CN110564663B - 微生物的受控生长 - Google Patents

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Abstract

调节微生物细胞的生长是有用的。本文的一些实施方案提供能够产生细菌素以控制微生物细胞生长的基因工程微生物细胞。在一些实施方案中，微生物细胞包含于期望的环境中。在一些实施方案中，污染性微生物细胞被中和。在一些实施方案中，第一微生物细胞类型调节第二微生物细胞类型的生长，以维持两种细胞类型的期望比例。

Description

微生物的受控生长
相关申请
本申请要求于2013年8月19日提交的美国临时申请序号61/867,510 的权益，在此将其以引用的方式整体并入。
序列表参考
本申请与电子格式的序列表一同提交。所述序列表以创建的最后在 2014年7月30日保存的名为20140814SGU-001-PCT SEQLIST.TXT的文档提交，其大小为380,083字节。将电子形式的序列表中的信息以引用的方式整体并入本文。
背景
从人类历史的开端起，人类已经使用微生物有机体来产生产品，例如在加工食物如乳酪、啤酒和葡萄酒中使用微生物有机体。在过去的几个世纪里，通常通过控制发酵条件或鉴定微生物有机体的表型特征，对微生物有机体介导的生产过程进行了研究并进行放大。
目前，许多产品都是利用涉及微生物有机体的生产过程生产的。在实验室，以及在一些药物制造过程中，可以在无菌、受控的环境中培养微生物有机体，包括基因工程化的微生物有机体。另一方面，用于涉及微生物的多种工业生产过程的给料不是无菌的，并且可能含有多种微生物菌株和物种。由此，用于实验室和制药过程的基因工程化的微生物不一定适用于如工业生产过程的生产过程，所述工业生产过程涉及利用给料或者在可能污染培养物的环境中被暴露于其它微生物，以及还可能涉及改变环境条件。本文描述了这样的微生物，其被工程化以控制它们自身的生长和其它微生物的生长和/或以响应它们环境中的改变。此类微生物适合在未经灭菌的、较不严格的受控给料中生长。此类微生物可用于在一系列不同的给料和环境中，稳定、一致地产生期望的产品。
领域
本文的实施方案一般地涉及微生物生长的控制。更具体而言，本文的一些实施方案涉及被工程化以用于响应培养环境中其它微生物和/或条件的可调节生长的微生物以及制备和利用此类工程化的微生物的方法。
概述
提供的本文公开的一个实施方案包括第一微生物细胞，其包含编码控制第二微生物细胞生长的分泌的细菌素的核酸，以及赋予抗所述分泌的细菌素抗性的核酸，其中将所述第一微生物细胞已被基因工程化以允许调节赋予抗细菌素抗性的核酸的表达或活性。根据该实施方案的一些方面，将赋予抗细菌素抗性的核酸的表达或活性降低至引起所述第一微生物细胞被所述细菌素中和的水平，如果第一微生物细胞从期望的生长环境中释放的话。根据该实施方案的一些方面，将所述第一微生物细胞基因工程化以生产期望的产物。根据该实施方案的一些方面，进一步选择分泌的细菌素以维持其中第一微生物细胞产生所期望的产物的培养中的至少一项条件。根据该实施方案的一些方面，所述培养包含至少一种入侵的微生物有机体。根据该实施方案的一些方面，所述培养的至少一项条件包括控制第二微生物细胞的生长，其中所述第二微生物细胞是所述培养的常见污染。根据该实施方案的一些方面，第二微生物细胞是与第一微生物细胞不同的菌株、物种或属。根据该实施方案的一些方面，微生物细胞还包含编码控制第三微生物细胞生长的第二分泌的细菌素的核酸以及赋予抗分泌的第二细菌素抗性的核酸，并且所述第一微生物细胞还已被基因工程化以允许调节赋予抗细菌素的抗性的核酸的表达或活性。根据该实施方案的一些方面，所述细菌素杀死第二微生物细胞。根据该实施方案的一些方面，所述细菌素降低了第二微生物细胞的生长速率。根据该实施方案的一些方面，所述细菌素阻止了第二微生物细胞的生长。根据该实施方案的一些方面，赋予抗细菌素抗性的核酸的转录受可调节的启动子的控制。根据该实施方案的一些方面，由赋予抗细菌素抗性的核酸编码的多肽的活性是可调节的。根据该实施方案的一些方面，编码细菌素的核酸位于微生物细胞的染色体上。根据该实施方案的一些方面，赋予抗细菌素抗性的核酸位于质粒上。根据该实施方案的一些方面，编码细菌素的核酸位于微生物细胞的染色体上，并且赋予抗细菌素抗性的核酸位于质粒上。根据该实施方案的一些方面，编码细菌素的核酸和赋予抗细菌素抗性的核酸位于一个或多个质粒上。根据该实施方案的一些方面，第一微生物细胞选自：细菌、酵母和藻类，例如光合微藻。
本文描述的另一实施方案包括控制培养基中的第二微生物细胞生长的方法，其中所述方法包括在第一微生物细胞产生足以控制第二微生物细胞生长的水平的细菌素的条件下，在包含第二微生物细胞的培养基中培养如本文所述的第一微生物细胞。根据该实施方案的一些方面，将所述培养连续维持至少30天，例如至少30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、 180、190、200、250、300、350、400、450或500天。根据该实施方案的一些方面，所述方法还包括检测培养基中的至少一种变化，以及响应所述变化而将第一微生物细胞再工程化，从而产生足以控制第三微生物细胞生长的水平的第二细菌素，所述变化包括第三微生物细胞的水平或活性的存在或增加。
提供的本文公开的另一实施方案包括检测培养物中的分子的存在、不存在或其量的方法。所述方法可以包括在受遗传上可调控的启动子控制的条件下，培养包含细菌素的第一基因工程化微生物细胞。在一些实施方案中，所述可调节的启动子受上述分子调节，以使(a)所述可调节的启动子在所述分子存在的情况下驱动转录，而在不存在所述分子的情况下不驱动转录；或(b)所述可调节的启动子在所述分子不存在的情况下驱动转录，而在所述分子存在的情况下不驱动转录。所述方法可以包括从培养物中分离一定量的第一微生物细胞的基因组核酸。所述方法可以包括由所述一定量的基因组核酸检测第一微生物细胞特有的核酸序列的存在、不存在或其量。根据该实施方案的一些方面，所述方法还包括将第一微生物细胞特有的核酸序列的量与参考核酸序列的量进行比较。
本文公开的另一实施方案包括基因工程载体，所述载体包含赋予针对细菌素的抗性的核酸，其中所述核酸的表达或活性被配置为响应给料中组分的存在、水平或不存在而改变。根据该实施方案的一些方面，所述载体还包含编码细菌素的核酸。根据该实施方案的一些方面，所述载体还包含编码期望的产物的核酸。
本文公开的另一实施方案包括试剂盒，其可以包含多种基因工程化微生物有机体菌株，其中每一菌株已被基因工程化以允许调节赋予针对不同的细菌素的抗性的核酸的表达或活性。
本文公开的另一实施方案包括鉴定调节工业培养基中的至少一种微生物细胞生长的至少一种细菌素的方法，其中所述方法包括将所述工业培养基与含有所述至少一种细菌素的培养基或组合物接触；以及确定所述至少一种细菌素对至少一种微生物细胞的生长是否有期望的作用。根据该实施方案的一些方面，所述方法包括将所述工业培养基与由如本文所述的第一微生物细胞产生的至少一种细菌素接触。根据该实施方案的一些方面，所述由第一微生物细胞产生的至少一种细菌素存在于从包含第一微生物细胞的培养物中获得的上清液中。根据该实施方案的一些方面，所述方法还包括构建基因工程化微生物细胞以产生已被确定对至少一种微生物细胞的生长具有期望的作用的至少一种细菌素。根据该实施方案的一些方面，所述至少一种微生物细胞是为工业培养基的常见入侵者的有机体。根据该实施方案的一些方面，所述至少一种微生物细胞是新近入侵已有工业培养物的有机体。
本文公开的另一实施方案包括用于中和培养基中的非期望的微生物有机体的系统。所述系统可以包含含有培养基的第一环境以及含有分泌两种或更多种不同的细菌素的第二微生物有机体的第二环境，其中所述第二微生物有机体含有针对所述两种或更多种不同的细菌素中每一种的免疫调节剂，其中所述第二环境与所述第一环境流体连通，其中所述第二环境与所述第一环境物理上分离以使所述第二微生物有机体不能从第二环境移动至第一环境，以及其中所述分泌的两种或更多种不同的细菌素进入第一环境的培养基中。根据该实施方案的一些方面，所述系统在培养基中还包含第一微生物有机体，其中所述第一微生物有机体不分泌所述两种或更多种不同的细菌素，以及其中所述第一微生物有机体未被两种或更多种不同的细菌素中任一者所中和。根据该实施方案的一些方面，所述第一微生物有机体是非-GMO。根据该实施方案的一些方面，所述第一微生物有机体使培养基中的组分进行发酵。根据该实施方案的一些方面，所述第一微生物有机体消除培养基的污染。根据该实施方案的一些方面，所述第一微生物有机体进行光合作用，并且所述光合作用包含包含在所述培养基的底物。根据该实施方案的一些方面，所述第二环境与所述第一环境通过可透过两种或更多种不同的细菌素而不可透过第二微生物有机体的下述中的至少一种分离：膜、网、过滤器或者瓣膜。根据该实施方案的一些方面，所述第二微生物有机体分泌至少3种细菌素，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、 18、19或20种细菌素。根据该实施方案的一些方面，所述第二环境包含不同于所述第二微生物有机体且也分泌细菌素的至少第三微生物有机体。根据该实施方案的一些方面，所述第三微生物有机体分泌至少2种细菌素，例如至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19或20种细菌素。本文公开的另一实施方案包括储存给料的方法。所述方法可以包括提供给料，提供第一微生物有机体，将所述给料与所述细菌素接触，以及将所述给料储存所需的时间段，其中所述第一微生物有机体分泌两种或更多种不同的细菌素。根据该实施方案的一些方面，将给料与细菌素接触包括将给料与微生物有机体接触。根据该实施方案的一些方面，将给料与细菌素接触包括将微生物有机体置于与所述给料的流体连通中，同时维持微生物有机体与给料的物理性分离，以使细菌素与给料接触，但所述微生物有机体不与给料直接接触。根据该实施方案的一些方面，通过可透过两种或更多种不同的细菌素而不可透过第一微生物有机体的下述中的至少一种或多种维持分离：膜、网、过滤器或者两种或更多种不同的细菌素可透过而第一微生物有机体不可透过的瓣膜。根据该实施方案的一些方面，所述方法还包括在将给料与细菌素接触之前或者同时，用第二微生物有机体发酵给料。根据该实施方案的一些方面，所述发酵包括在给料中产生期望的组分或者从给料中移除非期望的组分中的至少一项。根据该实施方案的一些方面，所述所需的时间包括至少1个月，例如至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、 11或12个月。根据该实施方案的一些方面，所述所需的时间包括至少6 个月，例如6、7、8、9、10、11或12个月。根据该实施方案的一些方面，所述第一微生物有机体分泌至少3种细菌素，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20种细菌素。
附图简要说明
图1为描述根据本文的一些实施方案，配置微生物细胞以控制第二微生物细胞生长的选项的流程图。
图2A为阐明根据本文的一些实施方案，第一微生物细胞控制其它微生物细胞的生长的示意图。图2B为阐明根据本文的一些实施方案，当第一微生物细胞不再处于期望的生长环境时，控制第一微生物细胞的生长的示意图。
图3为阐明根据本文的一些实施方案，第一微生物细胞控制第二微生物细胞的生长并中和期望的环境中的入侵细胞的示意图。
图4为阐明根据本文的一些实施方案，在期望的环境中，第一微生物细胞用第一抗菌素中和第一入侵细胞并用第二细菌素中和第二入侵细胞的示意图。
图5为阐明根据本文的一些实施方案，控制培养物中的至少第二微生物细胞生长的方法的流程图。
图6为阐明根据本文的一些实施方案的包含遗传防护者的系统的示意图。
图7为阐明根据本文的一些实施方案的可以用于光合生产的遗传防护系统的示意图。
图8为阐明根据本文的一些实施方案产生并利用细菌素的方法的流程图。
详细描述
根据本文的一些实施方案，提供了基因工程化的微生物有机体。在一些实施方案中，将微生物有机体工程化以控制环境中微生物群体(如利用给料的那些)的生长。如本文所使用的，细菌素的“中和”活性(和同一根词的变体)可以指微生物繁殖的阻止或细胞毒性。可将微生物有机体工程化以产生细菌素，所述细菌素是能够中和微生物的分泌的多肽。然而，产生细菌素免疫调节剂的微生物有机体能够抵抗某些细菌素。因此，在一些实施方案中，将第一微生物有机体进行工程化以分泌细菌素。在一些实施方案中，基于下述选择特定的细菌素：微生物细胞的类型、被调节的微生物细胞的类型、培养基的组成或者地理位置(例如，以靶向与特定类型的培养基和/或地理位置相关的特定污染性微生物有机体)。具有针对特定环境的期望特性的其它微生物有机体能够产生细菌素免疫调节剂 (因此在细菌素存在的情况下存活)，而非期望的其它微生物有机体(例如污染物、丧失了期望的特性的微生物有机体或者参与工业生产过程但是在主导条件下其生长或特定产物的生产是非期望的有机体)不能产生细菌素免疫调节剂，并因此被所述细菌素中和。
微生物有机体
根据一些方面，提供了基因工程化微生物。本文使用的基因工程化“微生物有机体”、“微生物”以及这些根词的变体(如其复数等)包含任何天然存在的物种或完全合成的原核或真核单细胞生物以及古菌物种的遗传修饰。因此，该表述可以指细菌物种、真菌物种以及藻类的细胞。
根据本文的实施方方案，可以使用的示例性微生物包括但不限于：细菌、酵母和藻类，例如光合微藻。此外，可以合成完全合成的微生物基因组，并将其移植进单个的微生物细胞内，从而产生能够连续自我复制的合成微生物(参见Gibson et al.(2010),“Creationof a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome,”Science329:52-56，在此以引用的方式将其整体并入)。由此，在一些实施方案中，微生物是完全合成的。可以在期望的框架上，将遗传组件(包括调节基因表达的组件和编码基因产物(例如细菌素、免疫调节剂、毒物、解毒剂以及工业上使用的分子)的组件)的期望组合组装进部分或完全合成的微生物中。用于工业应用的基因工程化微生物有机体的描述还可以在Wright,et al.(2013) “Building-in biosafety for synthetic biology”Microbiology159:1221-1235 中找到。
根据本文的实施方案，可以使用多种细菌菌种和菌株，以及可以提供遗传修饰的变体或基于已知菌种框架的合成的细菌。根据本文的实施方案，可以使用的具有工业应用特性的示例性的细菌包括但不限于：芽孢杆菌属菌种(例如凝结芽孢杆菌(Bacilluscoagulans)、枯草芽孢杆菌 (Bacillus subtilis)和地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis))、类芽孢杆菌属菌种、链霉菌属菌种、微球菌属菌种、棒状杆菌属菌种、醋杆菌属菌种、蓝藻属、沙门氏菌属菌种、红球菌属菌种、假单胞菌属菌种、乳杆菌属菌种、肠球菌属菌种、产碱菌属菌种、克雷伯氏菌属菌种,类芽孢杆菌属菌种、节杆菌属菌种、棒状杆菌属菌种、短杆菌属菌种、水生栖热菌 (Thermus aquaticus)、施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri)、热纤梭菌 (Clostridium thermocellus)以及大肠杆菌(Escherichia coli)。
根据本文的实施方案，可以使用多种酵母菌种和菌株，并且可以提供遗传修饰的变体或基于已知菌种框架的合成的酵母。根据本文的实施方案可以使用的具有工业应用特性的示例性的酵母包括但不限于：酵母属菌种(例如酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)、贝酵母(Saccharomyces bayanus)、鲍氏酵母菌(Saccharomycesboulardii))、假丝酵母属菌种(例如产朊假丝酵母(Candida utilis)、克鲁斯假丝酵母(Candida krusei))、裂殖酵母属菌种(例如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、日本裂殖酵母 (Schizosaccharomyces japonicas))、毕赤酵母属或汉逊酵母属菌种(例如毕赤酵母(Pichia pastoris)或多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha))以及酒香酵母属菌种(例如克劳森酒香酵母(Brettanomyces claussenii))。
根据本文的实施方案，可以使用多种藻类菌种和菌株，并且可以产生遗传修饰的变体或基于已知菌种框架合成的藻类。在一些实施方案中，所述藻类包括光合微藻。可以用于生物燃料并且根据本文的实施方案可以使用的示例性的藻类菌种包括：布朗葡萄藻(Botryococcus braunii)、小球藻属菌种、特氏杜氏藻(Dunaliella tertiolecta)、江蓠属菌种、颗石藻 (Pleurochrysis carterae)以及马尾藻属菌种。此外，许多藻类可以用于食物产品、肥料产品、废物中和、环境修复和碳水化合物的生产(例如，生物燃料)。
细菌素
本文使用的“细菌素”及该根词的变体指这样的多肽：其由宿主细胞分泌并且能够中和除产生所述多肽的个体宿主细胞之外的至少一种细胞，所述至少一种细胞包括与宿主细胞同源关联的细胞和其它微生物细胞。本文使用的“细菌素”还包含无细胞或化学合成形式的此种多肽。表达特定的“免疫调节剂”的细胞(本文更加详细地进行了讨论)对于特定细菌素或一类细菌素的中和作用是免疫的。由此，细菌素能够中和产生细菌素的细胞和/或其它微生物细胞，只要这些细胞不产生适当的免疫调节剂。由此，宿主细胞可以通过分泌细菌素而对多种其它微生物有机体发挥细胞毒性或生长抑制作用。在一些实施方案中，微生物细胞通过翻译机构(例如核糖体等)产生细菌素。在一些实施方案中，通过化学方法合成细菌素。一些细菌素可以来源于多肽前体。所述多肽前体可以经历剪切(例如蛋白酶处理)以获得细菌素自身多肽。由此，在一些实施方案中，细菌素由前体多肽产生。在一些实施方案中，细菌素包含经历翻译后修饰(例如剪切或添加一个或多个官能团)的多肽。
“抗生素”及该根词的变体指能够杀死至少一种微生物细胞或者阻止至少一种微生物细胞的生长的代谢途径的代谢物或中间体。一些抗生素可由微生物细胞产生，例如细菌。一些抗生素可以化学合成。应当理解，细菌素与抗生素的区别至少在于细菌素指基因产物(在一些实施方案中，其经历另外的翻译后加工)或其合成类似物，而抗生素指代谢途径的中间体或产物或者其合成的类似物。
细菌素的中和活性可以包括阻止微生物繁殖或细胞毒性。一些细菌素具有细胞毒活性(例如“杀菌剂”效应)，因此能够杀死微生物有机体，例如细菌、酵母、藻类、合成的微生物等。一些细菌素能够例如通过阻止细胞周期抑制微生物有机体的繁殖(例如“抑菌”效应)，例如细菌、酵母、藻类、合成的微生物等。
应当注意，已经提议将非细菌素方法靶向不同的微生物有机体。例如，已经提议将KAMORANTM化学制品靶向乳酸菌(LAB)家族的细菌(参见Union Nationale des Groupementsde Distillateurs D’Alcool,(2005) “Kamoran”)。应当注意，还提议将噬菌体靶向LAB家族的细菌(参见美国公开号2010/0330041)。应当注意，已经提议将杀虫剂靶向不同的污染性微生物有机体(参见McBride et al.,“Contamination Management in Low Cost OpenAlgae Ponds for Biofuels Production”Industrial Biotechnology 10: 221-227(2014))。然而，相对于化学制品、杀虫剂或噬菌体，细菌素可以提供多种优势。例如，细菌素可以避免给料中可能的毒性径流或副产品。例如，针对特定非期望的微生物有机体，细菌素可以具有比噬菌体、化学制品或杀虫剂更高的效力。例如，细菌素可以由经历对数生长的微生物有机体产生，因此能够容易地按比例增加或按比例降低，而噬菌体或化学制品/杀虫剂系统的增减性更加受限。例如，细菌素可以允许精确控制哪些有机体被中和，哪些不被中和，例如以避免培养基中的工业上可用的微生物有机体的中和。例如，噬菌体难于以工业规模生产，并且也难于控制，因为噬菌体具有传染性，能够引起基因调控的问题，以及因为噬菌体的保存很难。另一方面，根据本文的一些实施方案的细菌素可以组成工业过程的一部分，因此能够参与基因遏制和/或通过抑菌活性控制发酵过程。此外，可以通过免疫控制调整参与工业过程的微生物有机体的敏感性。此外，对于工业应用(如人或动物食品)而言，细菌素通常具有低水平的毒性，并且考虑根据本文的一些实施方案的细菌素适合用作食品防腐剂，如添加剂。
在一些实施方案中，基于期望的微生物调节的类型选择具体的中和活性(例如细胞毒性或阻止微生物繁殖)。由此，在一些实施方案中，将微生物细胞工程化以表达特定的细菌素或细菌素的组合。例如，在一些实施方案中，基于被调节的细胞，将微生物细胞工程化以表达特定的细菌素。在一些实施方案中，例如如果要杀死污染性细胞，则提供至少一种细胞毒性细菌素。在一些实施方案中，选择这样的细菌素或细菌素的组合：其对于通常存在于特定的培养物中或特定的地理位置，或者生长于特定的地理位置的特定类型的培养物中的污染物是有效的。在一些实施方案中，例如在其中微生物细胞比例的可逆调节是期望的实施方案中，提供抑制微生物繁殖的细菌素。在不受任何具体的理论限制的情况下，许多细菌素可以具有针对微生物有机体的中和活性，所述微生物有机体通常占据与产生所述细菌素的物种相同的生态位。由此，在一些实施方案中，当期望特定的细菌素活性范围时，从与所述细菌素靶向的一种或多种微生物有机体占据相同(或类似)的生态位的宿主物种中选择细菌素。
在一些实施方案中，在培养生长之前选择一种或多种细菌素活性，并且将一种或多种微生物有机体工程化以产生期望的培养环境。在一些实施方案中，可以基于它们中和可能试图在特定的培养物中生长的一种或多种入侵生物的能力来选择细菌素。在另一实施方案中，在菌株A产生中间体A，且菌株B将中间体A转化为中间体B的工业环境中，可将菌株A和B工程化，从而使得大量的中间体A通过产生使菌株A的生长在这些条件下被抑制或阻止的细菌素活性特性而将平衡移向利于菌株 B，而缺乏中间体A则将通过产生使菌株B的生长被抑制或阻止的细菌素活性特性将平衡移向利于菌株A。在一些实施方案中，基于现有的培养环境的一项或多项条件选择一种或多种细菌素活性。例如，如果在培养环境中鉴定出特定的入侵物，则可将“中和剂”微生物工程化以产生细菌素，从而中和鉴定的入侵物。在一些实施方案中，例如如果微生物细胞培养物中特定微生物细胞类型的生长太高，向现有的培养物中添加产生细菌素的基因工程细胞以使培养物重新平衡。在一些实施方案中，向现有的培养物中添加产生细菌素的基因工程细胞以中和培养物中的全部或基本全部微生物细胞，例如以消除培养环境中的工业培养物，从而可向培养环境中引入新的工业培养物。
例如，在一些实施方案中，抗真菌活性(如抗酵母活性)是期望的。已经鉴定了多种具有抗真菌活性的细菌素。例如，来自芽孢杆菌属的细菌素已经显示具有针对酵母菌株的中和活性(参见Adetunji and Olaoye (2013)Malaysian Journal of Microbiology 9:130-13，在此以引用的方式将其整体并入)，粪肠球菌(Enterococcus faecalis)肽(WLPPAGLLGRCGRWFRPWLLWLQ SGAQY KWLGNLFGLGPK,SEQ ID NO:1)已经显示具有针对假丝酵母菌种的中和活性(参见Shekh and Roy(2012)BMC Microbiology 12:132，在此以引用的方式将其整体并入)，以及来自假单胞菌属的细菌素已经显示具有针对如下述真菌的中和活性：新月弯孢(Curvularia lunata)、镰刀菌属(Fusarium)菌种、长蠕孢霉属(Helminthosporium)菌种以及双极霉属(Biopolaris)菌种(Shalani and Srivastava(2008)The Internet Journal of Microbiology.Volume 5 Number 2.DOI:10.5580/27dd–可在万维网 archive.ispub.com/journal/the-internet-journal-of-microbiology/volume-5-n umber-2/screening-for-antifungal-activity-of-pseudomonas-fluorescens-aga inst-phytopathogenic-fungi.html#sthash.d0Ys03UO.1DKuT1US.dpuf获得，在此以引用的方式将其整体并入)。以示例的方式，来自枯草芽孢杆菌的杀葡孢菌素AJ1316(参见Zuber,P et al.(1993)PeptideAntibiotics. In Bacillus subtilis and Other Gram-Positive Bacteria:Biochemistry, Physiology,and Molecular Genetics ed Sonenshein et al.,pp.897-916, American Society for Microbiology，在此以引用的方式将其整体并入) 和alirinB1(参见Shenin et al.(1995)Antibiot Khimioter 50:3-7，在此以引用的方式将其整体并入)已经显示具有抗真菌活性。由此，在一些实施方案中，例如在其中中和真菌微生物有机体是期望的实施方案中，细菌素包括杀葡孢菌素AJ1316或alirin B1中的至少一种。
例如，在一些实施方案中，蓝细菌培养物中的细菌素活性是理想的。在一些实施方案中，提供细菌素以中和蓝细菌。在一些实施方案中，提供细菌素以中和通常在蓝细菌培养环境中发现的入侵的微生物有机体。已经在多种蓝细菌菌种中鉴定了保守的细菌素多肽簇。例如，如Wang et al.(2011),Genome Mining Demonstrates the WidespreadOccurrence of Gene Clusters Encoding Bacteriocins in Cyanobacteria.PLoS ONE 6(7): e22384中所报道的(在此以引用的方式将其整体并入)，已经在至少43 种蓝细菌菌种中鉴定了至少145种推定的细菌素基因簇。示例性的蓝细菌细菌素显示于表1.2中，如SEQID NO 420、422、424、426、428、 30、432、434、436、438、440、442、444、446、448以及450。
在一些实施方案中，宿主细胞自身为微生物细胞。在一些实施方案中，细菌素中和不同于宿主细胞的菌种或菌株的细胞。在一些实施方案中，如果与宿主细胞相同的菌种或菌株的细胞缺乏合适的免疫调节剂，则细菌素中和这些细胞。由于细菌素能够介导宿主微生物有机体和非宿主微生物有机体这两种有机体的中和，技术人员将容易地理解细菌素不同于涉及宿主微生物仅可中和自身的内源性机制的毒物-解毒剂系统(本文更加详细地进行了描述)。换言之，细菌素能够中和除其产生细胞之外的细胞(例如，细菌素可被选择和/或工程化以作为生态位保护者发挥作用)，而毒物分子仅杀死产生它们的个体细胞(例如，作为自杀系统发挥作用)。
已经鉴定并表征了多种细菌素。在不受任何具体理论限制的情况下，可将示例性的细菌素分类为通常经历翻译后修饰的“I类”细菌素，和通常未修饰的“II类”细菌素。此外，各类中的示例性细菌素可以被分类为各种亚群，如表1.1中所总结的，其源自Cotter,P.D.et al.“Bacteriocins-a viable alternative to antibiotics”Nature ReviewsMicrobiology 11:95-105，在此以引用的方式将其整体并入。
在不受任何具体理论限制的情况下，细菌素可以以多种方式影响靶标微生物细胞的中和。例如，细菌素可以将细胞壁通透，因而将细胞壁去极化并干扰呼吸。
表1.1：示例性细菌素的分类
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根据本文的实施方案，可以使用多种细菌素。示例性的细菌素显示于表1.2中。在一些实施方案中，提供了包含表1.2的多肽序列的至少一种细菌素。如表1.2中所示，一些细菌素作为分子对发挥功能。由此，应当理解，除非另外明确声明，当本文讨论功能性的“细菌素”或“提供细菌素”等时，包括功能性的细菌素对以及单独发挥功能的细菌素。关于表1.2，括号中列出的“来源有机体”指示已知产生标明的细菌素的有机体的别称和/或菌株信息。
本文的实施方案还包括与表1.2中所述的细菌素具有同一性的肽和蛋白。术语“同一性””意为包括核酸或蛋白序列同源性或三维同源性。存在一些确定核酸或多肽序列同源性和/或与多肽的三维同源性的技术。这些方法被常规使用以发现一条序列、结构域或模型具有的与靶序列、结构域或模型的同一性程度。大范围的功能性细菌素可以包含本文公开的细菌素的特征，因而提供了与表1.2中的细菌素的很大程度的同一性。在一些实施方案中，细菌素与表1.2中的任何一种多肽具有至少约50％的同一性，例如，至少约50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、 57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、 68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、 79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、 90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的同一性。可以利用BLAST软件(Altschul,S.F.,et al.(1990)"Basic local alignment search tool."J.Mol.Biol.215:403-410，可在万维网blast.ncbi.nlm.nih.gov获得)和缺省参数来确定同一性百分比。
在一些实施方案中，提供了编码如本文所述的细菌素的多核苷酸。在一些实施方案中，所述多核苷酸包含于表达载体中。在一些实施方案中，所述多核苷酸或表达载体在微生物细胞内。编码表1.2中的多肽的示例性的多核苷酸序列显示于1.2中。SEQ ID NO：341至419(奇数序列标识号)代表基于各自多肽的逆向翻译的示例性多核苷酸。技术人员将会容易地理解，多种多核苷酸可以编码特定的多肽。例如，遗传密码简并，此外密码子的使用也可以根据其中基因产物被表达的特定有机体发生变化。在一些实施方案中，基于表达细菌素的有机体的密码子的使用来选择编码细菌素的多核苷酸。在一些实施方案中，编码细菌素的多核苷酸为基于表达所述细菌素的特定的有机体进行优化的密码子。
尽管表1.2中的细菌素是天然存在的，但是技术人员会理解，根据本文的一些实施方案可以使用表1.2中的细菌素的变体、除表1.2中的细菌素之外的天然存在的细菌素或其变体，或者合成的细菌素。在一些实施方案中，此类变体相对于野生型蛋白对相同或不同的微生物或微生物物种具有增加的或降低的细胞毒性或生长抑制活性水平。一些基序被认为是细菌素的特征。例如，基序YGXGV(SEQ ID NO:2)是IIa类细菌素特有的N-端共有序列，其中X是任意氨基酸残基。因此，在一些实施方案中，合成的细菌素包含与SEQ ID NO:2具有至少50％的同一性的N-端序列，例如与SEQ ID NO:2具有至少约50％、51％、52％、53％、54％、55％、 56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、 67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、 78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、 89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的同一性。在一些实施方案中，合成的细菌素含有包含SEQ ID NO: 2的N-端序列。此外，一些IIb类细菌素含有GxxxG基序。在不受任何具体理论限制的情况下，GxxxG基序被认为能够介导细胞膜中螺旋蛋白之间的关联，例如通过细胞膜相互作用促进细菌素介导的中和作用。由此，在一些实施方案中，细菌素含有促进与细胞膜的相互作用的基序。在一些实施方案中，细菌素含有GxxxG基序。任选地，含有GxxxG基序的细菌素可以包含螺旋结构。除本文所述的结构外，本文使用的“细菌素”还包含对微生物细胞具有与本文明确提供的任何细菌素基本相同的作用的结构。
已经显示，与任一单独的细菌素相比，含有两种或更多种细菌素或其部分的融合多肽可以具有针对更宽范围的微生物有机体的中和活性。例如，已经显示杂种细菌素Ent35–MccV (GKYYGNGVSCNKKGCSVDWGRAIGIIGNNSAANLATGGAAGWKSG GGASGRDIAMAIGTLSGQFVAGGIGAAAGGVAGGAIYDYASTHKPNP AMSPSGLGGTIKQKPEGIPSEAWNYAAGRLCNWSPNNLSDVCL，SEQID NO:3)显示出针对病原性革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌的抗微生物活性(
Figure BDA0002206189660000161
et al.(2012),FEBS Open Bio,2:12-19)。应当注意，该 Ent35-MccV融合细菌素从N-端至C-端包含N-端甘氨酸、肠道菌素 CRL35、含有三个甘氨酸的连接子以及C-端小菌素V。本文考虑包含具有细菌素活性的两种或更多种多肽的融合的细菌素。在一些实施方案中，提供了两种或更多种细菌素的融合多肽。在一些实施方案中，所述两种或更多种细菌素包含来自表1.2的多肽或其修饰。在一些实施方案中，包含两种或更多种细菌素的融合多肽比任一种单独的细菌素具有更宽范围的活性，例如具有针对更多微生物有机体的中和活性、更宽范围的环境条件下的中和活性，和/或更高效的中和活性。在一些实施方案中，提供了两种或更多种细菌素的融合物，例如2、3、4、5、6、7、8、9或10 种细菌素。在一些实施方案中，将两种或更多种细菌素多肽通过共价键(例如肽键)互相融合。在一些实施方案中，连接子位于两种细菌素多肽之间。在一些实施方案中，连接子包含一个或多个甘氨酸，例如约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个甘氨酸。在一些实施方案中，连接子在细胞内被剪切以产生融合蛋白中含有的单独的细菌素。在一些实施方案中，将本文提供的细菌素修饰以提供相对于未修饰的细菌素的期望的活性谱。例如，修饰的细菌素可以具有与未修饰的细菌素相同的针对有机体的增强或降低的活性。可选地，修饰的细菌素可以具有针对有机体的增强的活性，其中未修饰的细菌素对所述有机体具有较低活性或无活性。
表1.2：示例性细菌素
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本文使用的“细菌素多核苷酸”指编码细菌素的多核苷酸。在一些实施方案中，宿主细胞含有至少一种细菌素。
细菌素免疫调节剂
示例性的细菌素免疫调节剂显示于表2中。尽管表2中的免疫调节剂是天然存在的，技术人员会理解，根据本文的一些实施方案可以使用表2中的免疫调节剂的变体、除表2中的免疫调节剂之外的天然存在的免疫调节剂或者合成的免疫调节剂。
在一些实施方案中，特定的免疫调节剂或免疫调节剂的特定组合赋予针对特定的细菌素、细菌素的特定种类或分类或者细菌素的特定组合的免疫性。表2中鉴定了免疫调节剂能够赋予针对其的免疫性的示例性细菌素。尽管表2鉴定了示例性免疫调节剂的“来源有机体”，但是根据本文的一些实施方案，这些免疫调节剂可以在其它天然存在的微生物、遗传修饰的微生物或合成的微生物中容易地表达，从而提供期望的细菌素免疫活性。由此，本文使用的“免疫调节剂”不仅指本文明确提供的结构，还指与本文所述的“免疫调节剂”结构具有基本相同的作用的结构，包括完全合成的免疫调节剂，以及提供针对与本文公开的细菌素功能等同的细菌素的免疫性的免疫调节剂。
编码表2中的多肽的示例性的多核苷酸序列显示于表2中。技术人员会容易地理解，遗传密码是简并的，此外密码子的使用可以根据其中基因产物被表达的特定有机体而改变，由此，特定的多肽可以由多种多核苷酸编码。在一些实施方案中，基于表达细菌素免疫调节剂的有机体的密码子的使用来选择编码细菌素免疫调节剂的多核苷酸。在一些实施方案中，根据表达细菌素免疫调节剂的特定有机体对编码细菌素免疫调节剂的多核苷酸的密码子进行优化。大范围的功能性免疫调节剂可以包含本文所述的免疫调节剂的特征，因而提供与表2中的免疫调节剂很大程度的同一性。在一些实施方案中，免疫调节剂与表2中的任何一种多肽具有至少约50％的同一性，例如至少约50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、 66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、 77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、 88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的同一性。
表2：示例性细菌素免疫调节剂
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毒物-解毒剂系统
在期望的环境中牵制特定的微生物细胞是理想的，例如通过杀死微生物细胞或阻止微生物细胞的生长，如果其不再处于期望的环境中。可以将不同于细菌素的毒物-解毒剂系统用于实现此类牵制，或者用于微生物细胞的其它选择性生长。示例性的毒物解毒剂系统描述于美国专利号 5,910,438、6,180,407、7,176,029和7,183,097中，在此将其各自以引用的方式整体并入。在一些实施方案中，毒物-解毒剂系统包含细胞毒性(毒物) 多肽以及单个细胞中相应的抗毒素(解毒剂)多肽。本文使用的“毒物多核苷酸”指编码毒物多肽的多核苷酸，以及“解毒剂多核苷酸”指编码解毒剂多肽的多核苷酸。
在一些实施方案中，毒物多肽被组成型表达，而解毒剂多肽仅在期望的条件下表达。在一些实施方案中，毒物多肽仅在期望的条件下表达，而解毒剂多肽仅在期望的条件下表达。例如，在一些实施方案中，配置毒物/解毒剂系统，以使微生物细胞在期望的环境条件下存活，而在非期望的环境条件下死亡。例如，在一些实施方案中，配置毒物解毒剂系统，从而如果微生物细胞从应用其的工业过程的环境逃逸，则杀死微生物细胞。在其它实施方案中，配置毒物解毒剂，从而使微生物细胞当存在编码解毒剂多肽的载体(例如质粒)时存活，而当所述载体不存在时死亡。在一些实施方案中，毒物多肽由宿主基因组中的毒物多核苷酸编码，而解毒剂多肽由载体(如质粒或染色体外阵列或附加体或微型染色体)上的解毒剂多核苷酸编码，由此，所述解毒剂多肽仅在宿主细胞中存在所述载体的情况下表达。在一些实施方案中，毒物多肽由第一载体上的毒物多核苷酸编码，而解毒剂多肽由第二载体上的解毒剂多核苷酸编码，由此所述解毒剂多肽仅在存在所述第二载体时表达。在一些实施方案中，解毒剂多核苷酸的存在(由此存在解毒剂多肽)取决于重组事件的存在或不存在，例如编码解毒剂多核苷酸的多核苷酸序列整合进宿主基因组。应当理解，在解毒剂多肽的表达依赖于载体或重组事件的存在或不存在的一些实施方案中，毒物和解毒剂多肽各自都可以组成型表达。任选地，在解毒剂多肽的表达依赖于载体或重组事件的存在或不存在的一些实施方案中，毒物多肽和/或解毒剂多肽的表达是条件性的，例如以使毒物仅在不需要微生物细胞的条件下表达，和/或解毒剂多肽仅在需要微生物细胞的条件下表达。
结合本文的一些实施方案，可以用于毒物解毒剂系统的示例性的微生物毒素多肽/抗毒素多肽对(也被称为“毒物/解毒剂”对)包括但不限于： RelE/RelB、CcdB/CcdA、Kis/Kid、SoK/HoK、PasB(或PasC)/PasA、 PemK/PemI、Doc/Phd、MazE/MazF以及ParE/ParD。在不受任何具体理论限制的情况下，许多毒物多肽(例如RelE)在革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌以及古细菌中是高度保守的，由此，其可以在广泛的天然存在的微生物细胞、遗传修饰的微生物细胞以及完全合成的微生物细胞中具有细胞毒活性。此外，在不受任何具体理论限制的情况下，考虑解毒剂多肽通常能够在多种宿主环境中抑制其毒物多肽伴侣的活性，由此，能够容易地将毒物/解毒剂对(如本文描述的那些)用于广泛的天然存在的微生物细胞、遗传修饰的微生物细胞以及完全合成的微生物细胞中。
应当注意，毒物-解毒剂系统与细菌素系统的区别至少在于毒物-解毒剂系统提供了微生物细胞能够杀死或阻止自身的内源性系统，而细菌素系统提供了微生物细胞能够杀死或阻止其它细胞的外源性系统。然而还注意到，尽管毒物-解毒剂系统不能用于杀死或阻止除其中毒物被产生的单独细胞之外的细胞，但是在一些实施方案中，可以将毒物-解毒剂系统与如本文所述的细菌素系统一同使用。例如，在一些实施方案中，可将如本文所述的细菌素系统用于杀死培养物中除细菌素产生细胞之外的细胞或阻止其生长，而可将毒物-解毒剂系统用于杀死细菌素产生细胞或阻止其生长，如果所述细胞从其期望环境中逃逸的话。还可将毒物-解毒剂系统用于筛选已被基因工程化以表达可用于工业过程的分子(“工业上可用的分子”)的细菌素产生细胞。例如，在一些实施方案中，可通过将编码细菌素和工业上可用的分子的多核苷酸或者编码细菌素和解毒剂的多核苷酸置于单个启动子的控制之下，而将解毒剂的表达与工业上可用的分子或细菌素的表达绑定。因此，在一些实施方案中，编码细菌素或细菌素免疫调节剂的微生物细胞还包含毒物解毒剂系统。在一些实施方案中，细菌素系统可用于调节微生物细胞或特定环境中的其它微生物细胞的生长，而毒物-解毒剂系统可用于牵制特定环境中的微生物细胞。
启动子
启动子在本领域是众所周知的。启动子可被用于驱动一个或多个基因的转录。在一些实施方案中，启动子驱动编码如本文所述的期望的基因产物的多核苷酸的表达。在一些实施方案中，启动子驱动如本文所述的细菌素多核苷酸的表达。在一些实施方案中，启动子驱动如本文所述的免疫调节剂多核苷酸的表达。在一些实施方案中，启动子驱动细菌素核苷酸和免疫调节剂多核苷酸的表达。在一些实施方案中，启动子驱动编码下述中的至少一种的多核苷酸的表达：细菌素、免疫调节剂、工业上可用的分子、毒物分子或解毒剂分子。一些启动子在任何时间都能够驱动转录(“组成型启动子”)。一些启动子仅在选择的情况下驱动转录(“条件性启动子”)，例如依赖于环境条件、化合物、基因产物、细胞周期的阶段等的存在或不存在。
技术人员会理解，可以根据期望的表达活性选择合适的启动子，并将其顺式置于待表达的序列内。本文的表3.1-3.11中提供了具有示例性活性的示例性启动子。技术人员会理解，一些启动子可与特定的转录机构(例如RNA聚合酶、通用转录因子等)兼容。由此，尽管鉴定了对于本文所述的一些启动子可兼容的“物种”，考虑根据本文的一些实施方案，这些启动子能够在除所鉴定的物种之外的微生物中容易地发挥功能，例如在具有兼容的内源性转录机构的物种、包含兼容的转录机构遗传修饰的物种或者包含兼容的转录机构的完全合成的微生物有机体。
本文表3.1-3.11中的启动子可从生物砖基金会公开获得。根据生物砖基金会，鼓励按照BioBrickTM公共协议(BPA)使用这些启动子。
应当理解，任何本文所述的“编码”多核苷酸(例如细菌素多核苷酸、免疫多核苷酸、毒物多核苷酸、解毒剂多核苷酸或产物多核苷酸)通常可在期望的启动子的控制下表达。在一些实施方案中，单个“编码”多核苷酸受单个启动子的控制。在一些实施方案中，两个或更多个“编码”多核苷酸受单个启动子的控制，例如2、3、4、5、6、7、8、9或10个多核苷酸。由此，在一些实施方案中，不同细菌素的“混合物”可由单个微生物有机体产生。在一些实施方案中，细菌素多核苷酸受启动子的控制。在一些实施方案中，免疫调节剂受启动子的控制。在一些实施方案中，编码期望的基因产物的多核苷酸受启动子的控制。在一些实施方案中，细菌素多核苷酸和编码期望的基因产物的多核苷酸受相同启动子的控制。在一些实施方案中，细菌素多核苷酸和编码期望的基因产物的多核苷酸受不同的启动子的控制。在一些实施方案中，免疫调节剂多核苷酸和编码期望的基因产物的多核苷酸受相同启动子的控制。在一些实施方案中，细菌素多核苷酸和免疫调节剂多核苷酸受不同的启动子的控制。
通常，特定转录本的翻译起始受位于转录本编码序列的5’端的特定序列的调节。例如，编码序列可从配置以与起始tRNA配对的起始密码子开始。尽管天然存在的翻译系统通常使用Met(AUG)作为起始密码子，但是将会容易地理解，可将起始tRNA工程化以与任何期望的一个或多个三联体结合，因此在某些实施方案中，除AUG之外的三联体也可作为起始密码子发挥功能。此外，邻近起始密码子的序列能够促进核糖体的组装，例如典型的真核生物翻译系统中的Kozak序列((gcc)gccRccAUGG, SEQ ID NO:542，其中R代表“A”或“G”)或者内部核糖体进入位点(IRES)，或者典型的原核生物翻译系统中的Shine-Delgarno序列(GGAGGU,SEQ ID NO:543)。由此，在一些实施方案中，含有“编码多核苷酸序列，例如细菌素多核苷酸或免疫调节剂多核苷酸或者编码期望的工业产物的多核苷酸的转录本包含起始密码子和翻译起始序列。在一些实施方案中，例如如果两条或更多条“编码”多核苷酸序列顺式位于转录本上，则各多核苷酸序列包含合适的起始密码子和翻译起始序列。在一些实施方案中，例如如果两条或更多条“编码”多核苷酸序列顺式位于转录本上，则所述两条序列受单个翻译起始序列的控制，并且提供可以与两条顺式编码的多肽都发挥功能的单条多肽，或者提供用于分离两条顺式编码的多肽的手段，例如2A序列等。在一些实施方案中，翻译起始tRNA是可调节的，从而调节细菌素、免疫调节剂、毒物分子、解毒剂分子或工业上可用的分子的翻译的起始。
表3.1：示例性的金属敏感性启动子
Figure BDA0002206189660001431
表3.2：示例性的细胞信号响应性启动子
Figure BDA0002206189660001432
Figure BDA0002206189660001441
表3.3:示例性的组成型大肠杆菌σ70启动子
Figure BDA0002206189660001442
Figure BDA0002206189660001451
Figure BDA0002206189660001461
表3.4：示例性的组成型大肠杆菌σs启动子
Figure BDA0002206189660001462
表3.5：示例性的组成型大肠杆菌σ32启动子
Figure BDA0002206189660001471
表3.6：示例性的组成型枯草芽孢杆菌σA启动子
Figure BDA0002206189660001472
表3.7：示例性的组成型枯草芽孢杆菌σB启动子
Figure BDA0002206189660001473
表3.8：来自其它原核生物的示例性的组成型启动子
Figure BDA0002206189660001474
表3.9：来自噬菌体T7的示例性的组成型启动子
Figure BDA0002206189660001481
表3.10：来自酵母的示例性的组成型启动子
Figure BDA0002206189660001482
表3.11：来自其它真核生物的示例性的组成型启动子
Figure BDA0002206189660001491
上文提及的启动子仅以非限制性实例的方式提供。技术人员会容易地想到，根据本文的一些实施方案，可以容易地使用上述提及的启动子的多种变体以及多种其它启动子(包括从天然存在的有机体中分离的启动子、其变体以及完全合成的启动子)。
基因活性的调节
可以调节基因活性以增加或降低基因产物的活性。在一些实施方案中，其活性被调节的基因产物包括细菌素、免疫调节剂、工业上可用的分子、毒物分子或解毒剂分子。在一些实施方案中，此类基因产物中的两种或更多种受单基因调节系统的调节。在一些实施方案中，在基因表达水平调节基因活性。在一些实施方案中，在转录水平调节基因活性，例如通过激活或抑制启动子。在一些实施方案中，在转录后水平调节基因活性，例如通过调节RNA的稳定性。在一些实施方案中，在翻译水平调节基因活性，例如通过调节翻译的起始。在一些实施方案中，在翻译后水平调节基因活性，例如通过调节多肽的稳定性、对多肽进行翻译后修饰或者将所述多肽与抑制剂结合。
在一些实施方案中，基因活性增强。在一些实施方案中，增强细菌素、免疫调节剂、工业上可用的分子、毒物分子或解毒剂分子中至少一种的活性。从概念上讲，可以通过直接激活基因活性或者通过降低基因活性的抑制剂的活性而增强基因活性。在一些实施方案中，通过下述中的至少一种激活基因活性：诱导启动子活性，抑制转录阻遏子，增强RNA 稳定性，抑制转录后抑制剂(例如，抑制核酶或反义寡核苷酸)，诱导翻译 (例如，通过可调节的tRNA)，进行期望的翻译后修饰，或抑制翻译后抑制剂(例如靶向所述基因编码的多肽的蛋白酶)。在一些实施方案中，存在于期望的环境中的混合物诱导启动子。例如，培养基中铁的存在能够通过如本文所述的铁敏感性启动子诱导转录。在一些实施方案中，存在于期望的培养基中的化合物抑制转录阻遏子。例如，环境中四环素的存在能够抑制tet阻遏子，因而允许来自tetO启动子的活性。在一些实施方案中，仅在期望的培养基外发现的化合物诱导转录。
在一些实施方案中，降低基因活性。从概念上将，可以通过直接抑制基因活性或通过降低基因活性的激活子的活性来降低基因活性。在一些实施方案中，基因活性降低，但是仍保留某些水平的活性。在一些实施方案中，基因活性被完全抑制。在一些实施方案中，通过下述中的至少一种降低基因活性：抑制启动子活性，激活转录阻遏子，激活，降低 RNA稳定性，激活转录后抑制因子(例如，表达核酶或反义寡核苷酸)，抑制翻译(例如，通过可调节的tRNA)，未能进行需要的翻译后修饰，使多肽失活(例如通过结合抑制剂或者通过多肽特异的蛋白酶)，或者未能正确地定位多肽(例如未能分泌细菌素)。在一些实施方案中，通过移除来自期望位点的基因来降低基因活性，例如通过利用FLP-FRT或cre-lox盒切割基因或者通过质粒丢失或降解。在一些实施方案中，基因产物(例如多肽)或由基因产物产生的产物(例如酶反应的产物)抑制另外的基因活性(例如负反馈环)。
微生物有机体的遗传修饰
对微生物进行遗传修饰的技术在本领域是众所周知的。在一些实施方案中，对微生物进行遗传修饰，从而使其包含调节细菌素、免疫调节剂、工业上可用的分子、毒物分子或解毒剂分子中至少一种的表达并编码其中的至少一种的核酸序列。多核苷酸可被递送至微生物，并能够稳定整合进这些微生物的染色体内，或者能够游离于基因组而存在，例如在质粒、染色体外阵列、附加体、微型染色体等中存在。
微生物细胞遗传修饰的示例性载体包括但不限于：质粒、病毒(包括噬菌体)和转座子元件。此外，将会理解，可以在细胞中合成并组装包含期望序列的整个微生物基因组(参见，例如Gibson et al.(2010),Science 329: 52-56)。由此，在一些实施方案中，合成具有期望特征(如细菌素多核苷酸)的微生物基因组(或其部分)，并引入微生物细胞内。
对微生物细胞灵活地进行基因修饰可以是有用的，例如以将微生物细胞工程化或再工程化，从而使之具有期望的细菌素或者免疫调节剂活性类型和/或活性谱。在一些实施方案中，提供用于将一种或多种期望的细菌素和/或免疫调节剂多核苷酸插入多核苷酸序列内的盒。示例性的盒包括但不限于：Cre/lox盒或FLP/FRT盒。在一些实施方案中，所述盒位于质粒，以使具有期望的细菌素和/或免疫调节剂组合的质粒能够容易地导入微生物细胞内。在一些实施方案中，所述盒位于微生物细胞基因组内，以使具有期望的细菌素和/或免疫调节剂组合的盒能够导入期望的位点。
在一些实施方案中，可将质粒接合用于将来自“供体”微生物细胞的期望的质粒导入至受体微生物细胞内。
Figure BDA0002206189660001511
et al.(2013) Multicellular Computing UsingConjugation for Wiring.PLoS ONE 8(6): e65986，在此以引用的方式将其整体并入。在一些实施方案中，质粒接合可以通过将来自供体微生物细胞的接合质粒导入受体微生物细胞内而对受体微生物细胞进行遗传修饰。在不受任何具体理论限制的情况下，含有一组相同或功能相同的复制基因的接合质粒通常不能在同一微生物细胞中共存。由此，在一些实施方案中，质粒接合通过引入新的接合质粒以取代受体细胞中存在的另一接合质粒而将受体微生物细胞“重编程”。在一些实施方案中，使用质粒接合以将具有一种或多种细菌素和/或免疫调节剂的特定组合的微生物细胞工程化(或再工程化)。根据一些实施方案，提供含有细菌素和/或免疫调节剂的不同组合的多种接合质粒。质粒可以包含如本文所述的其它遗传组件，例如启动子、翻译起始位点等。在一些实施方案中，在一批供体细胞中提供多种接合质粒，以使可以选择含有期望质粒的供体细胞用于质粒接合。在一些实施方案中，选择细菌素和/或免疫调节剂的特定组合，并将合适的供体细胞与目标微生物细胞连接，从而将含有所述组合的接合质粒导入受体细胞。在一些实施方案中，受体细胞是“新近工程化的”细胞，例如以被导入或用于起始培养。在一些实施方案中，受体细胞是“再工程化的细胞”，例如以将新的细菌素(以及任选地免疫调节剂)活性导入遭遇新类型的入侵细胞的存在的培养物中，和/或以培养物中不再需要的细菌素活性。
培养基
微生物培养环境可以包含多种培养基，例如给料。具体培养基的选自可以取决于期望的应用。培养基的条件不仅包括化学组成，还包括温度、光的量、pH、CO2水平等。
在一些实施方案中，向含有其它微生物和至少一种给料的培养基中添加如本文所述的基因工程微生物。在一些实施方案中，培养基包含诱导细菌素和/或免疫调节剂的活性或其表达的化合物。在一些实施方案中，培养基包含抑制细菌素和/或免疫调节剂的活性或其表达的化合物。在一些实施方案中，诱导细菌素活性的化合物存在于给料外，而非给料中。在一些实施方案中，抑制免疫调节剂活性的化合存在于给料外，而非给料中。
本文使用的术语“给料”从广义上来说包含例如在工业方法的背景下可被微生物有机体耗尽、发酵、纯化、改良或以其它方式加工的材料。由此，“给料”不限于食物或食物产品。本文使用的“给料”是一类培养基。因此本文使用的“培养基”包括但不限于给料。由此，本文不论何时提及“培养基”，给料也被明确考虑在内。
基因工程微生物细胞
在一些实施方案中，提供遗传修饰的微生物细胞。可将遗传修饰的微生物细胞配置为用于多种目的。在一些实施方案中，微生物细胞包含遗传修饰，以调节细菌素、免疫调节剂、工业上可用的分子、毒物分子或解毒剂分子中至少一种的表达。在一些实施方案中，微生物细胞包含遗传修饰，以调节细菌素的表达。在一些实施方案中，微生物细胞包含遗传修饰，以调节免疫调节剂的表达。
在一些实施方案中，对遗传修饰的微生物细胞进行修饰以产生产物。在一些实施方案中，所述产物为基因产物，例如多肽或RNA。由此，本文提及的多核苷酸“编码”序列可以指编码多肽或RNA的序列。在一些实施方案中，微生物细胞可以被配置为产生有助于合成期望产物的一种或多种基因产物，例如碳水化合物、生物燃料、脂质、小分子或金属。在一些实施方案中，通过微生物细胞的一种或多种基因产物的活性合成产物。任选地，产物的合成还可涉及一种或多种其它微生物细胞的一种或多种基因产物的活性。在一些实施方案中，微生物细胞可以被配置为将培养基(例如给料)中的一种或多种物质去污或分解。去污可由微生物细胞的一种或多种基因产物完全或部分介导。在一些实施方案中，可以配置微生物细胞以清除材料，例如金属，如铁或稀土金属。
控制微生物细胞的生长
在一些实施方案中，对遗传修饰的微生物细胞进行修饰以调节其它微生物细胞的生长。在一些实施方案中，微生物细胞调节相同物种或菌株的其它微生物细胞(例如它们自身的克隆)的生长。在一些实施方案中，微生物细胞调节不同物种或菌株的微生物细胞(例如入侵物)的生长。在一些实施方案中，微生物细胞分泌细菌素以调节其它微生物细胞。上述其它微生物细胞每一种的调节可以依赖于具有针对特定分泌的细菌素的保护作用的免疫调节剂的表达(或其缺乏)。
本文使用的“期望的细胞”等指这样的微生物细胞：其具有对于微生物细胞的存活、生长和/或增殖是期望的，或者至少不存在细胞生长的负调控是期望的至少一种特性。在一些实施方案中，期望的细胞处于适当的环境中，例如其工业上可用的给料中。在一些实施方案中，期望的细胞是阳性选择的细胞，例如经受了特定的重组事件或表达高水平的可用的基因产物的细胞。在一些实施方案中，期望的细胞是被配置为中和污染性细胞(例如病原性细胞)的细胞。在一些实施方案中，期望的细胞是通过对应于可以存在于环境中的至少一种细菌素的免疫调节剂的表达阳性选择的细胞。在不受任何具体理论限制的情况下，考虑能够中和缺乏类似的中和功能的其它微生物细胞的微生物细胞将会具有竞争性优势。由此，在一些实施方案中，通过其中和其它细胞的能力选择期望的细胞。在一些实施方案中，通过表达细菌素和相应的免疫调节剂来阳向选择期望的细胞。
本文使用的“非期望的细胞”等指具有使存活、生长或增殖不理想的至少一种特性的微生物细胞。在一些实施方案中，非期望的细胞是入侵的微生物细胞，例如进入培养环境的污染性的细胞。在一些实施方案中，非期望的细胞从合适的培养基(例如其工业上可应用的给料)中逃逸。在一些实施方案中，非期望的细胞丢失了特定的质粒，或者未能经历特定的重组事件。在一些实施方案中，非期望的细胞未能产生或者产生低水平的期望的基因产物。在一些实施方案中，选择非期望的细胞。在一些实施方案中，针对通过降低细胞中抵抗环境中的细菌素的免疫调节剂的表达或其活性来选择非期望的细胞。在一些实施方案中，针对通过降低细胞中抵抗由所述细胞或其克隆分泌的细菌素的免疫调节剂的表达或其活性来选择非期望的细胞。在一些实施方案中，针对下述选择非期望的细胞：通过降低细胞中细菌素的表达，因而将所述细胞置于针对其它微生物细胞的竞争性劣势中。
图1为描述根据本文的一些实施方案，配置微生物细胞以控制第二微生物细胞的生长的选项的流程图。在一些实施方案中，提供第一微生物细胞。在一些实施方案中，第一微生物细胞分泌活性细菌素100。在一些实施方案中，第一微生物细胞不是期望的102。例如，在一些实施方案中，下述中的一项或多项能够使得第一微生物细胞在特定的环境在特定的时间是不理想的：第一微生物细胞位于其工业环境之外、不存在第一微生物细胞的期望的环境条件、第一微生物细胞已经产生了足够的产物，或者第一微生物细胞缺乏重组事件或载体112。由此，当第一微生物细胞是非期望的时，其免疫调节剂(与细菌素对应)可以失活122。例如，下述中的一项或多项：免疫调节剂启动子可以失活，免疫调节剂转录阻遏子可以具有活性，可以发生转录后沉默(例如通过核酶或反义)，可调节的 tRNA不能被诱导，可以发生转录后沉默(例如，通过位点特异的蛋白酶，或者沉默的翻译后修饰)，或者编码免疫调节剂的载体可以不存在132。在一些实施方案中，当第一细胞不具有活化的免疫调节剂时，所述第一细胞被由培养物中的其它细胞产生的细菌素142中和。在一些实施方案中，作为第一细胞被中和的结果，第二微生物细胞继续生长192。
在一些实施方案中，第一微生物细胞是期望的106。例如，下述中的一项或多项可以使得微生物细胞在特定的环境在特定的时间是理想的：第一微生物细胞位于其工业环境内，存在第一微生物细胞的期望的环境条件，第一微生物细胞还未产生足够的产物，或者第一微生物细胞经历了重组事件或含有特定的载体116。由此，当第一微生物细胞是期望的时，其可以产生活性免疫调节剂126。例如，在一些实施方案中，可以配置第一微生物细胞以使其具有以下的一种或多种：免疫调节剂多核苷酸的组成型启动子、免疫调节剂多核苷酸的激活的(而不一定是组成型的)启动子、免疫调节剂转录的失活的阻遏子、诱导以促进免疫调节剂产生的可调节的tRNA、不存在免疫调节剂的翻译后和转录后沉默、或者存在编码免疫调节剂的载体136。由此，第一微生物细胞能够在由第一微生物细胞分泌的细菌素存在的情况下存活146。作为由第一微生物细胞分泌的细菌素的结果，第二微生物细胞可以生长192或被中和196，这取决于第二微生物细胞是否具有免疫调节剂活性172或者不具有免疫调节剂活性176。
在一些实施方案中，第二微生物细胞是期望的152。例如，下述中的一项或几项可以使得第二微生物细胞是理想的162：第二微生物细胞中发生期望的重组事件，第二微生物细胞中存在期望的载体，第二微生物细胞产生产物，所述产物被期望产生更多(例如正反馈环)，或者当合适水平的期望产物被转录时免疫基因座和期望的产物处于相同的转录控制下。当第二微生物细胞是期望的时，其可以提供免疫调节剂活性，以防御特定的由第一微生物细胞产生的细菌素172。例如，在一些实施方案中，可以改造第二微生物细胞，以使免疫调节剂启动子是活化的(例如，组成型启动子)，免疫调节剂转录阻遏子是失活的，缺乏转录后沉默，可以存在被诱导以促进免疫调节剂表达的可调节的tRNA、缺乏免疫调节剂的翻译后沉默(例如通过位点特异的蛋白酶)或可以存在编码免疫调节剂的载体 182。由此，在一些实施方案中，当提供免疫调节剂活性时，第二微生物细胞可以存活192。
在一些实施方案中，第二微生物细胞是非期望的156。例如，下述中的一项或多项可以使得第二微生物细胞是不理想的：第二微生物细胞为入侵物(例如污染性细胞)，第二微生物细胞的非期望的环境条件(例如存在非期望的化合物或条件的，或者期望的化合物或条件不存在)，第二微生物细胞产生产物但是不期望更多的产物(例如负反馈环)，或者免疫调节剂基因座和期望的产物基因座处于相同的转录控制下，以及转录本的水平非期望的低(例如指示不能产生期望的产物)166。由此，在一些实施方案中，可能不存在免疫调节剂活性或者免疫调节剂的量不足以防御第二微生物细胞中的细菌素的作用176。例如，以下中的一项或多项：免疫调节剂启动子可以是失活的，免疫调节剂转录阻遏子可以是活化的，可以发生免疫调节剂的转录后沉默(例如通过核酶或反义寡核苷酸)，可调节的 tRNA不能被诱导(以使不能促进免疫调节剂的表达)，可以发生免疫调节剂的转录后沉默(例如通过位点特异的蛋白酶，或者沉默翻译后修饰)，或者可以不存在编码免疫调节剂的载体186。在一些实施方案中，第一微生物细胞提供分泌的细菌素活性100。由此，在一些实施方案中，第二微生物细胞可被细菌素杀死196。
本领域技术人员会理解，对于本文公开的此种和其它功能、结构和方法，可以以不同的顺序或序列实施或进行所述的功能、结构和步骤。此外，概述的功能和结构进作为实例提供，以及在不脱离公开的实施方案的实质的情况下，这些功能和结构中的一些可以是任选的，组合为更少的功能和结构，或者扩展为其它功能和结构。
对于多种遗传修饰的微生物细胞，控制培养物中的其它微生物细胞的生长可以是有用的。在一些实施方案中，微生物细胞控制培养物中其它微生物细胞的生长。根据本文的一些实施方案，第一微生物细胞能够控制一种或多种其它微生物细胞的生长的示例性功能和配置描述于表4 中。
表4：根据本文的一些实施方案，细菌素系统在遗传修饰的微生物细胞中的示例性 用途
Figure BDA0002206189660001561
Figure BDA0002206189660001571
图2是描述根据本文的一些实施方案，基因工程微生物细胞控制至少一种其它微生物细胞的生长的示意图。第一微生物细胞200可以包含细菌素多核苷酸和相应的免疫调节剂多核苷酸。所述细菌素多核苷酸可以任选地被整合进所述细胞的基因组中，而所述免疫调节剂多核苷酸可以任选地被整合进所述细胞中存在的质粒内。在一些实施方案中，细胞的非期望的克隆210(“不表达的克隆”)可以缺乏免疫调节剂活性，并且任选地可以缺乏细菌素活性。第一微生物细胞200的细菌素活性能够中和不表达的克隆210。在一些实施方案中，细胞的非期望的克隆220可以丢失包含免疫调节剂多核苷酸的质粒。第一微生物细胞200的细菌素活性可以中和非期望的克隆220。在一些实施方案中，微生物细胞230可以从期望的环境中逃逸，引起克隆丧失免疫调节剂活性。来自逃逸的细胞230 的细菌素活性和/或逃逸的细胞的克隆能够中和逃逸的细胞230。在一些实施方案中，逃逸的细胞230还包含毒物-解毒剂系统，以促进在逃逸的细胞逃逸时将其杀死。
图3为根据本文的一些实施方案，第一基因工程微生物细胞300控制期望的环境中的第二基因工程微生物细胞310和入侵细胞320的生长的示意图。第一基因工程微生物细胞300可以包含第一细菌素多核苷酸。第二基因工程微生物细胞310可以包含第二细菌素多核苷酸。第一和第二基因工程微生物细胞(300和310)各自可以包含编码针对第一细菌素的抗性的第一免疫调节剂多核苷酸和编码针对第二细菌素的抗性的第二免疫调节剂多核苷酸。如果第二基因工程微生物细胞310变为非期望的，它可以通过本文所讨论的任何机制丢失第一免疫调节剂活性，由此受来自第一基因工程微生物细胞300的第一细菌素活性的控制。如果入侵细胞320进入期望的环境，则来自第一基因工程微生物细胞300的第一细菌素以及来自第二基因工程微生物细胞310的第二细菌素可以中和入侵的细胞。
图4是根据本文的一些实施方案，第一基因工程微生物细胞400控制期望环境中的第一入侵细胞410和第二入侵细胞420的生长的示意图。第一基因工程细胞400可以至少包含编码第一细菌素的第一细菌素多核苷酸，和至少包含编码第二细菌素的第二细菌素多核苷酸。第一基因工程细胞400可以产生第一细菌素以中和第一入侵细胞410。第一基因工程细胞410可以产生第二细菌素以中和第二入侵细胞420。在一些实施方案中，所述第一入侵细胞是来自与第二入侵细胞不同的菌株或菌种。在一些实施方案中，第一入侵细胞与第二入侵细胞响应不同的细菌素活性谱。在一些实施方案中，第一入侵细胞与第二入侵细胞通常占据不同的生态位。
图5是阐明根据根据本文的一些实施方案，控制培养物中至少第二微生物细胞的生长的方法的流程图。该方法可以包括在第一微生物细胞产生足以控制第二微生物细胞的生长的水平的细菌素的条件下，在包含第二微生物细胞的培养基中培养第一微生物细胞510。第一微生物细胞的培养可以任选地连续维持一段时间520。在一些实施方案中，第一微生物细胞的培养连续维持至少3天，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、 12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、 60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、250、300、350、 400、450或500天，包括任何两个列出的值之间的范围。可以检测包括第三微生物细胞水平或活性存在或增加的培养基中的变化530。可以响应上述变化再工程化第一微生物细胞，以产生足以控制第三微生物细胞生长的水平的第二细菌素540。可在第一微生物细胞产生足以控制第三微生物细胞生长的水平的细菌素的条件下，在培养物中培养再工程化的第一微生物细胞550。可将再工程化的微生物细胞的培养连续重复一段时间 560。在一些实施方案中，将再工程化微生物细胞的培养连续维持至少3 天，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、 18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、 90、95、100、150、200、250、300、350、400、450或500天，包括任何两个列出的值之间的范围。
在一些实施方案中，第一微生物细胞可以控制第二微生物细胞的生长。在一些实施方案中，第一微生物细胞可以控制与第一微生物细胞相同菌株的第二微生物细胞的生长。各菌株细胞可以包含细菌素多核苷酸和免疫调节剂多核苷酸，以使如果表达，则所述免疫调节剂防御所述细菌素。由此，如果菌株克隆丧失免疫调节剂的表达，其将被来自相同菌株的细菌素活性中和。在一些实施方案中，免疫调节剂多核苷酸与细菌素多核苷酸是顺式的。由此，即使细菌素多核苷酸和免疫调节剂多核苷酸都被清除(例如，如果质粒丢失，或者FLP-FRT盒被剪切)，来自其它细胞的细菌素活性仍可以中和细胞。在一些实施方案中，免疫调节剂多核苷酸与细菌素多核苷酸是反式的。当微生物细胞是非期望的时(例如，如果质粒丢失，或者如果特定的环境条件诱导了免疫调节剂活性的丧失)，可以失去免疫调节剂活性。因此，来自这两种微生物细胞以及菌株的其它细胞的细菌素活性可以诱导微生物细胞的中和。
在一些实施方案中，控制两种或更多种微生物物种或菌株的比例。图3(参见细胞300和310)中显示了对比例的示例性控制。在一些实施方案中，当与产生细菌素的第二菌株或物种相比，第一微生物菌株或物种是较不期望的时，第一微生物菌株或物种通过本文所讨论的任何机制丧失免疫调节剂活性，从而增加第二菌株或物种对第一菌株或物种的比例。在控制第一和第二菌株或物种的比例的一些实施方案中，选择一种或多种抑菌性细菌素(而不是bacteriocitic细菌素)，以使对生长的控制可以容易地可逆，和/或以将清除菌株或物种的风险最小化。在一些实施方案中，在由目标化合物或物质(例如中间体或产物如工业上可用的分子)的存在所激活的启动子的控制下，第一微生物菌株或物种产生第一细菌素。由此，细菌素的水平随目标化合物水平的增加而增加。在一些实施方案中，第二微生物菌株或物种产生(或催化产生)目标化合物或物质，但是对于细菌素不具有免疫调节剂活性。随着目标化合物或物质的水平的增加，细菌素的水平也增加，因而中和了第二菌株(其缺乏合适的免疫调节剂或者其不具有足够量的合适的免疫调节剂以防御细菌素的作用)。由此，与第二菌株相比，第一菌株的相对水平增加。在一些实施方案中，第一微生物菌株产生第一产物和第一细菌素活性，以及第二微生物菌株产生第二产物和第二细菌素活性。在一些实施方案中，第一产物和第二产物是同一生物合成途径中的中间体。第一微生物菌株可以提供第一和第二免疫调节剂活性，其中所述第二免疫调节剂活性可以防御第二细菌素，并由第一产物的累积负调节(例如，第二免疫调节剂的表达被第一产物的存在所抑制)，以及所述第一免疫调节剂活性可以防御第一细菌素。第二微生物菌株也可以提供第一和第二免疫调节剂活性，除了第一免疫调节剂活性由第二产物的累积负调控(例如，第一免疫调节剂的表达被第二产物的存在所抑制)外。由此，当累积了相对大量的第一产物时，第一微生物菌株中的第二免疫调节剂失活，并且第一菌株的微生物细胞被第二细菌素中和，因而增加第二菌株对第一菌株的比例，并增加第二产物对第一产物的相对量。当累积了相对大量的第二产物时，第二微生物菌株中的第一免疫调节剂失活，并且第二菌株的微生物细胞被第一细菌素中和，第一菌株对第二菌株的比例增加，第一产物对第二产物的相对量增加。由此，可以调整第一菌株对第二菌株的比例，这取决于产物的相对水平。在一些实施方案中，维持第一菌株对第二菌株比例的平衡。在一些实施方案中，维持第一产物对第二产物比例的平衡。在一些实施方案中，第一微生物菌株的第二免疫调节剂响应第一环境条件或化合物，并且以其它方式如上文所述的控制第一和第二微生物菌株之间的比例。在一些实施方案中，第二微生物菌株的第一免疫调节剂响应第二环境条件或化合物，并且以其它方式如上文所述的控制第一和第二微生物菌株之间的比例。
在一些实施方案中，期望的是，微生物细胞被包含于特定环境中，例如以使第一微生物细胞仅可在特定培养基如工业给料中存活。在一些实施方案中，微生物细胞包含细菌素多核苷酸和免疫调节剂多核苷酸，以使免疫调节剂与细菌素对应。在一些实施方案中，当微生物细胞处于期望的环境中时，所述微生物细胞产生活化的细菌素和对应的免疫调节剂，但是当微生物细胞从期望的环境中逃逸时，所述微生物细胞产生活化的细菌素而非活化的免疫调节剂。因此，微生物细胞可以在期望的环境中生长，但是当其逃逸时，其被自身细菌素中和。例如，在一些实施方案中，由细菌素多核苷酸编码的细菌素组成型表达，而免疫调节剂仅在当微生物细胞处于期望的环境中时才表达。例如，在一些实施方案中，由细菌素多核苷酸编码的细菌素组成型表达，而免疫调节剂仅在当微生物细胞处于某一环境中时才表达。例如，在一些实施方案中，免疫调节剂的转录激活剂仅存在于期望的环境中。例如，在一些实施方案中，由细菌素多核苷酸编码的细菌素和免疫调节剂组成型表达，但是如果微生物细胞逃逸，则免疫调节剂缺失(例如通过FLP-FRT系统)。在不受任何具体理论限制的情况下，如果用于中和逃逸的微生物细胞的遗传系统未被用于培养物自身中，则维持培养物内的系统可能存在较小或不存在选择性压力，因此突变可以累积，这降低或清除了所述遗传系统的功能的发挥。由此，如果微生物细胞能够从培养物中逃逸，则存在遗传系统将不再发挥功能的可能性。相比之下，本文理解如果细菌素/免疫调节剂系统既可用于培养物中(例如，以控制培养物中其它基因工程细胞的生长和/ 或以中和入侵的微生物细胞)，又可用于培养物之外(例如，以中和从培养物中逃逸的微生物细胞)，则其在培养物中的使用可以提供针对细菌素系统的选择性压力以继续发挥功能。根据本文的一些实施方案，此类选择性压力可将遗传漂变最小化。根据本文的一些实施方案，此类选择性压力可以帮助确保如果微生物细胞从期望的培养环境中逃逸，则细菌素/免疫调节剂系统将会发挥功能以适当地中和逃逸的细胞。由此，在一些实施方案中，单个基因工程化线路，例如细菌素/免疫调节剂系统既可用于中和期望的培养环境中的其它微生物细胞，并当从期望的培养环境中逃逸时还中和微生物细胞和/或它的克隆。根据本文的一些实施方案，考虑可以调整本文公开的细菌素的任何或全部配置，以使当从期望的培养环境中逃逸时，逃逸的微生物有机体将被其自身细菌素(和/或其直接或间接后代的细菌素，和/或其它逃逸细胞和/或其直接或间接后代的细菌素)中和。
在一些实施方案中，微生物细胞可以以两种或多种方式控制生长。在一些实施方案中，微生物细胞可以执行表4中所述的两种或更多种功能。在一些实施方案中，微生物细胞使用相同细菌素/免疫调节剂对发挥两种或更多种不同的功能。在一些实施方案中，微生物细胞使用第一细菌素/免疫调节剂对用于第一功能，以及第二细菌素/免疫调节剂对用于第二功能。例如，在一些实施方案中，微生物细胞可以表达限制期望环境中丧失免疫调节剂活性的“不表达的”克隆的生长的细菌素，以及如果微生物细胞位于期望环境之外，则可以通过不表达其自身免疫调节剂(而仍表达细菌素)提供期望环境内的牵制。这两种形式的生长调节的示意图显示于图2中。例如，在一些实施方案中，第一微生物细胞可以表达限制第二微生物细胞的生长的细菌素，并且还能够中和入侵的细胞。这两种形式的生长调节的示意图显示于图3中。在一些实施方案中，利用相同的细菌素-免疫调节剂对，提供了两种或更多种形式的生长控制。在一些实施方案中，利用不同的细菌素免疫调节剂对，提供了每种形式的生长控制。例如，第一免疫基因座可以存在于质粒上，所述质粒还包含编码期望产物的多核苷酸。丢失所述质粒的克隆将会被对应的第一细菌素中和。第二免疫调节剂多核苷酸(对应于第二免疫调节剂)可被整合进微生物细胞的基因组内，并且当微生物细胞从其期望的环境中逃逸时可以被沉默(例如，第二免疫调节剂多肽可以位于当逸时被切除的FLP-FRT盒内)。由此，当逸时，微生物细胞可被第二细菌素中和。
应当注意，本文所述的一些实施方案可与毒物-解毒剂系统兼容。由此，在一些实施方案中，除细菌素和免疫调节剂之外，微生物细胞还包含被配置以当其不处于期望环境中时，杀死或阻止细胞的毒物-解毒剂系统。
控制两种或更多种不同类型的微生物细胞的生长是可用的。例如，环境可以包含或者可能包含两种或更多种不同类型的非期望的微生物有机体。由于不同的微生物有机体可以具有不同的针对细菌素的敏感性(例如，通过具有免疫调节剂的不同特性)，可以使用两种或更多种细菌素的组合(例如细菌素的“混合物”)用于控制两种或更多种微生物有机体的生长。在一些实施方案中，单一微生物细胞产生两种或更多种不同的细菌素，例如，至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、25、30、35、40、45或50种不同的细菌素，包括任何两个列出的值之间的范围。在一些实施方案中，提供两种或更多种不同的产生细菌素的微生物细胞的混合物，例如，2、3、4、5、6、7、8、 9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、 45或50种不同的产生细菌素的微生物细胞，包括任何两个列出的值之间的范围。任选地，产生细菌素的微生物细胞中的一种或多种可以产生两种或更多种不同的细菌素。
可将单一微生物细胞用于调节两种更多种不同类型的微生物细胞的生长。例如，可能的是，第一类型的入侵细胞具有针对第一类型的细菌素而非第二类型的细菌素的免疫力。由此，在一些实施方案中，微生物细胞包含两种或更多种细菌素多核苷酸，其中各细菌素多核苷酸编码不同的细菌素(参见，例如图4)。在一些实施方案中，微生物细胞包含编码至少三种不同的细菌素的多核苷酸，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、 11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多种不同的细菌素，包括任何两个列出的值之间的范围。在一些实施方案中，两种或更多种细菌素多核苷酸受单一启动子的控制。在一些实施方案中，受单一启动子的控制的各细菌素多核苷酸包含其自身翻译起始位点。在一些实施方案中，各细菌素多核苷酸受不同启动子的控制。在一些实施方案中，两种不同的细菌素受两种不同的而非结构或功能相同的启动子的控制。
