CZ216699A3 - Geny kodující pro deacetylázy aminokyselin se specifikací pro N-acetyl-L-fosfinothricin, způsob jejich izolace a jejich použití - Google Patents
Geny kodující pro deacetylázy aminokyselin se specifikací pro N-acetyl-L-fosfinothricin, způsob jejich izolace a jejich použití Download PDFInfo
- Publication number
- CZ216699A3 CZ216699A3 CZ992166A CZ216699A CZ216699A3 CZ 216699 A3 CZ216699 A3 CZ 216699A3 CZ 992166 A CZ992166 A CZ 992166A CZ 216699 A CZ216699 A CZ 216699A CZ 216699 A3 CZ216699 A3 CZ 216699A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- acetyl
- deacetylase
- ala
- ppt
- gly
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 86
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 17
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 title description 23
- 238000002955 isolation Methods 0.000 title description 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 35
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 claims abstract description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 30
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 27
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 22
- 241001600125 Delftia acidovorans Species 0.000 claims description 16
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 12
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 10
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 9
- 241000983364 Stenotrophomonas sp. Species 0.000 claims description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 4
- 108010040807 N-acetylphosphinothricin deacetylase Proteins 0.000 claims 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 abstract description 19
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 abstract description 8
- 206010021929 Infertility male Diseases 0.000 abstract description 2
- 208000007466 Male Infertility Diseases 0.000 abstract description 2
- 206010021928 Infertility female Diseases 0.000 abstract 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 46
- VZVQOWUYAAWBCP-LURJTMIESA-N N-acetyl-L-phosphinothricin Chemical compound CC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCP(C)(O)=O VZVQOWUYAAWBCP-LURJTMIESA-N 0.000 description 23
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 15
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 15
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 15
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 14
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 12
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 11
- IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N glufosinate-P Chemical compound CP(O)(=O)CC[C@H](N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 11
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 9
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N N-benzoylglycine Chemical compound OC(=O)CNC(=O)C1=CC=CC=C1 QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 7
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 7
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 7
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000002585 base Substances 0.000 description 6
- 108010093701 hippurate hydrolase Proteins 0.000 description 6
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 6
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 230000006196 deacetylation Effects 0.000 description 5
- 238000003381 deacetylation reaction Methods 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N Phosphinothricin Natural products CP(O)(=O)CCC(N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 4
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 241000589875 Campylobacter jejuni Species 0.000 description 3
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 3
- JRLGPAXAGHMNOL-LURJTMIESA-N N(2)-acetyl-L-ornithine Chemical compound CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC[NH3+] JRLGPAXAGHMNOL-LURJTMIESA-N 0.000 description 3
- RFMMMVDNIPUKGG-YFKPBYRVSA-N N-acetyl-L-glutamic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O RFMMMVDNIPUKGG-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N Thr-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 3
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 3
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- IVWWFWFVSWOTLP-YVZVNANGSA-N (3'as,4r,7'as)-2,2,2',2'-tetramethylspiro[1,3-dioxolane-4,6'-4,7a-dihydro-3ah-[1,3]dioxolo[4,5-c]pyran]-7'-one Chemical compound C([C@@H]1OC(O[C@@H]1C1=O)(C)C)O[C@]21COC(C)(C)O2 IVWWFWFVSWOTLP-YVZVNANGSA-N 0.000 description 2
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 241000370685 Arge Species 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- RWAZRMXTVSIVJR-YUMQZZPRSA-N Cys-Gly-His Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(O)=O RWAZRMXTVSIVJR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 2
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N His-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CBQJSKKFNMDLON-JTQLQIEISA-N N-acetyl-L-phenylalanine Chemical compound CC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CBQJSKKFNMDLON-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- -1 N-acetyl-amino Chemical class 0.000 description 2
- 241000122971 Stenotrophomonas Species 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108010033719 glycyl-histidyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 2
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 241000186361 Actinobacteria <class> Species 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- DWINFPQUSSHSFS-UVBJJODRSA-N Ala-Arg-Trp Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C12)C(=O)O DWINFPQUSSHSFS-UVBJJODRSA-N 0.000 description 1
- NXSFUECZFORGOG-CIUDSAMLSA-N Ala-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NXSFUECZFORGOG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- NWVVKQZOVSTDBQ-CIUDSAMLSA-N Ala-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NWVVKQZOVSTDBQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N Ala-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BVSGPHDECMJBDE-HGNGGELXSA-N Ala-Glu-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N BVSGPHDECMJBDE-HGNGGELXSA-N 0.000 description 1
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WGDNWOMKBUXFHR-BQBZGAKWSA-N Ala-Gly-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N WGDNWOMKBUXFHR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CFPQUJZTLUQUTJ-HTFCKZLJSA-N Ala-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H](C)N CFPQUJZTLUQUTJ-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N Ala-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- NLOMBWNGESDVJU-GUBZILKMSA-N Ala-Met-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NLOMBWNGESDVJU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N Ala-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- WQKAQKZRDIZYNV-VZFHVOOUSA-N Ala-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WQKAQKZRDIZYNV-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- AETQNIIFKCMVHP-UVBJJODRSA-N Ala-Trp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AETQNIIFKCMVHP-UVBJJODRSA-N 0.000 description 1
- BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 108090000531 Amidohydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000004092 Amidohydrolases Human genes 0.000 description 1
- 240000001436 Antirrhinum majus Species 0.000 description 1
- MCYJBCKCAPERSE-FXQIFTODSA-N Arg-Ala-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N MCYJBCKCAPERSE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- YFWTXMRJJDNTLM-LSJOCFKGSA-N Arg-Ala-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N YFWTXMRJJDNTLM-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N Arg-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N Arg-Arg-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KMSHNDWHPWXPEC-BQBZGAKWSA-N Arg-Asp-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KMSHNDWHPWXPEC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- TTXYKSADPSNOIF-IHRRRGAJSA-N Arg-Asp-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O TTXYKSADPSNOIF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N Arg-Gly-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CYXCAHZVPFREJD-LURJTMIESA-N Arg-Gly-Gly Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O CYXCAHZVPFREJD-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ASQKVGRCKOFKIU-KZVJFYERSA-N Arg-Thr-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O ASQKVGRCKOFKIU-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N Arg-Thr-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- YHZQOSXDTFRZKU-WDSOQIARSA-N Arg-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N)=CNC2=C1 YHZQOSXDTFRZKU-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- BDMIFVIWCNLDCT-CIUDSAMLSA-N Asn-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BDMIFVIWCNLDCT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N Asn-Gly-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SLHOOKXYTYAJGQ-XVYDVKMFSA-N Asp-Ala-His Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 SLHOOKXYTYAJGQ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N Asp-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N Asp-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O MRQQMVZUHXUPEV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N Asp-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N Asp-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N Asp-Met-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WWOYXVBGHAHQBG-FXQIFTODSA-N Asp-Met-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WWOYXVBGHAHQBG-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N Asp-Thr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- 101100283604 Caenorhabditis elegans pigk-1 gene Proteins 0.000 description 1
- SAEVTQWAYDPXMU-KATARQTJSA-N Cys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SAEVTQWAYDPXMU-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- RUFHOVYUYSNDNY-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O RUFHOVYUYSNDNY-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VXQOONWNIWFOCS-HGNGGELXSA-N Glu-His-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N VXQOONWNIWFOCS-HGNGGELXSA-N 0.000 description 1
- ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N Glu-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- DWBBKNPKDHXIAC-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O DWBBKNPKDHXIAC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UERORLSAFUHDGU-AVGNSLFASA-N Glu-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N UERORLSAFUHDGU-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZIYGTCDTJJCDDP-JYJNAYRXSA-N Glu-Phe-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N ZIYGTCDTJJCDDP-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N Glu-Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- RMWAOBGCZZSJHE-UMNHJUIQSA-N Glu-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RMWAOBGCZZSJHE-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 1
- RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N Gly-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QSDKBRMVXSWAQE-BFHQHQDPSA-N Gly-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN QSDKBRMVXSWAQE-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LLXVQPKEQQCISF-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN LLXVQPKEQQCISF-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- TZOVVRJYUDETQG-RCOVLWMOSA-N Gly-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CN TZOVVRJYUDETQG-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- TVDHVLGFJSHPAX-UWVGGRQHSA-N Gly-His-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 TVDHVLGFJSHPAX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ADZGCWWDPFDHCY-ZETCQYMHSA-N Gly-His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 ADZGCWWDPFDHCY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- HUFUVTYGPOUCBN-MBLNEYKQSA-N Gly-Thr-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HUFUVTYGPOUCBN-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N Gly-Val-Thr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 239000012630 HPLC buffer Substances 0.000 description 1
- DCRODRAURLJOFY-XPUUQOCRSA-N His-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O DCRODRAURLJOFY-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- PDSUIXMZYNURGI-AVGNSLFASA-N His-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 PDSUIXMZYNURGI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N His-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- TXLQHACKRLWYCM-DCAQKATOSA-N His-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O TXLQHACKRLWYCM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YOTNPRLPIPHQSB-XUXIUFHCSA-N Ile-Arg-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N YOTNPRLPIPHQSB-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N Ile-Arg-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- KIAOPHMUNPPGEN-PEXQALLHSA-N Ile-Gly-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N KIAOPHMUNPPGEN-PEXQALLHSA-N 0.000 description 1
- JLWLMGADIQFKRD-QSFUFRPTSA-N Ile-His-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CN=CN1 JLWLMGADIQFKRD-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- HQEPKOFULQTSFV-JURCDPSOSA-N Ile-Phe-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N HQEPKOFULQTSFV-JURCDPSOSA-N 0.000 description 1
- RQZFWBLDTBDEOF-RNJOBUHISA-N Ile-Val-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RQZFWBLDTBDEOF-RNJOBUHISA-N 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N L-alanine-L-arginine Natural products CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- JUWJEAPUNARGCF-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JUWJEAPUNARGCF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N Leu-Arg-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HBJZFCIVFIBNSV-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HBJZFCIVFIBNSV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HASRFYOMVPJRPU-SRVKXCTJSA-N Leu-Arg-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HASRFYOMVPJRPU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YORLGJINWYYIMX-KKUMJFAQSA-N Leu-Cys-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O YORLGJINWYYIMX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N Leu-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CPONGMJGVIAWEH-DCAQKATOSA-N Leu-Met-Ala Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CPONGMJGVIAWEH-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N Leu-Thr-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N Lys-Gly-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- SLQJJFAVWSZLBL-BJDJZHNGSA-N Lys-Ile-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN SLQJJFAVWSZLBL-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- MYZMQWHPDAYKIE-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O MYZMQWHPDAYKIE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SPNKGZFASINBMR-IHRRRGAJSA-N Lys-Met-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N SPNKGZFASINBMR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QEVRUYFHWJJUHZ-DCAQKATOSA-N Met-Ala-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QEVRUYFHWJJUHZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CUICVBQQHMKBRJ-LSJOCFKGSA-N Met-His-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CUICVBQQHMKBRJ-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- OSZTUONKUMCWEP-XUXIUFHCSA-N Met-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC OSZTUONKUMCWEP-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- CBQJSKKFNMDLON-UHFFFAOYSA-N N-Ac-Phenylalanine Natural products CC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CBQJSKKFNMDLON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N N-L-arginyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCCN=C(N)N WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N N-formyl-L-phenylalanine Chemical compound O=CN[C@H](C(=O)O)CC1=CC=CC=C1 NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- HCTXJGRYAACKOB-SRVKXCTJSA-N Phe-Asn-Asp Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N HCTXJGRYAACKOB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241001603151 Philus Species 0.000 description 1
- XQLBWXHVZVBNJM-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 XQLBWXHVZVBNJM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DMKWYMWNEKIPFC-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DMKWYMWNEKIPFC-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N Ser-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- GSCVDSBEYVGMJQ-SRVKXCTJSA-N Ser-Tyr-Asp Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O GSCVDSBEYVGMJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000187191 Streptomyces viridochromogenes Species 0.000 description 1
- 241001655322 Streptomycetales Species 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N Thr-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- CAJFZCICSVBOJK-SHGPDSBTSA-N Thr-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CAJFZCICSVBOJK-SHGPDSBTSA-N 0.000 description 1
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N Thr-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- JKGGPMOUIAAJAA-YEPSODPASA-N Thr-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JKGGPMOUIAAJAA-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- FDALPRWYVKJCLL-PMVVWTBXSA-N Thr-His-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(O)=O FDALPRWYVKJCLL-PMVVWTBXSA-N 0.000 description 1
- LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 1
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- MHNHRNHJMXAVHZ-AAEUAGOBSA-N Trp-Asn-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)NCC(=O)O)N MHNHRNHJMXAVHZ-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N Val-Ala-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 1
- 229910001514 alkali metal chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001617 alkaline earth metal chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N bis-tris Chemical compound OCCN(CCO)C(CO)(CO)CO OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 229940015062 campylobacter jejuni Drugs 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 150000004649 carbonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000009960 carding Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000012045 crude solution Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000010410 dusting Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010090037 glycyl-alanyl-isoleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010000434 glycyl-alanyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010023364 glycyl-histidyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 1
- 208000000509 infertility Diseases 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 208000021267 infertility disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 239000007003 mineral medium Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 1
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 238000010422 painting Methods 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010083476 phenylalanyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000005375 photometry Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000000707 stereoselective effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 108010015385 valyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
- C12N15/8209—Selection, visualisation of transformants, reporter constructs, e.g. antibiotic resistance markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8287—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for fertility modification, e.g. apomixis
- C12N15/8289—Male sterility
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Description
Vynález se týká molekuly DNA, která kóduje pro deacetylázy nebo proteiny s biologickou aktivitou deacetylázy a rovněž transgenních rostlinných buněk, které byly transformovány molekulou DNA podle vynálezu. Tyto molekuly se mohou používat k výrobě rostlin s řízené degradovatelnými částmi, to znamená samčí nebo samičí sterilní rostliny, a to specifickou expresí deacetylázového genu.
