val | Ala | Glu | Lys | Ile | Phe | Ala | Phe | Met | Ala | Glu | Lys | Gly |
695 | 700 | 705 | |||||||||||||
AAA | CAG | GCT | GAT | TTC | GTG | TTG | AGC | GTT | GGA | GAT | GAT | AGA | AGT | GAT | GAA |
Lys | Gin | Ala | Asp | Phe | Val | Leu | Ser | Val | Gly | Asp | Asp | Arg | Ser | Asp | Glu |
710 | 715 | 720 | |||||||||||||
GAC | ATG | TTT | GTG | GCC | ATT | GGG | GAT | GGA | ATA | AAA | AAG | GGT | CGG | ATA | ACT |
Asp | Met | Phe | Val | Ala | Ile | Gly | Asp | Gly | Ile | Lys | Lys | Gly | Arg | Ile | Thr |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
AAC | AAC | AAT | TCA | GTG | TTT | ACA | TGC | GTA | GTG | GGA | GAG | AAA | CCG | AGT | GCA |
Asn | Asn | Asn | Ser | Val | Phe | Thr | Cys | Val | Val | Gly | Glu | Lys | Pro | Ser | Ala |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
GCT | GAG | TAC | TTT | TTA | GAC | GAG | ACG | AAA | GAT | GTT | TCA | ATG | ATG | CTC | GAG |
Ala | Glu | Tyr | Phe | Leu | Asp | Glu | Thr | Lys | Asp | Val | Ser | Met | Met | Leu | Glu |
755
765
770
1904
1952
2000
2048
2096
2144
2192
2240
2288
2336
2384
2432
2480
760
104 ··
9
9 • 9
99 ·
9«9 99
AAG CTC GGG TGT CTC AGC AAC CAA GGA T GATGATCCGG AAGCTTCTCG 2528
Lys Leu Gly Cys Leu Ser Asn Gin Gly
775
TGATCTTTAT GAGTTAAAAG TTTTCGACTT TTTCTTCATC AAGATTCATG GGAAAGTTGT 2588
TCAATATGAA CTTGTGTTTC TTGGTTCTGG ATTTTAGGGA GTCTATGGAT CC 2640 (2)Informace o SEQ ID NO:25:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 779 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii)Typ molekuly: protein
Popis sekvence: | SEQ | ID NO:25 | J | ||||||||||||
Met | His | Ile | Lys | Asp | Ala | Leu | Pro | Ala | Ala | Val | Glu | Val | Phe | Tyr | Val |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Gly | Ala | Leu | Arg | Ala | Asp | Val | Gly | Pro | Thr | Glu | Gin | Asp | Asp | Val | Ser |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Thr | Leu | Leu | Asp | Arg | Phe | Asn | Cys | Val | Ala | Val | Phe | Val | Pro | Thr |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ser | Lys | Trp | Asp | Gin | Tyr | Tyr | His | Cys | Phe | Cys | Lys | Gin | Tyr | Leu | Trp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Pro | Ile | Phe | His | Tyr | Lys | Val | Pro | Ala | Ser | Asp | Val | Lys | Ser | Val | Pro |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asn | Ser | Arg | Asp | Ser | Trp | Asn | Ala | Tyr | Val | His | Val | Asn | Lys | Glu | Phe |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Ser | Gin | Lys | Val | Met | Glu | Ala | Val | Thr | Asn | Ala | Ser | Asn | Tyr | Val | Trp |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ile | His | Asp | Tyr | His | Leu | Met | Thr | Leu | Pro | Thr | Phe | Leu | Arg | Arg | Asp |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Phe | Cys | Arg | Phe | Lys | Ile | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ser | Pro | Phe | Pro | Ser |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ser | Glu | Val | Tyr | Lys | Thr | Leu | Pro | Met | Arg | Asn | Glu | Leu | Leu | Lys | Gly |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Leu | Leu | Asn | Ala | Asp | Leu | Ile | Gly | Phe | His | Thr | Tyr | Asp | Tyr | Ala | Arg |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
His | Phe | Leu | Thr | Cys | Cys | Ser | Arg | Met | Phe | Gly | Leu | Asp | His | Gin | Leu |
180 | 185 | 190 |
105 «· « · • · ·· • · · • · · · • · ···* · • · · ·· ·
Lys | Arg | Gly Tyr 195 | Ile | Phe | Leu | Glu 200 | Tyr | Asn | Gly | Arg | Ser 205 | Ile | Glu | Ile |
Lys | Ile | Lys Ala | Ser | Gly | Ile | His | Val | Gly | Arg | Met | Glu | Ser | Tyr | Leu |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||
Ser | Gin | Pro Asp | Thr | Arg | Leu | Gin | Val | Gin | Glu | Leu | Lys | Lys | Arg | Phe |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||
Glu | Gly | Lys Ile | Val | Leu | Leu | Gly | Val | Asp | Asp | Leu | Asp | Ile | Phe | Lys |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||
Gly | Val | Asn Phe | Lys | Val | Leu | Ala | Leu | Glu | Lys | Leu | Leu | Lys | Ser | His |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||
Pro | Ser | Trp Gin | Gly | Arg | Val | Val | Leu | Val | Gin | Ile | Leu | Asn | Pro | Ala |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||
Arg | Ala | Arg Cys | Gin | Asp | Val | Asp | Glu | Ile | Asn | Ala | Glu | Ile | Arg | Thr |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||
Val | Cys | Glu Arg | Ile | Asn | Asn | Glu | Leu | Gly | Ser | Pro | Gly | Tyr | Gin | Pro |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||
Val | Val | Leu Ile | Asp | Gly | Pro | Val | Ser | Leu | Ser | Glu | Lys | Ala | Ala | Tyr |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||
Tyr | Ala | Ile Ala | Asp | Met | Ala | Ile | Val | Thr | Pro | Leu | Arg | Asp | Gly | Met |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||
Asn | Leu | Ile Pro | Tyr | Glu | Tyr | Val | Val | Ser | Arg | Gin | Ser | Val | Asn | Asp |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||
Pro | Asn | Pro Asn | Thr | Pro | Lys | Lys | Ser | Met | Leu | Val | Val | Ser | Glu | Phe |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||
Ile | Gly | Cys Ser | Leu | Ser | Leu | Thr | Gly | Ala | Ile | Arg | Val | Asn | Pro | Trp |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||
Asp | Glu | Leu Glu | Thr | Ala | Glu | Ala | Leu | Tyr | Asp | Ala | Leu | Met | Ala | Pro |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||
Asp | Asp | His Lys | Glu | Thr | Ala | His | Met | Lys | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Ile |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||
Ser | His | Asp Val | Ala | Asn | Trp | Ala | Arg | Ser | Phe | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||
Gin | Ala | Cys Ile | Asp | His | Ser | Arg | Lys | Arg | Cys | Met | Asn | Leu | Gly | Phe |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||
Gly | Leu | Asp Thr | Arg | Val | Val | Leu | Phe | Asp | Glu | Lys | Phe | Ser | Lys | Leu |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||
Asp | Ile | Asp Val | Leu | Glu | Asn | Ala | Tyr | Ser | Met | Ala | Gin | Asn | Arg | Ala |
485 490 495
106 ·· • · · · • 9999 · • 9 • 99 ·· • 9 ·· Λ
9 9 ·
9 9 ·
999 999
Ile | Leu | Leu | Asp Tyr Asp Gly Thr Val Thr | Pro | Ser | Ile | Ser 510 | Lys | Ser | ||||||
500 | 505 | ||||||||||||||
Pro | Thr | Glu | Ala | Val | Ile | Ser | Met | Ile | Asn | Lys | Leu | Cys | Asn | Asp | Pro |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Lys | Asn | Met | Val | Phe | Ile | Val | Ser | Gly | Arg | Ser | Arg | Glu | Asn | Leu | Gly |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Ser | Trp | Phe | Gly | Ala | Cys | Glu | Lys | Pro | Ala | Ile | Ala | Ala | Glu | His | Gly |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Tyr | Phe | Ile | Arg | Trp | Ala | Gly | Asp | Gin | Glu | Trp | Glu | Thr | Cys | Ala | Arg |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Glu | Asn | Asn | Val | Gly | Trp | Met | Glu | Met | Ala | Glu | Pro | Val | Met | Asn | Leu |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Tyr | Thr | Glu | Thr | Thr | Asp | Gly | Ser | Tyr | Ile | Glu | Lys | Lys | Glu | Thr | Ala |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Met | Val | Trp | His | Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp | Lys | Asp | Leu | Gly | Leu | Glu | Gin |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Ala | Lys | Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu | Asn | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Val | Glu | Val | Lys | Arg | Gly | Gin | Tyr | Ile | Val | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Val |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Pro | His | Gly | Leu | Pro | Ser | Cys | Tyr | Asp | Ile | His | Arg | His | Arg | Phe | Val |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Glu | Ser | Phe | Asn | Leu | Asn | Phe | Phe | Lys | Tyr | Glu | Cys | Asn | Tyr | Arg | Gly |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Ser | Leu | Lys | Gly | Ile | Val | Ala | Glu | Lys | Ile | Phe | Ala | Phe | Met | Ala | Glu |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Lys | Gly | Lys | Gin | Ala | Asp | Phe | Val | Leu | Ser | Val | Gly | Asp | Asp | Arg | Ser |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Asp | Glu | Asp | Met | Phe | Val | Ala | Ile | Gly | Asp | Gly | Ile | Lys | Lys | Gly | Arg |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Ile | Thr | Asn | Asn | Asn | Ser | Val | Phe | Thr | Cys | Val | Val | Gly | Glu | Lys | Pro |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Ser | Ala | Ala | Glu | Tyr | Phe | Leu | Asp | Glu | Thr | Lys | Asp | Val | Ser | Met | Met |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Leu | Glu | Lys | Leu | Gly | Cys | Leu | Ser | Asn | Gin | Gly |
770 775
107
(2)Informace o SEQ ID NO:26:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 2130 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Helianthus annuus (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 171..2130 (D)Další informace:/částečná (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:26:
GGATCCTGCG | GTTTCATCAC | ACAATATGAT | ACTGTTACAT | CTGATGCCCC | TTCAGATGTC | 60 |
CCAAATAGGT | TGATTGTCGT | ATCGAATCAG | TTACCCATAA | TCGCTAGGCT | AAGACTAACG | 120 |
ACAATGGAGG | GTCCTTTTGG | GATTTCACTT | GGGACGAGAG | TTCGATTTAC | ATG CAC | 176 |
Met His 1
ATC Ile | AAA Lys | GAT Asp 5 | GCA Ala | TTA Leu | CCC Pro | GCA GCC GTT | GAG GTT TTC TAT GTT GGC GCA | 224 | ||||||||
Ala | Ala 10 | Val | Glu Val | Phe | Tyr 15 | Val | Gly | Ala | ||||||||
CTA | AGG | GCT | GAC | GTT | GGC | CCT | ACC | GAA | CAA | GAT | GAC | GTG | TCA | AAG | ACA | 272 |
Leu | Arg | Ala | Asp | Val | Gly | Pro | Thr | Glu | Gin | Asp | Asp | Val | Ser | Lys | Thr | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
TTG | CTC | GAT | AGG | TTT | AAT | TGC | GTT | GCG | GTT | TTT | GTC | CCT | ACT | TCA | AAA | 320 |
Leu | Leu | Asp | Arg | Phe | Asn | Cys | Val | Ala | Val | Phe | Val | Pro | Thr | Ser | Lys | |
35 | 40 | 45 | 50 | |||||||||||||
TGG | GAC | CAA | TAT | TAT | CAC | TGC | TTT | TGT | AAG | CAG | TAT | TTG | TGG | CCG | ATA | 368 |
Trp | Asp | Gin | Tyr | Tyr | His | Cys | Phe | Cys | Lys | Gin | Tyr | Leu | Trp | Pro | Ile | |
55 | 60 | 65 | ||||||||||||||
TTT | CAT | TAC | AAG | GTT | CCC | GCT | TCT | GAC | GTC | AAG | AGT | GTC | CCG | AAT | AGT | 416 |
Phe | His | Tyr | Lys | Val | Pro | Ala | Ser | Asp | Val | Lys | Ser | Val | Pro | Asn | Ser | |
70 | 75 | 80 | ||||||||||||||
CGG | GAT | TCA | TGG | AAC | GCT | TAT | GTT | CAC | GTG | AAC | AAA | GAG | TTT | TCC | CAG | 464 |
Arg | Asp | Ser | Trp | Asn | Ala | Tyr | Val | His | Val | Asn | Lys | Glu | Phe | Ser | Gin | |
85 | 90 | 95 |
108
• · ·· | • • | • • · · | • · • · | ·· ·· | ||||||||||||
AAG | GTG | ATG | GAG | GCA | GTA | ACC | AAT | GCT | AGC | AAT | TAT | GTA | TGG | ATA | CAT | 512 |
Lys | Val | Met | Glu | Ala | Val | Thr | Asn | Ala | Ser | Asn | Tyr | Val | Trp | Ile | His | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
GAC | TAC | CAT | TTA | ATG | ACG | CTA | CCG | ACT | TTC | TTG | AGG | CGG | GAT | TTT | TGT | 560 |
Asp | Tyr | His | Leu | Met | Thr | Leu | Pro | Thr | Phe | Leu | Arg | Arg | Asp | Phe | Cys | |
115 | 120 | 125 | 130 | |||||||||||||
CGT | TTT | AAA | ATC | GGT | TTT | TTT | CTG | CAT | AGC | CCG | TTT | CCT | TCC | TCG | GAG | 608 |
Arg | Phe | Lys | Ile | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Ser | Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | |
135 | 140 | 145 | ||||||||||||||
GTT | TAC | AAG | ACC | CTA | CCA | ATG | AGA | AAC | GAG | CTC | TTG | AAG | GGT | CTG | TTA | 656 |
Val | Tyr | Lys | Thr | Leu | Pro | Met | Arg | Asn | Glu | Leu | Leu | Lys | Gly | Leu | Leu | |
150 | 155 | 160 | ||||||||||||||
AAT | GCT | GAT | CTT | ATC | GGG | TTC | CAT | ACA | TAC | GAT | TAT | GCC | CGT | CAT | TTT | 704 |
Asn | Ala | Asp | Leu | Ile | Gly | Phe | His | Thr | Tyr | Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | |
165 | 170 | 175 | - | |||||||||||||
CTA | ACG | TGT | TGT | AGT | CGA | ATG | TTT | GGT | TTG | GAT | CAT | CAG | TTG | AAA | AGG | 752 |
