CZ298268B6 - Imunodiagnostický test používající redukující cinidla - Google Patents

Imunodiagnostický test používající redukující cinidla Download PDF

Info

Publication number
CZ298268B6
CZ298268B6 CZ20003819A CZ20003819A CZ298268B6 CZ 298268 B6 CZ298268 B6 CZ 298268B6 CZ 20003819 A CZ20003819 A CZ 20003819A CZ 20003819 A CZ20003819 A CZ 20003819A CZ 298268 B6 CZ298268 B6 CZ 298268B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
hcv
protein
reducing agent
immunoassay kit
solid phase
Prior art date
Application number
CZ20003819A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ20003819A3 (cs
Inventor
Maertens@Geert
Louwagie@Joost
Bosman@Alfons
Sablon@Erwin
Zrein@Maan
Original Assignee
Innogenetics N. V.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=8237028&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=CZ298268(B6) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Innogenetics N. V. filed Critical Innogenetics N. V.
Publication of CZ20003819A3 publication Critical patent/CZ20003819A3/cs
Publication of CZ298268B6 publication Critical patent/CZ298268B6/cs

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/573Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for enzymes or isoenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701Specific hybridization probes
    • C12Q1/706Specific hybridization probes for hepatitis
    • C12Q1/707Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/54306Solid-phase reaction mechanisms
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/54393Improving reaction conditions or stability, e.g. by coating or irradiation of surface, by reduction of non-specific binding, by promotion of specific binding
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/576Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/576Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis
    • G01N33/5767Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis non-A, non-B hepatitis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011Details
    • C12N2770/24011Flaviviridae
    • C12N2770/24211Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
    • C12N2770/24222New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Imunotest na pevné fázi obsahuje jako antigen HCVNS3 protein, nebo jeho analog v redukované forme nebo v prítomnosti redukujícího cinidla. Pri zpusobu výroby kitu imunotestu se redukcní cinidlo pridá alespon behem procesu potahování, blokování, fixace proteinu nebo behem predbežné úpravy pevné fáze. Kit imunotestu se použije pro detekci protilátek HCV NS3 proteinu.