Dosavadní stav techniky
Možnost chemicky indukované, reversibilní samčí sterility rostlin antherenní specifickou expresí N-acetyl-fosfinothricin (N-acetyl-PPT) specifickou deacetylázou se popisuje v evropské patentové přihlášce EP 631 716. Při tom použité deacetylázové geny z Streptomyces viridochromogenes [N-acetyl-L-fosfonothricyl-alynyl-alanin (N-acetyl-PPT)deacetylázy, dea], případně argE z Escherichia coli (N-acetyl-L-ornithin-deacetyláza) kódují proteiny se specifikací pro N-acetyl-L-PPT. Pro oba geny lze doložit při tapetum-specifické expresi v rostlinách výskyt samčích sterilních květů po ošetření jednotlivých pupenů pomocí N-acetyl-L-PPT. Pro úspěšné použití tohoto systému obzvláště při ošetření celých rostlin pomocí N-acetyl-PPT za podmínek praktického užití je výhodné použít deacetylázy s vysokou substantní afinitou. Proto jsou hledány další deacetylázy s vysokou afinitou k N-acefyl-PPT.
Tato přihláška si klade za úkol dát k dispozici molekulu DNA, která kóduje pro deacetylázy. Těmito deacetylázami je možné vytvořit rostliny s cíleně degradovatelnými částmi těchto rostlin. Obzvláště zajímavá je příprava samčích nebo samičích sterilních rostlin.
Podstata vynálezu
Vynález se týká molekuly DNA, která kóduje pro deacetylázy nebo proteiny s biologickou aktivitou deacetylázy. Enzymatické vlastnosti těchto proteinů se popisují v příkladech. Vynález se týká také molekuly DNA, která kóduje biologicky aktivní dílčí fragment nebo derivát. Molekuly podle vynálezu zahrnují také fragmenty, deriváty nebo alelické varianty. Jako fragmenty se rozumí části, které ještě vykazují biologickou aktivitu deacetylázy.
Vynález se kromě toho týká transgenních částí rostlin, které byly transformovány molekulami DNA podle vynálezu. Transgení buňky rostlin se mohou vyrábět známými technikami a regenerovat na celé rostliny.
Vynález se týká molekuly DNA kóduj ící protein s biologickou aktivitou N-acetyl-PPT-deacetylázy.
Vynález se týká obzvláště molekuly DNA kódující protein s biologickou aktivitou N-acetyl-PPT-deacetylázy vybrané ze skupiny sestávaj ící z • ·
• ·
a) molekul DNA, které kódují pro protein se sekvencí aminokyselin uvedenou jako SEQ ID No 2 a jejich fragmentů a/nebo derivátů;
b) molekul DNA, které kódují pro sekvenci nukleotidu uvedenou jako SEQ ID No 1 nebo sekvenci, která se v rámci degenerace genetického kódu od této sekvence odvozuj e;
c) molekul DNA, které kódují pro protein se sekvencí aminokyselin uvedenou jako SEQ ID No 4 nebo jejich fragmentů a/nebo derivátů a
d) molekul DNA, které kódují pro sekvenci nukleotidu uvedenou jako SEQ ID No 3 nebo sekvenci, která se v rámci degenerace genetického kódu od této sekvence odvozuj e.
Vynález se kromě toho týká mikroorganizmů Stenotrophomonas sp. (DSM 9734) a Comamonas acidovorans (DSM 11070), které jsou identifikovány a doloženy způsoby popsanými v této přihlášce.
Předmětem vynálezu jsou obzvláště rostlinné buňky nebo rostliny, které obsahují molekuly DNA podle vynálezu.
Zvláštní pozornost se věnuje způsobům přípravy rostlin s cíleně degradovatelnými částmi specifickou expresí deacetylázového genu a způsob přípravy samčích nebo samičích sterilních rostlin specifickou expresí deacetylázového genu.
Předložený vynález se tedy také týká :
(1) cíleného obohacení mikroorganismů s vysokou N-acety1-PPT-deacetylázovou aktivitou (2) izolace odpovídajících deacetylázových genů (3) čištění a charakterizace proteinů s vysokou N-acetyl-PPT-deacetylázovou aktivitou, kódovaných těmito geny (4) exprese deacetylázových genů v rostlinách.
Předložený vynález se dále týká :
molekuly DNA, která kóduje pro enzymy s vysokou N-acetyl-PPT-deacetylázovou aktivitou proteinů, které jsou kódovány těmito geny exprese těchto deacetylázových genů v rostlinách.
Z půdních vzorků je možné na minerálním mediu s chitinem jako jediným zdrojem C obohatit bakterie, které jsou schopné štěpit N-acetyl-PPT s vysokou efektivitou. Tímto bylo možné isolovat jako čisté kultury 2 bakteriální kmeny : Stenotrophomonas sp. (DSM-doklad-č. 9734) a Comamonas acidovorans (DSM-doklad-č. 11070).
Pro podmínky vyžadované pro průmyslovou výrobu je však podstatně výhodnější, moci použít čištěný enzym.
Předložená přihláška zahrnuje nové deacetylázy specifické pro L-N-acetyl-PPT, nový a účinný způsob čištění a charakterizace tohoto enzymu z obohacené kultury půdních ·· ·· -• · · · · * • · · · · · · • · · · · · · • · · · · · ···· ·· ·· · • · · · · · • · ·· ·· mikroorganizmů a použití této deacetylázy.
Vynález se tedy dále týká :
1. Deacetylázy s
- molekulovou hmotností od 20 000 do 100 000 D
- optimálním pH 6,5 - 10,0
- substrátovou specifitou vůči Ln - acetyl fosfinothricinu.
2. Způsobu výroby deacetylázy, který se vyznačuje tím, že se mikroorganismus tvořící spory kultivuje v médiu obsahujícím krabí chitin, a z těchto mikroorganismů se izoluje deacetyláza.
3. Použití deacetylázy je charakterizováno ad 1 k výrobě samčích sterilních rostlin a ke stereoselektivní tvorbě L-fosfinothricinu.
Vynález se týká obzvláště enzymu, který má teplotní optimum ležící mezi 30 °C a 50 °C.
Způsob podle vynálezu k výrobě deacetyláz se s výhodou provádí s mikroorganismy vybranými ze skupiny, která sestává z mikroorganismů popsaných v přihlášce.
Krabi chitin se může získat způsobem popsaným v Shimahara, Kenzo a Takiguchi, Yasuyuki (Methods in Enzymology,
Vol 161, strany 417 - 423, 1988) nebo je možné jej zakoupit u firmy Sigma.
K čištění deacetylázy se miktoorganismus kultivuje v živném médiu, které je pro něj optimální. Pěstování mik6
roorganismů se provádí aerobně, příkladně submerzně za třepání nebo míchání v třepací baňce nebo fermentorech, případně za uvádění vzduchu nebo kyslíku. Fermentace se může provádět v rozmezí teplot asi 20 °C až 40 °C, s výhodou při asi 25 °C až 37 °C, obzvláště výhodně při 30 °C až 37 °C. Kultivuje se v rozmezí pH mezi 5 a 8,5, s výhodou mezi 5,5 a 8,0.
Za těchto podmínek vykazují mikroorganismy obecně po 1 až 3 dnech významnou akumulaci enzymu. Syntéza deacetylázy začíná v log-fázi. Produkce enzymu se může sledovat pomocí testu aktivity analýzou HPLC, případně fotometricky. Živný roztok použitý k výrobě transaminázy obsahuje 0,2 až 5 %, s výhodou 0,5 až 2 % krabího chitinu a anorganické soli.
Z anorganických solí může živný roztok obsahovat příkladně chloridy, uhličitay, sírany nebo fosforečnany alkalických kovů nebo kovů alkalických zemin, železa, zinku a manganu, ale také amonné soli a dusičnany.
Podle vynálezu se mohou účinná množství deacetylázy použít k deacetylizaci jako volné nebo v imobilizované formě, s výhodou se použijí v rostlinách, které exprimují deac-geny.
K fixaci přicházejí v úvahu známé způsoby jako způsob popsaný v německém vykládacím spise 32 37 341 a 32 43 591.
Izolace a čištění enzymu se může provádět klasickým způsobem za využití ultrazvuku a French-Press, srážením síranem amonným, použitím iontoměničů, afinitní chromatografie a gelové permeace.
»· ·♦ Λ · • · «··· ·· ·· ···*
*«« ··· • · ·· ·*
Enzymový preparát je možné charakterizovat molekulovou hmotností 20 000 až 100 000 D, s výhodou 30 000 až 80 000 D, obzvláště výhodně 40 000 až 70 000 D. Optimální pH enzymového produktu je v oblasti pH 6,0 až 10,0, obzvláště 7,0 až 8,0. Teplotní optimum enzymu leží mezi 30 °C až 50 °C, obzvláště mezi 35 °C až 45 °C.
Geny kódující pro deacetylázy se klonují v E.coli.
V případě genu deacl z Stenotrophomonas sp. byla s použitím screeningu zjištěna fágemidová expresní banka z genomické DNA v E.coli na N-acetyl-PPT-specifickou deacetylázovou aktivitu. Gen deac2 z Comamonas acidovorans se klonuje komplementací mutantů E.coli-arg E s genomickou bankou.
Sekvence aminokyselin odvozené ze sekvencí DNA obou genů jsou vzájemně podobné a vykazují kromě toho homologii k hippurátovým hydrolázám, jaké jsou známé z proteinových databank.
Vysoká substrátová afinita proteinů deacl pro N-acetyl-L-PPT (Km = 670 μΜ) je u transgenních rostlin pozorovatelná díky vysoké citlivosti tkáně vůči této substanci.
Tak se mohou při konstitutivní expresi genů deac získat rostliny, jejichž listy citlivě reagují ještě na koncentrace až do 0,4 mg/ml N-acetyl-D,L-PPT (= 0,2 mg/ml L-enantiomeru). Při tapetum-specifické expresi bylo dosaženo indukce samčích sterilních květů ošetřením pupenů 2 mg/ml N-acetyl-D,L-PPT (= 1 mg/ml) L-enanciomeru). Popsané výsledky se vztahují na skleníkové rostliny. Na základě nízké koncentrace substance je při použití ve volném prostředí bez dalšího možné vyšší dávkování o pěti až desetinásobek .