Leu | Thr | Cys | Cys | Ser | Arg | Met | Phe | Gly | Leu | Asp | His | Gin | Leu | Lys | Arg | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GGG | TAC | ATT | TTC | TTG | GAA | TAT | AAT | GGA | AGG | AGC | ATT | GAG | ATC | AAG | ATA | 800 |
Gly | Tyr | Ile | Phe | Leu | Glu | Tyr | Asn | Gly | Arg | Ser | Ile | Glu | Ile | Lys | Ile | |
195 | 200 | 205 | 210 | |||||||||||||
AAG | GCG | AGC | GGG | ATT | CAT | GTT | GGT | CGA | ATG | GAG | TCG | TAC | TTG | AGT | CAG | 848 |
Lys | Ala | Ser | Gly | Ile | His | Val | Gly | Arg | Met | Glu | Ser | Tyr | Leu | Ser | Gin | |
215 | 220 | 225 | ||||||||||||||
CCC | GAT | ACA | AGA | TTA | CAA | GTT | CAA | GAA | CTA | AAA | AAA | CGT | TTC | GAA | GGG | 896 |
Pro | Asp | Thr | Arg | Leu | Gin | Val | Gin | Glu | Leu | Lys | Lys | Arg | Phe | Glu | Gly | |
230 | 235 | 240 | ||||||||||||||
AAA | ATC | GTG | CTA | CTT | GGA | GTT | GAT | GAT | TTG | GAT | ATA | TTC | AAA | GGT | GTG | 944 |
Lys | Ile | Val | Leu | Leu | Gly | Val | Asp | Asp | Leu | Asp | Ile | Phe | Lys | Gly | Val | |
245 | 250 | 255 | - | |||||||||||||
AAC | TTC | AAG | GTT | TTA | GCG | TTG | GAG | AAG | TTA | CTT | AAA | TCA | CAC | CCG | AGT | 992 |
Asn | Phe | Lys | Val | Leu | Ala | Leu | Glu | Lys | Leu | Leu | Lys | Ser | His | Pro | Ser | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
TGG | CAA | GGG | CGT | GTG | GTT | TTG | GTG | CAA | ATC | TTG | AAT | CCC | GCT | CGC | GCG | 1040 |
Trp | Gin | Gly | Arg | Val | Val | Leu | Val | Gin | Ile | Leu | Asn | Pro | Ala | Arg | Ala | |
275 | 280 | 285 | 290 | |||||||||||||
CGT | TGC | CAA | GAC | GTC | GAT | GAG | ATC | AAT | GCC | GAG | ATA | AGA | ACA | GTC | TGT | 1088 |
Arg | Cys | Gin | Asp | Val | Asp | Glu | Ile | Asn | Ala | Glu | Ile | Arg | Thr | Val | Cys | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
GAA | AGA | ATC | AAT | AAC | GAA | CTG | GGA | AGC | CCG | GGA | TAC | CAG | CCC | GTT | GTG | 1136 |
Glu | Arg | Ile | Asn | Asn | Glu | Leu | Gly | Ser | Pro | Gly | Tyr | Gin | Pro | Val | Val | |
310 | 315 | 320 |
109
TTA ATT GAT GGG | CCC GTT | TCG Ser | TTA Leu 330 | AGT Ser | GAA Glu | AAA Lys | GCT Ala | GCT Ala 335 | TAT Tyr | TAT Tyr | GCT Ala | 1184 | ||||
Leu | Ile | Asp 325 | Gly | Pro | Val | |||||||||||
ATC | GCC | GAT | ATG | GCA | ATT | GTT | ACA | CCG | TTA | CGT | GAC | GGC | ATG | AAT | CTT | 1232 |
Ile | Ala | Asp | Met | Ala | Ile | Val | Thr | Pro | Leu | Arg | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
ATC | CCG | TAC | GAG | TAC | GTC | GTT | TCC | CGA | CAA | AGT | GTT | AAT | GAC | CCA | AAT | 1280 |
Ile | Pro | Tyr | Glu | Tyr | Val | Val | Ser | Arg | Gin | Ser | Val | Asn | Asp | Pro | Asn | |
355 | 360 | 365 | 370 | |||||||||||||
CCC | AAT | ACT | CCA | AAA | AAG | AGC | ATG | CTA | GTG | GTC | TCC | GAG | TTC | ATC | GGG | 1328 |
Pro | Asn | Thr | Pro | Lys | Lys | Ser | Met | Leu | Val | Val | Ser | Glu | Phe | Ile | Gly | |
375 | 380 | 385 | ||||||||||||||
TGT | TCA | CTA | TCT | TTA | ACC | GGG | GCC | ATA | CGG | GTC | AAC | CCA | TGG | GAT | GAG | 1376 |
Cys | Ser | Leu | Ser | Leu | Thr | Gly | Ala | Ile | Arg | Val | Asn | Pro | Trp | Asp | Glu | |
390 | 395 | 400 | ||||||||||||||
TTG | GAG | ACA | GCA | GAA | GCA | TTA | TAC | GAC | GCA | CTC | ATG | GCT | CCT | GAT | GAC | 1424 |
Leu | Glu | Thr | Ala | Glu | Ala | Leu | Tyr | Asp | Ala | Leu | Met | Ala | Pro | Asp | Asp | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
CAT | AAA | GAA | ACC | GCC | CAC | ATG | AAA | CAG | TAT | CAA | TAC | ATT | ATC | TCC | CAT | 1472 |
His | Lys | Glu | Thr | Ala | His | Met | Lys | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Ile | Ser | His | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GAT | GTA | GCT | AAC | TGG | GCT | CGT | AGC | TTC | TTT | CAA | GAT | TTA | GAG | CAA | GCG | 1520 |
Asp | Val | Ala | Asn | Trp | Ala | Arg | Ser | Phe | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu | Gin | Ala | |
435 | 440 | 445 | 450 | |||||||||||||
TGC | ATC | GAT | CAT | TCT | CGT | AAA | CGA | TGC | ATG | AAT | TTA | GGA | TTT | GGG | TTA | 1568 |
Cys | Ile | Asp | His | Ser | Arg | Lys | Arg | Cys | Met | Asn | Leu | Gly | Phe | Gly | Leu | |
455 | 460 | 465 | ||||||||||||||
GAT | ACT | AGA | GTC | GTT | CTT | TTT | GAT | GAG | AAG | TTT | AGC | AAG | TTG | GAT | ATA | 1616 |
Asp | Thr | Arg | Val | Val | Leu | Phe | Asp | Glu | Lys | Phe | Ser | Lys | Leu | Asp | Ile | |
470 | 475 | 480 | ||||||||||||||
GAT | GTC | TTG | GAG | AAT | GCT | TAT | TCC | ATG | GCT | CAA | AAT | CGG | GCC | ATA | CTT | 1664 |
Asp | Val | Leu | Glu | Asn | Ala | Tyr | Ser | Met | Ala | Gin | Asn | Arg | Ala | Ile | Leu | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
TTG | GAC | TAT | GAC | GGC | ACT | GTT | ACT | CCA | TCT | ATC | AGT | AAA | TCT | CCA | ACT | 1712 |
Leu | Asp | Tyr | Asp | Gly | Thr | Val | Thr | Pro | Ser | Ile | Ser | Lys | Ser | Pro | Thr | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
GAA | GCT | GTT | ATC | TCC | ATG | ATC | AAC | AAA | CTG | TGC | AAT | GAT | CCA | AAG | AAC | 1760 |
Glu | Ala | Val | Ile | Ser | Met | Ile | Asn | Lys | Leu | Cys | Asn | Asp | Pro | Lys | Asn | |
515 | 520 | 525 | 530 | |||||||||||||
ATG | GTG | TTC | ATC | GTT | AGT | GGA | CGC | AGT | AGA | GAA | AAT | CTT | GGC | AGT | TGG | 1808 |
Met | Val | Phe | Ile | Val | Ser | Gly | Arg | Ser | Arg | Glu | Asn | Leu | Gly | Ser | Trp |
535 540 545
110
TTC Phe | GGC Gly | GCG Ala | TGT Cys 550 | GAG Glu | AAA Lys | CCC Pro | GCC Ala | ATT GCA | GCT GAG Ala Glu | CAC His | GGA Gly 560 | TAC Tyr | TTT Phe | 1856 | ||
Ile 555 | Ala | |||||||||||||||
ATA | AGG | TGG | GCG | GGT | GAT | CAA | GAA | TGG | GAA | ACG | TGC | GCA | CGT | GAG | AAT | 1904 |
Ile | Arg | Trp | Ala | Gly | Asp | Gin | Glu | Trp | Glu | Thr | Cys | Ala | Arg | Glu | Asn | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
AAT | GTC | GGG | TGG | ATG | GAA | ATG | GCT | GAG | CCG | GTT | ATG | AAT | CTT | TAT | ACA | 1952 |
Asn | Val | Gly | Trp | Met | Glu | Met | Ala | Glu | Pro | Val | Met | Asn | Leu | Tyr | Thr | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
GAA | ACT | ACT | GAC | GGT | TCG | TAT | ATT | GAA | AAG | AAA | GAA | ACT | GCA | ATG | GTT | 2000 |
Glu | Thr | Thr | Asp | Gly | Ser | Tyr | Ile | Glu | Lys | Lys | Glu | Thr | Ala | Met | Val | |
595 | 600 | 605 | 610 | |||||||||||||
TGG | CAC | TAT | GAA | GAT | GCT | GAT | AAA | GAT | CTT | GGG | TTG | GAG | CAG | GCT | AAG | 2048 |
Trp | His | Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp | Lys | Asp | Leu | Gly | Leu | Glu | Gin | Ala | Lys | |
615 | 620 | 625 | ||||||||||||||
GAA | CTG | TTG | GAC | CAT | CTT | GAA | AAC | GTG | CTC | GCT | AAT | GAG | CCC | GTT | GAA | 2096 |
Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu | Asn | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro | Val | Glu | |
630 | 635 | 640 | ||||||||||||||
GTG | AAA | CGA | GGT | CAA | TAC | ATT | GTA | GAA | GTT | AAA | C | 2130 | ||||
Val | Lys | Arg | Gly | Gin | Tyr | Ile | Val | Glu | Val | Lys |
645 650 (2)Informace o SEQ ID NO:27:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 653 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:27:
Met 1 | His | Ile | Lys | Asp 5 | Ala Leu | Pro Ala Ala Val Glu 10 | Val | Phe | Tyr 15 | Val | |||||
Gly | Ala | Leu | Arg | Ala | Asp | Val | Gly | Pro | Thr | Glu | Gin | Asp | Asp | Val | Ser |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Lys | Thr | Leu | Leu | Asp | Arg | Phe | Asn | Cys | Val | Ala | Val | Phe | Val | Pro | Thr |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ser | Lys | Trp | Asp | Gin | Tyr | Tyr | His | Cys | Phe | Cys | Lys | Gin | Tyr | Leu | Trp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Pro | Ile | Phe | His | Tyr | Lys | Val | Pro | Ala | Ser | Asp | Val | Lys | Ser | Val | Pro |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asn | Ser | Arg | Asp | Ser | Trp | Asn | Ala | Tyr | Val | His | Val | Asn | Lys | Glu | Phe |
85 | 90 | 95 |
111 • · frfr > frfr · » · · · • frfr · · » •
• fr ··
Ser Gin Lys Val Met Glu 100
Ile His Asp Tyr His Leu 115
Phe Cys Arg Phe Lys Ile 130
Ser Glu Val Tyr Lys Thr 145 150
Leu Leu Asn Ala Asp Leu 165
His Phe Leu Thr Cys Cys 180
Lys Arg Gly Tyr Ile Phe 195
Lys Ile Lys Ala Ser Gly 210
Ser Gin Pro Asp Thr Arg 225 230
Glu Gly Lys Ile Val Leu 245
Gly Val Asn Phe Lys Val 260
Pro Ser Trp Gin Gly Arg 275
Arg Ala Arg Cys Gin Asp 290
Val Cys Glu Arg Ile Asn 305 310
Val Val Leu Ile Asp Gly 325
Tyr Ala Ile Ala Asp Met 340
Asn Leu Ile Pro Tyr Glu 355
Pro Asn Pro Asn Thr Pro
370
Ile Gly Cys Ser Leu Ser
385 390
Ala Val Thr Asn Ala Ser Asn 105
Met Thr Leu Pro Thr Phe Leu 120 125
Gly Phe Phe Leu His Ser Pro 135 140
Leu Pro Met Arg Asn Glu Leu 155
Ile Gly Phe His Thr Tyr Asp 170
Ser Arg Met Phe Gly Leu Asp 185
Leu Glu Tyr Asn Gly Arg Ser 200 205
Ile His Val Gly Arg Met Glu 215 220
Leu Gin Val Gin Glu Leu Lys 235
Leu Gly Val Asp Asp Leu Asp 250
Leu Ala Leu Glu Lys Leu Leu 265
Val Val Leu Val Gin Ile Leu 280 285
Val Asp Glu Ile Asn Ala Glu 295 300
Asn Glu Leu Gly Ser Pro Gly 315
Pro Val Ser Leu Ser Glu Lys 330
Ala Ile Val Thr Pro Leu Arg 345
Tyr Val Val Ser Arg Gin Ser 360 365
Lys Lys Ser Met Leu Val Val
375 380
Leu Thr Gly Ala Ile Arg Val 395
Tyr Val Trp 110
Arg Arg Asp
Phe Pro Ser
Leu Lys Gly 160
Tyr Ala Arg 175
His Gin Leu 190
Ile Glu Ile
Ser Tyr Leu
Lys Arg Phe 240
Ile Phe Lys 255
Lys Ser His 270
Asn Pro Ala
Ile Arg Thr
Tyr Gin Pro 320
Ala Ala Tyr 335
Asp Gly Met 350
Val Asn Asp
Ser Glu Phe
Asn Pro Trp 400
112 ·» • · · ··
Asp Glu | Leu | Glu | Thr Ala Glu Ala 405 | Leu | Tyr 410 | Asp | Ala | Leu | Met | Ala 415 | Pro | ||||
Asp | Asp | His | Lys | Glu | Thr | Ala | His | Met | Lys | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Ile |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ser | His | Asp | Val | Ala | Asn | Trp | Ala | Arg | Ser | Phe | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Gin | Ala | Cys | Ile | Asp | His | Ser | Arg | Lys | Arg | Cys | Met | Asn | Leu | Gly | Phe |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Gly | Leu | Asp | Thr | Arg | Val | Val | Leu | Phe | Asp | Glu | Lys | Phe | Ser | Lys | Leu |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Asp | Ile | Asp | Val | Leu | Glu | Asn | Ala | Tyr | Ser | Met | Ala | Gin | Asn | Arg | Ala |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Ile | Leu | Leu | Asp | Tyr | Asp | Gly | Thr | Val | Thr | Pro | Ser | Ile | Ser | Lys | Ser |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Pro | Thr | Glu | Ala | Val | Ile | Ser | Met | Ile | Asn | Lys | Leu | Cys | Asn | Asp | Pro |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Lys | Asn | Met | Val | Phe | Ile | Val | Ser | Gly | Arg | Ser | Arg | Glu | Asn | Leu | Gly |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Ser | Trp | Phe | Gly | Ala | Cys | Glu | Lys | Pro | Ala | Ile | Ala | Ala | Glu | His | Gly |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Tyr | Phe | Ile | Arg | Trp | Ala | Gly | Asp | Gin | Glu | Trp | Glu | Thr | Cys | Ala | Arg |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Glu | Asn | Asn | Val | Gly | Trp | Met | Glu | Met | Ala | Glu | Pro | Val | Met | Asn | Leu |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Tyr | Thr | Glu | Thr | Thr | Asp | Gly | Ser | Tyr | Ile | Glu | Lys | Lys | Glu | Thr | Ala |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Met | Val | Trp | His | Tyr | Glu | Asp | Ala | Asp | Lys | Asp | Leu | Gly | Leu | Glu | Gin |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Ala | Lys | Glu | Leu | Leu | Asp | His | Leu | Glu | Asn | Val | Leu | Ala | Asn | Glu | Pro |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Val | Glu | Val | Lys | Arg | Gly | Gin | Tyr | Ile | Val | Glu | Val | Lys |
645 650 (2)Informace o SEQ ID NO:28:
{i) Charakteris t i .ka s^-kyenc^ (AjDélka: 390 párů bází (tí)Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární
113 ί 9 9 9 »·· *·· • · · • ···· * • v (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Helianthus annuus (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 3..258 (D)Další informace:/částečná (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:28:
TT GCA GAG AAG ATT TTT GCG TTC ATG GCT GAA AAG GGA AAA CAG GCT 47
Ala Glu Lys Ile Phe Ala Phe Met Ala Glu Lys Gly Lys Gin Ala
5 10 15 .