Description

Oblast techniky
Předkládaný vynález se vztahuje k oblasti diagnózy a léčení infekce HCV. Konkrétně se předkládaný vynález vztahuje k HCV NS3 helikáze (HCV NS3 helicase) a jejímu použití. Předkládaný vynález se také vztahuje ke zlepšeným imunodiagnostickým testům.
Dosavadní stav techniky
Virus hepatitidy C (Hepatitis C Virus, HCV) tvoří rod uvnitř Flaviviridae s nejbližší homologii k virům hepatitid G a GB a k Pešti virům (Pestiviruses). Genom škodující RNA (positivestranded RNA genom) kóduje nejméně 9 proteinů. Jádro El a E2 tvoří strukturní proteiny. NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A a NS5B jsou nestruktumí (nonstructural, NS) proteiny. Izoláty HCV vykazují vysokou úroveň sekvenční heterogenity, která umožňuje klasifikaci do minimálně 11 typů a 90 subtypů (Maertens and Stuyver, 1977). HVC infekce lidských jater je často klinicky benigní, se slabou žloutenkou v akutní fázi. V některých případech akutní slabé hepatitidy C (acute resolving hepatitis C) onemocnění může dokonce probíhat nepozorovaně. Ve většině případů (> 70 %) vede ale infekce HCV k chronicky přetrvávající nebo aktivní infekci, často s komplikacemi jatemí cirhózy a auto-imunitních potíží, Po 20 až 35 letech se může objevit hepatocelulární rakovina (Saito et al., 1990), některé dokonce bez přechodné fáze cirhózy. V současnosti není k dispozici žádná prevence a léčení interferonem alfa (IFN-α) vede pouze v 4 až 36 % léčených případů k dlouhodobému vyřešení v závislosti na genotypu HCV (Maertens anď Stuyver, 1997).
Protože nejsou v současné době k dispozici metody pro účinnou kultivaci HCV a protože v pacientech koluje jenom nepatrné množství HCV antigenů, nemůže se provádět rutinně přímý průkaz HCV a nepřímý důkaz je možný pouze s použitím obtížné amplifíkační techniky HCF RNA. Na rozdíl od mnoha ostatních virálních infekcí setrvávají částice HCV v krvi, játrech a lymfocytech, přestože existuje buněčná a humorální imunitní odpověď na většinu proteinů HCV. HCV protilátky mohou být vhodně detekovány ELISA technikou, která umožňuje testování mnoha vzorků v krevních bankách a klinických laboratořích. Ve většině zemí se vyžaduje a je nyní nařízené doplňkové testování protilátek. Odliší se tak skutečná HCV reaktivita od falešné reaktivity, která může být způsobena nespecifickou vazbou sérových nebo plazmových imunoglobulinů nebo anti-idiotypových (antiidiotypic) komponentů k potahovacím nebo blokovacím činidlům, nebo ke kontaminantům přítomným v preparátu HCV antigenů, nebo dokonce k fúzním částem nebo nespecifickým oblastem vlastních rekombinantních antigenů (McFarlane et al, 1990). Pro monitorování chronického onemocnění HCV (zejména během léčení) byla v poslední době zavedena detekce HCV RNA pomocí PCR nebo technik rozvětvené DNA (branched DNA, bDNA). Detekce HCV RNA je někdy překvapivě používána pro potvrzení testů přítomnosti HCV Ab, přestože pouze asi 70 a 94 % vzorků z opakovaně HCV Ab pozitivních pacientů je pozitivní při PCR buněčného hnízda (Marin et al., 1994), Z pozitivních dárců krve, kteří mají obvykle mírnější formu onemocnění a nízké hladiny HCV RNA, je pouze asi 40 % pozitivních při „nested“ PCR (Waumans et al, 1993; Stuyver et al. 1996). Proužkové testy (strip-based assays) tedy poskytují jedinou spolehlivou alternativu pro potvrzení HCV Ab. Dokonce i v případě nejasných výsledků v ověřovacím testu se doporučuje spíše serologické sledování než detekce HCV RNA (Di Bisceglie et al, 1998). Protože přírodní antigeny HCV nejsou k dispozici v dostatečném množství, používají takovéto konfirmační testy syntetické peptidy a/nebo rekombinantní fragmenty proteinů HCV. Jedním z kritických problémů při potvrzení protilátek představuje reaktivita NS3 proteinu (Zaaijer et al,, 1994)d. NS3 protilátky se často objevují jako první při sérokonverzních sériích a reaktivita NS3 proteinu se zdá být odlišná u různých komerčních testů dostupných v současnosti.
-1 CZ 298268 B6
Imunogenetics uvedla koncept proužkové technologie (strip technology), kde je obvykle aplikována kombinace syntetických peptidu a rekombinantních proteinů v samostatných, uspořádaných a snadno rozpoznatelných liniích. Testy INNO-LIA HíV Ab se ukázaly lepší než rutinně používané western bloty (Pollet et al., 1990). Line Immuno Assay umožňuje multiparametrové testování a tak umožňuje zahrnout mezní (cutoff) a jiné systémy hodnocení, zahrnutí kontroly přidání vzorku a také testování falešné reaktivity k ne-HCV proteinům, použitých jako nosič nebo fúzní partner nezbytný pro některé antigeny v ELISA testu. Forma testu umožňuje v zásadě kombinovat antigeny různých etiologických látek nebo fenotypově souvisejících podmínek v jednom testu.
INNO-LIA HCV Ab III je Line Immuno Assay třetí generace, který obsahuje HCV antigeny odvozené od Core oblasti, E2 hypervariabilní oblasti (HVR), oblasti NS3 helikázy a oblasti NS4A, NS4B a NS5A. U třetí generace testů dává vysoce purifikovaný rekombinantní subtyp proteinu lb NS3 a peptidy E2 vynikající citlivost při zachování specifity charakteristické pro testy založené na peptidech (Peeters et al., 1993). Pravděpodobně jednou z nej důležitějších vlastností tohoto testu je jeho nebývalá shoda sHCV RNA pozitivitou (Claeys et al., 1992; De Beenhouweretal., 1992).
Antigeny jsou naneseny v 6 oddělených liniích na nylonovém proužku s plastovou výztuhou. Na každém proužku jsou navíc čtyři kontrolní linie: anti-streptavidin, 3+ pozitivní kontrola (protilidský Ig), 1+ pozitivní kontrola (lidský IgG) a ± mezní linie (cutoff line) (lidské IgG), Zředěný testovací vzorek se inkubuje ve žlábku společně s LI A III proužkem. Jsou-li ve vzorku HCV protilátky, dojde k jejich navázání k HCV antigenům v liniích na proužku. Pak se přidá konjugát afínitně purifikovaných, s alkalickou fosfatázou konjugovaných kozích proti—lidských IgG (H+L), které reagují se specifickými komplexy HCV antigen/protilátka (jestliže došlo k jejich vytvoření). Inkubací s enzymovým substrátem dojde ke vzniku kaštanově hnědého zabarvení, jehož intenzita odpovídá množství HCV specifických protilátek zachycených ze vzorku na kterékoliv dané linii. Vývoj barevné reakce se zastaví kyselinou sírovou. Jestliže nejsou přítomné HCV specifické protilátky, konjugát se naváže pouze na kontrolní linie ±, l+a3+. Jestliže se omylem nepřidá vzorek, zabarví se pouze kontrolní linie ± a 1+.
Definice
Následující definice slouží pro ilustraci různých termínů a výrazů používaných v předkládaném vynálezu.
Termín „HCV NS3 protein“ se vztahuje k polypeptidu nebo jeho analogu (např. mimotopy - mimotopes) obsahujícímu aminokyselinovou sekvenci (a/nebo aminokyselinová analoga) definující alespoň jeden HCV epitop buď HCV NS3 proteázy, nebo helikázy.
Termín „obalový protein hepatitidy viru C“ se vztahuje k polypeptidu nebo jeho analogu (např. mimotopy) obsahujícímu aminokyselinovou sekvenci (a/nebo aminokyselinová analoga) definující alespoň jeden HCV epitop buď El nebo E2 oblasti (viz WO 96/04385, jehož obsah je zde zahrnut odkazem).
Také by mělo být jasné, že izoláty (biologické vzorky) použité v části příklady předkládaného vynálezu nebyly zamýšleny jako omezení oblasti vynálezu a že jakýkoliv izolát náležející k typu 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 1,2 nebo jakýkoliv nový genotyp HCV je vhodným zdrojem HCV sekvencí pro upotřebení předkládaného vynálezu.
HCV antigeny použité v předkládaném vynálezu můžou být virové proteiny plné délky, nebo jejich varianty o téměř plné délce nebo jejich funkční fragmenty (např. fragmenty, kterým nechybí sekvence nutné pro tvorbu nebo uchování epitopu). Dále můžou HCV antigeny předkládaného vynálezu také zahrnovat jiné sekvence, které neblokují nebo nebrání tvorbě kterýchkoliv zájmových konformačních epitopu. Přítomnost nebo nepřítomnosti konformačních epitopu tak může
-2CZ 298268 B6 být snadno určena prověřením daného antigenů protilátkou (polyklonální sérum nebo monoklo- ή nální protilátka) a porovnáním jejich aktivity s antigenem v denaturovaném stavu, kdy zůstanou ϊ zachovány pouze lineární epitopy (jestli, se vůbec některé epitopy zachovají). Když se při tako- í vém prověřování používají nejprve polyklonální protilátky, může být výhodné adsorbovat póly- i klonální sérum nejdříve s denaturovaným antigenem a zjistit, jestli udrží protilátky proti antigenů, ;
který zkoumáme. ;
Termínem „fúzní polypeptid“ se myslí polypeptid, u kterého je antigen (nebo antigeny), zejména HCV antigen (nebo antigeny) částí jednoho souvislého řetězce aminokyselin, který se neobjevuje 10 v přírodě. Antigeny HCV můžou být spojené přímo jeden k druhému peptidovými vazbami, nebo mohou být oddělené aminokyselinové sekvence exogenní k HCV.
Výraz „pevná fáze“ nebo „pevný nosič“ znamená pevný povrch, ke kterému se kovalentne nebo nekovalentně (například hydrofobní adsorpcí) váží jednotlivé HCV antigeny nebo fúzní polypep15 tidy obsahující HCV antigeny. Příkladem pevných povrchů můžou být mikrotitrační destičky, membránové proužky jako třeba nylonové nebo nitrocelulózové proužky a silikonové čipy.
Termínem „biologický vzorek“ se myslí tekutina nebo pletivo savčího jedince (např. antropoid nebo člověk), které běžně obsahují protilátky produkované individuem, zejména protilátky proti 20 HCV. Tekutina nebo pletivo můžou obsahovat také HCV antigeny. Takovéto složky jsou odborníkům známé a patří mezi ně mimo jiné krev, plasma, sérum, moč, míšní mok, tkáňový mok, respirační, střevní nebo močopohlavní výměšky, slzy, sliny, mléko, bílé krvinky a myelomy. Tělní složky zahrnují biologické tekutiny. Termín „biologické tekutiny“ se vztahuje k tekutinám získaných z organismu. Některé biologické tekutiny se používají jako zdroj jiných produktů, např. fak25 torů srážení (např. Faktor VIII), sérového albuminu, růstového hormonu atp. V takovém případě je důležité, aby zdroj biologických tekutin byl bez virových kontaminant, jakým může být například HCV.
Termín „imunologicky reaktivní“ znamená, že daný antigen bude reagovat specificky s protilát30 kami proti HCV přítomnými v tělních složkách z HCV infikovaného jedince nebo imunizovaného jedince.
Výraz „imunitní komplex“ se myslí struktura vytvořená při navázání protilátky k epitopů nebo antigenů,
Výrazy El a E2, které se zde používají, jsou plně vysvětlené ve WO 96/04385, který je v tomto popisu obsažen odkazem.
Výraz „purifikovaný“ se zde používá pro směs, kde požadovaný protein tvoří alespoň 35 % z celkových proteinů ve směsi. Lepší je, když daný protein tvoří nejméně 40 % ve směsi, nebo ještě lépe 50 %, 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 % a nebo vůbec nejlépe když tvoří nejméně 95 % ve směsi všech proteinů, směs může obsahovat i jiné složky, např. glycidy, sole, lipidy, rozpouštědla apod. bez ovlivnění stanovení procenta čistoty zde uvedeného. „Izolovaným“ HCV proteinem se myslí směs s HCV proteinem nejméně z 35 % čistým,
Výraz „podstatně purifikované proteiny“ (essentially purified proteins) se používá pro tak purifikované proteiny, které se můžou použít v in vitro diagnostických metodách a jako terapeutická sloučenina. Tyto proteiny jsou značně zbavené buněčných proteinů nebo DNA, proteinů vektora nebo DNA vektora, nebo jiných HCV virálních složek. Tyto proteiny jsou obvykle purifikovány 50 do značné homogenity (obvykle jsou z 80 % čisté, lépe z 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 %,
99,5 % a vůbec nejlepší je, když jsou kontaminující proteiny nedetekovatelné konvenčními metodami, jako například SDS-PAGE elektroforézou při barvení stříbrem.
-3LZ 298268 B6
Termín „rekombinantně exprimované” používaný v kontextu předkládaného vynálezu se vztahuje ke skutečnosti, že proteiny předkládaného vynálezu jsou produkovány metodami rekombinantní exprese v prokaryotech, nebo nižších či vyšších eukaryotech, jak je podobně diskutováno dále.
Výraz „nižší eukaiyoty“ se používá pro hostitelské buňky jako například kvasinky, houby atd. Nižší eukaryoty jsou většinou (ale ne nezbytně) jednobuněčné. Mezi preferované eukaiyoty patří kvasinky, zejména druhu Saccharomyces, Schizosaccharomyces, Klyveromyces, Pichia (např. Pichia pastoris), Hansunela (např. Hansunela polymorpha), Yarowia, Schwanniomyces, Zygosaccharomyces a podobně. Nej používanějšími kvasinkovými hostiteli jsou Saccharomyces cerevisiae, S. carlbergensis a K. lactis.
Výraz „prokaryota“ se vztahuje k hostitelům jako E. coli, Lactobacillus, Lactococcus, Salmonella, Streptococcus, Bacillus subtilis nebo Streptomyces. Také tito hostitelé jsou uvažováni v předkládaném vynálezu.
