CZ2001789A3 - Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin - Google Patents

Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin Download PDF

Info

Publication number
CZ2001789A3
CZ2001789A3 CZ2001789A CZ2001789A CZ2001789A3 CZ 2001789 A3 CZ2001789 A3 CZ 2001789A3 CZ 2001789 A CZ2001789 A CZ 2001789A CZ 2001789 A CZ2001789 A CZ 2001789A CZ 2001789 A3 CZ2001789 A3 CZ 2001789A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
opgl
polypeptide
nucleic acid
animal
modified
Prior art date
Application number
CZ2001789A
Other languages
English (en)
Inventor
Torben Halkier
Jesper Haaning
Original Assignee
Pharmexa A/S
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pharmexa A/S filed Critical Pharmexa A/S
Publication of CZ2001789A3 publication Critical patent/CZ2001789A3/cs

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/03Peptides having up to 20 amino acids in an undefined or only partially defined sequence; Derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70575NGF/TNF-superfamily, e.g. CD70, CD95L, CD153, CD154
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/08Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease
    • A61P19/10Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease for osteoporosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2799/00Uses of viruses
    • C12N2799/02Uses of viruses as vector
    • C12N2799/021Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Description

Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká zlepšeni terapie a prevence osteoporosy a jiných onemocněni charakterizovaných pokračující ztrátou kostní tkáně. Přesněji, předkládaný vynález poskytuje způsob pro snížení aktivity ligandu osteoprotegerinu (OPGL) umožněním produkce protilátek proti OPGL u jedinců trpících osteoporosou nebo rizikových z hlediska osteoporosy. Předkládaný vynález také poskytuje způsoby pro produkci modifikovaných OPGL použitelných v tomto způsobu, stejně jako modifikovaných OPGL jako takových. Předkládaný vynález také zahrnuje fragmenty nukleových kyselin kódující takové modifikované OPGL, stejně jako vektory inkorporující tyto fragmenty nukleových kyselin a hostitelské buňky a buněčné linie transformované těmito vektory. Vynález také poskytuje způsob pro identifikaci analogů OPGL, které jsou použitelné ve způsobu podle předkládaného vynálezu, stejně jako prostředků obsahujících modifikované OPGL nebo obsahujících nukleové kyseliny kódující analogy OPGL.
Dosavadní stav techniky
Osteoporosa je významný a narůstající zdravotnický problém ve světě. Postihuje přibližně 75 milionů lidí ve Spojených Státech Amerických, Evropě a Japonsku. Proto se jedná o nej častější systémové onemocnění kostí v průmyslových zemích.
Osteoporosa postihuje jednu ze čtyř žen po menopauze a většinu žen ve stáří, včetně významného počtu mužů. Náklady na osteoporosu ve Spojených Státech Amerických s 15 miliony • · · · • ·· ·· ···
postižených byly v roce 1984 vyčísleny na 3,8 bilionu USD.
Extrapolací lze odhadovat náklady ve světě na přibližně 20 bilionů USD.
Osteoporosa je systémové onemocnění skeletu charakterizované ztrátou kostní hmoty a zhoršením mikroarchitektury kostní tkáně, s následným zvýšením křehkosti kostí a náchylnosti k frakturám. Ačkoliv jsou postiženy všechny kosti, jsou nejčastějšími frakturami fraktura páteře, zápěstí a kyčle. Riziko vzniku osteoporosy se zvyšuje s věkem a je vyšší u žen než u mužů. Zdá se, že etiologie spočívá v mechanismu, který je základem zrychlení normální ztráty kostní hmoty, ke které dochází v menopause u žen a ke které dochází u všech jedinců s pokračujícím stárnutím.
Vrcholu množství kostní hmoty je dosaženo v přibližně 35 letech věku. Po dosažení vrcholu se množství kostní hmoty snižuje v důsledku nerovnováhy v remodelování. Z kostí se ztrácí jak minerální, tak organická matrix, ale zůstává zachována její základní organizace.
Kost se skládá z mineralizované extracelulární matrice složené z různých proteinů a proteoglykanů; základní složkou je kolagen typu I. Minerálem obsaženým v extracelulární matrici je hydroxyapatit (Ca3 (ΡΟ4) 2.Ca(OH)2) . Kost se nepřetržitě modeluje během růstu a vývoje a remodeluje se během života v reakci na fyzikální a chemické signály.
Růst, vývoj a udržování kostí jsou značně regulovanými procesy, které na buněčné úrovni zahrnuji koordinovanou regulaci buněk vytvářejících kost (osteoblastů) a buněk resorbujicích kost (osteoklastů). Množství kostní hmoty odráží rovnováhu mezi tvorbou a resorpcí kosti.
Osteoblasty vznikají z mezenchymových kmenových buněk a produkují kostní matrici během vývoje, po poranění kosti a během normální remodelace kosti, ke které dochází během života. Osteoklasty se diferencují z hematopoetických prekursorů monocytární-makrofágové linie a resorbují kostní matrici.
Nerovnováha mezi funkcí osteoblastů a osteoklastů může vést ke vzniku skeletální abnormalit charakterizovaných zmnožením kostní hmoty (osteopetrosa) nebo úbytkem kostní hmoty (osteoporosa).
Studie osteopetrosy na mutantních myší prokázaly, že genetické defekty ve vývoji, zrání a/nebo aktivaci osteoklastů vedou ke snížení resorpce kosti a uniformně k těžké osteopetrose (Marks, 1989). Nicméně, relativně málo je dosud známo o solubilních faktorech, které za fyziologického stavu regulují vývoj osteoklastů.
Nedávno byly charakterizovány dva proteiny, které se účastní této regulace (Simonet et al., 1997; Lacey et al., 1998). Těmito dvěma proteiny jsou osteoprotegerin a ligand osteoprotegerinu.
Osteoprotegerin je nový secernovaný člen rodiny receptoru pro faktor nekrosy nádorů. In vitro blokuje osteoprotegerin osteoklastogenesi způsobem závislým na dávce. Transgenní myši exprimující osteoprotegerin vykazují generalizované zvýšení hustoty kostí (osteopetrosu) asociovanou se snížením osteoklastů. Podání rekombinantního osteoprotegerinu vyvolává podobné účinky u normálních myší a chrání proti úbytku kostní hmoty indukovaného ovarektomií u krys (Simonet et al., 1997).
Dále, u osteoprotegerin-deficientních myši (knock-outované myši), které jsou normální v době porodu, se časně vyvíjí osteoporosa a arteriální kalcifikace (Bucay et al., 1998). Tato pozorování ukazují na možnost, že osteoprotegerin blokuje diferenciaci osteoklastů, základního, pokud ne jediného typu buněk resorbujících kost, což naznačuje, že může účinkovat jako humorální regulátor resorpce kosti. Osteoprotegerin je předmětem WO 97/23614.
Předpokládá se, že osteoprotegerin může vykazovat svůj účinek vazbou na a neutralizací faktoru, který stimuluje vývoj osteoklastů, a takto může inhibovat zrání osteoklastů (Simonet et al., 1997).
Ligand pro osteoprotegerin (OPGL) je člen cytokinové rodiny faktoru nekrosy nádorů a existuje jak v solubilní formě, tak ve formě vázané na membránu. OPGL se váže na osteoprotegerin s vazebnou afinitou 4 nM. In vitro aktivuje OPGL zralé osteoklasty a moduluje tvorbu osteoklastů z prekursorů kostní dřeně za přítomnosti CSF-1. Také bylo demonstrováno, že OPGL se váže na povrch progenitorů osteoklastů v kostní dřeni ošetřené CSF-1. Receptor pro OPGL na těchto hematopoetických progenitorových buňkách je, nicméně, neznámý. Rekombinantní solubilní OPGL je silným induktorem resorpce kosti in vivo (Lacey et al., 1998).
Popis OPGL
OPGL je syntetizován jako transmembránový protein II typu skládající se z 317 aminokyselin (lidský, SEQ ID NO: 2) nebo z 316 aminokyselin (myší, SEQ ID NO: 4 a 6). Přiřazení těchto dvou aminokyselinových sekvencí ukazuje, že identické aminokyselinové zbytky se nacházejí v 87% homologních pozic.
Aminokyselinová sekvence OPGL obsahuje krátkou cytoplasmatickou doménu na N-konci, po které následuje domnělý transmembránový region mezi aminokyselinovými zbytky 49 a 69. Podle jeho homologie s faktorem nekrosy nádorů a se předpokládalo, že extracelulárni část ÓPGL by se měla skládat ze dvou domén; stopkového regionu v rozsahu od aminokyselinového zbytku 70 až 157 a aktivní ligandové skupiny v rozsahu od aminokyselinového zbytku 158 do C-konce.
Nejvíce příbuzným proteinem k OPGL se zdá být cytokin indukující apoptosu - TRAIL - s méně než 25% identických aminokyselinových zbytků. OPGL byl také nedávno klonován v jiné souvislosti a byl označen jako TRANCE (Wong et al., 1997, J. Biol. Chem. 272: 25190-25194) a RANKL, v příslušném pořadí (Anderson et al., 1997, Nátuře 390: 175-179. Protein je také známý jako osteoklastový diferenciační faktor (ODF).
Několik N-koncových delečních variant myšího oPGL bylo exprimováno v E: coli a přečištěno. Tyto varianty se skládaly z aminokyselinových zbytků 75-316, 128-316, 137-316 a 158-316, v příslušném pořadí. Tři nej kratší varianty měly podobnou strukturu β-listu podle analýz cirkulárního dichroismu a všechny byly schopny vazby na osteoprotegerin. Významnější je, že tyto tři varianty byly aktivní v testech in vitro (Lacey et al., 1998) .
Nejkratší varianta byla studována dále. Podobně jako faktor nekrosy nádorů a existuje tato varianta OPGL v roztoku jako trimer a tvoří 3:3 komplexy při inkubaci s osteoprotegerinem. Bylo zjištěno, že vazebný afinita je 4 nM. Tato varianta indukuje významné zvýšení ionizovaného vápníku v krvi (hyperkalcemii) u myší in vivo. Současné podání osteoprotegerinu významně redukuje tento hyperkalcemický efekt
OPGL.
Nejdelší varianta (aminokyselinové zbytky 75-316) OPGL se neváže na osteoprotegerin a nemá žádnou biologickou aktivitu.
V době konstrukce N-koncových delečnich variant nebylo přirozené štěpící místo v OPGL známo. Exprese kompletního OPGL v lidských 293 fibroblastech vedla ke vzniku solubilního OPGL začínajícího aminokyselinovým zbytkem 139 myšího proteinu nebo homologním aminokyselinovým zbytkem 140 v lidském proteinu. Tyto expresní studie také ukázaly, že solubilní OPGL vzniklý expresí v lidských buňkách je glykosylovaný. Toto není překvapivé, protože jak myší, tak lidský OPGL-obsahuji tři potenciální glykosylační místa v C-koncové ligandové doméně.
Koncentrace osteoprotegerinu v krvi a ve tkáních nejsou známé, ale protein má významnou biologickou aktivitu v koncentracích 1 ng/ml.
Biologická aktivita OPGL
OPGL je účinný diferenciační faktor pro osteoklasty při kombinaci s CSF-1. Ani jedna z těchto složek není samostatně schopna indukovat diferenciaci osteoklastů z progenitorových buněk.
OPGL je účinný aktivátor zralých osteoklastů. Sám o sobě aktivuje OPGL zralé osteoklasty k resorpci kosti. Nebylo pozorováno, že by OPGL působil jako růstový faktor pro osteoklasty nebo jako faktor podporující přežívání osteoklastů v těchto pokusech.
• ··
·♦ 99 9
9
999
999
Nezdá se, že by bylo působeni OPGL omezeno druhově, protože myši OPGL také indukuje tvorbu osteoklastů v kulturách lidských mononukleárnich buněk periferní krve.
Podstata vynálezu
Předmětem předkládaného vynálezu je poskytnutí nové terapie proti stavům charakterizovaným nadměrnou resorpcí kostí, jako je osteoporosa. Další předmětem je vývoj autovakcíny proti OPGL, za účelem nové terapie osteoporosy a dalších patologických onemocnění charakterizovaných nadměrnou resorpcí kosti.
Zjistili jsme, že data uvedená výše ukazují na patofyziologickou úlohu OPGL. Důkaz in vivo je částečný nebo nepřímý, ale podle našeho názoru významný, zejména v kombinaci s přímým důkazem.
Pozorování, že injekce rekombinantní C-koncové domény OPGL myším vede k těžké hyperkalcemii podle našeho názoru ukazuje přímo na patofyziologickou úlohu.
Nepřímý důkaz pochází od osteoprotegerin-deficientních myší (knock-outovaných myší), které jsou normální v době porodu a u kterých se časně vyvíjí osteoporosa. Toto ukazuje, že odstranění proteinu, který se váže na OPGL a neutralizuje jeho účinky, vede k osteoporose. Domníváme se, že nejpravděpodobnější příčinou je zvýšené zrání a aktivace osteoklastů způsobené OPGL.
Dvěma dalšími nepřímými důkazy je to, že jak u myší transgenních pro osteoprotegerin, tak u myší, kterým se podal injekčně osteoprotegerin, se vyvinula osteopetrosa. Toto ukazuje, že nepřirozeně vysoké koncentrace proteinu, který váže OPGL a neutralizuje jeho účinky, vedou ke vzniku osteopetrosy. Předpokládáme, že toto má důsledek ve sníženém zrání a aktivaci osteoklastů, což je způsobeno neutralizací OPGL.
Proto navrhujeme model, ve kterém OPGL a osteoprotegerin působí jako pozitivní a negativní regulátory vývoje osteoklastů, v příslušném pořadí. Jinými slovy, OPGL podporuje resorpci kosti, zatímco osteoprotegerin inhibuje resorpci kosti.
Proto může být, vzhledem k osteoporose, OPGL považován za patogenní činidlo, které podporuje resorpci kosti, která nakonec vede k osteoporose. Obdobně, osteoprotegerin může být považován za terapeutické činidlo, které působí proti patogennímu činidlu neutralizací jeho účinků.
Proto navrhujeme inhibici diferenciace/zrání/tvorby osteoklastů a aktivace osteoklastů pomocí produkce protilátek schopných neutralizovat OPGL in vivo, což je bezpečný a účinný prostředek pro léčbu/zmírnění a/nebo prevenci osteoporosy a jiných onemocnění charakterizovaných nadměrnou resorpci kosti ve srovnání s rychlostí tvorby kosti.
Proto, v nej širším a nejobecnějším aspektu, předkládaný vynález spočívá ve způsobu pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin (OPGL) u zvířete, včetně člověka, kde uvedený způsob zahrnuje účinnou prezentaci imunologicky účinného činidla imunitnímu systému živočicha, kde uvedené činidlo je vybráno z
- alespoň jednoho OPGL polypeptidu nebo jeho subsekvence, které byly připraveny tak, že imunizace živočicha OPGL polypeptidem nebo jeho subsekvencí indukuje produkci protilátek proti OPGL polypeptidu; a/nebo
- alespoň jednoho analogu OPGL obsahujícího modifikaci OPGHL polypeptidu, kde imunizace živočicha analogem indukuje tvorbu protilátek proti OPGL polypeptidu.
Nejzajímavějším aspektem tohoto přístupu je to, že například osteoporosa může být kontrolována periodickými, ale ne příliš častými imunizacemi, což je v protikladu s jinými terapeutickými postupy, které vyžadují časté (například denní) podávání osteoprotegerinu nebo molekul majících vazebnou afinitu k analogům OPGL. Předpokládá se, že 1-4 injekce za rok imunogenního prostředku budou dostatečné pro získání požadovaného účinku, zatímco podávání osteoprotegerinu nebo jiných inhibitorů aktivity OPGL bude vyžadovat denní podávání.
Vynález se také týká analogů OPGL, stejně jako fragmentů nukleových kyselin kódujících tyto analogy. Vynález také zahrnuje imunogenní prostředky obsahující analogy nebo fragmenty nukleových kyselin.
Vynález se také týká způsobu pro identifikaci analogů OPGL, stejně jako přípravy prostředků obsahujících analogy OPGL.
Nakonec se vynález týká způsobu pro léčbu osteoporosy a jiných onemocnění charakterizovaných nadměrnou resorpcí kostí, který zahrnuje podání non-OPGL molekuly (obvykle protilátky), která blokuje interakci mezi OPGL a jeho receptorem na osteoklastech.
Podrobný popis vynálezu
• ·· ·· ·· · · • ·
·· · • · * · ·
• · ·♦ • · • ·· • ·
• · · • · · • · ·
• · · • · • ·
• · · · · ·· • · · • · ·
Definice
Následující termíny použité v předkládaném vynálezu a patentových nárocích budou definovány a podrobně vysvětleny pro jednoznačné pochopení vynálezu.
Termín T-lymfocyty označuje lymfocyty původem z thymu, které jsou odpovědná za různé buňkami zprostředkované imunitní reakce, stejně jako za pomocnou aktivitu v humorální imunitní reakci. Obdobně, termín B-lymfocyty označuje lymfocyty produkující protilátky.
Termín OPGL polypeptid označuje polypeptidy mající aminokyselinovou sekvenci výše uvedených OPGL proteinů získaných od lidí nebo od myší (nebo jejich zkrácené formy bez významné části epitopů pro B-lymfocyty s intaktním OPGL), ale také polypeptidy mající aminokyselinovou sekvenci identickou k analogům těchto dvou proteinů izolovaným z jiných druhů. Termín zahrnuje také neglykosylované formy OPGL, které jsou připraveny v prokaryotickém systému, stejně jako formy mající jiný charakter glykosylace způsobený, například, použitím kvasinkových nebo jiných než savčích eukaryotických expresních systémů. Je třeba poznamenat, že termín OPGL polypeptid označuje polypeptid, který je za normálních okolností neimunogenni, je-li přítomen u léčeného zvířete. Jinými slovy, OPGL polypeptid je vlastní protein nebo analog takového vlastního proteinu, který normálně nevyvolává imunitní odpověď proti OPGL u daného zvířete.
OPGL analog je OPGL polypeptid, jehož primární struktura byla změněna. Takovou změnou může být, například, fúze OPGL polypeptidu na vhodného fúzního partnera (tj. změna primární struktury zahrnující výlučně C- a/nebo N-koncové adice
99 99 9·9·99
9 · 9 9 9 99
9999 9 9999 99
9 9 9 9 9 9 99
999 99 ·9 999 99999 aminokyselinových zbytků) a/nebo může změnou být inserce a/nebo delece a/nebo substituce v aminokyselinové sekvenci OPGL polypeptidu. Termín také zahrnuje derivatizované OPGL molekuly, jak je uvedeno dále v části týkající se modifikací OPGL.
Je třeba poznamenat, že pro vyvoláni požadované imunity proti OPGL u člověka je představitelné použití vakcín tvořených xeno-analogy (například psími nebo prasečími analogy) lidského OPGL. Takové použití xeno-analogů pro imunizaci tvoří také část předkládaného vynálezu.
Termín polypeptid, jak je zde použit, označuje jak krátké peptidy od 2 do 10 aminokyselinových zbytků, oligopeptidy od 11 do 100 aminokyselinových zbytků a polypeptidy vetší než 100 aminokyselinových zbytků. Dále termín také zahrnuje proteiny, tj. funkční biomolekuly složené alespoň z jednoho polypeptidu; pokud obsahují dva polypeptidy, tak mohou tyto polypeptidy vytvářet komplexy, mohou být kovalentně navázané nebo mohou být nekovalentně navázané. Polypeptidy v proteinu mohou být glykosylované a/nebo lipidované a/nebo mohou obsahovat prostetické skupiny.
Termín subsekvence označuje jakýkoliv nepřetržitý řetězec alespoň 3 aminokyselin, nebo - pokud je to relevantní alespoň 3 nukleotidů, které jsou odvozeny přímo od přirozené aminokyselinové sekvence OPGL nebo od sekvence nukleových kyselin OPGL, v příslušném pořadí.
Termín živočich označuje živočicha jakéhokoliv druhu (výhodně savce), jako je Homo sapiens, Canis domesticus, atd., a ne jenom jediné zvíře. Nicméně, termín také označuje populaci takových živočišných druhů, protože je důležité, že ·« ···· jedinci imunizovaní způsobem podle předkládaného vynálezu mají všichni v podstatě stejný OPGL umožňující imunizaci živočichů stejným imunogenem. Pokud, například, existují v různých lidských populacích genetické variace OPGL, může být nezbytné použít v takových odlišných populacích různé imunogeny, aby bylo možno překonat autotoleranci k OPGL v každé populaci. Odborníkům v oboru bude jasné, že živočich je žijící jedinec, který má imunitní systém. Je výhodné, aby byl živočichem obratlovec, jako je savec.
Termín inhibice aktivity OPGL in vivo označuje snížení počtu interakcí mezi OPGL a jeho (neznámým) receptorem (nebo mezi OPGL a jinými významnými vazebnými partnery pro tuto molekulu) v živém organismu. Inhibice může být dosaženo různými mechanismy; z nich je nejjednodušší prostá interference s aktivním místem v OPGL vazbou protilátky. Nicméně, předkládaný vynález také zahrnuje to, že vazba protilátky vede k odstranění OPGL fagocytujičími buňkami (jako jsou makrofágy a jiné fagocytující buňky).
Výraz dosažení prezentace ... imunitnímu systému označuje to, že imunitní systém zvířete je podroben kontrolovanému působení imunogenu. Jak bude jasné z následující diskuse, takové působení imunogenu může být provedeno různými způsoby, z nichž nejvýznamnější je vakcinace farmaceutickými prostředky obsahujícími polypeptid (tj. vakcínami, které jsou podávány pro léčbu nebo zmírnění existujícího onemocnění) nebo vakcinace nukleovými kyselinami. Důsledkem tohoto postupu je to, že imunokompetentní buňky zvířete jsou konfrontovány s antigenem imunologicky účinným způsobem, zatímco přesný způsob pro dosažení tohoto výsledku je méně významný vzhledem k předmětu předkládaného vynálezu.
• ♦ · • · 4 ··· • 4 ···· • · · • 4 4 4 4 ·· • 4 • · • 4
♦ · 44 44 ··· • 4 • ·
Termín imunologicky účinné množství má význam obvyklý v oboru, tj. označuje množství imunogenu, které může indukovat imunitní odpověď , která významně postihuje patogenní činidlo, které sdílí imunologické rysy s imunogenem.
Termín modifikace OPGL označuje chemickou modifikaci polypeptidů, který tvoří skelet OPGL. Takovou modifikací může být například derivatizace (například alkylace) některých aminokyselinových zbytků v sekvenci OPGL, ale jak bude jasné z následujícího popisu, výhodnou modifikací je změna primární struktury aminokyselinové sekvence OPGL.
Termínem autotolerance k OPGL se míní to, že protože je OPGL vlastním proteinem ve vakcinované populaci, neudržuje se u normálních jedinců v populaci imunitní reakce proti OPGL; nelze vyloučit, že někteří jedinci v populaci živočichů mohou být schopni produkovat protilátky proti přirozenému OPGL, například v rámci autoimunitních onemocnění. Zvíře bude obvykle autotolerantní vzhledem k vlastnímu OPGL, ale nemůže být vyloučeno, že analogy OPGL z jiného druhu nebo z populace mající jiný OPGL fenotyp, budou také tolerovány uvedeným zvířetem.
Termín cizorodý T-lymfocytární epitop je peptid, který je schopen vazby na MHC molekulu a který stimuluje T-lymfocyty u živočicha. Výhodnými cizorodými T-lymfocytárními epitopy v předkládaném vynálezu jsou promiskuitní epitopy, tj. epitopy, které se váží na významnou frakci určité třídy MHC molekul v živočišném druhu nebo populaci. Je znám pouze velmi omezený počet takových promiskuitních T-lymfocytárních epitopů a tyto jsou podrobněji popsány dále. Je třeba poznamenat, že aby byly imunogeny použité ve způsobu podle předkládaného vynálezu účinné v co největší frakci živočišné populace, je ♦ ·· 9« 9999 99 9 ·· · · · · · 9 99 ···· · ···· · 9 φ •••99 9 9 9 9 9 9 ····· 9 9·φ ·· · ·9 99 999 99 »99 nutné: (1) insertovat několik cizorodých T-lymfocytárnich epitopů ve stejné analogu OPGL; (2) připravit několik analogů OPGL, kde každý analog má insertovaný jiný promiskuitní epitop. Je třeba si uvědomit také to, že koncept cizorodých ΤΙ ymf ocytárnich epitopů také zahrnuje použití kryptických Tlymfocytárních epitopů, tj . epitopů, které jsou odvozeny od vlastního proteinu a které se chovají imunogenně pouze tehdy, existují-li v izolované formě bez spojení s daným vlastním proteinem.
Cizorodý T-helper lymfocytární epitop je cizorodý Tlymfocytární epitop, který se váže na molekulu MHC třídy II a který může být prezentován na povrchu buňky prezentující antigen (APC) navázaný na molekulu MHC třídy II.
Termín funkční část (bio)molekuly označuje v předkládaném vynálezu část molekuly, která je odpovědná za alespoň jeden biochemický nebo fyziologický efekt molekuly. V oboru je dobře známo, že mnoho enzymů a jiných efektorových molekul má aktivní místo, které je odpovědné za efekty dané molekuly. Jiné části molekuly mohou sloužit pro stabilizaci nebo zesílení rozpustnosti a mohou být proto vynechány, pokud tyto funkce nejsou významné pro některá provedení předkládaného vynálezu, například je možné použít některé cytokiny jako modifikující skupiny v PGL (viz podrobná diskuse dále) a v takovém případě může být otázka stability irelevantní, protože vazba na OPGL dodává nutnou stabilitu.
Termín adjuvans má svůj obvyklý význam v oboru vakcinací, tj. označuje substanci nebo kompozici, která je (1) sama neschopná vyvolávat specifickou imunitní odpověď proti imunogenu ve vakcině, ale která, nicméně, (2) je schopna zesilovat imunitní reakci proti imunogenu. Jinými slovy,
• ·· 99 9999 99
· 9 9 9 9 ·
9 999 9 9 9 9» 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9
99 · «4 99 999 • · 9
vakcinace adjuvans samotným nevyvolává imunitní reakci proti imunogenu, vakcinace imunogenem může a nemusí vyvolat imunitní reakci proti imunogenu, ale kombinované vakcinace imunogenem a adjuvans indukuje imunitní reakci proti imunogenu, která je silnější než reakce indukovaná imunogenem samotným.