可将微生物细胞用于控制其工业环境中其它微生物细胞的生长，以有助于确保工业产物的一致性产生，不管培养环境的地理位置。在不受任何具体理论限制的情况下，通过微生物培养来制备的某些工业产物可以具有由与某些区域相关的地方性微生物菌群导致的某些特性(例如， Camembert干酪可以具有由法国Camembert的地方性微生物菌群导致的特定特征，或者酸面团面包(sourdough bread)可以具有由加拿大San Francisco,的地方性微生物菌群导致的特定特征)。由此，理想的是控制具体给料中的微生物菌群，以使在不同地理位置可以产生一致的工业产品。在一些实施方案中，将微生物细胞工程化以产生细菌素，从而中和不同地理位置发现的入侵的微生物细胞，这可以确保不同位置产生的产品的更加一致的工业产物特征。例如，可将被设计以用于在特定工业进程和在第一地理位置生长的微生物细胞工程化，以表达有效针对通常在第一地理位置遇到的一种或多种入侵生物的一种或多种细菌素。可将被设计以用于相同工业进程并在第二地理位置生长的微生物细胞工程化，以表达有效针对通常在第二地理位置中遇到的一种或多种入侵生物的一种或多种细菌素。可选地，可将被设计以用于特定工业进程并在两个不同的地理位置生长的微生物细胞工程化，以表达有效针对通常在这两个地理位置中的每一个中遇到的一种或多种入侵生物的一种或多种细菌素。
通常在工业生物技术中，目标是在连续生产过程中发挥作用，并且考虑生产过程持续得越长，则污染的可能性更大。因此，抵抗污染物的能力可以用于连续的工业生产过程。实验室中设计的合成的微生物经常用于工业生产过程中。由此，可将这些实验室工程化的“优势微生物”用于对抗非期望的入侵微生物菌株(例如来自环境的野生型菌株和/或来自其它工业生产过程的交叉污染物)，以及用于控制它们可能的遗传漂变和环境中的逃逸。根据本文的一些实施方案，可以对抗入侵的微生物菌株，可将遗传漂变最小化，以及可以通过诱导基于自杀性的细菌素的基因回路而将逃逸最小化。
将微生物培养保持稳定，持续一段连续的时间可以是有用的，例如以确保在一段连续的时间的一致的工业产物特征。在一些实施方案中，至少部分通过细菌素介导的入侵微生物细胞的中和，稳定地维持培养物。在一些实施方案中，至少部分通过细菌素介导的培养物中两种或更多种类型的基因工程化微生物细胞的比例控制，稳定地维持培养物。在一些实施方案中，至少部分通过将培养物中已经存在的微生物细胞再工程化，稳定地维持培养物。在一些实施方案中，将微生物细胞再工程化，以添加至少一种其它细菌素活性(例如通过添加新的细菌素，或者扩增已经存在的细菌素的表达)，从而中和新型入侵微生物有机体。在一些实施方案中，将微生物细胞再工程化以移除不再需要的至少一种细菌素活性。根据本文的一些实施方案，维持稳定培养物的示例性方法显示于图5中。在一些实施方案中，稳定的培养物被维持至少约3天，例如约3、4、5、 6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、 35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、 200、250、300、350、400、450或500天，包括任何两个列出的值之间的范围。
用于测定微生物有机体比例的方法
根据本文的一些实施方案，可以控制两种或更多种微生物菌株或物种的比例，这取决于环境中产物和/或的化合物的相对量。因此，在一些实施方案中，两种或更多种微生物菌株或物种的比例可以指示环境中产物和/或化合物的相对量。在一些实施方案中，测定如本文所述的第一菌株或物种和第二菌株或物种的微生物的相对量，从而指示第一产物或化合物对第二产物或化合物的相对比例或相对量。可以用不同的方式测定各微生物菌株或物种的相对量。在一些实施方案中，各菌株或物种包含独特的寡核苷酸或多肽“条形码”序列，以帮助特异性检测。在一些实施方案中，各菌株或物种包含不同的细菌素(因此不同的细菌素多核苷酸)，其可以充当条形码。在一些实施方案中，实施定量PCR、寡核苷酸阵列分析、流式细胞术、免疫细胞化学、原位杂交、ELISA、免疫印迹、寡核苷酸斑点杂交等中的至少一种，以测定两种不同的微生物菌株或物种的相对量。
用于测定工业培养基中微生物有机体的生长调节的方法
在一些实施方案中，对工业培养基中微生物有机体的生长进行调节。在向现有的微生物细胞工业培养物中添加特定的基因工程化微生物细胞或基因工程化细胞的组合之前，测定细菌素对现有的工业培养物中的微生物细胞的生长的影响(如果有的话)可以是有用的。在一些实施方案中，对由基因工程化细胞产生的特定细菌素或细菌素的组合对微生物有机体的影响进行评估。可以提供如本文所述的包含由基因工程化微生物细胞产生的一种或多种细菌素的培养基或其它组合物。在一些实施方案中，所述培养基包含含有一种或多种细菌素的上清液。在一些实施方案中，所述组合物包含一种或多种富集的或纯化的细菌素。在一些实施方案中，所述上清液或组合物是热稳定的，例如以通过高温培养促进其中任何微生物的清除，同时仍保留其中任何细菌素的功能。在一些实施方案中，所述培养基或组合物包含含有细菌素的冻干材料。在一些实施方案中，所述培养基或组合物包含与细菌素结合的物质，例如凝胶、基质或珠子。可向现有的培养物中添加所述含有细菌素的培养基或组合物。在一些实施方案中，将所述培养基或组合物添加至工业培养环境中的培养物中。在一些实施方案中，将所述培养基或组合物与来自工业培养环境的培养物样品接触。可对工业培养物中的微生物有机体的生长或生长缺乏进行评估，例如以确定一种或多种细菌素是否有效针对培养物中出现的新的入侵有机体，或者以确定一种或多种细菌素对培养物中现有有机体的影响。
在产生基因工程化微生物细胞之前，模拟一种或多种细菌素对特定培养环境的影响可以是有用的。在一些实施方案中，对已知培养环境中的具有期望活性的特定细菌素或细菌素的组合进行鉴定，并构建微生物细胞以产生期望的细菌素或细菌素组合。在一些实施方案中，将候选细菌素或细菌素的组合与部分目标工业培养物接触，并鉴定一种或多种细菌素对培养物中的微生物有机体的影响。在一些实施方案中，提供了多种细菌素。在一些实施方案中，在试剂盒中提供了多种细菌素。在一些实施方案中，细菌素由微生物细胞产生。在一些实施方案中，细菌素位于来自如本文所述的一种或多种微生物细胞的上清液中。在一些实施方案中，细菌素是化学合成的。可以制备一种或多种候选细菌素或细菌素的混合物，并且可将其与部分工业培养环境接触。在一些实施方案中，将一种或多种细菌素添加至已经存在于培养物中的产生细菌素的基因工程化细胞的上清液中，例如以确定将所述细胞工程化以产生至少一种其它细菌素的影响。在一些实施方案中，将来自工业培养环境的样品与各候选细菌素或细菌素的混合物接触。在一些实施方案中，将各候选细菌素或细菌素的混合物添加至培养环境中。在一些实施方案中，观察各候选细菌素或细菌素的组合的影响，例如如对培养物中的至少一种期望的微生物细胞的生长的影响，和/或对培养物中的至少一种非期望的微生物细胞的生长的影响。
根据对期望的细菌素组合的鉴定，可以构建微生物细胞以产生细菌素的期望组合。在一些实施方案中，将工业培养物中现有的微生物细胞，例如产生期望产物或中间体的微生物细胞再工程化，以产生期望的细菌素的组合。在一些实施方案中，通过质粒接合将微生物细胞再工程化。在一些实施方案中，将新的细胞工程化，以产生细菌素的期望组合，并添加至工业培养物中。
遗传防护微生物有机体和系统
可将产生细菌素的微生物有机体用于保护其它微生物有机体不受非期望的微生物有机体的影响。因此，在一些实施方案中，提供了“遗传防护微生物有机体”(作为速记，其在本文也可被称为“遗传防护者”)。本文使用的“遗传防护者”指微生物有机体或微生物有机体集合，其产生一种或多种细菌素，从而保护对所述细菌素的中和作用有免疫性但其自身不产生所述细菌素的“受保护的”微生物有机体。“受保护的”微生物有机体可以实施期望的工业生产过程(例如发酵)，而本文使用的“遗传防护者”自身不实施所述期望的工业生产过程。遗传防护微生物有机体可以表达并分泌一种或多种细菌素。任选地，遗传防护微生物有机体能够组成型表达并分泌一种或多种细菌素。遗传防护微生物有机体对由遗传防护者产生的细菌素可以是不敏感的，例如通过产生针对由遗传防护者分泌的细菌素的免疫调节剂，和/或通过成为对由遗传防护者产生的细菌素不敏感的一类微生物有机体(例如，如果所述遗传防护者包括酵母，并分泌特异性中和特定细菌如乳酸菌的细菌素)。在一些实施方案中，受保护的微生物有机体产生针对由遗传防护者产生的细菌素的免疫调节剂。在一些实施方案中，受保护的微生物有机体不易受由遗传防护者产生的细菌素的影响(例如，如果受保护的微生物有机体包括酵母，并且所述遗传防护微生物有机体产生特异性中和特定细菌的细菌素)。在一些实施方案中，受保护的微生物有机体不是遗传修饰的(“非GMO”)。在一些实施方案中，受保护的微生物有机体是非GMO，但是来自选择的菌株以具有期望的特性，例如通过选择性压力和/或经典的诱变。考虑即使受保护的微生物有机体具有理想的工业特性，但是所述受保护的微生物有机体可能不足以抵抗一种或多种非期望的微生物有机体，例如入侵的地方菌群。因此，在本文的一些实施方案中，遗传防护者保护受保护的微生物有机体不受非期望的微生物有机体的影响。以示例的方式，非GMO微生物有机体可以用于多种过程，例如食品生产或纯化，如水纯化。在一些实施方案中，基于非GMO“受保护的”微生物有机体破坏一种或多种污染物(例如，已知的水污染物)的能力对其进行选择，并提供遗传防护者以保护受保护的微生物有机体不受已知的或潜在的入侵的非期望的微生物有机体的影响。在一些实施方案中，提供包含如本文所述的遗传防护者的系统。
维持不含有遗传修饰的有机体培养基是有用的，例如以实施特定的工业方法，和/或以遵守某些产品标准或规范。考虑根据本文的一些实施方案，可通过细菌素可透过而遗传防护微生物有机体不可透过的膜将遗传防护者与“受保护的”微生物有机体分离。由此，由遗传防护者产生的细菌素能够进入由受保护的微生物有机体所占据的培养基，因而保护受保护的有机体不受一种或多种非期望的微生物有机体的影响，同时所述遗传防护者仍与所述微生物有机体分离。
本文考虑特定的培养基可被多种非期望的微生物有机体入侵和/或受多种非期望的微生物有机体的影响，所述非期望的微生物有机体可以是对不同的细菌素或细菌素的组合敏感的。因此，在一些实施方案中，遗传防护微生物有机体产生两种或更多种不同的细菌素，例如2、3、4、5、 6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、2、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95或100种不同的细菌素，包括任何两个列出的值之间的范围，例如2至100、2至50、 2至20、2至10、5至100、5至50、5至20、5至10、10至100、10至 50、10至20、20至100、20至50或50至100种不同的细菌素。以示例的方式，在一些实施方案中，遗传防护者包括单一的大肠杆菌菌株，其产生20种不同的细菌素。在一些实施方案中，遗传防护者产生细菌素的混合物。在一些实施方案中，遗传防护者包括两种或更多种不同的产生细菌素的微生物有机体的混合，例如2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、 12、13、14、15、16、17、18、19、20、2、30、35、40、45或50种不同的产生细菌素的微生物有机体，以提供细菌素的期望组合。以示例的方式，在一些实施方案中，遗传防护者包括4种不同的大肠杆菌菌株的组合，其中各菌株产生5种不同的细菌素(共20种不同的细菌素)。在一些实施方案中，遗传防护者产生靶向特定种类的微生物有机体(例如乳酸菌)的细菌素的混合物。
将遗传防护者与特定的环境或培养基分离是有用的，例如以维持工业培养环境或不含遗传修饰的有机体(GMO)的给料。在一些实施方案中，遗传防护者与受保护的微生物有机体物理分离。任选地，受保护的微生物有机体是非GMO。在一些实施方案中，遗传防护者与受保护的微生物有机体在时间上分离。任选地，受保护的微生物有机体是非GMO。例如，根据一些实施方案，在时间上分离可以包括：向培养基中添加遗传防护者以中和入侵生物，然后向所述培养基中添加所述受保护的微生物有机体。任选地，可在添加受保护的微生物有机体之前中和遗传防护者，例如通过如本文所述的细菌素或毒物-解毒剂系统。任选地，遗传防护者可被其自身细菌素中和，例如通过抑制遗传防护者中一种或多种相应的免疫调节剂的表达。例如，根据一些实施方案，在时间上分离可以包括：在培养基中培养受保护的微生物有机体，随后向所述培养基中添加遗传防护者。
在一些实施方案中，将遗传防护者置于第一环境中，并将受保护的微生物有机体置于第二环境中。可以通过由遗传防护者产生的细菌素可以透过而遗传防护者自身不能透过的膜将第一环境与第二环境分离。在一些实施方案中，所述膜对于受保护的微生物有机体是不通透的。在一些实施方案中，第一环境与第二环境流体连通。在不受任何理论限制的情况下，考虑由于细菌素通常包含可扩散的稳定的肽分子，因此在水性溶液中细菌素可以容易地从第一环境移动至第二环境。在一些实施方案中，所述第一环境包括第一室、槽或池，以及所述第二环境包括第二室、槽或池。在一些实施方案中，第二环境包括露天环境。任选地，工业生产过程例如发酵在第二环境中发生。在一些实施方案中，第一环境包括置于第二环境内部的容器。根据本文的实施方案，多种膜都适用于装置和系统，只要所述膜是细菌素可透过的但遗传防护者不可透过的。在一些实施方案中，所述膜包括下述中的至少一种：网孔、滤器(strainer)、过滤器(filter)、选择性阀、单向阀或多孔膜。在一些实施方案中，膜包含一个或多个具有直径小于遗传防护者的直径的孔。在一些实施方案中，细菌素通过所述膜扩散。在一些实施方案中，从第一环境至第二环境的流体运动驱动细菌素的移动。在一些实施方案中，基于培养基中已知的或可能非期望的微生物有机体选择遗传防护者。在一些实施方案中，一段时间之后改变遗传防护者。例如，响应入侵的非期望的微生物有机体的变化，可以调整遗传防护者，以添加其它细菌素和/或移除一些细菌素。
在一些实施方案中，在新的位置实施现有的微生物介导的工业方法，其特点为一种或多种可能的非期望的微生物有机体。由于现有的工业方法中的微生物有机体可能不产生针对新位置的非期望的微生物有机体中的一些或全部的细菌素，因此可向新位置的培养基中添加产生靶向非期望的微生物有机体的细菌素的遗传防护者。由此，遗传防护者的细菌素能够中和一种或多种非期望的微生物有机体，如果其存在于培养基中。
在一些实施方案中，遗传防护者产生细菌素的混合物。可以收集细菌素的混合物而不收集遗传防护者，并且可以将细菌素的混合物与目标培养基接触。由此，可以在培养基与遗传防护者之间维持分离。技术人员将会理解，多种方法都适用于将细菌素与遗传防护者分离，只要所述方法基本上不损害所述细菌素、使所述细菌素变性或者破坏所述细菌素。在一些实施方案中，通过滤出遗传防护者而收集细菌素的混合物。在一些实施方案中，通过离心将遗传防护者与细菌素分离而收集细菌素的混合物。在一些实施方案中，通过中和遗传防护者而收集细菌素的混合物。在一些实施方案中，在将混合物与培养基接触之前，储存所述混合物。
图6为显示根据本文的一些实施方案，包含遗传防护者的系统600 的示意图。系统600可以包含第一环境610和第二环境620。任选地，所述第二环境620可以包含入口622和/或出口624。待处理的液体或培养基，例如污水或给料可以通过入口622进入626，并通过出口离开628。通过膜630可将第一环境610与第二环境620分离，所述膜可透过细菌素，但是不可透过遗传防护微生物有机体640。第一环境610可以包含遗传防护微生物有机体640，其产生能够在第一环境610与第二环境620之间移动的细菌素650。第二环境620可以包含受保护的微生物有机体660，其对由遗传防护者640所产生的细菌素的中和作用不敏感。任选地，受保护的微生物有机体660可以是非GMO。然而，如果存在非期望的微生物有机体670、675，则所述非期望的微生物有机体670、675可被所述细菌素中和。在一些实施方案中，系统600包含污水处理系统。在一些实施方案中，所述系统包含第二入口623，以使待处理的液体在进入第二环境620之前进入627第一环境610。任选地，所述系统可以包含第二入口 623而非第一入口622。任选地，所述系统可以包含第二入口623以及第一入口622。由此，遗传防护微生物有机体640可以分泌细菌素以中和入侵的非期望的有机体670、675，同时维持遗传防护微生物有机体640与受保护的微生物有机体660之间的物理分离。
图7为显示根据本文的一些实施方案，可用于光合生产的遗传防护系统700的示意图。系统700可以包含第一环境710。任选地，第一环境 710可以包含入口715。第一环境710和可选的入口715可以与第二环境 720存在流体或气体连通。第一环境710可以通过细菌素和气体可以透过而遗传防护微生物有机体640不可透过的膜730与第二环境720分离。第一环境710可以包含遗传防护微生物有机体640，其产生可以在第一环境710与第二环境720之间移动的细菌素740。所述第二环境可以包含光合微生物有机体750，例如光合微藻。任选地，光合微生物有机体750是非GMO。光源760可以与第二环境720存在光通信。考虑光源760可以包括阳光和/或人工光。CO2 770可以进入第二环境720，并且可以与来自光源760的光组合，用于光合微生物有机体750的光合生产。任选地， CO2 770可以进入第一环境710的入口715，并通过膜730进入第二环境 720。由遗传防护微生物有机体740产生的细菌素740可以通过膜730进入第二环境720，并且能够中和第二环境中的非期望的微生物有机体780、785。任选地，所述第二环境可以包含出口780，并且由光合微生物有机体760产生的生物质790能够通过出口790离开第二环境720。由此，遗传防护微生物有机体640能够分泌细菌素以中和入侵的非期望的有机体 670、675，同时维持遗传防护微生物有机体640与光合微生物有机体750 以及生物质790之间的物理分离。
给料的保存和/或储存
在未在给料中实施工业方法的情况下储存给料是有用的，例如以增加储备，以防后续需要额外输出，以暂时降低输出和/或以将给料运送至不同的位置。例如，当用于饲养动物的给料被用于饲养动物时，其可以在夏天收获，并储存直至冬天。例如，给料可以经受初轮发酵，以产生给料中期望的组分，或者以破坏或移除给料中的期望的组分，和/或以稳定给料用于储存，然后可以保存所述肥料直至其被耗尽。
本文考虑，储存期间，非期望的微生物有机体可能污染给料和/或消耗或破坏给料中的一种或多种组分。例如，可以选择微生物有机体或者将微生物有机体工程化以由给料中的纤维素产生葡萄糖。然而，在包含葡萄糖的给料中，非期望的微生物有机体可以将葡萄糖分解代谢。因此，在一些实施方案中，向给料中添加遗传防护者，以保护所述给料在储存期间不受一种或多种非期望的微生物有机体的影响。在一些实施方案中，给料经受初轮加工(例如发酵)以产生、移除或破坏至少一种组分(例如以稳定给料用于储存和/或以提供给料中期望的组分，如来自纤维素的葡萄糖)，然后遗传防护者保护给料不受后续非期望的微生物有机体的影响。在一些实施方案中，在发酵期间和/或储存期间，通过细菌素可透过的膜将遗传防护者与给料物理分离。考虑根据本文的一些实施方案，给料中细菌素介导的非期望的微生物有机体的中和能够允许给料稳定储存较长时间。在一些实施方案中，给料稳定储存至少一个月，例如至少一个月，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、 20、21、22、23或24个月。
在一些实施方案中，将遗传防护者与给料接触。在一些实施方案中，遗传防护者已经存在于给料中，并且在储存之前或储存期间诱导遗传防护者的增殖，以使所述遗传防护者产生细菌素，从而中和给料中非期望的微生物有机体。
制备和利用产生细菌素的微生物有机体的方法：
根据本文的一些实施方案，可以制备产生细菌素的微生物有机体，以用于工业方法中，所述工业方法易受非期望的微生物有机体的污染或干扰或者处于所述污染或干扰的风险中。在一些实施方案中，设计用于细菌素的期望产生的线路，将核酸序列工程化，并将所述线路组装并引入宿主微生物有机体中。
图8为显示制备和利用细菌素的方法的流程图。所述方法可以包括鉴定编码靶向非期望的微生物有机体的细菌素的一组基因810。根据本文的一些实施方案，鉴定基因的方法包括利用电子数据库鉴定细菌素基因，例如可在万维网网址bactibase.pfba-lab-tun.org/main.php处进入的 bactibase。所述方法可以包括设计用于表达细菌素的构建体，包括整合基因集、启动子以及基因调控元件820。由此，可以设计构建体。根据本文的一些实施方案，用于设计合适的构建体的方法可以包括利用部件数据库，例如电子数据库，如生物砖(Biobricks)基金会部件数据库。本文考虑，根据一些实施方案，技术人员可以基于所鉴定的组件功能选择期望的组件(包括但不限于细菌素核苷酸、启动子和基因调控元件)，并基于鉴定的这些组件的功能，工程化具有期望功能的构建体。以示例的方式，可以在一个或多个数据库中找到不同的可能的元件的功能，如生物砖目录 (Biobrickscatalog)。生物砖组件的目录可在万维网parts.igem.org处进入。所述方法可以包括用可兼容的整合位点将基因集工程化830，这可以允许基因以期望的方式组装和/或被适当地引入期望的宿主中。可以使用多种合适的整合位点，例如限制位点、用于酶重组反应的底物或用于同源重组的序列。在一些实施方案中，基因集是合成的。在一些实施方案中，包含所述基因集的核酸是合成的。在一些实施方案中，在一种或多种载体如质粒中提供基因集。所述方法可以包括组装线路840。所述线路可以包括一种或多种细菌素核酸和合适的启动子以及调节元件。多种线路配置都可以是适合的。在一些实施方案中，单个启动子驱动多种细菌素和可选的目标基因产物的表达。在一些实施方案中，不同的细菌素核酸受不同的启动子的控制。在一些实施方案中，单一构建体如质粒中包含线路。在一些实施方案中，在两种或更多种构建体如质粒中包含线路。在一些实施方案中，包含完整线路的核酸是合成的。在一些实施方案中，利用常规分子克隆技术或者核酸合成与分子克隆的组合来组装所述线路。分子克隆技术对技术人员是众所周知的。在Green and Sambrook “Molecular Cloning:ALaboratory Manual”(2012)Cold Spring Harbor Laboratory Press；第四版中描述了许多合适的分子克隆技术，在此以引用的方式将其整体并入。所述方法可以包括将所述线路引入期望的宿主内 850。合适的宿主包括但不限于天然存在的、基因工程化的以及完全合成的微生物有机体，包括但不限于本文所述的示例性的微生物有机体。任选地，所述方法包括实施表型表征860，例如菌株行为。例如，下述可能是有用的：选择期望的转化体或重组体，确定菌株产生期望的细菌素，和/或确定调节线路响应适当的刺激，如工业前体或产物。所述方法可以包括工业应用，所述工业应用包括在生产计划中使用产生的菌株870。例如，产生细菌素的菌株可被引入现有的培养基中，或者可被用作新培养基的起始培养物。
试剂盒
根据本文的一些实施方案，提供试剂盒。在一些实施方案中，试剂盒含有如本文所述的细菌素、细菌素多核苷酸、免疫调节剂、免疫调节剂多核苷酸、其它遗传组件(如启动子、表达载体、接合质粒等)、基因工程化微生物细胞和/或培养基中的至少一种。在一些实施方案中，试剂盒还包含包装和/或使用其中的内含物的说明书。在一些实施方案中，试剂盒包含多种细菌素，例如用于确定候选细菌素或其组合对培养环境的影响。在一些实施方案中，试剂盒包含多种细菌素多核苷酸和免疫调节剂多核苷酸，例如用于构建具有期望特征的微生物细胞。在一些实施方案中，试剂盒包含多种供体微生物细胞，所述供体微生物细胞含有编码至少一种细菌素和/或至少一种免疫调节剂的多种组合的供体质粒。
实施例1：蓝细菌的保护和逃逸时的中和
提供含有脂质生物合成途径的蓝细菌。所述蓝细菌被基因工程化，以包含受具有组成型活性的第一启动子控制的细菌素多核苷酸。所述蓝细菌包含抵抗细菌素并受第二启动子控制的免疫调节剂的免疫调节剂多核苷酸，所述第二启动子仅在存在工业上有用的给料中发现的前体的情况下具有活性。将蓝细菌置于给料中。当蓝细菌在给料中产生脂质时，其还分泌活性细菌素，由此中和入侵的微生物。当从给料中逃逸时，所述蓝细菌不再具有免疫调节剂活性，但仍产生细菌素，并由此被所述细菌素中和。
实施例2：芽孢杆菌的保护、质粒的维持以及逃逸时的中和
提供基因工程化芽孢杆菌细胞，其包含整合进其染色体基因组的细菌素多核苷酸，以及含有抵抗细菌素的免疫调节剂的免疫调节剂多核苷酸和编码待被生产的多肽的多核苷酸的质粒。所述细菌素受组成型启动子的控制。所述免疫调节剂多核苷酸受这样的启动子的控制：其仅在存在工业上有用的给料中发现的前体的情况下具有活性。由此，当芽孢杆菌存在于给料中时，其产生细菌素，以杀死入侵的微生物细胞。此外，当芽孢杆菌克隆丢失质粒时，它们变为不理想的(由于它们不再能够产生待被生产的多肽)，并且作为也丢失免疫调节剂的结果，其被细菌素杀死。当从给料中逃逸时，芽孢杆菌细胞不再具有免疫调节剂活性，但仍产生细菌素，由此被其环境中的其它基因工程化芽孢杆菌细胞产生的细菌素所中和。
实施例3：酿酒酵母(S.cerevisiae)的两种伴侣菌株的水平的调节
提供第一酿酒酵母菌株。所述第一菌株包含受第一启动子控制的细菌素多核苷酸，所述第一启动子由代谢物的存在所诱导。由此，随着代谢物水平的增加，细菌素的表达更强。编码的细菌素阻止酿酒酵母的细胞周期，但是是抑菌性的而非溶菌性的。所述第一菌株还包含用于赋予针对第一细菌素的免疫性的免疫调节剂多核苷酸，所述细菌素受由仅在工业给料中存在的化合物所激活的启动子的控制。酿酒酵母的第二伴侣菌株包含编码产生代谢物的酶的多核苷酸，但是不包含相应的免疫调节剂活性。随着代谢物水平通过第二菌株的活性的增加，第一菌株产生越来越多的细菌素，由此阻止第二菌株的细胞周期，并降低可用的第二菌株细胞的相对量。同时，第一菌株继续增殖。因此，第一菌株对第二菌株的相对比例增加，并且代谢物的积累减少。
实施例4：大肠杆菌对嗜酸性氧化亚铁硫杆菌(A.ferrooxidans)的调节
将嗜酸性氧化亚铁硫杆菌菌株工程化，以从给料中Fe(II)至Fe(III)的氧化中产生储存的能量，所述给料包含将Fe(II)扩散至给料中的铁源。将大肠杆菌菌株工程化以控制嗜酸性氧化亚铁硫杆菌第一菌株的生长。所述嗜酸性氧化亚铁硫杆菌包含受rus操纵子启动子(SEQ ID NO:549)控制的编码大肠杆菌素-Ia(SEQ ID NO:56)的核酸，以及受组成型启动子(枯草芽孢杆菌ctc启动子，SEQ ID NO:663)控制的编码大肠杆菌素-Ia免疫调节剂(SEQ ID NO:464)的核酸。然而，所述氧化亚铁菌株不产生任何大肠杆菌素-E1免疫调节剂。所述大肠杆菌菌株包含受整合进其基因组的组成型启动子(SEQ ID NO:651)控制的编码大肠杆菌素-E1(SEQ ID NO:54) 和大肠杆菌素-E1免疫调节剂(SEQ ID NO:465)的核酸。然而，所述大肠杆菌菌株不产生大肠杆菌素-Ia免疫调节剂(SEQ ID NO:464)。随着嗜酸性氧化亚铁硫杆菌将Fe(II)氧化为Fe(III)，Fe(II)的水平降低。由此，rus 启动子的活性降低，并且嗜酸性氧化亚铁硫杆菌产生更低水平的大肠杆菌素-Ia(SEQ ID NO:54)。因此，大肠杆菌菌株的任何中和被最小化。大肠杆菌第二菌株增殖，产生更高水平的大肠杆菌素-E1(SEQID NO:54)。大肠杆菌素-E1中和嗜酸性氧化亚铁硫杆菌，因此存在较少的嗜酸性氧化亚铁硫杆菌将Fe(II)氧化至Fe(III)。因此，Fe(II)的水平再次增加。随着 Fe(II)累积，嗜酸性氧化亚铁硫杆菌产生更高水平的大肠杆菌素-Ia(SEQ ID NO:56)，中和大肠杆菌第二菌株的有机体。因此，在产生大肠杆菌素 -E1的最低限度的大肠杆菌的情况下，嗜酸性氧化亚铁硫杆菌的中和也是最低限度。嗜酸性氧化亚铁硫杆菌增殖，将Fe(II)氧化至Fe(III)，并储存能量。
实施例5：用于非GMO微生物有机体合成乙醇的遗传防护者
根据本文的一些实施方案，将遗传防护者用于保护从给料中的葡萄糖产生乙醇的非GMO微生物有机体。所述遗传防护者包括包含并表达受单一组成型启动子控制的20种不同的细菌素核酸的大肠杆菌菌株，并由此产生合适的化学计量比的20种不同的细菌素。也考虑根据本文的一些实施方案，其它合适的选择是提供包含五种不同的大肠杆菌菌株的遗传防护者，其中每种都包含并表达五种不同的细菌素。将所述遗传防护者置于如图6中所示的系统的第一环境610中。细菌素通过多孔膜扩散以进入第二环境。多孔膜由多孔的聚四氟乙烯制成，其可透过细菌素和液体，但是不能透过所述遗传防护者。在第二环境中培养非GMO发酵酿酒酵母。所述非GMO发酵酿酒酵母从给料中的葡萄糖产生乙醇。来自遗传防护者的细菌素中和入侵的微生物有机体，防止通过入侵的微生物有机体的给料污染和乙醇消耗。多孔膜维持了基因工程化遗传防护者与非 GMO发酵酵母之间的物理分离。由此，保护发酵酵母不受非期望的微生物有机体的影响，同时保持部分给料不含GMO。
实施例6：通过遗传防护者保护非GMO光合微藻
根据本文的一些实施方案，将遗传防护者用于保护产生生物质的非GMO光合微藻。生物质可以适用于多种下游应用，例如提取目标化合物、能量或动物饲料。遗传防护者包含50种不同的枯草芽孢杆菌菌株的混合物，其中每种产生不同的细菌素。将所述遗传防护者置于如图7中所示的系统的水性第一环境710中。所述系统还包含水性第二环境720，其含有非GMO光合微藻，产生生物质。通过0.5μm的玻璃纤维过滤器将第一环境与第二环境分离，从而允许气体、液体和细菌素在第一环境与第二环境之间传递，同时阻断细菌素从第一环境与第二环境之间的传递。CO2通过第一环境中的入口进入系统，并通过第一环境和第二环境扩散。阳光进入第二环境，并驱动光合微藻产生生物质。因此，在第二环境中产生高葡萄糖的生物质。所述50种不同的细菌素也从第一环境扩散至第二环境。所述细菌素中和入侵的非期望的微生物有机体，由此阻止生物质的污染，并阻止非期望的微生物有机体干扰生物质的产生和/或将生物质分解代谢。通过出口从第二环境中收获生物质。由此，在基因工程化遗传防护者与非GMO光合微藻之间维持物理分离，同时中和第二环境中入侵的微生物。
实施例7：针对乳酸菌家族(LAB)的酿酒酵母的保护
将酿酒酵母工程化，以产生对乳酸菌(LAB)具有活性的多种细菌素。根据bactibase数据库，Leucococin C(SEQ ID NO:368)和Diversin V41 (SEQ ID NO:74)显示对LAB细菌具有活性，所述数据库可在万维网 bactibase.pfba-lab-tun.org/main.php处进入。考虑由于酿酒酵母对 Leucococin或DiversinV41不敏感，不需要将相应的免疫基因座整合进酿酒酵母。由此，选择Leucococin C(SEQ ID NO:368)和Diversin V41(SEQ IDNO:74)，并提供编码Leucococin C(SEQ ID NO:369)和Diversin V41 (SEQ ID NO:75)的多核苷酸。所述多核苷酸编码Leucococin C(SEQ ID NO:368)和Diversin V41(SEQ ID NO:74)，每一种都融合至来自酵母交配因子α的信号肽中，以促进酿酒酵母的分泌。将所述多核苷酸整合进受强组成型启动子PPGK1(3-磷酸甘油酸激酶)(SEQ ID NO:692)控制的单一酿酒酵母菌株的基因组中。利用标准同源重组进行转化。本文考虑其它合适的强组成型启动子，包括但不限于PTEF1(翻译延伸因子)和PGAP (甘油醛-3-磷酸脱氢酶)(组成型酵母启动子的列表可在万维网 parts.igem.org/Promoters/Catalog/Yeast/Constitutive处获得)。通过对入侵生产计划的LAB培养物的抑制分析，测量由转化的酿酒酵母表达的细菌素的活性。随着入侵给料的非期望的微生物有机体的组成随时间的改变，可以生产产生额外的、更少和/或不同细菌素的酿酒酵母菌株，并将所述菌株引入工业给料中。
序列表
<110> 辛格隆股份公司(Syngulon SA)
<120> 微生物的受控生长
<130> SGU-001-PCT
<150> 61/867,510
<151> 2013-08-19
<160> 698
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 40
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 1
Trp Leu Pro Pro Ala Gly Leu Leu Gly Arg Cys Gly Arg Trp Phe Arg
1 5 10 15
Pro Trp Leu Leu Trp Leu Gln Ser Gly Ala Gln Tyr Lys Trp Leu Gly
20 25 30
Asn Leu Phe Gly Leu Gly Pro Lys
35 40
<210> 2
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 典型末端IIa的N端基序
<220>
<221> VARIANT
<222> 3
<223> Xaa =任何氨基酸
<400> 2
Tyr Gly Xaa Gly Val
1 5
<210> 3
<211> 135
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 混合细菌素 Ent35-MccV
<400> 3
Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser
1 5 10 15
Val Asp Trp Gly Arg Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala
20 25 30
Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser Gly Gly Gly Ala
35 40 45
Ser Gly Arg Asp Ile Ala Met Ala Ile Gly Thr Leu Ser Gly Gln Phe
50 55 60
Val Ala Gly Gly Ile Gly Ala Ala Ala Gly Gly Val Ala Gly Gly Ala
65 70 75 80
Ile Tyr Asp Tyr Ala Ser Thr His Lys Pro Asn Pro Ala Met Ser Pro
85 90 95
Ser Gly Leu Gly Gly Thr Ile Lys Gln Lys Pro Glu Gly Ile Pro Ser
100 105 110
Glu Ala Trp Asn Tyr Ala Ala Gly Arg Leu Cys Asn Trp Ser Pro Asn
115 120 125
Asn Leu Ser Asp Val Cys Leu
130 135
<210> 4
<211> 46
<212> PRT
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 4
Met Ile Ser Ser His Gln Lys Thr Leu Thr Asp Lys Glu Leu Ala Leu
1 5 10 15
Ile Ser Gly Gly Lys Thr His Tyr Pro Thr Asn Ala Trp Lys Ser Leu
20 25 30
Trp Lys Gly Phe Trp Glu Ser Leu Arg Tyr Thr Asp Gly Phe
35 40 45
<210> 5
<211> 141
<212> DNA
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 5
atgatttcat ctcatcaaaa aacgttaact gataaagaat tagcattaat ttctgggggg 60
aaaacgcact acccgactaa tgcatggaaa agtctttgga aaggtttctg ggaaagcctt 120
cgttatactg acggttttta g 141
<210> 6
<211> 81
<212> PRT
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 6
Met Ile Ser Met Ile Ser Ser His Gln Lys Thr Leu Thr Asp Lys Glu
1 5 10 15
Leu Ala Leu Ile Ser Gly Gly Lys Thr Tyr Tyr Gly Thr Asn Gly Val
20 25 30
His Cys Thr Lys Lys Ser Leu Trp Gly Lys Val Arg Leu Lys Asn Val
35 40 45
Ile Pro Gly Thr Leu Cys Arg Lys Gln Ser Leu Pro Ile Lys Gln Asp
50 55 60
Leu Lys Ile Leu Leu Gly Trp Ala Thr Gly Ala Phe Gly Lys Thr Phe
65 70 75 80
His
<210> 7
<211> 246
<212> DNA
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 7
atgatttcaa tgatttcatc tcatcaaaaa acgttaactg ataaagaatt agcattaatt 60
tctgggggga aaacgtacta tggtactaat ggtgtgcatt gtactaaaaa gagtctttgg 120
ggtaaagtac gcttaaaaaa cgtgattcct ggaactcttt gtcgtaagca atcgttgccg 180
atcaaacagg atttaaaaat tttactgggc tgggctacag gtgcttttgg caagacattt 240
cattaa 246
<210> 8
<211> 60
<212> PRT
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 8
Met Asp Lys Lys Thr Lys Ile Leu Phe Glu Val Leu Tyr Ile Ile Cys
1 5 10 15
Ile Ile Gly Pro Gln Phe Ile Leu Phe Val Thr Ala Lys Asn Asn Met
20 25 30
Tyr Gln Leu Val Gly Ser Phe Val Gly Ile Val Trp Phe Ser Tyr Ile
35 40 45
Phe Trp Tyr Ile Phe Phe Lys Gln His Lys Lys Met
50 55 60
<210> 9
<211> 183
<212> DNA
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 9
atggataaga aaacaaaaat attatttgaa gtattataca tcatctgtat aataggccct 60
caatttatat tatttgtgac tgcaaaaaac aatatgtatc agttggtggg ttcgtttgtt 120
ggaatagtat ggttttcgta tattttttgg tatatttttt tcaaacaaca taaaaaaatg 180
tag 183
<210> 10
<211> 65
<212> PRT
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 10
Met Ala Leu Lys Thr Leu Glu Lys His Glu Leu Arg Asn Val Met Gly
1 5 10 15
Gly Asn Lys Trp Gly Asn Ala Val Ile Gly Ala Ala Thr Gly Ala Thr
20 25 30
Arg Gly Val Ser Trp Cys Arg Gly Phe Gly Pro Trp Gly Met Thr Ala
35 40 45
Cys Ala Leu Gly Gly Ala Ala Ile Gly Gly Tyr Leu Gly Tyr Lys Ser
50 55 60
Asn
65
<210> 11
<211> 198
<212> DNA
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 11
atggctttaa aaacattaga aaaacatgaa ttaagaaatg taatgggtgg aaacaagtgg 60
gggaatgctg taataggagc tgctacggga gctactcgcg gagtaagttg gtgcagagga 120
ttcggaccat ggggaatgac tgcctgtgcg ttaggaggtg ctgcaattgg aggatatctg 180
ggatataaga gtaattaa 198
<210> 12
<211> 51
<212> PRT
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 12
Met Ser Trp Leu Asn Phe Leu Lys Tyr Ile Ala Lys Tyr Gly Lys Lys
1 5 10 15
Ala Val Ser Ala Ala Trp Lys Tyr Lys Gly Lys Val Leu Glu Trp Leu
20 25 30
Asn Val Gly Pro Thr Leu Glu Trp Val Trp Gln Lys Leu Lys Lys Ile
35 40 45
Ala Gly Leu
50
<210> 13
<211> 156
<212> DNA
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 13
atgagttggt taaatttttt aaaatacatc gctaaatatg gcaaaaaagc ggtatctgct 60
gcttggaagt acaaaggtaa agtattagaa tggcttaatg ttggtcctac tcttgaatgg 120
gtatggcaaa aattaaagaa aattgctgga ttataa 156
<210> 14
<211> 61
<212> PRT
<213> 鸟肠球菌(Enterococcus avium)
<400> 14
Met Thr Arg Ser Lys Lys Leu Asn Leu Arg Glu Met Lys Asn Val Val
1 5 10 15
Gly Gly Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys
20 25 30
Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Ile Ser Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala
35 40 45
Ala Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser
50 55 60
<210> 15
<211> 186
<212> DNA
<213> 鸟肠球菌(Enterococcus avium)
<400> 15
atgacaagat caaaaaaatt aaatttacgc gaaatgaaga atgttgttgg tggtacctac 60
tatggaaatg gtgtatcttg taacaagaaa ggctgttcag ttgactgggg caaagccatc 120
agtattatag gaaataattc cgcagcaaac ttagcaactg gtggtgctgc tggttggaag 180
tcataa 186
<210> 16
<211> 67
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 16
Met Lys Lys Lys Leu Val Ile Cys Gly Ile Ile Gly Ile Gly Phe Thr
1 5 10 15
Ala Leu Gly Thr Asn Val Glu Ala Ala Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu
20 25 30
Tyr Cys Asn Lys Gln Lys Cys Trp Val Asp Trp Asn Lys Ala Ser Arg
35 40 45
Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp Val Gln His Gly Pro Trp
50 55 60
Ala Pro Arg
65
<210> 17
<211> 204
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 17
atgaaaaaga aattagttat ttgtggcatt attgggattg gttttacagc attaggaaca 60
aatgtagaag ctgctacgta ttacggaaat ggtttatatt gtaataagca aaaatgttgg 120
gtagactgga ataaagcttc aagggaaatt ggaaaaatta ttgttaatgg ttgggtacaa 180
catggccctt gggctcctag atag 204
<210> 18
<211> 51
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 18
Met Lys Glu Gln Asn Ser Phe Asn Leu Leu Gln Glu Val Thr Glu Ser
1 5 10 15
Glu Leu Asp Leu Ile Leu Gly Ala Lys Gly Gly Ser Gly Val Ile His
20 25 30
Thr Ile Ser His Glu Val Ile Tyr Asn Ser Trp Asn Phe Val Phe Thr
35 40 45
Cys Cys Ser
50
<210> 19
<211> 156
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 19
atgaaagaac aaaactcttt taatcttctt caagaagtga cagaaagtga attggacctt 60
attttaggtg caaaaggcgg cagtggagtt attcatacaa tttctcatga agtaatatat 120
aatagctgga actttgtatt tacttgctgc tcttaa 156
<210> 20
<211> 74
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 20
Met Lys Lys Lys Val Leu Lys His Cys Val Ile Leu Gly Ile Leu Gly
1 5 10 15
Thr Cys Leu Ala Gly Ile Gly Thr Gly Ile Lys Val Asp Ala Ala Thr
20 25 30
Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Glu Lys Cys Trp Val Asp
35 40 45
Trp Asn Gln Ala Lys Gly Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp
50 55 60
Val Asn His Gly Pro Trp Ala Pro Arg Arg
65 70
<210> 21
<211> 225
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 21
atgaaaaaga aagtattaaa acattgtgtt attctaggaa tattaggaac ttgtctagct 60
ggcatcggta caggaataaa agttgatgca gctacttact atggaaatgg tctttattgt 120
aacaaagaaa aatgttgggt agattggaat caagctaaag gagaaattgg aaaaattatt 180
gttaatggtt gggttaatca tggtccatgg gcacctagaa ggtag 225
<210> 22
<211> 50
<212> PRT
<213> 肉毒杆菌(Clostridium botulinum)
<400> 22
Met Gln Lys Pro Glu Ile Ile Ser Ala Asp Leu Gly Leu Cys Ala Val
1 5 10 15
Asn Glu Phe Val Ala Leu Ala Ala Ile Pro Gly Gly Ala Ala Thr Phe
20 25 30
Ala Val Cys Gln Met Pro Asn Leu Asp Glu Ile Val Ser Asn Ala Ala
35 40 45
Tyr Val
50
<210> 23
<211> 153
<212> DNA
<213> 肉毒杆菌(Clostridium botulinum)
<400> 23
atgcaaaaac cagaaattat tagtgctgat ttagggcttt gtgcagttaa tgaatttgta 60
gctcttgctg ccattcctgg tggtgctgct acatttgcag tatgccaaat gccaaacttg 120
gatgagattg ttagtaatgc agcatatgtt taa 153
<210> 24
<211> 58
<212> PRT
<213> 马肠链球菌(Streptococcus equinus)
<400> 24
Met Met Asn Ala Thr Glu Asn Gln Ile Phe Val Glu Thr Val Ser Asp
1 5 10 15
Gln Glu Leu Glu Met Leu Ile Gly Gly Ala Asp Arg Gly Trp Ile Lys
20 25 30
Thr Leu Thr Lys Asp Cys Pro Asn Val Ile Ser Ser Ile Cys Ala Gly
35 40 45
Thr Ile Ile Thr Ala Cys Lys Asn Cys Ala
50 55
<210> 25
<211> 177
<212> DNA
<213> 马肠链球菌(Streptococcus equinus)
<400> 25
atgatgaatg ctactgaaaa ccaaattttt gttgagactg tgagtgacca agaattagaa 60
atgttaattg gtggtgcaga tcgtggatgg attaagactt taacaaaaga ttgtccaaat 120
gtaatttctt caatttgtgc aggtacaatt attacagctt gtaaaaattg tgcttaa 177
<210> 26
<211> 77
<212> PRT
<213> 田野环丝菌(Brochothrix campestris)
<400> 26
Met His Lys Val Lys Lys Leu Asn Asn Gln Glu Leu Gln Gln Ile Val
1 5 10 15
Gly Gly Tyr Ser Ser Lys Asp Cys Leu Lys Asp Ile Gly Lys Gly Ile
20 25 30
Gly Ala Gly Thr Val Ala Gly Ala Ala Gly Gly Gly Leu Ala Ala Gly
35 40 45
Leu Gly Ala Ile Pro Gly Ala Phe Val Gly Ala His Phe Gly Val Ile
50 55 60
Gly Gly Ser Ala Ala Cys Ile Gly Gly Leu Leu Gly Asn
65 70 75
<210> 27
<211> 234
<212> DNA
<213> 田野环丝菌(Brochothrix campestris)
<400> 27
atgcacaagg taaaaaaatt aaacaatcaa gagttacaac agatcgtggg aggttacagt 60
tcaaaagatt gtctaaaaga tattggtaaa ggaattggtg ctggtacagt agctggggca 120
gccggcggtg gcctagctgc aggattaggt gctatcccag gagcattcgt tggagcacat 180
tttggagtaa tcggcggatc tgccgcatgc attggtggat tattaggtaa ctag 234
<210> 28
<211> 80
<212> PRT
<213> 溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)
<400> 28
Met Ser Lys Lys Gln Ile Met Ser Asn Cys Ile Ser Ile Ala Leu Leu
1 5 10 15
Ile Ala Leu Ile Pro Asn Ile Tyr Phe Ile Ala Asp Lys Met Gly Ile
20 25 30
Gln Leu Ala Pro Ala Trp Tyr Gln Asp Ile Val Asn Trp Val Ser Ala
35 40 45
Gly Gly Thr Leu Thr Thr Gly Phe Ala Ile Ile Val Gly Val Thr Val
50 55 60
Pro Ala Trp Ile Ala Glu Ala Ala Ala Ala Phe Gly Ile Ala Ser Ala
65 70 75 80
<210> 29
<211> 243
<212> DNA
<213> 溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)
<400> 29
atgagtaaaa aacaaattat gagtaactgt atatcaattg cattattaat agcactaatt 60
cctaatatct attttattgc agataaaatg ggaattcagt tagcacctgc ttggtatcaa 120
gatattgtga attgggtatc tgctggtgga acacttacta ctggttttgc gattattgta 180
ggagttacag taccggcatg gatagcagaa gcagctgcag cttttggtat agcttcagca 240
tga 243
<210> 30
<211> 48
<212> PRT
<213> 溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)
<400> 30
Met Asn Lys Glu Leu Asn Ala Leu Thr Asn Pro Ile Asp Glu Lys Glu
1 5 10 15
Leu Glu Gln Ile Leu Gly Gly Gly Asn Gly Val Ile Lys Thr Ile Ser
20 25 30
His Glu Cys His Met Asn Thr Trp Gln Phe Ile Phe Thr Cys Cys Ser
35 40 45
<210> 31
<211> 147
<212> DNA
<213> 溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)
<400> 31
atgaacaaag aacttaatgc acttacaaat cctattgacg agaaggagct tgagcagatc 60
ctcggtggtg gcaatggtgt catcaagaca atcagccacg agtgccacat gaacacatgg 120
cagttcattt tcacatgttg ctcttaa 147
<210> 32
<211> 66
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 32
Met Asn Ser Val Lys Glu Leu Asn Val Lys Glu Met Lys Gln Leu His
1 5 10 15
Gly Gly Val Asn Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Ser Lys Thr Lys Cys
20 25 30
Ser Val Asn Trp Gly Gln Ala Phe Gln Glu Arg Tyr Thr Ala Gly Ile
35 40 45
Asn Ser Phe Val Ser Gly Val Ala Ser Gly Ala Gly Ser Ile Gly Arg
50 55 60
Arg Pro
65
<210> 33
<211> 201
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 33
atgaatagcg taaaagaatt aaacgtgaaa gaaatgaaac aattacacgg tggagtaaat 60
tatggtaatg gtgtttcttg cagtaaaaca aaatgttcag ttaactgggg acaagccttt 120
caagaaagat acacagctgg aattaactca tttgtaagtg gagtcgcttc tggggcagga 180
tccattggta ggagaccgta a 201
<210> 34
<211> 61
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 34
Met Lys Ser Val Lys Glu Leu Asn Lys Lys Glu Met Gln Gln Ile Asn
1 5 10 15
Gly Gly Ala Ile Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Lys Glu Lys
20 25 30
Cys Trp Val Asn Lys Ala Glu Asn Lys Gln Ala Ile Thr Gly Ile Val
35 40 45
Ile Gly Gly Trp Ala Ser Ser Leu Ala Gly Met Gly His
50 55 60
<210> 35
<211> 186
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 35
atgaaaagcg ttaaagaact aaataaaaaa gaaatgcaac aaattaatgg tggagctatc 60
tcttatggca atggtgttta ttgtaacaaa gagaaatgtt gggtaaacaa ggcagaaaac 120
aaacaagcta ttactggaat agttatcggt ggatgggctt ctagtttagc aggaatggga 180
cattaa 186
<210> 36
<211> 71
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 36
Met Asn Asn Val Lys Glu Leu Ser Ile Lys Glu Met Gln Gln Val Thr
1 5 10 15
Gly Gly Asp Gln Met Ser Asp Gly Val Asn Tyr Gly Lys Gly Ser Ser
20 25 30
Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Gly Leu Gly Ile Val Gly Gly Leu
35 40 45
Ala Thr Ile Pro Ser Gly Pro Leu Gly Trp Leu Ala Gly Ala Ala Gly
50 55 60
Val Ile Asn Ser Cys Met Lys
65 70
<210> 37
<211> 216
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 37
atgaataatg taaaagagtt aagtattaaa gaaatgcaac aagttactgg tggagaccaa 60
atgtcagatg gtgtaaatta tggaaaaggc tctagcttat caaaaggtgg tgccaaatgt 120
ggtttaggga tcgtcggcgg attagctact atcccttcag gtcctttagg ctggttagcc 180
ggagcagcag gtgtaattaa tagctgtatg aaataa 216
<210> 38
<211> 64
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 38
Met Leu Tyr Glu Leu Val Ala Tyr Gly Ile Ala Gln Gly Thr Ala Glu
1 5 10 15
Lys Val Val Ser Leu Ile Asn Ala Gly Leu Thr Val Gly Ser Ile Ile
20 25 30
Ser Ile Leu Gly Gly Val Thr Val Gly Leu Ser Gly Val Phe Thr Ala
35 40 45
Val Lys Ala Ala Ile Ala Lys Gln Gly Ile Lys Lys Ala Ile Gln Leu
50 55 60
<210> 39
<211> 195
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 39
atgttatatg aattagttgc atatggtatc gcacaaggta cagctgaaaa ggttgtaagt 60
ctaattaacg caggtttaac agtagggtct attatttcaa ttttgggtgg ggtcacagtc 120
ggtttatcag gtgtcttcac agcagttaaa gcagcaattg ctaaacaagg aataaaaaaa 180
gcaattcaat tataa 195
<210> 40
<211> 836
<212> PRT
<213> 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum)
<400> 40
Met Ile Lys Tyr Arg Leu Tyr Ala Pro Asn Asp Gly Asp Thr Met Thr
1 5 10 15
Val Ser Gly Gly Gly Gly Trp Val Ser Asn Asp Asp Arg Lys Gly Gly
20 25 30
Asn Asp Arg Asp Asn Gly Lys Gly Gly Ser Ala Val Asp Phe Ser Lys
35 40 45
Asn Pro Glu Lys Gln Ala Ile Val Asn Pro Tyr Leu Ala Ile Ala Ile
50 55 60
Pro Met Pro Val Tyr Pro Leu Tyr Gly Lys Leu Gly Phe Thr Ile Asn
65 70 75 80
Thr Thr Ala Ile Glu Thr Glu Leu Ala Asn Val Arg Ala Ala Ile Asn
85 90 95
Thr Lys Leu Ala Thr Leu Ser Ala Val Ile Gly Arg Ser Leu Pro Val
100 105 110
Val Gly Arg Val Phe Gly Val Thr Ala Ala Gly Met Trp Pro Ser Ser
115 120 125
Thr Ala Pro Ser Ser Leu Asp Ser Ile Tyr Asn Gln Ala His Gln Gln
130 135 140
Ala Leu Ala Gln Leu Ala Ala Gln Gln Gly Val Leu Asn Lys Gly Tyr
145 150 155 160
Asn Val Thr Ala Met Pro Ala Gly Phe Val Ser Ser Leu Pro Val Ser
165 170 175
Glu Ile Lys Ser Leu Pro Thr Ala Pro Ala Ser Leu Leu Ala Gln Ser
180 185 190
Val Ile Asn Thr Glu Leu Ser Gln Arg Gln Leu Ala Leu Thr Gln Pro
195 200 205
Thr Thr Asn Ala Pro Val Ala Asn Ile Pro Val Val Lys Ala Glu Lys
210 215 220
Thr Ala Met Pro Gly Val Tyr Ser Ala Lys Ile Ile Ala Gly Glu Pro
225 230 235 240
Ala Phe Gln Ile Lys Val Asp Asn Thr Lys Pro Ala Leu Ala Gln Asn
245 250 255
Pro Pro Lys Val Lys Asp Asp Ile Gln Val Ser Ser Phe Leu Ser Ser
260 265 270
Pro Val Ala Asp Thr His His Ala Phe Ile Asp Phe Gly Ser Asp His
275 280 285
Glu Pro Val Tyr Val Ser Leu Ser Lys Ile Val Thr Ala Glu Glu Glu
290 295 300
Lys Lys Gln Val Glu Glu Ala Lys Arg Arg Glu Gln Glu Trp Leu Leu
305 310 315 320
Arg His Pro Ile Thr Ala Ala Glu Arg Lys Leu Thr Glu Ile Arg Gln
325 330 335
Val Ile Ser Phe Ala Gln Gln Leu Lys Glu Ser Ser Val Ala Thr Ile
340 345 350
Ser Glu Lys Thr Lys Thr Val Ala Val Tyr Gln Glu Gln Val Asn Thr
355 360 365
Ala Ala Lys Asn Arg Asp Asn Phe Tyr Asn Gln Asn Arg Gly Leu Leu
370 375 380
Ser Ala Gly Ile Thr Gly Gly Pro Gly Tyr Pro Ile Tyr Leu Ala Leu
385 390 395 400
Trp Gln Thr Met Asn Asn Phe His Gln Ala Tyr Phe Arg Ala Asn Asn
405 410 415
Ala Leu Glu Gln Glu Ser His Val Leu Asn Leu Ala Arg Ser Asp Leu
420 425 430
Ala Lys Ala Glu Gln Leu Leu Ala Glu Asn Asn Arg Leu Gln Val Glu
435 440 445
Thr Glu Arg Thr Leu Ala Glu Glu Lys Glu Ile Lys Arg Asn Arg Val
450 455 460
Asn Val Ser Thr Phe Gly Thr Val Gln Thr Gln Leu Ser Lys Leu Leu
465 470 475 480
Ser Asp Phe Tyr Ala Val Thr Ser Leu Ser Gln Ser Val Pro Ser Gly
485 490 495
Ala Leu Ala Ser Phe Ser Tyr Asn Pro Gln Gly Met Ile Gly Ser Gly
500 505 510
Lys Ile Val Gly Lys Asp Val Asp Val Leu Phe Ser Ile Pro Val Lys
515 520 525
Asp Ile Pro Gly Tyr Lys Ser Pro Ile Asn Leu Asp Asp Leu Ala Lys
530 535 540
Lys Asn Gly Ser Leu Asp Leu Pro Ile Arg Leu Ala Phe Ser Asp Glu
545 550 555 560
Asn Gly Glu Arg Val Leu Arg Ala Phe Lys Ala Asp Ser Leu Arg Ile
565 570 575
Pro Ser Ser Val Arg Gly Val Ala Gly Ser Tyr Asp Lys Asn Thr Gly
580 585 590
Ile Phe Ser Ala Glu Ile Asp Gly Val Ser Ser Arg Leu Val Leu Glu
595 600 605
Asn Pro Ala Phe Pro Pro Thr Gly Asn Val Gly Asn Thr Gly Asn Thr
610 615 620
Ala Pro Asp Tyr Lys Ala Leu Leu Asn Thr Gly Val Asp Val Lys Pro
625 630 635 640
Val Asp Lys Ile Thr Val Thr Val Thr Pro Val Ala Asp Pro Val Asp
645 650 655
Ile Asp Asp Tyr Ile Ile Trp Leu Pro Thr Ala Ser Gly Ser Gly Val
660 665 670
Glu Pro Ile Tyr Val Val Phe Asn Ser Asn Pro Tyr Gly Gly Thr Glu
675 680 685
Lys Gly Lys Tyr Ser Lys Arg Tyr Tyr Asn Pro Asp Lys Ala Gly Gly
690 695 700
Pro Ile Leu Glu Leu Asp Trp Lys Asn Val Lys Ile Asp His Ala Gly
705 710 715 720
Val Asp Asn Val Lys Leu His Thr Gly Arg Phe Lys Ala Ser Val Glu
725 730 735
Asn Lys Val Met Ile Glu Arg Leu Glu Asn Ile Leu Asn Gly Gln Ile
740 745 750
Thr Ala Thr Asp Thr Asp Lys Arg Phe Tyr Thr His Glu Leu Arg Glu
755 760 765
Leu Asn Arg Tyr Arg Asn Leu Gly Ile Lys Asp Gly Glu Val Pro Ser
770 775 780
Ser Ile Gln Glu Glu Ser Ala Val Trp Asn Asp Thr His Thr Ala Thr
785 790 795 800
Leu Glu Asp Tyr Lys Ile Asn Glu Lys Glu Gln Pro Leu Tyr Thr Asp
805 810 815
Ala Ala Leu Gln Ala Ala Tyr Glu Gln Glu Leu Lys Asp Ala Leu Gly
820 825 830
Gly Lys His Gly
835
<210> 41
<211> 2511
<212> DNA
<213> 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum)
<400> 41
atgattaaat accgtttata tgctccaaat gatggagaca ccatgacagt gagtggtggt 60
ggtggttggg tttcaaacga tgatcgcaaa ggtggtaatg acagggacaa tggcaaaggt 120
ggttctgccg ttgattttag taaaaatcca gaaaagcagg ctatcgttaa tccctatttg 180
gcaatcgcga taccgatgcc ggtctaccct ctttatggaa agctagggtt cacaataaat 240
acgacggcaa ttgagactga actcgcaaat gtcagagcag caattaacac taaacttgca 300
acactcagtg cagtgattgg cagatcactt ccggtcgttg ggcgggtatt tggtgttact 360
gccgccggaa tgtggccttc tagtaccgct cccagtagtc tcgattctat atacaatcaa 420
gcacatcagc aggctttagc ccagttagct gctcaacagg gagtattaaa taaagggtat 480
aacgttacag caatgcctgc aggtttcgtc agcagtttgc ctgttagtga aatcaaatca 540
ttgccaacag ctcccgccag tttactggca caaagtgtga ttaataccga actttcccag 600
cgtcaactgg ctcttactca gcccacgacg aatgcaccag tcgcgaatat tcccgtagtt 660
aaagcagaga aaacagcaat gccaggtgtg tattcagcga aaattattgc tggtgagcct 720
gcattccaaa tcaaggtcga taataccaaa cctgctttgg cacagaatcc gccgaaagta 780
aaagatgata ttcaggtatc ttctttcctt tcctcgccag tagctgatac gcaccatgca 840
tttattgatt ttggcagcga tcatgaaccg gtatacgtgt ctctttcaaa gatcgtgaca 900
gccgaggagg agaaaaaaca ggttgaagag gccaagcgcc gtgagcagga gtggttgttg 960
cgtcatccaa ttacagctgc ggagcgaaaa ttaactgaaa tccgccaagt gatctctttt 1020
gctcaacagc taaaagaaag ctctgtcgca accatttcag aaaaaactaa aactgttgcg 1080
gtttaccaag aacaggtgaa taccgctgca aaaaatcgcg acaattttta taatcaaaat 1140
agaggtctgt taagtgcggg tataactggg ggaccgggat atcctattta tcttgcttta 1200
tggcaaacga tgaataactt tcatcaggct tatttcagag caaataatgc attggaacaa 1260
gagagtcatg ttctgaacct ggctcgttct gatctggcta aggctgagca attgcttgct 1320
gagaataatc gacttcaggt tgaaacggag cgaacgcttg ccgaagaaaa agagataaaa 1380
cgcaacaggg ttaatgtatc aacatttggc acagtgcaaa ctcaacttag taaattgctg 1440