Výraz „vyšší eukaryota“ se vztahuje k hostitelským buňkám odvozeným z vyšších zvířat, jako jsou savci, plazí, hmyz atd. V současnosti preferované vyšší eukaryotní hostitelské buňky jsou odvozené od křečků (Chinese hamster) (např. CHO), opic (např. COS nebo Věro buňky), ledvin mláďat křečků (baby hamster kidney - BHK), prasečích ledvin (PK15), buněk 13 z králičích ledvin (RK13), buněčné linie lidských osteosarkomů 143 B, lidská buněčná linie HeLa a lidské nádorové jaterní buněčné linie jako Hep G2 a hmyzí buněčné linie (např. Spodopterafrugiperda). Hostitelské buňky můžou být ve formě suspenze, kultur pěstovaných v baňkách, tkáňových kultur, orgánových kultur atp. Hostitelské buňky můžou také být z transgenních zvířat.
Termín „polypeptid“ se vztahuje k aminokyselinovému polymeru bez udání určité délky produktu; polypeptidem se tak rozumí peptid, oligopeptid a protein. Tento termín se také nevztahuje k a nevylučuje post-expresní modifikace polypeptidu, například glykosylaci, acetylaci, fosfory láci atak podobně. Definice zahrnuje například polypeptidy obsahující jeden nebo více analogů aminokyselin (včetně například normálně nebo více analogů aminokyselin (včetně například normálně se nevyskytujících aminokyselin, PNA atp.), polypeptidy se substituovanými vazbami a dalšími modifikacemi, které jsou známé odborníkům a které se vyskytují přírodně i takové, které se přírodně nevyskytují.
Výraz „rekombinantní polynukleotid nebo nukleová kyselina“ přináleží genomovému polynukleotidu nebo nukleové kyselině genomového, cDNA, polysyntetického nebo syntetického původu, které (podle původu nebo úprav): (1) nejsou spojení s žádným nebo jenom částí polynukleotidu, se kterým jsou spojeni přírodně, (2) jsou spojeni s jiným polynukleotidem než se kterým jsou spojeni přírodně (3) nevyskytují se v přírodě.
Termíny „rekombinantní hostitelské buňky“, „hostitelské buňky“, „buňky“, „buněčné linie“, „buněčné kultury“ a ostatní takovéto termíny, označující mikroorganismy nebo vyšší eukaryotní buněčné linie pěstované jako jednobuněčné jednotky, se vztahují k buňkám, které můžou být nebo byly použity jako příjemci pro rekombinantní vektory nebo jiné přenášené polypeptidy a zahrnují potomstvo originální buňky, která byla transformována. Je zřejmé, že potomstvo jedné rodičovské buňky nemusí být nutně zcela identické morfologicky, nebo co se týče genomové nebo celkové DNA jako originální rodič, díky přirozeným, náhodným nebo úmyslným mutacím.
Termín „repiikon“ se používá pro jakýkoliv genetický element, např. plazmid, chromozom, virus, kosmid atd., který se chová jako autonomní jednotka polynukleotidu replikujících se uvnitř buňky, tj. je schopný replikace, kterou sám řídí.
„Vektor“ je repiikon, který dále obsahuje sekvence zajišťující replikaci a/nebo expresi požadovaného otevřeného čtecího rámce.
-4CZ 29826» B6 „Řídicí sekvence“ se vztahuje k polynukleotidovým sekvencím, které jsou nezbytné pro expresi kódující sekvence, ke které jsou přiligovány. Povaha takovýchto řídicích sekvencí se liší v závislosti na hostitelském organismu; v prokaryotech takovéto řídicí sekvence obsahují zpravidla promotor, místo, kde se vážou ríbozómy a terminátory; u eukaryotů obecně takovéto řídicí sekvence obsahují promotor a můžou obsahovat zesilovače. Výraz „řídicí sekvence“ zahrnuje alespoň všechny komponenty, jejichž přítomnost je nutná pro expresi a může také zahrnovat další komponenty, jejichž přítomnost je výhodná, například úvodní sekvence, které řídí sekreci.
Termínem „promotor“ se označuje nukleotidové sekvence, která se skládá z konsensuálních sekvencí, které umožňují navázání RNA polymerázy na DNA templát takovým způsobem, že se iniciuje mRNA produkce z běžného počátečního místa transkripce pro přilehlý strukturní gen.
i
Výraz „operačně připojený“ se vztahuje k tahovému postavení vedle sebe, kde komponenty takto označené ve vztahu umožňujícím jim jejich fungování zamýšleným způsobem. Řídicí sekvence „operačně připojená“ ke kódující sekvenci je přiligována takovým způsobem, že za podmínek vhodných pro řídicí sekvenci se dosáhne exprese kódující sekvence.
„Otevřený čtecí rámec“ (open reading frame - ORF) je oblast polynukleotidové sekvence, která kóduje polypeptid a neobsahuje stop kodón ve vybraném čtecím rámci; tato oblast může reprezentovat část kódující sekvence nebo celkovou kódující sekvenci.
„Kódující sekvence“ je polynukleotidové sekvence, která je transkribovaná do mRNA a/nebo translatovaná do polypeptidů, je-li pod řízením odpovídajících regulačních sekvencí. Okraje kódující sekvence jsou určeny kodónem startujícím translaci na 5-konci a kodónem zastavujícím translaci na 3-konci. Kódující sekvence může zahrnovat kromě jiného mRNA, virovou RNA, DNA (včetně cDNA) a rekombinantní polynukleotidové sekvence.
Používané termíny „epitop“ nebo „antigenní determinanta“ znamenají aminokyselinovou sekvenci, která je imunoreaktivní. Obecně se epitop skládá z nejméně 3 až 4 aminokyselin, častěji ale z nejméně 5 až 6 aminokyselin, někdy z 7 až 8 aminokyselin a někdy dokonce až z okolo 10 aminokyselin. Epitop daného polypeptidů se zde myslí epitopy se stejnou aminokyselinovou sekvencí jako epitop ve stanoveném polypeptidů a jeho imunologické ekvivalenty. Takovéto ekvivalenty zahrnují také kmeny, subtypy (=genotypy), nebo typově (skupinově) specifické varianty, např. současně známé sekvence nebo kmeny náležící k genotypům la, lb, lc, ld, le, If, 2a, 2b, 2c, 2d, 2e, 2f, 2g, 2h, 2i, 3a, 3b, 3c, 3d, 3e, 3f, 3g, 4a, 4b, 4c, 4d, 4e, 4f, 4g, 4h, 4i, 4j, 4k, 41, 5a, 5b, 6a, 6b, 6c, 7a, 7b, 7c, 8a, 8b, 9a, 9b, 10a, 11a, 12a nebo jakýkoliv nově definovaný (sub)typ HCV. Mělo by být jasné, že aminokyselin tvořící epitop nemusí být částí lineární sekvence, ale můžou být proložené jednou nebo více sériemi různého počtu aminokyselin, čímž se vytvoří konformační epitop.
Cíle vynálezu
Cílem předkládaného vynálezu je poskytnout zlepšené komponenty diagnostického testu HCV a terapeutické proteiny.
Cílem předkládaného vynálezu je zejména poskytnout zlepšené preparáty HCV NS3 proteinu pro použití při diagnóze protilátek proti HCV,
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnutí metody pro zvýšení reaktivity HCV protilátek s rekombinantním nebo syntetickým NS3 helikázovým proteinem nebo jeho částí na pevném povrchu.
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnout nové sekvence kódující HCV NS3 protein.
-5CZ 298268 B6
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnout nové sekvence kódující HCV NS3 protein, který nereaguje s falešně pozitivními HCV vzorky.
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnout nové HCV NS3 polypeptidy.
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnout nové HCV NS3 polypeptidy, které nereagují s falešně pozitivními vzorky HCV.
Dalším cílem předkládaného vynálezu je poskytnout metodu pro detekci polypeptidu, podle vynálezu.
Všechny cíle předkládaného vynálezu se dosáhly formami vysvětlenými dále.
Citované prameny
Bums, J., Butler, J. Moran, J., and Whitesides, G. (1991) Selective reduction of disulfides by tris(2-carboxyethyl)phosphine. J. Org. Chem. 6, 2648-2650.
Chán, W. (1968) A method for the complete S sulfonation of cysteine residues in proteins. Biochemistry 7, 4247-4254.
Claeys, H., Volkaerts, A., Verhaert, H., De Beenhouwer, H., and Vermylen, C. (1992) Evaluation of anti-HCV capsid indeterminate samples. The Lancet 340,249.
Cole, R. (1967) Sulfitolysis. Meth. Enzymol. 11, 206.
Coligan, J., Kniisbeek, A., Margulis, D., Shevach, E. and Strober, W. (1992) Current protocols in immunology. Wiley Interscience.
De Beenhouwer, H., Verhaert, H., Claeys, H., and Vermylen, C. (1992) Confirmation of hepatitis Č virus positive blood donors by immunoblotting and polymerase chain reaction. Vox. Sang. 63. 198-203.
Di Bisceglie, AM, Carithers, RL Jr, Gores, GJ (1998) Hepatocellular carcinoma. Hepatology. 28, 1161-1165.
Gailit, J. (1993) Restoring free sulfhydryl groups in synthetic peptides. Anal. Biochem., 214, 334-335.
Holmgren A. (1979) Thioredoxin catalyses the reduction of insulin disulfides by dithiothreitol and dthydrolipoamide. J. Biol, Chem. 254, 9627-9632.
Inglis, A., and Liu, T. (1970) The stability of cysteine and cystine during acid hydrolysis of proteins and peptides. J. Biol. Chem. 245, 112-116.
McFarlane, L, Smith, H., Johnson, P., Bray, G., Vergani, D., and Williams, R. (1990) Hepatitis C virus antibodies in chronic active hepatitis: pathogenic factor or false-positive result? The Lancet 335, 754-757,
Maertens, G. and Stuyver, L. (1997) Genotypes and Genetíc variation of hepatitis C virus.
In: Molecular Medicine of Hepatitis (Eds. Zuckerman, A. and Harrison, T.), Molecular Medical
Science Series (Eds. James, K. and Moms A) John Wiley and Sons Ltd., Chichester, England,
Chapter 13, pp. 183-233.
-6CZ 298268 B6
Marin, M., Bresciani, S., Puoti, M., Rodella, A., Gussago, A., Ravaggi, A,, Pizzocolo, G.; Albertini, A., and Cariani, E. (1994) Clinical significance of sérum HCV RNA as markér of HCV infection. J. Clin. Microbiol. 32, 3008-3012.
Peeters, D., Dekeyser, F., DeLeys, R., Maertens, G., and Pollet, D. (1993) Confírmation of anti—hepatitis C virus antibodies using the INNO-LIA HCV Ab III including Core, E2/NS1, NS3, NS4, and NS5 epitopes. Intemational symposium on Viral Hepatitis and Liver Disease, Tokyo, abstract 413,
Pollet, D., Šaman, E., Peelers, D., Warmenbol, H., Heyndricks, L, Wouters, C., Beelaert, G., van der Groen, G., and Van Heuverswyn, H. (1990) Confírmation and differentiation of antibodies to human immunodefíciency virus 1 and 2 with a strip-based assay including recombinant antigens and synthetic peptides. Clin. Chem. 37, 1700-1707.
Saito, L, Miyamura, T, Ohbayashi, A„ Harada, H. Katayama, T., Kikuchi, S., Watanabe, Y., Koi, S., Onji, M., Ohta, Y,, Choo, Q.-L., Houghton, M., and Kuo, G. (1990) Proč. Nati. Acad. Sci. USA 87,6547-6549.
Singh, R., and Kats, L. (1995) Catalysis of reduction of disulfide by selenol. Anal. Biochem., 232, 86-91.
Stuyver, L, Fretz, C., Esquivel, C., Boudifa, A., Jaulmes, D., Azar, N., Lunel, F., Leroux-Roels,
G. , Maertens, G., and Foumel, J. (1996) HCV genotype analysis in apparently healthy anti-HCV positive Parisian blood donors, Transfusion 36, 552-558.
Thakur, M., DeFulvio, J., Richard, M. and Park, C. (1991) Technetium-99m labelled monoclonal antibodies: evaluation of reducing agents. Nucl. Med. Biol., 18, 227-233. Waumans, L., Claeys.
H. , Verhaert, H., Mertens, W., and Vermylen, C. (1993) Hepatitis C virus confírmation in blood donor screening. Vox. Sang. 64,145-149,
Wertman K.F., Wyman A.R. and Botstein D. (1986) Host/vector interactions which affect the viability of recombinant phage lambda dones. Gene 49: 253-262.
Zaaijer, H., Vrielink, H., van Exel-Oehlers, P., Cuypers, H., and Lelie, P. (1994) Confírmation of hepatitis C infection: a comparison of five immunoblot assays. Transfusion 34, 603-607.
Podstata vynálezu
Vynález se tyká kitu imunotestu na pevné fázi, který obsahuje na pevné fázi HCV NS3 protein, nebo jeho analog, v přítomnosti redukčního činidla, přičemž HCV NS3 protein nebo jeho analog obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 proteázy nebo helikázy.
Vynález se dále týká kitu imunotestu s pevnou fází, kteiý obsahuje na uvedené pevné fázi HCV NS3 protein nebo jeho analog, který je redukován redukčním činidlem, přičemž HCV NS3 protein nebo jeho analog obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 proteázy nebo helikázy.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je uvedeným HCV NS3 proteinem HCV NS3 aminokyselinová sekvence zvolená z množiny sestávající z SEQ ID NO: 3 až 18.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je HCV NS3 protein obsažen ve fúzním proteinu.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je fúzní protein zvolen z množiny 1 aminokyselinových sekvencí sestávajících z SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 SEQ ID NO: 24, ·*!
SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30 a SEQ ID NO: 32. | 'Λ
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je HCV NS3 proteinem neboβ jeho částí HCV NS3 helikázový protein obsahující buď S1200, A1218, A1384, P1407, V1412,1
P1424 nebo F1444, nebo kombinace jedné z aminokyselin s libovolnou z následujících amino-| kyselin zvolených zmnožiny sestávající zL1201, S1222,11274 S1289, T1321, A1323, T1369,·*
L1382, V1408, A1409, F1410, přičemž HCV NS3 helikázový protein nebo jeho část obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 helikázy.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je uvedeným HCV NS3 proteinem je HCV NS3 protein zpracovaný způsobem, který zahrnuje kroky sulfonace a následné desulfonace.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je uvedený HCV NS3 protein dále ošetřen detergent s obojetnými ionty.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kde je uvedený HCV NS3 protein ošetřen lauryldimethylbetainem jako detergentem s obojetnými ionty.
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je popsán výše, kterým je kit ELISA, testovací kit QUICK nebo kit imunotestu Line.