GAT TTC | GTG Val | TTG Leu | AGC Ser 20 | GTT GGA GAT GAT | AGA AGT GAT GAA GAC ATG TTT | 95 | ||||||||||
Asp | Phe | Val | Gly | Asp | Asp | Arg 25 | Ser Asp | Glu Asp | Met 30 | Phe | ||||||
GTG | GCC | ATT | GGG | GAT | GGA | ATA | AAA | AAG | GGT | CGG | ATA | ACT | AAC | AAC | AAT | 143 |
Val | Ala | Ile | Gly | Asp | Gly | Ile | Lys | Lys | Gly | Arg | Ile | Thr | Asn | Asn | Asn | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
TCA | GTG | TTT | ACA | TGC | GTA | GTG | GGA | GAG | AAA | CCG | AGT | GCA | GCT | GAG | TAC | 191 |
Ser | Val | Phe | Thr | Cys | Val | Val | Gly | Glu | Lys | Pro | Ser | Ala | Ala | Glu | Tyr | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
TTT | TTA | GAC | GAG | ACG | AAA | GAT | GTT | TCA | ATG | ATG | CTC | GAG | AAG | CTC | GGG | 239 |
Phe | Leu | Asp | Glu | Thr | Lys | Asp | Val | Ser | Met | Met | Leu | Glu | Lys | Leu | Gly |
70 75
TGT CTC AGC AAC CAA GGA T GATGATCCGG AAGCTTCTCG TGATCTTTAT 288
Cys Leu Ser Asn Gin Gly . 85
GAGTTAAAAG
TTTTCGACTT TTTCTTCATC AAGATTCATG GGAAAGTTGT TCAATATGAA
348
CTTGTGTTTC
TTGGTTCTGG ATTTTAGGGA GTCTATGGAT CC
390 (2)Informace o SEQ ID NO:29:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 85 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii)Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:29:
114 • # · * ·» «· ·* «·· ♦ · · · · · * * • · · · · « · ·»·· • · ···· < · · · * ··· ··· ·· · · · · * • · 9 99 · · · 9 9 ·9
Ala 1 | Glu | Lys | Ile | Phe 5 | Ala | Phe | Met | Ala | Glu 10 | Lys | Gly | Lys | Gin | Ala 15 | Asp |
Phe | Val | Leu | Ser 20 | Val | Gly | Asp | Asp | Arg 25 | Ser | Asp | Glu | Asp | Met 30 | Phe | Val |
Ala | Ile | Gly 35 | Asp | Gly | Ile | Lys | Lys 40 | Gly | Arg | Ile | Thr | Asn 45 | Asn | Asn | Ser |
Val | Phe 50 | Thr | Cys | Val | Val | Gly 55 | Glu | Lys | Pro | Ser | Ala 60 | Ala | Glu | Tyr | Phe |
Leu 65 | Asp | Glu | Thr | Lys | Asp 70 | Val | Ser | Met | Met | Leu 75 | Glu | Lys | Leu | Gly | Cys 80 |
Leu | Ser | Asn | Gin | Gly 85 |
(2)Informace o SEQ ID NO:30:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 24 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:30:
CCAIGGRTTI ACICKDATIG CICC (2)Informace o SEQ ID NO:31:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 23 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:31:
ATHGTIGTIW SIAAYMRIYT ICC
115 • mm * • · · · · • · φ · * · φ φφ «φφ φφφ φ φ · · *· «· ·· (2)Informace ο SEQ ID ΝΟ:32:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:32:
YTITGGCCIA TITTYCAYTA (2)Informace o SEQ ID NO:33:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:33: TGRTCIARIA RYTCYTTIGC (2)Informace o SEQ ID NO:34:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID N0:34:'
TCRTCIGTRA ARTCRTCICC
116 « · · • •999 9 > ·· · · ·· · • · · * ··· ·· ·* (2)Informace o SEQ ID NO:35:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:35:
TTYGAYTAYG AYGGIACIYT 20 (2)Informace o SEQ ID NO:36:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:36:
GGIYTIWBNG CIGARCAYGG (2)Informace o SEQ ID NO:37:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:37:
ATIGCIAARC CIGTIATGAA 9n
117 (2)Informace o SEQ ID NO:38:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 20 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:38:
CCIACXGTRC AIGCRAAIAC 20 (2)Informace o SEQ ID NO:39:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 2982 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Arabidopsis thaliana (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 64..2982 (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:39:
ATAAACTTCC TCGCGGCCGC CAGTGTGAGT AATTTAGTTT
TGGTTCTGTT TTGGTGTGAG
CGT ATG | CCT Pro | GGA Gly | AAT AAG | TAC AAC Tyr Asn | TGC Cys | AGT Ser | TCT TCT CAT ATC | CCA CTC | 108 | |||||||
Met 1 | Asn | Lys 5 | Ser 10 | Ser | His | Ile | Pro | Leu 15 | ||||||||
TCT | CGA | ACA | GAA | CGC | CTC | TTG | AGA | GAT | AGA | GAG | CTT | AGA | GAG | AAG | AGG | 156 |
Ser | Arg | Thr | Glu | Arg | Leu | Leu | Arg | Asp | Arg | Glu | Leu | Arg | Glu | Lys | Arg | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
AAG | AGC | AAC | CGA | GCT | CGT | AAT | CCT | AAT | GAC | GTT | GCT | GGC | AGT | TCC | GAG | 204 |
Lys | Ser | Asn | Arg | Ala | Arg | Asn | Pro | Asn | Asp | Val | Ala | Gly | Ser | Ser | Glu | |
35 | 40 | 45 |
118
AAC Asn | TCT GAG AAT GAC TTG | CGT Arg | TTA GAA GGT GAC | AGT Ser | TCA AGG CAG TAT | 252 | ||||||||||
Ser | Glu Asn Asp 50 | Leu | Leu 55 | Glu | Gly | Asp | Ser 60 | Arg | Gin | Tyr | ||||||
GTT | GAA | CAG | TAC | TTG | GAA | GGG | GCT | GCT | GCT | GCA | ATG | GCG | CAC | GAT | GAT | 300 |
Val | Glu | Gin | Tyr | Leu | Glu | Gly | Ala | Ala | Ala | Ala | Met | Ala | His | Asp | Asp | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
GCG | TGT | GAG | AGG | CAA | GAA | GTT | AGG | CCT | TAT | AAT | AGG | CAA | CGA | CTA | CTT | 348 |
Ala | Cys | Glu | Arg | Gin | Glu | Val | Arg | Pro | Tyr | Asn | Arg | Gin | Arg | Leu | Leu | |
80 | 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
GTA | GTG | GCT | AAC | AGG | CTC | CCA | GTT | TCT | CCC | GTG | AGA | AGA | GGT | GAA | GAT | 396 |
Val | Val | Ala | Asn | Arg | Leu | Pro | Val | Ser | Pro | Val | Arg | Arg | Gly | Glu | Asp | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
TCA | TGG | TCT | CTT | GAG | ATC | AGT | GCT | GGT | GGT | CTA | GTC | AGT | GCT | CTC | TTA | 444 |
Ser | Trp | Ser | Leu | Glu | Ile | Ser | Ala | Gly | Gly | Leu | Val | Ser | Ala | Leu | Leu | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
GGT | GTA | AAG | GAA | TTT | GAG | GCC | AGA | TGG | ATA | GGA | TGG | GCT | GGA | GTT | AAT | 492 |
Gly | Val | Lys | Glu | Phe | Glu | Ala | Arg | Trp | Ile | Gly | Trp | Ala | Gly | Val | Asn | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
GTG | CCT | GAT | GAG | GTT | GGA | CAG | AAG | GCA | CTT | AGC | AAA | GCT | TTG | GCT | GAG | 540 |
Val | Pro | Asp | Glu | Val | Gly | Gin | Lys | Ala | Leu | Ser | Lys | Ala | Leu | Ala | Glu | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
AAG | AGG | TGT | ATT | CCC | GTG | TTC | CTT | GAT | GAA | GAG | ATT | GTT | CAT | CAG | TAC | 588 |
Lys | Arg | Cys | Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Asp | Glu | Glu | Ile | Val | His | Gin | Tyr | |
160 | 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
TAT | AAT | GGT | TAC | TGC | AAC | AAT | ATT | CTG | TGG | CCT | CTG | TTT | CAC | TAC | CTT | 636 |
Tyr | Asn | Gly | Tyr | Cys | Asn | Asn | Ile | Leu | Trp | Pro | Leu | Phe | His | Tyr | Leu | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GGA | CTT | CCG | CAA | GAA | GAT | CGG | CTT | GCC | ACA | ACC | AGA | AGC | TTT | CAG | TCC | 684 |
Gly | Leu | Pro | Gin | Glu | Asp | Arg | Leu | Ala | Thr | Thr | Arg | Ser | Phe | Gin | Ser | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
CAA | TTT | GCT | GCA | TAC | AAG | AAG | GCA | AAC | CAA | ATG | TTC | GCT | GAT | GTT | GTA | 732 |
Gin | Phe | Ala | Ala | Tyr | Lys | Lys | Ala | Asn | Gin | Met | Phe | Ala | Asp | Val | Val | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
AAT | GAG | CAC | TAT | GAA | GAG | GGA | GAT | GTC | GTC | TGG | TGC | CAT | GAC | TAT | CAT | 780 |
Asn | Glu | His | Tyr | Glu | Glu | Gly | Asp | Val | Val | Trp | Cys | His | Asp | Tyr | His | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
CTT | ATG | TTC | CTT | CCT | AAA | TGC | CTT | AAG | GAG | TAC | AAC | AGT | AAG | ATG | AAA | 828 |
Leu | Met | Phe | Leu | Pro | Lys | Cys | Leu | Lys | Glu | Tyr | Asn | Ser | Lys | Met | Lys | |
240 | 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
GTT | GGA | TGG | TTT | CTC | CAT | ACA | CCA | TTC | CCT | TCG | TCT | GAG | ATA | CAC | AGG | 876 |
Val | Gly | Trp | Phe | Leu | His | Thr | Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | Ile | His | Arg | |
260 | 265 | 270 |
119 ····
ACA Thr | CTT Leu | CCA TCA CGA TCA GAG | CTC CTT CGG Leu Leu Arg 280 | TCA Ser | GTT Val | CTT GCT GCT Leu Ala Ala 285 | GAT Asp | 924 | ||||||||
Pro | Ser Arg 275 | Ser | Glu | |||||||||||||
TTA | GTT | GGC | TTC | CAT | ACA | TAT | GAC | TAT | GCA | AGG | CAC | TTT | GTG | AGT | GCG | 972 |
Leu | Val | Gly | Phe | His | Thr | Tyr | Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | Val | Ser | Ala | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
TGC | ACT | CGT | ATT | CTT | GGA | CTT | GAA | GGA | ACA | CCT | GAG | GGA | GTT | GAG | GAT | 1020 |
Cys | Thr | Arg | Ile | Leu | Gly | Leu | Glu | Gly | Thr | Pro | Glu | Gly | Val | Glu | Asp | |
305 | 310 | 315 | ||||||||||||||
CAA | GGC | AGG | CTC | ACT | CGT | GTA | GCT | GCT | TTT | CCA | ATT | GGC | ATA | GAT | TCT | 1068 |
Gin | Gly | Arg | Leu | Thr | Arg | Val | Ala | Ala | Phe | Pro | Ile | Gly | Ile | Asp | Ser | |
320 | 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
GAT | CGG | TTT | ATA | CGA | GCA | CTT | GAG | GTC | CCC | GAA | GTC | AAA | CAA | CAC | ATG | 1116 |
Asp | Arg | Phe | Ile | Arg | Ala | Leu | Glu | Val | Pro | Glu | Val | Lys | Gin | His | Met | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
AAG | GAA | TTG | AAA | GAA | AGA | TTT | ACT | GAC | AGA | AAG | GTG | ATG | TTA | GGT | GTT | 1164 |
Lys | Glu | Leu | Lys | Glu | Arg | Phe | Thr | Asp | Arg | Lys | Val | Met | Leu | Gly | Val | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
GAT | CGT | CTT | GAC | ATG | ATC | AAA | GGG | ATT | CCA | CAA | AAG | ATT | CTG | GCA | TTC | 1212 |
Asp | Arg | Leu | Asp | Met | Ile | Lys | Gly | Ile | Pro | Gin | Lys | Ile | Leu | Ala | Phe | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
GAA | AAA | TTT | CTC | GAG | GAA | AAT | GCA | AAC | TGG | CGT | GAT | AAA | GTG | GTC | TTA | 1260 |
Glu | Lys | Phe | Leu | Glu | Glu | Asn | Ala | Asn | Trp | Arg | Asp | Lys | Val | Val | Leu | |
385 | 390 | 395 | ||||||||||||||
TTG | AAA | ATT | GCG | GTG | CCA | ACA | AGA | CCT | GAC | GTT | CCT | GAG | TAT | CAA | ACA | 1308 |
Leu | Lys | Ile | Ala | Val | Pro | Thr | Arg | Pro | Asp | Val | Pro | Glu | Tyr | Gin | Thr | |
400 | 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
CTC | ACA | AGC | CAA | GTT | CAT | GAA | ATT | GTT | GGC | CGC | ATT | ATT | GGT | CGT | CTC | 1356 |
Leu | Thr | Ser | Gin | Val | His | Glu | Ile | Val | Gly | Arg | Ile | Ile | Gly | Arg | Leu | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GGG | ACA | CTG | ACT | GCA | GTT | CCA | ATA | CAT | CAT | CTG | GAT | CGG | TCT | CTG | GAC | 1404 |
Gly | Thr | Leu | Thr | Ala | Val | Pro | Ile | His | His | Leu | Asp | Arg | Ser | Leu | Asp | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
TTT | CAT | GCT | TTA | TGT | GCA | CTT | TAT | GCC | GTC | ACA | GAT | GTT | GCG | CTT | GTA | 1452 |
Phe | His | Ala | Leu | Cys | Ala | Leu | Tyr | Ala | Val | Thr | Asp | Val | Ala | Leu | Val | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ACA | TCT | TTG | AGA | GAT | GGG | ATG | AAT | CTT | GTC | AGT | TAT | GAG | TTT | GTT | GCT | 1500 |
Thr | Ser | Leu | Arg | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | Val | Ser | Tyr | Glu | Phe | Val | Ala | |
465 | 470 | 475 | ||||||||||||||
TGC | CAA | GAG | GCC | AAA | AAG | GGC | GTC | CTC | ATT | CTC | AGT | GAA | TTT | GCA | GGT | 1548 |
Cys | Gin | Glu | Ala | Lys | Lys | Gly | Val | Leu | Ile | Leu | Ser | Glu | Phe | Ala | Gly | |
480 | 485 | 490 | 495 |
120
9 9 9 ·· · • 9 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 999 999 « 9 9 9 · ·
999 99 99 99
9
9999
GCT Ala | GCA Ala | CAG Gin | TCT CTG | GGT GCT GGA GCT ATT CTT GTG | AAT Asn | CCT TGG AAC Pro Trp Asn 510 | 1596 | |||||||||
Ser | Leu 500 | Gly Ala | Gly Ala | Ile 505 | Leu Val | |||||||||||
ATC | ACA | GAA | GTT | GCT | GCC | TCC | ATT | GGA | CAA | GCC | CTA. | AAC | ATG | ACA | GCT | 1644 |
Ile | Thr | Glu | Val | Ala | Ala | Ser | Ile | Gly | Gin | Ala | Leu | Asn | Met | Thr | Ala | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
GAA | GAA | AGA | GAG | AAA | AGA | CAT | CGC | CAT | AAT | TTT | CAT | CAT | GTC | AAA | ACT | 1692 |
Glu | Glu | Arg | Glu | Lys | Arg | His | Arg | His | Asn | Phe | His | His | Val | Lys | Thr | |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
CAC | ACT | GCT | CAA | GAA | TGG | GCT | GAA | ACT | TTT | GTC | AGT | GAA | CTA | AAT | GAC | 1740 |
His | Thr | Ala | Gin | Glu | Trp | Ala | Glu | Thr | Phe | Val | Ser | Glu | Leu | Asn | Asp | |
545 | 550 | 555 | ||||||||||||||
ACT | GTA | ATT | GAG | GCG | CAA | CTA | CGA | ATT | AGT | AAA | GTC | CCA | CCA | GAG | CTT | 1788 |
Thr | Val | Ile | Glu | Ala | Gin | Leu | Arg | Ile | Ser | Lys | Val | Pro | Pro | Glu | Leu | |
560 | 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
CCA | CAG | CAT | GAT | GCA | ATT | CAA | CGG | TAT | TCA | AAG | TCC | AAC | AAC | AGG | CTT | 1836 |
Pro | Gin | His | Asp | Ala | Ile | Gin | Arg | Tyr | Ser | Lys | Ser | Asn | Asn | Arg | Leu | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
CTA | ATC | CTG | GGT | TTC | AAT | GCA | ACA | TTG | ACT | GAA | CCA | GTG | GAT | AAT | CAA | 1884 |
Leu | Ile | Leu | Gly | Phe | Asn | Ala | Thr | Leu | Thr | Glu | Pro | Val | Asp | Asn | Gin | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
GGG | AGA | AGA | GGT | GAT | CAA | ATA | AAG | GAG | ATG | GAT | CTT | AAT | CTA | CAC | CCT | 1932 |
Gly | Arg | Arg | Gly | Asp | Gin | Ile | Lys | Glu | Met | Asp | Leu | Asn | Leu | His | Pro | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
GAG | CTT | AAA | GGG | CCC | TTA | AAG | GCA | TTA | TGC | AGT | GAT | CCA | AGT | ACA | ACC | 1980 |
Glu | Leu | Lys | Gly | Pro | Leu | Lys | Ala | Leu | Cys | Ser | Asp | Pro | Ser | Thr | Thr | |
625 | 630 | 635 | ||||||||||||||
ATA | GTT | GTT | CTG | AGC | GGA | AGC | AGC | AGA | AGT | GTT | TTG | GAC | AAA | AAC | TTT | 2028 |
Ile | Val | Val | Leu | Ser | Gly | Ser | Ser | Arg | Ser | Val | Leu | Asp | Lys | Asn | Phe | |
640 | 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