tcagattttt atgctgttac atcactttcc caaagtgttc cttcgggggc attagcctct 1500
ttttcatata atccacaagg gatgattggc agcggtaaga ttgttgggaa ggatgtcgat 1560
gttttatttt ccatcccagt aaaagatatt ccgggatata aatctcctat taacttggac 1620
gatttagcca agaaaaatgg aagtctggat cttcccattc gtctggcatt ttctgatgag 1680
aatggagaaa gggttcttcg ggcattcaaa gcggatagtc tgcgaatccc ttcgagtgtc 1740
agaggtgtag cgggcagtta tgacaaaaat acgggtattt ttagtgcaga aattgatggt 1800
gtttcatctc gccttgtact ggaaaaccca gcgtttcctc cgaccggaaa tgtcggtaat 1860
acgggtaata ctgcacctga ctataaagca ttactgaata ctggtgttga tgttaaacct 1920
gttgataaaa tcacagttac ggtaacacca gttgctgatc cagtggatat tgatgactat 1980
ataatctggt tgccaactgc gtctggttct ggcgtggaac ccatttatgt cgtgtttaac 2040
agtaatccgt atggtgggac ggaaaaagga aaatatagca aacgttatta taatccagat 2100
aaggcaggcg gtccgatctt ggagctggat tggaaaaacg ttaagattga ccatgcaggt 2160
gtggacaatg ttaaattaca cacagggcgt ttcaaagcgt cggttgaaaa caaagtgatg 2220
attgaacgtt tggaaaacat actgaatggt caaatcacgg ccacggatac tgacaagcga 2280
ttctatacgc atgaattaag agagttaaac cgctacagaa atttaggcat caaagacggt 2340
gaagtgccta gtagcattca agaagaaagc gctgtttgga acgacacaca cacagcgacg 2400
cttgaagact acaaaattaa tgagaaagag caaccgttgt acactgatgc tgctttgcag 2460
gcagcctacg aacaggaact caaagacgca ttaggaggga aacatggcta a 2511
<210> 42
<211> 74
<212> PRT
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 42
Met Glu Asn Leu Gln Met Leu Thr Glu Glu Glu Leu Met Glu Ile Glu
1 5 10 15
Gly Gly Gly Trp Trp Asn Ser Trp Gly Lys Cys Val Ala Gly Thr Ile
20 25 30
Gly Gly Ala Gly Thr Gly Gly Leu Gly Gly Ala Ala Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Val Pro Val Ile Gly Thr Gly Ile Gly Gly Ala Ile Gly Gly Val Ser
50 55 60
Gly Gly Leu Thr Gly Ala Ala Thr Phe Cys
65 70
<210> 43
<211> 225
<212> DNA
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 43
atggaaaact tacaaatgtt aactgaagaa gaattaatgg aaattgaagg tggaggctgg 60
tggaatagct ggggtaaatg tgttgctgga actatcggtg gagctggaac tggtggttta 120
ggtggagctg ctgcaggttc agctgttccg gttattggta ctggtattgg tggcgctatt 180
ggtggagtta gcggtggcct tacaggtgca gctacttttt gctaa 225
<210> 44
<211> 78
<212> PRT
<213> 灰轮丝链轮丝菌(Streptoverticillium griseoverticillatum)
<400> 44
Met Thr Ala Ser Ile Leu Gln Gln Ser Val Val Asp Ala Asp Phe Arg
1 5 10 15
Ala Ala Leu Leu Glu Asn Pro Ala Ala Phe Gly Ala Ser Ala Ala Ala
20 25 30
Leu Pro Thr Pro Val Glu Ala Gln Asp Gln Ala Ser Leu Asp Phe Trp
35 40 45
Thr Lys Asp Ile Ala Ala Thr Glu Ala Phe Ala Cys Arg Gln Ser Cys
50 55 60
Ser Phe Gly Pro Phe Thr Phe Val Cys Asp Gly Asn Thr Lys
65 70 75
<210> 45
<211> 237
<212> DNA
<213> 灰轮丝链轮丝菌(Streptoverticillium griseoverticillatum)
<400> 45
atgaccgctt ccattcttca gcagtccgtc gtggacgccg acttccgcgc ggcgctgctt 60
gagaaccccg ccgccttcgg cgcttccgcc gcggccctgc ccacgcccgt cgaggcccag 120
gaccaggcgt cccttgactt ctggaccaag gacatcgccg ccacggaagc cttcgcctgc 180
cgccagagct gcagcttcgg cccgttcacc ttcgtgtgcg acggcaacac caagtaa 237
<210> 46
<211> 76
<212> PRT
<213> 嗜热地芽孢杆菌(Geobacillus kaustophilus)
<400> 46
Met Ser Leu Leu Ala Leu Val Ala Gly Thr Leu Gly Val Ser Gln Ser
1 5 10 15
Ile Ala Thr Thr Val Val Ser Ile Val Leu Thr Gly Ser Thr Leu Ile
20 25 30
Ser Ile Ile Leu Gly Ile Thr Ala Ile Leu Ser Gly Gly Val Asp Ala
35 40 45
Ile Leu Glu Ile Gly Trp Ser Ala Phe Val Ala Thr Val Lys Lys Ile
50 55 60
Val Ala Glu Arg Gly Lys Ala Ala Ala Ile Ala Trp
65 70 75
<210> 47
<211> 231
<212> DNA
<213> 嗜热地芽孢杆菌(Geobacillus kaustophilus)
<400> 47
atgagtttgc tggcgcttgt tgccgggacg ctcggcgtgt cacagtcaat cgcgacgacg 60
gttgtttcga ttgtgttgac cggctccact ctcatttcta ttattcttgg gatcaccgct 120
attttgtcag gtggagtcga cgccattttg gaaattgggt ggtcagcttt tgtcgcgacg 180
gtgaaaaaaa tagtggcgga acgaggaaaa gcggcagcga ttgcatggta a 231
<210> 48
<211> 309
<212> PRT
<213> 酪丁酸梭菌(Clostridium tyrobutyricum)
<400> 48
Met Arg Lys Val Phe Leu Arg Ser Ile Ile Ser Thr Leu Val Met Cys
1 5 10 15
Ala Phe Val Ser Ser Ser Phe Ser Val Asn Ala Asp Glu Ser Lys Pro
20 25 30
Asn Asp Glu Lys Ile Ile Asn Asn Ile Glu Asn Val Thr Thr Thr Lys
35 40 45
Asp Ile Val Lys Ser Asn Lys Asn Asn Ile Val Tyr Leu Asp Glu Gly
50 55 60
Val Met Ser Ile Pro Leu Ser Gly Arg Lys Pro Ile Ala Ile Lys Asp
65 70 75 80
Asp Asn Asn Lys Glu Asp Leu Thr Val Thr Leu Pro Ile Lys Asn Thr
85 90 95
Gly Asp Ile Ser Lys Ile Ser Ser Asn Gly Thr Ile Leu Tyr Lys Asn
100 105 110
Asn Ser Ser Asn Ser Ser Asn Ile Ala Leu Gln Pro Lys Asn Asp Gly
115 120 125
Phe Lys Ala Leu Ile Asn Ile Asn Asp Lys Leu Ala Asn Lys Glu Tyr
130 135 140
Glu Phe Thr Phe Asn Leu Pro Lys Asn Ser Lys Leu Ile Ser Ala Ala
145 150 155 160
Thr Tyr Leu Gly Lys Glu Tyr Asp Thr Lys Glu Val Phe Val Val Asp
165 170 175
Lys Asn Asn Ile Ile Thr Ser Ile Ile Ser Pro Ala Trp Ala Lys Asp
180 185 190
Ala Asn Gly His Asn Val Ser Thr Tyr Tyr Lys Ile Val Ser Asn Asn
195 200 205
Lys Leu Val Gln Val Val Glu Phe Thr Glu Asn Thr Ala Phe Pro Val
210 215 220
Val Ala Asp Pro Asn Trp Thr Lys Ile Gly Lys Cys Ala Gly Ser Ile
225 230 235 240
Ala Trp Ala Ile Gly Ser Gly Leu Phe Gly Gly Ala Lys Leu Ile Lys
245 250 255
Ile Lys Lys Tyr Ile Ala Glu Leu Gly Gly Leu Gln Lys Ala Ala Lys
260 265 270
Leu Leu Val Gly Ala Thr Thr Trp Glu Glu Lys Leu His Ala Gly Gly
275 280 285
Tyr Ala Leu Ile Asn Leu Ala Ala Glu Leu Thr Gly Val Ala Gly Ile
290 295 300
Gln Ala Asn Cys Phe
305
<210> 49
<211> 930
<212> DNA
<213> 酪丁酸梭菌(Clostridium tyrobutyricum)
<400> 49
ttgagaaaag tatttttaag atcaataatt tcaacattag ttatgtgtgc atttgtttca 60
agcagctttt cagtaaatgc ggatgaaagc aaaccaaatg atgaaaaaat aattaataac 120
atagaaaacg ttactactac taaagatatt gtaaaaagta ataaaaataa tattgtatat 180
ttagatgaag gtgtaatgag tattccattg tctgggagaa aacccattgc tattaaagat 240
gataataata aagaagattt aactgttaca ttacctatta agaatactgg agatatatct 300
aaaattagta gtaatggtac tattctgtat aaaaataata gtagtaattc atctaatata 360
gctttacaac ctaaaaatga tggatttaag gctttaataa atattaatga taagttagct 420
aataaagaat atgaatttac atttaattta cccaaaaaca gtaaattaat tagtgctgcc 480
acatatttgg gtaaagaata tgatacaaaa gaagtatttg tagtagacaa aaataatata 540
attacgagta ttattagtcc agcttgggct aaagatgcaa atggacataa tgtttctact 600
tattataaga tagtatcgaa taataaatta gtacaagttg ttgaattcac agaaaatact 660
gcattcccgg tggtagctga tcctaattgg actaaaattg ggaaatgcgc tgggtcaata 720
gcatgggcta taggttctgg cctttttggt ggagcaaagc taattaaaat aaaaaaatat 780
atagcagagc ttggaggact tcaaaaagca gctaaattat tagttggtgc aaccacttgg 840
gaagaaaaat tacacgcagg cggttatgca ttaattaact tagctgctga gctaacaggt 900
gtagcaggta tacaagcaaa ttgtttttaa 930
<210> 50
<211> 62
<212> PRT
<213> 凝结芽胞杆菌(Bacillus coagulans)
<400> 50
Met Lys Lys Ile Glu Lys Leu Thr Glu Lys Glu Met Ala Asn Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Thr Cys Gly Lys His Ser Cys
20 25 30
Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Thr Thr Cys Ile Ile Asn Asn Gly Ala
35 40 45
Met Ala Trp Ala Thr Gly Gly His Gln Gly Thr His Lys Cys
50 55 60
<210> 51
<211> 189
<212> DNA
<213> 凝结芽胞杆菌(Bacillus coagulans)
<400> 51
atgaaaaaaa ttgaaaaatt aactgaaaaa gaaatggcca atatcattgg tggtaaatac 60
tacggtaatg gggttacttg tggcaaacat tcctgctctg ttgactgggg taaggctacc 120
acctgcataa tcaataatgg agctatggca tgggctactg gtggacatca aggtactcat 180
aaatgctag 189
<210> 52
<211> 490
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 52
Met Asp Lys Val Thr Asp Asn Ser Pro Asp Val Glu Ser Thr Glu Ser
1 5 10 15
Thr Glu Gly Ser Phe Pro Thr Val Gly Val Asp Thr Gly Asp Thr Ile
20 25 30
Thr Ala Thr Leu Ala Thr Gly Thr Glu Asn Val Gly Gly Gly Gly Gly
35 40 45
Ala Phe Gly Gly Ala Ser Glu Ser Ser Ala Ala Ile His Ala Thr Ala
50 55 60
Lys Trp Ser Thr Ala Gln Leu Lys Lys His Gln Ala Glu Gln Ala Ala
65 70 75 80
Arg Ala Ala Ala Ala Glu Ala Ala Leu Ala Lys Ala Lys Ser Gln Arg
85 90 95
Asp Ala Leu Thr Gln Arg Leu Lys Asp Ile Val Asn Asp Ala Leu Arg
100 105 110
Ala Asn Ala Ala Arg Ser Pro Ser Val Thr Asp Leu Ala His Ala Asn
115 120 125
Asn Met Ala Met Gln Ala Glu Ala Glu Arg Leu Arg Leu Ala Lys Ala
130 135 140
Glu Gln Lys Ala Arg Glu Glu Ala Glu Ala Ala Glu Lys Ala Leu Arg
145 150 155 160
Glu Ala Glu Arg Gln Arg Asp Glu Ile Ala Arg Gln Gln Ala Glu Thr
165 170 175
Ala His Leu Leu Ala Met Ala Glu Ala Ala Glu Ala Glu Lys Asn Arg
180 185 190
Gln Asp Ser Leu Asp Glu Glu His Arg Ala Val Glu Val Ala Glu Lys
195 200 205
Lys Leu Ala Glu Ala Lys Ala Glu Leu Ala Lys Ala Glu Ser Asp Val
210 215 220
Gln Ser Lys Gln Ala Ile Val Ser Arg Val Ala Gly Glu Leu Glu Asn
225 230 235 240
Ala Gln Lys Ser Val Asp Val Lys Val Thr Gly Phe Pro Gly Trp Arg
245 250 255
Asp Val Gln Lys Lys Leu Glu Arg Gln Leu Gln Asp Lys Lys Asn Glu
260 265 270
Tyr Ser Ser Val Thr Asn Ala Leu Asn Ser Ala Val Ser Ile Arg Asp
275 280 285
Ala Lys Lys Thr Glu Val Gln Asn Ala Glu Ile Lys Leu Lys Glu Ala
290 295 300
Lys Asp Ala Leu Glu Lys Ser Gln Val Lys Asp Ser Val Asp Thr Met
305 310 315 320
Val Gly Phe Tyr Gln Tyr Ile Thr Glu Gln Tyr Gly Glu Lys Tyr Ser
325 330 335
Arg Ile Ala Gln Asp Leu Ala Glu Lys Ala Lys Gly Ser Lys Phe Asn
340 345 350
Ser Val Asp Glu Ala Leu Ala Ala Phe Glu Lys Tyr Lys Asn Val Leu
355 360 365
Asp Lys Lys Phe Ser Lys Val Asp Arg Asp Asp Ile Phe Asn Ala Leu
370 375 380
Glu Ser Ile Thr Tyr Asp Glu Trp Ala Lys His Leu Glu Lys Ile Ser
385 390 395 400
Arg Ala Leu Lys Val Thr Gly Tyr Leu Ser Phe Gly Tyr Asp Val Trp
405 410 415
Asp Gly Thr Leu Lys Gly Leu Lys Thr Gly Asp Trp Lys Pro Leu Phe
420 425 430
Val Thr Leu Glu Lys Ser Ala Val Asp Phe Gly Val Ala Lys Ile Val
435 440 445
Ala Leu Met Phe Ser Phe Ile Val Gly Ala Pro Leu Gly Phe Trp Gly
450 455 460
Ile Ala Ile Ile Thr Gly Ile Val Ser Ser Tyr Ile Gly Asp Asp Glu
465 470 475 480
Leu Asn Lys Leu Asn Glu Leu Leu Gly Ile
485 490
<210> 53
<211> 1473
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 53
atggataaag tcactgataa ttctccagat gtggagagca cagaatctac tgaggggtca 60
ttcccaactg ttggggttga tactggcgat acgattacag cgacgcttgc aactggaact 120
gaaaatgttg gtggaggcgg tggagcattt ggtggggcca gtgaaagttc tgctgcgata 180
catgcaaccg ctaaatggtc taccgcgcag ttgaaaaaac atcaggctga acaggctgcc 240
cgtgctgctg cggctgaggc agcattggca aaagcgaaat ctcagcgtga tgccctgact 300
caacgtctca aggatattgt taatgacgct ttacgtgcta atgccgctcg tagtccatca 360
gtaactgacc ttgctcatgc caataatatg gcaatgcagg cagaggctga gcgtttgcgc 420
cttgcgaagg cagagcaaaa agcccgtgaa gaagctgaag cagcagaaaa agcgctccgg 480
gaagcagaac gccaacgtga tgagattgcc cgccaacagg ctgaaaccgc gcatttgtta 540
gcaatggcgg aggcagcaga ggctgagaaa aatcgacagg attctcttga tgaagagcat 600
cgggctgtgg aagtggcaga gaagaagctg gctgaggcta aagctgaact ggcgaaggcc 660
gaaagcgatg tacagagtaa gcaagcgatt gtttccagag ttgcagggga gcttgaaaac 720
gctcaaaaaa gtgttgatgt gaaggttacc ggatttcctg gatggcgtga tgttcagaaa 780
aaactggaga gacaattgca ggataagaag aatgaatatt cgtcagtgac gaatgctctt 840
aattctgctg ttagcattag agatgctaaa aaaacagaag ttcagaatgc tgagataaaa 900
ttaaaagaag ctaaggatgc tcttgagaag agtcaggtaa aagactctgt tgatactatg 960
gttgggtttt atcaatatat aaccgaacaa tatggggaaa aatattccag aatagctcag 1020
gatttagctg aaaaggcgaa gggtagtaaa tttaatagtg ttgatgaagc acttgctgca 1080
tttgaaaagt ataaaaatgt actggataag aaattcagta aggttgatag ggatgatatt 1140
tttaatgctt tagagtctat tacttatgat gagtgggcca agcatctaga aaagatctct 1200
agggctctta aggttactgg atatttgtct ttcgggtatg atgtatggga tggtacccta 1260
aagggattaa aaacaggaga ctggaagcct ttatttgtca ctctggagaa gagcgcggta 1320
gatttcggcg tggcaaaaat tgtggcatta atgtttagtt ttattgttgg tgcgcctctt 1380
ggcttctggg gaattgcaat tatcacaggt attgtttctt cttacatagg ggatgatgag 1440
ttgaacaagc ttaatgaatt actaggtatt taa 1473
<210> 54
<211> 522
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 54
Met Glu Thr Ala Val Ala Tyr Tyr Lys Asp Gly Val Pro Tyr Asp Asp
1 5 10 15
Lys Gly Gln Val Ile Ile Thr Leu Leu Asn Gly Thr Pro Asp Gly Ser
20 25 30
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Lys Gly Gly Ser Lys Ser Glu Ser Ser
35 40 45
Ala Ala Ile His Ala Thr Ala Lys Trp Ser Thr Ala Gln Leu Lys Lys
50 55 60
Thr Gln Ala Glu Gln Ala Ala Arg Ala Lys Ala Ala Ala Glu Ala Gln
65 70 75 80
Ala Lys Ala Lys Ala Asn Arg Asp Ala Leu Thr Gln Arg Leu Lys Asp
85 90 95
Ile Val Asn Glu Ala Leu Arg His Asn Ala Ser Arg Thr Pro Ser Ala
100 105 110
Thr Glu Leu Ala His Ala Asn Asn Ala Ala Met Gln Ala Glu Asp Glu
115 120 125
Arg Leu Arg Leu Ala Lys Ala Glu Glu Lys Ala Arg Lys Glu Ala Glu
130 135 140
Ala Ala Glu Lys Ala Phe Gln Glu Ala Glu Gln Arg Arg Lys Glu Ile
145 150 155 160
Glu Arg Glu Lys Ala Glu Thr Glu Arg Gln Leu Lys Leu Ala Glu Ala
165 170 175
Glu Glu Lys Arg Leu Ala Ala Leu Ser Glu Glu Ala Lys Ala Val Glu
180 185 190
Ile Ala Gln Lys Lys Leu Ser Ala Ala Gln Ser Glu Val Val Lys Met
195 200 205
Asp Gly Glu Ile Lys Thr Leu Asn Ser Arg Leu Ser Ser Ser Ile His
210 215 220
Ala Arg Asp Ala Glu Met Lys Thr Leu Ala Gly Lys Arg Asn Glu Leu
225 230 235 240
Ala Gln Ala Ser Ala Lys Tyr Lys Glu Leu Asp Glu Leu Val Lys Lys
245 250 255
Leu Ser Pro Arg Ala Asn Asp Pro Leu Gln Asn Arg Pro Phe Phe Glu
260 265 270
Ala Thr Arg Arg Arg Val Gly Ala Gly Lys Ile Arg Glu Glu Lys Gln
275 280 285
Lys Gln Val Thr Ala Ser Glu Thr Arg Ile Asn Arg Ile Asn Ala Asp
290 295 300
Ile Thr Gln Ile Gln Lys Ala Ile Ser Gln Val Ser Asn Asn Arg Asn
305 310 315 320
Ala Gly Ile Ala Arg Val His Glu Ala Glu Glu Asn Leu Lys Lys Ala
325 330 335
Gln Asn Asn Leu Leu Asn Ser Gln Ile Lys Asp Ala Val Asp Ala Thr
340 345 350
Val Ser Phe Tyr Gln Thr Leu Thr Glu Lys Tyr Gly Glu Lys Tyr Ser
355 360 365
Lys Met Ala Gln Glu Leu Ala Asp Lys Ser Lys Gly Lys Lys Ile Gly
370 375 380
Asn Val Asn Glu Ala Leu Ala Ala Phe Glu Lys Tyr Lys Asp Val Leu
385 390 395 400
Asn Lys Lys Phe Ser Lys Ala Asp Arg Asp Ala Ile Phe Asn Ala Leu
405 410 415
Ala Ser Val Lys Tyr Asp Asp Trp Ala Lys His Leu Asp Gln Phe Ala
420 425 430
Lys Tyr Leu Lys Ile Thr Gly His Val Ser Phe Gly Tyr Asp Val Val
435 440 445
Ser Asp Ile Leu Lys Ile Lys Asp Thr Gly Asp Trp Lys Pro Leu Phe
450 455 460
Leu Thr Leu Glu Lys Lys Ala Ala Asp Ala Gly Val Ser Tyr Val Val
465 470 475 480
Ala Leu Leu Phe Ser Leu Leu Ala Gly Thr Thr Leu Gly Ile Trp Gly
485 490 495
Ile Ala Ile Val Thr Gly Ile Leu Cys Ser Tyr Ile Asp Lys Asn Lys
500 505 510
Leu Asn Thr Ile Asn Glu Val Leu Gly Ile
515 520
<210> 55
<211> 1569
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 55
atggaaaccg cggtagcgta ctataaagat ggtgttcctt atgatgataa gggacaggta 60
attattactc ttttgaatgg tactcctgac gggagtggct ctggcggcgg aggtggaaaa 120
ggaggcagta aaagtgaaag ttctgcagct attcatgcaa ctgctaaatg gtctactgct 180
caattaaaga aaacacaggc agagcaggct gcccgggcaa aagctgcagc ggaagcacag 240
gcgaaagcaa aggcaaacag ggatgcgctg actcagcgcc tgaaggatat cgtgaatgag 300
gctcttcgtc acaatgcctc acgtacgcct tcagcaacag agcttgctca tgctaataat 360
gcagctatgc aggcggaaga cgagcgtttg cgccttgcga aagcagaaga aaaagcccgt 420
aaagaagcgg aagcagcaga aaaggctttt caggaagcag aacaacgacg taaagagatt 480
gaacgggaga aggctgaaac agaacgccag ttgaaactgg ctgaagctga agagaaacga 540
ctggctgcat tgagtgaaga agctaaagct gttgagatcg cccaaaaaaa actttctgct 600
gcacaatctg aagtggtgaa aatggatgga gagattaaga ctctcaattc tcgtttaagc 660
tccagtatcc atgcccgtga tgcagaaatg aaaacgctcg ctggaaaacg aaatgaactg 720
gctcaggcat ccgctaaata taaagaactg gatgagctgg tcaaaaaact atcaccaaga 780
gccaatgatc cgcttcagaa ccgtcctttt tttgaagcaa ccagacgacg ggttggggcc 840
ggtaagatta gagaagaaaa acaaaaacag gtaacagcat cagaaacacg tattaaccgg 900
ataaatgctg atataactca gatccagaag gctatttctc aggtcagtaa taatcgtaat 960
gccggtatcg ctcgtgttca tgaagctgaa gaaaatttga aaaaagcaca gaataatctc 1020
cttaattcac agattaagga tgctgttgat gcaacagtta gcttttatca aacgctgact 1080
gaaaaatatg gtgaaaaata ttcgaaaatg gcacaggaac ttgctgataa gtctaaaggt 1140
aagaaaatcg gcaatgtgaa tgaagctctc gctgcttttg aaaaatacaa ggatgtttta 1200
aataagaaat tcagcaaagc cgatcgtgat gctattttta atgcgttggc atcggtgaag 1260
tatgatgact gggctaaaca tttagatcag tttgccaagt acttgaagat tacggggcat 1320
gtttcttttg gatatgatgt ggtatctgat atcctaaaaa ttaaggatac aggtgactgg 1380
aagccactat ttcttacatt agagaagaaa gctgcagatg caggggtgag ttatgttgtt 1440
gctttacttt ttagcttgct tgctggaact acattaggta tttggggtat tgctattgtt 1500
acaggaattc tatgctccta tattgataag aataaactta atactataaa tgaggtgtta 1560
gggatttaa 1569
<210> 56
<211> 626
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 56
Met Ser Asp Pro Val Arg Ile Thr Asn Pro Gly Ala Glu Ser Leu Gly
1 5 10 15
Tyr Asp Ser Asp Gly His Glu Ile Met Ala Val Asp Ile Tyr Val Asn
20 25 30
Pro Pro Arg Val Asp Val Phe His Gly Thr Pro Pro Ala Trp Ser Ser
35 40 45
Phe Gly Asn Lys Thr Ile Trp Gly Gly Asn Glu Trp Val Asp Asp Ser
50 55 60
Pro Thr Arg Ser Asp Ile Glu Lys Arg Asp Lys Glu Ile Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Lys Asn Thr Leu Ser Ala Gln Gln Lys Glu Asn Glu Asn Lys Arg Thr
85 90 95
Glu Ala Gly Lys Arg Leu Ser Ala Ala Ile Ala Ala Arg Glu Lys Asp
100 105 110
Glu Asn Thr Leu Lys Thr Leu Arg Ala Gly Asn Ala Asp Ala Ala Asp
115 120 125
Ile Thr Arg Gln Glu Phe Arg Leu Leu Gln Ala Glu Leu Arg Glu Tyr
130 135 140
Gly Phe Arg Thr Glu Ile Ala Gly Tyr Asp Ala Leu Arg Leu His Thr
145 150 155 160
Glu Ser Arg Met Leu Phe Ala Asp Ala Asp Ser Leu Arg Ile Ser Pro
165 170 175
Arg Glu Ala Arg Ser Leu Ile Glu Gln Ala Glu Lys Arg Gln Lys Asp
180 185 190
Ala Gln Asn Ala Asp Lys Lys Ala Ala Asp Met Leu Ala Glu Tyr Glu
195 200 205
Arg Arg Lys Gly Ile Leu Asp Thr Arg Leu Ser Glu Leu Glu Lys Asn
210 215 220
Gly Gly Ala Ala Leu Ala Val Leu Asp Ala Gln Gln Ala Arg Leu Leu
225 230 235 240
Gly Gln Gln Thr Arg Asn Asp Arg Ala Ile Ser Glu Ala Arg Asn Lys
245 250 255
Leu Ser Ser Val Thr Glu Ser Leu Asn Thr Ala Arg Asn Ala Leu Thr
260 265 270
Arg Ala Glu Gln Gln Leu Thr Gln Gln Lys Asn Thr Pro Asp Gly Lys
275 280 285
Thr Ile Val Ser Pro Glu Lys Phe Pro Gly Arg Ser Ser Thr Asn His
290 295 300
Ser Ile Val Val Ser Gly Asp Pro Arg Phe Ala Gly Thr Ile Lys Ile
305 310 315 320
Thr Thr Ser Ala Val Ile Asp Asn Arg Ala Asn Leu Asn Tyr Leu Leu
325 330 335
Ser His Ser Gly Leu Asp Tyr Lys Arg Asn Ile Leu Asn Asp Arg Asn
340 345 350
Pro Val Val Thr Glu Asp Val Glu Gly Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Ala
355 360 365
Glu Val Ala Glu Trp Asp Lys Leu Arg Gln Arg Leu Leu Asp Ala Arg
370 375 380
Asn Lys Ile Thr Ser Ala Glu Ser Ala Val Asn Ser Ala Arg Asn Asn
385 390 395 400
Leu Ser Ala Arg Thr Asn Glu Gln Lys His Ala Asn Asp Ala Leu Asn
405 410 415
Ala Leu Leu Lys Glu Lys Glu Asn Ile Arg Asn Gln Leu Ser Gly Ile
420 425 430
Asn Gln Lys Ile Ala Glu Glu Lys Arg Lys Gln Asp Glu Leu Lys Ala
435 440 445
Thr Lys Asp Ala Ile Asn Phe Thr Thr Glu Phe Leu Lys Ser Val Ser
450 455 460
Glu Lys Tyr Gly Ala Lys Ala Glu Gln Leu Ala Arg Glu Met Ala Gly
465 470 475 480
Gln Ala Lys Gly Lys Lys Ile Arg Asn Val Glu Glu Ala Leu Lys Thr
485 490 495
Tyr Glu Lys Tyr Arg Ala Asp Ile Asn Lys Lys Ile Asn Ala Lys Asp
500 505 510
Arg Ala Ala Ile Ala Ala Ala Leu Glu Ser Val Lys Leu Ser Asp Ile
515 520 525
Ser Ser Asn Leu Asn Arg Phe Ser Arg Gly Leu Gly Tyr Ala Gly Lys
530 535 540
Phe Thr Ser Leu Ala Asp Trp Ile Thr Glu Phe Gly Lys Ala Val Arg
545 550 555 560
Thr Glu Asn Trp Arg Pro Leu Phe Val Lys Thr Glu Thr Ile Ile Ala
565 570 575
Gly Asn Ala Ala Thr Ala Leu Val Ala Leu Val Phe Ser Ile Leu Thr
580 585 590
Gly Ser Ala Leu Gly Ile Ile Gly Tyr Gly Leu Leu Met Ala Val Thr
595 600 605
Gly Ala Leu Ile Asp Glu Ser Leu Val Glu Lys Ala Asn Lys Phe Trp
610 615 620
Gly Ile
625
<210> 57
<211> 1881
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 57
atgtctgacc ctgtacgtat tacaaatccc ggtgcagaat cgctggggta tgattcagat 60
ggccatgaaa ttatggccgt tgatatttat gtaaaccctc cacgtgtcga tgtctttcat 120
ggtaccccgc ctgcatggag ttccttcggg aacaaaacca tctggggcgg aaacgagtgg 180
gttgatgatt ccccaacccg aagtgatatc gaaaaaaggg acaaggaaat cacagcgtac 240
aaaaacacgc tcagcgcgca gcagaaagag aatgagaata agcgtactga agccggaaaa 300
cgcctctctg cggcgattgc tgcaagggaa aaagatgaaa acacactgaa aacactccgt 360
gccggaaacg cagatgccgc tgatattaca cgacaggagt tcagactcct gcaggcagag 420
ctgagagaat acggattccg tactgaaatc gccggatatg acgccctccg gctgcataca 480
gagagccgga tgctgtttgc tgatgctgat tctcttcgta tatctccccg ggaggccagg 540
tcgttaatcg aacaggctga aaaacggcag aaggatgcgc agaacgcaga caagaaggcc 600
gctgatatgc ttgctgaata cgagcgcaga aaaggtattc tggacacccg gttgtcagag 660
ctggaaaaaa atggcggggc agcccttgcc gttcttgatg cacaacaggc ccgtctgctc 720
gggcagcaga cacggaatga cagggccatt tcagaggccc ggaataaact cagttcagtg 780
acggaatcgc ttaacacggc ccgtaatgca ttaaccagag ctgaacaaca gctgacgcaa 840
cagaaaaaca cgcctgacgg caaaacgata gtttcccctg aaaaattccc ggggcgttca 900
tcaacaaatg attctattgt tgtgagcggt gatccgagat ttgccggtac gataaaaatc 960
acaaccagcg cagtcatcga taaccgtgca aacctgaatt atcttctgag ccattccggt 1020
ctggactata aacgcaatat tctgaatgac cggaatccgg tggtgacaga ggatgtggaa 1080
ggtgacaaga aaatttataa tgctgaagtt gctgaatggg ataagttacg gcaaagattg 1140
cttgatgcca gaaataaaat cacctctgct gaatctgcgg taaattcggc gagaaataac 1200
ctcagtgcca gaacaaatga gcaaaagcat gcaaatgacg ctcttaatgc cctgttgaag 1260
gaaaaagaga atatccgtaa ccagctttcc ggcatcaatc agaagatagc ggaagagaaa 1320
agaaaacagg atgaactgaa ggcaacgaaa gacgcaatta atttcacaac agagttcctg 1380
aaatcagttt cagaaaaata tggtgcaaaa gctgagcagt tagccagaga gatggccggg 1440
caggctaaag ggaagaaaat acgtaatgtt gaagaggcat taaaaacgta tgaaaagtac 1500
cgggctgaca ttaacaaaaa aattaatgca aaagatcgtg cagcgattgc cgcagccctt 1560
gagtctgtga agctgtctga tatatcgtct aatctgaaca gattcagtcg gggactggga 1620
tatgcaggaa aatttacaag tcttgctgac tggatcactg agtttggtaa ggctgtccgg 1680
acagagaact ggcgtcctct ttttgttaaa acagaaacca tcatagcagg caatgccgca 1740
acggctcttg tggcactggt cttcagtatt cttaccggaa gcgctttagg cattatcggg 1800
tatggtttac tgatggctgt caccggtgcg ctgattgatg aatcgcttgt ggaaaaagcg 1860
aataagttct ggggtattta a 1881
<210> 58
<211> 626
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 58
Met Ser Asp Pro Val Arg Ile Thr Asn Pro Gly Ala Glu Ser Leu Gly
1 5 10 15
Tyr Asp Ser Asp Gly His Glu Ile Met Ala Val Asp Ile Tyr Val Asn
20 25 30
Pro Pro Arg Val Asp Val Phe His Gly Thr Pro Pro Ala Trp Ser Ser
35 40 45
Phe Gly Asn Lys Thr Ile Trp Gly Gly Asn Glu Trp Val Asp Asp Ser
50 55 60
Pro Thr Arg Ser Asp Ile Glu Lys Arg Asp Lys Glu Ile Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Lys Asn Thr Leu Ser Ala Gln Gln Lys Glu Asn Glu Asn Lys Arg Thr
85 90 95
Glu Ala Gly Lys Arg Leu Ser Ala Ala Ile Ala Ala Arg Glu Lys Asp
100 105 110
Glu Asn Thr Leu Lys Thr Leu Arg Ala Gly Asn Ala Asp Ala Ala Asp
115 120 125
Ile Thr Arg Gln Glu Phe Arg Leu Leu Gln Ala Glu Leu Arg Glu Tyr
130 135 140
Gly Phe Arg Thr Glu Ile Ala Gly Tyr Asp Ala Leu Arg Leu His Thr
145 150 155 160
Glu Ser Arg Met Leu Phe Ala Asp Ala Asp Ser Leu Arg Ile Ser Pro
165 170 175
Arg Glu Ala Arg Ser Leu Ile Glu Gln Ala Glu Lys Arg Gln Lys Asp
180 185 190
Ala Gln Asn Ala Asp Lys Lys Ala Ala Asp Met Leu Ala Glu Tyr Glu
195 200 205
Arg Arg Lys Gly Ile Leu Asp Thr Arg Leu Ser Glu Leu Glu Lys Asn
210 215 220
Gly Gly Ala Ala Leu Ala Val Leu Asp Ala Gln Gln Ala Arg Leu Leu
225 230 235 240
Gly Gln Gln Thr Arg Asn Asp Arg Ala Ile Ser Glu Ala Arg Asn Lys
245 250 255
Leu Ser Ser Val Thr Glu Ser Leu Lys Thr Ala Arg Asn Ala Leu Thr
260 265 270
Arg Ala Glu Gln Gln Leu Thr Gln Gln Lys Asn Thr Pro Asp Gly Lys
275 280 285
Thr Ile Val Ser Pro Glu Lys Phe Pro Gly Arg Ser Ser Thr Asn His
290 295 300
Ser Ile Val Val Ser Gly Asp Pro Arg Phe Ala Gly Thr Ile Lys Ile
305 310 315 320
Thr Thr Ser Ala Val Ile Asp Asn Arg Ala Asn Leu Asn Tyr Leu Leu
325 330 335
Thr His Ser Gly Leu Asp Tyr Lys Arg Asn Ile Leu Asn Asp Arg Asn
340 345 350
Pro Val Val Thr Glu Asp Val Glu Gly Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Ala
355 360 365
Glu Val Ala Glu Trp Asp Lys Leu Arg Gln Arg Leu Leu Asp Ala Arg
370 375 380
Asn Lys Ile Thr Ser Ala Glu Ser Ala Ile Asn Ser Ala Arg Asn Asn
385 390 395 400
Val Ser Ala Arg Thr Asn Glu Gln Lys His Ala Asn Asp Ala Leu Asn
405 410 415
Ala Leu Leu Lys Glu Lys Glu Asn Ile Arg Ser Gln Leu Ala Asp Ile
420 425 430
Asn Gln Lys Ile Ala Glu Glu Lys Arg Lys Arg Asp Glu Ile Asn Met
435 440 445
Val Lys Asp Ala Ile Lys Leu Thr Ser Asp Phe Tyr Arg Thr Ile Tyr
450 455 460
Asp Glu Phe Gly Lys Gln Ala Ser Glu Leu Ala Lys Glu Leu Ala Ser
465 470 475 480
Val Ser Gln Gly Lys Gln Ile Lys Ser Val Asp Asp Ala Leu Asn Ala
485 490 495
Phe Asp Lys Phe Arg Asn Asn Leu Asn Lys Lys Tyr Asn Ile Gln Asp
500 505 510
Arg Met Ala Ile Ser Lys Ala Leu Glu Ala Ile Asn Gln Val His Met
515 520 525
Ala Glu Asn Phe Lys Leu Phe Ser Lys Ala Phe Gly Phe Thr Gly Lys
530 535 540
Val Ile Glu Arg Tyr Asp Val Ala Val Glu Leu Gln Lys Ala Val Lys
545 550 555 560
Thr Asp Asn Trp Arg Pro Phe Phe Val Lys Leu Glu Ser Leu Ala Ala
565 570 575
Gly Arg Ala Ala Ser Ala Val Thr Ala Trp Ala Phe Ser Val Met Leu
580 585 590
Gly Thr Pro Val Gly Ile Leu Gly Phe Ala Ile Ile Met Ala Ala Val
595 600 605
Ser Ala Leu Val Asn Asp Lys Phe Ile Glu Gln Val Asn Lys Leu Ile
610 615 620
Gly Ile
625
<210> 59
<211> 1881
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 59
atgtctgacc ctgtacgtat tacaaatccc ggtgcagaat cgctgggata tgattcagat 60
ggccatgaaa ttatggccgt tgatatttat gtaaaccctc cacgtgtcga tgtctttcat 120
ggtaccccgc ctgcatggag ttccttcggg aacaaaacca tctggggtgg aaacgagtgg 180
gtcgatgatt ccccaacccg aagtgatatc gaaaaaaggg acaaggaaat cacagcgtac 240
aaaaacacgc tcagcgcgca gcagaaagag aatgagaata agcgtactga agctggaaaa 300
cgcctttctg cggcaattgc tgcaagggaa aaagatgaaa acacactgaa aacactccgt 360
gccggaaacg cagatgccgc tgatattaca cgacaggagt tcagactcct gcaggcagag 420
ctgagagaat acggattccg tactgaaatc gccggatatg atgccctccg gctgcataca 480
gagagccgga tgctgtttgc tgatgctgat tctcttcgta tatctccccg cgaggccagg 540
tcgttaatcg aacaggctga aaaacggcag aaggatgcgc agaacgcaga caagaaggcc 600
gctgatatgc ttgctgaata cgagcgcaga aaaggtattc tggacacgcg gttgtcagag 660
ctggaaaaaa atggcggggc agcccttgcc gttcttgatg cacaacaggc ccgtctgctc 720
gggcagcaga cacggaatga cagggccatt tcagaggccc ggaataaact cagttcggtg 780
acggaatcgc ttaagacggc ccgtaatgca ttaaccagag ctgaacaaca gctgacgcaa 840
cagaaaaaca cgcctgacgg caaaacgata gtttcccctg aaaaattccc ggggcgttca 900
tcaacaaatc attctattgt tgtgagtggt gatccgaggt ttgccggtac gataaaaatc 960
acaaccagcg cggtcatcga taaccgtgca aacctgaatt atcttctgac ccattccggt 1020
ctggactata aacgcaatat tctgaatgac cggaatccgg tggtgacaga ggatgtggaa 1080
ggtgacaaga aaatttataa tgctgaagtt gctgaatggg ataagttacg gcaacgattg 1140
cttgatgcca gaaataaaat cacctctgct gaatctgcga taaattcggc gagaaataac 1200
gtcagtgcca gaacaaatga acaaaagcat gcaaatgacg ctcttaatgc cctgttgaag 1260
gaaaaagaga atatccgtag ccagcttgct gacatcaatc agaaaatagc tgaagagaaa 1320
agaaaaaggg atgaaataaa tatggtaaag gatgccataa aactcacctc tgatttctac 1380
agaacgatat atgatgagtt cggtaaacaa gcatccgaac ttgctaagga gctggcttct 1440
gtatctcaag ggaaacagat taagagtgtg gatgatgcac tgaacgcttt tgataaattc 1500
cgtaataatc tgaacaagaa atataacata caagatcgca tggccatttc taaagccctg 1560
gaagctatta atcaggtcca tatggcggag aattttaagc tgttcagtaa ggcatttggt 1620
tttaccggaa aagttattga acgttatgat gttgctgtgg agttacaaaa ggctgtaaaa 1680
acggacaact ggcgtccatt ttttgtaaaa cttgaatcac tggcagcagg aagagctgct 1740
tcagcagtta cagcatgggc gttttccgtc atgctgggaa cccctgtagg tattctgggt 1800
tttgcaatta ttatggcggc tgtgagtgcg cttgttaatg ataagtttat tgagcaggtc 1860
aataaactta ttggtatctg a 1881
<210> 60
<211> 271
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 60
Met Glu Thr Leu Thr Val His Ala Pro Ser Pro Ser Thr Asn Leu Pro
1 5 10 15
Ser Tyr Gly Asn Gly Ala Phe Ser Leu Ser Ala Pro His Val Pro Gly
20 25 30
Ala Gly Pro Leu Leu Val Gln Val Val Tyr Ser Phe Phe Gln Ser Pro
35 40 45
Asn Met Cys Leu Gln Ala Leu Thr Gln Leu Glu Asp Tyr Ile Lys Lys
50 55 60
His Gly Ala Ser Asn Pro Leu Thr Leu Gln Ile Ile Ser Thr Asn Ile
65 70 75 80
Gly Tyr Phe Cys Asn Ala Asp Arg Asn Leu Val Leu His Pro Gly Ile
85 90 95
Ser Val Tyr Asp Ala Tyr His Phe Ala Lys Pro Ala Pro Ser Gln Tyr
100 105 110
Asp Tyr Arg Ser Met Asn Met Lys Gln Met Ser Gly Asn Val Thr Thr
115 120 125
Pro Ile Val Ala Leu Ala His Tyr Leu Trp Gly Asn Gly Ala Glu Arg
130 135 140
Ser Val Asn Ile Ala Asn Ile Gly Leu Lys Ile Ser Pro Met Lys Ile
145 150 155 160
Asn Gln Ile Lys Asp Ile Ile Lys Ser Gly Val Val Gly Thr Phe Pro
165 170 175
Val Ser Thr Lys Phe Thr His Ala Thr Gly Asp Tyr Asn Val Ile Thr
180 185 190
Gly Ala Tyr Leu Gly Asn Ile Thr Leu Lys Thr Glu Gly Thr Leu Thr
195 200 205
Ile Ser Ala Asn Gly Ser Trp Thr Tyr Asn Gly Val Val Arg Ser Tyr
210 215 220
Asp Asp Lys Tyr Asp Phe Asn Ala Ser Thr His Arg Gly Ile Ile Gly
225 230 235 240
Glu Ser Leu Thr Arg Leu Gly Ala Met Phe Ser Gly Lys Glu Tyr Gln
245 250 255
Ile Leu Leu Pro Gly Glu Ile His Ile Lys Glu Ser Gly Lys Arg
260 265 270
<210> 61
<211> 816
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 61
atggaaacct taactgttca tgcaccatca ccatcaacta acttaccaag ttatggcaat 60
ggtgcatttt ctctttcagc accacatgtg cctggtgctg gccctctttt agtccaggtt 120
gtttatagtt ttttccagag tccaaacatg tgtcttcagg ctttaactca acttgaggat 180
tacatcaaaa aacatggggc cagcaaccct ctcacattgc agatcatatc gacaaatatt 240
ggttacttct gtaacgccga ccgaaatctg gttcttcacc ctggaataag cgtttatgac 300
gcttaccact tcgcaaaacc agcgccaagt caatatgact atcgctcaat gaatatgaaa 360
caaatgagcg gtaatgtcac tacaccaatt gtggcgcttg ctcactattt atggggtaat 420
ggcgctgaaa ggagcgttaa tatcgccaac attggtctta aaatttcccc tatgaaaatt 480
aatcagataa aagacattat aaaatctggt gtagtaggca cattccctgt ttctacaaag 540
ttcacacatg ccactggtga ttataatgtt attaccggtg catatcttgg taatatcaca 600
ctgaaaacag aaggtacttt aactatctct gccaatggct cctggactta caatggcgtt 660
gttcgttcat atgatgataa atacgatttt aacgccagca ctcaccgtgg cattatcgga 720
gagtcgctca caaggctcgg ggcgatgttt tctggtaaag agtaccagat actgcttcct 780
ggtgaaattc acattaaaga aagtggtaag cgataa 816
<210> 62
<211> 387
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 62
Met Gly Ser Asn Gly Ala Asp Asn Ala His Asn Asn Ala Phe Gly Gly
1 5 10 15
Gly Lys Asn Pro Gly Ile Gly Asn Thr Ser Gly Ala Gly Ser Asn Gly
20 25 30
Ser Ala Ser Ser Asn Arg Gly Asn Ser Asn Gly Trp Ser Trp Ser Asn
35 40 45
Lys Pro His Lys Asn Asp Gly Phe His Ser Asp Gly Ser Tyr His Ile
50 55 60
Thr Phe His Gly Asp Asn Asn Ser Lys Pro Lys Pro Gly Gly Asn Ser
65 70 75 80
Gly Asn Arg Gly Asn Asn Gly Asp Gly Ala Ser Ala Lys Val Gly Glu
85 90 95
Ile Thr Ile Thr Pro Asp Asn Ser Lys Pro Gly Arg Tyr Ile Ser Ser
100 105 110
Asn Pro Glu Tyr Ser Leu Leu Ala Lys Leu Ile Asp Ala Glu Ser Ile
115 120 125
Lys Gly Thr Glu Val Tyr Thr Phe His Thr Arg Lys Gly Gln Tyr Val
130 135 140
Lys Val Thr Val Pro Asp Ser Asn Ile Asp Lys Met Arg Val Asp Tyr
145 150 155 160
Val Asn Trp Lys Gly Pro Lys Tyr Asn Asn Lys Leu Val Lys Arg Phe
165 170 175
Val Ser Gln Phe Leu Leu Phe Arg Lys Glu Glu Lys Glu Lys Asn Glu
180 185 190
Lys Glu Ala Leu Leu Lys Ala Ser Glu Leu Val Ser Gly Met Gly Asp
195 200 205
Lys Leu Gly Glu Tyr Leu Gly Val Lys Tyr Lys Asn Val Ala Lys Glu
210 215 220
Val Ala Asn Asp Ile Lys Asn Phe His Gly Arg Asn Ile Arg Ser Tyr
225 230 235 240
Asn Glu Ala Met Ala Ser Leu Asn Lys Val Leu Ala Asn Pro Lys Met
245 250 255
Lys Val Asn Lys Ser Asp Lys Asp Ala Ile Val Asn Ala Trp Lys Gln
260 265 270
Val Asn Ala Lys Asp Met Ala Asn Lys Ile Gly Asn Leu Gly Lys Ala
275 280 285
Phe Lys Val Ala Asp Leu Ala Ile Lys Val Glu Lys Ile Arg Glu Lys
290 295 300
Ser Ile Glu Gly Tyr Asn Thr Gly Asn Trp Gly Pro Leu Leu Leu Glu
305 310 315 320
Val Glu Ser Trp Ile Ile Gly Gly Val Val Ala Gly Val Ala Ile Ser
325 330 335
Leu Phe Gly Ala Val Leu Ser Phe Leu Pro Ile Ser Gly Leu Ala Val
340 345 350
Thr Ala Leu Gly Val Ile Gly Ile Met Thr Ile Ser Tyr Leu Ser Ser
355 360 365
Phe Ile Asp Ala Asn Arg Val Ser Asn Ile Asn Asn Ile Ile Ser Ser
370 375 380
Val Ile Arg
385
<210> 63
<211> 51
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 63
gcaaatcgag tttcgaatat aaataacatt atatctagtg ttattcgatg a 51
<210> 64
<211> 103
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 64
Met Arg Thr Leu Thr Leu Asn Glu Leu Asp Ser Val Ser Gly Gly Ala
1 5 10 15
Ser Gly Arg Asp Ile Ala Met Ala Ile Gly Thr Leu Ser Gly Gln Phe
20 25 30
Val Ala Gly Gly Ile Gly Ala Ala Ala Gly Gly Val Ala Gly Gly Ala
35 40 45
Ile Tyr Asp Tyr Ala Ser Thr His Lys Pro Asn Pro Ala Met Ser Pro
50 55 60
Ser Gly Leu Gly Gly Thr Ile Lys Gln Lys Pro Glu Gly Ile Pro Ser
65 70 75 80
Glu Ala Trp Asn Tyr Ala Ala Gly Arg Leu Cys Asn Trp Ser Pro Asn
85 90 95
Asn Leu Ser Asp Val Cys Leu
100
<210> 65
<211> 312
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 65
atgagaactc tgactctaaa tgaattagat tctgtttctg gtggtgcttc agggcgtgat 60
attgcgatgg ctataggaac actatccgga caatttgttg caggaggaat tggagcagct 120
gctgggggtg tggctggagg tgcaatatat gactatgcat ccactcacaa acctaatcct 180
gcaatgtctc catccggttt aggaggaaca attaagcaaa aacccgaagg gataccttca 240
gaagcatgga actatgctgc gggaagattg tgtaattgga gtccaaataa tcttagtgat 300
gtttgtttat aa 312
<210> 66
<211> 58
<212> PRT
<213> 哥伦比亚肠球菌(Enterococcus columbae)
<400> 66
Met Met Asn Ala Thr Glu Asn Gln Ile Phe Val Glu Thr Val Ser Asp
1 5 10 15
Gln Glu Leu Glu Met Leu Ile Gly Gly Ala Gly Arg Gly Trp Ile Lys
20 25 30
Thr Leu Thr Lys Asp Cys Pro Asn Val Ile Ser Ser Ile Cys Ala Gly
35 40 45
Thr Ile Ile Thr Ala Cys Lys Asn Cys Ala
50 55
<210> 67
<211> 177
<212> DNA
<213> 哥伦比亚肠球菌(Enterococcus columbae)
<400> 67
atgatgaatg ctactgaaaa ccaaattttt gttgagactg tgagtgacca agaattagaa 60
atgttaattg gtggtgcagg tcgtggatgg attaagactt taacaaaaga ttgtccaaat 120
gtgatttctt caatttgtgc aggtacaatt attacagctt gtaaaaattg tgcttaa 177
<210> 68
<211> 59
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<400> 68
Met Asn Asn Val Lys Glu Leu Ser Met Thr Glu Leu Gln Thr Ile Thr
1 5 10 15
Gly Gly Ala Arg Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Lys Lys
20 25 30
Cys Trp Val Asn Arg Gly Glu Ala Thr Gln Ser Ile Ile Gly Gly Met
35 40 45
Ile Ser Gly Trp Ala Ser Gly Leu Ala Gly Met
50 55
<210> 69
<211> 180
<212> DNA
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<400> 69
atgaataatg taaaagaatt aagtatgaca gaattacaaa caattaccgg cggtgctaga 60
tcatatggca acggtgttta ctgtaataat aaaaaatgtt gggtaaatcg gggtgaagca 120
acgcaaagta ttattggtgg tatgattagc ggctgggcta gtggtttagc tggaatgtaa 180
<210> 70
<211> 64
<212> PRT
<213> 链霉菌属物种(Streptomyces sp.)