Příklady provedení vynálezu
Připojené příklady slouží k bližšímu vysvětlení vynálezu, aniž by jakkoliv omezovaly jeho rozsah. Údaje v procentech se vztahuj í na hmotnost, pokud není uvedeno j inak.
Příklad 1
Izolace a identifikace půdních mikroorganismů s N-acetylPPT-speciíickou deacetylázovou aktivitou
Vždy 1 g půdy (písčitá zemina, duna Schwanheimer) se při teplotě místnosti extrahuje po dobu jedné hodiny 10 mM NaCl, 10 mM Na-fosfátového pufru, pH = 7,0. K selekci rozdílných skupin mikroorganismů se části půd přeočkují do následujících kapalných médií :
(1) Médium MSI (pro Eubakterie):
mM glukózy 5 mM sukcinátu 10 mM glycerinu 1 g/1 nh4ci 50 ml/1 roztoku A 25 ml/1 roztoku B Roztok A : 50 g/1 K^HPO^
Roztok B : 2,5 g/1 MgS04
0,5 g/1 NaCl ml/1 stopových prvků (2) Médium s chitinem (pro Actinomycety a Streptomycety a • · ···· · · · · • · · « o · · · · · • · · · · · · · ·· · • · ··· · * · ··· ··· ······ ♦ · ······ ·· · · · ·* pro chitinovorní bakterie):
g/1 krabího chitinu i g/i (nh4)2so4 0,5 g/1 MgSO4 50 ml/1 roztoku A ml/1 stopových prvků (3) Antibiotikové médium (pro vyšší houby):
g/1 sladového extraktu 10 g/1 glukózy g/1 kvasinkového extraktu 0,5 g/1 (NH4)2S04 pg/ml tetracyklinu
Všechna média obsahují 5 mM N-acetyl-PPT a po přeočkování se inkubuji po dobu 3 až 5 dní při teplotě 28 °C.
Obohacené kultury se následně testují na deacetylaci N-acetyl-PPT. K tomu se buňky odstředí při 10 000 otáčkách za minutu a kapaliny se vyšetřují v analyzátoru aminokyselin (Biotronic LC 5001) z hlediska tvorby PPT. Pouze kultury z chitinového média se ukázaly být deacetylázově pozitivní. Po kultivaci na chitin-agarových plotnách se z těchto kultur izoluje celkem 40 jednotlivých kolonií, rekultivují se v kapalném chitinovém médiu a opětovně testují na deacetylázovou aktivitu. Přitom bylo nalezeno 6 pozitivních izolátů, z nichž mohly být po opakovaném natření na agarové plotny a další kultivaci získány jednotlivé kolonie čistých aktivních kultur. Kmen s nejvyšší deacetylázovou aktivitou byl identifikován jako Stenotrophomonas sp.
(Doklad DSM č. DSM 9734).
• · • 0 · « · · 0 • · » · · · · • · · · ··· ···
Příklad 2
Klonování a sekvenování N-acetyl-PPT-deacetylázového genu ze Stenotrophomonas sp.
Molekulárně biologické metody používané pro práci popisuje Maniatis a spol. 1982, Molecular Cloning : a laboratory manual Cold Spring Harbor, N.Y.
Genomická DNA ze Stenotrophomonas sp. se preparuje metodou podle Maede a spcl. 1982, J.Bacteroiol. 149, strany 114-122. Po parciální štěpení pomocí Sau3A se izoluje většinová frakce 4-10-kb a liguje se v lambda-ZAP-expres-vektoru Stratagenu štěpenéhc pomocí BamHI (ZAP Express Vector Kit. katalog č. 239 201, Instruction Manual). S balenou ligační násadou se vyrobí primární lambda fágová banka a následně se amplifikuje. Z toho se s pomocí pBK-CMV-fágemidového systému Strate genu (katalog č. 212 209,
Instruction Manual) nasací fágová expresní banka v Escherichia coli. Tato genová lanka se ověřuje na přítomnost deacetylázového genu pomocí screeningu aktivity na [14C]-N-acetyl-L-PPT jako substrátu. K tomuto účelu se přeočkuje 2000 jednotlivých klonů na mikrotitrační desky nechá se růst přes noc v mediu LB při teplotě 37 °C s 0,2 mM isopropylthioglalaktosidu (IPTG) jako induktorem a 50 pg/ml kanamycinu jako rezistentního markéru. Buňky se odstředí a inkubují se přes noc pri teplotě 28 °C vždy v 10 μΐ 1 mM [14C]-N-acetyl-L-PPT.
Následně se násady íinalyzují v achterpools chromatografií na tenké vrstvě a autoradiografií z hlediska reakce N-acetyl-PPT na PPT (viz EP 531 716, příklad 8) a při pozi• · · · · « · · ♦ · · • · · · · · · · ·· ·
9 9 9 9 9 9 9 999 999 ·*···· · · ······ «· · * · 9 9 tivním nálezu se jednotlivé klony dále testují. Tímto způsobem se mohl vyselektovat pozitivní klon s insertem 6-kb z 1920 transformantů. Tento fragment DNA byl blíže charakterizován restrikčním kartováním. Subklonováním restrikčních fragmentů insertu v pUC 18/19 a transformací rekombinantního plasmidu v E.coli bylo možné s pomocí výše popsaného testu aktivity lokalizovat strukturní gen deac na 2,5 kb (2487 základních párů) sall/smal fragmentu (obr. 1). Aktivita byla závislá na orientaci fragmentu relativně k lac-promotoru vektoru.
Fragment 2,5-kb se sekvencuje v obou řetězcích Sangerovou metodou (Sanger a spol., 1977, Proč. Nati. Acad. Sci USA 74 : 54 63 - 54 68). Celý fragment má délku 2478 nukleotidů, viz SEQ ID č. 1). Otevřený identifikační rámec délky 1493 nukleotidů začíná nukleotidem č. 367 a končí nukleotidem č. 1860.
Expresní studie se subfragmenty PCR z této oblasti v E. coli ukazují, že aktivní deacetylázový protein začíná v oblasti obsahující 1365 nukleotidů s ATG-startovním kodonem v pozici 496 a končící konečným kodonem TGA v pozici 1860. Sekvence aminokyselin odvozená ze sekvence aminokyselin představuje polypeptdd 454 aminokyselin (sekvence ID č. 2) s vypočtenou molekulovou hmotností 48,1 kDa.
Vyhledání homologu v EMBL-, DNA- a proteinových databankách vykázalo podobnosti s N-acetyl-PPT-deacetylázou z Comamonas acidovorans (37,4 % identických aminokyselin) popsanou poprvé v této přihlášce, hippurát-hydrolázy z Campylobacter jejuni (33,9 %) a N-acyl-L-aminohydrolázy z Bacillus stearothermophilus (33,7 %). Dále je gen izolovaný z Stenotrophomonas označován jako deac 1. Odpovídající protein se označuje jako Deac 1. Na základě homologie lze • © » · « · 4·4· ·· ·© » vycházet z toho, že také uvedené hippurát-hydrolázy a amidohydrolázy v kombinaci s promotory specifickými pro tkáně a následném ošetření se nohou s výhodou využít k výrobě rostlin se selektivně degradovatelnými tkáněmi, obzvláště samčích a/nebo samičích rjstlin.
Příklad 3
Charakterizace proteinu Deac 1
K přeexpresi a čištění deacetylázy z Stenotrophamonas sp. (deac 1) se použije glutathion-S-transferáza (GST)-GenFusionsvektor-System firmy Pharmacia (katalog č.
27-4581-01, katalog č. 27-4570-01). Tuto metodu popisuje Smith and Johnson, 1988, Gene 67:31 . Čištění fuzního proteinu se provádí afinitní chromatografii na Glutathion-Sepharose-4B.
Funkční deac-gen se jako 1,4-kb BamHl/Sall-PCR-fragment překlonuje na GST-ftzní vektor pGEX-4T-2 za řízení lac-pomotorem. Exprese lekombinantního fuzního proteinu se indukuje přídavkem 0,1 mí* IPTG. Elektroforézou surových extraktů transformantů E. coli SDS/polyakrylamid mohl být prokázán fuzní protein jeko pás 74-kDA.
K čištění proteinu se buňky z transformantu 2 1 kultury indukovaného expresně pozitivního E. coli rozruší ultrazvukem a extrakt se následně solubilizuje přídavkem 1 % Triton-X-100. Zbytek je vázán na Glutathion-Sepharosu-4B.
Po opakovaném promytí puírem PBS (140 mM NaCl, 3 mM KC1, 10 mM Na2HP04, 2 mM KH2PO4, pH = 7,3) byl štěpen fuzní protein vázaný na sepharosovou matrici trombinem. Eluát obsahuje • · · · φ · φφφ φ φ φ φ φ φ φ φ • φ φφφ φ φφφφ ΦΦ ΦΦ φφφφ ΦΦ ΦΦ φ φφφφ φ φφφφ φ φ φφφ φφφ φ φ φ • φ φ φ φ jako jediný proteinový pás štěpný produkt 48-kDa (po denaturalizující elektroforéze SDS/polyakrylamid), který byl při enzymovém pokusu (viz níže) identifikován jako N-acetyl-PPT-deacetyláza. Popsanou metodou bylo možné vyčistit ze 2 1 bakteriální kultury až k homogenímu stavu 200 pg deacetylázového proteinu.
Aktivita deacetylázového proteinu se měří dvěma následujícími pokusy :
(1) Radioaktivní test :
Vždy 2,5 pg čištěného enzymu se inkubuje po násadách 10 pl v pufru PBS s 0,1 mM [14C]-N-acetyl-L-PPT po dobu 15 minut při teplotě 37 °C. Následně se vzorky zředí 1:6 v 5 mM KH2PO4, 10 % methanolu, pH = 1,92 a analyzují se pomocí HPLC detektoru radioaktivity (dělicí sloupec : Spherisorb SAX, eluát; 5 mM KH2PO4, 10 % methanolu, pH = 1,92, eluční poměr : 0,5 ml/min). Za těchto podmínek eluuje [14C]-L-PPT za 4,5 minuty a [14C]-N-acetyl-L-PPT za 6,5 minuty. Specifické deacetylázové aktivity byly zjištěny v [nmol [14C]-L-PPT/min/mg proteinu]. Ke zjištění optima pH se inkubují násady v pufrovém systému sestávajícím z 40 mM Bis-Tris, Tris a Caps mezi pH 6 a 9. Pro měření hodnoty Km se provádí trojnásobné stanovení s koncentrací [^4C]-N-acetyl-L-PPT mezi 0,01 mM a 1 mM při hodnotě pH = 8,0 v přítomnosti 1 mM C0CI2.
(2) Neradioaktivní test :
K vyšetření substrátové specifriky se inkubuje vždy 5 pg čištěného enzymu v 20 pl násady v pufru PBS vždy s 25 mM určité N-acetyl-aminokyseliny, případně N-acyl-aminoky• · • · · · seliny po dobu 60 minut při teplotě 28 °C. Následně s vzorky měří na tvorbu aminokyselin (Biotronic LC 5001). Specifické aktivity se zjišťují v [nmol aminokyseliny /min/mg proteinu]. Pro N-acetyl-PPT-deacetylázu bylo zjištěno optimální pH = 8 (viz Tabulka 1) a optimální teplota 37 °C (viz Tabulka 2). Kinetická měření poskytla hodnotu Km 670 pm. Přídavkem 1 mM C0CI2 stoupla aktivita enzymu o asi 20 %.
Tabulka 1 : Optimum pH N-acetyl-PPT-deacetylázy
pH-hodnota | Specifická aktivita [mol/min/mg proteinu] |
6 | 2,4 |
7 | 7,2 |
8 | 12,0 |
9 | 8,5 |
Tabulka 2 : Optimum teploty N-acetyl-PPT-deacetylázy | |
Teplota | [°C] Specifická aktivita [nmol/min/mg proteinu] : |
28 | 9,6 |
37 | 16,8 |
50 | 14,9 |
60 | 4,3 |
Výsledky měření substrátové specificity jsou uvedeny v Tabulce 3.
