CN114657277A - 一种与小麦籽粒长度相关的kasp分子标记与应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一个小麦籽粒长度相关的KASP分子标记的应用。本发明所保护的一个技术方案是检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在制备鉴定或辅助鉴定籽粒长度产品中的应用。可将检测QTLqGL3B.1位点多态性和基因型的组合物与其它物质(如检测其它与小麦籽粒长度相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备高通量鉴定长粒小麦品种产品。

Description

一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用
技术领域
本发明涉及KASP分子标记的应用，特别涉及一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用。
背景技术
小麦作为全球重要的粮食作物，为人类消耗提供了约五分之一的卡路里。但是，随着人口的不断增长与耕地面积的逐渐减小之间的矛盾加剧，加之全球变暖带来的极端气候现象频发，严重制约了小麦的生产。因此，提高小麦产量是保障全球粮食和营养安全的一项紧迫任务。
小麦产量主要由粒重、穗粒数和单位面积的穗数构成。小麦粒重主要由籽粒大小决定，而小麦籽粒大小又可以进一步分解为粒长、粒宽、粒厚等构成要素。小麦粒重主要受加性效应控制，遗传力高达59-92％，是受多基因控制的数量性状。研究表明，小麦粒长、粒宽与粒重呈极显著正相关。小麦粒长主要在籽粒发育前期形成，受环境影响较小。因此，挖掘小麦粒长相关QTL，并开发与其紧密连锁的分子标记对于增加小麦粒长、提高小麦产量具有重要意义，也是小麦育种的重要目标之一。
分子标记辅助选择(marker assisted selection MAS)是基于基因型的选择，不受外界环境因素的影响，被越来越广泛地应用于育种实践中。常用的分子标记类型有RFLP、AFLP、 DArT、SSR等，但这些标记类型检测周期长、步骤繁琐、成本高，不易对育种后代材料进行大规模筛选。KASP(Kompetitive Allele-Specific PCR)标记，即竞争性等位基因特异性 PCR，是近年前发展起来的标记类型，它根据目标等位基因中包含的特定SNP(单碱基核苷酸多态性)或InDels(插入/缺失)设计引物，利用在引物末端加入不同的荧光集团，基于PCR终端荧光信号的读取判断对目标序列进行分型，具有准确性高、操作简单、鉴定高效、成本低的优点，并且能够实现高通量分析，极大地加快了分子标记辅助选择的进程，在作物育种中有着广阔的应用前景。因此，开发用于鉴定小麦多环境下增加籽粒长度的KASP标记，将为培育高产小麦品种提供有效的检测手段，对于确保小麦高产、稳产以及国家粮食安全和农业可持续发展具有十分重要的战略意义。
发明内容
本发明所要解决的一个技术问题是如何高通量鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度。
为了解决上述技术问题，本发明提供了下述A1-A3的任一种应用、A4的方法：
A1、检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述 PCR引物，所述PCR引物为P1或P2：
P1、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的第22-43位单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的第22-43位的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的的单链DNA组成的引物组；
P2、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA、核苷酸序列是SEQ IDNo.3的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组。
A2、检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在制备鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
A3、检测小麦基因组中所述QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在小麦育种中的应用或在制备小麦育种产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
所述育种的目的包括选育长粒小麦。
A4、鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的方法，包括检测待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度；所述基因型为小麦基因组中所述QTLqGL3B.1 位点的基因型；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为 G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述检测利用PCR引物进行，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
本发明所要解决的另一个技术问题是如何进行小麦育种。
为了解决上述技术问题，本发明提供了下述技术方案：
B1、A4所述的方法在小麦育种中的应用。
所述育种的目的包括选育长粒小麦。
B2、小麦育种的方法，包括：检测小麦基因组A1所述QTLqGL3B.1的多态性，选择小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A的纯合型的小麦作为亲本进行育种。
所述育种的目的包括选育长粒小麦。