Vynález se dále týká způsobu výroby kitu imunotestu, který je popsán výše, a kde je uvedené redukční činidlo přítomno v alespoň jednom z následujících kroků:
(i) potažení pevné fáze antigenem; a (ii) po (i), blokace pevné fáze; a (iii) po (ii), fixace proteinů nanesených na pevné fázi; a (iv) po (iii), předběžná úprava pevné fáze.
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se redukční činidlo přidá v kroku (i).
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v kroku (ii).
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v krocích (i) a (ii).
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v kroku (iii).
íí
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v kro-j cích (i) a (iii).J v
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v kro-ΐ ku (iv).
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se uvedené redukční činidlo přidá v krocích (i) a (iv).
-8CZ 298268 B6
Vynález se dále týká způsobu, který je po psán výše, kde se uvedeným redukční činidlem dithiotreitol (DTT), dithioerytrithiol (DTE) nebo tris(2-karboxyethyl)fosfin (TCEP).
Vynález se dále týká způsobu, který je popsán výše, kde se redukční činidlo použije v koncentračním rozmezí 0,1 mM až 1 M, výhodně 0,5 mM až 500 mM, ještě výhodněji 1 mM až 250 mM, přičemž některé aplikace mohou vyžadovat rozmezí od 0,5 mM do 50 mM, od 1 mM do 30 mM, od 2 mM do 20 mM nebo od 5 mM do 15 mM, nebo 10 mM.
Vynález se dále týká použití kitu imunotestu, který je popsán výše, pro detekci protilátek HCV NS3 proteinu.
Vynález se dále týká použití kitu imunotestu, který je popsán výše, prodetekci protilátek HCV NS3 proteinu v biologickém vzorku.
Vynález se dále týká použití kitu imunotestu, který je popsán výše, pro detekci ranné HCV NS3 sérokonverze.
Předkládaný vynález se vztahuje zejména k imunotestu s pevnou fází, obsahujícímu na zmíněné pevné fázi HCV NS3 antigen za přítomnosti redukčního činidla. Jak je ukázáno v části Příklady, účastní vynálezci zjistili, že přítomnost redukčního činidla jako je například DTT (vedle antigenu přichyceného k pevnému povrchu) učiní antigen imunotestu připojený na pevném povrchu mnohem více reaktivním s protilátkami proti danému antigenu. Také v roztoku se antigen redukcí stává reaktivnější.
Redukční činidlo podle předkládaného vynálezu je jakákoliv látka, která způsobí redukci S-S disulfidových můstků. Redukce „S-S“ disulfidových můstků je chemická reakce, kterou jsou disulfidy redukovány na thiol (-SH). Činidla a metody rozrušující disulfidové můstky jsou popsány v WO 96/04385 a jsou v tomto popisu zahrnuté odkazem. „S-S“ redukce se může dosáhnout (1) kaskádou enzymatických drah nebo (2) redukčními činidly. O enzymech jako thioredoxin, glutaredoxin je známo, že se účastní in vivo redukce disulfidů a také bylo prokázáno, že jsou účinné pří redukci „S-S“ při redukci „S-S“ můstků in vitro. Disulfidové vazby jsou rychle rozštěpeny redukovaným thioredoxinem při pH 7,0 reakcí druhého řádu, která je asi 104 krát rychlejší než odpovídající rychlostní konstanta reakce sDTT. Redukční kinetika může být dramaticky zvýšena preinkubací roztoku proteinu s 1 mM DTT nebo dihydrolipoamidem (Holmgren, 1979).
Thiolovými sloučeninami schopnými redukovat proteinové disulfidové můstky jsou například dithiothreitol (DTT), dithioeiythrytol (DTE), beta-merkaptoethanol, thiokarbamáty, bis(2-merkaptoethyl) sulfon a N,N'-bis(merkaptoacetyl) hydrazin a dithioničitan sodný.
Redukční činidla bez thiolových skupin, jako např. askorbát nebo chlorid cínatý (SnC12), které se ukázaly jako velmi užitečné při redukci disulfidových můstků v monoklonálních protilátkách (Thakur et al., 1991), se také můžou použít pro redukci NS3. Působení hydroboritanu sodného se ukázalo jako účinné pro redukci disulfidových můstků v peptidech (Gailit, 1993). Tris (2-karboxyetyl) fosforovodík (tris (2-karboxyethyl) phosphine, TCEP) je schopný redukovat disulfidy při nízkém pH (Bums et al, 1991). Selenol (selenol) katalyzuje redukci disulfidy na thioly, když se jako redukční činidlo použije DTT nebo borohydrid sodný. Jako prekurzor katalyzátoru se použil selenocysteamin, komerčně dostupný diselenid (Singh and Kats, 1995).
Předkládaný vynález se vztahuje zejména k metodám pro produkci imunotestu tak, jak jsou definovány výše, kde je dané redukční činidlo přidané k dané pevné fázi během kroku potahování, blokování a/nebo fixace daného antigenu na daný pevný povrch.
Předkládaný vynález se také vztahuje k metodě pro vykonávání imunotestu jak je definován výše, kde je daná redukční látka přidaná během předběžné úpravy pevné fáze.
-9CZ 298268 B6
Jak vědí odborníci, podmínky potahování se mohou značně lišit a zahrnují aplikaci proteinu na pevnou fázi a umožnění reakce, při níž se naváže protein na pevnou fázi. K navázání může dojít kovalentní, hydrofobní nebo iontovou vazbou, Van Der Waelsovými silami, vodíkovými můstky, ale i dalšími způsoby. Pro tento krok se může použít různé pufiy známé odborníkům, například karbamátový nebo fosfátový pufr, ale i další. Pro blokování se může použít metoda známá odborníkům, například se může použít albumin, sérové proteiny, polyvinylpyrolidon (PVP), detergenty, želatina, polyvinylalkohol (PVA) nebo kasein.
Pro fixaci se může použít jakákoliv metoda známá odborníkům. Další příklady blokování, fixace a potahování jsou v sekci Příklady.
Předkládaný vynález se dále zejména vztahuje k metodě definované výše, kde je dané redukční činidlo přidané kdané pevné fázi během procesu potahování pevné fáze antigenem. Příklady potahovacich pufrů jsou v sekci Příklady. Všechny ostatní známé potahovací pufry známé odborníkům také tvoří část předkládaného prohlášení.
Předkládaný vynález se vztahuje k metodě definované výše, kde je dané redukční činidlo přidané k dané pevné fázi během procesu blokování dané pevné fáze, včetně antigenů, který byl navíc aplikován za přítomnosti nebo nepřítomnosti redukčního činidla. Příklady blokujících pufrů jsou uvedeny v sekci Příklady. Všechny ostatní známé blokovací pufry známé odborníkům také tvoří část předkládaného prohlášení.
Předkládaný vynález se vztahuje k metodě definované výše, kde je dané redukční činidlo přidané k pevné fázi během procesu fixace potahovacího antigenů k dané pevné fázi, včetně antigenů, který navíc byl aplikován za přítomnosti nebo nepřítomnosti redukčního činidla. Fixačnímu kroku mohl předcházet krok blokování za přítomnosti nebo nepřítomnosti redukčního činidla. Příklady fixačních pufru jsou uvedené v sekci Příklady. Všechny ostatní známé fixační pufry známé odborníkům také tvoří část předkládaného prohlášení.
Předkládaný vynález se vztahuje k metodě provádění imunotestů, jak je definováno výše, kde je dané redukční činidlo přidané během předběžné úpravy pevné fáze před přidáním vzorku. Předběžná příprava destiček může být provedena s destičkami, které byly upraveny redukčním činidlem v potahovacím, blokovacím a/nebo fixačním kroku nebo s destičkami, které nebyly předem upraveny redukčním činidlem.
Nakonec, redukční činidlo může být přidané během jakéhokoliv dalšího kroku vykonávaného při enzymových imunotestech, jako část předkládaného vynálezu, třeba po aplikaci redukčního činidla v jednom nebo více zvýše uvedených čtyřech kroku (potahování, blokování, fixace a/nebo předběžná úprava). Takovéto další kroky zahrnují například inkubaci protilátek, detekci navázaných protilátek nebo vývoj zabarvení a další.
Předkládaný vynález se vztahuje přednostně k metodě, jak je definována výše, kde je daným redukčním činidlem DDT, DTE nebo TCEP.
Předkládaný vynález se rovněž týká způsobu, který je definován výše, kde je dané redukční činidlo použité v koncentraci v rozsahu od 0,1 mM do 1 M, zejména pak v koncentracích od 0,5 do 500 mM, od 1 do 250 mM a nejspíše pak v koncentraci od 1 do 50 mM. Některé aplikace můžou vyžadovat redukční činidlo o koncentraci v rozsahu od 0,5 do 50 mM, od 1 do 30 mM, od 2 do 20 mM, od 5 do 15 mM nebo 10 mM. Jiné aplikace vyžadují koncentrace DTT v rozsazích 50 až 500 mM, 100 až 300 mM nebo 200 mM, Preferovaným redukčním činidlem je zejména DTT.
Předkládaný vynález se týká způsobu, který je definován výše, kde je daným antigenem HCV
NS3 protein, zejména HCV NS3 helikáza. Také jakýkoliv další protein známý odborníkům může
-10CZ 298268 B6 reagovat lépe s protilátkami proti danému proteinu, když se protein přidá k pevné fázi za přítomnosti DTT, neboje upraven DTT následovně.
Předkládaný vynález se rovněž týká způsobu, který je definován výše, kde daný imunotest na pevné fázi obsahuje kombinaci antigenu různých etiologických látek nebo fenotypicky návazných podmínek,
Předkládaný vynález se rovněž týká imunotestu na pevné fázi připraveného metodami popsanými výše. Zejména kitu obsahujícího alespoň pevnou fázi, jako je mikrotitrační destička, membránový proužek nebo silikonový čip, který obsahuje antigen, ze přítomnosti redukční látky.
Předkládaný vynález se rovněž týká zejména ELISA připravené metodou definovanou výše.
U výhodného provedení se předkládaný vynález týká ELISA zhotovené metodou popsanou výše, kde je dané redukční činidlo výhodně přidáváno v potahovacím a/nebo fixačn ím kroku. U jednoho výhodného provedení může být redukční činidlo aplikováno ve fixačním kroku. Zejména se ale preferuje případ, kdy je redukční činidlo přidané v obou krocích, jak potahovacím, tak fixačním.
V jiném preferovaném případě se předkládaný vynález vztahuje k ELISA zhotoveným metodou popsanou výše, kde je dané redukční činidlo přidané během předběžné přípravy desky před přidáním vzorku. Předběžná příprava desky se může udělat u desek, které byly upravené redukčním činidlem při potahovacím a/nebo fixačním kroku, nebo u desek, které nebyly předtím upravené redukčním činidlem. Redukční činidlo se může také přidat během jakéhokoliv dalšího kroku enzymového imunotestu. Takovéto další kroky zahrnují například inkubaci protilátek, detekci navázaných protilátek, vývoj zabarvení a další.
Předkládaný vynález se také vztahuje k liniovému testu (Line Immunoassay, LIA) zhotovenému metodou popsanou výše.
V preferovaném případě se předkládaný vynález vztahuje k LIA zhotovenému metodou popsanou výše, kde je dané redukční činidlo přednostně přidáváno v potahovacím a/nebo fixačním kroku. Redukční činidlo se může také přidat během jakéhokoliv dalšího kroku zhotovování nebo provádění enzymového imunotestu. Takovéto další kroky zahrnují například fixaci, předběžnou úpravu, inkubaci protilátek, detekci navázaných protilátek, vývoj zabarvení a další.
Předkládaný vynález se rovněž týká QUICK testu zhotovenému metodou popsanou výše.
V preferovaném případě se předkládaný vynález vztahuje ke QUICK testu zhotovenému metodou popsanou výše, kde je dané redukční činidlo přednostně přidáváno při potahování antigenu na proužek. QUICK test je laterální průtokový test (lateral flow assay), kde jsou proužky potahovány antigenem postřikem. V tomto testu je redukční činidlo přednostně přidáváno do postřikovacího roztoku. Redukční činidlo se také může přidat během jakéhokoliv dalšího kroku při zhotovování nebo provádění enzymového testu. Takovéto další kroky zahrnují například blokování, fixaci, předběžnou přípravu, inkubaci protilátek, detekci navázaných protilátek, vývoj zabarvení a další.
Předkládaný vynález se také vztahuje k použití testu charakterizovanému výše pro in vitro diagnózu protilátek získaných proti antigenu vymezenému výše.
Předkládaný vynález se rovněž týká kitu imunotestu, který je definován výše, zahrnující HCV NS3 protein upravený metodou zahrnující kroky sulfonace a následné desulfonace.
Sulfonace a desulfonace je reakce, kterou, se do proteinu zavádí nebo se něj odstraňuje -SO3 skupina.
-11CZ 298268 B6
Sulfonace je definována jako proces, kde thiolové skupiny (SH) na proteinech (R) a disulfidové můstky jsou převedeny na S-sulfonáty, podle následující reakce;
RSH->RS-SO3 (1)
RS-SR + 2 -SOf + H2O -> 2 RS-SO3 + 2 OH' (2)
Produkty reakcí jsou S-sulfoproteiny které jsou obvykle stabilní při neutrálním pH. Reakce (1) se může provést inkubací roztoku proteinu s tetrathionátem při pH>7 (Inglis and Liu, 1970). Reakce (2) pokračuje do konce v přítomnosti mědnatých iontů (Coke 1967), Chán (1968) ukázal, že při působení siřičitanu sodného na protein a katalytického množství cysteinu za přítomnosti kyslíku dává sulfo-proteiny.
Desulfonace se může provést (1) přebytkem kompetitivních - SH (thiolových) skupin, (2) redukčním činidlem, nebo (3) inkubací při jiném než neutrálním pH.
RS-SO3 + R'SH -> RSH + R'S-SOf
RS-SO3 + redukční činidlo RSH
Kompetitivní thiolové skupiny se mohou získat z nízkomolekulámích sloučenin nebo z proteinových -SH skupin.
Příklady sloučenin obsahujících mono- nebo dithiol jsou;