• · ···· · · · · ·· · * · * · · ·· · ··· ··· ····· ·· · ·· · ·
Enzym má realitivně široké substrátové spektrum.
Nejvyšší konverze se dosáhne s kyselinou hippurovou (N-benzoyl-glycin) a N-acetyl-L-glutamátem. Afinita vůči N-acetyl-L-PPT činí přibližně o 50 % méně než pro oba výše jmenované substráty. Deacetyláza má výhradní specifitu pro N-acetyl-L-aminokyseliny. S odpovídajícími D-enantiomery nebyla pozorována žádná reakce.
Tabulka 3 : Substrátová specifita N-acetyl-PPT-deacetylázy
Substrát1 Relativní aktivita2 [%]
Kyselina hippurová | 100 |
(N-benzoyl-glycin) | |
N-Ac-fosfinothricin | 43 |
N-Ac-ornithin | 37 |
N-Ac-methionin | 0 |
N-Ac-tryptofan | 0,4 |
N-Ac-fenylalanin | 24 |
N-Ac-tyrosin | 11 |
kyselina N-Ac-glutamová | 100 |
N-Ac-glutamin | 30 |
N-Ac-glycin | 59 |
N-Ac-histidin | 43 |
N-Ac-leucin | 33 |
N-Ac-valin | 2 |
N-Ac-serin | 4 |
N-Ac-prolin | 0 |
U všech sloučenin se jedná o L-enanciomery • · · 2 Specifická aktivita změřená s kyselinou hippurovou byla stanovena na 100 % a ostatní hodnoty byly vztaženy k této hodnotě
Příklad 4
Konstitutivní exprese genu deac-1 v tabáku
Deacl-strukturní gen se překlonuje jako fragment 1,4 kb BamHl/Sall-PCT na binární vektor pPCV8081 (Koncz a Schell, 1986, Mol.Gen.Genet. 204:383-396) za řízení promotoru 35S. Vzniklý plasmid pPCVKDEACl (obrázek 2) se expresním vektorem 35S-promotor-deacl-strukturgen-35S-terminátor za použití standardních metod transformuje v Agrobacterium tumefaciens (kmen ATHV). Kousky listů tabáku (Nicotiana tabacum) se transformují rekombinantními agrobakteriemi metodou podle Horsch a spol., 1985, Science 227:1229-1231 a selektují na kanamycinovém mediu, 18 nezávislých tabákových transformantů se regeneruje a testuje na expresi deacetylázy v listech. V případě aktivity proteinu v transgenních rostlinách bylo třeba počítat s citlivostí listů vůči N-acetyl-PPT, neboť substance v rostlinách se potom na základě enzymatické aktivity deacetylázy přeměňuje na herbicidní účinnou látku fosfinothricin.
Při kapkovém pokuse se listy transgenních rostlin stejně jako několik netransgenních kontrolních rostlin ošetří vždy 5 μΐ následujících koncentrací N-acetyl-D,L-PPT :
mg/ml (= 15 mM), 1 mg/ml (= 3,75 mM), 0,4 mg/ml (= 1,5 mM), 0,1 mg/ml (= 0,38 mM). Ošetřená místa se po 1 až 2 týdnech vyšetřují na zesvětlení případně tvorbu nekroz. Zároveň se měří N-acetyl-PPT-specifická deacetylázová akti• *
vita transformantů a kontrolních rostlin v surovém extraktu. K tomu účelu se homogenizuje vždy 100 mg listového materiálu ve 200 μΐ pufru PBS, rozpadlé buňky se odstředí a zbytky obsahující protein se přes noc dialyzují při teplotě 4 °C proti stejnému pufru. Vždy 10 μΐ těchto vzorků se inkubuje přes noc při teplotě 37 °C v 0,1 mM [^4C]-N-acetyl-L-PPT. Násady se následně analyzují v HPLC na tvorbu [14C]-L-PPT, jak se popisuje výše.
Výsledky testů kapkových pokusů a testů aktivity uvádí pro vybrané rostliny Tabulka 4. Ukazuje se, že asi 60 % transformantů exprimuje deacetylázový protein a preferuje odpovídající fenotyp.
Tabulka 4 :
Citlivost rostlin pPCVKDEACl vůči N-acetyl-PPT a deacetylázová aktivita v surových extraktech
Rostlina | Kapkový pokus N-Ac-D,L-PPT 4 mg/ml | Deac. aktivita v surovém roztoku | [% L-PPT]1 | |||
1 mg/ml | 0,4 mg/ml | 0,1 mg/ml | ||||
Pozorování (list): | ||||||
Kontrola | - | - | - | - | 0 | |
pPCVK9 | + + + | + | - | - | 14,2 | |
pPCVK14 | zkroucen : | + | + | - | - | 12,1 |
PPCVK15 | zkroucen : | + + | + | + | - | 36,0 |
PPCVK16 | zkroucen | + | + | - | - | 4,7 |
pPCVK17 | , zkroucen | + | + | - | - | 4,3 |
+++ vztaženo na použitou radioaktivitu [^4C]-N-acetyl-L-PPT silná nekroza • · ···· ++ zřetelné škody + slabé zesvětlení žádné symptomy
Příklad 5
Tapetum-specifická exprese genu deacl v tabáku
Za použití standardních metod se tapetum-specifický promotor genu tapl z hledíku (Antirrhinum majus) jako fragment 2,2-kbEcoRl/BamHl fušuje se strukturním genem deacl (fragment 1,4-kb BamHl/Sall-PCR) a terminátorem 35S. Takto vzniklá expresní kazeta tapl-promotor-deac-strukturní gen-35S-terminátor se jako fragment 3,8-kb EcoRl vklonuje na pozici oblasti 35S-promoteru/terminátoru v binárním vektoru pPCV801 (plasmid pPCVTDEACl, obrázek 3). Transformace tabáku se provede stejně, jak se popisuje v příkladu 4.
V případě tapetum-specifické exprese deacetylázy by se měly ošetřením květních pupenů pomocí N-acetyl-PPT indukovat samčí sterilní květy. Konverze derivátů PPT na herbicidně účinnou látku fosfinothricin vede k selektivnímu poškození tapetum-tkáně, čímž se zabrání vývoji funkčních pollů.
Pomocí-acetyl-PPT se ošetří vždy jen jedna strana inflorescence (celá oblast vyvíjejícího se květního pupenu), druhá strana inflorescence zůstane neošetřena aby se zajistilo, že pozorované jevy nevznikají pochybením na daných rostlinách. Ošetření se provede v okamžiku, kdy jednotlivé pupeny nejsou větší než 5 mm (aktivní fáze pro tapetum-promotor). Transformanty tabáku a několik kontrolních rostlin NT Sam NN se v průběhu jednoho týdne ošetří třikrát 0,2 % • · · · · ·
N-acetyl-D,L-PPT (= 7,5 mM)/O,l % Genapol (smáčedlo). Po vykvetení pupenů (asi 9-11 dní po ukončení ošetřování) se rostliny vyšetřují z hlediska výskytu samčích sterilních květů.
Zároveň se měří N-acetyl-PPT specifická deacetylázová aktivita v nezralých antherenech transformantů a rovněž kontrolní rostliny. K tomu se preparuji nezralé anthereny z asi 5 mm velkých květních pupenů a přes noc se inkubuji při teplotě místnosti vždy v 50 μΜ roztoku [14C]-N-acetyl-L-PPT. Následně se anthereny promyji 1 x 500 μΐ pufru PBS a potom se homogenizují v 50 μΐ pufru PBS. Po odstředění rozpadlých buněk se zbytky zahustí ve Speed-Vac a pelety se rozpustí vždy v 30 μΐ pufru HPLC (5 mM KH2PO4, 10 % methanolu, pH = 1,92). Násady se analyzují v HPLC výše popsaným způsobem z hlediska tvorby [^4C]-PPT.
Výsledky ošetřování květů a testy aktivity uvádí pro vybrané rostliny Tabulka 5. Prakticky u všech transformantů byla zjištěna specifická deacetylázová aktivita pro anthereny. U třech transformantů se na straně květních hroznů ošetřené N-acetyl-PPT pozorují samčí sterilní květy, to znamená, že se nevytvořily žádné polly, případně květy se silně redukovanými polly. Účinek na nové zrající pupeny vydržel po dobu asi 3 týdnů. Neošetřené květy transformantů, stejně jako ošetřené květy kontrolních rostlin jsou ve všech případech fertilní. U samčích sterilních květů nebyla zjištěna tvorba semen. Řízené cizí sprášení samčích sterilních květů však bylo možné, čímž se dokázalo, že samičí části rostlin si zachovaly svou plnou funkci (Nacken a spol., 1991,
Mol.Gen.Genet. 229:129-136).
« · ·· ···· • · · · ·
Tabulka 5 :
Indukovaná samčí sterilita u rostlin pPCVTDEACl ošetřováním květů pomocí N-acetyl-PPT a deacetylázová aktivita v antherenech
Rostlina | Počet sterilních květů příp.květů s redukovanými polly | Deac. aktivita v antherenech [% L-PPT]1 |
Ošetřené Neošetřené |
Kontrola | 0 | 0 | 0 |
pPCVT14 | 18 | 0 | 70,0 |
pPCVT15 | 0 | 0 | 13,8 |
pPCVTló | 10 | 0 | 20,4 |
vztaženo na použitou radioaktivitu [14C]-N-acetyl-L-PPT
Příklad 6
Izolace a identifikace deacetylázy se specifitou pro
N-acetyl-fosfinothricin z Comamonas acidovorans
Půdní vzorek z Bangkoku se rozmíchá v minerálním solném mediu (0,5 g K2HPO4, 0,2 g MgSO4, 2 g (NH4)2SO4, 0,01 g FeSO4 v 980 ml H20), který jako jediný zdroj uhlíku obsahuje chitin (2 g/1) a následně se inkubuje 48 hodin při teplotě 30 °C. Potom se provede přeočkování do čerstvého media s minerálními solemi a po dalších 48 hodinách inkubace se očkuje na desky na LB medium (Miller, Experiments in molecular genetics, Cold Spring Harbour Laboratory Press) ve zře• · · · ďovací řadě.
Mezi narůstajícími koloniemi se nacházejí také takové bakteriální kmeny, které se jako čistá kultura vyznačují velmi dobrým zhodnocením N-acetyl-glutamátu jako jediného zdroje uhlíku (výtěr na mediu s minerálními solemi s N-acetyl-glutamátem (2 g/1 přidán jako sterilně filtrovaný roztok k autoklávovanému mediu s minerálními solemi se 14 g/1 agaru) vede během 12 hodin inkubace při teplotě 30 °C ke tvorbě zřetelně viditelnýých kolonií). Deacetylace N-acetyl-PPT se prokazuje stejně jako je popsáno výše. Kmen opatřený laboratorním označením B6 byl DSM identifikován jako Comamonas acidovorans [DSM 11070].
Příklad 7
Klonování deacetylázového genu z Comamonas acidovorans
Veškerá DNA z Comamonas acidovorans se izoluje, štěpí se EcoRI a liguje se rovněž EcoRI štěpenou DNA vektoru pACYC184 (Cang a Cohen, 1978, J.Bacteriol. 134, 1141-1156). Ligačni násada se použije k elektroporaci E. coli argE-Mutante XSID2 (Mountain a spol., 1984, Mol.Gen.Genet. 197, 82-89). Selekcí na komplementací arginin-auxotrofie se podařilo izolovat 8,9 kb velký EcoRI-fragment z genomu C. acidovorans, který byl dostatečný pro komlementaci. Subklonováním bylo možné omezit komplementující oblast na 1,4 kb velký fragment. Tento se vyskytuje v derivátu sekvencujícího vektoru pSVB30 označeném pGK83 (Arnold a Puhler, 1988, Gene 70, 172-178).
·· ·* • · · ·· ···»
Příklad 8
Sekvencování deacetylázového genu z Comamonas acidovorans
Komplementující fragment velký 1,4 kb (1387 základních párů) se známými metodami úplně ve dvou řetězcích sekvencu j e.