下述含有检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物的1)-3)中任一种产品也属于本发明的保护范围：
4)检测与小麦籽粒长度相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
5)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的产品；
6)用于小麦育种的产品。
上述应用、方法和产品中，所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸。所述检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)具体可为检测QTLqGL3B.1位点的核苷酸种类。小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的基因型可为GG、AA或AG。所述GG是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为G的纯合型，所述AA是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A的纯合型，所述AG是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A和G的杂合型。
A4所述方法中，所述根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度可为基因型为GG的待测小麦籽粒长度短于或候选短于基因型为AA的待测小麦籽粒长度。
上述应用、方法和产品中，所述小麦育种为培育长粒小麦。
上述应用、方法和产品中，所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型 (即等位基因)的组合物可为通过下述至少一种方法确定QTLqGL3B.1的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱和SNP芯片。其中，SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片，及基于荧光分子DNA 结合反应的芯片。
上述应用、方法和产品中，所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型 (即等位基因)的组合物如下1)、2)或3)：
D1)所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物含有扩增包括所述QTLqGL3B.1位点在内的小麦基因组DNA片段的PCR引物；
D2)所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物为含有所述 PCR引物的PCR试剂；
D3)含有D1)所述PCR引物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。
上述应用、方法和产品中，所述PCR引物可被标记物标记。所述标记物指可用于提供可检测的效果且可以连接至核酸的任何原子或分子。标记物包括但不限于染料；放射性标记，诸如32P；结合部分，诸如生物素(biotin)；半抗原，诸如地高辛(DIG)；发光、发磷光或发荧光部分；和单独的荧光染料或与可以通过荧光共振能量转移(FRET)抑制或移动发射光谱的部分组合的荧光染料。标记可以提供可通过荧光、放射性、比色、重量测定、X射线衍射或吸收、磁性、酶活性等检测的信号。标记可以是带电荷的部分(正电荷或负电荷) 或可选地，可以是电荷中性的。标记可以包括核酸或蛋白序列或由其组合，只要包含标记的序列是可检测的。在一些实施方案中，核酸在没有标记的情况下直接检测(例如，直接读取序列)。如所述PCR引物可为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组，序列表中SEQ ID No.2由43个核苷酸组成，第1-21位核苷酸为FAM接头序列(作为标记物)，第22-43 位核苷酸为特异序列；序列表中SEQ ID No.3由43个核苷酸组成，第1-21位核苷酸为HEX 接头序列(作为标记物)，第22-43位核苷酸为特异序列。
上述应用、方法和产品中，所述产品可为试剂或试剂盒或系统，所述系统可包括试剂或试剂盒、仪器和分析软件的组合产品，如由PCR引物、PARMS master mix试剂、酶标仪和在线软件SNP decoder(http://www.snpway.com/snpdecoder01/)组成的产品，由PCR引物、PARMS master mix试剂、在线软件SNP decoder和荧光定量PCR仪组成的组合产品。所述产品可包括上述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物。
本发明公开了一种新的用于检测小麦籽粒长度的KASP标记。本发明提供的特异引物组，由SEQ ID No.2所示的单链DNA、SEQ ID No.3所示的单链DNA和SEQ ID No.4所示的单链DNA组成，其中SEQ ID No.2所示的单链DNA和SEQ ID No.3所示的单链DNA带有荧光标记接头。本发明的一个实施例中，上述使用带有荧光标记接头的引物组扩增两组多个样品包括QTL qGL3B.1位点在内的小麦基因组DNA，进行荧光信号处理，确定了QTL qGL3B.1位点的核苷酸类型，并测定了每个待测样品的籽粒长度。实验证明，在由490个小麦品种组成的群体中，QTLqGL3B.1位点为G的纯合型小麦品种的籽粒长度显著短于QTL qGL3B.1位点为A的纯合型小麦品种的籽粒长度，说明QTLqGL3B.1为G的纯合型小麦品种的籽粒长度显著短于SNP位点QTLqGL3B.1为A的纯合型小麦品种。说明QTLqGL3B.1 是与小麦籽粒长度相关的SNP分子标记，本发明提供的特异引物组可用于鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度，可用于小麦籽粒长度品种的筛选，可用于小麦分子标记辅助育种，可用于长粒小麦的选育和培育。QTLqGL3B.1的多态性直接以DNA的形式表现，在小麦的各个组织及各个发育阶段均可检测到，有利于方便快捷地预测小麦籽粒长度。在实际应用中，为了提高准确率，可将检测QTLqGL3B.1位点多态性和基因型的组合物与其它物质(如检测其它与小麦籽粒长度相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定小麦籽粒长度的产品。将本发明中的特异性引物组运用于小麦籽粒长度分子标记辅助选择，能快速筛选出具有较长籽粒长度的小麦品种(种质)，从而加速长粒小麦新品种的培育进程。本发明对于利用分子标记辅助选择长粒小麦品种具有重要的理论意义和经济价值。
附图说明
图1为本发明实施例1中Kasp_qGL3B.1标记引物对与SEQ ID No.1所示序列的特异性结合位点。图中，深色背景代表3B染色体物理位置785,432,286bp(芯片位点AX-110418888) 处SNP，KASP标记上、下游引物位置以方框标识。图中序列为小麦3B染色体物理位置 785,432,348bp-785,432,109bp的序列，即SEQ ID No.1所示序列的反向互补序列。
图2为本发明实施例1中利用Kasp_qGL3B.1标记检测490个小麦品种的基因分型结果图。
图3为本发明实施例1中qGL3B.1不同等位类型的小麦种质在不同年份、不同环境中的籽粒长度测定结果。其中，统计分析采用双尾t-test检验，**代表P<0.01。17-18代表种植年份为2017-2018年、18-19代表种植年份为2018-2019年、19-20代表种植年份为2019-2020 年、20-21代表种植年份为2020-2021年。G、A表示在芯片位点AX-110418888处等位类型为G或A。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述，给出的实施例仅为了阐明本发明，而不是为了限制本发明的范围。以下提供的实施例可作为本技术领域普通技术人员进行进一步改进的指南，并不以任何方式构成对本发明的限制。
下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法，按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。
本实施例中所有引物合成均由通用生物系统(安徽)有限公司完成。普通小麦种质均为河北省农林科学院粮油作物研究所小麦研究中心保存。
实施例1
普通小麦QTL qGL3B.1在3B染色体物理位置785,432,286bp(芯片标记位点 AX-110418888，参考小麦品种中国春基因组IWGSC_RefSeq_v1.0， http://202.194.139.32/jbrowse-1.12.3-release/)存在一个SNP位点，为SEQ ID No.1第178位核苷酸，其核苷酸种类为G或A，以字母R代表。其一个等位基因型为GG(即SEQ ID No.1 第178位核苷酸为G的纯合型)，将该类型小麦作为qGL3B.1a(又称G碱基类型)；其另一个等位基因型为AA(即SEQ IDNo.1第178位核苷酸为A的纯合型)，将该类型小麦作为qGL3B.1b(又称A碱基类型)。
利用KASP标记批量检测每组中各普通小麦品种qGL3B.1等位基因类型，分为如下两个步骤：PCR扩增和基因分型。
(1)PCR扩增
以CTAB法提取普通小麦基因组DNA，加400μl TE溶解。DNA经1％琼脂糖凝胶电泳进行质量检测，所提DNA要求无明显杂质、条带清晰、无降解。DNA测浓度后，统一稀释为 80ng/μl，以稀释后的基因组DNA为模板，进行PCR扩增。
KASP标记引物工作液制备：根据小麦粒长QTL qGL3B.1在芯片位点AX-110418888处的 SNP设计KASP引物，该SNP位点的多态性为A/G碱基差异，引物序列见表1，其与SEQ IDNo.1 所示序列的特异性结合位点示意图见图1。
表1用于鉴定普通小麦QTL qGL3B.1等位变异的KASP标记引物序列
Figure BDA0003558696400000051
上述SEQ ID No.2与SEQ ID No.4所示的单链DNA分子扩增SEQ ID No.1第178位核苷酸为G的片段，用酶标仪或荧光定量PCR仪可读取到与FAM序列结合的荧光基团的荧光信号；
上述SEQ ID No.3与SEQ ID No.4所示的单链DNA分子扩增SEQ ID No.1第178位核苷酸为A的片段，用酶标仪或荧光定量PCR仪可读取到与HEX序列结合的荧光基团的荧光信号。
取上游引物-1(100μM)12μl、上游引物-1(100μM)12μl，下游引物(100μM) 30μl，用无菌超纯水补充至100μl，作为KASP标记的引物工作液，-20℃保存备用。
PCR扩增体系为：模板DNA 2.5μl(浓度为80ng/μl)，引物工作液0.07μl，2×KASPMaster Mix(LGC公司，LotNo.13375649)2.5μl，用无菌超纯水补充反应体系至5μl。
PCR反应程序为：94℃预变性15min；94℃变性20s、复性20s(第一次的复性温度为63℃，每个循环降温1℃)、72℃延伸20s共9个循环；94℃变性10s、55℃复性1min、72℃延伸20s共30个循环；72℃延伸3min、4℃保存。
(2)基因分型
PCR反应完成后利用酶标仪(美国BIOTEK公司)对反应产物进行荧光数据读取。FAM荧光激发波长为485nm，发射波长为520nm；HEX荧光激发波长为535nm，发射波长为 556nm；ROX荧光激发波长为575nm，发射波长610nm。荧光扫描结果利用Excel进行图形化展示，C碱基(G碱基反向互补配对碱基)类型带有FAM荧光，分布于x轴附近；T 碱基(A碱基反向互补配对碱基)类型带有HEX荧光，分布于y轴附近；杂合类型分布于对角线附近，无检出信号的样本分布于原点附近(见图2)。
应用KASP标记Kasp_qGL3B.1检测普通小麦种质籽粒长度。
针对490份中国小麦品种进行实验，所有品种均为公知品种，分别记载于如下非专利文献中：“曹文昕,万映秀,张琪琪,李炎,张平治.黄淮麦区主要推广小麦品种抗寒性的演变规律.麦类作物学报,2015,35(1):57-63.”、“耿晓丽,张月伶,臧新山,赵月,张金波,尤明山,倪中福,姚颖垠,辛明明,彭惠茹,孙其信.北方冬麦区与黄淮北片优良小麦品种(系)耐热性评价.麦类作物学报,2016,36(2):172-181.”、“郭总总,王翔,卫丽,白瑞英,曹云,郭创,尹钧.黄淮麦区小麦春化基因组成的多态性分布研究.河南农业大学学报,2014,48(3):255-262.”、“张帅,张希兰,张娜,赵明辉,乔文臣,孙丽静,李辉,傅晓艺,何明琦,纪军, 李俊明.黄淮麦区北片小麦穗部相关性状的全基因组关联分析.华北农学报,2020,35(增刊):31-39.”、“张颖君,高慧敏,李子千,胡梦芸,孙丽静,刘茜,吕亮杰,李辉.黄淮北片冬麦区抗赤霉病基因云澡遭员种质挖掘及溯源.华北农学报,2022,35(2):196-202.”、“ChenShulin, Cheng Xiyong,Yu Kang,Chang Xiangnan,Bi Huihui,Xu Haixia,Wang Junsen,Pei Xingxu, Zhang Ziliang,Zhan Kehui.Genome-wide association study ofdifferences in 14agronomic traits under low-and high-density planting modelsbased on the 660k SNP array for common wheat. Plant Breeding,2020,139(2):272-283.”。490份中国小麦品种均在河北省农林科学院粮油作物研究所小麦研究中心有保存，公众可以从河北省农林科学院粮油作物研究所获得，以重复本申请实验。
将这490份种质材料于2017-2018年、2018-2019年、2019-2020年、2020-2021年共4个年度在水地(足墒播种，拔节期和灌浆期各浇水一次，灌水量为50m3/亩)进行种植，2018-2019年、2019-2020年、2020-2021年共3个年度在旱地(足墒播种，全生育期不浇水)进行种植，行长3m，随机区组设计。
利用Kasp_qGL3B.1标记检测所有小麦品种，基因型检测结果见图2。
小麦收获后利用万深SC-G自动种子考种及千粒重分析仪(万深检测科技)测量小麦的籽粒长度。
不同年份水地小麦种质等位类型和籽粒长度见表2；不同年份旱地小麦种质等位类型和籽粒长度见表3。结果显示携带等位类型qGL3B.1a的小麦种质在不同年份的两种环境中籽粒长度均值都低于携带等位类型qGL3B.1b的小麦种质籽粒长度均值，两者具有极显著差异(P<0.01)，具体见表4、图3。
表2小麦种质Kasp_qGL3B.1标记检测结果和水地籽粒长度
Figure BDA0003558696400000061
Figure BDA0003558696400000071
Figure BDA0003558696400000081
Figure BDA0003558696400000091
Figure BDA0003558696400000101
Figure BDA0003558696400000111
Figure BDA0003558696400000121
Figure BDA0003558696400000131
Figure BDA0003558696400000141
Figure BDA0003558696400000151
Figure BDA0003558696400000161
Figure BDA0003558696400000171
表3小麦种质Kasp_qGL3B.1标记检测结果和旱地籽粒长度
Figure BDA0003558696400000172
Figure BDA0003558696400000181
Figure BDA0003558696400000191
Figure BDA0003558696400000201
Figure BDA0003558696400000211
Figure BDA0003558696400000221
Figure BDA0003558696400000231
Figure BDA0003558696400000241
Figure BDA0003558696400000251
Figure BDA0003558696400000261
Figure BDA0003558696400000271
Figure BDA0003558696400000281
表4普通小麦QTL qGL3B.1等位变异类型与籽粒长度关系的统计分析结果
Figure BDA0003558696400000282
注：统计分析采用双尾t-test检验(P<0.01代表差异达到极显著水平)。
综上，QTLqGL3B.1的基因型为GG(qGL3B.1a，又称G碱基类型)的小麦品种籽粒长度显著短于QTLqGL3B.1的基因型为AA(qGL3B.1b，又称A碱基类型)，说明SNP位点 QTLqGL3B.1为qGL3B.1a基因型小麦的籽粒长度显著短于SNP位点QTLqGL3B.1为 qGL3B.1b基因型的小麦。
以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说，在不脱离本发明的宗旨和范围，以及无需进行不必要的实验情况下，可在等同参数、浓度和条件下，在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例，应该理解为，可以对本发明作进一步的改进。总之，按本发明的原理，本申请欲包括任何变更、用途或对本发明的改进，包括脱离了本申请中已公开范围，而用本领域已知的常规技术进行的改变。按以下附带的权利要求的范围，可以进行一些基本特征的应用。
序列表
<110> 河北省农林科学院粮油作物研究所
<120> 一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用
<130> GNCSY220300
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 240
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
acctggtcat tctagctcct gcttgcctgc tcctgcacca ttatcacatt tctcatgtga 60
cttgttgctt gatttcatga tcactcaccc actcataacc atggatctaa ctcgttggct 120
ttcttcctca atgggacaat gtcacaatca ccatatctac attttccatg tgttgcarct 180
tttcacactg tgttaacaat ccttcagcat cctaacacct agacctcggg cacaggtggg 240
<210> 2
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
gaaggtgacc aagttcatgc tttgttaaca cagtgtgaaa agc 43
<210> 3
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
gaaggtcgga gtcaacggat tttgttaaca cagtgtgaaa agt 43
<210> 4
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
gaaggtgacc aagttcatgc tgctcgagtc cgtgacgac 39

Claims (10)

1.检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度中的应用；所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为P1或P2：
P1、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的第22-43位的单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的第22-43位的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组；
P2、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA、核苷酸序列是SEQ IDNo.3的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组。
2.检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在制备鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为权利要求1所述P1或权利要求1所述P2。
3.检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在小麦育种中的应用或在制备小麦育种产品中的应用，所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为权利要求1所述P1或权利要求1所述P2。
4.鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的方法，包括检测待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度；所述基因型为小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点的基因型；所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述检测利用PCR引物进行，所述PCR引物为权利要求1所述P1或权利要求1所述P2。
5.权利要求4所述的方法在小麦育种中的应用。
6.小麦育种的方法，包括：检测小麦基因组中权利要求1中所述QTLqGL3B.1位点的多态性，选择小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为G的纯合型小麦作为亲本进行育种。
7.含有检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物的产品，为1)-3)中任一种产品也属于本发明的保护范围：
1)检测与小麦籽粒长度相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
2)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的产品；
3)用于小麦育种的产品。
8.根据权利要求1-3和5中任一所述的应用、权利要求4或6所述的方法或权利要求7所述的产品，其特征在于：所述小麦育种为培育长粒小麦。
9.根据权利要求1-3、5和8中任一所述的应用、权利要求4、6或8所述的方法或权利要求7或8所述的产品，其特征在于：所述检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物为如下D1)、D2)或D3)：
D1)所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物含有扩增包括所述QTLqGL3B.1位点在内的小麦基因组DNA片段的PCR引物；
D2)所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物为含有所述PCR引物的PCR试剂；
D3)含有D1)所述PCR引物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。
10.根据权利要求9所述的应用、方法或产品，其特征在于：所述PCR引物为由序列表中SEQ ID No.1所示的单链DNA、序列表中SEQ ID No.2所示的单链DNA和由序列表中SEQ IDNo.3所示的单链DNA组成的引物组。
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