Termín zacílení molekuly označuje situaci, ve které se molekula po podání zvířeti objeví přednostně v některých tkáních nebo je přednostně asociována s některými buňkami nebo typy buněk. Tohoto může být dosaženo mnoha způsoby, včetně přípravy molekuly v prostředku usnadňujícím zacílení nebo vložení skupin usnadňujících zacílení do molekuly. Tyto možnosti budou podrobněji probrány dále.
Stimulace imunitního systému označuje to, že daná substance nebo prostředek vykazuje obecný, nespecifický imunostimulační efekt. Mnoho adjuvans a domnělých adjuvans (jako jsou některé cytokiny) má schopnost stimulovat imunitní systém. Výsledkem použití imunostimulačního činidla je zvýšená pozornost imunitního systému, což znamená, že simultánní nebo následná imunizace imunogenem indukuje významně účinnější imunitní reakci ve srovnání s izolovaným použitím imunogenu.
Výhodná provedení inhibice aktivity OPGL
Je výhodné, aby byl OPGL polypeptid použitý jako imunogen ve způsobu podle předkládaného vynálezu byla modifikovaná molekula, ve které je v aminokyselinové sekvenci OPGL přítomna alespoň jedna změna, protože tímto způsobem je značně zlepšena šance na získání úplného-významného překonání autotolerance proti OPGL. Je třeba uvést, že toto nevylučuje možnost použití takových modifikovaných OPGL v prostředcích, které dále usnadňují překonání autotolerance proti OPGL, například v prostředcích obsahujících adjuvans.
·· ···· ·· 9
• 9 • · 99
. · 999 • * ··· • · 9
* • · • · · • · 9 9
• · • · 9 9 9
>4 ·* <·* 99 999
Bylo prokázáno (v Dalum I, et al.
1996, J. Immunol. 157:
4796-4804), že potenciálně autoreaktivní B-lymfocyty rozpoznávající vlastní proteiny jsou fyziologicky přítomny u normálních jedinců. Nicméně, proto, aby byly tyto B-lymfocyty indukovány pro skutečnou tvorbu protilátek reaktivních s relevantními vlastními proteiny, je nutná asistence Tpomocných lymfocytů produkujících cytokiny (Th~lymfocytů). Normálně není tato asistence poskytnuta, protože T-lymfocyty obecně nerozpoznávají T-lymfocytární epitopy odvozené od vlastních proteinů, jsou-li prezentovány buňkami prezentujícími antigen (APC). Nicméně, dodáním cizorodosti vlastnímu proteinu (tj. vložením imunologicky významné modifikace) je možno dosáhnout aktivace T-lymfocytů rozpoznávajících cizorodý element na APC (jako jsou, prvotně, mononukleární buňky). Polyklonální B-lymfocyty (které jsou také APC) schopné rozpoznávání vlastních epitopů na modifikovaných vlastních proteinech také internalizuji antigen a následně prezentují jeho cizorodý T-lymfocytární epitop a aktivované T-lymfocyty následně dodávají cytokiny těmto polyklonálním B-lymfocytům reaktivním s vlastními proteiny. Protože jsou protilátky produkované těmito polyklonálními Blymfocyty reaktivní s různými epitopy na modifikovaném polypeptidu, včetně těch, které jsou také přítomny v přirozeném polypeptidu, indukuje se tvorba protilátek zkříženě reaktivních s nemodifikovaným vlastním proteinem. Nakonec mohou být aktivovány T-lymfocyty, pokud populace polyklonálních B-lymfocytů rozpoznává zcela cizorodý antigenem ačkoliv pouze insertovaný epitop je cizorodý pro hostitele. Tímto způsobem jsou indukovány protilátky zkříženě reaktivní s nemodifikovanými vlastními antigeny.
• · · · •·· · « ·
V oboru je známo několik způsobů pro modifikaci vlastního peptidového antigenu pro překonání autotolerance. Podle předkládaného vynálezu modifikace mohou zahrnovat:
- vložení alespoň jednoho cizorodého T-lymfocytárního antigenu, a/nebo
- vložení alespoň jedné první skupiny, která zaměřuje modifikovanou molekulu na buňky prezentující antigen (APC), a/nebo
- vložení alespoň jedné druhé skupiny, která stimuluje imunitní systém, a/nebo
- vložení alespoň jedné třetí skupiny, která optimalizuje prezentaci modifikovaného OPGL polypeptidu imunitnímu systému.
Nicméně, všechny tyto modifikace by měly být prováděny za zachování významné frakce původních B-lymfocytárních epitopů v OPGL, protože takto je zesíleno rozpoznávání přirozených molekul B-lymfocyty.
V jednom výhodném provedení jsou kovalentně nebo nekovalentně vloženy vedlejší skupiny (ve formě cizorodých T~ lymfocytárních epitopů nebo výše uvedených prvních, druhých a třetích skupin). To znamená, že řetězce aminokyselinových zbytků z OPGL jsou derivatizovány bez alterace primární aminokyselinové sekvence,nebo alespoň bez změn v peptidových vazbách mezi jednotlivými aminokyselinami v řetězci.
Alternativní, a výhodné, provedení využívá aminokyselinové substituce a/nebo delece a/nebo inserce a/nebo adice (které mohou být provedeny rekombinantními technikami nebo peptidovou syntézou; modifikace, které postihují delší řetězce aminokyselin, mohou způsobovat vznik fúzních polypeptidů).
• 44
Jednou speciální verzí tohoto provedení je technika popsaná ve WO 95/05849, která popisuje metodu pro inhibici vlastních proteinů imunizací analogy vlastních proteinů, kde určitý počet aminokyselinových sekvencí byl substituován odpovídajícím počtem aminokyselinových sekvencí, které každá obsahovaly cizorodý imunodominantní T-iymfocytárni epitop, za současného zachování celkové terciární struktury vlastního proteinu v analogu. Pro účely předkládaného vynálezu je nicméně dostatečné, pokud modifikace (kterou je inserce, adice, delece nebo substituce) vede ke vzniku cizorodého Tlymfocytárního epitopu a zároveň zachovává významný počet Blymfocytárních epitopů v OPGL. Nicméně, pro dosažení maximální účinnosti indukované imunitní reakce je výhodné, aby byla v modifikované molekule zachována celková terciární struktura OPGL.
Následující vzorec popisuje OPGL konstrukty spadající do rozsahu předkládaného vynálezu:
(MODl) S1 (OPGLel) nl (MOD2) s2 (OPGLe2) n2 . . . (MODx) sx (OPGLex) nx (I) kde OPGLei-OPGLex jsou x B-lymfocytárni epitopy obsahující subsekvence OPGL, které jsou nezávisle identické nebo neidentické a které mohou, ale nemusejí, obsahovat cizorodé vedlejší skupiny, x je celé číslo Ξ>3, nl-nx jsou x celých čísel ú 0 (alespoň 1 je žil) , MODi-MODx je x modifikaci vložených mezi konzervované B-lymfocytárni epitopy a si~sx je x celých čísel, z nichž jedno je > 1, pokud nejsou v OPGLe sekvencích vloženy žádné vedlejší skupiny). Proto za podmínky zachování imunogenicity konstruktu umožňuje předkládaný vynález všechny permutace původní OPGL sekvence a všechny druhy její modifikace. Vynález tedy zahrnuje modifikované OPGL získané vynecháním částí OPGL sekvence, které, například, vykazují nežádoucí účinky in vivo, nebo vynecháním částí, které jsou za normálních okolností intracelulárně a proto mohou způsobovat nežádoucí imunologické reakce.
Zachování významné frakce B-lymfocytárních epitopů nebo I celkové terciární struktury proteinu, který je modifikován způsobem zde popsaným, může být dosaženo několika způsoby. Je možno připravit polyklonální antisérum namířené proti OPGL (například antisérum připravené u králíků) a potom použít toto antisérum jako testovací činidlo (například v kompetitivní ELISA) proti produkovaným modifikovaným proteinů. Modifikované verze (analogy), které reagují ve stejném rozsahu s antisérem jako OPGL, mohou být považovány za verze se stejnou celkovou terciární strukturou jako POGL, zatímco analogy vykazující omezenou (ale stále ještě významnou a specifickou) reaktivitu s takovým antisérem mohou být považovány za verze zachovávající si významnou frakci původních B-lymfocytárních epitopů.
Alternativně mohou být připraveny monoklonální protilátky reaktivní s různými epitopy na OPGL a tyto mohou být použity jako testovací panel. Tento přístup je výhodný v tom, že umožňuje (1) mapování epitopů OPGL, a (2) mapování epitopů, které jsou zachovány v připraveném analogu.
Třetím přístupem může být určení 3-rozměrové struktury OPGL nebo jeho biologicky aktivní zkrácené varianty (viz výše) a srovnání této určené troj rozměrové struktury připravených analogů. Troj rozměrová struktura může být určena pomocí rentgenové difrakce a NMR-spektroskopie. Další informace týkající se trojrozměrné struktury mohou být získány z analýz cirkulárního dichroismu, které jsou výhodné v tom, že vyžadují pouze polypeptid v čisté formě (zatímco rentgenová difrakce • ·· ······ ·· ·
9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 · · ··· · · · • 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 •99 9 9 9 9 · · · 99 99· vyžaduje získáni krystalizovaného polypeptidů a NMR vyžaduje připraveni izotopových variant polypeptidů) pro získání použitelných informací o terciární struktuře dané molekuly. Nicméně, pro získání jednoznačných dat je nakonec nutné provedení rentgenové difrakce a/nebo NMR, protože cirkulární dichroismus poskytuje pouze nepřímé důkazy o správné 3rozměrné struktuře prostřednictvím informací o prvcích sekundární struktury.
V jednom provedení vynález využívá mnohotných prezentací Blymfocytárních epitopů OPGL (tj . sloučenin vzorce I, kde je alespoň jeden B-lymfocytární epitop přítomen ve dvou pozicích). Tohoto může být dosaženo různými způsoby, například jednoduše přípravou fúsních polypeptidů obsahujících strukturu (OPGL)m, kde m je celé číslo > 2, a potom vložením modifikací popsaných výše do alespoň jedné OPGL sekvence. Je výhodné, aby vložené modifikace obsahovaly alespoň jednu duplikaci Blymfocytárního epitopu a/nebo vložení haptenu.
Jak bylo uvedeno výše, vložení cizorodého T-lymfocytárního epitopu může být provedeno vložením alespoň jedné aminokyselinové inserce, adice, delece nebo substituce, samozřejmě, že normální situací bude vložení více než jedné změny aminokyselinové sekvence (například inserce nebo substituce kompletního T-lymfocytárního epitopu), ale významným cílem je to, aby analog OPGL, po zpracování buňkou prezentující antigen (APC), vedl ke prezentaci takového imunodominantního T-lymfocytárního epitopu v kontextu molekuly MHC třídy II na povrchu APC. Proto, pokud aminokyselinová sekvence OPGL obsahuje ve vhodných pozicích počet aminokyselinových zbytků, které se také nacházejí v cizorodém Th epitopu, tak může být vložení cizorodého Th epitopu provedeno dodáním zbývajících aminokyselin cizorodého epitopu • 9 9 9 9 · · · ···
9 9 9 9 9 9 99
9999 9 9999 9· • · · · · · 9 9 99
9 9 9 9 9 99
9 99 99 99 9 999 pomocí aminokyselinových insercí, adicí, delecí a substitucí.
Jinými slovy, není nutné vkládat celý Th epitop insercí nebo delecí pro splnění účelu předkládaného vynálezu.
Je výhodné, aby počet aminokyselinových insercí, delecí, substitucí a adicí byl alespoň 2, například 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 a 25 insercí, substitucí, adicí nebo delecí. Dále je výhodné, aby počet aminokyselinových 25 insercí, substitucí, adicí nebo delecí nepřesáhl 150, například maximálně 100, maximálně 90, maximálně 80 a maximálně 70. Je zejména výhodné, aby počet 25 insercí, substitucí, adicí nebo delecí nepřesáhl 60, zejména 50 nebo 40. nejvýhodnější je, aby tento počet nepřesáhl 30. S ohledem na aminokyselinové adice je třeba uvést, že pokud je výsledný konstrukt ve formě fúsního polypeptidu, tak je jejich počet často významně vyšší než 150.
Výhodná provedení vynálezu zahrnují modifikace vložením alespoň jednoho imunodominantního T-lymfocytárního epitopu. je třeba si uvědomit, že otázka imunodominance T-lymfocytárního epitopu závisí na daném živočišném druhu. Termín imunodominantní, jak je zde použit, označuje epitopy, které u vakcinovaného jedince/populace vedou ve vzniku významné imunitní reakce, ale je dobře známo, že T-lymfocytární epitop, který je imunodominantní u jednoho jedince/populace, nemusí nutně být imunodominantní u jiného jedince stejného druhu, ani když se může vázat na MHC-II molekuly u tohoto druhého jedince. Proto je pro účely předkládaného vynálezu imunodominantním T-lymfocytárním epitopem T-lymfocytární epitop, který může být účinný ve způsobení pomocného působení T-lymfocytů při prezentaci antigenu. typicky mají imunodominantní T-lymfocytární epitopy tu vlastnost, že jsou vždy prezentovány ve vazbě na MHC molekuly třídy li, bez • · · · · · • · · · ohledu na polypeptid, ve kterém se vyskytuji.
Jinou významnou skutečností je MHC restrikce Tlymfocytárních epitopů. Obecně, přirozené T-lymfocytární epitopy jsou MHC restrihované, t.j. některé polypeptidy tvořící T-lymfocytární epitopy se budou účinně vázat pouze na podskupinu MHC molekul třídy II. Toto má nakonec ten efekt, že použití jednoho specifického T-lymfocytárního epitopu povede k zisku složky vakciny, která je účinná pouze u části populace a podle velikosti této frakce může být nutné vložit více Tlymfocytárních epitopů do stejné molekuly, nebo alternativně, připravit vícesložkovou vakcínu, ve které jsou složkami OPGL varianty, které se navzájem liší charakterem vložených Tlymfocytárních epitopů.
Pokud je MHC restrikce použitých T-lymfocytů zcela neznámá (například když má vakcinovaný živočich chabě charakterizované složení MHC), tak může být frakce populace pokrytá specifickým složením vakciny určena podle následujícího vzorce:
- kde pi je frekvence responderů na i-tý cizorodý T~ lymfocytární epitop přítomný ve vakcíně v populaci, a n je celkový počet cizorodých T-lymfocytárních epitopů ve vakcíně. tedy, vakcina obsahující 3 cizorodé T-lymfocytární epitopy mající frekvence odpovědi v populaci 0,8, 0,7 a 0,6 dosáhne odpovědi
0,2 x 0,3 x 0,4
0, 976
t.j. 97,6 % populace bude mít statisticky významnou MHC-II zprostředkovanou reakci na vakcínu.
Výše uvedený vzorec se nedá použít na situace, kdy je znám více nebo méně přesný charakter MHC restrikce použitých peptidu. Pokud se, například, některý peptid váže pouze na lidské MHC II molekuly kódované HLA-DR alelami DR1, DR3, DR5 a DR7, potom použití tohoto peptidu společně s jiným peptidem, který se váže na zbývající MHC-II molekuly kódované HLA-DR alelami, pokryje 100% dané populace. Podobně, pokud se druhý peptid váže pouze na DR3 a DR5, tak přidání tohoto peptidu vůbec nezvýší pokrytí. Pokud se výpočet odpovědi populace založí pouze na MHC restrikci T-lymfocytárních epitopů ve vakcíně, pak může být frakce populace pokrytá specifickou vakcínou stanovena pomocí následujícího vzorce:
kde (pj je součet frekvencí v populaci alelových haplotypů kódujících MHC molekuly, které se váží na jeden z Tlymfocytárních epitopů ve vakcíně a který náleží do j-té skupiny 3 známých HLA lokusů (DP, DR a DQ) ; v praxi se nejprve určí to, která molekula MHC bude rozpoznávat každý Tlymfocytárni epitop ve vakcíně a potom se tyto typizují (DP, DR a DQ) - potom se pro každý typ sečtou jednotlivé frakvence různých uvedených alelových haplotypů, čímž se dosáhne <ρι, φ2 a Φ3.
Může se stát, že hodnota pi ve vzorci II přesáhne příslušnou teoretickou hodotu 7ti:
Π ο-ύ)2 (IV) kde Vj je součet frekvencí frekvencí v populaci alelových haplotypů kódujících MHC molekuly, které se váží na i-tý Tlymfocytární epitop ve vakcíně a který náleží do j-té skupiny známých HLA lokusů (DP, DR a DQ). To znamená, že v 1-πι populaci je frekvence responderů fresidua_i = (ρι-πι) / (l-πι) . Proto může být vzorec III upraven na vzorec V:
kde termín 1-fresiduai-i je nula, pokud je negativní. Je třeba poznamenat, že vzorec V vyžaduje, aby byly všechny epitopy byly haplotypově mapovány proti identické sadě haplotypů.
Proto je při výběru T-lymfocytárních epitopů , které mají být vloženy do analogu OPGL, mít všechny informace o epitopu, které jsou dostupné: (1) frekvenci responderů v populaci pro každý epitop, (2) charakter MHC restrikce a (3) frekvenci relevantních haplotypů v populaci.
Existuje mnoho přirozených promiskuitních Tlymfocytárních epitopů, které jsou aktivní u velké části jedinců živočišného druhu a tyto jsou výhodně použity ve vakcíně, což snižuje potřebu velmi velkého počtu různých analogů OPGL v jedné vakcíně.
Promiskuitní epitop podle předkládaného vynálezu může být přirozený lidský T-lymfocytárni epitop, jako jsou epitopy z tetanického toxoidu (například P2 a P30 epitopy), difterického toxoidu, hemaglutininu chřipkového viru (HA) a CS antigenu P.falciparum.
Během let bylo identifikováno mnoho dalších promiskuitních T-lymfocytárnich epitopů. byly identifikovány hlavně peptidy schopné vazby na velkou frakci HLA.DR molekul kódovaných různými HLA-DR alelami a tyto všechny jsou možnými Tlymfocytárními epitopy pro vložení do analogů OPGL podle předkládaného vynálezu. Viz též epitopy popsané v následujících odkazech: WO 98/23653 (Frazer, IH, et al., University of Queensland); Southwood, S. et al., 1998, J. Immunol. 160: 3363-3373; Sinigaglia F. et al., 1988, Nátuře 336: 778-780; Chicz, R.M. et al., 1993, J. Exp. Med. 178: 2747; Hammer, J. et al., 1993, Cell, 74: 197-203; a Falk, K. et al., 1994, Immunogenetics 39: 230-242. Poslední odkaz se týká také HLA.DQ a -DP ligandů. Všechny epitopy uvedené v těchto 5 odkazech jsou relevantní jako kandidáti naq přirozené epitopy použité v předkládaném vynálezu, stejně jako epitopy sdílící společné motivy s těmito epitopy.
Alternativně může být epitopem jakýkoliv artificiální Tlymfocytární epitop, který je schopen vazby na velkou frakci MHC molekul třídy II. Z tohoto hlediska jsou pan-DR epitopové peptidy (PADRE) popsané ve WO 95/07707 a v Alexander, J. et al., 1994, Immunity 1: 751-761 zajímavými kandidáty na epitopy použité v předkládaném vynálezu. Je třeba uvést, že nějúčinější PADRE peptidy popsané v uvedených odkazech obsahují D-aminokyseliny na C- a N-koncích pro zlepšení stability po podání. Nicméně, předkládaný vynález se primárně týká inkorporace relevantních epitopů jako součásti modifikovaného OPGL, který by měl být potom degradován enzymaticky v lysozomovém kompartmentu APC, aby byla umožněna následná prezentace v kontextu MHC-II molekuly a proto se nepředpokládá použití D-aminokysen v epitopech použitých v předkládaném vynálezu.
Jedním zejména výhodným PADRE peptidem je peptid obsahující aminokyselinovou sekvenci AKFVAAWTLKAAA nebo její imunologicky účinnou subsekvenci. Tento a jiné epitopy se stejným chyběním MHC restrikce, jsou výhodnými T~lymfocytárními epitopy , které jsou presentovány v analogách OPGL podle předkládaného • ·· ·· ··♦· ·· · ••9 · · · * · · · ···· · ···· · · · • · ··· 9 9 9 9 9 9 *········ 26 ♦·· ·· ·· ··· ·· ··· vynálezu. Takové super-promiskuitní epitopy umožňují nej jednodušší provedení vynálezu, ve kterém je imunitnímu systému vakcinovaného zvířete prezentován pouze jeden modifikovaný OPGL.
Jak bylo uvedeno výše, modifikace OPGL také zahrnuje vložení první skupiny, která směruje modifikovaný OPGL k APC nebo k B-lymfocytům. První skupinou může být například specifický vazebný partner pro specifický povrchový antigen Blymfocytu nebo pro specifický povrchový antigen APC. V oboru je známo mnoho takových specifických povrchových antigenů. například může být skupinou karbohydrát, pro který existuje receptor na -lymfocytech nebo na APC (například mannan nebo mannosa). Alternativně může být druhou skupinou hapten. Jako první skupina může být také použit fragment protilátky, který rozpoznává povrchovou molekulu na APC nebo lymfocytech (povrchovou molekulou může být například FCy receptor makrofágů nebo monocytů, jako je FCyRI nebo, alternativně, jakýkoli jiný specifický povrchový markér, jako je CD40 nebo CTLA-4). Je třeba uvést, že tyto zaměřovači skupiny mohou být také použity jako součást adjuvans, viz též dále.
Jako alternativa nebo doplněk k zacílení modifikovaného OPGL polypeptidu na některé typy buněk pro dosažení silnější imunitní reakce je možno zvýšit úroveň reaktivity imunitního systému obsažením výše uvedené druhé skupiny, která stimuluje imunitní systém. Typickými příklady takových druhých skupin jsou cytokiny a proteiny teplotního šoku nebo molekulové chaperony, stejně jako jejich účinné části.
Vhodnými cytokiny pro použití v předkládaném vynálezu jsou ty, které normálně působí jako adjuvans ve vakcinačním prostředku, t.j. například interferon y ((IFN-γ), interleukin 1 ((IL-1), interleukin 2 (IL-2), interleukin 4 (IL-4), interleukin 6 (IL-6), interleukin 2 ((IL-12), interleukin 13 ((IL—13), interleukin 15 (IL-15) a faktor stimulující kolonie granulocytů-makrofágů (GM-CSF); alternativně může být jako druhá skupina použita funkční část cytokinové molekuly. Pro použití takových cytokinů jako adjuvantních substancí viz dále.
Vhodnými proteiny teplotního šoku nebo molekulovými chaperony pro použití jako druhá skupina v předkládaném vynálezu jsou HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 ((též známý jako gp96, viz Wearsch, PA, et al., 1998, Biochemistry 37: 5709-19) a CRT (calretikulin). Alternativně může být druhou skupinou toxin, jako je listeriolycin (LLO), lipid A a termolabilní enterotoxin. Zajímavými možnostmi jsou také různé mykobakteriální deriváty, jako je MDP (muramyldipeptid), CFA (kompletní Freundovo adjuvans) a trehalosové diestery TDM a TDE.
Při provedení předkládaného vynálezu je také významná možnost vložení třetí skupiny, která zlepšuje prezentaci modifikovaného OPGL imunitnímu systému. V oboru existuje několik příkladů tohoto principu, například je známo, že palmitoylová lipidační kotva b proteinu OspA Borrelia burgdorferi může být použita tak, aby poskytovala samoadjuvantní polypeptidy ((viz například WO 96/40718) - zdá se, že lipidované proteiny vytvářejí struktury podobné micelám s jádrem skládajícím se z lipidační kotvy polypeptidů a z něj vyčnívajícími ostatními částmi molekuly, což vede ke znásobení prezentace antigenních determinant. Proto jsou použití těchto a příbuzných přístupů využívajících jiných lipidačních kotvících skupin (například myristylové skupiny, farnesylové skupiny, geranyl-geranylové skupiny, GPI-skupiny a N• ·· ·· ···· ·· ♦ · · · * · · « • ··· · · ··· · · ♦ · · · · · · · « ··· ·· ·· ··· ·» ·»· acyldiglyceridové skupiny) výhodnými provedeními vynálezu, zejména za dodržení podmínky, že taková lipidační kotva v rekombinantně produkovaném proteinu je jednoduchá a vyžaduje pouze použití, například, přirozených signálních sekvencí jako fúsních partnerů pro modifikovaný OPGL polypeptid. Jinou možností je použití C3d fragmentu faktoru C3 komplementu nebo 03 fragmentu samotného (viz Dempsey et al., 1996, Science 271: 480-350 a Lou and Kohler 1998, Nátuře Biotechnology 16: 458-462).
Alternativní provedení vynálezu, které také vede k výhodné prezentaci mnoha (například alespoň 2) kopií významných epitopových regionů OPGL imunitnímu systému, je kovalentní navázání OPGL, jeho subsekvence nebo varianty, na určité molekuly. Například mohou být použity polymery, například uhlovodany jako je dextran, viz například Lees A. et al., 1994, Vaccine 12: 1160-1166; Lees A. et al., 1990, J. Immunol. 145: 3594-3600, ale mannosa nebo mannan jsou také použitelnými alternativami. Integrální membránové proteiny u, například, E. coli a jiných bakterií, jsou také vhodnými partnery pro konjugaci. Tradiční nosiče, jako je přílipkový hemokyanin (KLH), tetanický toxoid, difterický toxoid a hovězí sérový albumin (BSA), jsou také vhodnými a použitelnými partnery pro konjugaci.
Některé oblasti přirozeného OPGL se zdají být vhodnější pro provedení modifikací. Vzhledem k strukturální podobnosti OPGL s TNF-α a jinými členy rodiny faktoru nekrosy nádorů se předpokládá, že vložení T-lymfocytárních epitopů nebo jiných modifikací v oblastech definovaných pozicemi 170-192, 198-218, 221-246, 256-261 nebo 285-316 (aminokyselinové číslování podle SEQ ID NO: 4, 6 a 12) bude s největší pravděpodobností vést k požadovanému výsledku. Tyto pozice se týkají myšího OPGL 29 • ·· · 4 · · · ··· • 44 · 4 4 4 44 • ··· · 4 444 «4 • · 4 4 4 · ···4 • · 4 4 · 444 ·· · 44 44 444 444 příslušné pozice v lidské molekule jsou 171-193, 199-219, 222247, 257-262 a 286-317 (aminokyselinové číslování podle SEQ ID NO: 2) .
Důvody pro vybrání těchto oblastí jsou (a) zachování známých a předpokládaných B-lymfocytárních epitopů, (b) zachování terciární struktury atd. V jakémkoliv případě je, . jak bylo uvedeno výše, snadné vyšetřovat sadu modifikovaných OPGL molekul, které byly upraveny vložením T-lymfocytárního epitopu do různých míst.