GGA | GAG | TAT | GAC | ATG | TGG | CTG | GCA | GCA | GAA | AAT | GGG | ATG | TTC | CTA | AGG | 2076 |
Gly | Glu | Tyr | Asp | Met | Trp | Leu | Ala | Ala | Glu | Asn | Gly | Met | Phe | Leu | Arg | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
CTT | ACG | AAT | GGA | GAG | TGG | ATG | ACT | ACA | ATG | CCA | GAA | CAC | TTG | AAC | ATG | 2124 |
Leu | Thr | Asn | Gly | Glu | Trp | Met | Thr | Thr | Met | Pro | Glu | His | Leu | Asn | Met | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
GAA | TGG | GTT | GAT | AGC | GTA | AAG | CAT | GTT | TTC | AAG | TAC | TTC | ACT | GAG | AGA | 2172 |
Glu | Trp | Val | Asp | Ser | Val | Lys | His | Val | Phe | Lys | Tyr | Phe | Thr | Glu | Arg | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
ACT | CCC | AGG | TCA | CAC | TTT | GAA | ACT | CGC | GAT | ACT | TCG | CTT | ATT | TGG | AAC | 2220 |
Thr | Pro | Arg | Ser | His | Phe | Glu | Thr | Arg | Asp | Thr | Ser | Leu | Ile | Trp | Asn | |
705 | 710 | 715 |
121
4« · · · ·· · »4 · 44 4 • 4
44
TAC Tyr 720 | AAA Lys | TAT Tyr | GCA GAT Ala Asp | ATC GAA TTC | GGG AGA CTT CAA GCA | AGA Arg | GAT Asp | TTG Leu 735 | 2268 | |||||||
Ile 725 | Glu | Phe | Gly Arg | Leu 730 | Gin | Ala | ||||||||||
TTA | CAA | CAC | TTA | TGG | ACA | GGT | CCA | ATC | TCT | AAT | GCA | TCA | GTT | GAT | GTT | 2316 |
Leu | Gin | His | Leu | Trp | Thr | Gly | Pro | Ile | Ser | Asn | Ala | Ser | Val | Asp | Val | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
GTC | CAA | GGA | AGC | CGC | TCT | GTG | GAA | GTC | CGT | GCA | GTT | GGT | GTC | ACA | AAG | 2364 |
Val | Gin | Gly | Ser | Arg | Ser | Val | Glu | Val | Arg | Ala | Val | Gly | Val | Thr | Lys | |
755 | 760 | 765 | ||||||||||||||
GGA | GCT | GCA | ATT | GAT | CGT | ATT | CTA | GGA | GAG | ATA | GTG | CAT | AGC | AAG | TCG | 2412 |
Gly | Ala | Ala | Ile | Asp | Arg | Ile | Leu | Gly | Glu | Ile | Val | His | Ser | Lys | Ser | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
ATG | ACT | ACA | CCA | ATC | GAT | TAC | GTC | TTG | TGC | ATT | GGT | CAT | TTC | TTG | GGG | 2460 |
Met | Thr | Thr | Pro | Ile | Asp | Tyr | Val | Leu | Cys | Ile | Gly | His | Phe | Leu | Gly | |
785 | 790 | 795 | ||||||||||||||
AAG | GAC | GAA | GAT | GTT | TAC | ACT | TTC | TTC | GAA | CCA | GAA | CTT | CCA | TCC | GAC | 2508 |
Lys | Asp | Glu | Asp | Val | Tyr | Thr | Phe | Phe | Glu | Pro | Glu | Leu | Pro | Ser | Asp | |
800 | 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
ATG | CCA | GCC | ATT | GCA | CGA | TCC | AGA | CCA | TCA | TCT | GAC | AGT | GGA | GCC | AAG | 2556 |
Met | Pro | Ala | Ile | Ala | Arg | Ser | Arg | Pro | Ser | Ser | Asp | Ser | Gly | Ala | Lys | |
820 | 825 | 830 | ||||||||||||||
TCA | TCA | TCA | GGA | GAC | CGA | AGA | CCA | CCT | TCA | AAG | TCG | ACA | CAT | AAC | AAC | 2604 |
Ser | Ser | Ser | Gly | Asp | Arg | Arg | Pro | Pro | Ser | Lys | Ser | Thr | His | Asn | Asn | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
AAC | AAA | AGT | GGA | TCA | AAA | TCC | TCA | TCA | TCC | TCT | AAC | TCT | AAC | AAC | AAC | 2652 |
Asn | Lys | Ser | Gly | Ser | Lys | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Asn | Ser | Asn | Asn | Asn | |
850 | 855 | 860 | ||||||||||||||
AAC | AAG | TCC | TCA | CAG | AGA | TCT | CTT | CAG | TCA | GAG | AGA | AAA | AGT | GGA | TCC | 2700 |
Asn | Lys | Ser | Ser | Gin | Arg | Ser | Leu | Gin | Ser | Glu | Arg | Lys | Ser | Gly | Ser | |
865 | 870 | 875 | ||||||||||||||
AAC | CAT | AGC | TTA | GGA | AAC | TCA | AGA | CGT | CCT | TCA | CCA | GAG | AAG | ATC | TCA | 2748 |
Asn | His | Ser | Leu | Gly | Asn | Ser | Arg | Arg | Pro | Ser | Pro | Glu | Lys | Ile | Ser | |
880 | 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
TGG | AAT | GTG | CTT | GAC | CTC | AAA | GGA | GAG | AAC | TAC | TTC | TCT | TGC | GCT | GTG | 2796 |
Trp | Asn | Val | Leu | Asp | Leu | Lys | Gly | Glu | Asn | Tyr | Phe | Ser | Cys | Ala | Val | |
900 | 905 | 910 | ||||||||||||||
GGT | CGT | ACT | CGC | ACC | AAT | GCT | AGA | TAT | CTC | CTT | GGC | TCA | CCT | GAC | GAC | i.844 |
Gly | Arg | Thr | Arg | Thr | Asn | Ala | Arg | Tyr | Leu | Leu | Gly | Ser | Pro | Asp | Asp | |
915 | 920 | 925 | ||||||||||||||
GTC | GTT | TGC | TTC | CTT | GAG | AAG | CTC | GCT | GAC | ACC | ACT | TCC | TCA | CCT | TAA | 2892 |
Val | Val | Cys | Phe | Leu | Glu | Lys | Leu | Ala | Asp | Thr | Thr | Ser | Ser | Pro | ★ | |
930 | 935 | 940 |
122
2940 ·· ·· ·· • · 0 0 0 0
0 0 0 0 0
00 000 · · ·
0 0 0
00 0· ··
TAT Tyr | CCC Pro 945 | GAG Glu | ACA Thr | GTG Val | TCA Ser | AGT Ser 950 | GAG TTC | ATG Met | TAA ★ | CCC AAT AAA AAC | TAT Tyr | ||||
Glu | Phe | Pro 955 | Asn | Lys | Asn | ||||||||||
TGT | TTT | GTA | ACA | AAA | AGC | AGC | CAT | TAC | CAG | ACT | CTT | TAG | TGG | ||
Cys | Phe | Val | Thr | Lys | Ser | Ser | His | Tyr | Gin | Thr | Leu | * | Trp | ||
960 | 965 | 970 |
2982 (2)Informace ο SEQ ID NO :40:
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 973 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii)Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:40:
Met Pro Gly Asn Lys Tyr Asn Cys Ser Ser Ser His Ile Pro Leu Ser 1 5 10 15
Arg Thr Glu Arg Leu Leu Arg Asp Arg Glu Leu Arg Glu Lys Arg Lys 20 25 30
Ser Asn Arg Ala Arg Asn Pro Asn Asp Val Ala Gly Ser Ser Glu Asn 35 40 45
Ser Glu Asn Asp Leu Arg Leu Glu Gly Asp Ser Ser Arg Gin Tyr Val 50 55 60
Glu Gin Tyr Leu Glu Gly Ala Ala Ala Ala Met Ala His Asp Asp Ala
70 75 80
Cys Glu Arg Gin Glu Val Arg Pro Tyr Asn Arg Gin Arg Leu Leu Val
90 95
Val Ala Asn Arg Leu Pro Val Ser Pro Val Arg Arg Gly Glu Asp Ser 100 105 110
Trp Ser Leu Glu Ile Ser Ala Gly Gly Leu Val Ser Ala Leu Leu Gly 115 120 125
Val Lys Glu Phe Glu Ala Arg Trp Ile Gly Trp Ala Gly Val Asn Val 130 135 140
Pro Asp Glu Val Gly Gin Lys Ala Leu Ser Lys Ala Leu Ala Glu Lys
145 150 155 160
Arg Cys Ile Pro Val Phe Leu Asp Glu Glu Ile Val His Gin Tyr Tyr
165 170 175
Asn Gly Tyr Cys Asn Asn Ile Leu Trp Pro Leu Phe His Tyr Leu Gly
180 185 190
123 • ···· to · • toto toto ·* • toto · · · · · • · · to to to · • to to * ··· ··» • to · · · • •to ·· ·· ·*
Leu | Pro | Gin Glu 195 | Asp Arg | Leu | Ala 200 | Thr | Thr Arg | Ser | Phe 205 | Gin | Ser | Gin | |||
Phe | Ala | Ala | Tyr | Lys | Lys | Ala | Asn | Gin | Met | Phe | Ala | Asp | Val | Val | Asn |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Glu | His | Tyr | Glu | Glu | Gly | Asp | Val | Val | Trp | Cys | His | Asp | Tyr | His | Leu |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Met | Phe | Leu | Pro | Lys | Cys | Leu | Lys | Glu | Tyr | Asn | Ser | Lys | Met | Lys | Val |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Gly | Trp | Phe | Leu | His | Thr | Pro | Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | Ile | His | Arg | Thr |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Leu | Pro | Ser | Arg | Ser | Glu | Leu | Leu | Arg | Ser | Val | Leu | Ala | Ala | Asp | Leu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Val | Gly | Phe | His | Thr | Tyr | Asp | Tyr | Ala | Arg | His | Phe | Val | Ser | Ala | Cys |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Thr | Arg | Ile. | Leu | Gly | Leu | Glu | Gly | Thr | Pro | Glu | Gly | Val | Glu | Asp | Gin |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Gly | Arg | Leu | Thr | Arg | Val | Ala | Ala | Phe | Pro | Ile | Gly | Ile | Asp | Ser | Asp |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Arg | Phe | Ile | Arg | Ala | Leu | Glu | Val | Pro | Glu | Val | Lys | Gin | His | Met | Lys |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Glu | Leu | Lys | Glu | Arg | Phe | Thr | Asp | Arg | Lys | Val | Met | Leu | Gly | Val | Asp |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Arg | Leu | Asp | Met | Ile | Lys | Gly | Ile | Pro | Gin | Lys | Ile | Leu | Ala | Phe | Glu |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Lys | Phe | Leu | Glu | Glu | Asn | Ala | Asn | Trp | Arg | Asp | Lys | Val | Val | Leu | Leu |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Lys | Ile | Ala | Val | Pro | Thr | Arg | Pro | Asp | Val | Pro | Glu | Tyr | Gin | Thr | Leu |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Thr | Ser | Gin | Val | His | Glu | Ile | Val | Gly | Arg | Ile | Ile | Gly | Arg | Leu | Gly |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Thr | Leu | Thr | Ala | Val | Pro | Ile | His | His | Leu | Asp | Arg | Ser | Leu | Asp | Phe |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
His | Ala | Leu | Cys | Ala | Leu | Tyr | Ala | Val | Thr | Asp | Val | Ala | Leu | Val | Thr |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Ser | Leu | Arg | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | Val | Ser | Tyr | Glu | Phe | Val | Ala | Cys |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Glu | Ala | Lys | Lys | Gly | Val | Leu | Ile | Leu | Ser | Glu | Phe | Ala | Gly | Ala |
485 490 495
124 • · · · · · * · . . · · « « · ··· ··« • · · · ·» ·· ·♦
Ala | Gin | Ser | Leu Gly 500 | Ala | Gly Ala | Ile 505 | Leu | Val | Asn | Pro | Trp Asn 510 | Ile | |||
Thr | Glu | Val | Ala | Ala | Ser | Ile | Gly | Gin | Ala | Leu | Asn | Met | Thr | Ala | Glu |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Glu | Arg | Glu | Lys | Arg | His | Arg | His | Asn | Phe | His | His | Val | Lys | Thr | His |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Thr | Ala | Gin | Glu | Trp | Ala | Glu | Thr | Phe | Val | Ser | Glu | Leu | Asn | Asp | Thr |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Val | Ile | Glu | Ala | Gin | Leu | Arg | Ile | Ser | Lys | Val | Pro | Pro | Glu | Leu | Pro |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Gin | His | Asp | Ala | Ile | Gin | Arg | Tyr | Ser | Lys | Ser | Asn | Asn | Arg | Leu | Leu |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ile | Leu | Gly | Phe | Asn | Ala | Thr | Leu | Thr | Glu | Pro | Val | Asp | Asn | Gin | Gly |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Arg | Arg | Gly | Asp | Gin | Ile | Lys | Glu | Met | Asp | Leu | Asn | Leu | His | Pro | Glu |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Leu | Lys | Gly | Pro | Leu | Lys | Ala | Leu | Cys | Ser | Asp | Pro | Ser | Thr | Thr | Ile |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Val | Val | Leu | Ser | Gly | Ser | Ser | Arg | Ser | Val | Leu | Asp | Lys | Asn | Phe | Gly |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Glu | Tyr | Asp | Met | Trp | Leu | Ala | Ala | Glu | Asn | Gly | Met | Phe | Leu | Arg | Leu |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Thr | Asn | Gly | Glu | Trp | Met | Thr | Thr | Met | Pro | Glu | His | Leu | Asn | Met | Glu |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Trp | Val | Asp | Ser | Val | Lys | His | Val | Phe | Lys | Tyr | Phe | Thr | Glu | Arg | Thr |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Pro | Arg | Ser | His | Phe | Glu | Thr | Arg | Asp | Thr | Ser | Leu | Ile | Trp | Asn | Tyr |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Lys | Tyr | Ala | Asp | Ile | Glu | Phe | Gly | Arg | Leu | Gin | Ala | Arg | Asp | Leu | Leu |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Gin | His | Leu | Trp | Thr | Gly | Pro | Ile | Ser | Asn | Ala | Ser | Val | Asp | Val | Val |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Gin | Gly | Ser | Arg | Ser | Val | Glu | Val | Arg | Ala | Val | Gly | Val | Thr | Lys | Gly |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Ala | Ala | Ile | Asp | Arg | Ile | Leu | Gly | Glu | Ile | Val | His | Ser | Lys | Ser | Met |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Thr | Thr | Pro | Ile | Asp | Tyr | Val | Leu | Cys | Ile | Gly | His | Phe | Leu | Gly | Lys |
785 790 795 800
125 ·« ·· · 4 4
4 4 4 ··· 444 • 4 · • ···· · • 4 4 • · · • 44 ··
Asp Glu Asp Val Tyr Thr
805
Pro Ala Ile Ala Arg Ser 820
Ser Ser Gly Asp Arg Arg 835
Lys Ser Gly Ser Lys Ser 850
Lys Ser Ser Gin Arg Ser 865 870
His Ser Leu Gly Asn Ser 885
Asn Val Leu Asp Leu Lys 900
Arg Thr Arg Thr Asn Ala 915
Val Cys Phe Leu Glu Lys 930
Pro Glu Thr Val Ser Ser 945 950
Phe Val Thr Lys Ser Ser 965
Phe Phe Glu Pro Glu Leu Pro 810
Arg Pro Ser Ser Asp Ser Gly 825
Pro Pro Ser Lys Ser Thr His 840 845
Ser Ser Ser Ser Asn Ser Asn 855 860
Leu Gin Ser Glu Arg Lys Ser 875
Arg Arg Pro Ser Pro Glu Lys 890
Gly Glu Asn Tyr Phe Ser Cys 905
Arg Tyr Leu Leu Gly Ser Pro 920 925
Leu Ala Asp Thr Thr Ser Ser 935 940
Glu Phe Met * Pro Asn Lys 955
His Tyr Gin Thr Leu * Trp 970
Ser Asp Met 815
Ala Lys Ser 830
Asn Asn Asn
Asn Asn Asn
Gly Ser Asn 880
Ile Ser Trp 895
Ala Val Gly 910
Asp Asp Val
Pro * Tyr
Asn Tyr Cys 960 (2)Informace o SEQ ID NO:41:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 300 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iíi)Hypotetický: Ne (iii) Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Oryza sativa (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:41:
ATAAACTTCC TCGGACCAAA GAAGAGCATG TTGGTTGTGT CGGAGTTTAT
CCTTCACTGA GTGGAGCCAT TCGTGTTAAC CCGTGGAATA TCGAGGCAAC
TGGTTGCTCA
TGCAGAGGCA
120
126 «« «· • * · · • · · · ··· ··· • · · • ···· · • · • · « »»· ·· ·· ·♦
- r
CTGAATGAGG | CCATCTCAAT | GTCAGAGCGT | AAAAGCAGCT | GAGGCACGAA | AAACATTACČ | • 180 |
GTTATGTCAG | CACCCATGAT | GTTGCATATT | GGTCTAAGAG | CTTTGTACAG | GACCTGGAGA | 240 |
GGGCTTGCAA | GGATCACTTT | AGGAAACCAT | GCTGGGGCAT | TGGATTGGAT | TTCGCTCAGG | 300 |
(2)Informace o SEQ ID NO:42:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 627 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Selaginella lepidophylla (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 4..627 (D)Další informace:/částečná (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:42
ATT ATG Met 1 | TGG Trp | GTG CAT GAT TAC | CAC CTC | TGT CTG GTC | CCT CAG ATG ATC | 48 | ||||||||||
Val | His | Asp 5 | Tyr | His | Leu | Cys | Leu 10 | Val | Pro | Gin | Met | Ile 15 | ||||
CGC | CAA | AAG | CTG | CCA | GAT | GTG | CAG | ATT | GGC | TTC | TTC | CTC | CAC | ACC | GCT | 96 |