cystein, cysteinamin, redukovaný glutathion, N-acetyl cystein, homocystein, beta-merkaptoetanol, thiokarbamáty, bis(2-merkaptoetanol) sulfon (BMS) a N,N-bis(merkaptoacetyl) hydrazín (BMH), 5,5'^dithiobis—(2-kyselina nitrobenzoová) (DTNB Elamnovo reagens), dithiothreitol (DTT) a dithioeiythritol (DTE).
Vynález se dále týká kitu imunotestu, který je definován výše, obsahujícího HCV NS3 protein, jak je definován výše, který je dále upravený detergentem s obojetným iontem (zwitterionic detergent). Empigen je znám jako lauryldimethylbetain a je zvláště výhodným příkladem detergentu s obojetným iontem. Odborníci znají další vhodné detergenty, které jsou uvedeny také v WO 96/04385.
Předkládaný vynález se dále vztahuje k metodě purifikace rekombinantně exprimovaného proteinu obsahujícímu cystein, která se sestává z nejméně 2, lépe ze 3 nebo 4 a nejlépe ze všech následujících kroků:
(a) sulfonace lyzátu rekombinantních hostitelských buněk nebo lýze rekombinantních hostitelských buněk za přítomnosti guanidin chloridu (přednostně 6 M Gu.HCl) a sulfonace buněčného lyzátu, (b) úprava detergentem s obojetným iontem (zwitterionic detergent), a přednostně po odstranění buněčných zbytků, (c) purifikace sulfonovaného rekombinantního proteinu nebo purifikace sulfonovaného rekombinantního proteinu s následným odstraněním detergentu s obojetným ionem, přičemž pro zmíněnou purifikaci se preferuje chromatografie, zejména Ni-IMAC chromatografie, kde je daný rekombinantní protein rekombinantním proteinem se značeným histidinem (His-tagged),
-12CZ 298268 B6 (d) desulfonace sulfonovaného rekombinantního proteinu nejlépe molárním přebytkem redukčního činidla jako je DTT, (e) uchování za přítomnosti molámího přebytku DTT.
Příkladem zvláště preferovaného detergentu sobojetným ionem (zwitterionic detergent) je Empigen. Zjistilo se, že použití takového detergentu sobojetným ionem a DTT zlepšuje purifikační protokol pro HCV NS3 helikázu a obalové proteiny HCV.
Předkládaný vynález se rovněž týká použití polynukleové kyseliny HCV kódující HCV NS3 polyprotein, jak je ukázáno na obr. 1 (SEQ ID NO 3-18), nebo specifické části polynukleové kyseliny HCV se sekvencí uvedenou v obr. 2-1, 3-1, 4-1, 5-1, 6-1, 7-1 a 8-1 (SEQ ID NO 19, 21, 23,25, 27, 29 a 31) pro přípravu kitu imunotestu, který je definován výše.
Předkládaný vynález se rovněž týká použití polynukleové kyseliny HCV definované výše a charakterizované na obr. 2-1, 3-1, 4-1, 5-1, 6-1, 7-1 a 8-1 a faktem, že její produkt nereaguje s falešně pozitivními HCV vzorky, nebo jejich části, která kóduje NS3 epitopy, které nereagují s falešně pozitivními HCV vzorky. Zejména bylo překvapivé, že proteiny kódované klony reprezentovanými SEQ ID NO 19,. 21, 23, 25, 27, 29 a 31 mají schopnost nereagovat s falešně pozitivními HCV vzorky, ale přesto jsou schopné reagovat s většinou známých vzorků pozitivních na NS3 protilátky po úpravě DTT.
Předkládaný vynález se dále týká použití rekombinantního vektoru obsahujícího popsanou polyhukleovou kyselinu.
Předkládaný vynález se dále týká použití hostitelské buňky obsahující vektor podle vynálezu.
Kromě reaktivity získané redukcí je také reaktivita velmi určená sekvencí NS3 antigenu.
Předkládaný vynález se dále rovněž týká použití HCV polypeptidu, který má část nebo všechna aminokyselinové sekvence uvedené na obr. 1, 2-2, 3-2, 4-2, 5-2, 6-2, 7-2 a 8-2 (SEQ ID NO 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32). Předkládaný vynález se rovněž týká použití proteinu HCV NS3 helíkázy, jak je uvedeno na obr. 1 (SEQ ID NO 1-18) nebo jeho specifické části.
Předkládaný vynález se rovněž týká použití proteinu HCV NS3 helikázy nebo jeho části obsahujícímu buď 51200, A1218, A1384, P14, T: 112, P1424 nebo P1444, nebo kombinace těchto aminokyselin s kteroukoliv z následujících aminokyselin LI201, S1222,11274, TI321, A1323, TI369, LI 382, V1408, A1409 nebo F1410. Číslování je podle běžně akceptovaného číslovacího systému pro aminokyseliny HCV.
Předkládaný vynález se rovněž týká imunotestu obsahujícího HCV NS3 polypeptid jak je definovaný výše. Daný imunotest může mít jakýkoliv formát známý odborníkům (viz například WO 96/13590 a Coligan et al., 1992). Předkládaný vynález se vztahuje zejména k metodě pro detekci polypeptidu vynálezu zahrnující:
kontakt daného polypeptidu s ligandem vázajícím se k danému polypeptidu;
určení komplexu vytvořeného mezi daným polypeptidem a daným ligandem.
Výraz „ligand“ se vztahuje k jakékoliv molekule schopné vázat polypeptidy předkládaného vynálezu. Druhý výraz se specificky vztahuje k polyklonálním a/nebo monoklonálním protilátkám specificky získaným (jakoukoliv známou metodou) proti polypeptidu předkládaného vynálezu a také zahrnuje jakékoliv protilátkám podobné a jiné konstrukty, popsaná detailně v EP 97870092.0 Lorré et al. Takovéto protilátky mohou být velmi užitečné pro detekci antigenu v biologických roztocích. Detekce antigenu se může provést jakýmkoliv imunotestem známým
-13CZ 298268 B6 odborníkům, jako například testy, které využívají biotin a avidin nebo streptavidin, ELISA, imunoprecipitace, imuno-histochemícké techniky a aglutinační testy. Detailní popis těchto testů je v WO 96/13590, který je tak zde zahrnut odkazem.
NS3 proteiny předkládaného vynálezu se také mohou použít při jakékoliv aplikaci, kde je na místě použití NS3 helikázy, například pro účely vyhledávání (screening) léků.
Přehled obrázků na výkresech
Obrázek 1. Aminokyselinová sekvence HCV NS3 klonu izolovaných z HCV subtypu la a lb infikovaného séra.
Obrázek 2-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 klonu 19b fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 2-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 klonu 19b fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence obsahuje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 3-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 klonu B9 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 3-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 klonu B9 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 4-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 Typ 3a klonu 21 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 4-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 Typ 3a klonu 21 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 5-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 Typ 3a klonu 32 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 5-2, Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 Typ 3a klonu 32 fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 6-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 Typ 2a fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 6-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 Typ 2a fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
-14CZ 298268 B6
Obrázek 7-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 Typ 2b fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 7-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 Typ 2b fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 8-1. DNA kódující sekvence mTNFH6NS3 Typ 2c fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Obrázek 8-2. Aminokyselinová sekvence mTNFH6NS3 Typ 2c fúzního proteinu. Sekvence znázorněná tučně není sekvence NS3. Tato sekvence kóduje fúzního partnera mTNF, hexahistidin a část multilinkeru.
Příklady provedení vynálezu
Příklad L Exprese HCV NS3 Typl klonu 19b v £ coli
1.1 Klonování genů HCVNS3 typ lb klony 19a a 19b
Doména NS3helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifikovala pomocí RT-PCR ze séra Ig8309 HCV subtypu lb (Innogenetics, Gent, Belgie) spoužitím syntetických oligonukleotidových primerů HCPr59 (5'-GGGCCCCACCATGGGGGTTGCGAAGGCGGTGGACTT-3r) (SEQ ID NO 1) a HCPr60 (5'-CTATTAGCTGAAAGTCGACTGTCTGGGTGACAGCA-3') (SEQ ID NO 2). Vznikl tak PCR fragment 19, který se nakloňoval do E. coli. Negativní (sense) primer HCPr59 nese restrikční místo pro Apal, které obsahuje umělý metionin. Pozitivní (antisense) oligonukleotid HCPr60 nese stopkodon po aminokyselině (aa) 1465. PCR fragment se následně rozštěpil Apal a výsledný Apal fragment 833 bp dlouhý byl klonován do expresního vektoru TNFHRP (Innogenetics, Gent, Belgie), který byl rozštěpen restrikčním enzymem Apal. Čtyři klony hepatitidy C (HCC1) se osekvenovaly: HCC119a a HCC119b (viz odvozená aminokyselinová sekvence na obr. 1 a obr. 2-2). Klon HCC1119b (pmTNFHRPHCC119b) se uložil pro další subklonování.
1.2 Konstrukce expresního plazmidu pEmTNFMPHHCC119b
Z vektoru pmTNFHRPHCC119b se izolovala kódovací sekvence NS3 klonu 19b dlouhá 900 bp pomocí restrikčního enzymu Ncol a tento úsek se vložil do stejným enzymem rozštěpeného expresního vektora pEmTNFMPH (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikl vektor pEmTNFMPHHCC119b. Tento plazmid exprimoval HCV NS3 klon 19b jako N-koncový fúzní protein s 25 aminokyselinami myšího TNF naN-konci následovaný hexahistidinovou purifikační kotvou a štěpným místem kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 19 a 20; obr. 2).
1.3 Exprese HCV NS3 klonu 19b v E. coli
Buňky kmene MC1061 (pAcI) (Wertman et al., 1986) se transformovaly plazmidem pEmTNFMPHHCC119b. Buňky MC1061 (pAcl) nesoucí plazmid pEmTNFMPHHCC119b se pěstovaly přes noc v kultivačním médiu Luria broth (LB) s přídavkem 10/ug/ml tetracyklinu pří °C. Kultury se zředily 20x čerstvým LB médiem a dále pěstovaly při 28 °C do OD60o 0,2; pak se zdvihla teplota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky. Exprese HCV NS3 klonu 19b fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
-15CZ 298268 B6
Příklad 2. Exprese HCV NS3 klonu B9 v E. coli
2.1 Klonování genu HCV NS3 Typ la klonu B9
Doména NS3helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifikovala pomocí RT-PCT ze séra IG21054 HCV subtypu la (Innogenetics, Gent, Belgie) s použitím syntetických oligonukleotidových primerů HCPr59 (5'-GGGCCCCACCATGGGGGTTGCGAAGGCGGTGGACTT-3') (SEQ ID NO 1) a HCPr60 (5'-CTATTAGCTGAAAGTCGACTGTCTGGGTGACAGCA-3') (SEQ ID NO 2). Vznikl tak PCR fragment B, který byl klonován do E. coli. Negativní (sense) primerHCPr59 vnese restrikční místo pro Apal, které obsahuje umělý metionin. Pozitivní (antisense) oligonukleotid HCPr60 vnese stopkodon po aminokyselině (aa) 1465. PCR fragment .je následně klonován do expresního vektora pGEM-T (Promega, Medison, WI, USA). Čtyři klony byly osekvenovány: B7, B9, B12 a B14 (viz odvozená aminokyselinová sekvence na obr. 1 a obr. 3-2). Klon B9 (pGEMTNS3B9) se uložil pro další subklonování.
2.2 Konstrukce expresního plazmidu pIGFHl 11NS3B9
Z vektoru pGEMTNS3B9 se izolovala kódovací sekvence klonu B9 dlouhá 850 bp pomocí restrikčních enzymů Ncol/Spel (fragment se s zarovnanými konci) a tento úsek se vložil do stejnými enzymy rozštěpeného expresního vektora pIGFHl 11 (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikl vektor pIGFHl 11NS3B9. Tento plazmid exprimoval HCV NS3 klon B9 jako N-koncový fúzní protein s 25 aminokyselinami myšího TNF na N-konci následovaný purifikovaným hexahistidinem a štěpným místem kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 21 a 22; obr. 3).
2.3 Exprese HCV NS3 klonu 9 v E. coli
Buňky kmene MC1061 (pAcI) (Wertman et al. 1986) se transformovaly plazmidem pIGFHl 11NS3B9. Buňky MC1061 (pAcl) nesoucí plazmid pIGFHl 11NS3B9 se pěstovaly přes noc v kultivačním médiu Luria Broth (LB) s přídavkem 10 μg/ml tetracyklinu při 28 °C. Kultury se zředily 20x čerstvým LB a dále pěstovaly při 28 °C do OD6qo 0,2; pak se zdvihla teplota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky. Exprese HCV NS3 klonu B9 fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
Příklad 3 Exprese HCV NS3 Typ la klonů A26, C16 a D18 v E. coli.
Klony A26, C16 a Dl8 se izolovaly z infikovaných sér HCV subtypu la (séra IG21051, IG17790 a IG21068) podobným způsobem, jak je uvedeno pro klon B9 s využitím primerů HCPr59 a HCPr60. Klony A5, A26, Cl, C3, C4, C12, Cl6, Dl7, Dl8 a D19 se klonovaly aosekvenovaly (viz předkládané aminokyselinové sekvence na obr. 1). Klony A26, C16 a Dl 8 se uložil pro další subklonování.
Příklad 4. Exprese HCV NS3 Typ 3a klonů 21 a 32 v E. coli
4. 1 Klonování genů HCV NS3 Typu 3a klonů 21 a 32 )
Doména NS3helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifikovala pomocí RT-PCR z HCV séra subtypu 3a IG21349 a Ig20014 (Innogenetics, Gent, Belgie) s použitím syntetických oligonukleotidových primerů 403 (5'-GGGCCCCACCATAGGTGTAGCAAAAGCCCTACAGTT3') (SEQ ID NO 33) a 404 (5'-CTATTAGCTGAAGTCAACGTACTGTTCAACAGC-3') (SEQ
ID NO 34). Vznikl tak v obou případech PCR'fragment o délce asi 850 bp, který se následně subklonoval do vektoru pGEM-T (Promega, Madison, WI, USA). Z každého klonového PCR fragmentu se osekvenovalo několik klonů, ale po sekvenování se z každého séra ukázal pouze
-16CZ 298268 B6 jeden klonovaný fragment jako zcela správný. Byly to klony 21 (pGEM-TNS3T3a21) ze séra IG21349 a klon 32 (pGEM-TNS3T3a.32) ze séra Ig20014 (obr. 4 a 5).