Protože nejvýhodnější provedení předkládaného vynálezu zahrnují inhibicí lidského OPGL, je proto výhodné, aby OPGL polypeptid uváděný výše byl lidský OPGL polypeptid. V tomto provedení je zejména výhodné, aby byl lidský OPGL polypeptid modifikován substitucí alespoň jedné aminokyselinové sekvence v SEQ ID NO: 2 (nebo v polypeptidů, kde byl Cys-221 v SEQ ID NO: 2 substituován serinem) alespoň jednou aminokyselinovou sekvencí stejné nebo jiné délky a obsahující cizorodý Th epitop. Substituované aminokyselinové zbytky jsou vybrány ze zbytků 257-262, 289-303 a 222-243 v SEQ ID NO: 2. Důvody pro takové konstrukty jsou podrobně popsány v příkladech.
Příprava OPGL a modifikovaných OPGL polypeptidů
Při provádění prezentace OPGL polypeptidů nebo modifikovaného OPGL polypeptidů imunitnímu systému živočicha prostřednictvím jeho podání živočichovi je příprava polypeptidů provedena podle principů obecně známých v oboru.
Příprava vakcín, které obsahují peptidové sekvence jako aktivní složky, je dobře známá v oboru, jak je doloženo například v US patentech 4608251; 4601903; 4599231; 4599230;
4596792 a 4578770, které jsou zde všechny uvedeny jako odkazy. Obvykle jsou takové vakcíny připraveny jako injekční prostředky, buď jako kapalné roztoky nebo suspenze; nebo jako pevné formy vhodné pro rozpuštění nebo suspendování v kapalině před injekčním podáním. Přípravek může být také emulsifikovaný. Aktivní imunogenní složka je často smísena s přísadami, které jsou farmaceuticky přijatelné a kompatibilní s aktivní složkou. Vhodnými přísadami jsou, například, voda, salinický roztok, dextrosa, glycerol, ethanol a podobně, a jejich kombinace. Dále - pokud je to vhodné - může vakcína obsahovat také malá množství pomocných substancí, jako jsou smáčivá nebo zvlhčovači činidla, pH pufrovací činidla nebo adjuvans, která zvyšují účinnost vakcíny; viz podrobný popis adjuvans uvedený dále.
Vakcíny jsou obvykle podány parenterálně, injekcí, například subkutánní, intrakutánní, intradermální, subdermální nebo intramuskulární. Další prostředky, které jsou vhodné pro jiné způsoby podání, jsou čípky a - v některých případech orální, bukální, sublinguální, inraperitoneální, intavaginální, analální, epidurální, spinální a intrakraniální prostředky. Pro čípky mohou být tradičními pojivý a nosiči například polyalkanglykoly nebo triglyceridy; takové čípky mohou být připraveny ze směsí obsahujících aktivní složku v rozmezí od 0,5% do 10%, lépe 1-2%. Orální prostředky mohou obsahovat běžné přísady, jako je například manitol, laktosa, škrob, stearan hořečnatý, sacharin sodný, celulosa, uhličitan hořečnatý a podobně, vše farmaceutické čistoty, tyto prostředky mohou mít také formu roztoků, suspenzí, tablet, pilulek, kapslí, prostředků se zpomaleným uvolňováním nebo prášků a obsahují 10-95% aktivní složky, výhodně 25-70%. Pro orální prostředky je zajímavou přísadou cholera-toxin (a také je vhodným partnerem pro konjugaci).
Polypeptidy mohou být připraveny ve vakcíně v neutrální formě nebo ve formě soli. Farmaceuticky přijatelné soli zahrnují adiční soli s kyselinami (tvořené s volnými aminoskupinami peptidu) a mezi použitelné kyseliny patří anorganické kyseliny, jako je, například, kyselina chlorovodíková nebo fosforečná, nebo organické kyseliny, jako je kyselina octová, vonná, mandlová a podobně. Soli tvořené s volnými karboxylovými skupinami mohou být také připraveny z anorganických baží, jako jsou například hydroxid sodný, draselný, amonný, vápenatý nebo železitý, a z organických baží, jako je například isopropylamin, trimethylamin, 2ethylaminoethanol, histidin, prokain a podobně.
vakcíny jsou podány způsobem slučitelným s dávkovou formou a v množství, které bude terapeuticky účinné a imunogenní. Podaná kvantita závisí na léčeném subjektu, včetně, například, kapacity imunitního systému jedince pro udržování imunitní reakce a požadovaného stupně ochrany. Vhodné dávky jsou v řádu několika stovek mikrogramů aktivního činidla na vakcinaci, s výhodným rozmezím od přibližně 0,1 pg do 2000 pg (je možno podat I dávky 1-10 mg), jako je například rozsah od 0,5 μg do přibližně 1000 μg, lépe od 1 μg do přibližně 500 μg a nejlépe od 10 μg do přibližně 100 μg. Vhodné režimy pro počáteční dávku a následné dosycovací dávky jsou také variabilní, ale obvykle je podána počáteční dávka a po ní další očkování nebo jiné formy podání.
Způsob aplikace může být různý. Lze použít jakékoliv běžné metody pro podání vakcín. Mezi tyto způsoby patří orální podání na pevné fyziologicky přijatelné bázi nebo ve fyziologicky přijatelné disperzi, parenterální podání, injekcí nebo jiným způsobem. Dávka vakcín závisí na způsobu podání a
• 9 4»·· • · • · ·· liší se podle věku vakcinovaného jedince a podle přípravy antigenu.
Některé polypeptidy vakciny jsou dostatečně imunogenní ve vakcíně, ale některé jiné imunitní reakce budou zesíleny, pokud bude vakcína dále obsahovat adjuvantní substanci.
Jsou známé různé metody pro dosaženi adjuvantního efektu pro vakciny. Obecné principy a způsoby jsou popsány v The theory and practical Application of Adjuvants, 1995, DuncanE.S., Stewart-Tull (ed.), John Wiley and Sons, Ltd., ISBN 0471-95170-6, a také ve Vaccines: New generation Immunological Adjuvants, 1995, Gregoriadis, G. et al. (ed.) , Plenům Press,
New York, ISBN 0-306-45283-9, kde obě tyto citace jsou zde uvedeny jako odkazy.
Zejména výhodné je použiti adjuvans, které usnadní překonání autotolerance k autoantigenům; ve skutečnosti je toto zásadní v případech, kdy je nemodifikovaný OPGL použit jako aktivní složka v autovakcíně. Příklady vhodných adjuvans jsou vybrány ze skupiny zahrnující adjuvans napomáhající prezentaci antigenu imunitnímu systému; imunomodulační adjuvans jako jsou toxiny, cytokiny a mykobakteriální deriváty; olejové prostředky; polymery; adjuvans vytvářející micely; saponiny; imunostimulační komplexní matrice (ISCOM matrice); částice; DDA; hlinitá adjuvans; DNA adjuvans; γinulin; a enkapsulační adjuvans. Obecně je třeba uvést, že výše uvedený popis, který se týká sloučenin a činidel použitelných jako první, druhá a třetí skupina v analogách, se také týká jejich použití jako adjuvans ve vakcíně podle předkládaného vynálezu.
Použití adjuvans zahrnuje použití činidel jako je hydroxid
• ·· ·· ···· • fc fc
·· · fc • fc
• ···
• · · fc · • ·
• · · «1 fc
··· ·· ·· ··· • fc ···
hlinitý nebo fosforečnan hlinitý (kamenec), které se běžně používají jako 0,05 až 0,1% roztok v pufrovaném salinickém roztoku, smíšených se syntetickými polymery sacharidů (například Carbopol®) použitými jako 0,25% roztok, agregace proteinu ve vakcíně teplem za použití teplot od 70 °C do 101 °C po dobu 30 sekund až 2 minut, a také agregace pomocí zesíťoacích činidel. Agregace reaktivací protilátkami k albuminu zpracovanými pepsinem (Fab fragmenty), smísením s bakteriálními buňkami jako je C. parvum nebo s endotoxiny nebo lipopolysacharidovými složkami gram-negativních bakterií, emulgováním ve fyziologicky přijatelném olejovém vejhikulu, jako je mannidmonooleat Aracel A) nebo emulgováním s 20% roztokem perfluorkarbonu (Fluosol-DA) použitému jako blokovací substituční činidlo, může být také použito. Výhodné je také smísení s oleji, jako je skvalen a IFA.
Podle předkládaného vynálezu je DDA (dimethyldioktadecylammoniumbromid) zajímavým kandidátem na adjuvans, stejně jako DNA a γ-inulin, ale také jako Freundovo kompletní adjuvans a nekompletní adjuvans a quillaja saponiny, jako je QuilA a QS21 a RIBI. Dalšími možnostmi jsou monofosforyllipid A (MPL), výše uvedené C3d a C3 a mramyldipeptid (MDP).
O liposomálních prostředcích je také známo, že mají adjuvantní účinek, a proto jsou liposomální adjuvans výhodnými adjuvans podle předkládaného vynálezu.
Také adjuvans typu imunostimulační komplexní matrice (ISCOM® matrice) jsou výhodnou volbou pro předkládaný vynález, zejména proto, že bylo prokázáno, že adjuvans tohoto typu jsou schopná zvýšit expresi MHC molekul II typu na APC. ISCOM® matrice se skládá z (volitelně frakcionovaných) saponinů • ·· · · ···· ·· • · · ··· ··· • ··· · ···· · · (triterpenoidů) z Quillaja saponaria, cholesterolu a fosfolipidu. Při smísení s imunogenním proteinem vznikají částice známé jako ISCOM částice, ve kterých saponin tvoří 6070% hmotnostních, cholesterol a fosfolipid 10-15% hmotnostních a protein 10-15% hmotnostních. Podrobnosti týkající se složení a použití imunostimulačních komplexů mohou být nalezeny například ve výše uvedených učebnicích týkajících se adjuvans, ale také v Morein B., et al., 1995, Clin. Immunother. 3: 461475, stejně jako v Barr IG a Mitchell GF, 1996, Immunol. and Cell Biology 74: 8-25 (obě práce jsou zde uvedeny jako odkazy) uvádjí užitečné instrukce pro přípravu kompletních imunostimulačních komplexů.
Jinou značně zajímavou (a proto výhodnou) možností pro dosažení adjuvantního efektu je použití techniky popsané v Gosselin et al., 1992 (která je zde uvedena jako odkaz). Stručně, prezentace relevantního antigenu, jako je antigen podle předkládaného vynálezu, může být zesílena konjugováním antigenu na protilátky (nebo její vazebný fragment pro antigen) proti Fcy receptorům na monocytech/makrofágách. Bylo prokázáno, že zejména konjugáty mezi antigenem a anti-FcyRI zesilují imunogenicitu pro účely vakcinace.
Další možností je použití zaměřovačích a imunomodulačních substancí (t.j. cytokinů) uvedených výše jako kandidáty na první a druhé skupiny v modifikovaných verzích OPGL. V této souvislosti je možno použít také syntetických induktorů cytokinů, jako je polyI:C.
Vhodné mykobakteriální deriváty jsou vybrány ze skupiny zahrnující muramyldipeptid, kompletní Freundovo adjuvans, RIBI a diesterů trehalosy, jako je TDM a TDE.
• · · · · ···· · 9 9 • · · · · 9 999 · 9
9 9 99 9 999 ··· ·· ·9 999 99 999
Vhodná činidla zaměřující antigen na imunitní systém jsou vybrána ze skupiny zahrnující CD40 ligand a CD40 protilátky nebo jejich specifické vazebné fragmenty (viz výše), mannosu, Fab fragment a CTLA-4.
Vhodná polymerová adjuvans jsou vybrána ze skupiny zahrnující uhlovodany jako je dextran, PEG, škrob, mannan a mannosu; plastových polymerů jako takových; a latexu, jako jsou latexové korálky.
Jiným zajímavým způsobem pro modulování imunitní odpovědi je použití OPGL imunogenu (volitelně společně s adjuvans a farmaceuticky přijatelnými nosiči a vehikuly) ve virtuální lymfatické uzlině (VLN) (lékařský prostředek vyvinutý v ImunoTherapy lne., 360 Lexington Avenue, New York, NY 100176501). VLN (tenká trubička) napodobuje strukturu a funkci lymfatické uzliny. Inserce VLN pod kůži vytváří místo sterilního zánětu se zvýšením koncentrace cytokinů a chemokinů. T- a B-lymfocyty, stejně jako APC, rychle reagují na výstražné signály, migruji do místa zánětu a akumulují se uvnitř porosní matrice VLN. Bylo prokázáno, že nutná dávka antigenu vyžadovaná pro udržení imunitní reakce na antigen je při použití VLN snížena a že imunologická ochrana dosažená vakcinací za použití VLN je lepší než konvenční imunizace využívající Ribi jako adjuvans. Technologie je stručně popsána v Gelber C. et al., 1998, Elicitation of Robust Cellular and Humoral Immune Responses to Smáli Amounts of Immunogens Using a Novel medical Device Designated the Virtual Lymph Node, v From the Laboratory to the Clinic, Book of Abstracts, October 12th - 15th 1998, Seascape Resort, Aptos, California.
Předpokládá se, že vakcina by měla být podána 1-6-krát za rok, jako například 1, 2, 3, 4, 5 nebo 6-krát za rok jedinci,
Φ ·» · · φφφφ ·· • ΦΦ Φ···· • ··φ φ φφφφφ φ • φ φφφ · · · ·· ··· φφ φ ·· • ΦΦ · · φφ φφφ·· který potřebuje takovou léčbu. Dříve bylo prokázáno, že paměťová imunita indukovaná použitím výhodných autovakcín podle předkládaného vynálezu není trvalá a proto imunitní systém potřebuje být periodicky vystavován působení OPGL nebo modifikovaných OPGL polypeptidů.
V důsledku genetických variací mohou různí jedinci reagovat různě silnou imunitní odpovědí na stejný polypeptid. Proto může vakcina podle předkládaného vynálezu obsahovat několik různých polypeptidů pro zesílení imunitní reakce, viz též diskusi uvedenou výše týkající se výběru vložených cizorodých T-lymfocytárních epitopů. Vakcina může obsahovat dva nebo více polypeptidů, kde všechny polypeptidy jsou takové, jak byly definovány výše.
Vakcina může v důsledku toho obsahovat 3-20 různých modifikovaných nebo nemodifikovaných polypeptidů, jako například 3-10 různých polypeptidů.
Vakcinace nukleovými kyselinami
Alternativou ke klasickému podání vakciny na bázi peptidu je technika vakcinace nukleovou kyselinou (též známá jako imunizace nukleovou kyselinou”, genetická imunizace a genová imunizace), která nabízí mnoho atraktivních vlastností.
Za prvé, oproti klasické vakcinací nevyžaduje vakcinace nukleovou kyselinou zdroj velkoobjemové produkce imunogenního činidla (například ve formě průmyslové fermentace mikroorganismů produkujících modifikovaný OPGL). Kromě toho, není zde potřeba přečištění prostředku a znovuskládání imunogenu. Konečně, protože vakcinace nukleovou kyselinou spočívá v biochemickém aparátu vakcinovaného jedince, který • · · ··· ··· • ··· ····· · · • · ··· · ··· ·
0*7 · · · · · ···
J ι ··· ·· ·· ··· ·· · vyrábí expresní produkt vložené nukleové kyseliny, dochází k optimálnímu posttranslačnímu zpracování produktu exprese; toto je zejména významné v případě autovakcinace, protože jak bylo uvedeno výše - významná frakce původních OPGL Blymfocytárních epitopů by měla být v modifikované molekule zachována a protože B-lymfocytární epitopy mohou být tvořeny částmi jakékoliv biomolekuly (například uhlovodanu, lipidu, proteinu atd.). Proto může být přirozená glykosylace a lipidace imunogenu velmi významná pro celkovou imunogenicitu a toto je nejlépe zajištěno produkcí imunogenu v hostiteli.
Proto výhodné provedení předkládaného vynálezu zahrnuje prezentaci modifikovaného OPGL imunitnímu systému prostřednictvím vložení nukleové kyseliny kódující modifikovaný OPGL do buněk živočicha a takto dosažením exprese in vivo v buňkách, do kterých byla nukleová kyselina vložena.
V tomto provedení je vloženou nukleovou kyselinou výhodně
DNA, která může být ve formě holé DNA, DNA připravené s nabitými nebo nenabitými lipidy, DNA připravené v liposomech, DNA obsažené ve virovém vektoru, DNA připravené s proteinem nebo polypeptidem usnadňujícím transfekci, DNA připravené se zaměřovačům proteinem nebo polypeptidem, DNA připravené s vápníkovým srážecím činidlem, DNA navázané na molekulu inertního nosiče, DNA enkapsulované v chitinu nebo chitosanu a DNA připravené s adjuvans. V této souvislosti je třeba uvést, že prakticky všechny úvahy týkající se použití adjuvans v tradiční přípravě vakcín se dají použít pro přípravu DNA vakcín. Proto se všechny popisy týkající se použití adjuvans v kontextu vakcín na bázi polypeptidu týkají také jejich použití v technologii vakcinace nukleovými kyselinami.
Způsoby podáni a schémata podání vakcín na bázi polypeptidů, které byly podrobně popsány výše, jsou také použitelné pro vakcíny na bázi nukleových kyselin podle předkládaného vynálezu a všechny úvahy týkající se způsobů podání a schémat podání pro polypeptidy se týkají také nukleových kyselin. Vakcíny na bázi nukleových kyselin mohou být podány také intravenosně nebo intraarteriálně. Dále, v oboru je dobře známo, že nukleokyselinové vakcíny mohou být podány za použití takzvaného genového děla a proto je také tento a ekvivalentní způsoby podání považován za součást předkládaného vynálezu. Nakonec, použití VLN v podání nukleových kyselin vedlo dle literatury k dobrým výsledkům a proto je tento způsob podání zejména výhodný.
Dále, nukleové kyseliny použité jako imunizační činidlo mohou obsahovat regiony kódující první, druhou a/nebo třetí skupinu, například ve formě imunomodulačních substancí popsaných výše, jako jsou cytokiny uvedené jako použitelná adjuvans. Výhodná verze tohoto provedení zahrnuje použití kódujícího regionu pro analog a kódujícího regionu pro imunomodulátor v různých čtecích rámcích nebo alespoň pod kontrolou různých promotorů. Proto je vyloučeno to, aby byl analog nebo epitop produkován jako fúsní partner k imunomodulátoru. Alternativně mohou být použity dva odlišné hukleotidové fragmenty, ale toto je méně výhodné z důvodu výhody zajištění současné exprese při obsažení obou kódujících regionů ve stejné molekule.
V souladu s tím se vynález také týká prostředku pro indukci produkce protilátek proti OPGL, který obsahuje
- fragment nukleové kyseliny nebo vektor podle předkládaného vynálezu (viz popis vektorů uvedený dále), a
- farmaceuticky nebo imunologicky přijatelné vehikulum a/nebo
nosič a/nebo adjuvans, jak byly popsány výše.
za normálních okolností je nukleová kyselina kódující variantu OPGL vložena ve formě vektoru, ve kterém je exprese pod kontrolou virového promotoru. Pro podrobnější popis vektorů podle předkládaného vynálezu viz dále. Podrobný popis týkající se přípravy a použití-nukleokyselinových vakcín je uveden, například, v Donnelly, J.J., et al., 1997, Annu. Rev. Immunol. 15: 617-648; a Donnely J.J. et al., 1997, Life Sciences 60: 163-172. Obě tyto práce jsou zde uvedeny jako odkazy.
Živé vakciny
Třetí alternativou pro prezentaci modifikovaných OPGL imunitnímu systému je použití technologie živých vakcín. Při použití živých vakcín je prezentace imunitnímu systému provedena podáním nepatogenních mikroorganismů živočichovi, kde uvedené mikroorganismy byly transformovány fragmentem nukleové kyseliny kódujícím modifikovaný OPGL nebo vektorem obsahujícím takový fragment nukleové kyseliny. Nepatogenním mikroorganismem může být jakýkoliv vhodný atenuovaný bakteriální kmen (atenuovaný pasážováním nebo odstraněním patogenních produktů exprese technikou rekombinantní DNA), jako je například Mycobacterium bovis BCG., nepatogenní Streptococcus spp., E. coli, Salmonella spp., Vibrio cholerae, Shigella atd. Přehledy týkající se přípravy živých vakcín jsou uvedeny v Saliou P., 1995, Rev. Prát. 45: 14921496 a Walker, P.D., 1992, Vaccine 10: 977-990, které jsou zde uvedeny jako odkazy. Podrobnosti týkající se fragmentů nukleových kyselin a vektorů použitých v takových živých vakcínách jsou uvedeny dále.
Alternativně k bakteriálním živým vakcínám může být • · · · ···· • · · · ··· · · ··· fragment nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu popsaný dále inkorporován do nevirulentniho virového vakcinačního vektoru, jako je kmen vakcinie nebo jakýkoliv jiný vhodný pox virus.
Obvykle je nepatogenní mikroorganismus nebo virus zvířeti pouze jednou, ale v některých případech může nutné podat mikroorganismus více než jednou za život udržení protektivní imunity. Předpokládá se, že imunizační podán být pro schémata, jako jsou schémata uvedená pro polypeptidovou vakcinaci, budou použitelná pro živé nebo virové vakciny.
Alternativně se živá nebo virová vakcina kombinuje s předchozí nebo následnou polypeptidovou a/nebo nukleokyselinovou vakcinaci. Například, je možno provést primární imunizaci živou nebo virovou vakcínou a potom provést následné dosycovací imunizace za použití polypeptidové nebo nukleokyselinové vakciny.
Mikroorganismus nebo virus může být transformován nukleovou kyselinou kóduj ici například ve formě první, druhou a/nebo třetí skupinu, imunomodulačních substancí popsaných výše, cytokiny uvedené jako jako jsou verze tohoto provedení zahrnuje použitelná adjuvans. Výhodná použití kódujícího regionu pro imunomodulátor v různých analog a kódujícího regionu pro čtecích rámcích nebo alespoň pod kontrolou různých promotorů, to, aby byl analog nebo epitop produkován k imunomodulátoru. Alternativně mohou být
Proto je vyloučeno jako fúsní partner jako transformační fragmenty. Samozřejmě při přítomnosti první a/nebo druhé a/nebo třetí skupiny ve stejném čtecím rámci může být získán expresní produkt, analog podle předkládaného vynálezu, a takové provedení je v předkládaném vynálezu zejména výhodné.
činidla použity dva odlišné nukleotidové
Použiti způsobu podle předkládaného vynálezu při léčbě onemocnění
Jak je jasné z uvedeného popisu, poskytnutí způsobu podle předkládaného vynálezu umožňuje kontrolu onemocnění charakterizovaných nadměrnou ztrátou kostní hmoty. V tomto kontextu je osteoporosa klíčovým cílem pro způsob podle předkládaného vynálezu, ale také vhodným cílem je ztráta kosti spojená s komplikovanými frakturami kostí. Proto zahrnuje významné provedení způsobu podle předkládaného vynálezu pro léčbu a/nebo prevenci a/nebo zmírnění osteoporosy nebo jiného stavu charakterizovaného nadměrnou resorpcí kosti, kde způsob obsahuje inhibici aktivity OPGL způsobem podle předkládaného vynálezu v takovém rozsahu, že rychlost resorpce kosti je významně snížena.
V předkládaných souvislostech je takové významné snížení alespoň 3% ve srovnání s patologickou rychlostí, ale předpokládá se vyšší snížení, například alespoň 5%, alespoň 7%, alespoň 9%, alespoň 11%, alespoň 13%, alespoň 15% a alespoň 17%, ale očekávají se i ještě vyšší snížení, jako například alespoň 20% nebo i alespoň 30%. Zejména výhodné je, aby snížení kostní resorpce vedlo k inverzi rovnováhy mezi tvorbou a resorpcí kosti, tj. aby bylo dosaženo stavu, kdy je rychlost tvorby kosti vyšší než rychlost resorpce kosti. Samozřejmé je, že tato nerovnováha nemůže být udržována (protože by vedla k osteopetrose), ale pečlivým kontrolováním počtu a imunologických důsledků imunizace jedince je možno dosáhnout časem rovnováhy, která vede k zachování kostní hmoty. Alternativně, pokud nemůže způsob podle předkládaného vynálezu ukončit u jedince ztrátu kostní hmoty, může způsob podle předkládaného vynálezu (volitelně v kombinaci s jinými známými metodami pro snížení ztráty kostí u pacientů s osteoporosou) být použit pro dosažení významného snížení ztráty kostní hmoty, což prodlouží dobu, po kterou má pacient dostatek kostní hmoty.
Způsoby pro měření rychlosti resorpce kosti a tvorby kosti jsou známé v oboru. Biochemické testy umožňují určit rychlost kostní resorpce pomocí měření koncentrací některých fragmentů kolagenu typu I v krvi (viz WO 93/15107 a WO 94/14844). Alternativně může být rychlost ztráty kostní hmoty měřena fyzikálně; representativní popisy způsobů pro hodnocení kostní hmoty neivazivními, fyzikálními metodami jsou uvedeny ve WO 88/06862, WO 94/12855, WO 95/14431 a WO 97/00643.
Peptidy, polypeptidy a prostředky podle předkládaného vynálezu
Jak je zřejmé z výše uvedeného popisu, je předkládaný vynález založen na konceptu imunizace jedinců proti OPGL antigenu pro nepřímé dosažení snížené aktivity osteoklastů. Výhodným způsobem pro dosaženi takové imunizace je použití modifikovaných verzí OPGL, což poskytuje molekuly, které nebyly dříve popsány v oboru.
Předpokládá se, že modifikované OPGL molekuly zde uvedené jsou sami o sobě nové a proto se významná část předkládaného vynálezu týká OPGL analogu, který je odvozen od živočišného OPGL a který obsahuje modifikace vedoucí k tomu, že imunizace živočicha analogem vede k produkci protilátek reagujících specificky s nemodifikovaným OPGL polypeptidem. Výhodně odpovídá charakter modifikace typům modifikací popsaným výše v popisu různých provedení způsobu podle předkládaného vynálezu při použití modifikovaného OPGL. Proto jsou jakékoliv zde uvedené popisy týkající se modifikovaných OPGL molekul ♦ · ·· ···· ·· • · · · · · · ··· · · ··· 9 9 relevantní pro účely popisu OPGL analogů podle předkládaného vynálezu.
Je třeba uvést, že výhodné modifikované molekuly OPGL obsahují modifikace, které vedou ke vzniku polypeptidu, který má alespoň 70% identitu sekvence s OPGL nebo s jeho subsekvencí délky alespoň 10 aminokyselin. Vyšší identity sekvence jsou výhodné, například alespoň 75% identita nebo i 80%, 85%, 90% nebo 95%. Identita sekvence pro proteiny a nukleové kyseliny může být vypočtena jako (Nref - Ndif) . 100/Nref, kde Ndif je celkový počet neidentických zbytků ve dvou seřazených sekvencích a kde Nref je počet zbytků v jedné ze sekvencí. Tak má DNA sekvence AGTCAGTC 75% identitu sekvence se sekvencí AATCAATC (Ndif = 2 a Nref = 8) .