<400> 70
Met Arg Ser Glu Met Thr Leu Thr Ser Thr Asn Ser Ala Glu Ala Leu
1 5 10 15
Ala Ala Gln Asp Phe Ala Asn Thr Val Leu Ser Ala Ala Ala Pro Gly
20 25 30
Phe His Ala Asp Cys Glu Thr Pro Ala Met Ala Thr Pro Ala Thr Pro
35 40 45
Thr Val Ala Gln Phe Val Ile Gln Gly Ser Thr Ile Cys Leu Val Cys
50 55 60
<210> 71
<211> 195
<212> DNA
<213> 链霉菌属物种(Streptomyces sp.)
<400> 71
gtgcgatctg agatgactct tacgagcacg aattccgctg aggctctggc ggcgcaggac 60
tttgcgaaca ccgttctcag cgcggcggcc ccgggcttcc acgcggactg cgagacgccg 120
gccatggcca ccccggccac gccgaccgtc gcccagttcg tgatccaggg cagcacgatc 180
tgcctggtct gctga 195
<210> 72
<211> 65
<212> PRT
<213> 嗜碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)
<400> 72
Met Val Asn Ser Lys Asp Leu Arg Asn Pro Glu Phe Arg Lys Ala Gln
1 5 10 15
Gly Leu Gln Phe Val Asp Glu Val Asn Glu Lys Glu Leu Ser Ser Leu
20 25 30
Ala Gly Ser Gly Asp Val His Ala Gln Thr Thr Trp Pro Cys Ala Thr
35 40 45
Val Gly Val Ser Val Ala Leu Cys Pro Thr Thr Lys Cys Thr Ser Gln
50 55 60
Cys
65
<210> 73
<211> 198
<212> DNA
<213> 嗜碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)
<400> 73
atggtaaatt caaaagattt gcgtaatcct gaattccgca aagcccaagg tctacaattc 60
gttgacgagg tgaacgagaa ggaactttcg tctctagctg gttcaggaga tgtgcatgca 120
caaacaactt ggccttgcgc tacagttggt gtctccgtag ccttgtgccc aactacaaag 180
tgtacaagcc agtgctaa 198
<210> 74
<211> 66
<212> PRT
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 74
Met Lys Asn Leu Lys Glu Gly Ser Tyr Thr Ala Val Asn Thr Asp Glu
1 5 10 15
Leu Lys Ser Ile Asn Gly Gly Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr
20 25 30
Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp Val Asp Trp Gly Gln Ala Ser Gly Cys
35 40 45
Ile Gly Gln Thr Val Val Gly Gly Trp Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly
50 55 60
Lys Cys
65
<210> 75
<211> 201
<212> DNA
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 75
atgaaaaact taaaagaagg ttcatacact gctgttaata ctgatgaatt aaaaagtatc 60
aatggtggaa caaaatatta tgggaatggc gtttattgca attctaaaaa atgttgggta 120
gattggggac aagcttcagg ttgtatcggt caaactgttg ttggcggatg gctaggcgga 180
gctataccag gtaaatgcta a 201
<210> 76
<211> 63
<212> PRT
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 76
Met Ile Lys Arg Glu Lys Asn Arg Thr Ile Ser Ser Leu Gly Tyr Glu
1 5 10 15
Glu Ile Ser Asn His Lys Leu Gln Glu Ile Gln Gly Gly Lys Gly Ile
20 25 30
Leu Gly Lys Leu Gly Val Val Gln Ala Gly Val Asp Phe Val Ser Gly
35 40 45
Val Trp Ala Gly Ile Lys Gln Ser Ala Lys Asp His Pro Asn Ala
50 55 60
<210> 77
<211> 192
<212> DNA
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 77
atgattaaaa gagaaaagaa cagaacaatt tcttcccttg gttatgaaga aatttctaat 60
cataaattgc aagaaataca aggtggaaaa ggaattcttg gtaaactagg agtagtacag 120
gcaggagtgg attttgtatc aggagtgtgg gctggaataa aacagtctgc caaagatcat 180
cctaatgcgt aa 192
<210> 78
<211> 75
<212> PRT
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 78
Met Lys Lys Gln Ile Leu Lys Gly Leu Val Ile Val Val Cys Leu Ser
1 5 10 15
Gly Ala Thr Phe Phe Ser Thr Pro Gln Gln Ala Ser Ala Ala Ala Pro
20 25 30
Lys Ile Thr Gln Lys Gln Lys Asn Cys Val Asn Gly Gln Leu Gly Gly
35 40 45
Met Leu Ala Gly Ala Leu Gly Gly Pro Gly Gly Val Val Leu Gly Gly
50 55 60
Ile Gly Gly Ala Ile Ala Gly Gly Cys Phe Asn
65 70 75
<210> 79
<211> 228
<212> DNA
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 79
atgaaaaaac aaattttaaa agggttggtt atagttgttt gtttatctgg ggcaacattt 60
ttctcaacac cacaacaagc ttctgctgct gcaccgaaaa ttactcaaaa acaaaaaaat 120
tgtgttaatg gacaattagg tggaatgctt gctggagctt tgggtggacc tggcggagtt 180
gtgttaggtg gtataggtgg tgcaatagca ggaggttgtt ttaattaa 228
<210> 80
<211> 72
<212> PRT
<213> 耐久肠球菌(Enterococcus durans)
<400> 80
Met Gln Thr Ile Lys Glu Leu Asn Thr Met Glu Leu Gln Glu Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Tyr Glu Leu Asn Arg Pro Asn
20 25 30
Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Ala Ala Gly Ile Leu Gly Ala
35 40 45
Gly Leu Gly Ala Val Gly Gly Gly Pro Gly Gly Phe Ile Ser Ala Gly
50 55 60
Ile Ser Ala Val Leu Gly Cys Met
65 70
<210> 81
<211> 219
<212> DNA
<213> 耐久肠球菌(Enterococcus durans)
<400> 81
atgcaaacga tcaaagaatt gaacacgatg gaattacaag aaataattgg aggtgaaaat 60
gaccatcgga tgccttacga attgaaccgt ccaaataatt tatccaaagg tggggctaag 120
tgtgctgctg gaatacttgg cgctggacta ggcgcagtag gcggtggacc tggcggattt 180
attagtgccg gaatcagtgc tgttcttggt tgtatgtaa 219
<210> 82
<211> 72
<212> PRT
<213> 耐久肠球菌(Enterococcus durans)
<400> 82
Met Gln Thr Ile Lys Glu Leu Asn Thr Met Glu Leu Gln Lys Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Tyr Glu Leu Asn Arg Pro Asn
20 25 30
Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Ala Ala Gly Ile Leu Gly Ala
35 40 45
Gly Leu Gly Ala Val Gly Gly Gly Pro Gly Gly Phe Ile Ser Ala Gly
50 55 60
Ile Ser Ala Val Leu Gly Cys Met
65 70
<210> 83
<211> 219
<212> DNA
<213> 耐久肠球菌(Enterococcus durans)
<400> 83
atgcaaacga tcaaagaatt gaacacgatg gaattacaaa aaataattgg aggtgaaaat 60
gaccatcgga tgccttacga attgaaccgt ccaaataatt tatccaaagg tggagctaag 120
tgcgctgccg gaatacttgg tgctggatta ggcgcagtag gcggtggacc tggcggattt 180
attagtgccg gaatcagtgc tgttcttggt tgtatgtaa 219
<210> 84
<211> 220
<212> PRT
<213> 停乳链球菌似马亚种(Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis)
<400> 84
Met Lys Lys Leu Lys Arg Leu Val Ile Ser Leu Val Thr Ser Leu Leu
1 5 10 15
Val Ile Ser Ser Thr Val Pro Ala Leu Val Tyr Ala Asn Glu Thr Asn
20 25 30
Asn Phe Ala Glu Thr Gln Lys Glu Ile Thr Thr Asn Ser Glu Ala Thr
35 40 45
Leu Thr Asn Glu Asp Tyr Thr Lys Leu Thr Ser Glu Val Lys Thr Ile
50 55 60
Tyr Thr Asn Leu Ile Gln Tyr Asp Gln Thr Lys Asn Lys Phe Tyr Val
65 70 75 80
Asp Glu Asp Lys Thr Glu Gln Tyr Tyr Asn Tyr Asp Asp Glu Ser Ile
85 90 95
Lys Gly Val Tyr Leu Met Lys Asp Ser Leu Asn Asp Glu Leu Asn Asn
100 105 110
Asn Asn Ser Ser Asn Tyr Ser Glu Ile Ile Asn Gln Lys Ile Ser Glu
115 120 125
Ile Asp Tyr Val Leu Gln Gly Asn Asp Ile Asn Asn Leu Ile Pro Ser
130 135 140
Asn Thr Arg Val Lys Arg Ser Ala Asp Phe Ser Trp Ile Gln Arg Cys
145 150 155 160
Leu Glu Glu Ala Trp Gly Tyr Ala Ile Ser Leu Val Thr Leu Lys Gly
165 170 175
Ile Ile Asn Leu Phe Lys Ala Gly Lys Phe Glu Ala Ala Ala Ala Lys
180 185 190
Leu Ala Ser Ala Thr Ala Gly Arg Ile Ala Gly Met Ala Ala Leu Phe
195 200 205
Ala Phe Val Ala Thr Cys Gly Ala Thr Thr Val Ser
210 215 220
<210> 85
<211> 663
<212> DNA
<213> 停乳链球菌似马亚种(Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis)
<400> 85
atgaaaaaat taaaacgtct tgttatctct cttgttactt cattactagt aatttcaagt 60
acagttccag cacttgttta cgctaatgaa acaaataact ttgcagaaac tcaaaaagaa 120
attacaacaa attcagaagc aacattaacc aatgaagact acactaaatt aacttccgaa 180
gtaaaaacaa tttatacaaa tctgattcaa tacgaccaaa caaaaaacaa attttacgtc 240
gatgaagaca aaactgaaca atattataac tacgatgatg aaagtataaa aggggtttat 300
ctcatgaaag atagtttgaa cgatgagtta aacaataata actcttcaaa ctattctgaa 360
ataattaatc aaaaaatctc tgaaattgac tatgtccttc aaggaaacga tataaataat 420
ttaattccta gcaataccag agtaaaaaga tcagcagatt tttcttggat tcaaagatgt 480
ctagaagaag catggggata tgctattagt ctagttactc taaaaggaat aatcaatcta 540
tttaaagcag gaaaatttga agctgctgct gctaaattag cttctgctac agcaggtaga 600
atcgctggaa tggctgcctt atttgctttc gtagcaactt gcggtgcgac aactgtatca 660
taa 663
<210> 86
<211> 57
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 86
Met Lys Gln Tyr Lys Val Leu Asn Glu Lys Glu Met Lys Lys Pro Ile
1 5 10 15
Gly Gly Glu Ser Val Phe Ser Lys Ile Gly Asn Ala Val Gly Pro Ala
20 25 30
Ala Tyr Trp Ile Leu Lys Gly Leu Gly Asn Met Ser Asp Val Asn Gln
35 40 45
Ala Asp Arg Ile Asn Arg Lys Lys His
50 55
<210> 87
<211> 174
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 87
atgaagcaat ataaagtatt gaatgaaaaa gaaatgaaaa aacctattgg gggagagtcg 60
gtttttagta aaataggtaa tgctgtaggt ccagctgctt attggatttt aaaaggatta 120
ggtaatatga gtgatgtaaa ccaagctgat agaattaata gaaagaaaca ttaa 174
<210> 88
<211> 44
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 88
Met Gly Ala Ile Ala Lys Leu Val Ala Lys Phe Gly Trp Pro Ile Val
1 5 10 15
Lys Lys Tyr Tyr Lys Gln Ile Met Gln Phe Ile Gly Glu Gly Trp Ala
20 25 30
Ile Asn Lys Ile Ile Asp Trp Ile Lys Lys His Ile
35 40
<210> 89
<211> 135
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 89
atgggagcaa tcgcaaaatt agtagcaaag tttggatggc caattgttaa aaagtattac 60
aaacaaatta tgcaatttat tggagaagga tgggcaatta acaaaattat tgattggatc 120
aaaaaacata tttaa 135
<210> 90
<211> 43
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 90
Met Gly Ala Ile Ala Lys Leu Val Ala Lys Phe Gly Trp Pro Phe Ile
1 5 10 15
Lys Lys Phe Tyr Lys Gln Ile Met Gln Phe Ile Gly Gln Gly Trp Thr
20 25 30
Ile Asp Gln Ile Glu Lys Trp Leu Lys Arg His
35 40
<210> 91
<211> 132
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 91
atgggagcaa tcgcaaaatt agtagcaaag tttggatggc catttattaa aaaattctac 60
aaacaaatta tgcagtttat cggacaagga tggacaatag atcaaattga aaaatggtta 120
aaaagacatt ga 132
<210> 92
<211> 74
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 92
Met Leu Asn Lys Lys Leu Leu Glu Asn Gly Val Val Asn Ala Val Thr
1 5 10 15
Ile Asp Glu Leu Asp Ala Gln Phe Gly Gly Met Ser Lys Arg Asp Cys
20 25 30
Asn Leu Met Lys Ala Cys Cys Ala Gly Gln Ala Val Thr Tyr Ala Ile
35 40 45
His Ser Leu Leu Asn Arg Leu Gly Gly Asp Ser Ser Asp Pro Ala Gly
50 55 60
Cys Asn Asp Ile Val Arg Lys Tyr Cys Lys
65 70
<210> 93
<211> 225
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 93
atgttaaata aaaaattatt agaaaatggt gtagtaaatg ctgtaacaat tgatgaactt 60
gatgctcaat ttggtggaat gagcaaacgt gattgtaact tgatgaaggc gtgttgtgct 120
ggacaagcag taacatatgc tattcatagt cttttaaatc gattaggtgg agactctagt 180
gatccagctg gttgtaatga tattgtaaga aaatattgta aataa 225
<210> 94
<211> 65
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 94
Met Lys His Leu Lys Ile Leu Ser Ile Lys Glu Thr Gln Leu Ile Tyr
1 5 10 15
Gly Gly Thr Thr His Ser Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys
20 25 30
Thr Lys Asn Lys Cys Thr Val Asp Trp Ala Lys Ala Thr Thr Cys Ile
35 40 45
Ala Gly Met Ser Ile Gly Gly Phe Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly Lys
50 55 60
Cys
65
<210> 95
<211> 195
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 95
atgaaacatt taaaaatttt gtctattaaa gagacacaac ttatctatgg gggtaccact 60
catagtggaa aatattatgg aaatggagtg tattgcacta aaaataaatg tacggtcgat 120
tgggccaagg caactacttg tattgcagga atgtctatag gtggtttttt aggtggagca 180
attccaggga agtgc 195
<210> 96
<211> 105
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 96
Met Val Lys Glu Asn Lys Phe Ser Lys Ile Phe Ile Leu Met Ala Leu
1 5 10 15
Ser Phe Leu Gly Leu Ala Leu Phe Ser Ala Ser Leu Gln Phe Leu Pro
20 25 30
Ile Ala His Met Ala Lys Glu Phe Gly Ile Pro Ala Ala Val Ala Gly
35 40 45
Thr Val Leu Asn Val Val Glu Ala Gly Gly Trp Val Thr Thr Ile Val
50 55 60
Ser Ile Leu Thr Ala Val Gly Ser Gly Gly Leu Ser Leu Leu Ala Ala
65 70 75 80
Ala Gly Arg Glu Ser Ile Lys Ala Tyr Leu Lys Lys Glu Ile Lys Lys
85 90 95
Lys Gly Lys Arg Ala Val Ile Ala Trp
100 105
<210> 97
<211> 318
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 97
atggttaaag aaaataaatt ttctaagatt tttattttaa tggctttgag ttttttgggg 60
ttagccttgt ttagtgcaag tcttcagttt ttgcccattg cacatatggc taaagagttc 120
ggtataccag cagcagttgc aggaactgtg cttaatgtag ttgaagctgg tggatgggtc 180
actactattg tatcaattct tactgctgta ggtagcggag gtctttcttt actcgctgca 240
gcaggaagag agtcaattaa agcatacctt aagaaagaaa ttaagaaaaa aggaaaaaga 300
gcagttattg cttggtaa 318
<210> 98
<211> 71
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 98
Met Gln Asn Val Lys Glu Leu Ser Thr Lys Glu Met Lys Gln Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Glu Asn Asp His Arg Met Pro Asn Glu Leu Asn Arg Pro Asn
20 25 30
Asn Leu Ser Lys Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Ala Ile Ala Gly Gly
35 40 45
Leu Phe Gly Ile Pro Lys Gly Pro Leu Ala Trp Ala Ala Gly Leu Ala
50 55 60
Asn Val Tyr Ser Lys Cys Asn
65 70
<210> 99
<211> 216
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 99
atgcaaaatg taaaagaatt aagtacgaaa gagatgaaac aaattatcgg tggagaaaat 60
gatcacagaa tgcctaatga gttaaataga cctaacaact tatctaaagg tggagcaaaa 120
tgtggtgctg caattgctgg gggattattt ggaatcccaa aaggaccact agcatgggct 180
gctgggttag caaatgtata ctctaaatgc aactaa 216
<210> 100
<211> 58
<212> PRT
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 100
Met Lys Lys Leu Thr Ser Lys Glu Met Ala Gln Val Val Gly Gly Lys
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp
20 25 30
Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu
35 40 45
Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser
50 55
<210> 101
<211> 177
<212> DNA
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 101
ttgaagaaat taacatcaaa agaaatggca caagtagtag gtggaaaata ctacggtaat 60
ggagtctcat gtaataaaaa agggtgcagt gttgattggg gaaaagctat tggcattatt 120
ggaaataatt ctgctgcgaa tttagctact ggtggagcag ctggttggaa aagttaa 177
<210> 102
<211> 44
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 102
Met Leu Ala Lys Ile Lys Ala Met Ile Lys Lys Phe Pro Asn Pro Tyr
1 5 10 15
Thr Leu Ala Ala Lys Leu Thr Thr Tyr Glu Ile Asn Trp Tyr Lys Gln
20 25 30
Gln Tyr Gly Arg Tyr Pro Trp Glu Arg Pro Val Ala
35 40
<210> 103
<211> 135
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 103
atgttagcaa aaattaaagc gatgattaag aagtttccga acccttatac tttagcagct 60
aagctaacga cttacgaaat taattggtat aaacaacaat acggtcgtta tccttgggag 120
cgccctgtag cataa 135
<210> 104
<211> 71
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 104
Met Arg Lys Lys Leu Phe Ser Leu Ala Leu Ile Gly Ile Phe Gly Leu
1 5 10 15
Val Val Thr Asn Phe Gly Thr Lys Val Asp Ala Ala Thr Arg Ser Tyr
20 25 30
Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Ser Lys Cys Trp Val Asn Trp Gly
35 40 45
Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala Gly Ile Val Ile Ser Gly Trp Ala Ser
50 55 60
Gly Leu Ala Gly Met Gly His
65 70
<210> 105
<211> 216
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 105
atgagaaaaa aattatttag tttagctctt attggaatat ttgggttagt tgtgacaaat 60
tttggtacaa aagttgatgc agctacgcgt tcatatggta atggtgttta ttgtaataat 120
agtaaatgct gggttaactg gggagaagct aaagagaata ttgcaggaat cgttattagt 180
ggctgggctt ctggtttggc aggtatggga cattaa 216
<210> 106
<211> 34
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 106
Met Asn Phe Leu Lys Asn Gly Ile Ala Lys Trp Met Thr Gly Ala Glu
1 5 10 15
Leu Gln Ala Tyr Lys Lys Lys Tyr Gly Cys Leu Pro Trp Glu Lys Ile
20 25 30
Ser Cys
<210> 107
<211> 105
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 107
atgaattttc ttaaaaatgg tatcgcaaaa tggatgaccg gtgctgaatt gcaagcgtat 60
aaaaagaaat atggatgctt gccatgggaa aaaatttctt gttaa 105
<210> 108
<211> 76
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 108
Met Lys Lys Lys Leu Val Lys Gly Leu Val Ile Cys Gly Met Ile Gly
1 5 10 15
Ile Gly Phe Thr Ala Leu Gly Thr Asn Val Glu Ala Ala Thr Tyr Tyr
20 25 30
Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Lys Gln Lys Cys Trp Val Asp Trp Ser
35 40 45
Arg Ala Arg Ser Glu Ile Ile Asp Arg Gly Val Lys Ala Tyr Val Asn
50 55 60
Gly Phe Thr Lys Val Leu Gly Gly Ile Gly Gly Arg
65 70 75
<210> 109
<211> 231
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 109
atgaaaaaga aattagttaa aggcttagtt atttgtggca tgattgggat tggttttaca 60
gcattaggaa caaatgtaga agccgccacg tattacggaa atggtgtcta ttgcaataag 120
caaaaatgtt gggtagattg gagtagagca cgttctgaaa ttatagacag aggcgtaaaa 180
gcatacgtca atggatttac gaaagtgtta ggtggtatag gtggaagata a 231
<210> 110
<211> 60
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 110
Met Lys Lys Glu Glu Leu Val Gly Met Ala Lys Glu Asp Phe Leu Asn
1 5 10 15
Val Ile Cys Glu Asn Asp Asn Lys Leu Glu Asn Ser Gly Ala Lys Cys
20 25 30
Pro Trp Trp Asn Leu Ser Cys His Leu Gly Asn Asp Gly Lys Ile Cys
35 40 45
Thr Tyr Ser His Glu Cys Thr Ala Gly Cys Asn Ala
50 55 60
<210> 111
<211> 183
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 111
atgaaaaaag aagaattagt aggaatggct aaggaagact ttttaaatgt tatttgtgaa 60
aatgacaaca aactagaaaa tagtggagca aaatgtcctt ggtggaatct ttcttgtcat 120
ttaggcaatg atggtaaaat ttgcacttat tcacatgaat gtaccgcagg ttgtaatgca 180
taa 183
<210> 112
<211> 61
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 112
Met Thr Glu Leu Asn Lys Arg Leu Gln Leu Lys Arg Asp Val Ser Thr
1 5 10 15
Glu Asn Ser Leu Lys Lys Ile Ser Asn Thr Asp Glu Thr His Gly Gly
20 25 30
Val Thr Thr Ser Ile Pro Cys Thr Val Met Val Ser Ala Ala Val Cys
35 40 45
Pro Thr Leu Val Cys Ser Asn Lys Cys Gly Gly Arg Gly
50 55 60
<210> 113
<211> 186
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 113
atgactgaac ttaacaaaag attacaatta aaaagagatg tttcaacaga aaatagtttg 60
aaaaaaattt ctaatactga tgaaacacat gggggagtta ctacatcaat tccatgtaca 120
gtaatggtta gtgcggcagt atgtcctacc cttgtttgct cgaataaatg tggcggtaga 180
ggctag 186
<210> 114
<211> 58
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 114
Met Gln Asn Val Lys Glu Val Ser Val Lys Glu Met Lys Gln Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Ser Asn Asp Ser Leu Trp Tyr Gly Val Gly Gln Phe Met Gly
20 25 30
Lys Gln Ala Asn Cys Ile Thr Asn His Pro Val Lys His Met Ile Ile
35 40 45
Pro Gly Tyr Cys Leu Ser Lys Ile Leu Gly
50 55
<210> 115
<211> 177
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 115
atgcaaaatg taaaagaagt ttctgtaaaa gagatgaaac aaattatcgg tggttctaat 60
gatagtcttt ggtatggtgt aggacaattt atgggtaaac aagcaaactg tataacaaac 120
catcctgtta aacacatgat aattcctgga tattgtttat cgaaaatttt agggtaa 177
<210> 116
<211> 55
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 116
Met Lys Lys Tyr Asn Glu Leu Ser Lys Lys Glu Leu Leu Gln Ile Gln
1 5 10 15
Gly Gly Ile Ala Pro Ile Ile Val Ala Gly Leu Gly Tyr Leu Val Lys
20 25 30
Asp Ala Trp Asp His Ser Asp Gln Ile Ile Ser Gly Phe Lys Lys Gly
35 40 45
Trp Asn Gly Gly Arg Arg Lys
50 55
<210> 117
<211> 168
<212> DNA
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 117
atgaaaaaat ataatgagtt atctaaaaaa gaacttctac agattcaagg aggaatagca 60
cctattatag ttgctggcct tggctattta gtaaaagatg catgggatca ctcagatcaa 120
ataatctcag gatttaaaaa aggttggaat ggtggacgta gaaaataa 168
<210> 118
<211> 343
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 118
Met Lys Asn Ile Leu Leu Ser Ile Leu Gly Val Leu Ser Ile Val Val
1 5 10 15
Ser Leu Ala Phe Ser Ser Tyr Ser Val Asn Ala Ala Ser Asn Glu Trp
20 25 30
Ser Trp Pro Leu Gly Lys Pro Tyr Ala Gly Arg Tyr Glu Glu Gly Gln
35 40 45
Gln Phe Gly Asn Thr Ala Phe Asn Arg Gly Gly Thr Tyr Phe His Asp
50 55 60
Gly Phe Asp Phe Gly Ser Ala Ile Tyr Gly Asn Gly Ser Val Tyr Ala
65 70 75 80
Val His Asp Gly Lys Ile Leu Tyr Ala Gly Trp Asp Pro Val Gly Gly
85 90 95
Gly Ser Leu Gly Ala Phe Ile Val Leu Gln Ala Gly Asn Thr Asn Val
100 105 110
Ile Tyr Gln Glu Phe Ser Arg Asn Val Gly Asp Ile Lys Val Ser Thr
115 120 125
Gly Gln Thr Val Lys Lys Gly Gln Leu Ile Gly Lys Phe Thr Ser Ser
130 135 140
His Leu His Leu Gly Met Thr Lys Lys Glu Trp Arg Ser Ala His Ser
145 150 155 160
Ser Trp Asn Lys Asp Asp Gly Thr Trp Phe Asn Pro Ile Pro Ile Leu
165 170 175
Gln Gly Gly Ser Thr Pro Thr Pro Pro Asn Pro Gly Pro Lys Asn Phe
180 185 190
Thr Thr Asn Val Arg Tyr Gly Leu Arg Val Leu Gly Gly Ser Trp Leu
195 200 205
Pro Glu Val Thr Asn Phe Asn Asn Thr Asn Asp Gly Phe Ala Gly Tyr
210 215 220
Pro Asn Arg Gln His Asp Met Leu Tyr Ile Lys Val Asp Lys Gly Gln
225 230 235 240
Met Lys Tyr Arg Val His Thr Ala Gln Ser Gly Trp Leu Pro Trp Val
245 250 255
Ser Lys Gly Asp Lys Ser Asp Thr Val Asn Gly Ala Ala Gly Met Pro
260 265 270
Gly Gln Ala Ile Asp Gly Val Gln Leu Asn Tyr Ile Thr Pro Lys Gly
275 280 285
Glu Lys Leu Ser Gln Ala Tyr Tyr Arg Ser Gln Thr Thr Lys Arg Ser
290 295 300
Gly Trp Leu Lys Val Ser Ala Asp Asn Gly Ser Ile Pro Gly Leu Asp
305 310 315 320
Ser Tyr Ala Gly Ile Phe Gly Glu Pro Leu Asp Arg Leu Gln Ile Gly
325 330 335
Ile Ser Gln Ser Asn Pro Phe
340
<210> 119
<211> 1032
<212> DNA
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 119
atgaaaaata ttttactttc tattctaggg gtattatcta tcgttgtttc tttggcgttt 60
tcttcttatt ctgtcaacgc agcttctaat gagtggtcgt ggccactggg caaaccatat 120
gcgggaagat atgaagaagg acaacaattc gggaacactg catttaaccg aggaggtact 180
tatttccatg atgggtttga ctttggttct gctatttatg gaaatggcag tgtgtatgct 240
gtgcatgatg gtaaaatttt atatgctggt tgggatcctg taggtggagg ctcattaggt 300
gcatttattg tactacaagc gggaaacaca aatgtgattt atcaagaatt tagccgaaat 360
gttggagata ttaaagttag cactggacaa actgttaaaa aaggacagct gataggaaag 420
tttacttcta gtcatttaca tttaggaatg acaaaaaaag aatggcgttc tgctcattct 480
tcttggaata aagatgatgg cacttggttt aacccaattc ctatacttca aggaggatct 540
acgcctacgc ctccaaatcc aggaccaaaa aatttcacaa caaatgttcg ttacggattg 600
cgggtcctcg gaggttcatg gttaccagaa gtaaccaact ttaacaatac caatgatggt 660
ttcgcaggtt accctaatcg tcaacatgat atgctttata taaaggtaga taaagggcaa 720
atgaaatatc gtgttcacac ggctcaaagt ggatggttgc cttgggtaag taaaggggat 780
aagagcgata cagtaaatgg agcggcaggt atgcctggac aagcaattga tggtgttcag 840
ctaaactata taactcctaa gggagaaaaa ttatcacagg cttactatcg ttcacaaact 900
acgaaacgat caggctggtt aaaagtaagt gcagataatg gttctattcc tggactagac 960
agttatgcag gaatctttgg agaaccgttg gatcgcttgc aaataggtat ttcacagtca 1020
aatccatttt aa 1032
<210> 120
<211> 56
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 120
Met Glu Asn Lys Lys Asp Leu Phe Asp Leu Glu Ile Lys Lys Asp Asn
1 5 10 15
Met Glu Asn Asn Asn Glu Leu Glu Ala Gln Ser Leu Gly Pro Ala Ile
20 25 30
Lys Ala Thr Arg Gln Val Cys Pro Lys Ala Thr Arg Phe Val Thr Val
35 40 45
Ser Cys Lys Lys Ser Asp Cys Gln
50 55
<210> 121
<211> 171
<212> DNA
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 121
atggaaaaca aaaaagattt atttgattta gaaatcaaaa aagataatat ggaaaataat 60
aatgaattag aagctcaatc tcttggtcct gcaattaagg caactagaca ggtatgtcct 120
aaagcaacac gttttgttac agtttcttgt aaaaaaagtg attgtcaata g 171
<210> 122
<211> 51
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 122
Met Ala Ala Phe Met Lys Leu Ile Gln Phe Leu Ala Thr Lys Gly Gln
1 5 10 15
Lys Tyr Val Ser Leu Ala Trp Lys His Lys Gly Thr Ile Leu Lys Trp
20 25 30
Ile Asn Ala Gly Gln Ser Phe Glu Trp Ile Tyr Lys Gln Ile Lys Lys
35 40 45
Leu Trp Ala
50
<210> 123
<211> 156
<212> DNA
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 123
atggcagcat ttatgaagtt aattcagttc ttagcaacta aaggtcaaaa gtatgtttca 60
cttgcatgga aacataaagg tactatttta aaatggatta acgccggtca aagttttgaa 120
tggatttata aacaaatcaa aaaattatgg gcataa 156
<210> 124
<211> 52
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 124
Met Glu Ala Val Lys Glu Lys Asn Asp Leu Phe Asn Leu Asp Val Lys
1 5 10 15
Val Asn Ala Lys Glu Ser Asn Asp Ser Gly Ala Glu Pro Arg Ile Ala
20 25 30
Ser Lys Phe Ile Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser Phe Asn
35 40 45
Ser Tyr Cys Cys
50
<210> 125
<211> 159
<212> DNA
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 125
atggaagcag taaaagaaaa aaatgatctt tttaatcttg atgttaaagt taatgcaaaa 60
gaatctaacg attcaggagc tgaaccaaga attgctagta aatttatatg tactcctgga 120
tgtgcaaaaa caggtagttt taacagttat tgttgttaa 159
<210> 126
<211> 55
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 126
Met Asn Asn Ser Leu Phe Asp Leu Asn Leu Asn Lys Gly Val Glu Thr
1 5 10 15
Gln Lys Ser Asp Leu Ser Pro Gln Ser Ala Ser Val Leu Lys Thr Ser
20 25 30
Ile Lys Val Ser Lys Lys Tyr Cys Lys Gly Val Thr Leu Thr Cys Gly
35 40 45
Cys Asn Ile Thr Gly Gly Lys
50 55
<210> 127
<211> 168
<212> DNA
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 127
atgaataact cattattcga tttaaaccta aacaaaggtg tagaaactca aaagagtgat 60
ttaagtccgc aatctgctag tgtcttgaag acttctatta aagtatctaa aaaatattgt 120
aaaggtgtta ctttaacatg cggttgcaat attactggtg gtaaataa 168
<210> 128
<211> 52
<212> PRT
<213> 鸡葡萄球菌(Staphylococcus gallinarum)
<400> 128
Met Glu Ala Val Lys Glu Lys Asn Glu Leu Phe Asp Leu Asp Val Lys
1 5 10 15
Val Asn Ala Lys Glu Ser Asn Asp Ser Gly Ala Glu Pro Arg Ile Ala
20 25 30
Ser Lys Phe Leu Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser Phe Asn
35 40 45
Ser Tyr Cys Cys
50
<210> 129
<211> 159
<212> DNA
<213> 鸡葡萄球菌(Staphylococcus gallinarum)
<400> 129
atggaagcag taaaagagaa aaatgaactt tttgatcttg acgttaaagt aaatgcaaaa 60
gagtctaatg attcaggcgc agaaccacga attgctagta aatttttatg tactcctgga 120
tgtgccaaaa caggtagctt caatagctac tgttgttaa 159
<210> 130
<211> 63
<212> PRT
<213> 格氏乳球菌(Lactococcus garvieae)
<400> 130
Met Glu Asn Asn Asn Tyr Thr Val Leu Ser Asp Glu Glu Leu Gln Lys
1 5 10 15
Ile Asp Gly Gly Ile Gly Gly Ala Leu Gly Asn Ala Leu Asn Gly Leu
20 25 30
Gly Thr Trp Ala Asn Met Met Asn Gly Gly Gly Phe Val Asn Gln Trp
35 40 45
Gln Val Tyr Ala Asn Lys Gly Lys Ile Asn Gln Tyr Arg Pro Tyr
50 55 60
<210> 131
<211> 192
<212> DNA
<213> 格氏乳球菌(Lactococcus garvieae)
<400> 131
atggaaaaca acaattacac agtactttca gatgaagaac tacaaaaaat tgatggtgga 60
atcggcgggg ctcttggtaa tgctctcaac ggattaggta cctgggcaaa catgatgaac 120
ggtggaggat ttgttaatca gtggcaagtt tatgctaata aaggaaaaat aaatcaatac 180
cgtccgtatt aa 192
<210> 132
<211> 63
<212> PRT
<213> 格氏乳球菌(Lactococcus garvieae)
<400> 132
Met Phe Asp Leu Val Ala Thr Gly Met Ala Ala Gly Val Ala Lys Thr
1 5 10 15
Ile Val Asn Ala Val Ser Ala Gly Met Asp Ile Ala Thr Ala Leu Ser
20 25 30
Leu Phe Ser Gly Ala Phe Thr Ala Ala Gly Gly Ile Met Ala Leu Ile
35 40 45
Lys Lys Tyr Ala Gln Lys Lys Leu Trp Lys Gln Leu Ile Ala Ala
50 55 60
<210> 133
<211> 192
<212> DNA
<213> 格氏乳球菌(Lactococcus garvieae)
<400> 133
atgtttgatt tagtcgcgac tggaatggct gcaggtgtag caaaaactat tgttaatgcc 60
gttagtgctg gtatggatat tgccactgct ttatcattgt tctcaggagc ttttactgca 120
gctgggggaa ttatggcact cattaaaaaa tatgctcaaa agaaattatg gaaacagctt 180
attgctgcat aa 192
<210> 134
<211> 91
<212> PRT
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 134
Met Val Thr Lys Tyr Gly Arg Asn Leu Gly Leu Asn Lys Val Glu Leu
1 5 10 15
Phe Ala Ile Trp Ala Val Leu Val Val Ala Leu Leu Leu Thr Thr Ala
20 25 30
Asn Ile Tyr Trp Ile Ala Asp Gln Phe Gly Ile His Leu Ala Thr Gly
35 40 45
Thr Ala Arg Lys Leu Leu Asp Ala Met Ala Ser Gly Ala Ser Leu Gly
50 55 60
Thr Ala Phe Ala Ala Ile Leu Gly Val Thr Leu Pro Ala Trp Ala Leu
65 70 75 80
Ala Ala Ala Gly Ala Leu Gly Ala Thr Ala Ala
85 90
<210> 135
<211> 276
<212> DNA
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 135
atggttacta agtacggacg taatttaggt ttgaacaagg tagagttgtt tgcaatttgg 60
gcggttttag tagttgctct tttattgacc acagcgaaca tttattggat tgctgatcaa 120
ttcgggattc atttagcgac tggaacagcc cgtaagttat tagatgcaat ggcttctggt 180
gcctcattgg gaactgcctt tgctgctatt ttgggcgtga cattacctgc atgggctttg 240
gcagctgcag gagcattggg agcgactgca gcctag 276
<210> 136
<211> 75
<212> PRT
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 136
Met Lys Asn Phe Asn Thr Leu Ser Phe Glu Thr Leu Ala Asn Ile Val
1 5 10 15
Gly Gly Arg Asn Asn Trp Ala Ala Asn Ile Gly Gly Val Gly Gly Ala
20 25 30
Thr Val Ala Gly Trp Ala Leu Gly Asn Ala Val Cys Gly Pro Ala Cys
35 40 45
Gly Phe Val Gly Ala His Tyr Val Pro Ile Ala Trp Ala Gly Val Thr
50 55 60
Ala Ala Thr Gly Gly Phe Gly Lys Ile Arg Lys
65 70 75
<210> 137
<211> 228
<212> DNA
<213> 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)
<400> 137
atgaaaaatt ttaatacatt atcatttgaa acattggcta acatagttgg tgggagaaat 60
aattgggctg ctaatatagg tggagtaggt ggagcgacag tcgctggatg ggctcttgga 120
aatgcagttt gcggtcctgc ttgtggcttt gttggagcac actatgttcc aatagcatgg 180
gctggcgtaa cggcagctac tggtggattc ggaaagataa gaaagtag 228
<210> 138
<211> 64
<212> PRT
<213> 胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
<400> 138
Met Ser Lys Leu Val Lys Thr Leu Thr Ile Ser Glu Ile Ser Lys Ala
1 5 10 15
Gln Asn Asn Gly Gly Lys Pro Ala Trp Cys Trp Tyr Thr Leu Ala Met
20 25 30
Cys Gly Ala Gly Tyr Asp Ser Gly Thr Cys Asp Tyr Met Tyr Ser His
35 40 45
Cys Phe Gly Ile Lys His His Ser Ser Gly Ser Ser Ser Tyr His Cys
50 55 60
<210> 139
<211> 195
<212> DNA
<213> 胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
<400> 139
atgagtaaat tggttaagac acttactata agtgaaattt ctaaggctca aaacaacggt 60
ggaaaacctg catggtgttg gtatacttta gcaatgtgtg gtgctggtta tgattcggga 120
acctgtgatt atatgtattc gcattgtttt ggtataaagc atcatagtag tggtagtagc 180
agttatcatt gttag 195
<210> 140
<211> 359
<212> PRT
<213> 地中海嗜盐菌(Haloferax mediterranei)
<400> 140
Met Ser Lys Asp Arg Asp Gly Arg Arg Thr Ser Arg Arg Gly Thr Leu
1 5 10 15
Lys Lys Ile Gly Gly Phe Ser Leu Gly Ala Leu Ser Phe Gly Ala Val
20 25 30
Gly Arg Thr Gln Ala Ala Thr Gly Ser Ser Val Thr Thr Ala Asp Ile
35 40 45
Ala Pro Pro Gly Pro Asn Gly Asp Pro Lys Ser Val Gln Ile Asp Asp
50 55 60
Lys Tyr Thr Gly Ala Glu Met Tyr Gly Glu Gly Asp Phe Arg Val Gly
65 70 75 80
Leu Gly Thr Asp Leu Thr Met Tyr Pro Pro Val Tyr Arg Glu Ser Leu
85 90 95
Gly Asn Gly Ser Gly Gly Trp Glu Phe Asp Phe Thr Val Cys Gly Ser
100 105 110
Thr Ala Cys Arg Phe Val Asp Ser Asn Gly Asp Val Lys Glu Asp Asp
115 120 125
Lys Ala Lys Glu Met Trp Trp Gln Glu Ile Asn Phe Asn Asp Ile Asn
130 135 140
Gln Asp Leu Tyr Ser Arg Asn Asp Ser Asp Trp Val Gly Ser Thr Pro
145 150 155 160
Ala Asp Thr Gln Pro Glu Phe Asp Tyr Thr Glu Phe Ala Leu Ala Arg
165 170 175
Asp Gly Val Thr Leu Ala Leu Thr Ala Leu Asn Pro Ala Met Gly Ser
180 185 190
Leu Ala Leu Gly Ala Thr Tyr Phe Leu Ser Asp Met Val Asn Trp Ile
195 200 205
Ala Ser Gln His Glu Asp Asp Ser Ser Leu Lys Arg Lys Trp Asp Tyr
210 215 220
Asp Gly Leu Ser Gly Pro Leu Tyr Ala Asp Ser Ser Thr Tyr Leu Leu
225 230 235 240
Ala Arg Asp Glu Met Thr Ser Asn Ser Tyr Glu Ser Phe Thr Ile Asp
245 250 255
Asn Ile Ala Val Ala Phe Pro Glu Phe Pro Val Arg Thr Lys Tyr Tyr
260 265 270
Val Thr Phe Thr Ala Pro Asp Asp Pro Ser Thr Gln Ser Ile Ser Thr
275 280 285
Leu Glu Glu Glu Gly Ile Tyr Arg Val Pro Ala Thr Glu Val Ala Ala
290 295 300
Ala Arg Pro Pro Gly Ser Arg Arg Ser Lys Ser Ala Ala Asp Glu Met
305 310 315 320
Val Tyr Val Ala Asp Pro Lys Lys Phe Ile Glu Val Glu Pro Val Lys
325 330 335
Asn Pro Ser Ile Pro Asp Arg Ile Tyr Glu Glu Ile Glu Gln Lys Lys
340 345 350
Lys Gln Arg Ser Arg Lys Gln
355
<210> 141
<211> 1080
<212> DNA
<213> 地中海嗜盐菌(Haloferax mediterranei)
<400> 141
atgtcgaaag acagagatgg gagaaggaca agtcggcgag gcacgttaaa gaaaatcggc 60
ggtttcagtc tcggagcgct tagtttcggg gcagtcggac gaactcaagc ggcgaccggc 120
tcatcggtta cgaccgctga tatcgcacct cccggaccga acggagaccc gaagagtgtt 180
cagatagatg ataaatacac cggagccgag atgtacggcg agggtgactt cagagtcggt 240
ctcggaactg acctgacgat gtatccgccc gtgtaccgtg agagtcttgg aaatggaagc 300
gggggttggg aattcgactt caccgtttgt gggtccactg cctgtcgatt tgtggacagt 360
aacggtgacg tcaaagagga cgacaaggcg aaagaaatgt ggtggcagga aattaacttc 420
aacgacataa atcaggattt atacagtcgg aacgattccg actgggtcgg gtcgacccct 480
gccgataccc aaccggagtt cgattacacc gactttgcgc tcgctcggga cggagtgacg 540
ctcgctctca cggcactcaa ccccgcaatg gggagtcttg cactcggtgc cacgtacttc 600
ctcagcgaca tggtgaactg gattgcgagc cagcacgaag acgacagttc gctcaagaga 660
aaatgggatt acgacgggct aagtgggccg ttgtacgccg attcgtcgac gtacctactg 720
gcacgcgacg agatgacttc gaactcgtac gaatcattca cgatcgataa catcgccgtt 780
gccttcccag agttccccgt ccggaccaag tactacgtca cattcactgc gccggatgac 840
ccgtcaacgc agtcgatatc tacgctcgaa gaggagggaa tctaccgagt gcccgctacg 900
gaagtggctg cggccagacc accggggtcc cgacgttcca aatcggcagc cgacgagatg 960
gtgtacgttg ccgatccgaa gaagttcata gaggtcgagc cggtgaagaa cccaagtatc 1020
ccggaccgaa tctacgagga gatagagcaa aaaaagaaac aacggagtag gaaacagtag 1080
<210> 142
<211> 311
<212> PRT
<213> 嗜盐古菌S8a(Haloarchaeon S8a)
<400> 142
Met Ser Asp Lys Asp Ser Ile Asn Arg Arg Asn Val Leu Arg Lys Ile
1 5 10 15
Gly Gly Ile Gly Val Ala Ser Ala Val Gly Phe Ser Gly Leu Ala Ser
20 25 30
Gly Glu Ser Leu Ser Asp Asp Glu Lys Gln Asp Val Ile Asp Thr Ile
35 40 45
Tyr Lys Ser Gln Arg Val Glu Gln Ile Lys Lys Lys Phe Gly Gly Val
50 55 60
Asn Ile Glu Pro Lys Lys Val Gln Ser Val Thr Thr Asn Gln Ser Gly
65 70 75 80
Asp Leu Val Thr Ala Lys Leu Ser Val Ser Asp Gly Asp Leu Val Tyr
85 90 95
Ser Ser Val Lys Asp Thr Thr Val Ile Val Gln Phe Asp Arg Ser Ala
100 105 110
Ser Glu Ile Gly Glu Ser Trp Pro Lys Asn Thr Glu Ala Phe Ile Lys
115 120 125
Ser Thr Ser Ser Gly Val Asp Leu Leu Arg Thr Ala Thr Asp Glu Glu
130 135 140
Ile Lys Asp Val Thr Glu Gly Val Asn Thr Ser Glu Ile Glu Ser Ala
145 150 155 160
Asp Ala Val Asn Ile Phe Ile Asp Pro Glu Ser Gln Thr Tyr Tyr Met
165 170 175
Glu Lys Tyr Asp Phe Asn Asn Lys Val Leu Glu Met Phe Glu Leu Ala
180 185 190
Thr Gly Gly Thr Ser Ser Gly Lys Ile Ser Pro Thr Arg Glu Asp Gln
195 200 205
Asn His Glu Tyr Asn Val Arg Glu His Lys Val Phe Asn Ser Glu Lys
210 215 220
Gln Asn Ile Gln Leu Gln Ser Asp Cys Asn Ile Asn Ser Asn Thr Ala
225 230 235 240
Ala Asp Val Ile Leu Cys Phe Asn Gln Val Gly Ser Cys Ala Leu Cys
245 250 255
Ser Pro Thr Leu Val Gly Gly Pro Val Pro Thr Val Ala Cys Leu Leu
260 265 270
Val Val Cys Phe Gly Thr Pro Asn Ala Val Ser Ala Ile Leu Glu Glu
275 280 285
Val Asp Asn Ser Cys Phe Asn Leu Ile Lys Asp Val Ile Ser Cys Trp
290 295 300
Asp Glu Trp Thr Ser Phe Trp
305 310
<210> 143
<211> 936
<212> DNA
<213> 嗜盐古菌S8a(Haloarchaeon S8a)
<400> 143
atgtcggata aagacagcat taacagaaga aatgtattaa gaaaaattgg cggtatcggt 60
gtggcttcag ctgtcggatt ttctggtttg gcaagcgggg aaagtcttag cgatgatgag 120
aaacaagatg ttattgacac aatttacaaa tcacaaagag ttgaacagat aaagaaaaag 180
ttcggaggag tgaatattga gccgaaaaag gttcaatctg taacgaccaa tcagagcgga 240
gatcttgtta cggcgaagct gtcggttagt gatggggatt tggtatattc gagtgtcaaa 300
gatacaactg taatagttca gttcgataga tcggcttctg aaattggtga aagttggccc 360
aagaatactg aggcattcat caaatcgacg tcctctgggg tcgatcttct acgtacagca 420
actgatgaag aaataaagga cgttactgag ggagtcaaca catctgaaat tgaatctgcg 480
gatgctgtta acatatttat tgatcctgaa tcacagacat actatatgga gaaatatgac 540
tttaataata aggtacttga gatgtttgaa ttagcgacag gtgggacaag tagtggtaaa 600
atctccccca cacgtgaaga ccagaatcac gaatataatg ttagggaaca taaagtattt 660
aactcagaaa aacagaatat acaacttcag agtgactgta atataaacag taacaccgct 720
gctgatgtta ttctatgctt caaccaggtt ggttcttgtg cactctgctc cccgacttta 780
gtcggaggtc cagtccctac agttgcatgt ctcttagtcg tctgtttcgg cactccaaat 840
gctgtgtccg cgatacttga agaagtcgat aattcttgct ttaacttgat caaggatgta 900
atttcgtgtt gggatgaatg gactagcttc tggtga 936
<210> 144
<211> 333
<212> PRT
<213> 瑞士乳杆菌(Lactobacillus helveticus)
<400> 144
Met Lys His Leu Asn Glu Thr Thr Asn Val Arg Ile Leu Ser Gln Phe
1 5 10 15
Asp Met Asp Thr Gly Tyr Gln Ala Val Val Gln Lys Gly Asn Val Gly
20 25 30
Ser Lys Tyr Val Tyr Gly Leu Gln Leu Arg Lys Gly Ala Thr Thr Ile
35 40 45
Leu Arg Gly Tyr Arg Gly Ser Lys Ile Asn Asn Pro Ile Leu Glu Leu
50 55 60
Ser Gly Gln Ala Gly Gly His Thr Gln Thr Trp Glu Phe Ala Gly Asp
65 70 75 80
Arg Lys Asp Ile Asn Gly Glu Glu Arg Ala Gly Gln Trp Phe Ile Gly
85 90 95
Val Lys Pro Ser Lys Ile Glu Gly Ser Lys Ile Ile Trp Ala Lys Gln
100 105 110
Ile Ala Arg Val Asp Leu Arg Asn Gln Met Gly Pro His Tyr Ser Asn
115 120 125
Thr Asp Phe Pro Arg Leu Ser Tyr Leu Asn Arg Ala Gly Ser Asn Pro
130 135 140
Phe Ala Gly Asn Lys Met Thr His Ala Glu Ala Ala Val Ser Pro Asp
145 150 155 160
Tyr Thr Lys Phe Leu Ile Ala Thr Val Glu Asn Asn Cys Ile Gly His
165 170 175
Phe Thr Ile Tyr Asn Leu Asp Thr Ile Asn Glu Lys Leu Asp Glu Lys
180 185 190
Gly Asn Ser Glu Asp Val Asn Leu Glu Thr Val Lys Tyr Glu Asp Ser
195 200 205
Phe Ile Ile Asp Asn Leu Tyr Gly Asp Asp Asn Asn Ser Ile Val Asn
210 215 220
Ser Ile Gln Gly Tyr Asp Leu Asp Asn Asp Gly Asn Ile Tyr Ile Ser
225 230 235 240
Ser Gln Lys Ala Pro Asp Phe Asp Gly Ser Tyr Tyr Ala His His Lys
245 250 255
Gln Ile Val Lys Ile Pro Tyr Tyr Ala Arg Ser Lys Glu Ser Glu Asp
260 265 270
Gln Trp Arg Ala Val Asn Leu Ser Glu Phe Gly Gly Leu Asp Ile Pro
275 280 285
Gly Lys His Ser Glu Val Glu Ser Ile Gln Ile Ile Gly Glu Asn His
290 295 300
Cys Tyr Leu Thr Val Ala Tyr His Ser Lys Asn Lys Ala Gly Glu Asn
305 310 315 320
Lys Thr Thr Leu Asn Glu Ile Tyr Glu Leu Ser Trp Asn
325 330
<210> 145
<211> 1002
<212> DNA
<213> 瑞士乳杆菌(Lactobacillus helveticus)
<400> 145
atgaagcatt taaatgaaac aactaatgtt agaattttaa gtcaatttga tatggatact 60
ggctatcaag cagtagttca aaaaggcaat gtaggttcaa aatatgtata tggattacaa 120
cttcgcaaag gtgctactac tatcttgcgt ggttaccgtg gaagtaaaat taataaccct 180
attcttgaat tatctggtca agcaggtggt cacacacaga catgggaatt tgctggtgat 240
cgtaaagaca ttaatggtga agaaagagca ggtcaatggt ttataggtgt taaaccatcg 300
aaaattgaag gaagcaaaat tatttgggca aagcaaattg caagagttga tcttagaaat 360
caaatgggac ctcattattc aaatactgac tttcctcgat tatcctactt gaatcgcgcc 420
ggttctaatc catttgctgg taataagatg acgcatgccg aagccgcagt atcacctgat 480
tatactaagt ttttaattgc tactgttgaa aataactgta ttggtcattt tactatatac 540
aatttagata caattaatga aaaacttgat gaaaagggaa atagtgaaga tgttaatctc 600
gaaactgtta aatacgaaga tagttttatc attgataatt tatatggtga tgataataat 660
tctattgtaa attcaattca agggtatgat ttggataatg atggaaatat ttatatttcc 720
agtcaaaaag cgccagattt tgatggctct tattatgcac atcataagca gattgttaag 780
attccatatt atgctcggtc taaagaaagc gaagaccaat ggagagctgt aaatttaagc 840
gaattcggtg gcttggatat tccaggtaaa catagtgaag ttgaaagcat ccaaattatt 900
ggtgagaatc attgttactt aactgttgca tatcattcta aaaataaagc gggtgaaaat 960
aaaactactt tgaatgagat ttatgaatta tcttggaatt ag 1002
<210> 146
<211> 74
<212> PRT
<213> 希拉肠球菌(Enterococcus hirae)
<400> 146
Met Lys Lys Lys Val Leu Lys His Cys Val Ile Leu Gly Ile Leu Gly
1 5 10 15
Thr Cys Leu Ala Gly Ile Gly Thr Gly Ile Lys Val Asp Ala Ala Thr
20 25 30
Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Glu Lys Cys Trp Val Asp
35 40 45
Trp Asn Gln Ala Lys Gly Glu Ile Gly Lys Ile Ile Val Asn Gly Trp
50 55 60
Val Asn His Gly Pro Trp Ala Pro Arg Arg
65 70
<210> 147
<211> 225
<212> DNA
<213> 希拉肠球菌(Enterococcus hirae)
<400> 147
atgaaaaaga aagtattaaa acattgtgtt attctaggaa tattaggaac ttgtctagct 60
ggcatcggta caggaataaa agttgatgca gctacttact atggaaatgg tctttattgt 120
aacaaagaaa aatgttgggt agattggaat caagctaaag gagaaattgg aaaaattatt 180
gttaatggtt gggttaatca tggtccatgg gcacctagaa ggtag 225
<210> 148
<211> 75
<212> PRT
<213> 约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)
<400> 148
Met Lys Gln Phe Asn Tyr Leu Ser His Lys Asp Leu Ala Val Val Val
1 5 10 15
Gly Gly Arg Asn Asn Trp Gln Thr Asn Val Gly Gly Ala Val Gly Ser
20 25 30
Ala Met Ile Gly Ala Thr Val Gly Gly Thr Ile Cys Gly Pro Ala Cys
35 40 45
Ala Val Ala Gly Ala His Tyr Leu Pro Ile Leu Trp Thr Ala Val Thr
50 55 60
Ala Ala Thr Gly Gly Phe Gly Lys Ile Arg Lys
65 70 75
<210> 149
<211> 228
<212> DNA
<213> 约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)
<400> 149
atgaaacaat ttaattattt atcacataaa gatttagcag tcgttgttgg tggaagaaat 60
aattggcaaa caaatgtggg aggagcagtg ggatcagcta tgattggggc tacagttggt 120
ggtacaattt gtggacctgc atgtgctgta gctggtgccc attatcttcc tattttatgg 180
acagcggtta cagctgcaac aggtggtttt ggcaagataa gaaagtag 228
<210> 150
<211> 62
<212> PRT
<213> 约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)
<400> 150
Met Lys Leu Asn Asp Lys Glu Leu Ser Lys Ile Val Gly Gly Asn Arg
1 5 10 15
Trp Gly Asp Thr Val Leu Ser Ala Ala Ser Gly Ala Gly Thr Gly Ile
20 25 30
Lys Ala Cys Lys Ser Phe Gly Pro Trp Gly Met Ala Ile Cys Gly Val
35 40 45
Gly Gly Ala Ala Ile Gly Gly Tyr Phe Gly Tyr Thr His Asn
50 55 60
<210> 151
<211> 189
<212> DNA
<213> 约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)
<400> 151
atgaaattaa atgacaaaga attatcaaag attgttggtg gaaatcgatg gggagatact 60
gttttatcag ctgctagtgg cgcaggaact ggtattaaag catgtaaaag ttttggccca 120
tggggaatgg caatttgtgg tgtaggaggt gcagcaatag gaggttattt tggctatact 180
cataattaa 189
<210> 152
<211> 59
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 152
Met Asn Lys Asn Glu Ile Glu Thr Gln Pro Val Thr Trp Leu Glu Glu
1 5 10 15
Val Ser Asp Gln Asn Phe Asp Glu Asp Val Phe Gly Ala Cys Ser Thr
20 25 30
Asn Thr Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Trp Gly Asn Asn Gly Ala Trp Cys
35 40 45
Thr Leu Thr His Glu Cys Met Ala Trp Cys Lys
50 55
<210> 153
<211> 180
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 153
atgaacaaaa atgaaattga aacacaacca gttacatggt tggaagaagt atctgatcaa 60
aattttgatg aagatgtatt tggtgcgtgt agtactaaca cattctcgct cagtgattac 120
tggggaaata acggggcttg gtgtacactc actcatgaat gtatggcttg gtgtaaataa 180
<210> 154
<211> 65
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 154
Met Lys Glu Lys Asn Met Lys Lys Asn Asp Thr Ile Glu Leu Gln Leu
1 5 10 15
Gly Lys Tyr Leu Glu Asp Asp Met Ile Glu Leu Ala Glu Gly Asp Glu
20 25 30
Ser His Gly Gly Thr Thr Pro Ala Thr Pro Ala Ile Ser Ile Leu Ser
35 40 45
Ala Tyr Ile Ser Thr Asn Thr Cys Pro Thr Thr Lys Cys Thr Arg Ala
50 55 60
Cys
65
<210> 155
<211> 198
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 155
atgaaagaaa aaaatatgaa aaagaatgac actattgaat tacaattggg aaaatacctt 60
gaagatgata tgattgaatt agctgaaggg gatgagtctc atggaggaac aacaccagca 120
actcctgcaa tctctattct cagtgcatat attagtacca atacttgtcc aacaacaaaa 180
tgtacacgtg cttgttaa 198