4.2 Konstrukce expresních plazmidů pGEM-TNS3T3a.21 a pGEM-TNS3T3a,32
Z vektorů pGEM-TNS3T3a.21 a pGEM-TNS3T3a.32 se izolovaly kódovací sekvence klonů. 21 a 32 dlouhé 850 bp pomocí restrikčních enzymů Ncol/Sall a tyto úseky se vložily do stejnými enzymy rozštěpeného expresního vektoru pIGFHl 11 (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikly vektory pIGFHl 1 lNS3T3a.21 a píGFHlllNS3T3a,32. Tyto plazmidy exprimovaly HCV NS3 Typ 3a klony 21 a 32 jako N-koncové fúzní proteiny s 25 aminokyselinami myšího TNF na Nkonci následovanými purifikovaným hexahistidinem a štěpným místem kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 23-26; obr. 4 a 5).
4.3 Exprese HCV NS3 typ 3a klonů 21 a 32 v E. coli
Buňky kmene MC1061 (pAcI) (Wertman et al., 1986) se transformovaly plazmidy pIGFHl 1 INS3T3a.21 a pIGFHlllNS3T3a.32. Buňky MC1061 (pAcI) nesoucí plazmid pIGFHl HNS3T3a.21 nebo pIGFHl llNS3T3a.32 se pěstovaly pres noc v kultivačním médiu Luria Broth (LB) se přídavkem 10 pg/ml tetracyklinu při 28 °C. Kultury se zředily 20x čerstvými LB a dále pěstovaly při 28 °C do OD60o 0,2; pak se zdvihla teplota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky. Exprese HCV NS3 klonu B9 fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
Příklad 5. Exprese HCV NS3 Typ2a klonu 3 v £. coli
5.1 Klonování genu HCV NS3 Typ2a klonu 3
Doména NS3 helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifikovala pomocí RT-PCR ze séra IG21342 HCV subtypu 2a (Innogenetics, Gent, Belgie) s použitím syntetických oligonukleotidových primerů 412 (5ř-GGGCCCCACCATGGGCGTGGCCAAGTCCATAGACTT-3') (SEQ ID 35) a 413 (5MZTATTGCTGAAGTCTACAACTTGAGTGACCGC-3') (SEQ ID NO 36). Vznikl tak PCR fragment o délce asi 850 bp, který byl následně subklonován do vektoru pGEM-T (Promega, Madison, WI, USA). Několik klonů se osekvenovalo a klon 3 pGEM-TNS3T2 se uchoval pro další subklonování (obr. 6).
5.2 Konstrukce expresního plažmidu pIGFHl 11NS3T2
Z vektoru pGEm-TNS3T2a se izolovala kódovací sekvence klonu 3 dlouhá 850 bp pomocí restrikčního enzymu Ncol a tento úsek se vložil do stejným enzymem rozštěpeného expresního vektoru pIGFHl 11 (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikl vektor pIGFHl 1 lNS3T2a. Tento plazmid exprimoval HCV NS3 Typ 2a klon 3 jako N- koncový fúzní protein s 25 aminokyselinami myšího TNF na N-konci následovaný purifíkovaný hexahistidinem a štěpným místem kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 27 a 28; obr. 6).
5.3 Exprese HCV NS3 Typ 2a klonu 3 v E. coli
Buňky kmene MC1061 (pAcI) (Wertman et al., 1986) se transformovaly plazmidem pIGFHl 1 lNS3T2a. Buňky MC1061 (pAcI) nesoucí plazmid pIGFHl 1 lNS3T2a se pěstovaly přes noc v kultivačním médiu Luria Broth (LB) s přídavkem 10 pg/ml tetracyklinu při 28 °C.
Kultury se zředily 20x čerstvým LB a dále pěstovaly při 28 °C do OD60o 0,2; pak se zdvihla teplota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky, Exprese HCV NS3 Typu 2a klonu 3 fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
-17CZ 298268 B6
Přiklad 6. Exprese HCV NS3 Typ 2b klonu 9 v £ coli J
6.1 Klonování genu HCV NS3 Typ 2b klonu 9
Doména NS3helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifíkovala pomocí RT-PCR ze séra 1
IG20192 HCV subtypu 2b (Innogenetics, Gent, Belgie) s použitím syntetických oligonukleotidových primerů 401 (5'<iGGCCCCACCATGGGCGTAGCCAAATCCATTGACTT-3') (SEQ ID NO 37) a 402 (5'-CTATTAGCTGAAGTCTACAATTTGAGACCGC-3') (SEQ ID NO 38). Vznikl tak PCR fragment o délce asi 850 bp, který byl následně subklonován do vektoru pGEMT (Promega, Madison WI, USA). Několika klonů se osekvenovalo a klon 9 se uchoval pro další subklonování (obr. 7).
6. 2 Konstrukce expresního plazmidu pIGFHl 1 lNS3T2b
Z vektoru pGEm-TNS3T2b se izolovala kódovací sekvence klonu 9 dlouhá 850 bp pomocí:
restrikčního enzymu Ncol a tento úsek se vložil do stejným enzymem rozštěpeného expresního vektoru pIGFHlll (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikl vektor pIGFHlllNS3T2b. Tentoj plazmid exprimoval HCV NS3 Typ 2b klon 9 jako N-koncový fúzní protein s 25 aminokyseli-í námi myšího TNF na N-konci následovaný purifikovaným hexahistidinem a štěpeným místemI kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 29-30; obr. 7).J
6.3 Exprese HCV NS3 Typ 2a klonu 3 v E colií
Buňky kmene MC1061 (pAcI) (Wertman et al. 1986) se transformovaly plazmidem pIGFHl HNS3T2b. Buňky MC1061 (pAcI) nesoucí plazmid pIGFHl l lNS3T2b se pěstovaly přes noc v kultivačním médiu Luria Broth (LB) s přídavkem 10 pg/ml tetracyklinu při 28 °C. Kultury se zředily 20x čerstvým LB a dále pěstovaly při 28 °C do ODóoo 0,2; pak se zdvihla teplota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky. Exprese HCV NS3 Typu 2b klonu B9 fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
Příklad 7. Exprese HCV NS3 Typ 2c klonu 14 v E. coli
7.1 Klonování genu HCV NS3 Typ 2c klonu 14
Doména NS3helikázy (aminokyseliny 1188-1465) se amplifíkovala pomocí RT-PCR ze séra IG20031 HCV subtypu 2c (Innogenetics, gent, Belgie) s použitím syntetických oligonukleotidových primerů 401 (5'-GGGCCCCACCATGGGGTAGCCAAATCCATTGACTT-3') (SEQ ID NO 37) a 402 (5'-CTATTAGCTGAAGTCTAGAATTTGAGACCGC-3') (SEQ ID NO 38). Vznikl tak PCR fragment o délce asi 850 bp, který byl následně subklonován do vektoru pGEMT (Promega, Madison WI, USA). Několik klonů se osekvenovalo a klon 14 (pGEM-TNS3T2c) se uchoval pro další subklonování (obr. 8). j i
7.2 Konstrukce expresního plazmidu pIGFHl llNS3T2c|
Z vektoru pGEM-TNS3T2 se izolovala kódovací sekvence klonu 14 dlouhá 850 bp pomocí restrikčního enzymu Ncol a tento úsek se vložil do stejným enzymem rozštěpeného expresníhoí vektoru pIGFHlll (Innogenetics, Gent, Belgie). Tak vznikl vektor pIGFHl 1 lNS3T2c. Tentoí plazmid exprimoval HCV NS3 Typ 2c klon 14 jako N-koncový fúzní protein s 25 aminokyselinámi myšího TFN na N-konci následovaný purifikovaným hexahistidinem a štěpným místem kyseliny mravenčí (SEQ ID NO 31 a 32; obr. 8).
-18CZ 298268 B6
Exprese HCV NS3 Typ 2c klonu 14 v A. coli í
Buňky kmene MC1061 (pAd) (Wertman et al., 1986) se transformovaly plazmidem{ pIGFHl 1 lNS3T2c. Buňky MC1061 (pAcI) nesoucí plazmid pIGFHl 1 lNS3T2b se pěstovaly přes noc v kultivačním médiu Luria Broth (LB) s přídavkem 10 pg/ml tetracyklinu při 28 °C.í
Kultury se zředily 20x čerstvým LB a dále pěstovaly při 28 °C do OD600 0,2; pak se zdvihla tep-1 lota na 42 °C. Za 2 až 3 hodiny po indukci se získaly buňky. Exprese HCV Typ 2c NS3 klonu 14| fúzního proteinu se analyzovala technikou western blotů s použitím specifických monoklonálních’] protilátek a HCV pozitivního lidského séra.
Příklad 8. Purifikace proteinové domény NS3 helikázy
Najeden gramekvivalent vlhké pasty E. coli se přidalo devět objemů 8M guanidin hydrochloridu (Gu.HCl) a 1 objem 0,2 M NaHPO4 a tato směs se homogenizovala souvislým vortexováním. Do roztoku se přidaly Na2S4O6 a Na2$Ch v pevném stavu až do konečných koncentrací 65 a 360 mM. Ze zásobního rozteku (0,1 M v 25% NH3) se přidal CuSO4 do konečné koncentrace 100 μΜ. Roztok se míchal přes noc v temné komoře a po inkubaci při -70 °C se vyčeřil centrifugací při 4 °C (30 minut, 20 OOOot./min, rotor JA20).
K supematantu se přidal lauryldimethylbetain, rovněž známá jako Epmigen BB (albright & Wilson Ltd., Oldbuiy, VB), a imidazol do finálních koncentrací 1% (váha/objem) a 20 mM. 1M HC1 se upravilo pH na hodnotu 7,2. Vzorek odpovídající 3 litrům kultury se nanesl na ekvilibrovanou kolonu Ni-IDA Sepharose FF rychlostí 2 ml/min (kolona XK 16/20, Pharmaeia, Upsala, Švédsko). Kolona byla ekvilibrována pufrem A, který obsahoval 20 mM imidazolu (pufr A: 50 mM fosfátu, 6M Gu.HCl, lauryldimethylbetain, pH 7,2). Ni-IDA kolona se potom postupně promyla:
pufrem A obsahujícím 20 mM imidazolu pufrem A obsahujícím 35 mM imidazolu
- pufrem A obsahujícím 50 mM imidazolu pufrem B obsahujícím 50 mM imidazolu (pufr B: 50 mM fosfátu, 6M Gu.HCl, pH 7,2) pufrem B obsahujícím 200 mM imidazolu
Každý promývací krok trval tak dlouho, dokud se absorbance při 280 nm nevrátila na základní úroveň. Kolona se regenerovala 50 mM EDTA, 500 mM NaCI, pH 7,0.
Frakce se analyzovaly pomocí SDS-PAGE elektroforézy za neredukuj ících podmínek a obarvením stříbrem. MTNF-NS3 B9 fúzní protein se získal elucí pufrem s 200 mM imidazolem. Western blot s použitím králičího proti—lidského TNF (1 pg NS3/dráhu) a králičí anti-£. coli (10 μg NS3/dráhu) ukázal, že NS3 vykázal po tomto jediném chromatografickém kroku více jak 99% čistotu.
Frakce získané po eluci 200 mM imidazolem se spojily a odsolily.
Vzorek 40 ml Ni-IDA eluátu se nanesl rychlostí 10 ml/min na 300 ml kolonu Sephadex G25 (XK50, Pharmaeia, Upsala, Švédsko) zekvilibrovanou pufrem s 50 mM fosfátu, 6 M močovinou a lmM EDTA, pH 7,2. Jímaly se 10 ml frakce a koncentrace proteinu se určila mikro BCA metodou (Pierce, Rockfor, IL, US). Koncentrace proteinu sé upravila před desulfonací na
500 pg/ml pufrem, který se použil pro odsolení. Celkový výtěžek byl 50 až 55 mg pufrovaného
NS3 fúzního proteinu/1 1 kultury.
-19cz. zvazoa bo
Nakonec se přidal DTT (zásobní roztok 100 mM v destilované vodě) ve lOOnásobném molámím ;j přebytku oproti obsahu cysteinu v NS3 antigenů (např. NS3 19b obsahuje 7 cysteinů). Roztok se i potom pročistil dusíkem a inkubován 1 hodinu při 28 °C. Vzorek NS3 se následně zředil přísluš- i ným pufrem použitým pro ELISA a LíA potahování.
Příklad 9. Reaktivita protilátek proti NS3 helikáze testována v LIA /
Aby se otestovala reaktivita protilátek proti NS3 helikáze aplikovala se na nylonový membráno- 1 vý proužek linie roztoku antigenů NS3 (50 pg/ml) ve fyziologickém roztoku tlumeném fosfátem (phosphate bufferred šalině, PBS). Proužky se po dobu alespoň jedné hodiny vysušily při teplotě 18 až 24 °C a dále blokovaly PBS/kaseinem za přítomnosti nebo nepřítomnosti redukčního činidla DTT (10 mM). Proužky se následně opláchly PBS obsahujícím Tween 20 s nebo bez DTT (10 mM) a s 1 mM EDTA. Membrány se usušily (30 minut) a rozstříhaly se proužky pro testování různých vzorků pacientů.
Výsledky experimentu, kde se proužky inkubovaly santi-HCV sérokonverzním panelem PHV903 (Boston Biomedica lne. Boston, USA) jsou uvedené v tabulce 1.
Příklad 10. Reaktivita protilátek proti NS3 helikáze testovaná v ELISA.
Aby se otestovala reaktivita protilátek proti NS3 helikáze potáhly se mikrotitrační ELISA destičky NS3 antigeny purifikovanými jakje uvedeno v příkladu 8 následujícím způsobem.
Jamky mikrotitrační destičky se potáhly NS3 proteinem o koncentraci 0,3 μ§/ιηΙ NS3 proteinu v potahovacím pufru obsahujícím 50 mM uhličitanový pufr, s nebo bez DTT (200 mM) a 1 mM EDTA. Mikrotitrační desky se inkubovaly 18 hodin při 20 °C a blokovaly 300 μΐ PBS/kase i nového pufru v každé jamce. Desky se inkubovaly 2 hodiny při 20 °C a následně fixovaly 300 μΐ fixačního pufru s nebo bez DTT (200 mM) a 1 mM EDTA 2 hodiny při 20 °C.
Výsledky ukazují tabulky 2 a 3. Tabulka 2 ukazuje hodnoty signálu k šumu testů zahrnujících NS3 potažené a fixované s nebo bez DTT při použití BBI sérokonverzních panelů PHV901 a PHV912. Tabulka 3 shrnuje počet dnů, o kolik můžou být detekovány HCV protilátky dříve, použije-li se test zahrnující DTT. U 12 HCV sérokonverzí še při použití DTT v testu dosáhlo detekce o celkem 34 dní dříve.
Tabulka 1. BB 1 panely testované v LIA potažené HCV NS3 jakje popsáno u vzorku 9
PHV +DTT -DTT1
903-01
903-0'2. -
903-03 T7-
903-04 2
903-05 2 +/-
9.03-0.6 2 +/-
903-07 4 2
903-08 4 2
bez reakce; + pozitivní reakce; hodnocení intenzity v porovnání s různými mezními hodnotami (cut off) linií nastříkanými na ten samý proužek
-20CZ Z98Z68 tJO
Tabulka 2: Panely BBI testované v ELIS A potažené HCV NS3 podle popisu v příkladu 10
MEMBER ID# DATUM KRVÁCENÍ +. DTT OD45O - DTT OD«5d
PHV901-01. 09/.23Z 93 o>i 0;,3
PHV901-02 27/11/93 0,1 0,3
PHV901-03 29/12/93 2,0 ' 2,9
PHV901-04; 31/12/93 2> 1 3;0.
PHV901-05 01/05/94 2,2 í , 3,1......
PHV901-06 01707,794 2,4 3,2 .......
PHV90T-C7' 02/01/94 ..... 4,1 ' ' 6,0.
PHV901-08 02/09/94 3, 9 5,9
PHV901-09 03/01/94 4,0 '7,9
PHV901-10· 03/08/94 4,1 7,8
PHV901-1T 14/04/94 θ.>3.
PHV903-01 02/07/92. 0,2· 0/.2
PHV903-02 02712/92· 0,9’ 0.,9.
PHV903-03 14/02/92 χ;3· ! ·· ' .1,6 '
PHV903-04 19/02/92. 2,5 2/7
PHV903-.05 21/02/92 4,8 2,8.
PHV9Ó3-06 26/02/92. 3,2 :4y 6
PHV903-07 28/02/92 3/5 5, 4’
PHV90.3~.08 ; 03/04/92 3,5' 4,1
PHV904-01 18/04/95 0,1. V,2
PHV904-02 20/04/95 0,1 0>3
PHV904-03 25/04/95 Ό,/1 . 0,2:
PHV904-04 04727/95 .0,1. 0)2-
PHV9.04-05 05/02/95. 0,4 0,4
PHV904-06 '0570979-5 o,8 0,5
PHV9Ó4-07 05/11/95 0-, 8; 0,5. '
PHV905-C1 17/11/95· ’Q’á 0,2
PHV90S-02 21/11/95 O.·,! o, 3
PHV905-03 11/24/95 0,1 0,3
PHV905-04 28/11/95 0,2: 0,3 ...... !
PHV905-05 12/01/9.5; 0., 5 0,3
PHV905-06 12/05/95 1,0 0,4
PHV905-07 12/08/95 2,5 0,8-
PHV905-08 12/12/95 3,5 2,2
PHV905-09 15/12/95 3,5 ‘ β <2