Vynález se také týká prostředků použitelných v provedení způsobu podle předkládaného vynálezu. Tak se vynález týká také imunogenního prostředku obsahujícího imunologicky účinné množství OPGL polypeptidu, který je pro zvíře vlastním proteinem, kde uvedený OPGL polypeptid je připraven společně s imunologicky přijatelným adjuvans tak, že je dosaženo překonání autotolerance živočicha k OPGL polypeptidu, kde prostředek dále obsahuje farmaceuticky a imunologicky přijatelné ředidlo a/nebo vehikulum a/nebo nosič a/nebo přísadu. Jinými slovy, tato část vynálezu se týká přípravků přirozených OPGL polypeptidů, které byly popsány v souvislosti s provedeními způsobu podle předkládaného vynálezu.
Vynález se týká také imunogenního prostředku obsahujícího imunologicky účinné množství analogu OPGL, kde uvedený prostředek dále obsahuje farmaceuticky a imunologicky přijatelné ředidlo a/nebo vehikulum a/nebo nosič a/nebo přísadu. Jinými slovy, tato část vynálezu se týká přípravků ·· φφ ···· φφ • φ · φ φ φ · • •Φ φ φ φφφ φ φ • ••φφ φφφφ ·♦· ·· φφ φφφ φφ φφφ obsahujících modifikovaný OPGL, jak byl popsán výše. Volba adjuvans, nosičů a vehikul je stejná, jak byla popsána výše při popisu přípravy modifikovaných a nemodifikovaných OPGL pro použití ve způsobu pro inhibici OPGL.
Polypeptidy jsou připraveny způsoby .dobře známými v oboru. Delší polypeptidy jsou obvykle připraveny pomocí rekombinantní techniky zahrnující vložení sekvence nukleové kyseliny kódující analog OPGL do vhodného vektoru, transformaci vhodné hostitelské buňky vektorem, expresi sekvence nukleové kyseliny, získání produktu exprese z hostitelské buňky nebo ze supernatantu kultury a následné přečištění a volitelně další modifikace, například znovusložení nebo derivatizaci.
Kratší peptidy jsou výhodně připraveny za použití známých technik peptidové syntézy na pevné fázi nebo v kapalné fázi. Nicméně, nedávné pokroky v této technologii umožňují produkci kompletních polypeptidů a proteinů pomocí těchto technik a proto předkládaný vynález zahrnuje syntetickou přípravu delších konstruktů.
Fragmenty nukleové kyseliny a vektory podle předkládaného vynálezu
Z výše uvedeného popisu je jasné, že modifikované OPGL polypeptidy mohou být připraveny pomocí rekombinantních technik, ale také chemickou syntézou nebo semisyntézou; poslední dvě možnosti jsou zejména významné tehdy, když modifikace spočívá v navázání na proteinový nosič (jako je KLH, difterický toxoid, tetanický toxoid a BSA) a neproteinové molekuly, jako jsou karbohydratové polymery a samozřejmě také tehdy, když modifikace zahrnuje adici vedlejších řetězců nebo vedlejších skupin k peptidovému řetězci odvozenému od OPGL.
Pro účely rekombinantní technologie - a samozřejmě také pro účely imunizace nukleovými kyselinami - jsou fragmenty nukleových kyselin kódující modifikovaný OPGL významnými chemickými produkty. Proto se významná část předkládaného vynálezu týká fragmentů nukleových kyselin, které kódují analogy OPGL, tj. polypeptid odvozený od OPGL, který buď obsahuje sekvenci přirozeného OPGL, ke které byl přidán nebo na kterou byl fúsován fúsní partner, nebo - výhodně polypeptid odvozený od OPGL, do kterého byl vložen cizorodý Tlymfocytární epitop prostřednictvím inserce a/nebo adice, výhodně prostřednictvím substituce a/nebo delece. Fragmenty nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu jsou DNA nebo RNA fragmenty.
Fragmenty nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu jsou obvykle insertovány ve vhodných vektorech za vzniku klonovacích nebo expresních vektorů obsahujících fragment nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu; takové nové vektory jsou součástí předkládaného vynálezu. Podrobnosti týkající se konstrukce těchto vektorů podle předkládaného vynálezu budou popsány dále v souvislosti s transformovanými buňkami a mikroorganismy. Vektory mohou, podle účelu a typu aplikace, být ve formě plasmidů, fágů, kosmidů, minichromosomů nebo virů, ale může se jednat také o „holou DNA, které je exprimována pouze přechodně v určitých typech buněk. Výhodné klonovací a expresní vektory podle předkládaného vynálezu jsou schopné autonomní replikace, což umožňuje dosažení vysokého počtu kopií pro vysokou expresi nebo vysokou úroveň replikace pro následné klonování.
Obecně obsahuje vektor podle předkládaného vynálezu následující prvky ve směru 5'->3', které jsou v operativní ··· • · *·
• · · ·· ··· ·· • · ·· vazbě: promotor pro řízeni exprese fragmentu nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu, volitelně sekvenci nukleové kyseliny kódující vedoucí peptid umožňující sekreci (do extracelulární fáze, nebo - pokud je to použitelné - do periplasmy) nebo integraci polypeptidového fragmentu do membrány, fragment nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu, a volitelně sekvenci nukleové kyseliny kódující terminátor. Při použití expresního vektoru v produkujících kmenech nebo buněčných liniích je pro zlepšení genetické stability transformovaných buněk výhodné, aby byl vektor, po vložení do hostitelské buňky, integrován do genomu hostitelské buňky. Naopak, při použití vektorů v dosažení in vivo exprese ve zvířatech (tj. při použití vektoru při DNA vakcinaci) je z důvodů bezpečnosti výhodné, aby vektor nemohl být integrován do genomu hostitelské buňky; obvykle se použije holá DNA nebo neintegrující virové vektory, jejichž výběr je dobře známý odborníkům v oboru.
Vektory podle předkládaného vynálezu jsou použity pro transformaci hostitelských buněk k produkci modifikovaných OPGL polypeptidu podle předkládaného vynálezu. Takové transformované buňky, které jsou také součástí předkládaného vynálezu, mohou být kultivované buňky nebo buněčné linie použité pro propagaci fragmentů nukleových kyselin a vektorů podle předkládaného vynálezu, nebo mohou být použity pro rekombinantní produkci modifikovaných OPGL polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Alternativně mohou být transformované buňky vhodnými kmeny pro živé vakciny, kde uvedený fragment nukleové kyseliny (v jedné nebo více kopiích) je do nich insertován tak, aby bylo dosaženo sekrece nebo integrace modifikovaného OPGL do bakteriální membrány nebo do buněčné stěny.
·· ····
Výhodnými bakteriálními buňkami podle předkládaného vynálezu jsou mikroorganismy, jako jsou bakterie (jako jsou Escherichia spp (například E. coli), Bacillus (například Bacillus subtilis), Salmonella nebo Mycobacterium (výhodně nepatogenní, například M. bovis BCG), kvasinky (jako je S.
cerevisiae) a protozoa. Alternativně může být transformované buňka původem z mnohobuněčného organismu, jako jsou houby, hmyz, rostliny a savci. Nej výhodnější jsou buňky od člověka, viz popis vektorů a buněčných linií uvedený dále. Nedávné výsledky naznačily výhodné použití komerčně dostupné linie od Drosophila melanogaster (Schneider 2 (S2) buněčná linie a vektorový systém od Invitrogen) pro rekombinantní produkci polypeptidů v laboratoři přihlašovatelů vynálezu a proto je tento expresní systém zejména výhodný.
Pro účely klonování a/nebo optimalizované exprese je výhodné, aby byla transformovaná buňka schopná replikovat fragment nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu. Buňky exprimující fragment nukleové kyseliny jsou výhodnými provedeními vynálezu; tyto buňky mohou být použity pro maloobejmovou nebo velkoobjemovou přípravu modifikovaného OPGL nebo - v případě nepatogenních bakterií - jako složky živých vakcín.
Při produkci modifikovaného OPGL podle předkládaného vynálezu pomocí transformovaných buněk je vhodné, i když ne zásadní, aby byl produkt exprese buď exportován do kultivačního media nebo přítomen na povrchu transformovaných buněk.
Po identifikaci účinné produkční buňky je výhodné, aby se z ní vytvořila stabilní buněčná linie nesoucí vektor podle předkládaného vynálezu a exprimující fragment nukleové ·· • · · • · • · •· ···· • · · to •· · ···· • to • to toto • · toto kyseliny kódující modifikovaný OPGL. Výhodně tato stabilní buněčná linie nese nebo secernuje analog OPGL podle předkládaného vynálezu, což usnadňuje jeho přečištění.
Obecně, jsou v hostiteli použity plasmidové vektory obsahující replikon a kontrolní sekvence, které jsou odvozeny od druhu kompatibilního s hostitelskou buňkou, vektory obvykle obsahuje replikačni místo, stejně jako značící sekvence, které umožňují fenotypovou selekci transformovaných buněk. Například, E. coli je obvykle transformována za použití pBR322, plasmidu odvozeného od E. coli (viz například Bolivar et al., 1977). pBR322 plasmid obsahuje geny pro resistenci na ampicilin a tetracyklin a proto poskytuje snadný prostředek pro identifikaci transformovaných buněk. pBR plasmid, nebo jiný mikrobiální plasmid nebo fág musí také obsahovat - nebo musí být modifikován tak, aby obsahoval - plasmid, který může být použit prokaryotickým mikroorganismem pro expresi.
Mezi promotory nej častěji používané pro rekombinantni DNA konstrukty patří B-laktamasový (penicilinasový) a laktosový promotorový systém (Chang et al., 1978; Itakura et al., 1977; Goeddel et al., 1979) a tryptofanový (trp) promotorový systém (Goeddel et al., 1979; EP-A-0036776). Ačkoliv toto jsou nejběžnější používané promotory, mohou být použity i další mikrobiální promotory a podrobnosti týkající se jejich nukleotidových sekvencí byly publikovány, což umožňuje jejich funkční ligaci na plasmidové vektory (Siebwenlist et al., 1980). Některé geny z prokaryont mohou být účinně exprimovány v E. coli z jejich vlastních promotorových sekvencí, takže není nutné artificiální přidání jiného promotoru.
Kromě prokaryotických organismů mohou být použity také eukaryotické mikroby, jako jsou kvasinkové kultury, a také zde • ♦· ·· ···· ·· • · · · · · · · · • ··· · · φφφ φφ • · · · · · · · φφ • · · · ···· ·*· ·♦ ·· ♦···· · by měl být promotor schopen řízení exprese. Saccharomyces cerevisiae, nebo běžné pekařské kvasinky, jsou nejčastěji používanými eukaryotickými mikroorganismy, ačkoliv je dostupných mnoho dalších kmenů. Pro expresi v Saccharomyces je běžně použit plasmid Yrp7 (Stinchcomb et al·., 1979; Kingsman et al. , 1979; Tschemper et al., 1980). Tento plasmid již obsahuje trpí gen, který je selekčním markérem pro mutantní kmeny kvasinek neschopných růstu v tryptofanu, jako je například ATCC č. 44076 nebo PEP4-1 (Jones, 1977). Přítomnost trpí léze jako charakteristika genomu kvasinkové hostitelské buňky potom poskytuje účinné prostředí pro detekci transformace pomocí kultivace za nepřítomnosti tryptofanu.
Mezi vhodné promotorové sekvence ve kvasinkových vektorech patří promotory pro 3-fosfoglyceratkinasu (Hitzman et al., 1980) nebo jiné glykolytické enzymy (Hess et al., 1968; Holladn et al., 1978), jako je enolasa, glyceraldehyd-3fosfatdehydrogenasa, hexokinasa, pyruvátdekarboxylasa, fosfofruktokinasa, glůukosa-6-fosfat isomerasa, 3fosfoglyceratmutasa, pyruvatkinasa, triosafosfatisomerasa, fosfoglukosaisomerasa a glukokinasa. Při konstrukci vhodných expresních plasmidů jsou terminační sekvence asociované s těmito geny také ligovány do expresního vektoru 3' k sekvenci, která má být exprimována, pro dosažení polyadenylace mRNA a terminace.
Jiné promotory, které mají další výhodu v transkripci řízené kultivačními podmínkami, jsou promotorový region alkohol-dehydrogenasy 2, isocytrochromu C, kyselé fosfatasy, degradačních enzymů asociovaných s metabolismem dusíku a výše uvedené glyceraldehyd-3-fosfat dehydrogenasy, a enzymy odpovědné za využití maltosy a galaktosy. Vhodný je jakýkoliv plasmidový vektor obsahující promotor, sekvenci rozpoznávající ·· ····
• · ·· • ··· ·· • · · ·· • · ·· ·· · počátek replikace a terminačni sekvenci kompatibilní s kvasinkami.
Kromě mikroorganismů mohou být také jako hostitelé použity kultury buněk odvozených od mnohobuněčných organismů. V zásadě je použitelná jakákoliv buněčná kultura, ať z obratlovců nebo z bezobratlých. Nicméně, významnější jsou buňky z obratlovců a propagace buněk od obratlovců v kultuře (tkáňové kultuře) se stala v posledních letech rutinním postupem (Tissue Culture, 1973). Příklady takových použitelných hostitelských buněčných linií jsou VĚRO a HeLa buňky, ovariálni buňky čínského křečka (CHO) a W138, BHK, COS-7, 293, buňky Spodoptera frugiperda (SF) (komerčně dostupné jako kompletní expresní systém od Protein Sciences, 1000 Research Parkway, Meriden, CT06450, USA a od Invitrogen) a MDCK buněčné linie. V předkládaném vynálezu je zejména výhodnou buněčnou linií S2 dostupná od Invitrogen, PO Box 2312, 9704 CH Groningen, The Netherlands.
Expresní vektory pro takové buňky obvykle obsahují (pokud je to nutné) sekvenci rozpoznávající počátek replikace, promotor umístěný před exprimovaným genem, společně s nezbytnými vazebnými místy pro ribozomy, místa pro sestřih RNA, polyadenylační místo a sekvence pro ukončení transkripce.
Pro použití v savčích buňkách jsou kontrolní funkce na expresních vektorech často dodány virovým materiálem. Například, běžně používané promotory jsou odvozené od polyomaviru, adenoviru 2 a nejčastěji od opičího viru 40 (SV40). Časné a pozdní promotory SV40 viru jsou zejména výhodné, protože jsou oba získány snadno z viru jako fragment, který také obsahuje SV40 virový zdroj replikace (Fiers et al., 1978). Také mohou být použity menší nebo větší fragmenty SV40, s podmínkou, že obsahují přibližně 250 bp sekvenci od HindlII
• · ··· · • ♦ · « • · · • ·· ·· • φ · φ • · ··· · * · φ · · • · · · • · • · • · ·· ··· místa směrem k BglI místu umístěnému ve virové sekvenci rozpoznávající počátek replikace. Dále je také možné, a často žádoucí, použít promotorové nebo kontrolní sekvence normálně asociované se sekvencí požadovaného genu, což zaručí, že takové kontrolní sekvence budou kompatibilní se systémy hostitelské buňky.
Sekvence rozpoznávající počátek replikace může být dodána buď úpravou vektoru tak, aby obsahoval exogenní sekvenci rozpoznávající počátek replikace, která může být odvozena z SV40 nebo jiného viru )například polyomaviru, adenoviru, VSV, BPV), nebo může být dodána chromosomálním replikačním mechanismem hostitelské buňky. Pokud je vektor integrován do chromosomu hostitelské buňky, tak je často dostatečná druhá varianta.
Identifikace použitelných analogů OPGL
Odborníkům v oboru bude jasné, že ne všechny možné varianty a modifikace přirozeného OPGL budou schopny vyvolat tvorbu protilátek u zvířete, které jsou zkříženě reaktivní s přirozenou formou. Není, nicméně, obtížné provést účinné standardní vyšetření na modifikované OPGL molekuly, které splňují minimální požadavky na zde popisovanou imunologickou reaktivitu. Proto se další část předkládaného vynálezu týká způsobu pro identifikaci modifikovaného OPGL polypeptidů, který je schopen indukovat protilátky proti nemodifikovanému OPGL polypeptidů u zvířete, kde nemodifikovaný OPGL polypeptid je (neimunogenní) vlastní protein, kde uvedený způsob zahrnuje:
- přípravu, pomocí peptidové syntézy nebo technik genového inženýrství, sady navzájem odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů, ve kterých byly v aminokyselinové sekvenci OPGL • ·
polypeptidu daného živočišného druhu provedeny inserce, delece nebo substituce aminokyselin, které vedly ke vzniku aminokyselinových sekvencí obsahujících T-lymfocytární epitopy, které jsou cizorodé pro živočišný·druh, nebo přípravu sady fragmentů nukleových kyselin kódujících sadu vzájemně odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů;
- testování členů sady modifikovaných OPGL polypeptidů nebo fragmentů nukleových kyselin na jejich schopnost indukovat produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v živočišném druhu; a
- identifikaci a volitelně izolaci členů sady modifikovaných OPGL polypeptidů, které významně indukují produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v druhu nebo identifikaci a volitelně izolaci polypeptidových expresních produktů kódovaných členy sady fragmentů nukleových kyselin, které významně indukují produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v živočišném druhu.
V této souvislosti je sada vzájemně odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů soubor neidentických modifikovaných OPGL polypeptidů, které byly, například, vybrány podle kriterií uvedených výše (například kombinací analýzy cirkulárního dichroismu), NMR spektrální analýzy a/nebo rentgenové difrakce). Tato sada může obsahovat pouze několik členů, ale předpokládá se, že může obsahovat také několik stovek členů.
Test členů sady může být nakonec proveden in vivo, ale může být proveden určitý počet testů in vitro, které zužují počet modifikovaných molekul, které mohou být použity pro předkládaný vynález.
Protože účelem vkládání cizorodých T-lymfocytárních epitopů ···
9 · • 9 • ···· •· •· • · · · · je podpora B-lymfocytárni odpovědi prostřednictvím pomoci Tlymfocytů, je podmínkou to, aby byla modifikovaným OPGL polypeptidem indukována proliferace T-lymfocytů. Proliferace T-lymfocytů může být testována standardními proliferačnimi testy in vitro. Stručně, vzorek bohatý na T-lymfocyty se získá od jedince kontaktuj i molekulu a a potom se kultivuje. Kultivované T-lymfocyty se s APC jedince, které předem Vychytaly modifikovanou zpracovaly ji a prezentují její T-lymfocytárni epitopy. Proliferace T-lymfocytů se sleduje a srovnává se s vhodnou kontrolou (například T-lymfocyty v kultuře kontaktovanými s APC, které zpracovaly přirozený, intaktni OPGL). Alternativně může být proliferace měřena stanovením koncentrace relevantních cytokinů uvolňovaných T-lymfocyty v reakci na rozpoznání cizorodých T-lymfocytárnich epitopů.
Takto může být dosaženo situace, že je značně pravděpodobné, že jeden modifikovaný OPGL ze sady je schopen indukovat tvorbu protilátek proti OPGL a je možné připravit imunogenní prostředek obsahující alespoň jeden OPGL polypeptid, který může indukovat protilátky proti nemodifikovanému OPGL u živočicha, u kterého je nemodifikovaný OPGL polypeptid vlastním proteinem, kde tato příprava zahrnuje smísení člena sady, který signifikantně indukuje produkci protilátek u živočicha, které jsou reaktivní s OPGL, s farmaceuticky a imunologicky přijatelným vehikulem a/nebo ředidlem a/nebo přísadou, v kombinaci s alespoň jedním farmaceuticky nosičem a/nebo volitelně a imunologicky přijatelným adjuvans.
Výše uvedené aspekty předkládaného vynálezu se týkají testu sady polypeptidu, který je proveden nejprve pomocí přípravy mnoha vzájemně odlišných sekvencí nukleových kyselin nebo vektorů podle předkládaného vynálezu, inserci těchto sekvencí nebo vektorů do vhodných expresních vektorů, transformaci vhodných hostitelských buněk vektory a expresi sekvencí nukleových kyselin podle předkládaného vynálezu. Tyto kroky mohou být následovány izolací produktů exprese. Je výhodné, aby byly sekvence nukleové kyseliny a/nebo vektory připraveny způsobem zahrnujícím provedení molekulární amplifikační techniky, jako je PCR, nebo pomocí syntézy nukleových kyselin.
Jiná část předkládaného vynálezu se týká způsobu pro léčbu, profylaxi nebo zmírnění onemocnění charakterizovaného nadměrnou resorpcí kosti u zvířete, včetně člověka, který zahrnuje podání účinného množství alespoň jedné substance odlišné od osteoprotegerinu, která blokuje stimulační efekt OPGL na aktivitu osteoklastů, uvedenému zvířeti. Předpokládáme, že takový postup nebyl nikdy v oboru navržen.
Výhodné provedení tohoto aspektu vynálezu zahrnuje použití protilátky specifické k OPGL (póly- nebo monoklonální) nebo její varianty se specifickou vazbou, jako substance blokující stimulační efekt OPGL. Je výhodné, aby byla protilátkou IgG nebo IgM molekula nebo specificky se vážící varianta odvozená od IgG nebo IgM. Specificky se vážící variantou protilátky může být Fab fragment, F(ab')2 fragment, humanizovaná monoklonální protilátka nebo její fragment, nebo fragment dinebo multimerní protilátky, jako je diaprotilátka (bispecifická dimerická molekula odvozená od protilátky vyráběná Cambridge Antibody Technology).
Příklady provedeni vynálezu
Rozhodli jsme se klonovat nebo syntetizovat cDNA kódující myší a lidský OPGL ve zkrácené verzi obsahující aminokyselinové zbytky 158-316 v případě myšího a zbytky 159• · • ·
9 · •9 •9
9· · • · · · 9· · 9 9 ·9 9 ♦ ♦ ♦ 9 9 99 • · 9 9· ·· ··· ··9
317 v případě lidského OPGL (čísla odpovídají číslováni v SEQ ID NO: 2 a 4, v příslušném pořadí). Protože zkrácené verze vykazují biologickou aktivitu, je logické zaměřit autoprotilátky proti této části OPGL. Kromě toho je při tomto provedení protein menší, což usnadňuje manipulaci s proteinem.
Syntetická cDNA kódující myší OPGL zbytky 158-316 byla syntetizována odstraněním suboptimálních E. coli a Pichia pastoris kodonů z publikované sekvence. Dále byly do otevřeného čtecího rámce inkorporovány N-kocová histidinová koncovka, část štěpícího místa signální sekvence a-párovacího faktoru ze Saccharomyces cerevisiae a vhodná místa pro restrikční enzymy (viz SEQ ID NO: 7).
Tato cDNA kódující přirozený myší OPGL byla klonována do standardního Escherichia coli expresního vektoru (pTrc99a) za použití BspHI a HindlII restrikčních enzymů a standardního klonovacího vektoru (pBluescript KS+) za použití Sací a KpnI restrikčních enzymů (za zisku SEQ ID NO: 9).
Exprese v buňkách Escherichia coli vedla k přibližně 30% rekombinantního OPGL přítomných v celkových proteinech Escherichia coli. Protein byl znovusložen a přečištěn za použití následujícího postupu:
1. Buňky byly získány odstředěním.
2. Buňky se suspendovaly ve fosfátem pufrovaném salinickém roztoku (PBS) a odstředily se.
3. Supernatant se odstranil a buňky se resuspendovaly ve třech objemech (100 mM Tris(hydroxymethyl)aminomethanhydrochloridu, mM dithiothreitolu (DTT), 0,5 M NaCl, pH 8,0).
4. K buňkám se přidalo 8 μΐ 50 mM PMSF a 80 μΐ lysozymu (10 mg/ml) na gram buněk a provedla se inkubace při teplotě okolí po dobu 20 minut.
5. Na každý gram buněčné pelety se přidaly 4 mg kyseliny deoxycholové a suspenze se inkubovala při 37 °C do vzniku viskozity.
6. přidá se 20 μΐ DNAsy (1 mg/ml) na gram buněk a MgC12 do 5 mM a suspenze se inkubuje při teplotě okolí po dobu 30 minut.
7. Suspenze se sonikuje na ledu do vymizení viskozity.
8. Po odstředění (20000 x g po dobu 30 minut) se peleta resuspenduje v H2O, opakovaně se odstředí a resuspenduje se ve 3 ml 1 M močoviny na gram hmotnosti buněk.
9. Po odstředění (20000 x g po dobu 30 minut) se peleta resuspenduje v 1 M guanidinhydrochloridu, 100 mM
Tris(hydroxymethyl)aminomethahydrochloridu, pH 7,5.
10. Po odstředění (20000 x g po dobu 30 minut) se peleta resuspenduje v 1 M guanidinhydrochloridu, 20 mM
Tris(hydroxymethyl)aminomethahydrochloridu, 1% βmerkaptoethanolu, pH 8,0, a mísí se přes noc při teplotě 4 °C.
11. Po odstředění (40000 x g po dobu 1-4 hodin) se supernatant přefiltruje a uskladní se při -20 °C.
12. Solubilizovaná inklusní tělíska se separují gelovou filtrační chromatografií za použití Superdex 200 materiálu (Pharmacia).
13. Frakce obsahující rekombinantní OPGL se shromáždí a ředí se na 0,1 mg/ml 1,5 M guanidinhydrochloridu, 20 mM
Tris(hydroxymethyl)aminomethahydrochloridem, 1 mM DTT, pH 7,5.
14. Materiál se dialyzuje přes noc při 4 °C proti 10 objemům
1,5 M guanidinhydrochloridu, 20 mM Tris(hydroxymethyl)aminomethahydrochloridu, 1 mM DTT, pH 7,5.
15. Materiál se dialyzuje přes noc při 4 °C proti 10 objemům
1,0 M guanidinhydrochloridu, 20 mM Tris(hydroxymethyl)aminomethahydrochloridu, 1 mM DTT, pH 7,5.
16. Materiál se dialyzuje přes noc při 4 °C proti 10 objemům
0,5 M guanidinhydrochloridu, 20 mM Tris(hydroxymethyl)57 • ·
aminomethahydrochloridu, 1 mM DTT, pH 7,5.
17. Materiál se dialyzuje přes noc při 4 °C proti 10 objemům mM Tris(hydroxymethyl)-aminomethahydrochloridu, 150 mM argininu, 1 mM DTT, pH 7,5.
18. Materiál se dialyzuje přes noc při 4 °C proti 10 objemům mM Tris(hydroxymethyl)-aminomethahydrochloridu, 150 mM argininu, pH 7,5.
19. Složený materiál se lyofilizuje a uskladní se při -20 °C.
Účinnost skládání tímto postupem je přibližně 40% a čistota přesahuje 65%. Přečištění a skládáni jsou stále předmětem dalších zlepšování. Skládání za imobilizovaného stavu je předmětem výzkumu a enzymatické odstranění histidinové koncovky je možno provést způsobem popsaným v Pedersen et al., 1999. Vlastnosti rekombinantního proteinu byly charakterizovány a verifikovány pomocí SDS-PAGE, N-koncového sekvencování,aminokyselinové analýzy a hmotnostní spektrometrie.