Příklad 9
Analýza kóduj ící oblasti a porovnání homologie sekvencované oblasti
Analýza kódující oblasti poskytla otevřený čtecí rámec od pozice 1 do 1206 (SEQ No. 3), který kóduje pro protein o velikosti 402 aminokyslin (SEQ ID No.4).
Porovnání homologie se známými geny z databank ukazuje zřetelnou homologii k jedné N-acyl-L-amidohydroláze z Bacillus stearothermophilus (ama, Sakanyan a spol., 1993,
Appl.Environ.Microbiol. 59, 3878-3888) a jedné hippurátové hydroláze z Campylobacter jejuni (dosud nezveřejněno). Ve srovnáni proteinů vykazuje hippurátová hydroláza 43 % identických aminokyselin (Tabulka 6). Navíc vykazuje gen na rovině DNA a proteinu velmi nápadnou homologii k deacetylázovému genu izolovanému z Stenotrophomonas spec. Vycházeje z označení genu z Stenotrophomonas sp. byl gen identifikovaný z C. acidovorans označen deac2.
♦ · • · • ··· ·· ··«* ► · ♦ fl ·· · • ·
Tabulka 6
Srovnání homologie se známými sekvencemi
Gen | Organismus | Funkce | Ident.AS | Kons.AS |
n. n | Campylobacter j ej uni | Hippurátová hydroláza (383 AS) | 43,1 % | 60,0 % |
deac2 | Stearothermo- philus | N-acyl-L-amidohydroláza (370 AS) | 37,0 % | 49,5 % |
Příklad 10
Přeexprese genu deac2 z rostlinného konstruktu Comamonas acidovorans
K analýze substrátové specifity deac2-genového produktu z Comamonas acidovorans se tento produkt přeexprimuje.
K tomu se gen klonuje na vektor s vysokým počtem kopií za řízení promotoru IacZ. Expresní účinnost je však omezena současnou translací IacZ-alfa, ke které dochází v jiném čtecím rámci. Proto se tato translace přeruší zavedením stop-kodonu, takže vektor pGK81 umožní přeexpresi deac2-genu, neovlivněnou nepoříznivě lac-Z-genem. Toto mohlo být prokázáno také fenotypicky, neboř tento konstrukt vykazuje zřetelně silnější komplementaci argE-mutantu E. coli.
K transformaci rostlin se strukturní gen deac2 překlonuje za použití binárního vektoru pROKl (Baulcombe a spol., 1986, Nátuře, 321:446-449) za konstitutivního promotoru 35S případně tapetum-specifického promotoru TA-29. Získané ** ·· • · · » · • ♦·· · » » · · · · « · · · · ···· ·· ·9
99 « · · · · • · · · • · ··· 999
9 9
99 99 expresní plasmidy pGK83 a pMF9 jsou znázorněny na obrázcích.
Příklad 11
Vyšetření substrátové specifity deac2-genového produktu z Comamonas acidovorans
K vyšetření substrátové specifity deac2-genového produktu z Comamonas acidovorans se použijí buňky E. coli kmenu XLI-Blue, permeabilizované ošetřením toluenem/ethanolem, s vektorem pGK81 a bez něj. Indukce reprimovaného deac2genu, vznikajícího v tomto kmenu, přítomným Lac1-represorem, je možné dosáhnout ošetřením IPTG. Permeabilizované buňky se inkubují s různými N-acetylovánými aminokyselinami (konečná koncentrace 25 mM) po dobu 3 hodiny při teplotě 30 °C a zbytky se vyšetřují s pomocí analyzáotoru aminokyselin. Z tohoto vyšetření vyplývá, že více jak 20 % disponibilního N-acetyl-ornitinu zreagovalo. Také pro N-acetyl-fosfino-thricin je možné zjistit vzrůstající deacetylaci na fosfinothricin, analogicky použité koncentraci N-acetyl-fosfino-thricinu (Tabulka 7).
Tabulka 7 :
Reakce N-acetylovaných aminokyselin deac2-genovým produktem
N-acetyl-ornitin (25 mM) | N-acetylfenylalanin (25 mM) | N-acetylfosfinothricin | ||
(12,5 mM) | (25 mM) | (50 mM) | ||
5860 nM | < 5 nM | 8,0 nM | 20,0 nM | 44,7 nM |
Uváděny jsou koncentrace použitých N-acetylovaných aminokyselin a aminokyselin vzniklých deacetylací.
V následujícím jsou uvedeny sekvenční protokoly SEQ ID No 1 až 4 .
Sekvenční protokol (1) Všeobecné informace (i) Přihlašovatel :
(A) Jméno : Hoechst Schering AgrEvo GmbH (B) Ulice : (C) Místo : Frankfurt (D) Spolková země : (E) Země : Německo (F) Poštovní směrovací číslo : 65926 (G) Telefon : 069-305-5596 (H) Telefax : (+69) 357175 (I) Telex : (ii) Název přihlášky : Nové geny kódující pro deacetylázy aminokyselin se specifikací pro N-acetyl-Lfosfinothricin, jejich izolace a použití (iii) Počet sekvencí : 4 (iv) Forma uložená v počítači :
(A) Nosič dat : pružný disk (B) Počítač : IBM PC kompatibilní (C) Provozní systém : PC-DOS/MS-DOS (D) Software : Patentln Release #1.0, verse • · • · · ·
#1.25 }EPA] (2) Informace k SEQ ID No 1 :
(i) Sekvenční charakteristika :
(A) Délka : 1365 základních bází (B) Druh : nukleová kyselina (C) Struktura : jednořetězová (D) Topologie : lineární (ii) Druh molekul : DNS (genomická) (ix) Znak :
(A) Jméno/Klíč : exon (B) Poloha : 1..1365 (xi) Popis sekvence : SEQ ID No 1 :
ATGATCCGCA | AGACCGTTCT | GTTGACTGCG | CTGTCCTGCG | CCCTGGCCTC | CGCGACAGCC | 60 |
ACCGCCGCCG | AAGGCCAGCG | GCCCGAGGTG | GAGGCCGCCG | CCGCGCGCCT | GCAGCGGCAG | 120 |
GTGGTGGAGT | GGCGCCGCGA | TTTCCACCAG | CATCCGGAGC | TGTCCAACCG | CGAGGTGCGC | 180 |
ACCGCCGCCA | AGGTGGCCGA | GCGCCTGCGC | GCGATGGGCC | TGCAACCGCA | GACCGGCGTC | 240 |
GCCGTGCACG | GCGTGGTGGC | GATCATCAAG | GGCGCCCTGC | CGGGGCCGAA | GATCGCCCTG | 300 |
CGCGCGGACA | TGGACGCGCT | GCCGGTGACC | GAACAGACCG | GGCTGCCGTT | CGCCTCCACC | 360 |
GCCACGGCCG | AGTACCGCGG | CGAGAAGGTC | GGGGTGATGC | ATGCCTGCGG | CCACGACGCC | 420 |
CATACCGCCA | CCCTGCTCGG | CGTGGCCGAC | GCGCTGGTGG | CCATGCGCGA | CACGCTGCCC | 480 |
GGCGAAGTAA | TGCTGATCTT | CCAGCCGGCC | GAGGAAGGCG | CGCCGCCGCC | GGAGCAGGGC | 540 |
• · · ·
GGTGCCGAGC TGATGCTCAA GGAGGGGCTG TTCAAGGAGT TCAAGCCGGA GGCGGTGTTC 600
GGCCTGCACG TGTTCTCCAG CGTCCAGGCC GGGCAGATCG CCGTGCGCGG CGGCCCGCTG 660
ATGGCCGCCT CCGACCGCTT CGCCATCACC GTCAACGGCC GCCAGACCCA TGGCTCGGCG 720
CCCTGGAACG GCATCGATCC GATTGTCGCC GCCTCCGACC TGATCGGCAC CGCGCAGACC 780
ATCGTCAGCC GCCGCGCCAA CCTGTCCAAG CAGCCGGCGG TGCTGACCTT CGGCGCGATC 840
AAGGGCGGCA TCCGCTACAA CATCATCCCC GACTCGGTGG AGATGGTCGG CACCATCCGC 900
ACCTTCGACC CGGACATGCG CAAGCAGATC TTCGCCGACT TGCGCAACGT CGCCGAGCAC 960
ACCGCTGCCG CATGGCGCCA CCGCCACCAC CGACATCTAC GAGAAGGACG GCAACCCGGC 1020
CACGGTCAAC GACCCGGCGC TGACCGCGCG CATGCTGCCC AGCCTGCAGG CCGTGGTCGG 1080
CAAGGACAAC GTCTACGAGC CGCCGCTGCA GATGGGCTCG GAGGACTTCT CGCTGTATGC 1140
GCAGCAGGTG CCGGCGATGT TCTTCTTCGT CGGCTCCACC GGCGCGGGCA TCGACCCGGC 1200
CACCGCGCCC AGCAACCACT CGCCGAAGTT CCTGCTCGAC GAGAAGGCGC TGGACGTGGG 1260
CCTGCGCGCG CTGCTGCAGG TGTCGCTGGA CTATCTGCAC GGTGGCAAGG CGGGGTGACC 1320
CCTGCCAGTA TCGTGCCCCC GATACGGAAG AAGGACCTCC CATGA
1365
A ·
AAAA
A A
(2) Informace k SEQ ID No 2 :
(i) Sekvenční charakteristika :
(A) Délka : 454 aminokyselin (B) Druh : aminokyselina (C) Struktura : jednořetězová (D) Topologie : lineární (ii) Druh molekul : protein (ix) Znak :
(A) Jméno/Klíč : protein (B) Poloha : 1..454 (xi) Popis sekvence : SEQ ID No 2:
Met 1 | Ile | Arg | Lys | Thr 5 | Val | Leu | Leu | Thr | Ala 10 | Leu | Ser | Cys | Ala | Leu 15 | Ala |
Ser | Ala | Thr | Ala 20 | Thr | Ala | Ala | Glu | Gly 25 | Gin | Arg | Pro | Glu | Val 30 | Glu | Ala |
Ala | Ala | Ala 35 | Arg | Leu | Gin | Arg | Gin 40 | Val | Val | Glu | Trp | Arg 45 | Arg | Asp | Phe |
His | Gin 50 | His | Pro | Glu | Leu | Ser 55 | Asn | Arg | Glu | Val | Arg 60 | Thr | Ala | Ala | Lys |
Val 65 | Ala | Glu | Arg | Leu | Arg 70 | Ala | Met | Gly | Leu | Gin 75 | Pro | Gin | Thr | Gly | Val 80 |
Ala | Val | His | Gly | Val 85 | Val | Ala | Ile | Ile | Lys 90 | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly 95 | Pro |
Lys | Ile | Ala | Leu | Arg | Ala | Asp | Met | Asp | Ala | Leu | Pro | Val | Thr | Glu | Gin |
100 105 110 • · • · · * • 44 4 4 • · · · · · • 4 4 4 4 4 • · 4 4 4
4444 44 ··
4 44
4 4 4 · • 4 4 4 4 • 4 444 444 • 44 ·ί