Claims (23)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY I i
    1. Kit imunotestu na pevné fázi, v y z n a č u j í c í se tím, že obsahuje na pevné fázi HCVJ
    NS3 protein, nebo jeho analog, v přítomnosti redukčního činidla, přičemž HCV NS3 protein nebo>
    jeho analog obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 pro-* teázy nebo helikázy.
  2. 2. Kit imunotestu na pevné fázi, vyznačující se tím, že obsahuje na uvedené pevné fázi HCV NS3 protein nebo jeho analog, v redukované formě, přičemž HCV NS3 protein nebo jeho analog obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 proteázy nebo helikázy.
  3. 3. Kit imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 2, vyznačující.se t í m , že HCV NS3 proteinem je HCV NS3 aminokyselinová sekvence zvolená z množiny sestávající z SEQ ID NO: 3 až 18.
  4. 4. Kit imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 3, vyznačující se tím, že HCV
    NS3 protein je obsažen ve fúzním proteinu. ·
  5. 5. Kit imunotestu podle nároku 4, v y z n a č u j í c í se t í m, že fúzní protein je zvolen z množiny aminokyselinových sekvencí sestávajících z SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30 a SEQ ID NO: 32.
  6. 6. Kit imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 5, vyznačující se tím, že HCV NS3 proteinem nebo jeho částí je HCV NS3 helikázový protein obsahující buď S1200, A1218, A1384, P1407, VI12, P1424 nebo F1.444, nebo kombinace jedné z aminokyselin s libovolnou z následujících aminokyselin zvolených z množiny sestávající z L1201, 1222, 11274, S1289, TI321, A1323, T1369, L1382, V140, A1409, F1410, přičemž HCVNS3 helikázový protein nebo jeho část obsahuje aminokyselinovou sekvenci definující alespoň jeden epitop HCV NS3 helikázy·
  7. 7. Kit imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 6, vyznačující se tím, že HCV NS3 proteinem je HCV NS3 protein zpracovaný způsobem, který zahrnuje kroky sulfonace a následné desulfonace.
  8. 8. Kit imunotestu podle nároku 7, vyznačující se tím, že HCV NS3 protein je ošetřen detergentem s obojetňými ionty.
  9. 9. Kit imunotestu podle nároku 8, vy značu j ící se tím, že HCV NS3 protein je ošetřen lauryldimethylbetainem jako detergentem s obojetňými ionty.
  10. 10* Kit imunotestu podle kteréhokoliv nároků 1 až 9, vy znač u j í cí se tím, že tímto kitem je kit ELISA, testovací kit QUICK nebo kit imunotestu Line.
  11. 11. Způsob výroby kit imunotestu kteréhokoliv z nároků 1 až 10, vy zn ač uj íc í se tím, že se redukční činidlo přidá alespoň v jednom z následujících kroků:
    (i) potažení pevné fáze antigenem; a (ii) po (i), blokace pevné fáze; a (iii) po (ii), fixace proteinů nanesených na pevné fázi; a (iv) po (iii), předběžná úprava pevné fáze.
    -24CZ 298268 B6
  12. 12. Způsob podle nároku 11,vyznačující ku (i).
  13. 13. Způsob podle nároku 11, vyznačující ku (ii).
  14. 14. Způsob podle nároku 11, vyznačující cích (i) a (ii).
  15. 15. Způsob podle nároku 11,vyznačující ku (iii).
  16. 16. Způsob podle nároku 11, v y z n a č u j í c í cích (i) a (iii).
  17. 17. Způsob podle nároku 11, v y z n a č u j í c í ku (iv).
  18. 18. Způsob podle nároku 11, vyznačující cích (i) a (iv).
    se tí m , že se redukční činidlo přidá vkros e t í m , že se redukční činidlo přidá v kros e t í m , že se redukční činidlo přidá v kros e t í m , že se redukční činidlo přidá v krose tí m, že se redukční činidlo přidá vkros e t í m , že se redukční činidlo přidá v kros e t í m , že se redukční činidlo přidá v kro-
  19. 19. Způsob podle kteréhokoliv z nároků II až 18, vyznačující se tím, že se jako redukční činidlo použije dithiotreitol neboli DTT, dithioerytrithiol neboli DTE nebo tris(2-karboxyethyl)fosfin neboli TCEP.
  20. 20. Způsob podle kteréhokoliv z nároků 11 až 19, v y z n a č u j í c í se tím, že se redukční činidlo použije v koncentračním rozmezí 0,1 mM až 1 M, výhodněji 0,5 až 500 mM, ještě výhodněji 1 až 250 mM, přičemž některé aplikace mohou vyžadovat rozmezí od 0,5 do 50 mM, od 1 do 30 mM, od 2 do 20 mM nebo od 5 do 15 mM, nebo 10 mM.
  21. 21. Použití kitu imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 2 pro detekci protilátek HCV NS3 proteinu.
  22. 22. Použití kitu imunotestu podle nároku 21, vyznačující se tím, že se uvedené protilátky detekují v biologickém vzorku.
  23. 23. Použití kitu imunotestu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 2 pro detekci ranné HCV NS3 sérokonverze.
CZ20003819A 1998-04-17 1999-04-15 Imunodiagnostický test používající redukující cinidla CZ298268B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP98870087 1998-04-17