Připravil se cysteinový substituční mutant přirozeného myšího OPGL (ve kterém je cystein odpovídající aminokyselinovému zbytku v SEQ ID NO: 4 substituován serinem, viz SEQ ID NO: 11 a 12). Toto je provedeno pro eliminaci potenciálních problémů se stabilitou u přečištěného rekombinantního proteinu. Tento mutovaný zkrácený OPGL slouží jako základ pro vakcinační konstrukty v souladu s popisem uvedeným dále, který platí pro DNA SEQ ID NO: 9. Pro stejný účel byl také připraven příslušný Cys->Ser mutant (ve kterém je substituován Cys221) lidského OPGL.
Vakcinační molekuly se nejprve připravily insercí nebo substitucí buď P2, nebo P30 epitopů z tetanického toxoidu ve vybraných pozicích. Později mohou být použity jiné vhodné · · · · · · ··· ·· ·· ·«· imunodominantní T-lymfocytární epitopy.
Pozice pro vkládáni variaci jsou vybrány podle znalostí existujících nebo předpokládaných B-lymfocytárních epitopů a předpokládaných prvků sekundární struktury přirozené molekuly, stejně jako podle porovnání s existující troj rozměrovou strukturou TNFa (la8m.pdb) a CD40 ligandů (laly.pdb) pro modelování sekundární a terciární struktury extracelulární části OPGL. Vkládání do myší molekuly proběhne v regionech odpovídajících aminokyselinovým zbytkům 170-192, 198-218, 221246, 256-261 a 285-316 (viz číslování aminokyselin podle SEQ ID NO: 4), zatímco vkládání do lidské molekuly proběhne v regionech odpovídajících aminokyselinovým zbytkům 171-193, 199-219, 222-247, 257-262 a 286-317.
Byly konstruovány čtyři varianty myšího OPGL a tyto varianty byly rekombinantně exprimovány v Escherichia coli:
DNA kódující mOPGL(158-316)_P30(256-261) s N-koncovou histidinovou koncovkou (SEQ ID NO: 13)
PCR SEQ ID NO: 9 byla provedena za použití SEQ ID NO: 22 a 25 jako primerů. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven SacII a KpnI a potom byl přečištěn z agarosového gelu. Druhá PCR za použití SEQ ID NO: 9 jako templátu byla provedena za použití primeru SEQ ID NO: 26 a primeru specifického pro vektor. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven KpnI a HindlII. Oba fragmenty byly potom ligovány do SEQ ID NO: 9 v pBluescript KS+ restrikčně tráveném SacII a HindlII. Pro správnou mutaci jedné baze v tomto konstruktu byla provedena PCR za použití konstruktu jako templátu s primery SEQ ID NO: 33 a 29. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven Pstl + EcoRI, byl přečištěn na gelu a potom byl ligován do chybného konstruktu tráveného Pstl a EcoRI. Verifikovaný konstrukt (SEQ ID NO: 13) byl potom přenesen do pTrc99a za použití restrikčních enzymů BspHI a HindlII.
DNA kódující mOPGL(158-316)_P2(256-261) s N-koncovou histidinovou koncovkou (SEQ ID NO: 15)
PCR byla provedena za použití SEQ ID NO: 27 a 28 jako primerů bez templátu. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven Pstl a EcoRI a potom byl přečištěn z agarosového gelu. Získaný fragment byl potom ligován do SEQ ID NO: 9 v pBluescript KS+ restrikčně tráveném SacII a HindlII. Verifikovaný konstrukt (SEQ ID NO: 15) byl potom přenesen do pTrc99a za použití restrikčních enzymů BspHI a HindlII.
DNA kódující mOPGL(158-316)_P2(288-302) s N-koncovou histidinovou koncovkou (SEQ ID NO: 17)
PCR SEQ ID NO: 9 byla provedena za použití SEQ ID NO: 22 a 29 jako primerů. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven Pstl a BstBI a potom byl přečištěn z agarosového gelu. Druhá PCR za použití SEQ ID NO: 9 jako templátu byla provedena za použití primerů SEQ ID NO: 30 a primerů specifického pro vektor. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven BstBI a KpnI a potom byl přečištěn na gelu. Oba fragmenty byly potom ligovány do SEQ ID NO: 9 v pBluescript KS+ restrikčně tráveném Pstl a KpnI. Verifikovaný konstrukt (SEQ ID NO: 17) byl potom přenesen do pTrc99a za použití restrikčních enzymů BspHI a HindlII.
DNA kódující mOPGL(158-316)_P30(221-241) s N-koncovou histidinovou koncovkou (SEQ ID NO: 19) • 4
4
PCR SEQ ID NO: 9 byla provedena za použiti SEQ ID NO: 22 a 29 jako primerů. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven SacII a KpnI a potom byl přečištěn z agarosového gelu. Druhá PCR za použiti SEQ ID NO: 9 jako templátu byla provedena za použití primerů SEQ ID NO: 34 a 31. Vzniklý PCR fragment byl restrikčně tráven KpnI a EcoRI a potom byl přečištěn na gelu. Oba fragmenty byly potom ligovány do SEQ ID NO: 9 v pBluescript KS+ restrikčně tráveném SacII a EcoRI. Verifikovaný konstrukt (SEQ ID NO: 19) byl potom přenesen do pTrc99a za použití restrikčních enzymů BspHI a HindlII.
Exprese těchto zkrácených variant OPGL proběhla v E. coli za zisku více než 20% celkového proteinu pro všechny varianty. Další vývoj výše popsaných přečišťovacích a skládacích postupů pro přirozený protein (SEQ ID NO: 9) bude proveden. Tento postup může sloužit jako základ pro vývoj optimálních postupů pro každou z variant. Imobilizované skládání variant proteinů využívající histidinovou koncovku je dalším postupem, na kterém se pracuje.
Alternativně mohou být varianty přímo přeneseny do expresních vektorů pro Pichia pastoris pomocí restrikčních enzymů, nebo do jiných kvasinkových expresních systému za použití PCR, pokud je požadována glykosylace. je třeba poznamenat, že glykosylace není nutná pro biologickou aktivitu OPGL in vivo. Je také možné exprimovat zkrácené OPGL v lidských 293 fibroblastech, jak je popsáno v Lacey et al. Exprese ve hmyzích buňkách je také možná (například v Schneider 2 (S2) buněčné linii a vektorovém systému nebo v buňkách Spodoptera frugiperda (SF) a vektorových systémech, kde obě linie jsou dostupné od Invitrogen).
Přečištěné varianty mohou být použity pro produkci ·· · * ♦ ♦ • ··· · · ··· • · · · · · • · · · · · · » .
**· ** ·· ··· ·· ··· protilátek u králíků pro pozdější použití jako detekční nástroje, protože neexistují žádné komerčně dostupné protilátky. Dále bude tento materiál velmi hodnotným prostředkem v biologických testech pro hodnocení potenciálně vhodných sloučenin pro autovakcíny. Příprava protilátek bude provedena za použití metod známých v oboru.
Selekce nejlepších kandidátů pro autovakcíny se provede hodnocením inhibiční aktivity v testech zrání/aktivace osteoklastů in vitro nebo in vivo na zvířecích modelech osteoporosy. Použitelné testy a modelové systémy jsou popsány v literatuře (například v Lacey et al., Fuller et al., a Simonet et al.).
Aktivita rekombinantních proteinů bude analyzována intravenosní injekcí 100 μΐ neanestezovaným Balb/c myším (0, 0,1 a 1,0 mg proteinu na kg hmotnosti myši) a o hodinu později odebráním 125 μΐ krve z hlavní žíly boltce za použití kapilárky potažené heparinem nasyceným vápníkem. Koncentrace vápníku se měří za použití ICA2 (Radiometer, Denmark). Přečištěný a složený rekombinantní myší OPGL (SEQ ID NO: 9) je reaktivní v tomto testu a zvyšuje koncentrace ionizovaného vápníku v cirkulaci o až 100%.
Kandidáti na autovakcínu budou hodnoceni například za použití autovakcinace a následného sledování inhibice uvolňování ionizovaného vápníku do periferní krve po injekci rekombinantního mOPGL myším (jak je popsáno v Burgess et al.).
Je třeba uvést, že jako alternativa k modifikovanému OPGL mohou antiidiotypové protilátky namířené proti idiotypu antiOPGL protilátky také sloužit jako imunogeny podle předkládaného vynálezu. Obdobně, použití mimotopových • · · · · · • ·
• ♦♦ ··· ·· · ♦ · · • · ·· ·· • · ♦ • · · • · · • · · · · polypeptidu, které mohou být izolovány, například, pomocí fágového zobrazovacího systému za použití anti-OPGL nebo osteoprotegerinu jako zachycovací sondy, jako imunogenů, spadá také do rozsahu předkládaného vynálezu.
Odkazy:
1. Bucay, N. et al., 1998, Genes Dev. 12: 1260-1268.
2. Lacey, D.L. et al., 1998, Cell 93: 165-176.
3. Marks, S.C. Jr., 1989, Am. J. Med. Genet. 34: 43-53.
4 . Simonet ., W.S. et al. (1997) , Cell 89: 309-319.
5. Fuler, W.S. et al., 1997, J. Exp. Med. 188: 997-1001
6. Burgess, T.L. et al., 1999, J. Cell. Biol. 145: 527-538.
7. Pedersen J. et al., 1999, Protein Expr. Purif. 15: 389-400.
• 44 44 4444 φ 4
• · · • * • ♦ 4
• 4 4 4 • 4 4 4 4 • 4
• 4 · • · 4 4 φ 4
• · · • · • 4
• · · 4 4 • 4 • 4 4 ·· 4
Seznam sekvenci <110> M&E Biotech A/S
HALKIER, Torben
HAANING, Jesper <120> Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin
<130> 22021 PC 1
<140>
<141>
<160> 35
<170> Patentln ver
<210> 1
<211> 2271
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS <222> (185)...(1138) <400> 1 aagcttggta ccgagctcgg aaagccgggc tccaagtcgg cgcagacaag aaggggaggg atccactact cgacccacgc cgccccacgt cgaggctccg agcgggagag ggaggagagc gtccgcgcgc cccaggagcc 60 ccgcagcctc cggagttggc 120 tccgaagcga gagggccgag 180 cgcc atg cgc cgc gcc agc aga gac tac acc aag tac ctg cgt ggc tcg 229 Met Arg Arg Ala Ser Arg Asp Tyr Thr Lys Tyr Leu Arg Gly Ser
1 5 10 15
gag gag atg ggc ggc ggc ccc gga gcc ccg cac gag ggc ccc ctg cac 277
* Glu Glu Met Gly Gly Gly Pro Gly Ala Pro His Glu Gly Pro Leu His
20 25 30
gcc ccg ccg ccg cct gcg ccg cac cag ccc ccc gcc gcc tcc cgc tcc 325
Ala Pro Pro Pro Pro Ala Pro His Gin Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser
35 40 45
atg ttc gtg gcc ctc ctg ggg ctg ggg ctg ggc cag gtt gtc tgc agc 373
Met Phe Val Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Gly Gin Val Val Cys Ser
55 60 φ φ ·· φ φ
gtc gcc ctg ttc ttc tat ttc aga gcg cag atg gat cct aat aga ata 421
Val Ala Leu Phe Phe Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile
65 70 75
tea gaa gat ggc act cac tgc att tat aga att ttg aga ctc cat gaa 469
Ser Glu Asp Gly Thr His Cys Ile Tyr Arg Ile Leu Arg Leu His Glu
80 85 90 95
aat gca gat ttt caa gac aca act ctg gag agt caa gat aca aaa tta 517
Asn Ala Asp Phe Gin Asp Thr Thr Leu Glu Ser Gin Asp Thr Lys Leu
100 105 110
ata cct gat tea tgt agg aga att aaa cag gcc ttt caa gga get gtg 565
Ile Pro Asp Ser Cys Arg Arg Ile Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val
115 120 125
caa aag gaa tta caa cat atc gtt gga tea cag cac atc aga gca gag 613
Gin Lys Glu Leu Gin His Ile Val Gly Ser Gin His Ile Arg Ala Glu
130 135 140
aaa gcg atg gtg gat ggc tea tgg tta gat ctg gcc aag agg age aag 661
Lys Ala Met Val Asp Gly Ser Trp Leu Asp Leu Ala Lys Arg Ser Lys
145 150 155
ctt gaa get cag cct ttt get ca t ctc act att aat gcc acc gac atc 709
Leu Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Thr Asp Ile
160 165 170 175
cca tet ggt tcc cat aaa gtg agt ctg tcc tet tgg tac cat gat cgg 757
Pro Ser Gly Ser His Lys Val Ser Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg
180 185 190
ggt tgg gcc aag atc tcc aac atg act ttt age aat gga aaa cta ata 805
Gly Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Phe Ser Asn Gly Lys Leu Ile
195 200 205
gtt aat cag gat ggc ttt tat tac ctg tat gcc aac att tgc ttt ega 853
Val Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg
210 215 220
cat cat gaa act tea gga gac cta get aca gag tat ctt caa cta atg 901
His His Glu Thr Ser Gly Asp Leu Ala Thr Glu Tyr Leu Gin Leu Met
225 230 235
gtg tac gtc act aaa acc age atc aaa atc cca agt tet cat acc ctg 949
Val Tyr Val Thr Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Thr Leu
240 245 250 255
atg aaa gga gga age acc aag tat tgg tea ggg aat tet gaa ttc cat 997
Met Lys Gly Gly Ser Thr Lys Tyr Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His
260 265 270
·« ···· • « • ···
ttt tat tcc ata aac gtt ggt gga ttt ttt aag Phe Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys tta cgg tet Leu Arg Ser 285 gga gag Gly Glu 1045
275 280
gaa atc agc Glu Ile Ser 290 atc gag gtc tcc aac ccc tcc tta Ile Glu Val Ser Asn Pro Ser Leu 295 ctg gat ccg Leu Asp Pro 300 gat cag Asp Gin 1093
gat gca aca Asp Ala Thr 305 tac ttt ggg gct ttt aaa gtt ega Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Arg 310 gat ata gat Asp Ile Asp 315 tga 1138
gccccagttt ttggagtgtt atgtatttcc tggatgtttg gaaacatttt ttaaaacaag 1198
ccaagaaaga tgtatatagg tgtgtgagac tactaagagg catggcccca acggtacacg 1258
actcagtatc catgctcttg accttgtaga gaacacgcgt atttacagcc agtgggagat 1318
gttagactca tggtgtgtta cacaatggtt tttaaatttt gtaatgaatt l cctagaatta 1378
aaccagattg gagcaattac gggttgacct tatgagaaac tgcatgtggg ctatgggagg 1438
ggttggtccc tggtcatgtg ccccttcgca gctgaagtgg agagggtgtc atetagegea 1498
attgaaggat catctgaagg ggcaaattct tttgaattgt tacatcatgc tggaacctgc 1558
aaaaaatact ttttctaatg aggagagaaa atatatgtat ttttatataa tatctaaagt 1618
tatatttcag atgtaatgtt ttctttgcaa agtattgtaa attatatttg tgctatagta 1678
tttgattcaa aatatttaaa aatgtcttgc tgttgacata tttaatgttt taaatgtaca 1738
gacatattta actggtgcac tttgtaaatt ccctggggaa aacttgcagc taaggagggg 1798
aaaaaaatgt tgtttcctaa tatcaaatgc agtatatttc ttcgttcttt ttaagttaat 1858
agattttttc agacttgtca agcctgtgca aaaaaattaa aatggatgcc ttgaataata 1918
agcaggatgt tggccaccag gtgcctttca aatttagaaa ctaattgact ttagaaagct 1978
gacattgcca aaaaggatac ataatgggcc actgaaatct gtcaagagta gttatataat 2038
tgttgaacag gtgtttttcc acaagtgccg caaattgtac cttttttttt ttttcaaaat 2098
agaaaagtta ttagtggttt atcagcaaaa aagtccaatt ttaatttagt aaatgttatc 2158
ttatactgta caataaaaac attgcctttg aatgttaatt ttttggtaca aaaataaatt 2218
tatatgaaaa aaaaaaaaaa agggcggccg ctctagaggg ccctattcta tag 2271
<210> 2 <211> 317 <212> PRT <213> Homo sapiens
<400> 2 Met Arg 1 Arg Ala Ser Arg Asp 5 Tyr Thr Lys Tyr 10 Leu Arg Gly Ser 15 Glu
Glu Met Gly Gly Gly Pro Gly Ala Pro His Glu Gly Pro Leu His Ala
20 25 30
Pro Pro Pro Pro Ala Pro His Gin Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser Met
35 40 45
Phe Val Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Gly Gin Val Val Cys Ser Val
50 55 60
Ala Leu Phe Phe Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile Ser
65 70 75 80
Glu Asp Gly Thr His Cys Ile Tyr Arg Ile Leu Arg Leu His Glu Asn
85 90 95
Ala Asp Phe Gin Asp Thr Thr Leu Glu Ser Gin Asp Thr Lys Leu Ile
100 105 110
Pro Asp Ser Cys Arg Arg Ile Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val Gin
115 120 125
Lys Glu Leu Gin His Ile Val Gly Ser Gin His Ile Arg Ala Glu Lys
130 135 140
Ala Met Val Asp Gly Ser Trp Leu Asp Leu Ala Lys Arg Ser Lys Leu
145 150 155 160
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Thr Asp Ile Pro
165 170 175
Ser Gly Ser His Lys Val Ser Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
180 185 190
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Phe Ser Asn Gly Lys Leu Ile Val
195 200 205
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
210 215 220
His Glu Thr Ser Gly Asp Leu Ala Thr Glu Tyr Leu Gin Leu Met Val
225 230 235 240
Tyr Val Thr Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Thr Leu Met
245 250 255
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Tyr Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe ·· ··· ·
260 265 270
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ser Gly Glu Glu
275 280 285 -
Ile Ser Ile Glu Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
290 295 300
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Arg Asp Ile Asp
305 310 315 <210> 3 <211> 951 <212> DNA <213> Mus musculus <220>
<221> CDS <222> (1) .. (951) <220>
<221> různé vlastnosti <222> (142) .. (213)
Transmembránova doména <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (454?..(948) <223> doména podobná faktoru nekrosy nádorů (TNF) <400> 3
atg Met 1 cgc Arg cgg Arg gcc Ala age Ser 5 ega Arg gac Asp tac ggc aag Lys 10 tac Tyr ctg Leu cgc Arg age Ser tcg Ser 15 gag Glu 48
Tyr Gly
gag atg ggc age ggc ccc ggc gtc cca cac gag ggt ccg ctg cac ccc 96
Glu Met Gly Ser Gly Pro Gly Val Pro His Glu Gly Pro Leu His Pro
20 25 30
gcg cct tet gca ccg gct ccg gcg ccg cca ccc gcc gcc tcc cgc tcc 144
Ala Pro Ser Ala Pro Ala Pro Ala Pro Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser
35 40 45
atg ttc ctg gcc ctc ctg ggg ctg gga ctg ggc cag gtg gtc tgc age 192
Met Phe Leu Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Gly Gin Val Val Cys Ser
50 55 60
atc gct ctg ttc ctg tac ttt ega gcg cag atg gat cct aac aga ata 240
Ile Ala Leu Phe Leu Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile
65 70 75 80
·· ··«·
tea Ser gaa Glu gac Asp agc act cac His tgc Cys ttt Phe tat aga atc Ile ctg Leu aga Arg ctc Leu cat His 95 gaa Glu 288
Ser Thr 85 Tyr Arg 90
aac gca ggt ttg cag gac tcg act ctg gag agt gaa gac aca cta cct 336
Asn Ala Gly Leu Gin Asp Ser Thr Leu Glu Ser Glu Asp Thr Leu Pro
100 105 110
gac tcc tgc agg agg atg aaa caa gcc ttt cag ggg gcc gtg cag aag 384
Asp Ser Cys Arg Arg Met Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val Gin Lys
115 120 125
gaa ctg caa cac att gtg ggg cca cag cgc ttc tea gga get cca get 432
Glu Leu Gin His Ile Val Gly Pro Gin Arg Phe Ser Gly Ala Pro Ala
130 135 140
atg atg gaa ggc tea tgg ttg gat gtg gcc cag ega ggc aag cct gag 480
Met Met Glu Gly Ser Trp Leu Asp Val Ala Gin Arg Gly Lys Pro Glu
145 150 155 160
gcc cag cca ttt gca cac ctc acc atc aat get gcc agc atc cca tcg 528
Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro Ser
165 170 175
ggt tcc cat aaa gtc act ctg tcc tet tgg tac cac gat ega ggc tgg 576
Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp
180 185 190
gcc aag atc tet aac atg acg tta agc aac gga aaa cta agg gtt aac 624
Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn
195 200 205
caa gat ggc ttc tat tac ctg tac gcc aac att tgc ttt cgg cat cat 672
Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His His
210 215 220
gaa aca tcg gga agc gta cct aca gac tat ctt cag ctg atg gtg tat 720
Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr
225 230 235 240
gtc gtt aaa acc agc atc aaa atc cca agt tet cat aac ctg atg aaa 768
Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met Lys
245 250 255
gga ggg agc acg aaa aac tgg tcg ggc aat tet gaa ttc cac ttt tat 816
Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr
260 265 270
tcc ata aat gtt ggg gga ttt ttc aag ctc ega get ggt gaa gaa att 864
Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile
275 280 285
·· ···« ·*·
age att cag Gin gtg Val tcc aac Ser Asn cct Pro 295 tcc Ser ctg Leu ctg gat Leu Asp ccg Pro 300 gat Asp caa gat gcg Gin Asp Ala 912
Ser Ile 290
acg tac ttt ggg get ttc aaa gtt cag gac ata gac tga 951
Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
305 310 315
<210> 4 <211> 316 <212> PRT <213> Mus musculus
<400> 4 Arg Asp Tyr Gly Lys 10 Tyr Leu Arg Ser Ser 15 Glu
Met 1 Arg Arg Ala Ser 5
Glu Met Gly Ser Gly Pro Gly Val Pro His Glu Gly Pro Leu His Pro
20 25 30
Ala Pro Ser Ala Pro Ala Pro Ala Pro Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser
35 40 45
Met Phe Leu Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Gly Gin Val Val Cys Ser
50 55 60
Ile Ala Leu Phe Leu Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile
65 70 75 80
Ser Glu Asp Ser Thr His Cys Phe Tyr Arg Ile Leu Arg Leu His Glu
85 90 95
Asn Ala Gly Leu Gin Asp Ser Thr Leu Glu Ser Glu Asp Thr Leu Pro
100 105 110
Asp Ser Cys Arg Arg Met Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val Gin Lys
115 120 125
Glu Leu Gin His Ile Val Gly Pro Gin Arg Phe Ser Gly Ala Pro Ala
130 135 140
Met Met Glu Gly Ser Trp Leu Asp Val Ala Gin Arg Gly Lys Pro Glu
145 150 155 160
Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asr. Ala Ala Ser Ile Pro Ser
165 170 175
Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp
180 185 190
Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn
195 200 205
·· ···« 99 e
·· 9 ··
·♦· • · ··· 9 9
* t · * 9 9 9
• · • · · 9 9
99 »· 999 99 99'
Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu 215 Tyr Ala Asn Ile Cys 220 Phe Arg His His
210
Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr
225 230 235 240
Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met Lys
245 250 255
Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr
260 265 270
Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile
275 280 285
Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala
290 295 300
Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
305 310 315
<210> 5 <211> 2299 <212> DNA <213> Mus musculus <220>
<221> CDS <222> (170)..(1120) <400> 5 gagctcggat ccactactcg acccacgcgt ccgcccacgc gtccggccag gacctctgtg 60 aaccggtcgg ggcgggggcc gcctggccgg gagtctgctc ggcggtgggt ggccgaggaa 120 gggagagaac gatcgcggag cagggcgccc gaactccggg cgccgcgcc atg cgc cgg 178 Met Arg Arg
gcc Ala agc Ser 5 ega Arg gac Asp tac Tyr ggc aag tac ctg Leu cgc agc Arg Ser tcg Ser 15 gag Glu gag atg Glu Met ggc Gly
Gly Lys 10 Tyr
agc ggc ccc ggc gtc cca cac gag ggt ccg ctg cac ccc gcg cct tet
Ser Gly Pro Gly Val Pro His Glu Gly Pro Leu His Pro Ala Pro Ser
20 25 30 35
gca ccg get ccg gcg ccg cca ccc gcc gcc tcc cgc tcc atg ttc ctg
Ala Pro Ala Pro Ala Pro Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser Met Phe Leu
40 45 50
gcc Ala ctc Leu ctg Leu ggg Gly 55 ctg Leu gga Gly ctg Leu ggc cag gtg Val gtc Val tgc Cys agc Ser atc Ile 65 gct Ala ctg Leu 370
Gly Gin 60
ttc ctg tac ttt ega gcg cag atg gat cct aac aga ata tea gaa gac 418
Phe Leu Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile Ser Glu Asp
70 75 80
agc act cac tgc ttt tat aga atc ctg aga ctc cat gaa aac gca ggt 466
Ser Thr His Cys Phe Tyr Arg Ile Leu Arg Leu His Glu Asn Ala Gly
85 90 95
ttg cag gac tcg act ctg gag agt gaa gac aca cta cct gac tcc tgc 514
Leu Gin Asp Ser Thr Leu Glu Ser Glu Asp Thr Leu Pro Asp Ser Cys
100 105 110 115
agg agg atg aaa caa gcc ttt cag ggg gcc gtg cag aag gaa ctg caa 562
Arg Arg Met Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val Gin Lys Glu Leu Gin
120 125 130
cac att gtg ggg cca cag ege ttc tea gga gct cca gct atg atg gaa 610
His Ile Val Gly Pro Gin Arg Phe Ser Gly Ala Pro Ala Met Met Glu
135 140 145
ggc tea tgg ttg gat gtg gcc cag ega ggc aag cct gag gcc cag cca 658
Gly Ser Trp Leu Asp Val Ala Gin Arg Gly Lys Pro Glu Ala Gin Pro
150 155 160
ttt gca cac ctc acc atc aat gct gcc agc atc cca tcg ggt tcc cat 706
Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro Ser Gly Ser His
165 170 175
aaa gtc act ctg tcc tet tgg tac cac gat ega ggc tgg gcc aag atc 754
Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp Ala Lys Ile
180 185 190 195
tet aac atg acg tta agc aac gga aaa cta agg gtt aac caa gat ggc 8 02
Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn Gin Asp Gly
200 205 210
ttc tat tac ctg tac gcc aac att tgc ttt cgg cat cat gaa aca tcg 850
Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His His Glu Thr Ser
215 220 225
gga agc gta cct aca gac tat ctt cag ctg atg gtg tat gtc gtt aaa 898
Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr Val Val Lys
230 235 240
acc agc atc aaa atc cca agt tet cat aac ctg atg aaa gga ggg agc 946
Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met Lys Gly Gly Ser
245 250 255
acg aaa aac tgg tcg ggc aat tet gaa ttc cac ttt tat tcc ata aat 994
Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr Ser Ile Asn
260 265 270 275
gtt ggg gga ttt ttc aag ctc ega gct ggt gaa gaa att agc att cag 1042
Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile Ser Ile Gin
280 285 290
gtg tcc aac cct tcc ctg ctg gat ccg gat caa gat gcg acg tac ttt 1090
Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala Thr Tyr Phe
295 300 305
ggg gct ttc aaa gtt cag gac ata gac tga gaeteattte i gtggaacatt 1140
Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
310 315
agcatggatg tcctagatgt ttggaaactt cttaaaaaat ggatgatgtc tatacatgtg 1200
taagactact aagagacatg gcccacggtg tatgaaactc acagccctct ctcttgagcc 1260
tgtacaggtt gtgtatatgt aaagtccata ggtgatgtta gattcatggt gattacacaa 1320
cggttttaca attttgtaat gatttcctag aattgaacca gattgggaga ggtattccga 1380
tgcttatgaa aaacttacac gtgagctatg gaagggggtc acagtctctg ggtctaaccc 1440
ctggacatgt gccactgaga accttgaaat taagaggatg ccatgtcatt gcaaagaaat 1500
gatagtgtga agggttaagt tcttttgaat tgttacattg cgctgggacc tgcaaataag 1560
ttcttttttt ctaatgagga gagaaaaata tatgtatttt tatataatgt ctaaagttat 1620
atttcaggtg taatgttttc tgtgcaaagt tttgtaaatt atatttgtgc tatagtattt 1680
gattcaaaat atttaaaaat gtctcactgt tgacatattt aatgttttaa atgtacagat 1740
gtatttaact ggtgcacttt gtaattcccc tgaaggtact cgtagctaag ggggcagaat 1800
actgtttctg gtgaccacat gtagtttatt tetttattet ttttaactta atagagtett 1860
cagacttgtc aaaactatgc aagcaaaata aataaataaa aataaaatga ataccttgaa 1920