Arg | Gin | Lys | Leu | Pro | Asp | Val | Gin | Ile | Gly | Phe | Phe | Leu | His | Thr | Ala | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
TTT | CCC | TCG | TCA | GAG | GTC | TTC | CGC | TGC | TTG | GCC | GCA | CGA | AAG | GAG | CTG | • '144 |
Phe | Pro | Ser | Ser | Glu | Val | Phe | Arg | Cys | Leu | Ala | Ala | Arg | Lys | Glu | Leu | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
CTG | GAC | GGC | ATG | CTT | GGT | GCC | AAC | TTG | GTT | GCT | TTC | CAG | ACG | CCA | GAG | 192 |
Leu | Asp | Gly | Met | Leu | Gly | Ala | Asn | Leu | Val | Ala | Phe | Gin | Thr | Pro | Glu | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
TAT | GCA | CAC | CAC | TTC | CTC | CAG | ACG | TGC | AGT | CGC | ATT | TCT | CTG | CTG | AAG | 240 |
Tyr | Ala | His | His | Phe | Leu | Gin | Thr | Cys | Ser | Arg | Ile | Ser | Leu | Leu | Lys | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
CAA | CCG | AGG | AAG | GCG | TTC | AGC | TCG | TTT | CGT | CAA | TGT | CTG | GTC | ATA | ATG | 288 |
Gin | Pro | Arg | Lys | Ala | Phe | Ser | Ser | Phe | Arg | Gin | Cys | Leu | Val | Ile | Met | |
80 | 85 | 90 | 95 |
127
CAA Gin | GAA Glu | GCG Ala | CTA Leu | CGA Arg 100 | GGG Gly | TCA Ser | AGA Arg | AGG TCA | TCG Ser | TTG Leu | CGC Arg | GTG ACA AGC ' | • 336 | |||
Arg | Ser 105 | Val | Thr 110 | Ser | ||||||||||||
TGA | CAA | CAT | CGC | GTG | TAC | GCG | AGA | AGC | TTC | TGT | CGT | ACG | AGC | TGT | TCT | 384 |
* | Gin | His | Arg | Val | Tyr | Ala | Arg | Ser | Phe | Cys | Arg | Thr | Ser | Cys | Ser | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
TGA | ACA | AGA | ACC | CAC | AGT | GGA | GGG | ACA | AGG | TCG | TTC | TCA | TTC | AGG | TTG | 432 |
* | Thr | Arg | Thr | His | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Ser | Phe | Ser | Phe | Arg | Leu | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
CGA | CCT | CCA | CGA | CTG | AGG | ATT | CTG | AGC | TTG | CTG | CGA | CCG | TAT | CCG | AAA | 480 |
Arg | Pro | Pro | Arg | Leu | Arg | Ile | Leu | Ser | Leu | Leu | Arg | Pro | Tyr | Pro | Lys | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
TTG | TTA | CAC | GTA | TTG | ACG | CTG | TGC | ACT | CGA | CGC | TCA | CAC | ACA | CCC | ACT | 528 |
Leu | Leu | His | Val | Leu | Thr | Leu | Cys | Thr | Arg | Arg | Ser | His | Thr | Pro | Thr | |
160 | 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
CGT | CTT | CCT | CAG | GCA | AGA | CAT | TGC | GTT | CTC | GCA | GTA | CCT | CGC | ACT | TCT | 576 |
Arg | Leu | Pro | Gin | Ala | Arg | His | Cys | Val | Leu | Ala | Val | Pro | Arg | Thr | Ser | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
CTC | GAT | CGC | CGA | TGC | TCT | TGC | AAT | CAA | CTG | TTC | GAT | GGC | ATG | AAC | CTC | 624 |
Leu | Asp | Arg | Arg | Cys | Ser | Cys | Asn | Gin | Leu | Phe | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | |
195 | 200 | 205 |
GTC 627
Val (2)Informace o SEQ ID NO:43:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 208 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (D)Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:43:
Met 1 | Trp | Val | His | Asp 5 | Tyr | His | Leu | Cys | Leu 10 | Val | Pro | Gin | Met | Ile 15 | Arg |
Gin | Lys | Leu | Pro 20 | Asp | Val | Gin | Ile | Gly 25 | Phe | Phe | Leu | His | Thr 30 | Ala | Phe |
Pro | Ser | Ser 35 | Glu | Val | Phe | Arg | Cys 40 | Leu | Ala | Ala | Arg | Lys 45 | Glu | Leu | Leu |
Asp | Gly | Met | Leu | Gly | Ala | Asn | Leu | Val | Ala | Phe | Gin | Thr | Pro | Glu | Tyr |
5θ 55 60
128
Ala 65 | His | His | Phe | Leu | Gin 70 | * · 4 4 4 4 4 4 Thr | 4 4 4 • 44 4 444 4 · 4 Cys | « 4 4 4 · 4 · | 4 4 4 4 4 4 4 Ile 75 | 4 4 4 · 4 · 4 4 4 4 4 4 Ser | 4 4 4 · 4 4 4 4 4 4 4 4 Leu | Leu | Lys | Gin 80 | |
4 · Ser | 4 · 4 4 4 4 4 4 Arg | ||||||||||||||
Pro | Arg | Lys | Ala | Phe | Ser | Ser | Phe | Arg | Gin | Cys | Leu | Val | Ile | Met | Gin |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Glu | Ala | Leu | Arg | Gly | Ser | Arg | Arg | Ser | Ser | Leu | Arg | Val | Thr | Ser | ★ |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gin | His | Arg | Val | Tyr | Ala | Arg | Ser | Phe | Cys | Arg | Thr | Ser | Cys | Ser | ★ |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Thr | Arg | Thr | His | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Ser | Phe | Ser | Phe | Arg | Leu | Arg |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Pro | Pro | Arg | Leu | Arg | Ile | Leu | Ser | Leu | Leu | Arg | Pro | Tyr | Pro | Lys | Leu |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Leu | His | Val | Leu | Thr | Leu | Cys | Thr | Arg | Arg | Ser | His | Thr | Pro | Thr | Arg |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Leu | Pro | Gin | Ala | Arg | His | Cys | Val | Leu | Ala | Val | Pro | Arg | Thr | Ser | Leu |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Asp | Arg | Arg | Cys | Ser | Cys | Asn | Gin | Leu | Phe | Asp | Gly | Met | Asn | Leu | Val |
195 200 205 (2)Informace o SEQ ID NO:44:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 645 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly; cDNA k mRNA (iií)Hypotetický: Ne (iii) Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Selaginella lepiddophyla (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:44:
GGGTGGTTCT TGCACACGCC GTTTCCCTCG TCTGAGATTT ACAGAACGCT GCCGCTGCGG 60
GCCGAGCTGC TCCAAGGCGT CTTAGGCGCG GACTTAGTGG GGTTCCACAC ATACGACTAT 120
GCAAGGCACT TTGTTAGCGC GATGCACACG GATACTCGGG CTGGAAGGCA CTCCCAGGGT 180
GTCGAGGATC AAGGGAAGAT CACGCGAGTG GCTGCCTTCC CCGTGGATCG ATTCGGAGCG 240
ATTTATCGAC GCGTAGAGAC CGATGCGGTC AAGAAACACA TGCAAGAGCT GAGCCAGGTT 300
129 • · · ···· · · · · • · · « ··· ·«·· • · ···· 9 9 9 9 9 999 999
9 9 9 9 9 9 9
9 9 99 9 99 9 9 9 9
TTGCTGTCGT | AAGGTTATGT | TGGGGTGGAT | AGGCTTGACA | TGATTAAAGG | AATTCCACAG | • 360 |
AAGCTGCTAG | CCTTTGAAAA | ATTCCTCGAG | GAGAACTCCG | AGTGGCGTGA | TAAGGTCGTC | 420 |
CTGGTGCAAA | TCGCGGTGCC | GACTAGAACG | GACGTCCTCG | AGTACCAAAA | GCTTACGAGC | 480 |
CAGGTTCACG | AGATTGTTGG | TCGCATAAAT | GGACGTTTCG | GCTCCTTGAC | GGCTGTTCCT | 540 |
ATCCATCACC | TCGATCGGTC | CATGAAATTT | CCGGAGCTTT | GTGCGTTATA | TGCAATCACT | 600 |
GATGTCCTGC | TCGTGACATC | CCTGCGCGAC | GGCATGAACT | TCGTC | 645 |
(2)Informace o SEQ ID NO:45:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 498 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Arabidopsís thaliana
(xi)Popis sekvence: GCCGTTGTGG ATTCATCGCC | SEQ ID NO: TCGCACAAGC | 45: ACTCTTGTCG | TGTCTGAGTT | TATTGGATGC | 60 | |
TCACCTTCTT | TGAGTGGTGC | CATTAGGGTG | AATCCATGGG | ATGTGGATGC | TGTTGCTGAA | 120 |
GCGGTAAACT | CGGCTCTTAA | AATAGTGAGA | CTGAGAAGCA | ACTACGGCAT | GAGAAACATT | 180 |
ATCATTATAT | TAGCACTCAT | GATGTTGGTT | ATTGGGCAAA | GAGCTTTATG | CAGGATCTTG | 240 |
AGAGAGCGTG | CCGAGATCAT | TATAGTAAAC | GTTGTTGGGG | GATTGGTTTT | GGCTTGGGGT | '300 |
TCAGAGTTTT | GTCACTCTCT | CCAAGTTTTA | GGAAGCTATC | TGTGGACACA | TTTGTTCCAG | 360 |
TTTATAGGAA | AACCACAGAG | AGGGCTAATA | TTCTTTTATA | ATGGTACTCT | TTGTTCCGAA | 42.0 |
AGCTCATTGT | TCAAGATCCA | GCAACGGGTT | CCTTGTCCTA | AGCCCCTTAA | GGCCCCATAA | 480 |
CCGGTGTTTT (2)Informace | TTAGTGAG o SEQ ID NO | :46: | 498 |
(i)Charakteristika sekvence (A) Délka: 463 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární
130 • · « ·· · :
• φ · · · · !
• > φφφφ φ · · * • · · · ·_ · »· < ·♦· ·· iii)Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii)Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Arabidopsis thaliana
(xi)Popis GCCGTTGTGG | sekvence: ATTCATCGCC | SEQ ID NO:· TCGCACAAGC | 46: ACTCTTGTCG | TGTCTGAGTT | TATTGGATGC | 60 |
TCACCTTCTT | TGAGTGGTGC | CATTGGGTGA | ATCCATGGGA | TGTGGATGCT | GTTGCTGAAG | 120 |
CGGTAAACTC | GGCTCTTAAA | ATGAGTGAGA | CTGAGAAGCA | ACTACGGCAT | GAGAAACATT | 180 |
ATCATTATAT | TAGCACTCAT | GATGTTGGTT | ATTGGGCAAA | GAGCTTTATG | CAGGATCTTG | 240 |
AGAGAGCGTG | CCGAGATCAT | TATAGTAAAC | GTTGTTGGGG | GATTGGTTTT | GGTTTGGGGT | 300 |
TCAGAGTTTT | TGTCACTCTC | TCCAAGTTTA | GGAAGCTATC | TTGGGACAAT | TGTTCCAGTT | 360 |
TTTAGGGAAA | ACACAGGGAA | GGTTATTTCC | TTGATTATAA | TGGACCTTGT | CCAAGCCCCA | 420 |
TTTTTAAGGC | CCAGGAACCG | GGTTTTTTTT | TCTTAAAGCC | CCT | 463 |
(2)Informace o SEQ ID NO:47:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 394 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly:' cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Arabidopsis thaliana (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:47:
GGTATTGATG | TAGAGGAAAT | ACGTGGTGAA | ATCGAAGAAA | GCTGCAGGAG | GATCAATGGA | 60 |
GAGTTTGGGA | AACCGGATAT | CAACCTATCA | TATATATTGA | TACCCGGTTT | CGATTAATGA | 120 |
AATAAATGCT | TATACCATAT | TGCTGAGTGC | GTGGTCGTTA | CAGCTGTTAG | AGATGGTATG | 180 |
AACCTTACTC | CCTACGAATA | TATCGTTTGT | AGACAAGGTT | TACTTGGGTC | TGAATCAGAC | 240 |
TTTAGTGGCC | CAAAGAAGAG | CATGTTGGTT | GCATCAAGTT | TATTTGGATG | TCCCCTTTCG | 300 |
131 • · • · · (2)Informace o SEQ ID NO:48:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 428 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Arabidopsis thaliana (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:48:
AAGTCCGTTG TGGATTCACG CCTCGCACAA GCACTCTTGT CGTGTCTAGT TTATTGGATG
CTCACCTTCT TTAGTGGTGC CATTAGGGTG AATCCATGGA TGTGGATGCT GTTGCTGAAG
CGGTAAACTC GGCTCTTAAA ATAGTGAGAC TGAGAAGCAA CTACGGCATG AGAAACATTA
TCATTATATT AGCACTCATG ATGTTGGTTA TTGGGCAAAG AGCTTTATGC AGGACTTAGA
GAGCGTGCCG AGATCATTAT AGTAAACGTT GTTGGGGGAT TGGTTTTGGT TTGGGGTTCA
AGTTTTGTCA CTCTCTCCAA GTTTTAGGAA GCTATCTTGT GGACACATTG TTCCAGTTTA
TAGAAACACA GGGAAGGGGC TATATTCTTG TTTAAATGGG ACCCCTTGTC CCTAAAAGTC
CCATTTGT (2)Informace o SEQ ID NO:49:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 481 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Arabidopsis thaliana
120
180
240
300
360
420
428
132 • · · 0 0 0 0
0 0 0 0 0 ·
000000 · · *
0 0 0 0 0 • 0 0 000 00 (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:49:
CAAACGAAGA | GCTTCGTGGG | AAAGTGGTTC | TCGTGCAGAT | TACTAATCCT | GCTCGTAGTT | 60 |
CAGGTAAGGA | TGTTCAAGAT | GTAGAGAAAC | AGATAAATTT | ATTGCTGATG | AGATCAATTC | 120 |
TAAATTTGGG | AGACCTGGTG | GTTATAAGCC | TATTGTTTTG | TAATGGACCT | GTTAGTACTT | 180 |
TGGATAAAGT | TGCTTATTAC | GCGATCTCGG | AGTGTGTTGT | CGTGAATCTG | TGAGAGATGG | 240 |
GATGAATTTG | GTGCCTTATA | AGTACACAGT | GACTCGGCAA | GGGAGCCCTG | CTTTGGATGC | 300 |
AGCTTTGGTT | TTGGGGAGGA | TGATGTTAGG | AAGAGTGTGA | TTATTGTTTC | TGAGGTTCAA | 360 |
CCGGTTGTCC | TCCATCTCTA | GTGGTGCGAT | CCCTTTTAAT | CCGTGGACAT | CGATCAGCAC | 420 |
TTACGCCATG | AGCTTCAAAT | CCGGTTTCCG | CAAAGGGAAA | ATTGCCCCGA | GCTTAAGGCC | 480 |
A 481 (2)Informace o SEQ ID NO:50:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 395 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Arabidopsis thaliana (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:50:
AGACCTGGTG | GTTATAAGCC | TATTGTGTTT | GTCAATGGAC | CTGTTAGTAC | TTTGGATAAA | 60 |
TTGCTTATTA | CGCGATCTCG | GAGTGTGTTG | TCGTGAATCT | GTGAGAGATG | GGATGAATTT | 120 |
GGTGCCTTAT | AAGTACACAG | TGACTCGGCA | AGGGAGCCCT | GCTTTGGATG | CAGCTTTAGG | 180 |
TTTTGGGGAG | GATGATGTTA | GGAAGAGTGT | GATTATTGTT | TCTAGTTCAT | CGGTTGTCTC | 240 |
CATCTCTGAG | TGGTGCGATC | CGTTAATCCG | TGGAACATCG | TGCAGTCACT | AAACGCCATG | 300 |
AGCCTGCAAT | ACGATGTCGC | AAAGGGAAAA | TCTTTGCCAC | CAGAAGCATC | ATAAGTACAT | 360 |
AAAGCCTCAC | AATTGCCTAT | TTGGGCCGGG | GTTTT | 395 |
133
44
4 4 4
4 4 4
(2)Informace o SEQ ID NO:51:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 431 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Oryza sativa (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: misc_feature (B) Umístění: 1 (D)Další informace:/standard_name=GENBANK ID:D22143 (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:51:
GGGAATGGAG | GGTCTCCGAG | CTGCAGCAGC | AATTTGAGGG | GAAGACTGTG | TTGCTCGGTG | 60 |
TGGATGACAT | GGATATCTTC | AAGGGTATCA | ACTTGAAGCT | TCTTGCCTTC | GAGAATATGT | 120 |
TGAGGACACA | TCCCAAGTGG | CAGGGGCGGG | CAGTGTTGGT | GCAAATTGCT | AATCCGGCCC | 180 |
GTGGAAAGGG | TAAGGATCTT | GAAGCCATCC | AGGCTGAGAT | TCATGAGAGC | TGCAAGAGGA | 240 |
TTAATGGAGA | GTTTGGCCAG | TCAGGATACA | GCCCTGTTGT | CTTCATTGAC | CGTGATGTGT | 300 |
CAAGTGTGGA | GGAAGATTGC | CTACTACACA | ATAGCAGAAT | GTGTGGTGGT | GACTGCTGTT | 360 |
AGGGATGGGA | TTGACTTGAC | ACCATATGGA | TATATTGTCT | GTAGGGCAGG | GGTCTTACTC | 420 |
ACATCAGAGG | T | 431 |
(2)Informace o SEQ ID NO:52:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 496 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne
134
·· · • · 4 • ···· · (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Oryza sativa (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klič: misc_feature (B) Umístění: 1 (D)Další informace:/standard_name=GENBANK ID:D40048 (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:52:
CTACCGTTCC CTCCCTGTTC GCGACGAGAT CCTCAAATCA CTGCTAAACT GCGATCTGAT 60
TGGGTTCCAC ACCTTTGATT ACGCGCGGCA TTTCCTGTCC TGCTGCAGCC GGATGCTGGG 120
GATCGAGTAC CAGTCGAAGA GGGGATATAT CGGTCTCGAT TACTTTGGCC GCACTGTTGG 180
GATAAAGATC ATGCCTGTTG GGATTAACAT GACGCAGCTG CAGACGCAGA TCCGGCTGCC 240
TGATCTTGAG TGGCGTGTCG CGAACTCCGG AAGCAGTTTG ATGGGAAGAC TGTCATGCTC 300
GGTGTGGATG ATATGGACAT ATTTAAGGGG ATTAATCTGA AAGTTCTTGC GTTTTGAGCA 360
GATGCTGAGG ACACACCCAA AATGGCAGCC AAGGCAGTTT TGGTGCAGAT TCAAACCAAG 420
GGTGGTTGTT GGGAGGACTT AGGTACAGCT AGATATGAGT TCAGGGGTAA TGACATTTCA 480
GGCGGTATTT CCTTGG 496 (2)Informace o SEQ ID NO:53:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 288 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA' k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A)Organizmus: Oryza sativa (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:53:
GGACCAAAGA AGAGCATGTT GGTTGTGTCG GAGTTTATTG GTTGCTCACC TTCACTGAGT 60
GGAGCCATTC GTGTTAACCC GTGGAATATC GAGGCAACTG CAGAGGCACT GAATGAGGCC 120
ATCTCAATGT CAGAGCGTAA AAGCAGCTGA GGCACGAAAA ACATTACCGT TATGTCAGCA 180