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20003819A3 CZ20003819A3 (cs) 2001-10-17
CZ298268B6 true CZ298268B6 (cs) 2007-08-08

Family

ID=8237028

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20003819A CZ298268B6 (cs) 1998-04-17 1999-04-15 Imunodiagnostický test používající redukující cinidla

Country Status (21)

Country Link
US (1) US7935490B2 (cs)
EP (2) EP1071955B2 (cs)
JP (2) JP2002512370A (cs)
KR (1) KR20010042807A (cs)
CN (1) CN1305589A (cs)
AT (2) ATE401340T1 (cs)
AU (1) AU751362B2 (cs)
BR (1) BRPI9909678B8 (cs)
CA (2) CA2324970C (cs)
CY (1) CY1108424T1 (cs)
CZ (1) CZ298268B6 (cs)
DE (2) DE69939132D1 (cs)
DK (2) DK1471074T3 (cs)
ES (2) ES2230851T5 (cs)
HU (1) HUP0101719A3 (cs)
IL (1) IL138791A0 (cs)
PL (1) PL343469A1 (cs)
PT (2) PT1471074E (cs)
TR (4) TR200101648T2 (cs)
WO (1) WO1999054735A1 (cs)
ZA (1) ZA200005445B (cs)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1555270A1 (en) * 1998-06-24 2005-07-20 Innogenetics N.V. HCV NS3 proteins and nucleic acids
US6960569B2 (en) * 2000-08-17 2005-11-01 Tripep Ab Hepatitis C virus non-structural NS3/4A fusion gene
US7022830B2 (en) 2000-08-17 2006-04-04 Tripep Ab Hepatitis C virus codon optimized non-structural NS3/4A fusion gene
AR035868A1 (es) 2001-04-24 2004-07-21 Innogenetics Nv Un acido nucleico recombinante que codifica una proteina de un peptido lider de lisozima de ave o equivalente funcional, un vector que lo comprende, una celula huesped, un metodo para producir una proteina de envoltura del hcv o una parte de la misma.
JP2004108914A (ja) * 2002-09-18 2004-04-08 Kudo Norio コラーゲンの測定方法
EP1558283A2 (en) * 2002-11-08 2005-08-03 Innogenetics N.V. Hcv vaccine compositions comprising e1 and ns3 peptides
US20050014136A1 (en) * 2003-05-28 2005-01-20 Innogenetics N.V. Modified HCV NS5
CN1871518B (zh) 2003-10-28 2010-08-25 株式会社先端生命科学研究所 丙型肝炎病毒的检测方法
CA2657223A1 (en) * 2006-07-07 2008-01-10 Pall Corporation Use of denaturing agents during affinity capture
US20100304353A1 (en) * 2007-07-16 2010-12-02 Pfizer Inc Methods of improving a genomic marker index of dairy animals and products
CN101970688A (zh) * 2007-09-12 2011-02-09 美国辉瑞有限公司 遗传标记和相关上位相互作用的使用方法
EP2205766A4 (en) * 2007-10-03 2012-12-12 Pfizer GENETIC MARKERS OF HORN AND CORNE-FREE LIVESTOCK AND RELATED METHODS
CN101952718A (zh) * 2007-12-17 2011-01-19 美国辉瑞有限公司 改善产乳动物和产品的遗传图谱的方法
EP2318838B1 (en) * 2008-07-16 2013-09-04 Radiometer Medical ApS High capacity solid phase
CN102081018A (zh) * 2009-11-30 2011-06-01 希森美康株式会社 样品的预处理方法及hcv的免疫测定方法
FR2984328B1 (fr) 2011-12-20 2016-12-30 Bio-Rad Innovations Procede de detection d'une infection par le virus de l'hepatite c
US10088483B2 (en) 2014-10-29 2018-10-02 Abbott Laboratories Subject anti-HCV antibody detection assays employing NS3 capture peptides
CN109870581B (zh) * 2017-12-04 2021-05-04 厦门万泰凯瑞生物技术有限公司 一种定量检测HBsAg的试剂盒及方法
CN109678954B (zh) * 2018-12-29 2022-01-07 山东莱博生物科技有限公司 一对能够特异性识别hcv ns3蛋白的单克隆抗体及其应用
CN110988362B (zh) * 2019-12-20 2023-11-14 迈克生物股份有限公司 抗组蛋白抗体测定试剂、试剂盒及其使用方法
CN112225783B (zh) * 2020-09-16 2021-08-31 东莞市朋志生物科技有限公司 Hcv重组抗原及其突变体
CN112285361B (zh) * 2020-09-27 2023-12-05 中国人民解放军空军军医大学 排除抗-cd38单克隆抗体药物对抗人球蛋白检测干扰的试剂
CN113219169B (zh) * 2021-05-22 2021-12-17 北京金诺百泰生物技术有限公司 生物检测用封闭剂及其制备方法、包被板及应用该包被板的试剂盒
CN115112897B (zh) * 2021-12-10 2024-11-01 中山大学附属第八医院(深圳福田) 一种用于鉴别抗体检测生物学假阳性的方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0139526A2 (en) * 1983-10-20 1985-05-02 Warner-Lambert Company An insolubilized stable specific binding protein
WO1996004385A2 (en) * 1994-07-29 1996-02-15 Innogenetics N.V. Purified hepatitis c virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4616078A (en) * 1985-04-08 1986-10-07 Eli Lilly And Company Process for purifying proinsulin-like materials
CA1340877C (en) * 1987-12-28 2000-01-18 Takashi Sugiyama Elastase inhibitory polypeptide and process for production thereof by recombinant gene technology
EP0341439B1 (en) * 1988-05-11 1993-08-04 Abbott Laboratories Method for increasing specificity in competitive immunoassays
US4923967A (en) * 1988-09-26 1990-05-08 Eli Lilly And Company Purification and refolding of recombinant proteins
US6194140B1 (en) * 1990-04-04 2001-02-27 Chiron Corporation HCV NS3 protein fragments having helicase activity and improved solubility
EP1304335B1 (en) * 1990-04-04 2009-06-10 Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. Hepatitis C virus protease
US5606031A (en) * 1990-04-06 1997-02-25 Lile; Jack Production and purification of biologically active recombinant neurotrophic protein in bacteria
WO1993000365A2 (en) * 1991-06-24 1993-01-07 Chiron Corporation Hepatitis c virus (hcv) polypeptides
JP3225468B2 (ja) 1992-08-28 2001-11-05 ダイナボット株式会社 抗体測定用試薬
NZ266148A (en) 1993-04-27 1997-06-24 Innogenetics Sa Nv Polynucleic acid compositions of hepatitis c virus sequences, hcv protein compositions and uses of both
DE69434295T2 (de) 1993-11-04 2006-02-16 Innogenetics N.V. Von menschlichen T-Zellen immunodominante Epitopen des Virus der C-Hepatitis
ES2167372T3 (es) 1994-06-23 2002-05-16 Energy Answers Corp Sistema para la obtencion de productos derivados de la ceniza y de energia a partir de residuos rechazados.
DE4428705A1 (de) * 1994-08-12 1996-02-15 Boehringer Mannheim Gmbh Rekombinantes Antigen aus der NS3-Region des Hepatitis C Virus
JPH0862219A (ja) 1994-08-19 1996-03-08 Dainabotsuto Kk 還元型抗原に対する抗体アッセイ試薬及びそれを使用した測定方法
PT804584E (pt) 1994-10-21 2002-11-29 Innogenetics Nv Sequencias de virus da hepatite c genotipo 7 e sua utilizacao como agentes profilacticos terapeuticos e de diagnostico
US5705330A (en) * 1995-04-14 1998-01-06 Abbott Laboratories Chemiluminescent immunoassay for antibody detection
US5616460A (en) * 1995-06-07 1997-04-01 Abbott Laboratories Buffer composition for reagents for immunoassay
JP3945822B2 (ja) 1996-05-24 2007-07-18 カイロン コーポレイション 複数エピトープ融合タンパク質
KR100487455B1 (ko) * 1997-01-13 2005-05-09 롬 앤드 하스 일렉트로닉 머티리얼스 씨엠피 홀딩스, 인코포레이티드 사진석판술에 의해 유도된 표면 패턴(들)이 있는 연마용 중합체 패드 및 이에 관련된 방법

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0139526A2 (en) * 1983-10-20 1985-05-02 Warner-Lambert Company An insolubilized stable specific binding protein
WO1996004385A2 (en) * 1994-07-29 1996-02-15 Innogenetics N.V. Purified hepatitis c virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use

Also Published As

Publication number Publication date
CY1108424T1 (el) 2014-04-09
DE69920895T3 (de) 2009-09-03
DK1071955T3 (da) 2005-02-07
EP1071955B2 (en) 2009-02-18
JP2002512370A (ja) 2002-04-23
EP1071955A1 (en) 2001-01-31
HK1036653A1 (en) 2002-01-11
ZA200005445B (en) 2003-01-06
AU751362B2 (en) 2002-08-15
CN1305589A (zh) 2001-07-25
CZ20003819A3 (cs) 2001-10-17
DK1471074T3 (da) 2008-11-17
IL138791A0 (en) 2001-10-31
US7935490B2 (en) 2011-05-03
TR200202213T2 (tr) 2002-11-21
DE69920895D1 (de) 2004-11-11
CA2324970A1 (en) 1999-10-28
DK1071955T4 (da) 2009-06-15
BRPI9909678B8 (pt) 2021-05-25
WO1999054735A1 (en) 1999-10-28
EP1471074A2 (en) 2004-10-27
PT1471074E (pt) 2008-10-23
HUP0101719A2 (hu) 2001-09-28
CA2658218A1 (en) 1999-10-28
PL343469A1 (en) 2001-08-13
DE69920895T2 (de) 2005-10-13
ES2230851T5 (es) 2009-06-25
JP2005185285A (ja) 2005-07-14
TR200003024T2 (tr) 2000-12-21
TR200101648T2 (tr) 2002-06-21
DE69939132D1 (de) 2008-08-28
ES2310701T3 (es) 2009-01-16
BR9909678B1 (pt) 2013-11-12
AU3817199A (en) 1999-11-08
KR20010042807A (ko) 2001-05-25
CA2658218C (en) 2014-10-28
EP1071955B1 (en) 2004-10-06
EP1471074B1 (en) 2008-07-16
ATE278960T1 (de) 2004-10-15
PT1071955E (pt) 2005-02-28
US20060263854A1 (en) 2006-11-23
ATE401340T1 (de) 2008-08-15
CA2324970C (en) 2009-06-30
TR200101647T2 (tr) 2002-06-21
BR9909678A (pt) 2000-12-19
EP1471074A3 (en) 2004-11-10
JP3974620B2 (ja) 2007-09-12
HUP0101719A3 (en) 2006-05-29
ES2230851T3 (es) 2005-05-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7935490B2 (en) Immunodiagnostic assays using reducing agents
FI113967B (fi) Hepatitis-C-virustesti
CZ20024058A3 (cs) Kombinační stanovení HCV antigen/protilátka
PL172133B1 (pl) Sposób tworzenia kombinacji antygenów wirusowego zapalenia watroby typu C (HCV) i sposób wykrywania przeciwcial przeciw wirusowemu zapaleniu watroby typu C (HCV)
FI118688B (fi) Hepatiitti-C-virustyypit 4,5 ja 6
RO115471B1 (ro) Metoda pentru stabilirea unuia sau a mai multor tipuri de virus al hepatitei c
JP2778886B2 (ja) C型肝炎ウィルスのコア抗原タンパク質及びそれを用いての診断方法及びキット
US20060234214A1 (en) Methods of detecting hepatitis C virus
AU2002301931B2 (en) Improved immunodiagnostic assays using reducing agents
CA2387666A1 (en) Redox reversible hcv proteins with native-like conformation
HK1036653B (en) Improved immunodiagnostic assays using reducing agents
MXPA00009956A (en) Improved immunodiagnostic assays using reducing agents
Bosman Maertens et al.(43) Pub. Date: Nov. 23, 2006
US20040185061A1 (en) Redox reversible HCV proteins with native-like conformation

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 19990415