Thr Gly Leu 115 | Pro | Phe Ala | Ser | Thr Ala Thr Ala Glu 120 | Tyr 125 | Arg | Gly | Glu | |||||||
Lys | Val | Gly | Val | Met | His | Ala | Cys | Gly | His | Asp | Ala | His | Thr | Ala | Thr |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Leu | Leu | Gly | Val | Ala | Asp | Ala | Leu | Val | Ala | Met | Arg | Asp | Thr | Leu | Pro |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Gly | Glu | Val | Met | Leu | Ile | Phe | Gin | Pro | Ala | Glu | Glu | Gly | Ala | Pro | Pro |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Pro | Glu | Gin | Gly | Gly | Ala | Glu | Leu | Met | Leu | Lys | Glu | Gly | Leu | Phe | Lys |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Glu | Phe | Lys | Pro | Glu | Ala | Val | Phe | Gly | Leu | His | Val | Phe | Ser | Ser | Val |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Gin | Ala | Gly | Gin | Ile | Ala | Val | Arg | Gly | Gly | Pro | Leu | Met | Ala | Ala | Ser |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Asp | Arg | Phe | Ala | Ile | Thr | Val | Asn | Gly | Arg | Gin | Thr | His | Gly | Ser | Ala |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Pro | Trp | Asn | Gly | Ile | Asp | Pro | Ile | Val | Ala | Ala | Ser | Asp | Leu | Ile | Gly |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Thr | Ala | Gin | Thr | Ile | Val | Ser | Arg | Arg | Ala | Asn | Leu | Ser | Lys | Gin | Pro |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ala | Val | Leu | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Lys | Gly | Gly | Ile | Arg | Tyr | Asn | Ile |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ile | Pro | Asp | Ser | Val | Glu | Met | Val | Gly | Thr | Ile | Arg | Thr | Phe | Asp | Pro |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Asp | Met | Arg | Lys | Gin | Ile | Phe | Ala | Asp | Leu | Arg | Asn | Val | Ala | Glu | His |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Thr | Ala | Ala | Ala | Trp | Arg | His | Arg | His | His | Arg | His | Leu | Arg | Glu | Gly |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Arg | Gin | Pro | Gly | His | Gly | Gin | Arg | Pro | Gly | Ala | Asp | Arg | Ala | His | Ala |
340 | 345 | 350 |
• · « · • · · · • *
Ala Gin Pro Ala Gly Arg Gly Arg 355 360
Ala Ala Asp Gly Leu Gly Gly Leu 370 375
Gly Asp Val Leu Leu Arg Arg Leu 385 390
His Arg Ala Gin Gin Pro Leu Ala 405
Ala Gly Arg Gly Pro Ala Arg Ala 420
Ala Arg Trp Gin Gly Gly Val Thr 435 440
Gin Gly Gin Arg Leu Arg Ala Ala 365
Leu Ala Val Cys Ala Ala Gly Ala 380
His Arg Arg Gly His Arg Pro Gly 395 400
Glu Val Pro Ala Arg Arg Glu Gly 410 415
Ala Ala Gly Val Ala Gly Leu Ser 425 43°
Pro Ala Ser Ile Val Pro Pro Ile 445
Arg Lys 450
Lys Asp Leu Pro (2) Informace k SEQ
ID No 3 :
(i) Sekvenční charakteristika :
(A) Délka : 1273 základních bází (B) Druh : nukleová kyselina (C) Struktura : jednořetězová (D) Topologie : lineární (ii) Druh molekul : DNS (genomická) (ix) Znak :
(A) Jméno/Klíč : exon (B) Poloha : 1..1273 « · * ·
9 9 9 9
999« · 9
9 9 9 9 9 *·♦· «9 99 · 9 9
9 9 9
9 9 9
999 999 ·
9 9 9 (xi) Popis sekvence : SEQ ID No 3
ATGGCCTTGC TGCAGGAGCT GCTGGACAGC GCACCCGAGA TCACCGCGCT GCGCCGCGAC
ATACATGCCC ATCCCGAACT GTGCTTCGAG GAACTGCGCA CCGCCGACCT GGTGGCCCGG 120
CAGCTCGAAG GCTGGGGCAT TGCCGTGCAC CGCGGCCTGG GCCGCACGGG CGTGGTGGGC 180
ACCATCCACG GCCGTGACGG CGGCGCCAGC GGCCGGGCCA TCGGGCTGCG CGCCGACATG 240
GACGCCCTGC CCATGCAGGA GTTCAACACC TTCGAGCACG CCAGCCGCCA CGCCGGAAAA 300
ATGCATGCCT GCGGACATGA CGGCCATGTC GCCATGCTGC TGGCCGCCGC GCAGTACCTG 360
GCCGTGCACC GCGACAGCTT CGAGGGCACG GTGCACCTGA TCTTCCAGCC GGCCGAAGAG 420
GGCGGCGGCG GGGCGCGCGA GATGGTCGAG GACGGCCTGT TCACCCAGTT CCCCATGCAG 480
GCCGTGTTCG GCATGCACAA CTGGCCGGGC ATGAAGGCCG GCACCATGCC GTGGGCCCCG 540
GGCCCGGCCA TGGCGTCGAG CAACGAGTTC CGCATCGTCG TGCGCGGCAA GGGCGGCCAC 600
GCGGCCATGC CGCACATGGT GATCGACCCG CTGCCCGTGG CGGCCCAGCT CATCCTGGGC 660
CTGCAGACCA TCGTCAGCCG CAACGTCAAG CCCATCGAGG CGGGCGTGGT CTCGGTCACC 720
ATGGTCCATG CGGGCGAGGC CACGAACGTG GTGCCCGACA GCGTGGAGCT GCAGGGCACG 780
GTGCGCACCT TCACGCTGGA GGTGCTGGAC CTGATCGAGC GGCGCATGAA GGCCCTGGCC 840
GAGAGCATCT GCGCGGCGCA TGACACGCGC TGCGAGTTCG AGTTCGTGCG CAACTACCCG 900
CCCACCATCA ACTCCGCCCC GGAGGCCGAG TTCGCACGCC GCGTCATGGC CGAGGTCGTG 960
GGCGAGGCCA ACGTGCTGCC CCAGGAGCCG TCCATGGGCG CCGAGGACTT CGCCTTCATG 1020
CTGCTGGAAA AGCCCGGCGC CTACTGCTTC ATCGCCAATG GCGACGGCGA CCACCGCGCC 1080
ATCGGCCACG GCGGCGGTCC CTGCACGCTG CACAACCCCA GCTACGACTT CAACGACCAG 1140
CTGATTCCGC AGGGCGCCAC GTTCTGGGTG AAGCTGGCCC AGCGCTGGCT GAGCGAGCCC 1200
ACGCGCTGAG GCCTTGCGGG GTCCGGCCGA CACCGGCATG TCACACACCG CACCTAGCAT 1260
GCGGTCCCTG TGA
1273 • · · ·
Φ · • φ φ φ · · φ φφφ φ φ • φ
(2) | Informace k SEQ ID No | 4 : |
(i) Sekvenční charakteristika : | ||
(A) Délka : 402 aminokyselin | ||
(B) Druh : aminokyselina | ||
(C) Struktura | : jednořetězová | |
(D) Topologie | : lineární | |
(ii) Druh molekul : | protein | |
(i x) Znak : | ||
(A) Jméno/Klíč | : protein | |
(B) Poloha : 1 | . .402 | |
(xi) Popis sekvence | : SEQ ID No 4 : | |
Met | Ala Leu Leu Gin Glu Leu | Leu Asp Ser Ala Pro Glu Ile Thr Ala |
1 | 5 | 10 15 |
Leu | Arg Arg Asp Ile His Ala | His Pro Glu Leu Cys Phe Glu Glu Leu |
20 | 25 30 | |
Arg | Thr Ala Asp Leu Val Ala | Arg Gin Leu Glu Gly Trp Gly Ile Ala |
35 | 40 45 | |
Val | His Arg Gly Leu Gly Arg | Thr Gly Val Val Gly Thr Ile His Gly |
50 55 | 60 | |
Arg | Asp Gly Gly Ala Ser Gly | Arg Ala Ile Gly Leu Arg Ala Asp Met |
65 | 70 | 75 80 |
Asp | Ala Leu Pro Met Gin Glu | Phe Asn Thr Phe Glu His Ala Ser Arg |
85 | 90 95 | |
His | Ala Gly Lys Met His Ala | Cys Gly His Asp Gly His Val Ala Met |
100 | 105 110 |
Asn Gly | Asp 355 | Gly Asp | His | Arg | Ala 360 | Ile Gly His | Gly | Gly 365 | Gly | Pro | Cys | ||||
Thr | Leu | His | Asn | Pro | Ser | Tyr | Asp | Phe | Asn | Asp | Gin | Leu | Ile | Pro | Gin |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Gly | Ala | Thr | Phe | Trp | Val | Lys | Leu | Ala | Gin | Arg | Trp | Leu | Ser | Glu | Pro |
Thr Arg
Vysvětlení obrázků na výkresech
Obrázek 1 Restrikční mapa fragmentu 2,5 kb Sall/BamHI, který zprostředkuje N-acetyl-PPT specifickou deacetylázovou aktivitu. Pozice a orientace strukturního genu deacl je označena šipkou (BP = bázické páry)
Obrázek 2
Obrázek 2
Mapa plasmidu pPVCKDEACl ke konstitutivní expresi genu deac v rostlinách
Mapa plasmidu pPCVTDEACl k tapetum-specifické expresi genu deac v rostlinách
Obrázek 2
Mapa plasmidu pGK83
Obrázek 2 Mapa plasmidu pMF9
Claims (7)
1. Molekula DNA kódující protein s biologickou aktivitou N-acetyl-fosfinothricin-deacetylázy.
2. Molekula DNA kódující protein s biologickou aktivitou N-acetyl-fosfinothricin-deacetylázy vybraná ze skupiny sestávající z
a) molekul DNA, které kódují pro protein se sekvencí aminokyselin uvedenou pod SEQ ID No 2 a jeho fragmenty a/nebo deriváty;
b) molekul DNA, které kódují pro sekvenci nukleotidů uvedenou pod SEQ ID No 1 nebo sekvence, které se od této sekvence odvozují v rámci degenerace genetického kódu;
c) molekul DNA, které kódují pro protein se sekvencí aminokyselin uvedenou pod SEQ ID No 4 nebo jeho fragmenty a/nebo deriváty a
d) molekul DNA, které kódují pro sekvenci nukleotidů uvedenou pod SEQ ID No 3 nebo sekvence, které se od této sekvence odvozují v rámci degenerace genetického kódu.
3. Způsob izolace mikroorganismů s vysokou N-acetyl-fosfinothricin-deacetylázovou aktivitou.
4.
Stenotrophomonas sp. (DSM 9734) a Comamonas • · • · · · · · acidovorans (DSM 11070).