CCCATGATGT TGCATATTGG TCTAAGAGCT TTGTACAGGA CCTGGAGAGG GCTTGCAAGG 240 ATCACTTTAG GAAACCATGC TGGGGCATTG GATTGGATTT CGCTCAGG t 288
135 • · · • frfrfr · « frt ·· frfr • · · · · fr· · • frfr · · · · fr · ·· frfrfr ··· • frfr frfr • frfr frfr ·· ·· (2)Informace o SEQ ID NO:54:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 2207 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: dva (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA k mRNA (iii) Hypotetický: Ne (iii)Antisence: Ne (vi)Původní zdroj:
(A) Organizmus: Solanum tuberosum (B) Druh: Kardal (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umístění: 161..1906 (D)Další informace:/částečná (ix) Vlastnosti:
(A) Jméno/Klíč: CDS (B) Umistění: 842..850 (D)Další informace:/function= „putative glycosylationsite (funkce=pravděpodobné místo glykosylace) (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:54:
CTTTTCTGAG TAATAACATA GGCATTGATT TTTTTTCAAT TAATAACACC | TGCAAACATT | 60 |
CCCATTGCCG GCATTCTCTG TTCTTACAAA AAAAAACATT TTTTTGTTCA | CATAAATTAG | 120 |
TTATGGCATC AGTATTGAAC CCTTTAACTT GTTATACAAT ATG GGT AAA Met Gly Lys | GCT ATA Ala Ile | 175 |
5
ATT TTT ATG | ATT TTT | ACT Thr | ATG TCT ATG AAT ATG ATT | AAA Lys | GCT GAA ACT | 223 | ||||||||||
Ile | Phe Met | Ile | Phe 10 | Met | Ser Met | Asn 15 | Met | Ile | Ala | Glu 20 | Thr | |||||
TGC | AAA | TCC | ATT | GAT | AAG | GGT | CCT | GTA | ATC | CCA | ACA | ACC | CCT | TTA | GTG | 271 |
Cys | Lys | Ser | Ile | Asp | Lys | Gly | Pro | Val | Ile | Pro | Thr | Thr | Pro | Leu | Val | |
25 | 30 | 35 | ||||||||||||||
ATT | TTT | CTT | GAA | AAA | GTT | CAA | GAA | GCT | GCT | CTT | CAA | ACT | TAT | GGC | CAT | 319 |
Ile | Phe | Leu | Glu | Lys | Val | Gin | Glu | Ala | Ala | Leu | Gin | Thr | Tyr | Gly | His | |
40 | 45 | 50 | ||||||||||||||
AAA | GGG | TTT | GAT | GCT | AAA | CTG | TTT | GTT | GAT | ATG | TCA | CTG | AGA | GAG | AGT | 367 |
Lys | Gly | Phe | Asp | Ala | Lys | Leu | Phe | Val | Asp | Met | Ser | Leu | Arg | Glu | Ser | |
55 | 60 | 65 |
136 ·0
0 0 0 • 0 0 4
000 004
0
00
0 • 0 ·
0 0«
0 0000 0
0 0
0 « 00 0 4 0 4
4 0
0 0
0 0 «00 00
CTT TCA GAA ACA | GTT Val | GAA GCT Glu Ala 75 | TTT Phe | AAT AAG CTT CCA AGA | GTT Val | GTG AAT | 415 | ||||||||
Leu 70 | Ser | Glu | Thr | Asn | Lys | Leu 80 | Pro | Arg | Val | Asn 85 | |||||
GGT | TCA | ATA | TCA | AAA | AGT GAT | TTG | GAT | GGT | TTT | ATA | GGT | AGT | TAC | TTG | 463 |
Gly | Ser | Ile | Ser | Lys | Ser Asp | Leu | Asp | Gly | Phe | Ile | Gly | Ser | Tyr | Leu | |
90 | 95 | 100 | |||||||||||||
AGT | AGT | CCT | GAT | AAG | GAT TTG | GTT | TAT | GTT | GAG | CCT | ATG | GAT | TTT | GTG | 511 |
Ser | Ser | Pro | Asp | Lys | Asp Leu | Val | Tyr | Val | Glu | Pro | Met | Asp | Phe | Val | |
105 | 110 | 115 | |||||||||||||
GCT | GAG | CCT | GAA | GGC | TTT TTG | CCA | AAG | GTG | AAG | AAT | TCT | GAG | GTG | AGG | 559 |
Ala | Glu | Pro | Glu | Gly | Phe Leu | Pro | Lys | Val | Lys | Asn | Ser | Glu | Val | Arg | |
120 | 125 | 130 | |||||||||||||
GCA | TGG | GCA | TTG | GAG | GTG CAT | TCA | CTT | TGG | AAG | AAT | TTA | AGT | AGG | AAA | 607 |
Ala | Trp | Ala | Leu | Glu | Val His | Ser | Leu | Trp | Lys | Asn | Leu | Ser | Arg | Lys | |
135 | 140 | 145 | |||||||||||||
GTG | GCT | GAT | CAT | GTA | TTG GAA | AAA | CCA | GAG | TTG | TAT | ACT | TTG | CTT | CCA | 655 |
Val | Ala | Asp | His | Val | Leu Glu | Lys | Pro | Glu | Leu | Tyr | Thr | Leu | Leu | Pro | |
150 | 155 | 160 | 165 | ||||||||||||
TTG | AAA | AAT | CCA | GTT | ATT ATA | CCG | GGA | TCG | CGT | TTT | AAG | GAG | GTT | TAT | 703 |
Leu | Lys | Asn | Pro | Val | Ile Ile | Pro | Gly | Ser | Arg | Phe | Lys | Glu | Val | Tyr | |
170 | 175 | 180 | |||||||||||||
TAT | TGG | GAT | TCT | TAT | TGG GTA | ATA | AGG | GGT | TTG | TTA | GCA | AGC | AAA | ATG | 751 |
Tyr | Trp | Asp | Ser | Tyr | Trp Val | Ile | Arg | Gly | Leu | Leu | Ala | Ser | Lys | Met | |
185 | 190 | 195 | |||||||||||||
TAT | GAA | ACT | GCA | AAA | GGG ATT | GTG | ACT | AAT | CTG | GTT | TCT | CTG | ATA | GAT | 799 |
Tyr | Glu | Thr | Ala | Lys | Gly Ile | Val | Thr | Asn | Leu | Val | Ser | Leu | Ile | Asp | |
200 | 205 | 210 | |||||||||||||
CAA | TTT | GGT | TAT | GTT | CTT AAC | GGT | GCA | AGA | GCA | TAC | TAC | AGT | AAC | AGA | 847 |
Gin | Phe | Gly | Tyr | Val | Leu Asn | Gly | Ala | Arg | Ala | Tyr | Tyr | Ser | Asn | Arg | |
215 | 220 | 225 | |||||||||||||
AGT | CAG | CCT | CCT | GTC | CTG GCC | ACG | ATG | ATT | GTT | GAC | ATA | TTC | AAT | CAG | 895 |
Ser | Gin | Pro | Pro | Val | Leu Ala | Thr | Met | Ile | Val | Asp | Ile | Phe | Asn | Gin | |
230 | 235 | 240 | 245 | ||||||||||||
ACA | GGT | GAT | TTA | AAT | TTG GTT | AGA | AGA | TCC | CTT | CCT | GCT | TTG | CTC | AAG | 943 |
Thr | Gly | Asp | Leu | Asn | Leu Val | Arg | Arg | Ser | Leu | Pro | Ala | Leu | Leu | Lys | |
250 | 255 | 260 | |||||||||||||
GAG | AAT | CAT | TTT | TGG | AAT TCA | GGA | ATA | CAT | AAG | GTG | ACT | ATT | CAA | GAT | 991 |
Glu | Asn | His | Phe | Trp | Asn Ser | Gly | Ile | His | Lys | Val | Thr | Ile | Gin | Asp | |
265 | 270 | 275 | |||||||||||||
GCT | CAG | GGA | TCA | AAC | CAC AGC | TTG | AGT | CGG | TAC | TAT | GCT | ATG | TGG | AAT | 1039 |
Ala | Gin | Gly | Ser | Asn | His Ser | Leu | Ser | Arg | Tyr | Tyr | Ala | Met | Trp | Asn |
280 285 290
137 • 4 4·
4 4 4 «4 4
4«· • « ¢414 •
• 44
AAG Lys | CCC Pro 295 | CGT Arg | CCA Pro | GAA TCG TCA ACT | ATA Ile | GAC AGT | GAA ACA GCT | TCC Ser | GTA Val | 1087 | ||||||
Glu | Ser | Ser 300 | Thr | Asp | Ser | Glu 305 | Thr | Ala | ||||||||
CTC | CCA | AAT | ATA | TGT | GAA | AAA | AGA | GAA | TTA | TAC | CGT | GAA | CTG | GCA | TCA | 1135 |
Leu | Pro | Asn | Ile | Cys | Glu | Lys | Arg | Glu | Leu | Tyr | Arg | Glu | Leu | Ala | Ser | |
310 | 315 | 320 | 325 | |||||||||||||
GCT | GCT | GAA | AGT | GGA | TGG | GAT | TTC | AGT | TCA | AGA | TGG | ATG | AGC | AAC | GGA | 1183 |
Ala | Ala | Glu | Ser | Gly | Trp | Asp | Phe | Ser | Ser | Arg | Trp | Met | Ser | Asn | Gly | |
330 | 335 | 340 | ||||||||||||||
TCT | GAT | CTG | ACA | ACA | ACT | AGT | ACA | ACA | TCA | ATT | CTA | CCA | GTT | GAT | TTG | 1231 |
Ser | Asp | Leu | Thr | Thr | Thr | Ser | Thr | Thr | Ser | Ile | Leu | Pro | Val | Asp | Leu | |
345 | 350 | 355 | ||||||||||||||
AAT | GCA | TTC | CTT | CTG | AAG | ATG | GAA | CTT | GAC | ATT | GCC | TTT | CTA | GCA | AAT | 1279 |
Asn | Ala | Phe | Leu | Leu | Lys | Met | Glu | Leu | Asp | Ile | Ala | Phe | Leu | Ala | Asn | |
360 | 365 | 370 | ||||||||||||||
CTT | GTT | GGA | GAA | AGT | AGC | ACG | GCT | TCA | CAT | TTT | ACA | GAA | GCT | GCT | CAA | 1327 |
Leu | Val | Gly | Glu | Ser | Ser | Thr | Ala | Ser | His | Phe | Thr | Glu | Ala | Ala | Gin | |
375 | 380 | 385 | ||||||||||||||
AAT | AGA | CAG | AAG | GCT | ATA | AAC | TGT | ATC | TTT | TGG | AAC | GCA | GAG | ATG | GGG | 1375 |
Asn | Arg | Gin | Lys | Ala | Ile | Asn | Cys | Ile | Phe | Trp | Asn | Ala | Glu | Met | Gly | |
390 | 395 | 400 | 405 | |||||||||||||
CAA | TGG | CTT | GAT | TAC | TGG | CTT | ACC | AAC | AGC' | GAC | ACA | TCT | GAG | GAT | ATT | 1423 |
Gin | Trp | Leu | Asp | Tyr | Trp | Leu | Thr | Asn | Ser | Asp | Thr | Ser | Glu | Asp | Ile | |
410 | 415 | 420 | ||||||||||||||
TAT | AAA | TGG | GAA | GAT | TTG | CAC | CAG | AAC | AAG | AAG | TCA | TTT | GCC | TCT | AAT | 1471 |
Tyr | Lys | Trp | Glu | Asp | Leu | His | Gin | Asn | Lys | Lys | Ser | Phe | Ala | Ser | Asn | |
425 | 430 | 435 | ||||||||||||||
TTT | GTT | CCG | CTG | TGG | ACT | GAA | ATT | TCT | TGT | TCA | GAT | AAT | AAT | ATC | ACA | 1519 |
Phe | Val | Pro | Leu | Trp | Thr | Glu | Ile | Ser | Cys | Ser | Asp | Asn | Asn | Ile | Thr | |
440 | 445 | 450 | ||||||||||||||
ACT | CAG | AAA | GTA | GTT | CAA | AGT | CTC | ATG | AGC | TCG | GGC | TTG | CTT | CAG | CCT | 1567 |
Thr | Gin | Lys | Val | Val | Gin | Ser | Leu | Met | Ser | Ser | Gly | Leu | Leu | Gin | Pro | |
455 | 460 | 465 | ||||||||||||||
GCA | GGG | ATT | GCA | ATG | ACC | TTG | TCT | AAT | ACT | GGA | CAG | CAA | TGG | GAT | TTT | 1615 |
Ala | Gly | Ile | Ala | Met | Thr | Leu | Ser | Asn | Thr | Gly | Gin | Gin | Trp | Asp | Phe | |
470 | 475 | 480 | 485 | |||||||||||||
CCG | AAT | GGT | TGG | CCC | CCC | CTT | CAA | CAC | ATA | ATC | ATT | GAA | GGT | CTC | TTA | 1663 |
Pro | Asn | Gly | Trp | Pro | Pro | Leu | Gin | His | Ile | Ile | Ile | Glu | Gly | Leu | Leu | |
490 | 495 | 500 | ||||||||||||||
AGG | TCT | GGA | CTA | GAA | GAG | GCA | AGA | ACC | TTA | GCA | AAA | GAC | ATT | GCT | ATT | 1711 |
Arg | Ser | Gly | Leu | Glu | Glu | Ala | Arg | Thr | Leu | Ala | Lys | Asp | Ile | Ala | Ile | |
505 | 510 | 515 |
138 • ·
• · • · • · • · • · • · | 9 9 9 9 • · · · • • | • • • | • · • • • • • · · | • · • · • · • | • 9 • · • · • · · • • · | • 9 • • • · · • • · | |||||||||
Thr | Glu | Ala | Ala | Gin | Asn | Arg | Gin | Lys | Ala | Ile | Asn | Cys | Ile | Phe | Trp |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Asn | Ala | Glu | Met | Gly | Gin | Trp | Leu | Asp | Tyr | Trp | Leu | Thr | Asn | Ser | Asp |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Thr | Ser | Glu | Asp | Ile | Tyr | Lys | Trp | Glu | Asp | Leu | His | Gin | Asn | Lys | Lys |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ser | Phe | Ala | Ser | Asn | Phe | Val | Pro | Leu | Trp | Thr | Glu | Ile | Ser | Cys | Ser |
435 | 440 | • A, | 445 | ||||||||||||
Asp | Asn | Asn | Ile | Thr | Thr | Gin | Lys | Val | Val | Gin | Ser | Leu | Met | Ser | Ser |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Gly | Leu | Leu | Gin | Pro | Ala | Gly | Ile | Ala | Met | Thr | Leu | Ser | Asn | Thr | Gly |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Gin | Trp | Asp | Phe | Pro | Asn | Gly | Trp | Pro | Pro | Leu | Gin | His | Ile | Ile |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Ile | Glu | Gly | Leu | Leu | Arg | Ser | Gly | Leu | Glu | Glu | Ala | Arg | Thr | Leu | Ala |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Lys | Asp | Ile | Ala | Ile | Arg | Trp | Leu | Arg | Thr | Asn | Tyr | Val | Thr | Tyr | Lys |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Lys | Thr | Gly | Ala | Met | Tyr | Glu | Lys | Tyr | Asp | Val | Thr | Lys | Cys | Gly | Ala |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Tyr | Gly | Gly | Gly | Gly | Glu | Tyr | Met | Ser | Gin | Thr | Gly | Phe | Gly | Trp | Ser |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Asn | Gly | Val | Val | Leu | Ala | Leu | Leu | Glu | Glu | Phe | Gly | Trp | Pro | Glu | Asp |
565 ’ 570 575
Leu Lys Ile Asp Cys 580 (2)Informace o SEQ ID NO:56:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 18 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID NO:56:
CTCAGATCTG GCCACAAA
139
Pro Arg
Ile Gly
Pro Met
Asn Ser 130
Asn Leu 145
Tyr Thr
Phe Lys
Leu Ala
Val Ser 210
Tyr Tyr. 225
Asp Ile
Pro Ala
Val Thr
Tyr Ala 290
Glu’ Thr 305
Arg Glu
Trp Met
Leu Pro
Ala Phe 370
Val Val Asn Gly Ser Ile Ser
Ser Tyr Leu Ser Ser Pro Asp 100 105
Asp Phe Val Ala Glu Pro Glu 115 120
Glu Val Arg Ala Trp Ala Leu 135
Ser Arg Lys Val Ala Asp His 150
Leu Leu Pro Leu Lys Asn Pro 165
Glu Val Tyr Tyr Trp Asp Ser 180 185
Ser Lys Met Tyr Glu Thr Ala 195 200
Leu Ile Asp Gin Phe Gly Tyr 215 .Ser^sn ;^^bi,^Se.r.<Gln. Pro Pro
Phe Asn Gin Thr Gly Asp Leu 245
Leu Leu Lys Glu Asn His Phe 260 265
Ile Gin Asp Ala Gin Gly Ser 275 280
Met Trp Asn Lys Pro Arg Pro 295
Ala Ser Val Leu Pro Asn Ile 310
Leu Ala Ser Ala Ala Glu Ser 325
Ser Asn Gly Ser Asp Leu Thr 340 345
Val Asp Leu Asn Ala Phe Leu 355 360
Leu Ala Asn Leu Val Gly Glu
375
Lys Ser Asp Leu Asp Gly Phe
95
Lys Asp Leu Val Tyr Val Glu 110
Gly Phe Leu Pro Lys Val Lys 125
Glu Val His Ser Leu Trp Lys 140
Val Leu Glu Lys Pro Glu Leu 155 160
Val Ile Ile Pro Gly Ser Arg 170 175
Tyr Trp Val Ile Arg Gly Leu 190
Lys Gly Ile Val Thr Asn Leu 205
Val Leu Asn Gly Ala Arg Ala 220
Val Leu Ala Thr Met Ile .y/jg 23 5
Asn Leu Val Arg Arg Ser Leu 250 255
Trp Asn Ser Gly Ile His Lys 27 5
Asn His Ser Leu Ser Arg Tyr 285
Glu Ser Ser Thr Ile Asp Ser 300
Cys Glu Lys Arg Glu Leu Tyr 315 320
Gly Trp Asp Phe Ser Ser Arg 330 335
Thr Thr Ser Thr Thr Ser Ile 350
Leu Lys Met Glu Leu Asp Ile 365
Ser Ser Thr Ala Ser His Phe 380
140
(2)Informace o SEQ ID NO:57:
(i) Charakteristika sekvence (A) Délka: 18 párů bázi (B) Typ: nukleová kyselina (C) Počet řetězců: jeden (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: Ne (xi)Popis sekvence: SEQ ID N0:6:
GTGCTCGTCT GCAGGTGC
Claims (98)
- PATENOVÉ NÁROKY1. Způsob modifikace vývoje a/nebo složení buněk, tkání a orgánů in vivo jinak než udělením schopnosti syntetizovat trehalasu, indukcí změn metabolické dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 2. Způsob stimulace toku uhlíku v buňkách v glykolytickém směru snížením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 3. Způsob inhibice toku uhlíku v buňkách v glykolytickém směru zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 4. Způsob inhibice fotosyntézy v buňkách snížením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 5. Způsob stimulace fotosyntézy v buňkách zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 6. Způsob stimulace aktivit spojených se spotřebou (sink-related activity) zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 7. Způsob stimulace růstu buněk nebo tkání snížením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 8. Způsob získání zakrslých organismů zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 9. Způsob zvýšení metabolismu buněk snížením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 10. Způsob podle nároků 2,4,7 nebo 9 charakterizovaný tak, že se uvedené snížení vnitrobuněčné koncentrace trehalosa-6-fosfátu uskuteční zvýšením aktivity trehalosafosfátfosfatasy (TPP).• · ···· • · • « • · • · ·»· ·* ·· ·· • · · · • · · · ··· ··· • · • · • * ··
- 11. Způsob podle nároku 10, charakterizovaný tak, že se zvýšení aktivity TPP dosáhne transformací uvedených buněk vektorem schopným exprese enzymu TPP.