<210> 156
<211> 51
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 156
Met Lys Glu Gln Asn Ser Phe Asn Leu Leu Gln Glu Val Thr Glu Ser
1 5 10 15
Glu Leu Asp Leu Ile Leu Gly Ala Lys Gly Gly Ser Gly Val Ile His
20 25 30
Thr Ile Ser His Glu Cys Asn Met Asn Ser Trp Gln Phe Val Phe Thr
35 40 45
Cys Cys Ser
50
<210> 157
<211> 156
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 157
atgaaagaac aaaactcttt taatcttctt caagaagtga cagaaagtga attggacctt 60
attttaggtg caaaaggcgg cagtggagtt attcatacaa tttctcatga atgtaatatg 120
aatagctggc aatttgtatt tacttgctgc tcttaa 156
<210> 158
<211> 53
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 158
Met Ala Gly Phe Leu Lys Val Val Gln Leu Leu Ala Lys Tyr Gly Ser
1 5 10 15
Lys Ala Val Gln Trp Ala Trp Ala Asn Lys Gly Lys Ile Leu Asp Trp
20 25 30
Leu Asn Ala Gly Gln Ala Ile Asp Trp Val Val Ser Lys Ile Lys Gln
35 40 45
Ile Leu Gly Ile Lys
50
<210> 159
<211> 162
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 159
atggcagggt ttttaaaagt agttcaatta ctagctaaat atggttctaa agctgtacaa 60
tgggcttggg caaacaaggg taagatttta gattggctta atgcaggtca ggctattgat 120
tgggtagttt cgaaaattaa gcaaatttta ggtattaagt aa 162
<210> 160
<211> 53
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 160
Met Ala Gly Phe Leu Lys Val Val Gln Ile Leu Ala Lys Tyr Gly Ser
1 5 10 15
Lys Ala Val Gln Trp Ala Trp Ala Asn Lys Gly Lys Ile Leu Asp Trp
20 25 30
Ile Asn Ala Gly Gln Ala Ile Asp Trp Val Val Glu Lys Ile Lys Gln
35 40 45
Ile Leu Gly Ile Lys
50
<210> 161
<211> 162
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 161
atggcagggt ttttaaaagt agtccaaatt ttggctaagt atggttctaa agccgtacaa 60
tgggcatggg caaataaagg aaaaatctta gattggatta atgcaggtca agctattgac 120
tgggtagttg aaaagattaa gcaaattttg ggtattaaat aa 162
<210> 162
<211> 65
<212> PRT
<213> 食淀粉乳杆菌(Lactobacillus amylovorus)
<400> 162
Met Lys Gln Leu Asn Ser Glu Gln Leu Gln Asn Ile Ile Gly Gly Asn
1 5 10 15
Arg Trp Thr Asn Ala Tyr Ser Ala Ala Leu Gly Cys Ala Val Pro Gly
20 25 30
Val Lys Tyr Gly Lys Lys Leu Gly Gly Val Trp Gly Ala Val Ile Gly
35 40 45
Gly Val Gly Gly Ala Ala Val Cys Gly Leu Ala Gly Tyr Val Arg Lys
50 55 60
Gly
65
<210> 163
<211> 198
<212> DNA
<213> 食淀粉乳杆菌(Lactobacillus amylovorus)
<400> 163
atgaaacaat tgaattcaga acaattacaa aatattatcg gtggaaatag atggactaat 60
gcatacagcg cagctttggg atgcgctgtc cctggagtta aatatggaaa aaaacttggt 120
ggcgtatggg gtgctgtaat tggtggcgta ggcggtgcag cagtctgtgg cttggcgggt 180
tatgttcgta aaggctaa 198
<210> 164
<211> 68
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌L45(Lactobacillus sakei L45)
<400> 164
Met Lys Thr Glu Lys Lys Val Leu Asp Glu Leu Ser Leu His Ala Ser
1 5 10 15
Ala Lys Met Gly Ala Arg Asp Val Glu Ser Ser Met Asn Ala Asp Ser
20 25 30
Thr Pro Val Leu Ala Ser Val Ala Val Ser Met Glu Leu Leu Pro Thr
35 40 45
Ala Ser Val Leu Tyr Ser Asp Val Ala Gly Cys Phe Lys Tyr Ser Ala
50 55 60
Lys His His Cys
65
<210> 165
<211> 207
<212> DNA
<213> 清酒乳杆菌 L45(Lactobacillus sakei L45)
<400> 165
atgaaaacag aaaaaaaggt tttagatgaa ctgagcttac acgcttctgc aaaaatggga 60
gcacgtgatg ttgaatccag catgaatgca gactcaacac cagttttagc atcagtcgct 120
gtatccatgg aattattgcc aactgcgtct gttctttatt cggatgttgc aggttgcttc 180
aaatattctg caaaacatca ttgttag 207
<210> 166
<211> 91
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 166
Met Lys Thr Lys Ser Leu Val Leu Ala Leu Ser Ala Val Thr Leu Phe
1 5 10 15
Ser Ala Gly Gly Ile Val Ala Gln Ala Glu Gly Thr Trp Gln His Gly
20 25 30
Tyr Gly Val Ser Ser Ala Tyr Ser Asn Tyr His His Gly Ser Lys Thr
35 40 45
His Ser Ala Thr Val Val Asn Asn Asn Thr Gly Arg Gln Gly Lys Asp
50 55 60
Thr Gln Arg Ala Gly Val Trp Ala Lys Ala Thr Val Gly Arg Asn Leu
65 70 75 80
Thr Glu Lys Ala Ser Phe Tyr Tyr Asn Phe Trp
85 90
<210> 167
<211> 276
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 167
atgaaaacca agtctctcgt attggcatta tctgcggtta cgttattctc tgccggagga 60
attgtagctc aagctgaagg aacatggcaa catggatatg gtgttagttc ggcatattca 120
aattatcatc atggtagcaa aactcattca gccacagttg taaataataa tactggccga 180
caaggtaagg atacacaacg tgccggtgtt tgggcaaaag ctactgttgg acgtaactta 240
actgaaaaag cttcatttta ttataacttt tggtaa 276
<210> 168
<211> 75
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 168
Met Lys Asn Gln Leu Asn Phe Asn Ile Val Ser Asp Glu Glu Leu Ser
1 5 10 15
Glu Ala Asn Gly Gly Lys Leu Thr Phe Ile Gln Ser Thr Ala Ala Gly
20 25 30
Asp Leu Tyr Tyr Asn Thr Asn Thr His Lys Tyr Val Tyr Gln Gln Thr
35 40 45
Gln Asn Ala Phe Gly Ala Ala Ala Asn Thr Ile Val Asn Gly Trp Met
50 55 60
Gly Gly Ala Ala Gly Gly Phe Gly Leu His His
65 70 75
<210> 169
<211> 228
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 169
atgaaaaatc aattaaattt taatattgtt tcagatgaag aactttcaga agctaacgga 60
ggaaaattaa catttattca atcgacagcg gctggagatt tatattacaa tactaataca 120
cacaaatatg tttaccaaca aactcaaaac gcttttgggg ctgctgctaa taccattgtt 180
aatggatgga tgggtggcgc tgctggaggt ttcgggttgc accattga 228
<210> 170
<211> 68
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 170
Met Lys Asn Gln Leu Asn Phe Asn Ile Val Ser Asp Glu Glu Leu Ala
1 5 10 15
Glu Val Asn Gly Gly Ser Leu Gln Tyr Val Met Ser Ala Gly Pro Tyr
20 25 30
Thr Trp Tyr Lys Asp Thr Arg Thr Gly Lys Thr Ile Cys Lys Gln Thr
35 40 45
Ile Asp Thr Ala Ser Tyr Thr Phe Gly Val Met Ala Glu Gly Trp Gly
50 55 60
Lys Thr Phe His
65
<210> 171
<211> 207
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 171
atgaaaaatc aattaaattt taatattgtt tctgatgaag aacttgcaga agttaatgga 60
ggaagcttgc agtatgttat gagtgctgga ccatatactt ggtataaaga tactagaaca 120
ggaaaaacaa tatgtaaaca gacaattgac acagcaagtt atacatttgg tgtaatggca 180
gaaggatggg gaaaaacatt ccactaa 207
<210> 172
<211> 63
<212> PRT
<213> 乳球菌属物种QU 12(Lactococcus sp. QU 12)
<400> 172
Met Lys Leu Ile Asp His Leu Gly Ala Pro Arg Trp Ala Val Asp Thr
1 5 10 15
Ile Leu Gly Ala Ile Ala Val Gly Asn Leu Ala Ser Trp Val Leu Ala
20 25 30
Leu Val Pro Gly Pro Gly Trp Ala Val Lys Ala Gly Leu Ala Thr Ala
35 40 45
Ala Ala Ile Val Lys His Gln Gly Lys Ala Ala Ala Ala Ala Trp
50 55 60
<210> 173
<211> 192
<212> DNA
<213> 乳球菌属物种 QU 12(Lactococcus sp. QU 12)
<400> 173
atgaaattaa ttgatcattt aggtgctcca agatgggccg ttgatactat tttaggtgca 60
atcgcagttg ggaacttagc aagttgggtt ctagcgcttg tccctggtcc agggtgggca 120
gtaaaagctg gtttagcaac tgctgctgcc atcgttaaac atcaaggtaa agctgccgct 180
gctgcttggt aa 192
<210> 174
<211> 50
<212> PRT
<213> 短芽孢杆菌属物种 GI-9(Brevibacillus sp. GI-9)
<400> 174
Met Ala Cys Gln Cys Pro Asp Ala Ile Ser Gly Trp Thr His Thr Asp
1 5 10 15
Tyr Gln Cys His Gly Leu Glu Asn Lys Met Tyr Arg His Val Tyr Ala
20 25 30
Ile Cys Met Asn Gly Thr Gln Val Tyr Cys Arg Thr Glu Trp Gly Ser
35 40 45
Ser Cys
50
<210> 175
<211> 153
<212> DNA
<213> 短芽孢杆菌属物种 GI-9(Brevibacillus sp. GI-9)
<400> 175
atggcttgcc aatgtccaga tgcgatctca ggttggacgc atacagatta ccagtgtcac 60
ggtttggaga ataaaatgta tagacatgtt tatgcaattt gcatgaacgg tactcaagta 120
tattgcagaa cagagtgggg tagcagctgc tag 153
<210> 176
<211> 57
<212> PRT
<213> 假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides)
<400> 176
Met Asn Lys Glu Tyr Asn Ser Ile Ser Asn Phe Lys Lys Ile Thr Asn
1 5 10 15
Lys Asp Leu Gln Asn Ile Asn Gly Gly Phe Ile Gly Arg Ala Ile Gly
20 25 30
Asp Phe Val Tyr Phe Gly Ala Lys Gly Leu Arg Glu Ser Gly Lys Leu
35 40 45
Leu Asn Tyr Tyr Tyr Lys His Lys His
50 55
<210> 177
<211> 174
<212> DNA
<213> 假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides)
<400> 177
atgaataaag aatataatag cattagcaat tttaaaaaaa ttactaataa agacttgcaa 60
aacataaatg gtggatttat tggtagggca ataggtgact ttgtgtactt tggagcgaag 120
ggactaagag aatctggtaa actacttaat tattactata agcataagca ttga 174
<210> 178
<211> 53
<212> PRT
<213> 假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides)
<400> 178
Met Lys Asn Gln Leu Met Ser Phe Glu Val Ile Ser Glu Lys Glu Leu
1 5 10 15
Ser Thr Val Gln Gly Gly Lys Gly Leu Gly Lys Leu Ile Gly Ile Asp
20 25 30
Trp Leu Leu Gly Gln Ala Lys Asp Ala Val Lys Gln Tyr Lys Lys Asp
35 40 45
Tyr Lys Arg Trp His
50
<210> 179
<211> 162
<212> DNA
<213> 假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides)
<400> 179
atgaaaaatc agttaatgtc tttcgaagtg atatcagaaa aagaattgtc cacggtacaa 60
ggtggcaaag gcttaggtaa actcatagga attgattggc ttttgggtca agctaaggac 120
gctgttaaac agtacaagaa ggattacaaa cgttggcact aa 162
<210> 180
<211> 61
<212> PRT
<213> 冷明串珠菌(Leuconostoc gelidum)
<400> 180
Met Met Asn Met Lys Pro Thr Glu Ser Tyr Glu Gln Leu Asp Asn Ser
1 5 10 15
Ala Leu Glu Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His
20 25 30
Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Phe Ser Ala
35 40 45
Gly Val His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp
50 55 60
<210> 181
<211> 186
<212> DNA
<213> 冷明串珠菌(Leuconostoc gelidum)
<400> 181
atgatgaaca tgaaacctac ggaaagctat gagcaattgg ataatagtgc tctcgaacaa 60
gtcgtaggag gtaagtatta tggtaacgga gttcattgca caaaaagtgg ttgttctgta 120
aactggggag aagccttttc agctggagta catcgtttag caaatggtgg aaatggtttc 180
tggtaa 186
<210> 182
<211> 61
<212> PRT
<213> 肉明串珠菌(Leuconostoc carnosum)
<400> 182
Met Asn Asn Met Lys Ser Ala Asp Asn Tyr Gln Gln Leu Asp Asn Asn
1 5 10 15
Ala Leu Glu Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His
20 25 30
Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Phe Ser Ala
35 40 45
Gly Val His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp
50 55 60
<210> 183
<211> 186
<212> DNA
<213> 肉明串珠菌(Leuconostoc carnosum)
<400> 183
atgaataaca tgaaatctgc ggataattat cagcaattgg ataataatgc tctcgaacaa 60
gtcgtaggag gtaagtatta tggtaacgga gttcattgca caaaaagtgg ttgttctgta 120
aactggggag aagccttttc agctggagta catcgtttag caaatggtgg aaatggtttc 180
tggtaa 186
<210> 184
<211> 63
<212> PRT
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 184
Met Phe Leu Val Asn Gln Leu Gly Ile Ser Lys Ser Leu Ala Asn Thr
1 5 10 15
Ile Leu Gly Ala Ile Ala Val Gly Asn Leu Ala Ser Trp Leu Leu Ala
20 25 30
Leu Val Pro Gly Pro Gly Trp Ala Thr Lys Ala Ala Leu Ala Thr Ala
35 40 45
Glu Thr Ile Val Lys His Glu Gly Lys Ala Ala Ala Ile Ala Trp
50 55 60
<210> 185
<211> 192
<212> DNA
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 185
atgttcttgg taaatcagtt agggatttca aaatcgttag ctaatactat tcttggtgca 60
attgctgttg gtaatttggc cagttggtta ttagctttgg ttcctggtcc gggttgggca 120
acaaaagcag cacttgcgac agctgaaaca attgtgaagc atgaaggaaa agcagctgct 180
attgcgtggt aa 192
<210> 186
<211> 74
<212> PRT
<213> 地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)
<400> 186
Met Ser Lys Lys Glu Met Ile Leu Ser Trp Lys Asn Pro Met Tyr Arg
1 5 10 15
Thr Glu Ser Ser Tyr His Pro Ala Gly Asn Ile Leu Lys Glu Leu Gln
20 25 30
Glu Glu Glu Gln His Ser Ile Ala Gly Gly Thr Ile Thr Leu Ser Thr
35 40 45
Cys Ala Ile Leu Ser Lys Pro Leu Gly Asn Asn Gly Tyr Leu Cys Thr
50 55 60
Val Thr Lys Glu Cys Met Pro Ser Cys Asn
65 70
<210> 187
<211> 225
<212> DNA
<213> 地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)
<400> 187
atgtcaaaaa aggaaatgat tctttcatgg aaaaatccta tgtatcgcac tgaatcttct 60
tatcatccag cagggaacat ccttaaagaa ctccaggaag aggaacagca cagcatcgcc 120
ggaggcacaa tcacgctcag cacttgtgcc atcttgagca agccgttagg aaataacgga 180
tacctgtgta cagtgacaaa agaatgcatg ccaagctgta actaa 225
<210> 188
<211> 266
<212> PRT
<213> 扩展短杆菌(Brevibacterium linens)
<400> 188
Met Asn Asn Leu Tyr Arg Glu Leu Ala Pro Ile Pro Gly Pro Ala Trp
1 5 10 15
Ala Glu Ile Glu Glu Glu Ala Arg Arg Thr Phe Lys Arg Asn Ile Ala
20 25 30
Gly Arg Arg Ile Val Asp Val Ala Gly Pro Thr Gly Phe Glu Thr Ser
35 40 45
Ala Val Thr Thr Gly His Ile Arg Asp Val Gln Ser Glu Thr Ser Gly
50 55 60
Leu Gln Val Lys Gln Arg Ile Val Gln Glu Tyr Ile Glu Leu Arg Thr
65 70 75 80
Pro Phe Thr Val Thr Arg Gln Ala Ile Asp Asp Val Ala Arg Gly Ser
85 90 95
Gly Asp Ser Asp Trp Gln Pro Val Lys Asp Ala Ala Thr Thr Ile Ala
100 105 110
Met Ala Glu Asp Arg Ala Ile Leu His Gly Leu Asp Ala Ala Gly Ile
115 120 125
Gly Gly Ile Val Pro Gly Ser Ser Asn Ala Ala Val Ala Ile Pro Asp
130 135 140
Ala Val Glu Asp Phe Ala Asp Ala Val Ala Gln Ala Leu Ser Val Leu
145 150 155 160
Arg Thr Val Gly Val Asp Gly Pro Tyr Ser Leu Leu Leu Ser Ser Ala
165 170 175
Glu Tyr Thr Lys Val Ser Glu Ser Thr Asp His Gly Tyr Pro Ile Arg
180 185 190
Glu His Leu Ser Arg Gln Leu Gly Ala Gly Glu Ile Ile Trp Ala Pro
195 200 205
Ala Leu Glu Gly Ala Leu Leu Val Ser Thr Arg Gly Gly Asp Tyr Glu
210 215 220
Leu His Leu Gly Gln Asp Leu Ser Ile Gly Tyr Tyr Ser His Asp Ser
225 230 235 240
Glu Thr Val Glu Leu Tyr Leu Gln Glu Thr Phe Gly Phe Leu Ala Leu
245 250 255
Thr Asp Glu Ser Ser Val Pro Leu Ser Leu
260 265
<210> 189
<211> 801
<212> DNA
<213> 扩展短杆菌(Brevibacterium linens)
<400> 189
gtgaataacc tctatcgcga gcttgccccc atccccggcc cggcctgggc ggagatcgag 60
gaggaggctc gacggacatt caaacgcaat atcgccggcc gccggatcgt cgatgtcgca 120
gggcccacgg gcttcgagac ctccgcggtg accactggcc acatccgaga cgtccagtcg 180
gagacgagcg gactgcaggt taagcagcgc atcgtgcagg aatacatcga gctgcggacc 240
ccattcaccg tgactcggca ggccatcgat gacgtggccc gcgggtccgg tgactcggac 300
tggcagcccg tcaaggatgc ggccacgacg atcgcgatgg ctgaagatcg ggccattctc 360
cacgggctcg atgcggccgg gatcggcgga atcgttcccg gcagctcgaa tgccgcagtg 420
gccatccccg acgccgtcga ggacttcgcg gacgccgtcg cccaggcgct gagtgtgctg 480
cgcacggtgg gagtcgacgg gccctacagc ctgttgctct cctccgcgga gtacaccaag 540
gtctccgagt ccaccgacca cggctacccg atccgcgagc acctctcccg gcagctcggc 600
gccggagaga tcatctgggc gcccgcgctc gaaggggcgc tgctcgtctc cacgcgcggg 660
ggtgactacg agctccacct cggccaggac ctgtcgatcg gttactacag ccacgacagc 720
gagaccgtcg aactctatct gcaggagacc ttcggattcc tcgcgctgac cgacgaatcc 780
agtgtgcctt tgagcctctg a 801
<210> 190
<211> 71
<212> PRT
<213> 英诺克李斯特菌(Listeria innocua)
<400> 190
Met Lys Lys Ala Ala Leu Lys Phe Ile Ile Val Ile Ala Ile Leu Gly
1 5 10 15
Phe Ser Phe Ser Phe Phe Ser Ile Gln Ser Glu Ala Lys Ser Tyr Gly
20 25 30
Asn Gly Val Gln Cys Asn Lys Lys Lys Cys Trp Val Asp Trp Gly Ser
35 40 45
Ala Ile Ser Thr Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Trp Ala Thr Gly
50 55 60
Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser
65 70
<210> 191
<211> 216
<212> DNA
<213> 英诺克李斯特菌(Listeria innocua)
<400> 191
ttgaagaagg cagcgttaaa atttattatt gttattgcta ttctaggttt cagtttttct 60
ttctttagca tacaatctga agctaaatct tatggaaatg gagttcagtg taataagaaa 120
aaatgttggg tagattgggg tagtgctata agtactattg gaaataattc tgcagcgaat 180
tgggctacag gtggagcagc tggttggaaa agctga 216
<210> 192
<211> 68
<212> PRT
<213> 芽孢杆菌属物种(Bacillus sp.)
<400> 192
Met Ser Gln Glu Ala Ile Ile Arg Ser Trp Lys Asp Pro Phe Ser Arg
1 5 10 15
Glu Asn Ser Thr Gln Asn Pro Ala Gly Asn Pro Phe Ser Glu Leu Lys
20 25 30
Glu Ala Gln Met Asp Lys Leu Val Gly Ala Gly Asp Met Glu Ala Ala
35 40 45
Cys Thr Phe Thr Leu Pro Gly Gly Gly Gly Val Cys Thr Leu Thr Ser
50 55 60
Glu Cys Ile Cys
65
<210> 193
<211> 207
<212> DNA
<213> 芽孢杆菌属物种(Bacillus sp.)
<400> 193
atgagtcaag aagctatcat tcgttcatgg aaagatcctt tttcccgtga aaattctaca 60
caaaatccag ctggtaaccc attcagtgag ctgaaagaag cacaaatgga taagttagta 120
ggtgcgggag acatggaagc agcatgtact tttacattgc ctggtggcgg cggtgtttgt 180
actctaactt ctgaatgtat ttgttaa 207
<210> 194
<211> 61
<212> PRT
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 194
Met Thr Asn Met Lys Ser Val Glu Ala Tyr Gln Gln Leu Asp Asn Gln
1 5 10 15
Asn Leu Lys Lys Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His
20 25 30
Cys Thr Lys Ser Gly Cys Ser Val Asn Trp Gly Glu Ala Ala Ser Ala
35 40 45
Gly Ile His Arg Leu Ala Asn Gly Gly Asn Gly Phe Trp
50 55 60
<210> 195
<211> 186
<212> DNA
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 195
atgacgaata tgaagtctgt ggaagcatat cagcaattag ataaccagaa tctcaagaaa 60
gttgttggtg gaaagtatta tgggaatggt gttcactgta caaaaagtgg atgctctgtt 120
aactggggag aagctgcctc agctggcata catcgtttgg ccaatggtgg aaatggattt 180
tggtaa 186
<210> 196
<211> 68
<212> PRT
<213> 密执安棒状杆菌密执安亚种(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis)
<400> 196
Met Asn Asp Ile Leu Glu Thr Glu Thr Pro Val Met Val Ser Pro Arg
1 5 10 15
Trp Asp Met Leu Leu Asp Ala Gly Glu Asp Thr Ser Pro Ser Val Gln
20 25 30
Thr Gln Ile Asp Ala Glu Phe Arg Arg Val Val Ser Pro Tyr Met Ser
35 40 45
Ser Ser Gly Trp Leu Cys Thr Leu Thr Ile Glu Cys Gly Thr Ile Ile
50 55 60
Cys Ala Cys Arg
65
<210> 197
<211> 207
<212> DNA
<213> 密执安棒状杆菌密执安亚种(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis)
<400> 197
atgaacgaca tcctcgagac ggagaccccc gtcatggtca gcccccggtg ggacatgctg 60
ctcgacgcgg gcgaggacac cagcccgtcc gtccagaccc agatcgacgc ggagttccgt 120
cgcgtcgtga gcccgtacat gtccagcagc ggctggctct gcacgctcac catcgaatgt 180
ggcaccatca tctgcgcgtg tcgctga 207
<210> 198
<211> 69
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 198
Met Glu Leu Lys Ala Ser Glu Phe Gly Val Val Leu Ser Val Asp Ala
1 5 10 15
Leu Lys Leu Ser Arg Gln Ser Pro Leu Gly Val Gly Ile Gly Gly Gly
20 25 30
Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Cys Gly Gly Gln Gly Gly Gly Cys
35 40 45
Gly Gly Cys Ser Asn Gly Cys Ser Gly Gly Asn Gly Gly Ser Gly Gly
50 55 60
Ser Gly Ser His Ile
65
<210> 199
<211> 207
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 199
atggaattaa aagcgagtga atttggtgta gttttgtccg ttgatgctct taaattatca 60
cgccagtctc cattaggtgt tggcattggt ggtggtggcg gcggcggcgg cggcggtagc 120
tgcggtggtc aaggtggcgg ttgtggtggt tgcagcaacg gttgtagtgg tggaaacggt 180
ggcagcggcg gaagtggttc acatatc 207
<210> 200
<211> 7
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 200
Met Arg Thr Gly Asn Ala Asn
1 5
<210> 201
<211> 24
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 201
atgcgtactg gtaatgcaaa ctaa 24
<210> 202
<211> 99
<212> PRT
<213> 肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)
<400> 202
Met Arg Glu Ile Ser Gln Lys Asp Leu Asn Leu Ala Phe Gly Ala Gly
1 5 10 15
Glu Thr Asp Pro Asn Thr Gln Leu Leu Asn Asp Leu Gly Asn Asn Met
20 25 30
Ala Trp Gly Ala Ala Leu Gly Ala Pro Gly Gly Leu Gly Ser Ala Ala
35 40 45
Leu Gly Ala Ala Gly Gly Ala Leu Gln Thr Val Gly Gln Gly Leu Ile
50 55 60
Asp His Gly Pro Val Asn Val Pro Ile Pro Val Leu Ile Gly Pro Ser
65 70 75 80
Trp Asn Gly Ser Gly Ser Gly Tyr Asn Ser Ala Thr Ser Ser Ser Gly
85 90 95
Ser Gly Ser
<210> 203
<211> 300
<212> DNA
<213> 肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)
<400> 203
atgagagaaa ttagtcaaaa ggacttaaat cttgcttttg gtgcaggaga gaccgatcca 60
aatactcaac ttctaaacga ccttggaaat aatatggcat ggggtgctgc tcttggcgct 120
cctggcggat taggatcagc agctttgggg gccgcgggag gtgcattaca aactgtaggg 180
caaggattaa ttgaccatgg tcctgtaaat gtccccatcc ctgtactcat cgggccaagc 240
tggaatggta gcggtagtgg ttataacagc gcaacatcca gttccggtag tggtagttaa 300
<210> 204
<211> 75
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 204
Met Arg Glu Ile Thr Glu Ser Gln Leu Arg Tyr Ile Ser Gly Ala Gly
1 5 10 15
Gly Ala Pro Ala Thr Ser Ala Asn Ala Ala Gly Ala Ala Ala Ile Val
20 25 30
Gly Ala Leu Ala Gly Ile Pro Gly Gly Pro Leu Gly Val Val Val Gly
35 40 45
Ala Val Ser Ala Gly Leu Thr Thr Ala Ile Gly Ser Thr Val Gly Ser
50 55 60
Gly Ser Ala Ser Ser Ser Ala Gly Gly Gly Ser
65 70 75
<210> 205
<211> 228
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 205
atgcgagaaa taacagaatc acagttaaga tatatttccg gggcgggagg tgcgccagcg 60
acttcagcta atgccgcagg tgctgcagct attgttggag ctctcgccgg aatacctggt 120
ggtccacttg gggttgtagt tggagccgta tctgccggtt tgacaacagc aattggctcg 180
accgtgggaa gtggtagtgc cagttcttct gctggtggcg gtagctaa 228
<210> 206
<211> 58
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 206
Met Ile Lys His Phe His Phe Asn Lys Leu Ser Ser Gly Lys Lys Asn
1 5 10 15
Asn Val Pro Ser Pro Ala Lys Gly Val Ile Gln Ile Lys Lys Ser Ala
20 25 30
Ser Gln Leu Thr Lys Gly Gly Ala Gly His Val Pro Glu Tyr Phe Val
35 40 45
Gly Ile Gly Thr Pro Ile Ser Phe Tyr Gly
50 55
<210> 207
<211> 177
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 207
atgattaagc attttcattt taataaactg tcttctggta aaaaaaataa tgttccatct 60
cctgcaaagg gggttataca aataaaaaaa tcagcatcgc aactcacaaa aggtggtgca 120
ggacatgtgc ctgagtattt tgtggggatt ggtacaccta tatctttcta tggctga 177
<210> 208
<211> 90
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 208
Met Tyr Met Arg Glu Leu Asp Arg Glu Glu Leu Asn Cys Val Gly Gly
1 5 10 15
Ala Gly Asp Pro Leu Ala Asp Pro Asn Ser Gln Ile Val Arg Gln Ile
20 25 30
Met Ser Asn Ala Ala Trp Gly Pro Pro Leu Val Pro Glu Arg Phe Arg
35 40 45
Gly Met Ala Val Gly Ala Ala Gly Gly Val Thr Gln Thr Val Leu Gln
50 55 60
Gly Ala Ala Ala His Met Pro Val Asn Val Pro Ile Pro Lys Val Pro
65 70 75 80
Met Gly Pro Ser Trp Asn Gly Ser Lys Gly
85 90
<210> 209
<211> 273
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 209
atgtatatga gagagttaga tagagaggaa ttaaattgcg ttggtggggc tggagatccg 60
cttgcagatc ctaattccca aattgtaaga cagataatgt ctaatgcggc atggggcccg 120
cctttggtgc cagagcggtt taggggaatg gctgttggag ccgcaggtgg ggttacgcag 180
acagttcttc aaggagcagc agctcatatg ccggttaatg tccctatacc taaagttccg 240
atgggaccct catggaacgg aagtaaagga taa 273
<210> 210
<211> 50
<212> PRT
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 210
Met Ser Gln Val Val Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys
1 5 10 15
Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile
20 25 30
Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp
35 40 45
Lys Ser
50
<210> 211
<211> 153
<212> DNA
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 211
atgtcacagg tagtaggtgg aaaatactac ggtaatggag tctcatgtaa taaaaaaggg 60
tgcagtgttg attggggaaa agcgattggc attattggaa ataattctgc tgcgaattta 120
gctactggtg gagcagctgg ttggaaaagt taa 153
<210> 212
<211> 58
<212> PRT
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 212
Met Lys Lys Leu Thr Ser Lys Glu Met Ala Gln Val Val Gly Gly Lys
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val Asp
20 25 30
Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn Leu
35 40 45
Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Lys Ser
50 55
<210> 213
<211> 177
<212> DNA
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 213
ttgaagaaat taacatcaaa agaaatggca caagtagtag gtgggaaata ctacggtaat 60
ggattatcat gtaataaaaa agggtgcagt gttgattggg gaaaagctat tggcattatt 120
ggaaataatt ctgctgcgaa tttagctact ggtggagcag ctggttggaa aagttaa 177
<210> 214
<211> 63
<212> PRT
<213> 变形链球菌(Streptococcus mutans)
<400> 214
Met Ser Asn Thr Gln Leu Leu Glu Val Leu Gly Thr Glu Thr Phe Asp
1 5 10 15
Val Gln Glu Asp Leu Phe Ala Phe Asp Thr Thr Asp Thr Thr Ile Val
20 25 30
Ala Ser Asn Asp Asp Pro Asp Thr Arg Phe Lys Ser Trp Ser Leu Cys
35 40 45
Thr Pro Gly Cys Ala Arg Thr Gly Ser Phe Asn Ser Tyr Cys Cys
50 55 60
<210> 215
<211> 192
<212> DNA
<213> 变形链球菌(Streptococcus mutans)
<400> 215
atgtcaaaca cacaattatt agaagtcctt ggtactgaaa cttttgatgt tcaagaagat 60
ctctttgctt ttgatacaac agatactact attgtggcaa gcaacgacga tccagatact 120
cgtttcaaaa gttggagcct ttgtacgcct ggttgtgcaa ggacaggtag tttcaatagt 180
tactgttgct ga 192
<210> 216
<211> 53
<212> PRT
<213> 变形链球菌(Streptococcus mutans)
<400> 216
Met Asn Lys Leu Asn Ser Asn Ala Val Val Ser Leu Asn Glu Val Ser
1 5 10 15
Asp Ser Glu Leu Asp Thr Ile Leu Gly Gly Asn Arg Trp Trp Gln Gly
20 25 30
Val Val Pro Thr Val Ser Tyr Glu Cys Arg Met Asn Ser Trp Gln His
35 40 45
Val Phe Thr Cys Cys
50
<210> 217
<211> 162
<212> DNA
<213> 变形链球菌(Streptococcus mutans)
<400> 217
atgaacaagt taaacagtaa cgcagtagtt tctttgaatg aagtttcaga ttctgaattg 60
gatactattt tgggtggtaa tcgttggtgg caaggtgttg tgccaacggt ctcatatgag 120
tgtcgcatga attcatggca acatgttttc acttgctgtt aa 162
<210> 218
<211> 57
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 218
Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys
1 5 10 15
Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro
20 25 30
Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr
35 40 45
Cys His Cys Ser Ile His Val Ser Lys
50 55
<210> 219
<211> 174
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 219
atgagtacaa aagattttaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60
tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120
ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtcat tgtagtattc acgtaagcaa ataa 174
<210> 220
<211> 57
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 220
Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys
1 5 10 15
Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro
20 25 30
Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr
35 40 45
Cys Asn Cys Ser Val His Val Ser Lys
50 55
<210> 221
<211> 171
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 221
atgagtacaa aagatttcaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60
tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120
ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtaat tgtagcgttc acgtaagcaa a 171
<210> 222
<211> 57
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 222
Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Thr
1 5 10 15
Asp Ser Gly Ala Ser Thr Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro
20 25 30
Gly Cys Lys Thr Gly Val Leu Met Gly Cys Asn Leu Lys Thr Ala Thr
35 40 45
Cys Asn Cys Ser Val His Val Ser Lys
50 55
<210> 223
<211> 174
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)
<400> 223
atgagtacaa aagatttcaa cttagatttg gtatctgttt caaaaacaga ttctggcgct 60
tcaacacgta ttaccagcat ttcgctttgt acaccaggtt gtaaaacagg tgttctgatg 120
ggatgtaacc tgaaaacagc aacttgtaat tgtagcgttc acgtaagcaa ataa 174
<210> 224
<211> 55
<212> PRT
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 224
Met Asn Asn Glu Asp Phe Asn Leu Asp Leu Ile Lys Ile Ser Lys Glu
1 5 10 15
Asn Asn Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Lys Ser Leu Cys Thr
20 25 30
Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ile Leu Met Thr Cys Pro Leu Lys Thr Ala
35 40 45
Thr Cys Gly Cys His Phe Gly
50 55
<210> 225
<211> 168
<212> DNA
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 225
atgaacaatg aagattttaa tttggatctc atcaaaatct caaaggaaaa caactcagga 60
gcttcacctc gaataactag taaatcatta tgtactcctg gatgtaagac gggtattttg 120
atgacttgtc cactaaaaac tgcaacctgt ggttgtcatt ttggataa 168
<210> 226
<211> 57
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 226
Met Ser Thr Lys Asp Phe Asn Leu Asp Leu Val Ser Val Ser Lys Lys
1 5 10 15
Asp Ser Gly Ala Ser Pro Arg Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro
20 25 30
Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr
35 40 45
Cys Asn Cys Ser Ile His Val Ser Lys
50 55
<210> 227
<211> 174
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 227
atgagtacaa aagattttaa cttggatttg gtatctgttt cgaagaaaga ttcaggtgca 60
tcaccacgca ttacaagtat ttcgctatgt acacccggtt gtaaaacagg agctctgatg 120
ggttgtaaca tgaaaacagc aacttgtaat tgtagtattc acgtaagcaa ataa 174
<210> 228
<211> 57
<212> PRT
<213> 沃氏葡萄球菌(Staphylococcus warneri)
<400> 228
Met Glu Asn Ser Lys Val Met Lys Asp Ile Glu Val Ala Asn Leu Leu
1 5 10 15
Glu Glu Val Gln Glu Asp Glu Leu Asn Glu Val Leu Gly Ala Lys Lys
20 25 30
Lys Ser Gly Val Ile Pro Thr Val Ser His Asp Cys His Met Asn Ser
35 40 45
Phe Gln Phe Val Phe Thr Cys Cys Ser
50 55
<210> 229
<211> 174
<212> DNA
<213> 沃氏葡萄球菌(Staphylococcus warneri)
<400> 229
atggaaaatt ctaaagttat gaaggacatt gaagtagcaa atttattaga agaggttcaa 60
gaagatgaat tgaatgaagt cttaggagct aagaaaaagt caggagtaat cccaactgtg 120
tcacacgatt gccatatgaa ttctttccaa tttgtattta cttgttgttc ataa 174
<210> 230
<211> 58
<212> PRT
<213> 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
<400> 230
Met Ala Glu Asn Leu Phe Asp Leu Asp Ile Gln Val Asn Lys Ser Gln
1 5 10 15
Gly Ser Val Glu Pro Gln Val Leu Ser Ile Val Ala Cys Ser Ser Gly
20 25 30
Cys Gly Ser Gly Lys Thr Ala Ala Ser Cys Val Glu Thr Cys Gly Asn
35 40 45
Arg Cys Phe Thr Asn Val Gly Ser Leu Cys
50 55
<210> 231
<211> 177
<212> DNA
<213> 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
<400> 231
atggctgaaa acttatttga tctggacatt caagtaaaca aatctcaagg ttctgtagag 60
cctcaggttc tgagcattgt tgcatgttct agcggatgtg gtagcggtaa aacagctgcc 120
agttgtgttg aaacttgtgg caaccggtgc tttactaacg ttggttcact ctgctaa 177
<210> 232
<211> 62
<212> PRT
<213> 乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)
<400> 232
Met Lys Lys Ile Glu Lys Leu Thr Glu Lys Glu Met Ala Asn Ile Ile
1 5 10 15
Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Thr Cys Gly Lys His Ser Cys
20 25 30
Ser Val Asp Trp Gly Lys Ala Thr Thr Cys Ile Ile Asn Asn Gly Ala
35 40 45
Met Ala Trp Ala Thr Gly Gly His Gln Gly Asn His Lys Cys
50 55 60
<210> 233
<211> 189
<212> DNA
<213> 乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)
<400> 233
atgaaaaaaa ttgaaaaatt aactgaaaaa gaaatggcca atatcattgg tggtaaatac 60
tacggtaatg gggttacttg tggcaaacat tcctgctctg ttgactgggg taaggctacc 120
acttgcataa tcaataatgg agctatggca tgggctactg gtggacatca aggtaatcat 180
aaatgctag 189
<210> 234
<211> 60
<212> PRT
<213> 戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)
<400> 234
Met Thr Glu Ile Lys Val Leu Asn Asp Lys Glu Leu Lys Asn Val Val
1 5 10 15
Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys Lys Thr Cys
20 25 30
Tyr Val Asp Trp Gly Gln Ala Thr Ala Ser Ile Gly Lys Ile Ile Val
35 40 45
Asn Gly Trp Thr Gln His Gly Pro Trp Ala His Arg
50 55 60
<210> 235
<211> 183
<212> DNA
<213> 戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)
<400> 235
atgactgaaa ttaaagtact aaacgataag gaactaaaaa atgtcgtagg aggaaagtat 60
tacggtaacg gagtgcattg tggtaaaaag acttgctatg tggactgggg acaagctaca 120
gctagcattg gaaaaattat agtgaacgga tggacacaac acgggccttg ggcacataga 180
taa 183
<210> 236
<211> 60
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 236
Met Lys Asn Asn Lys Asn Leu Phe Asp Leu Glu Ile Lys Lys Glu Thr
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Arg Ala Ser Val Lys Gln Cys Gln Lys Thr Leu Lys Ala Thr Arg Leu
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<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
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atgaaaaata acaaaaattt atttgattta gaaattaaaa aagaaacaag tcaaaacact 60
gatgaacttg aacctcaaac tgctggacca gcgattagag cttctgtgaa acaatgtcag 120
aaaactttga aagctacgcg tttatttaca gtgtcttgca aaggaaaaaa cggatgtaaa 180
tag 183
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<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
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Thr Val Asp Trp Ser Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ala Ala
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Ala Asn Leu Thr Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Asn Lys Gly
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gggattatag gaaacaatgc agcagcaaat ttgactacag gtggagccgc tggttggaac 180
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atgaaaaaat ttctagtttt gcgtgaccgt gaattaaatg ctatttcagg tggcgttttc 60
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aatatttctg gtggccgtcg gagtcgtaaa aatggaattg gatacgctat tggttatgcg 120
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<213>胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
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<213> 胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
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<213> 胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
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<213> 詹氏丙酸杆菌(Propionibacterium jensenii)
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145 150 155 160
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165 170 175
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195 200 205
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<212> DNA
<213> 詹氏丙酸杆菌(Propionibacterium jensenii)
<400> 269
atgaacaaaa cacacaaaat ggcgacgctg gtaattgccg cgatcttggc cgccggaatg 60
accgcaccaa ctgcctatgc agattctcct ggaaacacca gaattacagc cagcgagcaa 120
agcgtcctta cccagatact cggccacaaa cctacacaaa ctgaatataa ccgatacgtt 180
gagacttacg gaagcgtacc gaccgaagca gacatcaacg catatataga agcgtctgaa 240
tctgagggat catcaagtca aacggctgct cacgatgact cgacatcacc cggcacgagt 300
accgaaatct acacgcaggc agcccctgcc aggttctcaa tgtttttcct gtccggaact 360
tggatcacta ggagtggtgt agtatcgctc tccttgaagc caaggaaggg tggtattggc 420
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tggacacgat acaagaacaa cggcgtagac gccagcatga aaaagcagta catgtgccac 540
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gtcagtccag tcaagtgcaa ctag 624
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<213> 特氏丙酸杆菌(Propionibacterium thoenii)
<400> 270
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Ala Ala Phe Gly Ala Ser Leu Ala Ala Ala Pro Ser Ala Met Ala Val
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Cys Lys Thr Gly Ser Gly Gln Phe Arg Ile Arg Leu Asp Cys Asn Asn
50 55 60
Ala Pro Asp Lys Thr Ser Val Trp Ala Lys Pro Lys Val Met Val Ser
65 70 75 80
Val His Cys Leu Val Gly Gln Pro Arg Ser Ile Ser Phe Glu Thr Lys
85 90 95
<210> 271
<211> 291
<212> DNA
<213> 特氏丙酸杆菌(Propionibacterium thoenii)
<400> 271
atgaagaaga ccctcctgcg aagtggaacg atcgcactgg cgaccgcggc tgcatttggc 60
gcatcattgg cagccgcccc atctgccatg gccgttcctg gtggttgcac gtacacaaga 120
agcaatcgcg acgtcatcgg tacctgcaag actggaagcg gccagttccg aatccgactt 180
gactgcaaca acgctccaga caaaacttca gtctgggcca agcccaaggt aatggtgtcg 240
gttcactgtc ttgttggtca accgaggtcc atctcgttcg agaccaagtg a 291
<210> 272
<211> 255
<212> PRT
<213> 费氏丙酸杆菌费氏亚种(Propionibacterium freudenreichii subspfreudenreii)
<400> 272
Met Asn Thr Lys Ala Val Asn Leu Lys Ser Glu Asn Thr Thr Lys Leu
1 5 10 15
Val Ser Tyr Leu Thr Glu Asn Gln Leu Asp Glu Phe Ile Arg Arg Ile
20 25 30
Arg Ile Asp Gly Ala Leu Val Glu Glu Val Ser Gln Asn Ala Lys Gln
35 40 45
Ala Leu Asp Asn Thr Gly Leu Asn Gly Trp Ile Asn Thr Asp Cys Asp
50 55 60
Glu Gly Leu Leu Ser Asp Phe Ile Ser Lys Ile Ala Ser Ala Arg Trp
65 70 75 80
Ile Pro Leu Ala Glu Ser Ile Arg Pro Ala Val Thr Asp Arg Asp Lys
85 90 95
Tyr Arg Val Ser Cys Trp Phe Tyr Gln Gly Met Asn Ile Ala Ile Tyr
100 105 110
Ala Asn Ile Gly Gly Val Ala Asn Ile Ile Gly Tyr Thr Glu Ala Ala
115 120 125
Val Ala Thr Leu Leu Gly Ala Val Val Ala Val Ala Pro Val Val Pro
130 135 140
Gly Thr Pro Thr Pro Pro Lys Asp Lys Ser Ser Gln Tyr Lys Glu Val
145 150 155 160
Pro Leu Ala Val Arg Leu Ser Glu Thr Tyr His Glu Glu Gly Val Arg
165 170 175
Gly Leu Phe Asp Glu Leu Asn Tyr Ser Glu Ser Arg Met Ile Ser Thr
180 185 190
Leu Arg Arg Ala Ser Thr Asp Gly Val Leu Ile Asn Ser Trp Asn Asp
195 200 205
Gly Gln Asp Thr Ile Leu Leu Lys Lys Tyr Asn Phe Gln Asp Leu Gln
210 215 220
Leu Thr Val Arg Ser Arg Ile Val Gly Asn Gln Thr Ile Ile Glu Glu
225 230 235 240
Cys Lys Ile Thr Asp Gly Arg Lys Thr Leu Ser Asp Glu Thr Val
245 250 255
<210> 273
<211> 768
<212> DNA
<213> 费氏丙酸杆菌费氏亚种(Propionibacterium freudenreichii subspfreudenreii)
<400> 273
atgaatacca aagctgtaaa tctgaagtca gaaaacacga ctaagttggt gagctacctt 60
acggaaaatc aattggatga gtttattaga aggattcgca ttgatggcgc tcttgtggaa 120
gaggtcagtc aaaatgctaa gcaggcctta gataatactg ggctcaatgg ctggataaat 180
actgattgcg atgaaggcct tctctctgat ttcatttcaa agatagcaag tgctagatgg 240
attccattag ctgagtcaat tcgacctgcg gtgactgaca gggataagta tcgagtaagt 300
tgctggttct accaggggat gaatatagca atttacgcaa atatcggtgg cgtggccaat 360
attatcggct atacggaggc cgcagtcgca acactccttg gtgcagttgt ggcggtagct 420
cctgtggtcc ctggaactcc aacccctcca aaggacaaga gttcgcaata taaggaggtt 480
ccccttgccg ttcgtctttc cgaaacatac cacgaagagg gagtacgagg tctattcgac 540
gagctgaact actccgagag ccgtatgatc tctactctaa ggcgagcatc aaccgatgga 600
gtcctaatta attcttggaa cgatgggcag gatacaattc tgcttaagaa gtacaatttc 660
caagacttgc aactgactgt caggagccgc attgttggga atcaaacaat aattgaagaa 720
tgcaaaatca ctgatggtag aaaaactctt tcagacgaga ctgtgtag 768
<210> 274
<211> 618
<212> PRT
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 274
Met Ala Arg Pro Ile Ala Asp Leu Ile His Phe Asn Ser Thr Thr Val
1 5 10 15
Thr Ala Ser Gly Asp Val Tyr Tyr Gly Pro Gly Gly Gly Thr Gly Ile
20 25 30
Gly Pro Ile Ala Arg Pro Ile Glu His Gly Leu Asp Ser Ser Thr Glu
35 40 45
Asn Gly Trp Gln Glu Phe Glu Ser Tyr Ala Asp Val Gly Val Asp Pro
50 55 60
Arg Arg Tyr Val Pro Leu Gln Val Lys Glu Lys Arg Arg Glu Ile Glu
65 70 75 80
Leu Gln Phe Arg Asp Ala Glu Lys Lys Leu Glu Ala Ser Val Gln Ala
85 90 95
Glu Leu Asp Lys Ala Asp Ala Ala Leu Gly Pro Ala Lys Asn Leu Ala
100 105 110
Pro Leu Asp Val Ile Asn Arg Ser Leu Thr Ile Val Gly Asn Ala Leu
115 120 125
Gln Gln Lys Asn Gln Lys Leu Leu Leu Asn Gln Lys Lys Ile Thr Ser
130 135 140
Leu Gly Ala Lys Asn Phe Leu Thr Arg Thr Ala Glu Glu Ile Gly Glu
145 150 155 160
Gln Ala Val Arg Glu Gly Asn Ile Asn Gly Pro Glu Ala Tyr Met Arg
165 170 175
Phe Leu Asp Arg Glu Met Glu Gly Leu Thr Ala Ala Tyr Asn Val Lys
180 185 190
Leu Phe Thr Glu Ala Ile Ser Ser Leu Gln Ile Arg Met Asn Thr Leu
195 200 205
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Glu Gln Ala Ala Ala Glu Ala Lys Arg Lys Ala Glu Glu Gln Ala Arg
225 230 235 240
Gln Gln Ala Ala Ile Arg Ala Ala Asn Thr Tyr Ala Met Pro Ala Asn
245 250 255
Gly Ser Val Val Ala Thr Ala Ala Gly Arg Gly Leu Ile Gln Val Ala
260 265 270
Gln Gly Ala Ala Ser Leu Ala Gln Ala Ile Ser Asp Ala Ile Ala Val
275 280 285
Leu Gly Arg Val Leu Ala Ser Ala Pro Ser Val Met Ala Val Gly Phe
290 295 300
Ala Ser Leu Thr Tyr Ser Ser Arg Thr Ala Glu Gln Trp Gln Asp Gln
305 310 315 320
Thr Pro Asp Ser Val Arg Tyr Ala Leu Gly Met Asp Ala Ala Lys Leu
325 330 335
Gly Leu Pro Pro Ser Val Asn Leu Asn Ala Val Ala Lys Ala Ser Gly
340 345 350
Thr Val Asp Leu Pro Met Arg Leu Thr Asn Glu Ala Arg Gly Asn Thr
355 360 365
Thr Thr Leu Ser Val Val Ser Thr Asp Gly Val Ser Val Pro Lys Ala
370 375 380
Val Pro Val Arg Met Ala Ala Tyr Asn Ala Thr Thr Gly Leu Tyr Glu
385 390 395 400
Val Thr Val Pro Ser Thr Thr Ala Glu Ala Pro Pro Leu Ile Leu Thr
405 410 415
Trp Thr Pro Ala Ser Pro Pro Gly Asn Gln Asn Pro Ser Ser Thr Thr
420 425 430
Pro Val Val Pro Lys Pro Val Pro Val Tyr Glu Gly Ala Thr Leu Thr
435 440 445
Pro Val Lys Ala Thr Pro Glu Thr Tyr Pro Gly Val Ile Thr Leu Pro
450 455 460
Glu Asp Leu Ile Ile Gly Phe Pro Ala Asp Ser Gly Ile Lys Pro Ile
465 470 475 480
Tyr Val Met Phe Arg Asp Pro Arg Asp Val Pro Gly Ala Ala Thr Gly
485 490 495
Lys Gly Gln Pro Val Ser Gly Asn Trp Leu Gly Ala Ala Ser Gln Gly
500 505 510
Glu Gly Ala Pro Ile Pro Ser Gln Ile Ala Asp Lys Leu Arg Gly Lys
515 520 525
Thr Phe Lys Asn Trp Arg Asp Phe Arg Glu Gln Phe Trp Ile Ala Val
530 535 540
Ala Asn Asp Pro Glu Leu Ser Lys Gln Phe Asn Pro Gly Ser Leu Ala
545 550 555 560
Val Met Arg Asp Gly Gly Ala Pro Tyr Val Arg Glu Ser Glu Gln Ala
565 570 575
Gly Gly Arg Ile Lys Ile Glu Ile His His Lys Val Arg Val Ala Asp
580 585 590
Gly Gly Gly Val Tyr Asn Met Gly Asn Leu Val Ala Val Thr Pro Lys
595 600 605
Arg His Ile Glu Ile His Lys Gly Gly Lys
610 615
<210> 275
<211> 1857
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 275
atggcacgac ccattgctga ccttatccac ttcaactcta caactgtcac ggcaagcgga 60
gacgtttatt acggccctgg gggaggtacc ggcattggcc ccattgccag acctatagag 120
cacggcttgg attcgtccac tgaaaatggc tggcaagagt ttgaaagtta tgctgatgtg 180
ggcgttgacc ccagacgcta tgttcctctt caggttaaag aaaaacgcag ggagatcgag 240
cttcagttcc gagatgccga gaaaaaactt gaggcgtcgg tacaagccga gctggataag 300
gctgatgccg ctcttggtcc ggcaaagaat cttgcaccat tggacgtcat caaccgcagt 360
ctgaccatcg ttggaaacgc cctccagcaa aagaatcaaa aactactgct gaatcagaag 420
aagattacca gcctgggtgc aaagaatttc cttacccgta cggcggaaga gatcggtgaa 480
caagcggtgc gagaaggcaa tattaacggg cctgaagcct atatgcgctt cctcgacagg 540
gaaatggaag gtctcacggc agcttataac gtaaaactct tcaccgaagc gatcagtagt 600
ctccagatcc gcatgaatac gttgaccgcc gccaaagcaa gtattgaggc ggccgcagca 660
aacaaggcgc gtgaacaagc agcggctgag gccaaacgca aagccgaaga gcaggcccgc 720
cagcaagcgg cgataagagc tgccaatacc tatgccatgc cggccaatgg cagcgttgtc 780
gccaccgccg caggccgggg tctgatccag gtcgcacaag gcgccgcatc ccttgctcaa 840
gcgatctccg atgcgattgc cgtcctgggc cgggtcctgg cttcagcacc ctcggtgatg 900
gccgtgggct ttgccagtct gacctactcc tcccggactg ccgagcaatg gcaggaccaa 960
acgcccgata gcgttcgtta cgccctgggc atggatgccg ctaaattggg gcttccccca 1020
agcgtaaacc tgaacgcggt tgcaaaagcc agcggtaccg tcgatctgcc gatgcgcctg 1080
accaacgagg cacgaggcaa cacgacgacc ctttcggtgg tcagcaccga tggtgtgagc 1140
gttccgaaag ccgttccggt ccggatggcg gcctacaatg ccacgacagg cctgtacgag 1200
gttacggttc cctctacgac cgcagaagcg ccgccactga tcctgacctg gacgccggcg 1260
agtcctccag gaaaccagaa cccttcgagt accactccgg tcgtaccgaa gccggtgccg 1320
gtatatgagg gagcgaccct tacaccggtg aaggctaccc cggaaaccta tcctggggtg 1380
attacactac cggaagacct gatcatcggc ttcccggccg actcggggat caagccgatc 1440
tatgtgatgt tcagggatcc gcgggatgta cctggtgctg cgactggcaa gggacagccc 1500
gtcagcggta attggctcgg cgccgcctct caaggtgagg gggctccaat tccaagccag 1560
attgcggata aactacgtgg taagacattc aaaaactggc gggactttcg ggaacaattc 1620