5. Rostlinné buňky nebo rostliny, keré obsahují molekulu DNA podle nároku 1.
6. Způsob výroby rostlin s řízené degradovatelnými částmi specifickou expresí deacetylázového genu.
7. Způsob výroby samčích nebo samičích sterilních rostlin specifickou expresí deacetylázového genu.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19652284A DE19652284A1 (de) | 1996-12-16 | 1996-12-16 | Neue Gene codierend für Aminosäure-Deacetylasen mit Spezifität für N-Acetyl-L-Phosphinothricin, ihre Isolierung und Verwendung |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ216699A3 true CZ216699A3 (cs) | 1999-10-13 |
Family
ID=7814866
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ992166A CZ216699A3 (cs) | 1996-12-16 | 1997-12-03 | Geny kodující pro deacetylázy aminokyselin se specifikací pro N-acetyl-L-fosfinothricin, způsob jejich izolace a jejich použití |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US6177616B1 (cs) |
EP (1) | EP0942965B1 (cs) |
JP (1) | JP2001506130A (cs) |
CN (1) | CN1171993C (cs) |
AT (1) | ATE377072T1 (cs) |
AU (1) | AU727831B2 (cs) |
BR (1) | BR9714513A (cs) |
CA (1) | CA2275134A1 (cs) |
CZ (1) | CZ216699A3 (cs) |
DE (2) | DE19652284A1 (cs) |
ES (1) | ES2296318T3 (cs) |
HU (1) | HUP0000396A3 (cs) |
NZ (1) | NZ335852A (cs) |
PL (2) | PL193489B1 (cs) |
RU (1) | RU2205219C2 (cs) |
TR (1) | TR199901332T2 (cs) |
WO (1) | WO1998027201A2 (cs) |
ZA (1) | ZA9711146B (cs) |
Families Citing this family (120)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19933362A1 (de) * | 1999-07-20 | 2001-02-08 | Aventis Cropscience Gmbh | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren aus ihren racemischen N-Acetyl-D,L-Derivaten durch enzymatische Racemat-Spaltung mittels isolierter, rekombinanter Enzyme |
US6384304B1 (en) * | 1999-10-15 | 2002-05-07 | Plant Genetic Systems N.V. | Conditional sterility in wheat |
WO2002072804A2 (en) * | 2001-03-12 | 2002-09-19 | Bayer Bioscience N.V. | Novel genes for conditional cell ablation |
EP1258531A1 (en) * | 2001-05-14 | 2002-11-20 | Givaudan SA | Compounds and methods for inhibiting axillary malodour |
AU2002315526A1 (en) | 2001-07-06 | 2003-01-21 | Monsanto Technology Llc | Methods for enhancing segregation of transgenes in plants and compositions thereof |
US7132590B2 (en) * | 2001-12-18 | 2006-11-07 | The Arizona Board Of Regents On Behalf Of The University Of Arizona | Methods of making male-sterile plants by underexpressing allene oxide synthase |
EP2535414B1 (en) | 2003-04-29 | 2017-12-13 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Novel glyphosate-n-acetyltransferase (gat) genes |
WO2005001101A1 (en) | 2003-06-03 | 2005-01-06 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Conditional sterility in plants |
CA2733145C (en) * | 2003-07-02 | 2012-06-19 | Corus Pharma, Inc. | Aztreonam l-lysine and method of determining impurities therein |
WO2005070088A2 (en) | 2004-01-15 | 2005-08-04 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Chimeric sequences for tissue-specific gene expression in plants |
NZ571115A (en) * | 2006-03-02 | 2011-11-25 | Athenix Corp | Method and compositions for improved enzyme activity in transgenic plant |
US7951995B2 (en) | 2006-06-28 | 2011-05-31 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Soybean event 3560.4.3.5 and compositions and methods for the identification and detection thereof |
US8097712B2 (en) | 2007-11-07 | 2012-01-17 | Beelogics Inc. | Compositions for conferring tolerance to viral disease in social insects, and the use thereof |
US8748695B2 (en) * | 2008-07-23 | 2014-06-10 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Molecular markers linked to PPO inhibitor tolerance in soybeans |
US8697941B2 (en) | 2008-07-23 | 2014-04-15 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Molecular markers linked to PPO inhibitor tolerance in soybeans |
PL2342331T3 (pl) | 2008-09-26 | 2016-05-31 | Basf Agrochemical Products Bv | Mutanty ahas odporne na herbicydy i sposoby ich zastosowania |
CA2765034A1 (en) | 2009-06-09 | 2010-12-23 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Early endosperm promoter and methods of use |
US8962584B2 (en) | 2009-10-14 | 2015-02-24 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem, Ltd. | Compositions for controlling Varroa mites in bees |
EP2494056A1 (en) | 2009-10-26 | 2012-09-05 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Somatic ovule specific promoter and methods of use |
EP2529027A1 (en) | 2010-01-26 | 2012-12-05 | Pioneer-Hi-Bred International, Inc. | Hppd-inhibitor herbicide tolerance |
EP3231872B1 (en) | 2010-03-08 | 2020-05-06 | Monsanto Technology LLC | Polynucleotide molecules for gene regulation in plants |
CN103237894A (zh) | 2010-08-13 | 2013-08-07 | 先锋国际良种公司 | 包含具有羟基苯丙酮酸双加氧酶(hppd)活性的序列的组合物和方法 |
CN103748227A (zh) | 2010-11-24 | 2014-04-23 | 先锋国际良种公司 | 芸苔gat事件dp-073496-4及其鉴定和/或检测组合物和方法 |
WO2012071039A1 (en) | 2010-11-24 | 2012-05-31 | Pioner Hi-Bred International, Inc. | Brassica gat event dp-061061-7 and compositions and methods for the identification and/or detection thereof |
TWI667347B (zh) | 2010-12-15 | 2019-08-01 | 瑞士商先正達合夥公司 | 大豆品種syht0h2及偵測其之組合物及方法 |
AU2012308660B2 (en) | 2011-09-13 | 2017-05-25 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
US10760086B2 (en) | 2011-09-13 | 2020-09-01 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
US10806146B2 (en) | 2011-09-13 | 2020-10-20 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
EP2756085B1 (en) | 2011-09-13 | 2019-03-20 | Monsanto Technology LLC | Methods and compositions for weed control |
CN104160028A (zh) | 2011-09-13 | 2014-11-19 | 孟山都技术公司 | 用于杂草控制的方法和组合物 |
UA116093C2 (uk) | 2011-09-13 | 2018-02-12 | Монсанто Текнолоджи Ллс | Спосіб та композиція для боротьби з бур'янами (варіанти) |
AU2012308753B2 (en) | 2011-09-13 | 2018-05-17 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
EP2756084B1 (en) | 2011-09-13 | 2020-06-03 | Monsanto Technology LLC | Methods and compositions for weed control |
CA2848685A1 (en) | 2011-09-13 | 2013-03-21 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control comprising topical application of a glutamine synthetase polynucleotide |
MX350771B (es) | 2011-09-13 | 2017-09-15 | Monsanto Technology Llc | Métodos y composiciones para el control de malezas. |
US9840715B1 (en) | 2011-09-13 | 2017-12-12 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for delaying senescence and improving disease tolerance and yield in plants |
US10829828B2 (en) | 2011-09-13 | 2020-11-10 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
US9920326B1 (en) | 2011-09-14 | 2018-03-20 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for increasing invertase activity in plants |
US9204603B2 (en) | 2011-12-21 | 2015-12-08 | The Curators Of The University Of Missouri | Soybean variety S05-11482 |
US20130167262A1 (en) | 2011-12-21 | 2013-06-27 | The Curators Of The University Of Missouri | Soybean variety s05-11268 |
BR112014016791A2 (pt) | 2012-01-06 | 2019-09-24 | Pioneer Hi Bred Int | molécula de ácido nucléico isolada, cassete de expressão, vetor, célula vegetal, planta, semente transgénica, método para expressão de um polinucleotídeo em uma planta ou célula vegetal, método para expressão de um polinucleotídeo, preferencialmente em tecidos de óvulo de uma planta |
US9006515B2 (en) | 2012-01-06 | 2015-04-14 | Pioneer Hi Bred International Inc | Pollen preferred promoters and methods of use |
WO2013109754A1 (en) | 2012-01-17 | 2013-07-25 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Plant transcription factors, promoters and uses thereof |
CN104703998B (zh) | 2012-03-13 | 2020-08-21 | 先锋国际良种公司 | 植物中雄性育性的遗传减少 |
WO2013138309A1 (en) | 2012-03-13 | 2013-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
CN104619843B (zh) | 2012-05-24 | 2020-03-06 | A.B.种子有限公司 | 用于使基因表达沉默的组合物和方法 |
CA2876426A1 (en) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Methods and compositions involving als variants with native substrate preference |
AU2012208997B1 (en) | 2012-07-30 | 2013-09-19 | Dlf Usa Inc. | An alfalfa variety named magnum salt |
WO2014059155A1 (en) | 2012-10-11 | 2014-04-17 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Guard cell promoters and uses thereof |
AR093058A1 (es) | 2012-10-18 | 2015-05-13 | Monsanto Technology Llc | Metodos y composiciones para el control de pestes en plantas |
US20140173781A1 (en) | 2012-12-13 | 2014-06-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods and compositions for producing and selecting transgenic wheat plants |
WO2014100525A2 (en) | 2012-12-21 | 2014-06-26 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods for auxin-analog conjugation |
AU2013371825B2 (en) | 2013-01-01 | 2019-10-24 | A.B. Seeds Ltd. | Methods of introducing dsRNA to plant seeds for modulating gene expression |
US10683505B2 (en) | 2013-01-01 | 2020-06-16 | Monsanto Technology Llc | Methods of introducing dsRNA to plant seeds for modulating gene expression |
US10000767B2 (en) | 2013-01-28 | 2018-06-19 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for plant pest control |
AU2014248958A1 (en) | 2013-03-13 | 2015-10-01 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
UY35379A (es) | 2013-03-13 | 2014-09-30 | Monsanto Technology Llc | ?métodos y composiciones para el control de malezas?. |
AU2014241045B2 (en) | 2013-03-13 | 2017-08-31 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Glyphosate application for weed control in brassica |
BR112015023286A2 (pt) | 2013-03-14 | 2018-03-06 | Arzeda Corp | polipeptídeo recombinante com atividade da dicamba descarboxilase, construto de polinucleotídeo, célula, método de produção de uma célula hospedeira compreendendo um polinucleotídeo heterólogo que codifica um polipeptídeo tendo atividade da dicamba descarboxilase, método para descarboxilar dicamba, um derivado de dicamba ou um metabolito de dicamba, método para a detecção de um polipeptideo e método para a detecção da presença de um polinucleotideo que codifica um polipeptideo tendo atividade da dicamba descarboxilase |
CN105339380A (zh) | 2013-03-14 | 2016-02-17 | 先锋国际良种公司 | 用以防治昆虫害虫的组合物和方法 |
US20140304857A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-10-09 | Pioneer Hi Bred International Inc | Maize stress related transcription factor 18 and uses thereof |
CA2905595A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions having dicamba decarboxylase activity and methods of use |
US20140283211A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-18 | Monsanto Technology Llc | Methods and Compositions for Plant Pest Control |
US10568328B2 (en) | 2013-03-15 | 2020-02-25 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control |
US10023877B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-07-17 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | PHI-4 polypeptides and methods for their use |
BR112015023700A2 (pt) | 2013-03-15 | 2017-07-18 | Pioneer Hi Bred Int | método de aprimoramento da tolerância ao estresse abiótico em uma planta de cultura agrícola , planta de milho transgênica, célula vegetal, semente, método de regulação negativa de um gene de acc oxidase endógeno em uma planta de milho. |
EP2781151A1 (en) | 2013-03-18 | 2014-09-24 | Bayer CropScience AG | Methods of separating hybrid seed from a mixture of seeds |
EP3030663B1 (en) | 2013-07-19 | 2019-09-04 | Monsanto Technology LLC | Compositions and methods for controlling leptinotarsa |
US9850496B2 (en) | 2013-07-19 | 2017-12-26 | Monsanto Technology Llc | Compositions and methods for controlling Leptinotarsa |
CA2918909A1 (en) | 2013-07-25 | 2015-01-29 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Method for producing hybrid brassica seed |
EA030896B1 (ru) | 2013-08-16 | 2018-10-31 | Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. | Инсектицидные белки и способы их применения |
BR122021005579B1 (pt) | 2013-09-13 | 2022-11-29 | Pioneer Hi-Bred International, Inc | Construto de dna, método de obtenção de planta transgênica, proteína de fusão, método para controlar uma população de praga de inseto, método para inibir o crescimento ou matar uma praga de inseto |
CA2927180A1 (en) | 2013-10-18 | 2015-04-23 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Glyphosate-n-acetyltransferase (glyat) sequences and methods of use |