taataagtag gatgttggtc accaggtgcc tttcaaattt agaagctaat tgactttagg 1980
agctgacata gccaaaaagg atacataata ggctactgaa atctgtcagg agtatttatg 2040
caattattga acaggtgtct ttttttacaa gagctacaaa ttgtaaattt tgtttctttt 2100
ttttcccata gaaaatgtac tatagtttat cagccaaaaa acaatccact ttttaattta 2160
gtgaaagtta ttttattata ctgtacaata aaagcattgt ctctgaatgt taattttttg 2220
gtacaaaaaa taaatttgta cgaaaacctg aaaaaaaaaa aaaaaaaggg cggccgctct 2280 • · · • · · agagggccct attctatag
2299 <210> 6 <211> 316 <212> PRT <213> Mus musculus
<400> 6 Ala Ser 5 Arg Asp Tyr Gly Lys 10 Tyr Leu Arg Ser Ser 15 Glu
Met 1 Arg Arg
Glu Met Gly Ser Gly Pro Gly Val Pro His Glu Gly Pro Leu His Pro
20 25 30
Ala Pro Ser Ala Pro Ala Pro Ala Pro Pro Pro Ala Ala Ser Arg Ser
35 40 45
Met Phe Leu Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Gly Gin Val Val Cys Ser
50 55 60
Ile Ala Leu Phe Leu Tyr Phe Arg Ala Gin Met Asp Pro Asn Arg Ile
65 70 75 80
Ser Glu Asp Ser Thr His Cys Phe Tyr Arg Ile Leu Arg Leu His Glu
85 90 95
Asn Ala Gly Leu Gin Asp Ser Thr Leu Glu Ser Glu Asp Thr Leu Pro
100 105 110
Asp Ser Cys Arg Arg Met Lys Gin Ala Phe Gin Gly Ala Val Gin Lys
115 120 125
Glu Leu Gin His Ile Val Gly Pro Gin Arg Phe Ser Gly Ala Pro Ala
130 135 140
Met Met Glu Gly Ser Trp Leu Asp Val Ala Gin Arg Gly Lys Pro Glu
145 150 155 160
Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro Ser
165 170 175
Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp
180 185 190
Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn
195 200 205
Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His His
210 215 220
Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr
225 230 235 240
• · · ·
Val Val Lys Thr Ser 245 Ile Lys Ile Pro Ser 250 Ser His Asn Leu Met 255 Lys
Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr
260 265 270
Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile
275 280 285
Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Tkla
290 295 300
Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
305 310 315
<210> 7 <211> 564 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<221> CDS <222> (1)..(564) <220>
<223> Popis artificiální sekvence: Syntetický PCR produkt s optimálními kodony pro expresi v E.coli a P. pastoris <220>
<221> různé navázané složky <222> (43)..(84) <223> : His koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1).7(36) <223> c-koncová část α-párovaciho faktoru S.cerevisiae <220>
<221> různé vlastnosti <222> (85)..(561) <223> kódující zbytky 158-316 přirozeného myšího OPGL <400> 7 gag ctc gga tcc ctc gag aaa aga gag gct gaa gct cat gtc atg aaa 48
Glu Leu Gly Ser Leu Glu Lys Arg Glu Ala Glu Ala His Val Met Lys
10 15
cac His caa Gin cac His caa Gin 20 cat His caa Gin cat His caa Gin cat His 25 caa Gin cat His caa Gin aaa Lys cct Pro 30 gaa Glu gct Ala 96
cag cca ttc gct cat ctg acc atc aac gct gca tcg atc cct tet ggt 144
Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro Ser Gly
35 40 45
tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac ege ggt tgg gct 192
Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp Ala
50 55 60
aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt aac cag 240
Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn Gin
65 70 75 80
gac ggt ttc tac tac ctg tac gct aac atc tgt ttc aga cat cac gaa 288
Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His His Glu
85 90 95
acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt tac gtt 336
Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr Val
100 105 110
gtt aaa acc tet atc aaa atc cca tet tca cat aac ctg atg aaa ggt 384
Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met Lys Gly
115 120 125
ggt tet acc aaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc tac tet 432
Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr Ser
130 135 140
atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa atc tet 480
Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile Ser
145 150 155 160
atc cag gtt tet aac cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac gct acc 528
Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala Thr
165 170 175
tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac tag 564
Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 185 <210> 8 <211> 187 <212> PRT <213> Artificiálni sekvence <223> popis artificiálni sekvence: Syntetický PCR produkt s optimálními kodony pro expresi v E.coli a P. pastoris • ·
6 .
<400> 8
Glu 1 Leu Gly Ser Leu Glu Lys 5 Arg Glu Ala 10 Glu Ala His Val Met 15 Lys
His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin Lys Pro Glu Ala
20 25 30
Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro Ser Gly
35 40 45
Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly Trp Ala
50 55 60
Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val Asn Gin
65 70 75 80
Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His His Glu
85 90 95
Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val Tyr Val
100 105 110
Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met Lys Gly
115 120 125
Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr Ser
130 135 140
Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile Ser
145 150 155 160
Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala Thr
165 170 175
Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 185
<210> 9 <211> 519 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> pOpis artificiální sekvence: DNA kódující zbytky 158-316 přirozeného myšíh OPGL fúzovaná na His koncovku <220>
<221> CDS <222> (1)..(519) <220>
<221> různé navázané složky <222> (1).7(42) <223> His koncová <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43)..(519) <223> zbytky 158-316 myšího OPGL 5 <400> 9
atg Met 1 aaa Lys cac His caa Gin cac His 5 caa Gin cat His caa Gin cat His caa Gin 10 cat His caa Gin cat His caa Gin aaa Lys 15 cct Pro 48
gaa gct cag cca ttc gct cat ctg acc atc aac gct gca tcg atc cct 96
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
tet ggt tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac cgc ggt 144
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
tgg gct aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac gct aac atc tgt ttc aga cat 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
cac gaa acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt 288
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
tac gtt gtt aaa acc tet atc aaa atc cca tet tea cat aac ctg atg 336
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
aaa ggt ggt tet acc aaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc 384
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
tac tet atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa 432
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
atc tet atc cag gtt tet aac cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac 480
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
145 150 155 160 gct acc tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
519 <210> 10 <211> 173 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <223> Popis artificiální sekvence: DNA kódující zbytky 158-316 přirozeného myšíhc OPGL fúzovaná na His koncovku <400> 10 ~
Met 1 Lys His Gin His 5 Gin His Gin His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
145 150 155 160
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
<210> 11 <211> 519 <212> DNA <213>
Artificiální sekvence <220>
<223> popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, s mutací C na S, a His koncovky
I <220>
<221> CDS <222> (1)..(519) <220>
<221> různé navázané složky <222> (1) . . (42) <223:: His koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43)..(228) <223> 1 zbytky 158-219 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (232)..(519) <223> .zbytky 221-316 myšího OPGL <220>
<221> Mutace <222> (229)..(231) <223> ttgt (Cys) na tcc (Ser) <220>
<400> 11
atg Met 1 aaa Lys cac His caa Gin cac His 5 caa Gin cat His caa Gin cat His caa Gin 10 cat His caa Gin cat His caa Gin aaa Lys 15 cct Pro 48
gaa get cag cca ttc get cat ctg acc atc aac get gca tcg atc cct 96
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
tet ggt tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac ege ggt 144
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
tgg get aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac get aac atc tec ttc aga cat 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Ser Phe Arg His
65 70 75 80
cac gaa acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt 288
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
tac Tyr gtt Val gtt Val aaa Lys 100 acc Thr tet Ser atc Ile aaa Lys atc Ile 105 cca Pro tet Ser tea Ser cat His aac Asn 110 ctg Leu atg Met 336
aaa ggt ggt tet acc aaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc 304
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
tac tet atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga get ggt gaa gaa 432
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
atc tet atc cag gtt tet aac cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac 480
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
145 150 155 160
get acc tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac 519
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
<210> 12 <211> 173 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <223> Popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, s mutací C na S, a His koncovky
<400> 12 Gin His 5 Gin His Gin His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Met 1 Lys His
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Ser Phe Arg His
65 70 75 80
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
· ·♦ ··♦·
Tyr Ser 130 Ile Asn Val Gly Gly 135 Phe Phe Lys Leu Arg Ala 140 Gly Glu Glu
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp-Gin Asp
145 150 155 160
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
<210> 13 <211> 564 <212> DNA <213>
Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, modifikovaných vložením P30 epitopů tet·»”4 ”kého toxoidu, a His koncovky <220>
<221> CDS <222> (1)..(564) <220>
<221> různé navázané složky <222> (1)..(42) <223> hís koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43)..(336) <223> zbytky 158-255 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (337) .. (399) <223> ~p30 epitop tetanického toxoidu <220>
<221> různé vlastnosti <222> (400) .. (564) <223> zbytky 262-316 myšího OPGL <400> 13 atg aaa cac caa cac caa cat caa cat caa cat caa cat caa aaa cct 48
Met Lys His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin Lys Pro
10 15 • · «««·
gaa Glu gct Ala cag Gin cca Pro 20 ttc Phe gct Ala cat His ctg Leu acc Thr 25 atc Ile aac Asn gct Ala gca Ala tcg Ser 30 atc Ile cct Pro 96
tet ggt tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac cgc ggt 144
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
tgg gct aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac gct aac atc tgt ttc aga cat 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
cac gaa acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt 288
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
tac gtt gtt aaa acc tet atc aaa atc cca tet tca cat aac ctg atg 336
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
ttc aac aac ttc acc gtt tet ttc tgg ctg agg gta ccg aaa gtt tet 384
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser
115 120 125
gct tet cac ctg gaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc tac 432
Ala Ser His Leu Glu Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr
130 135 140
tet atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa atc 480
Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile
145 150 155 160
tet atc cag gtt tet aac cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac gct 528
Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala
165 170 175
acc tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac 564
Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 185 <210> 14 <211> 188 <212> PRT <213>
<223>
Artificiální sekvence
Popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, modifikovaných vložením P30 epitopů tetanického toxoidu, a His koncovky • W ···· • · • ··· .83
<400> 14
Met 1 Lys His Gin His 5 Gin His Gin His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser
115 120 125
Ala Ser His Leu Glu Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr
130 135 140
Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile
145 150 155 160
Ser Ile Gin Val Ser As n Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala
165 170 175
Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 185
<210> 15 <211> 546 <212> DNA <213>
Artificiálni sekvence <220>
<223> Popis artificiálni sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, P2 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky s vložením <220>
<221> CDS <222> (1)..(546)
84, • ·ΦΦ <220>
<221> různé ná vázané složky <222> (1)..(42) <223> His koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43)..(336) <223> izbytky 158-255 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (382)..(546) <223> zbytky 262-316 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (337?..(3Θ1) <223> ' P2 epitop tetanického toxoid» <400> 15
atg Met 1 aaa Lys cac His caa Gin cac His 5 caa Gin cat His caa Gin cat His caa Gin 10 cat His caa Gin cat His caa Gin aaa Lys 15 cct Pro 48
gaa get cag cca ttc get cat ctg acc atc aac get gca tcg atc cct 96
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
tet ggt tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac ege ggt 144
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
tgg get aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac get aac atc tgt ttc aga cat 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
cac gaa acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt 288
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
tac gtt gtt aaa acc cct atc aaa atc caa tet tca cat aac ctg atg 336
Tyr Val Val Lys Thr Pro Ile Lys Ile Gin Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
cag tac atc aaa get aat tcg aaa ttc atc ggt atc acc gaa ctg aac 384
Gin Tyr Ile Lys Ada Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu Asn
115 120 125
··· ·
tgg Trp tet Ser 130 ggt Gly aac tet gaa ttc Phe 135 cat His ttc tac Phe Tyr tet Ser atc aac gtt Val ggt Gly ggt Gly 432
Asn Ser Glu Ile 140 Asn
ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa atc tet atc cag gtt tet aac 480
Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn
145 150 155 160
cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac gct acc tac ttc ggg gcc ttc 528
Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe
165 170 175
aaa gtt cag gac atc gac 546
Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 <210> 16 <211> 182 <212> PRT c213> Artificiální sekvence c223> pOpis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL. zbytků 158-316, *P2 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky s vložením
<400> 16 His Gin His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Met 1 Lys His Gin His 5 Gin
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
Tyr Val Val Lys Thr Pro Ile Lys Ile Gin Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Gin Tyr Ile Lys Ala Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu Asn
115 120 125
Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly
130 135 140
• · · » · • ··♦
Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn
145 150 155 160
Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe
165 170 175
Lys Val Gin Asp Ile Asp
180 <210> 17 <211> 519 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, P2 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky <220>
<221> CDS <222> (1) . .(519) <220>
<221> různé navázané složky <222> (1) . . (42) <223> His koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43) .. (432) <223> i zbytky 158-287 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (478)..(519) <223> zbytky 303-316 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (433).. (477) <223> p2 epitop tetanického toxoidu <400> 17 s vložením
atg Met 1 aaa Lys cac His caa Gin cac His 5 caa Gin cat His caa Gin cat His caa Gin 10 cat His caa Gin cat His caa Gin aaa Lys 15 cct Pro 48
gaa gct cag cca ttc gct cat ctg acc atc aac gct gca tcg atc cct 96
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ada Ser Ile Pro
20 25 30
·♦·· !
tet Ser ggt Gly tet Ser 35 cat His aaa Lys gtt Val acc Thr ctg Leu 40 tet Ser tet Ser tgg Trp tat Tyr cac His 45 gac Asp ege Arg ggt Gly 144
tgg gct aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac gct aac atc tgt ttc aga cat 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
cac gaa acc tet ggt tet gtt cca acc gac tac ctg cag ctg atg gtt 2Θ8
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
tac gtt gtt aaa acc tet atc aaa atc cca tet tea cat aac ctg atg 336
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
aaa ggt ggt tet acc aaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc 384
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
tac tet atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa 432
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
cag tac atc aaa gct aat tcg aaa ttc atc ggt atc acc gaa ctg gac 480
Gin Tyr Ile Lys Ala Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu Asp
145 150 155 160
gct acc tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac 519
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170 <210> 18 <211> 173 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <223>
Popis artificiální sekvence: Fuze myšxho OPGL, zbytků 158—316
P2 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky s vložením <400> 18
Met 1 Lys His Gin His 5 Gin His Gin
Glu Ala Gin Pro 20 Phe Ala His Leu
His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly ··
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60 -
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Arg His
65 70 75 80
His Glu Thr Ser Gly Ser Val Pro Thr Asp Tyr Leu Gin Leu Met Val
85 90 95
Tyr Val Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
Gin Tyr Ile Lys Ala Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu Asp
145 150 155 160
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
<210> 19 <211> 519 <212> DNA <213>
Artificiální sekvence <220>
<223> popis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, s vložením P30 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky <220>
<221> CDS <222> (1)..(519) <220>
<221> různé navázané složky <222> (1)..(42) <223> His koncovka <220>
<221> různé vlastnosti <222> (43). . (231) <223> zbytky 158-220 myšího OPGL <220>
různé vlastnosti <221>
<222> (295) .. (519) <223> zbytky 242-316 myšího OPGL <220>
<221> různé vlastnosti <222> (232)..(294) <223> P30 epitop tetanického toxoidu <400> 19
atg Met 1 aaa Lys cac His caa Gin cac His 5 caa Gin cat His caa Gin cat His caa Gin 10 cat His caa Gin cat His caa Gin aaa Lys 15 cct Pro 48
gaa gct cag cca ttc gct cat ctg acc atc aac gct gca tcg atc cct 96
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
tet ggt tet cat aaa gtt acc ctg tet tet tgg tat cac gac cgc ggt 144
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
tgg gct aaa atc tet aac atg acc ctg tet aac ggt aaa ctg aga gtt 192
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
aac cag gac ggt ttc tac tac ctg tac gct aac atc tgt ttc aac aac 240
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Asn Asn
65 70 75 80
ttc acc gtt tet ttc tgg ctg agg gta ccg aaa gtt tet gct tet cac 288
Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser Ala Ser His
85 90 95
ctg gaa gtt aaa acc tet atc aaa atc cca tet tea cat aac ctg atg 336
Leu Glu Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
aaa ggt ggt tet acc aaa aac tgg tet ggt aac tet gaa ttc cat ttc 384
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
tac tet atc aac gtt ggt ggt ttc ttc aaa ctg aga gct ggt gaa gaa 432
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
atc tet atc cag gtt tet aac cct tet ctg ctg gac cca gac cag gac 480
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
145 150 155 160 gct acc tac ttc ggg gcc ttc aaa gtt cag gac atc gac
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
519 • · ··· · <210> 20 <211> 173 <212> PRT
Artificiální sekvence
P°Pis artificiální sekvence: Fúze myšího OPGL, zbytků 158-316, P30 epitopu tetanického toxoidu, a His koncovky s vložením <400> 20
Met 1 Lys His Gin His 5 Gin His Gin His Gin 10 His Gin His Gin Lys 15 Pro
Glu Ala Gin Pro Phe Ala His Leu Thr Ile Asn Ala Ala Ser Ile Pro
20 25 30
Ser Gly Ser His Lys Val Thr Leu Ser Ser Trp Tyr His Asp Arg Gly
35 40 45
Trp Ala Lys Ile Ser Asn Met Thr Leu Ser Asn Gly Lys Leu Arg Val
50 55 60
Asn Gin Asp Gly Phe Tyr Tyr Leu Tyr Ala Asn Ile Cys Phe Asn Asn
65 70 75 80
Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser 711a Ser His
85 90 95
Leu Glu Val Lys Thr Ser Ile Lys Ile Pro Ser Ser His Asn Leu Met
100 105 110
Lys Gly Gly Ser Thr Lys Asn Trp Ser Gly Asn Ser Glu Phe His Phe
115 120 125
Tyr Ser Ile Asn Val Gly Gly Phe Phe Lys Leu Arg Ala Gly Glu Glu
130 135 140
Ile Ser Ile Gin Val Ser Asn Pro Ser Leu Leu Asp Pro Asp Gin Asp
145 150 155 160
Ala Thr Tyr Phe Gly Ala Phe Lys Val Gin Asp Ile Asp
165 170
<210> 21 <211> 68 <212> DNA <213> Artificiální.sekvence <223> popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <220>
···· ·· 9· •4 •* •4
91
<400> 21
agctgcaggt agtcggttgg aacagaacca gaggtttcgt gatgtctgaa acagatgtta 60
gcgtacag 68
<210> 22 <211> 24 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> pOpis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 22 ctcatctgac catcaacgct gcat 24 <210> 23 <211> 64 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 23 tttcggtacc ctcagccaga aagaaacggt gaagttgttg aaacagatgt tagcgtacag 60 gtag 64 <210> 24 <211> 61 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> 1 Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 24 tgagggtacc gaaagtttct gcttctcacc tggaagttaa aacccctatc aaaatccaat 60 c 61 <210> 25 <211> 63 <212> DNA <213>
Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer
• 44 ···· • 4 V
44 · 4 4 4 4 44
• ··· • 4 4·· 4 4 4
• · 4 • · 4 4 4 4
• · · • * 4 4 4 4
··· 44 ·· ··· 44 4 4 «
<400> 25 tttcggtacc ctcagccaga aagaaacggt gaagttgttg aacatcaggt tatgtgaaga 60 ttg 63 <210> 26 <211> 62 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 26 tgagggtacc gaaagtttct gcttctcacc tggaaaactg gtctggtaac tctgaattcc 60 at 62 <210> 27 <211> 79 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 27 tacctgcagc tgatggttta cgttgttaaa acccctatca aaatccaatc ttcacataac 60 ctgatgcagt acatcaaag 79 <210> 28 <211> 83 <212> DNA <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Popis artificiální sekvence: syntetický PCR primer <400> 28 tggaattcag agttaccaga ccagttcagt tcggtgatac cgatgaattt cgaattagct ttgatgtact gcatcaggtt atg <210> 29 <211> 49 <212> DNA <213> , Artificiální sekvence • · · • · · ·
<220>
<223> Popis artificiálni sekvence: syntetický PCŘ'primer <400> 29 gaatttcgaa ttagctttga tgtactgttc ttcaccagct ctcagtttg 49 <210> 30 <211> 53 <212> DNA <213> Artificiálni sekvence <220>
<223> popis artificiálni sekvence: syntetický PCR primer <400> 30 gctaattcga aattcatcgg tatcaccgaa ctggacgcta cctacttcgg ggc 53 <210> 31 <211> 26 <212> DNA <213> Artifx··.. sekvence <220>
<223> popis artificiálni sekvence: syntetický PCR primer <400> 31 cttactagtc gatgtcctga actttg <210> 32 <211> 74 <212> DNA <213> . Artificiálni sekvence <220>
<223> popis artificiálni sekvence: syntetický PCR primer <400> 32 agtggaattc agagttacca gaccagtttt tggtagaacc acctttcatc aggttatgtg 60 aagatgggat tttg 74 <210> 33 <211> 65 <212> DNA <213> Clostridium tetani <400> 33 actacctgca gctgatggtt tacgttgtta aaacctctat caaaatccca tcttcacata 60 acctg 65 <210> 34 <211> 15 <212> PRT <213> Clostridium tetani <400> 34
Gin Tyr Ile Lys Ala Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu 15 10 15 <210> 35 <211> 21 <212> PRT <213> Clostridium tetani <400> 35
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser 15 10 15
Ala Ser His Leu Glu
Patentové

Claims (56)

1. Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin (OPGL) u zvířete, včetně člověka, vyznačující se tím, že zahrnuje účinnou prezentaci imunologicky účinného činidla imunitnímu systému živočicha, kde uvedené činidlo je vybráno z
- alespoň jednoho OPGL polypeptidů nebo jeho subsekvence, které byly připraveny tak, že imunizace živočicha OPGL polypeptidem nebo jeho subsekvencí indukuje produkci protilátek proti OPGL polypeptidů; a/nebo
- alespoň jednoho analogu OPGL obsahujícího alespoň jednu modifikaci aminokyselinové sekvence OPGL, kde imunizace živočicha analogem indukuje tvorbu protilátek proti OPGL polypeptidů;
kde vlastní OPGL zvířete je inhibován v důsledku vazby na protilátek, kde OPGL je protein, který působí jako diferenciační faktor pro osteoklasty a má aminokyselinovou sekvenci podle SEQ ID NO: 2 pro lidský OPGL a SEQ ID NO: 4 a 6 pro myší OPGL.
2. Způsob podle nároku lvyznačující se tím, že je prezentován analog OPGL s alespoň jednou modifikací aminokyselinové sekvence OPGL.
3. Způsob podle nároku 2vyznačující se tím, že modifikace vede k tomu, že je zachována významná frakce Blymfocytárních epitopů OPGL a že
- je vložen alespoň jeden T-pomocný lymfocytární epitop (Th epitop), a/nebo
- je vložena alespoň jedna první skupina, která způsobuje cílené dodání modifikované molekuly buňkám prezentujícím antigen (APC) nebo B-lymfocytům, a/nebo
ΦΦ·· • φ φφφφ
- je vložena alespoň jedna druhá skupina, která stimuluje imunitní systém, a/nebo
- je vložena alespoň jedna třetí skupina, která optimalizuje prezentaci modifikovaného OPGL polypeptidů imunitnímu systému.
4. Způsob podle nároku 3vyznačující se tím, že modifikace zahrnuje vložení cizorodého Th epitopů a/nebo první a/nebo druhé a/nebo třetí skupiny jako vedlejší skupiny, kovalentní nebo nekovalentní vazbou na vhodné chemické skupiny v OPGL nebo jeho subsekvenci.
5. Způsob podle nároků 3 nebo 4vyznačující se tím, že modifikace zahrnuje aminokyselinové substituce a/nebo delece a/nebo inserce a/nebo adice.
6. Způsob podle nároku 5vyznačující se tím, že modifikace vede ke vzniku fúzního polypeptidů.
7. Způsob podle nároků 5 nebo 6vyznačující se tím, že vložení aminokyselinové substituce a/nebo delece a/nebo inserce a/nebo adice vede k významnému zachování celkové terciární struktury OPGL.
8. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 2-7 vyznačuj ící se t i m, že modifikace zahrnuje duplikaci alespoň jednoho OPGL B-lymfocytárního epitopů a/nebo vložení haptenu.
9. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 3-8 vyznačuj ící se t i m, že cizorodý T-lymfocytární epitop je u zvířete imunodominantní.
10. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 3-9 vyznačuj íc i se t i m, že cizorodý T-lymfocytární epitop je schopen vazby na velkou část MHC molekul třídy II.
11. Způsob podle nároku 10 vyznačují' cl se tím, že alespoň jeden cizorodý T-lymfocytární epitop je vybrán z přirozeného T-lymfocytárního epitopů a .artificiálni peptidové sekvence vážící se na MHC třídy II.
12. Způsob podle nároku 11 vyznačující se tím, že přirozený T-lymfocytární epitop je vybrán ze skupiny zahrnující epitopy tetanického toxoidu, jako je P2 nebo P30, epitop difterického toxoidu, epitop hemaglutininu chřipkového viru a CS epitop P. falciparum.
13. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 3-12 vyznačující se tím, že první skupina je specifický vazebný partner pro povrchový antigen specifický pro B-lymfocyty nebo pro povrchový antigen specifický pro APC, jako je hapten nebo uhlovodan, pro který existuje receptor na B-lymfocytech nebo APC.
14. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 3-13 vyznačující se tím, že druhá skupina je vybrána z cytokinů, hormonů a proteinů teplotního šoku.
15. Způsob podle nároku 6vyznačující se tím, že cytokin je vybrán ze skupiny zahrnující interferon γ (IFNγ), Flt3L, interleukin 1 ((IL-1), interleukin 2 (IL-2), interleukin 4 (IL-4), interleukin 6 (IL-6), interleukin 12 ((IL-12), interleukin 13 ((IL-13), interleukin 15 (IL-15) a faktor stimulující kolonie granulocytů-makrofágů (GM-CSF), a tím, že protein teplotního šoku je vybrán ze skupiny zahrnující HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 a kalretikulin (CRT) nebo jejich účinné části.
16. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 3-15 vyznačující se tím, že třetí skupina má lipidový charakter, jako je palmitoylová skupina, myristylová skupina, farnesylová skupina, geranyl-geranylová skupina, GPIkotvicí skupina a N-acyldiglyceridová skupina.
17. Způsob podle jakéhokoliv z předcházejících nároků vyznačující se tím, že OPGL polypeptid nebo jeho subsekvence byla modifikována v jakékoliv z pozic 170192, v jakékoliv z pozic 198-218, v jakékoliv z pozic221-246, v jakékoliv z pozic 256-261 nebo v jakékoliv z pozic 285-316,
6 a 12, nebo tím, že OPGL polypeptid byl podle číslování aminokyselin podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 4, modifikován v jakékoliv pozic
171-193, v jakékoliv z pozic 199-219, v jakékoliv pozic
222-247, v jakékoliv z pozic 257-262 nebo v jakékoliv pozic
286-317 podle číslování aminokyselin podle
SEQ ID NO: 2.
18. Způsob podle nároku 17 vyznačující se tím, že modifikace zahrnuje substituci alespoň jedné aminokyselinové sekvence v pozicích definovaných v nároku 17 aminokyselinovou sekvencí stejné nebo jiné délky, která obsahuje cizorodý Th epitop.
19. Způsob podle nároku 18 vyznačujíc i se tím, že aminokyselinová sekvence obsahující cizorodý Th epitop substituuje aminokyseliny 256-261 a/nebo 288-302 a/nebo 221241 v SEQ ID NO: 4 nebo aminokyseliny 257-262 a/nebo 289-303 a/nebo 222-243 v SEQ ID NO: 2 nebo v polypeptidů, ve kterém byl cystein odpovídající Cys-221 substituován Ser.
·· · ♦ ···· · · • · · · · · · •·· · ···· · ·
20. Způsob podle jakéhokoliv z předcházejících nároků vyznačující se tím, že prezentace imunitnímu systému je provedena za použití alespoň dvou kopií OPGL polypeptidu, jeho subsekvence nebo modifikovaného OPGL polypeptidu, kovalentně nebo nekovalentně navázaného na molekulu nosiče, který je schopen provést účinnou prezentaci mnoha kopií antigenních determinant.
21. Způsob podle jakéhokoliv z předcházejících nároků vyznačující se tím, že OPGL polypeptid, jeho subsekvence nebo modifikovaný OPGL polypeptid byl připraven s adjuvans, které usnadňuje překonání autotolerance k autoantigenům.
22. Způsob podle jakéhokoliv z předcházejících nároků vyznačující se tím, že účinné množství OPGL polypeptidu nebo analogu OPGL je podáno zvířeti způsobem vybraným z parenterálního způsobu jako je intradermální, subdermální, intrakutání, subkutánní a intramuskulární způsob podání; orálního způsobu; bukkálního způsobu; subliguálního způsobu; epidurálního způsobu; spinálního způsobu; análního způsobu; a intrakraniálniho způsobu.
23. Způsob podle nároku 22 vyznačující se tím, že že účinné množství je od 0,5 μg do 2000 μg OPGL polypeptidu, jeho subsekvence nebo analogu.
24. Způsob podle nároku 22 nebo 23 vyznačující se tím, že OPGL polypeptid nebo analog je obsažen ve virtuální lymfatické uzlině (VLN).
25. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 1-21 vyznačující se tím, že prezentace
100
9 9 9 · · ···· «·
9 9 9 ··· ··· • ··· · 9999 9 φ ·· · · · 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9
99 9 99 99 999 99 9 modifikovaného OPGL imunitnímu systému je provedena vložením nukleové kyseliny kódující modifikovaný OPGL do buněk zvířete a takto dosažením exprese vložené nukleové kyseliny buňkami in vivo.
26. Způsob podle nároku 25 vyznačuj. ící se tím, že vložená nukleová kyselina je vybrána ze skupiny zahrnující holé DNA, DNA připravené s nabitými nebo nenabitými lipidy, DNA připravené v liposomech, DNA obsažené ve virovém vektoru, DNA připravené s proteinem nebo polypeptidem usnadňujícím transfekci, DNA připravené se proteinem nebo polypeptidem umožňujícím cílené podání, DNA připravené s vápníkovým srážecím činidlem, DNA navázané na molekulu inertního nosiče, DNA enkapsulované v chitinu nebo chitosanu a DNA připravené s adjuvans.
27. Způsob podle nároku 26 vyznačující se tím, že nukleová kyselina je obsažena ve VLN prostředku.
28. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 22-27 vyznačující se tím, že zahrnuje alespoň jedno podání/vložení za rok, jako například alespoň 2, alespoň 3, alespoň 4, alespoň 6 a alespoň 12 podání/vložení.
29. Způsob pro léčbu a/nebo prevenci a/nebo zmírnění osteoporosy nebo jiného onemocnění nebo stavu charakterizovaného nadměrnou resorpcí kosti vyznačující se tím, že zahrnuje inhibici aktivity OPGL podle jakéhokoliv z nároků 1-28 v takovém rozsahu, že rychlost resorpce kosti se významně sníží, například o alespoň 3%, alespoň 7%, alespoň 9%, alespoň 11%, alespoň 13%, alespoň 15% a alespoň 17%, alespoň 20% a alespoň 30%.
101
30. Analog OPGL, který je odvozen od OPGL polypeptidu a do kterého byla vložena modifikace, která způsobuje to, že po imunizaci zvířete analogem dochází k produkci protilátek proti OPGL polypeptidu a kde tato modifikace je definována v jakémkoliv z nároků 17-19, za současného zachování významné frakce B-lymfocytárních epitopů OPGL zvířete.
31. Analog OPGL podle nároku 30, kde modifikací je modifikace podle nároku 19.
32. Imunogenní prostředek vyznačující se tím, že obsahuje
- imunologicky účinné množství OPGL polypeptidu autologního pro zvíře, kde uvedený OPGL polypeptid je připraven společně s imunologicky přijatelným adjuvans pro překonání autotolerance zvířete k OPGL polypeptidu, kde prostředek dále obsahuje farmaceuticky a imunologicky přijatelný nosič a/nebo vehikulum, nebo
- imunologicky účinné množství analogu OPGL podle nároku 30 nebo 31, kde prostředek dále obsahuje farmaceuticky a imunologicky přijatelný nosič a/nebo vehikulum a volitelně adjuvans.
33. Fragment nukleové kyseliny, který kóduje analog OPGL podle nároku 30 nebo 31.
34. Vektor vyznačující se tím, že obsahuje fragment nukleové kyseliny podle nároku 33.
35. Vektor podle nároku 34 vyznačující se tím, že je schopen autonomní replikace.
102
36. Vektor podle nároku 34 nebo 35 vyznačující se tím, že je vybrán ze skupiny zahrnující plasmid, fág, kosmid, minichromosom a virus.
37. Vektor podle jakéhokoliv z nároků 34-36 vyznačující se tím, že obsahuje, ve směru 5'->3' a v operativní vazbě: promotor pro řízení exprese fragmentu nukleové kyseliny podle nároku 33, volitelně sekvenci nukleové kyseliny kódující vedoucí peptid umožňující sekreci nebo integraci polypeptidového fragmentu do membrány, fragment nukleové kyseliny podle nároku 33 a volitelně terminátor.
38. Vektor podle jakéhokoliv z nároků 34-37 vyznačující se tím, že po vložení do buněk je schopen nebo neschopen integrace do genomu hostitelské buňky.
39. Vektor podle nároku 37 nebo 38 vyznačující se tím, že promotor řídí expresi v eukaryotické buňce a/nebo v prokaryotické buňce.
40. Tranformovaná buňka obsahující vektor podle jakéhokoliv z nároků 34-39.
41. Transformovaná buňka podle nároku 40, která je schopna replikovat fragment nukleové kyseliny podle nároku 33.
42. Transformovaná buňka podle nároku 41, kterou je mikroorganismus vybraný z bakterií, kvasinek a protozoí, nebo buňka odvozená od mnohobuněčného organismu vybraná ze skupiny zahrnující buňky hub, hmyzí buňky jako je S2 nebo SF buňka, rostlinné buňky a savčí buňky.
43. Transformovaná buňka podle jakéhokoliv z nároků 40-42
103 ·♦ · · φφφφ φ · • · · φ φ · ·
Φ·· φ φφφφ · · φφφφ φ · · φφ φφ φφφ ·· · která exprimuje fragment nukleové kyseliny podle nároku 33.
44. Transformovaná buňka podle nároku 43, která secernuje nebo nese na svém povrchu analog OPGL podle nároku 30 nebo 31.
45. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 1-19. vyznačující se tím, že prezentace imunitnímu systému je provedena podáním nepatogenního mikroorganismu nebo viru, který nese fragment nukleové kyseliny, který kóduje a exprimuje OPGL polypeptid nebo analog.
46. Prostředek pro indukci produkce protilátek proti OPGL vyznačující se tím, že obsahuje fragment nukleové kyseliny podle nároku 33 nebo vektor podle jakéhokoliv z nároků 34-39, a
- farmaceuticky a imunologicky přijatelný nosič a/nebo vehikulum a/nebo adjuvans.
47. Stabilní buněčná linie obsahující vektor podle jakéhokoliv z nároků 34-39, která exprimuje fragment nukleové kyseliny podle nároku 33 a která volitelně secernuje nebo nese analog OPGL podle nároku 30 nebo 31 na svém povrchu.
48. Způsob přípravy buněk podle jakéhokoliv z nároků 40-44 vyznačující se tím, že zahrnuje transformaci hostitelských buněk fragmentem nukleové kyseliny podle nároku 33 nebo vektorem podle jakéhokoliv z nároků 34-39.
49. Způsob pro identifikaci modifikovaného OPGL polypeptidů, který je schopen indukovat tvorbu protilátek proti nemodifikovanému OPGL u zvířete, u kterého je nemodifikovaný OPGL polypeptid vlastním proteinem, vyznačující se tím, že zahrnuje ♦ ·· φ φ φφφφ φ φ • · · · φ · φφφ φφφφ φ φ · · φ φ ·
104 φ φ φ φ φ φφφ φφφ φφ φφ φφφ φφ
- přípravu, pomocí peptidové syntézy nebo technik genového inženýrství, sady navzájem odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů, ve kterých byly v aminokyselinové sekvenci OPGL polypeptidu daného živočišného druhu provedeny inserce, delece nebo substituce aminokyselin, které vedly ke vzniku aminokyselinových sekvencí obsahujících ,Τ-lymfocytární epitopy, které jsou cizorodé pro živočišný druh, nebo přípravu sady fragmentů nukleových kyselin kódujících sadu vzájemně odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů;
- testování členů sady modifikovaných OPGL polypeptidů nebo fragmentů nukleových kyselin na jejich schopnost indukovat produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v živočišném druhu; a
- identifikaci a volitelně izolaci členů sady modifikovaných OPGL polypeptidů, které významně indukují produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v druhu nebo identifikaci a volitelně izolaci polypeptidových expresních produktů kódovaných členy sady fragmentů nukleových kyselin, které významně indukují produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v živočišném druhu.
50. Způsob přípravy imunologického prostředku obsahujícího alespoň jeden modifikovaný OPGL polypeptid, který je schopen indukovat tvorbu protilátek proti nemodifikovanému OPGL u zvířete, u kterého je nemodifikovaný OPGL polypeptid vlastním proteinem, vyznačující se tím, že zahrnuje
- přípravu, pomocí peptidové syntézy nebo technik genového inženýrství, sady navzájem odlišných modifikovaných OPGL polypeptidů, ve kterých byly v aminokyselinové sekvenci OPGL polypeptidu daného živočišného druhu provedeny inserce, delece nebo substituce aminokyselin, které vedly ke vzniku aminokyselinových sekvencí obsahujících T-lymfocytární epitopy, které jsou cizorodé pro živočišný druh;
105
- testování členů sady na jejich schopnost indukovat produkci protilátek proti nemodifikovanému OPGL v živočišném druhu; a
- smísení členů sady, který významně indukující produkci protilátek u zvířete, které jsou reaktivní s OPGL, s farmaceuticky a imunologicky přijatelným nosičem a/nebo vehikulem, volitelně v kombinaci s alespoň jedním farmaceuticky a imunologicky přijatelným adjuvans.
51. Způsob podle nároku 49 nebo 50 vyznačující se tím, že příprava členů sady zahrnuje přípravu vzájemně odlišných sekvencí nukleové kyseliny, kde každá sekvence je sekvence nukleové kyseliny podle nároku 33, inserci sekvencí nukleové kyseliny do vhodných expresních vektorů, transformaci vhodných hostitelských buněk vektory a expresi sekvencí nukleové kyseliny, a potom volitelně izolaci produktů exprese.
52. Způsob podle nároku 51 vyznačující se tím, že příprava sekvencí nukleových kyselin a/nebo vektorů je provedena pomocí molekulárních amplifikačních technik, jako je PCR, nebo pomocí syntézy nukleových kyselin..
53. Použití OPGL nebo jeho subsekvence pro přípravu imunogenního prostředku obsahujícího adjuvans pro inhibici aktivity OPGL u zvířete.
54. Použití OPGL nebo jeho subsekvence pro přípravu imunogenního prostředku obsahujícího adjuvans pro léčbu, profylaxi nebo zmírnění osteoporosy nebo jiného stavu charakterizovaného nadměrnou resorpcí kosti.
55. Použití analogu OPGL podle nároku 30 nebo 31 pro přípravu imunogenního prostředku obsahujícího adjuvans pro inhibici aktivity OPGL u zvířete.
·♦ «···
106
56. Použití analogu OPGL podle nároku 30 nebo 31 pro přípravu imunogenního prostředku obsahujícího adjuvans pro léčbu, profylaxi nebo zmírnění osteoporosy nebo jinéhostavu charakterizovaného nadměrnou resorpcí kosti.
CZ2001789A 1998-09-15 1999-09-13 Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin CZ2001789A3 (cs)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DKPA199801164 1998-09-15
US10289698P 1998-10-02 1998-10-02