- 12. Způsob podle nároku 11, charakterizovaný tak, že se uvedené buňky transformují vektorem obsahujícím heterologní gen kódující TPP.
- 13. Způsob podle nároku 2,4,7 nebo 9, charakterizovaný tak, že se uvedené snížení vnitrobuněčné koncentrace trehalosa-6-fosfátu uskuteční snížením aktivity trehalosafosfátsyntasy (TPS).
- 14. Způsob podle nároku 13, charakterizovaný tak, že se snížení aktivity TPS uskuteční transformací uvedených buněk vektorem schopným exprese molekuly, která inhibuje TPS.
- 15. Způsob podle nároku 14, charakterizovaný tak, že uvedený vektor obsahuje anti-sense gen TPS.
- 16. Způsob podle nároku 10, charakterizovaný tak, že se uvedené znížení dosáhne mutací endogenního enzymu TPP.
- 17. Způsob podle nároku 10, charakterizovaný tak, že se uvedené znížení trehalosa-6-fosfátu uskuteční relativní overexpresí fosfo-alfa-(1,1)glukosidasy.
- 18. Způsob podle nároku 3, 5, 6 nebo 8, charakterizovaný tak, že se uvedené zvýšení vnitrobuněčné koncentrace trehalosa-6-fosfátu uskuteční zvýšením aktivity TPS.
- 19. Způsob podle nároku 18, charakterizovaný tak, že se uvedené zvýšení aktivity TPS dosáhe transformací uvedených buněk vektorem schopným exprese enzymu TPS.• · * · · • · ··· ···
- 20. Způsob podle nároku 19, charakterizovaný tak, že se uvedené buňky transformují vektorem obsahujícím heterologní gen kódující TPS.
- 21. Způsob podle nároku 3, 5, 6 nebo 8, charakterizovaný tak, že se uvedené zvýšení vnitrobuněčné koncentrace trehalosa-6-fosfátu uskuteční snížením aktivity TPP.
- 22. Způsob podle nároku 21, charakterizovaný tak, že se uvedené snížení aktivity TPP uskuteční transformací uvedených buněk vektorem schopným exprese molekuly, která inhibuje TPP
- 23. Způsob podle nároku 22, charakterizovaný tak, že uvedený vektor obsahuje anti-sense gen TPS.
- 24. Způsob podle nároku 16, charakterizovaný tak, že se uvedené zvýšení dosáhne mutací endogenního enzymu TPS.
- 25. Způsob podle kteréhokoliv nároku 1-24, charakterizovaný tak, že je uvedená buňka nebo buňky lokalizována v rostlině.
- 26. Způsob podle nároku 25, charakterizovaný tak, že jsou uvedené rostliny rostliny transgenní.
- 27. Způsob podle nároku 26, charakterizovaný tak, že jsou uvedené transgenní rostliny produkovány transformací Agronbacterium tumefaciens.
- 28. Způsob podle kteréhokoliv nároku 1-24, charakterizovaný tak, že je uvedená buňka nebo buňky lokalizována v živočichovi, přednostně v savci, ještě přednostněji v lidské bytosti.
- 29. Způsob podle kteréhokoliv nároku 1-24, charakterizovaný tak, ěe uvedené buňky jsou miroorganismy, přednostně mikroorganismy vybrané ze skupiny obsahující bakterie, mikroby, kvasinky, plísně, buněčné kultury, oocyty, spermatické buňky, hybridomy, Protista a kalusy.» · ·
- 30. Klonovací vektor, který obsahuje gen kódující TPP, uvedený gen není kvasinkovým TPP genem.
- 31. Klonovací vektor podle nároku 30, charakterizovanáý tak, že obsahuje nukleotidové sekvence vybrané ze skupiny nukleotidových sekvencí zobrazených v SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17 a částí kodujích TPP v dvoudílných enzymech, jak jsou kodovany v SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:39, SEQ IDNO:42, SEQ ID NO:44.
- 32. Klonovací vektor, který obsahuje anti-sense gen kódující TPS, který je po expresi schopný zamezit funkční aktivitě endogenního genu pro TPS.
- 33. Klonovací vektor, který obsahuje gen TPP, charakterizovaný ta, že obsahuje nukleotidové sekvence vybrané ze skupiny nukleotidových sekvencí zobrazených v SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:44.
- 34. Klonovací vektor, který obsahuje anti-sense gen kódující TPP, který je po expresi schopný zamezit funkční aktivitě endogenního genu pro TPP.
- 35. Rostlina charakterizovaná tak, že ona nebo její předchůdci jsou transformovány vektorem obsahujícím nukleotidovou sekvenci kódující TPP, přičemž uvedený gen není kvasinkový gen pro TPP, ale uvedená roslina stále obsahuje uvedenou nukleotidovou sekvenci.
- 36. Rostlina charakterizovaná tak, že ona nebo její předchůdci jsou transformovány vektorem obsahujícím nukleotidovou sekvenci kódující anti-sense gen TPP a uvedená roslina stále obsahuje uvedenou nukleotidovou sekvenci.• · · • · · • · ♦ · • · · · · · 9 • · ·
- 37. Rostlina charakterizovaná tak, že ona nebo její předchůdci jsou transformovány vektorem obsahujícím nukleotidovou sekvenci kódující anti-sense gen TPS a uvedená roslina stále obsahuje uvedenou nukleotidovou sekvenci.
- 38. Použití trehalosa-6-fosfátu k ovlivnění rozdělení karbohydrátů v buňkách.
- 39. Použití trehalosa-6-fosfátu ke zvýšení biomasy.
- 40. Použití trehalosa-6-fosfátu k ovlivnění aktivity hexokinasy in vivo.
- 41. Použití trehalosa-6-fosfátu k ovlivnění funkce hexokinasove signalizace in vivo.
- 42. Použití trehalosa-6-fosfátu k ovlivnění syntézy buněčné stěny.
- 43. Použití látek ovlivňujících vnitrobuněčnou dostupnost trehalosa-6 fosfátu ke zvýšení biomasy.
- 44. Použití látek ovlivňujících vnitrobuněčnou dostupnost trehalosa-6 fosfátu k ovlivnění aktivity hexokinasy.
- 45. Použití látek ovlivňujících vnitrobuněčnou dostupnost trehalosa-6 fosfátu k ovlivnění fofosyntézy.
- 46. Použití látek ovlivňujících vnitrobuněčnou dostupnost trehalosa-6 fosfátu k ovlivnění toku uhlíku v glykolytické cestě.
- 47. Způsob prevence chladového sládnutí zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.• * · · · · • · toto·· • · · ··· ···9 9 9 999 99 99
- 48. Způsob inhibice invertasy v řepě po sklizni zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 49. Použití látek ovlivňujících vnitrobuněčnou dostupnost trehalosa-6fosfátu k ovlivnění chladového sládnutí nebo inhibici invertasy.
- 50. Způsob podle nároku 47 nebo 48, charakterizovaný tak, že zvýšení vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu je výsledkem zvýšení aktivity trehalosafosfátsyntasy.
- 51. Způsob podle nároku 47, charakterizovaný tak, že je regulace dostupnosti trehalosa-6-fosfátu specificky zvýšená v bramborových hlízách.
- 52. Způsob podle nároku 51, charakterizovaný tak, že je gen kodujici trehalosafosfátsyntasu specificky exprimován ve hlízách.
- 53. Způsob podle nároku 52, charakterizovaný tak, že uvedený gen je gen pro TPS z Escherichia coli.
- 54. Způsob podle nároku 48, charakterizovaný tak, že je regulace dostupnosti trehalosa-6-fosfátu specificky zvýšená v hlavním kořenu řepy.
- 55. Způsob podle nároku 54, charakterizovaný tak, že je gen kodujici trehalosafosfátsyntasu specificky exprimován v hlavním kořeni.
- 56. Způsob akumulace trehalosy, charakterizovaný ta, že se organismus transformuje sekvencí DNA kódující dvoudílný enzym TPS-TPP.
- 57. Způsob podle nároku 56, charakterizovaný tak, že uvedený gen je dvoudílný gen z Arabidopsis thalíana • · • · • · · · · • · · · · • ·
- 58. Způsob podle nároku 56, charakterizovaný tak, že uvedený gen je dvoudílný gen z Selaginella lepidophylla.
- 59. Způsob podle nároku 56, charakterizovaný tak, že uvedený gen je lidský dvoudílný gen.
- 60. Způsob podle nároku 56, charakterizovaný tak, že uvedený gen je dvoudílný gen z Helianthus annuus.
- 61. Způsob zamezení metabolického řízení během produkce trehalosy expresí sekvence DNA kódující dvoudílný enzym TPS-TPP.
- 62. Způsob podle nároku 1-24, charakterizovaný tak, že je exprese TPP nebo TPS omezena na specifickou tkáň.
- 63. Způsob podle nároku 1-24, charakterizovaný tak, že exprese TPP nebo TPS je pod kontrolou indukovatelného promotoru.
- 64. Způsob stimulace toku uhlíku v buňkách v glykolytickém směru expresí trehalosa-6-fosfátfosfatasy.
- 65. Způsob inhibice toku uhlíku v buňkách v glykolytickém směru expresí trehalosa-6-fosfátsyntasy.
- 66. Způsob inhibice fotosyntézy v buňkách expresí trehalosa-6fosfátfosfatasy.
- 67. Způsob stimulace fotosyntézy v buňkách expresí trehalosa-6fosfátsyntasy.
- 68. Způsob stimulace aktivit spojených se spotřebou (sink-related activity) expresí trehalosa-6-fosfátsyntasy.• * * · · • · · · • · · · · · • · · • · · • * · · · • flfl · · · « • fl 99 99 * · «
- 69. Způsob stimulace růstu buněk nebo tkání expresí trehalosa-6fosfátfosfatasy.
- 70. Způsob získání organismů redukované velikosti expresí trehalosa-6fosfátsyntasy.
- 71. Způsob zvýšení metabolismu buněk expresí trehalosa-6fosfátfosfatasy.
- 72. Způsob zamezení chladového sládnutí expresí trehalosa-6fosfátsyntasy.
- 73. Způsob zamezení předčasného dozrávání snížením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 74. Způsob zamezení předčasného dozrávání expresí trehalosa-6fosfátfosfatasy.
- 75. Způsob indukce předčasného dozrávání zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 76. Způsob indukce předčasného dozrávání expresí trehalosa-6fosfátsyntasy.
- 77. Způsob zvýšení výnosu rostlin jejich transformací enzymem kódujícím trehalosa-6-fosfátfosfatasu.
- 78. Způsob zvýšení výnosu rostlin zvýšením vnitrobuněčné dostupnosti trehalosa-6-fosfátu.
- 79. Polynukleotid kódující trehalosa-6-fosfátsyntasu, charakterizovaný tak, že to je dvoudílný enzym mající mutaci v části kódující trehalosa-6-fosfátfosfatasu.• · • · • 4 4 • 4 4*4 4 44 44 4 444 44 4 · 4 « ·4 4 4 4 · 44 44 444 4444 4 4 444 44 44
- 80. Polynukleotid kódující trehalosa-6-fosfátfosfatasu, charakterizovaný tak, že to je dvoudílný enzym mající mutaci v části kódující trehalosa-6-fosfátsyntasu.
- 81. Polynukleotid podle nároku 79 nebo 80, charakterizovaný tak, že dvoudílný gen je lidský TPS/TPP.
- 82. Polynukleotid podle nároku 81, charakterizovaný tak, že lidský TPS/TPP obsahuje aminokyselinovou sekvenci podle SEQ ID NO:11.
- 83. Polynukleotid podle nároku 82, charakterizovaný tak, že obsahuje polynukleotidovou sekvenci SEQ ID NO:10.
- 84. Polynukleotid podle nároku 79 nebo 80, charakterizovaný tak, že dvoudílný gen je TPS/TPP gen Arabidopsis thaliana.
- 85. Polynukleotid podle nároku 84, charakterizovaný tak, že lidský TPS/TPP obsahuje aminokyselinovou sekvenci podle SEQ ID NO:40.
- 86. Polynukleotid podle nároku 85, charakterizovaný tak, že obsahuje polynukleotidovou sekvenci SEQ ID NO:39.
- 87. Polynukleotid podle nároku 79 nebo 80, charakterizovaný tak, že dvoudílný gen je TPS/TPP gen Selaginella lepidophylla.
- 88. Polynukleotid podle nároku 87, charakterizovaný tak, že lidský TPS/TPP obsahuje aminokyselinovou sekvenci podle SEQ ID NO:43 nebo odtud pocházející mutein.
- 89. Polynukleotid podle nároku 88, charakterizovaný tak, že obsahuje polynukleotidovou sekvenci SEQ ID NO:42 nebo SEQ ID NO:44.
- 90. Polynukleotid podle nároku 79 nebo 80, charakterizovaný tak, že dvoudílný gen je TPS/TPP gen Helianthus annuus.«44 4444 «·«· • 444 444 4 · 4 ·4 4 4444 4 4 4 4 4 4· 4 4 4 4444 444 4 444 4 44444 44 44
- 91. Polynukleotid podle nároku 90, charakterizovaný tak, že lidský TPS/TPP obsahuje aminokyselinovou sekvenci podle SEQ ID NO:25 nebo odtud pocházející mutein.
- 92. Polynukleotid podle nároku 91, charakterizovaný tak, že obsahuje polynukleotidovou sekvenci SEQ ID NO:24 nebo SEQ ID NO:26 nebo SEQ ID NO:28.
- 93. Vektor přechovávající polynukleotid podle kteréhokoliv nároku 7992.
- 94. Hostitelský organismus obsahující vektor podle nároku 93.
- 95. Hostitelský organismus podle nároku 94, charakterizovaný tak, to je Agrobacterium tumefaciens.
- 96. Buňka transformovaná hostitelským organismem podle nároku 94 nebo 95.
- 97. Buňka podle nároku 96, charakterizovaná tak, že to je rostlinná buňka.
