CN115873975B - 用于鉴定小麦白粉病抗性的snp分子标记及其应用 - Google Patents
用于鉴定小麦白粉病抗性的snp分子标记及其应用 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种用于鉴定小麦白粉病抗性的SNP分子标记及其应用。本发明属于基因生物技术领域，具体涉及一种用于鉴定小麦白粉病抗性的SNP分子标记及其应用。本发明检测小麦基因组中SNP的多态性或基因型的物质，包括检测待测小麦基因组中SNP位点的基因型，根据基因型鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性，此SNP位点为小麦1A染色体上的一个SNP位点，其核苷酸种类为A或T，为序列表中序列1的第101位核苷酸。利用该物质可预测小麦白粉病抗性和进行小麦育种。可将检测此SNP位点多态性和基因型的物质与其他物质(如检测其他与小麦白粉病抗性相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定小麦的白粉病抗性。
Description
技术领域
本发明属于基因生物技术领域，具体涉及一种用于鉴定小麦白粉病抗性的SNP分子标记及其应用。
背景技术
小麦是全球第一大粮食作物，中国小麦产量全世界第一，2019年达1.33亿吨。小麦的高产、稳产关系到国家粮食安全，但小麦生产经常受到一些生物或非生物胁迫，导致产量损失严重。白粉病就是小麦最主要的病害之一，它由专性寄生菌(Blumeria graminisf.sp.tritici)引起，在我国小麦种植区发生面积非常广。近年来，由于寄主抗性、气候条件和耕作模式等因素的变化，小麦白粉病的发生日益严重，其发生面积一直维持在600-800万hm2，给小麦生产造成了极大的损失。种植抗病品种是防治小麦白粉病最经济、有效和安全的方法。但是，由于植物与病原菌的协同进化作用，主效单基因抗病品种的广泛种植极易对病菌群体产生选择压力，造成病菌群体相应毒性基因的频率迅速上升，从而导致抗病性丧失。因此，挖掘新的抗小麦白粉病基因对提高小麦白粉病抗性具有十分重要的意义。
分子标记辅助选择(MAS,marker assisted selection)是基于基因型的直接选择，不受外界环境因素的影响，是近年来迅速发展起来的新技术，被广泛应运用于小麦抗病育种实践中。KASP(Kompetitive Allele-Specific PCR)标记，即竞争性等位基因特异性PCR，利用在引物末端加入不同的荧光集团，基于PCR终端荧光信号的读取判断对目标序列进行分型，可对目标等位基因中包含的特定SNP(单碱基核苷酸多态性)或InDels(插入/缺失)进行鉴定，与常用的分子标记(如RFLP、AFLP、DArT、SSR等)相比，KASP标记的鉴定过程具有高效、低廉、快捷、方便的优点，且能够进行高通量分析，极大地加快了分子标记辅助选择的进程，在作物育种中有着广阔的应用前景。因此，开发用于鉴定小麦白粉病抗性的KASP标记，将为培育抗白粉病小麦新品种提供有效的检测手段，对于确保小麦高产、稳产以及国家粮食安全和农业可持续发展具有十分重要的战略意义。
发明内容
本发明所要解决的问题是如何鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性，并进行小麦育种。
为了解决以上技术问题，本发明首先提供了检测小麦基因组中KASP的多态性或基因型的物质在如下任一中的应用，
(1)鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性；
(2)小麦育种；
(3)制备鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的产品；
(4)制备小麦育种的产品；
所述SNP位点为小麦1A染色体上的一个位点，其核苷酸种类为A或T，为序列表中序列1的第101位核苷酸。
以普通小麦品种中国春基因组IWGSC_RefSeq_v1.0序列为参考基因组，所述SNP位点为小麦1A染色体207,220,442bp处(具体为序列表中序列1第101位)。
本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的方法，包括检测待测小麦基因组中所述SNP位点的基因型，根据所述基因型鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性，所述基因型为AA或TT，所述AA是所述SNP为A的纯合型，所述TT是所述SNP为T的纯合型。
作为一种实施方案，所述鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的方法可包括如下步骤：
(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物组合物进行KASP分子标记检测；所述引物组合物由引物A、引物B和引物C组成；
所述引物A为核苷酸序列是序列表中序列2的单链DNA分子或核苷酸序列是序列表中序列2的第22-44位的单链DNA；
所述引物B为核苷酸序列是序列表中序列3的单链DNA分子或核苷酸序列是序列表中序列3的第22-44位的单链DNA；
所述引物C为核苷酸序列是序列表中序列4的单链DNA分子；
(2)完成步骤(1)后，进行荧光检测，确定待测小麦的所述SNP的基因型；
(3)根据基因型结果进行鉴定待测小麦的白粉病抗性：所述SNP的基因型为TT的待测小麦的白粉病抗性优于所述SNP的基因型为AA的待测小麦。
本发明还提供了小麦育种的方法。
本发明所提供的小麦育种的方法，包括检测小麦基因组中所述SNP位点的基因型，选择所述SNP的基因型为TT的小麦作为亲本进行育种，所述TT是所述SNP为T的纯合型。
作为一种实施方法，小麦育种的方法可包括如下步骤：
(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用上述引物组进行KASP分子标记检测；
(2)完成步骤(1)后，进行荧光检测，确定待测小麦所述SNP位点的基因型；
(3)选择TT基因型小麦进行抗白粉病小麦育种。
上述方法中，引物溶解与配制方法可为：先将3条引物分别用ddH2O稀释成100μM，再按如下配制引物工作液：引物A12μL、引物B12μL、引物C 30μL、ddH2O 46μL，作为KASP标记的引物工作液，-20℃保存备用。
上述方法中，KASP的反应体系可为：模板DNA 1.5μL，引物工作液0.0417μL，2×KASP Master Mix(LGC公司，Lot No.13426773)0.75μL，用无菌超纯水补充反应体系至3μL。
上述方法中，KASP标记可在普通PCR扩增仪上进行。
上述方法中，KASP标记的反应程序可为：
第一步：94℃预变性15min；
第二步：94℃变性20s、复性20s(第一次的复性温度为61℃，每个循环降温0.6℃)共10个循环；94℃变性20s、55℃复性1min共26个循环；
第三步：72℃延伸3min、4℃保存。
上述方法中，确定待测小麦所述SNP的基因型的方法可为：PCR反应完成后，利用荧光信号阅读仪(Omega)和荧光检测系统(Araya)将荧光信号转变为可分析的数值对反应产物进行荧光数据读取。采用终末端读取荧光值进行基因分型，荧光扫描结果利用R软件包进行图形化展示，A碱基类型带有FAM荧光，分布于x轴附近；T碱基类型带有HEX荧光，分布于y轴附近；无检出信号的样本分布于原点附近。
上述方法在小麦育种中的应用也属于本发明的保护范围。
本发明还提供了用于检测小麦基因组中SNP位点的多态性或基因型的产品。
本发明所提供的用于检测小麦基因组中所述SNP位点的多态性或基因型的产品，含有上述检测小麦基因组中SNP位点的多态性或基因型的物质，所述产品为任一种：
C1)检测小麦白粉病抗性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
C2)鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的产品；
C3)用于小麦育种的产品。
上述应用、方法和产品中，所述物质可为通过下述至少一种方法确定所述SNP位点的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱和SNP芯片。其中，SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片，及基于荧光分子DNA结合反应的芯片。
可选地，所述物质为如下D1)、D2)或D3)：
D1)所述物质为扩增包括所述SNP位点在内的小麦基因组DNA片段的引物组合物；
D2)所述物质为含有D1)所述引物组合物的PCR试剂；
D3)所述物质为含有D1)所述引物组合物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。
可选地，所述扩增可为PCR扩增。所述引物组合物由所述引物A、所述引物B和所述引物C组成。
D3)所述试剂盒还可包括KASP Master Mix。
上述应用、方法和产品中，所述引物组合物可被标记物标记也可不被标记物标记。所述标记物指可用于提供可检测的效果且可以连接至核酸的任何原子或分子。标记物包括但不限于染料；放射性标记，诸如32P；结合部分，诸如生物素(biotin)；半抗原，诸如地高辛(DIG)；发光、发磷光或发荧光部分；和单独的荧光染料或与可以通过荧光共振能量转移(FRET)抑制或移动发射光谱的部分组合的荧光染料。标记可以提供可通过荧光、放射性、比色、重量测定、X射线衍射或吸收、磁性、酶活性等检测的信号。标记可以是带电荷的部分(正电荷或负电荷)或可选地，可以是电荷中性的。标记可以包括核酸或蛋白序列或由其组合，只要包含标记的序列是可检测的。在一些实施方案中，核酸在没有标记的情况下直接检测(例如，直接读取序列)。如所述引物组合物可为由核苷酸序列是序列表中序列2的第22-44位的单链DNA、核苷酸序列是序列表中序列3的第22-44位的单链DNA和核苷酸序列是序列表中序列4的单链DNA组成的引物组合物，所述引物组合物也可为由序列表中序列2所示的单链DNA、序列表中序列3所示的单链DNA和由序列表中序列4所示的单链DNA的引物组。序列表中序列2由44个核苷酸组成，第1-21位核苷酸为FAM接头序列(作为标记物)，第22-44位核苷酸为特异序列；序列表中序列3由44个核苷酸组成，第1-21位核苷酸为HEX接头序列(作为标记物)，第22-44位核苷酸为特异序列。
本发明还提供了DNA分子，核苷酸序列如序列表的序列1所示。
上述的DNA分子的应用也属于本发明的保护范围之内。所述应用具体为在如下任一中的应用：
(1)鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性；
(2)小麦育种；
(3)制备鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的产品；
(4)制备小麦育种的产品。
可选地，在上述应用中，该DNA分子作为检测靶标。
可将检测所述SNP位点多态性和基因型的物质与其他物质(如检测其他与小麦白粉病抗性相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定小麦白粉病抗性的小麦品种的产品。
本文中，所述育种的目的可包括培育抗白粉病小麦。所述小麦可为纯系或自交系。
本发明利用全基因组关联分析(GWAS)的方法定位到1个与小麦白粉病抗性显著相关(P-Value 5.51E-07)的QTL位点QPm.ICO-1A，该位点位于小麦1A染色体，物理位置为207,220,442bp(参考小麦品种中国春基因组IWGSC_RefSeq_v1.0)，芯片标记位点为AX-111218406。此SNP位点为A/T碱基差异，将这两种等位基因类型分别命名为QPm.ICO-1Aa和QPm.ICO-1Ab。
本发明根据此SNP(A/T)位点(AX-111218406)开发了一个用于检测小麦白粉病抗性的KASP标记Kasp_Pm1A。携带FAM荧光、分布于x轴附近的为感小麦白粉病类型(QPm.ICO-1Aa)；携带HEX荧光、分布于y轴附近的为抗小麦白粉病类型(QPm.ICO-1Ab)。通过利用两组共340份中国小麦种质资源对该标记进行验证，显示该标记可以对QPm.ICO-1Aa和QPm.ICO-1Ab两种等位基因类型进行准确分型。
本发明提供了一种引物组合物，还提供了利用引物组合物鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的方法。本发明建立的方法可用于预测小麦白粉病抗性，可以对待筛选小麦进行早期筛选，可用于小麦分子标记辅助育种，在发掘小麦白粉病抗性的小麦种质资源和选育白粉病抗性增强的小麦品种的研究中具有重要的应用价值。
附图说明
图1：普通小麦抗白粉病基因QPm.ICO-1A的KASP标记引物位置。位于1A染色体物理位置207,220,442bp(芯片位点AX-111218406)处SNP(A/T)以红色标识；KASP标记上、下游引物位置以下划线标识。图中序列为小麦1A染色体物理位置207,220,342bp-207,220,542bp的序列。
图2：小麦种质材料Kasp_Pm1A标记检测结果图。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述，给出的实施例仅为了阐明本发明，而不是为了限制本发明的范围。以下提供的实施例可作为本技术领域普通技术人员进行进一步改进的指南，并不以任何方式构成对本发明的限制。
下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法，按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
以下实施例中的定量实验，如无特别说明，均设置三次重复实验。
以下实施例中的小麦材料分别记载于如下非专利文献中：“曹文昕,万映秀,张琪琪,李炎,张平治.黄淮麦区主要推广小麦品种抗寒性的演变规律.麦类作物学报,2015,35(1):57-63.”、“耿晓丽,张月伶,臧新山,赵月,张金波,尤明山,倪中福,姚颖垠,辛明明,彭惠茹,孙其信.北方冬麦区与黄淮北片优良小麦品种(系)耐热性评价.麦类作物学报,2016,36(2):172-181.”、“郭总总,王翔,卫丽,白瑞英,曹云,郭创,尹钧.黄淮麦区小麦春化基因组成的多态性分布研究.河南农业大学学报,2014,48(3):255-262.”、“张帅,张希兰,张娜,赵明辉,乔文臣,孙丽静,李辉,傅晓艺,何明琦,纪军,李俊明.黄淮麦区北片小麦穗部相关性状的全基因组关联分析.华北农学报,2020,35(增刊):31-39.”、“张颖君,高慧敏,李子千,胡梦芸,孙丽静,刘茜,吕亮杰,李辉.黄淮北片冬麦区抗赤霉病基因云澡遭员种质挖掘及溯源.华北农学报,2022,35(2)：196-202.”、“Chen Shulin,Cheng Xiyong,Yu Kang,Chang Xiangnan,Bi Huihui,Xu Haixia,Wang Junsen,Pei Xingxu,Zhang Ziliang,ZhanKehui.Genome-wide association study of differences in 14agronomic traitsunder low-and high-density planting models based on the 660k SNP array forcommon wheat.Plant Breeding,2020,139(2):272-283.”。实施例中的普通小麦种质均为河北省农林科学院粮油作物研究所小麦研究中心保存，公众可从申请人处获得该生物材料，该生物材料只为重复本发明的相关实验所用，不可作为其它用途使用。
小麦白粉病的菌株B.graminis f.sp.Tritici E21，记载于以下非专利文献中：Haixian Zhan,Yingli Wang,Dan Zhang,Chenhui Du,Xiaojun Zhang,Xiaoli Liu,Guangyuan Wang,Shuosheng Zhang.RNA-seq bulked segregant analysis combinedwith KASP genotyping rapidly identified PmCH7087 as responsible for powderymildew resistance in wheat.Plant Genome,2021,14:e20120，由华中农业大学植物科学技术学院兰彩霞教授提供。
实施例1、小麦白粉病抗性QTL位点QPm.ICO-1A区间SNP标记芯片位点AX-111218406及KASP标记引物组的获得
1.QTL定位和连锁标记芯片位点AX-111218406的发现
利用全基因组关联分析软件TASSEL 5.0进行小麦QTL定位。发现1A染色体上的物理位置207,220,442bp处的SNP位点AX-111218406与小麦白粉病抗性存在显著相关性，因此将其转化为KASP标记，用于分子标记辅助选择育种。SNP位点AX-111218406为序列1的第101位，其核苷酸种类为A或T。序列1的核苷酸序列为小麦1A染色体物理位置207,220,342bp-207,220,542bp的序列。序列表中序列1的w表示a或t。
2.KASP标记AX-111218406的引物组的获得
设计基于KASP技术检测SNP多态性位点的引物组(即KASP标记Kasp_Pm1A)，简称KASP引物组。KASP引物组由两条上游引物(引物A和引物B)和一条下游引物(引物C)组成，具体序列见表1。
表1用于鉴定小麦白粉病抗性QTL位点QPm.ICO-1A等位基因变异的KASP标记
引物A为5’端带有FAM荧光标签序列(下划线部分的碱基)的引物，和引物C扩增SNP位点AX-111218406为A的片段，用酶标仪或荧光定量PCR仪可读取到FAM基团的荧光信号；
引物B为5’端带有HEX荧光标签序列(下划线部分的碱基)的引物，和引物C扩增SNP位点AX-111218406为T的片段，用酶标仪或荧光定量PCR仪可读取到HEX基团的荧光信号。
利用KASP标记Kasp_Pm1A检测小麦白粉病抗性QPm.ICO-1A在1A染色体物理位置207,220,442bp(SNP位点AX-111218406)处不同等位基因类型。
1.PCR扩增体系及程序
KASP标记引物工作液制备：根据小麦白粉病抗性QTL位点QPm.ICO-1A在芯片位点AX-111218406处的SNP设计KASP引物，该SNP位点的多态性为A/T碱基差异，引物序列见表1。先将3条引物分别用ddH2O稀释成100μM，再按如下配方配制引物工作液：引物A12μL、引物B12μL、引物C 30μL、ddH2O 46μL。-20℃保存备用。
以CTAB法提取普通小麦叶片基因组DNA，加400μL TE溶解。DNA经1％琼脂糖凝胶电泳进行质量检测，所提DNA要求无明显杂质、条带清晰、无降解。DNA测浓度后，统一稀释为28.3ng/μL，以稀释后的小麦基因组DNA为模板，进行PCR扩增。
PCR扩增体系为：模板DNA 1.5μL，引物工作液0.0417μL，2×KASP Master Mix(LGC公司，Lot No.13426773)0.75μL，用无菌超纯水补充反应体系至3μL。
PCR反应程序为：94℃预变性15min；94℃变性20s、复性20s(第一次的复性温度为61℃，每个循环降温0.6℃)共10个循环；94℃变性20s、55℃复性1min共26个循环；72℃延伸3min、4℃保存。
实验同时设置反应体系中不添加模板DNA的空白对照(CK)，每个板设置1个对照。
2.基因分型
PCR反应完成后利用荧光信号阅读仪(Omega)和荧光检测系统(Araya)将荧光信号转变为可分析的数值对反应产物进行荧光数据读取。荧光扫描结果利用R软件包进行图形化展示，A碱基类型(QPm.ICO-1Aa)带有FAM荧光，分布于x轴附近；T碱基类型(QPm.ICO-1Ab)带有HEX荧光，分布于y轴附近；无检出信号的样本分布于原点附近。FAM激发波长为485nm，发射波长为520nm。HEX激发波长为535nm，发射波长为556nm。系统参比荧光ROX激发波长为575nm，发射波长为610nm。
结果如图2所示，若显示只有FAM基团的荧光信号，则所述待测小麦的AX-111218406的基因型为AA(即小麦基因组中SNP位点AX-111218406为A的纯合型)；若显示只有HEX基团的荧光信号，则所述待测小麦的AX-111218406基因型为TT(即小麦基因组中SNP位点AX-111218406为T的纯合型)。
实施例3、应用KASP标记Kasp_Pm1A辅助鉴定普通小麦种质材料的白粉病抗性
1.340份小麦种质白粉病抗性表型分析
340份小麦种质材料于2018-2019年、2019-2020年连续2年种植于河北省石家庄市，3m行长，行间距30cm，株距2cm，单行区，随机区组设计，三次重复，田间设白粉病接种行。
小麦白粉病表型鉴定具体步骤如下：
在小麦返青后期，用带有新鲜白粉病菌孢子的活体麦苗均匀扫抹田间白粉病接种行，第二天再重复1次，保证充分接菌，诱发田间白粉病充分发病。
春季进行小麦白粉病鉴定，小麦灌浆中期调查小麦白粉病发病情况，小麦白粉病病情分级标准如下：
0级：免疫，植株全株无病斑，无菌丝体附着。
1级：高抗，病斑很小，菌丝层稀薄，可见绿色叶面，偶有较大病斑，但仍透绿，产孢量极少。
2级：中抗，叶片病斑小，菌丝层较厚但立体感较弱，不透绿，能产生一定量孢子。
3级：中感，叶片病斑多，菌丝层厚、立体感强，叶片失绿，产孢量大，但病斑不连片。
4级：高感，叶片病斑很多，菌丝层厚，产孢量多，病斑连片。
发病程度介于两级之间的，以半级(0.5)表示。一般认为0～2级为抗病型，3～4级为感病型。
采用SAS 9.4统计软件对数据进行t检验分析，P＜0.01表示具有极显著性差异。
2.用KASP标记鉴定小麦SNP位点AX-111218406的基因型
按实施例2所述的方法，提取各实验材料叶片基因组DNA，并采用上述KASP分子标记检测受试小麦的基因型。
结果见表2和图2。图2中，AA为小麦材料的SNP位AX-111218406的基因型为AA，TT为小麦材料的SNP位点AX-111218406基因型为TT，CK为反应体系中不添加模板DNA的空白对照。
经KASP标记检测，340份中国小麦种质中，有214份种质为QPm.ICO-1Aa等位基因类型(感病类型)(即SNP位点AX-111218406基因型为AA)，126份种质为QPm.ICO-1Ab等位基因类型(抗病类型)(SNP位点AX-111218406的基因型为TT)。携带QPm.ICO-1Ab等位基因类型为TT的小麦种质在不同年份的白粉病抗性均强于携带QPm.ICO-1Aa等位基因类型为AA的小麦种质，两者达到极显著差异(P<0.01)水平(表3)。
表2小麦种质材料Kasp_Pm1A标记检测与白粉病抗性调查结果
表3小麦QPm.ICO-1A等位基因变异类型与白粉病抗性统计分析结果
注：统计分析采用双尾t-test检验(P<0.01代表差异达到极显著水平)
以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说，在不脱离本发明的宗旨和范围，以及无需进行不必要的实验情况下，可在等同参数、浓度和条件下，在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例，应该理解为，可以对本发明作进一步的改进。总之，按本发明的原理，本申请欲包括任何变更、用途或对本发明的改进，包括脱离了本申请中已公开范围，而用本领域已知的常规技术进行的改变。按以下附带的权利要求的范围，可以进行一些基本特征的应用。
Claims (6)
1.检测小麦基因组中SNP的多态性或基因型的物质在如下任一中的应用，
（1）鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性；
（2）小麦育种；
（3）制备鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的产品；
（4）制备小麦育种的产品；
所述SNP位点为小麦1A染色体上的一个SNP位点，其核苷酸种类为A或T，为序列表中序列1的第101位核苷酸；
所述SNP的基因型为AA或TT，所述AA是所述SNP为A的纯合型，所述TT是所述SNP为T的纯合型；所述SNP的基因型为TT的待测小麦的白粉病抗性高于所述SNP的基因型为AA的待测小麦。
2.鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的方法，其特征在于：包括检测待测小麦基因组中SNP位点的基因型，根据所述基因型鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性，所述SNP位点为小麦1A染色体上的一个SNP位点，其核苷酸种类为A或T，为序列表中序列1的第101位核苷酸；
所述SNP的基因型为AA或TT，所述AA是所述SNP为A的纯合型，所述TT是所述SNP为T的纯合型；所述SNP的基因型为TT的待测小麦的白粉病抗性高于所述SNP的基因型为AA的待测小麦。
3.小麦育种的方法，其特征在于：所述方法包括检测小麦基因组中权利要求1中所述SNP的基因型，选择所述SNP的基因型为TT的小麦作为亲本进行育种，所述TT是所述SNP为T的纯合型。
4.权利要求2或3所述的方法在小麦育种中的应用。
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述SNP的基因型为AA或TT，所述AA是所述SNP为A的纯合型，所述TT是所述SNP为T的纯合型；所述SNP的基因型为TT的待测小麦的白粉病抗性高于所述SNP的基因型为AA的待测小麦。
6. DNA分子在如下任一中的应用，
（1）鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性；
（2）小麦育种；
（3）制备鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的产品；
（4）制备小麦育种的产品；
所述DNA分子的核苷酸序列是序列表中的序列1。
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