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ2001789A3 true CZ2001789A3 (cs) 2001-08-15

Family

ID=26065320

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ2001789A CZ2001789A3 (cs) 1998-09-15 1999-09-13 Způsob pro in vivo inhibici aktivity ligandu pro osteoprotegerin

Country Status (24)

Country Link
US (2) US6645500B1 (cs)
EP (1) EP1114166B1 (cs)
JP (1) JP2002525060A (cs)
KR (1) KR100671036B1 (cs)
CN (1) CN1318105A (cs)
AT (1) ATE291628T1 (cs)
AU (1) AU754971B2 (cs)
CA (1) CA2343654A1 (cs)
CZ (1) CZ2001789A3 (cs)
DE (1) DE69924392T2 (cs)
EE (1) EE200100149A (cs)
ES (1) ES2239457T3 (cs)
HK (1) HK1040261A1 (cs)
HR (1) HRP20010188A2 (cs)
HU (1) HUP0103578A3 (cs)
ID (1) ID28386A (cs)
IL (2) IL141588A0 (cs)
NO (1) NO20011304L (cs)
NZ (1) NZ510508A (cs)
PL (1) PL196790B1 (cs)
PT (1) PT1114166E (cs)
SK (1) SK3062001A3 (cs)
TR (1) TR200100737T2 (cs)
WO (1) WO2000015807A1 (cs)

Families Citing this family (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1998046751A1 (en) * 1997-04-16 1998-10-22 Amgen Inc. Osteoprotegerin binding proteins and receptors
US6316408B1 (en) * 1997-04-16 2001-11-13 Amgen Inc. Methods of use for osetoprotegerin binding protein receptors
PT1114166E (pt) * 1998-09-15 2005-08-31 Pharmexa A S Metodo para regular negativamente a actividade do ligando da osteoprotegerina
GB9908263D0 (en) * 1999-04-13 1999-06-02 Binding Site The Limited Eliciting improved immune responses
WO2000067777A1 (en) * 1999-05-07 2000-11-16 Biofan Pty Ltd A method of prophylaxis and treatment and agents useful therefor
US6673771B1 (en) 1999-07-28 2004-01-06 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods of inhibiting osteoclast activity
JP4790179B2 (ja) * 1999-07-28 2011-10-12 ザ トラスティーズ オブ ザ ユニバーシティ オブ ペンシルベニア 破骨細胞活性を阻害する方法
WO2001023559A1 (en) * 1999-09-27 2001-04-05 Eli Lilly And Company Osteoclast differentiation factor regulatory region
AUPQ314799A0 (en) * 1999-09-29 1999-10-21 University Of Western Australia, The Bone cell factor
JP5025871B2 (ja) * 2000-02-21 2012-09-12 エイチ.リュンドベック エイ/エス アミロイドの新規なダウン−レギュレート方法
CZ20022748A3 (cs) * 2000-02-21 2004-03-17 Pharmexa A/S Nová metoda regulace obsahu amyloidu
EP1257648B2 (en) 2000-02-23 2016-09-14 Amgen Inc. Antagonistic selective binding agents of osteoprotegerin binding protein
US20030103978A1 (en) * 2000-02-23 2003-06-05 Amgen Inc. Selective binding agents of osteoprotegerin binding protein
WO2001091793A1 (en) * 2000-05-26 2001-12-06 Smithkline Beecham Corporation Anti-rank ligand monoclonal antibodies useful in treatment of rank ligand mediated disorders
AU2001288342A1 (en) * 2000-08-21 2002-03-04 Smith Kline Beecham Corporation Anti-rank ligand monoclonal antibodies useful in treatment of rank ligand mediated disorders
WO2002024228A1 (fr) * 2000-09-21 2002-03-28 Center For Advanced Science And Technology Incubation, Ltd. Méthode de régulation de la formation d'ostéoclastes
AU9303001A (en) 2000-09-22 2002-04-02 Immunex Corp Screening assays for agonists or antagonists of receptor activat or of nf-kb
US7128911B2 (en) 2001-01-19 2006-10-31 Cytos Biotechnology Ag Antigen arrays for treatment of bone disease
CA2441538A1 (en) * 2001-03-22 2002-10-17 Barnes-Jewish Hospital Stimulation of osteogenesis using rank ligand fusion proteins
DE60235418D1 (de) 2001-04-03 2010-04-01 Nestle Sa Osteoprotegerin in Milch
PL222211B1 (pl) * 2001-06-26 2016-07-29 Amgen Fremont Inc Przeciwciało przeciwko OPGL, kompozycja je zawierająca, jego zastosowanie i sposób jego wytwarzania, sposób wykrywania poziomu OPGL, kompozycja obejmująca polinukleotydy i komórka gosodarza
MY144532A (en) * 2001-08-20 2011-09-30 Lundbeck & Co As H Novel method for down-regulation of amyloid
US20030109444A1 (en) * 2001-10-12 2003-06-12 Jonathan Lam Bone anti-resorptive compounds
JP4336467B2 (ja) * 2001-10-15 2009-09-30 株式会社林原生物化学研究所 破骨細胞形成抑制因子の産生を調節し得る物質のスクリーニング方法
US7381792B2 (en) 2002-01-04 2008-06-03 Xencor, Inc. Variants of RANKL protein
EP1560843A4 (en) * 2002-01-04 2006-09-06 Xencor Inc NEW VARIANTS OF RANKL PROTEIN
EP1576088A4 (en) 2002-01-04 2006-09-06 Xencor Inc DOMINANT NEGATIVE PROTEINS AND METHOD THEREFOR
PL375041A1 (en) * 2002-04-05 2005-11-14 Amgen Inc. Human anti-opgl neutralizing antibodies as selective opgl pathway inhibitors
US6921538B2 (en) * 2002-05-10 2005-07-26 Allergan, Inc. Therapeutic treatments for neuropsychiatric disorders
US7462700B2 (en) 2002-12-10 2008-12-09 Schering-Plough Animal Health Corporation Canine RANKL and methods for preparing and using the same
CN1960752A (zh) * 2004-06-02 2007-05-09 赛托斯生物技术公司 非人类tnf-肽的载体偶联物的医药用途
US20080107597A1 (en) * 2006-01-12 2008-05-08 Anaptys Biosciences, Inc. Isolation of antibodies that cross-react and neutralize rankl originating from multiple species
WO2008088594A2 (en) * 2007-01-12 2008-07-24 Anaptysbio, Inc. Isolation of antibodies that cross-react and neutralize rankl orginating from multiple species
CN101434656B (zh) * 2007-11-16 2011-12-14 首都医科大学 Opg-hsp70融合蛋白的制备方法及用途
WO2009154770A2 (en) * 2008-06-18 2009-12-23 The Texas A & M University System Mesenchymal stem cells, compositions, and methods for treatment of cardiac tissue damage
WO2011128892A2 (en) * 2010-04-12 2011-10-20 Protea Vaccine Technologies Ltd. Modified forms of pneumococcal surface immunogenic protein b (psipb)
CN107286245B (zh) * 2016-04-11 2021-10-08 北京普纳生物科技有限公司 Pd-l1和pd-l2重组蛋白及其用途
CN107286244B (zh) * 2016-04-11 2021-10-08 北京普纳生物科技有限公司 抗免疫检查点pd-l1和pd-l2肿瘤疫苗
CN108498786A (zh) * 2018-02-13 2018-09-07 南昌大学第二附属医院 载骨保护素的缓释纳米粒及其制备方法和应用
KR102154637B1 (ko) * 2018-11-12 2020-09-10 조선대학교산학협력단 Rankl의 돌연변이체, 및 이를 포함하는 골다공증 예방 또는 치료용 약학 조성물
WO2024054566A1 (en) * 2022-09-07 2024-03-14 The Regents Of The University Of California Treatment of cancer by blockade of osteoprotegerin

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
IT1237764B (it) * 1989-11-10 1993-06-17 Eniricerche Spa Peptidi sintetici utili come carriers universali per la preparazione di coniugati immunogenici e loro impiego per lo sviluppo di vaccini sintetici.
DK96493D0 (da) * 1993-08-26 1993-08-26 Mouritsen Og Elsner Aps Fremgangsmaade til at inducere antistofresponser mod selvproteiner og autovaccine fremstillet ved fremgangsmaaden
DE4496393T1 (de) 1993-08-27 1996-11-21 Dow Chemical Co Verfahren zur Trennung von Enantiomeren
EP0755444A4 (en) * 1994-04-01 1998-01-14 Univ Utah MOLECULAR CLONING AND EXPRESSION OF AN INDUCTIBLE PROTEASOME ACTIVATOR BY INTERFERON GAMMA
US6340459B1 (en) * 1995-12-01 2002-01-22 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Therapeutic applications for the anti-T-BAM (CD40-L) monoclonal antibody 5C8 in the treatment of reperfusion injury in non-transplant recipients
US6369027B1 (en) * 1995-12-22 2002-04-09 Amgen Inc. Osteoprotegerin
AU5697098A (en) * 1996-12-13 1998-07-03 Schering Corporation Mammalian cell surface antigens; related reagents
EP2003203A1 (en) * 1996-12-23 2008-12-17 Immunex Corporation Ligand for receptor activator of nf-kappa b, ligand is member of TNF superfamily
WO1998046751A1 (en) * 1997-04-16 1998-10-22 Amgen Inc. Osteoprotegerin binding proteins and receptors
US5843678A (en) * 1997-04-16 1998-12-01 Amgen Inc. Osteoprotegerin binding proteins
PT1114166E (pt) * 1998-09-15 2005-08-31 Pharmexa A S Metodo para regular negativamente a actividade do ligando da osteoprotegerina

Also Published As

Publication number Publication date
HUP0103578A3 (en) 2005-11-28
ES2239457T3 (es) 2005-09-16
CN1318105A (zh) 2001-10-17
TR200100737T2 (tr) 2001-07-23
WO2000015807A1 (en) 2000-03-23
EP1114166A1 (en) 2001-07-11
SK3062001A3 (en) 2002-02-05
HUP0103578A2 (hu) 2002-01-28
EE200100149A (et) 2002-08-15
ATE291628T1 (de) 2005-04-15
KR100671036B1 (ko) 2007-01-18
US20040115199A1 (en) 2004-06-17
NO20011304L (no) 2001-05-15
PT1114166E (pt) 2005-08-31
ID28386A (id) 2001-05-17
JP2002525060A (ja) 2002-08-13
CA2343654A1 (en) 2000-03-23
US6645500B1 (en) 2003-11-11
KR20010085807A (ko) 2001-09-07
PL196790B1 (pl) 2008-01-31
AU754971B2 (en) 2002-11-28
DE69924392T2 (de) 2006-03-09
NZ510508A (en) 2005-05-27
IL141588A0 (en) 2002-03-10
HRP20010188A2 (en) 2002-04-30
PL346698A1 (en) 2002-02-25
IL141588A (en) 2008-07-08
HK1040261A1 (zh) 2002-05-31
NO20011304D0 (no) 2001-03-14
AU5617399A (en) 2000-04-03
DE69924392D1 (de) 2005-04-28
EP1114166B1 (en) 2005-03-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6645500B1 (en) Method for down-regulating osteoprotegerin ligand activity
US7070784B1 (en) Method for down-regulating GDF-8 activity using immunogenic GDF-8 analogues
AU2006312847A1 (en) Therapeutic vaccines targeting HMGB1
US20070184023A1 (en) Method for down-regulation of vegf
CZ20013709A3 (cs) Analog interleukinu 5, fragment nukleové kyseliny, vektor, buňka, přípravky a pouľití
US20020172673A1 (en) Method for down-regulating IgE
US20050063952A1 (en) Immunogenic CEA
WO2006102901A2 (en) Immunogenic egfr peptides comprising foreign t cell stimulating epitope
JP2007505601A (ja) ワクチン
HALKIER et al. Sommaire du brevet 2343654
EP1541587A2 (en) Method for down-regulating osteoprotegerin ligand activity
HALKIER et al. Patent 2343654 Summary
JP2007523605A (ja) 細胞毒性が低減された免疫原性ヒトTNFαアナログおよびそれらの製造方法
WO2008040759A1 (en) Method for down-regulation of cripto
CN101260152A (zh) 负调节Osteoprotegerin配体活性的方法