- 98. Rostlina nebo část rostliny, regenerovaná z rostlinné buňky podle nároku 97.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP96201225 | 1996-05-03 | ||
EP96202128 | 1996-07-26 | ||
EP96202395 | 1996-08-29 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ345098A3 true CZ345098A3 (cs) | 2000-01-12 |
Family
ID=27237548
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ19983450A CZ345098A3 (cs) | 1996-05-03 | 1997-05-02 | Regulace metabolismu modifikací hladiny trehalosa-6-fosfátu |
Country Status (24)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US6833490B1 (cs) |
EP (1) | EP0901527B1 (cs) |
JP (1) | JP2000510691A (cs) |
KR (1) | KR20000010758A (cs) |
CN (1) | CN1267558C (cs) |
AR (1) | AR006937A1 (cs) |
AT (1) | ATE301718T1 (cs) |
AU (2) | AU718379B2 (cs) |
BR (1) | BR9710959A (cs) |
CA (1) | CA2253348C (cs) |
CZ (1) | CZ345098A3 (cs) |
DE (1) | DE69733945T2 (cs) |
DK (1) | DK0901527T3 (cs) |
ES (1) | ES2243997T3 (cs) |
IL (1) | IL126781A0 (cs) |
IN (1) | IN1997CH00924A (cs) |
MA (1) | MA24248A1 (cs) |
MX (1) | MX9809128A (cs) |
NO (1) | NO985097L (cs) |
NZ (1) | NZ332677A (cs) |
PL (1) | PL329913A1 (cs) |
SK (1) | SK148498A3 (cs) |
TR (4) | TR199902037T2 (cs) |
WO (1) | WO1997042326A2 (cs) |
Families Citing this family (72)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5854067A (en) * | 1996-01-19 | 1998-12-29 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Hexokinase inhibitors |
US5891717A (en) * | 1996-01-19 | 1999-04-06 | Betagene, Inc. | Methods and compositions for inhibiting hexokinase |
IN1997CH00924A (en) * | 1996-05-03 | 2005-03-04 | Syngenta Mogen Bv | Regulating metabolism by modifying the level of trehalose-6-phosphate |
MX205414B (es) * | 1996-05-08 | 2001-12-07 | Univ Mexico Nacional Autonoma | Metodo para incrementar de trehalosa de los organismos por medio de su transformacion con el adnc de la trehalosa-6-fosfato sintasa/fosfatasa de selaginella lepidophylla. |
JP2001523110A (ja) * | 1997-05-02 | 2001-11-20 | モーヘン インターナショナル エヌ.ブイ. | 内在性トレハラーゼレベルの阻害によるトレハロース−6−リン酸のレベルの改変による代謝の調節 |
ZA989782B (en) | 1997-10-30 | 1999-05-04 | Mogen Int | Pre-and postharvest inhibition of remobilisation of storage compounds |
ZA989886B (en) * | 1997-10-30 | 1999-04-30 | Mogen Int | Nuclear male sterile plants method of producing same and methods to restore fertility |
WO1999024558A2 (en) * | 1997-10-30 | 1999-05-20 | Mogen International N.V. | Novel high-fermenting microorganisms |
WO1999023225A1 (en) * | 1997-10-30 | 1999-05-14 | Mogen International N.V. | Novel high-fermenting microorganisms |
DE19832334A1 (de) * | 1998-07-17 | 2000-01-20 | Norika Nordring Kartoffelzucht | Glucosylglycerolphosphatsynthasegene zur Erzeugung der niedermolekularen Schutzsubstanz Glucosylglycerol und ihre Verwendung |
EP1002867A1 (en) | 1998-10-15 | 2000-05-24 | K.U. Leuven Research & Development | Specific genetic modification of the activity of trehalose-6-phosphate synthase and expression in a homologous or heterologous environment |
US7612255B2 (en) * | 1999-02-03 | 2009-11-03 | Jonathan Gressel | Transgenic plants for mitigating introgression of genetically engineered genetic traits |
ES2241644T3 (es) | 1999-09-01 | 2005-11-01 | Monsanto Technology Llc | Secuencias reguladoras para el control selectivo de la expresion de genes en plantas. |
EA200200932A1 (ru) * | 2000-03-01 | 2003-02-27 | Рисерч Энд Дивелопмент Инститьют, Инк. | Трансгенные растения с повышенными урожайностью семян, биомассой и индексом урожайности |
GB0100105D0 (en) * | 2001-01-04 | 2001-02-14 | Leuven K U Res & Dev | The use of plant TPS (Trehalose-6-phosphate syntase) as a selectable marker for plant transformation |
PT1373488E (pt) | 2001-03-14 | 2009-07-31 | Univ Florida | Mutantes termoestáveis de enzimas de biossíntese de amido |
US8022272B2 (en) | 2001-07-13 | 2011-09-20 | Sungene Gmbh & Co. Kgaa | Expression cassettes for transgenic expression of nucleic acids |
CA2468727A1 (en) | 2001-12-03 | 2003-06-12 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Variants of adp-glucose pyrophosphorylase affecting phosphate sensitivity and other parameters |
KR100440725B1 (ko) * | 2002-06-20 | 2004-07-15 | 주식회사 그린진 바이오텍 | 비생물성 스트레스에 대한 단자엽 식물의 내성을증가시키는 방법 |
WO2004044143A2 (en) * | 2002-11-06 | 2004-05-27 | Cornell Research Foundation, Inc. | Tps plant gene constructs and transformants |
WO2005016268A2 (en) * | 2003-08-08 | 2005-02-24 | Mitochroma Research, Inc. | Alimentary compositions and methods for metabolic modulation |
CN101023175B (zh) * | 2004-04-20 | 2012-02-29 | 辛根塔参与股份公司 | 用于在植物繁殖组织中表达基因产物的调控序列 |
EP1645633B1 (en) | 2004-10-05 | 2011-09-21 | SunGene GmbH | Constitutive expression cassettes for regulation of plant expression |
EP1655364A3 (en) | 2004-11-05 | 2006-08-02 | BASF Plant Science GmbH | Expression cassettes for seed-preferential expression in plants |
EP1662000B1 (en) | 2004-11-25 | 2011-03-30 | SunGene GmbH | Expression cassettes for guard cell-preferential expression in plants |
CN101115385A (zh) * | 2004-12-03 | 2008-01-30 | 先正达参股股份有限公司 | 植物通过选择性抑制海藻糖-6-磷酸磷酸酶的胁迫耐性 |
EP1666599A3 (en) | 2004-12-04 | 2006-07-12 | SunGene GmbH | Expression cassettes for mesophyll- and/or epidermis-preferential expression in plants |
EP1669455B1 (en) | 2004-12-08 | 2009-10-28 | SunGene GmbH | Expression cassettes for vascular tissue-preferential expression in plants |
CN100355883C (zh) * | 2004-12-10 | 2007-12-19 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 水稻抗逆相关基因-海藻糖-6-磷酸磷酸化酶基因及其应用 |
EP1669456A3 (en) | 2004-12-11 | 2006-07-12 | SunGene GmbH | Expression cassettes for meristem-preferential expression in plants |
AU2006203837B2 (en) | 2005-01-07 | 2011-03-10 | Cold Spring Harbor Laboratory | Nucleotide sequences encoding Ramosa3 and sister of Ramosa3 and methods of use for same |
EP2184361A3 (en) | 2005-02-09 | 2010-07-14 | BASF Plant Science GmbH | Expression cassettes for regulation of expression in monocotyledonous plants |
CA2598307C (en) | 2005-02-26 | 2014-12-30 | Basf Plant Science Gmbh | Expression cassettes for seed-preferential expression in plants |
CN101137752B (zh) | 2005-03-08 | 2013-04-03 | 巴斯福植物科学有限公司 | 增强表达的内含子序列 |
EP1874938B1 (en) | 2005-04-19 | 2012-04-04 | BASF Plant Science GmbH | Starchy-endosperm and/or germinating embryo-specific expression in mono-cotyledonous plants |
US9085774B2 (en) | 2005-04-19 | 2015-07-21 | Basf Plant Science Gmbh | Methods controlling gene expression |
US7790873B2 (en) | 2005-05-10 | 2010-09-07 | Basf Plant Science Gmbh | Expression cassettes for seed-preferential expression in plants |
EP2522722A3 (en) * | 2005-12-09 | 2012-12-12 | BASF Plant Science GmbH | Nucleic acid molecules encoding polypeptides involved in regulation of sugar and lipid metabolism and methods of use VIII |
US8160670B2 (en) | 2005-12-28 | 2012-04-17 | Abbott Diabetes Care Inc. | Analyte monitoring: stabilizer for subcutaneous glucose sensor with incorporated antiglycolytic agent |
US8515518B2 (en) * | 2005-12-28 | 2013-08-20 | Abbott Diabetes Care Inc. | Analyte monitoring |
CN101374952B (zh) * | 2006-01-27 | 2011-07-06 | 福拉姆斯大学生物技术研究所 | 海藻糖-6-磷酸合酶调节植物生长的用途 |
BRPI0707297A2 (pt) | 2006-01-27 | 2011-05-03 | Vib Vzw E K U Leuven | Uso de uma trehalose-6-fosfato sintase de classe ii vengetal |
WO2007141790A2 (en) | 2006-06-07 | 2007-12-13 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem | Plant expression constructs and methods of utilizing same |
EP1873247A1 (en) * | 2006-06-29 | 2008-01-02 | VIB vzw | Novel bifunctional trehalose synthase |
WO2008071767A1 (en) * | 2006-12-15 | 2008-06-19 | Cropdesign N.V. | Plants having enhanced seed yield-related traits and a method for making the same |
BRPI0720084A2 (pt) * | 2006-12-15 | 2014-01-21 | Cropdesign Nv | Métodos para rendimento de semente aumentado em plantas em relação às plantas de controle, e para a produção de uma planta transgênica, planta, parte da planta ou célula da planta, molécula de ácido nucleico isolada, polipeptídeo isolado, construção, usos de uma construção e de um ácido nucleico, partes colhíveis de uma planta, e, produtos |
MX2009007565A (es) * | 2007-02-08 | 2009-07-22 | Basf Plant Science Gmbh | Uso de genes de trehalasa para proporcionar a las plantas resistencia contra nematodos. |
CA2675926A1 (en) | 2007-02-16 | 2008-08-21 | Basf Plant Science Gmbh | Nucleic acid sequences for regulation of embryo-specific expression in monocotyledonous plants |
EP2238231B1 (en) | 2008-01-03 | 2016-03-23 | Proterro, Inc. | Transgenic photosynthetic microorganisms and photobioreactor |
US8367392B2 (en) | 2008-09-05 | 2013-02-05 | Transalgae Ltd. | Genetic transformation of algal and cyanobacteria cells by microporation |
NZ591777A (en) | 2008-09-15 | 2012-12-21 | Agriculture Victoria Serv Pty | Modification of fructan biosynthesis, increasing plant biomass, and enhancing productivity of biochemical pathways in a plant |
US20100257639A1 (en) * | 2009-02-26 | 2010-10-07 | Robert Edward Bruccoleri | Methods and compositions for altering sugar beet or root crop storage tissue |
SG177412A1 (en) | 2009-06-30 | 2012-02-28 | Yissum Res Dev Co | Introducing dna into plant cells |
CN102471777B (zh) | 2009-07-10 | 2014-09-24 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 用于在植物中胚乳-特异性表达的表达盒 |
EP2507375A4 (en) | 2009-12-03 | 2013-04-24 | Basf Plant Science Co Gmbh | EXPRESSION CASSETTES FOR EMBRYOSPECIFIC EXPRESSION IN PLANTS |
CN102191228A (zh) * | 2010-03-12 | 2011-09-21 | 北京北方杰士生物科技有限责任公司 | 来自大肠杆菌合成海藻糖的融合蛋白及其在培育矮化草坪草中的应用 |
EP2676143B1 (en) | 2011-02-15 | 2023-11-01 | Hemosonics, Llc | Characterization of blood hemostasis and oxygen transport parameters |
PT2701514E (pt) * | 2011-04-26 | 2015-09-25 | Isis Innovation | Modificação dos níveis de trealose-6-fosfato em plantas |
US10420822B2 (en) | 2011-06-13 | 2019-09-24 | Ziolase, Llc | Compositions and methods to prevent and treat biofilms |
US20120315260A1 (en) * | 2011-06-13 | 2012-12-13 | Svetlana A. Ivanova | Compositions and Methods to Prevent and Treat Biofilms |
CA2841782A1 (en) * | 2011-07-15 | 2013-01-24 | Syngenta Participations Ag | Methods of increasing yield and stress tolerance in a plant |
KR20140067124A (ko) * | 2011-09-13 | 2014-06-03 | 스톨러 엔터프라이지즈, 인크. | 트레할로스의 적용에 의한 작물 수량의 향상 방법 |
HUP1400505A2 (en) | 2011-11-03 | 2015-03-02 | Syngenta Participations Ag | Polynucleotides, polypeptides and methods for enhancing photossimilation in plants |
US20150040268A1 (en) | 2013-04-25 | 2015-02-05 | Morflora Israel Ltd | Methods and compositions for the delivery of nucleic acids to seeds |
GB201511732D0 (en) | 2015-07-03 | 2015-08-19 | Rothamsted Res Ltd | Treating water stress in plants |
IL304057A (en) | 2016-03-16 | 2023-08-01 | Spogen Biotech Inc | Methods for promoting plant health using free enzymes and microorganisms that cause overexpression of enzymes |
TW201819627A (zh) * | 2016-11-28 | 2018-06-01 | 德商C 樂克塔股份有限公司 | 海藻糖磷酸化酶 |
GB201621193D0 (en) | 2016-12-13 | 2017-01-25 | Rothamsted Res Ltd | Induction of floral development in plants |
CA3049172A1 (en) * | 2016-12-21 | 2018-06-28 | Institute Of Crop Sciences, The Chinese Academy Of Agricultural Sciences | Plant grain trait-related protein, gene, promoter and snps and haplotypes |
CA3078280A1 (en) | 2017-10-05 | 2019-04-11 | Biogemma | Improved yield in plants by overexpressing a trehalose-6 phosphate synthase |
CN111567338B (zh) * | 2020-05-25 | 2021-07-06 | 华东师范大学 | 一种提高玉米高温胁迫下光合碳同化能力的方法 |
CN114868760B (zh) * | 2022-05-13 | 2024-01-16 | 辽宁省农业科学院 | 6-磷酸-海藻糖的应用及提升普通菜豆产量和抗病性的培育方法 |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU644619B2 (en) | 1989-12-21 | 1993-12-16 | Advanced Technologies (Cambridge) Limited | Modification of plant metabolism |
DE4004800C2 (de) * | 1990-02-13 | 2000-12-21 | Aventis Cropscience Gmbh | Im Habitus und Ertrag veränderte transgene Pflanzen |
DE69116413T2 (de) | 1990-03-28 | 1996-05-30 | Gist Brocades Nv | Neue Hefestämme mit erhöhtem Trehalosegehalt, Verfahren zur Gewinnung solcher Hefen und Verwendung dieser Hefen |
GB9117159D0 (en) | 1991-08-08 | 1991-09-25 | Cambridge Advanced Tech | Modification of sucrose accumulation |
FI943133A0 (fi) * | 1994-06-29 | 1994-06-29 | Alko Ab Oy | Transgena vaexter |
US5422254A (en) * | 1992-02-14 | 1995-06-06 | Oy Alko Ab | Method to increase the trehalose content of organisms by transforming them with the structural genes for the short and long chains of yeast trehalose synthase |
US6130368A (en) * | 1992-02-14 | 2000-10-10 | Btg International Ltd | Transgenic plants producing trehalose |
US6133034A (en) * | 1992-05-27 | 2000-10-17 | Calgene, Inc. | Methods and compositions related to the production of trehalose |
EP0577915A1 (fr) * | 1992-07-09 | 1994-01-12 | N.V. Algist-Bruggeman | Souches de levures transformées de manière à posséder une résistance au stress et/ou un pouvoir fermentatif amélioré |
DE69434173T2 (de) | 1993-06-30 | 2005-05-19 | Syngenta Mogen B.V. | Herstellung von trehalose in pflanzen |
EP0748381A1 (en) | 1994-03-09 | 1996-12-18 | Hoechst Schering AgrEvo GmbH | Processes for inhibiting and for inducing flower formation in plants |
DE4444460A1 (de) | 1994-11-29 | 1996-05-30 | Inst Genbiologische Forschung | Verfahren zur Steigerung des Ertrags sowie zur Veränderung des Blühverhaltens bei Pflanzen |
IL116564A0 (en) | 1995-01-04 | 1996-03-31 | Mogen Int | Process for producing trehalose in plants |
EP0784095A3 (en) | 1996-01-12 | 1997-12-29 | Mogen International N.V. | Enhanced accummulation of trehalose in plants |
US5854067A (en) | 1996-01-19 | 1998-12-29 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Hexokinase inhibitors |
IN1997CH00924A (en) * | 1996-05-03 | 2005-03-04 | Syngenta Mogen Bv | Regulating metabolism by modifying the level of trehalose-6-phosphate |
MX205414B (es) * | 1996-05-08 | 2001-12-07 | Univ Mexico Nacional Autonoma | Metodo para incrementar de trehalosa de los organismos por medio de su transformacion con el adnc de la trehalosa-6-fosfato sintasa/fosfatasa de selaginella lepidophylla. |
-
1997
- 1997-05-01 IN IN924CH1997 patent/IN1997CH00924A/xx unknown
- 1997-05-02 CN CNB971954496A patent/CN1267558C/zh not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 TR TR1999/02037T patent/TR199902037T2/xx unknown
- 1997-05-02 CA CA002253348A patent/CA2253348C/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 TR TR1999/02035T patent/TR199902035T2/xx unknown
- 1997-05-02 AU AU28988/97A patent/AU718379B2/en not_active Expired
- 1997-05-02 KR KR1019980708875A patent/KR20000010758A/ko not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 TR TR1998/02220T patent/TR199802220T2/xx unknown
- 1997-05-02 NZ NZ332677A patent/NZ332677A/en unknown
- 1997-05-02 CZ CZ19983450A patent/CZ345098A3/cs unknown
- 1997-05-02 EP EP97923086A patent/EP0901527B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 IL IL12678197A patent/IL126781A0/xx unknown
- 1997-05-02 US US09/171,937 patent/US6833490B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 DE DE69733945T patent/DE69733945T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 AT AT97923086T patent/ATE301718T1/de not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 JP JP09539558A patent/JP2000510691A/ja active Pending
- 1997-05-02 AR ARP970101812A patent/AR006937A1/es not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 ES ES97923086T patent/ES2243997T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1997-05-02 TR TR1999/02036T patent/TR199902036T2/xx unknown
- 1997-05-02 PL PL97329913A patent/PL329913A1/xx unknown
- 1997-05-02 SK SK1484-98A patent/SK148498A3/sk unknown
- 1997-05-02 MA MA24591A patent/MA24248A1/fr unknown
- 1997-05-02 WO PCT/EP1997/002497 patent/WO1997042326A2/en not_active Application Discontinuation
- 1997-05-02 MX MX9809128A patent/MX9809128A/es unknown
- 1997-05-02 BR BR9710959-2A patent/BR9710959A/pt not_active IP Right Cessation
- 1997-05-02 DK DK97923086T patent/DK0901527T3/da active
-
1998
- 1998-11-02 NO NO985097A patent/NO985097L/no not_active Application Discontinuation
-
2000
- 2000-07-07 AU AU45148/00A patent/AU4514800A/en not_active Abandoned
-
2003
- 2003-10-09 US US10/682,456 patent/US7247770B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-06-13 US US11/818,157 patent/US8124840B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2012
- 2012-01-30 US US13/361,046 patent/US20130191944A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ345098A3 (cs) | Regulace metabolismu modifikací hladiny trehalosa-6-fosfátu | |
AU738098B2 (en) | Regulating metabolism by modifying the level of trehalose-6-phosphate by inhibiting endogenous trehalase levels | |
JPH10501978A (ja) | トレハロース産生トランスジェニック植物 | |
JP2001000192A (ja) | ヒマワリファルネシルピロリン酸シンターゼ遺伝子を有する植物ベクターとその製造方法 | |
US8889949B2 (en) | Method for increasing resistance of monocot plants against abiotic stresses, TPSP fusion enzyme gene constructs, and transformants | |
AU727509B2 (en) | Method for increasing the trehalose content in organisms by means of their transformation with the cDNA of trehalose- 6-phosphate synthase/phosphatase from selaginella lepidophylla | |
PL179629B1 (pl) | mogacy podlegac ekspresji w roslinie, wektor do klonowania, mikroorganizm zawierajacy taki wektor, sposób otrzymywania rosliny lub komórki roslinnej, zrekombinowany roslinny genomowy DNA, komórka roslinna, kultura komórek roslinnych, sposób konserwowania rosliny lub czesci rosliny,sposób wytwarzania trehalozy i wyizolowana sekwencja DNA kodujaca aktywnosc syntazy trehalozofosforanowej PL PL PL PL PL PL PL PL | |
WO2012085806A1 (en) | Methods to obtain drought resistant plants | |
US6130368A (en) | Transgenic plants producing trehalose | |
EP0748381A1 (en) | Processes for inhibiting and for inducing flower formation in plants | |
KR100468307B1 (ko) | 트레할로스를생성하는유전자도입식물 | |
US20040123350A1 (en) | A method for increasing an abiotic-resistance in monocot plant | |
AU4892100A (en) | Enhanced accumulation of trehalose in plants | |
MXPA97000296A (en) | Increased accumulation of trehalosa in plan | |
MX2010014428A (es) | Metodo para la seleccion positiva de celulas vegetales geneticamente transformadas de maiz y otras especies. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |