CN1322246A - 静息蛋白及其使用方法 - Google Patents

Abstract

本发明描述了一种新型抗－血管生成蛋白质,即静息蛋白(restin),以及其片段。还描述了高效价表达蛋白质的方法。

Description

静息蛋白及其使用方法

本申请要求1997年12月8日提交的60/082,663申请、1998年4月22日提交的60/083,663申请、和1998年11月16日提交的60/108,536申请的优先权，其全部内容通过在此引述而合并于本篇。

本发明的背景

转移性癌症的预后症状保持着较大可能的不利情况。尽管有放疗和化疗的改进，但过去几十年接受治疗的患者的长期存活率仅表现出很微小的改进。缺少适用于转移性癌症的显著治疗方法强调了应集中发展新型治疗方法。在这一方面，针对固体肿瘤的肿瘤脉管系统治疗在几种动物模型系统中显示出很有希望的结果(Baillie等人(1995)Br.J.癌症72：257-67；Bicknell，R.(1994)Ann.Oncol.5(增刊)4：45-50；Fan等人(1995)趋势Pharmacol.科学16：57-66；Thorpe，P.E.及Burrows，F.J.(1995)乳腺癌研究。治疗34：237-51；Burrows，F.j.和Thorpe，P.E.(1994)Pharmacol.Ther.64：155-74)。如在裸鼠模型中，将野生VHL基因引入到786-0细胞，即一种RCC肿瘤细胞系中，抑制了肿瘤生长(Iliopoulos等人.(1995)Nat.Med.1：822-26)和血管生成。

超过若干立方毫米(mm³)的固体肿瘤的生长取决于新血管的形成(Folkman，J.(1971)N.Engl.J.Med.285：1182-86)。大量的研究已显示原发性肿瘤和转移性生长都与血管生成有关(Folkman，J.(1971)N.Engl.J.Med.285：1182-86；Folkman，J.(1972)Ann.Surg.175：409-16；Folkman，J.和Shing，Y(1992)J.生物化学。267：10931-34；Folkman，J(1996)科学.Am.275：150-54)。一些血管生成抑制剂已经确定。某些种类，如血小板因子-4(Maione等人(1990)科学247：77-79；Gupta等人(1995)Pro，Natl.Acad.科学(USA)92：7799-7803)，干扰素α，干扰素-可诱导蛋白质-10，和PEX(Angiolillo等人(1995)J.Exp.Med.182：155-62；Strieter等人(1995)生物化学，生物物理，研究，交流.210：51-57；Brooks等人(1998)细胞92：391-400)，是“与肿瘤无关的”，而其他两种，血管生成抑制素(angiostatin)和内抑制素(endostatin)是“与肿瘤有关的”(O’Reilly等人(1994)细胞79：315-28；O’Reilly等人(1997)细胞88：277-85)。血管生成抑制素，一种由调节基质金属弹性蛋白酶的肿瘤-渗透巨噬细胞产生的有效的血管生成内生抑制剂，抑制很多种原发及转移性肿瘤的生长(Lannutti等人(1997)癌症研究，57：5277-80；O’Reilly等人(1994)冷泉港，Symp.Quant.Biol.59：471-82；O’Reilly，M.S.，(1997)Exs.79：273-94；Sim等人(1997)癌症研究.57：1329-34；Wu等人(1997)生物化学，生物物理，研究，交流236：651-54)。

目前，O’Reilly等人((1997)细胞88：277-85)从鼠血管内皮瘤细胞系(EOMA)中分离的了内抑制素(endostatin)，一种血管生成抑制剂。在患有慢性肾衰但没有可检测到的肿瘤的患者中已检测到人类内抑制素片段的循环量，但这个片段含有缺失，没有抗-血管生成活性(Standker等人(1997)FEBSLETT.420：129-33)。内抑制素的氨基端序列与胶原质XVIII的羧基段部分对应。内抑制素是内皮扩增和血管生成的特异抑制剂。在Eschericha coli中表达的非重折叠沉淀蛋白质的系统用药会在异种移植物模型中产生Lewis肺癌、T241纤维肉瘤、B16恶性黑素瘤和EOMA细胞的生长退化(O’Reilly等人(1997)细胞88：277-85)。并且，在所研究的三种肿瘤类型中没有抗药记录。对内抑制素重复周期用药已报道会致使肿瘤休眠(Boehm等人(1997)自然390：404-407)。

这些研究得到的结果给治疗癌症带来了新方法，并为克服常在化疗期间可观察到的抗药性提供令人鼓舞的方法。然而，在所有这些研究中，抑制剂蛋白质的非重折叠沉淀形式是以悬浮态给肿瘤携带动物服用的。此外，需要大量的蛋白质产生肿瘤退化及致使肿瘤休眠。如Kerbel所指出的((1997)自然390：335-36)，需要口服这些蛋白质的等同物。如果可获得可溶解态的这些蛋白质重组形式，那么就可进行理论研究。并且，在活体内条件下研究其功效之前，可用溶解蛋白质在体外进行初始试验。此外，还报道尽管这些蛋白质有很大希望，但由于制备充足蛋白质进行试验有很大困难及有关它们抗血管生成性能的不一致结果(King，R.T.(1998)华尔街J，.第一页11月12日；Leff，D.N.(1998)今日生物世界9：1，10月20日)，使得评价它们的临床潜力受到阻碍。目前明显地存在需要一种制备大量可溶解形式的抗血管生成蛋白质的方法，并且其在体内和体外都有可靠的性能。

本发明的简述

描述了一种新型抗血管生成蛋白质，静息蛋白(restin)，以及其片段，突变体，衍生物和融合蛋白质。静息蛋白是胶原质XV的C-末端的蛋白片段，约20kDa。一个称作“apomigren”的片段，被发现其抗血管生成活性等于或超出内抑制素(endostatin)的抗血管生成活性。还描述了高效价表达蛋白质的方法。

本发明涉及发现分离的抗血管生成肽，称作“静息蛋白”，和其片段，称作“apomigren”。静息蛋白包括约170到约200个氨基酸残基，并且有至少70％的序列与人类胶原质XV的α1链的NC10域的C末端一致。Apomigren是静息蛋白的一个片段，包括最后80到90个邻接氨基酸与人类胶原质XV的α1链的NC10域的C末端对应。

本发明还包括分离的编码静息蛋白和apomigren的多聚核苷酸，互补序列和杂化本文描述序列的序列，与表达序列可实施连接的序列，及用这样的构建转化的宿主细胞。还公开了静息蛋白和apomigren的抗体。

本发明还涉及制备静息蛋白和apomigren，含静息蛋白和apomigren的融合蛋白质，以及含静息蛋白和apomigren的组合物或其融合产物的方法。本发明还公开了制备编码静息蛋白和apomigren的多肽的方法。

此外，本发明包括抑制哺乳动物组织内血管生成活性的方法，包括用含静息蛋白和apomigren的组合物接触组织，特别抑制产生在许多疾病和病状中的血管生成，包括癌症。

本发明还公开了使用静息蛋白和apomigren诱导细胞程序死亡，或EM1的抗体阻止细胞程序死亡。本发明进一步公开在基因治疗法中使用静息蛋白和apomigren。靶细胞可以是任何哺乳动物细胞，具体地是淋巴细胞，血细胞，TIL细胞，骨髓细胞，脉管细胞，肿瘤细胞，肝细胞，和成纤维细胞。

本发明的示图简介

图1是静息蛋白核苷酸序列示图(SEQ ID NO：)。

图2是静息蛋白氨基酸序列(SEQ ID NO：)。

图3是InVitrogen的Pichia pastoris表达载体示意图(美国，加里弗尼亚州，圣地亚哥)。

图4是修饰Pichia pastoris表达载体示意图。

图5是将静息蛋白克隆到修饰Pichia pastoris表达系统中的示意表示。

图6是用Coomassie蓝染色的SDS-PAGE电泳凝胶，表示不同文库的蛋白质表达。

图7包括四张图：静息蛋白蛋白质的亲水性，表面概率，柔性，和抗原指数。

图8包括三张图表示静息蛋白蛋白质的两亲性螺旋，两亲性片层，和二级结构。

图9是人类XV类胶原质的全长α1链及C末端85-氨基酸蛋白质apomigren的示意表示。深黑色方块表示胶原区域，白色方块表示非胶原区域。

图10是apomigren和鼠和人类endostatin的C末端氨基酸序列对比图。

图11是Ni-NTA柱的重组apomigren的洗脱图。表示出单位组分(X轴)在280nM(右Y轴)的吸收率和洗脱液PH值(左Y轴)。

图12是SDS-PAGE凝胶的照片。左边以kDa表示大小。1道包括大小标记，2道，加样到Ni-NTA柱前的apomigren蛋白质溶解产物；2道，流经柱；4道，组分4；5道和6道，组分23，分别是非还原的或还原的；7道，组分24；8道，组分27。

图13A，13B和13C是一组三张照片，表示用apomigren处理后用相差显微镜观察到的C-PAE细胞形态的变化。图13A，对照物；图13B，用0.05μg/ml的apomigren处理；图13C，用0.7μg/ml的apomigren处理。处理24小时后拍照，放大400倍显示。

图14表示掺入到用bFGF处理的C-PAE细胞中的胸苷掺入率，及细菌表达的提纯的溶解apomigren蛋白质。在X轴表示apomigren(●)，和鼠(□)和人类(○)endostatin的浓度，Y轴表示³H-胸苷掺入率。

图15是表示用apomigren进行的细胞周期分析柱状图。X轴表示apomigren的浓度，范围从0到1000ng/ml，Y轴表示S-相的细胞百分比。C-PAE细胞由深色柱表示，白色柱表示IMR-90细胞。

图16表示使用不同浓度的apomigren，鼠和人类endostatin对内皮细胞移动的抑制作用。X轴表示不同蛋白质的浓度，Y轴表示对dFGF反应的移动细胞百分比。对照物是用apomigren处理的IC-21细胞(■)，进行的处理包括对ECV304细胞的进行apomigren(●)和鼠(□)及人类(○)endostatin处理。

图17是柱状图表示用静息蛋白处理对ECV304细胞中所有移动的抑制作用。Y轴表示细胞移动的量，X轴表示什么也没用(-bFGF，对照物)，bFGF(正对照物)，和3.0、62.5、12、和50μg/ml的静息蛋白处理的ECV304细胞。

图18表示静息蛋白对肾癌细胞(RCC)肿瘤生长的影响，与endostatin对比。Y轴表示肿瘤体积为mm³，依据处理后的天数(X轴)绘制。相对于未处理的对照肿瘤(■)，在减缓肿瘤生长方面静息蛋白(●)优于endostatin(□)。

图19是柱状图表示用绒毛尿囊膜(CAM)仪测得的不同浓度apomigren(X轴)与血管生成响应(Y轴)的关系。测试仅使用载体，和VEGF和FGF-2的Apomigren(0.5，1，5，10，20和50μg/目)。

图20A-B是表格，表示用来克隆和表达不同抗-血管生成蛋白质的构建，克隆位点，和载体。还列出了表达蛋白质的氨基酸序列。

本发明的详述

很多疾病是由于不需要的血管生成造成的。换句话说，在一些条件下，在某些时候，或在具体组织中如果可能终止毛细血管的生长和扩张，许多疾病和令人不舒服的病状可能会被抑制或减轻。几种抗血管生成蛋白质已经被发现了(如血管生成抑制素(angiostatin)，内抑制素(endostatin))，但也报道了一些问题，涉及(1)是否能够制备充足量的蛋白质使得彻底测试它们的性能，(2)由这些蛋白质产生的抗-血管生成性能的再生性。

在本发明中，描述了一种新型抗-血管生成蛋白质，静息蛋白，以及其片段，融合蛋白质和抗体。还描述了编码静息蛋白的多核苷酸和其片段，以及含有这些多核苷酸的载体和宿主细胞。还描述了含静息蛋白作为生物活性组分的组合物，以及在哺乳动物组织内使用静息蛋白抑制血管生成活性的方法，如治疗以血管生成为特点的疾病和病状。

本发明包括用来检测和治疗由血管生成引起的或与之相关的疾病和病状的组合物和方法。不象其他的抗血管生成蛋白质，(如血管生成抑制素(angistatin)和内抑制素(endostatin))，静息蛋白是约170到约200个氨基酸的蛋白质片段，与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的约200个终端C-末端氨基酸相对应。与内抑制素不同，静息蛋白与肝磷脂没有或有很小的亲和力。

更具体地，本发明描述了称作“静息蛋白”的蛋白质，是一种含约170个氨基酸到约200个氨基酸的蛋白质，与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的约200个C-末端氨基酸相对应。不同于angiostatin和endostatin，静息蛋白还没有从体液中成功的分离出来，并似乎除了在天然胶原质XV分子之外没有自然地存在。静息蛋白可在分离的DNA或cDNA文库外克隆。用还原丙烯酰胺凝胶电泳测得静息蛋白的分子量为约20kDa。本发明还包括鼠静息蛋白，其片段，突变体，衍生物或融合蛋白质。

静息蛋白可以胶原质XV类分子自然存在，但也可重组制备，如多核苷酸序列(图1，SEQ ID NO：)编码静息蛋白(图2，SEQ ID NO：)可扩增，如可使用下列表1中列出的正向和反向引物。用来扩增的模板核苷酸可来自任何哺乳动物。

表1用来扩增抗-血管生成蛋白质的构建和引物序列

构建名	引物序列
		pET17bhis.mendo	5’-GGC ATA TGC ATA CTC ATC AGG ACTTT-3(上游)(SEQ ID NO：)
	5’-AAC TCG AGC TAT TTG GAG AAAGAG GT-3(下游)(SEQ ID NO：)
		Pet28a/mendo	5’-GGC ATA TGC ATA CTC ATC AGG ACTTT-3(上游)
	5’-AAG CGG CCG CCT ATT TGG AGAAAG AGG T-3(下游)(SEQ ID NO：)
		Pet28a/EM-1	5’-TTC CAT ATG CAT ACT CAT CAG GACTTT CAG CCA-3(上游)(SEQ ID NO：)
	5’-TTA GCG GCC GCC TAC TCA ATGCAC AGG ACG ATG TA-3(下游)(SEQ IDNO：)
		Pet28a/EM-2	5’-TTC CAT ATG CAT ACT CAT CAG GACTTT CAG CCA-3’(上游)(SEQ ID NO：)
	5’-TTA GCG GCC GCC TAG TTG TGGCAG CTC GCA GCT TTC TG-3’(下游)(SEQ ID NO：)

pPICZαA/mendo	5’-GGG AAT TCC ATA CTC ATC AGG ACTTT-3’(上游)(SEQ ID NO：)
			5’-AGG CGG CCG CCT ATT TGG AGAAAG AGG T-3’(下游)(SEQ ID NO：)
pPICZαA/His.mendo	5’-AAG AAT TCC ATC ATC ATC ATC ATCACA GCA GC-3’(上游)(SEQ ID NO：)
			5’-AAG CGG CCG CCT ATT TGG AGAAAG AGG T-3(下游)(SEQ ID NO：)
pPICZαA/Hendo	5’-TTT GAA TTC GCC CAC AGC CACCGC GAC TTC CAG CCG GTG CTC CA-3’(上游)(SEQ ID NO：)
			5’AAA AGC GGC CGC CTA CTT GGAGGC AGT CAT GAA GCT GTT CTC AA-3’(下游)(SEQ ID NO：)
pPICZαA/静息蛋白	5’-TTT TTT GAA TTC ATT TCA AGT GCCAAT TAT GAG AAG CCT GCT CTG CAT-3(上游)(SEQ ID NO：)
			5’-AAG AAT GCG GCC GCT TAC TTCCTA GCG TCT GTC ATG AAA CTG TTTTCG AT-3’(下游)(SEQ ID NO：)
pPICZαA/His.静息蛋白	5’-AAT TCC ATC ACC ATC ACC ATCACG-3’(上游)(SEQ ID NO：)

	5’AAT TCG TGA TGG TGA TGG TGATGG-3’(下游)(SEQ ID NO：)
		Ppet28a/M2	5’-TTT CAT ATG ATA TAC TCC TTT GATGGT CGA GAC ATA ATG ACA-3’(上游)(SEQ ID NO：)
	5’-AAT GCG GCC GCT TAC TTC CTA GCGTCT GTC ATG AAA CTG TTT TCG AT-3’(下游)(SEQ ID NO：)
		pPICZαA/M2	5’-AAG AAT TCC ATC ATC ATC ATC ATCACA GCA GC-3’(上游)(SEQ ID NO：)
	5’-AAT GCG GCC GCT TAC TTC CTA GCGTCT GTC ATG AAA CTG TTT TCG AT-3’(下游)(SEQ ID NO：)

然后产生的多聚核苷酸扩增产物能克隆到适当的载体中。“引物”表示与靶核苷酸序列互补的特异寡核苷酸序列，用来与靶核苷酸序列杂化并作为由DNA聚合酶、RNA聚合酶或反转录酶催化的核苷酸聚合反应的起始点。本文所使用的“静息蛋白”意指包括(SEQ ID NO：)的氨基酸序列的片段，突变体，同系物，类似物，和等位基因变体，以及鼠静息蛋白，鼠静息蛋白氨基酸序列的片段，突变体，同系物，类似物和等位基因变体。

可以理解认为，本发明考虑包括任何具有内皮抑制活性(如组合物总体抑制血管生成的能力，如抑制含成纤维细胞生长因子，血管生成相关因子，或其他已知生长因子的培养基中的牛毛细管内皮细胞的生长和移动)的静息蛋白衍生物。本发明包括整体静息蛋白蛋白质，静息蛋白蛋白质的衍生物和静息蛋白蛋白质的生物活性片段。这些包括具有静息蛋白活性，含氨基酸取代基或含糖或其他附着在氨基酸官能团上的分子的蛋白质。本发明还包括编码静息蛋白和静息蛋白受体的基因，和由这些基因编码的蛋白质。

本发明还包括含分离的编码静息蛋白的多核苷酸的组合物。以及含这种多核苷酸的载体和宿主细胞，及制备静息蛋白和其片段，突变体，同系物，类似物和等位基因变体的方法。本文所使用的“载体”意指其中核苷酸片段能插入或克隆的载体，其有将片段核酸转移到宿主细胞中的载体功能。这样的载体还可完成转移的核酸片段的复制和/或表达。载体实例包括如从质粒，抗菌素，或哺乳动物，植物或昆虫病毒，或非病毒载体如配体核酸共轭物，脂质体，或脂质核酸复合物衍生的核酸分子。所需要的是，将转移的核酸分子与表达对照序列实施连接以形成能表达转移核酸的表达载体。核酸的这种转移通常称作“转化”，是指将外源多核苷酸插入到宿主细胞中，与用来插入的方法无关。如，包括直接吸收，转导或f-交配。外源多核苷酸可保持为非整合载体，如质粒，或者，可整合到宿主基因组中。“实施连接”是指一种状态，其中所描述的组分处于使得它们以意图的方式起作用的关系中，如控制序列与编码序列“实施连接”是以在编码序列的表达是在与控制序列相容的条件下，获得这样的方式的连接。“编码序列”是多核苷酸序列，当置于适当的调节序列的控制下时(如实施连接)，其转录成mRNA并翻译成多肽。编码序列的边界由5’-端的翻译起始密码子和3’-端的终止密码子确定。这种边界能自然产生，或能通过此领域中已知的方法引入到或加入到多核苷酸序列中。编码序列可包括，但不限于此，mRNA，cDNA，和重组多核苷酸序列。

选取克隆的多核苷酸克隆在其中的载体，可能是由于其在原核生物体中起作用，或者，它的选取是由于其在真核生物体中起作用，允许编码静息蛋白蛋白质的多核苷酸克隆，和从多核苷酸获得的蛋白质表达的载体的两种实例，是Pet28(a)载体(美国威斯康星州Madison，Novagen)和修饰pPICαZA载体(美国加利弗尼亚州圣地亚哥InVitrogen)，其分别允许在细菌和酵母中表达蛋白质。

一旦多核苷酸已被克隆到适当的载体中，它可被转化成适当的宿主细胞。“宿主细胞”意指通过载体已经或能用作为转化核酸的受体的细胞。宿主细胞可以是原核生物或真核生物，哺乳动物，植物，或昆虫，能以单纯细胞存在，或以收集态存在，如作为培养基，或在组织培养基中，或在组织或生物体中存在。宿主细胞还可从多细胞生物体，如哺乳动物的正常或疾病组织中衍生得到。本文所使用的宿主细胞不仅包括用核酸转化的原始细胞，还包括仍然含有核酸的这种细胞的子代。

在一个具体实施中，分离的编码抗-血管生成蛋白质的多核苷酸还包括编码肽的多核苷酸接头。这样的接头对此领域中的技术人员是已知的，如接头可包括至少一种编码至少一种附加氨基酸的附加密码子。通常接头包括一个到约20或30个氨基酸。多核苷酸接头被翻译，如编码抗血管生成蛋白质的多核苷酸，致使在抗-血管生成蛋白质的氨基或羧基端带有至少一个其他氨基酸残基的抗-血管生成蛋白质的表达。一些附着在抗-血管生成蛋白质上的接头在图20中作了演示。重要的是，附加氨基酸，或氨基酸，没有损害抗-血管生成蛋白质的活性。

将选取的多核苷酸插入到载体中后，载体被转化成适当的原核株，在适合制备有生物活性的抗-血管生成蛋白质的条件下培养株(如维持在条件下)，从而制备有生物活性的抗-血管生成蛋白质，或其突变体，衍生物，片段或融合蛋白质。在一个具体实施中，本发明包括将编码抗-血管生成蛋白质克隆到载体pET17b或pET28a中，然后转化到细菌中。然后细菌宿主株表达抗-血管生成蛋白质。通常，制备的抗-血管生成蛋白质量为每升培养液约10-20毫克，或更多。

在本发明的另一个具体实施中，真核载体包括修饰酵母载体。如本文所描述的，一种方法使用pPICza质粒，其中质粒含有多克隆位点。多克隆位点已将一His.Tag基元序列插入到多克隆位点中。再者，载体能修饰加上NdeI位点，或其他适当的限制性位点。这样的位点对此领域中的技术人员是熟知的。通过这个具体实施制备的抗-血管生成蛋白质包括一个含有一个，或多个组氨酸，通常为约5-20个组氨酸的组氨酸标记基元序列(His.tag)。令人惊异地，这个His.tag没有损害抗-血管生成活性。

在这个具体实施中，较好的酵母表达体系是Pichia pastores。并且，通常制备的生物活性蛋白质的浓度为每升培养基质(液体)约10-20毫克。

一种制备静息蛋白的方法是，如扩增SEQ ID NO：的多核苷酸，将它克隆到表达载体中，如pET28(a)，pPIZAaA，或一些其他表达载体中，将含SEQ ID NO：的多核苷酸的载体转化到能表达由多核苷酸编码的多肽的宿主细胞中，在适于表达蛋白质的条件下培养转化的宿主细胞，然后从培养基中提取并提纯蛋白质。总体上讲是制备抗-血管生成蛋白质，具体讲是制备静息蛋白的方法示例，在下列实例中提供，也在Vikas P.Sukhatme的1998年12月8日提交的U.S.S.N.XX/XXX，XXX，“制备抗-血管生成蛋白质的方法”中提供，其全文参考收入本篇。静息蛋白蛋白质还可表达为转基因动物的产物如，表达为转基因牛，山羊，绵羊或猪的奶，或表达为转基因植物的产物，如与玉米中的淀粉分子相结合或化合的产物。

静息蛋白还可通过传统的，已知的化学合成法制备。通过合成方法构建本发明的蛋白质的方法对此领域中的技术人员是已知的。合成构建的静息蛋白蛋白质序列，由于享有初级，二级或三级结构和/或与如重组制备的静息蛋白一致的特性，可拥有与之相同的生物属性，包括生物活性。这样，合成构建的静息蛋白蛋白质，在筛查治疗化合物及发展抗体的免疫学方法中，可用来作为如重组制备的提纯静息蛋白蛋白质的生物活性或免疫学上的取代物。

静息蛋白蛋白质对于抑制血管生成是很有用的，如在下列实例中提供的标准测试中所确定的。静息蛋白不抑制其他细胞的生长，如IMR-90细胞，或IC-21细胞。测试显示在使用ECV304细胞作的内皮细胞移动试验中，用2.0-5.0μg/ml含量的静息蛋白处理产生50％的抑制作用，如静息蛋白含ED₅₀约2.0-5.0μg/ml。这与endostatin的抑制作用相同，但比在apomigren中观察到的活性差。在体内研究中(如肾癌细胞(RCC)模型)，人类静息蛋白产生对肿瘤生长有20-50％的抑制作用。鼠endostatin表现的更好，假定由于鼠蛋白质更适合于鼠的脉管系统。如本文所使用的，“ED₅₀”是与不存在组合物情况下所观察到的生物活性相比，将生物活性减少一半的组合物量的缩写。

如本文所使用的，“血管生成”意指在组织或器官中产生新血管，并包括内皮细胞扩增。在正常生理条件下，人类或动物仅在非常特异限制性的情况下进行血管生成。如，血管生成常常在伤口愈合，胎儿及胚胎发育，黄体，子宫内膜，及胎盘形成时可观察到。“内皮细胞”指衬于浆液膜腔，淋巴管，血管的薄层平坦的上皮细胞。因此，“抗-血管生成活性”是指组合物抑制血管生长的能力。血管生长是复杂的连续事件，包括局部破坏位于具体内皮细胞下的基低膜，扩增那些细胞，将细胞移动到未来血管的位置，重新组织细胞形成新的脉管膜，停止内皮细胞扩增，并且，掺入外膜细胞和其他细胞支持新血管壁。因此本文所使用的“抗-血管生成活性”包括中断任何或所有这些阶段，最终结果抑制新血管形成。

抗-血管生成活性可包括内皮细胞抑制活性，指组合物总体上抑制血管生成的能力，如在存在成纤维细胞生长因子，血管生成相关因子，或其他已知的生长因子的培养基中，抑制牛毛细管内皮细胞生长或移动的能力。“生长因子”是刺激细胞生长，再生，或合成活性的组合物。“血管生成相关因子”是抑制或促进血管生成的因子，如碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)，是一种血管生成促进剂。血管生成相关因子的另一种实例是血管生成抑制因子，如angiostatin(参阅如美国专利第5,801,012，美国专利第5,837,682，美国专利第5,733,876，美国专利第5,776,704，美国专利第5,639,725，美国专利第5,792,845，WO96/35774，WO95/29242，WO96/41194，WO97/23500)或endostatin(参阅如WO97/15666)。

“基本相同的生物活性”或“基本相同或较高的生物活性”是指组合物具有抗血管生成活性，并与静息蛋白表现类似，如在标准测试中所确定的。“标准测试”包括，但不限于此，那些使用在分子生物领域中的测试抗-血管生成活性，细胞周期停滞，及细胞程序死亡的方法。这样的测试包括，但不限于此，内皮细胞扩增测试，内皮细胞移动测试，细胞周期分析测试，内皮细胞管形成测试，细胞程序死亡检测，如通过程序死亡细胞形态或Annexin V-FITC测试，绒毛尿囊膜(CAM)测试，及裸鼠肾癌症肿瘤生长的抑制检测。这样的测试在下面的实例中提供，并在1997年12月8日提交的U.S.S.N.60/067,888，1998年4月22日提交的U.S.S.N.60/082,663，1998年11月16日提交的U.S.S.N.60/108,536，及Vikas P.Sukhatme，1998年12月8日提交的U.S.S.N.XX/XXX，XXX，“抗-血管生成肽及其使用方法”，和Vikas P.Sukhatme，1998年12月8日提交的U.S.S.N.XX/XXX，XXX，“制备抗-血管生成蛋白质的制备方法”中提供，所有文献全文通过在此引述而合并于本篇。

本发明还描述了静息蛋白的片段，突变体，同系物和类似物。静息蛋白的“片段”是比静息蛋白分子短的任何氨基酸序列，包括静息蛋白多肽的至少25个连续氨基酸。这样的突变体可能包括或也可能不包括从克隆过程中衍生的附加氨基酸，如与全部或部分接头序列对应的氨基酸残基或氨基酸序列。包含在本发明中的这种突变体，有或没有这种附加氨基酸残基的，都必须具有与自然或全长模式的参比多肽基本相同的生物活性。

如通过标准测试法所确定的，一个这种片段，称作为“apomigren”，发现其具有与人类或鼠endostatin相同或超出的抗-血管生成活性。Apomigren包括静息蛋白自身的最后的约85个氨基酸残基，从SEQ ID NO：的约氨基酸97到约氨基酸181：

IYS FDG RDI MTD PSW PQK VIW HGS SPH GVR LVDNYC EAW RTA DTA VTG LAS PLS TGK ILD QKA YSC ANRLIV LCI ENS FMT DAR K

因此，编码apomigren的多核苷酸序列与SEQ ID NO：的约核苷酸289到约核苷酸543对应，并能在SEQ ID NO：外扩增，使用正向引物

5’-AAG AAT GCG GCC GCT TAC TTC CTA GCG TCTGTC ATG AAA CTG TTT TCG AT-3’及与静息蛋白使用的相同的反向引物。如在下面实例中所演示的，如静息蛋白自身一样实施apomigren的克隆和表达。Apomigren在治疗血管生成疾病方面提供了优势，因为以重量为基础增加较小的肽会更有效，可能更好地渗透组织。

静息蛋白的“突变体”是指与等同物参比静息蛋白多肽的氨基酸序列相比，在氨基酸序列中包含任何变化的多肽。这种变化可以自然产生，或通过人为，化学能(如X-射线)处理产生，或通过其他形式化学引发突变产生，或通过遗传工程，或通过交配或其他形式的遗传信息交换产生。突变包括如碱基改变，缺失，掺入，倒位，转位，或重复。静息蛋白的突变体形式与等同物参比静息蛋白多核苷酸相比，可能表现出增加或减小的抗-血管生成活性，这样的突变体可能包含也可能不包含克隆过程衍生的附加氨基酸，如与全部或部分接头序列对应的氨基酸残基或氨基酸序列。

静息蛋白的“类似物”是指基本上与整体静息蛋白分子或其片段或等位基因变体相同的非自然分子，具有基本上相同的或超出的生物活性。这样的类似物包括生物活性静息蛋白的衍生物(如化学衍生物，如上所述)，以及其片段，突变体，同系物，和等位基因变体，其衍生物表现出与未修饰的静息蛋白多肽，片段，突变体，同系物，或等位基因变体性质上相似的拮抗效果。

静息蛋白的“等位基因”是指与参比静息蛋白多肽的多肽序列相比，含自然产生序列变异的多肽序列。编码静息蛋白多肽的多核苷酸的“等位基因”是指与编码参比静息蛋白多肽的参比多核苷酸序列相比，含序列变异的多核苷酸，其中编码静息蛋白多肽的多核苷酸的等位基因编码了静息蛋白多肽的等位基因形式。

假定多肽是静息蛋白的片段，突变体，类似物或等位基因变体，或它可能是两种或多种这些物质，如多肽可能即是静息蛋白多肽的类似物也是其突变体，这些都是可能的。如静息蛋白分子的缩短模式(如静息蛋白的片段)可在实验室制备。如果片段通过此领域中已知的方法引发突变，那么制备的分子就即是静息蛋白的片段，也是静息蛋白的突变体。在另一个实例中，制备静息蛋白的突变体，后来发现其作为一些哺乳动物个体的静息蛋白的等位基因存在。因此，这样的突变体静息蛋白分子会即是静息蛋白的突变体又是静息蛋白的等位基因变体。片段，突变体，等位基因变体，及类似物的组合包括在本发明的范围内。

包括在本发明中的是含与静息蛋白或apomigren基本上相同的氨基酸序列的蛋白质，或含与编码静息蛋白或apomigren的多核苷酸基本上相同的核酸序列的多核苷酸。“基本上相同的序列”意指核酸或多肽表现出至少约70％的序列与参比序列一致，如另一种核酸或多肽，通常至少约80％的序列与参比序列一致，较好的至少约90％的序列与参比序列一致，更好的至少约95％一致，最好的至少约97％序列与参比序列一致。序列的比较长度一般至少75个核苷酸碱基或25个氨基酸，更好所是至少150个核苷酸碱基或50个氨基酸，最好的是243-264个核苷酸碱基或81-88个氨基酸。本文所使用的“多肽”指氨基酸分子链，不是指产物的具体长度。这样，肽，寡肽和蛋白质包含在多肽的定义内。这项术语还包括已进行表达后修饰，如糖基化，乙酰基化，磷酸化等的多肽。一般，静息蛋白含有低于70％的氨基酸序列与endostatin一致。

本文所使用的“序列一致性”指两种聚合分子之间的亚基序列相似性，如在两种多核苷酸或两种多肽之间。当在两种分子的亚基位置上被相同的单体亚基占据时，如，如果在两种肽中每种肽的一个位置上，被丝氨酸占据，那么它们在那个位置上是一致的。两种序列间的一致性与匹配的或一致的位置数量呈正比，如，如果在两种肽或化合物序列中一半位置(如10个亚基长度的聚合物中的5个位置)是一致的，那么两种序列50％是一致的；如果90％的位置，如10个中9个是匹配的，两种序列享有90％序列一致性。作为实例，氨基酸序列VRGLQP和HAFLQP 6个位置中有3个一致，因此有50％的序列一致性，而序列VRGLQP和AFLQP 5个位置中有3个一致，因此有60％的序列一致性。两种序列之间的一致性与匹配的或一致的位置数量呈正比。这样，如果在具体肽中参比序列部分缺失，那么要计算序列一致性时，缺失的部分不作计算，如VRGLQP和VRGLP 6个位置有5个一致，因此有83.3％的序列一致性。

一致性常常用序列分析软件计算，如BLASTN或BLASTP(可从http：//www.ncbi，nlm.nih.gov/BLAST/获得)。使用BLASTN(适用于核苷酸序列)对比两种序列(如将两种序列彼此“Blast”，http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/b12.html)的缺省参数赋值为，匹配＝1，错配补偿＝-2，open gap＝5，extensiongap＝2。当使用适用于蛋白质序列的BLASTP时，缺省参数赋值为，匹配＝0，错配补偿＝0，open gap＝11，extension gap＝1。

当两种序列享有“序列同源性”时，意指两种序列彼此仅保守置换不同。对于多肽序列，这种保守置换包括在序列中的给定位置用一个氨基酸置换另一个同种类别氨基酸(如，共同具有疏水性，电荷，pK或其他构象或化学属性的氨基酸，如用缬氨酸置换亮氨酸，用精氨酸置换赖氨酸)，或位于序列的某些位置上的一中或多种非保守氨基酸置换，缺失，或插入，但没有将多肽的构象或折叠改变到多肽的生物活性被毁坏的程度。“保守置换”的实例包括用一个非极性(疏水性的)残基如异亮氨酸，缬氨酸，亮氨酸或蛋氨酸置换另一个；用一个极性(亲水性的)残基置换另一个，如精氨酸和赖氨酸之间，谷氨酰胺和天冬酰胺之间，甘氨酸和丝氨酸之间；用一个碱性残基如赖氨酸，精氨酸或组氨酸置换另一个；或用一个酸性残基如天冬氨酸或谷氨酸置换另一个；或使用化学衍生残基置换非衍生残基；只要多肽表现出所必需的生物活性。共享序列同源性的两个序列可称为“序列同系物”。

对于多肽，同源性一般使用序列分析软件测得(如威斯康星州生物技术中心大学的遗传计算机组的序列分析软件包，大学路1710，麦迪逊，WI53705)。蛋白质分析软件通过对不同置换，缺失，及其他修饰赋值同源性程度匹配类似的序列。保守置换一般包括下列组中的置换：甘氨酸，丙氨酸；缬氨酸，异亮氨酸，亮氨酸；天冬氨酸，谷氨酸；天冬酰胺，谷氨酰胺；丝氨酸，苏氨酸；赖氨酸，精氨酸；和苯基丙氨酸，酪氨酸。

本发明还包括静息蛋白和apomigren的化学衍生物。“化学衍生物”是指含一个或多个反应官能侧基团化学衍生的残基的多肽。这样的衍生残基包括如，其中游离氨基基团已被衍生形成氢氯化胺，p-甲苯磺酰基基团，苄氧羰基基团，叔-丁基氧羰基基团，氯乙酰基基团或甲酸基基团。游离羧基基团可被衍生形式盐，甲基和乙基酯或其他类型的酯或酰肼。游离羟基基团被衍生形成O-酰基或O-烃基衍生物。组氨酸的咪唑氮可被衍生形成N-imbenzyl组氨酸。作为化学衍生物还包括含一个或多个二十种标准氨基酸的自然产生的氨基酸衍生物的肽。如：4-羟基脯氨酸可被脯氨酸置换；5-羟基赖氨酸可被赖氨酸置换；3-甲基组氨酸可被组氨酸置换；高丝氨酸可被丝氨酸置换；尿氨酸可被赖氨酸置换。

编码静息蛋白的多核苷酸可在分离的DNA或cDNA文库外克隆。核酸或多肽，本文称作的“分离的”是指核酸或多肽基本上不含(即从中分离的)它们从其中获得的生物源的物质(如存在于核酸混合物中或细胞中)，其可能已经进行了进一步的加工。“分离的”核酸或多肽包括使用本文所描述的方法，相似的方法，或其他适当的方法获得的核酸或多肽，包括基本上纯的核酸或多肽，通过化学合成制备的，通过化学或生物技术组合方法制备的核酸或多肽，及重组制备分离的核酸或多肽。因此，分离的多肽意指一种相对不含其他蛋白质，碳氢化物，脂质，以及其他与其通常相关的细胞组成的多肽。分离的核酸不会与其在生物体自然产生的基因组中立即邻接的核酸，以及核酸是从其中衍生的核酸立即邻接(即共价结合)。因此，这项术语包括如，掺入到载体中的核酸(如自主病毒或质粒)，或以与其他核酸如通过化学方法或限制内切核酸酶处理制备的核酸片段无关的独立分子存在的核酸。本发明的多核苷酸和蛋白质还可用来设计成探针来分离的其他抗-血管生成蛋白质。较好的方法在Jacobs等人的美国专利No.5,837,490中提供，其全文参考收入本篇。设计寡核苷酸探针应较好地符合这些参数：(a)它应设计在含最少量多义碱基(“N’s”)的序列区域，如果有也很少，(b)它应设计成T_m为约80℃(对A或T假设2℃，对G或C为假设4度)。

寡核苷酸应较好地使用标记寡核苷酸通常采用的技术，用g-³²P ATP(特异活性6000Ci/毫摩尔)和T4多核苷酸激酶标记。其他标记技术也可使用。非掺入的标记应较好地通过凝胶过滤层析法或其他确定的技术除去。掺入到探针中的放射性活度的量应由闪烁计数仪测量定量。较好地，产物探针的特异活性应为约4×10⁶dpm/pmole。较好地，含全长克隆体库的细菌培养基应解冻，使用100μl的原种接种含25ml无菌L-肉汤(含氨卡青霉素100μg/ml)的无菌培养烧瓶。培养基应较好地在37℃饱和状态生长。饱和培养物应较好地用新鲜的L-肉汤稀释。这些稀释液的等分份应较好地平置以确定稀释度和体积，当在37℃在含1.5％琼脂的150mm培养皿中生长过夜后，在含L-肉汤(含100μg/ml氨卡青霉素)的固态细菌介质上将产出约5000个明显的分离良好的集落。其他获得明显的分离良好的集落的方法也可使用。

然后，应使用标准集落杂交方法将集落转移到硝化纤维滤膜中并溶解，变性，烘烤它们。高度严格条件是至少与，如在65℃1×SSC，或在42℃1×SSC及50％甲酰胺一样严格条件。中度严格条件是至少与，在65℃4×SSC，或在42℃4×SSC及50％甲酰胺一样的严格条件。比严格条件是至少与，在50℃4×SSC，或在40℃6×SSC及50％甲酰胺一样的严格条件。

然后，较好地将滤膜在65℃伴随轻柔搅拌在6×SSC中温育1小时，SSC(20×原种为175.3gNaCl/l，88.2g柠檬酸钠/l，用氢氧化钠调节PH7.0)含0.5％SDS，100μg/ml酵母DNA，10mMEDTA(每150mm滤膜约10mL)。较好地，然后将探针加入到浓度大于或等于1×10⁶dpm/ml杂交混合物中。较好地将滤膜在65℃轻柔搅拌温育过夜。较好地在室温无搅拌情况下用500ml 2×SSC/0.5％SDS冲洗滤膜，接着在室温用500ml 2×SSC/0.1％SDS轻柔晃动15分钟。在65℃用0.1×SSC/0.5％SDS第三次冲洗是随意的。然后较好地将滤膜干燥，并进行放射自显影充分长的时间以在X-射线胶片上显现正象。其他已知的杂交方法也可使用。然后挑选正集落，在培养基中生长，使用标准方法分离的质粒DNA。然后可通过限制酶切分析，杂交分析，或DNA测序检验克隆体。

本发明还包括含静息蛋白，及其片段，突变体，同源物，类似物和等位基因变体的融合蛋白质和嵌合蛋白质。融合或嵌合蛋白质可包括单一蛋白质的多聚体，如静息蛋白的重复或apomigren的重复，或者融合及嵌合蛋白质可由几种蛋白质组成，如静息蛋白和apomigren。融合蛋白质可包括两种或多种已知的抗-血管生成蛋白质的组合(如，angiostatin和endostatin，或angiostatin和endostatin的生物活性片段)，或抗-血管生成蛋白质与导向试剂的组合(如endostatin和上皮生长因子(EGF)或RGD肽)，或抗血管生成蛋白质与免疫球蛋白的组合(如，endostatin和IgG，特别将Fc部分除去)。融合和嵌合蛋白质还可包括静息蛋白，apomigren，它们的片段，突变体，同源物，类似物和等位基因变体，和其他抗-血管生成蛋白质，如endostatin，angiostatin，或EM1(如在Vikas P.Sukhatme 1998年12月8日提交的U.S.S.N，XX/XXX，XXX，“抗-血管生成肽和其使用方法”中所描述的，其全文参考收入本篇)。本文所使用的“融合蛋白质”还可包括其他组成，如用来传递化疗试剂，其中编码化疗试剂的多核苷酸与编码抗-血管生成蛋白质的多核苷酸连接。融合蛋白质还可包括抗-血管生成蛋白质的多聚体，如endostatin的二聚物或三聚物。这样的融合蛋白质可通过翻译后修饰连接(如化学连接)，或整体融合蛋白质可重组制备。

包括在本发明中的还有含静息蛋白，以及其片段，突变体，同源物，类似物和等位基因变体作为生物组分，抑制或促进哺乳动物组织内血管生成的组合物，及使用这种组合物来诊断，预后，及治疗特点在于或与血管生成活性或血管生成活性缺少有关的疾病或病状。这种方法可包括口服，局部，注射，移植，持续释放用药，或其他给药方式。

本发明包括使用静息蛋白和其片段，突变体，同源物，类似物，等位基因变体，以及融合和嵌合蛋白质作为组合物中的生物活性试剂，来治疗与血管生成活性有关的疾病或病状。治疗这种疾病的方法包括用含静息蛋白，其片段，突变体，同源物，类似物，或等位基因变体的组合物接触疾病侵袭组织。

本发明包括使用治疗上有效量的静息蛋白，或其生物活性片段，或具有抗-血管生成活性的静息蛋白片段组合，或静息蛋白刺激物和拮抗剂治疗由血管生成调节的疾病的方法。血管生成-调节的疾病包括，但不限于此，癌症，固体肿瘤，血液生肿瘤(如白血病)，肿瘤转移，良性肿瘤(如，血管瘤，听觉神经瘤，纤维神经瘤，砂眼，化浓性肉芽瘤)，风湿性关节炎，牛皮癣，视觉血管生成疾病(糖尿病视网膜病，早发视网膜病，斑点恶化，角膜移植排斥，新脉管青光眼，晶状体后纤维增生，虹膜发红)，Osler-Webber症，心肌血管生成，空斑新血管生成，毛细血管扩张，血友病关节，血管纤维瘤，伤口粒化。静息蛋白对治疗内皮细胞超常或不正常兴奋的疾病也是有用的。这些疾病包括，但不限于此，肠粘连，Orohn’s症，动脉硬化，硬皮病，疤痕肥大(即瘢痕瘤)。静息蛋白还可通过阻止胎儿种植所需的血管生成而用作避孕试剂。静息蛋白可用于治疗作为病理结果而生成血管的疾病如猫抓痕症(Rochele minaliaquintosa)和溃疡(Heliobacter pylori)。静息蛋白和apomigren还可用来防止透析性移植脉管管路狭窄，和肥胖，如通过抑制在脂肪组织的毛细管形成从而防止其扩张。静息蛋白和apomigren还可用来治疗定位(非转移性的)疾病。“癌症”意指瘤生长，增生或增殖生长或不正常细胞发育的病理状态，包括固体肿瘤，非固体肿瘤，及任何不正常的细胞增殖，如在白血病中所观察到的。如本文所使用的，“癌症”还指血管生成有关的癌症和肿瘤，即肿瘤为了其生长(体积和/或质量的扩张)，需要增加提供其血液的血管的数量和密度。“衰退”是指肿瘤质量和尺寸的减小。如本文所使用的，“治疗上有效量”意指组合物或方法中的每种活性组分的总量足以显示出有意义的患者受益，即治疗，治愈，防止或改善有关治疗状况，或增加治疗，治愈，防止或改善这种病状的比率。当使用组合时，这项术语是指活性组分的组合量产生治疗效果，不论是组合，连续用药还是同时用药。

或者，其中增加血管生成是所需的，如在伤口愈合中，或梗塞后心脏组织中，静息蛋白蛋白质的抗体或抗血清可用来阻断局部的自身的抗-血管生成和过程，从而增加新血管的形成以抑制组织的萎缩。

为治疗疾病，静息蛋白可与其他组合物和方法结合使用。如传统上治疗治疗可采用外科手术，放疗，化疗，或免疫治疗，结合使用静息蛋白，则静息蛋白可随后给患者服用以扩大微小转移的休眠，稳定并抑制任何残留原发性肿瘤的生长。静息蛋白或apomigren，或其片段，抗血清，受体刺激剂，或受体拮抗试剂，或其组合，也可与其他抗-血管生成化合物，或蛋白质，片段，抗血清，其他抗-血管生成蛋白质(如angiostatin，endostatin，EM1)的受体刺激剂，受体拮抗试剂结合。此外，静息蛋白，静息蛋白片段，静息蛋白抗血清，静息蛋白受体刺激剂，静息蛋白受体拮抗试剂，或它们的组合，可与药用可接受的赋形剂，及任意的持续释放基质，如生化能分解的聚合物，形成治疗组合物。本发明的组合物还可含有其他抗-血管生成蛋白质或嵌合化合物，如endostatin，angiostatin，EM1(如在Vikas P.Sukhatme 1998年12月8日提交的U.S.S.N，XX/XXX，XXX，“抗-血管生成肽和其使用方法”中所描述的，其全文参考收入本篇)，及它们的突变体，片段，和类似物。组合物可进一步含有其他试剂，或加强蛋白质活性或赠呈试剂活性或使用在治疗中，如化疗或放疗试剂。这种额外的因子和/或试剂可包括在组合物中以和本发明的蛋白质制备配合功效，或减小副作用。此外，本发明组合物的用药可与其他治疗方式同时进行，如与化疗或放疗法联合用药。

本发明包括通过使用含本发明的蛋白质的组合物与组织接触抑制哺乳动物组织中血管生成的方法。“接触”不仅意指局部使用，还指其他将组合物传递到组织中或组织细胞中的方式。

使用定时释放或持续释放给药系统也包括在本发明中。这种系统在外科手术很难进行或不可能进行的情况下是非常必要的，如患者年老，或疾病进程本身，或风险-受益分析显示控制好于治愈的情况。

如本文所使用的，持续释放基质是由可被酶分解的或酸/碱水解的或溶解的物质制成的，通常是聚合物。一旦插入到体内，基质被酶和体液作用。所需的持续释放基质是从生物相容物质中选取的，如；脂质体，聚交酯(聚合乳酸)，聚乙交酯(乙醇酸的聚合物)，聚交酯共聚乙交酯(乳酸和乙醇酸的共聚物)，聚酐，聚(原酸)酯，聚合蛋白，透明质酸，胶原质，软骨素硫酸盐，羧酸，脂肪酸，磷脂，多糖，核酸，聚合氨基酸，氨基酸如苯基丙氨酸，酪氨酸，异亮氨酸，多核苷酸，聚乙烯基丙烯，聚乙烯基吡咯烷酮，及硅树脂。较好的生物可分解基质是聚交酯，聚乙交酯，或聚交酯共聚乙交酯(乳酸和乙醇酸的共聚物)中的一种。

本发明的调节血管生成组合物可以是固态，液态或浮质的，可通过任何已知的用药途径用药。固态组合物的实例包括丸剂，霜剂和可植入药剂单元。丸剂可口服，治疗霜剂可局部用药。可植入药剂单元可定位用药如在肿瘤位置上，或为了系统释放调节血管生成的组合物，可植入药剂如在皮下。液态组合物的实例包括适合皮下，静脉内，动脉内注射的配方，及适合局部和眼内用药的配方。浮质配方的实例包括适合肺脏用药的吸剂配方。

使用此领域中普通技术人员已知的配制方法，在药用可接受的配方中，上面所描述的静息蛋白蛋白质和有抗血管生成活性的蛋白质片段能以分离的及基本上纯的蛋白质和蛋白质片段提供。这些配方能提通过标准途径用药。通常，组合可通过局部，经皮，腹腔内，颅骨内，脑室内，脑内，阴道内，子宫内，口服，直肠，注射(如静脉内，脊椎内，皮下，或肌肉)途径用药。此外，静息蛋白可掺入到生物可分解的聚合物中使得化合物持续释放，将聚合物植入需要给药部位的邻近，如肿瘤部位或植入到静息蛋白缓慢系统释放的部位。也可使用渗透微型泵通过套管对有关部位提供高浓度静息蛋白控制给药，如直接进入转移性生长部位或进入脉管提供给肿瘤。生物可分解聚合物及它们的应用在，如Brem等人(1991)(J.神经外科.74：441-446)中作了详细描述，其全文参考收入本篇。

本发明的含多肽的组合物可用静脉内用药，如通过注射单位剂量。“单位剂量”当关系到本发明的治疗组合物时，是指物理上不连续的单元，适合用作受试者的单一用量，每个单元含与所需稀释剂(载体或赋形剂)一起计算产生所需疗效的预定量的活性物质。

本发明组合物的用药模式包括静脉内，肌肉，腹腔内，胸骨内，皮下，关节腔内注射和灌注。注射用药用组合物包括药用可接受的无菌水性或非水性溶液，分散体，悬浮体，或乳液，以及在使用前重组在无菌可注射溶液或分散体中的无菌粉末。适合的水性及非水性载体，稀释剂，溶剂或赋形剂包括水，乙醇，多元醇(如丙三醇，丙烯丙二醇，聚乙烯乙二醇等等)，羧基甲基纤维素，和它们适当的混合物，植物油(如棕榈油)和可注射的有机酯如乙基油酸酯。如可通过使用涂覆物质如卵磷脂，通过保持分散体中所需的颗粒大小，及通过使用表面活性剂可维持适当的流动性。这些组合物也可含辅剂如防腐剂，润湿剂，乳化剂和分散剂。可加入各种抗细菌和抗真菌试剂如对羟基苯甲酸酯类，氯丁醇，苯酚山梨酸等以确保预防微生物作用。还可按需要加入等张试剂如糖，氯化钠等。可通过加入试剂如一硬脂酸铝和白明胶，它们可延迟吸收作用，来延长可注射药用形式的吸收时间。可注射缓释形式是通过在生物可分解聚合物如聚交酯-聚乙交酯，聚(原酸酯)和聚(酐)中形成药物微型胶囊基质而制备。根据聚合物与药物的比率和使用具体聚合物的性质，可控制药物释放率。缓释可注射配方还可通过将药物捕集在与身体组织相容的脂质体或微乳剂中而制备。可注射配方可通过保留细菌的滤膜过滤杀菌，或通过掺入杀菌试剂杀菌，固体杀菌组合物在使用前将其溶解或分散在无菌水或其他无菌可注射介质中。

本发明治疗组合物可在其中包括药用可接受的盐组分，如可从有机或无机酸获得的盐。“药用可接受的盐”是指在合理的医学判定范围内，适合用来与人类和低等动物的组织接触并没有不适当的毒性，刺激，过敏反应等的，并与合理的受益/风险比率相匹配的那些盐。药用可接受的盐在此领域中是众所周知的。如S.M.Berge等人在J.药科学(1997)66：1 et seq.中详细描述了药用可接受的盐，其参考收入本篇。药用可接受的盐包括与无机酸如盐酸或磷酸，或有机酸如醋酸，酒石酸，扁桃酸等形成的酸加成盐(与多肽的游离氨基基团形成的)。与游离羧基基团形成的盐也可从无机碱如氢氧化钠，氢氧化钾，氢氧化铵，氢氧化钙或氢氧化铁，及有机碱如异丙基胺，三甲基胺，2-乙基胺乙醇，组氨酸，普鲁卡因等获得。盐也可在本发明的化合物最后分离的和提纯期间原位制备，或独立地通过用适当的有机酸与游离碱官能反应制备。典型的酸加成盐包括，但不限于此，醋酸盐，已二酸盐，海藻酸盐，柠檬酸盐，天冬氨酸盐，安息香酸盐，苯磺酸盐，硫酸氢盐，丁酸盐，樟脑酸盐，樟脑磺酸盐，双葡萄糖酸盐，甘油磷酸盐，半硫酸盐，庚酸盐，己酸盐，延胡索酸盐，氢氯化物，氢溴化物，氢碘化物，2-羟基甲烷磺酸盐(羟乙磺酸盐)，乳酸盐，马来酸盐，甲烷磺酸盐，烟酸盐，2-萘磺酸盐，草酸盐，双羟萘酸盐，果胶脂酸盐，过硫酸盐，3-苯基丙酸盐，苦味酸盐，特戊酸盐，丙酸盐，琥珀酸盐，酒石酸盐，硫氰酸盐，磷酸盐，谷氨酸盐，重碳酸盐，p-甲苯磺酸盐，十一酸盐。并且，碱性含氮基团可被一些试剂季铵化如小分子烷基卤代物如甲基，乙基，丙基和丁基的氯代物，溴代物和碘代物；硫酸二烷基酯如硫酸二甲酯，二乙基酯，二丁基酯和二戊基酯；长链卤代物如癸基，十二烷基，十四烷基，十八烷基氯代物，溴代物，碘代物；芳烷基卤代物如苄基和苯乙基溴代物及其他。从而获得水或油溶或可分散产物。可用来制成药用可接受的酸加成盐的酸的实例包括，无机酸如盐酸，硫酸和磷酸，有机酸如草酸，马来酸，琥珀酸，柠檬酸。

如本文所使用的，“药用可接受的”，“生理上可忍受的”及它们合乎文法的变通，如它们所指的组合物，载体，稀释剂和试剂，是可互换使用的，表示物质可给哺乳动物服用，有最小量的不利生理反应如恶心，眩晕，胃部不适等。制备含活性组分溶解或分散其中的药用组合物在此领域中是众所周知的，不必限制在配方上。通常这种组合物制备成可注射液体溶液或悬浮体，然而，在使用前可溶解或悬浮在液体中的固体形式也可制备。也可制备乳化溶液。

可将药用可接受的并与活性组分相容的适合使用在本文所描述的治疗方法中的量的赋形剂与活性组分混合。适当的赋形剂包括如，水，盐水，葡萄糖，丙三醇，乙醇等及它们的组合。此外，如果需要，组合物可含有少量辅助物质如润湿剂或乳化剂，PH缓冲试剂等加强活性组分效力的辅剂。

本发明的静息蛋白多肽还可包括在含前体药物的组合物中。如本文所使用的，“前体药物”是指在体内很快地转化产生母体化合物的化合物，如在血液中通过酶解或水解。充分的讨论在T.Higuchi和V.Stella.的前体药物作为新型给药系统ACS讨论会系列的14卷中以及在Edward B.Roche.，的药物设计中的生物可逆载体美国药协会和Permagon出版社，1987中提供，两篇文献参考收入本篇。如本文所使用的，“药用可接受的前体药物”指(1)在合理的医学判定范围内，适合用来与人类和动物的组织接触并没有不适当的毒性，刺激，过敏反应等的，并与合理的受益/风险比率相匹配的，对它们要作的应用有效的本发明化合物的前体药物。(2)母体化合物的两性离子形式，在可能的场合。

本发明静息蛋白的剂量取决于要治疗的疾病状况和病状，以及其他临床因素如体重和人类或动物状态和化合物服用途径。治疗人类或动物，可服用约每公斤体重约10mg到每公斤体重约20mg的静息蛋白蛋白质或apomigren蛋白质。在组合治疗中，如，本发明的静息蛋白蛋白质和apomigren蛋白质与放疗，化疗或免疫治疗结合时，可减小剂量，如每公斤体重约0.1mg到每公斤体重约0.2mg。根据静息蛋白在具体动物或人体内的半衰期，静息蛋白可每天服用几次到一周服用一次。可以理解认为本发明对人类和牲畜都适用。本发明的方法预期考虑了单次服用和多次服用，假定在同时或在经过延长的一段时间服用。此外，静息蛋白和/或apomigren可结合其他形式的治疗服用，如化疗，放疗，或免疫治疗。

静息蛋白配方包括适于口服，直肠，眼(包括晶状体内，intracameral)，鼻，局部(包括口腔，舌下)，子宫内，阴道或注射(包括皮下，腹腔内，肌肉，静脉内，经皮，颅骨内，气管内，硬脑膜外)用药的配方。静息蛋白配方可方便地置于单位剂量形式中，可通过传统制药技术制备。这样的技术包括产生活性组分和药用载体或附形剂结合物的步骤。通常，制备配方是通过均一完全地产生活性组分与液体载体或均分固体载体或两者都有的结合物，如果需要，然后定形产品。

适于注射用药的配方包括水性或及非水性无菌注射溶液，其中含抗氧化剂，缓冲液，抑菌剂及给配方提供与预接受体的血液等张的溶质；水性及非水性无菌悬浮液，其中包括悬浮试剂和增稠试剂。配方可置于单位剂量的药剂中或置于多剂量的容器中，如密封的一次用量针剂和小瓶，也可储存在冷冻-干燥(冻干)状态，仅需要在使用前加入无菌液态载体，如注射用水。临时注射溶液和悬浮液可从前面描述的无菌粉末，颗粒和片剂种类制备。

当口服治疗上有效量的本发明的蛋白质时，本发明的静息蛋白蛋白质可以是片剂，胶囊，粉末，溶液或西也剂的形式。当以片剂形式服用时，本发明药用组合物可以另外包含固体载体如白明胶或辅剂。片剂，胶囊，和粉末含约5％到约95％的本发明的蛋白质，较好地含约25％到90％的本发明的蛋白质。当以液态形式服用时，可加入液态载体如水，石油，动物或植物源的油如花生油，矿物油，大豆油，或芝麻油或合成油。液态药用组合物可进一步包括生理盐水溶液，葡萄糖或其他糖类溶液，或乙二醇如1，2-亚乙基二醇，丙二醇，或聚乙二醇。当以液态形式服用时，药用组合物含约0.5％到90％重量比的本发明的蛋白质，较好地含约1％到50％的本发明的蛋白质。

当静脉内，皮肤或皮下注射服用治疗上有效量的本发明的蛋白质时，本发明的蛋白质的形式是不含热原质，注射可接受的水性溶液。制备具有适当的PH，等张性，稳定性等的这种注射接受的蛋白质溶液在此领域的技术范围内。适用于静脉内，皮肤，或皮下注射的较好的药用组合物中除了本发明的蛋白质外，还应含有等张赋形剂如氯化钠注射液，Ringer注射液，葡萄糖注射液，葡萄糖和氯化钠注射液，乳酸盐Ringer注射液，或其他此领域已知的赋形剂。本发明的药用组合物还可含有稳定剂，防腐剂，缓冲液，抗氧化剂，或其他此领域中的技术人员已知的添加剂。

在本发明的药用组合物中的本发明的蛋白质的量取决于要治疗病状的性质和严重性，及患者已进行的前期治疗的性质。根本上，由参与的医生来决定用本发明的蛋白质治疗每个具体患者的量，开始，参与医生给患者服用少剂量的本发明的蛋白质并观察患者的反应。加大服用本发明的蛋白质的量直到对患者获得最优的治疗效果，到这一点后剂量不再增加。

使用本发明的药用组合物静脉内治疗的持续时间是变化的，取决于要治疗的疾病的严重性和每个具体患者的病状和潜在特殊反应。可考虑认为本发明的蛋白质的每种应用的持续时间在连续静脉内用药的12到24小时范围内。最终，参与医生决定使用本发明的药用组合物静脉内治疗的适当的持续时间。较好的单位药剂配方含有服用组分的日剂量或单位，日亚-剂量，或其适当的部分剂量。应理解认为，除了具体上面提及的组分，本发明的配方还可包括其他此领域中有关这类配方的传统试剂。任意地，可掺入胞毒试剂或与静息蛋白蛋白质，或其生物官能片段结合，给患者提供双重治疗。

目前，治疗组合物对牲畜应用也是很有价值的。除了人类外，家养动物和纯种马也是使用本发明的蛋白质进行这种治疗的理想患者。胞毒试剂如蓖麻毒素与静息蛋白，及高亲和力静息蛋白蛋白质片段结合，从而提供一种破坏静息蛋白结合细胞的工具。这些细胞可在许多位置发现包括，但不限于此，微小转移和原发性肿瘤。与胞毒试剂结合的蛋白质以设计给所需位置最大给药的方式灌注。如通过套管将蓖麻毒素结合高亲和力静息蛋白片段传递到脉管中，提供给靶部位或直接给药到靶部位。这样的试剂还以可控方式通过与灌注套管连接的受体泵传递。静息蛋白拮抗剂的组合可与血管生成的刺激剂共同使用以增加组织的脉管形成。这种治疗用药法对破坏转移性癌症提供了有效的方法。

其他治疗方法包括服用与胞毒试剂结合的静息蛋白，静息蛋白片段，静息蛋白类似物，静息蛋白抗血清，或静息蛋白受体刺激剂和拮抗剂。可以理解认为，静息蛋白可来源于人类或动物。静息蛋白也可通过化学反应合成制备，或通过结合表达系统的重组技术制备。静息蛋白也可通过酶裂解分离的血纤维蛋白溶酶原或血纤维蛋白溶酶产生有抗血管生成活性的蛋白质而制备。静息蛋白还可通过模拟内源酶作用将血纤维蛋白溶酶原裂解成静息蛋白的化合物制备。静息蛋白的产量也可通过影响血纤维蛋白溶酶原裂解酶活性的化合物来调节。

使用蛋白质序列数据库如GenBank，Brookhaven蛋白质，SWISS-PROT，和PIR，将这些蛋白质的序列与已知序列比较确定潜在的序列同源性。这项信息便于排除表现出与其他分子有高度序列同源性的序列，从而增强静息蛋白抗血清，刺激剂和拮抗剂培养中的高特异性潜能。本发明还包括基因治疗，其中将编码静息蛋白或apomigren，或其突变体，片段，或融合蛋白质的多核苷酸引入或调节到患者体内。多种向细胞转移或传递DNA表达基因产品蛋白质的方法，或者称为基因治疗法，在N.Yang(1992)体内基因转移到哺乳动物体细胞中.Crit.Rev.生物技术.12(4)：335-356中作了公开，其参考收入本篇。基因治疗包括将DNA序列掺入到体细胞或生殖系细胞中，使用在来自体内或体内治疗中。  基因治疗是替换基因，增大正常或不正常基因的功能，并对抗感染的疾病或其他病理状况。

用基因治疗法治疗这些医学问题的方案包括：，确定缺损基因，然后加入功能基因替换缺损基因的功能或增加微弱功能基因；或预防方案，如加入产物蛋白质基因治疗病状，或使得组织或器官对治疗更敏感。预防方案的一个实例是，将基因如静息蛋白置于患者体内预防血管生成的发生，或插入使肿瘤细胞对辐射更敏感的基因，然后辐射肿瘤会产生增强杀死肿瘤细胞效果。

在本发明中预想了许多转移静息蛋白DNA或静息蛋白调节序列的方案。转染启动子序列，即是通常发现与静息蛋白特异相关的序列，或其他增加静息蛋白蛋白质产量的序列也预想作为基因治疗的方法。这项技术的实例在麻萨诸塞州，Cambridge的Transkaryotic治疗有限公司中可找到，使用同源重组插入开启细胞中促红细胞生成素基因的“遗传开关”。参阅1994年4月15日的基因工程新闻。这种“遗传开关”可用来激活细胞中通常不表达静息蛋白(静息蛋白受体)的静息蛋白(或静息蛋白受体)。

基因治疗的基因转移法分成三个主要的种类：物理法(如电泳，直接基因转移和粒子轰击)，化学法(脂质基载体，或其他非滤过性病毒载体)和生物法(如病毒-衍生载体和受体吸收)。如可使用的非滤过性病毒载体包括涂覆DNA的脂质体。这种脂质体/DNA复合物可直接静脉注射到患者体内。可以相信认为，脂质体/DNA复合物集中在肝脏，在肝脏复合物将DNA传递给巨噬细胞和Kupffer细胞。这些细胞寿命长，这样可提供传递DNA的长期表达。并且，为治疗DNA的定向传递，载体或基因的“裸”DNA可直接注射到需要治疗的器官，组织或肿瘤中。

基因治疗方法也可通过传递部位描述。传递基因的基本方法包括来自体内细胞基因转移，体内基因转移，和体外基因转移。在来自体内细胞基因转移中，从患者获取细胞并在细胞培养基中培养。将DNA转移到细胞中，转染的细胞数量扩增，然后重新植入患者体内。在体外基因转移中，转化的细胞是在培养基中生长的细胞，如组织培养细胞，及不是从具体患者获取的具体细胞。转染这些“实验室细胞”，选取转染的细胞并扩增，用来植入患者体内或作其他用途。

体内基因转移包括当细胞在患者体内时，将DNA引入到患者的细胞内。方法包括使用滤过性病毒调节基因转移，使用未感染病毒在患者体内传递基因，或在患者体内注射裸DNA，DNA被一部分基因产物蛋白质在其中表达的细胞吸收。另外，本文描述的其他方法，如使用“基因枪”，适用于体外插入静息蛋白DNA或静息蛋白调节序列。

基因治疗的化学方法可包括脂质基化合物，没有必要是脂质体，穿过细胞膜转移DNA。脂质转染剂或细胞转染剂，脂质基正离子与负电荷DNA结合，产生能穿过细胞膜复合物，提供DNA进入细胞内部。另一种化学方法使用受体基胞吞作用，包括将特异配体与细胞表面受体结合，将其包裹并穿过细胞膜运送。配体与DNA结合，整个复合物被运送到细胞内。将配体基因复合物注射到血流中，然后靶中含有特异结合配体的受体的细胞，将配体-DNA复合物运送到细胞中。

许多基因治疗法采用滤过性病毒载体将基因插入到细胞中。如，在来自体内方法已使用改变的逆转录病毒载体将基因引入到外围及肿瘤-渗透的淋巴细胞，肝细胞，上皮细胞，肌细胞，或其他体细胞中。然后将这些改变的细胞引入到患者体内提供插入DNA的基因产物。

在体内方案中，滤过性病毒载体也已使用将基因插入到细胞中。为了指导外源基因的组织特异表达，可使用已知的对组织特异的顺式作用调节元素或启动子。或者，这也可采用将通过DNA或滤过性病毒载体原位传递到体内特异解剖部位来实现。如，将基因转移到体内血管中可通过将体外转导的内皮细胞植入到在动脉管壁上选取的部位上实施。病毒感染了也表达基因产物的环境细胞。滤过性病毒载体可直接被传递到体内部位上，如通过导管，这样仅使某些区域被病毒感染，提供了长期部位特异基因表达。使用逆转录病毒载体进行体内基因转移也已在乳房组织和肝脏组织中通过将改变的病毒注射到导向器官的血管中得到论证。

已使用在基因治疗方案中的滤过性病毒载体包括，但不限于此，逆转录病毒，其他RNA病毒如脊髓灰质炎病毒或Sindbis病毒，腺病毒，腺相关病毒，疱疹病毒，SV40，牛痘，和其他DNA病毒。复制缺损鼠逆转录病毒载体是最广泛使用的基因转移载体。鼠白血病逆转录病毒由单链RNA组成，复合核核心蛋白质和聚合酶(pol)酶，由蛋白质核心(gag)包裹及被糖蛋白包膜(env)围绕，确定了宿主范围。逆转录病毒的基因组结构包括被5’和3’长端重复单元(LTR)包围的gag，pol，及env基因。只要滤过性病毒结构蛋白质在包装细胞系中以反式提供，逆转录病毒载体系统利用最小载体含5’和3’LTRs和包装信号的事实，足以使载体包装，感染及整合到靶细胞中。适合基因转移的逆转录病毒的基本优点包括高效感染及在多数细胞类型中基因表达，精确单拷贝载体整合到靶细胞染色体DNA中，逆转录病毒基因组的操作轻松。

腺病毒由线性，双链DNA组成，复合核心蛋白质并由衣壳蛋白质包围。分子病毒学的先进技术已能利用这些生物体的生物学知识创造能将新型基因序列转导到体内靶细胞中的载体。腺病毒基载体能高水平表达基因产物蛋白质。腺病毒载体具有高效感染性，即使使用低效价病毒。另外，病毒能如不含细胞病毒一样充分感染，所以不需要注射生产者细胞系。腺病毒另一个潜在优点是能获得体内异源基因的长期表达。

DNA传递的机械方法包括融合脂质囊如脂质体或其他膜融合囊，DNA脂质粒子掺和阳离子脂质如脂质转染剂，DNA的多赖氨酸调节转移，直接注射DNA，如将DNA显微注射到生殖细胞或体细胞中，气动传递DNA涂覆粒子，如在“基因枪”中使用的金粒子，无机化学法如磷酸钙转染。粒子-调节基因转移方法在转移植物组织中首先使用。使用粒子轰击装置，或“基因枪”，产生动力将DNA-涂覆高密度粒子(金或钨)加速到能穿过靶器官，组织或细胞的高速。粒子轰击可使用在体外系统，或使用来自体内或体内技术将DNA引入到细胞，组织或器官中。另一种方法，配体调节基因治疗，包括将DNA与特异配体复合形成配体-DNA缀合物，指导DNA到特异细胞或组织中。

已经发现将质粒DNA注射到肌肉细胞中产生高比率的转染并含标记基因持续表达的细胞。质粒的DNA能或不能整合到细胞的基因组中。未整合的转染DNA会使基因产物蛋白质在末端分化，未增殖的组织中的转染和表达延长一段时间，并且不用担心在细胞或线粒体基因组中突变插入，缺失，或改变。长期，但没有必要永久，将治疗基因转移到特异细胞中能对基因疾病提供治疗或预防。DNA能定期重新注射以保持基因产物含量，在受体细胞的基因组中没有突变产生。未整合外源DNA能允许在一个细胞内存在几种不同的外源DNA构建，所有的构建表达不同的基因产物。

基因转移电穿孔法使用电流使细胞或组织对电穿孔-调节调节的基因转移敏感。使用一定电场强度的短暂电脉冲增加膜的穿透性，使DNA分子能穿过进入到细胞中。这种技术也可使用在体外系统中，或使用来自体内或体内技术将DNA引入到细胞，组织或器官中。

载体调节体内基因转移可用来转染外源DNA进入到细胞中。载体-DNA复合物能方便地引入到体液或血流中，然后部位特异地定向到身体内的靶器官或组织中。脂质体和多聚阳离子都可使用，如多赖氨酸，脂质转染剂或细胞转染剂。脂质体可培养成细胞特异的或器官特异的，这样脂质体携带的外源DNA可被靶细胞吸收。针对某些细胞的特异受体注射免疫脂质体可用来作为一种将DNA插入到携带受体细胞中的便利方法。已使用的另一个载体系统是适用于体内基因转移携带DNA到肝细胞中的脱唾液酸糖蛋白/多赖氨酸缀合物系统。

转染的DNA也可与其他种类载体复合，这样DNA可被携带到受体细胞中，然后居留在细胞质或核质中。DNA能与载体核蛋白质偶合在特异基因工程囊复合物中，并被携带直接进入细胞核中。

静息蛋白的基因调节可通过服用与静息蛋白基因，或与resin基因有关的控制区域，或与静息蛋白基因的对应RNA转录物结合的化合物调节转录或翻译率来实施。另外，用编码静息蛋白的DNA序列转染的细胞也可给患者服用以维持体内静息蛋白源。如细胞可以用含编码静息蛋白的核酸序列的载体转染。转染细胞可以是从患者正常组织，患者病变组织中获得的，或可以不是患者的细胞。

如，从患者体内移出的肿瘤细胞可用能表达本发明的静息蛋白蛋白质的载体转染，并重新引入到患者体内。转染的肿瘤细胞在患者体内产生了抑制肿瘤生长的静息蛋白含量。患者可以是人类或非人类的动物。细胞也可以通过非载体，或此领域中已知的物理或化学方法如电穿孔法，离子穿孔法，或通过“基因枪”转染。另外，静息蛋白DNA可在没有载体辅助的情况下直接注射到患者体内。具体地，静息蛋白DNA可注射到皮肤，肌肉或血液中。

转染静息蛋白到患者体内的基因治疗方案可以是通过整合静息蛋白DNA到细胞的基因组中，到微型染色体中，或者在细胞质或核质中作为单独的复制或非复制DNA构建。静息蛋白表达可持续较长的一段时间，或定期重新注射以维持细胞，组织，器官，或确定的血液含量中所需的静息蛋白蛋白质含量。

此外，本发明包括抗体和抗血清，其可用来检测新型抗-血管生成蛋白质，并也可使用在诊断，预后，或治疗特点在于或与血管生成活性或活性缺少有关的疾病和病状中。这样的抗体和抗血清也可用来在需要的位置向上调节血管生成，如在梗塞后心脏组织中，静息蛋白蛋白质的抗体或抗血清可用来阻断局部的自身的抗-血管生成和过程，从而增加新血管的形成以抑制组织的萎缩。此外，静息蛋白和apomigren可用来诱导细胞程序死亡，或其抗体可用来防止细胞或组织中的细胞程序死亡。对细胞程序死亡的测定在Vikas P.Sukhatme 1998年12月8日提交的U.S.S.N.XX/XXX，XXX，“抗-血管生成肽及其应用方法”，和Dhanabal等人(1998)(“Endostatin诱导内皮细胞的细胞程序死亡”，J.生物化学.，提交的)中提供。

这种抗体和抗血清可与药用可接受的组合物和载体结合形成诊断，预后或治疗用组合物。“抗体”或“抗血清”是指一群免疫球蛋白分子和/或免疫球蛋白分子的免疫活性蛋白质，即含抗体结合位点或互补位的分子。

使用特异结合静息蛋白的抗体的被动抗体治疗可用来调节与血管生成相关的过程如再生，发育，伤口愈合及组织修复。此外，定向静息蛋白抗体的Fab区域的抗血清可服用以封闭内源静息蛋白抗血清与静息蛋白结合的能力。

本发明的静息蛋白还可用来产生对抑制剂和其受体特异的抗体。抗体可以是多克隆抗体或单克隆抗体。这些特异与静息蛋白或静息蛋白受体结合的抗体，可使用在此领域的技术人员众所周知的诊断方法和工具中，来检测或定量体液或组织中的静息蛋白或静息蛋白受体。这些测试的结果可用来诊断或预测癌症和其他血管生成调节的局部的出现和重现。

本发明还包括使用静息蛋白，静息蛋白的抗体，和含静息蛋白和/或其抗体的组合物诊断或预后特点在于血管生成活性的疾病。如本文所使用的，“预后方法”意指能预测诊断患有疾病的人类或动物的疾病的进展的方法，具体地，是与血管生成有关的疾病。本文所使用的“诊断方法”指能在人类或动物体内确定有与血管生成有关的疾病存在或确定其类型的方法。

静息蛋白可使用在检测及定量能结合静息蛋白的抗体的诊断方法和工具中。这些工具可检测循环静息蛋白抗体，其指示了在存在由原发性肿瘤原位分泌的静息蛋白情况下微小转移的扩散。有这种循环抗-静息蛋白抗体的患者很可能发展多种肿瘤及癌症，并很可能在治疗后或切除一段时间后重现癌症。这些抗-静息蛋白抗体的Fab片段可用作抗原，产生抗-静息蛋白Fab片段抗血清，其可用来中和抗-静息蛋白抗体。这种方法可减少被抗-静息蛋白抗体排除的循环静息蛋白，从而有效提高了循环静息蛋白含量。

本发明还包括分离对静息蛋白特异的受体。具有与组织结合高亲和力的蛋白质片段可用来在亲和柱上分离静息蛋白受体。静息蛋白受体的分离和提纯是阐明静息蛋白作用机制的基本步骤。分离静息蛋白受体及鉴定静息蛋白刺激剂和拮抗剂会促进药物发展以调节静息蛋白受体活性，最终途径是调节生物活性。使用原位和溶液杂交技术，分离受体能构建核苷酸探针以监控受体的定位及合成。并且，可分离出静息蛋白受体的基因，并掺入到表达载体中及转染到细胞中，如患者的肿瘤细胞，以增加细胞种类，组织或肿瘤结合静息蛋白及抑制局部血管生成的能力。

静息蛋白蛋白质可用来制成亲和柱从培养的肿瘤细胞中分离静息蛋白受体。分离及提纯静息蛋白受体后进行氨基酸测序。利用这项信息，基因或编码静息蛋白受体的基因可被确定并分离。接着，将克隆的核酸序列插入到能表达受体的载体中培养。这些技术对此领域的技术人员是众所周知的。将编码静息蛋白受体的核酸序列转染到肿瘤细胞中，转染的肿瘤细胞表达受体增强了这些细胞对内源或外源静息蛋白的反应，从而减小了转移生长率。

本发明的血管生成抑制蛋白质可在标准微量化学设备中合成，用HPLC和质量分光光度测定法检查纯度。蛋白质合成，HPLC提纯及质量分光光度法对这些领域中的技术人员是普遍了解的。静息蛋白蛋白质和静息蛋白受体也可在重组E.coli或酵母表达系统中制备，用柱层析提纯。

可合成完整静息蛋白分子的不同蛋白质片段使用在几种应用中包括，但不限于下面列出的：作为培养特异抗血清的抗原，作为在静息蛋白结合位点作用的刺激剂和拮抗剂，作为要与定向杀死结合静息蛋白细胞的胞毒试剂结合，或结合中使用的蛋白质。包含这些蛋白质的氨基酸序列根据它们在分子外部区域的位置来选取，便于与抗血清结合。静息蛋白的氨基和羧基末端，以及分子的中间区域在要合成的片段中独立表示。

静息蛋白的合成蛋白质片段有多种用途。与静息蛋白受体结合具有高度特异性及亲和力的蛋白质是放射性标记的，使用放射自显影和膜结合技术时可用来观察和定量结合位点。这种应用提供了重要的诊断和研究工具。了解静息蛋白受体的结合属性有利于研究与受体有关的转导机制。

使用标准技术静息蛋白和静息蛋白衍生的蛋白质可与其他分子偶合。静息蛋白的氨基和羧酸末端都含酪氨酸和赖氨酸残基，并用许多技术等位素及非等位素标记，如使用传统技术放射性标记(酪氨酸残基-氯胺T，iodogen，乳过氧化物酶；赖氨酸残基-Bolton-Hunter试剂)。这些偶合技术对此领域中的技术人员是众所周知的。或者，将酪氨酸和赖氨酸加入到不含这些残基的片段中，以便标记蛋白质上的活性氨基和羟基基团。根据在氨基酸上有的官能团选择偶合技术，官能团包括，但不限于氨基，sulfhydral，羧基，酰铵，酚，咪唑。用来影响这些偶合的多种试剂包括戊二醛，重氮化对二氨基联苯，碳化二亚胺，苯醌。

为了多种应用，静息蛋白蛋白质可与同位素，酶，载体蛋白质，胞毒试剂，荧光分子，化学发光剂，生物发光剂，及其他化合物化学偶合。使用适于特异反应的不同技术来确定偶合反应的效率。如使用氯胺T和Na¹²⁵I的高特异活性用¹²⁵I放射性标记静息蛋白蛋白质实施。用焦亚硫酸钠终止反应，混合物在一次性柱上脱盐。标记的蛋白质从柱上洗提出，分步收集。从每步收集物中移出等分份，并在用γ计数仪测量放射性活度。在这种方法中，未反应的Na¹²⁵I从标记的静息蛋白蛋白质分离。特异放射性活度最大的蛋白质组分保存作随后使用如分析与静息蛋白抗血清结合的能力。

此外，具有短寿命同位素的标记静息蛋白蛋白质能观察体内受体结合位点，使用正电子发射线断层显影术或其他现代放射显影技术用静息蛋白结合位点定位肿瘤。

在这些合成的蛋白质内系统置换氨基酸产生对静息蛋白受体高亲和力蛋白质刺激剂和拮抗剂，增强或减小了静息蛋白与其受体的结合。这样的刺激剂用来抑制微小转移的生长，从而限制了癌症的扩散。静息蛋白的拮抗剂用在脉管生成不充分的情况中，阻断对静息蛋白的抑制作用促进血管生成。如，这种治疗对促进糖尿病患者的伤口愈合有疗效。

本发明的静息蛋白蛋白质也可用作营养源或补充物。这种应用没有限制包括：用作蛋白质或氨基酸所补充物，用作碳源，用作氮源及用作碳水化合物源。在这种情况中，本发明的静息蛋白蛋白质可加到具体生物体的食物中，或能以单独的固态或液态制剂服用，如以粉末，丸剂，溶液，悬浮液或胶囊形式服用。对于微生物，本发明的蛋白质或多核苷酸可加到微生物在其中或其上培养的介质中。

本发明进一步由下列实例演示，这些实例并不意味着发明要以如在其范围上强加限制的任何方式来解释。相反，可清楚地理解认为，对发明的多种其他具体实施，修正，及等同物，也有这种借助方式，在阅读本文描述内容后，在此领域中的技术人员看来，这种借助方式没有背离本发明的精神和/或所附权利要求书的范围。实例

           实例1：细胞和细胞息

将从ATCC(美国典型培养物保藏中心，美国弗吉尼亚州，Manassas，大学路10801)获取的C-PAE(牛肺部动脉内皮细胞，ATCC No.CCL-209)细胞保持在含10％胎牛血清，100U/ml青霉素，100μg/ml链霉素和2mM L-谷氨酰胺的DMEM介质中。细胞在37℃含5％二氧化碳，IMR-90，肺成纤维细胞和IC-21的湿润环境中温育，从ATCC购得的巨噬细胞前体细胞保持在与C-PAE细胞相同的条件下，将HMVE-L细胞(人类肺原微脉管内皮细胞，美国加利弗尼亚州，圣地亚哥Clonetics)保持在EGM-2MV介质中。

               实例2：分离静息蛋白序列CDNA文库用作DNA-PCR模板。K562-红细胞文库JMN-人类mesothioliomaHFK-人类胎肾文库786-0-人类肾细胞癌MAB-人类成人脑293-对照物

从GIBCO-BRL(美国马里兰州，Gaithersburg生命技术公司)合成与胶原质XV NC10域的C-末端部分对应的引物。使用的引物是5’-TTT TTT GAA TTC ACC TCA AGT GCC ATTTAT GAG AAG CCT GCT CTG CAT TTG-3’(上游引物)和5’-AAG AAT GCG GCC GCT TAC TTC CTA GCG TCT GTC ATGAAA CTG TTT TCG AT-3’(下游引物)。

采用标准方法实施扩增。简要地，从每种CDNA文库中取出100ng的DNA用作模板。使用下列参数实施30个周期的扩增：94℃变性，60℃退火，72℃延展，每种处理1分钟。

540bp扩增片段，本文称为“静息蛋白”，提纯并用EcoRI和NotI消化。图5示意显示了将胶原质XV克隆到Pichia表达载体中(pPICZαA，美国加利弗尼亚州圣地亚哥，InVitrogen)。pPICZαA也用上面的限制性内切酶消化并与静息蛋白片段连接。用宿主株Top10F’(美国加利弗尼亚州，圣地亚哥，InVitrogen)实施初始转化。将正克隆，称为“pPICZαA-CXV”，测序以确证修饰。然后将质粒用SacI酶线性化，并通过氯化锂转化，用来同源重组到酵母宿主株GS115(美国加利弗尼亚州圣地亚哥，InVitrogen)中。如在Pichia表达操作手册中所描述的实施重组。在30℃让集落在YPD/Zeocin板上生长两天。将长在Zeocin上的克隆体收集作小规模诱导，如制造商(美国加利弗尼亚州，圣地亚哥，InVitrogen)所建议的实施诱导步骤。从K592和HFK文库中成功衍生静息蛋白。HFK克隆用作所有随后的研究中。

          实例3左Pichia表达系统中表达静息蛋白

将单一集落从YPD/Zeocin接种到500ml带挡板的烧瓶内的25ml BMGY/Zeo(100ug/ml)中。在晃动的温育箱内培养物在30℃生长直到培养物达到OD600 2-6(约16-24小时)。以1∶100稀释生长对数期的细胞用来接种1升培养物。加入500ml的BMGY介质，细胞在2升带挡板的烧瓶内生长，培养物达到OD600 15-20(约2-3天)。在室温通过在5000rmp离心10分钟收获细胞。倒出上清液，细胞沉淀重新悬浮在300-400ml的BMMY介质中诱导重组蛋白质的表达。为了保持诱导作用，每24小时加入100％甲醇到终浓度为0.5％。诱导后的第二，第三和第四天收集上清液，并通过考马斯染色的SDS-PAGE作蛋白质表达分析。

实例4：使用肝磷脂-琼脂糖柱提纯静息蛋白

通过用60-70％的硫酸铵沉淀浓缩上清液。沉淀的蛋白质在10,000rpm离心10分钟，沉淀重新悬浮在磷酸盐缓冲盐水中，并在4℃透析过夜。用10mM Tris和50mM氯化钠PH7.4实施终透析。用5ml肝磷脂-琼脂糖静息蛋白(药血生物技术有限公司，美国新泽西州Piscataway)填充Polyprep柱，并用10mMTris和50mM氯化钠PH7.4平衡。将浓缩的粗制蛋白质样品以20-30ml批量以10-15ml/小时的流速加样在柱上。柱用平衡缓冲液冲洗，直到在280nm的吸收度大于0.001。结合蛋白质通过分级梯度氯化钠(0.2M，0.6M，和1.0M)洗脱。当样品用SDS-PAGE分析时，洗脱图没有显示任何其他不同的蛋白质峰，大部分蛋白质没有与柱结合。降低氯化钠的浓度及改变PH没有改变结合图。重组蛋白质没有与肝磷脂柱结合。