WO2015061548A1 (en) | 2013-10-25 | 2015-04-30 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Stem canker tolerant soybeans and methods of use |
NZ719544A (en) | 2013-11-04 | 2022-09-30 | Beeologics Inc | Compositions and methods for controlling arthropod parasite and pest infestations |
UA119253C2 (uk) | 2013-12-10 | 2019-05-27 | Біолоджикс, Інк. | Спосіб боротьби із вірусом у кліща varroa та у бджіл |
US10334848B2 (en) | 2014-01-15 | 2019-07-02 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for weed control using EPSPS polynucleotides |
BR112016018103B1 (pt) | 2014-02-07 | 2024-01-16 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Polipeptídeo e seu uso, polinucleotídeo, composição, proteína de fusão, método para controlar uma população, método para inibir o crescimento, método para controlar a infestação, método para obtenção de uma planta ou célula vegetal, construto |
CA2939156A1 (en) | 2014-02-07 | 2015-08-13 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
BR112016022711A2 (pt) | 2014-04-01 | 2017-10-31 | Monsanto Technology Llc | composições e métodos para controle de pragas de inseto |
AU2015280252A1 (en) | 2014-06-23 | 2017-01-12 | Monsanto Technology Llc | Compositions and methods for regulating gene expression via RNA interference |
US11807857B2 (en) | 2014-06-25 | 2023-11-07 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for delivering nucleic acids to plant cells and regulating gene expression |
US9686931B2 (en) | 2014-07-07 | 2017-06-27 | Alforex Seeds LLC | Hybrid alfalfa variety named HybriForce-3400 |
RU2021123470A (ru) | 2014-07-29 | 2021-09-06 | Монсанто Текнолоджи Ллс | Композиции и способы борьбы с насекомыми-вредителями |
US20170218384A1 (en) | 2014-08-08 | 2017-08-03 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Ubiquitin promoters and introns and methods of use |
US20170247719A1 (en) | 2014-09-17 | 2017-08-31 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods to control insect pests |
AU2015323919B2 (en) | 2014-09-29 | 2019-01-31 | Dlf Usa Inc. | Low lignin non-transgenic alfalfa varieties and methods for producing the same |
BR112017007932A2 (pt) | 2014-10-16 | 2018-01-23 | Du Pont | proteínas inseticidas e métodos para uso das mesmas |
WO2016099916A1 (en) | 2014-12-19 | 2016-06-23 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Polylactic acid compositions with accelerated degradation rate and increased heat stability |
EP3256589B1 (en) | 2015-01-22 | 2021-12-22 | Monsanto Technology LLC | Compositions and methods for controlling leptinotarsa |
CN116333064A (zh) | 2015-05-19 | 2023-06-27 | 先锋国际良种公司 | 杀昆虫蛋白及其使用方法 |
CN107750125A (zh) | 2015-06-02 | 2018-03-02 | 孟山都技术有限公司 | 用于将多核苷酸递送至植物中的组合物和方法 |
WO2016196782A1 (en) | 2015-06-03 | 2016-12-08 | Monsanto Technology Llc | Methods and compositions for introducing nucleic acids into plants |
CA2986265A1 (en) | 2015-06-16 | 2016-12-22 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods to control insect pests |
WO2017023486A1 (en) | 2015-08-06 | 2017-02-09 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Plant derived insecticidal proteins and methods for their use |
US11104911B2 (en) | 2015-12-22 | 2021-08-31 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Embryo-preferred Zea mays promoters and methods of use |
BR112018016057A2 (pt) | 2016-02-05 | 2019-01-29 | Pioneer Hi Bred Int | métodos para selecionar uma planta de soja ou um germoplasma de soja com resistência aprimorada a infecção por podridão parda da haste e kit |
EP3451837B1 (en) | 2016-05-04 | 2021-08-25 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
CA3022858A1 (en) | 2016-06-16 | 2017-12-21 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods to control insect pests |
BR112018076816A2 (pt) | 2016-06-24 | 2019-09-03 | Pioneer Hi Bred Int | elemento regulador híbrido, promotor híbrido, construto de dna, cassete de expressão, célula hospedeira, planta transgênica, método para criar um elemento regulador híbrido e método para expressão direcionada de uma sequência de polinucleotídeos em uma planta ou célula vegetal |
EP3954202A1 (en) | 2016-07-01 | 2022-02-16 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins from plants and methods for their use |
WO2018013333A1 (en) | 2016-07-12 | 2018-01-18 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods to control insect pests |
EP3535285B1 (en) | 2016-11-01 | 2022-04-06 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
CA2968938A1 (en) | 2017-05-31 | 2018-11-30 | Bayer Cropscience Lp | Canola hybrid variety 5cn0130 |
CA2968905A1 (en) | 2017-05-31 | 2018-11-30 | Bayer Cropscience Lp | Canola hybrid variety 5cn0125 |
WO2019060383A1 (en) | 2017-09-25 | 2019-03-28 | Pioneer Hi-Bred, International, Inc. | PROMOTERS HAVING PREFERENCE FOR FABRICS AND METHODS OF USE |
CN109988806B (zh) * | 2017-12-29 | 2023-02-28 | 弈柯莱生物科技(上海)股份有限公司 | 一种n-乙酰-草铵膦盐的消旋方法 |
CN115850420A (zh) | 2018-03-14 | 2023-03-28 | 先锋国际良种公司 | 来自植物的杀昆虫蛋白及其使用方法 |
CN111867377B (zh) | 2018-03-14 | 2023-05-23 | 先锋国际良种公司 | 来自植物的杀昆虫蛋白及其使用方法 |
CA3004115A1 (en) | 2018-05-07 | 2019-11-07 | Bayer Cropscience Lp | Canola hybrid variety 6cn0122 |
WO2019226508A1 (en) | 2018-05-22 | 2019-11-28 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Plant regulatory elements and methods of use thereof |
WO2020005933A1 (en) | 2018-06-28 | 2020-01-02 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods for selecting transformed plants |
JP2022512817A (ja) | 2018-10-31 | 2022-02-07 | パイオニア ハイ-ブレッド インターナショナル, インコーポレイテッド | オクロバクテリウム(Ochrobactrum)媒介植物形質転換のための組成物及び方法 |
CA3040289A1 (en) | 2019-04-12 | 2020-10-12 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Canola hybrid variety 7cn0298 |
CA3047768A1 (en) | 2019-06-21 | 2020-12-21 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Canola hybrid variety 7cn0425 |
US11672218B2 (en) | 2020-04-24 | 2023-06-13 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Canola hybrid variety 7CN0065 |
US11997965B2 (en) | 2020-04-24 | 2024-06-04 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Canola hybrid variety 8CN0001 |
US11997966B2 (en) | 2020-04-24 | 2024-06-04 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Canola hybrid variety 7CN0020 |
WO2022015619A2 (en) | 2020-07-14 | 2022-01-20 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Insecticidal proteins and methods for their use |
CN112940963B (zh) * | 2021-01-22 | 2022-06-14 | 上海交通大学 | 脱乙酰酶DacApva、编码基因及其在脱乙酰反应中的应用 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE531716C (de) | 1930-06-08 | 1931-08-18 | Mergenthaler Setzmaschfab Gmbh | Einrichtung zum Ausrichten der Giessform gegenueber dem Giessformtraeger von Matrizensetz- und Zeilengiessmaschinen |
DK158316C (da) * | 1974-01-23 | 1990-10-08 | Toyo Jozo Kk | Fremgangsmaade til fremstilling af 3-substituerede 7-amino-3-cephem-4-carboxylsyrederivater |
DE4126414A1 (de) * | 1991-08-09 | 1993-02-11 | Hoechst Ag | Deacetylasegene zur erzeugung von phosphinothricin oder phosphinothricyl-alanyl-alanin, verfahren zu ihrer isolierung und ihre verwendung |
DE4308061A1 (de) * | 1993-03-13 | 1994-09-15 | Hoechst Ag | Neue Aminosäure-Deacetylase mit Spezifität für L-N-Acetyl-Phosphinothricin, ihre Herstellung und Verwendung |
DE19639463A1 (de) * | 1996-09-26 | 1998-04-02 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Verfahren zur Herstellung weiblich steriler Pflanzen |
-
1996
- 1996-12-16 DE DE19652284A patent/DE19652284A1/de not_active Withdrawn
-
1997
- 1997-12-03 WO PCT/EP1997/006755 patent/WO1998027201A2/de active IP Right Grant
- 1997-12-03 CA CA002275134A patent/CA2275134A1/en not_active Abandoned
- 1997-12-03 PL PL97377650A patent/PL193489B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-12-03 US US09/319,892 patent/US6177616B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-12-03 CZ CZ992166A patent/CZ216699A3/cs unknown
- 1997-12-03 PL PL97334530A patent/PL193522B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-12-03 ES ES97953733T patent/ES2296318T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1997-12-03 JP JP52724198A patent/JP2001506130A/ja not_active Ceased
- 1997-12-03 TR TR1999/01332T patent/TR199901332T2/xx unknown
- 1997-12-03 HU HU0000396A patent/HUP0000396A3/hu unknown
- 1997-12-03 BR BR9714513A patent/BR9714513A/pt not_active Application Discontinuation
- 1997-12-03 AU AU57535/98A patent/AU727831B2/en not_active Ceased
- 1997-12-03 RU RU99115170/13A patent/RU2205219C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1997-12-03 EP EP97953733A patent/EP0942965B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-12-03 NZ NZ335852A patent/NZ335852A/en unknown
- 1997-12-03 DE DE59712890T patent/DE59712890D1/de not_active Expired - Fee Related
- 1997-12-03 CN CNB971806055A patent/CN1171993C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1997-12-03 AT AT97953733T patent/ATE377072T1/de not_active IP Right Cessation
- 1997-12-11 ZA ZA9711146A patent/ZA9711146B/xx unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO1998027201A3 (de) | 1999-03-04 |
EP0942965B1 (de) | 2007-10-31 |
ATE377072T1 (de) | 2007-11-15 |
AU727831B2 (en) | 2001-01-04 |
JP2001506130A (ja) | 2001-05-15 |
HUP0000396A3 (en) | 2002-02-28 |
DE19652284A1 (de) | 1998-06-18 |
ES2296318T3 (es) | 2008-04-16 |
RU2205219C2 (ru) | 2003-05-27 |
PL193489B1 (pl) | 2007-02-28 |
HUP0000396A2 (hu) | 2000-06-28 |
EP0942965A2 (de) | 1999-09-22 |
US6177616B1 (en) | 2001-01-23 |
CA2275134A1 (en) | 1998-06-25 |
WO1998027201A2 (de) | 1998-06-25 |
NZ335852A (en) | 2001-06-29 |
CN1171993C (zh) | 2004-10-20 |
TR199901332T2 (xx) | 1999-09-21 |
AU5753598A (en) | 1998-07-15 |
DE59712890D1 (de) | 2007-12-13 |
PL334530A1 (en) | 2000-02-28 |
CN1240476A (zh) | 2000-01-05 |
ZA9711146B (en) | 1998-06-17 |
BR9714513A (pt) | 2000-03-21 |
PL193522B1 (pl) | 2007-02-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ216699A3 (cs) | Geny kodující pro deacetylázy aminokyselin se specifikací pro N-acetyl-L-fosfinothricin, způsob jejich izolace a jejich použití | |
Carreno-Lopez et al. | Physiological evidence for differently regulated tryptophan-dependent pathways for indole-3-acetic acid synthesis in Azospirillum brasilense | |
Mayfield et al. | Stable nuclear transformation of Chlamydomonas reinhardtii by using a C. reinhardtii gene as the selectable marker. | |
De Bruijn et al. | Rhizobium meliloti 1021 has three differentially regulated loci involved in glutamine biosynthesis, none of which is essential for symbiotic nitrogen fixation | |
Engelke et al. | Biochemical and genetical analysis of Rhizobium meliloti mutants defective in C4-dicarboxylate transport | |
US5177010A (en) | Process for transforming corn and the products thereof | |
US4940840A (en) | Novel chitinase-producing bacteria and plants | |
US5767371A (en) | Deacetylase genes for the production of phosphinothricin or phosphin-othricyl-alanyl-alanine, process for their isolation, and their use | |
JPH03501086A (ja) | パラチオンヒドロラーゼ類縁体並びにその製造方法及び精製方法 | |
CN110592137B (zh) | 拟南芥at5g10290基因及其突变体在提高植物耐旱性的应用 | |
US5668294A (en) | Metal resistance sequences and transgenic plants | |
US6852909B2 (en) | Process for producing female-sterile plants | |
JP2009536819A (ja) | 除草剤を分解するための酵素 | |
CN101668859A (zh) | 具有增强的产量相关性状的植物及其制备方法 | |
US6555733B2 (en) | Genes coding for amino acid deacetylases with specificity for N-acetyl-L-phosphinothricin, their isolation and use | |
US5474929A (en) | Selectable/reporter gene for use during genetic engineering of plants and plant cells | |
CN111560055B (zh) | 水稻基因OsLAT3在调节敌草快的吸收累积中的应用 | |
Rossbach et al. | Cloning and analysis of Agrobacterium tumefaciens C58 loci involved in glutamine biosynthesis: neither the glnA (GSI) nor the glnII (GSII) gene plays a special role in virulence | |
JP4534034B2 (ja) | 植物へ遺伝子を導入する効率が向上したアグロバクテリウム菌およびその作製方法 | |
WO2024218767A1 (en) | Plants comprising bromoform production genes | |
JP2000500002A (ja) | 新規なdna配列及び植物における防御誘導因子を同定するためのこれらの使用 | |
Holsters et al. | Present plant biotechnology | |
MXPA00012786A (en) | Water stress or salt stress tolerant transgenic cereal plants |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |