CN110583581A - 一种新型烟粉虱若虫rna干扰方法构建 - Google Patents

一种新型烟粉虱若虫rna干扰方法构建 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种烟粉虱若虫体壁渗透法RNA干扰的方法,包括如下步骤:1)棉花苗的培育;2)接虫产卵;3)采用体壁渗透法进行RNA干扰:准备好的dsRNA和外源对照基因dsEGFP,以1:1的体积比将星型聚合物的纳米材料和dsRNA混匀,小心地滴在若虫上,待液滴被虫体吸收后将棉叶插回装有清水的瓶中,放入培养箱中继续饲养,2天后记录死亡数并收集若虫样本。本发明方法利用新型纳米材料的强渗透性,使得dsRNA经体壁快速渗透进烟粉虱体内,显著降低了死亡率,提高了干扰效率,具有很高的时效性和良好的重复性。此外,本发明方法所用到的dsRNA量非常少,约0.3μl/头,在保证干扰效率的同时,大大降低了实验成本,具有很好的应用前景。

Description

一种新型烟粉虱若虫RNA干扰方法构建
技术领域
本发明属于生物领域,涉及一种新型烟粉虱若虫RNA干扰方法构建。
背景技术
烟粉虱Bemisia tabaci属于半翅目Hemiptera,粉虱科Aleyrodidae,作为一种世界性的农业害虫,广泛分布于中国、日本、马来西亚、印度、美国等国。烟粉虱是一个快速进化的复合种,B烟粉虱于1949年首次传入我国,并于20世纪90年代暴发成灾,给我国农业生产带来巨大经济损失。Q烟粉虱于2003年首次在我国云南省被发现,目前Q烟粉虱已取代B烟粉虱成为我国主要危害种。烟粉虱属多食性害虫,寄主谱广,其寄主植物涉及74科420种,主要包括十字花科、葫芦科、豆科、茄科等。它对寄主植物的危害包括直接取食植物汁液,造成植株衰弱;分泌蜜露,诱发煤污病;作为植物病毒载体,传播植物病毒病。鉴于烟粉虱危害的严重性,对它的防治工作已经到了刻不容缓的地步。传统的防治方法多采用化学防治,而长期依赖化学杀虫剂,势必导致烟粉虱抗性的产生。在美国、西班牙、希腊等地已发现烟粉虱对吡虫啉产生严重的抗药性。而在我国浙江、江苏、湖北等地也已发现烟粉虱吡虫啉的中高抗品系。因此开展新防治方法的理论基础研究和应用基础研究势在必行。
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是生物进化过程中一种高度保守的基因表达调节机制。它是由与靶基因序列同源的双链RNA(dsRNA)诱发的,特异性基因表达沉默现象。RNAi现象最早是在研究秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans反义RNA(antisense RNA)的过程中被发现,此后陆续在真菌、果蝇、拟南芥、昆虫、小鼠等多种真核生物中发现。它在真核生物中参与抵御病毒感染、抑制转座子活性、调控基因的表达,且在机体的发育调控及生理代谢方面具有重要的生物学意义。目前对昆虫进行RNAi的操作技术已经比较成熟,将dsRNA或siRNA导入昆虫体内主要有3种方法,即注射、饲喂和组织培养。注射法已成功应用于果蝇Drosophila、赤拟谷盗Tribolium castaneum、家蚕Bombyx mori、烟草天蛾Manducasexta、斜纹夜蛾Spodoptera litura、小菜蛾Plutella xylostella和棉铃虫Helicoverpaarmigera,也曾尝试用于烟粉虱的成虫,但其成活率仅有50%~60%。饲喂法已成功应用于长红锥蝽Rhodnius prolixus、棉铃虫和玉米根萤叶甲Diabrotica virgifera,且在烟粉虱成虫RNAi中有较好的表现。组织培养法由于其培养条件难以掌握,目前仅在果蝇、白纹伊蚊Aedes albopictus和埃及伊蚊Aedes aegypti中有应用。
RNAi技术作为基因沉默的工具,被广泛应用于基因功能的研究,而且在农作物害虫防治方面展现出良好的应用前景,目前已在鳞翅目和鞘翅目昆虫中试验成功。通过对棉铃虫幼虫饲喂表达P450基因(CYP6AE14)和谷胱甘肽基因GST1dsRNA的棉花,诱导RNAi并阻碍了幼虫发育,这一技术为田间害虫控制开辟了新领域;Baum及其同事利用含特定dsRNA的人工饲料饲喂玉米根萤叶甲,沉默了其14个特定基因,该RNAi为利用表达Bt毒素蛋白的玉米、棉花和大豆等作物来控制害虫,提供了一个独特的模式。RNAi应用于防治刺吸式的昆虫如半翅目蚜虫、叶蝉和粉虱同样具有极大的发展潜力。
目前,对烟粉虱成虫进行RNAi的操作技术已经比较成熟,但国内外关于烟粉虱若虫的RNAi的成熟经验太少,本实验采用新型纳米材料,以烟粉虱的3-4龄若虫为实验对象,成功建立一套成熟的RNAi技术。
发明内容
本发明方法
本发明提供的技术方案是:一种烟粉虱若虫体壁渗透法RNA干扰的方法,该方法包括如下步骤:
1)棉花苗的培育:将浸种过的棉籽播种到苗盆里,待棉苗长出1片直径1.5-2.5cm真叶时,将棉苗连根拔起待用;
2)接虫产卵:将棉苗放于2个接壤在一起的瓶中,瓶盖上设有透气孔,瓶中放入若干对烟粉虱成虫,产卵后将成虫吹走,将接完卵的棉苗放入培养箱中,待卵孵化并发育到3-4龄若虫后,记录若虫个数;
3)采用体壁渗透法进行RNA干扰:准备好1μg/μl的dsRNA和外源对照基因dsEGFP,以1:1的体积比将星型聚合物的纳米材料和dsRNA混匀,将附有3-4龄若虫的棉叶取出,用移液器吸取混合液,小心地滴在若虫上,液滴以刚好包裹住虫体为宜,待液滴被虫体吸收后将棉叶插回装有清水的瓶中,放入培养箱中继续饲养,2天后记录死亡数并收集若虫样本。其中,所述星型聚合物的纳米材料见中国专利申请201810350562.7(发明名称:一种星型聚合物及其制备方法和应用)中所述的纳米材料,优选是其实施例一和实施例二中所述星型聚合物P1和P2,其在水溶液中可自组装形成纳米微球。
其中星型聚合物P1的化学结构式为:
星型聚合物P2的化学结构式为:
所述的方法,其中第1)步中,待棉苗长出1片直径2cm真叶时,将棉苗连根拔起待用。
所述的方法,其中第2)步中,将棉苗放于2个接壤在一起的直径5.5cm,高15cm的塑料瓶中,瓶盖上开一个直径3cm的圆孔,用直径4cm的100目纱网将孔封上,用于透气,所述塑料瓶中放入15对烟粉虱成虫,产卵72小时后将成虫吹走;培养箱中的温度25±1℃、湿度70%±10%、光照周期16h:8h(L:D)。
本发明还提供一种用于制备烟粉虱成虫RNA(dsRNA)的PCR引物对,其是dsIX-F5和dsIX-R5,其序列如下:
dsIX-F5:TAATACGACTCACTATAGGCCAGTTCCTCAAGCTCCATC
dsIX-R5:TAATACGACTCACTATAGGTTTGGTAACGGCTCAGTCCT。
本发明方法相对于其他烟粉虱RNA干扰方法的优势如下:
烟粉虱属于刺吸式小型昆虫,3龄和4龄若虫体长约0.6-0.9mm。应用显微注射的方法进行RNA干扰,死亡率较高,而采用植物叶片饲喂的方法,受叶片影响较大,重复性较差。
本发明方法利用新型纳米材料的强渗透性,使得dsRNA经体壁快速渗透进烟粉虱体内,显著降低了死亡率,提高了干扰效率,具有很高的时效性和良好的重复性。此外,本发明方法所用到的dsRNA量非常少,约0.3μl/头,在保证干扰效率的同时,大大降低了实验成本,具有很好的应用前景。
附图说明
图1为本发明方法中的塑料瓶装置。
图2烟粉虱Btix RNA干扰,Adult:烟粉虱成虫;N3:3龄若虫;N4:4龄若虫;Nymph:烟粉虱若虫。
具体实施方式
下面通过具体实施方式的详细描述来进一步阐明本发明,但并不是对本发明的限制,仅仅作示例说明。
实验材料和方法
供试昆虫
Q烟粉虱最早于2009年6月采自北京中蔬大森林花卉市场所售一品红(Euphorbiapulcherrima Willd.)上,而后在玻璃温室中于棉花(Gossypium herbaceumL.cv.Zhongmian49)上继代饲养。为了保持种群的纯度,每隔2-3代用线粒体细胞色素氧化酶(mtCOI)进行监测。
供试试剂
RNA提取试剂Trizol(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA),cDNA反转录试剂盒RT reagent Kit(Takara Biotech),dsRNA合成试剂盒T7RiboMAXTM ExpressRNAi System,荧光定量试剂盒SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(TIANGEN,Beijing,China)和胶回收试剂盒(Promega),星型聚合物的纳米材料(中国专利申请201810350562.7(发明名称:一种星型聚合物及其制备方法和应用)中实施例二中星型聚合物P2在水溶液中自组装成的90nm的微球),DNA分子量标准、X-Gal和IPTG(TIANGEN,Beijing,China),氨苄青霉素钠盐(Amresco),琼脂糖(北京擎科),pEASY-T1vector(北京全式金),ES-Taq Mix DNA聚合酶。其它实验室常用化学试剂(分析纯)均为市售。
主要仪器
荧光定量PCR仪(ABI QuantStudio 3),PCR仪(Bio-Rad S1000),Nanodrop(ThermoScientific Nanodrop 2000),离心机(Eppendorf 5417R),水浴锅(北京六一制造厂),电泳仪和凝胶成像系统(Bio-Rad),恒温箱和高压灭菌锅(SanYo),组织研磨仪(上海净信科技),移液器(Eppendorf),超纯水仪(ZMQ55VOTI Mini Q),超净工作台(苏州净化科技有限公司)。
RNA提取及cDNA合成
利用Trizol试剂提取烟粉虱总RNA,具体步骤如下:
1)取烟粉虱若虫40头,立即放入液氮中冷冻,防止RNA降解。
2)向烟粉虱样品中加入1ml Trizol和1粒研磨珠,于预冷的组织研磨仪中研磨2-3min,使其充分匀浆,冰上静置5min。
3)加入300μl氯仿,漩涡振荡器剧烈振荡30s,使其充分混匀,冰上静置5min,4℃12000rpm离心15min。
4)轻轻吸取400μl的上清液于干净的离心管中。
5)加入等体积预冷的异丙醇,缓慢颠倒混匀,冰上放置10min以沉淀RNA,4℃12000rpm离心10min。
6)倒去上清液,加入1ml提前配置的预冷75%无水乙醇进行漂洗,4℃8000rpm离心5min。
7)倒去乙醇,并小心吸去遗留的液体,室温晾干,加入10μl预冷的DEPC水溶解,用Nanotrop测定RNA的浓度及OD260/OD280的比值,并且用1%琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性。
根据说明书的指示用TaKaRa公司的反转录试剂盒RT reagent Kit进行cDNA合成,步骤如下:
1)去除基因组DNA:
按如下表1的用量将试剂盒中的各组分加入到干静的离心管中,适度混匀后分装。置于PCR仪中42℃反应2min。
表1
2)合成cDNA
按如下表2将试剂盒中其它组分轻柔混匀,离心后放入PCR仪中37℃反应15min,85℃反应5s,产物保存于-20℃备用。
表2
荧光定量PCR分析
Intersex基因是性别决定级联的末端基因,在包括果蝇、家蚕、乳草蝽等多种昆虫中都被报道参与雌虫的体细胞性别分化。探究烟粉虱Btix基因的功能,有助于我们了解烟粉虱的性别决定机制,并为筛选防治烟粉虱的靶标基因,开发新的烟粉虱防治方法提供理论依据。通过分析室内饲养的Q型烟粉虱Btix基因在各个龄期的表达水平,发现Btix在卵期出现表达高峰,其次是3龄若虫期,而成虫期表达量低。由此,我们针对该基因开展若虫干扰实验。
1.荧光定量引物的筛选:利用Primer Premier 5.0软件设计符合荧光定量试验要求的特异性引物(退火温度≈60℃,产物大小100-200bp之间,避开干扰片段),然后以烟粉虱成虫cDNA为模板,利用所设计的引物,首先进行普通PCR,电泳检测PCR产物,确定产物大小正确且为单一明亮条带,并送公司测序以检验引物的特异性。
本发明中设计的引物见表3,PCR反应体系见表4。
表3引物
表4
利用ABI QuantStudio 3实时荧光定量仪进行RT-qPCR,将模板浓度梯度稀释,按照荧光定量试剂盒推荐的体系和程序进行操作,对引物的扩增效率进行检测。反应体系见表5,反应程序见表6。
表5
表6
在72℃延伸的时候获得熔解曲线,最后筛选出合适的荧光定量引物(表3)。
2.内参基因的选择,选择SDHA作为本发明的内参基因。
3.数据分析:利用ABI处理RT-qPCR数据,根据2-ΔΔCt计算得到各个基因的相对表达量,其中,目的引物的扩增效率(E)的计算公式为E=[10(-1/斜率)-1]×100%。
dsRNA合成
将验证后的Btix基因全长序列输入果蝇基因中的siRNA结合位点网站http://www.flyrnai.org/cgi-bin/RNAi_find_primers.pl设计相应的dsRNA引物(表3)。利用该引物,以烟粉虱成虫的cDNA为模板进行PCR,跑胶鉴定,回收与目的条带大小一致的片段,进行测序验证。然后用dsRNA合成试剂盒T7RiboMAXTM Express RNAi System合成dsRNA。
1)dsRNA合成
使用干净的RNA专用1.5ml离心管,依次加入的试剂见表7。
表7
37℃温育30min(温育时间可延长至2-6h,以增加产量),70℃10min,然后室温放置20min,缓慢冷却形成dsRNA。
2)DNA和单链RNA消除
每20μl体系中加入新稀释的1/200的RNase和RQ1RNase-Free DNase各1.0μl,37℃温育30min,以除去反应体系中的DNA和单链RNA。
3)dsRNA纯化
每管加入0.1倍体积的3M Sodium Acetate(pH 5.2)和1倍体积的异丙醇,缓慢上下颠倒混匀后冰上放置5min,然后4℃15000rpm离心15min。加入预先配好的预冷70%乙醇0.5ml进行漂洗,8000rpm离心5min,然后室温晾干约15min,加入1-2倍体积的Nuclease-Free Water,存储在-20℃(-80℃长期保存)。
烟粉虱若虫体壁渗透法RNA干扰
1)棉花苗的培育:将浸种过的棉籽播种到苗盆里,待棉苗长出1片直径2cm左右真叶时,将棉苗连根拔起待用。
2)接虫产卵:将棉苗放于2个接壤在一起的直径5.5cm,高15cm的塑料瓶中,瓶盖上开一个直径约3cm的圆孔,用剪好的直径约4cm的100目纱网将孔封上,用于透气(图1)。塑料瓶中放入15对烟粉虱成虫,产卵72小时后将成虫吹走。将接完卵的棉苗放入培养箱中(温度25±1℃、湿度70%±10%、光照周期16h:8h(L:D)),待卵孵化并发育到3-4龄若虫后,用显微镜记录其若虫个数,采用体壁渗透法进行RNA干扰。
3)体壁渗透法:准备好1μg/μl的dsRNA和外源对照基因dsEGFP,以1:1的体积比将纳米材料和dsRNA混匀,尽量避免沉淀的产生。将附有3-4龄若虫的棉叶取出,用10μl的移液器吸取混合液,小心地滴在若虫上,注意枪头不要触碰虫体,液滴以刚好包裹住虫体为宜,约0.3μl。待液滴被虫体吸收后将棉叶插回装有清水的塑料瓶中,放入培养箱中继续饲养,2天后记录死亡数并收集若虫样本。
两种烟粉虱RNA干扰方法的比较
分别利用烟粉虱成虫饲喂法和若虫体壁渗透法对Btix进行RNA干扰实验,以外源基因EGFP为对照,每个实验设置3个生物学重复。干扰两天后,利用RT-qPCR检测Btix的干扰效率,同时统计死亡率。实验结果表明,两种方法在保证烟粉虱存活率的前提下,均能有效降低Btix的表达量,且若虫体壁渗透法的干扰效率大于成虫饲喂法(用若虫体壁渗透法,Btix的表达量分别下降了59%和64%,而用成虫饲喂法,Btix的表达量只下降了23%)(图2)。

Claims (5)

1.一种烟粉虱若虫体壁渗透法RNA干扰的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)棉花苗的培育:将浸种过的棉籽播种到苗盆里,待棉苗长出1片直径1.5-2.5cm真叶时,将棉苗连根拔起待用;
2)接虫产卵:将棉苗放于2个接壤在一起的瓶中,瓶盖上设有透气孔,瓶中放入若干对烟粉虱成虫,产卵后将成虫吹走,将接完卵的棉苗放入培养箱中,待卵孵化并发育到3-4龄若虫后,记录若虫个数;
3)采用体壁渗透法进行RNA干扰:准备好1μg/μl的dsRNA和外源对照基因dsEGFP,以1:1的体积比将星型聚合物的纳米材料和dsRNA混匀,将附有3-4龄若虫的棉叶取出,用移液器吸取混合液,小心地滴在若虫上,液滴以刚好包裹住虫体为宜,待液滴被虫体吸收后将棉叶插回装有清水的瓶中,放入培养箱中继续饲养;,2天后记录死亡数并收集若虫样本;
其中,所述星型聚合物的纳米材料中星型聚合物P1或P2在水溶液中可自组装形成纳米微球,且星型聚合物P1的化学结构式为:
星型聚合物P2的化学结构式为:
2.如权利要求1所述的方法,其中第1)步中,待棉苗长出1片直径2cm真叶时,将棉苗连根拔起待用。
3.如权利要求1所述的方法,其中第2)步中,将棉苗放于2个接壤在一起的直径5.5cm,高15cm的塑料瓶中,瓶盖上开一个直径3cm的圆孔,用直径4cm的100目纱网将孔封上,用于透气,所述塑料瓶中放入15对烟粉虱成虫,产卵72小时后将成虫吹走。
4.如权利要求1所述的方法,其中第2)步中,培养箱中的温度25±1℃、湿度70%±10%、光照周期16h:8h(L:D)。
5.一种用于制备烟粉虱成虫RNA(dsRNA)的PCR引物对,其是dsIX-F5和dsIX-R5,其序列如下:
dsIX-F5:TAATACGACTCACTATAGGCCAGTTCCTCAAGCTCCATC
dsIX-R5:TAATACGACTCACTATAGGTTTGGTAACGGCTCAGTCCT。
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