实例5：构建组氨酸标记静息蛋白重组蛋白质

在氨基末端的静息蛋白分子的组氨酸标记基元序列简化提纯。合成两个互补的寡核苷酸引物，5’-TTT TTT GAA TTC ACCTCA AGT GCC ATT TAT GAG AAG CCT GCT CTG CAT TTG-3’(上游引物)和5’-AAG AAT GCG GCC GCT TAC TTC CTAGCG TCT GTC ATG AAA CTG TTT TCG AT-3’(下游引物)。这些引物编码组氨酸残基(在一段序列有6个组氨酸酰胺基)，侧翼有EcoRI限制性位点。用EcoRI消化构建pPICZαA-CXV。混合50μl每种引物(100μM)，并在95℃变性5分钟，立刻在冰上冷却。在16℃将退火的引物连接到EcoRI消化的载体主链上过夜。连接酶在70℃加热灭活10分钟，过量的引物用Glass Max(Gibco/BRL，美国马里兰州Gaithersburg)提纯柱除去。连接的载体用宿主株Top 10F’(美国加利弗尼亚州，圣地亚哥，InVitrogen)转化。重组克隆体用PCR和限制性内切酶分析筛选。通过测序进一步确证存在组氨酸标记基元序列，构建称为“pPICZαA/His.静息蛋白”。

用SacI线性化重组体pPICZαA/His.静息蛋白。使用株GS115(美国加利弗尼亚州圣地亚哥，InVitrogen)实施重组。实例6：鼠和人类endostatin的C-末端与apomigren的同源性

寻找GenBank中显示与endostatin有同源性的序列。一种这样的序列是人类XV类胶原质的C-末端区域。图9显示与整链相比的胶原质XV全长α1链的85个C-末端氨基酸。图10显示人类胶原质的85个C-末端氨基酸和鼠和人类endostatin间的同源性。人类胶原质XV的这个区域本文称为apomigren。在这些蛋白质的C-末端氨基酸间存在约60％氨基酸一致性。当计算保守置换时，这些区域享有约75％氨基酸一致性。

实例7：人类apomigren的克隆，表达和提纯

在pPICZαA-CXV载体模板上，其中含部分NC10域(555bp)，使用Vent DNA聚合酶扩增编码人类胶原质XV的C-末端85个氨基酸(255bp)的序列(Myers等人(1992)Ptoc，Natl.Acad.Sci.美国89：10144-48)。扩增实施30个周期，在94℃变性，在60℃退火，在72℃延展，每项处理1分钟，使用下列引物：5’-TTC  CAT ATG ATA TAC TCC TTT GAT GGT CGAGAC ATA ATG ACA-3’和5’-AAG AAT  GCG GCC GCT TAC TTCCTA GCG TCT GTC ATG AAA CTG TTT TC GAT-3’。扩增的DNA(255bp)使用QIA快速提纯工具(德国，Hilden，Qiagen)提纯，用NdeI和NotI消化(那些在引物中划线位点)，并连接到用NdeI和NotI预消化的Pet28(a)表达载体(美国威斯康星州麦迪逊，Novagen)中，以给出期望的蛋白质序列MGSSHHHHHHSSGLVPAGSHM-Apomigren，本文称为“apomigren”。(图10)。因为没有保证apomigren会与肝磷脂结合，如endostatin，所以从表达载体使用组氨酸标记以协助提纯过程。重组体apomigren的表达，处理及提纯使用含8M尿素的Ni-NTA柱实施，如由Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)，及在VikasP.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的，所有文献的全部内容参考收入本篇。使用两步PH方案(PH8.0和2.0)来从柱上洗脱蛋白质，结果在图11中显示，图11表示单位组分(X轴)在280nM(右Y轴)的吸收率和洗脱液PH值(左Y轴)。在组分4附近可观察到小的峰值，在组分23是大峰值。从选取的组分中取出15ml样品用SDS-PAGE分析，结果在图12中显示。1道包括大小标记，2道，加样到Ni-NTA柱前的apomigren蛋白质溶解产物；2道，流经柱；4道，组分4；5道和6道，组分23，分别是非还原的或还原的；7道，组分24；8道，组分27。在流经组分(比较3道和2道)中没有蛋白质，说明apomigren与Ni-NTA柱结合紧密。一些量的蛋白质在PH8.0的洗脱液中(4道，组分4)，但大部分蛋白质在PH2.0的洗脱溶液中(5-8道)。较大分子量的复合物可看到，相应为23，35，46，69kDa。5道和6道是组分23的非还原和还原样品，在还原样品中可看到14kDa的单一离散带。在用DTT还原的条件下，所有大分子复合物大小被转换到14kDa的单一带。在组分20-26中发现大部分蛋白质。

含提纯的apomigren的组分(组分20-26)被集中，并在分级递减尿素浓度的透析中缓慢重折叠。在4℃用无菌1X PBS，PH7.4实施终透析。透析期间，尽管一些蛋白质从溶液中沉淀，但仍有显著的组分保留在溶解态中。溶解蛋白质以小等分份保存在-70℃，每次使用新鲜的等分份。蛋白质的浓度通过BCA蛋白质检测(美国伊利诺斯州，Rockford，Pierce化学公司)来确定。通过实施LAL检测(美国马萨诸塞州Falmouth，Cape Cod联合有限公司)在提纯的溶解蛋白质上确定内毒素含量，含量约为6个单位/ml，蛋白质浓度为200μg/ml。在前面的试验中，这些含量在任何使用的检测法中没有可视效果。用组氨酸标记抗体在提纯蛋白质上实施Western印迹分析，显示正免疫反应性。

          实例8：apomigren改变内皮细胞的形态

当将apomigren蛋白质(0.5-1.0μg/ml)加给内皮细胞时，在这些细胞的形态上发生了令人惊异的变化。细胞出现变园，分离，以及膜生气孔，细胞质收缩，还观察到染色质浓缩，如通常在细胞程序死亡细胞中所观察到的。这些改变在图13中显示，图13是一组三张显微照片。胰蛋白酶化成片的C-PAE细胞，将其以约50％铺满率平铺在含3ng/ml bFGF的2％FBS中，同时加入0.05μg/ml和0.7μg/ml的apomigren。处理24小时或拍照(放大400倍)。Apomigren的浓度增加表现出有细胞程序死亡形态的细胞数量增加。图13B和13C显示用apomigren处理的细胞(分别用0.05mg/ml和0.07mg/ml)与未处理的对照物内皮细胞(图13A)的比较。这种改变在非内皮细胞如IMP-90中没有观察到。

细胞程序死亡形态也在用鼠endostatin处理过的内皮小细胞中观察到，但仅在5-10倍的高浓度下。人类endostatin对这些细胞没有可视效果。

            实例9：内皮细胞的增殖

为了测试apomigren对C-PAE细胞的抗-增殖效果，实施胸苷掺入检测法，如由Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)，及在VikasP.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的，所有文献的全部内容参考收入本篇。根据用endostatin试验的早期数据，初始试验用浓度在1-20μg/ml范围内的apomigren进行。将C-PAE细胞平铺在24个涂覆有纤维结合蛋白(10mg/ml)的培养皿中，每个培养皿上在含2％的FBS的0.5ml DMEM中涂12,500个细胞。在37℃温育24小时后，在有或没有蛋白质进行测试的情况中，将介质用新鲜DMEM和含3ng/ml bFGF的2％FBS(美国明尼苏达州Minneapolis，研究与发展系统)置换。细胞用1mCi的³H-胸苷脉冲24小时。介质被吸出，用PBS三次冲洗细胞，然后加入1.5 N氢氧化钠(每个培养皿100)溶解并在37℃温育30分钟。用液态闪烁计数仪确定与细胞相关的放射性活度。

在本试验中，在C-PAE细胞中测定随bFGF(3ng/ml和2％FBS)和由细菌表达的提纯的溶解apomigren蛋白质而变化的对甲基³H-胸苷吸收的抑制作用。结果在图14中显示。在X轴表示apomigren(●)，和鼠(□)和人类(○)endostatin的浓度，Y轴表示³H-胸苷掺入率。每个数据点是从典型试验中得到的三个值的平均值。在对照样品(仅使用bFGF)中DNA的合成考虑为100％。显示在某些浓度下apomigren和鼠及人类endostatin间的比较。通常，bFGF诱导增殖的剂量-相关抑制作用在C-PAE细胞中可观察到。在1μg/ml apomigren浓度下，C-PAE细胞的增殖完全被抑制了，在基础活性之下(即没有bFGF)。较低浓度的apomigren，如0.05-0.9μg/ml，表现出剂量-相关效果，0.1μg/ml ED₅₀值在范围300-400ng/ml。当与先前endostatin的数据相比时，apomigren的活性明显出众。

              实例10：细胞周期检测法

在完全介质中，将C-PAE和IMR-90细胞停滞接触抑制剂生长48小时。通过胰蛋白酶消化收获细胞，接种在涂有纤维结合蛋白(10μg/ml)的6个培养皿上。每个培养皿上在1％FCS加3 ng/ml的bFGF中接种0.2到0.3×10⁶个细胞。为了做剂量反应研究，加入不同浓度人类apomigren，在处理或21-24小时收获细胞。细胞用PBS缓冲液冲洗，并安装在70％冰冻乙醇中。安装细胞在含2％FCS和0.1％Tween-20的PBS缓冲液中重新水合。然后将细胞在1500xg离心10分钟，重新悬浮在0.5ml加入了Rnase(5μg/ml)的上面的PBS缓冲液中。Rnase消化在37℃进行1小时，接着用碘化丙锭(5μg/ml)染色。使用BectonDickinson FACStar加流细胞计数仪(美国马萨诸塞州Waltham，Becton Dickinson)分析细胞。使用MosFit软件计算在细胞周期不同相中的细胞百分比。通常方案如由Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)，及在Vikas P.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的实施，所有文献的全部内容参考收入本篇。

结果在图15中演示，图1 5是柱状图，X轴表示apomigren的浓度，范围从0到1000ng/ml，Y轴表示S-相的细胞百分比。C-PAE细胞由深色柱表示，白色柱表示IMR-90细胞。仅用bFGF和1％FBS处理的对照细胞考虑为100％。接触抑制细胞显示7％S-相细胞。胰蛋白酶化后，以约50％铺满率铺开，用bFGF(3ng/ml)和1％FBS刺激，21小时后(图15)可观察到S-相细胞增加到4.8倍。使用apomigren浓度范围从0.06-1.0μg/ml，ED₅₀约为500ng/ml，观察剂量-相关G1细胞周期停滞。为了核查这种效果的特异性，在IMR-90成纤维细胞上也进行apomigren测试。对于IMR-90细胞使用完全介质(10％FBS)作为刺激物。当与接触抑制细胞相比时，可观察到S-相细胞增加到14倍，然而，在存在apomigren的情况中，在内皮细胞中显示效果的相同剂量下，没有观察到细胞周期停滞。在使用完全介质作为内皮细胞刺激物的试验中，apomigren以剂量-相关方式产生细胞周期停滞，正如用bFGF刺激时所观察到的，说明apomigren能抵抗几种生长因子的刺激物。实例11：内皮细胞的细胞程序死亡和Annexin V-FITC检测法

因为apomigren抑制内皮细胞的增殖，并显示了对这些细胞形态上令人惊异的影响，所以研究apomigren在内皮细胞中诱导细胞程序死亡的能力。细胞程序死亡开始后，多数细胞种类将膜磷脂磷脂酰丝氨酸(PS)从质粒膜的内表面移位到膜外(VanEngeland等人(1998)细胞计量术31：1-9；Zhang等人(1997)生物技术23：525-31；Koopman等人(1994)血液84：1415-20)。PS，并因此而使细胞程序死亡，都可通过用Annexin的FITC缀合物染色检测，38 kDa蛋白质的钙-相关磷脂结合蛋白质对PS有高亲和力。PS通常在气泡形成及DNA片段化之前被检测出。

Annexin V，一种具有对磷脂酰丝氨酸(PS)高亲和力的钙相关磷脂结合蛋白质，可用来检测早期细胞程序死亡。简要地，将200,000个细胞平铺在纤维结合蛋白涂覆的6个培养皿上的含2％FBS和3ng/ml bFGF的DMEM中。给每个培养皿加入不同浓度的重组体apomigren，处理18显示后，收获并加工细胞。在分析前用碘化丙锭(PI)染色细胞。实施门控仅分析Annexin V正细胞和PI负细胞。使用人类重组TNT-α(40ng/ml)作为正对照物。方案的剩余步骤如由Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)，及在Vikas P.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的实施，所有文献的全部内容参考收入本篇。

当用不同浓度的apomigren，范围从0.1-1μg/ml，处理正增殖的C-PAE细胞时，增加数量的细胞变园，并从纤维结合蛋白涂覆的培养皿分离。在对照物中，细胞表现完整的内皮细胞形态，而用apomigren处理的细胞出现变园，并显示细胞程序死亡细胞的膜生气泡特点。在0.05-1.0μg/ml(p＝0.01)对照物和apomigren处理细胞之间的平均荧光亮度区别显著。用HMVE-L细胞重复这个试验，浓度在2.5-5μg/ml范围内的apomigren显示出，与使用正对照物TNT-α(40 ng/ml)和5％乙醇可比的在荧光强度上升高。在用apomigren处理的细胞中测量细胞内caspase活性，显示与对照物细胞相比增加到2倍。

          实例12：内皮细胞移动检测

使用ECV304和IC-21细胞实施移动检测如由Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)，及在Vikas P.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的，所有文献的全部内容参考收入本篇。通常，移动检测使用带有聚碳酸酯膜(25×80mm不含PVD，8μ孔，美国加力弗尼亚州Livermore，Poretics公司)的12个培养皿的Boyden趋化式箱(神经-探针有限公司，美国马里兰州Cabin John)实施。通过在37℃用含0.5％白明胶，1mM氯化钙和150mM氯化钠的溶液涂覆箱过夜来预防生长因子与箱非特异结合。ECV304细胞在含的5ng/ml DiI的10％FBS(1，1’-dioctadecy1-3，3，3’，3’，-tetramethyindocarbocyanine高氯酸DiIC18，)中生长过夜，用含0.05％BSA的PBS冲洗。接着胰蛋白酶化，使用Coulter-计数仪(英国，Luton)计数细胞，并稀释在含0.5％FBS的介质199(Gibco/BRL，美国马里兰州Gaithersburg)中到300,000个细胞/ml。较低的箱用含25ng/ml bFGF的介质199填充。较高的箱含不同浓度的重组蛋白质用15,000个细胞/培养皿接种。细胞允许在37℃移动4小时。这时，在膜上表面的细胞用细胞刮器移出，在较低表面的(移动的)细胞安装在3％甲醛中并用PBS冲洗。用荧光显微镜及数码相机获得在550nM的固定膜的成像。在每张膜上的细胞数量用OPTIMAS(6.0版本)软件(媒介细胞计数术，美国MD，Sliver Spring。L.P.)确定。

因为细胞对bFGF和VEGF刺激的反应是没有移动，所以人类ECV304细胞用不同浓度的apomigren和bFGF作为刺激物进行这项检测。结果显示在图16中，图16是演示在X轴上的不同蛋白质浓度，与在Y轴上的由于dFGF刺激移动的细胞百分比的关系图。对照物是用apomigren处理的IC-21细胞(■)，进行的处理包括对ECV304细胞的进行apomigren(●)和鼠(□)及人类(○)endostatin处理。

在这些剂量下，apomigren对IC-21前体细胞的移动没有影响，但在0.15-1.25μg/ml剂量下在内皮细胞中观察到令人惊异的移动抑制作用，用150ng/ml产生约80％的抑制作用(图16)。前面的工作显示endostatin抑制ECV304内皮细胞的移动，但是在高剂量下(ED₅₀约5ng/ml，10-15μg/ml下有80％的抑制作用)(Dhanabal等人(1999)(“人类endostatin的克隆，表达及体外活性”，癌症研究，出版中)。

静息蛋白对细胞移动的影响也作了研究。检测用如apomigren使用的方法，结果在图17中显示。静息蛋白对肾癌细胞(RCC)肿瘤生长的抑制作用也作了研究，用如在Vikas P.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“抗血管生成肽及其使用方法”，和在Vikas P.Sukhatme1998年12月8日提交的U.S.SN.XX/XXX，XXX，“制备抗血管生成蛋白质的方法”中所描述的进行实施，所有文献的全部内容参考收入本篇。

结果在图18中显示，在抑制肿瘤生长方面，静息蛋白(●)表现优于endostatin(○)，及未处理的对照肿瘤(■)。实例13：在肾肿瘤模式中angiostatin的效果

将肾肿瘤细胞系786-0皮下移植到无胸腺的裸鼠中。在2001磷酸缓冲盐水中约5百万个细胞接种在每只鼠的侧腹。每个肿瘤允许达到约200立方毫米。

持续3周每天给每只动物腹腔注射约20毫克提纯的重组静息蛋白或endostatin(1mg/kg)。结果在图18中显示，其中显示静息蛋白表现优于endostatin。实例14：CAM检测法

使用绒毛尿囊膜(CAM)检测法测试体内apomigren阻断bFGF诱导血管生成的能力。受精白Leghorn鸡蛋(SPAFAS有限公司，Norwich CT)打开置于100mm²培养皿上，并在37℃湿润温育箱内生长11天。含vitrogen(胶原质生物物料，PaloAlto，CA)浓度为0.73mg/ml的沉淀及补充加入仅载体，VECT+FGF-2，或组氨酸apomigren(0.5，1，5，10，20，或50μg/ml)的沉淀在37℃聚合2小时。将沉淀置于尼龙网上并取向在CAM周边上。将胚胎重置于温育箱内24小时。通过注射FITC-右旋糖苷到鸡胚胎的循环系统中，评定在胶原质网上入侵的新毛细管。在试验的最后，将网切碎，使用程序NIH成像1.59实施评定脉管密度。检测进行三次，进行四次独立的试验。结果在图19中小时。等同物

虽然本发明用其较好的具体实施进行了具体的显示及描述，但此领域中的技术人员应该理解的是，在没有背离如所附权利要求书所限定的本发明精神和范围的条件下，可以有形式及细节上的各种不同的变化。

Claims (87)

1.一种分离的静息蛋白，其包括含约170到约200个氨基酸残基的氨基酸序列，至少70％的序列与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的C-末端一致，其中分离的静息蛋白特点为具有抗-血管生成活性。

2.一种分离的静息蛋白，包括SEQ ID NO：氨基酸序列，其中分离的静息蛋白特点为具有抗-血管生成活性。

3.一种编码抗-血管生成蛋白质的分离的多核苷酸，蛋白质包括170到200个氨基酸残基，并进一步包括人类XV类胶原质的α1链的NC10域的C-末端。

4.一种编码抗-血管生成蛋白质的分离的多核苷酸，其包括SEQ ID NO：的氨基酸序列。

5.依据权利要求3的分离的多核苷酸，包括(a)SEQ ID NO：的核苷酸序列，(b)与SEQ ID NO：的核苷酸序列互补的序列，或(c)在严格条件下与SEQ ID NO：的核苷酸序列杂交的序列。

6.一种分离的多核苷酸，其包括被5’-TTT TTT GAA TTCACC TCA AGT GCC ATT TAT GAG AAG CCT GCT CTGCAT TTG-3’和5’-AAG AAT GCG GCC GCT TAC TTCCTA GCG TCT GTC ATG AAA CTG TTT TCG AT-3’引物扩增的核苷酸序列。

7.依据权利要求2的分离的静息蛋白的抗-血管生成片段，包括SEQ ID NO：的氨基酸序列的至少25个邻接氨基酸。

8.分离的静息蛋白的抗-血管生成片段，片段包括与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的C-末端对应的80到90个邻接氨基酸。

9.依据权利要求2的分离的静息蛋白的抗血管生成片段，该片段包括SEQ ID NO：的氨基酸97到氨基酸181。

10.一种编码抗血管生成蛋白质的分离的多核苷酸，其包括SEQID NO：的序列氨基酸片段，该片段包括氨基酸序列含SEQ IDNO：的氨基酸97到氨基酸181。

11.一种分离的多核苷酸，其包括(a)SEQ ID NO：的核苷酸序列的片段，该片段包括核苷酸序列含SEQ ID NO：的核苷酸289到核苷酸543；(b)SEQ ID NO：的核苷酸序列的片段的互补序列，片段包括核苷酸序列含SEQ ID NO：的核苷酸289到核苷酸543；或(c)在严格条件下与SEQ ID NO：的核苷酸序列的片段杂交的序列，片段包括核苷酸序列含SEQ IDNO：的核苷酸289到核苷酸543。

12.一种多核苷酸，其是权利要求3的分离的多核苷酸的等位基因变体。

13.依据权利要求11的分离的多核苷酸，其中多核苷酸与表达控制序列可实施连接。

14.用权利要求13的多核苷酸转移的宿主细胞。

15.依据权利要求14的宿主细胞，其中细胞是从细菌，酵母，哺乳动物，昆虫或植物的细胞中选取的。

16.一种制备由权利要求11的多核苷酸编码的蛋白质的方法，其中该方法包括：(a)生长用权利要求11的多核苷酸转移的宿主细胞的培养物，其中宿主细胞是从细菌，酵母，哺乳动物，昆虫或植物的细胞中选取的；(b)从培养物中提纯蛋白质；从而制备由权利要求11的多核苷酸编码的蛋白质。

17.一种融合蛋白质，其包括权利要求11的分离的静息蛋白及一种或多种其他蛋白质。

18.依据权利要求17的融合蛋白质，进一步包括至少一种蛋白质分子，选自包括静息蛋白，endostatin，angiostatin，apomigren，或endostatin突变体片段EM1的组中。

19.一种融合蛋白质，包括权利要求7的分离的静息蛋白片段及一种或多种其他蛋白质。

20.依据权利要求19的融合蛋白质，进一步包括至少一种蛋白质分子，选自包括静息蛋白，endostatin，angiostatin，apomigren，或endostatin突变体片段EM1的组中。

21.一种融合蛋白质，包括权利要求9的分离的静息蛋白片段及一种或多种其他蛋白质。

22.依据权利要求21的融合蛋白质，进一步包括至少一种蛋白质分子，选自包括静息蛋白，endostatin，angiostatin，apomigren，或endostatin突变体片段EM1的组中。

23.一种组合物，其包括权利要求1的分离的静息蛋白作为生物活性组分。

24.权利要求23的组合物，及药用-相容的载体。

25.一种组合物，其包括权利要求7的分离的静息蛋白片段作为生物活性组分。

26.权利要求25的组合物，及药用-相容的载体。

27.一种组合物，其包括权利要求的分离的静息蛋白片段作为生物活性组分。

28.权利要求27的组合物，及药用-相容的载体。

29.一种组合物，其包括权利要求17的融合蛋白质作为生物活性组分。

30.一种组合物，其包括权利要求19的融合蛋白质作为生物活性组分。

31.一种组合物，其包括权利要求21的融合蛋白质作为生物活性组分。

32.一种抑制哺乳动物组织内血管生成活性的方法，该方法包括用包括SEQ ID NO：的氨基酸序列的组合物接触组织。

33.依据权利要求32的方法，其中组合物包括含SEQ ID NO：的氨基酸97到氨基酸181的氨基酸序列。

34.一种使用权利要求23的组合物抑制特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

35.依据权利要求34的方法，其中疾病是从下列疾病中选取的包括：与血管生成有关的癌症，良性肿瘤，风湿性关节炎，牛皮癣，视觉血管生成疾病，Osler-Webber症，心肌血管生成，空斑新血管生成，毛细血管扩张，血友病关节，血管纤维瘤，伤口粒化，肠粘连，动脉硬化，硬皮病，疤痕肥大，猫抓痕症，Heliobacter pylori溃疡，透析性移植脉管管路狭窄，避孕，肥胖。

36.依据权利要求35的方法，其中疾病是癌症。

37.依据权利要求36的方法，其中疾病是肾癌症。

38.一种使用权利要求23的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

39.依据权利要求38的方法，其中疾病是癌症。

40.依据权利要求39的方法，其中疾病是肾癌症。

41.一种使用权利要求24的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

42.依据权利要求41的方法，其中疾病是癌症。

43.依据权利要求42的方法，其中疾病是肾癌症。

44.一种使用权利要求25的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

45.依据权利要求44的方法，其中疾病是癌症。

46.依据权利要求45的方法，其中疾病是肾癌症。

47.一种使用权利要求26的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用组合物。

48.依据权利要求47的方法，其中疾病是癌症。

49.依据权利要求48的方法，其中疾病是肾癌症。

50.一种使用权利要求27的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

51.依据权利要求50的方法，其中疾病是癌症。

52.依据权利要求51的方法，其中疾病是肾癌症。

53.一种使用权利要求28的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

54.依据权利要求53的方法，其中疾病是癌症。

55.依据权利要求54的方法，其中疾病是肾癌症。

56.一种使用权利要求29的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

57.依据权利要求56的方法，其中疾病是癌症。

58.依据权利要求57的方法，其中疾病是肾癌症。

59.一种使用权利要求30的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用该组合物。

60.依据权利要求59的方法，其中疾病是癌症。

61.依据权利要求60的方法，其中疾病是肾癌症。

62.一种使用权利要求31的组合物治疗特点在于血管生成活性的疾病的方法，该方法包括给患有疾病的患者服用组合物。

63.依据权利要求62的方法，其中疾病是癌症。

64.依据权利要求63的方法，其中疾病是肾癌症。

65.一种提供哺乳动物静息蛋白蛋白质的方法，该方法包括将哺乳动物细胞引入到人类体内，所说的哺乳动物细胞已在体外进行了将SEQ ID NO：的多核苷酸插入到其中的处理并在所说的哺乳动物体内表达治疗上有效量的静息蛋白蛋白质。

66.依据权利要求65的方法，其中细胞是淋巴细胞。

67.依据权利要求66分方法，其中淋巴细胞从T-淋巴细胞和B-淋巴细胞中选取。

68.依据权利要求66的方法，其中细胞从下列中选取包括：血细胞，TIL细胞，骨髓细胞，脉管细胞，肿瘤细胞，肝脏细胞，肌肉细胞，成纤维细胞。

69.依据权利要求65的方法，其中多核苷酸通过滤过性病毒载体插入到细胞中。

70.一种提供哺乳动物apomigren蛋白质的方法，该方法包括将哺乳动物细胞引入到人类体内，所说的哺乳动物细胞已在体外进行了将含SEQ ID NO：的核苷酸289到核苷酸543的多核苷酸插入到其中的处理并在所说的哺乳动物体内表达治疗上有效量的apomigren蛋白质。

71.依据权利要求70的方法，其中细胞是淋巴细胞。

72.依据权利要求71分方法，其中淋巴细胞从T-淋巴细胞和B-淋巴细胞中选取。

73.依据权利要求70的方法，其中细胞从下列中选取包括：血细胞，TIL细胞，骨髓细胞，脉管细胞，肿瘤细胞，肝脏细胞，肌肉细胞，成纤维细胞。

74.依据权利要求70的方法，其中多核苷酸通过滤过性病毒载体插入到细胞中。

75.一种制备分离多核苷酸的方法，方法包括的步骤有：

(a)制备一种或多种多核苷酸探针，在中度严格条件下与从下列核苷酸序列中选取的序列杂交：

(i)SEQ ID NO：；

(ii)编码含SEQ ID NO：的氨基酸序列的蛋白质的分离的多核苷酸；

(iii)编码与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的C-末端对应的181个邻接氨基酸的分离的多核苷酸；

(b)将所说的探针与哺乳动物DNA杂交；

(c)分离用探针探测的DNA多核苷酸；其中分离的多核苷酸核苷酸序列与SEQ ID NO：的核苷酸序列对应。

76.依据权利要求75制备的分离的多核苷酸。

77.分离的多核苷酸包括权利要求76的多核苷酸。

78.制备分离多核苷酸的方法，方法包括的步骤有：

(a)制备一种或多种多核苷酸探针，在中度严格条件下与从下列核苷酸序列中选取的序列杂交：

(i)SEQ ID NO：；

(ii)编码含SEQ ID NO：的氨基酸序列的蛋白质的分离的多核苷酸；

(iii)编码与人类XV类胶原质的α1链的NC10域的C-末端对应的181个邻接氨基酸的分离的多核苷酸；

(b)将所说的探针与哺乳动物DNA杂交；

(c)扩增哺乳动物DNA序列；

(d)分离步骤(c)的多核苷酸产品；

其中所说的分离的多核苷酸核苷酸序列与SEQ ID NO：的核苷酸序列对应。

79.依据权利要求78制备的分离的多核苷酸。

80.分离的多核苷酸包括权利要求79的多核苷酸。

81.权利要求1的分离的静息蛋白的抗体。

82.权利要求2的分离的静息蛋白的抗体。

83.权利要求7的分离的静息蛋白的片段的抗体。

84.权利要求8的分离的静息蛋白的片段的抗体。

85.权利要求9的分离的静息蛋白的片段的抗体。

86.权利要求1的静息蛋白蛋白质的分离的突变体，衍生物，类似物或同源物。

87.编码权利要求86的静息蛋白突变体，衍生物，类似物或同源物的分离的多核苷酸。

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