tggatagctg tggctaatga tcctgagtta agtaaacagt ttaatcctgg tagtttagct 1680
gtaatgagag atggaggggc tccttatgtc agagagtcag aacaggctgg cgggagaata 1740
aagatcgaaa tccaccacaa ggttcgagta gcagatggag gcggcgttta caatatgggg 1800
aaccttgttg cagtaacgcc aaaacgtcat atagaaatcc acaagggagg gaagtga 1857
<210> 276
<211> 689
<212> PRT
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 276
Met Ala Val Asn Asp Tyr Glu Pro Gly Ser Met Val Ile Thr His Val
1 5 10 15
Gln Gly Gly Gly Arg Asp Ile Ile Gln Tyr Ile Pro Ala Arg Ser Ser
20 25 30
Tyr Gly Thr Pro Pro Phe Val Pro Pro Gly Pro Ser Pro Tyr Val Gly
35 40 45
Thr Gly Met Gln Glu Tyr Arg Lys Leu Arg Ser Thr Leu Asp Lys Ser
50 55 60
His Ser Glu Leu Lys Lys Asn Leu Lys Asn Glu Thr Leu Lys Glu Val
65 70 75 80
Asp Glu Leu Lys Ser Glu Ala Gly Leu Pro Gly Lys Ala Val Ser Ala
85 90 95
Asn Asp Ile Arg Asp Glu Lys Ser Ile Val Asp Ala Leu Met Asp Ala
100 105 110
Lys Ala Lys Ser Leu Lys Ala Ile Glu Asp Arg Pro Ala Asn Leu Tyr
115 120 125
Thr Ala Ser Asp Phe Pro Gln Lys Ser Glu Ser Met Tyr Gln Ser Gln
130 135 140
Leu Leu Ala Ser Arg Lys Phe Tyr Gly Glu Phe Leu Asp Arg His Met
145 150 155 160
Ser Glu Leu Ala Lys Ala Tyr Ser Ala Asp Ile Tyr Lys Ala Gln Ile
165 170 175
Ala Ile Leu Lys Gln Thr Ser Gln Glu Leu Glu Asn Lys Ala Arg Ser
180 185 190
Leu Glu Ala Glu Ala Gln Arg Ala Ala Ala Glu Val Glu Ala Asp Tyr
195 200 205
Lys Ala Arg Lys Ala Asn Val Glu Lys Lys Val Gln Ser Glu Leu Asp
210 215 220
Gln Ala Gly Asn Ala Leu Pro Gln Leu Thr Asn Pro Thr Pro Glu Gln
225 230 235 240
Trp Leu Glu Arg Ala Thr Gln Leu Val Thr Gln Ala Ile Ala Asn Lys
245 250 255
Lys Lys Leu Gln Thr Ala Asn Asn Ala Leu Ile Ala Lys Ala Pro Asn
260 265 270
Ala Leu Glu Lys Gln Lys Ala Thr Tyr Asn Ala Asp Leu Leu Val Asp
275 280 285
Glu Ile Ala Ser Leu Gln Ala Arg Leu Asp Lys Leu Asn Ala Glu Thr
290 295 300
Ala Arg Arg Lys Glu Ile Ala Arg Gln Ala Ala Ile Arg Ala Ala Asn
305 310 315 320
Thr Tyr Ala Met Pro Ala Asn Gly Ser Val Val Ala Thr Ala Ala Gly
325 330 335
Arg Gly Leu Ile Gln Val Ala Gln Gly Ala Ala Ser Leu Ala Gln Ala
340 345 350
Ile Ser Asp Ala Ile Ala Val Leu Gly Arg Val Leu Ala Ser Ala Pro
355 360 365
Ser Val Met Ala Val Gly Phe Ala Ser Leu Thr Tyr Ser Ser Arg Thr
370 375 380
Ala Glu Gln Trp Gln Asp Gln Thr Pro Asp Ser Val Arg Tyr Ala Leu
385 390 395 400
Gly Met Asp Ala Ala Lys Leu Gly Leu Pro Pro Ser Val Asn Leu Asn
405 410 415
Ala Val Ala Lys Ala Ser Gly Thr Val Asp Leu Pro Met Arg Leu Thr
420 425 430
Asn Glu Ala Arg Gly Asn Thr Thr Thr Leu Ser Val Val Ser Thr Asp
435 440 445
Gly Val Ser Val Pro Lys Ala Val Pro Val Arg Met Ala Ala Tyr Asn
450 455 460
Ala Thr Thr Gly Leu Tyr Glu Val Thr Val Pro Ser Thr Thr Ala Glu
465 470 475 480
Ala Pro Pro Leu Ile Leu Thr Trp Thr Pro Ala Ser Pro Pro Gly Asn
485 490 495
Gln Asn Pro Ser Ser Thr Thr Pro Val Val Pro Lys Pro Val Pro Val
500 505 510
Tyr Glu Gly Ala Thr Leu Thr Pro Val Lys Ala Thr Pro Glu Thr Tyr
515 520 525
Pro Gly Val Ile Thr Leu Pro Glu Asp Leu Ile Ile Gly Phe Pro Ala
530 535 540
Asp Ser Gly Ile Lys Pro Ile Tyr Val Met Phe Arg Asp Pro Arg Asp
545 550 555 560
Val Pro Gly Ala Ala Thr Gly Lys Gly Gln Pro Val Ser Gly Asn Trp
565 570 575
Leu Gly Ala Ala Ser Gln Gly Glu Gly Ala Pro Ile Pro Ser Gln Ile
580 585 590
Ala Asp Lys Leu Arg Gly Lys Thr Phe Lys Asn Trp Arg Asp Phe Arg
595 600 605
Glu Gln Phe Trp Ile Ala Val Ala Asn Asp Pro Glu Leu Ser Lys Gln
610 615 620
Phe Asn Pro Gly Ser Leu Ala Val Met Arg Asp Gly Gly Ala Pro Tyr
625 630 635 640
Val Arg Glu Ser Glu Gln Ala Gly Gly Arg Ile Lys Ile Glu Ile His
645 650 655
His Lys Val Arg Ile Ala Asp Gly Gly Gly Val Tyr Asn Met Gly Asn
660 665 670
Leu Val Ala Val Thr Pro Lys Arg His Ile Glu Ile His Lys Gly Gly
675 680 685
Lys
<210> 277
<211> 2070
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 277
atggctgtca atgattacga acctggttcg atggttatta cacatgtgca gggtggtggg 60
cgtgacataa tccagtatat tcctgctcga tcaagctacg gtactccacc atttgtccca 120
ccaggaccaa gtccgtatgt cggtactgga atgcaggagt acaggaagct aagaagtacg 180
cttgataagt cccattcaga actcaagaaa aacctgaaaa atgaaaccct gaaggaggtt 240
gatgaactca agagtgaagc ggggttgcca ggtaaagcgg tcagtgccaa tgacatccgc 300
gatgaaaaga gtatcgttga tgcactcatg gatgccaaag caaaatcgct aaaggccatt 360
gaggatcgcc cggccaatct ttatacggct tcagactttc ctcagaagtc agagtcgatg 420
taccagagtc agttgctggc cagccgaaaa ttctatggag agttcctgga tcgccatatg 480
agtgagctgg ccaaagcgta cagcgccgat atctataagg cgcaaatcgc tatcttgaaa 540
caaacgtctc aagagctgga gaataaagcc cggtcattgg aagcagaagc ccagcgagcc 600
gctgctgagg tggaggcgga ctacaaggcc aggaaggcaa atgtcgagaa aaaagtgcag 660
tccgagcttg accaggctgg gaatgctttg cctcaactga ccaatccaac gccagagcag 720
tggcttgaac gcgctactca actggttacg caggcgatcg ccaataagaa gaaattgcag 780
actgcaaaca atgccttgat tgccaaggca cccaatgcac tggagaaaca aaaggcaacc 840
tacaacgccg atctcctagt ggatgaaatc gccagcctgc aagcacggct ggacaagctg 900
aacgccgaaa cggcaaggcg caaggaaatc gctcgtcaag cggcgatcag ggctgccaat 960
acttatgcca tgccagccaa tggcagcgtt gtcgccaccg ccgcaggccg gggtctgatc 1020
caggtcgcac aaggcgccgc atcccttgct caagcgatct ccgatgcgat tgccgtcctg 1080
ggccgggtcc tggcttcagc accctcggtg atggccgtgg gctttgccag tctgacctac 1140
tcctcccgga ctgccgagca atggcaggac caaacgcccg atagcgttcg ttacgccctg 1200
ggcatggatg ccgctaaatt ggggcttccc ccaagcgtaa acctgaacgc ggttgcaaaa 1260
gccagcggta ccgtcgatct gccgatgcgc ctgaccaacg aggcacgagg caacacgacg 1320
accctttcgg tggtcagcac cgatggtgtg agcgttccga aagccgttcc ggtccggatg 1380
gcggcctaca atgccacgac aggcctgtac gaggttacgg ttccctctac gaccgcagaa 1440
gcgccgccac tgatcctgac ctggacgccg gcgagtcctc caggaaacca gaacccttcg 1500
agtaccactc cggtcgtacc gaagccggtg ccggtatatg agggagcgac ccttacaccg 1560
gtgaaggcta ccccggaaac ctatcctggg gtgattacac taccggaaga cctgatcatc 1620
ggcttcccgg ccgactcggg gatcaagccg atctatgtga tgttcaggga tccgcgggat 1680
gtacctggtg ctgcgactgg caagggacag cccgtcagcg gtaattggct cggcgccgcc 1740
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ttcaaaaact ggcgggactt tcgggaacaa ttctggatag ctgtggctaa tgatcctgag 1860
ttaagtaaac agtttaatcc tggtagttta gctgtaatga gagatggagg ggctccttat 1920
gtcagagagt cagaacaggc tggcgggaga ataaagatcg aaatccacca caaggttcga 1980
atagcagatg gaggcggcgt ttacaatatg gggaaccttg ttgcagtaac gccaaaacgt 2040
catatagaaa tccacaaggg agggaagtga 2070
<210> 278
<211> 47
<212> PRT
<213> 活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)
<400> 278
Met Arg Asn Asp Val Leu Thr Leu Thr Asn Pro Met Glu Glu Lys Glu
1 5 10 15
Leu Glu Gln Ile Leu Gly Gly Gly Asn Gly Val Leu Lys Thr Ile Ser
20 25 30
His Glu Cys Asn Met Asn Thr Trp Gln Phe Leu Phe Thr Cys Cys
35 40 45
<210> 279
<211> 144
<212> DNA
<213> 活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)
<400> 279
atgagaaatg acgtattaac attaacaaac ccaatggaag agaacgaact ggagcagatc 60
ttaggtggtg gcaatggtgt gttaaaaacg attagccacg aatgcaatat gaacacatgg 120
cagttcctgt ttacttgttg ctaa 144
<210> 280
<211> 55
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 280
Met Lys Asn Ala Lys Ser Leu Thr Ile Gln Glu Met Lys Ser Ile Thr
1 5 10 15
Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Ser His Gly Cys
20 25 30
Ser Val Asn Trp Gly Gln Ala Trp Thr Cys Gly Val Asn His Leu Ala
35 40 45
Asn Gly Gly His Gly Val Cys
50 55
<210> 281
<211> 168
<212> DNA
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 281
atgaaaaacg caaaaagcct aacaattcaa gaaatgaaat ctattacagg tggtaaatac 60
tatggtaatg gcgttagctg taactctcac ggctgttcag taaattgggg gcaagcatgg 120
acttgtggag taaaccatct agctaatggc ggtcatggag tttgttaa 168
<210> 282
<211> 59
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 282
Met Asn Asn Val Lys Glu Leu Ser Met Thr Glu Leu Gln Thr Ile Thr
1 5 10 15
Gly Gly Ala Arg Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Lys Lys
20 25 30
Cys Trp Val Asn Arg Gly Glu Ala Thr Gln Ser Ile Ile Gly Gly Met
35 40 45
Ile Ser Gly Trp Ala Ser Gly Leu Ala Gly Met
50 55
<210> 283
<211> 180
<212> DNA
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 283
atgaataatg taaaagaatt aagtatgaca gaattacaaa caattaccgg cggtgctaga 60
tcatatggca acggtgttta ctgtaataat aaaaaatgtt gggtaaatcg gggtgaagca 120
acgcaaagta ttattggtgg tatgattagc ggctgggcta gtggtttagc tggaatgtaa 180
<210> 284
<211> 61
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 284
Met Glu Lys Phe Ile Glu Leu Ser Leu Lys Glu Val Thr Ala Ile Thr
1 5 10 15
Gly Gly Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys His Ser Cys
20 25 30
Thr Val Asp Trp Gly Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala
35 40 45
Ala Asn Trp Ala Thr Gly Gly Asn Ala Gly Trp Asn Lys
50 55 60
<210> 285
<211> 186
<212> DNA
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 285
atggaaaagt ttattgaatt atctttaaaa gaagtaacag caattacagg tggaaaatat 60
tatggtaacg gtgtacactg tggaaaacat tcatgtaccg tagactgggg aacagctatt 120
ggaaatatcg gaaataatgc agctgcaaac tgggccacag gcggaaacgc tggctggaat 180
aaataa 186
<210> 286
<211> 56
<212> PRT
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 286
Met Lys Ser Thr Asn Asn Gln Ser Ile Ala Glu Ile Ala Ala Val Asn
1 5 10 15
Ser Leu Gln Glu Val Ser Met Glu Glu Leu Asp Gln Ile Ile Gly Ala
20 25 30
Gly Asn Gly Val Val Leu Thr Leu Thr His Glu Cys Asn Leu Ala Thr
35 40 45
Trp Thr Lys Lys Leu Lys Cys Cys
50 55
<210> 287
<211> 171
<212> DNA
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 287
atgaaatcaa caaataatca aagtatcgca gaaattgcag cagtaaactc actacaagaa 60
gtaagtatgg aggaactaga ccaaattatt ggtgccggaa acggagtggt tcttactctt 120
actcatgaat gtaacctagc aacttggaca aaaaaactaa aatgttgcta a 171
<210> 288
<211> 51
<212> PRT
<213> 化脓性链球菌血清型M28(Streptococcus pyogenes serotype M28)
<400> 288
Met Ser Phe Met Lys Asn Ser Lys Asp Ile Leu Thr Asn Ala Ile Glu
1 5 10 15
Glu Val Ser Glu Lys Glu Leu Met Glu Val Ala Gly Gly Lys Lys Gly
20 25 30
Ser Gly Trp Phe Ala Thr Ile Thr Asp Asp Cys Pro Asn Ser Val Phe
35 40 45
Val Cys Cys
50
<210> 289
<211> 156
<212> DNA
<213> 化脓性链球菌血清型M28(Streptococcus pyogenes serotype M28)
<400> 289
atgagtttta tgaaaaattc aaaggatatt ttgactaatg ctatcgaaga agtttctgaa 60
aaagaactta tggaagtagc tggtggtaaa aaaggttccg gttggtttgc aactattact 120
gatgactgtc cgaactcagt attcgtttgt tgttaa 156
<210> 290
<211> 48
<212> PRT
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 290
Met Lys Asn Ser Lys Asp Val Leu Asn Asn Ala Ile Glu Glu Val Ser
1 5 10 15
Glu Lys Glu Leu Met Glu Val Ala Gly Gly Lys Lys Gly Pro Gly Trp
20 25 30
Ile Ala Thr Ile Thr Asp Asp Cys Pro Asn Ser Ile Phe Val Cys Cys
35 40 45
<210> 291
<211> 147
<212> DNA
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 291
atgaaaaact caaaagatgt tttgaacaat gctatcgaag aggtttctga aaaagaactt 60
atggaagtag ctggtggtaa aaaaggtcca ggttggattg caactattac tgatgactgt 120
ccaaactcaa tattcgtttg ttgttaa 147
<210> 292
<211> 48
<212> PRT
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 292
Met Lys Asn Ser Lys Asp Ile Leu Asn Asn Ala Ile Glu Glu Val Ser
1 5 10 15
Glu Lys Glu Leu Met Glu Val Ala Gly Gly Lys Arg Gly Ser Gly Trp
20 25 30
Ile Ala Thr Ile Thr Asp Asp Cys Pro Asn Ser Val Phe Val Cys Cys
35 40 45
<210> 293
<211> 147
<212> DNA
<213> 唾液链球菌(Streptococcus salivarius)
<400> 293
atgaaaaact caaaagatat tttgaacaat gctatcgaag aagtttctga aaaagaactt 60
atggaagtag ctggtggtaa aagaggttca ggttggattg caactattac tgatgactgt 120
ccaaactcag tattcgtttg ttgttaa 147
<210> 294
<211> 62
<212> PRT
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 294
Met Lys Ser Ser Phe Leu Glu Lys Asp Ile Glu Glu Gln Val Thr Trp
1 5 10 15
Phe Glu Glu Val Ser Glu Gln Glu Phe Asp Asp Asp Ile Phe Gly Ala
20 25 30
Cys Ser Thr Asn Thr Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Trp Gly Asn Lys Gly
35 40 45
Asn Trp Cys Thr Ala Thr His Glu Cys Met Ser Trp Cys Lys
50 55 60
<210> 295
<211> 189
<212> DNA
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 295
atgaaaagtt cttttttaga aaaagatata gaagaacaag tgacatggtt cgaggaagtt 60
tcagaacaag aatttgacga tgatattttt ggagcttgta gtacaaacac tttttctttg 120
agtgactatt ggggtaataa aggaaattgg tgtactgcta ctcacgaatg tatgtcttgg 180
tgtaaataa 189
<210> 296
<211> 67
<212> PRT
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 296
Met Lys Asn Glu Leu Gly Lys Phe Leu Glu Glu Asn Glu Leu Glu Leu
1 5 10 15
Gly Lys Phe Ser Glu Ser Asp Met Leu Glu Ile Thr Asp Asp Glu Val
20 25 30
Tyr Ala Ala Gly Thr Pro Leu Ala Leu Leu Gly Gly Ala Ala Thr Gly
35 40 45
Val Ile Gly Tyr Ile Ser Asn Gln Thr Cys Pro Thr Thr Ala Cys Thr
50 55 60
Arg Ala Cys
65
<210> 297
<211> 204
<212> DNA
<213> 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
<400> 297
atgaaaaatg aattaggtaa gtttttagaa gaaaacgaat tagagttagg taaattttca 60
gaatcagaca tgctagaaat tactgatgat gaagtatatg cagctggaac acctttagcc 120
ttattgggtg gagctgccac cggggtgata ggttatattt ctaaccaaac atgtccaaca 180
actgcttgta cacgcgcttg ctag 204
<210> 298
<211> 46
<212> PRT
<213> 化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)
<400> 298
Met Asn Asn Thr Ile Lys Asp Phe Asp Leu Asp Leu Lys Thr Asn Lys
1 5 10 15
Lys Asp Thr Ala Thr Pro Tyr Val Gly Ser Arg Tyr Leu Cys Thr Pro
20 25 30
Gly Ser Cys Trp Lys Leu Val Cys Phe Thr Thr Thr Val Lys
35 40 45
<210> 299
<211> 141
<212> DNA
<213> 化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)
<400> 299
atgaataaca caattaaaga ctttgatctc gatttgaaaa caaataaaaa agacactgct 60
acaccttatg ttggtagccg ttacctatgt acccctggtt cttgttggaa attagtttgc 120
tttacaacaa ctgttaaata a 141
<210> 300
<211> 51
<212> PRT
<213> 化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)
<400> 300
Met Glu Lys Asn Asn Glu Val Ile Asn Ser Ile Gln Glu Val Ser Leu
1 5 10 15
Glu Glu Leu Asp Gln Ile Ile Gly Ala Gly Lys Asn Gly Val Phe Lys
20 25 30
Thr Ile Ser His Glu Cys His Leu Asn Thr Trp Ala Phe Leu Ala Thr
35 40 45
Cys Cys Ser
50
<210> 301
<211> 156
<212> DNA
<213> 化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)
<400> 301
atggaaaaaa ataatgaagt aatcaactct attcaagaag ttagtcttga agaactcgat 60
caaattatcg gtgctggaaa aaatggtgtg tttaaaacaa tttctcatga gtgtcatttg 120
aatacatggg cattccttgc tacttgttgt tcataa 156
<210> 302
<211> 51
<212> PRT
<213> 化脓性链球菌血清型M49(Streptococcus pyogenes serotype M49)
<400> 302
Met Thr Lys Glu His Glu Ile Ile Asn Ser Ile Gln Glu Val Ser Leu
1 5 10 15
Glu Glu Leu Asp Gln Ile Ile Gly Ala Gly Lys Asn Gly Val Phe Lys
20 25 30
Thr Ile Ser His Glu Cys His Leu Asn Thr Trp Ala Phe Leu Ala Thr
35 40 45
Cys Cys Ser
50
<210> 303
<211> 156
<212> DNA
<213> 化脓性链球菌血清型M49(Streptococcus pyogenes serotype M49)
<400> 303
atggaaaaaa ataatgaagt aatcaactct attcaagaag ttagtcttga agaactcgat 60
caaattatcg gtgctggaaa aaatggtgtg tttaaaacaa tttctcatga gtgtcatttg 120
aatacatggg cattccttgc tacttgttgc tcataa 156
<210> 304
<211> 56
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 304
Met Glu Lys Leu Phe Lys Glu Val Lys Leu Glu Glu Leu Glu Asn Gln
1 5 10 15
Lys Gly Ser Gly Leu Gly Lys Ala Gln Cys Ala Ala Leu Trp Leu Gln
20 25 30
Cys Ala Ser Gly Gly Thr Ile Gly Cys Gly Gly Gly Ala Val Ala Cys
35 40 45
Gln Asn Tyr Arg Gln Phe Cys Arg
50 55
<210> 305
<211> 171
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 305
atggaaaagc tatttaaaga agttaaacta gaggaactcg aaaaccaaaa aggtagtgga 60
ttaggaaaag ctcagtgtgc tgcgttgtgg ctacaatgtg ctagtggcgg tacaattggt 120
tgtggtggcg gagctgttgc ttgtcaaaac tatcgtcaat tctgcagata a 171
<210> 306
<211> 56
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 306
Met Ser Lys Phe Asp Asp Phe Asp Leu Asp Val Val Lys Val Ser Lys
1 5 10 15
Gln Asp Ser Lys Ile Thr Pro Gln Trp Lys Ser Glu Ser Leu Cys Thr
20 25 30
Pro Gly Cys Val Thr Gly Ala Leu Gln Thr Cys Phe Leu Gln Thr Leu
35 40 45
Thr Cys Asn Cys Lys Ile Ser Lys
50 55
<210> 307
<211> 171
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 307
atgtcaaagt tcgatgattt cgatttggat gttgtgaaag tctctaaaca agactcaaaa 60
atcactccgc aatggaaaag tgaatcactt tgtacaccag gatgtgtaac tggtgcattg 120
caaacttgct tccttcaaac actaacttgt aactgcaaaa tctctaaata a 171
<210> 308
<211> 50
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 308
Met Lys Leu Pro Val Gln Gln Val Tyr Ser Val Tyr Gly Gly Lys Asp
1 5 10 15
Leu Pro Lys Gly His Ser His Ser Thr Met Pro Phe Leu Ser Lys Leu
20 25 30
Gln Phe Leu Thr Lys Ile Tyr Leu Leu Asp Ile His Thr Gln Pro Phe
35 40 45
Phe Ile
50
<210> 309
<211> 153
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 309
ttgaaattgc cggtgcaaca ggtctattcg gtctatgggg gtaaggatct cccaaaaggg 60
catagtcatt ctactatgcc ctttttaagt aaattacaat ttttaactaa aatctacctc 120
ttggatatac atacacaacc gtttttcatt tga 153
<210> 310
<211> 43
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 310
Met Lys Lys Ala Val Ile Val Glu Asn Lys Gly Cys Ala Thr Cys Ser
1 5 10 15
Ile Gly Ala Ala Cys Leu Val Asp Gly Pro Ile Pro Asp Phe Glu Ile
20 25 30
Ala Gly Ala Thr Gly Leu Phe Gly Leu Trp Gly
35 40
<210> 311
<211> 132
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 311
atgaaaaaag ctgtcattgt agaaaacaaa ggttgtgcaa catgctcgat cggagccgct 60
tgtctagtgg acggtcctat ccctgatttt gaaattgccg gtgcaacagg tctattcggt 120
ctatgggggt aa 132
<210> 312
<211> 58
<212> PRT
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 312
Met Met Asn Ala Thr Glu Asn Gln Ile Phe Val Glu Thr Val Ser Asp
1 5 10 15
Gln Glu Leu Glu Met Leu Ile Gly Gly Ala Asp Arg Gly Trp Ile Lys
20 25 30
Thr Leu Thr Lys Asp Cys Pro Asn Val Ile Ser Ser Ile Cys Ala Gly
35 40 45
Thr Ile Ile Thr Ala Cys Lys Asn Cys Ala
50 55
<210> 313
<211> 177
<212> DNA
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 313
atgatgaatg ctactgaaaa ccaaattttt gttgagactg tgagtgacca agaattagaa 60
atgttaattg gtggtgcaga tcgtggatgg attaagactt taacaaaaga ttgtccaaat 120
gtaatttctt caatttgtgc aggtacaatt attacagcct gtaaaaattg tgcttaa 177
<210> 314
<211> 64
<212> PRT
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 314
Met Lys Gln Tyr Asn Gly Phe Glu Val Leu His Glu Leu Asp Leu Ala
1 5 10 15
Asn Val Thr Gly Gly Gln Ile Asn Trp Gly Ser Val Val Gly His Cys
20 25 30
Ile Gly Gly Ala Ile Ile Gly Gly Ala Phe Ser Gly Gly Ala Ala Ala
35 40 45
Gly Val Gly Cys Leu Val Gly Ser Gly Lys Ala Ile Ile Asn Gly Leu
50 55 60
<210> 315
<211> 195
<212> DNA
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 315
atgaagcagt ataatggttt tgaggttcta catgaacttg acttagcaaa tgtaactggc 60
ggtcaaatta attggggatc agttgtagga cactgtatag gtggagctat tatcggaggt 120
gcattttcag gaggtgcagc ggctggagta ggatgccttg ttgggagcgg aaaggcaatc 180
ataaatggat tataa 195
<210> 316
<211> 85
<212> PRT
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 316
Met Asn Thr Ile Thr Ile Cys Lys Phe Asp Val Leu Asp Ala Glu Leu
1 5 10 15
Leu Ser Thr Val Glu Gly Gly Tyr Ser Gly Lys Asp Cys Leu Lys Asp
20 25 30
Met Gly Gly Tyr Ala Leu Ala Gly Ala Gly Ser Gly Ala Leu Trp Gly
35 40 45
Ala Pro Ala Gly Gly Val Gly Ala Leu Pro Gly Ala Phe Val Gly Ala
50 55 60
His Val Gly Ala Ile Ala Gly Gly Phe Ala Cys Met Gly Gly Met Ile
65 70 75 80
Gly Asn Lys Phe Asn
85
<210> 317
<211> 258
<212> DNA
<213> 嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)
<400> 317
atgaatacaa taactatttg taaatttgat gttttagatg ctgaacttct ttcgacagtt 60
gagggtggat actctggtaa ggattgttta aaagacatgg gaggatatgc attggcagga 120
gctggaagtg gagctctgtg gggagctcca gcaggaggtg ttggagcact tccaggtgca 180
tttgtcggag ctcatgttgg ggcaattgca ggaggctttg catgtatggg tggaatgatt 240
ggtaataagt ttaactaa 258
<210> 318
<211> 52
<212> PRT
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 318
Met Ser Glu Ile Lys Lys Ala Leu Asn Thr Leu Glu Ile Glu Asp Phe
1 5 10 15
Asp Ala Ile Glu Met Val Asp Val Asp Ala Met Pro Glu Asn Glu Ala
20 25 30
Leu Glu Ile Met Gly Ala Ser Cys Thr Thr Cys Val Cys Thr Cys Ser
35 40 45
Cys Cys Thr Thr
50
<210> 319
<211> 159
<212> DNA
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 319
atgagtgaaa ttaaaaaagc attaaatacg cttgaaattg aagattttga tgcaattgaa 60
atggttgatg ttgatgctat gccagaaaac gaagcgcttg aaattatggg agcgtcatgt 120
acgacatgcg tatgtacatg cagttgttgt acaacttga 159
<210> 320
<211> 47
<212> PRT
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 320
Met Glu Val Met Asn Asn Ala Leu Ile Thr Lys Val Asp Glu Glu Ile
1 5 10 15
Gly Gly Asn Ala Ala Cys Val Ile Gly Cys Ile Gly Ser Cys Val Ile
20 25 30
Ser Glu Gly Ile Gly Ser Leu Val Gly Thr Ala Phe Thr Leu Gly
35 40 45
<210> 321
<211> 144
<212> DNA
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 321
atggaagtta tgaacaatgc tttaattaca aaagtagatg aggagattgg aggaaacgct 60
gcttgtgtaa ttggttgtat tggcagttgc gtaattagtg aaggaattgg ttcacttgta 120
ggaacagcat ttactttagg ttaa 144
<210> 322
<211> 49
<212> PRT
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 322
Met Glu Val Leu Asn Lys Gln Asn Val Asn Ile Ile Pro Glu Ser Glu
1 5 10 15
Glu Val Gly Gly Trp Val Ala Cys Val Gly Ala Cys Gly Thr Val Cys
20 25 30
Leu Ala Ser Gly Gly Val Gly Thr Glu Phe Ala Ala Ala Ser Tyr Phe
35 40 45
Leu
<210> 323
<211> 150
<212> DNA
<213> 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 323
atggaagttt taaacaaaca aaatgtaaat attattccag aatctgaaga agtaggtgga 60
tgggtagcat gtgttggagc atgtggtaca gtatgtcttg ctagtggtgg tgttggaaca 120
gagtttgcag ctgcatctta tttcctataa 150
<210> 324
<211> 40
<212> PRT
<213> 苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)
<400> 324
Met Glu Thr Pro Val Val Gln Pro Arg Asp Trp Thr Cys Trp Ser Cys
1 5 10 15
Leu Val Cys Ala Ala Cys Ser Val Glu Leu Leu Asn Leu Val Thr Ala
20 25 30
Ala Thr Gly Ala Ser Thr Ala Ser
35 40
<210> 325
<211> 123
<212> DNA
<213> 苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)
<400> 325
atggaaacac cagtagtaca accaagggat tggacttgtt ggagttgctt agtatgtgca 60
gcatgttctg tggaattatt aaatttagtt actgcggcaa caggggctag tactgcaagc 120
taa 123
<210> 326
<211> 42
<212> PRT
<213> 豌豆根瘤菌三叶草生物型(Rhizobium leguminosarum bv. trifolii)
<400> 326
Met Asp Asn Lys Val Ala Lys Asn Val Glu Val Lys Lys Gly Ser Ile
1 5 10 15
Lys Ala Thr Phe Lys Ala Ala Val Leu Lys Ser Lys Thr Lys Val Asp
20 25 30
Ile Gly Gly Ser Arg Gln Gly Cys Val Ala
35 40
<210> 327
<211> 129
<212> DNA
<213> 豌豆根瘤菌三叶草生物型(Rhizobium leguminosarum bv. trifolii)
<400> 327
atggataaca aggttgcgaa gaatgtcgaa gtgaagaagg gctccatcaa ggcgaccttc 60
aaggctgctg ttctgaagtc gaagacgaag gtcgacatcg gaggtagccg tcagggctgc 120
gtcgcttaa 129
<210> 328
<211> 70
<212> PRT
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 328
Met Asn Thr Ile Glu Lys Phe Glu Asn Ile Lys Leu Phe Ser Leu Lys
1 5 10 15
Lys Ile Ile Gly Gly Lys Thr Val Asn Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys
20 25 30
Asn Gln Lys Lys Cys Trp Val Asn Trp Ser Glu Thr Ala Thr Thr Ile
35 40 45
Val Asn Asn Ser Ile Met Asn Gly Leu Thr Gly Gly Asn Ala Gly Trp
50 55 60
His Ser Gly Gly Arg Ala
65 70
<210> 329
<211> 213
<212> DNA
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 329
atgaatacaa ttgaaaaatt tgaaaatatt aaactttttt cactaaagaa aattatcggt 60
ggcaaaactg taaattatgg taatggcctt tattgtaacc aaaaaaaatg ctgggtaaac 120
tggtcagaaa ctgctacaac aatagtaaat aattccatca tgaacgggct cacaggtggt 180
aatgcgggtt ggcactcagg cgggagagca taa 213
<210> 330
<211> 76
<212> PRT
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 330
Met Asp Ile Leu Leu Glu Leu Ala Gly Tyr Thr Gly Ile Ala Ser Gly
1 5 10 15
Thr Ala Lys Lys Val Val Asp Ala Ile Asp Lys Gly Ala Ala Ala Phe
20 25 30
Val Ile Ile Ser Ile Ile Ser Thr Val Ile Ser Ala Gly Ala Leu Gly
35 40 45
Ala Val Ser Ala Ser Ala Asp Phe Ile Ile Leu Thr Val Lys Asn Tyr
50 55 60
Ile Ser Arg Asn Leu Lys Ala Gln Ala Val Ile Trp
65 70 75
<210> 331
<211> 231
<212> DNA
<213> 乳房链球菌(Streptococcus uberis)
<400> 331
atggacattt tattagaact cgcaggatat actgggatag cctcaggtac tgcaaaaaaa 60
gttgttgatg ccattgataa aggagctgca gcctttgtta ttatttcaat tatctcaaca 120
gtaattagtg cgggagcatt gggagcagtt tcagcctcag ctgattttat tattttaact 180
gtaaaaaatt acattagtag aaatttaaaa gcacaagctg tcatttggta a 231
<210> 332
<211> 64
<212> PRT
<213> 产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)
<400> 332
Met Asp Ser Glu Leu Phe Lys Leu Met Ala Thr Gln Gly Ala Phe Ala
1 5 10 15
Ile Leu Phe Ser Tyr Leu Leu Phe Tyr Val Leu Lys Glu Asn Ser Lys
20 25 30
Arg Glu Asp Lys Tyr Gln Asn Ile Ile Glu Glu Leu Thr Glu Leu Leu
35 40 45
Pro Lys Ile Lys Glu Asp Val Glu Asp Ile Lys Glu Lys Leu Asn Lys
50 55 60
<210> 333
<211> 195
<212> DNA
<213> 产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)
<400> 333
atggatagtg aattatttaa gttaatggca acacaaggag cctttgcaat attattttcg 60
tatttattgt tttatgtttt aaaagagaat agtaaaagag aagataagta tcaaaatata 120
atagaggagc ttacagaatt attgccaaaa ataaaagaag atgtagaaga tataaaagaa 180
aaacttaata aatag 195
<210> 334
<211> 47
<212> PRT
<213> 变异微球菌(Micrococcus varians)
<400> 334
Met Thr Asn Ala Phe Gln Ala Leu Asp Glu Val Thr Asp Ala Glu Leu
1 5 10 15
Asp Ala Ile Leu Gly Gly Gly Ser Gly Val Ile Pro Thr Ile Ser His
20 25 30
Glu Cys His Met Asn Ser Phe Gln Phe Val Phe Thr Cys Cys Ser
35 40 45
<210> 335
<211> 144
<212> DNA
<213> 变异微球菌(Micrococcus varians)
<400> 335
atgacgaacg catttcaggc actggacgaa gtcacggacg ccgagctcga cgccatcctt 60
ggcgggggca gtggtgttat tcccacgatc agccacgagt gccacatgaa ctccttccag 120
ttcgtgttca cctgctgctc ctga 144
<210> 336
<211> 285
<212> PRT
<213> 马链球菌兽疫亚种(Streptococcus equi subsp. zooepidemicus)
<400> 336
Met Lys Arg Ile Phe Phe Ala Phe Leu Ser Leu Cys Leu Phe Ile Phe
1 5 10 15
Gly Thr Gln Thr Val Ser Ala Ala Thr Tyr Thr Arg Pro Leu Asp Thr
20 25 30
Gly Asn Ile Thr Thr Gly Phe Asn Gly Tyr Pro Gly His Val Gly Val
35 40 45
Asp Tyr Ala Val Pro Val Gly Thr Pro Val Arg Ala Val Ala Asn Gly
50 55 60
Thr Val Lys Phe Ala Gly Asn Gly Ala Asn His Pro Trp Met Leu Trp
65 70 75 80
Met Ala Gly Asn Cys Val Leu Ile Gln His Ala Asp Gly Met His Thr
85 90 95
Gly Tyr Ala His Leu Ser Lys Ile Ser Val Ser Thr Asp Ser Thr Val
100 105 110
Lys Gln Gly Gln Ile Ile Gly Tyr Thr Gly Ala Thr Gly Gln Val Thr
115 120 125
Gly Pro His Leu His Phe Glu Met Leu Pro Ala Asn Pro Asn Trp Gln
130 135 140
Asn Gly Phe Ser Gly Arg Ile Asp Pro Thr Gly Tyr Ile Ala Asn Ala
145 150 155 160
Pro Val Phe Asn Gly Thr Thr Pro Thr Glu Pro Thr Thr Pro Thr Thr
165 170 175
Asn Leu Lys Ile Tyr Lys Val Asp Asp Leu Gln Lys Ile Asn Gly Ile
180 185 190
Trp Gln Val Arg Asn Asn Ile Leu Val Pro Thr Asp Phe Thr Trp Val
195 200 205
Asp Asn Gly Ile Ala Ala Asp Asp Val Ile Glu Val Thr Ser Asn Gly
210 215 220
Thr Arg Thr Ser Asp Gln Val Leu Gln Lys Gly Gly Tyr Phe Val Ile
225 230 235 240
Asn Pro Asn Asn Val Lys Ser Val Gly Thr Pro Met Lys Gly Ser Gly
245 250 255
Gly Leu Ser Trp Ala Gln Val Asn Phe Thr Thr Gly Gly Asn Val Trp
260 265 270
Leu Asn Thr Thr Ser Lys Asp Asn Leu Leu Tyr Gly Lys
275 280 285
<210> 337
<211> 858
<212> DNA
<213> 马链球菌兽疫亚种(Streptococcus equi subsp. zooepidemicus)
<400> 337
atgaaacgta tattttttgc tttcttaagt ttatgcttat ttatattcgg aacacaaacg 60
gtatctgcag ctacttatac tcggccatta gatacgggaa atatcactac agggtttaac 120
ggataccctg gtcatgttgg agtcgattat gcagtacccg ttggaactcc ggttagagca 180
gttgcaaatg gtacagtcaa atttgcaggt aatggggcta atcacccatg gatgctttgg 240
atggctggaa actgtgttct aattcaacat gctgacggga tgcatactgg atatgcacac 300
ttatcaaaaa tttcagttag cacagatagt acagttaaac aaggacaaat cataggttat 360
actggtgcca ccggccaagt taccggtcca catttgcatt ttgaaatgtt gccagcaaat 420
cctaactggc aaaatggttt ttctggaaga atagatccaa ccggatacat cgctaatgcc 480
cctgtattta atggaacaac acctacagaa cctactactc ctacaacaaa tttaaaaatc 540
tataaagttg atgatttaca aaaaattaat ggtatttggc aagtaagaaa taacatactt 600
gtaccaactg atttcacatg ggttgataat ggaattgcag cagatgatgt aattgaagta 660
actagcaatg gaacaagaac ctctgaccaa gttcttcaaa aaggtggtta ttttgtcatc 720
aatcctaata atgttaaaag tgttggaact ccgatgaaag gtagtggtgg tctatcttgg 780
gctcaagtaa actttacaac aggtggaaat gtctggttaa atactactag caaagacaac 840
ttactttacg gaaaataa 858
<210> 338
<211> 45
<212> PRT
<213> 橙色粘球菌(Myxococcus fulvus)
<400> 338
Ala Asn Cys Ser Cys Ser Thr Ala Ser Asp Tyr Cys Pro Ile Leu Thr
1 5 10 15
Phe Cys Thr Thr Gly Thr Ala Cys Ser Tyr Thr Pro Thr Gly Cys Gly
20 25 30
Thr Gly Trp Val Tyr Cys Ala Cys Asn Gly Asn Phe Tyr
35 40 45
<210> 339
<211> 135
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 338多肽的多核苷酸
<400> 339
gcgaactgca gctgcagcac cgcgagcgat tattgcccga ttctgacctt ttgcaccacc 60
ggcaccgcgt gcagctatac cccgaccggc tgcggcaccg gctgggtgta ttgcgcgtgc 120
aacggcaact tttat 135
<210> 340
<211> 19
<212> PRT
<213> 灰藤黄链霉菌(Streptomyces griseoluteus)
<400> 340
Cys Ala Asn Ser Cys Ser Tyr Gly Pro Leu Thr Trp Ser Cys Asp Gly
1 5 10 15
Asn Thr Lys
<210> 341
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 340多肽的多核苷酸
<400> 341
tgcgcgaaca gctgcagcta tggcccgctg acctggagct gcgatggcaa caccaaa 57
<210> 342
<211> 19
<212> PRT
<213> 灰轮丝链轮丝菌(Streptoverticillium griseoverticillatum)
<400> 342
Cys Lys Gln Ser Cys Ser Phe Gly Pro Phe Thr Phe Val Cys Asp Gly
1 5 10 15
Asn Thr Lys
<210> 343
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 342多肽的多核苷酸
<400> 343
tgcaaacaga gctgcagctt tggcccgttt acctttgtgt gcgatggcaa caccaaa 57
<210> 344
<211> 7
<212> PRT
<213> 肉食杆菌属物种(Carnobacterium sp.)
<400> 344
Gly Ser Glu Ile Gln Pro Arg
1 5
<210> 345
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 344多肽的多核苷酸
<400> 345
ggcagcgaaa ttcagccgcg c 21
<210> 346
<211> 39
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 346
Gly Thr Trp Asp Asp Ile Gly Gln Gly Ile Gly Arg Val Ala Tyr Trp
1 5 10 15
Val Gly Lys Ala Met Gly Asn Met Ser Asp Val Asn Gln Ala Ser Arg
20 25 30
Ile Asn Arg Lys Lys Lys His
35
<210> 347
<211> 117
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 346多肽的多核苷酸
<400> 347
ggcacctggg atgatattgg ccagggcatt ggccgcgtgg cgtattgggt gggcaaagcg 60
atgggcaaca tgagcgatgt gaaccaggcg agccgcatta accgcaaaaa aaaacat 117
<210> 348
<211> 35
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 348
Lys Lys Trp Gly Trp Leu Ala Trp Val Asp Pro Ala Tyr Glu Phe Ile
1 5 10 15
Lys Gly Phe Gly Lys Gly Ala Ile Lys Glu Gly Asn Lys Asp Lys Trp
20 25 30
Lys Asn Ile
35
<210> 349
<211> 105
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 348多肽的多核苷酸
<400> 349
aaaaaatggg gctggctggc gtgggtggat ccggcgtatg aatttattaa aggctttggc 60
aaaggcgcga ttaaagaagg caacaaagat aaatggaaaa acatt 105
<210> 350
<211> 19
<212> PRT
<213> 链霉菌属物种(Streptomyces sp.)
<400> 350
Cys Val Gln Ser Cys Ser Phe Gly Pro Leu Thr Trp Ser Cys Asp Gly
1 5 10 15
Asn Thr Lys
<210> 351
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 350多肽的多核苷酸
<400> 351
tgcgtgcaga gctgcagctt tggcccgctg acctggagct gcgatggcaa caccaaa 57
<210> 352
<211> 19
<212> PRT
<213> 利古里亚游动放线菌(Actinoplanes liguriae)
<400> 352
Ser Ser Gly Trp Val Cys Thr Leu Thr Ile Glu Cys Gly Thr Val Ile
1 5 10 15
Cys Ala Cys
<210> 353
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 352多肽的多核苷酸
<400> 353
agcagcggct gggtgtgcac cctgaccatt gaatgcggca ccgtgatttg cgcgtgc 57
<210> 354
<211> 38
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<220>
<221> VARIANT
<222> 37
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 354
Tyr Thr Ala Lys Gln Cys Leu Gln Ala Ile Gly Ser Cys Gly Ile Ala
1 5 10 15
Gly Thr Gly Ala Gly Ala Ala Gly Gly Pro Ala Gly Ala Phe Val Gly
20 25 30
Ala Xaa Val Val Xaa Ile
35
<210> 355
<211> 114
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 354多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (100)...(102)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (109)...(111)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 355
tataccgcga aacagtgcct gcaggcgatt ggcagctgcg gcattgcggg caccggcgcg 60
ggcgcggcgg gcggcccggc gggcgcgttt gtgggcgcgn nngtggtgnn natt 114
<210> 356
<211> 42
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<220>
<221> VARIANT
<222> 32
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 356
Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp
1 5 10 15
Val Asp Trp Gly Gln Ala Ala Gly Gly Ile Gly Gln Thr Val Val Xaa
20 25 30
Gly Trp Leu Gly Gly Ala Ile Pro Gly Lys
35 40
<210> 357
<211> 126
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 356多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (94)...(96)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 357
accaaatatt atggcaacgg cgtgtattgc aacagcaaaa aatgctgggt ggattggggc 60
caggcggcgg gcggcattgg ccagaccgtg gtgnnnggct ggctgggcgg cgcgattccg 120
ggcaaa 126
<210> 358
<211> 22
<212> PRT
<213> 变形链球菌(Streptococcus mutans)
<400> 358
Phe Lys Ser Trp Ser Phe Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser
1 5 10 15
Phe Asn Ser Tyr Cys Cys
20
<210> 359
<211> 132
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 358多肽的多核苷酸
<400> 359
tttaaaagct ggagcttttg caccccgggc tgcgcgaaaa ccggcagctt taacagctat 60
tgctgcttta aaagctggag cttttgcacc ccgggctgcg cgaaaaccgg cagctttaac 120
agctattgct gc 132
<210> 360
<211> 43
<212> PRT
<213> 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)
<400> 360
Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val
1 5 10 15
Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ser Ala Ala Asn
20 25 30
Leu Ala Thr Gly Gly Ala Ala Gly Trp Ser Lys
35 40
<210> 361
<211> 129
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 360多肽的多核苷酸
<400> 361
aaatattatg gcaacggcgt gagctgcaac aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggcaaa 60
gcgattggca ttattggcaa caacagcgcg gcgaacctgg cgaccggcgg cgcggcgggc 120
tggagcaaa 129
<210> 362
<211> 41
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<220>
<221> VARIANT
<222> 9, 14, 33, 37
<223> Xaa =任何氨基酸
<400> 362
Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val His Xaa Gly Lys His Ser Xaa Thr Val
1 5 10 15
Asp Trp Gly Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala Ala Asn
20 25 30
Xaa Ala Thr Gly Xaa Asn Ala Gly Gly
35 40
<210> 363
<211> 123
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 362多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (25)...(27)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (40)...(42)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (97)...(99)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (109)...(111)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 363
aaatattatg gcaacggcgt gcatnnnggc aaacatagcn nnaccgtgga ttggggcacc 60
gcgattggca acattggcaa caacgcggcg gcgaacnnng cgaccggcnn naacgcgggc 120
ggc 123
<210> 364
<211> 31
<212> PRT
<213> 副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei)
<400> 364
Gly Met Ser Gly Tyr Ile Gln Gly Ile Pro Asp Phe Leu Lys Gly Tyr
1 5 10 15
Leu His Gly Ile Ser Ala Ala Asn Lys His Lys Lys Gly Arg Leu
20 25 30
<210> 365
<211> 93
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 364多肽的多核苷酸
<400> 365
ggcatgagcg gctatattca gggcattccg gattttctga aaggctatct gcatggcatt 60
agcgcggcga acaaacataa aaaaggccgc ctg 93
<210> 366
<211> 31
<212> PRT
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 366
Lys Gly Lys Gly Phe Trp Ser Trp Ala Ser Lys Ala Thr Ser Trp Leu
1 5 10 15
Thr Gly Pro Gln Gln Pro Gly Ser Pro Leu Leu Lys Lys His Arg
20 25 30
<210> 367
<211> 93
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 366多肽的多核苷酸
<400> 367
aaaggcaaag gcttttggag ctgggcgagc aaagcgacca gctggctgac cggcccgcag 60
cagccgggca gcccgctgct gaaaaaacat cgc 93
<210> 368
<211> 43
<212> PRT
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 368
Lys Asn Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Thr Lys Lys Gly Cys Ser Val
1 5 10 15
Asp Trp Gly Tyr Ala Trp Thr Asn Ile Ala Asn Asn Ser Val Met Asn
20 25 30
Gly Leu Thr Gly Gly Asn Ala Gly Trp His Asn
35 40
<210> 369
<211> 129
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 368多肽的多核苷酸
<400> 369
aaaaactatg gcaacggcgt gcattgcacc aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggctat 60
gcgtggacca acattgcgaa caacagcgtg atgaacggcc tgaccggcgg caacgcgggc 120
tggcataac 129
<210> 370
<211> 47
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 370
Ala Ile Lys Leu Val Gln Ser Pro Asn Gly Asn Phe Ala Ala Ser Phe
1 5 10 15
Val Leu Asp Gly Thr Lys Trp Ile Phe Lys Ser Lys Tyr Tyr Asp Ser
20 25 30
Ser Lys Gly Tyr Trp Val Gly Ile Tyr Glu Val Trp Asp Arg Lys
35 40 45
<210> 371
<211> 141
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 370多肽的多核苷酸
<400> 371
gcgattaaac tggtgcagag cccgaacggc aactttgcgg cgagctttgt gctggatggc 60
accaaatgga tttttaaaag caaatattat gatagcagca aaggctattg ggtgggcatt 120
tatgaagtgt gggatcgcaa a 141
<210> 372
<211> 12
<212> PRT
<213> 地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)
<220>
<221> VARIANT
<222> 7
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 372
Ile Ser Leu Glu Ile Cys Xaa Ile Phe His Asp Asn
1 5 10
<210> 373
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 372多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (19)...(21)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 373
attagcctgg aaatttgcnn natttttcat gataac 36
<210> 374
<211> 37
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 374
Thr Ser Tyr Gly Asn Gly Val His Cys Asn Lys Ser Lys Cys Trp Ile
1 5 10 15
Asp Val Ser Glu Leu Glu Thr Tyr Lys Ala Gly Thr Val Ser Asn Pro
20 25 30
Lys Asp Ile Leu Trp
35
<210> 375
<211> 111
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 374多肽的多核苷酸
<400> 375
accagctatg gcaacggcgt gcattgcaac aaaagcaaat gctggattga tgtgagcgaa 60
ctggaaacct ataaagcggg caccgtgagc aacccgaaag atattctgtg g 111
<210> 376
<211> 9
<212> PRT
<213> 普城沙雷菌(Serratia plymuthica)
<400> 376
Asp Tyr His His Gly Val Arg Val Leu
1 5
<210> 377
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 376多肽的多核苷酸
<400> 377
gattatcatc atggcgtgcg cgtgctg 27
<210> 378
<211> 15
<212> PRT
<213> 盐杆菌属物种(Halobacterium sp.)
<400> 378
Asp Ile Asp Ile Thr Gly Cys Ser Ala Cys Lys Tyr Ala Ala Gly
1 5 10 15
<210> 379
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 378多肽的多核苷酸
<400> 379
gatattgata ttaccggctg cagcgcgtgc aaatatgcgg cgggc 45
<210> 380
<211> 12
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<220>
<221> VARIANT
<222> 1, 2, 6
<223> Xaa =任何氨基酸
<400> 380
Xaa Xaa Lys Glu Ile Xaa His Ile Phe His Asp Asn
1 5 10
<210> 381
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 380多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)...(3)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)...(6)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (16)...(18)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 381
nnnnnnaaag aaattnnnca tatttttcat gataac 36
<210> 382
<211> 12
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<400> 382
Thr Pro Val Val Asn Pro Pro Phe Leu Gln Gln Thr
1 5 10
<210> 383
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 382多肽的多核苷酸
<400> 383
accccggtgg tgaacccgcc gtttctgcag cagacc 36
<210> 384
<211> 10
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<220>
<221> VARIANT
<222> 10
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 384
Val Ala Pro Phe Pro Glu Gln Phe Leu Xaa
1 5 10
<210> 385
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 384多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (28)...(30)
<223> nnn =任何氨基酸编码三联体
<400> 385
gtggcgccgt ttccggaaca gtttctgnnn 30
<210> 386
<211> 9
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<400> 386
Asn Ile Pro Gln Leu Thr Pro Thr Pro
1 5
<210> 387
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 386多肽的多核苷酸
<400> 387
aacattccgc agctgacccc gaccccg 27
<210> 388
<211> 18
<212> PRT
<213> 苏云金芽胞杆菌杀虫亚种(Bacillus thuringiensis subsp. entomocidus)
<220>
<221> VARIANT
<222> 4, 7, 10
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 388
Asp Trp Thr Xaa Trp Ser Xaa Leu Val Xaa Ala Ala Cys Ser Val Glu
1 5 10 15
Leu Leu
<210> 389
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 388多肽的多核苷酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)...(12)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (19)...(21)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<220>
<221> misc_feature
<222> (28)...(30)
<223> nnn = 任何氨基酸编码三联体
<400> 389
gattggaccn nntggagcnn nctggtgnnn gcggcgtgca gcgtggaact gctg 54
<210> 390
<211> 30
<212> PRT
<213> 弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)
<400> 390
Ala Tyr Pro Gly Asn Gly Val His Cys Gly Lys Tyr Ser Cys Thr Val
1 5 10 15
Asp Lys Gln Thr Ala Ile Gly Asn Ile Gly Asn Asn Ala Ala
20 25 30
<210> 391
<211> 90
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 390多肽的多核苷酸
<400> 391
gcgtatccgg gcaacggcgt gcattgcggc aaatatagct gcaccgtgga taaacagacc 60
gcgattggca acattggcaa caacgcggcg 90
<210> 392
<211> 43
<212> PRT
<213> 广布肉毒杆菌(Carnobacterium divergens)
<400> 392
Thr Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Ser Lys Lys Cys Trp
1 5 10 15
Val Asp Trp Gly Thr Ala Gln Gly Cys Ile Asp Val Val Ile Gly Gln
20 25 30
Leu Gly Gly Gly Ile Pro Gly Lys Gly Lys Cys
35 40
<210> 393
<211> 129
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 392多肽的多核苷酸
<400> 393
accaaatatt atggcaacgg cgtgtattgc aacagcaaaa aatgctgggt ggattggggc 60
accgcgcagg gctgcattga tgtggtgatt ggccagctgg gcggcggcat tccgggcaaa 120
ggcaaatgc 129
<210> 394
<211> 62
<212> PRT
<213> 肠球菌属物种(Enterococcus sp.)
<400> 394
Asn Arg Trp Tyr Cys Asn Ser Ala Ala Gly Gly Val Gly Gly Ala Ala
1 5 10 15
Val Cys Gly Leu Ala Gly Tyr Val Gly Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala
20 25 30
Gly Glu Val Arg Lys Gly Trp Gly Met Ala Gly Gly Phe Thr His Asn
35 40 45
Lys Ala Cys Lys Ser Phe Pro Gly Ser Gly Trp Ala Ser Gly
50 55 60
<210> 395
<211> 186
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 394多肽的多核苷酸
<400> 395
aaccgctggt attgcaacag cgcggcgggc ggcgtgggcg gcgcggcggt gtgcggcctg 60
gcgggctatg tgggcgaagc gaaagaaaac attgcgggcg aagtgcgcaa aggctggggc 120
atggcgggcg gctttaccca taacaaagcg tgcaaaagct ttccgggcag cggctgggcg 180
agcggc 186
<210> 396
<211> 39
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 396
Thr Thr Lys Asn Tyr Gly Asn Gly Val Cys Asn Ser Val Asn Trp Cys
1 5 10 15
Gln Cys Gly Asn Val Trp Ala Ser Cys Asn Leu Ala Thr Gly Cys Ala
20 25 30
Ala Trp Leu Cys Lys Leu Ala
35
<210> 397
<211> 117
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 396多肽的多核苷酸
<400> 397
accaccaaaa actatggcaa cggcgtgtgc aacagcgtga actggtgcca gtgcggcaac 60
gtgtgggcga gctgcaacct ggcgaccggc tgcgcggcgt ggctgtgcaa actggcg 117
<210> 398
<211> 30
<212> PRT
<213> 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
<400> 398
Ala Ser Ile Ile Lys Thr Thr Ile Lys Val Ser Lys Ala Val Cys Lys
1 5 10 15
Thr Leu Thr Cys Ile Cys Thr Gly Ser Cys Ser Asn Cys Lys
20 25 30
<210> 399
<211> 90
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 398多肽的多核苷酸
<400> 399
gcgagcatta ttaaaaccac cattaaagtg agcaaagcgg tgtgcaaaac cctgacctgc 60
atttgcaccg gcagctgcag caactgcaaa 90
<210> 400
<211> 31
<212> PRT
<213> 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)
<400> 400
Ser Ala Ser Ile Val Lys Thr Thr Ile Lys Ala Ser Lys Lys Leu Cys
1 5 10 15
Arg Gly Phe Thr Leu Thr Cys Gly Cys His Phe Thr Gly Lys Lys
20 25 30
<210> 401
<211> 93
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 400多肽的多核苷酸
<400> 401
agcgcgagca ttgtgaaaac caccattaaa gcgagcaaaa aactgtgccg cggctttacc 60
ctgacctgcg gctgccattt taccggcaaa aaa 93
<210> 402
<211> 43
<212> PRT
<213> 屎肠球菌(Enterococcus faecium)
<400> 402
Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Asn Lys Lys Gly Cys Ser Val
1 5 10 15
Asp Trp Gly Lys Ala Ile Gly Ile Ile Gly Asn Asn Ala Ala Ala Asn
20 25 30
Leu Thr Thr Gly Gly Lys Ala Ala Trp Ala Cys
35 40
<210> 403
<211> 129
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 402多肽的多核苷酸
<400> 403
aaatattatg gcaacggcgt gagctgcaac aaaaaaggct gcagcgtgga ttggggcaaa 60
gcgattggca ttattggcaa caacgcggcg gcgaacctga ccaccggcgg caaagcggcg 120
tgggcgtgc 129
<210> 404
<211> 39
<212> PRT
<213> 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
<400> 404
Ala Thr Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Tyr Cys Asn Lys Gln Lys His Tyr
1 5 10 15
Thr Trp Val Asp Trp Asn Lys Ala Ser Arg Glu Ile Gly Lys Ile Thr
20 25 30
Val Asn Gly Trp Val Gln His
35
<210> 405
<211> 117
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 404多肽的多核苷酸
<400> 405
gcgacctatt atggcaacgg cctgtattgc aacaaacaga aacattatac ctgggtggat 60
tggaacaaag cgagccgcga aattggcaaa attaccgtga acggctgggt gcagcat 117
<210> 406
<211> 35
<212> PRT
<213> 环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)
<400> 406
Val Asn Tyr Gly Asn Gly Val Ser Cys Ser Lys Thr Lys Cys Ser Val
1 5 10 15
Asn Trp Gly Ile Ile Thr His Gln Ala Phe Arg Val Thr Ser Gly Val
20 25 30
Ala Ser Gly
35
<210> 407
<211> 105
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 406多肽的多核苷酸
<400> 407
gtgaactatg gcaacggcgt gagctgcagc aaaaccaaat gcagcgtgaa ctggggcatt 60
attacccatc aggcgtttcg cgtgaccagc ggcgtggcga gcggc 105
<210> 408
<211> 30
<212> PRT
<213> 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
<400> 408
Phe Val Tyr Gly Asn Gly Val Thr Ser Ile Leu Val Gln Ala Gln Phe
1 5 10 15
Leu Val Asn Gly Gln Arg Arg Phe Phe Tyr Thr Pro Asp Lys
20 25 30
<210> 409
<211> 90
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 408多肽的多核苷酸
<400> 409
tttgtgtatg gcaacggcgt gaccagcatt ctggtgcagg cgcagtttct ggtgaacggc 60
cagcgccgct ttttttatac cccggataaa 90
<210> 410
<211> 13
<212> PRT
<213> 鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)
<400> 410
Ala Val Pro Ala Val Arg Lys Thr Asn Glu Thr Leu Asp
1 5 10
<210> 411
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 410多肽的多核苷酸
<400> 411
gcggtgccgg cggtgcgcaa aaccaacgaa accctggat 39
<210> 412
<211> 69
<212> PRT
<213> 地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)
<400> 412
Met Lys Asn Ser Ala Ala Arg Glu Ala Phe Lys Gly Ala Asn His Pro
1 5 10 15
Ala Gly Met Val Ser Glu Glu Glu Leu Lys Ala Leu Val Gly Gly Asn
20 25 30
Asp Val Asn Pro Glu Thr Thr Pro Ala Thr Thr Ser Ser Trp Thr Cys
35 40 45
Ile Thr Ala Gly Val Thr Val Ser Ala Ser Leu Cys Pro Thr Thr Lys
50 55 60
Cys Thr Ser Arg Cys
65
<210> 413
<211> 207
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 412多肽的多核苷酸
<400> 413
atgaaaaaca gcgcggcgcg cgaagcgttt aaaggcgcga accatccggc gggcatggtg 60
agcgaagaag aactgaaagc gctggtgggc ggcaacgatg tgaacccgga aaccaccccg 120
gcgaccacca gcagctggac ctgcattacc gcgggcgtga ccgtgagcgc gagcctgtgc 180
ccgaccacca aatgcaccag ccgctgc 207
<210> 414
<211> 36
<212> PRT
<213> 胚芽乳杆菌(Lactobacillus plantarum)
<400> 414
Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Leu Ser Cys Ser Lys Lys Gly Cys Thr Val
1 5 10 15
Asn Trp Gly Gln Ala Phe Ser Cys Gly Val Asn Arg Val Ala Thr Ala
20 25 30
Gly His Gly Lys
35
<210> 415
<211> 108
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 414多肽的多核苷酸
<400> 415
aaatattatg gcaacggcct gagctgcagc aaaaaaggct gcaccgtgaa ctggggccag 60
gcgtttagct gcggcgtgaa ccgcgtggcg accgcgggcc atggcaaa 108
<210> 416
<211> 24
<212> PRT
<213> 嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)
<400> 416
Gly Asn Pro Lys Val Ala His Cys Ala Ser Gln Ile Gly Arg Ser Thr
1 5 10 15
Ala Trp Gly Ala Val Ser Gly Ala
20
<210> 417
<211> 72
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 416多肽的多核苷酸
<400> 417
ggcaacccga aagtggcgca ttgcgcgagc cagattggcc gcagcaccgc gtggggcgcg 60
gtgagcggcg cg 72
<210> 418
<211> 40
<212> PRT
<213> 粪肠球菌(Enterococcus faecalis)
<400> 418
Trp Leu Pro Pro Ala Gly Leu Leu Gly Arg Cys Gly Arg Trp Phe Arg
1 5 10 15
Pro Trp Leu Leu Trp Leu Gln Ser Gly Ala Gln Tyr Lys Trp Leu Gly
20 25 30
Asn Leu Phe Gly Leu Gly Pro Lys
35 40
<210> 419
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 编码SEQ ID NO: 418多肽的多核苷酸
<400> 419
tggctgccgc cggcgggcct gctgggccgc tgcggccgct ggtttcgccc gtggctgctg 60
tggctgcaga gcggcgcgca gtataaatgg ctgggcaacc tgtttggcct gggcccgaaa 120
<210> 420
<211> 40
<212> PRT
<213> 多变鱼腥藻(Anabaena variabilis)
<400> 420
Asn Leu Asp Gln Trp Leu Thr Glu Gln Val His Glu Phe Gln Asp Met
1 5 10 15
Tyr Leu Glu Pro Gln Ala Ile Ser Asn Gln Asp Ile Thr Phe Lys Leu
20 25 30
Ser Asp Leu Asp Phe Ile His Asn
35 40
<210> 421
<211> 124
<212> DNA
<213> 多变鱼腥藻(Anabaena variabilis)
<400> 421
taatttagat cagtggttaa cagaacaagt tcatgagttt caagatatgt acttggaacc 60
acaagcaata tccaatcaag acattacctt caaactatct gacctagatt ttattcataa 120
ttga 124
<210> 422
<211> 40
<212> PRT
<213> 念珠藻属物种(Nostoc sp)
<400> 422
Asn Leu Asp Gln Trp Leu Thr Glu Gln Val His Glu Phe Gln Asp Met
1 5 10 15
Tyr Leu Glu Pro Gln Ala Ile Ser Asn Gln Asp Ile Thr Phe Lys Leu
20 25 30
Ser Asp Leu Asp Phe Ile His Asn
35 40
<210> 423
<211> 123
<212> DNA
<213> 念珠藻属物种(Nostoc sp)
<400> 423
aatttagatc aatggttaac agaacaagtt catgagtttc aagatatgta cttggaacca 60
caagcaatat ccaatcaaga cattaccttc aaactgtcag acctagattt tattcataat 120
tga 123
<210> 424
<211> 7
<212> PRT
<213> 满江红念珠藻(Nostoc azollae)
<400> 424
His Arg Glu Lys Lys Ser Ala
1 5
<210> 425
<211> 24
<212> DNA
<213> 满江红念珠藻(Nostoc azollae)
<400> 425
cacagagaga aaaaatcagc atag 24
<210> 426
<211> 23
<212> PRT
<213> 深海单细胞蓝藻(Acaryochloris marina)
<400> 426
Thr Ser Asn Asn Trp Leu Ala Lys Asn Tyr Leu Ser Met Trp Asn Lys
1 5 10 15
Lys Ser Ser Asn Pro Asn Leu
20
<210> 427
<211> 72
<212> DNA
<213> 深海单细胞蓝藻(Acaryochloris marina)
<400> 427
acaagcaata actggctagc caaaaactat ctttctatgt ggaataaaaa gagcagtaat 60
ccaaaccttt ag 72
<210> 428
<211> 6
<212> PRT
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 428
Phe Arg Tyr Phe Trp Trp
1 5
<210> 429
<211> 21
<212> DNA
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 429
tttagatatt tttggtggta a 21
<210> 430
<211> 6
<212> PRT
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 430
Phe Arg Tyr Phe Trp Trp
1 5
<210> 431
<211> 21
<212> DNA
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 431
tttagatatt tttggtggta a 21
<210> 432
<211> 9
<212> PRT
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 432
Cys Gly Glu Lys Trp Arg Ile Phe Ser
1 5
<210> 433
<211> 27
<212> DNA
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 433
tgtggagaaa aatggagaat ttttagc 27
<210> 434
<211> 8
<212> PRT
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 434
Phe Arg Leu Gln Leu Trp Gln Phe
1 5
<210> 435
<211> 24
<212> DNA
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 435
tttcgcttac aactgtggca attt 24
<210> 436
<211> 16
<212> PRT
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 436
Leu Gly Cys Asn Gln Ser Ser Ile Trp Ser Ile Phe Phe Trp Asn His
1 5 10 15
<210> 437
<211> 51
<212> DNA
<213> 蓝杆藻(Cyanothece)
<400> 437
ctaggatgta accagagcag tatctggtca atttttttct ggaatcatta a 51
<210> 438
<211> 40
<212> PRT
<213> 原型微鞘藻(Microcoleus chthonoplastes)
<400> 438
Tyr Asn Leu Gln Gly Leu Pro Ala Ile Glu Ser Glu Asp Cys Ile Pro
1 5 10 15
Asp Ser Val Ala Pro Ser Asp Asp Trp Phe Ser Gly Val Ser Ser Leu
20 25 30
Phe Asn Arg Leu Thr Gly Leu Gly
35 40
<210> 439
<211> 123
<212> DNA
<213> 原型微鞘藻(Microcoleus chthonoplastes)
<400> 439
tataacctac aggggttgcc agcaattgag tcagaagact gtatcccaga ttctgtagcg 60
ccttcggatg attggttttc aggcgtatcg tctctgttta accgcttgac tgggttgggt 120
tag 123
<210> 440
<211> 37
<212> PRT
<213> 念珠藻属物种(Nostoc sp)
<400> 440
Trp Met Ala Ile Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly
1 5 10 15
Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Leu Gly Glu His Cys Cys His His Asp
20 25 30
Ser Gly Asn Lys Gly
35
<210> 441
<211> 114
<212> DNA
<213> 念珠藻属物种(Nostoc sp)
<400> 441
tggatggcga ttcgccgcat tttgcgttgt catccattcc acccaggggg ttatgatcct 60
gtaccagagt tgggtgagca ttgttgtcat catgatagcg ggaataaggg gtga 114
<210> 442
<211> 35
<212> PRT
<213> 多变鱼腥藻(Anabaena variabilis)
<400> 442
Trp Met Gly Ile Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly
1 5 10 15
Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Val Gly Glu His Cys Cys His His Asp
20 25 30
Ser Gly Lys
35
<210> 443
<211> 108
<212> DNA
<213> 多变鱼腥藻(Anabaena variabilis)
<400> 443
tggatgggga ttcgccgcat tttgcgttgt catccattcc acccaggcgg ttatgatcct 60
gtaccagagg tgggtgagca ttgttgtcat catgatagcg ggaagtag 108
<210> 444
<211> 48
<212> PRT
<213> 泡沫节球藻(Nodularia spumigena)
<400> 444
Trp Met Ala Thr Arg Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly
1 5 10 15
Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Val Lys His Asn Cys Cys Asp Gln His
20 25 30
Leu Ser Asp Ser Gly Lys Gln Thr Thr Glu Asp His His Lys Gly Ser
35 40 45
<210> 445
<211> 147
<212> DNA
<213> 泡沫节球藻(Nodularia spumigena)
<400> 445
tggatggcga ctcggcggat tttgcgttgt catcccttcc atcctggtgg atatgatcca 60
gttccagagg taaaacacaa ttgctgcgat cagcatctgt ccgattctgg gaaacagacc 120
acagaagacc atcacaaagg ctcgtag 147
<210> 446
<211> 34
<212> PRT
<213> 满江红念珠藻(Nostoc azollae)
<400> 446
Trp Met Ala Thr Leu Arg Ile Leu Arg Cys His Pro Phe His Pro Gly
1 5 10 15
Gly Tyr Asp Pro Val Pro Gly Leu Ala Glu Lys Ser Cys Cys Asp His
20 25 30
His Asp
<210> 447
<211> 105
<212> DNA
<213> 满江红念珠藻(Nostoc azollae)
<400> 447
tggatggcaa ctttgcggat tttacgctgt catcctttcc atcctggtgg ttatgatcct 60
gtaccaggac tagcggaaaa atcctgttgt gaccatcatg attga 105
<210> 448
<211> 28
<212> PRT
<213> 聚球藻属(Synechococcus)
<400> 448
Trp Leu Thr Ala Lys Arg Phe Cys Arg Cys His Pro Leu His Pro Gly
1 5 10 15
Gly Tyr Asp Pro Val Pro Glu Lys Lys Ser Val Leu
20 25
<210> 449
<211> 87
<212> DNA
<213> 聚球藻属(Synechococcus)
<400> 449
tggctaacag ccaagcgctt ttgtcgctgt catccgcttc atcctggcgg gtatgatccg 60
gtaccggaga agaaatcggt actctaa 87
<210> 450
<211> 23
<212> PRT
<213> 海洋原绿球藻(Prochlorococcus marinus)
<400> 450
Trp Leu Thr Leu Arg Arg Leu Ser Arg Cys His Pro Phe Thr Pro Cys
1 5 10 15
Gly Cys Asp Pro Val Pro Asp
20
<210> 451
<211> 72
<212> DNA
<213> 海洋原绿球藻(Prochlorococcus marinus)
<400> 451
tggctcaccc tgcggcgcct gtctcgttgc catcctttta ccccctgtgg ttgcgacccg 60
gtgcctgatt aa 72
<210> 452
<211> 69
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 452
Met Ser Tyr Lys Lys Leu Tyr Gln Leu Thr Ala Ile Phe Ser Leu Pro
1 5 10 15
Leu Thr Ile Leu Leu Val Ser Leu Ser Ser Leu Arg Ile Val Gly Glu
20 25 30
Gly Asn Ser Tyr Val Asp Val Phe Leu Ser Phe Ile Ile Phe Leu Gly
35 40 45
Phe Ile Glu Leu Ile His Gly Ile Arg Lys Ile Leu Val Trp Ser Gly
50 55 60
Trp Lys Asn Gly Ser
65
<210> 453
<211> 210
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 453
atgagttata aaaaactgta ccaattgacg gctatattta gtttacctct tactatctta 60
ttggtttcac tttcatccct tcggattgtt ggcgaaggga attcttatgt tgacgttttt 120
ctaagcttta taatatttct tggttttatt gagctgattc atgggattcg aaagattttg 180
gtctggtcag gctggaaaaa cggaagttaa 210
<210> 454
<211> 85
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 454
Met Gly Leu Lys Leu Asp Leu Thr Trp Phe Asp Lys Ser Thr Glu Asp
1 5 10 15
Phe Lys Gly Glu Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val
20 25 30
Met Glu Ser Leu Gly Val Pro Phe Lys Asp Asn Val Asn Asn Gly Cys
35 40 45
Phe Asp Val Ile Ala Glu Trp Val Pro Leu Leu Gln Pro Tyr Phe Asn
50 55 60
His Gln Ile Asp Ile Ser Asp Asn Glu Tyr Phe Val Ser Phe Asp Tyr
65 70 75 80
Arg Asp Gly Asp Trp
85
<210> 455
<211> 258
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 455
atgggactta aattggattt aacttggttt gataaaagta cagaagattt taagggtgag 60
gagtattcaa aagattttgg agatgacggt tcagttatgg aaagtctagg tgtgcctttt 120
aaggataatg ttaataacgg ttgctttgat gttatagctg aatgggtacc tttgctacaa 180
ccatacttta atcatcaaat tgatatttcc gataatgagt attttgtttc gtttgattat 240
cgtgatggtg attggtga 258
<210> 456
<211> 113
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 456
Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys
1 5 10 15
Thr Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Ser Glu Gly Tyr Tyr
20 25 30
Phe Leu Val Ser Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile
35 40 45
Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu Tyr Ile Ala Phe Asn Phe
50 55 60
Ile Lys Lys Asp Phe Phe Glu Arg Arg Lys Asn Leu Asn Asn Ala Pro
65 70 75 80
Val Ala Lys Leu Asn Leu Phe Met Leu Tyr Asn Leu Leu Cys Leu Val
85 90 95
Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Phe Ile Ser Ile Lys Asn
100 105 110
Asn
<210> 457
<211> 342
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 457
atgagcttaa gatactacat aaaaaatatt ttatttggcc tgtactgcac acttatatat 60
atatacctta taacaaaaaa cagcgaaggg tattatttcc ttgtgtcaga taagatgcta 120
tatgcaatag tgataagcac tattctatgt ccatattcaa aatatgctat tgaatacata 180
gcttttaact tcataaagaa agattttttc gaaagaagaa aaaacctaaa taacgccccc 240
gtagcaaaat taaacctatt tatgctatat aatctacttt gtttggtcct agcaatccca 300
tttggattgc taggactttt tatatcaata aagaataatt aa 342
<210> 458
<211> 85
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 458
Met Gly Leu Lys Leu His Ile His Trp Phe Asp Lys Lys Thr Glu Glu
1 5 10 15
Phe Lys Gly Gly Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val
20 25 30
Ile Glu Ser Leu Gly Met Pro Leu Lys Asp Asn Ile Asn Asn Gly Trp
35 40 45
Phe Asp Val Glu Lys Pro Trp Val Ser Ile Leu Gln Pro His Phe Lys
50 55 60
Asn Val Ile Asp Ile Ser Lys Phe Asp Tyr Phe Val Ser Phe Val Tyr
65 70 75 80
Arg Asp Gly Asn Trp
85
<210> 459
<211> 258
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 459
atggggctta aattacatat tcattggttt gataagaaaa ccgaagagtt taaaggcggt 60
gaatactcaa aagacttcgg tgatgatggt tctgtcattg aaagtctggg gatgccttta 120
aaggataata ttaataatgg ttggtttgat gttgaaaaac catgggtttc gatattacag 180
ccacacttta aaaatgtaat cgatattagt aaatttgatt actttgtatc ctttgtttac 240
cgggatggta actggtaa 258
<210> 460
<211> 86
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 460
Met Glu Leu Lys His Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Ala Glu Phe Leu
1 5 10 15
Glu Phe Val Lys Lys Ile Cys Arg Ala Glu Gly Ala Thr Glu Glu Asp
20 25 30
Asp Asn Lys Leu Val Arg Glu Phe Glu Arg Leu Thr Glu His Pro Asp
35 40 45
Gly Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Arg Asp Asp Arg Glu Asp Ser Pro
50 55 60
Glu Gly Ile Val Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys
65 70 75 80
Ser Gly Phe Lys Gln Gly
85
<210> 461
<211> 261
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 461
atggaactga aacatagtat tagtgattat accgaggctg aatttctgga gtttgtaaaa 60
aaaatatgta gagctgaagg tgctactgaa gaggatgaca ataaattagt gagagagttt 120
gagcgattaa ctgagcaccc agatggttca gatctgattt attatcctcg cgatgacagg 180
gaagatagtc ctgaagggat tgtcaaggaa attaaagaat ggcgagctgc taacggtaag 240
tcaggattta aacagggctg a 261
<210> 462
<211> 178
<212> PRT
<213> 弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)
<400> 462
Met Met Asn Glu His Ser Ile Asp Thr Asp Asn Arg Lys Ala Asn Asn
1 5 10 15
Ala Leu Tyr Leu Phe Ile Ile Ile Gly Leu Ile Pro Leu Leu Cys Ile
20 25 30
Phe Val Val Tyr Tyr Lys Thr Pro Asp Ala Leu Leu Leu Arg Lys Ile
35 40 45
Ala Thr Ser Thr Glu Asn Leu Pro Ser Ile Thr Ser Ser Tyr Asn Pro
50 55 60
Leu Met Thr Lys Val Met Asp Ile Tyr Cys Lys Thr Ala Pro Phe Leu
65 70 75 80
Ala Leu Ile Leu Tyr Ile Leu Thr Phe Lys Ile Arg Lys Leu Ile Asn
85 90 95
Asn Thr Asp Arg Asn Thr Val Leu Arg Ser Cys Leu Leu Ser Pro Leu
100 105 110
Val Tyr Ala Ala Ile Val Tyr Leu Phe Cys Phe Arg Asn Phe Glu Leu
115 120 125
Thr Thr Ala Gly Arg Pro Val Arg Leu Met Ala Thr Asn Asp Ala Thr
130 135 140
Leu Leu Leu Phe Tyr Ile Gly Leu Tyr Ser Ile Ile Phe Phe Thr Thr
145 150 155 160
Tyr Ile Thr Leu Phe Thr Pro Val Thr Ala Phe Lys Leu Leu Lys Lys
165 170 175
Arg Gln
<210> 463
<211> 537
<212> DNA
<213> 弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)
<400> 463
atgatgaatg aacactcaat agatacggac aacagaaagg ccaataacgc attgtattta 60
tttataataa tcggattaat accattattg tgcatttttg ttgtttacta caaaacgcca 120
gacgctttac ttttacgtaa aattgctaca agcactgaga atctcccgtc aataacatcc 180
tcctacaacc cattaatgac aaaggttatg gatatttatt gtaaaacagc gcctttcctt 240
gccttaatac tatacatcct aacctttaaa atcagaaaat taatcaacaa caccgacagg 300
aacactgtac ttagatcttg tttattaagt ccattggtct atgcagcaat tgtttatcta 360
ttctgcttcc gaaattttga gttaacaaca gccggaaggc ctgtcagatt aatggccacc 420
aatgacgcaa cactattgtt attttatatt ggtctgtact caataatttt ctttacaacc 480
tatatcacgc tattcacacc agtcactgca tttaaattat taaaaaaaag gcagtaa 537
<210> 464
<211> 111
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 464
Met Asn Arg Lys Tyr Tyr Phe Asn Asn Met Trp Trp Gly Trp Val Thr
1 5 10 15
Gly Gly Tyr Met Leu Tyr Met Ser Trp Asp Tyr Glu Phe Lys Tyr Arg
20 25 30
Leu Leu Phe Trp Cys Ile Ser Leu Cys Gly Met Val Leu Tyr Pro Val
35 40 45
Ala Lys Trp Tyr Ile Glu Asp Thr Ala Leu Lys Phe Thr Arg Pro Asp
50 55 60
Phe Trp Asn Ser Gly Phe Phe Ala Asp Thr Pro Gly Lys Met Gly Leu
65 70 75 80
Leu Ala Val Tyr Thr Gly Thr Val Phe Ile Leu Ser Leu Pro Leu Ser
85 90 95
Met Ile Tyr Ile Leu Ser Val Ile Ile Lys Arg Leu Ser Val Arg
100 105 110
<210> 465
<211> 336
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 465
atgaacagaa aatattattt taataatatg tggtggggat gggtgacggg gggatatatg 60
ctgtatatgt catgggatta tgagtttaaa tacagattac tgttctggtg tatttctctc 120
tgcggaatgg ttttgtatcc ggttgcaaaa tggtatattg aagatacagc tctaaaattt 180
acccggcctg atttctggaa cagcggtttt tttgctgata cacctggaaa aatggggttg 240
cttgcggttt atacgggtac tgttttcata ttatctcttc cgttaagtat gatatatatt 300
ctttctgtta ttataaaaag gctgtctgta agatag 336
<210> 466
<211> 115
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 466
Met Lys Leu Asp Ile Ser Val Lys Tyr Leu Leu Lys Ser Leu Ile Pro
1 5 10 15
Ile Leu Ile Ile Leu Thr Val Phe Tyr Leu Gly Trp Lys Asp Asn Gln
20 25 30
Glu Asn Ala Arg Met Phe Tyr Ala Phe Ile Gly Cys Ile Ile Ser Ala
35 40 45
Ile Thr Phe Pro Phe Ser Met Arg Ile Ile Gln Lys Met Val Ile Arg
50 55 60
Phe Thr Gly Lys Glu Phe Trp Gln Lys Asp Phe Phe Thr Asn Pro Val
65 70 75 80
Gly Gly Ser Leu Thr Ala Ile Phe Glu Leu Phe Cys Phe Val Ile Ser
85 90 95
Val Pro Val Val Ala Ile Tyr Leu Ile Phe Ile Leu Cys Lys Ala Leu
100 105 110
Ser Gly Lys
115
<210> 467
<211> 348
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 467
atgaaactgg atatatctgt aaagtattta ctgaaaagcc tgataccaat cctcattatt 60
cttacagttt tttatctggg atggaaagat aaccaggaaa atgcaagaat gttttatgcg 120
ttcatcggat gcattatcag tgccattact tttccttttt caatgaggat aatacagaaa 180
atggtaataa ggtttacagg gaaagaattc tggcaaaaag acttctttac aaatccagtt 240
ggcggaagct taactgcaat atttgaatta ttctgtttcg ttatatcagt tcctgtggtt 300
gccatttact taatttttat actctgcaaa gccctttcag gaaaatga 348
<210> 468
<211> 131
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 468
Met His Asn Thr Leu Leu Glu Lys Ile Ile Ala Tyr Leu Ser Leu Pro
1 5 10 15
Gly Phe His Ser Leu Asn Asn Pro Pro Leu Ser Glu Ala Phe Asn Leu
20 25 30
Tyr Val His Thr Ala Pro Leu Ala Ala Thr Ser Leu Phe Ile Phe Thr
35 40 45
His Lys Glu Leu Glu Leu Lys Pro Lys Ser Ser Pro Leu Arg Ala Leu
50 55 60
Lys Ile Leu Thr Pro Phe Thr Ile Leu Tyr Ile Ser Met Ile Tyr Cys
65 70 75 80
Phe Leu Leu Thr Asp Thr Glu Leu Thr Leu Ser Ser Lys Thr Phe Val
85 90 95
Leu Ile Val Lys Lys Arg Ser Val Phe Val Phe Phe Leu Tyr Asn Thr
100 105 110
Ile Tyr Trp Asp Ile Tyr Ile His Ile Phe Val Leu Leu Val Pro Tyr
115 120 125
Arg Asn Ile
130
<210> 469
<211> 396
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 469
atgcacaata cactcctcga aaaaatcatc gcatacctat ccctaccagg atttcattca 60
ttaaacaacc cgcccctaag cgaagcattc aatctctatg ttcatacagc ccctttagct 120
gcaaccagct tattcatatt cacacacaaa gaattagagt taaaaccaaa gtcgtcacct 180
ctgcgggcac taaagatatt aactcctttc actattcttt atatatccat gatatactgt 240
ttcttgctaa ctgacacaga actaaccttg tcatcaaaaa catttgtatt aatagtcaaa 300
aaacgatctg tttttgtctt ttttctatat aacactatat attgggatat atatattcac 360
atatttgtac ttttggttcc ttataggaac atataa 396
<210> 470
<211> 85
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 470
Met Glu Leu Lys Asn Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Thr Glu Phe Lys
1 5 10 15
Lys Ile Ile Glu Asp Ile Ile Asn Cys Glu Gly Asp Glu Lys Lys Gln
20 25 30
Asp Asp Asn Leu Glu His Phe Ile Ser Val Thr Glu His Pro Ser Gly
35 40 45
Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Glu Gly Asn Asn Asp Gly Ser Pro Glu
50 55 60
Ala Val Ile Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys Ser
65 70 75 80
Gly Phe Lys Gln Gly
85
<210> 471
<211> 258
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 471
atggaactga aaaacagcat tagtgattac actgaaactg aattcaaaaa aattattgaa 60
gacatcatca attgtgaagg tgatgaaaaa aaacaggatg ataacctcga gcattttata 120
agtgttactg agcatcctag tggttctgat ctgatttatt acccagaagg taataatgat 180
ggtagccctg aagctgttat taaagagatt aaagaatggc gagctgctaa cggtaagtca 240
ggatttaaac agggctga 258
<210> 472
<211> 98
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 472
Met Lys Lys Lys Gln Ile Glu Phe Glu Asn Glu Leu Arg Ser Met Leu
1 5 10 15
Ala Thr Ala Leu Glu Lys Asp Ile Ser Gln Glu Glu Arg Asn Ala Leu
20 25 30
Asn Ile Ala Glu Lys Ala Leu Asp Asn Ser Glu Tyr Leu Pro Lys Ile
35 40 45
Ile Leu Asn Leu Arg Lys Ala Leu Thr Pro Leu Ala Ile Asn Arg Thr
50 55 60
Leu Asn His Asp Leu Ser Glu Leu Tyr Lys Phe Ile Thr Ser Ser Lys
65 70 75 80
Ala Ser Asn Lys Asn Leu Gly Gly Gly Leu Ile Met Ser Trp Gly Arg
85 90 95
Leu Phe
<210> 473
<211> 297
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 473
atgaaaaaaa aacaaataga atttgaaaac gagctaagaa gtatgttggc taccgccctt 60
gaaaaagaca ttagtcaaga ggaaagaaat gctctgaata ttgcagaaaa ggcgcttgac 120
aattctgaat atttaccaaa aattatttta aacctcagaa aagccctaac tccattagct 180
ataaatcgaa cacttaacca tgatttatct gaactgtata aattcattac aagttccaaa 240
gcatcaaaca aaaatttagg tggtggttta attatgtcgt ggggacgact attctaa 297
<210> 474
<211> 98
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 474
Met Lys Lys Lys Gln Ile Glu Phe Glu Asn Glu Leu Arg Ser Met Leu
1 5 10 15
Ala Thr Ala Leu Glu Lys Asp Ile Ser Gln Glu Glu Arg Asn Ala Leu
20 25 30
Asn Ile Ala Glu Lys Ala Leu Asp Asn Ser Glu Tyr Leu Pro Lys Ile
35 40 45
Ile Leu Asn Leu Arg Lys Ala Leu Thr Pro Leu Ala Ile Asn Arg Thr
50 55 60
Leu Asn His Asp Leu Ser Glu Leu Tyr Lys Phe Ile Thr Ser Ser Lys
65 70 75 80
Ala Ser Asn Lys Asn Leu Gly Gly Gly Leu Ile Met Ser Trp Gly Arg
85 90 95
Leu Phe
<210> 475
<211> 297
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 475
atgaaaaaaa aacaaataga atttgaaaac gagctaagaa gtatgttggc taccgccctt 60
gaaaaagaca ttagtcaaga ggaaagaaat gctctgaata ttgcagaaaa ggcgcttgac 120
aattctgaat atttaccaaa aattatttta aacctcagaa aagccctaac tccattagct 180
ataaatcgaa cacttaacca tgatttatct gaactgtata aattcattac aagttccaaa 240
gcatcaaaca aaaatttagg tggtggttta attatgtcgt ggggacgact attctaa 297
<210> 476
<211> 87
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 476
Met Asn Lys Met Ala Met Ile Asp Leu Ala Lys Leu Phe Leu Ala Ser
1 5 10 15
Lys Ile Thr Ala Ile Glu Phe Ser Glu Arg Ile Cys Val Glu Arg Arg
20 25 30
Arg Leu Tyr Gly Val Lys Asp Leu Ser Pro Asn Ile Leu Asn Cys Gly
35 40 45
Glu Glu Leu Phe Met Ala Ala Glu Arg Phe Glu Pro Asp Ala Asp Arg
50 55 60
Ala Asn Tyr Glu Ile Asp Asp Asn Gly Leu Lys Val Glu Val Arg Ser
65 70 75 80
Ile Leu Glu Lys Phe Lys Leu
85
<210> 477
<211> 249
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 477
atgatcgatt tggcgaaatt atttttagct tcgaaaatta cagtgattga gttttcagag 60
cgaatttgtg ttgaacggag aagattgtat ggtgttaagg atttgtctcc gaatatatta 120
aattgtgggg aagagttgtc tatggctgct gagcgatttg agcctgatgc agatagggct 180
aattatgaaa ttgatgataa tggacttaag gtcgaggtcc gatctatctt ggaaaaactt 240
aaatcataa 249
<210> 478
<211> 83
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 478
Met Lys Leu Ser Pro Lys Ala Ala Ile Glu Val Cys Asn Glu Ala Ala
1 5 10 15
Lys Lys Gly Leu Trp Ile Leu Gly Ile Asp Gly Gly His Trp Leu Asn
20 25 30
Pro Gly Phe Arg Ile Asp Ser Ser Ala Ser Trp Thr Tyr Asp Met Pro
35 40 45
Glu Glu Tyr Lys Ser Lys Ile Pro Glu Asn Asn Arg Leu Ala Ile Glu
50 55 60
Asn Ile Lys Asp Asp Ile Glu Asn Gly Tyr Thr Ala Phe Ile Ile Thr
65 70 75 80
Leu Lys Met
<210> 479
<211> 243
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 479
atgaagttat caccaaaagc tgcaatagaa gtttgtaatg aagcagcgaa aaaaggctta 60
tggattttgg gcattgatgg tgggcattgg ctgaatcctg gattcaggat agatagttca 120
gcatcatgga catatgatat gccggagaat acaaatcaaa aatccctgaa aataatagat 180
tggctattga aaatattaaa gatgatattg agaatggata cactgctttc attatcacgt 240
taa 243
<210> 480
<211> 85
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 480
Met Gly Leu Lys Leu His Ile Asn Trp Phe Asp Lys Arg Thr Glu Glu
1 5 10 15
Phe Lys Gly Gly Glu Tyr Ser Lys Asp Phe Gly Asp Asp Gly Ser Val
20 25 30
Ile Glu Arg Leu Gly Met Pro Phe Lys Asp Asn Ile Asn Asn Gly Trp
35 40 45
Phe Asp Val Ile Ala Glu Trp Val Pro Leu Leu Gln Pro Tyr Phe Asn
50 55 60
His Gln Ile Asp Ile Ser Asp Asn Glu Tyr Phe Val Ser Phe Asp Tyr
65 70 75 80
Arg Asp Gly Asp Trp
85
<210> 481
<211> 258
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 481
atggggctta aattacatat taattggttt gataagacga ccgaggaatt taaaggtggt 60
gagtattcaa aagattttgg agatgatggc tcggtcattg aacgtcttgg aatgccttta 120
aaagataata tcaataatgg ttggtttgat gttatagctg aatgggtacc tttgctacaa 180
ccatacttta atcatcaaat tgatatttcc gataatgagt attttgtttc gtttgattat 240
cgtgatggtg attggtga 258
<210> 482
<211> 85
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 482
Met Glu Leu Lys Lys Ser Ile Gly Asp Tyr Thr Glu Thr Glu Phe Lys
1 5 10 15
Lys Ile Ile Glu Asn Ile Ile Asn Cys Glu Gly Asp Glu Lys Lys Gln
20 25 30
Asp Asp Asn Leu Glu His Phe Ile Ser Val Thr Glu His Pro Ser Gly
35 40 45
Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Glu Gly Asn Asn Asp Gly Ser Pro Glu
50 55 60
Ala Val Ile Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys Ser
65 70 75 80
Gly Phe Lys Gln Gly
85
<210> 483
<211> 258
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 483
gtggagctaa agaaaagtat tggtgattac actgaaaccg aattcaaaaa aattattgaa 60
aacatcatca attgtgaagg tgatgaaaaa aaacaggatg ataacctcga gcattttata 120
agtgttactg agcatcctag tggttctgat ctgatttatt acccagaagg taataatgat 180
ggtagccctg aagctgttat taaagagatt aaagaatggc gagctgctaa cggtaagtca 240
ggatttaaac agggctga 258
<210> 484
<211> 86
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 484
Met Glu Leu Lys His Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Ala Glu Phe Leu
1 5 10 15
Gln Leu Val Thr Thr Ile Cys Asn Ala Asp Thr Ser Ser Glu Glu Glu
20 25 30
Leu Val Lys Leu Val Thr His Phe Glu Glu Met Thr Glu His Pro Ser
35 40 45
Gly Ser Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Lys Glu Gly Asp Asp Asp Ser Pro
50 55 60
Ser Gly Ile Val Asn Thr Val Lys Gln Trp Arg Ala Ala Asn Gly Lys
65 70 75 80
Ser Gly Phe Lys Gln Gly
85
<210> 485
<211> 261
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 485
atggaactga agcatagcat tagtgattat acagaagctg aatttttaca acttgtaaca 60
acaatttgta atgcgaacac ttccagtgaa gaagaactgg ttaaattggt tacacacttt 120
gaggaaatga ctgagcaccc tagtggtagt gatttaatat attacccaaa agaaggtgat 180
gatgactcac cttcaggtat tgtaaacaca gtaaaacaat ggcgagccgc taacggtaag 240
tcaggattta aacagggcta a 261
<210> 486
<211> 141
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 486
Met Leu Thr Leu Tyr Gly Tyr Ile Arg Asn Val Phe Leu Tyr Arg Met
1 5 10 15
Asn Asp Arg Ser Cys Gly Asp Phe Met Lys Val Ile Ser Met Lys Phe
20 25 30
Ile Phe Ile Leu Thr Ile Ile Ala Leu Ala Ala Val Phe Phe Trp Ser
35 40 45
Glu Asp Lys Gly Pro Ala Cys Tyr Gln Val Ser Asp Glu Gln Ala Arg
50 55 60
Thr Phe Val Lys Asn Asp Tyr Leu Gln Arg Met Lys Arg Trp Asp Asn
65 70 75 80
Asp Val Gln Leu Leu Gly Thr Glu Ile Pro Lys Ile Thr Trp Glu Lys
85 90 95
Ile Glu Arg Ser Leu Thr Asp Val Glu Asp Glu Lys Thr Leu Leu Val
100 105 110
Pro Phe Lys Ala Glu Gly Pro Asp Gly Lys Arg Met Tyr Tyr Gly Met
115 120 125
Tyr His Cys Glu Glu Gly Tyr Val Glu Tyr Ala Asn Asp
130 135 140
<210> 487
<211> 354
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 487
atgaaagtaa ttagcatgaa atttattttt attttaacga ttattgctct tgctgctgtt 60
tttttctggt ctgaagataa aggtccggca tgctatcagg tcagcgatga acaggccaga 120
acgtttgtaa aaaatgatta cctgcaaaga atgaaacgct gggacaacga tgtacaactt 180
cttggtacag aaatcccgaa aattacatgg gaaaagattg agagaagttt aacagatgtt 240
gaagatgaaa aaacacttct tgtcccattt aaagctgaag gcccggacgg taagagaatg 300
tattatggca tgtaccattg tgaggaggga tatgttgaat atgcgaatga ctaa 354
<210> 488
<211> 175
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 488
Met Thr Ser Asn Lys Asp Lys Asn Lys Lys Ala Asn Glu Ile Leu Tyr
1 5 10 15
Ala Phe Ser Ile Ile Gly Ile Ile Pro Leu Met Ala Ile Leu Ile Leu
20 25 30
Arg Ile Asn Asp Pro Tyr Ser Gln Val Leu Tyr Tyr Leu Tyr Asn Lys
35 40 45
Val Ala Phe Leu Pro Ser Ile Thr Ser Leu His Asp Pro Val Met Thr
50 55 60
Thr Leu Met Ser Asn Tyr Asn Lys Thr Ala Pro Val Met Gly Ile Leu
65 70 75 80
Val Phe Leu Cys Thr Tyr Lys Thr Arg Glu Ile Ile Lys Pro Val Thr
85 90 95
Arg Lys Leu Val Val Gln Ser Cys Phe Trp Gly Pro Val Phe Tyr Ala
100 105 110
Ile Leu Ile Tyr Ile Thr Leu Phe Tyr Asn Leu Glu Leu Thr Thr Ala
115 120 125
Gly Gly Phe Phe Lys Leu Leu Ser His Asn Val Ile Thr Leu Phe Ile
130 135 140
Leu Tyr Cys Ser Ile Tyr Phe Thr Val Leu Thr Met Thr Tyr Ala Ile
145 150 155 160
Leu Leu Met Pro Leu Leu Val Ile Lys Tyr Phe Lys Gly Arg Gln
165 170 175
<210> 489
<211> 528
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 489
atgaccagca ataaagataa gaacaagaaa gcaaacgaaa tattatatgc attttccata 60
atcgggatta ttccattaat ggctatatta atacttcgaa taaatgatcc atattctcaa 120
gtgctgtact acttatataa taaggtggca tttctccctt ctattacatc attgcatgat 180
cccgtcatga caacacttat gtcaaactac aacaagacag cgccagttat gggtattctc 240
gtttttcttt gcacatataa gacaagagaa atcataaagc cagtaacaag aaaacttgtt 300
gtgcaatcct gtttctgggg gcccgttttt tatgccattc tgatttatat cacactgttc 360
tataatctgg aactaacaac agcaggtggt ttttttaaat tattatctca taatgtcatc 420
actctgttta ttttatattg ctccatttac tttactgttt taaccatgac atatgcgatt 480
ttactgatgc cattacttgt cattaaatat tttaaaggga ggcagtaa 528
<210> 490
<211> 78
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 490
Met Asp Arg Lys Arg Thr Lys Leu Glu Leu Leu Phe Ala Phe Ile Ile
1 5 10 15
Asn Ala Thr Ala Ile Tyr Ile Ala Leu Ala Ile Tyr Asp Cys Val Phe
20 25 30
Arg Gly Lys Asp Phe Leu Ser Met His Thr Phe Cys Phe Ser Ala Leu
35 40 45
Met Ser Ala Ile Cys Tyr Phe Val Gly Asp Asn Tyr Tyr Ser Ile Ser
50 55 60
Asp Lys Ile Lys Arg Arg Ser Tyr Glu Asn Ser Asp Ser Lys
65 70 75
<210> 491
<211> 237
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 491
atggatagaa aaagaacaaa attagagttg ttatttgcat ttataataaa tgccaccgca 60
atatatattg cattagctat atatgattgt gtttttagag gaaaggactt tttatccatg 120
catacatttt gcttctctgc attaatgtct gcaatatgtt actttgttgg tgataattat 180
tattcaatat ccgataagat aaaaaggaga tcatatgaga actctgactc taaatga 237
<210> 492
<211> 113
<212> PRT
<213> 宋内氏志贺氏菌(Shigella sonnei)
<400> 492
Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys
1 5 10 15
Ala Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Asn Glu Gly Tyr Tyr
20 25 30
Phe Leu Ala Ser Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile
35 40 45
Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu His Ile Phe Phe Lys Phe
50 55 60
Ile Lys Lys Asp Phe Phe Arg Lys Arg Lys Asn Leu Asn Lys Cys Pro
65 70 75 80
Arg Gly Lys Ile Lys Pro Tyr Leu Cys Val Tyr Asn Leu Leu Cys Leu
85 90 95
Val Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Val Tyr Ile Asn Lys
100 105 110
Glu
<210> 493
<211> 342
<212> DNA
<213> 宋内氏志贺氏菌(Shigella sonnei)
<400> 493
atgagtttaa gatactacat aaaaaatatt ttgtttggcc tatactgcgc acttatatat 60
atatacctta taacaaaaaa caacgaaggg tattatttcc tagcgtcaga taagatgcta 120
tacgcaatag tgataagcac tattctatgc ccatattcaa aatatgctat tgaacacata 180
ttttttaagt tcataaagaa agattttttc agaaaaagaa aaaacctaaa taaatgcccc 240
cgtggcaaaa ttaaaccgta tttatgcgta tacaatctac tttgtttggt cctagcaatc 300
ccatttggat tgctaggact tgtttatatc aataaagaat aa 342
<210> 494
<211> 113
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 494
Met Ser Leu Arg Tyr Tyr Ile Lys Asn Ile Leu Phe Gly Leu Tyr Cys
1 5 10 15
Thr Leu Ile Tyr Ile Tyr Leu Ile Thr Lys Asn Ser Glu Glu Tyr Tyr
20 25 30
Phe Leu Val Thr Asp Lys Met Leu Tyr Ala Ile Val Ile Ser Thr Ile
35 40 45
Leu Cys Pro Tyr Ser Lys Tyr Ala Ile Glu His Ile Ala Phe Asn Phe
50 55 60
Ile Lys Lys His Phe Phe Glu Arg Arg Lys Asn Leu Asn Asn Ala Pro
65 70 75 80
Val Ala Lys Leu Asn Leu Phe Met Leu Tyr Asn Leu Leu Cys Leu Val
85 90 95
Leu Ala Ile Pro Phe Gly Leu Leu Gly Leu Phe Ile Ser Ile Lys Asn
100 105 110
Asn
<210> 495
<211> 342
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 495
atgagcttaa gatactacat aaaaaatatt ttatttggcc tgtactgcac acttatatat 60
atatacctta taacaaaaaa cagcgaagag tattatttcc ttgtgacaga taagatgcta 120
tatgcaatag tgataagcac tattctatgt ccatattcaa aatatgctat tgaacacata 180
gcttttaact tcataaagaa acattttttc gaaagaagaa aaaacctaaa taacgccccc 240
gtagcaaaat taaacctatt tatgctatat aatctacttt gtttggtcct agcaatccca 300
tttggattgc taggactttt tatatcaata aagaataatt aa 342
<210> 496
<211> 113
<212> PRT
<213> 冷明串珠菌(Leuconostoc gelidum)
<400> 496
Met Arg Lys Asn Asn Ile Leu Leu Asp Asp Ala Lys Ile Tyr Thr Asn
1 5 10 15
Lys Leu Tyr Leu Leu Leu Ile Asp Arg Lys Asp Asp Ala Gly Tyr Gly
20 25 30
Asp Ile Cys Asp Val Leu Phe Gln Val Ser Lys Lys Leu Asp Ser Thr
35 40 45
Lys Asn Val Glu Ala Leu Ile Asn Arg Leu Val Asn Tyr Ile Arg Ile
50 55 60
Thr Ala Ser Thr Asn Arg Ile Lys Phe Ser Lys Asp Glu Glu Ala Val
65 70 75 80
Ile Ile Glu Leu Gly Val Ile Gly Gln Lys Ala Gly Leu Asn Gly Gln
85 90 95
Tyr Met Ala Asp Phe Ser Asp Lys Ser Gln Phe Tyr Ser Ile Phe Glu
100 105 110
Arg
<210> 497
<211> 342
<212> DNA
<213> 冷明串珠菌(Leuconostoc gelidum)
<400> 497
ttgagaaaaa ataacatttt attggacgat gctaaaatat acacgaacaa actctatttg 60
ctattaatcg atagaaaaga tgacgctggg tatggagata tttgtgatgt tttgtttcag 120
gtatccaaaa aattagatag cacaaaaaat gtagaagcat tgattaaccg attggtcaat 180
tatatacgaa ttaccgcttc aacaaacaga attaagtttt caaaagatga agaggctgta 240
attatagaac ttggtgtaat tggtcagaag gctggattaa acggccaata catggctgat 300
ttttctgaca aatctcagtt ttatagtatc tttgaaagat aa 342
<210> 498
<211> 91
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 498
Met Lys Lys Lys Val Asp Thr Glu Lys Gln Ile Thr Ser Trp Ala Ser
1 5 10 15
Asp Leu Ala Ser Lys Asn Glu Thr Lys Val Gln Glu Lys Leu Ile Leu
20 25 30
Ser Ser Tyr Ile Gln Asp Ile Glu Asn His Val Tyr Phe Pro Lys Ala
35 40 45
Met Ile Ser Leu Glu Lys Lys Leu Arg Asp Gln Asn Asn Ile Cys Ala
50 55 60
Leu Ser Lys Glu Val Asn Gln Phe Tyr Phe Lys Val Val Glu Val Asn
65 70 75 80
Gln Arg Lys Ser Trp Met Val Gly Leu Ile Val
85 90
<210> 499
<211> 276
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis subsp. cremoris)
<400> 499
atgaaaaaaa aagttgatac agaaaaacaa attacttctt gggcatctga cttagcttcc 60
aaaaatgaaa caaaggttca agaaaaatta atactgtctt cttatattca ggacatcgaa 120
aaccatgttt actttccaaa agcaatgatt tctttagaaa aaaaattacg agaccaaaat 180
aatatttgcg ctttatcaaa agaagtcaat cagttttatt ttaaagttgt tgaagtaaat 240
caaagaaaat cctggatggt aggtttgata gtttaa 276
<210> 500
<211> 112
<212> PRT
<213> 乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)
<400> 500
Met Asn Lys Thr Lys Ser Glu His Ile Lys Gln Gln Ala Leu Asp Leu
1 5 10 15
Phe Thr Arg Leu Gln Phe Leu Leu Gln Lys His Asp Thr Ile Glu Pro
20 25 30
Tyr Gln Tyr Val Leu Asp Ile Leu Glu Thr Gly Ile Ser Lys Thr Lys
35 40 45
His Asn Gln Gln Thr Pro Glu Arg Gln Ala Arg Val Val Tyr Asn Lys
50 55 60
Ile Ala Ser Gln Ala Leu Val Asp Lys Leu His Phe Thr Ala Glu Glu
65 70 75 80
Asn Lys Val Leu Ala Ala Ile Asn Glu Leu Ala His Ser Gln Lys Gly
85 90 95
Trp Gly Glu Phe Asn Met Leu Asp Thr Thr Asn Thr Trp Pro Ser Gln
100 105 110
<210> 501
<211> 339
<212> DNA
<213> 乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)
<400> 501
atgaataaga ctaagtcgga acatattaaa caacaagctt tggacttatt tactaggcta 60
cagtttttac tacagaagca cgatactatc gaaccttacc agtacgtttt agatattctg 120
gagactggta tcagtaaaac taaacataac cagcaaacgc ctgaacgaca agctcgtgta 180
gtctacaaca agattgccag ccaagcgtta gtagataagt tacattttac tgccgaagaa 240
aacaaagttc tagcagccat caatgaattg gcgcattctc aaaaagggtg gggcgagttt 300
aacatgctag atactaccaa tacgtggcct agccaatag 339
<210> 502
<211> 88
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 502
Met Ile Lys Asp Glu Lys Ile Asn Lys Ile Tyr Ala Leu Val Lys Ser
1 5 10 15
Ala Leu Asp Asn Thr Asp Val Lys Asn Asp Lys Lys Leu Ser Leu Leu
20 25 30
Leu Met Arg Ile Gln Glu Thr Ser Ile Asn Gly Glu Leu Phe Tyr Asp
35 40 45
Tyr Lys Lys Glu Leu Gln Pro Ala Ile Ser Met Tyr Ser Ile Gln His
50 55 60
Asn Phe Arg Val Pro Asp Asp Leu Val Lys Leu Leu Ala Leu Val Gln
65 70 75 80
Thr Pro Lys Ala Trp Ser Gly Phe
85
<210> 503
<211> 267
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 503
atgataaaag atgaaaaaat aaataaaatc tatgctttag ttaagagcgc acttgataat 60
acggatgtta agaatgataa aaaactttct ttacttctta tgagaataca agaaacatca 120
attaatggag aactatttta cgattataaa aaagaattac agccagctat tagtatgtac 180
tctattcaac ataactttcg ggttcctgac gatctagtaa aactgttagc attagttcaa 240
acacctaaag cttggtcagg gttttaa 267
<210> 504
<211> 111
<212> PRT
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 504
Met Asp Ile Lys Ser Gln Thr Leu Tyr Leu Asn Leu Ser Glu Ala Tyr
1 5 10 15
Lys Asp Pro Glu Val Lys Ala Asn Glu Phe Leu Ser Lys Leu Val Val
20 25 30
Gln Cys Ala Gly Lys Leu Thr Ala Ser Asn Ser Glu Asn Ser Tyr Ile
35 40 45
Glu Val Ile Ser Leu Leu Ser Arg Gly Ile Ser Ser Tyr Tyr Leu Ser
50 55 60
His Lys Arg Ile Ile Pro Ser Ser Met Leu Thr Ile Tyr Thr Gln Ile
65 70 75 80
Gln Lys Asp Ile Lys Asn Gly Asn Ile Asp Thr Glu Lys Leu Arg Lys
85 90 95
Tyr Glu Ile Ala Lys Gly Leu Met Ser Val Pro Tyr Ile Tyr Phe
100 105 110
<210> 505
<211> 336
<212> DNA
<213> 麦芽香肉杆菌(Carnobacterium maltaromaticum)
<400> 505
atggatataa agtctcaaac attatatttg aatctaagcg aggcatataa agaccctgaa 60
gtaaaagcta atgaattctt atcaaaatta gttgtacaat gtgctgggaa attaacagct 120
tcaaacagtg agaacagtta tattgaagta atatcattgc tatctagggg tatttctagt 180
tattatttat cccataaacg tataattcct tcaagtatgt taactatata tactcaaata 240
caaaaggata taaaaaacgg gaatattgac accgaaaaat taaggaaata tgagatagca 300
aaaggattaa tgtccgttcc ttatatatat ttctaa 336
<210> 506
<211> 245
<212> PRT
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 506
Met Arg Arg Tyr Leu Ile Leu Ile Val Ala Leu Ile Gly Ile Thr Gly
1 5 10 15
Leu Ser Gly Cys Tyr Gln Thr Ser His Lys Lys Val Arg Phe Asp Glu
20 25 30
Gly Ser Tyr Thr Asn Phe Ile Tyr Asp Asn Lys Ser Tyr Phe Val Thr
35 40 45
Asp Lys Glu Ile Pro Gln Glu Asn Val Asn Asn Ser Lys Val Lys Phe
50 55 60
Tyr Lys Leu Leu Ile Val Asp Met Lys Ser Glu Lys Leu Leu Ser Ser
65 70 75 80
Ser Asn Lys Asn Ser Val Thr Leu Val Leu Asn Asn Ile Tyr Glu Ala
85 90 95
Ser Asp Lys Ser Leu Cys Met Gly Ile Asn Asp Arg Tyr Tyr Lys Ile
100 105 110
Leu Pro Glu Ser Asp Lys Gly Ala Val Lys Ala Leu Arg Leu Gln Asn
115 120 125
Phe Asp Val Thr Ser Asp Ile Ser Asp Asp Asn Phe Val Ile Asp Lys
130 135 140
Asn Asp Ser Arg Lys Ile Asp Tyr Met Gly Asn Ile Tyr Ser Ile Ser
145 150 155 160
Asp Thr Thr Val Ser Asp Glu Glu Leu Gly Glu Tyr Gln Asp Val Leu
165 170 175
Ala Glu Val Arg Val Phe Asp Ser Val Ser Gly Lys Ser Ile Pro Arg
180 185 190
Ser Glu Trp Gly Arg Ile Asp Lys Asp Gly Ser Asn Ser Lys Gln Ser
195 200 205
Arg Thr Glu Trp Asp Tyr Gly Glu Ile His Ser Ile Arg Gly Lys Ser
210 215 220
Leu Thr Glu Ala Phe Ala Val Glu Ile Asn Asp Asp Phe Lys Leu Ala
225 230 235 240
Thr Lys Val Gly Asn
245
<210> 507
<211> 738
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)
<400> 507
atgagaagat atttaatact tattgtggcc ttaataggga taacaggttt atcagggtgt 60
tatcaaacaa gtcataaaaa ggtgaggttt gacgaaggaa gttatactaa ttttatttat 120
gataataaat cgtatttcgt aactgataag gagattcctc aggagaacgt taacaattcc 180
aaagtaaaat tttataagct gttgattgtt gacatgaaaa gtgagaaact tttatcaagt 240
agcaacaaaa atagtgtgac tttggtctta aataatattt atgaggcttc tgacaagtcg 300
ctatgtatgg gtattaacga cagatactat aagatacttc cagaaagtga taagggggcg 360
gtcaaagctt tgagattaca aaactttgat gtgacaagcg atatttctga tgataatttt 420
gttattgata aaaatgattc acgaaaaatt gactatatgg gaaatattta cagtatatcg 480
gacaccaccg tatctgatga agaattggga gaatatcagg atgttttagc tgaagtacgt 540
gtgtttgatt cagttagtgg caaaagtatc ccgaggtctg aatgggggag aattgataag 600
gatggttcaa attccaaaca gagtaggacg gaatgggatt atggcgaaat ccattctatt 660
agaggaaaat ctcttactga agcatttgcc gttgagataa atgatgattt taagcttgca 720
acgaaggtag gaaactag 738
<210> 508
<211> 261
<212> PRT
<213> 豌豆根瘤菌三叶草生物型(Rhizobium leguminosarum bv. trifolii)
<400> 508
Met Asn Asp Glu Ile Cys Leu Thr Gly Gly Gly Arg Thr Thr Val Thr
1 5 10 15
Arg Arg Gly Gly Val Val Tyr Arg Glu Gly Gly Pro Trp Ser Ser Thr
20 25 30
Val Ile Ser Leu Leu Arg His Leu Glu Ala Ser Gly Phe Ala Glu Ala
35 40 45
Pro Ser Val Val Gly Thr Gly Phe Asp Glu Arg Gly Arg Glu Thr Leu
50 55 60
Ser Phe Ile Glu Gly Glu Phe Val His Pro Gly Pro Trp Ser Glu Glu
65 70 75 80
Ala Phe Pro Gln Phe Gly Met Met Leu Arg Arg Leu His Asp Ala Thr
85 90 95
Ala Ser Phe Lys Pro Pro Glu Asn Ser Met Trp Arg Asp Trp Phe Gly
100 105 110
Arg Asn Leu Gly Glu Gly Gln His Val Ile Gly His Cys Asp Thr Gly
115 120 125
Pro Trp Asn Ile Val Cys Arg Ser Gly Leu Pro Val Gly Leu Ile Asp
130 135 140
Trp Glu Val Ala Gly Pro Val Arg Ala Asp Ile Glu Leu Ala Gln Ala
145 150 155 160
Cys Trp Leu Asn Ala Gln Leu Tyr Asp Asp Asp Ile Ala Glu Arg Val
165 170 175
Gly Leu Gly Ser Val Thr Met Arg Ala His Gln Val Arg Leu Leu Leu
180 185 190
Asp Gly Tyr Gly Leu Ser Arg Lys Gln Arg Gly Gly Phe Val Asp Lys
195 200 205
Leu Ile Thr Phe Ala Val His Asp Ala Ala Glu Gln Ala Lys Glu Ala
210 215 220
Ala Val Thr Pro Glu Ser Asn Asp Ala Glu Pro Leu Trp Ala Ile Ala
225 230 235 240
Trp Arg Thr Arg Ser Ala Ser Trp Met Leu His His Arg Gln Thr Leu
245 250 255
Glu Ala Ala Leu Ala
260
<210> 509
<211> 786
<212> DNA
<213> 豌豆根瘤菌三叶草生物型(Rhizobium leguminosarum bv. trifolii)
<400> 509
atgaatgatg agatttgcct gacaggtggc ggacgaacga ctgtcacgcg gcgcggcgga 60
gtcgtgtatc gcgaaggcgg cccgtggtca tcaaccgtca tttcgctcct gcggcatctg 120
gaagcctctg gcttcgctga agctccttcc gttgtcggca ccggtttcga tgagcgcggc 180
cgggagacat tatcgtttat cgagggtgag tttgttcacc caggcccttg gtcggaggag 240
gcttttccgc aatttggaat gatgttgcgg cgactgcacg atgccaccgc ctcgttcaaa 300
cctcccgaaa actcgatgtg gcgcgattgg ttcgggcgta acctcggtga gggtcaacac 360
gtaataggac actgcgacac aggcccatgg aacattgttt gccggtcagg attgcctgtc 420
gggttgatag attgggaggt ggctgggcct gtcagggcgg atatcgaatt ggcccaggct 480
tgttggctga atgcccagct ctacgatgac gacattgcgg agagggtcgg attaggctct 540
gtgaccatga gagcgcatca agttcgcctg ctgcttgacg gctatggtct gtctcggaag 600
caacgcggcg gcttcgtcga caagctaatc acgttcgcag ttcacgatgc ggccgagcag 660
gcgaaagagg cggctgtcac gccagagtcg aacgatgcgg aaccgctatg ggcaattgcc 720
tggcgcacta gaagtgcctc ctggatgctc catcatcggc aaacactgga agcagcgctg 780
gcatag 786
<210> 510
<211> 436
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 510
Met Asn Asn Ile Ile Pro Ile Met Ser Leu Leu Phe Lys Gln Leu Tyr
1 5 10 15
Ser Arg Gln Gly Lys Lys Asp Ala Ile Arg Ile Ala Ala Gly Leu Val
20 25 30
Ile Leu Ala Val Phe Glu Ile Gly Leu Ile Arg Gln Ala Gly Ile Asp
35 40 45
Glu Ser Val Leu Arg Lys Thr Tyr Ile Ile Leu Ala Leu Leu Leu Met
50 55 60
Asn Thr Tyr Met Val Phe Leu Ser Val Thr Ser Gln Trp Lys Glu Ser
65 70 75 80
Tyr Met Lys Leu Ser Cys Leu Leu Pro Ile Ser Ser Arg Ser Phe Trp
85 90 95
Leu Ala Gln Ser Val Val Leu Phe Val Asp Thr Cys Leu Arg Arg Thr
100 105 110
Leu Phe Phe Phe Ile Leu Pro Leu Phe Leu Phe Gly Asn Gly Thr Leu
115 120 125
Ser Gly Ala Gln Thr Leu Phe Trp Leu Gly Arg Phe Ser Phe Phe Thr
130 135 140
Val Tyr Ser Ile Ile Phe Gly Val Val Leu Ser Asn His Phe Val Lys
145 150 155 160
Lys Lys Asn Leu Met Phe Leu Leu His Ala Ala Ile Phe Ala Cys Val
165 170 175
Cys Ile Ser Ala Ala Leu Met Pro Ala Ala Thr Ile Pro Leu Cys Ala
180 185 190
Val His Ile Leu Trp Ala Val Val Ile Asp Phe Pro Val Phe Leu Gln
195 200 205
Ala Pro Pro Gln Gln Gly Lys Met His Ser Phe Met Arg Arg Ser Glu
210 215 220
Phe Ser Phe Tyr Lys Arg Glu Trp Asn Arg Phe Ile Ser Ser Lys Ala
225 230 235 240
Met Leu Leu Asn Tyr Ala Val Met Ala Val Phe Ser Gly Phe Phe Ser
245 250 255
Phe Gln Met Met Asn Thr Gly Ile Phe Asn Gln Gln Val Ile Tyr Ile
260 265 270
Val Ile Ser Ala Leu Leu Leu Ile Cys Ser Pro Ile Ala Leu Leu Tyr
275 280 285
Ser Ile Glu Lys Asn Asp Arg Met Leu Leu Ile Thr Leu Pro Ile Lys
290 295 300
Arg Lys Thr Met Phe Trp Ala Lys Tyr Arg Phe Tyr Ser Gly Leu Leu
305 310 315 320
Ala Gly Gly Phe Leu Leu Val Val Met Ile Val Gly Phe Ile Ser Gly
325 330 335
Arg Ser Ile Ser Val Leu Thr Phe Leu Gln Cys Ile Glu Leu Leu Leu
340 345 350
Ala Gly Ala Tyr Ile Arg Leu Thr Ala Asp Glu Lys Arg Pro Ser Phe
355 360 365
Ser Trp Gln Thr Glu Gln Gln Leu Trp Ser Gly Phe Ser Lys Tyr Arg
370 375 380
Ser Tyr Leu Phe Cys Leu Pro Leu Phe Leu Ala Ile Leu Ala Gly Thr
385 390 395 400
Ala Val Ser Leu Ala Val Ile Pro Ile Ala Gly Leu Val Ile Val Tyr
405 410 415
Tyr Leu Gln Lys Gln Asp Gly Gly Phe Phe Asp Thr Ser Lys Arg Glu
420 425 430
Arg Leu Gly Ser
435
<210> 511
<211> 1000
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 511
atgaataaca taatccctat catgtctttg ctgttcaaac agctttacag ccggcaaggg 60
aaaaaggacg ccatccgcat tgccgcaggc cttgtcattc tggccgtgtt tgaaatcggg 120
ctgatccgcc aggccggcat tgatgaatcg gtgttgcgca aaacgtatat catactcgcg 180
cttcttttga tgaacacata tatggtgttt ctttccgtga catcacaatg gaaggaatct 240
tatatgaagc tgagctgcct gctgccgatt tcttcacgga gcttttggct cgcccagagt 300
gtcgttttgt ttgtcgatac ctgtttgaga agaactttat tcttttttat tttaccgctg 360
ttcttatttg gaaacggaac gctgtcaggg gcgcaaacat tgttttggct cggcaggttt 420
tcgtttttta ccgtttactc cattattttc ggagttgtgc taagcaacca cttcgtcaaa 480
aagaagaact tgatgtttct gctgcatgcg gcgatattcg cctgtgtatg tatcagcgcc 540
gctttgatgc cggccgccac gattccgctt tgcgcggttc atatcctgtg ggcggtggtc 600
attgactttc ctgtctttct gcaggcgcct ccgcagcagg gcaagatgca ttcatttatg 660
cggcgatctg aattttcgtt ttacaaaaga gaatggaacc gatttatctc ttctaaagcg 720
atgctgttaa attacgcggt aatggcggta ttcagcggct tcttttcgtt ccagatgatg 780
aacaccggca tcttcaatca gcaagtgatt tatatcgtga tttccgcgct tttgctcatc 840
tgctcgccga tcgccctttt gtattcgatt gaaaaaaatg accggatgct gctcatcacg 900
cttccgatca agcgaaaaac gatgttttgg gcgaaatatc gcttttattc aggcctattg 960
gcaggcggat ttctccttgt cgtgatgatt gtgggtttca 1000
<210> 512
<211> 239
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 512
Met Ser Ile Leu Asp Ile His Asp Val Ser Val Trp Tyr Glu Arg Asp
1 5 10 15
Asn Val Ile Leu Glu Gln Val Asp Leu His Leu Glu Lys Gly Ala Val
20 25 30
Tyr Gly Leu Leu Gly Val Asn Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Ile Asn
35 40 45
Thr Leu Thr Gly Val Asn Arg Asn Phe Ser Gly Arg Phe Thr Leu Cys
50 55 60
Gly Ile Glu Ala Glu Ala Gly Met Pro Gln Lys Thr Ser Asp Gln Leu
65 70 75 80
Lys Thr His Arg Tyr Phe Ala Ala Asp Tyr Pro Leu Leu Phe Thr Glu
85 90 95
Ile Thr Ala Lys Asp Tyr Val Ser Phe Val His Ser Leu Tyr Gln Lys
100 105 110
Asp Phe Ser Glu Gln Gln Phe Ala Ser Leu Ala Glu Ala Phe His Phe
115 120 125
Ser Lys Tyr Ile Asn Arg Arg Ile Ser Glu Leu Ser Leu Gly Asn Arg
130 135 140
Gln Lys Val Val Leu Met Thr Gly Leu Leu Leu Arg Ala Pro Leu Phe
145 150 155 160
Ile Leu Asp Glu Pro Leu Val Gly Leu Asp Val Glu Ser Ile Glu Val
165 170 175
Phe Tyr Gln Lys Met Arg Glu Tyr Cys Glu Ala Gly Gly Thr Ile Leu
180 185 190
Phe Ser Ser His Leu Leu Asp Val Val Gln Arg Phe Cys Asp Tyr Ala
195 200 205
Ala Ile Leu His Asn Lys Gln Ile Gln Lys Val Ile Pro Ile Gly Glu
210 215 220
Glu Thr Asp Leu Arg Arg Glu Phe Phe Glu Val Ile Gly His Glu
225 230 235
<210> 513
<211> 716
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 513
gcattttgga tatacacgat gtatccgttt ggtatgaacg ggacaacgtc atcttagagc 60
acgtggactt acacttagaa aaaggcgccg tttacggatt gcttggggta aacggtgccg 120
gcaaaacaac actgatcaat acgctgacag gagtgaaccg caattacagc gggggcttta 180
cgctgtgcgg cattgaagct gaggccggca tgccgcagaa aacatcagat caactgaaga 240
ttcaccgtta cttcgccgct gattatccgc tgctgtttac agaaattacg gcgaaggact 300
atgtgtcttt cgtccattcg ctttatcaaa aggatttttc agagcgacag tttgccagtt 360
tggctgaggc ctttcatttt tcaaaataca tcaacaggag aatctcggag ctgtccttgg 420
ggaacaggca aaaggttgtg ttgatgacag gattattgct gcgggctccc ctgtttattt 480
tggatgagcc gctcgtcggt ttggatgtgg aatcaataga ggtcttttat cagaaaatgc 540
gggagtactg tgaggaaggc ggaaccattt tgttttcttc ccatctgctc gatgtcgtgc 600
agagattttg tgattttgcg gccattctgc acaacaaaca gatccaaaag gtcattccga 660
ttggggagga gaccgatctg cggcgggaat tttttgaggt tatcggccat gaataa 716
<210> 514
<211> 53
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 514
Met Ser Pro Ala Gln Arg Arg Ile Leu Leu Tyr Ile Leu Ser Phe Ile
1 5 10 15
Phe Val Ile Gly Ala Val Val Tyr Phe Val Lys Ser Asp Tyr Leu Phe
20 25 30
Thr Leu Ile Phe Ile Ala Ile Ala Ile Leu Phe Gly Met Arg Ala Arg
35 40 45
Lys Ala Asp Ser Arg
50
<210> 515
<211> 162
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 515
ttgtcaccag cacaaagaag aattttactg tatatccttt catttatctt tgtcatcggc 60
gcagtcgtct attttgtcaa aagcgattat ctgtttacgc tgattttcat tgccattgcc 120
attctgttcg ggatgcgcgc gcggaaggct gactcgcgat ga 162
<210> 516
<211> 87
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 516
Met Glu Leu Lys Asn Ser Ile Ser Asp Tyr Thr Glu Ala Glu Phe Val
1 5 10 15
Gln Leu Leu Lys Glu Ile Glu Lys Glu Asn Val Ala Ala Thr Asp Asp
20 25 30
Val Leu Asp Val Leu Leu Glu His Phe Val Lys Ile Thr Glu His Pro
35 40 45
Asp Gly Thr Asp Leu Ile Tyr Tyr Pro Ser Asp Asn Arg Asp Asp Ser
50 55 60
Pro Glu Gly Ile Val Lys Glu Ile Lys Glu Trp Arg Ala Ala Asn Gly
65 70 75 80
Lys Pro Gly Phe Lys Gln Gly
85
<210> 517
<211> 264
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 517
atggaactga aaaatagtat tagtgattac acagaggctg agtttgttca acttcttaag 60
gaaattgaaa aagagaatgt tgctgcaact gatgatgtgt tagatgtgtt actcgaacac 120
tttgtaaaaa ttactgagca tccagatgga acggatctga tttattatcc tagtgataat 180
agagacgata gccccgaagg gattgtcaag gaaattaaag aatggcgagc tgctaacggt 240
aagccaggat ttaaacaggg ctga 264
<210> 518
<211> 87
<212> PRT
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 518
Met Lys Ser Lys Ile Ser Glu Tyr Thr Glu Lys Glu Phe Leu Glu Phe
1 5 10 15
Val Glu Asp Ile Tyr Thr Asn Asn Lys Lys Lys Phe Pro Thr Glu Glu
20 25 30
Ser His Ile Gln Ala Val Leu Glu Phe Lys Lys Leu Thr Glu His Pro
35 40 45
Ser Gly Ser Asp Leu Leu Tyr Tyr Pro Asn Glu Asn Arg Glu Asp Ser
50 55 60
Pro Ala Gly Val Val Lys Glu Val Lys Glu Trp Arg Ala Ser Lys Gly
65 70 75 80
Leu Pro Gly Phe Lys Ala Gly
85
<210> 519
<211> 264
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 519
atgaagtcca agatttccga atatacggaa aaagagtttc ttgagtttgt tgaagacata 60
tacacaaaca ataagaaaaa gttccctacc gaggagtctc atattcaagc cgtgcttgaa 120
tttaaaaaac taacggaaca cccaagcggc tcagaccttc tttactaccc caacgaaaat 180
agagaagata gcccagctgg agttgtaaag gaagttaaag aatggcgtgc ttccaagggg 240
cttcctggct ttaaggccgg ttag 264
<210> 520
<211> 87
<212> PRT
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 520
Met Lys Ser Lys Ile Ser Glu Tyr Thr Glu Lys Glu Phe Leu Glu Phe
1 5 10 15
Val Lys Asp Ile Tyr Thr Asn Asn Lys Lys Lys Phe Pro Thr Glu Glu
20 25 30
Ser His Ile Gln Ala Val Leu Glu Phe Lys Lys Leu Thr Glu His Pro
35 40 45
Ser Gly Ser Asp Leu Leu Tyr Tyr Pro Asn Glu Asn Arg Glu Asp Ser
50 55 60
Pro Ala Gly Val Val Lys Glu Val Lys Glu Trp Arg Ala Ser Lys Gly
65 70 75 80
Leu Pro Gly Phe Lys Ala Gly
85
<210> 521
<211> 264
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 521
atgaagtcca agatttccga atatacggaa aaagagtttc ttgagtttgt taaagacata 60
tacacaaaca ataagaaaaa gttccctacc gaggagtctc atattcaagc cgtgcttgaa 120
tttaaaaaac taacggaaca cccaagcggc tcagaccttc tttactaccc caacgaaaat 180
agagaagata gcccagctgg agttgtaaag gaagttaaag aatggcgtgc ttccaagggg 240
cttcctggct ttaaggccgg ttag 264
<210> 522
<211> 95
<212> PRT
<213> 希拉肠球菌(Enterococcus hirae)
<400> 522
Met Asp Phe Thr Lys Glu Glu Lys Leu Leu Asn Ala Ile Ser Lys Val
1 5 10 15
Tyr Asn Glu Ala Thr Ile Asp Asp Tyr Pro Asp Leu Lys Glu Lys Leu
20 25 30
Phe Leu Tyr Ser Lys Glu Ile Ser Glu Gly Lys Ser Val Gly Glu Val
35 40 45
Ser Met Lys Leu Ser Ser Phe Leu Gly Arg Tyr Ile Leu Lys His Lys
50 55 60
Phe Gly Leu Pro Lys Ser Leu Ile Glu Leu Gln Glu Ile Val Ser Lys
65 70 75 80
Glu Ser Gln Val Tyr Arg Gly Trp Ala Ser Ile Gly Ile Trp Ser
85 90 95
<210> 523
<211> 288
<212> DNA
<213> 希拉肠球菌(Enterococcus hirae)
<400> 523
atggatttta ctaaagaaga aaaactttta aatgcaatta gtaaagtata caatgaagca 60
actatagatg actatcctga cttaaaagaa aagctctttc tttattctaa agaaatcagt 120
gagggaaaaa gtgttggtga agttagtatg aaattaagta gttttcttgg aagatatatt 180
ttaaaacata aatttggatt acctaaatct ttaatagaat tacaagaaat tgttagtaag 240
gaatctcaag tatatagagg atgggcttct attggtattt ggagttaa 288
<210> 524
<211> 113
<212> PRT
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 524
Met Lys Lys Lys Tyr Arg Tyr Leu Glu Asp Ser Lys Asn Tyr Thr Ser
1 5 10 15
Thr Leu Tyr Ser Leu Leu Val Asp Asn Val Asp Lys Pro Gly Tyr Ser
20 25 30
Asp Ile Cys Asp Val Leu Leu Gln Val Ser Lys Lys Leu Asp Asn Thr
35 40 45
Gln Ser Val Glu Ala Leu Ile Asn Arg Leu Val Asn Tyr Ile Arg Ile
50 55 60
Thr Ala Ser Thr Tyr Lys Ile Ile Phe Ser Lys Lys Glu Glu Glu Leu
65 70 75 80
Ile Ile Lys Leu Gly Val Ile Gly Gln Lys Ala Gly Leu Asn Gly Gln
85 90 95
Tyr Met Ala Asp Phe Ser Asp Lys Ser Gln Phe Tyr Ser Val Phe Asp
100 105 110
Gln
<210> 525
<211> 342
<212> DNA
<213> 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)
<400> 525
ttgaaaaaaa agtatcggta tttagaagat agcaaaaatt acactagtac actctattct 60
ctgttagttg ataatgttga caaacctgga tactcagata tttgcgatgt tttgcttcaa 120
gtttctaaga agttggataa tactcaaagt gttgaagcgc taattaatcg attggttaat 180
tatattcgta ttactgcttc aacatacaaa attatttttt caaaaaaaga agaggaattg 240
attataaaac ttggtgttat tggacaaaaa gctggactta atggtcagta tatggctgat 300
ttttcagaca agtctcagtt ttacagcgtt ttcgatcagt aa 342
<210> 526
<211> 93
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 526
Met Ser Phe Leu Asn Phe Ala Phe Ser Pro Val Phe Phe Ser Ile Met
1 5 10 15
Ala Cys Tyr Phe Ile Val Trp Arg Asn Lys Arg Asn Glu Phe Val Cys
20 25 30
Asn Arg Leu Leu Ser Ile Ile Ile Ile Ser Phe Leu Ile Cys Phe Ile
35 40 45
Tyr Pro Trp Leu Asn Tyr Lys Ile Glu Val Lys Tyr Tyr Ile Phe Glu
50 55 60
Gln Phe Tyr Leu Phe Cys Phe Leu Ser Ser Leu Val Ala Val Val Ile
65 70 75 80
Asn Leu Ile Val Tyr Phe Ile Leu Tyr Arg Arg Cys Ile
85 90
<210> 527
<211> 282
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 527
atgagttttc ttaattttgc attttctcct gtattcttct ccattatggc gtgttatttc 60
attgtatgga gaaataaacg aaacgaattt gtctgcaata gattgctatc aattataata 120
atatcttttt tgatatgctt catatatcca tggctaaatt acaaaatcga agttaaatat 180
tatatatttg aacagtttta tcttttttgt tttttatcgt cactcgtggc tgttgtaata 240
aacctaattg tatactttat attatacagg agatgtatat ga 282
<210> 528
<211> 96
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 528
Met His Leu Lys Tyr Tyr Leu His Asn Leu Pro Glu Ser Leu Ile Pro
1 5 10 15
Trp Ile Leu Ile Leu Ile Phe Asn Asp Asn Asp Asn Thr Pro Leu Leu
20 25 30
Phe Ile Phe Ile Ser Ser Ile His Val Leu Leu Tyr Pro Tyr Ser Lys
35 40 45
Leu Thr Ile Ser Arg Tyr Ile Lys Glu Asn Thr Lys Leu Lys Lys Glu
50 55 60
Pro Trp Tyr Leu Cys Lys Leu Ser Ala Leu Phe Tyr Leu Leu Met Ala
65 70 75 80
Ile Pro Val Gly Leu Pro Ser Phe Ile Tyr Tyr Thr Leu Lys Arg Asn
85 90 95
<210> 529
<211> 291
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 529
atgcatttaa aatactacct acataattta cctgaatcac ttataccatg gattcttatt 60
ttaatattta acgacaatga taacactcct ttgttattta tatttatatc atcaatacat 120
gtattgctat atccatactc taaattaacc atatctagat atatcaaaga aaatacaaag 180
ttaaaaaaag aaccctggta cttatgcaag ttatctgcat tgttttattt attaatggca 240
atcccagtag gattgccaag tttcatatat tacactctaa agagaaatta a 291
<210> 530
<211> 344
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 530
Met Met Ile Gln Ser His Pro Leu Leu Ala Ala Pro Leu Ala Val Gly
1 5 10 15
Asp Thr Ile Gly Phe Phe Ser Ser Ser Ala Pro Ala Thr Val Thr Ala
20 25 30
Lys Asn Arg Phe Phe Arg Gly Val Glu Phe Leu Gln Arg Lys Gly Phe
35 40 45
Lys Leu Val Ser Gly Lys Leu Thr Gly Lys Thr Asp Phe Tyr Arg Ser
50 55 60
Gly Thr Ile Lys Glu Arg Ala Gln Glu Phe Asn Glu Leu Val Tyr Asn
65 70 75 80
Pro Asp Ile Thr Cys Ile Met Ser Thr Ile Gly Gly Asp Asn Ser Asn
85 90 95
Ser Leu Leu Pro Phe Leu Asp Tyr Asp Ala Ile Ile Ala Asn Pro Lys
100 105 110
Ile Ile Ile Gly Tyr Ser Asp Thr Thr Ala Leu Leu Ala Gly Ile Tyr
115 120 125
Ala Lys Thr Gly Leu Ile Thr Phe Tyr Gly Pro Ala Leu Ile Pro Ser
130 135 140
Phe Gly Glu His Pro Pro Leu Val Asp Ile Thr Tyr Glu Ser Phe Ile
145 150 155 160
Lys Ile Leu Thr Arg Lys Gln Ser Gly Ile Tyr Thr Tyr Thr Leu Pro
165 170 175
Glu Lys Trp Ser Asp Glu Ser Ile Asn Trp Asn Glu Asn Lys Ile Leu
180 185 190
Arg Pro Lys Lys Leu Tyr Lys Asn Asn Cys Ala Phe Tyr Gly Ser Gly
195 200 205
Lys Val Glu Gly Arg Val Ile Gly Gly Asn Leu Asn Thr Leu Thr Gly
210 215 220
Ile Trp Gly Ser Glu Trp Met Pro Glu Ile Leu Asn Gly Asp Ile Leu
225 230 235 240
Phe Ile Glu Asp Ser Arg Lys Ser Ile Ala Thr Ile Glu Arg Leu Phe
245 250 255
Ser Met Leu Lys Leu Asn Arg Val Phe Asp Lys Val Ser Ala Ile Ile
260 265 270
Leu Gly Lys His Glu Leu Phe Asp Cys Ala Gly Ser Lys Arg Arg Pro
275 280 285
Tyr Glu Val Leu Thr Glu Val Leu Asp Gly Lys Gln Ile Pro Val Leu
290 295 300
Asp Gly Phe Asp Cys Ser His Thr His Pro Met Leu Thr Leu Pro Leu
305 310 315 320
Gly Val Lys Leu Ala Ile Asp Phe Asp Asn Lys Asn Ile Ser Ile Thr
325 330 335
Glu Gln Tyr Leu Ser Thr Glu Lys
340
<210> 531
<211> 1000
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 531
atgatgatac aatctcatcc actactggcc gctcccctgg cagtaggaga tacaattggt 60
ttcttttcat catctgctcc ggcaacagtt actgcaaaaa atcgtttttt tcggggagtt 120
gagtttcttc agagaaaggg atttaagctg gtatcaggga agcttaccgg taaaacagat 180
ttttatcgtt caggtactat taaagaaaga gctcaagaat ttaatgagtt agtctacaat 240
cctgatatta cctgtataat gtcaacgatc ggtggagata acagtaattc actactaccg 300
tttctggact atgatgctat cattgcaaac cccaaaatta tcataggtta ctcagataca 360
actgctttat tagcaggaat atatgcaaaa acagggttaa taacattcta tggaccagct 420
cttattcctt cgtttggtga acatccacct cttgtggata taacatatga atcatttatt 480
aaaatactaa caagaaaaca atcaggaata tatacctaca cattacctga aaagtggagt 540
gatgagagca taaactggaa tgaaaacaag atattaaggc ctaagaagct atataaaaac 600
aactgtgcct tttatggttc cggaaaagtt gaggggcgtg taattggagg aaatctaaat 660
actttgacag gtatatgggg gagtgaatgg atgcctgaaa ttcttaatgg agatatattg 720
tttattgagg acagtcggaa aagcattgca acaattgaac gattattctc tatgctaaag 780
cttaatcgcg tgtttgataa agttagtgca ataatactcg ggaaacatga gctttttgat 840
tgtgcaggaa gtaaacgcag accatatgaa gtattaacag aggtattaga tgggaaacag 900
attcctgtac tggatggatt tgattgttca catacacatc caatgctaac tcttccactt 960
ggtgtaaaat tagctattga ctttgacaac aaaaatatat 1000
<210> 532
<211> 90
<212> PRT
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 532
Met Lys Ala Asp Tyr Lys Lys Ile Asn Ser Ile Leu Thr Tyr Thr Ser
1 5 10 15
Thr Ala Leu Lys Asn Pro Lys Ile Ile Lys Asp Lys Asp Leu Val Val
20 25 30
Leu Leu Thr Ile Ile Gln Glu Glu Ala Lys Gln Asn Arg Ile Phe Tyr
35 40 45
Asp Tyr Lys Arg Lys Phe Arg Pro Ala Val Thr Arg Phe Thr Ile Asp
50 55 60
Asn Asn Phe Glu Ile Pro Asp Cys Leu Val Lys Leu Leu Ser Ala Val
65 70 75 80
Glu Thr Pro Lys Ala Trp Ser Gly Phe Ser
85 90
<210> 533
<211> 268
<212> DNA
<213> 清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)
<400> 533
ggcagattat aaaaaaataa attcaatact aacttacaca tctactgctt taaaaaaccc 60
taaaattata aaagataaag atttagtagt ccttctaact attattcaag aagaagccaa 120
acaaaataga atcttttatg attataaaag aaaatttcgt ccagcggtta ctcgctttac 180
aattgataat aattttgaga ttcctgattg tttggttaaa ctactgtcag ctgttgaaac 240
acctaaggcg tggtctggat ttagttag 268
<210> 534
<211> 83
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 534
Met Lys Leu Ser Pro Lys Ala Ala Ile Glu Val Cys Asn Glu Ala Ala
1 5 10 15
Lys Lys Gly Leu Trp Ile Leu Gly Ile Asp Gly Gly His Trp Leu Asn
20 25 30
Pro Gly Phe Arg Ile Asp Ser Ser Ala Ser Trp Thr Tyr Asp Met Pro
35 40 45
Glu Glu Tyr Lys Ser Lys Thr Pro Glu Asn Asn Arg Leu Ala Ile Glu
50 55 60
Asn Ile Lys Asp Asp Ile Glu Asn Gly Tyr Thr Ala Phe Ile Ile Thr
65 70 75 80
Leu Lys Met
<210> 535
<211> 251
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 535
tgaagttatc accaaaagct gcaatagaag tttgtaatga agcagcgaaa aaaggcttat 60
ggattttggg cattgatggt gggcattggc tgaatcctgg attcaggata gatagttcag 120
catcatggac atatgatatg ccggaggaat acaaatcaaa aacccctgaa aataatagat 180
tggctattga aaatattaaa gatgatattg agaatggata cactgctttc attatcacgt 240
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<210> 536
<211> 436
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 536
Met Asn Asn Ile Phe Pro Ile Met Ser Leu Leu Phe Lys Gln Leu Tyr
1 5 10 15
Ser Arg Gln Gly Lys Lys Asp Ala Ile Arg Ile Ala Ala Gly Leu Val
20 25 30
Ile Leu Ala Val Phe Glu Ile Gly Leu Ile Arg Gln Ala Gly Ile Asp
35 40 45
Glu Ser Val Leu Gly Lys Thr Tyr Ile Ile Leu Ala Leu Leu Leu Met
50 55 60
Asn Thr Tyr Met Val Phe Leu Ser Val Thr Ser Gln Trp Lys Glu Ser
65 70 75 80
Tyr Met Lys Leu Ser Cys Leu Leu Pro Ile Ser Ser Arg Ser Phe Trp
85 90 95
Leu Ala Gln Ser Val Val Leu Phe Val Asp Thr Cys Leu Arg Arg Thr
100 105 110
Leu Phe Phe Phe Ile Leu Pro Leu Phe Leu Phe Gly Asn Gly Thr Leu
115 120 125
Ser Gly Ala Gln Thr Leu Phe Trp Leu Gly Arg Phe Ser Phe Phe Thr
130 135 140
Val Tyr Ser Ile Leu Phe Gly Val Met Leu Ser Asn His Phe Val Lys
145 150 155 160
Lys Lys Asn Ser Met Phe Leu Leu His Ala Ala Val Phe Ala Phe Val
165 170 175
Cys Leu Ser Ala Ala Phe Met Pro Ala Val Thr Ile Pro Leu Cys Ala
180 185 190
Val His Met Leu Trp Ala Val Ile Ile Asp Phe Pro Val Phe Leu Gln
195 200 205
Ala Pro Pro His Gln Ser Lys Met His Phe Phe Met Arg Arg Ser Glu
210 215 220
Phe Ser Phe Tyr Lys Arg Glu Trp Asn Arg Phe Ile Ser Ser Lys Ala
225 230 235 240
Met Leu Leu Asn Tyr Val Val Met Ala Ala Phe Ser Gly Phe Phe Ser
245 250 255
Phe Gln Met Met Asn Thr Gly Ile Phe Asn Gln Gln Val Ile Tyr Ile
260 265 270
Val Ile Ser Ala Leu Leu Leu Ile Cys Ser Pro Ile Ala Leu Leu Tyr
275 280 285
Ser Ile Glu Lys Asn Asp Arg Met Leu Leu Ile Thr Leu Pro Ile Lys
290 295 300
Arg Arg Thr Met Phe Trp Ala Lys Tyr Arg Phe Tyr Ser Gly Leu Leu
305 310 315 320
Ala Gly Gly Phe Leu Leu Val Ala Ile Ile Val Gly Phe Ile Ser Gly
325 330 335
Arg Pro Ile Ser Ala Leu Thr Phe Val Gln Cys Met Glu Leu Leu Leu
340 345 350
Ala Gly Ala Phe Ile Arg Leu Thr Ala Asp Glu Lys Arg Pro Ser Phe
355 360 365
Gly Trp Gln Thr Glu Gln Gln Leu Trp Ser Gly Phe Ser Lys Tyr Arg
370 375 380
Ser Tyr Leu Phe Cys Leu Pro Leu Phe Leu Ala Thr Leu Ala Gly Thr
385 390 395 400
Ala Val Ser Leu Ala Val Ile Pro Ile Ala Ala Leu Ile Ile Val Tyr
405 410 415
Tyr Leu Gln Lys Gln Asp Gly Gly Phe Phe Asp Thr Ser Lys Arg Glu
420 425 430
Arg Ile Gly Ser
435
<210> 537
<211> 1000
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 537
ttggggagga gaccgatctg cggcgggaat tttttgaggt tatcggccat gaataacata 60
ttccccatca tgtcgttgct gttcaaacag ctgtacagcc ggcaagggaa aaaggacgct 120
atccgcattg ctgcagggct tgtgattctc gccgtgtttg aaatcgggct gatccgacaa 180
gccggcattg acgaatcggt gttgggaaaa acgtatatca tattggcgct tctcttaatg 240
aacacgtata tggtgtttct ttccgtgaca tcacaatgga aggaatctta tatgaagctg 300
agctgtctgc tgccgatttc atcacggagc ttttggctcg cccagagtgt cgttctgttt 360
gtcgatacct gtttgagaag aacgttattc ttttttattt taccgctgtt cttatttgga 420
aacggaacgc tgtcaggggc gcaaacattg ttttggcttg gcagattttc gttttttacc 480
gtttactcga ttctattcgg agttatgcta agcaaccatt tcgtcaaaaa gaagaactcg 540
atgtttctgc tgcatgcggc ggtattcgcc tttgtatgcc tcagtgccgc ttttatgccg 600
gccgtcacga tcccgctatg cgcggttcac atgctatggg cggtgatcat tgactttccg 660
gtctttctgc aggcgcctcc gcatcagagc aagatgcatt tttttatgcg gcgatctgaa 720
ttttcgtttt acaaaagaga atggaaccga tttatttctt ctaaagcgat gctgttaaat 780
tacgtggtga tggcggcgtt cagcggattc ttttcgttcc agatgatgaa cactggcatc 840
ttcaatcagc aagtgattta tattgtgatt tccgctctat tgctgatttg ctcgccgatc 900
gcccttttgt actctattga aaaaaacgat cgcatgctgc tcatcacgct tccaattaaa 960
agaagaacga tgttttgggc gaaatatcgc ttttattcag 1000
<210> 538
<211> 580
<212> PRT
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 538
Met Glu Arg Lys Gln Lys Asn Ser Leu Phe Asn Tyr Ile Tyr Ser Leu
1 5 10 15
Met Asp Val Arg Gly Lys Phe Leu Phe Phe Ser Met Leu Phe Ile Thr
20 25 30
Ser Leu Ser Ser Ile Ile Ile Ser Ile Ser Pro Leu Ile Leu Ala Lys
35 40 45
Ile Thr Asp Leu Leu Ser Gly Ser Leu Ser Asn Phe Ser Tyr Glu Tyr
50 55 60
Leu Val Leu Leu Ala Cys Leu Tyr Met Phe Cys Val Ile Ser Asn Lys
65 70 75 80
Ala Ser Val Phe Leu Phe Met Ile Leu Gln Ser Ser Leu Arg Ile Asn
85 90 95
Met Gln Lys Lys Met Ser Leu Lys Tyr Leu Arg Glu Leu Tyr Asn Glu
100 105 110
Asn Ile Thr Asn Leu Ser Lys Asn Asn Ala Gly Tyr Thr Thr Gln Ser
115 120 125
Leu Asn Gln Ala Ser Asn Asp Ile Tyr Ile Leu Val Arg Asn Val Ser
130 135 140
Gln Asn Ile Leu Ser Pro Val Ile Gln Leu Ile Ser Thr Ile Val Val
145 150 155 160
Val Leu Ser Thr Lys Asp Trp Phe Ser Ala Gly Val Phe Phe Leu Tyr
165 170 175
Ile Leu Val Phe Val Ile Phe Asn Thr Arg Leu Thr Gly Ser Leu Ala
180 185 190
Ser Leu Arg Lys His Ser Met Asp Ile Thr Leu Asn Ser Tyr Ser Leu
195 200 205
Leu Ser Asp Thr Val Asp Asn Met Ile Ala Ala Lys Lys Asn Asn Ala
210 215 220
Leu Arg Leu Ile Ser Glu Arg Tyr Glu Asp Ala Leu Thr Gln Glu Asn
225 230 235 240
Asn Ala Gln Lys Lys Tyr Trp Leu Leu Ser Ser Lys Val Leu Leu Leu
245 250 255
Asn Ser Leu Leu Ala Val Ile Leu Phe Gly Ser Val Phe Ile Tyr Asn
260 265 270
Ile Leu Gly Val Leu Asn Gly Val Val Ser Ile Gly His Phe Ile Met
275 280 285
Ile Thr Ser Tyr Ile Ile Leu Leu Ser Thr Pro Val Glu Asn Ile Gly
290 295 300
Ala Leu Leu Ser Glu Ile Arg Gln Ser Met Ser Ser Leu Ala Gly Phe
305 310 315 320
Ile Gln Arg His Ala Glu Asn Lys Ala Thr Ser Pro Ser Ile Pro Phe
325 330 335
Leu Asn Met Glu Arg Lys Leu Asn Leu Ser Ile Arg Glu Leu Ser Phe
340 345 350
Ser Tyr Ser Asp Asp Lys Lys Ile Leu Asn Ser Val Ser Leu Asp Leu
355 360 365
Phe Thr Gly Lys Met Tyr Ser Leu Thr Gly Pro Ser Gly Ser Gly Lys
370 375 380
Ser Thr Leu Val Lys Ile Ile Ser Gly Tyr Tyr Lys Asn Tyr Phe Gly
385 390 395 400
Asp Ile Tyr Leu Asn Asp Ile Ser Leu Arg Asn Ile Ser Asp Glu Asp
405 410 415
Leu Asn Asp Ala Ile Tyr Tyr Leu Thr Gln Asp Asp Tyr Ile Phe Met
420 425 430
Asp Thr Leu Arg Phe Asn Leu Arg Leu Ala Asn Tyr Asp Ala Ser Glu
435 440 445
Asn Glu Ile Phe Lys Val Leu Lys Leu Ala Asn Leu Ser Val Val Asn
450 455 460
Asn Glu Pro Val Ser Leu Asp Thr His Leu Ile Asn Arg Gly Asn Asn
465 470 475 480
Tyr Ser Gly Gly Gln Lys Gln Arg Ile Ser Leu Ala Arg Leu Phe Leu
485 490 495
Arg Lys Pro Ala Ile Ile Ile Ile Asp Glu Ala Thr Ser Ala Leu Asp
500 505 510
Tyr Ile Asn Glu Ser Glu Ile Leu Ser Ser Ile Arg Thr His Phe Pro
515 520 525
Asp Ala Leu Ile Ile Asn Ile Ser His Arg Ile Asn Leu Leu Glu Cys
530 535 540
Ser Asp Cys Val Tyr Val Leu Asn Glu Gly Asn Ile Val Ala Ser Gly
545 550 555 560
His Phe Arg Asp Leu Met Val Ser Asn Glu Tyr Ile Ser Gly Leu Ala
565 570 575
Ser Val Thr Glu
580
<210> 539
<211> 1000
<212> DNA
<213> 大肠杆菌((Escherichia coli))
<400> 539
atggaaagaa aacagaaaaa ctcattattt aattatattt attcattaat ggatgtaaga 60
ggtaaatttt tattcttttc catgttattc attacatcat tatcatcgat aatcatatct 120
atttcaccat tgattcttgc aaagattaca gatttactgt ctggctcatt gtcaaatttt 180
agttatgaat atctggtttt acttgcctgt ttatacatgt tttgcgttat atctaataaa 240
gcaagtgttt ttttatttat gatactgcaa agtagtctac gtattaacat gcagaaaaaa 300
atgtcgctaa agtatttgag agaattgtat aacgaaaata taactaactt gagtaaaaat 360
aatgctggat atacaacgca aagtcttaac caggcttcaa atgacattta tattcttgtg 420
agaaatgttt cccagaatat cctgtcacct gttatacaac ttatttccac tattgttgtt 480
gttttatcta cgaaggactg gttttctgcc ggtgtgtttt ttctctatat tctggtattt 540
gtaattttta ataccagact gactggcagt ttagcgtctc tcagaaaaca cagcatggat 600
atcactctta actcttatag tctgttatct gatactgttg ataacatgat agcagctaaa 660
aagaataatg cattaagact tatttctgaa cgttatgaag atgctctcac tcaggaaaac 720
aatgctcaga aaaaatactg gttactcagt tctaaagttc ttttattgaa ctctttactt 780
gctgtaatat tatttggttc tgtattcata tataatattt taggtgtgct gaatggtgta 840
gttagtatcg gccacttcat tatgattaca tcatatatca ttcttctttc aacgccagtg 900
gaaaatatag gggcattgct aagtgagatc aggcagtcaa tgtctagcct ggcaggtttt 960
attcaacgtc atgccgagaa taaagccaca tctccttcaa 1000
<210> 540
<211> 95
<212> PRT
<213> 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)
<400> 540
Met Thr Leu Leu Ser Phe Gly Phe Ser Pro Val Phe Phe Ser Val Met
1 5 10 15
Ala Phe Cys Ile Ile Ser Arg Ser Lys Phe Tyr Pro Gln Arg Thr Arg
20 25 30
Asn Lys Val Ile Val Leu Ile Leu Leu Thr Phe Phe Ile Cys Phe Leu
35 40 45
Tyr Pro Leu Thr Lys Val Tyr Leu Val Gly Ser Tyr Gly Ile Phe Asp
50 55 60
Lys Phe Tyr Leu Phe Cys Phe Ile Ser Thr Leu Ile Ala Ile Ala Ile
65 70 75 80
Asn Val Val Ile Leu Thr Ile Asn Gly Ala Lys Asn Glu Arg Asn
85 90 95
<210> 541
<211> 288
<212> DNA
<213> 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)
<400> 541
atgacattac tttcatttgg attttctcct gttttctttt cagtcatggc gttctgtatc 60
atttcacgta gtaaattcta tccgcagaga acgcgaaaca aagttattgt tctgatttta 120
ctaacttttt ttatttgttt tttatatcca ttaacaaaag tgtatctggt gggaagttac 180
ggtatatttg acaaattcta cctcttttgc tttatttcta cgttaattgc aatagcaatt 240
aacgtagtga tacttacaat aaatggagct aagaatgaga gaaattag 288
<210> 542
<211> 13
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Kozak序列
<400> 542
gccgccrcca ugg 13
<210> 543
<211> 6
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Shine-Delgarno序列
<400> 543
ggaggu 6
<210> 544
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 引导启动子
<400> 544
gaaaaccttg tcaatgaaga gcgatctatg 30
<210> 545
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> FecA启动子
<400> 545
ttctcgttcg actcatagct gaacacaaca 30
<210> 546
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Cu敏感性启动子
<400> 546
atgacaaaat tgtcat 16
<210> 547
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Fe启动子
<400> 547
accaatgctg ggaacggcca gggcacctaa 30
<210> 548
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Fe和UV启动子
<400> 548
ctgaaagcgc ataccgctat ggagggggtt 30
<210> 549
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PrFe (PI + PII rus操纵子)
<400> 549
tagatatgcc tgaaagcgca taccgctatg 30
<210> 550
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Lux盒式右侧
<400> 550
tgttatagtc gaatacctct ggcggtgata 30
<210> 551
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Las) TetO
<400> 551
ttttggtaca ctccctatca gtgatagaga 30
<210> 552
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Las) CIO
<400> 552
ctttttggta cactacctct ggcggtgata 30
<210> 553
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Rhl)
<400> 553
tacgcaagaa aatggtttgt tatagtcgaa 30
<210> 554
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 双启动子(LuxR/HSL，阳性/ cI，阴性)
<400> 554
cgtgcgtgtt gataacaccg tgcgtgttga 30
<210> 555
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 位于来自金黄色葡萄球菌(S. aureus)agr操纵子的P2启动子
<400> 555
agattgtact aaatcgtata atgacagtga 30
<210> 556
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> plux-cI杂合启动子
<400> 556
gtgttgatgc ttttatcacc gccagtggta 30
<210> 557
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> plux-lac杂合启动子
<400> 557
agtgtgtgga attgtgagcg gataacaatt 30
<210> 558
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CinR, CinL和葡萄糖控制的启动子
<400> 558
acatcttaaa agttttagta tcatattcgt 30
<210> 559
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 可被CI抑制的RhIR启动子
<400> 559
tacgcaagaa aatggtttgt tatagtcgaa 30
<210> 560
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 反向Lux启动子
<400> 560
tcttgcgtaa acctgtacga tcctacaggt 30
<210> 561
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> rhlI启动子
<400> 561
atcctccttt agtcttcccc ctcatgtgtg 30
<210> 562
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> lasI启动子
<400> 562
taaaattatg aaatttgcat aaattcttca 30
<210> 563
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LuxR+3OC6HSL独立的R0065
<400> 563
gtgttgacta ttttacctct ggcggtgata 30
<210> 564
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LasR/LasI 可诱导的& RHLR/RHLI可抑制的启动子
<400> 564
gaaatctggc agtttttggt acacgaaagc 30
<210> 565
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLux/cI杂合启动子
<400> 565
acaccgtgcg tgttgatata gtcgaataaa 30
<210> 566
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLas启动子
<400> 566
aaaattatga aatttgtata aattcttcag 30
<210> 567
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLas/cI杂合启动子
<400> 567
ggttcttttt ggtacctctg gcggtgataa 30
<210> 568
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLas/Lux杂合启动子
<400> 568
tgtaggatcg tacaggtata aattcttcag 30
<210> 569
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLux
<400> 569
caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30
<210> 570
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pLux/Las杂合启动子
<400> 570
ctatctcatt tgctagtata gtcgaataaa 30
<210> 571
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 杂合启动子: HSL-LuxR 激活的，P22 C2抑制的
<400> 571
tagtttataa tttaagtgtt ctttaatttc 30
<210> 572
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PAI+LasR -> LuxI (AI)
<400> 572
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 573
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PAI+LasR -> LasI & AI+LuxR --| LasI
<400> 573
aataactctg atagtgctag tgtagatctc 30
<210> 574
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PAI+LasR -> LasI+GFP & AI+LuxR --| LasI+GFP
<400> 574
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 575
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 复合QS -> LuxI & LasI回路
<400> 575
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 576
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 位点3突变的启动子lux pR-3 (luxR & HSL调节的)
<400> 576
caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30
<210> 577
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 位点5突变的启动子lux pR-5 (luxR & HSL调节的)
<400> 577
caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30
<210> 578
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 位点3&5突变的启动子lux pR-3/5 (luxR &
HSL调节的)
<400> 578
caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30
<210> 579
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(HSL-介导的luxR 阻遏子)
<400> 579
ttgacacctg taggatcgta caggtataat 30
<210> 580
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(luxR & HSL 调节的 -- lux pR)
<400> 580
caagaaaatg gtttgttata gtcgaataaa 30
<210> 581
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(luxR & HSL 调节的-- lux pL)
<400> 581
cacgcaaaac ttgcgacaaa caataggtaa 30
<210> 582
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(RhlR & C4-HSL调节的)
<400> 582
gttagctttc gaattggcta aaaagtgttc 30
<210> 583
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(cinR和HSL调节的)
<400> 583
ccattctgct ttccacgaac ttgaaaacgc 30
<210> 584
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子(LasR & PAI调节的)
<400> 584
ggccgcgggt tctttttggt acacgaaagc 30
<210> 585
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 启动子, 标准的(luxR和HSL调节的 -- lux
pR)
<400> 585
aagaaaatgg tttgttgata ctcgaataaa 30
<210> 586
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Bla)
<400> 586
gtttatacat aggcgagtac tctgttatgg 30
<210> 587
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Cat)
<400> 587
agaggttcca actttcacca taatgaaaca 30
<210> 588
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P(Kat)
<400> 588
taaacaacta acggacaatt ctacctaaca 30
<210> 589
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 用于构建引物家族成员的模板
<400> 589
acatcaagcc aaattaaaca ggattaacac 30
<210> 590
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 反向λcI-调节的启动子
<400> 590
gaggtaaaat agtcaacacg cacggtgtta 30
<210> 591
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Key Promoter absorbs 3
<400> 591
caggccggaa taactcccta taatgcgcca 30
<210> 592
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 592
ggctagctca gtcctaggta cagtgctagc 30
<210> 593
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 593
agctagctca gtcctaggta ttatgctagc 30
<210> 594
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 594
agctagctca gtcctaggta ctgtgctagc 30
<210> 595
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 595
agctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30
<210> 596
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 596
agctagctca gtcctaggta ttgtgctagc 30
<210> 597
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 597
ggctagctca gtcctaggta ctatgctagc 30
<210> 598
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 598
ggctagctca gtcctaggta tagtgctagc 30
<210> 599
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 599
ggctagctca gccctaggta ttatgctagc 30
<210> 600
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 600
agctagctca gtcctaggta taatgctagc 30
<210> 601
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 601
agctagctca gtcctaggga ctgtgctagc 30
<210> 602
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 602
ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30
<210> 603
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 603
ggctagctca gtcctaggta tagtgctagc 30
<210> 604
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 604
agctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30
<210> 605
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 605
ggctagctca gtcctaggga ttatgctagc 30
<210> 606
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 606
ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30
<210> 607
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 607
agctagctca gcccttggta caatgctagc 30
<210> 608
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 608
agctagctca gtcctaggga ctatgctagc 30
<210> 609
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 609
agctagctca gtcctaggga ttgtgctagc 30
<210> 610
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 610
ggctagctca gtcctaggta ttgtgctagc 30
<210> 611
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子家族成员
<400> 611
agctagctca gtcctaggta taatgctagc 30
<210> 612
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 来自J23107的1bp突变体
<400> 612
ggctagctca gtcctaggta ttatgctagc 30
<210> 613
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 来自J23114的1bp突变体
<400> 613
ggctagctca gtcctaggta caatgctagc 30
<210> 614
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 反向pBAD
<400> 614
aaagtgtgac gccgtgcaaa taatcaatgt 30
<210> 615
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NikR启动子，抑制expre的转录因子的条带螺旋-螺旋家族的蛋白
<400> 615
gacgaatact taaaatcgtc atacttattt 30
<210> 616
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> lacq_启动子
<400> 616
aaacctttcg cggtatggca tgatagcgcc 30
<210> 617
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> lacIQ -启动子序列
<400> 617
tgatagcgcc cggaagagag tcaattcagg 30
<210> 618
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 大肠杆菌(E. Coli)CreABCD磷酸盐感应操纵子启动子
<400> 618
ttatttaccg tgacgaacta attgctcgtg 30
<210> 619
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> GlnRS启动子
<400> 619
catacgccgt tatacgttgt ttacgctttg 30
<210> 620
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> lacZ的组成型弱启动子
<400> 620
ttatgcttcc ggctcgtatg ttgtgtggac 30
<210> 621
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 突变的LacZ启动子
<400> 621
ttatgcttcc ggctcgtatg gtgtgtggac 30
<210> 622
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 在-10与-35元件之间具有(TA)10的组成型启动子
<400> 622
atatatatat atatataatg gaagcgtttt 30
<210> 623
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 在-10与-35元件之间具有(TA)9的组成型启动子
<400> 623
atatatatat atatataatg gaagcgtttt 30
<210> 624
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 在-10与-35元件之间具有(C)10的组成型启动子
<400> 624
ccccgaaagc ttaagaatat aattgtaagc 30
<210> 625
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 在-10与-35元件之间具有(C)12的组成型启动子
<400> 625
ccccgaaagc ttaagaatat aattgtaagc 30
<210> 626
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 13 bp位于-10与-35元件之间的优化的(TA)重复组成型启动子
<400> 626
tgacaatata tatatatata taatgctagc 30
<210> 627
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 15 bp位于-10与-35元件之间的优化的(TA)重复组成型启动子
<400> 627
acaatatata tatatatata taatgctagc 30
<210> 628
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 17 bp位于-10与-35元件之间的优化的(TA)重复组成型启动子
<400> 628
aatatatata tatatatata taatgctagc 30
<210> 629
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 19 bp位于-10与-35 元件之间的优化的(TA)重复组成型启动子
<400> 629
tatatatata tatatatata taatgctagc 30
<210> 630
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 21 bp位于-10与-35元件之间的优化的(TA)重复组成型启动子
<400> 630
tatatatata tatatatata taatgctagc 30
<210> 631
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 17 bp位于-10与-35元件之间的优化的(A)重复组成型启动子
<400> 631
aaaaaaaaaa aaaaaaaata taatgctagc 30
<210> 632
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 18 bp位于-10与-35元件之间的优化的(A)重复组成型启动子
<400> 632
aaaaaaaaaa aaaaaaaata taatgctagc 30
<210> 633
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> J23101:GFP
<400> 633
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 634
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> J23119:IFP
<400> 634
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 635
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> J23119:HO1
<400> 635
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 636
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 红外线信号报告基因(J23119:IFP:J23119:HO1)
<400> 636
caccttcggg tgggcctttc tgcgtttata 30
<210> 637
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 双终止子+组成型启动子
<400> 637
ggctagctca gtcctaggta cagtgctagc 30
<210> 638
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 双末端 + 组成型启动子+ 强RBS
<400> 638
tgctagctac tagagattaa agaggagaaa 30
<210> 639
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> IPTG可诱导的Lac启动子盒
<400> 639
ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30
<210> 640
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> IPTG可诱导的Lac启动子盒
<400> 640
ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30
<210> 641
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> IPTG可诱导的 Lac启动子盒
<400> 641
ttgtgagcgg ataacaagat actgagcaca 30
<210> 642
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因I启动子
<400> 642
cctgttttta tgttattctc tctgtaaagg 30
<210> 643
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因II启动子
<400> 643
aaatatttgc ttatacaatc ttcctgtttt 30
<210> 644
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因III启动子
<400> 644
gctgataaac cgatacaatt aaaggctcct 30
<210> 645
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因IV启动子
<400> 645
ctcttctcag cgtcttaatc taagctatcg 30
<210> 646
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因V启动子
<400> 646
atgagccagt tcttaaaatc gcataaggta 30
<210> 647
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因VI启动子
<400> 647
ctattgattg tgacaaaata aacttattcc 30
<210> 648
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13K07基因VIII启动子
<400> 648
gtttcgcgct tggtataatc gctgggggtc 30
<210> 649
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> M13110
<400> 649
ctttgcttct gactataata gtcagggtaa 30
<210> 650
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Modified promoter sequence of g3.
<400> 650
aaaccgatac aattaaaggc tcctgctagc 30
<210> 651
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子I
<400> 651
caccacactg atagtgctag tgtagatcac 30
<210> 652
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 组成型启动子II
<400> 652
gccggaataa ctccctataa tgcgccacca 30
<210> 653
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> --指定部分列表--
<400> 653
ttgacaagct tttcctcagc tccgtaaact 30
<210> 654
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 全长的稳定期osmY启动子
<400> 654
ggtttcaaaa ttgtgatcta tatttaacaa 30
<210> 655
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 最小的稳定期osmY启动子
<400> 655
ggtttcaaaa ttgtgatcta tatttaacaa 30
<210> 656
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> htpG热休克启动子
<400> 656
tctattccaa taaagaaatc ttcctgcgtg 30
<210> 657
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的组成型启动子强启动子veg
<400> 657
aaaaatgggc tcgtgttgta caataaatgt 30
<210> 658
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的组成型启动子43
<400> 658
aaaaaaagcg cgcgattatg taaaatataa 30
<210> 659
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的强组成型启动子
<400> 659
aattgcagta ggcatgacaa aatggactca 30
<210> 660
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PliaG
<400> 660
caagcttttc ctttataata gaatgaatga 30
<210> 661
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PlepA
<400> 661
tctaagctag tgtattttgc gtttaatagt 30
<210> 662
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Pveg
<400> 662
aatgggctcg tgttgtacaa taaatgtagt 30
<210> 663
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的启动子ctc
<400> 663
atccttatcg ttatgggtat tgtttgtaat 30
<210> 664
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的启动子gsiB
<400> 664
taaaagaatt gtgagcggga atacaacaac 30
<210> 665
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 枯草芽孢杆菌的组成型启动子43
<400> 665
aaaaaaagcg cgcgattatg taaaatataa 30
<210> 666
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 来自沙门菌属的Pspv2
<400> 666
tacaaaataa ttcccctgca aacattatca 30
<210> 667
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 来自沙门菌属的Pspv
<400> 667
tacaaaataa ttcccctgca aacattatcg 30
<210> 668
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7启动子(来自T7噬菌体的强启动子)
<400> 668
agggaataca agctacttgt tctttttgca 30
<210> 669
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7启动子
<400> 669
taatacgact cactataggg aga 23
<210> 670
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7启动子
<400> 670
gaatttaata cgactcacta tagggaga 28
<210> 671
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7一致性-10和剩余部分
<400> 671
taatacgact cactatagg 19
<210> 672
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 重叠的T7启动子
<400> 672
gagtcgtatt aatacgactc actatagggg 30
<210> 673
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 更多重叠的T7启动子
<400> 673
agtgagtcgt actacgactc actatagggg 30
<210> 674
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 弱重叠的T7启动子
<400> 674
gagtcgtatt aatacgactc tctatagggg 30
<210> 675
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7一致性启动子序列
<400> 675
taatacgact cactataggg aga 23
<210> 676
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7 RNAP启动子
<400> 676
ttatacgact cactataggg aga 23
<210> 677
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7 RNAP启动子
<400> 677
gaatacgact cactataggg aga 23
<210> 678
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7 RNAP启动子
<400> 678
taatacgtct cactataggg aga 23
<210> 679
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7 RNAP启动子
<400> 679
tcatacgact cactataggg aga 23
<210> 680
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7强启动子
<400> 680
taatacgact cactataggg agaccacaac 30
<210> 681
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7弱结合和持续合成能力
<400> 681
taattgaact cactaaaggg agaccacagc 30
<210> 682
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T7弱结合启动子
<400> 682
cgaagtaata cgactcacta ttagggaaga 30
<210> 683
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pCyc (中等)启动子
<400> 683
acaaacacaa atacacacac taaattaata 30
<210> 684
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pAdh (强)启动子
<400> 684
ccaagcatac aatcaactat ctcatataca 30
<210> 685
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pSte5 (弱)启动子
<400> 685
gatacaggat acagcggaaa caacttttaa 30
<210> 686
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 酵母ADH1启动子
<400> 686
tttcaagcta taccaagcat acaatcaact 30
<210> 687
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> cyc100最小的启动子
<400> 687
cctttgcagc ataaattact atacttctat 30
<210> 688
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> cyc70最小的启动子
<400> 688
cctttgcagc ataaattact atacttctat 30
<210> 689
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> cyc43最小的启动子
<400> 689
cctttgcagc ataaattact atacttctat 30
<210> 690
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> cyc28最小的启动子
<400> 690
cctttgcagc ataaattact atacttctat 30
<210> 691
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> cyc16最小的启动子
<400> 691
cctttgcagc ataaattact atacttctat 30
<210> 692
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pPGK1
<400> 692
ttatctactt tttacaacaa atataaaaca 30
<210> 693
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pCYC酵母启动子
<400> 693
acaaacacaa atacacacac taaattaata 30
<210> 694
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 酵母GPD (TDH3)启动子
<400> 694
gtttcgaata aacacacata aacaaacaaa 30
<210> 695
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 酵母中等长度的ADH1启动子
<400> 695
ccaagcatac aatcaactat ctcatataca 30
<210> 696
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G2/M 细胞周期特异的酵母CLB1启动子区域
<400> 696
accatcaaag gaagctttaa tcttctcata 30
<210> 697
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CMV启动子
<400> 697
agaacccact gcttactggc ttatcgaaat 30
<210> 698
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Ubc启动子
<400> 698
ggccgttttt ggcttttttg ttagacgaag 30

Claims (24)

1.控制第二微生物细胞生长的方法，所述方法包括：
允许重组工程化的第一微生物细胞在由所述第一微生物细胞发酵并且还包含所述第二微生物细胞的培养基中增殖，其中所述第二微生物细胞干扰所述培养基的发酵，
所述第一微生物细胞包含与启动子可操作连接的编码第一细菌素的第一核酸，所述方法还包括将所述第一细菌素表达并分泌到培养基中，其中选择所述第一细菌素以抑制或防止所述第二微生物细胞的繁殖，
其中所述第一微生物细胞已被基因工程化，以有条件地减少或消除细胞免疫调节剂的转录、转录后表达或转录后活性中的至少一种，所述细胞免疫调节剂赋予抗所述第一微生物细胞中分泌的第一细菌素的抗性，所述减少或消除与所述分泌的第一细菌素的同时表达，从而降低所述细胞免疫调节剂的免疫调节剂活性，
所述第二微生物细胞由于在第二微生物细胞中的所述细胞免疫调节剂无活性或不存在而对所述分泌的第一细菌素易感，由此所述分泌的第一细菌素抑制或防止所述第二微生物细胞的繁殖，并且由此所述培养基由第一微生物细胞发酵。
2.如权利要求1所述的方法，其还包括：
在允许所述重组工程化的第一微生物细胞在所述培养基中增殖后，检测所述培养基中的至少一种变化，所述变化包括自所述允许重组工程化细胞增殖开始以后的第三微生物细胞的水平或活性的增加；和
响应所述变化将所述第一微生物细胞再工程化，以产生抑制所述第三微生物细胞生长的第二细菌素。
3.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基还包含第三微生物细胞，并且
其中所述第一微生物细胞还包含编码能够抑制所述第三微生物细胞生长的分泌的第二细菌素的第三核酸，
所述方法还包括允许所述第一微生物细胞产生抑制所述第三微生物细胞生长的所述分泌的第二细菌素。
4.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基包含含有两种或更多种不同细菌素的上清液。
5.如权利要求3所述的方法，其中所述培养基包含含有所述分泌的第一细菌素和所述分泌的第二细菌素的上清液。
6.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基包含工业培养基。
7.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基包含给料。
8.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基包含除食物产品之外的给料。
9.如权利要求1所述的方法，其中通过所述分泌的第一细菌素可透过而所述第一微生物细胞不可透过的下述中的至少一种将所述第一微生物细胞与所述第二微生物细胞分离：网、滤器、过滤器、选择性阀、单向阀或多孔膜。
10.如权利要求2所述的方法，其中所述将所述第一微生物细胞再工程化包括将编码期望的细菌素的盒插入所述第一微生物细胞的多核苷酸中，使得所述第一微生物细胞具有期望的细菌素活性。
11.如权利要求2所述的方法，其中所述将所述第一微生物细胞再工程化包括将编码期望的细胞免疫调节剂的盒插入所述第一微生物细胞的多核苷酸中，使得所述第一微生物细胞具有期望的细胞免疫调节剂活性。
12.如权利要求1所述的方法，其中所述第二微生物细胞包括致病性细胞。
13.如权利要求1所述的方法，其中所述第二微生物细胞是不能产生足够水平的期望的基因产物的基因工程化细胞。
14.如权利要求1所述的方法，其中所述第二微生物细胞是能够产生工业产物的基因工程化细胞，但是在所述培养基中所述第二微生物细胞不是期望的。
15.如权利要求1所述的方法，其中所述第一核酸或第二核酸中的至少一种包含合成的核酸。
16.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基选自：给料、食物、污水或工业培养基。
17.如权利要求1所述的方法，其中所述培养基为食物产品。
18.如权利要求1所述的方法，其中所述第二微生物细胞产生产物，并且其中在抑制或防止所述第二微生物细胞的繁殖后不再产生所述第二微生物细胞的产物。
19.如权利要求1所述的方法，其中所述第一微生物细胞经重组工程化以表达编码工业上有用的分子的核酸，所述工业上有用的分子参与所述培养基的发酵，从而产生所述工业上有用的分子。
20.如权利要求19所述的方法，其中所述工业上有用的分子包括有助于合成碳水化合物、生物燃料、脂质、小分子或金属的一种或多种基因产物。
21.如权利要求19所述的方法，其中所述第二微生物细胞包含突变，所述突变导致所述第二微生物细胞不产生工业上有用的分子，或产生比所述第一微生物细胞更少量的工业上有用的分子，并且其中所述抑制或防止所述第二微生物细胞的繁殖使遗传漂变最小化。
22.如权利要求1所述的方法，其中所述第二微生物细胞选自：与所述第一微生物细胞相同的物种、与所述第一微生物细胞相同的菌株、或与所述第一微生物细胞克隆相关的。
23.如权利要求21所述的方法，其中所述第二微生物细胞选自：与所述第一微生物细胞相同的物种、与所述第一微生物细胞相同的菌株、或与所述第一微生物细胞克隆相关的。
24.如权利要求1所述的方法，所述第一微生物细胞还包含编码细胞免疫调节剂的第二核酸，所述细胞免疫调节剂赋予所述第一微生物细胞对所述分泌的第一细菌素的抗性，所述第二核酸与所述启动子或不同的启动子可操作地连接，并且所述第一微生物细胞表达所述细胞免疫调节剂。
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